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用于检测J亚群禽白血病病毒的斑点杂交方法

阅读:1029发布:2020-09-21

专利汇可以提供用于检测J亚群禽白血病病毒的斑点杂交方法专利检索,专利查询,专利分析的服务。并且本 发明 涉及一种用于检测J亚群禽白血病病毒的斑点杂交方法。所述的核酸探针是基于J亚群禽白血病病 毒囊 膜env特异性基因序列,长度为248bp, 位置 在hprs-103 原型 毒株的第6736bp-6983bp之间,通过合成该目的基因,大量克隆;标记制备ALV-J的核酸探针;提取接毒细胞DNA,用斑点杂交的方法进行检测,在尼龙膜固定DNA,预杂交和杂交,洗膜,显色检测斑点杂交反应阳性。通过摸索ALV-J核酸探针与DNA反应最佳反应 温度 为50℃,探针反应浓度25ng/ml,确定用于检测ALV-J的斑点杂交方法,斑点杂交的结果表明该核酸探针能有效地检测出ALV-J,对禽白血病各亚群、 马 立克氏病、网状内皮增生症有效地进行 鉴别 诊断 ,并且该核酸探针的检测快捷准确,因此本发明为J亚群禽白血病的诊断提供了新的思路和方法。,下面是用于检测J亚群禽白血病病毒的斑点杂交方法专利的具体信息内容。

1.一种用于检测J亚群禽白血病病毒的核酸探针,其特征在于:
其具体制备步骤如下:
通过比较国内外各J亚群禽白血病病毒代表毒株env基因同源性,从gp37基因设计出高度保守长度248bp目的基因片段,其基因序列如Seq ID No:1所示,用以作为制备核酸探针的基序,位置在Hprs-103原型病毒基因序列第6736-6983bp,合成该目的基因,进行大量克隆;
向离心管中加1μg上述克隆获得的DNA模板、高压灭菌的双蒸至最终体积为16μl;
沸水水浴10min变性DNA,迅速放入水中冷却2min;加4μl地高辛引物混合至离心管中并简单离心;在37℃温箱内孵化20h以上;65℃加热10min终止反应。

说明书全文

用于检测J亚群禽白血病病毒的斑点杂交方法

(一)技术领域

[0001] 本发明涉及一种用于检测J亚群禽白血病病毒的斑点杂交方法。(二)背景技术
[0002] J亚群禽白血病是由J亚群禽白血病病毒(ALV-J)引起的一种肿瘤疾病。临床感染主要表现为髓细胞瘤、免疫耐受、高死亡率和生长迟缓。目前,以J亚群禽白血病为主的肿瘤性疾病在鸡群中蔓延,特别是血管瘤型J亚群禽白血病的爆发给我国养禽业带来巨大的经济损失。
[0003] 1、J亚群禽白血病在我国鸡群发病特点
[0004] (1)早期感染普遍、发病日龄明显提前。目前在青年鸡群或开产前的鸡群中J亚群白血病已成为常见病。
[0005] (2)感染率及发病率居高不下。近10年来,在肉种鸡、蛋种鸡中感染率均在10%左右。
[0006] (3)宿主范围扩展。J亚群禽白血病最初在肉鸡中发病,目前在蛋鸡群中高发,我国特有鸡种麻鸡、柴鸡及芦花鸡中也检出了ALV-J,J亚群白血病宿主范围正在明显扩大。
[0007] (4)致病性增强。蛋鸡及地方鸡中发现的肿瘤要比肉种鸡中的病变更为严重,在患病肉鸡病变器官从未见过的髓细胞瘤,却在蛋鸡中比较常见,如颈部髓细胞瘤、腰荐髓细胞瘤、肠髓细胞瘤等。
[0008] (5)肿瘤趋于多样化。目前,我国感染鸡群中出现了诸多以前罕见的肿瘤,如血管瘤、成红细胞瘤、肝细胞癌、腺癌、纤维瘤、纤维肉瘤、皮肤癌和输卵管癌等。
[0009] 2、禽肿瘤性疾病混合感染加大了诊断难度
[0010] 目前以ALV-J为主的禽肿瘤性疾病在蛋鸡群中广泛流行,与立克氏病、网状内皮增生症等肿瘤性疾病混合感染频发,国内报道从感染ALV-J肿瘤中检测出马立克氏病病毒和网状内皮增生症病毒、从马立克疫苗中发现禽白血病病毒的污染。近年来,国内外均在鸡群中发现ALV群内的混合感染,这大大增加了疾病的诊断难度,给养禽业带来巨大的经济损失。
[0011] 3、J亚群禽白血病的诊断方法研究现状
[0012] 目前对J亚群禽白血病的诊断,可通过临床剖检和组织病理学检查初步诊断,进一步确诊需要通过间接免疫荧光或ELISA、PCR方法实现。
[0013] 间接免疫荧光方法需要对病毒分离鉴定,利用特异性单克隆抗体进行,具有周期长、成本高易于出现非特异性抗原反应干扰等缺点;目前,我们使用的ELISA试剂盒产于国外,需要同时检测抗原和抗体进行综合性诊断,而且检测成本高,价格昂贵,同时由于ALV-J gp85基因高度变动,使国外检测试剂盒对国内毒株的检测结果不确实;PCR技术容易受到很多因素干扰,并可能出现假阳性和假阴性结果。
[0014] 鉴于以上诊断手段具有易受非特异性干扰、不能全面确诊的缺点,对于大规模爆发J亚群禽白血病的情况,我们急需一种快速准确而又经济实用的诊断方法。
[0015] 4、ALV-J env基因具有重要的生物学功能
[0016] env基因是ALV-J病毒特异性生物学功能基因,包括gp85和gp37两个结构基因。gp85基因编码表面蛋白(SU),gp37基因编码跨膜蛋白(TM),是病毒表面两个重要的抗原。
env基因对于病毒分型及感染转录具有重要的生物学意义。
[0017] 基于此,通过比较国内外各J亚群禽白血病病毒代表毒株env基因同源性,从gp37基因设计出高度保守长度约248bp目的基因片段,用以作为制备核酸探针的基序。
[0018] 迄今为止,我国报道的禽血病为A、B、J亚群,C、D亚群仅出现在国外,在我国未见报道。(三)发明内容
[0019] 本发明的目的是提供一种用于检测J亚群禽白血病病毒的斑点杂交方法,为J亚群禽白血病及其他禽肿瘤性疾病的鉴别诊断提供一种新的精准有效检测手段,以降低养禽业因ALV-J感染而造成的经济损失。
[0020] 本发明的主要内容:通过DNAstar分析软件比较确定ALV-J各代表毒株env(囊膜蛋白基因)保守基因序列;制备标记ALV-J核酸探针;明确核酸探针与提取接毒细胞DNA斑点杂交的最佳反应条件。
[0021] 核酸探针与接毒细胞反应最适温度以及探针反应浓度是斑点杂交反应的关键。
[0022] 与现有技术相比,本发明的优点是:
[0023] 1、本发明是基于ALV-J囊膜蛋白env保守基因而制备的ALV-J核酸探针,这在国内尚属首次,该探针特异性强,检测效果精准。
[0024] 2、本发明制备的检测J亚群禽白血病斑点杂交方法可以对ALV其他亚群、禽马立克氏病、网状内皮组织增生症进行鉴别诊断,若感染ALV-J白血病,可以检测到ALV-J反应阳性,而ALV其他亚群、马立克氏病和网状内皮增生症反应阴性。
[0025] 3、本发明可以提高诊断的精准度,减少检测的成本,大幅度降低因J亚群禽白血病造成的直接和间接经济损失,这是现有J亚群禽白血病诊断手段所不能达到的效果。(四)附图说明
[0026] 图1为本发明检测J亚群禽白血病病毒的斑点杂交流程图
[0027] 图1中,1是提取接毒细胞DNA样品,2固定DNA,3是预杂交,4是制备核酸探针,5是标记核酸探针,6是加入标记核酸探针,7是杂交,8是漂洗,9是斑点杂交检测阳性结果。
[0028] 图2为ALV-J斑点杂交检测结果。
[0029] 图2中,1是检测ALV-A毒株DNA结果;2是检测ALV-B毒株DNA结果;3是检测马立克氏病病毒DNA结果;4是检测ALV-J宁夏毒株DNA结果;5是检测网状内皮组织增生症病毒DNA结果;6是正常细胞DNA阴性对照;7是酶切DNA片段阳性对照。
[0030] 说明:迄今为止,我国报道的禽血病为A、B、J亚群,C、D亚群仅出现在国外,在我国未见报道。据此,ALV的阳性对照选择A、B亚群。(五)具体实施方式
[0031] 下面结合附图对检测ALV-J的斑点杂交方法作进一步的详细说明。
[0032] 1、通过DNAstar分析软件比较同源性确定ALV-J各代表毒株env(囊膜蛋白基因)保守基因序列:
[0033] caagccatgaaggaacatacagagaagatacgggtggaagatgatcccataggggattggtttacgcgcacgtttggtgatctaggaaggtggctcgcgaaaggtgttaagacgctactgtttgccttgcttgtcatagcctgtctattagctatcattccatgtgtaatcaagtgctttcaggattgtctatcgagaacaatgaatcagtttatggatgaacgcataagatatcatagaattaggga
[0034] 2、利用随机引物法进行地高辛标记探针步骤如下:
[0035] 向离心管中加1μgDNA模板、高压灭菌的双蒸至最终体积为16μl;沸水水浴10min变性DNA,迅速放入水中冷却2min;加4μl地高辛引物混合至离心管中并简单离心;在37℃温箱内孵化20h以上;65℃加热10min终止反应,即标记探针。
[0036] 3、经过反复试验,确定ALV-J核酸探针与ALV接毒细胞DNA的最佳杂交反应程序,基本步骤如下:
[0037] 裁一张适当大小带正电尼龙膜,划好格子(0.7mm×0.7mm);提取接毒细胞DNA1μl点于膜上(流程图1),稍微凉干;将尼龙膜放于变性液(0.5mol/L NaOH,1.5mol/L NaCl)变性10min,再放于中和液(0.5mol/L Tris-cl,3.0mol/L NaCl)中和5min;用2×SSC(0.03mol/L柠檬酸钠,0.3mol/L NaCl)冲洗1min,处理后的尼龙膜可放在2-8℃较长时间保存;将尼龙膜放于80℃烤箱干烤2h,固定DNA(流程图2);将尼龙膜加入装有地高辛预杂交液(DIG High Prime DNA Labeling and Detection Starter Kit I)的无菌三瓶中,42℃,30min,其间经常摇晃(流程图3);加冷却的标记探针(浓度50-80ng/μl)于预热杂交液,混合后不产生泡沫,即制备成探针杂交液(探针稀释浓度20-30ng/ml左右);将尼龙膜放于含有探针的杂交液中(流程图7),温度范围42-54℃,培养过夜(10h);杂交结束后,取尼龙膜放于洗液I(2×SSC,0.1%SDS)中冲洗2次,每次5min,常温15-25℃持续搅动;
然后放于提前预热到65-68℃洗液II(0.5×SSC,0.1%SDS)中冲洗2次,每次15min;室温下,将尼龙膜放培养皿冲洗液中((0.1mol/L马来酸、0.5mol/L NaCl、0.3%Tween20))内浸泡1-5min;放入100ml新配置封闭液中(0.1mol/L马来酸溶液1:10稀释)浸泡,37℃摇晃
30-60min;接着放入抗体稀释液(Anti-Digoxigenin-AP用Blocking solution 1:5000稀释)中浸泡30min;然后在冲洗液中室温洗膜2次,每次15min;在20ml检测液中(0.1mol/L Tris-cl;0.1mol/L NaCl)平衡2-5min(流程图8);避光,观察检测结果呈阳性(流程图
9),建立了ALV-J斑点杂交检测方法。
[0038] 从图2中的检测结果可以看到1、2、3结果阴性,4、5结果阳性,即可确定检测结果。
[0039] 图2中结果说明了本发明检测J亚群禽白血病的斑点杂交效果明显。
[0040] 本发明应用于禽白血病J亚群的病毒快速检测,通过该斑点杂交方法有效地提高了诊断速度,并且能对禽白血病各亚群、马立克氏病、网状内皮组织增生症进行鉴别诊断,降低了养禽业因ALV-J感染而造成的经济损失,为禽肿瘤性病毒诊断方法提供了一种新的思路和方法。
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