序号 专利名 申请号 申请日 公开(公告)号 公开(公告)日 发明人
1 构建简化基因组文库的方法及试剂 CN201611193343.X 2016-12-21 CN106676099B 2019-07-02 王克剑; 刘庆
发明提供了一种构建简化基因组文库的方法及试剂盒。该方法包括:利用第一对引物对全基因组进行非特异性扩增,得到随机扩增片段;利用第二对引物对随机扩增片段进行特异性扩增,得到简化基因组文库。该方法利用非特异性扩增在基因组上存在随机性的特点,无需高质量或高浓度的DNA,无需繁琐的酶切建库步骤,只需要对样本DNA进行简单的PCR反应,可以随意选择目标片段。通过简单更改PCR退火温度或引物序列就可以灵活控制目标片段在全基因组的覆盖区域。该方法步骤简捷易行、灵活度高、成本较低,而且测序结果准确性高。
2 一种羊皮肤组织酵母cDNA文库及其构建方法 CN201811555952.4 2018-12-19 CN109680344A 2019-04-26 李有文; 张雪萍; 米丽开姆·托合提尼亚改; 童建军; 何川川
发明公开了一种羊皮肤组织酵母cDNA文库及其构建方法,涉及生物技术领域。本发明方法包括:提取羊痘病羊皮组织总RNA;从所述总RNA中分离出mRNA;构建酵母双杂交文库;鉴定所述酵母双杂交文库的质量;提取所述酵母双杂交文库的质粒,并将文库保存。本发明提取的文库质粒可直接用于酵母文库筛选;本发明通过上述方法建立了羊皮肤组织酵母cDNA文库,为以后研究羊痘病病例提供科学依据。
3 DNA编码化合物库中On-DNA芳硝基化合物还原成On-DNA芳胺化合物的方法 CN201811546746.7 2018-12-18 CN109680342A 2019-04-26 吴阿亮; 温石阳; 曲毅; 徐艳芬; 袁友浪; 张朝欣; 裴增飞; 陈雯婷; 李科; 蒯乐天; 杨洪芳; 彭宣嘉
发明涉及一种DNA编码化合物库构建中On-DNA芳硝基化合物经还原反应将硝基还原为基制备On-DNA芳胺化合物的方法:该方法以On-DNA芳硝基化合物为原料,以为氢源,四羟基二为还原剂,不需要添加任何金属催化剂,就可以得到硝基还原的On-DNA芳胺产物。本发明所提供的On-DNA芳胺化合物的制备方法,反应条件温和,不使用任何金属催化剂,成本低、后处理简单、环境友好,产率高,适合使用多孔板进行的DNA编码化合物库的合成。
4 一种乳杆菌特异性数据库及其应用 CN201910012202.0 2019-01-07 CN109680082A 2019-04-26 徐岩; 吴群; 杜如冰
发明公开了一种乳杆菌特异性数据库及其应用,属于生物领域和生物信息学领域。本发明通过大量的研究实验,获得了不同乳杆菌的特异性基因,这些特异性基因能够将该种乳杆菌与其他175种乳杆菌区分开来。进一步地,本发明针对特异性基因,设计了大量引物并进行了验证,结果显示可以用于区分所有乳杆菌不同种;这些引物可应用于定性或者定量PCR,能够从不同环境中准确地鉴定或者筛选对应的乳杆菌种;同时,用于荧光定量PCR检测时,具有速度快、检测限低、准确度高和应用范围广的特点。从本发明建立的数据库中,使用者可以根据想要分析、鉴定、筛选的乳杆菌可以快速定目的基因信息或者可扩增目的基因的引物。
5 采用磁珠混样处理DNA的测序文库标准化方法及试剂 CN201811599011.0 2018-12-26 CN109680042A 2019-04-26 冯延叶; 赖煦卉; 孙大鹏; 赵骞; 吴知才
发明公开了一种采用磁珠混样处理DNA的测序文库标准化方法及试剂盒,本发明利用固定数量的磁珠捕获DNA分子,使得获取固定量的DNA分子变得容易,后续的混样中只需要按照DNA分子摩尔比例分配每个样本的上机测序数据即可,省去了前期处理的测DNA浓度,测DNA文库摩尔浓度等繁琐的步骤,大大简化了多个不同样本DNA文库上机测序前的处理过程,可以实现自动化操作,成本低,实用性强。
6 一种针对FFPE和cfDNA的DNA二代测序文库构建的试剂盒及其应用 CN201811548483.3 2018-12-18 CN109680040A 2019-04-26 习杨; 蒋国成; 陈旭; 陈刚
发明涉及一种针对FFPE和cfDNA样本的DNA二代测序文库构建的试剂盒及其应用,所述的试剂盒包含:末端修复,加dA尾的酶体系,接头连接的酶体系,PCR扩增的Mix;本发明还涉及上述试剂盒的用途和使用方法。该试剂盒不仅可实现常规样本的DNA建库,尤其对于较难得到高品质DNA文库的样本(如FFPE和cfDNA样本)有突出的表现,优于同类产品50%建库产量,目的片段更富集,且操作简单、快速、无偏好PCR扩增。
7 一种生化试剂盒及其应用方法 CN201811575706.5 2018-12-22 CN109652861A 2019-04-19 罗俊峰; 陈苗苗; 杨继伟; 刘香琼; 欧阳虎; 陈云弟
发明适用于生化技术领域,提供了一种生化试剂盒及其应用方法,该试剂盒包括:盒体以及存放于盒体中的试剂;试剂包括:浓度为5~40μM的试剂A,浓度为0.5~10μM的试剂B,浓度为500~50000units/mL的试剂C,浓度为1~10mM的试剂D,浓度为500~50000units/mL的试剂E,浓度为1~100μM的试剂F,浓度为500~50000units/mL的试剂G;和浓度为1~10μM的试剂H;试剂A为Cas12a和/或Cas9;试剂B为sgRNA;试剂C为聚合酶;试剂D为硫代核苷酸;试剂E为核酸外切酶;试剂F为含有分子标签序列的试剂;试剂G为酶制剂;试剂H为含有通用测序引物序列和酶的试剂。利用本发明的试剂对基因区域进行富集并构建基因文库,可较传统富集方式缩短3~5倍的时间,富集区域的局限性小,且操作简便,试剂成本较低。
8 二代测序建库试剂组分质控方法及使用的模板组合 CN201811635588.2 2018-12-29 CN109629008A 2019-04-16 任丽平; 王瑞超; 梁加龙; 蔡万世
发明公开了一种对建库流程进行质控的方法,所述方法包括:将A序列末端补平磷酸化加A,A序列为双链序列SEQ ID NO.4,其中最后四个核苷酸GATC为单链末端;将B序列末端补平磷酸化加A,B序列为双链序列SEQ ID NO.8,其中开始四个核苷酸TGCA为单链末端;将C序列末端补平磷酸化加A,C序列为双链序列SEQ ID NO.11。本发明还公开了对建库过程中的步骤进行质控的模板组合,所述模板组合包括:SEQ ID NO.4、SEQ ID NO.8、SEQ ID NO.11、SEQ SEQ ID NO.14、ID NO.17、SEQ ID NO.20和SEQ ID NO.23。
9 一种基于两步PCR的高通量建库方法 CN201811478422.4 2018-12-05 CN109628440A 2019-04-16 李明; 田溯宁; 杨俊
发明公开了一种一种基于两步PCR的高通量建库方法,提高建库效率的建库方法。它包括PCR扩增、核酸外切酶选择消化和磁珠纯化。本发明简化了建库步骤,提高了建库效率。
10 基于高通量测序的中枢系统感染病原检测文库构建方法、检测方法和试剂 CN201811327028.0 2018-11-08 CN109610008A 2019-04-12 刘华勇; 萧卓; 袁剑颖; 吴红龙
一种基于高通量测序的中枢系统感染病原检测文库构建方法、检测方法和试剂盒,文库构建方法包括:从样本中提取DNA并将DNA片段化得到片段化的DNA序列;将片段化的DNA序列加入末端修复体系中进行末端修复反应,末端修复反应完成后,直接向反应体系中添加接头序列、连接酶、ATP以及聚乙二醇,在连接酶作用下以ATP为辅酶,催化接头序列连接到末端修复反应产物的两端,得到接头连接产物;纯化接头连接产物后,加入与接头序列两端互补的核酸单链作为引物进行PCR扩增。该方法能够实现快速、广谱的中枢系统感染病原生物检测,无需预知太多检测样本的临床信息,可以快速高效地进行检测,检测结果无偏向性,还可以解决低浓度脑脊液样本文库构建失败率高的问题。
11 一种植物降解组文库构建方法 CN201811557992.2 2018-12-19 CN109457299A 2019-03-12 李用芳; 王丽; 魏康宁; 崔俊霞; 刘海英; 王梦蕾; 赵淼
发明公开了一种植物降解组文库构建方法,5’RNA接头中含有Ecop15I酶的识别位点,由Ecop15I酶切,文库插入片段长度为27个基,5’RNA接头序列为GUUCAGAGUUCUACAGUCCGACGAUCAGCAG,其中下划线部分是EcoP15I酶的识别序列,双链DNA接头序列的上链:5’NNTGGAATTCTCGGGTGCCAAGG 3’,下链:5’CCTTGGCACCCGAGAATTCCA 3’,由于5’RNA接头序列及双链DNA接头序列的改变,所构建的植物降解组文库能够采用Illumina TruSeq小RNA文库测序方法进行测序,因此测序简便易行。
12 一种测序用DNA文库 CN201710647896.6 2017-08-01 CN109321984A 2019-02-12 潘伟业; 王占东; 赵雪丹; 程世月; 玄兆伶; 李大为; 梁峻彬; 陈重建
发明涉及一种测序用DNA文库。本发明的测序用DNA文库包括第一双链DNA分子,所述第一双链DNA分子包括第一DNA链,该第一DNA链从5'端起依次包括位于5'端的桥式引物DNA序列1、目的片段特异性扩增引物DNA序列1、待读取DNA序列S、目的片段特异性扩增引物DNA序列2的反向互补序列以及位于3'端的桥式引物DNA序列2的反向互补序列,所述桥式引物DNA序列1和所述桥式引物DNA序列2是测序芯片上的DNA序列,所述目的片段特异性扩增引物DNA序列1和所述目的片段特异性扩增引物DNA序列2用于对包含待读取DNA序列S的目的DNA片段进行特异性扩增的引物DNA序列。本发明的测序用DNA文库能够增加单轮测序反应中基读取复杂度,从而提高测序质量
13 寡核苷酸指导和记录的编码探针分子的组合合成 CN201780035706.3 2017-06-08 CN109312492A 2019-02-05 理查德·爱德华·瓦特斯
本公开涉及多官能分子,其包括式(I)的分子:(I)([(B1)M-D-L1]Y-H1)O-G-(H2-[L2-E-(B2)K]W)P,其中G、H1、H2、D、E、B1、B2、M、K、L1、L2、O、P、Y和W在本文中定义。本公开还涉及制备这些多官能分子的方法和使用这些多官能分子来鉴定能够结合靶分子的编码分子的方法。
14 PacBio测序平台多样品混合测序文库构建的带标签接头及应用 CN201811067092.X 2018-09-13 CN109136222A 2019-01-04 方涛
发明涉及一种PacBio测序平台多样品混合测序文库构建的带标签接头及应用,所述带标签接头包括5’端连接的16个基序列、3’端连接的16个碱基序列和PacBio测序平台通用的哑铃结构平末端接头,5’端连接的16个碱基序列与3’端连接的16个碱基序列反向互补配对,带标签接头的碱基序列如SEQ ID No.1‑96所示。将该标签序列应用于混样测序,与现有技术相比,该标签序列的设计综合考虑每个标签之间的差异度、每个标签与通用接头之间的差异度,显著提高了标签序列识别效率和测序准确度,大幅度提高待测样本容量。同时,标签序列应用于混样测序,实现了同一个Cell中多个样本混合测序的流程,减少样本用量的同时也优化试剂用量,有效的节约了试剂耗材,降低了实验成本。
15 一种测序文库构建的方法、建库试剂及其应用 CN201710500504.3 2017-06-27 CN109136217A 2019-01-04 陈俊清; 张聪; 唐玉婧; 方俊彬; 杨晓琴; 钟宏斌; 刘娜
申请公开了一种测序文库构建的方法、建库试剂及其应用。本申请的测序文库构建方法,包括采用简并引物对富集的靶标基因进行恒温扩增,然后对恒温扩增产物进行末端修复、加“A”基、加接头,纯化获得测序文库;简并引物的5’端具有标签序列,3’端为随机序列。本申请的测序文库构建方法,通过简并引物对靶标基因进行恒温扩增,得到适合于测序的片段化DNA,省略了打断步骤,避免了由此造成的标签序列丢失和测序无用数据。本申请的测序文库构建方法简化了建库流程、缩短了建库周期、降低了建库成本、提高了数据利用率,为高通量测序提供了一种新的建库方案。
16 用于核酸组装的组合物和方法 CN201680081641.1 2016-12-21 CN109069667A 2018-12-21 I·萨埃姆
本公开的方面涉及用于多核苷酸组装的组合物和方法。在一些实施方式中,提供了终止子寡核苷酸。
17 一种适用于细菌的Hi-C高通量测序建库方法 CN201811087438.2 2018-09-18 CN109056078A 2018-12-21 张骥诚
发明涉及一种适用于细菌的Hi‑C高通量测序建库方法,该方法包:(1)样品甲交联;(2)液氮研磨和溶菌酶并行裂解交联后物料,释放细胞染色质;细胞染色质依次经SDS灭活内源酶、经Sau3AI核酸内切酶酶切打断获得酶切后物料;SDS灭活内源酶的条件为:65℃孵育10min后立即放置上;(3)酶切后物料进行末端补平;(4)末端补平后DNA分子内连接;(5)解交联分子内连接后物料并去除未连接的末端生物素,获得纯化DNA,声波随机打断DNA成利于测序的片段大小从而获得DNA测序文库。该方法通过设计合适的内源酶灭活条件,调整灭活时间和温度,从而解决了原核生物染色质偏少、互作捕获难度大的技术问题,实现了细菌的Hi‑C高通量测序建库,扩大了Hi‑C技术的适用范围。
18 一种适用于PacBio测序平台的扩增子混样测序文库构建方法 CN201811067161.7 2018-09-13 CN109056077A 2018-12-21 方涛
发明涉及一种适用于PacBio测序平台的扩增子混样测序文库构建方法,针对现有PacBio核酸测序平台应用于扩增子扩增的文库构建中,存在试剂成本高、步骤复杂等技术问题,该方法基于扩增子样本的扩增原理,结合PacBio测序技术特征,针对每个待测样本在第一步扩增中引入反向互补的标签序列,使同一次扩增的扩增子都标记有标签序列,将带有不同标签的扩增子混合,标签序列在后续文库构建中一直保留,因此该方法可实现多个扩增子样品仅需一次文库构建,简化了实验操作流程,提高了建库效率,降低了测序成本。本发明在设计标签序列时,使每种样本的两个引物5’端添加的标签序列反向互补,测序时两端均可识别出标签序列,极大提高扩增子样本的标签序列识别效率。
19 一种类湿性关节炎的外泌体miRNA标志物及试剂 CN201811100516.8 2018-09-20 CN109055538A 2018-12-21 雷署丰; 武龙飞; 邓飞艳
发明公开了一种类湿性关节炎的外泌体miRNA标志物及试剂盒,属于生物检测技术领域。本发明提供的外泌体miR‑204‑5p序列及相应引物可以用于制备类风湿关节炎诊断试剂盒,具有很高的灵敏度与特异性,有利于推动我国类风湿性关节炎的早期诊断、预测治疗、监测复发的发展。
20 一种微量DNA样品高通量测序文库的构建技术 CN201811025369.2 2018-09-04 CN109023537A 2018-12-18 赵小东; 康亚妮; 胡丛霞; 徐伟
发明提供了一种微量DNA样品高通量测序文库的构建技术。具体地,本发明方法包括步骤:(a)提供DNA片段和辅助核酸片段;(b)向DNA片段和辅助核酸片段两端添加接头;(c)用特异性抗体捕获、富集末端带有接头的DNA片段和辅助核酸片段;(d)用特异性酶去除所述辅助核酸片段;(e)用特异性引物对所述步骤(c)中捕获、富集的DNA片段和辅助核酸片段进行扩增,从而获得扩增产物。本发明方法更适用于少量来源的微量样品的文库构建;文库质量好,无污染;成本较低,具有较高的普遍适用性。
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