序号 专利名 申请号 申请日 公开(公告)号 公开(公告)日 发明人
121 一种16S rDNA高通量测序文库的构建方法 CN201610700936.4 2016-08-23 CN106282177A 2017-01-04 刘青青; 谢文龙; 李珊; 王松林; 陈荣山; 肖辛野; 李奇渊; 姚迅
发明提供的是一种适用于16S rDNA高通量测序文库的构建方法,采用引物的上游引物为SEQ ID NO.1-8中任意一条,下游引物为SEQ ID NO.9-20中任意一条。本发明提供的引物同时包含接头序列、index序列、测序引物序列和目的片段扩增序列,使得整个建库过程只需一步PCR即可完成,与两步扩增法相比,明显缩短建库时间。且本发明文库构建完成后采用beads纯化法,并对beads用量及洗脱方式进行优化,与传统胶回收纯化法相比,节约了时间,提高了文库纯化效率。
122 一种坛紫菜核心种质库的构建方法 CN201610655114.9 2016-08-11 CN106222283A 2016-12-14 谢潮添; 陈昌生; 徐燕; 纪德华
一种坛紫菜核心种质库的构建方法,涉及坛紫菜。包括以下步骤:1)坛紫菜种质的收集和纯化;2)提取坛紫菜各种质品系基因组DNA;3)基于SSR分子标记的坛紫菜种质品系遗传多样性分析;4)计算各种质品系间遗传相似性系数;5)逐步聚类取样构建核心种质库。得到的核心种质库能以最少的样品数量最大程度地保存原种质的遗传多样性,从而简化后续坛紫菜杂交育种时进行亲本组配的环节,提高育种效率和育种成效。
123 一种串联RAD标签测序文库的构建方法 CN201610629494.9 2016-08-02 CN106192021A 2016-12-07 王师; 包振民; 刘平平; 吕佳; 张玲玲
发明公开了一种串联RAD标签测序文库的构建方法,步骤为:1)酶切:利用内切酶对DNA进行酶切反应;2)接头连接:对酶切片段分别连接接头,接头设计有SapI酶的酶切位点和用于实现标签串联的特征序列以及扩增引物结合的通用序列;3)连接产物扩增:利用生物素引物和普通引物组合进行PCR扩增,富集,切胶回收PCR产物,再次扩增,等量混合纯化;4)串联标签文库:利用SapI酶对PCR产物进行酶切,依次串联;5)串联长标签富集:串联长标签经凝胶纯化后利用引物进行PCR扩增,引入barcode构建文库;6)文库测序本发明能够实现对全基因组范围遗传标记和表观遗传变异进行高通量、低成本地筛查和检测。
124 通用型BRCA1基因多重PCR建库试剂 CN201610583781.0 2016-07-22 CN106191269A 2016-12-07 黄薇; 邵志敏; 施锦绣; 胡欣
发明涉及通用型BRCA1基因多重PCR建库试剂盒。具体而言,本发明提供一种引物产品,所述产品中的引物包括SEQ ID NO:1-84所示的引物序列。本发明还提供一种多核苷酸序列产品,该产品中的每一种多核苷酸序列分别含有悬挂接头序列和SEQ ID NO:1-84任一所示的引物序列。还提供了相应的试剂盒及BRCA1基因多重PCR建库或BRCA1基因突变筛查方法。
125 一种基于高通量测序构建白血病微小残留病灶TCR文库的多重PCR引物和方法 CN201510501106.4 2015-08-14 CN105154440B 2016-11-30 葛良进; 刘松; 林群婷; 刘丽春; 曾立董; 黄莎莎; 黄亮; 李改玲
发明提供了一种基于高通量测序构建白血病微小残留病灶TCR文库的多重PCR引物,包括上游引物和下游引物,所述上游引物为比SEQ ID NO:1~SEQ ID NO:25所示的核苷酸序列多或少0~3个基的核苷酸序列组成的上游引物组;所述下游引物为比SEQ ID NO:26~SEQ ID NO:38所示的核苷酸序列多或少0~3个碱基的核苷酸序列组成的。本发明提供的多重PCR引物组能高效构建白血病患者的T淋巴细胞受体高通量测序文库,可获得丰富的白血病微小残留病灶TCR重排信息。
126 一种游离DNA文库构建方法及试剂 CN201610460199.5 2016-06-22 CN106148513A 2016-11-23 祝云英
发明公开了一种游离DNA文库构建方法及试剂盒,包括以下步骤:(1)抽提血浆中游离DNA,加入游离DNA末端补平酶和dNTP,补平游离DNA末端并在游离DNA的3’端增加基A;(2)直接往步骤1反应体系中加入磷酸化酶去除多余的dNTP;(3)直接往步骤2反应体系中加入DNA连接试剂,使目标待测DNA与DNA接头连接。本发明可供高通量测序仪检测的测序文库,可实现单管和无需PCR扩增,从而使游离DNA检测更快速和更简便。
127 一种分泌抗原特异性抗体浆细胞的分离方法 CN201610356287.0 2016-05-26 CN105950552A 2016-09-21 赖增祖; 叶欣; 徐健; 杨奎东
发明公开了一种分泌抗原特异性抗体浆细胞的分离方法,通过使用浆细胞标记物CD38或CD138单抗与抗IgG抗体交联的双功能抗体和交联有特定抗原的磁珠分离得到分泌抗原特异性抗体的浆细胞。本发明能够准确获得将分泌抗原特异性的抗体浆细胞,极大地减少了工作量,成功率较高。
128 一种真核生物样本的mRNA和小RNA建库的方法 CN201610222093.1 2016-04-11 CN105907747A 2016-08-31 白灵; 邓腊梅; 左海洋; 王英男; 师文霞
发明公开一种真核生物样本的mRNA和小RNA建库的方法。该方法包括以下步骤:S1,利用磁珠从总RNA中纯化mRNA,得到mRNA和清液;S2,将清液用乙醇沉淀的方法回收得到RNA;以及S3,利用S1中得到的mRNA构建mRNA文库和利用S2中得到的RNA构建小RNA文库。本发明充分利用同一份真核生物总RNA的mRNA和小RNA而进行mRNA文库和小RNA文库的构建,在很大程度上解决了样本量限制的问题。
129 一种基于IonPGMTM测序平台的扩增子DNA文库的构建方法、试剂及其应用 CN201610140002.X 2016-03-11 CN105779437A 2016-07-20 钱飞箭; 丁志远; 蔡乐靖; 陈帼婧; 屠勇军; 陈贤丰
发明公开了一种基于Ion PGMTM测序平台的扩增子DNA文库的构建方法、试剂及其应用,构建过程包括目标区域扩增、引物及修饰清除、接头连接、磁珠纯化、文库扩增、文库检测、高通量测序等步骤。本发明还提供一种用于构建基于Ion PGMTM测序平台的扩增子DNA文库的多重PCR扩增目标区域试剂、接头连接反应试剂、扩增试剂。本发明步骤简单,目标区域富集后通过一次的PCR扩增,然后采用磁珠纯化产物,即得到测序文库;同时降低了建库的成本,减少了由于PCR扩增中引入突变的可能。使得测序质量更佳精确。
130 一种基于高通量测序构建猪BCR重链文库的多重PCR引物和方法 CN201510478591.8 2015-08-07 CN105087560B 2016-06-01 葛良进; 刘松; 黄莎莎; 刘丽春; 黄亮; 林群婷; 李改玲
发明提供了一种基于高通量测序构建猪BCR重链文库的多重PCR引物和方法。所述的多重PCR引物包括上游引物和下游引物,所述上游引物为SEQ ID NO:1所示的核苷酸序列,所述下游引物为SEQ ID NO:2~SEQ ID NO:6所示的核苷酸序列组成的下游引物组。本发明提供的多重PCR引物组能高效构建猪的B淋巴细胞受体高通量测序文库,可获得丰富的猪BCR重排信息。
131 用于生物芯片的印刷方法及其应用 CN201510902943.8 2015-12-09 CN105463586A 2016-04-06 杨华卫; 曾冀
发明涉及一种用于生物芯片的印刷方法及其应用。该印刷方法包括以图形的形式将待测样品和标志物或者将待测样品、标志物和对待测样品具有质控作用的生物分子固定到生物芯片的基片上,由此制得生物芯片。采用该方法印刷生物芯片,不会抑制任何芯片反应,芯片反应会非常稳定。该生物印刷方法简化了芯片制造过程,且使得芯片反应结果的判读变得更为便捷,同时增加了芯片的检测通量,使得芯片上探针的定位更加精准。
132 构建链特异性转录组文库的方法 CN201510964353.8 2015-12-21 CN105349533A 2016-02-24 杨吉元
发明公开一种构建链特异性转录组文库的方法,包括:步骤1)mRNA片段化处理;步骤2)反转录:片段化的mRNA 3'端连接已知序列的R3接头;采用RT primer与R3接头退火配对进行反转录,合成cDNA第一链;步骤3)cDNA 3'端标记:去除RNA后,采用TdT对cDNA 3'端添加多个dC基,并采用ddCTP进行末端封闭,然后与F5G引物进行配对,在聚合酶作用下复制cDNA第一链;步骤4)PCR扩增;步骤5)质检。本发明的片段化mRNA先连接接头再合成,以提高cDNA合成效率、cDNA均一性;cDNA第一链合成后,采用TdT在其3'端添加多个dC碱基及ddCTP进行封闭,然后与含多个dG碱基的F5G引物配对,在聚合酶的作用下进行复制cDNA第一链,如此可有效降低自连二聚体的产生、提高文库均一性。
133 一种单管高通量测序文库的构建方法 CN201510496049.5 2015-08-13 CN105332063A 2016-02-17 陈琰; 郭飞飞
发明公开了一种单管高通量测序文库的构建方法,包括如下步骤:(1)针对若干目的基因分别设计若干对基本扩增引物;(2)设计一对不对称连接探针和一不与人类基因组形成互补的通用引物;(3)将模板、上述若干对基本扩增引物、不对称探针、通用引物置于一含有DNA连接酶和DNA末端修饰酶的PCR反应体系中进行扩增,得扩增产物,该扩增的程序依次包括:预变性、第一阶段扩增和第二阶段扩增;(4)将扩增产物纯化后,即得所述高通量测序文库。本发明的单管高通量测序文库的构建方法针对多个靶序列进行单管,快速完成文库的构建,结合高通量测序平台可以十分有效的解决目前对于临床上肿瘤、遗传病等疾病中在少量的临床样本基础上需要对体细胞多基因、多靶点检测这一难点,且成本低廉。
134 一种基于高通量测序构建白血病微小残留病灶TCR文库的多重PCR引物和方法 CN201510501106.4 2015-08-14 CN105154440A 2015-12-16 葛良进; 刘松; 林群婷; 刘丽春; 曾立董; 黄莎莎; 黄亮; 李改玲
发明提供了一种基于高通量测序构建白血病微小残留病灶TCR文库的多重PCR引物,包括上游引物和下游引物,所述上游引物为比SEQ ID NO:1~SEQ ID NO:25所示的核苷酸序列多或少0~3个基的核苷酸序列组成的上游引物组;所述下游引物为比SEQ ID NO:26~SEQ ID NO:38所示的核苷酸序列多或少0~3个碱基的核苷酸序列组成的。本发明提供的多重PCR引物组能高效构建白血病患者的T淋巴细胞受体高通量测序文库,可获得丰富的白血病微小残留病灶TCR重排信息。
135 高通量测序文库及其构建方法 CN201510055922.7 2015-02-03 CN104561362A 2015-04-29 蒋智; 王大伟; 李明洲; 李宗文; 朱海浩; 王苗英; 刘运超
发明公开了一种高通量测序文库及其构建方法。该构建方法包括以下步骤:S1,从DNA-蛋白交联复合体中获取DNA片段;S2,利用核酸外切酶对DNA片段进行酶切;以及S3,对酶切后的DNA片段进行文库构建,得到高通量测序文库;其中,核酸外切酶是指作用于双链DNA,具有3’→5’核酸外切酶活性而不具有DNA聚合酶活性的核酸酶。上述文库构建方法,通过用具有3’→5’核酸外切酶活性而不具有DNA聚合酶活性的核酸外切酶替代现有技术中的具有3’→5’核酸外切酶活性且具有DNA聚合酶活性的klenow片段,因而能够将非目的片段中的标记去除得更彻底,使所得DNA片段纯度大大提高,进而提高后续测序数据的有效量。
136 基因分型测序文库的构建方法和测序方法 CN201410835787.3 2014-12-26 CN104561294A 2015-04-29 王大伟; 刘运超; 蒋智; 李明渊; 朱海浩; 孙晴晴
发明公开了一种基因分型测序文库的构建方法和测序方法。其中,构建方法包括以下步骤:S1,在对基因组DNA进行第一次酶切产生第一酶切片段的同时,在第一酶切片段的两端连上样本标签序列,得到带标签的第一酶切片段;S2,利用带文库标签序列的扩增引物对第一酶切片段进行PCR扩增,得到基因分型测序文库。本发明的上述构建方法,通过在第一次酶切产生酶切片段的同时在酶切片段两端直接连上样本标签序列,使得所构建的文库在上机测序时能够在读取样本标签信息之后直接进入目的酶切片段序列的读取,进而使得目的酶切片段序列的读长增加,减少了无效数据量,提高了测序数据的有效量。
137 多核苷酸变体的组合自动化平行合成 CN200980159766.1 2009-09-18 CN102803489B 2015-01-28 杰弗里·科尔贝克; 本杰明·米杰茨; 洛林·琼·吉尔; 理查德·J·福克斯; 韦丝娜·米切尔; 凡植·罗伯特·朴; 林恩·吉尔森
本公开内容涉及用于有效合成、克隆、转化和筛选多核苷酸变体的大型多样文库的方法,所述多核苷酸变体相对于参考多核苷酸包含明确的核苷酸差异。
138 一种无引物的基因合成方法 CN201410211672.7 2014-05-19 CN104109683A 2014-10-22 马立新; 沈鹤霄; 陈晚苹; 华权高; 张桂敏; 杨明波; 陈羽西
发明公开了一种无引物的基因合成方法,属于基因的人工合成领域。本发明首先公开了一个pNew载体质粒,其核苷酸序列为SEQ ID NO.33所示。本发明还公开了用pNew载体质粒构建的包含有16384(47)个质粒的载体库。本发明进一步公开了一种无引物的基因合成方法,包括以下步骤:(1)将待合成的目标基因DNA序列按照每个片段82bp进行分组;(2)将分组的片段分别在构建的质粒库中找到对应的质粒;(3)将对应的质粒酶切,用抗生素筛选,重构得到含82bp目的基因序列的质粒;(4)通过金克隆反应将基因片段拼接成完整的目的基因。本发明基因合成方法不需要利用引物,合成成本低,突变率极其低,准确率高,可以合成诸如高度重复序列、Poly A等特殊的基因序列,操作简单,能实现自动化操作。
139 甲基化高通量检测方法 CN201110133858.1 2011-05-23 CN102796808B 2014-06-18 罗慧娟; 吉冠玉; 蒋慧; 吴明枝; 孙继华; 吴仁花; 王君文; 高飞
发明提供一种甲基化高通量检测方法,特别提供了一种结合序列捕获和重亚硫酸盐测序的方法,该方法能够同时准确有效地分析几个样品中的目标区域甲基化状态,降低探针设计的难度,增加操作及应用的可行性,使得对全基因组内感兴趣的目标序列和区域进行高通量高精度的甲基化检测成为现实,并且该方法还具有针对性强以及节约成本和时间的特点。
140 多核苷酸装配的组合物和方法 CN200980154897.0 2009-11-19 CN102282255B 2014-05-07 扎克·塞贝; 雷蒙德·洛; 杰弗里·A·尤伯萨克斯; 苏尼尔·S·钱德兰; 埃里克·杰迪戴亚·迪安; 达伦·M·普拉特; 肯尼思·俊树·竹冈
发明提供组合物和从大量组分多核苷酸快速装配为一个或多个装配好的多核苷酸的方法。本发明的方法使用环形核酸载体,所述载体包含DNA片段D,侧邻于可退火接头序列、可退火接头序列对LA和LB、或可退火接头序列/引物结合片段对LA和PB或PA和LB。限制性内切酶消化包含用于装配的DNA片段的大量载体以产生大量DNA片段,包括元件PA-D-LB、LA-D-LB、和LA-D-PB,或D-LB、LA-D-LB、和LA-D。可退火接头序列LA和LB提供了DNA片段的互补末端,其用于宿主细胞介导的同源重组或同时在聚合酶循环装配反应中与引物结合片段PA和PB反应,从而使多种DNA片段有序装配成为一个或多个装配好的多核苷酸。
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