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Gene for raffinose synthetase, production of raffinose and transformed plant

阅读:41发布:2020-10-14

专利汇可以提供Gene for raffinose synthetase, production of raffinose and transformed plant专利检索,专利查询,专利分析的服务。并且PROBLEM TO BE SOLVED: To obtain raffinose synthetase having activity for producing raffinose from sucrose and galactinol, capable of changing a content of oligosaccharide belonging to a raffinose group in plants, and useful in e.g. food materials. SOLUTION: This synthetase has activity for producing raffinose from sucrose and galactinol and has the following physicochemical properties; action and substrate specificity, to produce raffinose from sucrose and galactinol; optimum pH, 6-8; optimum temperature, 35-40 deg.C; molecular weight, 75-95 kDa (gel filtration); 90-100 kDa (polyacrylamide electrophoresis); inhibition, inhibited by iodoacetamide, N-ethylmaleimide and myoinositol. This raffinose synthetase is a protein (A) having an amino acid sequence expressed by formula I or II or (B) having an amino acid sequence wherein one or several amino acid(s) is (are) substituted, deleted, inserted, added or inverted in the amino acid sequence of formula I or II, and has activity for producing raffinose from sucrose and galactinol.,下面是Gene for raffinose synthetase, production of raffinose and transformed plant专利的具体信息内容。

【特許請求の範囲】
  • 【請求項1】 スクロースとガラクチノールからラフィノースを生成する活性を有するラフィノース合成酵素。
  • 【請求項2】 下記(A)、(B)、(C)又は(D)
    に示すタンパク質であるラフィノース合成酵素。 (A)配列表の配列番号5に記載のアミノ酸配列を有するタンパク質。 (B)配列表の配列番号5に記載のアミノ酸配列において、1若しくは数個のアミノ酸の置換、欠失、挿入、付加、又は逆位を含むアミノ酸配列からなり、かつ、スクロースとガラクチノールからラフィノースを生成する活性を有するタンパク質。 (C)配列表の配列番号24に記載のアミノ酸配列を有するタンパク質。 (D)配列表の配列番号24に記載のアミノ酸配列において、1若しくは数個のアミノ酸の置換、欠失、挿入、
    付加、又は逆位を含むアミノ酸配列からなり、かつ、スクロースとガラクチノールからラフィノースを生成する活性を有するタンパク質。
  • 【請求項3】 下記性質を有する請求項1記載のラフィノース合成酵素。 (1)作用及び基質特異性:スクロースとガラクチノールからラフィノースを生成する。 (2)至適pH:約6〜8 (3)至適温度:約35〜40℃ (4)分子量: ゲルろ過クロマトグラフィーにより測定される分子量:約75kDa〜95kDa ポリアクリルアミドゲル電気泳動により測定される分子量:約90kDa〜100kDa 還元条件下におけるSDS−ポリアクリルアミドゲル電気泳動により測定される分子量:約90kDa〜10
    0kDa (5)阻害:ヨードアセトアミド、N−エチルマレイミド、ミオイノシトールにより阻害される。
  • 【請求項4】 アミノ酸配列中に、配列表の配列番号2
    8〜30に示す各アミノ酸配列を含む請求項1記載のラフィノース合成酵素。
  • 【請求項5】 下記(C)又は(D)に示すタンパク質であるラフィノース合成酵素。 (C)配列表の配列番号24に記載のアミノ酸配列を有するタンパク質。 (D)配列表の配列番号24に記載のアミノ酸配列において、1若しくは数個のアミノ酸の置換、欠失、挿入、
    付加、又は逆位を含むアミノ酸配列からなり、かつ、スクロースとガラクチノールからラフィノースを生成する活性を有するタンパク質。
  • 【請求項6】 スクロース及びガラクチノールに請求項1〜5のいずれか一項に記載のラフィノース合成酵素を作用させてラフィノースを生成させることを特徴とするラフィノースの製造方法。
  • 【請求項7】 請求項1〜5のいずれか一項に記載のラフィノース合成酵素をコードするDNA。
  • 【請求項8】 下記(A)、(B)、(C)又は(D)
    に示すタンパク質をコードするDNA。 (A)配列表の配列番号5に記載のアミノ酸配列を有するタンパク質。 (B)配列表の配列番号5に記載のアミノ酸配列において、1若しくは数個のアミノ酸の置換、欠失、挿入、付加、又は逆位を含むアミノ酸配列からなり、かつ、スクロースとガラクチノールからラフィノースを生成する活性を有するタンパク質。 (C)配列表の配列番号24に記載のアミノ酸配列を有するタンパク質。 (D)配列表の配列番号24に記載のアミノ酸配列において、1若しくは数個のアミノ酸の置換、欠失、挿入、
    付加、又は逆位を含むアミノ酸配列からなり、かつ、スクロースとガラクチノールからラフィノースを生成する活性を有するタンパク質。
  • 【請求項9】 下記(C)又は(D)に示すタンパク質をコードするDNA。 (C)配列表の配列番号24に記載のアミノ酸配列を有するタンパク質。 (D)配列表の配列番号24に記載のアミノ酸配列において、1若しくは数個のアミノ酸の置換、欠失、挿入、
    付加、又は逆位を含むアミノ酸配列からなり、かつ、スクロースとガラクチノールからラフィノースを生成する活性を有するタンパク質。
  • 【請求項10】 下記(a)、(b)、(c)又は(d)に示すDNAである請求項8記載のDNA。 (a)配列表の配列番号4に記載の塩基配列のうち、少なくとも塩基番号56〜2407からなる塩基配列を含むDNA。 (b)配列表の配列番号4に記載の塩基配列のうち、少なくとも塩基番号56〜2407からなる塩基配列とストリンジェントな条件下でハイブリダイズし、かつスクロースとガラクチノールからラフィノースを生成する活性を有するタンパク質をコードするDNA。 (c)配列表の配列番号23に記載の塩基配列のうち、
    少なくとも塩基番号156〜2405からなる塩基配列を含むDNA。 (d)配列表の配列番号23に記載の塩基配列のうち、
    少なくとも塩基番号156〜2405からなる塩基配列とストリンジェントな条件下でハイブリダイズし、かつスクロースとガラクチノールからラフィノースを生成する活性を有するタンパク質をコードするDNA。
  • 【請求項11】 下記(c)又は(d)に示すDNAである請求項9記載のDNA。 (c)配列表の配列番号23に記載の塩基配列のうち、
    少なくとも塩基番号156〜2405からなる塩基配列を含むDNA。 (d)配列表の配列番号23に記載の塩基配列のうち、
    少なくとも塩基番号156〜2405からなる塩基配列とストリンジェントな条件下でハイブリダイズし、かつスクロースとガラクチノールからラフィノースを生成する活性を有するタンパク質をコードするDNA。
  • 【請求項12】 下記(e)又は(f)に示すDNA。 (e)配列表の配列番号4に記載の塩基配列のうち、少なくとも塩基番号56〜2407からなる塩基配列若しくはその相補的塩基配列とストリンジェントな条件下でハイブリダイズするDNA。 (f)配列表の配列番号23に記載の塩基配列のうち、
    少なくとも塩基番号156〜2405からなる塩基配列若しくはその相補的塩基配列とストリンジェントな条件下でハイブリダイズするDNA。
  • 【請求項13】 ラフィノース合成酵素遺伝子又はその一部と、植物細胞で発現可能な転写制御領域とを含むキメラ遺伝子。
  • 【請求項14】 前記ラフィノース合成酵素遺伝子が、
    請求項7〜11のいずれか一項に記載のDNAである請求項12記載のキメラ遺伝子。
  • 【請求項15】 前記転写制御領域が、前記DNAのコード鎖に相補的な配列を有するアンチセンスRNAを発現するように前記DNAに連結されている請求項13又は14記載のキメラ遺伝子。
  • 【請求項16】 請求項13〜15のいずれか一項に記載のキメラ遺伝子で形質転換された植物。
  • 【請求項17】 請求項13〜15のいずれか一項に記載のキメラ遺伝子で植物を形質転換し、この遺伝子を植物細胞内で発現させることにより、前記植物のラフィノース族オリゴ糖含量を変化させる方法。
  • 说明书全文

    【発明の詳細な説明】

    【0001】

    【発明の属する技術分野】本発明は、ラフィノース合成酵素、ラフィノース合成酵素もしくはラフィノース合成酵素を含む細胞抽出物を用いたラフィノースを合成する方法、ラフィノース合成酵素をコードするDNA、及びこのDNAの植物における利用に関する。 ラフィノースは、ビフィズス菌増殖活性を有し食品原料として、あるいは臓器保存液などの医薬品として様々な分野で利用されている。

    【0002】

    【従来の技術】ラフィノースは、スクロースのグルコシル基にガラクトースがα−1,6結合したラフィノース族オリゴ糖の一つである。 ラフィノース属オリゴ糖には、ラフィノースの他に、ガラクトースが2つ結合したスタキオース、3つ結合したベルバスコースなどがある。 これらの糖は、豆類、ナタネ、綿実など様々な植物の種子中の貯蔵糖と、キュウリやメロンなどウリ科植物にみられる転流糖として、また耐冷性を獲得したロゼット葉、甜菜(サトウダイコン)など植物に広く存在する。

    【0003】ラフィノース族オリゴ糖の生合成は、次のようであり、 UDP-カ゛ラクトース + ミオイノシトール → カ゛ラクチノール + UDP ・・・
    (a)カ゛ラクチノール + スクロース → ラフィノース + ミオイノシトール ・・・
    (b)カ゛ラクチノール + ラフィノース → スタキオース + ミオイノシトール ・・・
    (c) 各々の反応は(a)ガラクチノール合成酵素(GS:EC
    2.4.1.123)、(b)ラフィノース合成酵素(RS:EC
    2.4.1.82)(c)スタキオース合成酵素(STS:EC2.
    4.1.67)により触媒される。

    【0004】現在、ラフィノースは、甜菜から抽出され、スクロース精製過程において分離精製されている。
    しかし、ラフィノースはスクロースの結晶性を低下させるので、甜菜は低ラフィノースを目標に育種、改良され、甜菜中のラフィノース含量は0.03%から0.1
    6%(Enzyme Microb. Technol., Vol.4 May, 130-135
    (1982))と低い。 従って、このような低含量の甜菜より効率的にラフィノースを得るのは容易ではない。

    【0005】先に述べたように、ラフィノースは、ダイズをはじめとするマメ科の成熟種子に含まれているほか、甜菜、あるいはキュウリなどのウリ科植物に含まれている。 ダイズの成熟種子中には、ダイズオリゴ糖として、スクロース(含有量約5%)、スタキオース(同約4%)、ラフィノース(同約1%)が含まれている。 これらのダイズオリゴ糖は、脱脂ダイズから除蛋白した画分に回収され、濃縮後、機能性食品などに利用されている。 しかし、オリゴ糖全体の中でもラフィノースは10
    %であり、量的にも少ない。

    【0006】一方、ラフィノースの酵素的合成法も報告されている(Trends in Glycoscience and Glycotechno
    logy 7.34, 149-158(1995))。 これは、α-ガラクトシダーゼの縮合反応によりガラクトビオースを合成し、さらにこのガラクトビオースをガラクトシル基の供与体としてスクロースにガラクトシル転移反応により転移させて、ラフィノースを合成する方法である。 しかし、この反応は、乳糖加分解物1.9kgよりガラクトビオースが350g合成され、ガラクトビオース190gとスクロース760gよりラフィノース100gが得られる反応であり、生成するラフィノースの収率が低く、効率的な合成法には至っていない。

    【0007】以上のような方法の他に、生合成系酵素遺伝子の形質転換により、ラフィノース含量の高い植物を育種する方法も考えられる。 例えば、Kerrらはガラクチノール合成酵素遺伝子をクローニングし、ナタネを形質転換した(WO93/02196)。 しかし、その結果、GS
    活性は増加したが、ラフィノース族オリゴ糖は逆に低下し、ガラクチノール合成酵素を導入することによるラフィノース族オリゴ糖の生合成を増加させるという目的は達成されなかった。 したがって、植物のラフィノース族オリゴ糖の含量を増加させるする方法は提供されていない。

    【0008】一方、ラフィノ―ス族オリゴ糖を低減化することも求められている。 先に述ベたように、ラフィノース族オリゴ糖は、主に、ダイズなど豆類、ナタネ、綿実など様々な植物の種子中の貯蔵糖と、キュウリやメロンなどウリ科植物にみられる転流糖として、また、耐冷性を獲得したロゼット葉、甜菜、など植物に広く存在しており、ダイズ、ナタネ、綿実などの搾油されたミールには、これらのラフィノース族オリゴ糖が含まれている。 これらミールのほとんどは、飼料として利用されているが、α−ガラクトシダーゼを持たないヒトや動物は、直接ラフィノース族オリゴ糖を消化することはできない。 さらに、ラフィノース族オリゴ糖は、腸内細菌が資化しガスを発生させるなどにより、飼料の代謝エネルギー効率を低下させることが知られており、飼料中のラフィノース族オリゴ糖を除くことで、トリの飼料効率が上昇したと報告されている(Coon, Proceeding Soybean
    Utilization Alternatives. Univrsity of Minnesota,
    203-211 (1989))。 このようなことから、ラフィノース族オリゴ糖の減少したダイズ、ナタネ、綿実などの飼料作物が望まれている。

    【0009】また、これらの植物の中では、油の含量を多くする育種がなされてきた。 光合成産物は、油脂、タンパク質、ラフィノース族オリゴ糖を含む糖質に分配されている。 ダイズでは、油脂量と糖質量に負の相関があることが報告されている。 ラフィノース族オリゴ糖の生成を抑制することにより、同じ光合成の能カのダイズにおいて油脂含量を増加させることが期待できる。

    【0010】以上の観点から、Kerrらは、交配選抜育種により、ラフィノース族オリゴ糖が80%から90
    %低下した低ラフィノース族オリゴ糖ダイズ品種を作出したと報告している(WO93/00742)。 しかしこれは、品種の作出であり、栽培適性や、耐病性などに対応した様々な品種に応用できるものではない。 また、広く様々な植物に適用できるものではない。

    【0011】甜菜、サトウキビなどにも含まれるラフィノースは、砂糖の結晶性を低下させることが知られている。 従って、ラフィノースの生成がなければ、これら植物での砂糖の生成効率が上がることが期待できるが、ラフィノースを含まないテンサイは作出されていない。

    【0012】上述したように、従来精製されたラフィノース合成酵素は、酵素活性として確認されているのみであり、酵素の同定はなされていなかった。 また、その活性も低いものであり、活性の高いラフィノース合成酵素が望まれていた。 また、従来のラフィノースの製造法は収率が低く、効率のよいラフィノースの製造法が望まれていた。 その一方で、ラフィノ―ス族オリゴ糖が低減化された植物を育種することも望まれている。

    【0013】

    【発明が解決しようとする課題】本発明は、上記観点からなされたものであり、活性の高いラフィノース合成酵素及びこれをコードするDNAの取得、効率的なラフィノースの酵素的合成法、及びラフィノース合成酵素をコードするDNAの植物における利用法を提供することを課題とする。

    【0014】

    【課題を解決するための手段】本発明者は、上記課題を解決するために鋭意検討を行った結果、キュウリからラフィノース合成酵素を精製することに成功した。 また、
    このラフィノース合成酵素をコードする遺伝子をクローニングするために、本発明者らは鋭意検討を行った。 その結果、キュウリのラフィノース合成酵素ペプチド断片のアミノ酸配列より推定した塩基配列をもとに一本鎖D
    NAを化学合成し、この一本鎖合成DNAをプライマーとして、キュウリから抽出したpoly(A) + RNA
    より作製したcDNAを鋳型としてPCRを行い、ラフィノース合成酵素遺伝子に特異的なDNA断片を得た。
    さらに、このDNA断片をプローブとしてキュウリ由来cDNAライブラリーに対しハイブリダイゼーションを行い、ラフィノース合成酵素遺伝子を単離する方法を採用し、ラフィノース合成酵素遺伝子を単離した。 また、
    キュウリ由来ラフィノース合成酵素遺伝子の情報をもとにダイズ由来ラフィノース合成酵素遺伝子をクローニングするために鋭意研究を行い、その結果、ダイズ由来ラフィノース合成酵素遺伝子を単離した。 この単離したラフィノース合成酵素遺伝子断片を用い、植物で発現可能な制御領域を有するキメラ遺伝子を作成し、植物を形質転換した。 さらに、導入したラフィノース合成酵素遺伝子により、ラフィノース族オリゴ糖の低減化した植物を作出するに至った。

    【0015】すなわち本発明は、スクロースとガラクチノールからラフィノースを生成する活性を有するラフィノース合成酵素を提供する。 好ましくは、本発明は、下記(A)、(B)、(C)又は(D)に示すタンパク質であるラフィノース合成酵素を提供する。 (A)配列表の配列番号5に記載のアミノ酸配列を有するタンパク質。 (B)配列表の配列番号5に記載のアミノ酸配列において、1若しくは数個のアミノ酸の置換、欠失、挿入、付加、又は逆位を含むアミノ酸配列からなり、かつ、スクロースとガラクチノールからラフィノースを生成する活性を有するタンパク質。 (C)配列表の配列番号24に記載のアミノ酸配列を有するタンパク質。 (D)配列表の配列番号24に記載のアミノ酸配列において、1若しくは数個のアミノ酸の置換、欠失、挿入、
    付加、又は逆位を含むアミノ酸配列からなり、かつ、スクロースとガラクチノールからラフィノースを生成する活性を有するタンパク質。

    【0016】また、本発明は、下記性質を有するラフィノース合成酵素を提供する。 (1)作用及び基質特異性:スクロースとガラクチノールからラフィノースを生成する。 (2)至適pH:約6〜8 (3)至適温度:約35〜40℃ (4)分子量: ゲルろ過クロマトグラフィーにより測定される分子量:約75kDa〜95kDa ポリアクリルアミドゲル電気泳動(Native P
    AGE)により測定される分子量:約90kDa〜10
    0kDa 還元条件下におけるSDS−ポリアクリルアミドゲル電気泳動(SDS−PAGE)により測定される分子量:約90kDa〜100kDa (5)阻害:ヨードアセトアミド、N−エチルマレイミド、ミオイノシトールにより阻害される。

    【0017】本発明は、上記ラフィノース合成酵素の具体的な態様として、アミノ酸配列中に、配列表配列番号28〜30に示す各アミノ酸配列を含むラフィノース合成酵素を提供する。

    【0018】また、本発明は、下記(C)又は(D)に示すタンパク質であるラフィノース合成酵素を提供する。 (C)配列表の配列番号24に記載のアミノ酸配列を有するタンパク質。 (D)配列表の配列番号24に記載のアミノ酸配列において、1若しくは数個のアミノ酸の置換、欠失、挿入、
    付加、又は逆位を含むアミノ酸配列からなり、かつ、スクロースとガラクチノールからラフィノースを生成する活性を有するタンパク質。

    【0019】本発明はまた、スクロース及びガラクチノールに上記ラフィノース合成酵素を作用させてラフィノースを生成させることを特徴とするラフィノースの製造方法を提供する。

    【0020】本発明はさらに、上記ラフィノース合成酵素をコードするDNA、及び、特に、下記(A)、
    (B)、(C)又は(D)に示すタンパク質をコードするDNAを提供する。 (A)配列表の配列番号5に記載のアミノ酸配列を有するタンパク質。 (B)配列表の配列番号5に記載のアミノ酸配列において、1若しくは数個のアミノ酸の置換、欠失、挿入、付加、又は逆位を含むアミノ酸配列からなり、かつ、スクロースとガラクチノールからラフィノースを生成する活性を有するタンパク質。 (C)配列表の配列番号24に記載のアミノ酸配列を有するタンパク質。 (D)配列表の配列番号24に記載のアミノ酸配列において、1若しくは数個のアミノ酸の置換、欠失、挿入、
    付加、又は逆位を含むアミノ酸配列からなり、かつ、スクロースとガラクチノールからラフィノースを生成する活性を有するタンパク質。

    【0021】本発明は、上記DNAの具体的態様として、下記(a)、(b)、(c)又は(d)に示すDN
    Aを提供する。 (a)配列表の配列番号4に記載の塩基配列のうち、少なくとも塩基番号56〜2407からなる塩基配列を含むDNA。 (b)配列表の配列番号4に記載の塩基配列のうち、少なくとも塩基番号56〜2407からなる塩基配列とストリンジェントな条件下でハイブリダイズし、かつスクロースとガラクチノールからラフィノースを生成する活性を有するタンパク質をコードするDNA。 (c)配列表の配列番号23に記載の塩基配列のうち、
    少なくとも塩基番号156〜2405からなる塩基配列を含むDNA。 (d)配列表の配列番号23に記載の塩基配列のうち、
    少なくとも塩基番号156〜2405からなる塩基配列とストリンジェントな条件下でハイブリダイズし、かつスクロースとガラクチノールからラフィノースを生成する活性を有するタンパク質をコードするDNA。

    【0022】また、本発明は、ラフィノース合成酵素のアンチセンスRNAまたはセンスRNAを発現させるために使用できるDNA、すなわち、下記(e)又は(f)に示すDNAを提供する。 (e)配列表の配列番号4に記載の塩基配列のうち、少なくとも塩基番号56〜2407からなる塩基配列若しくはその相補的塩基配列とストリンジェントな条件下でハイブリダイズするDNA。 (f)配列表の配列番号23に記載の塩基配列のうち、
    少なくとも塩基番号156〜2405からなる塩基配列若しくはその相補的塩基配列とストリンジェントな条件下でハイブリダイズするDNA。

    【0023】さらに本発明は、ラフィノース合成酵素遺伝子又はその一部と、植物細胞で発現可能な転写制御領域とを含むキメラ遺伝子、及び、このキメラ遺伝子で形質転換された植物を提供する。

    【0024】また本発明は、前記キメラ遺伝子で植物を形質転換し、この遺伝子を植物細胞内で発現させることにより、前記植物のラフィノース族オリゴ糖含量を変化させる方法を提供する。

    【0025】以下、上記(1)〜(5)に記載の性質を有するラフィノース合成酵素、又は、上記(A)、
    (B)、(C)及び(D)のタンパク質であるラフィノース合成酵素を、単に「ラフィノース合成酵素」ということがある。 また、ラフィノース合成酵素をコードするDNA、又はラフィノース合成酵素をコードし、さらに非翻訳領域を含むDNAを、「ラフィノース合成酵素遺伝子」ということがある。

    【0026】

    【発明の実施の形態】

    以下、本発明を詳細に説明する。 <1>本発明のラフィノース合成酵素 本発明のラフィノース合成酵素は、下記(A)、
    (B)、(C)又は(D)に示すタンパク質である。 (A)配列表の配列番号5に記載のアミノ酸配列を有するタンパク質。 (B)配列表の配列番号5に記載のアミノ酸配列において、1若しくは数個のアミノ酸の置換、欠失、挿入、付加、又は逆位を含むアミノ酸配列からなり、かつ、スクロースとガラクチノールからラフィノースを生成する活性を有するタンパク質。 (C)配列表の配列番号24に記載のアミノ酸配列を有するタンパク質。 (D)配列表の配列番号24に記載のアミノ酸配列において、1若しくは数個のアミノ酸の置換、欠失、挿入、
    付加、又は逆位を含むアミノ酸配列からなり、かつ、スクロースとガラクチノールからラフィノースを生成する活性を有するタンパク質。

    【0027】本発明のラフィノース合成酵素には、下記性質を有するものが含まれる。 (1)作用及び基質特異性:スクロースとガラクチノールからラフィノースを生成する。 (2)至適pH:約6〜8 (3)至適温度:約35〜40℃ (4)分子量: ゲルろ過クロマトグラフィーにより測定される分子量:約75kDa〜95kDa ポリアクリルアミドゲル電気泳動(Native P
    AGE)により測定される分子量:約90kDa〜10
    0kDa 還元条件下におけるSDS−ポリアクリルアミドゲル電気泳動(SDS−PAGE)により測定される分子量:約90kDa〜100kDa (5)阻害:ヨードアセトアミド、N−エチルマレイミド、ミオイノシトールにより阻害される。

    【0028】上記の性質を有するラフィノース合成酵素は、キュウリ本葉より単離、精製されたものであり、発明者により初めて同定された。 このキュウリ由来のラフィノース合成酵素は、後記実施例に示すように、その酵素タンパク質のアミノ酸配列中に、配列表配列番号1〜
    3、または、28〜30に示す各アミノ酸配列を含んでいる。 また、その全アミノ酸配列を、配列表配列番号5
    に示す。

    【0029】ラフィノース合成酵素は、ウリ科植物、例えばメロン(Cucumis melo)、キュウリ(Cucumis sati
    vus)などの植物から得られる。 特に、これらの植物の葉、特に葉脈部分、及び種子等の組織がラフィノース合成酵素の含有量が多い。

    【0030】次に、本発明のラフィノース合成酵素の製造法の例として、キュウリからラフィノース合成酵素を単離・精製する方法を説明する。 播種後6〜10週間のキュウリ本葉より、葉脈部分を集め、液体窒素下で乳鉢等を用いて磨砕し、緩衝液を加えてタンパク質を抽出する。 その際、ラフィノース合成酵素の分解、失活等を防ぐための物質、例えばPMSF(フェニルメタンスルフォニルフルオリド)等のプロテアーゼ阻害剤や、ポリクラールAT(セルバ(Serva)社製)等を加えてもよい。 この抽出液から濾過及び遠心分離により不溶物を除去し、粗抽出液を得る。

    【0031】上記のようにして得られる粗抽出液を、通常のタンパク質の精製法、例えば、陰イオン交換クロマトグラフィー、ハイドロキシアパタイトクロマトグラフィー、ゲル濾過、塩析等を組み合わせて分画することによって、ラフィノース合成酵素を精製することができる。

    【0032】陰イオン交換クロマトグラフィーは、例えば、HiTrapQ(ファルマシア社製)等の強塩基性陰イオン交換体や、DEAE−TOYOPEARL(東ソー社製)等の弱塩基性陰イオン交換体を充填したカラムを用いることによって行うことができる。 ラフィノース合成酵素を含む抽出液をこれらのカラムに通液させて酵素をカラムに吸着させ、カラムを洗浄した後に、高塩濃度の緩衝液を用いて酵素を溶出させる。 その際、段階的に塩濃度を高めてもよく、濃度勾配をかけてもよい。
    例えば、HiTrapQカラムを用いた場合には、カラムに吸着したラフィノース合成酵素活性は、0.3M程度のNaClで溶出される。 また、DEAE−TOYO
    PEARLでは溶出液として0.05M〜0.35MのNaCl濃度勾配が、ハイドロキシアパタイトクロマトグラフィーでは溶出液として0.01M〜0.3Mのリン酸濃度勾配が好ましい。

    【0033】上記の操作の順は特に問わず、また、各操作は2回又はそれ以上繰り返してもよい。 また、それぞれのカラムに試料液を通液する前に、透析等によって試料液を適当な緩衝液に交換しておくことが望ましい。 さらに、それぞれの段階で試料液を濃縮してもよい。

    【0034】精製の各段階においては、分画されたフラクション中に含まれるラフィノース合成酵素活性を測定し、活性の高いフラクションを集めて次の段階に供試することが好ましい。 ラフィノース合成酵素活性を測定する方法としては、例えば、Lehle,H らにより報告されている放射性同位体を用いる方法(Eur.J.Biochem.,38,10
    3-110(1973))が挙げられる。 また、この変法として、
    反応温度と基質濃度を変更してもよい。 例えば、最終濃度として、10mM 14 C-スクロース、20mM ガラクチノール、25mM HEPES(2-(4-(2-ヒト゛ロキシエチル)-1-ヒ゜ヘ゜ラシ゛ニル)エタンスルホン酸)-NaOH,pH7.0、
    5mM DTT(ジチオスレイトール)を含む反応液に、10μlの酵素液を加えて50μlとする。 これを、32℃、1時間インキュベートして反応を行い、2
    00μlのエタノールを加え、95℃で30秒間加熱して、反応を停止する。 この反応液の遠心上清をワットマン3MM濾紙にスポットし、n−プロパノール:酢酸エチル:水=4:1:2にて展開した。 14 Cのラフィノースへの取り込みを調べ、これをラフィノース合成酵素活性(nmol/時間)とする。

    【0035】本発明者は、上記の方法に代わる方法として、ラフィノース合成反応により生成するラフィノースをHPLC(高速液体クロマトグラフィー)により定量することによって、ラフィノース合成酵素活性を測定する方法を開発した。 この方法によれば、Lehle,Hらの方法に比べて簡便かつ迅速に測定することができ、特に精製操作における活性フラクションの検出には好適である。 以下に本方法を説明する。

    【0036】ラフィノース合成反応は、最終濃度が下記の組成になるように調製した反応液に10〜50μlのラフィノース合成酵素液を添加して100μlとし、3
    2℃で60分間、反応を行う。 〔反応液組成(最終濃度)〕 2.5 mM スクロース 5 mM ガラクチノール 5 mM DTT 20 mM トリス塩酸緩衝液(pH7.0)

    【0037】上記のようにして反応を行った後、反応液の4倍容のエタノールを加え、95℃で30秒間加熱して反応を停止する。 これを遠心し、遠心上清を減圧乾固した後、蒸留水に溶解し、HPLCにて反応生成物中のラフィノースを定量し、ラフィノース酵素活性とする。
    HPLCは、例えば、糖分析システムDX500(Carb
    oPac PA1カラム、パルスドアンペロメトリー検出器(ダイオネクス社製))を用いて行うことができる。

    【0038】反応時間を変化させたときの生成ラフィノース量を上記の方法により測定した結果を図1に示す。
    図から明らかなように、本方法により、ラフィノース合成酵素活性を直線性よく、かつ簡便に測定することができる。

    【0039】精製されたラフィノース合成酵素の精製度の確認や分子量の測定は、ゲル電気泳動、ゲルろ過クロマトグラフィー等によって行うことができる。 また、酵素学的性質は、反応温度あるいは反応pHを変化させて酵素活性を測定し、あるいは種々の酵素阻害剤や金属イオン等を反応液に添加し、残存酵素活性を測定することによって、検討すればよい。 さらに、ラフィノース合成酵素を種々のpH条件下又は温度条件下に一定時間さらした後に酵素活性を測定することにより、安定pH範囲及び安定温度範囲を調べることができる。

    【0040】前記したラフィノース合成酵素の性質は、
    このようにして決定されたものであるが、測定条件によって異なる結果が得られる場合があることに留意すべきである。 例えば、ゲルろ過クロマトグラフィーによる分子量の測定は、用いるゲルろ過担体や緩衝液の種類、あるいは分子量マーカーによって、影響される。 また、酵素活性は、同じpHであっても緩衝液の種類又は塩濃度によって異なることが多い。 したがって、ラフィノース合成酵素の同定に際しては、個々の性質のみではなく、
    総合的な検討を行うことが好ましい。

    【0041】本発明のラフィノース合成酵素は、上記のようにキュウリから単離・精製することによって得られるが、異種タンパク質の醗酵生産に通常用いられている方法によって、後述するキュウリ由来、ダイズ由来あるいはその他の植物由来のラフィノース合成酵素をコードするDNAを適当な宿主に導入し、発現させることによっても製造することができる。

    【0042】ラフィノース合成酵素遺伝子を発現させるための宿主としては、エシェリヒア・コリ(Esche
    richia coli)をはじめとする種々の原核細胞、サッカロマイセス・セレビシエ(Saccharo
    myces cerevisiae)をはじめとする種々の真核細胞が考えられるが、植物細胞、特にタバコ、
    キュウリ、シロイヌナズナ(アラビドプシス)等の植物由来の細胞が望ましい。

    【0043】形質転換に用いる組み換えプラスミドは、
    発現させようとする細胞の種類に応じた発現ベクターに、ラフィノース合成酵素をコードするDNAを挿入することで調製可能である。 植物の発現ベクターは、植物で働くプロモーターDNA配列、またはそれらを複数個組み合わせたものと、植物で働くターミネーターDNA
    配列を持ち、その間に外来遺伝子を挿入できる配列を有するものであればよい。

    【0044】このようなプロモーターには、植物体全体で発現するCaMV 35SRNAプロモーター、Ca
    MV 19SRNAプロモーター、ノパリン合成酵素プロモーター等、緑色組織で発現するRubisCO小サブユニットプロモーター等、種子などの部位特異的に発現するナピン(napin)、ファセオリン(phas
    eolin)等の遺伝子のプロモーター等が挙げられる。 さらに、上記のようなターミネーターとしてはノパリン合成酵素ターミネーター、RubisCO小サブユニット3'側部位等が挙げられる。

    【0045】植物用の発現ベクターとしてpBI12
    1、p35S−GFP(CLONTECH社製)等が市販されているのでこれを用いてもよい。 ウイルスRNA
    を発現するベクターを用い、そのコードしている外皮タンパク質などの遺伝子をラフィノース合成酵素遺伝子に置換してもよい。

    【0046】形質転換には通常用いられている方法、アグロバクテリウム法、パーティクルガン法、エレクトロポレーション法、PEG法等を、供試する宿主細胞に応じて用いればよい。 ラフィノース合成酵素活性の検出には、ラフィノース合成酵素精製を行った方法を用いることができる。 その際、試料を陰イオン交換カラムに通すなどして、あらかじめα‐ガラクトシダーゼを除いておくことが望ましい。

    【0047】キュウリ由来のラフィノース合成酵素をコードする遺伝子とは、発現した時にラフィノース合成酵素活性を有するものであればすべて含まれるが、好ましくは、配列表の配列番号5記載のアミノ酸配列をコードするDNAを有する遺伝子、又は配列表の配列番号4記載の塩基配列を有する遺伝子が挙げられる。 また、ダイズ由来のラフィノース合成酵素をコードする遺伝子とは、発現した時にラフィノース合成酵素活性を有するものであればすべて含まれるが、好ましくは、配列表の配列番号24記載のアミノ酸配列をコードするDNAを有する遺伝子、又は配列表の配列番号23記載の塩基配列を有する遺伝子が挙げられる。 尚、配列表の配列番号5
    又は24記載のアミノ酸配列をコードする遺伝子とは、
    コドンの縮重を考慮すると種々の塩基配列が包含される。 即ち、このような種々の塩基配列の中から、遺伝子発現系の諸要素、たとえば宿主細胞の種類等による優先コドン、転写されたRNAにより形成される高次構造の回避などを考慮して選択すればよい。 選択された塩基配列は、自然界からクローニングされたDNAであっても、人為的に化学合成されたDNAであってもよい。

    【0048】<2>本発明のラフィノース合成酵素をコードするDNA ラフィノース合成酵素をコードするDNAは、キュウリなどの植物体から単離したpoly(A) + RNAからcDNAライブラリーを調製し、このcDNAライブラリーをハイブリダイゼーションによってスクリーニングすることによって、取得することができる。 ハイブリダイゼーションに用いるプローブは、ラフィノース合成酵素タンパク質の部分アミノ酸配列に基づいて合成されたオリゴヌクレオチドをプライマーとするPCR(polyme
    rase chain reaction)によって増幅することによって、取得することができる。

    【0049】以下に、キュウリ由来のpoly(A) +
    RNAから本発明のDNAを取得する方法を具体的に説明する。 poly(A) + RNAの抽出部位としては、
    ラフィノース合成酵素遺伝子が発現していればキュウリ植物体のどこを用いても良く、様々な生長段階の葉、
    茎、蕾、果実、種子等より得ることができるが、望ましくは果実をつけた後の展開葉、特に葉脈部分を材料とするのがよい。

    【0050】キュウリ組織から全RNAを抽出するには、効率よく損傷の少ないRNAが得られるならば方法は制限されず、例えば、フェノール/SDS法、グアニジンイソチオシアネート/塩化セシウム法等、公知のいずれの方法によっても可能である。 こうして得た全RN
    Aからオリゴ(dT)担体を用いてpoly(A) +
    NAを分離できる。 また、全RNAを抽出せずにpol
    y(A) + RNAを得ることのできるキット(MPG
    Direct mRNA Purification
    Kit、CPG,INC. 社等)を使用しても良い。

    【0051】cDNAライブラリーのスクリーニングに使用するプローブのDNA断片は、PCRを行うことで得ることができる。 既にわかっているペプチド断片のアミノ酸配列、例えば配列表配列番号1〜3に示すアミノ酸配列より推定される塩基配列を有する一本鎖DNAを化学合成し、これをプライマーに用いてPCRを行う。
    プライマーには、得られているペプチド断片のアミノ酸配列のどの部分を用いてもよいが、コドンの縮重が少なく、複雑な高次構造を形成しないと思われる配列を選ぶのが望ましい。 また、RACE(Rapid Ampl
    ification of cDNA End:PCR
    PROTOCOLS A Guideto Meth
    ods and Applications、ACAD
    EMIC press INC. p28〜38)を行っても良い。

    【0052】このようなPCRの鋳型には、cDNAライブラリー、一本鎖cDNAを用いることが望ましい。
    PCR反応に逆転写酵素活性を有する耐熱性DNAポリメラーゼを用いる場合には、poly(A) + RNA、
    場合によっては全RNAを用いても良い。

    【0053】cDNAライブラリーを作製するためには、まずpoly(A) + RNAを鋳型にし、オリゴ(dT)プライマー、ランダムプライマー等を用い、逆転写酵素によって一本鎖cDNAを合成し、次にグブラ−ホフマン(Gubler and Hoffman)
    法、オカヤマ−バーグ(Okayama−Berg)法(Molecular Cloning 2nd ed
    ition、Cold Spring Harbor
    press、1989)等により二本鎖cDNAを合成する。 ラフィノース合成酵素遺伝子の発現量が少ない場合には、PCRを利用したcDNAライブラリー作製キット(Capfinder PCR cDNA Lib
    rary Construction Kit(CLO
    NTECH社)等)を用いて、PCRによってcDNA
    を増幅してもよい。 このようにして合成したcDNA
    は、平滑末端化、リンカーの付加、PCRによる制限酵素サイトの付加等を行うことにより、ファージベクター、プラスミド等のクローニングベクターにクローニングできる。

    【0054】ハイブリダイゼーション用のプローブには、上記のPCRで得られたDNA断片のうち、ラフィノース合成酵素cDNAに特徴的な部分を選ぶ。 また、
    5'末端側に近いDNA断片を選ぶのが望ましい。 このように選んだ増幅DNA断片を、PCR反応液から精製する。 この際、増幅したDNA断片をプラスミドを用いてサブクローニングし、プラスミドを大量調製してから制限酵素で切断し、電気泳動後にゲルを切り出して精製しても、また、プラスミドを鋳型にPCRを行って、目的部分だけを増幅して用いてもよい。 さらには、最初に増幅したDNA断片の量が十分に多い場合には、増幅したDNA断片をサブクローニングせずに電気泳動し、目的DNA断片のバンドを含むゲル断片を切り出し、そのゲル断片から精製してもよい。

    【0055】cDNAライブラリーから目的クローンを得るためのスクリーニングにはハイブリダイゼーションを行う。 上記の方法で得られたDNA断片はラベルしてハイブリダイゼーションのプローブとすることができる。 ラベルにはラジオアイソトープ、ビオチン等、種々のものを用いることができるが、ランダムプライミング法でラベルすることが望ましい。 また、スクリーニングにはハイブリダイゼーションではなくPCRを用いてもよい。 さらに、ハイブリダイゼーションとPCRを組み合わせてもよい。 上記のようにして得られたキュウリ由来のラフィノース合成酵素をコードするDNAの塩基配列、及びこの塩基配列から推定されるアミノ酸配列を配列表配列番号4に例示する。 また、このアミノ酸配列のみを配列番号5に示す。 後記実施例3で得られたラフィノース合成酵素をコードするDNAを含むDNA断片を含むプラスミドpMossloxCRSを保持するエシェリヒア・コリJM109の形質転換体AJ13263
    は、平成8年11月19日より、通商産業省工業技術院生命工学工業技術研究所(郵便番号305 日本国茨城県つくば市東一丁目1番3号)にブダペスト条約に基づき国際寄託されており、受託番号FERMBP−574
    8が付与されている。

    【0056】さらに、上記のようにして一つの植物から得られたラフィノース合成酵素遺伝子を利用して、他の植物からラフィノース合成酵素遺伝子を取得できる。 ラフィノース合成酵素を得るための植物としては先に述べたラフィノースを合成している植物であれば何でもよく、例えば、ダイズ、ソラマメ、ナタネ、ヒマワリ、ワタ、シュガービートなどがある。 例として、キュウリ由来ラフィノース合成酵素をコードするDNAを利用した、ダイズのラフィノース合成酵素をコードするDNA
    の取得について説明する。

    【0057】ダイズのラフィノース合成酵素遺伝子は、
    ダイズ由来のpoly(A)+RNAからcDNAライブラリーを調製し、キュウリ由来ラフィノース合成酵素をコードするDNAの塩基配列に基づいて選択されたプローブを用いてcDNAライブラリーをスクリーニングすることによって取得することができる。

    【0058】RNAの抽出部位としては、ラフィノース合成酵素が発現していればダイズ植物体のどこでもよいが、望ましくは種子、特に、開花後の未熟種子でラフィノース族オリゴ糖が生成している時期のものがよい。

    【0059】ダイズ未熟種子より全RNAを抽出するには、効率よく損傷の少ないRNAが得られるならば方法は特に制限されず、先のキュウリに関して述べた方法のいずれによっても可能である。

    【0060】ハイブリダイゼーションのプローブは、ダイズ由来ラフィノース合成酵素遺伝子と相同性が高い配列を有する必要がある。 ハイブリダイゼーションに用いるプローブは、キュウリ由来ラフィノース合成酵素遺伝子とすることもできるが、そのなかのラフィノース合成酵素の保存された領域をプローブにすることが望ましい。 しかし、キュウリ由来ラフィノース合成酵素遺伝子の情報からでは、そのような配列を特定することはできない。 このような配列を有するハイブリダイゼーションのプローブを得るには以下のようないくつかの方法による必要がある。 簡便には、キュウリのラフィノース合成酵素遺伝子を適当な制限酵素で切断して得た断片を、それぞれ、ダイズRNAに対しノーザンハイブリダイゼーションを行い、ハイブリダイズするDNA断片をプローブとしてもよい。 また、キュウリ由来ラフィノース合成酵素のアミノ酸配列に基づいて合成されたプライマーを用いダイズRNAを鋳型としたRT−PCRによって得ることもできる。 また、キュウリ由来ラフィノース合成酵素をコードするDNAと相同性のあるシロイヌナズナEST配列に基づいて合成されたオリゴヌクレオチドをプライマーとして、シロイヌナズナRNAのRT−PC
    Rによって取得することができる。

    【0061】好ましくは、次のようにして、目的の遺伝子と相同性の高いものを得る。 まず、Gen Bank
    データベースよりキュウリ由来ラフィノース合成酵素遺伝子に対し相同性を有するシロイヌナズナなどのEST
    配列をGenetix Mac等のソフトウェアを用いて検索する。 得られた配列と、キュウリラフィノース合成酵素遺伝子との間で相同性の高い領域は、様々な種に由来するラフィノース合成酵素間において保存されている配列を含むと考えられる。 この領域のDNA断片を得るには、例えば、シロイヌナズナのRNAより調製した一本鎖DNAを鋳型とし、相同性の高い領域の配列に基づいて合成したオリゴヌクレオチドをプライマーとしてPCRにて増幅して得ることができる。 この増幅断片の塩基配列を解析し、キュウリと相同性の高い配列を有するものを選ぶ。 得られたDNA断片は、先に記載のように、ラベルし、プローブとして用いる。

    【0062】cDNAライブラリーから目的クローンを得るためのスクリーニングには、キュウリ遺伝子のクローニングと同様にハイブリダイゼーションを行う。 上述のようにして得られたダイズ由来ラフィノース合成酵素をコードするDNAの塩基配列、及びこの塩基配列から推定されるアミノ酸配列を配列表配列番号23に示す。
    また、このアミノ酸配列のみを配列番号24に示す。 上記方法で取得したキュウリ由来ラフィノース合成酵素に対するダイズ由来ラフィノース合成酵素の相同性は、ギャップを考慮したマキシマム・マッチングにより、アミノ酸配列では38%、塩基配列では50%であった。 後記実施例4で得られたラフィノース合成酵素をコードするDNAを含むDNA断片を含むプラスミドpMOSS
    loxSRSを保持するエシェリヒア・コリJM109
    の形質転換体AJ13379は、平成9年10月20日から、通商産業省工業技術院生命工学工業技術研究所(郵便番号305 日本国茨城県つくば市東一丁目1番3号)にブタペスト条約に基づき国際寄託されており、
    受託番号FERM BP−6149が付与されている。

    【0063】キュウリ由来ラフィノース合成酵素と、ダイズ由来ラフィノース合成酵素の情報を利用して、さらに他の植物からラフィノース合成酵素遺伝子を取得することができる。 両タンパク質で保存されたアミノ酸配列、例えば、配列表配列番号28(配列番号24のアミノ酸番号199〜208)、29(配列番号24のアミノ酸番号302〜314)、30(配列番号24のアミノ酸番号513〜527)などから推定される塩基配列を有する一本鎖DNA、及び、推定される塩基配列と相補的塩基配列を有する一本鎖DNAを合成し、これらをプライマーに用いてRT−PCRを行う。 プライマーには上記配列のどの部分を用いてもよいが、コドンの縮重が少なく、複雑な高次構造を形成しないと思われる配列を選ぶのが望ましい。 遺伝子を取得しようとする植物の全RNA、場合によっては、poly(A) + RNAよりcDNAを合成し、これを鋳型にしてPCRを行う。
    得られたDNA断片は適当なベクターにクローニングし塩基配列を解析し、この塩基配列がキュウリもしくはダイズ由来ラフィノース合成酵素遺伝子と相同性を有するか、または、翻訳したアミノ酸配列がキュウリ及びダイズ由来ラフィノース合成酵素のアミノ酸配列と相同性を有するかどうか確認すればよい。 これにより得られたD
    NA断片はcDNAライブラリーのスクリーニングに用いることができる。 また、遺伝子を取得しようとする植物の全RNA、場合によっては、poly(A) + RN
    Aより合成した一本鎖cDNAを鋳型にして、RACE
    を行ってもよい。

    【0064】本発明のDNAは、コードされるラフィノース合成酵素の活性、すなわちスクロースとガラクチノールからラフィノースを生成する活性が損なわれない限り、1若しくは複数の位置での1若しくは数個のアミノ酸の置換、欠失、挿入、付加、又は逆位を含むラフィノース合成酵素タンパク質をコードするものであってもよい。 ここで、「数個」とは、アミノ酸残基のタンパク質の立体構造における位置や種類によっても異なる。 それは、イソロイシンとバリンのように、アミノ酸によっては、類縁性の高いアミノ酸が存在し、そのようなアミノ酸の違いが、タンパク質の立体構造に大きな影響を与えないことに由来する。 従って、キュウリ由来ラフイノース合成酵素を構成する784アミノ酸残基全体に対し、
    35から40%以上の相同性を有し、ラフイノース合成酵素活性を有するものであってもよい。 さらに、好ましくは、510番目のアミノ酸から610番目のアミノ酸の間において、65%以上の相同性を有することである。 さらに好ましくは、「数個」が、2から40個、好ましくは、2から20個、さらに、2から10個である。 また、ダイズ由来ラフイノース合成酵素を構成する750アミノ酸残基全体に対しても、同様に35から4
    0%以上の相同性を有し、ラフイノース合成酵素活性を有するものであってもよい。 さらに、好ましくは、47
    8番目のアミノ酸から577番目のアミノ酸の間において、65%以上の相同性を有することである。 ここでいう相同性とは、ギャップを考慮したマキシマム・マッチングを行ったときの値をいう。

    【0065】遺伝子全長において、約50%以上の相同性があり、かつ、その中で約300塩基にわたる65%
    以上の相同性がある遺伝子を含む。 そのような遺伝子は、GenBankなどのデータベースを用いて、キュウリ由来ラフイノース合成酵素遺伝子に対し相同性を有する遺伝子を検索することによって、塩基配列情報を得ることができる。 ホモロジー解析プログラムはLipm
    an−Pearson法を採用したGENETIX−M
    AC(遺伝子情報処理ソフトウエア、ソフトウエア開発社)などを用いてもよく、また、インターネット上に公開されているものを使用してもよい。 このような方法により得られた塩基配列は遺伝子全長を含む場合と、遺伝子全長を含まない場合がある。 遺伝子全長を含まない場合は、目的植物組織より抽出したRNAを鋳型に、キュウリ由来ラフイノース合成酵素遺伝子と相同性の高い部位に対応するプライマーを用い、5'RACE法、3'
    RACE法にて、容易に全長遺伝子を取得することができる。 得られた全長遺伝子は、先に述べたような、Solu
    ble Protein Expression System(INVITROGEN社)や、Tig
    ht Control Expression System (INVITROGEN社)や、QI
    Aexpress System(QIAGEN社)などのキットが提供する適当な発現ベクターに組み込み、遺伝子を発現させ、記載の方法でラフィノース合成酵素活性を測定し、活性を有するクローンを選抜すればよい。 遺伝子の発現方法については、Plant Molecular Biology, A Laboratory Manu
    al (Melody S. Clark (Ed.), Springer)などに詳しく記載されている。

    【0066】このようなラフィノース合成酵素と実質的に同一のタンパク質をコードするDNAは、例えば部位特異的変異法によって、特定の部位のアミノ酸が置換、
    欠失、挿入、付加されるように塩基配列を改変することによって得られる。 また、上記のような改変されたDN
    Aは、従来知られている突然変異処理によっても取得され得る。 突然変異処理としては、ラフィノース合成酵素をコードするDNAをヒドロキシルアミン等でインビトロ処理する方法、及びラフィノース合成酵素をコードするDNAを保持するエシェリヒア属細菌を、紫外線照射またはN−メチル−N'−ニトロ−N−ニトロソグアニジン(NTG)もしくは亜硝酸等の通常人工突然変異に用いられている変異剤によって処理する方法が挙げられる。

    【0067】また、上記のような塩基の置換、欠失、挿入、付加、又は逆位等には、キュウリまたはダイズの個体差、品種間差、遺伝子の多コピー化、各器官、組織の違いに基づく場合などの天然に生じる変異も含まれる。

    【0068】上記のような変異を有するDNAを、適当な細胞で発現させ、発現産物のラフィノース合成酵素活性を調べることにより、ラフィノース合成酵素と実質的に同一のタンパク質をコードするDNAが得られる。 また、変異を有するラフィノース合成酵素をコードするD
    NAまたはこれを保持する細胞から、例えば配列表の配列番号4に記載の塩基配列のうち、塩基番号56〜24
    07からなる塩基配列、または、配列番号23に記載の塩基配列のうち、塩基番号156〜2405からなる塩基配列を有するDNAとストリンジェントな条件下でハイブリダイズし、かつ、ラフィノース合成酵素活性を有するタンパク質をコードするDNAを単離することによっても、ラフィノース合成酵素タンパク質と実質的に同一のタンパク質をコードするDNAが得られる。 ここでいう「ストリンジェントな条件」とは、いわゆる特異的なハイブリッドが形成され、非特異的なハイブリッドが形成されない条件をいう。 この条件を明確に数値化することは困難であるが、一例を示せば、相同性が高いDN
    A同士、例えば50%以上の相同性を有するDNA同士がハイブリダイズし、それより相同性が低いDNA同士がハイブリダイズしない条件、あるいは通常のサザンハイブリダイゼーションの洗いの条件である60℃、1×
    SSC,0.1%SDS、好ましくは、0.1×SS
    C、0.1%SDSに相当する塩濃度でハイブリダイズする条件が挙げられる。 このような条件でハイブリダイズする遺伝子の中には途中にストップコドンが発生したものや、活性中心の変異により活性を失ったものも含まれるが、それらについては、市販の活性発現ベクターにつなぎラフィノ―ス合成酵素活性を記述の方法で測定することによって容易に取り除くことができる。

    【0069】尚、本発明のDNAを、ラフィノース合成酵素のアンチセンスRNAを発現させるために用いる場合には、このDNAは活性のあるラフィノース合成酵素をコードしている必要はない。 また、センスRNAによっても、相同性のある内在性遺伝子の機能を抑制することができる。 このような場合も、DNAが活性あるラフイノース合成酵素遺伝子をコードしている必要はなく、
    また、全長を含まなくてもよく、好ましくは、60%以上の相同性を有する翻訳領域が500塩基対程度あればよい。 このようなDNAの例としては、下記(e)又は(f)のDNAが挙げられる。 (e)配列表の配列番号4に記載の塩基配列のうち、少なくとも塩基番号56〜2407からなる塩基配列若しくはその相補的塩基配列とストリンジェントな条件下でハイブリダイズするDNA。 (f)配列表の配列番号23に記載の塩基配列のうち、
    少なくとも塩基番号156〜2405からなる塩基配列若しくはその相補的塩基配列とストリンジェントな条件下でハイブリダイズするDNA。

    【0070】本発明者らが、目的とする、キュウリ由来またはダイズ由来のラフィノース合成酵素のcDNAのクローニングに成功した方法は上述の通りであるが、それ以外に下記の方法が挙げられる。 (1)キュウリ由来またはダイズ由来のラフィノース合成酵素を単離精製し、決定されるアミノ酸配列、または配列番号5または配列番号24に示すアミノ酸配列を基に全塩基配列を化学合成する。 (2)キュウリまたはダイズの植物体から染色体DNA
    を調製し、プラスミドベクター等を用いて染色体DNA
    ライブラリーを作製し、このライブラリーからラフィノース合成酵素遺伝子を、ハイブリダイゼーンション又はPCRによって取得する。 尚、染色体由来のラフィノース合成酵素遺伝子は、コード領域にイントロンが含まれることが予想されるが、このようなイントロンによって分断されたDNAであっても、ラフィノース合成酵素をコードする限り本発明のDNAに含まれる。 (3)poly(A) + RNAを分子量等によって分画し、ホイートジャーム又はウサギ網状赤血球を用いたインビトロ翻訳系に供し、ラフィノース合成酵素活性を有するポリペプチドをコードするmRNAが存在する画分を決定し、それより目的のcDNA断片を作製、取得する。 (4)抗キュウリラフィノース合成酵素抗体または抗ダイズラフィノース合成酵素抗体を作製し、タンパク質発現ベクターにcDNAライブラリーを乗せ、適当な宿主に感染させてcDNAがコードするタンパク質を発現させ、先程の抗体を用いて目的のcDNAをスクリーニングしても良い。 (5)ペプチド断片のアミノ酸配列から適当なプライマーを合成し、RACE法によって、末端を含む配列を増幅し、これをクローニングしてもよい。

    【0071】ラフィノース合成酵素遺伝子を発現させるには、酵素をコードする領域のDNAを種々の発現ベクターに組み込み遺伝子を発現させればよく、詳しくは、
    Plant Molecular Biology−A
    Laboratory Manual(M.S.Cla
    rk(eds.),Springer)などに記載されている。 ベクターとしては、市販の発現ベクターを使用してもよい。 発現の確認は、本明細書に記載の方法によって活性を測定することによって行うことができる。

    【0072】例として、ダイズ由来ラフィノース合成酵素遺伝子によるラフィノース合成酵素の活性発現方法について説明する。 pMOSSloxSRSのラフィノース合成酵素遺伝子の156番目の塩基のATGを含む上流すぐにNdeIの制限酵素サイトを、また2405番目の塩基の下流にBamHIサイトを、それぞれの制限酵素サイトを含むようにデザインしたプライマーを用いたPCRによって付加する。 次に、フェノールクロロホルムにて精製した先のラフィノース合成酵素遺伝子とp
    ET3aをNdeI、BamHIにて消化する。 消化したそれぞれのDNAは、アガロースゲル電気泳動によって精製する。 ダイズ由来ラフィノース合成酵素遺伝子の内部にはBamHIサイトが存在するので、あらかじめ、PCRなどによって変異を入れておくか、アガロース電気泳動によって目的サイズの断片を選ぶ。 精製したラフィノース合成酵素断片と、ベクターはライゲーションし、ゲルで確認する。 さらにラフィノース合成酵素遺伝子がATGコドンから開始することを塩基配列解析により確認する。 このベクターをE. coli BL21
    (DE3)pLysEに形質転換しクロラムフェニコールとアンピシリンを含むLB培地で選抜をする。 形質転換体はPCRなどによってその挿入断片を確認し、目的の形質転換体をLB培地で培養し菌体を得る。 菌体はS
    DSを含むゲルローディング緩衝液にて100℃、3分間インキュベートし、SDSポリアクリルアミドゲルにて電気泳動し、目的のサイズのタンパク質のバンドを確認する。 この選抜された菌を培養し、菌体をソニックなどにより壊し、タンパク質を抽出する。 このタンパク質抽出液のラフィノース合成酵素活性を本明細書に記載の方法で測定すればよい。

    【0073】<3>本発明のラフィノースの製造法 本発明のラフィノースの製造法においては、スクロース及びガラクチノールに上記ラフィノース合成酵素を作用させてラフィノースを生成させる。 ラフィノース合成酵素は、スクロースとガラクチノールに作用させると、ガラクチノールを構成するガラクトース残基がスクロースに転移し、ラフィノースが生成する。 その際、ガラクチノールを構成するミオイノシトールが生成する。

    【0074】ラフィノースの製造に使用するラフィノース合成酵素は、植物体から抽出した酵素であっても、本発明のDNAを用いた遺伝子組換え法によって製造した酵素であってもよい。

    【0075】スクロース及びガラクチノールにラフィノース合成酵素を作用させるには、ラフィノース合成酵素又はラフィノース合成酵素生産能を有する細胞をアルギン酸ゲルやポリアクリルアミドゲル等の担体に固定化した固定化酵素又は固定化細胞をカラムに充填し、このカラムにスクロース及びガラクチノールを含む溶液を通液してもよい。 担体及びラフィノース合成酵素又は細胞を担体に固定化する方法は、通常のバイオリアクターに用いられる材料及び方法を採用することができる。

    【0076】ラフィノース合成反応は、例えば、スクロース及びガラクチノールを含む水溶液又は緩衝液等の溶液に、ラフィノース合成酵素を添加することによって行われる。 前記溶液のpHは、約6〜8の範囲内、特にp
    H7前後に調整されることが好ましい。 また、反応温度は約28〜42℃、好ましくは35〜40゜Cの範囲内、特に38℃前後であることが好ましい。 尚、本発明のラフィノース合成酵素は、約pH5〜8の範囲、特にpH6付近で安定である。 また、本酵素は少なくとも約40℃以下の温度範囲で安定である。

    【0077】本発明のラフィノース合成酵素は、ヨードアセトアミド、N−エチルマレイミド、MnCl 2 、Z
    nCl 2 、NiCl 2によって酵素活性が阻害されるので、これらの物質が反応液に含まれないことが望ましい。

    【0078】反応液に加えるガラクチノール及びスクロースの濃度は、ガラクチノール 5mM以上、スクロース 1.5mM以上が好適である。 また、反応液に加えるラフィノース合成酵素の添加量は、基質量に応じて添加すればよい。

    【0079】反応液に含まれる未反応のスクロース、ガラクチノール及び酵素反応により生じるミオイノシトールからラフィノースを分離する方法としては、例えばゲル濾過クロマトグラフィーが挙げられる。

    【0080】<4>本発明のキメラ遺伝子及び形質転換植物 本発明のキメラ遺伝子は、ラフィノース合成酵素遺伝子又はその一部と、植物細胞で発現可能な転写制御領域とを含む。 ラフィノース合成酵素遺伝子としては、前記<
    2>に記載した本発明のラフィノース合成酵素をコードするDNAが挙げられる。 さらに、本発明のキメラ遺伝子をアンチセンス遺伝子として利用する場合には、ラフィノース合成酵素をコードするDNAの他に、ラフィノース合成酵素遺伝子の非翻訳領域又はその一部であっても、使用できる場合がある。 非翻訳領域としては、例えば配列表配列番号4において塩基番号1〜55(5'非翻訳領域)、あるいは2407〜2517に示す配列(3'非翻訳領域)、また、配列表配列番号23においては塩基番号1〜155、あるいは2406〜2765
    が挙げられる。

    【0081】本発明のキメラ遺伝子において、転写制御領域が、ラフィノース合成酵素をコードするDNAに、
    このDNAコード鎖に相同なmRNA(センスRNA)
    を発現するように連結されている場合は、このキメラ遺伝子が導入された植物細胞はラフィノース合成酵素を発現し、ラフィノース族オリゴ糖含量が増加する。 一方、
    前記転写制御領域が、前記DNAのコード鎖に相補的な配列を有するRNA(アンチセンスRNA)を発現するように前記DNAに連結されている場合、および、ラフィノース合成酵素遺伝子の一部の断片、好ましくは、上流コード領域の約200塩基対以上に対するセンスRN
    Aを発現するように連結されている場合、これらのキメラ遺伝子が導入された植物細胞は、内在性ラフィノース合成酵素の発現が抑制され、ラフィノース族オリゴ糖が低減化する。

    【0082】上記のように、本発明のキメラ遺伝子で植物を形質転換し、この遺伝子を植物細胞内で発現させることにより、前記植物のラフィノース族オリゴ糖含量を変化させることができる。

    【0083】本発明を適用する植物としては、油糧植物であるダイズ、ナタネ、ワタ、砂糖を生産するテンサイ、サトウキビ、モデル植物としてシロイヌナズナ等が挙げられる。

    【0084】また、植物細胞で発現可能な転写制御領域としては、前述したような、植物全体で発現するCaM
    V 35SRNAプロモーター、CaMV 19SRN
    Aプロモーター、ノパリン合成酵素プロモーター等、緑色組織で発現するRubisCO小サブユニットプロモーター等、種子などの部位特異的に発現するナピン(n
    apin)、ファセオリン(phaseolin)等の遺伝子のプロモーター領域等が挙げられる。 また、キメラ遺伝子の3'末端には、ノパリン合成酵素ターミネーター、RubisCO小サブユニット3'側部位等のターミネーターが連結されてもよい。

    【0085】キメラ遺伝子で植物を形質転換には通常用いられている方法、アグロバクテリウム法、パーティクルガン法、エレクトロポレーション法、PEG法等を、
    供試する宿主細胞に応じて用いればよい。

    【0086】植物にキメラ遺伝子を導入する形質転換法としては、アグロバクテリウム法、パーティクルガン法、エレクトロポレーション法、PEG法等が挙げられる。 アグロバクテリウム法として具体的には、バイナリーベクターを用いる方法がある。 すなわち、Tiプラスミド由来のT−DNA、大腸菌などの生物で機能可能な複製起点、及びベクターを保持する植物細胞または微生物細胞を選択するためのマーカー遺伝子を含むベクターを植物に感染させ、この植物から採取した種子を生育させ、マーカー遺伝子の発現を指標としてベクターが導入された植物を選択する。 得られた植物について、ラフィノース合成酵素活性を測定するか、あるいはラフィノース族オリゴ糖の含量が変化したものを選択することによって、目的とする形質転換植物を取得することができる。

    【0087】以下に、ダイズにキメラ遺伝子を導入する方法について説明する。 ダイズ形質転換には、パーティクルガン法(Pro. Natl. Acad. Sci. USA, 86, 145 (19
    89)、TIBTECH, 8, 145 (1990)、Bio/Technology, 6, 92
    3 (1988)、Plant Physiol.,87, 671 (1988)、Develop.
    Genetics, 11, 289 (1990)、Plant cell Tissue &Organ
    Culture, 33, 227 (1993))、アグロバクテリウム法(Plant Physiol., 91, 1212 (1989)、 WO94/02620、 P
    lant Mol. Biol., 9, 135 (1987)、Bio/Technology, 6,
    915 (1988))、エレクトロポレーション法(Plant Phy
    siol., 99, 81(1992)、Plant Physiol., 84, 856 (198
    9)、Plant Cell Reports, 10, 97 (1991))のいずれの方法も用いることができる。

    【0088】パーティクルガン法においては、エンブリオジェニック(embryogenic)組織、あるいは、開やく後30日から40日の未熟種子の胚軸を用いればよい。
    約1gのエンブリオジェニック組織をペトリ皿に広げ、
    日的のキメラ遺伝子をコーテイングした金粒子、タングステン粒子などを打ち込めばよい。 組織は、1時間から2時問後液体培地に移し、培養する。 2週間後、形質転換体選抜のための抗生物質入りの培地に移し、培養する。 6週間後に、緑色の耐性不定胚が得られるので、これをさらに新しい培地に移して培養し、植物体を再生させる。 あるいは、胚軸を用いた場合には、胚軸を無菌的に摘出し、パーティクルガンで処理した後、高濃度のサイトカイニンを含むMS培地(Murashige and Skoog, P
    hysiologiaPlantrum, 15, 473-497 (1962))にて培養をする。 暗黒下で、2週間培養した後、サイトカイニンの含量を低下させたMS培地にて12時間から16時間、
    光照射下で室温で培養する。 このとき、選抜マーカーとして用いた抗生物質を培地に添加しておくことが望ましい。 移植組織より多芽体が形成したら、ホルモン無添加の培地に移すことで、発根させる。 この幼植物体を温室に移し、栽培する。

    【0089】アグロバクテリウムを用いる方法では、植物組織としてコチルドナリーノッド(Cotyldonary no
    d)を用いることが望ましい。 アグロパクテリウムは、
    市販のLBA4404、C58、Z707などを用いることができるが、望ましくは、Z707がよい。 ベクターは、pMON530(Monsanto Co.)に目的遺伝子を挿入したプラスミドなどを用いることができる。 ダイレクト・フリーズ・ソー(Direct freeze thaw)方法(An
    et al., Plant Mol. Biol. Mannual A3:1-19, 1988)
    などによって、アグロバクテリウム ツメファシエンス(Agrobacterium tumefaciens)Z707(Hepburn et
    al., J, Gen. Microbiol, 131, 2961 (1985))にプラスミドを導入する。 このキメラ遺伝子で形質転換したアグロバクテリウムは、一晩培養し、5000rpm、5分間遠心し、B5懸濁培地に懸濁する。 ダイズ種子は滅菌し1/10濃度のB5培地にて3日間培養し、発芽させる。 子葉を切り出し、アグロバクテリウムの懸濁液で、
    2時間供培養する。 この子葉をB5培地(ガンボルグ(G
    amborg)B5塩(Exp. Cell. Res., 50, 151 (1968)、ガンボルグB5ビタミン、3%スクロース。5μMベンジルアミノプリン、10μM IBA、100μM アセトシリンゴン含有)に移し、25℃、23時間光照射(60μEm -2 S -1 )の条件下で3日問培養する。 次に、
    アグロバクテリウムを除去するためにB5培地(5μM
    ベンジルアミノプリン、100mg/Lカルベニシリン、100mg/L バンコマイシン、500mg/L
    セファタキシム(cefotaxime))にて4日間25℃で毎日培地を交換しながら培養する。 その後、B5培地(2
    00mg/Lカナマイシン)にて培養する。 1から2カ月でマルチシュートが形成される。 これを、B5培地(0.58mg/L ジベレリン、50mg/L カナマイシン)で培養し、シュートを伸長させる。 次に、B5
    培地(10μM IBA)に移し、発根させる。 発根した幼植物体は、馴化し、温室にて栽培することによって形質転換体を得ることができる。

    【0090】ラフィノース合成酵素遺伝子を導入した形質転換体植物の確認は、形質転換体より、DNAを抽出し、ラフィノース合成酵素遺伝子をプローブに用いてサザンハイブリダイゼーションを行えば容易に確認できる。

    【0091】

    【実施例】以下に、本発明を実施例によりさらに具体的に説明する。 はじめに、以下の実施例において、各精製工程における活性画分の確認及び酵素の特性検討に用いたラフィノース合成酵素活性の測定法を説明する。

    【0092】<ラフィノース合成酵素活性測定法>ラフィノース合成酵素の活性は、ラフィノース合成反応により生成したラフィノースをHPLC(高速液体クロマトグラフィー)により定量することによって行った。 HP
    LCは、糖分析システムDX500(CarboPac PA1カラム、パルスドアンペロメトリー検出器(ダイオネクス社製))を用いて行った。

    【0093】ラフィノース合成反応は、最終濃度が下記の組成になるように調製した反応液に10〜50μlのラフィノース合成酵素液を添加して100μlとし、3
    2℃で60分間、反応を行った。 〔反応液組成(最終濃度)〕 2.5 mM スクロース 5 mM ガラクチノール 5 mM DTT 20 mM トリス塩酸緩衝液(pH7.0)

    【0094】上記のようにして反応を行った後、反応液の4倍容のエタノールを加え、95℃で30秒間加熱して反応を停止した。 これを遠心し、遠心上清を減圧乾固した後、蒸留水に溶解し、糖分析システムにて反応生成物中のラフィノースを定量し、ラフィノース酵素活性とした。

    【0095】

    【実施例1】 キュウリからのラフィノース合成酵素の精製 <1>キュウリからのラフィノース合成酵素の抽出 播種後6〜10週間のキュウリ(品種「SUYOU」)
    本葉より、葉脈系を集め、液体窒素にて凍結し、−80
    ℃にて保存した。 凍結した葉脈系約200gを液体窒素下で乳鉢にて磨砕し、緩衝液1(40mM トリス塩酸緩衝液(pH7.0)、5mM DTT、1mM PMSF
    (フェニルメタンスルフォニルフルオリド)、1%ポリクラールAT;セルバ社製)を加え、タンパク質を抽出した。 抽出液は、ガーゼやミラクロス(カルバイオケム−ノボバイオケム(Calbiochem- Novobiochem)社)などのフィルターにて濾過し、濾液を4℃、約30,000
    ×gで60分間遠心した。 得られた遠心上清を粗抽出液とした。

    【0096】<2>陰イオン交換クロマトグラフィー(1) 上記で得られた粗抽出液約560mlを、緩衝液2(2
    0mM トリス塩酸緩衝液(pH7.0)、5mM DT
    T)にて平衡化した強塩基性陰イオン交換クロマトグラフィーカラム(HiTrapQ;ファルマシア社製、
    1.6cm×2.5cm)を5本連結したカラムに供し、ラフィノース合成酵素活性をカラムに吸着させた。
    続いてカラムの5倍容の緩衝液3(20mM トリス塩酸緩衝液(pH7.0)、0.2M NaCl、5mM D
    TT)にてカラムを洗浄して非吸着タンパク質を洗い流した後、50mlの緩衝液4(20mM トリス塩酸緩衝液(pH7.0)、0.3M NaCl、5mM DT
    T)にてラフィノース合成酵素活性を カラムから容出させた。

    【0097】<3>陰イオン交換クロマトグラフィー(2) 上記の溶出液約75mlを透析チューブ(Pormem
    branes MWCO:10,000;スペクトラ(S
    pectra)社製)に入れ、10Lの緩衝液5(20
    mM トリス塩酸緩衝液(pH7.0)、0.05M Na
    Cl、5mMDTT)に対して、4℃で一晩透析した。
    透析した試料を緩衝液5で平衡化した弱塩基性陰イオン交換クロマトグラフィーカラム(DEAE−TOYOP
    EARL;東ソー社製、2.2×20cm)に供し、ラフィノース合成酵素活性をカラムに吸着させた。 続いてカラムの5倍容の緩衝液5にてカラムを洗浄して非吸着タンパク質を洗い流した後、20カラム容に対し0.0
    5M〜0.35MのNaCl濃度勾配を直線的にかけて酵素活性を溶出し分画した。

    【0098】<4>ゲル濾過クロマトグラフィー 上記で得られた溶出液約160mlを、濃縮器(セントリプレップ10;Amicon社製)を用いて6.5m
    lに濃縮した。 この濃縮液3mlずつをゲルろ過クロマトグラフィーカラム(Superdex 200pg;
    ファルマシア社製、2.6cm×60cm)に供した。
    カラムの平衡化と溶出は、緩衝液6(20mM トリス塩酸緩衝液(pH7.0)、0.1M NaCl、5mM
    DTT、0.02% Tween 20)を用いて行った。 分画した各画分のうち、ラフィノース合成酵素活性を有する画分を集めた。

    【0099】<5>ハイドロキシアパタイトクロマトグラフィー ゲル濾過で分画したラフィノース合成酵素活性画分約2
    5mlを、セントリプレップ10にて濃縮し、さらに、
    緩衝液7(0.01M リン酸ナトリウム緩衝液(pH
    7.0)、5mM DTT、0.02% Tween 2
    0)を用いて緩衝液交換を行った。 得られた濃縮液約1.2mlを、あらかじめ同緩衝液にて平衡化したハイドロキシアパタイトカラム(Bio−Scale CH
    T−1;バイオラッド社製、0.7×5.2)に供し、
    ラフィノース合成酵素活性を吸着させた。 カラムを、カラム体積の5倍量(10ml)の同緩衝液にて洗浄した後、20カラム容に対し、0.01M〜0.3Mのリン酸濃度勾配を直線的にかけて酵素活性を溶出し分画した。

    【0100】<6>ハイドロキシアパタイトリクロマトグラフィー 上記のようにして得られたハイドロキシアパタイトクロマトグラフィーによる活性画分を同様にしてリクロマトし、精製ラフィノース合成酵素画分(約2ml)とした。

    【0101】本活性画分のタンパク質量は約200μg
    であった。 また、全活性は5700nmol/時間であり、タンパク質当たりの比活性は約28μmol/時間/mgであった。 この活性画分は、後述するように電気泳動上で分子量約90kDa〜100kDaの単一バンドを示すタンパク質のみを含んでいた。 得られた精製酵素標品の比活性は、粗抽出液の約2000倍であり、H
    iTrapQによる強塩基性陰イオン交換クロマトグラフィー後の酵素量に対する回収率は12%であった。 精製の結果を表1にまとめた。

    【0102】

    【表1】 表1 ─────────────────────────────────── 全タンパク質 全活性 比活性 収率 mg nmol/h nmol/h/mg % ─────────────────────────────────── 粗抽出液 1915 20700 11 − HiTrapQ 1092 48800 45 100 DEAE-TOYOPERAL 540 33000 61 68 Superdex 200pg 1.79 26500 14800 54 ハイト゛ロキシアハ゜タイトクロマトク゛ラフィー(1) 0.51 12600 24700 26 ハイト゛ロキシアハ゜タイトクロマトク゛ラフィー(2) 0.20 5700 28500 12 ───────────────────────────────────

    【0103】

    【実施例2】 ラフィノース合成酵素の特性の検討 実施例1で得られた精製ラフィノース合成酵素の特性を検討した。

    【0104】<1>分子量測定 (1)ゲルろ過クロマトグラフィー 精製ラフィノース合成酵素を10μlとり、この試料および分子量マーカー(ゲル濾過用分子量マーカーキット:ファルマシア社製)をゲルろ過クロマトグラフィーカラム(Superdex 200pg;ファルマシア社製)に供した。 カラムの平衡化と溶出は、緩衝液6
    (20mM トリス塩酸緩衝液(pH7.0)、0.1M
    NaCl、5mM DTT、0.02% Tween 2
    0)を用いて行った。 その結果、ラフィノース合成酵素の分子量は、約75kDa〜95kDaと推定された。

    【0105】(2)ポリアクリルアミドゲル電気泳動(Native PAGE) 精製ラフィノース合成酵素を10μlとり、同量のサンプル緩衝液(0.0625M トリス−塩酸(pH6.
    8)、15%グリセロール、0.001%BPB)を加え、電気泳動サンプルとした。 このサンプル10μlを10%ポリアクリルアミドゲル(第一化学薬品製、マルチゲル10)に供し、0.025M トリス−0.19
    2M グリシン緩衝液(pH8.4)で40mA、約60
    分泳動した。 泳動後、シルベストステイン銀染色キット(ナカライテスク社製)にて染色した。 その結果、分子量は約90kDa〜100kDaと推定された。

    【0106】(3)SDS−ポリアクリルアミドゲル電気泳動(SDS−PAGE) 精製ラフィノース合成酵素を10μlとり、同量のサンプル緩衝液(0.0625M トリス−塩酸(pH6.
    8)、2% SDS、10%グリセロール、5%メルカプトエタノール、0.001%BPB)を加え沸騰浴中で1分間加熱し、電気泳動サンプルとした。 このサンプル10μlを10〜20%グラジエントポリアクリルアミドゲル(第一化学薬品製)に供し、0.1%SDSを含む0.025M トリス−0.192M グリシン緩衝液(pH8.4)で40mA、約70分泳動した。 泳動後、シルベストステイン銀染色キット(ナカライテスク社製)にて染色した。 結果を図2に示す。 その結果、分子量は約90kDa〜100kDaと推定された。

    【0107】<2>反応至適温度 前記のラフィノース合成酵素活性測定法にしたがって、
    種々の温度条件下(28℃、32℃、36℃、40℃、
    44℃、48℃、52℃)でラフィノース合成酵素活性を測定した。 各反応液に加えた酵素液は、2μlとした。 32℃での酵素活性を100としたときの各温度での相対活性を図3に示す。 その結果、ラフィノース合成酵素は、約25〜42゜Cにわたる範囲で活性を示し、
    反応至適温度は、35〜40℃付近であった。

    【0108】<3>至適反応pH 前記のラフィノース合成酵素活性測定法にしたがって、
    種々のpH条件下(pH4〜11)でラフィノース合成酵素活性を測定した。 各反応には、50mMクエン酸緩衝液(pH4〜6)、50mM リン酸カリウム緩衝液(pH5.5〜7.5)、50mM ビス−トリス緩衝液(pH6〜7)、20mM トリス−塩酸緩衝液(p
    H7〜8.5)、50mM グリシン−NaOH緩衝液(pH9〜11)を用いた。 また、各反応液に加えた酵素液は、2μlとした。 結果を図4に示す。

    【0109】その結果、ラフィノース合成酵素はpH5
    〜10の範囲で活性を示し、反応至適pHは、用いた緩衝液の種類によっても異なるが、6〜8付近であった。

    【0110】<4>阻害剤及び金属イオンの検討 精製ラフィノース合成酵素の反応液に、各種の酵素阻害剤又は金属イオンを終濃度で1mMとなるように添加し、ラフィノース合成酵素活性を前記と同様にして測定した。 阻害剤又は金属イオンを添加しない場合の酵素活性に対する残存活性を表2に示す。 ヨードアセトアミドは酵素活性を顕著に阻害し、N−エチルマレイミドも阻害効果を示した。 また、CaCl 2 、CuCl 2 、MgC
    2は阻害効果がほとんど認められなかったが、MnC
    2 、ZnCl 2 、NiCl 2は阻害効果を示した。

    【0111】

    【表2】

    【0112】<5>ミオイノシトールによる阻害 ラフィノース合成反応の反応生成物であるミオイノシトールによる阻害を調べた。 各種濃度のミオイノシトールを反応液に添加し、ラフィノース合成酵素活性を測定した。 結果を図5に示す。 添加したミオイノシトールの濃度とともに酵素活性は阻害された。

    【0113】<6>安定pH 50mM ビストリス塩酸緩衝液(pH5〜8、0.5
    mM DTTを含む)、又は20mM トリス−塩酸緩衝液(pH7〜8、0.5mM DTTを含む)中で、前記陰イオン交換クロマトグラフィー(2)で得られたラフィノース合成酵素画分を4時間、4℃にてインキュベートした後、ラフィノース合成酵素活性を測定した。 インキュベートに用いた緩衝液のpHに対する酵素活性を図6に示す。 いずれのインキュベート条件においてもラフィノース合成活性が認められ、特にpH5〜7.5の範囲で安定であった。

    【0114】<7>安定温度 20mM トリス−塩酸緩衝液(pH7、5mM DTT
    を含む)にて、前記陰イオン交換クロマトグラフィー(2)で得られたラフィノース合成酵素画分を28℃、
    32℃、37℃又は40℃で60分インキュベートした後、ラフィノース合成酵素活性を測定した。 その結果、
    本酵素は、28℃〜40℃の範囲で前記インキュベート処理を行わなかった対照区と比較して80%〜100%
    の活性を有し、安定であった。

    【0115】<8>アミノ酸配列の解析 精製ラフィノース合成酵素のシステイン残基を還元ピリジルエチル化し、脱塩した。 これをリジルエンドペプチダーゼ(Achromobacter protease 1、和光純薬工業社製)にて37℃、12時間消化し、ペプチド断片化した。 得られたペプチド混合液を逆相HPLC(カラム:
    ウォーターズ μBondasphere(φ2.1×150 mm、C 18 、300
    )、ウォーターズ社製(ミリポア社))に供し、各ペプチド断片を分離取得した。 溶媒には0.1%TFA(トリフルオロ酢酸)を用い、アセトニトリルの濃度勾配により溶出を行った。 取得したペプチド断片のうち、3つの断片について、アミノ酸配列をプロテインシークエンーサーにより決定した。 決定された各ペプチドのアミノ酸配列を配列表配列番号1〜3に示す。 以下、これらのペプチドを、それぞれ順にペプチド1、2、及び3という。

    【0116】

    【実施例3】 キュウリ由来ラフィノース合成酵素をコードするDNAの取得 <1>PCR法によるラフィノース合成酵素cDNAの部分断片の単離 キュウリの主葉脈22gを液体窒素中で乳鉢を用いて磨砕した。 この磨砕物を、80℃に余熱した抽出バッファー(100mM塩化リチウム、100mMトリス−塩酸
    (pH8.0)、10mM EDTA、1%SDS)と等量のフェノールを混合したものに加え、撹拌後、フェノールと等量のクロロホルム:イソアミルアルコール(2
    4:1)を加え、再び撹拌を行い、この混合液を4℃で9250×g、15分間遠心処理し、上清を採取した。
    この上清に対して繰り返しフェノール処理、クロロホルム:イソアミルアルコール処理を行い、遠心上清を得た。 この上清に等量の4M塩化リチウムを加え、−70
    ℃で1時間静置した。

    【0117】室温にて解凍後、4℃で9250×g、3
    0分間遠心処理し沈殿を得た。 この沈殿を2M塩化リチウム、80%エタノールにより1回ずつ洗浄し、乾燥後2mlのジエチルピロカーボネート処理水に溶解し、精製全RNAとした。 得られた全RNAは2.38mgであった。

    【0118】この全RNA全量を、オリゴ(dT)セルロースカラムを用いたpoly(A) + RNA精製キット(STRATAGENE CLONING SYST
    EMS社製)に供し、poly(A) + RNA分子を精製し、42.5μgのpoly(A) + RNAを得た。

    【0119】上記のようにして得られたpoly(A)
    + RNAから逆転写酵素SuperScriptII
    (GIBCO BRL社製)を用いて一本鎖cDNAを合成した。 このcDNA混合物からラフィノース合成酵素cDNAを単離するために、PCR法による増幅を行った。 PCRに用いるプライマーは、実施例2で決定したキュウリ由来のラフィノース合成酵素のペプチド断片のアミノ酸配列から、図7に示す一本鎖オリゴヌクレオチド(配列番号6〜22)を合成した。 各プライマーの配列において、RはA又はGを、YはC又はTを、MはA又はCを、KはG又はTを、DはG、A又はTを、H
    はA、T又はCを、BはG、T又はCを、NはG、A、
    T若しくはC、又はイノシン(塩基はヒポキサンチン)
    を、それぞれ表す。

    【0120】プライマーとして、5'側プライマーにA
    (A1(配列番号6)、A2(配列番号7)、A3(配列番号8)、A4(配列番号9))、3'側プライマーにD'(D'1(配列番号21)、D'2(配列番号2
    2))の組み合わせと、5'側プライマーにC2(配列番号14))、及び3'プライマーにB'1(配列番号18)、あるいはB'2(配列番号19)を用いたときに、約540塩基対のDNAが増幅された。 この断片をTAクローニングキット(INVITROGENBV社製)を用いてプラスミドpCRIIにクローニングし、
    塩基配列を解析したところ、両末端のプライマー配列の内側にペプチド1、2のアミノ酸配列をコードしている塩基配列が存在し、前記増幅断片はラフィノース合成酵素遺伝子に由来するDNA断片であることがわかった。

    【0121】さらに、クローニングした上記PCR増幅DNA断片のラフィノース合成酵素遺伝子上での位置を特定するために、RACEキット(3'Ampifin
    der RACE Kit(CLONTECH社製))
    を用いて、3'RACEを行った。

    【0122】前記cDNA混合物を鋳型に、5'側プライマーにC(C1(配列番号13)、C2(配列番号1
    4))、3'側プライマーにはオリゴ(dT)とアンカー配列を有するプライマーを用いてPCRを行い、さらにこうして得られた増幅断片を鋳型に、Cより内側に位置するD(D1(配列番号15)、D2(配列番号16))
    を5'側プライマーに、3'側プライマーにはオリゴ(dT)−アンカープライマーを用いてPCRを行った。 その結果、C1(配列番号13)、C2(配列番号14)とオリゴ(dT)−アンカープライマーで増幅したDNAを鋳型に、D2(配列番号16)とオリゴ(d
    T)−アンカープライマーでPCRを行ったときのみ、
    約2400塩基対のDNA断片が増幅した。 また、5'
    側プライマーにC(C1(配列番号13)、C2(配列番号14))、3'側プライマーにはオリゴ(dT)−アンカープライマーを用いてPCRを行い、さらにこうして得られた増幅断片を鋳型に、5'側プライマーにE
    (配列番号17)、3'側プライマーにはオリゴ(d
    T)−アンカープライマーを用いてPCRを行った。 その結果、いずれの場合も、約300塩基対のDNA断片を増幅した。

    【0123】同様に、前記cDNA混合物を鋳型に、
    5'側プライマーにA(A1(配列番号6)、A2(配列番号7)、A3(配列番号8)あるいはA4(配列番号9))、3'側プライマーにはオリゴ(dT)とアンカー配列を有するプライマーを用いてPCRを行い、さらにこうして得られた増幅断片を鋳型に、Aより内側に位置するB(B1(配列番号10)、B2(配列番号11)あるいはB3(配列番号12))、3'側に同じオリゴ(d
    T)−アンカープライマーを用いてPCRを行った。 その結果、Aのいずれのプライマーを用いたときも、B2
    プライマーを用いたときに約2000塩基対のDNA断片を得た。 そこで、A2、B2プライマーを用いて増幅したDNA断片をクローニングした。 塩基配列を解析したところ、5'側にプライマー作成に用いたペプチド断片1のアミノ酸配列をコードする塩基配列が存在した。
    また、3'側にはpoly(A)配列と、その上流にペプチド断片3に対応する塩基配列が存在した。

    【0124】先のPCRの結果と合わせると、ラフィノース合成酵素ペプチド断片は、そのN末端側から2、
    1、3の順に並んでおり、先にPCRによって得られた約540塩基対のDNA断片は、ラフィノース合成酵素遺伝子上の5'末端に近い部分であることがわかった。
    ラフィノース合成遺伝子全長を含むcDNAクローンをスクリーニングするためには、プローブとするDNAが5'末端側に近い部分を検出できることが望ましいため、このDNA断片をプローブとしてcDNAライブラリーのスクリーニングに使用した。

    【0125】<2>ラフィノース合成酵素cDNAのコード領域全長のクローニング まず、以下のようにしてcDNAライブラリーを作製した。 <1>で得られたpoly(A) + RNA 3.8
    μgからTime Saver cDNA合成キット(Pharmacia Biotech社製)を用いて、2本鎖cDNAを合成した。 得られたcDNAを、
    λファージベクターλMOSSlox(Amersha
    m社製)のEcoRI制限酵素切断部位に組み込んだ後、GigapackII Goldパッケージングキット(STRATAGENE CLONING SYST
    EMS社製)を用いて、ファージタンパク質中に取り込ませ、キュウリのcDNAライブラリーを調製した。 なお、本ライブラリーのタイターは1.46×10 7 pf
    u/μgベクターであった。

    【0126】上記のキュウリのcDNAライブラリーから1.4×10 5 pfuに相当するファージを宿主細胞エシェリヒア・コリ ER1647に感染させた後、直径90mmの寒天プレート14枚に、プレートあたり1.0×10 4 pfuとなるように蒔いた。 これを37
    ℃で約6.5時間培養した後、プレート上に形成されたファージプラークをナイロンメンブレン(Amersh
    am社製Hybond−N+)に転写した。

    【0127】次に、上記ナイロンメンブレンを、アルカリで処理して転写されたDNAを変性させ、中和した後に洗浄した。 その後、このナイロンメンブレンを80℃
    で2時間処理することでDNAをメンブレン上に固定した。

    【0128】得られたナイロンメンブレンに対し、<1
    >で得た約540塩基対のDNA断片をプローブに用い、陽性クローンのスクリーニングを行った。 上記の約540塩基対のDNA断片を、制限酵素EcoRIで消化後に電気泳動し、約540塩基対のインサートのみを切り出して精製したものを、DNAラベル・検出システム(Gene Images ラベリング・検出システム(Amersham社製))を用いてフルオレセインラベルし、プローブとした。 前記のナイロンメンブレンを60℃で30分間、プレハイブリダイゼーションを行い、次いでラベルしたプローブを加えて60℃で16時間のハイブリダイゼーションを行った。 ラベルされたD
    NAを検出するための抗体(アルカリフォスファターゼ標識抗フルオレセイン抗体)は、50000倍に希釈して用いた。 このスクリーニングにおいて陽性クローンの候補株を得た。 得られた候補株について上記と同様にしてスクリーニングをさらに2回繰返し、純化した陽性クローンを取得した。

    【0129】上記の陽性クローンをエシェリヒア・コリBM25.8に感染させ、カルベニシリンを含む選択培地上で培養することで、cDNAを含むプラスミドベクターpMOSSlox−CRSを切り出した。 このプラスミドの挿入cDNAの長さは約2.5kbであった。
    さらにこのプラスミドで腸菌JM109を形質転換し、
    形質転換体からプラスミドDNAを調製し、これを塩基配列を解析するための試料とした。

    【0130】挿入cDNAの塩基配列の解析にはTaq
    DyeDeoxy Terminator Cycl
    e Sequencing Kit(Perkin−E
    lmer社製)を用いる従来公知の方法で行った。

    【0131】その結果、配列表の配列番号4に示す23
    52塩基対よりなる塩基配列が明らかとなった。 この配列中には、本発明者らが用いたDNAプローブの塩基配列と一致する部分が存在した。 また、塩基配列から翻訳されるアミノ酸配列を配列番号4及び配列番号5に示した。 このアミノ酸配列中には、本発明者らが得たキュウリ由来のラフィノースシンターゼのペプチド1(配列番号5中、アミノ酸番号215〜244)、2(配列番号5中、アミノ酸番号61〜79)及び3(配列番号5
    中、アミノ酸番号756〜769)と一致する部分が存在し、ラフィノース合成酵素をコードすることが確認された。

    【0132】上記のようにして得られたラフィノース合成酵素をコードするDNAを含むプラスミドpMoss
    loxCRSを保持するエシェリヒア・コリJM109
    の形質転換体AJ13263は、平成8年11月19日より、通商産業省工業技術院生命工学工業技術研究所(郵便番号305 日本国茨城県つくば市東一丁目1番3号)にブダペスト条約に基づき国際寄託されており、
    受託番号FERM BP−5748が付与されている。

    【0133】

    【実施例4】 ダイズ由来ラフィノース合成酵素をコードするDNAの取得 <1>ダイズ由来ラフィノース合成酵素遺伝子クローニングのためのプローブの検索 キュウリ由来ラフィノース合成酵素遺伝子全長をプローブとして用いて、ダイズ全RNAに対しノーザンハイブリダイゼーションを行った。 プローブは、キュウリ由来ラフィノース合成酵素遺伝子を含むDNA断片を、実施例3で得られたプラスミドpMossloxCRSを制限酵素NotIで消化し、アガロースゲル電気泳動に付し、挿入断片を単離し、単離したDNA断片をα−P 32
    dCTPにてラベルすることによって得た。 全RNAとしてはダイズ未熟種子(開花後5〜6週間)よりSDS
    −フェノール法にて調製した全RNA30μgを用いた。 30分間のプレハイブリダイゼーションの後、プローブを加えて42℃、一晩、ハイブリダイゼーションを行った。 1×SSC、0.1%SDS、60℃の条件で洗浄した。 コントロールのキュウリ由来ラフィノース合成酵素のシグナルは認められたが、ダイズ由来RNAに対してははっきりしたシグナルが得られなかった。 キュウリ全長をプローブにするよりも、より保存された領域をプローブにすることが望ましいと判断した。

    【0134】<2>シロイヌナズナのラフィノース合成酵素遺伝子の部分断片の単離 シロイヌナズナの開花後17〜20日の莢125mgを液体窒素中で乳鉢を用いて磨砕した。 この磨砕物に3m
    lの2×CTAB(2%セチルトリメチルアンモニウム ブロマイド、0.1M トリス塩酸緩衝液(pH9.
    5)、1.4MNaCl、0.5% メルカプトエタノール)を加え拡散させ、65℃で10分間振盪した。 これをファルコンチューブのブルーマックス(50ml)
    に移し、3mlのクロロホルム:イソアミルアルコール(24:1(v/v))を加え穏やかに混和し、12000
    rpmで10分間遠心した。 上清を3mlのクロロホルム:イソアミルアルコール(24:1(v/v))にて再度抽出し、10000rpmで25分間遠心した。 遠心上清1.8mlに対し、1.5mlのイソアミルアルコールを加え混和し、12000rpmで15分間、4℃にて遠心し沈殿を得た。 沈殿を70%エタノールで洗浄し沈殿を乾燥し、1mlのTE緩衝液に溶解した。 4分の1量の10M 塩化リチウム溶液を加えて混和し氷中で4時間静置し12000rpmで15分間、4℃にて遠心した。 沈殿を2M 塩化リチウム、70%エタノールにて洗浄し、乾燥後、100μlのTE緩衝液に溶解した。 フェノール:クロロホルム(1:1(v/v))を加え攪拌し、12000rpmで15分間、4℃にて遠心し、水層を得た。 この水層をエタノール沈殿に付し、沈殿を70%エタノールで洗浄後、乾燥し、10μlのジエチルピロカーボネート処理水に溶解し全RNAとした。 得られた全RNAは18.7μgであった。 この全RNAから逆転写酵素SuperScriptII(GI
    BCO BRL社製)を用いて一本鎖cDNAを合成した。

    【0135】このcDNA混合物からラフィノース合成酵素遺伝子部分断片をPCRにより増幅させるためにプライマーを合成した。 プライマーは、キュウリ由来ラフィノース合成酵素遺伝子と相同性を有するDNAをジーンバンクより検索し、保存されている領域より一本鎖オリゴヌクレオチド(配列番号25、26)として合成した。 先の一本鎖cDNAを鋳型にして、このプライマーによりPCRを行ったところ、約250塩基対のDNA
    断片が増幅された。 この断片をTAクローニングキット(INVITROGEN BV社製)を用いてプラスミドpCR2.1にクローニングし塩基配列を解析したところ、配列番号27に示す塩基配列が得られた。 キュウリ由来ラフィノース合成酵素と相同性を有するシロイヌナズナ由来ラフィノース合成酵素cDNA部分断片が得られたと認められた。

    【0136】<3>ダイズ由来ラフィノース合成酵素c
    DNAのクローニング ダイズの開花後5〜6週間の種子4.5gを液体窒素中で乳鉢にて磨砕した。 磨砕物より、SDS−フェノール法にて1.3mgの全RNAを抽出した。 抽出物をオリゴdTセルロースカラム(poly(A) + RNA精製キット:STRATAGENE CLONING SYS
    TEMS社製)に供し、約6μgのpoly(A) +
    NAを単離した。 このうち約2μgのpoly(A) +
    RNAからTimeSaver cDNA合成キット(Pharmacia biotech社製)にて、オリゴdTプライマーにより二本鎖cDNAを合成した。
    得られたcDNAをλファージベクターλMOSSlo
    x(Amersham社製)のEcoRI制限酵素切断部位に組み込んだ後、Gigapack III Gold
    パッケージングキット(STRATAGENE CLO
    NING SYSTEMS社製)を用いてファージ粒子中に取り込ませダイズのcDNAライブラリーを調製した。 なお、本ライブラリーのタイターは1.42×10
    7 pfu/μgベクターDNAであった。

    【0137】ダイズcDNAライブラリーから1.5×
    10 5 pfuに相当するファージを、キュウリcDNA
    ライブラリーと同様に、ナイロンメンブレン(Hybo
    nd−N + ;Amersham社製)に転写し固定した。 1枚のプレートに対し、2枚のメンブレンを転写し2セットを用意した。 得られたメンブレンに対し、<2
    >で得られたシロイヌナズナ由来ラフィノース合成酵素cDNA遺伝子部分断片を用いてスクリーニングを行った。 このDNA断片は、Gene Imagesラベリング検出システム(Amersham社製)を用いてフルオレセインラベルしプローブとした。 ハイブリダイゼーション及び検出は、キュウリcDNAライブラリースクリーニングと同様に行った。 ただし、メンブランの洗浄は、1セットを1×SSC、0.1%SDSで、1セットを0.1×SSC、0.1%SDSで60℃にて行った。 両条件下で陽性のクローンの候補株を15個得、
    候補株について上記と同様にスクリーニングをさらに1
    回繰り返し純化したクローン5株を取得した。

    【0138】上記陽性クローンをE. coli BM2
    5.8に感染させ、cDNAを含むプラスミドを切り出した。 さらに、このプラスミドで、E. coli JM
    109を形質転換し、形質転換体よりプラスミドDNA
    を調製し塩基配列解析試料とした。 塩基配列解析はキュウリ由来ラフィノース合成酵素遺伝子と同様に行った。
    5クローンのうちの一つであるpMOSSloxSRS
    は、塩基配列解析より、ダイズ由来ラフィノース合成酵素遺伝子全長を含むことが確認された。

    【0139】pMOSSloxSRSの挿入断片は、配列番号23に示す2780塩基対よりなる配列を有しており、750アミノ酸からなるラフィノース合成酵素をコードしていた。 他のクローンの挿入断片は、pMOS
    SloxSRSのものより短くラフィノース合成酵素遺伝子の5'側を欠失していた。

    【0140】上記のようにして得られたラフィノース合成酵素をコードするDNAを含むDNA断片を含むプラスミドpMOSSloxSRSを保持するエシェリヒア・コリJM109の形質転換体AJ13379は、平成9年10月20日から、通商産業省工業技術院生命工学工業技術研究所(郵便番号305 日本国茨城県つくば市東一丁目1番3号)にブタペスト条約に基づき国際寄託されており、受託番号FERM BP−6149が付与されている。

    【0141】

    【実施例5】 ラフィノース合成酵素をコードするDN
    Aを含むキメラ遺伝子及び形質転換植物 <1>キメラ遺伝子を含むプラスミドの構築 アグロバクテリウムとしてLBA4404、バイナリーベクターとしてpBI121(CLONTECH社)を用いて、シロイヌナズナにラフィノース合成酵素のDN
    A断片を導入した。 pBI121は、pBIN19由来のプラスミドであり、ノパリン合成酵素遺伝子プロモーター、ネオマイシンホスホトランスフェラーゼ構造遺伝子(NPTII)、ノパリン合成酵素遺伝子ターミネーター(Nos−ter)、CaMV 35Sプロモーター、GUS(β−グルクロニダーゼ)遺伝子、及びNo
    s−terが接続し、これらの両側に植物への移行が可能な配列を有する。 CaMV 35Sプロモーターの下流にはSmaI部位があり、この部位に挿入されたインサートは該プロモーターの制御下で発現する。

    【0142】バイナリーベクターpBI121に、実施例3で得られたキュウリ由来ラフィノース合成酵素遺伝子断片を挿入した。 ラフィノース合成酵素遺伝子をDr
    aI消化し、配列表配列番号4において1382番目から2529番目までの塩基を含むDNA断片をアガロースゲル電気泳動により調製した。 この断片をpBI12
    1のSmaIサイトにライゲーションした。 このライゲーション反応液を用いてエシェリヒア・コリHB101
    を形質転換し、形質転換株から組換えプラスミドを調製した。 得られた組換えプラスミドのうち、CaMV 3
    5Sプロモーターにラフィノース合成酵素DNA断片が逆向きに接続したもの(アンチセンス)、正の向きに接続したもの(センス)ものを2種選択し、それぞれ、p
    BIcRS1及びpBIcRS9と命名した。

    【0143】また、ラフィノース合成酵素を発現させるキメラ遺伝子を含むプラスミドを構築した。 ラフィノース合成酵素遺伝子を含むpMOSSloxCRSをNo
    tI消化し、ラフィノース合成酵素遺伝子断片をアガロースゲル電気泳動により調製した。 このDNA断片のN
    otI切断部位をdNTPを用いたTaqポリメラーゼ反応によってフィルインし、3'側にA塩基を突出させたCRS断片を得た。 一方、pBI121はSmaI消化し、アガロースゲル電気泳動にて直鎖状のDNAを精製し、dTTPを用いてTaqポリメラーゼ反応により、3'側にT塩基を付加させたpBI121/Sma
    Iを得た。 精製した後、CRS断片をpBI121/S
    maIにライゲーションした。 このライゲーション反応液を用いてエシェリヒア・コリHB101を形質転換した。 得られた形質転換株よりプラスミドDNAを調製し、これを制限酵素EcoRI、BamHI、XhoI
    のそれぞれ、及び、組み合わせによる消化を行った。 得られた断片の分子量をアガロース電気泳動で測定し、物理的地図を作成した。 作成した物理的地図から、組換えプラスミドのうち、CaMV 35Sプロモーターに対し、ラフィノース合成酵素遺伝子が正方向に接続したものを選び、pBIsRS1と名付けた。

    【0144】上記のようにして得られたプラスミドを、
    これらを含むシェリヒア・コリHB101とアグロバクテリウムLBA4404をトリペアレンタルメイティングすることによりアグロバクテリウムLBA4404に導入した。

    【0145】<2>形質転換 シロイヌナズナの形質転換は以下のように行った。 シロイヌナズナ(Arabidopsis thalian
    a)の種子は、吸水処理後、1%Tween20を含む80%エタノールにて5分間、同じく1%Tween2
    0を含む10%次亜塩素酸ナトリウムで10分間処理し、滅菌水で5回洗浄して殺菌した。 これを、1%低融点アガロースに懸濁し、MS培地(MS基本培地(Muras
    hige and Skoog, Physiologia Plantrum, 15, 473-497
    (1962))、B5ビタミン、10g/L スクロース 0.
    5g/L MES、pH5.8)にまいた。 これを、2
    2℃、16時間光照射、8時間暗期の培養室にて1週間培養し、双葉が展開したものをロックウールに定植した。 同条件で培養を続け、約3週間後、植物が抽台し、
    茎の高さが数cmになったところで摘心をした。 摘心後1週間し、伸長した側枝の最初の花が開花した状態まで生育させた。

    【0146】ラフィノース合成酵素遺伝子を含む組換えプラスミドを導入したアグロバクテリウムの前培養を2
    mlのLB培地で行った。 これを、50mg/Lカナマイシン、25mg/Lストレプトマイシン含有のLB培地に接種し28℃で、約1日培養した。 室温で集菌し、
    浸潤用懸濁培地(1/2MS塩、1/2ガンボルグ(Gam
    borg)B5ビタミン、5%スクロース、0.5g/L M
    ES、pH5.7(KOH)、使用直前にベンジルアミノプリンを最終濃度0.044μM、またシルウェット
    (SilwetL77)を1L当たり200μl(最終濃度0.02%)加える)に菌液のOD 600が0.8になるように懸濁した。

    【0147】浸潤を行う植物より開花結実している花を取り除いた。 ロックウールを逆さにして、前記アグロバクテリウム懸濁液に結実していない花を漬け、デシケータに入れて、40mmHGで15分間減圧した。 2から4週間で、種子を集めた。 収穫した種子は、デシケータで保存した。

    【0148】つぎに、選抜培地にて、形質転換体を選抜した。 先に述ベたように種子を殺菌し、選抜培地(MS
    塩、ガンボルグB5ビタミン、1%スクロース、0.5
    g/L MES、pH5.8、0.8%寒天;オートクレーブ後、選択用抗生物質、カルベニシリン(最終濃度100mg/L、カナマイシン(最終濃度50mg/
    L)を加える)にて22℃で培養し、耐性植物を選抜した。 耐性植物は新しい培地に移し、本葉が展開するまで育てた。 ここの植物から種子を収穫した。 同様の選抜を繰り返し、T3種子を獲得した。 T3種子について、先に述ベた方法によりラフィノース含量を定量した。 結果を3に示す。

    【0149】

    【表3】 表3 ─────────────────────────────── 植物(プラスミド) ラフィノース含量(mg/g) ─────────────────────────────── 野生株 0.20 形質転換体(pBIcRS1) 0.00 形質転換体(pBIcRS9) 0.00 形質転換体(pBIsRS1) 0.22 ───────────────────────────────

    【0150】

    【発明の効果】本発明により、精製されたラフィノース合成酵素、ラフィノース合成酵素遺伝子、ラフィノース合成酵素遺伝子と植物で発現可能な制御領域を有するキメラ遺伝子、及びこのキメラ遺伝子が導入された植物が提供される。

    【0151】本発明のラフィノース合成酵素を用いることにより、スクロース及びガラクチノールから効率よくラフィノースを合成することができる。 また、本発明のラフィノース合成酵素遺伝子又はキメラ遺伝子を利用することにより、植物のラフィノース族オリゴ糖含量を変化させることができる。

    【0152】

    【配列表】

    配列番号:1 配列の長さ:30 配列の型:アミノ酸 トポロジー:直鎖状 配列の種類:ペプチド フラグメント型:中間部ペプチド 配列 Phe Gly Trp Cys Thr Trp Asp Ala Phe Tyr Leu Thr Val His Pro Gln 1 5 10 15 Gly Val Ile Glu Gly Val Arg His Leu Val Asp Gly Gly Cys 20 25 30

    【0153】配列番号:2 配列の長さ:19 配列の型:アミノ酸 トポロジー:直鎖状 配列の種類:ペプチド フラグメント型:中間部ペプチド 配列 Pro Val Ser Val Gly Cys Phe Val Gly Phe Asp Ala Ser Glu Pro Asp 1 5 10 15 Ser Arg His

    【0154】配列番号:3 配列の長さ:14 配列の型:アミノ酸 トポロジー:直鎖状 配列の種類:ペプチド フラグメント型:中間部ペプチド 配列 Tyr Asp Gln Asp Gln Met Val Val Val Gln Val Pro Trp Pro 1 5 10

    【0155】配列番号:4 配列の長さ:2569 配列の型:核酸 鎖の数:二本鎖 トポロジー:直鎖状 配列の種類:cDNA to mRNA 起源 生物名:キュウリ(Cucumis sativus) 配列の特徴 特徴を表す記号:CDS 存在位置:56..2407 配列 AAAAAACAAC CCTTCTTTTA GTTTTTTGGG TTTGTTTCTT CTTTTCTTCT CACAA ATG 58 Met 1 GCT CCT AGT TTT AAA AAT GGT GGC TCC AAC GTA GTT TCA TTT GAT GGC 106 Ala Pro Ser Phe Lys Asn Gly Gly Ser Asn Val Val Ser Phe Asp Gly 5 10 15 TTA AAT GAC ATG TCG TCA CCG TTT GCA ATC GAC GGA TCG GAT TTC ACT 154 Leu Asn Asp Met Ser Ser Pro Phe Ala Ile Asp Gly Ser Asp Phe Thr 20 25 30 GTG AAC GGT CAT TCG TTT CTG TCC GAT GTT CCT GAG AAC ATT GTT GCT 202 Val Asn Gly His Ser Phe Leu Ser Asp Val Pro Glu Asn Ile Val Ala 35 40 45 TCT CCT TCT CCG TAC ACT TCG ATA GAC AAG TCC CCG GTT TCG GTT GGT 250 Ser Pro Ser Pro Tyr Thr Ser Ile Asp Lys Ser Pro Val Ser Val Gly 50 55 60 65 TGC TTT GTT GGA TTC GAC GCG TCG GAA CCT GAT AGC CGA CAT GTT GTT 298 Cys Phe Val Gly Phe Asp Ala Ser Glu Pro Asp Ser Arg His Val Val 70 75 80 TCG ATT GGG AAG CTG AAG GAT ATT CGG TTT ATG AGT ATT TTC AGG TTT 346 Ser Ile Gly Lys Leu Lys Asp Ile Arg Phe Met Ser Ile Phe Arg Phe 85 90 95 AAG GTT TGG TGG ACT ACA CAC TGG GTT GGT CGA AAT GGT GGG GAT CTT 394 Lys Val Trp Trp Thr Thr His Trp Val Gly Arg Asn Gly Gly Asp Leu 100 105 110 GAA TCG GAG ACT CAG ATT GTG ATC CTT GAG AAG TCA GAT TCT GGT CGA 442 Glu Ser Glu Thr Gln Ile Val Ile Leu Glu Lys Ser Asp Ser Gly Arg 115 120 125 CCG TAT GTT TTC CTT CTT CCG ATC GTT GAG GGA CCG TTC CGA ACC TCG 490 Pro Tyr Val Phe Leu Leu Pro Ile Val Glu Gly Pro Phe Arg Thr Ser 130 135 140 145 ATT CAG CCT GGG GAT GAT GAC TTT GTC GAT GTT TGT GTC GAG AGT GGT 538 Ile Gln Pro Gly Asp Asp Asp Phe Val Asp Val Cys Val Glu Ser Gly 150 155 160 TCG TCG AAA GTT GTT GAT GCA TCG TTC CGA AGT ATG TTG TAT CTT CAT 586 Ser Ser Lys Val Val Asp Ala Ser Phe Arg Ser Met Leu Tyr Leu His 165 170 175 GCT GGT GAT GAT CCG TTT GCA CTT GTT AAA GAG GCG ATG AAG ATC GTG 634 Ala Gly Asp Asp Pro Phe Ala Leu Val Lys Glu Ala Met Lys Ile Val 180 185 190 AGG ACC CAT CTT GGA ACT TTT CGC TTG TTG GAG GAG AAG ACT CCA CCA 682 Arg Thr His Leu Gly Thr Phe Arg Leu Leu Glu Glu Lys Thr Pro Pro 195 200 205 GGT ATC GTG GAC AAA TTC GGT TGG TGC ACG TGG GAC GCG TTT TAC CTA 730 Gly Ile Val Asp Lys Phe Gly Trp Cys Thr Trp Asp Ala Phe Tyr Leu 210 215 220 225 ACG GTT CAT CCA CAG GGC GTA ATA GAA GGC GTG AGG CAT CTC GTC GAC 778 Thr Val His Pro Gln Gly Val Ile Glu Gly Val Arg His Leu Val Asp 230 235 240 GGC GGT TGT CCT CCC GGT TTA GTC CTA ATC GAC GAT GGT TGG CAA TCC 826 Gly Gly Cys Pro Pro Gly Leu Val Leu Ile Asp Asp Gly Trp Gln Ser 245 250 255 ATC GGA CAC GAT TCG GAT CCC ATC ACC AAA GAA GGA ATG AAC CAA ACC 874 Ile Gly His Asp Ser Asp Pro Ile Thr Lys Glu Gly Met Asn Gln Thr 260 265 270 GTC GCC GGC GAG CAA ATG CCC TGC CGT CTT TTG AAA TTC CAA GAG AAT 922 Val Ala Gly Glu Gln Met Pro Cys Arg Leu Leu Lys Phe Gln Glu Asn 275 280 285 TAC AAA TTC CGT GAC TAC GTC AAT CCC AAG GCC ACC GGC CCC CGA GCC 970 Tyr Lys Phe Arg Asp Tyr Val Asn Pro Lys Ala Thr Gly Pro Arg Ala 290 295 300 305 GGC CAG AAG GGG ATG AAG GCG TTT ATA GAT GAA CTC AAA GGA GAG TTT 1018 Gly Gln Lys Gly Met Lys Ala Phe Ile Asp Glu Leu Lys Gly Glu Phe 310 315 320 AAG ACT GTG GAG CAT GTT TAT GTT TGG CAT GCT TTG TGT GGA TAT TGG 1066 Lys Thr Val Glu His Val Tyr Val Trp His Ala Leu Cys Gly Tyr Trp 325 330 335 GGT GGC CTT CGC CCG CAG GTG CCT GGC TTG CCT GAG GCA CGT GTG ATT 1114 Gly Gly Leu Arg Pro Gln Val Pro Gly Leu Pro Glu Ala Arg Val Ile 340 345 350 CAG CCA GTG CTT TCA CCA GGG CTG CAG ATG ACG ATG GAG GAT TTG GCG 1162 Gln Pro Val Leu Ser Pro Gly Leu Gln Met Thr Met Glu Asp Leu Ala 355 360 365 GTG GAT AAG ATT GTT CTT CAT AAG GTC GGG CTG GTC CCG CCG GAG AAG 1210 Val Asp Lys Ile Val Leu His Lys Val Gly Leu Val Pro Pro Glu Lys 370 375 380 385 GCT GAG GAG ATG TAC GAA GGA CTT CAT GCT CAT TTG GAA AAA GTT GGG 1258 Ala Glu Glu Met Tyr Glu Gly Leu His Ala His Leu Glu Lys Val Gly 390 395 400 ATC GAC GGT GTT AAG ATT GAC GTT ATC CAC CTA TTG GAG ATG TTG TGT 1306 Ile Asp Gly Val Lys Ile Asp Val Ile His Leu Leu Glu Met Leu Cys 405 410 415 GAA GAC TAT GGA GGG AGA GTG GAT TTG GCA AAG GCA TAT TAC AAA GCA 1354 Glu Asp Tyr Gly Gly Arg Val Asp Leu Ala Lys Ala Tyr Tyr Lys Ala 420 425 430 ATG ACC AAA TCA ATA AAT AAA CAT TTT AAA GGA AAT GGA GTC ATT GCA 1402 Met Thr Lys Ser Ile Asn Lys His Phe Lys Gly Asn Gly Val Ile Ala 435 440 445 AGT ATG GAA CAT TGT AAC GAC TTC ATG TTC CTT GGC ACG GAA GCT ATC 1450 Ser Met Glu His Cys Asn Asp Phe Met Phe Leu Gly Thr Glu Ala Ile 450 455 460 465 TCT CTT GGT CGT GTT GGT GAT GAC TTT TGG TGC ACG GAC CCC TCT GGT 1498 Ser Leu Gly Arg Val Gly Asp Asp Phe Trp Cys Thr Asp Pro Ser Gly 470 475 480 GAT CCA AAC GGT ACG TTT TGG CTC CAA GGA TGT CAC ATG GTT CAT TGT 1546 Asp Pro Asn Gly Thr Phe Trp Leu Gln Gly Cys His Met Val His Cys 485 490 495 GCC AAC GAC AGC TTG TGG ATG GGG AAC TTC ATC CAC CCT GAC TGG GAT 1594 Ala Asn Asp Ser Leu Trp Met Gly Asn Phe Ile His Pro Asp Trp Asp 500 505 510 ATG TTC CAA TCC ACC CAC CCT TGT GCC GCC TTC CAT GCT GCC TCT CGA 1642 Met Phe Gln Ser Thr His Pro Cys Ala Ala Phe His Ala Ala Ser Arg 515 520 525 GCC ATC TCT GGT GGC CCG ATC TAT GTT AGT GAT TCT GTG GGA AAG CAT 1690 Ala Ile Ser Gly Gly Pro Ile Tyr Val Ser Asp Ser Val Gly Lys His 530 535 540 545 AAC TTT GAT CTT CTG AAA AAA CTA GTG CTT CCT GAT GGA TCG ATC CTT 1738 Asn Phe Asp Leu Leu Lys Lys Leu Val Leu Pro Asp Gly Ser Ile Leu 550 555 560 CGA AGT GAG TAC TAT GCA CTC CCG ACT CGC GAT TGT TTG TTT GAA GAC 1786 Arg Ser Glu Tyr Tyr Ala Leu Pro Thr Arg Asp Cys Leu Phe Glu Asp 565 570 575 CCT TTG CAT AAT GGA GAA ACT ATG CTT AAG ATT TGG AAT CTC AAC AAG 1834 Pro Leu His Asn Gly Glu Thr Met Leu Lys Ile Trp Asn Leu Asn Lys 580 585 590 TTC ACT GGA GTG ATT GGT GCA TTC AAC TGC CAA GGA GGA GGA TGG TGT 1882 Phe Thr Gly Val Ile Gly Ala Phe Asn Cys Gln Gly Gly Gly Trp Cys 595 600 605 CGT GAG ACA CGC CGC AAC CAA TGC TTT TCA CAA TAC TCA AAA CGA GTG 1930 Arg Glu Thr Arg Arg Asn Gln Cys Phe Ser Gln Tyr Ser Lys Arg Val 610 615 620 625 ACA TCC AAA ACT AAC CCA AAA GAC ATA GAA TGG CAC AGT GGA GAA AAC 1978 Thr Ser Lys Thr Asn Pro Lys Asp Ile Glu Trp His Ser Gly Glu Asn 630 635 640 CCT ATC TCT ATT GAA GGC GTT AAA ACC TTT GCG CTT TAC CTC TAT CAA 2026 Pro Ile Ser Ile Glu Gly Val Lys Thr Phe Ala Leu Tyr Leu Tyr Gln 645 650 655 GCC AAA AAA CTT ATC CTC TCC AAG CCC TCT CAA GAT CTT GAC ATA GCT 2074 Ala Lys Lys Leu Ile Leu Ser Lys Pro Ser Gln Asp Leu Asp Ile Ala 660 665 670 CTT GAC CCA TTC GAA TTC GAG CTC ATC ACT GTT TCA CCA GTG ACC AAA 2122 Leu Asp Pro Phe Glu Phe Glu Leu Ile Thr Val Ser Pro Val Thr Lys 675 680 685 CTC ATC CAA ACT TCT CTA CAC TTT GCC CCA ATT GGG CTG GTG AAC ATG 2170 Leu Ile Gln Thr Ser Leu His Phe Ala Pro Ile Gly Leu Val Asn Met 690 695 700 705 CTT AAC ACT AGT GGA GCC ATC CAA TCT GTG GAC TAT GAC GAT GAC CTA 2218 Leu Asn Thr Ser Gly Ala Ile Gln Ser Val Asp Tyr Asp Asp Asp Leu 710 715 720 AGC TCA GTC GAG ATT GGT GTC AAA GGG TGT GGT GAG ATG CGA GTA TTT 2266 Ser Ser Val Glu Ile Gly Val Lys Gly Cys Gly Glu Met Arg Val Phe 725 730 735 GCA TCG AAA AAA CCA AGG GCT TGT CGT ATT GAT GGG GAG GAT GTT GGG 2314 Ala Ser Lys Lys Pro Arg Ala Cys Arg Ile Asp Gly Glu Asp Val Gly 740 745 750 TTC AAG TAT GAT CAG GAC CAA ATG GTG GTG GTT CAA GTG CCA TGG CCA 2362 Phe Lys Tyr Asp Gln Asp Gln Met Val Val Val Gln Val Pro Trp Pro 755 760 765 ATT GAT TCT TCA TCG GGT GGC ATT TCG GTT ATC GAG TAC TTG TTT 2407 Ile Asp Ser Ser Ser Gly Gly Ile Ser Val Ile Glu Tyr Leu Phe 770 775 780 TAATTTTTAT TTATGTARAG CTCAATGATT GTTGTTGTTG TCGCTGTTGT TGCTATCAAT 2467 GTATTTCTCT CCAAAAGAAA ATTATGTGTA ATTTGGAGAG TAATTAAGTG AGTKAAATTT 2527 TAAATAARAC TACTTTTAAT TATTTATCAA AAAAAAAAAA AA 2569

    【0156】配列番号:5 配列の長さ:784 配列の型:アミノ酸 トポロジー:直鎖状 配列の種類:タンパク質 配列 Met Ala Pro Ser Phe Lys Asn Gly Gly Ser Asn Val Val Ser Phe Asp 1 5 10 15 Gly Leu Asn Asp Met Ser Ser Pro Phe Ala Ile Asp Gly Ser Asp Phe 20 25 30 Thr Val Asn Gly His Ser Phe Leu Ser Asp Val Pro Glu Asn Ile Val 35 40 45 Ala Ser Pro Ser Pro Tyr Thr Ser Ile Asp Lys Ser Pro Val Ser Val 50 55 60 Gly Cys Phe Val Gly Phe Asp Ala Ser Glu Pro Asp Ser Arg His Val 65 70 75 80 Val Ser Ile Gly Lys Leu Lys Asp Ile Arg Phe Met Ser Ile Phe Arg 85 90 95 Phe Lys Val Trp Trp Thr Thr His Trp Val Gly Arg Asn Gly Gly Asp 100 105 110 Leu Glu Ser Glu Thr Gln Ile Val Ile Leu Glu Lys Ser Asp Ser Gly 115 120 125 Arg Pro Tyr Val Phe Leu Leu Pro Ile Val Glu Gly Pro Phe Arg Thr 130 135 140 Ser Ile Gln Pro Gly Asp Asp Asp Phe Val Asp Val Cys Val Glu Ser 145 150 155 160 Gly Ser Ser Lys Val Val Asp Ala Ser Phe Arg Ser Met Leu Tyr Leu 165 170 175 His Ala Gly Asp Asp Pro Phe Ala Leu Val Lys Glu Ala Met Lys Ile 180 185 190 Val Arg Thr His Leu Gly Thr Phe Arg Leu Leu Glu Glu Lys Thr Pro 195 200 205 Pro Gly Ile Val Asp Lys Phe Gly Trp Cys Thr Trp Asp Ala Phe Tyr 210 215 220 Leu Thr Val His Pro Gln Gly Val Ile Glu Gly Val Arg His Leu Val 225 230 235 240 Asp Gly Gly Cys Pro Pro Gly Leu Val Leu Ile Asp Asp Gly Trp Gln 245 250 255 Ser Ile Gly His Asp Ser Asp Pro Ile Thr Lys Glu Gly Met Asn Gln 260 265 270 Thr Val Ala Gly Glu Gln Met Pro Cys Arg Leu Leu Lys Phe Gln Glu 275 280 285 Asn Tyr Lys Phe Arg Asp Tyr Val Asn Pro Lys Ala Thr Gly Pro Arg 290 295 300 Ala Gly Gln Lys Gly Met Lys Ala Phe Ile Asp Glu Leu Lys Gly Glu 305 310 315 320 Phe Lys Thr Val Glu His Val Tyr Val Trp His Ala Leu Cys Gly Tyr 325 330 335 Trp Gly Gly Leu Arg Pro Gln Val Pro Gly Leu Pro Glu Ala Arg Val 340 345 350 Ile Gln Pro Val Leu Ser Pro Gly Leu Gln Met Thr Met Glu Asp Leu 355 360 365 Ala Val Asp Lys Ile Val Leu His Lys Val Gly Leu Val Pro Pro Glu 370 375 380 Lys Ala Glu Glu Met Tyr Glu Gly Leu His Ala His Leu Glu Lys Val 385 390 395 400 Gly Ile Asp Gly Val Lys Ile Asp Val Ile His Leu Leu Glu Met Leu 405 410 415 Cys Glu Asp Tyr Gly Gly Arg Val Asp Leu Ala Lys Ala Tyr Tyr Lys 420 425 430 Ala Met Thr Lys Ser Ile Asn Lys His Phe Lys Gly Asn Gly Val Ile 435 440 445 Ala Ser Met Glu His Cys Asn Asp Phe Met Phe Leu Gly Thr Glu Ala 450 455 460 Ile Ser Leu Gly Arg Val Gly Asp Asp Phe Trp Cys Thr Asp Pro Ser 465 470 475 480 Gly Asp Pro Asn Gly Thr Phe Trp Leu Gln Gly Cys His Met Val His 485 490 495 Cys Ala Asn Asp Ser Leu Trp Met Gly Asn Phe Ile His Pro Asp Trp 500 505 510 Asp Met Phe Gln Ser Thr His Pro Cys Ala Ala Phe His Ala Ala Ser 515 520 525 Arg Ala Ile Ser Gly Gly Pro Ile Tyr Val Ser Asp Ser Val Gly Lys 530 535 540 His Asn Phe Asp Leu Leu Lys Lys Leu Val Leu Pro Asp Gly Ser Ile 545 550 555 560 Leu Arg Ser Glu Tyr Tyr Ala Leu Pro Thr Arg Asp Cys Leu Phe Glu 565 570 575 Asp Pro Leu His Asn Gly Glu Thr Met Leu Lys Ile Trp Asn Leu Asn 580 585 590 Lys Phe Thr Gly Val Ile Gly Ala Phe Asn Cys Gln Gly Gly Gly Trp 595 600 605 Cys Arg Glu Thr Arg Arg Asn Gln Cys Phe Ser Gln Tyr Ser Lys Arg 610 615 620 Val Thr Ser Lys Thr Asn Pro Lys Asp Ile Glu Trp His Ser Gly Glu 625 630 635 640 Asn Pro Ile Ser Ile Glu Gly Val Lys Thr Phe Ala Leu Tyr Leu Tyr 645 650 655 Gln Ala Lys Lys Leu Ile Leu Ser Lys Pro Ser Gln Asp Leu Asp Ile 660 665 670 Ala Leu Asp Pro Phe Glu Phe Glu Leu Ile Thr Val Ser Pro Val Thr 675 680 685 Lys Leu Ile Gln Thr Ser Leu His Phe Ala Pro Ile Gly Leu Val Asn 690 695 700 Met Leu Asn Thr Ser Gly Ala Ile Gln Ser Val Asp Tyr Asp Asp Asp 705 710 715 720 Leu Ser Ser Val Glu Ile Gly Val Lys Gly Cys Gly Glu Met Arg Val 725 730 735 Phe Ala Ser Lys Lys Pro Arg Ala Cys Arg Ile Asp Gly Glu Asp Val 740 745 750 Gly Phe Lys Tyr Asp Gln Asp Gln Met Val Val Val Gln Val Pro Trp 755 760 765 Pro Ile Asp Ser Ser Ser Gly Gly Ile Ser Val Ile Glu Tyr Leu Phe 770 775 780

    【0157】配列番号:6 配列の長さ:23 配列の型:核酸 鎖の数:一本鎖 トポロジー:直鎖状 配列の種類:他の核酸 合成DNA 配列 TTYTAYCTBA CHGTNCAYCC TCA 23

    【0158】配列番号:7 配列の長さ:23 配列の型:核酸 鎖の数:一本鎖 トポロジー:直鎖状 配列の種類:他の核酸 合成DNA 配列 TTYTAYCTBA CHGTNCAYCC CCA 23

    【0159】配列番号:8 配列の長さ:23 配列の型:核酸 鎖の数:一本鎖 トポロジー:直鎖状 配列の種類:他の核酸 合成DNA 配列 TTYTAYCTBA CHGTNCAYCC ACA 23

    【0160】配列番号:9 配列の長さ:23 配列の型:核酸 鎖の数:一本鎖 トポロジー:直鎖状 配列の種類:他の核酸 合成DNA 配列 TTYTAYCTBA CHGTNCAYCC GCA 23

    【0161】配列番号:10 配列の長さ:26 配列の型:核酸 鎖の数:一本鎖 トポロジー:直鎖状 配列の種類:他の核酸 合成DNA 配列の特徴: その他の情報:6番目及び11番目のヌクレオチドNはイノシンを、他のNは、A、G、C又はTを表す。 配列 GARGGNGTNM GNCAYCTRGT NGAYGG 26

    【0162】配列番号:11 配列の長さ:26 配列の型:核酸 鎖の数:一本鎖 トポロジー:直鎖状 配列の種類:他の核酸 合成DNA 配列の特徴: その他の情報:6番目及び11番目のヌクレオチドNはイノシンを、他のNは、A、G、C又はTを表す。 配列 GARGGNGTNM GNCAYCTYGT NGAYGG 26

    【0163】配列番号:12 配列の長さ:26 配列の型:核酸 鎖の数:一本鎖 トポロジー:直鎖状 配列の種類:他の核酸 合成DNA 配列の特徴: その他の情報:6番目及び11番目のヌクレオチドNはイノシンを、他のNは、A、G、C又はTを表す。 配列 GARGGNGTNM GNCAYTTRGT NGAYGG 26

    【0164】配列番号:13 配列の長さ:26 配列の型:核酸 鎖の数:一本鎖 トポロジー:直鎖状 配列の種類:他の核酸 合成DNA 配列の特徴: その他の情報:3番目のヌクレオチドNはイノシンを、
    他のNは、A、G、C又はTを表す。 配列 GTNGGNTGYT TYGTNGGYTT YGAYGC 26

    【0165】配列番号:14 配列の長さ:26 配列の型:核酸 鎖の数:一本鎖 トポロジー:直鎖状 配列の種類:他の核酸 合成DNA 配列の特徴: その他の情報:3番目のヌクレオチドNはイノシンを、
    他のNは、A、G、C又はTを表す。 配列 GTNGGNTGYT TYGTNGGRTT YGAYGC 26

    【0166】配列番号:15 配列の長さ:29 配列の型:核酸 鎖の数:一本鎖 トポロジー:直鎖状 配列の種類:他の核酸 合成DNA 配列の特徴: その他の情報:9番目及び11番目のヌクレオチドNはイノシンを、他のNは、A、G、C又はTを表す。 配列 TTYGAYGCNT CNGARCCHGA YTCDCGNCA 29

    【0167】配列番号:16 配列の長さ:30 配列の型:核酸 鎖の数:一本鎖 トポロジー:直鎖状 配列の種類:他の核酸 合成DNA 配列の特徴: その他の情報:9番目及び11番目のヌクレオチドNはイノシンを、他のNは、A、G、C又はTを表す。 配列 TTYGAYGCNT CNGARCCHGA YTCDAGYCAY 30

    【0168】配列番号:17 配列の長さ:20 配列の型:核酸 鎖の数:一本鎖 トポロジー:直鎖状 配列の種類:他の核酸 合成DNA 配列 GAYCARGAYC TRATGGTNGT 20

    【0169】配列番号:18 配列の長さ:26 配列の型:核酸 鎖の数:一本鎖 トポロジー:直鎖状 配列の種類:他の核酸 合成DNA 配列の特徴: その他の情報:6番目及び15番目のヌクレオチドNはイノシンを、他のNは、A、G、C又はTを表す。 配列 CCRTCNACYA GRTGNCKNAC NCCYTC 26

    【0170】配列番号:19 配列の長さ:26 配列の型:核酸 鎖の数:一本鎖 トポロジー:直鎖状 配列の種類:他の核酸 合成DNA 配列の特徴: その他の情報:6番目及び15番目のヌクレオチドNはイノシンを、他のNは、A、G、C又はTを表す。 配列 CCRTCNACRA GRTGNCKNAC NCCYTC 26

    【0171】配列番号:20 配列の長さ:26 配列の型:核酸 鎖の数:一本鎖 トポロジー:直鎖状 配列の種類:他の核酸 合成DNA 配列の特徴: その他の情報:6番目及び15番目のヌクレオチドNはイノシンを、他のNは、A、G、C又はTを表す。 配列 CCRTCNACYA TRTGNCKNAC NCCYTC 26

    【0172】配列番号:21 配列の長さ:29 配列の型:核酸 鎖の数:一本鎖 トポロジー:直鎖状 配列の種類:他の核酸 合成DNA 配列の特徴: その他の情報:3番目及び18番目のヌクレオチドNはイノシンを、他のNは、A、G、C又はTを表す。 配列 TGNCGHGART CDGGYTCNGA NGCRTCRAA 29

    【0173】配列番号:22 配列の長さ:30 配列の型:核酸 鎖の数:一本鎖 トポロジー:直鎖状 配列の種類:他の核酸 合成DNA 配列の特徴: その他の情報:19番目のヌクレオチドNはイノシンを、
    他のNは、A、G、C又はTを表す。 配列 RTGRCTHGAR TCDGGYTCNG ANGCRTCRAA 30

    【0174】配列番号:23 配列の長さ:2780 配列の型:核酸 鎖の数:二本鎖 トポロジー:直鎖状 配列の種類:cDNA to mRNA 起源 生物名:ダイズ(Glycine max cv. Clark63) 配列の特徴 特徴を表す記号:CDS 存在位置:156..2405 配列 TCTTCCATTG GAGGACCATT TCCTCCTGGA ATAGAAATAC TACCACACTT TTCTTTTTTC 60 ACTTCTCTAA GTTGCTAAGT TAATTGCTCC TTCATTTTTT CACTCTTCGT TCTCGCGTAC 120 CCGTGTCACG GTAACTCGTG GTGAAGTGTT CGAAA ATG ACT GTC ACA CCT AAG 173 Met Thr Val Thr Pro Lys 1 5 ATC TCA GTT AAC GAT GGG AAA CTT GTT GTC CAT GGT AAG ACC ATT CTG 221 Ile Ser Val Asn Asp Gly Lys Leu Val Val His Gly Lys Thr Ile Leu 10 15 20 ACT GGA GTG CCA GAC AAC GTT GTG CTG ACT CCA GGT TCT GGA AGG GGT 269 Thr Gly Val Pro Asp Asn Val Val Leu Thr Pro Gly Ser Gly Arg Gly 25 30 35 CTT GTG ACT GGT GCT TTT GTT GGT GCC ACA GCT TCA CAC AGC AAA AGT 317 Leu Val Thr Gly Ala Phe Val Gly Ala Thr Ala Ser His Ser Lys Ser 40 45 50 CTC CAT GTG TTT CCA ATG GGT GTT TTA GAG GGG CTC CGG TTC ATG TGT 365 Leu His Val Phe Pro Met Gly Val Leu Glu Gly Leu Arg Phe Met Cys 55 60 65 70 TGT TTC CGG TTC AAG TTA TGG TGG ATG ACT CAG AGA ATG GGA ACT TGT 413 Cys Phe Arg Phe Lys Leu Trp Trp Met Thr Gln Arg Met Gly Thr Cys 75 80 85 GGG AGG GAT GTT CCT CTG GAG ACT CAA TTC ATG CTT ATT GAG AGC AAA 461 Gly Arg Asp Val Pro Leu Glu Thr Gln Phe Met Leu Ile Glu Ser Lys 90 95 100 GAG AGT GAA ACT GAT GGG GAG AAT TCT CCA ATC ATC TAC ACT GTC TTG 509 Glu Ser Glu Thr Asp Gly Glu Asn Ser Pro Ile Ile Tyr Thr Val Leu 105 110 115 CTT CCT CTC CTC GAA GGT CAA TTC CGA GCT GTT CTT CAA GGC AAT GAC 557 Leu Pro Leu Leu Glu Gly Gln Phe Arg Ala Val Leu Gln Gly Asn Asp 120 125 130 AAG AAC GAG ATA GAG ATT TGC CTC GAG AGT GGG GAT AAT GCA GTT GAG 605 Lys Asn Glu Ile Glu Ile Cys Leu Glu Ser Gly Asp Asn Ala Val Glu 135 140 145 150 ACT GAC CAA GGC CTT CAC ATG GTT TAC ATG CAT GCT GGG ACC AAT CCC 653 Thr Asp Gln Gly Leu His Met Val Tyr Met His Ala Gly Thr Asn Pro 155 160 165 TTT GAA GTC ATC AAT CAA GCT GTC AAG GCT GTG GAA AAA CAC ATG CAA 701 Phe Glu Val Ile Asn Gln Ala Val Lys Ala Val Glu Lys His Met Gln 170 175 180 ACT TTT CTT CAT CGT GAG AAG AAA AGG TTG CCA TCT TGT CTT GAC TGG 749 Thr Phe Leu His Arg Glu Lys Lys Arg Leu Pro Ser Cys Leu Asp Trp 185 190 195 TTT GGA TGG TGC ACA TGG GAT GCT TTC TAT ACT GAT GTC ACA GCT GAG 797 Phe Gly Trp Cys Thr Trp Asp Ala Phe Tyr Thr Asp Val Thr Ala Glu 200 205 210 GGT GTT GAG GAA GGC CTG AAA AGT CTA TCA CAG GGA GGT ACA CCT CCA 845 Gly Val Glu Glu Gly Leu Lys Ser Leu Ser Gln Gly Gly Thr Pro Pro 215 220 225 230 CGA TTC CTC ATC ATA GAT GAT GGT TGG CAA CAG ATT GAA AAT AAA GCA 893 Arg Phe Leu Ile Ile Asp Asp Gly Trp Gln Gln Ile Glu Asn Lys Ala 235 240 245 AAG GAT GCT ACT GAA TGT TTG GTA CAA GAA GGA GCA CAG TTT GCT ACT 941 Lys Asp Ala Thr Glu Cys Leu Val Gln Glu Gly Ala Gln Phe Ala Thr 250 255 260 AGG TTG ACT GGT ATT AAA GAG AAT ACT AAA TTT CAA AAG AAA TTA CAG 989 Arg Leu Thr Gly Ile Lys Glu Asn Thr Lys Phe Gln Lys Lys Leu Gln 265 270 275 AAC AAT GAG CAG ATG TCA GGT CTG AAG CAT CTA GTA CAT GGA GCA AAG 1037 Asn Asn Glu Gln Met Ser Gly Leu Lys His Leu Val His Gly Ala Lys 280 285 290 CAG CAT CAC AAT GTG AAA AAT GTA TAT GTA TGG CAT GCA CTA GCT GGT 1085 Gln His His Asn Val Lys Asn Val Tyr Val Trp His Ala Leu Ala Gly 295 300 305 310 TAT TGG GGT GGA GTG AAG CCA GCA GCA ACC GGC ATG GAA CAT TAT GAC 1133 Tyr Trp Gly Gly Val Lys Pro Ala Ala Thr Gly Met Glu His Tyr Asp 315 320 325 ACT GCC TTG GCA TAT CCA GTG CAG TCA CCA GGC GTG CTA GGA AAC CAA 1181 Thr Ala Leu Ala Tyr Pro Val Gln Ser Pro Gly Val Leu Gly Asn Gln 330 335 340 CCA GAC ATT GTC ATG GAC AGC TTG GCT GTA CAT GGC CTT GGC CTA GTG 1229 Pro Asp Ile Val Met Asp Ser Leu Ala Val His Gly Leu Gly Leu Val 345 350 355 CAC CCA AAG AAG GTT TTC AAT TTC TAC AAC GAG CTC CAT GCT TAC TTA 1277 His Pro Lys Lys Val Phe Asn Phe Tyr Asn Glu Leu His Ala Tyr Leu 360 365 370 GCT TCT TGT GGA GTA GAT GGA GTG AAG GTT GAT GTG CAG AAC ATT ATT 1325 Ala Ser Cys Gly Val Asp Gly Val Lys Val Asp Val Gln Asn Ile Ile 375 380 385 390 GAG ACC CTT GGT GCG GGA CAT GGT GGC CGA GTG TCA CTT ACT CGC AGC 1373 Glu Thr Leu Gly Ala Gly His Gly Gly Arg Val Ser Leu Thr Arg Ser 395 400 405 TAT CAT CAC GCG CTT GAG GCT TCC ATT GCT AGC AAT TTT ACT GAT AAC 1421 Tyr His His Ala Leu Glu Ala Ser Ile Ala Ser Asn Phe Thr Asp Asn 410 415 420 GGA TGC ATT GCG TGT ATG TGT CAC AAC ACT GAT GGA CTT TAT AGT GCT 1469 Gly Cys Ile Ala Cys Met Cys His Asn Thr Asp Gly Leu Tyr Ser Ala 425 430 435 AAG CAG ACT GCT ATT GTG AGA GCT TCT GAT GAT TTT TAC CCT CGT GAT 1517 Lys Gln Thr Ala Ile Val Arg Ala Ser Asp Asp Phe Tyr Pro Arg Asp 440 445 450 CCT GCT TCC CAT ACC ATC CAT ATT TCT TCT GTT GCA TAC AAC TCA CTA 1565 Pro Ala Ser His Thr Ile His Ile Ser Ser Val Ala Tyr Asn Ser Leu 455 460 465 470 TTC CTT GGA GAA TTC ATG CAA CCT GAC TGG GAC ATG TTT CAT AGT TTA 1613 Phe Leu Gly Glu Phe Met Gln Pro Asp Trp Asp Met Phe His Ser Leu 475 480 485 CAC CCA GCA GCA GAT TAT CAT GCT GCA GCT CGT GCA ATT GGT GGA TGT 1661 His Pro Ala Ala Asp Tyr His Ala Ala Ala Arg Ala Ile Gly Gly Cys 490 495 500 CCT ATT TAT GTT AGT GAC AAG CCA GGC AAT CAC AAT TTT GAT CTT CTT 1709 Pro Ile Tyr Val Ser Asp Lys Pro Gly Asn His Asn Phe Asp Leu Leu 505 510 515 AAG AAG CTG GTT CTC CCG GAT GGT TCG GTT CTC CGT GCT CAG TTA CCT 1757 Lys Lys Leu Val Leu Pro Asp Gly Ser Val Leu Arg Ala Gln Leu Pro 520 525 530 GGC AGG CCA ACT CGT GAT TCT CTA TTT GTG GAT CCA GCC AGA GAT AGG 1805 Gly Arg Pro Thr Arg Asp Ser Leu Phe Val Asp Pro Ala Arg Asp Arg 535 540 545 550 ACT AGC TTG CTC AAA ATA TGG AAC CTG AAC AAA TGC TCT GGA GTT GTT 1853 Thr Ser Leu Leu Lys Ile Trp Asn Leu Asn Lys Cys Ser Gly Val Val 555 560 565 GGT GTA TTT AAC TGC CAA GGT GCT GGA TGG TGC AAG ATA GAG AAG AAA 1901 Gly Val Phe Asn Cys Gln Gly Ala Gly Trp Cys Lys Ile Glu Lys Lys 570 575 580 ACC CGC ATC CAT GAT ACA TCT CCT GGT ACA CTC ACC GCC TCT GTC TGC 1949 Thr Arg Ile His Asp Thr Ser Pro Gly Thr Leu Thr Ala Ser Val Cys 585 590 595 GCC TCT GAT GTT GAC CTC ATC ACA CAA GTA GCA GGT GCT GAA TGG CTT 1997 Ala Ser Asp Val Asp Leu Ile Thr Gln Val Ala Gly Ala Glu Trp Leu 600 605 610 GGA GAT ACA ATT GTT TAT GCT TAC AGA TCA GGT GAG GTG ATT CGG CTA 2045 Gly Asp Thr Ile Val Tyr Ala Tyr Arg Ser Gly Glu Val Ile Arg Leu 615 620 625 630 CCA AAA GGG GTT TCA ATT CCA GTG ACA CTA AAA GTT CTG GAG TTT GAG 2093 Pro Lys Gly Val Ser Ile Pro Val Thr Leu Lys Val Leu Glu Phe Glu 635 640 645 CTT TTC CAC TTC TGT CCA ATC CAA GAA ATA GCT CCA AGT ATA TCA TTT 2141 Leu Phe His Phe Cys Pro Ile Gln Glu Ile Ala Pro Ser Ile Ser Phe 650 655 660 GCA GCA ATA GGG CTA CTG GAT ATG TTC AAC ACT GGA GGA GCA GTG GAG 2189 Ala Ala Ile Gly Leu Leu Asp Met Phe Asn Thr Gly Gly Ala Val Glu 665 670 675 CAG GTT GAG ATT CAT AAC CGA GCA GCA ACG AAA ACA ATA GCT CTT AGT 2237 Gln Val Glu Ile His Asn Arg Ala Ala Thr Lys Thr Ile Ala Leu Ser 680 685 690 GTA AGG GGA AGA GGC AGA TTT GGA GTT TAC TCC TCC CAG AGA CCA CTG 2285 Val Arg Gly Arg Gly Arg Phe Gly Val Tyr Ser Ser Gln Arg Pro Leu 695 700 705 710 AAG TGT GTG GTA GGT GGC GCT GAA ACC GAC TTC AAC TAT GAC TCA GAG 2333 Lys Cys Val Val Gly Gly Ala Glu Thr Asp Phe Asn Tyr Asp Ser Glu 715 720 725 ACC GGG TTG ACA ACC TTC TCC ATT CCA GTT TCT CCA GAG GAG ATG TAC 2381 Thr Gly Leu Thr Thr Phe Ser Ile Pro Val Ser Pro Glu Glu Met Tyr 730 735 740 AGA TGG TCA ATA GAG ATC CAA GTT TGAGTCCTTT TTAAGACTTG GTGTTTGATG 2435 Arg Trp Ser Ile Glu Ile Gln Val 745 750 CATTGTTGTA TCAGGAGAAG GGTTTTGTTG TAATTAAGCA TTGAGGGAAT TGTTGGAGTC 2495 AGGCAGAGAG AGAGGGGGGA GGTTTGTTGT AAGACACCTA GTATTAGTAT CATGTAGTGG 2555 AGAAAAAGGG TTGTTGATCC TAATAGCTAG ACAAGGCATG TTGTAGTAGT CATGGGGTGG 2615 GGAAGTCCTT TTGTTGTAGC ATGTAATTTG GTTTAGACTT GTAGTATGTC ATCAATTAGA 2675 TGGATAAAGA GAGAATATTG TTATCTACCC GAGGATGTAA CAATGTTTGT TTCTCTGAAT 2735 AAAAAGTTCA CATCTGTCTT TTGGAATAAT AAAAAAAAAA AAAAA 2780

    【0175】配列番号:24 配列の長さ:750 配列の型:アミノ酸 トポロジー:直鎖状 配列の種類:タンパク質 配列 Met Thr Val Thr Pro Lys Ile Ser Val Asn Asp Gly Lys Leu Val Val 1 5 10 15 His Gly Lys Thr Ile Leu Thr Gly Val Pro Asp Asn Val Val Leu Thr 20 25 30 Pro Gly Ser Gly Arg Gly Leu Val Thr Gly Ala Phe Val Gly Ala Thr 35 40 45 Ala Ser His Ser Lys Ser Leu His Val Phe Pro Met Gly Val Leu Glu 50 55 60 Gly Leu Arg Phe Met Cys Cys Phe Arg Phe Lys Leu Trp Trp Met Thr 65 70 75 80 Gln Arg Met Gly Thr Cys Gly Arg Asp Val Pro Leu Glu Thr Gln Phe 85 90 95 Met Leu Ile Glu Ser Lys Glu Ser Glu Thr Asp Gly Glu Asn Ser Pro 100 105 110 Ile Ile Tyr Thr Val Leu Leu Pro Leu Leu Glu Gly Gln Phe Arg Ala 115 120 125 Val Leu Gln Gly Asn Asp Lys Asn Glu Ile Glu Ile Cys Leu Glu Ser 130 135 140 Gly Asp Asn Ala Val Glu Thr Asp Gln Gly Leu His Met Val Tyr Met 145 150 155 160 His Ala Gly Thr Asn Pro Phe Glu Val Ile Asn Gln Ala Val Lys Ala 165 170 175 Val Glu Lys His Met Gln Thr Phe Leu His Arg Glu Lys Lys Arg Leu 180 185 190 Pro Ser Cys Leu Asp Trp Phe Gly Trp Cys Thr Trp Asp Ala Phe Tyr 195 200 205 Thr Asp Val Thr Ala Glu Gly Val Glu Glu Gly Leu Lys Ser Leu Ser 210 215 220 Gln Gly Gly Thr Pro Pro Arg Phe Leu Ile Ile Asp Asp Gly Trp Gln 225 230 235 240 Gln Ile Glu Asn Lys Ala Lys Asp Ala Thr Glu Cys Leu Val Gln Glu 245 250 255 Gly Ala Gln Phe Ala Thr Arg Leu Thr Gly Ile Lys Glu Asn Thr Lys 260 265 270 Phe Gln Lys Lys Leu Gln Asn Asn Glu Gln Met Ser Gly Leu Lys His 275 280 285 Leu Val His Gly Ala Lys Gln His His Asn Val Lys Asn Val Tyr Val 290 295 300 Trp His Ala Leu Ala Gly Tyr Trp Gly Gly Val Lys Pro Ala Ala Thr 305 310 315 320 Gly Met Glu His Tyr Asp Thr Ala Leu Ala Tyr Pro Val Gln Ser Pro 325 330 335 Gly Val Leu Gly Asn Gln Pro Asp Ile Val Met Asp Ser Leu Ala Val 340 345 350 His Gly Leu Gly Leu Val His Pro Lys Lys Val Phe Asn Phe Tyr Asn 355 360 365 Glu Leu His Ala Tyr Leu Ala Ser Cys Gly Val Asp Gly Val Lys Val 370 375 380 Asp Val Gln Asn Ile Ile Glu Thr Leu Gly Ala Gly His Gly Gly Arg 385 390 395 400 Val Ser Leu Thr Arg Ser Tyr His His Ala Leu Glu Ala Ser Ile Ala 405 410 415 Ser Asn Phe Thr Asp Asn Gly Cys Ile Ala Cys Met Cys His Asn Thr 420 425 430 Asp Gly Leu Tyr Ser Ala Lys Gln Thr Ala Ile Val Arg Ala Ser Asp 435 440 445 Asp Phe Tyr Pro Arg Asp Pro Ala Ser His Thr Ile His Ile Ser Ser 450 455 460 Val Ala Tyr Asn Ser Leu Phe Leu Gly Glu Phe Met Gln Pro Asp Trp 465 470 475 480 Asp Met Phe His Ser Leu His Pro Ala Ala Asp Tyr His Ala Ala Ala 485 490 495 Arg Ala Ile Gly Gly Cys Pro Ile Tyr Val Ser Asp Lys Pro Gly Asn 500 505 510 His Asn Phe Asp Leu Leu Lys Lys Leu Val Leu Pro Asp Gly Ser Val 515 520 525 Leu Arg Ala Gln Leu Pro Gly Arg Pro Thr Arg Asp Ser Leu Phe Val 530 535 540 Asp Pro Ala Arg Asp Arg Thr Ser Leu Leu Lys Ile Trp Asn Leu Asn 545 550 555 560 Lys Cys Ser Gly Val Val Gly Val Phe Asn Cys Gln Gly Ala Gly Trp 565 570 575 Cys Lys Ile Glu Lys Lys Thr Arg Ile His Asp Thr Ser Pro Gly Thr 580 585 590 Leu Thr Ala Ser Val Cys Ala Ser Asp Val Asp Leu Ile Thr Gln Val 595 600 605 Ala Gly Ala Glu Trp Leu Gly Asp Thr Ile Val Tyr Ala Tyr Arg Ser 610 615 620 Gly Glu Val Ile Arg Leu Pro Lys Gly Val Ser Ile Pro Val Thr Leu 625 630 635 640 Lys Val Leu Glu Phe Glu Leu Phe His Phe Cys Pro Ile Gln Glu Ile 645 650 655 Ala Pro Ser Ile Ser Phe Ala Ala Ile Gly Leu Leu Asp Met Phe Asn 660 665 670 Thr Gly Gly Ala Val Glu Gln Val Glu Ile His Asn Arg Ala Ala Thr 675 680 685 Lys Thr Ile Ala Leu Ser Val Arg Gly Arg Gly Arg Phe Gly Val Tyr 690 695 700 Ser Ser Gln Arg Pro Leu Lys Cys Val Val Gly Gly Ala Glu Thr Asp 705 710 715 720 Phe Asn Tyr Asp Ser Glu Thr Gly Leu Thr Thr Phe Ser Ile Pro Val 725 730 735 Ser Pro Glu Glu Met Tyr Arg Trp Ser Ile Glu Ile Gln Val 740 745 750

    【0176】配列番号:25 配列の長さ:26 配列の型:核酸 鎖の数:一本鎖 トポロジー:直鎖状 配列の種類:他の核酸 合成DNA 配列 ATSCAVCCTG ACTGGGATAT GTTCCA 26

    【0177】配列番号:26 配列の長さ:26 配列の型:核酸 鎖の数:一本鎖 トポロジー:直鎖状 配列の種類:他の核酸 合成DNA 配列 CGAAGGAYYG AWCCATCAGG AARHAM 26

    【0178】配列番号:27 配列の長さ:253 配列の型:核酸 鎖の数:二本鎖 トポロジー:直鎖状 配列の種類:cDNA to mRNA 起源 生物名:シロイヌナズナ(Arabidopsis thaliana) 配列 GGCTTATGCA ACCTGACTGG GAATGTTCCA TAGTCTACAC CCAACTGCAG AGTACCATGC 60 TGCAGCGCGT GCAGTGGGTG GATGCGCAAT CTATGTCAGT GATAAGCCAG GCAACCACAA 120 CTTTGATCTA TTGAGGAAGC TGGTTCTTCC TGATGGTTCA GTTCTTCGGG CTAAGCTCCC 180 GGGTAGGCCT ACCCGTGACT GCTTATTCGC TGATCCAGCT AGAGATGGGA TCAGCTTGCT 240 CAAGATCTGG AAC 253

    【0179】配列番号:28 配列の長さ:10 配列の型:アミノ酸 トポロジー:直鎖状 配列の種類:ペプチド 配列 Phe Gly Trp Cys Thr Trp Asp Ala Phe Tyr 1 5 10

    【0180】配列番号:29 配列の長さ:13 配列の型:アミノ酸 トポロジー:直鎖状 配列の種類:ペプチド 配列の特徴: その他の情報:8番目のアミノ酸XaaはAla又はCysを表す。 配列 Val Tyr Val Trp His Ala Leu Xaa Gly Tyr Trp Gly Gly 1 5 10

    【0181】配列番号:30 配列の長さ:15 配列の型:アミノ酸 トポロジー:直鎖状 配列の種類:ペプチド 配列 His Asn Phe Asp Leu Leu Lys Lys Leu Val Leu Pro Asp Gly Ser 1 5 10 15

    【図面の簡単な説明】

    【図1】 ラフィノース合成反応によって生じるラフィノース生成量と反応時間との関係を示す図。

    【図2】 ラフィノース合成酵素のSDS−ポリアクリルアミドゲル電気泳動の結果を示す模式図。 Mは分子量マーカーを、Sはラフィノース合成酵素を含む試料を示す。 数字は分子量(kDa)を表す。

    【図3】 ラフィノース合成酵素活性に対する反応温度の影響を示す図。

    【図4】 ラフィノース合成酵素活性に対する反応pH
    の影響を示す図。

    【図5】 ラフィノース合成酵素活性に対するミオイノシトールの影響を示す図。

    【図6】 ラフィノース合成酵素の安定pH範囲を示す図。

    【図7】 合成プライマーとペプチドのアミノ酸配列との関係を示す図。 RはA又はGを、YはC又はTを、M
    はA又はCを、KはG又はTを、DはG、A又はTを、
    HはA、T又はCを、BはG、T又はCを、NはG、
    A、T若しくはCを、Iはイノシンを表す。

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