1.一种进行实时测定的方法，所述方法包括以下步骤：
(a)将含有多肽的产物的样品经由第一保持盘管移动至多肽结合柱；
(b)将所述样品中的所述多肽结合至所述多肽结合柱，从而将所述样品中的所述多肽与所述样品的其余部分分离；
(c)将洗脱缓冲溶液经由所述第一保持盘管并通过所述多肽结合柱下游的第二保持盘管从缓冲液源移动至所述多肽结合柱，从而洗脱与所述多肽结合柱结合的多肽，并将包含所述洗脱缓冲溶液和洗脱的多肽的洗脱液/多肽混合物移动至所述第二保持盘管；
(d)将所述洗脱液/多肽混合物从所述第二保持盘管移动至反应室；
(e)将所述洗脱液/多肽混合物中的所述多肽在所述反应室中进行孵育，从而产生变性的多肽；
(f)在(e)之后，将切割二硫键交联的还原试剂经由第一保持盘管移动至所述反应室；
(g)将所述变性的多肽与所述还原试剂在所述反应室中进行孵育，从而产生变性和还原的多肽；
(h)在(g)之后，将使巯基烷基化的烷基化试剂移动至所述反应室；
(i)将所述变性和还原的多肽与所述烷基化试剂在所述反应室中进行孵育，从而使所述变性和还原的多肽烷基化；
(j)将所述变性、还原并烷基化的多肽，所述洗脱缓冲溶液，所述还原试剂和所述烷基化试剂经由所述第一保持盘管从所述反应室移动至脱盐柱，所述脱盐柱用蛋白质水解缓冲液平衡；
(k)将所述变性、还原并烷基化的多肽应用至所述脱盐柱，从而将所述变性、还原并烷基化的多肽与所述还原试剂和烷基化试剂分离，从而得到脱盐的多肽；
(l)将所述脱盐的多肽移动至所述脱盐柱下游的蛋白水解酶柱；
(m)在第三多肽柱中消化所述脱盐的多肽，从而产生消化的多肽；以及
(n)将所述消化的多肽移动至分析装置以分析所述消化的多肽。
2.如权利要求1所述的方法，其中自动执行(a)、(c)、(d)、(f)、(h)、(i)、(l)和(n)中的一个或多个。
3.如权利要求1或2所述的方法，其中(a)至(n)在封闭系统中执行。
4.如权利要求1至3中任一项所述的方法，其中(a)包括将多通路阀定位在第一位置，在所述第一位置中，所述第一保持盘管和所述多肽结合柱经由所述多通路阀的第一通路流体地联接。
5.如权利要求4所述的方法，其中(d)包括将所述多通路阀定位在第二位置，在所述第二位置中，所述第二保持盘管和所述反应室经由所述多通路阀的第二通路流体地联接。
6.如权利要求5所述的方法，其中(f)和(h)各自包括将所述多通路阀定位在第三位置，在所述第三位置中，所述第一保持盘管和所述反应室经由所述多通路阀的第三通路流体地联接。
7.如权利要求6所述的方法，其中(j)包括：
将所述变性、还原并烷基化的多肽，所述洗脱缓冲溶液，所述还原试剂和所述烷基化试剂经由所述多通路阀的所述第三通路从所述反应室移动至所述脱盐柱；并且
将所述多通路阀定位在第四位置，在所述第四位置中，所述第一保持盘管和所述脱盐柱经由所述多通路阀的第四通路流体地联接。
8.如权利要求1至7中任一项所述的方法，所述方法进一步包括在(d)之前或期间，将与所述反应室流体地联接并位于其下游的第一阀移动至第一位置，在所述第一位置中，所述第一阀将从所述第一保持盘管接收的超过所述反应室容积的内容物引导至废物室。
9.如权利要求8所述的方法，所述方法进一步包括在(i)之后，将所述第一阀从所述第一位置移动至第二位置，在所述第二位置中，所述第一阀将空气引导至所述反应室中。
10.如权利要求1至9中任一项所述的方法，所述方法进一步包括在(k)之后并且在(l)之前，(o)将与所述脱盐柱和所述蛋白水解酶柱流体地联接并位于其之间的第二阀从第一位置移动至第二位置，在所述第一位置中所述第二阀将从所述脱盐柱接收的内容物引导至废物室，在所述第二位置中所述第二阀将从所述脱盐柱接收的内容物引导至所述蛋白水解酶柱。
11.如权利要求1至10中任一项所述的方法，其中(a)包括将所述产物的所述样品经由所述第一保持盘管从含有所述多肽的容器移动至所述多肽结合柱。
12.如权利要求1至11中任一项所述的方法，所述方法进一步包括在(d)之前，用变性试剂至少部分地填充所述反应室，并且其中(e)包括将所述洗脱液/多肽混合物中的多肽与所述变性试剂在所述反应室中进行孵育。
13.如权利要求12所述的方法，其中用所述变性试剂至少部分地填充所述反应室包括将所述变性试剂经由所述第一保持盘管从变性缓冲液源移动至所述反应室。
14.如权利要求1至13中任一项所述的方法，所述方法进一步包括向所述反应室施加热。
15.如权利要求12所述的方法，其中(j)进一步包括将所述变性试剂经由所述第一保持盘管从所述反应室移动至所述脱盐柱，并且其中(k)进一步将所述变性、还原并烷基化的多肽与所述变性试剂分离。
16.一种用于使用封闭系统执行实时测定的方法，所述封闭系统包括多通路阀、在所述多通路阀上游的第一保持盘管、与所述多通路阀的第一通路流体地联接并位于其下游的多肽结合柱、与所述多肽结合柱流体地联接并位于其下游的第二保持盘管、与所述多通路阀的第二和第三通路流体地联接并位于其下游的反应室、与所述多通路阀的第四通路流体地联接并位于其下游的脱盐柱，以及在所述脱盐柱下游的蛋白水解酶柱，所述方法包括：
(a)经由与所述封闭系统通信地联接的控制器，将含有多肽的产物的样品移动至所述第一保持盘管；
(b)经由所述控制器将所述多通路阀定位在第一位置，在所述第一位置中，所述第一保持盘管经由所述多通路阀的所述第一通路连接至所述多肽结合柱，使得所述样品流动至第一柱，从而所述样品中的多肽结合至所述多肽结合柱上；
(c)当所述多通路阀处于所述第一位置时，经由控制器将洗脱缓冲溶液从洗脱缓冲溶液源经由所述多肽结合柱移动至所述第二保持盘管，使得所述洗脱缓冲溶液洗脱基本上所有与所述多肽结合柱结合的多肽；
(d)经由所述控制器将所述多通路阀移动至第二位置，在所述第二位置中，所述第二保持盘管经由所述多通路阀的所述第二通路连接至所述反应室；
(e)当所述多通路阀处于所述第二位置时，经由所述控制器将包含所述洗脱缓冲溶液和洗脱的多肽的洗脱液/多肽混合物移动至所述反应室，从而使所述洗脱液/多肽混合物中的多肽变性；
(f)经由所述控制器将多通路阀移动至第三位置，在所述第三位置中，所述第一保持盘管经由所述多通路阀的所述第三通路连接至所述反应室；
(g)在(f)之后，经由所述控制器将切割二硫键交联的还原试剂移动至所述第一保持盘管，并且经由所述控制器将所述还原试剂从所述第一保持盘管经由所述多通路阀的所述第三通路移动至所述反应室，从而还原所述变性的多肽；
(h)在(g)之后，经由所述控制器将使巯基烷基化的烷基化试剂移动至所述第一保持盘管，并且经由所述控制器将所述烷基化试剂从所述第一保持盘管经由所述第三通路移动至所述反应室，从而烷基化所述变性和还原的多肽；
(i)经由所述控制器将所述烷基化的多肽、所述洗脱缓冲溶液、所述还原试剂和所述烷基化试剂从所述反应室经由所述第三通路移动至所述第一保持盘管；
(j)经由所述控制器将所述多通路阀移动至第四位置，在所述第四位置中，所述第一保持盘管经由所述多通路阀的第四通路连接至所述脱盐柱，并且当所述多通路阀处于在所述第四位置时，将所述烷基化的多肽、所述洗脱缓冲溶液、所述还原试剂和所述烷基化试剂从所述第一保持盘管移动至所述脱盐柱，从而将所述变性、还原并烷基化的多肽应用至所述脱盐柱，由此将所述变性、还原并烷基化的多肽与所述还原试剂和烷基化试剂分离，得到脱盐的多肽；
(k)经由所述控制器将所述脱盐的多肽移动至所述蛋白水解酶柱，从而消化所述脱盐的多肽；以及
(l)经由所述控制器将所述消化的多肽传送至分析装置，从而分析所述消化的多肽。
17.如权利要求16所述的方法，其中(a)包括经由所述控制器将所述样品从含有所述多肽的容器移动至所述第一保持盘管。
18.如权利要求16或17所述的方法，其中(k)包括将所述消化的多肽传送至选自由以下组成的组的分析装置：液相色谱装置、高效液相色谱装置、超高效液相色谱装置、质谱装置和聚糖分析装置，或其组合。
19.如权利要求16至18中任一项所述的方法，所述方法进一步包括在(e)之前，经由所述控制器将所述多通路阀移动至所述第三位置，并经由所述控制器将变性试剂移动至所述反应室。
20.如权利要求19所述的方法，其中将所述变性试剂移动至所述反应室包括：经由所述控制器将所述变性试剂从变性缓冲液源经由泵移动至所述第一保持盘管，并经由所述控制器将所述变性试剂从所述第一保持盘管经由所述多通路阀的第三通路移动至所述反应室。
21.如权利要求19或20所述的方法，其中(i)进一步包括将所述变性试剂从所述反应室经由所述第三通路移动至所述第一保持盘管，并且其中(j)进一步包括将所述变性试剂从所述第一保持盘管移动至所述脱盐柱，并且当所述变性、还原并烷基化的多肽应用于所述脱盐柱时，所述变性、还原并烷基化的多肽与所述变性试剂借此进一步分离。
22.一种用于执行联机实时测定的封闭系统，所述系统包括：
第一保持盘管，所述第一保持盘管流体地布置成接收含有多肽的产物的样品；
多通路阀，所述多通路阀流体地联接至所述第一保持盘管并位于其下游；
多肽结合柱，所述多肽结合柱流体地联接至所述多通路阀，并布置成经由所述多通路阀的第一通路从所述第一保持盘管接收所述样品，所述多肽结合柱被配置为结合来自所述样品的所述多肽，
缓冲液源，所述缓冲液源流体地联接至所述多通路阀，并被布置成向位于所述多肽结合柱下游的第二保持盘管供应洗脱缓冲溶液，使得所述洗脱缓冲溶液适于从所述多肽结合柱上洗脱基本上所有的所述多肽；
反应室，所述反应室流体地联接至所述多通路阀并被布置在所述多肽结合柱下游，所述反应室适于经由所述多通路阀的第二通路从所述多肽结合柱接收混合物，所述混合物包含所述洗脱缓冲溶液和所述洗脱的多肽，其中所述混合物的多肽在所述反应室中变性，其中所述反应室被布置成经由所述多通路阀的第一保持盘管和第三通路接收切割二硫键交联的还原试剂，所述还原试剂还原所述变性的多肽，并且其中所述反应室还被布置成经由所述多通路阀的第一保持盘管和第三通路接收使巯基烷基化的烷基化试剂，其中所述烷基化试剂在所述反应室中将所述变性并还原的多肽烷基化；
脱盐柱，所述脱盐柱流体地联接至所述多通路阀，并且被布置成从所述反应室接收变性、还原并烷基化的多肽，所述洗脱缓冲溶液和所述烷基化试剂，所述脱盐柱被配置为将所述变性、还原并烷基化的多肽与所述洗脱缓冲溶液、所述还原试剂和所述烷基化试剂分离；
以及
蛋白水解酶柱，所述蛋白水解酶柱流体地联接至第二多肽柱并被布置成在其下游以从所述脱盐柱获得所述分离的多肽，所述蛋白水解酶柱被配置为消化脱盐的多肽。
23.如权利要求22所述的系统，所述系统进一步包括生物反应器，所述生物反应器被配置为产生含有多肽的产物，其中所述第一保持盘管流体地联接至所述生物反应器。
24.如权利要求22或23所述的系统，其中所述多通路阀包含12个卫星通路和中心共享通路阀。
25.如权利要求22至24中任一项所述的系统，其中所述多肽结合柱选自由以下组成的组：蛋白A柱、蛋白G柱、蛋白A/G柱、蛋白L柱、氨基酸柱、亲和素柱、链霉亲和素柱、碳水化合物结合柱、碳水化合物柱、谷胱甘肽柱、肝素柱、疏水相互作用柱、免疫亲和柱、核苷酸/辅酶柱、专门柱和固定化金属亲和色谱(IMAC)柱。
26.如权利要求22至25中任一项所述的系统，所述系统进一步包括泵，所述其被配置为将所述产物的样品从所述生物反应器泵送至所述第一保持盘管。
27.如权利要求22至26中任一项所述的系统，其中所述还原试剂选自由以下组成的组：
二硫苏糖醇(DTT)、谷胱甘肽、β-巯基乙醇(β-ME)和三(2-羧乙基)膦(TCEP)。
28.如权利要求22至27中任一项所述的系统，其中所述烷基化试剂是吲哚-3-乙酸(IAA)。
29.如权利要求22至28中任一项所述的系统，其中所述脱盐柱是尺寸排阻色谱柱。
30.如权利要求22至29中任一项所述的系统，其中所述蛋白水解酶柱包含蛋白水解酶，并且其中所述蛋白水解酶是内肽酶。
31.如权利要求30所述的系统，其中所述内肽酶选自由以下组成的组：胰蛋白酶、胰凝乳蛋白酶、弹性蛋白酶、嗜热菌蛋白酶、胃蛋白酶、谷氨酰内肽酶、脑啡肽酶、Lys-C蛋白酶和金黄色葡萄球菌V8蛋白酶。
32.如权利要求22至31中任一项所述的系统，其中所述反应室至少部分地预填充有变性试剂。
33.如权利要求32所述的系统，所述系统进一步包括泵，所述泵被配置为将所述变性试剂从变性缓冲液源经由所述第一保持盘管泵送至所述反应室。
34.如权利要求32或33所述的系统，其中所述变性试剂包括变性去污剂或离液剂。
35.如权利要求34所述的系统，其中所述离液剂选自由以下组成的组：尿素、正丁醇、乙醇、氯化胍、高氯酸锂、乙酸锂、氯化镁、苯酚、2-丙醇、和硫脲。
36.如权利要求34所述的系统，其中所述变性去污剂选自由以下组成的组：十二烷基硫酸钠(SDS)、胆酸钠、脱氧胆酸钠、甘氨胆酸钠、牛磺胆酸钠、牛磺脱氧胆酸钠、N-月桂酰肌氨酸、十二烷基硫酸锂、十六烷基三甲基溴化铵(CTAB)和三甲基(十四烷基)溴化铵(TTAB)。
37.如权利要求36所述的系统，其中所述变性去污剂是SDS。
38.如权利要求32所述的系统，其中所述变性试剂包括加热的流体。
39.如权利要求22至38中任一项所述的系统，所述系统进一步包括加热元件，所述加热元件紧邻所述反应室定位，所述加热元件被配置为向所述反应室施加热。
40.如权利要求39所述的系统，其中所述热具有在约22℃至约120℃之间的温度。
41.如权利要求40所述的系统，其中所述热具有约40℃的温度。
42.如权利要求22至41中任一项所述的系统，所述系统进一步包括第一阀，所述第一阀流体地联接至所述反应室并位于其下游，其中所述第一阀在第一位置和第二位置中可操作，在所述第一位置中所述第一阀将从所述第一保持盘管接收的超过所述反应室容积的内容物引导至废物，在所述第二位置中所述第一阀将空气引导至所述反应室中。
43.如权利要求42所述的系统，所述系统进一步包括控制器，所述控制器通信地联接至所述第一阀以控制所述第一阀的位置，其中在将所述变性、还原并烷基化的多肽，所述洗脱缓冲溶液，所述变性试剂，所述还原试剂和所述烷基化试剂从所述反应室移动至所述脱盐柱之前，所述控制器将所述第一阀从所述第一位置移动至所述第二位置。
44.如权利要求22至43中任一项所述的系统，所述系统进一步包括第二阀，所述第二阀流体地联接至所述脱盐柱和所述蛋白水解酶柱并位于其之间，其中所述第二阀在第一位置和第二位置中可操作，在所述第一位置中所述第二阀将从所述脱盐柱接收的内容物引导至废物，在所述第二位置中所述第二阀将从所述脱盐柱接收的内容物引导至所述蛋白水解酶柱。
45.如权利要求44所述的系统，所述系统进一步包括控制器，所述控制器通信地联接至所述第二阀以控制所述第二阀的位置，其中在所述脱盐柱将所述变性、还原并烷基化的多肽与所述洗脱缓冲溶液、所述变性试剂、所述还原试剂和所述烷基化试剂分离之后，所述控制器将所述第二阀从所述第一位置移动至所述第二位置。
46.如权利要求22至41中任一项所述的系统，所述系统进一步包括控制器，所述控制器通信地联接至所述反应室，所述控制器被配置为将所述反应室保持在大约40摄氏度的温度。
47.如权利要求22至41中任一项所述的系统，所述系统进一步包括控制器，所述控制器通信地联接至所述多通路阀，所述控制器被配置为选择性地打开和关闭所述多通路阀的第一、第二、第三和第四通路。
48.一种用于执行实时测定的封闭系统，所述系统包括：
多通路阀；
第一保持盘管，所述第一保持盘管在所述多通路阀上游；
多肽结合柱，所述多肽结合柱流体地联接至所述多通路阀的第一通路并在其下游；
第二保持盘管，所述第二保持盘管流体地联接至所述多肽结合柱并在其下游；
反应室，所述反应室流体地联接至所述多通路阀的第二和第三通路并在其下游；
脱盐柱，所述脱盐柱流体地联接至所述多通路阀的第四通路并在其下游；
蛋白水解酶柱，所述蛋白水解酶柱位于所述脱盐柱下游；以及
控制器，所述控制器通信地联接至所述多通路阀并且包括存储器、处理器以及逻辑，所述逻辑存储在所述存储器上并且可由所述处理器执行以：
(a)将含有多肽的产物的样品移动至所述第一保持盘管；
(b)将所述多通路阀定位在第一位置，在所述第一位置中，所述第一保持盘管经由所述多通路阀的所述第一通路连接至所述多肽结合柱，使得所述样品流动至第一柱，从而所述样品中的多肽结合至所述多肽结合柱上；
(c)当所述多通路阀处于所述第一位置时，将洗脱缓冲溶液从洗脱缓冲溶液源经由所述多肽结合柱移动至所述第二保持盘管，使得所述洗脱缓冲溶液洗脱基本上所有与所述多肽结合柱结合的所述多肽；
(d)将所述多通路阀移动至第二位置，在所述第二位置中，所述第二保持盘管经由所述多通路阀的所述第二通路连接至所述反应室；
(e)当所述多通路阀处于所述第二位置时，将包含所述洗脱缓冲溶液和洗脱的多肽的洗脱液/多肽混合物移动至所述反应室，从而将所述洗脱液/多肽混合物中的所述多肽变性；
(f)将所述多通路阀移动至第三位置，在所述第三位置中，所述第一保持盘管经由所述多通路阀的所述第三通路连接至所述反应室；
(g)在(f)之后，将切割二硫键的还原试剂移动至所述第一保持盘管，并且将所述还原试剂从所述第一保持盘管经由所述多通路阀的所述第三通路移动至所述反应室，从而还原所述变性的多肽；
(h)在(g)之后，将使巯基烷基化的烷基化试剂移动至所述第一保持盘管，并且将所述烷基化试剂从所述第一保持盘管经由所述第三通路移动至所述反应室，从而烷基化所述变性并还原的多肽；
(i)将所述变性、还原并烷基化的多肽，所述洗脱缓冲溶液，所述还原试剂和所述烷基化试剂从所述反应室经由所述第三通路移动至所述第一保持盘管；
(j)将所述多通路阀移动至第四位置，在所述第四位置中，所述第一保持盘管经由所述多通路阀的所述第四通路连接至所述脱盐柱，并且当所述多通路阀处于所述第四位置时，将所述变性、还原并烷基化的多肽，所述洗脱缓冲溶液，所述还原试剂和所述烷基化试剂从所述第一保持盘管移动至所述脱盐柱，从而使所述变性、还原并烷基化的多肽脱盐；
(k)将所述脱盐的多肽移动至所述蛋白水解酶柱，从而消化所述脱盐的多肽；以及(l)将所述消化的多肽传送至聚糖分析装置，从而分离并量化所述消化的多肽。
49.如权利要求48所述的系统，其中所述多肽结合柱选自由以下组成的组：蛋白A柱、蛋白G柱、蛋白A/G柱、蛋白L柱、氨基酸柱、亲和素柱、链霉亲和素柱、碳水化合物结合柱、碳水化合物柱、谷胱甘肽柱、肝素柱、疏水相互作用柱、免疫亲和柱、核苷酸/辅酶柱、专门柱和固定化金属亲和色谱(IMAC)柱。
50.如权利要求48或49所述的系统，所述系统进一步包括泵，所述泵被配置为将所述产物的所述样品从包含所述产物的生物反应器泵送至所述第一保持盘管。
51.如权利要求48至50中任一项所述的系统，其中所述还原试剂选自由以下组成的组：
二硫苏糖醇(DTT)、谷胱甘肽、β-巯基乙醇(β-ME)和三(2-羧乙基)膦(TCEP)。
52.如权利要求48所述的系统，其中所述烷基化试剂是吲哚-3-乙酸(IAA)。
53.如权利要求48所述的系统，其中所述脱盐柱是尺寸排阻色谱柱。
54.如权利要求48所述的系统，其中所述蛋白水解酶柱包含蛋白水解酶，并且其中所述蛋白水解酶是内切蛋白酶。
55.如权利要求54所述的系统，其中所述内切蛋白酶选自由以下组成的组：胰蛋白酶、胰凝乳蛋白酶、弹性蛋白酶、嗜热菌蛋白酶、胃蛋白酶、谷氨酰内肽酶、脑啡肽酶、Lys-C蛋白酶和金黄色葡萄球菌V8蛋白酶。
56.如权利要求48所述的系统，其中在(e)之前，所述逻辑可由所述处理器执行以将所述多通路阀移动至所述第三位置并且将变性试剂移动至所述反应室。
57.如权利要求56所述的系统，其中所述逻辑可由所述处理器执行，以将所述变性试剂从变性缓冲液源经由布置在所述第一保持盘管上游的泵移动至所述第一保持盘管，并且将所述变性试剂从所述第一保持盘管经由所述多通路阀的所述第三通路移动至所述反应室。
58.如权利要求56或57所述的系统，其中所述变性试剂包括变性去污剂或离液剂。
59.如权利要求58所述的系统，其中所述离液剂选自由以下组成的组：尿素、正丁醇、乙醇、氯化胍、高氯酸锂、乙酸锂、氯化镁、苯酚、2-丙醇、和硫脲。
60.如权利要求58所述的系统，其中所述变性去污剂选自由以下组成的组：十二烷基硫酸钠(SDS)、胆酸钠、脱氧胆酸钠、甘氨胆酸钠、牛磺胆酸钠、牛磺脱氧胆酸钠、N-月桂酰肌氨酸、十二烷基硫酸锂、十六烷基三甲基溴化铵(CTAB)和三甲基(十四烷基)溴化铵(TTAB)。
61.如权利要求60所述的系统，其中所述变性去污剂是SDS。
62.如权利要求57或58所述的系统，其中所述变性试剂包括热。
63.如权利要求56至62中任一项所述的系统，其中在(e)之前或期间，所述逻辑可由所述处理器执行以将热施加至所述反应室。
64.如权利要求62或63所述的系统，其中所述热具有从约22℃至约120℃的温度。
65.如权利要求64所述的系统，其中所述热具有约40℃的温度。
66.如权利要求48所述的系统，所述系统进一步包括第一阀，所述第一阀流体地联接至所述反应室并位于其下游，其中所述第一阀在第一位置和第二位置中可操作，在所述第一位置中所述第一阀将从所述第一保持盘管接收的超过所述反应室容积的内容物引导至废物室，在所述第二位置中所述第一阀将空气引导至所述反应室中，其中所述控制器通信地联接至所述第一阀以控制所述第一阀的位置，其中在(h)之后，所述控制器将所述第一阀从所述第一位置移动至所述第二位置。
67.如权利要求48所述的系统，所述系统进一步包括第二阀，所述第二阀流体地联接至所述脱盐柱和所述蛋白水解酶柱并位于其之间，其中所述第二阀在第一位置和第二位置中可操作，在所述第一位置中所述第二阀将从所述脱盐柱接收的内容物引导至废物室，在所述第二位置中所述第二阀将从所述脱盐柱接收的内容物引导至所述蛋白水解酶柱，其中所述控制器通信地联接至所述第二阀以控制所述第二阀的位置，其中在(j)之后，所述控制器将所述第二阀从所述第一位置移动至所述第二位置。
68.如权利要求48所述的系统，其中所述控制器通信地联接至所述反应室，所述控制器被配置为将所述反应室保持在大约40℃的温度。
69.如权利要求1-21所述的方法或如权利要求22-68所述的系统，其中所述产物的所述多肽是治疗性多肽。
70.如权利要求69所述的方法或系统，其中所述治疗性多肽选自由以下组成的组：抗体或其抗原结合片段、抗体或抗体片段的衍生物、和融合多肽。
71.如权利要求70所述的方法或系统，其中所述抗体选自由以下组成的组：英夫利昔单抗、贝伐单抗、兰尼单抗、西妥昔单抗、兰尼单抗、帕利珠单抗、阿巴伏单抗、阿昔单抗、阿克托克单抗、阿达木单抗、阿非莫单抗、阿托珠单抗、阿珠单抗、培化阿珠单抗、ald518、阿仑单抗、阿利库单抗、阿仑单抗、阿妥莫单抗、阿麦妥昔单抗、马安那莫单抗、安芦珠单抗、阿泊珠单抗、阿西莫单抗、阿塞珠单抗、阿替奴单抗、阿替珠单抗、阿托立木单抗、托珠单抗、巴匹珠单抗、巴利昔单抗、巴维昔单抗、贝妥莫单抗、贝利木单抗、苯拉利珠单抗、柏替木单抗、贝索单抗、贝伐珠单抗、贝洛托单抗、比西单抗、比伐珠单抗、莫-比伐珠单抗、博纳吐单抗、布索珠单抗、本妥昔单抗、巴列津单抗、布洛鲁单抗、康纳单抗、莫坎妥珠单抗、莫坎妥珠单抗、卡普赛珠单抗、卡罗单抗喷地肽、卡鲁单抗、卡妥索单抗、cc49、西利珠单抗、赛妥珠单抗、西妥昔单抗、泊西他珠单抗、西妥木单抗、克拉扎珠单抗、克立昔单抗、克伐珠单抗、可那木单抗、克雷内治单抗、cr6261、达西珠单抗、达克珠单抗、达罗土珠单抗、达雷木单抗、地莫米佐单抗、地诺单抗、地莫单抗、阿托度单抗、德罗图单抗、杜力戈图单抗、杜匹鲁单抗、依美昔单抗、依库丽单抗、埃巴单抗、依决洛单抗、依法利珠单抗、依芬古单抗、埃罗妥珠单抗、艾西莫单抗、埃文单抗、培化恩莫单抗、恩诺珠单抗、恩诺珠单抗、依诺替库单抗、依诺替库单抗、埃斯托西单抗、西依匹莫单抗、依帕珠单抗、厄利珠单抗、厄马索单抗、埃达珠单抗、依卓利珠单抗、艾韦单抗、艾韦单抗、法索单抗、法拉莫单抗、法拉图珠单抗、法希奴单抗、fbta05、非维珠单抗、非扎奴单抗、费希腊妥单抗、芬妥木单抗、弗兰托单抗、芳妥珠单抗、弗罗鲁单抗、福拉韦单抗、夫苏木单抗、弗兰单抗、弗图希单抗、加利昔单抗、盖尼柱单抗、盖坦德单抗、加维莫单抗、吉妥珠单抗奥佐米星、吉伏珠单抗、吉仁土昔单抗、维德汀单抗、戈利木单抗、戈利昔单抗、gs6624、替伊立珠单抗、替伊莫单抗、依库单抗、伊戈伏单抗、英西单抗、英戈土珠单抗、英克拉库单抗、依坦希单抗、英夫利西单抗、英妥木单抗、伊诺莫单抗、伊珠单抗奥佐米星、伊匹木单抗、艾雷妥木单抗、依拓珠单抗、希凯珠单抗、凯利昔单抗、拉贝珠单抗、来金珠单抗、来马索单抗、乐地单抗、来沙木单抗、利韦单抗、利格珠单抗、林妥珠单抗、立鲁单抗、莫-洛伏珠单抗、鲁卡木单抗、鲁昔单抗、马帕木单抗、马司莫单抗、美力姆单抗、马妥珠单抗、美泊利单抗、美替木单抗、米拉珠单抗、明瑞莫单抗、米妥莫单抗、莫格穆里单抗、莫罗木单抗、莫他珠单抗、莫希土姆单抗、莫罗单抗-cd3、他那可单抗、纳米鲁单抗、他那莫单抗、纳瑞特单抗、那他珠单抗、奈巴库单抗、奈昔木单抗、奈瑞莫单抗、耐西维单抗、尼妥珠单抗、纳武单抗、巯诺莫单抗、奥卡土珠单抗、奥瑞珠单抗、奥度莫单抗、奥法木单抗、奥拉图单抗、奥鲁凯珠单抗、奥马珠单抗、欧那土珠单抗、莫奥珠单抗、奥戈伏单抗、奥泰单抗、奥昔珠单抗、欧西鲁单抗、欧赞尼珠单抗、欧拉丽珠单抗、帕吉昔单抗、帕利珠单抗、帕尼单抗、帕诺库单抗、帕萨土珠单抗、帕考珠单抗、帕特立珠单抗、帕图单抗、帕尼单抗、培拉凯珠单抗、培妥珠单抗、培克珠单抗、皮地利珠单抗、平妥莫单抗、普拉库鲁单抗、拍珠单抗、普立昔单抗、普托木单抗、PRO140、坤立珠单抗、雷库图单抗、雷德图单抗、雷韦单抗、雷莫芦单抗、雷珠单抗、雷昔库单抗、瑞加韦单抗、瑞利珠单抗、利妥木单抗、利妥昔单抗、罗妥木单抗、罗勒杜单抗、罗姆苏珠单抗、隆他利珠单抗、罗利珠单抗、鲁利珠单抗、沙玛立珠单抗、沙鲁单抗、沙妥莫单抗喷地肽、苏金单抗、司韦单抗、西罗珠单抗、西法木单抗、司妥昔单抗、西姆土珠单抗、西利珠单抗、希瑞库单抗、苏兰珠单抗、苏力图单抗、松普希珠单抗、松妥珠单抗、司他芦单抗、硫索单抗、索维单抗、他贝鲁单抗、他珠单抗、他度珠单抗、他利珠单抗、他尼珠单抗、帕他莫单抗、替非珠单抗、阿替莫单抗、替妥莫单抗、替非珠单抗、阿替莫单抗、替妥莫单抗、替奈昔单抗、替利珠单抗、替普单抗、替扎贝鲁单抗、TGN1412、曲美木单抗、替西木单抗、替拉珠单抗、替加珠单抗、TNX-650、托珠单抗、托利珠单抗、托西莫单抗、曲洛青木单抗、曲妥珠单抗、TRBS07、曲加立珠单抗、曲美木单抗、西莫白介素单抗、妥韦单抗、乌波利土西单抗、乌瑞鲁单抗、乌珠单抗、优特克单抗、伐利昔单抗、维特立珠单抗、维多珠单抗、维妥珠单抗、维帕莫单抗、维西库单抗、维西珠单抗、伏洛昔单抗、伏妥土珠单抗、伏妥莫单抗、扎芦木单抗、扎木单抗、扎土希单抗、齐拉木单抗、阿佐莫单抗，以及表1中显示的那些抗体。
72.如权利要求70所述的方法或系统，其中所述治疗性多肽是选自由以下组成的组的多肽：糖蛋白、CD多肽、HER受体多肽、细胞粘附多肽、生长因子多肽、胰岛素多肽、胰岛素相关多肽、凝血多肽、凝血相关多肽、白蛋白、IgE、血型抗原、集落刺激因子、受体、神经营养因子、干扰素、白介素、病毒抗原、脂蛋白、降钙素、胰高血糖素、心钠素、肺表面活性剂、肿瘤坏死因子-α和-β、脑啡肽酶、小鼠促性腺激素相关肽、DNA酶、抑制素、激活素、整联蛋白、蛋白A、蛋白D、类风湿因子、免疫毒素、骨形态发生蛋白、超氧化物歧化酶、表面膜多肽、衰变促进因子、AIDS包膜、转运多肽、归巢受体、地址素、调节多肽、免疫粘附素、肌生长抑制素、TALL多肽、淀粉样多肽、胸腺基质淋巴细胞生成素、RANK配体、c-kit多肽、TNF受体和血管生成素、及其生物活性片段、类似物或变体。
73.一种监测由权利要求22或48所述的封闭系统执行的联机实时测定的方法，所述方法包括：
确定所述封闭系统中的条件是否满足预定的性能阈值；并且
当确定所述封闭系统中的条件不满足所述预定的性能阈值时，调整至少一种细胞培养构成，直到所述封闭系统中的条件满足所述预定的性能阈值。
74.如权利要求73所述的方法，其中调节至少一种细胞培养构成包括调节以下中的一种或多种：pH、压力、温度、培养基流量、培养基含量、气体处理策略、搅拌、添加剂含量、添加剂进料速率或灌注速率。
75.一种使用如权利要求22或48所述的封闭系统来延长生产运行的方法，所述方法包括：
确定所述封闭系统中的条件是否满足预定的性能阈值；并且
当确定所述封闭系统中的条件不满足所述预定的性能阈值时，调整至少一种细胞培养构成，直到所述封闭系统中的条件满足所述预定的性能阈值。
76.如权利要求75所述的方法，其中调节至少一种细胞培养构成包括调节以下中的一种或多种：pH、压力、温度、培养基流量、培养基含量、气体处理策略、搅拌、添加剂含量、添加剂进料速率或灌注速率。
77.一种减轻风险的方法，所述方法包括：
确定与如权利要求22或48所述的封闭系统的运行相关的过程和产物质量数据；
确定所述过程和产物质量数据是否满足预定的风险阈值；并且
根据所述过程和产物质量数据是否满足所述预定的风险阈值来确定是否继续、调整或停止所述封闭系统的运行。