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与在细胞疗法给药有关的组合物、制品和方法

阅读:971发布:2022-02-01

专利汇可以提供与在细胞疗法给药有关的组合物、制品和方法专利检索,专利查询,专利分析的服务。并且本 申请 提供了用于与涉及给予一个或多个剂量的 治疗 性T细胞组合物的 细胞疗法 结合使用的方法、组合物和制品。所述T细胞组合物的细胞表达重组受体或其他转基因受体,所述重组受体例如为嵌合受体,如嵌合 抗原 受体(CAR),所述其他转基因受体例如为T细胞受体(TCR)。所提供的实施方案的特征,包括所给予的细胞数量或细胞单位和/或所给予的细胞效 力 ,所述特征提供了各种优点,如被给予所述T细胞组合物的受试者中的毒性 风 险较低。,下面是与在细胞疗法给药有关的组合物、制品和方法专利的具体信息内容。

1.一种制品,其包含:
(a)包含治疗性T细胞组合物的单位剂量的容器,所述治疗性T细胞组合物包含T细胞,所述T细胞包含特异性地结合抗原的任选地为嵌合抗原受体(CAR)的重组受体,其中所述单位剂量含有在给定范围内的目标数量的参考单位(RU),其中在给定组合物中的RU由下式定义:
RU=A x B,其中:
A是在所述给定组合物中存在的具有表型的细胞的数量、或其倍数、分数或变换,或者是在所述给定组合物中具有两种或更多种表型的细胞的数量的平均值或加权平均值、或所述平均值或加权平均值的倍数、分数或变换;并且
B是指示在所述给定组合物中重组受体依赖性、任选地CAR依赖性活性的程度或与其相关的参数的值、或所述值的分数或倍数或变换;并且
(b)用于将所述组合物、任选地其一个或多个单位剂量给予至受试者、任选地患有或怀疑患有疾病或病症的受试者的说明书
2.根据权利要求1所述的制品,其中参考单位的所述目标数量小于参考单位的安全数量,其中,参考单位的所述安全数量是相对于在用包含表达所述重组受体、任选地所述CAR的T细胞的治疗性T细胞组合物治疗后分析的一组受试者,向在曾持续发生不良事件的组中的那些受试者中的受试者给予的疗法的参考单位的最低数量。
3.根据权利要求2所述的制品,其中所述不良事件是严重不良事件,任选地严重神经毒性,任选地等于或高于4级或5级或至少延长的3级神经毒性。
4.根据权利要求2或权利要求3所述的制品,其中参考单位的所述目标数量比参考单位的所述安全数量少了对应于安全系数的量和/或少了在1.5倍至3倍范围内、任选地约2倍的量,或少了作为向未发生过所述不良事件的一组受试者给予的所述治疗性T细胞组合物的平均单位数量的标准偏差的倍数的量,任选地其中所述组的受试者展现出0-2级神经毒性,任选地其中所述倍数是在1.5倍至3倍的范围内。
5.根据权利要求1-4中任一项所述的制品,其中参考单位的所述目标数量等于或高于参考单位的参考功效数量,其中所述参考功效数量是相对于在用包含所述重组受体、任选地所述CAR的治疗性T细胞组合物治疗后分析的一组受试者,向展现出所希望的治疗结果、任选地部分反应或完全反应(CR)的组中的一名或多名受试者给予的疗法的单位的数量。
6.根据权利要求1-5中任一项所述的制品,其中:
A是在所述给定组合物中存在的具有表型的细胞的数量,并且B是指示在所述给定组合物中重组受体依赖性活性的程度或与其相关的参数的值;
A和/或B分别是数量或值的变换,其中所述变换包括对数变换、幂变换或罗吉特变换;
A是在所述给定组合物中存在的具有表型的细胞的数量,并且B是指示在所述给定T细胞组合物中的CAR依赖性活性的程度或与其相关的参数的值的倍数或变换,任选地其中B是所述值的对数变换。
7.根据权利要求1-6中任一项所述的制品,其中所述表型包括表面标记的阳性表达,所述表面标记是CD3、CD4或CD8中的一种或多种,和/或所述表型包括所述重组受体、任选地所述CAR或用于表达所述重组受体的替代标记的阳性表达。
8.根据权利要求7所述的制品,其中所述表型是CD3+CAR、CD4+/CAR+、CD8+/CAR+。
9.根据权利要求1-8中任一项所述的制品,其中所述表型包括不存在指示凋亡、或在凋亡级联或途径中的一个或多个步骤的因子,任选地其中所述表型包括凋亡标记的阴性表达。
10.根据权利要求9所述的制品,其中所述凋亡标记是表面磷脂酰丝酸和/或用膜联蛋白V检测,或是半胱天冬酶的活性或前体形式,任选地半胱天冬酶3的活性或前体形式。
11.根据权利要求1-10中任一项所述的制品,其中所述表型包括膜联蛋白-。
12.根据权利要求1-11中任一项所述的制品,其中A是为CD3+CAR+细胞的凋亡标记阴性(-)细胞的总数、为CD4+CAR+的凋亡标记阴性(-)细胞的总数、为CD8+CAR+细胞的凋亡标记阴性(-)细胞的总数、或所述总数的倍数或变换值,其中所述凋亡标记是膜联蛋白V或活性半胱天冬酶3。
13.一种制品,其包含:
(a)包含治疗性T细胞组合物的单位剂量的容器,所述治疗性T细胞组合物包含表达与抗原特异性地结合的重组受体、任选地嵌合抗原受体(CAR)的T细胞,其中所述单位剂量含有所述治疗性T细胞组合物的目标剂量,其中:
(i)如果指示所述组合物的重组受体依赖性活性、任选地CAR依赖性活性的程度或与其相关的参数的值等于或大于阈值,则所述目标剂量是第一数量的在所述组合物中具有给定表型的细胞或是在第一数量范围内的在所述组合物中具有给定表型的细胞;
(ii)如果所述参数的值小于所述阈值,则所述目标剂量是第二数量的在所述组合物中具有给定表型的细胞或是第二数量范围内的在所述组合物中具有给定表型的细胞,其中所述第一数量低于所述第二数量,或者所述第一范围低于所述第二范围;以及(b)用于将所述组合物、任选地其一个或多个单位剂量给予至受试者、任选地患有或怀疑患有疾病或病症的受试者的说明书。
14.根据权利要求13所述的制品,其中所述重组受体依赖性活性、任选地CAR依赖性活性的阈值小于参考安全值,其中所述参考安全值是相对于在用包含表达所述重组受体、任选地所述CAR的T细胞的治疗性T细胞组合物治疗后分析的一组受试者,向在曾持续发生不良事件的组中的那些受试者中的受试者给予的所述治疗性组合物的所述重组受体依赖性活性的最低值,任选地其中所述不良事件是严重不良事件,任选地等于或高于4级或5级或至少延长的3级神经毒性的严重神经毒性。
15.一种制品,其包含:
(a)包含单位剂量的治疗性T细胞组合物的容器,所述治疗性T细胞组合物包含T细胞,所述T细胞包含特异性地结合抗原的任选地为嵌合抗原受体(CAR)的重组受体,其中:
所述单位剂量含有所述治疗性T细胞组合物的目标剂量;并且
所述治疗性T细胞组合物高于B的规格下限(LSL)且低于规格上限(USL),其中B是指示所述组合物的重组受体依赖性活性的程度或与其相关的参数的值;以及
(b)用于将所述组合物、任选地其一个或多个单位剂量给予至受试者、任选地患有或怀疑患有疾病或病症的受试者的说明书。
16.根据权利要求1-48中任一项所述的制品,其中所述参数是一种或多种因子、任选地可溶性因子的量度或其归一化值,所述一种或多种因子任选地为细胞因子、趋化因子或可溶性受体中的一种或组合,所述可溶性受体任选地为可溶性共刺激受体。
17.根据权利要求16所述的制品,其中所述量度是在如下测定中的,所述测定涉及在所述抗原、表达所述抗原的细胞和/或与所述重组受体、任选地所述CAR特异性地结合的药剂的存在下将给定组合物或其样品培养或孵育固定的时间、任选地24小时。
18.根据权利要求16或权利要求17所述的制品,其中所述因子的所述量度是:
(i)所述因子的浓度、相对浓度、量或相对量;或
(ii)每单位的在所述给定组合物中的输入细胞而言所述因子的量或相对量,或
(iii)每单位时间、任选地一小时,每单位的在所述给定组合物中的输入细胞而言所述因子的量或相对量;或
(iv)指示(i)-(iii)中任何一项的平。
19.根据权利要求16-18中任一项所述的制品,其中:
所述一种或多种因子是促炎性细胞因子、Th2细胞因子和Th17细胞因子中的一种或组合;或
所述一种或多种因子是IL-2、IFN-γ、TNF-α、IL4、IL-5、IL-10、IL-13、GM-CSF、sCD137、MIP1a和M1Pb中的一种或者两种或更多种的组合,任选地IL-2、IFN-γ、TNF-α和IL-10中的一种或者两种或更多种的组合。
20.根据权利要求16-19中任一项所述的制品,其中:
所述参数是TNF-α、IFN-γ和IL-2中的至少两种或者TNF-α、IFN-γ和IL-2的量度的算术平均值或几何平均值,所述量度任选地为量或浓度。
21.根据权利要求1-20中任一项所述的制品,其中:
所述表型是CD8+CAR+细胞或凋亡标记-CD8+CAR+细胞,任选地其中所述凋亡标记是膜联蛋白V或活性半胱天冬酶3;并且
所述参数是促炎性细胞因子的量度或者是其归一化值,所述促炎性细胞因子任选地是TNF-α、IL-2和IFN-γ中的一种或组合。
22.根据权利要求1-21中任一项所述的制品,其中所述治疗性T细胞组合物包含在约
1000万个细胞/mL与约7000万个细胞/mL之间、在约1000万个存活细胞/mL与约7000万个存活细胞/mL之间或在约1500万个细胞或存活细胞/mL与约6000万个细胞或存活细胞/mL之间。
23.根据权利要求1-22中任一项所述的制品,其中所述T细胞组合物包含大于1000万个细胞或存活细胞/mL,或大于1500万个细胞或1500万个存活细胞/mL。
24.根据权利要求1-23中任一项所述的制品,其中所述组合物进一步包含冷冻保护剂和/或所述制品进一步包括用于在给予至所述受试者之前将所述组合物解冻的说明书。
25.根据权利要求1-24中任一项所述的制品,其中所述疾病或病症是癌症,任选地骨髓瘤、淋巴瘤或白血病。
26.根据权利要求25所述的制品,其中所述疾病或病症是B细胞恶性肿瘤,任选地B细胞恶性肿瘤选自急性成淋巴细胞性白血病(ALL)、成人ALL、慢性成淋巴细胞性白血病(CLL)、非霍奇金淋巴瘤(NHL)、和弥漫性大B细胞淋巴瘤(DLBCL)。
27.根据权利要求1-26中任一项所述的制品,其中所述重组受体是CAR。
28.根据权利要求27所述的制品,其中所述CAR包含与所述抗原特异性地结合的细胞外抗原识别结构域和包含ITAM的细胞内信号传导结构域,其中任选地,所述细胞内信号传导结构域包含CD3-ζ(CD3ζ)链的细胞内结构域;和/或其中所述CAR进一步包含共刺激信号传导区域,所述共刺激信号传导区域任选地包含4-1BB的信号传导结构域。
29.根据权利要求1-28中任一项所述的制品,其中所述T细胞是CD4+或CD8+。
30.根据权利要求1-29中任一项所述的制品,其中所述T细胞是从受试者获得的原代T细胞。
31.根据权利要求1-30中任一项所述的制品,其中所述制品进一步含有指示所述容器包含所述目标数量的单位的信息。
32.根据权利要求1-31中任一项所述的制品,其中所述容器是第一容器,并且所述制品进一步包含另外的容器,其中每个所述另外的容器包含单位剂量,所述单位剂量包含所述目标数量的所述T细胞组合物的单位。
33.根据权利要求1-32中任一项所述的制品组合物,其中所述T细胞组合物通过如下的过程生产,在所述过程中:
具有指示生物活性细胞特征和/或不存在凋亡或早期或晚期凋亡的表型的细胞(1)在所述组合物中的CAR+细胞中、(2)在所述组合物中的CAR+CD3+细胞中、和/或(3)在所述组合物中的CAR+CD8+细胞中的频率,与在通过所述过程产生的多种T细胞组合物中的所述频率的平均值相比变化不超过40%、或不超过30%、或不超过20%或不超过10%或不超过5%和/或与这种平均值相比变化不超过一个标准偏差;或
在所述组合物中具有指示不存在凋亡或早期或晚期凋亡的表型的细胞(1)在所述组合物中的CAR+细胞中、(2)在所述组合物中的CAR+CD3+细胞中、和/或(3)在所述组合物中的CAR+CD8+细胞中的频率,与在通过所述过程生产的多种T细胞组合物相比变化不超过40%或不超过20%或不超过10%。
34.一种治疗方法,所述方法包括向患有疾病或病症的受试者给予T细胞组合物的单位剂量,所述T细胞组合物包含含有特异性地结合与疾病或病症相关的抗原的重组受体、任选地嵌合抗原受体(CAR)的细胞,其中所述单位剂量含有在给定范围内的目标数量的参考单位(RU),其中在给定组合物中的RU由下式定义:
RU=A x B,其中:
A是在所述给定组合物中存在的具有表型的细胞的数量、或其倍数、分数或变换,或者是在所述给定组合物中具有两种或更多种表型的细胞的数量的平均值或加权平均值、或所述平均值或加权平均值的倍数、分数或变换;并且
B是指示在所述给定组合物中重组受体依赖性、任选地CAR依赖性活性的程度或与其相关的参数的值、或所述值的倍数或变换。
35.根据权利要求34所述的方法,其中参考单位的所述目标数量小于参考单位的安全数量,其中,参考单位的所述安全数量是相对于在用包含表达所述重组受体、任选地所述CAR的T细胞的治疗性T细胞组合物治疗后分析的一组受试者,向在曾持续发生不良事件的组中的那些受试者中的受试者给予的疗法的参考单位的最低数量。
36.根据权利要求35所述的方法,其中所述不良事件是严重不良事件,任选地严重神经毒性,任选地等于或高于4级或5级或至少延长的3级神经毒性。
37.根据权利要求35或权利要求36所述的方法,其中参考单位的所述目标数量比参考单位的所述安全数量少了对应于安全系数的量和/或少了在1.5倍至3倍范围内、任选地约2倍的量,或少了作为向未发生过所述不良事件的一组受试者给予的所述治疗性T细胞组合物的平均单位数量的标准偏差的倍数的量,任选地其中所述组的受试者展现出0-2级神经毒性,任选地其中所述倍数是在1.5倍至3倍的范围内。
38.根据权利要求34-37中任一项所述的方法,其中参考单位的所述目标数量等于或高于参考单位的参考功效数量,其中所述参考功效数量是相对于在用包含所述重组受体、任选地所述CAR的治疗性T细胞组合物治疗后分析的一组受试者,向展现出所希望的治疗结果、任选地部分反应或完全反应(CR)的组中的一名或多名受试者给予的疗法的单位的数量。
39.根据权利要求34-38中任一项所述的方法,其中
A是在所述给定组合物中存在的具有表型的细胞的数量,并且B是指示在所述给定组合物中重组受体依赖性活性的程度或与其相关的参数的值;
A和/或B分别是数量或值的变换,其中所述变换包括对数变换、幂变换或罗吉特变换;

A是在所述给定组合物中存在的具有表型的细胞的数量,并且B是指示在所述给定T细胞组合物中的CAR依赖性活性的程度或与其相关的参数的值的倍数或变换,任选地其中B是所述值的对数变换。
40.根据权利要求34-39中任一项所述的方法,其中所述表型包括表面标记的阳性表达,所述表面标记是CD3、CD4或CD8中的一种或多种,和/或所述表型包括所述重组受体、任选地所述CAR或用于表达所述重组受体的替代标记的阳性表达。
41.根据权利要求40所述的方法,其中所述表型是CD3+CAR、CD4+/CAR+、CD8+/CAR+。
42.根据权利要求34-40中任一项所述的方法,其中所述表型包括不存在指示凋亡、或在凋亡级联或途径中的一个或多个步骤的因子,任选地其中所述表型包括凋亡标记的阴性表达。
43.根据权利要求42所述的方法,其中所述凋亡标记是表面磷脂酰丝氨酸和/或用膜联蛋白V检测,或是半胱天冬酶的活性或前体形式,任选地半胱天冬酶3的活性或前体形式。
44.根据权利要求34-43中任一项所述的方法,其中所述表型包括膜联蛋白-。
45.根据权利要求34-44中任一项所述的方法,其中A是为CD3+CAR+细胞的凋亡标记阴性(-)细胞的总数、为CD4+CAR+的凋亡标记阴性(-)细胞的总数、为CD8+CAR+细胞的凋亡标记阴性(-)细胞的总数、或所述总数的倍数或变换值,其中所述凋亡标记是膜联蛋白V或活性半胱天冬酶3。
46.一种治疗方法,所述方法包括向患有疾病或病症的受试者给予T细胞组合物的单位剂量,所述T细胞组合物包含含有特异性地结合与所述疾病或病症相关的抗原的重组受体、任选地嵌合抗原受体(CAR)的细胞,其中所述单位剂量含有所述治疗性T细胞组合物的目标剂量,其中:
(i)如果指示所述组合物的重组受体依赖性、任选地CAR依赖性活性的程度或与其相关的参数的值等于或大于阈值,则所述目标剂量是第一数量的在所述组合物中具有给定表型的细胞或是在第一数量范围内的在所述组合物中具有给定表型的细胞;
(ii)如果所述参数的值小于所述阈值,则所述目标剂量是第二数量的在所述组合物中具有给定表型的细胞或是第二数量范围内的在所述组合物中具有给定表型的细胞,其中所述第一数量低于所述第二数量,或者所述第一范围低于所述第二范围。
47.根据权利要求46所述的方法,其中所述重组受体依赖性活性的阈值小于参考安全值,其中所述参考安全值是相对于在用包含表达所述重组受体、任选地所述CAR的T细胞的治疗性T细胞组合物治疗后分析的一组受试者,向在曾持续发生不良事件的组中的那些受试者中的受试者给予的所述治疗性组合物的所述CAR依赖性活性的最低值,任选地其中所述不良事件是严重不良事件,任选地等于或高于4级或5级或至少延长的3级神经毒性的严重神经毒性。
48.根据权利要求34-47中任一项所述的方法,其中所述参数是一种或多种因子、任选地可溶性因子的量度或其归一化值,所述一种或多种因子任选地为细胞因子、趋化因子或可溶性受体中的一种或组合,所述可溶性受体任选地为可溶性共刺激受体。
49.根据权利要求48所述的方法,其中所述量度是在如下测定中的,所述测定涉及在所述抗原、表达所述抗原的细胞和/或与所述重组受体、任选地所述CAR特异性地结合的药剂的存在下将给定组合物或其样品培养或孵育固定的时间、任选地24小时。
50.根据权利要求48或权利要求49所述的方法,其中所述因子的所述量度是:
(i)所述因子的浓度、相对浓度、量或相对量;或
(ii)每单位的在所述给定组合物中的输入细胞而言所述因子的量或相对量,或
(iii)每单位时间、任选地一小时,每单位的在所述给定组合物中的输入细胞而言所述因子的量或相对量;或
(iv)指示(i)-(iii)中任何一项的水平。
51.根据权利要求48-50中任一项所述的方法,其中:
所述一种或多种因子是促炎性细胞因子、Th2细胞因子和Th17细胞因子中的一种或组合;或
所述一种或多种因子是IL-2、IFN-γ、TNF-α、IL4、IL-5、IL-10、IL-13、GM-CSF、sCD137、MIP1a和M1Pb中的一种或者两种或更多种的组合,任选地IL-2、IFN-γ、TNF-α和IL-10中的一种或者两种或更多种的组合。
52.根据权利要求48-51中任一项的方法,其中所述参数是TNF-α、IFN-γ和IL-2中的至少两种或者TNF-α、IFN-γ和IL-2的量度的算术平均值或几何平均值,所述量度任选地为量或浓度。
53.根据权利要求34-52中任一项所述的方法,其中:
所述表型是CD8+CAR+细胞或凋亡标记-CD8+CAR+细胞,任选地其中所述凋亡标记是膜联蛋白V或活性半胱天冬酶3;并且
所述参数是促炎性细胞因子的量度或者是其归一化值,所述促炎性细胞因子任选地是TNF-α、IL-2和IFN-γ中的一种或组合。
54.根据权利要求34-54中任一项所述的方法,其中所述治疗性T细胞组合物包含在约
1000万个细胞/mL与约7000万个细胞/mL之间、在约1000万个存活细胞/mL与约7000万个存活细胞/mL之间或在约1500万个细胞或存活细胞/mL与约6000万个细胞或存活细胞/mL之间。
55.根据权利要求34-54中任一项所述的方法,其中所述T细胞组合物包含大于1000万个细胞或存活细胞/mL或大于1500万个细胞或存活细胞/mL。
56.根据权利要求34-55中任一项所述的方法,其中所述疾病或病症是癌症,任选地骨髓瘤、淋巴瘤或白血病。
57.根据权利要求56所述的方法,其中所述疾病或病症是B细胞恶性肿瘤,任选地B细胞恶性肿瘤选自急性成淋巴细胞性白血病(ALL)、成人ALL、慢性成淋巴细胞性白血病(CLL)、非霍奇金淋巴瘤(NHL)、和弥漫性大B细胞淋巴瘤(DLBCL)。
58.根据权利要求34-57中任一项所述的方法,其中所述重组受体是CAR。
59.根据权利要求58所述的方法,其中所述CAR包含与所述抗原特异性地结合的细胞外抗原识别结构域和包含ITAM的细胞内信号传导结构域,其中任选地,所述细胞内信号传导结构域包含CD3-ζ(CD3ζ)链的细胞内结构域;和/或其中所述CAR进一步包含共刺激信号传导区域,所述共刺激信号传导区域任选地包含4-1BB的信号传导结构域。
60.根据权利要求34-59中任一项所述的方法,其中所述T细胞是CD4+或CD8+。
61.根据权利要求34-60中任一项所述的方法,其中所述T细胞是原代T细胞,任选地其中所述T细胞对所述受试者而言是自体的或者对所述受试者而言是同种异体的。
62.根据权利要求34-61中任一项所述的方法,其中所述方法进一步包括在给予所述T细胞组合物之前给予淋巴细胞清除化学疗法和/或其中所述受试者在给予所述T细胞组合物之前已经接受过淋巴细胞清除化学疗法。
63.根据权利要求62所述的方法,其中所述淋巴细胞清除化学疗法包括向所述受试者给予氟达拉滨和/或环磷酰胺。
64.一种测定包含T细胞组合物单位剂量的治疗性组合物的方法,所述方法包括:
(a)测定来自T细胞组合物的样品,所述T细胞组合物包含源自患有疾病或病症的受试者的并用编码重组受体、任选地嵌合抗原受体(CAR)的核酸转导的T细胞,所述重组受体特异性地结合与疾病或病症相关的抗原,其中所述测定确定所述细胞组合物的B,其中B是指示在所述给定组合物中重组受体依赖性活性、任选地CAR依赖性活性的程度或与其相关的参数的值、或所述值的倍数或变换;并且
(b)基于B评估所述细胞组合物的效和/或评估所述组合物是否高于B的规格下限
(LSL)或低于B的规格上限(USL)。
65.一种测定治疗性T组合物的方法,所述方法包括对来自T细胞组合物的样品基于B评估所述细胞组合物的效力和/或评估所述组合物是否高于B的规格下限(LSL)或低于B的规格上限(USL),所述T细胞组合物包含含有特异性地结合与疾病或病症相关的抗原的重组受体的T细胞。
66.根据权利要求64或权利要求65所述的方法,其中只有在所述组合物低于B的所述USL时所述产品才被释放用于治疗所述受试者。
67.根据权利要求64或权利要求65所述的方法,其中如果B高于所述USL,则建议不将所述组合物给予至所述受试者或将给予至所述受试者的细胞的数量改变至经调整的单位剂量,其中所述经调整的单位剂量含有在所述T细胞组合物中目标数量的细胞或目标数量的参考单位(RU),其中在给定组合物中的RU由下式定义:
RU=A x B,其中:
A是在所述给定组合物中存在的具有表型的细胞的数量、或其倍数、分数或变换,或者是在所述给定组合物中具有两种或更多种表型的细胞的数量的平均值或加权平均值、或所述平均值或加权平均值的倍数、分数或变换;并且
B是指示在所述给定组合物中重组受体依赖性、任选地CAR依赖性活性的程度或与其相关的参数的值、或所述值的分数或倍数或变换。
68.根据权利要求67所述的方法,其中单位的所述目标数量小于参考单位的安全数量,其中,参考单位的所述安全数量是相对于在用包含表达所述重组受体、任选地所述CAR的T细胞的治疗性T细胞组合物治疗后分析的一组受试者,向在曾持续发生不良事件的组中的那些受试者中的受试者给予的疗法的参考单位的最低数量。
69.根据权利要求68所述的方法,其中所述不良事件是严重不良事件,任选地严重神经毒性,任选地等于或高于4级或5级或至少延长的3级神经毒性。
70.根据权利要求68或权利要求69所述的方法,其中参考单位的所述目标数量比参考单位的所述安全数量少了对应于安全系数的量和/或少了在1.5倍至3倍范围内、任选地约2倍的量,或少了作为向未发生过所述不良事件的一组受试者给予的所述治疗性T细胞组合物的平均单位数量的标准偏差的倍数的量,任选地其中所述组的受试者展现出0-2级神经毒性,任选地其中所述倍数是在1.5倍至3倍的范围内。
71.根据权利要求67-70中任一项所述的方法,其中参考单位的所述目标数量等于或高于参考单位的参考功效数量,其中所述参考功效数量是相对于在用包含所述重组受体、任选地所述CAR的治疗性T细胞组合物治疗后分析的一组受试者,向展现出所希望的治疗结果、任选地部分反应或完全反应(CR)的组中的一名或多名受试者给予的疗法的单位的数量。
72.根据权利要求67-71中任一项所述的方法,其中所述经调整的单位剂量小于向用包含表达所述重组受体、任选地所述CAR的T细胞的所述治疗性T细胞组合物治疗的一组受试者给予的平均单位剂量,任选地小于其1.5倍、小于其2倍、小于其3倍、小于其4倍。
73.根据权利要求67-72中任一项所述的方法,其中在向所述受试者给予所述T细胞组合物之后评估所述T细胞组合物的样品,任选地冷冻保存的样品。
74.根据权利要求67-73中任一项所述的方法,其中如果B高于所述USL,则确定所述受试者有毒性险;和/或
则监测被给予所述组合物的受试者和/或用药剂治疗被给予所述组合物的受试者,以在给予所述细胞组合物之后和任选地在发生毒性结果的体征或症状之前改善或降低所述毒性结果或细胞因子释放综合征的可能性。
75.一种评估对治疗性T细胞组合物的毒性的风险的方法,所述方法包括:
(a)对来自已经给予至受试者的T细胞组合物的样品评估参考单位(RU),所述T细胞组合物包含T细胞,所述T细胞包含特异性地结合与疾病或病症相关的抗原的重组受体,其中在给定组合物中的RU由下式定义:
RU=A x B,其中:
A是在所述给定组合物中存在的具有表型的细胞的细胞数量、或其倍数、分数或变换,或者是在所述给定组合物中具有两种或更多种表型的细胞的数量的平均值或加权平均值、或所述平均值或加权平均值的倍数、分数或变换;并且
B是指示在所述给定组合物中重组受体依赖性、任选地CAR依赖性活性的程度或与其相关的参数的值、或所述值的分数或倍数或变换;并且
(b)将所述RU与参考安全数量的单位进行比较,其中所述比较指示所述受试者是否有发生不良事件、任选地严重不良事件、任选地等于或高于4级或5级或至少延长的3级神经毒性的严重神经毒性的风险。
76.根据权利要求75所述的方法,其中单位的所述参考安全数量是相对于在用包含表达所述重组受体、任选地所述CAR的T细胞的治疗性T细胞组合物治疗后分析的一组受试者,向在曾持续发生所述不良事件的组中的那些受试者中的受试者给予的疗法的参考单位的最低数量。
77.根据权利要求75所述的方法,其中如果所述比较指示所述RU高于单位的所述参考安全数量,则监测被给予所述组合物的所述受试者和/或用药剂治疗被给予所述组合物的所述受试者,以在给予所述细胞组合物之后和任选地在发生毒性结果的体征或症状之前改善或降低所述毒性结果或细胞因子释放综合征的可能性。
78.一种生产包含T细胞组合物单位剂量的治疗性组合物的方法,所述方法包括:
(a)测定来自T细胞组合物的样品,所述T细胞组合物包含源自患有疾病或病症的受试者的并用编码重组受体、任选地嵌合抗原受体(CAR)的核酸转导的T细胞,所述重组受体特异性地结合与疾病或病症相关的抗原,其中所述测定确定所述细胞组合物的B,其中B是指示在所述给定组合物中重组受体依赖性、任选地CAR依赖性活性的程度或与其相关的参数的值、或所述值的分数或倍数或变换;并且
(b)向容器中填充所述组合物的全部或部分和任选地另一种溶液以实现所述T细胞组合物的单位剂量,其中所述单位剂量含有在所述T细胞组合物中目标数量的参考单位(RU),其中在给定组合物中的RU由下式定义:
RU=A x B,其中A是在所述给定组合物中存在的具有表型的细胞的数量、或其倍数、分数或变换,或者是在所述给定组合物中具有两种或更多种表型的细胞的数量的平均值或加权平均值、或所述平均值或加权平均值的倍数、分数或变换。
79.一种生产包含T细胞组合物单位剂量的治疗性组合物的方法,所述方法包括向容器中填充T细胞组合物的全部或部分和任选地另一种溶液以实现所述T细胞组合物的单位剂量,所述T细胞组合物包含含有特异性地结合与疾病或病症相关的抗原的重组受体的T细胞,其中所述单位剂量含有在所述T细胞组合物中目标数量的参考单位(RU),其中在给定组合物中的RU由下式定义:
RU=A x B,其中
A是在所述给定组合物中存在的具有表型的细胞的数量、或其倍数、分数或变换,或者是在所述给定组合物中具有两种或更多种表型的细胞的数量的平均值或加权平均值、或所述平均值或加权平均值的倍数、分数或变换;并且
B是指示在所述给定组合物中重组受体依赖性、任选地CAR依赖性活性的程度或与其相关的参数的值、或所述值的分数、倍数或变换。
80.根据权利要求67-79中任一项所述的方法,其中
A是在所述给定组合物中存在的具有表型的细胞的数量,并且B是指示在所述给定组合物中重组受体依赖性活性的程度或与其相关的参数的值;
A和/或B分别是数量或值的变换,其中所述变换包括对数变换、幂变换或罗吉特变换;

A是在所述给定组合物中存在的具有表型的细胞的数量,并且B是指示在所述给定T细胞组合物中的CAR依赖性活性的程度或与其相关的参数的值的倍数或变换,任选地其中B是所述值的对数变换。
81.根据权利要求67-80中任一项所述的方法,其中所述表型包括表面标记的阳性表达,所述表面标记是CD3、CD4或CD8中的一种或多种,和/或所述表型包括所述重组受体、任选地所述CAR或用于表达所述重组受体的替代标记的阳性表达。
82.根据权利要求81所述的方法,其中所述表型是CD3+CAR、CD4+/CAR+、CD8+/CAR+。
83.根据权利要求67-82中任一项所述的方法,其中所述表型包括不存在指示凋亡、或在凋亡级联或途径中的一个或多个步骤的因子,任选地其中所述表型包括凋亡标记的阴性表达。
84.根据权利要求83所述的方法,其中所述凋亡标记是表面磷脂酰丝氨酸和/或用膜联蛋白V检测,或是半胱天冬酶的活性或前体形式,任选地半胱天冬酶3的活性或前体形式。
85.根据权利要求67-84中任一项所述的方法,其中所述表型包括膜联蛋白-。
86.根据权利要求67-85中任一项所述的方法,其中A是为CD3+CAR+细胞的凋亡标记阴性(-)细胞的总数、为CD4+CAR+的凋亡标记阴性(-)细胞的总数、为CD8+CAR+细胞的凋亡标记阴性(-)细胞的总数、或所述总数的倍数或变换值,其中所述凋亡标记是膜联蛋白V或半胱天冬酶。
87.根据权利要求64-86中任一项所述的方法,其中所述参数是一种或多种因子、任选地可溶性因子的量度或其归一化值,所述一种或多种因子任选地为细胞因子、趋化因子或可溶性受体中的一种或组合,所述可溶性受体任选地为可溶性共刺激受体。
88.根据权利要求87所述的方法,其中所述量度是在如下测定中的,所述测定涉及在所述抗原、表达所述抗原的细胞和/或与所述重组受体、任选地所述CAR特异性地结合的药剂的存在下将给定组合物或其样品培养或孵育固定的时间、任选地24小时。
89.根据权利要求87或权利要求88所述的方法,其中所述因子的所述量度是:
(i)所述因子的浓度、相对浓度、量或相对量;或
(ii)每单位的在所述给定组合物中的输入细胞而言所述因子的量或相对量,或
(iii)每单位时间、任选地一小时,每单位的在所述给定组合物中的输入细胞而言所述因子的量或相对量;或
(iv)指示(i)-(iii)中任何一项的水平。
90.根据权利要求87-89中任一项所述的方法,其中:
所述一种或多种因子是促炎性细胞因子、Th2细胞因子和Th17细胞因子中的一种或组合;或
所述一种或多种因子是IL-2、IFN-γ、TNF-α、IL4、IL-5、IL-10、IL-13、GM-CSF、sCD137、MIP1a和M1Pb中的一种或者两种或更多种的组合,任选地IL-2、IFN-γ、TNF-α和IL-10中的一种或者两种或更多种的组合。
91.根据权利要求87-90中任一项所述的方法,其中所述参数是TNF-α、IFN-γ和IL-2中的至少两种或者TNF-α、IFN-γ和IL-2的量度的算术平均值或几何平均值,所述量度任选地为量或浓度。
92.根据权利要求67-91中任一项所述的方法,其中:
所述表型是CD8+CAR+细胞或凋亡标记-CD8+CAR+细胞,任选地其中所述凋亡标记是膜联蛋白V或活性半胱天冬酶3;并且
所述参数是促炎性细胞因子的量度或者是其归一化值,所述促炎性细胞因子任选地是TNF-α、IL-2和IFN-γ中的一种或组合。
93.根据权利要求64-92中任一项所述的方法,其中所述重组受体是CAR。
94.根据权利要求93所述的方法,其中所述CAR包含与所述抗原特异性地结合的细胞外抗原识别结构域和包含ITAM的细胞内信号传导结构域,其中任选地,所述细胞内信号传导结构域包含CD3-ζ(CD3ζ)链的细胞内结构域;和/或其中所述CAR进一步包含共刺激信号传导区域,所述共刺激信号传导区域任选地包含4-1BB的信号传导结构域。
95.根据权利要求64-94中任一项所述的方法,其中所述T细胞是CD4+或CD8+。
96.根据权利要求64-95中任一项所述的方法,其中所述T细胞是原代T细胞,任选地对所述受试者而言是自体的或同种异体的。
97.一种容器,其包含浓度在约1000万个细胞与约7000万个细胞/mL之间的治疗性T细胞组合物、和任选地另一种溶液,其中所述治疗性T细胞组合物包含含有重组受体的T细胞。
98.根据权利要求97所述的容器,其中所述浓度在约1500万与约6000万个细胞/mL之间。
99.根据权利要求97或权利要求98所述的容器,其中浓度为或为约1500万个细胞/mL。
100.根据权利要求97或权利要求98所述的容器,其中所述容器填充有另一种溶液,并且所述溶液包含冷冻保护剂、任选地DMSO。
101.根据权利要求97-100中任一项所述的容器,其中所述容器是小瓶或是袋。
102.根据权利要求97-101中任一项所述的容器,其中所述容器是小瓶,任选地冷冻小瓶,并且所述组合物的体积为不超过20mL,任选地1mL至20mL、1mL至15mL、1mL至10mL、1mL至
5mL、1mL至2.5mL、2.5mL至20mL、2.5mL至15mL、2.5mL至10mL、2.5mL至5mL、5mL至20mL、5mL至
15mL、5mL至10mL、10mL至20mL、10mL至15mL或15mL至20mL。
103.根据权利要求97-101中任一项所述的容器,其中所述容器是袋,任选地冷冻袋,并且所述组合物的体积:
在或在约15mL与150mL、20mL与100mL、20mL与80mL、20mL与60mL、20mL与40mL、40mL与
100mL、40mL与80mL、40mL与60mL、60mL与100mL、60mL与80mL或80mL与100mL之间,每个都包含端值;或
为至少或至少约15mL、至少或至少约20mL、至少或至少约30mL、至少或至少约40mL、至少或至少约50mL、至少或至少约60mL、至少或至少约70mL、至少或至少约80mL或至少或至少约90mL;和/或
为不超过100mL。
104.根据权利要求97-103中任一项所述的容器,其中所述容器中所述组合物的表面积与体积比:
在或在约0.1cm-1与100cm-1、1cm-1与50cm-1、1cm-1与20cm-1、1cm-1与10cm-1、1cm-1与7cm-1、-1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1
1cm 与6cm 、1cm 与3cm 、1cm 与2cm 、2cm 与20cm 、2cm 与10cm 、2cm 与7cm 、2cm与6cm-1、2cm-1与3cm-1、3cm-1与20cm-1、3cm-1与10cm-1、3cm-1与7cm-1、3cm-1与6cm-1、6cm-1与
20cm-1、6cm-1与10cm-1、6cm-1与7cm-1、7cm-1与20cm-1、7cm-1与10cm-1、或7cm-1与20cm-1之间,每个都包含端值;或
为、为约、或为至少3cm-1、4cm-1、5cm-1、6cm-1、7cm-1、10cm-1、15cm-1或20cm-1。
105.根据权利要求97-104中任一项所述的容器,其中所述T细胞源自患有疾病或病症的受试者并用编码对与疾病或病症相关或由疾病或病症表达的抗原有特异性的重组受体、任选地嵌合抗原受体(CAR)的核酸转导,和/或所述T细胞包含重组受体、任选地CAR。
106.根据权利要求97-105中任一项所述的容器,其中所述重组受体是CAR。
107.根据权利要求106所述的容器,其中所述CAR包含与所述抗原特异性地结合的细胞外抗原识别结构域和包含ITAM的细胞内信号传导结构域,其中任选地,所述细胞内信号传导结构域包含CD3-ζ(CD3ζ)链的细胞内结构域;和/或其中所述CAR进一步包含共刺激信号传导区域,所述共刺激信号传导区域任选地包含4-1BB的信号传导结构域。
108.根据权利要求97-107中任一项所述的容器,其中所述T细胞是CD4+或CD8+。
109.根据权利要求97-108中任一项所述的方法,其中所述T细胞是原代T细胞。
110.根据权利要求97-109中任一项所述的容器,其中所述T细胞组合物通过如下的过程生产,在所述过程中:
具有指示生物活性细胞特征和/或不存在凋亡或早期或晚期凋亡的表型的细胞(1)在所述组合物中的CAR+细胞中、(2)在所述组合物中的CAR+CD3+细胞中、和/或(3)在所述组合物中的CAR+CD8+细胞中的频率,与在通过所述过程产生的多种T细胞组合物中的所述频率的平均值相比变化不超过40%、或不超过30%、或不超过20%或不超过10%或不超过5%和/或与这种平均值相比变化不超过一个标准偏差;或
在所述组合物中具有指示不存在凋亡或早期或晚期凋亡的表型的细胞(1)在所述组合物中的CAR+细胞中、(2)在所述组合物中的CAR+CD3+细胞中、和/或(3)在所述组合物中的CAR+CD8+细胞中的频率,与在通过所述过程生产的多种T细胞组合物相比变化不超过40%或不超过20%或不超过10%。
111.一种生产用于细胞疗法的治疗性T细胞组合物的方法,所述方法包括向容器中填充包含T细胞的组合物的全部或部分至浓度在约1000万个细胞与约7000万个细胞/mL之间、和任选地另一种溶液,其中所述T细胞包含重组受体、任选地嵌合抗原受体(CAR)。
112.根据权利要求111所述的方法,其中所述T细胞源自患有疾病或病症的受试者并用编码对与疾病或病症相关或由疾病或病症表达的抗原有特异性的重组受体、任选地嵌合抗原受体(CAR)的核酸转导,和/或所述T细胞包含重组受体、任选地CAR。
113.根据权利要求78-96和112中任一项所述的方法,其中所述容器填充有约1500万与约6000万个细胞/mL之间。
114.根据权利要求78-96、112和113中任一项所述的方法,其中所述容器填充有或填充有约1000万个细胞/mL或填充有大于1000万个细胞/mL。
115.根据权利要求78-96和112-114中任一项所述的方法,其中所述容器填充有或填充有约1500万个细胞/mL或填充有大于1500万个细胞/mL。
116.根据权利要求78-96和112-115中任一项所述的方法,其中:
所述填充以自动化方式进行;和/或
在封闭的系统中进行。
117.根据权利要求78-96和112-116中任一项所述的方法,其中所述容器填充有另一种溶液,并且所述溶液包含冷冻保护剂、任选地DMSO。
118.根据权利要求78-96和112-117中任一项所述的方法,其进一步包括将所述容器中的细胞冷冻或将所述容器存储在低于或约低于80℃的温度下。
119.根据权利要求78-96和112-118中任一项所述的方法,其中所述容器是小瓶或是袋。
120.根据权利要求78-96和112-119中任一项所述的方法,其中所述容器是小瓶,任选地冷冻小瓶,并且所述容器填充有体积为不超过20mL,任选地1mL至20mL、1mL至15mL、1mL至
10mL、1mL至5mL、1mL至2.5mL、2.5mL至20mL、2.5mL至15mL、2.5mL至10mL、2.5mL至5mL、5mL至
20mL、5mL至15mL、5mL至10mL、10mL至20mL、10mL至15mL或15mL至20mL的所述组合物。
121.根据权利要求78-96和112-120中任一项所述的方法,其中所述容器是袋,任选地冷冻袋,并且所述容器填充有所述组合物至以下体积:
在或在约15mL与150mL、20mL与100mL、20mL与80mL、20mL与60mL、20mL与40mL、40mL与
100mL、40mL与80mL、40mL与60mL、60mL与100mL、60mL与80mL或80mL与100mL之间,每个都包含端值;或
为至少或至少约15mL、至少或至少约20mL、至少或至少约30mL、至少或至少约40mL、至少或至少约50mL、至少或至少约60mL、至少或至少约70mL、至少或至少约80mL或至少或至少约90mL;和/或
为不超过100mL。
122.根据权利要求78-96和112-121中任一项所述的方法,其中所述容器填充有所述组合物至以下表面积与体积比:
在或在约0.1cm-1与100cm-1、1cm-1与50cm-1、1cm-1与20cm-1、1cm-1与10cm-1、1cm-1与7cm-1、
1cm-1与6cm-1、1cm-1与3cm-1、1cm-1与2cm-1、2cm-1与20cm-1、2cm-1与10cm-1、2cm-1与7cm-1、2cm-1与6cm-1、2cm-1与3cm-1、3cm-1与20cm-1、3cm-1与10cm-1、3cm-1与7cm-1、3cm-1与6cm-1、6cm-1与
20cm-1、6cm-1与10cm-1、6cm-1与7cm-1、7cm-1与20cm-1、7cm-1与10cm-1、或7cm-1与20cm-1之间,每个都包含端值;或
为、为约、或为至少3cm-1、4cm-1、5cm-1、6cm-1、7cm-1、10cm-1、15cm-1或20cm-1。
123.根据权利要求78-96和112-122中任一项所述的方法,其中所述重组受体是CAR。
124.根据权利要求123所述的方法,其中所述CAR包含与所述抗原特异性地结合的细胞外抗原识别结构域和包含ITAM的细胞内信号传导结构域,其中任选地,所述细胞内信号传导结构域包含CD3-ζ(CD3ζ)链的细胞内结构域;和/或其中所述CAR进一步包含共刺激信号传导区域,所述共刺激信号传导区域任选地包含4-1BB的信号传导结构域。
125.根据权利要求78-96和112-124中任一项所述的方法,其中所述T细胞是CD4+或CD8+。
126.根据权利要求78-96和112-125中任一项所述的方法,其中所述T细胞是原代T细胞,任选地对所述受试者而言是自体的或同种异体的。
127.根据权利要求34-96和112-126中任一项所述的方法,其中所述T细胞组合物通过如下的过程生产,在所述过程中:
具有指示生物活性细胞特征和/或不存在凋亡或早期或晚期凋亡的表型的细胞(1)在所述组合物中的CAR+细胞中、(2)在所述组合物中的CAR+CD3+细胞中、和/或(3)在所述组合物中的CAR+CD8+细胞中的频率,与在通过所述过程产生的多种T细胞组合物中的所述频率的平均值相比变化不超过40%、或不超过30%、或不超过20%或不超过10%或不超过5%和/或与这种平均值相比变化不超过一个标准偏差;或
在所述组合物中具有指示不存在凋亡或早期或晚期凋亡的表型的细胞(1)在所述组合物中的CAR+细胞中、(2)在所述组合物中的CAR+CD3+细胞中、和/或(3)在所述组合物中的CAR+CD8+细胞中的频率,与在通过所述过程生产的多种T细胞组合物相比变化不超过40%或不超过20%或不超过10%。
128.一种治疗性T细胞组合物的单位剂量,所述单位剂量包含一定数量的细胞,所述细胞包含对与疾病或病症相关或由疾病或病症表达的抗原有特异性的重组受体、任选地嵌合抗原受体(CAR),其中所述数量的细胞是在或在约5.0 x 106个与2.25 x 107个之间、5.0 x 
106个与2.0 x 107个之间、5.0 x 106个与1.5 x 107个之间、5.0 x 106个与1.0 x 107个之
6 6 6 7 6
间、5.0 x 10个与7.5 x 10个之间、7.5 x 10个与2.25 x 10个之间、7.5 x 10个与2.0 x 107个之间、7.5 x 106个与1.5 x 107个之间、7.5 x 106个与1.0 x 107个之间、1.0 x 107个与2.25 x 107个之间、1.0 x 107个与2.0 x 107个之间、1.0 x 107个与1.5 x 107个之间、
1.5 x 107个与2.25 x 107个之间、1.5 x 107个与2.0 x 107个之间、2.0 x 107个与2.25 x 
7
10个之间的重组受体表达细胞,任选地呈CD8+的或呈凋亡标记阴性(-)和CD8+的重组受体表达细胞,任选地其中所述凋亡标记是膜联蛋白V或活性半胱天冬酶3。
129.根据权利要求128所述的单位剂量,其中所述数量的细胞是:
在至少或至少约5 x 106个、6 x 106个、7 x 106个、8 x 106个、9 x 106个、10 x 106个与约15 x 106个之间的重组受体表达细胞,任选地呈CD8+的或呈凋亡标记阴性(-)和CD8+的重组受体表达细胞,任选地其中所述凋亡标记是膜联蛋白V或活性半胱天冬酶3;
在至少或至少约5.55 x 106个、6.66 x 106个、7.77 x 106个、8.99 x 106个、1.0 x 107个、1.1 x 107个与约1.67 x 107个之间的重组受体表达细胞,任选地呈CD8+的或呈凋亡标记阴性(-)和CD8+的重组受体表达细胞,任选地其中所述凋亡标记是膜联蛋白V或活性半胱天冬酶3;
在至少或至少约6.25 x 106个、7.5 x 106个、8.75 x 106个、1.0 x 107个、1.13 x 107个、1.25 x 107个与约1.9 x 107个之间的重组受体表达细胞,任选地呈CD8+的或呈凋亡标记阴性(-)和CD8+的重组受体表达细胞,任选地其中所述凋亡标记是膜联蛋白V或活性半胱天冬酶3;
在至少或至少约7.14 x 106个、8.5 x 106个、1.0 x 107个、1.14 x 107个、1.29 x 107个、1.42 x 107个与约2.14 x 107个之间的重组受体表达细胞,任选地呈CD8+的或呈凋亡标记阴性(-)和CD8+的重组受体表达细胞,任选地其中所述凋亡标记是膜联蛋白V或活性半胱天冬酶3。
130.根据权利要求128或权利要求129所述的单位剂量,其中所述单位剂量不包含大于阈值数量的参考单位(RU),其中在给定组合物中RU的数量由下式定义:
RU=A x B,其中
A是在所述给定组合物中存在的具有表型的细胞的细胞数量、或其倍数或变换,或者是在所述给定组合物中具有两种或更多种表型的细胞的数量的平均值或加权平均值、或所述平均值或加权平均值的倍数、分数或变换;并且
B是指示在所述给定T细胞组合物中重组受体依赖性、任选地CAR依赖性活性的程度或与其相关的参数的值、或所述值的倍数或变换。
131.根据权利要求130所述的单位剂量,其中参考单位的所述阈值数量小于单位的参考安全数量,其中单位的所述参考安全数量是相对于在用包含表达所述重组受体、任选地所述CAR的T细胞的治疗性T细胞组合物治疗后分析的一组受试者,向在曾持续发生不良事件的组中的那些受试者中的受试者给予的疗法的单位的最低数量,任选地其中所述不良事件是严重不良事件,任选地等于或高于4级或5级或至少延长的3级神经毒性的严重神经毒性。
132.根据权利要求130或权利要求131所述的单位剂量,其中单位的所述阈值数量比单位的所述参考安全数量少了对应于安全系数的量和/或少了在1.5倍至3倍范围内、任选地约2倍的量,或少了作为向未发生过所述不良事件的一组受试者给予的所述治疗性T细胞组合物的平均单位数量的标准偏差的倍数的量,任选地其中所述组的受试者展现出0-2级神经毒性,任选地其中所述倍数是在1.5倍至3倍的范围内。
133.根据权利要求130-132中任一项所述的单位剂量,其中单位的所述阈值数量等于或高于单位的参考功效数量,其中所述参考功效数量是相对于在用包含所述重组受体、任选地所述CAR的T细胞组合物治疗后分析的一组受试者,向展现出所希望的治疗结果、任选地完全反应(CR)的组中的一名或多名受试者给予的疗法的单位的数量。
134.根据权利要求130-133中任一项所述的单位剂量,其中在所述组合物中至少50%、至少60%、至少75%、至少80%或至少90%的CD8+细胞和/或CD8+CAR+细胞不呈凋亡标记阳性,不是凋亡的或不处于凋亡的早期阶段,或不处于凋亡的晚期阶段。
135.根据权利要求130-134中任一项所述的单位剂量组合物,其中所述T细胞组合物通过如下的过程生产,在所述过程中:
具有指示生物活性细胞特征和/或不存在凋亡或早期或晚期凋亡的表型的细胞(1)在所述组合物中的CAR+细胞中、(2)在所述组合物中的CAR+CD3+细胞中、和/或(3)在所述组合物中的CAR+CD8+细胞中的频率,与在通过所述过程产生的多种T细胞组合物中的所述频率的平均值相比变化不超过40%、或不超过30%、或不超过20%或不超过10%或不超过5%和/或与这种平均值相比变化不超过一个标准偏差;或
在所述组合物中具有指示不存在凋亡或早期或晚期凋亡的表型的细胞(1)在所述组合物中的CAR+细胞中、(2)在所述组合物中的CAR+CD3+细胞中、和/或(3)在所述组合物中的CAR+CD8+细胞中的频率,与在通过所述过程生产的多种T细胞组合物相比变化不超过40%或不超过20%或不超过10%。
136.一种确定受试者是否有毒性风险的方法,所述方法包括测定在受试者的血液样品中重组受体表达细胞的数量,所述受试者先前已经被给予一定剂量的所述重组受体表达细胞,其中如果重组受体表达细胞的峰值扩增发生在给予细胞疗法的7天内或约7天内,则所述受试者有发生毒性的风险。
137.一种确定受试者是否有毒性风险的方法,所述方法包括测定在受试者的血液样品中重组受体表达细胞的数量,所述受试者先前已经被给予一定剂量的所述重组受体表达细胞,其中如果出现以下情况,则所述受试者有发生毒性的风险:
(i)在所述给予开始之后不超过四天,在所述受试者的血液样品中重组受体表达细胞的所述数量是至少为或至少约2个重组受体表达细胞/微升;
(ii)在所述给予开始之后不超过五天或六天,在所述受试者的所述血液样品中重组受体表达细胞的所述数量是至少为或至少约5个重组受体表达细胞/微升或是至少为或至少约10个重组受体表达细胞/微升;或
(iii)在所述给予开始之后不超过七天,在所述受试者的血液样品中重组受体表达细胞的所述数量是至少为或至少约15个重组受体表达细胞/微升。
138.一种确定受试者是否有毒性风险的方法,所述方法包括:
(a)向患有疾病或病症的受试者给予一定剂量的表达重组受体的细胞;并且
(b)在给予所述细胞之后,测定在受试者血液中的重组受体表达细胞的数量,其中如果出现以下情况,则所述受试者有发生毒性的风险:
(i)在所述给予开始之后不超过四天,在所述受试者的血液样品中重组受体表达细胞的所述数量是至少为或至少约2个重组受体表达细胞/微升;
(ii)在所述给予开始之后不超过五天或六天,在所述受试者的所述血液样品中重组受体表达细胞的所述数量是至少为或至少约5个重组受体表达细胞/微升或是至少为或至少约10个重组受体表达细胞/微升;或
(iii)在所述给予开始之后不超过七天,在所述受试者的血液样品中重组受体表达细胞的所述数量是至少为或至少约15个重组受体表达细胞/微升。
139.根据权利要求136-139中任一项所述的方法,其中如果进一步地,在来自所述受试者的血液或血清样品中检测到的白细胞介素-15(IL-15)的水平、量或浓度等于或高于阈值,则所述受试者有发生毒性的风险,任选地其中所述阈值为30pg/mL,任选地其中所述样品是在开始给予所述细胞疗法后在或在约1天、2天、3天、4天或5天或不超过1天、2天、3天、4天或5天从所述受试者获得的。
140.一种确定受试者是否有毒性风险的方法,所述方法包括测定在受试者的血液或血清样品中白细胞介素-15(IL-15)的水平、量或浓度,所述受试者先前已经被给予一定剂量的所述重组受体表达细胞,其中如果检测到的白细胞介素-15(IL-15)的水平、量或浓度等于或高于阈值,则所述受试者有发生毒性的风险,任选地其中所述阈值为30pg/mL,任选地其中所述样品是在开始给予细胞疗法后在或在约1天、2天、3天、4天或5天或不超过1天、2天、3天、4天或5天从所述受试者获得的。
141.一种确定受试者是否有毒性风险的方法,所述方法包括:
(a)向患有疾病或病症的受试者给予一定剂量的表达重组受体的细胞;并且
(b)在给予所述细胞之后,测定在所述受试者的血液或血清样品中白细胞介素-15(IL-
15)的水平、量或浓度,其中如果检测到的白细胞介素-15(IL-15)的水平、量或浓度等于或高于阈值,则所述受试者有发生毒性的风险,任选地其中所述阈值为30pg/mL,任选地其中所述样品是在开始给予细胞疗法后在或在约1天、2天、3天、4天或5天或不超过1天、2天、3天、4天或5天从所述受试者获得的。
142.根据权利要求136-141中任一项所述的方法,其中所述毒性是等于或高于4级或5级的神经毒性或至少延长的3级神经毒性。
143.根据权利要求16-142中任一项所述的方法,其中如果确定所述受试者有发生毒性的风险;则停止给予所述重组受体表达细胞,向所述受试者给予较低剂量的重组受体表达细胞的剂量;向所述受试者给予表达不同重组受体的细胞;和/或向所述受试者给予能够治疗、预防、延迟或减弱所述毒性发生的药剂。
144.一种评估用于在生产治疗性T细胞组合物中使用的条件或原材料的方法,所述方法包括:
(a)对在测试条件或原材料的存在下生产的T细胞组合物评估重组受体依赖性活性或表型;并且
(b)将所述重组受体依赖性活性或所述表型与从对照组合物产生的重组受体依赖性活性或表型进行比较或者与标准单位比较重组受体依赖性活性或表型,
其中如果使用所述测试条件或原材料生产的细胞组合物的重组受体依赖性活性或表型从由所述对照组合物产生的重组受体依赖性活性或从所述标准单位的变化不超过40%或不超过30%或不超过20%或不超过10%或不超过5%,则确定所述测试条件或原材料适合释放以用于在生产T细胞组合物的方法中使用。
145.根据权利要求144所述的方法,其中通过包括以下的过程生产所述治疗性T细胞组合物:
(i)从生物样品中选择T细胞群,从而获得输入组合物;
(ii)在一定条件下将包含T细胞的所述输入组合物与包含编码所述重组受体的核酸分子的药剂一起孵育,以将编码所述重组受体的所述核酸引入所述群体中的细胞中,任选地其中包含编码所述重组受体的核酸分子的所述药剂是病毒载体,任选地慢病毒载体或γ逆转录病毒载体;并且
(iii)在所述孵育之前、期间和/或之后刺激所述细胞,其中刺激包括在刺激条件的存在下孵育所述细胞,所述刺激条件诱导所述细胞的初级信号、信号传导、刺激、激活和/或扩增,
其中所述测试条件或原材料存在于步骤(i)-(iii)中的一个或多个中。
146.根据权利要求144或权利要求145所述的方法,其中所述测试条件或原材料包括血清的存在或浓度;血清的类型或量,培养时间;刺激条件的存在或量;刺激条件的类型或量;
氨基酸的存在或量;温度;所述输入组合物的来源或细胞类型;在所述输入组合物中细胞类型的比率或百分比,任选地CD4+/CD8+细胞比率;珠的存在或量;细胞密度;静态培养;摇动培养;灌注;病毒载体的类型;病毒拷贝数量;转导佐剂的存在;冷冻保存中所述输入组合物的细胞密度;所述重组受体的表达程度;或调节细胞表型的化合物的存在。
147.根据权利要求145或权利要求146所述的方法,其中所述测试条件或原材料包括刺激条件的存在,并且所述刺激条件包括与能够激活TCR复合物的一种或多种组分的一个或多个细胞内信号传导结构域和/或一种或多种共刺激分子的一个或多个细胞内信号传导结构域的试剂一起孵育。
148.根据权利要求147所述的方法,其中所述刺激试剂能够激活TCR复合物的一种或多种组分的一个或多个细胞内信号传导结构域和/或一种或多种共刺激分子的一个或多个细胞内信号传导结构域。
149.根据权利要求147或权利要求148所述的方法,其中所述刺激试剂包含与TCR复合物的成员特异性地结合的一级药剂和与T细胞共刺激分子特异性地结合的二级药剂。
150.根据权利要求149所述的方法,其中所述一级药剂特异性地结合CD3,和/或所述共刺激分子选自CD28、CD137(4-1-BB)、OX40或ICOS。
151.根据权利要求149或权利要求150所述的方法,其中所述一级药剂和所述二级药剂包含抗体和/或存在于固体支持物的表面上,所述固体支持物任选地为珠。
152.根据权利要求144-151中任一项所述的方法,其中使用相同的过程生产所述对照组合物和T细胞组合物,包括来自相同的细胞群,除了所述对照组合物是在对照条件或对照原材料的存在下进行。
153.根据权利要求152所述的方法,其中所述对照是所述原材料或条件的对照批次或标准。
154.根据权利要求144-153中任一项所述的方法,其中:
对在所述测试条件或原材料的存在下生产的多种治疗性T细胞组合物实施所述方法;
如果使用所述测试条件或原材料生产的所述多种细胞组合物的每一种的重组受体依赖性活性或表型从由所述对照组合物产生的重组受体依赖性活性或从所述标准单位的变化不超过40%或不超过30%或不超过20%或不超过10%或不超过5%,则确定所述测试原材料或条件适合释放以用于在生产治疗性T细胞组合物的方法中使用。
155.根据权利要求144-154中任一项所述的方法,其中所述重组受体依赖性活性是抗原特异性活性。
156.根据权利要求144-155中任一项所述的方法,其中所述重组受体依赖性活性是促炎性细胞因子的重组受体依赖性或抗原特异性依赖性产生或积累,任选地其中所述促炎性细胞因子是IL-2、TNF-α、IFNγ或IL-10。
157.根据权利要求144-156中任一项所述的方法,其中所述表型包括特定的分化状态和/或记忆/干细胞样表型。
158.根据权利要求144-157中任一项所述的方法,其中所述表型包括表面标记的阳性表达,所述表面标记是CD3、CD8、CD27、CD28,和/或所述表型包括所述重组受体、任选地所述CAR或用于表达所述重组受体的替代标记的阳性表达。
159.根据权利要求144-158中任一项所述的方法,其中所述表型包括CD27+/CD28+/CD8+。
160.一种细胞组合物,其包含通过根据权利要求111-127中任一项所述的方法生产的治疗性T细胞组合物。
161.一种治疗的方法,所述方法包括向患有疾病或病症的受试者给予根据权利要求
160的细胞组合物或根据权利要求128-135中任一项的细胞的一个或多个单位剂量。
162.根据权利要求34-63和161中任一项所述的方法,其中大于或大于约50%、约60%、约70%或约80%的根据所述方法治疗的受试者未展现出3级或更高等级的细胞因子释放综合征(CRS)和/或未展现出3级或更高等级的神经毒性、任选地等于或高于4级或5级或至少延长的3级神经毒性,和/或大于40%或50%或55%的根据所述方法治疗的受试者未展现出任何神经毒性或CRS。
163.根据权利要求34-63、161和162中任一项所述的方法,其中如与根据所述方法治疗的总受试者相比,所述方法导致在如下受试者之间的严重不良副作用的发生率没有显著差异:(i)在开始给予所述治疗性T细胞组合物之前已经接受过较少的先前疗法、任选地少于两种先前疗法的受试者,(ii)年龄小、任选地小于30岁的受试者,(iii)在来自受试者的单采术样品中CD4:CD8的比率低于某一阈值、任选地低于1:1或低于1.5:1或低于0.5:1或更低的受试者,任选地其中所给予的剂量是基于总T细胞或表达重组受体的总T细胞;(iv)体重大于在所治疗的受试者的组中的平均体重的受试者;(v)血小板计数小于或约小于120,000的受试者;(vi)患有B细胞白血病、任选地急性淋巴细胞白血病(ALL)的受试者;(vii)在开始给予所述治疗性T细胞组合物之前,例如就在开始给予所述治疗性T细胞组合物之前或在开始给予所述治疗性T细胞组合物之前一个月内,具有高疾病负荷的受试者,任选地如基于大于或等于5%的骨髓原始细胞的百分比、直径乘积之和(SPD)、或乳酸脱氢酶的水平确定的;或(ix)在开始给予所述治疗性T细胞组合物之前已经接受过桥接化学疗法的受试者;
(x)在开始给予所述治疗性T细胞组合物之前已经用淋巴细胞清除疗法预处理的受试者,所述淋巴细胞清除疗法任选地包括给予氟达拉滨和/或环磷酰胺;和/或(xi)在开始给予所述治疗性T细胞组合物之前在血液样品中的白细胞介素-15(IL-15)的水平、量或浓度大于或等于阈值的受试者,任选地其中所述阈值是30pg/ml血浆
164.根据权利要求163所述的方法,其中所述严重不良副作用是3级或更高等级的神经毒性,任选地等于或高于4级或5级或至少延长的3级神经毒性,或者是脑水肿。
165.根据权利要求34-63和161-165中任一项所述的方法,其中所述治疗性T细胞组合物的给予不包括在给予所述治疗性T细胞组合物之前或同时和/或在发生除发热以外的毒性体征或症状之前给予能够治疗、预防、延迟或减弱所述毒性的发生的药剂或治疗;和/或所述治疗性T细胞组合物的给予是或可以是在诊患者环境中或在所述受试者没有住院过夜或持续连续一天或多天的情况下给予至受试者,和/或是在所述受试者没有住院持续一天或多天的情况下,任选地除非或直到所述受试者展现出持续发热或在用退热剂治疗之后没有或尚未减少或未减少超过1℃的发热。
166.一种设计用于给予治疗性T细胞组合物的试验的方法,所述方法包括基于一种或多种风险因素的存在或不存在将受试者分配至治疗方案,其中如果受试者不包含所述一种或多种风险因素,则所述受试者被分配接受所述治疗性T细胞组合物的第一剂量,并且如果所述受试者包含一种或多种所述风险因素,则所述受试者被分配接受所述治疗性T细胞组合物的第二剂量,所述第二剂量小于所述第一剂量,
其中所述一种或多种风险因素选自(i)在开始给予所述治疗性T细胞组合物之前已经接受过较少的先前疗法、任选地少于两种先前疗法的受试者,(ii)年龄小、任选地小于30岁的受试者,(iii)在来自受试者的单采术样品中CD4:CD8的比率低于某一阈值、任选地低于
1:1或低于1.5:1或低于0.5:1或更低的受试者,任选地其中所给予的剂量是基于总T细胞或表达重组受体的总T细胞;(iv)体重大于在所治疗的受试者的组中的平均体重的受试者;
(v)血小板计数小于或约小于120,000的受试者;(vi)患有B细胞白血病、任选地急性淋巴细胞白血病(ALL)的受试者;(vii)在开始给予所述治疗性T细胞组合物之前,例如就在开始给予所述治疗性T细胞组合物之前或在开始给予所述治疗性T细胞组合物之前一个月内,具有高疾病负荷的受试者,任选地如基于大于或等于5%的骨髓原始细胞的百分比、直径乘积之和(SPD)、或乳酸脱氢酶的水平确定的;或(ix)在开始给予所述治疗性T细胞组合物之前已经接受过桥接化学疗法的受试者;(x)在开始给予所述治疗性T细胞组合物之前已经用淋巴细胞清除疗法预处理的受试者,所述淋巴细胞清除疗法任选地包括给予氟达拉滨和/或环磷酰胺;和/或(xi)在开始给予所述治疗性T细胞组合物之前在血液样品中的白细胞介素-
15(IL-15)的水平、量或浓度大于阈值的受试者。
167.根据权利要求166所述的方法,其中所述第二剂量的细胞的数量或重组受体表达细胞的数量是所述第一剂量的细胞的数量或重组受体表达细胞的数量的小于或小于约1.5倍、小于或小于约2.0倍、小于或小于约3.0倍、小于或小于约4.0倍、小于或小于约5.0倍或小于或小于约10倍。
168.根据权利要求166或权利要求167所述的方法,其进一步包括,在向多名受试者给予所述第二剂量之后,如果大于或大于约50%、约60%、约70%或约80%的用所述第二剂量治疗的受试者未展现出3级或更高等级的细胞因子释放综合征(CRS)和/或未展现出3级或更高等级的神经毒性、任选地等于或高于4级或5级或至少延长的3级神经毒性,和/或大于
40%或50%或55%的根据所述方法治疗的受试者未展现出任何神经毒性或CRS,则增加所述剂量。
169.根据权利要求166-168中任一项所述的方法,其中所述治疗性T细胞组合物包含T细胞,所述T细胞包含特异性地结合与所述疾病或病症相关的抗原的重组受体、任选地嵌合抗原受体(CAR)。
170.根据权利要求169所述的方法,其中所述重组受体是CAR。
171.根据权利要求170所述的方法,其中所述CAR包含与所述抗原特异性地结合的细胞外抗原识别结构域和包含ITAM的细胞内信号传导结构域,其中任选地,所述细胞内信号传导结构域包含CD3-ζ(CD3ζ)链的细胞内结构域;和/或其中所述CAR进一步包含共刺激信号传导区域,所述共刺激信号传导区域任选地包含4-1BB的信号传导结构域。
172.根据权利要求166-171中任一项所述的方法,其中所述T细胞是CD4+或CD8+。
173.根据权利要求166-172中任一项所述的方法,其中所述T细胞是原代T细胞,任选地其中所述T细胞对所述受试者而言是自体的或者对所述受试者而言是同种异体的。
173.根据权利要求166-172中任一项所述的方法,其中所述T细胞是原代T细胞,任选地其中所述T细胞对所述受试者而言是自体的或者对所述受试者而言是同种异体的。

说明书全文

与在细胞疗法给药有关的组合物、制品和方法

[0001] 相关申请
[0002] 本申请要求以下美国临时专利申请的优先权权益:2017年2月27日提交的标题为“与在细胞疗法中给药有关的组合物、制品和方法(COMPOSITIONS,ARTICLES OF 
MANUFACTURE AND METHODS RELATED TO DOSING IN CELL THERAPY)”的62/464,371;2017
年3月1日提交的标题为“与在细胞疗法中给药有关的组合物、制品和方法(COMPOSITIONS,
ARTICLES OF MANUFACTURE AND METHODS RELATED TO DOSING IN CELL THERAPY)”的62/
465,817;2017年3月10日提交的标题为“与在细胞疗法中给药有关的组合物、制品和方法
(COMPOSITIONS,ARTICLES OF MANUFACTURE AND METHODS RELATED TO DOSING IN CELL 
THERAPY)”的62/470,180;2017年6月29日提交的标题为“与在细胞疗法中给药有关的组合
物、制品和方法(COMPOSITIONS,ARTICLES OF MANUFACTURE AND METHODS RELATED TO 
DOSING IN CELL THERAPY)”的62/527,002;2017年11月1日提交的标题为“与在细胞疗法中
给药有关的组合物、制品和方法(COMPOSITIONS,ARTICLES OF MANUFACTURE AND METHODS 
RELATED TO DOSING IN CELL THERAPY)”的62/580,416;2017年11月10日提交的标题为“与
在细胞疗法中给药有关的组合物、制品和方法(COMPOSITIONS,ARTICLES OF MANUFACTURE 
AND METHODS RELATED TO DOSING IN CELL THERAPY)”的62/584,740;以及12月8日提交的
标题为“与在细胞疗法中给药有关的组合物、制品和方法(COMPOSITIONS,ARTICLES OF 
MANUFACTURE AND METHODS RELATED TO DOSING IN CELL THERAPY)”的62/596,703,出于
所有目的将所述美国临时专利申请的内容通过引用以其整体特此并入。
[0003] 通过引用并入序列表
[0004] 本申请是与电子格式的序列表一起提交申请的。序列表以2018年2月27日创建的名为735042009340SeqList.TXT的文件提供,其大小为37,444字节。将在电子格式的序列表
中的信息通过引用以其整体并入。

技术领域

[0005] 本公开文本涉及细胞疗法,所述细胞疗法包括给予一个或多个剂量的治疗性T细胞组合物;以及涉及用于在所述细胞疗法中使用的方法、组合物和制品。所述T细胞组合物
的细胞表达重组受体或其他转基因受体,所述重组受体例如为嵌合受体,如嵌合抗原受体
(CAR),所述其他转基因受体例如为T细胞受体(TCR)。本公开文本的实施方案的特征(包括
所给予的细胞数量或细胞单位和/或所给予的细胞效)提供了各种优点,如被给予T细胞
组合物的受试者中的毒性险较低。

背景技术

[0006] 多种细胞疗法方法可用于治疗疾病和病症。需要改进的方法例如以降低此类方法的毒性风险。例如,需要改进的方法来降低对细胞疗法发生毒性的风险,同时保持所给予的
细胞在受试者中的功效。提供了满足此类需求的组合物、制品、方法和用途。
发明内容
[0007] 本文提供了与以下有关的实施方案:细胞疗法,如过继细胞疗法,包括可用于预测、降低、预防、改善的那些;或者可能与此类疗法相关的一种或多种不希望的或不良的作
用或毒性、或其风险,如毒性,包括严重毒性(包括严重或致命神经毒性(包括与脑肿相关
或涉及脑水肿的毒性))。此类所提供的实施方案包括制品、组合物(如含有细胞的一个或多
个单位剂量的组合物)和方法和用途,例如涉及或用于过继细胞免疫疗法(如工程化T细胞
疗法,包括CAR-T细胞疗法)的那些。
[0008] 所提供的实施方案包括制品,如包含以下的那些:(a)包含治疗性T细胞组合物的单位剂量的容器,所述治疗性T细胞组合物包含T细胞,所述T细胞包含特异性地结合抗原的
重组受体(其任选地是嵌合抗原受体(CAR)),其中所述单位剂量含有在给定范围内的目标
数量的参考单位(RU),其中在给定组合物中的RU由式RU=A x B定义,其中:A是在给定组合
物中存在的具有表型的细胞的数量、或其倍数、分数或变换,或者是在给定组合物中具有两
种或更多种表型的细胞的数量的平均值或加权平均值、或所述平均值或加权平均值的倍
数、分数或变换;并且B是指示在给定组合物中的重组受体依赖性(任选地CAR依赖性)活性
的程度或与其相关的参数的值、或所述值的分数或倍数或变换;以及(b)用于将所述组合物
(任选地其一个或多个单位剂量)给予至受试者(任选地患有或怀疑患有疾病或病症的受试
者)的说明书
[0009] 还提供了制品,所述制品包含:(a)包含治疗性T细胞组合物的单位剂量的容器,所述治疗性T细胞组合物包含T细胞,所述T细胞包含特异性地结合抗原的重组受体(其任选地
是嵌合抗原受体(CAR)),其中:所述单位剂量含有或含有约(i)目标数量的总重组受体表达
细胞或目标数量的总CD3+重组受体表达细胞或目标数量的总CD8+重组受体表达细胞,或者
(ii)在给定范围内的目标数量的参考单位(RU),参考RU的所述目标数量等于或低于RU的阈
值数量,其中所述单位剂量不含有大于阈值数量的RU,其中在给定组合物中的RU的数量由
式RU=A x B定义,其中A是在给定组合物中存在的具有表型的细胞的数量、或其倍数或变
换,或者是在给定组合物中具有两种或更多种表型的细胞的数量的平均值或加权平均值、
或所述平均值或加权平均值的倍数、分数或变换;并且B是指示在给定T细胞组合物中的重
组受体依赖性(任选地CAR依赖性)活性的程度或与其相关的参数的值、或所述值的倍数或
变换;以及(b)用于将所述组合物(任选地其一个或多个单位剂量)给予至受试者(任选地患
有或怀疑患有疾病或病症的受试者)的说明书。
[0010] 还提供了制品,所述制品包含:(a)包含治疗性T细胞组合物的单位剂量的容器,所述治疗性T细胞组合物包含T细胞,所述T细胞表达特异性地结合抗原的嵌合抗原受体
(CAR),其中所述单位剂量含有所述治疗性T细胞组合物的目标剂量,其中:(i)如果指示所
述组合物的重组受体依赖性活性的程度或与其相关的参数的值等于或大于阈值,则所述目
标剂量是第一数量(或是在第一数量范围内)的在所述组合物中具有给定表型的细胞;(ii)
如果所述参数的值小于所述阈值,则所述目标剂量是第二数量(或是在第二数量范围内)的
在所述组合物具有给定表型的细胞,其中所述第一数量(或第一范围)低于所述第二数量
(或第二范围);以及(b)用于将所述组合物(任选地其一个或多个单位剂量)给予至受试者
(任选地患有或怀疑患有疾病或病症的受试者)的说明书。
[0011] 还提供了制品,所述制品包含:(a)包含治疗性T细胞组合物的单位剂量的容器,所述治疗性T细胞组合物包含T细胞,所述T细胞包含特异性地结合抗原的重组受体(其任选地
是嵌合抗原受体(CAR)),其中:所述单位剂量含有所述治疗性T细胞组合物的目标剂量;并
且所述治疗性T细胞组合物高于B的规格下限(LSL)且低于规格上限(USL),其中B是指示所
述组合物的重组受体依赖性活性的程度或与其相关的参数的值;以及(b)用于将所述组合
物(任选地其一个或多个单位剂量)给予至受试者(任选地患有或怀疑患有疾病或病症的受
试者)的说明书。
[0012] 本文提供了治疗的方法,所述方法包括向患有疾病或病症的受试者给予T细胞组合物的单位剂量,所述T细胞组合物包含如下细胞,所述细胞包含特异性地结合与所述疾病
或病症相关的抗原的重组受体(任选地嵌合抗原受体(CAR)),其中所述单位剂量含有在给
定范围内的目标数量的参考单位(RU),其中在给定组合物中的RU由式RU=A x B定义,其
中:A是在给定组合物中存在的具有表型的细胞的数量、或其倍数、分数或变换,或者是在给定组合物中具有两种或更多种表型的细胞的数量的平均值或加权平均值、或所述平均值或
加权平均值的倍数、分数或变换;并且B是指示在给定组合物中的重组受体依赖性(任选地
CAR依赖性)活性的程度或与其相关的参数的值、或所述值的倍数或变换。
[0013] 本文提供了治疗的方法,所述方法包括向患有疾病或病症的受试者给予T细胞组合物的单位剂量,所述T细胞组合物包含如下细胞,所述细胞包含特异性地结合与所述疾病
或病症相关的抗原的重组受体(任选地嵌合抗原受体(CAR)),其中:所述单位剂量含有或含
有约(i)目标数量的总重组受体表达细胞或目标数量的总CD8+重组受体表达细胞,或者
(ii)在给定范围内的目标数量的参考单位(RU),所述目标数量等于或低于RU的阈值数量,
其中所述单位剂量不含有大于阈值数量的RU,其中在给定组合物中的RU的数量由式RU=A 
x B定义,其中A是在给定组合物中存在的具有表型的细胞的数量、或其倍数或变换,或者是
在给定组合物中具有两种或更多种表型的细胞的数量的平均值或加权平均值、或所述平均
值或加权平均值的倍数、分数或变换;并且B是指示在给定T细胞组合物中的重组受体依赖
性(任选地CAR依赖性)活性的程度或与其相关的参数的值、或所述值的倍数或变换。
[0014] 在特定实施方案中,A是T细胞的总数、CD3+细胞的总数、CD4+或CD8+细胞的总数、CD3+CAR+细胞的总数、CD8+CAR+细胞的总数、CD4+CAR+总数、或任何前述的活细胞或存活细
胞的总数、或所述总数的倍数或变换值。在一些实施方案中,A是CD3+细胞的总数、CD8+的总数、CD3+CAR+细胞的总数、CD8+CAR+细胞的总数、或任何前述的活细胞或存活细胞的总数、
或所述总数的倍数或变换值。在某些实施方案中,A是凋亡标记阴性(-)细胞(其为CD3+CAR+
细胞)的总数、凋亡标记阴性(-)细胞(其为CD4+CAR+)的总数、凋亡标记阴性(-)细胞(其为
CD8+CAR+细胞)的总数、或所述总数的倍数或变换值,其中所述凋亡标记是膜联蛋白V或活
性半胱天冬酶3。在特定实施方案中,A是凋亡标记-CD3+CAR+细胞的总数或凋亡标记-CD8+
CAR+细胞的总数,任选地其中所述凋亡标记是膜联蛋白V或活性半胱天冬酶3。
[0015] 还提供了治疗的方法,所述方法包括向患有疾病或病症的受试者给予T细胞组合物的单位剂量,所述T细胞组合物包含如下细胞,所述细胞包含特异性地结合与所述疾病或
病症相关的抗原的重组受体(任选地嵌合抗原受体(CAR)),其中所述单位剂量含有目标剂
量的所述治疗性T细胞组合物:(i)如果指示所述组合物的重组受体依赖性(任选地CAR依赖
性)活性的程度或与其相关的参数的值等于或大于阈值,则所述目标剂量是第一数量(或是
在第一数量范围内)的在所述组合物中具有给定表型的细胞;(ii)如果所述参数的值小于
所述阈值,则所述目标剂量是第二数量(或是在第二数量范围内)的在所述组合物中具有给
定表型的细胞,其中所述第一数量(或第一范围)低于所述第二数量(或第二范围)。
[0016] 还提供了测定包含T细胞组合物单位剂量的治疗性组合物的方法,所述方法包括:(a)测定来自T细胞组合物的样品,所述T细胞组合物包含源自患有疾病或病症的受试者的
并用编码重组受体(任选地嵌合抗原受体(CAR))的核酸转导的T细胞,所述重组受体特异性
地结合与疾病或病症相关的抗原,其中所述测定确定所述细胞组合物的B,其中B是指示在
给定组合物中的重组受体依赖性活性的程度或与其相关的参数的值、或所述值的倍数或变
换;并且(b)基于B评估所述细胞组合物的效力和/或评估所述组合物是否高于B的规格下限
(LSL)或低于B的规格上限(USL)。
[0017] 还提供了一种测定治疗性T组合物的方法,所述方法包括对来自T细胞组合物的样品基于B评估所述细胞组合物的效力和/或评估所述组合物是否高于B的规格下限(LSL)或
低于B的规格上限(USL),所述T细胞组合物包含含有特异性地结合与疾病或病症相关的抗
原的重组受体的T细胞。
[0018] 还提供了一种评估对治疗性T细胞组合物的毒性的风险的方法,所述方法包括:(a)对来自已经给予至受试者的T细胞组合物的样品评估在给定范围内的参考单位(RU),所
述T细胞组合物包含T细胞,所述T细胞包含特异性地结合与疾病或病症相关的抗原的重组
受体,其中在给定组合物中的RU由式RU=A x B定义,其中:A是在给定组合物中存在的具有
表型的细胞的细胞数量、或其倍数、分数或变换,或者是在给定组合物中具有两种或更多种
表型的细胞的数量的平均值或加权平均值、或所述平均值或加权平均值的倍数、分数或变
换;并且B是指示在给定组合物中的重组受体依赖性(任选地CAR依赖性)活性的程度或与其
相关的参数的值、或所述值的分数或倍数或变换;并且(b)将所述RU与参考安全数量的RU进
行比较,其中所述比较指示所述受试者是否有发生不良事件(任选地严重不良事件,任选地
等于或高于4级或5级或至少延长的3级神经毒性的严重神经毒性)的风险。
[0019] 还提供了一种生产包含T细胞组合物单位剂量的治疗性组合物的方法,所述方法包括:(a)测定T细胞组合物,所述T细胞组合物包含源自患有疾病或病症的受试者的并用编
码重组受体(任选地嵌合抗原受体(CAR))的核酸转导的T细胞,所述重组受体特异性地结合
与疾病或病症相关的抗原,其中所述测定确定所述细胞组合物的B,其中B是指示在给定组
合物中的重组受体依赖性(任选地CAR依赖性)活性的程度或与其相关的参数的值、或所述
值的倍数或变换;并且(b)向容器中填充组合物的全部或部分和任选地另一种溶液以实现T
细胞组合物单位剂量,其中所述单位剂量含有目标数量的所述T细胞组合物的参考单位
(RU),其中在给定组合物中的RU由式RU=A x B定义,其中A是在给定组合物中存在的具有
表型的细胞的数量、或其倍数、分数或变换,或者是在给定组合物中具有两种或更多种表型
的细胞的数量的平均值或加权平均值、或所述平均值或加权平均值的倍数、分数或变换。
[0020] 还提供了一种生产包含T细胞组合物单位剂量的治疗性组合物的方法,所述方法包括向容器中填充T细胞组合物(所述T细胞组合物包含如下T细胞,所述T细胞包含特异性
地结合与疾病或病症相关的抗原的重组受体)的全部或部分和任选地另一种溶液以实现T
细胞组合物单位剂量,其中所述单位剂量含有目标数量的所述T细胞组合物的参考单位
(RU),其中在给定组合物中的RU由式RU=A x B定义,其中A是在给定组合物中存在的具有
表型的细胞的数量、或其倍数、分数或变换,或者是在给定组合物中具有两种或更多种表型
的细胞的数量的平均值或加权平均值、或所述平均值或加权平均值的倍数、分数或变换;并
且B是指示在给定组合物中的重组受体依赖性(任选地CAR依赖性)活性的程度或与其相关
的参数的值、或所述值的倍数或变换。
[0021] 还提供了一种生产用于细胞疗法的治疗性T细胞组合物的方法,所述方法包括向容器中填充包含T细胞的组合物的全部或部分至浓度在约1000万个细胞与约7000万个细
胞/mL之间(包含端值)、和任选地另一种溶液。
[0022] 提供了一种治疗性T细胞组合物的单位剂量,所述单位剂量包含一定数量的细胞,所述细胞包含对与疾病或病症相关或由疾病或病症表达的抗原有特异性的重组受体、任选
地嵌合抗原受体(CAR),其中所述数量的细胞是在或在约5.0x 106个与2.25x 107个之间、
5.0x 106个与2.0x 107个之间、5.0x 106个与1.5x 107个之间、5.0x 106个与1.0x 107个之
间、5.0x 106个与7.5x 106个之间、7.5x 106个与2.25x 107个之间、7.5x 106个与2.0x 107
6 7 6 7 7
个之间、7.5x10个与1.5x 10个之间、7.5x 10 个与1.0x 10 个之间、1.0x 10个与2.25x 
107个之间、1.0x 107个与2.0x 107个之间、1.0x 107个与1.5x 107个之间、1.5x 107个与
2.25x 107个之间、1.5x 107个与2.0x 107个之间、2.0x 107个与2.25x 107个之间的重组受
体表达细胞(每个都包含端值),任选地呈CD8+的或呈凋亡标记阴性(-)和CD8+的重组受体
表达细胞,任选地其中所述凋亡标记是膜联蛋白V或活性半胱天冬酶3。
[0023] 本文提供了一种确定受试者是否有毒性风险的方法,所述方法包括测定在受试者血液中的重组受体表达细胞的数量,所述受试者先前已经被给予一定剂量的重组受体表达
细胞,其中如果:(i)在给予开始之后不超过四天,在受试者血液中的重组受体表达细胞的
数量是至少为或至少约2个重组受体表达细胞/微升;(ii)在给予开始之后不超过五天或六
天,在受试者血液中的重组受体表达细胞的数量是至少为或至少约5个重组受体表达细胞/
微升或是至少为或至少约10个重组受体表达细胞/微升;或者(iii)在给予开始之后不超过
七天,在受试者血液中的重组受体表达细胞的数量是至少为或至少约15个重组受体表达细
胞/微升,则所述受试者有发生毒性的风险。
[0024] 还提供了一种确定受试者是否有毒性风险的方法,所述方法包括:(a)向患有疾病或病症的受试者给予一定剂量的表达重组受体的细胞;并且(b)在给予所述细胞之后,测定
在受试者血液中的重组受体表达细胞的数量,其中如果:(i)在给予开始之后不超过四天,
在受试者血液中的重组受体表达细胞的数量是至少为或至少约2个重组受体表达细胞/微
升;(ii)在给予开始之后不超过五天或六天,在受试者血液中的重组受体表达细胞的数量
是至少为或至少约5个重组受体表达细胞/微升或是至少为或至少约10个重组受体表达细
胞/微升;或者(iii)在给予开始之后不超过七天,在受试者血液中的重组受体表达细胞的
数量是至少为或至少约15个重组受体表达细胞/微升,则所述受试者有发生毒性的风险。
[0025] 还提供了一种评估用于在生产治疗性T细胞组合物中使用的刺激试剂的方法,所述方法包括:(i)对使用刺激试剂生产的T细胞组合物评估重组受体依赖性活性或表型;并
且(ii)将重组受体依赖性活性或表型与从对照组合物产生的重组受体依赖性活性或表型
进行比较,或者与标准单位比较重组受体依赖性活性或表型,其中如果使用刺激试剂生产
的细胞组合物的重组受体依赖性活性或表型从由对照组合物产生的重组受体依赖性活性
或从标准单位的变化不超过40%或不超过30%或不超过20%或不超过10%或不超过5%,
则确定所述刺激剂适合释放以用于在生产治疗性T细胞组合物的方法中使用。
[0026] 在一些任何此类实施方案中,在某些方面,重组受体依赖性活性的程度或水平或治疗性T细胞组合物的表型代表所述治疗组合物和/或其生产特有的属性或特性,所述属性
或特性与在向受试者给予治疗性T细胞组合物后发生不良的副作用的风险相关。在一些方
面,在具有一种或多种风险因素的某些受试者中例如在以下受试者中此类风险较大或以较
高的发生率发生:(i)在开始给予治疗性T细胞组合物之前已经接受过较少的先前疗法(任
选地少于两种先前疗法)的受试者,(ii)年龄小(任选地小于30岁)的受试者,(iii)其中在
来自受试者的单采术样品中的CD4:CD8的比率低于某一阈值(任选地低于1:1或低于1.5:1
或低于0.5:1或更低)(例如其中所给予的剂量是基于总T细胞或表达工程化或重组受体(如
CAR)的总T细胞,例如,未指定剂量中CD4+或CD8+ T细胞的数量或比率)的受试者;(iv)体重
大于在所治疗的受试者的组中的平均体重的受试者;(v)血小板计数小于或约小于120,000
的受试者;(vi)患有B细胞白血病(任选地急性淋巴细胞白血病(ALL))的受试者;(vii)在开
始给予治疗性T细胞组合物之前(例如就在开始给予治疗性T细胞组合物之前或在开始给予
治疗性T细胞组合物之前一个月内)具有高疾病负荷的受试者,任选地如基于大于或等于
5%的骨髓原始细胞的百分比、直径乘积之和(SPD)、或乳酸脱氢酶的水平来确定的;或
(viii)未展现急性成淋巴细胞性白血病(ALL)的费城染色体(Ph+)和/或Ph染色体样(Ph样)
分子亚型的受试者;(ix)在开始给予治疗性T细胞组合物之前已经接受过桥接化学疗法的
受试者;(x)在开始给予治疗性T细胞组合物之前已经用淋巴细胞清除疗法(任选地包括给
氟达拉滨和/或环磷酰胺)预处理的受试者;和/或(xi)其中在开始给予治疗性T细胞组合
物之前在血液样品中的白细胞介素-15(IL-15)的水平、量或浓度大于阈值的受试者。在一
些实施方案中,所提供的实施方案(例如所提供的方法、制品、组合物、剂量和给药策略)考
虑了此类属性或特性(例如与给予受试者有关的),并且从而预防、改善或降低在给予治疗
性T细胞组合物后受试者发生不良事件或毒性(如严重神经毒性或3级或更高等级或延长的
3级、4级或5级神经毒性)的风险或可能性。
[0027] 在一些任何此类实施方案中,示例性属性包括给予至单独受试者的单独剂量中存活细胞和/或各种表型的细胞的数量或频率(或数量/kg)。示例性的此类表型包括一种或多
种表面标记的表达,如通过流式细胞术评估的。例如,在一些方面,表型包括CD3+、CD8+、CD4+和/或CAR+。表型还包括存活力和与有功能的、健康的或有生物活性的细胞相关的那些表
型或指示有功能的、健康的或有生物活性的细胞的那些表型或被认为指示有功能的、健康
的或有生物活性的细胞的那些表型。在某些方面,此类表型包括指示凋亡、指示凋亡细胞或
指示一种或多种死亡或凋亡途径进入的各种(例如,早期或晚期)阶段的标记(例如膜联蛋
白V、半胱天冬酶3)的阴性或低的存在或表达。在特定的方面,此类标记包括细胞响应于
PMA/离子霉素和/或FOXP3以非CAR抗原特异性方式(如以细胞内细胞因子染色(ICS))产生
细胞因子或其他因子的能力。在一些方面,标记和表型包括与以下中的一种或多种相关的
那些:T细胞激活、消耗、干细胞样特性、幼稚T细胞、寿命、T细胞亚组、一种或多种记忆表型和一种或多种T-记忆亚组(如TCM、TEM和TSCM中的一种或多种)的表型。
[0028] 在一些任何此类实施方案中,治疗性细胞组合物相关属性包括所给予剂量中CD8+CAR+ T细胞的总数、所给予剂量中观察到对于指示凋亡的因子呈阴性(例如用膜联蛋白V的
表面染色(膜联蛋白V-)或半胱天冬酶3切割(表明非凋亡细胞))的CD8+CAR+ T细胞的总数
或频率(例如,在CD8+CAR+ T细胞中)。在特定的例子中,治疗性细胞组合物相关属性包括所
给予剂量中CD3+CAR+ T细胞的总数、所给予剂量中观察到对于指示凋亡的因子呈阴性(例
如用膜联蛋白V的表面染色(膜联蛋白V-)或半胱天冬酶3切割(表明非凋亡细胞))的CD3+
CAR+ T细胞的总数或频率(例如,在CD3+CAR+ T细胞中)。
[0029] 在一些任何此类实施方案中,示例性参数是治疗性组合物和/或其生产特有的特性,包括存活细胞浓度(VCC)、在接种与药物产品收获之间细胞的倍数扩增;和在所给予的
剂量中的载体拷贝数(VCN)。示例性参数还包括通常与组合物中细胞的功能或活性或其他
特征或能力相关或指示组合物中细胞的功能或活性或其他特征或能力的那些参数。这些包
括与细胞刺激的结果相关的各种属性,包括增殖和激活或活性的各种指示,包括以TCR和/
或CAR诱导或依赖性方式诱导的那些。与功能或活性有关的示例性的此类参数是响应于CAR
抗原特异性或其他刺激在组合物中的细胞产生一种或多种因子(如各种细胞因子)的量度
或水平(如量或其浓度或水平/细胞)。
[0030] 在一些任何此类实施方案中,在共培养测定中评估指示组合物的CAR靶向的抗原特异性活性和功能(如CAR-抗原依赖性细胞因子分泌和细胞毒性)的参数。在表达CD19的靶
细胞的存在下孵育正在被评估的治疗性组合物的细胞。对于细胞因子测定,可以在将靶细
胞和一定量的多种组合物(包括相同数量的转导细胞或CAR+细胞)以相同的体积孵育例如
大约22-24小时的一段时间后评估一种或多种细胞因子(例如IL-2、IFN-γ、TNF-α、IL-6、
sCD137、MIP1b、MIP1a、IL-10、IL-4、IL-13、IL-5或GM-CSF)的累积量(pg/mL)。此类测定提供了在所述剂量中每个CAR+细胞的抗原特异性细胞因子分泌的量度。在其他测定中,在与T细
胞孵育之后评估针对表达CD19的靶细胞的细胞溶解活性。
[0031] 在一些任何此类实施方案中,评估了响应于非CAR抗原特异性刺激物的活性或功能效应的量度,如在用抗CD3/抗CD28(例如涂覆在磁珠上)刺激后的细胞因子或其他因子产
生。在此类测定中,在培养物中的T细胞中包括较少CAR+细胞的培养物可以展现出较高的相
对水平的量度。
[0032] 在一些任何此类实施方案中,相对于载体拷贝数(每个细胞或每个基因组)的关系被认为是以下的替代指示物:细胞适应性和/或与组合物中的工程化或非工程化细胞的相
对表现相关的多个变量和/或组合物中总细胞密度。例如,在一些实施方案中,来自血液样
品的在过程的开始时总体上较不健康的细胞在转导期期间具有较低的存活可能性,和/或
在转导期间的细胞死亡可以提高转导效率。因此,在某些情况下,每种组合物而言较高拷贝
数的病毒载体(如经由慢病毒或γ逆转录病毒载体转导引入的一种病毒载体)可能指示如
下组合物:其中较大百分比的细胞在过程的开始时不健康并且在特定的方面可能具有与神
经毒性(例如相反地)相关的特性。在一些实施方案中,较高的转导频率可能导致在低温保
存、储存和解冻期间具有较高频率的工程化(例如,CAR+)细胞的组合物。在某些方面,当剂
量是基于工程化细胞(或其亚型,例如CAR+CD3+)的数量时,具有较高频率的工程化细胞的
此类组合物可能包括较低的总体细胞密度,这在特定实施方案中与降低水平或频率的生物
活性或非凋亡的细胞相关。
[0033] 在一些任何此类实施方案中,在给予至受试者的剂量中对于凋亡标记(包括膜联蛋白V)的表面染色呈阴性的细胞的一个或多个数量或归一化数量的各种量度(或在产物的
细胞中如在CAR+CD3+或CAR+CD8+中此类凋亡标记阴性细胞的频率)与不良事件(如毒性,例
如神经毒性)相关或相关联。在一些方面,通常观察到膜联蛋白V和半胱天冬酶3是相似的。
尽管此类参数也可以被认为与CAR-T细胞组合物的功能或效力有关,并且因此可以预期与
功效有关,但是这些变量通常与治疗反应结果(例如受试者是否实现了完全反应或无反应)
不显著相关。
[0034] 在一些任何此类实施方案中,治疗性CAR-T细胞组合物的属性或参数的组合(例如,抗原特异性活性和/或存活力)、受试者因素和/或特征(例如,年龄、体重和/或疾病)和
其他治疗(例如,先前治疗的数量)与例如在用CAR-T细胞组合物治疗后发生致命神经毒性
的风险相关。
[0035] 在一些任何此类实施方案中,脑水肿与CAR T细胞的早期和快速扩增、和/或与IL-15、炎症生物标记和CAR-T生长因子的水平升高相关和/或相关联。在一些方面,CD8+CAR+细
胞的剂量和功能、和受试者特征和/或因素一起驱动早期和/或快速CAR-T细胞扩增、与早期
和/或快速CAR-T细胞扩增相关和/或相关联。
[0036] 在一些任何此类实施方案中,受试者特征和/或因素是或包括年龄小(例如,小于30岁的年龄)、先前治疗(例如,用两种或更少的先前方案)、强化的桥接化学疗法、和/或使
用高强度氟达拉滨/环磷酰胺(如用于淋巴细胞清除)。
[0037] 在一些任何此类实施方案中,脑水肿(例如与CAR-T细胞疗法相关的和/或CAR-T细胞疗法后的脑水肿)与内皮损伤和完全血脑屏障(BBB)破坏相关。在某些方面,脑水肿与脑
的CAR T细胞浸润、中枢神经系统(CNS)白血病、或先前的CNS白血病疗法不相关。
[0038] 在一些任何此类实施方案中,在治疗(例如用CAR-T细胞疗法)之前或先于治疗(例如用CAR-T细胞疗法)鉴定高风险患者是潜在地管理和减轻风险(例如,毒性如神经毒性或
脑水肿的风险或可能性)的关键。在特定的方面,可以通过最小化CAR-T细胞组合物的变异
性(例如,最小化细胞组合物之间针对参数如存活力、CD4+/CD8+比率和活性的变异性)来减
轻、降低和/或减少致命神经毒性的风险。在某些方面,使用所定义的组合物产物(例如,具
有限定参数的CAR-T细胞组合物)可以降低剂量和功能的变异性。
[0039] 在一些任何此类实施方案中,所提供的方法、制品、组合物、剂量和给药策略的优点在于它们考虑并且在相关的情况下调整或校正潜在的变异性来源,所述潜在的变异性来
源包括源自试剂的变化的那些和/或患者与患者之间的变异性。例如,在某些实施方案中,
通过涉及使用T细胞刺激/扩增试剂(或其批次)的过程生产工程化T细胞可能是有利的,所
述T细胞刺激/扩增试剂(或其批次)已经通过释放测定被验证为如相比于参数的阈值水平
低于可接受的变异范围或在可接受的变异范围内,所述参数为例如关于治疗性组合物的这
样的参数的特异性活性(例如在通过T细胞工程化过程生产的最终T细胞组合物中诱导特定
程度的抗原特异性活性所需的试剂的量或相对量的量度,例如,如与对照试剂或关于这种
测定的标准单位相比)。在特定实施方案中,所提供的实施方案涉及细胞剂量,其中所述细
胞通过如下过程生产,所述过程涉及释放测定以确认这样的特异性活性参数(例如,抗原特
异性炎性细胞因子量度)的任何变异性在可接受的范围内和/或低于规格上限。在一些实施
方案中,所提供的过程包括这样的释放测定。在某些实施方案中,细胞组合物的生产使用其
中此类参数的变异在可接受的范围内的试剂和/或过程进行。在特定实施方案中,所提供的
方法、组合物和制品的优点在于它们使用如下给药和/或细胞生产策略,所述给药和/或细
胞生产策略例如通过最小化第二参数的变异性减轻与此类特异性活性参数的潜在变异相
关的风险,所述第二参数连同特异性活性参数与毒性的风险相关。例如,通过最小化通过过
程生产的生物活性或健康细胞(例如,非凋亡细胞)的频率变异,可以最小化特异性活性相
关参数的变化对安全性的影响。在一些实施方案中,包括与生物活性或非凋亡细胞如生物
活性或非凋亡工程化细胞或工程化CD8+细胞的数量或频率有关的一个或多个特征的剂量
或给药策略降低与抗原特异性活性参数的变异相关的风险。在某些方面,这通过包括此类
细胞上限的剂量和/或基于参考单位(例如,基于考虑生物活性细胞的数量的公式)定义剂
量的剂量来实现。
[0040] 在特定实施方案中,使用此类生物活性细胞在工程化细胞中的频率的变异性降低的过程降低了当基于工程化T细胞数量作为整体给药时,某些患者(例如具有较不倾向于细
胞凋亡或是更健康的细胞的那些)将被无意给予比生物活性细胞的预期剂量更高的剂量的
风险。已经进一步观察到过程(如对表型和功能具有更大程度的控制的这种过程)降低了通
过所述过程生产的细胞以抗原特异性方式产生炎性细胞因子的能力的变异性程度。上述研
究中的结果与如下解释是一致的:特别是当与生物活性工程化细胞的数量组合时,考虑此
类细胞特异性活性参数的给药策略(例如,在给定剂量中表现这种活性的特定目标范围-或
不超过阈值)可以用于提供如下剂量,所述剂量能够实现所希望的临床或治疗结果,同时仍
在安全范围内或降低不希望的毒性(例如神经毒性)的风险。
[0041] 在一些实施方案中,使用始终产生较高频率的生物活性工程化细胞的过程允许使用如与其他给药策略(其中较高频率的工程化细胞呈凋亡标记阳性或者以其他方式较不健
康)相比远远更低(从工程化(例如CAR+)细胞的数量的度来看)的细胞剂量。例如,基于本
文中的观察结果并且考虑到可用的给药策略通常未考虑凋亡细胞的频率的观察结果,在某
些实施方案中,工程化(例如,CAR+)T细胞(例如,工程化CD8+和/或CD4+细胞)的数量低至
500万、1000万、1100万、1200万、1300万、1400万、1500万、1600万、1700万、1800万、1900万、
2000万、3000万、4000万或5000万个细胞。
[0042] 在一些任何此类实施方案中,所提供的实施方案包括评估或确定在给定组合物中存在的给定表型的细胞的数量、或其倍数或分数或变换。在一些实施方案中,A是在给定组
合物中具有两种或更多种表型的细胞的数量的平均值或加权平均值、或所述平均值或加权
平均值的倍数、分数或变换。在某些实施方案中,单位的目标数量小于单位的阈值数量,所
述阈值数量任选地是参考单位的安全数量,其中,参考单位的所述安全数量是相对于在用
包含表达重组受体(任选地CAR)的T细胞的治疗性T细胞组合物治疗后分析的一组受试者,
向在曾持续发生不良事件的组中的那些受试者中的受试者给予的疗法的参考单位的最低
数量。在特定实施方案中,不良事件是严重不良事件,任选地严重神经毒性,任选地等于或
高于4级或5级或至少延长的3级神经毒性。
[0043] 在一些实施方案中,参考单位的目标数量比参考单位的安全数量少了对应于安全系数的量和/或少了在1.5倍至3倍范围内(任选地约2倍)的量、或少了为未发生过不良事件
(任选地0-2级神经毒性)的一组受试者的标准偏差的倍数(任选地其中所述倍数在1.5倍至
3倍的范围内)的量。在某些实施方案中,参考单位的目标数量等于或高于参考单位的参考
功效数量,其中所述参考功效数量是相对于在用包含重组受体(任选地CAR)的治疗性T细胞
组合物治疗后分析的一组受试者,向展现出所希望的治疗结果(任选地部分反应或完全反
应(CR))的组中的一名或多名受试者给予的疗法的单位的数量。
[0044] 在特定实施方案中,A是在给定组合物中具有两种或更多种表型的细胞的数量的平均值或加权平均值、或所述平均值或加权平均值的倍数、分数或变换。在一些实施方案
中:所述目标数量是重组受体表达细胞(其呈CD3+、呈凋亡标记阴性(-)和CD3+)的目标数
量,任选地其中所述凋亡标记是膜联蛋白V或活性半胱天冬酶3;或所述目标数量是重组受
体表达细胞(其呈CD8+、呈凋亡标记阴性(-)和CD8+)的目标数量,任选地其中所述凋亡标记
是膜联蛋白V或活性半胱天冬酶3。
[0045] 在某些实施方案中,在(i)中的所述目标数量的细胞为:在或在约5.0x 106个与2.25x 107个之间、5.0x 106个与2.0x 107个之间、5.0x 106个与1.5x 107个之间、5.0x 106
7 6 6 6 7
个与1.0x 10个之间、5.0x 10个与7.5x 10个之间、7.5x 10 个与2.25x 10个之间、7.5x 
106个与2.0x 107个之间、7.5x 106个与1.5x 107个之间、7.5x 106个与1.0x 107个之间、
1.0x 107个与2.25x 107个之间、1.0x 107个与2.0x 107个之间、1.0x 107个与1.5x 107个之间、1.5x 107个与2.25x 107个之间、1.5x 107个与2.0x 107个之间、2.0x 107个与2.25x 107个之间的重组受体表达细胞(每个都包含端值),任选地呈CD3+或CD8+的或呈凋亡标记阴性
(-)和CD8+的重组受体表达细胞,任选地其中所述凋亡标记是膜联蛋白V或活性半胱天冬酶
3。
[0046] 在特定实施方案中,在(i)中的所述目标数量的细胞为:在至少或至少约5x 1066 6 6 6 6 6
个、6x 10个、7x 10个、8x 10个、9x 10个、10x 10个与约15x 10个之间的重组受体表达
细胞(每个都包含端值),任选地呈CD8+的或呈凋亡标记阴性(-)和CD8+的重组受体表达细
胞,任选地其中所述凋亡标记是膜联蛋白V或活性半胱天冬酶3;在至少或至少约5.55x 106
个、6.66x 106个、7.77x 106个、8.99x 106个、1.0x 107个、1.1x 107个与约1.67x 107个之间的重组受体表达细胞(每个都包含端值),任选地呈CD8+的或呈凋亡标记阴性(-)和CD8+的
重组受体表达细胞,任选地其中所述凋亡标记是膜联蛋白V或活性半胱天冬酶3;在至少或
至少约6.25x 106个、7.5x 106个、8.75x 106个、1.0x 107个、1.13x 107个、1.25x 107个与约
1.9x 107个之间的重组受体表达细胞(每个都包含端值),任选地呈CD8+的或呈凋亡标记阴
性(-)和CD8+的重组受体表达细胞,任选地其中所述凋亡标记是膜联蛋白V或活性半胱天冬
酶3;在至少或至少约7.14x 106个、8.5x 106个、1.0x 107个、1.14x 107个、1.29x 107个、
1.42x 107个与约2.14x 107个之间的重组受体表达细胞(每个都包含端值),任选地呈CD8+
的或呈凋亡标记阴性(-)和CD8+的重组受体表达细胞,任选地其中所述凋亡标记是膜联蛋
白V或活性半胱天冬酶3。
[0047] 在一些实施方案中,在(i)中的所述目标数量的细胞为:在至少或至少约5x 106个、6x 106个、7x 106个、8x 106个、9x 106个、10x 106个与约15x106个之间的呈凋亡标记阴性(-)和CD8+的重组受体表达细胞(每个都包含端值),任选地其中所述凋亡标记是膜联蛋
白V或活性半胱天冬酶3。在某些实施方案中,在(i)中的所述目标数量的细胞为:在至少或
6 6 6 7 7 7
至少约6.25x 10个、7.5x 10个、8.75x 10个、1.0x 10 个、1.13x 10个、1.25x 10 个与约
1.9x 107个之间的呈CD8+的重组受体表达细胞(每个都包含端值)。
[0048] 在特定实施方案中,RU的目标参考数量小于单位的阈值数量或小于RU的参考安全数量,其中RU的所述参考安全数量是相对于在用包含表达重组受体(任选地CAR)的T细胞的
治疗性T细胞组合物治疗后分析的一组受试者,向在曾持续发生不良事件的组中的那些受
试者中的受试者给予的疗法的参考单位的最低数量。
[0049] 在一些实施方案中,A是在给定组合物中存在的具有表型的细胞数量,并且B是指示在给定组合物中的重组受体依赖性活性的程度或与其相关的参数的值。在某些实施方案
中,A和/或B分别是数量或值的变换,其中所述变换包括对数变换、幂变换或罗吉特(logit)
变换。在特定实施方案中,A是在给定组合物中存在的具有表型的细胞的数量,并且B是指示
在给定T细胞组合物中的CAR依赖性活性的程度或与其相关的参数的值的倍数或变换,任选
地其中B是所述值的对数变换。
[0050] 在一些实施方案中,对数变换是常用对数(log10(x))、自然对数(ln(x))或二元对数(log2(x))。在某些实施方案中,是在组合物中的存活细胞的数量,和/或是不凋亡、不展
现指示早期凋亡或指示凋亡的因子、不处于凋亡的早期阶段、或不处于凋亡的晚期阶段的
细胞的数量,和/或是特定分化状态的细胞的数量,和/或是具有记忆/干细胞样属性的细胞
的数量或是其倍数或变换。
[0051] 在特定实施方案中,表型包括表面标记的阳性表达,所述表面标记是CD3、CD4或CD8中的一种或多种,和/或表型包括重组受体(任选地CAR)或用于表达重组受体的替代标
记的阳性表达。在一些实施方案中,表型是CD3+CAR、CD4+/CAR+、CD8+/CAR+。在某些实施方案中,表型包括:不存在指示凋亡、或在凋亡级联或途径中的一个或多个步骤的因子,任选
地不存在凋亡标记的表达。在特定实施方案中,表型包括凋亡标记(任选地早期凋亡或晚期
凋亡标记)的阴性表达。在一些实施方案中,凋亡标记是表面磷脂酰丝酸和/或用膜联蛋
白V检测,或是半胱天冬酶的活性或前体形式,任选地半胱天冬酶3的活性或前体形式。在某
些实施方案中,表型包括膜联蛋白-。
[0052] 在特定实施方案中,表型包含产生细胞因子的一种或组合(任选地对抗原或重组受体是非特异性的和/或是多克隆产生的)的指示物,其中所述一种或多种细胞因子是IL-
2、IL-13、IL-17、IFN-γ或TNF-α。在一些实施方案中,在测定(任选地细胞内细胞因子染色测定)中测量产生的指示物,所述测定包括将T细胞组合物的样品与多克隆药剂、抗原特异
性药剂或结合重组受体(任选地CAR)的药剂一起孵育。在某些实施方案中,所述药剂是或包
含PMA和离子霉素,或者是或包含T细胞受体或T细胞受体复合物激动剂。在特定实施方案
中,表型包括激活标记的阴性表达,其中所述激活标记选自CD25、CD127、LAG3、Ki67及其组合。
[0053] 在一些实施方案中,表型包括消耗标记的阴性表达,其中所述消耗标记是PD1或FOXP3基因产物或其组合。在某些实施方案中,表型包括幼稚表型或记忆表型,任选地其中
所述记忆表型包括T效应记忆表型、T中央记忆表型或表达CD45RA(Temra)的T效应记忆表
型。
[0054] 在一些实施方案中,重组受体依赖性活性的阈值小于参考安全值,其中所述参考安全值是相对于在用包含表达重组受体(任选地CAR)的T细胞的治疗性T细胞组合物治疗后
分析的一组受试者,向在曾持续发生不良事件的组中的那些受试者中的受试者给予的治疗
性组合物的CAR依赖性活性的最低值。在某些实施方案中,所述量度是在如下测定中的,所
述测定涉及在抗原、表达抗原的细胞和/或与重组受体(任选地CAR)特异性地结合的药剂的
存在下将给定组合物或其样品培养或孵育固定的时间(任选地24小时)。在特定实施方案
中,所述测定是ELISA。
[0055] 在一些实施方案中,因子的量度是:(i)因子的浓度、相对浓度、量或相对量;或(ii)每单位的在给定组合物中的输入细胞而言因子的量或相对量,或(iii)每单位时间(任
选地一小时)每单位的在给定组合物中的输入细胞而言因子的量或相对量;或(iv)指示
(i)-(iii)中任何一项的水平。在某些实施方案中,所述一种或多种因子是可溶性因子的一
种或组合,任选地细胞因子、趋化因子或可溶性受体中的一种或组合,所述可溶性受体任选
地为可溶性共刺激受体。在特定实施方案中,所述一种或多种因子是促炎性细胞因子、Th2
细胞因子和Th17细胞因子中的一种或组合。在一些实施方案中,所述一种或多种因子是IL-
2、IFN-γ、TNF-α、IL4、IL-5、IL-10、IL-13、GM-CSF、sCD137、MIP1a和M1Pb中的一种或组合。
在某些实施方案中,所述一种或多种因子是IL-2、IFN-γ、TNF-α和IL-10中的一种或组合。
在特定实施方案中,所述一种或多种因子是前述可溶性因子中的任何两种或更多种的组
合,并且所述参数是两种或更多种因子的量度的算术平均值或几何平均值。
[0056] 在一些实施方案中,所述参数是TNF-α、IFN-γ和IL-2中的至少两种或者TNF-α、IFN-γ和IL-2的量度(任选地量或浓度)的算术平均值或几何平均值。在某些实施方案中,
所述参数是所述量度的归一化值,其中归一化是与所述因子的参考量度相比较的。在特定
实施方案中,参考量度是在包含嵌合抗原受体(CAR)的多种(任选地至少10种、至少15种、至
少20种)参考治疗性T细胞组合物中的量度的平均值,其中:(i)已经观察到或确定了每种参
考治疗性T细胞组合物在向受试者给予后导致可接受的安全性特征,任选地其中所述受试
者患有表达所述抗原或与所述抗原相关的疾病或病症;和/或(ii)已经观察到或确定了每
种参考治疗性T细胞组合物在向受试者给予后导致所希望的功效,任选地其中所述受试者
患有表达所述抗原或与所述抗原相关的疾病或病症。在一些实施方案中,可接受的安全性
特征是不存在观察到的2级或更高等级或不存在3级或更高等级的神经毒性。在某些实施方
案中,可接受的安全性特征是不存在观察到的3级或更高等级的神经毒性。
[0057] 在特定实施方案中,所述功效是部分反应或是完全反应(CR)。在一些实施方案中,参考量度是通过相同的测定,所述因子在参考T细胞组合物中的量度,所述参考T细胞组合
物是通过与治疗性T细胞组合物相同的方法产生的,但不表达重组受体(任选地CAR)、不特
异性识别抗原和/或不表达任何重组受体,任选地任何CAR。在某些实施方案中,将所述参数
归一化以控制所述一种或多种因子的量度的患者特异性变异。
[0058] 在特定实施方案中,所述参数是所述因子的量度的归一化值(与对照因子在相同测定中的相同量度相比),其中所述对照因子在治疗性T细胞组合物中的水平已知不会(或
已经观察到不会)指示不良事件或毒性结果或不良事件或毒性结果的可能性或风险或者与
其相关或者与其显著相关,其中所述不良事件或毒性结果任选地是严重神经毒性。在一些
实施方案中,所述对照因子是与在给予T细胞组合物后持续发生不良事件的多名受试者中
的不良事件的发生无统计学相关和/或不相关的因子,任选地所述对照因子是或包含IL-5、
IL-13、GM-CSF和IL-6的一种或组合,任选地其中所述对照因子的量度是前述中的两种或更
多种的算术平均值或几何平均值。
[0059] 在某些实施方案中,所述参数不包含细胞溶解活性或其量度。在特定实施方案中,所述参数不包含重组受体依赖性或抗原特异性细胞溶解活性或其量度。在一些实施方案
中,表型是CD8+CAR+细胞或凋亡标记-CD8+CAR+细胞,任选地其中所述凋亡标记是膜联蛋白
V或活性半胱天冬酶3;并且所述参数是促炎性细胞因子的量度或者是其归一化值,所述促
炎性细胞因子任选地是TNF-α、IL-2和IFN-γ中的一种或组合。
[0060] 在某些实施方案中,所述不良事件是4级或5级神经毒性,并且单位的阈值数量:是或是约1.75x 107(如果A是凋亡标记阴性(-)和CD8+CAR+的,并且B是TNF-α)、或其归一化
值;是或是约2.19x 107(如果A是CD8+CAR+的,并且B是TNF-α)、或其归一化值;是或是约
1.25x 107(如果A是凋亡标记阴性(-)CD8+CAR+的,并且如果B是IFN-γ)、或其归一化值;是
或是约1.56x 107(如果A是CD8+CAR+的,并且B是IFN-γ)、或其归一化值;是或是约1.5x 107(如果A是凋亡标记阴性(-)CD8+CAR+的,并且如果B是IL-2)、或其归一化值;是或是约1.88x 
107(如果A是CD8+CAR+的,并且B是IL-2)、或其归一化值;是或是约1.5x 107(如果A是凋亡标记阴性(-)CD8+CAR+的,并且如果B是TNF-α和IFN-γ)、或其归一化值;是或是约1.88x 107
7
(如果A是CD8+CAR+的,并且B是TNF-α和IFN-γ)、或其归一化值;是或是约2.0x 10 (如果A
是凋亡标记阴性(-)CD8+CAR+的,并且如果B是TNF-α和IL-2)、或其归一化值;是或是约2.5x 
107(如果A是CD8+CAR+的,并且B是TNF-α和IL-2)、或其归一化值;是或是约1.25x 107(如果A是凋亡标记阴性(-)CD8+CAR+的,并且如果B是IFN-γ和IL-2)、或其归一化值;是或是约
7
1.56x 10 (如果A是CD8+CAR+的,并且B是IFN-γ和IL-2)、或其归一化值;是或是约1.75x 
107(如果A是凋亡标记阴性(-)CD8+CAR+的,并且如果B是TNF-α、IFN-γ和IL-2)、或其归一
化值;是或是约2.19x 107(如果A是CD8+CAR+的,并且B是TNF-α、IFN-γ和IL-2)、或其归一化值,任选地其中所述凋亡标记是膜联蛋白V或活性半胱天冬酶3。
[0061] 在特定实施方案中,所述不良事件是4级或5级神经毒性,并且所述目标参考单位的给定范围:是在或约在2.0x 105与1.75x 107之间(包含端值)(如果A是凋亡标记阴性(-)
和CD8+CAR+的,并且B是TNF-α)、或其归一化值;是在或约在2.5x 105与2.19x 107之间(包含端值)(如果A是CD8+CAR+的,并且B是TNF-α)、或其归一化值;是在或约在4x 105与1.25x 107之间(包含端值)(如果A是凋亡标记阴性(-)CD8+CAR+的,并且如果B是IFN-γ)、或其归一化
值;是在或约在5x 106与1.56x 107之间(包含端值)(如果A是CD8+CAR+的,并且B是IFN-γ)、或其归一化值;是在或约在2.0x 105与1.5x 107之间(如果A是凋亡标记阴性(-)CD8+CAR+
的,并且如果B是IL-2)、或其归一化值;是在或约在2.5x 105与1.88x 107之间(包含端值)
(如果A是CD8+CAR+的,并且B是IL-2)、或其归一化值;是在或约在3.0x 105与1.5x 107之间
(包含端值)(如果A是凋亡标记阴性(-)CD8+CAR+的,并且如果B是TNF-α和IFN-γ)、或其归
一化值;是在或约在3.75x 105与1.88x 107之间(包含端值)(如果A是CD8+CAR+的,并且B是
TNF-α和IFN-γ)、或其归一化值;是在或约在3.0x 105与2.0x 107之间(包含端值)(如果A是凋亡标记阴性(-)CD8+CAR+的,并且如果B是TNF-α和IL-2)、或其归一化值;是在或约在
3.75x 105与2.5x 107之间(包含端值)(如果A是CD8+CAR+的,并且B是TNF-α和IL-2)、或其归一化值;是在或约在4.0x 105与1.25x 107之间(包含端值)(如果A是凋亡标记阴性(-)CD8+
CAR+的,并且如果B是IFN-γ和IL-2)、或其归一化值;是在或约在5.0x 105与1.56x 107之间(包含端值)(如果A是CD8+CAR+的,并且如果B是IFN-γ和IL-2)、或其归一化值;是在或约在
5 7
4.0x 10与1.75x 10之间(包含端值)(如果A是凋亡标记阴性(-)CD8+CAR+的,并且如果B是
TNF-α、IFN-γ和IL-2)、或其归一化值;是在或约在5.0x 105与2.19x 107之间(包含端值)
(如果A是CD8+CAR+的,并且B是TNF-α、IFN-γ和IL-2)、或其归一化值,任选地其中所述凋亡标记是膜联蛋白V或活性半胱天冬酶3。
[0062] 在一些实施方案中,所述不良事件是至少延长的3级神经毒性,并且单位的阈值数量:是或是约1.0x 106(如果A是凋亡标记阴性(-)和CD8+CAR+的,并且B是TNF-α)、或其归一化值;是或是约1.25x 106(如果A是CD8+CAR+的,并且B是TNF-α)、或其归一化值;是或是约
2.0x 106(如果A是凋亡标记阴性(-)CD8+CAR+的,并且如果B是IFN-γ)、或其归一化值;是
或是约2.5x 106(如果A是CD8+CAR+的,并且B是IFN-γ)、或其归一化值;是或是约3.0x 106
(如果A是凋亡标记阴性(-)CD8+CAR+的,并且如果B是IL-2)、或其归一化值;是或是约3.75x 
106(如果A是CD8+CAR+的,并且B是IL-2)、或其归一化值;是或是约1.5x 106(如果A是凋亡标记阴性(-)CD8+CAR+的,并且如果B是TNF-α和IFN-γ)、或其归一化值;是或是约1.88x 106
(如果A是CD8+CAR+的,并且B是TNF-α和IFN-γ)、或其归一化值;是或是约2.5x 106(如果A
是凋亡标记阴性(-)CD8+CAR+的,并且如果B是TNF-α和IL-2)、或其归一化值;是或是约
6 6
3.12x 10(如果A是CD8+CAR+的,并且B是TNF-α和IL-2)、或其归一化值;是或是约3.0x 10
(如果A是凋亡标记阴性(-)CD8+CAR+的,并且如果B是IFN-γ和IL-2)、或其归一化值;是或
是约3.75x106(如果A是CD8+CAR+的,并且B是IFN-γ和IL-2)、或其归一化值;是或是约2.0x 
106(如果A是凋亡标记阴性(-)CD8+CAR+的,并且如果B是TNF-α、IFN-γ和IL-2)、或其归一
6
化值;是或是约2.5x 10 (如果A是CD8+CAR+的,并且B是TNF-α、IFN-γ和IL-2)、或其归一化值,任选地其中所述凋亡标记是膜联蛋白V或活性半胱天冬酶3。
[0063] 在某些实施方案中,所述不良事件是至少延长的3级,并且所述目标参考单位的给定范围:是在或约在3.0x 105与1.0x 106之间(包含端值)(如果A是凋亡标记阴性(-)和CD8+
5 6
CAR+的,并且B是TNF-α)、或其归一化值;是在或约在3.75x 10与1.25x 10之间(包含端值)
(如果A是CD8+CAR+的,并且B是TNF-α)、或其归一化值;是在或约在4x 105与2.0x 106之间
(包含端值)(如果A是凋亡标记阴性(-)CD8+CAR+的,并且如果B是IFN-γ)、或其归一化值;
是在或约在5x 106与2.5x 106之间(包含端值)(如果A是CD8+CAR+的,并且B是IFN-γ)、或其
归一化值;是在或约在2.0x 105与3.0x 106之间(包含端值)(如果A是凋亡标记阴性(-)CD8+
CAR+的,并且如果B是IL-2)、或其归一化值;是在或约在2.5x 105与3.75x 106之间(包含端
值)(如果A是CD8+CAR+的,并且B是IL-2)、或其归一化值;是在或约在3.0x 105与1.5x 106之间(包含端值)(如果A是凋亡标记阴性(-)CD8+CAR+的,并且如果B是TNF-α和IFN-γ)、或其
归一化值;是在或约在3.75x 105与1.88x 106之间(包含端值)(如果A是CD8+CAR+的,并且B
是TNF-α和IFN-γ)、或其归一化值;是在或约在3.0x 105与2.5x 106之间(包含端值)(如果A是凋亡标记阴性(-)CD8+CAR+的,并且如果B是TNF-α和IL-2)、或其归一化值;是在或约在
3.75x 105与3.12x 106之间(包含端值)(如果A是CD8+CAR+的,并且B是TNF-α和IL-2)、或其
归一化值;是在或约在4.0x 105与3.0x 106之间(包含端值)(如果A是凋亡标记阴性(-)CD8+
CAR+的,并且如果B是IFN-γ和IL-2)、或其归一化值;是在或约在5.0x 105与3.75x 106之间(包含端值)(如果A是CD8+CAR+的,并且B是IFN-γ和IL-2)、或其归一化值;是在或约在4.0x 
105与2.0x 106之间(包含端值)(如果A是凋亡标记阴性(-)CD8+CAR+的,并且如果B是TNF-α、IFN-γ和IL-2)、或其归一化值;是在或约在5.0x 105与2.5x 106之间(包含端值)(如果A是
CD8+CAR+的,并且B是TNF-α、IFN-γ和IL-2)、或其归一化值,任选地其中所述凋亡标记是膜联蛋白V或活性半胱天冬酶3。
[0064] 在特定实施方案中,治疗性T细胞组合物包含在约1000万个细胞/mL与约7000万个细胞/mL之间、或在约1000万个存活细胞/mL与约7000万个存活细胞/mL之间,每个都包含端
值。在一些实施方案中,治疗性T细胞组合物包含在约1500万个细胞或存活细胞/mL与约
6000万个细胞或存活细胞/mL之间,每个都包含端值。在某些实施方案中,T细胞组合物包含
大于1000万个细胞或存活细胞/mL。在特定实施方案中,治疗性T细胞组合物包含大于1500
万个细胞或大于1500万个细胞/mL。在一些实施方案中,所述组合物进一步包含冷冻保护剂
和/或所述制品进一步包括用于在给予至受试者之前将所述组合物解冻的说明书。
[0065] 在某些实施方案中,疾病或病症是癌症,任选地骨髓瘤、淋巴瘤或白血病。在特定实施方案中,疾病或病症是B细胞恶性肿瘤,任选地B细胞恶性肿瘤选自急性成淋巴细胞性
白血病(ALL)、成人ALL、慢性成淋巴细胞性白血病(CLL)、非霍奇金淋巴瘤(NHL)、和弥漫性
大B细胞淋巴瘤(DLBCL)。在一些实施方案中,抗原是αvβ6整合素(avb6整合素)、B细胞成熟抗原(BCMA)、B7-H3、B7-H6、酸酐酶9(CA9,也称为CAIX或G250)、癌症-睾丸抗原、癌症/睾丸抗原1B(CTAG,也称为NY-ESO-1和LAGE-2)、癌胚抗原(CEA)、细胞周期蛋白、细胞周期蛋白A2、C-C基序趋化因子配体1(CCL-1)、CD19、CD20、CD22、CD23、CD24、CD30、CD33、CD38、CD44、CD44v6、CD44v7/8、CD123、CD138、CD171、表皮生长因子蛋白(EGFR)、截短的表皮生长因子蛋白(tEGFR)、III型表皮生长因子受体突变(EGFR vIII)、上皮糖蛋白2(EPG-2)、上皮糖蛋白
40(EPG-40)、肝配蛋白B2、肝配蛋白受体A2(EPHa2)、雌激素受体、Fc受体样5(FCRL5;也称为Fc受体同源物5或FCRH5)、胎儿乙酰胆受体(胎儿AchR)、叶酸结合蛋白(FBP)、叶酸受体α、神经节苷脂GD2、O-乙酰化GD2(OGD2)、神经节苷脂GD3、糖蛋白100(gp100)、G蛋白偶联受体
5D(GPCR5D)、Her2/neu(受体酪氨酸激酶erb-B2)、Her3(erb-B3)、Her4(erb-B4)、erbB二聚
体、人高分子量黑色素瘤相关抗原(HMW-MAA)、乙型肝炎表面抗原、人白细胞抗原A1(HLA-
A1)、人白细胞抗原A2(HLA-A2)、IL-22受体α(IL-22Ra)、IL-13受体α2(IL-13Ra2)、激酶插入结构域受体(kdr)、κ轻链、L1细胞粘附分子(L1-CAM)、L1-CAM的CE7表位、含有富亮氨酸重复序列的蛋白8家族成员A(LRRC8A)、路易斯Y、黑色素瘤相关抗原(MAGE)-A1、MAGE-A3、MAGE-
A6、间皮素、c-Met、鼠类巨细胞病毒(CMV)、粘蛋白1(MUC1)、MUC16、自然杀伤细胞2族成员D(NKG2D)配体、黑色素A(MART-1)、神经细胞粘附分子(NCAM)、癌胚胎抗原、优先表达的黑色
素瘤抗原(PRAME)、孕受体、前列腺特异性抗原、前列腺干细胞抗原(PSCA)、前列腺特异性膜抗原(PSMA)、受体酪氨酸激酶样孤儿受体1(ROR1)、存活蛋白、滋养层糖蛋白(TPBG,也称
作5T4)、肿瘤相关糖蛋白72(TAG72)、血管内皮生长因子受体(VEGFR)、血管内皮生长因子受
体2(VEGFR2)、Wilms肿瘤1(WT-1)、病原体特异性抗原、或与通用标签相关的抗原、和/或生
物素化的分子、和/或由HIV、HCV、HBV或其他病原体表达的分子。在一些实施方案中,受体靶向的抗原包括与B细胞恶性肿瘤相关的抗原,如许多已知B细胞标记中的任何一种。在一些
实施方案中,抗原是或包括CD20、CD19、CD22、ROR1、CD45、CD21、CD5、CD33、Igκ、Igλ、CD79a、CD79b或CD30。
[0066] 在特定实施方案中,制品进一步含有指示容器包含目标数量的单位的信息。在一些实施方案中,容器是第一容器,并且制品进一步包含另外的容器,其中每个所述另外的容
器包含单位剂量,所述单位剂量包含目标数量的T细胞组合物单位。在某些实施方案中,所
述另外的容器包含在约1000万个细胞或存活细胞/mL与约7000万个细胞或存活细胞/mL之
间、在约1500万个细胞或存活细胞与约6000万个细胞或存活细胞/mL之间(每个都包含端
值)、大于1000万个细胞或存活细胞/mL、大于1500万个细胞或存活细胞/mL、或其组合。在特定实施方案中,单位剂量含有不超过15x 106数量的CD8+CAR+细胞,所述CD8+CAR+细胞对于
膜联蛋白V的检测或对于半胱天冬酶3的活性或前体形式呈阴性。在一些实施方案中,单位
剂量进一步包含一个数量的呈CAR阳性的CD4+细胞,其中所述数量是与CD8+CAR+细胞的比
率为或为约1:1。
[0067] 在某些实施方案中,T细胞组合物通过如下的过程生产,在所述过程中:具有指示生物活性细胞特征和/或不存在凋亡或早期或晚期凋亡的表型的细胞(1)在组合物中的CAR
+细胞中、(2)在组合物中的CAR+CD3+细胞中、和/或(3)在组合物中的CAR+CD8+细胞中的频
率,与在通过所述过程生产的多种T细胞组合物中的所述频率的平均值相比变化不超过
40%、或不超过30%、或不超过20%或不超过10%或不超过5%和/或与这种平均值相比变
化不超过一个标准偏差;或者在组合物中具有指示不存在凋亡或早期或晚期凋亡的表型的
细胞(1)在组合物中的CAR+细胞中、(2)在组合物中的CAR+CD3+细胞中、和/或(3)在组合物
中的CAR+CD8+细胞中的频率,与在通过所述过程生产的多种T细胞组合物相比变化不超过
40%或不超过20%或不超过10%。
[0068] 在特定实施方案中,所述过程包括:(a)在一定条件下将包含T细胞的细胞群与包含编码重组受体的核酸分子的药剂一起孵育,以将编码重组受体的核酸引入所述群体的细
胞中;并且(b)在所述孵育之前、期间和/或之后刺激所述细胞,其中刺激包括在刺激条件的
存在下孵育所述细胞,所述刺激条件诱导所述细胞的初级信号、信号传导、刺激、激活和/或扩增。在一些实施方案中,所述过程进一步包括在(a)之前从生物样品中分离细胞群。在某
些实施方案中,所述分离包括,基于CD3的表面表达或基于CD4和CD8之一或两者的表面表达
来选择细胞,任选地通过阳性或阴性选择。
[0069] 在一些实施方案,生物样品是或包含全血样品、血沉棕黄层样品、外周血单核细胞(PBMC)样品、未分级T细胞样品、淋巴细胞样品、白细胞样品、单采术产物或白细胞分离术产物。
[0070] 在某些实施方案中,刺激条件包括与能够激活TCR复合物的一种或多种组分的一个或多个细胞内信号传导结构域和/或一种或多种共刺激分子的一个或多个细胞内信号传
导结构域的刺激试剂一起孵育。
[0071] 在特定实施方案中,刺激试剂包含与TCR复合物的成员特异性地结合的一级药剂和与T细胞共刺激分子特异性地结合的二级药剂。在一些实施方案中,一级药剂特异性地结
合CD3和/或共刺激分子选自CD28、CD137(4-1-BB)、OX40或ICOS。在某些实施方案中,一级药剂和二级药剂包含抗体和/或存在于固体支持物(任选地珠)的表面上。
[0072] 在特定实施方案中:刺激试剂是如下的一种:其中已经确定重组受体依赖性活性或抗原特异性活性,任选地促炎性细胞因子的重组受体依赖性或抗原特异性依赖性产生或
积累,与使用刺激试剂通过所述过程生产的多种T细胞组合物中的促炎性细胞因子的产生
或积累的量度的平均值相比变化不超过40%、或不超过30%、或不超过20%或不超过10%
或不超过5%,和/或与这种平均值相比变化不超过一个标准偏差;和/或刺激试剂是如下的
一种:其中已经确定重组受体依赖性活性或抗原特异性活性,任选地促炎性细胞因子的重
组受体依赖性或抗原特异性依赖性产生或积累,在通过所述过程生产的多种T细胞组合物
中变化不超过40%、或不超过30%、或不超过20%或不超过10%或不超过5%;和/或刺激试
剂是如下的一种:其中已经确定重组受体依赖性活性或抗原特异性活性,任选地使用刺激
试剂生产的细胞组合物的促炎性细胞因子的重组受体依赖性或抗原特异性依赖性产生或
积累,与对照组合物相比变化不超过40%、不超过30%、不超过20%或不超过10%或不超过
5%,其中除了所述对照组合物在对照刺激试剂或重组受体依赖性活性的标准单位的存在
下进行之外,所述对照组合物和所述细胞组合物使用相同的过程(包括从相同的细胞群)生
产。在一些实施方案中,当在所述过程中使用时,已知对照刺激试剂生产其中重组受体依赖
性活性或抗原特异性活性是在可接受的变异范围内的T细胞组合物。
[0073] 在某些实施方案中,容器填充有T细胞组合物的全部或部分和任选地另一种溶液,至浓度在约1000万个细胞与约7000万个细胞/mL之间,包含端值。在特定实施方案中,所述
容器填充有另一种溶液,并且所述溶液包含冷冻保护剂,任选地DMSO。在一些实施方案中,
浓度在约1500万个与约6000万个细胞/mL之间(包含端值)。在某些实施方案中,浓度大于
1000万个细胞/mL。在特定实施方案中,浓度大于1500万个细胞/mL。在一些实施方案中,
DMSO的浓度是或是约或不超过7.5%。在某些实施方案中,浓度大于6000万个细胞/mL。在特
定实施方案中,DMSO的浓度大于7.5%,任选地在或约在7.5%与9.0%之间(包括端值)。
[0074] 在一些实施方案中,所述填充以自动方式进行,任选地在封闭的系统中进行。在某些实施方案中,经调整的单位剂量小于用包含表达重组受体(任选地CAR)的T细胞的治疗性
T细胞组合物治疗的一组受试者的平均单位剂量,任选地小于其1.5倍、小于其2倍、小于其3
倍、小于其4倍。在特定实施方案中,在向受试者给予T细胞组合物之后评估T细胞组合物的
样品,任选地冷冻保存的样品。在一些实施方案中,如果B高于USL,则将受试者确定为有毒
性风险。在某些实施方案中,如果B高于USL,则监测被给予组合物的受试者和/或用药剂治
疗被给予组合物的受试者,以在给予细胞组合物之后和任选地在发生毒性结果的体征或症
状之前改善或降低毒性结果或细胞因子释放综合征的可能性。
附图说明
[0075] 图1示出了显示在给予含有抗CD19 CAR表达细胞的T细胞组合物之后在不同时间点处血液中CAR+细胞/μL的浓度的图。示出了发生3级或更低级(星形)、4级(五边形)或5级
(圆形)神经毒性的受试者的数据。
[0076] 图2示出了显示在给予含有抗CD19 CAR表达细胞的T细胞组合物之后在不同时间点处血液中CAR+细胞/μL的浓度的图。示出了发生2级或更低级(正方形)、3级(星形)、延长
的3级(菱形)、4级(五边形)或5级(带箭头的圆形)神经毒性的受试者的数据。
[0077] 图3A至3V示出了对含有表达抗CD19 CAR的细胞的细胞组合物的不同参数定量的箱形图。左侧的箱形图比较了从发生4级或更低级神经毒性的受试者来源的细胞组合物的
测量值与从发生5级神经毒性的受试者来源的细胞组合物的测量值。右侧的箱形图比较了
从经历了完全反应(CR)的受试者来源的细胞组合物的测量值与从经历了无反应(NR)的受
试者来源的细胞组合物的测量值。从无法获得其反应的受试者来源的细胞组合物的测量值
也示于此图(NA)中。
[0078] 图3A的箱形图示出了给予至受试者的CD8+CAR+凋亡标记阴性细胞的总数的测量值。
[0079] 图3B的箱形图示出了在所给予的剂量下通过内部细胞因子染色(ICS)得出的在PMA/离子霉素之后呈IL-13阳性的CD8+CAR+细胞的百分比。
[0080] 图3C的箱形图示出了所给予的CD8+CAR+凋亡标记(膜联蛋白V-)-阴性细胞的数量/kg。
[0081] 图3D的箱形图示出了呈CD127+阳性的CD4+CAR+细胞的百分比。
[0082] 图3E的箱形图示出了所输注的细胞总数/kg。
[0083] 图3F的箱形图示出了通过ICS得出的在PMA/离子霉素之后呈IL-13阳性的CD4+CAR+细胞的百分比。
[0084] 图3G的箱形图示出了在所给予的CD8+CAR+细胞中的凋亡标记(膜联蛋白V)阳性细胞的频率。
[0085] 图3H的箱形图示出了通过QPCR检测的FOXP3水平。
[0086] 图3I的箱形图示出了所给予的CD3+CAR+凋亡标记(膜联蛋白V)-阴性细胞的总数。
[0087] 图3J的箱形图示出了所给予的CD3+CAR+凋亡标记(膜联蛋白V-)-阴性细胞的数量/kg。
[0088] 图3K的箱形图示出了冷冻保存的药物产品(CDP)的存活细胞浓度。
[0089] 图3L的箱形图示出了所输注的总细胞。
[0090] 图3M的箱形图示出了CD4+CAR+细胞中IL2的ICS。
[0091] 图3N的箱形图示出了在所给予的CD3+CAR+细胞中的凋亡标记(膜联蛋白V)-阳性细胞的频率。
[0092] 图3O的箱形图示出了每个CD4+细胞而言FOXP3+细胞的频率。
[0093] 图3P的箱形图示出了CD3+细胞的频率。
[0094] 图3Q的箱形图示出了所给予的CD8+CAR+细胞的数量/kg。
[0095] 图3R的箱形图示出了非抗原/CAR特异性IL-10产生/总细胞(CD3/28刺激)。
[0096] 图3S的箱形图示出了CD4+CAR+细胞的TNFα的ICS。
[0097] 图3T的箱形图示出了CD8+CAR+细胞的TNFα的ICS。
[0098] 图3U的箱形图示出了非抗原/CAR特异性IL-6产生/总细胞(CD3/28刺激)。
[0099] 图3V的箱形图示出了所给予的CD3+CAR+细胞数量/kg。
[0100] 图4示出了对在用CD19刺激后通过含有表达抗CD19 CAR的细胞的细胞组合物的TNF-α产生定量的箱形图。左侧的箱形图比较了从发生4级或更低级神经毒性的受试者来源
的细胞组合物的测量值与从发生5级神经毒性的受试者来源的细胞组合物的测量值。右侧
的箱形图比较了从经历了CR的受试者来源的细胞组合物的测量值与从经历了NR的受试者
来源的细胞组合物的测量值。从无法获得其反应的受试者来源的细胞组合物的测量值也示
于此图(NA)中。
[0101] 图5A-B示出了对在用CD19刺激后通过含有表达抗CD19 CAR的细胞的在细胞组合物中的细胞因子产生定量的箱形图。左侧的箱形图比较了从发生4级或更低级神经毒性的
受试者来源的细胞组合物的测量值与从发生5级神经毒性的受试者来源的细胞组合物的测
量值。右侧的箱形图比较了从经历了CR的受试者来源的细胞组合物的测量值与从经历了NR
的受试者来源的细胞组合物的测量值。从无法获得其反应的受试者来源的细胞组合物的测
量值也示于此图(NA)中。
[0102] 图5A的箱形图示出了抗原刺激的IL-2产生。
[0103] 图5B的箱形图示出了抗原刺激的IFNγ产生。
[0104] 图6A和6B示出了在所给予的剂量中的凋亡标记-(膜联蛋白V-)CD8+CAR+细胞的数量和抗原刺激的TNFα产生的二维散点图。从发生4级或更低等级(圆形)或5级神经毒性(三
角形)的受试者来源的细胞组合物的数据点示于图6A中。从发生0-2级、3级、延长的3级
(3p)、4级和5级神经毒性的受试者来源的细胞组合物的数据点示于图6B中。在图6B中,示出
了与发生5级神经毒性并接受了用环磷酰胺(CY)或氟达拉滨和环磷酰胺(Flu/CY)的淋巴细
胞清除化学疗法的受试者相关的数据点。椭圆指示从临床研究(其中没有受试者展现出5级
神经毒性或脑水肿)评估的11种示例性细胞组合物中的大多数的这些参数的范围。
[0105] 图7示出了在所给予的剂量中的凋亡标记-(膜联蛋白V-)CD8+CAR+细胞的数量和抗原刺激的TNFα产生的二维散点图。示出了从发生4级或更低级(正方形和圆形)或5级神经
毒性(三角形)的受试者来源的细胞组合物的数据点。示出了从另外的临床研究的受试者来
源的细胞组合物(正方形)。
[0106] 图8示出了显示对于发生了不同等级的神经毒性的受试者而言所给予的凋亡标记(膜联蛋白V)-CD8+CAR+细胞的数量x TNF-α产生的单独数据点的图。
[0107] 图9示出了显示对于具有不同反应的受试者而言所给予的凋亡标记-(膜联蛋白V-)CD8+CAR+细胞的数量x TNF-α产生的单独数据点的图。
[0108] 图10示出了显示对于发生了不同等级的神经毒性的受试者而言所给予的凋亡标记-(膜联蛋白V-)CD8+CAR+细胞的数量x IFNγ产生的单独数据点的图。
[0109] 图11示出了显示对于具有不同临床反应的受试者而言所给予的凋亡标记-(膜联蛋白V-)CD8+CAR+细胞的数量x IFNγ产生的单独数据点的图。
[0110] 图12示出了显示对于发生了不同等级的神经毒性的受试者而言所给予的凋亡标记-(膜联蛋白V-)CD8+CAR+细胞的数量x IL-2产生的单独数据点的图。
[0111] 图13示出了显示对于具有不同临床反应的受试者而言所给予的凋亡标记-(膜联蛋白V-)CD8+CAR+细胞的数量x IL-2产生的单独数据点的图。
[0112] 图14A和14B示出了显示对于发生了不同等级的神经毒性的受试者(图14A)或对于具有不同反应的受试者(图14B)而言所给予的凋亡标记-(膜联蛋白V-)CD8+CAR+细胞的数
量(A)x归一化的TNF-α产生(B)的单独数据点的图。
[0113] 图15A和15B示出了显示对于发生了不同等级的神经毒性的受试者(图15A)或对于具有不同反应的受试者(图15B)而言所给予的凋亡标记-(膜联蛋白V-)CD8+CAR+细胞的数
量(A)x归一化的IFNγ产生(B)的单独数据点的图。
[0114] 图16A和16B示出了显示对于发生了不同等级的神经毒性的受试者(图16A)或对于具有不同反应的受试者(图16B)而言所给予的凋亡标记-(膜联蛋白V-)CD8+CAR+细胞的数
量(A)x归一化的IL-2产生(B)的单独数据点的图。
[0115] 图17A和17B示出了显示对于发生了不同等级的神经毒性的受试者(图17A)或对于具有不同反应的受试者(图17B)而言所给予的凋亡标记-(膜联蛋白V-)CD8+CAR+细胞的数
量(A)x归一化的TNF-α和IFNγ产生(B)的单独数据点的图。
[0116] 图18A和18B示出了显示对于发生了不同等级的神经毒性的受试者(图18A)或对于具有不同反应的受试者(图18B)而言所给予的凋亡标记-(膜联蛋白V-)CD8+CAR+细胞的数
量(A)x归一化的TNF-α和IL-2产生(B)的单独数据点的图。
[0117] 图19A和19B示出了显示对于发生了不同等级的神经毒性的受试者(图19A)或对于具有不同反应的受试者(图19B)而言所给予的凋亡标记-(膜联蛋白V-)CD8+CAR+细胞的数
量(A)x归一化的IFNγ和IL-2产生(B)的单独数据点的图。
[0118] 图20A和20B示出了显示对于发生了不同等级的神经毒性的受试者(图20A)或对于具有不同反应的受试者(图20B)而言所给予的凋亡标记-(膜联蛋白V-)CD8+CAR+细胞的数
量(A)x归一化的TNF-α、IFNγ和IL-2产生(B)的单独数据点的图。
[0119] 图21A和21B示出了显示来自含有抗CD19 CAR+细胞的组合物的细胞的表型的图,所述组合物是通过实施例1(A)中所描述的过程和实施例2(B)中所描述的替代性过程产生
的。图21A示出了显示凋亡标记-(膜联蛋白V-)细胞在CD8+CAR+细胞中的百分比的箱形图。
图21B示出了显示对于通过示例性过程A和示例性过程B产生的细胞组合物,所给予的膜联
蛋白阴性CD8+CAR+细胞和细胞因子产生的单独细胞组合物的值的图。阴影框指示观察到的
分布。
[0120] 图22示出了向发生了0-2级或3-5级神经毒性的受试者给予的CD3+CAR+细胞的数量/kg(x106个细胞/kg)的单独数据点。
[0121] 图23A-C示出了比较含有表达抗CD19 CAR的细胞的T细胞组合物的箱形图。图23A和23B示出了比较在生产期间用来自不同批次的相同试剂处理的T细胞组合物的箱形图。图
23A对在用CD19刺激后细胞的TNF-α产生进行了定量。图23B显示了CD27+/CD28+细胞在CD8+
CAR+细胞中的频率。示出了与神经毒性0-2级(正方形)、3级(带箭头的星形)、延长的3级
(3p;菱形)、4级(带箭头的五边形)和5级(圆形)相关的T细胞组合物的数据点。图23C示出了
在用在不同条件下存储的相同介质产生的含有表达抗CD19CAR的细胞的T细胞组合物中在
用CD19表达细胞刺激后的TNF-α产生。
[0122] 图24示出了显示在实施例8中所描述的用于产生含有CAR T细胞的工程化细胞组合物的过程的不同阶段,富集CD4+和CD8+细胞的T细胞组合物的T细胞纯度的箱形图。示出
了CD4+和CD8+细胞在组合物中的频率(总白细胞的%)。
[0123] 图25示出了描绘在剂量水平1(DL1)和剂量水平2(DL2)处在单独剂量中的CD3+ T细胞的水平的图。
[0124] 图26示出了显示在高或低的配制体积中含有CAR-T细胞的治疗性细胞组合物的半胱天冬酶-3阴性CD4+和CD8+ T细胞的浓度、存活力和频率的箱形图。
[0125] 图27示出了显示所输注的含有CAR T细胞的单独治疗性细胞组合物的受控剂量、T细胞表型和细胞特异性功能的图。示出了输注到单独受试者中的CD4+CAR+、CD8+CAR+、CD4+
CAR+TNF-α、CD8+CAR+TNF-α、CD4+CAR+CCR7+、CD8+CAR+CCR7+的量的数据点。
[0126] 图28示出了显示以下的图:(i)对于许多单独受试者中的每一个,单独非装箱点指示在峰值时(在单独受试者的基础上,在用表达抗CD19 CAR的T细胞组合物治疗受试者后评
估CAR+ T细胞数量的时间点中,测量到CAR+T细胞的最高数量的时间点)的最大PK测量值
(CAR+ T细胞数量/μL血液(PK测量值)),其中点也指示对于每名受试者观察到的神经毒性
的最高等级:0-2级(正方形)、3级(星形)、延长的3级(菱形)、4级(带箭头的五边形)或5级
(圆形)神经毒性,以及(ii)对于那些被认为具有早期或晚期CAR+ T细胞峰值(分别由带有
范围条的装箱点的上线和下线指示)的此类患者,在给予此类T细胞组合物之前和之后在各
个指定时间点处在血清中的IL-15(皮克/mL)的中值水平。椭圆指示如与其他受试者相比,
观察到CAR-T细胞早期快速扩增的受试者。

具体实施方式

[0127] 本申请中提及的所有出版物(包括专利文献、科学文章和数据库)出于所有目的通过引用以其整体并入,在程度上如同每个单独的出版物通过引用单独并入。如果本文所述
的定义与通过引用并入本文的专利、申请、公开的申请和其他出版物中所述的定义相反或
在其他方面不一致,则本文所述的定义优先于通过引用并入本文的定义。
[0128] 本文使用的章节标题只是出于组织的目的,而不应解释为限制所描述的主题。
[0129] I.降低毒性风险的治疗性T细胞组合物的剂量和剂量确定
[0130] 本文提供了与用于治疗疾病和病症(包括各种肿瘤)的细胞疗法(如工程化T细胞疗法)结合使用的方法、组合物和制品。所提供的实施方案涉及含有工程化T细胞(例如被工
程化以表达重组蛋白如表达重组受体的那些)的治疗性T细胞组合物,所述重组受体被设计
用于识别和/或特异性地结合与所述疾病或病症相关的分子并导致反应,例如在与此类分
子结合后针对此类分子的免疫应答。受体可包括嵌合受体例如嵌合抗原受体(CAR)和其他
转基因抗原受体,包括转基因T细胞受体(TCR)。
[0131] 在一些方面,所提供的实施方案涉及如下方面:其中与治疗性T细胞组合物的功能或活性(例如,抗原特异性或重组受体依赖性活性)有关的某些参数可以预测在被给予T细
胞组合物的受试者中发生不良事件或毒性(如严重神经毒性)的可能性的风险,和/或可以
提供关于治疗性T细胞组合物的效力的信息。所提供的实施方案的方面还涉及给予或提供
包含一个数量的单位(如目标数量的单位)的单位剂量,所述单位剂量是某种表型(如指示
生物活性细胞或细胞群的表型)的细胞的数量的函数,以及在治疗性T细胞组合物中存在的
细胞的功能或活性,例如抗原特异性或重组受体依赖性活性,包括用于与给予治疗性T细胞
组合物结合使用。在一些方面,所提供的方法可以改善或降低在被给予一定剂量的治疗性T
细胞组合物的受试者的毒性的风险,同时确保T细胞组合物的效力。还提供了含有细胞并且
设计用于在此类给药方案之后给予的制品。
[0132] 在一些实施方案中,所提供的方法、剂量、单位剂量、组合物和制品是基于以下观察结果:当确定细胞疗法的适当剂量和/或释放用于疗法的细胞组合物时,考虑某些参数及
其组合可能是有利的。在某些可用的方法中,剂量是基于特定细胞类型(如被工程化以展现
出特定的活性的那些,如呈工程化受体阳性的那些)的数量。例如,在某些可用的方法和剂
量中,剂量是基于在存活的工程化T细胞或其亚组的数量(或数量/患者体重)(如存活的细
胞毒性(例如,CD8+)工程化T细胞的数量)之间观察到的关系或怀疑的关系。在各种背景下,
此类数量可能与功效和/或安全性结果(如反应和/或毒性(如神经毒性(NTx)、脑水肿和
CRS)的风险)有关系。本文提供了基于如下观察结果的实施方案:尽管如此,在一些背景下,这些度量不能始终充分地预测毒性的风险(例如严重神经毒性或脑水肿的风险),特别是在
不考虑其他变量的情况下。因此,仅依赖于此类度量来定义剂量和评价释放的产物的途径
可能不完全令人满意。例如,在一些背景下,此类途径可能无法限定适当的安全范围和/或
治疗窗口,以进行安全且有效的细胞疗法。本文提供了解决此类缺点的方法(包括治疗、给
药、剂量确定和释放测定方法)、以及剂量和治疗性组合物。
[0133] 在一些方面,本文发现某些产品特异性属性和临床或患者特异性因素可能影响在给予细胞疗法后发生毒性的风险、相对风险或概率。在一些情况下,此类产品特异性和/或
患者特异性属性的变异性可能导致给予至一组受试者内的不同个体的治疗性细胞组合物
的剂量属性的变异性,和/或导致在这种给予后在此类不同的个体中观察到的结果的变异
性。在一些方面,尽管给予至各种单独受试者的剂量具有某些相似性(例如在所给予的剂量
或组合物含有被工程化以表达相同的工程化受体(如嵌合抗原受体)、含有相同的载体或用
相同的载体转导或转染的细胞的情况下),但是仍然观察到这种变异性;在一些方面,给予
至不同受试者的不同剂量或组合物包括或含有相同数量(或数量/受试者的体重或其他特
征)的细胞(或特定表型的细胞)或由其组成。在一些方面,控制细胞组合物的一个或多个属
性的变异性可以使此类风险最小化和/或使剂量属性或结果的这种变异性最小化。在一些
方面,最小化或控制变异性(如在给予特定疗法的受试者中一种或多种产品或组合物属性
的变异程度(或增加的一致性)可以最小化在患者中的结果或剂量属性的变异性的影响,所
述患者具有会以其他方式影响此类结果或剂量属性的患者特异性因素或临床因素的变异
性。例如,在一些方面,减少一个或多个产品或组合物属性的变异性可以减少受试者或受试
者群体发生治疗相关毒性(如神经毒性或脑水肿或其等级)的变异性,或者可以降低受试者
或受试者群体发生治疗相关毒性(如神经毒性或脑水肿或其等级)的风险或可能性,例如不
会降低或实质上降低实现特定反应或临床结果的可能性。在一些情况下,减少导致临床或
患者特异性因素的变异性可以最小化在给予细胞疗法后发生毒性(如神经毒性或脑水肿)
的风险。
[0134] 在一些方面,在细胞组合物的单位剂量之间的变异性可以归因于在产生或制造工程化细胞疗法中使用的制造过程的一个或多个方面。在一些情况下,原材料的变化或其处
理或储存可能影响本文观察到的影响毒性风险和/或结果的变量。在一些方面,在许多受试
者中在进行的过程中原材料的批次间变异性或储存/处理和/或不同原材料的使用可能有
影响,例如通过增加所生成的细胞组合物的变异性或者增加或减少所生成的细胞组合物的
某些方面,例如如果有变化则会导致被给予细胞疗法的受试者中(特别是在某些患者特异
性属性有所不同的此类受试者中)的毒性风险或临床结果的变异性的方面。在一些实施方
案中,提供了如下途径,其涉及评估、测试和/或控制由于一种或多种(例如任何或全部)原
材料、一个或多个批次、一种或多种试剂或其储存或处理、或其变化引起的对一个或多个此
类产品属性或风险或可能性的潜在影响或在一个或多个此类产品属性或风险或可能性方
面的变异性。在一些实施方案中,此类途径包括测定,如在使用这种原材料、批次、储存或处理之前、在生产待给予至受试者的细胞组合物中或在这种给予之前进行的那些测定。在一
些方面,测定评估原材料、批次、变化、或处理或储存方法对在细胞组合物中的一个或多个
属性(如本文中观察到的那些)的影响,所述一个或多个属性例如为影响毒性风险或结果或
者加剧患者间变异性在此类结果中的影响的那些。在一些方面,测定评估与另一种材料、批
次、或储存或处理方法相比,在此类一个或多个属性中是否存在可接受的低变异程度或对
此类一个或多个属性是否具有可接受的低影响。在一些方面,用于储存或处理的原材料、批
次或方法被释放以用于在制造待给予至患者的细胞疗法(或这样的细胞疗法被给予至患
者)中使用-如果例如只有所述测定证实了这种变异或影响是在可接受的范围或值或限度
内或只有在此之后。在一些任何此类实施方案中,所评估的此类参数可以包括生物活性细
胞、非凋亡细胞、健康细胞、特定效力的细胞数量或百分比(或生物活性细胞、非凋亡细胞或健康细胞或给定表型的有效细胞的数量或百分比)和/或指示组合物的效力(如每个细胞的
效力)的度量。在一些实施方案中,使用新的原材料或批次或储存或处理方法确定一个或多
个此类属性的变异性低于某一水平,可以在实施此类新的原材料或批次或储存或处理方法
后减轻毒性风险或反应降低。在一些实施方案中,此类所提供的方法包括在产品释放之前
测定组合物和/或基于此类参数调整给药策略的方法。
[0135] 在一些实施方案中,一种或多种风险或结果(如毒性风险)或适当剂量可能依赖于一种或多种治疗特异性或患者特异性变量,或随一种或多种治疗特异性或患者特异性变量
而变化。例如,在一些实施方案中可能与某些毒性(包括神经毒性或脑水肿或其等级)的风
险相关的示例性临床和患者属性包括患者健康或年龄(例如,患者是否大于或小于或等于
30岁年龄)、先前治疗史(包括先前治疗的次数和/或患者在治疗前是否已接受淋巴细胞清
除和/或维持化学疗法,如包括氟达拉滨的一种)。特别地,可能增加在给予细胞疗法(例如
CAR-T细胞疗法)的一定剂量的细胞后发生毒性的风险、相对风险和/或可能性的此类患者
或临床属性包括例如较少的先前疗法(如两种或更少的先前疗法)、年龄小(例如小于30岁
的年龄)、患者单采术样品中CD4+与CD8+ T细胞的比率、或由于基于体重的细胞给药而给予
至受试者的细胞数量(例如将更多的细胞给予至体重更大的受试者)。此类属性可能影响从
受试者产生的工程化细胞组合物的所得属性和/或影响在输注时可能促成在给予细胞疗法
(例如CAR T细胞)后发生毒性的风险的患者因素。提供了降低在一个或多个此类患者特异
性或治疗属性方面具有变异性的患者中的结果和/或毒性风险的变异性的途径。还提供了
在确定或配制或向一个或多个患者给予一定剂量的细胞疗法中考虑此类患者特异性或治
疗特异性属性的途径。
[0136] 在一些实施方案中,所提供的途径如给予方法和剂量包括(或包括给予)在给予至如下受试者的剂量中较少的细胞或较少的生物活性或有效细胞(或工程化细胞),所述受试
者更健康的、更年轻(例如小于30岁年龄)、已经具有较少先前疗法(例如两种或更少的先前
疗法)、或已经进行某种先前治疗(如淋巴细胞清除疗法或化学疗法,如包括氟达拉滨的一
种)和/或移植。在其他实施方案中,过程或给药途径的属性考虑了此类患者特异性因素的
变异性,例如,使得此类患者特异性因素不会导致或不会实质导致毒性或其他风险的变异
性。在一些实施方案中,所提供的方法实施单调的剂量,例如,CAR+细胞的总数、CAR+CD8+ T细胞和/或CAR+/CD4+ T细胞的总数,例如向所治疗的一组受试者(包括体重可变的受试者)
中的每一个给予精确或固定剂量的此类细胞类型。在一些方面,如果疗法是自体的,则患者
特异性变量与给药有关,使得患者细胞的特性将与组合物中的细胞的健康或功能或适合度
有关。
[0137] 在一些方面,某些患者或临床因素可以放大所给予的细胞疗法的细胞在给予疗法的受试者内的扩增,这在一些情况下可能影响(如增加)在给予细胞疗法后发生毒性(例如
神经毒性)的风险、相对风险或可能性,或者与在给予细胞疗法后发生毒性(例如神经毒性)
的风险、相对风险或可能性相关、或与在给予细胞疗法后发生毒性(例如神经毒性)的风险、
相对风险或可能性的增加相关。在一些实施方案中,与发生毒性(如神经毒性或脑水肿)的
风险相关的患者或临床因素,包括疾病类型(例如ALL);疾病负荷(例如,如通过体积量度或
炎性标记的存在确定的);受试者是否接受先前的桥接化学疗法或淋巴细胞清除疗法,如涉
及氟达拉滨(Flu)或环磷酰胺和氟达拉滨(CY/Flu);例如在开始给予细胞疗法后的2、3、4、
5、6或7天内,在血液中的峰值早期重组受体(例如CAR)-T细胞扩增;和/或如在开始给予细
胞疗法后的2、3、4、5、6或7天内,在血液或血清中存在IL-15的峰值水平,如大于或等于
30pg/mL。在一些实施方案中,所提供的途径(如所提供的过程和/或给药策略,如用于控制
剂量和/或变异性的途径)可以最小化或降低此类风险和/或最小化患者或临床因素对此类
风险或结果的影响。此类途径包括其中在调整或确定对此类受试者的剂量中考虑此类因素
的那些、以及其中使用使此类因素对毒性风险或结果的影响最小化的过程或剂量的属性的
那些。
[0138] 在一些实施方案中,所提供的组合物、剂量和方法的优点在于它们限制了给予至单独受试者的细胞的剂量的变异性、观察到与不良事件(如毒性,如神经毒性,包括严重形
式的神经毒性和/或脑水肿)相关的因素的变异性。在一些方面,通过考虑或校正这种变异
性的剂量或剂量确定途径(例如,基于展现出已知与不良事件相关的特性的细胞的数量或
细胞的表型进行给药)来限制或降低这种变异性。在一些方面,通过使用考虑这种变异性的
释放测定来限制变异性。在一些实施方案中,除了工程化T细胞的数量之外,剂量和/或产品
释放进一步基于重要度量的组合中的一个或多个。在一些方面,此类度量包括指示存活细
胞具有生物活性或健康(例如,未死亡程序化)的程度的参数,所述程度在一些方面是基于
不存在可检测的凋亡标记和/或基于如与死亡的或凋亡的细胞相比相对低水平的某些因子
的细胞内产生来确定。在一些方面,度量包括工程化CD8+细胞的频率,而不是仅考虑工程化
T细胞作为整体的数量和/或CD4:CD8细胞在工程化细胞中的比率。在一些方面,度量包括指
示在组合物中存在的抗原特异性或细胞特异性活性的程度的参数,例如在组合物中的细胞
能够发挥某些活性或功能(例如响应于抗原特异性或细胞特异性刺激而分泌某些因子(如
促炎性细胞因子))的程度的量度。
[0139] 在一些实施方案中,剂量是基于生物活性的工程化T细胞的数量;在一些方面,生物活性是指未被程序化以经历细胞死亡的细胞特性,例如,非凋亡细胞或未显示进入凋亡
途径的指示的细胞的特性。在一些方面,剂量是基于生物活性的工程化CD8+ T细胞的数量,
和/或,在剂量是基于生物活性的工程化T细胞的总数的情况下,还指定生物活性CD8+工程
化T细胞的上限或阈值数量。
[0140] 在一些实施方案中,确保单位剂量涵盖相对一致数量的生物活性工程化细胞部分地通过如下细胞生产过程来实现,所述细胞生产过程在通过所述过程生产的组合物(包括
从来自许多不同受试者的样品来源的那些,如具有不同特征(如不同年龄、先前疗法的次数
和/或类型、以及其适应症和亚型或严重性或等级)的那些)中展现出低的或低于可接受的
或阈值变异的这种生物活性群体的变异。在一些方面,此类过程产生这种生物活性群体的
如下频率,所述频率在此类多种样品和患者中与通过所述过程生产的多种T细胞组合物中
的所述频率的平均值相比变化不超过20%或不超过10%或不超过5%,和/或与这种平均值
相比变化不超过一个标准偏差,或者在通过所述过程生产的多种T细胞组合物中变化不超
过20%、或不超过10%、或不超过5%。在一些此类方面,考虑到生物活性或非凋亡细胞在此类细胞中的预期频率、和/或在从代表性受试者群体工程化的细胞组合物之间的这种频率
的变异,剂量是基于工程化T细胞或CD8+工程化T细胞的数量(或数量/患者体重或身高或血
液体积)。在一些方面,考虑到这种变异和频率,选择细胞群在剂量中的数量以提供足够的
安全范围,例如以低于阈值。
[0141] 在一些实施方案中,剂量和/或产品释放进一步是基于指示效力的度量,例如提供关于不良事件或毒性风险信息的抗原特异性或细胞特异性活性的特定量度。在一些方面,
这种度量是或包括本文中观察到或所描述的与不良事件(如严重或特定等级的(例如,3级、
延长的3级、4级和/或5级)神经毒性或脑水肿)的风险相关的参数。在一些方面,所述参数指
示炎性细胞因子的和/或TNFα、IFNg、IL-2和IL-10的一种或组合的工程化细胞特异性或抗
原特异性释放。
[0142] 在一些实施方案中,所述途径进一步解释了变异性(例如,在从不同受试者工程化的细胞之间,和/或在所述过程中不同原材料(如激活试剂)的使用)。例如,在一些实施方案
中,将指示细胞特异性活性或效力的参数针对类似量度进行归一化,所述类似量度可以在
此类受试者或过程之间变化,但不预测不良结果。例如,在一些方面,可以将指示细胞特异
性活性的参数(例如,促炎性细胞因子的抗原特异性分泌的量度)针对或相对于另一个参数
(例如不与不希望结果(如严重或一定等级的(例如,3级、延长的3级、4级和/或5级)神经毒
性或脑水肿)相关或不预测所述不希望结果的因子的抗原特异性或细胞特异性释放)进行
归一化。例如,观察到在一些实施方案中,细胞因子如IL-5、IL-13、GM-CSF和IL-6的分泌不与不希望结果相关或不预测所述不希望结果。响应于细胞特异性抗原,尽管在从不同受试
者工程化的细胞之间可能有变化(例如,患者间变异性),但是在此参数中的变异性通常不
与不希望结果(如严重或一定等级的(例如,3级、延长的3级、4级和/或5级)神经毒性或脑水
肿)相关或不预测所述不希望结果的风险。在一些实施方案中,一种或多种此类细胞因子的
分泌可以用作对照因子,如IL-5、IL-13、GM-CSF和IL-6中的两种或更多种的量度的算术平
均值或几何平均值。
[0143] 在一些方面,目前可用的方法不能令人满意地表征治疗性T细胞组合物的安全性和功效。例如,在一些情况下,目前的方法利用较低的阈值释放参数(例如,测量治疗性T细
胞组合物的干扰素-γ释放),其不包括安全上限。在一些情况下,除非满足较低的阈值,否
则治疗性T细胞组合物将不被释放以进一步用作疗法;例如,如果治疗性T细胞组合物在限
定的测定中不释放高于阈值量的细胞因子,则组合物将不被释放用于输注到患者体内。在
一些方面,此类参数可以包括细胞因子释放、细胞毒性颗粒释放和T细胞激活状态的确定
(例如,某一百分比的细胞表达一种或多种激活标记)。在一些方面,目前使用的参数包括
CAR+细胞和/或展现出特定表型的细胞的百分比下限。在一些方法中,有可能的是,尽管可
以通过确保治疗性T细胞组合物具有最小活性(即释放最小量的细胞因子和/或在细胞毒性
测定中以某一水平表现)或表型来控制功效,但是使用类似参数的上限不会确定给予组合
物是否安全。
[0144] 所提供的实施方案是基于以下发现:与治疗性T细胞组合物的功能或活性相关的某些表型和/或参数与在被给予T细胞组合物的受试者中发生毒性(例如严重神经毒性)的
风险相关。在一些方面,发现被给予的细胞的适合性是与毒性风险相关的特征。在一些实施
方案中,给予至受试者的具有指示生物活性的表型的细胞(如不具有凋亡表型和/或具有不
展现出指示凋亡的参数(例如指示早期或晚期凋亡的参数,如通过膜联蛋白V检测到)的表
型和/或产生某些细胞因子(例如促炎性细胞因子)的细胞)的数量或剂量可能与毒性的风
险相关。在一些方面,接受较高的细胞总数(如基于总的CD3+CAR+细胞或CD8+CAR+细胞或其
亚组)的受试者可能比接受较少的此类细胞总数的受试者具有更大的发生严重毒性的风
险。在一些情况下,未考虑具有此类特征的总细胞的数量和/或其中在一组被治疗的受试者
中所给予的细胞的表型或功能具有高度变异性的某些给药方案在某些方面可能导致在被
治疗的受试者中发生总体毒性风险。
[0145] 在一些方面,发现展现出这样的表型的所给予的细胞的较低总剂量可能是合乎需要的,例如,以改善或最小化毒性的风险。然而,尽管细胞的此类特征可能影响在被给予细
胞的受试者中的毒性风险,但是给予太少的此类细胞可能降低治疗性组合物的功效。为了
解释功效,常见的是在给药方法中设定细胞组合物的效力下限(如基于细胞溶解活性、细胞
因子或与治疗性T细胞组合物相关的其他因子的产生),例如以确保将足够的细胞给予至受
试者以实现效果。然而,本文描述的研究表明,如果此类细胞展现出高水平的抗原特异性活
性或功能,给予一定剂量的细胞(包括固定剂量的细胞)的其中仅满足了较低水平的效力或
功能的给药方法可能正在使受试者处于毒性的风险中。
[0146] 基于本文的发现,提供了方法、组合物和制品,其中细胞的单位剂量是基于两种功能:(A)某种表型(如指示生物活性的表型)的细胞数量、和(B)指示在组合物中的重组受体
依赖性活性和/或抗原特异性活性或与其相关的参数的值。在本文的别处(包括在实施例
中)描述了在本文中发现是A或B的指示物的示例性变量。在一些实施方案中,功能B(如抗原
特异性细胞因子(例如促炎性细胞因子)产生或积累)是通常可以在由源自受试者的细胞产
生的T细胞组合物中相异和/或是可变的一种,包括例如由于受试者的特定疾病或病症、受
试者的年龄、受试者的体重、先前的治疗、以及可能改变或影响T细胞的一个或多个功能属
性的其他因素引起的患者特异性风险因素。
[0147] 在一些实施方案中,发现B是治疗性T细胞组合物的安全性的指示物。在一些情况下,如果B太高了,应给予较低剂量的细胞以降低或最小化毒性(如严重神经毒性)的风险。
在一些情况下,如果B低于阈值水平或极限,则可以给予的剂量可以有更大的窗口,使得可
以将细胞的目标剂量给予至受试者,而没有已知的发生毒性的风险或不良事件(如严重毒
性)的风险。在一些方面,控制或调整被给予的治疗性T细胞组合物中的总细胞或特定表型
(例如CD3+CAR+或CD8+CAR+或膜联蛋白V-CD8+CAR+)的总细胞的数量可以标准化或调节所
给予的T细胞组合物在所治疗的受试者中的总活性单位,从而考虑了在从一组受试者来源
的T细胞组合物中的T细胞之间的B的功能或活性差异,所述功能或活性差异否则可能已经
导致在一些受试者中发生毒性(例如严重毒性)的风险。
[0148] 在一些实施方案中,B(其是重组受体依赖性(例如CAR依赖性)如抗原特异性活性的参数的值)可以为T细胞组合物提供效力控制。在一些方面,基于B的T细胞功能的效力测
定可以提供优于现有方法的优点。首先,在一些方面,用于细胞组合物的现有效力测定依赖
于与细胞的功效相关的特征,例如细胞溶解活性和/或IFN-γ产生,而不是安全性。此外,此类效力测定通常仅具有在所述测定内的效力的下限或较低水平。
[0149] 基于本文的发现,所提供的实施方案包括效力测定,如其中存在规格下限(LSL)和/或规格上限(USL)的那些。在一些方面,USL是基于参数B。在一些方面,USL提供T细胞组
合物的安全性检查,例如结合在将组合物给予至受试者之前的释放测定。如上所述,各种临
床标准和其他患者特异性特征可以影响工程化细胞的功能的程度或范围。同样地,在一些
情况下,结合制造或工程化细胞组合物使用的和/或在冷冻通过细胞过程生产的细胞中的
整个过程(包括试剂)也可能导致使用相同过程生产的多种T细胞组合物之间的B的变异性。
在一些情况下,发现低于小于15x 106个细胞/mL的密度冷冻细胞可以导致T细胞组合物的
变异性增加和/或效力降低。在一些实施方案中,所提供的方法特别有利于评估如下细胞组
合物,其中具有某种表型(如下面描述的表型A,包括指示生物活性的表型,例如膜联蛋白V-
CD8+CAR+)的细胞的变异性在通过所述过程生产的多种T细胞组合物之间或与通过所述过
程生产的多种T细胞组合物中的表型的频率的平均值相比变化或可能变化超过20%、超过
30%、超过40%、超过50%或更多,和/或与这种平均值相比变化或可能变化不超过一个标
准偏差。
[0150] 在所提供的方法和剂量的一些实施方案中,细胞通过设计用于使因子(如本文中观察到与神经毒性的风险相关(单独或组合)的那些)的变异性最小化的过程来生产。在此
类实施方案的一些方面,给药可以是基于工程化细胞或工程化T细胞或T细胞群的总数量或
相对数量,而不增加当使用此类参数更具可变性的过程生产细胞时可能存在的毒性的风
险。在一些方面,此类过程包括使用慢病毒载体、定义的T细胞亚组(如CD4和/或CD8细胞)的
比率。在一些方面,它们包括将包括CAR的细胞工程化,所述CAR具有41BB衍生的共刺激结构
域而不是CD28结构域。在一些方面,所述过程包括受控的T细胞亚组、细胞因子和试剂的比
率(以允许控制表型、功能和代谢状态),和/或在给予之前在样品的冷冻保存、储存和/或解
冻期间受控的且相对较高的总细胞密度(如在1000万与6000万之间或在1500万与6000万之
间个细胞/mL(每个都包含端值))。在一些方面,使用其中更容易控制T细胞的代谢和功能特
性的过程。在一些实施方案中,此类过程用于,甚至在可能影响细胞健康的患者特异性变量
的背景下,提供一致剂量的生物活性细胞。
[0151] 实施方案包括其中过程生产生物活性或健康细胞在CD8+CAR+细胞中更高频率(如通过使用所述过程产生的样品中的各种凋亡标记的阴性所测量的)的那些。在一些方面,在
来自不同受试者的通过所述过程生产的样品之间所述参数的变异程度较低。如本文所观察
到的,此类细胞的数量可能与5级神经毒性和脑水肿相关,然而CD3+CAR+存活细胞(不考虑
凋亡状态与生物活性细胞)可能并不总是预测毒性或清楚地限定关于此风险的安全边界
[0152] 在一些实施方案中,使用此类生物活性细胞在工程化细胞中的频率的变异性降低的过程降低了当基于工程化T细胞数量作为整体给药时,某些患者(如具有如所描述的患者
特异性风险因素的那些(例如具有较不倾向于细胞凋亡或是更健康的细胞的那些))将被无
意给予比生物活性细胞的预期剂量更高的剂量的风险。已经进一步观察到对表型和功能具
有更大程度的控制的过程降低了通过所述过程生产的细胞以抗原特异性方式产生炎性细
胞因子的能力的变异性程度。本文中的结果与如下解释是一致的:特别是当与生物活性工
程化细胞的数量组合时,考虑此类细胞特异性活性参数的给药策略(例如,在给定剂量中表
现这种活性的特定目标范围-或不超过阈值)可以用于提供如下剂量,所述剂量能够实现所
希望的临床或治疗结果,同时仍在安全范围内或降低不希望的毒性(例如神经毒性)的风
险。
[0153] 在一些实施方案中,使用始终产生较高频率的生物活性工程化细胞的过程允许使用如与其他给药策略(其中较高频率的工程化细胞呈凋亡标记阳性或者以其他方式较不健
康)相比远远更低(从工程化(例如CAR+)细胞的数量的角度来看)的细胞剂量。例如,基于本
文中的观察结果并且考虑到可用的给药策略通常未考虑凋亡细胞的频率的观察结果,在一
些实施方案中,工程化(例如,CAR+)T细胞(例如,工程化CD8+和/或CD4+细胞)的数量低至
500万、1000万、1100万、1200万、1300万、1400万、1500万、1600万、1700万、1800万、1900万、
2000万、3000万、4000万或5000万个细胞。
[0154] 所提供的方法提供了释放测定,所述释放测定可以监测或评估细胞组合物,以确定如果将所述组合物给予至受试者,这是否有可能与发生毒性(如严重神经毒性)的风险相
关。在一些实施方案中,如果B高于USL,则推荐不将T细胞组合物给予至受试者和/或改变或
调整待给予至受试者的单位剂量。如果B低于USL,则可以释放产品用于治疗。在一些实施方
案中,评估B是否高于LSL和/或低于USL还可以提供关于先前被给予T细胞组合物的受试者
是否具有发生毒性(如严重毒性)的风险的信息。在一些实施方案中,在对B评估之后进行对
给予至受试者的T细胞组合物的样品的评估。在一些实施方案中,如果B等于或高于USL,则
被给予T细胞组合物的受试者被确定具有发生毒性(如严重神经毒性)的风险。在此类实施
方案中,监测被给予组合物的受试者和/或用药剂治疗被给予组合物的受试者,以在给予细
胞组合物之后和任选地在发生毒性结果的体征或症状之前改善或降低毒性结果(如神经毒
性)或细胞因子释放综合征的可能性。
[0155] 在一些方面,所提供的实施方案是基于以下观察结果:过继细胞疗法的功效可能受到被给予此类细胞的受试者中的毒性发生的限制,所述毒性在一些情况下可能是严重
的。例如,在一些情况下,给予一定剂量的表达重组受体(例如CAR)的细胞可能导致毒性或
其风险,如CRS或神经毒性。在一些情况下,虽然较高剂量的此类细胞可以增加治疗的功效
(例如,通过增加对细胞的暴露,例如通过促进扩增和/或持久性),但是它们也可能导致甚
至更高的发生毒性或更严重毒性的风险。而且,在一些情况下,具有较高疾病负荷的受试者
也可能具有更高的发生毒性或更严重毒性的风险。
[0156] 用于治疗或改善毒性的某些可用的方法可能并不总是完全令人满意。许多此类途径集中于例如靶向毒性的下游效应(如通过细胞因子阻断),和/或递送药剂如高剂量类固
醇,所述药剂也可能消除或损害所给予的细胞的功能。另外地,此类途径通常涉及仅在检测
到毒性的体征或症状时才给予此类干预,所述毒性的体征或症状通常包括中等或严重毒性
(例如中等或严重CRS)的体征或症状。这些其他途径中的许多也不防止可能与过继细胞疗
法相关的其他形式的毒性如神经毒性。在一些情况下,这是在此类症状是严重的时候,并且
因此可能需要甚至更严厉或更极端的治疗(例如更高的剂量或增加的给予频率)来改善或
治疗所述毒性。
[0157] 某些替代性途径的使用不会为此类问题提供满意的解决方案。在一些情况下,此类药剂和疗法(例如类固醇)它们本身与毒性副作用相关。在较高剂量或频率(其中需要给
予所述药剂或疗法或用所述药剂或疗法治疗以便治疗或改善可能由细胞疗法引起的毒性
的严重性)下,此类副作用可能甚至更大。此外,在一些情况下,认为用于治疗毒性的药剂或疗法可能限制细胞疗法的功效,如作为细胞疗法的一部分提供的在细胞上表达的嵌合受体
(例如CAR)的功效(Sentman(2013)Immunotherapy,5:10)。
[0158] 所提供的实施方案提供如下的优势:在被给予治疗性T细胞组合物的受试者中处理或解决毒性(如严重神经毒性)的风险。在一些实施方案中,通过所提供的实施方案(其中
通过对受试者的给药来评估和/或调整组合物的安全性特征)降低或防止受试者发生毒性
(如严重神经毒性)的可能性。在一些实施方案中,通过在释放用于给予至受试者之前监测
或评估治疗性T细胞组合物的安全性和/或通过给予细胞的单位剂量(其含有不超过细胞的
目标剂量或等于或不超过目标数量的参考单位(RU)的细胞)来降低或防止受试者发生毒性
(如严重毒性)的可能性。
[0159] 在一些实施方案中,例如,与其他方法(其中尚未在安全性控制的测定中对治疗性T细胞组合物进行评估,和/或其中尚未根据考虑了A和B的所提供的给药配方和/或以目标
数量的治疗性T细胞组合物的RU(如少于阈值数量的RU)给药或以目标数量的细胞或在给定
目标范围内的细胞数量给药来向受试者给予治疗性T组合物)相比,所提供的实施方案被设
计成导致以下项或包括导致以下项的特征:较低程度的毒性、毒性结果或症状、毒性促进特
征、因子或特性(如与细胞因子释放综合征(CRS)或神经毒性相关或指示细胞因子释放综合
征(CRS)或神经毒性的症状或结果)或较低程度的其风险。
[0160] 毒性和毒性结果
[0161] 在一些方面,疗法(如细胞疗法)的毒性结果是细胞因子释放综合征(CRS)或严重CRS(sCRS)或与细胞因子释放综合征(CRS)或严重CRS(sCRS)相关或指示细胞因子释放综合
征(CRS)或严重CRS(sCRS)。在一些情况下,在过继T细胞疗法和向受试者给予其他生物制品
后可发生CRS,例如sCRS。参见Davila等人,Sci Transl Med 6,224ra25(2014);Brentjens
等人,Sci.Transl.Med.5,177ra38(2013);Grupp等人,N.Engl.J.Med.368,1509-1518
(2013);和Kochenderfer等人,Blood 119,2709-2720(2012);Xu等人,Cancer Letters 343
(2014)172-78。
[0162] 通常,CRS由例如通过T细胞、B细胞、NK细胞、单核细胞和/或巨噬细胞介导的过度的全身免疫应答引起。这种细胞可释放大量炎症介质如细胞因子和趋化因子。细胞因子可
能触发急性炎症应答和/或诱导内皮器官损伤,所述内皮器官损伤可能导致微血管渗漏、心
力衰竭或死亡。严重危及生命的CRS可导致浸润和肺损伤、肾衰竭或弥散性血管内凝血。
其他严重危及生命的毒性可包括心脏毒性、呼吸窘迫、神经毒性和/或肝衰竭。
[0163] CRS的结果、体征和症状是已知的,并且包括本文所述的那些。在一些实施方案中,当特定剂量方案或给药影响或不影响给定的CRS相关的结果、体征或症状时,可指定特定结
果、体征和症状和/或量或程度。
[0164] 在给予表达CAR的细胞的情况下,CRS(如严重CRS)通常在输注表达CAR的细胞之后6-20天发生。参见Xu等人,Cancer Letters 343(2014)172-78。在一些情况下,CRS在CAR T
细胞输注后少于6天或超过20天发生。CRS的发生率和时间可能与在输注时的基线细胞因子
水平或肿瘤负荷有关。通常,CRS包括干扰素(IFN)-γ、肿瘤坏死因子(TNF)-α和/或白细胞
介素(IL)-2的血清水平升高。可在CRS中快速诱导的其他细胞因子是IL-1β、IL-6、IL-8和
IL-10。
[0165] 已经研发CRS标准,其显现与CRS的发作相关,以预测哪些患者更可能具有发生sCRS的风险(参见Davilla等人Science translational medicine.2014;6(224):
224ra25)。因素包括发热、缺、低血压、神经系统改变、升高的炎性细胞因子血清水平,如一组七种细胞因子(IFNγ、IL-5、IL-6、IL-10、Flt-3L、曲动蛋白和GM-CSF),这七种细胞因子的治疗诱导的升高可以与治疗前肿瘤负荷和sCRS症状相关联。关于CRS的诊断和管理的
其他指南是已知的(参见例如,Lee等人,Blood.2014;124(2):188-95)。在一些实施方案中,反映CRS等级的标准是下表1中详述的那些标准。
[0166]
[0167] 在一些实施方案中,受试者被认为响应于或继发于细胞疗法或其一剂细胞的给予而产生“严重CRS”(“sCRS”),条件是给药后所述受试者显示:(1)至少38摄氏度的发热至少三天;(2)细胞因子升高,其包括(a)与紧跟着给药后的水平相比,下列七种细胞因子中至少
两种的最大倍数变化为至少75倍:干扰素γ(IFNγ)、GM-CSF、IL-6、IL-10、Flt-3L、分形趋化因子(fracktalkine)和IL-5和/或(b)与紧跟着给药后的水平相比,下列七种细胞因子中
的至少一种的最大倍数变化为至少250倍:干扰素γ(IFNγ)、GM-CSF、IL-6、IL-10、Flt-3L、分形趋化因子和IL-5;(c)至少一种毒性临床症状如低血压(需要至少一次静脉血管活性加
压药)或缺氧(PO2<90%)或一种或多种神经病症(包括精神状态改变、迟钝和/或癫痫)。在
一些实施方案中,严重CRS包括3级或更高等级的CRS,如表1中所列。
[0168] 在一些实施方案中,与严重CRS或3级CRS或更高等级(如4级或更高等级)相关的结果如表1中所示。在一些实施方案中,这些包括以下一种或多种:持续发热例如指定温度
发热(例如大于38摄氏度或大于约38摄氏度)两天或更多天,例如三天或更多天,例如四天
或更多天或至少连续三天;大于38摄氏度或大于约38摄氏度的发热;与至少两种细胞因子
(例如,下组中的至少两种,该组由以下各项组成:干扰素γ(IFNγ)、GM-CSF、IL-6、IL-10、Flt-3L、分形趋化因子和IL-5和/或肿瘤坏死因子α(TNFα))的治疗前水平相比细胞因子升
高,如最大倍数变化例如至少75倍或至少约75倍,或至少一种这样的细胞因子的最大倍数
变化例如至少250倍或至少约250倍;和/或至少一种毒性临床体征如低血压(例如,如通过
至少一种静脉内血管活性加压器测量的);缺氧(例如,血浆氧(PO2)水平低于90%或低于约
90%);和/或一种或多种神经病症(包括精神状态改变、迟钝和癫痫)。在一些实施方案中,
严重CRS包括需要在重症监护病房(ICU)中进行管理或护理的CRS。
[0169] 在一些实施方案中,严重CRS包括以下的组合:(1)持续发热(至少38摄氏度的发热至少三天)和(2)CRP的血清水平为至少20mg/dL或至少约20mg/dL。在一些实施方案中,严重
CRS包括需要使用两种或更多种血管加压药的低血压或需要机械通气的呼吸衰竭。在一些
实施方案中,在第二次或随后的给予中增加血管加压药的剂量。
[0170] 在一些实施方案中,严重CRS或3级CRS涵盖丙氨酸氨基转移酶的增加、天冬氨酸氨基转移酶的增加、寒战,发热型嗜中性粒细胞减少症、头痛、左心室功能障碍、脑病、脑积水和/或震颤。
[0171] 在一些方面,疗法(如细胞疗法)的毒性结果是神经毒性或严重神经毒性或与神经毒性或严重神经毒性相关或指示神经毒性或严重神经毒性。在一些实施方案中,与神经毒
性的临床风险相关的症状包括意识模糊、谵妄、表达性失语、迟钝、肌阵挛、嗜睡、精神状态改变、惊厥、癫痫样活动、癫痫(任选地通过脑电图[EEG]证实)、升高的β淀粉样蛋白(Aβ)水平,升高的谷氨酸水平和升高的氧自由基水平。在一些实施方案中,基于严重程度对神经毒
性进行分级(例如,使用1-5级量表(参见例如Guido Cavaletti&Paola Marmiroli Nature 
Reviews Neurology 6,657-666(December 2010);美国国家癌症研究所—常见毒性标准第
4.03版(NCI-CTCAE v4.03))。
[0172] 在一些情形中,神经症状可能是sCRS的最早症状。在一些实施方案中,观察到神经症状在细胞疗法输注后5至7天开始。在一些实施方案中,神经系统变化的持续时间可能在3
至19天的范围内。在一些情况下,在sCRS的其他症状消退后,会发生神经变化的恢复。在一
些实施方案中,通过用抗IL-6和/或一种或多种类固醇治疗不会加速神经变化的消退时间
或程度。
[0173] 在一些实施方案中,如本文所用,如果在给药后受试者显示出如下限制自理(例如洗澡、穿衣和脱衣、进食、如厕、服药)的症状,则认为受试者响应于或继发于细胞疗法或其一剂细胞的给予而产生“严重神经毒性”:1)外周运动神经病的症状,包括外周运动神经的
炎症或退化;2)外周感觉神经病的症状,包括外周感觉神经的炎症或退化、感觉迟钝(如感
官知觉失真),导致异常和不愉快的感觉、神经痛(如沿着神经或一组神经的剧烈疼痛感),
和/或感觉异常如感觉神经元的功能性紊乱,导致在没有刺激的情况下刺痛、麻木、压迫、冷和温的异常皮肤感觉。在一些实施方案中,严重神经毒性包括3级或更高等级的神经毒性如
表2中所示。在一些实施方案中,如果3级神经毒性的症状持续10天或更长时间,严重神经毒
性被认为是延长的3级。在一些实施方案中,如果给定等级(如3级或更高等级)毒性的症状
存在或已经存在至少10天或至少约10天或至少11天或至少约11天或至少10-11天或约10-
11天,则毒性(如神经毒性,如3级或4级神经毒性)被认为是延长的神经毒性(例如,延长的3
级神经毒性)。延长的3级神经毒性通常与持续大于或大于平均9天、8天或1周的3级神经毒
性相关。在一些方面,非延长的3级神经毒性通常与不持续大于或大于平均9天、8天或1周或
者在一些情况下少于如6天、5天、4天或3天的3级神经毒性的症状相关。
[0174]
[0175]
[0176] 在一些实施方案中,与其他实施方案或方法相比,所提供的实施方案(包括治疗方法、用途、制品、单位剂量)导致与在细胞疗法后的神经毒性相关的症状减轻。例如,与通过其他方法治疗的受试者相比,根据所提供的方法治疗的受试者可能具有减轻的神经毒性症
状如四肢无力或麻木、丧失记忆、视力和/或智力、无法控制的强迫性和/或强制性行为、妄
想、头痛、认知和行为问题(包括丧失运动控制、认知恶化和自主神经系统功能障碍以及性
功能障碍)。在一些实施方案中,根据所提供的方法治疗的受试者可具有与外周运动神经
病、外周感觉神经病、感觉迟钝、神经痛或感觉异常相关的症状减轻。
[0177] 在一些实施方案中,所述方法减轻与神经毒性相关的结果,包括对神经系统和/或脑的损害,如神经元的死亡。在一些方面,所述方法降低与神经毒性相关的因子的水平,如β淀粉样蛋白(Aβ)、谷氨酸和氧自由基。
[0178] 在一些实施方案中,被给予一个或多个单位剂量的所提供的治疗性T细胞组合物的受试者、或根据所提供的方法被给予释放用于给药的治疗性T细胞组合物的受试者、和/
或根据所提供的方法给药的受试者具有降低的发生严重不良事件的可能性,所述严重不良
事件如至少延长的3级神经毒性,如4级或5级神经毒性。在一些方面,根据所提供的实施方
案治疗的受试者不发生神经毒性,或发生的神经毒性的等级低于如果受试者通过其他方法
或用其他治疗性T细胞组合物(包括未根据所提供的方法进行评估的治疗性T细胞组合物)
治疗的严重性。
[0179] II.细胞组合物的属性
[0180] 本文所提供的方法涉及在治疗性T细胞组合物中的细胞的属性。在一些实施方案中,单独的或组合的属性与发生不良事件或毒性(如严重毒性,如至少延长的3级毒性或4级
或5级毒性)的风险相关。在一些实施方案中,所述属性是在组合物中的细胞的表型,在本文
中也称为“A”,包括指示细胞或细胞群的生物活性的表型。在一些实施方案中,所述属性是重组受体依赖性活性,如抗原特异性活性,在本文中也称为“B”。在一些实施方案中,结合所提供的方法考虑在T细胞组合物中的细胞的属性A和/或B。在一些方面,结合确定目标数量
的参考单位(RU),如结合提供或给予治疗性T细胞组合物的单位剂量,考虑属性A和B的函
数。在一些方面,将属性B的阈值、或B的较低规格水平(LSL)和较高规格水平(USL)用于如结
合效力测定或释放测定来评估或确定治疗性T细胞组合物的安全性或安全的可能性。提供
了考虑或评估属性A和/或B的各种示例性方法。
[0181] A.细胞组合物的表型
[0182] 在一些实施方案中,表型“A”是一种或多种特定分子的存在或不存在,所述一种或多种特定分子包括可以由T细胞组合物内的细胞或细胞亚群积累或产生的表面分子和/或
分子。在一些实施方案中,表型直接或相反地指示T细胞组合物内的细胞或细胞群的生物活
性。在一些实施方案中,表型可以包括细胞活性,如响应于刺激物而产生因子。在某些实施
方案中,进行细胞组合物的评估以鉴定、检测或定量细胞组合物的表型。在特定实施方案
中,进行细胞组合物的测量以鉴定、检测或定量特定分子的存在、不存在、表达程度或水平。
[0183] 在一些实施方案中,表型指示细胞的存活力。在一些实施方案中,表型指示凋亡的不存在、早期阶段凋亡的不存在或晚期阶段凋亡的不存在。在一些实施方案中,表型是指示
凋亡、早期凋亡或晚期阶段凋亡不存在的因子的不存在。在一些实施方案中,表型是T细胞
的亚群或亚组(如重组受体表达T细胞(例如CAR+ T细胞)或CD8+ T细胞、幼稚T细胞、或记忆
T细胞的某些亚群、或展现记忆干细胞样属性的T细胞)的表型。在一些实施方案中,表型是
未被激活、和/或缺乏一种或多种激活标记的表达或一种或多种激活标记的表达被减少或
很低的细胞的表型。在一些实施方案中,表型是未被消耗和/或缺乏一种或多种消耗标记的
表达或一种或多种消耗标记的表达被减少或很低的细胞的表型。
[0184] 在一些实施方案中,表型通过一种或多种特定分子的存在、不存在或在细胞中的表达水平来指示,所述一种或多种特定分子是例如指示表型的某些表面标记(例如表面蛋
白)、指示表型的细胞内标记、或指示表型的核酸、或指示表型的其他分子或因子。在一些实施方案中,表型是或包含一种或多种特定分子的阳性或阴性表达。在一些实施方案中,特定
分子包括但不限于表面标记(例如,膜糖蛋白或受体)、与凋亡或存活力相关的标记、或指示
免疫细胞状态的特定分子(例如,与激活、消耗或成熟或幼稚表型相关的标记)。在一些实施
方案中,用于基于特定分子评估或测量、计数和/或定量细胞的任何已知方法都可以用于确
定表型的细胞的数量。
[0185] 在一些实施方案中,表型是或包括在细胞中一种或多种特定分子的阳性或阴性表达。在一些实施方案中,阳性表达由细胞中特定分子的可检测量指示。在某些实施方案中,
可检测量是在细胞中特定分子的任何检测量。在特定实施方案中,可检测量是大于在细胞
中的背景(例如背景染色、信号等)的量。在某些实施方案中,阳性表达是大于阈值(例如预
定的阈值)的特定分子的量。同样地,在特定实施方案中,具有特定分子的阴性表达的细胞
可以是未确定具有阳性表达的任何细胞,或者是缺乏可检测量的特定分子或可检测量的特
定分子高于背景的细胞。在一些实施方案中,如果特定分子的量低于阈值,则细胞具有特定
分子的阴性表达。本领域技术人员将理解如何定义阈值来定义特定分子的阳性和/或阴性
表达作为常规技能,并且所述阈值可以根据特定参数(例如但不限于检测的测定或方法、特
定分子的身份、用于检测的试剂和仪器)来定义。
[0186] 可以用于检测特定分子和/或分析细胞表型的方法的例子包括但不限于生化分析;免疫化学分析;图像分析;细胞形态学分析;分子分析如PCR、测序、DNA甲基化的确定;蛋白质组学分析,如蛋白质糖基化和/或磷酸化模式的确定;基因组学分析;表观基因组学分
析;转录组学分析;及其任何组合。在一些实施方案中,通过图像分析、PCR(包括PCR的标准和所有变体)、微阵列(包括但不限于DNA微阵列、用于microRNA的MMchips、蛋白质微阵列、
细胞微阵列、抗体微阵列和碳水化合物阵列)、测序、生物标记检测或用于确定DNA甲基化或
蛋白质糖基化模式的方法来分析表型的分子特征。在特定实施方案中,特定分子是多肽,即
蛋白质。在一些实施方案中,特定分子是多核苷酸。
[0187] 在一些实施方案中,通过将细胞与一种或多种抗体或其他结合剂一起孵育来确定特定分子的阳性或阴性表达,所述一种或多种抗体或其他结合剂与分别在阳性或阴性选择
的细胞上表达(标记+)或以相对较高水平表达(标记高)的一种或多种表面标记特异性地结
合。在特定实施方案中,阳性或阴性表达通过流式细胞术、免疫组织化学或用于检测特异性
标记的任何其他合适的方法来确定。
[0188] 在特定实施方案中,用流式细胞术来评估特定分子的表达。流式细胞术是通过将细胞悬浮在流体流中并通过电子检测仪器传递它们,用于细胞计数、细胞分选、生物标记检
测和蛋白质工程的基于激光或基于阻抗的生物物理学技术。它允许每秒高达数千个粒子的
物理和化学特征的同时多参数分析。
[0189] 可以将由流式细胞仪产生的数据在单个维度上绘制以产生直方图,或者在二维点图中或甚至在三维中绘制。可以基于荧光强度,通过创建一系列子集提取(称为“”)将这
些图上的区域依次分开。存在用于诊断和临床目的(尤其是与免疫学有关的)的特定门控方
案。通常以对数标度制作图。因为不同的荧光染料的发射光谱重叠,所以检测器处的信号必
须以电子方式以及计算方式进行补偿。使用流式细胞仪累积的数据可以使用软件进行分
析,所述软件是例如JMP(统计软件)、WinMDI[10]、Flowing Software[11]和web-based 
Cytobank[12])、Cellcion、FCS Express、FlowJo、FACSDiva、CytoPaint(aka Paint-A-
Gate)[13]、VenturiOne、CellQuest Pro、Infinicyt或Cytospec。
[0190] 流式细胞术是本领域的标准技术,并且技术人员将容易地理解如何设计或定制方案来检测一种或多种特定分子并分析数据以确定一种或多种特定分子在细胞群中的表达。
用于流式细胞术的标准方案和技术发现于Loyd“Flow Cytometry in Microbiology;
Practical Flow Cytometry by Howard M.Shapiro;Flow Cytometry for Biotechnology 
by Larry A.Sklar;Handbook of Flow Cytometry Methods by J.Paul Robinson等人;
Current Protocols in Cytometry,Wiley-Liss Pub,Flow Cytometry in Clinical 
Diagnosis,v4,(Carey、McCoy、和Keren编),ASCP Press,2007;Ormerod,M.G.(编辑)(2000)
Flow Cytometry-A practical approach.第3版.Oxford University Press,Oxford,UK;
Ormerod,M.G.(1999)Flow Cytometry.第2版.BIOS Scientific Publishers,Oxford.;以
及Flow Cytometry-A basic introduction.Michael G.Ormerod,2008中。
[0191] 在一些实施方案中,将细胞通过表型分选以进行进一步分析。在一些实施方案中,通过荧光激活的细胞分选(FACS)对在相同细胞组合物内的不同表型的细胞进行分选。FACS
是一种特殊类型的流式细胞术,其允许基于每个细胞的特定光散射和荧光特征,将细胞的
异质混合物分选到两个或更多个容器中,每次一个细胞。它是有用的科学仪器,因为它提供
来自单独细胞的荧光信号以及特别感兴趣的细胞的物理分离的快速、客观和定量记录。
[0192] 在一些实施方案中,表型包括总T细胞的数量或总CD3+ T细胞的数量。在特定实施方案中,T细胞组合物,例如含有表达重组受体或CAR的细胞的治疗性T细胞组合物,可以包
括T细胞的一种或多种不同的亚型。在一些实施方案中,表型是或包括T细胞亚型的身份。T
细胞的不同的群体或亚型包括但不限于效应T细胞、辅助T细胞、记忆T细胞、调节性T细胞、
CD4+ T细胞、和CD8+ T细胞。在某些实施方案中,可以通过检测特定分子的存在或不存在来
鉴定T细胞亚型。在某些实施方案中,特定分子是可以用于鉴定T细胞亚型的表面标记。
[0193] 在一些实施方案中,表型是一种或多种特定分子的阳性或高水平表达,所述一种或多种特定分子是表面标记,例如CD3、CD4、CD8、CD28、CD62L、CCR7、CD27、CD127、CD45RA、和/或CD45RO。在某些实施方案中,表型是T细胞的或T细胞的亚群或亚组的表面标记,例如
基于一种或多种表面标记(例如,CD3+、CD4+、CD8+、CD28+、CD62L+、CCR7+、CD27+、CD127+、CD4+ + + +
、CD8、CD45RA、和/或CD45RO)的阳性表面标记表达。
[0194] 在某些实施方案中,表面标记指示重组受体(例如CAR)的表达。在特定实施方案中,表面标记是重组受体(例如CAR)的表达,其在一些方面可以使用抗体(如抗独特型抗体)
来确定。在一些实施方案中,指示重组受体的表达的表面标记是替代标记。在一些实施方案
中,替代标记是经制备在细胞表面上与重组受体(例如,CAR)共表达的蛋白质。在特定实施
方案中,这种替代标记是已经修饰以具有极少或无活性的表面蛋白。在某些实施方案中,在
编码用于转导的重组受体的相同多核苷酸上编码替代标记。替代标记的非限制性例子包括
但不限于截短的EGFR(EGFRt)、截短的HER2(tHER2)或前列腺特异性膜抗原(PSMA)或其修饰
形式。在一些方面,标记(例如替代标记)包括CD34的全部或部分(例如,截短形式)、NGFR、
CD19或截短的CD19(例如,截短的非人CD19)或表皮生长因子受体(例如,tEGFR)。在某些实
施方案中,具有可检测量的CAR的细胞具有是或包括CAR+的表型。在特定实施方案中,具有
可检测量的替代标记的细胞具有是或包括CAR+的表型。
[0195] 在某些实施方案中,表型包括表面标记CD3、CD4、CD8中的一种或多种、和/或重组受体(例如CAR)或其指示重组受体(例如CAR)的表达或与重组受体(例如CAR)的表达相关的
替代标记的表达(例如表面表达)。
[0196] 在特定实施方案中,通过一种或多种特定分子的表达来鉴定表型,所述一种或多种特定分子是表面标记。在某些实施方案中,表型是或包括CD3、CD4、CD8和/或重组受体(例如CAR)的阳性或阴性表达。在某些实施方案中,重组受体是CAR。在特定实施方案中,表型包括CD3+/CAR+、CD4+/CAR+和/或CD8+/CAR+。
[0197] 在一些实施方案中,表型是存活力。在某些实施方案中,表型是标记的阳性表达,所述标记指示细胞经历正常功能性细胞过程和/或尚未经历坏死或程序性细胞死亡或不在
经历坏死或程序性细胞死亡的过程下。在一些实施方案中,可以通过细胞的氧化还原电位、
细胞膜的完整性或线粒体的活性或功能来评估存活力。在一些实施方案中,存活力是与细
胞死亡相关的特定分子的不存在、或在测定中细胞死亡的指示的不存在。
[0198] 在一些实施方案中,表型是或包含细胞存活力。在某些实施方案中,可以通过在本领域中常规的许多手段来检测、测量和/或评估细胞的存活力。此类存活力测定的非限制性
例子包括但不限于染料摄取测定(例如,黄绿素AM测定)、XTT细胞存活力测定、和染料排
除测定(例如,台盼蓝、伊红或丙啶染料排除测定)。存活力测定可用于确定细胞剂量、细胞
组合物和/或细胞样品中的存活细胞的数量或百分比(例如,频率)。在特定实施方案中,表
型包括细胞存活力以及其他特征(例如,重组受体表达)。
[0199] 在某些实施方案中,表型是或包括细胞存活力、存活的CD3+、存活CD4+、存活CD8+、存活CD3+/CAR+、存活CD4+/CAR+、存活CD8+/CAR+或其组合。
[0200] 在特定实施方案中,表型是或包括凋亡的不存在和/或细胞正在经历凋亡过程的指示。凋亡是程序性细胞死亡的过程,所述过程包括导致特征性细胞变化和死亡的一系列
定型的形态学和生物化学事件。这些变化包括起泡、细胞皱缩、核碎裂、染色质浓缩、染色体DNA片段化、和全局mRNA衰变。凋亡是一种充分表征的过程,并且与各个阶段相关的特定分
子在本领域中是熟知的。
[0201] 在一些实施方案中,表型是早期阶段凋亡的不存在、和/或与早期阶段凋亡相关的指示物和/或特定分子的不存在。在凋亡的早期阶段,细胞和线粒体膜的变化变得明显。在
细胞的细胞质和细胞核中生物化学变化也很明显。例如,凋亡的早期阶段可以通过某些半
胱天冬酶(例如,2、8、9和10)的激活来指示。在特定实施方案中,表型是晚期阶段凋亡的促存在、和/或与晚期阶段凋亡相关的指示物和/或特定分子的不存在。凋亡的中期至晚期阶
段的特征在于膜完整性的进一步丧失、染色质浓缩和DNA片段化,包括生物化学事件如半胱
天冬酶3、6和7的激活。
[0202] 在特定实施方案中,表型是与程序性细胞死亡相关的一种或多种因子的阴性表达。在某些实施方案中,表型是与凋亡相关的一种或多种因子的阴性表达,所述一种或多种
因子包括已知启动凋亡的促凋亡因子,例如死亡受体途径的成员、线粒体(内在)途径的激
活成员,如Bcl-2家族成员(例如Bax、Bad和Bid)以及半胱天冬酶。在一些实施方案中,表型
是阴性或低量的凋亡标记。在某些实施方案中,表型是凋亡标记的阴性表达。在某些实施方
案中,表型是不存在指示物,例如膜联蛋白V分子,其当与细胞组合物一起孵育或接触细胞
组合物时优先结合经历凋亡的细胞。在一些实施方案中,表型是或包括指示细胞中的凋亡
状态的一种或多种标记的表达。
[0203] 在一些实施方案中,表型是特定分子的阴性(或低)表达,所述特定分子是凋亡的标记。各种凋亡标记对本领域普通技术人员而言是已知的,并且包括但不限于一种或多种
半胱天冬酶(即激活的半胱天冬酶)的活性的增加、PARP切割的增加、Bcl-2家族蛋白(细胞
死亡途径的成员(例如Fas和FADD))的激活和/或转位、核皱缩的存在(例如,通过显微镜
测)和染色体DNA片段化的存在(例如,染色体DNA梯的存在),如用凋亡测定(包括TUNEL染色
和膜联蛋白V染色)检测的。
[0204] 半胱天冬酶是在天冬氨酸残基之后切割蛋白质的酶,所述术语源自“半胱氨酸-天冬氨酸蛋白酶”。半胱天冬酶参与凋亡,因此半胱天冬酶(如半胱天冬酶-3)的激活指示凋亡
的增加或复苏。在某些实施方案中,可以通过普通技术人员已知的方法来检测半胱天冬酶
激活。在一些实施方案中,与激活的半胱天冬酶特异性结合(即,与切割过的多肽特异性结
合)的抗体可以用于检测半胱天冬酶激活。在另一个例子中,半胱天冬酶活性的荧光色素抑
制剂(FLICA)测定可以用于通过检测半胱天冬酶-3对乙酰基Asp-Glu-Val-Asp7-酰胺基-4-
甲基香豆素(Ac-DEVD-AMC)的水解(即检测荧光的7-氨基-4-甲基香豆素(AMC)的释放)来检
测半胱天冬酶-3激活。FLICA测定可以用于通过检测由多种半胱天冬酶处理的底物的产物
来确定半胱天冬酶激活(例如,FAM-VAD-FMK FLICA)。其他技术包括使用激活发光的半胱天
冬酶-8四肽底物(Z-LETD-氨基萤光素)、半胱天冬酶-9四肽底物(Z-LEHD-氨基萤光素)、半
胱天冬酶-3/7底物(Z-DEVD-氨基萤光素)、半胱天冬酶-6底物(Z-VEID-氨基萤光素)或半胱
天冬酶-2底物(Z-VDVAD-氨基萤光素)的The 半胱天冬酶测定
(PROMEGA)。
[0205] 在某些实施方案中,表型是或包括活性半胱天冬酶-1、活性半胱天冬酶-2、活性半胱天冬酶-3、活性半胱天冬酶-7、活性半胱天冬酶-8、活性半胱天冬酶-9、活性半胱天冬酶-
10和/或活性半胱天冬酶-13在细胞中的阴性表达。在特定实施方案中,表型是或包括活性
半胱天冬酶3-。在一些实施方案中,半胱天冬酶的前体形式(酶原切割形式),如上述任何形
式,也是指示凋亡存在的标记。在一些实施方案中,表型是或包括半胱天冬酶的前体形式
(如半胱天冬酶-3的前体形式)的不存在或阴性表达。
[0206] 在一些实施方案中,凋亡标记是切割的聚ADP-核糖聚合酶1(PARP)。PARP在凋亡的早期阶段被半胱天冬酶切割。因此,切割的PARP肽的检测是凋亡的标记。在特定实施方案
中,表型是或包括切割的PARP的阳性或阴性表达。
[0207] 在一些实施方案中,凋亡标记是检测与凋亡相关的细胞中的特征的试剂。在某些实施方案中,试剂是膜联蛋白V分子。在凋亡的早期阶段中,脂质磷脂酰丝氨酸(PS)从质膜
的内部小叶转位到外部小叶。PS通常受限于健康和/或非凋亡细胞中的内膜。膜联蛋白V是
一种以高亲和力优先结合磷脂酰丝氨酸(PS)的蛋白质。当与荧光标签或其他报告基因缀合
时,膜联蛋白V可以用于快速检测凋亡的这种早期细胞表面指示物。在一些实施方案中,PS
在外膜上的存在将持续到凋亡的晚期阶段。因此,在一些实施方案中,膜联蛋白V染色是凋
亡的早期和晚期阶段的指示。在某些实施方案中,将膜联蛋白(例如膜联蛋白V)用可检测的
标记进行标记,并且与在细胞组合物中的细胞一起孵育、暴露于在细胞组合物中的细胞和/
或与在细胞组合物中的细胞接触,以例如通过流式细胞术检测正在经历凋亡的细胞。在一
些实施方案中,将荧光标记的膜联蛋白(例如膜联蛋白V)用于将细胞染色供流式细胞术分
析(例如用膜联蛋白-V/7-AAD测定)。适合于用膜联蛋白进行凋亡检测的替代性方案包括利
放射性标记的膜联蛋白V的技术和测定。在某些实施方案中,表型是或包括膜联蛋白的阴
性染色,例如膜联蛋白V-。在特定实施方案中,表型是或包括外部质膜上PS的不存在。在某
些实施方案中,表型是或包括不被膜联蛋白(例如膜联蛋白V)结合的细胞。在某些实施方案
中,在外膜上缺乏可检测的PS的细胞是膜联蛋白V-的。在特定实施方案中,在与标记的膜联
蛋白V孵育之后在测定(例如流式细胞术)中未被膜联蛋白V-结合的细胞是膜联蛋白V-的。
[0208] 在特定实施方案中,表型是膜联蛋白V-、膜联蛋白V-CD3+、膜联蛋白V-CD4+、膜联蛋白V-CD8+、膜联蛋白V-CD3+/CAR+、膜联蛋白V-CD4+/CAR+、膜联蛋白V-CD8+/CAR+、激活的半胱天冬酶3-、激活的半胱天冬酶3-/CD3+、激活的半胱天冬酶3-/CD4+、激活的半胱天冬酶
3-/CD8+、激活的半胱天冬酶3-/CD3+/CAR+、激活的半胱天冬酶3-/CD4+/CAR+、激活的半胱
天冬酶3-/CD8+/CAR+、或其组合。
[0209] 特定实施方案预期呈凋亡标记表达阳性的细胞正在经历程序性细胞死亡,显示降低的免疫功能或没有免疫功能,并且具有减弱的能力(如果有的话)来激活、扩增和/或结合
抗原以启动、执行或有助于免疫应答或活性。在特定实施方案中,表型被定义为激活的半胱
天冬酶的阴性表达和/或膜联蛋白V的阴性染色。
[0210] 在某些实施方案中,表型是或包括激活的半胱天冬酶3-(半胱天冬酶3-)和/或膜联蛋白V-。
[0211] 在某些实施方案中,表型是与炎性细胞死亡相关的一种或多种因子的阴性表达。在一些实施方案中,炎性细胞死亡是细胞焦亡。在特定实施方案中,细胞焦亡发生在或可能
潜在地发生在病毒感染的和/或转导的细胞,例如病毒感染的和/或转导的CD4+和/或CD8+ 
T细胞中。在一些实施方案中,细胞焦亡是细胞裂解、细胞肿胀、孔形成、DNA片段化和/或半胱天冬酶-1激活中的一种或多种或可能与其相关。在某些实施方案中,细胞焦亡不导致膜
起泡、半胱天冬酶-3激活和/或细胞色素-C释放。
[0212] 在一些实施方案中,与细胞焦亡相关的一种或多种因子是或包括模式识别受体、炎性体、活性半胱天冬酶-1、活性IL-1b和/或活性IL-18。在一些实施方案中,所述一种或多种因子是或包括激活的和/或连接的模式受体。在特定实施方案中,所述一种或多种因子是
或包括激活的和/或连接的TLR、NOD样受体、RIG-I、MDA5和/或STING。在一些实施方案中,所述一种或多种因子是或包括活性IL-1b。在特定实施方案中,所述一种或多种因子是或包括
活性IL-18。在某些实施方案中,所述一种或多种因子是或包括活性半胱天冬酶-1。
[0213] 在某些实施方案中,表型是或包括激活的半胱天冬酶-1-(半胱天冬酶-1-)。在一些实施方案中,表型是或包括活性IL-1b-。在特定实施方案中,表型是或包括活性IL-18-。
[0214] 在特定实施方案中,炎性细胞死亡是或包括坏死性凋亡。在某些实施方案中,表型是与坏死性凋亡相关的一种或多种因子的阴性表达。在一些实施方案中,坏死性凋亡是由
RIP激酶家族的激活驱动的程序性坏死细胞死亡。在一些实施方案中,坏死性凋亡发生或可
能发生在受体的TNF家族结合和/或激活后和/或在模式识别受体的接合(即病毒组分结合
RIG-I/MDA5或相关途径)后。在一些实施方案中,在病毒感染期间的TNFα产生导致对其受体
TNFR1的刺激、对TNFR相关死亡蛋白TRADD的激活,所述TNFR相关死亡蛋白TRADD进而激活
RIPK1以募集RIPK3以形成坏死体(necrosome)。在一些实施方案中,坏死体的形成导致MLKL
磷酸化和MLKL的寡聚化,其允许MLKL插入并透过质膜和细胞器。在一些实施方案中,MLKL
的整合导致炎性表型和损伤相关分子模式(DAMP)的释放,其引发免疫应答。
[0215] 在一些实施方案中,与坏死性凋亡相关的一种或多种因子是激活的和/或连接的模式识别受体,例如,激活的和/或连接的RIG-I/MDA5、激活的TNFR1、TRADD、坏死体、和/或磷酸化和/或低聚化的MLKL。在一些实施方案中,与坏死性凋亡相关的一种或多种因子是或
包括激活的RIP激酶,例如RIPK1、RIPK2、RIPK3、RIPK4和/或RIPK5。在一些实施方案中,所述一种或多种因子是激活的RIPK1和/或RIPK3。在一些实施方案中,表型是或包括激活的
RIPK1-、激活的RIPK3-、磷酸化的MLKL-和/或寡聚化的MLKL-。
[0216] 在特定实施方案中,表型是与自体吞噬相关的一种或多种因子的阴性表达。在一些实施方案中,自体吞噬是或包括在某些细胞培养条件(例如,在关键营养素受限和/或响
应于某些细胞因子的情况下的条件)下发生和/或可能发生的细胞内在分解代谢机制。在一
些实施方案中,自体吞噬独立于半胱天冬酶活性而发生。
[0217] 在一些实施方案中,自体吞噬是巨型自体吞噬(macro-autophagy)、微型自体吞噬(micro-autophagy)和/或分子伴侣介导的自体吞噬。在一些实施方案中,与自体吞噬标记
相关的一种或多种因子包括AMPK、ULK1、ULK2和/或其他Atg家族成员(例如,ATG16L)、
PIK3C3、BECN1、Vps34、Beclin-1、MAP1LC3A,B,C、GABARAP、GABARAPL1、GABARAPL2、UVRAG、IRGM、CLN3、Parkin、p62、和LAMP2和/或如描述于Behrends、Nature.2010年7月1日;466
(7302):68-76以及Glick等人J Pathol.2010年5月;221(l):3-12中的其他已知的因子。在
一些实施方案中,表型是AMPK-、ULK1-、ULK2-、PIK3C3-、BECN1-、Vps34-、Beclin-1-、
MAP1LC3A-、MAP1LC3B-、MAP1LC3C-、GABARAP-、GABARAPL1-、GABARAPL2-、UVRAG-、IRGM-、CLN3-、Parkin-、p62-和/或LAMP2-。
[0218] 表型包括通常与T细胞的一种或多种亚型或亚群或其表型相关的一种或多种标记的表达或表面表达。T细胞亚型和亚群可以包括CD4+和/或CD8+ T细胞及其亚型,所述CD4+
和/或CD8+ T细胞及其亚型可以包括幼稚T(TN)细胞、效应T细胞(TEFF)、记忆T细胞及其亚型
(如干细胞记忆T(TSCM)、中枢记忆T(TCM),效应记忆T(TEM)、TEMRA细胞或终末分化效应记忆T细胞)、肿瘤浸润淋巴细胞(TIL)、未成熟T细胞、成熟T细胞、辅助T细胞、细胞毒性T细胞、粘膜相关不变T(MAIT)细胞、天然存在和适应性调节T(Treg)细胞、辅助T细胞(如TH1细胞、TH2细
胞、TH3细胞、TH17细胞、TH9细胞、TH22细胞、滤泡辅助细胞T细胞)、α/βT细胞和δ/γT细胞。
[0219] 在一些实施方案中,表型是或包括记忆T细胞或记忆T细胞亚组的表型。记忆T细胞是先前已经暴露于其同源抗原的抗原特异性T细胞。在感染已经消退之后,记忆T细胞长期
存在。记忆T细胞在再次暴露于其同源抗原后迅速扩增为大量的效应T细胞,从而为免疫系
统提供针对过去感染的“记忆”。记忆T细胞包含三种亚型:中央记忆T细胞(TCM细胞)和两种类型的效应记忆T细胞(TEM细胞和TEMRA细胞)。在一些实施方案中,表型是或包括记忆T细胞
的表型(或与其相关的一种或多种标记),如TCM细胞、TEM细胞或TEMRA细胞、记忆干T细胞(TSCM)细胞、或其组合。在特定实施方案中,表型是或包括一种或多种特定分子的表达,所述一种
或多种特定分子是记忆和/或记忆T细胞或其亚型的标记。
[0220] 在特定实施方案中,表型是或包括一种或多种特定分子的表达,所述一种或多种特定分子是幼稚T细胞的标记。幼稚T细胞包括新鲜T细胞,所述新鲜T细胞已经在骨髓中产
生并且能够对免疫系统之前未处理过的新遭遇到的含有抗原的病原体作出响应。在通过其
同源抗原刺激之后,一部分激活的幼稚T细胞将发育成记忆细胞。
[0221] 在一些实施方案中,表型是或包括记忆T细胞或幼稚T细胞。在某些实施方案中,表型是一种或多种特定分子的阳性或阴性表达,所述一种或多种特定分子是记忆标记。在一
些实施方案中,记忆标记是可以用于定义记忆T细胞群的特定分子。
[0222] 在一些实施方案中,表型是或包括非记忆T细胞或其亚型的表型或与非记忆T细胞或其亚型相关一种或多种标记;在一些方面,它是或包括与幼稚细胞相关的表型或标记。在
一些实施方案中,表型是CCR7+/CD27+/CD28+/CD45RA+。在某些实施方案中,表型是或包括
CCR7+/CD45RA+。在一些实施方案中,表型是或包括中央记忆T细胞的表型。在特定实施方案
中,表型是或包括CCR7+/CD27+/CD28+/CD45RA-。在一些实施方案中,表型是或包括效应记忆细胞。在一些实施方案中,表型是或包括CCR7-/CD27+/CD28+/CD45RA-。在某些实施方案中,+
表型是或包括TEMRA细胞或TSCM细胞的表型。在某些实施方案中,表型是或包括CD45RA。在特定实施方案中,表型是或包括CCR7-/CD27-/CD28-/CD45RA+。在一些实施方案中,表型是或包括CD27+/CD28+、CD27-/CD28+、CD27+/CD28-、或CD27-/CD28-中的一种。
[0223] 在一些实施方案中,表型是或包括任何前述表型特性,并且进一步包括重组受体的表达,如与表达CAR的记忆T细胞或记忆亚型相关的表型,或与表达CAR的幼稚细胞相关的
表型。在某些实施方案中,表型是或包括表达CAR的中央记忆T细胞或干中央记忆T细胞的表
型。在特定实施方案中,表型是或包括表达CAR的效应记忆细胞的表型。在一些实施方案中,表型是或包括表达CAR的TEMRA细胞的表型。在特定实施方案中,表型是或包括CAR+/CCR7+/
CD27+/CD28+/CD45RA-;CAR+/CCR7-/CD27+/CD28+/CD45RA-;CAR+/CCR7-/CD27-/CD28-/CD45RA+;CAR+/CD27+/CD28+;CAR+/CD27-/CD28+;CAR+/CD27+/CD28-;或CAR+/CD27-/CD28-。
[0224] 在某些实施方案中,表型是或包括呈凋亡标记阴性的T细胞的表型。在某些实施方案中,表型是或包括呈凋亡标记阴性的幼稚细胞。在一些实施方案中,凋亡标记是激活的半
胱天冬酶3。在一些实施方案中,凋亡标记是通过膜联蛋白V的阳性染色。
[0225] 在特定实施方案中,表型是或包括表达CAR的呈凋亡标记阴性的记忆T细胞或其亚型的表型。在特定实施方案中,表型是或包括表达CAR的呈凋亡标记阴性的记忆T细胞或特
定亚型的表型。在某些实施方案中,表型是或包括表达CAR的呈凋亡标记阴性的幼稚细胞。
在某些实施方案中,表型是或包括表达CAR的呈凋亡标记阴性的中央记忆T细胞或TSCM细胞
或幼稚细胞的表型。在特定实施方案中,表型是或包括表达CAR的呈凋亡标记阴性的效应记
- + + + +
忆细胞的表型。在某些实施方案中,表型是或包括膜联蛋白V /CAR /CCR7 /CD27/CD28 /
CD45RA-;膜联蛋白V-/CAR+/CCR7-/CD27+/CD28+/CD45RA-;膜联蛋白V-/CAR+/CCR7-/CD27-/
CD28-/CD45RA+;膜联蛋白V-/CAR+/CD27+/CD28+;膜联蛋白V-/CAR+/CD27-/CD28+;膜联蛋白V-/CAR+/CD27+/CD28-;或膜联蛋白V-/CAR+/CD27-/CD28-。在某些实施方案中,表型是或包括激- + + + + - - + -
活的半胱天冬酶3 /CAR/CCR7 /CD27 /CD28/CD45RA ;激活的半胱天冬酶3 /CAR/CCR7 /
CD27+/CD28+/CD45RA-;激活的半胱天冬酶3-/CAR+/CCR7-/CD27-/CD28-/CD45RA+;激活的半胱天冬酶3-/CAR+/CD27+/CD28+;激活的半胱天冬酶3-/CAR+/CD27-/CD28+;激活的半胱天冬酶
3-/CAR+/CD27+/CD28-;或激活的半胱天冬酶3-/CAR+/CD27-/CD28-。
[0226] 在一些实施方案中,表型是或包括消耗标记的阳性或阴性表达。T细胞消耗是在许多慢性感染和癌症期间出现的T细胞功能障碍的状态。它通过效应功能差、抑制性受体的持
续表达和不同于功能性效应或记忆T细胞的转录状态来定义。消耗阻止了对感染和肿瘤的
最佳控制。在某些实施方案中,表型是或包括与消耗相关的特定分子的阳性或阴性表达。在
某些实施方案中,特定分子是与消耗或与消耗相关的质量(例如效应功能差或抑制性受体
表达)相关的任何分子。在特定实施方案中,表型是免疫检查点抑制剂的阳性或阴性表达。
在特定实施方案中,消耗标记是CTLA-4、FOXP3、PD-1、TIGIT、LAB-3、2B4、BTLA、TIM3、VISTA、或CD96、或其组合。在某些实施方案中,表型是CTLA-4、FOXP3、PD-1、TIGIT、LAB-3、2B4、BTLA、TIM3、VISTA、或CD96、或其组合的阳性或阴性表达。在特定实施方案中,表型是PD1和/或FOXP3的阳性或阴性表达。
[0227] 在某些实施方案中,表型是与T细胞激活相关的特定分子的阴性表达。在一些实施方案中,表型是或包括一种或多种作为激活标记的特定分子的阴性表达。T细胞激活是指在
通过抗原呈递细胞(APC)刺激T细胞后通过T细胞引发免疫应答。这种交互式途径解释了触
发T细胞激活及其下游途径的主要刺激信号。通常,T细胞激活需要两种同时发生的信号。第
一种是T细胞受体复合物(TCR)与携带肽抗原的主要组织相容性复合物(MHC)分子的结合。
第二种有由共刺激受体CD28与在APC表面上的蛋白质(如B7-2或B7-1)的结合提供。在某些
实施方案中,所述特定分子与TCR激活相关,例如,由于T细胞激活而被激活、改变或表达。在一些实施方案中,所述特定分子与CD28受体的激活相关,例如,由于T细胞激活而被激活、改变或表达的分子。
[0228] 在一些实施方案中,表型是或包括消耗标记的阳性或阴性表达。T细胞消耗是在许多慢性感染和癌症期间出现的T细胞功能障碍的状态。它通过效应功能差、抑制性受体的持
续表达和不同于功能性效应或记忆T细胞的转录状态来定义。消耗阻止了对感染和肿瘤的
最佳控制。在某些实施方案中,表型是或包括与消耗相关的特定分子的阳性或阴性表达。在
某些实施方案中,特定分子是与消耗或与消耗相关的质量(例如效应功能差或抑制性受体
表达)相关的任何分子。在特定实施方案中,表型是免疫检查点抑制剂的阳性或阴性表达。
在特定实施方案中,消耗标记是CTLA-4、FOXP3、PD-1、TIGIT、LAB-3、2B4、BTLA、TIM3、VISTA、或CD96、或其组合。在某些实施方案中,表型是CTLA-4、FOXP3、PD-1、TIGIT、LAB-3、2B4、BTLA、TIM3、VISTA、或CD96、或其组合的阳性或阴性表达。在特定实施方案中,表型是PD1和/或FOXP3的阳性或阴性表达。
[0229] 在一些实施方案中,表型是或包括在表达重组受体或CAR的CD3+细胞中消耗标记的阳性或阴性表达。在特定实施方案中,表型是或包括在表达重组受体或CAR的CD4+细胞中
消耗标记的阳性或阴性表达。在一些实施方案中,表型是或包括消耗标记和CD3+的阳性或
阴性表达以及重组受体或CAR的阳性表达。在特定实施方案中,表型是或包括在表达重组受
体或CAR的CD4+细胞中消耗标记的阳性或阴性表达。在一些实施方案中,表型是或包括在表
达重组受体或CAR的CD8+细胞中消耗标记的阳性或阴性表达。在特定实施方案中,消耗标记
是CTLA-4、FOXP3、PD-1、TIGIT、LAB-3、2B4、BTLA、TIM3、VISTA、或CD96中的一种或多种。在特定实施方案中,消耗标记是PD1和/或FOXP3。
[0230] 在特定实施方案中,表型是或包括PD1-/CD3+、PD1-/CD4+、PD1-/CD8+、PD1-/CD3+/CAR+、PD1-/CD4+/CAR+、PD1-/CD8+/CAR+、PD1-/膜联蛋白V-、PD1-/膜联蛋白V-/CD3+、PD1-/膜联蛋白V-/CD4+、PD1-/膜联蛋白V-/CD8+、PD1-/膜联蛋白V/-CD3+/CAR+、PD1-/膜联蛋白
V-/CD4+/CAR+、PD1-/膜联蛋白V-/CD8+/CAR+、PD1-/激活的半胱天冬酶3-、PD1-/激活的半
胱天冬酶3-/CD3+、PD1-/激活的半胱天冬酶3-/CD4+、PD1-/激活的半胱天冬酶3-/CD8+、
PD1-/激活的半胱天冬酶3-/CD3+/CAR+、PD1-/激活的半胱天冬酶3-/CD4+/CAR+、PD1-/激活
的半胱天冬酶3-/CD8+/CAR+、或其组合。
[0231] 在某些实施方案中,表型是或包括FOXP3-/CD3+、FOXP3-CD4+、FOXP3-/CD8+、FOXP3-/CD3+/CAR+、FOXP3-/CD4+/CAR+、FOXP3-/CD8+/CAR+、FOXP3-/膜联蛋白V-、FOXP3-/
膜联蛋白V-/CD3+、FOXP3-/膜联蛋白V-/CD4+、FOXP3-/膜联蛋白V-/CD8+、FOXP3-/膜联蛋白
V/-CD3+/CAR+、FOXP3-/膜联蛋白V-/CD4+/CAR+、FOXP3-/膜联蛋白V-/CD8+/CAR+、FOXP3-/
激活的半胱天冬酶3-、FOXP3-/激活的半胱天冬酶3-/CD3+、FOXP3-/激活的半胱天冬酶3-/
CD4+、FOXP3-/激活的半胱天冬酶3-/CD8+、FOXP3-/激活的半胱天冬酶3-/CD3+/CAR+、
FOXP3-/激活的半胱天冬酶3-/CD4+/CAR+、FOXP3-/激活的半胱天冬酶3-/CD8+/CAR+、或其
组合。
[0232] 在某些实施方案中,表型是与T细胞激活相关的特定分子的阴性表达。在一些实施方案中,表型是或包括一种或多种作为激活标记的特定分子的阴性表达。T细胞激活是指在
通过抗原呈递细胞(APC)刺激T细胞后通过T细胞引发免疫应答。这种交互式途径解释了触
发T细胞激活及其下游途径的主要刺激信号。通常,T细胞激活需要两种同时发生的信号。第
一种是T细胞受体复合物(TCR)与携带肽抗原的主要组织相容性复合物(MHC)分子的结合。
第二种有由共刺激受体CD28与在APC表面上的蛋白质(如B7-2或B7-1)的结合提供。在某些
实施方案中,所述特定分子与TCR激活相关,例如,由于T细胞激活而被激活、改变或表达。在一些实施方案中,所述特定分子与CD28受体的激活相关,例如,由于T细胞激活而被激活、改变或表达的分子。
[0233] 在特定实施方案中,表型是或包括一种或多种作为激活标记的特定分子的阴性表达。在某些实施方案中,激活标记是CD25、CD26、CD27、CD28、CD30、CD71、CD154、CD40L、CD127、LAG3、Ki67中的一种或多种、或其组合。在某些实施方案中,表型是CD25、CD26、CD27、CD28、CD30、CD71、CD154、CD40L、CD127、LAG3、或Ki67中的一种或多种的阴性或阳性表达。在某些实施方案中,表型是或包括CD25、CD127、LAG3、Ki67或其组合的表达。
[0234] 在一些实施方案中,表型是或包括在表达重组受体或CAR的CD3+细胞中激活标记的阳性或阴性表达。在特定实施方案中,表型是或包括在表达重组受体或CAR的CD4+细胞中
激活标记的阳性或阴性表达。在一些实施方案中,表型是或包括在表达重组受体或CAR的
CD8+细胞中激活标记的阳性或阴性表达。在特定实施方案中,激活标记是CD25、CD26、CD27、CD28、CD30、CD71、CD154、CD40L、CD127、LAG3、或Ki67中的一种或多种。在特定实施方案中,激活标记是CD25、CD127、LAG3、Ki67、或其组合。
[0235] 在特定实施方案中,表型是或包括激活标记以及CD3+、CD4+、CD8+、CD3+/CAR+、CD4+/CAR+、CD8+/CAR+、膜联蛋白V-、膜联蛋白V-/CD3+、膜联蛋白V-/CD4+、膜联蛋白V-/CD8+、膜联蛋白V/-CD3+/CAR+、膜联蛋白V-/CD4+/CAR+、膜联蛋白V-/CD8+/CAR+、激活的半胱天冬酶3-、激活的半胱天冬酶3-/CD3+、激活的半胱天冬酶3-/CD4+、激活的半胱天冬酶3-/CD8+、激活的半胱天冬酶3-/CD3+/CAR+、激活的半胱天冬酶3-/CD4+/CAR+、激活的半胱天冬酶3-/
CD8+/CAR+、或其组合的阳性或阴性表达。
[0236] 在一些实施方案中,通过对刺激物(例如刺激、触发、诱导、刺激或延长免疫细胞功能的刺激物)的响应来评估表型。在某些实施方案中,在刺激条件或刺激剂的存在下孵育细
胞,表型是或包括对刺激的反应。在特定实施方案中,表型是或包括响应于一种或多种刺激
而产生或分泌可溶性因子。在一些实施方案中,表型是或包括响应于一种或多种刺激而缺
乏或产生或分泌可溶性因子。在某些实施方案中,可溶性因子是细胞因子。
[0237] 在一些实施方案中,刺激条件可以包括以下中的一种或多种:特定培养基、温度、氧含量、二氧化碳含量、时间、药剂(例如,营养素、氨基酸、抗生素、离子和/或刺激因子(如细胞因子、趋化因子、抗原、结合配偶体、融合蛋白、重组可溶性受体和任何其他旨在激活细胞的药剂))。在一些实施方案中,刺激细胞并且通过是否产生或分泌可溶性因子(例如细胞
因子或趋化因子)来确定表型。在一些实施方案中,刺激是非特异性的,即不是抗原特异性
刺激。在一些实施方案中,将细胞在刺激条件或刺激剂的存在下孵育约1小时、约2小时、约3小时、约4小时、约5小时、约6小时、约7小时、约8小时、约9小时、约10小时、约11小时、约12小时、约18小时、约24小时、约48小时,或孵育在1小时与4小时之间、在1小时与12小时之间、在
12小时与24小时之间(每个都包含端值)的持续时间,或孵育超过24小时。
[0238] 在一些实施方案中,将细胞用药剂刺激,所述药剂是对重组受体特异的抗原或其表位或者是结合和/或识别重组受体的抗体或其片段,或其组合。在一些实施方案中,所述
重组受体是CAR,并且所述药剂是对所述CAR特异的抗原或其表位,或者是结合和/或识别所
述CAR的抗体或其片段,或其组合。在特定实施方案中,通过在靶细胞的存在下孵育细胞来
刺激细胞,所述靶细胞具有由所述CAR识别的抗原的表面表达。在某些实施方案中,所述重
组受体是CAR,并且所述药剂是结合所述CAR的抗体或其活性片段、变体或部分。在某些实施
方案中,与所述CAR结合的所述抗体或其活性片段、变体或部分是抗独特型(抗ID)抗体。
[0239] 在一些实施方案中,刺激条件或刺激剂包括一种或多种药剂(例如配体),其能够激活TCR复合物的细胞内信号传导结构域。在一些方面,所述药剂在T细胞中开启或启动
TCR/CD3细胞内信号传导级联。此类药剂可以包括例如结合至固体支持物(如珠)的抗体,如
对TCR组分和/或共刺激受体具有特异性的抗体(例如抗CD3、抗CD28);和/或一种或多种细
胞因子。在一些实施方案中,所述一种或多种药剂是PMA和离子霉素。
[0240] 在特定实施方案中,表型是或包括响应于一种或多种刺激而产生或分泌细胞因子。细胞因子的产生和/或分泌有助于免疫应答,并参与不同的过程,包括诱导抗病毒蛋白
和诱导T细胞增殖。细胞因子不是预先形成的因子,而是响应于细胞激活而快速产生和分
泌。可以通过本领域已知的任何合适的技术测量、检测和/或定量细胞因子的产生或分泌。
[0241] 在某些实施方案中,表型是一种或多种细胞因子的产生。在特定实施方案中,通过细胞内细胞因子染色来测量、检测和/或定量一种或多种细胞因子的产生。通过流式细胞术
的细胞内细胞因子染色(ICS)是非常适合于在单细胞水平上研究细胞因子产生的一种技
术。它检测在细胞刺激后在内质网内的细胞因子的产生和积累,从而允许鉴定对于特定细
胞因子的产生呈阳性或阴性的细胞群或基于阈值将高产和低产细胞分离。ICS还可以与其
他流式细胞术方案结合用于使用细胞表面标记或用MHC多聚体进行免疫表型分析以获得特
定细胞亚群中的细胞因子产生,使其成为极其灵活和通用的方法。用于测量或检测细胞因
子产生的其他单细胞技术包括但不限于ELISPOT、有限稀释和T细胞克隆。
[0242] 在一些实施方案中,表型是细胞因子的产生。在特定实施方案中,表型是缺乏细胞因子的产生。在特定实施方案中,表型是呈细胞因子产生阳性的或是高水平的细胞因子产
生。在某些实施方案中,表型是对于细胞因子的产生呈阴性或是低水平的细胞因子产生。细
胞因子可以包括但不限于IL-1、IL-1β、IL-2、sIL-2Ra、IL-3、IL-5、IL-6、IL-7、IL-8、IL-10、IL-12、IL-13、IL 27、IL-33、IL-35、TNF、TNFα、CXCL2、CCL2、CCL3、CCL5、CCL17、CCL24、PGD2、LTB4、干扰素γ(IFN-γ)、粒细胞巨噬细胞集落刺激因子(GM-CSF)、巨噬细胞炎性蛋白
(MIP)-1a、MIP-1b、Flt-3L、分形趋化因子和/或IL-5。
[0243] 在一些实施方案中,表型是或包括细胞因子的产生。在某些实施方案中,表型是或包括超过一种细胞因子的产生。在某些实施方案中,表型是或包括缺乏一种或多种细胞因
子的产生。在某些实施方案中,表型是或包括IL-2、IL-13、IFN-γ或TNF-α中的一种或多种的产生或其缺乏。在一些实施方案中,表型是生产的存在、和/或高水平的细胞因子产生的
存在。在一些实施方案中,表型是低的细胞因子产生、减少的细胞因子产生、或细胞因子的
产生不存在。
[0244] 在一些实施方案中,表型是或包括细胞因子的内部(细胞内)产生,例如,如在刺激剂的存在下或在刺激条件下在分泌被阻止或抑制时评估的。在特定实施方案中,表型是或
包括细胞因子的内部产生的缺乏或不存在。在某些实施方案中,当用ICS测定评估超过一种
细胞因子的产生时,表型是或包括一种或多种细胞因子的内部量。在某些实施方案中,表型
是或包括IL-2、IL-13、IFN-γ或TNF-α中的一种或多种的内部量,如通过ICS测定评估的。在一些实施方案中,表型是或包括低的内部量的或缺乏可检测量的一种或多种细胞因子,如
用ICS测定评估的。在某些实施方案中,表型是或包括低的内部量的或缺乏可检测量的IL-
2、IL-13、IFN-γ或TNF-α,如用ICS测定评估的。
[0245] 特定实施方案预期表型可以包括细胞因子的产生、或缺乏或少量的细胞因子产生。这可能取决于若干种因素,包括但不限于细胞因子的身份、为了检测细胞因子而进行的
测定、以及与测定一起使用的刺激剂或条件。例如,在一些实施方案中,预期表型是或包括
如通过ICS指示的缺乏或低水平的IL-13产生,而在一些实施方案中,表型是或包括如通过
ICS指示的IFN-γ的产生。
[0246] 在一些实施方案中,表型是或包括一种或多种细胞因子、以及CD3+、CD4+、CD8+、CD3+/CAR+、CD4+/CAR+、CD8+/CAR+、膜联蛋白V-、膜联蛋白V-CD3+、膜联蛋白V-CD4+、膜联蛋白V-CD8+、膜联蛋白V-CD3+/CAR+、膜联蛋白V-CD4+/CAR+、膜联蛋白V-CD8+/CAR+、激活的半胱天冬酶3-、激活的半胱天冬酶3-/CD3+、激活的半胱天冬酶3-/CD4+、激活的半胱天冬酶
3-/CD8+、激活的半胱天冬酶3-/CD3+/CAR+、激活的半胱天冬酶3-/CD4+/CAR+、或激活的半
胱天冬酶3-/CD8+/CAR+、或其组合的产生。在特定实施方案中,表型是或包括在CD4+/CAR+
和/或CD8+/CAR+中的一种或多种细胞因子的产生。
[0247] 在一些实施方案中,表型是或包括缺乏一种或多种细胞因子的产生。在某些实施方案中,表型是或包括缺乏一种或多种细胞因子、以及CD3+、CD4+、CD8+、CD3+/CAR+、CD4+/CAR+、CD8+/CAR+、膜联蛋白V-、膜联蛋白V-CD3+、膜联蛋白V-CD4+、膜联蛋白V-CD8+、膜联蛋白V-CD3+/CAR+、膜联蛋白V-CD4+/CAR+、膜联蛋白V-CD8+/CAR+、激活的半胱天冬酶3-、激活的半胱天冬酶3-/CD3+、激活的半胱天冬酶3-/CD4+、激活的半胱天冬酶3-/CD8+、激活的半
胱天冬酶3-/CD3+/CAR+、激活的半胱天冬酶3-/CD4+/CAR+、或激活的半胱天冬酶3-/CD8+/
CAR+、或其组合的产生。
[0248] 在特定实施方案中,表型是或包括IL-2、IL-13、IFN-γ或TNF-α中的一种或多种的内部量的存在或不存在(如用ICS测定评估的),和针对特定细胞类型的细胞亚组或细胞的
一种或多种特异性标记的内部量的存在或不存在。在一些实施方案中,表型是或包括IL-2、
IL-13、IFN-γ或TNF-α中的一种或多种以及CD4+/CAR+和/或CD8+/CAR+的产生或其缺乏。在
某些实施方案中,表型是或包括IL-2和CD4+/CAR+和/或CD8+/CAR+的产生。在一些实施方案
中,表型是或包括IL-2和CD4+/CAR+和/或CD8+/CAR+的缺乏或低产生。在一些实施方案中,
表型是或包括IL-13和CD4+/CAR+和/或CD8+/CAR+的产生。在一些实施方案中,表型是或包
括IL-13和CD4+/CAR+和/或CD8+/CAR+的产生。在某些实施方案中,表型是或包括IL-13和
CD4+/CAR+和/或CD8+/CAR+的缺乏或低产生。在一些实施方案中,表型是或包括IFN-γ和
CD4+/CAR+和/或CD8+/CAR+的产生。在某些实施方案中,表型是或包括TNF-α和CD4+/CAR+
和/或CD8+/CAR+的产生。在某些实施方案中,表型是或包括TNF-α和CD4+/CAR+和/或CD8+/
CAR+的缺乏或低产生。
[0249] 可以根据所提供的方法评估或确定单独的或组合的任何一种或多种所述表型。在一些实施方案中,表型是CD3+、CD3+/CAR+、CD4+/CAR+、CD8+/CAR+、或其组合。
[0250] 在某些实施方案中,表型是或包括CD3+。在某些实施方案中,表型是或包括CD3+/CAR+。在一些实施方案中,表型是或包括CD8+/CAR+。在某些实施方案中,表型是或包括
[0251] 在特定实施方案中,表型是或包括膜联蛋白-/CD3+/CAR+。在一些实施方案中,表型是或包括膜联蛋白-/CD4+/CAR+。在特定实施方案中,表型是膜联蛋白-/CD8+/CAR。
[0252] 在特定实施方案中,表型是或包括缺乏或少量的细胞内IL-2和CD4+/CAR+。在特定实施方案中,表型是缺乏或少量的细胞内IL-13和CD4+/CAR+。在一些实施方案中,表型是缺
乏或少量的IL-13的细胞内表达和CD8+/CAR+细胞。在特定实施方案中,表型是缺乏或少量
的细胞内TNF-αCD4+/CAR+。
[0253] 在某些实施方案中,表型是或包括CD8+/CAR+。在某些实施方案中,表型是或包括膜联蛋白-/CD8+/CAR+。
[0254] 在某些实施方案中,确定、测量、获得、检测、观察和/或鉴定细胞组合物的特定表型的数量、倍数或分数。在一些实施方案中,细胞组合物是T细胞组合物。在某些实施方案
中,细胞组合物含有表达重组受体(例如CAR)的细胞。在特定实施方案中,细胞组合物是含
有表达重组受体的细胞的治疗性T组合物,所述治疗性T组合物可以给予至受试者以治疗疾
病或病症。在某些实施方案中,表型的细胞的数量是细胞组合物的表型的细胞的总量。在某
些实施方案中,表型的细胞数量是在细胞组合物的剂量中存在的具有表型的细胞的总数。
在特定实施方案中,表型的细胞的数量是在细胞组合物的样品中存在的具有表型的细胞的
数量。在一些实施方案中,表型的细胞的数量可以表示为在细胞组合物、或其剂量或样品中
存在的具有表型的细胞的频率、比率和/或百分比。
[0255] 在一些实施方案中,细胞组合物是从受试者获得的,并且表型的细胞的数量、倍数或分数是归一化至受试者的体重的在细胞组合物中存在的具有表型的细胞的数量。在某些
实施方案中,表型的测量是每磅受试者体重的表型细胞数量。在特定实施方案中,表型的测
量是每1lb.、2lbs.、3lbs.、4lbs.、5lbs.、10lbs.或20lbs.受试者体重的表型细胞数量。在一些实施方案中,表型的测量是每kg受试者体重的表型细胞数量。在特定实施方案中,表型
的测量是每1kg、2kg、3kg、4kg、5kg、10kg或20kg受试者体重的表型细胞数量。
[0256] 在特定实施方案中,表型的细胞的数量、倍数或分数被变换,例如以压缩数量、倍数或分数的相关值的范围。在一些实施方案中,变换是对数据集中的每个点的任何确定性
数学函数的应用,例如,每个数据点x被变换的值y=f(x)替换,其中f是函数。通常,可以应用变换使得数据看起来更接近地满足要应用的统计推断过程的假设,或者改善图的可解释
性或外观。在大多数情况下,用于变换数据的函数是可逆的,并且通常是连续的。变换通常
应用于可比较测量的集合。合适的变换的例子包括但不限于对数和平方根变换、倒数变换
和幂变换。在某些实施方案中,通过对数变换将表型的细胞的数量、倍数或分数进行变换。
在某些实施方案中,对数变换是常用对数(log10(x))、自然对数(ln(x))或二元对数(log2
(x))。
[0257] B.抗原特异性或重组受体依赖性活性
[0258] 特定实施方案预期重组受体依赖性活性(例如CAR依赖性活性)或“B”是在表达重组受体的细胞中发生的、不在和/或不能在不表达重组受体的细胞中发生的活性。在一些实
施方案中,重组受体依赖性活性是取决于重组受体的活性或存在的活性。重组受体依赖性
活性可以是直接或间接受重组受体的表达和/或存在影响或者受重组受体的活性的变化
(如受体刺激)的影响的任何细胞过程。在一些实施方案中,重组受体依赖性活性可以包括
但不限于细胞过程如细胞分裂、DNA复制、转录、蛋白质合成、膜转运、蛋白质转位和/或分
泌,或者它可以是免疫细胞功能,例如细胞溶解活性。在某些实施方案中,重组受体依赖性
活性可以通过CAR受体的确认、细胞内信号传导分子的磷酸化、蛋白质的降解、蛋白质的转
录、翻译、转位、和/或因子(如蛋白质、或生长因子、细胞因子)的产生和分泌的变化来测量。
在某些实施方案中,重组受体是CAR。
[0259] 在某些实施方案中,重组受体依赖性活性(例如CAR依赖性活性)是在刺激细胞组合物后的因子的测量,例如量或浓度、或量或浓度的变化。在某些实施方案中,因子可以是
蛋白质、磷酸化蛋白质、经切割的蛋白质、转位的蛋白质、活性确认中的蛋白质、多核苷酸、RNA多核苷酸、mRNA和/或shRNA。在某些实施方案中,测量可以包括但不限于激酶活性、蛋白酶活性、磷酸酶活性的增加或减少、cAMP产生、ATP代谢、转位(例如蛋白质的核定位)、转录活性的增加、翻译活性的增加、可溶性因子的产生和/或分泌、细胞摄取、泛素化和/或蛋白
质降解。
[0260] 在特定实施方案中,因子是被分泌的可溶性因子,如激素、生长因子、趋化因子和/或细胞因子。
[0261] 在一些实施方案中,重组受体活性(例如CAR依赖性活性)是对刺激的反应。在某些实施方案中,在刺激条件或刺激剂的存在下孵育细胞,并且活性是或包括对刺激的反应的
至少一个方面。反应可以包括但不限于细胞内信号传导事件(如受体分子活性增加、一种或
多种激酶的激酶活性增加、一种或多种基因的转录增加、一种或多种蛋白质的蛋白质合成
增加)、和/或细胞内信号传导分子(例如,蛋白质的激酶活性增加)。在一些实施方案中,反
应或活性与免疫活性相关,并且可以包括但不限于可溶性因子(例如细胞因子)产生和/或
分泌、抗体产生增加、和/或细胞溶解活性增加。
[0262] 在特定实施方案中,通过测量、检测或定量对刺激物()的反应(即由刺激物启动、触发、支持、延长和/或引起的至少一种活性)来评估对细胞组合物的刺激的反应。在某些实
施方案中,细胞被刺激并且对刺激的反应是对表达重组受体的细胞特异的活性。在某些实
施方案中,活性是重组受体特异性活性,并且活性发生在表达重组受体的细胞中,但不发生
在不表达受体的细胞中或仅在不表达受体的细胞中发生最少。在特定实施方案中,重组受
体是CAR。在一些实施方案中,活性是CAR依赖性活性。
[0263] 用于刺激细胞(例如免疫细胞或T细胞)的条件可以包括以下中的一种或多种:特定培养基、温度、氧含量、二氧化碳含量、时间、药剂(例如,营养素、氨基酸、抗生素、离子和/或刺激因子(如细胞因子、趋化因子、抗原、结合配偶体、融合蛋白、重组可溶性受体和任何其他旨在激活细胞的药剂))。在一些实施方案中,刺激细胞并且通过是否产生或分泌可溶
性因子(例如细胞因子或趋化因子)来确定活性。在一些实施方案中,刺激是非特异性的,即
不是抗原特异性刺激。
[0264] 在一些实施方案中,活性对表达重组受体的细胞是特异的。在一些实施方案中,对表达重组受体的细胞特异的活性不会发生在缺乏重组受体表达的细胞中。在某些实施方案
中,重组受体是CAR,并且活性是CAR依赖性活性。在特定实施方案中,在活性存在于表达重
组受体的细胞中的相同条件下,所述活性不存在于缺乏重组受体表达的细胞中。在某些实
施方案中,在相同条件下,CAR依赖性活性比在CAR-细胞中的CAR依赖性活性少约10%、约
20%、约30%、约40%、约50%、约60%、约70%、约75%、约80%、约85%、约90%、约95%、约
97%、约98%、约99%、或约99%。
[0265] 在一些实施方案中,活性对表达重组受体(例如CAR)的细胞是特异的,并且通过用对表达重组受体的细胞特异的药剂或在对表达重组受体的细胞特异的刺激条件下刺激产
生所述活性。在一些实施方案中,重组受体是CAR,并且CAR特异性刺激刺激、触发、启动和/或延长在CAR+细胞中的活性,但不刺激、触发、启动和/或延长在CAR-细胞中的活性。在一些实施方案中,在通过CAR特异性刺激物刺激后,CAR依赖性活性在CAR-细胞中比在CAR+细胞
中少约10%、约20%、约30%、约40%、约50%、约60%、约70%、约75%、约80%、约85%、约
90%、约95%、约97%、约98%、约99%、或约99%。
[0266] 在某些实施方案中,活性是由对重组受体特异的药剂刺激的重组受体依赖性,例如CAR依赖性活性。在一些实施方案中,重组受体特异性药剂(例如CAR特异性药剂)是由重
组受体(例如CAR)结合和/或识别的抗原或其表位。在一些实施方案中,重组受体特异性药
剂是结合和/或识别重组受体的抗体或其活性片段。在一些实施方案中,所述药剂是与重组
受体结合抗独特型抗体或其活性片段、变体或部分(抗ID)。在某些实施方案中,重组受体特
异性药剂是在其表面上表达抗原的细胞。在一些实施方案中,重组受体依赖性活性通过由
重组受体结合和/或识别的抗原或其表位来刺激。在某些实施方案中,重组受体依赖性活性
通过结合和/或识别重组受体的抗体或其活性片段来刺激。在特定实施方案中,重组受体依
赖性活性通过抗ID来刺激。
[0267] 在一些实施方案中,在含有表达重组受体(例如CAR)的细胞的细胞组合物中测量活性,并且将测量值与一个或多个对照进行比较。在某些实施方案中,对照是未受刺激的相
似或相同的细胞组合物。例如,在一些实施方案中,在与药剂一起孵育之后或期间在细胞组
合物中测量活性,并且将所得的测量值与来自未与药剂一起孵育的相似或相同细胞组合物
的活性的对照测量值进行比较。在一些实施方案中,活性是重组受体依赖性活性,并且所述
细胞组合物和所述对照细胞组合物都含有表达重组受体的细胞。在一些实施方案中,活性
是重组受体依赖性活性,并且对照是从不含有表达重组受体的细胞(例如CAR+细胞)的类似
细胞组合物取得。因此,在一些实施方案中,将含有重组受体表达细胞的细胞组合物和不含
有重组受体表达细胞的对照细胞组合物与表达重组受体的特定药剂接触。在某些实施方案
中,对照是来自任何刺激之前取得的表达重组受体的相同细胞组合物的测量值。在某些实
施方案中,获得对照测量值以确定背景信号,并且从活性的测量值中减去对照测量值。在一
些实施方案中,将在细胞组合物中的活性的测量值除以对照测量值,以获得活性与对照水
平的比的值。
[0268] 在特定实施方案中,活性是或包括可溶性因子的产生和/或分泌。在一些实施方案中,活性是重组受体(例如CAR)依赖性活性,所述重组受体(例如CAR)依赖性活性是或包括
可溶性因子的产生和/或分泌。在某些实施方案中,可溶性因子是细胞因子或趋化因子。
[0269] 用于测量可溶性因子的产生或分泌的合适技术在本领域中是已知的。可溶性因子的产生和/或分泌可以通过确定因子的细胞外量的浓度或量,或确定编码因子的基因的转
录活性的量来测量。合适的技术包括但不限于以下测定:如免疫测定、基于适体的测定、组
织学或细胞学测定、mRNA表达水平测定、酶联免疫吸附测定(ELISA)、免疫印迹、免疫沉淀、放射免疫测定(RIA)、免疫染色、流式细胞术测定、表面等离子体共振(SPR)、化学发光测定、侧向流动免疫测定、抑制测定或亲合力测定、蛋白质微阵列、高效液相色谱(HPLC)、中尺度
发现(Meso Scale Discovery,MSD)电化学发光和基于珠的多重免疫测定(MIA)。在一些实
施方案中,合适的技术可以使用特异性地结合可溶性因子的可检测结合试剂。
[0270] 在特定实施方案中,通过ELISA(酶联免疫吸附测定)来测量可溶性因子的测量值。ELISA是设计用于检测和定量物质如肽、细胞因子、抗体和激素的一种基于板的测定技术。
在ELISA中,必须将可溶性因子固定在固体表面上,并然后与跟酶连接的抗体复合。经由与
底物一起孵育以产生可检测的信号评估缀合的酶活性来完成检测。在一些实施方案中,用
ELISA测定来测量CAR依赖性活性。
[0271] 在一些实施方案中,重组受体依赖性活性是可溶性因子的分泌或产生。在某些实施方案中,通过重组受体特异性药剂(例如CAR+特异性药剂)在含有重组受体表达细胞(例
如CAR表达细胞)的细胞组合物中刺激产生或分泌。在一些实施方案中,重组受体特异性药
剂是对重组受体特异的抗原或其表位;表达抗原的细胞,例如靶细胞;或结合和/或识别重
组受体的抗体或其部分或变体;或其组合。在某些实施方案中,重组受体特异性药剂是重组
蛋白,所述重组蛋白包含由重组受体结合或识别的抗原或其表位。
[0272] 在某些实施方案中,通过将含有表达重组受体(例如CAR)的细胞的细胞组合物与重组受体特异性药剂(例如CAR+特异性药剂)一起孵育来测量重组受体依赖性可溶性因子
产生和/或分泌。在某些实施方案中,可溶性因子是细胞因子或趋化因子。在一些实施方案
中,含有重组受体表达细胞的在细胞组合物中的细胞在重组受体特异性药剂的存在下孵育
一定的时间量,并且在孵育期间在一个或多个时间点处测量可溶性因子的产生和/或分泌。
在一些实施方案中,将细胞与CAR特异性药剂一起孵育长达或约1小时、约2小时、约3小时、
约4小时、约5小时、约6小时、约7小时、约8小时、约9小时、约10小时、约11小时、约12小时、约
18小时、约19小时、约20小时、约21小时、约22小时、约23小时、约24小时、约48小时,或孵育在1小时与4小时之间、在1小时与12小时之间、在12小时与24小时之间(每个都包含端值)的
持续时间,或孵育超过24小时,并且检测可溶性因子(例如细胞因子)的量。
[0273] 在一些实施方案中,重组受体特异性药剂是表达由重组受体识别的抗原的靶细胞。在一些实施方案中,重组受体是CAR,并且将细胞组合物的细胞与靶细胞一起以约10:1、约5:1、约4:1、约3:1、约2:1、约1:1、约1:2、约1:3、约1:4、约1:5、约1:6、约1:7、约1:8、约1:
9、或约1:10、或任何前述之间的范围的细胞组合物的总细胞、CAR+细胞、CAR+/CD8+细胞或
膜联蛋白-/CAR+/CD8+细胞与靶细胞的比率孵育,如以在10:1与1:1之间、在3:1与1:3之间、
或在1:1与1:10之间(每个都包含端值)的比率孵育。
[0274] 在一些实施方案,将在约1x102个与约1x104个之间、在约1x103个与约1x105个之间、在约1x104个与约1x106个之间、在约1x105个与约1x107个之间、在约1x106个与约1x108个之间、在约1x107个与约1x109个之间、或在约1x108个与约1x1010个之间的在细胞组合物中的细胞(每个都包含端值)与重组受体特异性药剂(例如,CAR+特异性试剂)一起孵育。在一些
实施方案中,将在约1x106个与约1x107个之间的在细胞组合物中的细胞(包含端值)与重组
受体特异性药剂(例如,CAR+特异性试剂)一起孵育。在某些实施方案中,将约2.5x106个组
合物的细胞与重组受体特异性药剂一起孵育。在某些实施方案,将在约1x102个与约1x104个
之间、在约1x103个与约1x105个之间、在约1x104个与约1x106个之间、在约1x105个与约1x107
6 8 7 9 8
个之间、在约1x10个与约1x10个之间、在约1x10 个与约1x10 个之间、或在约1x10个与约
1x1010个之间的细胞组合物的重组受体表达细胞、CAR+细胞、CAR+/CD8+细胞、或膜联蛋白-/CAR+/CD8+细胞(每个都包含端值)与CAR+特异性药剂一起孵育。
[0275] 在一些实施方案中,将细胞组合物的细胞在一定体积的细胞培养基中与重组受体特异性药剂(例如CAR+特异性药剂)一起孵育。在某些实施方案中,将细胞在至少或约1μL、
至少或约10μL、至少或约25μL、至少或约50μL、至少或约100μL、至少或约500μL、至少或约
1mL、至少或约1.5mL、至少或约2mL、至少或约2.5mL、至少或约5mL、至少或约10mL、至少或约
20mL、至少或约25mL、至少或约50mL、至少或约100mL、或大于100mL的体积中与重组受体特
异性药剂一起孵育。在某些实施方案中,将细胞在落入在约1μL与约100μL之间、在约100μL与约500μL之间、在约500μL与约1mL之间、在约500μL与约1mL之间、在约1mL与约10mL之间、在约10mL与约50mL之间、或在约10mL与约100mL之间(每个都包含端值)的体积中与CAR+特
异性药剂一起孵育。在某些实施方案中,将细胞在约100μL与约1mL之间(包含端值)的体积
中与重组受体特异性药剂一起孵育。在特定实施方案中,将细胞在约500μL的体积中与重组
受体特异性药剂一起孵育。
[0276] 在一些实施方案中,将细胞组合物的细胞以在约1fmol与约1pmol之间、在约1pmol与约1nmol之间、在约1nmol与约1μmol之间、在约1μmol与约1mmol之间、或在约1mmol与1mol之间(每个都包含端值)的量与CAR+特异性药剂一起孵育。在特定实施方案中,将细胞组合
物的细胞以在约1fM与约1pM之间、在约1pM与约1nM之间、在约1nM与约1μM之间、在约1μM与约1mM之间、或在约1mM与1mol之间(每个都包含端值)的浓度与CAR+特异性药剂一起孵育。
示例性单位包括但不限于pg/mL、pg/(mL/hr)、pg(mL x细胞)、pg/(mL x hr x细胞)、和pg/
(mL x hr x 106个细胞)。
[0277] 在某些实施方案中,重组受体特异性活性(例如CAR+特异性活性)的测量值是在孵育期间或结束时的时间点的T细胞组合物中可溶性因子的量或浓度、或相对量或浓度。在特
定实施方案中,将测量值减去或归一化至对照测量值。在一些实施方案中,对照测量值是在
孵育之前取得的来自相同细胞组合物的测量值。在特定实施方案中,对照测量值是从未与
重组受体特异性刺激剂一起孵育的相同对照细胞组合物取得的测量值。在某些实施方案
中,对照是在与重组受体特异性药剂孵育期间的相同时间点从不含有重组受体阳性细胞的
细胞组合物取得的测量值。
[0278] 在一些实施方案中,测量值是如与对照相比的量或浓度的归一化比率。在特定实施方案中,测量值是每时间量(例如,每分钟或每小时)的可溶性因子的量或浓度。在一些实
施方案中,测量值是每个细胞或每设定或参考数量的细胞(例如,每100个细胞、每103个细
胞、每104个细胞、每105个细胞、每106个细胞等)的可溶性因子的量或浓度。在某些实施方案中,测量值是每时间量、每个细胞或每参考数量的细胞的可溶性因子的量或浓度。在一些实
施方案中,测量值是每个细胞组合物的表达重组受体的细胞、CAR+细胞、CAR+/CD8+细胞或
膜联蛋白-/CAR+/CD8+细胞的可溶性因子的量或浓度。在某些实施方案中,测量值是每时间
量(例如,每分钟或每小时)每个细胞组合物的表达重组受体的细胞、CAR+细胞、CAR+/CD8+
细胞或膜联蛋白-/CAR+/CD8+细胞的可溶性因子的量或浓度。在一些实施方案中,测量值是
每时间量每重组受体或CAR+特异性药剂的量或浓度的可溶性因子的量或浓度。在一些实施
方案中,测量值是每个细胞或每设定或参考数量的细胞每CAR+特异性药剂的量或浓度的可
溶性因子的量或浓度。在某些实施方案中,测量值是每时间量、每重量受体或CAR+特异性试
药的量或浓度、每个细胞或每参考数量的细胞的可溶性因子的量或浓度。在一些实施方案
中,测量值是每重组受体或CAR+特异性药剂的量或浓度、每个细胞组合物的表达重组受体
的细胞、CAR+细胞、CAR+/CD8+细胞或膜联蛋白-/CAR+/CD8+细胞的可溶性因子的量或浓度。
在某些实施方案中,测量值是每时间量、每重量受体或CAR+特异性药剂的量或浓度、每细胞
组合物的CAR+细胞、CAR+/CD8+细胞、或膜联蛋白-/CAR+/CD8+细胞的量的可溶性因子的量
或浓度。
[0279] 在特定实施方案中,重组受体或CAR依赖性活性是两种或更多种可溶性因子的产生或分泌。在某些实施方案中,重组受体或CAR依赖性活性是两种、三种、四种、五种、六种、七种、八种、九种、十种或超过十种可溶性因子的产生或分泌。在一些实施方案中,将两种、三种、四种、五种、六种、七种、八种、九种、十种或超过十种可溶性因子的测量值合并成算术平均值或几何平均值。在某些测量中,重组受体活性的测量值是两种、三种、四种、五种、六种、七种、八种、九种、十种或超过十种可溶性因子的复合物的分泌。
[0280] 在特定实施方案中,将重组受体依赖性活性的测量值例如通过对数变换进行变换。在某些实施方案中,将重组受体活性的测量值通过常用对数(log10(x))、自然对数(ln
(x))或二元对数(log2(x))进行变换。在一些实施方案中,重组受体依赖性活性的测量值是
两种或更多种可溶性因子的产生或分泌的测量值的复合。在一些实施方案中,在合并成复
合测量值之前,将可溶性因子的产生或分泌的两个或更多个测量值进行变换。在特定实施
方案中,在归一化至参考测量值之前,将重组受体依赖性活性的测量值进行变换。在某些实
施方案中,在归一化至参考测量值之前,将重组受体依赖性活性的测量值进行变换。
[0281] 在某些实施方案中,可溶性因子是细胞因子。细胞因子是在细胞通讯中广泛发挥作用的一大组小的信号传导分子。细胞因子最常与各种免疫调节分子(包括白细胞介素、趋
化因子和干扰素)相关。可替代地,细胞因子可以通过它们的结构来表征,其被分类为四个
家族:包括IL-2亚家族、IFN亚家族和IL-10亚家族的四α螺旋家族;IL-1家族、IL-17家族、和包括转化生长因子β家族成员的半胱氨酸结细胞因子。在一些实施方案中,CAR依赖性活性
是包括白细胞介素、干扰素和趋化因子的一种或多种可溶性因子的产生或分泌。在特定实
施方案中,CAR依赖性活性是IL-2家族成员、IFN亚家族成员、IL-10亚家族成员;IL-1家族成员、IL-17家族成员、半胱氨酸结细胞因子和/或转化生长因子β家族的成员中的一种或多种
的产生或分泌。
[0282] 在特定实施方案中,重组受体或CAR依赖性活性是IL-1、IL-1β、IL-2、sIL-2Ra、IL-3、IL-5、IL-6、IL-7、IL-8、IL-10、IL-12、IL-13、IL 27、IL-33、IL-35、TNF、TNFα、CXCL2、CCL2、CCL3、CCL5、CCL17、CCL24、PGD2、LTB4、干扰素γ(IFN-γ)、粒细胞巨噬细胞集落刺激因子(GM-CSF)、巨噬细胞炎性蛋白(MIP)-1a、MIP-1b、Flt-3L、分形趋化因子和/或IL-5中的一种或多种的产生和/或分泌。在某些实施方案中,CAR依赖性活性是Th17细胞因子的产生
或分泌。在一些实施方案中,Th17细胞因子是GMCSF。在一些实施方案中,CAR依赖性活性包
括Th2细胞因子的产生或分泌,其中所述Th2细胞因子是IL-4、IL-5、IL-10或IL-13。
[0283] 在某些实施方案中,重组受体或CAR依赖性活性是促炎性细胞因子的产生或分泌。促炎性细胞因子在启动炎性反应中起作用并且调节针对介导先天免疫应答的病原体的宿
主防御。促炎性细胞因子包括但不限于白细胞介素(IL)、白细胞介素-1-β(IL-1)、白细胞介素-3(IL-3)、白细胞介素-5(IL-5)、白细胞介素-6(IL-6)、白细胞介素-13(IL-13)、肿瘤坏
死因子(TNF)、CXC-趋化因子配体2(CXCL2)、CC-趋化因子配体2(CCL2)、CC-趋化因子配体3
(CCL3)、CC-趋化因子配体5(CCL5)、CC-趋化因子配体17(CCL17)、CC-趋化因子配体24
(CCL24)、前列腺素D2(PGD2)和白三烯B4(LTB4)以及IL-33。在一些实施方案中,CAR依赖性
活性是白细胞介素和/或TNF家族成员的产生和/或分泌。在特定实施方案中,CAR依赖性活
性是IL-1、IL-6、IL-8、和IL-18、TNF-α或其组合的产生和/或分泌。
[0284] 在特定实施方案中,CAR特异性活性是IL-2、IFN-γ、TNF-α或其组合的分泌。
[0285] 在特定实施方案中,活性是T细胞组合物的细胞溶解(细胞毒性)活性。在特定实施方案中,活性是重组受体(例如CAR)依赖性细胞溶解活性。在一些实施方案中,通过将表达
重组受体的细胞或含有表达重组受体的细胞的细胞组合物暴露于表达由重组受体结合和/
或识别的抗原或表位的靶细胞、与表达由重组受体结合和/或识别的抗原或表位的靶细胞
一起孵育和/或与表达由重组受体结合和/或识别的抗原或表位的靶细胞接触来评估重组
受体依赖性细胞溶解活性。可以通过直接或间接测量随时间的靶细胞数量来测量细胞溶解
活性。例如,可以在与重组受体表达细胞孵育之前将靶细胞与可检测标记(这样的标记是可
检测的然后靶细胞被裂解、或在存活靶细胞中是可检测的可检测标记)一起孵育。这些读数
提供直接或间接的靶细胞数量和/或靶细胞死亡,并且可以在测定期间的不同时间点进行
测量。靶细胞数量的减少和/或靶细胞死亡的增加指示细胞的细胞溶解活性。用于进行细胞
溶解测定的合适的方法在本领域中是已知的,并且包括但不限于铬-51释放测定、非放射性
铬测定、使用荧光染料(如羧基荧光素琥珀酰亚胺酯(CFSE)、PKH-2和PKH-26)的流式细胞术
测定。
[0286] 在某些实施方案中,重组受体(例如CAR)依赖性细胞溶解活性是通过将含有表达重组受体的细胞的细胞组合物与表达由重组受体结合或识别的抗原或其表位的靶细胞一
起孵育来测量的。在某些实施方案中,重组受体是CAR。在一些实施方案中,将细胞组合物的细胞与靶细胞以约10:1、约5:1、约4:1、约3:1、约2:1、约1:1、约1:2、约1:3、约1:4、约1:5、约
1:6、约1:7、约1:8、约1:9、或约1:10的比率,或以在10:1与1:1之间、在3:1与1:3之间、或在
1:1与1:10之间(每个都包含端值)的比率孵育。在一些实施方案中,将细胞组合物的细胞与
靶细胞以约10:1、约5:1、约4:1、约3:1、约2:1、约1:1、约1:2、约1:3、约1:4、约1:5、约1:6、约
1:7、约1:8、约1:9、或约1:10的细胞组合物的CAR+细胞、CAR+/CD8+细胞或膜联蛋白-/CAR+/CD8+细胞与靶细胞的比率,或以在10:1与1:1之间、在3:1与1:3之间、或在1:1与1:10之间
(每个都包含端值)的比率孵育。
[0287] 在某些实施方案中,将细胞组合物的细胞与靶细胞一起孵育长达或约1小时、约2小时、约3小时、约4小时、约5小时、约6小时、约8小时、约12小时、约18小时、约24小时、约48小时、或大于48小时。在一些实施方案中,将细胞组合物孵育约18小时、19小时、20小时、21小时、22小时、23小时、或24小时。在一些实施方案,将在约1x102个与约1x104个之间、在约
1x103个与约1x105个之间、在约1x104个与约1x106个之间、在约1x105个与约1x107个之间、在约1x106个与约1x108个之间、在约1x107个与约1x109个之间、或在约1x108个与约1x1010个之间的在细胞组合物中的细胞(每个都包含端值)与靶细胞一起孵育。在某些实施方案中,将
在约1x102个与约1x104个之间、在约1x103个与约1x105个之间、在约1x104个与约1x106个之
间、在约1x105个与约1x107个之间、在约1x106个与约1x108个之间、在约1x107个与约1x109个
8 10
之间、或在约1x10 个与约1x10 个之间的细胞组合物的CAR+细胞、CAR+/CD8+细胞、或膜联
蛋白-/CAR+/CD8+细胞(每个都包含端值)与靶细胞一起孵育。
[0288] 在一些实施方案中,将活性的测量值与对照进行比较。在某些实施方案中,对照是未与细胞组合物一起孵育的靶细胞的培养物。在一些实施方案中,对照是来自以相同比率
与靶细胞一起孵育的不含有CAR+细胞的对照细胞组合物的测量值。
[0289] 在某些实施方案中,细胞溶解活性测定的测量值是在孵育期间或结束时的时间点存活的靶细胞的数量。在某些实施方案中,测量值是在孵育期间释放的靶细胞死亡标记(例
如铬-51)的量。在一些实施方案中,测量值是通过从单独孵育的对照的靶细胞的量减去在
给定时间点在共孵育中的靶细胞的量确定的靶细胞死亡的量。在一些实施方案中,测量值
是与靶细胞的起始量相比在一定时间点保持的靶细胞的百分比。在特定实施方案中,测量
值是在一定时间量内被杀伤的细胞的量。在某些实施方案中,测量值是每个在细胞组合物
中的细胞的被杀伤的细胞的量。在一些实施方案中,测量值是每个细胞的被杀伤的细胞的
量,或每设定或参考数量的细胞的被杀伤的细胞的量,例如但不限于组合物的每100个细
胞、每103个细胞、每104个细胞、每105个细胞、每106个细胞、每107个细胞、每108个细胞、每
9 10
10个细胞、或每10 个细胞的被杀伤的靶细胞的量。在特定实施方案中,测量值是细胞组合
物中每个CAR+细胞、CAR+/CD8+细胞或膜联蛋白-/CAR+/CD8+细胞或其参考或设定数量的被
杀伤的细胞的量。在某些实施方案中,测量值是在一定时间量内每个在细胞组合物中的细
胞的被杀伤的细胞的量。在特定实施方案中,测量值是在一定时间量内每个在细胞组合物
中的CAR+细胞、CAR+/CD8+细胞或膜联蛋白-/CAR+/CD8+细胞的被杀伤的细胞的量。
[0290] 在一些实施方案中,重组受体依赖性活性不是细胞溶解活性。在特定实施方案中,CAR+依赖性活性不是细胞溶解活性。
[0291] 参考标准
[0292] 特定实施方案预期可以将重组受体依赖性活性和/或CAR+依赖性活性的测量值归一化至参考测量值(即参考量度)。在特定实施方案中,参考测量值是活性的预定测量值或
其值。在一些实施方案中,参考测量值是从不同受试者来源的多种细胞组合物的平均值或
众数。在一些实施方案中,所述多种细胞组合物源自不同的受试者并且含有表达相同重组
受体的细胞。在某些实施方案中,参考标准源自以与重组受体依赖性活性的测量值相同的
方式从对照组归一化或减去的测量值。在特定实施方案中,参考测量值源自在与重组受体
活性的测量值相同的测定条件下取得的从不同细胞组合物取得的测量值。在特定实施方案
中,将重组受体依赖性活性的测量值归一化至参考测量值。
[0293] 在某些实施方案中,参考测量值是来自多种细胞组合物的测量值的平均值或众数。在某些实施方案中,参考测量值取自含有表达相同CAR的细胞的细胞组合物,所述CAR被
所述多种细胞组合物中的至少一部分细胞表达。在某些实施方案中,参考测量值是从两种、
三种、四种、五种、六种、七种、八种、九种、十种、十一种、十二种、十三种、十四种、十五种、十六种、十七种、十八种、十九种、二十种、二十一种、二十二种、二十三种、二十四种、二十五种、超过二十五种、超过三十多种、超过四十种、或超过五十种细胞组合物取得的测量值的
平均值或中值。
[0294] 在某些实施方案中,重组受体特异性或CAR特异性活性的测量值取自从患有疾病或病症的人受试者来源的细胞组合物,并与参考测量值进行比较。在某些实施方案中,参考
测量值取自作为治疗性T细胞组合物的细胞组合物。在某些实施方案中,治疗性T细胞组合
物是例如在临床试验中治疗性地给予至人受试者的细胞组合物。在一些实施方案中,在给
予参考T细胞组合物后的安全性和功效结果是已知的。在某些实施方案中,受试者患有表达
抗原或与抗原相关的疾病或病症。
[0295] 在一些实施方案中,已经将每种参考T细胞组合物给予至受试者。在特定实施方案中,观察到并确定参考T细胞组合物的给予在给予至受试者后导致可接受的安全性。在特定
实施方案中,参考T细胞组合物的给予未导致任何严重毒性。在某些实施方案中,参考T细胞
组合物的给予不导致任何严重神经毒性。在特定实施方案中,参考T细胞组合物是与4级或
更低等级、3级或更低等级、2级或更低等级、1级或更低等级、或0级得分的神经毒性相关的
所有组合物。在一些实施方案中,参考细胞组合物与可接受的安全性特征相关。在特定实施
方案中,可接受的安全性特征是不存在观察到的1级或更高等级、观察到的2级或更高等级、
观察到的3级或更高等级、或4级或更高等级的神经毒性。在某些实施方案中,参考T细胞组
合物与不存在观察到的3级或更高等级的神经毒性的可接受的安全性特征相关。在特定实
施方案中,参考T细胞组合物与不存在观察到的3级或更高等级的神经毒性的可接受的安全
性特征相关。
[0296] 在某些实施方案中,已经观察到或确定每种参考治疗性T细胞组合物在给予至受试者后导致所希望的功效。在某些实施方案中,如同被给予参考T细胞组合物的受试者一
样,受试者具有表达抗原或与抗原相关的疾病或病症。在特定实施方案中,已经观察到或确
定每种参考治疗性T细胞组合物导致完全反应(CR)。
[0297] 在一些实施方案中,重组受体依赖性活性的测量值是一种或多种可溶性因子的产生或分泌的测量值。在某些实施方案中,可溶性因子是一种或多种细胞因子。在特定实施方
案中,CAR特异性活性是两种或更多种细胞因子的分泌。在某些实施方案中,两种或更多种
细胞因子的重组受体依赖性分泌的测量值取自细胞组合物并且被归一化至对应细胞因子
的参考测量值。在一些实施方案中,将两个或更多个归一化的测量值归一化至参考测量值。
在一些实施方案中,归一化的测量值被合并成单个复合值。
[0298] 在特定实施方案中,CAR特异性活性是IL-2、IFN-γ、TNF-α或其组合的分泌。在某些实施方案中,IL-2、IFN-γ、TNF-α或其组合的CAR依赖性分泌的测量值取自细胞组合物并且被归一化至对应细胞因子的参考测量值。在一些实施方案中,将IL-2、IFN-γ和TNF-α中
的两种或更多种的测量值归一化至参考测量值。在一些实施方案中,将归一化的测量值合
并成单个值。
[0299] 特定实施方案预期当参考测量值源自与可接受的安全性特征和/或所希望的功效相关的参考组合物时,接近1的归一化的测量值将具有也与可接受的安全性特征和/或所希
望的功效相关的高概率。某些实施方案预期如果测量值与参考测量值的比率接近或为大约
1:1,则来自T细胞组合物的测量值将具有与可接受的安全性特征和/或所希望的功效相关
的高概率。
[0300] 特定实施方案预期已经观察到特定细胞因子的CAR+依赖性分泌不指示不良事件或毒性结果或可能性、或与不良事件或毒性结果或可能性不相关或不显著相关。对于这些
细胞因子,CAR依赖性分泌的测量值确实预测治疗性给予T细胞组合物的安全性或功效。在
一些实施方案中,测量了与安全性或功效不相关或不指示安全性或功效的细胞因子的CAR
依赖性分泌的测量值,并将其与参考测量值进行比较或归一化至参考测量值,所述参考测
量值源自从源自其他受试者的细胞组合物取得的对应细胞因子的测量值。在一些实施方案
中,将与安全性或功效不相关或不指示安全性或功效的细胞因子的CAR依赖性细胞因子分
泌的测量值与对应的参考测量值进行比较,以确定细胞组合物是否产生对CAR依赖性刺激
的可变反应。在一些实施方案中,不认为分泌与安全性或功效相关或指示安全性或功效。特
定实施方案预期IL-4、IL-5、IL-10或IL-13或其复合物的CAR依赖性细胞因子分泌的一个或
多个测量值的归一化可用于确定或确认从细胞组合物取得的测量值的变异性和可靠性。
[0301] III.评估治疗性T细胞组合物的方法
[0302] 本文提供了涉及表征或评估在将一个或多个单位剂量的治疗性T细胞组合物给予至患有疾病或病症的受试者之前或同时或之后的治疗性组合物(在一些实施方案中)和治
疗性T细胞组合物的效力和/或安全性和/或活性和/或功效的方法。在一些实施方案中,所
提供的方法评估了在给予本文描述的T细胞组合物后发生不良事件的风险。在一些实施方
案中,如果确定组合物在预定的安全性范围之外,则不将T细胞组合物释放用于随后给予至
受试者。在一些方面,所提供的方法提供了释放测定,所述释放测定可以评估细胞组合物以
确定,在其他方面,如果向受试者给予组合物,是否可能与发生毒性(如严重神经毒性)的风
险相关和/或是否有可能是有效的。在一些实施方案中,如果B高于USL,则推荐不将T细胞组
合物给予至受试者和/或改变或调整待给予至受试者的单位剂量。如果B低于USL,则可以释
放产品用于治疗。
[0303] 在一些实施方案中,使用本文描述的方法评估的样品取自或源自T细胞组合物,所述T细胞组合物包含从患有疾病或病症的受试者来源并用编码特异性地结合与疾病或病症
相关的抗原的重组受体(任选地嵌合抗原受体(CAR))的核酸转导的T细胞。在一些方面,本
文描述的测定确定细胞组合物的B,其中B是指示给定组合物中重组受体依赖性活性的程度
或与其相关的参数的值、或所述值的倍数或变换。本文还提供了测定治疗性T组合物的方
法,所述方法包括基于B对来自T细胞组合物的样品评估所述细胞组合物的效力,所述T细胞
组合物包含T细胞,所述T细胞包含特异性地结合与疾病或病症相关的抗原的重组受体,其
中B是指示给定组合物中的活性程度或与其相关的参数的值、或所述值的倍数或变换。在一
些实施方案中,所提供的方法进一步基于B评估细胞组合物的效力和/或评估所述组合物是
否高于B的LSL和/或低于USL。
[0304] 在一些实施方案中,如果B高于USL,则将待给予至受试者的单位剂量进行改变或调整,其中经调整的单位剂量含有在T细胞组合物中目标数量的细胞或目标数量的参考单
位(RU),其中在给定组合物中的RU由式RU=A x B定义,其中:A是在给定组合物中存在的具
有表型的细胞的细胞数量、或其倍数、分数或变换,或者是在给定组合物中具有两种或更多
种表型的细胞的数量的平均值或加权平均值、或所述平均值或加权平均值的倍数、分数或
变换;并且B是指示在给定组合物中的重组受体依赖性(任选地CAR依赖性)活性的程度或与
其相关的参数的值、或所述值的分数或倍数或变换。
[0305] 在一些实施方案中,参数是一种或多种因子的量度或其归一化值。在一些实施方案中,产生的指示物在细胞内细胞因子染色测定中进行测量,所述测定包括将T细胞组合物
的样品与多克隆药剂、抗原特异性药剂或结合重组受体的药剂一起孵育。在一些实施方案
中,所述量度是在如下测定中的,所述测定涉及在抗原、表达抗原的细胞和/或与重组受体
(任选地CAR)特异性地结合的药剂的存在下将给定组合物或其样品培养或孵育固定的时间
(任选地24小时)。在一些方面,所述测定是ELISA。
[0306] 在一些实施方案中,因子的量度是指示以下的量度或水平:因子的浓度、相对浓度、量或相对量;每单位的在给定组合物中的输入细胞而言因子的量或相对量;每单位的时
间(任选地一小时)每单位的在给定组合物中的输入细胞而言因子的量或相对量。在一些实
施方案中,所述一种或多种因子是可溶性因子的一种或组合,任选地细胞因子、趋化因子或
可溶性受体中的一种或组合,所述可溶性受体任选地为可溶性共刺激受体。
[0307] 在一些实施方案中,参数是一种或多种因子的量度或其归一化值。在一些实施方案中,重组受体依赖性活性是IL-1、IL-1β、IL-2、sIL-2Ra、IL-3、IL-5、IL-6、IL-7、IL-8、IL-
10、IL-12、IL-13、IL 27、IL-33、IL-35、TNF、TNFα、CXCL2、CCL2、CCL3、CCL5、CCL17、CCL24、PGD2、LTB4、干扰素γ(IFN-γ)、粒细胞巨噬细胞集落刺激因子(GM-CSF)、巨噬细胞炎性蛋
白(MIP)-1a、MIP-1b、Flt-3L、分形趋化因子和/或IL-5中的一种或多种的产生或积累的量
度。在某些实施方案中,CAR依赖性活性是Th17细胞因子的产生或分泌。在一些实施方案中,Th17细胞因子是GMCSF。在一些实施方案中,重组受体依赖性活性是Th2细胞因子的产生或
积累的量度,其中所述Th2细胞因子是IL-4、IL-5、IL-10或IL-13。在某些实施方案中,B指示促炎性细胞因子的产生和/或分泌,所述促炎性细胞因子是例如白细胞介素(IL)、白细胞介
素-1-β(IL-1)、白细胞介素-3(IL-3)、白细胞介素-5(IL-5)、白细胞介素-6(IL-6)、白细胞介素-13(IL-13)、肿瘤坏死因子(TNF)、CXC-趋化因子配体2(CXCL2)、CC-趋化因子配体2
(CCL2)、CC-趋化因子配体3(CCL3)、CC-趋化因子配体5(CCL5)、CC-趋化因子配体17
(CCL17)、CC-趋化因子配体24(CCL24)、前列腺素D2(PGD2)和白三烯B4(LTB4)以及IL-33。在
一些实施方案中,重组受体依赖性活性是白细胞介素和/或TNF家族成员如IL-1、IL-6、IL-8
和IL-18、TNF-α或其组合的产生或积累的量度。在特定实施方案中,重组受体依赖性活性是IL-2、IFN-γ、TNF-α或其组合的产生或积累的量度。在一些实施方案中,所述一种或多种因子是促炎性细胞因子、Th2细胞因子和Th17细胞因子中的一种或组合。在一些实施方案中,
所述一种或多种因子是IL-2、IFN-γ、TNF-α、IL4、IL-5、IL-10、IL-13、GM-CSF、sCD137、MIP1a和M1Pb中的一种或组合。在一些实施方案中,所述一种或多种因子是IL-2、IFN-γ、
TNF-α和IL-10中的一种或组合。
[0308] 在一些实施方案中,所述一种或多种因子是可溶性因子的一种或组合,任选地细胞因子、趋化因子或可溶性受体中的一种或组合,所述可溶性受体任选地为可溶性共刺激
受体。在一些实施方案中,参数是两种或更多种因子的量度的算术平均值或几何平均值。在
一些实施方案中,所述参数是TNF-α、IFN-γ和IL-2中的至少两种或者TNF-α、IFN-γ和IL-2的量度(任选地量或浓度)的算术平均值或几何平均值。在一些实施方案中,所述参数是所
述量度的归一化值,其中归一化是与所述因子的参考量度相比较的。
[0309] 在一些实施方案中,A是在给定组合物中存在的给定表型的细胞的数量、或其倍数或分数或变换。在一些方面,A是在给定组合物中具有两种或更多种表型的细胞的数量的平
均值或加权平均值、或所述平均值或加权平均值的倍数、分数或变换,其中任选地所述两种
或更多种表型包括包含CD8+的第一表型和包含CD4+的第二表型。
[0310] 在一些实施方案中,参考RU的目标数量等于或低于RU的阈值数量,其中经调整的单位剂量不包含大于阈值数量的RU。在一些方面,单位的目标数量小于单位的阈值数量,所
述阈值数量任选地是参考单位的安全数量,其中,参考单位的所述安全数量是相对于在用
包含表达重组受体(任选地CAR)的T细胞的治疗性T细胞组合物治疗后分析的一组受试者,
向在曾持续发生不良事件的组中的那些受试者中的受试者给予的疗法的参考单位的最低
数量。在一些方面,不良事件是严重不良事件,任选地严重神经毒性,任选地等于或高于4级或5级或至少延长的3级神经毒性。在一些方面,参考单位的目标数量比参考单位的安全数
量少了对应于安全系数的量和/或少了在1.5倍至3倍范围内(任选地约2倍)的量、或少了为
未发生过不良事件(任选地0-2级神经毒性)的一组受试者的标准偏差的倍数(任选地其中
所述倍数在1.5倍至3倍的范围内)的量。在一些实施方案中,参考单位的目标数量比参考单
位的安全数量小与安全系数对应的量。在某些实施方案中,安全系数是在安全数量的0.5倍
至10倍、1.0倍-5.0倍、或1.5倍至3倍的范围内,和/或是安全数量的为、约、或至少1倍、1.5倍、2倍、2.5倍或3倍。在特定实施方案中,安全系数小于安全数量。在一些实施方案中,安全系数是相对于在用包含表达重组受体(如CAR)的T细胞的治疗性T细胞组合物治疗后分析的
一组受试者,与向在未发生过不良事件的组中的受试者(例如,在经历了2级或更低等级的
神经毒性的组中的受试者)给予的以参考单位计的剂量的平均值(例如均值)之间的标准偏
差的倍数。在一些实施方案中,安全系数是在标准偏差的0.5倍至10倍、1.0倍-5.0倍、或1.5倍至3倍的范围内,和/或是标准偏差的为、约、或至少1倍、1.5倍、2倍、2.5倍或3倍。在一些实施方案中,比安全数量低与安全系数对应的量的参考单位的数量或剂量包括,例如相对
于继续发生反应(例如CR)的一组受试者,与反应(例如CR)相关的参考单位的数量或剂量。
[0311] 在一些方面,参考单位的目标数量等于或高于参考单位的参考功效数量,其中所述参考功效数量是相对于在用包含重组受体(任选地CAR)的治疗性T细胞组合物治疗后分
析的一组受试者,向展现出所希望的治疗结果(任选地部分反应或完全反应(CR))的组中的
一名或多名受试者给予的疗法的单位的数量。
[0312] 在一些方面,经调整的单位剂量小于用包含表达重组受体(任选地CAR)的T细胞的治疗性T细胞组合物治疗的一组受试者的平均单位剂量,任选地小于其1.5倍、小于其2倍、
小于其3倍、小于其4倍。
[0313] 在一些实施方案中,在向受试者给予T细胞组合物之后评估T细胞组合物的样品,任选地冷冻保存的样品。在一些实施方案中,如果B高于USL,则将受试者确定为有毒性风
险。在一些实施方案中,如果B高于USL,则监测被给予组合物的受试者和/或用药剂治疗被
给予组合物的受试者,以在给予细胞组合物之后和任选地在发生毒性结果的体征或症状之
前改善或降低毒性结果或细胞因子释放综合征的可能性。
[0314] 本文还提供了评估对治疗性T细胞组合物的毒性的风险的方法,所述方法包括:(a)对来自已经给予至受试者的T细胞组合物的样品评估在给定范围内的参考单位(RU),所
述T细胞组合物包含T细胞,所述T细胞包含特异性地结合与疾病或病症相关的抗原的重组
受体,其中在给定组合物中的RU由式RU=A x B定义,其中:A是在给定组合物中存在的具有
表型的细胞的细胞数量、或其倍数、分数或变换,或者是在给定组合物中具有两种或更多种
表型的细胞的数量的平均值或加权平均值、或所述平均值或加权平均值的倍数、分数或变
换;并且B是指示在给定组合物中的重组受体依赖性(任选地CAR依赖性)活性的程度或与其
相关的参数的值、或所述值的分数或倍数或变换;并且(b)将所述RU与参考安全数量的RU进
行比较,其中所述比较指示所述受试者是否有发生不良事件(任选地严重不良事件,任选地
等于或高于4级或5级或至少延长的3级神经毒性的严重神经毒性)的风险。在一些方面,A是
在给定组合物中存在的给定表型的细胞的数量、或其倍数或分数或变换。在一些方面,A是
在给定组合物中具有两种或更多种表型的细胞的数量的平均值或加权平均值、或所述平均
值或加权平均值的倍数、分数或变换,其中任选地所述两种或更多种表型包括包含CD8+的
第一表型和包含CD4+的第二表型。在一些方面,RU的参考安全数量是相对于在用包含表达
重组受体(任选地CAR)的T细胞的治疗性T细胞组合物治疗后分析的一组受试者,向在曾持
续发生不良事件的组中的那些受试者中的受试者给予的疗法的参考单位的最低数量。在一
些方面,如果所述比较指示RU高于参考安全RU,则监测被给予组合物的受试者和/或用药剂
治疗被给予组合物的受试者,以在给予细胞组合物之后和任选地在发生毒性结果的体征或
症状之前改善或降低毒性结果或细胞因子释放综合征的可能性。
[0315] 本文还提供了生产包含T细胞组合物单位剂量的治疗性组合物的方法,所述方法包括:(a)测定T细胞组合物,所述T细胞组合物包含源自患有疾病或病症的受试者的并用编
码重组受体(任选地嵌合抗原受体(CAR))的核酸转导的T细胞,所述重组受体特异性地结合
与疾病或病症相关的抗原,其中所述测定确定所述细胞组合物的B,其中B是指示在给定组
合物中的重组受体依赖性(任选地CAR依赖性)活性的程度或与其相关的参数的值、或所述
值的倍数或变换;并且(b)向容器(例如,小瓶)中填充组合物的全部或部分和任选地另一种
溶液以实现T细胞组合物单位剂量,其中所述单位剂量含有目标数量的所述T细胞组合物的
参考单位(RU),其中在给定组合物中的RU由式RU=A x B定义,其中A是在给定组合物中存
在的具有表型的细胞的细胞数量、或其倍数、分数或变换,或者是在给定组合物中具有两种
或更多种表型的细胞的数量的平均值或加权平均值、或所述平均值或加权平均值的倍数、
分数或变换。
[0316] 本文还提供了生产包含T细胞组合物单位剂量的治疗性组合物的方法,所述方法包括向容器(例如,小瓶)中填充T细胞组合物(所述T细胞组合物包含如下T细胞,所述T细胞
包含特异性地结合与疾病或病症相关的抗原的重组受体)的全部或部分和任选地另一种溶
液以实现T细胞组合物单位剂量,其中所述单位剂量含有目标数量的所述T细胞组合物的参
考单位(RU),其中在给定组合物中的RU由式RU=A x B定义,其中A是在给定组合物中存在
的具有表型的细胞的数量、或其倍数、分数或变换,或者是在给定组合物中具有两种或更多
种表型的细胞的数量的平均值或加权平均值、或所述平均值或加权平均值的倍数、分数或
变换;并且B是指示在给定组合物中的重组受体依赖性(任选地CAR依赖性)活性的程度或与
其相关的参数的值、或所述值的倍数或变换。在一些方面,A是在给定组合物中存在的给定
表型的细胞的数量、或其倍数或分数或变换。在一些方面,A是在给定组合物中具有两种或
更多种表型的细胞的数量的平均值或加权平均值、或所述平均值或加权平均值的倍数、分
数或变换,其中任选地所述两种或更多种表型包括包含CD8+的第一表型和包含CD4+的第二
表型。
[0317] 在一些实施方案中,A是在给定组合物中存在的具有表型的细胞数量,并且B是指示在给定组合物中的重组受体依赖性活性的程度或与其相关的参数的值。在一些实施方案
中,A和/或B分别是数量或值的变换,其中所述变换包括对数变换、幂变换或罗吉特(logit)
变换。在一些实施方案中,A是在给定组合物中存在的具有表型的细胞的数量,并且B是指示
在给定T细胞组合物中的CAR依赖性活性的程度或与其相关的参数的值的倍数或变换,任选
地其中B是所述值的对数变换。在一些实施方案中,对数变换是常用对数(log10(x))、自然
对数(ln(x))或二元对数(log2(x))。
[0318] 在一些实施方案中,A是在组合物中的存活细胞的数量,和/或是不凋亡、不展现指示早期凋亡或指示凋亡的因子、不处于凋亡的早期阶段、或不处于凋亡的晚期阶段的细胞
的数量,和/或是特定分化状态的细胞的数量,和/或是具有记忆/干细胞样属性的细胞的数
量或是其倍数或变换。在一些实施方案中,表型包括:不存在指示凋亡、或在凋亡级联或途
径中的一个或多个步骤的因子,任选地不存在凋亡标记的表达。在一些实施方案中,表型包
括凋亡标记(任选地早期凋亡或晚期凋亡标记)的阴性表达。在一些实施方案中,凋亡标记
是表面磷脂酰丝氨酸和/或用膜联蛋白V检测,或是半胱天冬酶的活性或前体形式,任选地
半胱天冬酶3的活性或前体形式。在一些实施方案中,表型包括膜联蛋白-。在一些实施方案
中,A是T细胞的总数、CD3+细胞的总数、CD4+或CD8+细胞的总数、CD3+CAR+细胞的总数、CD8+CAR+细胞的总数、CD4+CAR+总数、或任何前述的活细胞或存活细胞的总数、或所述总数的倍
数或变换值。在一些实施方案中,A是CD3+细胞的总数、CD8+的总数、CD3+CAR+细胞的总数、CD8+CAR+细胞的总数、或任何前述的活细胞或存活细胞的总数、或所述总数的倍数或变换
值。在一些实施方案中,A是凋亡标记阴性(-)细胞(其为CD3+CAR+细胞)的总数、凋亡标记阴
性(-)细胞(其为CD4+CAR+)的总数、凋亡标记阴性(-)细胞(其为CD8+CAR+细胞)的总数、或
所述总数的倍数或变换值,其中所述凋亡标记是膜联蛋白V或半胱天冬酶。A是膜联蛋白-
CD3+CAR+细胞的总数、膜联蛋白-CD4+CAR+的总数、膜联蛋白-CD8+CAR+细胞的总数、或所述
总数的倍数或变换值。在一些实施方案中,A是膜联蛋白-CD3+CAR+细胞的总数或膜联蛋白-
CD8+CAR+细胞的总数。
[0319] 在一些实施方案中,表型包括表面标记的阳性表达,所述表面标记是CD3、CD4或CD8中的一种或多种,和/或表型包括重组受体(任选地CAR)或用于表达重组受体的替代标
记的阳性表达。在一些方面,表型是CD3+CAR、CD4+/CAR+、CD8+/CAR+。在一些实施方案中,表型包含产生细胞因子的一种或组合(任选地对抗原或重组受体是非特异性的和/或是多克
隆产生的)的指示物,其中所述一种或多种细胞因子是IL-2、IL-13、IL-17、IFN-γ或TNF-α。
在一些实施方案中,在测定(任选地细胞内细胞因子染色测定)中测量产生的指示物,所述
测定包括将T细胞组合物的样品与多克隆药剂、抗原特异性药剂或结合重组受体(任选地
CAR)的药剂一起孵育。在一些实施方案中,所述药剂是或包含PMA和离子霉素,或者是或包
含T细胞受体或T细胞受体复合物激动剂。在一些实施方案中,表型包括激活标记的阴性表
达,其中所述激活标记选自CD25、CD127、LAG3、Ki67及其组合。在一些实施方案中,表型包括消耗标记的阴性表达,其中所述消耗标记是PD1或FOXP3基因产物或其组合。在一些实施方
案中,表型包括幼稚表型或记忆表型,任选地其中所述记忆表型包括T效应记忆表型、T中央
记忆表型或表达CD45RA(Temra)的T效应记忆表型。
[0320] 在一些实施方案中,重组受体依赖性活性是促炎性细胞因子(任选地,TNF-α、IFN-γ、IL-2和IL-10的一种或组合)的产生或积累的量度。在一些实施方案中,参考量度是在包
含嵌合抗原受体(CAR)的多种(任选地至少10种、至少15种、至少20种)参考治疗性T细胞组
合物中的量度的平均值,其中:(i)已经观察到或确定了每种参考治疗性T细胞组合物在向
受试者给予后导致可接受的安全性特征,任选地其中所述受试者患有表达所述抗原或与所
述抗原相关的疾病或病症;和/或(ii)已经观察到或确定了每种参考治疗性T细胞组合物在
向受试者给予后导致所希望的功效,任选地其中所述受试者患有表达所述抗原或与所述抗
原相关的疾病或病症。
[0321] 在一些特定实施方案中,所述参数是所述量度的归一化值,其中归一化是与所述因子的参考量度相比较的。在一些实施方案中,参考量度是在包含嵌合抗原受体(CAR)的多
种(任选地至少10种、至少15种、至少20种)参考治疗性T细胞组合物中的量度的平均值,其
中:(i)已经观察到或确定了每种参考治疗性T细胞组合物在向受试者给予后导致可接受的
安全性特征,任选地其中所述受试者患有表达所述抗原或与所述抗原相关的疾病或病症;
和/或(ii)已经观察到或确定了每种参考治疗性T细胞组合物在向受试者给予后导致所希
望的功效,任选地其中所述受试者患有表达所述抗原或与所述抗原相关的疾病或病症。在
一些实施方案中,可接受的安全性特征是不存在观察到的2级或更高等级或不存在3级或更
高等级的神经毒性。
[0322] 在一些实施方案中,可接受的安全性特征是不存在观察到的3级或更高等级的神经毒性。在一些实施方案中,所述功效是部分反应或是完全反应(CR)。在一些实施方案中,
参考量度是通过相同的测定,所述因子在参考T细胞组合物中的量度,所述参考T细胞组合
物是通过与治疗性T细胞组合物相同的方法产生的,但不表达重组受体(任选地CAR)、不特
异性识别抗原和/或不表达任何重组受体,任选地任何CAR。在一些实施方案中,将所述参数
归一化以控制所述一种或多种因子的量度的患者特异性变异。在一些实施方案中,所述参
数是所述因子的量度的归一化值(与对照因子在相同测定中的相同量度相比),其中所述对
照因子在治疗性T细胞组合物中的水平已知不会(或已经观察到不会)指示不良事件或毒性
结果或不良事件或毒性结果的可能性或风险或者与其相关或者与其显著相关,其中所述不
良事件或毒性结果任选地是严重神经毒性。在一些实施方案中,所述对照因子是或包含与
在给予T细胞组合物后持续发生不良事件的多名受试者中的不良事件的发生无统计学相关
和/或不相关的因子,任选地所述对照因子是IL-5、IL-13、GM-CSF和IL-6的一种或组合,任
选地其中所述对照因子的量度是前述中的两种或更多种的算术平均值或几何平均值。
[0323] 在一些实施方案中,所述参数不包含细胞溶解活性或其量度。在一些实施方案中,所述参数不包含重组受体依赖性或抗原特异性细胞溶解活性或其量度。
[0324] 在一些特定实施方案中,表型是CD8+CAR+细胞或膜联蛋白-CD8+CAR+细胞;并且参数是促炎性细胞因子的量度或者是其归一化值,所述促炎性细胞因子任选地是TNF-α、IL-2
和IFN-γ中的一种或组合。
[0325] 在一些实施方案中,所述不良事件是4级或5级神经毒性,并且所述阈值:是或是约1.75x 107(如果A是凋亡标记阴性(-)和CD8+CAR+的,并且B是TNF-α)、或其归一化值;是或
是约2.19x 107(如果A是CD8+CAR+的,并且B是TNF-α)、或其归一化值;是或是约1.25x 107
(如果A是凋亡标记阴性(-)CD8+CAR+的,并且如果B是IFN-γ)、或其归一化值;是或是约
1.56x 107(如果A是CD8+CAR+的,并且B是IFN-γ)、或其归一化值;是或是约1.5x 107(如果A是凋亡标记阴性(-)CD8+CAR+的,并且如果B是IL-2)、或其归一化值;是或是约1.88x 107
(如果A是CD8+CAR+的,并且B是IL-2)、或其归一化值;是或是约1.5x 107(如果A是凋亡标记
阴性(-)CD8+CAR+的,并且如果B是TNF-α和IFN-γ)、或其归一化值;是或是约1.88x 107(如果A是CD8+CAR+的,并且B是TNF-α和IFN-γ)、或其归一化值;是或是约2.0x 107(如果A是凋亡标记阴性(-)CD8+CAR+的,并且如果B是TNF-α和IL-2)、或其归一化值;是或是约2.5x 107
7
(如果A是CD8+CAR+的,并且B是TNF-α和IL-2)、或其归一化值;是或是约1.25x 10 (如果A是凋亡标记阴性(-)CD8+CAR+的,并且如果B是IFN-γ和IL-2)、或其归一化值;是或是约1.56x 
107(如果A是CD8+CAR+的,并且B是IFN-γ和IL-2)、或其归一化值;是或是约1.75x 107(如果A是凋亡标记阴性(-)CD8+CAR+的,并且如果B是TNF-α、IFN-γ和IL-2)、或其归一化值;是或
7
是约2.19x 10 (如果A是CD8+CAR+的,并且B是TNF-α、IFN-γ和IL-2)、或其归一化值,任选地其中所述凋亡标记是膜联蛋白V或活性半胱天冬酶3。
[0326] 在一些实施方案中,所述不良事件是4级或5级神经毒性,并且所述目标参考单位的给定范围:是在或约在2.0x 105与1.75x 107之间(包含端值)(如果A是凋亡标记阴性(-)
和CD8+CAR+的,并且B是TNF-α)、或其归一化值;是在或约在2.5x 105与2.19x 107之间(包含端值)(如果A是CD8+CAR+的,并且B是TNF-α)、或其归一化值;是在或约在4x 105与1.25x 107之间(包含端值)(如果A是凋亡标记阴性(-)CD8+CAR+的,并且如果B是IFN-γ)、或其归一化
值;是在或约在5x 106与1.56x 107之间(包含端值)(如果A是CD8+CAR+的,并且B是IFN-γ)、或其归一化值;是在或约在2.0x 105与1.5x 107之间(包含端值)(如果A是凋亡标记阴性(-)
CD8+CAR+的,并且如果B是IL-2)、或其归一化值;是在或约在2.5x 105与1.88x 107之间(包
5
含端值)(如果A是CD8+CAR+的,并且B是IL-2)、或其归一化值;是在或约在3.0x 10 与1.5x 
107之间(包含端值)(如果A是凋亡标记阴性(-)CD8+CAR+的,并且如果B是TNF-α和IFN-γ)、
或其归一化值;是在或约在3.75x 105与1.88x 107之间(包含端值)(如果A是CD8+CAR+的,并
且B是TNF-α和IFN-γ)、或其归一化值;是在或约在3.0x 105与2.0x 107之间(包含端值)(如果A是凋亡标记阴性(-)CD8+CAR+的,并且如果B是TNF-α和IL-2)、或其归一化值;是在或约
在3.75x 105与2.5x 107之间(包含端值)(如果A是CD8+CAR+的,并且B是TNF-α和IL-2)、或其归一化值;是在或约在4.0x 105与1.25x 107之间(包含端值)(如果A是凋亡标记阴性(-)CD8
+CAR+的,并且如果B是IFN-γ和IL-2)、或其归一化值;是在或约在5.0x 105与1.56x 107之
间(包含端值)(如果A是CD8+CAR+的,并且如果B是IFN-γ和IL-2)、或其归一化值;是在或约
在4.0x 105与1.75x 107之间(包含端值)(如果A是凋亡标记阴性(-)CD8+CAR+的,并且如果B
是TNF-α、IFN-γ和IL-2)、或其归一化值;是在或约在5.0x 105与2.19x 107之间(包含端值)(如果A是CD8+CAR+的,并且B是TNF-α、IFN-γ和IL-2)、或其归一化值,任选地其中所述凋亡标记是膜联蛋白V或活性半胱天冬酶3。
[0327] 在一些实施方案中,所述不良事件是至少延长的3级神经毒性,并且所述阈值:是或是约1.0x 106(如果A是凋亡标记阴性(-)和CD8+CAR+的,并且B是TNF-α)、或其归一化值;
是或是约1.25x 106(如果A是CD8+CAR+的,并且B是TNF-α)、或其归一化值;是或是约2.0x 
106(如果A是凋亡标记阴性(-)CD8+CAR+的,并且如果B是IFN-γ)、或其归一化值;是或是约
2.5x 106(如果A是CD8+CAR+的,并且B是IFN-γ)、或其归一化值;是或是约3.0x 106(如果A
是凋亡标记阴性(-)CD8+CAR+的,并且如果B是IL-2)、或其归一化值;是或是约3.75x 106
(如果A是CD8+CAR+的,并且B是IL-2)、或其归一化值;是或是约1.5x 106(如果A是凋亡标记
阴性(-)CD8+CAR+的,并且如果B是TNF-α和IFN-γ)、或其归一化值;是或是约1.88x 106(如果A是CD8+CAR+的,并且B是TNF-α和IFN-γ)、或其归一化值;是或是约2.5x 106(如果A是凋亡标记阴性(-)CD8+CAR+的,并且如果B是TNF-α和IL-2)、或其归一化值;是或是约3.12x 
106(如果A是CD8+CAR+的,并且B是TNF-α和IL-2)、或其归一化值;是或是约3.0x 106(如果A是凋亡标记阴性(-)CD8+CAR+的,并且如果B是IFN-γ和IL-2)、或其归一化值;是或是约
6 6
3.75x10 (如果A是CD8+CAR+的,并且B是IFN-γ和IL-2)、或其归一化值;是或是约2.0x 10
(如果A是凋亡标记阴性(-)CD8+CAR+的,并且如果B是TNF-α、IFN-γ和IL-2)、或其归一化
值;是或是约2.5x 106(如果A是CD8+CAR+的,并且B是TNF-α、IFN-γ和IL-2)、或其归一化
值,任选地其中所述凋亡标记是膜联蛋白V或活性半胱天冬酶3。
[0328] 在一些实施方案中,所述不良事件是至少延长的3级,并且所述目标参考单位的给定范围:是在或约在3.0x 105与1.0x 106之间(包含端值)(如果A是凋亡标记阴性(-)和CD8+
CAR+的,并且B是TNF-α)、或其归一化值;是在或约在3.75x 105与1.25x 106之间(包含端值)(如果A是CD8+CAR+的,并且B是TNF-α)、或其归一化值;是在或约在4x 105与2.0x 106之间
(包含端值)(如果A是凋亡标记阴性(-)CD8+CAR+的,并且如果B是IFN-γ)、或其归一化值;
是在或约在5x 106与2.5x 106之间(包含端值)(如果A是CD8+CAR+的,并且B是IFN-γ)、或其
归一化值;是在或约在2.0x 105与3.0x 106之间(包含端值)(如果A是凋亡标记阴性(-)CD8+
CAR+的,并且如果B是IL-2)、或其归一化值;是在或约在2.5x 105与3.75x 106之间(包含端
值)(如果A是CD8+CAR+的,并且B是IL-2)、或其归一化值;是在或约在3.0x 105与1.5x 106之间(包含端值)(如果A是凋亡标记阴性(-)CD8+CAR+的,并且如果B是TNF-α和IFN-γ)、或其
5 6
归一化值;是在或约在3.75x 10与1.88x 10之间(包含端值)(如果A是CD8+CAR+的,并且B
是TNF-α和IFN-γ)、或其归一化值;是在或约在3.0x 105与2.5x 106之间(包含端值)(如果A是凋亡标记阴性(-)CD8+CAR+的,并且如果B是TNF-α和IL-2)、或其归一化值;是在或约在
3.75x 105与3.12x 106之间(包含端值)(如果A是CD8+CAR+的,并且B是TNF-α和IL-2)、或其
5 6
归一化值;是在或约在4.0x 10与3.0x 10之间(包含端值)(如果A是凋亡标记阴性(-)CD8+
CAR+的,并且如果B是IFN-γ和IL-2)、或其归一化值;是在或约在5.0x 105与3.75x 106之间(包含端值)(如果A是CD8+CAR+的,并且B是IFN-γ和IL-2)、或其归一化值;是在或约在4.0x 
105与2.0x 106之间(包含端值)(如果A是凋亡标记阴性(-)CD8+CAR+的,并且如果B是TNF-α、
5 6
IFN-γ和IL-2)、或其归一化值;是在或约在5.0x 10与2.5x 10之间(包含端值)(如果A是
CD8+CAR+的,并且B是TNF-α、IFN-γ和IL-2)、或其归一化值,任选地其中所述凋亡标记是膜联蛋白V或活性半胱天冬酶3。
[0329] 在可以与本文描述的任何其他实施方案组合的一些实施方案中,重组受体是CAR。在一些实施方案中,所述CAR包含与所述抗原特异性地结合的细胞外抗原识别结构域和包
含ITAM的细胞内信号传导结构域,其中任选地,所述细胞内信号传导结构域包含CD3-ζ(CD3
ζ)链的细胞内结构域;和/或其中所述CAR进一步包含共刺激信号传导区域,其任选包含
CD28或4-1BB的信号传导结构域。在可以与任何其他实施方案组合的一些实施方案中,T细
胞是CD4+或CD8+的。在一些实施方案中,T细胞是原代T细胞,任选地对受试者是自体的或同
种异体的。
[0330] IV.用治疗性T细胞组合物治疗的方法
[0331] 本文提供了涉及向患有疾病或病症的受试者给予一个或多个单位剂量的治疗性T细胞组合物的方法。在一些实施方案中,所述一个或多个单位剂量含有基于A(表型的细胞
的数量)和/或B(与重组受体依赖性活性(如CAR依赖性活性,例如抗原特异性活性)的程度
相关的参数的值)的目标参考数量的单位的细胞组合物。
[0332] A.疾病和病症以及给予的方法
[0333] 在一些实施方案中,将一定剂量的表达重组受体的细胞给予至受试者以治疗或预防疾病、病症和障碍,包括癌症。在一些实施方案中,将细胞、群体和组合物给予至受试者或患者,所述受试者或患者患有要例如通过过继细胞疗法(如过继T细胞疗法)治疗的特定疾
病或病症。在一些实施方案中,将细胞和组合物(例如在孵育和/或其他处理步骤后的工程
化组合物和生产结束时(end-of-production)的组合物)给予至受试者,例如患有疾病或病
症或具有疾病或病症的风险的受试者。在一些方面,所述方法由此治疗疾病或病症(例如,
改善其一种或多种症状),例如通过减轻表达由工程化T细胞识别的抗原的癌症中的肿瘤负
荷来治疗。
[0334] 用于过继细胞疗法的细胞的给予方法是已知的,并且可以与所提供的方法和组合物一起使用。例如,过继T细胞治疗方法描述于例如Gruenberg等人的美国专利申请公开号
2003/0170238;Rosenberg的美国专利号4,690,915;Rosenberg(2011)Nat Rev Clin 
Oncol.8(10):577-85。参见例如,Themeli等人(2013)Nat Biotechnol.31(10):928-933;
Tsukahara等人(2013)Biochem Biophys Res Commun 438(1):84-9;Davila等人(2013)
PLoS ONE 8(4):e61338。
[0335] 所治疗的疾病或病症可以是任何疾病或病症,其中抗原的表达与疾病状况或障碍的病因学相关和/或参与其中,例如导致、加剧这种疾病、病症或障碍或以其他方式参与其
中。示例性疾病和病症可以包括与恶性肿瘤或细胞转化(例如癌症)、自身免疫性疾病或炎
性疾病或例如由细菌、病毒或其他病原体引起的感染性疾病相关的疾病或病症。上文描述
了示例性抗原,其包括与可以治疗的各种疾病和病症相关的抗原。在特定实施方案中,所述
嵌合抗原受体或转基因TCR与和所述疾病或病症相关的抗原特异性地结合。
[0336] 疾病、病症和障碍包括肿瘤,包括实体瘤、血液学恶性肿瘤和黑色素瘤,并且包括局部和转移性肿瘤;感染性疾病,如病毒或其他病原体的感染,例如HIV、HCV、HBV、CMV和寄生虫病;以及自身免疫和炎性疾病。在一些实施方案中,疾病或病症是肿瘤、癌症、恶性肿
瘤、肿疡或其他增殖性疾病或障碍。此类疾病包括但不限于白血病、淋巴瘤(例如慢性淋巴
细胞白血病(CLL)、急性成淋巴细胞性白血病(ALL)、非霍奇金淋巴瘤、急性髓样白血病、多
发性骨髓瘤、难治性滤泡性淋巴瘤、套细胞淋巴瘤、惰性B细胞淋巴瘤、B细胞恶性肿瘤)、结肠癌、肺癌、肝癌、乳腺癌前列腺癌、卵巢癌、皮肤癌、黑色素瘤、骨癌和脑癌、卵巢癌、上皮癌、肾细胞癌、胰腺腺癌、霍奇金淋巴瘤、宫颈癌、结直肠癌、胶质母细胞瘤、神经母细胞瘤、尤因肉瘤、髓母细胞瘤、骨肉瘤、滑膜肉瘤和/或间皮瘤。在一些实施方案中,受试者患有急性成淋巴细胞性白血病(ALL)。在一些实施方案中,受试者患有非霍奇金淋巴瘤。
[0337] 在一些实施方案中,疾病或病症是感染性疾病或病症,例如但不限于病毒、逆转录病毒、细菌和原生动物感染、免疫缺陷、巨细胞病毒(CMV)、埃-巴二氏病毒(Epstein-Barr 
virus,EBV)、腺病毒、BK多瘤病毒。在一些实施方案中,所述疾病或病症是自身免疫性或炎性疾病或病症,如关节炎(例如类风湿性关节炎(RA))、I型糖尿病、系统性红斑狼疮(SLE)、
炎性肠病、屑病、硬皮病、自身免疫性甲状腺疾病、格雷夫斯病、克罗恩病、多发性硬化症、哮喘和/或与移植相关的疾病或病症。
[0338] 在一些实施方案中,与疾病或障碍相关的抗原选自孤儿酪氨酸激酶受体RORl、tEGFR、Her2、Ll-CAM、CD19、CD20、CD22、间皮素、CEA、和乙型肝炎表面抗原、抗叶酸受体、CD23、CD24、CD30、CD33、CD38、CD44、EGFR、EGP-2、EGP-4、0EPHa2、ErbB2、3或4、FBP、胎儿乙酰胆碱受体、GD2、GD3、HMW-MAA、IL-22R-α、IL-13R-α2、kdr、κ轻链、路易斯Y、L1细胞粘附分子、MAGE-A1、间皮素、MUC1、MUC16、PSCA、NKG2D配体、NY-ESO-1、MART-1、gp100、癌胚胎抗原、ROR1、TAG72、VEGF-R2、癌胚抗原(CEA)、前列腺特异性抗原、PSMA、Her2/neu、雌激素受体、孕酮受体、肝配蛋白B2、CD123、CS-1、c-Met、GD-2和MAGE A3、CE7、Wilms肿瘤1(WT-1)、细胞周期蛋白(如细胞周期蛋白A1(CCNA1))和/或生物素化分子,和/或由HIV、HCV、HBV表达的分子
或其他病原体。
[0339] 在一些实施方案中,抗原是或包括αvβ6整合素(avb6整合素)、B细胞成熟抗原(BCMA)、B7-H3、B7-H6、碳酸酐酶9(CA9,也称为CAIX或G250)、癌症-睾丸抗原、癌症/睾丸抗原1B(CTAG,也称为NY-ESO-1和LAGE-2)、癌胚抗原(CEA)、细胞周期蛋白、细胞周期蛋白A2、C-C基序趋化因子配体1(CCL-1)、CD19、CD20、CD22、CD23、CD24、CD30、CD33、CD38、CD44、CD44v6、CD44v7/8、CD123、CD138、CD171、表皮生长因子蛋白(EGFR)、截短的表皮生长因子蛋白(tEGFR)、III型表皮生长因子受体突变(EGFR vIII)、上皮糖蛋白2(EPG-2)、上皮糖蛋白
40(EPG-40)、肝配蛋白B2、肝配蛋白受体A2(EPHa2)、雌激素受体、Fc受体样5(FCRL5;也称为Fc受体同源物5或FCRH5)、胎儿乙酰胆碱受体(胎儿AchR)、叶酸结合蛋白(FBP)、叶酸受体α、神经节苷脂GD2、O-乙酰化GD2(OGD2)、神经节苷脂GD3、糖蛋白100(gp100)、G蛋白偶联受体
5D(GPCR5D)、Her2/neu(受体酪氨酸激酶erb-B2)、Her3(erb-B3)、Her4(erb-B4)、erbB二聚
体、人高分子量黑色素瘤相关抗原(HMW-MAA)、乙型肝炎表面抗原、人白细胞抗原A1(HLA-
A1)、人白细胞抗原A2(HLA-A2)、IL-22受体α(IL-22Ra)、IL-13受体α2(IL-13Ra2)、激酶插入结构域受体(kdr)、κ轻链、L1细胞粘附分子(L1-CAM)、L1-CAM的CE7表位、含有富亮氨酸重复序列的蛋白8家族成员A(LRRC8A)、路易斯Y、黑色素瘤相关抗原(MAGE)-A1、MAGE-A3、MAGE-
A6、间皮素、c-Met、鼠类巨细胞病毒(CMV)、粘蛋白1(MUC1)、MUC16、自然杀伤细胞2族成员D(NKG2D)配体、黑色素A(MART-1)、神经细胞粘附分子(NCAM)、癌胚胎抗原、优先表达的黑色
素瘤抗原(PRAME)、孕酮受体、前列腺特异性抗原、前列腺干细胞抗原(PSCA)、前列腺特异性膜抗原(PSMA)、受体酪氨酸激酶样孤儿受体1(ROR1)、存活蛋白、滋养层糖蛋白(TPBG,也称
作5T4)、肿瘤相关糖蛋白72(TAG72)、血管内皮生长因子受体(VEGFR)、血管内皮生长因子受
体2(VEGFR2)、Wilms肿瘤1(WT-1)、病原体特异性抗原、或与通用标签相关的抗原、和/或生
物素化的分子、和/或由HIV、HCV、HBV或其他病原体表达的分子。在一些实施方案中,受体靶向的抗原包括与B细胞恶性肿瘤相关的抗原,如许多已知B细胞标记中的任何一种。在一些
实施方案中,抗原是或包括CD20、CD19、CD22、ROR1、CD45、CD21、CD5、CD33、Igκ、Igλ、CD79a、CD79b或CD30。
[0340] 在一些实施方案中,细胞疗法(例如,过继T细胞疗法)通过自体转移进行,其中从接受细胞疗法的受试者或从源自这种受试者的样品中分离和/或以其他方式制备细胞。因
此,在一些方面,所述细胞源自需要治疗的受试者(例如,患者),并且在分离和处理后将所
述细胞给予同一受试者。
[0341] 在一些实施方案中,细胞疗法(例如,过继T细胞疗法)通过同种异体转移进行,其中从将要接受或最终接受细胞疗法的受试者以外的受试者(例如,第一受试者)分离和/或
以其他方式制备细胞。在这样的实施方案中,然后将所述细胞给予至相同物种的不同受试
者,例如第二受试者。在一些实施方案中,所述第一和第二受试者在遗传上是相同的。在一
些实施方案中,所述第一和第二受试者在遗传上是相似的。在一些实施方案中,所述第二受
试者与所述第一受试者表达相同的HLA类别或超类型。
[0342] 所述细胞可以通过任何合适的方式给予,例如通过推注输注,通过注射例如静脉内或皮下注射、眼内注射、眼周注射、视网膜下注射、玻璃体内注射、经中隔注射、巩膜下注射、脉络膜内注射、前房注射、结膜下(subconjectval)注射、结膜下(subconjuntival)注
射、眼球筋膜囊下(sub-Tenon)注射、球后注射、球周注射或后近巩膜(posterior 
juxtascleral)递送。在一些实施方案中,它们通过肠胃外、肺内和鼻内给予以及(如果需要
用于局部治疗的话)病灶内给予。肠胃外输注包括肌内、静脉内、动脉内、腹膜内或皮下给
予。在一些实施方案中,给定剂量通过细胞的单次推注给药来给予。在一些实施方案中,给
定剂量通过细胞的多次推注给药例如在不超过3天的时间段内来给予,或通过细胞的连续
输注给药。
[0343] 为了预防或治疗疾病,适当的剂量可取决于待治疗的疾病类型、细胞或重组受体的类型、疾病的严重程度和病程、细胞是否针对预防或治疗目的而被给予、先前的治疗、受
试者的临床病史和对细胞的应答以及主治医师的决断。在一些实施方案中,所述组合物和
细胞适合一次或在一系列治疗中给予受试者。
[0344] 在一些实施方案中,所述细胞作为组合治疗的一部分给予,如与另一种治疗性干预如抗体或工程化细胞或受体或药剂(如细胞毒性剂或治疗剂)同时给予或以任何顺序依
次给予。在一些实施方案中,所述细胞与一种或多种另外的治疗剂共同给予或与另一种治
疗性干预联合给予(同时或以任何顺序依次给予)。在一些情境下,将所述细胞与另一种疗
法在时间上足够接近地共同给予,使得所述细胞群增强一种或多种另外的治疗剂的效果,
或反之亦然。在一些实施方案中,所述细胞在一种或多种另外的治疗剂之前给予。在一些实
施方案中,所述细胞在一种或多种另外的治疗剂之后给予。在一些实施方案中,一种或多种
另外的药剂包括细胞因子(如IL-2)以例如增强持久性。在一些实施方案中,所述方法包括
给予化学治疗剂。
[0345] 在一些实施方案中,所述方法包括在给予之前给予化学治疗剂例如调节化学治疗剂,例如以便减轻肿瘤负荷。
[0346] 在一些方面,使用免疫清除(例如,淋巴细胞清除)疗法的预处理受试者可以改善过继细胞疗法(ACT)的效果。
[0347] 因此,在一些实施方案中,所述方法包括在开始细胞疗法之前向受试者给予预处理剂,例如淋巴细胞清除剂或化学治疗剂,例如环磷酰胺、氟达拉滨或其组合。例如,可以在开始细胞疗法之前至少2天(如至少3、4、5、6或7天),向受试者给予预处理剂。在一些实施方案中,在开始细胞疗法之前不超过7天(例如不超过6、5、4、3或2天),向受试者给予预处理
剂。示例性预处理给药方案描述于国际专利申请号WO 2016/191756中。
[0348] 在一些实施方案中,将受试者用在或在约20mg/kg与120mg/kg之间、如在或在约40mg/kg与80mg/kg之间(每个都包含端值)的剂量的环磷酰胺进行预处理。在一些方面,将
受试者用60mg/kg或约60mg/kg的环磷酰胺进行预处理。在一些实施方案中,将受试者用在
或在约200mg/m2与4440mg/m2之间、如在或在约200mg/m2与500mg/m2之间(每个都包含端
值)的剂量的环磷酰胺进行预处理。在一些情形中,将受试者用300mg/m2的环磷酰胺进行预
处理,在一些情况下每天进行,例如300mg/m2/天。在一些情形中,将受试者用500mg/m2或约
500mg/m2的环磷酰胺进行预处理,在一些情况下每天进行,例如500mg/m2/天。在一些情形
中,将受试者用2220-4440mg/m2或约2220-4440mg/m2的环磷酰胺进行预处理。在一些方面,
将受试者用如下或约如下的剂量进行预处理:200mg/m2/天、250mg/m2/天、300mg/m2/天、
350mg/m2/天、400mg/m2/天、450mg/m2/天、500mg/m2/天、550mg/m2/天、600mg/m2/天、
650mg/m2/天、700mg/m2/天、800mg/m2/天、900mg/m2/天、或1000mg/m2/天。在一些实施方案中,环磷酰胺可以按单一剂量给予或者可以按多个剂量给予,如每天给予、每隔一天给予或
每隔两天给予。在一些实施方案中,将环磷酰胺每天给予一次,持续一天或两天或三天或更
多天。在一些实施方案中,本文描述的剂量代表每日剂量,例如mg/m2/天,每天给予持续连
续三天。
[0349] 在一些实施方案中,当淋巴细胞清除剂包含氟达拉滨时,向受试者给予在或在约1mg/m2和100mg/m2之间、如在或在约10mg/m2和75mg/m2、15mg/m2和50mg/m2、20mg/m2和30mg/m2或24mg/m2和26mg/m2之间(每个都包含端值)的剂量的氟达拉滨。在一些情形中,将受试者
用如下或约如下的剂量进行预处理:10mg/m2/天、15mg/m2/天、20mg/m2/天、25mg/m2/天、
30mg/m2/天、35mg/m2/天、40mg/m2/天、45mg/m2/天、50mg/m2/天、55mg/m2/天、60mg/m2/天、
65mg/m2/天、70mg/m2/天、75mg/m2/天、80mg/m2/天、85mg/m2/天、90mg/m2/天、95mg/m2/天、
100mg/m2/天、200mg/m2/天、或300mg/m2/天。在一些情形中,向受试者给予25mg/m2的氟达拉滨。在一些情形中,向受试者给予30mg/m2的氟达拉滨。在一些实施方案中,氟达拉滨可以按单一剂量给予或者可以按多个剂量给予,如每天给予、每隔一天给予或每隔两天给予。在一
些实施方案中,每天给予氟达拉滨,如持续1-5天,例如持续3至5天。在一些实施方案中,本文描述的剂量代表每日剂量,例如mg/m2/天,每天给予持续连续三天。
[0350] 在一些实施方案中,淋巴细胞清除剂包含药剂的组合,如环磷酰胺和氟达拉滨的组合。因此,药剂的组合可包括任何剂量或给药时间表(如上述那些剂量或给药时间表)下
的环磷酰胺以及任何剂量或给药时间表(如上述那些剂量或给药时间表)下的氟达拉滨。例
如,在一些方面,在第一剂量或后续剂量之前,向受试者给予60mg/kg(约2g/m2)的环磷酰胺
2
和3至5次剂量的25mg/m氟达拉滨。给药
[0351] 在一些实施方案中,药物组合物包含有效治疗或预防疾病或病症的量(例如治疗有效量或预防有效量)的细胞。在一些实施方案中,组合物包括有效减少疾病或病症负荷的
量的细胞。
[0352] 在一些实施方案中,提供了涉及向受试者给予一个或多个单位剂量的治疗性T细胞组合物的方法,其中每个单位剂量含有(i)目标数量的总重组受体表达(例如CAR表达)细
胞或目标数量的某种表型的总重组受体表达(例如CAR表达)细胞;或(ii)在给定或目标范
围的RU内的目标数量的参考单位(RU)的T细胞组合物。在一些实施方案中,单位剂量不含有
大于阈值数量的RU,如大于安全数量的参考单位。
[0353] 在一些实施方案中,提供了涉及向患有疾病或病症的受试者给予T细胞组合物的单位剂量的治疗方法,所述T细胞组合物包含含有特异性地结合与疾病或病症相关的抗原
的重组受体(如嵌合抗原受体(CAR))的细胞,其中所述单位剂量含有在给定范围内的目标
数量的参考单位(RU)。在给定组合物中的RU由式RU=A x B定义,其中:A是在给定组合物中
存在的具有表型的细胞的数量、或其倍数、分数或变换,或者是在给定组合物中具有两种或
更多种表型的细胞的数量的平均值或加权平均值、或所述平均值或加权平均值的倍数、分
数或变换;并且B是指示在给定组合物中的重组受体依赖性(任选地CAR依赖性)活性的程度
或与其相关的参数的值、或所述值的倍数或变换。参考确定或提供用于给予的细胞的单位
剂量,本文描述了与A和B相关的示例性属性。
[0354] 在一些实施方案中,A是在给定组合物中存在的给定表型(例如是或包括如本文描述的CD8+细胞或其他表型的表型)的细胞的数量、或其倍数或分数或变换。在一些实施方案
中,A是在给定组合物中具有两种或更多种表型的细胞的数量的平均值或加权平均值、或所
述平均值或加权平均值的倍数、分数或变换。在一个例子中,两种或更多种表型包括包含
CD8+的第一表型和包含CD4+的第二表型。
[0355] 在一些实施方案中,在用于给予的单位剂量中包含的目标数量的单位小于参考单位的阈值数量,例如已鉴定或已知指示不良事件(如严重毒性,如至少延长的3级或更高等
级的毒性或4级或5级毒性)的风险的预定阈值。在一些实施方案中,RU的阈值数量是参考单
位的安全数量,所述安全数量可以从用治疗性T细胞组合物(以及典型地使用相同或类似的
方法产生(例如工程化、培养、培育、激活、冷冻保存)的治疗性T细胞组合物)类似地治疗的
一组或多名受试者确定。在一些实施方案中,多名受试者包括至少10名受试者,如至少15
名、至少20名、至少25名、至少30名、至少40名、至少50名、至少60名、至少70名、至少80名、至少90名、至少100名或更多名受试者。
[0356] 在一些实施方案中,参考单位的安全数量是相对于在用包含表达重组受体(如CAR)的T细胞的治疗性T细胞组合物治疗后分析的一组受试者,向在曾持续发生不良事件的
组中的那些受试者中的受试者给予的疗法的参考单位的最低数量。在一些实施方案中,不
良事件是严重不良事件,任选地严重神经毒性,任选地等于或高于4级或5级或至少延长的3
级神经毒性。
[0357] 在一些实施方案中,参考单位的目标数量比参考单位的安全数量少了对应于安全系数的量和/或少了在1.5倍至3倍范围内(任选地约2倍)的量、或少了为未发生过不良事件
(任选地0-2级神经毒性)的一组受试者的标准偏差的倍数(任选地其中所述倍数在1.5倍至
3倍的范围内)的量。
[0358] 在一些实施方案中,参考单位的目标数量等于或高于参考单位的参考功效数量,所述参考功效数量可以从用治疗性T细胞组合物(以及典型地使用相同或类似的方法产生
(例如工程化、培养、培育、激活、冷冻保存)的治疗性T细胞组合物)类似地治疗的一组或多
名受试者确定。在一些实施方案中,多名受试者包括至少10名受试者,如至少15名、至少20
名、至少25名、至少30名、至少40名、至少50名、至少60名、至少70名、至少80名、至少90名、至少100名或更多名受试者。在一些实施方案中,参考单位的功效数量是相对于在用包含重组
受体(任选地CAR)的治疗性T细胞组合物治疗后分析的一组受试者,向展现出所希望的治疗
结果(任选地部分反应或完全反应(CR))的组中的一名或多名受试者给予的疗法的单位的
数量。
[0359] 在一些实施方案中,提供了涉及向患有疾病或病症的受试者给予T细胞组合物的单位剂量的方法,所述T细胞组合物包含含有特异性地结合与疾病或病症相关的抗原的重
组受体(如嵌合抗原受体(CAR))的细胞,其中给予了目标数量的治疗性组合物的总CD8+重
组受体表达细胞和/或给予了单位剂量的此类细胞(其中给予了在给定范围内的目标数量
的参考单位),如上所述。在一些情况下,所给予的参考单位的目标数量等于或低于RU的阈
值数量,使得单位剂量不含有大于阈值数量的RU。在一些方面,所给予的目标数量的总CD8+
重组受体细胞呈CD8+、呈凋亡标记阴性(-)和CD8+,任选地其中所述凋亡标记是膜联蛋白V
或活性半胱天冬酶3。
[0360] 在一些实施方案中,所提供的方法涉及给予含有一定数量的细胞的剂量,例如提供目标数量的细胞的剂量。在一些实施方案中,剂量(如靶细胞的目标数量)在或在约5.0x 
106与2.25x 107、5.0x 106与2.0x 107、5.0x 106与1.5x 107、5.0x 106与1.0x 107、5.0x 106
6 6 7 6 7 6 7 6
与7.5x 10 、7.5x 10 与2.25x 10 、7.5x 10与2.0x 10、7.5x 10与1.5x 10、7.5x 10 与
1.0x 107、1.0x 107与2.25x 107、1.0x 107与2.0x 107、1.0x 107与1.5x 107、1.5x 107与
2.25x 107、1.5x 107与2.0x 107、2.0x 107与2.25x 107之间,每个都包含端值。在一些实施方案中,这种剂量(如这种目标数量的细胞)是指在所给予的组合物中的总重组受体表达细
胞。在一些实施方案中,这种剂量(如这种目标数量的细胞)是指呈CD8+的或呈凋亡标记阴
性(-)和CD8+的总重组受体表达细胞。在一些实施方案中,所述凋亡标记是膜联蛋白V或活
性半胱天冬酶3。
[0361] 在一些实施方案中,单位剂量的细胞的剂量包含一个数量的细胞,如目标数量的细胞,在至少或至少约5x 106个、6x 106个、7x 106个、8x 106个、9x 106个、10x 106个与约
15x 106个之间的重组受体表达细胞,例如呈CD8+的或呈凋亡标记阴性(-)和CD8+的重组受
体表达细胞,任选地其中所述凋亡标记是膜联蛋白V或活性半胱天冬酶3。
[0362] 在一些实施方案中,单位剂量的细胞的剂量包含一个数量的细胞,如目标数量的细胞,在至少或至少约5.55x 106个、6.66x 106个、7.77x 106个、8.99x 106个、1.0x 107个、
1.1x 107个与约1.67x 107个之间的重组受体表达细胞,任选地呈CD8+的或呈凋亡标记阴性
(-)和CD8+的重组受体表达细胞,例如其中所述凋亡标记是膜联蛋白V或活性半胱天冬酶3。
[0363] 在一些实施方案中,单位剂量的细胞的剂量包含一个数量的细胞,如目标数量的细胞,在至少或至少约6.25x 106个、7.5x 106个、8.75x 106个、1.0x 107个、1.13x 107个、
1.25x 107个与约1.9x 107个之间的重组受体表达细胞,任选地呈CD8+的或呈凋亡标记阴性
(-)和CD8+的重组受体表达细胞,例如其中所述凋亡标记是膜联蛋白V或活性半胱天冬酶3。
[0364] 在一些实施方案中,单位剂量的细胞的剂量包含一个数量的细胞,如目标数量的细胞,在至少或至少约7.14x 106个、8.5x 106个、1.0x 107个、1.14x 107个、1.29x 107个、
1.42x 107个与约2.14x 107个之间的重组受体表达细胞,任选地呈CD8+的或呈凋亡标记阴
性(-)和CD8+的重组受体表达细胞,任选地其中所述凋亡标记是膜联蛋白V或活性半胱天冬
酶3。
[0365] 在一些实施方案中,单位剂量的细胞的剂量包含一个数量的细胞,如目标数量的细胞,在至少或至少约5x 106个、6x 106个、7x 106个、8x 106个、9x 106个、10x 106个与约
15x 106个之间的是凋亡标记阴性(-)和CD8+的重组受体表达细胞,任选地其中所述凋亡标
记是膜联蛋白V或活性半胱天冬酶3。
[0366] 在一些实施方案中,单位剂量的细胞的剂量包含一个数量的细胞,如目标数量的细胞,在至少或至少约6.25x 106个、7.5x 106个、8.75x 106个、1.0x 107个、1.13x 107个、
1.25x 107个与约1.9x 107个之间的呈CD8+的重组受体表达细胞。
[0367] 在一些实施方案中,所述方法包括向患有疾病或病症的受试者给予T细胞组合物的单位剂量的治疗方法,所述T细胞组合物包含含有特异性地结合与疾病或病症相关的抗
原的重组受体(如嵌合抗原受体(CAR))的细胞,其中所述单位剂量含有在给定范围内的目
标数量的参考单位(RU)。在一些实施方案中,参考单位的目标数量小于阈值,如小于参考安
全值。在一些方面,不良事件是严重不良事件,如等于或高于4级或5级或至少延长的3级神
经毒性的严重神经毒性。在一些实施方案中,阈值比参考安全值小与安全系数对应的量或
小至少2倍。
[0368] 在一些实施方案中,所述不良事件是4级或5级神经毒性,并且所述阈值:是或是约7
1.75x 10 (如果A是凋亡标记阴性(-)和CD8+CAR+的,并且B是TNF-α)、或其归一化值;是或
是约2.19x 107(如果A是CD8+CAR+的,并且B是TNF-α)、或其归一化值;是或是约1.25x 107
(如果A是凋亡标记阴性(-)CD8+CAR+的,并且如果B是IFN-γ)、或其归一化值;是或是约
1.56x 107(如果A是CD8+CAR+的,并且B是IFN-γ)、或其归一化值;是或是约1.5x 107(如果A是凋亡标记阴性(-)CD8+CAR+的,并且如果B是IL-2)、或其归一化值;是或是约1.88x 107
(如果A是CD8+CAR+的,并且B是IL-2)、或其归一化值;是或是约1.5x 107(如果A是凋亡标记
阴性(-)CD8+CAR+的,并且如果B是TNF-α和IFN-γ)、或其归一化值;是或是约1.88x 107(如果A是CD8+CAR+的,并且B是TNF-α和IFN-γ)、或其归一化值;是或是约2.0x 107(如果A是凋亡标记阴性(-)CD8+CAR+的,并且如果B是TNF-α和IL-2)、或其归一化值;是或是约2.5x 107(如果A是CD8+CAR+的,并且B是TNF-α和IL-2)、或其归一化值;是或是约1.25x 107(如果A是凋亡标记阴性(-)CD8+CAR+的,并且如果B是IFN-γ和IL-2)、或其归一化值;是或是约1.56x 
107(如果A是CD8+CAR+的,并且B是IFN-γ和IL-2)、或其归一化值;是或是约1.75x 107(如果A是凋亡标记阴性(-)CD8+CAR+的,并且如果B是TNF-α、IFN-γ和IL-2)、或其归一化值;是或是约2.19x 107(如果A是CD8+CAR+的,并且B是TNF-α、IFN-γ和IL-2)、或其归一化值。在一些实施方案中,凋亡标记是膜联蛋白V或活性半胱天冬酶3。
[0369] 在一些实施方案中,所述不良事件是4级或5级神经毒性,并且所述目标参考单位的给定范围:是在或约在2.0x 105与1.75x 107之间(包含端值)(如果A是凋亡标记阴性(-)
和CD8+CAR+的,并且B是TNF-α)、或其归一化值;是在或约在2.5x 105与2.19x 107之间(包含
5 7
端值)(如果A是CD8+CAR+的,并且B是TNF-α)、或其归一化值;是在或约在4x 10 与1.25x 10之间(包含端值)(如果A是凋亡标记阴性(-)CD8+CAR+的,并且如果B是IFN-γ)、或其归一化
值;是在或约在5x 106与1.56x 107之间(包含端值)(如果A是CD8+CAR+的,并且B是IFN-γ)、或其归一化值;是在或约在2.0x 105与1.5x 107之间(包含端值)(如果A是凋亡标记阴性(-)
CD8+CAR+的,并且如果B是IL-2)、或其归一化值;是在或约在2.5x 105与1.88x 107之间(包
含端值)(如果A是CD8+CAR+的,并且B是IL-2)、或其归一化值;是在或约在3.0x 105与1.5x 
107之间(包含端值)(如果A是凋亡标记阴性(-)CD8+CAR+的,并且如果B是TNF-α和IFN-γ)、
或其归一化值;是在或约在3.75x 105与1.88x 107之间(包含端值)(如果A是CD8+CAR+的,并
且B是TNF-α和IFN-γ)、或其归一化值;是在或约在3.0x 105与2.0x 107之间(包含端值)(如果A是凋亡标记阴性(-)CD8+CAR+的,并且如果B是TNF-α和IL-2)、或其归一化值;是在或约
在3.75x 105与2.5x 107之间(包含端值)(如果A是CD8+CAR+的,并且B是TNF-α和IL-2)、或其归一化值;是在或约在4.0x 105与1.25x 107之间(包含端值)(如果A是凋亡标记阴性(-)CD8
+CAR+的,并且如果B是IFN-γ和IL-2)、或其归一化值;是在或约在5.0x 105与1.56x 107之
间(包含端值)(如果A是CD8+CAR+的,并且如果B是IFN-γ和IL-2)、或其归一化值;是在或约
在4.0x 105与1.75x 107之间(包含端值)(如果A是凋亡标记阴性(-)CD8+CAR+的,并且如果B
是TNF-α、IFN-γ和IL-2)、或其归一化值;是在或约在5.0x 105与2.19x 107之间(包含端值)(如果A是CD8+CAR+的,并且B是TNF-α、IFN-γ和IL-2)、或其归一化值。在一些实施方案中,凋亡标记是膜联蛋白V或活性半胱天冬酶3。
[0370] 在一些实施方案中,所述不良事件是至少延长的3级神经毒性,并且所述阈值:是或是约1.0x 106(如果A是凋亡标记阴性(-)和CD8+CAR+的,并且B是TNF-α)、或其归一化值;
是或是约1.25x 106(如果A是CD8+CAR+的,并且B是TNF-α)、或其归一化值;是或是约2.0x 
6
10 (如果A是凋亡标记阴性(-)CD8+CAR+的,并且如果B是IFN-γ)、或其归一化值;是或是约
2.5x 106(如果A是CD8+CAR+的,并且B是IFN-γ)、或其归一化值;是或是约3.0x 106(如果A
是凋亡标记阴性(-)CD8+CAR+的,并且如果B是IL-2)、或其归一化值;是或是约3.75x 106
(如果A是CD8+CAR+的,并且B是IL-2)、或其归一化值;是或是约1.5x 106(如果A是凋亡标记
阴性(-)CD8+CAR+的,并且如果B是TNF-α和IFN-γ)、或其归一化值;是或是约1.88x 106(如果A是CD8+CAR+的,并且B是TNF-α和IFN-γ)、或其归一化值;是或是约2.5x 106(如果A是凋亡标记阴性(-)CD8+CAR+的,并且如果B是TNF-α和IL-2)、或其归一化值;是或是约3.12x 
106(如果A是CD8+CAR+的,并且B是TNF-α和IL-2)、或其归一化值;是或是约3.0x 106(如果A是凋亡标记阴性(-)CD8+CAR+的,并且如果B是IFN-γ和IL-2)、或其归一化值;是或是约
3.75x 106(如果A是CD8+CAR+的,并且B是IFN-γ和IL-2)、或其归一化值;是或是约2.0x 106(如果A是凋亡标记阴性(-)CD8+CAR+的,并且如果B是TNF-α、IFN-γ和IL-2)、或其归一化
值;是或是约2.5x 106(如果A是CD8+CAR+的,并且B是TNF-α、IFN-γ和IL-2)、或其归一化
值。在一些实施方案中,凋亡标记是膜联蛋白V或活性半胱天冬酶3。
[0371] 在一些实施方案中,所述不良事件是至少延长的3级,并且所述目标参考单位的给5 6
定范围:是在或约在3.0x 10与1.0x 10之间(包含端值)(如果A是凋亡标记阴性(-)和CD8+
CAR+的,并且B是TNF-α)、或其归一化值;是在或约在3.75x 105与1.25x 106之间(包含端值)(如果A是CD8+CAR+的,并且B是TNF-α)、或其归一化值;是在或约在4x 105与2.0x 106之间
(包含端值)(如果A是凋亡标记阴性(-)CD8+CAR+的,并且如果B是IFN-γ)、或其归一化值;
6 6
是在或约在5x 10与2.5x 10之间(包含端值)(如果A是CD8+CAR+的,并且B是IFN-γ)、或其
归一化值;是在或约在2.0x 105与3.0x 106之间(包含端值)(如果A是凋亡标记阴性(-)CD8+
CAR+的,并且如果B是IL-2)、或其归一化值;是在或约在2.5x 105与3.75x 106之间(包含端
值)(如果A是CD8+CAR+的,并且B是IL-2)、或其归一化值;是在或约在3.0x 105与1.5x 106之间(包含端值)(如果A是凋亡标记阴性(-)CD8+CAR+的,并且如果B是TNF-α和IFN-γ)、或其
归一化值;是在或约在3.75x 105与1.88x 106之间(包含端值)(如果A是CD8+CAR+的,并且B
是TNF-α和IFN-γ)、或其归一化值;是在或约在3.0x 105与2.5x 106之间(包含端值)(如果A是凋亡标记阴性(-)CD8+CAR+的,并且如果B是TNF-α和IL-2)、或其归一化值;是在或约在
3.75x 105与3.12x 106之间(包含端值)(如果A是CD8+CAR+的,并且B是TNF-α和IL-2)、或其
归一化值;是在或约在4.0x 105与3.0x 106之间(包含端值)(如果A是凋亡标记阴性(-)CD8+
CAR+的,并且如果B是IFN-γ和IL-2)、或其归一化值;是在或约在5.0x 105与3.75x 106之间(包含端值)(如果A是CD8+CAR+的,并且B是IFN-γ和IL-2)、或其归一化值;是在或约在4.0x 
105与2.0x 106之间(包含端值)(如果A是凋亡标记阴性(-)CD8+CAR+的,并且如果B是TNF-α、IFN-γ和IL-2)、或其归一化值;是在或约在5.0x 105与2.5x 106之间(包含端值)(如果A是
CD8+CAR+的,并且B是TNF-α、IFN-γ和IL-2)、或其归一化值。在一些实施方案中,凋亡标记是膜联蛋白V或活性半胱天冬酶3。
[0372] 在某些实施方案中,所述细胞或单独的细胞亚型群体以约100万至约1000亿个细胞和/或按每公斤体重所述细胞量的范围给予受试者,例如,100万至约500亿个细胞(例如,
约500万个细胞、约2500万个细胞、约5亿个细胞、约10亿个细胞、约50亿个细胞、约200亿个细胞、约300亿个细胞、约400亿个细胞或由任两个前述值定义的范围),如约1000万至约
1000亿个细胞(例如,约2000万个细胞、约3000万个细胞、约4000万个细胞、约6000万个细
胞、约7000万个细胞、约8000万个细胞、约9000万个细胞、约100亿个细胞、约250亿个细胞、约500亿个细胞、约750亿个细胞、约900亿个细胞或由任两个前述值定义的范围),并且在一
些情况下约1亿个细胞至约500亿个细胞(例如,约1.2亿个细胞、约2.5亿个细胞、约3.5亿个
细胞、约4.5亿个细胞、约6.5亿个细胞、约8亿个细胞、约9亿个细胞、约30亿个细胞、约300亿个细胞、约450亿个细胞)或在这些范围和/或每公斤体重的范围之间的任何值。剂量可以根
据疾病或障碍和/或患者和/或其他治疗特有的属性而变化。
[0373] 例如,在一些实施方案中,如果受试者是人,那么剂量包括少于约5x 108个总重组受体(例如CAR)表达细胞、T细胞或外周血单核细胞(PBMC),例如,在约1x 106到5x 108个此
类细胞的范围内,例如2x 106、5x 106、1x 107、5x 107、1x 108或5x 108个或全部此类细胞,或任两个前述值之间的范围。
[0374] 在一些实施方案中,基因工程化细胞的剂量包含从或从约1x 105至5x 108个表达CAR的总T细胞、1x 105至2.5x 108个表达CAR的总T细胞、1x 105至1x 108个表达CAR的总T细
胞、1x 105至5x 107个表达CAR的总T细胞、1x 105至2.5x 107个表达CAR的总T细胞、1x 105至
1x 107个表达CAR的总T细胞、1x 105至5x 106个表达CAR的总T细胞、1x 105至2.5x 106个表
5 6 6 8
达CAR的总T细胞、1x 10至1x 10个表达CAR的总T细胞、1x 10至5x 10个表达CAR的总T细
胞、1x 106至2.5x 108个表达CAR的总T细胞、1x 106至1x 108个表达CAR的总T细胞、1x 106至
5x 107个表达CAR的总T细胞、1x 106至2.5x 107个表达CAR的总T细胞、1x 106至1x 107个表
达CAR的总T细胞、1x 106至5x 106个表达CAR的总T细胞、1x 106至2.5x 106个表达CAR的总T
6 8 6 8
细胞、2.5x 10 至5x 10个表达CAR的总T细胞、2.5x 10 至2.5x 10 个表达CAR的总T细胞、
2.5x 106至1x 108个表达CAR的总T细胞、2.5x 106至5x 107个表达CAR的总T细胞、2.5x 106
至2.5x 107个表达CAR的总T细胞、2.5x 106至1x 107个表达CAR的总T细胞、2.5x 106至5x 
106个表达CAR的总T细胞、5x 106至5x 108个表达CAR的总T细胞、5x 106至2.5x 108个表达
CAR的总T细胞、5x 106至1x 108个表达CAR的总T细胞、5x 106至5x 107个表达CAR的总T细
胞、5x 106至2.5x 107个表达CAR的总T细胞、5x 106至1x 107个表达CAR的总T细胞、1x 107至
5x 108个表达CAR的总T细胞、1x 107至2.5x 108个表达CAR的总T细胞、1x 107至1x 108个表
达CAR的总T细胞、1x 107至5x 107个表达CAR的总T细胞、1x 107至2.5x 107个表达CAR的总T
细胞、2.5x 107至5x 108个表达CAR的总T细胞、2.5x 107至2.5x 108个表达CAR的总T细胞、
2.5x 107至1x 108个表达CAR的总T细胞、2.5x 107至5x 107个表达CAR的总T细胞、5x 107至
5x 108个表达CAR的总T细胞、5x 107至2.5x 108个表达CAR的总T细胞、5x 107至1x 108个表
达CAR的总T细胞、1x 108至5x 108个表达CAR的总T细胞、1x 108至2.5x 108个表达CAR的总T
细胞、或2.5x 108至5x 108个表达CAR的总T细胞。
[0375] 在一些实施方案中,基因工程化细胞的剂量包含至少或至少约1x 105个表达CAR的细胞、至少或至少约2.5x 105个表达CAR的细胞、至少或至少约5x 105个表达CAR的细胞、
至少或至少约1x 106个表达CAR的细胞、至少或至少约2.5x 106个表达CAR的细胞、至少或至
少约5x 106个表达CAR的细胞、至少或至少约1x 107个表达CAR的细胞、至少或至少约2.5x 
7 7 8
10个表达CAR的细胞、至少或至少约5x 10个表达CAR的细胞、至少或至少约1x 10个表达
CAR的细胞、至少或至少约2.5x 108个表达CAR的细胞、或者至少或至少约5x 108个表达CAR
的细胞。
[0376] 在一些实施方案中,细胞疗法包含给予一定剂量,所述剂量包含以下细胞数量:为5 8
或为约1x 10至5x 10个总重组受体表达细胞、总T细胞或总外周血单核细胞(PBMC)、为或
为约5x 105至1x 107个总重组受体表达细胞、总T细胞或总外周血单核细胞(PBMC)、或者为
或为约1x 106至1x 107个总重组受体表达细胞、总T细胞或总外周血单核细胞(PBMC),每个
都包含端值。在一些实施方案中,细胞疗法包括给予一定剂量的细胞,所述剂量包含以下细
胞数量:至少或约至少1x 105个总重组受体表达细胞、总T细胞或总外周血单核细胞
(PBMC),如至少或至少1x 106个、至少或约至少1x 107个、至少或约至少1x 108个此类细胞。
在一些实施方案中,所述数量是关于CD3+或CD8+的总数,在一些情况下也是关于重组受体
表达(例如CAR+)细胞。在一些实施方案中,细胞疗法包含给予一定剂量,所述剂量包含以下
细胞数量:为或为约1x 105至5x 108个CD3+或CD8+总T细胞或CD3+或CD8+重组受体表达细
胞、为或为约5x 105至1x 107个CD3+或CD8+总T细胞或CD3+或CD8+重组受体表达细胞、或者
6 7
为或为约1x 10至1x 10个CD3+或CD8+总T细胞或CD3+或CD8+重组受体表达细胞,每个都包
含端值。在一些实施方案中,细胞疗法包含给予一定剂量,所述剂量包含以下细胞数量:从
或从约1x 105至5x 108个总CD3+/CAR+或CD8+/CAR+细胞、从或从约5x 105至1x 107个总CD3
+/CAR+或CD8+/CAR+细胞、或从或从约1x 106至1x 107个总CD3+/CAR+或CD8+/CAR+细胞,每
个都包含端值。
[0377] 在一些实施方案中,剂量的T细胞包括CD4+ T细胞、CD8+ T细胞或CD4+和CD8+ T细胞。
[0378] 在一些实施方案中,例如,在受试者是人的情况下,所述剂量的CD8+ T细胞(包括6 8
在剂量中包括CD4+和CD8+ T细胞)包括在约1x 10个与5x 10个之间(包含端值)的总重组
受体(例如CAR)表达CD8+细胞,例如,在约5x 106个至1x 108个此类细胞的范围内,例如1x 
107个、2.5x 107个、5x 107个、7.5x 107个、1x 108个或5x 108个总此类细胞,或在任两个前述值之间的范围。在一些实施方案中,给予患者多个剂量,并且每个剂量或总剂量可以在任
何前述值内。在一些实施方案中,细胞剂量包括给予从或从约1x 107至0.75x 108个表达重
组受体的总CD8+ T细胞、1x 107至2.5x 107个表达重组受体的总CD8+ T细胞、从或从约1x 
107至0.75x 108个表达重组受体的总CD8+T细胞(每个都包含端值)。在一些实施方案中,细
胞的剂量包含给予或给予约1x 107、2.5x 107、5x 107、7.5x 107、1x 108或5x 108个总重组受体表达CD8+ T细胞。
[0379] 在一些实施方案中,细胞(例如,表达重组受体的T细胞)的剂量作为单一剂量给予受试者,或者在两周、一个月、三个月、六个月、1年或更长的时间段内仅给予一次。
[0380] 在过继细胞疗法的背景下,给定“剂量”的给予包括以单一组合物和/或单次不间断给药的方式(例如以单次注射或连续输注的方式)给予给定量或数量的细胞,并且还包括
在不超过3天的指定时间段内以在多个单独组合物或输注中提供的分割剂量的方式给予给
定量或数量的细胞。因此,在一些情况下,剂量是指定数量的细胞的单次或连续给药,在单
个时间点给予或开始。然而,在一些情况下,剂量在不超过三天的时间段内以多次注射或输
注的方式给予,如每天一次持续三天或两天或者通过在一天的时间内多次输注。
[0381] 因此,在一些方面,所述剂量的细胞以单一药物组合物给予。在一些实施方案中,所述剂量的细胞以共同含有第一剂量的细胞的多种组合物给予。
[0382] 术语“分割剂量”是指分割的剂量,使其在超过一天的时间内给予。这种类型的给药包括在本方法中并且被认为是单一剂量。
[0383] 因此,在一些方面,所述剂量可作为分割剂量给予。例如,在一些实施方案中,剂量可以在2天或3天内给予受试者。用于分割给药的示例性方法包括在第一天给予25%的剂量并在第二天给予剩余的75%的剂量。在其他实施方案中,可以在第一天给予33%的第一剂
量,并且在第二天给予剩余的67%。在一些方面,在第一天给予10%的剂量,在第二天给予
30%的剂量,并且在第三天给予60%的剂量。在一些实施方案中,分割剂量不超过3天。
[0384] 在一些实施方案中,细胞以所需剂量给予,所述所需剂量在一些方面包括所需剂量或数量的细胞或一种或多种细胞类型和/或所需比率的细胞类型。因此,在一些实施方案
中,细胞的剂量基于总细胞的目标数量或单位的目标参考数量、和所需的单独群体或亚型
的比率(如CD4+与CD8+的比率)。在一些实施方案中,细胞的剂量基于所需的总细胞的目标
数量或在单独群体中的或单独细胞类型的单位的目标参考数量。在一些实施方案中,剂量
基于此类特征的组合,如所需的总细胞数量、目标参考单位、所需的比率、和所需的单独群
体中的细胞的总数。
[0385] 在一些实施方案中,以所需剂量的总细胞(如期望剂量的T细胞)的耐受差异或在所述耐受差异之内给予细胞的群体或亚型如CD8+和CD4+ T细胞。在一些方面,所需剂量是所
需细胞数或被给予所述细胞的受试者的每单位体重的所需细胞数(例如,细胞/kg)。在一些
方面,所需剂量等于或高于最小细胞数量或每单位体重的最小细胞数量。在一些方面,在以
所需剂量给予的总细胞中,单独群体或亚型以等于或接近所需输出比率(如CD4+与CD8+比
率)存在,例如在这种比率的一定耐受差异或误差内。
[0386] 在一些实施方案中,细胞以所需剂量的一种或多种单独细胞群或亚型的耐受差异或在所述耐受差异之内给予,如所需剂量的CD4+细胞和/或所需剂量的CD8+细胞。在一些方
面,所需剂量是所需的亚型或群体的细胞数量或所需的被给予所述细胞的受试者的每单位
体重的此类细胞数量(例如,细胞/kg)。在一些方面,所需剂量等于或高于最小的群体或亚
型的细胞数量或每单位体重的最小的群体或亚型的细胞数量。
[0387] 因此,在一些实施方案中,剂量基于所需的总细胞的固定剂量和所需比率,和/或基于所需的一种或多种单独亚型或亚群(例如,各自)的固定剂量。因此,在一些实施方案
中,剂量基于所需的固定剂量,其可以等于或高于T细胞的最小剂量和/或等于或高于最大
剂量,并且在一些方面,所需的CD4+与CD8+细胞的比率、和/或基于所需的CD4+和/或CD8+细
胞的固定剂量。
[0388] 在一些实施方案中,目标剂量或剂量包括或包括约或者小于或小于约5x 106个CD8+CAR+细胞,包括或包括约或者小于或小于约7x 106个CD8+CAR+细胞或CD3+CAR+细胞,
包括或包括约或者小于或小于约8x 106个CD8+CAR+细胞或CD3+CAR+细胞,包括或包括约或
者小于或小于约8x 106个CD8+CAR+细胞或CD3+CAR+细胞,包括或包括约或者小于或小于约
9x 106个CD8+CAR+细胞或CD3+CAR+细胞,包括或包括约或者小于或小于约10x 106个CD8+
CAR+细胞,包括或包括约或者小于或小于约11x 106个CD8+CAR+细胞或CD3+CAR+细胞,包括
或包括约或者小于或小于约12x 106个CD8+CAR+细胞,包括或包括约或者小于或小于约13x 
6 6
10个CD8+CAR+细胞或CD3+CAR+细胞,包括或包括约或者小于或小于约14x 10 个CD8+CAR+
细胞,包括或包括约或者小于或小于约15x 106个CD8+CAR+细胞或CD3+CAR+细胞,包括或包
括约或者小于或小于约20x 106个或30x 106个或40x 106个或50x 106个CD8+CAR+细胞或
CD3+CAR+细胞。在此类实施方案的一些方面,这种剂量的等于或约或者至少为或至少约
70%、75%、80%、85%或90%的CD8+CAR+细胞展现出指示细胞健康或生物活性的CAR细胞
的一种或多种特性或表型,例如凋亡标记的不存在,和/或用于产生细胞的过程在70%-
90%或在平均80%的时间内实现在剂量中的CD8+CAR+细胞中的此类细胞的百分比。在一些
方面,在剂量之间的生物活性或功能性或非凋亡细胞的频率的变异小于阈值,和/或所述频
率在70%-80%的范围之外变化不超过1%、5%、10%或20%的时间。
[0389] 在一些实施方案中,细胞在多种细胞群或亚型(如CD4+和CD8+细胞或亚型)的所需输出比率的耐受范围下或耐受范围内给予。在一些方面,所需比率可以是特定比率或可以
是一系列比率。例如,在一些实施方案中,所需比率(例如,CD4+与CD8+细胞的比率)在1:5或约1:5和5:1或约5:1之间(或大于约1:5且小于约5:1),或在1:3或约1:3和3:1或约3:1之间
(或大于约1:3且小于约3:1),如在2:1或约2:1和1:5或约1:5之间(或大于约1:5且小于约2:
1)(每个都包含端值),或例如等于或约5:1、4.5:1、4:1、3.5:1、3:1、2.5:1、2:1、1.9:1、1.8:
1、1.7:1、1.6:1、1.5:1、1.4:1、1.3:1、1.2:1、1.1:1、1:1、1:1.1、1:1.2、1:1.3、1:1.4、1:
1.5、1:1.6、1:1.7、1:1.8、1:1.9、1:2、1:2.5、1:3、1:3.5、1:4、1:4.5或1:5。在一些方面,耐受的差异在所需比率的约1%、约2%、约3%、约4%、约5%、约10%、约15%、约20%、约
25%、约30%、约35%、约40%、约45%、约50%内,包括这些范围之间的任何值。
[0390] B.患者和/或临床因素
[0391] 在一些所提供的实施方案中,可以将根据本文所提供的方法的一定剂量的细胞给予至具有患者特异性和/或临床风险因素(如本文描述的任何一种)的受试者。在一些实施
方案中,如与根据所述方法治疗的整个组的受试者或不具有此类患者特异性或临床风险因
素的受试者相比,在此类受治疗的受试者中,所述方法导致在毒性(例如,严重不良副作用、CRS、和/或神经毒性或其等级)的发生率或风险方面没有实质差异、没有显著差异或没有高
于阈值水平或程度的差异。在某些实施方案中,与受试者的总数或没有风险因素的受试者
相比,具有这种风险因素的受试者的差异不大于1%、5%、10%、15%、20%、25%或30%、
35%或40%。在一些实施方案中,毒性是CRS。在特定实施方案中,毒性是2级或更高等级、3级或更高等级、4级或更高等级、或5级的CRS。在某些实施方案中,毒性是神经毒性。在特定实施方案中,毒性是2级或更高等级、3级或更高等级、4级或更高等级、或5级的神经毒性。在一些实施方案中,毒性是脑水肿或与脑水肿相关。
[0392] 在某些实施方案中,将根据本文所提供的方法的一定剂量的细胞给予至没有患者和/或临床因素(如本文描述的任何一种)的受试者。在一些实施方案中,将降低和/或较低
剂量的细胞给予至具有患者和/或临床因素的受试者。在某些实施方案中,降低和/或较低
剂量比给予至没有患者和/或临床因素的受试者的剂量少了或少了至少5%、10%、15%、
20%、25%、30%、35%、40%、45%、50%、60%、70%、80%、90%、或95%。在某些实施方案中,在被给予所述剂量的细胞的没有患者和/或临床因素的受试者与被给予所述较低剂量
的细胞的具有患者和/或临床因素的受试者之间,在毒性(例如,严重不良副作用、CRS、和/
或神经毒性)的发生率方面没有实质差异。
[0393] 在一些实施方案中,患者和/或临床因素是先前疗法的量,例如,在开始给予治疗性T细胞组合物之前的一种或多种疗法。在一些实施方案中,已经给予所述先前疗法以治疗
与治疗性T细胞组合物相同的疾病和/或病症。在特定实施方案中,患者和/或临床因素是少
于十种先前疗法、九种先前疗法、八种先前疗法、七种先前疗法、六种先前疗法、五种先前疗法、四种先前疗法、三种先前疗法、两种先前疗法、或少于一种先前疗法。在一些实施方案
中,患者和/或临床因素是少于三种先前疗法。在某些实施方案中,患者和/或临床因素是两
种或更少种先前疗法。
[0394] 在某些实施方案中,患者和/或临床因素是年龄,例如在开始给予治疗性T细胞组合物时的受试者年龄。在某些实施方案中,患者和/或临床因素是年轻的和/或相对年轻的
年龄。在一些实施方案中,患者和/或临床因素是小于65岁、60岁、55岁、50岁、45岁、40岁、35岁、30岁、25岁或20岁的年龄。在特定实施方案中,患者和/或临床因素是小于30岁的年龄。
[0395] 在特定实施方案中,患者和/或临床因素是来自受试者的单采术样品中CD4:CD8 T细胞的比率。在一些实施方案中,患者和/或临床因素是单采术样品中CD4:CD8 T细胞的比
率低于某个阈值。在某些实施方案中,患者和/或临床因素是低于3:1、2:1、1.5:1、1:1、0.9:
1、0.8:1、0.7:1、0.6:1、0.5:1、0.4:1、0.3:1、0.2:1、或0.1:1的CD4:CD8 T细胞的比率。在某些实施方案中,当所给予的剂量是基于总T细胞或表达重组受体的总T细胞时,单采术样品
中CD4:CD8 T细胞的比率是患者和/或临床因素。在特定实施方案中,患者和/或临床因素是
低于1:5、低于1:1或低于0.5:1的在单采术样品中的CD4:CD8 T细胞的比率。
[0396] 在某些实施方案中,患者和/或临床因素是受试者重量,例如体重。在某些实施方案中,受试者重量是在给予治疗性T细胞组合物时的受试者的重量。在某些实施方案中,患
者和/或临床因素是高于100lbs.、高于125lbs.、高于150lbs.、高于175lbs.、高于200lbs.、高于225lbs.、高于250lbs.、高于275lbs.、高于300lbs.、高于350lbs.、或高于400lbs.的重量。在特定实施方案中,患者和/或临床因素是高于50kg、60kg、70kg、80kg、90kg、100kg、
125kg、150kg、175kg、或200kg的重量。在一些实施方案中,患者和/或临床因素是大于一组受试者中的平均重量的重量。在特定实施方案中,患者和/或临床因素是大于一组受试者中
的平均、中值和/或众数重量的重量。在一些实施方案中,用相同的治疗性细胞组合物治疗
所述组的受试者。
[0397] 在某些实施方案中,患者和/或临床因素是血小板计数。在一些实施方案中,患者和/或临床因素是或是约小于500,000、小于450,000、小于400,000、小于350,000、小于300,
000、小于250,000、小于200,000、小于180,000、小于160,000、小于140,000、小于120,000、小于100,000、小于75,000、小于50,000、或小于25,000的血小板计数。在一些实施方案中,患者和/或临床因素是小于120,000的血小板计数。
[0398] 在特定实施方案中,患者和/或临床因素是患有白血病。在一些实施方案中,患者或临床因素是患有B细胞白血病。在某些实施方案中,所述白血病是急性成淋巴细胞性白血
病(ALL)、非霍奇金淋巴瘤(NHL)、慢性淋巴细胞白血病(CLL)、弥漫性大B细胞淋巴瘤
(DLBCL)或急性髓性白血病(AML)。在某些实施方案中,患者和/或临床因素是患有急性淋巴
细胞白血病(ALL)。
[0399] 在特定实施方案中,患者和/或临床因素是高疾病负荷,例如在开始给予治疗性T细胞组合物之前的高疾病负荷。在某些实施方案中,患者和/或临床因素是就在开始给予治
疗性T细胞组合物之前、或在开始给予治疗性T细胞组合物之前的1周、2周、3周、4周、5周、6周、7周、8周、9周、一个月、两个月、三个月、四个月、五个月、六个月或大于六个月内的高疾病负荷。在一些实施方案中,高疾病负荷是根据骨髓原始细胞的百分比确定的。在某些实施
方案中,高疾病负荷是大于或等于1%、2%、3%、4%、5%、6%、7%、8%、9%或10%的原始细胞。在一些实施方案中,患者和/或临床因素是就在开始给予治疗性T细胞组合物之前或
在开始给予治疗性T细胞组合物之前的一个月内的大于5%原始细胞的疾病负荷。在某些实
施方案中,患者和/或临床因素是高疾病负荷,如直径乘积之和(SPD)或乳酸脱氢酶水平。
[0400] 在特定实施方案中,患者和/或临床因素是高肿瘤负荷,例如在开始给予治疗性T细胞组合物之前的高疾病负荷。在一些实施方案中,指示肿瘤负荷的因素是一个或多个肿
瘤的体积量度。在一些实施方案中,体积量度是一个或多个病灶的量度,例如肿瘤大小、肿
瘤直径、肿瘤体积、肿瘤质量、肿瘤负担或体积、肿瘤相关水肿、肿瘤相关坏死和/或转移的数量或范围。在一些实施方案中,肿瘤的体积量度是二维量度。例如,在一些实施方案中,将一个或多个病灶的面积计算为所有可测量肿瘤的最长直径与最长垂直直径的乘积。在一些
情况下,肿瘤的体积量度是一维量度。在一些情况下,将可测量病灶的大小评估为最长直
径。在一些实施方案中,测量直径乘积之和(SPD)、最长肿瘤直径(LD)、最长肿瘤直径之和
(SLD)、坏死、肿瘤体积、坏死体积、坏死-肿瘤比率(NTR)、瘤周水肿(PTE)和水肿-肿瘤比率(ETR)。
[0401] 用于测量和评估肿瘤负荷的示例性方法包括描述于例如以下文献中的那些:Carceller等人,Pediatr Blood Cancer.(2016)63(8):1400-1406和Eisenhauer等人,Eur 
J Cancer.(2009)45(2):228-247。在一些实施方案中,体积是通过确定所有可测量肿瘤的
最大垂直直径的乘积之和而测量的直径乘积之和(SPD)。在一些方面,在一个维度上用最长
直径(LD)和/或通过确定所有可测量病灶的最长肿瘤直径之和(SLD)来测量肿瘤或病灶。在
一些实施方案中,肿瘤的体积量度是肿瘤坏死的体积定量,例如坏死体积和/或坏死-肿瘤
比率(NTR),参见Monsky等人,Anticancer Res.(2012)32(11):4951-4961。在一些方面,肿
瘤的体积量度是肿瘤相关水肿的体积定量,例如瘤周水肿(PTE)和/或水肿-肿瘤比率
(ETR)。在一些实施方案中,测量可以使用受试者的成像技术来进行,例如计算机断层成像
(CT)、正电子发射断层成像(PET)和/或磁共振成像(MRI)。
[0402] 在一些实施方案中,体积量度是SPD,并且在一些情况下,毒性(例如CRS或NT)的发生与高于阈值的SPD值相关。在一些实施方案中,体积量度是SPD,并且阈值为或为约30/
cm2,为或为约40/cm2,为或为约50/cm2,为或为约60/cm2,或者为或为约70/cm2。在一些实施方案中,体积量度是SPD,并且阈值为或为约30/cm2,为或为约40/cm2,为或为约50/cm2,为或为约60/cm2,或者为或为约70/cm2。在某些实施方案中,患者和/或临床因素是大于30/cm2、大于40/cm2、大于50/cm2、大于60/cm2、或大于70/cm2的SPD。
[0403] 在一些实施方案中,肿瘤的体积量度是在筛选期间(如常规评估或抽血)确定,以确认和/或鉴定受试者中的病症或疾病。
[0404] 在特定实施方案中,患者和/或临床因素是炎性标记的水平、量和/或浓度。在一些实施方案中,炎性标记是或包括检测和评估的C反应蛋白(CRP)、红细胞沉降率(ESR)、白蛋
白、蛋白、β2微球蛋白(β2-M)或乳酸脱氢酶(LDH)的水平或存在。在一些实施方案中,使用免疫测定评估炎性标记。例如,可以使用酶联免疫吸附测定(ELISA)、酶免疫测定(EIA)、放
射免疫测定(RIA)、表面等离子体共振(SPR)、蛋白质印迹、侧向流测定、免疫组织化学、蛋白质阵列或免疫PCR(iPCR)来检测炎性标记。在一些实施方案中,炎性标记的存在、水平、量
和/或浓度指示肿瘤负荷,例如高肿瘤负荷。在一些情况下,使用流式细胞术测定或评估炎
性标记。在一些情况下,试剂是结合炎性标记的可溶性蛋白质。在一些例子中,试剂是结合C反应蛋白(CRP)、红细胞沉降率(ESR)、白蛋白、铁蛋白、β2微球蛋白(β2-M)或乳酸脱氢酶
(LDH)的蛋白质。
[0405] 在一些实施方案中,患者和/或临床因素是炎性标记的水平、量或浓度,所述炎性标记的水平、量或浓度大于或大于约或是在接受治疗性T细胞组合物的给予之前从一组受
试者获得的样品中测量的炎性标记的水平、量或浓度的平均、中值或平均值的5%、10%、
15%、20%、25%、30%、40%、50%、75%、100%、150%、1倍、2倍、3倍、4倍、5倍,和/或是大于在接受治疗性T细胞组合物的给予之前从一组受试者获得的样品中测量的炎性标记的水
平、量或浓度的中值或平均值的3、2.5、2、1.5、1、0.8、0.6、0.5、0.4、0.3、0.2或0.1个标准偏差,其中所述组的每名受试者在给予治疗性T细胞组合物后没有继续发生2级或更高等级、3
级或更高等级、延长的3级或更高等级、4级或更高等级、或5级毒性。在一些实施方案中,毒性是神经毒性。
[0406] 在一些实施方案中,生物标记(例如炎性标记)是或包括C反应蛋白(CRP)。在一些实施方案中,使用体外酶联免疫吸附测定来评估CRP,以从样品(如血清、血浆或血液)获得
人CRP的定量测量值。在一些例子中,使用人酶联免疫吸附测定(ELISA)检测CRP。在一些实
施方案中,生物标记(例如,炎性标记)是或包括红细胞沉降率(ESR)。在一些实施方案中,通过测量红细胞在竖直移液管或导管中从血浆分离后已经下降的距离(以毫米/小时为单位)
来评估ESR。在一些实施方案中,生物标记是或包括白蛋白。在一些方面,使用比色测试或体外酶联免疫吸附测定来评估白蛋白。在一些例子中,使用人酶联免疫吸附测定(ELISA)检测
白蛋白。在一些实施方案中,生物标记(例如炎性标记)是或包括铁蛋白或β2微球蛋白。在一些实施方案中,铁蛋白或β2微球蛋白是使用免疫测定来评估,或使用ELISA来检测。在一些
方面,生物标记(例如炎性标记)是或包括乳酸脱氢酶(LDH),并且LDH是使用比色测试或体
外酶联免疫吸附测定来评估。
[0407] 在一些实施方案中,患者和/或临床因素是LDH的水平、浓度和/或量。在一些实施方案中,毒性(例如CRS或NT)的发生与高于阈值的LDH值相关。在一些实施方案中,炎性标记
是LDH,并且阈值为或为约300单位/升,为或为约400单位/升,为或为约500单位/升或者为
或为约600单位/升。在特定实施方案中,患者和/或临床风险因素是至少300单位/升、至少
400单位/升、至少500单位/升、或至少600单位/升。
[0408] 在一些实施方案中,LDH的水平、浓度和/或数量是疾病负荷(例如,肿瘤或癌症)的替代,并且可以用于某些受试者的潜在神经毒性风险的评估和/或治疗的风险适应性给药
或调节。在一些方面,LDH水平可以单独地和/或与另一种治疗前参数组合地评估,所述治疗
前参数例如为疾病负荷的另一种量度或指示物,例如体积肿瘤测量值,例如尺寸乘积之和
(SPD)或疾病负荷的其他基于CT或基于MRI的体积测量值,例如本文所述的任一种。在一些
方面,对指示疾病负荷的一个或多个参数进行评估,并且在一些情况下所述一个或多个参
数可以指示在T细胞疗法后发生神经毒性的风险的存在、不存在或程度。在一些方面,所述
一个或多个参数包括LDH和/或体积肿瘤测量值。在一些实施方案中,参数是SPD和/或LDH。
[0409] 在一些实施方案中,患者和/或临床因素是在开始给予治疗性T细胞组合物之前接受桥接化学疗法。
[0410] 在特定实施方案中,患者和/或临床因素是例如在开始给予治疗性T细胞组合物之前用淋巴细胞清除疗法进行预处理。在一些实施方案中,淋巴细胞清除疗法是或包括给予
化学疗法。在某些实施方案中,淋巴细胞清除疗法是或包括给予。在特定实施方案中,患者
和/或临床因素是在开始给予治疗性T细胞组合物之前用氟达拉滨和/或环磷酰胺进行预处
理。在某些实施方案中,患者和/或临床因素是在开始给予治疗性T细胞组合物之前用环磷
酰胺进行预处理。在一些实施方案中,患者和/或临床因素是在开始给予治疗性T细胞组合
物之前用氟达拉滨和环磷酰胺进行预处理。
[0411] 在某些实施方案中,患者和/或临床因素是疾病的分子亚型。在某些实施方案中,患者和/或临床因素是白血病的分子亚型。在特定实施方案中,患者和/或临床因素是ALL的
分子亚型。在某些实施方案中,患者和/或临床因素是ALL的分子亚型,所述ALL的分子亚型
不是ALL的费城染色体阳性(Ph+)或费城染色体(Ph)样分子亚型,如非Ph分子亚型。在特定
实施方案中,ALL的非Ph分子亚型包括但不限于与TCF3-PBX1融合、ETV6-RUNX1融合、EP300-
ZNF384融合、KMT2A-AFF1融合、超倍性、或dic(9;20)染色体异常(例如,dic(9;20)(p13.2;
q11.2))相关的亚型。
[0412] 在某些实施方案中,费城染色体含有导致新的嵌合基因和蛋白质的转位(t(9;22)(q34;ql 1)),所述新的嵌合基因和蛋白质将在22号染色体上的BCR基因与在9号染色体上
的编码Abelson酪氨酸激酶(ABL1)的基因融合。在特定实施方案中,ALL的费城样(Ph样)亚
型的特征在于被不同地称为“簇群R8”、“费城染色体(Ph)样”、“Ph样”、“BCR-ABLl样”、或“激活的酪氨酸激酶基因表达标签”的相关基因表达标签。尽管事实是,在一些实施方案中,Ph
样受试者不具有费城染色体转位或BCR-ABLl融合转录物,但是已显示这些基因表达标签与
在Ph+ALL受试者中测量的基因表达特征高度相似。已经描述了鉴定和/或确定Ph+和/或Ph
样ALL亚型的方法和技术(参见例如,Roberts等人,N Engl J Med(2014)371(11):1005-
1015;Roberts等人Cancer Cell(2012)14;22(2):153-66;Perez-Andreu等人Nature 
Genetics(2013)45(12):1494-1498;Yap等人Leuk Lymphoma(2017)58(4):950-958;
Roberts等人J Clin Oncol(2017)35(4):394-401;Harvey等人Blood(2013)122:826;
Harvey等人,Blood(2010)116(23):4874-4884;以及PCT申请号WO 2013/090419,通过引用
以其整体特此并入。
[0413] 在一些实施方案中,患者和/或临床因素是在开始给予治疗性T细胞组合物之前在血液、血清或血浆样品中细胞因子的水平、量或浓度。在一些实施方案中,细胞因子是白细
胞介素,例如白细胞介素-15(IL-15)。在特定实施方案中,患者和/或临床因素是在开始给
予治疗性T细胞组合物之前在血液样品中IL-15的升高水平、量或浓度。在某些实施方案中,
患者和/或临床因素是在开始给予治疗性T细胞组合物之前在血液、血清或血浆样品中大于
或等于1pg/mL、5pg/mL、10pg/mL、15pg/mL、20pg/mL、25pg/mL、30pg/mL、35pg/mL、40pg/mL、
45pg/mL、50pg/mL、100pg/mL、150pg/mL、200pg/mL、250pg/mL、或300pg/mL的IL-15的水平、量或浓度。在某些实施方案中,患者和/或临床因素是在开始给予治疗性T细胞组合物之前
在血液、血清或血浆样品中大于或等于30pg/mL的IL-15的水平、量或浓度。
[0414] 在特定实施方案中,患者和/或临床因素是IL-15的水平、量或浓度,所述IL-15的水平、量或浓度大于或大于约或是在接受包含一定剂量的用重组受体工程化的细胞的治疗
性T细胞组合物的给予之前从一组受试者获得的血液样品中的IL-15的水平、量或浓度的平
均、中值或平均值的5%、10%、15%、20%、25%、30%、40%、50%、75%、100%、150%、1倍、
2倍、3倍、4倍、5倍,和/或是大于在接受包含一定剂量的用重组受体工程化的细胞的治疗性T细胞组合物的给予之前从一组受试者获得的血液样品中的IL-15的水平、量或浓度的中值
或平均值的3、2.5、2、1.5、1、0.8、0.6、0.5、0.4、0.3、0.2或0.1个标准偏差,其中所述组的每名受试者在给予治疗性T细胞组合物后没有继续发生2级或更高等级、3级或更高等级、延长
的3级或更高等级、4级或更高等级、或5级毒性。在一些实施方案中,毒性是神经毒性。
[0415] 在某些实施方案中,患者和/或临床因素是细胞组合物在其给予至受试者后的药代动力学特性,例如是重组受体表达细胞(例如,CAR T细胞)的体内扩增。在一些实施方案
中,药代动力学参数可以包括暴露、数量、浓度、持久性和增殖。在一些情况下,药代动力学可以通过测量诸如以下等参数来评估:最大(峰值)血浆浓度(Cmax)、峰值时间(即出现最大
血浆浓度(Cmax)的时间;Tmax)、最小血浆浓度(即治疗剂(例如,CAR+ T细胞)的剂量之间的最小血浆浓度;Cmin)、给予后的消除半衰期(T1/2)和曲线下面积(即通过标绘时间与治疗剂CAR+ T细胞的血浆浓度产生的曲线下面积;AUC)。给予后血浆中特定治疗剂(例如CAR+ T细胞)
的浓度可以使用本领域已知的任何适合于评估治疗剂(例如CAR+ T细胞)在血液样品中的
浓度的方法或本文所述的任何方法来测量。例如,可以使用基于核酸的方法(如定量PCR
(qPCR))或基于流式细胞术的方法或其他测定,例如免疫测定、ELISA或基于色谱/质谱的测
定。
[0416] 在一些实施方案中,确定所给予细胞(例如CAR+ T细胞组合物)的药代动力学(PK)以评估所给予细胞的可用性,例如生物利用度。在一些实施方案中,所给予细胞的确定的药
代动力学参数包括最大(峰值)血浆浓度(Cmax),例如CD3+CAR+细胞、CD4+CAR+细胞和/或CD8
+CAR+ T细胞的Cmax;实现Cmax的时间点(Tmax),例如CD3+CAR+细胞、CD4+CAR+细胞和/或CD8+ CAR+ T细胞的Tmax和/或曲线下面积(AUC),例如CD3+CAR+细胞、CD4+ CAR+细胞和/或CD8+
CAR+ T细胞的AUC0-28。在一些实施方案中,药代动力学参数是峰值CD3+CAR+T细胞浓度(Cmax CD3+CAR+ T细胞)或CD8+ CAR+ T细胞浓度(Cmax CD8+CAR+ T细胞)。在一些实施方案中,药代动力学参数是CD3+CAR+ T细胞的AUC0-28(AUC0-28 CD3+CAR+ T细胞),或CD8+ CAR+ T细胞的
AUC0-28(AUC0-28 CD8+CAR+ T细胞)。
[0417] 指示扩增和/或持久性的细胞(例如T细胞疗法给予的T细胞)的暴露(例如数量或浓度)可以根据暴露至受试者的细胞的最大数量或浓度、可检测细胞或高于某一数量或百
分比的细胞的持续时间、细胞的数量或浓度随时间的曲线下面积(AUC)和/或其组合及其指
示物来陈述。此类结果可以使用已知方法来评估,例如使用qPCR来检测与特定样品(例如血
液、血清、血浆或组织,如肿瘤样品)中核酸或DNA的总量相比,编码重组受体的核酸的拷贝
数;和/或使用流式细胞术测定,通常使用对受体具有特异性的抗体来检测表达受体的细
胞。还可以使用基于细胞的测定来检测功能细胞的数量或百分比或浓度,所述功能细胞例
如为能够结合至和/或中和和/或诱导针对疾病或病症的细胞或表达由受体识别的抗原的
细胞的应答(例如细胞毒性应答)的细胞。
[0418] 在一些实施方案中,暴露可以陈述为在给予一定剂量的治疗剂(例如CAR+ T细胞)后的治疗剂浓度-时间曲线下面积(AUC),如通过药代动力学分析所确定。在一些情况下,对
于细胞疗法中给予的细胞,AUC是以细胞*天/μL或以其相应单位来表示。在一些实施方案
中,AUC被测量为患者群体(如样品患者群体)中的平均AUC,例如一个或多个患者的平均
AUC。在一些实施方案中,全身暴露是指在某一时间段内的曲线下面积(AUC),例如,第0天到第1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、21、28天或更长时间,或第1、2、3、4、5、6、7、8、9、
10、11、12、13、14、15周或更长时间,或第1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、18、24、48个月或更长时间。在一些实施方案中,AUC被测量为给予治疗剂(例如CAR+T细胞)后第0天到第28天的
AUC(AUC0-28),包括所有测量数据和从所测量的药代动力学(PK)参数外推的数据,例如来自
患者群体(例如样品患者群体)的平均AUC。在一些实施方案中,为了确定随时间的暴露,例
如某一时间段的AUC,例如AUC0-28,使用随时间的多次测量或参数(例如,细胞浓度)评估(例如,每1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、21或28天或更长时间进行的测量)产生治疗剂浓度-时间曲线。
[0419] 在一些实施方案中,确定了在给予T细胞后表达重组受体的细胞(例如,基于T细胞的疗法所给予的CAR表达细胞)在受试者体内的存在和/或量。在一些方面,使用基于核酸的
方法(例如定量PCR(qPCR))来评估受试者的血液或血清或器官或组织样品(例如,疾病部位
例如肿瘤样品)中表达重组受体的细胞(例如,出于基于T细胞的疗法给予的表达CAR的细
胞)的量。在一些方面,持久性被定量为每微克的DNA中编码受体(例如,CAR)的DNA或质粒的
拷贝,或者定量为每微升的样品(例如,血液或血清)中表达受体的(例如,表达CAR的)细胞
的数量,或者每微升的样品中外周血单核细胞(PBMC)或白细胞或T细胞的总数。在一些实施
方案中,用于qPCR或其他基于核酸的方法的引物或探针对结合、识别和/或扩增编码重组受
体的核酸和/或质粒和/或载体中的其他组分或元件具有特异性,所述其他组分或元件包括
调节元件(例如启动子、转录和/或转录后调节元件)或反应元件,或标记(例如替代标记)。
在一些实施方案中,所述引物可以对调节元件(例如土拨鼠肝炎病毒转录后调节元件
(WPRE))具有特异性。
[0420] 在一些实施方案中,在给予T细胞(例如,表达CAR的T细胞)后在或至少在2、3、4、5、6、7、14、15、27或28天在受试者体内检测细胞。在一些方面,在给予T细胞(例如,表达CAR的T细胞)后,在或至少在2、4或6周,或3、6或12、18或24或30或36个月,或1、2、3、4、5年或更长时间,检测所述细胞。在一些实施方案中,例如通过指定的方法,如qPCR或基于流式细胞术的
检测方法,可在受试者的血清、血浆、血液或组织(例如,肿瘤样品)中检测表达受体的细胞。
[0421] 在一些实施方案中,在给予T细胞(例如,表达CAR的T细胞)后,表达受体的细胞(例如,表达CAR的细胞)在受试者中扩增。在一些方面,增加的受试者对细胞的暴露包括增加的
细胞扩增。如本文所示,在给予细胞疗法后早期(例如在7天内,如4-7天内)发生的扩增增加
与发生毒性的风险或可能风险相关、相关联,和/或可以指示发生毒性的风险或可能风险。
在一些实施方案中,提供了如下方法:其中对受试者监测所给予的重组受体表达细胞的药
代动力学特性,并且如果检测到早期或快速扩增,则可以将改善毒性或毒性的风险或可能
风险的一种或多种药剂给予至受试者。改善毒性的示例性药剂是已知的并且描述于例如第
IV.E章节中。
[0422] 在特定实施方案中,药代动力学参数是指示受试者中细胞的早期或快速扩增的一定数量的重组受体表达细胞。在一些实施方案中,如果在开始给予细胞疗法之后的四天、五
天、六天、七天、八天、九天、十天、十一天、十二天、十三天、或十四天或更多天内收集的血液或血清样品中检测到每微升至少、为或约2个、3个、4个、5个、10个、15个、20个、25个、30个、
35个、40个、45个、50个、75个、100个、125个、150个、或200个重组受体表达细胞,则可以显示这种可检测的扩增。在一些实施方案中,药代动力学参数是一定数量的重组受体表达细胞,
其是在开始给予之后四天内收集的血液或血清样品中每微升至少、为或约2个重组受体表
达细胞。在特定实施方案中,药代动力学参数是一定数量的重组受体表达细胞,其是在开始
给予之后五天或六天内收集的血液或血清样品中每微升至少、为或约5个重组受体表达细
胞。在一些实施方案中,药代动力学参数是一定数量的重组受体表达细胞,其是在开始给予
之后五天或六天内收集的血液或血清样品中每微升至少、为或约10个重组受体表达细胞。
在特定实施方案中,药代动力学参数是一定数量的重组受体表达细胞,其是在开始给予之
后七天内收集的血液或血清样品中每微升至少、为或约15个重组受体表达细胞。
[0423] 在特定实施方案中,本文提供了设计用于给予治疗性T细胞组合物的试验的方法。在一些实施方案中,所述方法包括基于一种或多种患者和/或临床风险因素(如所描述的任
何一种)的存在或不存在将受试者分配到治疗方案。在一些实施方案中,不具有或未被鉴定
或认为具有患者和/或临床因素的受试者被分配以接受一定剂量的治疗性T细胞组合物。在
特定实施方案中,受试者具有或被鉴定或被认为具有患者和/或临床因素,并且被分配以给
予降低和/或较低剂量的细胞。在某些实施方案中,降低和/或较低剂量比给予至没有患者
和/或临床因素的受试者的剂量少了或少了至少5%、10%、15%、20%、25%、30%、35%、
40%、45%、50%、60%、70%、80%、90%、或95%。在某些实施方案中,在被给予所述剂量的细胞的没有患者和/或临床因素的受试者与被给予所述较低剂量的细胞的具有患者和/或
临床因素的受试者之间,在毒性(例如,严重不良副作用、CRS、和/或神经毒性)的发生率方
面没有实质差异。
[0424] 在某些实施方案中,如果受试者具有如下的一个或多个患者和/或临床因素,则所述受试者被分配给予低剂量或减少的剂量,所述一个或多个患者和/或临床因素可以包括
但不限于:(i)在开始给予治疗性T细胞组合物之前已经接受过较少的先前疗法(任选地少
于两种先前疗法)的受试者,(ii)年龄小(任选地小于30岁)的受试者,(iii)其中在来自受
试者的单采术样品中的CD4:CD8的比率低于某一阈值(任选地低于1:1或低于1.5:1或低于
0.5:1或更低)(任选地其中所给予的剂量是基于总T细胞或表达重组受体的总T细胞)的受
试者;(iv)体重大于在所治疗的受试者的组中的平均体重的受试者;(v)血小板计数小于或
约小于120,000的受试者;(vi)患有B细胞白血病(任选地急性淋巴细胞白血病(ALL))的受
试者;(vii)在开始给予治疗性T细胞组合物之前(例如就在开始给予治疗性T细胞组合物之
前或在开始给予治疗性T细胞组合物之前一个月内)具有高疾病负荷的受试者,任选地如基
于大于或等于5%的骨髓原始细胞的百分比、直径乘积之和(SPD)、或乳酸脱氢酶的水平来
确定的;(ix)在开始给予治疗性T细胞组合物之前已经接受过桥接化学疗法的受试者;(x)
在开始给予治疗性T细胞组合物之前已经用淋巴细胞清除疗法(任选地包括给予氟达拉滨
和/或环磷酰胺)预处理的受试者;和/或(xi)其中在开始给予治疗性T细胞组合物之前在血
液样品中的白细胞介素-15(IL-15)的水平、量或浓度大于或等于阈值(任选地其中所述阈
值是30pg/mL血浆)的受试者,(xii)表达重组受体的细胞的快速的体内扩增,(xiii)未展现
急性成淋巴细胞性白血病(ALL)的费城染色体(Ph+)和/或Ph染色体样(Ph样)分子亚型的受
试者。
[0425] C.反应结果
[0426] 在一些实施方案中,可以监测或评估在给予T细胞组合物后在受试者中的反应结果。在一些实施方案中,反应结果是无反应。在一些实施方案中,反应结果是部分反应。在一些实施方案中,反应结果是完全反应(CR)。在一些实施方案中,通过监测受试者的疾病负荷
来评估反应结果。在一些实施方案中,可以评估无反应、部分反应或临床或完全反应的存
在。
[0427] 在一些实施方案中,部分反应或完全反应是治疗剂减少或防止受试者中的疾病或病症的扩展或负荷的反应。例如,当疾病或病症是肿瘤时,如果与用治疗剂(例如CAR T细
胞)治疗之前相比,肿瘤大小、体积、转移、骨髓中原始细胞(blast)的百分比或可分子检测
的癌症有所减少,和/或预后或存活或与肿瘤负荷相关的其他症状有所改善,则存在或呈现
减少的疾病负荷。
[0428] 在一些实施方案中,疾病或病症是肿瘤,并且疾病负荷的减少是肿瘤尺寸的减小。在一些实施方案中,疾病负荷的减少是由一种或多种因素的减少来指示,所述因素例如受
试者或其体液或器官或组织中的疾病细胞的负担或数量、肿瘤的质量或体积、或转移的程
度或范围。在一些实施方案中,可以针对形态学疾病和/或微小残留疾病的程度评估或监测
疾病负荷(例如肿瘤负荷)。
[0429] 在一些实施方案中,检测、评估或测量受试者中疾病或病症的负荷。可以在一些方面通过检测受试者中或受试者的器官、组织或体液(如血液或血清)中的疾病或疾病相关细
胞例如肿瘤细胞的总数来检测疾病负荷。在一些实施方案中,通过测量实体瘤的质量和/或
转移的数量或成都来评估疾病负荷,例如肿瘤负荷。在一些方面,评估受试者的存活、特定
时间段内的存活、存活程度、无事件或无症状存活的存在或持续时间或无复发存活。在一些
实施方案中,评估疾病或病症的任何症状。在一些实施方案中,指定疾病或病症负荷的量
度。
[0430] 在一些实施方案中,疾病负荷可以包括受试者或受试者的器官、组织或体液(例如肿瘤或其他位置(例如,其可指示转移)的器官或组织)中疾病细胞的总数。例如,可以在某
些血液恶性肿瘤环境中在血液或骨髓中检测和/或定量肿瘤细胞。在一些实施方案中,疾病
负荷可包括肿瘤的质量、转移的数量或程度和/或骨髓中存在的原始细胞的百分比。
[0431] 在一些实施方案中,受试者患有白血病。疾病负荷的程度可以通过评估血液或骨髓中的残留白血病来确定。
[0432] 在一些实施方案中,如果与用治疗剂治疗前骨髓中的原始细胞的百分比相比,骨髓中原始细胞的百分比有所减少,则存在反应结果。在一些实施方案中,如果与治疗前骨髓
中原始细胞的数量或百分比相比,骨髓中原始细胞的数量或百分比降低或减少至少或至少
约20%、30%、40%、50%、60%、70%、80%、90%、95%或更多,则存在疾病负荷的减少。
[0433] 在一些实施方案中,如果受试者不展现形态学疾病(非形态学疾病)或者不展现显著的形态学疾病,则受试者展现反应。在一些实施方案中,如果例如如通过光学显微镜检测
到在骨髓中存在大于或等于5%的原始细胞,则受试者展现出形态学疾病。在一些实施方案
中,如果骨髓中存在少于5%原始细胞,则受试者展现出完全或临床缓解。
[0434] 在一些实施方案中,如果受试者在治疗前展现形态学疾病并且在治疗后展现具有或不具有可分子检测(例如,如通过流式细胞术或定量PCR检测)的分子疾病(例如,最小残
留疾病(MRD))的完全缓解(例如,骨髓中的原始细胞少于5%),则受试者展现减小或降低的
疾病负荷。在一些实施方案中,如果受试者在治疗前展现分子疾病并且在治疗后不展现分
子疾病,则受试者展现减小或降低的疾病负荷。
[0435] 在一些实施方案中,受试者可展现出完全缓解,但存在一小部分形态学上(通过光学显微镜技术)不可检测的残留白血病细胞。如果受试者展现在骨髓中小于5%原始细胞并
且展现可分子检测的癌症,则称受试者展现最小残留疾病(MRD)。在一些实施方案中,可以
使用允许灵敏检测少量细胞的各种分子技术中的任何一种来评估可分子检测的癌症。在一
些方面,此类技术包括PCR测定,其可以确定由染色体易位产生的独特Ig/T细胞受体基因重
排或融合转录物。在一些实施方案中,流式细胞术可以用于基于白血病特异性免疫表型鉴
定癌细胞。在一些实施方案中,癌症的分子检测可以检测到100,000个正常细胞中的1个白
血病或原始细胞或10,000个正常细胞中的1个白血病或原始细胞。在一些实施方案中,如果
如通过PCR或流式细胞术检测到100,000个细胞中的至少或大于1个白血病细胞,则受试者
展现出可分子检测的MRD。
[0436] 在一些实施方案中,受试者的疾病负荷是不可分子检测的或MRD-,使得在一些情况下使用PCR或流式细胞术技术不能检测到受试者体内的白血病细胞。
[0437] 在一些实施方案中,反应结果是CR的不存在或完全反应的存在,其中受试者实现或展现最小残留疾病或可分子检测的疾病状态。在一些实施方案中,反应结果是具有可分
子检测的疾病的CR的存在或不具有可分子检测的疾病的CR的存在。在一些实施方案中,使
用如本文所述的方法(例如通过流式细胞术或qPCR方法评估骨髓中的原始细胞或分子疾病
的方法)评估受试者的疾病负荷。
[0438] 在一些实施方案中,在给予细胞后,例如通过许多已知方法中的任一种测量工程化细胞群的生物学活性。待评估的参数包括工程化或天然T细胞或其他免疫细胞与抗原的
特异性结合,其在体内例如通过成像进行评估,或离体例如通过ELISA或流式细胞术进行评
估。在某些实施方案中,可以使用本领域已知的任何合适的方法(如描述于例如
Kochenderfer等人,J.Immunotherapy,32(7):689-702(2009)和Herman等人
J.Immunological Methods,285(1):25-40(2004)中的细胞毒性测定)测量工程化细胞破坏
靶细胞的能力。在一些实施方案中,通过测定一种或多种细胞因子(例如CD 107a、IFNγ、
IL-2和TNF)的表达和/或分泌来测量细胞的生物学活性。在一些方面,通过评估临床结果
(如肿瘤负荷或负担的减少)来测量生物活性。
[0439] C.改善或治疗毒性的药剂
[0440] 在一些实施方案中,本文提供的方法涉及在给予包含表达重组受体(例如CAR)的细胞的细胞疗法后,对受试者监测毒性的风险或可能风险,和/或鉴定具有发生毒性(例如
严重毒性,如严重CRS或严重神经毒性)的风险或可能风险的受试者。在一些实施方案中,所
述方法包括给予一种或多种药剂或疗法,所述一种或多种药剂或疗法治疗细胞疗法的毒性
(如CRS或神经毒性,例如严重CRS或严重神经毒性)。在一些实施方案中,在确定受试者具有
发生毒性(如严重毒性)的风险的时候和/或在已经表现出毒性的一种或多种体征或症状的
时候给予所述药剂。
[0441] 在一些实施方案中,所述药剂是类固醇。在一些实施方案中,所述药剂是细胞因子受体(如IL-6受体、CD122受体(IL-2Rβ受体)或CCR2)的拮抗剂或抑制剂,或者是细胞因子
(如IL-6、MCP-1、IL-10、IFN-γ、IL-8或IL-18)的抑制剂。在一些实施方案中,所述药剂是细胞因子受体和/或细胞因子(如TGF-β)的激动剂。在一些实施方案中,所述药剂(例如激动
剂、拮抗剂或抑制剂)是抗体或抗原结合片段、小分子、蛋白质或肽、或核酸。
[0442] 在一些实施方案中,可以将流体推注用作干预,例如用于治疗与CRS相关的低血压。在一些实施方案中,目标血球容积水平为>24%。在一些实施方案中,干预包括使用具有血液或血浆过滤的吸收性树脂技术。在一些情况下,干预包括透析血浆置换或类似技术。
在一些实施方案中,可以使用血管加压药(vassopressor)或对乙酰氨基酚。
[0443] 1.类固醇
[0444] 在一些实施方案中,治疗和/或预防、延迟或减弱对细胞疗法的毒性的发生或发生对细胞疗法的毒性的风险的药剂是类固醇(例如,皮质类固醇),所述毒性是例如2级或更高
等级或严重CRS或神经毒性。皮质类固醇通常包括糖皮质激素和盐皮质激素。
[0445] 任何皮质类固醇(例如糖皮质激素)可以用于本文所提供的方法中。在一些实施方案中,糖皮质激素包括合成和非合成的糖皮质激素。示例性糖皮质激素包括但不限于:阿氯
米松(alclomethasone)、阿尔孕酮(algestone)、倍氯米松(beclomethasone)(例如二丙酸
倍氯米松)、倍他米松(betamethasone)(例如倍他米松17-戊酸酯、倍他米松醋酸钠、倍他米
松磷酸钠、倍他米松戊酸酯)、布地奈德(budesonide)、氯倍他索(clobetasol)(例如丙酸氯
倍他索)、氯倍他松(clobetasone)、氯可托龙(clocortolone)(例如氯可托龙新戊酸酯)、氯
泼尼醇(cloprednol)、皮质酮、可的松(cortisone)和氢化可的松(hydrocortisone)(例如
醋酸氢化可的松)、可的伐唑(cortivazol)、地夫可特(deflazacort)、地奈德(desonide)、
去羟米松(desoximethasone)、地塞米松(dexamethasone)(例如地塞米松21-磷酸酯、醋酸
地塞米松、地塞米松磷酸钠)、二氟拉松(diflorasone)(例如二氟拉松二醋酸酯)、二氟可龙
(diflucortolone)、二氟泼尼酯(difluprednate)、甘草次酸(enoxolone)、氟扎可特
(fluazacort)、氟氯奈德(flucloronide)、氟氢可的松(fludrocortisone)(例如醋酸氟氢
可的松)、氟米松(flumethasone)(例如特戊酸氟米松)、氟尼缩松(flunisolide)、氟轻松
(fluocinolone)(例如丙酮化氟轻松)、醋酸氟轻松(fluocinonide)、氟可丁(fluocortin)、
氟可龙(fluocortolone)、氟米龙(fluorometholone)(例如醋酸氟米龙)、氟培龙
(fluperolone)(例如醋酸氟培龙)、氟泼尼定(fluprednidene)、氟泼尼龙
(fluprednisolone)、丙酮缩氟氢羟龙(flurandrenolide)、氟替卡松(fluticasone)(例如
丙酸氟替卡松)、福莫可他(formocortal)、氯氟舒松(halcinonide)、卤倍他索
(halobetasol)、卤米松(halometasone)、卤泼尼松(halopredone)、氢可他酯
(hydrocortamate)、氢化可的松(例如氢化可的松21-丁酸酯、氢化可的松醋丙酯、醋酸氢化
可的松、氢化可的松丁丙酸酯、丁酸氢化可的松、氢化可的松环戊丙酸酯、氢化可的松半琥
珀酸酯、氢化可的松丙丁酸酯、磷酸氢化可的松钠、氢化可的松琥珀酸钠、戊酸氢化可的
松)、依碳酸氯替泼诺(loteprednol etabonate)、泼尼酮(mazipredone)、甲羟松
(medrysone)、甲泼尼松(meprednisone)、甲基泼尼松龙(乙丙酸甲基泼尼松龙、醋酸甲基泼
尼松龙、半琥珀酸甲基泼尼松龙、甲基泼尼松龙琥珀酸钠)、莫米松(mometasone)(如糠酸莫
米松)、帕拉米松(如醋酸帕拉米松)、泼尼卡酯(prednicarbate)、泼尼松龙(prednisolone)
(例如泼尼松龙25-二乙氨基乙酸酯、泼尼松龙磷酸钠、泼尼松龙21-半琥珀酸盐、醋酸泼尼
松龙;泼尼松龙法尼酯、泼尼松龙半琥珀酸盐、泼尼松龙-21(β-D-葡萄糖酸苷)、间磺苯甲酸泼尼松龙、泼尼松龙司替酸酯、泼尼松龙叔丁乙酸酯、四氢邻苯二甲酸泼尼松龙)、泼尼松(prednisone)、泼尼松龙戊酸酯(prednival)、泼尼立定(prednylidene)、利美索龙
(rimexolone)、替可的松(tixocortol)、曲安西龙(triamcinolone)(例如曲安奈德
(triamcinolone acetonide)、苯曲安奈德(triamcinolone benetonide)、己曲安奈德
(triamcinolone hexacetonide)、曲安奈德21-棕榈酸酯、醋酸曲安西龙)。这些糖皮质激素
及其盐详细论述于例如以下文献中:Remington's Pharmaceutical Sciences,A.Osol编
辑,Mack Pub.Co.,Easton,Pa.(第16版,1980)。
[0446] 在一些例子中,糖皮质激素选自可的松、地塞米松、氢化可的松、甲基泼尼松龙、泼尼松龙和泼尼松。在特定例子中,糖皮质激素是地塞米松。
[0447] 在一些实施方案中,所述药剂是皮质类固醇并且以对治疗、改善或减轻对细胞疗法的毒性(如CRS或神经毒性)的一种或多种症状是治疗有效的量给予。在一些实施方案中,
改善或成功治疗的指示物包括确定未能在毒性分级量表(例如CRS或神经毒性分级量表)上
显示相关分数(如小于3的分数),或在如本文所讨论的分级量表上的分级或严重程度的变
化(如从4分到3分的变化)。
[0448] 在一些方面,皮质类固醇是以治疗有效剂量提供。治疗有效浓度可以通过在已知的体外或体内(例如动物模型)系统中进行测试,凭经验确定。例如,可以通过标准临床技术
来确定被给予以改善对细胞疗法的毒性(如CRS或神经毒性)的症状或副作用的所选择的皮
质类固醇的量。此外,可以采用动物模型来帮助确定最佳剂量范围。可以凭经验确定的精确
剂量可以取决于具体的治疗制剂、方案和给药时间表、给予途径和疾病的严重性。
[0449] 可以按有效改善与毒性(如与CRS或神经毒性)相关的一种或多种症状的任何量给予皮质类固醇。可以将皮质类固醇(例如糖皮质激素)例如以如下的量给予至70kg成年人受
试者:每个剂量在或在约0.1与100mg之间,在0.1至80mg、0.1至60mg、0.1至40mg、0.1至
30mg、0.1至20mg、0.1至15mg、0.1至10mg、0.1至5mg、0.2至40mg、0.2至30mg、0.2至20mg、0.2至15mg、0.2至10mg、0.2至5mg、0.4至40mg、0.4至30mg、0.4至20mg、0.4至15mg、0.4至10mg、
0.4至5mg、0.4至4mg、1至20mg、1至15mg或1至10mg之间(每个都包含端值)。通常,将皮质类固醇(如糖皮质激素)以如下量给予至普通成年人受试者:在或在约0.4与20mg/剂之间,例
如,为或为约0.4mg、0.5mg、0.6mg、0.7mg、0.75mg、0.8mg、0.9mg、1mg、2mg、3mg、4mg、5mg、
6mg、7mg、8mg、9mg、10mg、11mg、12mg、13mg、14mg、15mg、16mg、17mg、18mg、19mg或20mg/剂量。
[0450] 在一些实施方案中,可以将皮质类固醇以例如以下剂量给予至通常体重为约70kg至75kg的普通成年人受试者:为或为约0.001mg/kg(受试者)、0.002mg/kg、0.003mg/kg、
0.004mg/kg、0.005mg/kg、0.006mg/kg、0.007mg/kg、0.008mg/kg、0.009mg/kg、0.01mg/kg、
0.015mg/kg、0.02mg/kg、0.025mg/kg、0.03mg/kg、0.035mg/kg、0.04mg/kg、0.045mg/kg、
0.05mg/kg、0.055mg/kg、0.06mg/kg、0.065mg/kg、0.07mg/kg、0.075mg/kg、0.08mg/kg、
0.085mg/kg、0.09mg/kg、0.095mg/kg、0.1mg/kg、0.15mg/kg、0.2mg/kg、0.25mg/kg、0.30mg/kg、0.35mg/kg、0.40mg/kg、0.45mg/kg、0.50mg/kg、0.55mg/kg、0.60mg/kg、0.65mg/kg、
0.70mg/kg、0.75mg/kg、0.80mg/kg、0.85mg/kg、0.90mg/kg、0.95mg/kg、1mg/kg、1.05mg/kg、
1.1mg/kg、1.15mg/kg、1.20mg/kg、1.25mg/kg、1.3mg/kg、1.35mg/kg或1.4mg/kg。
[0451] 可以将皮质类固醇或糖皮质激素(例如地塞米松)按以下途径给予:口服(片剂、液体或液体浓缩物)(PO)、静脉内(IV)、肌肉内或通过本文所述的任何其他已知途径(例如,关
于药物配制品)。在一些方面,将皮质类固醇以推注形式给予,并且在其他方面,可以将其在一定时间段内给予。
[0452] 在一些方面,可以将糖皮质激素在超过一天的时间段内给予,例如在两天内、在3天内、或在4天内或更多天内。在一些实施方案中,可以将皮质类固醇每天一次、每天两次、或者每天三次或更多次给予。例如,在一些例子中,可以将皮质类固醇(例如地塞米松)每天
两次以10mg(或等效量)IV给予,持续三天。
[0453] 在一些实施方案中,将皮质类固醇(例如糖皮质激素)的剂量以每次治疗连续降低的剂量给予。因此,在一些此类治疗方案中,皮质类固醇的剂量是逐渐减少的。例如,可以将皮质类固醇以4mg的初始剂量(或等效剂量,例如关于地塞米松)给予,并且在每次连续给予
时可以降低剂量,使得下一次给予的剂量为3mg,下一次给予为2mg,并且下一次给予为1mg。
[0454] 通常,所给予的皮质类固醇的剂量取决于特定的皮质类固醇,因为不同皮质类固醇之间存在效力差异。通常应理解,药物的效力不同,剂量可以因此而变化,以获得相同的
效果。表4显示各种糖皮质激素和给予途径的在效力方面的等效性。临床给药中的等效效力
是熟知的。有关等效类固醇给药(以非时间治疗方式)的信息可以参见British National 
Formulary(BNF)37,1999年3月。
[0455]
[0456] 因此,在一些实施方案中,将类固醇按以下等效剂量量来给予:为或为约1.0mg至20mg地塞米松/天,例如1.0mg至15mg地塞米松/天、1.0mg至10mg地塞米松/天、2.0mg至8mg
地塞米松/天或2.0mg至6.0mg地塞米松/天,每个都包含端值。在一些情况下,将类固醇以为
或为约4mg、或者为或为约8mg地塞米松/天的等效剂量给予。
[0457] 在一些实施方案中,如果在用托西利珠单抗治疗后持续发热,则给予类固醇。例如,在一些实施方案中,在持续发热的情况下,将地塞米松以多达每6-12小时5-10mg的剂量
口服或静脉内给予。在一些实施方案中,将托西利珠单抗与补氧同时给予或在补氧后给予。
[0458] 2.其他药剂
[0459] 在一些实施方案中,治疗或改善细胞疗法的毒性(如CRS或神经毒性)的症状的药剂是针对细胞因子的一种药剂,例如是细胞因子的拮抗剂或抑制剂,所述细胞因子是例如
转化生长因子β(TGFβ)、白细胞介素6(IL-6)、白细胞介素10(IL-10)、IL-2、MIP1β(CCL4)、TNFα、IL-1、干扰素γ(IFN-γ)或单核细胞趋化蛋白-1(MCP-1)。在一些实施方案中,治疗或改善细胞疗法的毒性(如CRS或神经毒性)的症状的药剂是靶向(例如抑制或是其拮抗剂)细
胞因子受体的一种药剂,所述细胞因子受体是例如IL-6受体(IL-6R)、IL-2受体(IL-2R/
CD25)、MCP-1(CCL2)受体(CCR2或CCR4)、TGF-β受体(TGF-βI、II或III)、IFN-γ受体
(IFNGR)、MIP1β受体(例如,CCR5)、TNFα受体(例如,TNFR1)、IL-1受体(IL1-Rα/IL-1Rβ)或IL-10受体(IL-10R)。
[0460] 可以通过标准临床技术来确定治疗或改善细胞疗法的毒性(如CRS或神经毒性)症状的所选择的药剂被给予以改善对细胞疗法的毒性(如CRS或神经毒性)的症状或副作用的
量。示例性的不良事件包括但不限于丙氨酸氨基转移酶的增加、天冬氨酸氨基转移酶的增
加、寒战、发热型嗜中性粒细胞减少症、头痛、低血压、左心室功能障碍、脑病、脑积水、癫痫发作和/或震颤。
[0461] 在一些实施方案中,将所述药剂按以下剂量量来给予:为或为约30mg至5000mg,例如50mg至1000mg、50mg至500mg、50mg至200mg、50mg至100mg、100mg至1000mg、100mg至
500mg、100mg至200mg、200mg至1000mg、200mg至500mg或500mg至1000mg。
[0462] 在一些实施方案中,将所述药剂按以下剂量来给予:为或为约0.5mg/kg至100mg/kg,例如为或为约1mg/kg至50mg/kg、1mg/kg至25mg/kg、1mg/kg至10mg/kg、1mg/kg至5mg/
kg、5mg/kg至100mg/kg、5mg/kg至50mg/kg、5mg/kg至25mg/kg、5mg/kg至10mg/kg、10mg/kg至
100mg/kg、10mg/kg至50mg/kg、10mg/kg至25mg/kg、25mg/kg至100mg/kg、25mg/kg至50mg/kg至50mg/kg至100mg/kg。在一些实施方案中,将所述药剂按以下剂量量来给予:为或为约
1mg/kg至10mg/kg、2mg/kg至8mg/kg、2mg/kg至6mg/kg、2mg/kg至4mg/kg或6mg/kg至8mg/kg,每个都包含端值。在一些方面,将所述药剂按以下剂量量来给予:至少或至少约或约1mg/
kg、2mg/kg、4mg/kg、6mg/kg、8mg/kg、10mg/kg或更多。在一些实施方案中,将所述药剂以
4mg/kg或8mg/kg的剂量给予。
[0463] 在一些实施方案中,所述药剂是通过注射来给予,例如静脉内或皮下注射、眼内注射、眼周注射、视网膜下注射、玻璃体内注射、经中隔注射、巩膜下注射、脉络膜内注射、前房注射、结膜下注射(subconjectval  injection)、结膜下注射(subconjuntival 
injection)、眼球筋膜囊下(sub-Tenon)注射、球后注射、球周注射或后近巩膜(posterior 
juxtascleral)递送。在一些实施方案中,它们通过肠胃外、肺内和鼻内给予以及(如果需要
用于局部治疗的话)病灶内给予。肠胃外输注包括肌内、静脉内、动脉内、腹膜内或皮下给
予。
[0464] 在一些实施方案中,所述药剂的量是约或大约每天两次、每天、每隔一天、每周三次、每周、每隔一周或每个月一次来给予。
[0465] 在一些实施方案中,所述药剂是作为组合物或配制品(例如如下文所述的药物组合物或配制品)的一部分给予。因此,在一些情况下,如下所述给予包含所述药剂的组合物。
在其他方面,所述药剂是单独给予,并且例如关于组合物和配制品,可以通过任何已知的可
接受的给予途径或通过本文所述的途径来给予。
[0466] 在一些实施方案中,治疗或改善细胞疗法的毒性(如CRS或神经毒性)的症状的药剂是抗体或抗原结合片段。在一些实施方案中,所述药剂是托西利珠单抗、司妥昔单抗
(siltuximab)、赛利珠单抗(sarilumab)、奥洛珠单抗(olokizumab)(CDP6038)、西莫单抗
(elsilimomab)、ALD518/BMS-945429、司鲁库单抗(sirukumab)(CNTO 136)、CPSI-2634、
ARGX-109、FE301或FM101。
[0467] 在一些实施方案中,所述药剂是IL-6或IL-6受体(IL-6R)的拮抗剂或抑制剂。在一些方面,所述药剂是中和IL-6活性的抗体,例如结合至IL-6或IL-6R的抗体或抗原结合片
段。例如,在一些实施方案中,所述药剂是或包含托西利珠单抗(阿特利珠单抗
(atlizumab))或赛利珠单抗、抗IL-6R抗体。在一些实施方案中,所述药剂是美国专利号8,
562,991中描述的抗IL-6R抗体。在一些情况下,靶向IL-6的药剂是抗IL-6抗体,例如司妥昔
单抗、艾西莫单抗、ALD518/BMS-945429、司鲁库单抗(CNTO 136)、CPSI-2634、ARGX-109、
FE301、FM101或奥洛珠单抗(CDP6038)。在一些方面,所述药剂可通过抑制配体-受体相互作
用来中和IL-6活性。这种通用型途径的可行性已经用针对白细胞介素-1的天然存在受体拮
抗剂来证明。参见Harmurn,C.H.等人,Nature(1990)343:336-340。在一些方面,IL-6/IL-6R
拮抗剂或抑制剂是IL-6突变蛋白,例如美国专利号5591827中描述的IL-6突变蛋白。在一些
实施方案中,作为IL-6/IL-6R的拮抗剂或抑制剂的药剂是小分子、蛋白质或肽或核酸。
[0468] 在一些实施方案中,所述药剂是托西利珠单抗。在一些实施方案中,将托西利珠单抗根据所提供的方法作为早期干预来给予,剂量从或从约1mg/kg至12mg/kg,例如为或为约
4mg/kg、8mg/kg或10mg/kg。在一些实施方案中,将托西利珠单抗通过静脉内输注来给予。在一些实施方案中,给予托西利珠单抗用于持续10小时的高于39℃的持续发热,所述发热对
于对乙酰氨基酚无反应。在一些实施方案中,如果在初始剂量48小时后症状复发,则提供托
西利珠单抗的第二次给予。
[0469] 在一些实施方案中,所述药剂是TGF-β或TGF-β受体(例如TGF-β受体I、II或III)的激动剂或刺激剂。在一些方面,所述药剂是增加TGF-β活性的抗体,例如结合至TGF-β或其一种受体的抗体或抗原结合片段。在一些实施方案中,作为TGF-β和/或其受体的激动剂或刺激剂的药剂是小分子、蛋白质或肽或核酸。
[0470] 在一些实施方案中,所述药剂是MCP-1(CCL2)或MCP-1受体(例如,MCP-1受体CCR2或CCR4)的拮抗剂或抑制剂。在一些方面,所述药剂是中和MCP-1活性的抗体,例如结合MCP-
1或其一种受体(CCR2或CCR4)的抗体或抗原结合片段。在一些实施方案中,MCP-1拮抗剂或
抑制剂是在Gong等人J Exp Med.1997年7月7日;186(1):131-137或Shahrara等人J 
Immunol2008;180:3447-3456中所描述的任何一种。在一些实施方案中,作为MCP-1和/或其
受体(CCR2或CCR4)的拮抗剂或抑制剂的药剂是小分子、蛋白质或肽或核酸。
[0471] 在一些实施方案中,所述药剂是IFN-γ或IFN-γ受体(IFNGR)的拮抗剂或抑制剂。在一些方面,所述药剂是中和IFN-γ活性的抗体,例如结合至IFN-γ或其受体(IFNGR)的抗
体或抗原结合片段。在一些方面,IFN-γ中和抗体是在Dobber等人Cell Immunol.1995年2
月;160(2):185-92或Ozmen等人J Immunol.1993年4月1日;150(7):2698-705中所描述的任
何一种。在一些实施方案中,作为IFN-γ/IFNGR的拮抗剂或抑制剂的药剂是小分子、蛋白质
或肽或核酸。
[0472] 在一些实施方案中,所述药剂是IL-10或IL-10受体(IL-10R)的拮抗剂或抑制剂。在一些方面,所述药剂是中和IL-10活性的抗体,例如结合至IL-10或IL-10R的抗体或抗原
结合片段。在一些方面,IL-10中和抗体是在Dobber等人Cell Immunol.1995年2月;160(2):
185-92或Hunter等人J Immunol.2005年6月1日;174(11):7368-75中所描述的任何一种。在
一些实施方案中,作为IL-10/IL-10R的拮抗剂或抑制剂的药剂是小分子、蛋白质或肽或核
酸。
[0473] V.工程化细胞
[0474] 本文提供了表达一种或多种重组抗原受体的工程化细胞。在一些实施方案中,细胞可以包括用重组受体(如嵌合抗原受体)进行基因工程化的细胞。
[0475] A.重组抗原受体
[0476] 提供了表达重组受体的工程化细胞(如T细胞),所述重组受体包括含有配体结合结构域或其结合片段的嵌合受体(如功能性非TCR抗原受体、如嵌合抗原受体(CAR)),并且
还包括T细胞受体(TCR)(如转基因TCR)及其组分。嵌合受体(如CAR)通常包括(在一些方面
经由接头和/或一个或多个跨膜结构域)与一种或多种细胞内信号传导组分连接的细胞外
抗原(或配体)结合结构域。
[0477] 1.嵌合抗原受体
[0478] 示例性抗原受体(包括CAR)以及将此类受体工程化并引入细胞的方法包括例如以下文献中所述的那些:国际专利申请公开号WO 200014257、WO 2013126726、WO 2012/
129514、WO 2014031687、WO 2013/166321、WO 2013/071154、WO 2013/123061、美国专利申请公开号US 2002131960、US 2013287748、US 20130149337、美国专利号:6,451,995、7,
446,190、8,252,592、8,339,645、8,398,282、7,446,179、6,410,319、7,070,995、7,265,
209、7,354,762、7,446,191、8,324,353和8,479,118,以及欧洲专利申请号EP 2537416,和/或以下文献中所述的那些:Sadelain等人,Cancer Discov.,3(4):388–398(2013);Davila
等人PLoS ONE 8(4):e61338(2013);Turtle等人,Curr.Opin.Immunol.,24(5):633-39
(2012);Wu等人,Cancer,18(2):160-75(2012)。在一些方面,抗原受体包括如美国专利号7,
446,190中所述的CAR,和国际专利申请公开号WO/2014055668A1中所述的那些。CAR的例子
包括如任何前述出版物中所披露的CAR,例如WO2014031687、US 8,339,645、US 7,446,179、US 2013/0149337、美国专利号7,446,190、美国专利号8,389,282,Kochenderfer等人,
Nature Reviews Clinical Oncology,10,267-276(2013);Wang等人,J.Immunother.35
(9):689-701(2012);以及Brentjens等人,Sci Transl Med,.5(177)(2013)。还参见
WO2014031687、US 8,339,645、US 7,446,179、US 2013/0149337、美国专利号:7,446,190和美国专利号:8,389,282。嵌合受体(如CAR)通常包括细胞外抗原结合结构域,如抗体分子的
一部分,通常是抗体的可变重(VH)链区域和/或可变轻(VL)链区域,例如scFv抗体片段。
[0479] 在一些实施方案中,重组受体(例如抗原受体)含有结合(例如,特异性地结合)抗原、配体和/或标记的细胞外抗原结合结构域或配体结合结构域。所述抗原受体包括功能性
非TCR抗原受体,如嵌合抗原受体(CAR)。在一些实施方案中,抗原受体是含有特异性地结合
抗原的细胞外抗原识别结构域。在一些实施方案中,CAR被构建为具有对特定抗原、标记或
配体的特异性,所述特定抗原、标记或配体是例如在由过继疗法靶向的特定细胞类型中表
达的抗原(例如癌症标记)和/或旨在诱导衰减应答的抗原(例如在正常或未患病细胞类型
上表达的抗原)。因此,CAR通常在其细胞外部分中包括一种或多种配体-(例如,抗原-)结合
分子,例如一种或多种抗原结合片段、结构域或部分,或一种或多种抗体可变结构域,和/或抗体分子。在一些实施方案中,CAR包括抗体分子的一个或多个抗原结合部分,如源自单克
隆抗体(mAb)的可变重链(VH)和可变轻链(VL)的单链抗体片段(scFv)、或单结构域抗体
(sdAb)(如sdFv、纳米抗体、VHH和VNAR)。在一些实施方案中,抗原结合片段包含通过柔性接头连接的抗体可变区。
[0480] 在一些实施方案中,嵌合受体靶向的抗原包括在通过过继细胞疗法靶向的疾病、病症或细胞类型的情况下表达的抗原。所述疾病和病症包括增殖性、肿瘤性和恶性疾病和
障碍,包括癌症和肿瘤,包括血液癌、免疫系统癌症,如淋巴瘤、白血病和/或骨髓瘤,如B型白血病、T型白血病和骨髓性白血病、淋巴瘤和多发性骨髓瘤。在一些实施方案中,受体所靶向的抗原是多肽。在一些实施方案中,其是碳水化合物或其他分子。在一些实施方案中,与
正常或非靶向细胞或组织(例如在健康细胞或组织中)相比,抗原在疾病或病症的细胞例如
肿瘤细胞或致病细胞上选择性表达或过表达。在其他实施方案中,抗原在正常细胞上表达
和/或在工程化细胞上表达。
[0481] 在一些实施方案中,受体所靶向的抗原包括孤儿酪氨酸激酶受体ROR1、tEGFR、Her2、Ll-CAM、CD19、CD20、CD22、间皮素、CEA和乙型肝炎表面抗原、抗叶酸受体、CD23、CD24、CD30、CD33、CD38、CD44、EGFR、EGP-2、EGP-4、0EPHa2、ErbB2、3或4、FBP、胎儿乙酰胆碱受体、GD2、GD3、HMW-MAA、IL-22R-α、IL-13R-α2、kdr、κ轻链、路易斯Y、L1-细胞粘附分子、MAGE-A1、间皮素、MUC1、MUC16、PSCA、NKG2D配体、NY-ESO-1、MART-1、gp100、癌胚胎抗原、ROR1、TAG72、VEGF-R2、癌胚抗原(CEA)、前列腺特异性抗原、PSMA、Her2/neu、雌激素受体、孕酮受体、肝配蛋白B2、CD123、c-Met、GD-2和MAGE A3、CE7、Wilms肿瘤1(WT-1)、细胞周期蛋白(如细胞周期蛋白A1(CCNA1))和/或生物素化分子和/或由HIV、HCV、HBV或其他病原体表达的分子。
[0482] 在一些实施方案中,受体靶向的抗原包括αvβ6整合素(avb6整合素)、B细胞成熟抗原(BCMA)、B7-H3、B7-H6、碳酸酐酶9(CA9,也称为CAIX或G250)、癌症-睾丸抗原、癌症/睾丸抗原1B(CTAG,也称为NY-ESO-1和LAGE-2)、癌胚抗原(CEA)、细胞周期蛋白、细胞周期蛋白
A2、C-C基序趋化因子配体1(CCL-1)、CD19、CD20、CD22、CD23、CD24、CD30、CD33、CD38、CD44、CD44v6、CD44v7/8、CD123、CD138、CD171、表皮生长因子蛋白(EGFR)、截短的表皮生长因子蛋白(tEGFR)、III型表皮生长因子受体突变(EGFR vIII)、上皮糖蛋白2(EPG-2)、上皮糖蛋白
40(EPG-40)、肝配蛋白B2、肝配蛋白受体A2(EPHa2)、雌激素受体、Fc受体样5(FCRL5;也称为Fc受体同源物5或FCRH5)、胎儿乙酰胆碱受体(胎儿AchR)、叶酸结合蛋白(FBP)、叶酸受体α、胎儿乙酰胆碱受体、神经节苷脂GD2、O-乙酰化GD2(OGD2)、神经节苷脂GD3、糖蛋白100
(gp100)、G蛋白偶联受体5D(GPCR5D)、Her2/neu(受体酪氨酸激酶erb-B2)、Her3(erb-B3)、
Her4(erb-B4)、erbB二聚体、人高分子量黑色素瘤相关抗原(HMW-MAA)、乙型肝炎表面抗原、人白细胞抗原A1(HLA-AIA1)、人白细胞抗原A2(HLA-A2)、IL-22受体α(IL-22Ra)、IL-13受体α2(IL-13Ra2)、激酶插入结构域受体(kdr)、κ轻链、L1细胞粘附分子(L1-CAM)、L1-CAM的CE7表位、含有富亮氨酸重复序列的蛋白8家族成员A(LRRC8A)、路易斯Y、黑色素瘤相关抗原
(MAGE)-A1、MAGE-A3、MAGE-A6、间皮素、c-Met、鼠类巨细胞病毒(CMV)、粘蛋白1(MUC1)、
MUC16、自然杀伤细胞2族成员D(NKG2D)配体、黑色素A(MART-1)、神经细胞粘附分子(NCAM)、癌胚胎抗原、优先表达的黑色素瘤抗原(PRAME)、孕酮受体、前列腺特异性抗原、前列腺干细胞抗原(PSCA)、前列腺特异性膜抗原(PSMA)、受体酪氨酸激酶样孤儿受体1(ROR1)、存活蛋
白、滋养层糖蛋白(TPBG,也称作5T4)、肿瘤相关糖蛋白72(TAG72)、血管内皮生长因子受体
(VEGFR)、血管内皮生长因子受体2(VEGFR2)、Wilms肿瘤1(WT-1)、病原体特异性抗原或与通
用标签相关的抗原、和/或生物素化的分子、和/或由HIV、HCV、HBV或其他病原体表达的分
子。在一些实施方案中,受体靶向的抗原包括与B细胞恶性肿瘤相关的抗原,如许多已知B细
胞标记中的任何一种。在一些实施方案中,受体靶向的抗原是以下项或包括以下项:CD20、
CD19、CD22、ROR1、CD45、CD21、CD5、CD33、Igκ、Igλ、CD79a、CD79b或CD30。
[0483] 在一些实施方案中,CAR结合病原体特异性抗原。在一些实施方案中,CAR特异于病毒抗原(如来自HIV、HCV、HBV等的病毒抗原)、细菌抗原和/或寄生虫抗原。
[0484] 在一些实施方案中,抗体或抗原结合片段(例如scFv或VH结构域)特异性地识别抗原,如CD19。在一些实施方案中,抗体或抗原结合片段源自特异性地结合CD19的抗体或抗原
结合片段,或者是特异性地结合CD19的抗体或抗原结合片段的变体。
[0485] 在一些实施方案中,scFv和/或VH结构域源自FMC63。FMC63通常是指针对表达人源CD19的Nalm-1和-16细胞产生的小鼠单克隆IgG1抗体(Ling,N.R.,等人(1987).Leucocyte 
typing III.302)。FMC63抗体包含SEQ ID NO:38所示的CDR H1;SEQ ID NO:39所示的CDR 
H2;SEQ ID NO:40或54所示的CDR H3;以及SEQ ID NO:35所示的CDR L1SEQ ID NO:36或55
所示的CDR L2;和SEQ ID NO:37或56所示的CDR L3。FMC63抗体包含含有SEQ ID NO:41的氨
基酸序列的重链可变区(VH)和含有SEQ ID NO:42的氨基酸序列的轻链可变区(VL)。在一些
实施方案中,scFv包含:含有SEQ ID NO:35的CDR L1序列、SEQ ID NO:36的CDR L2序列、和
SEQ ID NO:37的CDR L3序列的可变轻链,和/或含有SEQ ID NO:38的CDR H1序列、SEQ ID 
NO:39的CDR H2序列、和SEQ ID NO:40的CDR H3序列的可变重链,或者与其具有至少85%、
86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或更多的序列同一性的任何前述的变体。在一些实施方案中,scFv包含SEQ ID NO:41所示的FMC63的
可变重链区和SEQ ID NO:42所示的FMC63的可变轻链区,或者与其具有至少85%、86%、
87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或更多的序列同一性的任何前述的变体。在一些实施方案中,可变重链和可变轻链通过接头连接。在一些
实施方案中,接头如SEQ ID NO:58所示。在一些实施方案中,scFv依次包含VH、接头和VL。在一些实施方案中,scFv依次包含VL、接头和VH。在一些实施方案中,scFv由SEQ ID NO:57所示的核苷酸序列或展现出与SEQ ID NO:57至少85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、
92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%序列同一性的序列编码。在一些实施方案中,scFv包含SEQ ID NO:43所示的氨基酸序列或展现出与SEQ ID NO:43至少85%、86%、
87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%序列同一性的序列。
[0486] 在一些实施方案中,scFv和/或VH结构域源自SJ25C1。SJ25C1是指针对表达人源CD19的Nalm-1和-16细胞产生的小鼠单克隆IgG1抗体(Ling,N.R.,等人(1987).Leucocyte 
typing III.302)。SJ25C1抗体包含SEQ ID NO:47-49分别所示的CDR H1、H2和H3,以及SEQ 
ID NO:44-46分别所示的CDR L1、L2和L3序列。SJ25C1抗体包含含有SEQ ID NO:50的氨基酸
序列的重链可变区(VH)和含有SEQ ID NO:51的氨基酸序列的轻链可变区(VL)。在一些实施
方案中,svFv包含含有SEQ ID NO:44所示的CDR L1序列;SEQ ID NO:45所示的CDR L2;和
SEQ ID NO:46所示的CDR L3的可变轻链;和/或含有SEQ ID NO:47所示的CDR H1、SEQ ID 
NO:48所示的CDR H2、和SEQ ID NO:49所示的CDR H3的可变重链,或与其具有至少85%、
86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或更多的序列同一性的任何前述的变体。在一些实施方案中,scFv包含SEQ ID NO:50所示的SJ25C1
的可变重链区和SEQ ID NO:51所示的SJ25C1的可变轻链区,或者与其具有至少85%、86%、
87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或更多的序列同一性的任何前述的变体。在一些实施方案中,可变重链和可变轻链通过接头连接。在一些
实施方案中,接头如SEQ ID NO:52所示。在一些实施方案中,scFv依次包含VH、接头和VL。在一些实施方案中,scFv依次包含VL、接头和VH。在一些实施方案中,scFv包含SEQ ID NO:53所示的氨基酸序列或展现出与SEQ ID NO:53至少85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、
92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%序列同一性的序列。
[0487] 在一些方面,CAR含有结合或识别(例如特异性地结合)通用标签或通用表位的配体-(例如,抗原-)结合结构域。在一些方面,结合结构域可以结合分子、标签、多肽和/或表位,所述分子、标签、多肽和/或表位可以被连接至识别与疾病或障碍相关的抗原的不同结
合分子(例如,抗体或抗原结合片段)。示例性标签或表位包括染料(例如,荧光素异硫氰酸
盐)或生物素。在一些方面,结合分子(例如,抗体或抗原结合片段)与标签连接,所述标签识别与具有表达对所述标签特异的CAR的工程化细胞的疾病或障碍相关的抗原(例如,肿瘤抗
原),以实现所述工程化细胞的细胞毒性或其他效应功能。在一些方面,CAR对与疾病或障碍
相关的抗原的特异性由标记的结合分子(例如,抗体)提供,并且不同的标记的结合分子可
以用于靶向不同的抗原。对通用标签或通用表位特异的示例性CAR包括例如在U.S.9,233,
125、WO 2016/030414,Urbanska等人,(2012)Cancer Res 72:1844–1852,以及Tamada等人,(2012).Clin Cancer Res 18:6436–6445中所描述的那些。
[0488] 在一些实施方案中,CAR含有TCR样抗体,例如抗体或抗原结合片段(例如scFv),其特异性地识别作为主要组织相容性复合物(MHC)-肽复合物存在于细胞表面上的细胞内抗
原(例如肿瘤相关抗原)。在一些实施方案中,识别MHC-肽复合物的抗体或其抗原结合部分
可以作为重组受体的部分(如抗原受体)在细胞上表达。所述抗原受体包括功能性非T细胞
受体(TCR)抗原受体,如嵌合抗原受体(CAR)。在一些实施方案中,含有针对肽-MHC复合物展
现出TCR样特异性的抗体或抗原结合片段的CAR也可以称为TCR样CAR。在一些实施方案中,
CAR是TCR样CAR,并且抗原是加工过的肽抗原,如细胞内蛋白的肽抗原,其与TCR一样在MHC
分子的背景下在细胞表面上被识别。在一些实施方案中,在一些方面,对TCR样CAR的MHC-肽
复合物具有特异性的细胞外抗原结合结构域通过接头和/或一个或多个跨膜结构域与一个
或多个细胞内信号传导组分连接。在一些实施方案中,此类分子通常可以通过天然抗原受
体(如TCR)模拟或接近信号,并且任选地通过这种受体与共刺激受体组合模拟或接近信号。
[0489] 提及“主要组织相容性复合物”(MHC)是指含有多态性肽结合位点或结合沟的蛋白质,通常是糖蛋白,在一些情况下,所述蛋白质可以与多肽的肽抗原(包括由细胞机构处理
的肽抗原)复合。在一些情况下,MHC分子可以在细胞表面上展示或表达,包括作为与肽的复
合物,即MHC-肽复合物,用于呈现具有T细胞上的抗原受体(如TCR或TCR样抗体)可识别的构
象的抗原。通常,MHC I类分子是异二聚体,其具有跨越α链的膜,在一些情况下具有三个α结构域和非共价缔合的β2微球蛋白。通常,MHC II类分子由两种跨膜糖蛋白α和β组成,两者通常都跨越膜。MHC分子可以包括MHC的有效部分,其含有抗原结合位点或用于结合肽的位点
以及由适当抗原受体识别所需的序列。在一些实施方案中,MHC I类分子将源自胞质溶胶的
肽递送至细胞表面,其中MHC-肽复合物由T细胞(例如通常CD8+ T细胞,但在一些情况下是
CD4+ T细胞)识别。在一些实施方案中,MHC II类分子将源自囊泡系统的肽递送至细胞表
面,其中所述肽通常由CD4+ T细胞识别。通常,MHC分子由一组连基因座编码,其在小鼠中统称为H-2并且在人中统称为人白细胞抗原(HLA)。因此,通常人MHC也以可称为人白细胞抗
原(HLA)。
[0490] 术语“MHC-肽复合物”或“肽-MHC复合物”或其变体是指肽抗原与MHC分子的复合物或缔合物,例如通常通过所述肽在MHC分子的结合沟或裂缝中的非共价相互作用来形成。在
一些实施方案中,MHC-肽复合物存在或展示于细胞表面上。在一些实施方案中,MHC-肽复合
物可由抗原受体(如TCR、TCR样CAR或其抗原结合部分)特异性地识别。
[0491] 在一些实施方案中,多肽的肽(如肽抗原或表位)可以与MHC分子缔合,例如用于由抗原受体识别。通常,所述肽源自或基于较长生物分子(如多肽或蛋白质)的片段。在一些实
施方案中,所述肽的长度通常为约8至约24个氨基酸。在一些实施方案中,肽的长度为或为
约9至22个氨基酸,用于在MHC II类复合物中识别。在一些实施方案中,肽的长度为或为约8
至13个氨基酸,用于在MHC I类复合物中识别。在一些实施方案中,在识别MHC分子(如MHC-
肽复合物)背景中的肽后,抗原受体(如TCR或TCR样CAR)产生或触发激活信号至T细胞,诱导
T细胞应答,如T细胞增殖、细胞因子产生、细胞毒性T细胞应答或其他应答。
[0492] 在一些实施方案中,TCR样抗体或抗原结合部分是已知的或可通过已知方法产生(参见例如美国公开申请号US 2002/0150914;US 2003/0223994;US 2004/0191260;US 
2006/0034850;US 2007/00992530;US 20090226474;US 20090304679;和国际申请公开号
WO 03/068201)。
[0493] 在一些实施方案中,特异性地结合至MHC-肽复合物的抗体或其抗原结合部分可以通过用有效量的含有特定MHC-肽复合物的免疫原对宿主进行免疫来产生。在一些情况下,
MHC-肽复合物的肽是能够结合至MHC的抗原的表位,例如肿瘤抗原,例如通用肿瘤抗原、骨
髓瘤抗原或如下文所述的其他抗原。在一些实施方案中,然后向宿主给予有效量的免疫原
以用于引发免疫应答,其中所述免疫原保持其三维形式持续一段足以引发针对所述肽在所
述MHC分子的结合沟中的三维呈递的免疫应答的时间。然后测定从宿主收集的血清以确定
是否产生了识别MHC分子结合沟中的肽的三维呈现的所需抗体。在一些实施方案中,可以评
估所产生的抗体以确认所述抗体可以区分MHC-肽复合物与单独的MHC分子、单独的目标肽
以及MHC与无关肽的复合物。然后可以分离所希望的抗体。
[0494] 在一些实施方案中,特异性地结合至MHC-肽复合物的抗体或其抗原结合部分可以通过采用抗体文库展示方法(如噬菌体抗体文库)来产生。在一些实施方案中,可以产生突
变体Fab、scFv或其他抗体形式的噬菌体展示文库,例如,其中所述文库的成员在一个或多
个CDR的一个或多个残基处发生突变。参见例如美国专利申请公开号US 20020150914、US 
20140294841;以及Cohen CJ.等人(2003)J Mol.Recogn.16:324-332。
[0495] 本文中的术语“抗体”在最广泛的意义上使用,并且包括多克隆和单克隆抗体,包括完整抗体和功能性(抗原结合)抗体片段,包括片段抗原结合(Fab)片段、F(ab')2片段、
Fab'片段、Fv片段、重组IgG(rIgG)片段、能够特异性地结合抗原的可变重链(VH)区、单链抗体片段(包括单链可变片段(scFv))以及单结构域抗体(例如,sdAb、sdFv、纳米抗体、VHH或
VNAR)片段。所述术语涵盖免疫球蛋白的基因工程化的和/或以其他方式修饰的形式,如胞内
抗体、肽体(peptibody)、嵌合抗体、全人抗体、人源化抗体和异缀合抗体(heteroconjugate antibody)、多特异性(例如,双特异性)抗体、双抗体、三抗体和四抗体、串联二-scFv、串联三-scFv。除非另有说明,否则术语“抗体”应理解为涵盖其功能性抗体片段。所述术语还涵盖完整或全长抗体,包括任何类别或亚类(包括IgG及其亚类、IgM、IgE、IgA和IgD)的抗体。
在一些方面,CAR是双特异性CAR,例如,含有具有不同特异性的两个抗原结合结构域。
[0496] 在一些实施方案中,抗原结合蛋白、抗体及其抗原结合片段特异性地识别全长抗体的抗原。在一些实施方案中,抗体的重链和轻链可以是全长的或者可以是抗原结合部分
(Fab、F(ab’)2、Fv或单链Fv片段(scFv))。在其他实施方案中,所述抗体重链恒定区选自例如IgG1、IgG2、IgG3、IgG4、IgM、IgA1、IgA2、IgD和IgE,特别是选自例如IgG1、IgG2、IgG3和IgG4,更特别是IgG1(例如,人IgG1)。在另一个实施方案中,抗体轻链恒定区选自例如κ或λ,特别是κ。
[0497] 所提供的抗体包括抗体片段。“抗体片段”是指不同于完整抗体的分子,其包含完整抗体的结合完整抗体所结合的抗原的一部分。抗体片段的例子包括但不限于Fv、Fab、
Fab'、Fab'-SH、F(ab')2;双抗体;线性抗体;可变重链(VH)区、单链抗体分子(如scFv)和单一结构域VH单一抗体;和由抗体片段形成的多特异性抗体。在具体实施方案中,所述抗体是包
含可变重链区和/或可变轻链区的单链抗体片段,如scFv。
[0498] 术语“可变区”或“可变结构域”是指抗体重链或轻链的参与抗体与抗原的结合的结构域。天然抗体的重链和轻链的可变结构域(分别为VH和VL)通常具有相似的结构,每个结
构域包含四个保守的框架区(FR)和三个CDR。(参见例如,Kindt等人Kuby Immunology,第6
版,W.H.Freeman and Co.,第91页(2007))。单个VH或VL结构域可以足以赋予抗原结合特异
性。此外,可以使用来自结合抗原的抗体的VH或VL结构域分离结合所述特定抗原的抗体,以
分别筛选互补的VL或VH结构域的文库。参见例如,Portolano等人,J.Immunol.150:880-887
(1993);Clarkson等人,Nature 352:624-628(1991)。
[0499] 单结构域抗体(sdAb)是包含抗体的全部或部分重链可变结构域或者全部或部分轻链可变结构域的抗体片段。在某些实施方案中,单结构域抗体是人单结构域抗体。在一些
实施方案中,CAR包含特异性地结合抗原的抗体重链结构域,所述抗原例如癌症标记或待靶
向的细胞或疾病(例如肿瘤细胞或癌细胞)的细胞表面抗原,例如本文所述或已知的任何靶
抗原。示例性的单结构域抗体包括sdFv、纳米抗体、VHH或VNAR。
[0500] 抗体片段可以通过各种技术制备,包括但不限于完整抗体的蛋白水解消化以及通过重组宿主细胞产生。在一些实施方案中,所述抗体是重组产生的片段,如包含天然不存在
的排列的片段(如具有通过合成接头(例如,肽接头)连接的两个或更多个抗体区或链的那
些),和/或可不通过酶消化天然存在的完整抗体产生的片段。在一些实施方案中,抗体片段
是scFv。
[0501] “人源化”抗体是这样的抗体,其中所有或基本上所有CDR氨基酸残基源自非人CDR并且所有或基本上所有FR氨基酸残基源自人FR。人源化抗体任选地可以包括源自人抗体的
抗体恒定区的至少一部分。非人抗体的“人源化形式”是指所述非人抗体的变体,其经历人
源化以通常降低对人的免疫原性,同时保留亲本非人抗体的特异性和亲和力。在一些实施
方案中,人源化抗体中的一些FR残基被来自非人抗体(例如,衍生出CDR残基的抗体)的相应
残基取代,例如以恢复或改善抗体特异性或亲和力。
[0502] 因此,在一些实施方案中,嵌合抗原受体(包括TCR样CAR)包括含有抗体或抗体片段的细胞外部分。在一些实施方案中,所述抗体或片段包括scFv。在一些方面,抗体或抗原
结合片段可以通过筛选多个(例如文库)抗原结合片段或分子,例如通过筛选scFv文库以结
合特定抗原或配体来获得。
[0503] 在一些方面,重组受体(例如嵌合抗原受体)包括含有一个或多个配体-(例如,抗原-)结合结构域的细胞外部分,如抗体或其片段、和一个或多个细胞内信号传导区域或结
构域(也可互换地称为细胞质信号传导结构域或区域)。在一些方面,重组受体(例如CAR)进
一步包括间隔子和/或跨膜结构域或部分。在一些方面,间隔子和/或跨膜结构域可以连接
含有配体-(例如,抗原-)结合结构域的细胞外部分和一个或多个细胞内信号传导区域或结
构域。
[0504] 在一些实施方案中,重组受体例如CAR的抗体部分进一步包括免疫球蛋白恒定区(如铰链区,例如IgG4铰链区)和/或CH1/CL和/或Fc区的至少一部分。在一些实施方案中,恒
定区或部分是人IgG如IgG4或IgG1的。在一些方面,恒定区的部分用作抗原识别组分(例如,
scFv)与跨膜结构域之间的间隔子区。与不存在间隔子的情况下相比,间隔子的长度可以提
供抗原结合后增强的细胞反应性。示例性间隔子(例如铰链区)包括在国际专利申请公开号
WO 2014031687中描述的那些。在一些例子中,间隔子的长度为或为约12个氨基酸或者长度
不超过12个氨基酸。示例性间隔子包括具有至少约10至229个氨基酸、约10至200个氨基酸、
约10至175个氨基酸、约10至150个氨基酸、约10至125个氨基酸、约10至100个氨基酸、约10
至75个氨基酸、约10至50个氨基酸,约10至40个氨基酸、约10至30个氨基酸、约10至20个氨
基酸或约10至15个氨基酸(并且包括任何列出的范围的端点之间的任何整数)的那些。在一
些实施方案中,间隔子区具有约12个或更少的氨基酸、约119个或更少的氨基酸或约229个
或更少的氨基酸。在一些实施方案中,间隔子具有少于250个氨基酸的长度、少于200个氨基
酸的长度、少于150个氨基酸的长度、少于100个氨基酸的长度、少于75个氨基酸的长度、少
于50个氨基酸的长度、少于25个氨基酸的长度、少于20个氨基酸的长度、少于15个氨基酸的
长度、少于12个氨基酸的长度、或少于10个氨基酸的长度。在一些实施方案中,间隔子具有
从或从约10至250个氨基酸的长度、10至150个氨基酸的长度、10至100个氨基酸的长度、10
至50个氨基酸的长度、10至25个氨基酸的长度、10至15个氨基酸的长度、15至250个氨基酸
的长度、15至150个氨基酸的长度、15至100个氨基酸的长度、15至50个氨基酸的长度、15至
25个氨基酸的长度、25至250个氨基酸的长度、25至100个氨基酸的长度、25至50个氨基酸的
长度、50至250个氨基酸的长度、50至150个氨基酸的长度、50至100个氨基酸的长度、100至
250个氨基酸的长度、100至150个氨基酸的长度、或150至250个氨基酸的长度。示例性间隔
子包括单独的IgG4铰链、与CH2和CH3结构域连接的IgG4铰链或与CH3结构域连接的IgG4铰
链。示例性间隔子包括但不限于在Hudecek等人Clin.Cancer Res.,19:3153(2013),国际专
利申请公开号WO2014031687,美国专利号8,822,647或公开申请号US2014/0271635中所描
述的那些。
[0505] 在一些实施方案中,恒定区或部分是人IgG如IgG4或IgG1的。在一些方面,间隔子是多肽间隔子,如选自以下的一种或多种:(a)包含免疫球蛋白铰链或其修饰形式的全部或
部分或由其组成或包含约15个氨基酸或更少,并且不包含CD28细胞外区域或CD8细胞外区
域,(b)包含免疫球蛋白铰链(任选地IgG4铰链)或其修饰形式的全部或部分或由其组成和/
或包含约15个氨基酸或更少,并且不包含CD28细胞外区域或CD8细胞外区域,或(c)是或是
约12个氨基酸的长度和/或包含免疫球蛋白铰链(任选地IgG4铰链)或其修饰形式的全部或
部分或由其组成;或(d)包含式X1PPX2P(SEQ ID NO:31)(其中X1是甘氨酸、半胱氨酸或精氨
酸并且X2是半胱氨酸或苏氨酸)或由其组成。在一些实施方案中,间隔子具有序列
ESKYGPPCPPCP(SEQ ID NO:1所示),并且由SEQ ID NO:2所示的序列编码。在一些实施方案
中,间隔子具有SEQ ID NO:3中所示的序列。在一些实施方案中,间隔子具有SEQ ID NO:4所
示的序列。在一些实施方案中,恒定区或部分是IgD的。在一些实施方案中,间隔子具有SEQ ID NO:5所示的序列。在一些实施方案中,间隔子具有展现出与SEQ ID NO:1、3、4或5或27-
34中的任一个至少85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、
97%、98%、99%或更多序列同一性的氨基酸序列。
[0506] 这个抗原识别结构域通常连接至一种或多种细胞内信号传导组分(如通过抗原受体复合物(如TCR复合物)(在CAR的情况下)模拟激活和/或经由另一种细胞表面受体传导信
号的信号传导组分)。因此,在一些实施方案中,抗原结合组分(例如,抗体)被连接至一个或多个跨膜和细胞内信号传导结构域。在一些实施方案中,所述跨膜结构域与细胞外结构域
融合。在一个实施方案中,使用天然与所述受体(例如,CAR)中的一个结构域缔合的跨膜结
构域。在一些情形中,通过氨基酸取代选择或修饰所述跨膜结构域以避免此类结构域与相
同或不同表面膜蛋白的跨膜结构域结合,以最小化与所述受体复合物的其他成员的相互作
用。
[0507] 在一些实施方案中,所述跨膜结构域源自天然或合成来源。当来源是天然的时,在一些方面,所述结构域可以源自任何膜结合蛋白或跨膜蛋白。跨膜区包括源自以下的那些
(即至少包含以下的跨膜区):T细胞受体的α、β或ζ链,CD28,CD3ε,CD45,CD4,CD5,CD8,CD9,CD16,CD22,CD33,CD37,CD64,CD80,CD86,CD134,CD137(4-1BB),CD154。可替代地,在一些实施方案中,跨膜结构域是合成的。在一些方面,合成跨膜结构域主要包含疏水性残基,例如
亮氨酸和缬氨酸。在一些方面,将在合成跨膜结构域的每个末端发现苯丙氨酸、色氨酸和缬
氨酸的三联体。在一些实施方案中,连接是通过接头、间隔子和/或一个或多个跨膜结构域。
在一些方面,跨膜结构域含有CD28的跨膜部分或其变体。所述细胞外结构域和跨膜可以直
接或间接连接。在一些实施方案中,所述细胞外结构域和跨膜通过间隔子(如本文描述的任
何间隔子)连接。
[0508] 细胞内信号传导结构域包括通过天然抗原受体模拟或接近信号、通过这种受体与共刺激受体组合模拟或接近信号和/或仅通过共刺激受体模拟或接近信号的那些。在一些
实施方案中,存在短的寡肽或多肽接头例如长度为2至10个氨基酸的接头(如含有甘氨酸和
丝氨酸的接头,例如甘氨酸-丝氨酸双联体),并在CAR的跨膜结构域和细胞质信号传导结构
域之间形成连接。
[0509] 受体例如CAR通常包括至少一种细胞内信号传导组分或多种细胞内信号传导组分。在一些实施方案中,受体包括TCR复合物的细胞内组分,如介导T细胞激活和细胞毒性的
TCR CD3链例如CD3ζ链。因此,在一些方面,将抗原结合部分连接至一个或多个细胞信号传
导模。在一些实施方案中,细胞信号传导模块包括CD3跨膜结构域、CD3细胞内信号传导结
构域和/或其他CD跨膜结构域。在一些实施方案中,受体例如CAR进一步包括一种或多种另
外的分子(如Fc受体γ、CD8、CD4、CD25或CD16)的一部分。例如,在一些方面,CAR或其他嵌合受体包括CD3-ζ(CD3-ζ)或Fc受体γ与CD8、CD4、CD25或CD16之间的嵌合分子。
[0510] 在一些实施方案中,在连接CAR或其他嵌合受体后,受体的细胞质结构域或细胞内信号传导结构域激活免疫细胞(例如工程化以表达所述CAR的T细胞)的正常效应子功能或
应答中的至少一种。例如,在一些情况下,CAR诱导T细胞的功能,如细胞毒活性或T辅助活性如细胞因子或其他因子的分泌。在一些实施方案中,使用抗原受体组分或共刺激分子的细
胞内信号传导结构域的截短部分代替完整的免疫刺激链,例如条件是所述截短部分转导效
应子功能信号。在一些实施方案中,一个或多个细胞内信号传导结构域包括T细胞受体
(TCR)的细胞质序列,并且在一些方面还包括共受体的那些细胞质序列,所述共受体在自然
环境中与此类受体协同作用以启动抗原受体接合后的信号转导。
[0511] 在天然TCR的情况下,完全激活通常不仅需要通过TCR进行信号传导,还需要共刺激信号。
[0512] 因此,在一些实施方案中,为了促进完全激活,用于生成次级或共刺激信号的组分也被包括在所述CAR中。在其他实施方案中,所述CAR不包括用于生成共刺激信号的组分。在
一些方面,另外的CAR在同一细胞中表达,并且提供用于生成次级或共刺激信号的组分。
[0513] 在一些方面,T细胞激活被描述为由两类胞质信号传导序列介导:通过TCR启动抗原依赖性初级激活的那些(初级胞质信号传导序列)以及以抗原非依赖性方式起作用以提
供次级或共刺激信号的那些(次级胞质信号传导序列)。在一些方面,CAR包括此类信号传导
组分中的一种或两种。
[0514] 在一些方面,所述CAR包括调节所述TCR复合物的初级激活的初级胞质信号传导序列。以刺激方式起作用的初级胞质信号传导序列可以含有信号传导基序(其被称为基于免
疫受体酪氨酸的激活基序或ITAM)。含有初级细胞质信号传导序列的ITAM的例子包括源自
以下项的那些:TCRζ、FcRγ、FcRβ、CD3γ、CD3δ、CD3ε、CD8、CD22、CD79a、CD79b和CD66d。在一些实施方案中,所述CAR中的胞质信号传导分子含有源自CD3ζ的胞质信号传导结构域、其部
分或序列。
[0515] 在一些实施方案中,CAR包括共刺激受体如CD28、4-1BB、OX40、DAP10和ICOS的信号传导结构域和/或跨膜部分。在一些方面,同一CAR同时包括激活和共刺激组分。
[0516] 在一些实施方案中,激活结构域包括于一个CAR内,而共刺激组分是由识别另一种抗原的另一种CAR提供。在一些实施方案中,CAR包括在同一细胞上表达的激活或刺激CAR、
共刺激CAR(参见WO 2014/055668)。在一些方面,细胞包括一种或多种刺激或激活CAR和/或
共刺激CAR。在一些实施方案中,细胞进一步包括抑制性CAR(iCAR,参见Fedorov等人,
Sci.Transl.Medicine,5(215)(2013),例如识别除了与疾病或病症相关和/或对所述疾病
或病症具有特异性的抗原以外的抗原的CAR,其中通过靶向疾病的CAR递送的激活信号由于
抑制性CAR与其配体的结合而有所减小或被抑制,例如以减小脱靶效应。
[0517] 在某些实施方案中,细胞内信号传导结构域包含连接至CD3(例如,CD3-ζ)细胞内结构域的CD28跨膜和信号传导结构域。在一些实施方案中,细胞内信号传导结构域包含连
接至CD3ζ细胞内结构域的嵌合CD28和CD137(4-1BB,TNFRSF9)共刺激结构域。
[0518] 在一些实施方案中,CAR在细胞质部分中包含一个或多个,例如两个或更多个共刺激结构域和激活结构域,例如主激活结构域。示例性CAR包含CD3-ζ、CD28和4-1BB的细胞内
组分。
[0519] 在一些实施方案中,CAR或其他抗原受体还包括标记,例如细胞表面标记,其可以用于确认细胞表达受体的转导或工程化,所述受体例如细胞表面受体的截短形式,例如截
短的EGFR(tEGFR)。在一些方面,所述标记包括CD34、NGFR或表皮生长因子受体(例如,
tEGFR)的全部或部分(例如,截短形式)。在一些实施方案中,编码所述标记的核酸与编码接
头序列(如可切割的接头序列,例如T2A)的多核苷酸可操作地连接。例如,标记和任选地接
头序列可以是如已公开专利申请号WO 2014031687中所披露的任何一种。例如,标记可以是
截短的EGFR(tEGFR),其任选地连接至接头序列,如T2A可切割接头序列。截短的EGFR(例如
tEGFR)的示例性多肽包含SEQ ID NO:7或23所示的氨基酸序列或展现出与SEQ ID NO:7或
23至少85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、
99%或更高序列同一性的氨基酸序列。示例性T2A接头序列包含SEQ ID NO:6所示的氨基酸
序列或展现与SEQ ID NO:6至少85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、
95%、96%、97%、98%、99%或更多序列同一性的氨基酸序列。
[0520] 在一些实施方案中,标记是并非在T细胞上天然发现或并非在T细胞表面上天然发现的分子(例如细胞表面蛋白)或其部分。在一些实施方案中,所述分子是非自身分子(例
如,非自身蛋白),即没有被细胞过继转移到其中的宿主的免疫系统识别为“自身”的分子。
[0521] 在一些实施方案中,所述标记不起任何治疗功能和/或除了用作基因工程化(例如,用于选择成功工程化的细胞)的标记之外不产生任何作用。在其他实施方案中,所述标
记可以是治疗性分子或另外发挥一些所需作用的分子,如在体内细胞将遇到的配体,如共
刺激性或免疫检查点分子,以在过继转移和遇到配体时增强和/或减弱所述细胞的应答。
[0522] 在一些情况下,CAR被称为第一代、第二代、第三代或第四代CAR。在一些方面,第一代CAR是在抗原结合后例如经由CD3链诱导的信号单独地提供初级刺激或激活信号的一种CAR;在一些方面,第二代CAR是提供这样的信号和共刺激信号的一种CAR,例如包括来自一
种或多种共刺激受体如CD28、CD137(4-1BB)、OX40(CD134)、CD27、DAP10、DAP12、NKG2D、ICOS和/或其他共刺激受体的一个或多个细胞内信号传导区域或结构域的一种CAR;在一些方
面,第三代CAR是包括不同共刺激受体(例如选自CD28、CD137(4-1BB)、OX40(CD134)、CD27、DAP10、DAP12、NKG2D、ICOS和/或其他共刺激受体)的多个共刺激结构域的一种CAR;在一些
方面,第四代CAR是包括不同共刺激受体(例如选自CD28、CD137(4-1BB)、OX40(CD134)、
CD27、DAP10、DAP12、NKG2D、ICOS和/或其他共刺激受体)的三个或更多个共刺激结构域的一种CAR。
[0523] 在一些实施方案中,嵌合抗原受体包括含有抗体或抗体片段的细胞外部分。在一些方面,嵌合抗原受体包括含有抗体或片段的细胞外部分和细胞内信号传导结构域。在一
些实施方案中,抗体或片段包括scFv,并且细胞内结构域含有ITAM。在一些方面,所述细胞
内信号传导结构域包括CD3-zeta(CD3ζ)链的ζ链的信号传导结构域。在一些实施方案中,嵌合抗原受体包括连接细胞外结构域与细胞内信号传导结构域的跨膜结构域。在一些方面,
所述跨膜结构域含有CD28的跨膜部分。在一些实施方案中,嵌合抗原受体含有T细胞共刺激
分子的细胞内结构域。可以直接或间接连接细胞外结构域和跨膜结构域的抗原结合部分。
在一些实施方案中,细胞外结构域和跨膜结构域的抗原结合部分通过间隔子(如本文描述
的任何间隔子)连接。在一些实施方案中,受体含有衍生出跨膜结构域的分子的细胞外部
分,如CD28细胞外部分。在一些实施方案中,嵌合抗原受体含有源自T细胞共刺激分子的细
胞内结构域或其功能变体,如位于跨膜结构域与包含ITAM的(例如源自CD3ζ的)信号传导结
构域之间。在一些方面,T细胞共刺激分子是CD28或41BB。
[0524] 例如,在一些实施方案中,CAR含有抗体(例如抗体片段)、是或含有CD28的跨膜部分或其功能变体的跨膜结构域、以及含有CD28的信号传导部分或其功能变体和CD3ζ的信号
传导部分或其功能变体的细胞内信号传导结构域。在一些实施方案中,CAR含有抗体例如抗
体片段,跨膜结构域(其是CD28的跨膜部分或其功能变体或含有CD28的跨膜部分或其功能
变体)以及含有4-1BB的信号传导部分或其功能变体和CD3ζ的信号传导部分或其功能变体
的细胞内信号传导结构域。在一些此类实施方案中,受体进一步包括含有Ig分子(如人Ig分
子,如Ig铰链或其变体,例如IgG4铰链或其变体)的一部分的间隔子,如仅含铰链的间隔子。
[0525] 在一些实施方案中,重组受体例如CAR的跨膜结构域是人CD28(例如登录号P10747.1)的跨膜结构域或其变体或包括人CD28的跨膜结构域或其变体,如包含SEQ ID 
NO:8所示的氨基酸序列或展现出与SEQ ID NO:8至少85%、86%、87%、88%、89%、90%、
91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或更高序列同一性的氨基酸序列的跨膜结构域;在一些实施方案中,重组受体的含有跨膜结构域的部分包含SEQ ID NO:9所示的
氨基酸序列或与其具有至少85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、
95%、96%、97%、98%、99%或更高或者约85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、
93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或更高序列同一性的氨基酸序列。
[0526] 在一些实施方案中,重组受体(例如,CAR)的一种或多种细胞内信号传导组分含有人CD28的细胞内共刺激信号传导结构域或其功能变体或部分,如在天然CD28蛋白的位置
186-187具有LL至GG取代的结构域。例如,细胞内信号传导结构域可以包含SEQ ID NO:10或
11中所示的氨基酸序列或展现与SEQ ID NO:10或11至少85%、86%、87%、88%、89%、
90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或更高序列同一性的氨基酸序列。在一些实施方案中,细胞内结构域包含4-1BB(例如登录号Q07011.1)的细胞内共刺激信
号传导结构域或其功能变体或部分,如SEQ ID NO:12所示的氨基酸序列或展现出与SEQ ID 
NO:12至少85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、
98%、99%或更高序列同一性的氨基酸序列。
[0527] 在一些实施方案中,重组受体(例如,CAR)的细胞内信号传导结构域包含人CD3ζ刺激信号传导结构域或其功能变体,如人CD3ζ的亚型3(登录号P20963.2)的112个AA的细胞质
结构域或如美国专利号7,446,190或美国专利号8,911,993中所述的CD3ζ信号传导结构域。
例如,在一些实施方案中,细胞内信号传导结构域包含SEQ ID NO:13、14或15所示的氨基酸
序列或展现与SEQ ID NO:13、14或15至少85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、
93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或更高序列同一性的氨基酸序列。
[0528] 在一些方面,间隔子仅含有IgG的铰链区,如仅IgG4或IgG1的铰链,如SEQ ID NO:1中所示的仅铰链间隔子。在其他实施方案中,间隔子是或含有任选地与CH2和/或CH3结构域
连接的Ig铰链,如IgG4衍生的铰链。在一些实施方案中,间隔子是Ig铰链例如IgG4铰链,其
与如SEQ ID NO:4所示的CH2和CH3结构域连接。在一些实施方案中,间隔子是Ig铰链例如
IgG4铰链,其仅与如SEQ ID NO:3所示的CH3结构域连接。在一些实施方案中,间隔子是或包
含富含甘氨酸-丝氨酸的序列或其他柔性接头如已知的柔性接头。
[0529] 例如,在一些实施方案中,CAR包括抗体(如抗体片段,包括scFv)、间隔子(如含有免疫球蛋白分子的一部分的间隔子,如铰链区和/或重链分子的一个或多个恒定区,如含有
Ig铰链的间隔子)、含有CD28衍生的跨膜结构域、CD28衍生的细胞内信号传导结构域和CD3ζ
信号传导结构域中的全部或部分的跨膜结构域。在一些实施方案中,CAR包括抗体或片段
(例如scFv)、间隔子(如任何含Ig铰链的间隔子)、CD28衍生的跨膜结构域、4-1BB衍生的细
胞内信号传导结构域和CD3ζ衍生的信号传导结构域。
[0530] 在一些实施方案中,编码此类CAR构建体的核酸分子进一步包括编码T2A核糖体跳跃元件的序列和/或tEGFR序列例如在编码CAR的序列的下游。在一些实施方案中,所述序列
编码SEQ ID NO:6所示的T2A核糖体跳跃元件或展现出与SEQ ID NO:6至少85%、86%、
87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或更高序列同一性的氨基酸序列。在一些实施方案中,还可以生成表达抗原受体(例如CAR)的T细胞以将
截短的EGFR(EGFRt)表达为非免疫原性选择表位(例如通过引入编码被T2A核糖体开关分隔
开的CAR和EGFRt的构建体,以表达来自相同构建体的两种蛋白质),然后所述非免疫原性选
择表位可用作检测此类细胞的标志物(参见例如美国专利号8,802,374)。在一些实施方案
中,序列编码SEQ ID NO:7或23所示的tEGFR序列或展现出与SEQ ID NO:7或23至少85%、
86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或更高序列同一性的氨基酸序列。
[0531] 由给予受试者的细胞表达的重组受体(如CAR)通常识别或特异性地结合以下分子,所述分子在被治疗的疾病或病症或其细胞中表达、与被治疗的疾病或病症或其细胞相
关和/或对被治疗的疾病或病症或其细胞具特异性。在特异性结合分子(例如,抗原)后,受
体通常将免疫刺激性信号(如ITAM转导的信号)递送至细胞中,由此促进靶向疾病或病症的
免疫应答。例如,在一些实施方案中,细胞表达CAR,其特异性地结合由疾病或病症的细胞或组织表达的或与疾病或病症相关的抗原。
[0532] B.TCR
[0533] 在一些实施方案中,提供了工程化细胞(如T细胞),其表达识别靶多肽(如肿瘤、病毒或自身免疫蛋白的抗原)的肽表位或T细胞表位的T细胞受体(TCR)或其抗原结合部分。
[0534] 在一些实施方案中,“T细胞受体”或“TCR”是含有可变α和β链(也分别称为TCRα和TCRβ)或可变γ和δ链(也分别称为TCRα和TCRβ)的分子或其抗原结合部分,并且其能够特异性地结合至与MHC分子结合的肽。在一些实施方案中,所述TCR呈αβ形式。通常,以αβ和γδ形式存在的TCR一般在结构上相似,但是表达它们的T细胞可以具有不同的解剖位置或功能。TCR可以在细胞的表面上发现或以可溶形式发现。通常,发现TCR在T细胞(或T淋巴细胞)的
表面上,在此处它通常负责识别与主要组织相容性复合物(MHC)分子结合的抗原。
[0535] 除非另有说明,否则术语“TCR”应理解为涵盖完整的TCR以及其抗原结合部分或其抗原结合片段。在一些实施方案中,TCR是完整或全长TCR,包括呈αβ形式或γδ形式的TCR。
在一些实施方案中,所述TCR是这样的抗原结合部分,其少于全长TCR但与在MHC分子中结合
的特定肽结合(如与MHC-肽复合物结合)。在一些情况下,TCR的抗原结合部分或片段可以仅
含有全长或完整TCR的结构性结构域的一部分,但是仍能够结合与完整TCR结合的肽表位
(如MHC-肽复合物)。在一些情况下,抗原结合部分含有TCR的可变结构域(如TCR的可变α链
和可变β链),足以形成用于与特定MHC-肽复合物结合的结合位点。通常,TCR的可变链含有
参与肽、MHC和/或MHC-肽复合物的识别的互补决定区。
[0536] 在一些实施方案中,TCR的可变结构域含有超变环或互补决定区(CDR),其通常是抗原识别和结合能力和特异性的主要贡献者。在一些实施方案中,TCR的CDR或其组合形成
给定TCR分子的全部或基本上全部的抗原结合位点。TCR链的可变区内的各个CDR通常由框
架区(FR)隔开,与CDR相比,所述框架区通常在TCR分子之间展示较低可变性(参见,例如,
Jores等人,Proc.Nat'l Acad.Sci.U.S.A.87:9138,1990;Chothia等人,EMBO J.7:3745,
1988;还参见Lefranc等人,Dev.Comp.Immunol.27:55,2003)。在一些实施方案中,CDR3是负
责抗原结合或特异性的主要CDR,或者是在给定TCR可变区的用于所述肽-MHC复合物的加工
肽部分的抗原识别和/或用于与其相互作用的三个CDR中最重要的CDR。在一些情况下,所述
α链的CDR1可以与某些抗原肽的N-末端部分相互作用。在一些情况下,所述β链的CDR1可以
与所述肽的C-末端部分相互作用。在一些情况下,CDR2对与所述MHC-肽复合物的MHC部分的
相互作用或识别具有最强的作用或者是主要的负责CDR。在一些实施方案中,所述β-链的可
变区可以含有另外的高变区(CDR4或HVR4),其通常参与超抗原结合而非抗原识别(Kotb
(1995)Clinical Microbiology Reviews,8:411-426)。
[0537] 在一些实施方案中,TCR还可以含有恒定结构域、跨膜结构域和/或短细胞质尾(参见,例如,Janeway等人,Immunobiology:The Immune System in Health and Disease,第3
版,Current Biology Publications,第4页:33,1997)。在一些方面,TCR的每条链可以具有
一个N末端免疫球蛋白可变结构域、一个免疫球蛋白恒定结构域、跨膜区和位于C末端的短
细胞质尾。在一些实施方案中,TCR与参与介导信号转导的CD3复合物的不变蛋白质缔合。
[0538] 在一些实施方案中,TCR链含有一个或多个恒定结构域。例如,给定TCR链的细胞外部分(例如,α链或β链)可以含有与细胞膜相邻的两个免疫球蛋白样结构域,例如可变结构
域(例如,Vα或Vβ;通常基于Kabat编号的氨基酸1至116,Kabat等人,“Sequences of 
Proteins of Immunological Interest”,US Dept.Health and Human Services,Public 
Health Service National Institutes of Health,1991,第5版)和恒定结构域(例如,α链
恒定域或Cα,通常基于Kabat编号的位置117至259,或β链恒定结构域或Cβ,通常基于Kabat的链的位置117至295)。例如,在一些情况下,由两条链形成的TCR的细胞外部分含有两个膜
近端恒定结构域和两个膜远端可变结构域,其中可变结构域各自含有CDR。TCR的恒定结构
域可含有短连接序列,其中半胱氨酸残基形成二硫键,由此连接TCR的两条链。在一些实施
方案中,TCR可在每条α和β链中具有另外的半胱氨酸残基,使得TCR在恒定结构域中含有两
个二硫键。
[0539] 在一些实施方案中,所述TCR链含有跨膜结构域。在一些实施方案中,所述跨膜结构域带正电荷。在一些情况下,所述TCR链含有胞质尾。在一些情况下,结构允许TCR与其他
分子(如CD3和其亚基)缔合。例如,含有恒定结构域与跨膜区的TCR可以将所述蛋白质锚定
在细胞膜中并与所述CD3信号传导装置或复合物的不变亚基缔合。CD3信号传导亚基(例如,
CD3γ、CD3δ、CD3ε和CD3ζ链)的细胞内尾含有TCR复合物的信号传导能力中所涉及的一个或多个基于免疫受体酪氨酸的激活基序或ITAM。
[0540] 在一些实施方案中,TCR可以是两条链α和β(或者任选地γ和δ)的异二聚体,或者其可以是单链TCR构建体。在一些实施方案中,TCR是含有两条单独链(α和β链或γ和δ链)的异二聚体,所述链是通过例如一个或多个二硫键连接。
[0541] 在一些实施方案中,TCR可以从一个或多个已知的TCR序列(如Vα,β链的序列)产生,所述一个或多个已知的TCR序列的基本上全长的编码序列是易于获得的。用于从细胞来
源获得全长TCR序列(包括V链序列)的方法是熟知的。在一些实施方案中,编码TCR的核酸可
以从多种来源获得,如通过一种或多种给定细胞内的或从所述一种或多种给定细胞分离的
编码TCR的核酸的聚合酶链式反应(PCR)扩增获得,或者通过公众可获得的TCR DNA序列的
合成获得。
[0542] 在一些实施方案中,TCR是从生物来源获得,如来自细胞(如来自T细胞,例如细胞毒性T细胞)、T细胞杂交瘤或其他公众可获得的来源。在一些实施方案中,T细胞可以从体内
分离的细胞获得。在一些实施方案中,TCR是胸腺选择的TCR。在一些实施方案中,TCR是新表位限制性TCR。在一些实施方案中,T细胞可以是培养的T细胞杂交瘤或克隆。在一些实施方
案中,TCR或其抗原结合部分可以从TCR序列的知识合成地产生。
[0543] 在一些实施方案中,TCR是从通过针对靶多肽抗原或其靶T细胞表位筛选候选TCR文库而鉴定或选择的TCR产生的。TCR文库可以通过扩增来自T细胞的Vα和Vβ库来产生,所述T细胞是从受试者分离,包括存在于PBMC、脾或其他淋巴器官中的细胞。在一些情况下,T细
胞可以从肿瘤浸润性淋巴细胞(TIL)扩增。在一些实施方案中,可以从CD4+或CD8+细胞产生
TCR文库。在一些实施方案中,所述TCR可以从正常或健康受试者的T细胞来源扩增,即正常
TCR文库。在一些实施方案中,所述TCR可以从患病受试者的T细胞来源扩增,即患病TCR文
库。在一些实施方案中,使用简并引物扩增Vα和Vβ的基因库,如通过在从人获得的样品(如T细胞)中进行RT-PCR。在一些实施方案中,scTv文库可以从天然Vα和Vβ文库组装,其中扩增的产物被克隆或组装以通过接头分开。取决于受试者和细胞的来源,所述文库可以是HLA等
位基因特异性的。可替代地,在一些实施方案中,TCR文库可以通过亲本或支架TCR分子的诱
变或多样化产生。在一些方面,所述TCR经受定向进化,如通过诱变例如所述α或β链。在一些方面,所述TCR的CDR内的特定残基被改变。在一些实施方案中,可以通过亲和力成熟来修饰
选择的TCR。在一些实施方案中,可以选择抗原特异性T细胞,如通过筛选以评估针对所述肽
的CTL活性。在一些方面,可以选择例如存在于抗原特异性T细胞上的TCR,如通过结合活性,例如对所述抗原的特定亲和力或亲合力。
[0544] 在一些实施方案中,TCR或其抗原结合部分是已经修饰或工程化的。在一些实施方案中,使用定向进化方法来产生具有改变的特性如具有较高的对特定MHC-肽复合物的亲和
力的TCR。在一些实施方案中,通过展示方法来实现定向进化,所述展示方法包括但不限于
酵母展示(Holler等人,(2003)Nat Immunol,4,55-62;Holler等人(2000)Proc Natl Acad 
Sci U S A,97,5387-92)、噬菌体展示(Li等人(2005)Nat Biotechnol,23,349-54)、或T细
胞展示(Chervin等人(2008)J Immunol Methods,339,175-84)。在一些实施方案中,展示途
径涉及工程化或修饰已知的亲本或参考TCR。例如,在一些情况下,野生型TCR可以用作模板
以用于产生诱变的TCR,其中CDR的一个或多个残基被突变,并且选择具有所需改变的特性
(如对所需靶抗原具有更高的亲和力)的突变体。
[0545] 在一些实施方案中,用于产生或生成目标TCR的靶多肽的肽是已知的或可以由熟练技术人员容易地鉴定。在一些实施方案中,适用于产生TCR或抗原结合部分的肽可以基于
目标靶多肽(如下文所述的靶多肽)中HLA限制性基序的存在来确定。在一些实施方案中,使
用本领域技术人员已知的计算机预测模型鉴定肽。在一些实施方案中,对于预测MHC I类结
合位点,此类模型包括但不限于ProPred1(Singh和Raghava(2001)Bioinformatics17(12):
1236-1237)和SYFPEITHI(参见Schuler等人(2007)Immunoinformatics Methods in 
Molecular Biology,409(1):75-93 2007)。在一些实施方案中,MHC限制性表位是HLA-
A0201,其在所有高加索人的约39%-46%中表达,并因此代表用于制备TCR或其他MHC-肽结
合分子的MHC抗原的合适选择。
[0546] 使用计算机预测模型的HLA-A0201结合基序以及蛋白酶体和免疫蛋白酶体的切割位点是本领域技术人员已知的。对于预测MHC I类结合位点,此类模型包括但不限于
ProPred1(更详细地描述于Singh和Raghava,ProPred:prediction of HLA-DR binding 
sites.BIOINFORMATICS 17(12):1236-12372001中)和SYFPEITHI(参见Schuler等人
SYFPEITHI,Database for Searching and  T-Cell Epitope  Prediction.于
Immunoinformatics Methods in Molecular Biology,第409(1)卷:75-93 2007)。
[0547] 在一些实施方案中,所述TCR或其抗原结合部分可以是重组产生的天然蛋白质或其突变形式(其中一种或多种特性(如结合特征)已经被改变)。在一些实施方案中,TCR可以
源自各种动物物种之一,如人、小鼠、大鼠或其他哺乳动物。TCR可以是细胞结合的或呈可溶形式。在一些实施方案中,出于所提供的方法的目的,所述TCR呈在细胞的表面上表达的细
胞结合形式。
[0548] 在一些实施方案中,所述TCR是全长TCR。在一些实施方案中,所述TCR是抗原结合部分。在一些实施方案中,所述TCR是二聚体TCR(dTCR)。在一些实施方案中,所述TCR是单链TCR(sc-TCR)。在一些实施方案中,dTCR或scTCR具有如WO 03/020763、WO 04/033685、WO 
2011/044186中所述的结构。
[0549] 在一些实施方案中,TCR含有对应于跨膜序列的序列。在一些实施方案中,所述TCR确实含有对应于胞质序列的序列。在一些实施方案中,所述TCR能够与CD3形成TCR复合物。
在一些实施方案中,任何TCR(包括dTCR或scTCR)可以与在T细胞的表面上产生活性TCR的信
号传导结构域连接。在一些实施方案中,所述TCR在细胞的表面上表达。
[0550] 在一些实施方案中,dTCR含有第一多肽(其中对应于TCRα链可变区序列的序列与对应于TCRα链恒定区细胞外序列的序列的N末端融合)和第二多肽(其中对应于TCRβ链可变
区序列的序列与对应于TCRβ链恒定区细胞外序列的序列的N末端融合),所述第一和第二多
肽通过二硫键连接。在一些实施方案中,所述键可以对应于天然二聚αβTCR中存在的天然链间二硫键。在一些实施方案中,所述链间二硫键不存在于天然TCR中。例如,在一些实施方案中,可以将一个或多个半胱氨酸掺入dTCR多肽对的恒定区细胞外序列中。在一些情况下,可
能需要天然和非天然二硫键。在一些实施方案中,所述TCR含有跨膜序列以锚定至膜。
[0551] 在一些实施方案中,dTCR含有TCRα链(含有可变α结构域、恒定α结构域和附接至恒定α结构域C末端的第一二聚化基序)和TCRβ链(包含可变β结构域、恒定β结构域和附接至恒定β结构域C末端的第一二聚化基序),其中所述第一和第二二聚化基序易于相互作用以在第一二聚化基序的氨基酸与第二二聚化基序的氨基酸之间形成共价键,从而将TCRα链与
TCRβ链连接在一起。
[0552] 在一些实施方案中,TCR是scTCR。通常,可以使用本领域技术人员已知的方法来生成scTCR,参见例如,Soo Hoo,W.F.等人PNAS(USA)89,4759(1992);Wülfing,C.和Plü
ckthun,A.,J.Mol.Biol.242,655(1994);Kurucz,I.等人PNAS(USA)90 3830(1993);国际公
开的PCT号WO 96/13593、WO96/18105、WO99/60120、WO99/18129、WO 03/020763、WO2011/
044186;以及Schlueter,C.J.等人J.Mol.Biol.256,859(1996)。在一些实施方案中,scTCR
含有引入的非天然链间二硫键以促进TCR链的缔合(参见,例如,国际公开PCT号WO 03/
020763)。在一些实施方案中,scTCR是非二硫键连接的截短的TCR,其中与其C-末端融合的
异源亮氨酸拉链促进链缔合(参见例如国际公开的PCT号WO 99/60120)。在一些实施方案
中,scTCR含有经由肽接头与TCRβ可变结构域共价连接的TCRα可变结构域(参见例如,国际
公开的PCT号WO 99/18129)。
[0553] 在一些实施方案中,scTCR含有由对应于TCRα链可变区的氨基酸序列构成的第一区段、由对应于TCRβ链可变区序列的氨基酸序列构成的第二区段(融合至对应于TCRβ链恒
定结构域细胞外序列的氨基酸序列的N末端)和将第一区段的C末端连接至第二区段的N末
端的接头序列。
[0554] 在一些实施方案中,scTCR含有第一区段(其由与α链细胞外恒定结构域序列的N末端融合的α链可变区序列构成)和第二区段(其由与序列β链细胞外恒定和跨膜序列的N末端
融合的β链可变区序列构成)以及任选地接头序列(其将所述第一区段的C末端连接至所述
第二区段的N末端)。
[0555] 在一些实施方案中,scTCR含有第一区段(其由与β链细胞外恒定结构域序列的N末端融合的TCRβ链可变区序列构成)和第二区段(其由与序列α链细胞外恒定和跨膜序列的N
末端融合的α链可变区序列构成)以及任选地接头序列(其将所述第一区段的C末端连接至
所述第二区段的N末端)。
[0556] 在一些实施方案中,scTCR的连接所述第一和第二TCR区段的接头可以是能够形成单多肽链同时保留TCR结合特异性的任何接头。在一些实施方案中,接头序列可例如具有
式-P-AA-P-,其中P是脯氨酸并且AA代表氨基酸序列,其中所述氨基酸是甘氨酸和丝氨酸。
在一些实施方案中,所述第一和第二区段配对,使得其可变区序列定向用于这种结合。因
此,在一些情况下,所述接头具有足够的长度以跨越所述第一区段的C末端与所述第二区段
的N末端之间的距离,或反之亦然,但是不能太长以阻断或减少所述scTCR与所述靶配体的
结合。在一些实施方案中,所述接头可以含有为或为约10至45个氨基酸,如10至30个氨基酸
或26至41个氨基酸残基,例如29、30、31或32个氨基酸。在一些实施方案中,接头具有式-
PGGG-(SGGGG)5-P-,其中P是脯氨酸,G是甘氨酸并且S是丝氨酸(SEQ ID NO:16)。在一些实
施方案中,所述接头具有序列GSADDAKKDAAKKDGKS(SEQ ID NO:17)
[0557] 在一些实施方案中,scTCR含有共价二硫键,其将α链的恒定结构域的免疫球蛋白区域的残基连接至β链的恒定结构域的免疫球蛋白区域的残基。在一些实施方案中,天然
TCR中不存在链间二硫键。例如,在一些实施方案中,可以将一个或多个半胱氨酸掺入scTCR
多肽的第一和第二区段的恒定区细胞外序列中。在一些情况下,可能需要天然和非天然二
硫键。
[0558] 在含有引入的链间二硫键的dTCR或scTCR的一些实施方案中,不存在天然二硫键。在一些实施方案中,用形成天然链间二硫键的一个或多个天然半胱氨酸取代另一残基,如
取代丝氨酸或丙氨酸。在一些实施方案中,可以通过使第一和第二区段上的非半胱氨酸残
基突变为半胱氨酸来形成引入的二硫键。TCR的示例性非天然二硫键描述于已公开的国际
PCT号WO2006/000830中。
[0559] 在一些实施方案中,TCR或其抗原结合片段对靶抗原以平衡结合常数展现出亲和力,所述平衡结合常数在或在约10-5与10-12M之间以及其中的所有单独值和范围。在一些实
施方案中,靶抗原是MHC-肽复合物或配体。
[0560] 在一些实施方案中,编码TCR(如α和β链)的一种或多种核酸可以通过PCR、克隆或其他合适的方法扩增,并且克隆到合适的表达载体中。表达载体可以是任何合适的重组表
达载体,并且可以用于转化或转染任何合适的宿主。合适的载体包括设计用于繁殖和扩增
或用于表达或用于两者的那些,如质粒和病毒。
[0561] 在一些实施方案中,载体可以是以下系列的载体:pUC系列(Fermentas Life Sciences)、pBluescript系列(Stratagene,加利福尼亚州拉霍亚)、pET系列(Novagen,威斯康星州麦迪逊)、pGEX系列(Pharmacia Biotech,瑞典乌普萨拉)或pEX系列(Clontech,加利
福尼亚州帕罗奥图)。在一些情况下,也可以使用噬菌体载体,如λG10、λGT11、λZapII
(Stratagene)、λEMBL4和λNM1149。在一些实施方案中,可以使用植物表达载体,并且包括pBI01、pBI101.2、pBI101.3、pBI121和pBIN19(Clontech)。在一些实施方案中,动物表达载体包括pEUK-Cl、pMAM和pMAMneo(Clontech)。在一些实施方案中,使用病毒载体,如逆转录
病毒载体。
[0562] 在一些实施方案中,可以使用标准重组DNA技术来制备所述重组表达载体。在一些实施方案中,载体可以含有调节序列,如转录和翻译起始和终止密码子,其对引入载体的宿
主(例如,细菌、真菌,植物或动物)的类型具特异性,酌情并考虑所述载体是基于DNA还是基于RNA。在一些实施方案中,载体可以含有非天然启动子,其可操作地连接至编码TCR或抗原
结合部分(或其他MHC-肽结合分子)的核苷酸序列。在一些实施方案中,所述启动子可以是
非病毒启动子或病毒启动子,如巨细胞病毒(CMV)启动子、SV40启动子、RSV启动子和在鼠干
细胞病毒的长末端重复序列中发现的启动子。还考虑了熟练技术人员已知的其他启动子。
[0563] 在一些实施方案中,为了产生编码TCR的载体,将α和β链从表达目标TCR的T细胞克隆分离的总cDNA进行PCR扩增,并将其克隆到表达载体中。在一些实施方案中,将所述α和β链克隆到同一载体中。在一些实施方案中,将所述α和β链克隆到不同的载体中。在一些实施方案中,将所产生的α和β链掺入逆转录病毒(例如慢病毒)载体中。
[0564] C.多靶向
[0565] 在一些实施方案中,细胞和方法包括多靶向策略,例如在细胞上表达两种或更多种基因工程化受体,每种受体识别相同或不同的抗原,并且通常各自包括不同的细胞内信
号传导组分。此类多靶向策略描述于例如以下文献中:国际专利申请公开号WO 
2014055668A1(描述激活和共刺激CAR的组合,例如,靶向单独存在于脱靶(例如正常细胞)
上,但仅一起存在于待治疗疾病或病症的细胞上的两种不同抗原)和Fedorov等人,
Sci.Transl.Medicine,5(215)(2013)(描述了表达激活和抑制性CAR的细胞,例如其中激活
CAR结合同时在正常或非患病细胞和待治疗疾病或病症的细胞上表达的一种抗原,并且抑
制性CAR结合仅在正常细胞或不希望治疗的细胞上表达的另一种抗原的那些细胞)。
[0566] 例如,在一些实施方案中,所述细胞包括表达第一基因工程化抗原受体(例如,CAR或TCR)的受体,其通常在特异性结合至由第一受体识别的抗原(例如第一抗原)后,能够诱
导激活信号至所述细胞。在一些实施方案中,细胞还包括第二基因工程化抗原受体(例如,
CAR或TCR),例如嵌合共刺激受体,所述受体通常在特异性结合至由第二受体识别的第二抗
原后,能够将共刺激信号诱导至免疫细胞。在一些实施方案中,第一抗原与第二抗原是相同
的。在一些实施方案中,第一抗原与第二抗原是不同的。
[0567] 在一些实施方案中,第一和/或第二基因工程化抗原受体(例如CAR或TCR)能够诱导激活信号至所述细胞。在一些实施方案中,受体包括含有ITAM或ITAM样基序的细胞内信
号传导组分。在一些实施方案中,由第一受体诱导的激活涉及信号转导或细胞中蛋白质表
达的变化,导致启动免疫应答(例如ITAM磷酸化)和/或启动ITAM介导的信号转导级联、形成
免疫突触和/或所结合受体(例如CD4或CD8等)附近的分子的聚簇、激活一种或多种转录因
子(例如NF-κB和/或AP-1)、和/或诱导因子(例如细胞因子)的基因表达、增殖和/或存活。
[0568] 在一些实施方案中,第一受体和/或第二受体包括共刺激受体(如CD28、CD137(4-1BB)、OX40、CD27、DAP10、DAP12、NKG2D、ICOS和/或其他共刺激受体)的细胞内信号传导结构域。在一些实施方案中,第一和第二受体包括不同的共刺激受体的细胞内信号传导结构域。
在一个实施方案中,第一受体含有CD28共刺激信号传导区域,并且第二受体含有4-1BB共刺
激信号传导区域,或反之亦然。
[0569] 在一些实施方案中,第一和/或第二受体包括含有ITAM或ITAM样基序的细胞内信号传导结构域和共刺激受体的细胞内信号传导结构域。
[0570] 在一些实施方案中,第一受体含有包含ITAM或ITAM样基序的细胞内信号传导结构域,并且第二受体含有共刺激受体的细胞内信号传导结构域。与在相同细胞中诱导的激活
信号组合的共刺激信号是导致免疫应答的共刺激信号,所述免疫应答是例如稳健且持续的
免疫应答,如增加的基因表达、细胞因子和其他因子的分泌、以及T细胞介导的效应子功能
(如细胞杀伤)。
[0571] 在一些实施方案中,单独的第一受体的连接和单独的第二受体的连接都不会诱导稳健的免疫应答。在一些方面,如果仅连接一个受体,则细胞变得耐受抗原或对抗原无反
应,或被抑制,和/或不被诱导增殖或分泌因子或实现效应子功能。然而,在一些此类实施方案中,在连接多个受体时,如在遇到表达第一和第二抗原的细胞时,实现所需应答,如完全
免疫激活或刺激,例如如通过一种或多种细胞因子的分泌、增殖、持久性和/或执行免疫效
应子功能(如靶细胞的细胞毒性杀伤)所指示的。
[0572] 在一些实施方案中,两种受体分别将激活和抑制信号诱导至细胞,使得一种受体与其抗原的结合激活细胞或诱导应答,但是第二抑制性受体与其抗原的结合诱导了抑制或
减弱所述应答的信号。例子是激活CAR与抑制性CAR或iCAR的组合。例如,可以使用这种策
略,其中激活CAR结合在疾病或病症中表达但也在正常细胞上表达的抗原,并且抑制性受体
结合在正常细胞上表达但不在疾病或病症的细胞上表达的单独抗原。
[0573] 在一些实施方案中,多靶向策略用于以下情况:其中与特定疾病或病症相关的抗原在未患病细胞上表达和/或在工程化细胞本身上表达,所述表达为瞬时表达(例如,在与
基因工程化相关的刺激后)或永久表达。在此类情况下,通过需要连接两个分开的和单独特
异性抗原受体,可以改善特异性、选择性和/或功效。
[0574] 在一些实施方案中,多种抗原(例如第一和第二抗原)在所靶向的细胞、组织或疾病或病症上(例如在癌细胞上)表达。在一些方面,细胞、组织、疾病或病症是多发性骨髓瘤
或多发性骨髓瘤细胞。在一些实施方案中,多种抗原中的一种或多种通常也在不需要用细
胞疗法靶向的细胞(例如正常或未患病细胞或组织,和/或工程化细胞本身)上表达。在此类
实施方案中,通过需要连接多个受体以实现细胞的反应,实现特异性和/或功效。
[0575] D.用于工程化的细胞和细胞的制备
[0576] 还提供了细胞,如含有工程化重组受体的细胞,如本文描述的。还提供了此类细胞的群体、含有此类细胞和/或富含此类细胞的组合物,例如其中表达重组受体(例如嵌合受
体)的细胞构成组合物中总细胞的或某种类型的细胞(如T细胞或CD8+或CD4+细胞)的至少
50、60、70、80、90、91、92、93、94、95、96、97、98、99或更高百分比。所述组合物包括用于给予(如用于过继细胞疗法)的药物组合物和配制品。还提供了例如根据所提供的方法将所述细
胞和组合物给予受试者例如患者的治疗方法。
[0577] 因此,还提供了表达重组受体(例如CAR)的基因工程化细胞。细胞通常是真核细胞,例如哺乳动物细胞,并且通常是人细胞。在一些实施方案中,所述细胞源自血液、骨髓、淋巴或淋巴器官,是免疫系统的细胞,如先天免疫或适应性免疫的细胞,例如骨髓或淋巴细
胞,包括淋巴细胞,通常为T细胞和/或NK细胞。其他示例性细胞包括干细胞,如多潜能干细
胞和多能干细胞,包括诱导多能干细胞(iPSC)。细胞通常是原代细胞如直接从受试者分离
和/或从受试者分离并冷冻的那些原代细胞。在一些实施方案中,细胞包括T细胞或其他细
胞类型的一个或多个亚组,如整个T细胞群、CD4+细胞、CD8+细胞及其亚群,如由以下各项所定义的那些亚群:功能、激活状态、成熟度、分化的可能性、扩增、再循环、定位和/或持久能力、抗原特异性、抗原受体类型、在特定器官或区室中的存在、标记或细胞因子分泌特征和/或分化程度。关于待治疗的受试者,细胞可以是同种异体的和/或自体的。所述方法包括现
成的方法。在一些方面,如对于现有技术,所述细胞是多能和/或多潜能的,如干细胞,如诱导多能干细胞(iPSC)。在一些实施方案中,所述方法包括从所述受试者中分离细胞,如本文
所述制备、处理、培养和/或工程化它们,并且在冷冻保存之前或之后将它们重新引入同一
患者体内。
[0578] T细胞和/或CD4+和/或CD8+ T细胞的亚型和亚群包括原初T(TN)细胞、效应T细胞(TEFF)、记忆T细胞及其亚型(如干细胞记忆T(TSCM)、中枢记忆T(TCM)、效应记忆T(TEM)或终末分化的效应记忆T细胞)、肿瘤浸润性淋巴细胞(TIL)、未成熟T细胞、成熟T细胞、辅助T细胞、细胞毒性T细胞、粘膜相关恒定T(MAIT)细胞、天然存在和适应性调节性T(Treg)细胞、辅助T
细胞(如TH1细胞、TH2细胞、TH3细胞、TH17细胞、TH9细胞、TH22细胞、滤泡性辅助T细胞)、α/βT细胞以及δ/γT细胞。
[0579] 在一些实施方案中,所述细胞是天然杀伤(NK)细胞。在一些实施方案中,所述细胞是单核细胞或粒细胞,例如骨髓细胞、巨噬细胞、嗜中性粒细胞、树突细胞、肥大细胞、嗜酸性粒细胞和/或嗜碱性粒细胞。
[0580] 在一些实施方案中,所述细胞包括经由基因工程引入的一种或多种核酸,从而表达此类核酸的重组或基因工程化产物。在一些实施方案中,核酸是异源的,即通常不存在于
细胞或从细胞获得的样品中,如从另一种生物或细胞获得的核酸,例如,所述核酸通常不在
被工程化的细胞和/或这种细胞所来源的生物中发现。在一些实施方案中,核酸不是天然存
在的如自然界中未发现的核酸,包括包含编码来自多种不同细胞类型的各种结构域的核酸
的嵌合组合的核酸。
[0581] 在一些实施方案中,制造、生成或产生细胞疗法(例如,含有表达重组受体的细胞的治疗性细胞组合物)可以经由包括一个或多个另外的处理步骤(例如用于激活或刺激、转
导、培育、扩增、洗涤、悬浮、稀释、浓缩和/或配制细胞的步骤)的过程进行。在一些实施方案中,生成或产生细胞疗法的方法包括从受试者中分离细胞,在一个或多个刺激条件下制备、
处理、培养。在一些实施方案中,所述方法包括按以下顺序进行的处理步骤,其中:首先将细胞(例如原代细胞)从生物样品中分离(例如选择或分离);将所选择的细胞与病毒载体粒子
一起孵育用于转导,任选地在刺激试剂的存在下刺激所分离的细胞的步骤之后;培养所转
导的细胞,例如以扩增细胞;将所转导的细胞配制在组合物中并将所述组合物引入所提供
的生物医学材料容器中。在一些实施方案中,在冷冻保存之前或之后将生成的工程化细胞
重新引入同一受试者中。
[0582] 在一些实施方案中,所述一个或多个处理步骤可以包括以下中的一个或多个:(a)洗涤含有细胞的生物样品(例如,全血样品、血沉棕黄层样品、外周血单核细胞(PBMC)样品、未分级的T细胞样品、淋巴细胞样品、白细胞样品、单采术产物、或白细胞分离术产物),(b)从样品中分离(例如选择)所希望的细胞亚组或群体(例如,CD4+和/或CD8+ T细胞),例如,
通过将细胞与选择或免疫亲和试剂一起孵育以进行基于免疫亲和的分离;(c)通过将细胞
暴露于刺激条件和/或刺激试剂来激活和/或刺激细胞,这可以在将细胞与病毒载体粒子一
起孵育之前、期间和/或之后进行,(d)将分离的(例如选择的)细胞与病毒载体粒子一起孵
育,例如,转导所述细胞,(e)使用如所描述的方法来培养、培育或扩增细胞,和(f)例如在药学上可接受的缓冲液、冷冻保存剂或其他合适的培养基中配制所转导的细胞。在一些实施
方案中,将PBMC样品、未分级的T细胞样品、淋巴细胞样品、白细胞样品、单采术产物或白细胞分离术产物的细胞低温冷冻(cryofrozen),并且然后在用于分离、选择、孵育、转导、转
染、培育、扩增和/或配制细胞的任何步骤之前解冻。
[0583] 在一些实施方案中,在任何上述步骤之前或之后也可以进行洗涤或悬浮步骤的一个或多个另外的步骤,例如用于细胞的稀释、浓缩和/或缓冲液交换。在一些方面,将所得的工程化细胞组合物引入一个或多个所提供的生物医学培养容器中。
[0584] 在一些实施方案中,用于临床用途(例如过继细胞疗法中)的细胞的制备中的一个、多个或所有步骤是在未将细胞暴露于非无菌条件下和不需要使用无菌室或无菌柜的情
况下进行。在这种方法的一些实施方案中,细胞被隔离、分离或选择、转导、洗涤、任选地激活或刺激和配制,都在封闭系统内进行。在这样的过程的一些方面,使细胞从封闭的系统中
表达并将其引入一个或多个生物材料容器中。在一些实施方案中,所述方法是以自动方式
进行的。在一些实施方案中,一个或多个步骤是在封闭的系统或装置之外进行的。
[0585] 在一些实施方案中,将封闭的系统用于执行用于制造、生成或产生细胞疗法的方法的一个或多个其他处理步骤。在一些实施方案中,一个或多个或所有处理步骤(例如隔
离、选择和/或富集、处理、与转导和工程化结合的孵育)和配制步骤是使用集成或自含式系
统中的系统、装置或设备进行和/或以自动化或可编程方式进行。在一些方面,所述系统或
设备包括与所述系统或设备通信的计算机和/或计算机程序,其允许用户对处理、分离、工
程化和配制步骤的各个方面进行编程、控制、评估其结果和/或调整。在一个例子中,所述系统是如国际专利申请公开号WO 2009/072003或US 20110003380A1中所述的系统。在一个例
子中,所述系统是如国际公开号WO 2016/073602中所述的系统。
[0586] 在一些实施方案中,工程化细胞的制备包括一个或多个培养和/或制备步骤。用于引入重组受体(例如CAR)的细胞可以从样品(如生物样品,例如获自或源自受试者的一种样
品)中分离。在一些实施方案中,分离出细胞的受试者是患有疾病或病症或需要细胞疗法或
将对其给予细胞疗法的受试者。在一些实施方案中,所述受试者是需要特定治疗性干预(如
过继细胞疗法,其中细胞被分离、加工和/或工程化)的人。
[0587] 因此,在一些实施方案中,细胞是原代细胞,例如原代人细胞。样品包括直接取自受试者的组织、流体和其他样品,以及来自一个或多个处理步骤(如分离、离心、基因工程化(例如用病毒载体转导)、洗涤和/或孵育)的样品。所述生物样品可以是直接从生物来源获
得的样品或经过加工的样品。生物样品包括但不限于体液(如血液、血浆、血清、脑脊液、滑液、尿液和汗液)、组织和器官样品,包括由其衍生的加工样品。
[0588] 在一些方面,细胞从其中来源或分离的样品是血液或血液来源的样品,或者是或源自单采术或白细胞分离术产物。示例性样品包括全血、外周血单核细胞(PBMC)、白细胞、
骨髓、胸腺、组织活检、肿瘤、白血病、淋巴瘤、淋巴结、肠相关淋巴组织、粘膜相关淋巴组织、脾、其他淋巴组织、肝、肺、胃、肠、结肠、肾、胰腺、乳房、骨、前列腺、子宫颈、睾丸、卵巢、扁桃体或其他器官和/或由其衍生的细胞。在细胞疗法(例如过继细胞疗法)的背景下,样品包括
来自自体和同种异体来源的样品。
[0589] 在一些实施方案中,细胞源自细胞系,例如,T细胞系。在一些实施方案中,细胞获得自异种来源,例如获得自小鼠、大鼠、非人灵长类动物、或猪。
[0590] 在一些实施方案中,细胞的分离包括一个或多个制备和/或基于非亲和力的细胞分离步骤。在一些例子中,将细胞在存在一种或多种试剂的情况下洗涤、离心和/或孵育,例如以去除不需要的组分、针对所需组分进行富集、裂解或去除对特定试剂敏感的细胞。在一
些例子中,基于一种或多种特性(如密度、粘附特性、尺寸、对特定组分的敏感性和/或抗性)分离细胞。
[0591] 在一些例子中,来自受试者的循环血液的细胞例如通过单采术或白细胞分离术获得。在一些方面,所述样品含有淋巴细胞,包括T细胞、单核细胞、粒细胞、B细胞、其他有核白细胞、红细胞和/或血小板,并且在一些方面含有除红细胞和血小板之外的细胞。
[0592] 在一些实施方案中,洗涤从受试者收集的血细胞,例如以去除血浆级分并将细胞置于适当的缓冲液或介质中以用于随后的处理步骤。在一些实施方案中,用磷酸盐缓冲盐
水(PBS)洗涤所述细胞。在一些实施方案中,洗涤溶液缺乏钙和/或镁和/或许多或所有二价
阳离子。在一些方面,根据制造商的说明书,使用半自动“流通”离心机(例如,Cobe 2991细胞加工器,Baxter)完成洗涤步骤。在一些方面,根据制造商的说明书在离心室中进行洗涤
步骤,所述离心室是例如由Biosafe SA生产和销售的那些,包括与 和 2系
统一起使用的那些,包括A-200/F和A-200离心室。在一些方面,根据制造商的说明书,通过
切向流过滤(TFF)完成洗涤步骤。在一些实施方案中,洗涤后将所述细胞重悬于多种生物相
容性缓冲液(例如像不含Ca++/Mg++的PBS)中。在某些实施方案中,去除血细胞样品的组分
并将所述细胞直接重悬于培养基中。
[0593] 在一些实施方案中,所述方法包括基于密度的细胞分离方法,如通过裂解红细胞并通过Percoll或Ficoll梯度离心而从外周血制备白细胞。
[0594] 在一些实施方案中,分离方法包括基于细胞中一种或多种特定分子(如表面标记,例如表面蛋白、细胞内标记或核酸)的表达或存在来分离不同细胞类型。在一些实施方案
中,可以使用任何已知的基于此类标记的用于分离的方法。在一些实施方案中,所述分离是
基于亲和力或免疫亲和力的分离。例如,在一些方面,所述分离包括基于所述细胞的一种或
多种标记(通常为细胞表面标记)的表达或表达水平来分离细胞和细胞群,例如通过和与此
类标记特异性地结合的抗体或结合配偶体一起孵育,然后通常是洗涤步骤和从那些未与所
述抗体或结合配偶体结合的细胞中分离已结合所述抗体或结合配偶体的细胞。
[0595] 此类分离步骤可以基于阳性选择(其中保留已经结合所述试剂的细胞以供进一步使用)和/或阴性选择(其中保留未与所述抗体或结合配偶体结合的细胞)。在一些例子中,
保留两种级分以供进一步使用。在一些方面,在没有可用于特异性鉴定异质群体中的细胞
类型的抗体的情况下,阴性选择可能特别有用,使得最好基于由除所需群体之外的细胞表
达的标记进行分离。
[0596] 所述分离不需要导致100%富集或去除特定细胞群或表达特定标记的细胞。例如,针对特定类型的细胞(如表达标记的那些)的阳性选择或富集是指增加此类细胞的数量或
百分比,但不需要导致不表达所述标记的细胞的完全不存在。同样地,特定类型的细胞(如
表达标记的那些)的阴性选择、去除或耗尽是指减少此类细胞的数量或百分比,但不需要导
致所有此类细胞的完全去除。
[0597] 在一些例子中,进行多轮分离步骤,其中来自一个步骤的阳性或阴性选择的级分经受另一个分离步骤,如随后的阳性或阴性选择。在一些例子中,单个分离步骤可以同时耗
尽表达多种标记的细胞,如通过将细胞与多种抗体或结合配偶体(每种抗体或结合配偶体
对被靶向用于阴性选择的标记具特异性)一起孵育。同样地,通过将细胞与在各种细胞类型
上表达的多种抗体或结合配偶体一起孵育,可以同时阳性选择多种细胞类型。
[0598] 例如,在一些方面,T细胞的特定亚群,如对一种或多种表面标记呈阳性或高水平表达的细胞(例如CD28+、CD62L+、CCR7+、CD27+、CD127+、CD4+、CD8+、CD45RA+和/或CD45RO+ T细胞)通过阳性或阴性选择技术来分离。
[0599] 例如,CD3+、CD28+  T细胞可以使用CD3/CD28缀合的磁珠(例如,M-450 CD3/CD28 T细胞扩增器)进行阳性选择。
[0600] 在一些实施方案中,通过阳性选择针对特定细胞群富集或者通过阴性选择针对特定细胞群耗尽来进行分离。在一些实施方案中,通过将细胞与一种或多种抗体或其他结合
剂一起孵育来完成阳性或阴性选择,所述一种或多种抗体或其他结合剂与分别在阳性或阴
性选择的细胞上表达或以相对较高水平(标记高)(标记+)的一种或多种表面标记特异性地
结合。
[0601] 在一些实施方案中,通过阴性选择在非T细胞(如B细胞、单核细胞或其他白细胞,如CD14)上表达的标记,将T细胞与PBMC样品分离。在一些方面,CD4+或CD8+选择步骤用于分
离CD4+辅助细胞和CD8+细胞毒性T细胞。此类CD4+和CD8+群体可以通过针对在一种或多种
幼稚T细胞、记忆T细胞和/或效应T细胞亚群上表达或表达至相对较高程度的标记进行阳性
或阴性选择来进一步分选为亚群。
[0602] 在一些实施方案中,如通过基于与相应亚群相关的表面抗原进行阳性或阴性选择,将CD8+细胞针对幼稚、中枢记忆、效应子记忆和/或中枢记忆干细胞进一步富集或耗尽。
在一些实施方案中,针对中枢记忆T(TCM)细胞进行富集以增加功效,如以改善给予后的长
期存活、扩增和/或移植,这在一些方面在此类亚群中特别稳健。参见Terakura等人(2012)
Blood.1:72-82;Wang等人(2012)J Immunother.35(9):689-701。在一些实施方案中,组合
富含TCM的CD8+ T细胞与CD4+ T细胞进一步增强功效。
[0603] 在实施方案中,记忆T细胞存在于CD8+外周血淋巴细胞的CD62L+和CD62L-两个子集中。可以例如使用抗CD8和抗CD62L抗体将PBMC针对CD62L-CD8+和/或CD62L+CD8+级分进
行富集或耗尽。
[0604] 在一些实施方案中,中枢记忆T(TCM)细胞的富集是基于CD45RO、CD62L、CCR7、CD28、CD3和/或CD127的阳性或高表面表达;在一些方面,它是基于对表达或高度表达
CD45RA和/或颗粒酶B的细胞的阴性选择。在一些方面,通过耗尽表达CD4、CD14、CD45RA的细胞、以及阳性选择或富集表达CD62L的细胞来进行对富集TCM细胞的CD8+群体的分离。在一
个方面,中枢记忆T(TCM)细胞的富集从基于CD4表达所选择的阴性细胞级分开始进行,所述
阴性细胞级分基于CD14和CD45RA的表达进行阴性选择且基于CD62L进行阳性选择。在一些
方面这种选择是同时进行的,而在其他方面以任何顺序依次进行。在一些方面,用于制备
CD8+细胞群或亚群的相同的基于CD4表达的选择步骤也用于生成CD4+细胞群或亚群,使得
来自基于CD4的分离的阳性和阴性级分被保留并用于所述方法的后续步骤中,任选地在一
个或多个其他阳性或阴性选择步骤之后。
[0605] 在特定例子中,PBMC样品或其他白细胞样品进行CD4+细胞的选择,其中保留了阴性和阳性级分。然后所述阴性级分基于CD14和CD45RA或ROR1的表达进行阴性选择,并基于
中枢记忆T细胞(如CD62L或CCR7)的标记特征进行阳性选择,其中以任何顺序进行所述阳性
和阴性选择。
[0606] 通过鉴定具有细胞表面抗原的细胞群,将CD4+ T辅助细胞分类为幼稚、中枢记忆和效应细胞。CD4+淋巴细胞可通过标准方法获得。在一些实施方案中,幼稚CD4+ T淋巴细胞
是CD45RO-、CD45RA+、CD62L+、CD4+ T细胞。在一些实施方案中,中枢记忆CD4+细胞是CD62L+和CD45RO+。在一些实施方案中,效应CD4+细胞是CD62L-和CD45RO-。
[0607] 在一个例子中,为了通过阴性选择富集CD4+细胞,单克隆抗体混合剂通常包括针对CD14、CD20、CD11b、CD16、HLA-DR和CD8的抗体。在一些实施方案中,所述抗体或结合配偶体与固体支持物或基质(如磁珠或顺磁珠)结合,以允许细胞分离以用于阳性和/或阴性选
择。例如,在一些实施方案中,使用免疫磁性(或亲和磁性)分开技术来分开或分离细胞和细
胞群(综述于Methods in Molecular  Medicine,第58卷:Metastasis Research 
Protocols,第2卷:Cell Behavior In Vitro and In Vivo,第17-25页S.A.Brooks和
U.Schumacher编辑 Humana Press Inc.,新泽西州托托瓦)。
[0608] 在一些方面,可以依次进行两个或更多个选择步骤。例如,将待分离的细胞的样品或组合物经受CD8+细胞的选择,其中保留了阴性和阳性级分。可以进一步将CD8阴性级分经
受CD4+细胞的选择。在一些方面,将待分离的细胞的样品或组合物经受CD4+细胞的选择,其
中保留了阴性和阳性级分并且可以将CD4阴性级分经受对CD8+细胞的选择。用于细胞选择
的示例性方法描述于国际专利申请公开号WO 2015157384和/或WO 2015/164675中,将其通
过引用以其整体并入,可以将其全部或部分与本文描述的方法结合使用。
[0609] 在一些方面,将待分离的细胞的样品或组合物与小的可磁化或磁响应材料(如磁响应颗粒或微粒,如顺磁珠(例如像Dynalbeads或MACS珠))一起孵育。磁响应材料(例如,颗
粒)通常直接或间接地附着于结合配偶体(例如,抗体),所述结合配偶体与希望分离(例如,
希望阴性地或阳性地选择)的一个细胞、多个细胞或细胞群上存在的分子(例如,表面标记)
特异性地结合。
[0610] 在一些实施方案中,所述磁性颗粒或珠包含与特异性结合成员(如抗体或其他结合配偶体)结合的磁响应材料。有许多在磁分离方法中使用的熟知的磁响应材料。合适的磁
性颗粒包括在Molday,美国专利号4,452,773和在欧洲专利说明书EP 452342 B(将其通过
引用特此并入)中描述的那些。胶体大小的颗粒,如在Owen美国专利号4,795,698以及
Liberti等人,美国专利号5,200,084中描述的那些是其他例子。
[0611] 所述孵育通常在这样的条件下进行,由此抗体或结合配偶体或者与附着于磁性颗粒或珠的此类抗体或结合配偶体特异性地结合的分子(如二抗或其他试剂)与细胞表面分
子(如果存在于所述样品内的细胞上的话)特异性地结合。
[0612] 在一些方面,将所述样品置于磁场中,并且具有附着于其上的磁响应或可磁化颗粒的那些细胞将被吸引到磁体并与未标记的细胞分离。对于阳性选择,保留被磁铁吸引的
细胞;对于阴性选择,保留未被吸引的细胞(未标记的细胞)。在一些方面,在同一选择步骤
期间进行阳性和阴性选择的组合,其中保留阳性和阴性级分并进一步加工或经受另外的分
离步骤。
[0613] 在某些实施方案中,所述磁响应颗粒被包被在一抗或其他结合伴侣、二抗、凝集素、酶或链霉亲和素中。在某些实施方案中,所述磁性颗粒通过对一种或多种标记具特异性
的一抗的包被而附着于细胞。在某些实施方案中,用一抗或结合配偶体标记所述细胞而不
是珠,并且然后添加细胞类型特异性二抗或其他结合配偶体(例如链霉亲和素)包被的磁性
颗粒。在某些实施方案中,将链霉亲和素包被的磁性颗粒与生物素化的一抗或二抗结合使
用。
[0614] 在一些实施方案中,所述磁响应颗粒保持附着于所述细胞,所述细胞随后被孵育,培养和/或工程化;在一些方面,所述颗粒保持附着于所述细胞以用于给予患者。在一些实
施方案中,从所述细胞中去除可磁化或磁响应颗粒。用于从细胞中去除可磁化颗粒的方法
是已知的,并且包括例如使用竞争性非标记抗体、可磁化颗粒或与可切割接头缀合的抗体
等。在一些实施方案中,可磁化颗粒是可生物降解的。
[0615] 在一些实施方案中,基于亲和力的选择是经由磁激活细胞分选(MACS)(Miltenyi Biotec,加利福尼亚州奥本)。磁激活细胞分选(MACS)系统能够高纯度选择附着有磁化颗粒
的细胞。在某些实施方案中,MACS以这样的模式操作,其中在施加外部磁场之后依次洗脱非
靶标和靶标种类。也就是说,附着于磁化颗粒的细胞保持在适当的位置,而未附着的种类被
洗脱。然后,在完成第一次洗脱步骤之后,以某种方式释放被捕获在磁场中并被阻止洗脱的
种类,使得它们可以被洗脱和回收。在某些实施方案中,所述非靶细胞被标记并从异质细胞
群中耗尽。
[0616] 在某些实施方案中,使用这样的系统、装置或设备进行分离或分开,所述系统、装置或设备进行所述方法的分离、细胞制备、分开、加工、孵育、培养和/或制备步骤中的一种或多种。在一些方面,所述系统用于在封闭或无菌环境中进行这些步骤中的每一个,例如以
最小化错误、用户操作和/或污染。在一个例子中,所述系统是如国际专利申请公开号WO 
2009/072003或US 20110003380 A1中所述的系统。在一些方面,将单采术或白细胞分离术
产物或由其衍生的样品进行加工和/或使用如在国际专利申请公开号WO 2016/073602或US 
2016/0122782(将其内容通过引用以其整体并入)中所描述的系统、设备、装置、和/或方法
进行分离或选择。在一些实施方案中,根据在国际专利申请公开号WO 2015/164675(将其内
容通过引用以其整体并入)中描述的方法进行分离或分开。
[0617] 在一些实施方案中,所述系统或设备在集成或独立系统中和/或以自动或可编程方式进行分离、处理、工程化和配制步骤中的一个或多个(例如,全部)。在一些方面,所述系统或设备包括与所述系统或设备通信的计算机和/或计算机程序,其允许用户对处理、分
离、工程化和配制步骤的各个方面进行编程、控制、评估其结果和/或调整。
[0618] 在一些方面,使用CliniMACS系统(Miltenyi Biotic)进行分离和/或其他步骤,例如用于在封闭和无菌系统中在临床规模水平上的细胞的自动化分离。部件可包括集成的微
计算机、磁分离单元、蠕动和各种夹管。在一些方面,集成计算机控制仪器的所有部件
并指示系统以标准化顺序执行重复过程。在一些方面,所述磁分离单元包括可移动的永磁
体和用于选择柱的支架。所述蠕动泵控制整个管组的流速,并与夹管阀一起确保缓冲液通
过所述系统的受控流动和细胞的连续悬浮。
[0619] 在一些方面,所述CliniMACS系统使用抗体偶联的可磁化颗粒,其在无菌,无热原的溶液中提供。在一些实施方案中,在用磁性颗粒标记细胞后,洗涤所述细胞以去除过量的
颗粒。然后将细胞制备袋连接到管组,所述管组又连接到含有缓冲液的袋和细胞收集袋。所
述管组由预装配的无菌管(包括预柱和分离柱)组成,并且仅供一次性使用。在启动分离程
序后,所述系统自动将细胞样品施加到分离柱。标记的细胞保留在柱内,而未标记的细胞通
过一系列洗涤步骤去除。在一些实施方案中,用于与本文描述的方法一起使用的细胞群是
未标记的并且不保留在柱中。在一些实施方案中,用于与本文描述的方法一起使用的细胞
群被标记并保留在柱中。在一些实施方案中,用于与本文描述的方法一起使用的细胞群在
去除磁场后从柱中洗脱,并且收集在细胞收集袋内。
[0620] 在某些实施方案中,使用CliniMACS Prodigy系统(Miltenyi Biotec)进行分离和/或其他步骤。在一些方面,CliniMACS Prodigy系统配备有细胞加工联合体,其允许通过
离心自动化洗涤和分级分离细胞。CliniMACS Prodigy系统还可以包括机载相机和图像识
别软件,其通过辨别源细胞产物的宏观层来确定最佳的细胞分级分离终点。例如,可以将外
周血自动分离成红细胞、白细胞和血浆层。所述CliniMACS Prodigy系统还可以包括集成的
细胞培养室,其实现细胞培养方案,例如像细胞分化和扩增、抗原加载和长期细胞培养。输
入端口可以允许无菌移除和补充培养基,并且可以使用集成显微镜监测细胞。参见例如,
Klebanoff等人(2012)J Immunother.35(9):651-660,Terakura等人(2012)Blood.1:72-
82;和Wang等人(2012)J Immunother.35(9):689-701。
[0621] 在一些实施方案中,通过流式细胞术收集和富集(或耗尽)本文描述的细胞群,其中针对多种细胞表面标记染色的细胞在流体流中载携。在一些实施方案中,通过制备规模
(FACS)分类收集和富集(或耗尽)本文描述的细胞群。在某些实施方案中,通过使用微机电
系统(MEMS)芯片结合基于FACS的检测系统来收集和富集(或耗竭)本文描述的细胞群(参见
例如,WO 2010/033140,Cho等人(2010)Lab Chip 10,1567-1573;和Godin等人(2008)J 
Biophoton.1(5):355–376)。在两种情况下,细胞可以用多种标记来标记,允许以高纯度分
离明确定义的T细胞亚组。
[0622] 在一些实施方案中,用一种或多种可检测标记来标记抗体或结合配偶体,以促进分离供阳性和/或阴性选择。例如,分离可以基于与荧光标记的抗体的结合。在一些例子中,基于对一种或多种细胞表面标记具特异性的抗体或其他结合配偶体的结合来分离细胞在
流体流中载携,如通过荧光激活细胞分选(FACS),包括制备规模(FACS)和/或微机电系统
(MEMS)芯片,例如与流式细胞检测系统组合。此类方法允许基于多种标记同时进行阳性和
阴性选择。
[0623] 在一些实施方案中,制备方法包括在分离、孵育和/或工程化之前或之后冷冻(例如,冷冻保存)细胞的步骤。在一些实施方案中,所述冷冻和后续解冻步骤去除所述细胞群
中的粒细胞,并且在一定程度上去除单核细胞。在一些实施方案中,例如在洗涤步骤之后将
所述细胞悬浮在冷冻溶液中以去除血浆和血小板。在一些方面,可以使用多种已知的冷冻
溶液和参数中的任何一种。一个例子涉及使用含有20%DMSO和8%人血清白蛋白(HSA)的
PBS,或其他合适的细胞冷冻培养基。然后将其用培养基1:1稀释,使得DMSO和HSA的最终浓
度分别为10%和4%。在一些实施方案中,通过任何方法和/或使用本文描述的任何试剂、容
器、冷冻溶液和/或冷冻保护剂冷冻细胞。在一些实施方案中,然后将所述细胞以1°/分钟或
约1°/分钟的速率冷冻至-80℃并储存在液氮储罐的气相中。
[0624] 在一些实施方案中,所提供的方法包括培育、孵育、培养和/或基因工程步骤。例如,在一些实施方案中,提供了用于孵育耗尽的细胞群和培养起始组合物和/或将它们工程
化的方法。
[0625] 因此,在一些实施方案中,在培养起始组合物中孵育细胞群。孵育和/或工程化可以在培养容器中进行,所述培养容器是如单元、室、孔、柱、管、管组、阀、小瓶、培养皿、袋或其他用于培养或培育细胞的容器。
[0626] 在一些实施方案中,在基因工程化之前或与其相连地孵育和/或培养细胞。所述孵育步骤可以包括培养、培育、刺激、激活和/或繁殖。在一些实施方案中,在刺激条件或刺激剂的存在下孵育所述组合物或细胞。这些条件包括针对以下而设计的那些条件:用于诱导
群体中细胞的增殖、扩增、激活和/或存活的条件,用于模拟抗原暴露和/或用于引发细胞进
行基因工程化,如以引入重组抗原受体。
[0627] 条件可以包括以下中的一种或多种:特定培养基、温度、氧含量、二氧化碳含量、时间、药剂(例如,营养素、氨基酸、抗生素、离子和/或刺激因子(如细胞因子、趋化因子、抗原、结合配偶体、融合蛋白、重组可溶性受体和任何其他旨在激活细胞的药剂))。在一些方面,在一种或多种细胞因子的存在下将细胞孵育,并且在一些实施方案中可以使用细胞因子混
合物,例如,如在国际专利申请公开号WO 2015157384中所描述。在一些实施方案中,在转导之前、同时或之后将细胞与一种或多种细胞因子和/或细胞因子混合物一起孵育。
[0628] 在一些实施方案中,刺激条件或药剂包括一种或多种药剂(例如配体),其能够激活TCR复合物的细胞内信号传导结构域。在一些方面,所述药剂在T细胞中开启或启动TCR/
CD3细胞内信号传导级联。此类药剂可包括抗体如对于TCR具有特异性的抗体,例如抗CD3。
在一些实施方案中,刺激条件包括一种或多种药剂例如配体,其能够刺激共刺激受体,例如
抗CD28。在一些实施方案中,此类药剂和/或配体可以与固体支持物如珠和/或一种或多种
细胞因子结合。在本文中(例如在第V-D-1章节中)描述了示例性刺激试剂。任选地,扩增方
法还可以包括向培养基中添加抗CD3和/或抗CD28抗体(例如,以至少约0.5ng/mL的浓度)的
步骤。在一些实施方案中,所述刺激剂包括IL-2、IL-15和/或IL-7。在一些方面,IL-2浓度为至少约10单位/mL。在一些实施方案中,所述刺激剂包括IL-2、IL-7和/或IL-15,例如,浓度为、至少、或约10单位/mL、20单位/mL、50单位/mL、100单位/mL、250单位/mL、500单位/mL、
600单位/mL、700单位/mL、800单位/mL、900单位/mL、或1,000单位/mL。
[0629] 在一些方面,孵育是根据多种技术来进行,例如以下文献中所述的那些技术:授予Riddell等人的美国专利号6,040,1 77;Klebanoff等人(2012)J Immunother.35(9):651-
660;Terakura等人(2012)Blood.1:72-82;和/或Wang等人(2012)J Immunother.35(9):
689-701。在一些方面,使用如在国际专利申请公开号WO 2016/073602或US 2016/0122782
(将其内容通过引用以其整体并入)中所描述的系统、设备、装置和/或方法进行孵育。在一
些实施方案中,根据在国际专利申请公开号WO 2015/164675(将其内容通过引用以其整体
并入)中描述的方法进行孵育和/或培养。在一些实施方案中,在离心室中进行的孵育的至
少一部分包括与一种或多种试剂混合以诱导刺激和/或激活。在一些实施方案中,将细胞
(如所选择的细胞)与刺激条件或刺激剂在离心室中混合。在此类过程的一些方面,将一定
体积的细胞与一定量的一种或多种刺激条件或刺激剂混合,所述刺激条件或刺激剂远小于
在细胞培养板或其他系统中进行类似刺激时通常使用的刺激条件或刺激剂。
[0630] 在一些实施方案中,将刺激剂添加至室空腔中的细胞,所添加的量与例如在周期性振荡或旋转的管或袋中进行选择而不在离心室中混合时,实现相同数量的细胞或相同体
积的细胞的大致相同或类似的选择效率通常使用或将需要的刺激剂的量相比显著较小(例
如不大于所述量的5%、10%、20%、30%、40%、50%、60%、70%或80%)。在一些实施方案中,在向细胞和刺激剂中添加孵育缓冲液的情况下进行孵育,以实现例如10mL至200mL(例
如至少或约至少或约10mL、20mL、30mL、40mL、50mL、60mL、70mL、80mL、90mL、100mL、150mL或
200mL)试剂的孵育的目标体积。在一些实施方案中,在添加细胞之前预先混合孵育缓冲液
和刺激剂。在一些实施方案中,将孵育缓冲液和刺激剂单独添加至细胞中。在一些实施方案
中,在周期性温和混合条件下进行刺激孵育,这可能有助于促进能量上有利的相互作用,并
且从而允许使用较少的总体刺激剂,同时实现细胞的刺激和激活。
[0631] 在一些实施方案中,孵育通常在混合条件下进行,例如在旋转的存在下,通常以相对低的力或速度旋转,例如速度低于用于使细胞沉淀的速度,例如为或为约600rpm至
1700rpm(例如,为或为约或至少600rpm、1000rpm或1500rpm或1700rpm),例如在样品或室壁
或其他容器壁处的一定RCF下,所述RCF为或为约80g至100g(例如,为或为约或至少80g、
85g、90g、95g或100g)。在一些实施方案中,旋转是使用以这种低速旋转和之后的休息时间
段的重复间隔来进行,例如旋转和/或休息1、2、3、4、5、6、7、8、9或10秒,例如旋转大约1或2秒,然后休息大约5、6、7或8秒。
[0632] 在一些实施方案中,例如与刺激剂一起孵育的总持续时间在或在约1小时与96小时之间、1小时与72小时之间、1小时与48小时之间、4小时与36小时之间、8小时与30小时之
间或12小时与24小时之间,如至少或约至少6小时、12小时、18小时、24小时、36小时或72小时,每个都包含端值。在一些实施方案中,进一步孵育持续的时间在或约在1小时与48小时
之间、4小时与36小时之间、8小时与30小时之间或12小时与24小时之间,每个都包含端值。
[0633] 在一些实施方案中,处理步骤包括引入编码重组蛋白的核酸分子。此类重组蛋白是重组受体,如在第V章节中描述的任何重组受体。在细胞中引入编码重组蛋白(如重组受
体)的核酸分子可以使用许多已知载体中的任何一种进行。此类载体包括病毒和非病毒系
统,包括慢病毒和γ逆转录病毒系统,以及基于转座子的系统,如基于PiggyBac或Sleeping Beauty的基因转移系统。示例性方法包括用于转移编码受体的核酸的那些,包括通过病毒
(如逆转录病毒或慢病毒)、转导、转座子和电穿孔。
[0634] 在一些实施方案中,通过以下方式完成基因转移:首先刺激细胞,如通过将其与诱导反应(如增殖、存活和/或激活)的刺激物进行组合,例如如通过细胞因子或激活标记的表
达测量的,然后转导激活的细胞,并且在培养物中扩增至足以用于临床应用的数量。
[0635] 在一些实施方案中,使用重组感染性病毒粒子(如例如源自猿猴病毒40(SV40)、腺病毒、腺相关病毒(AAV)的载体和人免疫缺陷病毒(HIV))将重组核酸转移至细胞中。在一些
实施方案中,使用重组慢病毒载体或逆转录病毒载体(如γ-逆转录病毒载体)将重组核酸
转移到T细胞中。
[0636] 病毒转导(例如,慢病毒转导)的方法是已知的。示例性方法描述于例如Wang等人(2012)J.Immunother.35(9):689-701;Cooper等人(2003)Blood.101:1637–1644;
Verhoeyen等人(2009)Methods Mol Biol.506:97-114;以及Cavalieri等人(2003)
Blood.102(2):497-505中。
[0637] 在一些实施方案中,所述引入通过使组合物的一个或多个细胞与编码重组蛋白(例如,重组受体)的核酸分子接触来进行。在一些实施方案中,所述接触可以通过离心如旋
转接种(例如离心接种)来实现。所述方法包括如国际公开号WO 2016/073602中所述的任何
方法。示例性离心室包括由Biosafe SA生产和销售的那些,包括用于 和 2
系统的那些,包括A-200/F和A-200离心室以及用于此类系统的各种试剂盒。示例性室、系统
和处理仪器和机柜描述于例如以下文献中:美国专利号6,123,655、美国专利号6,733,433
和公开的美国专利申请公开号US 2008/0171951,以及公开的国际专利申请公开号WO 00/
38762,将其各自的内容通过引用以其整体并入本文。用于此类系统的示例性试剂盒包括但
不限于由BioSafe SA以产品名CS-430.1、CS-490.1、CS-600.1或CS-900.2销售的一次性试
剂盒。
[0638] 在一些实施方案中,将系统与其他仪器一起包括和/或置于与其他仪器相关联,所述其他仪器包括用于操作、自动化、控制和/或监测转导步骤以及在系统中执行的一个或多
个各种其他处理步骤(例如,可以使用或结合如本文或在国际公开号WO 2016/073602中描
述的离心室系统进行的一个或多个处理步骤)的方面的仪器。在一些实施方案中,这种仪器
容纳于机柜中。在一些实施方案中,所述仪器包括机柜,其包括外壳,所述外壳含有控制电
路、离心机、罩、电机、泵、传感器、显示器和用户界面。示例性装置描述于美国专利号6,123,
655、美国专利号6,733,433和US 2008/0171951中。
[0639] 在一些实施方案中,所述系统包含一系列容器,例如袋、管路、旋塞、夹子、连接器和离心室。在一些实施方案中,容器(如袋)包括一个或多个容器(如袋),其在同一容器或单独的容器(如同一袋或单独的袋)中含有待转导的细胞和病毒载体粒子。在一些实施方案
中,所述系统还包括一个或多个容器(例如袋),所述容器含有介质,例如稀释剂和/或洗涤
溶液,在所述方法期间将所述介质抽入室和/或其他部件中以稀释、重悬和/或洗涤组分和/
或组合物。所述容器可以连接在系统中的一个或多个位置,例如连接在对应于输入管线、稀
释剂管线、洗涤管线、废液管线和/或输出管线的位置。
[0640] 在一些实施方案中,所述室与离心机相关联,离心机能够实现所述室的旋转,例如围绕其旋转轴旋转。结合细胞的转导和/或在一个或多个其他处理步骤中,旋转可以发生在
孵育之前、期间和/或之后。因此,在一些实施方案中,各个处理步骤中的一个或多个在旋转下(例如在特定的力下)进行。所述室通常能够竖直或大致竖直地旋转,使得所述室在离心
期间竖直放置,并且侧壁和轴是竖直或大致竖直的,且一个或多个端壁是水平或大致水平
的。
[0641] 在一些实施方案中,可以使含有细胞、病毒粒子和试剂的组合物旋转,通常以相对较低的力或速度旋转,例如速度低于用于沉淀细胞的速度,例如为或为约600rpm至1700rpm
(例如,为或为约或至少600rpm、1000rpm或1500rpm或1700rpm)。在一些实施方案中,旋转是以为或为约100g至3200g(例如,为或为约或至少为或为约100g、200g、300g、400g、500g、
1000g、1500g、2000g、2500g、3000g或3200g)的力(例如,相对离心力)来进行,如例如在室或空腔的内壁或外壁处所测量。术语“相对离心力”或RCF通常被理解为在如与旋转轴相比在
空间的特定点处,相对于地球的重力,施加在物体或物质(例如细胞、样品或团粒和/或所旋
转的室或其他容器中的点)上的有效力。所述值可以使用熟知的公式来确定,所述公式考虑
到重力、旋转速度和旋转半径(与旋转轴的距离以及测量RCF的物体、物质或颗粒)。
[0642] 在一些实施方案中,在基因工程的至少一部分(例如转导)期间,和/或在基因工程之后,将细胞转移到容器如袋中,用于培养经基因工程化的细胞,例如用于培育或扩增细
胞,如上所述。在一些实施方案中,用于培育或扩增细胞的容器是生物反应器袋,如灌注袋。
[0643] 在一些实施方案中,所提供的方法包括用于培育工程化细胞(例如在促进增殖和/或扩增的条件下培育细胞)的一个或多个步骤。在一些实施方案中,在基因工程的步骤(例
如通过转导或转染将重组多肽引入细胞)之后在促进增殖和/或扩增的条件下培育工程化
细胞。在特定实施方案中,在刺激条件下孵育细胞并用重组多核苷酸(例如编码重组受体的
多核苷酸)转导或转染细胞之后培育细胞。在一些实施方案中,所述培育产生一种或多种富
集T细胞的培育组合物。
[0644] 在一些方面,培养基是支持细胞(如T细胞)的生长、培育、扩增或增殖的适应性培养基。在一些方面,培养基可以是含有盐、氨基酸、维生素、糖或其任何组合的混合物的液
体。在一些实施方案中,培养基进一步含有一种或多种刺激条件或刺激剂,例如在孵育期间
刺激细胞的培育、扩增或增殖。在一些实施方案中,刺激条件是或包括选自IL-2、IL-7或IL-
15的一种或多种细胞因子。在一些实施方案中,所述细胞因子是重组细胞因子。在一些实施
方案中,在培养或孵育期间在培养基中的一种或多种细胞因子的浓度独立地为或为约1IU/
mL至1500IU/mL,例如为或为约1IU/mL至100IU/mL、2IU/mL至50IU/mL、5IU/mL至10IU/mL、
10IU/mL至500IU/mL、50IU/mL至250IU/mL或100IU/mL至200IU/mL、50IU/mL至1500IU/mL、
100IU/mL至1000IU/mL或200IU/mL至600IU/mL。在一些实施方案中,所述一种或多种细胞因
子的浓度独立地为至少或至少约1IU/mL、5IU/mL、10IU/mL、50IU/mL、100IU/mL、200IU/mL、
500IU/mL、1000IU/mL或1500IU/mL。
[0645] 在一些方面,在转移工程化细胞和培养基之后,将细胞孵育至少一部分时间。在一些实施方案中,刺激条件通常包括适合于初级免疫细胞如人T淋巴细胞生长的温度,例如至
少约25摄氏度,通常为至少约30摄氏度,并且通常在或约在37摄氏度。在一些实施方案中,
在25至38摄氏度(如30至37摄氏度,例如为或约37摄氏度±2摄氏度)的温度下孵育细胞。在
一些实施方案中,将孵育进行一段时间直至培养(例如培育或扩增)产生所希望的或阈值密
度、数量或剂量的细胞。在一些实施方案中,孵育是大于或大于约或持续约或24小时、48小
时、72小时、96小时、5天、6天、7天、8天、9天或更长时间。
[0646] 在一些实施方案中,在维持细胞培养物中目标量的二氧化碳的条件下孵育细胞。在一些方面,这确保了细胞在生长期间的最佳培育、扩增和增殖。在一些方面,二氧化碳
(CO2)的量在所述气体的10%与0%(v/v)之间,如在所述气体的8%与2%(v/v)之间,例如,
为或约5%(v/v)CO2的量。
[0647] 在一些实施方案中,使用与生物反应器结合使用的容器(例如袋)孵育细胞。在一些情况下,生物反应器可以经受运动或摇摆,其在一些方面可以增加氧气传递。使生物反应
器运动可以包括但不限于沿着水平轴线旋转、沿着竖直轴线旋转、沿着生物反应器的倾斜
(tilted或inclined)的水平轴线的摇摆运动、或其任何组合。在一些实施方案中,在摇摆的
情况下进行孵育的至少一部分。可以调节摇摆速度和摇摆角度以实现所希望的搅动。在一
些实施方案中,摇摆角度为或为约20°、19°、18°、17°、16°、15°、14°、13°、12°、11°、10°、9°、
8°、7°、6°、5°、4°、3°、2°或1°。在某些实施方案中,摇摆角度在6-16°之间,包含端值。在其他实施方案中,摇摆角度在7-16°之间。在其他实施方案中,摇摆角度在8°-12°之间,包含端
值。在一些实施方案中,摇摆速率为1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、1 12、13、14、15、16、17、18、
19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40rpm。在一些实施方案中,摇摆速率在4rpm与12rpm之间,例如在4rpm与6rpm之间,包含端值。在摇摆运动
(例如以在5°与10°之间(包含端值)(如6°)的角度,以恒定摇摆速度(例如在5RPM与15RPM之
间(包含端值)(如6RMP或10RPM)的速度))的情况下进行至少一部分的细胞培养物扩增。CD4
+和CD8+细胞各自单独扩增,直至它们各自达到阈值量或细胞密度。
[0648] 在一些实施方案中,在静态条件下进行至少一部分的孵育。在一些实施方案中,在灌注(例如在培养期间灌注出用过的培养基并灌注入新鲜培养基)的情况下进行至少一部
分的孵育。在一些实施方案中,所述方法包括将新鲜培养基灌注到细胞培养物中(如通过补
料端口)的步骤。在一些实施方案中,在灌注期间添加的培养基含有所述一种或多种刺激
剂,例如,一种或多种重组细胞因子,如IL-2、IL-7和/或IL-15。在一些实施方案中,在灌注期间添加的培养基与在静态孵育期间使用的培养基相同。
[0649] 在一些实施方案中,在孵育之后,将容器(例如袋)重新连接到系统以进行用于制造、生成或产生细胞疗法的一个或多个其他处理步骤的系统上,例如重新连接到含有离心
室的系统上。在一些方面,将培养的细胞从袋转移到室的内部空腔中用于配制培养的细胞。
[0650] 在一些实施方案中,通过以下方法扩增T细胞:向培养起始组合物中加入饲养细胞(如非分裂外周血单核细胞(PBMC))(例如,使得所得细胞群含有至少约5、10、20或40种或更
多种PBMC饲养细胞,以使初始群体中的每种T淋巴细胞进行扩增);以及孵育培养物(例如,
持续足以扩增T细胞数量的时间)。在一些方面,非分裂饲养细胞可以包含γ照射的PBMC饲
养细胞。在一些实施方案中,用在约3000至3600拉德范围内的γ射线来照射所述PBMC以防
止细胞分裂。在一些方面,在添加所述T细胞群之前将所述饲养细胞添加到培养基中。
[0651] 在一些实施方案中,刺激条件包括适合于人T淋巴细胞生长的温度,例如至少约25摄氏度,通常至少约30摄氏度,并且通常为或为约37摄氏度。任选地,孵育可以进一步包括
添加非分裂的EBV变换的类淋巴母细胞(LCL)作为饲养细胞。可以用约6000至10,000拉德范
围内的γ射线照射LCL。在一些方面,所述LCL饲养细胞以任何合适的量(如LCL饲养细胞与
初始T淋巴细胞的比率为至少约10:1)提供。
[0652] 在实施方案中,通过用抗原刺激幼稚或抗原特异性T淋巴细胞获得抗原特异性T细胞如抗原特异性CD4+和/或CD8+ T细胞。例如,可通过从感染的受试者分离T细胞并用相同
的抗原在体外刺激细胞,针对巨细胞病毒抗原生成抗原特异性T细胞系或克隆。
[0653] 在一些实施方案中,在已经转导、转染、培育和/或扩增细胞之后,收集(例如收获)工程化细胞用于配制。在一些实施方案中,在开始和/或启动、或结束和/或完成处理步骤
(如分离、选择、孵育、刺激、激活、转导、转染、培育和/或扩增步骤)之后的一定量的时间内(例如,在2天、3天、4天、5天、6天、7天、8天、9天、10天、11天、12天、13天或14天或在其之内)收获细胞。在某些实施方案中,在培育(例如,在培育的1天、2天、3天、4天、5天、6天、7天、8天、9天或10天或在其之内)之后和/或在工程化细胞和/或包括工程化细胞的细胞组合物已
经扩展至阈值细胞密度、细胞数量,和/或扩增之后收集工程化细胞。在一些实施方案中,通过本文描述的任何方法(例如,如在第VI章节中所描述的)配制收获的细胞。
[0654] 1.刺激试剂
[0655] 在一些实施方案中,可以将细胞与能够激活和/或扩增T细胞的刺激试剂一起孵育和/或接触。在某些实施方案中,刺激试剂包含与能够激活和/或扩增细胞(例如T细胞)的一
种或多种药剂(例如生物分子)缀合或连接的颗粒(例如珠),其。在一些实施方案中,所述一
种或多种药剂与珠结合。在一些实施方案中,珠是生物相容的,即由适合于生物学用途的材
料构成。在一些实施方案中,珠对培养的细胞(例如培养的T细胞)是无毒的。在一些实施方
案中,珠可以是能够以允许药剂与细胞之间相互作用的方式附接药剂的任何颗粒。
[0656] 在一些实施方案中,刺激试剂包含能够激活和/或扩增细胞(例如T细胞)的一种或多种药剂,所述一种或多种药剂结合至或以其他方式附接于珠,例如结合至或附接于珠的
表面。在某些实施方案中,珠是非细胞颗粒。在特定实施方案中,珠可以包括胶体颗粒、微球体、纳米颗粒、磁珠等。在一些实施方案中,珠是琼脂糖珠。在某些实施方案中,珠是琼脂糖凝胶珠。
[0657] 在特定实施方案中,刺激试剂包含单分散的珠。在某些实施方案中,是单分散的珠包含彼此的直径标准偏差小于5%的尺寸分散体。
[0658] 在一些实施方案中,珠含有一种或多种药剂,例如与珠的表面偶联、缀合或连接(直接或间接)的药剂。在一些实施方案中,如本文考虑的药剂可以包括但不限于RNA、DNA、
蛋白质(例如,酶)、抗原、多克隆抗体、单克隆抗体、抗体片段、碳水化合物、脂质凝集素或对所希望的靶标具有亲和力的任何其他生物分子。在一些实施方案中,所希望的靶标是T细胞
受体和/或T细胞受体的组分。在某些实施方案中,所希望的靶标是CD3。在某些实施方案中,所希望的靶标是共刺激分子,例如CD28。所述一种或多种药剂可以通过在本领域中已知和
可用的各种方法直接或间接附接于珠上。所述附接可以是共价的、非共价的、静电的或疏水
的,并且可以通过各种附接手段(包括例如化学手段、机械手段或酶促手段)来实现。在一些
实施方案中,生物分子(例如,生物素化的抗CD3抗体)可以经由直接附接至珠的另一种生物
分子(例如,抗生物素抗体)间接附接至珠上。
[0659] 在一些实施方案中,与珠附接的一种或多种药剂是抗体。所述抗体可以包括多克隆抗体、单克隆抗体(包括具有免疫球蛋白Fc区的全长抗体)、具有多表位特异性的抗体组
合物、多特异性抗体(例如,双特异性抗体、双抗体和单链分子)、以及抗体片段(例如,Fab、F(ab')2和Fv)。在一些实施方案中,刺激试剂是抗体片段(包括抗原结合片段),例如Fab、
Fab′-SH、Fv、scFv、或(Fab′)2片段。应当理解,任何同种型的恒定区可以用于本文考虑的抗体,包括IgG、IgM、IgA、IgD和IgE恒定区,并且此类恒定区可以从任何人或动物物种(例如,鼠类物种)获得。在一些实施方案中,所述药剂是结合和/或识别T细胞受体的一种或多种组
分的抗体。在特定实施方案中,所述药剂是抗CD3抗体。在某些实施方案中,所述药剂是结合和/或识别共同受体的抗体。在一些实施方案中,刺激试剂包含抗CD28抗体。
[0660] 在一些实施方案中,珠具有大于约0.001μm、大于约0.01μm、大于约0.1μm、大于约1.0μm、大于约10μm、大于约50μm、大于约100μm或大于约1000μm和不超过约1500μm的直径。
在一些实施方案中,珠具有约1.0μm至约500μm、约1.0μm至约150μm、约1.0μm至约30μm、约
1.0μm至约10μm、约1.0μm至约5.0μm、约2.0μm至约5.0μm、或约3.0μm至约5.0μm的直径。在一些实施方案中,珠具有约3μm至约5μm的直径。在一些实施方案中,珠具有至少或至少约或约
0.001μm、0.01μm、0.1μm、0.5μm、1.0μm、1.5μm、2.0μm、2.5μm、3.0μm、3.5μm、4.0μm、4.5μm、
5.0μm、5.5μm、6.0μm、6.5μm、7.0μm、7.5μm、8.0μm、8.5μm、9.0μm、9.5μm、10μm、12μm、14μm、16μm、18μm或20μm的直径。在某些实施方案中,珠具有4.5μm或约4.5μm的直径。在某些实施方案中,珠具有2.8μm或约2.8μm的直径。
[0661] 在一些实施方案中,珠具有大于0.001g/cm3、大于0.01g/cm3、大于0.05g/cm3、大于0.1g/cm3、大于0.5g/cm3、大于0.6g/cm3、大于0.7g/cm3、大于0.8g/cm3、大于0.9g/cm3、大于
1g/cm3、大于1.1g/cm3、大于1.2g/cm3、大于1.3g/cm3、大于1.4g/cm3、大于1.5g/cm3、大于2g/cm3、大于3g/cm3、大于4g/cm3、或大于5g/cm3的密度。在一些实施方案中,珠具有以下的密度:在约0.001g/cm3与约100g/cm3、约0.01g/cm3与约50g/cm3、约0.1g/cm3与约10g/cm3、约
0.1g/cm3与约.5g/cm3、约0.5g/cm3与约1g/cm3、约0.5g/cm3与约1.5g/cm3、约1g/cm3与约
1.5g/cm3、约1g/cm3与约2g/cm3、或约1g/cm3与约5g/cm3之间,每个都包含端值。在一些实施
3 3 3 3 3 3
方案中,珠具有约0.5g/cm 、约0.5g/cm、约0.6g/cm、约0.7g/cm、约0.8g/cm、约0.9g/cm 、约1.0g/cm3、约1.1g/cm3、约1.2g/cm3、约1.3g/cm3、约1.4g/cm3、约1.5g/cm3、约1.6g/cm3、约
1.7g/cm3、约1.8g/cm3、约1.9g/cm3、或约2.0g/cm3的密度。在某些实施方案中,珠具有约
1.6g/cm3的密度。在特定实施方案中,珠或颗粒具有约1.5g/cm3的密度。在某些实施方案中,
3
颗粒具有约1.3g/cm的密度。
[0662] 在某些实施方案中,多个珠具有均匀的密度。在某些实施方案中,均匀的密度包含平均珠密度的小于10%、小于5%或小于1%的密度标准偏差。
[0663] 在一些实施方案中,珠具有以下的表面积:在约0.001m2/克颗粒(m2/g)与约1,2 2 2 2 2 2 2 2
000m/g、约.010m/g与约100m/g、约0.1m/g与约10m/g、约0.1m/g与约1m/g、约1m /g与约
10m2/g、约10m2/g与约100m2/g、约0.5m2/g与约20m2/g、约0.5m2/g与约5m2/g、或约1m2/g与约
4m2/g之间,每个都包含端值。在一些实施方案中,颗粒或珠具有从约1m2/g至约4m2/g的表面积。
[0664] 在一些实施方案中,珠含有在珠的表面处或附近的可以与药剂偶联、连接或缀合的至少一种材料。在一些实施方案中,珠是表面官能化的,即包含能够与结合分子(例如,多核苷酸或多肽)形成共价键的官能团。在特定实施方案中,珠包含表面暴露的羧基、氨基、羟基、甲苯磺酰基、环氧基和/或氯甲基基团。在特定实施方案中,珠包含表面暴露的琼脂糖
和/或琼脂糖凝胶。在某些实施方案中,珠表面包含附接的刺激试剂,其可以结合或附接结
合分子。在特定实施方案中,生物分子是多肽。在一些实施方案中,珠包含表面暴露的蛋白
质A、蛋白质G或生物素。
[0665] 在一些实施方案中,珠在磁场中起反应。在一些实施方案中,珠是磁珠。在一些实施方案中,磁珠是顺磁性的。在特定实施方案中,磁珠是超顺磁性的。在某些实施方案中,珠不显示任何磁性特性,除非它们暴露于磁场。
[0666] 在特定实施方案中,珠包含磁芯、顺磁芯或超顺磁芯。在一些实施方案中,磁芯含有金属。在一些实施方案中,金属可以是但不限于铁、镍、、钴、钆、锰、钽、锌、锆或其任何组合。在某些实施方案中,磁芯包含金属氧化物(例如,氧化铁)、铁氧体(例如,锰铁氧体、钴铁氧体、镍铁氧体等)、赤铁矿和金属合金(例如,CoTaZn)。在一些实施方案中,磁芯包含铁氧体、金属、金属合金、氧化铁或二氧化铬中的一种或多种。在一些实施方案中,磁芯包含元素铁或其化合物。在一些实施方案中,磁芯包含磁铁矿(Fe3O4)、磁赤铁矿(γFe2O3)或硫复
铁矿(Fe3S4)中的一种或多种。在一些实施方案中,内芯包含氧化铁(例如,Fe3O4)。
[0667] 在某些实施方案中,珠含有被表面官能化涂层(coat或coating)覆盖的磁性、顺磁性和/或超顺磁性芯。在一些实施方案中,涂层可以含有如下材料,所述材料可以包括但不
限于聚合物、多糖、二氧化脂肪酸、蛋白质、碳、琼脂糖、琼脂糖凝胶或其组合。在一些实施方案中,聚合物可以是聚乙二醇、聚(乳酸-共-乙醇酸)、聚戊二醛、聚氨酯、聚苯乙烯或聚乙烯醇。在某些实施方案中,外涂层(coat或coating)包含聚苯乙烯。在特定实施方案中,外涂层是表面功能化的。
[0668] 在一些实施方案中,刺激试剂包含珠,所述珠含有金属氧化物芯(例如,氧化铁芯)和涂层,其中所述金属氧化物芯包含至少一种多糖(例如,葡聚糖),并且其中所述涂层包含
至少一种多糖(例如,氨基葡聚糖)、至少一种聚合物(例如,聚氨酯)和二氧化硅。在一些实
施方案中,金属氧化物芯是胶体氧化铁芯。在某些实施方案中,所述一种或多种药剂包括抗
体或其抗原结合片段。在特定实施方案中,所述一种或多种药剂包括抗CD3抗体和抗CD28抗
体。在一些实施方案中,刺激试剂包含抗CD3抗体、抗CD28抗体和抗生物素抗体。在一些实施方案中,刺激试剂包含抗生物素抗体。在一些实施方案中,珠具有约3μm至约10μm的直径。在一些实施方案中,珠具有约3μm至约5μm的直径。在某些实施方案中,珠具有约3.5μm的直径。
[0669] 在一些实施方案中,刺激试剂包含附接于珠的一种或多种药剂,所述珠包含金属氧化物芯(例如,氧化铁内芯)和涂层(例如,保护涂层),其中所述涂层包含聚苯乙烯。在某
些实施方案中,珠是单分散的超顺磁珠,其包含超顺磁性铁芯(例如,包含磁铁矿(Fe3O4)和/或磁赤铁矿(γFe2O3)的芯)和聚苯乙烯涂层(coat或coating)。在一些实施方案中,珠是无
孔的。在一些实施方案中,珠含有一种或多种药剂附接的官能化表面。在某些实施方案中,
所述一种或多种药剂与珠在表面上共价结合。在一些实施方案中,所述一种或多种药剂包
括抗体或其抗原结合片段。在一些实施方案中,所述一种或多种药剂包括抗CD3抗体和抗
CD28抗体。在某些实施方案中,珠具有约1.5g/cm3的密度和约1m2/g至约4m2/g的表面积。在
特定实施方案中;珠是单分散的超顺磁珠,其具有约4.5μm的直径和约1.5g/cm3的密度。在
一些实施方案中,珠是具有约2.8μm的平均直径和约1.3g/cm3的密度的单分散的超顺磁珠。
[0670] E.用于基因工程的载体和方法
[0671] 编码重组受体的多核苷酸(核酸分子)可以包括在用于将细胞基因工程化以表达此类受体的载体中。在一些实施方案中,所述载体或构建体含有一个或多个启动子,所述一
个或多个启动子与编码所述多肽或受体的核苷酸可操作地连接以驱动所述核苷酸的表达。
在一些实施方案中,所述启动子可操作地连接至一个或多于一个核酸分子。
[0672] 在一些情况下,所述载体是病毒载体,如逆转录病毒载体,例如慢病毒载体或γ逆转录病毒载体。在一些实施方案中,例如通过逆转录病毒转导、转染或转化将编码重组受体
的多核苷酸(如载体)引入含有培养细胞的组合物中。
[0673] 用于引入基因工程化组分例如重组受体(例如CAR或TCR)的各种方法是熟知的,并且可以与所提供的方法和组合物一起使用。示例性方法包括用于转移编码多肽或受体的核
酸的那些方法,包括经由病毒载体,例如逆转录病毒或慢病毒、非病毒载体或转座子(例如
睡美人(Sleeping Beauty)转座子系统)。基因转移的方法可以包括转导、电穿孔或导致基
因转移到细胞中的其他方法。
[0674] 在一些实施方案中,通过以下方式完成基因转移:首先刺激细胞,如通过将其与诱导反应(如增殖、存活和/或激活)的刺激物进行组合,例如如通过细胞因子或激活标记的表
达测量的,然后转导激活的细胞,并且在培养物中扩增至足以用于临床应用的数量。
[0675] 在一些背景下,可能需要防止刺激因子(例如,淋巴因子或细胞因子)的过表达可能潜在地导致受试者中不希望的结果或较低的疗效(例如受试者中与毒性相关的因素)的
可能性。因此,在一些情境下,经工程化的细胞包括导致所述细胞在体内(如在过继免疫疗
法中给予时)对阴性选择易感的基因区段。例如,在一些方面,将细胞工程化,使得它们可以由于给予它们的患者的体内状况的改变而被消除。阴性选择性表型可以由赋予对所给予的
药剂(例如,化合物)的敏感性的基因的插入而产生。阴性选择性基因包括单纯疱疹病毒I型
胸苷激酶(HSV-I TK)基因(Wigler等人,Cell II:223,1977),其赋予更昔洛韦敏感性;细胞
次黄嘌呤磷酸核糖基转移酶(HPRT)基因;细胞腺嘌呤磷酸核糖基转移酶(APRT)基因;细菌
胞嘧啶脱氨酶(Mullen等人,Proc.Natl.Acad.Sci.USA.89:33(1992))。
[0676] 在一些实施方案中,使用重组感染性病毒粒子(如例如源自猿猴病毒40(SV40)、腺病毒、腺相关病毒(AAV)的载体)将重组核酸转移至细胞中。在一些实施方案中,使用重组慢
病毒载体或逆转录病毒载体(如γ-逆转录病毒载体)将重组核酸转移到T细胞中(参见例
如,Koste等人(2014)Gene Therapy 2014年4月3日.doi:10.1038/gt.2014.25;Carlens等
人(2000)Exp Hematol 28(10):1137-46;Alonso-Camino等人(2013)Mol Ther Nucl Acids 
2,e93;Park等人,Trends Biotechnol.2011年11月29(11):550–557。
[0677] 在一些实施方案中,将编码重组受体和/或另外的多肽的多核苷酸包含在载体中或可以将其克隆到一种或多种载体中。在一些实施方案中,所述一种或多种载体可以用于
转化或转染宿主细胞,例如用于工程化的细胞。示例性载体包括设计用于引入、增殖和扩增
或用于表达或用于两者的载体,如质粒和病毒载体。在一些方面,载体是表达载体,例如,重组表达载体。在一些实施方案中,可以使用标准重组DNA技术来制备所述重组表达载体。
[0678] 在一些实施方案中,载体可以是以下系列的载体:pUC系列(Fermentas Life Sciences)、pBluescript系列(Stratagene,加利福尼亚州拉霍亚)、pET系列(Novagen,威斯康星州麦迪逊)、pGEX系列(Pharmacia Biotech,瑞典乌普萨拉)或pEX系列(Clontech,加利
福尼亚州帕罗奥图)。在一些情况下,也可以使用噬菌体载体,如λG10、λGT11、λZapII
(Stratagene)、λEMBL4和λNM1149。在一些实施方案中,可以使用植物表达载体,并且包括pBI01、pBI101.2、pBI101.3、pBI121和pBIN19(Clontech)。在一些实施方案中,动物表达载体包括pEUK-Cl、pMAM和pMAMneo(Clontech)。
[0679] 在一些实施方案中,载体是病毒载体,如逆转录病毒载体。在一些实施方案中,将编码重组受体和/或一种或多种另外的多肽的多核苷酸经由逆转录病毒或慢病毒载体或经
由转座子引入细胞中(参见例如,Baum等人(2006)Molecular Therapy:The Journal of 
the American Society of Gene Therapy.13:1050-1063;Frecha等人(2010)Molecular 
Therapy 18:1748-1757;以及Hackett等人(2010)Molecular Therapy 18:674-683)。
[0680] 在一些实施方案中,可以将转录单元工程化为含有IRES的双顺反子单元,其允许通过来自单一启动子的信息共表达基因产物(例如编码重组受体和另外的多肽的基因产
物)。可替代地,在一些情况下,单一启动子可引导RNA的表达,所述RNA在单一开放阅读框
(ORF)中含有两个或三个基因(例如编码标记和编码重组受体),所述基因通过编码自切割
肽(例如,2A序列)的序列或蛋白酶识别位点(例如,弗林蛋白酶(furin))彼此分开。因此,所述ORF编码单个多肽,其在翻译期间(在2A的情况下)或翻译后被加工成单独的蛋白质。在一
些情况下,所述肽(如T2A)可以导致核糖体跳过(核糖体跳跃)2A元件C末端处的肽键的合
成,这导致2A序列末端与下游的下一个肽之间的分离(参见例如,de Felipe.Genetic 
Vaccines and Ther.2:13(2004)和deFelipe等人Traffic 5:616-626(2004))。各种2A元件
是已知的。可以用于本文所公开的方法和系统中的2A序列的例子包括但不限于来自以下病
毒的2A序列:疫病毒(F2A,例如,SEQ ID NO:21)、马鼻炎A病毒(E2A,例如,SEQ ID NO:
20)、明脉扁刺蛾β四体病毒(T2A,例如,SEQ ID NO:6或17)和猪捷申病毒-1(P2A,例如,SEQ ID NO:18或19),如美国专利公开号20070116690中所述。
[0681] 在一些实施方案中,重组受体(例如CAR)是在启动子的控制下。在一些实施方案中,载体包括启动子。在一些实施方案中,启动子是或包含组成型启动子。示例性组成型启
动子包括例如猿病毒40早期启动子(SV40)、巨细胞病毒立即早期启动子(CMV)、人泛素C启
动子(UBC)、人延伸因子1α启动子(EF1α)、小鼠磷酸甘油酸激酶1启动子(PGK)、和与CMV早期增强子偶联的鸡β-肌动蛋白启动子(CAGG)。在一些实施方案中,组成型启动子是合成的或
修饰的启动子。在一些实施方案中,启动子是或包含MND启动子(含有具有骨髓增生性肉瘤
病毒增强子的经修饰的MoMuLV LTR的U3区的一种合成启动子)(参见Challita等人(1995)
J.Virol.69(2):748-755)。在一些实施方案中,启动子是组织特异性启动子。在另一个实施
方案中,启动子是病毒启动子。在另一个实施方案中,启动子是非病毒启动子。在一些实施
方案中,示例性启动子可以包括但不限于人延伸因子1α(EF1α)启动子或其修饰形式或MND
启动子。
[0682] 在一些实施方案中,启动子是受调节的启动子(例如,诱导型启动子)。在一些实施方案中,启动子是诱导型启动子或阻抑型启动子。在一些实施方案中,启动子包含Lac操纵
子序列、四环素操纵子序列、半乳糖操纵子序列或多西环素操纵子序列,或者是其类似物或
能够由Lac阻遏因子或四环素阻遏因子或其类似物结合或识别。在一些实施方案中,多核苷
酸不包括调节元件,例如,启动子。
[0683] 在一些情况下,编码重组受体的核酸序列含有编码信号肽的信号序列。在一些方面,信号序列可以编码源自天然多肽的信号肽。在其他方面,信号序列可以编码异源或非天
然信号肽,例如SEQ ID NO:25所示并且由SEQ ID NO:24所示核苷酸序列编码的GMCSFRα链
的示例性信号肽。在一些情况下,编码重组受体(例如嵌合抗原受体(CAR))的核酸序列含有
编码信号肽的信号序列。非限制性示例性信号肽包括例如SEQ ID NO:25所示并且由SEQ ID 
NO:24所示核苷酸序列编码的GMCSFRα链信号肽,或SEQ ID NO:26所示的CD8α信号肽。
[0684] 在一些实施方案中,多核苷酸含有编码一种或多种另外的多肽(例如一种或多种标记和/或一种或多种效应分子)的核酸序列。在一些实施方案中,所述一种或多种标记包
括转导标记、替代标记和/或选择标记。例如编码一种或多种另外的多肽的引入的另外的核
酸序列包括可以例如通过促进存活力和/或转移细胞的功能改善疗法的功效的核酸序列;
提供用于选择和/或评价细胞的遗传标记如以便在体内评估存活或定位的核酸序列;例如
通过使细胞对体内阴性选择易感来提高安全性的核酸序列,如以下文献中所述:Lupton 
S.D.等人,Mol.and Cell Biol.,11:6(1991);和Riddell等人,Human Gene Therapy 3:
319-338(1992);还参见WO 1992008796和WO 1994028143(描述了使用从融合显性的阳性选
择标记与阴性选择标记来源的双功能选择融合基因)和美国专利号6,040,177。
[0685] 在一些实施方案中,单一启动子可以指导RNA的表达,所述RNA在单个开放阅读框(ORF)中含有两个或三个基因(例如,编码参与调节代谢途径的分子和编码重组受体),所述
基因由编码自切割肽(例如2A序列)或蛋白酶识别位点(例如弗林蛋白酶(furin))的序列彼
此分开。因此,所述ORF编码单个多肽,其在翻译期间(在2A的情况下)或翻译后被加工成单
独的蛋白质。在一些情况下,所述肽(如T2A)可以导致核糖体跳过(核糖体跳跃)2A元件C末
端处的肽键的合成,这导致2A序列末端与下游的下一个肽之间的分离(参见例如,de 
Felipe.Genetic Vaccines and Ther.2:13(2004)和deFelipe等人Traffic 5:616-626
(2004))。许多2A元件是已知的。可以用于本文公开的方法和核酸中的2A序列的例子包括但
不限于来自口蹄疫病毒的2A序列(F2A,例如SEQ ID NO:22)、来自马鼻炎A病毒的2A序列
(E2A,例如SEQ ID NO:21)、来自明脉扁刺蛾β四体病毒(Thosea asigna virus)的2A序列
(T2A,例如SEQ ID NO:6或18)和来自猪捷申病毒(porcine teschovirus)-1的2A序列(P2A,
例如SEQ ID NO:19或20),如美国专利公开号20070116690中所述。
[0686] 在一些实施方案中,载体含有编码一种或多种标记的核酸序列。在一些实施方案中,一种或多种标记是转导标记、替代标记和/或选择标记。
[0687] 在一些实施方案中,标记是转导标记或替代标记。转导标记或替代标记可用于检测已经引入多核苷酸(例如编码重组受体的多核苷酸)的细胞。在一些实施方案中,转导标
记可以指示或确认对细胞的修饰。在一些实施方案中,替代标记是经制备在细胞表面上与
重组受体(例如,CAR)共表达的蛋白质。在特定实施方案中,这种替代标记是已经修饰以具
有极少或无活性的表面蛋白。在一些实施方案中,替代标记是由编码重组受体的相同多核
苷酸编码。在一些实施方案中,编码重组受体的核酸序列与编码标记的核酸序列可操作地
连接,任选地通过内部核糖体进入位点(IRES)或编码自切割肽或导致核糖体跳跃的肽(例
如2A序列,例如T2A、P2A、E2A或F2A)的核酸分开。在一些情况下,外在标记基因可以结合工程化细胞用于允许检测或选择细胞,并且在一些情况下还可以用于促进细胞自杀。
[0688] 示例性替代标记可以包括截短形式的细胞表面多肽,如是非功能性的并且不转导或不能转导信号或通常被细胞表面多肽的全长形式转导的信号、和/或不内化或不能内化
的截短形式。示例性截短的细胞表面多肽包括截短形式的生长因子或其他受体,如截短的
人表皮生长因子受体2(tHER2)、截短的表皮生长因子受体(tEGFR,在SEQ ID NO:7或23中列
出的示例性tEGFR序列)或前列腺特异性膜抗原(PSMA)或其修饰形式。tEGFR可以含有被抗
体西妥昔单抗 或其他治疗性抗EGFR抗体或结合分子识别的表位,其可以被用
于鉴定或选择已经用tEGFR构建体和编码的外源蛋白质工程化的细胞,和/或用于消除或分
离表达所编码的外源蛋白质的细胞。参见美国专利号8,802,374以及Liu等人,Nature 
Biotech.2016年四月;34(4):430-434)。在一些方面,标记(例如替代标记)包括CD34的全部
或部分(例如,截短形式)、NGFR、CD19或截短的CD19(例如,截短的非人CD19)或表皮生长因
子受体(例如,tEGFR)。
[0689] 在一些实施方案中,标记是或包含荧光蛋白,例如绿色荧光蛋白(GFP)、增强型绿色荧光蛋白(EGFP)(例如超折叠GFP(sfGFP))、红色荧光蛋白(RFP)(例如tdTomato、
mCherry、mStrawberry、AsRed2、DsRed或DsRed2)、青色荧光蛋白(CFP)、蓝绿色荧光蛋白
(BFP)、增强型蓝色荧光蛋白(EBFP)和黄色荧光蛋白(YFP)及其变体,包括物种变体、单体
体和密码子优化的和/或增强的荧光蛋白变体。在一些实施方案中,标记是或包含酶(如萤
光素酶)、来自大肠杆菌的lacZ基因、碱性磷酸酶、分泌的胚胎碱性磷酸酶(SEAP)、氯霉素乙酰转移酶(CAT)。示例性发光报告基因包括萤光素酶(luc)、β-半乳糖苷酶、氯霉素乙酰转移酶(CAT)、β-葡萄糖醛酸酶(GUS)或其变体。
[0690] 在一些实施方案中,标记是选择标记。在一些实施方案中,选择标记是或包含赋予对外源药剂或药物的抗性的多肽。在一些实施方案中,选择标记是抗生素抗性基因。在一些
实施方案中,选择标记是向哺乳动物细胞赋予抗生素抗性的抗生素抗性基因。在一些实施
方案中,选择标记是或包含嘌呤霉素抗性基因、潮霉素抗性基因、杀稻瘟菌素抗性基因、新
霉素抗性基因、遗传霉素抗性基因或博莱霉素抗性基因或其修饰形式。
[0691] 在一些实施方案中,所述逆转录病毒载体具有长末端重复序列(LTR),例如源自莫洛尼鼠白血病病毒(MoMLV)、骨髓增生性肉瘤病毒(MPSV)、鼠胚胎干细胞病毒(MESV)、鼠干
细胞病毒(MSCV)、脾病灶形成病毒(SFFV)或腺相关病毒(AAV)的逆转录病毒载体。大多数逆
转录病毒载体源自鼠逆转录病毒。在一些实施方案中,所述逆转录病毒包括源自任何禽类
或哺乳动物细胞来源的那些。所述逆转录病毒通常是双嗜性的,这意味着它们能够感染包
括人在内的若干种物种的宿主细胞。在一个实施方案中,待表达的基因替代逆转录病毒
gag、pol和/或env序列。已经描述了许多说明性逆转录病毒系统(例如,美国专利号5,219,
740;6,207,453;5,219,740;Miller和Rosman(1989)BioTechniques 7:980-990;Miller,
A.D.(1990)Human Gene Therapy 1:5-14;Scarpa等人(1991)Virology 180:849-852;
Burns等人(1993)Proc.Natl.Acad.Sci.USA 90:8033-8037;以及Boris-Lawrie和Temin
(1993)Cur.Opin.Genet.Develop.3:102-109。
[0692] 慢病毒转导的方法是已知的。示例性方法描述于例如Wang等人(2012)J.Immunother.35(9):689-701;Cooper等人(2003)Blood.101:1637-1644;Verhoeyen等人
(2009)Methods Mol Biol.506:97-114;以及Cavalieri等人(2003)Blood.102(2):497-505
中。在一些实施方案中,例如通过逆转录病毒转导、转染或转化,将编码重组受体和/或一种或多种另外的多肽的多核苷酸引入含有培养细胞的组合物中。
[0693] 在一些实施方案中,经由电穿孔将重组核酸转移到T细胞中(参见例如,Chicaybam等人,(2013)PLoS ONE 8(3):e60298和Van Tedeloo等人(2000)Gene Therapy 7(16):
1431-1437)。在一些实施方案中,经由转座将重组核酸转移到T细胞中(参见例如,Manuri等
人(2010)Hum Gene Ther 21(4):427-437;Sharma等人(2013)Molec Ther Nucl Acids 2,
e74;以及Huang等人(2009)Methods Mol Biol 506:115-126)。在免疫细胞中引入和表达遗
传物质的其他方法包括磷酸钙转染(例如,如在Current Protocols in Molecular 
Biology,John Wiley&Sons,New York.N.Y.中所述)、原生质体融合、阳离子脂质体介导的
转染;钨粒子促进的微粒轰击(Johnston,Nature,346:776-777(1990));以及磷酸锶DNA共
沉淀(Brash等人,Mol.Cell Biol.,7:2031-2034(1987))。在一些方面,根据制造商的说明
书在离心室中进行洗涤步骤,所述离心室是例如由Biosafe SA生产和销售的那些,包括与
和 2系统一起使用的那些,包括A-200/F和A-200离心室。
[0694] 用于转移编码重组产物的核酸的其他途径和载体是描述于例如以下文献中的那些:国际专利申请公开号WO 2014055668和美国专利号7,446,190。
[0695] 在一些实施方案中,细胞(例如,T细胞)可以在扩增期间或之后例如用T细胞受体(TCR)或嵌合抗原受体(CAR)进行转染。例如,这种用于引入所需多肽或受体的基因的转染
可以用任何合适的逆转录病毒载体进行。然后可以使遗传修饰的细胞群摆脱初始刺激物
(例如CD3/CD28刺激物),并且随后用第二种类型的刺激物(例如经由从头引入的受体)进行
刺激。所述第二种类型的刺激物可以包括肽/MHC分子形式的抗原刺激物、遗传引入的受体
的同源(交联)配体(例如CAR的天然配体)或在新受体的框架内直接结合(例如通过识别受
体内的恒定区)的任何配体(如抗体)。参见例如,Cheadle等人,“Chimeric antigen 
receptors for T-cell based therapy”Methods Mol Biol.2012;907:645-66;或Barrett
等人,Chimeric Antigen Receptor Therapy for Cancer Annual Review of Medicine第
65卷:333-347(2014)。
[0696] 另外的核酸(例如,用于引入的基因)包括用于改善治疗功效的那些,如通过促进转移细胞的活力和/或功能;用于提供选择和/或评价细胞的遗传标记的基因,如以评估体
内存活或定位;改善安全性的基因,例如通过使细胞在体内对阴性选择易感,如Lupton 
S.D.等人,Mol.and Cell Biol.,11:6(1991)和Riddell等人,Human Gene Therapy 3:319-
338(1992)所述;还参见Lupton等人的PCT/US91/08442和PCT/US94/05601的出版物,其描述
了使用由将显性阳性选择性标记与阴性选择性标记融合而得到的双功能选择性融合基因。
参见例如,Riddell等人,美国专利号6,040,177,第14-17栏。
[0697] 在一些实施方案中,在基因工程化之前或与其相连地孵育和/或培养细胞。所述孵育步骤可以包括培养、培育、刺激、激活和/或繁殖。孵育和/或工程化可以在培养容器中进
行,所述培养容器是如单元、室、孔、柱、管、管组、阀、小瓶、培养皿、袋或其他用于培养或培育细胞的容器。在一些实施方案中,在刺激条件或刺激剂的存在下孵育所述组合物或细胞。
这些条件包括针对以下而设计的那些条件:用于诱导群体中细胞的增殖、扩增、激活和/或
存活的条件,用于模拟抗原暴露和/或用于引发细胞进行基因工程化,如以引入重组抗原受
体。在一些实施方案中,可以使用摇摆生物反应器(如WAVETM生物反应器(GE Healthcare)或
RM(Sartorius))进行一个或多个孵育步骤。在一些实施方案中,可以使用静态
生物反应器或孵育室进行一个或多个孵育步骤。在特定实施方案中,如果使用摇摆生物反
应器进行一个或多个孵育步骤,可以将抗剪切剂(例如泊洛沙姆)添加至组合物中。
[0698] 在一些情况下,可以使用不需要激活细胞(例如,T细胞)的载体。在一些此类情形中,可以在激活之前选择和/或转导细胞。因此,可以在培养细胞之前或之后将细胞工程化,并且在一些情况下在培养的同一时间或至少一部分期间将细胞工程化。
[0699] 条件可以包括以下中的一种或多种:特定培养基、温度、氧含量、二氧化碳含量、时间、药剂(例如,营养素、氨基酸、抗生素、离子和/或刺激因子(如细胞因子、趋化因子、抗原、结合配偶体、融合蛋白、重组可溶性受体和任何其他旨在激活细胞的药剂))。在一些方面,在一种或多种细胞因子的存在下将细胞孵育,并且在一些实施方案中可以使用细胞因子混
合物,例如,如在国际专利申请公开号WO 2015157384中所描述。在一些实施方案中,在转导之前、同时或之后将细胞与一种或多种细胞因子和/或细胞因子混合物一起孵育。
[0700] 在一些实施方案中,刺激条件或药剂包括一种或多种药剂(例如配体),其能够激活TCR复合物的细胞内信号传导结构域。在一些方面,所述药剂在T细胞中开启或启动TCR/
CD3细胞内信号传导级联。此类药剂可包括抗体如对于TCR组分具有特异性的抗体,例如抗
CD3。在一些实施方案中,刺激条件包括一种或多种药剂例如配体,其能够刺激共刺激受体,例如抗CD28。在一些实施方案中,此类药剂和/或配体可以与固体支持物如珠和/或一种或
多种细胞因子结合。任选地,扩增方法还可以包括向培养基中添加抗CD3和/或抗CD28抗体
(例如,以至少约0.5ng/mL的浓度)的步骤。在一些实施方案中,刺激剂包括IL-2和/或IL-
15,例如,浓度为至少约10单位/mL的IL-2。在某些实施方案中,刺激条件包括与本文描述的任何刺激试剂(如在第V-D-1章节中所描述的那些)一起孵育。
[0701] 在一些方面,孵育是根据多种技术来进行,例如以下文献中所述的那些技术:授予Riddell等人的美国专利号6,040,1 77;Klebanoff等人(2012)J Immunother.35(9):651-
660;Terakura等人(2012)Blood.1:72-82;和/或Wang等人(2012)J Immunother.35(9):
689-701。在一些方面,使用如在国际专利申请公开号WO 2016/073602或US 2016/0122782
(将其内容通过引用以其整体并入)中所描述的系统、设备、装置和/或方法进行转导。在一
些实施方案中,根据在国际专利申请公开号WO 2015/164675(将其内容通过引用以其整体
并入)中描述的方法进行转导。
[0702] 在一些实施方案中,通过以下方法扩增T细胞:向培养起始组合物中加入饲养细胞(如非分裂外周血单核细胞(PBMC))(例如,使得所得细胞群含有至少约5、10、20或40种或更
多种PBMC饲养细胞,以使初始群体中的每种T淋巴细胞进行扩增);以及孵育培养物(例如,
持续足以扩增T细胞数量的时间)。在一些方面,非分裂饲养细胞可以包含γ照射的PBMC饲
养细胞。在一些实施方案中,用在约3000至3600拉德范围内的γ射线来照射所述PBMC以防
止细胞分裂。在一些方面,在添加所述T细胞群之前将所述饲养细胞添加到培养基中。
[0703] 在一些实施方案中,刺激条件包括适合于人T淋巴细胞生长的温度,例如至少约25摄氏度,通常至少约30摄氏度,并且通常为或为约37摄氏度。任选地,孵育可以进一步包括
添加非分裂的EBV变换的类淋巴母细胞(LCL)作为饲养细胞。可以用约6000至10,000拉德范
围内的γ射线照射LCL。在一些方面,所述LCL饲养细胞以任何合适的量(如LCL饲养细胞与
初始T淋巴细胞的比率为至少约10:1)提供。
[0704] 在一些实施方案中,制备方法包括在分离、孵育和/或工程化之前或之后冷冻(例如,冷冻保存)细胞的步骤。在一些实施方案中,所述冷冻和后续解冻步骤去除所述细胞群
中的粒细胞,并且在一定程度上去除单核细胞。在一些实施方案中,例如在洗涤步骤之后将
所述细胞悬浮在冷冻溶液中以去除血浆和血小板。在一些方面,可以使用多种已知的冷冻
溶液和参数中的任何一种。一个例子涉及使用含有20%DMSO和8%人血清白蛋白(HSA)的
PBS,或其他合适的细胞冷冻培养基。然后将其用培养基1:1稀释,使得DMSO和HSA的最终浓
度分别为10%和4%。然后通常将细胞以1°/分钟的速率冷冻至-80℃并储存在液氮储罐的
气相中。在一些实施方案中,将组合物密封在适合于冷冻保存的袋(例如, 冷
冻袋,Miltenyi Biotec)中。在一些实施方案中,将组合物密封在适合于冷冻保存的小瓶
(例如, 小瓶,Cook Regentec)中。在一些实施方案中,用于冷冻的步骤和/或试
剂是或包括本文描述的任何用于冷冻的步骤和/或试剂。
[0705] 在特定实施方案中,例如在洗涤步骤后冷冻细胞,例如以去除血浆和血小板。在一些实施方案中,在与制造和/或生成表达重组受体(例如,CAR)的细胞(例如,CD4+和/或CD8+ T细胞)相关的任何步骤之前、之后和/或期间冷冻细胞。在某些实施方案中,此类步骤可以
包括与生成工程化细胞相关的任何步骤,包括但不限于,选择和/或分离细胞亚组(例如,
CD4+和/或CD8+ T细胞)、刺激和/或扩增细胞(例如T细胞或其亚组)、或转染或转导细胞。在
一些实施方案中,细胞是在选择和/或分离细胞、刺激和/或扩增细胞、或转染或转导细胞之
前从受试者收集的单采术样品的细胞。在特定实施方案中,在完成工程化过程之后,例如在
涉及分离、选择、刺激、激活、转导、转染和/或扩增的一个或多个步骤的过程之后冷冻细胞。
[0706] 在一些实施方案中,将细胞悬浮在冷冻溶液(例如,冷冻保护剂和/或含有冷冻保护剂的溶液)中。在一些方面,可以使用各种已知的冷冻溶液和参数中的任何一种,包括含
有冷冻保存或玻璃化介质的冷冻溶液或含有冷冻保护剂的溶液。合适的冷冻保护剂包括但
不限于二甲亚砜(DMSO)、甘油、乙二醇、丙烯乙二醇、乙烯乙二醇、丙二醇、聚乙二醇(PEG)、
1,2-丙二醇(PROH)或其混合物。在一些例子中,冷冻保存溶液可以含有一种或多种非细胞
渗透性冷冻保存剂,包括但不限于,聚乙烯吡咯烷酮、羟乙基淀粉、多糖、单糖、藻酸盐、海藻糖、子糖、葡聚糖、人血清白蛋白、聚蔗糖、脂蛋白、聚乙烯吡咯烷酮、羟乙基淀粉、自体血浆或其混合物。在一些实施方案中,将细胞悬浮于冷冻溶液中,其中冷冻保护剂的终浓度为
按体积计在约1%与约20%之间、在约3%与约9%之间、或在约6%与约9%之间,每个都包
含端值。在某些实施方案中,冷冻溶液中冷冻保护剂的最终浓度为按体积计约3%、约4%、
约5%、约5.5%、约6%、约6.5%、约7%、约7.5%、约8%、约8.5%、约9%、约9.5%、或约
10%。
[0707] 在一些实施方案中,例如在特定细胞密度(例如,已知或受控的细胞密度)下冷冻细胞。在某些实施方案中,冷冻过程期间的细胞密度可能影响在冷冻过程期间和/或由于冷
冻过程发生的细胞死亡和/或细胞损伤。
[0708] 例如,在特定实施方案中,细胞密度在冷冻过程期间随着周围环境而影响平衡,例如渗透平衡。在一些实施方案中,这种平衡是、包括和/或导致脱水。在某些实施方案中,脱水是或包括在与冷冻溶液(例如,DMSO和/或含DMSO的溶液)接触、组合和/或一起孵育的情
况下发生的细胞脱水。在特定实施方案中,脱水是或包括由细胞外空间中晶的成核和扩
大(例如通过降低暴露于细胞的有效液体水浓度)引起的脱水。在一些实施方案中,以如下
细胞密度冷冻细胞,所述细胞密度导致比以不同的(例如,更高或更低的)细胞密度冷冻的
细胞更慢和/或更不快速的脱水。在一些实施方案中,以如下细胞密度冷冻细胞,所述细胞
密度导致比在相同或相似的条件下以不同的细胞密度(例如,更高或更低)冷冻的细胞的脱
水更慢约、或至少、或为5%、10%、20%、25%、30%、40%、50%、60%、70%、80%、90%、
100%、125%、150%、175%、200%、1倍、2倍、3倍、4倍、5倍、10倍、50倍、或100倍。
[0709] 在一些实施方案中,冷冻保护剂是DMSO。在特定实施方案中,将细胞悬浮于冷冻溶液中,其中DMSO的终浓度为按体积计在约1%与约20%之间、在约3%与约9%之间、或在约
6%与约9%之间,每个都包含端值。在某些实施方案中,冷冻溶液中DMSO的最终浓度为按体
积计约3%、约4%、约5%、约5.5%、约6%、约6.5%、约7%、约7.5%、约8%、约8.5%、约
9%、约9.5%、或约10%。
[0710] 在特定实施方案中,将细胞以在或在约0.1×106个细胞/mL与约5,000×106个细胞/mL之间、在或在约1×106个细胞/mL与约500×106个细胞/mL之间、在或在约5×106个细
胞/mL与约150×106个细胞/mL之间、在或在约10×106个细胞/mL与约70×106个细胞/mL之
间、或在或在约15×106个细胞/mL与约60×106个细胞/mL之间(每个都包含端值)的密度悬
浮于冷冻溶液中。在一些实施方案中,细胞是存活细胞。
[0711] 在某些实施方案中,将细胞以在或在约1×106个细胞/mL与约1×108个细胞/mL之间、在约1×106个细胞/mL与约2×107个细胞/mL之间、在约1×107个细胞/mL与约5×107个
细胞/mL之间、或在约1×107个细胞/mL与5×107个细胞/mL之间(每个都包含端值)的密度悬
6
浮于冷冻溶液中。在某些实施方案中,将细胞以如下密度悬浮于冷冻溶液中:约1×10个细
胞/mL、约2×106个细胞/mL、约5×106个细胞/mL、约1×107个细胞/mL、约1.5×107个细胞/
mL、约2×107个细胞/mL、约2.5×107个细胞/mL、约2.5×107个细胞/mL、约2.5×107个细胞/
mL、约3×107个细胞/mL、约3.5×107个细胞/mL、约4×107个细胞/mL、约4.5×107个细胞/
mL、或约5×107个细胞/mL,每个都包含端值。在某些实施方案中,将细胞以在约1.5×107个
细胞/mL与约6×107个细胞/mL之间(包含端值)的密度悬浮于冷冻溶液中。在某些实施方案
中,将细胞以至少约1×107个细胞/mL的密度悬浮于冷冻溶液中。在特定实施方案中,将细
胞以至少约1.5x 107个细胞/mL的密度悬浮于冷冻溶液中。在一些实施方案中,细胞是存活
细胞。
[0712] 在一些实施方案中,将细胞冷冻在容器中。在某些实施方案中,容器是冷冻容器和/或冷冻保护剂容器。适合用于低温冷冻的容器包括但不限于小瓶、袋(例如,塑料袋)和
罐。在特定实施方案中,将细胞(例如,相同细胞组合物(如含有CAR表达细胞的细胞组合物)
的细胞)冷冻在1个、2个、3个、4个、5个、6个、7个、8个、9个、10个或超过10个单独的容器中。
例如,在一些实施方案中,将细胞和/或细胞的组合物悬浮在一定体积中(例如在溶液、冷冻
溶液和/或冷冻保护剂中,并且大于适合于一个容器的体积),并且因此所述体积被放入两
个或更多个容器中。在一些实施方案中,所述体积为、为约、或小于100mL、50mL、25mL、20mL、
15mL、10mL、5mL、或小于5mL,并且将细胞冷冻在两个、三个、四个、五个、六个、七个、八个、九个、十个或超过十个单独的小瓶中。在特定实施方案中,将相同体积的细胞放入每个小瓶
中。在一些实施方案中,小瓶是相同的小瓶,例如相同构造、型号和/或制造批次的小瓶。在特定实施方案中,所述体积为、为约、或大于10mL、15mL、20mL、25mL、30mL、40mL、50mL、60mL、
70mL、80mL、90mL、100mL、120mL、150mL、200mL或超过200mL,并且将细胞冷冻在两个、三个、四个、五个、六个、七个、八个、九个、十个或超过十个单独的袋中。在特定实施方案中,将相同体积的细胞放入每个袋中。在一些实施方案中,袋是相同的袋,例如相同构造、型号和/或制造批次的袋。
[0713] 在一些实施方案中,容器是小瓶。在某些实施方案中,容器是填充体积为、为约或至少0.5mL、1mL、2mL、3mL、4mL、5mL、6mL、7mL、8mL、9mL、10mL、11mL、12mL、13mL、14mL、15mL、
16mL、17mL、18mL、19mL、20mL、25mL、30mL、35mL、40mL、45mL、或50mL的小瓶。在一些实施方案中,小瓶具有如下的填充体积:在1mL与120mL之间、1mL与20mL之间、1mL与5mL之间、1mL与
10mL之间、1mL与40mL之间、或20mL与40mL之间,每个都包含端值。在一些实施方案中,小瓶是冷冻小瓶(freezing vial)、冷冻保护剂小瓶和/或冷冻小瓶(cryovial)。合适的小瓶是
已知的,并且包括但不限于 小瓶(Cook Regentec)、以及在美国专利号US 8,
936,905、US 9,565,854和US 8,709,797(通过引用以其整体特此并入)中描述的小瓶。
[0714] 在特定实施方案中,容器是袋。在某些实施方案中,容器是填充体积为、为约或至少0.5mL、1mL、2mL、3mL、4mL、5mL、6mL、7mL、8mL、9mL、10mL、11mL、12mL、13mL、14mL、15mL、
16mL、17mL、18mL、19mL、20mL、25mL、30mL、35mL、40mL、45mL、或50mL的袋。在一些实施方案中,袋具有如下的填充体积:在1mL与120mL之间、1mL与20mL之间、1mL与5mL之间、1mL与40mL之间、20mL与40mL之间、1mL与70mL之间、或50mL与70mL之间,每个都包含端值。在一些实施方案中,所述袋填充有为、约、或小于100mL、75mL、70mL、50mL、25mL、20mL或10mL的体积。合适的袋是已知的,并且包括但不限于 冷冻袋(Miltenyi Biotec)。在某些实施
方案中,体积是在室温下的体积。在一些实施方案中,体积是在如下温度的体积:在37℃与4℃之间、在16℃与27℃之间、包含端值,或为、为约、或至少16℃、17℃、18℃、19℃、20℃、21℃、22℃、23℃、24℃、25℃、26℃、27℃、28℃、29℃、30℃、31℃、32℃、33℃、34℃、35℃、36℃、或37℃。在一些实施方案中,体积是在25℃的体积。
[0715] 在一些实施方案中,将在1mL与20mL之间的体积的培养基或溶液(例如,冷冻溶液)中的细胞冷冻在一个或多个小瓶中,包含端值。在一些实施方案中,所述一个或多个小瓶具
有在1mL与5mL之间(包含端值)的填充体积。在某些实施方案中,将在20mL与120mL之间(包
含端值)的体积的培养基或溶液(例如,冷冻溶液)中的细胞冷冻在一个或多个袋中。在特定
实施方案中,所述一个或多个袋具有在20mL与40mL之间(包含端值)的填充体积。在一些实
施方案中,将在120mL或更大的体积的培养基或溶液(例如,冷冻溶液)中的细胞冷冻在一个
或多个袋中。在某些实施方案中,所述一个或多个袋具有在50mL与70mL之间(包含端值)的
填充体积。
[0716] 在某些实施方案中,将细胞冷冻在以一定表面积与体积比被放入容器(例如,袋或小瓶)中的溶液(例如,冷冻溶液)中。在特定实施方案中,所述表面积与体积比为从或从约
-1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1
0.1cm 至100cm ;1cm 至50cm 、1cm 至20cm 、1cm 至10cm 、2cm 至10cm 、3cm 至7cm
-1、或3cm-1至6cm-1(包含端值)。在特定实施方案中,表面积与体积的比在或在约3cm-1至6cm-1之间。在一些实施方案中,所述表面积与体积比为、为约、或为至少3cm-1、4cm-1、5cm-1、6cm-1、或7cm-1。
[0717] 在一些实施方案中,转移到冷冻保存介质与一个或多个处理步骤相关,所述处理步骤可以涉及洗涤样品(例如,工程化细胞组合物),例如以去除培养基和/或将细胞替换在
适当的冷冻保存缓冲液或培养基中供随后冷冻。在某些实施方案中,转移至冷冻保存介质
是在封闭和无菌系统中在临床规模水平上完全自动化的。在某些实施方案中,使用
CliniMACS系统(Miltenyi Biotec)实施向冷冻保存介质的转移。
[0718] 在一些实施方案中,细胞被解冻。在特定实施方案中,细胞被快速解冻,例如,尽可能快速地解冻而不使细胞过热或将细胞暴露于高温,例如高于37℃。在一些实施方案中,快速解冻减少和/或防止细胞暴露于高浓度的冷冻保护剂和/或DMSO。在特定实施方案中,解
冻发生的速率可能受在其中冷冻和解冻细胞的容器(例如,小瓶和/或袋)的特性的影响。在
特定实施方案中,将细胞在如下的温度下解冻:为、为约、或低于37℃、35℃、32℃、30℃、29℃、28℃、27℃、26℃、25℃、24℃、23℃、22℃、21℃、20℃、或15℃,或在15℃与30℃之间、在
23℃与28℃之间、或在24℃与26℃之间,每个都包含端值。在一些实施方案中,在加热块上
或在水浴中解冻细胞。在某些实施方案中,不在加热块上或水浴上解冻细胞。在一些实施方
案中,在室温下解冻细胞。在一些实施方案中,容器壁的厚度影响细胞解冻的速率,例如在
具有厚壁的容器中的细胞以比在具有更薄的壁的容器中更慢的速率解冻。在一些实施方案
中,具有低的表面积与体积比的容器具有缓慢和/或不均匀的解冻速率。在一些实施方案
中,将低温冷冻细胞在具有如下的表面积与体积比的容器中快速解冻:为、为约、或至少
-1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1
1cm 、2cm 、3cm 、4cm 、5cm 、6cm 、或7cm 、8cm 、9cm 、或10cm 。在特定实施方案中,将细胞在、在约、或在少于120分钟、90分钟、60分钟、45分钟、30分钟、25分钟、20分钟、15分钟、或十分钟内解冻。在一些实施方案中,将细胞解冻持续10分钟与60分钟之间、15分钟与45分
钟之间、或15分钟与25分钟之间,每个都包含端值。在特定实施方案中,将细胞在、在约或在少于20分钟内解冻。
[0719] 在某些实施方案中,在给予之前或在任何后续工程化和/或处理步骤之前,将解冻的细胞静置,例如孵育或培养。在一些实施方案中,在低的和/或不可检测的量的冷冻保护
剂中或在不存在冷冻保护剂(例如,DMSO)的情况下静置细胞。在特定实施方案中,在洗涤步
骤之后或之后立即静置解冻的细胞,例如,以去除冷冻保护剂和/或DMSO。在一些实施方案
中,静置是或包括在或在约37℃下培养和/或孵育。在一些实施方案中,在不存在与任何处
理或工程化步骤一起使用和/或与任何处理或工程化步骤相关的任何试剂(例如刺激试剂、
珠试剂或重组细胞因子)的情况下进行静置。在一些实施方案中,将细胞静止、静止约、或静止至少5分钟、10分钟、15分钟、30分钟、1小时、2小时、3小时、4小时、5小时、6小时、8小时、12小时、18小时、或24小时。在某些实施方案中,将细胞静置2小时、约2小时或至少2小时。
[0720] 在一些实施方案中,在用于处理和/或工程化细胞的所述方法之前、期间或之后将细胞冷冻,例如冷冻保存。在一些实施方案中,所述冷冻和后续解冻步骤去除所述细胞群中
的粒细胞,并且在一定程度上去除单核细胞。然后通常将细胞以1°/分钟的速率冷冻至-80
℃并储存在液氮储罐的气相中。在一些实施方案中,使用控制速率的冷冻机以约1°/分钟的
速率主动和/或有效地冷却细胞。在一些实施方案中,可以用控制速率的冷冻机来冷冻细
胞。在一些方面,使用控制速率的冷冻机以程序化冷却曲线(具有多个冷却和/或加热速率
的曲线)来冷冻细胞。可以将此类冷冻曲线程序化以控制成核,例如形成冰,例如以减少细
胞内冰形成。
[0721] 在一些实施方案中,冷冻细胞(包括如所描述的在冷冻保护剂的存在下冷冻和/或以特定体积或表面积与体积比填充到容器中的任何细胞和组合物,例如特定浓度或细胞密
度的细胞组合物)的特征包括:与用替代手段冷冻的细胞相比,改善的、增加的和/或更快的
扩增;改善的、增加的和/或增强的细胞存活率和减少的细胞死亡例子(例如坏死、程序性细
胞死亡和/或凋亡);改善的、增强的和/或增加的活性(例如细胞溶解活性);和/或减少的解
冻之后的衰老或静止的例子。
[0722] 在特定实施方案中,将细胞以本文提供的细胞密度和/或表面积与体积比冷冻,并且如与在相同或相似条件下以不同的细胞密度和/或不同的表面积与体积比冷冻的细胞相
比,在冷冻、低温冷冻和/或冷冻保存期间具有减少的细胞死亡(例如,坏死和/或凋亡),和/或具有减少的由冷冻、低温冷冻和/或冷冻保存引起的细胞死亡(例如,坏死和/或凋亡)。在
特定实施方案中,将细胞以本文提供的细胞密度和/或表面积与体积比冷冻,并且在冷冻、
低温冷冻和/或冷冻保存之后48小时内,例如在解冻冷冻细胞之后,具有减少的、延迟的细
胞死亡,例如,例如经由坏死、程序性细胞死亡、凋亡而死亡的细胞的量的减少。在某些实施方案中,如与在相同或相似条件下以不同的细胞密度和/或不同的表面积与体积比冷冻的
细胞相比,至少或约5%、10%、20%、25%、30%、40%、50%、60%、70%、80%、90%或99%更少的细胞在冷冻和/或冷冻保存期间死亡和/或由于冷冻和/或冷冻保存而引起死亡。在
某些实施方案中,少于40%、30%、25%、20%、15%、10%、5%、1%、0.1%或0.01%的以所提供的细胞密度和/或表面积与体积比冷冻的细胞在冷冻、低温冷冻和/或冷冻保存期间死
亡或由于冷冻、低温冷冻和/或冷冻保存而死亡。
[0723] 在一些实施方案中,将细胞以本文提供的细胞密度和/或表面积与体积比冷冻,并且如与在相同或相似条件下以不同的细胞密度和/或不同的表面积与体积比冷冻的细胞相
比,具有减少的归因于冷冻、低温冷冻和/或冷冻保存和/或由冷冻、低温冷冻和/或冷冻保
存引起的衰老或静止的例子。在特定实施方案中,如与在相同或相似条件下以不同的细胞
密度和/或不同的表面积与体积比冷冻的细胞相比,至少或约5%、10%、20%、25%、30%、
40%、50%、60%、70%、80%、90%或99%更少的细胞是衰老和/或静止的细胞。在某些实施方案中,将细胞以所提供的细胞密度和/或表面积与体积比冷冻,并且少于40%、30%、
25%、20%、15%、10%、5%、1%、0.1%或0.01%的细胞由于冷冻、低温冷冻和/或冷冻保存而变得衰老和/或静止。
[0724] 在某些实施方案中,将细胞以本文提供的细胞密度和/或表面积与体积比冷冻,例如低温冷冻,并且如与在相同或相似条件下以不同的细胞密度和/或表面积与体积比冷冻
的细胞相比,在将细胞解冻之后,例如在刺激条件下,例如通过与本文描述的刺激试剂一起
孵育,具有改善的、更快的和/或更快速的扩增。在特定实施方案中,如与在相同或相似的条件下以不同的细胞密度和/或不同的表面积与体积比冷冻的细胞相比,细胞以为、为约或为
至少5%、10%、20%、25%、30%、40%、50%、60%、70%、80%、90%、100%、150%、200%、1倍、1.5倍、2倍、3倍、4倍、5倍、或10倍更快的和/或更快速的速率扩增。例如,在一些实施方案中,与在相同或相似的条件下以不同的细胞密度和/或不同的表面积与体积比冷冻的解
冻细胞相比,解冻细胞在、在约、或在至少5%、10%、20%、25%、30%、40%、50%、60%、
70%、80%、90%、95%、或99%更少的时间内达到阈值扩增,例如预定的细胞数量、密度或因子(如2倍扩增)。
[0725] 在一些实施方案中,将细胞以所述细胞密度冷冻,例如低温冷冻,并且如与在相同或相似的条件下以不同的细胞密度(例如,更高或更低的密度)冷冻的细胞相比,在将细胞
解冻之后具有改善的、增加的和/或更多的细胞溶解活性,例如,如通过用于测量本文描述
的细胞溶解活性的任何测定测量的。在特定实施方案中,如与在相同或相似的条件下以不
同的密度冷冻的细胞相比,细胞溶解活性增加了、增加了约、或增加了至少5%、10%、20%、
25%、30%、40%、50%、60%、70%、80%、90%、100%、150%、200%、1倍、1.5倍、2倍、3倍、4倍、5倍、或10倍。
[0726] VI.组合物和配制品
[0727] 还提供了包括细胞的组合物,包括药物组合物和配制品,如包括用于以给定剂量或其部分给予的细胞数量的单位剂型组合物。药物组合物和配制品通常包括一种或多种任
选的药学上可接受的载体或赋形剂。在一些实施方案中,组合物包括至少一种另外的治疗
剂。
[0728] 术语“药物配制品”是指这样的制剂,其处于使得其中所含活性成分的生物活性有效的形式,并且不含对给予配制品的受试者具有不可接受的毒性的另外的组分。
[0729] “药学上可接受的载体”是指药物配制品中除了活性成分以外的对受试者无毒的成分。药学上可接受的载体包括但不限于缓冲液、赋形剂、稳定剂或防腐剂
[0730] 在一些方面,载体的选择部分取决于特定细胞和/或给予方法。因此,存在多种合适的配制品。例如,所述药物组合物可以含有防腐剂。合适的防腐剂可以包括例如对羟基苯
甲酸甲酯、对羟基苯甲酸丙酯、苯甲酸钠和苯扎氯铵。在一些方面,使用两种或更多种防腐
剂的混合物。防腐剂或其混合物通常以总组合物重量的约0.0001%至约2%的量存在。载体
描述于例如Remington’s Pharmaceutical Sciences第16版,Osol,A.编辑(1980)。药学上
可接受的载体在所用的剂量和浓度下通常对接受者无毒,并且包括但不限于:缓冲剂,如磷
酸盐、柠檬酸盐和其他有机酸;抗氧化剂,包括抗坏血酸和甲硫氨酸;防腐剂(如十八烷基二甲基苄基氯化铵;六甲氯铵;苯扎氯铵;苄索氯铵;苯酚、丁醇或苄醇;烷基对羟基苯甲酸酯,如对羟基苯甲酸甲酯或对羟基苯甲酸丙酯;儿茶酚;间苯二酚;环己醇;3-戊醇;和间甲酚);
低分子量(少于约10个残基)多肽;蛋白质,如血清白蛋白、明胶或免疫球蛋白;亲水性聚合
物,如聚乙烯吡咯烷酮;氨基酸,如甘氨酸、谷氨酰胺、天冬酰胺、组氨酸、精氨酸或赖氨酸;
单糖、二糖和其他碳水化合物,包括葡萄糖、甘露糖或糊精;螯合剂,如EDTA;糖类,如蔗糖、甘露醇、海藻糖或山梨糖醇;成盐抗衡离子,如钠;金属络合物(例如锌-蛋白质络合物);和/或非离子表面活性剂,如聚乙二醇(PEG)。
[0731] 在一些方面,在所述组合物中包括缓冲剂。合适的缓冲剂包括例如柠檬酸、柠檬酸钠、磷酸、磷酸和各种其他酸和盐。在一些方面,使用两种或更多种缓冲剂的混合物。缓冲剂或其混合物通常以总组合物重量的约0.001%至约4%的量存在。制备可给予的药物组合
物的方法是已知的。示例性方法更详细地描述于例如Remington:The Science and 
Practice of Pharmacy,Lippincott Williams&Wilkins;第21版(2005年5月1日)中。
[0732] 配制品可以包括水溶液。所述配制品或组合物还可含有可用于用细胞治疗的特定适应症、疾病或病症的多于一种活性成分,优选具有与所述细胞互补的活性的那些成分,其
中各自的活性不会相互产生不利影响。此类活性成分以有效用于既定目的的量以合适的方
式组合存在。因此,在一些实施方案中,药物组合物还包括其他药物活性药剂或药物,例如
化学治疗剂,例如天冬酰胺酶、白消安、卡铂、顺铂、柔红霉素、多柔比星、氟尿嘧啶、吉西他滨、羟基脲、甲氨蝶呤、紫杉醇、利妥昔单抗、长春碱和/或长春新碱。
[0733] 在一些实施方案中,组合物包括有效减少疾病或病症负荷的量的细胞,和/或在受试者中不导致CRS或严重CRS和/或实现如本文所描述的方法的任何其他结果的量的细胞。
[0734] 在一些实施方案中,药物组合物包含有效治疗或预防疾病或病症的量(例如治疗有效量或预防有效量)的细胞。在一些实施方案中,通过定期评估所治疗的受试者来监测治
疗或预防功效。所需剂量可以通过细胞的单次推注给予、通过细胞的多次推注给予或通过
细胞的连续输注给予来递送。
[0735] 细胞和组合物可以使用标准给予技术、配制品和/或装置来给予。所述细胞的给予可以是自体的或异源的。例如,免疫应答细胞或祖细胞可以从一名受试者获得,并且给予同
一受试者或不同的相容受试者。外周血衍生的免疫应答细胞或其后代(例如,体内、离体或
体外衍生的)可以经由局部注射(包括导管给予)、全身注射、局部注射、静脉内注射或肠胃
外给予来给予。当给予治疗组合物(例如,含有遗传修饰的免疫应答细胞的药物组合物)时,
通常将其配制成单位剂量可注射形式(溶液、悬浮液、乳液)。
[0736] 配制品包括用于口服、静脉内、腹膜内、皮下、经肺、透皮、肌内、鼻内、经颊、舌下或栓剂给予的那些。在一些实施方案中,肠胃外给予所述细胞群。如本文所用的术语“肠胃外”包括静脉内、肌内、皮下、直肠、阴道和腹膜内给予。在一些实施方案中,通过静脉内、腹膜内或皮下注射给予外周全身递送将细胞给予至受试者。
[0737] 在一些实施方案中,组合物作为无菌液体制剂(例如,等渗水溶液、悬浮液、乳液、分散体或粘性组合物,其在一些方面可以缓冲至所选pH)提供。液体制剂一般比凝胶、其他
粘性组合物和固体组合物制备起来更容易。另外地,液体组合物稍微更方便给予,特别是通
过注射。在另一方面,粘性组合物可以配制在适当的粘度范围内,以提供与特定组织的更长
的接触时间。液体或黏性组合物可以包含载体,其可以是溶剂或分散介质,其含有例如水、
盐水、磷酸盐缓冲盐水、多元醇(例如,甘油、丙二醇、液体聚乙二醇)及其合适的混合物。
[0738] 无菌可注射溶液可以通过将细胞掺入溶剂中来制备,例如与合适的载体、稀释剂或赋形剂(如无菌水、生理盐水、葡萄糖、右旋糖等)混合。组合物可以含有辅助物质,例如润湿剂、分散剂或乳化剂(例如甲基纤维素)、pH缓冲剂、胶凝或粘度增强添加剂、防腐剂、调味剂和/或颜料,这取决于给予途径和所需的制剂。在一些方面,可以参考标准文本来制备合
适的制剂。
[0739] 可以添加各种增强所述组合物的稳定性和无菌性的添加剂,包括抗微生物防腐剂、抗氧化剂、螯合剂和缓冲剂。可以通过各种抗细菌和抗真菌剂(例如对羟基苯甲酸酯、氯丁醇、苯酚和山梨酸)来确保防止微生物的作用。通过使用延迟吸收的药剂(例如单硬脂酸
和明胶)可以实现可注射药物形式的延长吸收。
[0740] 用于体内给予的配制品通常是无菌的。可以例如通过经无菌滤膜过滤容易地实现无菌。
[0741] 在一些实施方案中,治疗性T细胞组合物包含在约1000万个细胞/mL与约7000万个细胞/mL之间、或在约1000万个存活细胞/mL与约7000万个存活细胞/mL之间,每个都包含端
值。在一些实施方案中,治疗性T细胞组合物包含在约1500万个细胞或存活细胞/mL与约
6000万个细胞或存活细胞/mL之间,每个都包含端值。在一些实施方案中,T细胞组合物包含
大于1000万个细胞或存活细胞/mL。在一些实施方案中,治疗性T细胞组合物包含大于1500
万个细胞或大于1500万个细胞/mL。
[0742] 在一些实施方案中,所述制品进一步含有指示容器(例如小瓶或袋,如IV袋或注射器)含有目标数量的单位的信息。
[0743] 在一些实施方案中,制品、容器是第一容器,并且制品进一步包含另外的容器,其中每个所述另外的容器包含单位剂量,所述单位剂量包含目标数量的T细胞组合物单位。在
一些实施方案中,另外的容器包含在约1000万个细胞或存活细胞/mL与约7000万个细胞或
存活细胞/mL之间、在约1500万个细胞或存活细胞与约6000万个细胞或存活细胞/mL之间、
大于1000万个细胞或存活细胞/mL、大于1500万个细胞或存活细胞/mL(每个都包含端值)、
或其组合。在一些实施方案中,所述组合物进一步包含冷冻保护剂和/或所述制品进一步包
括用于在给予至受试者之前将所述组合物解冻的说明书。
[0744] 在一些实施方案中,例如在洗涤步骤之后将所述细胞悬浮在冷冻溶液中以去除血浆和血小板。在一些方面,可以使用多种已知的冷冻溶液和参数中的任何一种。一个例子涉
及使用含有20%DMSO和8%人血清白蛋白(HSA)的PBS,或其他合适的细胞冷冻培养基。然后
将其用培养基1:1稀释,使得DMSO和HSA的最终浓度分别为10%和4%。
[0745] 在一些方面,可以使用多种已知的冷冻溶液和参数中的任何一种。在一些实施方案中,细胞样品可以含有包含冷冻保护剂的冷冻保存或玻璃化介质或溶液。合适的冷冻保
护剂包括但不限于二甲亚砜(DMSO)、甘油、乙二醇、丙烯乙二醇、乙烯乙二醇、丙二醇、聚乙二醇(PEG)、1,2-丙二醇(PROH)或其混合物。在一些例子中,冷冻保存溶液可以含有一种或
多种非细胞渗透性冷冻保存剂,包括但不限于,聚乙烯吡咯烷酮、羟乙基淀粉、多糖、单糖、藻酸盐、海藻糖、棉子糖、葡聚糖、人血清白蛋白、聚蔗糖、脂蛋白、聚乙烯吡咯烷酮、羟乙基淀粉、自体血浆或其混合物。在一些实施方案中,将细胞悬浮于冷冻溶液中,其中冷冻保护
剂的终浓度为按体积计在约1%与约20%之间、在约3%与约9%之间、或在约6%与约9%之
间,每个都包含端值。在某些实施方案中,冷冻溶液中冷冻保护剂的最终浓度为按体积计约
3%、约4%、约5%、约5.5%、约6%、约6.5%、约7%、约7.5%、约8%、约8.5%、约9%、约
9.5%、或约10%。
[0746] 在一些实施方案中,冷冻保护剂是DMSO。在特定实施方案中,将细胞悬浮于冷冻溶液中,其中DMSO的终浓度为按体积计在约1%与约20%之间、在约3%与约9%之间、或在约
6%与约9%之间,每个都包含端值。在某些实施方案中,冷冻溶液中DMSO的最终浓度为按体
积计约3%、约4%、约5%、约5.5%、约6%、约6.5%、约7%、约7.5%、约8%、约8.5%、约
9%、约9.5%、或约10%。
[0747] 在某些实施方案中,将细胞以在约1×106个细胞/mL与约1×108个细胞/mL之间、在约1×106个细胞/mL与约2×107个细胞/mL之间、在约1×107个细胞/mL与约5×107个细胞/
mL之间、或在约1×107个细胞/mL至5×107个细胞/mL之间(每个都包含端值)的密度悬浮于
冷冻溶液中。在某些实施方案中,将细胞以如下密度悬浮于冷冻溶液中:约1×106个细胞/
6 6 7 7
mL、约2×10个细胞/mL、约5×10个细胞/mL、约1×10 个细胞/mL、约1.5×10个细胞/mL、
约2×107个细胞/mL、约2.5×107个细胞/mL、约2.5×107个细胞/mL、约2.5×107个细胞/mL、
约3×107个细胞/mL、约3.5×107个细胞/mL、约4×107个细胞/mL、约4.5×107个细胞/mL、或
约5×107个细胞/mL。在某些实施方案中,将细胞以在约1.5×107个细胞/mL与约6×107个细
胞/mL之间(包含端值)的密度悬浮于冷冻溶液中。在某些实施方案中,将细胞以至少约1×
107个细胞/mL的密度悬浮于冷冻溶液中。在特定实施方案中,将细胞以至少约1.5x107个细
胞/mL的密度悬浮于冷冻溶液中。在一些实施方案中,细胞是存活细胞。
[0748] 在一些实施方案中,转移到冷冻保存介质与一个或多个处理步骤相关,所述处理步骤可以涉及洗涤样品(例如,工程化细胞组合物),例如以去除培养基和/或将细胞替换在
适当的冷冻保存缓冲液或培养基中供随后冷冻。在某些实施方案中,转移至冷冻保存介质
是在封闭和无菌系统中在临床规模水平上完全自动化的。在某些实施方案中,使用
CliniMACS系统(Miltenyi Biotec)实施向冷冻保存介质的转移。
[0749] 在一些实施方案中,在用于处理和/或工程化细胞的所述方法之前、期间或之后将细胞冷冻,例如冷冻保存。在一些实施方案中,所述冷冻和后续解冻步骤去除所述细胞群中
的粒细胞,并且在一定程度上去除单核细胞。然后通常将细胞以1°/分钟的速率冷冻至-80
℃并储存在液氮储罐的气相中。
[0750] 在一些实施方案中,将组合物密封在适合于冷冻保存的袋(例如, 冷冻袋,Miltenyi Biotec)中。在一些实施方案中,将组合物密封在适合于冷冻保存的小瓶
(例如, 小瓶,Cook Regentec)中。
[0751] VII.制品
[0752] 还提供了制品,如试剂盒和设备,用于根据用于过继细胞疗法的所提供的方法将细胞给予至受试者,以及用于储存和给予细胞和组合物。
[0753] 制品包括一个或多个容器(通常多个容器)、包装材料、以及在一个或多个容器和/或包装上或与一个或多个容器和/或包装相关的标签或包装说明书(通常包括用于将细胞
给予至受试者的说明书)。
[0754] 容器通常含有待给予的细胞,例如,其一个或多个单位剂量。制品通常包括多个容器,每个容器含有细胞的单一单位剂量。单位剂量可以是在第一剂量中要给予至受试者的
细胞的量或数量,或者是在第一剂量或任何一个或多个连续剂量中要给予的细胞的两倍数
量(或更多数量)。它可以是结合给予方法将向受试者给予的细胞的最低剂量或最低可能剂
量。在一些实施方案中,单位剂量是根据本文的方法将以单一剂量向患有特定疾病或病症
的任何受试者给予的最小细胞数量或细胞数量或最小数量的参考单位或目标参考单位或
在目标范围内的参考单位。在一些实施方案中,单位剂量中的细胞数量是期望以一定剂量
给予至特定受试者(如细胞已经从其来源的受试者)的细胞的数量或重组受体表达细胞或
CAR表达细胞的数量、或某一表型(例如CD8+、凋亡标记阴性(例如膜联蛋白V-或半胱天冬酶
3-)和CD8+)的此类细胞的数量。在一些实施方案中,单位剂量中目标数量的参考单位或在
目标范围内的参考单位是随着细胞数量或重组受体表达细胞或CAR表达细胞的数量、或某
一表型(例如CD8+、凋亡标记阴性(例如膜联蛋白V-或半胱天冬酶3-)和CD8+)的此类细胞的
数量、以及组合物的重组受体依赖性活性(例如抗原特异性活性)而变化的,并且期望以一
定剂量给予至特定受试者(如细胞已经从其来源的受试者)的组合物的参考单位。在一些实
施方案中,细胞已经源自要通过如本文提供的方法治疗或对其有需要的受试者。
[0755] 在一些实施方案中,制品含有细胞的单位剂量,其含有如根据如本文其他地方所描述的公式在给定范围内的目标数量的参考单位(RU)。目标数量的参考单位(RU)或目标数
量的总细胞的示例性单位剂量包括贯穿本公开文本所描述的任何单位剂量。
[0756] 在一些实施方案中,每个容器单独地包含细胞的单位剂量,例如包括相同或基本上相同的细胞数量或重组受体表达细胞或CAR表达细胞的数量、或某一表型(例如CD8+、凋
亡标记阴性(例如膜联蛋白V-或半胱天冬酶3-))的此类细胞的数量。在一些实施方案中,每
个容器单独地包含细胞的单位剂量,例如包括相同或基本上相同的数量的目标参考单位或
在目标范围内的数量的参考单位。
[0757] 合适的容器包括例如瓶子、小瓶、注射器和柔性袋(如输液袋)。在特定实施方案中,容器是袋,例如柔性袋,如适合用于将细胞输注到受试者的那些,例如柔性塑料或PVC
袋、和/或IV溶液袋。在一些实施方案中,袋是可密封的和/或能够灭菌的,以便提供细胞和
组合物的无菌溶液和递送。在一些实施方案中,容器(例如袋)具有如下的容量:为或约或至
少为或约10mL、20mL、30mL、40mL、50mL、60mL、70mL、80mL、90mL、100mL、200mL、300mL、400mL、
500mL、或1000mL容量,例如在为或约10mL与为或约100mL之间、或在为或约10mL与为或约
500mL之间的容量,每个都包含端值。在一些实施方案中,容器(例如袋)是稳定的材料的和/
或由稳定的材料制成和/或在各种温度中的一个或多个温度下(例如在冷的温度(例如低于
或低于约或为或约-20℃、-80℃、-120℃、135℃和/或在适合于冷冻保存的温度)、和/或其
他温度(例如适合于解冻细胞的温度和体温(如为或约37℃))中)提供细胞的稳定存储和/
或维持,例如,以允许在治疗之前例如在受试者的位置或治疗的位置(例如在床边)解冻。
[0758] 容器可以由多种材料(如玻璃或塑料)形成。在一些实施方案中,容器具有一个或多个端口,例如,无菌接入端口,例如,用于将管路或插管与一个或多个管连接,例如,用于静脉内或其他输注和/或用于连接以便从其他容器(如细胞培养和/或存储袋或其他容器)
来回转移。示例性容器包括输液袋、静脉内溶液袋、小瓶,包括具有可被注射用针刺穿的塞
子的那些。
[0759] 制品可以进一步包括具有一条或多条识别信息和/或使用说明的包装说明书或标签。在一些实施方案中,信息或说明指示内容物可以或应当用于治疗特定病症或疾病,和/
或提供为此的说明书。标签或包装说明书可以指示制品的内容物将用于治疗疾病或病症。
在一些实施方案中,标签或包装说明书提供了例如根据所提供的方法的任何实施方案,经
由涉及给予第一剂量和一个或多个连续剂量的细胞的方法,治疗受试者(例如,细胞已经从
其来源的受试者)的说明书。在一些实施方案中,说明书指定在第一剂量中给予一个单位剂
量(例如制品中单一独立容器的内容物),随后在指定的时间点或在指定的时间窗口内和/
或在检测到受试者中一种或多种因子或结果的存在或不存在或量或程度之后给予一个或
多个连续剂量。
[0760] 在一些实施方案中,说明指定向受试者给予一个或多个单位剂量。
[0761] 在一些实施方案中,标签或包装说明书或包装包含指示细胞来源和/或将被给予的受试者的特定身份的标识符。在自体转移的情况下,细胞来源的受试者的身份与要给予
细胞的受试者的身份相同。因此,识别信息可以指定将细胞给予至特定患者,例如细胞最初
来源的那个患者。这样的信息能以条形码或其他编码标识符的形式存在于包装材料和/或
标签中,或者可以指示受试者的名称和/或其他识别特征。
[0762] 在一些实施方案中,制品包括一个或多个(通常多个)容器,所述容器含有包含细胞(例如其单独的单位剂型)的组合物,并且进一步包括在其中含有包括另外的药剂的组合
物的一个或多个另外的容器,所述另外的药剂是例如细胞毒性剂或其他治疗剂,例如,其与
细胞组合(例如,同时或以任何顺序依次)给予。可替代地或另外,制品还可以包括另一种或
相同的容器,所述容器包含药学上可接受的缓冲剂。它还可以包括其他材料,如其他缓冲
剂、稀释剂、过滤器、管路、针头和/或注射器。
[0763] 术语“包装说明书”用于指通常包括在治疗产品的商业包装中的说明书,所述说明书包含关于使用此类治疗产品的适应症、用法、剂量、给予、组合疗法、禁忌症和/或警告的信息。
[0764] VIII.定义
[0765] 除非另外定义,否则本文使用的所有领域术语、符号和其他技术和科学术语或用辞旨在具有与所要求保护的主题所属领域的普通技术人员通常理解的含义相同的含义。在
一些情况下,为了清楚和/或为了便于参考而在本文中定义具有通常理解的含义的术语,并
且本文中包含的此类定义不应被解释为表示与本领域通常理解的实质性差异。
[0766] 如本文所用的,单数形式“一种/个(a/an)”和“所述(the)”包括复数种/个指示物,除非上下文另外明确说明。例如,“一种/个(a或an)”意指“至少一种/个”或“一种/个或多种/个”。应理解,本文描述的方面和变化包括“由方面和变化组成”和/或“基本上由方面和变化组成”。
[0767] 贯穿本公开内容,所要求保护的主题的各个方面以范围形式呈现。应当理解,范围形式的描述仅仅是为了方便和简洁,并且不应被解释为对所要求保护的主题的范围的僵硬
限制。因此,应当认为范围的描述具体公开了所有可能的子范围以及所述范围内的各个数
值。例如,在提供一系列值的情况下,应当理解,在所述范围的上限和下限之间的每个中间
值以及在所述范围内的任何其他所述或中间值包含在所要求保护的主题内。这些更小范围
的上限和下限可以独立地被包括在更小范围之内,并且也被涵盖在所要求保护地主题之
内,服从于在所陈述范围内任何确切排除的限制。在所陈述范围包括限制中的一者或两者
的情况下,排除了那些包括的限制中的任一者或两者的范围也包括在所描述或所要求保护
的主题内。无论范围的广度如何,这都适用。
[0768] 如本文所用的术语“约”是指本技术领域的技术人员容易知道的相应值的通常误差范围。本文对“约”某一值或参数的提及包括(并描述)针对所述值或参数本身的实施方
案。例如,涉及“约X”的描述包括“X”的描述。
[0769] 如本文所用的,组合物是指两种或更多种产物、物质或化合物(包括细胞)的任何混合物。其可以是溶液、悬浮液、液体、粉末、糊剂、水性、非水性或其任何组合。
[0770] 如本文所用的,细胞或细胞群对特定标记呈“阳性”的陈述是指特定标记(通常为表面标记)在细胞上或细胞中的可检测的存在。当提及表面标记时,所述术语是指如通过流
式细胞术检测到的,表面表达的存在,例如通过用与所述标记特异性地结合的抗体进行染
色并检测所述抗体,其中所述染色通过流式细胞术以如下水平是可检测的,所述水平基本
上高于在其他方面相同的条件下用同种型匹配对照进行相同程序检测到的染色,和/或所
述水平基本上与已知呈所述标记阳性的细胞的水平相似,和/或所述水平基本上高于已知
呈所述标记阴性的细胞的水平。
[0771] 如本文所用的,细胞或细胞群对特定标记呈“阴性”的陈述是指特定标记(通常为表面标记)在细胞上或细胞中不存在实质上可检测的存在。当提及表面标记时,所述术语是
指如通过流式细胞术检测到的,表面表达的不存在,例如通过用与所述标记特异性地结合
的抗体进行染色并检测所述抗体,其中所述染色通过流式细胞术以如下水平没有检测到,
所述水平基本上高于在其他方面相同的条件下用同种型匹配对照进行相同程序检测到的
染色,和/或所述水平基本上低于已知呈所述标记阳性的细胞的水平,和/或所述水平与已
知呈所述标记阴性的细胞的水平相比是基本上相似的。
[0772] 如本文所用的,术语“载体”是指能够繁殖与其连接的另一种核酸的核酸分子。所述术语包括作为自我复制核酸结构的载体以及掺入已引入其的宿主细胞基因组中的载体。
某些载体能够指导它们可操作地连接的核酸的表达。此类载体在本文中称为“表达载体”。
[0773] IX.示例性实施方案
[0774] 1.一种制品,其包含:
[0775] (a)包含治疗性T细胞组合物的单位剂量的容器,所述治疗性T细胞组合物包含T细胞,所述T细胞包含特异性地结合抗原的任选地为嵌合抗原受体(CAR)的重组受体,其中所
述单位剂量含有在给定范围内的目标数量的参考单位(RU),其中在给定组合物中的RU由下
式定义:
[0776] RU=A x B,其中:
[0777] A是在所述给定组合物中存在的具有表型的细胞的数量、或其倍数、分数或变换,或者是在所述给定组合物中具有两种或更多种表型的细胞的数量的平均值或加权平均值、
或所述平均值或加权平均值的倍数、分数或变换;并且
[0778] B是指示在所述给定组合物中重组受体依赖性、任选地CAR依赖性活性的程度或与其相关的参数的值、或所述值的分数或倍数或变换;并且
[0779] (b)用于将所述组合物、任选地其一个或多个单位剂量给予至受试者、任选地患有或怀疑患有疾病或病症的受试者的说明书。
[0780] 2.根据实施方案1的制品,其中A是在所述给定组合物中存在的给定表型的细胞的数量、或其倍数或分数或变换。
[0781] 3.根据实施方案1的制品,其中A是在所述给定组合物中具有两种或更多种表型的细胞的数量的平均值或加权平均值、或所述平均值或加权平均值的倍数、分数或变换。
[0782] 4.根据实施方案1-3中任一项的制品,其中单位的所述目标数量小于单位的阈值数量,所述阈值数量任选地是参考单位的安全数量,其中,参考单位的所述安全数量是相对
于在用包含表达所述重组受体、任选地所述CAR的T细胞的治疗性T细胞组合物治疗后分析
的一组受试者,向在曾持续发生不良事件的组中的那些受试者中的受试者给予的疗法的参
考单位的最低数量。
[0783] 5.根据实施方案4的制品,其中所述不良事件是严重不良事件,任选地严重神经毒性,任选地等于或高于4级或5级或至少延长的3级神经毒性。
[0784] 6.根据实施方案4或实施方案5的制品,其中参考单位的所述目标数量比参考单位的所述安全数量少了对应于安全系数的量和/或少了在1.5倍至3倍范围内、任选地约2倍的
量、或少了为未发生过所述不良事件、任选地0-2级神经毒性的一组受试者的标准偏差的倍
数的量,任选地其中所述倍数在1.5倍至3倍的范围内。
[0785] 7.根据实施方案1-6中任一项的制品,其中参考单位的所述目标数量等于或高于参考单位的参考功效数量,其中所述参考功效数量是相对于在用包含所述重组受体、任选
地所述CAR的治疗性T细胞组合物治疗后分析的一组受试者,向展现出所希望的治疗结果、
任选地部分反应或完全反应(CR)的组中的一名或多名受试者给予的疗法的单位的数量。
[0786] 8.一种制品,其包含:
[0787] (a)包含治疗性T细胞组合物的单位剂量的容器,所述治疗性T细胞组合物包含T细胞,所述T细胞包含特异性地结合抗原的任选地为嵌合抗原受体(CAR)的重组受体,其中:
[0788] 所述单位剂量含有或含有约(i)目标数量的总重组受体表达细胞或目标数量的总CD3+重组受体表达细胞或目标数量的总CD8+重组受体表达细胞,或者(ii)在给定范围内的
目标数量的参考单位(RU),参考RU的所述目标数量等于或低于RU的阈值数量,其中所述单
位剂量不含有大于所述阈值数量的RU,
[0789] 其中在给定组合物中的RU的数量由下式定义:
[0790] RU=A x B,其中
[0791] A是在所述给定组合物中存在的具有表型的细胞的数量、或其倍数或变换,或者是在所述给定组合物中具有两种或更多种表型的细胞的数量的平均值或加权平均值、或所述
平均值或加权平均值的倍数、分数或变换;并且
[0792] B是指示在所述给定T细胞组合物中的重组受体依赖性、任选地CAR依赖性活性的程度或与其相关的参数的值、或所述值的倍数或变换;并且
[0793] (b)用于将所述组合物、任选地其一个或多个单位剂量给予至受试者、任选地患有或怀疑患有疾病或病症的受试者的说明书。
[0794] 9.根据实施方案8的制品,其中A是在所述给定组合物中存在的给定表型的细胞的数量、或其倍数或分数或变换。
[0795] 10.根据实施方案8的制品,其中A是在所述给定组合物中具有两种或更多种表型的细胞的数量的平均值或加权平均值、或所述平均值或加权平均值的倍数、分数或变换。
[0796] 11.根据实施方案8-10中任一项的制品,其中:
[0797] 所述目标数量是重组受体表达细胞的目标数量,所述重组受体表达细胞呈CD3+、呈凋亡标记阴性(-)和CD3+,任选地其中所述凋亡标记是膜联蛋白V或活性半胱天冬酶3;或
[0798] 所述目标数量是重组受体表达细胞的目标数量,所述重组受体表达细胞呈CD8+、呈凋亡标记阴性(-)和CD8+,任选地其中所述凋亡标记是膜联蛋白V或活性半胱天冬酶3。
[0799] 12.根据实施方案1-11中任一项的制品,其中在(i)中的所述目标数量的细胞为:在或在约5.0x 106个与2.25x 107个之间、5.0x 106个与2.0x 107个之间、5.0x 106个与1.5x 
107个之间、5.0x 106个与1.0x 107个之间、5.0x 106个与7.5x 106个之间、7.5x 106个与
2.25x 107个之间、7.5x 106个与2.0x 107个之间、7.5x 106个与1.5x 107个之间、7.5x 106个与1.0x 107个之间、1.0x 107个与2.25x 107个之间、1.0x 107个与2.0x 107个之间、1.0x 
7 7 7 7 7 7
10个与1.5x 10 个之间、1.5x 10 个与2.25x 10 个之间、1.5x 10个与2.0x 10 个之间、
2.0x107个与2.25x 107个之间的重组受体表达细胞(每个都包含端值),任选地是CD3+或CD8
+的或是凋亡标记阴性(-)和CD8+的重组受体表达细胞,任选地其中所述凋亡标记是膜联蛋
白V或活性半胱天冬酶3。
[0800] 13.根据实施方案1-12中任一项的制品,其中在(i)中的所述目标数量的细胞为:
[0801] 在至少或至少约5x 106个、6x 106个、7x 106个、8x 106个、9x 106个、10x 106个与约15x 106个之间的重组受体表达细胞,每个都包含端值,任选地呈CD8+的或呈凋亡标记阴性(-)和CD8+的重组受体表达细胞,任选地其中所述凋亡标记是膜联蛋白V或活性半胱天冬
酶3;
[0802] 在至少或至少约5.55x 106个、6.66x 106个、7.77x 106个、8.99x 106个、1.0x 107个、1.1x 107个与约1.67x 107个之间的重组受体表达细胞,每个都包含端值,任选地呈CD8+的或呈凋亡标记阴性(-)和CD8+的重组受体表达细胞,任选地其中所述凋亡标记是膜联蛋白V或活性半胱天冬酶3;
[0803] 在至少或至少约6.25x 106个、7.5x 106个、8.75x 106个、1.0x 107个、1.13x 107个、1.25x 107个与约1.9x 107个之间的重组受体表达细胞,每个都包含端值,任选地呈CD8+的或呈凋亡标记阴性(-)和CD8+的重组受体表达细胞,任选地其中所述凋亡标记是膜联蛋
白V或活性半胱天冬酶3;
[0804] 在至少或至少约7.14x 106个、8.5x 106个、1.0x 107个、1.14x 107个、1.29x 107个、1.42x 107个与约2.14x 107个之间的重组受体表达细胞,每个都包含端值,任选地呈CD8+的或呈凋亡标记阴性(-)和CD8+的重组受体表达细胞,任选地其中所述凋亡标记是膜联蛋
白V或活性半胱天冬酶3。
[0805] 14.根据实施方案1-13中任一项的制品,其中在(i)中的所述目标数量的细胞为:在至少或至少约5x 106个、6x 106个、7x 106个、8x 106个、9x 106个、10x 106个与约15x 106个之间的是凋亡标记阴性(-)和CD8+的重组受体表达细胞,每个都包含端值,任选地其中所
述凋亡标记是膜联蛋白V或活性半胱天冬酶3。
[0806] 15.根据实施方案1-13中任一项的制品,其中在(i)中的所述目标数量的细胞为:在至少或至少约6.25x 106个、7.5x 106个、8.75x 106个、1.0x 107个、1.13x 107个、1.25x 
107个与约1.9x 107个之间的呈CD8+的重组受体表达细胞,每个都包含端值。
[0807] 16.根据实施方案8-15中任一项的制品,其中RU的所述目标参考数量小于单位的阈值数量或小于RU的参考安全数量,其中RU的所述参考安全数量是相对于在用包含表达所
述重组受体、任选地所述CAR的T细胞的治疗性T细胞组合物治疗后分析的一组受试者,向在
曾持续发生不良事件的组中的那些受试者中的受试者给予的疗法的参考单位的最低数量。
[0808] 17.根据实施方案16的制品,其中所述不良事件是严重不良事件,任选地等于或高于4级或5级或至少延长的3级神经毒性的严重神经毒性。
[0809] 18.根据实施方案16或实施方案17的制品,其中RU的所述目标参考数量比单位的所述参考安全数量少了对应于安全系数的量或少了至少2倍。
[0810] 19.根据实施方案8-18中任一项的制品,其中参考单位的所述目标数量等于或高于参考单位的参考功效数量,其中所述参考功效数量是相对于在用包含所述重组受体、任
选地所述CAR的T细胞组合物治疗后分析的一组受试者,向展现出所希望的治疗结果、任选
地完全反应(CR)的组中的一名或多名受试者给予的疗法的参考单位的数量。
[0811] 20.根据实施方案1-19中任一项的制品,其中A是在所述给定组合物中存在的具有表型的细胞的数量,并且B是指示在所述给定组合物中的重组受体依赖性活性的程度或与
其相关的参数的值。
[0812] 21.根据实施方案1-20中任一项的制品,其中A和/或B分别是数量或值的变换,其中所述变换包括对数变换、幂变换或罗吉特(logit)变换。
[0813] 22.根据实施方案1-21中任一项的制品,其中A是在所述给定组合物中存在的具有表型的细胞的数量,并且B是指示在所述给定T细胞组合物中的CAR依赖性活性的程度或与
其相关的参数的值的倍数或变换,任选地其中B是所述值的对数变换。
[0814] 23.根据实施方案21或实施方案22的制品,其中所述对数变换是常用对数(log10(x))、自然对数(ln(x))或二元对数(log2(x))。
[0815] 24.根据实施方案1-23中任一项的制品,其中A是在所述组合物中的存活细胞的数量,和/或是不凋亡、不展现指示早期凋亡或指示凋亡的因子、不处于凋亡的早期阶段、或不处于凋亡的晚期阶段的细胞的数量,和/或是特定分化状态的细胞的数量,和/或是具有记
忆/干细胞样属性的细胞的数量或是其倍数或变换。
[0816] 25.根据实施方案1-24中任一项的制品,其中所述表型包括表面标记的阳性表达,所述表面标记是CD3、CD4或CD8中的一种或多种,和/或所述表型包括所述重组受体、任选地
所述CAR或用于表达所述重组受体的替代标记的阳性表达。
[0817] 26.根据实施方案25的制品,其中所述表型是CD3+CAR、CD4+/CAR+、CD8+/CAR+。
[0818] 27.根据实施方案1-26中任一项的制品,其中所述表型包括:不存在指示凋亡、或在凋亡级联或途径中的一个或多个步骤的因子,任选地不存在凋亡标记的表达。
[0819] 28.根据实施方案1-27中任一项的制品,其中所述表型包括凋亡标记、任选地早期凋亡或晚期凋亡标记的阴性表达。
[0820] 29.根据实施方案28的制品,其中所述凋亡标记是表面磷脂酰丝氨酸和/或用膜联蛋白V检测,或是半胱天冬酶的活性或前体形式,任选地半胱天冬酶3的活性或前体形式。
[0821] 30.根据实施方案1-29中任一项的制品,其中所述表型包括膜联蛋白-。
[0822] 31.根据实施方案1-30中任一项的制品,其中所述表型包含产生细胞因子的一种或组合的指示物,所述细胞因子的一种或组合任选地对抗原或重组受体是非特异性的和/
或是多克隆产生的,其中所述一种或多种细胞因子是IL-2、IL-13、IL-17、IFN-γ或TNF-α。
[0823] 32.根据实施方案31的制品,其中产生的所述指示物在测定、任选地细胞内细胞因子染色测定中进行测量,所述测定包括将所述T细胞组合物的样品与多克隆药剂、抗原特异
性药剂或结合所述重组受体、任选地CAR的药剂一起孵育。
[0824] 33.根据实施方案31或实施方案32的制品,其中所述药剂是或包含PMA和离子霉素,或者是或包含T细胞受体或T细胞受体复合物激动剂。
[0825] 34.根据实施方案1-33中任一项的制品,其中所述表型包括激活标记的阴性表达,其中所述激活标记选自CD25、CD127、LAG3、Ki67及其组合。
[0826] 35.根据实施方案1-34中任一项的制品,其中所述表型包括消耗标记的阴性表达,其中所述消耗标记是PD1或FOXP3基因产物或其组合。
[0827] 36.根据实施方案1-35中任一项的制品,其中所述表型包括幼稚表型或记忆表型,任选地其中所述记忆表型包括T效应记忆表型、T中央记忆表型或表达CD45RA(Temra)的T效
应记忆表型。
[0828] 37.根据实施方案1-36中任一项的制品,其中A是T细胞的总数、CD3+细胞的总数、CD4+或CD8+细胞的总数、CD3+CAR+细胞的总数、CD8+CAR+细胞的总数、CD4+CAR+总数、或任
何前述的活细胞或存活细胞的总数、或所述总数的倍数或变换值。
[0829] 38.根据实施方案1-37中任一项的制品,其中A是CD3+细胞的总数、CD8+的总数、CD3+CAR+细胞的总数、CD8+CAR+细胞的总数、或任何前述的活细胞或存活细胞的总数、或所
述总数的倍数或变换值。
[0830] 39.根据实施方案1-38中任一项的制品,其中A是为CD3+CAR+细胞的凋亡标记阴性(-)细胞的总数、为CD4+CAR+的凋亡标记阴性(-)细胞的总数、为CD8+CAR+细胞的凋亡标记
阴性(-)细胞的总数、或所述总数的倍数或变换值,其中所述凋亡标记是膜联蛋白V或活性
半胱天冬酶3。
[0831] 40.根据实施方案1-39中任一项的制品,其中A是凋亡标记-CD3+CAR+细胞的总数或凋亡标记-CD8+CAR+细胞的总数,任选地其中所述凋亡标记是膜联蛋白V或活性半胱天冬
酶3。
[0832] 41.一种制品,其包含:
[0833] (a)包含治疗性T细胞组合物的单位剂量的容器,所述治疗性T细胞组合物包含表达特异性地结合抗原的嵌合抗原受体(CAR)的T细胞,其中所述单位剂量含有所述治疗性T
细胞组合物的目标剂量,其中:
[0834] (i)如果指示所述组合物的重组受体依赖性活性的程度或与其相关的参数的值等于或大于阈值,则所述目标剂量是第一数量(或是在第一数量范围内)的在所述组合物中具
有给定表型的细胞;
[0835] (ii)如果所述参数的值小于所述阈值,则所述目标剂量是第二数量(或是在第二数量范围内)的在所述组合物中具有给定表型的细胞,
[0836] 其中所述第一数量(或第一范围)低于所述第二数量(或第二范围);以及
[0837] (b)用于将所述组合物、任选地其一个或多个单位剂量给予至受试者、任选地患有或怀疑患有疾病或病症的受试者的说明书。
[0838] 42.根据实施方案41的制品,其中所述重组受体依赖性活性的阈值小于参考安全值,其中所述参考安全值是相对于在用包含表达所述重组受体、任选地所述CAR的T细胞的
治疗性T细胞组合物治疗后分析的一组受试者,向在曾持续发生不良事件的组中的那些受
试者中的受试者给予的治疗性组合物的CAR依赖性活性的最低值。
[0839] 43.根据实施方案42的制品,其中所述不良事件是严重不良事件,任选地等于或高于4级或5级或至少延长的3级神经毒性的严重神经毒性。
[0840] 44.根据实施方案42或实施方案43的制品,其中所述阈值比所述参考安全值小了与安全系数对应的量或小了至少2倍。
[0841] 45.根据实施方案41-44中任一项的制品,其中所述第一数量比所述第二数量低了大于或大于约1.5倍、2.0倍、3.0倍、4.0倍、5.0倍、6.0倍、7.0倍、8.0倍、9.0倍、10.0倍或更多。
[0842] 46.一种制品,其包含:
[0843] (a)包含单位剂量的治疗性T细胞组合物的容器,所述治疗性T细胞组合物包含T细胞,所述T细胞包含特异性地结合抗原的任选地为嵌合抗原受体(CAR)的重组受体,其中:
[0844] 所述单位剂量含有所述治疗性T细胞组合物的目标剂量;并且
[0845] 所述治疗性T细胞组合物高于B的规格下限(LSL)且低于规格上限(USL),其中B是指示所述组合物的重组受体依赖性活性的程度或与其相关的参数的值;以及
[0846] (b)用于将所述组合物、任选地其一个或多个单位剂量给予至受试者、任选地患有或怀疑患有疾病或病症的受试者的说明书。
[0847] 47.根据实施方案46的制品,其中只有在所述组合物低于B的所述USL时所述产品才被释放用于治疗所述受试者。
[0848] 48.根据实施方案41-47中任一项的制品,其中所述重组受体依赖性活性是促炎性细胞因子、任选地TNF-α、IFN-γ、IL-2和IL-10的一种或组合的产生或积累的量度。
[0849] 49.实施方案1-48中任一项的制品,其中所述参数是一种或多种因子的量度或其归一化值。
[0850] 50.根据实施方案49的制品,其中所述量度是在如下测定中的,所述测定涉及在所述抗原、表达所述抗原的细胞和/或与所述重组受体、任选地所述CAR特异性地结合的药剂
的存在下将给定组合物或其样品培养或孵育固定的时间、任选地24小时。
[0851] 51.根据实施方案50的制品,其中所述测定是ELISA。
[0852] 52.根据实施方案49-51中任一项的制品,其中所述因子的所述量度是:
[0853] (i)所述因子的浓度、相对浓度、量或相对量;或
[0854] (ii)每单位的在所述给定组合物中的输入细胞而言所述因子的量或相对量,或
[0855] (iii)每单位时间、任选地一小时,每单位的在所述给定组合物中的输入细胞而言所述因子的量或相对量;或
[0856] (iv)指示(i)-(iii)中任何一项的水平。
[0857] 53.根据实施方案49-52中任一项的制品,其中所述一种或多种因子是可溶性因子的一种或组合,任选地细胞因子、趋化因子或可溶性受体中的一种或组合,所述可溶性受体
任选地为可溶性共刺激受体。
[0858] 54.根据实施方案49-53中任一项的制品,其中所述一种或多种因子是促炎性细胞因子、Th2细胞因子和Th17细胞因子中的一种或组合。
[0859] 55.根据实施方案49-54中任一项的制品,其中所述一种或多种因子是IL-2、IFN-γ、TNF-α、IL4、IL-5、IL-10、IL-13、GM-CSF、sCD137、MIP1a和M1Pb中的一种或组合。
[0860] 56.根据实施方案49-55中任一项的制品,其中所述一种或多种因子是IL-2、IFN-γ、TNF-α和IL-10中的一种或组合。
[0861] 57.根据实施方案53-56中任一项的制品,其中所述一种或多种因子是前述可溶性因子中的任何两种或更多种的组合,并且所述参数是所述两种或更多种因子的所述量度的
算术平均值或几何平均值。
[0862] 58.根据实施方案49-57中任一项的制品,其中所述参数是TNF-α、IFN-γ和IL-2中的至少两种或者TNF-α、IFN-γ和IL-2的量度的算术平均值或几何平均值,所述量度任选地
为量或浓度。
[0863] 59.根据实施方案49-58中任一项的制品,其中所述参数是所述量度的归一化值,其中归一化是与所述因子的参考量度相比较的。
[0864] 60.根据实施方案59的制品,其中所述参考量度是在包含所述嵌合抗原受体(CAR)的多种、任选地至少10种、至少15种、至少20种参考治疗性T细胞组合物中的所述量度的平
均值,其中:
[0865] (i)已经观察到或确定了每种所述参考治疗性T细胞组合物在向受试者给予后导致可接受的安全性特征,任选地其中所述受试者患有表达所述抗原或与所述抗原相关的疾
病或病症;和/或
[0866] (ii)已经观察到或确定了每种所述参考治疗性T细胞组合物在向受试者给予后导致所希望的功效,任选地其中所述受试者患有表达所述抗原或与所述抗原相关的疾病或病
症。
[0867] 61.根据实施方案60的制品,其中所述可接受的安全性特征是不存在观察到的2级或更高等级或不存在3级或更高等级的神经毒性。
[0868] 62.根据实施方案60或实施方案61的制品,其中所述可接受的安全性特征是不存在观察到的3级或更高等级的神经毒性。
[0869] 63.根据实施方案60-62中任一项的制品,其中所述功效是部分反应或是完全反应(CR)。
[0870] 64.根据实施方案59的制品,其中所述参考量度是通过相同的测定,所述因子在参考T细胞组合物中的所述量度,所述参考T细胞组合物是通过与所述治疗性T细胞组合物相
同的方法产生的,但不表达所述重组受体、任选地所述CAR、不特异性识别所述抗原和/或不
表达任何重组受体,任选地任何CAR。
[0871] 65.根据实施方案64的制品,其中将所述参数归一化以控制所述一种或多种因子的所述量度的患者特异性变异。
[0872] 66.根据实施方案64或实施方案65的制品,其中所述参数是与对照因子在相同测定中的相同量度相比所述因子的所述量度的归一化值,其中所述对照因子在治疗性T细胞
组合物中的水平已知不会、或已经观察到不会指示不良事件或毒性结果或不良事件或毒性
结果的可能性或风险或者与其相关或者与其显著相关,其中所述不良事件或毒性结果任选
地是严重神经毒性。
[0873] 67.根据实施方案66的制品,其中所述对照因子是与在给予所述T细胞组合物后持续发生所述不良事件的多名受试者中的所述不良事件的发生无统计学相关和/或不相关的
因子,任选地所述对照因子是或包含IL-5、IL-13、GM-CSF和IL-6的一种或组合,任选地其中所述对照因子的所述量度是前述中的两种或更多种的算术平均值或几何平均值。
[0874] 68.根据实施方案1-67中任一项的制品,其中所述参数不包含细胞溶解活性或其量度。
[0875] 69.根据实施方案1-68中任一项的制品,其中所述参数不包含重组受体依赖性或抗原特异性细胞溶解活性或其量度。
[0876] 70.根据实施方案1-40和49-69中任一项的制品,其中:
[0877] 所述表型是CD8+CAR+细胞或凋亡标记-CD8+CAR+细胞,任选地其中所述凋亡标记是膜联蛋白V或活性半胱天冬酶3;并且
[0878] 所述参数是促炎性细胞因子的量度或者是其归一化值,所述促炎性细胞因子任选地是TNF-α、IL-2和IFN-γ中的一种或组合。
[0879] 71.根据实施方案1-70中任一项的制品,其中所述不良事件是4级或5级神经毒性,并且单位的所述阈值数量:
[0880] 是或是约1.75x 107(如果A是凋亡标记阴性(-)和CD8+CAR+的,并且B是TNF-α)、或其归一化值;
[0881] 是或是约2.19x 107(如果A是CD8+CAR+的,并且B是TNF-α)、或其归一化值;
[0882] 是或是约1.25x 107(如果A是凋亡标记阴性(-)CD8+CAR+的,并且如果B是IFN-γ)、或其归一化值;
[0883] 是或是约1.56x 107(如果A是CD8+CAR+的,并且B是IFN-γ)、或其归一化值;
[0884] 是或是约1.5x 107(如果A是凋亡标记阴性(-)CD8+CAR+的,并且如果B是IL-2)、或其归一化值;
[0885] 是或是约1.88x 107(如果A是CD8+CAR+的,并且B是IL-2)、或其归一化值;
[0886] 是或是约1.5x 107(如果A是凋亡标记阴性(-)CD8+CAR+的,并且如果B是TNF-α和IFN-γ)、或其归一化值;
[0887] 是或是约1.88x 107(如果A是CD8+CAR+的,并且B是TNF-α和IFN-γ)、或其归一化值;
[0888] 是或是约2.0x 107(如果A是凋亡标记阴性(-)CD8+CAR+的,并且如果B是TNF-α和IL-2)、或其归一化值;
[0889] 是或是约2.5x 107(如果A是CD8+CAR+的,并且B是TNF-α和IL-2)、或其归一化值;
[0890] 是或是约1.25x 107(如果A是凋亡标记阴性(-)CD8+CAR+的,并且如果B是IFN-γ和IL-2)、或其归一化值;
[0891] 是或是约1.56x 107(如果A是CD8+CAR+的,并且B是IFN-γ和IL-2)、或其归一化值;
[0892] 是或是约1.75x 107(如果A是凋亡标记阴性(-)CD8+CAR+的,并且如果B是TNF-α、IFN-γ和IL-2)、或其归一化值;
[0893] 是或是约2.19x 107(如果A是CD8+CAR+的,并且B是TNF-α、IFN-γ和IL-2)、或其归一化值,
[0894] 任选地其中所述凋亡标记是膜联蛋白V或活性半胱天冬酶3。
[0895] 72.根据实施方案1-71中任一项的制品,其中所述不良事件是4级或5级神经毒性,并且所述目标参考单位的所述给定范围:
[0896] 是在或约在2.0x 105与1.75x 107之间(包含端值)(如果A是凋亡标记阴性(-)和CD8+CAR+的,并且B是TNF-α)、或其归一化值;
[0897] 是在或约在2.5x 105与2.19x 107之间(包含端值)(如果A是CD8+CAR+的,并且B是TNF-α)、或其归一化值;
[0898] 是在或约在4x 105与1.25x 107之间(包含端值)(如果A是凋亡标记阴性(-)CD8+CAR+的,并且如果B是IFN-γ)、或其归一化值;
[0899] 是在或约在5x 106与1.56x 107之间(包含端值)(如果A是CD8+CAR+的,并且B是IFN-γ)、或其归一化值;
[0900] 是在或约在2.0x 105与1.5x 107之间(包含端值)(如果A是凋亡标记阴性(-)CD8+CAR+的,并且如果B是IL-2)、或其归一化值;
[0901] 是在或约在2.5x 105与1.88x 107之间(包含端值)(如果A是CD8+CAR+的,并且B是IL-2)、或其归一化值;
[0902] 是在或约在3.0x 105与1.5x 107之间(包含端值)(如果A是凋亡标记阴性(-)CD8+CAR+的,并且如果B是TNF-α和IFN-γ)、或其归一化值;
[0903] 是在或约在3.75x 105与1.88x 107之间(包含端值)(如果A是CD8+CAR+的,并且B是TNF-α和IFN-γ)、或其归一化值;
[0904] 是在或约在3.0x 105与2.0x 107之间(包含端值)(如果A是凋亡标记阴性(-)CD8+CAR+的,并且如果B是TNF-α和IL-2)、或其归一化值;
[0905] 是在或约在3.75x 105与2.5x 107之间(包含端值)(如果A是CD8+CAR+的,并且B是TNF-α和IL-2)、或其归一化值;
[0906] 是在或约在4.0x 105与1.25x 107之间(包含端值)(如果A是凋亡标记阴性(-)CD8+CAR+的,并且如果B是IFN-γ和IL-2)、或其归一化值;
[0907] 是在或约在5.0x 105与1.56x 107之间(包含端值)(如果A是CD8+CAR+的,并且如果B是IFN-γ和IL-2)、或其归一化值;
[0908] 是在或约在4.0x 105与1.75x 107之间(包含端值)(如果A是凋亡标记阴性(-)CD8+CAR+的,并且如果B是TNF-α、IFN-γ和IL-2)、或其归一化值;
[0909] 是在或约在5.0x 105与2.19x 107之间(包含端值)(如果A是CD8+CAR+的,并且B是TNF-α、IFN-γ和IL-2)、或其归一化值,
[0910] 任选地其中所述凋亡标记是膜联蛋白V或活性半胱天冬酶3。
[0911] 73.根据实施方案1-70中任一项的制品,其中所述不良事件是至少延长的3级神经毒性,并且单位的所述阈值数量:
[0912] 是或是约1.0x 106(如果A是凋亡标记阴性(-)和CD8+CAR+的,并且B是TNF-α)、或其归一化值;
[0913] 是或是约1.25x 106(如果A是CD8+CAR+的,并且B是TNF-α)、或其归一化值;
[0914] 是或是约2.0x 106(如果A是凋亡标记阴性(-)CD8+CAR+的,并且如果B是IFN-γ)、或其归一化值;
[0915] 是或是约2.5x 106(如果A是CD8+CAR+的,并且B是IFN-γ)、或其归一化值;
[0916] 是或是约3.0x 106(如果A是凋亡标记阴性(-)CD8+CAR+的,并且如果B是IL-2)、或其归一化值;
[0917] 是或是约3.75x 106(如果A是CD8+CAR+的,并且B是IL-2)、或其归一化值;
[0918] 是或是约1.5x 106(如果A是凋亡标记阴性(-)CD8+CAR+的,并且如果B是TNF-α和IFN-γ)、或其归一化值;
[0919] 是或是约1.88x 106(如果A是CD8+CAR+的,并且B是TNF-α和IFN-γ)、或其归一化值;
[0920] 是或是约2.5x 106(如果A是凋亡标记阴性(-)CD8+CAR+的,并且如果B是TNF-α和IL-2)、或其归一化值;
[0921] 是或是约3.12x 106(如果A是CD8+CAR+的,并且B是TNF-α和IL-2)、或其归一化值;
[0922] 是或是约3.0x 106(如果A是凋亡标记阴性(-)CD8+CAR+的,并且如果B是IFN-γ和IL-2)、或其归一化值;
[0923] 是或是约3.75x 106(如果A是CD8+CAR+的,并且B是IFN-γ和IL-2)、或其归一化值;
[0924] 是或是约2.0x 106(如果A是凋亡标记阴性(-)CD8+CAR+的,并且如果B是TNF-α、IFN-γ和IL-2)、或其归一化值;
[0925] 是或是约2.5x 106(如果A是CD8+CAR+的,并且B是TNF-α、IFN-γ和IL-2)、或其归一化值,任选地其中所述凋亡标记是膜联蛋白V或活性半胱天冬酶3。
[0926] 74.根据实施方案1-70和73中任一项的制品,其中所述不良事件是至少延长的3级,并且所述目标参考单位的所述给定范围:
[0927] 是在或约在3.0x 105与1.0x 106之间(包含端值)(如果A是凋亡标记阴性(-)和CD8+CAR+的,并且B是TNF-α)、或其归一化值;
[0928] 是在或约在3.75x 105与1.25x 106之间(包含端值)(如果A是CD8+CAR+的,并且B是TNF-α)、或其归一化值;
[0929] 是在或约在4x 105与2.0x 106之间(包含端值)(如果A是凋亡标记阴性(-)CD8+CAR+的,并且如果B是IFN-γ)、或其归一化值;
[0930] 是在或约在5x 106与2.5x 106之间(包含端值)(如果A是CD8+CAR+的,并且B是IFN-γ)、或其归一化值;
[0931] 是在或约在2.0x 105与3.0x 106之间(包含端值)(如果A是凋亡标记阴性(-)CD8+CAR+的,并且如果B是IL-2)、或其归一化值;
[0932] 是在或约在2.5x 105与3.75x 106之间(包含端值)(如果A是CD8+CAR+的,并且B是IL-2)、或其归一化值;
[0933] 是在或约在3.0x 105与1.5x 106之间(包含端值)(如果A是凋亡标记阴性(-)CD8+CAR+的,并且如果B是TNF-α和IFN-γ)、或其归一化值;
[0934] 是在或约在3.75x 105与1.88x 106之间(包含端值)(如果A是CD8+CAR+的,并且B是TNF-α和IFN-γ)、或其归一化值;
[0935] 是在或约在3.0x 105与2.5x 106之间(包含端值)(如果A是凋亡标记阴性(-)CD8+CAR+的,并且如果B是TNF-α和IL-2)、或其归一化值;
[0936] 是在或约在3.75x 105与3.12x 106之间(包含端值)(如果A是CD8+CAR+的,并且B是TNF-α和IL-2)、或其归一化值;
[0937] 是在或约在4.0x 105与3.0x 106之间(包含端值)(如果A是凋亡标记阴性(-)CD8+CAR+的,并且如果B是IFN-γ和IL-2)、或其归一化值;
[0938] 是在或约在5.0x 105与3.75x 106之间(包含端值)(如果A是CD8+CAR+的,并且B是IFN-γ和IL-2)、或其归一化值;
[0939] 是在或约在4.0x 105与2.0x 106之间(包含端值)(如果A是凋亡标记阴性(-)CD8+CAR+的,并且如果B是TNF-α、IFN-γ和IL-2)、或其归一化值;
[0940] 是在或约在5.0x 105与2.5x 106之间(包含端值)(如果A是CD8+CAR+的,并且B是TNF-α、IFN-γ和IL-2)、或其归一化值,
[0941] 任选地其中所述凋亡标记是膜联蛋白V或活性半胱天冬酶3。
[0942] 75.根据实施方案1-74中任一项的制品,其中所述治疗性T细胞组合物包含在约1000万个细胞/mL与约7000万个细胞/mL之间、或在约1000万个存活细胞/mL与约7000万个
存活细胞/mL之间,每个都包含端值。
[0943] 76.根据实施方案1-75中任一项的制品,其中所述治疗性T细胞组合物包含在约1500万个细胞或存活细胞/mL与约6000万个细胞或存活细胞/mL之间,包含端值。
[0944] 77.根据实施方案1-76中任一项的制品,其中所述T细胞组合物包含大于1000万个细胞或存活细胞/mL。
[0945] 78.根据实施方案1-77中任一项的制品,其中所述治疗性T细胞组合物包含大于1500万个细胞或大于1500万个细胞/mL。
[0946] 79.根据实施方案1-78中任一项的制品,其中所述组合物进一步包含冷冻保护剂和/或所述制品进一步包括用于在给予至所述受试者之前将所述组合物解冻的说明书。
[0947] 80.根据实施方案1-79中任一项的制品,其中所述疾病或病症是癌症,任选地骨髓瘤、淋巴瘤或白血病。
[0948] 81.根据实施方案80的制品,其中所述疾病或病症是B细胞恶性肿瘤,任选地B细胞恶性肿瘤选自急性成淋巴细胞性白血病(ALL)、成人ALL、慢性成淋巴细胞性白血病(CLL)、
非霍奇金淋巴瘤(NHL)、和弥漫性大B细胞淋巴瘤(DLBCL)。
[0949] 82.根据实施方案1-81中任一项的制品,其中所述抗原是CD19、CD22、ROR1、Igκ、Her2、L1-CAM、CD20、间皮素、CEA、乙型肝炎表面抗原、抗叶酸受体、CD23、CD24、CD30、CD33、CD38、CD44、EGFR、EGP-2、EGP-4、EPHa2、ErbB2、ErbB3、ErbB4、FBP、胎儿乙酰胆碱受体、GD2、GD3、HMW-MAA、IL-22R-α、IL-13R-α2、kdr、κ轻链、路易斯Y、L1-细胞粘附分子、MAGE-A1、间皮素、MUC1、MUC16、PSCA、NKG2D配体、NY-ESO-1、MART-1、gp100、癌胚胎抗原、TAG72、VEGF-R2、癌胚抗原(CEA)、前列腺特异性抗原、PSMA、雌激素受体、孕酮受体、肝配蛋白B2、CD123、CS-
1、c-Met、GD-2、MAGE A3、CE7、Wilms肿瘤1(WT-1)和细胞周期蛋白A1(CCNA1)。
[0950] 83.根据实施方案1-82中任一项的制品,其中所述重组受体是CAR。
[0951] 84.根据实施方案83的制品,其中所述CAR包含与所述抗原特异性地结合的细胞外抗原识别结构域和包含ITAM的细胞内信号传导结构域,其中任选地,所述细胞内信号传导
结构域包含CD3-ζ(CD3ζ)链的细胞内结构域;和/或其中所述CAR进一步包含共刺激信号传
导区域,其任选地包含CD28或4-1BB的信号传导结构域。
[0952] 85.根据实施方案1-84中任一项的制品,其中所述T细胞是CD4+或CD8+。
[0953] 86.根据实施方案1-85中任一项的制品,其中所述T细胞是从受试者获得的原代T细胞。
[0954] 87.根据实施方案1-86中任一项的制品,其中所述制品进一步含有指示容器包含所述目标数量的单位的信息。
[0955] 88.根据实施方案1-87中任一项的制品,其中所述容器是第一容器,并且所述制品进一步包含另外的容器,其中每个所述另外的容器包含单位剂量,所述单位剂量包含所述
目标数量的T细胞组合物的单位。
[0956] 89.根据实施方案88的制品,其中所述另外的容器包含在约1000万个细胞或存活细胞/mL与约7000万个细胞或存活细胞/mL之间、在约1500万个细胞或存活细胞与约6000万
个细胞或存活细胞/mL之间,每个都包含端值;或大于1000万个细胞或存活细胞/mL、大于
1500万个细胞或存活细胞/mL、或其组合。
[0957] 90.根据实施方案1-89中任一项的制品,其中所述单位剂量含有不超过15x 106数量的CD8+CAR+细胞,所述CD8+CAR+细胞对于膜联蛋白V的检测或对于半胱天冬酶3的活性或
前体形式呈阴性。
[0958] 91.根据实施方案1-90中任一项的制品,其中所述单位剂量进一步包含一个数量的呈CAR阳性的CD4+细胞,其中所述数量是与CD8+CAR+细胞的比率为或为约1:1。
[0959] 92.根据实施方案1-91中任一项的制品组合物,其中所述T细胞组合物通过如下的过程生产,在所述过程中:
[0960] 具有指示生物活性细胞特征和/或不存在凋亡或早期或晚期凋亡的表型的细胞(1)在所述组合物中的CAR+细胞中、(2)在所述组合物中的CAR+CD3+细胞中、和/或(3)在所
述组合物中的CAR+CD8+细胞中的频率,与在通过所述过程产生的多种T细胞组合物中的所
述频率的平均值相比变化不超过40%、或不超过30%、或不超过20%或不超过10%或不超
过5%和/或与这种平均值相比变化不超过一个标准偏差;或
[0961] 或者在所述组合物中具有指示不存在凋亡或早期或晚期凋亡的表型的细胞(1)在所述组合物中的CAR+细胞中、(2)在所述组合物中的CAR+CD3+细胞中、和/或(3)在所述组合
物中的CAR+CD8+细胞中的频率,与在通过所述过程生产的多种T细胞组合物相比变化不超
过40%或不超过20%或不超过10%。
[0962] 93.根据实施方案92的制品,其中所述过程包括:
[0963] (a)在一定条件下将包含T细胞的细胞群与包含编码所述重组受体的核酸分子的药剂一起孵育,以将编码所述重组受体的所述核酸引入所述群体的细胞中;并且
[0964] (b)在所述孵育之前、期间和/或之后刺激所述细胞,其中刺激包括在刺激条件的存在下孵育所述细胞,所述刺激条件诱导所述细胞的初级信号、信号传导、刺激、激活和/或扩增。
[0965] 94.根据实施方案93的制品,其中所述过程进一步包括在(a)之前从生物样品中分离细胞的所述群体。
[0966] 95.根据实施方案94的制品,其中所述分离包括,基于CD3的表面表达或基于CD4和CD8之一或两者的表面表达来选择细胞,任选地通过阳性或阴性选择。
[0967] 96.根据实施方案94或实施方案95的制品,其中所述分离包括进行基于免疫亲和的选择。
[0968] 97.根据实施方案94-96的制品,其中所述生物样品是或包含全血样品、血沉棕黄层样品、外周血单核细胞(PBMC)样品、未分级T细胞样品、淋巴细胞样品、白细胞样品、单采术产物或白细胞分离术产物。
[0969] 98.实施方案93-97中任一项的制品,其中所述刺激条件包括与能够激活TCR复合物的一种或多种组分的一个或多个细胞内信号传导结构域和/或一种或多种共刺激分子的
一个或多个细胞内信号传导结构域的刺激试剂一起孵育。
[0970] 99.根据实施方案98的制品,其中所述刺激试剂包含与TCR复合物的成员特异性地结合的一级药剂和与T细胞共刺激分子特异性地结合的二级药剂。
[0971] 100.根据实施方案98或实施方案99的制品,其中所述一级药剂特异性地结合CD3和/或所述共刺激分子选自CD28、CD137(4-1-BB)、OX40或ICOS。
[0972] 101.根据实施方案99或实施方案100的制品,其中所述一级药剂和所述二级药剂包含抗体和/或存在于固体支持物、任选地珠的表面上。
[0973] 102.根据实施方案98-101中任一项的制品,其中:
[0974] 所述刺激试剂是如下的一种:其中已经确定重组受体依赖性活性或抗原特异性活性,任选地促炎性细胞因子的重组受体依赖性或抗原特异性依赖性产生或积累,与使用所
述刺激试剂通过所述过程生产的多种T细胞组合物中的促炎性细胞因子的产生或积累的量
度的平均值相比变化不超过40%、或不超过30%、或不超过20%或不超过10%或不超过
5%,和/或与这种平均值相比变化不超过一个标准偏差;和/或
[0975] 所述刺激试剂是如下的一种:其中已经确定重组受体依赖性活性或抗原特异性活性,任选地促炎性细胞因子的重组受体依赖性或抗原特异性依赖性产生或积累,在通过所
述过程生产的多种T细胞组合物中变化不超过40%、或不超过30%、或不超过20%或不超过
10%或不超过5%;和/或
[0976] 所述刺激试剂是如下的一种:其中已经确定重组受体依赖性活性或抗原特异性活性,任选地使用所述刺激试剂生产的细胞组合物的促炎性细胞因子的重组受体依赖性或抗
原特异性依赖性产生或积累,与对照组合物相比变化不超过40%、不超过30%、不超过20%
或不超过10%或不超过5%,其中除了所述对照组合物在对照刺激试剂或所述重组受体依
赖性活性的标准单位的存在下进行之外,所述对照组合物和所述细胞组合物使用相同的过
程、包括从相同的细胞群生产。
[0977] 103.根据实施方案102的制品,其中当在所述过程中使用时,已知所述对照刺激试剂生产其中所述重组受体依赖性活性或抗原特异性活性是在可接受的变异范围内的T细胞
组合物。
[0978] 104.根据实施方案93-103中任一项的制品,其中对所述细胞的所述刺激是在任选地在或约37度下持续18-24小时的所述孵育之前进行或开始。
[0979] 105.根据实施方案93-104中任一项的制品,其中所述刺激条件包括选自IL-2、IL-15和IL-7的细胞因子。
[0980] 106.根据实施方案93-105中任一项的制品,其中对细胞的所述刺激在任选地持续一段时间以实现阈值浓度的所述孵育之后进行。
[0981] 107.根据实施方案93-106中任一项的制品,其进一步包括(c)向容器中填充所述T细胞组合物的全部或部分和任选地另一种溶液,至浓度在约1000万个细胞与约7000万个细
胞/mL之间,包含端值。
[0982] 108.根据实施方案107的制品,其中所述容器填充有另一种溶液,并且所述溶液包含冷冻保护剂,任选地DMSO。
[0983] 109.根据实施方案107或实施方案108的制品,其中所述浓度在约1500万个与约6000万个细胞/mL之间,包含端值。
[0984] 110.根据实施方案107-109中任一项的制品,其中所述浓度大于1000万个细胞/mL。
[0985] 111.根据实施方案107-110中任一项的制品,其中所述浓度大于1500万个细胞/mL。
[0986] 112.根据实施方案107-111中任一项的制品,其中DMSO的所述浓度是或是约或不超过7.5%。
[0987] 113.根据实施方案107或实施方案108的制品,其中所述浓度大于6000万个细胞/mL。
[0988] 114.根据实施方案107-108和113中任一项的制品,其中DMSO的所述浓度大于7.5%,任选地在或约在7.5%与9.0%之间,包含端值。
[0989] 115.根据实施方案93-114中任一项的制品,其中包含编码所述重组受体的核酸分子的所述药剂是病毒载体,任选地慢病毒载体或γ逆转录病毒载体。
[0990] 116.根据实施方案107-115中任一项的制品,其中所述填充以自动方式进行,任选地在封闭的系统中进行。
[0991] 117.根据实施方案93-116中任一项的制品,其进一步包括将所述容器中的所述细胞冷冻或将所述容器存储在低于或约低于80℃的温度下。
[0992] 118.一种治疗方法,所述方法包括向患有疾病或病症的受试者给予T细胞组合物的单位剂量,所述T细胞组合物包含含有特异性地结合与疾病或病症相关的抗原的重组受
体、任选地嵌合抗原受体(CAR)的细胞,其中所述单位剂量含有在给定范围内的目标数量的
参考单位(RU),其中在给定组合物中的RU由下式定义:
[0993] RU=A x B,其中:
[0994] A是在所述给定组合物中存在的具有表型的细胞的数量、或其倍数、分数或变换,或者是在所述给定组合物中具有两种或更多种表型的细胞的数量的平均值或加权平均值、
或所述平均值或加权平均值的倍数、分数或变换;并且
[0995] B是指示在所述给定组合物中重组受体依赖性、任选地CAR依赖性活性的程度或与其相关的参数的值、或所述值的倍数或变换。
[0996] 119.根据实施方案118的方法,其中A是在所述给定组合物中存在的给定表型的细胞的数量、或其倍数或分数或变换。
[0997] 120.根据实施方案118的方法,其中A是在所述给定组合物中具有两种或更多种表型的细胞的数量的平均值或加权平均值、或所述平均值或加权平均值的倍数、分数或变换。
[0998] 121.根据实施方案118-120中任一项的方法,其中单位的所述目标数量小于RU的阈值数量,所述阈值数量任选地是参考单位的安全数量,其中,参考单位的所述安全数量是
相对于在用包含表达所述重组受体、任选地所述CAR的T细胞的治疗性T细胞组合物治疗后
分析的一组受试者,向在曾持续发生不良事件的组中的那些受试者中的受试者给予的疗法
的参考单位的最低数量。
[0999] 122.根据实施方案121的方法,其中所述不良事件是严重不良事件,任选地严重神经毒性,任选地等于或高于4级或5级或至少延长的3级神经毒性。
[1000] 123.根据实施方案121或实施方案122的方法,其中参考单位的所述目标数量比参考单位的所述安全数量少了对应于安全系数的量和/或少了在1.5倍至3倍范围内、任选地
约2倍的量、或少了为未发生过所述不良事件、任选地0-2级神经毒性的一组受试者的标准
偏差的倍数的量,任选地其中所述倍数在1.5倍至3倍的范围内。
[1001] 124.根据实施方案118-123中任一项的方法,其中参考单位的所述目标数量等于或高于参考单位的参考功效数量,其中所述参考功效数量是相对于在用包含所述重组受
体、任选地所述CAR的治疗性T细胞组合物治疗后分析的一组受试者,向展现出所希望的治
疗结果、任选地部分反应或完全反应(CR)的组中的一名或多名受试者给予的疗法的单位的
数量。
[1002] 125.一种治疗方法,所述方法包括向患有疾病或病症的受试者给予T细胞组合物的单位剂量,所述T细胞组合物包含如下细胞,所述细胞包含特异性地结合与所述疾病或病
症相关的抗原的重组受体、任选地嵌合抗原受体(CAR),其中所述单位剂量含有或含有约
(i)目标数量的总重组受体表达细胞或目标数量的总CD8+重组受体表达细胞,或者(ii)在
给定范围内的目标数量的参考单位(RU),所述目标数量等于或低于RU的阈值数量,其中所
述单位剂量不含有大于所述阈值数量的RU,
[1003] 其中在给定组合物中的RU的数量由下式定义:
[1004] RU=A x B,其中
[1005] A是在所述给定组合物中存在的具有表型的细胞的数量、或其倍数或变换,或者是在所述给定组合物中具有两种或更多种表型的细胞的数量的平均值或加权平均值、或所述
平均值或加权平均值的倍数、分数或变换;并且
[1006] B是指示在所述给定T细胞组合物中重组受体依赖性、任选地CAR依赖性活性的程度或与其相关的参数的值、或所述值的倍数或变换。
[1007] 126.根据实施方案125的方法,其中A是在所述给定组合物中存在的给定表型的细胞的数量、或其倍数或分数或变换。
[1008] 127.根据实施方案125的方法,其中A是在所述给定组合物中具有两种或更多种表型的细胞的数量的平均值或加权平均值、或所述平均值或加权平均值的倍数、分数或变换。
[1009] 128.根据实施方案118-127中任一项的方法,其中所述目标数量是重组受体表达细胞的目标数量,所述重组受体表达细胞呈CD3+或CD8+、呈凋亡标记阴性(-)和CD3+或CD8
+,任选地其中所述凋亡标记是膜联蛋白V或活性半胱天冬酶3。
[1010] 129.根据实施方案125-128中任一项的方法,其中在(i)中的所述目标数量的细胞为:在或在约5.0x 106个与2.25x 107个之间、5.0x 106个与2.0x 107个之间、5.0x 106个与
1.5x 107个之间、5.0x 106个与1.0x 107个之间、5.0x 106个与7.5x 106个之间、7.5x 106个与2.25x 107个之间、7.5x 106个与2.0x 107个之间、7.5x 106个与1.5x 107个之间、7.5x 
6 7 7 7 7 7
10个与1.0x 10 个之间、1.0x 10 个与2.25x 10 个之间、1.0x 10个与2.0x 10 个之间、
1.0x 107个与1.5x 107个之间、1.5x 107个与2.25x 107个之间、1.5x 107个与2.0x 107个之间、2.0x 107个与2.25x 107个之间的重组受体表达细胞(每个都包含端值),任选地呈CD8+
的或呈凋亡标记阴性(-)和CD8+的重组受体表达细胞,任选地其中所述凋亡标记是膜联蛋
白V或活性半胱天冬酶3。
[1011] 130.根据实施方案125-129中任一项的方法,其中在(i)中的所述目标数量的细胞为:
[1012] 在至少或至少约5x 106个、6x 106个、7x 106个、8x 106个、9x 106个、10x 106个与约15x 106个之间的重组受体表达细胞,每个都包含端值,任选地呈CD8+的或呈凋亡标记阴性(-)和CD8+的重组受体表达细胞,任选地其中所述凋亡标记是膜联蛋白V或活性半胱天冬
酶3;
[1013] 在至少或至少约5.55x 106个、6.66x 106个、7.77x 106个、8.99x 106个、1.0x 107个、1.1x 107个与约1.67x 107个之间的重组受体表达细胞,每个都包含端值,任选地呈CD8+的或呈凋亡标记阴性(-)和CD8+的重组受体表达细胞,任选地其中所述凋亡标记是膜联蛋白V或活性半胱天冬酶3;
[1014] 在至少或至少约6.25x 106个、7.5x 106个、8.75x 106个、1.0x 107个、1.13x 107个、1.25x 107个与约1.9x 107个之间的重组受体表达细胞,每个都包含端值,任选地呈CD8+的或呈凋亡标记阴性(-)和CD8+的重组受体表达细胞,任选地其中所述凋亡标记是膜联蛋
白V或活性半胱天冬酶3;
[1015] 在至少或至少约7.14x 106个、8.5x 106个、1.0x 107个、1.14x 107个、1.29x 107个、1.42x 107个与约2.14x 107个之间的重组受体表达细胞,每个都包含端值,任选地呈CD8+的或呈凋亡标记阴性(-)和CD8+的重组受体表达细胞,任选地其中所述凋亡标记是膜联蛋
白V或活性半胱天冬酶3。
[1016] 131.根据实施方案125-130中任一项的方法,其中在(i)中的所述目标数量的细胞为:在至少或至少约5x 106个、6x 106个、7x 106个、8x 106个、9x 106个、10x 106个与约15x 
106个之间的是凋亡标记阴性(-)和CD8+的重组受体表达细胞,每个都包含端值,任选地其
中所述凋亡标记是膜联蛋白V或活性半胱天冬酶3。
[1017] 132.根据实施方案125-130中任一项的方法,其中在(i)中的所述目标数量的细胞为:在至少或至少约6.25x 106个、7.5x 106个、8.75x 106个、1.0x 107个、1.13x 107个、
1.25x 107个与约1.9x 107个之间的呈CD8+的重组受体表达细胞,每个都包含端值。
[1018] 133.根据实施方案118-132中任一项的方法,其中RU的所述目标参考数量小于RU的参考安全数量,其中RU的所述参考安全数量是相对于在用包含表达所述重组受体、任选
地所述CAR的T细胞的治疗性T细胞组合物治疗后分析的一组受试者,向在曾持续发生不良
事件的组中的那些受试者中的受试者给予的疗法的参考单位的最低数量。
[1019] 134.根据实施方案133的方法,其中所述不良事件是严重不良事件,任选地等于或高于4级或5级或至少延长的3级神经毒性的严重神经毒性。
[1020] 135.根据实施方案133或实施方案134的方法,其中RU的所述目标参考数量比单位的所述参考安全数量少了对应于安全系数的量或少了至少2倍。
[1021] 136.根据实施方案118-135中任一项的方法,其中参考单位的所述目标数量等于或高于参考单位的参考功效数量,其中所述参考功效数量是相对于在用包含所述重组受
体、任选地所述CAR的T细胞组合物治疗后分析的一组受试者,向展现出所希望的治疗结果、
任选地完全反应(CR)的组中的一名或多名受试者给予的疗法的参考单位的数量。
[1022] 137.根据实施方案118-136中任一项的方法,其中A是在所述给定组合物中存在的具有表型的细胞的数量,并且B是指示在所述给定组合物中的重组受体依赖性活性的程度
或与其相关的参数的值。
[1023] 138.根据实施方案118-137中任一项的方法,其中A和/或B分别是数量或值的变换,其中所述变换包括对数变换、幂变换或罗吉特(logit)变换。
[1024] 139.根据实施方案118-138中任一项的方法,其中A是在所述给定组合物中存在的具有表型的细胞的数量,并且B是指示在所述给定T细胞组合物中的CAR依赖性活性的程度
或与其相关的参数的值的倍数或变换,任选地其中B是所述值的对数变换。
[1025] 140.根据实施方案138或实施方案139的方法,其中所述对数变换是常用对数(log10(x))、自然对数(ln(x))或二元对数(log2(x))。
[1026] 141.根据实施方案118-140中任一项的方法,其中A是在所述组合物中的存活细胞的数量,和/或是不凋亡、不展现指示早期凋亡或指示凋亡的因子、不处于凋亡的早期阶段、或不处于凋亡的晚期阶段的细胞的数量,和/或是特定分化状态的细胞的数量,和/或是具
有记忆/干细胞样属性的细胞的数量,或是这些数量的倍数或变换。
[1027] 142.根据实施方案118-141中任一项的方法,其中所述表型包括表面标记的阳性表达,所述表面标记是CD3、CD4或CD8中的一种或多种,和/或所述表型包括所述重组受体、
任选地所述CAR或用于表达所述重组受体的替代标记的阳性表达。
[1028] 143.根据实施方案142的方法,其中所述表型是CD3+CAR、CD4+/CAR+、CD8+/CAR+。
[1029] 144.根据实施方案118-143中任一项的方法,其中所述表型包括:不存在指示凋亡、或在凋亡级联或途径中的一个或多个步骤的因子,任选地不存在凋亡标记的表达。
[1030] 145.根据实施方案118-144中任一项的方法,其中所述表型包括凋亡标记、任选地早期凋亡或晚期凋亡标记的阴性表达。
[1031] 146.根据实施方案145的方法,其中所述凋亡标记是表面磷脂酰丝氨酸和/或用膜联蛋白V检测,或是半胱天冬酶的活性或前体形式,任选地半胱天冬酶3的活性或前体形式。
[1032] 147.根据实施方案118-146中任一项的方法,其中所述表型包括膜联蛋白-。
[1033] 148.根据实施方案118-147中任一项的方法,其中所述表型包含产生细胞因子的一种或组合的指示物,所述细胞因子的一种或组合任选地对抗原或重组受体是非特异性的
和/或是多克隆产生的,其中所述一种或多种细胞因子是IL-2、IL-13、IL-17、IFN-γ或TNF-α。
[1034] 149.根据实施方案148的方法,其中产生的所述指示物在测定、任选地细胞内细胞因子染色测定中进行测量,所述测定包括将所述T细胞组合物的样品与多克隆药剂、抗原特
异性药剂或结合所述重组受体、任选地CAR的药剂一起孵育。
[1035] 150.根据实施方案148或实施方案149的方法,其中所述药剂是或包含PMA和离子霉素,或者是或包含T细胞受体或T细胞受体复合物激动剂。
[1036] 151.根据实施方案118-150中任一项的方法,其中所述表型包括激活标记的阴性表达,其中所述激活标记选自CD25、CD127、LAG3、Ki67及其组合。
[1037] 152.根据实施方案118-151中任一项的方法,其中所述表型包括消耗标记的阴性表达,其中所述消耗标记是PD1或FOXP3基因产物或其组合。
[1038] 153.根据实施方案118-152中任一项的方法,其中所述表型包括幼稚表型或记忆表型,任选地其中所述记忆表型包括T效应记忆表型、T中央记忆表型或表达CD45RA(Temra)
的T效应记忆表型。
[1039] 154.根据实施方案118-153中任一项的方法,其中A是T细胞的总数、CD3+细胞的总数、CD4+或CD8+细胞的总数、CD3+CAR+细胞的总数、CD8+CAR+细胞的总数、CD4+CAR+总数、或任何前述的活细胞或存活细胞的总数、或所述总数的倍数或变换值。
[1040] 155.根据实施方案118-154中任一项的方法,其中A是CD3+细胞的总数、CD8+的总数、CD3+CAR+细胞的总数、CD8+CAR+细胞的总数、或任何前述的活细胞或存活细胞的总数、
或所述总数的倍数或变换值。
[1041] 156.根据实施方案118-155中任一项的方法,其中A是为CD3+CAR+细胞的凋亡标记阴性(-)细胞的总数、为CD4+CAR+的凋亡标记阴性(-)细胞的总数、为CD8+CAR+细胞的凋亡
标记阴性(-)细胞的总数、或所述总数的倍数或变换值,其中所述凋亡标记是膜联蛋白V或
半胱天冬酶。
[1042] 157.根据实施方案118-156中任一项的方法,其中A是凋亡标记-CD3+CAR+细胞的总数或凋亡标记-CD8+CAR+细胞的总数,其中所述凋亡标记是膜联蛋白V或半胱天冬酶。
[1043] 158.一种治疗方法,所述方法包括向患有疾病或病症的受试者给予T细胞组合物的单位剂量,所述T细胞组合物包含含有特异性地结合与所述疾病或病症相关的抗原的重
组受体、任选地嵌合抗原受体(CAR)的细胞,其中所述单位剂量含有所述治疗性T细胞组合
物的目标剂量:
[1044] (i)如果指示所述组合物的重组受体依赖性、任选地CAR依赖性活性的程度或与其相关的参数的值等于或大于阈值,则所述目标剂量是第一数量(或是在第一数量范围内)的
在所述组合物中具有给定表型的细胞;
[1045] (ii)如果所述参数的值小于所述阈值,则所述目标剂量是第二数量(或是在第二数量范围内)的在所述组合物中具有给定表型的细胞,
[1046] 其中所述第一数量(或第一范围)低于所述第二数量(或第二范围)。
[1047] 159.根据实施方案158的方法,其中所述重组受体依赖性活性的阈值小于参考安全值,其中所述参考安全值是相对于在用包含表达所述重组受体、任选地所述CAR的T细胞
的治疗性T细胞组合物治疗后分析的一组受试者,向在曾持续发生不良事件的组中的那些
受试者中的受试者给予的治疗性组合物的CAR依赖性活性的最低值。
[1048] 160.根据实施方案159的方法,其中所述不良事件是严重不良事件,任选地等于或高于4级或5级或至少延长的3级神经毒性的严重神经毒性。
[1049] 161.根据实施方案159或实施方案160的方法,其中所述阈值比所述参考安全值小了与安全系数对应的量或小了至少2倍。
[1050] 162.根据实施方案159-161中任一项的方法,其中所述第一数量比所述第二数量低了大于或大于约1.5倍、2.0倍、3.0倍、4.0倍、5.0倍、6.0倍、7.0倍、8.0倍、9.0倍、10.0倍或更多。
[1051] 163.根据实施方案118-162中任一项的方法,其中所述重组受体依赖性活性是促炎性细胞因子、任选地TNF-α、IFN-γ、IL-2和IL-10的一种或组合的产生或积累的量度。
[1052] 164.根据实施方案118-163中任一项的方法,其中所述参数是一种或多种因子的量度或其归一化值。
[1053] 165.根据实施方案164的方法,其中所述量度是在如下测定中的,所述测定涉及在所述抗原、表达所述抗原的细胞和/或与所述重组受体、任选地所述CAR特异性地结合的药
剂的存在下将给定组合物或其样品培养或孵育固定的时间、任选地24小时。
[1054] 166.根据实施方案165的方法,其中所述测定是ELISA。
[1055] 167.根据实施方案164-166中任一项的方法,其中所述因子的所述量度是:
[1056] (i)所述因子的浓度、相对浓度、量或相对量;或
[1057] (ii)每单位的在所述给定组合物中的输入细胞而言所述因子的量或相对量,或
[1058] (iii)每单位时间、任选地一小时,每单位的在所述给定组合物中的输入细胞而言所述因子的量或相对量;或
[1059] (iv)指示(i)-(iii)中任何一项的水平。
[1060] 168.根据实施方案164-167中任一项的方法,其中所述一种或多种因子是可溶性因子的一种或组合,任选地细胞因子、趋化因子或可溶性受体中的一种或组合,所述可溶性
受体任选地为可溶性共刺激受体。
[1061] 169.根据实施方案164-168中任一项的方法,其中所述一种或多种因子是促炎性细胞因子、Th2细胞因子和Th17细胞因子中的一种或组合。
[1062] 170.根据实施方案164-169中任一项的方法,其中所述一种或多种因子是IL-2、IFN-γ、TNF-α、IL4、IL-5、IL-10、IL-13、GM-CSF、sCD137、MIP1a和M1Pb中的一种或组合。
[1063] 171.根据实施方案164-170中任一项的方法,其中所述一种或多种因子是IL-2、IFN-γ、TNF-α和IL-10中的一种或组合。
[1064] 172.根据实施方案168-171中任一项的方法,其中所述一种或多种因子是前述可溶性因子中的任何两种或更多种的组合,并且所述参数是所述两种或更多种因子的所述量
度的算术平均值或几何平均值。
[1065] 173.根据实施方案168-172中任一项的方法,其中所述参数是TNF-α、IFN-γ和IL-2中的至少两种或者TNF-α、IFN-γ和IL-2的量度的算术平均值或几何平均值,所述量度任
选地为量或浓度。
[1066] 174.根据实施方案164-173中任一项的方法,其中所述参数是所述量度的归一化值,其中归一化是与所述因子的参考量度相比较的。
[1067] 175.根据实施方案174的制品,其中所述参考量度是在包含所述嵌合抗原受体(CAR)的多种、任选地至少10种、至少15种、至少20种参考治疗性T细胞组合物中的所述量度
的平均值,其中:
[1068] (i)已经观察到或确定了每种所述参考治疗性T细胞组合物在向受试者给予后导致可接受的安全性特征,任选地其中所述受试者患有表达所述抗原或与所述抗原相关的疾
病或病症;和/或
[1069] (ii)已经观察到或确定了每种所述参考治疗性T细胞组合物在向受试者给予后导致所希望的功效,任选地其中所述受试者患有表达所述抗原或与所述抗原相关的疾病或病
症。
[1070] 176.根据实施方案175的方法,其中所述可接受的安全性特征是不存在观察到的2级或更高等级或不存在3级或更高等级的神经毒性。
[1071] 177.根据实施方案175或实施方案176的方法,其中所述可接受的安全性特征是不存在观察到的3级或更高等级的神经毒性。
[1072] 178.根据实施方案177中任一项的方法,其中所述功效是部分反应或是完全反应(CR)。
[1073] 179.根据实施方案178的方法,其中所述参考量度是通过相同的测定,所述因子在参考T细胞组合物中的所述量度,所述参考T细胞组合物是通过与所述治疗性T细胞组合物
相同的方法产生的,但不表达所述重组受体、任选地所述CAR、不特异性识别所述抗原和/或
不表达任何重组受体,任选地任何CAR。
[1074] 180.根据实施方案179的方法,其中将所述参数归一化以控制所述一种或多种因子的所述量度的患者特异性变异。
[1075] 181.根据实施方案179或实施方案180的方法,其中所述参数是与对照因子在相同测定中的相同量度相比所述因子的所述量度的归一化值,其中所述对照因子在治疗性T细
胞组合物中的水平已知不会、或已经观察到不会指示不良事件或毒性结果或不良事件或毒
性结果的可能性或风险或者与其相关或者与其显著相关,其中所述不良事件或毒性结果任
选地是严重神经毒性。
[1076] 182.根据实施方案181的方法,其中所述对照因子是或包含与在给予所述T细胞组合物后持续发生所述不良事件的多名受试者中的所述不良事件的发生无统计学相关和/或
不相关的因子,任选地所述对照因子是IL-5、IL-13、GM-CSF和IL-6的一种或组合,任选地其中所述对照因子的所述量度是前述中的两种或更多种的算术平均值或几何平均值。
[1077] 183.根据实施方案118-182中任一项的方法,其中所述参数不包含细胞溶解活性或其量度。
[1078] 184.根据实施方案118-183中任一项的方法,其中所述参数不包含重组受体依赖性或抗原特异性细胞溶解活性或其量度。
[1079] 185.根据实施方案118-184中任一项的方法,其中:
[1080] 所述表型是CD8+CAR+细胞或凋亡标记-CD8+CAR+细胞,任选地其中所述凋亡标记是膜联蛋白V或活性半胱天冬酶3;并且
[1081] 所述参数是促炎性细胞因子的量度或者是其归一化值,所述促炎性细胞因子任选地是TNF-α、IL-2和IFN-γ中的一种或组合。
[1082] 186.根据实施方案118-185中任一项的方法,其中所述不良事件是4级或5级神经毒性,并且所述阈值:
[1083] 是或是约1.75x 107(如果A是凋亡标记阴性(-)和CD8+CAR+的,并且B是TNF-α)、或其归一化值;
[1084] 是或是约2.19x 107(如果A是CD8+CAR+的,并且B是TNF-α)、或其归一化值;
[1085] 是或是约1.25x 107(如果A是凋亡标记阴性(-)CD8+CAR+的,并且如果B是IFN-γ)、或其归一化值;
[1086] 是或是约1.56x 107(如果A是CD8+CAR+的,并且B是IFN-γ)、或其归一化值;
[1087] 是或是约1.5x 107(如果A是凋亡标记阴性(-)CD8+CAR+的,并且如果B是IL-2)、或其归一化值;
[1088] 是或是约1.88x 107(如果A是CD8+CAR+的,并且B是IL-2)、或其归一化值;
[1089] 是或是约1.5x 107(如果A是凋亡标记阴性(-)CD8+CAR+的,并且如果B是TNF-α和IFN-γ)、或其归一化值;
[1090] 是或是约1.88x 107(如果A是CD8+CAR+的,并且B是TNF-α和IFN-γ)、或其归一化值;
[1091] 是或是约2.0x 107(如果A是凋亡标记阴性(-)CD8+CAR+的,并且如果B是TNF-α和IL-2)、或其归一化值;
[1092] 是或是约2.5x 107(如果A是CD8+CAR+的,并且B是TNF-α和IL-2)、或其归一化值;
[1093] 是或是约1.25x 107(如果A是凋亡标记阴性(-)CD8+CAR+的,并且如果B是IFN-γ和IL-2)、或其归一化值;
[1094] 是或是约1.56x 107(如果A是CD8+CAR+的,并且B是IFN-γ和IL-2)、或其归一化值;
[1095] 是或是约1.75x 107(如果A是凋亡标记阴性(-)CD8+CAR+的,并且如果B是TNF-α、IFN-γ和IL-2)、或其归一化值;
[1096] 是或是约2.19x 107(如果A是CD8+CAR+的,并且B是TNF-α、IFN-γ和IL-2)、或其归一化值,
[1097] 任选地其中所述凋亡标记是膜联蛋白V或活性半胱天冬酶3。
[1098] 187.根据实施方案118-186中任一项的方法,其中所述不良事件是4级或5级神经毒性,并且所述目标参考单位的所述给定范围:
[1099] 是在或约在2.0x 105与1.75x 107之间(包含端值)(如果A是凋亡标记阴性(-)和CD8+CAR+的,并且B是TNF-α)、或其归一化值;
[1100] 是在或约在2.5x 105与2.19x 107之间(包含端值)(如果A是CD8+CAR+的,并且B是TNF-α)、或其归一化值;
[1101] 是在或约在4x 105与1.25x 107之间(包含端值)(如果A是凋亡标记阴性(-)CD8+CAR+的,并且如果B是IFN-γ)、或其归一化值;
[1102] 是在或约在5x 106与1.56x 107之间(包含端值)(如果A是CD8+CAR+的,并且B是IFN-γ)、或其归一化值;
[1103] 是在或约在2.0x 105与1.5x 107之间(包含端值)(如果A是凋亡标记阴性(-)CD8+CAR+的,并且如果B是IL-2)、或其归一化值;
[1104] 是在或约在2.5x 105与1.88x 107之间(包含端值)(如果A是CD8+CAR+的,并且B是IL-2)、或其归一化值;
[1105] 是在或约在3.0x 105与1.5x 107之间(包含端值)(如果A是凋亡标记阴性(-)CD8+CAR+的,并且如果B是TNF-α和IFN-γ)、或其归一化值;
[1106] 是在或约在3.75x 105与1.88x 107之间(包含端值)(如果A是CD8+CAR+的,并且B是TNF-α和IFN-γ)、或其归一化值;
[1107] 是在或约在3.0x 105与2.0x 107之间(包含端值)(如果A是凋亡标记阴性(-)CD8+CAR+的,并且如果B是TNF-α和IL-2)、或其归一化值;
[1108] 是在或约在3.75x 105与2.5x 107之间(包含端值)(如果A是CD8+CAR+的,并且B是TNF-α和IL-2)、或其归一化值;
[1109] 是在或约在4.0x 105与1.25x 107之间(包含端值)(如果A是凋亡标记阴性(-)CD8+CAR+的,并且如果B是IFN-γ和IL-2)、或其归一化值;
[1110] 是在或约在5.0x 105与1.56x 107之间(包含端值)(如果A是CD8+CAR+的,并且如果B是IFN-γ和IL-2)、或其归一化值;
[1111] 是在或约在4.0x 105与1.75x 107之间(包含端值)(如果A是凋亡标记阴性(-)CD8+CAR+的,并且如果B是TNF-α、IFN-γ和IL-2)、或其归一化值;
[1112] 是在或约在5.0x 105与2.19x 107之间(包含端值)(如果A是CD8+CAR+的,并且B是TNF-α、IFN-γ和IL-2)、或其归一化值,
[1113] 任选地其中所述凋亡标记是膜联蛋白V或活性半胱天冬酶3。
[1114] 188.根据实施方案118-185中任一项的方法,其中所述不良事件是至少延长的3级神经毒性,并且所述阈值:
[1115] 是或是约1.0x 106(如果A是凋亡标记阴性(-)和CD8+CAR+的,并且B是TNF-α)、或其归一化值;
[1116] 是或是约1.25x 106(如果A是CD8+CAR+的,并且B是TNF-α)、或其归一化值;
[1117] 是或是约2.0x 106(如果A是凋亡标记阴性(-)CD8+CAR+的,并且如果B是IFN-γ)、或其归一化值;
[1118] 是或是约2.5x 106(如果A是CD8+CAR+的,并且B是IFN-γ)、或其归一化值;
[1119] 是或是约3.0x 106(如果A是凋亡标记阴性(-)CD8+CAR+的,并且如果B是IL-2)、或其归一化值;
[1120] 是或是约3.75x 106(如果A是CD8+CAR+的,并且B是IL-2)、或其归一化值;
[1121] 是或是约1.5x 106(如果A是凋亡标记阴性(-)CD8+CAR+的,并且如果B是TNF-α和IFN-γ)、或其归一化值;
[1122] 是或是约1.88x 106(如果A是CD8+CAR+的,并且B是TNF-α和IFN-γ)、或其归一化值;
[1123] 是或是约2.5x 106(如果A是凋亡标记阴性(-)CD8+CAR+的,并且如果B是TNF-α和IL-2)、或其归一化值;
[1124] 是或是约3.12x 106(如果A是CD8+CAR+的,并且B是TNF-α和IL-2)、或其归一化值;
[1125] 是或是约3.0x 106(如果A是凋亡标记阴性(-)CD8+CAR+的,并且如果B是IFN-γ和IL-2)、或其归一化值;
[1126] 是或是约3.75x 106(如果A是CD8+CAR+的,并且B是IFN-γ和IL-2)、或其归一化值;
[1127] 是或是约2.0x 106(如果A是凋亡标记阴性(-)CD8+CAR+的,并且如果B是TNF-α、IFN-γ和IL-2)、或其归一化值;
[1128] 是或是约2.5x 106(如果A是CD8+CAR+的,并且B是TNF-α、IFN-γ和IL-2)、或其归一化值,任选地其中所述凋亡标记是膜联蛋白V或活性半胱天冬酶3。
[1129] 189.根据实施方案118-185和188中任一项的方法,其中所述不良事件是至少延长的3级,并且所述目标参考单位的所述给定范围:
[1130] 是在或约在3.0x 105与1.0x 106之间(包含端值)(如果A是凋亡标记阴性(-)和CD8+CAR+的,并且B是TNF-α)、或其归一化值;
[1131] 是在或约在3.75x 105与1.25x 106之间(包含端值)(如果A是CD8+CAR+的,并且B是TNF-α)、或其归一化值;
[1132] 是在或约在4x 105与2.0x 106之间(包含端值)(如果A是凋亡标记阴性(-)CD8+CAR+的,并且如果B是IFN-γ)、或其归一化值;
[1133] 是在或约在5x 106与2.5x 106之间(包含端值)(如果A是CD8+CAR+的,并且B是IFN-γ)、或其归一化值;
[1134] 是在或约在2.0x 105与3.0x 106之间(包含端值)(如果A是凋亡标记阴性(-)CD8+CAR+的,并且如果B是IL-2)、或其归一化值;
[1135] 是在或约在2.5x 105与3.75x 106之间(包含端值)(如果A是CD8+CAR+的,并且B是IL-2)、或其归一化值;
[1136] 是在或约在3.0x 105与1.5x 106之间(包含端值)(如果A是凋亡标记阴性(-)CD8+CAR+的,并且如果B是TNF-α和IFN-γ)、或其归一化值;
[1137] 是在或约在3.75x 105与1.88x 106之间(包含端值)(如果A是CD8+CAR+的,并且B是TNF-α和IFN-γ)、或其归一化值;
[1138] 是在或约在3.0x 105与2.5x 106之间(包含端值)(如果A是凋亡标记阴性(-)CD8+CAR+的,并且如果B是TNF-α和IL-2)、或其归一化值;
[1139] 是在或约在3.75x 105与3.12x 106之间(包含端值)(如果A是CD8+CAR+的,并且B是TNF-α和IL-2)、或其归一化值;
[1140] 是在或约在4.0x 105与3.0x 106之间(包含端值)(如果A是凋亡标记阴性(-)CD8+CAR+的,并且如果B是IFN-γ和IL-2)、或其归一化值;
[1141] 是在或约在5.0x 105与3.75x 106之间(包含端值)(如果A是CD8+CAR+的,并且B是IFN-γ和IL-2)、或其归一化值;
[1142] 是在或约在4.0x 105与2.0x 106之间(包含端值)(如果A是凋亡标记阴性(-)CD8+CAR+的,并且如果B是TNF-α、IFN-γ和IL-2)、或其归一化值;
[1143] 是在或约在5.0x 105与2.5x 106之间(包含端值)(如果A是CD8+CAR+的,并且B是TNF-α、IFN-γ和IL-2)、或其归一化值,
[1144] 任选地其中所述凋亡标记是膜联蛋白V或活性半胱天冬酶3。
[1145] 190.根据实施方案118-189中任一项的方法,其中所述治疗性T细胞组合物包含在约1000万个细胞/mL与约7000万个细胞/mL之间、或在约1000万个存活细胞/mL与约7000万
个存活细胞/mL之间,每个都包含端值。
[1146] 191.根据实施方案118-190中任一项的方法,其中所述治疗性T细胞组合物包含在约1500万个细胞或存活细胞/mL与约6000万个细胞或存活细胞/mL之间,每个都包含端值。
[1147] 192.根据实施方案118-191中任一项的方法,其中所述T细胞组合物包含大于1000万个细胞或存活细胞/mL。
[1148] 193.根据实施方案118-192中任一项的方法,其中所述治疗性T细胞组合物包含大于1500万个细胞或大于1500万个细胞/mL。
[1149] 194.根据实施方案118-193中任一项的方法,其中所述疾病或病症是癌症,任选地骨髓瘤、淋巴瘤或白血病。
[1150] 195.根据实施方案194的方法,其中所述疾病或病症是B细胞恶性肿瘤,任选地B细胞恶性肿瘤选自急性成淋巴细胞性白血病(ALL)、成人ALL、慢性成淋巴细胞性白血病
(CLL)、非霍奇金淋巴瘤(NHL)、和弥漫性大B细胞淋巴瘤(DLBCL)。
[1151] 196.根据实施方案118-195中任一项的方法,其中所述抗原是CD19、CD22、ROR1、Igκ、Her2、L1-CAM、CD20、间皮素、CEA、乙型肝炎表面抗原、抗叶酸受体、CD23、CD24、CD30、CD33、CD38、CD44、EGFR、EGP-2、EGP-4、EPHa2、ErbB2、ErbB3、ErbB4、FBP、胎儿乙酰胆碱受体、GD2、GD3、HMW-MAA、IL-22R-α、IL-13R-α2、kdr、κ轻链、路易斯Y、L1-细胞粘附分子、MAGE-A1、间皮素、MUC1、MUC16、PSCA、NKG2D配体、NY-ESO-1、MART-1、gp100、癌胚胎抗原、TAG72、VEGF-R2、癌胚抗原(CEA)、前列腺特异性抗原、PSMA、雌激素受体、孕酮受体、肝配蛋白B2、CD123、CS-1、c-Met、GD-2、MAGE A3、CE7、Wilms肿瘤1(WT-1)和细胞周期蛋白A1(CCNA1)。
[1152] 197.根据实施方案118-196中任一项的方法,其中所述重组受体是CAR。
[1153] 198.根据实施方案197的方法,其中所述CAR包含与所述抗原特异性地结合的细胞外抗原识别结构域和包含ITAM的细胞内信号传导结构域,其中任选地,所述细胞内信号传
导结构域包含CD3-ζ(CD3ζ)链的细胞内结构域;和/或其中所述CAR进一步包含共刺激信号
传导区域,其任选包含CD28或4-1BB的信号传导结构域。
[1154] 199.根据实施方案118-198中任一项的方法,其中所述T细胞是CD4+或CD8+的。
[1155] 200.根据实施方案118-199中任一项的方法,其中所述T细胞是原代T细胞,任选地其中所述T细胞对所述受试者而言是自体的或者对所述受试者而言是同种异体的。
[1156] 201.根据实施方案118-200中任一项的方法,其中所述单位剂量含有不超过15x 106数量的CD8+CAR+细胞,所述CD8+CAR+细胞对于膜联蛋白V的检测或对于半胱天冬酶3的
活性或前体形式呈阴性。
[1157] 202.根据实施方案118-201中任一项的方法,其中所述单位剂量进一步包含一个数量的呈CAR阳性的CD4+细胞,其中所述数量是至少或是与CD8+CAR+细胞的比率为或为约
1:1。
[1158] 203.实施方案118-202中任一项的方法,其中所述方法进一步包括在给予所述T细胞组合物之前给予淋巴细胞清除化学疗法和/或其中所述受试者在给予所述T细胞组合物
之前已经接受过淋巴细胞清除化学疗法。
[1159] 204.根据实施方案203的方法,其中所述淋巴细胞清除化学疗法包括向所述受试者给予氟达拉滨和/或环磷酰胺。
[1160] 205.根据实施方案204的方法,其中所述环磷酰胺以从或从约30mg/kg至60mg/kg的量给予,和/或所述氟达拉滨以从或从约25mg/m2至30mg/m2的量给予。
[1161] 206.根据实施方案204的方法,其中:
[1162] 所述环磷酰胺以从或从约900至1000mg的量给予,和/或所述氟达拉滨以从或从约25mg/m2至30mg/m2的量给予;或
[1163] 所述环磷酰胺以从或从约300mg/m2的量给予,和/或所述氟达拉滨以从或从约30mg/m2的量给予。
[1164] 207.根据实施方案204的方法,其中所述环磷酰胺以从或从约500mg/m2的量给予,和/或所述氟达拉滨以从或从约30mg/m2的量给予。
[1165] 208.根据实施方案204的方法,其中所述环磷酰胺以从或从约500mg/m2的量给予,和/或所述氟达拉滨以从或从约60mg/m2的量给予。
[1166] 209.根据实施方案203-208中任一项的方法,其中所述淋巴细胞清除疗法每天给予一次,持续连续三天。
[1167] 210.根据实施方案203-209中任一项的方法,其中所述淋巴细胞清除疗法在给予所述T细胞组合物之前第5天、之前第4天和之前第3天给予。
[1168] 211.根据实施方案203-210中任一项的方法,其中所述淋巴细胞清除疗法每天给予一次持续3-5天,任选地每天一次持续3天。
[1169] 212.根据实施方案204-211中任一项的方法,其中所述氟达拉滨和所述环磷酰胺是依次给予的。
[1170] 213.根据实施方案204-211中任一项的方法,其中所述氟达拉滨和所述环磷酰胺是同时给予的。
[1171] 214.一种测定包含T细胞组合物单位剂量的治疗性组合物的方法,所述方法包括:
[1172] (a)测定来自T细胞组合物的样品,所述T细胞组合物包含源自患有疾病或病症的受试者的并用编码重组受体、任选地嵌合抗原受体(CAR)的核酸转导的T细胞,所述重组受
体特异性地结合与疾病或病症相关的抗原,其中所述测定确定所述细胞组合物的B,其中B
是指示在所述给定组合物中的重组受体依赖性活性的程度或与其相关的参数的值、或所述
值的倍数或变换;并且
[1173] (b)基于B评估所述细胞组合物的效力和/或评估所述组合物是否高于B的规格下限(LSL)或低于B的规格上限(USL)。
[1174] 215.一种测定治疗性T组合物的方法,所述方法包括对来自T细胞组合物的样品基于B评估所述细胞组合物的效力和/或评估所述组合物是否高于B的规格下限(LSL)或低于B
的规格上限(USL),所述T细胞组合物包含含有特异性地结合与疾病或病症相关的抗原的重
组受体的T细胞。
[1175] 216.根据实施方案214或实施方案215的方法,其中只有在所述组合物低于B的所述USL时所述产品才被释放用于治疗所述受试者。
[1176] 217.根据实施方案214或实施方案215的方法,其中如果B高于所述USL,则建议不将所述组合物给予至所述受试者或改变给予至所述受试者的细胞的数量至经调整的单位
剂量,其中所述经调整的单位剂量含有在所述T细胞组合物中目标数量的细胞或目标数量
的参考单位(RU),其中在给定组合物中的RU由下式定义:
[1177] RU=A x B,其中:
[1178] A是在所述给定组合物中存在的具有表型的细胞的数量、或其倍数、分数或变换,或者是在所述给定组合物中具有两种或更多种表型的细胞的数量的平均值或加权平均值、
或所述平均值或加权平均值的倍数、分数或变换;并且
[1179] B是指示在所述给定组合物中重组受体依赖性、任选地CAR依赖性活性的程度或与其相关的参数的值、或所述值的分数或倍数或变换。
[1180] 218.根据实施方案214-217中任一项的方法,其中A是在所述给定组合物中存在的给定表型的细胞的数量、或其倍数或分数或变换。
[1181] 219.根据实施方案214-217中任一项的方法,其中A是在所述给定组合物中具有两种或更多种表型的细胞的数量的平均值或加权平均值、或所述平均值或加权平均值的倍
数、分数或变换。
[1182] 220.根据实施方案214-219中任一项的方法,其中单位的所述目标数量小于单位的阈值数量,所述阈值数量任选地是参考单位的安全数量,其中,参考单位的所述安全数量
是相对于在用包含表达所述重组受体、任选地所述CAR的T细胞的治疗性T细胞组合物治疗
后分析的一组受试者,向在曾持续发生不良事件的组中的那些受试者中的受试者给予的疗
法的参考单位的最低数量。
[1183] 221.根据实施方案220的方法,其中所述不良事件是严重不良事件,任选地严重神经毒性,任选地等于或高于4级或5级或至少延长的3级神经毒性。
[1184] 222.根据实施方案220或实施方案221的方法,其中参考单位的所述目标数量比参考单位的所述安全数量少了对应于安全系数的量和/或少了在1.5倍至3倍范围内、任选地
约2倍的量、或少了为未发生过所述不良事件、任选地0-2级神经毒性的一组受试者的标准
偏差的倍数的量,任选地其中所述倍数在1.5倍至3倍的范围内。
[1185] 223.根据实施方案217-222中任一项的方法,其中参考单位的所述目标数量等于或高于参考单位的参考功效数量,其中所述参考功效数量是相对于在用包含所述重组受
体、任选地所述CAR的治疗性T细胞组合物治疗后分析的一组受试者,向展现出所希望的治
疗结果、任选地部分反应或完全反应(CR)的组中的一名或多名受试者给予的疗法的单位的
数量。
[1186] 224.根据实施方案217-223中任一项的方法,其中所述经调整的单位剂量小于用包含所述表达重组受体、任选地所述CAR的T细胞的所述治疗性T细胞组合物治疗的一组受
试者的平均单位剂量,任选地小于其1.5倍、小于其2倍、小于其3倍、小于其4倍。
[1187] 225.根据实施方案214-224中任一项的方法,其中在向所述受试者给予所述T细胞组合物之后评估所述T细胞组合物的样品,任选地冷冻保存的样品。
[1188] 226.根据实施方案214-225中任一项的方法,其中如果B高于所述USL,则将所述受试者确定为有毒性风险。
[1189] 227.根据实施方案214-225中任一项的方法,其中如果B高于所述USL,则监测被给予所述组合物的受试者和/或用药剂治疗被给予所述组合物的受试者,以在给予所述细胞
组合物之后和任选地在发生毒性结果的体征或症状之前改善或降低所述毒性结果或细胞
因子释放综合征的可能性。
[1190] 228.一种评估对治疗性T细胞组合物的毒性的风险的方法,所述方法包括:
[1191] (a)对来自已经给予至受试者的T细胞组合物的样品评估在给定范围内的参考单位(RU),所述T细胞组合物包含T细胞,所述T细胞包含特异性地结合与疾病或病症相关的抗
原的重组受体,其中在给定组合物中的RU由下式定义:
[1192] RU=A x B,其中:
[1193] A是在所述给定组合物中存在的具有表型的细胞的细胞数量、或其倍数、分数或变换,或者是在所述给定组合物中具有两种或更多种表型的细胞的数量的平均值或加权平均
值、或所述平均值或加权平均值的倍数、分数或变换;并且
[1194] B是指示在所述给定组合物中重组受体依赖性、任选地CAR依赖性活性的程度或与其相关的参数的值、或所述值的分数或倍数或变换;并且
[1195] (b)将所述RU与参考安全数量的RU进行比较,其中所述比较指示所述受试者是否有发生不良事件、任选地严重不良事件、任选地等于或高于4级或5级或至少延长的3级神经
毒性的严重神经毒性)的风险。
[1196] 229.根据实施方案228的方法,其中A是在所述给定组合物中存在的给定表型的细胞的数量、或其倍数或分数或变换。
[1197] 230.根据实施方案229的方法,其中A是在所述给定组合物中具有两种或更多种表型的细胞的数量的平均值或加权平均值、或所述平均值或加权平均值的倍数、分数或变换。
[1198] 231.根据实施方案228-230中任一项的方法,其中RU的所述参考安全数量是相对于在用包含表达所述重组受体、任选地所述CAR的所述T细胞的治疗性T细胞组合物治疗后
分析的一组受试者,向在曾持续发生所述不良事件的组中的那些受试者中的受试者给予的
疗法的参考单位的最低数量。
[1199] 232.根据实施方案228-231中任一项的方法,其中如果所述比较指示所述RU高于所述参考安全RU,则监测被给予所述组合物的所述受试者和/或用药剂治疗被给予所述组
合物的所述受试者,以在给予所述细胞组合物之后和任选地在发生毒性结果的体征或症状
之前改善或降低所述毒性结果或细胞因子释放综合征的可能性。
[1200] 233.一种生产包含T细胞组合物单位剂量的治疗性组合物的方法,所述方法包括:
[1201] (a)测定T细胞组合物,所述T细胞组合物包含源自患有疾病或病症的受试者的并用编码重组受体、任选地嵌合抗原受体(CAR)的核酸转导的T细胞,所述重组受体特异性地
结合与疾病或病症相关的抗原,其中所述测定确定所述细胞组合物的B,其中B是指示在所
述给定组合物中的重组受体依赖性、任选地CAR依赖性活性的程度或与其相关的参数的值、
或所述值的倍数或变换;并且
[1202] (b)向容器中填充所述组合物的全部或部分和任选地另一种溶液以实现所述T细胞组合物的单位剂量,其中所述单位剂量含有在所述T细胞组合物中目标数量的参考单位
(RU),其中在给定组合物中的RU由下式定义:
[1203] RU=A x B,其中A是在所述给定组合物中存在的具有表型的细胞的数量、或其倍数、分数或变换,或者是在所述给定组合物中具有两种或更多种表型的细胞的数量的平均
值或加权平均值、或所述平均值或加权平均值的倍数、分数或变换。
[1204] 234.一种生产包含T细胞组合物单位剂量的治疗性组合物的方法,所述方法包括向容器中填充T细胞组合物的全部或部分和任选地另一种溶液以实现T细胞组合物单位剂
量,所述T细胞组合物包含含有特异性地结合与疾病或病症相关的抗原的重组受体的T细
胞,其中所述单位剂量含有目标数量的所述T细胞组合物的参考单位(RU),其中在给定组合
物中的RU由下式定义:
[1205] RU=A x B,其中
[1206] A是在所述给定组合物中存在的具有表型的细胞的数量、或其倍数、分数或变换,或者是在所述给定组合物中具有两种或更多种表型的细胞的数量的平均值或加权平均值、
或所述平均值或加权平均值的倍数、分数或变换;并且
[1207] B是指示在所述给定组合物中重组受体依赖性、任选地CAR依赖性活性的程度或与其相关的参数的值、或所述值的倍数或变换。
[1208] 235.根据实施方案233或实施方案234的方法,其中A是在所述给定组合物中存在的给定表型的细胞的数量、或其倍数或分数或变换。
[1209] 236.根据实施方案233或实施方案234的方法,其中A是在所述给定组合物中具有两种或更多种表型的细胞的数量的平均值或加权平均值、或所述平均值或加权平均值的倍
数、分数或变换。
[1210] 237.根据实施方案217-236中任一项的方法,其中A是在所述给定组合物中存在的具有表型的细胞的数量,并且B是指示在所述给定组合物中的重组受体依赖性活性的程度
或与其相关的参数的值。
[1211] 238.根据实施方案217-237中任一项的方法,其中A和/或B分别是数量或值的变换,其中所述变换包括对数变换、幂变换或罗吉特(logit)变换。
[1212] 239.根据实施方案217-238中任一项的方法,其中A是在所述给定组合物中存在的具有表型的细胞的数量,并且B是指示在所述给定T细胞组合物中的CAR依赖性活性的程度
或与其相关的参数的值的倍数或变换,任选地其中B是所述值的对数变换。
[1213] 240.根据实施方案238或实施方案239的方法,其中所述对数变换是常用对数(log10(x))、自然对数(ln(x))或二元对数(log2(x))。
[1214] 241.根据实施方案217-240中任一项的方法,其中A是在所述组合物中的存活细胞的数量,和/或是不凋亡、不展现指示早期凋亡或指示凋亡的因子、不处于凋亡的早期阶段、或不处于凋亡的晚期阶段的细胞的数量,和/或是特定分化状态的细胞的数量,和/或是具
有记忆/干细胞样属性的细胞的数量,或是这些数量的倍数或变换。
[1215] 242.根据实施方案217-241中任一项的方法,其中所述表型包括表面标记的阳性表达,所述表面标记是CD3、CD4或CD8中的一种或多种,和/或所述表型包括所述重组受体、
任选地所述CAR或用于表达所述重组受体的替代标记的阳性表达。
[1216] 243.根据实施方案242的方法,其中所述表型是CD3+CAR、CD4+/CAR+、CD8+/CAR+。
[1217] 244.根据实施方案217-243中任一项的方法,其中所述表型包括:不存在指示凋亡、或在凋亡级联或途径中的一个或多个步骤的因子,任选地不存在凋亡标记的表达。
[1218] 245.根据实施方案217-244中任一项的方法,其中所述表型包括凋亡标记、任选地早期凋亡或晚期凋亡标记的阴性表达。
[1219] 246.根据实施方案245的方法,其中所述凋亡标记是表面磷脂酰丝氨酸和/或用膜联蛋白V检测,或是半胱天冬酶的活性或前体形式,任选地半胱天冬酶3的活性或前体形式。
[1220] 247.根据实施方案217-246中任一项的方法,其中所述表型包含膜联蛋白-。
[1221] 248.根据实施方案217-247中任一项的方法,其中所述表型包含产生细胞因子的一种或组合的指示物,所述细胞因子的一种或组合任选地对抗原或重组受体是非特异性的
和/或是多克隆产生的,其中所述一种或多种细胞因子是IL-2、IL-13、IL-17、IFN-γ或TNF-α。
[1222] 249.根据实施方案248的方法,其中产生的所述指示物在测定、任选地细胞内细胞因子染色测定中进行测量,所述测定包括将所述T细胞组合物的样品与多克隆药剂、抗原特
异性药剂或结合所述重组受体、任选地CAR的药剂一起孵育。
[1223] 250.根据实施方案248或实施方案249的方法,其中所述药剂是或包含PMA和离子霉素,或者是或包含T细胞受体或T细胞受体复合物激动剂。
[1224] 251.根据实施方案217-250中任一项的方法,其中所述表型包括激活标记的阴性表达,其中所述激活标记选自CD25、CD127、LAG3、Ki67及其组合。
[1225] 252.根据实施方案217-251中任一项的方法,其中所述表型包括消耗标记的阴性表达,其中所述消耗标记是PD1或FOXP3基因产物或其组合。
[1226] 253.根据实施方案217-252中任一项的方法,其中所述表型包括幼稚表型或记忆表型,任选地其中所述记忆表型包括T效应记忆表型、T中央记忆表型或表达CD45RA(Temra)
的T效应记忆表型。
[1227] 254.根据实施方案217-253中任一项的方法,其中A是T细胞的总数、CD3+细胞的总数、CD4+或CD8+细胞的总数、CD3+CAR+细胞的总数、CD8+CAR+细胞的总数、CD4+CAR+总数、或任何前述的活细胞或存活细胞的总数、或所述总数的倍数或变换值。
[1228] 255.根据实施方案217-253中任一项的方法,其中A是CD3+细胞的总数、CD8+的总数、CD3+CAR+细胞的总数、CD8+CAR+细胞的总数、或任何前述的活细胞或存活细胞的总数、
或所述总数的倍数或变换值。
[1229] 256.根据实施方案217-253中任一项的方法,其中A是为CD3+CAR+细胞的凋亡标记阴性(-)细胞的总数、为CD4+CAR+的凋亡标记阴性(-)细胞的总数、为CD8+CAR+细胞的凋亡
标记阴性(-)细胞的总数、或所述总数的倍数或变换值,其中所述凋亡标记是膜联蛋白V或
半胱天冬酶。
[1230] 257.根据实施方案217-256中任一项的方法,其中A是膜联蛋白-CD3+CAR+细胞的总数或膜联蛋白-CD8+CAR+细胞的总数。
[1231] 258.根据实施方案214-257中任一项的方法,其中所述重组受体依赖性活性是促炎性细胞因子、任选地TNF-α、IFN-γ、IL-2和IL-10的一种或组合的产生或积累的量度。
[1232] 259.根据实施方案214-258中任一项的方法,其中所述参数是一种或多种因子的量度或其归一化值。
[1233] 260.根据实施方案259的方法,其中所述量度是在如下测定中的,所述测定涉及在所述抗原、表达所述抗原的细胞和/或与所述重组受体、任选地所述CAR特异性地结合的药
剂的存在下将给定组合物或其样品培养或孵育固定的时间、任选地24小时。
[1234] 261.根据实施方案260的方法,其中所述测定是ELISA。
[1235] 262.根据实施方案259-261中任一项的方法,其中所述因子的所述量度是:
[1236] (i)所述因子的浓度、相对浓度、量或相对量;或
[1237] (ii)每单位的在所述给定组合物中的输入细胞而言所述因子的量或相对量,或
[1238] (iii)每单位时间、任选地一小时,每单位的在所述给定组合物中的输入细胞而言所述因子的量或相对量;或
[1239] (iv)指示(i)-(iii)中任何一项的水平。
[1240] 263.根据实施方案259-262中任一项的方法,其中所述一种或多种因子是可溶性因子的一种或组合,任选地细胞因子、趋化因子或可溶性受体中的一种或组合,所述可溶性
受体任选地为可溶性共刺激受体。
[1241] 264.根据实施方案259-263中任一项的方法,其中所述一种或多种因子是促炎性细胞因子、Th2细胞因子和Th17细胞因子中的一种或组合。
[1242] 265.根据实施方案259-264中任一项的方法,其中所述一种或多种因子是IL-2、IFN-γ、TNF-α、IL4、IL-5、IL-10、IL-13、GM-CSF、sCD137、MIP1a和M1Pb中的一种或组合。
[1243] 266.根据实施方案259-265中任一项的方法,其中所述一种或多种因子是IL-2、IFN-γ、TNF-α和IL-10中的一种或组合。
[1244] 267.根据实施方案259-266中任一项的方法,其中所述一种或多种因子是前述可溶性因子中的任何两种或更多种的组合,并且所述参数是所述两种或更多种因子的所述量
度的算术平均值或几何平均值。
[1245] 268.根据实施方案259-267中任一项的方法,其中所述参数是TNF-α、IFN-γ和IL-2中的至少两种或者TNF-α、IFN-γ和IL-2的量度的算术平均值或几何平均值,所述量度任
选地为量或浓度。
[1246] 269.根据实施方案259-268中任一项的方法,其中所述参数是所述量度的归一化值,其中归一化是与所述因子的参考量度相比较的。
[1247] 270.根据实施方案269的方法,其中所述参考量度是在包含所述嵌合抗原受体(CAR)的多种、任选地至少10种、至少15种、至少20种参考治疗性T细胞组合物中的所述量度
的平均值,其中:
[1248] (i)已经观察到或确定了每种所述参考治疗性T细胞组合物在向受试者给予后导致可接受的安全性特征,任选地其中所述受试者患有表达所述抗原或与所述抗原相关的疾
病或病症;和/或
[1249] (ii)已经观察到或确定了每种所述参考治疗性T细胞组合物在向受试者给予后导致所希望的功效,任选地其中所述受试者患有表达所述抗原或与所述抗原相关的疾病或病
症。
[1250] 271.根据实施方案270的方法,其中所述可接受的安全性特征是不存在观察到的2级或更高等级或不存在3级或更高等级的神经毒性。
[1251] 272.根据实施方案270或实施方案271的方法,其中所述可接受的安全性特征是不存在观察到的3级或更高等级的神经毒性。
[1252] 273.根据实施方案270-272中任一项的方法,其中所述功效是部分反应或是完全反应(CR)。
[1253] 274.根据实施方案269的方法,其中所述参考量度是通过相同的测定,所述因子在参考T细胞组合物中的所述量度,所述参考T细胞组合物是通过与所述治疗性T细胞组合物
相同的方法产生的,但不表达所述重组受体、任选地所述CAR、不特异性识别所述抗原和/或
不表达任何重组受体,任选地任何CAR。
[1254] 275.根据实施方案274的方法,其中将所述参数归一化以控制所述一种或多种因子的所述量度的患者特异性变异。
[1255] 276.根据实施方案274或实施方案275的方法,其中所述参数是与对照因子在相同测定中的相同量度相比所述因子的所述量度的归一化值,其中所述对照因子在治疗性T细
胞组合物中的水平已知不会、或已经观察到不会指示不良事件或毒性结果或不良事件或毒
性结果的可能性或风险或者与其相关或者与其显著相关,其中所述不良事件或毒性结果任
选地是严重神经毒性。
[1256] 277.根据实施方案276的方法,其中所述对照因子是或包含与在给予所述T细胞组合物后持续发生所述不良事件的多名受试者中的所述不良事件的发生无统计学相关和/或
不相关的因子,任选地所述对照因子是IL-5、IL-13、GM-CSF和IL-6的一种或组合,任选地其中所述对照因子的所述量度是前述中的两种或更多种的算术平均值或几何平均值。
[1257] 278.根据实施方案214-277中任一项的方法,其中所述参数不包含细胞溶解活性或其量度。
[1258] 279.根据实施方案214-278中任一项的方法,其中所述参数不包含重组受体依赖性或抗原特异性细胞溶解活性或其量度。
[1259] 280.实施方案217-279中任一项的方法,其中:
[1260] 所述表型是CD8+CAR+细胞或凋亡标记-CD8+CAR+细胞,任选地其中所述凋亡标记是膜联蛋白V或活性半胱天冬酶3;并且
[1261] 所述参数是促炎性细胞因子的量度或者是其归一化值,所述促炎性细胞因子任选地是TNF-α、IL-2和IFN-γ中的一种或组合。
[1262] 281.实施方案217-280中任一项的方法,其中:
[1263] 所述不良事件是4级或5级神经毒性,并且所述阈值:
[1264] 是或是约1.75x 107(如果A是凋亡标记阴性(-)和CD8+CAR+的,并且B是TNF-α)、或其归一化值;
[1265] 是或是约2.19x 107(如果A是CD8+CAR+的,并且B是TNF-α)、或其归一化值;
[1266] 是或是约1.25x 107(如果A是凋亡标记阴性(-)CD8+CAR+的,并且如果B是IFN-γ)、或其归一化值;
[1267] 是或是约1.56x 107(如果A是CD8+CAR+的,并且B是IFN-γ)、或其归一化值;
[1268] 是或是约1.5x 107(如果A是凋亡标记阴性(-)CD8+CAR+的,并且如果B是IL-2)、或其归一化值;
[1269] 是或是约1.88x 107(如果A是CD8+CAR+的,并且B是IL-2)、或其归一化值;
[1270] 是或是约1.5x 107(如果A是凋亡标记阴性(-)CD8+CAR+的,并且如果B是TNF-α和IFN-γ)、或其归一化值;
[1271] 是或是约1.88x 107(如果A是CD8+CAR+的,并且B是TNF-α和IFN-γ)、或其归一化值;
[1272] 是或是约2.0x 107(如果A是凋亡标记阴性(-)CD8+CAR+的,并且如果B是TNF-α和IL-2)、或其归一化值;
[1273] 是或是约2.5x 107(如果A是CD8+CAR+的,并且B是TNF-α和IL-2)、或其归一化值;
[1274] 是或是约1.25x 107(如果A是凋亡标记阴性(-)CD8+CAR+的,并且如果B是IFN-γ和IL-2)、或其归一化值;
[1275] 是或是约1.56x 107(如果A是CD8+CAR+的,并且B是IFN-γ和IL-2)、或其归一化值;
[1276] 是或是约1.75x 107(如果A是凋亡标记阴性(-)CD8+CAR+的,并且如果B是TNF-α、IFN-γ和IL-2)、或其归一化值;
[1277] 是或是约2.19x 107(如果A是CD8+CAR+的,并且B是TNF-α、IFN-γ和IL-2)、或其归一化值,
[1278] 任选地其中所述凋亡标记是膜联蛋白V或活性半胱天冬酶3。
[1279] 282.根据实施方案217-281中任一项的方法,其中所述不良事件是4级或5级神经毒性,并且所述目标参考单位的所述给定范围:
[1280] 是在或约在2.0x 105与1.75x 107之间(包含端值)(如果A是凋亡标记阴性(-)和CD8+CAR+的,并且B是TNF-α)、或其归一化值;
[1281] 是在或约在2.5x 105与2.19x 107之间(包含端值)(如果A是CD8+CAR+的,并且B是TNF-α)、或其归一化值;
[1282] 是在或约在4x 105与1.25x 107之间(包含端值)(如果A是凋亡标记阴性(-)CD8+CAR+的,并且如果B是IFN-γ)、或其归一化值;
[1283] 是在或约在5x 106与1.56x 107之间(包含端值)(如果A是CD8+CAR+的,并且B是IFN-γ)、或其归一化值;
[1284] 是在或约在2.0x 105与1.5x 107之间(包含端值)(如果A是凋亡标记阴性(-)CD8+CAR+的,并且如果B是IL-2)、或其归一化值;
[1285] 是在或约在2.5x 105与1.88x 107之间(包含端值)(如果A是CD8+CAR+的,并且B是IL-2)、或其归一化值;
[1286] 是在或约在3.0x 105与1.5x 107之间(包含端值)(如果A是凋亡标记阴性(-)CD8+CAR+的,并且如果B是TNF-α和IFN-γ)、或其归一化值;
[1287] 是在或约在3.75x 105与1.88x 107之间(包含端值)(如果A是CD8+CAR+的,并且B是TNF-α和IFN-γ)、或其归一化值;
[1288] 是在或约在3.0x 105与2.0x 107之间(包含端值)(如果A是凋亡标记阴性(-)CD8+CAR+的,并且如果B是TNF-α和IL-2)、或其归一化值;
[1289] 是在或约在3.75x 105与2.5x 107之间(包含端值)(如果A是CD8+CAR+的,并且B是TNF-α和IL-2)、或其归一化值;
[1290] 是在或约在4.0x 105与1.25x 107之间(包含端值)(如果A是凋亡标记阴性(-)CD8+CAR+的,并且如果B是IFN-γ和IL-2)、或其归一化值;
[1291] 是在或约在5.0x 105与1.56x 107之间(包含端值)(如果A是CD8+CAR+的,并且如果B是IFN-γ和IL-2)、或其归一化值;
[1292] 是在或约在4.0x 105与1.75x 107之间(包含端值)(如果A是凋亡标记阴性(-)CD8+CAR+的,并且如果B是TNF-α、IFN-γ和IL-2)、或其归一化值;
[1293] 是在或约在5.0x 105与2.19x 107之间(包含端值)(如果A是CD8+CAR+的,并且B是TNF-α、IFN-γ和IL-2)、或其归一化值,
[1294] 任选地其中所述凋亡标记是膜联蛋白V或活性半胱天冬酶3。
[1295] 283.根据实施方案217-280中任一项的方法,其中所述不良事件是至少延长的3级神经毒性,并且所述阈值:
[1296] 是或是约1.0x 106(如果A是凋亡标记阴性(-)和CD8+CAR+的,并且B是TNF-α)、或其归一化值;
[1297] 是或是约1.25x 106(如果A是CD8+CAR+的,并且B是TNF-α)、或其归一化值;
[1298] 是或是约2.0x 106(如果A是凋亡标记阴性(-)CD8+CAR+的,并且如果B是IFN-γ)、或其归一化值;
[1299] 是或是约2.5x 106(如果A是CD8+CAR+的,并且B是IFN-γ)、或其归一化值;
[1300] 是或是约3.0x 106(如果A是凋亡标记阴性(-)CD8+CAR+的,并且如果B是IL-2)、或其归一化值;
[1301] 是或是约3.75x 106(如果A是CD8+CAR+的,并且B是IL-2)、或其归一化值;
[1302] 是或是约1.5x 106(如果A是凋亡标记阴性(-)CD8+CAR+的,并且如果B是TNF-α和IFN-γ)、或其归一化值;
[1303] 是或是约1.88x 106(如果A是CD8+CAR+的,并且B是TNF-α和IFN-γ)、或其归一化值;
[1304] 是或是约2.5x 106(如果A是凋亡标记阴性(-)CD8+CAR+的,并且如果B是TNF-α和IL-2)、或其归一化值;
[1305] 是或是约3.12x 106(如果A是CD8+CAR+的,并且B是TNF-α和IL-2)、或其归一化值;
[1306] 是或是约3.0x 106(如果A是凋亡标记阴性(-)CD8+CAR+的,并且如果B是IFN-γ和IL-2)、或其归一化值;
[1307] 是或是约3.75x 106(如果A是CD8+CAR+的,并且B是IFN-γ和IL-2)、或其归一化值;
[1308] 是或是约2.0x 106(如果A是凋亡标记阴性(-)CD8+CAR+的,并且如果B是TNF-α、IFN-γ和IL-2)、或其归一化值;
[1309] 是或是约2.5x 106(如果A是CD8+CAR+的,并且B是TNF-α、IFN-γ和IL-2)、或其归一化值,任选地其中所述凋亡标记是膜联蛋白V或活性半胱天冬酶3。
[1310] 284.根据实施方案217-280和283中任一项的方法,其中所述不良事件是至少延长的3级,并且所述目标参考单位的所述给定范围:
[1311] 是在或约在3.0x 105与1.0x 106之间(包含端值)(如果A是凋亡标记阴性(-)和CD8+CAR+的,并且B是TNF-α)、或其归一化值;
[1312] 是在或约在3.75x 105与1.25x 106之间(包含端值)(如果A是CD8+CAR+的,并且B是TNF-α)、或其归一化值;
[1313] 是在或约在4x 105与2.0x 106之间(包含端值)(如果A是凋亡标记阴性(-)CD8+CAR+的,并且如果B是IFN-γ)、或其归一化值;
[1314] 是在或约在5x 106与2.5x 106之间(包含端值)(如果A是CD8+CAR+的,并且B是IFN-γ)、或其归一化值;
[1315] 是在或约在2.0x 105与3.0x 106之间(包含端值)(如果A是凋亡标记阴性(-)CD8+CAR+的,并且如果B是IL-2)、或其归一化值;
[1316] 是在或约在2.5x 105与3.75x 106之间(包含端值)(如果A是CD8+CAR+的,并且B是IL-2)、或其归一化值;
[1317] 是在或约在3.0x 105与1.5x 106之间(包含端值)(如果A是凋亡标记阴性(-)CD8+CAR+的,并且如果B是TNF-α和IFN-γ)、或其归一化值;
[1318] 是在或约在3.75x 105与1.88x 106之间(包含端值)(如果A是CD8+CAR+的,并且B是TNF-α和IFN-γ)、或其归一化值;
[1319] 是在或约在3.0x 105与2.5x 106之间(包含端值)(如果A是凋亡标记阴性(-)CD8+CAR+的,并且如果B是TNF-α和IL-2)、或其归一化值;
[1320] 是在或约在3.75x 105与3.12x 106之间(包含端值)(如果A是CD8+CAR+的,并且B是TNF-α和IL-2)、或其归一化值;
[1321] 是在或约在4.0x 105与3.0x 106之间(包含端值)(如果A是凋亡标记阴性(-)CD8+CAR+的,并且如果B是IFN-γ和IL-2)、或其归一化值;
[1322] 是在或约在5.0x 105与3.75x 106之间(包含端值)(如果A是CD8+CAR+的,并且B是IFN-γ和IL-2)、或其归一化值;
[1323] 是在或约在4.0x 105与2.0x 106之间(包含端值)(如果A是凋亡标记阴性(-)CD8+CAR+的,并且如果B是TNF-α、IFN-γ和IL-2)、或其归一化值;
[1324] 是在或约在5.0x 105与2.5x 106之间(包含端值)(如果A是CD8+CAR+的,并且B是TNF-α、IFN-γ和IL-2)、或其归一化值,
[1325] 任选地其中所述凋亡标记是膜联蛋白V或活性半胱天冬酶3。
[1326] 285.根据实施方案214-284中任一项的方法,其中所述重组受体是CAR。
[1327] 286.根据实施方案285的方法,其中所述CAR包含与所述抗原特异性地结合的细胞外抗原识别结构域和包含ITAM的细胞内信号传导结构域,其中任选地,所述细胞内信号传
导结构域包含CD3-ζ(CD3ζ)链的细胞内结构域;和/或其中所述CAR进一步包含共刺激信号
传导区域,其任选包含CD28或4-1BB的信号传导结构域。
[1328] 287.根据实施方案214-286中任一项的方法,其中所述T细胞是CD4+或CD8+的。
[1329] 288.根据实施方案214-287中任一项的方法,其中所述T细胞是原代T细胞,任选地对所述受试者而言是自体的或同种异体的。
[1330] 289.一种生产用于细胞疗法的治疗性T细胞组合物的方法,所述方法包括向容器中填充包含T细胞的组合物的全部或部分至浓度在约1000万个细胞与约7000万个细胞/mL
之间(包含端值)、和任选地另一种溶液。
[1331] 290.根据实施方案289的方法,其中所述T细胞源自患有疾病或病症的受试者并用编码对与疾病或病症相关或由疾病或病症表达的抗原有特异性的重组受体、任选地嵌合抗
原受体(CAR)的核酸转导,和/或所述T细胞包含重组受体、任选地CAR。
[1332] 291.根据实施方案233-290中任一项的方法,其中所述容器填充有在约1500万与约6000万个细胞/mL之间,包含端值。
[1333] 292.根据实施方案233-291中任一项的方法,其中所述容器填充有大于1000万个细胞/mL。
[1334] 293.根据实施方案233-292中任一项的方法,其中所述容器填充有大于1500万个细胞/mL。
[1335] 294.根据实施方案233-293中任一项的方法,其中所述填充以自动的方式进行。
[1336] 295.根据实施方案233-295中任一项的方法,其中所述填充在封闭的系统中进行。
[1337] 296.根据实施方案233-295中任一项的方法,其中所述容器填充有另一种溶液并且所述溶液包含冷冻保护剂、任选地DMSO。
[1338] 297.根据实施方案233-295中任一项的方法,其进一步包括将所述容器中的所述细胞冷冻或将所述容器存储在低于或约低于80℃的温度下。
[1339] 298.根据实施方案233-298中任一项的方法,其中所述重组受体是CAR。
[1340] 299.根据实施方案298的方法,其中所述CAR包含与所述抗原特异性地结合的细胞外抗原识别结构域和包含ITAM的细胞内信号传导结构域,其中任选地,所述细胞内信号传
导结构域包含CD3-ζ(CD3ζ)链的细胞内结构域;和/或其中所述CAR进一步包含共刺激信号
传导区域,其任选包含CD28或4-1BB的信号传导结构域。
[1341] 300.根据实施方案233-299中任一项的方法,其中所述T细胞是CD4+或CD8+的。
[1342] 301.根据实施方案233-301中任一项的方法,其中所述T细胞是原代T细胞,任选地对所述受试者而言是自体的或同种异体的。
[1343] 302.根据实施方案118-301中任一项的方法,其中所述T细胞组合物通过如下的过程生产,在所述过程中:
[1344] 具有指示生物活性细胞特征和/或不存在凋亡或早期或晚期凋亡的表型的细胞(1)在所述组合物中的CAR+细胞中、(2)在所述组合物中的CAR+CD3+细胞中、和/或(3)在所
述组合物中的CAR+CD8+细胞中的频率,与在通过所述过程产生的多种T细胞组合物中的所
述频率的平均值相比变化不超过40%、或不超过30%、或不超过20%或不超过10%或不超
过5%和/或与这种平均值相比变化不超过一个标准偏差;或
[1345] 或者在所述组合物中具有指示不存在凋亡或早期或晚期凋亡的表型的细胞(1)在所述组合物中的CAR+细胞中、(2)在所述组合物中的CAR+CD3+细胞中、和/或(3)在所述组合
物中的CAR+CD8+细胞中的频率,与在通过所述过程生产的多种T细胞组合物相比变化不超
过40%或不超过20%或不超过10%。
[1346] 303.根据实施方案302的方法,其中所述过程包括:
[1347] (a)在一定条件下将包含T细胞的细胞群与包含编码所述重组受体的核酸分子的药剂一起孵育,以将编码所述重组受体的所述核酸引入所述群体的细胞中;并且
[1348] (b)在所述孵育之前、期间和/或之后刺激所述细胞,其中刺激包括在刺激条件的存在下孵育所述细胞,所述刺激条件诱导所述细胞的初级信号、信号传导、刺激、激活和/或扩增。
[1349] 304.根据实施方案303的方法,其中所述过程进一步包括在(a)之前从生物样品中分离细胞的所述群体。
[1350] 305.根据实施方案304的方法,其中所述分离包括,基于CD3的表面表达或基于CD4和CD8之一或两者的表面表达来选择细胞,任选地通过阳性或阴性选择。
[1351] 306.根据实施方案304或实施方案305的方法,其中所述分离包括进行基于免疫亲和的选择。
[1352] 307.根据实施方案304-306的方法,其中所述生物样品是或包含全血样品、血沉棕黄层样品、外周血单核细胞(PBMC)样品、未分级T细胞样品、淋巴细胞样品、白细胞样品、单采术产物或白细胞分离术产物。
[1353] 308.实施方案303-307中任一项的方法,其中所述刺激条件包括与能够激活TCR复合物的一种或多种组分的一个或多个细胞内信号传导结构域和/或一种或多种共刺激分子
的一个或多个细胞内信号传导结构域的刺激试剂一起孵育。
[1354] 309.根据实施方案308的方法,其中所述刺激试剂包含与TCR复合物的成员特异性地结合的一级药剂和与T细胞共刺激分子特异性地结合的二级药剂。
[1355] 310.根据实施方案308或实施方案309的方法,其中所述一级药剂特异性地结合CD3和/或所述共刺激分子选自CD28、CD137(4-1-BB)、OX40或ICOS。
[1356] 311.根据实施方案306或实施方案310的方法,其中所述一级药剂和所述二级药剂包含抗体和/或存在于固体支持物、任选地珠的表面上。
[1357] 312.根据实施方案308-311中任一项的方法,其中:
[1358] 所述刺激试剂是如下的一种:其中已经确定重组受体依赖性活性或抗原特异性活性,任选地促炎性细胞因子的重组受体依赖性或抗原特异性依赖性产生或积累,与使用所
述刺激试剂通过所述过程生产的多种T细胞组合物中的促炎性细胞因子的产生或积累的量
度的平均值相比变化不超过40%、或不超过30%、或不超过20%或不超过10%或不超过
5%,和/或与这种平均值相比变化不超过一个标准偏差;和/或
[1359] 所述刺激试剂是如下的一种:其中已经确定重组受体依赖性活性或抗原特异性活性,任选地促炎性细胞因子的重组受体依赖性或抗原特异性依赖性产生或积累,在通过所
述过程生产的多种T细胞组合物中变化不超过40%、或不超过30%、或不超过20%或不超过
10%或不超过5%;和/或
[1360] 所述刺激试剂是如下的一种:其中已经确定重组受体依赖性活性或抗原特异性活性,任选地使用所述刺激试剂生产的细胞组合物的促炎性细胞因子的重组受体依赖性或抗
原特异性依赖性产生或积累,与对照组合物相比变化不超过40%、或不超过30%、或不超过
20%或不超过10%或不超过5%,其中除了所述对照组合物在对照刺激试剂或所述重组受
体依赖性活性的标准单位的存在下进行之外,所述对照组合物和所述细胞组合物使用相同
的过程、包括从相同的细胞群生产。
[1361] 313.根据实施方案312的方法,其中当在所述过程中使用时,已知所述对照刺激试剂生产其中所述重组受体依赖性活性或抗原特异性活性是在可接受的变异范围内的T细胞
组合物。
[1362] 314.根据实施方案303-313中任一项的方法,其中对所述细胞的所述刺激是在任选地在或约37度下持续18-24小时的所述孵育之前进行或开始。
[1363] 315.根据实施方案303-314中任一项的方法,其中所述刺激条件包括选自IL-2、IL-15和IL-7的细胞因子。
[1364] 316.根据实施方案303-315中任一项的方法,其中对细胞的所述刺激在任选地持续一段时间以实现阈值浓度的所述孵育之后进行。
[1365] 317.根据实施方案303-316中任一项的方法,其进一步包括(c)向容器中填充所述T细胞组合物的全部或部分和任选地另一种溶液,至浓度在约1000万个细胞与约7000万个
细胞/ml之间,包含端值。
[1366] 318.根据实施方案317的方法,其中向所述容器中填充另一种溶液并且所述溶液包含冷冻保护剂、任选地DMSO。
[1367] 319.根据实施方案317或实施方案318的方法,其中所述浓度在约1500万个与约6000万个细胞/ml之间,包含端值。
[1368] 320.根据实施方案317-319中任一项的方法,其中所述浓度大于1000万个细胞/ml。
[1369] 321.根据实施方案317-320中任一项的方法,其中所述浓度大于1500万个细胞/ml。
[1370] 322.根据实施方案317-321中任一项的方法,其中DMSO的所述浓度是或是约或不超过7.5%。
[1371] 323.根据实施方案317或实施方案318的方法,其中所述浓度大于6000万个细胞/mL。
[1372] 324.根据实施方案317-320和323中任一项的方法,其中DMSO的所述浓度大于7.5%,任选地在或约在7.5%与9.0%之间,包含端值。
[1373] 325.根据实施方案303-324中任一项的方法,其中包含编码所述重组受体的核酸分子的所述药剂是病毒载体,任选地慢病毒载体或γ逆转录病毒载体。
[1374] 326.根据实施方案317-325中任一项的方法,其中所述填充以自动方式进行,任选地在封闭的系统中进行。
[1375] 327.根据实施方案303-326中任一项的方法,其进一步包括将所述容器中的所述细胞冷冻或将所述容器存储在低于或约低于80℃的温度下。
[1376] 328.一种治疗性T细胞组合物单位剂量,所述单位剂量包含一定数量的细胞,所述细胞包含对与疾病或病症相关或由疾病或病症表达的抗原有特异性的重组受体(任选地嵌
合抗原受体(CAR),其中所述数量的细胞是在或在约5.0x 106个与2.25x 107个之间、5.0x 
106个与2.0x 107个之间、5.0x 106个与1.5x 107个之间、5.0x 106个与1.0x 107个之间、
5.0x 106个与7.5x 106个之间、7.5x 106个与2.25x 107个之间、7.5x 106个与2.0x 107个之间、7.5x 106个与1.5x 107个之间、7.5x 106个与1.0x 107个之间、1.0x 107个与2.25x 107个之间、1.0x 107个与2.0x 107个之间、1.0x 107个与1.5x 107个之间、1.5x 107个与2.25x 
7 7 7 7 7
10个之间、1.5x 10 个与2.0x 10 个之间、2.0x 10个与2.25x 10 个之间的重组受体表达
细胞,任选地呈CD8+的或呈凋亡标记阴性(-)和CD8+的重组受体表达细胞(每个都包含端
值),任选地其中所述凋亡标记是膜联蛋白V或活性半胱天冬酶3。
[1377] 329.根据实施方案328的单位剂量,其中细胞的所述数量是:
[1378] 在至少或至少约5x 106个、6x 106个、7x 106个、8x 106个、9x 106个、10x 106个与约15x 106个之间的重组受体表达细胞,每个都包含端值,任选地呈CD8+的或呈凋亡标记阴性(-)和CD8+的重组受体表达细胞,任选地其中所述凋亡标记是膜联蛋白V或活性半胱天冬
酶3;
[1379] 在至少或至少约5.55x 106个、6.66x 106个、7.77x 106个、8.99x 106个、1.0x 107个、1.1x 107个与约1.67x 107个之间的重组受体表达细胞,任选地呈CD8+的或呈凋亡标记阴性(-)和CD8+的重组受体表达细胞,每个都包含端值,任选地其中所述凋亡标记是膜联蛋
白V或活性半胱天冬酶3;
[1380] 在至少或至少约6.25x 106个、7.5x 106个、8.75x 106个、1.0x 107个、1.13x 107个、1.25x 107个与约1.9x 107个之间的重组受体表达细胞,任选地呈CD8+的或呈凋亡标记
阴性(-)和CD8+的重组受体表达细胞,每个都包含端值,任选地其中所述凋亡标记是膜联蛋
白V或活性半胱天冬酶3;
[1381] 在至少或至少约7.14x 106个、8.5x 106个、1.0x 107个、1.14x 107个、1.29x 107个、1.42x 107个与约2.14x 107个之间的重组受体表达细胞,任选地呈CD8+的或呈凋亡标记
阴性(-)和CD8+的重组受体表达细胞,每个都包含端值,任选地其中所述凋亡标记是膜联蛋
白V或活性半胱天冬酶3。
[1382] 330.根据实施方案328或实施方案329的单位剂量,其中所述数量的细胞为在至少或至少约5x 106个、6x 106个、7x 106个、8x 106个、9x 106个、10x 106个与约15x 106个之间的呈CD8+的重组受体表达细胞,每个都包含端值。
[1383] 331.根据实施方案328或实施方案329的单位剂量,其中所述数量的细胞为在至少或至少约6.25x 106个、7.5x 106个、8.75x 106个、1.0x 107个、1.13x 107个、1.25x 107个与
7
约1.9x 10 个之间的是凋亡标记阴性(-)和CD8+的重组受体表达细胞,任选地其中所述凋
亡标记是膜联蛋白V或活性半胱天冬酶3,每个都包含端值。
[1384] 332.根据实施方案328-332中任一项的单位剂量,其中所述单位剂量不包含大于阈值数量的参考单位(RU),其中在给定组合物中RU的所述数量由下式定义:
[1385] RU=A x B,其中
[1386] A是在所述给定组合物中存在的具有表型的细胞的细胞数量、或其倍数或变换,或者是在所述给定组合物中具有两种或更多种表型的细胞的数量的平均值或加权平均值、或
所述平均值或加权平均值的倍数、分数或变换;并且
[1387] B是指示在所述给定T细胞组合物中重组受体依赖性、任选地CAR依赖性活性的程度或与其相关的参数的值、或所述值的倍数或变换。
[1388] 333.根据实施方案332的单位剂量,其中参考单位的所述阈值数量小于单位的参考安全数量,其中单位的所述参考安全数量是相对于在用包含表达所述重组受体、任选地
所述CAR的T细胞的治疗性T细胞组合物治疗后分析的一组受试者,向在曾持续发生不良事
件的组中的那些受试者中的受试者给予的疗法的单位的最低数量。
[1389] 334.根据实施方案333的单位剂量,其中所述不良事件是严重不良事件,任选地等于或高于4级或5级或至少延长的3级神经毒性的严重神经毒性。
[1390] 335.根据实施方案333或实施方案334的单位剂量,其中单位的所述阈值数量比单位的所述参考安全数量少了对应于安全系数的量或少了至少2倍。
[1391] 336.根据实施方案332-335中任一项的单位剂量,其中单位的所述阈值数量等于或高于单位的参考功效数量,其中所述参考功效数量是相对于在用包含所述重组受体、任
选地所述CAR的T细胞组合物治疗后分析的一组受试者,向展现出所希望的治疗结果、任选
地完全反应(CR)的组中的一名或多名受试者给予的疗法的单位的数量。
[1392] 337.根据实施方案121-127中任一项的单位剂量,其中在所述组合物中至少50%、至少60%、至少75%、至少80%或至少90%的CD8+细胞和/或CD8+CAR+细胞不呈凋亡标记阳
性,不是凋亡的或不处于凋亡的早期阶段,或不处于凋亡的晚期阶段。
[1393] 338.根据实施方案328-337中任一项的单位剂量,包含不超过1.88x 107个的CD8+CAR+ T细胞,任选地不是凋亡的或不处于凋亡的早期阶段或不处于凋亡的晚期阶段的CD8+
CAR+ T细胞。
[1394] 339.根据实施方案328-338中任一项的单位剂量组合物,其中所述剂量包含至少5x 106个膜联蛋白-CD8+CAR+细胞但不超过1.5x 107个膜联蛋白-CD8+CAR+细胞。
[1395] 340.根据实施方案328-339中任一项的单位剂量组合物,其中所述T细胞组合物通过如下的过程生产,在所述过程中:
[1396] 具有指示生物活性细胞特征和/或不存在凋亡或早期或晚期凋亡的表型的细胞(1)在所述组合物中的CAR+细胞中、(2)在所述组合物中的CAR+CD3+细胞中、和/或(3)在所
述组合物中的CAR+CD8+细胞中的频率,与在通过所述过程产生的多种T细胞组合物中的所
述频率的平均值相比变化不超过40%、或不超过30%、或不超过20%或不超过10%或不超
过5%和/或与这种平均值相比变化不超过一个标准偏差;或
[1397] 在所述组合物中具有指示不存在凋亡或早期或晚期凋亡的表型的细胞(1)在所述组合物中的CAR+细胞中、(2)在所述组合物中的CAR+CD3+细胞中、和/或(3)在所述组合物中
的CAR+CD8+细胞中的频率,与在通过所述过程生产的多种T细胞组合物相比变化不超过
40%或不超过20%或不超过10%。
[1398] 341.根据实施方案340的单位剂量,其中所述过程包括:
[1399] (a)在一定条件下将包含T细胞的细胞群与包含编码所述重组受体的核酸分子的药剂一起孵育,以将编码所述重组受体的所述核酸引入所述群体的细胞中;并且
[1400] (b)在所述孵育之前、期间和/或之后刺激所述细胞,其中刺激包括在刺激条件的存在下孵育所述细胞,所述刺激条件诱导所述细胞的初级信号、信号传导、刺激、激活和/或扩增。
[1401] 342.根据实施方案341的单位剂量,其中所述过程进一步包括在(a)之前从生物样品中分离细胞的所述群体。
[1402] 343.根据实施方案342的单位剂量,其中所述分离包括,基于CD3的表面表达或基于CD4和CD8之一或两者的表面表达来选择细胞,任选地通过阳性或阴性选择。
[1403] 344.根据实施方案342或实施方案343的单位剂量,其中所述分离包括进行基于免疫亲和的选择。
[1404] 345.根据实施方案342-344的单位剂量,其中所述生物样品是或包含全血样品、血沉棕黄层样品、外周血单核细胞(PBMC)样品、未分级T细胞样品、淋巴细胞样品、白细胞样
品、单采术产物或白细胞分离术产物。
[1405] 346.根据实施方案341-345中任一项的单位剂量,其中所述刺激条件包括与能够激活TCR复合物的一种或多种组分的一个或多个细胞内信号传导结构域和/或一种或多种
共刺激分子的一个或多个细胞内信号传导结构域的刺激试剂一起孵育。
[1406] 347.根据实施方案346的单位剂量,其中所述刺激试剂包含与TCR复合物的成员特异性地结合的一级药剂和与T细胞共刺激分子特异性地结合的二级药剂。
[1407] 348.根据实施方案346或实施方案347的单位剂量,其中所述一级药剂特异性地结合CD3,和/或所述共刺激分子选自CD28、CD137(4-1-BB)、OX40或ICOS。
[1408] 349.根据实施方案347或实施方案348的单位剂量,其中所述一级药剂和所述二级药剂包含抗体和/或存在于固体支持物、任选地珠的表面上。
[1409] 350.根据实施方案346-349中任一项的单位剂量,其中:
[1410] 所述刺激试剂是如下的一种:其中已经确定重组受体依赖性活性或抗原特异性活性,任选地促炎性细胞因子的重组受体依赖性或抗原特异性依赖性产生或积累,与使用所
述刺激试剂通过所述过程生产的多种T细胞组合物中的促炎性细胞因子的产生或积累的量
度的平均值相比变化不超过40%、或不超过30%、或不超过20%或不超过10%或不超过
5%,和/或与这种平均值相比变化不超过一个标准偏差;和/或
[1411] 所述刺激试剂是如下的一种:其中已经确定重组受体依赖性活性或抗原特异性活性,任选地促炎性细胞因子的重组受体依赖性或抗原特异性依赖性产生或积累,在通过所
述过程生产的多种T细胞组合物中变化不超过40%、不超过30%、或不超过20%或不超过
10%或不超过5%;和/或
[1412] 所述刺激试剂是如下的一种:其中已经确定重组受体依赖性活性或抗原特异性活性,任选地使用所述刺激试剂生产的细胞组合物的促炎性细胞因子的重组受体依赖性或抗
原特异性依赖性产生或积累,与对照组合物相比变化不超过40%、或不超过30%、或不超过
20%或不超过10%或不超过5%,其中除了所述对照组合物在对照刺激试剂或所述重组受
体依赖性活性的标准单位的存在下进行之外,所述对照组合物和所述细胞组合物使用相同
的过程、包括从相同的细胞群生产。
[1413] 351.根据实施方案350的单位剂量,其中当在所述过程中使用时,已知所述对照刺激试剂生产其中所述重组受体依赖性活性或抗原特异性活性是在可接受的变异范围内的T
细胞组合物。
[1414] 352.根据实施方案341-351中任一项的单位剂量,其中对所述细胞的所述刺激是在任选地在或约37度下持续18-24小时的所述孵育之前进行或开始。
[1415] 353.根据实施方案341-352中任一项的单位剂量,其中所述刺激条件包括选自IL-2、IL-15和IL-7的细胞因子。
[1416] 354.根据实施方案341-353中任一项的单位剂量,其中对细胞的所述刺激在任选地持续一段时间以实现阈值浓度的所述孵育之后进行。
[1417] 355.根据实施方案341-354中任一项的单位剂量,其进一步包括(c)向容器中填充所述T细胞组合物的全部或部分和任选地另一种溶液,至浓度在约1000万个细胞与约7000
万个细胞/ml之间,包含端值。
[1418] 356.根据实施方案355的单位剂量,其中向所述容器中填充另一种溶液并且所述溶液包含冷冻保护剂、任选地DMSO。
[1419] 357.根据实施方案355或实施方案356的单位剂量,其中所述浓度在约1500万个与约6000万个细胞/ml之间,包含端值。
[1420] 358.根据实施方案355-357中任一项的单位剂量,其中所述浓度大于1000万个细胞/ml。
[1421] 359.根据实施方案355-358中任一项的单位剂量,其中所述浓度大于1500万个细胞/ml。
[1422] 360.根据实施方案355-359中任一项的单位剂量,其中DMSO的所述浓度是或是约或不超过7.5%。
[1423] 361.根据实施方案355或实施方案356的单位剂量,其中所述浓度大于6000万个细胞/mL。
[1424] 362.根据实施方案355-358和361中任一项的单位剂量,其中DMSO的所述浓度大于7.5%,任选地在或约在7.5%与9.0%之间,包含端值。
[1425] 363.根据实施方案341-362中任一项的单位剂量,其中包含编码所述重组受体的核酸分子的所述药剂是病毒载体,任选地慢病毒载体或γ逆转录病毒载体。
[1426] 364.根据实施方案355-363中任一项的单位剂量,其中所述填充以自动方式进行,任选地在封闭的系统中进行。
[1427] 365.根据实施方案341-364中任一项的单位剂量,其进一步包括将所述容器中的所述细胞冷冻或将所述容器存储在低于或约低于80℃的温度下。
[1428] 366.一种确定受试者是否有毒性风险的方法,所述方法包括测定在受试者血液中的重组受体表达细胞的数量,所述受试者先前已经被给予一定剂量的所述重组受体表达细
胞,其中如果出现以下情况,则所述受试者有发生毒性的风险:
[1429] (i)在所述给予开始之后不超过四天,在所述受试者血液中的重组受体表达细胞的所述数量是至少为或至少约2个重组受体表达细胞/微升;
[1430] (ii)在所述给予开始之后不超过五天或六天,在所述受试者血液中的重组受体表达细胞的所述数量是至少为或至少约5个重组受体表达细胞/微升或是至少为或至少约10
个重组受体表达细胞/微升;或
[1431] (iii)在所述给予开始之后不超过七天,在所述受试者血液中的重组受体表达细胞的所述数量是至少为或至少约15个重组受体表达细胞/微升。
[1432] 367.一种确定受试者是否有毒性风险的方法,所述方法包括:
[1433] (a)向患有疾病或病症的受试者给予一定剂量的表达重组受体的细胞;并且
[1434] (b)在给予所述细胞之后,测定在受试者血液中的重组受体表达细胞的数量,其中如果出现以下情况,则所述受试者有发生毒性的风险:
[1435] (i)在所述给予开始之后不超过四天,在所述受试者血液中的重组受体表达细胞的所述数量是至少为或至少约2个重组受体表达细胞/微升;
[1436] (ii)在所述给予开始之后不超过五天或六天,在所述受试者血液中的重组受体表达细胞的所述数量是至少为或至少约5个重组受体表达细胞/微升或是至少为或至少约10
个重组受体表达细胞/微升;或
[1437] (iii)在所述给予开始之后不超过七天,在所述受试者血液中的重组受体表达细胞的所述数量是至少为或至少约15个重组受体表达细胞/微升。
[1438] 368.根据实施方案366或实施方案367的方法,其中如果确定所述受试者有发生毒性的风险;则停止给予所述重组受体表达细胞,向所述受试者给予较低剂量的重组受体表
达细胞的剂量;向所述受试者给予表达不同重组受体的细胞;和/或向所述受试者给予能够
治疗、预防、延迟或减弱所述毒性发生的药剂。
[1439] 369.根据实施方案366-368中任一项的方法,其中如果确定所述受试者有发生毒性的风险,则向所述受试者给予能够治疗、预防、延迟或减弱所述毒性发生的药剂。
[1440] 370.一种评估用于在生产治疗性T细胞组合物中使用的刺激试剂的方法,所述方法包括:
[1441] (i)对使用刺激试剂生产的T细胞组合物评估重组受体依赖性活性或表型;并且
[1442] (ii)将所述重组受体依赖性活性或所述表型与从对照组合物产生的重组受体依赖性活性或表型进行比较,或者与标准单位比较重组受体依赖性活性或表型,
[1443] 其中如果使用所述刺激试剂生产的所述细胞组合物的重组受体依赖性活性或表型从由所述对照组合物产生的重组受体依赖性活性或从所述标准单位的变化不超过40%
或不超过30%或不超过20%或不超过10%或不超过5%,则确定所述刺激剂适合释放以用
于在生产治疗性T细胞组合物的方法中使用。
[1444] 371.根据实施方案370的方法,其中所述重组受体依赖性活性是抗原特异性活性。
[1445] 372.根据实施方案370或实施方案371的方法,其中所述对照组合物和T细胞组合物使用相同的过程生产,包括来自相同的细胞群,除了所述对照组合物在对照刺激试剂的
存在下进行。
[1446] 373.根据实施方案370-372中任一项的方法,其中评估了重组受体依赖性活性并将其与从对照组合物产生的重组受体依赖性活性进行比较或与标准单位比较重组受体依
赖性活性。
[1447] 374.根据实施方案370-373中任一项的方法,其中所述重组受体依赖性活性是促炎性细胞因子的重组受体依赖性或抗原特异性依赖性产生或积累。
[1448] 375.根据实施方案364的方法,其中所述促炎性细胞因子是IL-2、TNF-α、IFNγ或IL-10。
[1449] 376.根据实施方案370-372中任一项的方法,其中评估了表型并将其与从对照组合物产生的相同表型进行比较或与标准单位比较表型。
[1450] 377.根据实施方案370-372和376中任一项的方法,其中所述表型包括特定分化状态和/或记忆/干细胞样表型。
[1451] 378.根据实施方案370-372、376和377中任一项的方法,其中所述表型包括表面标记的阳性表达,所述表面标记是CD3、CD8、CD27、CD28,和/或所述表型包括所述重组受体、任选地所述CAR或用于表达所述重组受体的替代标记的阳性表达。
[1452] 379.根据实施方案370-372和376-378中任一项的方法,其中所述表型包括CD27+/CD28+/CD8+。
[1453] 380.根据实施方案370-379中任一项的方法,其中所述刺激试剂能够激活TCR复合物的一种或多种组分的一个或多个细胞内信号传导结构域和/或一种或多种共刺激分子的
一个或多个细胞内信号传导结构域。
[1454] 381.根据实施方案370-380中任一项的方法,其中所述刺激试剂包含与TCR复合物的成员特异性地结合的一级药剂和与T细胞共刺激分子特异性地结合的二级药剂。
[1455] 382.根据实施方案380或实施方案381的方法,其中所述一级药剂特异性地结合CD3,和/或所述共刺激分子选自CD28、CD137(4-1-BB)、OX40或ICOS。
[1456] 383.根据实施方案381或实施方案382的方法,其中所述一级药剂和所述二级药剂包含抗体和/或存在于固体支持物、任选地珠的表面上。
[1457] 384.一种容器,其包含浓度在约1000万个细胞与约7000万个细胞/mL之间的治疗性T细胞组合物、和任选地另一种溶液,其中所述治疗性T细胞组合物包含含有重组受体的T
细胞。
[1458] 385.根据实施方案384的容器,其中所述浓度在约1500万与约6000万个细胞/mL之间。
[1459] 386.根据实施方案384或385的容器,其中所述浓度为或为约1500万个细胞/mL。
[1460] 387.根据实施方案384或385的容器,其中所述容器填充有另一种溶液,并且所述溶液包含冷冻保护剂、任选地DMSO。
[1461] 388.根据实施方案384-386中任一项的容器,其中所述容器是小瓶或是袋。
[1462] 389.根据实施方案384-387中任一项的容器,其中所述容器是小瓶,任选地冷冻小瓶,并且所述组合物的体积为不超过20mL,任选地1mL至20mL、1mL至15mL、1mL至10mL、1mL至
5mL、1mL至2.5mL、2.5mL至20mL、2.5mL至15mL、2.5mL至10mL、2.5mL至5mL、5mL至20mL、5mL至
15mL、5mL至10mL、10mL至20mL、10mL至15mL或15mL至20mL。
[1463] 390.根据实施方案384-388中任一项的容器,其中所述容器是袋,任选地冷冻袋,并且所述组合物的体积:
[1464] 在或在约15mL与150mL、20mL与100mL、20mL与80mL、20mL与60mL、20mL与40mL、40mL与100mL、40mL与80mL、40mL与60mL、60mL与100mL、60mL与80mL或80mL与100mL之间,每个都包含端值;或
[1465] 为至少或至少约15mL、至少或至少约20mL、至少或至少约30mL、至少或至少约40mL、至少或至少约50mL、至少或至少约60mL、至少或至少约70mL、至少或至少约80mL或至
少或至少约90mL;和/或
[1466] 为不超过100mL。
[1467] 391.根据实施方案384-390中任一项的容器,其中所述容器中所述组合物的表面积与体积比:
[1468] 在或在约0.1cm-1与100cm-1、1cm-1与50cm-1、1cm-1与20cm-1、1cm-1与10cm-1、1cm-1与7cm-1、1cm-1与6cm-1、1cm-1与3cm-1、1cm-1与2cm-1、2cm-1与20cm-1、2cm-1与10cm-1、2cm-1与7cm-1、
2cm-1与6cm-1、2cm-1与3cm-1、3cm-1与20cm-1、3cm-1与10cm-1、3cm-1与7cm-1、3cm-1与6cm-1、6cm-1与20cm-1、6cm-1与10cm-1、6cm-1与7cm-1、7cm-1与20cm-1、7cm-1与10cm-1、或7cm-1与20cm-1之间,每个都包含端值;或
[1469] 为、为约、或为至少3cm-1、4cm-1、5cm-1、6cm-1、7cm-1、10cm-1、15cm-1或20cm-1。
[1470] 392.根据实施方案384-3391中任一项的容器,其中所述T细胞源自患有疾病或病症的受试者并用编码对与疾病或病症相关或由疾病或病症表达的抗原有特异性的重组受
体、任选地嵌合抗原受体(CAR)的核酸转导,和/或所述T细胞包含重组受体、任选地CAR。
[1471] 393.根据实施方案97-105中任一项的容器,其中所述重组受体是CAR。
[1472] 394.根据实施方案106的容器,其中所述CAR包含与所述抗原特异性地结合的细胞外抗原识别结构域和包含ITAM的细胞内信号传导结构域,其中任选地,所述细胞内信号传
导结构域包含CD3-ζ(CD3ζ)链的细胞内结构域;和/或其中所述CAR进一步包含共刺激信号
传导区域,所述共刺激信号传导区域任选地包含4-1BB的信号传导结构域。
[1473] 395.根据实施方案97-107中任一项的容器,其中所述T细胞是CD4+或CD8+的。
[1474] 396.根据实施方案97-108中任一项的方法,其中所述T细胞是原代T细胞。
[1475] 397.根据实施方案97-109中任一项的容器,其中所述T细胞组合物通过如下的过程生产,在所述过程中:
[1476] 具有指示生物活性细胞特征和/或不存在凋亡或早期或晚期凋亡的表型的细胞(1)在所述组合物中的CAR+细胞中、(2)在所述组合物中的CAR+CD3+细胞中、和/或(3)在所
述组合物中的CAR+CD8+细胞中的频率,与在通过所述过程产生的多种T细胞组合物中的所
述频率的平均值相比变化不超过40%、或不超过30%、或不超过20%或不超过10%或不超
过5%和/或与这种平均值相比变化不超过一个标准偏差;或
[1477] 在所述组合物中具有指示不存在凋亡或早期或晚期凋亡的表型的细胞(1)在所述组合物中的CAR+细胞中、(2)在所述组合物中的CAR+CD3+细胞中、和/或(3)在所述组合物中
的CAR+CD8+细胞中的频率,与在通过所述过程生产的多种T细胞组合物相比变化不超过
40%或不超过20%或不超过10%。
[1478] X.实施例
[1479] 以下实施例被包括在内仅用于说明目的,并不旨在限制本发明的范围。
[1480] 实施例1:预测严重神经毒性的CAR+ T细胞组合物参数的确定
[1481] 在用治疗性组合物治疗患有复发性或难治性急性成淋巴细胞性白血病(ALL)的受试者后评估了各种参数,所述治疗性组合物含有被工程化以表达抗CD19嵌合抗原受体
(CAR)的自体T细胞。评估的参数包括治疗性细胞组合物和剂量的参数(包括各种表型的细
胞的功能特征及数量和频率)、患者特征、以及临床和治疗参数(包括指示反应相关和毒性
相关结果的那些参数)。
[1482] 事后对单独受试者分析了参数,并使用许多统计学分析(包括描述性、图形、非参数和基于模型的分析)在受试者之间进行了比较。评估了不同参数之间的关系。特别地,所
述研究评估了单独患者以及细胞组合物或剂量的各种参数与展现治疗反应的可能性和/或
与不良后果如神经毒性(例如,严重或5级神经毒性和脑水肿)的风险相关(直接或相反)的
程度。
[1483] A.CAR+ T细胞疗法
[1484] 已经向评估的受试者(N=38)给予用于治疗成人ALL的含有表达抗CD19嵌合抗原受体(CAR)的自体T细胞的T细胞组合物。在治疗开始时,在38名受试者中有三十二名(32名)
展现出骨髓中的疾病的形态学证据(至少5%的原始细胞),并且通过PCR得出有六名(6名)
展现出可分子检测的疾病。受试者的年龄为18岁或以上,患有复发性或难治性形态学CD19
阳性疾病(如由骨髓中大于5%的原始细胞定义),包括髓外和费城染色体阳性(Ph+)疾病,
接受一线挽救疗法或更高线疗法(包括后同种异体造血干细胞治疗),并且东部肿瘤协作组
(ECOG)得分为0-2分。受试者具有足够的器官功能,如由以下值所示:血清肌酸酐≤1.5x正
常[ULN]上限或肌酸酐清除率>30mL/min/1.73m2、丙氨酸氨基转移酶<5x ULN、胆红素<
2.0mg/dL、≤1级呼吸困难和室内空气中≥92%的饱和氧、和左室射血分数≥40%。受试者
包括接受先前博纳吐单抗治疗的那些受试者。排除标准包括孤立性髓外疾病或伯基特病
(Burkett’s disease)、活性CNS受累伴疾病(CNS3)或CNS病理、活性急性(II-IV级)或广泛
性慢性移植物抗宿主病(GvHD)、活动性感染和先前基因疗法。还排除包括在过去6个月内使
用阿仑单抗治疗、在过去3个月内使用氯法拉滨或克拉屈滨治疗、在过去4周内使用GvHD药
物治疗、或在过去一周内使用挽救化学疗法和治疗性皮质类固醇治疗的那些受试者在内的
受试者。
[1485] 表E1A中显示了在研究中包括的受试者的人口统计学和基线特征。
[1486] 表E1-A:人口统计学和基线特征
[1487]
[1488] IT,鞘内;LD,淋巴细胞清除。
[1489] aHyper CVAD部分A或B,方案含有氟达拉滨和/或阿糖胞苷。
[1490] 所给予的治疗性T细胞组合物通过如下过程生成,所述过程包括从来自单独受试者的白细胞分离术样品对T细胞(包括CD4+和CD8+细胞)进行基于免疫亲和力的选择,随后
用编码抗CD19 CAR的病毒载体的激活和转导、扩增和冷冻保存。CAR含有源自鼠类抗体的抗
CD19 scFv;包括细胞外区域、跨膜结构域和共刺激区域的CD28区域;以及CD3-ζ细胞内信号传导结构域。在静脉内给予之前在床边解冻冷冻保存的细胞组合物。给予已经填充和冷冻
保存的全部体积的细胞组合物。
[1491] 已经以大约1x 106个CD3+CAR+细胞/kg(受试者体重)的第一目标剂量给予细胞。针对已被给予类似组合物的患有形态学疾病的一组受试者,已经以一系列不同CD3+CAR+细
胞数量/给予剂量基于比较毒性结果部分地评估了给予的目标剂量和剂量范围。特别地,评
估了CD3+CAR+/kg剂量的关系以及是否包括受试者是否继续发生3级神经毒性,并且目标剂
量和剂量范围低于给予至已经证实3级或更高等级的神经毒性的任何此类受试者的CD3+
CAR+细胞/kg的最低数量,小于至少1.5x 106个CD3+CAR+细胞/kg的安全范围。参见图22。剂
量未考虑CD4+与CD8+细胞或其他T细胞亚组的数量或频率。评估针对CAR抗原+细胞的细胞
毒性活性作为效力的量度。一些受试者在初始剂量后在大约14与28天之间接受了第二剂
量。在给予自体CAR表达细胞之前,已经向受试者给予预处理的淋巴细胞清除化学疗法,其
2
仅含有单一剂量的环磷酰胺(约1-3g/m)或含有环磷酰胺(30-60mg/kg)和氟达拉滨(25mg/
m2-30 mg/m2,经三天每天给予)。
[1492] 监测受试者的反应和其他结果,包括检查骨髓、外周血和脑脊液(CSF)。还评估并监测受试者的神经毒性(神经系统并发症,包括以下症状:意识错乱、失语症、脑病、肌阵挛癫痫、惊厥、嗜睡和/或精神状态改变),根据国家癌症研究所—常见毒性标准(CTCAE)量表
4.03版(NCI-CTCAE v4.03),按1-5量表评级。常见毒性标准(CTCAE)量表4.03版(NCI-CTCAE 
v4.03)。参见美国卫生和公共服务部的不良事件通用术语(CTCAE)第4版,公开于:2009年5
月28日(v4.03:2010年6月14日);和Guido Cavaletti&Paola Marmiroli Nature Reviews 
Neurology 6,657-666(2010年12月)。还确定并监测细胞因子释放综合征(CRS),并基于严
重性进行评级。
[1493] 对于在治疗开始时展现出形态学疾病的受试者,将反应(显示完全反应(CR)或完全反应不完全骨髓恢复(CRi)的受试者的百分比(CR/CRi比率)(在中值4个月随访中))和毒
性结果汇总于表E1-B和E1-C中。(NE=不可评价)。如所示,56%的受试者发生了3-5级神经
毒性。五名(5名)受试者发生了5级神经毒性以及特别地5级脑水肿。
[1494] 表E1-B:治疗受试者的总结
[1495]
[1496]
[1497] 表E1-C:32名患有形态学疾病的治疗受试者的结果
[1498] (总治疗=38名受试者)
[1499]
[1500] 另外6名治疗受试者在治疗的时候呈微小残留疾病(MRD+)阳性。
[1501] 如来自公开获得信息报道的,已经在若干项不同的临床试验中,包括在涉及表达具有不同抗原结合结构域和不同共刺激结构域的不同CAR的CAR-T细胞(所述CAR-T细胞用
不同的制造方案产生并且用于治疗不同的疾病或适应症)的试验中报道了至少15例5级神
经毒性和至少13例与CAR-T细胞疗法相关的脑水肿。
[1502] B.CAR-T细胞在血液中的药代动力学(PK)
[1503] 对从在给予第一和(在适用的情况下)第二剂量的细胞组合物后的不同时间点的受试者的血液来源的样品进行分析。通过流式细胞术对样品分析血液中CAR表达细胞的存
在和数量。
[1504] 如图1和图2所示,在继续发生更严重神经毒性的受试者(并且特别是发生了5级神经毒性和脑水肿的那些)的血液中观察到更快速的CAR表达T细胞的峰值扩增。例如,结果指
示这些受试者在第一剂量的细胞之后4-7天内展现出可检测水平的CAR+细胞/μL血液,其中
在给予细胞之后七天内在所有此类受试者的血液中观察到大于20个CAR+细胞/μL血液。在
具有3级或4级神经毒性的受试者中,通常在稍后时间观察到CAR+ T细胞的峰值扩增,并且
每微升具有较低的CAR+ T细胞峰值数量(图2)。
[1505] C.在不同受试者中的临床、患者、转化医学和CMC参数的评估和比较
[1506] 根据治疗开始时疾病的严重程度和治疗结果或毒性的发生(包括不同程度的神经毒性),对不同患者组评估了各种参数。如在本实施例和在实施例2中所述,通过描述性、图
形、非参数和基于模型的分析评估了相关性和显著性的存在或不存在。使用单变量和多变
量逻辑回归分析了大约500个临床和转化医学参数。使用非参数检验和基于分区(决策树)
的方法在单变量和多变量分析中检测了大约140个化学、制造和控制(CMC)参数。
[1507] 在来自已给予至受试者的T细胞组合物的样品(从已给予至受试者的冷冻保存的治疗组合物样品(CDP)中解冻)中评估了各种CMC属性。对样品分析了各种参数的存在、不存
在、水平、归一化水平、量和/或归一化量。评估的示例性临床和患者属性包括患者年龄、先前治疗史以及在治疗之前患者是否已接受淋巴细胞清除和/或维持化学疗法、神经毒性的
发生和等级以及其他毒性结果。细胞组合物特异性和/或剂量相关参数包括(在给予的和/
或根据受试者体重给予的剂量中)各种细胞群的数量和频率(或其归一化值)、细胞因子产
生、响应于CAR抗原刺激的细胞毒性活性、以及响应于各种条件指示诸如激活或刺激和/或
效应功能等功能的其他参数。评估了在输注CAR+T细胞后在治疗性组合物中的各种参数(单
独地和在一些情况下其组合)与在单独受试者中观察到的神经毒性和其他结果的相关程
度。
[1508] 对于在治疗开始时展现出形态学疾病的受试者亚组对某些参数的示例性统计分析的结果与如下发现一致:患者年龄、先前治疗史和淋巴细胞清除和/或维持化学疗法与5
级神经毒性的发生相关(直接或相反)。例如,在这组受试者中,年龄小于30岁的较年轻患者
(已接受较低数量(等于2种或更少)的先前疗法的那些和在3个月内已接受氟达拉滨或侵入
性维持化学疗法的那些)在这项研究中更有可能发生了5级神经毒性。针对示例性临床因
素,在用细胞疗法治疗后经历脑水肿的计算优势比估计值显示在表E1-D中。通过将发生与
人口统计学或治疗史相关的5级神经毒性的几率除以与不存在人口统计学或治疗史相关的
几率来计算优势比。优势比超过1指示发生5级神经毒性的概率或可能性增加。
[1509] 表E1-D:与脑水肿相关的示例性临床因素
[1510]
[1511] 对于先前的CNS辐照、先前的鞘内(IT)化学疗法治疗、先前的CNS疾病、先前的同种异体细胞疗法、更高的ECOG表现状态、或先前的博纳吐单抗治疗,未观察到更高风险的关
联。
[1512] 在这项研究中,也观察到某些此类参数(例如,年轻(≤30y)患者年龄和较少的先前治疗)与某些治疗性组合物特异性或剂量相关属性(包括在一定剂量的细胞中受试者接
受的CD8+CAR+AnnV阴性细胞的总数、以及促炎性细胞因子IL-2的抗原特异性积累的水平,
如在表达CD19(CAR抗原,指示CAR诱导的细胞活性)的细胞的存在下在解冻的治疗性细胞组
合物的培养物中测量的)相关。评估的示例性属性还包括给予至单独受试者的单独剂量中
存活细胞和/或各种表型的细胞的数量或频率(或数量/kg)。示例性的此类表型包括一种或
多种表面标记的表达,如通过流式细胞术评估的。例如,表型包括CD3+、CD8+、CD4+和/或CAR+。表型还包括存活力、以及与功能、健康或生物活性细胞相关或指示功能、健康或生物活性细胞或被认为指示功能、健康或生物活性细胞的那些。在一些方面,此类表型包括指示凋
亡、指示凋亡细胞或指示一种或多种死亡或凋亡途径进入的各种(例如,早期或晚期)阶段
的标记(例如膜联蛋白V、半胱天冬酶3)的阴性或低的存在或表达。在一些方面,此类标记包
括细胞响应于PMA/离子霉素和/或FOXP3以非CAR抗原特异性方式(如以细胞内细胞因子染
色(ICS))产生细胞因子或其他因子的能力。在一些方面,标记和表型包括与T细胞激活、消
耗、干细胞样特性、幼稚T细胞、寿命、T细胞亚群、一种或多种记忆表型和T-记忆亚组(如TCM、TEM、TSCM)的表型相关的那些。
[1513] 例如,治疗性细胞组合物相关属性包括所给予剂量中CD8+CAR+ T细胞的总数、所给予剂量中观察到对于指示凋亡的因子呈阴性(例如用膜联蛋白V的表面染色(膜联蛋白
V-)或半胱天冬酶3切割(指示非凋亡细胞))的CD8+CAR+ T细胞的总数或频率(例如,在CD8+
CAR+ T细胞中)。在一些例子中,治疗性细胞组合物相关属性包括所给予剂量中CD3+CAR+ T
细胞的总数、所给予剂量中观察到对于指示凋亡的因子呈阴性(例如用膜联蛋白V的表面染
色(膜联蛋白V-)或半胱天冬酶3切割(表明非凋亡细胞))的CD3+CAR+ T细胞的总数或频率
(例如,在CD3+CAR+ T细胞中)。
[1514] 示例性参数包括治疗性组合物和/或其生产特有的特性,包括存活细胞浓度(VCC)、在接种与药物产品收获之间细胞的倍数扩增;和在所给予的剂量中的载体拷贝数
(VCN)。
[1515] 示例性参数还包括通常与组合物中细胞的功能或活性或其他特征或能力相关或指示组合物中细胞的功能或活性或其他特征或能力的那些参数。这些包括与细胞刺激的结
果相关的各种属性,包括增殖和激活或活性的各种指示,包括以TCR和/或CAR诱导或依赖性
方式诱导的那些。与功能或活性有关的示例性的此类参数是响应于CAR抗原特异性或其他
刺激在组合物中的细胞产生一种或多种因子(如各种细胞因子)的量度或水平(如量或其浓
度或水平/细胞)。
[1516] 在细胞内细胞因子染色(ICS)测定中,将基于流动的方法用于评估组合物中的细胞响应于非抗原特异性刺激产生各种细胞因子的能力。在高尔基体抑制剂的存在下用PMA/
离子霉素刺激细胞。通过靶向FOXP3基因的Treg特异性脱甲基化区域(TSDR)的qPCR测定评
估FoxP3表达。未观察到指示Treg表型的FOXP3水平。
[1517] 在共培养测定中评估指示组合物的CAR靶向的抗原特异性活性和功能(如CAR-抗原依赖性细胞因子分泌和细胞毒性)的若干个参数。在表达CD19的靶细胞的存在下孵育正
在被评估的治疗性组合物的细胞。对于细胞因子测定,在将靶细胞和一定量的多种组合物
(包括相同数量的转导细胞或CAR+细胞)以相同的体积孵育大约22-24小时的一段时间后评
估一种或多种细胞因子(例如IL-2、IFN-γ、TNF-α、IL-6、sCD137、MIP1b、MIP1a、IL-10、IL-
4、IL-13、IL-5或GM-CSF)的累积量(pg/mL)。此类测定提供了在所述剂量中每个CAR+细胞的
抗原特异性细胞因子分泌的量度。在其他测定中,在与T细胞孵育之后评估针对表达CD19的
靶细胞的细胞溶解活性。
[1518] 在一些情况下,评估了响应于非CAR抗原特异性刺激物的活性或功能效应的量度,如在用抗CD3/抗CD28(例如涂覆在磁珠上)刺激后的细胞因子或其他因子产生。在此类测定
中,在培养物中的T细胞中包括较少CAR+细胞的培养物可以展现出较高的相对水平的量度。
[1519] 表E2列出了以无偏倚的方式从已经针对在所述研究中给予至受试者的治疗性细胞组合物和/或其剂量评估的属性中选择的多个属性的列表。经由单变量分析在治疗开始
时已经展现出形态学疾病的受试者的亚组(22名)评估了这些属性。表E2列出了p值,其表明
观察到基于单变量分析每个属性与神经毒性等级和/或脑水肿相关(直接(+)或相反(-))的
程度(相对于其他受试者比较5级神经毒性/脑水肿)。在15名受试者中,还评估了每个属性
与反应结果相关或不相关的程度(如通过比较实现了完全反应(CR)或无反应(NR)的受试者
评估的);表E2还列出了这项比较的p值。
[1520] 基于在给定属性与神经毒性/脑水肿(5级神经毒性/CE与4级或更低等级神经毒性)之间的单变量统计学比较,按照最低p值到最高p值以降序排列在表E2中所列出的参数。
对于关于神经毒性等级的p值小于或等于0.2的参数,表E2进一步指示观察到的与神经毒性
的关系是直接的((+),指示如与具有4级或更低等级的神经毒性级的那些受试者相比,在具
有5级神经毒性和脑水肿的受试者中观察到参数的平均水平或量度更大),还是相反的
((-),指示在5级受试者中观察到参数的平均水平或量度更低)。
[1521] 图3A至图3U显示了其中在参数与5级神经毒性之间观察到关系(直接的或相反的)的参数亚组的图,描绘了在不同神经毒性或反应组中的单独受试者的结果。关于神经毒性
这些图的观察到的p值为0.05或更低。
[1522] 图3V显示了比较给予至受试者的CD3+CAR+细胞数量/kg(剂量)的量度以及受试者是否发生5级神经毒性(右侧)和/或实现完全反应(左侧)的图。尽管观察到两个变量之间的
关系,但CD3+CAR+细胞/kg不是5级神经毒性的强预测因子,并且没有观察到明显的安全范
围。结果与如下解释一致:仅基于CD3+CAR+剂量的数量或频率定义剂量,而没有考虑其他参
数如生物活性(例如,非凋亡)细胞和/或CD8与CD4细胞的表现,可能不足以预防严重神经毒
性的风险,并且开发考虑如本文所观察到的一个或多个预测参数的给药策略是有利的。
[1523] 图4、5A和5B显示了对于不同神经毒性或反应组中的单独受试者,各个细胞因子(TNFα、IFNγ、IL-2)的抗原特异性分泌的量度的图和p值。
[1524] 如所示,观察到在治疗性细胞组合物和剂量中评估的许多参数与将组合物给予至受试者后发生5级神经毒性显著相关(直接地或相反地)。
[1525] 表E2:评估治疗性细胞组合物和/或剂量的参数以及与神经毒性和反应结果的相关性
[1526]
[1527]
[1528]
[1529]
[1530]
[1531]
[1532]
[1533] 据观察,在这项研究中观察到的关于载体拷贝数(每个细胞或每个基因组)的关系被认为是细胞适应性和/或与组合物中的工程化或非工程化细胞的相对表现相关的多个变
量和/或组合物中总细胞密度的替代指示物。例如,在一些实施方案中,来自血液样品的在
过程的开始时总体上较不健康的细胞在转导期期间具有较低的存活可能性和/或在转导期
间的细胞死亡可以提高转导效率。因此,在一些方面,在一些情况下,每种组合物的较高拷
贝数的病毒载体(如经由慢病毒或γ逆转录病毒载体转导引入的一种病毒载体可能指示其
中较大百分比的细胞在过程的开始时不健康并且在一些方面可能具有与神经毒性(例如相
反地)相关的特性的组合物。在一些实施方案中,较高的转导频率可能导致在低温保存、储
存和解冻期间具有较高频率的工程化(例如,CAR+)细胞的组合物。在一些方面,当剂量是基
于工程化细胞(或其亚型,例如CAR+CD3+)的数量时,具有较高频率的工程化细胞的此类组
合物可能包括较低的总体细胞密度,这在一些实施方案中与降低水平或频率的生物活性或
非凋亡的细胞相关。
[1534] 这项单变量分析的结果鉴定了剂量和/或治疗性细胞组合物的若干个参数,观察到所述参数与5级神经毒性/脑水肿的发生显著相关(直接地或相反地)。此类参数包括指示
在剂量中给予的细胞的数量、数量/患者体重和/或频率,所述细胞具有通常指示生物活性
细胞(如非凋亡CAR+ T细胞或非凋亡CAR+CD8+ T细胞)的表型。观察到与5级神经毒性相关
的许多参数与治疗反应结果不显著相关(这里,受试者是否实现了完全反应或无反应)。在
各种情况下,观察到许多实现CR的受试者具有如下水平的这些参数,所述水平低于(对于直
接相关)与在发生不希望的效果如5级神经毒性的受试者中观察到的最低数量(对于直接相
关)对应的阈值水平。例如,结果指示,表达CAR的生物活性或非凋亡CD3+和/或CD8+细胞的
数量可以用于确定在安全和功效边界内的剂量以降低神经毒性的风险并且在观测到反应
的范围内。在致命神经毒性与T细胞分化状态或其他表型之间未鉴定出关联。
[1535] 在给予至受试者的剂量中对于凋亡标记(包括膜联蛋白V)的表面染色呈阴性的细胞的一个或多个数量或归一化数量的各种量度(或在产物的细胞中如在CAR+CD3+或CAR+
CD8+中的此类凋亡标记阴性细胞的频率)观察到与神经毒性相关。通常观察到膜联蛋白V和
半胱天冬酶3的结果是相似的。尽管此类参数也可以被认为与CAR-T细胞组合物的功能或效
力有关,并且因此可以预期与功效有关,但是这些变量通常与治疗反应结果(在这种情况
下,受试者是否实现了完全反应或无反应)不观察到显著相关(参见例如图2-5)。
[1536] 结果与以下一致:使用非凋亡(和/或生物活性)T细胞或CAR+细胞或其亚组的频率或数量(如由各种量度指示的)作为预测5级神经毒性或脑水肿和/或神经毒性的严重程度
的参数、以及使用此类参数来确定CAR-T疗法的适当剂量和/或适当安全限度。
[1537] 实施例2:预测严重神经毒性和/或脑水肿的CAR+ T细胞组合物参数的多变量分析
[1538] 单变量分析通常一次考虑一个协变量。多变量分析一次和/或组合考虑多个协变量,并且通常能够考虑协方差,即协变量之间的相互作用。
[1539] 进行多变量分析以鉴定与临床和/或毒性结果强相关和/或具有临床和/或毒性结果的高预测值的参数(在单变量分析中单独评估的那些中)的组合。
[1540] 进行递归的双因子分区树分析以分析不同的属性组合。具体地,使用基于分区(算法的,决策树)的二元分类途径来检测来自单变量分析的合并数据集,包括大约250个协变
量(参数)。通常,经典回归方法生成通常更适合于物理化学数据和/或假设检验的功能(线
性和非线性)关系。分区方法通常生成算法(“树”)模型,其在一些实施方案中可能更适合于生物数据和探索性分析。与数据挖掘技术如支持向量机(SVM)和人工神经网络(ANN)相比,
分区模型在易于解释方面可能是有利的。
[1541] 分区模型通常包括例如预测平均反应的嵌套“如果-则-否则(if-then-else)”箱/桶。在一些实施方案中,因为分区方法不假设先验模型,因此它们在评估噪声或主观测量、
非线性度和具有混合数据类型(即分类的和/或连续的预测器和反应变量)的数据集方面更
有用。
[1542] 通常,基于树的途径是非参数的,并且与其他多变量方法相比,能更好地处理噪声和主观测量、连续和分类变量的组合以及非线性关系。
[1543] 在本研究的途径中,考虑了总组38名受试者的数据、以及单独地一组24名形态学受试者的数据。通过以如下三种不同方式对患者进行分组来评估与神经毒性的相关性:根
据受试者是否发生5级神经毒性,他们是否发生4级或5级神经毒性,以及他们是否发生4级、
5级或延长的(10天或更长时间)3级神经毒性(3p)。通过一次使用最多两个协变量(一个主
要预测器和一个次要预测器)的组合并且将分裂大小保持在最少五个观察值来最小化模型
复杂性。
[1544] 进行了迭代搜索,其中使用(相同的)最佳主要预测器和若干个次要预测器生成了几个替代模型,只要假阳性和假阴性的数量令人满意地小即可。然后搜索考虑下一个最佳
主要预测器,并重复所述步骤。评价了几个替代模型,并且发现较好的模型(具有最少数量
的假阳性和假阴性的模型)始终使用类似的协变量。
[1545] 通过这种方法观察到特定对的参数对神经毒性的严重程度(例如,5级神经毒性)具有强的预测能力。此类对包括在给予剂量中的特定细胞群(如CAR+CD3+非凋亡或CAR+CD8
+非凋亡)的数量或归一化数量和治疗性组合物中CAR抗原特异性活性的指示物(如促炎性
细胞因子)的组合。此类对包括给予至受试者的凋亡标记阴性CD8+CAR表达细胞的数量、结
6
合指示TNF-α产生(如通过在与CD19表达细胞以1:1的比率共培养中含有0.25x10个CD3+
CAR+细胞的治疗性细胞组合物的样品的18小时共培养后在上清液中的积累所测量的(参见
图6A和6B))的参数的组合。对于其他促炎性细胞因子如IFN-γ和IL-2代替TNF-α,观察到类
似的发现。
[1546] 没有观察到这些变量组合在本研究中相反地或直接地强烈预测反应(如通过CR与无CR测量的)(参见例如图9、11、13)。另外,在实施例1中描述的研究中实现CR或CRi的若干
名受试者已经接受了含有低于在继续发生5级神经毒性/脑水肿的受试者中给予的任何剂
量的最低数量(或归一化数量)的凋亡标记-CD8+CAR+细胞数量(或归一化数量)的细胞产物
剂量。类似地,已经向若干名继续实现CR的受试者给予细胞组合物,所述细胞组合物经由测
定确定具有低于在向发生5级神经毒性/脑水肿的任何受试者给予的组合物中所观察到的
最低水平的CAR抗原特异性细胞因子(例如,TNF-a、IFN-g、IL-2)产生水平(参见例如,图4和
5)。
[1547] 来自另一个试验的事后分析的结果符合将所鉴定的协变量对用于确定剂量和预测神经毒性的实用性。针对被认为与上述研究中的神经毒性结果相关或相反地相关的某些
参数的量度,分析了在另一项临床研究中向具有复发性或难治性成人ALL的受试者(选择用
于代表一系列不同反应)的亚组(31名中的11名)给予类似抗CD19 CAR表达细胞组合物后的
结果。在31名受试者中,77%经历过CR或CRi,其中在CR/CRi受试者中复发率为61%并且干
细胞移植(SCT)率为27%。42%经历过3级或更高等级的CRS,并且35%经历过3级或4级神经
毒性;31名受试者中没有一名经历过5级神经毒性或脑水肿。
[1548] 在这项其他研究中,针对受试者和细胞组合物评估和比较了某些参数,总体上如上所述,包括给予的凋亡标记阴性CD8+CAR表达细胞的数量和抗原特异性活性的相同参数
(在涉及与如上所用的CD19表达细胞共培养的测定中TNF-α积累的相同量度)。结果显示在
图7和图6B中。对于向从其他类似临床研究中评价的11名受试者(没有一人展现出5级神经
毒性或脑水肿)中的每一名给予的剂量:(i)凋亡标记阴性、CAR表达CD8+细胞的数量低于在
上述研究中给予至任何5级神经毒性受试者的剂量中此类细胞的最低数量,和/或(ii)指示
CAR诱导活性的参数水平(例如,TNF-α产生的量度)(B)低于在上述研究中在用于5级受试者
的剂量中观察到的最低水平。如图6B所示,在所评估的其他研究中在大多数受试者中用于
这项测定的一般产品曲线范围低于指示CAR诱导活性的这种水平,如由阴影椭圆所示。
[1549] 因此,在使用相似CAR表达细胞组合物的另一项研究中的受试者中,没有一人发生过5级神经毒性,在预测神经毒性的对中的一个或两个协变量低于对于经历毒性的任何患
者观察到的水平。当评估IFNg或IL-2(代替TNF-α)时观察到类似的结果。结果符合如下解
释:使用功能属性(如通过在与抗原表达细胞共培养后促炎性细胞因子的分泌评估的,CAR
抗原特异性活性的程度)和非凋亡CAR+CD8+细胞的数量(或数量/重量)的组合确定或评估
适当的剂量以最小化神经毒性的风险或严重程度。
[1550] 研究结果符合使用复合途径来确定给予CAR-T组合物的适当单位剂量的优点。例如,结果符合如下途径的实用性:其中单位剂量是基于两个或更多个参数,和/或其中待给
予的单位剂量的释放仅在考虑了可能由这两个或更多个参数中的每一个贡献的任何变异
性之后发生。例如,结果符合给予单位剂量和/或鉴定适当剂量的优点,其中剂量(A)涉及特
定表型的细胞(如CD3+CAR+、CD8+CAR+、或CD8+CAR+凋亡标记-阴性)的数量或量以及多种表
型的细胞的另一种或复合数量,(B)指示CAR诱导的/依赖性和/或抗原特异性活性如CAR诱
导的促炎性细胞因子产生。结果符合如下复合途径的实用性,其中(1)给予目标数量的细胞
(A),条件是活性的量度(B)低于某一阈值数量(基于与毒性的相关性),(2)取决于B是高于
还是低于给定的一个或多个阈值,给予不同的目标剂量(A)(以及任选地,其中如果B高于上
限安全阈值,则不给予细胞)和/或(3)剂量被定义为目标数量的参考单位,参考单位的所述
数量是基于A和B的函数(例如,Ax B、或者A和B的一个或多个变换值或一个或多个倍数的函
数)确定的。
[1551] 此外,据观察,在一些情况下,在用于生产工程化T细胞组合物的过程中(在其他类似的细胞工程化过程中)使用的存储或处理条件或者一种或多种原材料或一种或多种试剂
批次的变化显现在最终治疗性组合物中与在本文中观察到与神经毒性和/或脑水肿的严重
程度具有关系(例如,在上述研究中,例如与另一个协变量组合)的某些参数相关。例如,观
察到此类存储或处理条件或此类材料或试剂的批次的差异与在通过所述方法生产的治疗
性组合物中的抗原特异性活性的某些量度(例如响应于与表达CAR抗原的细胞共培养的促
炎性细胞因子(例如,TNFα)产生的量度)的变化相关。
[1552] 对于通过使用两种不同批次的原材料的过程产生的两组治疗性细胞组合物,比较了对于示例性参数的量度(CAR抗原特异性TNFα产生的量度和在CAR+细胞中CD27+/CD28+表
型的频率)观察到的水平。
[1553] 结果显示在图23A和23B中。如所示,这些参数的水平在样品之间变化。与使用相同试剂的一个批次(批次1)的可比较的过程产生的那些细胞组合物相比,在使用原材料的另
一批次(批次2)的过程产生的细胞组合物中观察到每个参数的更高平均水平(TNFa:p=
0.066);(CD27+/CD28+频率:p=0.018)。图23B进一步指示由被给予每种单独细胞组合物的
受试者发生的神经毒性/脑水肿的等级。在15名受试者中,在已经被给予使用批次2的试剂
生产的细胞组合物的受试者中观察到更高等级的神经毒性/脑水肿。
[1554] 在另一个例子中,还观察到试剂的存储和/或处理影响两组治疗性细胞组合物中的参数,所述两组治疗性细胞组合物通过使用相同细胞培养基的过程产生,所述相同细胞
培养基与在其他类似的细胞工程化过程中的两种不同的存储和/或处理条件一起使用。对
从在每种条件下储存的相同培养基产生的两组治疗性细胞组合物评估响应于与表达CAR抗
原的细胞共培养的TNF-α产生。如图23C中所示,TNF-α产生的水平在样品之间变化。与使用在第二存储条件下储存的相同培养基产生的那些细胞组合物相比,在使用在第一存储条件
下储存的培养基产生的细胞组合物中观察到较低TNF-α产生的趋势。
[1555] 观察结果符合如下解释:可能有利的是,例如在鉴定安全且有效的细胞组合物剂量时,从由源自不同受试者的细胞产生的组合物的角度,和/或在存在原材料或试剂的一种
或多种不同存储或处理条件(例如使用不同批次的试剂或其他原材料)的情况下,考虑(例
如,在将产品和/或因子释放到给药策略中之前的测定)可能有助于组合物中的某些细胞/
抗原特异性活性的因子的变异性程度。所述结果突出了本文提供的实施方案的某些优点。
在一些方面,有利的是,例如当引入在不同条件下存储或处理的新批次或试剂,例如使用测
试使用包含此类变化的过程制成的细胞组合物的一个或多个参数(例如本文观察到的与神
经毒性风险相关的那些参数)的释放测定时,减少此类参数的变异性和/或确认在此类不同
条件/批次之间的可接受的变异性范围,以便避免例如在不同的剂量或细胞产品中此类参
数的变化。
[1556] 在一些实施方案中,所提供的方法、制品、组合物、剂量和给药策略的优点在于它们考虑并且在相关的情况下调整或校正潜在的变异性来源,所述潜在的变异性来源包括源
自试剂的变化的那些和/或患者与患者之间的变异性。例如,在一些实施方案中,通过涉及
使用T细胞刺激/扩增试剂(或其批次)的过程生产工程化T细胞可能是有利的,所述T细胞刺
激/扩增试剂(或其批次)已经通过释放测定被验证为如相比于参数的阈值水平低于可接受
的变异范围或在可接受的变异范围内,所述参数为例如关于治疗性组合物的这样的参数的
特异性活性(例如在通过T细胞工程化过程生产的最终T细胞组合物中诱导特定程度的抗原
特异性活性所需的试剂的量或相对量的量度,例如,如与对照试剂或关于这种测定的标准
单位相比)而言。在一些实施方案中,所提供的实施方案涉及细胞剂量,其中所述细胞通过
如下过程生产,所述过程涉及释放测定以确认这样的特异性活性参数(例如,抗原特异性炎
性细胞因子量度)的任何变异性在可接受的范围内和/或低于规格上限。在一些实施方案
中,所提供的过程包括这样的释放测定。在一些实施方案中,细胞组合物的生产使用其中此
类参数的变异在可接受的范围内的试剂和/或过程进行。在一些实施方案中,所提供的方
法、组合物和制品的优点在于它们使用如下给药和/或细胞生产策略,所述给药和/或细胞
生产策略例如通过最小化第二参数的变异性减轻与此类特异性活性参数的潜在变异相关
的风险,所述第二参数连同特异性活性参数与毒性的风险相关。例如,通过最小化通过过程
生产的生物活性或健康细胞(例如,非凋亡细胞)的频率变异,可以最小化特异性活性相关
参数的变化对安全性的影响。在一些实施方案中,包括与生物活性或非凋亡细胞如生物活
性或非凋亡工程化细胞或工程化CD8+细胞的数量或频率有关的一个或多个特征的剂量或
给药策略降低与抗原特异性活性参数的变异相关的风险。在一些方面,这通过包括此类细
胞上限的剂量和/或基于参考单位(例如,基于考虑生物活性细胞的数量的公式)定义剂量
的剂量来实现。
[1557] 将在实施例1的研究中给予至受试者的组合物与通过用于生产工程化T细胞的替代过程,从源自患有复发性或难治性NHL的受试者的血液样品中生产的组合物进行比较。所
述过程涉及分别产生并且然后以大约目标比率混合源自相同受试者的工程化T细胞的CD4+
和CD8+群体。每个群体经由类似的过程产生,所述类似的过程涉及例如在细胞的激活、转导
(其涉及使用慢病毒载体)和/或扩增期间,使用不同的因子和试剂(包括细胞因子)。所述过
程进一步涉及以比上述研究中的过程中使用的密度可比较地更高的细胞密度填充产品容
器、冷冻保存和解冻细胞,并且在样品中是一致的(参见实施例4)。通常,所述过程允许对最终组合物中的工程化细胞的表型、功能和代谢特征的增强程度的控制。CAR包括41BB衍生的
共刺激结构域而不是CD28结构域。
[1558] 据观察,如与实施例1中分析的样品相比,在使用过程(例如,使用控制比率的T细胞亚组、细胞因子和试剂以允许控制表型、功能和代谢状态、以及在冷冻保存期间控制的和
更高的细胞密度的一种过程)产生的样品中,在本文观察到的可强烈预测(单独和/或组合)
严重神经毒性风险的治疗性细胞组合物属性方面存在较少的受试者与受试者之间的变异
性。
[1559] 例如,与如实施例1中所述给予的样品相比,替代过程(B)导致在CD8+CAR+细胞中生物活性或健康细胞的频率更高,如通过在使用所述过程产生的样品中对各种凋亡标记的
阴性所测量的(参见例如,图21A)。另外,在来自不同受试者的通过所述过程生产的样品之
间所述参数的变异程度较低。如本文所观察到的,观察到此类细胞的数量与5级神经毒性和
脑水肿相关,然而CD3+CAR+存活细胞(不考虑凋亡状态与生物活性细胞)是较糟糕的预测器
或不能清楚地限定安全边界。在一些实施方案中,使用此类生物活性细胞在工程化细胞中
的频率的变异性降低的过程降低了当基于工程化T细胞数量作为整体给药时,某些患者(例
如具有较不倾向于细胞凋亡或是更健康的细胞的那些)将被无意给予比生物活性细胞的预
期剂量更高的剂量的风险。已经进一步观察到过程(如对表型和功能具有更大程度的控制
的这种过程)降低了通过所述过程生产的细胞以抗原特异性方式产生炎性细胞因子的能力
的变异性程度(参见例如,图21B)。上述研究中的结果与如下解释是一致的:特别是当与生
物活性工程化细胞的数量组合时,考虑此类细胞特异性活性参数的给药策略(例如,在给定
剂量中表现这种活性的特定目标范围-或不超过阈值)可以用于提供如下剂量,所述剂量能
够实现所希望的临床或治疗结果,同时仍在安全范围内或降低不希望的毒性(例如神经毒
性)的风险。
[1560] 在一些实施方案中,使用始终产生较高频率的生物活性工程化细胞的过程允许使用如与其他给药策略(其中较高频率的工程化细胞呈凋亡标记阳性或者以其他方式较不健
康)相比远远更低(从工程化(例如CAR+)细胞的数量的角度来看)的细胞剂量。例如,基于本
文中的观察结果并且考虑到可用的给药策略通常未考虑凋亡细胞的频率的观察结果,在一
些实施方案中,工程化(例如,CAR+)T细胞(例如,工程化CD8+和/或CD4+细胞)的数量低至
500万、1000万、1100万、1200万、1300万、1400万、1500万、1600万、1700万、1800万、1900万、
2000万、3000万、4000万或5000万个细胞。
[1561] 实施例3:目标剂量单位的确定和公式
[1562] 基于在被认为预测神经毒性等级的多变量分析中鉴定的参数组合,鉴定和开发了示例性剂量、剂量范围、以及用于给药和剂量确定的方法和公式。
[1563] 仅评估了所有38名受试者或形态学受试者的数据。剂量数据可用于37/38名受试者;仅对形态学疾病负荷患者考虑了与反应(CR与无CR)的相关性,并且对于已经发生5级神
经毒性并且不可评价CR的受试者不考虑与反应(CR与无CR)的相关性。对于单独受试者,确
定了给予的剂量中参考单位(RU)的数量,其中:
[1564] RU=A x B,
[1565] A等于凋亡标记阴性CD8+CAR表达细胞的数量,并且
[1566] B是指示在组合物中的细胞中的CAR抗原特异性活性的参数。在一些分析中(参见图8-13),B是指示单独细胞因子的抗原特异性产生水平的量度(例如,每输入细胞数量每小
时的浓度),或对于多种细胞因子,这种量度的几何或算术平均值。
[1567] 在其他分析中(参见图14-20),B是基于这种量度或复合量度,在具有0-2级神经毒性的受试者中被归一化至这种量度的中心趋势的指示一种或多种细胞因子水平的校正值。
[1568] 对于根据神经毒性等级(其中受试者根据他们是否发生4级或5级神经毒性或者它们是否发生3级(3p)、4级或5级神经毒性)和/或反应率(CR/无CR)分组的受试者亚组在对数
尺度上绘制结果。
[1569] 结果显示在图8-20中。具体地,图8-13显示了在38名受试者中的结果。
[1570] 图14、15和16显示了在32名形态学疾病受试者中的RU结果,其中A等于凋亡标记阴性CD8+CAR表达细胞的数量,B是单独细胞因子(分别为TNF-α、IFN-γ和IL-2)的抗原特异性
产生的校正量度,其在具有0-2等神经毒性的受试者中被归一化至单独细胞因子量度的中
心趋势(其中图14A、15A和16A显示在将受试者根据神经毒性等级分组的情况下的结果,并
且图14B、15B和16B显示了在将受试者根据反应(CR与无CR)分组的情况下的结果)。
[1571] 在展现不同毒性等级的受试者的分组之间观察到各种RU数量的分离。将结果用于鉴定参考单位的示例性上限或阈值数量(基于公式RU=A x B)以及示例性目标RU和目标剂
量。在一些例子中,阈值或目标RU被鉴定为低于在已经发生特定等级的神经毒性的受试者
中确定的RU,在一些方面,少于对应于安全窗口的RU数量,例如导致RU减少1.5倍或2倍。根
据反应对患者进行分组的图与如下发现一致:目标RU值和目标剂量在可接受的反应窗口
内。
[1572] 实施例4:冷冻保存的组合物中总细胞密度与组合物的指示细胞功能和其他属性的参数的相关性
[1573] 检测了在治疗性T细胞组合物的冷冻保存和存储期间的细胞密度(例如存活细胞浓度(VCC))的影响。已知增加某些组合物中的细胞密度降低细胞存活率。然而,在本文中观
察到,对于用于治疗用途的一些冷冻保存的细胞组合物,特别是以相对低的细胞密度(例如
低于10%的细胞体积比总冷冻体积)冷冻保存的那些,在组合物(例如治疗产品)的冷冻保
存、存储和/或解冻期间增加细胞密度可能例如关于细胞健康和/或生物活性和/或功能是
有利的。
[1574] 已经用DMSO以大约低于1%(细胞体积占总冷冻体积的百分比)的不同密度低温冷冻了在实施例1中描述的临床研究中给予至受试者的冷冻保存的治疗性细胞组合物。在评
估上述各种参数的研究中,将在模拟给予细胞组合物的那些条件的条件下冷冻保存、维持
和解冻的来自细胞组合物的样品维持、运输和解冻,包括相似的时间段。
[1575] 为了评估在冷冻保存存储和解冻期间细胞密度的影响,评估了已经以不同的细胞密度(1x 106个细胞/mL、8x 106个细胞/mL、和15x 106个细胞/mL)和用不同浓度的DMSO(按
体积计在大约3%与9%DMSO之间)低温冷冻的来自不同受试者的细胞组合物。然后解冻冷
冻保存的细胞组合物,并评估了组合物中的细胞效力(如通过抗原特异性细胞毒性的量度
评估的)。
[1576] 结果显示,通常观察到细胞效力的增加与在冷冻保存期间较高的细胞浓度和/或DMSO浓度相关。所述结果符合冷冻保存条件可能影响治疗性T细胞组合物的生物活性的解
释。
[1577] 在另外的研究中,将含有表达抗CD19 CAR的细胞的细胞组合物在不同浓度(例如,6 6 6 6 6
1×10个细胞/mL、2×10个细胞/mL、5×10个细胞/mL、10×10个细胞/mL、20×10个细胞/
mL、50×106个细胞/mL、和100×106个细胞/mL的浓度)和7.5%DMSO下冷冻保存,并且储存在
80度持续大约15小时,解冻,并且然后通过流式细胞术分析存活力(存活细胞浓度(VCC)和
直径,以及分析凋亡标记(例如,膜联蛋白V和激活的半胱天冬酶3)。
[1578] 在低温冷冻和解冻期间,本研究中观察到的存活细胞浓度损失(%差异VCC)的范围为10%-45%。在这些属性的浓度中没有观察到总体趋势。
[1579] 评估凋亡标记的结果证明了在CD4+CAR表达细胞和CD8+CAR表达细胞中的整体趋势,其中对于已经以较低细胞浓度冷冻和储存细胞的组合物,在解冻后观察到凋亡标记+细
胞的细胞水平较高。特别地,结果指示,在DMSO浓度的测试范围内(如7.5%DMSO),在一些实施方案中,在冷冻保存、存储和解冻期间在为或约1000万与为或约6000万个细胞/mL之间或
者在为或约1500万与为或约6000万或7000万个细胞/mL之间的总细胞密度对于在冷冻保存
和解冻后增加组合物中生物活性细胞的细胞健康和/或频率是特别有利的。
[1580] 所述结果符合在治疗性T细胞产品的冷冻保存中较高细胞密度或细胞浓度的CD8+细胞和/或CD4+细胞的实用性。
[1581] 实施例5:评估和比较在不同受试者中的神经病理学
[1582] 在患有急性成淋巴细胞性白血病(ALL)的四名受试者进行了神经病理学的尸检评估,所述受试者在用治疗性组合物治疗后发生了严重神经毒性(包括4级或5级神经毒性和/
或脑水肿),所述治疗性组合物含有被工程化以表达嵌合抗原受体(CAR)的T细胞。具体地,
对已经经历5级脑水肿的2名受试者(n=2)和在已经经历严重神经毒性(没有脑水肿)的2名
受试者(n=2)中进行了尸检研究。所述结果总体上支持如下结论:未观察到B-ALL的脑受累
是脑水肿的因素。在具有脑水肿的两名受试者中,在CNS中未观察到先天免疫细胞、B-ALL癌
细胞和CD19+癌细胞。此外,在具有脑水肿的患者中,水肿倾向于被观察到是血管性的,而不是细胞毒性的。在具有脑水肿的患者中,血管周围纤维蛋白和红细胞外渗表明完全血脑屏
障破坏(BBB)。在这些受试者中观察到BBB。还观察到内皮损伤。然而,显现不存在任何显著
的T细胞浸润,这与不是由于在脑或CNS内的CAR T细胞浸润和/或激活而发生了脑水肿的结
论一致。
[1583] 此外,在已发生脑水肿的受试者的脑中观察到星形胶质细胞和小胶质细胞损伤/激活的血管周围和更弥散的模式,指示BBB。所述观察结果与小神经胶质细胞激活是在被给
予CAR-T细胞疗法的受试者中发生脑水肿的贡献者的结论一致。此外,在发生脑水肿的受试
者中观察到对星形胶质细胞的不可逆损伤(星形胶质细胞突破折),与在发生4级神经毒性
的受试者中观察到的星形胶质细胞增殖形成对比。在展现出脑水肿的受试者的外周组织
(如肺、肝或肾)中未观察到显著的水肿。在发生4级神经毒性的受试者中未观察到BBB的完
全分解和由此产生的血管源性水肿。
[1584] 在未发生脑水肿的受试者(n=2)的尸检中,观察到与对局灶性损伤的简单反应不一致的弥漫性CD8+ T细胞浸润。在这些受试者中,T细胞存在于CNS中。在没有脑水肿的这些
受试者中未观察到血脑屏障病理学的证据。
[1585] 实施例6:向患有复发和难治性非霍奇金淋巴瘤(NHL)的受试者给予表达抗CD19 CAR的细胞
[1586] 将含有表达对CD19具有特异性的嵌合抗原受体(CAR)的自体T细胞的治疗性CAR+ T细胞组合物给予至患有B细胞恶性肿瘤的受试者。所给予的治疗性T细胞组合物是通过包
括从来自待治疗的单独受试者的白细胞分离术样品对CD4+和CD8+细胞进行基于免疫亲和
力的富集的过程产生的。分别激活分离的CD4+和CD8+ T细胞并将其各自用编码抗CD19 CAR
的慢病毒载体转导。在细胞因子的存在下将工程化CD4+和CD8+ T细胞各自扩增至细胞的阈
值数量。在扩增后,以低体积配制和冷冻保存细胞。CAR含有源自鼠类抗体的抗CD19 scFv、
源自免疫球蛋白的间隔子、源自CD28的跨膜结构域、源自4-1BB的共刺激区域和CD3-ζ细胞
内信号传导结构域。在静脉内给予之前将冷冻保存的细胞组合物解冻。通过给予以约1:1的
目标比率给予的经配制CD4+CAR+细胞群和经配制CD8+CAR+群体,将治疗性T细胞剂量作为
定义的细胞组合物来给予。
[1587] A.受试者和治疗
[1588] 实施例6.A.1
[1589] 本实施例6.A.1中所述的研究描述了在向患有B细胞恶性肿瘤的患者给予此类疗法的正在进行的临床研究中通过特定时间点(6.A.1)治疗和评价受试者。具体地,一个群组
(完整群组)的(在这一时间点,五十五名(55名))成年人受试者患有复发性或难治性(R/R)
侵袭性非霍奇金淋巴瘤(NHL),包括从头或从惰性淋巴瘤变换(NOS)的弥漫性大B细胞淋巴
瘤(DLBCL)、原发性纵隔大B细胞淋巴瘤(PMBCL)和2个治疗线失败后的3b级滤泡性淋巴瘤
(FLG3B)。所治疗的受试者包括东部肿瘤协作组(ECOG)得分在0与2之间的那些(中值随访期
为3.2个月)。完整群组不包括患有套细胞淋巴瘤(MCL)的受试者。基于先前的同种异体干细
胞移植(SCT)继发中枢神经系统(CNS)受累或ECOG评分为2不排除受试者,并且对于单采术
不需要最小绝对淋巴细胞计数(ALC)。
[1590] 对完整群组内受试者的核心子集分别评估结果(完整群组内的受试者不包括体力状态不佳(ECOG 2)、从边缘区淋巴瘤(MZL)和/或慢性淋巴细胞白血病(CLL,Richter's)转
化的DLBCL)的受试者(核心群组))。在实施例1.A.1的时间点,评估所述核心群组内44名受
试者的结果。
[1591] 表E3中列出了在6.A.1中的时间点的完整和核心群组受试者的人口统计学和基线特征。
[1592]
[1593]
[1594] *到最后一次含化疗方案的SD或PD或在自体SCT后<12个月复发
[1595] 如表E4中所述,向受试者给予表达CAR的T细胞的单一或双剂量(每个单一剂量分别经由CD4+表达CAR的T细胞和CD8+表达CAR的T细胞单独输注来给予),如下:含有5x 107个
表达CAR的T细胞的剂量水平1(DL-1)的单一剂量(n=30,针对实施例6.A.1中评估的受试
者);DL1的双剂量,其中每个剂量相隔约十四(14)天给予(n=6,针对实施例6.A.1中评估的
受试者,包括一名由于给药错误而无意中通过二剂量时间表接受两次DL2剂量的受试者);
或含有1x 108个(DL-2)表达CAR的总T细胞的剂量水平2(DL-2)的单一剂量(n=18,针对实
施例6.A.1中评估的受试者)。在CAR+ T细胞输注前三(3)天开始,受试者接受采用氟拉滨
2 2
(flu,30mg/m)和环磷酰胺(Cy,300mg/m)的淋巴细胞清除化学疗法。
[1596] 表E4:用于含有抗CD19 CAR T细胞的细胞组合物的T细胞亚组的剂量水平和数量
[1597]
[1598] 实施例6.A.2
[1599] 对于实施例6.A.2,在上述本实施例中描述的临床研究中的后续时间点,将结果在第二时间点进行分析。在实施例6.A.2中在这一分析时间点,已经治疗74名患者(男性51名,
女性23名)。受试者包括完整DLBCL群组(包括67名DLBCL NOS(45名从头形成,14名从FL转
化,8名从CLL或MZL转化),1名FL 3B级,和1名PMBCL)中的六十九名(69名)受试者和MCL群组
中的5名受试者。在完整(DLBCL)群组的受试者中,中值年龄为61岁(范围26,82),中值先前
疗法为3(范围1,12),46名(67%)为化疗难治性,32名(46%)有任何先前的移植,并且至少
16名(23%)患者有双重/三重命中淋巴瘤。核心群组中的四十九(49)名受试者在6.A.2中在
这一时间点进行评估。
[1600] B.安全性
[1601] 评估了在给予CAR-T细胞疗法之后的治疗紧急不良事件(TEAE)的存在或不存在。还评估并监测受试者的神经毒性(神经系统并发症,包括以下症状:意识错乱、失语症、脑
病、肌阵挛癫痫、惊厥、嗜睡和/或精神状态改变),根据国家癌症研究所—常见毒性标准
(CTCAE)量表4.03版(NCI-CTCAE v4.03),按1-5量表评级。常见毒性标准(CTCAE)量表4.03
版(NCI-CTCAE v4.03)。参见美国卫生和公共服务部的不良事件通用术语(CTCAE)第4版,公
开于:2009年5月28日(v4.03:2010年6月14日);和Guido Cavaletti&Paola Marmiroli 
Nature Reviews Neurology 6,657-666(2010年12月)。还确定并监测细胞因子释放综合征
(CRS),并基于严重性进行评级。参见Lee等人,Blood.2014;124(2):188-95。
[1602] 实施例6.B.1
[1603] 实施例6.B.1描述了基于实施例6.B.1中的分析时间点的结果。
[1604] 在实施例6.B.1分析中在84%的完整群组受试者中,未观察到严重(3级或更高等级)细胞因子释放综合征(CRS)和严重神经毒性。此外,据观察,完整群组受试者中的60%未
发生任何等级的CRS或神经毒性。在剂量水平之间没有观察到CRS、神经毒性(NT)、sCRS或严
重神经毒性(sNT)的发生率的差异。表E5汇总了在接受至少一个剂量的CAR-T细胞后28天,
患者中细胞因子释放综合征(CRS)和神经毒性不良事件的发生率。如表E5中所示,在接受单
一剂量DL2或双剂量DL1的任何受试者中均未观察到sCRS(3-4级)。在完整群组受试者中的
16%(9/55)和核心子集受试者中的18%(8/44)中观察到严重神经毒性或严重CRS(3-4级)。
11%(n=6)的受试者接受托西利珠单抗,24%(n=13)的受试者接受地塞米松。在完整群组
内的ECOG2受试者中,所观察到的CRS和神经毒性的比率分别为71%和29%。
[1605]
[1606] 包括一名由于给药错误而按DL2 2-剂量时间表治疗的患者
[1607] 实施例6.B.2
[1608] 实施例6.B.2描述了在实施例6.B.2中时间点的评估。到此时间点,从淋巴细胞清除(LD)至给予表达CAR的T细胞后90天收集不良事件(AE)数据。在第二时间点,评价了DLBCL
群组(完整群组)中的69名受试者的安全性,其中38名接受DL1单一剂量,25名接受DL2单一
剂量,以及6名接受DL1双剂量时间表。CRS或NT以外最常见的TEAE包括嗜中性粒细胞减少症
(41%,28/69)、疲劳(30%,21/69)、血小板减少症(30%,21/69)和贫血(26%,18/69)。观察到一名5级TEAE弥漫性肺泡损伤。
[1609] 未观察到急性输注毒性,并且观察到完全群组中的大多数受试者(64%(44/69))没有CRS或NT,这表明可以在门诊递送表达CAR的T细胞。CAR T细胞相关毒性(包括CRS和NT)
的比率在剂量水平之间没有差异。观察到跨越群组和剂量水平的安全性特征是相似的。在
完整群组中经历过任何等级CRS或NT的25名受试者(36%)中,21名(30%)具有CRS且14名
(20%)具有NT。没有受试者具有3级CRS,并且只有1名(1%,1/69)具有4级CRS且需要ICU护
理;另外29%(20/69)具有1-2级CRS。在20%的NT患者中,6%(4/69)具有1-2级且14%(10/
69)具有3-4级;2名(3%)有癫痫发作。未观察到5级CRS或5级NT。未观察到脑水肿的发生。所有CRS和NT事件均得到消退,但一例1级震颤除外,所述震颤在分析时正在进行。首次CRS和
NT发病的中值时间分别为5天(范围2,12)和10天(范围5,23)。在输注后的前72小时内,没有观察到受试者具有NT,并且观察到仅10%(7/69)具有CRS(所有均为1级);在>70%的受试者
中,CRS在NT之前。总之,十三(13)名受试者(19%)需要使用抗细胞因子疗法干预CRS或NT(1
名(1%)单独使用托西利珠单抗,6名(9%)单独使用地塞米松或6名(9%)使用此二者)且只
有一名需要任何血管加压药支持。托西利珠单抗和地塞米松的中值剂量分别为1和6。中值
CRS和NT持续时间分别为5天和11天。核心群组(n=49)的分析也显示相似的CRS和NT率。
[1610] 在这一评估中,在剂量下观察到CRS和/或NT的低发生率和晚期发作,支持门诊输注的可行性,如在首次发热体征或持续超过特定时间段的发热时住院。在6.B.2中评估时,
四名受试者已经在门诊环境中接受治疗。
[1611] C.治疗后的反应结果
[1612] 监测受试者的反应,包括通过在给予CAR+ T细胞后1、3、6、7、12、18和24个月时评估肿瘤负荷。
[1613] 实施例6.C.1
[1614] 实施例6.C.1描述了基于实施例6.A.1和6.B.1中的分析时间点的结果。
[1615] 反应率列于表E6中。在受试者群组中观察到高持久反应率,所述群组包括过度预治疗或具有较差预后和/或具有复发或难治性疾病的受试者。对于核心(n=44)群组中所有
剂量的受试者,所观察到的总体反应率(ORR)为86%,并且所观察到的完全反应(CR)率为
59%。对于核心群组,在三个月时,总体反应率(ORR)为66%;在核心群组中三个月的CR率为
50%。在核心群组中,3个月的ORR在剂量水平1下为58%(11/19),在剂量水平2下为78%;剂量水平1的3个月CR率为42%(8/19),并且剂量水平2为56%(5/9),与所提出的对治疗结果
的剂量反应效应一致。另外,所述结果符合剂量与反应持久性之间的关系。
[1616]
[1617]
[1618] DL1S:DL1 1-剂量时间表;DL2S:DL2 1-剂量时间表;DL1D:DL1 2-剂量时间表;
[1619] a 包括具有PD、死亡或28天重分期扫描(restaging scan)事件的患者。不包括在数据快照前<28天治疗的患者。
[1620] b 分母是在数据快照日期之前(在第3个月进行功效评估或者先前的PD或死亡评估),在≥3个月前接受CAR T细胞疗法的患者数量。
[1621] c 包括一名由于给药错误而按DL2 2-剂量时间表治疗的患者
[1622] 在评价的特定时间点之前六个月或更长时间治疗的受试者中,十(10)名患者在三个月时已经处于反应中,9名(90%)在六个月时仍有反应。在评价时间点,核心子集中97%
已经反应的受试者存活并且处于随访中,中值随访时间为3.2个月。在反应者中观察到延长
的存活,且在具有CR的受试者中观察到反应持久性增加。虽然5/6的具有较差表现状态
(ECOG 2)的受试者已经期满,但所有在三个月时处于反应中的患者在评价时都保持存活。
[1623] 实施例6.C.2
[1624] 实施例6.C.2描述了基于实施例6.A.2和6.B.2中的分析时间点的结果。
[1625] 直到实施例6.C.2中的时间点,评价完整DLBCL群组中的68名受试者的反应。总体或客观反应(OR)、3个月和6个月的客观反应率分别为75%(51/68)、49%(27/55)和40%
(14/35)。完全反应(CR)率、3个月CR率和6个月CR率分别为56%(38/68)、40%(22/55)和
37%(13/35)。在DL2下治疗的受试者中观察到3个月时反应率提高的趋势(与DL1相比):对
于ORR,63%(12/19;95%CI 38,84)相对于40%(12/30;95%CI 23,59)CR,p=0.148;以及对于CR,58%(11/19;95%CI 34,80)相对于27%(8/30;95%CI:12,46),p=0.0385。在16名双重/三重命中淋巴瘤受试者中,ORR为81%并且3个月CR率为60%。
[1626] 在核心群组(对于实施例1.C.2中的时间点,n=49)中,OR、3个月和6个月OR率分别为84%(41/49)、65%(26/40)和57%(13/23)。CR率、3个月CR率和6个月CR率分别为61%
(30/49)、53%(21/40)和52%(12/23)。观察到在较高剂量下3个月时持久的ORR和CR类似的
改善趋势。具体地,与给予DL1的核心群组受试者中52%(11/21;95%CI 30,74)和33%(7/
21;95%CI 15,57)的3个月ORR和CR相比,对于给予DL2的核心群组中的受试者,3个月ORR为
80%(12/15;95%CI 52,96)并且3个月CR为73%(11/15;95%CI 45,92),其中分别为p=
0.159和p=0.0409。在已经接受DL2和3个月随访(n=15)的CORE群组受试者中,3个月ORR为
80%并且3个月CR为73%。
[1627] 在1.C.2中所述时间点完整群组和核心群组中的中值DOR分别为5.0和9.2个月;在完整群组中,CR的中值持续时间为9.2个月。核心群组中尚未达到CR的中值持续时间。完整
群组中的中值总生存期(OS)为13.7个月,并且核心群组尚未达到。完整群组中的6个月OS为
75%,其中中值随访时间为5.8个月。核心群组的6个月OS为88%、其中中值随访时间为5.6
个月。
[1628] D.评估血液中的CAR+ T细胞
[1629] 基于来自实施例6.A.1、6.B.1和6.C.1中描述的时间点的数据,进行药代动力学分析以评估在治疗后不同时间点的外周血中CAR+ T细胞的数量。分析了来自在实施例6.A.1
中的时间点在DLBCL群组中评估的五十五(55)名受试者和如在下面实施例7中所述的套细
胞淋巴瘤(MCL)群组中的四(4)名受试者(在相同时间点评估)的结果。使用经验证的流式细
胞术进行药代动力学(PK)测量,以检测CAR构建体中表达的标记,以及使用基于定量PCR的
测定法以检测CAR构建体的整合。使用抗CD19抗体通过流式细胞术评估B细胞发育不全。在
两个所给予的剂量水平下,在整个评估过程中检测CD4+和CD8+CAR表达细胞,如通过在对数
标度上标绘的细胞数量/μL血液(中值±四分位数)所测量。相对于接受DL1,接受DL2的受试
者在外周血中具有更高的对于CD3+/CAR+、CD4+/CAR+和CD8+/CAR+ T细胞子集的中值Cmax和中值AUC0-28(对于CD3+、CD4+和CD8+,AUC0-28:DL2相对于DL1分别为1836相对于461、350相对于
182以及1628相对于114;对于CD8+,p<0.05;Cmax;DL2相对于DL1分别为99.8相对于27.9、
+ +
15.1相对于5.2以及73.1相对于5.5个细胞/μL)。达到CD3CAR T细胞扩增最大值的中值时
间为15天(范围8-29),并且剂量水平之间没有差异。表达CAR的CD4+和CD8+ T细胞以相对相
似的水平定位于骨髓。
[1630] 与较低剂量水平相比,在没有观察到毒性增加的情况下在给予较高剂量水平的受+ +
试者中观察到中值曲线下面积(AUC)(在血液中随着时间的CD8CAR T细胞数量)增加。在反
应者(CR/PR)中观察到高于非反应者(PD)的峰值CD8+/CAR+ T细胞暴露;即使在疾病已经进
展的受试者中,也观察到在评估期间(包括至3个月和6个月时)细胞的持久性。CD8+CAR+ T细
胞的中值Cmax和中值AUC0-28在反应受试者中更高且在第3个月时具有持久的反应(在第3个
月时CR/PR中相对于在第3个月时PD中,CD8+Cmax中值=20.8相对于5.5;CD8+AUC0-28中值=
235相对于55)。在被评价CAR T细胞持久性的受试者中,29名受试者中的90%和93%在第3
个月时分别具有可检测的CD8+和CD4+CAR+ T细胞;19名受试者中的63%和58%在第6个月时
分别具有可检测的CD8+和CD4+CAR+ T细胞。在第3个月和第6个月时,在具有持久反应或复发
的受试者之间未观察到CAR+ T细胞持久性的统计学显著差异。尽管在第3个月时几乎所有
受试者97%(34/35)且在第6个月时100%(24/24)被证明B细胞发育不良(<1个细胞/μl),但
+
在11名受试者的89%中在复发时CAR T细胞的PK是可检测的。
[1631] 未观察到如与DL1相比在DL2下更高的Cmax和AUC0-28与增加的CRS或NT相关。对于任何NT或>2级CRS,CD4+/CAR+和CD8+/CAR+ T细胞的中值AUC比对于DL2的中值AUC分别高5至10
倍和3至5倍。观察到较高的疾病负荷和炎性细胞因子的基线水平与较高的CAR+ T细胞水平
峰值、较高的细胞因子水平峰值和较高的CRS和NT发生率相关。结果与以下结论一致:DL2下
的较高Cmax和中值AUC0-28没有增加CRS或NT。
[1632] 实施例7:向患有套细胞淋巴瘤(MCL)的受试者给予表达抗CD19 CAR的细胞
[1633] 将含有表达对CD19具有特异性的嵌合抗原受体(CAR)的自体T细胞的治疗性CAR+ T细胞组合物(如实施例1中所述来产生)给予至四(4)名患有套细胞淋巴瘤(MCL)且1线治疗
已经失败的人受试者。在静脉内给予之前将冷冻保存的细胞组合物解冻。将治疗性T细胞组
合物作为定义的组合物细胞产物来给予,其具有源自相同受试者的CAR+工程化T细胞的经
配制CD4+和CD8+群体,以约1:1的目标比率来给予。以含有5x 107个表达CAR的T细胞的剂量
水平1(DL1)的单一剂量向受试者给予表达CAR的T细胞的剂量(作为表达CAR的CD4+和CD8+ 
T细胞的分割剂量)。在CAR+ T细胞输注前三(3)天开始,受试者接受采用氟拉滨(flu,30mg/
m2)和环磷酰胺(Cy,300mg/m2)的淋巴细胞清除化学疗法。
[1634] 如实施例1中所述监测受试者的反应和毒性。在任何受试者中均未观察到CRS或神经毒性。在所治疗的4名受试者中,两(2)名受试者实现PR(非持久),且两(2)名受试者患有
进行性疾病。
[1635] 实施例8:用于给予的治疗性T细胞组合物的属性和用于产生组合物的过程
[1636] 使用流式细胞术和体外测定,对用于在上述实施例2中给予的、含有表达对CD19特异的嵌合抗原受体(CAR)的自体T细胞的示例性治疗性T细胞组合物评估了大于一百种表
型、功能和细胞健康相关属性。检测了来自在如下临床研究中招募的受试者的治疗性细胞
组合物,所述临床研究评价用于治疗复发性/难治性B细胞非霍奇金淋巴瘤的抗CD19 CAR-T
细胞疗法(N=63;核心群组)。针对各种属性,在工程化之前和之后评估细胞。评估的属性包括实施例1中描述的那些,并且在表E7中列出了示例性评估的属性。使用流式细胞术检测了
与细胞产品的细胞健康以及记忆和其他表型相关的表型标记。使用体外抗原特异性生物测
定评估T细胞功能性。对来自配制的治疗性T细胞组合物的样品进行表征和释放测试,所述
治疗性T细胞组合物经历了与给予的细胞组合物的那些相对应的代表性次数的冷冻-解冻
循环。
[1637]
[1638] 为了产生用于给予的细胞组合物,经由白细胞分离术从受试者中分离自体细胞。对白细胞分离术样品进行产生CAR表达细胞的过程。所述过程涉及使用自动洗涤来洗涤细
胞和基于免疫亲和的选择来纯化CD4+和CD8+ T细胞,产生分别富含CD8+(其中中值99%、内
部四分位数间距(IQR)98%-100%的细胞为CD8+)和CD4+(其中中值99%、IQR 99%-100%
的细胞为CD4+)细胞的两种组合物。
[1639] 如图24所示并汇总于表E8中,自动化T细胞纯化产生指定纯度的CD8+和CD4+ T细胞群。在一些实施方案中,以与扩增持续时间或扩增的其他方面或与T细胞特异性试剂孵育
无关的方式,此类纯化方面可以降低在所述过程中的转导步骤中转导非T细胞的概率和/或
导致治疗性细胞组合物中的高T细胞纯度。
[1640]
[1641] 将富集的CD4+和CD8+组合物的细胞分别用编码具有41BB共刺激结构域的抗CD19 CAR的载体进行慢病毒转导。然后在刺激试剂的存在下分别孵育转导的群体用于细胞扩增。
配制并分别冷冻保存并在给予之前储存扩增的CD8+和CD4+细胞。为了最小化在批次和/或
来自不同患者的细胞组合物(例如具有不同患者属性的那些)之间在指示细胞健康的参数
方面的变异,在批次间将细胞保持在恒定的体积。细胞产品展现出紧密的存活细胞浓度范
围(基于对一组受试者的细胞组合物的评估,CD8+:中值31x 106个细胞/mL,IQR 28-40x 106个细胞/mL,N=38;CD4+:中值35x 106个细胞/mL,IQR 31-40x 106,N=36)。
[1642] 在给予位点,根据与在适当剂量(例如对于DL1或DL2)中的CD8+CAR+和CD4+CAR+细胞的数量对应的每个组合物的目标体积,解冻和给予细胞。为了最小化在批次之间细胞健
康的变异,对于配制、冷冻保存和存储保持在恒定的体积,具有紧密的存活细胞浓度范围
(CD8+:中值31x 106个细胞/mL,IQR 28-40x 106个细胞/mL,N=38;CD4+:中值35x 106个细胞/mL,IQR 31-40x 106,N=36)。
[1643] 在临床试验期间,存在从大体积配制到小体积配制的过程变化。变化后的治疗性细胞组合物以恒定的低体积配制,具有严格控制的存活细胞浓度范围。在一些情况下,使用
低体积配制代替高体积配制。评估了指示用于给予的组合物中CAR表达T细胞的健康的参
数,例如通过测量解冻后的存活力、细胞表面膜联蛋白V表达和活性细胞内半胱天冬酶3的
水平。对以高体积配制的细胞组合物和以低体积配制的那些进行了比较。
[1644] 从高体积配制到低体积配制的过程变化导致过程稳健性增加和细胞健康属性的变异性减少。来自单独细胞组合物的CD4+和CD8+ T细胞中存活细胞的浓度、百分比和活性
半胱天冬酶3阴性细胞的百分比的值显示于图25中并汇总于表E9中。膜联蛋白V表达细胞的
+ +
中值百分比为11%(IQR 9%-18%;N=33)的CD8CAR T细胞和10%(IQR 8%-17%;N=31)
的CD4+CAR+ T细胞。观察到半胱天冬酶3表达与膜联蛋白V表达相似。向低体积配制的转变导
致所述过程的稳健性增加和细胞健康属性的变异减少。
[1645]
[1646] ·精确控制用于给予的组合物中CAR+CD4+和CAR+CD8+ T细胞的数量。对于给定剂量,观察到实际给予至示例性受试者组的细胞数量在细胞的目标数量的8%或更少内:对于
7 + +
以DL1给予细胞的受试者(n=48),2.4-2.7x 10个(目标±8%)CD4CAR T细胞和2.4-2.7x 
107个(目标±8%)CD8+CAR+ T细胞
[1647] ·对于以DL2给予细胞的受试者(n=20),4.6-5.1x 107个(目标±8%)CD4+CAR+ T细胞或4.6-5.1x 107个(目标±8%)CD8+CAR+ T细胞。
[1648] 发现给予剂量的范围在不同的示例性受试者组中具有低变异性:
[1649] -在DL1(n=34)下48-52×106个CD3+CAR+T细胞
[1650] -在DL2(n=29)下96-101×106个CD3+CAR+T细胞
[1651] -在DL1(n=34)下24-27x 106个CD4+CAR+或CD8+CAR+T细胞
[1652] -在DL2(n=29)下46-51x 106个CD4+CAR+或CD8+CAR+T细胞。
[1653] 如图26所示,观察到给予至受试者的CAR表达T细胞组合物展现出高的T细胞纯度和低的批次间变异。所述过程和产品对照导致含有CAR T细胞的治疗性细胞组合物在细胞
特异性T细胞功能方面具有低的批次与批次间变异性。
[1654] 体外抗原特异性细胞因子积累和细胞内细胞因子染色(ICS)显示,对于多种细胞因子(IL-2、TNF-α和IFN-γ)的细胞因子产生,批次之间具有相似的低变异。在示例性ICS实验中,将来自组合物的细胞用CD19刺激,针对细胞因子(包括TNF-α)和表面蛋白(包括作为
记忆表型标记的C-C趋化因子受体7型(CCR7))染色,并通过流式细胞术进行分析。确定了在
用于给予的组合物中呈细胞因子或表面蛋白阳性的细胞的数量。图27显示在用于以DL1和
DL2给予的CAR T细胞组合物中的CD4+CAR+和CD8+CAR+细胞、CD4+CAR+TNF-α+和CD8+CAR+
TNF-α+细胞、CD4+CAR+CCR7+和CD8+CAR+CCR7+细胞的数量。将这些结果汇总于表E10中。结
果显示CD4+CAR+和CD8+CAR+细胞、CD4+CAR+TNF-α+和CD8+CAR+TNF-α+细胞、CD4+CAR+CCR7+和CD8+CAR+CCR7+细胞的数量的低变异性。例如,观察到呈TNF-α产生阳性的细胞数量的紧
密范围(n=61)。
[1655]
[1656] 指示在用CD19刺激之后通过CAR+细胞的肿瘤坏死因子α(TNFα)产生的参数在不同批次之间显示出窄范围,其中对于CD4+CAR+ T细胞(N=59)相对标准偏差(RSD)为37%,且对
于CD8+CAR+ T细胞(N=61)RSD为51%。
[1657] 结果与如下观察结果一致:含有精确且一致剂量的CD4+和CD8+CAR T细胞的组合物、CD4+和CD8+ T细胞培养条件的控制和优化、细胞因子产生的低变异性、和/或用于给予的组合物的恒定配制和体积可以导致组合物中的细胞健康一致。在提供的实施方案中,这种
制造和控制过程的各方面有助于使用来自许多不同受试者的细胞工程化并且产生用于给
予至许多不同受试者的此类细胞组合物的属性的低变异性。在一些方面,此类方面包括在
受试者之间使用精确、一致的平坦剂量的给予的CD4+和CD8+细胞;控制和优化CD4+和CD8+ 
T细胞培养条件,例如导致例如在不同的受试者之间的表型(例如CCR7)和体外功能(例如,
在抗原刺激之后的IL-2、TNF-α和IFN-γ产生)的药物产品批次间变异性低的那些;以及使
用药物产品的恒定配制和体积,这可以导致或促成通过所述方法产生的治疗性细胞组合物
之间在指示细胞健康的属性方面的一致性。
[1658] 实施例9:与CAR+ T细胞疗法后发生神经毒性相关的另外的基线因素
[1659] 对在针对B细胞恶性肿瘤(如ALL和NHL)的许多不同临床研究中用CAR-T细胞组合物治疗之前测量的各种基线因素进行评估并在发生过和未发生过3级或更高等级神经毒性
的受试者之间进行比较。分析来自3项临床试验的数据(包括在实施例1中描述的涉及在患
有ALL的受试者中的抗CD19CAR-T治疗的研究(试验1),在实施例2中描述的涉及向患有复发
性或难治性成人ALL的受试者给予的类似的抗CD19 CAR治疗的临床研究(试验2),以及其中
患有B细胞恶性肿瘤(包括ALL和非霍奇金淋巴瘤(NHL))的受试者用表达不同抗CD19 CAR的
细胞进行治疗的另外的临床试验(试验3)。向受试者给予抗CD19 CAR-T细胞组合物并监测
临床反应和不良结果。如在实施例1中所述,将神经毒性在0-5的尺度上进行分级。
[1660] 事后分析基线因素,并使用许多统计学分析在受试者之间进行比较。观察到与受试者中3级或更高等级神经毒性相关的示例性基线因素列于下面表E11-A和E11-B中,包括
在给予CAR-T细胞之前的血清IL-15水平和血小板细胞计数、疾病类型(与ALL相比的非霍奇
金淋巴瘤(NHL))、和如通过骨髓中原始细胞的百分比定义的疾病负荷。基因表达标签也是
鉴定的参数之一:呈费城染色体阳性(Ph+)或具有像Ph+基因表达特征(Ph样)的基因表达特
征的受试者比没有的受试者(非pH)具有显著更少的3级或更高等级神经毒性的例子。表
E11-A显示了在试验1中与3级或更高等级神经毒性相关的示例性基线因素。表E11-B显示了
在三项临床试验中与3级或更高等级神经毒性相关的示例性基线因素。
[1661] 表E11-A:在试验1中与3级或更高等级神经毒性相关的示例性基线参数
[1662]
[1663]
[1664] 表E11-B:与3级或更高等级神经毒性相关的示例性基线参数
[1665]
[1666] a双侧Fisher精确检验
[1667] b高IL-15≥30pg/mL。
[1668] 对试验1中在给予CAR-T细胞之后的不同时间点从受试者收集的血液样品分析CAR+-T细胞计数。在治疗前(筛选)和不同治疗后时间点(第2天、第4天和第7天)评估来自受试
者的细胞因子(例如IL-15)的血清水平。结果证明,延长和致命的神经毒性与IL-15(一种T
细胞促进细胞因子)和CAR T细胞扩增的水平的早期和快速上升相关。
[1669] 如在实施例1中所讨论,在继续发生更严重神经毒性的受试者(并且特别是发生了5级神经毒性和脑水肿的那些)的血液中观察到CAR表达T细胞的更快速的CAR-T细胞扩增和
更早的峰值扩增。例如,结果指示这些受试者在第一剂量的细胞之后4-7天内展现出可检测
水平的CAR+细胞/μL血液,其中在给予细胞之后七天内在所有此类受试者的血液中观察到
大于20个CAR+细胞/μL血液(参见图1和2)。在具有较不验证神经毒性的受试者中,通常在稍
后时间观察到CAR+ T细胞的峰值扩增,并且每微升具有较低的CAR+ T细胞峰值数量(图2、
28)。
[1670] 在CAR-T细胞输注后其中值水平比基线水平超过若干倍的细胞因子包括IL-2(14倍)、IL-6(2.7倍)、IL-10(3.5倍)、IL-15(2.5倍)和IFN-γ(3.3倍)。如与具有较迟峰值CAR-T细胞扩增的受试者相比,对于经历了较早峰值CAR-T细胞扩增(第7天达到峰值CAR+-T数
量)的受试者组,观察到在给予后第4天在血清中的较高中值基线血清IL-15水平和急剧增
加(图28)。在测量血清IL-15水平的下一个时间点(第7天),在具有快速峰值扩增的这些受
试者中的血清IL-15水平已经下降并且与在具有较迟峰值扩增的受试者中的水平大致相当
或低于所述水平。结果与如下结论一致:基线血清IL-15水平和/或IL-15水平的更高或快速
增加,可能指示在CAR-T细胞治疗后神经毒性或脑水肿的潜在风险或其严重程度或与其相
关。还观察到淋巴细胞清除和桥接化学疗法与T细胞增殖-促进细胞因子如IL-15的增加相
关。
[1671] 本发明并不旨在限于具体公开的实施方案的范围,所提供的实施例例如是为了说明本发明的各个方面。根据本文的描述和传授,对组合物和方法的各种修改将变得清楚。可
以在不脱离本公开文本的真实范围和精神的情况下实践这些变化,并且这些变化旨在落入
本公开文本的范围内。
[1672] 序列
[1673]
[1674]
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[1677]
[1678]
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