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新的纤维细胞生长因子

阅读:1发布:2020-05-18

专利汇可以提供新的纤维细胞生长因子专利检索,专利查询,专利分析的服务。并且本 发明 鉴别 了新的核酸序列,多肽序列,及其核酸调节元件,其编码 成 纤维 细胞 生长因子(FGF),优选FGF-20或FGF-23,这是参与发育、分化和形态发生例如细胞之间 信号 传导及 细胞增殖 的一类多肽。本发明的FGF、其 片段 及衍 生物 具有一或多种以下生物学活性,例如促进 伤口愈合 ;促进神经元存活;刺激如下细胞增殖,例如干细胞,成纤维细胞,神经元,神经胶质细胞,少突胶质细胞,神经膜细胞或其祖细胞增殖;调节细胞分化;诱导胚胎发育;刺激神经突生长;增强神经损伤或神经元损伤恢复;刺激髓鞘形成;刺激血管发生;受体结合活性;调节 肿瘤 发生等。,下面是新的纤维细胞生长因子专利的具体信息内容。

1.一种治疗脊髓损伤;脊髓创伤;由缺血发作、梗塞、出血或 动脉瘤引起的神经组织损伤;Huntington′s病;脊髓病;脊髓炎; 脊髓空洞症的方法,包括为需要治疗的患者施用有效量的FGF-20 多肽或其生物活性片段
2.权利要求1的方法,其中所述FGF-20多肽来源于人。
3.权利要求2的方法,其中所述多肽具有FGF-20特异性免疫 原性活性。
4.权利要求1的方法,其中所述多肽包含图1所示第1-211 位基酸。
5.权利要求1的方法,其中所述多肽与图1所示人FGF-20的 第1-211位氨基酸具有95%序列相同性,且所述FGF-20具有FGF 活性。
6.权利要求2的方法,其中所述多肽与图1所示人FGF-20的 第1-211位氨基酸具有95%序列相同性,且所述FGF-20具有FGF 活性。
7.一种治疗脊髓损伤;脊髓创伤;由缺血发作,梗塞,出血或 动脉瘤引起的神经组织损伤;Huntington′s病;脊髓病;脊髓炎; 脊髓空洞症的方法,包括为需要治疗的患者施用有效量的具有编码 FGF-20多肽或其生物活性片段的核苷酸序列的核酸。
8.权利要求7的方法,其中所述核酸来源于人。
9.权利要求8的方法,其中所述核苷酸序列不间断地编码FGF- 20。
10.权利要求7的方法,其中所述核苷酸序列与图1所示核苷酸 序列具有95%序列相同性。
11.权利要求8的方法,其中所述核苷酸序列与图1所述核苷酸 序列具有95%序列相同性。
12一种治疗肾上腺脑白质营养不良,渐进性多病灶脑白质病, 脑脊髓炎,Guillian-Barre综合征,异型球蛋白血症,或慢性炎症性 脱髓鞘多神经病变的方法,包括为需要治疗的患者施用有效量的具 有编码FGF-20多肽或其生物活性片段的核苷酸序列的核酸。
13.权利要求12的方法,其中所述FGF-20多肽来源于人。
14.权利要求13的方法,其中所述多肽具有FGF-20特异性免 疫原性活性。
15.权利要求12的方法,其中所述多肽包含图1所述第1-211 位氨基酸。
16.权利要求12的方法,其中所述多肽与图1所示人FGF-20 的第1-211位氨基酸具有95%序列相同性,且所述FGF-20具有FGF 活性。
17.权利要求13的方法,其中所述多肽与图1所示人FGF-20 的第1-211位氨基酸具有95%序列相同性,且所述FGF-20具有FGF 活性。
18.一种治疗肾上腺脑白质营养不良,渐进性多病灶脑白质病, 脑脊髓炎,Guillian-Barre综合征,异型球蛋白血症,或慢性炎症性 脱髓鞘多神经病变的方法,包括为需要治疗的患者施用有效量的具 有编码FGF-20多肽或其生物活性片段的核苷酸序列的核酸。
19.权利要求18的方法,其中所述核酸来源于人。
20.权利要求19的方法,其中所述核苷酸序列不间断编码 FGF-20。
21.权利要求18的方法,其中所述核苷酸序列与图1所示核苷 酸序列具有95%序列相同性。
22.权利要求19的方法,其中所述核苷酸序列与图1所示核苷 酸序列具有95%序列相同性。
23.一种促进移植物存活的方法,包括为需要治疗的患者施用 有效量的FGF-20多肽或其生物活性片段。
24.权利要求23的方法,其中所述FGF-20多肽来源于人。
25.权利要求24的方法,其中所述多肽具有FGF-20特异性免 疫原性活性。
26.权利要求23的方法,其中所述多肽包含图1所示第1-211 位氨基酸。
27.权利要求23的方法,其中所述多肽与图1所示人FGF-20 的第1-211位氨基酸具有95%序列相同性,且所述FGF-20具有FGF 活性。
28.权利要求24的方法,其中所述多肽与图1所示人FGF-20 的第1-211位氨基酸具有95%序列相同性,且所述FGF-20具有FGF 活性。
29.一种促进移植物存活的方法,包括为需要治疗的患者施用 有效量的具有编码FGF-20多肽或其生物活性片段的核苷酸序列的 核酸。
30.权利要求29的方法,其中所述核酸来源于人。
31.权利要求30的方法,其中所述核苷酸序列不间断编码FGF- 20。
32.权利要求29的方法,其中所述核苷酸序列与图1所示核苷 酸具有95%序列相同性。
33.权利要求30的方法,其中所述核苷酸序列与图1所示核苷 酸序列具有95%序列相同性。

说明书全文

发明背景

纤维细胞生长因子在许多生物学功能包括例如细胞增殖和分 化以及发育中发挥重要作用。

发明描述

已经鉴别了编码成纤维细胞生长因子(FGF)、优选FGF-20(在 与本申请相应的临时申请中称为FGF-21)或FGF-23(与公布的 FGF-22相同)的新的核酸,多肽序列,及其核酸调节因子,这是 一类参与发育、分化和形态发生(例如细胞之间信号传导及细胞增 殖)的多肽。本发明的一种FGF,其片段及其衍生物,具有一或多 种以下生物学活性,包括但非限于;FGF活性;及FGF特异性免 疫原性活性。根据本发明,鉴别了至少两类新FGF,例如FGF-20 和FGF-23。

“FGF活性”是指例如促进伤口愈合;促进神经元存活;刺激 细胞增殖,例如干细胞、成纤维细胞、神经元、神经胶质细胞、少 突胶质细胞、神经膜细胞或它们的祖细胞增殖;调节细胞分化;诱 导胚胎发育;刺激神经突长出;增强神经或神经元损伤恢复;刺激 髓鞘形成;刺激血管发生;受体结合活性;调节肿瘤发生等。

“FGF特异性免疫原性活性”是指例如FGF多肽激发针对FGF 的选择性免疫应答,例如针对哺乳动物FGF-20的选择性免疫应答。 因此,由选自哺乳动物FGF(例如图1和图2中的FGF)的基酸 序列刺激抗体、T细胞、巨噬细胞、B细胞、树突细胞,是一种特 异性免疫原性活性。这些应答可以常规测定。

FGF,如FGF-20或FGF-23,是全长哺乳动物多肽,其具有可 得自天然来源的氨基酸序列,并具有一或多种上述活性。其可以具 有图1和图2所示序列,序列中具有起自起始密码子止于终止密码 子的一个开放读框。其包括天然发生的正常序列,天然发生的突变 序列,及天然发生的多态性序列,包括单核苷酸多态性(SNP)等 序列。天然来源包括例如活细胞,例如得自组织或完整有机体,培 养细胞系,包括原代及无限增殖化细胞系,活检组织等。

本发明还涉及哺乳动物FGF的片段。所述片段优选是“生物 活性的”。“生物活性的”是指所述多肽片段在活系统或活系统成分 中具有活性。生物活性包括那些提及的活性,例如FGF活性,如FGF 受体结合活性,及FGF免疫原性活性。片段可以根据任何所需方 法制备,包括化学合成,遗传工程,裂解产物等。FGF的生物学片 段包括这样的多肽,其在蛋白质的羧基或氨基端的氨基酸序列被除 去或修饰。

FGF-20和FGF-23的任何可公开获得的核酸片段及多肽片段, 或其同源片段,均不包括在本发明内,例如g5762262,其是从 Xenopus laevis中鉴别的相似序列。可公开获得的核酸的核苷酸及 氨基酸序列可以通过查询公共数据库而鉴别。

本发明还涉及一种FGF-20,其具有图1所示的第1-211位推 导氨基酸序列,及一种FGF-23,其具有图2所示的第1-169位推 导氨基酸序列。推断FGP-20的分子量为大约23.5kdal,pI为大约 9.25。推断FGF-23的分子量为大约19.6kdal,pI为大约12.32。

蛋白质的相同性程度是指蛋白质中相同的氨基酸数目与氨基酸 残基总数的比值:相似性程度是指相同的氨基酸残基数加上保守取 代的氨基酸数(如用V取代L等)与氨基酸残基总数的比值。对 于DNA,相同性与相似性相同,均是指相同核苷酸数与总长度的 比值。

本发明的FGF多肽,例如具有图1和图2所示氨基酸序列, 可以通过任何适当方法分析以鉴别所述多肽中其它结构和/或功能 结构域,包括跨膜区域,疏区域。例如FGF多肽可以通过例如 以下所述方法分析;Kyte和Doolittle,分子生物学杂志157:105,1982; EMBL Protein Predict;Rost和Sander,蛋白质19:55-72,1994。

本发明FGF的其它同源物可以根据不同方法得自哺乳动物和 非哺乳动物来源。例如,可利用与衍生自图1和图2的寡核苷酸杂 交选择同源物,例如Sambrook等,分子克隆1989,第11章所述。 这种同源物可以具有与GENE不同数量的核苷酸及氨基酸序列相同 性和相似性。哺乳动物生物体包括例如啮齿动物,小鼠,大鼠,仓 鼠,猴子,猪,等。非哺乳动物生物体包括例如脊椎动物,无脊 椎动物,斑鱼,鸡,果蝇,C.elegans,Xenopus,酵母如S.pombe, S.cerevisiae,蛔虫,原核生物,植物,Arabidopsis,病毒,artemia 等。

本发明还涉及FGF特异性氨基酸序列,例如见于图1和图2 的特定序列中的一个指定氨基酸序列,见于本发明FGF中的保守 氨基酸基序。可以使用相关蛋白质之间的对比,如其它相关FGFs(见 例如Venkataraman等,美国科学院院报96:3658-3663,1999),以选 择特异于FGF的序列。

例如,对比FGF-20和FGF-23的蛋白质序列,并基于与图1 和图2所示同源的保守区域产生氨基酸基序。本发明涉及任何核酸 或其多肽序列,例如包含三或多个保守或同源残基的多肽,例如 LYGS,HFLP,VQGTR,RIEENGHNTY,QFEENWYNTY,AGTPSA, AAERSA等。其它特异性和/或保守氨基酸序列可以常规发现,例 如通过使用BLAST计算机程序查询基因/蛋白质数据库而发现。 FGF特异性氨基酸序列或基序可以用于产生作为抗原的肽,以产生 特异性免疫应答。通过这种免疫获得的抗体可以用作哺乳动物FGF 蛋白的特异探针以进行诊断或研究。

正如所论及的,本发明多肽可以包含FGF的不同氨基酸序列 (例如全长序列,即具有图1和图2所示起始和终止密码子,成熟 氨基酸序列,即FGF多肽是作为前体产生,所述前体被加工成成 熟多肽,或这些序列的片段)。有用的片段包括例如包含或基本由 任何前述结构域及特异的和保守的氨基酸序列组成的片段。

本发明FGF多肽的片段可以加以选择以具有特异生物活性, 例如FGF受体结合活性或免疫原性活性。

这些活性的测定见于下文及实施例所述。这些多肽也可以如EP 496 162所述鉴别和制备。一个有用片段可包含或基本上由例如图1 和图2所示的大约9个连续氨基酸,优选大约10,15,20,30,40 个连续氨基酸组成。

本发明的多肽也可以与图1和图2所示氨基酸序列具有100% 或略低的氨基酸序列相同性。针对以下论述;序列相同性是指在对 比序列的相应位置发现与图1和图2所示序列相同的核苷酸或氨基 酸。与图1和图2所示氨基酸序列具有低于100%序列相同性的多 肽,可以含有与天然发生序列不同的取代,包括同源和非同源氨基 酸取代。同源氨基酸取代实例见以下所述。基于FGF多肽序列对 比,相同和同源残基总和除以残基总数等于序列相似性百分率。为 计算序列相同性和相似性,将对比序列进行序列对比,并根据任何 所需方法,公式,计算机程序等计算,包括例如FASTA,BLAST。 与图1和图2所示氨基酸序列具有低于100%氨基酸序列相同性的 多肽,可以具有大约99%,98%,97%,95%,90.5%,90%,85 %,70%或低如大约60%序列相同性。

本发明还涉及FGF-21和FGF-23的FGF多肽突变蛋白,即具 有与得自天然来源的氨基酸序列不同的氨基酸序列的任何多肽(哺 乳动物FGF的片段与天然发生的FGF尽管氨基酸数目不同但在氨 基酸序列上没有差异)。因此,FGF多肽突变蛋白包含氨基酸取代, 插入和缺失,包括非天然发生的氨基酸。

本发明FGF氨基酸序列的突变蛋白还可以基于从基因数据库 (例如Genbank,EMBL)中进行同源性查询而制备。序列同源性 查询可以通过各种方法实现,包括BLAST计算机程序,Smith- Waterman公式等。通过鉴别及对比多肽之间一个结构域内的相同 和/或同源氨基酸,然后基于这种序列对比修饰一个氨基酸,可以将 突变蛋白导入一个序列中。例如,本发明的FGF与各种已知FGF 呈现序列相同性,例如Venkataraman等,美国科学院院报96: 3658-3663,1999所述。这些多肽之间的序列对比,尤其在 Venkataraman等氨基酸取代的表1中鉴别的保守氨基酸残基对比, 可以鉴别修饰后预期会降低、减少或消除FGF生物活性如受体结 合活性的残基。例如,当序列对比揭示出在两或多个结构域之间保 守的相同氨基酸时,预计所述氨基酸的消除或取代会负面影响其生 物活性。

氨基酸取代可以通过用一个同源氨基酸取代另一个氨基酸而产 生。同源氨基酸可以基于侧链的大小和极化程度限定,包括小型非 极性氨基酸;半胱氨酸,脯氨酸,丙氨酸,苏氨酸;小型极性氨基 酸;丝氨酸,甘氨酸,天冬氨酸,天冬酰胺;大型极性氨基酸;谷 氨酸,谷氨酰胺,赖氨酸,精氨酸;中等极性氨基酸;酪氨酸,组 氨酸,色氨酸;大型非极性氨基酸:苯丙氨酸,甲硫氨酸,亮氨酸, 异亮氨酸,缬氨酸。同源氨基酸还可以如下分组:无电荷的极性R 组,甘氨酸,丝氨酸,苏氨酸,半胱氨酸,酪氨酸,天冬酰胺,谷 氨酰胺;酸性氨基酸(负电荷的),天冬氨酸和谷氨酸;性氨基 酸(正电荷的),赖氨酸,精氨酸,组氨酸。同源氨基酸还包括如 下所述那些氨基酸:Dayhoff,蛋白质序列和结构图5,1978,及 Argos,EMBO杂志8,779-785,1989。

本发明涉及突变蛋白多肽及编码这种多肽的突变蛋白核酸。因 此,本发明涉及图1和图2所示核苷酸序列,其中所述编码多肽及 一或多个氨基酸位置的核酸被取代或缺失,或既取代又缺失,并且 由所述核酸编码的多肽具有一种生物活性,例如增强神经或神经元 损伤恢复。一种多肽突变蛋白及其相应核苷酸编码序列可以具有图 1和图2所示氨基酸序列,但在一或多个位置由同源氨基酸取代, 例如具有1,5,10,15或20个取代。修饰怎样影响所述活性可以 根据上述,下述及本领域技术人员已知的方法测定。例如本领域已 知许多分析FGF活性的方法,包括例如测定神经元存活及其它神 经营养活性的分析,如实施例中所述及例如Kanda等,li7t.J.Devl. Neuroscie7tce,12(3):191-200,1999所述,及FGF受体结合活性分 析。

正如所述的,氨基酸取代也可以基于与相关其它FGF的相似 性而产生。其它突变可以通过修饰或突变图1和图2所示核苷酸序 列,及选择那些影响其一或多种活性的突变的而常规选择,例如根 据以下所述方法和实施例通过测定活性选择。

本发明的哺乳动物FGF,其片段或取代的多肽还可以包含各种 修饰,其中这类修饰包括脂质修饰,甲基化,磷酸化,糖基化,共 价修饰(例如R组氨基酸),氨基酸取代,氨基酸缺失,或氨基酸 添加。对所述多肽进行修饰可以根据多种方法实现,包括重组,合 成,化学法等。

本发明多肽(例如全长多肽,其片段,其突变体)可以以多种 方式应用,例如在分析中作为针对抗体的免疫原,作为生物活性剂 (例如具有一或多种与本发明FGF相关的活性)。

编码本发明FGF的多肽,其衍生物,或其片段,可以与一或 多个结构结构域,功能结构域,可检测结构域,抗原结构域,和/ 或感兴趣的所需多肽组合,以非天然存在的方式排列,即它们是非 天然发生的。包含这种特征的多肽是一种嵌合或融合多肽。这种嵌 合多肽可以根据多种方法制备,包括化学,合成,准合成,和/或 重组方法。编码嵌合多肽的一种嵌合核酸在一个连续(例如具有多 个N-末端结构域以稳定或增强活性)或间断的开放读框中,可以 含有连续的多个结构域或所需的多肽,例如含有内含子,剪接位点, 增强子等。所述嵌合核酸可以根据多种方法生产。见例如美国专利 No.5,439,819所述。结构域或所需多肽可以具有任何所需性质,包 括一种生物功能如信号传导,生长促进,细胞定向(例如信号序列, 靶向序列,如定向至内质网或核)等,一种结构功能如疏水性,亲 水性,跨膜等,受体-配体功能,和/或可检测功能,例如与酶, 荧光多肽,绿荧光蛋白组合(Chalfie等,科学263:802,1994;Cheng 等,自然生物技术14:606,1996;Levy等,自然生物技术14:610,1996) 等。另外,一种多肽,或其一部分,当导入宿主细胞中时可以用作 检测标记。例如编码本发明氨基酸序列的核酸,可以在读框中融合 一个所需编码序列,作为进行纯化,选择或生产的标记。所述融合 区域可以编码一个切割位点以易于表达,分离,纯化等。

本发明多肽可以在一个表达系统中生产,例如在根据本发明的 体内、体外、无细胞、重组、细胞融合等表达系统中。通过这种系 统对所述多肽进行的修饰包括糖基化,氨基酸取代(例如通过使用 不同密码子),多肽加工如消化,切割,内肽酶或外肽酶活性,附 加化学组分,包括脂质和磷酸等。

本发明多肽可以根据常规方法从天然来源,转化的宿主细胞(培 养基或细胞)中回收,包括去污剂提取(例如非离子型去污剂,Triton X-100,CHAPS,octylglucoside,Igepal CA-630),硫酸铵或乙醇沉淀, 酸提取,阴离子或阳离子交换层析,磷酸纤维素层析,疏水作用层 析,羟磷灰石层析,凝集素层析,凝胶电泳。需要时在完成成熟蛋 白质构型中可以使用蛋白质重折叠步骤。最后,可以使用高效液相 层析(HPLC)进行纯化。FGF多肽也可以用本领域已知的其它FGF 分离方法分离,例如以下所述多种FGF分离方法:美国专利 5,604,293,5,395,756,5,155,214,4,902,782及Santos-Ocampo等, 生物化学杂志271:1726-1731,1996(从细菌宿主中纯化FGF,如从 大肠杆菌中纯化)。另一种方法是与一个亲和标记(Flag表位,HA 表位,myc表位,6×组氨酸,麦芽糖结合蛋白,壳多糖酶等)一 起重组表达FGF,然后通过抗标记抗体缀合的亲和层析纯化。

本发明还涉及核酸,如编码本发明FGF多肽及其片段的DNA 和RNA。FGF核酸(如FGF-20或FGF-23)或其片段,是具有可 得自天然来源的核苷酸序列的核酸。其因此包括天然发生的序列, 正常序列,天然发生的突变体,及天然发生的多态等位基因(例如 SNP)等。天然来源包括例如得自组织和完整生物体的活细胞,肿 瘤,培养的细胞系,包括原代和无限增殖的细胞系。

本发明的核酸序列可以含有如图1和图2所示完整编码序列, 其简并序列和片段。本发明的核酸序列还可以包含一个核苷酸序 列,其与上述和下述任何核苷酸序列均100%互补,例如是它们的 反义序列。

本发明的核酸序列可以得自许多不同来源。其可以得自DNA 或RNA,如聚腺苷酸化mRNA,例如分离自组织,细胞或整个生 物体。所述核酸可以直接得自DNA或RNA,或得自cDNA文库。 所述核酸可以得自特定发育阶段的细胞或组织(例如得自胚胎或成 人心脏或骨骼肌细胞或组织),具有所需基因型,表型等。

如以上关于FGF多肽的论述,包含编码本发明多肽的核苷酸 序列的核酸,可以包括仅编码序列;编码序列和附加的编码序列(例 如编码前导肽,分泌性肽,导向肽,酶促肽,荧光肽或其它诊断性 肽的序列),编码序列和非编码序列,例如在5’或3’末端或分散 于编码序列中的非翻译序列,例如内含子。包含不间断编码多肽的 核苷酸序列的核酸,是指所述核苷酸序列含有一个FGF氨基酸编 码序列,所述编码序列不被非编码核苷酸中断或介于其间,例如没 有内含子。这种核苷酸序列还可以称为是连续的。编码人,小鼠, 或其它哺乳动物FGF等的基因组DNA可以常规获得。

本发明的核酸还可以包含一个表达控制序列,其可操纵地连接 于上述核酸。术语“表达控制序列”是指一个核酸序列,其调节由 与其可操纵连接的核酸编码的多肽表达。表达可以在mRNA或多 肽水平调节。因此,所述表达控制序列包括mRNA元件和蛋白质 相关元件。这种元件包括启动子,增强子(病毒或细胞的),核糖 体结合序列,转录终止子等。当所述表达控制序列的定位方式使得 实现或达到所述编码序列表达时,表达控制序列就是可操纵地连接 于所述核苷酸编码序列。例如,当一个启动子可操纵地连接于编码 序列的5’时,该编码序列的表达由该启动子驱动。表达控制序列 可以异源于正常基因或者可以是其内源性的。

本发明的核酸可以基于核酸杂交而选择。两个单链核酸制备物 杂交在一起的能是其核苷酸序列互补性的测定标准,例如核苷酸 之间的碱基配对如A-T,G-C等。本发明因此还涉及与包含图1和 图2所示核苷酸序列的核酸杂交的核酸及其互补体。与图1和图2 的序列杂交的核苷酸序列具有互补核酸链,或在存在聚合酶(即一 种适当的核酸合成酶)的情况下作为模板。本发明包括核酸的两条 链,例如有义链和反义链。

可以选择杂交条件以选择与图1和图2所示核苷酸序列具有所 需量核苷酸互补性的核酸。能与这种序列杂交的核酸,优选序列之 间具有例如大约85%,更优选90%,92%,及特别优选95%,97% 或100%互补性。本发明特别涉及与图1和图2所示核苷酸序列在 低或高严格条件下杂交的核酸序列。

可以用多种方式选择与FGF序列杂交的核酸。例如,印迹(即 含有核酸的基质),芯片阵列,及其它包含感兴趣核酸的基质,可 以在预杂交溶液(6×SSC,0.5%SDS,100μg/ml变性的鲑精DNA, 5×Denhardt′s溶液,和50%甲酰胺)中于30℃温育过夜,然后 根据已知程序与可检测寡核苷酸探针(见下文)在杂交溶液(例如6 ×SSC,0.5%SDS,100μg/ml变性鲑精DNA和50%甲酰胺)中于42 ℃杂交过夜。在高严格条件下洗涤印迹,以使例如碱基对错配少 于5%(例如在65℃在0.1%SSC和0.1%SDS中洗涤两次各30分 钟),即选择具有95%或更高序列相同性的序列。高严格条件的其 它非限制实例包括在含有30mM NaCl和0.5%SDS的水相缓冲液 中于65℃最后洗涤一次。另一种高严格条件例如是在7%SDS, 0.5M NaPO4,pH7,1mM EDTA中于50℃杂交例如过夜,随后 在42℃用1%SDS溶液洗涤一或多次。

高严格性洗涤可以使错配少于5%,而不严格或低严格性洗涤 条件(例如在37℃在0.2%SSC和0.5%SDS中洗涤两次各30分 钟)可以使错配接近20%。低严格条件的另一个非限制性实例包括 在42℃在含有30mM NaCl和0.5%SDS的缓冲液中最后洗涤一 次。洗涤和杂交也可以如Sambrook等,分子克隆,第9章所述进 行。

杂交也可以基于计算所述探针与其靶位之间形成的杂交体的解 链温度(Tm)而进行,如Sambrook等所述。通常地,解链温度Tm 是在此温度短寡核苷酸(含有18个核苷酸或更少)将从其靶序列 中解链,该温度如下计算:Tm=(A和T的数目)×2℃+(C和G 的数目)×4℃。针对较长的分子,Tm=81.5+16.61og10[Na+]+0.41 (%GC)-600/N,其中[Na+]是钠离子的摩尔浓度,%GC是探针中 GC碱基对的百分率,N是长度。杂交可以在低于该温度的一些温 度进行,以保证所述探针和靶位可以杂交。通过进一步降低温度可 以允许错配。。

可以选择严格条件以分离在探针(例如FGF的寡核苷酸)和 靶核酸之间具有例如至少大约95%,优选97%核苷酸互补性的序列 及其互补体。

根据本发明,核酸或多肽在图1和图2所示核苷酸或氨基酸序 列中可以包含一或多个不同之处。对核苷酸和/或氨基酸序列进行 改变或修饰可以通过任何适当方法实现,包括定点或随机诱变。。

本发明的编码哺乳动物FGF如FGF-20或FGF-23的核酸,可 以包含在天然发生的基因中存在的核苷酸,例如天然发生的多态 性,正常或突变等位基因(核苷酸或氨基酸),在哺乳动物自然群 体如人,猴子,猪,小鼠,大鼠或兔子中发现的突变。例如,人FGF 核酸或多肽包含在自然人群中出现的核苷酸或氨基酸。术语“天然 发生的”是指所述核酸可得自天然来源,例如动物组织和细胞,体 液,组织培养细胞,法医样品。天然发生的突变可以包括核苷酸序 列的缺失(例如截短的氨基或羧基端),取代,倒置,或添加。这 些基因可以根据本领域技术人员已知方法通过核酸杂交而检测和分 离。编码本发明哺乳动物FGF的核苷酸序列可以含有在天然发生 的基因,转录物,或cDNA中发现的密码子。例如图1和图2所示, 或者其可以含有编码相同氨基酸序列的简并密码子。例如,可以改 变序列中的密码子以优化所述序列以在所需宿主中表达。

本发明的核酸可以包含例如DNA,RNA,合成的核酸,肽核 酸,修饰的核苷酸,或混合物。DNA可以是双链或单链的。包含 核酸的核苷酸可以根据所需目的通过许多已知键结合,所述键例如 酯,sulfamate,sulfamide,硫代膦酸酯,氨基膦酸酯,甲基膦酸酯, 氨基甲酸等,所述目的例如对核酸酶如RNAase H的抗性,改良体 内稳定性等。见例如美国专利No.5,378,825所述。

可以对所述核酸进行多种修饰,如附着可检测标记(抗生物素 蛋白,生物素,放射性元素),改良杂交,检测或稳定性的组分。 所述核酸分子还可以根据所需方法附于固体支持物,例如硝基纤维 素,磁性顺磁性微球体(例如美国专利No.5,411,863;美国专利 No.5,543,289所述;例如包含磁性,超磁性,顺磁性,超顺磁性化铁和多糖微球体),尼龙,琼脂糖,重氮化纤维素,乳胶固体 微球体,聚丙烯酰胺等。见例如美国专利No5,470,967;5,476,925; 5,478,893所述。

本发明的另一方面涉及寡核苷酸或核酸探针。这种寡核苷酸或 核酸探针可以用于例如检测,定量或分离测试样品中哺乳动物FGF 核酸,或鉴别FGF同源物。在一个优选实施方案中,所述核酸可 以用作寡核苷酸探针,例如在PCR,差异展示,基因芯片(例如 Affymetrix GeneChips;美国专利No.5,143,854,美国专利No, 5,424,186;美国专利No.5,874,2 19;PCT WO92/10092;PCT WO 90/15070)和其它所用方法中。针对包括研究,诊断和法医学目的 在内的许多不同目的,需要进行检测。针对诊断目的,需要鉴别样 品中核酸序列的存在或数量,其中所述样品得自组织,细胞,体液 等。在一个优选方法中,本发明涉及一种检测核酸的方法,包括将 测试样品中靶核酸与一种寡核苷酸在有效实现所述靶核酸与所述寡 核苷酸杂交的条件下接触;及检测杂交情况。本发明的寡核苷酸还 可以用于合成核酸的扩增中,如PCR(例如Saiki等,科学241:53, 1988;美国专利No.4,683,202;PCR方案:方法和应用指导,Innis 等编辑,学术出版社,纽约1990);差异展示(见例如Liang等,核 酸研究21:3269-3275,1993;美国专利No.5,599,672;WO97/18454)。

可以与针对其它基因的寡核苷酸组合完成检测,所述其它基因 例如参与信号转导,生长,癌症,细胞程序死亡的基因,或上述或 下述任何基因等。寡核苷酸还可以用于测试突变,例如使用错配 DNA修复技术,如美国专利No.5,683,877;美国专利No.5,656,430; Wu等,美国科学院院报89:8779-8783,1992所述。

本发明的寡核苷酸可以包含图1和图2的任何连续核苷酸序列 或其互补序列,或者任何所述序列或其互补序列。本发明的这些寡 核苷酸(核酸)可以是任何所需大小,例如大约10-200个核苷酸, 12-100个核苷酸,优选12-50个,12-25个,14-16个,至少 大约15个,至少大约20个,至少大约25个核苷酸等。所述寡核 苷酸可以具有非天然发生的核苷酸,例如肌苷,AZT,3TC等。所 述寡核苷酸与图1和图2所示序列可以具有100%相同性或互补, 或者其可以具有错配或核苷酸取代,例如1,2,3,4或5个取代。 例如,所述寡核苷酸与图1和图2所示序列可以具有70-99%相同 性,例如90,95或97%相同性。根据本发明,所述寡核苷酸可以 包含一个试剂盒,其中所述试剂盒包括一种所需的缓冲液(例如磷 酸盐缓冲液,tris缓冲液等),检测成分等。所述寡核苷酸可以用本 领域已知放射性或非放射性标记加以标记。

本发明的另一方面是哺乳动物FGF独有的一个核苷酸序列。 FGF独有的一个序列,是指FGF中出现的一特定顺序的核苷酸, 例如在图1和图2的核苷酸序列中,但在其它核酸中很少或不常见, 尤其在动物核酸优选哺乳动物如人,大鼠,小鼠等核酸中不存在。 独特的核苷酸序列包括编码图1和图2所示氨基酸的序列或其互补 序列。这种序列在本文所述的及并入参考的任何方法中均可用作探 针。包括有义和反义核苷酸序列。本发明的独特核酸可以常规测定。 包含这个独特序列的核酸可以用作杂交探针,以鉴别包含核酸混合 物的样品中例如人或小鼠FGF的存在情况,例如在Northern印迹 中。杂交可以在高严格条件(如上述)下进行,以选择与所述探针 具有至少95%相同性(即互补性)的核酸(及其可含有编码序列的 互补体),但也可以使用较低严格条件。独特的FGF核苷酸序列也 可以在其5’或3’末端与本专利提及的各种核苷酸序列在读框内 融合,所述序列包括FGF其它部分,酶,GFP等的编码序列,表 达控制序列等。

正如已经论述的,杂交可以根据所需选择性在不同条件下进 行,例如Sambrook等,分子克隆1989所述。例如,为特异性检测 本发明的FGF,可以将寡核苷酸与靶核酸在所述寡核苷酸只与其杂 交的条件下杂交,例如其中所述寡核苷酸与靶核酸100%互补。如 果需要选择低于100%核苷酸互补性的靶核酸,可以使用不同条件, 所述互补性例如是至少大约99%,97%,95%,90%,86.4%,85%, 70%,67%。

本发明的核酸可以根据任何所需方法标记。所述核酸可以使用 放射性示踪物标记,常用的示踪物如32P,35S,125I,3H或14C。放射 标记可以根据任何方法进行,例如在3’和5’末端用放射标记的 核苷酸,多核苷酸激酶(有或无磷酸酶去磷酸作用)或连接酶(根 据欲标记的末端而定)末端标记。也可以使用非放射性标记,将本 发明核酸与具有以下性质的残基组合,所述性质为免疫学性质(抗 原,半抗原),对某些试剂(配体)的特异亲和性,使可检测酶反 应完成的性质(酶或辅酶,酶底物,或参与酶反应的其它物质), 或特征性物理性质如荧光性或发射或吸收所需波长的光等。

本发明的核酸,包括寡核苷酸,反义核酸等,可以用于在所有 器官,组织,细胞等中检测FGF的表达,这通过多种方法进行, 包括Northern印迹,PCR,原位杂交,差异展示,核酸阵列,斑点 印迹等。这种核酸可以特别用于检测FGF的扰乱表达,例如细胞 特异性和/或亚细胞改变。FGF的水平可以单独或与其它基因产物 特别是参与神经元生理的其它基因产物组合测定。

本发明的核酸可以在许多不同系统中表达,根据所需目的在体 内或在体外表达。例如,核酸可以插入表达载体中,导入所需宿主 中,并在有效实现由所述核酸编码的多肽表达的条件下培养。有效 条件包括适于所述宿主细胞产生所述多肽的任何培养条件,包括有 效温度,pH,培养基,培养宿主细胞的培养基中的添加剂(例如如 果所述编码核酸毗邻dhfr基因,则为增强或诱导表达的添加剂,如 丁酸盐或氨甲蝶呤),环己酰亚胺,细胞密度,培养皿等。核酸可 以通过任何有效方法导入细胞中,包括例如裸DNA,磷酸沉淀, 注射,DEAE-葡聚糖介导的转染,与脂质体融合,与增强细胞对其 摄取的制剂缀合,病毒转染。导入本发明核酸的细胞是一种转化的 宿主细胞。所述核酸可以在宿主细胞染色体外或整合入染色体中。 其可以是稳定或瞬时的。根据与宿主细胞的相容性选择表达载体。 宿主细胞包括哺乳动物细胞例如COS,CV1,BHK,CHO,HeLa,LTK, NIH 3T3,293,PAE,人成纤维细胞,人原位肿瘤细胞,睾丸细胞, 神经胶质细胞,神经原,少突胶质细胞,成神经细胞瘤细胞,神经 胶质瘤细胞等,昆虫细胞如Sf9(S.frugipeda)和果蝇,细菌如大肠 杆菌,链球菌,芽孢杆菌,酵母如Sacharomyces,S.cerevisiae,真 菌细胞,植物细胞,胚胎干细胞(例如哺乳动物,如小鼠或人), 神经元干细胞,成纤维细胞,肌细胞,心肌细胞,和T细胞。

表达控制序列根据与宿主相容性及所需目的相似选择,例如高 拷贝数,高数量,诱导,扩增,控制表达。可以应用的其它序列包 括增强子如来自SV40,CMV,RSV的增强子,诱导型启动子,细胞 类型特异性元件,或允许选择性或特异性细胞表达的序列。可以用 于驱动表达的启动子包括例如内源性启动子,细胞信号转导途径中 其它基因的启动子,针对细菌宿主的MMTV,SV40,trp,lac,tac或T7 启动子;或针对酵母的α因子,醇氧化酶,或PGH启动子。RNA 启动子可以用于产生RNA转录物,如T7或SP6。见例如Melton 等,核酸研究19(18):7035-7056,1984;Dunn和Studie,分子生物 学杂志166:477-435,1984;美国专利No.5,891,636;Studier等,基 因表达技术,酶学方法85:60-89,1987。

本发明的核酸或多肽在核酸或蛋白质电泳,层析等中可以用作 大小标记。指定的限制片段可以通过扫描限制位点序列,计算大小, 及进行相应限制消化而确定。

本发明的FGF多肽和核酸可以是“分离的”。术语“分离的” 是指在其原始环境或自然状态中未发现的形式,例如更浓缩的,更 纯化的,从组分中分离的,存在于表达异源FGF基因的细胞裂解 物中。当FGF在转染的细胞系中作为异源基因表达时,将本发明 基因在基因表达的条件下导入细胞中。术语“异源”是指基因已经 通过“人工”导入细胞系中。基因导入细胞系中的方法如上述。表 达FGF基因的转染(或转化)的细胞可以如实施例所述裂解及作 为裂解物(即“分离的”)使用,或可以使用完整细胞系。

通常地,术语“有效条件”是指例如可以达到所需结果的一种 环境。这种环境包括例如缓冲液,氧化剂,还原剂,pH,辅因子, 温度,离子浓度,所用细胞的合适时期和/或阶段(如在细胞周期 的特定部分,或在特定基因被表达的特殊阶段),培养条件(包括 底物,氧,二氧化等)。

为增强稳定性,可以修饰施用的核酸,例如使其对细胞酶,氧 化,还原,核酸酶等有抗性,或增强细胞对其的摄取。可以使用任 何适当修饰,包括例如连接于吖啶嵌入剂和/或疏水尾部的硫代磷 酸酯,甲基磷酸酯,磷酸二酯寡核苷酸,补骨脂素衍生物,2-核糖 修饰,戊糖衍生物,氮碱基衍生物等。见例如美国专利No.5,576,208 和美国专利No.5,744,362所述。在本发明中可以使用的其它衍生 物,修饰等见上述。一般地,本发明的反义核酸可以包含天然发生 核苷酸、非天然发生核苷酸的单体及其组合,以增强细胞摄取和/ 或稳定性。

反义核酸可以作为裸核酸,与促进细胞对其摄取的其它制剂复 合或形成胶囊,注射入细胞中,或任何适当输送方式而施用。

本发明还涉及本发明FGF如FGF-20和FGF-23的使用方法。 这种方法包括针对以下一或多种目的为宿主施用有效量的本发明 FGF或编码该FGF的核酸:促进以下细胞存活和/或增殖,例如神 经元,少突胶质细胞,神经膜细胞,干细胞,尤其神经干细胞,内 皮细胞,化细胞,及能应答FGF-20或FGF-23的任何细胞类型, 例如在细胞表面表达其关联受体(如FGFR 1-4)的细胞,或其祖 细胞;促进伤口愈合;调节细胞分化;诱导胚胎发育;刺激神经突 生长;增强神经或神经元损伤恢复;刺激髓鞘形成;刺激血管发生; 受体结合活性。

本发明还涉及本发明FGF如FGF-20和FGF-23或编码该FGF 的核酸的使用指导和方法。这种方法包括针对以下一或多种目的为 宿主施用有效量的本发明FGF:增强神经和轴突损伤恢复;刺激髓 鞘形成,血管发生,伤口愈合,溃疡愈合,诱导骨缺失修复,促进 移植物存活及诱导胚胎发育。上述应用是FGF促进细胞存活和/或 增殖,抑制和/或刺激某些细胞分化的潜在活性结果。FGF可以诱 导以下来源的干细胞,祖细胞,前体细胞和成熟细胞的存活/增殖: 神经元,少突胶质细胞,神经膜细胞,内皮细胞,角质细胞及表达 任何FGF受体的其它类型细胞。另外,FGF可以通过诱导神经突 生长/延伸而诱导神经元祖细胞分化。

可以进行以下体外和体内分析以测定FGF对上述细胞功能的 活性。

体外分析:

在体外诱导少突胶质细胞增殖:用于测定FGF对细胞增殖作 用的少突胶质细胞是建立的细胞系如N20.1或初级啮齿动物少突胶 质细胞。初级啮齿动物(大鼠)少突胶质细胞和少突胶质细胞祖细 胞可以通过以下一种技术分离和纯化:示差粘附技术(Mitrovic等, 1994);Percol梯度离心(Mattera等,神经化学研究1984,6(1)41-50 及Kim等,神经科学杂志1983年12月;62(1-3):295-301)及免疫 分离。不管少突胶质细胞的来源(初级细胞或细胞系)或其分离和 纯化方法如何,均可以进行少突胶质细胞增殖分析,时间为3,5 和7天。阳性对照物是FGF家族的其它成员如FGF-2或FGF-9。 通过MTT分析和3H-胸苷掺入分析测定细胞增殖。少突胶质细胞 增殖分析也见于Danilenko等,Arch Biochem Biophys.1999 Jan 1:361 (1):34-46。

诱导神经突生长: PC 12分析:可以在PC-12细胞系(衍生自 大鼠嗜铬细胞瘤)(Rydel,1987 Greene,1976)中测试FGF家族新成 员诱导分化和神经突生长情况。另外,由于示出一部分NGF诱导 应答是由于自分泌NGF诱导的FGF-2产生所致,因此可以检测新 FGF对PC12细胞产生NGF正调节的作用(Chevet等,生物化学杂 志1999 Jul 23:274(3):20901-8)。

后根神经节(DRG)中的神经突生长:DGR通过解剖大鼠胎儿 DRG并将其在神经培养基中培养而分离;DRG中神经突生长程度 通过肉眼评价并与未处理的对照组比较确定神经突的数量和长度而 加以量化。

可以对源于成纤维细胞和内皮细胞的细胞进行分析。针对成纤 维细胞,可以使用加以修改的NIH 3T3增殖分析而进行分析。为确 定FGF诱导内皮细胞增殖的作用,可以使用以下细胞:HUVEC细 胞,微血管内皮细胞和主动脉内皮细胞。可如文献中所述进行相关 体外分析,以确定FGF作为治疗剂治疗创伤,溃疡或骨损伤的治 疗潜力。

与CNS再生相关的其它分析包括激活生长相关或存活相关的 基因表达的分析(Meiners等,发育生物学1993 Dec:160(2):480- 93),在体内调节其它生长因子的分析(Yoshida,1992),调节神经元 电生理学的分析(Terlau,1990),作为少突胶质细胞,神经膜细胞或 星形胶质细胞促有丝分裂原或分化因子的活性的分析(Genburger, 1987;Stemple,1988;Kalcheim,Dev Biol.1989 Jul:134(1):1-10; Murphy,1990),促进皮质神经元,海马神经元,运动神经元,感觉 神经元,交感神经元或副交感神经元体外存活的分析(Eckstein,1994; Unsicker等,Ann N.Y Acad Sci.1991:638:300-5;Grothe等,Int J Dev Biol.1996 Feb:40(1):403-10),体外促进运动神经元存活的分 析等。

体内分析:

可例如在以下模型中检测新FGF再形成髓鞘的潜力:a)缺乏 髓磷脂的动物模型,如将来自用FGF处理的供体动物的SVZ细胞 移植入髓磷脂缺乏的小鼠中,并测定少突胶质细胞在体内的延伸; b)去髓鞘动物模型,如PLT诱导的CR-EAE及MBP过继转移诱导 的CR-EAE。也见于Gumpel,1992和Hinks等,分子细胞神经学1999 Aug:14(2):153-68所述分析。

可在以下体内模型中测试FGF诱导神经再生神经保护的能力: 机械损害/损伤模型(横断伞形穹(fimbria fornix)途径,坐骨神经, 脊髓,视神经及横断DRG);由于脑血管损害而造成的神经元损害 模型,如颈动脉闭塞,短暂MCAO闭塞,及缺氧-缺血性脑损伤; 及由于MPTP产生的损害或KA产生的癫痫发作而化学诱导的神经 变性模型。

典型的体内分析包括例如在海马局部缺血后测定神经元损失减 少(Sasaki,1992;MacMillan等,Can J Neurol Sci 1993 Feb:20(1): 37-40),在传导途径损伤后促进皮质神经元存活(Gomez-Pinilla,1992; Peterson等,神经学杂志1996 Feb 1:16(3):886-98),保护前脑基 底胆碱能神经元免于创伤引起的变性,及减少MPTP引起的或损害 引起的黑质神经元损失(Anderson等,自然1998 Mar 24:332(6162): 360-1;Otto,1989;Gomez-Pinilla,1992;Otto,1990);及在体外作为“神 经球”的神经祖细胞的长期生长(参见Svendsen等,神经学趋势1999 Aug:22(S):357-64)。使用的创伤模型也见于如视神经横断(Sievers, 1987);坐骨神经横断(Cordeiro等,Plast Reconstr Surg.1989 June:83 (6):1013-9;Khouri等,显微外科1989:10(3):206-9),横断的 DRG(Aebischer等,神经学研究杂志1989 Jul.?3(3):282-9),脊髓 横断(Cheng等,科学1996 Jul 26:273(5274):510-3 1996),及面神 经损伤(Kuzis 1990);使用的脑血管损伤模型如缺氧-局部缺血性脑 损伤模型(MacMillen,1993)和MCA闭塞模型(Kawamata等,美国科 学院院报1997 Jul 22:94(15):8179-84;Schabitz,1999);及其它神经 变性模型如kianic acid(KA)处理(Liu等,Brain Res 1993 Oct 29:626 (1-2):335-8)或摇摆小鼠中MND(Ikeda等,神经学研究1995 Dec:17 (6):445-8)。

术语“施用”是指将FGF,编码FGF的核酸,或其它活性剂, 输送至靶位,例如创伤,损伤的组织等。FGF可以施用于任何靶位 (例如在体内,在体外或原位),包括培养细胞和具有要治疗的创 伤,病变或疾病的宿主,通过适于达到上述作用的有效途径施用, 例如FGF配方可以通过直接注射入靶位或附近而施用。也可以如 下施用,如局部,肠道,非肠道,静脉内,肌内,皮下,口服,鼻 内,脑内,心室内,池内,颅内,植入所需部位,例如在凝胶泡沫 中,胶原充填的神经中等,例如根据所处理的靶位位置确定。FGF 也可以使用渗透持续施用。FGF还可以作为由细胞摄取的核酸而 施用。施用核酸的方法包括上述那些方法,及本领域已知其它常规 技术。

将有效量的FGF施用于靶位。有效量是这样的数量,其能够 达到所需作用,优选有益或治疗作用。这种数量可以常规确定,例 如通过进行剂量应答实验,其中为靶细胞施用不同剂量以确定达到 所需目的的有效量,例如刺激神经突生长或促进神经元存活。基于 许多因素选择数量,包括施用FGF的环境(例如脑部损伤的患者, 动物模型,组织培养细胞等),处理的细胞的位置,处理的患者或 动物的年龄,健康状态,性别和体重等。

一方面,本发明涉及治疗神经元损伤的方法,如神经损伤或创 伤,脊髓损伤或创伤,由例如发生局部缺血,梗塞,出血和动脉瘤 导致的神经组织损伤,本发明还涉及治疗神经元疾病的方法,例如 神经元变性疾病如Alzheimer′s病,Parkinson′s病,Huntington′s病, 多发性硬化症,脊髓病,脊髓炎和脊髓空洞症等,所述方法包括施 用有效量的本发明FGF。

本发明的FGF可以用于治疗特征在于破坏神经元和少突胶质 细胞的CNS和PNS神经变性和脱髓鞘病变。FGF可用作再生髓鞘 治疗剂以治疗多发性硬化症及其它初级和/或二级CNS或PNS脱髓 鞘病变。CNS初级脱髓鞘病变包括肾上腺性脑白质营养不良,脑白 质病(如渐进性多病灶脑白质病),脑脊髓炎(如急性播散性静脉周脑 脊髓炎)。二级CNS脱髓鞘表示CNS创伤,中毒(氰化物,六氯酚) 或局部缺血(中)中脱髓鞘损伤形成。PNS脱髓鞘病变包括初级 功能失调如Guillian-Barre综合征(GBS),异型球蛋白血症,慢性炎 症性脱髓鞘多神经病变(CIDP)。另外,FGF用于治疗CNS和PNS 神经变性病变,其中神经损伤由于损伤/创伤(机械性,化学性, 脑血管损伤及由于感染和自身免疫应答引起的炎症)所致,及用于 治疗其它神经变性病变。

本发明的FGF还可以用于促进移植物存活。例如,FGF可用 于刺激多种细胞,组织或器官的移植物存活(例如异基因的,等基 因的或自体移植物),所述细胞,组织或器官如皮肤,肌束,骨, 肾脏,角膜等。本发明还涵盖了细胞移植物进入源于神经元,神经 胶质细胞或干细胞的CNS或PNS中。移植物可以制备自天然来源 或通过移植的细胞或组织在体外扩展或通过使用分化的或未分化的 干细胞制备。术语“促进”是指与未处理的细胞,组织或器官相比, 增强经FGF处理的移植的细胞,组织或器官存活。分析移植物存 活的方法是常规方法。

测定移植物存活的分析是本领域常规进行及熟知的。常规体外 分析包括例如MTT,MTS,Thy掺入,存活/死亡细胞分析(例如用 钙黄绿素AM和溴乙锭同源二聚体-EthD-1双重染色),测定总细胞 数,例如通过使用显微镜评估或通过计数细胞的物理方法如使用血 细胞计数仪。常规体内方法包括例如CNS指征,神经学功能改善 检测,或成像技术如MTR,MRS,CT或MRI,有或无Gd增进。

可以根据本发明进行治疗的其它情况包括预防因MI所致心肌 损伤,诱导血管发生,伤口愈合,溃疡愈合,预防骨破坏及诱导新 骨形成,促进移植物存活及诱导胚胎发育。

在治疗上述疾病/状况中有用的FGF活性包括:促进细胞存活 和/或增殖,抑制和/或刺激以下类型细胞分化:诱导以下来源的干 细胞,祖细胞,前体细胞和成熟细胞存活/增殖:神经元,少突胶 质细胞,神经膜细胞,内皮细胞,角质细胞,成骨细胞及表达任何 FGF受体的其它细胞。另外,FGF通过诱导神经突生长/延伸而诱 导神经元祖细胞分化的作用在治疗任何类型神经元损伤/损害中均 有用。

术语“治疗”是指引起所述损伤或疾病改善的任何作用,如促 进神经元,神经胶质细胞,少突胶质细胞,星形细胞,神经膜细胞 等存活,刺激髓鞘形成,刺激细胞增殖等,如上所述。为治疗这种 损伤和疾病,FGF可以配制为组合物,或核酸,并应用于损伤或病 变区域,例如使用外科技术。

本发明的FGF还可以针对本文揭示的任何治疗方法通过施用 核酸而施用,例如在基因治疗中。基因输送载体可以源于病毒或非 病毒来源(见Jolly,癌症基因治疗1:51-64(1994);Kimura,人体 基因治疗5:845-852(1994);Connelly,人体基因治疗1:185-193 (1995);及Kaplitt,自然遗传学6:148-153(1994))。输送包含本发 明治疗剂编码序列的构建体的基因治疗载体可以局部或系统应用。 这些构建体可以利用病毒或非病毒载体方法。这种编码序列的表达 可以施用内源哺乳动物启动子或异源启动子诱导。所述编码序列的 表达可以是组成型或调节性的。

本发明可以应用携带或表达选择的感兴趣核酸分子的重组逆转 录病毒。可以应用的逆转录病毒载体包括如下所述那些载体:EP 0 415 731;WO90/07936;WO94103622;WO93/25698;WO93/25234; 美国专利5,219,740;WO93/11230;WO93/10218;Vile和Hart,癌症 研究53:3860-3864(1993);Vile和Hart,癌症研究53:962-967(1993); Ram等,癌症研究53:83-88(1993);Takamiya等,神经学研究杂志 33:493-503(1992);Baba等,神经外科杂志79:729-735(1993);美 国专利No.4,777,127;GB专利No.2,200,651;及EP 0 345 242。优 选的重组逆转录病毒包括WO91/02805所述那些。

适于与上述逆转录病毒载体构建体一起使用的包装细胞系可易 于制备(见PCT出版物WO95/30763和WO92/05266),并用于产 生生产细胞系(也称为载体细胞系),以生产重组载体颗粒。在本发 明特别优选的实施方案中,包装细胞系从人体(如HT1080细胞) 或水貂亲代细胞系中生产,从而产生在人体血清中可以免于失活的 重组逆转录病毒。

本发明还应用基于α病毒的载体,其可以作为基因输送载体。 这种载体可以从众多α病毒中构建,包括例如新培斯病毒载体, Semliki森林病毒(ATCC VR-67;ATCC VR-1247),Ross River病毒 (ATCC VR-373;ATCC VR-1246)和委内瑞拉马脑炎病毒(ATCC VR- 923;ATCC VR-1250 ATCC VR-1249;ATCC VR-532)。这种载体系 统的代表性实例包括以下所述那些载体系统:美国专利Nos. 5,091,309;5,217,S79;和5,185,440;及PCT出版物Nos.WO92/10578; WO94/21792;WO95/27069;WO95/27044;和WO95107994。

本发明的基因输送载体还可以应用细小病毒如腺伴随病毒 (AAV)载体。代表性实例包括AAV载体,由Srivastava在WO93/09239, Samulski等,病毒杂志63:3822-3S28(1989);Mendelson等,病毒 学166:154-165(1988);及Flotte等,P.N.A.S.90:10613-10617(1993) 所揭示。

腺病毒载体的代表性实例包括以下所述那些载体:Berkner,生 物技术6:616-627(1988);Rosenfeld等,科学252:431-434(1991); WO93/19191;Kolls等,P.N.A.S.915-219(1994);Kass-Eisler等, P.N.A.S.90:11498-11502(1993);Guzman等,循环88:2838-2848 (1993);Guzman等,循环研究73:12021207(1993);Zabner等,细 胞75:207-216(1993);Li等,人体基因治疗4:403-409(1993);Cailaud 等,欧洲神经学杂志5:1287-1291(1993);Vincent等,自然遗传学 5:130-134(1993);Jaffe等,Abat.Gebiet 1:372-378(1992);及Levrero 等,基因101:195-202(1992)。可应用于本发明的腺病毒基因治疗 载体例如还包括以下所述那些:WO94/12649,WO93/03769;WO 93/19191;WO94/28938;WO95/11984和WO~95/00655。可以采用 连接于灭活腺病毒的DNA,如Curiel,人体基因治疗3:147-154(1992) 所述。

可以应用其它基因输送载体和方法,包括连接于或未连接于灭 活腺病毒的聚阳离子浓缩DNA,例如Curiel,人体基因治疗3: 147-154(1992)所述;配体连接的DNA,例如Wu,生物化学杂志264: 16985-16987(1989);真核细胞输送载体细胞,例如见1994年5月 9日提请的美国专利申请No.08/240,030,和美国专利申请No. 08/404,796;光聚合的水凝胶材料的沉积;手握式基因转移粒子枪, 如美国专利No.5,149,655所述;电离辐射,如美国专利No.5,206,152 和WO92/11 033所述;用细胞膜中和或融合核电荷。其它方法如 Philip,分子细胞生物学14:2411-2418(1994)及Woffendin,美国科 学院院报91:1581-1585(1994)所述。

也可以应用裸DNA。裸DNA导入方法例如WO90/11092和美 国专利No.5,580,859所述。使用可生物降解的乳胶珠可改善摄取效 力。DNA包被的乳胶珠在珠被胞吞开始后有效转运至细胞中。进 一步改进所述方法可以通过对所述珠进行处理以提高疏水性,从而 促进内涵体的破坏及所述DNA释放入胞质中。可作为基因输送载 体的脂质体见于美国专利No.5,422,120,PCT专利出版物Nos.WO 95/13796,WO94/23697和WO91/14445,及EP No.0 524 968所述。

适合使用的其它非病毒输送系统包括机械输送系统,如 Woffendin等,美国科学院院报91(24):11581-11585(1994)所述方 法。另外,这种的编码序列和表达产物可以通过光聚合水凝胶材料 的沉积输送。可用于输送编码序列的其它常规基因输送方法,包括 例如使用手握式基因转移粒子枪,如美国专利No.5,149,655所述; 使用电离辐射以激活转移的基因,如美国专利No.5,206,152和PCT 专利出版物No.WO92/11033所述。

本发明还涉及一种刺激细胞增殖的方法,包括施用有效量的 FGF-9(例如Kanda等,如前),FGF-20或FGF-23,或其生物活性 片段。术语“刺激细胞增殖”是指施用的FGF导致细胞分裂或有 丝分裂。FGF可以以任何有效形式(核酸或多肽)施用于任何适当 宿主。

例如,在一个实施方案中,该方法可用于鉴别FGF的兴奋剂 和拮抗剂。在这种情况中,将FGF施用于细胞系、包括建立的和 初级细胞如脊髓运动神经元可以是有用的。建立细胞系包括例如美 国组织培养物保藏中心(atccc.org)中贮存的任何细胞系,包括例如 DBTRG-OSMG,PFSK-1,MSTO-211H,NCI-H378,NCIN41/, NCI-H526,HCN-1A,HCN-2,CATH.a,NG108-15,NCI-H446, NCI-H209,NCI-H146,NCI-H82,NCI-H345,NCI-H510A,D283 Med, D341 Med,C6,IMR-32,Neuro-2a,NB41A3,BC3H1,A172,Mpf, T98G[T98-G],SCP,CCF-STTG1,DI TNCI,CTX TNA2,PG-4(S+L-), G355-5,SW 598[SW-598;SW598],C6/LacZ,9L/lacZ,NIE-115,SH- SY5Y,BE(2)-M17,BE(2)-C,MC-IXC,SK-N-BE(2),CHP212, C6/IacZ7,M059K,M059J,F98,RG2[D74],NCI-H250,NCI-H1915, OAl,TE 615.T,SVG p12,TE671亚系No.2,MBr C11,SK-N-MC,SW 1088[SW-1088;SW1088],SW 1783[SW-1783;SW1783],U-87 MG, U-118 MG,U-138 MG,MDA-MB-361,DU 145,Hs 683,H4,293,PC- 12,P19,NTERA-2cl.D1[NT2/D1],BCE C/D-1b,SK-N-AS,SK-N-FI, SK-N-DZ,SK-N-SH,Daoy,优选N20.1细胞。

FGF的推定兴奋剂和拮抗剂可以在体外施用于已经施用FGF 的细胞,如上述细胞系,或者推定的制剂可以在体外或体内施用于 天然产生FGF的细胞。这种制剂的兴奋或拮抗作用可以用任何本 领域公认的分析测定,如本文所述那些分析。

也可以用本发明FGF刺激神经干细胞以增殖。所得细胞可以 用作移植回其所衍生的同一患者中的神经细胞来源(即自体的), 排除了与异基因移植相关的任何典型问题,如排斥。因此,本发明 方法涉及施用有效量的FGF以刺激神经干细胞增殖和分化,并将 所述干细胞移植回去。

本发明还涉及特异识别本发明FGF的抗体。特异于FGF的抗 体是指所述抗体识别在FGF内或包括其的一个限定氨基酸序列, 如图1和图2所示序列。因此,一种特异性抗体一般与图1和图2 中发现的一个氨基酸序列即一个表位的结合亲和性比与例如通过免 疫印迹分析或其它常规免疫分析检测/测定的一个不同表位的结合 亲和性高。因此,特异于人FGF-21的一个表位的抗体可用于检测 样品中所述表位的存在情况,例如含有人FGF-21基因产物的组织 样品,将其与没有所述表位的样品区分。这种抗体见于Santa Cruz, 生物技术公司研究产品目录并可据此配制。

抗体,例如多克隆抗体,单克隆抗体,重组抗体,嵌合抗体, 人化抗体,可以根据任何所需方法制备。也见于筛选重组免疫球蛋 白文库(例如Orlandi等,美国科学院院报86:3833-3837,1989;Huse 等,科学256:1275-1281,1989);体外刺激淋巴细胞群,Winter和 Milstein,自然349:293-299,1991。例如,针对单克隆抗体的生产, 可以将图1和图2的多肽以有效量经皮下和/或腹膜内施用于小鼠, 山羊或兔,有或无佐剂,以激发免疫应答。所述抗体也可以是单链 或Fab片段。所述抗体可以是IgM,IgG,亚型,IgG2a,IgGI等。 抗体和免疫应答也可以通过施用裸DNA而产生。见例如美国专利 Nos.5,703,055;5,589,466;5,580,859所述。

用于诱导抗体的FGF或其片段不需要具有生物活性;然而, 其在单独或与载体组合的情况下必需具有免疫原性活性。用于诱导 FGF特异性抗体的肽可以具有由至少5个氨基酸,优选至少10个 氨基酸组成的氨基酸序列。FGF氨基酸的短序列,例如5个氨基酸, 可以与另一种蛋白质如匙孔嘁血蓝蛋白融合,或与另一种有用载体 融合,所述嵌合分子用于抗体生产。在生产抗体中有用的FGF区 域可以凭经验选择,或者可以分析例如从cDNA中推导的GENE 氨基酸序列,以确定高免疫原性区域。选择适当表位的分析例如 Ausubel FM等(1989,分子生物学通用方案,第2卷,John Wiley & Sons)所述。

产生抗体的有用序列包括例如图1和图2所示顺序的序列。这 种序列的抗体可用于区分FGF的不同转录物。见上述。

特定的FGF抗体可用于诊断特征在于FGF数量或分布不同的 前病理改变状态,及慢性或急性疾病。针对FGF的诊断测试包括 利用抗体和标记以检测人(或小鼠等,如果在使用小鼠的情况中) 体液,组织或这种组织的提取物中的FGF。

本发明的多肽和抗体可以加以修饰或不加修饰而使用。通常 地,可以将所述多肽和抗体与提供可检测信号的物质共价或非共价 结合而标记。本领域已知并且在科技和专利文献中均广泛报道过众 多标记和缀合方法。适当的标记包括放射性核素,酶,底物,辅因 子,抑制剂,荧光剂,化学发光剂,磁性粒子等。教导使用这种标 记的专利包括美国专利Nos.3,817,837;3,850,752;3,939,350;3, 996,345;4,277,437;4,275,149和4,366,241。

结合FGF的抗体及其它配体可以通过各种方式使用,包括作 为治疗,诊断和商业研究手段,以在Western印迹,ELISA,免疫 沉淀,RIA中例如确定动物,组织,细胞等中FGF多肽的水平, 鉴别其细胞定位和/或分布,纯化或包含其一部分的多肽,调节其 功能。本发明涉及这种分析,进行这种分析的组合物和试剂盒。利 用这些和其它方法,本发明的抗体可以用于检测各种样品中的FGF 多肽或其片段,所述样品包括组织,细胞,体液,血液,尿液,脑 脊髓液。

另外,也可以制备结合本发明FGF多肽的配体或其衍生物, 例如使用合成的肽文库或aptamers(例如Pitrung等,美国专利No. 5,143,854;Geysen等,免疫学方法杂志102:259-274,1987;Scott等, 科学249:386,1990;Blackwell等,科学250:1104,1990;Tuerk等, 1990,科学249:505)。

本发明还涉及一种根据所需方法制备的FGF多肽,例如美国 专利No.5,434,050中所揭示方法。例如在结合分析中可以使用一种 标记的多肽,以鉴别结合或附于FGF的物质,追踪在细胞,体外, 体内或原位系统中FGF的运动等。

本发明的核酸,多肽,抗体,配体等可以是分离的。术语“分 离的”是指物质处于在其原始环境或自然中未发现的形式,即更浓 缩,更纯化,从成分中分离等。分离的核酸包括例如具有分离自活 动物体中发现的染色体DNA的FGF序列的核酸,例如作为完整基 因,转录物或cDNA。这种核酸可以是载体的一部分或插入染色体 中(通过在其正常位置之外的位置通过特异基因定向或通过随机整 合),而且仍是分离的,不是其自然环境中发现的形式。本发明的 核酸或多肽还可以是基本纯化的。基本纯化是指核酸或多肽是分离 的,而且基本没有其它核酸或多肽,即所述核酸或多肽是主要的及 活性组分。

本发明还涉及一种包含FGF的转基因动物,例如非人哺乳动 物如小鼠转基因动物可以根据已知方法制备,包括例如通过将重组 基因原核注射入单细胞胚的原核中,将人工酵母染色体掺入胚胎干 细胞中,基因定向方法,胚胎干细胞方法学。见例如美国专利Nos. 4,736,866;4,873,191;4,873,316;5,082,779;5,304,489;5,174,986; 5,175,384;5,175,385;5,221,778;Gordon等,美国科学院院报77: 7380-7384,1980;Palmiter等,细胞41:343-345,1985;Palmiter等,Ann. Rev.Genet.,20:465-499,1986;Askew等,分子细胞生物学13:4115- 4124,1993;Games等,自然373:523-527,1995;Valancius和 Smithies,分子细胞生物学11:1402-1408,1991;Stacey等,分子细 胞生物学14:1009-1016,1994;Hasty等,自然350:243-246,1995; Rubinstein等,核酸研究21:2613-2617,1993。本发明的核酸可以导 入任何非人哺乳动物中,包括小鼠(Hogan等,操纵小鼠胚胎实验指 南,冷泉港实验室,冷泉港,纽约1986),猪(Hammer等,自然315: 343-345,1985),绵羊(Hammer等,自然315:343-345,1985),牛, 大鼠或灵长类动物。也见于例如Church,1987,生物技术趋势5:13-19; Clark等,生物技术趋势5:20-24,1987);及DePamphilis等,生物 技术6:662-680,1988。另外,例如特定的转基因大鼠和小鼠具有商 业价值。这些转基因动物是测试GENE功能,作为蛇的食物,作为 遗传标记以检测株系起源(即其中已经插入FGF-21,FGF-23或其 片段)等的有用动物模型。这种转基因动物还可以包含其它转基因。 转基因动物可以根据任何适当方法制备及应用。

所述核酸的其它方面参考分子生物学标准教材。见例如Davis 等,分子生物学基本方法,Elsevir科学出版公司,纽约,1986;Hames 等,核酸杂交,IL出版社,1985;Sambrook等,分子克隆,CSH 出版社1989;Howe,基因克隆和操纵,Cambridge大学出版社, 1995。

附图简述

图1示出FGF-20的核苷酸和氨基酸序列(SEQ ID NO:1和2)。

图2示出FGF-23的核苷酸和氨基酸序列(SEQ ID NO:3和4)。

图3示出FGF-20蛋白与已知FGF家族成员的氨基酸序列对比。 xfgf-20来自Xenopus laevis。

图4示出少突胶质细胞增殖。图4A示出少突胶质细胞增殖。 图4B示出活性通过煮沸所述蛋白质而废除。

图5示出FGF-20对N20.1少突胶质细胞增殖的作用。

图6示出FGF对初级大鼠少突胶质细胞(PRO)增殖的作用。图 6A示出用FGF-2处理的细胞。图6B示出用FGF-20处理的细胞。

图7示出FGF对神经元起源的细胞系存活/增殖的作用。图7A 示出FGF-20的作用。图7B示出FGF-2,FGF-9,和FGF-20的作 用。

图8示出神经突生长。培养的PC12细胞用重组FGF-20加肝 素(左侧)或只用肝素(右侧)处理6天。固定细胞并针对βIII微 管蛋白进行染色,细胞核用7-AAD成象。在只用肝素处理的细胞 中未观测到神经突生长。

图9示出FGF-20是皮质神经元的强有力存活因子。

实施例

实施例1:少突胶质细胞增殖和存活

用于测定生长因子(GF)对细胞增殖作用的少突胶质细胞是 建立的细胞系如N20或初级啮齿动物少突胶质细胞。初级啮齿动物 (大鼠)少突胶质细胞和少突胶质细胞祖细胞通过差示粘附技术 (Mitrovic,1994)和Percol梯度离心(Mattera等,神经化学研究1984, 6(1)41-50;Kim等,神经学杂志1983 Dec:62(1-3):295-301)分离 和纯化。将2.5×104个细胞/ml铺板于96孔平板中进行少突胶质细 胞增殖分析。用生长因子刺激细胞3,5和7天。阳性对照物是FGF 家族的其它成员,如FGF-2或FGF-9。细胞增殖通过MTT分析和3H 胸苷掺入分析测定。

图4,5和6示出FGF20以时间和剂量依赖方式刺激N 20.1少 突胶质细胞系的少突胶质细胞增殖。N20.1细胞用FGF-20的部分 纯化的肝素琼脂糖层析样品处理。增殖通过MTT染色确定。FGF- 20诱导少突胶质细胞增殖(图4A),而且该活性通过煮沸所述蛋白 质而废除(图4B)。

上述观测通过从肝素和S柱中制备部分纯化的物质而证实(图 5)。N20.1细胞用来自肝素或S柱的FGF-20处理。将所述细胞与 FGF-20温育5天,并通过MTT染色确定相对于未处理对照组的增 殖的增加。FGF-9用作阳性对照,并使用适当的相应缓冲液(H和 S)作为阴性对照。部分纯化的物质的活性与FGF-9活性相当。

另外,FGF-20诱导初级大鼠少突胶质细胞增殖(图6B)。少 突胶质细胞用FGF-2(图6A)和FGF-20(图6B)处理。将细胞与 GF温育3天,并通过MTT染色确定超过未处理对照组的增殖增加。 部分纯化的物质的活性与FGF-2相当。FGF-20是少突胶质细胞增 殖的强有力诱导因子,而且其活性与FGF家族其它成员如FGF-2 和FGF-9相当。

实施例2:诱导神经元存活

通过将2.5×104个细胞/ml铺板于96孔平板的低浓度血清培养 基中进行神经元存活分析。在这些条件下,神经元由于生长因子的 除去而发生细胞程序死亡。将细胞用生长因子刺激不同时间,3天 -12天。阳性对照是FGF家族的其它成员如FGF-2或FGF-9。神 经元存活通过MTT测定。

图7和图9示出FGF-20是强有力的神经营养因子,可刺激神 经元起源细胞存活。

将PC 12细胞铺板于存在低浓度血清(1%Nu血清)的96孔 平板中。将包括FGF-20在内的不同生长因子以0.0025-2500ng/ml 浓度加入。在7和10天后,用MTT分析测定相对存活率,并与未 处理的对照组对比。FGF-20的数据示于图7A,FGF-2,FGF-9和 FGF-20的数据示于图7B。

实施例3:诱导神经突生长

FGF-20呈现对PC 12细胞生长有作用。这种作用不依赖于NGF 预处理(见表1和图9)。

在此分析中部分纯化的FGF-21的表现与观测到的FGF-9表现 相似,它们的序列非常相似。另外,对比FGF家族不同成员在PC 12 细胞中诱导神经突生长的活性(FGF-1,FGF-2,FGF-4,FGF-6,FGF-7, FGF-8,FGF-9,FGF-10,FGF-16,FGF-16,FGF17,FGF-18,见表2)。 在此系统中诱导神经突生长的最强有力的FGF是FGF-2和FGF-9 及FGF-20/21。发现两个FGF,即FGF-7和FGF-10,在该系统中 不论肝素存在与否均无活性。

从大鼠胚胎脑(E16)中分离初级大鼠胚胎脑皮质细胞。在显微 镜下切下皮质层,并用Hanks溶液洗6次,不用酶处理而机械性解 离。将神经元在由以下成分组成的培养基中培养:补加10%马血清, 10%FCS,2mM L-谷氨酰胺,HEPES缓冲液的DMEM。在24小 时后,加入由10μM FdU和1μM胞嘧啶阿拉伯糖苷组成的抑制剂 混合物培养3天,以抑制除了神经元之外所有其它细胞增殖。在培 养8天后,收获神经元并铺板于含有低浓度血清(2%Nu血清)培养 基的96孔平板中。加入浓度范围在0.0025-2500ng/ml的不同生长 因子,包括FGF-20。5天后,用MTT分析测定相对存活率并与未 处理的对照对比。

表1:FGF-20在PC 12细胞中是神经突延伸的强有力诱导因子:

如图7所示实验铺板并处理PC 12细胞。加入浓度范围为0.0025- 2500ng/ml的FGF-9和FGF-20。在处理7和12天后,神经突延伸 通过将所述细胞用Wright染色随后用显微镜检测而确定。%生长 (outgrowth)表示估算的细胞数目。

由于FGF-9和FGF20/21处理所诱导的神经突生长的观测概况 如下所示。最高浓度的部分纯化的物质对细胞有毒性,其影响存活 (见图7B)和神经突生长(如下)。

                 在PC 12细胞中神经突延伸

生长因子        浓度                 %生长

                ng/ml          7天         12天

FGF-9          0               0            0

                0.025           <5          5

                0.25            5            10-20

                2.5             5-10         20-30

                25              60           60

                250             90           100

                2500            90-100       100

FGF-21         0               0            0

                0.025           <5          5

                0.25            10           10

                2.5             20-30        30

                25              50           60

                250             90           80

                2500            0            0

表2:神经突生长-不同FGF家族成员之间的对比:

培养的PC 12细胞用FGF处理并目测记录神经突生长。FGF 20 是测试的FGF家族成员中最强有力的神经营养GF。

加入的FGF                应答

FGF-1(酸性FGF)           ++

FGF-2(碱性FGF)           ++++

FGF-4                    +

FGF-6                    +

FGF-7                    -

FGF-8                    ++

FGF-9                    +++

FGF-10                   -

FGF-16                   +

FGF-17                   ++

FGF-18                   ++

FGF-21                   +++

本申请要求申请日为2000年12月8日的美国临时申请60/251, 837的优先权,该申请全文引入本文作参考。

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