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抗TREM2抗体及其使用方法

阅读:725发布:2022-06-07

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1.一种结合到TREM2蛋白的分离的抗体,其中所述抗体诱导一种或多种TREM2活性并且增强由一种或多种TREM2配体与所述TREM2蛋白的结合诱导的一种或多种TREM2活性。
2.如权利要求1所述的分离的抗体,其中与在所述分离的抗体不存在下由一种或多种TREM2配体与所述TREM2蛋白的结合诱导的一种或多种TREM2活性相比,所述抗体增强由所述一种或多种TREM2配体与所述TREM2蛋白的结合诱导的所述一种或多种TREM2活性。
3.如权利要求1或权利要求2所述的分离的抗体,其中所述抗体增强所述一种或多种
TREM2活性而不阻断所述一种或多种TREM2配体与所述TREM2蛋白的结合。
4.如权利要求1或权利要求2所述的分离的抗体,其中所述抗体不与所述一种或多种
TREM2配体竞争结合到所述TREM2蛋白。
5.如权利要求1-4中任一项所述的分离的抗体,其中所述抗体增强所述一种或多种
TREM2配体与所述TREM2蛋白的结合。
6.一种结合到TREM2蛋白的分离的抗体,其中所述抗体诱导一种或多种TREM2活性而不阻断一种或多种TREM2配体与所述TREM2蛋白的结合。
7.如权利要求6所述的分离的抗体,其中所述抗体增强所述一种或多种TREM2配体与所述TREM2蛋白的结合。
8.如权利要求6-7中任一项所述的分离的抗体,其中所述抗体增强由所述一种或多种TREM2配体与所述TREM2蛋白的结合诱导的一种或多种TREM2活性。
9.如权利要求8所述的分离的抗体,其中与在所述分离的抗体不存在下由所述一种或多种TREM2配体与所述TREM2蛋白的结合诱导的一种或多种TREM2活性相比,所述抗体增强由所述一种或多种TREM2配体与所述TREM2蛋白的结合诱导的所述一种或多种TREM2活性。
10.如权利要求1-9中任一项所述的分离的抗体,其中所述抗体与所述一种或多种
TREM2配体协同作用以增强所述一种或多种TREM2活性。
11.如权利要求1-10中任一项所述的分离的抗体,其中所述抗体在TREM2的细胞表面簇集不存在下增强所述一种或多种TREM2活性。
12.如权利要求1-11中任一项所述的分离的抗体,其中所述抗体通过诱导或保持TREM2的细胞表面簇集来增强所述一种或多种TREM2活性。
13.如权利要求12所述的分离的抗体,其中所述抗体通过在一种或多种免疫细胞上表达的Fc-γ受体来簇集。
14.如权利要求13所述的分离的抗体,其中所述一种或多种免疫细胞是B细胞或小神经胶质细胞。
15.如权利要求1-14中任一项所述的分离的抗体,其中由一种或多种TREM2配体与所述TREM2蛋白的结合诱导的所述一种或多种TREM2活性的所述增强在选自由以下组成的组的原代细胞上测量:树突细胞、骨髓衍生的树突细胞、单核细胞、小神经胶质细胞、巨噬细胞、嗜中性粒细胞、NK细胞、破骨细胞、皮肤朗格汉斯细胞、以及库普弗细胞,或在细胞系上测量,并且其中由一种或多种TREM2配体与所述TREM2蛋白的结合诱导的所述一种或多种TREM2活性的所述增强利用体外细胞测定来测量。
16.如权利要求1-15中任一项所述的分离的抗体,其中所述抗体增加可溶性TREM2的平、增加可溶性TREM2的半衰期、或两者。
17.如权利要求16所述的分离的抗体,其中可溶性TREM2的所述水平选自由以下组成的组:TREM2的血清水平、TREM2的脑脊髓液(CSF)水平、TREM2的组织水平、以及其任何组合。
18.如权利要求1-15中任一项所述的分离的抗体,其中所述抗体不结合到可溶性
TREM2。
19.如权利要求18所述的分离的抗体,其中所述抗体不结合到体内可溶性TREM2。
20.如权利要求1-15中任一项所述的分离的抗体,其中所述抗体降低一种或多种细胞中的TREM2的水平。
21.如权利要求20所述的分离的抗体,其中所述抗体降低TREM2的细胞表面水平、降低TREM2的细胞内水平、降低TREM2的总水平、或其任何组合。
22.如权利要求20或权利要求21所述的分离的抗体,其中所述抗体诱导TREM2降解、
TREM2裂解、TREM2内化、TREM2脱落、TREM2表达的下调、或其任何组合。
23.如权利要求20-22中任一项所述的分离的抗体,其中一种或多种细胞中的TREM2的所述水平在选自由以下组成的组的原代细胞中测量:树突细胞、骨髓衍生的树突细胞、单核细胞、小神经胶质细胞、巨噬细胞、嗜中性粒细胞、NK细胞、破骨细胞、皮肤朗格汉斯细胞、以及库普弗细胞,或在细胞系上测量,并且其中TREM2的所述细胞水平利用体外细胞测定来测量。
24.如权利要求1-23中任一项所述的分离的抗体,其中所述TREM2蛋白是哺乳动物蛋白或人蛋白。
25.如权利要求24所述的分离的抗体,其中所述TREM2蛋白是野生型蛋白。
26.如权利要求24所述的分离的抗体,其中所述TREM2蛋白是天然存在的变体。
27.如权利要求1-26中任一项所述的分离的抗体,其中所述TREM2蛋白在人树突细胞、人巨噬细胞、人单核细胞、人破骨细胞、人皮肤朗格汉斯细胞、人库普弗细胞、人小神经胶质细胞、或其任何组合上表达。
28.如权利要求1-27中任一项所述的分离的抗体,其中所述一种或多种TREM2活性选自由以下组成的组:
(a)TREM2结合到DAP12;
(b)DAP12磷酸化
(c)活化Syk激酶;
(d)调控选自由以下组成的组的一种或多种促炎介质:IFN-β、IL-1α、IL-1β、TNF-α、IL-
6、IL-8、CRP、CD86、MCP-1/CCL2、CCL3、CCL4、CCL5、CCR2、CXCL-10、Gata3、IL-20家族成员、IL-33、LIF、IFN-γ、OSM、CNTF、CSF-1、OPN、CD11c、GM-CSF、IL-11、IL-12、IL-17、IL-18、以及IL-23,任选地其中所述调控发生在选自由以下组成的组的一种或多种细胞中:巨噬细胞、M1巨噬细胞、活化的M1巨噬细胞、M2巨噬细胞、树突细胞、单核细胞、破骨细胞、皮肤朗格汉斯细胞、库普弗细胞、以及小神经胶质细胞;
(e)将Syk募集到DAP12/TREM2复合物;
(f)增加一种或多种TREM2依赖性基因的活性,任选地其中所述一种或多种TREM2依赖性基因包括活化T细胞的核因子(NFAT)转录因子;
(g)增加树突细胞、巨噬细胞、M1巨噬细胞、活化的M1巨噬细胞、M2巨噬细胞、单核细胞、破骨细胞、皮肤朗格汉斯细胞、库普弗细胞、小神经胶质细胞、M1小神经胶质细胞、活化的M1小神经胶质细胞、和M2小神经胶质细胞、或其任何组合的存活;
(h)调控选自由以下组成的组的一种或多种刺激性分子的表达:CD83、CD86、II类MHC、CD40、以及其任何组合,任选地其中所述CD40在树突细胞、单核细胞、巨噬细胞、或其任何组合上表达,并且任选地其中所述树突细胞包括骨髓衍生的树突细胞;
(i)增加记忆;以及
(j)减少认知缺陷
29.如权利要求1-28中任一项所述的分离的抗体,其中所述抗体属于IgG类、IgM类、或IgA类。
30.如权利要求29所述的分离的抗体,其中所述抗体属于IgG类并且具有IgG1、IgG2、IgG3、或IgG4同种型。
31.如权利要求30所述的分离的抗体,其中所述抗体具有IgG2同种型。
32.如权利要求30或权利要求31所述的分离的抗体,其中所述抗体包含人IgG2恒定区。
33.如权利要求32所述的分离的抗体,其中所述人IgG2恒定区包括Fc区。
34.如权利要求29-33中任一项所述的分离的抗体,其中所述抗体不依赖于结合到Fc受体而增强所述一种或多种TREM2活性。
35.如权利要求30-34中任一项所述的分离的抗体,其中所述抗体结合抑制性Fc受体。
36.如权利要求35所述的分离的抗体,其中所述抑制性Fc受体是抑制性Fc-γ受体IIB(FcγIIB)。
37.如权利要求36所述的分离的抗体,其中:
(a)所述分离的抗体具有人或小鼠IgG1同种型并且包含在所述Fc区中的在选自由以下组成的组的残基位置处的一个或多个基酸取代:N297A、D265A、D270A、L234A、L235A、G237A、C226S、C229S、E233P、L234V、L234F、L235E、P331S、S267E、L328F、A330L、M252Y、S254T、T256E、L328E、P238D、S267E、L328F、E233D、G237D、H268D、P271G、A330R、以及其任何组合,其中所述残基的编号根据EU编号,或者包含在所述Fc区中的在对应于甘氨酸236的位置处的氨基酸缺失;
(b)所述分离的抗体具有IgG1同种型并且包含IgG2同种型重链恒定结构域1(CH1)和铰链区,任选地其中所述IgG2同种型CH1和铰链区包含氨基酸序列ASTKGPSVFP LAPCSRSTSE STAALGCLVK DYFPEPVTVS WNSGALTSGVHTFPAVLQSS GLYSLSSVVT VPSSNFGTQT YTCNVDHKPS NTKVDKTVERKCCVECPPCP(SEQ ID NO:886),并且任选地其中所述抗体Fc区包含S267E氨基酸取代、L328F氨基酸取代、或两者、和/或N297A或N297Q氨基酸取代,其中所述残基的编号根据EU编号;
(c)所述分离的抗体具有IgG2同种型并且包含在所述Fc区中的在选自由以下组成的组的残基位置处的一个或多个氨基酸取代:P238S、V234A、G237A、H268A、H268Q、V309L、A330S、P331S、C214S、C232S、C233S、S267E、L328F、M252Y、S254T、T256E、H268E、N297A、N297Q、A330L、以及其任何组合,其中所述残基的编号根据EU编号;
(d)所述分离的抗体具有人或小鼠IgG4同种型并且包含在所述Fc区中的在选自由以下组成的组的残基位置处的一个或多个氨基酸取代:L235A、G237A、S228P、L236E、S267E、E318A、L328F、M252Y、S254T、T256E、E233P、F234V、L234A/F234A、S228P、S241P、L248E、T394D、N297A、N297Q、L235E、以及其任何组合,其中所述残基的编号根据EU编号;或者(e)所述分离的抗体具有杂合IgG2/4同种型,并且任选地其中所述抗体包含含有人
IgG2的氨基酸118至260和人IgG4的氨基酸261至447的氨基酸序列,其中所述残基的编号根据EU编号。
38.如权利要求1-28中任一项所述的分离的抗体,其中所述抗体具有IgG4同种型。
39.如权利要求38所述的分离的抗体,其中所述抗体包含在残基位置228处的S228P氨基酸取代、在残基位置234处的F234A氨基酸取代、在残基位置235处的L235A氨基酸取代,其中所述残基位置的编号根据EU编号。
40.如权利要求1-39中任一项所述的分离的抗体,其中所述抗体结合到选自由以下组成的组的氨基酸残基内的一种或多种氨基酸:
i.SEQ ID NO:1的氨基酸残基19-174、或TREM2蛋白上的对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基19-174的氨基酸残基;
ii.SEQ ID NO:1的氨基酸残基29-112、或TREM2蛋白上的对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基29-112的氨基酸残基;
iii.SEQ ID NO:1的氨基酸残基113-174、或TREM2蛋白上的对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基113-174的氨基酸残基;
iv.SEQ ID NO:1的氨基酸残基35-49、或TREM2蛋白上的对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基35-49的氨基酸残基;
v.SEQ ID NO:1的氨基酸残基35-49和140-150、或TREM2蛋白上的对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基35-49和140-150的氨基酸残基;
vi.SEQ ID NO:1的氨基酸残基39-49、或TREM2蛋白上的对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基39-49的氨基酸残基;
vii.SEQ ID NO:1的氨基酸残基39-49和63-77、或TREM2蛋白上的对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基39-49和63-77的氨基酸残基;
viii.SEQ ID NO:1的氨基酸残基51-61、或TREM2蛋白上的对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基51-61的氨基酸残基;
ix.SEQ ID NO:1的氨基酸残基55-62、或TREM2蛋白上的对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基55-62的氨基酸残基;
x.SEQ ID NO:1的氨基酸残基55-62、104-109、和148-158、或TREM2蛋白上的对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基55-62、104-109、和148-158的氨基酸残基;
xi.SEQ ID NO:1的氨基酸残基55-62、104-109、和160-166、或TREM2蛋白上的对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基55-62、104-109、和160-166的氨基酸残基;
xii.SEQ ID NO:1的氨基酸残基55-65、或TREM2蛋白上的对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基55-65的氨基酸残基;
xiii.SEQ ID NO:1的氨基酸残基55-65和124-134、或TREM2蛋白上的对应于SEQ ID 
NO:1的氨基酸残基55-65和124-134的氨基酸残基;
xiv.SEQ ID NO:1的氨基酸残基63-73、或TREM2蛋白上的对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基63-73的氨基酸残基;
xv.SEQ ID NO:1的氨基酸残基63-77、或TREM2蛋白上的对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基63-77的氨基酸残基;
xvi.SEQ ID NO:1的氨基酸残基104-109、或TREM2蛋白上的对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基104-109的氨基酸残基;
xvii.SEQ ID NO:1的氨基酸残基117-133、或TREM2蛋白上的对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基117-133的氨基酸残基;
xviii.SEQ ID NO:1的氨基酸残基124-134、或TREM2蛋白上的对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基124-134的氨基酸残基;
xix.SEQ ID NO:1的氨基酸残基137-146、或TREM2蛋白上的对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基137-146的氨基酸残基;
xx.SEQ ID NO:1的氨基酸残基139-147、或TREM2蛋白上的对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基139-147的氨基酸残基;
xxi.SEQ ID NO:1的氨基酸残基139-149、或TREM2蛋白上的对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基139-149的氨基酸残基;
xxii.SEQ ID NO:1的氨基酸残基140-150、或TREM2蛋白上的对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基140-150的氨基酸残基;
xxiii.SEQ ID NO:1的氨基酸残基140-146、或TREM2蛋白上的对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基140-146的氨基酸残基;
xxiv.SEQ ID NO:1的氨基酸残基140-143、或TREM2蛋白上的对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基140-143的氨基酸残基;
xxv.SEQ ID NO:1的氨基酸残基142-152、或TREM2蛋白上的对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基142-152的氨基酸残基;
xxvi.SEQ ID NO:1的氨基酸残基146-154、或TREM2蛋白上的对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基146-154的氨基酸残基;
xxvii.SEQ ID NO:1的氨基酸残基148-158、或TREM2蛋白上的对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基148-158的氨基酸残基;
xxviii.SEQ ID NO:1的氨基酸残基149-157、或TREM2蛋白上的对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基149-157的氨基酸残基;
xxix.SEQ ID NO:1的氨基酸残基149和150、或TREM2蛋白上的对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基149和150的氨基酸残基;
xxx.SEQ ID NO:1的氨基酸残基151-155、或TREM2蛋白上的对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基151-155的氨基酸残基;
xxxi.SEQ ID NO:1的氨基酸残基154-161、或TREM2蛋白上的对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基154-161的氨基酸残基;
xxxii.SEQ ID NO:1的氨基酸残基156-170、或TREM2蛋白上的对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基156-170的氨基酸残基;
xxxiii.SEQ ID NO:1的氨基酸残基160-166、或TREM2蛋白上的对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基160-166的氨基酸残基;以及
xxxiv.SEQ ID NO:1的氨基酸残基162-165、或TREM2蛋白上的对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基162-165的氨基酸残基。
41.如权利要求1-39中任一项所述的分离的抗体,其中所述抗体结合到SEQ ID NO:1的选自由以下组成的组的一个或多个氨基酸残基:K42、H43、W44、G45、H67、R77、T88、H114、E117、E151、D152、H154、以及E156,或结合到哺乳动物TREM2蛋白上的对应于SEQ ID NO:1的选自由以下组成的组的氨基酸残基的一个或多个氨基酸残基:K42、H43、W44、G45、H67、R77、T88、H114、E117、E151、D152、H154、以及E156。
42.如权利要求1-41中任一项所述的分离的抗体,其中所述抗体与选自由以下组成的组的一种或多种抗体竞争结合到TREM2:3B10、7B3、8F8、9F5、9G1、9G3、11A8、12F9、7E9、7F6、
8C3、2C5、3C5、4C12、7D9、2F6、3A7、7E5、11H5、1B4、6H2、7B11、18D8、18E4、29F6、40D5、43B9、
44A8、44B4、以及其任何组合。
43.如权利要求1-41中任一项所述的分离的抗体,其中所述抗体包含轻链可变结构域和重链可变结构域,其中所述轻链可变结构域、或所述重链可变结构域、或两者包含选自抗体的HVR-L1、HVR-L2、HVR-L3、HVR-H1、HVR-H2、以及HVR-H3的至少一个、两个、三个、四个、五个、或六个HVR,所述抗体选自由以下组成的组:4D11、7C5、6G12、8F11、8E10、7E5、7F8、8F8、
1H7、2H8、3A2、3A7、3B10、4F11、6H6、7A9、7B3、8A1、9F5、9G1、9G3、10A9、11A8、12D9、12F9、
10C1、7E9、7F6、8C3、2C5、3C5、4C12、7D9、2F6、11H5、B4、6H2、7B11v1、7B11v2、18D8、18E4v1、
18E4v2、29F6v1、29F6v2、40D5v1、40D5v2、43B9、44A8v1、44A8v2、44B4v1、以及44B4v2。
44.如权利要求43所述的分离的抗体,其中:
(a)所述HVR-L1包含选自由以下组成的组的氨基酸序列:SEQ ID NO:9-23、SEQ ID NO:
581、SEQ ID NO:690-694、SEQ ID NO:734-738、以及SEQ ID NO:826-828;
(b)所述HVR-L2包含选自由以下组成的组的氨基酸序列:SEQ ID NO:24-33、SEQ ID NO:695-697、和SEQ ID NO:739-743;
(c)所述HVR-L3包含选自由以下组成的组的氨基酸序列:SEQ ID NO:34-47、SEQ ID NO:582、SEQ ID NO:583、SEQ ID NO:698-702、以及SEQ ID NO:744-746;
(d)所述HVR-H1包含选自由以下组成的组的氨基酸序列:SEQ ID NO:48-65、SEQ ID NO:584、SEQ ID NO:703-705、SEQ ID NO:747-754、以及SEQ ID NO:829-835;
(e)所述HVR-H2包含选自由以下组成的组的氨基酸序列:SEQ ID NO:66-84、SEQ ID NO:585-587、SEQ ID NO:706-708、SEQ ID NO:755-762、SEQ ID NO:836-842、以及SEQ ID NO:888;或者
(f)所述HVR-H3包含选自由以下组成的组的氨基酸序列:SEQ ID NO:85-102、SEQ ID NO:588、SEQ ID NO:589、SEQ ID NO:709、SEQ ID NO:710、以及SEQ ID NO:763-770。
45.如权利要求43所述的分离的抗体,其中:
(a)所述HVR-L1包含SEQ ID NO:11的氨基酸序列,所述HVR-L2包含SEQ ID NO:26的氨基酸序列,所述HVR-L3包含SEQ ID NO:36的氨基酸序列,所述HVR-H1包含SEQ ID NO:51的氨基酸序列,所述HVR-H2包含SEQ ID NO:69的氨基酸序列,并且所述HVR-H3包含SEQ ID NO:88的氨基酸序列;
(b)所述HVR-L1包含SEQ ID NO:14的氨基酸序列,所述HVR-L2包含SEQ ID NO:28的氨基酸序列,所述HVR-L3包含SEQ ID NO:39的氨基酸序列,所述HVR-H1包含SEQ ID NO:53的氨基酸序列,所述HVR-H2包含SEQ ID NO:71的氨基酸序列,并且所述HVR-H3包含SEQ ID NO:90的氨基酸序列;
(c)所述HVR-L1包含SEQ ID NO:16的氨基酸序列,所述HVR-L2包含SEQ ID NO:29的氨基酸序列,所述HVR-L3包含SEQ ID NO:35的氨基酸序列,所述HVR-H1包含SEQ ID NO:55的氨基酸序列,所述HVR-H2包含SEQ ID NO:73的氨基酸序列,并且所述HVR-H3包含SEQ ID NO:92的氨基酸序列;
(d)所述HVR-H1包含SEQ ID NO:58的氨基酸序列,所述HVR-H2包含SEQ ID NO:76的氨基酸序列,并且所述HVR-H3包含SEQ ID NO:95的氨基酸序列;
(e)所述HVR-L1包含SEQ ID NO:19的氨基酸序列,所述HVR-L2包含SEQ ID NO:28的氨基酸序列,所述HVR-L3包含SEQ ID NO:43的氨基酸序列,所述HVR-H1包含SEQ ID NO:60的氨基酸序列,所述HVR-H2包含SEQ ID NO:78的氨基酸序列,并且所述HVR-H3包含SEQ ID NO:97的氨基酸序列;
(f)所述HVR-L1包含SEQ ID NO:19的氨基酸序列,所述HVR-L2包含SEQ ID NO:28的氨基酸序列,所述HVR-L3包含SEQ ID NO:43的氨基酸序列,所述HVR-H1包含SEQ ID NO:60的氨基酸序列,所述HVR-H2包含SEQ ID NO:888的氨基酸序列,并且所述HVR-H3包含SEQ ID NO:97的氨基酸序列;
(g)所述HVR-L1包含SEQ ID NO:20的氨基酸序列,所述HVR-L2包含SEQ ID NO:28的氨基酸序列,所述HVR-L3包含SEQ ID NO:44的氨基酸序列,所述HVR-H1包含SEQ ID NO:61的氨基酸序列,所述HVR-H2包含SEQ ID NO:79的氨基酸序列,并且所述HVR-H3包含SEQ ID NO:98的氨基酸序列;
(h)所述HVR-L1包含SEQ ID NO:21的氨基酸序列,所述HVR-L2包含SEQ ID NO:32的氨基酸序列,所述HVR-L3包含SEQ ID NO:45的氨基酸序列,所述HVR-H1包含SEQ ID NO:62的氨基酸序列,所述HVR-H2包含SEQ ID NO:80的氨基酸序列,并且所述HVR-H3包含SEQ ID NO:99的氨基酸序列;
(i)所述HVR-L1包含SEQ ID NO:22的氨基酸序列,所述HVR-L2包含SEQ ID NO:29的氨基酸序列,所述HVR-L3包含SEQ ID NO:46的氨基酸序列,所述HVR-H1包含SEQ ID NO:63的氨基酸序列,所述HVR-H2包含SEQ ID NO:82的氨基酸序列,并且所述HVR-H3包含SEQ ID NO:100的氨基酸序列;或者
(j)所述HVR-L1包含SEQ ID NO:16的氨基酸序列,所述HVR-L2包含SEQ ID NO:29的氨基酸序列,所述HVR-L3包含SEQ ID NO:35的氨基酸序列,所述HVR-H1包含SEQ ID NO:65的氨基酸序列,所述HVR-H2包含SEQ ID NO:84的氨基酸序列,并且所述HVR-H3包含SEQ ID NO:102的氨基酸序列。
46.如权利要求1-41中任一项所述的分离的抗体,其中所述抗体包含轻链可变结构域和重链可变结构域,其中所述轻链可变结构域包含:
(a)HVR-L1,其包含选自由以下组成的组的氨基酸序列:SEQ ID NO:9-23、SEQ ID NO:
581、SEQ ID NO:690-694、SEQ ID NO:734-738、以及SEQ ID NO:826-828,或包含与选自由以下组成的组的氨基酸序列具有至少约90%同源性的氨基酸序列:SEQ ID NO:9-23、SEQ ID NO:581、SEQ ID NO:690-694、SEQ ID NO:734-738、以及SEQ ID NO:826-828;
(b)HVR-L2,其包含选自由以下组成的组的氨基酸序列:SEQ ID NO:24-33、SEQ ID NO:
695-697、和SEQ ID NO:739-743,或包含与选自由以下组成的组的氨基酸序列具有至少约
90%同源性的氨基酸序列:SEQ ID NO:24-33、SEQ ID NO:695-697、和SEQ ID NO:739-743;
以及
(c)HVR-L3,其包含选自由以下组成的组的氨基酸序列:SEQ ID NO:34-47、SEQ ID NO:
582、SEQ ID NO:583、SEQ ID NO:698-702、以及SEQ ID NO:744-746,或包含与选自由以下组成的组的氨基酸序列具有至少约90%同源性的氨基酸序列:SEQ ID NO:34-47、SEQ ID NO:582、SEQ ID NO:583、SEQ ID NO:698-702、以及SEQ ID NO:744-746;并且
其中所述重链可变结构域包含:
(a)HVR-H1,其包含选自由以下组成的组的氨基酸序列:SEQ ID NO:48-65、SEQ ID NO:
584、SEQ ID NO:703-705、SEQ ID NO:747-754、以及SEQ ID NO:829-835,或包含与选自由以下组成的组的氨基酸序列具有至少约90%同源性的氨基酸序列:SEQ ID NO:48-65、SEQ ID NO:584、SEQ ID NO:703-705、SEQ ID NO:747-754、以及SEQ ID NO:829-835;
(b)HVR-H2,其包含选自由以下组成的组的氨基酸序列:SEQ ID NO:66-84、SEQ ID NO:
585-587、SEQ ID NO:706-708、SEQ ID NO:755-762、SEQ ID NO:836-842、以及SEQ ID NO:
888,或包含与选自由以下组成的组的氨基酸序列具有至少约90%同源性的氨基酸序列:
SEQ ID NO:66-84、SEQ ID NO:585-587、SEQ ID NO:706-708、SEQ ID NO:755-762、SEQ ID NO:836-842、以及SEQ ID NO:888;以及
(c)HVR-H3,其包含选自由以下组成的组的氨基酸序列:SEQ ID NO:85-102、SEQ ID NO:588、SEQ ID NO:589、SEQ ID NO:709、SEQ ID NO:710、以及SEQ ID NO:763-770,或包含与选自由以下组成的组的氨基酸序列具有至少约90%同源性的氨基酸序列:SEQ ID NO:
85-102、SEQ ID NO:588、SEQ ID NO:589、SEQ ID NO:709、SEQ ID NO:710、以及SEQ ID NO:
763-770。
47.如权利要求1-41中任一项所述的分离的抗体,其中所述抗体包含:轻链可变结构域,其包含选自由以下组成的组的氨基酸序列:SEQ ID NO:219-398、SEQ ID NO:602-634、SEQ ID NO:679-689、SEQ ID NO:724-730、SEQ ID NO:809-816、SEQ ID NO:821、SEQ ID NO:843、SEQ ID NO:844、SEQ ID NO:849、以及SEQ ID NO:850;和/或重链可变结构域,其包含选自由以下组成的组的氨基酸序列:SEQ ID NO:399-580、SEQ ID NO:635-678、SEQ ID NO:731-733、SEQ ID NO:817-820、SEQ ID NO:822-825、以及SEQ ID NO:845-847。
48.一种结合到TREM2蛋白的分离的抗体,其中所述抗体结合到选自由以下组成的组的氨基酸残基内的一种或多种氨基酸:
i.SEQ ID NO:1的氨基酸残基19-174、或TREM2蛋白上的对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基19-174的氨基酸残基;
ii.SEQ ID NO:1的氨基酸残基29-112、或TREM2蛋白上的对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基29-112的氨基酸残基;
iii.SEQ ID NO:1的氨基酸残基113-174、或TREM2蛋白上的对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基113-174的氨基酸残基;
iv.SEQ ID NO:1的氨基酸残基35-49、或TREM2蛋白上的对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基35-49的氨基酸残基;
v.SEQ ID NO:1的氨基酸残基35-49和140-150、或TREM2蛋白上的对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基35-49和140-150的氨基酸残基;
vi.SEQ ID NO:1的氨基酸残基39-49、或TREM2蛋白上的对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基39-49的氨基酸残基;
vii.SEQ ID NO:1的氨基酸残基39-49和63-77、或TREM2蛋白上的对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基39-49和63-77的氨基酸残基;
viii.SEQ ID NO:1的氨基酸残基51-61、或TREM2蛋白上的对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基51-61的氨基酸残基;
ix.SEQ ID NO:1的氨基酸残基55-62、或TREM2蛋白上的对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基55-62的氨基酸残基;
x.SEQ ID NO:1的氨基酸残基55-62、104-109、和148-158、或TREM2蛋白上的对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基55-62、104-109、和148-158的氨基酸残基;
xi.SEQ ID NO:1的氨基酸残基55-62、104-109、和160-166、或TREM2蛋白上的对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基55-62、104-109、和160-166的氨基酸残基;
xii.SEQ ID NO:1的氨基酸残基55-65、或TREM2蛋白上的对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基55-65的氨基酸残基;
xiii.SEQ ID NO:1的氨基酸残基55-65和124-134、或TREM2蛋白上的对应于SEQ ID 
NO:1的氨基酸残基55-65和124-134的氨基酸残基;
xiv.SEQ ID NO:1的氨基酸残基63-73、或TREM2蛋白上的对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基63-73的氨基酸残基;
xv.SEQ ID NO:1的氨基酸残基63-77、或TREM2蛋白上的对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基63-77的氨基酸残基;
xvi.SEQ ID NO:1的氨基酸残基104-109、或TREM2蛋白上的对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基104-109的氨基酸残基;
xvii.SEQ ID NO:1的氨基酸残基117-133、或TREM2蛋白上的对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基117-133的氨基酸残基;
xviii.SEQ ID NO:1的氨基酸残基124-134、或TREM2蛋白上的对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基124-134的氨基酸残基;
xix.SEQ ID NO:1的氨基酸残基137-146、或TREM2蛋白上的对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基137-146的氨基酸残基;
xx.SEQ ID NO:1的氨基酸残基139-147、或TREM2蛋白上的对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基139-147的氨基酸残基;
xxi.SEQ ID NO:1的氨基酸残基139-149、或TREM2蛋白上的对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基139-149的氨基酸残基;
xxii.SEQ ID NO:1的氨基酸残基140-150、或TREM2蛋白上的对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基140-150的氨基酸残基;
xxiii.SEQ ID NO:1的氨基酸残基140-146、或TREM2蛋白上的对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基140-146的氨基酸残基;
xxiv.SEQ ID NO:1的氨基酸残基140-143、或TREM2蛋白上的对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基140-143的氨基酸残基;
xxv.SEQ ID NO:1的氨基酸残基142-152、或TREM2蛋白上的对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基142-152的氨基酸残基;
xxvi.SEQ ID NO:1的氨基酸残基146-154、或TREM2蛋白上的对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基146-154的氨基酸残基;
xxvii.SEQ ID NO:1的氨基酸残基148-158、或TREM2蛋白上的对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基148-158的氨基酸残基;
xxviii.SEQ ID NO:1的氨基酸残基149-157、或TREM2蛋白上的对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基149-157的氨基酸残基;
xxix.SEQ ID NO:1的氨基酸残基149和150、或TREM2蛋白上的对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基149和150的氨基酸残基;
xxx.SEQ ID NO:1的氨基酸残基151-155、或TREM2蛋白上的对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基151-155的氨基酸残基;
xxxi.SEQ ID NO:1的氨基酸残基154-161、或TREM2蛋白上的对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基154-161的氨基酸残基;
xxxii.SEQ ID NO:1的氨基酸残基156-170、或TREM2蛋白上的对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基156-170的氨基酸残基;
xxxiii.SEQ ID NO:1的氨基酸残基160-166、或TREM2蛋白上的对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基160-166的氨基酸残基;以及
xxxiv.SEQ ID NO:1的氨基酸残基162-165、或TREM2蛋白上的对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基162-165的氨基酸残基。
49.如权利要求48所述的分离的抗体,其中所述抗体诱导一种或多种TREM2活性并且增强由一种或多种TREM2配体与所述TREM2蛋白的结合诱导的一种或多种TREM2活性。
50.如权利要求48或权利要求49所述的分离的抗体,其中所述抗体还结合到选自由以下组成的组的一个或多个氨基酸残基:
i.SEQ ID NO:1的氨基酸残基Arg47或Asp87;
ii.SEQ ID NO:1的氨基酸残基40-44;
iii.SEQ ID NO:1的氨基酸残基67-76;以及
iv.SEQ ID NO:1的氨基酸残基114-118。
51.一种结合到TREM2蛋白的分离的抗体,其中所述抗体结合到SEQ ID NO:1的选自由以下组成的组的一个或多个氨基酸残基:K42、H43、W44、G45、H67、R77、T88、H114、E117、E151、D152、H154、以及E156,或结合到哺乳动物TREM2蛋白上的对应于SEQ ID NO:1的选自由以下组成的组的氨基酸残基的一个或多个氨基酸残基:K42、H43、W44、G45、H67、R77、T88、H114、E117、E151、D152、H154、以及E156。
52.一种结合到TREM2蛋白的分离的抗体,其中所述抗体与选自由以下组成的组的一种或多种抗体竞争结合到TREM2:1A7、3A2、3B10、6G12、6H6、7A9、7B3、8A1、8E10、8F11、8F8、
9F5、9G1、9G3、10A9、10C1、11A8、12E2、12F9、12G6、2C7、2F5、3C1、4D7、4D11、6C11、6G12、7A3、
7C5、7E9、7F6、7G1、7H1、8C3、8F10、12A1、1E9、2C5、3C5、4C12、4F2、5A2、6B3、7D1、7D9、11D8、
8A12、10E7、10B11、10D2、7D5、2A7、3G12、6H9、8G9、9B4、10A1、11A8、12F3、2F8、10E3、1H7、
2F6、2H8、3A7、7E5、7F8、11H5、7C5、4F11、12D9、1B4v1、1B4v2、6H2、7B11v1、7B11v2、18D8、
18E4v1、18E4v2、29F6v1、29F6v2、40D5v1、40D5v2、43B9、44A8v1、44A8v2、44B4v1、44B4v2、以及其任何组合。
53.一种结合到TREM2蛋白的分离的抗体,其中所述抗体包含轻链可变结构域和重链可变结构域,其中所述轻链可变结构域、或所述重链可变结构域、或两者包含选自抗体的HVR-L1、HVR-L2、HVR-L3、HVR-H1、HVR-H2、以及HVR-H3的至少一个、两个、三个、四个、五个、或六个HVR,所述抗体选自由以下组成的组:1A7、3A2、3B10、6G12、6H6、7A9、7B3、8A1、8E10、8F11、
8F8、9F5、9G1、9G3、10A9、10C1、11A8、12E2、12F9、12G6、2C7、2F5、3C1、4D7、4D11、6C11、6G12、
7A3、7C5、7E9、7F6、7G1、7H1、8C3、8F10、12A1、1E9、2C5、3C5、4C12、4F2、5A2、6B3、7D1、7D9、
11D8、8A12、10E7、10B11、10D2、7D5、2A7、3G12、6H9、8G9、9B4、10A1、11A8、12F3、2F8、10E3、
1H7、2F6、2H8、3A7、7E5、7F8、11H5、7C5、4F11、12D9、1B4v1、1B4v2、6H2、7B11v1、7B11v2、
18D8、18E4v1、18E4v2、29F6v1、29F6v2、40D5v1、40D5v2、43B9、44A8v1、44A8v2、44B4v1、以及
44B4v2。
54.如权利要求53所述的分离的抗体,其中:
(a)所述HVR-L1包含选自由以下组成的组的氨基酸序列:SEQ ID NO:9-23、SEQ ID NO:
581、SEQ ID NO:690-694、SEQ ID NO:734-738、以及SEQ ID NO:826-828;
(b)所述HVR-L2包含选自由以下组成的组的氨基酸序列:SEQ ID NO:24-33、SEQ ID NO:695-697、和SEQ ID NO:739-743;
(c)所述HVR-L3包含选自由以下组成的组的氨基酸序列:SEQ ID NO:34-47、SEQ ID NO:582、SEQ ID NO:583、SEQ ID NO:698-702、以及SEQ ID NO:744-746;
(d)所述HVR-H1包含选自由以下组成的组的氨基酸序列:SEQ ID NO:48-65、SEQ ID NO:584、SEQ ID NO:703-705、SEQ ID NO:747-754、以及SEQ ID NO:829-835;
(e)所述HVR-H2包含选自由以下组成的组的氨基酸序列:SEQ ID NO:66-84、SEQ ID NO:585-587、SEQ ID NO:706-708、SEQ ID NO:755-762、SEQ ID NO:836-842、以及SEQ ID NO:888;或者
(f)所述HVR-H3包含选自由以下组成的组的氨基酸序列:SEQ ID NO:85-102、SEQ ID NO:588、SEQ ID NO:589、SEQ ID NO:709、SEQ ID NO:710、以及SEQ ID NO:763-770。
55.如权利要求53或权利要求54所述的分离的抗体,其中:
(a)所述HVR-L1包含SEQ ID NO:9的氨基酸序列,所述HVR-L2包含SEQ ID NO:24的氨基酸序列,所述HVR-L3包含SEQ ID NO:34的氨基酸序列,所述HVR-H1包含SEQ ID NO:48的氨基酸序列,所述HVR-H2包含SEQ ID NO:66的氨基酸序列,并且所述HVR-H3包含SEQ ID NO:
85的氨基酸序列;
(b)所述HVR-L1包含SEQ ID NO:10的氨基酸序列,所述HVR-L2包含SEQ ID NO:25的氨基酸序列,所述HVR-L3包含SEQ ID NO:35的氨基酸序列,所述HVR-H1包含SEQ ID NO:49的氨基酸序列,所述HVR-H2包含SEQ ID NO:67的氨基酸序列,并且所述HVR-H3包含SEQ ID NO:86的氨基酸序列;
(c)所述HVR-L1包含SEQ ID NO:12的氨基酸序列,所述HVR-L2包含SEQ ID NO:26的氨基酸序列,所述HVR-L3包含SEQ ID NO:37的氨基酸序列,所述HVR-H1包含SEQ ID NO:50的氨基酸序列,所述HVR-H2包含SEQ ID NO:68的氨基酸序列,并且所述HVR-H3包含SEQ ID NO:87的氨基酸序列;
(d)所述HVR-L1包含SEQ ID NO:11的氨基酸序列,所述HVR-L2包含SEQ ID NO:26的氨基酸序列,所述HVR-L3包含SEQ ID NO:36的氨基酸序列,所述HVR-H1包含SEQ ID NO:51的氨基酸序列,所述HVR-H2包含SEQ ID NO:69的氨基酸序列,并且所述HVR-H3包含SEQ ID NO:88的氨基酸序列;
(e)所述HVR-L1包含SEQ ID NO:13的氨基酸序列,所述HVR-L2包含SEQ ID NO:27的氨基酸序列,所述HVR-L3包含SEQ ID NO:38的氨基酸序列,所述HVR-H1包含SEQ ID NO:52的氨基酸序列,所述HVR-H2包含SEQ ID NO:70的氨基酸序列,并且所述HVR-H3包含SEQ ID NO:89的氨基酸序列;
(f)所述HVR-L1包含SEQ ID NO:14的氨基酸序列,所述HVR-L2包含SEQ ID NO:28的氨基酸序列,所述HVR-L3包含SEQ ID NO:39的氨基酸序列,所述HVR-H1包含SEQ ID NO:53的氨基酸序列,所述HVR-H2包含SEQ ID NO:71的氨基酸序列,并且所述HVR-H3包含SEQ ID NO:90的氨基酸序列;
(g)所述HVR-L1包含SEQ ID NO:15的氨基酸序列,所述HVR-L2包含SEQ ID NO:28的氨基酸序列,所述HVR-L3包含SEQ ID NO:40的氨基酸序列,所述HVR-H1包含SEQ ID NO:54的氨基酸序列,所述HVR-H2包含SEQ ID NO:72的氨基酸序列,并且所述HVR-H3包含SEQ ID NO:91的氨基酸序列;
(h)所述HVR-L1包含SEQ ID NO:16的氨基酸序列,所述HVR-L2包含SEQ ID NO:29的氨基酸序列,所述HVR-L3包含SEQ ID NO:35的氨基酸序列,所述HVR-H1包含SEQ ID NO:55的氨基酸序列,所述HVR-H2包含SEQ ID NO:73的氨基酸序列,并且所述HVR-H3包含SEQ ID NO:92的氨基酸序列;
(i)所述HVR-L1包含SEQ ID NO:581的氨基酸序列,所述HVR-L2包含SEQ ID NO:29的氨基酸序列,所述HVR-L3包含SEQ ID NO:582的氨基酸序列,所述HVR-H1包含SEQ ID NO:56的氨基酸序列,所述HVR-H2包含SEQ ID NO:74的氨基酸序列,并且所述HVR-H3包含SEQ ID NO:93的氨基酸序列;
(j)所述HVR-L1包含SEQ ID NO:17的氨基酸序列,所述HVR-L2包含SEQ ID NO:30的氨基酸序列,所述HVR-L3包含SEQ ID NO:41的氨基酸序列,所述HVR-H1包含SEQ ID NO:57的氨基酸序列,所述HVR-H2包含SEQ ID NO:75的氨基酸序列,并且所述HVR-H3包含SEQ ID NO:94的氨基酸序列;
(k)所述HVR-L1包含SEQ ID NO:58的氨基酸序列,所述HVR-H2包含SEQ ID NO:76的氨基酸序列,并且所述HVR-H3包含SEQ ID NO:95的氨基酸序列;
(l)所述HVR-L1包含SEQ ID NO:18的氨基酸序列,所述HVR-L2包含SEQ ID NO:31的氨基酸序列,所述HVR-L3包含SEQ ID NO:42的氨基酸序列,所述HVR-H1包含SEQ ID NO:59的氨基酸序列,所述HVR-H2包含SEQ ID NO:77的氨基酸序列,并且所述HVR-H3包含SEQ ID NO:96的氨基酸序列;
(m)所述HVR-L1包含SEQ ID NO:19的氨基酸序列,所述HVR-L2包含SEQ ID NO:28的氨基酸序列,所述HVR-L3包含SEQ ID NO:43的氨基酸序列,所述HVR-H1包含SEQ ID NO:60的氨基酸序列,所述HVR-H2包含SEQ ID NO:78的氨基酸序列,并且所述HVR-H3包含SEQ ID NO:97的氨基酸序列;
(n)所述HVR-L1包含SEQ ID NO:19的氨基酸序列,所述HVR-L2包含SEQ ID NO:28的氨基酸序列,所述HVR-L3包含SEQ ID NO:43的氨基酸序列,所述HVR-H1包含SEQ ID NO:60的氨基酸序列,所述HVR-H2包含SEQ ID NO:888的氨基酸序列,并且所述HVR-H3包含SEQ ID NO:97的氨基酸序列;
(o)所述HVR-L1包含SEQ ID NO:20的氨基酸序列,所述HVR-L2包含SEQ ID NO:28的氨基酸序列,所述HVR-L3包含SEQ ID NO:44的氨基酸序列,所述HVR-H1包含SEQ ID NO:61的氨基酸序列,所述HVR-H2包含SEQ ID NO:79的氨基酸序列,并且所述HVR-H3包含SEQ ID NO:98的氨基酸序列;
(p)所述HVR-L1包含SEQ ID NO:21的氨基酸序列,所述HVR-L2包含SEQ ID NO:32的氨基酸序列,所述HVR-L3包含SEQ ID NO:45的氨基酸序列,所述HVR-H1包含SEQ ID NO:62的氨基酸序列,所述HVR-H2包含SEQ ID NO:80的氨基酸序列,并且所述HVR-H3包含SEQ ID NO:99的氨基酸序列;
(q)所述HVR-L1包含SEQ ID NO:15的氨基酸序列,所述HVR-L2包含SEQ ID NO:33的氨基酸序列,所述HVR-L3包含SEQ ID NO:40的氨基酸序列,所述HVR-H1包含SEQ ID NO:54的氨基酸序列,所述HVR-H2包含SEQ ID NO:81的氨基酸序列,并且所述HVR-H3包含SEQ ID NO:91的氨基酸序列;
(r)所述HVR-L1包含SEQ ID NO:22的氨基酸序列,所述HVR-L2包含SEQ ID NO:29的氨基酸序列,所述HVR-L3包含SEQ ID NO:46的氨基酸序列,所述HVR-H1包含SEQ ID NO:63的氨基酸序列,所述HVR-H2包含SEQ ID NO:82的氨基酸序列,并且所述HVR-H3包含SEQ ID NO:100的氨基酸序列;
(s)所述HVR-L1包含SEQ ID NO:23的氨基酸序列,所述HVR-L2包含SEQ ID NO:29的氨基酸序列,所述HVR-L3包含SEQ ID NO:47的氨基酸序列,所述HVR-H1包含SEQ ID NO:64的氨基酸序列,所述HVR-H2包含SEQ ID NO:83的氨基酸序列,并且所述HVR-H3包含SEQ ID NO:101的氨基酸序列;
(t)所述HVR-L1包含SEQ ID NO:16的氨基酸序列,所述HVR-L2包含SEQ ID NO:29的氨基酸序列,所述HVR-L3包含SEQ ID NO:35的氨基酸序列,所述HVR-H1包含SEQ ID NO:65的氨基酸序列,所述HVR-H2包含SEQ ID NO:84的氨基酸序列,并且所述HVR-H3包含SEQ ID NO:102的氨基酸序列;
(u)所述HVR-L1包含SEQ ID NO:581的氨基酸序列,所述HVR-L2包含SEQ ID NO:29的氨基酸序列,所述HVR-L3包含SEQ ID NO:582的氨基酸序列,所述HVR-H1包含SEQ ID NO:56的氨基酸序列,所述HVR-H2包含SEQ ID NO:585的氨基酸序列,并且所述HVR-H3包含SEQ ID NO:588的氨基酸序列;
(v)所述HVR-L1包含SEQ ID NO:10的氨基酸序列,所述HVR-L2包含SEQ ID NO:29的氨基酸序列,所述HVR-L3包含SEQ ID NO:35的氨基酸序列,所述HVR-H1包含SEQ ID NO:49的氨基酸序列,所述HVR-H2包含SEQ ID NO:586的氨基酸序列,并且所述HVR-H3包含SEQ ID NO:86的氨基酸序列;或者
(w)所述HVR-L1包含SEQ ID NO:14的氨基酸序列,所述HVR-L2包含SEQ ID NO:28的氨基酸序列,所述HVR-L3包含SEQ ID NO:583的氨基酸序列,所述HVR-H1包含SEQ ID NO:584的氨基酸序列,所述HVR-H2包含SEQ ID NO:587的氨基酸序列,并且所述HVR-H3包含SEQ ID NO:589的氨基酸序列。
56.如权利要求53所述的分离的抗体,其中所述轻链可变结构域包含:
(a)HVR-L1,其包含选自由以下组成的组的氨基酸序列:SEQ ID NO:9-23、SEQ ID NO:
581、SEQ ID NO:690-694、SEQ ID NO:734-738、以及SEQ ID NO:826-828,或包含与选自由以下组成的组的氨基酸序列具有至少约90%同源性的氨基酸序列:SEQ ID NO:9-23、SEQ ID NO:581、SEQ ID NO:690-694、SEQ ID NO:734-738、以及SEQ ID NO:826-828;
(b)HVR-L2,其包含选自由以下组成的组的氨基酸序列:SEQ ID NO:24-33、SEQ ID NO:
695-697、和SEQ ID NO:739-743,或包含与选自由以下组成的组的氨基酸序列具有至少约
90%同源性的氨基酸序列:SEQ ID NO:24-33、SEQ ID NO:695-697、和SEQ ID NO:739-743;
以及
(c)HVR-L3,其包含选自由以下组成的组的氨基酸序列:SEQ ID NO:34-47、SEQ ID NO:
582、SEQ ID NO:583、SEQ ID NO:698-702、以及SEQ ID NO:744-746,或包含与选自由以下组成的组的氨基酸序列具有至少约90%同源性的氨基酸序列:SEQ ID NO:34-47、SEQ ID NO:582、SEQ ID NO:583、SEQ ID NO:698-702、以及SEQ ID NO:744-746;并且
其中所述重链可变结构域包含:
(a)HVR-H1,其包含选自由以下组成的组的氨基酸序列:SEQ ID NO:48-65、SEQ ID NO:
584、SEQ ID NO:703-705、SEQ ID NO:747-754、以及SEQ ID NO:829-835,或包含与选自由以下组成的组的氨基酸序列具有至少约90%同源性的氨基酸序列:SEQ ID NO:48-65、SEQ ID NO:584、SEQ ID NO:703-705、SEQ ID NO:747-754、以及SEQ ID NO:829-835;
(b)HVR-H2,其包含选自由以下组成的组的氨基酸序列:SEQ ID NO:66-84、SEQ ID NO:
585-587、SEQ ID NO:706-708、SEQ ID NO:755-762、SEQ ID NO:836-842、以及SEQ ID NO:
888,或包含与选自由以下组成的组的氨基酸序列具有至少约90%同源性的氨基酸序列:
SEQ ID NO:66-84、SEQ ID NO:585-587、SEQ ID NO:706-708、SEQ ID NO:755-762、SEQ ID NO:836-842、以及SEQ ID NO:888;以及
(c)HVR-H3,其包含选自由以下组成的组的氨基酸序列:SEQ ID NO:85-102、SEQ ID NO:588、SEQ ID NO:589、SEQ ID NO:709、SEQ ID NO:710、以及SEQ ID NO:763-770,或包含与选自由以下组成的组的氨基酸序列具有至少约90%同源性的氨基酸序列:SEQ ID NO:
85-102、SEQ ID NO:588、SEQ ID NO:589、SEQ ID NO:709、SEQ ID NO:710、以及SEQ ID NO:
763-770。
57.如权利要求53-56中任一项所述的分离的抗体,其中所述抗体包含:轻链可变结构域,其包含选自由以下组成的组的氨基酸序列:SEQ ID NO:219-398、SEQ ID NO:602-634、SEQ ID NO:679-689、SEQ ID NO:724-730、SEQ ID NO:809-816、SEQ ID NO:821、SEQ ID NO:843、SEQ ID NO:844、SEQ ID NO:849、以及SEQ ID NO:850;和/或重链可变结构域,其包含选自由以下组成的组的氨基酸序列:SEQ ID NO:399-580、SEQ ID NO:635-678、SEQ ID NO:731-733、SEQ ID NO:817-820、SEQ ID NO:822-825、以及SEQ ID NO:845-847。
58.如权利要求48-57中任一项所述的分离的抗体,其中所述抗体与一种或多种TREM2配体竞争结合到所述TREM2蛋白。
59.如权利要求48-58中任一项所述的分离的抗体,其中所述抗体是结合到TREM2蛋白的惰性抗体。
60.如权利要求48-58中任一项所述的分离的抗体,其中所述抗体是结合到TREM2的拮抗剂抗体。
61.如权利要求59或权利要求60所述的分离的抗体,其中所述TREM2蛋白是哺乳动物蛋白或人蛋白。
62.如权利要求61所述的分离的抗体,其中所述TREM2蛋白是野生型蛋白。
63.如权利要求61所述的分离的抗体,其中所述TREM2蛋白是天然存在的变体。
64.如权利要求61所述的分离的抗体,其中所述TREM2蛋白是疾病变体。
65.如权利要求60-64中任一项所述的分离的抗体,其中所述抗体抑制一种或多种
TREM2活性。
66.如权利要求65所述的分离的抗体,其中所述一种或多种TREM2活性选自由以下组成的组:
(a)TREM2结合到DAP12;
(b)DAP12磷酸化;
(c)活化Syk激酶;
(d)将Syk募集到DAP12/TREM2复合物;
(e)增加一种或多种TREM2依赖性基因的活性,任选地其中所述一种或多种TREM2依赖性基因包括活化T细胞的核因子(NFAT)转录因子;
(f)增加肿瘤体积;以及
(g)增加肿瘤生长速率。
67.如权利要求60-66中任一项所述的分离的抗体,其中所述抗体抑制TREM2与一种或多种TREM2配体之间的相互作用、抑制TREM2信号转导、或两者。
68.如权利要求60-67中任一项所述的分离的抗体,其中所述抗体不能够结合Fc-γ受体(FcγR)。
69.如权利要求59-68中任一项所述的分离的抗体,其中所述抗体具有IgG1、IgG2、
IgG3、或IgG4同种型。
70.如权利要求69所述的分离的抗体,其中:
(a)所述抗体具有人或小鼠IgG1同种型并且包含在所述Fc区中的在选自由以下组成的组的残基位置处的一个或多个氨基酸取代:N297A、N297Q、D270A、D265A、L234A、L235A、C226S、C229S、P238S、E233P、L234V、P238A、A327Q、A327G、P329A、K322A、L234F、L235E、P331S、T394D、A330L、M252Y、S254T、T256E、、L328E、P238D、S267E、L328F、E233D、G237D、H268D、P271G、A330R、以及其任何组合,其中所述残基的编号根据EU编号,或者包含在所述Fc区中的在对应于甘氨酸236的位置处的氨基酸缺失;
(b)所述抗体具有IgG2同种型并且包含在所述Fc区中的在选自由以下组成的组的残基位置处的一个或多个氨基酸取代:P238S、V234A、G237A、H268A、H268Q、H268E、V309L、N297A、N297Q、A330S、P331S、C232S、C233S、M252Y、S254T、T256E、以及其任何组合,其中所述残基的编号根据EU编号;或者
(c)所述抗体具有IgG4同种型并且包含在所述Fc区中的在选自由以下组成的组的残基位置处的一个或多个氨基酸取代:E233P、F234V、L234A/F234A、L235A、G237A、E318A、S228P、L236E、S241P、L248E、T394D、M252Y、S254T、T256E、N297A、N297Q、以及其任何组合,其中所述残基的编号根据EU编号。
71.如权利要求70所述的分离的抗体,其中:
(a)所述Fc区还包含在选自由以下组成的组的位置处的一个或多个额外的氨基酸取
代:A330L、L234F;L235E、P331S、以及其任何组合,其中所述残基的编号根据EU编号;
(b)所述Fc区还包含在选自由以下组成的组的位置处的一个或多个额外的氨基酸取
代:M252Y、S254T、T256E、以及其任何组合,其中所述残基的编号根据EU编号;或者(c)所述Fc区还包含根据EU编号的S228P氨基酸取代。
72.如权利要求1-71中任一项所述的分离的抗体,其中所述抗体是结合到选自由以下组成的组的一种或多种人蛋白的抗体片段:人TREM2、人TREM2的天然存在的变体、和人TREM2的疾病变体,并且任选地其中所述抗体片段与第二抗体片段交联,所述第二抗体片段交结合到选自由以下组成的组的一种或多种人蛋白:人TREM2、人TREM2的天然存在的变体、和人TREM2的疾病变体。
73.如权利要求72所述的分离的抗体,其中所述片段是Fab、Fab’、Fab’-SH、F(ab’)2、Fv或scFv片段。
74.如权利要求1-73中任一项所述的分离的抗体,其中所述一种或多种TREM2配体选自由以下组成的组:大肠杆菌细胞、凋亡细胞、核酸、阴离子脂质、阴离子脂质、APOE、APOE2、APOE3、APOE4、阴离子APOE、阴离子APOE2、阴离子APOE3、阴离子APOE4、脂化APOE、脂化APOE2、脂化APOE3、脂化APOE4、两性离子脂质、带负电荷的磷脂、磷脂酰丝氨酸、硫脂、磷脂酰胆、鞘磷脂、膜磷脂、脂化蛋白、蛋白脂质、脂化肽、脂化淀粉样蛋白β肽、以及其任何组合。
75.如权利要求1-74中任一项所述的分离的抗体,其中所述抗体是鼠抗体。
76.如权利要求1-74中任一项所述的分离的抗体,其中所述抗体是人源化抗体、双特异性抗体、多价抗体、偶联抗体、或嵌合抗体
77.如权利要求1-76中任一项所述的分离的抗体,其中所述抗体是单克隆抗体。
78.如权利要求1-77中任一项所述的分离的抗体,其中所述抗体是识别第一抗原和第二抗原的双特异性抗体。
79.如权利要求78所述的分离的抗体,其中所述第一抗原是人TREM2或其天然存在的变体,并且所述第二抗原是:
(a)有助于跨血脑屏障转运的抗原;
(b)有助于跨血脑屏障转运的抗原,其选自由以下组成的组:转蛋白受体(TR)、胰岛素受体(HIR)、胰岛素样生长因子受体(IGFR)、低密度脂蛋白受体相关蛋白1和低密度脂蛋白受体相关蛋白2(LPR-1和LPR-2)、白喉毒素受体、CRM197、美洲驼单结构域抗体、TMEM30(A)、蛋白转导结构域、TAT、Syn-B、穿膜肽、聚精氨酸肽、血管肽、以及ANG1005;
(c)致病性物质,其选自由致病性肽或蛋白质和致病性核酸组成的组,其中所述致病性核酸是反义GGCCCC(G2C4)重复序列扩增RNA,所述致病性蛋白选自由以下组成的组:淀粉样蛋白β、寡聚淀粉样蛋白β、淀粉样蛋白β斑、淀粉样蛋白前体蛋白或其片段、Tau、IAPP、α-突触核蛋白、TDP-43、FUS蛋白、C9orf72(染色体9开放阅读框72)、c9RAN蛋白、朊病毒蛋白、PrPSc、亨廷顿蛋白、降血素、超化物歧化酶、共济失调蛋白、共济失调蛋白1、共济失调蛋白2、共济失调蛋白3、共济失调蛋白7、共济失调蛋白8、共济失调蛋白10、路易小体、心房利钠因子、胰岛淀粉样蛋白多肽、胰岛素、载脂蛋白AI、血清淀粉样蛋白A、medin、泌乳素、转甲状腺素蛋白、溶菌酶、β2微球蛋白、凝溶胶蛋白、膜上皮蛋白、抑半胱氨酸蛋白酶蛋白、免疫球蛋白轻链AL、S-IBM蛋白、重复序列相关非ATG(RAN)翻译产物、二肽重复序列(DPR)肽、甘氨酸-丙氨酸(GA)重复序列肽、甘氨酸-脯氨酸(GP)重复序列肽、甘氨酸-精氨酸(GR)重复序列肽、脯氨酸-丙氨酸(PA)重复序列肽、泛素、以及脯氨酸-精氨酸(PR)重复序列肽;
(d)在免疫细胞上表达的配体和/或蛋白质,其中所述配体和/或蛋白质选自由以下组成的组:CD40、OX40、ICOS、CD28、CD137/4-1BB、CD27、GITR、PD-L1、CTLA-4、PD-L2、PD-1、B7-H3、B7-H4、HVEM、BTLA、KIR、GAL9、TIM3、A2AR、LAG、以及磷脂酰丝氨酸;以及(e)在一种或多种肿瘤细胞上表达的蛋白质、脂质、多糖、或糖脂。
80.如权利要求1-79中任一项所述的分离的抗体,其中所述抗体与特异性地结合致病性物质的一种或多种抗体组合使用,所述致病性物质选自由以下组成的组:致病性肽、致病性蛋白、淀粉样蛋白β、寡聚淀粉样蛋白β、淀粉样蛋白β斑、淀粉样蛋白前体蛋白或其片段、Tau、IAPP、α-突触核蛋白、TDP-43、FUS蛋白、C9orf72(染色体9开放阅读框72)、朊病毒蛋白、PrPSc、亨廷顿蛋白、降血钙素、超氧化物歧化酶、共济失调蛋白、共济失调蛋白1、共济失调蛋白2、共济失调蛋白3、共济失调蛋白7、共济失调蛋白8、共济失调蛋白10、路易小体、心房利钠因子、胰岛淀粉样蛋白多肽、胰岛素、载脂蛋白AI、血清淀粉样蛋白A、medin、泌乳素、转甲状腺素蛋白、溶菌酶、β2微球蛋白、凝溶胶蛋白、角膜上皮蛋白、抑半胱氨酸蛋白酶蛋白、免疫球蛋白轻链AL、S-IBM蛋白、重复序列相关非ATG(RAN)翻译产物、二肽重复序列(DPR)肽、甘氨酸-丙氨酸(GA)重复序列肽、甘氨酸-脯氨酸(GP)重复序列肽、甘氨酸-精氨酸(GR)重复序列肽、脯氨酸-丙氨酸(PA)重复序列肽、泛素、和脯氨酸-精氨酸(PR)重复序列肽、以及其任何组合;或与结合免疫调节蛋白的一种或多种抗体组合使用,所述免疫调节蛋白选自由以下组成的组:CD40、OX40、ICOS、CD28、CD137/4-1BB、CD27、GITR、PD-L1、CTLA-4、PD-L2、PD-1、B7-H3、B7-H4、HVEM、BTLA、KIR、GAL9、TIM3、A2AR、LAG-3、TREM1、TREM2、CD33、唾液酸结合性免疫球蛋白样凝集素-5、唾液酸结合性免疫球蛋白样凝集素-9、唾液酸结合性免疫球蛋白样凝集素-11、磷脂酰丝氨酸、致病性核酸、反义GGCCCC(G2C4)重复序列扩增RNA、以及其任何组合。
81.如前述权利要求中任一项所述的分离的抗体,其中当施用到个体时增加记忆力、减少认知缺陷、或两者。
82.如前述权利要求中任一项所述的分离的抗体,其中所述抗体特异性地结合到人
TREM2和小鼠TREM2两者。
83.如前述权利要求中任一项所述的分离的抗体,其中所述抗体对于人TREM2和小鼠
TREM2具有范围是约12.8nM至约1.2nM、或小于1.2nM的解离常数(KD),其中所述KD在大约4℃的温度下确定。
84.如前述权利要求中任一项所述的分离的抗体,其中所述抗体对于人TREM2具有范围是12.8nM至约2.9nM、或小于2.9nM的解离常数(KD),其中所述KD在大约4℃的温度下确定。
85.如前述权利要求中任一项所述的分离的抗体,其中所述抗体对于小鼠TREM2具有范围是约10.4nM至约1.2nM、或小于1.2nM的解离常数(KD),其中所述KD在大约4℃的温度下确定。
86.如前述权利要求中任一项所述的分离的抗体,其中所述抗体不抑制先天免疫细胞的生长。
87.如前述权利要求中任一项所述的分离的抗体,其中所述抗体以小于1nM的KD结合到原代免疫细胞,其中所述KD在大约4℃的温度下确定。
88.如前述权利要求中任一项所述的分离的抗体,其中所述抗体在大脑、或脑脊髓液(CSF)、或两者中积累至在血液中1%或更多的抗体浓度的程度。
89.如前述权利要求中任一项所述的分离的抗体,其中所述抗体在大脑、或脑脊髓液(CSF)、或两者中积累至在血液中2%或更多的抗体浓度的程度。
90.如前述权利要求中任一项所述的分离的抗体,其中所述抗体在大脑、或脑脊髓液(CSF)、或两者中积累至在血液中3%或更多的抗体浓度的程度。
91.如前述权利要求中任一项所述的分离的抗体,其中所述抗体在大脑、或脑脊髓液(CSF)、或两者中积累至在血液中4%或更多的抗体浓度的程度。
92.一种的分离的核酸,其包含编码如前述权利要求中任一项所述的抗体的核酸序列。
93.一种载体,其包含如权利要求92所述的核酸。
94.一种分离的宿主细胞,其包含如权利要求93所述的载体。
95.一种产生结合到TREM2的抗体的方法,其包括培养如权利要求94所述的细胞以产生所述抗体。
96.如权利要求95所述的方法,其还包括回收由所述细胞产生的所述抗体。
97.一种结合到TREM2的分离的抗体,其通过如权利要求95或权力要求96所述的方法产生。
98.一种药物组合物,其包含如权利要求1-91中任一项所述的抗体和药学上可接受的载剂。
99.一种预防、降低险、或治疗患有选自由以下组成的组的疾病、病症、或损伤的个体的方法:痴呆、额颞叶痴呆、阿尔茨海默氏病、Nasu-Hakola病、认知缺陷、记忆力丧失、脊髓损伤、创伤性脑损伤、多发性硬化症、慢性结肠炎、溃疡性结肠炎、以及癌症,所述方法包括向有需要的个体施用治疗有效量的结合到TREM2蛋白的分离的抗体。
100.如权利要求99所述的方法,其中所述分离的抗体是:
(a)激动剂抗体;
(b)惰性抗体;或
(c)拮抗剂抗体。
101.如权利要求99或权利要求100所述的方法,其中所述分离的抗体是如权利要求1-
91中任一项所述的抗体。
102.如权利要求99-101中任一项所述的方法,其中所述疾病、病症、或损伤是阿尔茨海默氏病。
103.如权利要求99-102中任一项所述的方法,其中结合到TREM2蛋白的所述分离的抗体增加一种或多种炎性介质的表达,其中所述一种或多种炎性介质选自由以下组成的组:
IL-1β、TNF-α、YM-1、CD86、CCL2、CCL3、CCL5、CCR2、CXCL10、Gata3、Rorc、以及其任何组合。
104.如权利要求99-102中任一项所述的方法,其中结合到TREM2蛋白的所述分离的抗体降低一种或多种炎性介质的表达,其中所述一种或多种炎性介质选自由以下组成的组:
FLT1、OPN、CSF-1、CD11c、AXL、以及其任何组合。
105.如权利要求99-104中任一项所述的方法,其中结合到TREM2蛋白的所述分离的抗体降低所述个体中的Aβ肽的水平。
106.如权利要求99-105中任一项所述的方法,其中结合到TREM2蛋白的所述分离的抗体增加所述个体的大脑中的CD11b+小神经胶质细胞的数量。
107.如权利要求99-106中任一项所述的方法,其中结合到TREM2蛋白的所述分离的抗体增加所述个体的记忆力。
108.如权利要求99-107中任一项所述的方法,其中结合到TREM2蛋白的所述分离的抗体减少所述个体的认知缺陷。
109.如权利要求99-108中任一项所述的方法,其中结合到TREM2蛋白的所述分离的抗体增加所述个体的运动协调。
110.如权利要求99-109中任一项所述的方法,其还包括向所述个体施用特异性地结合到抑制性检查点分子的至少一种抗体和/或另一种标准或研究性抗癌疗法。
111.如权利要求110所述的方法,其中特异性地结合到抑制性检查点分子的所述至少一种抗体与所述分离的抗体组合施用。
112.如权利要求110或权利要求111所述的方法,其中特异性地结合到抑制性检查点分子的所述至少一种抗体选自由以下组成的组:抗PD-L1抗体、抗CTLA-4抗体、抗PD-L2抗体、抗PD-1抗体、抗B7-H3抗体、抗B7-H4抗体、和抗HVEM抗体、抗B淋巴细胞和T淋巴细胞衰减因子(BTLA)抗体、抗杀伤细胞抑制性受体(KIR)抗体、抗GAL9抗体、抗TIM3抗体、抗A2AR抗体、抗LAG-3抗体、抗磷脂酰丝氨酸抗体、抗CD27抗体、以及其任何组合。
113.如权利要求110所述的方法,其中所述标准或研究性抗癌疗法是选自由以下组成的组的一种或多种疗法:放射疗法、细胞毒性化学疗法、靶向疗法、激素疗法、伊替尼曲妥珠单抗 贝伐单抗 奥法木单抗
利妥昔单抗 冷冻疗法消融、射频消融、过继细胞
转移(ACT)、嵌合抗原受体T细胞转移(CAR-T)、疫苗疗法、以及细胞因子疗法。
114.如权利要求99-113中任一项所述的方法,其还包括向所述个体施用特异性地结合到抑制性细胞因子的至少一种抗体。
115.如权利要求114所述的方法,其中特异性地结合到抑制性细胞因子的所述至少一种抗体与所述分离的抗体组合施用。
116.如权利要求114或权利要求115所述的方法,其中特异性地结合到抑制性细胞因子的所述至少一种抗体选自由以下组成的组:抗CCL2抗体、抗CSF-1抗体、抗IL-2抗体、以及其任何组合。
117.如权利要求99-116中任一项所述的方法,其还包括向所述个体施用特异性地结合到刺激性检查点蛋白的至少一种激动性抗体。
118.如权利要求117所述的方法,其中特异性地结合到刺激性检查点蛋白的所述至少一种激动性抗体与所述分离的抗体组合施用。
119.如权利要求117或权利要求118所述的方法,其中特异性地结合到刺激性检查点蛋白的所述至少一种激动性抗体选自由以下组成的组:激动剂抗CD40抗体、激动剂抗OX40抗体、激动剂抗ICOS抗体、激动剂抗CD28抗体、激动剂抗CD137/4-1BB抗体、激动剂抗CD27抗体、激动剂抗糖皮质激素诱导的TNFR相关蛋白GITR抗体、以及其任何组合。
120.如权利要求99-119中任一项所述的方法,其还包括向所述个体施用至少一种刺激性细胞因子。
121.如权利要求120所述的方法,其中所述至少一种刺激性细胞因子与所述分离的抗体组合施用。
122.如权利要求120或权利要求121所述的方法,其中所述至少一种刺激性细胞因子选自由以下组成的组:TNF-α、IL-10、IL-6、IL-8、CRP、细胞因子蛋白家族的TGF-β成员、IL-20家族成员、IL-33、LIF、OSM、CNTF、TGF-β、IL-11、IL-12、IL-17、IL-8、IL-23、IFN-α、IFN-β、IL-2、IL-18、GM-CSF、G-CSF、以及其任何组合。
123.一种增强有需要的个体中的由一种或多种TREM2配体与TREM2蛋白的结合诱导的
一种或多种TREM2活性的方法,其包括向所述个体施用治疗有效量的结合到TREM2蛋白的分离的抗体。
124.一种诱导有需要的个体中的一种或多种TREM2活性的方法,其包括向所述个体施用治疗有效量的结合到TREM2蛋白的分离的抗体。
125.一种在有需要的个体中诱导一种或多种TREM2活性并且增强由一种或多种TREM2
配体与TREM2蛋白的结合诱导的一种或多种TREM2活性的方法,其包括向所述个体施用治疗有效量的结合到TREM2蛋白的分离的抗体。
126.一种降低有需要的个体中的一种或多种细胞上的TREM2的细胞水平的方法,其包括向所述个体施用治疗有效量的结合到TREM2蛋白的分离的抗体。
127.如权利要求123-126中任一项所述的方法,其中所述分离的抗体是如权利要求1-
91中任一项所述的抗体。
128.如权利要求99-127中任一项所述的方法,其中所述个体具有TREM2的杂合变体,其中所述变体包含选自由以下组成的组的一个或多个取代:
i.编码SEQ ID NO:1的氨基酸残基Glu14的核酸序列中的谷氨酸向终止密码子的取代;
ii.编码SEQ ID NO:1的氨基酸残基Gln33的核酸序列中的谷氨酰胺向终止密码子的取代;
iii.编码SEQ ID NO:1的氨基酸残基Trp44的核酸序列中的色氨酸向终止密码子的取
代;
iv.在对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基Arg47的氨基酸处的精氨酸向组氨酸的氨基酸取代;
v.编码SEQ ID NO:1的氨基酸残基Trp78的核酸序列中的色氨酸向终止密码子的取代;
vi.在对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基Val126的氨基酸处的缬氨酸向甘氨酸的氨基
酸取代;
vii.在对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基Asp134的氨基酸处的天冬氨酸向甘氨酸的氨基酸取代;以及
viii.在对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基Lys186的氨基酸处的赖氨酸向天冬酰胺的
氨基酸取代。
129.如权利要求99-128中任一项所述的方法,其中所述个体具有TREM2的杂合变体,其中所述变体包含:在对应于编码SEQ ID NO:1的核酸序列的核苷酸残基G313的核苷酸处的嘌呤核苷酸缺失;在对应于编码SEQ ID NO:1的核酸序列的核苷酸残基G267的核苷酸处的鸟嘌呤核苷酸缺失;或两者。
130.如权利要求99-129中任一项所述的方法,其中所述个体具有DAP12的杂合变体,其中所述变体包括选自由以下组成的组的一个或多个变体:
i.在对应于SEQ ID NO:2的氨基酸残基Met1的氨基酸处的蛋氨酸向苏氨酸的取代;
ii.在对应于SEQ ID NO:2的氨基酸残基Gly49的氨基酸处的甘氨酸向精氨酸的氨基酸取代;
iii.编码SEQ ID NO:2的核酸序列的外显子1-4内的缺失;
iv.在编码SEQ ID NO:2的核酸序列的外显子3处的14个氨基酸残基的插入;以及
v.在对应于编码SEQ ID NO:2的核酸序列的核苷酸残基G141的核苷酸处的鸟嘌呤核苷酸缺失。
131.一种诱导或促进有需要的个体中的先天免疫细胞存活或伤口愈合的方法,其包括向所述个体施用治疗有效量的结合到TREM2蛋白的分离的激动剂抗体。
132.如权利要求131所述的方法,其中所述分离的抗体是如权利要求1-58和72-91中任一项所述的抗体。
133.一种在有需要的个体中增加记忆力、减少认知缺陷、或两者的方法,其包括向所述个体施用治疗有效量的结合到TREM2蛋白的分离的激动剂抗体。
134.一种增加有需要的个体的运动协调的方法,其包括向所述个体施用治疗有效量的结合到TREM2蛋白的分离的激动剂抗体。
135.一种降低有需要的个体中的Aβ肽水平的方法,其包括向所述个体施用治疗有效量的结合到TREM2蛋白的分离的激动剂抗体。
+
136.一种增加有需要的个体中的CD11b 小神经胶质细胞的数量的方法,其包括向所述个体施用治疗有效量的结合到TREM2蛋白的分离的激动剂抗体。
137.一种增加有需要的个体中的FLT1、OPNCSF1、CD11c、以及AXL中的一种或多种的水平的方法,其包括向所述个体施用治疗有效量的结合到TREM2蛋白的分离的激动剂抗体。
138.一种治疗有需要的个体的脊髓损伤的方法,其包括向所述个体施用治疗有效量的结合到TREM2蛋白的分离的激动剂抗体。
139.一种治疗有需要的个体的慢性结肠炎或溃疡性结肠炎的方法,其包括向所述个体施用治疗有效量的结合到TREM2蛋白的分离的激动剂抗体。
140.如权利要求133-139中任一项所述的权利要求所述的方法,其中所述分离的抗体是如权利要求1-91中任一项所述的抗体。
141.如前述权利要求中任一项所述的权利要求所述的方法,其中所述抗体不抑制先天免疫细胞的生长。
142.如前述权利要求中任一项所述的权利要求所述的方法,其中所述抗体以小于1nM的KD结合到原代免疫细胞,其中所述KD在大约4℃的温度下确定。
143.如前述权利要求中任一项所述的权利要求所述的方法,其中所述抗体在大脑、或脑脊髓液(CSF)、或两者中积累至在血液中1%或更多的抗体浓度的程度。
144.如前述权利要求中任一项所述的权利要求所述的方法,其中所述抗体在大脑、或脑脊髓液(CSF)、或两者中积累至在血液中2%或更多的抗体浓度的程度。
145.如前述权利要求中任一项所述的权利要求所述的方法,其中所述抗体在大脑、或脑脊髓液(CSF)、或两者中积累至在血液中3%或更多的抗体浓度的程度。
146.如前述权利要求中任一项所述的权利要求所述的方法,其中所述抗体在大脑、或脑脊髓液(CSF)、或两者中积累至在血液中4%或更多的抗体浓度的程度。

说明书全文

抗TREM2抗体及其使用方法

[0001] 相关申请的交叉引用
[0002] 本申请要求2015年10月06日提交的美国临时申请号62/238,044和2016年8月01日提交的美国临时申请号62/369,666的权益,其各自特此以引用的方式整体并入。
[0003] 以ASCII文本文件提交序列表
[0004] 以下以ASCII文本文件提交的内容以引用的方式整体并入本文:计算机可读形式(CRF)的序列表(文件名:735022000940SEQLISTING.TXT,记录日期:2016年10月6日,大小:651KB)。
[0005] 本公开的领域
[0006] 本公开涉及抗TREM2抗体和此类抗体的治疗性用途。
[0007] 本公开的背景
[0008] 髓细胞上表达的触发受体-2(TREM2)是主要在髓系细胞,如巨噬细胞、树突细胞、单核细胞、皮肤朗格汉斯细胞(Langerhans cell)、库普弗细胞(Kupffer cell)、破骨细胞及小神经胶质细胞上表达的免疫球蛋白样受体;而且是调节Toll样受体(TLR)信号传导、调节炎性细胞因子以及正常破骨细胞发育所需的。TREM2是作为TREM跨膜糖蛋白的成员被发现,这些糖蛋白属于单一免疫球蛋白可变(IgV)结构域受体家族。编码人和小鼠TREM的基因分别定位于人染色体6p21.1和小鼠染色体17C3上。TREM簇包括在人和小鼠中编码TREM1、TREM2、TREM4及TREM5的基因,以及TREM样基因。另外,还在小鼠中鉴别出TREM3和浆细胞样树突细胞(pDC)-TREM。TREM样基因,即在人中的TREML1和TREML2,以及在小鼠中的Treml1和Treml2分别编码TLT-1和TLT-2。这些受体家族中得到最佳表征的两种受体TREM1和TREM2与Ig-SF的其它成员,如活化NK细胞受体(与NKp44具有20%同一性)展现约20%序列同源性以及某种同源性,并且通过与DAP12介导的信号传导途径相关联来起作用。
[0009] TREM2最初是以编码TREM1同源物的cDNA形式克隆(Bouchon,A等人,J Exp Med,2001.194(8):第1111-22页)。此受体是一种约40kDa的糖蛋白,在N-去糖基化之后减少成
26kDa。TREM2基因编码一种长度是230个基酸的蛋白质,该蛋白质包括细胞外结构域、跨膜区及短胞质尾。细胞外区是由外显子2编码,由单一V型Ig-SF结构域构成,含有三个潜在的N-糖基化位点。推定的跨膜区含有带电荷的赖氨酸残基。TREM2的胞质尾缺少信号传导基序并且被认为是通过信号传导衔接分子DAP12/TRYROBP进行信号传导。
[0010] 信号传导衔接分子DAP12在包括小神经胶质细胞、巨噬细胞、粒细胞、NK细胞及树突细胞(DC)在内的参与固有免疫反应的多种细胞的表面处以同二聚体形式表达。DAP12是基于与人T细胞受体(TCR)相关CD3链和Fc受体(FcR)γ链的同源性的I型跨膜衔接蛋白质家族的成员(Turnbull,IR和Colonna,M,Nat Rev Immunol,2007.7(2):第155-61页)。这些蛋白质共有许多结构和功能特征,包括在其胞质结构域中的一个或多个ITAM基序、在跨膜区中的带电荷的酸性残基(对于与其配偶体链相互作用至关重要)及在酪氨酸磷酸化后募集含Src同源结构域-2(SH2)的蛋白质的能。ITAM基序通过活化ZAP70或Syk酪氨酸激酶来介导信号传播。这两种激酶使若干底物磷酸化,由此促进信号传导复合物的形成,从而引起细胞活化。有趣的是,一些B细胞和T细胞在炎症情况下也表达DAP12。就人来说,已经在患有慢性炎症性疾病的患者中,在自体免疫T细胞情况下描述了表达此蛋白质的CD4+CD28-T细胞、αβTCR+CD4+T细胞及CD8+T细胞亚群(Schleinitz,N.等人,PLoS ONE,4(2009),第e6264页)。鉴于DAP12在小鼠腹膜巨噬细胞中表达平较高,认为此蛋白质将在其它巨噬细胞相关细胞中表达,如骨髓中的破骨细胞、肝中的库普弗细胞、中的肺泡巨噬细胞、皮肤朗格汉斯细胞及脑中的小神经胶质细胞(Takaki,R等人,Immunol Rev,2006.214:第118-29页)。
[0011] 经鉴别,TREM2在人单核细胞源性树突细胞的表面上表达并且在小鼠巨噬细胞系RAW264中作为mRNA转录物(Bouchon,A等人,J Exp Med,2001.194(8):第1111-22页)。人TREM2是所描述的在DC表面上的首个DAP12相关受体。研究证实,相较于野生型细胞,TREM2的细胞表面表达在DAP12缺陷型骨髓源性树突细胞(BMDC)中以及在DAP12缺陷型巨噬细胞中减少(Ito,H和Hamerman,JA,Eur J Immunol.42(1):第176-85页;Hamerman,JA等人,J Immunol,2006.177(4):第2051-5页;及Hamerman,JA等人,Nat Immunol,2005.6(6):第579-86页)。这表明,最大TREM2表面表达需要形成TREM2/DAP12复合物。
[0012] 近期的研究也显示,TREM2在通过循环浸润组织的巨噬细胞上以及在IL-4或IL-13活化的巨噬细胞上存在表面表达(Turnbull,IR等人,J Immunol,2006.177(6):第3520-4页)。不过,在其它细胞群中,如组织驻留巨噬细胞、循环单核细胞或骨髓中的相应祖细胞中并不总是见到TREM2的表达,这表明TREM2的表达不是在中央诱导的,而是在组织浸润期间或通过细胞因子介导的活化局部诱导的。此外,还观察到,IFN-γ和LPS减少TREM2的表达。另外,近期报导TREM2在实验性自身免疫性脑脊髓炎或阿尔茨海默氏病期间于中枢神经系统中的小神经胶质细胞和浸润巨噬细胞上高水平表达(Picchio,L等人,Eur J Immunol,
2007.37(5):第1290-301页;及Wang Y,Cell.2015年3月12日;160(6):1061-71)。
[0013] 已证明,TREM2通过DAP12进行信号传导。此引起下游Syk/Zap70酪氨酸激酶家族PI3K的活化及其它细胞内信号。在髓样细胞上,TLR信号对于活化,如在感染反应的情况下至关重要,而且还在病理性炎症反应,如在巨噬细胞和树突细胞的情况下的炎症反应中起关键作用(Hamerman,JA等人,(2006)J Immunol 177:2051-2055;Ito,H等人,Eur J Immunol 42:176-185;Neumann,H等人,(2007)J Neuroimmunol 184:92-99;Takahashi,K等人,(2005)J Exp Med 201:647-657;及Takahashi,K等人,(2007)PLoS Med 4:e124)。据悉,TREM2或DAP12缺乏会使促炎性信号传导增加。在用典型TLR配体,如LPS、CpG DNA及酵母聚糖刺激的情况下显示出在体外TREM2缺乏的影响。TREM-2缺陷型树突细胞在刺激存在下显示IL-12p70、TNF、IL-6及IL-10的释放增加,但在无刺激存在下未增加。
[0014] 近期若干研究探索了由TREM2/DAP12途径的活化诱导的细胞内信号传导事件。举例来说,TREM2被认为活化细胞存活(例如蛋白质激酶B-Akt)、细胞活化和分化(例如Syk、Erk1/2、PLC-γ等)以及肌动蛋白细胞骨架控制(例如Syk、Vav等)中所涉及的信号传导途径(Peng,Q等人,Sci Signal.3(122):第ra38页;及Whittaker,GC等人,J Biol Chem.285(5):第2976-85页)。在连接TREM2后,DAP12中的ITAM酪氨酸被SRC家族激酶磷酸化,引起Syk激酶和/或ZAP70激酶的募集和活化。在小鼠中,Syk可能是所涉及的主要激酶,而在人中,Syk和ZAP70看来与此类含ITAM的亚基有效偶合,通过其串联SH2结构域结合这些亚基。
[0015] 关于TREM2信号传导的研究显示,与TREM1相同,TREM2通过DAP12介导的信号传导也引起细胞内离子含量增加以及ERK1/2的ERK1/2磷酸化(Bouchon,A等人,J Exp Med,2001.194(8):第1111-22页;及Sharif,O和Knapp,S,Immunobiology,2008.213(9-10):第
701-13页)。重要的是,TREM2受体连接不会诱导IkB-a降解以及随后的NF-kB核转位,这指出TREM2与TREM1信号传导之间可能的差异(Bouchon,A等人,J Exp Med,2001.194(8):第
1111-22页)。TREM2在不成熟树突细胞上的受体交联触发T细胞共刺激所涉及的分子,如CD86、CD40及II类MHC上调,以及趋化因子受体CCR7上调(Bouchon,A等人,J Exp Med,
2001.194(8):第1111-22页)。TREM2还在小神经胶质细胞上表达,其中受体交联引起ERK1/2磷酸化和CCR7增加,但不引起CD86或II类MHC表达增加,表明在TREM2信号传导中可能存在细胞类型特异性差异。另外,在小神经胶质细胞、髓样前体、CHO或EK293细胞中TREM2信号传导的过表达引起对神经系统中的凋亡神经元、神经和非神经组织碎片、致病性蛋白、细菌以及其他外来侵入物的吞噬作用增加,其伴随以ERK依赖性方式进行的F-肌动蛋白的极化和重组(Takahashi,K等人,PLoS Med,2007.4(4):第e124页;Neumann,H和Takahashi,K,J Neuroimmunol,2007.184(1-2):第92-9页;以及Kleinberg等人,Sci Transl Med.2014年7月2日;6(243):243ra86)。然而,在一些生理环境(诸如肺炎球菌性肺炎)中,TREM2似乎降低吞噬作用。因此,TREM2缺陷型肺泡巨噬细胞表现加强的自肺的细菌清除和对体内细菌的增强的吞噬作用(Sharif等人,PLoS Pathog.2014年6月12日;10(6):e1004167)。
[0016] 还证明,相较于用非特异性shRNAi处理的对照骨髓源性巨噬细胞(BMDM),使用shRNAi使TREM2沉默的BMDM细胞响应于TLR2/6配体酵母聚糖和TLR9配体CpG而展示TNF分泌增加,表明TREM2负面地调控巨噬细胞中的细胞因子合成(Ito,H和Hamerman,JA,Eur J Immunol.42(1):第176-85页;Hamerman,JA等人,J Immunol,2006.177(4):第2051-5页;及Hamerman,JA等人,Nat Immunol,2005.6(6):第579-86页)。这些结果已经使用来自TREM2敲除的小鼠的BMDM细胞进行证实,并且进一步显示,响应于LPS,在TREM2-/-BMDM细胞中的TNF和IL-6水平高于野生型BMDM细胞(Turnbull,IR等人,J Immunol,2006.177(6):第3520-4页;及Turnbull,IR和Colonna,M,Nat Rev Immunol,2007.7(2):第155-61页)。另外,经证实,在将小神经胶质细胞与凋亡的神经元一起培养之后,这些细胞中的TREM2过表达引起TNF和诱导性一化氮(iNOS)mRNA减少,而TREM2敲低使TNF和iNOS mRNA水平适度增加。这表明,与作为细胞因子合成的正调节物的TREM1相对,TREM2是细胞因子合成的负调节物。认为TREM2对炎症的这种影响与巨噬细胞的类型无关,因为其在小神经胶质细胞和BMDM细胞中都有出现。
[0017] 另外,已证明,在中枢神经系统的驻留髓样细胞中,小神经胶质细胞活化会引起炎症(Neumann,H等人,(2007)J Neuroimmunol 184:92-99;Takahashi,K等人,(2005)J Exp Med 201:647-657;Takahashi,K等人,(2007)PLoS Med 4:e124;及Hsieh,CL等人,(2009)J Neurochem 109:1144-1156)。此外,小神经胶质细胞的活化还牵涉到额颞叶痴呆(FTD)、阿尔茨海默氏病、帕金森氏病(Parkinson’s disease)、中/缺血性脑损伤及多发性硬化。减少TREM2活化使得某些活化和炎症标志物,如髓样细胞中的NOS2基因转录增加,而增加TREM2活化则使NOS2转录减少。认为濒死的神经元表达TREM2的内源性配体。HSP60被牵涉作为成神经细胞瘤细胞上TREM2的配体(Stefani,L等人,(2009)Neurochem 110:284-294)。TREM2过表达还引起小神经胶质细胞对濒死神经元的吞噬作用增加,并且以类似方式增加其它髓系细胞的吞噬作用。TREM2也牵涉到髓样细胞迁移,因为TREM2缺陷髓样细胞不能填充阿尔茨海默氏病的啮齿动物模型的大脑(Malm,TM等人,Neurotherapeutics.2014年11月
18日)。
[0018] 在人中,已证明,TREM2的完全缺乏会引起Nasu-Hakola病,这是一种罕见的神经退化性疾病,伴随晚期发作性痴呆、脱髓鞘及脑萎缩(Paloneva,J等人,(2002)Am J Hum Genet 71:656-662;及Paloneva,J等人,(2003)J Exp Med 198:669-675)。DAP12缺乏也会引起Nasu-Hakola病。另外,具有额颞叶痴呆(FTD)表现的个体的外显子组测序鉴别到TREM2中的纯合突变(Guerreiro,RJ等人,(2013)JAMA Neurol 70:78-84;Guerreiro,RJ等人,(2012)Arch Neurol:1-7)。最近,发现TREM2中的杂合突变使阿尔茨海默氏病的风险增加多至3倍(Guerreiro,R等人,(2013)N Engl J Med 368:117-127;Jonsson,T等人,(2013)N Engl J Med 368:107-116;以及Neumann,H等人,(2013)N Engl J Med 368:182-184)。甚至携带杂合TREM2突变的没有阿尔茨海默氏病的个体与具有两个正常TREM2等位基因的个体相比显示更差的认知。这些携带者还显示出倍增的脑体积收缩率(Rajagopalan等人,(2013)N Engl J Med 369;16)。这些突变中的一些导致TREM2的截短和可能的功能丧失。同时其他的涉及氨基酸的变化,包括Q33X、R47H、T66M、以及S116C(Borroni B等人Neurobiol Aging.2014年4月;35(4):934.e7-10)。具有TREM2纯合突变的某些个体的成像分析也显示脱髓鞘的证据。另外,显示TREM2的R47H变体(在TREM2的位置47处的精氨酸向组氨酸氨基酸取代)(其是最常见的TREM2突变)位于TREM2的免疫球蛋白结构域内并且减少配体结合。显示其他TREM2突变减少TREM2的细胞表面表达,从而指示功能丧失是增加的AD风险的原因(Wang Y,Cell.2015;160(6):1061-71)。
[0019] 此外,与晚期发作发展阿尔茨海默氏病(LOAD)相关的基因表达的分子网络的分级排序组织结构的基于整合性网络的方法将作为TREM2的信号传导分子的TYROBP/DAP12鉴别为与LOAD相关联的免疫/小神经胶质细胞基因模的关键调节物。基于TREM2调节的其他基因的数量和调节丧失的量值以及LOAD大脑中的差异表达,发现TYROBP是如分级排序的最高评分的免疫/小神经胶质细胞模块的病因调节物。TYROBP在LOAD大脑中显著地上调,并且跨轻度认知障碍(MCI)存在TYROBP表达变化的进展,所述轻度认知障碍经常在LOAD之前发生(Zhang等人,(2013)Cell 153,707-720;以及Ma等人,Mol Neurobiol.2014年7月23日)。以使此类病因网络恢复至正常状态的方式靶向此类病因网络可以是治疗疾病的方式。
[0020] TREM2在病理学病状(包括阿尔茨海默氏病)期间在中枢神经系统中的小神经胶质细胞和浸润性巨噬细胞上高度表达(Picchio,L等人,(2007)Eur J Immunol,37(5):第1290-301页;以及Wang等人,(2015),Cell.;160(6):1061-71)。也已证明,在作为阿尔茨海默氏病模型的APP23转基因小鼠中TREM2基因表达增加,其中小鼠表达与家族性阿尔茨海默氏病有关的淀粉样前体蛋白的突变体形式(Melchior,B等人,ASN Neuro 2:e00037)。另外,已证明,在过表达TREM2的BV-2小神经胶质细胞系中淀粉样1-42的摄入增加。
[0021] 还证明,在EAE小鼠多发性硬化模型中TREM2上调(Neumann,H等人,(2007)J Neuroimmunol 184:92-99;Takahashi,K等人,(2005)J Exp Med 201:647-657;及
Takahashi,K等人,(2007)PLoS Med 4:e124)。在体外用TREM2转导骨髓源性髓样前体细胞(BM-DC)使得变性髓磷脂的吞噬作用增加。对珠粒或对神经元片段的吞噬作用增加。响应于LPS,这些细胞显示增加的IL-10和降低的IL-1β。过表达TREM2的髓样细胞的静脉内移植可抑制体内EAE。相反地,显示TREM2缺陷加重多发性硬化症的双环己草酰二腙模型中的多发性硬化症(Cantoni等人,Acta Neuropathol(2015)129(3):429-47;Luigi Poliani等人,(2015)J Clin Invest.125(5):2161-2170)。还显示TREM2缺陷也加重啮齿动物模型中的阿尔茨海默氏病(Wang等人,(2015),Cell.;160(6):1061-71),虽然也报道了显示啮齿动物模型中TREM2缺陷型阿尔茨海默氏病的有益作用的相反数据(Jay等人,(2015)J Exp Med 
212:287-295)。还显示TREM2对于大脑中小神经胶质细胞的存活是所需要的(Otero等人,(2009)Nat Immunol.;10:734-43)。概括地说,TREM2变体被鉴别为额颞叶痴呆、帕金森氏病、和肌萎缩性侧索硬化症的遗传风险因子(Borroni B等人Neurobiol Aging.2014年4月;
35(4):934.e7-10;Rayaprolu S等人,Mol Neurodegener.2013年6月21日;8:19;以及Cady J等人,JAMA Neurol.2014年4月;71(4):449-53)。此共同的遗传连表明TREM2在调控神经退行性疾病病理方面的更一般性的作用。
[0022] 已描述了TREM2抗体,但是仅报道的作用是对于培养的细胞而言,并且其治疗性用途受限,部分地因为它们阻断TREM2与其天然配体之间的相互作用,并且充当呈溶液形式的拮抗剂。呈溶液形式的此类抗体模拟TREM2突变的功能表型的疾病引发的丧失并且因此造成安全和效力风险。现有抗TREM2抗体的另一个问题是其需要通过涂覆在塑料板上或通过二抗簇集以便诱导激动性活性。因此,存在对于特异性地结合细胞表面上的TREM2并且以安全且有效的方式调控(例如,活化)一种或多种TREM2活性以便治疗与降低的TREM2活性相关联的一种或多种疾病、病症、和病状的抗体的需要。
[0023] 一些疾病可能需要在任何条件下均不活化TREM2的TREM2阻断抗体。例如,肿瘤微环境由包括T淋巴细胞、巨噬细胞及髓系/粒细胞系细胞的异质免疫浸润物构成。调节特定免疫细胞亚群的治疗方法是改变标准护理。靶向T细胞上表达的免疫调节分子(如CTLA-4和PD-1)的“检查点阻断”抗体已在多种肿瘤类型中展现出临床活性(Naidoo等人,(2014)British Journal of Cancer111,2214–2219)。
[0024] 靶向肿瘤相关巨噬细胞(例如M2型巨噬细胞)的癌症免疫疗法是一个热的研究领域。肿瘤中M2巨噬细胞的存在与预后不良有关。
[0025] 因此,还存在对于特异性地结合细胞表面上的TREM2并且调控(例如,抑制和/或以其他方式减少)配体结合和/或一种或多种TREM2活性以便预防、降低癌症的风险、或治疗癌症的抗体的需要。
[0026] 本文所引用的所有参考文献,包括专利申请和公布在内,都以引用的方式整体并入本文中。
[0027] 本公开的概述
[0028] 本公开大体上涉及包含抗体的组合物,所述抗体例如特异性地结合TREM2蛋白,例如哺乳动物TREM2(例如,任何非人哺乳动物)或人TREM2的单克隆抗体、嵌合抗体、人源化抗体、抗体片段等;并且涉及使用此类组合物的方法。本公开的抗体可包括激动剂抗体、拮抗剂抗体、或惰性抗体。本文所提供的方法在预防、降低风险、或治疗患有以下疾病的个体方面得到应用:痴呆、额颞叶痴呆、阿尔茨海默氏病、血管性痴呆、混合型痴呆、克-雅二氏病(Creutzfeldt-Jakob disease)、正常压力脑积水、肌萎缩性侧索硬化症、亨廷顿氏病(Huntington’s disease)、tau蛋白病(taupathy disease)、Nasu-Hakola病、中风、急性创伤、慢性创伤、认知缺陷、记忆力丧失、狼疮、急性和慢性结肠炎、类风湿关节炎、伤口愈合、克罗恩氏病(Crohn's disease)、炎症性肠病、溃疡性结肠炎、肥胖症、疟疾、特发性震颤、中枢神经系统狼疮、贝切特氏病(Behcet's disease)、帕金森氏病(Parkinson’s disease)、路易体痴呆、多系统萎缩、希一德二氏综合征(Shy-Drager syndrome)、进行性核上性麻痹、皮层基底神经节变性、急性播散性脑脊髓炎、肉芽肿病症、结节病、老化疾病、癫痫发作、脊髓损伤、创伤性脑损伤、年龄相关性黄斑变性、青光眼、色素性视网膜炎、视网膜变性、呼吸道感染、败血症、眼部感染、全身感染、狼疮、关节炎、多发性硬化症、低骨密度、骨质疏松症、骨生成、骨质增生疾病、佩吉特氏骨病(Paget's disease of bone)、实体和血液癌症、膀胱癌、脑癌、乳腺癌、结肠癌、直肠癌、子宫内膜癌、肾癌、肾细胞癌、肾盂癌、白血病、肺癌、黑素瘤、非霍奇金氏淋巴瘤(non-Hodgkin’s lymphoma)、胰腺癌、前列腺癌、卵巢癌、纤维肉瘤、急性成淋巴细胞白血病(ALL)、急性骨髓性白血病(AML)、慢性淋巴细胞白血病(CLL)、慢性骨髓性白血病(CML)、多发性骨髓瘤、真性红细胞增多症、原发性血小板增多症、原发性或特发性骨髓纤维化、原发性或特发性脊髓硬化症、髓样来源的肿瘤、表达TREM2和/或TREM2配体的肿瘤、甲状腺癌、感染、CNS疱疹、寄生虫感染、锥虫感染、Cruzi感染、绿假单胞菌感染(Pseudomonas aeruginosa infection)、杜氏利什曼原虫感染(Leishmania donovani infection)、B族链球菌感染(group B Streptococcus infection)、空肠弯曲杆菌感染(Campylobacter jejuni infection)、脑膜炎奈瑟氏球菌感染(Neisseria meningiditis infection)、I型HIV、以及流感嗜血杆菌。本文所提供的方法也在诱导或促进有需要的个体中的一种或多种免疫细胞的存活、成熟、功能性、迁移、或增殖方面得到应用。本文所提供的方法在降低有需要的个体中的以下各项的活性、功能性、或存活方面得到另外的应用:调节性T细胞、肿瘤包埋的免疫抑制树突细胞、肿瘤包埋的免疫抑制巨噬细胞、嗜中性粒细胞、自然杀伤(NK)细胞、骨髓来源的抑制细胞、肿瘤相关巨噬细胞、嗜中性粒细胞、NK细胞、急性骨髓性白血病(AML)细胞、慢性淋巴细胞白血病(CLL)细胞、或慢性骨髓性白血病(CML)细胞[0029] 在一些实施方案中,肿瘤细胞诸如急性髓母细胞性白血病(AML)细胞表达TREM2。因此,本公开的抗TREM2抗体也在治疗癌症方面得到应用。在一些实施方案中,抗TREM2抗体(包括显示出抗体依赖性细胞介导的细胞毒性(ADCC)的抗体)和/或TREM2抗体药物偶联物可用于靶向和抑制癌症,诸如AML。
[0030] 本公开的某些方面至少部分地基于鉴别两种不同类别的特异性地结合到并且调控TREM2蛋白的分离的抗体。
[0031] 一类抗体涉及激动剂抗体,其诱导例如人原代免疫细胞和TREM2表达细胞系上的一种或多种TREM2活性并且当与一种或多种TREM2配体组合时增强由一种或多种TREM2配体与TREM2蛋白的结合诱导的一种或多种TREM2活性。有利地,此类激动剂抗TREM2抗体可增强配体诱导的TREM2活性而不与一种或多种TREM2配体竞争结合到TREM2蛋白或不以其他方式阻断一种或多种TREM2配体与TREM2蛋白的结合。在一些实施方案中,所述激动剂抗体可活化和/或增强一种或多种TREM2活性,无论所述抗体簇集或呈溶液形式。在一些实施方案中,所述激动剂抗体可在溶液中活化TREM2而不需要通过二抗、通过Fc受体、或通过结合到板来簇集。在一些实施方案中,所述激动剂抗体可活化TREM2,无论抗体簇集的机制是否存在于体内治疗性作用位点处。在一些实施方案中,所述激动剂抗体可具有增加的安全性和效力。在一些实施方案中,所述激动剂抗体可确保表达TREM2的免疫细胞主要在需要其治疗性效力的位置中起作用并且能够与其生理靶标相互作用。在一些实施方案中,所述激动剂抗体不阻断导致疾病风险增加的TREM2活性,所述疾病风险与在降低TREM2活性的基因突变的情况下观察到的那些相似。
[0032] 第二类抗体涉及拮抗剂抗体,其特异性地结合到并抑制TREM2并且不能够活化TREM2,无论所述抗体簇集或呈溶液形式。在一些实施方案中,所述拮抗剂抗体具有增加的安全性和效力。在一些实施方案中,所述拮抗剂抗体不能够活化TREM2,无论其构型或其簇集的能力如何。
[0033] 因此,本公开的某些方面涉及一种结合到TREM2蛋白的分离的(例如,单克隆的)抗体,其中所述抗体诱导一种或多种TREM2活性并且增强由一种或多种TREM2配体与TREM2蛋白的结合诱导的一种或多种TREM2活性。在一些实施方案中,与在分离的抗体不存在下由一种或多种TREM2配体与TREM2蛋白的结合诱导的一种或多种TREM2活性相比,所述抗体增强由一种或多种TREM2配体与TREM2蛋白的结合诱导的一种或多种TREM2活性。在一些实施方案中,所述抗体增强一种或多种TREM2活性而不阻断一种或多种TREM2配体与TREM2蛋白的结合。在一些实施方案中,所述抗体不与一种或多种TREM2配体竞争结合到TREM2蛋白。在一些实施方案中,所述抗体增强一种或多种TREM2配体与TREM2蛋白的结合。
[0034] 本公开的其他方面涉及一种结合到TREM2蛋白的分离的(例如,单克隆的)抗体,其中所述抗体诱导一种或多种TREM2活性而不阻断一种或多种TREM2配体与TREM2蛋白的结合。在一些实施方案中,所述抗体不与一种或多种TREM2配体竞争结合到TREM2蛋白。在一些实施方案中,所述抗体增强一种或多种TREM2配体与TREM2蛋白的结合。在一些实施方案中,所述抗体增强由一种或多种TREM2配体与TREM2蛋白的结合诱导的一种或多种TREM2活性。在一些实施方案中,与在分离的抗体不存在下由一种或多种TREM2配体与TREM2蛋白的结合诱导的一种或多种TREM2活性相比,所述抗体增强由一种或多种TREM2配体与TREM2蛋白的结合诱导的一种或多种TREM2活性。
[0035] 在可与前述实施方案中的任一项组合的一些实施方案中,所述抗体与一种或多种TREM2配体协同作用以增强一种或多种TREM2活性。在可与前述实施方案中的任一项组合的一些实施方案中,所述抗体与一种或多种TREM2配体协同作用以增强一种或多种TREM2活性。在可与前述实施方案中的任一项组合的一些实施方案中,所述抗体在TREM2的细胞表面簇集不存在下增强一种或多种TREM2活性。在可与前述实施方案中的任一项组合的一些实施方案中,所述抗体通过诱导或保持TREM2的细胞表面簇集来增强一种或多种TREM2活性。在可与前述实施方案中的任一项组合的一些实施方案中,所述抗体通过在一种或多种免疫细胞上表达的Fc-γ受体来簇集。在可与前述实施方案中的任一项组合的一些实施方案中,所述一种或多种免疫细胞是B细胞或小神经胶质细胞。在可与前述实施方案中的任一项组合的一些实施方案中,由一种或多种TREM2配体与TREM2蛋白的结合诱导的一种或多种
TREM2活性的增强在选自由以下组成的组的原代细胞上测量:树突细胞、骨髓衍生的树突细胞、单核细胞、小神经胶质细胞、巨噬细胞、嗜中性粒细胞、NK细胞、破骨细胞、皮肤朗格汉斯细胞、以及库普弗细胞,或在细胞系上测量,并且其中由一种或多种TREM2配体与TREM2蛋白的结合诱导的一种或多种TREM2活性的增强利用体外细胞测定来测量。在可与前述实施方案中的任一项组合的一些实施方案中,所述抗体增加可溶性TREM2的水平、增加可溶性TREM2的半衰期、或两者。在可与前述实施方案中的任一项组合的一些实施方案中,可溶性TREM2的水平选自由以下组成的组:TREM2的血清水平、TREM2的脑脊髓液(CSF)水平、TREM2的组织水平、以及其任何组合。在可与前述实施方案中的任一项组合的一些实施方案中,所述抗体不结合到可溶性TREM2。在可与前述实施方案中的任一项组合的一些实施方案中,所述抗体不结合到体内可溶性TREM2。在可与前述实施方案中的任一项组合的一些实施方案中,所述可溶性TREM2对应于选自由以下组成的组的氨基酸残基:SEQ ID NO:1的氨基酸残基19-160、SEQ ID NO:1的氨基酸残基19-159、SEQ ID NO:1的氨基酸残基19-158、SEQ ID NO:1的氨基酸残基19-157、SEQ ID NO:1的氨基酸残基19-156、SEQ ID NO:1的氨基酸残基
19-155、以及SEQ ID NO:1的氨基酸残基19-154。在可与前述实施方案中的任一项组合的一些实施方案中,所述抗体降低一种或多种细胞中的TREM2的水平。在可与前述实施方案中的任一项组合的一些实施方案中,所述抗体降低TREM2的细胞表面水平、降低TREM2的细胞内水平、降低TREM2的总水平、或其任何组合。在可与前述实施方案中的任一项组合的一些实施方案中,所述抗体诱导TREM2降解、TREM2裂解、TREM2内化、TREM2脱落、TREM2表达的下调、或其任何组合。在可与前述实施方案中的任一项组合的一些实施方案中,一种或多种细胞中的TREM2的水平在选自由以下组成的组的原代细胞中测量:树突细胞、骨髓衍生的树突细胞、单核细胞、小神经胶质细胞、巨噬细胞、嗜中性粒细胞、NK细胞、破骨细胞、皮肤朗格汉斯细胞、以及库普弗细胞,或在细胞系上测量,并且其中TREM2的细胞水平利用体外细胞测定来测量。在可与前述实施方案中的任一项组合的一些实施方案中,所述TREM2蛋白是哺乳动物(诸如非人哺乳动物)蛋白或人蛋白。在可与前述实施方案中的任一项组合的一些实施方案中,所述TREM2蛋白是野生型蛋白。在可与前述实施方案中的任一项组合的一些实施方案中,所述TREM2蛋白是天然存在的变体。在可与前述实施方案中的任一项组合的一些实施方案中,所述TREM2蛋白在人树突细胞、人巨噬细胞、人单核细胞、人破骨细胞、人皮肤朗格汉斯细胞、人库普弗细胞、人小神经胶质细胞、或其任何组合上表达。在可与前述实施方案中的任一项组合的一些实施方案中,所述一种或多种TREM2活性选自由以下组成的组:(a)TREM2结合到DAP12;(b)TREM2磷酸化;(c)DAP12磷酸化;(d)活化一种或多种酪氨酸激酶,任选地其中所述一种或多种酪氨酸激酶包括Syk激酶、ZAP70激酶、或两者;(e)活化磷脂酰肌醇3-激酶(PI3K);(f)活化蛋白激酶B(Akt);(g)将磷脂酶C-γ(PLC-γ)募集到细胞质膜、活化PLC-γ、或两者;(h)将TEC家族激酶dVav募集到细胞质膜;(i)活化核因子-rB(NF-rB);
(j)抑制MAPK信号传导;(k)用于T细胞活化的接头(LAT)、用于B细胞活化的接头(LAB)、或两者的磷酸化;(l)活化IL-2诱导的酪氨酸激酶(Itk);(m)调控选自由以下组成的组的一种或多种促炎介质:IFN-β、IL-1α、IL-1β、TNF-α、IL-6、IL-8、CRP、CD86、MCP-1/CCL2、CCL3、CCL4、CCL5、CCR2、CXCL-10、Gata3、IL-20家族成员、IL-33、LIF、IFN-γ、OSM、CNTF、CSF-1、OPN、CD11c、GM-CSF、IL-11、IL-12、IL-17、IL-18、以及IL-23,任选地其中所述调控发生在选自由以下组成的组的一种或多种细胞中:巨噬细胞、M1巨噬细胞、活化的M1巨噬细胞、M2巨噬细胞、树突细胞、单核细胞、破骨细胞、皮肤朗格汉斯细胞、库普弗细胞、以及小神经胶质细胞;
(n)调控选自由以下组成的组的一种或多种抗炎介质:IL-4、IL-10TGF-β、IL-13、IL-35IL-
16、IFN-α、IL-1Ra、VEGF、G-CSF、YM、AXL、FLT1、以及TNF或IL-6的可溶性受体,任选地其中所述调控发生在选自由以下组成的组的一种或多种细胞中:巨噬细胞、M1巨噬细胞、活化的M1巨噬细胞、M2巨噬细胞、树突细胞、单核细胞、破骨细胞、皮肤朗格汉斯细胞、库普弗细胞、以及小神经胶质细胞;(o)调控其表达在炎症诱导之后增加的一种或多种基因,任选地其中所述一种或多种基因选自由Fabp3、Fabp5、和LDR组成的组;(p)细胞外信号调节激酶(ERK)的磷酸化;(q)调控选自由以下组成的组的一种或多种细胞中的C-C趋化因子受体7(CCR7)的表达:巨噬细胞、M1巨噬细胞、活化的M1巨噬细胞、M2巨噬细胞、树突细胞、单核细胞、破骨细胞、皮肤朗格汉斯细胞、库普弗细胞、小神经胶质细胞、M1小神经胶质细胞、活化的M1小神经胶质细胞、和M2小神经胶质细胞、以及其任何组合;(r)诱导小神经胶质细胞向CCL19和CCL21表达细胞的趋化性;(s)破坏的TREM2/DAP12依赖性基因表达的正常化;(t)将Syk、ZAP70、或两者募集到DAP12/TREM2复合物;(u)增加一种或多种TREM2依赖性基因的活性,任选地其中所述一种或多种TREM2依赖性基因包括活化T细胞的核因子(NFAT)转录因子;(v)增加树突细胞、单核细胞、小神经胶质细胞、M1小神经胶质细胞、活化的M1小神经胶质细胞、和M2小神经胶质细胞、巨噬细胞、M1巨噬细胞、活化的M1巨噬细胞、M2巨噬细胞、或其任何组合的成熟;(w)增加树突细胞、单核细胞、小神经胶质细胞、M1小神经胶质细胞、活化的M1小神经胶质细胞、和M2小神经胶质细胞、巨噬细胞、M1巨噬细胞、活化的M1巨噬细胞、M2巨噬细胞、或其任何组合引发或调控T细胞的功能的能力,任选地其中所述T细胞是选自由以下组成的组的一种或多种细胞:CD8+T细胞、CD4+T细胞、调节性T细胞、以及其任何组合;(x)骨髓衍生的树突细胞引发或调控抗原特异性T细胞的功能的增强的能力、正常化的能力、或两者,任选地其中所述抗原特异性T细胞是选自由以下组成的组的一种或多种细胞:CD8+T细胞、CD4+T细胞、调节性T细胞、以及其任何组合;(y)骨髓衍生的树突细胞诱导抗原特异性T细胞增殖的增强的能力、正常化的能力、或两者;(z)诱导破骨细胞产生、增加破骨细胞生成的速率、或两者;(aa)增加树突细胞、巨噬细胞、M1巨噬细胞、活化的M1巨噬细胞、M2巨噬细胞、单核细胞、破骨细胞、皮肤朗格汉斯细胞、库普弗细胞、小神经胶质细胞、M1小神经胶质细胞、活化的M1小神经胶质细胞、和M2小神经胶质细胞、或其任何组合的存活;(bb)增加树突细胞、巨噬细胞、M1巨噬细胞、活化的M1巨噬细胞、M2巨噬细胞、小神经胶质细胞、M1小神经胶质细胞、活化的M1小神经胶质细胞、和M2小神经胶质细胞、或其任何组合的功能;(cc)增加由树突细胞、巨噬细胞、M1巨噬细胞、活化的M1巨噬细胞、M2巨噬细胞、单核细胞、小神经胶质细胞、M1小神经胶质细胞、活化的M1小神经胶质细胞、和M2小神经胶质细胞、或其任何组合进行的吞噬作用;(dd)诱导选自由以下组成的组的一种或多种类型的清除:凋亡神经元清除、神经组织碎片清除、非神经组织碎片清除、细菌或其他异物清除、致病性物质清除、肿瘤细胞清除、或其任何组合,任选地其中所述致病性物质选自由以下组成的组:淀粉样蛋白β或其片段、Tau、IAPP、α-突触核蛋白、TDP-43、FUS蛋白、朊病毒蛋白、PrPSc、亨廷顿蛋白、降血钙素、超氧化物歧化酶、共济失调蛋白、路易小体、心房利钠因子、胰岛淀粉样蛋白多肽、胰岛素、载脂蛋白AI、血清淀粉样蛋白A、medin、泌乳素、转甲状腺素蛋白、溶菌酶、β
2微球蛋白、凝溶胶蛋白、膜上皮蛋白、抑半胱氨酸蛋白酶蛋白(cystatin)、免疫球蛋白轻链AL、S-IBM蛋白、和重复序列相关非ATG(RAN)翻译产物(包括由甘氨酸-丙氨酸(GA)、甘氨酸-脯氨酸(GP)、甘氨酸-精氨酸(GR)、脯氨酸-丙氨酸(PA)、或脯氨酸-精氨酸(PR)构成的二肽重复序列(DPR肽)、反义GGCCCC(G2C4)重复序列扩增RNA);(ee)诱导对以下中的一种或多种的吞噬作用:凋亡神经元、神经组织碎片、非神经组织碎片、细菌、其他异物、致病性物质、肿瘤细胞、或其任何组合,任选地其中所述致病性物质选自由以下组成的组:淀粉样蛋白β或其片段、Tau、IAPP、α-突触核蛋白、TDP-43、FUS蛋白、朊病毒蛋白、PrPSc、亨廷顿蛋白、降血钙素、超氧化物歧化酶、共济失调蛋白、路易小体、心房利钠因子、胰岛淀粉样蛋白多肽、胰岛素、载脂蛋白AI、血清淀粉样蛋白A、medin、泌乳素、转甲状腺素蛋白、溶菌酶、β2微球蛋白、凝溶胶蛋白、角膜上皮蛋白、抑半胱氨酸蛋白酶蛋白、免疫球蛋白轻链AL、S-IBM蛋白、和重复序列相关非ATG(RAN)翻译产物(包括由甘氨酸-丙氨酸(GA)、甘氨酸-脯氨酸(GP)、甘氨酸-精氨酸(GR)、脯氨酸-丙氨酸(PA)、或脯氨酸-精氨酸(PR)构成的二肽重复序列(DPR肽)、反义GGCCCC(G2C4)重复序列扩增RNA);(ff)调控选自由以下组成的组的一种或多种刺激性分子的表达:CD83、CD86、II类MHC、CD40、以及其任何组合,任选地其中所述CD40在树突细胞、单核细胞、巨噬细胞、或其任何组合上表达,并且任选地其中所述树突细胞包括骨髓衍生的树突细胞;(gg)调控选自由以下组成的组的一种或多种促炎介质的分泌:IFN-β、IL-1α、IL-1β、CD86、TNF-α、IL-6、IL-8、CRP、MCP-1/CCL2、CCL3、CCL4、CCL5、CCR2、CXCL-10、Gata3、IL-20家族成员、IL-33、LIF、IFN-γ、OSM、CNTF、CSF-1、OPN、CD11c、GM-CSF、IL-11、IL-12、IL-17、IL-18、以及IL-23,并且任选地其中所述调控发生在选自由以下组成的组的一种或多种细胞中:巨噬细胞、M1巨噬细胞、活化的M1巨噬细胞、M2巨噬细胞、树突细胞、单核细胞、破骨细胞、皮肤朗格汉斯细胞、库普弗细胞、以及小神经胶质细胞;(hh)调控选自由以下组成的组的一种或多种抗炎介质的分泌:IL-4、IL-10TGF-β、IL-13、IL-35IL-16、IFN-α、IL-1Ra、VEGF、G-CSF、YM、AXL、FLT1、以及TNF或IL-6的可溶性受体,并且任选地其中所述调控发生在选自由以下组成的组的一种或多种细胞中:巨噬细胞、M1巨噬细胞、活化的M1巨噬细胞、M2巨噬细胞、树突细胞、单核细胞、破骨细胞、皮肤朗格汉斯细胞、库普弗细胞、以及小神经胶质细胞;(ii)调控选自由以下组成的组的一种或多种蛋白质的表达:C1qa、C1qB、C1qC、C1s、C1R、C4、C2、C3、ITGB2、HMOX1、LAT2.CASP1、CSTA、VSIG4、MS4A4A、C3AR1、GPX1、TyroBP、ALOX5AP、ITGAM、SLC7A7、CD4、ITGAX、PYCARD、以及VEGF;(jj)增加记忆力;以及(kk)减少认知缺陷。在可与前述实施方案中的任一项组合的一些实施方案中,所述一种或多种TREM2活性选自由以下组成的组:(a)TREM2结合到DAP12;(b)DAP12磷酸化;(c)活化Syk激酶;(d)调控选自由以下组成的组的一种或多种促炎介质:IFN-β、IL-1α、IL-1β、TNF-α、IL-
6、IL-8、CRP、CD86、MCP-1/CCL2、CCL3、CCL4、CCL5、CCR2、CXCL-10、Gata3、IL-20家族成员、IL-33、LIF、IFN-γ、OSM、CNTF、CSF-1、OPN、CD11c、GM-CSF、IL-11、IL-12、IL-17、IL-18、以及IL-23,任选地其中所述调控发生在选自由以下组成的组的一种或多种细胞中:巨噬细胞、M1巨噬细胞、活化的M1巨噬细胞、M2巨噬细胞、树突细胞、单核细胞、破骨细胞、皮肤朗格汉斯细胞、库普弗细胞、以及小神经胶质细胞;(e)将Syk募集到DAP12/TREM2复合物;(f)增加一种或多种TREM2依赖性基因的活性,任选地其中所述一种或多种TREM2依赖性基因包括活化T细胞的核因子(NFAT)转录因子;(g)增加树突细胞、巨噬细胞、M1巨噬细胞、活化的M1巨噬细胞、M2巨噬细胞、单核细胞、破骨细胞、皮肤朗格汉斯细胞、库普弗细胞、小神经胶质细胞、M1小神经胶质细胞、活化的M1小神经胶质细胞、和M2小神经胶质细胞、或其任何组合的存活;(h)调控选自由以下组成的组的一种或多种刺激性分子的表达:CD83、CD86、II类MHC、CD40、以及其任何组合,任选地其中所述CD40在树突细胞、单核细胞、巨噬细胞、或其任何组合上表达,并且任选地其中所述树突细胞包括骨髓衍生的树突细胞;(i)增加记忆力;以及(j)减少认知缺陷。在可与前述实施方案中的任一项组合的一些实施方案中,所述抗体属于IgG类、IgM类、或IgA类。在可与前述实施方案中的任一项组合的一些实施方案中,所述抗体属于IgG类并且具有IgG1、IgG2、IgG3、或IgG4同种型。在可与前述实施方案中的任一项组合的一些实施方案中,所述抗体具有IgG2同种型。在可与前述实施方案中的任一项组合的一些实施方案中,所述抗体包含人IgG2恒定区。在可与前述实施方案中的任一项组合的一些实施方案中,所述人IgG2恒定区包括Fc区。在可与前述实施方案中的任一项组合的一些实施方案中,所述抗体不依赖于结合到Fc受体而增强一种或多种TREM2活性。在可与前述实施方案中的任一项组合的一些实施方案中,所述抗体结合抑制性Fc受体。在可与前述实施方案中的任一项组合的一些实施方案中,所述抑制性Fc受体是抑制性Fc-γ受体IIB(FcγIIB)。在可与前述实施方案中的任一项组合的一些实施方案中:(a)所述分离的抗体具有人或小鼠IgG1同种型并且包含在Fc区中的在选自由以下组成的组的残基位置处的一个或多个氨基酸取代:N297A、D265A、D270A、L234A、L235A、G237A、C226S、C229S、E233P、L234V、L234F、L235E、P331S、S267E、L328F、A330L、M252Y、S254T、T256E、、L328E、P238D、S267E、L328F、E233D、G237D、H268D、P271G、A330R、以及其任何组合,其中所述残基的编号根据EU编号,或者包含在Fc区中的在对应于甘氨酸236的位置处的氨基酸缺失;(b)所述分离的抗体具有IgG1同种型并且包含IgG2同种型重链恒定结构域1(CH1)和铰链区,任选地其中所述IgG2同种型CH1和铰链区包含氨基酸序列ASTKGPSVFP LAPCSRSTSE  STAALGCLVK 
DYFPEPVTVS WNSGALTSGVHTFPAVLQSS GLYSLSSVVT VPSSNFGTQT YTCNVDHKPS 
NTKVDKTVERKCCVECPPCP(SEQ ID NO:886),并且任选地其中所述抗体Fc区包含S267E氨基酸取代、L328F氨基酸取代、或两者、和/或N297A或N297Q氨基酸取代,其中所述残基的编号根据EU编号;(c)所述分离的抗体具有IgG2同种型并且包含在Fc区中的在选自由以下组成的组的残基位置处的一个或多个氨基酸取代:P238S、V234A、G237A、H268A、H268Q、V309L、A330S、P331S、C214S、C232S、C233S、S267E、L328F、M252Y、S254T、T256E、H268E、N297A、N297Q、A330L、以及其任何组合,其中所述残基的编号根据EU编号;(d)所述分离的抗体具有人或小鼠IgG4同种型并且包含在Fc区中的在选自由以下组成的组的残基位置处的一个或多个氨基酸取代:L235A、G237A、S228P、L236E、S267E、E318A、L328F、M252Y、S254T、T256E、E233P、F234V、L234A/F234A、S228P、S241P、L248E、T394D、N297A、N297Q、L235E、以及其任何组合,其中所述残基的编号根据EU编号;或者(e)所述分离的抗体具有杂合IgG2/4同种型,并且任选地其中所述抗体包含含有人IgG2的氨基酸118至260和人IgG4的氨基酸261至447的氨基酸序列,其中所述残基的编号根据EU编号。在可与前述实施方案中的任一项组合的一些实施方案中,所述抗体具有IgG4同种型。在可与前述实施方案中的任一项组合的一些实施方案中,所述抗体包含在残基位置228处的S228P氨基酸取代、在残基位置234处的F234A氨基酸取代、在残基位置235处的L235A氨基酸取代,其中所述残基位置的编号根据EU编号。
[0036] 在可与前述实施方案中的任一项组合的一些实施方案中,所述抗体结合到选自由以下组成的组的氨基酸残基内的一种或多种氨基酸:(i)SEQ ID NO:1的氨基酸残基19-174、或TREM2蛋白上的对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基19-174的氨基酸残基;(ii)SEQ ID NO:1的氨基酸残基29-112、或TREM2蛋白上的对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基29-112的氨基酸残基;(iii)SEQ ID NO:1的氨基酸残基113-174、或TREM2蛋白上的对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基113-174的氨基酸残基;(iv)SEQ ID NO:1的氨基酸残基35-49、或TREM2蛋白上的对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基35-49的氨基酸残基;(v)SEQ ID NO:1的氨基酸残基
35-49和140-150、或TREM2蛋白上的对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基35-49和140-150的氨基酸残基;(vi)SEQ ID NO:1的氨基酸残基39-49、或TREM2蛋白上的对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基39-49的氨基酸残基;(vii)SEQ ID NO:1的氨基酸残基39-49和63-77、或TREM2蛋白上的对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基39-49和63-77的氨基酸残基;(viii)SEQ ID NO:1的氨基酸残基51-61、或TREM2蛋白上的对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基51-61的氨基酸残基;(ix)SEQ ID NO:1的氨基酸残基55-62、或TREM2蛋白上的对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基55-62的氨基酸残基;(x)SEQ ID NO:1的氨基酸残基55-62、104-109、和148-158、或TREM2蛋白上的对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基55-62、104-109、和148-158的氨基酸残基;(xi)SEQ ID NO:1的氨基酸残基55-62、104-109、和160-166、或TREM2蛋白上的对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基55-62、104-109、和160-166的氨基酸残基;(xii)SEQ ID NO:1的氨基酸残基55-65、或TREM2蛋白上的对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基55-65的氨基酸残基;(xiii)SEQ ID NO:1的氨基酸残基55-65和124-134、或TREM2蛋白上的对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基55-65和124-134的氨基酸残基;(xiv)SEQ ID NO:1的氨基酸残基63-73、或TREM2蛋白上的对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基63-73的氨基酸残基;(xv)SEQ ID NO:1的氨基酸残基63-77、或TREM2蛋白上的对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基63-77的氨基酸残基;(xvi)SEQ ID NO:1的氨基酸残基104-109、或TREM2蛋白上的对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基104-109的氨基酸残基;(xvii)SEQ ID NO:1的氨基酸残基117-133、或TREM2蛋白上的对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基117-133的氨基酸残基;(xviii)SEQ ID NO:1的氨基酸残基124-134、或TREM2蛋白上的对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基124-134的氨基酸残基;
(xix)SEQ ID NO:1的氨基酸残基137-146、或TREM2蛋白上的对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基137-146的氨基酸残基;(xx)SEQ ID NO:1的氨基酸残基139-147、或TREM2蛋白上的对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基139-147的氨基酸残基;(xxi)SEQ ID NO:1的氨基酸残基
139-149、或TREM2蛋白上的对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基139-149的氨基酸残基;
(xxii)SEQ ID NO:1的氨基酸残基140-150、或TREM2蛋白上的对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基140-150的氨基酸残基;(xxiii)SEQ ID NO:1的氨基酸残基140-146、或TREM2蛋白上的对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基140-146的氨基酸残基;(xxiv)SEQ ID NO:1的氨基酸残基140-143、或TREM2蛋白上的对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基140-143的氨基酸残基;
(xxv)SEQ ID NO:1的氨基酸残基142-152、或TREM2蛋白上的对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基142-152的氨基酸残基;(xxvi)SEQ ID NO:1的氨基酸残基146-154、或TREM2蛋白上的对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基146-154的氨基酸残基;(xxvii)SEQ ID NO:1的氨基酸残基148-158、或TREM2蛋白上的对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基148-158的氨基酸残基;
(xxviii)SEQ ID NO:1的氨基酸残基149-157、或TREM2蛋白上的对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基149-157的氨基酸残基;(xxix)SEQ ID NO:1的氨基酸残基149和150、或TREM2蛋白上的对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基149和150的氨基酸残基;(xxx)SEQ ID NO:1的氨基酸残基151-155、或TREM2蛋白上的对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基151-155的氨基酸残基;
(xxxi)SEQ ID NO:1的氨基酸残基154-161、或TREM2蛋白上的对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基154-161的氨基酸残基;(xxxii)SEQ ID NO:1的氨基酸残基156-170、或TREM2蛋白上的对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基156-170的氨基酸残基;(xxxiii)SEQ ID NO:1的氨基酸残基160-166、或TREM2蛋白上的对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基160-166的氨基酸残基;
以及(xxxiv)SEQ ID NO:1的氨基酸残基162-165、或TREM2蛋白上的对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基162-165的氨基酸残基。在可与前述实施方案中的任一项组合的一些实施方案中,所述抗体结合到SEQ ID NO:1的选自由以下组成的组的一个或多个氨基酸残基:K42、H43、W44、G45、H67、R77、T88、H114、E117、E151、D152、H154、以及E156,或结合到哺乳动物TREM2蛋白上的对应于SEQ ID NO:1的选自由以下组成的组的氨基酸残基的一个或多个氨基酸残基:K42、H43、W44、G45、H67、R77、T88、H114、E117、E151、D152、H154、以及E156。在可与前述实施方案中的任一项组合的一些实施方案中,所述抗体结合到SEQ ID NO:1的选自由以下组成的组的一个或多个氨基酸残基:E151、D152、H154、以及E156,或结合到哺乳动物TREM2蛋白上的对应于SEQ ID NO:1的选自由以下组成的组的氨基酸残基的一个或多个氨基酸残基:E151、D152、H154、以及E156。在可与前述实施方案中的任一项组合的一些实施方案中,所述抗体与选自由以下组成的组的一种或多种抗体竞争结合到TREM2:3B10、7B3、
8F8、9F5、9G1、9G3、11A8、12F9、7E9、7F6、8C3、2C5、3C5、4C12、7D9、2F6、3A7、7E5、11H5、1B4、
6H2、7B11、18D8、18E4、29F6、40D5、43B9、44A8、44B4、以及其任何组合。
[0037] 在可与前述实施方案中的任一项组合的一些实施方案中,所述抗体包含轻链可变结构域和重链可变结构域,其中所述轻链可变结构域、或所述重链可变结构域、或两者包含选自抗体的HVR-L1、HVR-L2、HVR-L3、HVR-H1、HVR-H2、以及HVR-H3的至少一个、两个、三个、四个、五个、或六个HVR,所述抗体选自由以下组成的组:4D11、7C5、6G12、8F11、8E10、7E5、7F8、8F8、1H7、2H8、3A2、3A7、3B10、4F11、6H6、7A9、7B3、8A1、9F5、9G1、9G3、10A9、11A8、12D9、
12F9、10C1、7E9、7F6、8C3、2C5、3C5、4C12、7D9、2F6、11H5、B4、6H2、7B11v1、7B11v2、18D8、
18E4v1、18E4v2、29F6v1、29F6v2、40D5v1、40D5v2、43B9、44A8v1、44A8v2、44B4v1、以及
44B4v2。在可与前述实施方案中的任一项组合的一些实施方案中:(a)所述HVR-L1包含选自由以下组成的组的氨基酸序列:SEQ ID NO:9-23、SEQ ID NO:581、SEQ ID NO:690-694、SEQ ID NO:734-738、以及SEQ ID NO:826-828;(b)所述HVR-L2包含选自由以下组成的组的氨基酸序列:SEQ ID NO:24-33、SEQ ID NO:695-697、和SEQ ID NO:739-743;以及(c)所述HVR-L3包含选自由以下组成的组的氨基酸序列:SEQ ID NO:34-47、SEQ ID NO:582、SEQ ID NO:
583、SEQ ID NO:698-702、以及SEQ ID NO:744-746;(d)所述HVR-H1包含选自由以下组成的组的氨基酸序列:SEQ ID NO:48-65、SEQ ID NO:584、SEQ ID NO:703-705、SEQ ID NO:747-
754、以及SEQ ID NO:829-835;(e)所述HVR-H2包含选自由以下组成的组的氨基酸序列:SEQ ID NO:66-84、SEQ ID NO:585-587、SEQ ID NO:706-708、SEQ ID NO:755-762、SEQ ID NO:
836-842、以及SEQ ID NO:888;或者(f)所述HVR-H3包含选自由以下组成的组的氨基酸序列:SEQ ID NO:85-102、SEQ ID NO:588、SEQ ID NO:589、SEQ ID NO:709、SEQ ID NO:710、以及SEQ ID NO:763-770。在可与前述实施方案中的任一项组合的一些实施方案中:(a)所述HVR-L1包含SEQ ID NO:11的氨基酸序列,所述HVR-L2包含SEQ ID NO:26的氨基酸序列,所述HVR-L3包含SEQ ID NO:36的氨基酸序列,所述HVR-H1包含SEQ ID NO:51的氨基酸序列,所述HVR-H2包含SEQ ID NO:69的氨基酸序列,并且所述HVR-H3包含SEQ ID NO:88的氨基酸序列;(b)所述HVR-L1包含SEQ ID NO:14的氨基酸序列,所述HVR-L2包含SEQ ID NO:28的氨基酸序列,所述HVR-L3包含SEQ ID NO:39的氨基酸序列,所述HVR-H1包含SEQ ID NO:
53的氨基酸序列,所述HVR-H2包含SEQ ID NO:71的氨基酸序列,并且所述HVR-H3包含SEQ ID NO:90的氨基酸序列;(c)所述HVR-L1包含SEQ ID NO:11的氨基酸序列,所述HVR-L2包含SEQ ID NO:26的氨基酸序列,所述HVR-L3包含SEQ ID NO:36的氨基酸序列,所述HVR-H1包含SEQ ID NO:51的氨基酸序列,所述HVR-H2包含SEQ ID NO:69的氨基酸序列,并且所述HVR-H3包含SEQ ID NO:88的氨基酸序列;(d)所述HVR-L1包含SEQ ID NO:16的氨基酸序列,所述HVR-L2包含SEQ ID NO:29的氨基酸序列,所述HVR-L3包含SEQ ID NO:35的氨基酸序列,所述HVR-H1包含SEQ ID NO:55的氨基酸序列,所述HVR-H2包含SEQ ID NO:73的氨基酸序列,并且所述HVR-H3包含SEQ ID NO:92的氨基酸序列;(e)所述HVR-H1包含SEQ ID NO:58的氨基酸序列,所述HVR-H2包含SEQ ID NO:76的氨基酸序列,并且所述HVR-H3包含SEQ ID NO:95的氨基酸序列;(f)所述HVR-L1包含SEQ ID NO:19的氨基酸序列,所述HVR-L2包含SEQ ID NO:28的氨基酸序列,所述HVR-L3包含SEQ ID NO:43的氨基酸序列,所述HVR-H1包含SEQ ID NO:60的氨基酸序列,所述HVR-H2包含SEQ ID NO:78的氨基酸序列,并且所述HVR-H3包含SEQ ID NO:97的氨基酸序列;(g)所述HVR-L1包含SEQ ID NO:20的氨基酸序列,所述HVR-L2包含SEQ ID NO:28的氨基酸序列,所述HVR-L3包含SEQ ID NO:44的氨基酸序列,所述HVR-H1包含SEQ ID NO:61的氨基酸序列,所述HVR-H2包含SEQ ID NO:79的氨基酸序列,并且所述HVR-H3包含SEQ ID NO:98的氨基酸序列;(h)所述HVR-L1包含SEQ ID NO:21的氨基酸序列,所述HVR-L2包含SEQ ID NO:32的氨基酸序列,所述HVR-L3包含SEQ ID NO:45的氨基酸序列,所述HVR-H1包含SEQ ID NO:62的氨基酸序列,所述HVR-H2包含SEQ ID NO:80的氨基酸序列,并且所述HVR-H3包含SEQ ID NO:99的氨基酸序列;(i)所述HVR-L1包含SEQ ID NO:22的氨基酸序列,所述HVR-L2包含SEQ ID NO:29的氨基酸序列,所述HVR-L3包含SEQ ID NO:46的氨基酸序列,所述HVR-H1包含SEQ ID NO:63的氨基酸序列,所述HVR-H2包含SEQ ID NO:82的氨基酸序列,并且所述HVR-H3包含SEQ ID NO:100的氨基酸序列;或者(j)所述HVR-L1包含SEQ ID NO:16的氨基酸序列,所述HVR-L2包含SEQ ID NO:29的氨基酸序列,所述HVR-L3包含SEQ ID NO:35的氨基酸序列,所述HVR-H1包含SEQ ID NO:65的氨基酸序列,所述HVR-H2包含SEQ ID NO:84的氨基酸序列,并且所述HVR-H3包含SEQ ID NO:102的氨基酸序列。在可与前述实施方案中的任一项组合的一些实施方案中,所述抗体包含轻链可变结构域和重链可变结构域,其中所述轻链可变结构域包含:(a)HVR-L1,其包含选自由以下组成的组的氨基酸序列:SEQ ID NO:9-23、SEQ ID NO:581、SEQ ID NO:690-694、SEQ ID NO:
734-738、以及SEQ ID NO:826-828,或包含与选自由以下组成的组的氨基酸序列具有至少约90%同源性的氨基酸序列:SEQ ID NO:9-23、SEQ ID NO:581、SEQ ID NO:690-694、SEQ ID NO:734-738、以及SEQ ID NO:826-828;(b)HVR-L2,其包含选自由以下组成的组的氨基酸序列:SEQ ID NO:24-33、SEQ ID NO:695-697、和SEQ ID NO:739-743,或包含与选自由以下组成的组的氨基酸序列具有至少约90%同源性的氨基酸序列:SEQ ID NO:24-33、SEQ ID NO:695-697、和SEQ ID NO:739-743;以及(c)HVR-L3,其包含选自由以下组成的组的氨基酸序列:SEQ ID NO:34-47、SEQ ID NO:582、SEQ ID NO:583、SEQ ID NO:698-702、以及SEQ ID NO:744-746,或包含与选自由以下组成的组的氨基酸序列具有至少约90%同源性的氨基酸序列:SEQ ID NO:34-47、SEQ ID NO:582、SEQ ID NO:583、SEQ ID NO:698-702、以及SEQ ID NO:744-746;并且其中所述重链可变结构域包含:(a)HVR-H1,其包含选自由以下组成的组的氨基酸序列:SEQ ID NO:48-65、SEQ ID NO:584、SEQ ID NO:703-705、SEQ ID NO:747-
754、以及SEQ ID NO:829-835,或包含与选自由以下组成的组的氨基酸序列具有至少约
90%同源性的氨基酸序列:SEQ ID NO:48-65、SEQ ID NO:584、SEQ ID NO:703-705、SEQ ID NO:747-754、以及SEQ ID NO:829-835;(b)HVR-H2,其包含选自由以下组成的组的氨基酸序列:SEQ ID NO:66-84、SEQ ID NO:585-587、SEQ ID NO:706-708、SEQ ID NO:755-762、SEQ ID NO:836-842、以及SEQ ID NO:888,或包含与选自由以下组成的组的氨基酸序列具有至少约90%同源性的氨基酸序列:SEQ ID NO:66-84、SEQ ID NO:585-587、SEQ ID NO:706-
708、SEQ ID NO:755-762、SEQ ID NO:836-842、以及SEQ ID NO:888;以及(c)HVR-H3,其包含选自由以下组成的组的氨基酸序列:SEQ ID NO:85-102、SEQ ID NO:588、SEQ ID NO:
589、SEQ ID NO:709、SEQ ID NO:710、以及SEQ ID NO:763-770,或包含与选自由以下组成的组的氨基酸序列具有至少约90%同源性的氨基酸序列:SEQ ID NO:85-102、SEQ ID NO:
588、SEQ ID NO:589、SEQ ID NO:709、SEQ ID NO:710、以及SEQ ID NO:763-770。在可与前述实施方案中的任一项组合的一些实施方案中,所述抗体包含:轻链可变结构域,其包含选自由以下组成的组的氨基酸序列:SEQ ID NO:219-398、SEQ ID NO:602-634、SEQ ID NO:
679-689、SEQ ID NO:724-730、SEQ ID NO:809-816、SEQ ID NO:821、SEQ ID NO:843、SEQ ID NO:844、SEQ ID NO:849、以及SEQ ID NO:850;和/或重链可变结构域,其包含选自由以下组成的组的氨基酸序列:SEQ ID NO:399-580、SEQ ID NO:635-678、SEQ ID NO:731-733、和SEQ ID NO:817-820、SEQ ID NO:822-825、以及SEQ ID NO:845-847。在可与前述实施方案中的任一项组合的一些实施方案中,所述抗体包含轻链可变结构域和重链可变结构域,其中:(a)所述轻链可变结构域包含SEQ ID NO:333的氨基酸序列并且所述重链可变结构域包含SEQ ID NO:521的氨基酸序列;(b)所述轻链可变结构域包含SEQ ID NO:850的氨基酸序列并且所述重链可变结构域包含SEQ ID NO:521的氨基酸序列;(c)所述轻链可变结构域包含SEQ ID NO:334的氨基酸序列并且所述重链可变结构域包含SEQ ID NO:522的氨基酸序列;(d)所述轻链可变结构域包含SEQ ID NO:335的氨基酸序列并且所述重链可变结构域包含SEQ ID NO:523的氨基酸序列;(e)所述轻链可变结构域包含SEQ ID NO:336的氨基酸序列并且所述重链可变结构域包含SEQ ID NO:524的氨基酸序列;(f)所述轻链可变结构域包含SEQ ID NO:337的氨基酸序列并且所述重链可变结构域包含SEQ ID NO:525的氨基酸序列;(g)所述轻链可变结构域包含SEQ ID NO:338的氨基酸序列并且所述重链可变结构域包含SEQ ID NO:526的氨基酸序列;(h)所述轻链可变结构域包含SEQ ID NO:339的氨基酸序列并且所述重链可变结构域包含SEQ ID NO:526的氨基酸序列;(i)所述轻链可变结构域包含SEQ ID NO:340的氨基酸序列并且所述重链可变结构域包含SEQ ID NO:527的氨基酸序列;(j)所述轻链可变结构域包含SEQ ID NO:341的氨基酸序列并且所述重链可变结构域包含SEQ ID NO:528的氨基酸序列;(k)所述轻链可变结构域包含SEQ ID NO:342的氨基酸序列并且所述重链可变结构域包含SEQ ID NO:529的氨基酸序列;(l)所述轻链可变结构域包含SEQ ID NO:343的氨基酸序列并且所述重链可变结构域包含SEQ ID NO:530的氨基酸序列;(m)所述轻链可变结构域包含SEQ ID NO:843的氨基酸序列并且所述重链可变结构域包含SEQ ID NO:845的氨基酸序列;(n)所述轻链可变结构域包含SEQ ID NO:844的氨基酸序列并且所述重链可变结构域包含SEQ ID NO:846的氨基酸序列;(o)所述轻链可变结构域包含SEQ ID NO:844的氨基酸序列并且所述重链可变结构域包含SEQ ID NO:847的氨基酸序列;(p)所述轻链可变结构域包含SEQ ID NO:219的氨基酸序列并且所述重链可变结构域包含SEQ ID NO:399的氨基酸序列;(q)所述轻链可变结构域包含SEQ ID NO:230的氨基酸序列并且所述重链可变结构域包含SEQ ID NO:409的氨基酸序列;(r)所述轻链可变结构域包含SEQ ID NO:252的氨基酸序列并且所述重链可变结构域包含SEQ ID NO:419的氨基酸序列;(s)所述轻链可变结构域包含SEQ ID NO:241的氨基酸序列并且所述重链可变结构域包含SEQ ID NO:429的氨基酸序列;(t)所述轻链可变结构域包含SEQ ID NO:849的氨基酸序列并且所述重链可变结构域包含SEQ ID NO:429的氨基酸序列;(u)所述轻链可变结构域包含SEQ ID NO:263的氨基酸序列并且所述重链可变结构域包含SEQ ID NO:439的氨基酸序列;(v)所述轻链可变结构域包含SEQ ID NO:274的氨基酸序列并且所述重链可变结构域包含SEQ ID NO:449的氨基酸序列;(w)所述轻链可变结构域包含SEQ ID NO:285的氨基酸序列并且所述重链可变结构域包含SEQ ID NO:459的氨基酸序列;(x)所述轻链可变结构域包含SEQ ID NO:286的氨基酸序列并且所述重链可变结构域包含SEQ ID NO:460的氨基酸序列;(y)所述轻链可变结构域包含SEQ ID NO:287的氨基酸序列并且所述重链可变结构域包含SEQ ID NO:461的氨基酸序列;(z)所述轻链可变结构域包含SEQ ID NO:298的氨基酸序列并且所述重链可变结构域包含SEQ ID NO:429的氨基酸序列;(aa)所述轻链可变结构域包含SEQ ID NO:299的氨基酸序列并且所述重链可变结构域包含SEQ ID NO:471的氨基酸序列;(bb)所述轻链可变结构域包含SEQ ID NO:310的氨基酸序列并且所述重链可变结构域包含SEQ ID NO:461的氨基酸序列;(cc)所述轻链可变结构域包含SEQ ID NO:679的氨基酸序列并且所述重链可变结构域包含SEQ ID NO:481的氨基酸序列;(dd)所述轻链可变结构域包含SEQ ID NO:311的氨基酸序列并且所述重链可变结构域包含SEQ ID NO:491的氨基酸序列;(ee)所述轻链可变结构域包含SEQ ID NO:322的氨基酸序列并且所述重链可变结构域包含SEQ ID NO:511的氨基酸序列;(ff)所述轻链可变结构域包含SEQ ID NO:344的氨基酸序列并且所述重链可变结构域包含SEQ ID NO:531的氨基酸序列;(gg)所述轻链可变结构域包含SEQ ID NO:355的氨基酸序列并且所述重链可变结构域包含SEQ ID NO:
635的氨基酸序列;(hh)所述轻链可变结构域包含SEQ ID NO:365的氨基酸序列并且所述重链可变结构域包含SEQ ID NO:541的氨基酸序列;(ii)所述轻链可变结构域包含SEQ ID NO:376的氨基酸序列并且所述重链可变结构域包含SEQ ID NO:551的氨基酸序列;(jj)所述轻链可变结构域包含SEQ ID NO:387的氨基酸序列并且所述重链可变结构域包含SEQ ID NO:561的氨基酸序列;(kk)所述轻链可变结构域包含SEQ ID NO:398的氨基酸序列并且所述重链可变结构域包含SEQ ID NO:571的氨基酸序列;(ll)所述轻链可变结构域包含SEQ ID NO:724的氨基酸序列并且所述重链可变结构域包含SEQ ID NO:731的氨基酸序列;(mm)所述轻链可变结构域包含SEQ ID NO:809的氨基酸序列并且所述重链可变结构域包含SEQ ID NO:731的氨基酸序列;(nn)所述轻链可变结构域包含SEQ ID NO:725的氨基酸序列并且所述重链可变结构域包含SEQ ID NO:732的氨基酸序列;(oo)所述轻链可变结构域包含SEQ ID NO:726的氨基酸序列并且所述重链可变结构域包含SEQ ID NO:731的氨基酸序列;(pp)所述轻链可变结构域包含SEQ ID NO:726的氨基酸序列并且所述重链可变结构域包含SEQ ID NO:817的氨基酸序列;(qq)所述轻链可变结构域包含SEQ ID NO:727的氨基酸序列并且所述重链可变结构域包含SEQ ID NO:731的氨基酸序列;(rr)所述轻链可变结构域包含SEQ ID NO:728的氨基酸序列并且所述重链可变结构域包含SEQ ID NO:733的氨基酸序列;(ss)所述轻链可变结构域包含SEQ ID NO:810的氨基酸序列并且所述重链可变结构域包含SEQ ID NO:818的氨基酸序列;(tt)所述轻链可变结构域包含SEQ ID NO:811的氨基酸序列并且所述重链可变结构域包含SEQ ID NO:733的氨基酸序列;(uu)所述轻链可变结构域包含SEQ ID NO:729的氨基酸序列并且所述重链可变结构域包含SEQ ID NO:731的氨基酸序列;(vv)所述轻链可变结构域包含SEQ ID NO:812的氨基酸序列并且所述重链可变结构域包含SEQ ID NO:819的氨基酸序列;(ww)所述轻链可变结构域包含SEQ ID NO:729的氨基酸序列并且所述重链可变结构域包含SEQ ID NO:820的氨基酸序列;(xx)所述轻链可变结构域包含SEQ ID NO:730的氨基酸序列并且所述重链可变结构域包含SEQ ID NO:731的氨基酸序列;(yy)所述轻链可变结构域包含SEQ ID NO:813的氨基酸序列并且所述重链可变结构域包含SEQ ID NO:731的氨基酸序列;(zz)所述轻链可变结构域包含SEQ ID NO:814的氨基酸序列并且所述重链可变结构域包含SEQ ID NO:822的氨基酸序列;(aaa)所述轻链可变结构域包含SEQ ID NO:815的氨基酸序列并且所述重链可变结构域包含SEQ ID NO:824的氨基酸序列;
或者(bbb)所述轻链可变结构域包含SEQ ID NO:816的氨基酸序列并且所述重链可变结构域包含SEQ ID NO:825的氨基酸序列。在可与前述实施方案中的任一项组合的一些实施方案中,所述抗体包含:选自由以下组成的组的抗体的轻链可变结构域:3B10、7B3、8F8、9F5、
9G1、9G3、11A8、12F9、7E9、7F6、8C3、2C5、3C5、4C12、7D9、2F6、3A7、7E5、11H5、1B4v1、1B4v2、
6H2、7B11v1、7B11v2、18D8、18E4v1、18E4v2、29F6v1、29F6v2、40D5v1、40D5v2、43B9、44A8v1、
44A8v2、44B4v1、以及44B4v2;和/或选自由以下组成的组的抗体的重链可变结构域:3B10、
7B3、8F8、9F5、9G1、9G3、11A8、12F9、7E9、7F6、8C3、2C5、3C5、4C12、7D9、2F6、3A7、77E5、11H5、
1B4v1、1B4v2、6H2、7B11v1、7B11v2、18D8、18E4v1、18E4v2、29F6v1、29F6v2、40D5v1、40D5v2、
43B9、44A8v1、44A8v2、44B4v1、以及44B4v2。在可与前述实施方案中的任一项组合的一些实施方案中,所述抗TREM2抗体包含轻链可变结构域和重链可变结构域,其中所述轻链可变结构域包含HVR-L1、HVR-L2、HVR-L3,所述重链可变结构域包含HVR-H1、HVR-H2、和HVR-H3,并且其中所述HVR-H3包含选自由以下组成的组的氨基酸序列:SEQ ID NO:85-102、SEQ ID NO:588、SEQ ID NO:589、SEQ ID NO:709、SEQ ID NO:710、以及SEQ ID NO:763-770,或包含与选自由以下组成的组的氨基酸序列具有至少约90%同源性的氨基酸序列:SEQ ID NO:
85-102、SEQ ID NO:588、SEQ ID NO:589、SEQ ID NO:709、SEQ ID NO:710、以及SEQ ID NO:
763-770。
[0038] 本公开的其他方面涉及一种结合到TREM2蛋白的分离的(例如,单克隆的)抗体,其中所述抗体结合到选自由以下组成的组的氨基酸残基内的一种或多种氨基酸:(i)SEQ ID NO:1的氨基酸残基19-174、或TREM2蛋白上的对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基19-174的氨基酸残基;(ii)SEQ ID NO:1的氨基酸残基29-112、或TREM2蛋白上的对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基29-112的氨基酸残基;(iii)SEQ ID NO:1的氨基酸残基113-174、或TREM2蛋白上的对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基113-174的氨基酸残基;(iv)SEQ ID NO:1的氨基酸残基35-49、或TREM2蛋白上的对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基35-49的氨基酸残基;(v)SEQ ID NO:1的氨基酸残基35-49和140-150、或TREM2蛋白上的对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基35-49和140-150的氨基酸残基;(vi)SEQ ID NO:1的氨基酸残基39-49、或TREM2蛋白上的对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基39-49的氨基酸残基;(vii)SEQ ID NO:1的氨基酸残基39-49和63-77、或TREM2蛋白上的对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基39-49和63-77的氨基酸残基;(viii)SEQ ID NO:1的氨基酸残基51-61、或TREM2蛋白上的对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基51-61的氨基酸残基;(ix)SEQ ID NO:1的氨基酸残基55-62、或TREM2蛋白上的对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基55-62的氨基酸残基;(x)SEQ ID NO:1的氨基酸残基55-62、104-109、和148-158、或TREM2蛋白上的对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基55-62、104-
109、和148-158的氨基酸残基;(xi)SEQ ID NO:1的氨基酸残基55-62、104-109、和160-166、或TREM2蛋白上的对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基55-62、104-109、和160-166的氨基酸残基;(xii)SEQ ID NO:1的氨基酸残基55-65、或TREM2蛋白上的对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基55-65的氨基酸残基;(xiii)SEQ ID NO:1的氨基酸残基55-65和124-134、或TREM2蛋白上的对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基55-65和124-134的氨基酸残基;(xiv)SEQ ID NO:1的氨基酸残基63-73、或TREM2蛋白上的对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基63-73的氨基酸残基;(xv)SEQ ID NO:1的氨基酸残基63-77、或TREM2蛋白上的对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基63-77的氨基酸残基;(xvi)SEQ ID NO:1的氨基酸残基104-109、或TREM2蛋白上的对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基104-109的氨基酸残基;(xvii)SEQ ID NO:1的氨基酸残基
117-133、或TREM2蛋白上的对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基117-133的氨基酸残基;
(xviii)SEQ ID NO:1的氨基酸残基124-134、或TREM2蛋白上的对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基124-134的氨基酸残基;(xix)SEQ ID NO:1的氨基酸残基137-146、或TREM2蛋白上的对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基137-146的氨基酸残基;(xx)SEQ ID NO:1的氨基酸残基
139-147、或TREM2蛋白上的对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基139-147的氨基酸残基;(xxi)SEQ ID NO:1的氨基酸残基139-149、或TREM2蛋白上的对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基
139-149的氨基酸残基;(xxii)SEQ ID NO:1的氨基酸残基140-150、或TREM2蛋白上的对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基140-150的氨基酸残基;(xxiii)SEQ ID NO:1的氨基酸残基
140-146、或TREM2蛋白上的对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基140-146的氨基酸残基;
(xxiv)SEQ ID NO:1的氨基酸残基140-143、或TREM2蛋白上的对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基140-143的氨基酸残基;(xxv)SEQ ID NO:1的氨基酸残基142-152、或TREM2蛋白上的对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基142-152的氨基酸残基;(xxvi)SEQ ID NO:1的氨基酸残基
146-154、或TREM2蛋白上的对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基146-154的氨基酸残基;
(xxvii)SEQ ID NO:1的氨基酸残基148-158、或TREM2蛋白上的对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基148-158的氨基酸残基;(xxviii)SEQ ID NO:1的氨基酸残基149-157、或TREM2蛋白上的对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基149-157的氨基酸残基;(xxix)SEQ ID NO:1的氨基酸残基149和150、或TREM2蛋白上的对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基149和150的氨基酸残基;(xxx)SEQ ID NO:1的氨基酸残基151-155、或TREM2蛋白上的对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基151-155的氨基酸残基;(xxxi)SEQ ID NO:1的氨基酸残基154-161、或TREM2蛋白上的对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基154-161的氨基酸残基;(xxxii)SEQ ID NO:1的氨基酸残基156-170、或TREM2蛋白上的对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基156-170的氨基酸残基;
(xxxiii)SEQ ID NO:1的氨基酸残基160-166、或TREM2蛋白上的对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基160-166的氨基酸残基;以及(xxxiv)SEQ ID NO:1的氨基酸残基162-165、或TREM2蛋白上的对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基162-165的氨基酸残基。在一些实施方案中,所述抗体诱导一种或多种TREM2活性并且增强由一种或多种TREM2配体与TREM2蛋白的结合诱导的一种或多种TREM2活性。在一些实施方案中,所述抗体还结合到选自由以下组成的组的一个或多个氨基酸残基:(i)SEQ ID NO:1的氨基酸残基Arg47或Asp87;(ii)SEQ ID NO:1的氨基酸残基40-44;(iii)SEQ ID NO:1的氨基酸残基67-76;以及(iv)SEQ ID NO:1的氨基酸残基114-118。
[0039] 本公开的其他方面涉及一种结合到TREM2蛋白的分离的(例如,单克隆的)抗体,其中所述抗体结合到SEQ ID NO:1的选自由以下组成的组的一个或多个氨基酸残基:K42、H43、W44、G45、H67、R77、T88、H114、E117、E151、D152、H154、以及E156,或结合到哺乳动物TREM2蛋白上的对应于SEQ ID NO:1的选自由以下组成的组的氨基酸残基的一个或多个氨基酸残基:K42、H43、W44、G45、H67、R77、T88、H114、E117、E151、D152、H154、以及E156。在一些实施方案中,所述抗体结合到SEQ ID NO:1的选自由以下组成的组的一个或多个氨基酸残基:E151、D152、H154、以及E156,或结合到哺乳动物TREM2蛋白上的对应于SEQ ID NO:1的选自由以下组成的组的氨基酸残基的一个或多个氨基酸残基:E151、D152、H154、以及E156。本公开的其他方面涉及一种结合到TREM2蛋白的分离的(例如,单克隆的)抗体,其中所述抗体结合到SEQ ID NO:1的选自由以下组成的组的一个或多个氨基酸残基:E151、D152、H154、以及E156,或结合到哺乳动物TREM2蛋白上的对应于SEQ ID NO:1的选自由以下组成的组的氨基酸残基的一个或多个氨基酸残基:E151、D152、H154、以及E156。
[0040] 本公开的其他方面涉及一种结合到TREM2蛋白的分离的(例如,单克隆的)抗体,其中所述抗体与选自由以下组成的组的一种或多种抗体竞争结合到TREM2:1A7、3A2、3B10、6G12、6H6、7A9、7B3、8A1、8E10、8F11、8F8、9F5、9G1、9G3、10A9、10C1、11A8、12E2、12F9、12G6、
2C7、2F5、3C1、4D7、4D11、6C11、6G12、7A3、7C5、7E9、7F6、7G1、7H1、8C3、8F10、12A1、1E9、2C5、
3C5、4C12、4F2、5A2、6B3、7D1、7D9、11D8、8A12、10E7、10B11、10D2、7D5、2A7、3G12、6H9、8G9、
9B4、10A1、11A8、12F3、2F8、10E3、1H7、2F6、2H8、3A7、7E5、7F8、11H5、7C5、4F11、12D9、1B4v1、
1B4v2、6H2、7B11v1、7B11v2、18D8、18E4v1、18E4v2、29F6v1、29F6v2、40D5v1、40D5v2、43B9、
44A8v1、44A8v2、44B4v1、44B4v2、以及其任何组合。
[0041] 本公开的其他方面涉及一种结合到TREM2蛋白的分离的(例如,单克隆的)抗体,其中所述抗体包含轻链可变结构域和重链可变结构域,其中所述轻链可变结构域、或所述重链可变结构域、或两者包含选自抗体的HVR-L1、HVR-L2、HVR-L3、HVR-H1、HVR-H2、以及HVR-H3的至少一个、两个、三个、四个、五个、或六个HVR,所述抗体选自由以下组成的组:1A7、3A2、3B10、6G12、6H6、7A9、7B3、8A1、8E10、8F11、8F8、9F5、9G1、9G3、10A9、10C1、11A8、12E2、
12F9、12G6、2C7、2F5、3C1、4D7、4D11、6C11、6G12、7A3、7C5、7E9、7F6、7G1、7H1、8C3、8F10、
12A1、1E9、2C5、3C5、4C12、4F2、5A2、6B3、7D1、7D9、11D8、8A12、10E7、10B11、10D2、7D5、2A7、
3G12、6H9、8G9、9B4、10A1、11A8、12F3、2F8、10E3、1H7、2F6、2H8、3A7、7E5、7F8、11H5、7C5、
4F11、12D9、1B4v1、1B4v2、6H2、7B11v1、7B11v2、18D8、18E4v1、18E4v2、29F6v1、29F6v2、
40D5v1、40D5v2、43B9、44A8v1、44A8v2、44B4v1、以及44B4v2。在一些实施方案中:(a)所述HVR-L1包含选自由以下组成的组的氨基酸序列:SEQ ID NO:9-23、SEQ ID NO:581、SEQ ID NO:690-694、SEQ ID NO:734-738、以及SEQ ID NO:826-828;(b)所述HVR-L2包含选自由以下组成的组的氨基酸序列:SEQ ID NO:24-33、SEQ ID NO:695-697、和SEQ ID NO:739-743;
以及(c)所述HVR-L3包含选自由以下组成的组的氨基酸序列:SEQ ID NO:34-47、SEQ ID NO:582、SEQ ID NO:583、SEQ ID NO:698-702、以及SEQ ID NO:744-746;(d)所述HVR-H1包含选自由以下组成的组的氨基酸序列:SEQ ID NO:48-65、SEQ ID NO:584、SEQ ID NO:703-
705、SEQ ID NO:747-754、以及SEQ ID NO:829-835;(e)所述HVR-H2包含选自由以下组成的组的氨基酸序列:SEQ ID NO:66-84、SEQ ID NO:585-587、SEQ ID NO:706-708、SEQ ID NO:
755-762、SEQ ID NO:836-842、以及SEQ ID NO:888;或者(f)所述HVR-H3包含选自由以下组成的组的氨基酸序列:SEQ ID NO:85-102、SEQ ID NO:588、SEQ ID NO:589、SEQ ID NO:
709、SEQ ID NO:710、以及SEQ ID NO:763-770。在一些实施方案中:(a)所述HVR-L1包含SEQ ID NO:9的氨基酸序列,所述HVR-L2包含SEQ ID NO:24的氨基酸序列,所述HVR-L3包含SEQ ID NO:34的氨基酸序列,所述HVR-H1包含SEQ ID NO:48的氨基酸序列,所述HVR-H2包含SEQ ID NO:66的氨基酸序列,并且所述HVR-H3包含SEQ ID NO:85的氨基酸序列;(b)所述HVR-L1包含SEQ ID NO:9的氨基酸序列,所述HVR-L2包含SEQ ID NO:24的氨基酸序列,所述HVR-L3包含SEQ ID NO:34的氨基酸序列,所述HVR-H1包含SEQ ID NO:48的氨基酸序列,所述HVR-H2包含SEQ ID NO:66的氨基酸序列,并且所述HVR-H3包含SEQ ID NO:85的氨基酸序列;(c)所述HVR-L1包含SEQ ID NO:10的氨基酸序列,所述HVR-L2包含SEQ ID NO:25的氨基酸序列,所述HVR-L3包含SEQ ID NO:35的氨基酸序列,所述HVR-H1包含SEQ ID NO:49的氨基酸序列,所述HVR-H2包含SEQ ID NO:67的氨基酸序列,并且所述HVR-H3包含SEQ ID NO:86的氨基酸序列;(d)所述HVR-L1包含SEQ ID NO:12的氨基酸序列,所述HVR-L2包含SEQ ID NO:
26的氨基酸序列,所述HVR-L3包含SEQ ID NO:37的氨基酸序列,所述HVR-H1包含SEQ ID NO:50的氨基酸序列,所述HVR-H2包含SEQ ID NO:68的氨基酸序列,并且所述HVR-H3包含SEQ ID NO:87的氨基酸序列;(e)所述HVR-L1包含SEQ ID NO:11的氨基酸序列,所述HVR-L2包含SEQ ID NO:26的氨基酸序列,所述HVR-L3包含SEQ ID NO:36的氨基酸序列,所述HVR-H1包含SEQ ID NO:51的氨基酸序列,所述HVR-H2包含SEQ ID NO:69的氨基酸序列,并且所述HVR-H3包含SEQ ID NO:88的氨基酸序列;(f)所述HVR-L1包含SEQ ID NO:13的氨基酸序列,所述HVR-L2包含SEQ ID NO:27的氨基酸序列,所述HVR-L3包含SEQ ID NO:38的氨基酸序列,所述HVR-H1包含SEQ ID NO:52的氨基酸序列,所述HVR-H2包含SEQ ID NO:70的氨基酸序列,并且所述HVR-H3包含SEQ ID NO:89的氨基酸序列;(g)所述HVR-L1包含SEQ ID NO:
14的氨基酸序列,所述HVR-L2包含SEQ ID NO:28的氨基酸序列,所述HVR-L3包含SEQ ID NO:39的氨基酸序列,所述HVR-H1包含SEQ ID NO:53的氨基酸序列,所述HVR-H2包含SEQ ID NO:71的氨基酸序列,并且所述HVR-H3包含SEQ ID NO:90的氨基酸序列;(h)所述HVR-L1包含SEQ ID NO:13的氨基酸序列,所述HVR-L2包含SEQ ID NO:27的氨基酸序列,所述HVR-L3包含SEQ ID NO:38的氨基酸序列,所述HVR-H1包含SEQ ID NO:52的氨基酸序列,所述HVR-H2包含SEQ ID NO:70的氨基酸序列,并且所述HVR-H3包含SEQ ID NO:89的氨基酸序列;(i)所述HVR-L1包含SEQ ID NO:13的氨基酸序列,所述HVR-L2包含SEQ ID NO:27的氨基酸序列,所述HVR-L3包含SEQ ID NO:38的氨基酸序列,所述HVR-H1包含SEQ ID NO:52的氨基酸序列,所述HVR-H2包含SEQ ID NO:70的氨基酸序列,并且所述HVR-H3包含SEQ ID NO:89的氨基酸序列;(j)所述HVR-L1包含SEQ ID NO:15的氨基酸序列,所述HVR-L2包含SEQ ID NO:
28的氨基酸序列,所述HVR-L3包含SEQ ID NO:40的氨基酸序列,所述HVR-H1包含SEQ ID NO:54的氨基酸序列,所述HVR-H2包含SEQ ID NO:72的氨基酸序列,并且所述HVR-H3包含SEQ ID NO:91的氨基酸序列;(k)所述HVR-L1包含SEQ ID NO:11的氨基酸序列,所述HVR-L2包含SEQ ID NO:26的氨基酸序列,所述HVR-L3包含SEQ ID NO:36的氨基酸序列,所述HVR-H1包含SEQ ID NO:51的氨基酸序列,所述HVR-H2包含SEQ ID NO:69的氨基酸序列,并且所述HVR-H3包含SEQ ID NO:88的氨基酸序列;(l)所述HVR-L1包含SEQ ID NO:16的氨基酸序列,所述HVR-L2包含SEQ ID NO:29的氨基酸序列,所述HVR-L3包含SEQ ID NO:35的氨基酸序列,所述HVR-H1包含SEQ ID NO:55的氨基酸序列,所述HVR-H2包含SEQ ID NO:73的氨基酸序列,并且所述HVR-H3包含SEQ ID NO:92的氨基酸序列;(m)所述HVR-L1包含SEQ ID NO:
15的氨基酸序列,所述HVR-L2包含SEQ ID NO:28的氨基酸序列,所述HVR-L3包含SEQ ID NO:40的氨基酸序列,所述HVR-H1包含SEQ ID NO:54的氨基酸序列,所述HVR-H2包含SEQ ID NO:72的氨基酸序列,并且所述HVR-H3包含SEQ ID NO:91的氨基酸序列;(n)所述HVR-L1包含SEQ ID NO:581的氨基酸序列,所述HVR-L2包含SEQ ID NO:29的氨基酸序列,所述HVR-L3包含SEQ ID NO:582的氨基酸序列,所述HVR-H1包含SEQ ID NO:56的氨基酸序列,所述HVR-H2包含SEQ ID NO:74的氨基酸序列,并且所述HVR-H3包含SEQ ID NO:93的氨基酸序列;(o)所述HVR-L1包含SEQ ID NO:17的氨基酸序列,所述HVR-L2包含SEQ ID NO:30的氨基酸序列,所述HVR-L3包含SEQ ID NO:41的氨基酸序列,所述HVR-H1包含SEQ ID NO:57的氨基酸序列,所述HVR-H2包含SEQ ID NO:75的氨基酸序列,并且所述HVR-H3包含SEQ ID NO:94的氨基酸序列;(p)所述HVR-H1包含SEQ ID NO:58的氨基酸序列,所述HVR-H2包含SEQ ID NO:
76的氨基酸序列,并且所述HVR-H3包含SEQ ID NO:95的氨基酸序列;(q)所述HVR-L1包含SEQ ID NO:18的氨基酸序列,所述HVR-L2包含SEQ ID NO:31的氨基酸序列,所述HVR-L3包含SEQ ID NO:42的氨基酸序列,所述HVR-H1包含SEQ ID NO:59的氨基酸序列,所述HVR-H2包含SEQ ID NO:77的氨基酸序列,并且所述HVR-H3包含SEQ ID NO:96的氨基酸序列;(r)所述HVR-L1包含SEQ ID NO:19的氨基酸序列,所述HVR-L2包含SEQ ID NO:28的氨基酸序列,所述HVR-L3包含SEQ ID NO:43的氨基酸序列,所述HVR-H1包含SEQ ID NO:60的氨基酸序列,所述HVR-H2包含SEQ ID NO:78的氨基酸序列,并且所述HVR-H3包含SEQ ID NO:97的氨基酸序列;(s)所述HVR-L1包含SEQ ID NO:20的氨基酸序列,所述HVR-L2包含SEQ ID NO:28的氨基酸序列,所述HVR-L3包含SEQ ID NO:44的氨基酸序列,所述HVR-H1包含SEQ ID NO:
61的氨基酸序列,所述HVR-H2包含SEQ ID NO:79的氨基酸序列,并且所述HVR-H3包含SEQ ID NO:98的氨基酸序列;(t)所述HVR-L1包含SEQ ID NO:21的氨基酸序列,所述HVR-L2包含SEQ ID NO:32的氨基酸序列,所述HVR-L3包含SEQ ID NO:45的氨基酸序列,所述HVR-H1包含SEQ ID NO:62的氨基酸序列,所述HVR-H2包含SEQ ID NO:80的氨基酸序列,并且所述HVR-H3包含SEQ ID NO:99的氨基酸序列;(u)所述HVR-L1包含SEQ ID NO:15的氨基酸序列,所述HVR-L2包含SEQ ID NO:33的氨基酸序列,所述HVR-L3包含SEQ ID NO:40的氨基酸序列,所述HVR-H1包含SEQ ID NO:54的氨基酸序列,所述HVR-H2包含SEQ ID NO:81的氨基酸序列,并且所述HVR-H3包含SEQ ID NO:91的氨基酸序列;(v)所述HVR-L1包含SEQ ID NO:22的氨基酸序列,所述HVR-L2包含SEQ ID NO:29的氨基酸序列,所述HVR-L3包含SEQ ID NO:
46的氨基酸序列,所述HVR-H1包含SEQ ID NO:63的氨基酸序列,所述HVR-H2包含SEQ ID NO:82的氨基酸序列,并且所述HVR-H3包含SEQ ID NO:100的氨基酸序列;(w)所述HVR-L1包含SEQ ID NO:23的氨基酸序列,所述HVR-L2包含SEQ ID NO:29的氨基酸序列,所述HVR-L3包含SEQ ID NO:47的氨基酸序列,所述HVR-H1包含SEQ ID NO:64的氨基酸序列,所述HVR-H2包含SEQ ID NO:83的氨基酸序列,并且所述HVR-H3包含SEQ ID NO:101的氨基酸序列;
(x)所述HVR-L1包含SEQ ID NO:16的氨基酸序列,所述HVR-L2包含SEQ ID NO:29的氨基酸序列,所述HVR-L3包含SEQ ID NO:35的氨基酸序列,所述HVR-H1包含SEQ ID NO:65的氨基酸序列,所述HVR-H2包含SEQ ID NO:84的氨基酸序列,并且所述HVR-H3包含SEQ ID NO:102的氨基酸序列;(y)所述HVR-L1包含SEQ ID NO:581的氨基酸序列,所述HVR-L2包含SEQ ID NO:29的氨基酸序列,所述HVR-L3包含SEQ ID NO:582的氨基酸序列,所述HVR-H1包含SEQ ID NO:56的氨基酸序列,所述HVR-H2包含SEQ ID NO:585的氨基酸序列,并且所述HVR-H3包含SEQ ID NO:588的氨基酸序列;(z)所述HVR-L1包含SEQ ID NO:10的氨基酸序列,所述HVR-L2包含SEQ ID NO:29的氨基酸序列,所述HVR-L3包含SEQ ID NO:35的氨基酸序列,所述HVR-H1包含SEQ ID NO:49的氨基酸序列,所述HVR-H2包含SEQ ID NO:586的氨基酸序列,并且所述HVR-H3包含SEQ ID NO:86的氨基酸序列;或者(aa)所述HVR-L1包含SEQ ID NO:14的氨基酸序列,所述HVR-L2包含SEQ ID NO:28的氨基酸序列,所述HVR-L3包含SEQ ID NO:
583的氨基酸序列,所述HVR-H1包含SEQ ID NO:584的氨基酸序列,所述HVR-H2包含SEQ ID NO:587的氨基酸序列,并且所述HVR-H3包含SEQ ID NO:589的氨基酸序列。在一些实施方案中,所述轻链可变结构域包含:(a)HVR-L1,其包含选自由以下组成的组的氨基酸序列:SEQ ID NO:9-23、SEQ ID NO:581、SEQ ID NO:690-694、SEQ ID NO:734-738、以及SEQ ID NO:
826-828,或包含与选自由以下组成的组的氨基酸序列具有至少约90%同源性的氨基酸序列:SEQ ID NO:9-23、SEQ ID NO:581、SEQ ID NO:690-694、SEQ ID NO:734-738、以及SEQ ID NO:826-828;(b)HVR-L2,其包含选自由以下组成的组的氨基酸序列:SEQ ID NO:24-33、SEQ ID NO:695-697、和SEQ ID NO:739-743,或包含与选自由以下组成的组的氨基酸序列具有至少约90%同源性的氨基酸序列:SEQ ID NO:24-33、SEQ ID NO:695-697、和SEQ ID NO:739-743;以及(c)HVR-L3,其包含选自由以下组成的组的氨基酸序列:SEQ ID NO:34-
47、SEQ ID NO:582、SEQ ID NO:583、SEQ ID NO:698-702、以及SEQ ID NO:744-746,或包含与选自由以下组成的组的氨基酸序列具有至少约90%同源性的氨基酸序列:SEQ ID NO:
34-47、SEQ ID NO:582、SEQ ID NO:583、SEQ ID NO:698-702、以及SEQ ID NO:744-746;并且其中所述重链可变结构域包含:(a)HVR-H1,其包含选自由以下组成的组的氨基酸序列:
SEQ ID NO:48-65、SEQ ID NO:584、SEQ ID NO:703-705、SEQ ID NO:747-754、以及SEQ ID NO:829-835,或包含与选自由以下组成的组的氨基酸序列具有至少约90%同源性的氨基酸序列:SEQ ID NO:48-65、SEQ ID NO:584、SEQ ID NO:703-705、SEQ ID NO:747-754、以及SEQ ID NO:829-835;(b)HVR-H2,其包含选自由以下组成的组的氨基酸序列:SEQ ID NO:
66-84、SEQ ID NO:585-587、SEQ ID NO:706-708、SEQ ID NO:755-762、SEQ ID NO:836-
842、以及SEQ ID NO:888,或包含与选自由以下组成的组的氨基酸序列具有至少约90%同源性的氨基酸序列:SEQ ID NO:66-84、SEQ ID NO:585-587、SEQ ID NO:706-708、SEQ ID NO:755-762、SEQ ID NO:836-842、以及SEQ ID NO:888;以及(c)HVR-H3,其包含选自由以下组成的组的氨基酸序列:SEQ ID NO:85-102、SEQ ID NO:588、SEQ ID NO:589、SEQ ID NO:
709、SEQ ID NO:710、以及SEQ ID NO:763-770,或包含与选自由以下组成的组的氨基酸序列具有至少约90%同源性的氨基酸序列:SEQ ID NO:85-102、SEQ ID NO:588、SEQ ID NO:
589、SEQ ID NO:709、SEQ ID NO:710、以及SEQ ID NO:763-770。在一些实施方案中,所述抗TREM2抗体包含轻链可变结构域和重链可变结构域,其中所述轻链可变结构域包含HVR-L1、HVR-L2、HVR-L3,所述重链可变结构域包含HVR-H1、HVR-H2、和HVR-H3,并且其中所述HVR-H3包含选自由以下组成的组的氨基酸序列:SEQ ID NO:85-102、SEQ ID NO:588、SEQ ID NO:
589、SEQ ID NO:709、SEQ ID NO:710、以及SEQ ID NO:763-770,或包含与选自由以下组成的组的氨基酸序列具有至少约90%同源性的氨基酸序列:SEQ ID NO:85-102、SEQ ID NO:
588、SEQ ID NO:589、SEQ ID NO:709、SEQ ID NO:710、以及SEQ ID NO:763-770。在一些实施方案中,所述抗体包含:轻链可变结构域,其包含选自由以下组成的组的氨基酸序列:SEQ ID NO:219-398、SEQ ID NO:602-634、SEQ ID NO:679-689、SEQ ID NO:724-730、SEQ ID NO:809-816、SEQ ID NO:821、SEQ ID NO:843、SEQ ID NO:844、SEQ ID NO:849、以及SEQ ID NO:850;和/或重链可变结构域,其包含选自由以下组成的组的氨基酸序列:SEQ ID NO:
399-580、SEQ ID NO:635-678、SEQ ID NO:731-733、SEQ ID NO:817-820、SEQ ID NO:822-
825、以及SEQ ID NO:845-847。在一些实施方案中,所述抗体包含轻链可变结构域和重链可变结构域,其中:(a)所述轻链可变结构域包含SEQ ID NO:333的氨基酸序列并且所述重链可变结构域包含SEQ ID NO:521的氨基酸序列;(b)所述轻链可变结构域包含SEQ ID NO:
850的氨基酸序列并且所述重链可变结构域包含SEQ ID NO:521的氨基酸序列;(c)所述轻链可变结构域包含SEQ ID NO:334的氨基酸序列并且所述重链可变结构域包含SEQ ID NO:
522的氨基酸序列;(d)所述轻链可变结构域包含SEQ ID NO:335的氨基酸序列并且所述重链可变结构域包含SEQ ID NO:523的氨基酸序列;(e)所述轻链可变结构域包含SEQ ID NO:
336的氨基酸序列并且所述重链可变结构域包含SEQ ID NO:524的氨基酸序列;(f)所述轻链可变结构域包含SEQ ID NO:337的氨基酸序列并且所述重链可变结构域包含SEQ ID NO:
525的氨基酸序列;(g)所述轻链可变结构域包含SEQ ID NO:338的氨基酸序列并且所述重链可变结构域包含SEQ ID NO:526的氨基酸序列;(h)所述轻链可变结构域包含SEQ ID NO:
339的氨基酸序列并且所述重链可变结构域包含SEQ ID NO:526的氨基酸序列;(i)所述轻链可变结构域包含SEQ ID NO:340的氨基酸序列并且所述重链可变结构域包含SEQ ID NO:
527的氨基酸序列;(j)所述轻链可变结构域包含SEQ ID NO:341的氨基酸序列并且所述重链可变结构域包含SEQ ID NO:528的氨基酸序列;(k)所述轻链可变结构域包含SEQ ID NO:
342的氨基酸序列并且所述重链可变结构域包含SEQ ID NO:529的氨基酸序列;(l)所述轻链可变结构域包含SEQ ID NO:343的氨基酸序列并且所述重链可变结构域包含SEQ ID NO:
530的氨基酸序列;(m)所述轻链可变结构域包含SEQ ID NO:843的氨基酸序列并且所述重链可变结构域包含SEQ ID NO:845的氨基酸序列;(n)所述轻链可变结构域包含SEQ ID NO:
844的氨基酸序列并且所述重链可变结构域包含SEQ ID NO:846的氨基酸序列;(o)所述轻链可变结构域包含SEQ ID NO:844的氨基酸序列并且所述重链可变结构域包含SEQ ID NO:
847的氨基酸序列;(p)所述轻链可变结构域包含SEQ ID NO:219的氨基酸序列并且所述重链可变结构域包含SEQ ID NO:399的氨基酸序列;(q)所述轻链可变结构域包含SEQ ID NO:
230的氨基酸序列并且所述重链可变结构域包含SEQ ID NO:409的氨基酸序列;(r)所述轻链可变结构域包含SEQ ID NO:252的氨基酸序列并且所述重链可变结构域包含SEQ ID NO:
419的氨基酸序列;(s)所述轻链可变结构域包含SEQ ID NO:241的氨基酸序列并且所述重链可变结构域包含SEQ ID NO:429的氨基酸序列;(t)所述轻链可变结构域包含SEQ ID NO:
849的氨基酸序列并且所述重链可变结构域包含SEQ ID NO:429的氨基酸序列;(u)所述轻链可变结构域包含SEQ ID NO:263的氨基酸序列并且所述重链可变结构域包含SEQ ID NO:
439的氨基酸序列;(v)所述轻链可变结构域包含SEQ ID NO:274的氨基酸序列并且所述重链可变结构域包含SEQ ID NO:449的氨基酸序列;(w)所述轻链可变结构域包含SEQ ID NO:
285的氨基酸序列并且所述重链可变结构域包含SEQ ID NO:459的氨基酸序列;(x)所述轻链可变结构域包含SEQ ID NO:286的氨基酸序列并且所述重链可变结构域包含SEQ ID NO:
460的氨基酸序列;(y)所述轻链可变结构域包含SEQ ID NO:287的氨基酸序列并且所述重链可变结构域包含SEQ ID NO:461的氨基酸序列;(z)所述轻链可变结构域包含SEQ ID NO:
298的氨基酸序列并且所述重链可变结构域包含SEQ ID NO:429的氨基酸序列;(aa)所述轻链可变结构域包含SEQ ID NO:299的氨基酸序列并且所述重链可变结构域包含SEQ ID NO:
471的氨基酸序列;(bb)所述轻链可变结构域包含SEQ ID NO:310的氨基酸序列并且所述重链可变结构域包含SEQ ID NO:461的氨基酸序列;(cc)所述轻链可变结构域包含SEQ ID NO:679的氨基酸序列并且所述重链可变结构域包含SEQ ID NO:481的氨基酸序列;(dd)所述轻链可变结构域包含SEQ ID NO:311的氨基酸序列并且所述重链可变结构域包含SEQ ID NO:491的氨基酸序列;(ee)所述轻链可变结构域包含SEQ ID NO:322的氨基酸序列并且所述重链可变结构域包含SEQ ID NO:511的氨基酸序列;(ff)所述轻链可变结构域包含SEQ ID NO:344的氨基酸序列并且所述重链可变结构域包含SEQ ID NO:531的氨基酸序列;(gg)所述轻链可变结构域包含SEQ ID NO:355的氨基酸序列并且所述重链可变结构域包含SEQ ID NO:635的氨基酸序列;(hh)所述轻链可变结构域包含SEQ ID NO:365的氨基酸序列并且所述重链可变结构域包含SEQ ID NO:541的氨基酸序列;(ii)所述轻链可变结构域包含SEQ ID NO:376的氨基酸序列并且所述重链可变结构域包含SEQ ID NO:551的氨基酸序列;(jj)所述轻链可变结构域包含SEQ ID NO:387的氨基酸序列并且所述重链可变结构域包含SEQ ID NO:561的氨基酸序列;(kk)所述轻链可变结构域包含SEQ ID NO:398的氨基酸序列并且所述重链可变结构域包含SEQ ID NO:571的氨基酸序列;(ll)所述轻链可变结构域包含SEQ ID NO:724的氨基酸序列并且所述重链可变结构域包含SEQ ID NO:731的氨基酸序列;(mm)所述轻链可变结构域包含SEQ ID NO:809的氨基酸序列并且所述重链可变结构域包含SEQ ID NO:731的氨基酸序列;(nn)所述轻链可变结构域包含SEQ ID NO:725的氨基酸序列并且所述重链可变结构域包含SEQ ID NO:732的氨基酸序列;(oo)所述轻链可变结构域包含SEQ ID NO:726的氨基酸序列并且所述重链可变结构域包含SEQ ID NO:731的氨基酸序列;(pp)所述轻链可变结构域包含SEQ ID NO:726的氨基酸序列并且所述重链可变结构域包含SEQ ID NO:817的氨基酸序列;(qq)所述轻链可变结构域包含SEQ ID NO:727的氨基酸序列并且所述重链可变结构域包含SEQ ID NO:731的氨基酸序列;(rr)所述轻链可变结构域包含SEQ ID NO:728的氨基酸序列并且所述重链可变结构域包含SEQ ID NO:733的氨基酸序列;(ss)所述轻链可变结构域包含SEQ ID NO:810的氨基酸序列并且所述重链可变结构域包含SEQ ID NO:818的氨基酸序列;(tt)所述轻链可变结构域包含SEQ ID NO:811的氨基酸序列并且所述重链可变结构域包含SEQ ID NO:733的氨基酸序列;(uu)所述轻链可变结构域包含SEQ ID NO:729的氨基酸序列并且所述重链可变结构域包含SEQ ID NO:731的氨基酸序列;(vv)所述轻链可变结构域包含SEQ ID NO:812的氨基酸序列并且所述重链可变结构域包含SEQ ID NO:819的氨基酸序列;(ww)所述轻链可变结构域包含SEQ ID NO:729的氨基酸序列并且所述重链可变结构域包含SEQ ID NO:820的氨基酸序列;(xx)所述轻链可变结构域包含SEQ ID NO:730的氨基酸序列并且所述重链可变结构域包含SEQ ID NO:731的氨基酸序列;(yy)所述轻链可变结构域包含SEQ ID NO:813的氨基酸序列并且所述重链可变结构域包含SEQ ID NO:731的氨基酸序列;(zz)所述轻链可变结构域包含SEQ ID NO:814的氨基酸序列并且所述重链可变结构域包含SEQ ID NO:822的氨基酸序列;(aaa)所述轻链可变结构域包含SEQ ID NO:815的氨基酸序列并且所述重链可变结构域包含SEQ ID NO:824的氨基酸序列;
或者(bbb)所述轻链可变结构域包含SEQ ID NO:816的氨基酸序列并且所述重链可变结构域包含SEQ ID NO:825的氨基酸序列。
[0042] 本公开的其他方面涉及一种结合到TREM2蛋白的分离的(例如,单克隆的)抗体,其中所述抗体包含:轻链可变结构域,其包含选自由以下组成的组的氨基酸序列:SEQ ID NO:219-398、SEQ ID NO:602-634、SEQ ID NO:679-689、SEQ ID NO:724-730、SEQ ID NO:809-
816、SEQ ID NO:821、SEQ ID NO:843、SEQ ID NO:844、SEQ ID NO:849、以及SEQ ID NO:
850;和/或重链可变结构域,其包含选自由以下组成的组的氨基酸序列:SEQ ID NO:399-
580、SEQ ID NO:635-678、SEQ ID NO:731-733、和SEQ ID NO:817-820、SEQ ID NO:822-
825、以及SEQ ID NO:845-847。在一些实施方案中,所述抗体包含:轻链可变结构域,其包含SEQ ID NO:843的氨基酸序列;和重链可变结构域,其包含SEQ ID NO:845的氨基酸序列。在一些实施方案中,所述抗体包含:轻链可变结构域,其包含SEQ ID NO:843的氨基酸序列;和重链可变结构域,其包含SEQ ID NO:846的氨基酸序列。在一些实施方案中,所述抗体包含:
轻链可变结构域,其包含SEQ ID NO:843的氨基酸序列;和重链可变结构域,其包含SEQ ID NO:847的氨基酸序列。在一些实施方案中,所述抗体包含:轻链可变结构域,其包含SEQ ID NO:844的氨基酸序列;和重链可变结构域,其包含SEQ ID NO:847的氨基酸序列。在一些实施方案中,所述抗体包含轻链可变结构域和重链可变结构域,其中:(a)所述轻链可变结构域包含SEQ ID NO:333的氨基酸序列并且所述重链可变结构域包含SEQ ID NO:521的氨基酸序列;(b)所述轻链可变结构域包含SEQ ID NO:850的氨基酸序列并且所述重链可变结构域包含SEQ ID NO:521的氨基酸序列;(c)所述轻链可变结构域包含SEQ ID NO:334的氨基酸序列并且所述重链可变结构域包含SEQ ID NO:522的氨基酸序列;(d)所述轻链可变结构域包含SEQ ID NO:335的氨基酸序列并且所述重链可变结构域包含SEQ ID NO:523的氨基酸序列;(e)所述轻链可变结构域包含SEQ ID NO:336的氨基酸序列并且所述重链可变结构域包含SEQ ID NO:524的氨基酸序列;(f)所述轻链可变结构域包含SEQ ID NO:337的氨基酸序列并且所述重链可变结构域包含SEQ ID NO:525的氨基酸序列;(g)所述轻链可变结构域包含SEQ ID NO:338的氨基酸序列并且所述重链可变结构域包含SEQ ID NO:526的氨基酸序列;(h)所述轻链可变结构域包含SEQ ID NO:339的氨基酸序列并且所述重链可变结构域包含SEQ ID NO:526的氨基酸序列;(i)所述轻链可变结构域包含SEQ ID NO:340的氨基酸序列并且所述重链可变结构域包含SEQ ID NO:527的氨基酸序列;(j)所述轻链可变结构域包含SEQ ID NO:341的氨基酸序列并且所述重链可变结构域包含SEQ ID NO:528的氨基酸序列;(k)所述轻链可变结构域包含SEQ ID NO:342的氨基酸序列并且所述重链可变结构域包含SEQ ID NO:529的氨基酸序列;(l)所述轻链可变结构域包含SEQ ID NO:343的氨基酸序列并且所述重链可变结构域包含SEQ ID NO:530的氨基酸序列;(m)所述轻链可变结构域包含SEQ ID NO:843的氨基酸序列并且所述重链可变结构域包含SEQ ID NO:845的氨基酸序列;(n)所述轻链可变结构域包含SEQ ID NO:844的氨基酸序列并且所述重链可变结构域包含SEQ ID NO:846的氨基酸序列;(o)所述轻链可变结构域包含SEQ ID NO:844的氨基酸序列并且所述重链可变结构域包含SEQ ID NO:847的氨基酸序列;(p)所述轻链可变结构域包含SEQ ID NO:219的氨基酸序列并且所述重链可变结构域包含SEQ ID NO:399的氨基酸序列;(q)所述轻链可变结构域包含SEQ ID NO:230的氨基酸序列并且所述重链可变结构域包含SEQ ID NO:409的氨基酸序列;(r)所述轻链可变结构域包含SEQ ID NO:252的氨基酸序列并且所述重链可变结构域包含SEQ ID NO:419的氨基酸序列;(s)所述轻链可变结构域包含SEQ ID NO:241的氨基酸序列并且所述重链可变结构域包含SEQ ID NO:429的氨基酸序列;(t)所述轻链可变结构域包含SEQ ID NO:849的氨基酸序列并且所述重链可变结构域包含SEQ ID NO:429的氨基酸序列;(u)所述轻链可变结构域包含SEQ ID NO:263的氨基酸序列并且所述重链可变结构域包含SEQ ID NO:439的氨基酸序列;(v)所述轻链可变结构域包含SEQ ID NO:274的氨基酸序列并且所述重链可变结构域包含SEQ ID NO:449的氨基酸序列;(w)所述轻链可变结构域包含SEQ ID NO:285的氨基酸序列并且所述重链可变结构域包含SEQ ID NO:459的氨基酸序列;(x)所述轻链可变结构域包含SEQ ID NO:286的氨基酸序列并且所述重链可变结构域包含SEQ ID NO:460的氨基酸序列;(y)所述轻链可变结构域包含SEQ ID NO:287的氨基酸序列并且所述重链可变结构域包含SEQ ID NO:461的氨基酸序列;(z)所述轻链可变结构域包含SEQ ID NO:298的氨基酸序列并且所述重链可变结构域包含SEQ ID NO:429的氨基酸序列;(aa)所述轻链可变结构域包含SEQ ID NO:299的氨基酸序列并且所述重链可变结构域包含SEQ ID NO:471的氨基酸序列;(bb)所述轻链可变结构域包含SEQ ID NO:310的氨基酸序列并且所述重链可变结构域包含SEQ ID NO:461的氨基酸序列;(cc)所述轻链可变结构域包含SEQ ID NO:679的氨基酸序列并且所述重链可变结构域包含SEQ ID NO:481的氨基酸序列;(dd)所述轻链可变结构域包含SEQ ID NO:311的氨基酸序列并且所述重链可变结构域包含SEQ ID NO:491的氨基酸序列;(ee)所述轻链可变结构域包含SEQ ID NO:322的氨基酸序列并且所述重链可变结构域包含SEQ ID NO:511的氨基酸序列;(ff)所述轻链可变结构域包含SEQ ID NO:344的氨基酸序列并且所述重链可变结构域包含SEQ ID NO:531的氨基酸序列;(gg)所述轻链可变结构域包含SEQ ID NO:
355的氨基酸序列并且所述重链可变结构域包含SEQ ID NO:635的氨基酸序列;(hh)所述轻链可变结构域包含SEQ ID NO:365的氨基酸序列并且所述重链可变结构域包含SEQ ID NO:
541的氨基酸序列;(ii)所述轻链可变结构域包含SEQ ID NO:376的氨基酸序列并且所述重链可变结构域包含SEQ ID NO:551的氨基酸序列;(jj)所述轻链可变结构域包含SEQ ID NO:387的氨基酸序列并且所述重链可变结构域包含SEQ ID NO:561的氨基酸序列;(kk)所述轻链可变结构域包含SEQ ID NO:398的氨基酸序列并且所述重链可变结构域包含SEQ ID NO:571的氨基酸序列;(ll)所述轻链可变结构域包含SEQ ID NO:724的氨基酸序列并且所述重链可变结构域包含SEQ ID NO:731的氨基酸序列;(mm)所述轻链可变结构域包含SEQ ID NO:809的氨基酸序列并且所述重链可变结构域包含SEQ ID NO:731的氨基酸序列;(nn)所述轻链可变结构域包含SEQ ID NO:725的氨基酸序列并且所述重链可变结构域包含SEQ ID NO:732的氨基酸序列;(oo)所述轻链可变结构域包含SEQ ID NO:726的氨基酸序列并且所述重链可变结构域包含SEQ ID NO:731的氨基酸序列;(pp)所述轻链可变结构域包含SEQ ID NO:726的氨基酸序列并且所述重链可变结构域包含SEQ ID NO:817的氨基酸序列;(qq)所述轻链可变结构域包含SEQ ID NO:727的氨基酸序列并且所述重链可变结构域包含SEQ ID NO:731的氨基酸序列;(rr)所述轻链可变结构域包含SEQ ID NO:728的氨基酸序列并且所述重链可变结构域包含SEQ ID NO:733的氨基酸序列;(ss)所述轻链可变结构域包含SEQ ID NO:810的氨基酸序列并且所述重链可变结构域包含SEQ ID NO:818的氨基酸序列;(tt)所述轻链可变结构域包含SEQ ID NO:811的氨基酸序列并且所述重链可变结构域包含SEQ ID NO:733的氨基酸序列;(uu)所述轻链可变结构域包含SEQ ID NO:729的氨基酸序列并且所述重链可变结构域包含SEQ ID NO:731的氨基酸序列;(vv)所述轻链可变结构域包含SEQ ID NO:812的氨基酸序列并且所述重链可变结构域包含SEQ ID NO:819的氨基酸序列;(ww)所述轻链可变结构域包含SEQ ID NO:729的氨基酸序列并且所述重链可变结构域包含SEQ ID NO:820的氨基酸序列;(xx)所述轻链可变结构域包含SEQ ID NO:730的氨基酸序列并且所述重链可变结构域包含SEQ ID NO:731的氨基酸序列;(yy)所述轻链可变结构域包含SEQ ID NO:813的氨基酸序列并且所述重链可变结构域包含SEQ ID NO:731的氨基酸序列;(zz)所述轻链可变结构域包含SEQ ID NO:814的氨基酸序列并且所述重链可变结构域包含SEQ ID NO:822的氨基酸序列;(aaa)所述轻链可变结构域包含SEQ ID NO:815的氨基酸序列并且所述重链可变结构域包含SEQ ID NO:824的氨基酸序列;或者(bbb)所述轻链可变结构域包含SEQ ID NO:816的氨基酸序列并且所述重链可变结构域包含SEQ ID NO:825的氨基酸序列。
[0043] 本公开的其他方面涉及一种结合到TREM2蛋白的分离的(例如,单克隆的)抗体,其中所述抗体包含:选自由以下组成的组的抗体的轻链可变结构域:1A7、3A2、3B10、6G12、6H6、7A9、7B3、8A1、8E10、8F11、8F8、9F5、9G1、9G3、10A9、10C1、11A8、12E2、12F9、12G6、2C7、
2F5、3C1、4D7、4D11、6C11、6G12、7A3、7C5、7E9、7F6、7G1、7H1、8C3、8F10、12A1、1E9、2C5、3C5、
4C12、4F2、5A2、6B3、7D1、7D9、11D8、8A12、10E7、10B11、10D2、7D5、2A7、3G12、6H9、8G9、9B4、
10A1、11A8、12F3、2F8、10E3、1H7、2F6、2H8、3A7、7E5、7F8、11H5、7C5、4F11、12D9、1B4v1、
1B4v2、6H2、7B11v1、7B11v2、18D8、18E4v1、18E4v2、29F6v1、29F6v2、40D5v1、40D5v2、43B9、
44A8v1、44A8v2、44B4v1、以及44B4v2;和/或选自由以下组成的组的抗体的重链可变结构域:1A7、3A2、3B10、6G12、6H6、7A9、7B3、8A1、8E10、8F11、8F8、9F5、9G1、9G3、10A9、10C1、
11A8、12E2、12F9、12G6、2C7、2F5、3C1、4D7、4D11、6C11、6G12、7A3、7C5、7E9、7F6、7G1、7H1、
8C3、8F10、12A1、1E9、2C5、3C5、4C12、4F2、5A2、6B3、7D1、7D9、11D8、8A12、10E7、10B11、10D2、
7D5、2A7、3G12、6H9、8G9、9B4、10A1、11A8、12F3、2F8、10E3、1H7、2F6、2H8、3A7、7E5、7F8、
11H5、7C5、4F11、12D9、1B4v1、1B4v2、6H2、7B11v1、7B11v2、18D8、18E4v1、18E4v2、29F6v1、
29F6v2、40D5v1、40D5v2、43B9、44A8v1、44A8v2、44B4v1、以及44B4v2。
[0044] 本公开的其他方面涉及一种结合到TREM2蛋白的分离的(例如,单克隆的)抗体,其中所述抗体与选自由以下组成的组的抗体结合基本上相同的TREM2表位:1A7、3A2、3B10、6G12、6H6、7A9、7B3、8A1、8E10、8F11、8F8、9F5、9G1、9G3、10A9、10C1、11A8、12E2、12F9、12G6、
2C7、2F5、3C1、4D7、4D11、6C11、6G12、7A3、7C5、7E9、7F6、7G1、7H1、8C3、8F10、12A1、1E9、2C5、
3C5、4C12、4F2、5A2、6B3、7D1、7D9、11D8、8A12、10E7、10B11、10D2、7D5、2A7、3G12、6H9、8G9、
9B4、10A1、11A8、12F3、2F8、10E3、1H7、2F6、2H8、3A7、7E5、7F8、11H5、7C5、4F11、12D9、1B4v1、
1B4v2、6H2、7B11v1、7B11v2、18D8、18E4v1、18E4v2、29F6v1、29F6v2、40D5v1、40D5v2、43B9、
44A8v1、44A8v2、44B4v1、以及44B4v2。
[0045] 本公开的其他方面涉及一种结合到TREM2蛋白的分离的(例如,单克隆的)抗体,其中所述抗体包含轻链可变结构域和重链可变结构域,其中所述轻链可变结构域包含:(a)HVR-L1,其包含选自由以下组成的组的氨基酸序列:SEQ ID NO:9-23、SEQ ID NO:581、SEQ ID NO:690-694、SEQ ID NO:734-738、以及SEQ ID NO:826-828,或包含与选自由以下组成的组的氨基酸序列具有至少约90%同源性的氨基酸序列:SEQ ID NO:9-23、SEQ ID NO:581、SEQ ID NO:690-694、SEQ ID NO:734-738、以及SEQ ID NO:826-828;(b)HVR-L2,其包含选自由以下组成的组的氨基酸序列:SEQ ID NO:24-33、SEQ ID NO:695-697、和SEQ ID NO:739-743,或包含与选自由以下组成的组的氨基酸序列具有至少约90%同源性的氨基酸序列:SEQ ID NO:24-33、SEQ ID NO:695-697、和SEQ ID NO:739-743;以及(c)HVR-L3,其包含选自由以下组成的组的氨基酸序列:SEQ ID NO:34-47、SEQ ID NO:582、SEQ ID NO:583、SEQ ID NO:698-702、以及SEQ ID NO:744-746,或包含与选自由以下组成的组的氨基酸序列具有至少约90%同源性的氨基酸序列:SEQ ID NO:34-47、SEQ ID NO:582、SEQ ID NO:
583、SEQ ID NO:698-702、以及SEQ ID NO:744-746;并且其中所述重链可变结构域包含:
(a)HVR-H1,其包含选自由以下组成的组的氨基酸序列:SEQ ID NO:48-65、SEQ ID NO:584、SEQ ID NO:703-705、SEQ ID NO:747-754、以及SEQ ID NO:829-835,或包含与选自由以下组成的组的氨基酸序列具有至少约90%同源性的氨基酸序列:SEQ ID NO:48-65、SEQ ID NO:584、SEQ ID NO:703-705、SEQ ID NO:747-754、以及SEQ ID NO:829-835;(b)HVR-H2,其包含选自由以下组成的组的氨基酸序列:SEQ ID NO:66-84、SEQ ID NO:585-587、SEQ ID NO:706-708、SEQ ID NO:755-762、SEQ ID NO:836-842、以及SEQ ID NO:888,或包含与选自由以下组成的组的氨基酸序列具有至少约90%同源性的氨基酸序列:SEQ ID NO:66-84、SEQ ID NO:585-587、SEQ ID NO:706-708、SEQ ID NO:755-762、SEQ ID NO:836-842、以及SEQ ID NO:888;以及(c)HVR-H3,其包含选自由以下组成的组的氨基酸序列:SEQ ID NO:
85-102、SEQ ID NO:588、SEQ ID NO:589、SEQ ID NO:709、SEQ ID NO:710、以及SEQ ID NO:
763-770,或包含与选自由以下组成的组的氨基酸序列具有至少约90%同源性的氨基酸序列:SEQ ID NO:85-102、SEQ ID NO:588、SEQ ID NO:589、SEQ ID NO:709、SEQ ID NO:710、以及SEQ ID NO:763-770。本公开的其他方面涉及一种结合到TREM2蛋白的分离的(例如,单克隆的)抗体,其中所述抗TREM2抗体包含轻链可变结构域和重链可变结构域,其中所述轻链可变结构域包含HVR-L1、HVR-L2、HVR-L3,所述重链可变结构域包含HVR-H1、HVR-H2、和HVR-H3,并且其中所述HVR-H3包含选自由以下组成的组的氨基酸序列:SEQ ID NO:85-102、SEQ ID NO:588、SEQ ID NO:589、SEQ ID NO:709、SEQ ID NO:710、以及SEQ ID NO:763-
770,或包含与选自由以下组成的组的氨基酸序列具有至少约90%同源性的氨基酸序列:
SEQ ID NO:85-102、SEQ ID NO:588、SEQ ID NO:589、SEQ ID NO:709、SEQ ID NO:710、以及SEQ ID NO:763-770。
[0046] 在可与前述实施方案中的任一项组合的一些实施方案中,所述抗体与一种或多种TREM2配体竞争结合到TREM2蛋白。在可与前述实施方案中的任一项组合的一些实施方案中,所述抗体诱导一种或多种TRME2活性并且增强由一种或多种TREM2配体与TREM2蛋白的结合诱导的一种或多种TREM2活性。在可与前述实施方案中的任一项组合的一些实施方案中,所述抗体诱导一种或多种TRME2活性而不阻断一种或多种TREM2配体与TREM2蛋白的结合。在可与前述实施方案中的任一项组合的一些实施方案中,所述抗体诱导一种或多种TRME2活性而不阻断一种或多种TREM2配体与TREM2蛋白的结合。在可与前述实施方案中的任一项组合的一些实施方案中,所述抗体增强一种或多种TREM2活性。在可与前述实施方案中的任一项组合的一些实施方案中,所述抗体不与一种或多种TREM2配体竞争结合到TREM2蛋白。在可与前述实施方案中的任一项组合的一些实施方案中,所述抗体增强一种或多种TREM2配体与TREM2蛋白的结合。在可与前述实施方案中的任一项组合的一些实施方案中,与在分离的抗体不存在下由一种或多种TREM2配体与TREM2蛋白的结合诱导的一种或多种TREM2活性相比,所述抗体增强由一种或多种TREM2配体与TREM2蛋白的结合诱导的一种或多种TREM2活性。在可与前述实施方案中的任一项组合的一些实施方案中,所述抗体与一种或多种TREM2配体协同作用以增强一种或多种TREM2活性。在可与前述实施方案中的任一项组合的一些实施方案中,所述抗体在TREM2的细胞表面簇集不存在下增强一种或多种TREM2活性。在可与前述实施方案中的任一项组合的一些实施方案中,所述抗体通过诱导或保持TREM2的细胞表面簇集来增强一种或多种TREM2活性。在可与前述实施方案中的任一项组合的一些实施方案中,所述抗体通过在一种或多种免疫细胞上表达的Fc-γ受体来簇集。在可与前述实施方案中的任一项组合的一些实施方案中,所述一种或多种免疫细胞是B细胞或小神经胶质细胞。在可与前述实施方案中的任一项组合的一些实施方案中,所述抗体增加可溶性TREM2的水平、增加可溶性TREM2的半衰期、或两者。在可与前述实施方案中的任一项组合的一些实施方案中,可溶性TREM2的水平选自由以下组成的组:TREM2的血清水平、TREM2的脑脊髓液(CSF)水平、TREM2的组织水平、以及其任何组合。在可与前述实施方案中的任一项组合的一些实施方案中,所述抗体降低一种或多种细胞中的TREM2的水平。在可与前述实施方案中的任一项组合的一些实施方案中,所述抗体降低TREM2的细胞表面水平、降低TREM2的细胞内水平、降低TREM2的总水平、或其任何组合。在可与前述实施方案中的任一项组合的一些实施方案中,所述抗体诱导TREM2降解、TREM2裂解、TREM2内化、TREM2脱落、TREM2表达的下调、或其任何组合。在可与前述实施方案中的任一项组合的一些实施方案中,一种或多种细胞中的TREM2的水平在选自由以下组成的组的原代细胞中测量:树突细胞、骨髓衍生的树突细胞、单核细胞、小神经胶质细胞、巨噬细胞、嗜中性粒细胞、NK细胞、破骨细胞、皮肤朗格汉斯细胞、以及库普弗细胞,或在细胞系上测量,并且其中TREM2的细胞水平利用体外细胞测定来测量。在可与前述实施方案中的任一项组合的一些实施方案中,所述TREM2蛋白是哺乳动物蛋白或人蛋白。在可与前述实施方案中的任一项组合的一些实施方案中,所述TREM2蛋白是野生型蛋白。在可与前述实施方案中的任一项组合的一些实施方案中,所述TREM2蛋白是天然存在的变体。在可与前述实施方案中的任一项组合的一些实施方案中,所述TREM2蛋白在人树突细胞、人巨噬细胞、人单核细胞、人破骨细胞、人皮肤朗格汉斯细胞、人库普弗细胞、人小神经胶质细胞、或其任何组合上表达。在可与前述实施方案中的任一项组合的一些实施方案中,所述一种或多种TREM2活性选自由以下组成的组:(a)TREM2结合到DAP12;(b)TREM2磷酸化;(c)DAP12磷酸化;(d)活化一种或多种酪氨酸激酶,任选地其中所述一种或多种酪氨酸激酶包括Syk激酶、ZAP70激酶、或两者;(e)活化磷脂酰肌醇3-激酶(PI3K);(f)活化蛋白激酶B(Akt);(g)将磷脂酶C-γ(PLC-γ)募集到细胞质膜、活化PLC-γ、或两者;(h)将TEC家族激酶dVav募集到细胞质膜;(i)活化核因子-rB(NF-rB);(j)抑制MAPK信号传导;(k)用于T细胞活化的接头(LAT)、用于B细胞活化的接头(LAB)、或两者的磷酸化;(l)活化IL-2诱导的酪氨酸激酶(Itk);(m)调控选自由以下组成的组的一种或多种促炎介质:IFN-β、IL-1α、IL-1β、TNF-α、IL-6、IL-8、CRP、CD86、MCP-1/CCL2、CCL3、CCL4、CCL5、CCR2、CXCL-10、Gata3、IL-20家族成员、IL-33、LIF、IFN-γ、OSM、CNTF、CSF-1、OPN、CD11c、GM-CSF、IL-11、IL-12、IL-17、IL-18、以及IL-23,任选地其中所述调控发生在选自由以下组成的组的一种或多种细胞中:巨噬细胞、M1巨噬细胞、活化的M1巨噬细胞、M2巨噬细胞、树突细胞、单核细胞、破骨细胞、皮肤朗格汉斯细胞、库普弗细胞、以及小神经胶质细胞;
(n)调控选自由以下组成的组的一种或多种抗炎介质:IL-4、IL-10、TGF-β、IL-13、IL-35、IL-16、IFN-α、IL-1Ra、VEGF、G-CSF、YM、AXL、FLT1、以及TNF或IL-6的可溶性受体,任选地其中所述调控发生在选自由以下组成的组的一种或多种细胞中:巨噬细胞、M1巨噬细胞、活化的M1巨噬细胞、M2巨噬细胞、树突细胞、单核细胞、破骨细胞、皮肤朗格汉斯细胞、库普弗细胞、以及小神经胶质细胞;(o)调控其表达在炎症诱导之后增加的一种或多种基因,任选地其中所述一种或多种基因选自由Fabp3、Fabp5、和LDR组成的组;(p)细胞外信号调节激酶(ERK)的磷酸化;(q)调控选自由以下组成的组的一种或多种细胞中的C-C趋化因子受体7(CCR7)的表达:巨噬细胞、M1巨噬细胞、活化的M1巨噬细胞、M2巨噬细胞、树突细胞、单核细胞、破骨细胞、皮肤朗格汉斯细胞、库普弗细胞、小神经胶质细胞、M1小神经胶质细胞、活化的M1小神经胶质细胞、和M2小神经胶质细胞、以及其任何组合;(r)诱导小神经胶质细胞向CCL19和CCL21表达细胞的趋化性;(s)破坏的TREM2/DAP12依赖性基因表达的正常化;(t)将Syk、ZAP70、或两者募集到DAP12/TREM2复合物;(u)增加一种或多种TREM2依赖性基因的活性,任选地其中所述一种或多种TREM2依赖性基因包括活化T细胞的核因子(NFAT)转录因子;(v)增加树突细胞、单核细胞、小神经胶质细胞、M1小神经胶质细胞、活化的M1小神经胶质细胞、和M2小神经胶质细胞、巨噬细胞、M1巨噬细胞、活化的M1巨噬细胞、M2巨噬细胞、或其任何组合的成熟;(w)增加树突细胞、单核细胞、小神经胶质细胞、M1小神经胶质细胞、活化的M1小神经胶质细胞、和M2小神经胶质细胞、巨噬细胞、M1巨噬细胞、活化的M1巨噬细胞、M2巨噬细胞、或其任何组合引发或调控T细胞的功能的能力,任选地其中所述T细胞是选自由以下组成的组的一种或多种细胞:CD8+T细胞、CD4+T细胞、调节性T细胞、以及其任何组合;(x)骨髓衍生的树突细胞引发或调控抗原特异性T细胞的功能的增强的能力、正常化的能力、或两者,任选地其中所述抗原特异性T细胞是选自由以下组成的组的一种或多种细胞:CD8+T细胞、CD4+T细胞、调节性T细胞、以及其任何组合;(y)诱导破骨细胞产生、增加破骨细胞生成的速率、或两者;(z)增加树突细胞、巨噬细胞、M1巨噬细胞、活化的M1巨噬细胞、M2巨噬细胞、单核细胞、破骨细胞、皮肤朗格汉斯细胞、库普弗细胞、小神经胶质细胞、M1小神经胶质细胞、活化的M1小神经胶质细胞、和M2小神经胶质细胞、或其任何组合的存活;
(aa)增加树突细胞、巨噬细胞、M1巨噬细胞、活化的M1巨噬细胞、M2巨噬细胞、小神经胶质细胞、M1小神经胶质细胞、活化的M1小神经胶质细胞、和M2小神经胶质细胞、或其任何组合的功能;(bb)增加由树突细胞、巨噬细胞、M1巨噬细胞、活化的M1巨噬细胞、M2巨噬细胞、单核细胞、小神经胶质细胞、M1小神经胶质细胞、活化的M1小神经胶质细胞、和M2小神经胶质细胞、或其任何组合进行的吞噬作用;(cc)诱导选自由以下组成的组的一种或多种类型的清除:凋亡神经元清除、神经组织碎片清除、非神经组织碎片清除、细菌或其他异物清除、致病性物质清除、肿瘤细胞清除、或其任何组合,任选地其中所述致病性物质选自由以下组成的组:淀粉样蛋白β或其片段、Tau、IAPP、α-突触核蛋白、TDP-43、FUS蛋白、朊病毒蛋白、PrPSc、亨廷顿蛋白、降血钙素、超氧化物歧化酶、共济失调蛋白、路易小体、心房利钠因子、胰岛淀粉样蛋白多肽、胰岛素、载脂蛋白AI、血清淀粉样蛋白A、medin、泌乳素、转甲状腺素蛋白、溶菌酶、β2微球蛋白、凝溶胶蛋白、角膜上皮蛋白、抑半胱氨酸蛋白酶蛋白、免疫球蛋白轻链AL、S-IBM蛋白、和重复序列相关非ATG(RAN)翻译产物(包括由甘氨酸-丙氨酸(GA)、甘氨酸-脯氨酸(GP)、甘氨酸-精氨酸(GR)、脯氨酸-丙氨酸(PA)、或脯氨酸-精氨酸(PR)构成的二肽重复序列(DPR肽)、反义GGCCCC(G2C4)重复序列扩增RNA);(dd)诱导对以下中的一种或多种的吞噬作用:凋亡神经元、神经组织碎片、非神经组织碎片、细菌、其他异物、致病性物质、肿瘤细胞、或其任何组合,任选地其中所述致病性物质选自由以下组成的组:淀粉样蛋白β或其片段、Tau、IAPP、α-突触核蛋白、TDP-43、FUS蛋白、朊病毒蛋白、PrPSc、亨廷顿蛋白、降血钙素、超氧化物歧化酶、共济失调蛋白、路易小体、心房利钠因子、胰岛淀粉样蛋白多肽、胰岛素、载脂蛋白AI、血清淀粉样蛋白A、medin、泌乳素、转甲状腺素蛋白、溶菌酶、β2微球蛋白、凝溶胶蛋白、角膜上皮蛋白、抑半胱氨酸蛋白酶蛋白、免疫球蛋白轻链AL、S-IBM蛋白、和重复序列相关非ATG(RAN)翻译产物(包括由甘氨酸-丙氨酸(GA)、甘氨酸-脯氨酸(GP)、甘氨酸-精氨酸(GR)、脯氨酸-丙氨酸(PA)、或脯氨酸-精氨酸(PR)构成的二肽重复序列(DPR肽)、反义GGCCCC(G2C4)重复序列扩增RNA);(ee)增加选自由以下组成的组的一种或多种刺激性分子的表达:CD83、CD86、II类MHC、CD40、以及其任何组合,任选地其中所述CD40在树突细胞、单核细胞、巨噬细胞、或其任何组合上表达,并且任选地其中所述树突细胞包括骨髓衍生的树突细胞;(ff)调控选自由以下组成的组的一种或多种促炎介质的分泌:IFN-β、IL-1α、IL-1β、CD86、TNF-α、IL-6、IL-8、CRP、MCP-1/CCL2、CCL3、CCL4、CCL5、CCR2、CXCL-10、Gata3、IL-20家族成员、IL-33、LIF、IFN-γ、OSM、CNTF、CSF-1、OPN、CD11c、GM-CSF、IL-11、IL-12、IL-17、IL-18、以及IL-23,并且任选地其中所述调控发生在选自由以下组成的组的一种或多种细胞中:巨噬细胞、M1巨噬细胞、活化的M1巨噬细胞、M2巨噬细胞、树突细胞、单核细胞、破骨细胞、皮肤朗格汉斯细胞、库普弗细胞、以及小神经胶质细胞;(gg)调控选自由以下组成的组的一种或多种抗炎介质的分泌:IL-4、IL-10TGF-β、IL-13、IL-35IL-16、IFN-α、IL-1Ra、VEGF、G-CSF、YM、AXL、FLT1、以及TNF或IL-6的可溶性受体,并且任选地其中所述调控发生在选自由以下组成的组的一种或多种细胞中:巨噬细胞、M1巨噬细胞、活化的M1巨噬细胞、M2巨噬细胞、树突细胞、单核细胞、破骨细胞、皮肤朗格汉斯细胞、库普弗细胞、以及小神经胶质细胞;(hh)调控选自由以下组成的组的一种或多种蛋白质的表达:C1qa、C1qB、C1qC、C1s、C1R、C4、C2、C3、ITGB2、HMOX1、LAT2.CASP1、CSTA、VSIG4、MS4A4A、C3AR1、GPX1、TyroBP、ALOX5AP、ITGAM、SLC7A7、CD4、ITGAX、PYCARD、以及VEGF;(ii)增加记忆力;以及(jj)减少认知缺陷。在可与前述实施方案中的任一项组合的一些实施方案中,所述一种或多种TREM2活性选自由以下组成的组:(a)TREM2结合到DAP12;(b)DAP12磷酸化;(c)活化Syk激酶;(d)调控选自由以下组成的组的一种或多种促炎介质:IFN-β、IL-1α、IL-1β、TNF-α、IL-
6、IL-8、CRP、CD86、MCP-1/CCL2、CCL3、CCL4、CCL5、CCR2、CXCL-10、Gata3、IL-20家族成员、IL-33、LIF、IFN-γ、OSM、CNTF、CSF-1、OPN、CD11c、GM-CSF、IL-11、IL-12、IL-17、IL-18、以及IL-23,任选地其中所述调控发生在选自由以下组成的组的一种或多种细胞中:巨噬细胞、M1巨噬细胞、活化的M1巨噬细胞、M2巨噬细胞、树突细胞、单核细胞、破骨细胞、皮肤朗格汉斯细胞、库普弗细胞、以及小神经胶质细胞;(e)将Syk募集到DAP12/TREM2复合物;(f)增加一种或多种TREM2依赖性基因的活性,任选地其中所述一种或多种TREM2依赖性基因包括活化T细胞的核因子(NFAT)转录因子;(g)增加树突细胞、巨噬细胞、M1巨噬细胞、活化的M1巨噬细胞、M2巨噬细胞、单核细胞、破骨细胞、皮肤朗格汉斯细胞、库普弗细胞、小神经胶质细胞、M1小神经胶质细胞、活化的M1小神经胶质细胞、和M2小神经胶质细胞、或其任何组合的存活;(h)调控选自由以下组成的组的一种或多种刺激性分子的表达:CD83、CD86、II类MHC、CD40、以及其任何组合,任选地其中所述CD40在树突细胞、单核细胞、巨噬细胞、或其任何组合上表达,并且任选地其中所述树突细胞包括骨髓衍生的树突细胞;(i)增加记忆力;以及(j)减少认知缺陷。在可与前述实施方案中的任一项组合的一些实施方案中,所述抗体属于IgG类、IgM类、或IgA类。在可与前述实施方案中的任一项组合的一些实施方案中,所述抗体属于IgG类并且具有IgG1、IgG2、IgG3、或IgG4同种型。在可与前述实施方案中的任一项组合的一些实施方案中,所述抗体具有IgG2同种型。在可与前述实施方案中的任一项组合的一些实施方案中,所述抗体包含人IgG2恒定区。在可与前述实施方案中的任一项组合的一些实施方案中,所述人IgG2恒定区包括Fc区。在可与前述实施方案中的任一项组合的一些实施方案中,所述抗体不依赖于结合到Fc受体而增强一种或多种TREM2活性。在可与前述实施方案中的任一项组合的一些实施方案中,所述抗体结合抑制性Fc受体。在可与前述实施方案中的任一项组合的一些实施方案中,所述抑制性Fc受体是抑制性Fc-γ受体IIB(FcγIIB)。在可与前述实施方案中的任一项组合的一些实施方案中:(a)所述分离的抗体具有人或小鼠IgG1同种型并且包含在Fc区中的在选自由以下组成的组的残基位置处的一个或多个氨基酸取代:N297A、D265A、D270A、L234A、L235A、G237A、C226S、C229S、E233P、L234V、L234F、L235E、P331S、S267E、L328F、A330L、M252Y、S254T、T256E、、L328E、P238D、S267E、L328F、E233D、G237D、H268D、P271G、A330R、以及其任何组合,其中所述残基的编号根据EU编号,或者包含在Fc区中的在对应于甘氨酸236的位置处的氨基酸缺失;(b)所述分离的抗体具有IgG1同种型并且包含IgG2同种型重链恒定区1(CH1)和铰链区,任选地其中所述IgG2同种型CH1和铰链区包含氨基酸序列ASTKGPSVFP LAPCSRSTSE STAALGCLVK DYFPEPVTVS 
WNSGALTSGVHTFPAVLQSS GLYSLSSVVTVPSSNFGTQT YTCNVDHKPS NTKVDKTVERKCCVECPPCP(SEQ ID NO:886),并且任选地其中所述抗体Fc区包含S267E氨基酸取代、L328F氨基酸取代、或两者、和/或N297A或N297Q氨基酸取代,其中所述残基的编号根据EU编号;(c)所述分离的抗体具有IgG2同种型并且包含在Fc区中的在选自由以下组成的组的残基位置处的一个或多个氨基酸取代:P238S、V234A、G237A、H268A、H268Q、V309L、A330S、P331S、C214S、C232S、C233S、S267E、L328F、M252Y、S254T、T256E、H268E、N297A、N297Q、A330L、以及其任何组合,其中所述残基的编号根据EU编号;(d)所述分离的抗体具有人或小鼠IgG4同种型并且包含在Fc区中的在选自由以下组成的组的残基位置处的一个或多个氨基酸取代:L235A、G237A、S228P、L236E、S267E、E318A、L328F、M252Y、S254T、T256E、E233P、F234V、L234A/F234A、S228P、S241P、L248E、T394D、N297A、N297Q、L235E、以及其任何组合,其中所述残基的编号根据EU编号;或者(e)所述分离的抗体具有杂合IgG2/4同种型,并且任选地其中所述抗体包含含有人IgG2的氨基酸118至260和人IgG4的氨基酸261至447的氨基酸序列,其中所述残基的编号根据EU或Kabat编号。在可与前述实施方案中的任一项组合的一些实施方案中,所述抗体是结合到TREM2蛋白的惰性抗体。在可与前述实施方案中的任一项组合的一些实施方案中,所述抗体是结合到TREM2蛋白的拮抗剂抗体。在可与前述实施方案中的任一项组合的一些实施方案中,所述TREM2蛋白是哺乳动物蛋白或人蛋白。在可与前述实施方案中的任一项组合的一些实施方案中,所述TREM2蛋白是野生型蛋白。在可与前述实施方案中的任一项组合的一些实施方案中,所述TREM2蛋白是天然存在的变体。在可与前述实施方案中的任一项组合的一些实施方案中,所述TREM2蛋白是疾病变体。在可与前述实施方案中的任一项组合的一些实施方案中,所述抗体抑制一种或多种TREM2活性。在可与前述实施方案中的任一项组合的一些实施方案中,所述一种或多种TREM2活性选自由以下组成的组:(a)TREM2结合到DAP12;
(b)TREM2磷酸化;(c)DAP12磷酸化;(d)活化一种或多种酪氨酸激酶,任选地其中所述一种或多种酪氨酸激酶包括Syk激酶、ZAP70激酶、或两者;(e)活化磷脂酰肌醇3-激酶(PI3K);
(f)活化蛋白激酶B(Akt);(g)将磷脂酶C-γ(PLC-γ)募集到细胞质膜、活化PLC-γ、或两者;(h)将TEC家族激酶dVav募集到细胞质膜;(i)活化核因子-rB(NF-rB);(j)抑制MAPK信号传导;(k)用于T细胞活化的接头(LAT)、用于B细胞活化的接头(LAB)、或两者的磷酸化;(l)活化IL-2诱导的酪氨酸激酶(Itk);(m)调控选自由以下组成的组的一种或多种促炎介质:
IFN-β、IL-1α、IL-1β、TNF-α、IL-6、IL-8、CRP、CD86、MCP-1/CCL2、CCL3、CCL4、CCL5、CCR2、CXCL-10、Gata3、IL-20家族成员、IL-33、LIF、IFN-γ、OSM、CNTF、CSF-1、OPN、CD11c、GM-CSF、IL-11、IL-12、IL-17、IL-18、以及IL-23,任选地其中所述调控发生在选自由以下组成的组的一种或多种细胞中:巨噬细胞、M1巨噬细胞、活化的M1巨噬细胞、M2巨噬细胞、树突细胞、单核细胞、破骨细胞、皮肤朗格汉斯细胞、库普弗细胞、以及小神经胶质细胞;(n)调控选自由以下组成的组的一种或多种抗炎介质:IL-4、IL-10TGF-β、IL-13、IL-35IL-16、IFN-α、IL-
1Ra、VEGF、G-CSF、YM、AXL、FLT1以及TNF或IL-6的可溶性受体,任选地其中所述调控发生在选自由以下组成的组的一种或多种细胞中:巨噬细胞、M1巨噬细胞、活化的M1巨噬细胞、M2巨噬细胞、树突细胞、单核细胞、破骨细胞、皮肤朗格汉斯细胞、库普弗细胞、以及小神经胶质细胞;(o)调控其表达在炎症诱导之后增加的一种或多种基因,任选地其中所述一种或多种基因选自由Fabp3、Fabp5、和LDR组成的组;(p)细胞外信号调节激酶(ERK)的磷酸化;(q)增加选自由以下组成的组的一种或多种细胞中的C-C趋化因子受体7(CCR7)的表达:巨噬细胞、M1巨噬细胞、活化的M1巨噬细胞、M2巨噬细胞、树突细胞、单核细胞、破骨细胞、皮肤朗格汉斯细胞、库普弗细胞、小神经胶质细胞、M1小神经胶质细胞、活化的M1小神经胶质细胞、和M2小神经胶质细胞、以及其任何组合;(r)诱导小神经胶质细胞向CCL19和CCL21表达细胞的趋化性;(s)破坏的TREM2/DAP12依赖性基因表达的正常化;(t)将Syk、ZAP70、或两者募集到DAP12/TREM2复合物;(u)增加一种或多种TREM2依赖性基因的活性,任选地其中所述一种或多种TREM2依赖性基因包括活化T细胞的核因子(NFAT)转录因子;(v)促进选自由以下组成的组的一种或多种细胞的增殖、成熟、迁移、分化、或功能性:免疫抑制树突细胞、免疫抑制巨噬细胞、免疫抑制嗜中性粒细胞、免疫抑制NK细胞、骨髓来源的抑制细胞、肿瘤相关巨噬细胞、肿瘤相关抑制嗜中性粒细胞、肿瘤相关抑制NK细胞、调节性T细胞、以及其任何组合;
(w)增强选自由以下组成的组的一种或多种细胞到肿瘤中浸润:免疫抑制树突细胞、免疫抑制巨噬细胞、免疫抑制嗜中性粒细胞、免疫抑制NK细胞、骨髓来源的抑制细胞、肿瘤相关巨噬细胞、肿瘤相关抑制嗜中性粒细胞、肿瘤相关抑制NK细胞、调节性T细胞、以及其任何组合;(x)增加肿瘤、外周血、淋巴样器官、或其任何组合中的促进肿瘤的髓样免疫抑制细胞或促进肿瘤的粒细胞性免疫抑制细胞的数量;(y)增强骨髓来源的抑制细胞(MDSC)的促进肿瘤的活性;(z)增加肿瘤中或外周血中的促进肿瘤的细胞因子的表达,任选地其中所述促进肿瘤的细胞因子选自由TGF-β、IL-10、和其任何组合组成的组;(aa)增加促进肿瘤的FoxP3+调节性T淋巴细胞的肿瘤浸润;(bb)降低具有肿瘤杀伤潜力的肿瘤特异性T淋巴细胞的活化;(cc)降低选自由以下组成的组的一种或多种细胞的浸润:具有肿瘤杀伤潜力的肿瘤特异性T淋巴细胞、具有肿瘤杀伤潜力的肿瘤特异性NK细胞、具有增强免疫应答的潜力的肿瘤特异性B淋巴细胞、以及其任何组合;(dd)增加肿瘤体积;(ee)增加肿瘤生长速率;(ff)增加转移;(gg)增加肿瘤复发率;(hh)降低调控抗肿瘤T细胞应答的一种或多种免疫疗法的效力,任选地其中所述一种或多种免疫疗法选自由PD1/PDL1阻断、CTLA-4阻断、和癌症疫苗组成的组;(ii)抑制PLCγ/PKC/钙动员;以及(jj)抑制PI3K/Akt、Ras/MAPK信号传导。在可与前述实施方案中的任一项组合的一些实施方案中,所述一种或多种TREM2活性选自由以下组成的组:(a)TREM2结合到DAP12;(b)DAP12磷酸化;(c)活化Syk激酶;(d)将Syk募集到DAP12/TREM2复合物;(e)增加一种或多种TREM2依赖性基因的活性,任选地其中所述一种或多种TREM2依赖性基因包括活化T细胞的核因子(NFAT)转录因子;(f)增加肿瘤体积;以及(g)增加肿瘤生长速率。在可与前述实施方案中的任一项组合的一些实施方案中,所述抗体抑制TREM2与一种或多种TREM2配体之间的相互作用、抑制TREM2信号转导、或两者。在可与前述实施方案中的任一项组合的一些实施方案中,所述抗体不能够结合Fc-γ受体(FcγR)。在可与前述实施方案中的任一项组合的一些实施方案中,所述抗体具有IgG1、IgG2、IgG3、或IgG4同种型。在可与前述实施方案中的任一项组合的一些实施方案中:(a)所述抗体具有人或小鼠IgG1同种型并且包含在Fc区中的在选自由以下组成的组的残基位置处的一个或多个氨基酸取代:N297A、N297Q、D270A、D265A、L234A、L235A、C226S、C229S、P238S、E233P、L234V、P238A、A327Q、A327G、P329A、K322A、L234F、L235E、P331S、T394D、A330L、M252Y、S254T、T256E、、L328E、P238D、S267E、L328F、E233D、G237D、H268D、P271G、A330R、以及其任何组合,其中所述残基的编号根据EU编号,或者包含在Fc区中的在对应于甘氨酸236的位置处的氨基酸缺失;(b)所述抗体具有IgG2同种型并且包含在Fc区中的在选自由以下组成的组的残基位置处的一个或多个氨基酸取代:P238S、V234A、G237A、H268A、H268Q、H268E、V309L、N297A、N297Q、A330S、P331S、C232S、C233S、M252Y、S254T、T256E、以及其任何组合,其中所述残基的编号根据EU编号;或者(c)所述抗体具有人IgG4同种型并且包含在Fc区中的在选自由以下组成的组的残基位置处的一个或多个氨基酸取代:E233P、F234V、L234A/F234A、L235A、G237A、E318A、S228P、L236E、S241P、L248E、T394D、M252Y、S254T、T256E、N297A、N297Q、以及其任何组合,其中所述残基的编号根据EU编号。在可与前述实施方案中的任一项组合的一些实施方案中:(a)Fc区还包含在选自由以下组成的组的位置处的一个或多个额外的氨基酸取代:A330L、L234F;L235E、P331S、以及其任何组合,其中所述残基的编号根据EU编号;(b)Fc区还包含在选自由以下组成的组的位置处的一个或多个额外的氨基酸取代:M252Y、S254T、T256E、以及其任何组合,其中所述残基的编号根据EU编号;或者(c)Fc区还包含根据EU编号的S228P氨基酸取代。在可与前述实施方案中的任一项组合的一些实施方案中,所述抗体是结合到选自由以下组成的组的一种或多种人蛋白的抗体片段:
人TREM2、人TREM2的天然存在的变体、和人TREM2的疾病变体,并且任选地其中所述抗体片段与与第二抗体片段交联,所述第二抗体片段结合到选自由以下组成的组的一种或多种人蛋白:人TREM2、人TREM2的天然存在的变体、和人TREM2的疾病变体。在可与前述实施方案中的任一项组合的一些实施方案中,所述片段是Fab、Fab’、Fab’-SH、F(ab’)2、Fv或scFv片段。
在可与前述实施方案中的任一项组合的一些实施方案中,所述一种或多种TREM2配体选自由以下组成的组:大肠杆菌细胞、凋亡细胞、核酸、阴离子脂质、阴离子脂质、APOE、APOE2、APOE3、APOE4、阴离子APOE、阴离子APOE2、阴离子APOE3、阴离子APOE4、脂化APOE、脂化APOE2、脂化APOE3、脂化APOE4、两性离子脂质、带负电荷的磷脂、磷脂酰丝氨酸、硫脂、磷脂酰胆、鞘磷脂、膜磷脂、脂化蛋白、蛋白脂质、脂化肽、脂化淀粉样蛋白β肽、以及其任何组合。在可与前述实施方案中的任一项组合的一些实施方案中,所述抗体是鼠抗体。在可与前述实施方案中的任一项组合的一些实施方案中,所述抗体是人源化抗体、双特异性抗体、多价抗体、偶联抗体、或嵌合抗体。在可与前述实施方案中的任一项组合的一些实施方案中,所述抗体是单克隆抗体。在可与前述实施方案中的任一项组合的一些实施方案中,所述抗体是识别第一抗原和第二抗原的双特异性抗体。在可与前述实施方案中的任一项组合的一些实施方案中,所述第一抗原是人TREM2或其天然存在的变体,并且所述第二抗原是:(a)有助于跨血脑屏障转运的抗原;(b)有助于跨血脑屏障转运的抗原,其选自由以下组成的组:
蛋白受体(TR)、胰岛素受体(HIR)、胰岛素样生长因子受体(IGFR)、低密度脂蛋白受体相关蛋白1和低密度脂蛋白受体相关蛋白2(LPR-1和LPR-2)、白喉毒素受体、CRM197、美洲驼单结构域抗体、TMEM 30(A)、蛋白转导结构域、TAT、Syn-B、穿膜肽、聚精氨酸肽、血管肽、以及ANG1005;(c)选自由致病性肽或蛋白质或致病性核酸组成的组的致病性物质,其中所述致病性核酸是反义GGCCCC(G2C4)重复序列扩增RNA,所述致病性蛋白选自由以下组成的组:
淀粉样蛋白β、寡聚淀粉样蛋白β、淀粉样蛋白β斑、淀粉样蛋白前体蛋白或其片段、Tau、IAPP、α-突触核蛋白、TDP-43、FUS蛋白、C9orf72(染色体9开放阅读框72)、c9RAN蛋白、朊病毒蛋白、PrPSc、亨廷顿蛋白、降血钙素、超氧化物歧化酶、共济失调蛋白、共济失调蛋白1、共济失调蛋白2、共济失调蛋白3、共济失调蛋白7、共济失调蛋白8、共济失调蛋白10、路易小体、心房利钠因子、胰岛淀粉样蛋白多肽、胰岛素、载脂蛋白AI、血清淀粉样蛋白A、medin、泌乳素、转甲状腺素蛋白、溶菌酶、β2微球蛋白、凝溶胶蛋白、角膜上皮蛋白、抑半胱氨酸蛋白酶蛋白、免疫球蛋白轻链AL、S-IBM蛋白、重复序列相关非ATG(RAN)翻译产物、二肽重复序列(DPR)肽、甘氨酸-丙氨酸(GA)重复序列肽、甘氨酸-脯氨酸(GP)重复序列肽、甘氨酸-精氨酸(GR)重复序列肽、脯氨酸-丙氨酸(PA)重复序列肽、泛素、以及脯氨酸-精氨酸(PR)重复序列肽;(d)在免疫细胞上表达的配体和/或蛋白质,其中所述配体和/或蛋白质选自由以下组成的组:CD40、OX40、ICOS、CD28、CD137/4-1BB、CD27、GITR、PD-L1、CTLA-4、PD-L2、PD-1、B7-H3、B7-H4、HVEM、BTLA、KIR、GAL9、TIM3、A2AR、LAG-3、以及磷脂酰丝氨酸;以及(e)在一种或多种肿瘤细胞上表达的蛋白质、脂质、多糖、或糖脂。在可与前述实施方案中的任一项组合的一些实施方案中,所述抗体与特异性地结合致病性物质的一种或多种抗体组合使用,所述致病性物质选自由以下组成的组:致病性肽、致病性蛋白、淀粉样蛋白β、寡聚淀粉样蛋白β、淀粉样蛋白β斑、淀粉样蛋白前体蛋白或其片段、Tau、IAPP、α-突触核蛋白、TDP-43、FUS蛋白、C9orf72(染色体9开放阅读框72)、朊病毒蛋白、PrPSc、亨廷顿蛋白、降血钙素、超氧化物歧化酶、共济失调蛋白、共济失调蛋白1、共济失调蛋白2、共济失调蛋白3、共济失调蛋白7、共济失调蛋白8、共济失调蛋白10、路易小体、心房利钠因子、胰岛淀粉样蛋白多肽、胰岛素、载脂蛋白AI、血清淀粉样蛋白A、medin、泌乳素、转甲状腺素蛋白、溶菌酶、β2微球蛋白、凝溶胶蛋白、角膜上皮蛋白、抑半胱氨酸蛋白酶蛋白、免疫球蛋白轻链AL、S-IBM蛋白、重复序列相关非ATG(RAN)翻译产物、二肽重复序列(DPR)肽、甘氨酸-丙氨酸(GA)重复序列肽、甘氨酸-脯氨酸(GP)重复序列肽、甘氨酸-精氨酸(GR)重复序列肽、脯氨酸-丙氨酸(PA)重复序列肽、泛素、和脯氨酸-精氨酸(PR)重复序列肽、以及其任何组合;或与结合免疫调节蛋白的一种或多种抗体组合使用,所述免疫调节蛋白选自由以下组成的组:CD40、OX40、ICOS、CD28、CD137/4-1BB、CD27、GITR、PD-L1、CTLA-4、PD-L2、PD-1、B7-H3、B7-H4、HVEM、BTLA、KIR、GAL9、TIM3、A2AR、LAG-3、TREM1、TREM2、CD33、唾液酸结合性免疫球蛋白样凝集素-5、唾液酸结合性免疫球蛋白样凝集素-9、唾液酸结合性免疫球蛋白样凝集素-11、磷脂酰丝氨酸、致病性核酸、反义GGCCCC(G2C4)重复序列扩增RNA、以及其任何组合。在可与前述实施方案中的任一项组合的一些实施方案中,当施用到个体时增加记忆力、减少认知缺陷、或两者。在可与前述实施方案中的任一项组合的一些实施方案中,所述抗体特异性地结合到人TREM2和小鼠TREM2。在可与前述实施方案中的任一项组合的一些实施方案中,所述抗体对于人TREM2和小鼠TREM2具有范围是约12.8nM至约1.2nM、或小于1.2nM的解离常数(KD)。在可与前述实施方案中的任一项组合的一些实施方案中,所述抗体对于人TREM2具有范围是约12.8nM至约2.9nM、或小于2.9nM的解离常数(KD)。在可与前述实施方案中的任一项组合的一些实施方案中,所述抗体对于小鼠TREM2具有范围是约10.4nM至约1.2nM、或小于1.2nM的解离常数(KD)。在可与前述实施方案中的任一项组合的一些实施方案中,KD在大约4℃的温度下确定。
在可与前述实施方案中的任一项组合的一些实施方案中,所述抗体不抑制先天免疫细胞的生长。在可与前述实施方案中的任一项组合的一些实施方案中,所述抗体以小于1nM的KD结合到原代免疫细胞。在可与前述实施方案中的任一项组合的一些实施方案中,所述抗体在大脑、或脑脊髓液(CSF)、或两者中积累至在血液中1%或更多的抗体浓度的程度。在可与前述实施方案中的任一项组合的一些实施方案中,所述抗体在大脑、或脑脊髓液(CSF)、或两者中积累至在血液中2%或更多的抗体浓度的程度。在可与前述实施方案中的任一项组合的一些实施方案中,所述抗体在大脑、或脑脊髓液(CSF)、或两者中积累至在血液中3%或更多的抗体浓度的程度。在可与前述实施方案中的任一项组合的一些实施方案中,所述抗体在大脑、或脑脊髓液(CSF)、或两者中积累至在血液中4%或更多的抗体浓度的程度。
[0047] 本公开的其他方面涉及一种包含编码如前述实施方案中任一项所述的抗体的核酸序列的分离的核酸。本公开的其他方面涉及一种包含如前述实施方案中任一项所述的核酸的载体。本公开的其他方面涉及一种包含如前述实施方案中任一项所述的载体的分离的宿主细胞。本公开的其他方面涉及一种产生结合到TREM2的抗体的方法,其包括培养如前述实施方案中任一项所述的宿主细胞以产生所述抗体。在一些实施方案中,所述方法还包括回收由所述细胞产生的抗体。本公开的其他方面涉及一种通过如前述实施方案中任一项所述的方法产生的结合到TREM2的分离的(例如,单克隆的)抗体。本公开的其他方面涉及一种包含如前述实施方案中任一项所述的抗体和药学上可接受的载剂的药物组合物。
[0048] 本公开的其他方面涉及一种预防、降低风险、或治疗患有选自由以下组成的组的疾病、病症、或损伤的个体的方法:痴呆、额颞叶痴呆、阿尔茨海默氏病、血管性痴呆、混合型痴呆、克-雅二氏病、正常压力脑积水、肌萎缩性侧索硬化症、亨廷顿氏病、tau蛋白病、Nasu-Hakola病、中风、急性创伤、慢性创伤、认知缺陷、记忆力丧失、狼疮、急性和慢性结肠炎、类风湿关节炎、伤口愈合、克罗恩氏病、炎症性肠病、溃疡性结肠炎、肥胖症、疟疾、特发性震颤、中枢神经系统狼疮、贝切特氏病、帕金森氏病、路易体痴呆、多系统萎缩、希一德二氏综合征、进行性核上性麻痹、皮层基底神经节变性、急性播散性脑脊髓炎、肉芽肿病症、结节病、老化疾病、癫痫发作、脊髓损伤、创伤性脑损伤、年龄相关性黄斑变性、青光眼、色素性视网膜炎、视网膜变性、呼吸道感染、败血症、眼部感染、全身感染、狼疮、关节炎、多发性硬化症、低骨密度、骨质疏松症、骨生成、骨质增生疾病、佩吉特氏骨病、膀胱癌、脑癌、乳腺癌、结肠癌、直肠癌、子宫内膜癌、肾癌、肾细胞癌、肾盂癌、白血病、肺癌、黑素瘤、非霍奇金氏淋巴瘤、胰腺癌、前列腺癌、卵巢癌、纤维肉瘤、急性成淋巴细胞白血病(ALL)、急性骨髓性白血病(AML)、慢性淋巴细胞白血病(CLL)、慢性骨髓性白血病(CML)、多发性骨髓瘤、真性红细胞增多症、原发性血小板增多症、原发性或特发性骨髓纤维化、原发性或特发性脊髓硬化症、髓样来源的肿瘤、甲状腺癌、感染、CNS疱疹、寄生虫感染、锥虫感染、Cruzi感染、铜绿假单胞菌感染、杜氏利什曼原虫感染、B族链球菌感染、空肠弯曲杆菌感染、脑膜炎奈瑟氏球菌感染、I型HIV、以及流感嗜血杆菌,所述方法包括向有需要的个体施用治疗有效量的结合到TREM2蛋白的分离的(例如,单克隆的)抗体。本公开的其他方面涉及一种结合到TREM2蛋白的分离的(例如,单克隆的)抗体,其用于预防、降低风险、或治疗患有选自由以下组成的组的疾病、病症、或损伤的个体:痴呆、额颞叶痴呆、阿尔茨海默氏病、血管性痴呆、混合型痴呆、克-雅二氏病、正常压力脑积水、肌萎缩性侧索硬化症、亨廷顿氏病、tau蛋白病、Nasu-Hakola病、中风、急性创伤、慢性创伤、认知缺陷、记忆力丧失、狼疮、急性和慢性结肠炎、类风湿关节炎、伤口愈合、克罗恩氏病、炎症性肠病、溃疡性结肠炎、肥胖症、疟疾、特发性震颤、中枢神经系统狼疮、贝切特氏病、帕金森氏病、路易体痴呆、多系统萎缩、希一德二氏综合征、进行性核上性麻痹、皮层基底神经节变性、急性播散性脑脊髓炎、肉芽肿病症、结节病、老化疾病、癫痫发作、脊髓损伤、创伤性脑损伤、年龄相关性黄斑变性、青光眼、色素性视网膜炎、视网膜变性、呼吸道感染、败血症、眼部感染、全身感染、狼疮、关节炎、多发性硬化症、低骨密度、骨质疏松症、骨生成、骨质增生疾病、佩吉特氏骨病、膀胱癌、脑癌、乳腺癌、结肠癌、直肠癌、子宫内膜癌、肾癌、肾细胞癌、肾盂癌、白血病、肺癌、黑素瘤、非霍奇金氏淋巴瘤、胰腺癌、前列腺癌、卵巢癌、纤维肉瘤、急性成淋巴细胞白血病(ALL)、急性骨髓性白血病(AML)、慢性淋巴细胞白血病(CLL)、慢性骨髓性白血病(CML)、多发性骨髓瘤、真性红细胞增多症、原发性血小板增多症、原发性或特发性骨髓纤维化、原发性或特发性脊髓硬化症、髓样来源的肿瘤、甲状腺癌、感染、CNS疱疹、寄生虫感染、锥虫感染、Cruzi感染、铜绿假单胞菌感染、杜氏利什曼原虫感染、B族链球菌感染、空肠弯曲杆菌感染、脑膜炎奈瑟氏球菌感染、I型HIV、以及流感嗜血杆菌。本公开的其他方面涉及结合到TREM2蛋白的分离的(例如,单克隆的)抗体在制造用于预防、降低风险、或治疗患有选自由以下组成的组的疾病、病症、或损伤的个体的药品方面的用途:痴呆、额颞叶痴呆、阿尔茨海默氏病、血管性痴呆、混合型痴呆、克-雅二氏病、正常压力脑积水、肌萎缩性侧索硬化症、亨廷顿氏病、tau蛋白病、Nasu-Hakola病、中风、急性创伤、慢性创伤、认知缺陷、记忆力丧失、狼疮、急性和慢性结肠炎、类风湿关节炎、伤口愈合、克罗恩氏病、炎症性肠病、溃疡性结肠炎、肥胖症、疟疾、特发性震颤、中枢神经系统狼疮、贝切特氏病、帕金森氏病、路易体痴呆、多系统萎缩、希一德二氏综合征、进行性核上性麻痹、皮层基底神经节变性、急性播散性脑脊髓炎、肉芽肿病症、结节病、老化疾病、癫痫发作、脊髓损伤、创伤性脑损伤、年龄相关性黄斑变性、青光眼、色素性视网膜炎、视网膜变性、呼吸道感染、败血症、眼部感染、全身感染、狼疮、关节炎、多发性硬化症、低骨密度、骨质疏松症、骨生成、骨质增生疾病、佩吉特氏骨病、膀胱癌、脑癌、乳腺癌、结肠癌、直肠癌、子宫内膜癌、肾癌、肾细胞癌、肾盂癌、白血病、肺癌、黑素瘤、非霍奇金氏淋巴瘤、胰腺癌、前列腺癌、卵巢癌、纤维肉瘤、急性成淋巴细胞白血病(ALL)、急性骨髓性白血病(AML)、慢性淋巴细胞白血病(CLL)、慢性骨髓性白血病(CML)、多发性骨髓瘤、真性红细胞增多症、原发性血小板增多症、原发性或特发性骨髓纤维化、原发性或特发性脊髓硬化症、髓样来源的肿瘤、甲状腺癌、感染、CNS疱疹、寄生虫感染、锥虫感染、Cruzi感染、铜绿假单胞菌感染、杜氏利什曼原虫感染、B族链球菌感染、空肠弯曲杆菌感染、脑膜炎奈瑟氏球菌感染、I型HIV、以及流感嗜血杆菌。本公开的其他方面涉及一种预防、降低风险、或治疗患有选自由以下组成的组的疾病、病症、或损伤的个体的方法:痴呆、额颞叶痴呆、阿尔茨海默氏病、Nasu-Hakola病、认知缺陷、记忆力丧失、脊髓损伤、创伤性脑损伤、多发性硬化症、慢性结肠炎、溃疡性结肠炎以及癌症,所述方法包括向有需要的个体施用治疗有效量的结合到TREM2蛋白的分离的(例如,单克隆的)抗体。本公开的其他方面涉及一种结合到TREM2蛋白的分离的(例如,单克隆的)抗体,其用于预防、降低风险、或治疗患有选自由以下组成的组的疾病、病症、或损伤的个体:痴呆、额颞叶痴呆、阿尔茨海默氏病、Nasu-Hakola病、认知缺陷、记忆力丧失、脊髓损伤、创伤性脑损伤、多发性硬化症、慢性结肠炎、溃疡性结肠炎以及癌症。本公开的其他方面涉及结合到TREM2蛋白的分离的(例如,单克隆的)抗体在制造用于预防、降低风险、或治疗患有选自由以下组成的组的疾病、病症、或损伤的个体的药品方面的用途:痴呆、额颞叶痴呆、阿尔茨海默氏病、Nasu-Hakola病、认知缺陷、记忆力丧失、脊髓损伤、创伤性脑损伤、多发性硬化症、慢性结肠炎、溃疡性结肠炎以及癌症。在一些实施方案中,所述分离的抗体是:(a)激动剂抗体;(b)惰性抗体;或(c)拮抗剂抗体。在一些实施方案中,所述分离的抗体是如前述实施方案中任一项所述的抗体。在一些实施方案中,所述疾病、病症、或损伤是阿尔茨海默氏病。在一些实施方案中,结合到TREM2蛋白的分离的抗体增加一种或多种炎性介质的表达,其中所述一种或多种炎性介质选自由以下组成的组:IL-1β、TNF-α、YM-1、CD86、CCL2、CCL3、CCL5、CCR2、CXCL10、Gata3、Rorc、以及其任何组合。在一些实施方案中,结合到TREM2蛋白的分离的抗体降低一种或多种炎性介质的表达,其中所述一种或多种炎性介质选自由以下组成的组:FLT1、OPN、CSF-1、CD11c、AXL、以及其任何组合。在一些实施方案中,结合到TREM2蛋白的分离的抗体降低个体中的Aβ肽的水平。在一些实施方案中,结合到TREM2蛋白的分离的抗体增加个体的大脑中的CD11b+小神经胶质细胞的数量。在一些实施方案中,结合到TREM2蛋白的分离的抗体增加个体的记忆力。在一些实施方案中,结合到TREM2蛋白的分离的抗体减少个体的认知缺陷。在一些实施方案中,结合到TREM2蛋白的分离的抗体增加个体的运动协调。在一些实施方案中,所述方法还包括向所述个体施用特异性地结合到抑制性检查点分子的至少一种抗体和/或另一种标准或研究性抗癌疗法。在一些实施方案中,特异性地结合到抑制性检查点分子的至少一种抗体与所述分离的抗体组合施用。在一些实施方案中,特异性地结合到抑制性检查点分子的至少一种抗体选自由以下组成的组:抗PD-L1抗体、抗CTLA-4抗体、抗PD-L2抗体、抗PD-1抗体、抗B7-H3抗体、抗B7-H4抗体、和抗HVEM抗体、抗B淋巴细胞和T淋巴细胞衰减因子(BTLA)抗体、抗杀伤细胞抑制性受体(KIR)抗体、抗GAL9抗体、抗TIM3抗体、抗A2AR抗体、抗LAG-3抗体、抗磷脂酰丝氨酸抗体、抗CD27抗体、以及其任何组合。在一些实施方案中,所述标准或研究性抗癌疗法是选自由以下组成的组的一种或多种疗法:放射疗法、细胞毒性化学疗法、靶向疗法、激素疗法、伊替尼 曲妥珠单抗 贝伐单抗 奥法木单抗
利妥昔单抗 冷冻疗法消融、射频
消融、过继细胞转移(ACT)、嵌合抗原受体T细胞转移(CAR-T)、疫苗疗法、以及细胞因子疗法。在一些实施方案中,所述方法还包括向所述个体施用特异性地结合到抑制性细胞因子的至少一种抗体。在一些实施方案中,特异性地结合到抑制性细胞因子的至少一种抗体与所述分离的抗体组合施用。在一些实施方案中,特异性地结合到抑制性细胞因子的至少一种抗体选自由以下组成的组:抗CCL2抗体、抗CSF-1抗体、抗IL-2抗体、以及其任何组合。在一些实施方案中,所述方法还包括向所述个体施用特异性地结合到刺激性检查点蛋白的至少一种激动性抗体。在一些实施方案中,特异性地结合到刺激性检查点蛋白的至少一种激动性抗体与所述分离的抗体组合施用。在一些实施方案中,特异性地结合到刺激性检查点蛋白的至少一种激动性抗体选自由以下组成的组:激动剂抗CD40抗体、激动剂抗OX40抗体、激动剂抗ICOS抗体、激动剂抗CD28抗体、激动剂抗CD137/4-1BB抗体、激动剂抗CD27抗体、激动剂抗糖皮质激素诱导的TNFR相关蛋白GITR抗体、以及其任何组合。在一些实施方案中,所述方法还包括向所述个体施用至少一种刺激性细胞因子。在一些实施方案中,所述至少一种刺激性细胞因子与所述分离的抗体组合施用。在一些实施方案中,所述至少一种刺激性细胞因子选自由以下组成的组:TNF-α、IL-10、IL-6、IL-8、CRP、细胞因子蛋白家族的TGF-β成员、IL-20家族成员、IL-33、LIF、OSM、CNTF、TGF-β、IL-11、IL-12、IL-17、IL-8、IL-23、IFN-α、IFN-β、IL-2、IL-18、GM-CSF、G-CSF、以及其任何组合。
[0049] 本公开的其他方面涉及一种增强有需要的个体中的由一种或多种TREM2配体与TREM2蛋白的结合诱导的一种或多种TREM2活性的方法,其包括向所述个体施用治疗有效量的结合到TREM2蛋白的分离的(例如,单克隆的)抗体。本公开的其他方面涉及一种结合到TREM2蛋白的分离的(例如,单克隆的)抗体,其用于增强有需要的个体中的由一种或多种TREM2配体与TREM2蛋白的结合诱导的一种或多种TREM2活性。本公开的其他方面涉及结合到TREM2蛋白的分离的(例如,单克隆的)抗体在制造用于增强有需要的个体中的由一种或多种TREM2配体与TREM2蛋白的结合诱导的一种或多种TREM2活性的药品方面的用途。在一些实施方案中,所述分离的抗体是如前述实施方案中任一项所述的抗体。
[0050] 本公开的其他方面涉及一种诱导有需要的个体中的一种或多种TREM2活性的方法,其包括向所述个体施用治疗有效量的结合到TREM2蛋白的分离的(例如,单克隆的)抗体。本公开的其他方面涉及一种结合到TREM2蛋白的分离的(例如,单克隆的)抗体,其用于诱导有需要的个体中的一种或多种TREM2活性。本公开的其他方面涉及结合到TREM2蛋白的分离的(例如,单克隆的)抗体在制造用于诱导有需要的个体中的一种或多种TREM2活性的药品方面的用途。在一些实施方案中,所述分离的抗体是如前述实施方案中任一项所述的抗体。
[0051] 本公开的其他方面涉及一种在有需要的个体中诱导一种或多种TREM2活性并且增强由一种或多种TREM2配体与TREM2蛋白的结合诱导的一种或多种TREM2活性的方法,其包括向所述个体施用治疗有效量的结合到TREM2蛋白的分离的(例如,单克隆的)抗体。本公开的其他方面涉及一种结合到TREM2蛋白的分离的(例如,单克隆的)抗体,其用于诱导一种或多种TREM2活性并且增强有需要的个体中的由一种或多种TREM2配体与TREM2蛋白的结合诱导的一种或多种TREM2活性。本公开的其他方面涉及结合到TREM2蛋白的分离的(例如,单克隆的)抗体在制造用于诱导一种或多种TREM2活性并且增强有需要的个体中的由一种或多种TREM2配体与TREM2蛋白的结合诱导的一种或多种TREM2活性的药品方面的用途。在一些实施方案中,所述分离的抗体是如前述实施方案中任一项所述的抗体。
[0052] 本公开的其他方面涉及一种降低有需要的个体中的一种或多种细胞中的TREM2的细胞水平的方法,其包括向所述个体施用治疗有效量的结合到TREM2蛋白的分离的(例如,单克隆的)抗体。本公开的其他方面涉及一种结合到TREM2蛋白的分离的(例如,单克隆的)抗体,其用于降低有需要的个体中的一种或多种细胞中的TREM2的细胞水平。本公开的其他方面涉及结合到TREM2蛋白的分离的(例如,单克隆的)抗体在制造用于降低有需要的个体中的一种或多种细胞中的TREM2的细胞水平的药品方面的用途。在一些实施方案中,所述分离的抗体是如前述实施方案中任一项所述的抗体。
[0053] 在可与前述实施方案中的任一项组合的一些实施方案中,所述个体具有TREM2的杂合变体,其中所述变体包含选自由以下组成的组的一个或多个取代:i.编码SEQ ID NO:1的氨基酸残基Glu14的核酸序列中的谷氨酸向终止密码子的取代;ii.编码SEQ ID NO:1的氨基酸残基Gln33的核酸序列中的谷氨酰胺向终止密码子的取代;iii.编码SEQ ID NO:1的氨基酸残基Trp44的核酸序列中的色氨酸向终止密码子的取代;iv.在对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基Arg47的氨基酸处的精氨酸向组氨酸的氨基酸取代;v.编码SEQ ID NO:1的氨基酸残基Trp78的核酸序列中的色氨酸向终止密码子的取代;vi.在对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基Val126的氨基酸处的缬氨酸向甘氨酸的氨基酸取代;vii.在对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基Asp134的氨基酸处的天冬氨酸向甘氨酸的氨基酸取代;以及viii.在对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基Lys186的氨基酸处的赖氨酸向天冬酰胺的氨基酸取代。在可与前述实施方案中的任一项组合的一些实施方案中,所述个体具有TREM2的杂合变体,其中所述变体包含:在对应于编码SEQ ID NO:1的核酸序列的核苷酸残基G313的核苷酸处的嘌呤核苷酸缺失;在对应于编码SEQ ID NO:1的核酸序列的核苷酸残基G267的核苷酸处的鸟嘌呤核苷酸缺失;或两者。在可与前述实施方案中的任一项组合的一些实施方案中,所述个体具有DAP12的杂合变体,其中所述变体包括选自由以下组成的组的一个或多个变体:i.在对应于SEQ ID NO:2的氨基酸残基Met1的氨基酸处的蛋氨酸向苏氨酸的取代;ii.在对应于SEQ ID NO:2的氨基酸残基Gly49的氨基酸处的甘氨酸向精氨酸的氨基酸取代;iii.编码SEQ ID NO:2的核酸序列的外显子1-4内的缺失;iv.在编码SEQ ID NO:2的核酸序列的外显子3处的14个氨基酸残基的插入;以及v.在对应于编码SEQ ID NO:2的核酸序列的核苷酸残基G141的核苷酸处的鸟嘌呤核苷酸缺失。
[0054] 本公开的其他方面涉及一种诱导或促进有需要的个体中的先天免疫细胞存活或伤口愈合的方法,其包括向所述个体施用治疗有效量的结合到TREM2蛋白的分离的激动剂抗体。本公开的其他方面涉及一种结合到TREM2蛋白的分离的激动剂抗体,其用于诱导或促进有需要的个体中的先天免疫细胞存活或伤口愈合。本公开的其他方面涉及结合到TREM2蛋白的分离的激动剂抗体在制造用于诱导或促进有需要的个体中的先天免疫细胞存活或伤口愈合的药品方面的用途。在一些实施方案中,所述分离的激动剂抗体是如前述实施方案中任一项所述的激动剂抗体。
[0055] 本公开的其他方面涉及一种在有需要的个体中增加记忆力、减少认知缺陷、或两者的方法,其包括向所述个体施用治疗有效量的结合到TREM2蛋白的分离的激动剂抗体。本公开的其他方面涉及一种结合到TREM2蛋白的分离的激动剂抗体,其用于在有需要的个体中增加记忆力、减少认知缺陷、或两者。本公开的其他方面涉及结合到TREM2蛋白的分离的激动剂抗体在制造用于在有需要的个体中增加记忆力、减少认知缺陷、或两者的药品方面的用途。在一些实施方案中,所述分离的激动剂抗体是如前述实施方案中任一项所述的激动剂抗体。
[0056] 本公开的其他方面涉及一种增加有需要的个体的运动协调的方法,其包括向所述个体施用治疗有效量的结合到TREM2蛋白的分离的激动剂抗体。本公开的其他方面涉及一种结合到TREM2蛋白的分离的激动剂抗体,其用于增加有需要的个体的运动协调。本公开的其他方面涉及结合到TREM2蛋白的分离的激动剂抗体在制造用于增加有需要的个体的运动协调的药品方面的用途。在一些实施方案中,所述分离的激动剂抗体是如前述实施方案中任一项所述的激动剂抗体。
[0057] 本公开的其他方面涉及一种降低有需要的个体中的Aβ肽水平的方法,其包括向所述个体施用治疗有效量的结合到TREM2蛋白的分离的激动剂抗体。本公开的其他方面涉及一种结合到TREM2蛋白的分离的激动剂抗体,其用于降低有需要的个体中的Aβ肽水平。本公开的其他方面涉及结合到TREM2蛋白的分离的激动剂抗体在制造用于降低有需要的个体中的Aβ肽水平的药品方面的用途。在一些实施方案中,所述分离的激动剂抗体是如前述实施方案中任一项所述的激动剂抗体。
[0058] 本公开的其他方面涉及一种增加有需要的个体中的CD11b+小神经胶质细胞的数量的方法,其包括向所述个体施用治疗有效量的结合到TREM2蛋白的分离的激动剂抗体。本公开的其他方面涉及一种结合到TREM2蛋白的分离的激动剂抗体,其用于增加有需要的个体中的CD11b+小神经胶质细胞的数量。本公开的其他方面涉及结合到TREM2蛋白的分离的激动剂抗体在制造用于增加有需要的个体中的CD11b+小神经胶质细胞的数量的药品方面的用途。在一些实施方案中,所述分离的激动剂抗体是如前述实施方案中任一项所述的激动剂抗体。
[0059] 本公开的其他方面涉及一种增加有需要的个体中的FLT1、OPNCSF1、CD11c、以及AXL中的一种或多种的水平的方法,其包括向所述个体施用治疗有效量的结合到TREM2蛋白的分离的激动剂抗体。本公开的其他方面涉及一种结合到TREM2蛋白的分离的激动剂抗体,其用于增加有需要的个体中的FLT1、OPNCSF1、CD11c、以及AXL中的一种或多种的水平。本公开的其他方面涉及结合到TREM2蛋白的分离的激动剂抗体在制造用于增加有需要的个体中的FLT1、OPNCSF1、CD11c、以及AXL中的一种或多种的水平的药品方面的用途。在一些实施方案中,所述分离的激动剂抗体是如前述实施方案中任一项所述的激动剂抗体。
[0060] 本公开的其他方面涉及一种治疗有需要的个体的脊髓损伤的方法,其包括向所述个体施用治疗有效量的结合到TREM2蛋白的分离的激动剂抗体。本公开的其他方面涉及一种结合到TREM2蛋白的分离的激动剂抗体,其用于治疗有需要的个体的脊髓损伤。本公开的其他方面涉及结合到TREM2蛋白的分离的激动剂抗体在制造用于治疗有需要的个体的脊髓损伤的药品方面的用途。在一些实施方案中,所述分离的激动剂抗体是如前述实施方案中任一项所述的激动剂抗体。
[0061] 本公开的其他方面涉及一种治疗有需要的个体的慢性结肠炎或溃疡性结肠炎的方法,其包括向所述个体施用治疗有效量的结合到TREM2蛋白的分离的激动剂抗体。本公开的其他方面涉及一种结合到TREM2蛋白的分离的激动剂抗体,其用于治疗有需要的个体的慢性结肠炎或溃疡性结肠炎。本公开的其他方面涉及结合到TREM2蛋白的分离的激动剂抗体在制造用于治疗有需要的个体的慢性结肠炎或溃疡性结肠炎的药品方面的用途。在一些实施方案中,所述分离的激动剂抗体是如前述实施方案中任一项所述的激动剂抗体。
[0062] 在可与前述实施方案中的任一项组合的一些实施方案中,所述抗体不抑制先天免疫细胞的生长。在可与前述实施方案中的任一项组合的一些实施方案中,所述抗体以小于1nM的KD结合到原代免疫细胞。在可与前述实施方案中的任一项组合的一些实施方案中,KD在大约4℃的温度下确定。在可与前述实施方案中的任一项组合的一些实施方案中,所述抗体在大脑、或脑脊髓液(CSF)、或两者中积累至在血液中1%或更多的抗体浓度的程度。在可与前述实施方案中的任一项组合的一些实施方案中,所述抗体在大脑、或脑脊髓液(CSF)、或两者中积累至在血液中2%或更多的抗体浓度的程度。在可与前述实施方案中的任一项组合的一些实施方案中,所述抗体在大脑、或脑脊髓液(CSF)、或两者中积累至在血液中3%或更多的抗体浓度的程度。在可与前述实施方案中的任一项组合的一些实施方案中,所述抗体在大脑、或脑脊髓液(CSF)、或两者中积累至在血液中4%或更多的抗体浓度的程度。
[0063] 附图简述
[0064] 图1A示出人TREM2蛋白(SEQ ID NO:1)与人NCTR2蛋白(SEQ ID NO:851)之间的氨基酸序列比对,其描绘两种蛋白质之间的同源性。共有序列是SEQ ID NO:852。
[0065] 图1B示出若干TREM蛋白与IgV家族的其他成员之间的基于结构的序列比对。氨基酸残基编号与人TREM1蛋白的成熟序列一致。TREM1的二级结构元件针对β链以箭头描绘并且α螺旋以圆柱形描绘。参与同源和异源二聚体形成的氨基酸残基在黑色背景上示出。形成二硫键并且对于V型Ig折叠是保守的半胱氨酸残基以粗体描绘并且使用星号标记。空位以“–”指示。违反抗体样二聚体形成模式的M-1残基以实心三角形标记,如(例如,Radaev等人,(2003)Structure.11(12):1527-1535)。TREM-1_人(SEQ ID NO:853)、TREM-2_人(SEQ ID NO:854)、TREM-1_小鼠(SEQ ID NO:855)、TREM-2_小鼠(SEQ ID NO:856)、TREM-3_小鼠(SEQ ID NO:857)、NKp44(SEQ ID NO:858)、aTCR_人(SEQ ID NO:859)、bTCR_人(SEQ ID NO:860)、gTCR_人(SEQ ID NO:861)、dTCR_人(SEQ ID NO:862)、Vd_人(SEQ ID NO:863)、hIGG1_小鼠(SEQ ID NO:864)、lIGG1_小鼠(SEQ ID NO:865)、CD8_人(SEQ ID NO:866)、以及CTLA4_人(SEQ ID NO:867)。
[0066] 图2示出人TREM1蛋白(SEQ ID NO:868)与人TREM2蛋白(SEQ ID NO:1)之间的氨基酸序列比对,其描绘两种蛋白质之间的同源性。共有序列是SEQ ID NO:869。
[0067] 图3A示出证明TREM2抗体7E5和2H8与表达重组小鼠TREM2的小鼠细胞系(BWZ)的结合的FACS图。图3B示出抗体7E5和2H8结合到野生型(TREM2+/+)骨髓衍生的小鼠巨噬细胞(BMMac)和TREM2缺陷(TREM2-/-)BMMac。抗体mIgG1表示阴性同种型对照。阴影图表示TREM2阴性细胞群体。黑色轮廓图表示TREM2阳性细胞群体。图3C示出证明TREM2抗体7E5与表达重组小鼠TREM2的BWZ细胞但是不与亲本BWZ细胞的剂量依赖性结合的剂量应答曲线。抗体mIgG1表示阴性同种型对照。
[0068] 图4A示出证明TREM2抗体10A9、10C1、和8F8与表达重组人TREM2-DAP12融合蛋白的人细胞系(293)的结合的FACS图。阴影图表示TREM2阴性细胞群体。黑色轮廓图表示TREM2阳性细胞群体。图4B示出抗体10A9、10C1、和8F8结合到原代人树突细胞(hDC)。阴影图示出同种型抗体阴性对照的结合。黑色轮廓图表示TREM2抗体的结合。图4C示出用于组合人源化形式的抗TREM2抗体9F5(mAb T2-9F5.1)的抗体轻链可变区(VL)序列的示意图。额外的变型在每个序列下列出。附图包括人源化抗体9F5的形式的序列。在附图中,IGKV2-29*02(SEQ ID NO:870);连接区(SEQ ID NO:871);T2-9F5.1(SEQ ID NO:872);2-29*02(SEQ ID NO:873);h9F5-L1(SEQ ID NO:874);h9F5-L2(SEQ ID NO:875)。图4D示出用于组合人源化形式的抗TREM2抗体9F5(mAb T2-9F5.1)的抗体重链可变区(VH)序列的示意图。额外的变型在每个序列下列出。附图包括人源化抗体9F5的形式的序列。在附图中,IGHV1-46*01(SEQ ID NO:
876);连接区(SEQ ID NO:877);T2-9F5.1(SEQ ID NO:878);1-46*01(SEQ ID NO:879);
h9F5-H1(SEQ ID NO:880);h9F5-H2(SEQ ID NO:881);h9F5-H3(SEQ ID NO:882)。图4E示出抗TREM2抗体9F5(MAb)、以及抗TREM2抗体T21-9(Fab)、T22(Fab)、和T45-10(Fab)与野生型TREM2(%WT)、与指示的TREM2突变体的结合反应性百分比。
[0069] 图5A示出在与TREM2抗体2F6、11H5、2H8、1H7、3A7、3B10、10A9、7F8、以及7E5一起孵育之后小鼠骨髓衍生的巨噬细胞中如通过蛋白质印迹分析确定的Syk磷酸化。作为对照,不进行处理(NT)或与mIgG1同种型对照一起孵育的细胞不诱导Syk磷酸化。图5B示出在与TREM2抗体7E5、3A7、和2F6一起孵育之后WT、Fc受体共同γ链缺陷(FcgR-/-)和TREM2缺陷(TREM2-/-)骨髓衍生的小鼠巨噬细胞中如通过蛋白质印迹确定的Syk磷酸化。
[0070] 图6A示出在过表达Fc受体FcR2b和FcR3的P815细胞系的存在下,不进行处理(NT)或使用TREM2抗体7E5、3A7、8F8、以及2F6进行处理的野生型(WT)和TREM2缺陷(TREM2-/-)骨髓衍生的小鼠巨噬细胞中如通过蛋白质印迹确定的Syk磷酸化。抗体IgG1是同种型对照。图6B示出在表达内源性Fc受体FcR2b的原代鼠B细胞的存在下,不进行处理(NT)或使用TREM2抗体7E5、3A7、8F8、以及2F6进行处理的WT骨髓衍生的小鼠巨噬细胞中如通过蛋白质印迹确定的Syk磷酸化。抗体IgG1是同种型对照。
[0071] 图7A示出在与TREM2抗体11A2、11H5、2F6、3A7、4G3、12F9、3B10、以及7A9一起孵育之后或不进行处理(NT)的小鼠巨噬细胞中如通过蛋白质印迹确定的DAP12磷酸化(pTyr)。抗体mIgG1是同种型阴性对照。图7B示出在不进行处理(NT)或使用TREM2抗体7E5和2F6进行处理的野生型(WT)和TREM2缺陷(TREM2-/-)小鼠巨噬细胞中如通过蛋白质印迹确定的
DAP12磷酸化。图7C示出在来自使用对照抗体MOPC.1或TREM2抗体7E5处理15分钟的小鼠的腹膜细胞中如通过蛋白质印迹免疫沉淀确定的DAP12磷酸化。图7D示出进行15分钟处理的MOPC1处理小鼠相对于IP-TREM2的倍数变化。图7E示出在来自使用对照抗体MOPC.1或TREM2抗体7E5处理24小时的小鼠的腹膜细胞中如通过蛋白质印迹免疫沉淀确定的DAP12磷酸化。
图7F示出进行24小时处理的MOPC1处理小鼠相对于IP-TREM2的倍数变化。
[0072] 图8A示出在基于细胞的测定中小鼠TREM2依赖性荧光素酶报告蛋白的诱导。细胞不进行处理(NT)或使用板结合的全长抗TREM2抗体1H7、2F6、2H8、3A7、3B10、7E5、7F8、8F8、以及11H5进行处理。结果表达为相对于背景的倍数。背景水平用虚线描绘。图8B示出在基于细胞的测定中人TREM2依赖性荧光素酶报告蛋白的诱导。细胞不进行处理(NT)或使用板结合的全长抗TREM2抗体9F5、9G1、9G3、10A9、10C1、11A8、12D9、12E2、12F9、12G6、2C7、2F5、3C1、以及4D7进行处理。结果表达为相对于背景的倍数。抗体msIgG1是同种型阴性对照。使用PMA/离子霉素(P+I)进行处理的细胞代表阳性对照。图8C示出通过增加板结合的磷脂酰丝氨酸(PS)或鞘磷脂(SM)的浓度进行小鼠TREM2依赖性荧光素酶报告基因表达的诱导。结果表达为绝对发光值。图8D示出通过增加板结合的磷脂酰丝氨酸(PS)或鞘磷脂(SM)的浓度进行人TREM2依赖性荧光素酶报告基因表达的诱导。结果表达为绝对发光值。图8E示出通过增加载脂蛋白E(APOE)的浓度进行人TREM2依赖性荧光素酶报告基因表达的诱导。测试APOE的三种不同的等位基因(APOE2、APOE3和APOE4)。结果表达为绝对发光值。图8F示出如通过ELISA检测的APOE2、APOE3和APOE4与重组人TREM2蛋白的结合。结果表达为OD450。
[0073] 图9A示出在基于细胞的测定中小鼠TREM2依赖性荧光素酶报告蛋白的诱导。细胞不进行处理(NT)或使用可溶性全长抗TREM2抗体1H7、2F6、2H8、3A7、3B10、7E5、7F8、8F8、以及11H5进行处理。抗体mIgG1是同种型阴性对照。使用PMA/离子霉素进行处理的细胞代表阳性对照。结果表达为相对于背景的倍数(用虚线表示)。图9B示出通过呈溶液形式的全长抗TREM2抗体9F5、9G1、9G3、10A9、10C1、11A8、12D9、12E2、12F9、12G6、2C7、2F5、3C1、以及4D7进行人TREM2依赖性荧光素酶报告基因表达的诱导。抗体mIgG1是同种型阴性对照。使用PMA/离子霉素进行处理的细胞代表阳性对照。结果表达为相对于背景的倍数(用虚线表示)。图9C示出在基于细胞的测定中TREM2荧光素酶报告蛋白的剂量依赖性诱导。细胞不进行处理(NT)或使用增加浓度的呈溶液形式的全长抗TREM2抗体7E5进行处理。结果表达为绝对发光值。数据使用Prism6软件进行分析并且与log(激动剂)相对于应答四参数可变斜率拟合。
EC50=1.52nM。
[0074] 图10A示出通过添加指示量的呈溶液形式的全长抗TREM2抗体7E5并且结合增加浓度的板结合的磷脂酰丝氨酸(PS)进行小鼠TREM2依赖性荧光素酶报告基因表达的诱导。图10B示出通过添加指示量的呈溶液形式的全长IgG1同种型对照抗体并且结合增加浓度的板结合的磷脂酰丝氨酸(PS)进行小鼠TREM2依赖性荧光素酶报告基因表达的诱导。图10C示出通过添加指示量的呈溶液形式的全长抗TREM2抗体7E5并且结合增加浓度的板结合的鞘磷脂(SM)进行小鼠TREM2依赖性荧光素酶报告基因表达的诱导。图10D示出通过添加指示量的呈溶液形式的全长IgG1同种型对照抗体并且结合增加浓度的板结合的鞘磷脂(SM)进行小鼠TREM2依赖性荧光素酶报告基因表达的诱导。图10E示出通过添加呈溶液形式的全长抗TREM2抗体2F6、3A7、3B10、8F8、以及11H5或IgG1同种型对照并且结合增加浓度的板结合的磷脂酰丝氨酸(PS)进行小鼠TREM2依赖性荧光素酶报告基因表达的诱导。结果表达为绝对发光值。图10F示出通过添加呈溶液形式的与商业抗体相比的全长抗TREM2抗体7E5并且结合增加浓度的板结合的鞘磷脂(SM)进行小鼠TREM2依赖性荧光素酶报告基因表达的诱导。
小鼠IgG1和大鼠IgG2b抗体用作同种型对照。
[0075] 图11A示出通过添加指示量的呈溶液形式的全长抗TREM2抗体9F5并且结合增加浓度的板结合的磷脂酰丝氨酸(PS)进行人TREM2依赖性荧光素酶报告基因表达的诱导。图11B示出通过添加指示量的呈溶液形式的全长IgG1同种型对照抗体并且结合增加浓度的板结合的磷脂酰丝氨酸(PS)进行人TREM2依赖性荧光素酶报告基因表达的诱导。图11C示出通过呈溶液形式的全长抗TREM2抗体7B3、9G1、9G3、9F5、以及IgG1同种型对照抗体(msIgG1)并且结合增加浓度的板结合的磷脂酰丝氨酸(PS)进行人TREM2依赖性荧光素酶报告基因表达的诱导。结果表达为绝对发光值。图11D示出通过呈溶液形式的全长抗TREM2抗体11A8、12F9、3B10、8F8、以及IgG1同种型对照抗体(msIgG1)并且结合增加浓度的板结合的磷脂酰丝氨酸(PS)进行人TREM2依赖性荧光素酶报告基因表达的诱导。结果表达为绝对发光值。图11E示出在5μg/ml的全长抗TREM2抗体9F5、7B3、和9G3的存在下和在呈溶液形式的IgG1同种型对照抗体(msIgG1)的存在下重组人TREM2蛋白与APOE3的结合。示出两次重复的平均值和SEM。
图11F示出在15μg/ml的全长抗TREM2抗体9F5、7B3、和9G3的存在下和在呈溶液形式的IgG1同种型对照抗体(msIgG1)的存在下重组人TREM2蛋白与APOE3的结合。示出两次重复的平均值和SEM。
[0076] 图12A示出在与100nM可溶性全长抗TREM2抗体1H7、2F6、2H8、3A7、7E5、7F8、以及8F8或商业抗体(R&D目录号F7E57291)一起孵育之后野生型(WT)骨髓衍生的小鼠巨噬细胞的活力。作为阴性对照,细胞与小鼠IgG1和大鼠IgG2b同种型对照抗体一起孵育。结果表达为活细胞%,其中100%是非处理细胞的活力并且0%是在细胞因子M-CSF不存在下培养的细胞的活力。图12B示出在与2.5ug/ml或10ug/ml的板结合的全长抗TREM2抗体2F6、3A7、
7E5、以及8F8一起孵育之后野生型(WT)骨髓衍生的小鼠巨噬细胞的活力。作为阴性对照,细胞与小鼠IgG1(mIgG1)一起孵育。结果表达为发光,它是细胞活力的量度。虚线指示细胞不进行处理时的基线平均活力。图12C示出表达标志物CD11b或CD11b和Gr1的免疫细胞的数量,所述标志物存在于注射抗TREM2抗体7E5或同种型对照抗体(mIgG1)的小鼠的大脑中。
[0077] 图13A示出确定单独地或与LPS组合注射到腹腔中的TREM2抗体对于免疫细胞的总数量的影响的示例性体内实验的设计。图13B示出在单独地注射LPS、对照(CTR)或TREM2抗体7E5或与LPS组合注射CTR或TREM2抗体7E5之后腹腔中的嗜中性粒细胞的百分比。图13C示出在单独地注射LPS、对照(CTR)或TREM2抗体7E5或与LPS组合注射CTR或TREM2抗体7E5之后腹腔中的嗜中性粒细胞的数量。图13D示出在单独地注射LPS、对照(CTR)或TREM2抗体8F8或与LPS组合注射CTR或TREM2抗体8F8之后腹腔中的嗜中性粒细胞的百分比。图13E示出在单独地注射LPS、对照(CTR)或TREM2抗体8F8或与LPS组合注射CTR或TREM2抗体8F8之后腹腔中的嗜中性粒细胞的数量。图13F示出在单独地注射LPS、对照(CTR)或TREM2抗体7E5或与LPS组合注射CTR或TREM2抗体7E5之后腹腔中的驻留型巨噬细胞(CD11b+F4/80高)的百分比。图13G示出在单独地注射LPS、对照(CTR)或TREM2抗体7E5或与LPS组合注射CTR或TREM2抗体
7E5之后腹腔中的驻留型巨噬细胞(CD11b+F4/80高)的数量。图13H示出在单独地注射LPS、对照(CTR)或TREM2抗体8F8或与LPS组合注射CTR或TREM2抗体8F8之后腹腔中的驻留型巨噬细+ 高
胞(CD11bF4/80 )的百分比。图13I示出在单独地注射LPS、对照(CTR)或TREM2抗体8F8或与LPS组合注射CTR或TREM2抗体8F8之后腹腔中的驻留型巨噬细胞(CD11b+F4/80高)的数量。图
13J示出在单独地注射LPS、对照(CTR)或TREM2抗体7E5或与LPS组合注射CTR或TREM2抗体
7E5之后腹腔中的小的浸润性巨噬细胞(CD11b+F4/80中)的百分比。图13K示出在单独地注射LPS、对照(CTR)或TREM2抗体7E5或与LPS组合注射CTR或TREM2抗体7E5之后腹腔中的小的浸润性巨噬细胞(CD11b+F4/80中)的数量。图13L示出在单独地注射LPS、对照(CTR)或TREM2抗体8F8或与LPS组合注射CTR或TREM2抗体8F8之后腹腔中的小的浸润性巨噬细胞(CD11b+F4/
80中)的百分比。图13M示出在单独地注射LPS、对照(CTR)或TREM2抗体8F8或与LPS组合注射+ 中
CTR或TREM2抗体8F8之后腹腔中的小的浸润性巨噬细胞(CD11bF4/80 )的数量。图13N示出确定单独地或与LPS组合注射到腹腔中的TREM2抗体对于产生炎性介质CCL4、IL-1β、和MCP-
1(CCL2)的影响的示例性体内实验的设计。图13O示出在与LPS组合注射对照(CTR)或TREM2抗体7E5和8F8之后腹腔中的CCL4的以pg/ml计的浓度。图13P示出在与LPS组合注射对照(CTR)或TREM2抗体7E5和8F8之后腹腔中的IL-1β的以pg/ml计的浓度。图13Q示出在与LPS组合注射对照(CTR)或TREM2抗体7E5和8F8之后腹腔中的MCP-1(CCL2)的以pg/ml计的浓度。
[0078] 图14示出在三只小鼠的腹膜中注射指示剂量的抗体之后2天、4天、8天、以及15天存在于血清中的7E5抗体的平均浓度(ug/ml)。可溶性7E5抗体的测量通过标准ELISA进行。数据使用Prism6软件进行分析并且与指数单相衰减曲线(exponential one-phase decay curve)拟合来计算半衰期。抗体的半衰期在小鼠血清中是大约9.5天。
[0079] 图15示出在腹膜中注射指示剂量的抗体之后2天、4天、8天、以及15天存在于血清中的可溶性TREM2受体(sTREM2)的浓度(ng/ml)。可溶性TREM2的测量通过ELISA进行。
[0080] 图16A示出响应于板结合的磷脂酰丝氨酸(PS)和鞘磷脂(SM),培养物中的TREM2受体下调。图16B示出响应于呈溶液形式的可溶性全长抗TREM2抗体3A7和2F6并且结合增加浓度的板结合的磷脂酰丝氨酸(PS),培养物中的TREM2受体下调。
[0081] 图17A示出如实施例16所述,使用包含IL-1b、IL-6、TNFa、IL-12、YM-1、IL-1Ra、MRC1、IL-10、CD86、FCGR1B、以及TGFb的 基因表达探针的TaqMan测定(Applied Biosystems,Invitrogen)和实时PCR获得的在注射抗TREM2抗体7E5的APP/PS1小鼠的海马体中的促炎和抗炎基因的表达的变化。倍数变化相对于对照小鼠中的基因表达(虚线)。使用抗TREM2抗体7E5进行处理显著地使IL-1b、IL-6、TNFa、以及CD86的表达增加大约2倍。
FCGR1B的表达增加大约3倍,并且IL-10的表达增加大约4倍。相比之下,IL-1Ra的表达降低一半。IL-12、YM-1、MRC1、以及TGFB的表达保持不变。将所有的基因表达数据归一化为18S rRNA表达。图17B示出如实施例16所述,使用包含IL-1b、TNFa、YM-1、IL-1Rn CD86、TGF-β1、CCL2、CCL3、CCL5、CCR2、CXCL10、Gata3以及Rorc的 基因表达探针的TaqMan测定
(Applied Biosystems,Invitrogen)和实时PCR获得的在小鼠颅内注射抗TREM2抗体7E5之后24小时和72小时5XFAD小鼠的海马体中的促炎和抗炎基因的表达的变化。倍数变化相对于使用同种型对照抗体处理的小鼠中的基因表达。虚线指示使用对照抗体处理的小鼠中的表达水平。使用抗TREM2抗体7E5进行的处理在注射后72小时显著地使IL-1b、TNFa、YM-1、CD86、CCL2、CCL3、CCR2、CXCL10、Gata3以及Rorc的表达增加大约2倍。CCL5的表达增加大约3倍。IL-1Rn和TGFB的表达则保持不变。将所有的基因表达数据归一化为18S rRNA表达。*=Pval<0.05;**=Pval<0.01。图17C示出在颅内注射5mg/ml 7E5或对照msIgG1抗体的APP/PS1*
小鼠的大脑中的FLT1的表达的变化。Pval<0.01,学生t检验(Student’s t-test)。图17D-图17P示出如实施例16所述,使用包含CCL2、CXCL10、Rorc、TNFα、AXL、LDR、CXCR4、Fabp5、Fabp3、OPN、FLT1、CSF-1、以及CD11c的 基因表达探针的TaqMan测定和实时PCR获
得的在小鼠每周注射50mg/kg抗TREM2抗体7E5之后3月5XFAD小鼠的大脑中的细胞因子和趋化因子的表达。图17D示出CCL2的结果。图17E示出CXCL10的结果。图17F示出Rorc的结果。图
17G示出TNFα的结果。图17H示出CSF-1的结果。图17I示出OPN的结果。图17J示出CD11c的结果。图17K示出Flt1的结果。图17L示出AXL的结果。图17M示出LDR的结果。图17N示出CXCR4的结果。图17O示出Fabp5的结果。图17P示出Fabp3的结果。对于图17D-图17P,*Pval<0.05,**Pval<0.01,***Pval<0.001,使用Tukey post hoc检验的单因素方差分析(One Way Anova)。
图17Q示出如实施例16所述,使用用兔多克隆抗体Aβ1–16(Invitrogen)染色的Aβ的自由漂浮免疫组织化学获得的在颅内注射抗TREM2抗体7E5或同种型对照抗体(mIgG1)的APP/PS1小鼠的额叶皮层(FCX)和海马体(HPC)中的Aβ肽的定量。**=Pval<0.01,使用Fisher’s PLSD post hoc检验的双因素ANOVA。图17R示出如实施例16所述,使用用兔多克隆抗体Aβ1–16(Invitrogen)染色的Aβ的自由漂浮免疫组织化学获得的在长期颅内注射抗TREM2抗体7E5或同种型对照抗体(mIgG1)的5xFAD小鼠的额叶皮层(FCX)和海马体(HPC)中的Aβ肽的定量。*=Pval<0.05;**=Pval<0.01。图17S-图17U示出来自使用测量Aβ38(Ab38)、Aβ40(Ab40)、和Aβ42(Ab42)的Meso Scale Discovery Aβ试剂盒进行的对来自长期颅内注射抗TREM2抗体7E5或同种型对照抗体(mIgG1)的5xFAD小鼠的额叶皮层的不可溶蛋白质的分析的结果。在使用7E5进行的处理之后存在不可溶Aβ42的显著降低。图17S示出Aβ38(Ab38)的结果。图17T示出Aβ40(Ab40)的结果。图17U示出Aβ42(Ab42)的结果。图17V示出如实施例16所述,使用用大鼠单克隆抗体(Serotec,Raleigh,NC,USA)染色的CD11b的自由漂浮免疫组织化学获得的在颅内注射抗TREM2抗体7E5或同种型对照抗体(mIgG1)的APP/PS1小鼠的额叶皮层(FCX)和海马体(HPC)中的CD11b表达细胞的定量。**=Pval<0.01。图17W示出如实施例16所述,使用用大鼠单克隆抗体(Serotec,Raleigh,NC,USA)染色的CD11b的自由漂浮免疫组织化学获得的在长期颅内注射抗TREM2抗体7E5或同种型对照抗体(mIgG1)的小鼠的额叶皮层(FCX)和海马体(HPC)中的CD11b表达细胞的定量。**=Pval<0.01。图17X示出如实施例16所述,使用长期注射7E5或对照抗体的WT或5xFAD小鼠的放射臂水迷宫测试评估的认知功能结果。放射臂水迷宫测试在使用抗体进行的处理12周之后执行。图形表示完成任务所执行的错误的平均数量。单元(block)是三个试验的平均值。与非转基因野生型小鼠(WT)相比,接受对照抗体的5XFAD转基因小鼠显著地受损,在整个第二天的测试中得分平均多于3个错误。相比之下,使用任一抗体处理的WT小鼠在单元8至10中得分小于一个错误,如从具有正常认知功能的小鼠所期待的。使用抗TREM2抗体7E5抗体处理的5XFAD转基因小鼠比使用同种型抗体处理的对照5XFAD转基因小鼠表现地显著更好,并且在单元5、9、和10中与正常非转基因小鼠没有差别,从而指示认知功能的恢复。条指示SEM,*=Pval<0.05,**=Pval<
0.05。图17Y示出如实施例16所述,使用长期注射7E5或对照抗体的WT或5xFAD小鼠的新物品认知测试(novel object recognition test,NORT)评估的认知功能结果。NORT测试在使用抗体进行处理12周之后执行。条形图表示在新物品处花费的时间的百分比。使用对照抗体处理的5XFAD小鼠在探索新物品上花费仅约50%的时间,这指示高度未配对的认知功能。相比之下,使用抗TREM2抗体7E5处理的小鼠在探索新物品上花费67%的时间,这接近于正常**
认知功能,从而指示几乎完全恢复。Post hoc Fisher’s PLSD检验用于统计分析 =Pval<
0.01。
[0082] 图18示出存在于天然小鼠或携带指示类型的肿瘤的小鼠的脾(SPL)中或肿瘤(Tum)中的指示的免疫细胞群体上的TREM2表达。
[0083] 图19A示出在接种MC38肿瘤细胞之后8天或26天测量的野生型(WT)或TREM2缺陷(KO)小鼠中的肿瘤大小。每个点指示单个小鼠。指出平均值和标准误差(SEM)。Mann-
Whitney U检验用于统计分析。图19B示出在野生型(WT)或TREM2缺陷(KO)小鼠中移植的MC38细胞的中值生长曲线。
[0084] 图20示出使用不同剂量的抗TREM2抗体7E5处理的具有创伤性脑损伤的小鼠的认知功能的剂量依赖性改善。认知功能使用新物品认知测试(NORT)进行评估,如实施例25所描述的。处理组是:1=40mg/Kg 7E5;2=20mg/Kg 7E5;3=10mg/Kg 7E5;4=5mg/Kg 7E5并且CTR=40mg/Kg同种型对照抗体mIgG1。NORT测试在损伤之后32天执行。条形图表示在新物品处花费的时间占两种物品的总探索时间花费的百分比。“基线”条形图表示在探索两个相同的物品上花费的时间,无论小鼠所接受的处理如何它是相似的。“测试”条形图表示在探索新物品上花费的时间。使用对照抗体处理的具有创伤性脑损伤的小鼠在探索新物品上花费仅57.4%±5.3%,这指示高度未配对的认知功能。相比之下,使用最高剂量的抗TREM2抗体7E5处理的小鼠在探索新物品上花费73.9%±5.4%的时间,这接近于正常认知功能,指示几乎完全恢复。Post hoc Fisher’s PLSD检验用于统计分析*=Pval<0.05。
[0085] 图21A示出在注射布氏巯基乙酸盐(Brewer’s Thioglyicollate)并且然后施用抗TREM2抗体7E5或同种型对照抗体(mIgG1)的TREM2野生型小鼠(WT)和TREM2敲除小鼠(KO)的腹膜腔中测量的细胞因子TNFa的量。与对照处理小鼠相比,TNFa的浓度在使用抗体7E5处理的小鼠中增加约6倍。图21B示出在注射布氏巯基乙酸盐并且然后施用抗TREM2抗体7E5或同种型对照抗体(mIgG1)的TREM2野生型小鼠(WT)和TREM2敲除小鼠(KO)的腹膜腔中测量的细胞因子CCL2的量。与对照处理小鼠相比,CCL2的浓度在使用抗体7E5处理的小鼠中增加约2倍。这些细胞因子的增加是特异性的,因为它不发生在TREM2KO小鼠中。
[0086] 图22A和图22B示出测量在第0天诱导脊髓损伤之后使用抗TREM2抗体7E5(7E5)或同种型对照抗体(对照IgG)处理的小鼠的后肢性能的Basso小鼠标度(BMS)的结果。图22A示出BMS评分。图22B示出BMS子评分。结果指示抗体7E5引发脊髓挫伤之后运动功能的瞬时改善,如通过BMS评分系统所测量的。*p<0.05,使用Tukey post hoc检验的双因素重复ANOVA。
[0087] 图23示出在与可溶性TREM2抗体9F5或10A9一起孵育之后人单核细胞衍生的树突细胞的存活百分比(%)。相比于抗体10A9,在与抗体9F5一起孵育之后树突细胞的存活没有显著降低。“mIgG1”是指小鼠同种型对照抗体,并且“培养基”是指仅培养基对照。
[0088] 图24示出使用抗TREM2抗体7E5的对长期葡聚糖硫酸钠(DSS)攻击的小鼠的处理显著地减少慢性结肠炎的症状。图24A示出使用抗体7E5处理的长期DSS攻击的小鼠的体重损失。图24B示出使用抗体7E5处理的长期DSS攻击的小鼠的疾病活性指数。图24C示出使用抗体7E5处理的长期DSS攻击的小鼠的结肠长度。图24D示出使用抗体7E5处理的长期DSS攻击的小鼠的结肠内窥镜评分。统计分析使用双因素ANOVA(图24A和图24B)或未配对的t检验(图24C和图24D)来执行,***p<0.001,****p<0.0001。
[0089] 图25示出抗TREM2抗体9F5可结合到并且交联由小鼠巨噬细胞表达的人TREM2。图25A示出FACS图,显示人特异性TREM2抗体9F5和10A9与在来自人源化TEM2 BAC转基因小鼠(huTREM2Tg)的巨噬细胞但是不在来自野生型小鼠(WT)的巨噬细胞上表达的人TREM2的结合。结合到人和小鼠TREM2两者的抗TREM2抗体(抗体2F5和来自R&D的商业抗体)显示与来自WT和huTREM2 Tg小鼠两者的巨噬细胞上表达的TREM2的阳性结合。灰色阴影图是同种型染色的细胞,并且黑线图示出使用抗TREM2抗体染色的细胞。图25B示出来自用板结合的9F5或对照抗体体外刺激的人源化TEM2BAC转基因小鼠(Bac-Tg)的巨噬细胞的TNFα的分泌。图25C示出在来自人源化TREM2 BAC转基因小鼠(Bac-Tg)或野生型小鼠(WT)的巨噬细胞上的抗TREM2抗体9F5的体外簇集之后的Dap12磷酸化(pTyr)。对照I抗体不诱导Dap12磷酸化。
[0090] 图26A示出在与野生型小鼠(WT)相比的人TREM2 BAC转基因小鼠(huTREM2 Tg)中测量的可溶性人Trem2(sTREM2)的水平。抗TREM2抗体T21-9显著地增加sTREM2的血浆水平,而抗TREM2抗体9F5并未如此。图26B示出相比于抗TREM2抗体T21-9,抗TREM2抗体9F5仅非常微弱地结合到血浆样品中的sTREM2。X轴代表所测试的血浆的稀释因子,并且Y轴示出光密度读数。
[0091] 公开详述
[0092] 一般技术
[0093] 本文所述或提及的技术和程序由本领域的技术人员大体上良好地理解并且常常使用常规方法来采用,例如像在以下中描述的广泛利用的方法:Sambrook等人,Molecular Cloning:A Laboratory Manual第3版(2001)Cold Spring Harbor Laboratory Press,Cold Spring Harbor,N.Y.;Current Protocols in Molecular Biology(F.M.Ausubel等人编,(2003));the series Methods in Enzymology(Academic Press公司):PCR 2:A Practical Approach(M.J.MacPherson、B.D.Hames和G.R.Taylor编(1995)),Harlow和Lane编(1988)Antibodies,A Laboratory Manual和Animal Cell Culture(R.I.Freshney编(1987));Oligonucleotide Synthesis(M.J.Gait编,1984);Methods in Molecular Biology,Humana Press;Cell Biology:A Laboratory Notebook(J.E.Cellis编,1998)Academic Press;Animal Cell Culture(R.I.Freshney)编,1987);Introduction to Cell and Tissue Culture(J.P.Mather和P.E.Roberts,1998)Plenum Press;Cell and Tissue Culture:Laboratory Procedures(A.Doyle、J.B.Griffiths、和D.G.Newell编,1993-8)J.Wiley and Sons;Handbook of Experimental Immunology(D.M.Weir和C.C.Blackwell编);Gene Transfer Vectors for Mammalian Cells(J.M.Miller和M.P.Calos编,1987);
PCR:The Polymerase Chain Reaction,(Mullis等人编,1994);Current Protocols in Immunology(J.E.Coligan等人编,1991);Short Protocols in Molecular Biology(Wiley and Sons,1999);Immunobiology(C.A.Janeway和P.Travers,1997);Antibodies(P.Finch,
1997);Antibodies:A Practical Approach(D.Catty.编,IRL Press,1988-1989);
Monoclonal Antibodies:A Practical Approach(P.Shepherd和C.Dean编,Oxford 
University Press,2000);Using Antibodies:A Laboratory Manual(E.Harlow和D.Lane(Cold Spring Harbor Laboratory Press,1999);The Antibodies(M.Zanetti和
J.D.Capra编,Harwood Academic Publishers,1995);以及Cancer:Principles and Practice of Oncology(V.T.DeVita等人编,J.B.Lippincott Company,1993)。
[0094] 定义
[0095] 如本文所使用,术语“预防”包括针对个体的特定疾病、病症或病况的发生或复发提供防治。个体可能易感染或易患上特定疾病、病症或病况,或有发生此类疾病、病症或病况的风险,但尚未被诊断患有该疾病、病症或病况。
[0096] 如本文所使用,“有发生特定疾病、病症或病况的风险”的个体可能具有或可能不具有可检测的疾病或疾病症状,并且在本文所描述的治疗方法之前,可能展示或可能尚未展示可检测的疾病或疾病症状。“有风险”表示,个体具有一个或多个风险因素,如本领域中所知,该一个或多个风险因素是与特定疾病、病症或病况相关的可测量的参数。具有这些风险因素中的一个或多个的个体发生特定疾病、病症或病况的概率高于不具有这些风险因素中的一个或多个的个体。
[0097] 如本文所使用,术语“治疗”是指被设计用于在临床病理学过程期间改变所治疗的个体的自然病程的临床干预。期望的治疗作用包括降低进展速率、改善或减轻病理状态,及缓解或改善特定疾病、病症或病况的预后。举例来说,如果与特定疾病、病症或病况有关的一种或多种症状减轻或消除,则个体被成功“治疗”。
[0098] “有效量”是指以所需剂量并且在所需时间段内至少有效达成所期望治疗或预防结果的量。有效量可以分一次或多次施用来提供。本文中的有效量可根据以下因素而变化:诸如个体的疾病状态、年龄、性别和体重、以及治疗在个体中引发所需应答的能力。有效量还是其中治疗有益作用超过治疗的任何毒性或有害作用的量。对于预防性用途,有益或所需的结果包括以下结果:诸如消除或降低风险、减轻严重性、或延迟疾病(包括所述疾病的生物化学的、组织学的和/或行为的症状、在所述疾病发展期间呈现的所述疾病的并发症和中间病理学表型)的发作。对于治疗性用途,有益或所需的结果包括以下临床结果:诸如减少由疾病引起的一种或多种症状、提高患有疾病的患者的生活质量、减少治疗疾病所需要的其他药品的剂量、诸如通过靶向来增强另一种药品的作用、延迟疾病进展、和/或延长存活。药物、化合物、或药物组合物的有效量是足以直接或间接实现预防性或治疗性治疗的量。如在临床环境中所理解的,药物、化合物、或药物组合物的有效量可与或可不与另一种药物、化合物、或药物组合物结合来实现。因此,可在施用一种或多种治疗剂的情形中考虑“有效量”,并且如果与一种或多种其他药剂结合可实现或实现了合乎需要的结果,则可考虑以有效量给予单种药剂。
[0099] “治疗有效量”是实现特定疾病、病症或病况的可测量的改善所需的至少最低浓度。治疗有效量在本文中可以根据多种因素而变化,如疾病状态;患者的年龄、性别及体重;以及抗TREM2抗体在个体体内引起期望的反应的能力。治疗有效量还是抗TREM2抗体的治疗有益作用超过其任何有毒或有害作用的量。
[0100] 如本文所使用,与另一化合物或组合物“结合”施用包括同时施用和/或在不同时间施用。结合施用还涵盖作为共配制物施用,或作为独立组合物施用,包括以不同给药频率或时间间隔,以及使用相同施用途径或不同施用途径。
[0101] 术语“免疫球蛋白”(Ig)在本文中可与“抗体”互换使用。术语“抗体”在本文中是以最广泛意义使用,并且特别涵盖单克隆抗体、多克隆抗体、由至少两种完整抗体形成的多特异性抗体(例如双特异性抗体),及抗体片段,只要这些抗体展现期望的生物活性即可。
[0102] 基本的4链抗体单元是由两条相同轻链(L)和两条相同重链(H)构成的异四聚糖蛋白。VH与VL配对一起形成单一抗原结合位点。有关不同抗体类别的结构和特性,参见例如,Basic and Clinical Immunology,第8版,Daniel P.Stites,Abba I.Terr及Tristram G.Parslow(编),Appleton&Lange,Norwalk,CT,1994,第71页和第6章。
[0103] 来自任何脊椎动物物种的L链基于其恒定结构域的氨基酸序列可以被归为两种明显相异的类型之一,称为kappa(“κ”)和lambda(“λ”)。取决于重链恒定结构域(CH)的氨基酸序列,可以将免疫球蛋白分为不同类别或同种型。存在五类免疫球蛋白:IgA、IgD、IgE、IgG及IgM,具有分别称为alpha(“α”)、delta(“δ”)、epsilon(“ε”)、gamma(“γ”)及mu(“μ”)的重链。γ和α类别基于CH序列和功能的相对微小差异进一步分成亚类(同种型),例如人表达以下亚类:IgG1、IgG2、IgG3、IgG4、IgA1及IgA2。不同类别的免疫球蛋白的亚基结构和三维构型是众所周知的并且大体上描述于例如Abbas等人,Cellular and  Molecular Immunology,第4版(W.B.Saunders Co.,2000)中。
[0104] “天然抗体”通常是由两条相同轻链(L)和两条相同重链(H)构成的约150,000道尔顿的异四聚糖蛋白。每条轻链通过一个共价二硫键连接至重链,但二硫键联的数量在不同免疫球蛋白同种型的重链间有不同。每条重链和轻链还具有规律间隔的链内二硫桥。每条重链在一端具有一个可变结构域(VH),随后是多个恒定结构域。每条轻链在一端具有一个可变结构域(VL)并且在其另一端具有一个恒定结构域;轻链的恒定结构域与重链的第一恒定结构域对齐,并且轻链可变结构域与重链可变结构域对齐。据悉,特定氨基酸残基在轻链与重链可变结构域之间形成界面(interface)。
[0105] “分离的”抗体,如本公开的分离的抗TREM2抗体,是自其产生环境(例如天然或重组地)的组分鉴定、分离和/或回收的抗体。优选地,分离的多肽不与其产生环境中的所有其它污染组分缔合。其产生环境的污染组分,如由重组转染的细胞产生的那些,是典型地干扰有关抗体的研究、诊断或治疗应用的物质,并且可以包括酶、激素及其它蛋白质或非蛋白质溶质。在优选实施方案中,该多肽将纯化:(1)达到通过例如Lowry法测定的以重量计超过95%,并且在一些实施方案中达到以重量计超过99%的抗体;(2)达到利用转杯式测序仪(spinning cup sequenator)足以获得N末端或内部氨基酸序列的至少15个残基的程度;或(3)使用考马斯蓝(Coomassie blue)或优选染色,在非还原或还原条件下通过SDS-PAGE测定达到均质。分离的抗体包括在重组T细胞内原位产生的抗体,因为该抗体天然环境中的至少一种组分将不存在。不过,分离的多肽或抗体通常是通过至少一个纯化步骤制备。
[0106] 抗体,如本公开的抗TREM2抗体的“可变区”或“可变结构域”是指该抗体重链或轻链的氨基末端结构域。重链和轻链的可变结构域可以分别称为“VH”和“VL”。这些结构域一般是抗体变化最大的部分(相对于同类别的其它抗体)并且含有抗原结合位点。
[0107] 术语“可变”是指可变结构域的某些区段的序列在抗体间广泛不同的事实,如本公开的抗TREM2抗体。V结构域介导抗原结合并且确定特定抗体对其特定抗原的特异性。然而,可变性并非均匀分布于整个可变结构域中。取而代之的是,其集中在轻链和重链可变结构域中称为高变区(HVR)的三个区段中。可变结构域中保守程度较高的部分称为框架区(FR)。天然重链和轻链的可变结构域各自包含通过三个HVR连接的四个FR区,主要呈β-折叠构型,这些区域形成了连接β-折叠结构,并且在一些情况下形成β-折叠结构的一部分的环。每条链中的HVR是通过FR区紧密保持在一起,并且与来自另一条链的HVR促成了抗体的抗原结合位点的形成(参见Kabat等人,Sequences of Immunological Interest,第五版,National Institute ofHealth,Bethesda,MD(1991))。恒定结构域不直接参与抗体与抗原的结合,但展现各种效应功能,如使抗体参与抗体依赖性细胞毒性。
[0108] 如本文所使用,术语“单克隆抗体”是指从基本上均质的抗体群获得的抗体,即,除可能微量存在的可能天然存在的突变和/或翻译后修饰(例如异构化、酰胺化等)外,构成该群的个别抗体是相同的,如本公开的单克隆抗TREM2抗体。单克隆抗体针对单一抗原位点的具有高度特异性。与通常包括针对不同决定基(表位)的不同抗体的多克隆抗体制剂相对,每一单克隆抗体针对抗原上的单个决定基。除其特异性之外,单克隆抗体是有利的,因为它们通过杂交瘤培养合成,不被其他免疫球蛋白污染。修饰语“单克隆”指示抗体是自基本上均质的抗体群获得的性质,而不应解释为需要通过任何特定方法产生该抗体。举例来说,根据本发明使用的单克隆抗体可以通过多种技术制备,包括例如,杂交瘤法(例如,Kohler和Milstein.,Nature,256:495-97(1975);Hongo等人,Hybridoma,14(3):253-260(1995);Harlow等人,Antibodies:A Laboratory Manual,(Cold Spring Harbor Laboratory 
Press,第2版,1988);Hammerling等人,Monoclonal Antibodies and T-Cell Hybridomas 
563-681(Elsevier,N.Y.,1981))、重组DNA法(参见例如,美国专利号4,816,567)、噬菌体展示技术(参见例如,Clackson等人,Nature,352:624-628(1991);Marks等人,
J.Mol.Biol.222:581-597(1992);Sidhu等人,J.Mol.Biol.338(2):299-310(2004);Lee等人,J.Mol.Biol.340(5):1073-1093(2004);Fellouse,Proc.Nat’l Acad.Sci.USA101(34):
12467-472(2004);及Lee等人,J.Immunol.Methods284(1-2):119-132(2004)、及用于在动物中产生具有部分或全部的编码人免疫球蛋白序列的人免疫球蛋白基因座或基因的人或类人抗体的技术(参见例如,WO 1998/24893;WO 1996/34096;WO 1996/33735;WO 1991/
10741;Jakobovits等人,Proc.Nat’l Acad.Sci.USA 90:2551(1993);Jakobovits等人,Nature 362:255-258(1993);Bruggemann等人,Year in Immunol.7:33(1993);美国专利号
5,545,807、5,545,806、5,569,825、5,625,126、5,633,425及5,661,016;Marks等人,Bio/Technology 10:779-783(1992);Lonberg等人,Nature 368:856-859(1994);Morrison,Nature 368:812-813(1994);Fishwild等人,Nature Biotechnol.14:845-851(1996);
Neuberger,Nature  Biotechnol.14:826(1996);及Lonberg和Huszar,
Intern.Rev.Immunol.13:65-93(1995)。
[0109] 术语“全长抗体”、“完整抗体”或“全抗体”可互换使用,指呈基本上完整形式的抗体,如本公开的抗TREM2抗体,与抗体片段相对。确切地说,全抗体包括具有重链和轻链(包括Fc区)的那些。恒定结构域可以是天然序列恒定结构域(例如,人天然序列恒定结构域)或其氨基酸序列变体。在一些情况下,完整抗体可以具有一种或多种效应功能。
[0110] “抗体片段”包括完整抗体的一部分,优选完整抗体的抗原结合区和/或可变区。抗体片段的实例包括Fab、Fab'、F(ab')2及Fv片段;双功能抗体(diabody);线性抗体(参见美国专利5,641,870,实施例2;Zapata等人,Protein Eng.8(10):1057-1062(1995));单链抗体分子;及由抗体片段形成的多特异性抗体。
[0111] 木瓜蛋白酶消化抗体,如本公开的抗TREM2抗体,产生两个相同的抗原结合片段,称为“Fab”片段;及残留的“Fc”片段,此名称反映容易结晶的能力。Fab片段由完整L链以及H链的可变区结构域(VH),和一条重链的第一恒定结构域(CH1)组成。每个Fab片段关于抗原结合都是单价的,即,其具有单一抗原结合位点。胃蛋白酶处理抗体得到单一大F(ab')2片段,该片段大致对应于两个二硫键连接的具有不同抗原结合活性的Fab片段并且仍能够交联抗原。Fab'片段与Fab片段的不同之处在于,F(ab')片段在CH1结构域的羧基末端处含有若干其它残基,包括抗体铰链区中的一或多个半胱氨酸。Fab'-SH在本文中是Fab'片段的名称,其中恒定结构域的半胱氨酸残基带有游离硫醇基。F(ab')2抗体片段最初是以Fab'片段对产生,在这些Fab'片段之间具有铰链半胱氨酸。抗体片段的其它化学偶合也是已知的。
[0112] Fc片段包含通过二硫键保持在一起的两个H链的羧基末端部分。抗体的效应功能是由Fc区中的序列决定,该区域也被某些类型细胞上所见的Fc受体(FcR)所识别。
[0113] “Fv”是含有完整抗原识别和结合位点的最小抗体片段。这一片段是由紧密非共价缔合的一个重链可变结构域和一个轻链可变结构域形成的二聚体组成。由这两个结构域折叠得到六个高变环(由H和L链各得到3个环),这些高变环提供用于抗原结合的氨基酸残基并赋予抗体抗原结合特异性。不过,即使单一可变结构域(或仅包含对抗原具有特异性的三个HVR的一半Fv)也能够识别并结合抗原,但亲和力低于完整结合位点。
[0114] “单链Fv”,又缩写为“sFv”或“scFv”,是包含连接成单一多肽链的VH和VL抗体结构域的抗体片段。优选sFv多肽另外包含在VH与VL结构域之间的多肽连接子,所述连接子使sFv能够形成抗原结合所期望的结构。有关sFv的评述,参见Plückthun,The Pharmacology of Monoclonal Antibodies,第113卷,Rosenburg和Moore编,Springer-VerLAG-3,New York,第269-315页(1994)。
[0115] 抗体,如本公开的抗TREM2抗体的“功能片段”包含完整抗体中保持或具有改变的FcR结合能力的一部分,一般包括完整抗体的抗原结合区或可变区,或者抗体的F区。抗体片段的实例包括线性抗体、单链抗体分子及由抗体片段形成的多特异性抗体。
[0116] 术语“双功能抗体”是指通过在VH与VL结构域之间用短连接子(约5-10个残基)构造sFv片段(参看前一段),以使得实现V结构域的链间而非链内配对,由此产生二价片段,即,具有两个抗原结合位点的片段来制备的小抗体片段。双特异性双功能抗体是两个“交叉”sFv片段的异二聚体,其中两个抗体的VH和VL结构域存在于不同多肽链上。双功能抗体较详细地描述于例如EP 404,097;WO 93/11161;及Hollinger等人,Proc.Nat’l Acad.Sci.USA 90:6444-48(1993)中。
[0117] 如本文所使用,“嵌合抗体”是指这样一种抗体(免疫球蛋白),其中重链和/或轻链的一部分与来源于特定物种或属于特定抗体种类或亚类的抗体中的相应序列一致或同源,而所述链的其余部分与来源于另一物种或属于另一抗体种类或亚类的抗体中的相应序列一致或同源,如本公开的嵌合抗TREM2抗体,以及此类抗体的片段,只要其展现所希望的生物活性即可(美国专利号4,816,567;Morrison等人,Proc.Nat’l Acad.Sci.USA,81:6851-55(1984))。本文所关注的嵌合抗体包括 抗体,其中该抗体的抗原结合区
来源于通过例如用所关注抗原对猕猴进行免疫而产生的抗体。如本文所使用,“人源化抗体”作为“嵌合抗体”的亚组使用。
[0118] 非人(例如鼠)抗体的“人源化”形式,如本公开的抗TREM2抗体的人源化形式,是含有来源于非人免疫球蛋白的最小序列的嵌合抗体。在一个实施方案中,人源化抗体是这样一种人免疫球蛋白(受体抗体),其中来自受体的HVR的残基被来自具有所期望的特异性、亲和力和/或能力的非人物种(供体抗体),如小鼠、大鼠、兔或非人灵长类动物的HVR的残基置换。在一些情况下,人免疫球蛋白的FR残基被相应的非人残基置换。此外,人源化抗体可以包含在受体抗体或供体抗体中未发现的残基。进行这些修饰以用于进一步改进抗体性能,如结合亲和力。一般来说,人源化抗体将包含至少一个并且典型地两个可变结构域的基本上全部,其中所有或基本上所有的高变环对应于非人免疫球蛋白序列的高变环,并且所有或基本上所有的FR区是人免疫球蛋白序列的FR区,不过FR区可以包括改善如结合亲和力、异构化、免疫原性等抗体性能的一个或多个单独的FR残基取代。FR中这些氨基酸取代的数量典型地在H链中不超过6个,并且在L链中不超过3个。人源化抗体任选还将包含免疫球蛋白恒定区(Fc)的至少一部分,典型地人免疫球蛋白的Fc的至少一部分。有关其它细节,参见例如,Jones等人,Nature 321:522-525(1986);Riechmann等人,Nature 332:323-329(1988);及Presta,Curr.Op.Struct.Biol.2:593-596(1992)。另参见例如,Vaswani和Hamilton,Ann.Allergy,Asthma&Immunol.1:105-115(1998);Harris,
Biochem.Soc.Transactions 23:1035-1038(1995);Hurle和Gross,Curr.Op.Biotech.5:
428-433(1994);以及美国专利号6,982,321和7,087,409。
[0119] “人抗体”是氨基酸序列对应于由人产生和/或使用如本文所公开的制备人抗体的任何技术制备的抗体(如本公开的抗TREM2抗体)的氨基酸序列的抗体。这一人抗体的定义特别排除了包含非人抗原结合残基的人源化抗体。人抗体可以使用本领域中已知的各种技术产生,包括噬菌体展示文库。Hoogenboom和Winter,J.Mol.Biol.,227:381(1991);Marks等人,J.Mol.Biol.,222:581(1991)。另外,可用于制备人单克隆抗体的方法描述于Cole等人,Monoclonal Antibodies and Cancer Therapy,Alan R.Liss,第77页(1985);Boerner等人,J.Immunol.,147(1):86-95(1991)中。另参见van  Dijk和van de Winkel,Curr.Opin.Pharmacol.5:368-74(2001)。人抗体可以通过将抗原施用给转基因动物来制备,所述转基因动物经修饰以响应于抗原激发产生此类抗体,但其内源性基因座失能,例如经免疫的xenomice(关于XENOMOUSETM技术,参见例如美国专利号6,075,181和6,150,584)。
关于经由人B细胞杂交瘤技术产生的人抗体,另参见例如,Li等人,Proc.Nat’l 
Acad.Sci.USA,103:3557-3562(2006)。
[0120] 术语“高变区”、“HVR”或“HV”当在本文中使用时,是指抗体可变结构域中序列高变和/或形成结构确定的环的区域,如本公开的抗TREM2抗体的所述区域。一般而言,抗体包含六个HVR:三个在VH中(H1、H2、H3),且三个在VL中(L1、L2、L3)。在天然抗体中,H3和L3展示六个HVR的最高多样性,并且确切地说,据信H3在赋予抗体精细特异性方面起到独特作用。参见例如,Xu等人,Immunity 13:37-45(2000);Johnson和Wu,Methods in Molecular Biology 248:1-25(Lo编,Human Press,Totowa,NJ,2003))。实际上,仅由重链组成的天然存在的骆驼抗体在无轻链存在下起作用并且稳定。参见例如,Hamers-Casterman等人,Nature 363:446-448(1993);及Sheriff等人,Nature Struct.Biol.3:733-736(1996)。
[0121] 本文中使用并且涵盖多种HVR描述。作为Kabat互补决定区(CDR)的HVR基于序列可变性并且是最常用的(Kabat等人,见上文)。而Chothia是指结构环的位置(Chothia和Lesk J.Mol.Biol.196:901-917(1987))。AbM HVR表示Kabat CDR与Chothia结构环之间的折衷,并且被Oxford Molecular的AbM抗体建模软件使用。“接触”HVR基于对可用复杂晶体结构的分析。这些HVR各自的残基如下所示。
[0122]
[0123] HVR可以包括如下的“延伸的HVR”:VL中的24-36或24-34(L1)、46-56或50-56(L2),及89-97或89-96(L3);及VH中的26-35(H1)、50-65或49-65(优选实施方案)(H2),及93-102、94-102或95-102(H3)。关于这些延伸的HVR定义中的每一种,可变结构域残基都是根据Kabat等人(见上文)编号。
[0124] “框架”或“FR”残基是除如本文中所定义的HVR残基以外的那些可变结构域残基。
[0125] 短语“根据Kabat的可变结构域残基编号”或“根据Kabat的氨基酸位置编号”及其变化形式是指Kabat等人(见上文)中用于编辑抗体的重链可变结构域或轻链可变结构域的编号系统。使用这一编号系统,实际的线性氨基酸序列可以含有对应于可变结构域FR或HVR的缩短或插入的较少或额外氨基酸。举例来说,重链可变结构域可以包括在H2的残基52之后的单一氨基酸插入(根据Kabat的残基52a)及在重链FR残基82之后的插入残基(例如根据Kabat的残基82a、82b及82c等)。可以通过将抗体序列同源区与“标准”Kabat编号序列比对来确定给定抗体中残基的Kabat编号。
[0126] 当提到可变结构域中的残基时,一般使用Kabat编号系统(近似地,轻链的残基1-107及重链的残基1-113)(例如Kabat等人,Sequences of Immunological Interest.第5版,Public Health Service,National Institutes of Health,Bethesda,Md.(1991))。当提到免疫球蛋白重链恒定区中的残基时,一般使用“EU或Kabat编号系统”或“EU索引”(例如Kabat等人,见上文中报导的EU索引)。“根据Kabat的EU索引”是指人IgG1EU抗体的残基编号。提到的抗体可变结构域中的残基编号意思指根据Kabat编号系统进行的残基编号。提到的抗体恒定结构域中的残基编号意思指根据EU或Kabat编号系统进行的残基编号(例如参见美国专利公布号2010-280227)。
[0127] 如本文所使用,“接受者人框架”是包含来源于人免疫球蛋白框架或人共有框架的VL或VH框架的氨基酸序列的框架。“来源于”人免疫球蛋白框架或人共有框架的接受者人框架可以包含其相同氨基酸序列,或其可以含有预先存在的氨基酸序列变化。在一些实施方案中,预先存在的氨基酸变化的数量是10个或更少、9个或更少、8个或更少、7个或更少、6个或更少、5个或更少、4个或更少、3个或更少、或2个或更少。当在VH中存在预先存在的氨基酸变化时,优选这些变化仅在位置71H、73H及78H中的三个、两个或一个处发生;例如,在这些位置处的氨基酸残基可以是71A、73T和/或78A。在一些实施方案中,VL接受者人框架的序列与VL人免疫球蛋白框架序列或人共有框架序列一致。
[0128] “人共有框架”是表示所选人免疫球蛋白VL或VH框架序列中最常出现的氨基酸残基的框架。一般而言,人免疫球蛋白VL或VH序列选自可变结构域序列亚群。一般而言,这些序列亚群是如Kabat等人,Sequences of Proteins of Immunological Interest,第5版,Public Health Service,National Institutes of Health,Bethesda,MD(1991)中的亚群。实例包括对于VL,该亚群可以是根据Kabat等人(见上文)的亚群κI、κII、κIII或κIV。另外,对于VH,该亚群可以是根据Kabat等人(见上文)的亚群I、亚区II或亚群III。
[0129] 在例如本公开的抗TREM2抗体的指定位置处的“氨基酸修饰”是指指定残基的取代或缺失,或邻近指定残基的至少一个氨基酸残基的插入。“邻近”指定残基的插入意思指在其一个至两个残基范围内插入。该插入可以在指定残基的N末端或C末端。本文中优选的氨基酸修饰是取代。
[0130] “亲和力成熟的”抗体,如本公开的亲和力成熟的抗TREM2抗体,是在其一个或多个HVR中具有一个或多个改变使得该抗体对抗原的亲和力较之不具有这些改变的亲本抗体有所改善的抗体。在一个实施方案中,亲和力成熟的抗体对靶抗原具有纳摩尔浓度或甚至皮摩尔浓度的亲和力。亲和力成熟的抗体通过本领域中已知的程序产生。举例来说,Marks等人,Bio/Technology 10:779-783(1992)描述了通过VH和VL结构域改组进行的亲和力成熟。HVR和/或框架残基的随机诱变描述于例如:Barbas等人,Proc Nat.Acad.Sci.USA 91:
3809-3813(1994);Schier等人,Gene 169:147-155(1995);Yelton等人,J.Immunol.155:
1994-2004(1995);Jackson等人,J.Immunol.154(7):3310-9(1995);及Hawkins等人,
J.Mol.Biol.226:889-896(1992)。
[0131] 如本文所使用,术语“特异性识别”或“特异性结合”是指在包括生物分子的异质分子群存在下确定靶存在的靶与抗体,如抗TREM2抗体与TREM2之间,可测量并且可再现的相互作用,如吸引或结合。举例来说,特异性或优先结合到靶或表位的抗体,如本公开的抗TREM2抗体是较之其结合到其它靶或该靶的其它表位,以较高亲和力、亲合力,更容易和/或以较长的持续时间结合此靶或表位的抗体。通过阅读此定义,还应理解,例如,特异性或优先结合到第一靶的抗体(或部分)可以或可以不特异性或优先结合到第二靶。因此,“特异性结合”或“优先结合”未必需要(但其可以包括)排外性结合。特异性结合到靶的抗体可以具有至少约103M-1或104M-1,有时约105M-1或106M-1,在其它情况下约106M-1或107M-1、约108M-1至109M-1,或约1010M-1至1011M-1或更高的缔合常数。可以使用多种免疫测定方式来选择与特定蛋白质特异性免疫反应的抗体。举例来说,固相ELISA免疫测定常用于选择与蛋白质特异性免疫反应的单克隆抗体。有关可以用于测定特异性免疫反应性的免疫测定形式和条件的说明,参见例如,Harlow和Lane(1988)Antibodies,A Laboratory Manual,Cold Spring Harbor Publications,New York。
[0132] 如本文所使用,TREM2蛋白或DAP12蛋白与第二蛋白质之间的“相互作用”涵盖但不限于,蛋白质-蛋白质相互作用、物理相互作用、化学相互作用、结合、共价结合及离子结合。如本文所使用,当抗体破坏、减少或完全消除两种蛋白质之间的相互作用时,抗体“抑制两种蛋白质之间的相互作用”。当本公开的抗体或其片段结合到两种蛋白质之一时,该抗体或其片段“抑制两种蛋白质之间的相互作用”。
[0133] “激动剂”抗体或“活化”抗体是在抗体结合抗原之后,诱导(例如增加)抗原的一种或多种活性或功能的抗体,如本公开的激动剂抗TREM2抗体。
[0134] “拮抗剂”抗体或“阻断”抗体是在抗体结合抗原之后抑制或减少或消除(例如,降低)抗原结合到一种或多种配体,和/或在抗体结合抗原之后减少或消除(例如,降低)抗原的一种或多种活性或功能的抗体,诸如本公开的拮抗剂抗TREM2抗体。在一些实施方案中,拮抗剂抗体或阻断抗体基本上或完全抑制抗原结合到一种或多种配体和/或抗原的一种或多种活性或功能。
[0135] 抗体“效应功能”是指由抗体Fc区(天然序列Fc区或氨基酸序列变体Fc区)引起的生物活性,并且随抗体同种型而变化。
[0136] 术语“Fc区”在本文中用于定义免疫球蛋白重链的C末端区域,包括天然序列Fc区和变体Fc区。尽管免疫球蛋白重链的Fc区的边界可能不同,但人IgG重链Fc区通常被限定为从位置Cys226处的氨基酸残基,或从Pro230至其羧基末端的链段。例如在抗体产生或纯化期间,或通过工程改造编码抗体重链的核酸可以去除Fc区的C末端赖氨酸(根据EU或Kabat编号系统的残基447)。因此,完整抗体的组成可以包含去除所有K447残基的抗体群、未去除K447残基的抗体群,及具有含有和不含K447残基的抗体的混合物的抗体群。适用于本公开的抗体中的天然序列Fc区包括人IgG1、IgG2、IgG3及IgG4。
[0137] “天然序列Fc区”包含与自然界中所见Fc区的氨基酸序列一致的氨基酸序列。天然序列人Fc区包括天然序列人IgG1Fc区(非A和A同种异型);天然序列人IgG2Fc区;天然序列人IgG3Fc区;及天然序列人IgG4Fc区,以及其天然存在的变体。
[0138] “变体Fc区”包含由于至少一个氨基酸修饰,优选一个或多个氨基酸取代而不同于天然序列Fc区的氨基酸序列。优选地,相较于天然序列Fc区或亲本多肽的Fc区,变体Fc区在天然序列Fc区中或亲本多肽的Fc区中具有至少一个氨基酸取代,例如约一个至约十个氨基酸取代,并且优选约一个至约五个氨基酸取代。本文中的变体Fc区将优选与天然序列Fc区和/或与亲本多肽的Fc区具有至少约80%同源性,并且最优选与其具有至少约90%同源性,更优选与其具有至少约95%同源性。
[0139] “Fc受体”或“FcR”描述结合到抗体Fc区的受体。优选的FcR是天然序列人FcR。此外,优选FcR是结合IgG抗体的受体(γ受体)并且包括FcγRI、FcγRII及FcγRIII亚类的受体,包括这些受体的等位基因变体和替代性剪接形式,FcγRII受体包括FcγRIIA(“活化受体”)和FcγRIIB(“抑制性受体”),这些受体具有类似氨基酸序列,主要差异在于其细胞质结构域。活化受体FcγRIIA在其细胞质结构域中含有免疫受体酪氨酸活化基序(“ITAM”)。抑制性受体FcγRIIB在其细胞质结构域中含有免疫受体酪氨酸抑制基序(“ITIM”)。(参见例如,M. Annu.Rev.Immunol.15:203-234(1997))。FcR评述于Ravetch和Kinet,
Annu.Rev.Immunol.9:457-92(1991);Capel等人,Immunomethods 4:25-34(1994);及de Haas等人,J.Lab.Clin.Med.126:330-41(1995)。其它FcR,包括将来会鉴定的那些,都涵盖在本文的术语“FcR”中。FcR还可以增加抗体的血清半衰期。
[0140] 可以例如在表达人FcRn的转基因小鼠或转染的人细胞系中,或在施用了具有变体Fc区的多肽的灵长类动物中,对人FcRn高亲和力结合多肽在体内与FcRn的结合和血清半衰期进行测定。WO 2004/42072(Presta)描述了与FcR的结合改善或减少的抗体变体。另参见例如,Shields等人,J.Biol.Chem.9(2):6591-6604(2001)。
[0141] 如本文所使用,关于肽、多肽或抗体序列的“氨基酸序列同一性百分比(%)”及“同源性”是指在对准候选序列与特定肽或多肽序列并在必要时引入空位以达到最大序列同一性百分比之后,并且在不将任何保守型取代视为序列同一性的一部分的情况下,候选序列中与特定肽或多肽序列中的氨基酸残基相同的氨基酸残基的百分比。可以通过本领域技能范围内的多种方式,例如使用公开可用的计算机软件,如BLAST、BLAST-2、ALIGN或MEGALIGNTM(DNASTAR)软件,实现比对以达到测定氨基酸序列同一性百分比的目的。本领域技术人员可以确定适于测量比对的参数,包括本领域内已知在所比较的序列的全长内实现最大比对所需的任何算法
[0142] 编码抗体,如本公开的抗TREM2抗体的“分离的”核酸分子是这样一种核酸分子,该核酸分子是从在产生该核酸分子的环境中通常与其缔合的至少一种污染核酸分子鉴定并分离。优选地,分离的核酸与产生环境有关的所有组分无关。编码本文的多肽和抗体的分离的核酸分子是除在自然界发现的形式或环境外的形式。因此,分离的核酸分子有别于天然存在于细胞中的编码本文的多肽和抗体的核酸。
[0143] 如本文所使用,术语“载体”意图指这样一种核酸分子,该核酸分子能够转运其所连接的另一核酸。一类载体是“质粒”,其指其中可以连接额外DNA区段的环状双链DNA。另一类载体是噬菌体载体。另一类载体是病毒载体,其中可以将额外DNA区段连接至病毒基因组中。某些载体能够在引入这些载体的宿主细胞中自主复制(例如,具有细菌复制起点的细菌载体及游离型哺乳动物载体)。其它载体(例如,非游离型哺乳动物载体)可以在引入宿主细胞之后整合至宿主细胞的基因组中,并由此与宿主基因组一起复制。此外,某些载体能够引导与其可操作地连接的基因的表达。此类载体在本文中称为重组表达载体”,或简称为“表达载体”。一般而言,重组DNA技术中利用的表达载体通常是质粒形式。在本说明书中,由于质粒是最常用的载体形式,故“质粒”与“载体”可互换使用。
[0144] “多核苷酸”或“核酸”在本文中可互换使用,指的是任何长度的核苷酸的聚合物,并且包括DNA和RNA。核苷酸可以是脱氧核糖核苷酸、核糖核苷酸、修饰的核苷酸或碱基,和/或其类似物,或者是可以通过DNA或RNA聚合酶,或通过合成反应并入聚合物中的任何底物。多核苷酸可以包含修饰的核苷酸,如甲基化核苷酸及其类似物。如果存在,则对核苷酸结构的修饰可以在聚合物组装之前或之后进行。核苷酸序列可以间杂有非核苷酸组分。多核苷酸可以包含在合成之后进行的修饰,如与标记偶联。其它类型的修饰包括例如,“加帽”;一个或多个天然存在的核苷酸被类似物取代;核苷酸间修饰,如例如具有不带电荷的键联(例如甲基膦酸酯、磷酸三酯、氨基磷酸酯、氨基甲酸酯等)的修饰和具有带电荷的键联(例如硫代磷酸酯、二硫代磷酸酯等)的修饰;含有侧接部分,如例如蛋白质(例如核酸酶、毒素、抗体、信号肽、聚L-赖氨酸等)等的修饰;具有插入剂(例如吖啶、补骨脂素等)的修饰;含有螯合剂(例如金属、放射性金属、、氧化性金属等)的修饰;含有烷化剂的修饰;具有修饰的键联(例如α异头核酸等)的修饰;以及多核苷酸的未修饰形式。另外,最初存在于糖中的任何羟基都可以例如被膦酸酯基、磷酸酯基置换;被标准保护基保护;或经过活化以与另外的核苷酸形成另外的键联;或者可以偶联至固体或半固体支撑物。5'和3'末端OH可以被磷酸化或者被胺或具有1至20个原子的有机封端基团部分取代。其它羟基也可以被衍生物成标准保护基。多核苷酸也可以含有本领域中一般已知的核糖或脱氧核糖的类似物形式,包括例如,2'-O-甲基-、2'-O-烯丙基、2'-氟-或2'-叠氮基-核糖、碳环糖类似物、α-异头糖、差向异构糖(如阿拉伯糖、木糖或来苏糖)、吡喃糖、呋喃糖、景天庚酮糖、无环类似物,及碱基核苷类似物,如甲基核糖苷。一个或多个磷酸二酯键可以被替代性连接基团置换。这些替代性连接基团包括但不限于,其中磷酸酯被P(O)S(“硫代磷酸酯”)、P(S)S(“二硫代磷酸酯”)、(O)NR2(“氨基磷酸酯”)、P(O)R、P(O)OR'、CO或CH2(“甲缩”)置换的实施方案,其中每个R或R'独立地是H或者任选含有醚(-O-)键联、芳基、烯基、环烷基、环烯基或芳烷基的被取代或未被取代的烷基(1-20个C)。多核苷酸中未必所有键联都是相同的。前述说明适用于本文提到的所有多核苷酸,包括RNA和DNA。
[0145] “宿主细胞”包括可以作为或已经作为载体的受体以并入多核苷酸插入物的个别细胞或细胞培养物。宿主细胞包括单个宿主细胞的子代,并且该子代可能由于天然突变、意外突变或有意突变而与原始亲本细胞未必完全相同(在形态或基因组DNA互补序列方面)。宿主细胞包括在体内经本发明的多核苷酸转染的细胞。
[0146] 如本文所使用,“载剂”包括在所用剂量和浓度下对暴露于其的细胞或哺乳动物无毒的药学上可接受的载剂、赋形剂或稳定剂。通常,生理学上可接受的载剂是pH缓冲水溶液。生理学上可接受的载剂的实例包括缓冲剂,如磷酸盐柠檬酸盐及其它有机酸;抗氧化剂,包括抗坏血酸;低分子量(小于约10个残基)多肽;蛋白质,如血清白蛋白、明胶或免疫球蛋白;亲水性聚合物,如聚乙烯吡咯烷酮;氨基酸,如甘氨酸、谷氨酰胺、天冬酰胺、精氨酸或赖氨酸;单糖、二糖及其它碳水化合物,包括葡萄糖、甘露糖或糊精;螯合剂,如EDTA;糖醇,如甘露糖醇或山梨糖醇;成盐平衡离子,如钠;和/或非离子表面活性剂,如TWEENTM、聚乙二醇(PEG)及PLURONICSTM。
[0147] 如本文所使用,术语“约”是指此技术领域技术人员易于了解的个别值的常见误差范围。提到“约”一个值或参数在本文中包括(并描述)针对该值或参数本身的实施方案。
[0148] 除非上下文另作清楚地指示,否则如本文和所附权利要求书中所使用,单数形式“一个(种)”及“该”包括复数个(种)参照物。举例来说,提到一种“抗体”是提到一种至多种抗体,如摩尔量,并且包括本领域技术人员已知的其等效物等等。
[0149] 应了解,本文所描述的本公开的各方面和实施方案包括“包含”这些方面和实施方案,“由这些方面和实施方案组成”和/或“基本上由这些方面和实施方案组成”。
[0150] 综述
[0151] 本公开涉及具有一种或多种激动剂或拮抗剂活性的抗TREM2抗体(例如,单克隆抗体);制备及使用此类抗体的方法;含有此类抗体的药物组合物;编码此类抗体的核酸;及含有编码此类抗体的核酸的宿主细胞。
[0152] 在一些实施方案中,本公开的抗TREM2抗体的激动性活性至少部分地由于所述抗体增强由一种或多种TREM2配体与TREM2蛋白的结合诱导的一种或多种TREM2活性而不与一种或多种TREM2配体竞争结合到TREM2蛋白或不以其他方式阻断一种或多种TREM2配体与TREM2蛋白的结合的能力而产生。在一些实施方案中,将通过抗TREM2抗体实现的一种或多种TREM2活性的增强与在抗TREM2抗体不存在下由一种或多种TREM2配体与TREM2蛋白的结合诱导的一种或多种TREM2活性进行比较。在一些实施方案中,一种或多种TREM2活性的增强可通过本文所公开的若干种技术中的任一种在体外或在体内确定或测试(参见,例如,实施例3-13和实施例24)。
[0153] 因此,本公开的某些方面至少部分地基于抗TREM2抗体的鉴别,所述抗TREM2抗体能够以高亲和力结合到人和小鼠TREM2两者(参见,例如,实施例1);可活化并增强(例如,通过与TREM2配体协同作用)TREM2活性(参见,例如,实施例3-13和实施例24)。有利地,本公开的激动剂抗TREM2抗体显示在治疗阿尔茨海默氏病的若干小鼠模型中的阿尔茨海默氏病和阿尔茨海默氏病的症状方面是治疗有效的(参见,例如,实施例16)。
[0154] 本公开的其它方面至少部分基于以下意外的发现,当本公开的抗TREM2抗体产生或以其它方式被格式化而使得其不能诱导或保持TREM2受体簇集时,该抗体还可以诱导拮抗性活性。在一些实施方案中,本公开的抗TREM2抗体展现一种或多种拮抗性TREM2活性,包括但不限于抑制TREM2依赖性基因活化(参见例如,实施例7和8)。
[0155] TREM2蛋白
[0156] 在一方面,本公开提供结合到本公开的TREM2蛋白并且在结合到细胞中表达的TREM2蛋白之后诱导一种或多种TREM2活性和/或增强一种或多种TREM2活性的抗体。
[0157] 本公开的TREM2蛋白包括但不限于人TREM2蛋白(Uniprot登记号Q9NZC2;SEQ ID NO:1)、和非人哺乳动物TREM2蛋白,诸如小鼠TREM2蛋白(Uniprot登记号Q99NH8;SEQ ID NO:2)、大鼠TREM2蛋白(Uniprot登记号D3ZZ89;SEQ ID NO:3)、恒河猴TREM2蛋白(Uniprot登记号F6QVF2;SEQ ID NO:4)、TREM2蛋白(Uniprot登记号Q05B59;SEQ ID NO:5)、马TREM2蛋白(Uniprot登记号F7D6L0;SEQ ID NO:6)、猪TREM2蛋白(Uniprot登记号H2EZZ3;SEQ ID NO:7)、以及狗TREM2蛋白(Uniprot登记号E2RP46;SEQ ID NO:8)。如本文所用的“TREM2蛋白”是指野生型序列和天然存在的变体序列两者。
[0158] 在髓细胞上表达的触发受体-2(TREM2)不同地称为TREM-2、TREM2a、TREM2b、TREM2c,在髓细胞上表达的触发受体-2a及在单核细胞上表达的触发受体-2。TREM2是具有
230个氨基酸的膜蛋白。TREM2是主要在髓系细胞,包括但不限于,巨噬细胞、树突细胞、单核细胞、皮肤朗格汉斯细胞、库普弗细胞、破骨细胞及小神经胶质细胞上表达的免疫球蛋白样受体。在一些实施方案中,TREM2与DAP12形成受体信号传导复合物。在一些实施方案中,TREM2通过DAP12(ITAM结构域衔接蛋白)进行磷酸化和信号传导。在一些实施方案中,TREM2信号传导引起PI3K或其它细胞内信号的下游活化。在髓细胞上,Toll样受体(TLR)信号对于活化TREM2活性很重要,例如在感染反应的情况下。TLR还在致病性炎症性反应中起到关键作用,例如在巨噬细胞和树突细胞中表达的TLR。
[0159] 在一些实施方案中,人TREM2氨基酸序列的实例在下文示出为SEQ ID NO:1:
[0160]
[0161] 在一些实施方案中,人TREM2是包含信号肽的前体蛋白。在一些实施方案中,人TREM2是成熟蛋白质。在一些实施方案中,成熟TREM2蛋白不包含信号肽。在一些实施方案中,成熟TREM2蛋白质在细胞上表达。在一些实施方案中,TREM2含有位于人TREM2(SEQ ID NO:1)的氨基酸残基1-18处的信号肽;位于人TREM2(SEQ ID NO:1)的氨基酸残基29-112处的细胞外免疫球蛋白样可变型(IgV)结构域;位于人TREM2(SEQ ID NO:1)的氨基酸残基113-174处的额外细胞外序列;位于人TREM2(SEQ ID NO:1)的氨基酸残基175-195处的跨膜结构域;及位于人TREM2(SEQ ID NO:1)的氨基酸残基196-230处的细胞内结构域。
[0162] 人TREM2的跨膜结构域在氨基酸残基186处含有可以与DAP12中的天冬氨酸相互作用的赖氨酸,DAP12是转导来自TREM2、TREM1及其它相关IgV家族成员的信号传导的关键衔接蛋白。
[0163] 人TREM2的同源物包括但不限于,自然杀伤(NK)细胞受体NK-p44(NCTR2)、聚合免疫球蛋白受体(pIgR)、CD300E、CD300A、CD300C及TREML1/TLT1。在一些实施方案中,NCTR2与TREM2在IgV结构域内具有相似性。
[0164] DAP12蛋白
[0165] 在一方面,本公开提供也可结合至本公开的DAP12蛋白并在结合至细胞中表达的DAP12蛋白之后调节一种或多种DAP12活性的抗体。
[0166] 本公开的DAP12蛋白包括但不限于,哺乳动物(例如,非人哺乳动物)DAP12蛋白、人DAP12蛋白(Uniprot登记号O43914)、小鼠DAP12蛋白(Uniprot登记号O54885)、大鼠DAP12蛋白(Uniprot登记号Q6X9T7)、恒河猴DAP12蛋白(Uniprot登记号Q8WNQ8)、牛DAP12蛋白(Uniprot登记号Q95J80)及猪DAP12蛋白(Uniprot登记号Q9TU45)。如本文所使用,“DAP12蛋白”同时指野生型序列和天然存在的变体序列。
[0167] DNAX活化蛋白12(DAP12)不同地称为杀伤细胞活化受体相关蛋白、KAR相关蛋白(KARAP)、PLOSL、PLO-SL、TYRO蛋白及酪氨酸激酶结合蛋白。DAP12是具有113个氨基酸的膜蛋白。在一些实施方案中,DAP12用作跨膜信号传导多肽,其在其细胞质结构域中含有免疫受体酪氨酸活化基序(ITAM)。其可能与膜糖蛋白的杀伤细胞抑制受体(KIR)家族相关并且可以充当活化信号转导元件。在其它实施方案中,DAP12蛋白可以结合ζ链(TCR)相关蛋白激酶70kDa(ZAP-70)及脾酪氨酸激酶(SYK),并且在信号转导、骨塑建、脑髓鞘形成及炎症中起到作用。
[0168] DAP12编码基因内的突变与多囊性脂膜样骨发育不良伴硬化性脑白质病(PLOSL,又称Nasu-Hakola病)相关。不希望受理论束缚,据信DAP12受体是TREM2,也引起PLOSL。已经鉴别出编码DAP12不同的亚型的多种替代性转录变体。DAP12与CD300家族的活化受体非共价缔合。CD300-TYROBP/DAP12复合物的交联引起细胞活化,如由整合素介导的中性粒细胞活化。DAP12是一种同二聚体;二硫键连接的蛋白质。在一些实施方案中,DAP12根据相似性并经由ITAM结构域,以及在SYK情况下经由SH2结构域与SIRPB1、TREM1、CLECSF5、SIGLEC14、CD300LB、CD300E及CD300D相互作用。在其它实施方案中,DAP12活化SYK,其介导中性粒细胞和巨噬细胞整合素介导的活化。在其它实施方案中,DAP12与KLRC2和KIR2DS3相互作用。
[0169] 在一些实施方案中,人DAP12氨基酸序列的实例在下文示出为SEQ ID NO:887:
[0170]
[0171] 在一些实施方案中,人DAP12是包含信号肽的前体蛋白。在一些实施方案中,人DAP12是成熟蛋白质。在一些实施方案中,成熟DAP12蛋白不包含信号肽。在一些实施方案中,成熟DAP12蛋白质在细胞上表达。DAP12是I型单次跨膜蛋白。其含有位于人DAP12(SEQ ID NO:887)的氨基酸残基22-40处的细胞外结构域;位于人DAP12(SEQ ID NO:887)的氨基酸残基41-61处的跨膜结构域;及位于人DAP12(SEQ ID NO:887)的氨基酸残基62-113处的细胞内结构域。免疫受体酪氨酸活化基序(ITAM)结构域位于人DAP12(SEQ ID NO:887)的氨基酸残基80-118处。
[0172] 在一些实施方案中,DAP12中的天冬氨酸残基与在氨基酸残基186处含有赖氨酸的人TREM2的跨膜结构域相互作用,并转导来自TREM2、TREM1及其它相关IgV家族成员蛋白的信号传导。
[0173] 抗TREM2抗体
[0174] 本公开某些方面涉及特异性结合至TREM2的抗体(例如,单克隆抗体)。在一些实施方案中,本公开的抗体结合成熟TREM2蛋白。在一些实施方案中,本公开的抗体结合成熟TREM2蛋白,其中该成熟TREM2蛋白在细胞上表达。在一些实施方案中,本公开的抗体结合在选自以下的一种或多种人细胞上表达的TREM2蛋白:人树突细胞、人巨噬细胞、人单核细胞、人破骨细胞、人皮肤朗格汉斯细胞、人库普弗细胞、人小神经胶质细胞及其任何组合。在一些实施方案中,本公开的抗体是激动剂抗体。在一些实施方案中,本公开的抗体是惰性抗体。在一些实施方案中,本公开的抗体是拮抗剂抗体。
[0175] 在一些实施方案中,本公开的抗TREM2抗体结合到TREM2蛋白而不与一种或多种TREM2配体竞争结合到TREM2蛋白、不抑制、或不以其他方式阻断一种或多种TREM2配体结合到TREM2蛋白。合适的TREM2配体的实例包括但不限于由大肠杆菌细胞表达的TREM2配体、凋亡细胞、核酸、阴离子脂质、APOE、APOE2、APOE3、APOE4、阴离子APOE、阴离子APOE2、阴离子APOE3、阴离子APOE4、脂化APOE、脂化APOE2、脂化APOE3、脂化APOE4、两性离子脂质、带负电荷的磷脂、磷脂酰丝氨酸、硫脂、磷脂酰胆碱、鞘磷脂、膜磷脂、脂化蛋白、蛋白脂质、脂化肽、以及脂化淀粉样蛋白β肽。因此,在某些实施方案中,所述一种或多种TREM2配体包括大肠杆菌细胞、凋亡细胞、核酸、阴离子脂质、两性离子脂质、带负电荷的磷脂、磷脂酰丝氨酸(PS)、硫脂、磷脂酰胆碱、鞘磷脂(SM)、磷脂、脂化蛋白、蛋白脂质、脂化肽、以及脂化淀粉样蛋白β肽。
[0176] 在一些实施方案中,本公开的抗TREM2抗体不抑制一种或多种先天免疫细胞的生长。在一些实施方案中,本公开的抗TREM2抗体以小于50nM、小于45nM、小于40nM、小于35nM、小于30nM、小于25nM、小于20nM、小于15nM、小于10nM、小于9nM、小于8nM、小于7nM、小于6nM、小于5nM、小于4nM、小于3nM、小于2nM、或小于1nM的KD结合到一种或多种原代免疫细胞。在一些实施方案中,本公开的抗TREM2抗体在大脑、或脑脊髓液(CSF)、或两者中积累至在血液中1%或更多、2%或更多、3%或更多、4%或更多、5%或更多、6%或更多、7%或更多、8%或更多、9%或更多、10%或更多的抗体浓度的程度。在一些实施方案中,解离常数(KD)在大约4℃的温度下确定。在一些实施方案中,KD使用单价抗体(例如,Fab)或呈单价形式的全长抗体来确定。用于制备并选择与TREM2相互作用和/或特异性地结合到TREM2的抗体的方法在本文中进行了描述。(例如,参见实施例1)。
[0177] 激动剂抗TREM2抗体
[0178] 本公开的抗TREM2抗体通常结合到在细胞上表达的一种或多种TREM2蛋白。一类抗体是激动剂抗体。例如,认为TREM2受体需要在细胞表面上簇集以便转导信号。因此,激动剂抗体可具有刺激例如TREM2受体的独特特征。例如,它们可具有与受体活化相容的正确表位特异性以及诱导或保持受体在细胞表面上簇集的能力。此外,本公开的激动剂抗TREM2抗体可显示出结合TREM2而不阻断一种或多种TREM2配体的同时结合的能力。本公开的抗TREM2抗体还可显示出与一种或多种TREM2配体的相加和/或协同的功能性相互作用。因此,在一些实施方案中,当结合到与本公开的一种或多种TREM2配体组合的本公开的抗TREM2抗体时的TREM2的最大活性可大于(例如,增强)当单独暴露于饱和浓度的配体或单独暴露于饱和浓度的抗体时的TREM2的最大活性。此外,在抗体存在下,在给定浓度的TREM2配体下的TREM2的活性可较大(例如,增强)。因此,在一些实施方案中,本公开的抗TREM2抗体具有与一种或多种TREM2配体的相加作用以增强当结合到TREM2蛋白时的一种或多种TREM2活性。在一些实施方案中,本公开的抗TREM2抗体与一种或多种TREM2配体协同作用以增强一种或多种TREM2活性。在一些实施方案中,与在本公开的抗TREM2抗体不存在下一种或多种TREM2配体诱导一种或多种TREM2活性的效能相比,所述抗体增加一种或多种TREM2配体诱导一种或多种TREM2活性的效能。在一些实施方案中,本公开的抗TREM2抗体在TREM2的细胞表面簇集不存在下增强一种或多种TREM2活性。在一些实施方案中,本公开的抗TREM2抗体通过诱导或保持TREM2的细胞表面簇集来增强一种或多种TREM2活性。在一些实施方案中,本公开的抗TREM2抗体通过在一种或多种免疫细胞(包括但不限于B细胞和小神经胶质细胞)上表达的一种或多种Fc-γ受体簇集。在一些实施方案中,通过一种或多种TREM2配体与TREM2蛋白的结合诱导的一种或多种TREM2活性的增强在原代细胞上测量,所述原代细胞包括但不限于树突细胞、骨髓衍生的树突细胞、单核细胞、小神经胶质细胞、巨噬细胞、嗜中性粒细胞、NK细胞、破骨细胞、皮肤朗格汉斯细胞、以及库普弗细胞,或在细胞系上测量,并且由一种或多种TREM2配体与TREM2蛋白的结合诱导的一种或多种TREM2活性的增强例如利用体外细胞测定来测量。
[0179] 在体内,本公开的抗TREM2抗体可通过多种潜在机制活化受体。在一些实施方案中,本公开的激动性抗TREM2抗体由于正确表位特异性具有活化呈溶液形式的TREM2而不必与二抗簇集、在板上结合、或通过Fcg受体簇集的能力。在一些实施方案中,本公开的抗TREM2抗体具有人抗体的同种型,诸如IgG2,所述同种型由于其独特的结构具有使受体簇集、或使受体保持在簇集构型中、从而活化受体(诸如TREM2)而不结合到Fc受体的固有能力(例如,White等人,(2015)Cancer Cell 27,138–148)。
[0180] 在一些实施方案中,本公开的抗TREM2抗体可通过结合到相邻细胞上的Fcg受体而使受体(例如,TREM2)簇集。抗体的恒定IgG Fc部分与Fcg受体的结合导致抗体的聚集,并且抗体进而使所述抗体通过其可变区所结合到的受体聚集(Chu等人(2008)Mol Immunol,45:3926-3933;以及Wilson等人,(2011)Cancer Cell 19,101–113)。与不引发细胞因子分泌、氧化爆发、吞噬作用增加、以及抗体依赖性细胞介导的细胞毒性(ADCC)增强的抑制性Fcg受体FcgR(FcgRIIB)的结合经常是使抗体在体内簇集的优选方式,因为与FcgRIIB的结合不与免疫不良作用相关联。本文所述的任何合适的测定(例如,参见,
[0181] 实施例4)可用于确定抗体簇集。
[0182] 其他机制也可用于使受体(例如,TREM2)簇集。例如,在一些实施方案中,交联在一起的抗体片段(例如,Fab片段)可用于以与如上所述的具有结合Fcg受体的Fc区的抗体相似的方式使受体(例如,TREM2)簇集。在一些实施方案中,如果交联的抗体片段(例如,Fab片段)诱导细胞表面上的受体簇集并且结合靶标(例如,TREM2)上的适当表位,则所述交联的抗体片段可充当激动剂抗体。
[0183] 在一些实施方案中,本公开的结合TREM2蛋白的抗体可包括由于其表位特异性而结合TREM2并且活化一种或多种TREM2活性的激动剂抗体。在一些实施方案中,此类抗体可结合到TREM2上的配体结合位点并且模拟一种或多种TREM2配体的作用、或通过结合到不是配体结合位点的一个或多个结构域来刺激靶标抗原转导信号。在一些实施方案中,所述抗体不与配体结合竞争结合到TREM2或不以其他方式阻断配体结合到TREM2。在一些实施方案中,所述抗体与一种或多种TREM2配体相加地或协同地作用来活化和/或增强一种多种TREM2活性。
[0184] 在一些实施方案中,可由本公开的抗TREM2抗体和/或本公开的一种或多种TREM2配体诱导和/或增强的TREM2活性包括但不限于TREM2结合到DAP12;TREM2磷酸化;DAP12磷酸化;活化一种或多种酪氨酸激酶,任选地其中所述一种或多种酪氨酸激酶包括Syk激酶、ZAP70激酶、或两者;活化磷脂酰肌醇3-激酶(PI3K);活化蛋白激酶B(Akt);将磷脂酶C-γ(PLC-γ)募集到细胞质膜、活化PLC-γ、或两者;将TEC家族激酶dVav募集到细胞质膜;活化核因子-rB(NF-rB);抑制MAPK信号传导;用于T细胞活化的接头(LAT)、用于B细胞活化的接头(LAB)、或两者的磷酸化;活化IL-2诱导的酪氨酸激酶(Itk);调控选自以下的一种或多种促炎介质:IFN-β、IL-1α、IL-1β、TNF-α、YM-1、IL-6、IL-8、CRP、CD86、MCP-1/CCL2、CCL3、CCL4、CCL5、CCR2、CXCL-10、Gata3、Rorc、IL-20家族成员、IL-33、LIF、IFN-γ、OSM、CNTF、GM-CSF、CSF-1、MHC-II、OPN、CD11c、GM-CSF、IL-11、IL-12、IL-17、IL-18、以及IL-23,任选地其中所述调控发生在选自以下的一种或多种细胞中:巨噬细胞、M1巨噬细胞、活化的M1巨噬细胞、M2巨噬细胞、树突细胞、单核细胞、破骨细胞、皮肤朗格汉斯细胞、库普弗细胞、以及小神经胶质细胞;调控选自以下的一种或多种抗炎介质:IL-4、IL-10TGF-β、IL-13、IL-35IL-16、IFN-α、IL-1Ra、VEGF、G-CSF、YM、AXL、FLT1、以及TNF或IL-6的可溶性受体,任选地其中所述调控发生在选自以下的一种或多种细胞中:巨噬细胞、M1巨噬细胞、活化的M1巨噬细胞、M2巨噬细胞、树突细胞、单核细胞、破骨细胞、皮肤朗格汉斯细胞、库普弗细胞、以及小神经胶质细胞;调控其表达在炎症诱导之后增加的一种或多种基因,任选地其中所述一种或多种基因选自Fabp3、Fabp5、和LDR;细胞外信号调节激酶(ERK)的磷酸化;调控其表达在炎症诱导之后增加的一种或多种基因,任选地其中所述一种或多种基因选自Fabp3、Fabp5、和LDR组成的组;调控选自以下的一种或多种细胞中的C-C趋化因子受体7(CCR7)的表达:巨噬细胞、M1巨噬细胞、活化的M1巨噬细胞、M2巨噬细胞、树突细胞、单核细胞、破骨细胞、皮肤朗格汉斯细胞、库普弗细胞、小神经胶质细胞、M1小神经胶质细胞、活化的M1小神经胶质细胞、和M2小神经胶质细胞、以及其任何组合;诱导小神经胶质细胞向CCL19和CCL21表达细胞的趋化性;破坏的TREM2/DAP12依赖性基因表达的正常化;将Syk、ZAP70、或两者募集到DAP12/TREM2复合物;增加一种或多种TREM2依赖性基因的活性,任选地其中所述一种或多种TREM2依赖性基因包括活化T细胞的核因子(NFAT)转录因子;增加树突细胞、单核细胞、小神经胶质细胞、M1小神经胶质细胞、活化的M1小神经胶质细胞、和M2小神经胶质细胞、巨噬细胞、M1巨噬细胞、活化的M1巨噬细胞、M2巨噬细胞、或其任何组合的成熟;增加树突细胞、单核细胞、小神经胶质细胞、M1小神经胶质细胞、活化的M1小神经胶质细胞、和M2小神经胶质细胞、巨噬细胞、M1巨噬细胞、活化的M1巨噬细胞、M2巨噬细胞、或其任何组合引发或调控T细胞的功能的能力,任选地其中所述T细胞是选自CD8+T细胞、CD4+T细胞、调节性T细胞、以及其任何组合的一种或多种细胞;骨髓衍生的树突细胞引发或调控抗原特异性T细胞的功能的增强的能力、正常化的能力、或两者,任选地其中所述抗原特异性T细胞是选自CD8+T细胞、CD4+T细胞、调节性T细胞、以及其任何组合的一种或多种细胞;诱导破骨细胞产生、增加破骨细胞生成的速率、或两者;增加树突细胞、巨噬细胞、M1巨噬细胞、活化的M1巨噬细胞、M2巨噬细胞、单核细胞、破骨细胞、皮肤朗格汉斯细胞、库普弗细胞、小神经胶质细胞、M1小神经胶质细胞、活化的M1小神经胶质细胞、和M2小神经胶质细胞、或其任何组合的存活;增加树突细胞、巨噬细胞、M1巨噬细胞、活化的M1巨噬细胞、M2巨噬细胞、小神经胶质细胞、M1小神经胶质细胞、活化的M1小神经胶质细胞、和M2小神经胶质细胞、或其任何组合的功能;增加由树突细胞、巨噬细胞、M1巨噬细胞、活化的M1巨噬细胞、M2巨噬细胞、单核细胞、小神经胶质细胞、M1小神经胶质细胞、活化的M1小神经胶质细胞、和M2小神经胶质细胞、或其任何组合进行的吞噬作用;诱导选自以下的一种或多种类型的清除:凋亡神经元清除、神经组织碎片清除、非神经组织碎片清除、细菌或其他异物清除、致病性物质清除、肿瘤细胞清除、或其任何组合,任选地其中所述致病性物质选自淀粉样蛋白β或其片段、Tau、IAPP、α-突触核蛋白、TDP-43、FUS蛋白、朊病毒蛋白、PrPSc、亨廷顿蛋白、降血钙素、超氧化物歧化酶、共济失调蛋白、路易小体、心房利钠因子、胰岛淀粉样蛋白多肽、胰岛素、载脂蛋白AI、血清淀粉样蛋白A、medin、泌乳素、转甲状腺素蛋白、溶菌酶、β2微球蛋白、凝溶胶蛋白、角膜上皮蛋白、抑半胱氨酸蛋白酶蛋白、免疫球蛋白轻链AL、S-IBM蛋白、和重复序列相关非ATG(RAN)翻译产物(包括由甘氨酸-丙氨酸(GA)、甘氨酸-脯氨酸(GP)、甘氨酸-精氨酸(GR)、脯氨酸-丙氨酸(PA)、或脯氨酸-精氨酸(PR)构成的二肽重复序列(DPR肽)、反义GGCCCC(G2C4)重复序列扩增RNA);诱导对以下中的一种或多种的吞噬作用:凋亡神经元、神经组织碎片、非神经组织碎片、细菌、其他异物、致病性物质、肿瘤细胞、或其任何组合,任选地其中所述致病性物质选自淀粉样蛋白β或其片段、Tau、IAPP、α-突触核蛋白、TDP-43、FUS蛋白、朊病毒蛋白、PrPSc、亨廷顿蛋白、降血钙素、超氧化物歧化酶、共济失调蛋白、路易小体、心房利钠因子、胰岛淀粉样蛋白多肽、胰岛素、载脂蛋白AI、血清淀粉样蛋白A、medin、泌乳素、转甲状腺素蛋白、溶菌酶、β2微球蛋白、凝溶胶蛋白、角膜上皮蛋白、抑半胱氨酸蛋白酶蛋白、免疫球蛋白轻链AL、S-IBM蛋白、和重复序列相关非ATG(RAN)翻译产物(包括由甘氨酸-丙氨酸(GA)、甘氨酸-脯氨酸(GP)、甘氨酸-精氨酸(GR)、脯氨酸-丙氨酸(PA)、或脯氨酸-精氨酸(PR)构成的二肽重复序列(DPR肽)、反义GGCCCC(G2C4)重复序列扩增RNA);调控选自CD83、CD86、II类MHC、CD40、以及其任何组合的一种或多种刺激性分子的表达,任选地其中所述CD40在树突细胞、单核细胞、巨噬细胞、或其任何组合上表达,并且任选地其中所述树突细胞包括骨髓衍生的树突细胞;调控一种或多种促炎介质的分泌,任选地其中所述一种或多种促炎介质选自IFN-β、IL-1α、IL-1β、CD86、TNF-α、IL-6、IL-8、CRP、MCP-1/CCL2、CCL3、CCL4、CCL5、CCR2、CXCL-10、Gata3、IL-20家族成员、IL-33、LIF、IFN-γ、OSM、CNTF、CSF-1、OPN、CD11c、GM-CSF、IL-11、IL-12、IL-17、IL-18、和IL-23、以及其任何组合;调控选自由以下组成的组的一种或多种抗炎介质的分泌:IL-4、IL-10TGF-β、IL-13、IL-35IL-16、IFN-α、IL-1Ra、VEGF、G-CSF、YM、AXL、FLT1、和TNF或IL-6的可溶性受体、以及其任何组合;调控选自以下的一种或多种蛋白质的表达:C1qa、C1qB、C1qC、C1s、C1R、C4、C2、C3、ITGB2、HMOX1、LAT2.CASP1、CSTA、VSIG4、MS4A4A、C3AR1、GPX1、TyroBP、ALOX5AP、ITGAM、SLC7A7、CD4、ITGAX、PYCARD、以及VEGF;增加记忆力;以及减少认知缺陷。在一些实施方案中,本公开的抗TREM2抗体当施用到个体时增加记忆力和/或减少认知缺陷。
[0185] 如本文所用,与在本公开的抗TREM2抗体不存在下由一种或多种TREM2配体与TREM2蛋白的结合诱导的一种或多种TREM2活性的水平相比,如果所述抗体诱导一种或多种TREM2活性的至少2倍、至少3倍、至少4倍、至少5倍、至少6倍、至少7倍、至少8倍、至少9倍、至少10倍、至少11倍、至少12倍、至少13倍、至少14倍、至少15倍、至少16倍、至少17倍、至少18倍、至少19倍、至少20倍或更大增加,则所述抗体增强由一种或多种TREM2与TREM2蛋白的结合诱导的一种或多种TREM2活性。在一些实施方案中,一种多种TREM2活性的增加可通过本文所述的或本领域已知的任何合适的体外基于细胞的测定或合适的体内模型测量,例如通过利用基于荧光素酶的报告蛋白测定来测量TREM2依赖性基因表达、使用蛋白质印迹分析来测量下游信号传导配偶体(诸如Syk)的TREM2诱导的磷酸化的增加、或通过利用流式细胞术诸如荧光活化细胞分选法(FACS)来测量TREM2活化的标志物的细胞表面水平的变化。可使用本文所述的或本领域已知的任何体外基于细胞的测定或合适的体内模型来测量TREM2与一种或多种TREM2配体之间的相互作用(例如,结合)。
[0186] 在一些实施方案中,当TREM2配体在其EC50浓度下使用时,与在本公开的抗TREM2抗体不存在下由TREM2配体与TREM2蛋白的结合诱导的TREM2依赖性基因转录的水平相比,如果所述抗体在范围是约0.5nM至约50nM、或大于50nM的浓度下使用时诱导配体诱导的TREM2依赖性基因转录的约1倍至约6倍、或多于6倍增加,则所述抗体增强由TREM2配体与TREM2蛋白的结合诱导的一种或多种TREM2活性。在一些实施方案中,当TREM2配体在其EC50浓度下使用时,与在所述抗TREM2抗体不存在下由TREM2配体与TREM2蛋白的结合诱导的TREM2依赖性基因转录的水平相比,当在范围是约0.5nM至约50nM、或大于50nM的浓度下使用时,配体诱导的TREM2依赖性基因转录的增加是至少1倍、至少2倍、至少3倍、至少4倍、至少5倍、至少6倍、至少7倍、至少8倍、至少9倍、至少10倍、至少11倍、至少12倍、至少13倍、至少14倍、至少15倍、至少16倍、至少17倍、至少18倍、至少19倍、至少20倍或更多。在一些实施方案中,所述抗TREM2抗体在至少0.5nM、至少0.6nM、至少0.7nM、至少0.8nM、至少0.9nM、至少1nM、至少
2nM、至少3nM、至少4nM、至少5nM、至少6nM、至少7nM、至少8nM、至少9nM、至少10nM、至少
15nM、至少20nM、至少25nM、至少30nM、至少35nM、至少40nM、至少45nM、至少46nM、至少47nM、至少48nM、至少49nM、或至少50nM的浓度下使用。在一些实施方案中,TREM2配体是磷脂酰丝氨酸(PS)。在一些实施方案中,TREM2配体是鞘磷脂(SM)。在一些实施方案中,一种多种TEM2活性的增加可通过本文所述的或本领域已知的任何合适的体外基于细胞的测定或合适的体内模型来测量。在一些实施方案中,使用基于荧光素酶的报告蛋白测定来测量在抗体存在和不存在下配体诱导的TREM2依赖性基因表达的成倍增加,如实施例8、图10A-图10F和图
11A-图11D所述的。
[0187] 如本文所用,利用本文所述的或本领域已知的任何体外测定或基于细胞的培养物测定,如果在饱和抗体浓度下,本公开的抗TREM2抗体使配体与TREM2的结合降低小于20%,则所述抗TREM2抗体不与一种或多种TREM2配体竞争、不抑制、或不以其他方式阻断一种或多种TREM2配体与TREM2之间的相互作用(例如,结合)。在一些实施方案中,利用本文所述的或本领域已知的任何体外测定或基于细胞的培养物测定,在饱和抗体浓度下,本公开的抗TREM2抗体使一种或多种TREM2配体与TREM2之间的相互作用(例如,结合)抑制小于20%、小于19%、小于18%、小于17%、小于16%、小于15%、小于14%、小于13%、小于12%、小于11%、小于10%、小于9%、小于8%、小于7%、小于6%、小于5%、小于4%、小于3%、小于
2%、或小于1%。
[0188] 在一些实施方案中,本公开的抗TREM2抗体是诱导一种或多种TREM2活性的激动剂抗体。在一些实施方案中,所述抗体在结合到在细胞上表达的TREM2蛋白之后诱导一种或多种TREM2活性。在一些实施方案中,所述抗体在结合到未结合到细胞膜的可溶性TREM2蛋白之后诱导一种或多种TREM2活性。在某些实施方案中,所述TREM2蛋白在细胞表面上表达。在某些实施方案中,可溶性TREM2蛋白(sTREM2)可非限制地存在于细胞外环境中、血清中、脑脊髓液(CSF)中、以及组织内的胞间隙中。在某些实施方案中,可溶性TREM2蛋白(sTREM2)是非细胞的。在一些实施方案中,本公开的抗TREM2抗体增加可溶性TREM2蛋白(sTREM2)的水平和/或增加可溶性TREM2蛋白(sTREM2)的半衰期。在一些实施方案中,本公开的可溶性TREM2(sTREM2)蛋白对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基19-160。在一些实施方案中,本公开的可溶性TREM2(sTREM2)蛋白对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基19-159。在一些实施方案中,本公开的可溶性TREM2(sTREM2)蛋白对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基19-158。在一些实施方案中,本公开的可溶性TREM2(sTREM2)蛋白对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基19-157。在一些实施方案中,本公开的可溶性TREM2(sTREM2)蛋白对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基19-156。在一些实施方案中,本公开的可溶性TREM2(sTREM2)蛋白对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基19-155。在一些实施方案中,本公开的可溶性TREM2(sTREM2)蛋白对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基19-154。
[0189] 在一些实施方案中,本公开的可溶性TREM2(sTREM2)蛋白可以是细胞TREM2受体的失活变体。在一些实施方案中,sTREM2可存在于外周诸如血浆中,或受试者的大脑中,并且可隔离(sequester)抗TREM2抗体。此类隔离的抗体将不能够结合到和活化例如存在于细胞上的细胞TREM2受体。因此,在某些实施方案中,本公开的抗TREM2抗体(诸如本公开的激动剂抗TREM2抗体)不结合到可溶性TREM2。在一些实施方案中,本公开的抗TREM2抗体(诸如本公开的激动剂抗TREM2抗体)不结合到体内可溶性TREM2。在一些实施方案中,本公开的不结合可溶性TREM2的激动剂抗TREM2抗体可结合到TREM2上的表位,所述表位例如可包括细胞TREM2的在sTREM2中不包含的细胞外结构域的一部分,例如氨基酸残基161-175内的一个或多个氨基酸残基;可在TREM2的跨膜部分处或附近;或者可包括TREM2的跨膜部分。在一些实施方案中,此类抗体可结合到包括SEQ ID NO:1的氨基酸残基E151、D152、H154、以及E156的表位。在一些实施方案中,此类抗体可结合到包括TREM2的细胞外结构域的N末端区域的表位。因此,此类抗TREM2抗体结合细胞TREM2而不结合可溶性TREM2。有利地,此类抗TREM2抗体将不被存在于例如外周或大脑中的sTREM2隔离,并且将因此可用于活化存在于细胞上的细胞TREM2受体。
[0190] 由本公开的抗TREM2抗体诱导的TREM2活性可包括(a)调控一种或多种抗炎细胞因子的表达,任选地其中所述一种或多种抗炎细胞因子选自IL-4、IL-10TGF-β、IL-13、IL-35IL-16、IFN-α、IL-1Ra、VEGF、G-CSF、YM、AXL、FLT1以及TNF或IL-6的可溶性受体;(b)调控选自以下的一种或多种细胞中的一种或多种抗炎细胞因子的表达:巨噬细胞、树突细胞、骨髓衍生的树突细胞、单核细胞、破骨细胞、以及小神经胶质细胞;(c)调控一种或多种促炎细胞因子的表达,任选地其中所述一种或多种促炎细胞因子选自IFN-β、IL-1α、IL-1β、TNF-α、IL-6、IL-8、CRP、IL-20家族成员、IL-33、LIF、IFN-γ、OSM、CNTF、GM-CSF、IL-11、IL-12、IL-
17、IL-18、IL-23、CXCL10、CCL4、以及MCP-1;(d)调控选自以下的一种或多种细胞中的一种或多种促炎细胞因子的表达:巨噬细胞、树突细胞、骨髓衍生的树突细胞、单核细胞、破骨细胞、以及小神经胶质细胞;(e)活化细胞外信号调节激酶(ERK)磷酸化;(f)活化多种细胞蛋白上的酪氨酸磷酸化;(g)调控C-C趋化因子受体7(CCR7)的表达;(h)活化小神经胶质细胞向CCL19和CCL21表达细胞的趋化性;(i)增加由选自以下的一种或多种细胞进行的引发和/或调控一种或多种T细胞(诸如CD8+T细胞、CD4+T细胞和/或调节性T细胞)的功能:树突细胞、骨髓衍生的树突细胞、单核细胞、小神经胶质细胞、M1小神经胶质细胞、活化的M1小神经胶质细胞、M2小神经胶质细胞、巨噬细胞、M1巨噬细胞、活化的M1巨噬细胞、以及M2巨噬细胞;(j)活化破骨细胞产生、增加破骨细胞生成的速率、或两者;(k)增加选自以下的一种或多种细胞的存活:树突细胞、骨髓衍生的树突细胞、巨噬细胞、M1巨噬细胞、活化的M1巨噬细胞、M2巨噬细胞、单核细胞、破骨细胞、T细胞、T辅助细胞、细胞毒性T细胞、粒细胞、嗜中性粒细胞、小神经胶质细胞、M1小神经胶质细胞、活化的M1小神经胶质细胞、以及M2小神经胶质细胞;(l)增加选自以下的一种或多种细胞的增殖:树突细胞、骨髓衍生的树突细胞、巨噬细胞、M1巨噬细胞、活化的M1巨噬细胞、M2巨噬细胞、单核细胞、破骨细胞、T细胞、T辅助细胞、细胞毒性T细胞、粒细胞、嗜中性粒细胞、小神经胶质细胞、M1小神经胶质细胞、活化的M1小神经胶质细胞、以及M2小神经胶质细胞;(m)活化选自以下的一种或多种细胞的迁移:树突细胞、骨髓衍生的树突细胞、巨噬细胞、M1巨噬细胞、活化的M1巨噬细胞、M2巨噬细胞、单核细胞、破骨细胞、T细胞、T辅助细胞、细胞毒性T细胞、粒细胞、嗜中性粒细胞、小神经胶质细胞、M1小神经胶质细胞、活化的M1小神经胶质细胞、以及M2小神经胶质细胞;(n)活化选自以下的一种或多种细胞的一种或多种功能:树突细胞、骨髓衍生的树突细胞、巨噬细胞、M1巨噬细胞、活化的M1巨噬细胞、M2巨噬细胞、单核细胞、破骨细胞、T细胞、T辅助细胞、细胞毒性T细胞、粒细胞、嗜中性粒细胞、小神经胶质细胞、M1小神经胶质细胞、活化的M1小神经胶质细胞、以及M2小神经胶质细胞;(o)活化选自以下的一种或多种细胞的成熟:树突细胞、骨髓衍生的树突细胞、巨噬细胞、M1巨噬细胞、活化的M1巨噬细胞、M2巨噬细胞、单核细胞、破骨细胞、T细胞、T辅助细胞、细胞毒性T细胞、粒细胞、嗜中性粒细胞、小神经胶质细胞、M1小神经胶质细胞、活化的M1小神经胶质细胞、以及M2小神经胶质细胞;(p)活化选自以下的一种或多种类型的清除:凋亡神经元清除、神经组织碎片清除、非神经组织碎片清除、细菌清除、其他异物清除、致病性蛋白清除、致病性肽清除、以及肿瘤细胞清除;任选地其中所述致病性蛋白选自淀粉样蛋白β、寡聚淀粉样蛋白β、淀粉样蛋白β斑、淀粉样蛋白前体蛋白或其片段、Tau、IAPP、α-突触核蛋白、TDP-43、FUS蛋白、C9orf72(染色体9开放阅读框72)、c9RAN蛋白、朊病毒蛋白、PrPSc、亨廷顿蛋白、降血钙素、超氧化物歧化酶、共济失调蛋白、共济失调蛋白1、共济失调蛋白2、共济失调蛋白3、共济失调蛋白7、共济失调蛋白8、共济失调蛋白10、路易小体、心房利钠因子、胰岛淀粉样蛋白多肽、胰岛素、载脂蛋白AI、血清淀粉样蛋白A、medin、泌乳素、转甲状腺素蛋白、溶菌酶、β2微球蛋白、凝溶胶蛋白、角膜上皮蛋白、抑半胱氨酸蛋白酶蛋白、免疫球蛋白轻链AL、S-IBM蛋白、重复序列相关非ATG(RAN)翻译产物、二肽重复序列(DPR)肽、甘氨酸-丙氨酸(GA)重复序列肽、甘氨酸-脯氨酸(GP)重复序列肽、甘氨酸-精氨酸(GR)重复序列肽、脯氨酸-丙氨酸(PA)重复序列肽、泛素、以及脯氨酸-精氨酸(PR)重复序列肽并且所述肿瘤细胞来自选自以下的癌症:膀胱癌、脑癌、乳腺癌、结肠癌、直肠癌、子宫内膜癌、肾癌、肾细胞癌、肾盂癌、白血病、肺癌、黑素瘤、非霍奇金氏淋巴瘤、胰腺癌、前列腺癌、卵巢癌、纤维肉瘤、以及甲状腺癌;(q)抑制对以下中的一种或多种的吞噬作用:凋亡神经元、神经组织碎片、非神经组织碎片、细菌、其他异物、致病性蛋白、致病性肽、致病性核酸、或肿瘤细胞;任选地其中所述致病性核酸是反义GGCCCC(G2C4)重复序列扩增RNA,所述致病性蛋白选自淀粉样蛋白β、寡聚淀粉样蛋白β、淀粉样蛋白β斑、淀粉样蛋白前体蛋白或其片段、Tau、IAPP、α-突触核蛋白、TDP-43、FUS蛋白、C9orf72(染色体9开放阅读框
72)、c9RAN蛋白、朊病毒蛋白、PrPSc、亨廷顿蛋白、降血钙素、超氧化物歧化酶、共济失调蛋白、共济失调蛋白1、共济失调蛋白2、共济失调蛋白3、共济失调蛋白7、共济失调蛋白8、共济失调蛋白10、路易小体、心房利钠因子、胰岛淀粉样蛋白多肽、胰岛素、载脂蛋白AI、血清淀粉样蛋白A、medin、泌乳素、转甲状腺素蛋白、溶菌酶、β2微球蛋白、凝溶胶蛋白、角膜上皮蛋白、抑半胱氨酸蛋白酶蛋白、免疫球蛋白轻链AL、S-IBM蛋白、重复序列相关非ATG(RAN)翻译产物、二肽重复序列(DPR)肽、甘氨酸-丙氨酸(GA)重复序列肽、甘氨酸-脯氨酸(GP)重复序列肽、甘氨酸-精氨酸(GR)重复序列肽、脯氨酸-丙氨酸(PA)重复序列肽、泛素、以及脯氨酸-精氨酸(PR)重复序列肽,并且所述肿瘤细胞来自选自以下的癌症:膀胱癌、脑癌、乳腺癌、结肠癌、直肠癌、子宫内膜癌、肾癌、肾细胞癌、肾盂癌、白血病、肺癌、黑素瘤、非霍奇金氏淋巴瘤、胰腺癌、前列腺癌、卵巢癌、纤维肉瘤、或甲状腺癌;(r)结合到肿瘤细胞上的TREM2配体;
(s)结合到选自以下的细胞上的TREM2配体:嗜中性粒细胞、树突细胞、骨髓衍生的树突细胞、单核细胞、小神经胶质细胞、以及巨噬细胞;(t)活化由以下中的一种或多种进行的肿瘤细胞杀伤:小神经胶质细胞、巨噬细胞、树突细胞、骨髓衍生的树突细胞、嗜中性粒细胞、T细胞、T辅助细胞、或细胞毒性T细胞;(u)活化以下中的一种或多种的抗肿瘤细胞增殖活性:小神经胶质细胞、巨噬细胞、树突细胞、骨髓衍生的树突细胞、嗜中性粒细胞、T细胞、T辅助细胞、或细胞毒性T细胞;(v)活化以下中的一种或多种的抗肿瘤细胞迁移活性:小神经胶质细胞、巨噬细胞、树突细胞、骨髓衍生的树突细胞、嗜中性粒细胞、T细胞、T辅助细胞、或细胞毒性T细胞;(w)活化一种或多种含有ITAM基序的受体,任选地其中所述一种或多种含有ITAM基序的受体选自TREM1、TREM2、FcgR、DAP10、以及DAP12;(x)活化通过一种或多种模式识别受体(PRR)进行的信号传导,任选地其中所述一种或多种PRR选自识别病原体相关分子模式(PAMP)的受体、识别损害相关分子模式(DAMP)的受体、以及其任何组合;(y)活化一种或多种含有基序D/Ex0–2YxxL/IX6–8YxxL/I(SEQ ID NO:883)的受体;(z)活化通过一种或多种Toll样受体进行的信号传导;(aa)活化JAK-STAT信号传导途径;(bb)活化B细胞的核因子κ-轻链增强子(NFκB)的活化;(cc)含有ITAM基序的受体的磷酸化;(dd)调控一种或多种炎性受体的表达,任选地其中所述一种或多种炎性受体包括CD86并且所述一种或多种炎性受体在以下中的一种或多种上表达:小神经胶质细胞、巨噬细胞、树突细胞、骨髓衍生的树突细胞、嗜中性粒细胞、T细胞、T辅助细胞、或细胞毒性T细胞;(ee)增加一种或多种TREM2依赖性基因的表达;(gg)破坏的TREM2依赖性基因表达的正常化;(ff)增加一种或多种ITAM依赖性基因的表达,任选地其中所述一种多种ITAM依赖性基因通过活化T细胞的核因子(NFAT)转录因子活化;(gg)抑制以下中的一种或多种的分化:免疫抑制树突细胞、免疫抑制巨噬细胞、骨髓来源的抑制细胞、肿瘤相关巨噬细胞、免疫抑制嗜中性粒细胞、以及调节性T细胞;
(hh)抑制以下中的一种或多种的功能性:免疫抑制树突细胞、免疫抑制巨噬细胞、骨髓来源的抑制细胞、肿瘤相关巨噬细胞、免疫抑制嗜中性粒细胞、以及调节性T细胞;(ii)减少以下中的一种或多种到肿瘤中的浸润:免疫抑制树突细胞、免疫抑制巨噬细胞、骨髓来源的抑制细胞、肿瘤相关巨噬细胞、免疫抑制嗜中性粒细胞、以及调节性T细胞;(jj)减少肿瘤中、外周血中、或其他淋巴样器官中的促进肿瘤的髓样/粒细胞性免疫抑制细胞的数量;(kk)抑制骨髓来源的抑制细胞的促进肿瘤的活性;(ll)减少肿瘤中或外周血中促进肿瘤的细胞因子的表达,任选地其中所述促进肿瘤的细胞因子是TGF-β或IL-10;(mm)减少促进肿瘤的FoxP3+调节性T淋巴细胞的肿瘤浸润;(nn)增加具有肿瘤杀伤潜力的肿瘤特异性T淋巴细胞的活化;(oo)降低肿瘤体积;(pp)降低肿瘤生长速率;(qq)增加调控抗肿瘤T细胞应答的一种或多种免疫疗法的效力,任选地其中所述一种或多种免疫疗法选自PD1/PDL1阻断、CTLA-4阻断、和癌症疫苗;(rr)抑制PLCγ/PKC/钙动员;以及(uu)抑制PI3K/Akt、Ras/MAPK信号传导。
(ss)增加由树突细胞、巨噬细胞、单核细胞、和/或小神经胶质细胞进行的吞噬作用;(tt)诱导或保持细胞表面上的TREM2簇集;(xx)TREM2结合到DAP12;(uu)TREM2磷酸化;(vv)DAP12磷酸化;(ww)TREM2磷酸化;(xx)活化一种或多种SRC家族酪氨酸激酶,包括Syk激酶;(yy)增加记忆力;以及(zz)减少认知缺陷。
[0191] 本公开的抗TREM2抗体可用于预防、降低风险、或治疗痴呆、额颞叶痴呆、阿尔茨海默氏病、血管性痴呆、混合型痴呆、克-雅二氏病、正常压力脑积水、肌萎缩性侧索硬化症、亨廷顿氏病、tau蛋白病、Nasu-Hakola病、中风、急性创伤、慢性创伤、认知缺陷、记忆力丧失、狼疮、急性和慢性结肠炎、类风湿关节炎、伤口愈合、克罗恩氏病、炎症性肠病、溃疡性结肠炎、肥胖症、疟疾、特发性震颤、中枢神经系统狼疮、贝切特氏病、帕金森氏病、路易体痴呆、多系统萎缩、希一德二氏综合征、进行性核上性麻痹、皮层基底神经节变性、急性播散性脑脊髓炎、肉芽肿病症、结节病、老化疾病、癫痫发作、脊髓损伤、创伤性脑损伤、年龄相关性黄斑变性、青光眼、色素性视网膜炎、视网膜变性、呼吸道感染、败血症、眼部感染、全身感染、狼疮、关节炎、多发性硬化症、低骨密度、骨质疏松症、骨生成、骨质增生疾病、佩吉特氏骨病、实体和血液癌症、膀胱癌、脑癌、乳腺癌、结肠癌、直肠癌、子宫内膜癌、肾癌、肾细胞癌、肾盂癌、白血病、肺癌、黑素瘤、非霍奇金氏淋巴瘤、胰腺癌、前列腺癌、卵巢癌、纤维肉瘤、急性成淋巴细胞白血病(ALL)、急性骨髓性白血病(AML)、慢性淋巴细胞白血病(CLL)、慢性骨髓性白血病(CML)、多发性骨髓瘤、真性红细胞增多症、原发性血小板增多症、原发性或特发性骨髓纤维化、原发性或特发性脊髓硬化症、髓样来源的肿瘤、表达TREM2的肿瘤、甲状腺癌、感染、CNS疱疹、寄生虫感染、锥虫感染、Cruzi感染、铜绿假单胞菌感染、杜氏利什曼原虫感染、B族链球菌感染、空肠弯曲杆菌感染、脑膜炎奈瑟氏球菌感染、I型HIV、以及流感嗜血杆菌。本文所提供的方法也在诱导或促进有需要的个体中的一种或多种免疫细胞的存活、成熟、功能性、迁移、或增殖方面得到应用。本文所提供的方法在降低有需要的个体中的以下各项的活性、功能性、或存活方面得到另外的应用:调节性T细胞、肿瘤包埋的免疫抑制树突细胞、肿瘤包埋的免疫抑制巨噬细胞、骨髓来源的抑制细胞、肿瘤相关巨噬细胞、急性骨髓性白血病(AML)细胞、慢性淋巴细胞白血病(CLL)细胞、或慢性骨髓性白血病(CML)细胞。本文所提供的方法在增加记忆力和/或减少认知缺陷方面得到另外的应用。
[0192] 本公开的抗TREM2抗体也可用于晚期伤口护理。在一些实施方案中,本公开的抗TREM2抗体是单克隆抗体。本公开的抗TREM2抗体可针对诱导一种或多种TREM2活性进行测试,所述一种或多种TREM2活性包括(a)调控一种或多种抗炎细胞因子的表达,任选地其中所述一种或多种抗炎细胞因子选自IL-4、IL-10TGF-β、IL-13、IL-35IL-16、IFN-α、IL-1Ra、VEGF、G-CSF、YM、AXL、FLT1以及TNF或IL-6的可溶性受体;(b)调控选自以下的一种或多种细胞中的一种或多种抗炎细胞因子的表达:巨噬细胞、树突细胞、骨髓衍生的树突细胞、单核细胞、破骨细胞、以及小神经胶质细胞;(c)调控一种或多种促炎细胞因子的表达,任选地其中所述一种或多种促炎细胞因子选自IFN-β、IL-1α、IL-1β、TNF-α、YM-1、CD86、CCL2、CCL3、CCL5、CCR2、Gata3、Rorc、IL-6、IL-8、CRP、IL-20家族成员、IL-33、LIF、IFN-γ、OSM、CNTF、GM-CSF、IL-11、IL-12、IL-17、IL-18、IL-23、CXCL10、CCL4、FLT1、CSF-1、OPN、MHC-II、CD11c、AXL以及MCP-1;(d)调控选自以下的一种或多种细胞中的一种或多种促炎细胞因子的表达:巨噬细胞、树突细胞、骨髓衍生的树突细胞、单核细胞、破骨细胞、以及小神经胶质细胞;(e)活化细胞外信号调节激酶(ERK)磷酸化;(f)活化多种细胞蛋白上的酪氨酸磷酸化;(g)调控C-C趋化因子受体7(CCR7)的表达;(h)活化小神经胶质细胞向CCL19和CCL21表达细胞的趋化性;(i)增加由选自以下的一种或多种细胞进行的引发或调控T细胞(诸如CD8+T细胞、CD4+T细胞、和/或调节性T细胞)的功能:树突细胞、骨髓衍生的树突细胞、单核细胞、小神经胶质细胞、M1小神经胶质细胞、活化的M1小神经胶质细胞、M2小神经胶质细胞、巨噬细胞、M1巨噬细胞、活化的M1巨噬细胞、以及M2巨噬细胞;(j)活化破骨细胞产生、增加破骨细胞生成的速率、或两者;(k)增加选自以下的一种或多种细胞的存活:树突细胞、骨髓衍生的树突细胞、巨噬细胞、M1巨噬细胞、活化的M1巨噬细胞、M2巨噬细胞、单核细胞、破骨细胞、T细胞、T辅助细胞、细胞毒性T细胞、粒细胞、嗜中性粒细胞、小神经胶质细胞、M1小神经胶质细胞、活化的M1小神经胶质细胞、以及M2小神经胶质细胞;(l)增加选自以下的一种或多种细胞的增殖:树突细胞、骨髓衍生的树突细胞、巨噬细胞、M1巨噬细胞、活化的M1巨噬细胞、M2巨噬细胞、单核细胞、破骨细胞、T细胞、T辅助细胞、细胞毒性T细胞、粒细胞、嗜中性粒细胞、小神经胶质细胞、M1小神经胶质细胞、活化的M1小神经胶质细胞、以及M2小神经胶质细胞;(m)活化选自以下的一种或多种细胞的迁移:树突细胞、骨髓衍生的树突细胞、巨噬细胞、M1巨噬细胞、活化的M1巨噬细胞、M2巨噬细胞、单核细胞、破骨细胞、T细胞、T辅助细胞、细胞毒性T细胞、粒细胞、嗜中性粒细胞、小神经胶质细胞、M1小神经胶质细胞、活化的M1小神经胶质细胞、以及M2小神经胶质细胞;(n)活化选自以下的一种或多种细胞的一种或多种功能:树突细胞、骨髓衍生的树突细胞、巨噬细胞、M1巨噬细胞、活化的M1巨噬细胞、M2巨噬细胞、单核细胞、破骨细胞、T细胞、T辅助细胞、细胞毒性T细胞、粒细胞、嗜中性粒细胞、小神经胶质细胞、M1小神经胶质细胞、活化的M1小神经胶质细胞、以及M2小神经胶质细胞;(o)活化选自以下的一种或多种细胞的成熟:树突细胞、骨髓衍生的树突细胞、巨噬细胞、M1巨噬细胞、活化的M1巨噬细胞、M2巨噬细胞、单核细胞、破骨细胞、T细胞、T辅助细胞、细胞毒性T细胞、粒细胞、嗜中性粒细胞、小神经胶质细胞、M1小神经胶质细胞、活化的M1小神经胶质细胞、以及M2小神经胶质细胞;(p)活化选自以下的一种或多种类型的清除:凋亡神经元清除、神经组织碎片清除、非神经组织碎片清除、细菌清除、其他异物清除、致病性蛋白清除、致病性肽清除、以及肿瘤细胞清除;任选地其中所述致病性蛋白选自淀粉样蛋白β、寡聚淀粉样蛋白β、淀粉样蛋白β斑、淀粉样蛋白前体蛋白或其片段、Tau、IAPP、α-突触核蛋白、TDP-43、FUS蛋白、C9orf72(染色体9开放阅读框72)、c9RAN蛋白、朊病毒蛋白、PrPSc、亨廷顿蛋白、降血钙素、超氧化物歧化酶、共济失调蛋白、共济失调蛋白1、共济失调蛋白2、共济失调蛋白3、共济失调蛋白7、共济失调蛋白8、共济失调蛋白10、路易小体、心房利钠因子、胰岛淀粉样蛋白多肽、胰岛素、载脂蛋白AI、血清淀粉样蛋白A、medin、泌乳素、转甲状腺素蛋白、溶菌酶、β2微球蛋白、凝溶胶蛋白、角膜上皮蛋白、抑半胱氨酸蛋白酶蛋白、免疫球蛋白轻链AL、S-IBM蛋白、重复序列相关非ATG(RAN)翻译产物、二肽重复序列(DPR)肽、甘氨酸-丙氨酸(GA)重复序列肽、甘氨酸-脯氨酸(GP)重复序列肽、甘氨酸-精氨酸(GR)重复序列肽、脯氨酸-丙氨酸(PA)重复序列肽、泛素、以及脯氨酸-精氨酸(PR)重复序列肽并且所述肿瘤细胞来自选自以下的癌症:膀胱癌、脑癌、乳腺癌、结肠癌、直肠癌、子宫内膜癌、肾癌、肾细胞癌、肾盂癌、白血病、肺癌、黑素瘤、非霍奇金氏淋巴瘤、胰腺癌、前列腺癌、卵巢癌、纤维肉瘤、以及甲状腺癌;(u)活化对以下中的一种或多种的吞噬作用:凋亡神经元、神经组织碎片、非神经组织碎片、细菌、其他异物、致病性蛋白、致病性肽、致病性核酸、或肿瘤细胞;任选地其中所述致病性核酸是反义GGCCCC(G2C4)重复序列扩增RNA,所述致病性蛋白选自淀粉样蛋白β、寡聚淀粉样蛋白β、淀粉样蛋白β斑、淀粉样蛋白前体蛋白或其片段、Tau、IAPP、α-突触核蛋白、TDP-
43、FUS蛋白、C9orf72(染色体9开放阅读框72)、c9RAN蛋白、朊病毒蛋白、PrPSc、亨廷顿蛋白、降血钙素、超氧化物歧化酶、共济失调蛋白、共济失调蛋白1、共济失调蛋白2、共济失调蛋白3、共济失调蛋白7、共济失调蛋白8、共济失调蛋白10、路易小体、心房利钠因子、胰岛淀粉样蛋白多肽、胰岛素、载脂蛋白AI、血清淀粉样蛋白A、medin、泌乳素、转甲状腺素蛋白、溶菌酶、β2微球蛋白、凝溶胶蛋白、角膜上皮蛋白、抑半胱氨酸蛋白酶蛋白、免疫球蛋白轻链AL、S-IBM蛋白、重复序列相关非ATG(RAN)翻译产物、二肽重复序列(DPR)肽、甘氨酸-丙氨酸(GA)重复序列肽、甘氨酸-脯氨酸(GP)重复序列肽、甘氨酸-精氨酸(GR)重复序列肽、脯氨酸-丙氨酸(PA)重复序列肽、泛素、以及脯氨酸-精氨酸(PR)重复序列肽,并且所述肿瘤细胞来自选自以下的癌症:膀胱癌、脑癌、乳腺癌、结肠癌、直肠癌、子宫内膜癌、肾癌、肾细胞癌、肾盂癌、白血病、肺癌、黑素瘤、非霍奇金氏淋巴瘤、胰腺癌、前列腺癌、卵巢癌、纤维肉瘤、或甲状腺癌;(p)结合到肿瘤细胞上的TREM2配体;(q)结合到选自以下的细胞上的TREM2配体:
嗜中性粒细胞、树突细胞、骨髓衍生的树突细胞、单核细胞、小神经胶质细胞、以及巨噬细胞;(r)活化由以下中的一种或多种进行的肿瘤细胞杀伤:小神经胶质细胞、巨噬细胞、树突细胞、骨髓衍生的树突细胞、嗜中性粒细胞、T细胞、T辅助细胞、或细胞毒性T细胞;(s)活化以下中的一种或多种的抗肿瘤细胞增殖活性:小神经胶质细胞、巨噬细胞、树突细胞、骨髓衍生的树突细胞、嗜中性粒细胞、T细胞、T辅助细胞、或细胞毒性T细胞;(t)活化以下中的一种或多种的抗肿瘤细胞迁移活性:小神经胶质细胞、巨噬细胞、树突细胞、骨髓衍生的树突细胞、嗜中性粒细胞、T细胞、T辅助细胞、或细胞毒性T细胞;(y)活化一种或多种含有ITAM基序的受体,任选地其中所述一种或多种含有ITAM基序的受体选自TREM1、TREM2、FcgR、DAP10、以及DAP12;(z)活化通过一种或多种模式识别受体(PRR)进行的信号传导,任选地其中所述一种或多种PRR选自识别病原体相关分子模式(PAMP)的受体、识别损害相关分子模式(DAMP)的受体、以及其任何组合;(aa)活化一种或多种含有基序D/Ex0–2YxxL/IX6–8YxxL/I(SEQ ID NO:883)的受体;(bb)活化通过一种或多种Toll样受体进行的信号传导;(cc)活化JAK-STAT信号传导途径;(dd)活化B细胞的核因子κ-轻链增强子(NFκB)的活化;(dd)含有ITAM基序的受体的磷酸化;(ee)调控一种或多种炎性受体的表达,任选地其中所述一种或多种炎性受体包括CD86并且所述一种或多种炎性受体在以下中的一种或多种上表达:小神经胶质细胞、巨噬细胞、树突细胞、骨髓衍生的树突细胞、嗜中性粒细胞、T细胞、T辅助细胞、或细胞毒性T细胞;(ff)增加一种或多种TREM2依赖性基因的表达;(gg)破坏的TREM2依赖性基因表达的正常化;(hh)增加一种或多种ITAM依赖性基因的表达,任选地其中所述一种多种ITAM依赖性基因通过活化T细胞的核因子(NFAT)转录因子活化;(ii)抑制以下中的一种或多种的分化:免疫抑制树突细胞、免疫抑制巨噬细胞、骨髓来源的抑制细胞、肿瘤相关巨噬细胞、免疫抑制嗜中性粒细胞、以及调节性T细胞;(jj)抑制以下中的一种或多种的功能性:免疫抑制树突细胞、免疫抑制巨噬细胞、骨髓来源的抑制细胞、肿瘤相关巨噬细胞、免疫抑制嗜中性粒细胞、以及调节性T细胞;(nn)减少以下中的一种或多种到肿瘤中的浸润:免疫抑制树突细胞、免疫抑制巨噬细胞、骨髓来源的抑制细胞、肿瘤相关巨噬细胞、免疫抑制嗜中性粒细胞、以及调节性T细胞;(kk)减少肿瘤中、外周血中、或其他淋巴样器官中的促进肿瘤的髓样/粒细胞性免疫抑制细胞的数量;(ll)抑制骨髓来源的抑制细胞的促进肿瘤的活性;(mm)减少肿瘤中或外周血中促进肿瘤的细胞因子的表达,任选地其中所述促进肿瘤的细胞因子是TGF-β或IL-10;(nn)减少促进肿瘤的FoxP3+调节性T淋巴细胞的肿瘤浸润;
(oo)增加具有肿瘤杀伤潜力的肿瘤特异性T淋巴细胞的活化;(pp)降低肿瘤体积;(qq)降低肿瘤生长速率;(rr)增加调控抗肿瘤T细胞应答的一种或多种免疫疗法的效力,任选地其中所述一种或多种免疫疗法选自PD1/PDL1阻断、CTLA-4阻断、和癌症疫苗;(ww)抑制PLCγ/PKC/钙动员;以及(xx)抑制PI3K/Akt、Ras/MAPK信号传导。(xx)增加由树突细胞、巨噬细胞、单核细胞、和/或小神经胶质细胞进行的吞噬作用;(yy)诱导或保持细胞表面上的TREM2簇集;(zz)TREM2结合到DAP12;(aaa)TREM2磷酸化;(bbb)DAP12磷酸化;(ccc)TREM2自身磷酸化;(ddd)活化一种或多种SRC家族酪氨酸激酶,包括Syk激酶;(eee)调控选自由以下组成的组的一种或多种蛋白质的表达:C1qa、C1qB、C1qC、C1s、C1R、C4、C2、C3、ITGB2、HMOX1、LAT2.CASP1、CSTA、VSIG4、MS4A4A、C3AR1、GPX1、TyroBP、ALOX5AP、ITGAM、SLC7A7、CD4、ITGAX、PYCARD、以及VEGF;(fff)增加记忆力;以及(ggg)减少认知缺陷。可用的测定可包括蛋白质印迹(例如,用于酪氨酸磷酸化的DAP12或苏氨酸/丝氨酸磷酸化的PI3K激酶底物)、ELISA(例如,用于分泌的白介素或细胞因子分泌)、FACS(例如,用于结合到TREM2的抗TREM2)、免疫细胞化学(例如,用于例如,用于酪氨酸磷酸化的DAP12或苏氨酸/丝氨酸磷酸化的PI3K激酶底物)、报告基因测定(例如,用于TLR活化)、树突细胞、巨噬细胞、单核细胞、破骨细胞、皮肤朗格汉斯细胞、库普弗细胞、和/或小神经胶质细胞的增加的存活和/或功能、由巨噬细胞、树突细胞、皮肤朗格汉斯细胞、库普弗细胞、单核细胞、破骨细胞、和/或小神经胶质细胞进行的对凋亡神经元、受损突触、淀粉样蛋白β或其片段、Tau、IAPP、α-突触核蛋白、TDP-43、FUS蛋白、朊病毒蛋白、PrPSc、亨廷顿蛋白、降血钙素、超氧化物歧化酶、共济失调蛋白、路易小体、心房利钠因子、胰岛淀粉样蛋白多肽、胰岛素、载脂蛋白AI、血清淀粉样蛋白A、medin、泌乳素、转甲状腺素蛋白、溶菌酶、β2微球蛋白、凝溶胶蛋白、角膜上皮蛋白、抑半胱氨酸蛋白酶蛋白、免疫球蛋白轻链AL、S-IBM蛋白、重复序列相关非ATG(RAN)翻译产物、二肽重复序列(DPR)肽、甘氨酸-丙氨酸(GA)重复序列肽、甘氨酸-脯氨酸(GP)重复序列肽、甘氨酸-精氨酸(GR)重复序列肽、脯氨酸-丙氨酸(PA)重复序列肽、和脯氨酸-精氨酸(PR)重复序列肽、神经组织碎片、非神经组织碎片、细菌、其他异物、致病性蛋白、致病性肽、致病性核酸、或肿瘤细胞的增加的吞噬作用、增加的细胞骨架再组织、以及减少的小神经胶质细胞促炎应答、或本领域已知的其他测定。
[0193] 依赖于结合至FcgR受体来活化靶受体的抗体如果被工程改造成消除FcgR结合,则可能丧失其激动剂活性(参见例如,Wilson等人(2011)Cancer Cell 19,101–113;Armour等人(2003)Immunology 40(2003)585–593);及White等人,(2015)Cancer Cell 27,138–148)。因此,认为当具有正确表位特异性的本公开的抗TREM2抗体具有来自人IgG2同种型的Fc结构域(CH1和铰链区)或能够优先结合抑制性FcgRIIB受体的另一类Fc结构域或其变体时,该抗体可以是激动剂抗体并且活化靶抗原,同时具有最少不良作用。
[0194] 示例性激动剂抗体Fc同种型和修饰提供于下表A中。在一些实施方案中,激动剂抗体具有下表A中所列的Fc同种型。
[0195] 表A:能够结合Fcγ受体的示例性抗TREM2抗体Fc同种型
[0196]
[0197]
[0198] 除表A中所描述的同种型外,并且不希望受理论束缚,认为结合人活化Fcg受体I、IIA、IIC、IIIA、IIIB和/或小鼠Fcg受体I、III及IV的具有人IgG1或IgG3同种型的抗体及其突变体(例如Strohl(2009)Current Opinion in Biotechnology 2009,20:685–691)也可以在体内充当激动剂抗体,但可能引起ADCC相关不良作用。不过,相较于抑制性Fcg受体FcgRIIB,此类Fcg受体看来不太容易用于体内抗体结合(参见例如,White等人(2013)Cancer Immunol.Immunother.62,941–948;及Li等人(2011)Science 333(6045):1030–
1034)。
[0199] 在一些实施方案中,激动剂抗体属于IgG类别、IgM类别或IgA类别。在一些实施方案中,激动剂抗体具有IgG1、IgG2、IgG3或IgG4同种型。
[0200] 在某些实施方案中,激动剂抗体具有IgG2同种型。在一些实施方案中,激动剂抗体含有人IgG2恒定区。在一些实施方案中,人IgG2恒定区包括Fc区。在一些实施方案中,激动剂抗体诱导与结合至Fc受体无关的一种或多种TREM2活性、DAP12活性或两者。在一些实施方案中,激动剂抗体结合抑制性Fc受体。在某些实施方案中,抑制性Fc受体是抑制性Fcγ受体IIB(FcγIIB)。在一些实施方案中,Fc区含有一个或多个修饰。举例来说,在一些实施方案中,Fc区含有一个或多个氨基酸取代(例如相对于同一同种型的野生型Fc区)。在一些实施方案中,该一个或多个氨基酸取代选自V234A(Alegre等人,(1994)Transplantation 57:1537-1543.31;Xu等人,(2000)Cell Immunol,200:16-26)、G237A(Cole等人(1999)
Transplantation,68:563-571)、H268Q、V309L、A330S、P331S(US 2007/0148167;Armour等人(1999)Eur J Immunol 29:2613-2624;Armour等人(2000)The Haematology Journal 1(增刊1):27;Armour等人(2000)The Haematology Journal 1(增刊1):27)、C232S和/或C233S(White等人(2015)Cancer Cell 27,138–148)、S267E、L328F(Chu等人,(2008)Mol Immunol,45:3926-3933)、M252Y、S254T和/或T256E,其中氨基酸位置是根据EU或Kabat编号规定。
[0201] 在一些实施方案中,激动剂抗体具有含重链恒定结构域的IgG2同种型,该重链恒定结构域含有C127S氨基酸取代,其中该氨基酸位置是根据EU或Kabat编号规定(White等人(2015)Cancer Cell 27,138-148;Lightle等人(2010)PROTEIN SCIENCE 19:753-762;及WO2008079246)。
[0202] 在一些实施方案中,激动剂抗体具有含κ轻链恒定结构域的IgG2同种型,该轻链恒定结构域含有C214S氨基酸取代,其中该氨基酸位置是根据EU或Kabat编号规定(White等人(2015)Cancer Cell 27,138-148;Lightle等人(2010)PROTEIN SCIENCE 19:753-762;及WO2008079246)。
[0203] 在某些实施方案中,激动剂抗体具有IgG1同种型。在一些实施方案中,激动剂抗体含有小鼠IgG1恒定区。在一些实施方案中,激动剂抗体含有人IgG1恒定区。在一些实施方案中,人IgG1恒定区包括Fc区。在一些实施方案中,激动剂抗体结合抑制性Fc受体。在某些实施方案中,抑制性Fc受体是抑制性Fcγ受体IIB(FcγIIB)。在一些实施方案中,Fc区含有一个或多个修饰。举例来说,在一些实施方案中,Fc区含有一个或多个氨基酸取代(例如相对于同一同种型的野生型Fc区)。在一些实施方案中,该一个或多个氨基酸取代选自N297A(Bolt  S等人(1993)Eur J Immunol  23:403-411)、D265A(Shields等人(2001)R.J.Biol.Chem.276,6591–6604)、L234A、L235A(Hutchins等人(1995)Proc Natl Acad Sci USA,92:11980-11984;Alegre等人(1994)Transplantation 57:1537-1543.31;Xu等人(2000)Cell Immunol,200:16-26)、G237A(Alegre等人(1994)Transplantation 57:1537-
1543.31;Xu等人(2000)Cell Immunol,200:16-26)、C226S、C229S、E233P、L234V、L234F、L235E(McEarchern等人(2007)Blood,109:1185-1192)、P331S(Sazinsky等人(2008)Proc Natl Acad Sci USA 2008,105:20167-20172)、S267E、L328F、A330L、M252Y、S254T和/或T256E,其中氨基酸位置是根据EU或Kabat编号规定。
[0204] 在一些实施方案中,抗体包括IgG2同种型重链恒定结构域1(CH1)和铰链区(White等人(2015)Cancer Cell 27,138–148)。在某些实施方案中,IgG2同种型CH1和铰链区含有氨基酸序列ASTKGPSVFPLAPCSRSTSESTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSNFGTQTYTCNVDHKPSNTKVDKTVERKCCVECPPCP(SEQ ID NO:886)。在一些实施方案中,抗体Fc区含有S267E氨基酸取代、L328F氨基酸取代或两者,和/或N297A或N297Q氨基酸取代,其中氨基酸位置是根据EU或Kabat编号规定。
[0205] 在某些实施方案中,激动剂抗体具有IgG4同种型。在一些实施方案中,激动剂抗体含有人IgG4恒定区。在一些实施方案中,人IgG4恒定区包括Fc区。在一些实施方案中,激动剂抗体结合抑制性Fc受体。在某些实施方案中,抑制性Fc受体是抑制性Fcγ受体IIB(FcγIIB)。在一些实施方案中,Fc区含有一个或多个修饰。举例来说,在一些实施方案中,Fc区含有一个或多个氨基酸取代(例如相对于同一同种型的野生型Fc区)。在一些实施方案中,该一个或多个氨基酸取代选自L235A、G237A、S228P、L236E(Reddy等人(2000)J Immunol,164:1925-1933)、S267E、E318A、L328F、M252Y、S254T和/或T256E,其中氨基酸位置是根据EU或Kabat编号规定。
[0206] 在某些实施方案中,所述激动剂抗体具有杂合IgG2/4同种型。在一些实施方案中,所述激动剂抗体包含含有人IgG2的根据EU或Kabat编号的氨基酸118至260和人IgG4的根据EU或Kabat编号的氨基酸261-447的氨基酸序列(WO 1997/11971;WO 2007/106585)。
[0207] 在某些实施方案中,所述抗体包含小鼠IgG4恒定区(Bartholomaeus等人(2014).J.Immunol.192,2091-2098)。
[0208] 在一些实施方案中,所述Fc区还包含选自以下的一个或多个额外的氨基酸取代:根据EU或Kabat编号的A330L、L234F;L235E、或P331S;以及其任何组合。
[0209] 惰性抗体
[0210] 本公开的另一抗体类别包括惰性抗体。如本文所使用,“惰性”抗体是指特异性结合其靶抗原但不调节(例如减小/抑制或活化/诱导)抗原功能的抗体。举例来说,在TREM2情况下,惰性抗体不调节配体结合和/或TREM2活性。不希望受理论束缚,认为不能将TREM2群集于细胞表面上的抗体可以是惰性抗体,即使这些抗体具有与受体活化相容的表位特异性。
[0211] 在一些实施方案中,结合TREM2蛋白的抗体可包括结合TREM2但是由于其表位特异性而不调控蛋白质功能的抗体。此类功能上惰性的抗体可用作将毒素或转移到肿瘤细胞的运载工具(cargo),如针对CD33抗体吉妥单抗奥佐米星(作为麦罗塔(Mylotarg)销售)所描述的,所述CD33抗体偶联到来自加利车霉素类别的细胞毒性剂并且用于靶向并杀伤急性髓性白血病肿瘤(Naito等人,(2000),Leukemia,14,1436-1443;Ricart(2011)Clin Cancer Res 17;6417-6436;Hamann等人,(2002)Journal:Bioconjugate Chemistry,13,47-58;以及Beitz等人,(2001)Clin Cancer Res 7;1490–6.)。因此,在一些实施方案中,本公开的抗体是结合TREM2但是不能够诱导一种或多种TREM2活性(例如,本文所述的TREM2活性)的惰性抗体。
[0212] 示例性惰性抗体Fc同种型和修饰提供在以下表B中。在一些实施方案中,所述惰性抗体具有在以下表B中列出的Fc同种型。
[0213] 拮抗剂抗体
[0214] 本公开的抗体的第三种类别包括拮抗剂抗体。在一些实施方案中,结合TREM2蛋白的抗体可包括结合TREM2并且通过防止TREM2与一种或多种TREM2配体之间的相互作用或通过防止在配体存在下将来自TREM2的细胞外结构域的信号转导到细胞细胞质中来抑制一种或多种TREM2活性的拮抗剂抗体。在一些实施方案中,本公开的拮抗剂抗体可具有本公开的激动剂抗体的表位特异性,但是具有不能够结合Fcg受体并且因此不能够例如使TREM2受体簇集的Fc结构域。
[0215] 在一些实施方案中,本公开的抗体是拮抗剂抗体。在一些实施方案中,所述拮抗剂抗体抑制一种或多种TREM2活性。在一些实施方案中,所述拮抗剂抗体降低一种或多种TREM2依赖性基因的活性。在一些实施方案中,所述抗TREM2抗体降低一种或多种细胞中的TREM2的水平(例如,细胞表面水平、细胞内水平、或总水平)。在一些实施方案中,所述抗TREM2抗体诱导TREM2的降解。在一些实施方案中,所述抗TREM2抗体诱导TREM2的裂解。在一些实施方案中,所述抗TREM2抗体诱导TREM2的内化。在一些实施方案中,所述抗TREM2抗体诱导TREM2的脱落。在一些实施方案中,所述抗TREM2抗体诱导TREM2表达的下调。在一些实施方案中,所述抗TREM2抗体抑制TREM2与一种或多种TREM2配体之间的相互作用(例如,结合)。在一些实施方案中,所述抗TREM2抗体瞬时活化TREM2并且然后诱导TREM2的降解。在一些实施方案中,所述抗TREM2抗体瞬时活化TREM2并且然后诱导TREM2的裂解。在一些实施方案中,所述抗TREM2抗体瞬时活化TREM2并且然后诱导TREM2的内化。在一些实施方案中,所述抗TREM2抗体瞬时活化TREM2并且然后诱导TREM2的脱落。在一些实施方案中,所述抗TREM2抗体瞬时活化TREM2表达并且然后诱导TREM2表达的下调。在一些实施方案中,所述抗TREM2抗体瞬时活化TREM2并且然后诱导TREM2的降低的表达。在某些实施方案中,所述个体具有TREM2变体等位基因。在一些实施方案中,所述抗TREM2抗体以溶液形式起作用。
[0216] 在一些实施方案中,所述一种或多种TREM2依赖性基因包括但不限于一种或多种活化T细胞的核因子(NFAT)转录因子。在一些实施方案中,所述拮抗剂抗体降低巨噬细胞、小神经胶质细胞、M1巨噬细胞、M1小神经胶质细胞、M2巨噬细胞、M2小神经胶质细胞、破骨细胞、皮肤朗格汉斯细胞、库普弗细胞、和/或树突细胞的存活。在一些实施方案中,所述拮抗剂抗体抑制TREM2与一种或多种TREM2配体之间的相互作用。在一些实施方案中,所述拮抗剂抗体抑制TREM2信号转导。在一些实施方案中,所述拮抗剂抗体抑制TREM2与一种或多种TREM2配体之间的相互作用并且抑制TREM2信号转导。在一些实施方案中,所述拮抗剂抗体抑制TREM2与DAP12的相互作用。
[0217] 一种或多种细胞中的TREM2的水平(例如,细胞水平)可是指但不限于TREM2的细胞表面水平、TREM2的细胞内水平、和TREM2的总水平。在一些实施方案中,降低TREM2的细胞水平包括降低TREM2的细胞表面水平。如本文所用,TREM2的细胞表面水平可通过本文所述的或本领域已知的任何体外基于细胞的测定或合适的体内模型来测量,例如,利用流式细胞术,诸如荧光激活细胞分选(FACS)来测量TREM2的细胞表面水平。在一些实施方案中,降低细胞中的TREM2的水平包括降低TREM2的细胞内水平。如本文所用,TREM2的细胞内水平可通过本文所述的或本领域已知的任何体外基于细胞的测定或合适的体内模型(例如,免疫染色、蛋白质印迹分析、共免疫沉淀、以及细胞计数)来测量。在一些实施方案中,降低TREM2的细胞水平包括降低TREM2的总水平。如本文所用,TREM2的总水平可通过本文所述的或本领域已知的任何体外基于细胞的测定或合适的体内模型(例如,免疫染色、蛋白质印迹分析、共免疫沉淀、以及细胞计数)来测量。在一些实施方案中,抗TREM2抗体诱导TREM2降解、TREM2裂解、TREM2内化、TREM2脱落、和/或TREM2表达的下调。在一些实施方案中,一种或多种细胞中的TREM2的水平(例如,细胞水平)利用体外细胞测定在原代细胞(例如,树突细胞、骨髓衍生的树突细胞、单核细胞、小神经胶质细胞、以及巨噬细胞)上或在细胞系上测量。在一些实施方案中,与在本公开的抗TREM2抗体不存在下TREM2的细胞水平相比,所述抗TREM2抗体使TREM2的细胞水平降低至少15%、至少20%、至少25%、至少30%、至少35%、至少40%、至少45%、至少50%、至少55%、至少60%、至少65%、至少70%、至少75%、至少80%、至少85%、至少90%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、至少99%、或更多。可使用本文所述的或本领域已知的任何体外基于细胞的测定或合适的体内模型来测量TREM2与一种或多种TREM2配体之间的相互作用(例如,结合)的抑制。在一些实施方案中,利用本文所述的或本领域已知的任何体外测定或基于细胞的培养物测定,在饱和抗体浓度下,本公开的抗TREM2抗体使TREM2与一种或多种TREM2配体之间的相互作用(例如,结合)抑制至少
15%、至少20%、至少25%、至少30%、至少35%、至少40%、至少45%、至少50%、至少55%、至少60%、至少65%、至少70%、至少75%、至少80%、至少85%、至少90%、至少95%、至少
96%、至少97%、至少98%、至少99%、或更多。
[0218] 在一些实施方案中,激动剂抗体起作用需要抗体交联。抗体交联可以在体外通过结合至二抗或在体内通过结合至Fc受体发生。举例来说,拮抗性抗体可以经由生物素/抗生蛋白链菌素交联或在体外经由二抗结合而转化成激动性抗体(参见例如,Gravestein等人(1996)J.Exp.Med.184:675-685;Gravestein等人(1994)International Immunol.7:551-557)。激动性抗体可以通过模拟受体配体的生物活性或通过增强受体聚集,由此活化受体信号传导来发挥其活性。在一些实施方案中,拮抗活性不需要存在抗体交联。在一些实施方案中,当呈现为单体时,抗体将充当拮抗剂,当呈现为二聚体或多聚体时,抗体将充当激动剂。拮抗性抗体可以通过阻断受体-配体相互作用来发挥其活性。
[0219] 示例性拮抗剂抗体Fc同种型和修饰提供在以下表B中。在一些实施方案中,所述拮抗剂抗体具有在以下表B中列出的Fc同种型。
[0220] 惰性和拮抗剂抗体的示例性Fc同种型
[0221] 在一些实施方案中,惰性和/或拮抗剂抗TREM抗体具有在以下表B中列出的Fc同种型。
[0222] 表B:与Fcγ受体的结合减少的示例性抗TREM2抗体Fc同种型
[0223]
[0224]
[0225] 在某些实施方案中,该抗体具有IgG1同种型。在一些实施方案中,抗体含有小鼠IgG1恒定区。在一些实施方案中,抗体含有人IgG1恒定区。在一些实施方案中,人IgG1恒定区包括Fc区。在一些实施方案中,Fc区含有一个或多个修饰。举例来说,在一些实施方案中,Fc区含有一个或多个氨基酸取代(例如相对于同一同种型的野生型Fc区)。在一些实施方案中,该一个或多个氨基酸取代选自N297A、N297Q(Bolt S等人(1993)Eur J Immunol 23:403-411)、D265A、L234A、L235A(McEarchern等人(2007)Blood,109:1185-1192)、C226S、C229S(McEarchern等人(2007)Blood,109:1185-1192)、P238S(Davis等人(2007)J 
Rheumatol,34:2204-2210)、E233P、L234V(McEarchern等人(2007)Blood,109:1185-1192)、P238A、A327Q、A327G、P329A(Shields RL.等人(2001)J Biol Chem.276(9):6591-604)、K322A、L234F、L235E(Hezareh等人(2001)J Virol 75,12161–12168;Oganesyan等人(2008).Acta Crystallographica 64,700–704)、P331S(Oganesyan等人(2008)Acta 
Crystallographica 64,700–704)、T394D(Wilkinson等人(2013)MAbs 5(3):406–417)、A330L、M252Y、S254T和/或T256E,其中氨基酸位置是根据EU或Kabat编号规定。在某些实施方案中,Fc区另外在对应于根据EU或Kabat编号规定的甘氨酸236的位置处包含氨基酸缺失。
[0226] 在一些实施方案中,抗体具有含重链恒定区的IgG1同种型,该重链恒定区含有根据EU或Kabat编号规定的C220S氨基酸取代。
[0227] 在一些实施方案中,Fc区另外含有根据EU或Kabat编号规定选自t A330L、L234F、L235E和/或P331S的一个或多个额外氨基酸取代。
[0228] 在某些实施方案中,该抗体具有IgG2同种型。在一些实施方案中,抗体含有人IgG2恒定区。在一些实施方案中,人IgG2恒定区包括Fc区。在一些实施方案中,Fc区含有一个或多个修饰。举例来说,在一些实施方案中,Fc区含有一个或多个氨基酸取代(例如相对于同一同种型的野生型Fc区)。在一些实施方案中,该一个或多个氨基酸取代选自V234A、G237A、H268E、V309L、N297A、N297Q、A330S、P331S、C232S、C233S、M252Y、S254T和/或T256E,其中氨基酸位置是根据EU或Kabat编号规定。
[0229] 在某些实施方案中,该抗体具有IgG4同种型。在一些实施方案中,抗体含有人IgG4恒定区。在一些实施方案中,人IgG4恒定区包括Fc区。在一些实施方案中,Fc区含有一个或多个修饰。举例来说,在一些实施方案中,Fc区含有一个或多个氨基酸取代(例如相对于同一同种型的野生型Fc区)。在一些实施方案中,该一个或多个氨基酸取代选自E233P、F234V、L235A、G237A、E318A(Hutchins等人(1995)Proc Natl Acad Sci USA,92:11980-11984)、S228P、L236E、S241P、L248E(Reddy等人(2000)J Immunol,164:1925-1933;Angal等人(1993)Mol Immunol.30(1):105-8;US 8614299B2)、T394D、M252Y、S254T、T256E、和/或N297A、N297Q,其中氨基酸位置是根据EU或Kabat编号规定。
[0230] 在一些实施方案中,Fc区另外含有选自M252Y、S254T和/或T256E的一个或多个额外氨基酸取代,其中氨基酸位置是根据EU或Kabat编号规定。
[0231] 其它IgG突变
[0232] 在一些实施方案中,本文所描述的IgG1变体中的一种或多种可以与A330L突变(Lazar等人(2006)Proc Natl Acad Sci USA,103:4005-4010),或L234F、L235E和/或P331S突变(Sazinsky等人(2008)Proc Natl Acad Sci USA,105:20167-20172)中的一种或多种组合,以消除补体活化,其中氨基酸位置是根据EU或Kabat编号规定。在一些实施方案中,本文所描述的IgG变体可以与该一种或多种突变组合以增大抗体在人血清中的半衰期(例如,根据EU或Kabat编号规定的M252Y、S254T、T256E突变)(Dall’Acqua等人(2006)J Biol Chem,281:23514-23524;及Strohl等人(2009)Current Opinion in Biotechnology,20:
685–691)。
[0233] 在一些实施方案中,本公开的IgG4变体可以与根据EU或Kabat编号规定的S228P突变(Angal等人(1993)Mol Immunol,30:105-108)和/或与Peters等人(2012)J Biol Chem.13;287(29):24525-33中所描述的一种或多种突变组合以增强抗体稳定化。
[0234] 示例性抗TREM2抗体
[0235] 在一些实施方案中,与在本公开的分离的抗TREM2抗体不存在下由一种或多种TREM2配体与TREM2蛋白的结合诱导的一种或多种TREM2活性相比,所述抗体增强由一种或多种TREM2配体与TREM2蛋白的结合诱导的一种或多种TREM2活性。在一些实施方案中,所述抗TREM2抗体增强一种或多种TREM2活性而不与一种或多种TREM2配体竞争结合到TREM2蛋白或不以其他方式阻断一种或多种TREM2配体与TREM2蛋白的结合。在一些实施方案中,所述抗体是人抗体、人源化抗体、双特异性抗体、多价抗体、或嵌合抗体。此类抗体的示例性描述存在于整个本公开中。在一些实施方案中,所述抗体是识别第一抗原和第二抗原的双特异性抗体。
[0236] 在一些实施方案中,本公开的抗TREM2抗体结合到人TREM2或其同源物,包括但不限于哺乳动物(例如,非人哺乳动物)TREM2蛋白、小鼠TREM2蛋白(Uniprot登记号Q99NH8)、大鼠TREM2蛋白(Uniprot登记号D3ZZ89)、恒河猴TREM2蛋白(Uniprot登记号F6QVF2)、牛TREM2蛋白(Uniprot登记号Q05B59)、马TREM2蛋白(Uniprot登记号F7D6L0)、猪TREM2蛋白(Uniprot登记号H2EZZ3)、以及狗TREM2蛋白(Uniprot登记号E2RP46)。在一些实施方案中,本公开的抗TREM2抗体特异性地结合到人TREM2。在一些实施方案中,本公开的抗TREM2抗体特异性地结合到小鼠TREM2。在一些实施方案中,本公开的抗TREM2抗体特异性地结合到人TREM2和小鼠TREM2两者。在一些实施方案中,本公开的抗TREM2抗体调控(例如,诱导或抑制)至少一种TREM2活性。在一些实施方案中,所述至少一种TREM2活性包括但不限于(a)调控一种或多种抗炎介质的表达,任选地其中所述一种或多种抗炎介质选自IL-4、IL-10TGF-β、IL-13、IL-35IL-16、IFN-α、IL-1Ra、VEGF、G-CSF、YM、AXL、FLT1、以及TNF或IL-6的可溶性受体;(b)调控选自以下的一种或多种细胞中的一种或多种抗炎介质的表达:巨噬细胞、树突细胞、骨髓衍生的树突细胞、单核细胞、破骨细胞、以及小神经胶质细胞;(c)调控一种或多种促炎介质的表达,任选地其中所述一种或多种促炎介质选自IFN-β、IL-1α、IL-1β、TNF-α、IL-6、IL-8、CRP、CD86、MCP-1/CCL2、CCL3、CCL4、CCL5、CCR2、CXCL-10、Gata3、IL-20家族成员、IL-33、LIF、IFN-γ、OSM、CNTF、CSF1、OPN、CD11c、GM-CSF、IL-11、IL-12、IL-17、IL-18、以及IL-23;调控其表达在炎症诱导之后增加的一种或多种基因,任选地其中所述一种或多种基因选自Fabp3、Fabp5、和LDR组成的组;调控一种或多种促炎介质的分泌,所述一种或多种促炎介质选自IFN-β、IL-1α、IL-1β、CD86、TNF-α、IL-6、IL-8、CRP、MCP-1/CCL2、CCL3、CCL4、CCL5、CCR2、CXCL-10、Gata3、IL-20家族成员、IL-33、LIF、IFN-γ、OSM、CNTF、CSF-1、OPN、CD11c、GM-CSF、IL-11、IL-12、IL-17、IL-18、以及IL-23,并且任选地其中所述调控发生在选自以下的一种或多中细胞中:巨噬细胞、M1巨噬细胞、活化的M1巨噬细胞、M2巨噬细胞、树突细胞、单核细胞、破骨细胞、皮肤朗格汉斯细胞、库普弗细胞、以及小神经胶质细胞;调控选自以下的一种或多种抗炎介质的分泌:IL-4、IL-10TGF-β、IL-13、IL-35IL-16、IFN-α、IL-1Ra、VEGF、G-CSF、YM、AXL、FLT1、以及TNF或IL-6的可溶性受体,并且任选地其中所述调控发生在选自以下的一种或多种细胞中:巨噬细胞、M1巨噬细胞、活化的M1巨噬细胞、M2巨噬细胞、树突细胞、单核细胞、破骨细胞、皮肤朗格汉斯细胞、库普弗细胞、以及小神经胶质细胞;
(d)调控选自以下的一种或多种细胞中的一种或多种促炎介质的表达:巨噬细胞、树突细胞、骨髓衍生的树突细胞、单核细胞、破骨细胞、以及小神经胶质细胞;(e)活化细胞外信号调节激酶(ERK)磷酸化;(f)活化多种细胞蛋白上的酪氨酸磷酸化;(g)调控C-C趋化因子受体7(CCR7)的表达;(h)活化小神经胶质细胞向CCL19和CCL21表达细胞的趋化性;(i)增加由选自以下的一种或多种细胞诱导的T细胞引发和/或调控CD8+T细胞、CD4+T细胞、和/或调节性T细胞的T细胞功能:树突细胞、骨髓衍生的树突细胞、单核细胞、小神经胶质细胞、M1小神经胶质细胞、活化的M1小神经胶质细胞、M2小神经胶质细胞、巨噬细胞、M1巨噬细胞、活化的M1巨噬细胞、以及M2巨噬细胞;(j)活化破骨细胞产生、增加破骨细胞生成的速率、或两者;
(k)增加选自以下的一种或多种细胞的存活:树突细胞、骨髓衍生的树突细胞、巨噬细胞、M1巨噬细胞、活化的M1巨噬细胞、M2巨噬细胞、单核细胞、破骨细胞、T细胞、T辅助细胞、细胞毒性T细胞、粒细胞、嗜中性粒细胞、小神经胶质细胞、M1小神经胶质细胞、活化的M1小神经胶质细胞、以及M2小神经胶质细胞;(l)增加选自以下的一种或多种细胞的增殖:树突细胞、骨髓衍生的树突细胞、巨噬细胞、M1巨噬细胞、活化的M1巨噬细胞、M2巨噬细胞、单核细胞、破骨细胞、T细胞、T辅助细胞、细胞毒性T细胞、粒细胞、嗜中性粒细胞、小神经胶质细胞、M1小神经胶质细胞、活化的M1小神经胶质细胞、以及M2小神经胶质细胞;(m)活化选自以下的一种或多种细胞的迁移:树突细胞、骨髓衍生的树突细胞、巨噬细胞、M1巨噬细胞、活化的M1巨噬细胞、M2巨噬细胞、单核细胞、破骨细胞、T细胞、T辅助细胞、细胞毒性T细胞、粒细胞、嗜中性粒细胞、小神经胶质细胞、M1小神经胶质细胞、活化的M1小神经胶质细胞、以及M2小神经胶质细胞;(n)活化选自以下的一种或多种细胞的一种或多种功能:树突细胞、骨髓衍生的树突细胞、巨噬细胞、M1巨噬细胞、活化的M1巨噬细胞、M2巨噬细胞、单核细胞、破骨细胞、T细胞、T辅助细胞、细胞毒性T细胞、粒细胞、嗜中性粒细胞、小神经胶质细胞、M1小神经胶质细胞、活化的M1小神经胶质细胞、以及M2小神经胶质细胞;(o)活化选自以下的一种或多种细胞的成熟:树突细胞、骨髓衍生的树突细胞、巨噬细胞、M1巨噬细胞、活化的M1巨噬细胞、M2巨噬细胞、单核细胞、破骨细胞、T细胞、T辅助细胞、细胞毒性T细胞、粒细胞、嗜中性粒细胞、小神经胶质细胞、M1小神经胶质细胞、活化的M1小神经胶质细胞、以及M2小神经胶质细胞;(p)活化选自以下的一种或多种类型的清除:凋亡神经元清除、神经组织碎片清除、非神经组织碎片清除、细菌清除、其他异物清除、致病性蛋白清除、致病性肽清除、以及肿瘤细胞清除;任选地其中所述致病性蛋白选自淀粉样蛋白β、寡聚淀粉样蛋白β、淀粉样蛋白β斑、淀粉样蛋白前体蛋白或其片段、Tau、IAPP、α-突触核蛋白、TDP-43、FUS蛋白、C9orf72(染色体9开放阅读框72)、c9RAN蛋白、朊病毒蛋白、PrPSc、亨廷顿蛋白、降血钙素、超氧化物歧化酶、共济失调蛋白、共济失调蛋白1、共济失调蛋白2、共济失调蛋白3、共济失调蛋白7、共济失调蛋白8、共济失调蛋白10、路易小体、心房利钠因子、胰岛淀粉样蛋白多肽、胰岛素、载脂蛋白AI、血清淀粉样蛋白A、medin、泌乳素、转甲状腺素蛋白、溶菌酶、β2微球蛋白、凝溶胶蛋白、角膜上皮蛋白、抑半胱氨酸蛋白酶蛋白、免疫球蛋白轻链AL、S-IBM蛋白、重复序列相关非ATG(RAN)翻译产物、二肽重复序列(DPR)肽、甘氨酸-丙氨酸(GA)重复序列肽、甘氨酸-脯氨酸(GP)重复序列肽、甘氨酸-精氨酸(GR)重复序列肽、脯氨酸-丙氨酸(PA)重复序列肽、泛素、以及脯氨酸-精氨酸(PR)重复序列肽并且所述肿瘤细胞来自选自以下的癌症:膀胱癌、脑癌、乳腺癌、结肠癌、直肠癌、子宫内膜癌、肾癌、肾细胞癌、肾盂癌、白血病、肺癌、黑素瘤、非霍奇金氏淋巴瘤、胰腺癌、前列腺癌、卵巢癌、纤维肉瘤、以及甲状腺癌;(u)活化对以下中的一种或多种的吞噬作用:凋亡神经元、神经组织碎片、非神经组织碎片、细菌、其他异物、致病性蛋白、致病性肽、致病性核酸、或肿瘤细胞;任选地其中所述致病性核酸是反义GGCCCC(G2C4)重复序列扩增RNA,所述致病性蛋白选自淀粉样蛋白β、寡聚淀粉样蛋白β、淀粉样蛋白β斑、淀粉样蛋白前体蛋白或其片段、Tau、IAPP、α-突触核蛋白、TDP-43、FUS蛋白、C9orf72(染色体9开放阅读框72)、c9RAN蛋白、朊病毒蛋白、PrPSc、亨廷顿蛋白、降血钙素、超氧化物歧化酶、共济失调蛋白、共济失调蛋白1、共济失调蛋白2、共济失调蛋白3、共济失调蛋白7、共济失调蛋白8、共济失调蛋白10、路易小体、心房利钠因子、胰岛淀粉样蛋白多肽、胰岛素、载脂蛋白AI、血清淀粉样蛋白A、medin、泌乳素、转甲状腺素蛋白、溶菌酶、β2微球蛋白、凝溶胶蛋白、角膜上皮蛋白、抑半胱氨酸蛋白酶蛋白、免疫球蛋白轻链AL、S-IBM蛋白、重复序列相关非ATG(RAN)翻译产物、二肽重复序列(DPR)肽、甘氨酸-丙氨酸(GA)重复序列肽、甘氨酸-脯氨酸(GP)重复序列肽、甘氨酸-精氨酸(GR)重复序列肽、脯氨酸-丙氨酸(PA)重复序列肽、泛素、以及脯氨酸-精氨酸(PR)重复序列肽,并且所述肿瘤细胞来自选自以下的癌症:膀胱癌、脑癌、乳腺癌、结肠癌、直肠癌、子宫内膜癌、肾癌、肾细胞癌、肾盂癌、白血病、肺癌、黑素瘤、非霍奇金氏淋巴瘤、胰腺癌、前列腺癌、卵巢癌、纤维肉瘤、或甲状腺癌;(p)结合到肿瘤细胞上的TREM2配体;(q)结合到选自以下的细胞上的TREM2配体:嗜中性粒细胞、树突细胞、骨髓衍生的树突细胞、单核细胞、小神经胶质细胞、以及巨噬细胞;(r)活化由以下中的一种或多种进行的肿瘤细胞杀伤:小神经胶质细胞、巨噬细胞、树突细胞、骨髓衍生的树突细胞、嗜中性粒细胞、T细胞、T辅助细胞、或细胞毒性T细胞;(s)活化以下中的一种或多种的抗肿瘤细胞增殖活性:小神经胶质细胞、巨噬细胞、树突细胞、骨髓衍生的树突细胞、嗜中性粒细胞、T细胞、T辅助细胞、或细胞毒性T细胞;(t)活化以下中的一种或多种的抗肿瘤细胞迁移活性:小神经胶质细胞、巨噬细胞、树突细胞、骨髓衍生的树突细胞、嗜中性粒细胞、T细胞、T辅助细胞、或细胞毒性T细胞;(y)活化一种或多种含有ITAM基序的受体,任选地其中所述一种或多种含有ITAM基序的受体选自TREM1、TREM2、FcgR、DAP10、以及DAP12;(z)活化通过一种或多种模式识别受体(PRR)进行的信号传导,任选地其中所述一种或多种PRR选自识别病原体相关分子模式(PAMP)的受体、识别损害相关分子模式(DAMP)的受体、以及其任何组合;(aa)活化一种或多种含有基序D/Ex0–2YxxL/IX6–8YxxL/I(SEQ ID NO:883)的受体;(bb)活化通过一种或多种Toll样受体进行的信号传导;(cc)活化JAK-STAT信号传导途径;(dd)活化B细胞的核因子κ-轻链增强子(NFκB)的活化;(dd)含有ITAM基序的受体的磷酸化;(ee)调控一种或多种炎性受体的表达,任选地其中所述一种或多种炎性受体包括CD86并且所述一种或多种炎性受体在以下中的一种或多种上表达:小神经胶质细胞、巨噬细胞、树突细胞、骨髓衍生的树突细胞、嗜中性粒细胞、T细胞、T辅助细胞、或细胞毒性T细胞;(ff)增加一种或多种TREM2依赖性基因的表达;(gg)破坏的TREM2依赖性基因表达的正常化;(hh)增加一种或多种ITAM依赖性基因的表达,任选地其中所述一种多种ITAM依赖性基因通过活化T细胞的核因子(NFAT)转录因子活化;(ii)抑制以下中的一种或多种的分化:免疫抑制树突细胞、免疫抑制巨噬细胞、骨髓来源的抑制细胞、肿瘤相关巨噬细胞、免疫抑制嗜中性粒细胞、以及调节性T细胞;(jj)抑制以下中的一种或多种的功能性:免疫抑制树突细胞、免疫抑制巨噬细胞、骨髓来源的抑制细胞、肿瘤相关巨噬细胞、免疫抑制嗜中性粒细胞、以及调节性T细胞;(kk)减少以下中的一种或多种到肿瘤中的浸润:免疫抑制树突细胞、免疫抑制巨噬细胞、骨髓来源的抑制细胞、肿瘤相关巨噬细胞、免疫抑制嗜中性粒细胞、以及调节性T细胞;(ll)减少肿瘤中、外周血中、或其他淋巴样器官中的促进肿瘤的髓样/粒细胞性免疫抑制细胞的数量;(mm)抑制骨髓来源的抑制细胞的促进肿瘤的活性;(nn)减少肿瘤中或外周血中促进肿瘤的细胞因子的表达,任选地其中所述促进肿瘤的细胞因子是TGF-β或IL-10;(oo)减少促进肿瘤的FoxP3+调节性T淋巴细胞的肿瘤浸润;(pp)增加具有肿瘤杀伤潜力的肿瘤特异性T淋巴细胞的活化;(qq)降低肿瘤体积;(rr)降低肿瘤生长速率;(ss)增加调控抗肿瘤T细胞应答的一种或多种免疫疗法的效力,任选地其中所述一种或多种免疫疗法选自PD1/PDL1阻断、CTLA-4阻断、和癌症疫苗;(tt)抑制PLCγ/PKC/钙动员;
以及(uu)抑制PI3K/Akt、Ras/MAPK信号传导。(vv)增加由树突细胞、巨噬细胞、单核细胞、和/或小神经胶质细胞进行的吞噬作用;(ww)诱导或保持细胞表面上的TREM2簇集;(xx)TREM2结合到DAP12;(yy)TREM2磷酸化;(zz)DAP12磷酸化;(aaa)活化一种或多种SRC家族酪氨酸激酶,包括Syk激酶;(bbb)将Syk、ZAP70、或两者募集到DAP12/TREM2复合物;(ccc)调控选自以下的一种或多种蛋白质的表达:C1qa、C1qB、C1qC、C1s、C1R、C4、C2、C3、ITGB2、HMOX1、LAT2.CASP1、CSTA、VSIG4、MS4A4A、C3AR1、GPX1、TyroBP、ALOX5AP、ITGAM、SLC7A7、CD4、ITGAX、PYCARD、以及VEGF;(ddd)增加记忆力;以及(eee)减少认知缺陷。
[0237] 在一些实施方案中,本公开的抗TREM2抗体结合到本公开的TREM2蛋白的膜结合的或可溶性形式和/或天然存在的变体。在某些优选的实施方案中,所述抗TREM2抗体结合到人TREM2。
[0238] 在一些实施方案中,本公开的抗TREM2抗体是激动剂抗体或拮抗剂抗体,其结合到本公开的在细胞表面上表达的TREM2蛋白,并且在结合到表面表达的TREM2蛋白之后调控(例如,诱导或抑制)本公开的至少一种TREM2活性。在一些实施方案中,本公开的抗TREM2抗体是惰性抗体。
[0239] 抗TREM2抗体结合区
[0240] 本公开的某些方面提供结合到一种或多种氨基酸的抗TREM2抗体,所述一种或多种氨基酸在人TREM2(SEQ ID NO:1)的氨基酸残基19-174;29-112;113-174;35-49、35-49和140-150;39-49、39-49和63-77;51-61;55-62;55-62、104-109、和148-158;55-62、104-109、和160-166;55-65、55-65和124-134;63-73;63-77;104-109;117-133;124-134;137-146;
139-147;139-149;140-150;140-146;140-143;142-152;146-154;148-158;149-157;149和
150;151-155;154-161;156-170;160-166;或162-165内,或在TREM2同源物或直系同源物上的对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基19-174;29-112;113-174;35-49、35-49和140-150;39-
49、39-49和63-77;51-61;55-62;55-62、104-109、和148-158;55-62、104-109、和160-166;
55-65、55-65和124-134;63-73;63-77;104-109;117-133;124-134;137-146;139-147;139-
149;140-150;140-146;140-143;142-152;146-154;148-158;149-157;149和150;151-155;
154-161;156-170;160-166;或162-165的氨基酸残基内。在一些实施方案中,所述抗TREM2抗体结合到一种或多种氨基酸,所述一种或多种氨基酸在人TREM2(SEQ ID NO:1)的氨基酸残基35-49内,或在TREM2同源物或直系同源物上的对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基35-49的氨基酸残基内。在一些实施方案中,所述抗TREM2抗体结合到一种或多种氨基酸,所述一种或多种氨基酸在人TREM2(SEQ ID NO:1)的氨基酸残基35-49和140-150内,或在TREM2同源物或直系同源物上的对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基35-49和140-150的氨基酸残基内。在一些实施方案中,所述抗TREM2抗体结合到一种或多种氨基酸,所述一种或多种氨基酸在人TREM2(SEQ ID NO:1)的氨基酸残基39-49内,或在TREM2同源物或直系同源物上的对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基39-49的氨基酸残基内。在一些实施方案中,所述抗TREM2抗体结合到一种或多种氨基酸,所述一种或多种氨基酸在人TREM2(SEQ ID NO:1)的氨基酸残基39-49和63-77内,或在TREM2同源物或直系同源物上的对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基
39-49和63-77的氨基酸残基内。在一些实施方案中,所述抗TREM2抗体结合到一种或多种氨基酸,所述一种或多种氨基酸在人TREM2(SEQ ID NO:1)的氨基酸残基51-61内,或在TREM2同源物或直系同源物上的对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基51-61的氨基酸残基内。在一些实施方案中,所述抗TREM2抗体结合到一种或多种氨基酸,所述一种或多种氨基酸在人TREM2(SEQ ID NO:1)的氨基酸残基55-62内,或在TREM2同源物或直系同源物上的对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基55-62的氨基酸残基内。在一些实施方案中,所述抗TREM2抗体结合到一种或多种氨基酸,所述一种或多种氨基酸在人TREM2(SEQ ID NO:1)的氨基酸残基
55-62、104-109、和148-158内,或在TREM2同源物或直系同源物上的对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基55-62、104-109、和148-158的氨基酸残基内。在一些实施方案中,所述抗TREM2抗体结合到一种或多种氨基酸,所述一种或多种氨基酸在人TREM2(SEQ ID NO:1)的氨基酸残基55-62、104-109、和160-166内,或在TREM2同源物或直系同源物上的对应于SEQ ID NO:
1的氨基酸残基55-62、104-109、和160-166的氨基酸残基内。在一些实施方案中,所述抗TREM2抗体结合到一种或多种氨基酸,所述一种或多种氨基酸在人TREM2(SEQ ID NO:1)的氨基酸残基55-65内,或在TREM2同源物或直系同源物上的对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基55-65的氨基酸残基内。在一些实施方案中,所述抗TREM2抗体结合到一种或多种氨基酸,所述一种或多种氨基酸在人TREM2(SEQ ID NO:1)的氨基酸残基55-65和124-134内,或在TREM2同源物或直系同源物上的对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基55-65和124-134的氨基酸残基内。在一些实施方案中,所述抗TREM2抗体结合到一种或多种氨基酸,所述一种或多种氨基酸在人TREM2(SEQ ID NO:1)的氨基酸残基63-73内,或在TREM2同源物或直系同源物上的对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基63-73的氨基酸残基内。在一些实施方案中,所述抗TREM2抗体结合到一种或多种氨基酸,所述一种或多种氨基酸在人TREM2(SEQ ID NO:1)的氨基酸残基63-77内,或在TREM2同源物或直系同源物上的对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基63-77的氨基酸残基内。在一些实施方案中,所述抗TREM2抗体结合到一种或多种氨基酸,所述一种或多种氨基酸在人TREM2(SEQ ID NO:1)的氨基酸残基104-109内,或在TREM2同源物或直系同源物上的对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基104-109的氨基酸残基内。在一些实施方案中,所述抗TREM2抗体结合到一种或多种氨基酸,所述一种或多种氨基酸在人TREM2(SEQ ID NO:1)的氨基酸残基117-133内,或在TREM2同源物或直系同源物上的对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基117-133的氨基酸残基内。在一些实施方案中,所述抗TREM2抗体结合到一种或多种氨基酸,所述一种或多种氨基酸在人TREM2(SEQ ID NO:1)的氨基酸残基124-
134内,或在TREM2同源物或直系同源物上的对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基124-134的氨基酸残基内。在一些实施方案中,所述抗TREM2抗体结合到一种或多种氨基酸,所述一种或多种氨基酸在人TREM2(SEQ ID NO:1)的氨基酸残基137-146内,或在TREM2同源物或直系同源物上的对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基137-146的氨基酸残基内。在一些实施方案中,所述抗TREM2抗体结合到一种或多种氨基酸,所述一种或多种氨基酸在人TREM2(SEQ ID NO:1)的氨基酸残基139-147内,或在TREM2同源物或直系同源物上的对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基139-147的氨基酸残基内。在一些实施方案中,所述抗TREM2抗体结合到一种或多种氨基酸,所述一种或多种氨基酸在人TREM2(SEQ ID NO:1)的氨基酸残基139-149内,或在TREM2同源物或直系同源物上的对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基139-149的氨基酸残基内。在一些实施方案中,所述抗TREM2抗体结合到一种或多种氨基酸,所述一种或多种氨基酸在人TREM2(SEQ ID NO:1)的氨基酸残基140-150内,或在TREM2同源物或直系同源物上的对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基140-150的氨基酸残基内。在一些实施方案中,所述抗TREM2抗体结合到一种或多种氨基酸,所述一种或多种氨基酸在人TREM2(SEQ ID NO:1)的氨基酸残基140-146内,或在TREM2同源物或直系同源物上的对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基140-146的氨基酸残基内。在一些实施方案中,所述抗TREM2抗体结合到一种或多种氨基酸,所述一种或多种氨基酸在人TREM2(SEQ ID NO:1)的氨基酸残基140-143内,或在TREM2同源物或直系同源物上的对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基140-143的氨基酸残基内。在一些实施方案中,所述抗TREM2抗体结合到一种或多种氨基酸,所述一种或多种氨基酸在人TREM2(SEQ ID NO:1)的氨基酸残基142-152内,或在TREM2同源物或直系同源物上的对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基142-152的氨基酸残基内。在一些实施方案中,所述抗TREM2抗体结合到一种或多种氨基酸,所述一种或多种氨基酸在人TREM2(SEQ ID NO:1)的氨基酸残基146-154内,或在TREM2同源物或直系同源物上的对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基146-154的氨基酸残基内。在一些实施方案中,所述抗TREM2抗体结合到一种或多种氨基酸,所述一种或多种氨基酸在人TREM2(SEQ ID NO:1)的氨基酸残基148-158内,或在TREM2同源物或直系同源物上的对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基148-158的氨基酸残基内。在一些实施方案中,所述抗TREM2抗体结合到一种或多种氨基酸,所述一种或多种氨基酸在人TREM2(SEQ ID NO:1)的氨基酸残基149-157内,或在TREM2同源物或直系同源物上的对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基149-157的氨基酸残基内。在一些实施方案中,所述抗TREM2抗体结合到一种或多种氨基酸,所述一种或多种氨基酸在人TREM2(SEQ ID NO:1)的氨基酸残基149和150内,或在TREM2同源物或直系同源物上的对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基149和150的氨基酸残基内。在一些实施方案中,所述抗TREM2抗体结合到一种或多种氨基酸,所述一种或多种氨基酸在人TREM2(SEQ ID NO:1)的氨基酸残基154-161内,或在TREM2同源物或直系同源物上的对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基154-161的氨基酸残基内。在一些实施方案中,所述抗TREM2抗体结合到一种或多种氨基酸,所述一种或多种氨基酸在人TREM2(SEQ ID NO:1)的氨基酸残基156-170内,或在TREM2同源物或直系同源物上的对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基156-170的氨基酸残基内。在一些实施方案中,所述抗TREM2抗体结合到一种或多种氨基酸,所述一种或多种氨基酸在人TREM2(SEQ ID NO:1)的氨基酸残基160-166内,或在TREM2同源物或直系同源物上的对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基160-166的氨基酸残基内。在一些实施方案中,所述抗TREM2抗体结合到一种或多种氨基酸,所述一种或多种氨基酸在人TREM2(SEQ ID NO:1)的氨基酸残基162-165内,或在TREM2同源物或直系同源物上的对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基162-165的氨基酸残基内。
[0241] 在其他实施方案中,本公开的抗TREM2抗体结合到包含人TREM 2(SEQ ID NO:1)的氨基酸残基Arg47或Asp87的表位。在一些实施方案中,本公开的抗TREM2抗体结合到包含人TREM 2(SEQ ID NO:1)的氨基酸残基40-44的表位。在一些实施方案中,本公开的抗TREM2抗体结合到包含人TREM2(SEQ ID NO:1)的氨基酸残基67-76的表位。在一些实施方案中,本公开的抗TREM2抗体结合到包含人TREM 2(SEQ ID NO:1)的氨基酸残基114-118的表位。
[0242] 在一些实施方案中,本公开的抗TREM2抗体结合到SEQ ID NO:1的选自以下的一个或多个氨基酸残基:K42、H43、W44、G45、H67、R77、T88、H114、E117、E151、D152、H154、以及E156,或结合到哺乳动物TREM2蛋白上的对应于SEQ ID NO:1的选自以下的氨基酸残基的一个或多个氨基酸残基:K42、H43、W44、G45、H67、R77、T88、H114、E117、E151、D152、H154、以及E156。在一些实施方案中,本公开的抗TREM2抗体结合到SEQ ID NO:1的选自E151、D152、H154、以及E156的一个或多个、两个或更多个、三个或更多个、或全部四个氨基酸残基,或结合到哺乳动物TREM2蛋白上的对应于SEQ ID NO:1的选自E151、D152、H154、以及E156的氨基酸残基的一个或多个、两个或更多个、三个或更多个、或全部四个氨基酸残基。在一些实施方案中,本公开的抗TREM2抗体结合到SEQ ID NO:1的选自K42和H114的一个或多个或全部两个氨基酸残基,或结合到哺乳动物TREM2蛋白上的对应于SEQ ID NO:1的选自K42和H114的氨基酸残基的一个或多个、或全部两个氨基酸残基。在一些实施方案中,本公开的抗TREM2抗体结合到SEQ ID NO:1的选自K42、G45、和H114的一个或多个、两个或更多个、或全部三个氨基酸残基,或结合到哺乳动物TREM2蛋白上的对应于SEQ ID NO:1的选自K42、G45、和H114的氨基酸残基的一个或多个、两个或更多个、或全部三个氨基酸残基。在一些实施方案中,本公开的抗TREM2抗体结合到SEQ ID NO:1的氨基酸残基R77,或结合到哺乳动物TREM2蛋白上的对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基R77的氨基酸残基。
[0243] 在一些实施方案中,本公开的抗TREM2抗体竞争性地抑制选自在表2A、表2B、表3A、表3B、表4A、表4B、表7A、以及表7B中列出的任一种抗体中的至少一种抗体的结合。在一些实施方案中,本公开的抗TREM2抗体竞争性地抑制选自以下的至少一种抗体的结合:11A7、3A2、3B10、6G12、6H6、7A9、7B3、8A1、8E10、8F11、8F8、9F5、9G1、9G3、10A9、10C1、11A8、12E2、
12F9、12G6、2C7、2F5、3C1、4D7、4D11、6C11、6G12、7A3、7C5、7E9、7F6、7G1、7H1、8C3、8F10、
12A1、1E9、2C5、3C5、4C12、4F2、5A2、6B3、7D1、7D9、11D8、8A12、10E7、10B11、10D2、7D5、2A7、
3G12、6H9、8G9、9B4、10A1、11A8、12F3、2F8、10E3、1H7、2F6、2H8、3A7、7E5、7F8、11H5、7C5、
4F11、12D9、1B4v1、1B4v2、6H2、7B11v1、7B11v2、18D8、18E4v1、18E4v2、29F6v1、29F6v2、
40D5v1、40D5v2、43B9、44A8v1、44A8v2、44B4v1、以及44B4v2。
[0244] 在一些实施方案中,本公开的抗TREM2抗体结合到与选自在表2A、表2B、表3A、表3B、表4A、表4B、表7A、以及表7B中列出的任一种抗体中的至少一种抗体所结合的TREM2表位相同或重叠的人TREM2表位。在一些实施方案中,本公开的抗TREM2抗体结合到与选自以下的至少一种抗体所结合的TREM2表位相同或重叠的人TREM2表位:11A7、3A2、3B10、6G12、
6H6、7A9、7B3、8A1、8E10、8F11、8F8、9F5、9G1、9G3、10A9、10C1、11A8、12E2、12F9、12G6、2C7、
2F5、3C1、4D7、4D11、6C11、6G12、7A3、7C5、7E9、7F6、7G1、7H1、8C3、8F10、12A1、1E9、2C5、3C5、
4C12、4F2、5A2、6B3、7D1、7D9、11D8、8A12、10E7、10B11、10D2、7D5、2A7、3G12、6H9、8G9、9B4、
10A1、11A8、12F3、2F8、10E3、1H7、2F6、2H8、3A7、7E5、7F8、11H5、7C5、4F11、12D9、1B4v1、
1B4v2、6H2、7B11v1、7B11v2、18D8、18E4v1、18E4v2、29F6v1、29F6v2、40D5v1、40D5v2、43B9、
44A8v1、44A8v2、44B4v1、以及44B4v2。
[0245] 在一些实施方案中,本公开的抗TREM2抗体结合选自在表2A、表2B、表3A、表3B、表4A、表4B、表7A、以及表7B中列出的任一种抗体中的至少一种抗体所结合的基本上相同的TREM2表位。在一些实施方案中,本公开的抗TREM2抗体结合选自以下的至少一种抗体所结合的基本上相同的TREM2表位:1A7、3A2、3B10、6G12、6H6、7A9、7B3、8A1、8E10、8F11、8F8、
9F5、9G1、9G3、10A9、10C1、11A8、12E2、12F9、12G6、2C7、2F5、3C1、4D7、4D11、6C11、6G12、7A3、
7C5、7E9、7F6、7G1、7H1、8C3、8F10、12A1、1E9、2C5、3C5、4C12、4F2、5A2、6B3、7D1、7D9、11D8、
8A12、10E7、10B11、10D2、7D5、2A7、3G12、6H9、8G9、9B4、10A1、11A8、12F3、2F8、10E3、1H7、
2F6、2H8、3A7、7E5、7F8、11H5、7C5、4F11、12D9、1B4v1、1B4v2、6H2、7B11v1、7B11v2、18D8、
18E4v1、18E4v2、29F6v1、29F6v2、40D5v1、40D5v2、43B9、44A8v1、44A8v2、44B4v1、以及
44B4v2。用于定位抗体结合的表位的详细示例性方法提供在Morris(1996)“Epitope 
Mapping Protocols,”在Methods in Molecular Biology第66卷(Humana Press,Totowa,NJ)中。
[0246] 在一些实施方案中,本公开的抗TREM2抗体与选自以下的一种或多种抗体竞争结合到TREM2:1A7、3A2、3B10、6G12、6H6、7A9、7B3、8A1、8E10、8F11、8F8、9F5、9G1、9G3、10A9、10C1、11A8、12E2、12F9、12G6、2C7、2F5、3C1、4D7、4D11、6C11、6G12、7A3、7C5、7E9、7F6、7G1、
7H1、8C3、8F10、12A1、1E9、2C5、3C5、4C12、4F2、5A2、6B3、7D1、7D9、11D8、8A12、10E7、10B11、
10D2、7D5、2A7、3G12、6H9、8G9、9B4、10A1、11A8、12F3、2F8、10E3、1H7、2F6、2H8、3A7、7E5、
7F8、11H5、7C5、4F11、12D9、1B4v1、1B4v2、6H2、7B11v1、7B11v2、18D8、18E4v1、18E4v2、
29F6v1、29F6v2、40D5v1、40D5v2、43B9、44A8v1、44A8v2、44B4v1、和44B4v2、以及其任何组合。
[0247] 在示例性竞争测定中,在包含结合到TREM2(例如,人或非人灵长类)的第一标记抗体和测试其与第一抗体竞争结合到TREM2的能力的第二未标记抗体的溶液中孵育固定的TREM2或在细胞表面上表达TREM2的细胞。第二抗体可存在于杂交瘤上清液中。作为对照,在包含第一标记抗体但不包含第二未标记抗体的溶液中孵育固定的TREM2或表达TREM2的细胞。在容许第一抗体结合到TREM2的条件下孵育之后,去除过量未结合抗体,并且测量与固定的TREM2或表达TREM2的细胞缔合的标记的量。如果相对于对照样品,与固定的TREM2或表达TREM2的细胞缔合的标记的量在测试样品中基本上降低,则这指示第二抗体与第一抗体竞争结合到TREM2。参见,Harlow和Lane(1988)Antibodies:A Laboratory Manual第14章(Cold Spring Harbor Laboratory,Cold Spring Harbor,NY)。
[0248] 抗TREM2抗体轻链可变区和重链可变区
[0249] 在一些实施方案中,本公开的抗TREM2抗体包含:(a)轻链可变区,其包含选自抗体中的任一种的HVR-L1、HVR-L2、和HVR-L3的至少一个、两个、或三个HVR,所述抗体在表2A、表2B、表3A、表3B、表4A、表4B、表7A、以及表7B中列出或选自1A7、3A2、3B10、6G12、6H6、7A9、
7B3、8A1、8E10、8F11、8F8、9F5、9G1、9G3、10A9、10C1、11A8、12E2、12F9、12G6、2C7、2F5、3C1、
4D7、4D11、6C11、6G12、7A3、7C5、7E9、7F6、7G1、7H1、8C3、8F10、12A1、1E9、2C5、3C5、4C12、
4F2、5A2、6B3、7D1、7D9、11D8、8A12、10E7、10B11、10D2、7D5、2A7、3G12、6H9、8G9、9B4、10A1、
11A8、12F3、2F8、10E3、1H7、2F6、2H8、3A7、7E5、7F8、11H5、7C5、4F11、12D9、1B4v1、1B4v2、
6H2、7B11v1、7B11v2、18D8、18E4v1、18E4v2、29F6v1、29F6v2、40D5v1、40D5v2、43B9、44A8v1、
44A8v2、44B4v1、和44B4v2、以及其任何组合;和/或(b)重链可变区,其包含选自抗体中的任一种的HVR-H1、HVR-H2、和HVR-H3的至少一个、两个、或三个HVR,所述抗体在表2A、表2B、表
3A、表3B、表4A、表4B、表7A、以及表7B中列出或选自1A7、3A2、3B10、6G12、6H6、7A9、7B3、8A1、
8E10、8F11、8F8、9F5、9G1、9G3、10A9、10C1、11A8、12E2、12F9、12G6、2C7、2F5、3C1、4D7、4D11、
6C11、6G12、7A3、7C5、7E9、7F6、7G1、7H1、8C3、8F10、12A1、1E9、2C5、3C5、4C12、4F2、5A2、6B3、
7D1、7D9、11D8、8A12、10E7、10B11、10D2、7D5、2A7、3G12、6H9、8G9、9B4、10A1、11A8、12F3、
2F8、10E3、1H7、2F6、2H8、3A7、7E5、7F8、11H5、7C5、4F11、12D9、1B4v1、1B4v2、6H2、7B11v1、
7B11v2、18D8、18E4v1、18E4v2、29F6v1、29F6v2、40D5v1、40D5v2、43B9、44A8v1、44A8v2、
44B4v1、和44B4v2、以及其任何组合。在一些实施方案中,所述HVR-L1、HVR-L2、HVR-L3、HVR-H1、HVR-H2、以及HVR-H3包含EU或Kabat HVR、Chothia HVR、或接触HVR序列,所述序列如表
2A、表2B、表3A、表3B、表4A、表4B、表7A、以及表7B所示或来自选自以下的抗体:1A7、3A2、
3B10、6G12、6H6、7A9、7B3、8A1、8E10、8F11、8F8、9F5、9G1、9G3、10A9、10C1、11A8、12E2、12F9、
12G6、2C7、2F5、3C1、4D7、4D11、6C11、6G12、7A3、7C5、7E9、7F6、7G1、7H1、8C3、8F10、12A1、
1E9、2C5、3C5、4C12、4F2、5A2、6B3、7D1、7D9、11D8、8A12、10E7、10B11、10D2、7D5、2A7、3G12、
6H9、8G9、9B4、10A1、11A8、12F3、2F8、10E3、1H7、2F6、2H8、3A7、7E5、7F8、11H5、7C5、4F11、
12D9、1B4v1、1B4v2、6H2、7B11v1、7B11v2、18D8、18E4v1、18E4v2、29F6v1、29F6v2、40D5v1、
40D5v2、43B9、44A8v1、44A8v2、44B4v1、和44B4v2、以及其任何组合。
[0250] 在一些实施方案中,本公开的抗TREM2抗体包含选自以下的至少一个、两个、三个、四个、五个、或六个HVR:(i)HVR-L1,其包含表2A、表2B、表3A、表3B、表4A、表4B、表7A、以及表7B中列出的或来自选自1A7、3A2、3B10、6G12、6H6、7A9、7B3、8A1、8E10、8F11、8F8、9F5、9G1、
9G3、10A9、10C1、11A8、12E2、12F9、12G6、2C7、2F5、3C1、4D7、4D11、6C11、6G12、7A3、7C5、7E9、
7F6、7G1、7H1、8C3、8F10、12A1、1E9、2C5、3C5、4C12、4F2、5A2、6B3、7D1、7D9、11D8、8A12、
10E7、10B11、10D2、7D5、2A7、3G12、6H9、8G9、9B4、10A1、11A8、12F3、2F8、10E3、1H7、2F6、2H8、
3A7、7E5、7F8、11H5、7C5、4F11、12D9、1B4v1、1B4v2、6H2、7B11v1、7B11v2、18D8、18E4v1、
18E4v2、29F6v1、29F6v2、40D5v1、40D5v2、43B9、44A8v1、44A8v2、44B4v1、以及44B4v2的抗体的HVR-L1序列中的任一个的氨基酸序列;(ii)HVR-L2,其包含表2A、表2B、表3A、表3B、表4A、表4B、表7A、以及表7B中列出的或来自选自1A7、3A2、3B10、6G12、6H6、7A9、7B3、8A1、8E10、
8F11、8F8、9F5、9G1、9G3、10A9、10C1、11A8、12E2、12F9、12G6、2C7、2F5、3C1、4D7、4D11、6C11、
6G12、7A3、7C5、7E9、7F6、7G1、7H1、8C3、8F10、12A1、1E9、2C5、3C5、4C12、4F2、5A2、6B3、7D1、
7D9、11D8、8A12、10E7、10B11、10D2、7D5、2A7、3G12、6H9、8G9、9B4、10A1、11A8、12F3、2F8、
10E3、1H7、2F6、2H8、3A7、7E5、7F8、11H5、7C5、4F11、12D9、1B4v1、1B4v2、6H2、7B11v1、
7B11v2、18D8、18E4v1、18E4v2、29F6v1、29F6v2、40D5v1、40D5v2、43B9、44A8v1、44A8v2、
44B4v1、以及44B4v2的抗体的HVR-L2序列中的任一个的氨基酸序列;(iii)HVR-L3,其包含表2A、表2B、表3A、表3B、表4A、表4B、表7A、以及表7B中列出的或来自选自1A7、3A2、3B10、
6G12、6H6、7A9、7B3、8A1、8E10、8F11、8F8、9F5、9G1、9G3、10A9、10C1、11A8、12E2、12F9、12G6、
2C7、2F5、3C1、4D7、4D11、6C11、6G12、7A3、7C5、7E9、7F6、7G1、7H1、8C3、8F10、12A1、1E9、2C5、
3C5、4C12、4F2、5A2、6B3、7D1、7D9、11D8、8A12、10E7、10B11、10D2、7D5、2A7、3G12、6H9、8G9、
9B4、10A1、11A8、12F3、2F8、10E3、1H7、2F6、2H8、3A7、7E5、7F8、11H5、7C5、4F11、12D9、1B4v1、
1B4v2、6H2、7B11v1、7B11v2、18D8、18E4v1、18E4v2、29F6v1、29F6v2、40D5v1、40D5v2、43B9、
44A8v1、44A8v2、44B4v1、以及44B4v2的抗体的HVR-L3序列中的任一个的氨基酸序列;(iv)HVR-H1,其包含表2A、表2B、表3A、表3B、表4A、表4B、表7A、以及表7B中列出的或来自选自
1A7、3A2、3B10、6G12、6H6、7A9、7B3、8A1、8E10、8F11、8F8、9F5、9G1、9G3、10A9、10C1、11A8、
12E2、12F9、12G6、2C7、2F5、3C1、4D7、4D11、6C11、6G12、7A3、7C5、7E9、7F6、7G1、7H1、8C3、
8F10、12A1、1E9、2C5、3C5、4C12、4F2、5A2、6B3、7D1、7D9、11D8、8A12、10E7、10B11、10D2、7D5、
2A7、3G12、6H9、8G9、9B4、10A1、11A8、12F3、2F8、10E3、1H7、2F6、2H8、3A7、7E5、7F8、11H5、
7C5、4F11、12D9、1B4v1、1B4v2、6H2、7B11v1、7B11v2、18D8、18E4v1、18E4v2、29F6v1、29F6v2、
40D5v1、40D5v2、43B9、44A8v1、44A8v2、44B4v1、以及44B4v2的抗体的HVR-H1序列中的任一个的氨基酸序列;(v)HVR-H2,其包含表2A、表2B、表3A、表3B、表4A、表4B、表7A、以及表7B中列出的或来自选自1A7、3A2、3B10、6G12、6H6、7A9、7B3、8A1、8E10、8F11、8F8、9F5、9G1、9G3、
10A9、10C1、11A8、12E2、12F9、12G6、2C7、2F5、3C1、4D7、4D11、6C11、6G12、7A3、7C5、7E9、7F6、
7G1、7H1、8C3、8F10、12A1、1E9、2C5、3C5、4C12、4F2、5A2、6B3、7D1、7D9、11D8、8A12、10E7、
10B11、10D2、7D5、2A7、3G12、6H9、8G9、9B4、10A1、11A8、12F3、2F8、10E3、1H7、2F6、2H8、3A7、
7E5、7F8、11H5、7C5、4F11、12D9、1B4v1、1B4v2、6H2、7B11v1、7B11v2、18D8、18E4v1、18E4v2、
29F6v1、29F6v2、40D5v1、40D5v2、43B9、44A8v1、44A8v2、44B4v1、以及44B4v2的抗体的HVR-H2序列中的任一个的氨基酸序列;以及(vi)HVR-H3,其包含表2A、表2B、表3A、表3B、表4A、表
4B、表7A、以及表7B中列出的或来自选自1A7、3A2、3B10、6G12、6H6、7A9、7B3、8A1、8E10、
8F11、8F8、9F5、9G1、9G3、10A9、10C1、11A8、12E2、12F9、12G6、2C7、2F5、3C1、4D7、4D11、6C11、
6G12、7A3、7C5、7E9、7F6、7G1、7H1、8C3、8F10、12A1、1E9、2C5、3C5、4C12、4F2、5A2、6B3、7D1、
7D9、11D8、8A12、10E7、10B11、10D2、7D5、2A7、3G12、6H9、8G9、9B4、10A1、11A8、12F3、2F8、
10E3、1H7、2F6、2H8、3A7、7E5、7F8、11H5、7C5、4F11、12D9、1B4v1、1B4v2、6H2、7B11v1、
7B11v2、18D8、18E4v1、18E4v2、29F6v1、29F6v2、40D5v1、40D5v2、43B9、44A8v1、44A8v2、
44B4v1、以及44B4v2的抗体的HVR-H3序列中的任一个的氨基酸序列。在一些实施方案中,本公开的抗TREM2抗体包含轻链可变结构域和重链可变结构域,其中(a)所述HVR-L1包含SEQ ID NO:9的氨基酸序列,所述HVR-L2包含SEQ ID NO:24的氨基酸序列,所述HVR-L3包含SEQ ID NO:34的氨基酸序列,所述HVR-H1包含SEQ ID NO:48的氨基酸序列,所述HVR-H2包含SEQ ID NO:66的氨基酸序列,并且所述HVR-H3包含SEQ ID NO:85的氨基酸序列;(b)所述HVR-L1包含SEQ ID NO:9的氨基酸序列,所述HVR-L2包含SEQ ID NO:24的氨基酸序列,所述HVR-L3包含SEQ ID NO:34的氨基酸序列,所述HVR-H1包含SEQ ID NO:48的氨基酸序列,所述HVR-H2包含SEQ ID NO:66的氨基酸序列,并且所述HVR-H3包含SEQ ID NO:85的氨基酸序列;(c)所述HVR-L1包含SEQ ID NO:10的氨基酸序列,所述HVR-L2包含SEQ ID NO:25的氨基酸序列,所述HVR-L3包含SEQ ID NO:35的氨基酸序列,所述HVR-H1包含SEQ ID NO:49的氨基酸序列,所述HVR-H2包含SEQ ID NO:67的氨基酸序列,并且所述HVR-H3包含SEQ ID NO:86的氨基酸序列;(d)所述HVR-L1包含SEQ ID NO:12的氨基酸序列,所述HVR-L2包含SEQ ID NO:
26的氨基酸序列,所述HVR-L3包含SEQ ID NO:37的氨基酸序列,所述HVR-H1包含SEQ ID NO:50的氨基酸序列,所述HVR-H2包含SEQ ID NO:68的氨基酸序列,并且所述HVR-H3包含SEQ ID NO:87的氨基酸序列;(e)所述HVR-L1包含SEQ ID NO:11的氨基酸序列,所述HVR-L2包含SEQ ID NO:26的氨基酸序列,所述HVR-L3包含SEQ ID NO:36的氨基酸序列,所述HVR-H1包含SEQ ID NO:51的氨基酸序列,所述HVR-H2包含SEQ ID NO:69的氨基酸序列,并且所述HVR-H3包含SEQ ID NO:88的氨基酸序列;(f)所述HVR-L1包含SEQ ID NO:13的氨基酸序列,所述HVR-L2包含SEQ ID NO:27的氨基酸序列,所述HVR-L3包含SEQ ID NO:38的氨基酸序列,所述HVR-H1包含SEQ ID NO:52的氨基酸序列,所述HVR-H2包含SEQ ID NO:70的氨基酸序列,并且所述HVR-H3包含SEQ ID NO:89的氨基酸序列;(g)所述HVR-L1包含SEQ ID NO:
14的氨基酸序列,所述HVR-L2包含SEQ ID NO:28的氨基酸序列,所述HVR-L3包含SEQ ID NO:39的氨基酸序列,所述HVR-H1包含SEQ ID NO:53的氨基酸序列,所述HVR-H2包含SEQ ID NO:71的氨基酸序列,并且所述HVR-H3包含SEQ ID NO:90的氨基酸序列;(h)所述HVR-L1包含SEQ ID NO:13的氨基酸序列,所述HVR-L2包含SEQ ID NO:27的氨基酸序列,所述HVR-L3包含SEQ ID NO:38的氨基酸序列,所述HVR-H1包含SEQ ID NO:52的氨基酸序列,所述HVR-H2包含SEQ ID NO:70的氨基酸序列,并且所述HVR-H3包含SEQ ID NO:89的氨基酸序列;(i)所述HVR-L1包含SEQ ID NO:13的氨基酸序列,所述HVR-L2包含SEQ ID NO:27的氨基酸序列,所述HVR-L3包含SEQ ID NO:38的氨基酸序列,所述HVR-H1包含SEQ ID NO:52的氨基酸序列,所述HVR-H2包含SEQ ID NO:70的氨基酸序列,并且所述HVR-H3包含SEQ ID NO:89的氨基酸序列;(j)所述HVR-L1包含SEQ ID NO:15的氨基酸序列,所述HVR-L2包含SEQ ID NO:
28的氨基酸序列,所述HVR-L3包含SEQ ID NO:40的氨基酸序列,所述HVR-H1包含SEQ ID NO:54的氨基酸序列,所述HVR-H2包含SEQ ID NO:72的氨基酸序列,并且所述HVR-H3包含SEQ ID NO:91的氨基酸序列;(k)所述HVR-L1包含SEQ ID NO:11的氨基酸序列,所述HVR-L2包含SEQ ID NO:26的氨基酸序列,所述HVR-L3包含SEQ ID NO:36的氨基酸序列,所述HVR-H1包含SEQ ID NO:51的氨基酸序列,所述HVR-H2包含SEQ ID NO:69的氨基酸序列,并且所述HVR-H3包含SEQ ID NO:88的氨基酸序列;(l)所述HVR-L1包含SEQ ID NO:16的氨基酸序列,所述HVR-L2包含SEQ ID NO:29的氨基酸序列,所述HVR-L3包含SEQ ID NO:35的氨基酸序列,所述HVR-H1包含SEQ ID NO:55的氨基酸序列,所述HVR-H2包含SEQ ID NO:73的氨基酸序列,并且所述HVR-H3包含SEQ ID NO:92的氨基酸序列;(m)所述HVR-L1包含SEQ ID NO:
15的氨基酸序列,所述HVR-L2包含SEQ ID NO:28的氨基酸序列,所述HVR-L3包含SEQ ID NO:40的氨基酸序列,所述HVR-H1包含SEQ ID NO:54的氨基酸序列,所述HVR-H2包含SEQ ID NO:72的氨基酸序列,并且所述HVR-H3包含SEQ ID NO:91的氨基酸序列;(n)所述HVR-L1包含SEQ ID NO:581的氨基酸序列,所述HVR-L2包含SEQ ID NO:29的氨基酸序列,所述HVR-L3包含SEQ ID NO:582的氨基酸序列,所述HVR-H1包含SEQ ID NO:56的氨基酸序列,所述HVR-H2包含SEQ ID NO:74的氨基酸序列,并且所述HVR-H3包含SEQ ID NO:93的氨基酸序列;(o)所述HVR-L1包含SEQ ID NO:17的氨基酸序列,所述HVR-L2包含SEQ ID NO:30的氨基酸序列,所述HVR-L3包含SEQ ID NO:41的氨基酸序列,所述HVR-H1包含SEQ ID NO:57的氨基酸序列,所述HVR-H2包含SEQ ID NO:75的氨基酸序列,并且所述HVR-H3包含SEQ ID NO:94的氨基酸序列;(p)所述HVR-H1包含SEQ ID NO:58的氨基酸序列,所述HVR-H2包含SEQ ID NO:
76的氨基酸序列,并且所述HVR-H3包含SEQ ID NO:95的氨基酸序列;(q)所述HVR-L1包含SEQ ID NO:18的氨基酸序列,所述HVR-L2包含SEQ ID NO:31的氨基酸序列,所述HVR-L3包含SEQ ID NO:42的氨基酸序列,所述HVR-H1包含SEQ ID NO:59的氨基酸序列,所述HVR-H2包含SEQ ID NO:77的氨基酸序列,并且所述HVR-H3包含SEQ ID NO:96的氨基酸序列;(r)所述HVR-L1包含SEQ ID NO:19的氨基酸序列,所述HVR-L2包含SEQ ID NO:28的氨基酸序列,所述HVR-L3包含SEQ ID NO:43的氨基酸序列,所述HVR-H1包含SEQ ID NO:60的氨基酸序列,所述HVR-H2包含SEQ ID NO:78的氨基酸序列,并且所述HVR-H3包含SEQ ID NO:97的氨基酸序列;(s)所述HVR-L1包含SEQ ID NO:20的氨基酸序列,所述HVR-L2包含SEQ ID NO:28的氨基酸序列,所述HVR-L3包含SEQ ID NO:44的氨基酸序列,所述HVR-H1包含SEQ ID NO:
61的氨基酸序列,所述HVR-H2包含SEQ ID NO:79的氨基酸序列,并且所述HVR-H3包含SEQ ID NO:98的氨基酸序列;(t)所述HVR-L1包含SEQ ID NO:21的氨基酸序列,所述HVR-L2包含SEQ ID NO:32的氨基酸序列,所述HVR-L3包含SEQ ID NO:45的氨基酸序列,所述HVR-H1包含SEQ ID NO:62的氨基酸序列,所述HVR-H2包含SEQ ID NO:80的氨基酸序列,并且所述HVR-H3包含SEQ ID NO:99的氨基酸序列;(u)所述HVR-L1包含SEQ ID NO:15的氨基酸序列,所述HVR-L2包含SEQ ID NO:33的氨基酸序列,所述HVR-L3包含SEQ ID NO:40的氨基酸序列,所述HVR-H1包含SEQ ID NO:54的氨基酸序列,所述HVR-H2包含SEQ ID NO:81的氨基酸序列,并且所述HVR-H3包含SEQ ID NO:91的氨基酸序列;(v)所述HVR-L1包含SEQ ID NO:22的氨基酸序列,所述HVR-L2包含SEQ ID NO:29的氨基酸序列,所述HVR-L3包含SEQ ID NO:
46的氨基酸序列,所述HVR-H1包含SEQ ID NO:63的氨基酸序列,所述HVR-H2包含SEQ ID NO:82的氨基酸序列,并且所述HVR-H3包含SEQ ID NO:100的氨基酸序列;(w)所述HVR-L1包含SEQ ID NO:23的氨基酸序列,所述HVR-L2包含SEQ ID NO:29的氨基酸序列,所述HVR-L3包含SEQ ID NO:47的氨基酸序列,所述HVR-H1包含SEQ ID NO:64的氨基酸序列,所述HVR-H2包含SEQ ID NO:83的氨基酸序列,并且所述HVR-H3包含SEQ ID NO:101的氨基酸序列;
(x)所述HVR-L1包含SEQ ID NO:16的氨基酸序列,所述HVR-L2包含SEQ ID NO:29的氨基酸序列,所述HVR-L3包含SEQ ID NO:35的氨基酸序列,所述HVR-H1包含SEQ ID NO:65的氨基酸序列,所述HVR-H2包含SEQ ID NO:84的氨基酸序列,并且所述HVR-H3包含SEQ ID NO:102的氨基酸序列,(y)所述HVR-L1包含SEQ ID NO:581的氨基酸序列,所述HVR-L2包含SEQ ID NO:29的氨基酸序列,所述HVR-L3包含SEQ ID NO:582的氨基酸序列,所述HVR-H1包含SEQ ID NO:56的氨基酸序列,所述HVR-H2包含SEQ ID NO:585的氨基酸序列,并且所述HVR-H3包含SEQ ID NO:588的氨基酸序列,(z)所述HVR-L1包含SEQ ID NO:10的氨基酸序列,所述HVR-L2包含SEQ ID NO:29的氨基酸序列,所述HVR-L3包含SEQ ID NO:35的氨基酸序列,所述HVR-H1包含SEQ ID NO:49的氨基酸序列,所述HVR-H2包含SEQ ID NO:586的氨基酸序列,并且所述HVR-H3包含SEQ ID NO:86的氨基酸序列,或者(aa)所述HVR-L1包含SEQ ID NO:14的氨基酸序列,所述HVR-L2包含SEQ ID NO:28的氨基酸序列,所述HVR-L3包含SEQ ID NO:
583的氨基酸序列,所述HVR-H1包含SEQ ID NO:584的氨基酸序列,所述HVR-H2包含SEQ ID NO:587的氨基酸序列,并且所述HVR-H3包含SEQ ID NO:589的氨基酸序列。
[0251] 在一些实施方案中,本公开的抗TREM2抗体包含选自以下的至少一个、两个、三个、四个、五个、或六个HVR:(i)HVR-L1,其包含选自SEQ ID NO:826-828的氨基酸序列,或包含与选自SEQ ID NO:826-828的氨基酸序列具有至少约90%同源性的氨基酸序列;(ii)HVR-L2,其包含表2A、表2B、表3A、表3B、表4A、表4B、表7A、以及表7B中列出的或来自选自1A7、3A2、3B10、6G12、6H6、7A9、7B3、8A1、8E10、8F11、8F8、9F5、9G1、9G3、10A9、10C1、11A8、12E2、
12F9、12G6、2C7、2F5、3C1、4D7、4D11、6C11、6G12、7A3、7C5、7E9、7F6、7G1、7H1、8C3、8F10、
12A1、1E9、2C5、3C5、4C12、4F2、5A2、6B3、7D1、7D9、11D8、8A12、10E7、10B11、10D2、7D5、2A7、
3G12、6H9、8G9、9B4、10A1、11A8、12F3、2F8、10E3、1H7、2F6、2H8、3A7、7E5、7F8、11H5、7C5、
4F11、12D9、1B4v1、1B4v2、6H2、7B11v1、7B11v2、18D8、18E4v1、18E4v2、29F6v1、29F6v2、
40D5v1、40D5v2、43B9、44A8v1、44A8v2、44B4v1、以及44B4v2的抗体的HVR-L2序列中的任一个的氨基酸序列;(iii)HVR-L3,其包含表2A、表2B、表3A、表3B、表4A、表4B、表7A、以及表7B中列出的或来自选自1A7、3A2、3B10、6G12、6H6、7A9、7B3、8A1、8E10、8F11、8F8、9F5、9G1、
9G3、10A9、10C1、11A8、12E2、12F9、12G6、2C7、2F5、3C1、4D7、4D11、6C11、6G12、7A3、7C5、7E9、
7F6、7G1、7H1、8C3、8F10、12A1、1E9、2C5、3C5、4C12、4F2、5A2、6B3、7D1、7D9、11D8、8A12、
10E7、10B11、10D2、7D5、2A7、3G12、6H9、8G9、9B4、10A1、11A8、12F3、2F8、10E3、1H7、2F6、2H8、
3A7、7E5、7F8、11H5、7C5、4F11、12D9、1B4v1、1B4v2、6H2、7B11v1、7B11v2、18D8、18E4v1、
18E4v2、29F6v1、29F6v2、40D5v1、40D5v2、43B9、44A8v1、44A8v2、44B4v1、以及44B4v2的抗体的HVR-L3序列中的任一个的氨基酸序列;(iv)HVR-H1,其包含选自SEQ ID NO:829-835的氨基酸序列,或包含与选自SEQ ID NO:829-835的氨基酸序列具有至少约90%同源性的氨基酸序列;(v)HVR-H2,其包含选自SEQ ID NO:836-842的氨基酸序列,或包含与选自SEQ ID NO:836-842的氨基酸序列具有至少约90%同源性的氨基酸序列;以及(vi)HVR-H3,其包含表2A、表2B、表3A、表3B、表4A、表4B、表7A、以及表7B中列出的或来自选自1A7、3A2、3B10、
6G12、6H6、7A9、7B3、8A1、8E10、8F11、8F8、9F5、9G1、9G3、10A9、10C1、11A8、12E2、12F9、12G6、
2C7、2F5、3C1、4D7、4D11、6C11、6G12、7A3、7C5、7E9、7F6、7G1、7H1、8C3、8F10、12A1、1E9、2C5、
3C5、4C12、4F2、5A2、6B3、7D1、7D9、11D8、8A12、10E7、10B11、10D2、7D5、2A7、3G12、6H9、8G9、
9B4、10A1、11A8、12F3、2F8、10E3、1H7、2F6、2H8、3A7、7E5、7F8、11H5、7C5、4F11、12D9、1B4v1、
1B4v2、6H2、7B11v1、7B11v2、18D8、18E4v1、18E4v2、29F6v1、29F6v2、40D5v1、40D5v2、43B9、
44A8v1、44A8v2、44B4v1、以及44B4v2的抗体的HVR-H3序列中的任一个的氨基酸序列。
[0252] 在一些实施方案中,本公开的抗TREM2抗体包含轻链可变结构域和重链可变结构域,其中所述轻链可变结构域包含以下中的一个或多个:(a)HVR-L1,其包含选自以下的氨基酸序列:SEQ ID NO:9-23、SEQ ID NO:581、SEQ ID NO:690-694、SEQ ID NO:734-738、以及SEQ ID NO:826-828,或包含与选自以下的氨基酸序列具有至少约90%同源性的氨基酸序列:SEQ ID NO:9-23、SEQ ID NO:581、SEQ ID NO:690-694、SEQ ID NO:734-738、以及SEQ ID NO:826-828;(b)HVR-L2,其包含选自以下的氨基酸序列:SEQ ID NO:24-33、SEQ ID NO:695-697、和SEQ ID NO:739-743,或包含与选自以下的氨基酸序列具有至少约90%同源性的氨基酸序列:SEQ ID NO:24-33、SEQ ID NO:695-697、和SEQ ID NO:739-743;以及(c)HVR-L3,其包含选自以下的氨基酸序列:SEQ ID NO:34-47、SEQ ID NO:582、SEQ ID NO:
583、SEQ ID NO:698-702、以及SEQ ID NO:744-746,或包含与选自以下的氨基酸序列具有至少约90%同源性的氨基酸序列:SEQ ID NO:34-47、SEQ ID NO:582、SEQ ID NO:583、SEQ ID NO:698-702、以及SEQ ID NO:744-746;并且/或者其中所述重链可变结构域包含以下中的一个或多个:(a)HVR-H1,其包含选自以下的氨基酸序列:SEQ ID NO:48-65、SEQ ID NO:
584、SEQ ID NO:703-705、SEQ ID NO:747-754、以及SEQ ID NO:829-835,或包含与选自以下的氨基酸序列具有至少约90%同源性的氨基酸序列:SEQ ID NO:48-65、SEQ ID NO:584、SEQ ID NO:703-705、SEQ ID NO:747-754、以及SEQ ID NO:829-835;(b)HVR-H2,其包含选自以下的氨基酸序列:SEQ ID NO:66-84、SEQ ID NO:585-587、SEQ ID NO:706-708、SEQ ID NO:755-762、SEQ ID NO:836-842、以及SEQ ID NO:888,或包含与选自以下的氨基酸序列具有至少约90%同源性的氨基酸序列:SEQ ID NO:66-84、SEQ ID NO:585-587、SEQ ID NO:
706-708、SEQ ID NO:755-762、SEQ ID NO:836-842、以及SEQ ID NO:888;以及(c)HVR-H3,其包含选自以下的氨基酸序列:SEQ ID NO:85-102、SEQ ID NO:588、SEQ ID NO:589、SEQ ID NO:709、SEQ ID NO:710、以及SEQ ID NO:763-770,或包含与选自以下的氨基酸序列具有至少约90%同源性的氨基酸序列:SEQ ID NO:85-102、SEQ ID NO:588、SEQ ID NO:589、SEQ ID NO:709、SEQ ID NO:710、以及SEQ ID NO:763-770。
[0253] 在一些实施方案中,本公开的抗TREM2抗体包含:抗体中的任一种的轻链可变区,所述抗体在表2A、表2B、表3A、表3B、表4A、表4B、表7A、以及表7B中列出或选自1A7、3A2、3B10、6G12、6H6、7A9、7B3、8A1、8E10、8F11、8F8、9F5、9F5v2、9G1、9G3、10A9、10C1、11A8、
12E2、12F9、12G6、2C7、2F5、3C1、4D7、4D11、6C11、6G12、7A3、7C5、7E9、7F6、7G1、7H1、8C3、
8F10、12A1、1E9、2C5、3C5、4C12、4F2、5A2、6B3、7D1、7D9、11D8、8A12、10E7、10B11、10D2、7D5、
2A7、3G12、6H9、8G9、9B4、10A1、11A8、12F3、2F8、10E3、1H7、2F6、2H8、3A7、7E5、7E5v2、7F8、
11H5、7C5、4F11、12D9、1B4v1、1B4v2、6H2、7B11v1、7B11v2、18D8、18E4v1、18E4v2、29F6v1、
29F6v2、40D5v1、40D5v2、43B9、44A8v1、44A8v2、44B4v1、以及44B4v2;和/或抗体中的任一种的重链可变区,所述抗体在表2A、表2B、表3A、表3B、表4A、表4B、表7A、以及表7B中列出或选自1A7、3A2、3B10、6G12、6H6、7A9、7B3、8A1、8E10、8F11、8F8、9F5、9G1、9G3、10A9、10C1、11A8、
12E2、12F9、12G6、2C7、2F5、3C1、4D7、4D11、6C11、6G12、7A3、7C5、7E9、7F6、7G1、7H1、8C3、
8F10、12A1、1E9、2C5、3C5、4C12、4F2、5A2、6B3、7D1、7D9、11D8、8A12、10E7、10B11、10D2、7D5、
2A7、3G12、6H9、8G9、9B4、10A1、11A8、12F3、2F8、10E3、1H7、2F6、2H8、3A7、7E5、7F8、11H5、
7C5、4F11、12D9、1B4v1、1B4v2、6H2、7B11v1、7B11v2、18D8、18E4v1、18E4v2、29F6v1、29F6v2、
40D5v1、40D5v2、43B9、44A8v1、44A8v2、44B4v1、以及44B4v2。在一些实施方案中,本公开的抗TREM2抗体包含:轻链可变区,其包含选自以下中的任一个的氨基酸序列:SEQ ID NO:
219-398、SEQ ID NO:602-634、SEQ ID NO:679-689、SEQ ID NO:724-730、SEQ ID NO:809-
816、SEQ ID NO:821、SEQ ID NO:843、SEQ ID NO:844、SEQ ID NO:849、以及SEQ ID NO:
850;和/或重链可变结构域,其包含选自以下中的任一个的氨基酸序列:SEQ ID NO:399-
580、SEQ ID NO:635-678、SEQ ID NO:731-733、和SEQ ID NO:817-820、SEQ ID NO:822-
825、以及SEQ ID NO:845-847。在一些实施方案中,所述抗体包含:轻链可变结构域,其包含SEQ ID NO:843的氨基酸序列;和重链可变结构域,其包含SEQ ID NO:845的氨基酸序列。在一些实施方案中,所述抗体包含:轻链可变结构域,其包含SEQ ID NO:843的氨基酸序列;和重链可变结构域,其包含SEQ ID NO:846的氨基酸序列。在一些实施方案中,所述抗体包含:
轻链可变结构域,其包含SEQ ID NO:843的氨基酸序列;和重链可变结构域,其包含SEQ ID NO:847的氨基酸序列。在一些实施方案中,所述抗体包含:轻链可变结构域,其包含SEQ ID NO:844的氨基酸序列;和重链可变结构域,其包含SEQ ID NO:845的氨基酸序列。在一些实施方案中,所述抗体包含:轻链可变结构域,其包含SEQ ID NO:844的氨基酸序列;和重链可变结构域,其包含SEQ ID NO:846的氨基酸序列。在一些实施方案中,所述抗体包含:轻链可变结构域,其包含SEQ ID NO:844的氨基酸序列;和重链可变结构域,其包含SEQ ID NO:847的氨基酸序列。在一些实施方案中,所述抗体包含轻链可变结构域和重链可变结构域,其中:(a)所述轻链可变结构域包含SEQ ID NO:333的氨基酸序列并且所述重链可变结构域包含SEQ ID NO:521的氨基酸序列;(b)所述轻链可变结构域包含SEQ ID NO:850的氨基酸序列并且所述重链可变结构域包含SEQ ID NO:521的氨基酸序列;(c)所述轻链可变结构域包含SEQ ID NO:334的氨基酸序列并且所述重链可变结构域包含SEQ ID NO:522的氨基酸序列;(d)所述轻链可变结构域包含SEQ ID NO:335的氨基酸序列并且所述重链可变结构域包含SEQ ID NO:523的氨基酸序列;(e)所述轻链可变结构域包含SEQ ID NO:336的氨基酸序列并且所述重链可变结构域包含SEQ ID NO:524的氨基酸序列;(f)所述轻链可变结构域包含SEQ ID NO:337的氨基酸序列并且所述重链可变结构域包含SEQ ID NO:525的氨基酸序列;(g)所述轻链可变结构域包含SEQ ID NO:338的氨基酸序列并且所述重链可变结构域包含SEQ ID NO:526的氨基酸序列;(h)所述轻链可变结构域包含SEQ ID NO:339的氨基酸序列并且所述重链可变结构域包含SEQ ID NO:526的氨基酸序列;(i)所述轻链可变结构域包含SEQ ID NO:340的氨基酸序列并且所述重链可变结构域包含SEQ ID NO:527的氨基酸序列;(j)所述轻链可变结构域包含SEQ ID NO:341的氨基酸序列并且所述重链可变结构域包含SEQ ID NO:528的氨基酸序列;(k)所述轻链可变结构域包含SEQ ID NO:342的氨基酸序列并且所述重链可变结构域包含SEQ ID NO:529的氨基酸序列;(l)所述轻链可变结构域包含SEQ ID NO:343的氨基酸序列并且所述重链可变结构域包含SEQ ID NO:530的氨基酸序列;(m)所述轻链可变结构域包含SEQ ID NO:843的氨基酸序列并且所述重链可变结构域包含SEQ ID NO:845的氨基酸序列;(n)所述轻链可变结构域包含SEQ ID NO:844的氨基酸序列并且所述重链可变结构域包含SEQ ID NO:846的氨基酸序列;(o)所述轻链可变结构域包含SEQ ID NO:844的氨基酸序列并且所述重链可变结构域包含SEQ ID NO:847的氨基酸序列;(p)所述轻链可变结构域包含SEQ ID NO:219的氨基酸序列并且所述重链可变结构域包含SEQ ID NO:399的氨基酸序列;(q)所述轻链可变结构域包含SEQ ID NO:230的氨基酸序列并且所述重链可变结构域包含SEQ ID NO:409的氨基酸序列;(r)所述轻链可变结构域包含SEQ ID NO:252的氨基酸序列并且所述重链可变结构域包含SEQ ID NO:419的氨基酸序列;(s)所述轻链可变结构域包含SEQ ID NO:241的氨基酸序列并且所述重链可变结构域包含SEQ ID NO:429的氨基酸序列;(t)所述轻链可变结构域包含SEQ ID NO:849的氨基酸序列并且所述重链可变结构域包含SEQ ID NO:429的氨基酸序列;(u)所述轻链可变结构域包含SEQ ID NO:263的氨基酸序列并且所述重链可变结构域包含SEQ ID NO:439的氨基酸序列;(v)所述轻链可变结构域包含SEQ ID NO:274的氨基酸序列并且所述重链可变结构域包含SEQ ID NO:449的氨基酸序列;(w)所述轻链可变结构域包含SEQ ID NO:285的氨基酸序列并且所述重链可变结构域包含SEQ ID NO:459的氨基酸序列;(x)所述轻链可变结构域包含SEQ ID NO:286的氨基酸序列并且所述重链可变结构域包含SEQ ID NO:460的氨基酸序列;(y)所述轻链可变结构域包含SEQ ID NO:287的氨基酸序列并且所述重链可变结构域包含SEQ ID NO:461的氨基酸序列;(z)所述轻链可变结构域包含SEQ ID NO:298的氨基酸序列并且所述重链可变结构域包含SEQ ID NO:429的氨基酸序列;(aa)所述轻链可变结构域包含SEQ ID NO:299的氨基酸序列并且所述重链可变结构域包含SEQ ID NO:471的氨基酸序列;(bb)所述轻链可变结构域包含SEQ ID NO:310的氨基酸序列并且所述重链可变结构域包含SEQ ID NO:461的氨基酸序列;(cc)所述轻链可变结构域包含SEQ ID NO:679的氨基酸序列并且所述重链可变结构域包含SEQ ID NO:481的氨基酸序列;(dd)所述轻链可变结构域包含SEQ ID NO:311的氨基酸序列并且所述重链可变结构域包含SEQ ID NO:491的氨基酸序列;(ee)所述轻链可变结构域包含SEQ ID NO:322的氨基酸序列并且所述重链可变结构域包含SEQ ID NO:511的氨基酸序列;(ff)所述轻链可变结构域包含SEQ ID NO:344的氨基酸序列并且所述重链可变结构域包含SEQ ID NO:531的氨基酸序列;(gg)所述轻链可变结构域包含SEQ ID NO:355的氨基酸序列并且所述重链可变结构域包含SEQ ID NO:635的氨基酸序列;(hh)所述轻链可变结构域包含SEQ ID NO:365的氨基酸序列并且所述重链可变结构域包含SEQ ID NO:541的氨基酸序列;(ii)所述轻链可变结构域包含SEQ ID NO:
376的氨基酸序列并且所述重链可变结构域包含SEQ ID NO:551的氨基酸序列;(jj)所述轻链可变结构域包含SEQ ID NO:387的氨基酸序列并且所述重链可变结构域包含SEQ ID NO:
561的氨基酸序列;(kk)所述轻链可变结构域包含SEQ ID NO:398的氨基酸序列并且所述重链可变结构域包含SEQ ID NO:571的氨基酸序列;(ll)所述轻链可变结构域包含SEQ ID NO:724的氨基酸序列并且所述重链可变结构域包含SEQ ID NO:731的氨基酸序列;(mm)所述轻链可变结构域包含SEQ ID NO:809的氨基酸序列并且所述重链可变结构域包含SEQ ID NO:731的氨基酸序列;(nn)所述轻链可变结构域包含SEQ ID NO:725的氨基酸序列并且所述重链可变结构域包含SEQ ID NO:732的氨基酸序列;(oo)所述轻链可变结构域包含SEQ ID NO:726的氨基酸序列并且所述重链可变结构域包含SEQ ID NO:731的氨基酸序列;(pp)所述轻链可变结构域包含SEQ ID NO:726的氨基酸序列并且所述重链可变结构域包含SEQ ID NO:817的氨基酸序列;(qq)所述轻链可变结构域包含SEQ ID NO:727的氨基酸序列并且所述重链可变结构域包含SEQ ID NO:731的氨基酸序列;(rr)所述轻链可变结构域包含SEQ ID NO:728的氨基酸序列并且所述重链可变结构域包含SEQ ID NO:733的氨基酸序列;(ss)所述轻链可变结构域包含SEQ ID NO:810的氨基酸序列并且所述重链可变结构域包含SEQ ID NO:818的氨基酸序列;(tt)所述轻链可变结构域包含SEQ ID NO:811的氨基酸序列并且所述重链可变结构域包含SEQ ID NO:733的氨基酸序列;(uu)所述轻链可变结构域包含SEQ ID NO:729的氨基酸序列并且所述重链可变结构域包含SEQ ID NO:731的氨基酸序列;(vv)所述轻链可变结构域包含SEQ ID NO:812的氨基酸序列并且所述重链可变结构域包含SEQ ID NO:819的氨基酸序列;(ww)所述轻链可变结构域包含SEQ ID NO:729的氨基酸序列并且所述重链可变结构域包含SEQ ID NO:820的氨基酸序列;(xx)所述轻链可变结构域包含SEQ ID NO:730的氨基酸序列并且所述重链可变结构域包含SEQ ID NO:731的氨基酸序列;(yy)所述轻链可变结构域包含SEQ ID NO:813的氨基酸序列并且所述重链可变结构域包含SEQ ID NO:731的氨基酸序列;(zz)所述轻链可变结构域包含SEQ ID NO:814的氨基酸序列并且所述重链可变结构域包含SEQ ID NO:822的氨基酸序列;(aaa)所述轻链可变结构域包含SEQ ID NO:815的氨基酸序列并且所述重链可变结构域包含SEQ ID NO:824的氨基酸序列;
或者(bbb)所述轻链可变结构域包含SEQ ID NO:816的氨基酸序列并且所述重链可变结构域包含SEQ ID NO:825的氨基酸序列。
[0254] 本公开的抗体中的任一种可由细胞系产生。在一些实施方案中,所述细胞系可以是哺乳动物细胞系。在某些实施方案中,所述细胞系可以是杂交瘤细胞系。在其他实施方案中,所述细胞系可以是酵母细胞系。可使用适于抗体产生的本领域已知的任何细胞系来产生本公开的抗体。用于抗体产生的示例性细胞系在整个本公开中进行描述。
[0255] 在一些实施方案中,抗TREM2抗体是选自以下的抗TREM2单克隆抗体:1A7、3A2、3B10、6G12、6H6、7A9、7B3、8A1、8E10、8F11、8F8、9F5、9G1、9G3、10A9、10C1、11A8、12E2、12F9、
12G6、2C7、2F5、3C1、4D7、4D11、6C11、6G12、7A3、7C5、7E9、7F6、7G1、7H1、8C3、8F10、12A1、
1E9、2C5、3C5、4C12、4F2、5A2、6B3、7D1、7D9、11D8、8A12、10E7、10B11、10D2、7D5、2A7、3G12、
6H9、8G9、9B4、10A1、11A8、12F3、2F8、10E3、1H7、2F6、2H8、3A7、7E5、7F8、11H5、7C5、4F11、
12D9、1B4v1、1B4v2、6H2、7B11v1、7B11v2、18D8、18E4v1、18E4v2、29F6v1、29F6v2、40D5v1、
40D5v2、43B9、44A8v1、44A8v2、44B4v1、和44B4v2、以及其人源化变体。在某些实施方案中,所述抗TREM2抗体是激动剂抗体。在某些实施方案中,所述抗TREM2抗体是惰性抗体。在某些实施方案中,所述抗TREM2抗体是拮抗剂抗体。
[0256] 在一些实施方案中,所述抗TREM2抗体是抗TREM2单克隆抗体7E5。在一些实施方案中,所述抗TREM2抗体是与7E5结合基本上相同的TREM2表位的分离的抗体。在一些实施方案中,所述抗TREM2抗体是包含单克隆抗体7E5的重链可变结构域的HVR-H1、HVR-H2、和HVR-H3的分离的抗体。在一些实施方案中,所述抗TREM2抗体是包含单克隆抗体7E5的轻链可变结构域的HVR-L1、HVR-L2、和HVR-L3的分离的抗体。在一些实施方案中,所述抗TREM2抗体是包含单克隆抗体7E5的重链可变结构域的HVR-H1、HVR-H2、和HVR-H3以及轻链可变结构域的HVR-L1、HVR-L2、和HVR-L3的分离的抗体。
[0257] 在一些实施方案中,所述抗TREM2抗体是抗TREM2单克隆抗体9F5。在一些实施方案中,所述抗TREM2抗体是与9F5结合基本上相同的TREM2表位的分离的抗体。在一些实施方案中,所述抗TREM2抗体是包含单克隆抗体9F5的重链可变结构域的HVR-H1、HVR-H2、和HVR-H3的分离的抗体。在一些实施方案中,所述抗TREM2抗体是包含单克隆抗体9F5的轻链可变结构域的HVR-L1、HVR-L2、和HVR-L3的分离的抗体。在一些实施方案中,所述抗TREM2抗体是包含单克隆抗体9F5的重链可变结构域的HVR-H1、HVR-H2、和HVR-H3以及轻链可变结构域的HVR-L1、HVR-L2、和HVR-L3的分离的抗体。
[0258] 在一些实施方案中,所述抗TREM2抗体是抗TREM2单克隆抗体3A7。在一些实施方案中,所述抗TREM2抗体是与3A7结合基本上相同的TREM2表位的分离的抗体。在一些实施方案中,所述抗TREM2抗体是包含单克隆抗体3A7的重链可变结构域的HVR-H1、HVR-H2、和HVR-H3的分离的抗体。在一些实施方案中,所述抗TREM2抗体是包含单克隆抗体3A7的轻链可变结构域的HVR-L1、HVR-L2、和HVR-L3的分离的抗体。在一些实施方案中,所述抗TREM2抗体是包含单克隆抗体3A7的重链可变结构域的HVR-H1、HVR-H2、和HVR-H3以及轻链可变结构域的HVR-L1、HVR-L2、和HVR-L3的分离的抗体。
[0259] 在一些实施方案中,所述抗TREM2抗体是抗TREM2单克隆抗体4D11。在一些实施方案中,所述抗TREM2抗体是与4D11结合基本上相同的TREM2表位的分离的抗体。在一些实施方案中,所述抗TREM2抗体是包含单克隆抗体4D11的重链可变结构域的HVR-H1、HVR-H2、和HVR-H3的分离的抗体。在一些实施方案中,所述抗TREM2抗体是包含单克隆抗体4D11的轻链可变结构域的HVR-L1、HVR-L2、和HVR-L3的分离的抗体。在一些实施方案中,所述抗TREM2抗体是包含单克隆抗体4D11的重链可变结构域的HVR-H1、HVR-H2、和HVR-H3以及轻链可变结构域的HVR-L1、HVR-L2、和HVR-L3的分离的抗体。
[0260] 在一些实施方案中,所述抗TREM2抗体是抗TREM2单克隆抗体12F9。在一些实施方案中,所述抗TREM2抗体是与12F9结合基本上相同的TREM2表位的分离的抗体。在一些实施方案中,所述抗TREM2抗体是包含单克隆抗体12F9的重链可变结构域的HVR-H1、HVR-H2、和HVR-H3的分离的抗体。在一些实施方案中,所述抗TREM2抗体是包含单克隆抗体12F9的轻链可变结构域的HVR-L1、HVR-L2、和HVR-L3的分离的抗体。在一些实施方案中,所述抗TREM2抗体是包含单克隆抗体12F9的重链可变结构域的HVR-H1、HVR-H2、和HVR-H3以及轻链可变结构域的HVR-L1、HVR-L2、和HVR-L3的分离的抗体。
[0261] 在一些实施方案中,所述抗TREM2抗体是抗TREM2单克隆抗体8F8。在一些实施方案中,所述抗TREM2抗体是与8F8结合基本上相同的TREM2表位的分离的抗体。在一些实施方案中,所述抗TREM2抗体是包含单克隆抗体8F8的重链可变结构域的HVR-H1、HVR-H2、和HVR-H3的分离的抗体。在一些实施方案中,所述抗TREM2抗体是包含单克隆抗体8F8的轻链可变结构域的HVR-L1、HVR-L2、和HVR-L3的分离的抗体。在一些实施方案中,所述抗TREM2抗体是包含单克隆抗体8F8的重链可变结构域的HVR-H1、HVR-H2、和HVR-H3以及轻链可变结构域的HVR-L1、HVR-L2、和HVR-L3的分离的抗体。
[0262] 在一些实施方案中,所述抗TREM2抗体是抗TREM2单克隆抗体1B4。在一些实施方案中,所述抗TREM2抗体是与1B4结合基本上相同的TREM2表位的分离的抗体。在一些实施方案中,所述抗TREM2抗体是包含单克隆抗体1B4的重链可变结构域的HVR-H1、HVR-H2、和HVR-H3的分离的抗体。在一些实施方案中,所述抗TREM2抗体是包含单克隆抗体1B4v1的轻链可变结构域的HVR-L1、HVR-L2、和HVR-L3的分离的抗体。在一些实施方案中,所述抗TREM2抗体是包含单克隆抗体1B4v2的轻链可变结构域的HVR-L1、HVR-L2、和HVR-L3的分离的抗体。在一些实施方案中,所述抗TREM2抗体是包含单克隆抗体1B4的重链可变结构域的HVR-H1、HVR-H2、和HVR-H3以及单克隆抗体1B4v1的轻链可变结构域的HVR-L1、HVR-L2、和HVR-L3的分离的抗体。在一些实施方案中,所述抗TREM2抗体是包含单克隆抗体1B4的重链可变结构域的HVR-H1、HVR-H2、和HVR-H3以及单克隆抗体1B4v2的轻链可变结构域的HVR-L1、HVR-L2、和HVR-L3的分离的抗体。
[0263] 在一些实施方案中,所述抗TREM2抗体是抗TREM2单克隆抗体6H2。在一些实施方案中,所述抗TREM2抗体是与6H2结合基本上相同的TREM2表位的分离的抗体。在一些实施方案中,所述抗TREM2抗体是包含单克隆抗体6H2的重链可变结构域的HVR-H1、HVR-H2、和HVR-H3的分离的抗体。在一些实施方案中,所述抗TREM2抗体是包含单克隆抗体6H2的轻链可变结构域的HVR-L1、HVR-L2、和HVR-L3的分离的抗体。在一些实施方案中,所述抗TREM2抗体是包含单克隆抗体6H2的重链可变结构域的HVR-H1、HVR-H2、和HVR-H3以及轻链可变结构域的HVR-L1、HVR-L2、和HVR-L3的分离的抗体。
[0264] 在一些实施方案中,所述抗TREM2抗体是抗TREM2单克隆抗体7B11。在一些实施方案中,所述抗TREM2抗体是与7B11结合基本上相同的TREM2表位的分离的抗体。在一些实施方案中,所述抗TREM2抗体是包含单克隆抗体7B11v1的重链可变结构域的HVR-H1、HVR-H2、和HVR-H3的分离的抗体。在一些实施方案中,所述抗TREM2抗体是包含单克隆抗体7B11v2的重链可变结构域的HVR-H1、HVR-H2、和HVR-H3的分离的抗体。在一些实施方案中,所述抗TREM2抗体是包含单克隆抗体7B11的轻链可变结构域的HVR-L1、HVR-L2、和HVR-L3的分离的抗体。在一些实施方案中,所述抗TREM2抗体是包含单克隆抗体7B11v1的重链可变结构域的HVR-H1、HVR-H2、和HVR-H3以及单克隆抗体7B11的轻链可变结构域的HVR-L1、HVR-L2、和HVR-L3的分离的抗体。在一些实施方案中,所述抗TREM2抗体是包含单克隆抗体7B11v2的重链可变结构域的HVR-H1、HVR-H2、和HVR-H3以及单克隆抗体7B11的轻链可变结构域的HVR-L1、HVR-L2、和HVR-L3的分离的抗体。
[0265] 在一些实施方案中,所述抗TREM2抗体是抗TREM2单克隆抗体18D8。在一些实施方案中,所述抗TREM2抗体是与18D8结合基本上相同的TREM2表位的分离的抗体。在一些实施方案中,所述抗TREM2抗体是包含单克隆抗体18D8的重链可变结构域的HVR-H1、HVR-H2、和HVR-H3的分离的抗体。在一些实施方案中,所述抗TREM2抗体是包含单克隆抗体18D8的轻链可变结构域的HVR-L1、HVR-L2、和HVR-L3的分离的抗体。在一些实施方案中,所述抗TREM2抗体是包含单克隆抗体18D8的重链可变结构域的HVR-H1、HVR-H2、和HVR-H3以及轻链可变结构域的HVR-L1、HVR-L2、和HVR-L3的分离的抗体。
[0266] 在一些实施方案中,所述抗TREM2抗体是抗TREM2单克隆抗体18E4v1。在一些实施方案中,所述抗TREM2抗体是与18E4v1结合基本上相同的TREM2表位的分离的抗体。在一些实施方案中,所述抗TREM2抗体是包含单克隆抗体18E4v1的重链可变结构域的HVR-H1、HVR-H2、和HVR-H3的分离的抗体。在一些实施方案中,所述抗TREM2抗体是包含单克隆抗体18E4v1的轻链可变结构域的HVR-L1、HVR-L2、和HVR-L3的分离的抗体。在一些实施方案中,所述抗TREM2抗体是包含单克隆抗体18E4v1的重链可变结构域的HVR-H1、HVR-H2、和HVR-H3以及轻链可变结构域的HVR-L1、HVR-L2、和HVR-L3的分离的抗体。
[0267] 在一些实施方案中,所述抗TREM2抗体是抗TREM2单克隆抗体18E4v2。在一些实施方案中,所述抗TREM2抗体是与18E4v2结合基本上相同的TREM2表位的分离的抗体。在一些实施方案中,所述抗TREM2抗体是包含单克隆抗体18E4v2的重链可变结构域的HVR-H1、HVR-H2、和HVR-H3的分离的抗体。在一些实施方案中,所述抗TREM2抗体是包含单克隆抗体18E4v2的轻链可变结构域的HVR-L1、HVR-L2、和HVR-L3的分离的抗体。在一些实施方案中,所述抗TREM2抗体是包含单克隆抗体18E4v2的重链可变结构域的HVR-H1、HVR-H2、和HVR-H3以及轻链可变结构域的HVR-L1、HVR-L2、和HVR-L3的分离的抗体。
[0268] 在一些实施方案中,所述抗TREM2抗体是抗TREM2单克隆抗体29F6v1。在一些实施方案中,所述抗TREM2抗体是与29F6v1结合基本上相同的TREM2表位的分离的抗体。在一些实施方案中,所述抗TREM2抗体是包含单克隆抗体29F6v1的重链可变结构域的HVR-H1、HVR-H2、和HVR-H3的分离的抗体。在一些实施方案中,所述抗TREM2抗体是包含单克隆抗体29F6v1的轻链可变结构域的HVR-L1、HVR-L2、和HVR-L3的分离的抗体。在一些实施方案中,所述抗TREM2抗体是包含单克隆抗体29F6v1的重链可变结构域的HVR-H1、HVR-H2、和HVR-H3以及轻链可变结构域的HVR-L1、HVR-L2、和HVR-L3的分离的抗体。
[0269] 在一些实施方案中,所述抗TREM2抗体是抗TREM2单克隆抗体29F6v2。在一些实施方案中,所述抗TREM2抗体是与29F6v2结合基本上相同的TREM2表位的分离的抗体。在一些实施方案中,所述抗TREM2抗体是包含单克隆抗体29F6v2的重链可变结构域的HVR-H1、HVR-H2、和HVR-H3的分离的抗体。在一些实施方案中,所述抗TREM2抗体是包含单克隆抗体29F6v2的轻链可变结构域的HVR-L1、HVR-L2、和HVR-L3的分离的抗体。在一些实施方案中,所述抗TREM2抗体是包含单克隆抗体29F6v2的重链可变结构域的HVR-H1、HVR-H2、和HVR-H3以及轻链可变结构域的HVR-L1、HVR-L2、和HVR-L3的分离的抗体。
[0270] 在一些实施方案中,所述抗TREM2抗体是抗TREM2单克隆抗体40D5。在一些实施方案中,所述抗TREM2抗体是与40D5结合基本上相同的TREM2表位的分离的抗体。在一些实施方案中,所述抗TREM2抗体是包含单克隆抗体40D5v1的重链可变结构域的HVR-H1、HVR-H2、和HVR-H3的分离的抗体。在一些实施方案中,所述抗TREM2抗体是包含单克隆抗体40D5v2的重链可变结构域的HVR-H1、HVR-H2、和HVR-H3的分离的抗体。在一些实施方案中,所述抗TREM2抗体是包含单克隆抗体40D5的轻链可变结构域的HVR-L1、HVR-L2、和HVR-L3的分离的抗体。在一些实施方案中,所述抗TREM2抗体是包含单克隆抗体40D5v1的重链可变结构域的HVR-H1、HVR-H2、和HVR-H3以及单克隆抗体40D5的轻链可变结构域的HVR-L1、HVR-L2、和HVR-L3的分离的抗体。在一些实施方案中,所述抗TREM2抗体是包含单克隆抗体40D5v2的重链可变结构域的HVR-H1、HVR-H2、和HVR-H3以及单克隆抗体40D5的轻链可变结构域的HVR-L1、HVR-L2、和HVR-L3的分离的抗体,。
[0271] 在一些实施方案中,所述抗TREM2抗体是抗TREM2单克隆抗体43B9。在一些实施方案中,所述抗TREM2抗体是与43B9结合基本上相同的TREM2表位的分离的抗体。在一些实施方案中,所述抗TREM2抗体是包含单克隆抗体43B9的重链可变结构域的HVR-H1、HVR-H2、和HVR-H3的分离的抗体。在一些实施方案中,所述抗TREM2抗体是包含单克隆抗体43B9的轻链可变结构域的HVR-L1、HVR-L2、和HVR-L3的分离的抗体。在一些实施方案中,所述抗TREM2抗体是包含单克隆抗体43B9的重链可变结构域的HVR-H1、HVR-H2、和HVR-H3以及轻链可变结构域的HVR-L1、HVR-L2、和HVR-L3的分离的抗体。
[0272] 在一些实施方案中,所述抗TREM2抗体是抗TREM2单克隆抗体44A8。在一些实施方案中,所述抗TREM2抗体是与44A8结合基本上相同的TREM2表位的分离的抗体。在一些实施方案中,所述抗TREM2抗体是包含单克隆抗体44A8的重链可变结构域的HVR-H1、HVR-H2、和HVR-H3的分离的抗体。在一些实施方案中,所述抗TREM2抗体是包含单克隆抗体44A8v1的轻链可变结构域的HVR-L1、HVR-L2、和HVR-L3的分离的抗体。在一些实施方案中,所述抗TREM2抗体是包含单克隆抗体44A8v2的轻链可变结构域的HVR-L1、HVR-L2、和HVR-L3的分离的抗体。在一些实施方案中,所述抗TREM2抗体是包含单克隆抗体44A8的重链可变结构域的HVR-H1、HVR-H2、和HVR-H3以及单克隆抗体44A8v1的轻链可变结构域的HVR-L1、HVR-L2、和HVR-L3的分离的抗体。在一些实施方案中,所述抗TREM2抗体是包含单克隆抗体44A8的重链可变结构域的HVR-H1、HVR-H2、和HVR-H3以及单克隆抗体44A8v2的轻链可变结构域的HVR-L1、HVR-L2、和HVR-L3的分离的抗体。
[0273] 在一些实施方案中,所述抗TREM2抗体是抗TREM2单克隆抗体44B4v1。在一些实施方案中,所述抗TREM2抗体是与44B4v1结合基本上相同的TREM2表位的分离的抗体。在一些实施方案中,所述抗TREM2抗体是包含单克隆抗体44B4v1的重链可变结构域的HVR-H1、HVR-H2、和HVR-H3的分离的抗体。在一些实施方案中,所述抗TREM2抗体是包含单克隆抗体44B4v1的轻链可变结构域的HVR-L1、HVR-L2、和HVR-L3的分离的抗体。在一些实施方案中,所述抗TREM2抗体是包含单克隆抗体44B4v1的重链可变结构域的HVR-H1、HVR-H2、和HVR-H3以及轻链可变结构域的HVR-L1、HVR-L2、和HVR-L3的分离的抗体。
[0274] 在一些实施方案中,所述抗TREM2抗体是抗TREM2单克隆抗体44B4v2。在一些实施方案中,所述抗TREM2抗体是与44B4v2结合基本上相同的TREM2表位的分离的抗体。在一些实施方案中,所述抗TREM2抗体是包含单克隆抗体44B4v2的重链可变结构域的HVR-H1、HVR-H2、和HVR-H3的分离的抗体。在一些实施方案中,所述抗TREM2抗体是包含单克隆抗体44B4v2的轻链可变结构域的HVR-L1、HVR-L2、和HVR-L3的分离的抗体。在一些实施方案中,所述抗TREM2抗体是包含单克隆抗体44B4v2的重链可变结构域的HVR-H1、HVR-H2、和HVR-H3以及轻链可变结构域的HVR-L1、HVR-L2、和HVR-L3的分离的抗体。
[0275] 在一些实施方案中,本公开的抗TREM2抗体不与一种或多种TREM2配体竞争结合到TREM2。在一些实施方案中,本公开的抗TREM2抗体能够结合TREM2而不阻断一种或多种TREM2配体与TREM2的同时结合。在一些实施方案中,本公开的抗TREM2抗体能够与一种或多种TREM2配体进行相加和/或协同功能性相互作用。在一些实施方案中,本公开的抗TREM2抗体增加暴露于饱和浓度的一种或多种TREM2配体的TREM2的最大活性。在一些实施方案中,本公开的抗TREM2抗体增加在一种或多种TREM2配体的任何浓度下获得的TREM2的活性。
[0276] 抗TREM2抗体结合亲和力
[0277] 抗TREM2抗体对于人TREM2和小鼠TREM2的解离常数(KD)可小于15nM、小于14.5nM、小于14nM、小于13.5nM、小于13nM、小于12.9nM、小于12.8nM、小于12.7nM、小于12.6nM、小于12.5nM、小于12.4nM、小于12.3nM、小于12.2nM、小于12.1nM、小于12nM、小于11.5nM、小于
11nM、小于10.9nM、小于10.8nM、小于10.7nM、小于10.6nM、小于10.5nM、小于10.4nM、小于
10.3nM、小于10.2nM、小于10.1nM、小于10nM、小于9.5nM、小于9nM、小于8.5nM、小于8nM、小于7.5nM、小于7nM、小于6.9nM、小于6.8nM、小于6.7nM、小于6.6nM、小于6.5nM、小于6.4nM、小于6.3nM、小于6.2nM、小于6.1nM、小于6nM、小于5.5nM、小于5nM、小于4.5nM、小于4nM、小于3.5nM、小于3.4nM、小于3.3nM、小于3.2nM、小于3.1nM、小于3nM、小于2.9nM、小于2.8nM、小于2.7nM、小于2.6nM、小于2.5nM、小于2.4nM、小于2.3nM、小于2.2nM、小于2.1nM、小于
2nM、小于1.9nM、小于1.8nM、小于1.7nM、小于1.6nM、小于1.5nM、小于1.4nM、小于1.3nM、小于1.2nM、小于1.1nM、小于1nM、小于0.95nM、或小于0.9nM。在一些实施方案中,解离常数的范围是约12.8nM至约1.2nM、或小于1.2nM。在一些实施方案中,抗TREM2抗体对于人TREM2的解离常数的范围是约12.8nM至约2.9nM、或小于2.9nM。在一些实施方案中,抗TREM2抗体对于小鼠TREM2的解离常数的范围是约10.4nM至约1.2nM、或小于1.2nM。
[0278] 在一些实施方案中,本公开的抗TREM2抗体当施用到个体时增加记忆力和/或减少认知缺陷。在一些实施方案中,本公开的抗TREM2抗体不抑制一种或多种先天免疫细胞的生长。在一些实施方案中,本公开的抗TREM2抗体以小于50nM、小于45nM、小于40nM、小于35nM、小于30nM、小于25nM、小于20nM、小于15nM、小于10nM、小于9nM、小于8nM、小于7nM、小于6nM、小于5nM、小于4nM、小于3nM、小于2nM、或小于1nM的KD结合到一种或多种原代免疫细胞。在一些实施方案中,解离常数(KD)在大约4℃的温度下确定。在一些实施方案中,KD使用单价抗体(例如,Fab)或呈单价形式的全长抗体来确定。用于制备并选择与TREM2相互作用和/或特异性地结合到TREM2的方法在本文中进行描述。(例如,参见实施例1)。
[0279] 解离常数可通过任何分析技术来确定,所述分析技术包括任何生物化学或生物物理技术,诸如ELISA、表面等离子共振(SPR)、生物膜干涉测量法(参见,例如,ForteBio的Octet系统)、等温滴定量热法(ITC)、差示扫描量热法(DSC)、圆二色性(CD)、停流分析、以及比色或荧光蛋白熔融分析。在一些实施方案中,对于TREM2的解离常数(KD)在大约4℃的温度下确定。在一些实施方案中,KD使用单价抗体(例如,Fab)或全长抗体来确定。在一些实施方案中,KD使用呈单价形式的全长抗体来确定。利用例如本文所述的任何测定(参见,例如,实施例1)。
[0280] 额外的抗TREM2抗体(例如,特异性地结合到本公开的TREM2蛋白的抗体)可通过本领域已知的各种测定针对其物理/化学特性和/或生物活性来鉴别、筛选、和/或表征。
[0281] 双特异性抗体
[0282] 本公开的某些方面涉及结合到本公开的TREM2蛋白和第二抗原的双特异性抗体。生成双特异性抗体的方法是本领域熟知的并且在本文中进行描述。在一些实施方案中,本公开的双特异性抗体结合到人TREM2(SEQ ID NO:1)的一个或多个氨基酸残基,或结合到TREM2蛋白上的对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基的氨基酸残基。在其他实施方案中,本公开的双特异性抗体还结合到人DAP12(SEQ ID NO:887)的一个或多个氨基酸残基,或结合到DAP12蛋白上的对应于SEQ ID NO:887的氨基酸残基的氨基酸残基。
[0283] 在一些实施方案中,本公开的双特异性抗体识别第一抗原和第二抗原。在一些实施方案中,所述第一抗原是TREM2或其天然存在的变体、或人DAP12或其天然存在的变体。在一些实施方案中,所述第二抗原是a)有助于跨血脑屏障转运的抗原;(b)有助于跨血脑屏障转运的抗原,其选自转铁蛋白受体(TR)、胰岛素受体(HIR)、胰岛素样生长因子受体(IGFR)、低密度脂蛋白受体相关蛋白1和低密度脂蛋白受体相关蛋白2(LPR-1和LPR-2)、白喉毒素受体、CRM197、美洲驼单结构域抗体、TMEM 30(A)、蛋白转导结构域、TAT、Syn-B、穿膜肽、聚精氨酸肽、血管肽、以及ANG1005;(c)致病性蛋白,其选自淀粉样蛋白β、寡聚淀粉样蛋白β、淀粉样蛋白β斑、淀粉样蛋白前体蛋白或其片段、Tau、IAPP、α-突触核蛋白、TDP-43、FUS蛋白、C9orf72(染色体9开放阅读框72)、c9RAN蛋白、朊病毒蛋白、PrPSc、亨廷顿蛋白、降血钙素、超氧化物歧化酶、共济失调蛋白、共济失调蛋白1、共济失调蛋白2、共济失调蛋白3、共济失调蛋白7、共济失调蛋白8、共济失调蛋白10、路易小体、心房利钠因子、胰岛淀粉样蛋白多肽、胰岛素、载脂蛋白AI、血清淀粉样蛋白A、medin、泌乳素、转甲状腺素蛋白、溶菌酶、β2微球蛋白、凝溶胶蛋白、角膜上皮蛋白、抑半胱氨酸蛋白酶蛋白、免疫球蛋白轻链AL、S-IBM蛋白、重复序列相关非ATG(RAN)翻译产物、二肽重复序列(DPR)肽、甘氨酸-丙氨酸(GA)重复序列肽、甘氨酸-脯氨酸(GP)重复序列肽、甘氨酸-精氨酸(GR)重复序列肽、脯氨酸-丙氨酸(PA)重复序列肽、泛素、以及脯氨酸-精氨酸(PR)重复序列肽;以及(d)在免疫细胞上表达的配体和/或蛋白质,其中所述配体和/或蛋白质选自CD40、OX40、ICOS、CD28、CD137/4-1BB、CD27、GITR、PD-L1、CTLA-4、PD-L2、PD-1、B7-H3、B7-H4、HVEM、BTLA、KIR、GAL9、TIM3、A2AR、LAG-3、以及磷脂酰丝氨酸;以及(e)在一种或多种肿瘤细胞上表达的蛋白质、脂质、多糖、或糖脂以及其任何组合。
[0284] 抗体片段
[0285] 本公开的某些方面涉及结合到人TREM2、人TREM2的天然存在的变体、以及人TREM2的疾病变体中的一种或多种的抗体片段。在一些实施方案中,所述抗体片段是Fab、Fab’、Fab’-SH、F(ab’)2、Fv或scFv片段。在一些实施方案中,所述抗体片段与特异性地结合致病性蛋白的一种或多种抗体组合使用,所述致病性蛋白选自:a)有助于跨血脑屏障转运的抗原;(b)有助于跨血脑屏障转运的抗原,其选自转铁蛋白受体(TR)、胰岛素受体(HIR)、胰岛素样生长因子受体(IGFR)、低密度脂蛋白受体相关蛋白1和低密度脂蛋白受体相关蛋白2(LPR-1和LPR-2)、白喉毒素受体、CRM197、美洲驼单结构域抗体、TMEM 30(A)、蛋白转导结构域、TAT、Syn-B、穿膜肽、聚精氨酸肽、血管肽、以及ANG1005;(c)致病性蛋白,其选自淀粉样蛋白β、寡聚淀粉样蛋白β、淀粉样蛋白β斑、淀粉样蛋白前体蛋白或其片段、Tau、IAPP、α-突触核蛋白、TDP-43、FUS蛋白、C9orf72(染色体9开放阅读框72)、c9RAN蛋白、朊病毒蛋白、PrPSc、亨廷顿蛋白、降血钙素、超氧化物歧化酶、共济失调蛋白、共济失调蛋白1、共济失调蛋白2、共济失调蛋白3、共济失调蛋白7、共济失调蛋白8、共济失调蛋白10、路易小体、心房利钠因子、胰岛淀粉样蛋白多肽、胰岛素、载脂蛋白AI、血清淀粉样蛋白A、medin、泌乳素、转甲状腺素蛋白、溶菌酶、β2微球蛋白、凝溶胶蛋白、角膜上皮蛋白、抑半胱氨酸蛋白酶蛋白、免疫球蛋白轻链AL、S-IBM蛋白、重复序列相关非ATG(RAN)翻译产物、二肽重复序列(DPR)肽、甘氨酸-丙氨酸(GA)重复序列肽、甘氨酸-脯氨酸(GP)重复序列肽、甘氨酸-精氨酸(GR)重复序列肽、脯氨酸-丙氨酸(PA)重复序列肽、泛素、以及脯氨酸-精氨酸(PR)重复序列肽;以及(d)在免疫细胞上表达的配体和/或蛋白质,其中所述配体和/或蛋白质选自CD40、OX40、ICOS、CD28、CD137/4-1BB、CD27、GITR、PD-L1、CTLA-4、PD-L2、PD-1、B7-H3、B7-H4、HVEM、BTLA、KIR、GAL9、TIM3、A2AR、LAG-3、以及磷脂酰丝氨酸;以及(e)在一种或多种肿瘤细胞上表达的蛋白质、脂质、多糖、或糖脂、以及其任何组合。
[0286] 抗体框架
[0287] 本文所述的抗体中的任一种还包含框架。在一些实施方案中,所述框架是人免疫球蛋白框架。例如,在一些实施方案中,抗体(例如,抗TREM2抗体)包含如任何以上实施方案中的HVR,并且还包含受体人框架,例如人免疫球蛋白框架或人共有框架。人免疫球蛋白框架可以是人抗体的一部分,或者非人抗体可通过使用人框架区替换一个或多个内源性框架来人源化。可用于人源化的人框架区包括但不限于:使用“最佳拟合”方法选择的框架区(参见,例如,Sims等人,J.Immunol.151:2296(1993));衍生自特定亚组的轻链可变区或重链可变区的人抗体的共有序列的框架区(参见,例如,Carter等人,Proc.Natl.Acad.Sci89:4285(1992);以及Presta等人J.Immunol.,151:2623(1993));人成熟(体细胞突变)框架区或人种系框架区(参见,例如,Almagro和Fransson,Front.Biosci.13:1619-1633(2008));以及衍生自筛选FR文库的框架区(参见,例如,Baca等人,J.Biol.Chem.272:10678-10684(1997)和Rosok等人,J.Biol.Chem.271:22611-22618(1996))。
[0288] 在一些实施方案中,抗体包含轻链可变区,所述轻链可变区包含本公开的HVR-L1、HVR-L2、和HVR-L3以及如表4A所示的轻链框架区中的一个、两个、三个或四个。在一些实施方案中,抗体包含重链可变区,所述重链可变区包含本公开的HVR-H1、HVR-H2、和HVR-H3以及如表4B所示的重链框架区中的一个、两个、三个或四个。在一些实施方案中,抗体包含轻链可变区,所述轻链可变区包含本公开的HVR-L1、HVR-L2、和HVR-L3以及如表4A所示的轻链框架区中的一个、两个、三个或四个;并且还包含重链可变区,所述重链可变区包含包括本公开的HVR-H1、HVR-H2、和HVR-H3以及如表4B所示的重链框架区中的一个、两个、三个或四个。
[0289] PI3K活化。
[0290] 在一些实施方案中,本公开的抗TREM2抗体可在结合到在细胞中表达的TREM2蛋白之后诱导PI3K活化。
[0291] PI3K是能够使磷脂酰肌醇(PtdIns)的肌醇环的3位羟基磷酸化的相关细胞内信号转导剂激酶的家族。PI3K家族基于一级结构、调节、和体外脂质底物特异性而分为三种不同的类别(类别I、类别II、和类别III)。
[0292] 活化的PI3K产生各种3-磷酸化的磷酸肌醇,包括但不限于,PtdIns3P、PtdIns(3,4)P2、PtdIns(3,5)P2及PtdIns(3,4,5)P3。这些3-磷酸化的磷酸肌醇通过将信号传导蛋白募集至各种细胞膜的机制起作用。这些信号传导蛋白含有磷酸肌醇结合结构域,包括但不限于,PX结构域、普列克底物蛋白(pleckstrin)同源结构域(PH结构域)及FYVE结构域。本领域中已知用于测定PI3K活化的任何方法都可以使用。
[0293] 在一些实施方案中,本公开的抗TREM2抗体可有益于预防、降低风险、或治疗与降低水平的PI3K活性相关联的病状和/或疾病,所述病状和/或疾病包括痴呆、额颞叶痴呆、阿尔茨海默氏病、血管性痴呆、混合型痴呆、克-雅二氏病、正常压力脑积水、肌萎缩性侧索硬化症、亨廷顿氏病、tau蛋白病、Nasu-Hakola病、中风、急性创伤、慢性创伤、认知缺陷、记忆力丧失、狼疮、急性和慢性结肠炎、类风湿关节炎、伤口愈合、克罗恩氏病、炎症性肠病、溃疡性结肠炎、肥胖症、疟疾、特发性震颤、中枢神经系统狼疮、贝切特氏病、帕金森氏病、路易体痴呆、多系统萎缩、希一德二氏综合征、进行性核上性麻痹、皮层基底神经节变性、急性播散性脑脊髓炎、肉芽肿病症、结节病、老化疾病、癫痫发作、脊髓损伤、创伤性脑损伤、年龄相关性黄斑变性、青光眼、色素性视网膜炎、视网膜变性、呼吸道感染、败血症、眼部感染、全身感染、狼疮、关节炎、多发性硬化症、低骨密度、骨质疏松症、骨生成、骨质增生疾病、佩吉特氏骨病、癌症、膀胱癌、脑癌、乳腺癌、结肠癌、直肠癌、子宫内膜癌、肾癌、肾细胞癌、肾盂癌、白血病、肺癌、黑素瘤、非霍奇金氏淋巴瘤、胰腺癌、前列腺癌、卵巢癌、纤维肉瘤、急性成淋巴细胞白血病(ALL)、急性骨髓性白血病(AML)、慢性淋巴细胞白血病(CLL)、慢性骨髓性白血病(CML)、多发性骨髓瘤、真性红细胞增多症、原发性血小板增多症、原发性或特发性骨髓纤维化、原发性或特发性脊髓硬化症、髓样来源的肿瘤、表达TREM2的肿瘤、甲状腺癌、感染、CNS疱疹、寄生虫感染、锥虫感染、Cruzi感染、铜绿假单胞菌感染、杜氏利什曼原虫感染、B族链球菌感染、空肠弯曲杆菌感染、脑膜炎奈瑟氏球菌感染、I型HIV、以及流感嗜血杆菌,其包括向有需要的个体施用治疗有效量的不抑制TREM2与一种或多种TREM2配体之间的相互作用和/或增强至少一种TREM2配体的一种或多种活性的药剂。本公开的其他方面涉及一种不抑制TREM2与一种或多种TREM2配体之间的相互作用和/或增强至少一种TREM2配体的一种或多种活性的药剂,其用于预防、降低风险、或治疗选自以下的疾病、病症、或损伤:痴呆、额颞叶痴呆、阿尔茨海默氏病、血管性痴呆、混合型痴呆、克-雅二氏病、正常压力脑积水、肌萎缩性侧索硬化症、亨廷顿氏病、tau蛋白病、Nasu-Hakola病、中风、急性创伤、慢性创伤、认知缺陷、记忆力丧失、狼疮、急性和慢性结肠炎、类风湿关节炎、伤口愈合、克罗恩氏病、炎症性肠病、溃疡性结肠炎、肥胖症、疟疾、特发性震颤、中枢神经系统狼疮、贝切特氏病、帕金森氏病、路易体痴呆、多系统萎缩、希一德二氏综合征、进行性核上性麻痹、皮层基底神经节变性、急性播散性脑脊髓炎、肉芽肿病症、结节病、老化疾病、癫痫发作、脊髓损伤、创伤性脑损伤、年龄相关性黄斑变性、青光眼、色素性视网膜炎、视网膜变性、呼吸道感染、败血症、眼部感染、全身感染、狼疮、关节炎、多发性硬化症、低骨密度、骨质疏松症、骨生成、骨质增生疾病、佩吉特氏骨病、癌症、膀胱癌、脑癌、乳腺癌、结肠癌、直肠癌、子宫内膜癌、肾癌、肾细胞癌、肾盂癌、白血病、肺癌、黑素瘤、非霍奇金氏淋巴瘤、胰腺癌、前列腺癌、卵巢癌、纤维肉瘤、急性成淋巴细胞白血病(ALL)、急性骨髓性白血病(AML)、慢性淋巴细胞白血病(CLL)、慢性骨髓性白血病(CML)、多发性骨髓瘤、真性红细胞增多症、原发性血小板增多症、原发性或特发性骨髓纤维化、原发性或特发性脊髓硬化症、髓样来源的肿瘤、表达TREM2的肿瘤、甲状腺癌、感染、CNS疱疹、寄生虫感染、锥虫感染、Cruzi感染、铜绿假单胞菌感染、杜氏利什曼原虫感染、B族链球菌感染、空肠弯曲杆菌感染、脑膜炎奈瑟氏球菌感染、I型HIV、以及流感嗜血杆菌。
[0294] 抗炎介质的调控表达
[0295] 在一些实施方案中,本公开的抗TREM2抗体在结合到在细胞表面上表达的TREM2蛋白之后调控(例如,增加或降低)大脑中的抗炎介质。本公开的抗TREM2抗体在结合到在细胞中表达的TREM2蛋白之后调控细胞因子(例如,抗炎介质)的表达和/或调控促炎介质的表达。一旦细胞由于TREM2信号传导的缺陷而死亡,它们就诱导促炎应答。
[0296] 炎症是血管组织对如病原体、受损细胞及刺激物等有害刺激的复杂生物反应的一部分。急性炎症的典型症状是疼痛、发热、泛红、肿胀及功能丧失。炎症是生物体去除有害刺激并起始愈合过程的保护性尝试。炎症可以分类为急性炎症或慢性炎症。急性炎症是身体对有害刺激的初始反应,并且通过增加血浆和白细胞(尤其粒细胞)从血液向受损组织中的移动来实现。一系列生物化学事件将传播炎性反应并使其成熟,牵涉局部血管系统、免疫系统和受损组织内的各种细胞。慢性炎症是长期炎症,会导致存在于炎症部位的细胞类型的进行性转变,并且是以组织随炎症过程而同时破坏和愈合为特征。
[0297] 如本文所用,抗炎介质是直接或间接(例如,以抗炎信号传导途径的方式)参与减少、抑制、或使炎性应答失活的机制的蛋白质。可使用本领域已知的用于鉴别和表征抗炎介质的任何方法。抗炎介质的实例包括但不限于细胞因子,诸如IL-4、IL-10TGF-β、IL-13、IL-35IL-16、IFN-α、IL-1Ra、VEGF、G-CSF、YM、AXL、FLT1以及TNF或IL-6的可溶性受体。
[0298] 在一些实施方案中,本公开的抗TREM2抗体可调控细胞因子(诸如IL-12p70、IL-6、和IL-10)的表达。在某些实施方案中,细胞因子的调控表达发生在巨噬细胞、树突细胞、单核细胞、破骨细胞,皮肤朗格汉斯细胞、库普弗细胞、和/或小神经胶质细胞中。调控表达可包括但不限于调控基因表达、调控转录表达、或调控蛋白质表达。可使用本领域已知的用于确定基因、转录物(例如,mRNA)、和/或蛋白质表达的任何方法。例如,可使用Northern印迹分析来确定细胞因子基因表达水平,可使用RT-PCR来确定细胞因子转录的水平,并且可使用蛋白质印迹分析来确定细胞因子蛋白水平。
[0299] 如本文所用,如果细胞因子在使用本公开的抗TREM2抗体治疗的受试者的一种或多种细胞中的表达与在未使用抗TREM2抗体治疗的对应受试者的一种或多种细胞中表达的相同的细胞因子的表达相比被调控,则所述细胞因子可具有调控的(例如,增加的或降低的)表达。在一些实施方案中,例如与在未使用本公开的抗TREM2抗体治疗的受试者的一种或多种细胞中的细胞因子表达相比,所述抗TREM2抗体可使对应受试者的一种或多种细胞中的细胞因子表达调控至少10%、至少15%、至少20%、至少25%、至少30%、至少35%、至少40%、至少45%、至少50%、至少55%、至少60%、至少65%,至少70%,至少75%,至少80%、至少85%、至少90%、至少95%、至少100%、至少110%、至少115%、至少120%、至少
125%、至少130%、至少135%、至少140%、至少145%、至少150%、至少160%、至少170%、至少180%、至少190%、或至少200%。在其他实施方案中,例如与在未使用本公开的抗TREM2抗体治疗的受试者的一种或多种细胞中的细胞因子表达相比,所述抗TREM2抗体使对应受试者的一种或多种细胞中的细胞因子表达调控至少1.5倍、至少1.6倍、至少1.7倍、至少1.8倍、至少1.9倍、至少2.0倍、至少2.1倍、至少2.15倍、至少2.2倍、至少2.25倍、至少2.3倍、至少2.35倍、至少2.4倍、至少2.45倍、至少2.5倍、至少2.55倍、至少3.0倍、至少3.5倍、至少4.0倍、至少4.5倍、至少5.0倍、至少5.5倍、至少6.0倍、至少6.5倍、至少7.0倍、至少7.5倍、至少8.0倍、至少8.5倍、至少9.0倍、至少9.5倍、或至少10倍。
[0300] 在一些实施方案中,本公开的抗TREM2抗体可用于预防、降低风险、或治疗与异常水平的一种或多种抗炎介质相关联的病状和/或疾病,所述病状和/或疾病包括痴呆、额颞叶痴呆、阿尔茨海默氏病、血管性痴呆、混合型痴呆、克-雅二氏病、正常压力脑积水、肌萎缩性侧索硬化症、亨廷顿氏病、tau蛋白病、Nasu-Hakola病、中风、急性创伤、慢性创伤、认知缺陷、记忆力丧失、狼疮、急性和慢性结肠炎、类风湿关节炎、伤口愈合、克罗恩氏病、炎症性肠病、溃疡性结肠炎、肥胖症、疟疾、特发性震颤、中枢神经系统狼疮、贝切特氏病、帕金森氏病、路易体痴呆、多系统萎缩、希一德二氏综合征、进行性核上性麻痹、皮层基底神经节变性、急性播散性脑脊髓炎、肉芽肿病症、结节病、老化疾病、癫痫发作、脊髓损伤、创伤性脑损伤、年龄相关性黄斑变性、青光眼、色素性视网膜炎、视网膜变性、呼吸道感染、败血症、眼部感染、全身感染、狼疮、关节炎、多发性硬化症、低骨密度、骨质疏松症、骨生成、骨质增生疾病、佩吉特氏骨病、癌症、膀胱癌、脑癌、乳腺癌、结肠癌、直肠癌、子宫内膜癌、肾癌、肾细胞癌、肾盂癌、白血病、肺癌、黑素瘤、非霍奇金氏淋巴瘤、胰腺癌、前列腺癌、卵巢癌、纤维肉瘤、急性成淋巴细胞白血病(ALL)、急性骨髓性白血病(AML)、慢性淋巴细胞白血病(CLL)、慢性骨髓性白血病(CML)、多发性骨髓瘤、真性红细胞增多症、原发性血小板增多症、原发性或特发性骨髓纤维化、原发性或特发性脊髓硬化症、髓样来源的肿瘤、表达TREM2的肿瘤、甲状腺癌、感染、CNS疱疹、寄生虫感染、锥虫感染、Cruzi感染、铜绿假单胞菌感染、杜氏利什曼原虫感染、B族链球菌感染、空肠弯曲杆菌感染、脑膜炎奈瑟氏球菌感染、I型HIV、以及流感嗜血杆菌,其包括向有需要的个体施用治疗有效量的不抑制TREM2与一种或多种TREM2配体之间的相互作用和/或增强至少一种TREM2配体的一种或多种活性的药剂。本公开的其他方面涉及一种不抑制TREM2与一种或多种TREM2配体之间的相互作用和/或增强至少一种TREM2配体的一种或多种活性的药剂,其用于预防、降低风险、或治疗选自以下的疾病、病症、或损伤:痴呆、额颞叶痴呆、阿尔茨海默氏病、血管性痴呆、混合型痴呆、克-雅二氏病、正常压力脑积水、肌萎缩性侧索硬化症、亨廷顿氏病、tau蛋白病、Nasu-Hakola病、中风、急性创伤、慢性创伤、认知缺陷、记忆力丧失、狼疮、急性和慢性结肠炎、类风湿关节炎、伤口愈合、克罗恩氏病、炎症性肠病、溃疡性结肠炎、肥胖症、疟疾、特发性震颤、中枢神经系统狼疮、贝切特氏病、帕金森氏病、路易体痴呆、多系统萎缩、希一德二氏综合征、进行性核上性麻痹、皮层基底神经节变性、急性播散性脑脊髓炎、肉芽肿病症、结节病、老化疾病、癫痫发作、脊髓损伤、创伤性脑损伤、年龄相关性黄斑变性、青光眼、色素性视网膜炎、视网膜变性、呼吸道感染、败血症、眼部感染、全身感染、狼疮、关节炎、多发性硬化症、低骨密度、骨质疏松症、骨生成、骨质增生疾病、佩吉特氏骨病、癌症、膀胱癌、脑癌、乳腺癌、结肠癌、直肠癌、子宫内膜癌、肾癌、肾细胞癌、肾盂癌、白血病、肺癌、黑素瘤、非霍奇金氏淋巴瘤、胰腺癌、前列腺癌、卵巢癌、纤维肉瘤、急性成淋巴细胞白血病(ALL)、急性骨髓性白血病(AML)、慢性淋巴细胞白血病(CLL)、慢性骨髓性白血病(CML)、多发性骨髓瘤、真性红细胞增多症、原发性血小板增多症、原发性或特发性骨髓纤维化、原发性或特发性脊髓硬化症、髓样来源的肿瘤、表达TREM2的肿瘤、甲状腺癌、感染、CNS疱疹、寄生虫感染、锥虫感染、Cruzi感染、铜绿假单胞菌感染、杜氏利什曼原虫感染、B族链球菌感染、空肠弯曲杆菌感染、脑膜炎奈瑟氏球菌感染、I型HIV、以及流感嗜血杆菌。
[0301] 促炎介质的调控表达
[0302] 在一些实施方案中,本公开的抗TREM2抗体可在结合到在细胞中表达的TREM2蛋白之后调控(例如,增加或降低)促炎介质的表达。
[0303] 如本文所用,促炎介质是直接或间接(例如,以促炎信号传导途径的方式)参与诱导、活化、促进、或以其他方式增加炎性应答的机制的蛋白质。可使用本领域已知的用于鉴别和表征促炎介质的任何方法。促炎介质的实例包括但不限于细胞因子,诸如IFN-β、IL-1α、IL-1β、CD86、TNF-α、IL-6、IL-8、CRP、MCP-1/CCL2、CCL3、CCL4、CCL5、CCR2、CXCL-10、Gata3、IL-20家族成员、IL-33、LIF、IFN-γ、OSM、CNTF、CSF1、OPN、CD11c、GM-CSF、IL-11、IL-12、IL-17、IL-18、以及IL-23。
[0304] 在一些实施方案中,本公开的抗TREM2抗体可调控促炎介质的功能性表达和/或分泌,所述促炎介质诸如IFN-β、IL-1α、IL-1β、CD86、TNF-α、IL-6、IL-8、CRP、MCP-1/CCL2、CCL3、CCL4、CCL5、CCR2、CXCL-10、Gata3、IL-20家族成员、IL-33、LIF、IFN-γ、OSM、CNTF、CSF1、OPN、CD11c、GM-CSF、IL-11、IL-12、IL-17、IL-18、以及IL-23。在某些实施方案中,促炎介质的调控表达发生在巨噬细胞、树突细胞、单核细胞、破骨细胞,皮肤朗格汉斯细胞、库普弗细胞、和/或小神经胶质细胞中。调控表达可包括但不限于调控基因表达、调控转录表达、或调控蛋白质表达。可使用本领域已知的用于确定基因、转录物(例如,mRNA)、和/或蛋白质表达的任何方法。例如,可使用Northern印迹分析来确定促炎介质基因表达水平,可使用RT-PCR来确定促炎介质转录的水平,并且可使用蛋白质印迹分析来确定促炎介质蛋白水平。
[0305] 在某些实施方案中,促炎介质包括炎性细胞因子。因此,在某些实施方案中,本公开的抗TREM2抗体可调控一种或多种炎性细胞因子的分泌。其分泌可通过本公开的抗TREM2抗体减少的炎性细胞因子的实例包括但不限于IFN-β、IL-1α、IL-1β、CD86、TNF-α、IL-6、IL-8、CRP、MCP-1/CCL2、CCL3、CCL4、CCL5、CCR2、CXCL-10、Gata3、IL-20家族成员、IL-33、LIF、IFN-γ、OSM、CNTF、CSF1、OPN、CD11c、GM-CSF、IL-11、IL-12、IL-17、IL-18、以及IL-23。
[0306] 在某些实施方案中,促炎介质包括炎性受体。因此,在某些实施方案中,本公开的抗TREM2抗体可调控一种或多种炎性受体的表达。其表达可通过本公开的抗TREM2抗体减少的炎性受体的实例包括但不限于CD86。
[0307] 如本文所用,如果促炎介质在使用本公开的激动剂抗TREM2抗体治疗的受试者的一种或多种细胞中的表达与在未使用激动剂抗TREM2抗体治疗的对应受试者的一种或多种细胞中表达的相同的促炎介质的表达相比被调控(例如,增加或降低),则所述促炎介质可具有调控的表达。在一些实施方案中,例如与在未使用本公开的激动剂抗TREM2抗体治疗的受试者的一种或多种细胞中的促炎介质表达相比,所述激动剂抗TREM2抗体可使对应受试者的一种或多种细胞中的促炎介质表达调控至少10%、至少15%、至少20%、至少25%、至少30%、至少35%、至少40%、至少45%、至少50%、至少55%、至少60%、至少65%,至少70%,至少75%,至少80%、至少85%、至少90%、至少95%、至少100%、至少110%、至少
115%、至少120%、至少125%、至少130%、至少135%、至少140%、至少145%、至少150%、至少160%、至少170%、至少180%、至少190%、或至少200%。在其他实施方案中,例如与在未使用抗TREM2抗体治疗的受试者的一种或多种细胞中的促炎介质表达相比,激动剂抗TREM2抗体使对应受试者的一种或多种细胞中的促炎介质表达调控至少1.5倍、至少1.6倍、至少1.7倍、至少1.8倍、至少1.9倍、至少2.0倍、至少2.1倍、至少2.15倍、至少2.2倍、至少
2.25倍、至少2.3倍、至少2.35倍、至少2.4倍、至少2.45倍、至少2.5倍、至少2.55倍、至少3.0倍、至少3.5倍、至少4.0倍、至少4.5倍、至少5.0倍、至少5.5倍、至少6.0倍、至少6.5倍、至少
7.0倍、至少7.5倍、至少8.0倍、至少8.5倍、至少9.0倍、至少9.5倍、或至少10倍。
[0308] 在一些实施方案中,本公开的抗TREM2抗体可用于预防、降低风险、或治疗与异常水平的一种或多种促炎介质相关联的病状和/或疾病,所述病状和/或疾病包括痴呆、额颞叶痴呆、阿尔茨海默氏病、血管性痴呆、混合型痴呆、克-雅二氏病、正常压力脑积水、肌萎缩性侧索硬化症、亨廷顿氏病、tau蛋白病、Nasu-Hakola病、中风、急性创伤、慢性创伤、认知缺陷、记忆力丧失、狼疮、急性和慢性结肠炎、类风湿关节炎、伤口愈合、克罗恩氏病、炎症性肠病、溃疡性结肠炎、肥胖症、疟疾、特发性震颤、中枢神经系统狼疮、贝切特氏病、帕金森氏病、路易体痴呆、多系统萎缩、希一德二氏综合征、进行性核上性麻痹、皮层基底神经节变性、急性播散性脑脊髓炎、肉芽肿病症、结节病、老化疾病、癫痫发作、脊髓损伤、创伤性脑损伤、年龄相关性黄斑变性、青光眼、色素性视网膜炎、视网膜变性、呼吸道感染、败血症、眼部感染、全身感染、狼疮、关节炎、多发性硬化症、低骨密度、骨质疏松症、骨生成、骨质增生疾病、佩吉特氏骨病、癌症、膀胱癌、脑癌、乳腺癌、结肠癌、直肠癌、子宫内膜癌、肾癌、肾细胞癌、肾盂癌、白血病、肺癌、黑素瘤、非霍奇金氏淋巴瘤、胰腺癌、前列腺癌、卵巢癌、纤维肉瘤、急性成淋巴细胞白血病(ALL)、急性骨髓性白血病(AML)、慢性淋巴细胞白血病(CLL)、慢性骨髓性白血病(CML)、多发性骨髓瘤、真性红细胞增多症、原发性血小板增多症、原发性或特发性骨髓纤维化、原发性或特发性脊髓硬化症、髓样来源的肿瘤、表达TREM2的肿瘤、甲状腺癌、感染、CNS疱疹、寄生虫感染、锥虫感染、Cruzi感染、铜绿假单胞菌感染、杜氏利什曼原虫感染、B族链球菌感染、空肠弯曲杆菌感染、脑膜炎奈瑟氏球菌感染、I型HIV、以及流感嗜血杆菌,其包括向有需要的个体施用治疗有效量的不抑制TREM2与一种或多种TREM2配体之间的相互作用和/或增强至少一种TREM2配体的一种或多种活性的药剂。本公开的其他方面涉及一种不抑制TREM2与一种或多种TREM2配体之间的相互作用和/或增强至少一种TREM2配体的一种或多种活性的药剂,其用于预防、降低风险、或治疗选自以下的疾病、病症、或损伤:痴呆、额颞叶痴呆、阿尔茨海默氏病、血管性痴呆、混合型痴呆、克-雅二氏病、正常压力脑积水、肌萎缩性侧索硬化症、亨廷顿氏病、tau蛋白病、Nasu-Hakola病、中风、急性创伤、慢性创伤、认知缺陷、记忆力丧失、狼疮、急性和慢性结肠炎、类风湿关节炎、伤口愈合、克罗恩氏病、炎症性肠病、溃疡性结肠炎、肥胖症、疟疾、特发性震颤、中枢神经系统狼疮、贝切特氏病、帕金森氏病、路易体痴呆、多系统萎缩、希一德二氏综合征、进行性核上性麻痹、皮层基底神经节变性、急性播散性脑脊髓炎、肉芽肿病症、结节病、老化疾病、癫痫发作、脊髓损伤、创伤性脑损伤、年龄相关性黄斑变性、青光眼、色素性视网膜炎、视网膜变性、呼吸道感染、败血症、眼部感染、全身感染、狼疮、关节炎、多发性硬化症、低骨密度、骨质疏松症、骨生成、骨质增生疾病、佩吉特氏骨病、癌症、膀胱癌、脑癌、乳腺癌、结肠癌、直肠癌、子宫内膜癌、肾癌、肾细胞癌、肾盂癌、白血病、肺癌、黑素瘤、非霍奇金氏淋巴瘤、胰腺癌、前列腺癌、卵巢癌、纤维肉瘤、急性成淋巴细胞白血病(ALL)、急性骨髓性白血病(AML)、慢性淋巴细胞白血病(CLL)、慢性骨髓性白血病(CML)、多发性骨髓瘤、真性红细胞增多症、原发性血小板增多症、原发性或特发性骨髓纤维化、原发性或特发性脊髓硬化症、髓样来源的肿瘤、表达TREM2的肿瘤、甲状腺癌、感染、CNS疱疹、寄生虫感染、锥虫感染、Cruzi感染、铜绿假单胞菌感染、杜氏利什曼原虫感染、B族链球菌感染、空肠弯曲杆菌感染、脑膜炎奈瑟氏球菌感染、I型HIV、以及流感嗜血杆菌。
[0309] ERK磷酸化
[0310] 在一些实施方案中,本公开的抗TREM2抗体可在结合到在细胞中表达的TREM2蛋白之后诱导细胞外信号调节激酶(ERK)磷酸化。
[0311] 细胞外信号调节激酶(ERK)是参与例如分化细胞中的减数分裂、有丝分裂、和有丝分裂后功能的调节的广泛表达的蛋白激酶细胞内信号传导激酶。各种刺激使ERK途径活化,所述刺激诸如生长因子、细胞因子、病毒感染、异源三聚体G蛋白偶联受体的配体、转化剂、以及致癌物。ERK的磷酸化导致其激酶活性的活化。
[0312] 在一些实施方案中,本公开的抗TREM2抗体可有益于预防、降低风险、或治疗与降低水平的ERK磷酸化相关联的病状和/或疾病,所述病状和/或疾病包括痴呆、额颞叶痴呆、阿尔茨海默氏病、血管性痴呆、混合型痴呆、克-雅二氏病、正常压力脑积水、肌萎缩性侧索硬化症、亨廷顿氏病、tau蛋白病、Nasu-Hakola病、中风、急性创伤、慢性创伤、认知缺陷、记忆力丧失、狼疮、急性和慢性结肠炎、类风湿关节炎、伤口愈合、克罗恩氏病、炎症性肠病、溃疡性结肠炎、肥胖症、疟疾、特发性震颤、中枢神经系统狼疮、贝切特氏病、帕金森氏病、路易体痴呆、多系统萎缩、希一德二氏综合征、进行性核上性麻痹、皮层基底神经节变性、急性播散性脑脊髓炎、肉芽肿病症、结节病、老化疾病、癫痫发作、脊髓损伤、创伤性脑损伤、年龄相关性黄斑变性、青光眼、色素性视网膜炎、视网膜变性、呼吸道感染、败血症、眼部感染、全身感染、狼疮、关节炎、多发性硬化症、低骨密度、骨质疏松症、骨生成、骨质增生疾病、佩吉特氏骨病、癌症、膀胱癌、脑癌、乳腺癌、结肠癌、直肠癌、子宫内膜癌、肾癌、肾细胞癌、肾盂癌、白血病、肺癌、黑素瘤、非霍奇金氏淋巴瘤、胰腺癌、前列腺癌、卵巢癌、纤维肉瘤、急性成淋巴细胞白血病(ALL)、急性骨髓性白血病(AML)、慢性淋巴细胞白血病(CLL)、慢性骨髓性白血病(CML)、多发性骨髓瘤、真性红细胞增多症、原发性血小板增多症、原发性或特发性骨髓纤维化、原发性或特发性脊髓硬化症、髓样来源的肿瘤、表达TREM2的肿瘤、甲状腺癌、感染、CNS疱疹、寄生虫感染、锥虫感染、Cruzi感染、铜绿假单胞菌感染、杜氏利什曼原虫感染、B族链球菌感染、空肠弯曲杆菌感染、脑膜炎奈瑟氏球菌感染、I型HIV、以及流感嗜血杆菌,其包括向有需要的个体施用治疗有效量的不抑制TREM2与一种或多种TREM2配体之间的相互作用和/或增强至少一种TREM2配体的一种或多种活性的药剂。本公开的其他方面涉及一种不抑制TREM2与一种或多种TREM2配体之间的相互作用和/或增强至少一种TREM2配体的一种或多种活性的药剂,其用于预防、降低风险、或治疗选自以下的疾病、病症、或损伤:痴呆、额颞叶痴呆、阿尔茨海默氏病、血管性痴呆、混合型痴呆、克-雅二氏病、正常压力脑积水、肌萎缩性侧索硬化症、亨廷顿氏病、tau蛋白病、Nasu-Hakola病、中风、急性创伤、慢性创伤、认知缺陷、记忆力丧失、狼疮、急性和慢性结肠炎、类风湿关节炎、伤口愈合、克罗恩氏病、炎症性肠病、溃疡性结肠炎、肥胖症、疟疾、特发性震颤、中枢神经系统狼疮、贝切特氏病、帕金森氏病、路易体痴呆、多系统萎缩、希一德二氏综合征、进行性核上性麻痹、皮层基底神经节变性、急性播散性脑脊髓炎、肉芽肿病症、结节病、老化疾病、癫痫发作、脊髓损伤、创伤性脑损伤、年龄相关性黄斑变性、青光眼、色素性视网膜炎、视网膜变性、呼吸道感染、败血症、眼部感染、全身感染、狼疮、关节炎、多发性硬化症、低骨密度、骨质疏松症、骨生成、骨质增生疾病、佩吉特氏骨病、癌症、膀胱癌、脑癌、乳腺癌、结肠癌、直肠癌、子宫内膜癌、肾癌、肾细胞癌、肾盂癌、白血病、肺癌、黑素瘤、非霍奇金氏淋巴瘤、胰腺癌、前列腺癌、卵巢癌、纤维肉瘤、急性成淋巴细胞白血病(ALL)、急性骨髓性白血病(AML)、慢性淋巴细胞白血病(CLL)、慢性骨髓性白血病(CML)、多发性骨髓瘤、真性红细胞增多症、原发性血小板增多症、原发性或特发性骨髓纤维化、原发性或特发性脊髓硬化症、髓样来源的肿瘤、表达TREM2的肿瘤、甲状腺癌、感染、CNS疱疹、寄生虫感染、锥虫感染、Cruzi感染、铜绿假单胞菌感染、杜氏利什曼原虫感染、B族链球菌感染、空肠弯曲杆菌感染、脑膜炎奈瑟氏球菌感染、I型HIV、以及流感嗜血杆菌。
[0313] Syk磷酸化
[0314] 在一些实施方案中,本公开的抗TREM2抗体可在结合到在细胞中表达的TREM2蛋白之后诱导脾酪氨酸激酶(Syk)磷酸化。
[0315] 脾酪氨酸激酶(Syk)是通过使若干底物磷酸化、从而有助于形成导致细胞活化和炎性过程的信号传导复合物来在TREM2下游起作用的细胞内信号传导分子。
[0316] 在一些实施方案中,本公开的抗TREM2抗体可有益于预防、降低风险、或治疗与降低水平的Syk磷酸化相关联的病状和/或疾病,所述病状和/或疾病包括痴呆、额颞叶痴呆、阿尔茨海默氏病、血管性痴呆、混合型痴呆、克-雅二氏病、正常压力脑积水、肌萎缩性侧索硬化症、亨廷顿氏病、tau蛋白病、Nasu-Hakola病、中风、急性创伤、慢性创伤、认知缺陷、记忆力丧失、狼疮、急性和慢性结肠炎、类风湿关节炎、伤口愈合、克罗恩氏病、炎症性肠病、溃疡性结肠炎、肥胖症、疟疾、特发性震颤、中枢神经系统狼疮、贝切特氏病、帕金森氏病、路易体痴呆、多系统萎缩、希一德二氏综合征、进行性核上性麻痹、皮层基底神经节变性、急性播散性脑脊髓炎、肉芽肿病症、结节病、老化疾病、癫痫发作、脊髓损伤、创伤性脑损伤、年龄相关性黄斑变性、青光眼、色素性视网膜炎、视网膜变性、呼吸道感染、败血症、眼部感染、全身感染、狼疮、关节炎、多发性硬化症、低骨密度、骨质疏松症、骨生成、骨质增生疾病、佩吉特氏骨病、癌症、膀胱癌、脑癌、乳腺癌、结肠癌、直肠癌、子宫内膜癌、肾癌、肾细胞癌、肾盂癌、白血病、肺癌、黑素瘤、非霍奇金氏淋巴瘤、胰腺癌、前列腺癌、卵巢癌、纤维肉瘤、急性成淋巴细胞白血病(ALL)、急性骨髓性白血病(AML)、慢性淋巴细胞白血病(CLL)、慢性骨髓性白血病(CML)、多发性骨髓瘤、真性红细胞增多症、原发性血小板增多症、原发性或特发性骨髓纤维化、原发性或特发性脊髓硬化症、髓样来源的肿瘤、表达TREM2的肿瘤、甲状腺癌、感染、CNS疱疹、寄生虫感染、锥虫感染、Cruzi感染、铜绿假单胞菌感染、杜氏利什曼原虫感染、B族链球菌感染、空肠弯曲杆菌感染、脑膜炎奈瑟氏球菌感染、I型HIV、以及流感嗜血杆菌,其包括向有需要的个体施用治疗有效量的不抑制TREM2与一种或多种TREM2配体之间的相互作用和/或增强至少一种TREM2配体的一种或多种活性的药剂。本公开的其他方面涉及一种不抑制TREM2与一种或多种TREM2配体之间的相互作用和/或增强至少一种TREM2配体的一种或多种活性的药剂,其用于预防、降低风险、或治疗选自以下的疾病、病症、或损伤:痴呆、额颞叶痴呆、阿尔茨海默氏病、血管性痴呆、混合型痴呆、克-雅二氏病、正常压力脑积水、肌萎缩性侧索硬化症、亨廷顿氏病、tau蛋白病、Nasu-Hakola病、中风、急性创伤、慢性创伤、认知缺陷、记忆力丧失、狼疮、急性和慢性结肠炎、类风湿关节炎、伤口愈合、克罗恩氏病、炎症性肠病、溃疡性结肠炎、肥胖症、疟疾、特发性震颤、中枢神经系统狼疮、贝切特氏病、帕金森氏病、路易体痴呆、多系统萎缩、希一德二氏综合征、进行性核上性麻痹、皮层基底神经节变性、急性播散性脑脊髓炎、肉芽肿病症、结节病、老化疾病、癫痫发作、脊髓损伤、创伤性脑损伤、年龄相关性黄斑变性、青光眼、色素性视网膜炎、视网膜变性、呼吸道感染、败血症、眼部感染、全身感染、狼疮、关节炎、多发性硬化症、低骨密度、骨质疏松症、骨生成、骨质增生疾病、佩吉特氏骨病、癌症、膀胱癌、脑癌、乳腺癌、结肠癌、直肠癌、子宫内膜癌、肾癌、肾细胞癌、肾盂癌、白血病、肺癌、黑素瘤、非霍奇金氏淋巴瘤、胰腺癌、前列腺癌、卵巢癌、纤维肉瘤、急性成淋巴细胞白血病(ALL)、急性骨髓性白血病(AML)、慢性淋巴细胞白血病(CLL)、慢性骨髓性白血病(CML)、多发性骨髓瘤、真性红细胞增多症、原发性血小板增多症、原发性或特发性骨髓纤维化、原发性或特发性脊髓硬化症、髓样来源的肿瘤、表达TREM2的肿瘤、甲状腺癌、感染、CNS疱疹、寄生虫感染、锥虫感染、Cruzi感染、铜绿假单胞菌感染、杜氏利什曼原虫感染、B族链球菌感染、空肠弯曲杆菌感染、脑膜炎奈瑟氏球菌感染、I型HIV、以及流感嗜血杆菌。
[0317] TREM2自身磷酸化
[0318] 在一些实施方案中,本公开的抗TREM2抗体可在结合到在细胞中表达的TREM2蛋白之后诱导TREM2自身磷酸化。
[0319] 在一些实施方案中,本公开的抗TREM2抗体可有益于预防、降低风险、或治疗与降低水平的TREM2磷酸化相关联的病状和/或疾病,所述病状和/或疾病包括痴呆、额颞叶痴呆、阿尔茨海默氏病、血管性痴呆、混合型痴呆、克-雅二氏病、正常压力脑积水、肌萎缩性侧索硬化症、亨廷顿氏病、tau蛋白病、Nasu-Hakola病、中风、急性创伤、慢性创伤、认知缺陷、记忆力丧失、狼疮、急性和慢性结肠炎、类风湿关节炎、伤口愈合、克罗恩氏病、炎症性肠病、溃疡性结肠炎、肥胖症、疟疾、特发性震颤、中枢神经系统狼疮、贝切特氏病、帕金森氏病、路易体痴呆、多系统萎缩、希一德二氏综合征、进行性核上性麻痹、皮层基底神经节变性、急性播散性脑脊髓炎、肉芽肿病症、结节病、老化疾病、癫痫发作、脊髓损伤、创伤性脑损伤、年龄相关性黄斑变性、青光眼、色素性视网膜炎、视网膜变性、呼吸道感染、败血症、眼部感染、全身感染、狼疮、关节炎、多发性硬化症、低骨密度、骨质疏松症、骨生成、骨质增生疾病、佩吉特氏骨病、癌症、膀胱癌、脑癌、乳腺癌、结肠癌、直肠癌、子宫内膜癌、肾癌、肾细胞癌、肾盂癌、白血病、肺癌、黑素瘤、非霍奇金氏淋巴瘤、胰腺癌、前列腺癌、卵巢癌、纤维肉瘤、急性成淋巴细胞白血病(ALL)、急性骨髓性白血病(AML)、慢性淋巴细胞白血病(CLL)、慢性骨髓性白血病(CML)、多发性骨髓瘤、真性红细胞增多症、原发性血小板增多症、原发性或特发性骨髓纤维化、原发性或特发性脊髓硬化症、髓样来源的肿瘤、表达TREM2的肿瘤、甲状腺癌、感染、CNS疱疹、寄生虫感染、锥虫感染、Cruzi感染、铜绿假单胞菌感染、杜氏利什曼原虫感染、B族链球菌感染、空肠弯曲杆菌感染、脑膜炎奈瑟氏球菌感染、I型HIV、以及流感嗜血杆菌,其包括向有需要的个体施用治疗有效量的不抑制TREM2与一种或多种TREM2配体之间的相互作用和/或增强至少一种TREM2配体的一种或多种活性的药剂。本公开的其他方面涉及一种不抑制TREM2与一种或多种TREM2配体之间的相互作用和/或增强至少一种TREM2配体的一种或多种活性的药剂,其用于预防、降低风险、或治疗选自以下的疾病、病症、或损伤:痴呆、额颞叶痴呆、阿尔茨海默氏病、血管性痴呆、混合型痴呆、克-雅二氏病、正常压力脑积水、肌萎缩性侧索硬化症、亨廷顿氏病、tau蛋白病、Nasu-Hakola病、中风、急性创伤、慢性创伤、认知缺陷、记忆力丧失、狼疮、急性和慢性结肠炎、类风湿关节炎、伤口愈合、克罗恩氏病、炎症性肠病、溃疡性结肠炎、肥胖症、疟疾、特发性震颤、中枢神经系统狼疮、贝切特氏病、帕金森氏病、路易体痴呆、多系统萎缩、希一德二氏综合征、进行性核上性麻痹、皮层基底神经节变性、急性播散性脑脊髓炎、肉芽肿病症、结节病、老化疾病、癫痫发作、脊髓损伤、创伤性脑损伤、年龄相关性黄斑变性、青光眼、色素性视网膜炎、视网膜变性、呼吸道感染、败血症、眼部感染、全身感染、狼疮、关节炎、多发性硬化症、低骨密度、骨质疏松症、骨生成、骨质增生疾病、佩吉特氏骨病、癌症、膀胱癌、脑癌、乳腺癌、结肠癌、直肠癌、子宫内膜癌、肾癌、肾细胞癌、肾盂癌、白血病、肺癌、黑素瘤、非霍奇金氏淋巴瘤、胰腺癌、前列腺癌、卵巢癌、纤维肉瘤、急性成淋巴细胞白血病(ALL)、急性骨髓性白血病(AML)、慢性淋巴细胞白血病(CLL)、慢性骨髓性白血病(CML)、多发性骨髓瘤、真性红细胞增多症、原发性血小板增多症、原发性或特发性骨髓纤维化、原发性或特发性脊髓硬化症、髓样来源的肿瘤、表达TREM2的肿瘤、甲状腺癌、感染、CNS疱疹、寄生虫感染、锥虫感染、Cruzi感染、铜绿假单胞菌感染、杜氏利什曼原虫感染、B族链球菌感染、空肠弯曲杆菌感染、脑膜炎奈瑟氏球菌感染、I型HIV、以及流感嗜血杆菌。
[0320] DAP12结合和磷酸化
[0321] 在一些实施方案中,本公开的抗TREM2抗体可诱导TREM2与DAP12的结合。在其他实施方案中,本公开的抗TREM2抗体可在结合到在细胞中表达的TREM2蛋白之后诱导DAP12磷酸化。在其他实施方案中,TREM2介导的DAP12磷酸化由一种或多种SRC家族酪氨酸激酶诱导。Src家族酪氨酸激酶的实例包括但不限于Src、Syk、Yes、Fyn、Fgr、Lck、Hck、Blk、Lyn、以及Frk。
[0322] DAP12可变地称为TYRO蛋白酪氨酸激酶结合蛋白、TYROBP、KARAP、以及PLOSL。DAP12是跨膜信号传导蛋白,它在其细胞质结构域中含有基于免疫受体酪氨酸的活化基序(ITAM)。在某些实施方案中,抗TREM2和/或抗DAP12抗体可诱导DAP12在其ITAM基序中的磷酸化。可使用本领域已知的用于确定蛋白质磷酸化(诸如DAP12磷酸化)的任何方法。
[0323] 在一些实施方案中,DAP12被SRC家族激酶磷酸化,从而引起Syk激酶、ZAP70激酶、或两者募集到DAP12/TREM2复合物并活化。因此,在某些实施方案中,本公开的抗TREM2抗体可将Syk、ZAP70、或两者募集到DAP12/TREM2复合物。不希望受到理论的束缚,据信本公开的抗TREM2抗体可用于预防、降低风险、或治疗与降低水平的DAP12活性、DAP12磷酸化、或Syk、ZAP70、或两者到DAP12/TREM2复合物的募集相关联的病状和/或疾病,所述病状和/或疾病包括痴呆、额颞叶痴呆、阿尔茨海默氏病、血管性痴呆、混合型痴呆、克-雅二氏病、正常压力脑积水、肌萎缩性侧索硬化症、亨廷顿氏病、tau蛋白病、Nasu-Hakola病、中风、急性创伤、慢性创伤、认知缺陷、记忆力丧失、狼疮、急性和慢性结肠炎、类风湿关节炎、伤口愈合、克罗恩氏病、炎症性肠病、溃疡性结肠炎、肥胖症、疟疾、特发性震颤、中枢神经系统狼疮、贝切特氏病、帕金森氏病、路易体痴呆、多系统萎缩、希一德二氏综合征、进行性核上性麻痹、皮层基底神经节变性、急性播散性脑脊髓炎、肉芽肿病症、结节病、老化疾病、癫痫发作、脊髓损伤、创伤性脑损伤、年龄相关性黄斑变性、青光眼、色素性视网膜炎、视网膜变性、呼吸道感染、败血症、眼部感染、全身感染、狼疮、关节炎、多发性硬化症、低骨密度、骨质疏松症、骨生成、骨质增生疾病、佩吉特氏骨病、癌症、膀胱癌、脑癌、乳腺癌、结肠癌、直肠癌、子宫内膜癌、肾癌、肾细胞癌、肾盂癌、白血病、肺癌、黑素瘤、非霍奇金氏淋巴瘤、胰腺癌、前列腺癌、卵巢癌、纤维肉瘤、急性成淋巴细胞白血病(ALL)、急性骨髓性白血病(AML)、慢性淋巴细胞白血病(CLL)、慢性骨髓性白血病(CML)、多发性骨髓瘤、真性红细胞增多症、原发性血小板增多症、原发性或特发性骨髓纤维化、原发性或特发性脊髓硬化症、髓样来源的肿瘤、表达TREM2的肿瘤、甲状腺癌、感染、CNS疱疹、寄生虫感染、锥虫感染、Cruzi感染、铜绿假单胞菌感染、杜氏利什曼原虫感染、B族链球菌感染、空肠弯曲杆菌感染、脑膜炎奈瑟氏球菌感染、I型HIV、以及流感嗜血杆菌,其包括向有需要的个体施用治疗有效量的不抑制TREM2与一种或多种TREM2配体之间的相互作用和/或增强至少一种或多种TREM2配体的一种或多种活性的药剂,本公开的其他方面涉及一种不抑制TREM2与一种或多种TREM2配体之间的相互作用和/或增强一种或多种TREM2配体的一种或多种活性的药剂,其用于预防、降低风险、或治疗选自以下的疾病、病症、或损伤:痴呆、额颞叶痴呆、阿尔茨海默氏病、血管性痴呆、混合型痴呆、克-雅二氏病、正常压力脑积水、肌萎缩性侧索硬化症、亨廷顿氏病、tau蛋白病、Nasu-Hakola病、中风、急性创伤、慢性创伤、认知缺陷、记忆力丧失、狼疮、急性和慢性结肠炎、类风湿关节炎、伤口愈合、克罗恩氏病、炎症性肠病、溃疡性结肠炎、肥胖症、疟疾、特发性震颤、中枢神经系统狼疮、贝切特氏病、帕金森氏病、路易体痴呆、多系统萎缩、希一德二氏综合征、进行性核上性麻痹、皮层基底神经节变性、急性播散性脑脊髓炎、肉芽肿病症、结节病、老化疾病、癫痫发作、脊髓损伤、创伤性脑损伤、年龄相关性黄斑变性、青光眼、色素性视网膜炎、视网膜变性、呼吸道感染、败血症、眼部感染、全身感染、狼疮、关节炎、多发性硬化症、低骨密度、骨质疏松症、骨生成、骨质增生疾病、佩吉特氏骨病、癌症、膀胱癌、脑癌、乳腺癌、结肠癌、直肠癌、子宫内膜癌、肾癌、肾细胞癌、肾盂癌、白血病、肺癌、黑素瘤、非霍奇金氏淋巴瘤、胰腺癌、前列腺癌、卵巢癌、纤维肉瘤、急性成淋巴细胞白血病(ALL)、急性骨髓性白血病(AML)、慢性淋巴细胞白血病(CLL)、慢性骨髓性白血病(CML)、多发性骨髓瘤、真性红细胞增多症、原发性血小板增多症、原发性或特发性骨髓纤维化、原发性或特发性脊髓硬化症、髓样来源的肿瘤、表达TREM2的肿瘤、甲状腺癌、感染、CNS疱疹、寄生虫感染、锥虫感染、Cruzi感染、铜绿假单胞菌感染、杜氏利什曼原虫感染、B族链球菌感染、空肠弯曲杆菌感染、脑膜炎奈瑟氏球菌感染、I型HIV、以及流感嗜血杆菌。
[0324] C-C趋化因子受体7的调控表达
[0325] 在一些实施方案中,本公开的抗TREM2抗体可在结合到在细胞中表达的TREM2蛋白之后调控(例如,增加或降低)C-C趋化因子受体7(CCR7)的表达。调控表达可包括但不限于调控基因表达、调控转录表达、或调控蛋白质表达。可使用本领域已知的用于确定基因、转录物(例如,mRNA)、和/或蛋白质表达的任何方法。例如,可使用Northern印迹分析来确定抗炎介质基因表达水平,可使用RT-PCR来确定抗炎介质转录的水平,并且可使用蛋白质印迹分析来确定抗炎介质蛋白水平。
[0326] C-C趋化因子受体7(CCR7)是G蛋白偶联受体家族的成员。CCR7在各种淋巴样组织中表达并且可使B细胞和T细胞活化。在一些实施方案中,CCR7可调控记忆T细胞向二级淋巴样器官(诸如淋巴结)的迁移。在其他实施方案中,CCR7可刺激树突细胞成熟。CCR7是可结合趋化因子(C-C基序)配体CCL19/ELC和CCL21的受体蛋白。
[0327] 如本文所用,如果CCR7在使用本公开的抗TREM2抗体治疗的受试者的一种或多种细胞中的表达与在未使用抗TREM2抗体治疗的对应受试者的一种或多种细胞中表达的CCR7的表达相比被调控,则CCR7可具有调控的(例如,增加的或降低的)表达。在一些实施方案中,例如与在未使用本公开的抗TREM2抗体治疗的受试者的一种或多种细胞中的CCR7表达相比,所述抗TREM2抗体可使对应受试者的一种或多种细胞中的CCR7表达调控至少10%、至少15%、至少20%、至少25%、至少30%、至少35%、至少40%、至少45%、至少50%、至少55%、至少60%、至少65%,至少70%,至少75%,至少80%、至少85%、至少90%、至少95%、至少100%、至少110%、至少115%、至少120%、至少125%、至少130%、至少135%、至少
140%、至少145%、至少150%、至少160%、至少170%、至少180%、至少190%、或至少
200%。在其他实施方案中,例如与在未使用本公开的抗TREM2抗体治疗的受试者的一种或多种细胞中的CCR7表达相比,所述抗TREM2抗体使对应受试者的一种或多种细胞中的CCR7表达调控至少1.5倍、至少1.6倍、至少1.7倍、至少1.8倍、至少1.9倍、至少2.0倍、至少2.1倍、至少2.15倍、至少2.2倍、至少2.25倍、至少2.3倍、至少2.35倍、至少2.4倍、至少2.45倍、至少2.5倍、至少2.55倍、至少3.0倍、至少3.5倍、至少4.0倍、至少4.5倍、至少5.0倍、至少
5.5倍、至少6.0倍、至少6.5倍、至少7.0倍、至少7.5倍、至少8.0倍、至少8.5倍、至少9.0倍、至少9.5倍、或至少10倍。
[0328] 在一些实施方案中,CCR7的调控表达发生在巨噬细胞、树突细胞、和/或小神经胶质细胞中。CCR7的增加的表达可诱导小神经胶质细胞向表达趋化因子CCL19和CCL21的细胞的趋化性。因此,在某些实施方案中,本公开的抗TREM2抗体可诱导小神经胶质细胞向CCL19和CCL21表达细胞的趋化性。
[0329] 在一些实施方案中,本公开的抗TREM2抗体可用于预防、降低风险、或治疗与异常水平的CCR7相关联的病状和/或疾病,所述病状和/或疾病包括痴呆、额颞叶痴呆、阿尔茨海默氏病、Nasu-Hakola病、帕金森氏病、肌萎缩性侧索硬化症、亨廷顿氏病、以及tau蛋白病。
[0330] 炎症诱导的基因的调控表达
[0331] 在一些实施方案中,本公开的抗TREM2抗体可在结合到在细胞中表达的TREM2蛋白之后调控(例如,增加或降低)其表达在炎症诱导之后增加的一种或多种基因的表达。此类基因的实例包括但不限于Fabp3、Fabp5、和LDR。调控表达可包括但不限于调控基因表达、调控转录表达、或调控蛋白质表达。可使用本领域已知的用于确定基因、转录物(例如,mRNA)、和/或蛋白质表达的任何方法。例如,可使用Northern印迹分析来确定抗炎介质基因表达水平,可使用RT-PCR来确定抗炎介质转录的水平,并且可使用蛋白质印迹分析来确定抗炎介质蛋白水平。
[0332] 如本文所用,如果一种或多种基因(例如,Fabp3、Fabp5、和/或LDR)在使用本公开的抗TREM2抗体治疗的受试者的一种或多种细胞中的表达与在未使用抗TREM2抗体治疗的对应受试者的一种或多种细胞中表达的一种或多种基因的表达相比被调控,则所述一种或多种基因可具有调控的(例如,增加的或降低的)表达。在一些实施方案中,例如与在未使用本公开的抗TREM2抗体治疗的受试者的一种或多种细胞中的基因(例如,Fabp3、Fabp5、和/或LDR)表达相比,所述抗TREM2抗体可使对应受试者的一种或多种细胞中的基因(例如,Fabp3、Fabp5、和/或LDR)表达调控至少10%、至少15%、至少20%、至少25%、至少30%、至少35%、至少40%、至少45%、至少50%、至少55%、至少60%、至少65%,至少70%,至少75%,至少80%、至少85%、至少90%、至少95%、至少100%、至少110%、至少115%、至少
120%、至少125%、至少130%、至少135%、至少140%、至少145%、至少150%、至少160%、至少170%、至少180%、至少190%、或至少200%。在其他实施方案中,例如与在未使用本公开的抗TREM2抗体治疗的受试者的一种或多种细胞中的基因(例如,Fabp3、Fabp5、和/或LDR)表达相比,所述抗TREM2抗体使对应受试者的一种或多种细胞中的基因(例如,Fabp3、Fabp5、和/或LDR)表达调控至少1.5倍、至少1.6倍、至少1.7倍、至少1.8倍、至少1.9倍、至少
2.0倍、至少2.1倍、至少2.15倍、至少2.2倍、至少2.25倍、至少2.3倍、至少2.35倍、至少2.4倍、至少2.45倍、至少2.5倍、至少2.55倍、至少3.0倍、至少3.5倍、至少4.0倍、至少4.5倍、至少5.0倍、至少5.5倍、至少6.0倍、至少6.5倍、至少7.0倍、至少7.5倍、至少8.0倍、至少8.5倍、至少9.0倍、至少9.5倍、或至少10倍。
[0333] 骨髓衍生的树突细胞引发或调控抗原特异性T细胞的功能的能力的增强或正常化[0334] 在一些实施方案中,本公开的抗TREM2抗体可在结合到在细胞中表达的TREM2蛋白之后使骨髓衍生的树突细胞引发或调控抗原特异性T细胞的功能的能力增强和/或正常化,所述抗原特异性T细胞包括CD8+T细胞、CD4+T细胞、和/或调节性T细胞。
[0335] 在一些实施方案中,例如与在未使用本公开的激动剂抗TREM2抗体治疗的受试者中的骨髓衍生的树突细胞引发或调控一种或多种抗原特异性T细胞的功能的能力相比,所述激动剂抗TREM2抗体可使对应受试者中的骨髓衍生的树突细胞引发或调控一种或多种抗原特异性T细胞的功能的能力增强和/或正常化至少10%、至少15%、至少20%、至少25%、至少30%、至少35%、至少40%、至少45%、至少50%、至少55%、至少60%、至少65%,至少70%,至少75%,至少80%、至少85%、至少90%、至少95%、至少100%、至少110%、至少
115%、至少120%、至少125%、至少130%、至少135%、至少140%、至少145%、至少150%、至少160%、至少170%、至少180%、至少190%、或至少200%。在其他实施方案中,例如与在未使用激动剂抗TREM2抗体治疗的受试者中的骨髓衍生的树突细胞引发或调控抗原特异性T细胞的功能的能力相比,激动剂抗TREM2抗体可使对应受试者中的骨髓衍生的树突细胞引发或调控抗原特异性T细胞的功能的能力增强和/或正常化至少1.5倍、至少1.6倍、至少1.7倍、至少1.8倍、至少1.9倍、至少2.0倍、至少2.1倍、至少2.15倍、至少2.2倍、至少2.25倍、至少2.3倍、至少2.35倍、至少2.4倍、至少2.45倍、至少2.5倍、至少2.55倍、至少3.0倍、至少
3.5倍、至少4.0倍、至少4.5倍、至少5.0倍、至少5.5倍、至少6.0倍、至少6.5倍、至少7.0倍、至少7.5倍、至少8.0倍、至少8.5倍、至少9.0倍、至少9.5倍、或至少10倍。
[0336] 在一些实施方案中,本公开的抗TREM2抗体可有益于预防、降低风险、或治疗与骨髓衍生的树突细胞引发或调控抗原特异性T细胞的功能的降低的或下调的能力相关联的病状和/或疾病,所述病状和/或疾病包括痴呆、额颞叶痴呆、阿尔茨海默氏病、血管性痴呆、混合型痴呆、克-雅二氏病、正常压力脑积水、肌萎缩性侧索硬化症、亨廷顿氏病、tau蛋白病、Nasu-Hakola病、中风、急性创伤、慢性创伤、认知缺陷、记忆力丧失、狼疮、急性和慢性结肠炎、类风湿关节炎、伤口愈合、克罗恩氏病、炎症性肠病、溃疡性结肠炎、肥胖症、疟疾、特发性震颤、中枢神经系统狼疮、贝切特氏病、帕金森氏病、路易体痴呆、多系统萎缩、希一德二氏综合征、进行性核上性麻痹、皮层基底神经节变性、急性播散性脑脊髓炎、肉芽肿病症、结节病、老化疾病、癫痫发作、脊髓损伤、创伤性脑损伤、年龄相关性黄斑变性、青光眼、色素性视网膜炎、视网膜变性、呼吸道感染、败血症、眼部感染、全身感染、狼疮、关节炎、多发性硬化症、低骨密度、骨质疏松症、骨生成、骨质增生疾病、佩吉特氏骨病、癌症、膀胱癌、脑癌、乳腺癌、结肠癌、直肠癌、子宫内膜癌、肾癌、肾细胞癌、肾盂癌、白血病、肺癌、黑素瘤、非霍奇金氏淋巴瘤、胰腺癌、前列腺癌、卵巢癌、纤维肉瘤、急性成淋巴细胞白血病(ALL)、急性骨髓性白血病(AML)、慢性淋巴细胞白血病(CLL)、慢性骨髓性白血病(CML)、多发性骨髓瘤、真性红细胞增多症、原发性血小板增多症、原发性或特发性骨髓纤维化、原发性或特发性脊髓硬化症、髓样来源的肿瘤、表达TREM2的肿瘤、甲状腺癌、感染、CNS疱疹、寄生虫感染、锥虫感染、Cruzi感染、铜绿假单胞菌感染、杜氏利什曼原虫感染、B族链球菌感染、空肠弯曲杆菌感染、脑膜炎奈瑟氏球菌感染、I型HIV、以及流感嗜血杆菌,其包括向有需要的个体施用治疗有效量的不抑制TREM2与一种或多种TREM2配体之间的相互作用和/或增强一种或多种TREM2配体的一种或多种活性的药剂。本公开的其他方面涉及一种不抑制TREM2与一种或多种TREM2配体之间的相互作用和/或增强一种或多种TREM2配体的一种或多种活性的药剂,其用于预防、降低风险、或治疗选自以下的疾病、病症、或损伤:痴呆、额颞叶痴呆、阿尔茨海默氏病、血管性痴呆、混合型痴呆、克-雅二氏病、正常压力脑积水、肌萎缩性侧索硬化症、亨廷顿氏病、tau蛋白病、Nasu-Hakola病、中风、急性创伤、慢性创伤、认知缺陷、记忆力丧失、狼疮、急性和慢性结肠炎、类风湿关节炎、伤口愈合、克罗恩氏病、炎症性肠病、溃疡性结肠炎、肥胖症、疟疾、特发性震颤、中枢神经系统狼疮、贝切特氏病、帕金森氏病、路易体痴呆、多系统萎缩、希一德二氏综合征、进行性核上性麻痹、皮层基底神经节变性、急性播散性脑脊髓炎、肉芽肿病症、结节病、老化疾病、癫痫发作、脊髓损伤、创伤性脑损伤、年龄相关性黄斑变性、青光眼、色素性视网膜炎、视网膜变性、呼吸道感染、败血症、眼部感染、全身感染、狼疮、关节炎、多发性硬化症、低骨密度、骨质疏松症、骨生成、骨质增生疾病、佩吉特氏骨病、癌症、膀胱癌、脑癌、乳腺癌、结肠癌、直肠癌、子宫内膜癌、肾癌、肾细胞癌、肾盂癌、白血病、肺癌、黑素瘤、非霍奇金氏淋巴瘤、胰腺癌、前列腺癌、卵巢癌、纤维肉瘤、急性成淋巴细胞白血病(ALL)、急性骨髓性白血病(AML)、慢性淋巴细胞白血病(CLL)、慢性骨髓性白血病(CML)、多发性骨髓瘤、真性红细胞增多症、原发性血小板增多症、原发性或特发性骨髓纤维化、原发性或特发性脊髓硬化症、髓样来源的肿瘤、表达TREM2的肿瘤、甲状腺癌、感染、CNS疱疹、寄生虫感染、锥虫感染、Cruzi感染、铜绿假单胞菌感染、杜氏利什曼原虫感染、B族链球菌感染、空肠弯曲杆菌感染、脑膜炎奈瑟氏球菌感染、I型HIV、以及流感嗜血杆菌。
[0337] 破骨细胞产生
[0338] 在一些实施方案中,本公开的抗TREM2抗体可在结合到在细胞中表达的TREM2蛋白之后诱导破骨细胞产生和/或增加破骨细胞生成的速率。
[0339] 如本文所用,破骨细胞是可通过去除骨组织的矿化基质且破坏有机骨(例如,骨吸收)来去除骨组织的骨细胞类型。破骨细胞可通过单核细胞-巨噬细胞细胞系的细胞融合来形成。在一些实施方案中,破骨细胞可通过抗酒石酸酸性磷酸酶(TRAP)和组织蛋白酶K的高表达来表征。
[0340] 如本文所用,如果在使用本公开的激动剂抗TREM2抗体治疗的受试者中的破骨细胞生成的速率大于未使用激动剂抗TREM2抗体治疗的对应受试者中的破骨细胞生成的速率,则破骨细胞生成的速率可增加。在一些实施方案中,例如与在未使用本公开的激动剂抗TREM2抗体治疗的受试者中的破骨细胞生成的速率相比,所述激动剂抗TREM2抗体可使对应受试者中的破骨细胞生成的速率增加至少10%、至少15%、至少20%、至少25%、至少30%、至少35%、至少40%、至少45%、至少50%、至少55%、至少60%、至少65%,至少70%,至少75%,至少80%、至少85%、至少90%、至少95%、至少100%、至少110%、至少115%、至少
120%、至少125%、至少130%、至少135%、至少140%、至少145%、至少150%、至少160%、至少170%、至少180%、至少190%、或至少200%。在其他实施方案中,例如与在未使用本公开的激动剂抗TREM2抗体治疗的受试者中的破骨细胞生成的速率相比,所述激动剂抗TREM2抗体可使对应受试者中的破骨细胞生成的速率增加至少1.5倍、至少1.6倍、至少1.7倍、至少1.8倍、至少1.9倍、至少2.0倍、至少2.1倍、至少2.15倍、至少2.2倍、至少2.25倍、至少2.3倍、至少2.35倍、至少2.4倍、至少2.45倍、至少2.5倍、至少2.55倍、至少3.0倍、至少3.5倍、至少4.0倍、至少4.5倍、至少5.0倍、至少5.5倍、至少6.0倍、至少6.5倍、至少7.0倍、至少7.5倍、至少8.0倍、至少8.5倍、至少9.0倍、至少9.5倍、或至少10倍。
[0341] 如本文所用,如果在使用本公开的拮抗剂抗TREM2抗体治疗的受试者中的破骨细胞生成的速率小于未使用拮抗剂抗TREM2抗体治疗的对应受试者中的破骨细胞生成的速率,则破骨细胞生成的速率可降低。在一些实施方案中,例如与在未使用本公开的拮抗剂抗TREM2抗体治疗的受试者中的破骨细胞生成的速率相比,所述拮抗剂抗TREM2抗体可使对应受试者中的破骨细胞生成的速率降低至少10%、至少15%、至少20%、至少25%、至少30%、至少35%、至少40%、至少45%、至少50%、至少55%、至少60%、至少65%,至少70%,至少75%,至少80%、至少85%、至少90%、至少95%、至少100%、至少110%、至少115%、至少
120%、至少125%、至少130%、至少135%、至少140%、至少145%、至少150%、至少160%、至少170%、至少180%、至少190%、或至少200%。在其他实施方案中,例如与在未使用本公开的拮抗剂抗TREM2抗体治疗的受试者中的破骨细胞生成的速率相比,所述拮抗剂抗TREM2抗体可使对应受试者中的破骨细胞生成的速率降低至少1.5倍、至少1.6倍、至少1.7倍、至少1.8倍、至少1.9倍、至少2.0倍、至少2.1倍、至少2.15倍、至少2.2倍、至少2.25倍、至少2.3倍、至少2.35倍、至少2.4倍、至少2.45倍、至少2.5倍、至少2.55倍、至少3.0倍、至少3.5倍、至少4.0倍、至少4.5倍、至少5.0倍、至少5.5倍、至少6.0倍、至少6.5倍、至少7.0倍、至少7.5倍、至少8.0倍、至少8.5倍、至少9.0倍、至少9.5倍、或至少10倍。
[0342] 在一些实施方案中,本公开的抗TREM2抗体可有益于预防、降低风险、或治疗与异常骨形成和维持相关联的病状和/或疾病,所述病状和/或疾病包括骨质疏松症(其与骨密度的病理学降低相关联)和骨质增生疾病(其与骨密度的病理学增加相关联)。
[0343] TREM2表达细胞的增殖、存活和功能性
[0344] 在一些实施方案中,本公开的抗TREM2抗体可在结合到在细胞上表达的TREM2蛋白之后增加树突细胞、巨噬细胞、单核细胞、破骨细胞、皮肤朗格汉斯细胞、库普弗细胞、以及小神经胶质细胞(小神经胶质细胞(microglia))的增殖、存活、和/或功能。在一些实施方案中,本公开的抗TREM2抗体不抑制一种或多种先天免疫细胞的生长(例如,增殖和/或存活)。
[0345] 小神经胶质细胞是大脑和脊髓的常驻型巨噬细胞的胶质细胞类型,并且因此充当中枢神经系统(CNS)中的主动免疫防御机制的第一和主要形式。小神经胶质细胞占大脑内总胶质细胞群体的20%。小神经胶质细胞不断清除CNS的斑块、受损神经元和感染物。大脑和脊髓被认为是“免疫特许的”器官,因为它们通过已知为血脑屏障的一系列内皮细胞而与身体其他部分分开,所述血脑屏障防止大部分感染到达脆弱的神经组织。在感染物直接引入到大脑或穿过血脑屏障的情况下,小神经胶质细胞必须快速反应以便在感染物损害敏感的神经组织之前减少炎症并消灭感染物。由于来自身体其他部分的抗体的不可用性(很少有抗体足够小而穿过血脑屏障),小神经胶质细胞必须能够识别异物、将其吞并并且充当活化T细胞的抗原呈递细胞。因为此过程必须快速进行以防止潜在致命的损害,所以小神经胶质细胞对于CNS中的甚至较小的病理学变化也是极其敏感的。它们部分地由于具有对细胞外的甚至较小的变化进行响应的独特的钾通道来实现此敏感性。
[0346] 如本文所用,本公开的巨噬细胞包括但不限于M1巨噬细胞、活化的M1巨噬细胞、和M2巨噬细胞。如本文所用,本公开的小神经胶质细胞包括但不限于M1小神经胶质细胞、活化的M1小神经胶质细胞、和M2小神经胶质细胞。在一些实施方案中,本公开的抗TREM2抗体可有益于降低风险、或治疗与免疫细胞的降低的增殖或存活相关联的病状和/或疾病,所述病状和/或疾病包括痴呆、额颞叶痴呆、阿尔茨海默氏病、血管性痴呆、混合型痴呆、克-雅二氏病、正常压力脑积水、肌萎缩性侧索硬化症、亨廷顿氏病、tau蛋白病、Nasu-Hakola病、中风、急性创伤、慢性创伤、认知缺陷、记忆力丧失、狼疮、急性和慢性结肠炎、类风湿关节炎、伤口愈合、克罗恩氏病、炎症性肠病、溃疡性结肠炎、肥胖症、疟疾、特发性震颤、中枢神经系统狼疮、贝切特氏病、帕金森氏病、路易体痴呆、多系统萎缩、希一德二氏综合征、进行性核上性麻痹、皮层基底神经节变性、急性播散性脑脊髓炎、肉芽肿病症、结节病、老化疾病、癫痫发作、脊髓损伤、创伤性脑损伤、年龄相关性黄斑变性、青光眼、色素性视网膜炎、视网膜变性、呼吸道感染、败血症、眼部感染、全身感染、狼疮、关节炎、多发性硬化症、低骨密度、骨质疏松症、骨生成、骨质增生疾病、佩吉特氏骨病、癌症、膀胱癌、脑癌、乳腺癌、结肠癌、直肠癌、子宫内膜癌、肾癌、肾细胞癌、肾盂癌、白血病、肺癌、黑素瘤、非霍奇金氏淋巴瘤、胰腺癌、前列腺癌、卵巢癌、纤维肉瘤、急性成淋巴细胞白血病(ALL)、急性骨髓性白血病(AML)、慢性淋巴细胞白血病(CLL)、慢性骨髓性白血病(CML)、多发性骨髓瘤、真性红细胞增多症、原发性血小板增多症、原发性或特发性骨髓纤维化、原发性或特发性脊髓硬化症、髓样来源的肿瘤、表达TREM2的肿瘤、甲状腺癌、感染、CNS疱疹、寄生虫感染、锥虫感染、Cruzi感染、铜绿假单胞菌感染、杜氏利什曼原虫感染、B族链球菌感染、空肠弯曲杆菌感染、脑膜炎奈瑟氏球菌感染、I型HIV、以及流感嗜血杆菌,其包括向有需要的个体施用治疗有效量的不抑制TREM2与一种或多种TREM2配体之间的相互作用和/或增强一种或多种TREM2配体的一种或多种活性的药剂。本公开的其他方面涉及一种不抑制TREM2与一种或多种TREM2配体之间的相互作用和/或增强一种或多种TREM2配体的一种或多种活性的药剂,其用于预防、降低风险、或治疗选自以下的疾病、病症、或损伤:痴呆、额颞叶痴呆、阿尔茨海默氏病、血管性痴呆、混合型痴呆、克-雅二氏病、正常压力脑积水、肌萎缩性侧索硬化症、亨廷顿氏病、tau蛋白病、Nasu-Hakola病、中风、急性创伤、慢性创伤、认知缺陷、记忆力丧失、狼疮、急性和慢性结肠炎、类风湿关节炎、伤口愈合、克罗恩氏病、炎症性肠病、溃疡性结肠炎、肥胖症、疟疾、特发性震颤、中枢神经系统狼疮、贝切特氏病、帕金森氏病、路易体痴呆、多系统萎缩、希一德二氏综合征、进行性核上性麻痹、皮层基底神经节变性、急性播散性脑脊髓炎、肉芽肿病症、结节病、老化疾病、癫痫发作、脊髓损伤、创伤性脑损伤、年龄相关性黄斑变性、青光眼、色素性视网膜炎、视网膜变性、呼吸道感染、败血症、眼部感染、全身感染、狼疮、关节炎、多发性硬化症、低骨密度、骨质疏松症、骨生成、骨质增生疾病、佩吉特氏骨病、癌症、膀胱癌、脑癌、乳腺癌、结肠癌、直肠癌、子宫内膜癌、肾癌、肾细胞癌、肾盂癌、白血病、肺癌、黑素瘤、非霍奇金氏淋巴瘤、胰腺癌、前列腺癌、卵巢癌、纤维肉瘤、急性成淋巴细胞白血病(ALL)、急性骨髓性白血病(AML)、慢性淋巴细胞白血病(CLL)、慢性骨髓性白血病(CML)、多发性骨髓瘤、真性红细胞增多症、原发性血小板增多症、原发性或特发性骨髓纤维化、原发性或特发性脊髓硬化症、髓样来源的肿瘤、表达TREM2的肿瘤、甲状腺癌、感染、CNS疱疹、寄生虫感染、锥虫感染、Cruzi感染、铜绿假单胞菌感染、杜氏利什曼原虫感染、B族链球菌感染、空肠弯曲杆菌感染、脑膜炎奈瑟氏球菌感染、I型HIV、以及流感嗜血杆菌。
[0347] 在一些实施方案中,本公开的抗TREM2抗体可增加树突细胞、单核细胞、和/或巨噬细胞上的CD83和/或CD86的表达。
[0348] 如本文所用,如果在使用本公开的抗TREM2抗体治疗的受试者中的树突细胞、巨噬细胞、单核细胞、破骨细胞、皮肤朗格汉斯细胞、库普弗细胞、和/或小神经胶质细胞的增殖速率、存活、和/或功能大于在未使用抗TREM2抗体治疗的对应受试者中的树突细胞、巨噬细胞、单核细胞、破骨细胞、皮肤朗格汉斯细胞、库普弗细胞、和/或小神经胶质细胞的增殖速率、存活、和/或功能,则巨噬细胞、树突细胞、单核细胞、和/或小神经胶质细胞的增殖速率、存活、和/或功能可包括增加的表达。在一些实施方案中,例如与在未使用本公开的抗TREM2抗体治疗的受试者中的树突细胞、巨噬细胞、单核细胞、破骨细胞、皮肤朗格汉斯细胞、库普弗细胞、和/或小神经胶质细胞的增殖速率、存活、和/或功能相比,所述抗TREM2抗体可使对应受试者中的树突细胞、巨噬细胞、单核细胞、破骨细胞、皮肤朗格汉斯细胞、库普弗细胞、和/或小神经胶质细胞的增殖速率、存活、和/或功能增加至少10%、至少15%、至少20%、至少25%、至少30%、至少35%、至少40%、至少45%、至少50%、至少55%、至少60%、至少65%,至少70%,至少75%,至少80%、至少85%、至少90%、至少95%、至少100%、至少
110%、至少115%、至少120%、至少125%、至少130%、至少135%、至少140%、至少145%、至少150%、至少160%、至少170%、至少180%、至少190%、或至少200%。在其他实施方案中,例如与在未使用本公开的抗TREM2抗体治疗的受试者中的树突细胞、巨噬细胞、单核细胞、破骨细胞、皮肤朗格汉斯细胞、库普弗细胞、和/或小神经胶质细胞的增殖速率、存活和/或功能相比,所述抗TREM2抗体可使对应受试者中的树突细胞、巨噬细胞、单核细胞、破骨细胞、皮肤朗格汉斯细胞、库普弗细胞、和/或小神经胶质细胞的增殖速率、存活、和/或功能增加至少1.5倍、至少1.6倍、至少1.7倍、至少1.8倍、至少1.9倍、至少2.0倍、至少2.1倍、至少
2.15倍、至少2.2倍、至少2.25倍、至少2.3倍、至少2.35倍、至少2.4倍、至少2.45倍、至少2.5倍、至少2.55倍、至少3.0倍、至少3.5倍、至少4.0倍、至少4.5倍、至少5.0倍、至少5.5倍、至少6.0倍、至少6.5倍、至少7.0倍、至少7.5倍、至少8.0倍、至少8.5倍、至少9.0倍、至少9.5倍、或至少10倍。
[0349] 在一些实施方案中,本公开的抗TREM2抗体可有益于预防、降低风险、或治疗与树突细胞、巨噬细胞、单核细胞、破骨细胞、皮肤朗格汉斯细胞、库普弗细胞、和/或小神经胶质细胞的功能的减少相关联的病状和/或疾病,所述病状和/或疾病包括痴呆、额颞叶痴呆、阿尔茨海默氏病、血管性痴呆、混合型痴呆、克-雅二氏病、正常压力脑积水、肌萎缩性侧索硬化症、亨廷顿氏病、tau蛋白病、Nasu-Hakola病、中风、急性创伤、慢性创伤、认知缺陷、记忆力丧失、狼疮、急性和慢性结肠炎、类风湿关节炎、伤口愈合、克罗恩氏病、炎症性肠病、溃疡性结肠炎、肥胖症、疟疾、特发性震颤、中枢神经系统狼疮、贝切特氏病、帕金森氏病、路易体痴呆、多系统萎缩、希一德二氏综合征、进行性核上性麻痹、皮层基底神经节变性、急性播散性脑脊髓炎、肉芽肿病症、结节病、老化疾病、癫痫发作、脊髓损伤、创伤性脑损伤、年龄相关性黄斑变性、青光眼、色素性视网膜炎、视网膜变性、呼吸道感染、败血症、眼部感染、全身感染、狼疮、关节炎、多发性硬化症、低骨密度、骨质疏松症、骨生成、骨质增生疾病、佩吉特氏骨病、癌症、膀胱癌、脑癌、乳腺癌、结肠癌、直肠癌、子宫内膜癌、肾癌、肾细胞癌、肾盂癌、白血病、肺癌、黑素瘤、非霍奇金氏淋巴瘤、胰腺癌、前列腺癌、卵巢癌、纤维肉瘤、急性成淋巴细胞白血病(ALL)、急性骨髓性白血病(AML)、慢性淋巴细胞白血病(CLL)、慢性骨髓性白血病(CML)、多发性骨髓瘤、真性红细胞增多症、原发性血小板增多症、原发性或特发性骨髓纤维化、原发性或特发性脊髓硬化症、髓样来源的肿瘤、表达TREM2的肿瘤、甲状腺癌、感染、CNS疱疹、寄生虫感染、锥虫感染、Cruzi感染、铜绿假单胞菌感染、杜氏利什曼原虫感染、B族链球菌感染、空肠弯曲杆菌感染、脑膜炎奈瑟氏球菌感染、I型HIV、以及流感嗜血杆菌,其包括向有需要的个体施用治疗有效量的不抑制TREM2与一种或多种TREM2配体之间的相互作用和/或增强至少一种TREM2配体的一种或多种活性的药剂。本公开的其他方面涉及一种不抑制TREM2与一种或多种TREM2配体之间的相互作用和/或增强至少一种TREM2配体的一种或多种活性的药剂,其用于预防、降低风险、或治疗选自以下的疾病、病症、或损伤:痴呆、额颞叶痴呆、阿尔茨海默氏病、血管性痴呆、混合型痴呆、克-雅二氏病、正常压力脑积水、肌萎缩性侧索硬化症、亨廷顿氏病、tau蛋白病、Nasu-Hakola病、中风、急性创伤、慢性创伤、认知缺陷、记忆力丧失、狼疮、急性和慢性结肠炎、类风湿关节炎、伤口愈合、克罗恩氏病、炎症性肠病、溃疡性结肠炎、肥胖症、疟疾、特发性震颤、中枢神经系统狼疮、贝切特氏病、帕金森氏病、路易体痴呆、多系统萎缩、希一德二氏综合征、进行性核上性麻痹、皮层基底神经节变性、急性播散性脑脊髓炎、肉芽肿病症、结节病、老化疾病、癫痫发作、脊髓损伤、创伤性脑损伤、年龄相关性黄斑变性、青光眼、色素性视网膜炎、视网膜变性、呼吸道感染、败血症、眼部感染、全身感染、狼疮、关节炎、多发性硬化症、低骨密度、骨质疏松症、骨生成、骨质增生疾病、佩吉特氏骨病、癌症、膀胱癌、脑癌、乳腺癌、结肠癌、直肠癌、子宫内膜癌、肾癌、肾细胞癌、肾盂癌、白血病、肺癌、黑素瘤、非霍奇金氏淋巴瘤、胰腺癌、前列腺癌、卵巢癌、纤维肉瘤、急性成淋巴细胞白血病(ALL)、急性骨髓性白血病(AML)、慢性淋巴细胞白血病(CLL)、慢性骨髓性白血病(CML)、多发性骨髓瘤、真性红细胞增多症、原发性血小板增多症、原发性或特发性骨髓纤维化、原发性或特发性脊髓硬化症、髓样来源的肿瘤、表达TREM2的肿瘤、甲状腺癌、感染、CNS疱疹、寄生虫感染、锥虫感染、Cruzi感染、铜绿假单胞菌感染、杜氏利什曼原虫感染、B族链球菌感染、空肠弯曲杆菌感染、脑膜炎奈瑟氏球菌感染、I型HIV、以及流感嗜血杆菌。
[0350] 清除和吞噬作用
[0351] 在一些实施方案中,本公开的抗TREM2抗体可在结合到在细胞中表达的TREM2蛋白之后诱导对以下中的一种或多种的清除和/或吞噬作用:凋亡神经元、神经系统的神经组织碎片、神经系统的非神经组织碎片、细菌、其他异物、致病性蛋白、致病性肽、致病性核酸、或肿瘤细胞。在某些实施方案中,致病性蛋白包括但不限于淀粉样蛋白β或其片段、Tau、IAPP、α-突触核蛋白、TDP-43、FUS蛋白、朊病毒蛋白、PrPSc、亨廷顿蛋白、降血钙素、超氧化物歧化酶、共济失调蛋白、路易小体、心房利钠因子、胰岛淀粉样蛋白多肽、胰岛素、载脂蛋白AI、血清淀粉样蛋白A、medin、泌乳素、转甲状腺素蛋白、溶菌酶、β2微球蛋白、凝溶胶蛋白、角膜上皮蛋白、抑半胱氨酸蛋白酶蛋白、免疫球蛋白轻链AL、S-IBM蛋白、以及重复序列相关非ATG(RAN)翻译产物,包括由甘氨酸-丙氨酸(GA)、甘氨酸-脯氨酸(GP)、甘氨酸-精氨酸(GR)、脯氨酸-丙氨酸(PA)、或脯氨酸-精氨酸(PR)构成的二肽重复序列(DPR肽)。在某些实施方案中,致病性核酸包括但不限于反义GGCCCC(G2C4)重复序列扩增RNA。
[0352] 在一些实施方案中,本公开的抗TREM2抗体可诱导一种或多种类型的清除,包括但不限于凋亡神经元清除、神经组织碎片清除、非神经组织碎片清除、细菌或其他异物清除、致病性蛋白清除、致病性肽清除、致病性核酸清除、以及肿瘤细胞清除。
[0353] 在一些实施方案中,本公开的抗TREM2抗体可诱导对以下中的一种或多种的吞噬作用:凋亡神经元、神经组织碎片、非神经组织碎片、细菌、其他异物、致病性蛋白、致病性肽、致病性核酸、和/或肿瘤细胞。
[0354] 在一些实施方案中,本公开的抗TREM2抗体可在降低水平的巨噬细胞集落刺激因子(MCSF)的条件下增加由巨噬细胞、树突细胞、单核细胞、和/或小神经胶质细胞进行的吞噬作用。可替代地,在一些实施方案中,本公开的抗TREM2抗体可在正常水平的巨噬细胞集落刺激因子(MCSF)的存在下增加由巨噬细胞、树突细胞、单核细胞、和/或小神经胶质细胞进行的吞噬作用
[0355] 在一些实施方案中,本公开的抗TREM2抗体可有益于预防、降低风险、或治疗与对凋亡神经元、神经系统的神经组织碎片、神经系统的非神经组织碎片、细菌、其他异物、致病性蛋白、致病性肽、致病性核酸、或肿瘤细胞的清除和/或吞噬作用相关联的病状和/或疾病,所述病状和/或疾病包括痴呆、额颞叶痴呆、阿尔茨海默氏病、血管性痴呆、混合型痴呆、克-雅二氏病、正常压力脑积水、肌萎缩性侧索硬化症、亨廷顿氏病、tau蛋白病、Nasu-Hakola病、中风、急性创伤、慢性创伤、认知缺陷、记忆力丧失、狼疮、急性和慢性结肠炎、类风湿关节炎、伤口愈合、克罗恩氏病、炎症性肠病、溃疡性结肠炎、肥胖症、疟疾、特发性震颤、中枢神经系统狼疮、贝切特氏病、帕金森氏病、路易体痴呆、多系统萎缩、希一德二氏综合征、进行性核上性麻痹、皮层基底神经节变性、急性播散性脑脊髓炎、肉芽肿病症、结节病、老化疾病、癫痫发作、脊髓损伤、创伤性脑损伤、年龄相关性黄斑变性、青光眼、色素性视网膜炎、视网膜变性、呼吸道感染、败血症、眼部感染、全身感染、狼疮、关节炎、多发性硬化症、低骨密度、骨质疏松症、骨生成、骨质增生疾病、佩吉特氏骨病、癌症、膀胱癌、脑癌、乳腺癌、结肠癌、直肠癌、子宫内膜癌、肾癌、肾细胞癌、肾盂癌、白血病、肺癌、黑素瘤、非霍奇金氏淋巴瘤、胰腺癌、前列腺癌、卵巢癌、纤维肉瘤、急性成淋巴细胞白血病(ALL)、急性骨髓性白血病(AML)、慢性淋巴细胞白血病(CLL)、慢性骨髓性白血病(CML)、多发性骨髓瘤、真性红细胞增多症、原发性血小板增多症、原发性或特发性骨髓纤维化、原发性或特发性脊髓硬化症、髓样来源的肿瘤、表达TREM2的肿瘤、甲状腺癌、感染、CNS疱疹、寄生虫感染、锥虫感染、Cruzi感染、铜绿假单胞菌感染、杜氏利什曼原虫感染、B族链球菌感染、空肠弯曲杆菌感染、脑膜炎奈瑟氏球菌感染、I型HIV、以及流感嗜血杆菌,其包括向有需要的个体施用治疗有效量的不抑制TREM2与一种或多种TREM2配体之间的相互作用和/或增强至少一种TREM2配体的一种或多种活性的药剂。本公开的其他方面涉及一种不抑制TREM2之间的相互作用并且用于预防、降低风险、或治疗选自以下的疾病、病症、或损伤的药剂:痴呆、额颞叶痴呆、阿尔茨海默氏病、血管性痴呆、混合型痴呆、克-雅二氏病、正常压力脑积水、肌萎缩性侧索硬化症、亨廷顿氏病、tau蛋白病、Nasu-Hakola病、中风、急性创伤、慢性创伤、认知缺陷、记忆力丧失、狼疮、急性和慢性结肠炎、类风湿关节炎、伤口愈合、克罗恩氏病、炎症性肠病、溃疡性结肠炎、肥胖症、疟疾、特发性震颤、中枢神经系统狼疮、贝切特氏病、帕金森氏病、路易体痴呆、多系统萎缩、希一德二氏综合征、进行性核上性麻痹、皮层基底神经节变性、急性播散性脑脊髓炎、肉芽肿病症、结节病、老化疾病、癫痫发作、脊髓损伤、创伤性脑损伤、年龄相关性黄斑变性、青光眼、色素性视网膜炎、视网膜变性、呼吸道感染、败血症、眼部感染、全身感染、狼疮、关节炎、多发性硬化症、低骨密度、骨质疏松症、骨生成、骨质增生疾病、佩吉特氏骨病、癌症、膀胱癌、脑癌、乳腺癌、结肠癌、直肠癌、子宫内膜癌、肾癌、肾细胞癌、肾盂癌、白血病、肺癌、黑素瘤、非霍奇金氏淋巴瘤、胰腺癌、前列腺癌、卵巢癌、纤维肉瘤、急性成淋巴细胞白血病(ALL)、急性骨髓性白血病(AML)、慢性淋巴细胞白血病(CLL)、慢性骨髓性白血病(CML)、多发性骨髓瘤、真性红细胞增多症、原发性血小板增多症、原发性或特发性骨髓纤维化、原发性或特发性脊髓硬化症、髓样来源的肿瘤、表达TREM2的肿瘤、甲状腺癌、感染、CNS疱疹、寄生虫感染、锥虫感染、Cruzi感染、铜绿假单胞菌感染、杜氏利什曼原虫感染、B族链球菌感染、空肠弯曲杆菌感染、脑膜炎奈瑟氏球菌感染、I型HIV、以及流感嗜血杆菌。
[0356] TREM2依赖性基因表达
[0357] 在一些实施方案中,本公开的激动剂抗TREM2抗体可增加TREM2依赖性基因(诸如转录因子的活化T细胞的核因子(NFAT)家族的一种或多种转录因子)的活性和/或表达。可替代地,本公开的拮抗性抗TREM2抗体可抑制TREM2依赖性基因(诸如转录因子的NFAT家族的一种或多种转录因子)的活性和/或表达。
[0358] 在一些实施方案中,本公开的抗TREM2抗体可有益于预防、降低风险、或治疗与降低水平的TREM2依赖性基因相关联的病状和/或疾病,所述病状和/或疾病包括痴呆、额颞叶痴呆、阿尔茨海默氏病、血管性痴呆、混合型痴呆、克-雅二氏病、正常压力脑积水、肌萎缩性侧索硬化症、亨廷顿氏病、tau蛋白病、Nasu-Hakola病、中风、急性创伤、慢性创伤、认知缺陷、记忆力丧失、狼疮、急性和慢性结肠炎、类风湿关节炎、伤口愈合、克罗恩氏病、炎症性肠病、溃疡性结肠炎、肥胖症、疟疾、特发性震颤、中枢神经系统狼疮、贝切特氏病、帕金森氏病、路易体痴呆、多系统萎缩、希一德二氏综合征、进行性核上性麻痹、皮层基底神经节变性、急性播散性脑脊髓炎、肉芽肿病症、结节病、老化疾病、癫痫发作、脊髓损伤、创伤性脑损伤、年龄相关性黄斑变性、青光眼、色素性视网膜炎、视网膜变性、呼吸道感染、败血症、眼部感染、全身感染、狼疮、关节炎、多发性硬化症、低骨密度、骨质疏松症、骨生成、骨质增生疾病、佩吉特氏骨病、癌症、膀胱癌、脑癌、乳腺癌、结肠癌、直肠癌、子宫内膜癌、肾癌、肾细胞癌、肾盂癌、白血病、肺癌、黑素瘤、非霍奇金氏淋巴瘤、胰腺癌、前列腺癌、卵巢癌、纤维肉瘤、急性成淋巴细胞白血病(ALL)、急性骨髓性白血病(AML)、慢性淋巴细胞白血病(CLL)、慢性骨髓性白血病(CML)、多发性骨髓瘤、真性红细胞增多症、原发性血小板增多症、原发性或特发性骨髓纤维化、原发性或特发性脊髓硬化症、髓样来源的肿瘤、表达TREM2的肿瘤、甲状腺癌、感染、CNS疱疹、寄生虫感染、锥虫感染、Cruzi感染、铜绿假单胞菌感染、杜氏利什曼原虫感染、B族链球菌感染、空肠弯曲杆菌感染、脑膜炎奈瑟氏球菌感染、I型HIV、以及流感嗜血杆菌,其包括向有需要的个体施用治疗有效量的不抑制TREM2与一种或多种TREM2配体之间的相互作用和/或增强至少一种TREM2配体的一种或多种活性的药剂。本公开的其他方面涉及一种不抑制TREM2与一种或多种CD33配体之间的相互作用的药剂,其用于预防、降低风险、或治疗选自以下的疾病、病症、或损伤:痴呆、额颞叶痴呆、阿尔茨海默氏病、血管性痴呆、混合型痴呆、克-雅二氏病、正常压力脑积水、肌萎缩性侧索硬化症、亨廷顿氏病、tau蛋白病、Nasu-Hakola病、中风、急性创伤、慢性创伤、认知缺陷、记忆力丧失、狼疮、急性和慢性结肠炎、类风湿关节炎、伤口愈合、克罗恩氏病、炎症性肠病、溃疡性结肠炎、肥胖症、疟疾、特发性震颤、中枢神经系统狼疮、贝切特氏病、帕金森氏病、路易体痴呆、多系统萎缩、希一德二氏综合征、进行性核上性麻痹、皮层基底神经节变性、急性播散性脑脊髓炎、肉芽肿病症、结节病、老化疾病、癫痫发作、脊髓损伤、创伤性脑损伤、年龄相关性黄斑变性、青光眼、色素性视网膜炎、视网膜变性、呼吸道感染、败血症、眼部感染、全身感染、狼疮、关节炎、多发性硬化症、低骨密度、骨质疏松症、骨生成、骨质增生疾病、佩吉特氏骨病、癌症、膀胱癌、脑癌、乳腺癌、结肠癌、直肠癌、子宫内膜癌、肾癌、肾细胞癌、肾盂癌、白血病、肺癌、黑素瘤、非霍奇金氏淋巴瘤、胰腺癌、前列腺癌、卵巢癌、纤维肉瘤、急性成淋巴细胞白血病(ALL)、急性骨髓性白血病(AML)、慢性淋巴细胞白血病(CLL)、慢性骨髓性白血病(CML)、多发性骨髓瘤、真性红细胞增多症、原发性血小板增多症、原发性或特发性骨髓纤维化、原发性或特发性脊髓硬化症、髓样来源的肿瘤、表达TREM2的肿瘤、甲状腺癌、感染、CNS疱疹、寄生虫感染、锥虫感染、Cruzi感染、铜绿假单胞菌感染、杜氏利什曼原虫感染、B族链球菌感染、空肠弯曲杆菌感染、脑膜炎奈瑟氏球菌感染、I型HIV、以及流感嗜血杆菌。
[0359] 抗体制剂
[0360] 本公开的抗TREM2抗体可涵盖多克隆抗体、单克隆抗体、人源化和嵌合抗体、人抗体、抗体片段(例如,Fab、Fab’-SH、Fv、scFv、以及F(ab’)2)、双特异性和多特异性抗体、多价抗体、文库衍生抗体、具有修改的效应功能的抗体、包含抗体部分的融合蛋白、以及包含抗原识别位点(诸如具有本公开的TREM2蛋白的氨基酸残基的表位)的任何其他修饰构型的免疫球蛋白分子,包括抗体的糖基化变体、抗体的氨基酸序列变体、以及共价修饰的抗体。所述抗TREM2抗体可以是人、鼠、大鼠、或具有任何其他来源(包括嵌合或人源化抗体)。
[0361] (1)多克隆抗体
[0362] 多克隆抗体,如抗TREM2多克隆抗体,一般是在动物体内通过多次皮下(sc)或腹膜内(ip)注射相关抗原和佐剂而产生。使用双官能试剂或衍生化试剂,例如顺丁烯二酰亚氨基苯甲酰基磺基琥珀酰亚胺酯(通过半胱氨酸残基偶联)、N-羟基琥珀酰亚胺(通过赖氨酸残基偶联)、戊二醛、琥珀酸酐、SOCl2或R1N=C=NR(其中R和R1独立地是低级烷基)将相关抗原(例如本公开的纯化或重组的TREM2蛋白)与有待免疫的物种中的免疫原性蛋白质(例如匙孔血蓝蛋白(KLH)、血清白蛋白、牛甲状腺球蛋白或大豆胰蛋白酶抑制剂)偶联可为有用的。可以使用的佐剂的实例包括弗氏完全佐剂(Freund’s complete adjuvant)及MPL-TDM佐剂(单磷酰脂A、合成海藻糖棒杆菌分支菌酸二酯)。免疫方案可以由本领域技术人员选择,无需过多实验。
[0363] 通过将例如100μg(对于兔)或5μg(对于小鼠)所希望的抗原、免疫原性偶联物或衍生物与3体积弗氏完全佐剂组合并在多个部位皮内注射该溶液,来针对该蛋白质或偶联物对动物进行免疫。一个月后,用初始量的1/5至1/10的含肽或偶联物的弗氏完全佐剂,通过在多个部位皮下注射对动物加强免疫。七至十四天后,对动物抽血并测定血清中的抗体效价。对动物进行加强免疫,直到效价处于稳定水平。偶联物还可以在重组细胞培养物中制备成蛋白质融合物形式。另外,聚集剂,如明矾,也适合增强免疫反应。
[0364] (2)单克隆抗体
[0365] 单克隆抗体,如抗TREM2单克隆抗体,是从基本上均质的抗体群获得,即,构成该群体的单独抗体除可能微量存在的天然存在的突变和/或翻译后修饰(例如异构化、酰胺化)外是相同的。因此,修饰语“单克隆”指示抗体不是分散抗体的混合物的性质。
[0366] 举例来说,可以使用最先由 等人,Nature,256:495(1975)描述的杂交瘤方法,或者可以通过重组DNA方法(美国专利号4,816,567)制备抗TREM2单克隆抗体。
[0367] 在杂交瘤方法中,如上文所描述,对小鼠或其它适合宿主动物(如仓鼠)进行免疫以诱发产生或能够产生特异性结合到用于免疫的蛋白质(例如本公开的纯化或重组的TREM2蛋白)的抗体的淋巴细胞。或者,可以在体外免疫淋巴细胞。接着,使用适合的融合剂,如聚乙二醇,使淋巴细胞与骨髓瘤细胞融合,以形成杂交瘤细胞(Goding,Monoclonal Antibodies:Principles and Practice,第59-103页(Academic Press,1986))。
[0368] 免疫剂将典型地包括抗原蛋白(例如本公开的纯化或重组的TREM2蛋白)或其融合变体。一般说来,如果需要人来源的细胞,则使用外周血淋巴细胞(“PBL”),而如果需要非人哺乳动物来源,则使用脾或淋巴结细胞。接着,使用适合融合剂,如聚乙二醇,使淋巴细胞与永生化细胞系融合,以形成杂交瘤细胞。Goding,Monoclonal Antibodies:Principles and Practice,Academic Press(1986),第59-103页。
[0369] 永生化细胞系通常是经过转化的哺乳动物细胞,特别是啮齿动物、牛或人来源的骨髓瘤细胞。通常采用大鼠或小鼠骨髓瘤细胞系。将由此制备的杂交瘤细胞接种于适合培养基中并使其生长,该培养基优选含有抑制未融合的亲本骨髓瘤细胞生长或存活的一种或多种物质。举例来说,如果亲本骨髓瘤细胞缺乏酶次黄嘌呤鸟嘌呤磷酸核糖转移酶(HGPRT或HPRT),则杂交瘤培养基典型地将包括次黄嘌呤、氨基蝶呤及胸苷(HAT培养基),这些是防止HGPRT缺陷型细胞生长的物质。
[0370] 优选的永生化骨髓瘤细胞是有效融合,支持所选抗体产生细胞稳定高水平产生抗体并且对如HAT培养基等培养基敏感的那些细胞。其中,优选鼠骨髓瘤细胞系,如来源于MOPC-21和MPC-11小鼠肿瘤(获自Salk Institute Cell Distribution Center,San Diego,California USA)的那些,以及SP-2细胞及其衍生物(例如X63-Ag8-653)(获自
American Type Culture Collection,Manassas,Virginia USA)。也已经描述用于产生人单克隆抗体的人骨髓瘤和小鼠-人杂合骨髓瘤细胞系(Kozbor,J.Immunol.,133:3001
(1984);Brodeur等人,Monoclonal Antibody  Production Techniques and 
Applications,第51-63页(Marcel Dekker,Inc.,New York,1987))。
[0371] 测定正在生长杂交瘤细胞的培养基中针对抗原(例如本公开的TREM2蛋白)的单克隆抗体的产生情况。优选地,通过免疫沉淀法或通过体外结合测定,如放射免疫测定(RIA)或酶联免疫吸附测定(ELISA)测定由杂交瘤细胞产生的单克隆抗体的结合特异性。
[0372] 可以测定培养杂交瘤细胞的培养基中针对所希望的抗原(例如本公开的TREM2蛋白)的单克隆抗体的存在。优选地,可以通过免疫沉淀法或通过体外结合测定,如放射免疫测定(RIA)或酶联测定(ELISA)测定单克隆抗体的结合亲和力和特异性。这些技术和测定是本领域中已知的。举例来说,可以通过Munson等人,Anal.Biochem.,107:220(1980)的Scatchard分析测定结合亲和力。
[0373] 在鉴定出产生具有所希望的特异性、亲和力和/或活性的抗体的杂交瘤细胞之后,可以通过限制性稀释程序亚克隆这些克隆并通过标准方法使其生长(Goding,见上文)。适合此目的的培养基包括例如D-MEM或RPMI-1640培养基。此外,可以在哺乳动物中在体内以肿瘤形式使杂交瘤细胞生长。
[0374] 由亚克隆分泌的单克隆抗体宜通过常规免疫球蛋白纯化程序,如蛋白质A-琼脂糖色谱法、羟磷灰石色谱法、凝胶电泳透析、亲和色谱法及以上描述的其它方法从培养基、腹水或血清分离。
[0375] 还可以通过重组DNA方法,如美国专利号4,816,567公开并且如上所描述的那些方法制备抗TREM2单克隆抗体。编码这些单克隆抗体的DNA易于使用常规程序(例如,通过使用特异性结合到编码鼠抗体重链和轻链的基因的寡聚核苷酸探针)分离并测序。杂交瘤细胞用作此类DNA的优选来源。分离后,就可以将DNA置于表达载体中,接着将这些表达载体转染至不会另外产生免疫球蛋白的宿主细胞,如大肠杆菌细胞、猿COS细胞、中国仓鼠卵巢(CHO)细胞或骨髓瘤细胞中,以便在此类重组宿主细胞中合成单克隆抗体。有关在细菌中重组表达编码抗体的DNA的评述文章包括Skerra等人,Curr.Opin.Immunol.,5:256-262(1993)及Plückthun,Immunol.Rev.130:151-188(1992)。
[0376] 在某些实施方案中,可以从使用McCafferty等人,Nature,348:552-554(1990)中所描述的技术产生的抗体噬菌体文库中分离抗TREM2单克隆抗体。Clackson等人,Nature,352:624-628(1991)及Marks等人,J.Mol.Biol.,222:581-597(1991)描述了分别从噬菌体文库分离鼠和人抗体。后续公布描述了通过链改组(Marks等人,Bio/Technology,10:779-
783(1992)),以及作为构建极大噬菌体文库的策略的组合感染和体内重组(Waterhouse等人,Nucl.Acids Res.,21:2265-2266(1993))来产生高亲和力(纳摩尔浓度(“nM”)范围)人抗体。因此,这些技术可用作传统单克隆抗体杂交瘤技术的替代方案,用于分离具有希望的特异性的单克隆抗体(例如,结合本公开的TREM2蛋白的那些抗体)。
[0377] 还可以例如通过用人重链和轻链恒定结构域的编码序列取代同源鼠序列(美国专利号4,816,567;Morrison等人,Proc.Natl Acad.Sci.USA,81:6851(1984)),或通过将非免疫球蛋白多肽的编码序列的全部或一部分与免疫球蛋白编码序列共价接合来修饰编码抗体或其片段的DNA。典型地,用此类非免疫球蛋白多肽取代抗体的恒定结构域,或者用其取代抗体的一个抗原组合位点的可变结构域,以产生一个抗原组合位点对抗原具有特异性并且另一个抗原组合位点对不同抗原具有特异性的嵌合二价抗体。
[0378] 本文所描述的单克隆抗体(例如,本公开的抗TREM2抗体或其片段)可以是单价的,其制备方法是本领域众所周知的。举例来说,一种方法涉及重组表达免疫球蛋白轻链和修饰的重链。该重链一般在Fc区中任一点处截短以防止重链交联。或者,相关半胱氨酸残基可以用另一氨基酸残基取代或缺失,以防止交联。体外方法也适于制备单价抗体。可以使用本领域中已知的常规技术消化抗体以产生其片段,特别是Fab片段。
[0379] 还可以在体外,使用合成蛋白质化学中的已知方法,包括涉及交联剂的方法制备嵌合或杂合抗TREM2抗体。举例来说,可以使用二硫化物交换反应或通过形成硫醚键来构造免疫毒素。适合此目的的试剂的实例包括亚氨基硫醇酯和4-巯基丁酰亚氨酸甲酯。
[0380] (3)人源化抗体
[0381] 本公开的抗TREM2抗体或其抗体片段可以另外包括人源化或人抗体。非人(例如鼠)抗体的人源化形式是含有嵌合免疫球蛋白、免疫球蛋白链或其来源于非人免疫球蛋白的最小序列的片段(如Fab、Fab’-SH、Fv、scFv、F(ab’)2,或抗体的其它抗原结合子序列)。人源化抗体包括来自受体互补决定区(CDR)的残基被来自具有所需特异性、亲和力及容量的非人物种(供体抗体;如小鼠、大鼠或兔)的CDR的残基置换的人免疫球蛋白(受体抗体)。在一些情况下,人免疫球蛋白的Fv骨架残基被相应非人残基置换。人源化抗体还可包含在受体抗体和输入的CDR或骨架序列中都未发现的残基。一般来说,人源化抗体将包含至少一个且典型地两个可变结构域的基本上全部,其中所有或基本上所有的CDR区与非人免疫球蛋白的CDR区对应并且所有或基本上所有的FR区是人免疫球蛋白共有序列的FR区。人源化抗体最佳还将包含免疫球蛋白恒定区(Fc)的至少一部分,典型地人免疫球蛋白恒定区的至少一部分。Jones等人,Nature 321:522-525(1986);Riechmann等人,Nature 332:323-329(1988)及Presta,Curr.Opin.Struct.Biol.2:593-596(1992)。
[0382] 用于使非人抗TREM2抗体人源化的方法是本领域众所周知的。一般来说,人源化抗体中引入了一或多个来自非人来源的氨基酸残基。这些非人氨基酸残基通常称为“输入”残基,这些残基典型地是从“输入”可变结构域获得。人源化可以基本上遵循Winter及同事,Jones等人,Nature 321:522-525(1986);Riechmann等人,Nature 332:323-327(1988);Verhoeyen等人,Science 239:1534-1536(1988)的方法,或通过用啮齿动物CDR或CDR序列取代人抗体的相应序列来进行。因此,此类“人源化”抗体是嵌合抗体(美国专利号4,816,
567),其中大体上少于完整人可变结构域被来自非人物种的相应序列取代。实际上,人源化抗体典型地是其中一些CDR残基并且可能一些FR残基被来自啮齿动物抗体中类似位点的残基取代的人抗体。
[0383] 用于制备人源化抗体的人轻链和重链可变结构域的选择对于降低抗原性至关重要。根据所谓的“最佳拟合”方法,针对已知人可变结构域序列的完整文库筛选啮齿动物抗体可变结构域的序列。接着,最接近啮齿动物序列的人序列被接受作为人源化抗体的人骨架(FR)。Sims等人,J.Immunol.,151:2296(1993);Chothia等人,J.Mol.Biol.,196:901(1987)。另一方法使用了来源于具有特定轻链或重链亚组的所有人抗体的共有序列的特定骨架。该骨架可以用于若干不同的人源化抗体。Carter等人,Proc.Nat’l Acad.Sci.USA 89:4285(1992);Presta等人,J.Immunol.151:2623(1993)。
[0384] 另外,重要的是使人源化的抗体保持对抗原的高亲和力及其它有利的生物特性。为达到此目标,根据优选方法,通过使用亲本序列与人源化序列的三维模型分析亲本序列与各种概念性人源化产物的方法来制备人源化抗体。三维免疫球蛋白模型是常用的并且是本领域技术人员所熟悉的。可用计算机程序说明并展示选定的候选免疫球蛋白序列可能的三维构象结构。检查这些展示允许分析所述残基在候选免疫球蛋白序列功能中的可能作用,即,分析影响候选免疫球蛋白结合其抗原的能力的残基。以此方式,可以从受体序列和输入序列中选出FR残基并组合,以获得所希望的抗体特征,如增加对一种或多种靶抗原(例如本公开的TREM2蛋白)的亲和力。一般来说,CDR残基直接并且最充分地参与影响抗原结合。
[0385] 预期各种形式的人源化抗TREM2抗体。例如,人源化抗TREM2抗体可以是抗体片段,诸如Fab,其任选地与一种或多种TREM2配体(诸如HSP60)偶联。可替代地,人源化抗TREM2抗体可以是完整抗体,诸如完整IgG1抗体。
[0386] (4)人抗体
[0387] 或者,可以产生人抗TREM2抗体。举例来说,现可能产生在免疫后能够在无内源免疫球蛋白产生的情况下产生完全人抗体库的转基因动物(例如,小鼠)。嵌合和生殖系突变小鼠中抗体重链连接区(JH)基因的纯合性缺失会导致内源抗体产生的完全抑制。在所述生殖系突变小鼠中转入人生殖系免疫球蛋白基因阵列将在抗原激发后产生人抗体。参见例如,Jakobovits等人,Proc.Nat’l Acad.Sci.USA,90:2551(1993);Jakobovits等人,Nature,362:255-258(1993);Bruggermann等人,Year in Immunol.,7:33(1993);美国专利号5,591,669和WO 97/17852。
[0388] 或者,可以使用噬菌体展示技术在体外,由来自未免疫供体的免疫球蛋白可变(V)结构域基因库产生人抗TREM2抗体及抗体片段。McCafferty等人,Nature 348:552-553(1990);Hoogenboom和Winter,J.Mol.Biol.227:381(1991)。根据此技术,将抗体V结构域同框克隆至如M13或fd等丝状噬菌体的主要或次要衣壳蛋白基因中,并在噬菌体粒子的表面上展示为功能性抗体片段。由于丝状粒子含有噬菌体基因组的单链DNA拷贝,故基于抗体功能特性进行的选择还导致选出编码展现这些特性的抗体的基因。因此,该噬菌体模拟B细胞的某些特性。噬菌体展示可以通过多种方式执行,如例如Johnson,Kevin S.和Chiswell,David J.,Curr.Opin Struct.Biol.3:564-571(1993)中所评述。可以使用若干V基因区段来源进行噬菌体展示。Clackson等人,Nature 352:624-628(1991)从来源于免疫小鼠的脾的小型V基因随机组合文库分离出一系列不同的抗噁唑酮抗体。可以构造来自未免疫的人供体的V基因库,并且可以基本上遵循Marks等人,J.Mol.Biol.222:581-597(1991),或Griffith等人,EMBO J.12:725-734(1993)所描述的技术分离针对一系列不同抗原(包括自体抗原)的抗体。另参见美国专利号5,565,332和5,573,905。另外,还可以使用酵母展示技术在体外产生人抗TREM2抗体及抗体片段(例如WO 2009/036379;WO 2010/105256;WO 
2012/009568;US 2009/0181855;US 2010/0056386;及Feldhaus和Siegel(2004)
J.Immunological Methods 290:69-80)。在其它实施方案中,可以使用核糖体展示技术在体外产生人抗TREM2抗体及抗体片段(例如,Roberts和Szostak(1997)Proc Natl Acad Sci 
94:12297-12302;Schaffitzel等人(1999)J.Immunolical Methods 231:119-135;
Lipovsek和Plückthun(2004)J.Immunological Methods 290:51-67)。
[0389] Cole等人和Boerner等人的技术也可用于制备人抗TREM2单克隆抗体(Cole等人,Monoclonal Antibodies and Cancer Therapy,Alan R.Liss,第77页(1985)及Boerner等人,J.Immunol.147(1):86-95(1991)。类似地,还可以通过将人免疫球蛋白基因座引入转基因动物(例如小鼠)中来制备人抗TREM2抗体,在这些转基因动物中,已经使内源免疫球蛋白基因部分地或完全地失活。在激发之后,观察到人抗体的产生,该抗体在所有方面都紧密地类似于在人所见,包括基因重排、组装及抗体库。此方法描述于例如美国专利号5,545,807、5,545,806、5,569,825、5,625,126、5,633,425、5,661,016,及以下科学公布中:Marks等人,Bio/Technology 10:779-783(1992);Lonberg等人,Nature 368:856-859(1994);
Morrison,Nature 368:812-13(1994);Fishwild等人,Nature Biotechnology 14:845-51(1996);Neuberger,Nature Biotechnology 14:826(1996);及Lonberg和Huszar,
Intern.Rev.Immunol.13:65-93(1995)。
[0390] 最后,还可以在体外由活化B细胞产生人抗TREM2抗体(参见美国专利号5,567,610和5,229,275)。
[0391] (5)抗体片段
[0392] 在某些实施方案中,使用抗TREM2抗体片段而非全抗TREM2抗体具有优点。在一些实施方案中,较小的片段尺寸实现快速清除和更好的脑渗透。
[0393] 已开发出用于产生抗体片段的各种技术。传统上,经由蛋白水解消化完整抗体得到这些片段(参见例如,Morimoto等人,J.Biochem.Biophys.Method.24:107-117(1992);及Brennan等人,Science 229:81(1985))。不过,现在可以通过重组宿主细胞,例如使用编码本公开的抗TREM2抗体的核酸直接产生这些片段。Fab、Fv及scFv抗体片段都可以在大肠杆菌中表达并由其分泌,由此能够直接产生大量这些片段。抗TREM2抗体片段还可以从如以上所论述的抗体噬菌体文库分离。或者,可以直接从大肠杆菌回收Fab’-SH片段并以化学方式偶合以形成F(ab’)2片段(Carter等人,Bio/Technology 10:163-167(1992))。根据另一方法,可以从重组宿主细胞培养物直接分离F(ab’)2片段。美国专利号5,869,046中描述了具有增加体内的半衰期的Fab和F(ab’)2抗体片段的产生。在其它实施方案中,所选抗体是单链Fv抗体(scFv)。参见WO 93/16185;美国专利号5,571,894和美国专利号5,587,458。抗TREM2抗体片段也可以是“线性抗体”,例如,如美国专利5,641,870中所描述。此类线性抗体片段可以是单特异性或双特异性的。
[0394] (6)双特异性和多特异性抗体
[0395] 双特异性抗体(BsAb)是对至少两个不同表位,包括在同一或另一蛋白质(例如,一种或多种本公开的TREM2蛋白)上的那些表位具有结合特异性的抗体。或者,BsAb的一部分可以用于结合到靶TREM2抗原,而另一部分可以与结合到第二蛋白质的臂组合。此类抗体可以来源于全长抗体或抗体片段(例如F(ab')2双特异性抗体)。
[0396] 用于制备双特异性抗体的方法是本领域中已知的。产生全长双特异性抗体的传统方法是基于两个免疫球蛋白重链/轻链对的共表达,其中这两条链具有不同特异性。Millstein等人,Nature,305:537-539(1983)。由于免疫球蛋白重链和轻链的随机分配,使得这些杂交瘤(四源杂交瘤(quadroma))产生10种不同抗体分子的潜在混合物,其中仅一种具有正确的双特异性结构。正确分子的纯化通常是通过亲和色谱步骤进行,不过这些步骤相当繁琐,并且产物产率较低。WO 93/08829和Traunecker等人,EMBO J.,10:3655-3659(1991)中公开了类似程序。
[0397] 根据不同方法,将具有所希望的结合特异性(抗体-抗原组合位点)的抗体可变结构域与免疫球蛋白恒定结构域序列融合。融合优选是与免疫球蛋白重链恒定结构域进行,包含铰链区、CH2及CH3区的至少一部分。优选具有在至少一种融合物中存在含有轻链结合所需位点的第一重链恒定区(CH1)。将编码免疫球蛋白重链融合物以及必要时免疫球蛋白轻链的DNA插入独立表达载体中,并将其共转染至适合宿主生物体中。由此在构造中使用不等比率的三个多肽链提供最佳产率的实施方案中为调整这三个多肽片段的相互比例提供较大灵活性。然而,当相等比率的至少两条多肽链的表达产生高产率时,或当这些比率不具有特别意义时,可将两条或全部三条多肽链的编码序列插入一个表达载体中。
[0398] 在此方法的优选实施方案中,双特异性抗体由在一臂中的具有第一结合特异性的杂交免疫球蛋白重链及在另一臂中的杂交免疫球蛋白重链-轻链对(提供第二结合特异性)构成。已发现,此不对称结构有助于所希望的双特异性化合物与不想要的免疫球蛋白链组合分离,因为在双特异性分子仅一半中免疫球蛋白轻链的存在提供一种容易的分离方式。WO 94/04690中公开此方法。有关产生双特异性抗体的其它详情,参见例如,Suresh等人,Methods in Enzymology 121:210(1986);以及Garber,Nature Reviews Drug Discovery 
13,799-801(2014)。
[0399] 根据WO 96/27011或美国专利号5,731,168中所描述的另一方法,可以对一对抗体分子之间的界面进行工程改造以使从重组细胞培养物回收的异二聚体的百分含量最大。优选的界面包含抗体恒定结构域的CH3区的至少一部分。在此方法中,来自第一抗体分子的界面的一个或多个小氨基酸链被大侧链(例如酪氨酸或色氨酸)置换。通过用较小的氨基酸侧链(例如丙氨酸或苏氨酸)置换较大氨基酸侧链,在第二抗体分子的界面上产生与较大侧链相同或类似大小的补偿性“空腔”。由此提供相对于如同二聚体等其它不想要的终产物而增加异二聚体产率的机制。
[0400] 由抗体片段产生双特异性抗体的技术已在文献中描述。举例来说,可以使用化学键联制备双特异性抗体。Brennan等人,Science229:81(1985)描述了蛋白水解裂解完整抗体以产生F(ab’)2片段的程序。这些片段在二硫醇络合剂亚砷酸钠存在下被还原以使邻近的二硫醇稳定并防止分子间二硫键的形成。接着,所产生的Fab’片段被转化成硫代硝基苯甲酸酯(TNB)衍生物。接着,将Fab’-TNB衍生物之一再转化成Fab’-TNB衍生物以形成双特异性抗体。产生的双特异性抗体可以用作选择性固定酶的试剂。
[0401] Fab’片段可以直接从大肠杆菌回收并以化学方式偶合以形成双特异性抗体。Shalaby等人,J.Exp.Med.175:217-225(1992)描述了完全人源化双特异性抗体F(ab’)2分子的产生。每个Fab'片段都是由大肠杆菌单独分泌并在体外经历定向化学偶合以形成双特异性抗体。由此形成的双特异性抗体能够结合到过表达ErbB2受体的细胞和正常人T细胞,并且触发人细胞毒性淋巴细胞针对人乳房肿瘤靶的溶解活性。
[0402] 直接由重组细胞培养物制备和分离二价抗体片段的各种技术已得以描述。举例来说,已经使用亮氨酸拉链制备出二价异二聚体。Kostelny等人,J.Immunol.,148(5):1547-1553(1992)。通过基因融合将来自Fos和Jun蛋白的亮氨酸拉链肽连接至两种不同抗体的Fab’部分。抗体同二聚体在铰链区处还原以形成单体,然后再氧化形成抗体异二聚体。
Hollinger等人,Proc.Nat’l Acad.Sci.USA,90:6444-6448(1993)所描述的“双功能抗体”技术提供了制备双特异性/二价抗体片段的替代机制。这些片段包含通过连接子连接至轻链可变结构域(VL)的重链可变结构域(VH),该连接子太短而使得同一链上的两个结构域之间无法配对。因此,迫使一个片段的VH和VL结构域与另一片段的互补VL和VH结构域配对,由此形成两个抗原结合位点。另外,已报导通过使用单链Fv(sFv)二聚体制备双特异性/二价抗体片段的另一策略。参见Gruber等人,J.Immunol.,152:5368(1994)。
[0403] 生成双特异性抗体的另一种方法是指定受控Fab臂交换(cFAE),它是生成双特异性IgG1(bsIgG1)的容易使用的方法。所述方案涉及以下各项:(i)单独表达包含在CH3结构域中的单个匹配点突变的两个亲本IgG1;(ii)在体外容许氧化还原条件下混合亲本IgG1以实现半个分子的重组;(iii)去除还原剂以允许链间二硫键的再氧化;以及(iv)使用基于色谱的方法或基于质谱(MS)的方法分析交换效率和最终产物。所述方案在实验室规模(微克至毫克)和设计来模拟大规模生产(千克)的微型生物反应器规模(毫克至克)两者下均生成具有规则IgG构造、特征和质量属性的bsAb。从良好质量纯化的蛋白质开始,≥95%的交换效率可在2-3天内获得(包括质量控制)。参见Labrijn等人,Natur Protocols 9,2450-2463(2014);以及Garber,Nature Reviews Drug Discovery 13,799-801(2014)。
[0404] 还预期具有超过两个价态的抗体。例如,可制备三特异性抗体。Tutt等人,J.Immunol.147:60(1991)。
[0405] 示例性双特异性抗体可结合到给定分子(例如,本公开的TREM2蛋白)上的两个不同的表位。在一些实施方案中,双特异性抗体结合到第一抗原(诸如本公开的TREM2或DAP12蛋白)和有助于跨血脑屏障转运的第二抗原。有助于跨血脑屏障转运的多种抗原是本领域已知的(参见,例如,Gabathuler R.,Approaches to transport therapeutic drugs across the blood-brain barrier to treat brain diseases,Neurobiol.Dis.37(2010)48-57)。此类第二抗原包括但不限于转铁蛋白受体(TR)、胰岛素受体(HIR)、胰岛素样生长因子受体(IGFR)、低密度脂蛋白受体相关蛋白1和低密度脂蛋白受体相关蛋白2(LPR-1和LPR-2)、白喉毒素受体(包括CRM197(白喉毒素的非毒性突变体))、美洲驼单结构域抗体(诸如TMEM 30(A)(翻转酶))、蛋白转导结构域(诸如TAT、Syn-B、或穿膜肽)、聚精氨酸肽或通常带正电荷的肽、血管肽诸如ANG1005(参见,例如,Gabathuler,2010)、以及在血脑屏障内皮细胞上富含的其他细胞表面蛋白(参见,例如,Daneman等人,PLoS One.2010年10月29日;5(10):e13741)。在一些实施方案中,抗TREM2抗体的第二抗原可包括但不限于本公开的DAP12抗原。在其他实施方案中,抗DAP12抗体的第二抗原可包括但不限于本公开的TREM2抗原。在其他实施方案中,结合到TREM2和DAP12两者的双特异性抗体可有助于并且增强一种或多种TREM2活性。在其他实施方案中,抗TREM2抗体的第二抗原可包括但不限于Aβ肽、抗原或α突触核蛋白抗原、或Tau蛋白抗原、或TDP-43蛋白抗原、或朊病毒蛋白抗原、或亨廷顿蛋白抗原、或RNA、翻译产物抗原,包括由甘氨酸-丙氨酸(GA)、甘氨酸-脯氨酸(GP)、甘氨酸-精氨酸(GR)、脯氨酸-丙氨酸(PA)、或脯氨酸-精氨酸(PR)构成的二肽重复序列(DPR肽)。
[0406] (7)多价抗体
[0407] 多价抗体可能比二价抗体更快地被表达抗体所结合的抗原的细胞内化(和/或分解代谢)。本公开的抗TREM2抗体或其抗体片段可以是具有三个或更多个抗原结合位点(例如四价抗体)的多价抗体(除IgM类别外的类别),这些抗体可以通过重组表达编码抗体多肽链的核酸容易地产生。多价抗体可以包含二聚化结构域及三个或更多个抗原结合位点。优选的二聚化结构域包含Fc区或铰链区。在此情况下,抗体将包含Fc区以及在Fc区的氨基末端的三个或更多个抗原结合位点。本文中优选的多价抗体含有三个至约八个,但优选四个抗原结合位点。多价抗体含有至少一条多肽链(并且优选两条多肽链),其中这一条或多条多肽链包含两个或更多个可变结构域。举例来说,所述一条或多条多肽链可以包含VD1-(X1)n-VD2-(X2)n-Fc,其中VD1是第一可变结构域,VD2是第二可变结构域,Fc是Fc区的一条多肽链,X1和X2表示氨基酸或多肽,并且n是0或1。类似地,所述一条或多条多肽链可以包含VH-CH1-柔性连接子-VH-CH1-Fc区链;或VH-CH1-VH-CH1-Fc区链。本文中的多价抗体优选另外包含至少两个(并且优选四个)轻链可变结构域多肽。本文中的多价抗体可以例如包含约两个至约八个轻链可变结构域多肽。此处涵盖的轻链可变结构域多肽包含轻链可变结构域并且任选地,另外包含CL结构域。多价抗体可以识别TREM2抗原,以及但不限于额外抗原Aβ肽、抗原或α突触核蛋白蛋白质抗原,或Tau蛋白抗原,或TDP-43蛋白质抗原,或朊病毒蛋白抗原,或亨廷顿蛋白抗原,或RAN,翻译产物抗原,包括由甘氨酸-丙氨酸(GA)、甘氨酸-脯氨酸(GP)、甘氨酸-精氨酸(GR)、脯氨酸-丙氨酸(PA)或脯氨酸-精氨酸(PR)构成的二肽重复(DPR肽),胰岛素受体、类胰岛素生长因子受体。转铁蛋白受体或有助于抗体跨血脑屏障转移的任何其它抗原。
[0408] (8)效应功能工程改造
[0409] 另外,可能希望对本公开的抗TREM2抗体进行修饰以改变效应功能和/或增加抗体的血清半衰期。举例来说,可以对恒定区上的Fc受体结合位点进行修饰或突变以去除或降低与某些Fc受体,如FcγRI、FcγRII和/或FcγRIII的结合亲和力以降低抗体依赖性细胞介导的细胞毒性。在一些实施方案中,通过去除抗体Fc区(例如在IgG的CH 2结构域中)的N-糖基化来减弱效应功能。在一些实施方案中,如PCT WO 99/58572以及Armour等人,Molecular Immunology 40:585-593(2003);Reddy等人,J.Immunology 164:1925-1933(2000)中所描述,通过修饰人IgG的如233-236、297和/或327-331等区域来减弱效应功能。
在其他实施方案中,还可能希望修饰本公开的抗TREM2抗体以修改效应功能来增加朝向含有ITIM的FcgRIIb(CD32b)的发现选择性,以增加TREM2抗体在相邻细胞上的簇集而不活化体液应答,包括抗体依赖性细胞介导的细胞毒性和抗体依赖性细胞吞噬作用。
[0410] 为了增加抗体的血清半衰期,如美国专利5,739,277中所描述,可以将挽救受体(salvage receptor)结合表位并入抗体(尤其是抗体片段)中。如本文所使用,术语“挽救受体结合表位”是指IgG分子(例如IgG1、IgG2、IgG3或IgG4)的Fc区中负责增加IgG分子体内血清半衰期的表位。
[0411] (9)其他氨基酸序列修饰
[0412] 也涵盖有关本公开的抗TREM2抗体或其抗体片段的氨基酸序列修饰。举例来说,可能希望改善这些抗体或抗体片段的结合亲和力和/或其它生物特性。抗体或抗体片段的氨基酸序列变体是通过将适当核苷酸变化引入编码这些抗体或抗体片段的核酸中,或通过肽合成来制备。此类修饰包括例如抗体的氨基酸序列内残基的缺失和/或插入和/或取代。可进行缺失、插入及取代的任何组合以得到最终构建体,只要最终构建体具有所希望的特征(即,能够与本公开的TREM2蛋白结合或物理相互作用)。氨基酸变化也可以改变抗体的翻译后加工,如改变糖基化位点的数目或位置。
[0413] 用于鉴定抗TREM2抗体中作为优选诱变位置的残基或区域的一种有用方法称为“丙氨酸扫描诱变”,如Cunningham及Wells,Science,244:1081-1085(1989)所述。此处,鉴定一个残基或一组靶残基(例如,带电残基,如arg、asp、his、lys及glu)并用呈中性或带负电的氨基酸(最优选丙氨酸或聚丙氨酸)置换来影响氨基酸与靶抗原的相互作用。然后,通过将另外的或其它变体引入取代位点或用于取代位点来改进对取代展示功能性敏感性的氨基酸位置。因此,尽管引入氨基酸序列变异的位点是预定的,但突变本身的性质不必是预定的。举例来说,为了分析给定位点处突变的性能,在靶密码子或区域处进行丙氨酸扫描或随机诱变并针对希望的活性筛选所表达的抗体变体。
[0414] 氨基酸序列插入包括长度范围从一个残基到含有一百个或更多个残基的多肽的氨基(“N”)和/或羧基(“C”)末端融合物,以及具有单个或多个氨基酸残基的序列内插入。末端插入的实例包括具有N末端甲硫氨酰基残基的抗体或与细胞毒性多肽融合的抗体。抗体分子的其它插入变体包括抗体的N末端或C末端与增加抗体的血清半衰期的酶或多肽的融合物。
[0415] 另一类变体是氨基酸取代变体。这些变体在抗体分子中具有至少一个氨基酸残基被不同残基置换。最值得关注的供取代诱变的位点包括高变区,但也涵盖FR变化。保守取代如下表C中标题“优选的取代”下所示。如果这些取代引起生物活性的变化,则可以引入更实质性的变化,在表C中命名为“示例性取代”,或如下文参照氨基酸类别进一步描述,并筛选产物。
[0416] 表C:氨基酸取代
[0417]
[0418] 通过选择对维持(a)多肽主链在取代区域中的结构,例如折叠或螺旋构象;(b)分子在靶位点处的电荷或疏水性;或(c)侧链的体积的影响显著不同的取代来实现抗体生物特性的显著变化。天然存在的残基基于常见侧链特性分成以下各组:
[0419] (1)疏水性:正亮氨酸、met、ala、val、leu、ile;
[0420] (2)中性亲水性:cys、ser、thr;
[0421] (3)酸性:asp、glu;
[0422] (4)碱性:asn、gln、his、lys、arg;
[0423] (5)影响链取向的残基:gly、pro;及
[0424] (6)芳香族:trp、tyr、phe。
[0425] 非保守性取代需要将这些类别之一的成员换成另一类别。
[0426] 不参与维持抗体适当构型的任何半胱氨酸残基一般也可以被丝氨酸取代,以改善分子的氧化稳定性并防止异常交联。反之,可以将半胱氨酸键添加至抗体中以改善其稳定性(特别是在抗体是抗体片段,如Fv片段的情况下)。
[0427] 一类特别优选的取代变体涉及取代亲本抗体(例如人源化或人抗TREM2抗体)的一个或多个高变区残基。一般来说,所得到的选择用于进一步开发的变体将具有相对于从其产生这些变体的亲本抗体有所改善的生物特性。用于产生此类取代变体的便利方法涉及使用噬菌体展示进行的亲和力成熟。简单点说,使若干高变区位点(例如6-7个位点)突变以在每一位点处产生所有可能的氨基取代。由此产生的抗体变体自丝状噬菌体粒子以单价方式作为与包装于每一粒子中的M13基因III产物的融合物形式展示。接着,针对本文所公开的生物活性(例如结合亲和力)筛选噬菌体展示的变体。为鉴定供修饰的候选高变区位点,可以进行丙氨酸扫描诱变以鉴定明显有助于抗原结合的高变区残基。替代地或另外,分析抗原-抗体复合物的晶体结构以鉴定抗体与抗原(例如本公开的TREM2蛋白)之间的接触点可为有益的。此类接触残基及邻近残基是根据本文中详述的技术进行取代的候选物。在产生此类变体后,就如本文所描述,使该组变体经历筛选并且可以选出在一种或多种相关测定中具有优良特性的抗体进行进一步开发。
[0428] 抗体的另一类氨基酸变体改变了抗体的初始糖基化模式。改变意思指缺失抗体中所发现的一个或多个碳水化合物部分,和/或添加一个或多个抗体中不存在的糖基化位点。
[0429] 抗体的糖基化典型地是N连接或O连接的。N-连接是指碳水化合物部分连接至天冬酰胺残基的侧链。三肽序列天冬酰胺-X-丝氨酸和天冬酰胺-X-苏氨酸(其中X是除脯氨酸外的任何氨基酸)是将碳水化合物部分酶促连接至天冬酰胺侧链的识别序列。因此,在多肽中这些三肽序列中任一种的存在产生了潜在的糖基化位点。O-连接的糖基化是指糖N-乙酰半乳糖胺、半乳糖或木糖连接至羟基氨基酸,最常见是丝氨酸或苏氨酸,不过也可以使用5-羟基脯氨酸或5-羟基赖氨酸。
[0430] 在抗体中添加糖基化位点通常通过改变氨基酸序列,以使其含有上述三肽序列(对于N-连接的糖基化位点)中的一个或多个来实现。还可以通过初始抗体中一个或多个丝氨酸或苏氨酸残基的添加或取代来进行改变(对于O-连接的糖基化位点)
[0431] 编码抗IgE抗体的氨基酸序列变体的核酸分子通过本领域中已知的多种方法制备。这些方法包括但不限于,从天然来源分离(在天然存在的氨基酸序列变体的情况下),或通过抗体(例如本公开的抗TREM2体)或抗体片段的预先制备的变体或非变体形式的寡聚核苷酸介导的(或定点)诱变、PCR诱变及盒式诱变来制备。
[0432] (10)其他抗体修饰
[0433] 本公开的抗TREM2抗体,或其抗体片段可以进一步修饰成含有本领域中已知并且易于得到的额外非蛋白质部分或含有本领域中已知并且易于得到的不同类型的药物偶联物。优选地,适于抗体衍生化的部分是水溶性聚合物。水溶性聚合物的非限制性实例包括但不限于,聚乙二醇(PEG)、乙二醇/丙二醇共聚物、羧甲基纤维素、葡聚糖、聚乙烯醇、聚乙烯吡咯烷酮、聚-1,3-二氧戊环、聚-1,3,6-三噁烷、乙烯/顺丁烯二酸酐共聚物、聚氨基酸(均聚物或无规共聚物)及葡聚糖或聚(n-乙烯吡咯烷酮)聚乙二醇、聚丙二醇均聚物、聚氧化丙烯/氧化乙烯共聚物、聚氧乙基化多元醇(例如甘油)、聚乙烯醇及其混合物。聚乙二醇丙醛因其于水中的稳定性而可能在制造时具有优势。聚合物可以具有任何分子量,并且可以是分支或未分支的。连接至抗体的聚合物的数目可以变化,并且如果连接超过一种聚合物,则这些聚合物可以是相同或不同分子。一般来说,用于衍生化的聚合物的数目和/或类型可以基于以下考虑来确定:包括但不限于,待改善的抗体的特定特性或功能,抗体衍生物是否会在指定条件下用于疗法等。此类技术和其它适合配制物公开于Remington:The Science and Practice of Pharmacy,第20版,Alfonso Gennaro编,Philadelphia College of Pharmacy and Science(2000)中。
[0434] 药物偶联涉及生物活性细胞毒性(抗癌)有效负荷或药物偶合到特异性地靶向某一肿瘤标志物(例如,理想地仅存在于肿瘤细胞中或肿瘤细胞上的蛋白质)的抗体。抗体在体内追踪这些蛋白质并且使其本身连接到癌细胞的表面。抗体与靶标蛋白(抗原)之间的生物化学反应触发肿瘤细胞中的信号,所述肿瘤细胞然后连同细胞毒素一起吸收或内化抗体。在ADC内化之后,细胞毒性药物被释放并杀伤癌症。由于此靶向,理想地,所述药物具有较低的副作用,并且比其他化疗剂给出更宽的治疗窗口。偶联所公开的抗体的技术是本领域已知的(参见,例如,Jane de Lartigue,OncLive2012年7月5日;ADC Review on antibody-drug conjugates;以及Ducry等人,(2010).Bioconjugate Chemistry 21(1):5-
13)。
[0435] 结合测定和其他测定
[0436] 可例如通过已知的方法(诸如ELISA、蛋白质印迹等)针对抗原结合活性测试本公开的抗TREM2抗体。
[0437] 在一些实施方案中,竞争测定可用于鉴别与以下抗体中的任一种竞争结合到TREM2的抗体,所述以下抗体在表2A、表2B、表3A、表3B、表4A、表4B、表7A、以及表7B中列出,选自1A7、3A2、3B10、6G12、6H6、7A9、7B3、8A1、8E10、8F11、8F8、9F5、9G1、9G3、10A9、10C1、
11A8、12E2、12F9、12G6、2C7、2F5、3C1、4D7、4D11、6C11、6G12、7A3、7C5、7E9、7F6、7G1、7H1、
8C3、8F10、12A1、1E9、2C5、3C5、4C12、4F2、5A2、6B3、7D1、7D9、11D8、8A12、10E7、10B11、10D2、
7D5、2A7、3G12、6H9、8G9、9B4、10A1、11A8、12F3、2F8、10E3、1H7、2F6、2H8、3A7、7E5、7F8、
11H5、7C5、4F11、12D9、1B4v1、1B4v2、6H2、7B11v1、7B11v2、18D8、18E4v1、18E4v2、29F6v1、
29F6v2、40D5v1、40D5v2、43B9、44A8v1、44A8v2、44B4v1、和44B4v2、以及其人源化变体、和/或人源化抗体M7E57291。在某些实施方案中,此竞争抗体结合到以下抗体中的任一种所结合的相同表位(例如,线性或构象表位),所述以下抗体在表1中列出,选自4D11、7C5、6G12、
8F11、8E10、7E5、7F8、8F8、1H7、2H8、3A2、3A7、3B10、4F11、6H6、7A9、7B3、8A1、9F5、9G1、9G3、
10A9、11A8、12D9、12F9、1B4v1、1B4v2、6H2、7B11v1、7B11v2、18D8、18E4v1、18E4v2、、以及其人源化衍生物、和/或人和/或人源化M7E57291。用于定位抗体结合的表位的详细示例性方法提供在Morris(1996)“Epitope Mapping Protocols,”在Methods in Molecular 
Biology第66卷(Humana Press,Totowa,NJ)中。
[0438] 在示例性竞争测定中,在包含结合到TREM2(例如,人或非人灵长类)的第一标记抗体和测试其与第一抗体竞争结合到TREM2的能力的第二未标记抗体的溶液中孵育固定的TREM2或在细胞表面上表达TREM2的细胞。第二抗体可存在于杂交瘤上清液中。作为对照,在包含第一标记抗体但不包含第二未标记抗体的溶液中孵育固定的TREM2或表达TREM2的细胞。在容许第一抗体结合到TREM2的条件下孵育之后,去除过量未结合抗体,并且测量与固定的TREM2或表达TREM2的细胞缔合的标记的量。如果相对于对照样品,与固定的TREM2或表达TREM2的细胞缔合的标记的量在测试样品中基本上降低,则这指示第二抗体与第一抗体竞争结合到TREM2。参见,Harlow和Lane(1988)Antibodies:A Laboratory Manual第14章(Cold Spring Harbor Laboratory,Cold Spring Harbor,NY)。
[0439] 核酸、载体、和宿主细胞
[0440] 本公开的抗TREM2抗体可以使用例如美国专利号4,816,567中所描述的重组方法和组合物产生。在一些实施方案中,提供了具有编码任一本公开的抗TREM2抗体的核苷酸序列的分离的核酸。此类核酸可以编码含有抗TREM2抗体的VL的氨基酸序列和/或含有该抗体的VH的氨基酸序列(例如,抗体的轻链和/或重链)。在一些实施方案中,提供了含有这些核酸的一种或多种载体(例如表达载体)。在一些实施方案中,还提供了含有该核酸的宿主细胞。在一些实施方案中,宿主细胞含有以下(例如,被以下转导):(1)包含核酸的载体,该核酸编码含有抗体VL的氨基酸序列及含有抗体VH的氨基酸序列,或(2)第一载体和第二载体,所述第一载体含有编码含有抗体VL的氨基酸序列的核酸,所述第二载体含有编码含有抗体VH的氨基酸序列的核酸。在一些实施方案中,宿主细胞是真核细胞,例如中国仓鼠卵巢(CHO)细胞或淋巴系细胞(例如,Y0、NS0、Sp20细胞)。本公开的宿主细胞还包括但不限于分离的细胞、体外培养的细胞、和离体培养的细胞。
[0441] 提供了制备本公开的抗TREM2抗体的方法。在一些实施方案中,该方法包括在适于表达抗TREM2抗体的条件下,培养本公开的宿主细胞,该宿主细胞含有编码该抗体的核酸。在一些实施方案中,随后从宿主细胞(或宿主细胞培养基)回收抗体。
[0442] 对于重组产生本公开的抗TREM2抗体,分离出编码该抗TREM2抗体的核酸,并将其插入一个或多个载体中以进一步在宿主细胞中克隆和/或表达。此核酸可以使用常规程序(例如,通过使用能够特异性结合到编码抗体重链和轻链的基因的寡聚核苷酸探针)容易地分离并测序。
[0443] 含有编码本文所描述的任何本公开的抗TREM2抗体或其片段多肽(包括抗体)的核酸序列的适合载体包括但不限于,克隆载体和表达载体。适合的克隆载体可以根据标准技术构建,或者可以选自本领域中可用的大量克隆载体。尽管所选克隆载体可以根据打算使用的宿主细胞而变化,但有用的克隆载体一般能够自复制,可以具有特定限制性核酸内切酶的单一靶,和/或可以携带可以用于选择含有载体的克隆的标志物的基因。适合的实例包括质粒及细菌病毒,例如pUC18、pUC19、Bluescript(例如pBS SK+)及其衍生物、mpl8、mpl9、pBR322、pMB9、ColE1、pCR1、RP4、噬菌体DNA,及穿梭载体,如pSA3和pAT28。这些和许多其它克隆载体可购自商业供应商,如BioRad、Strategene及Invitrogen。
[0444] 表达载体一般是含有本公开的核酸的可复制的多核苷酸构建体。表达载体可以在宿主细胞中作为游离基因或作为染色体DNA的整体部分复制。适合的表达载体包括但不限于,质粒、病毒载体,包括腺病毒、腺相关病毒、反转录病毒、粘粒及PCT公布号WO 87/04462中公开的表达载体。载体组分一般可以包括但不限于,以下一种或多种:信号序列;复制起点;一个或多个标志物基因;适合的转录控制元件(如启动子、增强子及终止子)。对于表达(即,翻译),通常还需要一个或多个翻译控制元件,如核糖体结合位点、翻译起始位点及终止密码子。
[0445] 可以通过多种适合手段中的任一种,包括电穿孔;采用氯化钙、氯化铷、磷酸钙、DEAE-葡聚糖或其它物质进行的转染;微弹轰击;脂转染;及感染(例如,当载体是感染物,如牛痘病毒时),将含有所关注核酸的载体引入宿主细胞中。引入载体或多核苷酸的选择将通常取决于宿主细胞的特征。在一些实施方案中,载体包含含有编码本公开的抗TREM2抗体的一个或多个氨基酸序列的核酸。
[0446] 适于克隆或表达抗体编码载体的宿主细胞包括原核或真核细胞。举例来说,可以在细菌中产生本公开的抗TREM2抗体,特别是在不需要糖基化和Fc效应功能时。关于在细菌中表达抗体片段及多肽(例如,美国专利号5,648,237、5,789,199及5,840,523;及Charlton,Methods in Molecular Biology,第248卷(B.K.C.Lo编,Humana Press,Totowa,NJ,2003),第245-254页,描述在大肠杆菌中表达抗体片段)。表达之后,可以从细菌细胞浆的可溶部分中分离抗体并且可以进一步纯化。
[0447] 除原核生物外,真核微生物如丝状真菌或酵母,也是适于抗体编码载体的克隆或表达宿主,包括糖基化途径已经“人源化”使得所产生的抗体具有部分或完全人糖基化模式的真菌及酵母菌株(例如,Gerngross,Nat.Biotech.22:1409-1414(2004);及Li等人,Nat.Biotech.24:210-215(2006))。
[0448] 适于表达糖基化抗体的宿主细胞也可以来源于多细胞生物体(无脊椎动物及脊椎动物)。无脊椎动物细胞的实例包括植物及昆虫细胞。已鉴别出可以与昆虫细胞联合使用,特别是用于转染草地贪夜蛾(Spodoptera frugiperda)细胞的众多杆状病毒病毒株。植物细胞培养物也可以用作宿主(例如,美国专利号5,959,177、6,040,498、6,420,548、7,125,978及6,417,429,描述了用于在转基因植物中产生抗体的PLANTIBODIESTM技术)。
[0449] 脊椎动物细胞也可以用作宿主。举例来说,可以使用适于在悬浮液中生长的哺乳动物细胞系。有用的哺乳动物宿主细胞系的其它实例是被SV40转化的猴肾CV1细胞系(COS-7);人胚肾细胞系(293或293细胞,如例如Graham等人,J.Gen Virol.36:59(1977)中所述);
幼仓鼠肾细胞(BHK);小鼠赛托利氏细胞(sertoli cell)(TM4细胞,如例如Mather,
Biol.Reprod.23:243-251(1980)中所述);猴肾细胞(CV1);非洲绿猴肾细胞(VERO-76);人子宫颈癌细胞(HELA);犬肾细胞(MDCK;布法罗大鼠(buffalo rat)肝细胞(BRL 3A);人肺细胞(W138);人肝细胞(Hep G2);小鼠乳房肿瘤(MMT 060562);TRI细胞,如例如Mather等人,Annals N.Y.Acad.Sci.383:44-68(1982)中所述;MRC 5细胞;及FS4细胞。其它有用的哺乳动物宿主细胞系包括中国仓鼠卵巢(CHO)细胞,包括DHFR-CHO细胞(Urlaub等人,
Proc.Natl.Acad.Sci.USA 77:4216(1980));及骨髓瘤细胞系,如Y0、NS0及Sp2/0。关于适于产生抗体的某些哺乳动物宿主细胞系的评述,参见例如Yazaki和Wu,Methods in 
Molecular Biology,第248卷(B.K.C.Lo编,Humana Press,Totowa,NJ),第255-268页
(2003)。
[0450] 药物组合物
[0451] 可以通过将本公开的抗TREM2抗体与适当药学上可接受的载剂或稀释剂组合而将所述抗体并入多种配制物中以便治疗性施用,并且可以被配制成固体、半固体、液体或气体形式的制剂。此类配制物的实例包括但不限于,片剂、胶囊、粉末、颗粒、药膏、溶液、栓剂、注射液、吸入剂、凝胶、微球体及气雾剂。取决于所希望的配制物,药物组合物可以包含药学上可接受的无毒载剂或稀释剂,这些载剂或稀释剂是常用于配制供动物或人施用的药物组合物的媒介物。选择的稀释剂不应影响组合的生物活性。此类稀释剂的实例包括但不限于,蒸馏水、缓冲水、生理盐水、PBS、林格氏溶液(Ringer’s solution)、右旋糖溶液及汉克氏溶液(Hank’s solution)。本公开的药物组合物或配制物可以另外包含其它载剂、佐剂,或无毒、非治疗性、无免疫原性稳定剂、赋形剂等。这些组合物还可以包含接近生理条件的额外物质,如pH调节剂和缓冲剂、毒性调节剂、润湿剂及清洁剂。
[0452] 本公开的药物组合物也可以包含多种稳定剂中的任一种,如抗氧化剂。当药物组合物包含多肽时,该多肽可以与各种众所周知的在体内增强该多肽的稳定性,或以其它方式增强其药理学特性(例如,增加该多肽的半衰期,降低其毒性及增进溶解或吸收)的化合物形成络合物。此类改良或络合剂的实例包括但不限于,硫酸盐、葡糖酸盐、柠檬酸盐及磷酸盐。组合物中的多肽还可以与增强其体内属性的分子形成复合物。此类分子包括但不限于,碳水化合物、多胺、氨基酸、其它肽、离子(例如钠、钾、钙、镁、锰)及脂质。
[0453] 有关适于各种类型施用的配制物的其它实例可以见于Remington’s Pharmaceutical Sciences,Mace Publishing Company,Philadelphia,PA,第17版(1985)中。有关药物递送方法的简要综述,参见Langer,Science 249:1527-1533(1990)。
[0454] 对于经口施用,施用的活性成分可以呈固体剂型,如胶囊、片剂及粉末;或呈液体剂型,如酏剂、糖浆及混悬液。活性组分可以与无活性成分和粉末状载剂,如葡萄糖、乳糖、蔗糖、甘露糖醇、淀粉、纤维素或纤维素衍生物、硬脂酸镁、硬脂酸、糖精钠、滑石、碳酸镁一起封装于明胶胶囊中。可以添加以提供希望的颜色味道、稳定性、缓冲能力、分散性或其它已知的期望特征的额外无活性成分的实例是红色氧化铁、胶、月桂基硫酸钠、二氧化及可食用白墨。可以使用类似稀释剂制备压制片剂。片剂和胶囊都可以被制造成持续释放产品的形式,以在数小时的时间里提供持续药物释放。压制片剂可以包覆糖衣或包覆膜衣以掩盖任何不愉快的味道并保护片剂免受大气影响,或包覆肠衣以在胃肠道中选择性崩解。供经口施用的液体剂型可以含有着色剂调味剂以增加患者接受度。
[0455] 适于肠胃外施用的配制物包括水性和非水性、等渗无菌注射溶液,这些溶液可以含有抗氧化剂、缓冲剂、抑菌剂及使配制物与预定接受者的血液等渗的溶质;以及水性和非水性无菌混悬液,这些混悬液可以包括悬浮剂、增溶剂增稠剂、稳定剂及防腐剂
[0456] 用于配制药物组合物的组分优选具有高纯度并且基本上不含可能有害的污染物(例如,至少是国家食品(NF)级,一般至少是分析级,并且更典型地至少是药品级)。此外,打算体内使用的组合物通常是无菌的。就给定化合物必须在使用前合成来说,所得产品典型地基本上不含在合成或纯化过程期间可能存在的任何可能有毒的物质,特别是任何内毒素。供肠胃外施用的组合物也是无菌的,基本上等渗并且在GMP条件下制备。
[0457] 配制物可以被优化成在脑或中枢神经系统中保持和稳定。当将药剂施用至脑室中时,希望该药剂保持在该隔室中,而不扩散或以其它方式跨过血脑屏障。稳定技术包括与如聚乙二醇、聚丙烯酰胺、中性蛋白质载体等基团交联、多聚化或连接,以便增加分子量。
[0458] 用于增加保持的其它策略包括将抗体(诸如本公开的抗TREM2抗体)覆埋在生物可降解或生物可蚀性植入物中。治疗活性剂的释放速率受经由聚合物基质运输的速率及植入物生物降解速率控制。经聚合物阻隔层运输药物还将受化合物溶解性;聚合物亲水性;聚合物交联程度;在吸收水后聚合物膨胀以使聚合物阻隔层更易于透过药物;植入物的几何形状等影响。植入物具有与选作植入部位的区域的大小和形状相称的尺寸。植入物可以是粒子、薄片、贴片、平板、纤维、微胶囊等,并且可以具有与所选插入部位相容的任何大小或形状。
[0459] 植入物可以是单件式的,即,具有活性剂均匀地分布于聚合物基质中,或被包封,在此情况下,活性剂储集层被聚合物基质包封。打算使用的聚合物组合物的选择将随施用部位、希望的治疗时间段、患者耐受性、待治疗疾病的性质等而变化。聚合物的特征将包括在植入部位的生物降解性、与所关注药剂的相容性、易于包封、在生理环境中的半衰期。
[0460] 可以使用的生物可降解聚合物组合物可以是当降解时会产生生理学上可接受的降解产物的有机酯或醚,包括单体。酸酐、酰胺、原酸酯等可以单独使用,或与其它单体组合使用。这些聚合物将是缩合聚合物。聚合物可以是交联或未交联的。值得关注的是羟基脂肪族羧酸聚合物(均聚物或共聚物),及多糖。所关注的聚酯中包括D-乳酸、L-乳酸、外消旋乳酸、羟基乙酸、聚己内酯及其组合的聚合物。通过采用L-乳酸酯或D-乳酸酯,得到缓慢生物降解的聚合物,而利用外消旋物,降解将明显增强。羟基乙酸与乳酸的共聚物特别值得关注,在此情况下,生物降解速率受羟基乙酸与乳酸的比率控制。最快降解的共聚物具有大致相等量的羟基乙酸和乳酸,在此情况下,任一均聚物对降解的抗性较强。羟基乙酸与乳酸的比率还将影响植入物的脆性,在此情况下,对于较大几何形状,将需要柔性较强的植入物。值得关注的多糖是藻酸钙,及官能化纤维素,特别是以不溶于水、约5kD至500kD分子量为特征的羧甲基纤维素酯等。在本发明的植入物中还可以采用生物可降解水凝胶。水凝胶典型地是以能够吸收液体为特征的共聚物材料。可以采用的示例性生物可降解水凝胶描述于Heller:Hydrogels in Medicine and Pharmacy,N.A.Peppes编,第III卷,CRC Press,Boca Raton,Fla.,1987,第137-149页中。
[0461] 药物剂量
[0462] 本公开的包含本公开的抗TREM2抗体的药物组合物可根据已知的方法施用给需要使用TREM2抗体治疗的个体(优选地是人),所述已知的方法诸如以推注方式或通过经一段时间连续输注的静脉内施用、通过肌肉内、腹膜内、脑脊髓内、颅内、脊柱内、皮下、关节内、滑膜内、囊内、口服、局部或吸入途径。
[0463] 本公开的药物组合物的剂量和希望的药物浓度可以取决于预期的特定用途而变化。适当剂量或施用途径的确定在普通技术人员的技能范围内。动物实验为确定人疗法的有效剂量提供了可靠指导。可以遵循Mordenti,J.和Chappell,W.“The  Use of Interspecies Scaling in Toxicokinetics,”Toxicokinetics and New Drug 
Development,Yacobi等人编,Pergamon Press,New York 1989,第42-46页中所描述的原理执行有效剂量的种间缩放。
[0464] 对于在体内施用本公开的抗TREM2抗体中的任一种,取决于施用途径,正常剂量可以在每天每kg个体的体重约10ng至约100mg或更高,优选每天约1mg/kg至10mg/kg间变化。对于在数天或更长时间内重复施用,取决于待治疗疾病、病症或病况的严重程度,持续治疗直到达到所希望的症状抑制。
[0465] 示例性给药方案可以包括施用约2mg/kg初始剂量的抗TREM2抗体,随后隔周施用约1mg/kg的每周维持剂量。取决于医生希望实现的药物动力学衰减模式,其它剂量方案也可能是有用的。举例来说,本文中涵盖一周向个体给药一至二十一次。在某些实施方案,可以使用在约3μg/kg至约2mg/kg范围内(如约3μg/kg、约10μg/kg、约30μg/kg、约100μg/kg、约300μg/kg、约1mg/kg及约2mg/kg)的剂量。在某些实施方案中,剂量频率是每天三次、每天两次、每天一次、隔天一次、每周一次、每两周一次、每四周一次、每五周一次、每六周一次、每七周一次、每八周一次、每九周一次、每十周一次,或每月一次、每两个月一次、每三个月一次或更长时间。治疗进展易于通过常规技术和测定监测。给药方案,包括施用的抗TREM2抗体,可以与所用剂量无关而随时间变化
[0466] 用于特定抗TREM2抗体的剂量可在已被给予抗TREM2抗体的一次或多次施用的个体中凭经验确定。个体被给予增量剂量的抗TREM2抗体。为了评估抗TREM2抗体的效力,可监测本公开的疾病、病症、或病状(例如,痴呆、额颞叶痴呆、阿尔茨海默氏病、Nasu-Hakola病、以及多发性硬化症)中的任一种的临床症状。
[0467] 根据例如受者的生理状况、施用目的是治疗性的还是预防性的、以及熟练从业人员已知的其他因素,本公开的抗TREM2抗体的施用可以是连续的或间断的。抗TREM2抗体的施用可在预选时间段内基本上是连续的或可以是以一系列间隔的剂量进行。
[0468] 有关具体递送剂量和方法的指导提供于文献中;参见例如,美国专利号4,657,760、5,206,344或5,225,212。不同配制物将有效用于不同治疗方法和不同病症,以及意图治疗特定器官或组织的施用可能需要以不同于另一器官或组织的方式递送,都在本公开的范围内。此外,剂量可以通过一次或多次独立施用,或通过连续输注施用。对于在数天或更长时间内重复施用,取决于病况,将持续治疗直至疾病症状发生所希望的抑制。不过,其它给药方案也可能是有用的。此治疗的进展易于通过常规技术和测定进行监测。
[0469] 治疗性用途
[0470] 本公开的其他方面提供用于以下各项的方法:在有需要的个体中调控(例如,活化或抑制)TREM2;调控(例如,活化或抑制)DAP12;调控(例如,活化或抑制)PI3K;调控(例如,增加或减少)一种或多种促炎和抗炎介质(例如,IFN-a4、IFN-b、IL-1β、TNF-α、IL-10、IL-6、IL-8、IL-23、趋化因子蛋白家族的TGF-β成员、IL-20家族成员、IL-33、LIF、IFN-γ、OSM、CNTF、TGF-β、GM-CSF、IL-11、IL-12、IL-17、IL-18、IL-23、CCL4、MCP-1、VEGF、CXCL10以及CRP)的表达;或调控(例如,增加或减少)一种或多种TREM2表达细胞的存活;或调控(例如,增加或减少)一种或多种TREM2表达细胞的功能性;或调控(例如,增加或减少)一种或多种TREM2表达细胞的增殖或;或调控(例如,增加或减少)一种或多种TREM2表达细胞的迁移;或调控(例如,增加或减少)一种或多种TREM2表达细胞与其他细胞的相互作用;所述方法通过向所述个体施用治疗有效量的本公开的抗TREM2抗体以在所述个体中调控(例如,诱导或抑制)一种或多种TREM2活性来进行。
[0471] 如本文所公开,本公开的抗TREM2抗体可用于预防、降低风险、或治疗痴呆、额颞叶痴呆、阿尔茨海默氏病、血管性痴呆、混合型痴呆、克-雅二氏病、正常压力脑积水、肌萎缩性侧索硬化症、亨廷顿氏病、tau蛋白病、Nasu-Hakola病、中风、急性创伤、慢性创伤、认知缺陷、记忆力丧失、狼疮、急性和慢性结肠炎、类风湿关节炎、伤口愈合、克罗恩氏病、炎症性肠病、溃疡性结肠炎、肥胖症、疟疾、特发性震颤、中枢神经系统狼疮、贝切特氏病、帕金森氏病、路易体痴呆、多系统萎缩、希一德二氏综合征、进行性核上性麻痹、皮层基底神经节变性、急性播散性脑脊髓炎、肉芽肿病症、结节病、老化疾病、癫痫发作、脊髓损伤、创伤性脑损伤、年龄相关性黄斑变性、青光眼、色素性视网膜炎、视网膜变性、呼吸道感染、败血症、眼部感染、全身感染、狼疮、关节炎、多发性硬化症、低骨密度、骨质疏松症、骨生成、骨质增生疾病、佩吉特氏骨病、癌症、膀胱癌、脑癌、乳腺癌、结肠癌、直肠癌、子宫内膜癌、肾癌、肾细胞癌、肾盂癌、白血病、肺癌、黑素瘤、非霍奇金氏淋巴瘤、胰腺癌、前列腺癌、卵巢癌、纤维肉瘤、急性成淋巴细胞白血病(ALL)、急性骨髓性白血病(AML)、慢性淋巴细胞白血病(CLL)、慢性骨髓性白血病(CML)、多发性骨髓瘤、真性红细胞增多症、原发性血小板增多症、原发性或特发性骨髓纤维化、原发性或特发性脊髓硬化症、髓样来源的肿瘤、表达TREM2的肿瘤、甲状腺癌、感染、CNS疱疹、寄生虫感染、锥虫感染、Cruzi感染、铜绿假单胞菌感染、杜氏利什曼原虫感染、B族链球菌感染、空肠弯曲杆菌感染、脑膜炎奈瑟氏球菌感染、I型HIV、和/或流感嗜血杆菌。在一些实施方案中,所述抗TREM2抗体是激动剂抗体。
[0472] 在一些实施方案中,本公开提供用于预防、降低风险、或治疗患有以下疾病的个体的方法:痴呆、额颞叶痴呆、阿尔茨海默氏病、血管性痴呆、混合型痴呆、克-雅二氏病、正常压力脑积水、肌萎缩性侧索硬化症、亨廷顿氏病、tau蛋白病、Nasu-Hakola病、中风、急性创伤、慢性创伤、认知缺陷、记忆力丧失、狼疮、急性和慢性结肠炎、类风湿关节炎、伤口愈合、克罗恩氏病、炎症性肠病、溃疡性结肠炎、肥胖症、疟疾、特发性震颤、中枢神经系统狼疮、贝切特氏病、帕金森氏病、路易体痴呆、多系统萎缩、希一德二氏综合征、进行性核上性麻痹、皮层基底神经节变性、急性播散性脑脊髓炎、肉芽肿病症、结节病、老化疾病、癫痫发作、脊髓损伤、创伤性脑损伤、年龄相关性黄斑变性、青光眼、色素性视网膜炎、视网膜变性、呼吸道感染、败血症、眼部感染、全身感染、狼疮、关节炎、多发性硬化症、低骨密度、骨质疏松症、骨生成、骨质增生疾病、佩吉特氏骨病、癌症、膀胱癌、脑癌、乳腺癌、结肠癌、直肠癌、子宫内膜癌、肾癌、肾细胞癌、肾盂癌、白血病、肺癌、黑素瘤、非霍奇金氏淋巴瘤、胰腺癌、前列腺癌、卵巢癌、纤维肉瘤、急性成淋巴细胞白血病(ALL)、急性骨髓性白血病(AML)、慢性淋巴细胞白血病(CLL)、慢性骨髓性白血病(CML)、多发性骨髓瘤、真性红细胞增多症、原发性血小板增多症、原发性或特发性骨髓纤维化、原发性或特发性脊髓硬化症、髓样来源的肿瘤、表达TREM2的肿瘤、甲状腺癌、感染、CNS疱疹、寄生虫感染、锥虫感染、Cruzi感染、铜绿假单胞菌感染、杜氏利什曼原虫感染、B族链球菌感染、空肠弯曲杆菌感染、脑膜炎奈瑟氏球菌感染、I型HIV、以及流感嗜血杆菌,所述方法通过向所述个体施用治疗有效量的本公开的抗TREM2抗体来进行。在一些实施方案中,所述抗TREM2抗体是激动剂抗体。在一些实施方案中,所述抗TREM2抗体是惰性抗体。在一些实施方案中,所述抗TREM2抗体是拮抗剂抗体。在一些实施方案中,所述方法还包括向所述个体施用特异性地结合到抑制性检查点分子的至少一种抗体,和/或另一种标准或研究性抗癌疗法。在一些实施方案中,特异性地结合到抑制性检查点分子的抗体与所述分离的抗体组合施用。在一些实施方案中,特异性地结合到抑制性检查点分子的至少一种抗体选自抗PD-L1抗体、抗CTLA-4抗体、抗PD-L2抗体、抗PD-1抗体、抗B7-H3抗体、抗B7-H4抗体、和抗HVEM抗体、抗B淋巴细胞和T淋巴细胞衰减因子(BTLA)抗体、抗杀伤细胞抑制性受体(KIR)抗体、抗GAL9抗体、抗TIM3抗体、抗A2AR抗体、抗LAG-3抗体、抗磷脂酰丝氨酸抗体、抗CD27抗体、以及其任何组合。在一些实施方案中,所述标准或研究性抗癌疗法是选自以下的一种或多种疗法:放射疗法、细胞毒性化 学 疗法 、靶 向疗法 、激素疗 法、伊 马替尼 曲妥珠 单抗
贝伐单抗 奥法木单抗 利妥昔单抗
冷冻疗法、消融、射频消融、过继细胞转移(ACT)、嵌合抗原受体
T细胞转移(CAR-T)、疫苗疗法、以及细胞因子疗法。在一些实施方案中,所述方法还包括向所述个体施用特异性地结合到抑制性细胞因子的至少一种抗体。在一些实施方案中,特异性地结合到抑制性细胞因子的至少一种抗体与所述分离的抗体组合施用。在一些实施方案中,特异性地结合到抑制性细胞因子的至少一种抗体选自抗CCL2抗体、抗CSF-1抗体、抗IL-
2抗体、以及其任何组合。在一些实施方案中,所述方法还包括向所述个体施用特异性地结合到刺激性检查点蛋白的至少一种激动性抗体。在一些实施方案中,特异性地结合到刺激性检查点蛋白的至少一种激动性抗体与所述分离的抗体组合施用。在一些实施方案中,特异性地结合到刺激性检查点蛋白的至少一种激动性抗体选自激动剂抗CD40抗体、激动剂抗OX40抗体、激动剂抗ICOS抗体、激动剂抗CD28抗体、激动剂抗CD137/4-1BB抗体、激动剂抗CD27抗体、激动剂抗糖皮质激素诱导的TNFR相关蛋白GITR抗体、以及其任何组合。在一些实施方案中,所述方法还包括向所述个体施用至少一种刺激性细胞因子。在一些实施方案中,所述至少一种刺激性细胞因子与所述分离的抗体组合施用。在一些实施方案中,所述至少一种刺激性细胞因子选自TNF-α、IL-10、IL-6、IL-8、CRP、细胞因子蛋白家族的TGF-β成员、IL-20家族成员、IL-33、LIF、OSM、CNTF、TGF-β、IL-11、IL-12、IL-17、IL-8、IL-23、IFN-α、IFN-β、IL-2、IL-18、GM-CSF、G-CSF、以及其任何组合。
[0473] 在一些实施方案中,本公开提供通过向患有阿尔茨海默氏病的个体施用治疗有效量的本公开的抗TREM2抗体来预防、降低风险、或治疗所述个体的方法。在一些实施方案中,所述抗TREM2抗体是激动剂抗体。在一些实施方案中,所述抗TREM2抗体增加一种或多种炎性介质的表达,所述一种或多种炎性介质诸如IL-1β、TNF-α、YM-1、CD86、CCL2、CCL3、CCL5、CCR2、CXCL10、Gata3、Rorc、以及其任何组合。在一些实施方案中,所述抗TREM2抗体降低一种或多种炎性介质的表达,所述一种或多种炎性介质诸如FLT1、OPN、CSF-1、CD11c、AXL、以及其任何组合。在一些实施方案中,所述抗TREM2抗体降低个体中(例如,个体的大脑中)的Aβ肽的水平。在一些实施方案中,所述抗TREM2抗体增加个体的大脑中的CD11b+小神经胶质细胞的数量。在一些实施方案中,所述抗TREM2抗体增加个体的记忆力。在一些实施方案中,所述抗TREM2抗体减少个体的认知缺陷。在一些实施方案中,所述抗TREM2抗体增加个体的运动协调。
[0474] 在一些实施方案中,本公开提供通过向有需要的个体施用治疗有效量的本公开的抗TREM2抗体来在所述个体中增加记忆力、减少认知缺陷、或两者的方法。在一些实施方案中,所述抗TREM2抗体是激动剂抗体。
[0475] 在一些实施方案中,本公开提供通过向有需要的个体施用治疗有效量的本公开的抗TREM2抗体来增加所述个体的运动协调的方法。在一些实施方案中,所述抗TREM2抗体是激动剂抗体。
[0476] 在一些实施方案中,本公开提供通过向有需要的个体施用治疗有效量的本公开的抗TREM2抗体来降低所述个体中的Aβ肽的水平的方法。在一些实施方案中,所述抗TREM2抗体是激动剂抗体。
[0477] 在一些实施方案中,本公开提供通过向有需要的个体施用治疗有效量的本公开的+抗TREM2抗体来增加所述个体中的CD11b 小神经胶质细胞的数量的方法。在一些实施方案中,所述抗TREM2抗体是激动剂抗体。
[0478] 在一些实施方案中,本公开提供通过向有需要的个体施用治疗有效量的本公开的抗TREM2抗体来增加所述个体中的FLT1、OPNCSF1、CD11c、以及AXL中一种或多种的水平的方法。在一些实施方案中,所述抗TREM2抗体是激动剂抗体。
[0479] 在一些实施方案中,例如与在未使用本公开的抗TREM2抗体治疗的个体的一种或多种细胞中的一种或多种炎性介质(诸如IL-1β、TNF-α、YM-1、CD86、CCL2、CCL3、CCL5、CCR2、CXCL10、Gata3、Rorc、以及其任何组合)的表达相比,所述抗TREM2抗体可使对应个体的一种或多种细胞中的一种或多种炎性介质(诸如IL-1β、TNF-α、YM-1、CD86、CCL2、CCL3、CCL5、CCR2、CXCL10、Gata3、Rorc、以及其任何组合)的表达增加至少10%、至少15%、至少20%、至少25%、至少30%、至少35%、至少40%、至少45%、至少50%、至少55%、至少60%、至少65%,至少70%,至少75%,至少80%、至少85%、至少90%、至少95%、至少100%、至少
110%、至少115%、至少120%、至少125%、至少130%、至少135%、至少140%、至少145%、至少150%、至少160%、至少170%、至少180%、至少190%、或至少200%。在其他实施方案中,例如与在未使用本公开的抗TREM2抗体治疗的个体的一种或多种细胞中的一种或多种炎性介质(诸如IL-1β、TNF-α、YM-1、CD86、CCL2、CCL3、CCL5、CCR2、CXCL10、Gata3、Rorc、以及其任何组合)的表达相比,所述抗TREM2抗体使对应个体的一种或多种细胞中的一种或多种炎性介质(诸如IL-1β、TNF-α、YM-1、CD86、CCL2、CCL3、CCL5、CCR2、CXCL10、Gata3、Rorc、以及其任何组合)的表达增加至少1.5倍、至少1.6倍、至少1.7倍、至少1.8倍、至少1.9倍、至少
2.0倍、至少2.1倍、至少2.15倍、至少2.2倍、至少2.25倍、至少2.3倍、至少2.35倍、至少2.4倍、至少2.45倍、至少2.5倍、至少2.55倍、至少3.0倍、至少3.5倍、至少4.0倍、至少4.5倍、至少5.0倍、至少5.5倍、至少6.0倍、至少6.5倍、至少7.0倍、至少7.5倍、至少8.0倍、至少8.5倍、至少9.0倍、至少9.5倍、或至少10倍。
[0480] 在一些实施方案中,例如与在未使用本公开的抗TREM2抗体治疗的个体的一种或多种细胞中的一种或多种炎性介质(诸如FLT1、OPN、CSF-1、CD11c、AXL、以及其任何组合)的表达相比,所述抗TREM2抗体可使对应个体的一种或多种细胞中的一种或多种炎性介质(诸如FLT1、OPN、CSF-1、CD11c、AXL、以及其任何组合)的表达降低至少10%、至少15%、至少20%、至少25%、至少30%、至少35%、至少40%、至少45%、至少50%、至少55%、至少60%、至少65%,至少70%,至少75%,至少80%、至少85%、至少90%、至少95%、至少100%、至少
110%、至少115%、至少120%、至少125%、至少130%、至少135%、至少140%、至少145%、至少150%、至少160%、至少170%、至少180%、至少190%、或至少200%。在其他实施方案中,例如与在未使用本公开的抗TREM2抗体治疗的个体的一种或多种细胞中的一种或多种炎性介质(诸如FLT1、OPN、CSF-1、CD11c、AXL、以及其任何组合)的表达相比,所述抗TREM2抗体可使对应个体的一种或多种细胞中的一种或多种炎性介质(诸如FLT1、OPN、CSF-1、CD11c、AXL、以及其任何组合)的表达降低至少1.5倍、至少1.6倍、至少1.7倍、至少1.8倍、至少1.9倍、至少2.0倍、至少2.1倍、至少2.15倍、至少2.2倍、至少2.25倍、至少2.3倍、至少
2.35倍、至少2.4倍、至少2.45倍、至少2.5倍、至少2.55倍、至少3.0倍、至少3.5倍、至少4.0倍、至少4.5倍、至少5.0倍、至少5.5倍、至少6.0倍、至少6.5倍、至少7.0倍、至少7.5倍、至少
8.0倍、至少8.5倍、至少9.0倍、至少9.5倍、或至少10倍。
[0481] 在一些实施方案中,例如与在未使用本公开的抗TREM2抗体治疗的个体的一种或多种细胞中的Aβ肽的水平相比,所述抗TREM2抗体可使对应个体的一种或多种细胞中的Aβ肽的水平降低至少10%、至少15%、至少20%、至少25%、至少30%、至少35%、至少40%、至少45%、至少50%、至少55%、至少60%、至少65%,至少70%,至少75%,至少80%、至少85%、至少90%、至少95%、至少100%、至少110%、至少115%、至少120%、至少125%、至少
130%、至少135%、至少140%、至少145%、至少150%、至少160%、至少170%、至少180%、至少190%、或至少200%。在其他实施方案中,例如与在未使用本公开的抗TREM2抗体治疗的个体的一种或多种细胞中的Aβ肽的水平相比,所述抗TREM2抗体使对应个体的一种或多种细胞中的Aβ肽的水平降低至少1.5倍、至少1.6倍、至少1.7倍、至少1.8倍、至少1.9倍、至少2.0倍、至少2.1倍、至少2.15倍、至少2.2倍、至少2.25倍、至少2.3倍、至少2.35倍、至少
2.4倍、至少2.45倍、至少2.5倍、至少2.55倍、至少3.0倍、至少3.5倍、至少4.0倍、至少4.5倍、至少5.0倍、至少5.5倍、至少6.0倍、至少6.5倍、至少7.0倍、至少7.5倍、至少8.0倍、至少
8.5倍、至少9.0倍、至少9.5倍、或至少10倍。
[0482] 在一些实施方案中,例如与在未使用本公开的抗TREM2抗体治疗的个体的记忆力相比,所述抗TREM2抗体可使对应个体的记忆力增加至少10%、至少15%、至少20%、至少25%、至少30%、至少35%、至少40%、至少45%、至少50%、至少55%、至少60%、至少65%,至少70%,至少75%,至少80%、至少85%、至少90%、至少95%、至少100%、至少110%、至少115%、至少120%、至少125%、至少130%、至少135%、至少140%、至少145%、至少
150%、至少160%、至少170%、至少180%、至少190%、或至少200%。在其他实施方案中,例如与在未使用本公开的抗TREM2抗体治疗的个体的记忆力相比,所述抗TREM2抗体可使对应个体的记忆力增加至少1.5倍、至少1.6倍、至少1.7倍、至少1.8倍、至少1.9倍、至少2.0倍、至少2.1倍、至少2.15倍、至少2.2倍、至少2.25倍、至少2.3倍、至少2.35倍、至少2.4倍、至少
2.45倍、至少2.5倍、至少2.55倍、至少3.0倍、至少3.5倍、至少4.0倍、至少4.5倍、至少5.0倍、至少5.5倍、至少6.0倍、至少6.5倍、至少7.0倍、至少7.5倍、至少8.0倍、至少8.5倍、至少
9.0倍、至少9.5倍、或至少10倍。
[0483] 在一些实施方案中,例如与在未使用本公开的抗TREM2抗体治疗的个体的认知缺陷相比,所述抗TREM2抗体可使对应个体的认知缺陷减少至少10%、至少15%、至少20%、至少25%、至少30%、至少35%、至少40%、至少45%、至少50%、至少55%、至少60%、至少65%,至少70%,至少75%,至少80%、至少85%、至少90%、至少95%、至少100%、至少
110%、至少115%、至少120%、至少125%、至少130%、至少135%、至少140%、至少145%、至少150%、至少160%、至少170%、至少180%、至少190%、或至少200%。在其他实施方案中,例如与在未使用本公开的抗TREM2抗体治疗的个体的认知缺陷相比,所述抗TREM2抗体可使对应个体的认知缺陷减少至少1.5倍、至少1.6倍、至少1.7倍、至少1.8倍、至少1.9倍、至少2.0倍、至少2.1倍、至少2.15倍、至少2.2倍、至少2.25倍、至少2.3倍、至少2.35倍、至少
2.4倍、至少2.45倍、至少2.5倍、至少2.55倍、至少3.0倍、至少3.5倍、至少4.0倍、至少4.5倍、至少5.0倍、至少5.5倍、至少6.0倍、至少6.5倍、至少7.0倍、至少7.5倍、至少8.0倍、至少
8.5倍、至少9.0倍、至少9.5倍、或至少10倍。
[0484] 在一些实施方案中,例如与在未使用本公开的抗TREM2抗体治疗的个体的运动协调相比,所述抗TREM2抗体可使对应个体的运动协调增加至少10%、至少15%、至少20%、至少25%、至少30%、至少35%、至少40%、至少45%、至少50%、至少55%、至少60%、至少65%,至少70%,至少75%,至少80%、至少85%、至少90%、至少95%、至少100%、至少
110%、至少115%、至少120%、至少125%、至少130%、至少135%、至少140%、至少145%、至少150%、至少160%、至少170%、至少180%、至少190%、或至少200%。在其他实施方案中,例如与在未使用本公开的抗TREM2抗体治疗的个体的运动协调相比,所述抗TREM2抗体可使对应个体的运动协调增加至少1.5倍、至少1.6倍、至少1.7倍、至少1.8倍、至少1.9倍、至少2.0倍、至少2.1倍、至少2.15倍、至少2.2倍、至少2.25倍、至少2.3倍、至少2.35倍、至少
2.4倍、至少2.45倍、至少2.5倍、至少2.55倍、至少3.0倍、至少3.5倍、至少4.0倍、至少4.5倍、至少5.0倍、至少5.5倍、至少6.0倍、至少6.5倍、至少7.0倍、至少7.5倍、至少8.0倍、至少
8.5倍、至少9.0倍、至少9.5倍、或至少10倍。
[0485] 本公开的其他方面涉及通过向有需要的个体施用治疗有效量的本公开的抗TREM2抗体来增强所述个体中的由一种或多种TREM2配体与TREM2蛋白的结合诱导的一种或多种TREM2活性的方法。本公开的其他方面涉及通过向有需要的个体施用治疗有效量的本公开的抗TREM2抗体来诱导所述个体中的一种或多种TREM2活性的方法。可使用用于测量TREM2活性的任何合适的方法,诸如本公开的体外基于细胞的测定或体内模型。示例性TREM2活性包括但不限于TREM2结合到DAP12;TREM2磷酸化;DAP12磷酸化;活化一种或多种酪氨酸激酶,任选地其中所述一种或多种酪氨酸激酶包括Syk激酶、ZAP70激酶、或两者;活化磷脂酰肌醇3-激酶(PI3K);活化蛋白激酶B(Akt);将磷脂酶C-γ(PLC-γ)募集到细胞质膜、活化PLC-γ、或两者;将TEC家族激酶dVav募集到细胞质膜;活化核因子-rB(NF-rB);抑制MAPK信号传导;用于T细胞活化的接头(LAT)、用于B细胞活化的接头(LAB)、或两者的磷酸化;活化IL-2诱导的酪氨酸激酶(Itk);瞬时活化之后抑制选自以下的一种或多种促炎介质:IFN-a4、IFN-b、IL-1β、TNF-α、IL-10、IL-6、IL-8、CRP、趋化因子蛋白家族的TGF-β成员、IL-20家族成员、IL-33、LIF、IFN-γ、OSM、CNTF、TGF-β、GM-CSF、IL-11、IL-12、IL-17、IL-18、IL-23、CXCL10、VEGF、CCL4、以及MCP-1,任选地其中所述瞬时活化之后抑制发生在选自以下的一种或多种细胞中:巨噬细胞、M1巨噬细胞、活化的M1巨噬细胞、M2巨噬细胞、树突细胞、单核细胞、破骨细胞、皮肤朗格汉斯细胞、库普弗细胞、以及小神经胶质细胞;细胞外信号调节激酶(ERK)的磷酸化;增加选自以下的一种或多种细胞中的C-C趋化因子受体7(CCR7)的表达:巨噬细胞、M1巨噬细胞、活化的M1巨噬细胞、M2巨噬细胞、树突细胞、单核细胞、破骨细胞、皮肤朗格汉斯细胞、库普弗细胞、小神经胶质细胞、M1小神经胶质细胞、活化的M1小神经胶质细胞、和M2小神经胶质细胞、以及其任何组合;诱导小神经胶质细胞向CCL19和CCL21表达细胞的趋化性;破坏的TREM2/DAP12依赖性基因表达的正常化;将Syk、ZAP70、或两者募集到DAP12/TREM2复合物;增加一种或多种TREM2依赖性基因的活性,任选地其中所述一种或多种TREM2依赖性基因包括活化T细胞的核因子(NFAT)转录因子;增加树突细胞、单核细胞、小神经胶质细胞、M1小神经胶质细胞、活化的M1小神经胶质细胞、和M2小神经胶质细胞、巨噬细胞、M1巨噬细胞、活化的M1巨噬细胞、M2巨噬细胞、或其任何组合的成熟;增加树突细胞、单核细胞、小神经胶质细胞、M1小神经胶质细胞、活化的M1小神经胶质细胞、和M2小神经胶质细胞、巨噬细胞、M1巨噬细胞、活化的M1巨噬细胞、M2巨噬细胞、或其任何组合诱导T细胞增殖的能力;骨髓衍生的树突细胞诱导抗原特异性T细胞增殖的增强的能力、正常化的能力、或两者;诱导破骨细胞产生、增加破骨细胞生成的速率、或两者;增加树突细胞、巨噬细胞、M1巨噬细胞、活化的M1巨噬细胞、M2巨噬细胞、单核细胞、破骨细胞、皮肤朗格汉斯细胞、库普弗细胞、小神经胶质细胞、M1小神经胶质细胞、活化的M1小神经胶质细胞、和M2小神经胶质细胞、或其任何组合的存活;增加树突细胞、巨噬细胞、M1巨噬细胞、活化的M1巨噬细胞、M2巨噬细胞、小神经胶质细胞、M1小神经胶质细胞、活化的M1小神经胶质细胞、和M2小神经胶质细胞、或其任何组合的功能;调控由树突细胞、巨噬细胞、M1巨噬细胞、活化的M1巨噬细胞、M2巨噬细胞、单核细胞、小神经胶质细胞、M1小神经胶质细胞、活化的M1小神经胶质细胞、和M2小神经胶质细胞、或其任何组合进行的吞噬作用;诱导选自以下的一种或多种类型的清除:凋亡神经元清除、神经组织碎片清除、非神经组织碎片清除、细菌或其他异物清除、致病性物质清除、肿瘤细胞清除、或其任何组合,任选地其中所述致病性物质选自淀粉样蛋白β或其片段、Tau、IAPP、α-突触核蛋白、TDP-43、FUS蛋白、朊病毒蛋白、PrPSc、亨廷顿蛋白、降血钙素、超氧化物歧化酶、共济失调蛋白、路易小体、心房利钠因子、胰岛淀粉样蛋白多肽、胰岛素、载脂蛋白AI、血清淀粉样蛋白A、medin、泌乳素、转甲状腺素蛋白、溶菌酶、β2微球蛋白、凝溶胶蛋白、角膜上皮蛋白、抑半胱氨酸蛋白酶蛋白、免疫球蛋白轻链AL、S-IBM蛋白、和重复序列相关非ATG(RAN)翻译产物(包括由甘氨酸-丙氨酸(GA)、甘氨酸-脯氨酸(GP)、甘氨酸-精氨酸(GR)、脯氨酸-丙氨酸(PA)、或脯氨酸-精氨酸(PR)构成的二肽重复序列(DPR肽)、反义GGCCCC(G2C4)重复序列扩增RNA);诱导对以下中的一种或多种的吞噬作用:凋亡神经元、神经组织碎片、非神经组织碎片、细菌、其他异物、致病性物质、肿瘤细胞、或其任何组合,任选地其中所述致病性物质选自淀粉样蛋白β或其片段、Tau、IAPP、α-突触核蛋白、TDP-43、FUS蛋白、朊病毒蛋白、PrPSc、亨廷顿蛋白、降血钙素、超氧化物歧化酶、共济失调蛋白、路易小体、心房利钠因子、胰岛淀粉样蛋白多肽、胰岛素、载脂蛋白AI、血清淀粉样蛋白A、medin、泌乳素、转甲状腺素蛋白、溶菌酶、β2微球蛋白、凝溶胶蛋白、角膜上皮蛋白、抑半胱氨酸蛋白酶蛋白、免疫球蛋白轻链AL、S-IBM蛋白、和重复序列相关非ATG(RAN)翻译产物(包括由甘氨酸-丙氨酸(GA)、甘氨酸-脯氨酸(GP)、甘氨酸-精氨酸(GR)、脯氨酸-丙氨酸(PA)、或脯氨酸-精氨酸(PR)构成的二肽重复序列(DPR肽)、反义GGCCCC(G2C4)重复序列扩增RNA);增加选自CD83、CD86、II类MHC、CD40、以及其任何组合的一种或多种刺激性分子的表达,任选地其中所述CD40在树突细胞、单核细胞、巨噬细胞、或其任何组合上表达,并且任选地其中所述树突细胞包括骨髓衍生的树突细胞;减少一种或多种炎性介质的分泌,任选地其中所述一种或多种炎性介质选自CD86、IFN-a4、IFN-b、IL-1β、TNF-α、IL-10、IL-6、IL-8、CRP、趋化因子蛋白家族TGF-β成员、IL-20家族成员、IL-33、LIF、IFN-γ、OSM、CNTF、TGF-β、GM-CSF、IL-11、IL-12、IL-17、IL-18、IL-23、CXCL10、VEGF、CCL4、和MCP-1、以及其任何组合;增加记忆力;以及减少认知缺陷。
[0486] 如本文所公开的,本公开的抗TREM2抗体可用于降低一种或多种细胞和/或细胞系上的TREM2的细胞水平,所述一种或多种细胞包括但不限于树突细胞、骨髓衍生的树突细胞、单核细胞、小神经胶质细胞、巨噬细胞、嗜中性粒细胞,NK细胞、破骨细胞、皮肤朗格汉斯细胞、以及库普弗细胞。在一些实施方案中,本公开提供通过向有需要的个体施用治疗有效量的本公开的抗TREM2抗体来降低所述个体中的一种或多种细胞上的TREM2的细胞水平的方法。在一些实施方案中,所述一种或多种细胞选自树突细胞、骨髓衍生的树突细胞、单核细胞、小神经胶质细胞、巨噬细胞、嗜中性粒细胞,NK细胞、破骨细胞、皮肤朗格汉斯细胞、和库普弗细胞、以及其任何组合。TREM2的细胞水平可是指但不限于TREM2的细胞表面水平、TREM2的细胞内水平、和TREM2的总水平。在一些实施方案中,降低TREM2的细胞水平包括降低TREM2的细胞表面水平。如本文所用,TREM2的细胞表面水平可通过本文所述的或本领域已知的任何体外基于细胞的测定或合适的体内模型来测量。在一些实施方案中,降低TREM2的细胞水平包括降低TREM2的细胞内水平。如本文所用,TREM2的细胞内水平可通过本文所述的或本领域已知的任何体外基于细胞的测定或合适的体内模型来测量。在一些实施方案中,降低TREM2的细胞水平包括降低TREM2的总水平。如本文所用,TREM2的总水平可通过本文所述的或本领域已知的任何体外基于细胞的测定或合适的体内模型来测量。在一些实施方案中,抗TREM2抗体诱导TREM2降解、TREM2裂解、TREM2内化、TREM2脱落、和/或TREM2表达的下调。在一些实施方案中,TREM2的细胞水平利用体外细胞测定在原代细胞(例如,树突细胞、骨髓衍生的树突细胞、单核细胞、小神经胶质细胞、以及巨噬细胞)上或在细胞系上测量。
[0487] 如本文所公开的,本公开的抗TREM2抗体还可用于增加记忆力和/或减少认知缺陷。在一些实施方案中,本公开提供通过向有需要的个体施用治疗有效量的本公开的抗TREM2抗体来在所述个体中增加记忆力和/或减少认知缺陷的方法。
[0488] 在某些实施方案中,所述个体具有杂合TREM2变体等位基因,所述等位基因具有在编码人TREM2蛋白(SEQ ID NO:1)的氨基酸残基14的核酸序列中的谷氨酸向终止密码子的取代。在某些实施方案中,所述个体具有杂合TREM2变体等位基因,所述等位基因具有在编码人TREM2蛋白(SEQ ID NO:1)的氨基酸残基33的核酸序列中的谷氨酰胺向终止密码子的取代。在某些实施方案中,所述个体具有杂合TREM2变体等位基因,所述等位基因具有在编码人TREM2蛋白(SEQ ID NO:1)的氨基酸残基44的核酸序列中的色氨酸向终止密码子的取代。在某些实施方案中,所述个体具有杂合TREM2变体等位基因,所述等位基因具有在人TREM2蛋白(SEQ ID NO:1)的氨基酸残基47处的精氨酸向组氨酸氨基酸的取代。在某些实施方案中,所述个体具有杂合TREM2变体等位基因,所述等位基因具有在编码人TREM2蛋白(SEQ ID NO:1)的氨基酸残基78的核酸序列中的色氨酸向终止密码子的取代。在某些实施方案中,所述个体具有杂合TREM2变体等位基因,所述等位基因具有在对应于人TREM2蛋白(SEQ ID NO:1)的氨基酸残基126的氨基酸处的缬氨酸向甘氨酸氨基酸的取代。在某些实施方案中,所述个体具有杂合TREM2变体等位基因,所述等位基因具有在对应于人TREM2蛋白(SEQ ID NO:1)的氨基酸残基134的氨基酸处的天冬氨酸向甘氨酸氨基酸的取代。在某些实施方案中,所述个体具有杂合TREM2变体等位基因,所述等位基因具有在对应于人TREM2蛋白(SEQ ID NO:1)的氨基酸残基186的氨基酸处的赖氨酸向天冬酰胺氨基酸的取代。
[0489] 在一些实施方案中,所述个体具有杂合TREM2变体等位基因,所述等位基因具有在对应于编码SEQ ID NO:1的核酸序列的核苷酸残基G313的核苷酸处的鸟嘌呤核苷酸缺失;在对应于编码SEQ ID NO:1的核酸序列的核苷酸残基G267的核苷酸处的鸟嘌呤核苷酸缺失;在对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基Thr66的氨基酸处的苏氨酸向蛋氨酸氨基酸的取代;和/或在对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基Ser116的氨基酸处的丝氨酸向半胱氨酸氨基酸的取代。
[0490] 在一些实施方案中,所述个体具有杂合DAP12变体等位基因,所述等位基因具有在对应于SEQ ID NO:887的氨基酸残基Met1的氨基酸处的蛋氨酸向苏氨酸的取代、在对应于SEQ ID NO:887的氨基酸残基Gly49的氨基酸处的甘氨酸向精氨酸氨基酸的取代、编码SEQ ID NO:887的核酸序列的外显子1-4内的缺失、在编码SEQ ID NO:887的核酸序列的外显子3处的14个氨基酸残基的插入、和/或在对应于编码SEQ ID NO:887的核酸序列的核苷酸残基G141的核苷酸处的鸟嘌呤核苷酸缺失。
[0491] 如本文所公开的,本公开的抗TREM2抗体还可用于诱导和/或促进先天免疫细胞存活。在一些实施方案中,本公开提供通过向有需要的个体施用治疗有效量的本公开的激动剂抗TREM2抗体来在所述个体中诱导和/或促进先天免疫细胞存活的方法。
[0492] 如本文所公开的,本公开的抗TREM2抗体还可用于诸如在损伤之后诱导和/或促进伤口愈合。在一些实施方案中,所述伤口愈合可以是损伤之后的结肠伤口修复。在一些实施方案中,本公开提供通过向有需要的个体施用治疗有效量的本公开的激动剂抗TREM2抗体来在所述个体中诱导或促进伤口愈合的方法。
[0493] 在一些实施方案中,本公开的方法可涉及抗TREM2抗体或双特异性抗体与TLR拮抗剂或与中和TLR激动剂(例如,中和细胞因子或白介素抗体)的药剂的共施用。
[0494] 在一些实施方案中,本公开的方法可涉及嵌合构建体(包括本公开的抗TREM2抗体)与TREM2配体(诸如HSP60)结合的施用。
[0495] 在一些实施方案中,本公开的抗TREM2抗体不抑制一种或多种先天免疫细胞的生长。在一些实施方案中,本公开的抗TREM2抗体以小于50nM、小于45nM、小于40nM、小于35nM、小于30nM、小于25nM、小于20nM、小于15nM、小于10nM、小于9nM、小于8nM、小于7nM、小于6nM、小于5nM、小于4nM、小于3nM、小于2nM、或小于1nM的KD结合到一种或多种原代免疫细胞。在一些实施方案中,本公开的抗TREM2抗体在大脑、或脑脊髓液(CSF)、或两者中积累至在血液中1%或更多、2%或更多、3%或更多、4%或更多、5%或更多、6%或更多、7%或更多、8%或更多、9%或更多、10%或更多的抗体浓度的程度。
[0496] 在一些实施方案中,受试者或个体是哺乳动物。哺乳动物包括但不限于驯化动物(例如,牛、羊、猫、狗、以及马)、灵长类动物(例如,人和非人灵长类动物,诸如猴)、兔、以及啮齿动物(例如,小鼠和大鼠)。在一些实施方案中,所述受试者或个体是人。
[0497] 痴呆
[0498] 痴呆是一种非特异性综合症(即,一组征象和症状),表现为先前未受损害的个体的总体认知能力严重丧失,超出可能由正常年龄预期的程度。痴呆可以是由独特的全脑损伤引起的静态痴呆。或者,痴呆可以是进行性的,由于身体损伤或疾病而引起长期减退。尽管痴呆在老年人群中较为常见,但其也可以在65岁前发生。痴呆所影响的认知区域包括但不限于,记忆、注意力持续时间、语言及解决问题的能力。一般来说,在个体被诊断患有痴呆之前,症状必须存在至少六个月。
[0499] 痴呆的示例性形式包括但不限于,额颞叶痴呆、阿尔茨海默氏病、血管性痴呆、语义性痴呆及路易体痴呆。
[0500] 在一些实施方案中,施用本公开的抗TREM2抗体可预防、降低风险、和/或治疗痴呆。在一些实施方案中,施用抗TREM2抗体可在患有痴呆的个体中诱导一种或多种TREM2活性(例如,DAP12磷酸化、PI3K活化、一种或多种抗炎介质的增加的表达、或一种或多种促炎介质的减少的表达)。
[0501] 额颞叶痴呆
[0502] 额颞叶痴呆(FTD)是由脑额叶进行性恶化引起的一种病况。随时间推移,退化可能发展至颞叶。FTD的发病率仅次于阿尔茨海默氏病(AD),在早老性痴呆病例中占20%。FTD的临床特征包括记忆减退、行为异常、性格改变及语言障碍(Cruts,M.和Van Broeckhoven,C.,Trends Genet.24:186-194(2008);Neary,D.等人,Neurology51:1546-1554(1998);Ratnavalli,E.,Brayne,C.,Dawson,K.&Hodges,J.R.,Neurology 58:1615-1621(2002))。
[0503] 相当大一部分的FTD病例是以常染色体显性方式遗传,但即使是在一个家族中,症状也可能从伴随行为障碍的FTD到原发性进行性失语,乃至皮质基底神经节变性。与大多数神经退化性疾病相同,FTD可以通过患病脑中特定蛋白质聚集体的病理性存在为特征。在历史上,最初关于FTD的说明认识到在神经元纤维缠结或皮克体(Pick body)中存在过度磷酸化的Tau蛋白的神经元内积累。在若干家族中鉴别出Tau蛋白编码基因的突变支持了微管相关蛋白Tau的致病作用(Hutton,M.等人,Nature 393:702-705(1998))。然而,大部分的FTD脑显示无过度磷酸化的Tau积累,而是与泛素(Ub)和TAR DNA结合蛋白(TDP43)展现免疫反应性(Neumann,M.等人,Arch.Neurol.64:1388-1394(2007))。已证明,包含Ub的FTD病例(FTD-U)中大部分携带颗粒蛋白前体基因的突变。
[0504] 在一些实施方案中,施用本公开的抗TREM2抗体可预防、降低风险、和/或治疗FTD。在一些实施方案中,施用抗TREM2抗体可在患有FTD的个体中诱导一种或多种TREM2活性(例如,DAP12磷酸化、PI3K活化、一种或多种抗炎介质的增加的表达、或一种或多种促炎介质的减少的表达)。
[0505] 阿尔茨海默氏病
[0506] 阿尔茨海默氏病(AD)是痴呆最常见的形式。该疾病无法治愈,随着其进展而恶化,并且最终导致死亡。最常在年龄超过65岁的人群中诊断出AD。不过,发病率不太高的早发型阿尔茨海默氏病发病要早得多。
[0507] 阿尔茨海默氏病的常见症状包括行为症状,如难以记住近期事件;认知症状、困惑、易怒及攻击性、情绪波动、语言障碍及长期记忆丧失。随着疾病发展,身体功能丧失,最终导致死亡。阿尔茨海默氏病在变得完全明显之前发展了未知并且不同量的时间,而且该疾病可以在未诊断情况下进展数年。
[0508] 在一些实施方案中,施用本公开的抗TREM2抗体可预防、降低风险、和/或治疗阿尔茨海默氏病。在一些实施方案中,施用抗TREM2抗体可在患有阿尔茨海默氏病的个体中诱导一种或多种TREM2活性(例如,DAP12磷酸化、PI3K活化、一种或多种抗炎介质的增加的表达、或一种或多种促炎介质的减少的表达)。
[0509] Nasu-Hakola病
[0510] Nasu-Hakola病(NHD),又称为多囊性脂膜样骨发育不良伴硬化性脑白质病(PLOSL),是由下肢和上肢的多囊性骨病变引起的伴随复发性骨折的进行性早老型痴呆为特征的一种罕见的遗传性脑白质营养不良。NHD的病程一般分为四个阶段:潜伏阶段、骨阶段、早期神经病阶段及晚期神经病阶段。在儿童期(潜伏期)正常发育之后,NHD在青春期或青年时期开始表现(典型年龄在20-30岁发作),出现手、腕、踝及脚部疼痛。接着,患者由于肢体骨骼中的多囊性骨病变和骨质疏松病变而开始经历复发性骨折(骨阶段)。在三十或四十岁期间(早期神经病阶段),患者出现额叶综合症特有的明显性格改变(例如精神欢快、注意力不集中、丧失判断力及社交退缩)。典型地,患者还经历进行性记忆障碍。另外,常常观察到癫痫发作。最后(晚期神经病阶段),患者发展成明显痴呆,不能说话和移动,通常在50岁时死亡。
[0511] 在一些实施方案中,施用本公开的抗TREM2抗体可预防、降低风险、和/或治疗Nasu-Hakola病(NHD)。在一些实施方案中,施用抗TREM2抗体可在患有NHD的个体中诱导一种或多种TREM2活性(例如,DAP12磷酸化、PI3K活化、一种或多种抗炎介质的增加的表达、或一种或多种促炎介质的减少的表达)。
[0512] 帕金森氏病
[0513] 帕金森氏病,可以称为特发性或原发性帕金森病、运动功能减退强直综合症(HRS)或震颤性麻痹,是影响运动系统控制的一种神经退化性脑病。脑中产多巴胺细胞的进行性死亡引起帕金森氏病的主要症状。帕金森氏病最常诊断于超过50岁的人群。帕金森氏病在大多数人中是特发性的(成因未知)。不过,遗传因素在该疾病中也起到作用。
[0514] 帕金森氏病的症状包括但不限于,手、臂、腿、颚及面部颤动;肢体和躯干肌肉僵硬;行动缓慢(运动徐缓);姿势不稳;难以步行;神经精神问题;言语或行为改变;抑郁;焦虑;疼痛;精神病;痴呆;幻觉;及睡眠问题。
[0515] 在一些实施方案中,施用本公开的抗TREM2抗体可预防、降低风险、和/或治疗帕金森氏病。在一些实施方案中,施用抗TREM2抗体可在患有帕金森氏病的个体中诱导一种或多种TREM2活性(例如,DAP12磷酸化、PI3K活化、一种或多种抗炎介质的增加的表达、或一种或多种促炎介质的减少的表达)。
[0516] 肌萎缩性侧索硬化症
[0517] 如本文所使用,肌萎缩性侧索硬化症(ALS),或运动神经元疾病,或Lou Gehrig病可互换使用,并且指由不同病因引起的以迅速进行性虚弱、肌肉萎缩和肌束颤动、肌痉挛、讲话困难(构音困难)、难以吞咽(吞咽困难)及难以呼吸(呼吸困难)为特征的衰弱性疾病。
[0518] 已证明,颗粒蛋白前体在ALS中起作用(Schymick,JC等人(2007)J  Neurol Neurosurg Psychiatry.;78:754-6)而且也保护由致ALS蛋白,如TDP-43引起的损伤
(Laird,AS等人(2010).PLoS ONE 5:e13368)。另外,经证实,在脊髓损伤后,NGF前体诱导p75介导的少突胶质细胞和皮质脊髓神经元死亡(Beatty等人,Neuron(2002),36,第375-
386页;Giehl等人,Proc.Natl.Acad.Sci USA(2004),101,第6226-30页)。
[0519] 在一些实施方案中,施用本公开的抗TREM2抗体可预防、降低风险、和/或治疗ALS。在一些实施方案中,施用抗TREM2抗体可在患有ALS的个体中诱导一种或多种TREM2活性(例如,DAP12磷酸化、PI3K活化、一种或多种抗炎介质的增加的表达、或一种或多种促炎介质的减少的表达)。
[0520] 亨廷顿氏病
[0521] 亨廷顿氏病(HD)是由亨廷顿基因(HTT)的常染色体显性突变引起的一种遗传性神经退化性疾病。亨廷顿基因内细胞因子-腺嘌呤-鸟嘌呤(CAG)三联体重复序列扩增导致产生由该基因编码的亨廷顿蛋白(Htt)的突变体形式。这一突变亨廷顿蛋白(mHtt)有毒并且导致神经元死亡。亨廷顿氏病的症状最常见于介于35岁与44岁之间的年龄,不过其也可以见于任何年龄。
[0522] 亨廷顿氏病的症状包括但不限于,运动控制问题、急动、随意运动(舞蹈病)、异常眼动、平衡障碍、癫痫发作、咀嚼困难、吞咽困难、认知问题、讲话改变、记忆障碍、思考困难、失眠、疲劳、痴呆、性格改变、抑郁、焦虑及强迫行为。
[0523] 在一些实施方案中,施用本公开的抗TREM2抗体可预防、降低风险、和/或治疗亨廷顿氏病(HD)。在一些实施方案中,施用抗TREM2抗体可在患有HD的个体中诱导一种或多种TREM2活性(例如,DAP12磷酸化、PI3K活化、一种或多种抗炎介质的增加的表达、或一种或多种促炎介质的减少的表达)。
[0524] Tau蛋白病
[0525] Tau蛋白病,或Tau病是由微管相关蛋白tau在脑内聚集引起的一类神经退化性疾病。阿尔茨海默氏病(AD)是最熟知的tau蛋白病,并且涉及呈不可溶神经原纤维缠结(NFT)形式的神经元内的tau蛋白的积累。其他tau蛋白病和病症包括进行性核上性麻痹、拳击员痴呆(慢性创伤性脑病)、与染色体17连锁的额颞叶痴呆和帕金森神经机能障碍、Lytico-Bodig病(关岛帕金森-痴呆复合征)、缠结为主的痴呆、神经节神经胶质瘤和神经节细胞瘤、脑膜血管瘤病、亚急性硬化性全脑炎、铅中毒脑病、结节性硬化症、哈-斯二氏病(Hallervorden-Spatz disease)、脂褐质沉积症、皮克氏病(Pick’s disease)、皮层基底变性、嗜银颗粒病(AGD)、亨廷顿氏病、额颞叶痴呆、以及额颞叶变性。
[0526] 在一些实施方案中,施用本公开的抗TREM2抗体可预防、降低风险、和/或治疗tau蛋白病。在一些实施方案中,施用抗TREM2抗体可在患有tau蛋白病的个体中诱导一种或多种TREM2活性(例如,DAP12磷酸化、PI3K活化、一种或多种抗炎介质的增加的表达、或一种或多种促炎介质的减少的表达)。
[0527] 多发性硬化症
[0528] 多发性硬化(MS)又可以称为播散性硬化或播散性脑脊髓炎。MS是脑和脊髓轴突周围的脂肪髓鞘受损,导致脱髓鞘和瘢痕形成以及众多征象和症状的一种炎症性疾病。MS影响脑和脊髓中的神经细胞彼此有效通信的能力。神经细胞通过将电信号(称为动作电位)沿隔离物质(称为髓磷脂)内所含的纤维(称为轴突)向下传送来进行通信。就MS来说,身体自身的免疫系统攻击并损害髓磷脂。当髓磷脂丧失时,轴突不再有效地传导信号。MS通常在青少年时发作,并且较常见于女性。
[0529] MS的症状包括但不限于,感觉改变,如敏感性或麻刺感丧失;刺痛感或麻木,如感觉迟钝和感觉异常;肌肉软弱;阵挛;肌肉痉挛;移动困难;协调和平衡困难,如共济失调;讲话困难,如构音困难,或难以吞咽,如吞咽困难;视力问题,如眼球震颤、视神经炎,包括光幻视和复视;疲劳;急性或慢性疼痛;及排尿和排便困难;不同程度的认知障碍;抑郁或情绪不稳定的情感症状;Uhthoff现象,这是由暴露于高于常温的环境温度引起的现存症状的恶化;及莱尔米特征(Lhermitte’s sign),这是在曲颈时蔓延至背部的一种触电感。
[0530] 在一些实施方案中,施用本公开的抗TREM2抗体可预防、降低风险、和/或治疗多发性硬化症。在一些实施方案中,施用抗TREM2抗体可在患有多发性硬化症的个体中诱导一种或多种TREM2活性(例如,DAP12磷酸化、PI3K活化、一种或多种抗炎介质的增加的表达、以及一种或多种促炎介质的减少的表达)。
[0531] 癌症
[0532] 本公开的再另外的方面提供用于预防、降低风险、或治疗患有癌症的个体的方法,其包括向所述个体施用治疗有效量的本公开的分离的抗TREM2抗体。在这些方法中可使用本公开的分离的抗体中的任一种。在一些实施方案中,所述分离的抗体是本公开的激动剂抗体。在其他实施方案中,所述分离的抗体是本公开的拮抗剂抗体。
[0533] 如上所述,已知肿瘤微环境含有异质免疫浸润物,其包括T淋巴细胞、巨噬细胞和髓样/粒细胞谱系的细胞。具体地,肿瘤中M2巨噬细胞的存在与预后不良相关联。减少肿瘤中的这些细胞的数量的疗法(诸如CSF-1R阻断剂)在临床前模型和早期阶段临床研究中显示有益作用。已显示TREM2与CSF-1协同作用来促进体外巨噬细胞的存活,并且与其他类型的吞噬细胞相比,此作用在M2型巨噬细胞中是特别突出的。开创性临床前研究也已显示靶向肿瘤相关巨噬细胞的药物(例如,CSF-1/CSF-1R阻断抗体)与靶向T细胞的检查点阻断抗体之间的协同效应,这指示操纵两种细胞类型在单个疗法有效性不佳的肿瘤模型中显示效力(Zhu Y;Cancer Res.2014年9月15日;74(18):5057-69)。因此,不希望受到理论的束缚,认为阻断肿瘤相关巨噬细胞中的TREM2信号传导可抑制肿瘤微环境中的免疫应答的抑制,从而引起治疗性抗肿瘤免疫应答。
[0534] 由于TREM2与CSF-1之间的协同效应以及靶向肿瘤相关巨噬细胞与靶向T细胞之间的协同效应,在一些实施方案中,用于预防、降低风险、或治疗患有癌症的个体的方法还包括向所述个体施用特异性地结合到抑制性检查点分子的至少一种抗体。特异性地结合到抑制性检查点分子的抗体的实例包括但不限于抗PD-L1抗体、抗CTLA-4抗体、抗PD-L2抗体、抗PD-1抗体、抗B7-H3抗体、抗B7-H4抗体、和抗HVEM抗体、抗BTLA抗体、抗GAL9抗体、抗TIM3抗体、抗A2AR抗体、抗LAG-3抗体、抗磷脂酰丝氨酸抗体、以及其任何组合。在一些实施方案中,特异性地结合到抑制性检查点分子的至少一种抗体与本公开的拮抗剂抗TREM2抗体组合施用。
[0535] 在一些实施方案中,待通过本公开的方法预防或治疗的癌症包括但不限于鳞状细胞癌(例如,上皮鳞状细胞癌)、肺癌(包括小细胞肺癌、非小细胞肺癌、肺腺癌和肺鳞状癌)、腹膜癌、肝细胞癌、胃癌或胃癌(包括胃肠癌和胃肠道基质癌)、胰腺癌、胶质母细胞瘤、宫颈癌、卵巢癌、肝癌、膀胱癌、尿道癌、肝细胞癌、乳腺癌、结肠癌、直肠癌、结肠直肠癌、子宫内膜或子宫癌、唾液腺癌、肾脏癌症或肾癌、前列腺癌、外阴癌、甲状腺癌、肝癌、肛门癌、阴茎癌、黑素瘤、表面散布的黑素瘤、恶性痣性黑素瘤、肢端雀斑样痣性黑素瘤、结节性黑素瘤、多发性骨髓瘤和B细胞淋巴瘤;慢性淋巴细胞白血病(CLL);急性成淋巴细胞白血病(ALL);多毛细胞白血病;慢性成髓细胞性白血病;以及移植后淋巴组织增生性病症(PTLD)、以及与瘢痣病相关联的异常血管增生、水肿(诸如与大脑肿瘤相关联的水肿)、梅格斯氏综合征(Meigs'syndrome)、脑癌以及头颈癌、以及相关联的转移瘤。在一些实施方案中,所述癌症是结肠直肠癌。在一些实施方案中,所述癌症选自非小细胞肺癌、胶质母细胞瘤、神经母细胞瘤、肾细胞癌、膀胱癌、卵巢癌、黑素瘤、乳腺癌、胃癌、以及肝细胞癌。在一些实施方案中,所述癌症是三阴性乳腺癌。在一些实施方案中,所述癌症可以是早期癌症或晚期癌症。在一些实施方案中,所述癌症可以是原发性肿瘤。在一些实施方案中,所述癌症可以是衍生自以上癌症类型中的任一种的在第二位点处的转移性肿瘤。
[0536] 在一些实施方案中,本公开的抗TREM2抗体可用于预防、降低风险、或治疗癌症,所述癌症包括但不限于膀胱癌、乳腺癌、结肠和直肠癌、子宫内膜癌、肾癌、肾细胞癌、肾盂癌、白血病、肺癌、黑素瘤、非霍奇金氏淋巴瘤、胰腺癌、前列腺癌、卵巢癌、纤维肉瘤、以及甲状腺癌。
[0537] 在一些实施方案中,本公开提供通过向患有癌症的个体施用治疗有效量的本公开的抗TREM2抗体来预防、降低风险、或治疗所述个体的方法。
[0538] 在一些实施方案中,所述方法还包括向所述个体施用特异性地结合到抑制性检查点分子的至少一种抗体和/或另一种标准或研究性抗癌疗法。在一些实施方案中,特异性地结合到抑制性检查点分子的至少一种抗体与所述分离的抗体组合施用。在一些实施方案中,特异性地结合到抑制性检查点分子的至少一种抗体选自抗PD-L1抗体、抗CTLA-4抗体、抗PD-L2抗体、抗PD-1抗体、抗B7-H3抗体、抗B7-H4抗体、和抗HVEM抗体、抗B淋巴细胞和T淋巴细胞衰减因子(BTLA)抗体、抗杀伤细胞抑制性受体(KIR)抗体、抗GAL9抗体、抗TIM3抗体、抗A2AR抗体、抗LAG-3抗体、抗磷脂酰丝氨酸抗体、抗CD27抗体、以及其任何组合。在一些实施方案中,所述标准或研究性抗癌疗法是选自以下的一种或多种疗法:放射疗法、细胞毒性化学疗法、靶向疗法、伊马替尼 曲妥珠单抗 过继细胞转移(ACT)、嵌合抗原受体T细胞转移(CAR-T)、疫苗疗法、激素疗法、贝伐单抗 奥法
木单抗 利妥昔单抗 冷冻疗法、消
融、射频消融、以及细胞因子疗法。
[0539] 在一些实施方案中,所述方法还包括向所述个体施用特异性地结合到抑制性细胞因子的至少一种抗体。在一些实施方案中,特异性地结合到抑制性细胞因子的至少一种抗体与所述分离的抗体组合施用。在一些实施方案中,特异性地结合到抑制性细胞因子的至少一种抗体选自抗CCL2抗体、抗CSF-1抗体、抗IL-2抗体、以及其任何组合。
[0540] 在一些实施方案中,所述方法还包括向所述个体施用特异性地结合到刺激性检查点蛋白的至少一种激动性抗体。在一些实施方案中,特异性地结合到刺激性检查点蛋白的至少一种激动性抗体与所述分离的抗体组合施用。在一些实施方案中,特异性地结合到刺激性检查点蛋白的至少一种激动性抗体选自激动剂抗CD40抗体、激动剂抗OX40抗体、激动剂抗ICOS抗体、激动剂抗CD28抗体、激动剂抗CD137/4-1BB抗体、激动剂抗CD27抗体、激动剂抗糖皮质激素诱导的TNFR相关蛋白GITR抗体、以及其任何组合。
[0541] 在一些实施方案中,所述方法还包括向所述个体施用至少一种刺激性细胞因子。在一些实施方案中,所述至少一种刺激性细胞因子与所述分离的抗体组合施用。在一些实施方案中,所述至少一种刺激性细胞因子选自TNF-α、IL-1α、IL-1β、IL-10、IL-6、IL-8、CRP、细胞因子蛋白家族的TGF-β成员、IL-20家族成员、IL-33、LIF、IFN-γ、OSM、CNTF、TGF-β、IL-
11、IL-12、IL-17、IL-8、CRP、IFN-α、IFN-β、IL-2、IL-18、IL-23、CXCL10、CCL4、MCP-1、VEGF、GM-CSF、G-CSF、以及其任何组合。
[0542] 试剂盒/制品
[0543] 本公开还提供含有本公开的分离的抗体(例如,本文所述的抗TREM2或抗DAP12抗体)或其功能性片段的试剂盒。本公开的试剂盒可包括包含本公开的纯化抗体的一种或多种容器。在一些实施方案中,所述试剂盒还包括用于根据本公开的方法使用的说明书。在一些实施方案中,这些说明书包括根据本公开的任何方法施用本公开的分离的抗体(例如,本文所述的抗TREM2或抗DAP12抗体)以防止、降低风险、或治疗患有选自以下的疾病、病症、或损伤的个体的描述:痴呆、额颞叶痴呆、阿尔茨海默氏病、Nasu-Hakola病、多发性硬化症、以及癌症。
[0544] 在一些实施方案中,所述说明书包括如何检测例如个体中、组织样品中、或细胞中的TREM2和/或DAP12的描述。所述试剂盒还可包括基于鉴别个体是否患有疾病和疾病阶段来选择适于治疗的个体的描述。
[0545] 在一些实施方案中,所述试剂盒还可包括本公开的另一种抗体(例如,特异性地结合到抑制性检查点分子的至少一种抗体、特异性地结合到抑制性细胞因子的至少一种抗体、和/或特异性地结合到刺激性检查点蛋白的至少一种激动性抗体)和/或至少一种刺激性细胞因子。在一些实施方案中,所述试剂盒还可包括用于根据本公开的任何方法使用与本公开的分离的抗体(例如,本文所述的抗TREM2拮抗剂抗体)组合的抗体和/或刺激性细胞因子的说明书、用于根据本公开的任何方法使用与抗体和/或刺激性细胞因子组合的本公开的分离的抗体的说明书、或用于根据本公开的任何方法使用本公开的分离的抗体和抗体和/或刺激性细胞因子的说明书。
[0546] 所述说明书通常包括关于意图治疗的剂量、给药时程和施用途径的信息。所述容器可以是单位剂量、整批包装(例如,多剂量包装)或亚单位剂量。提供在本公开的试剂盒中的说明书通常是在标签或包装插页上的书面说明书(例如,包括在试剂盒中的纸张),但是机器可读的说明书(例如载于磁盘或存储光盘上的说明书)也是可接受的。
[0547] 标签或包装说明书指示组合物用于治疗例如本公开的疾病。可以提供用于实践本文所描述的任何方法的说明书。
[0548] 本公开的试剂盒呈适合包装形式。适合的包装包括但不限于,小瓶、瓶、广口瓶、柔性包装(例如密封Mylar或塑料袋)等。还涵盖与特定装置,如吸入器、经鼻施用装置(例如喷雾器)或输注装置(如微型)结合使用的包装。试剂盒可以具有无菌进入口(例如,该容器可以是一种静脉内溶液袋或具有皮下注射针可刺穿的塞子的小瓶)。该容器也可以具有无菌进入口(例如,该容器可以是一种静脉内溶液袋或具有皮下注射针可刺穿的塞子的小瓶)。组合物中的至少一种活性剂是本公开的分离的抗体(例如本文所描述的抗TREM2或抗DAP12抗体)。该容器可以另外包含第二药物活性剂。
[0549] 试剂盒可任选地提供额外的组分,诸如缓冲剂和解释性信息。通常,所述试剂盒包括容器和在容器上或与容器相关联的标签或包装插页。
[0550] 诊断性用途
[0551] 本公开的分离的抗体(例如,本文所述的抗TREM2或抗DAP12抗体)也具有诊断性用途。因此,本公开提供使用本公开的抗体或其功能性片段以用于诊断性目的(诸如检测个体中或来源于个体的组织样品中的TREM2或DAP12)的方法。
[0552] 在一些实施方案中,所述个体是人。在一些实施方案中,所述个体是患有癌症或处于发展癌症的风险的人患者。在一些实施方案中,所述诊断性方法涉及检测生物样品(诸如活组织检查样本、组织、或细胞)中的TREM2或DAP12。本公开的分离的抗体(例如,本文所述的抗TREM2或抗DAP12抗体)与生物样品接触,并且检测抗原结合的抗体。例如,肿瘤样品(例如,活组织检查样本)可使用本文所述的抗TREM2或抗DAP12抗体染色以便检测和/或定量肿瘤相关巨噬细胞(例如,M2型巨噬细胞)。。所述检测方法可涉及抗原结合的抗体的定量。生物样品中的抗体检测可使用本领域已知的任何方法来发生,所述方法包括免疫荧光显微镜法、免疫细胞化学、免疫组织化学、ELISA、FACS分析、免疫沉淀、或微电子发射断层成像。在某些实施方案中,抗体例如使用18F进行放射标记并且随后利用微正电子发射断层成像分析进行检测。抗体结合也可通过无创技术在患者中进行定量,所述无创技术诸如正电子发射断层成像(PET)、X射线计算机断层成像、单光子发射计算机断层成像(SPECT)、计算机断层成像(CT)、以及计算机轴向断层成像(CAT)。
[0553] 在其他实施方案中,本公开的分离的抗体(例如,本文所述的抗TREM2或抗DAP12抗体)可用于检测和/或定量例如取自临床前疾病模型(例如,非人疾病模型)的大脑样本中的小神经胶质细胞。由此,本公开的分离的抗体(例如,本文所述的抗TREM2或抗DAP12抗体)可用于评价与对照相比,针对神经系统疾病或损伤(诸如痴呆、额颞叶痴呆、阿尔茨海默氏病、Nasu-Hakola病、或多发性硬化症)的模型中在治疗之后的治疗性应答。
[0554] 通过参照以下实施例将更全面地理解本公开。然而,不应将这些实施例解释为限制本发明的范围。本公开通篇的所有引用内容都特此以引用的方式明确地并入。实施例
[0555] 实施例1:激动剂抗TREM2抗体的产生、鉴别和表征
[0556] 引言
[0557] 人TREM2蛋白的氨基酸序列在以下SEQ ID NO:1中阐述。人TREM2包含位于SEQ ID NO:1的氨基残基1-18处的信号肽。人TREM2包含位于SEQ ID NO:1的氨基残基29-112处的细胞外免疫球蛋白样可变型(IgV)结构域;位于SEQ ID NO:1的氨基残基113-174处的额外的细胞外序列;位于SEQ ID NO:1的氨基残基175-195处的跨膜结构域;以及位于SEQ ID NO:1的氨基残基196-230处的细胞内结构域。
[0558] TREM2氨基酸序列(SEQ ID NO:1):
[0559]
[0560] 人TREM2的已知特征是跨膜结构域包含可与DAP12中的天冬氨酸相互作用的赖氨酸(aa186),所述DAP12是转导来自TREM2、TREM1、和其他相关IgV家族成员的信号传导的关键衔接蛋白。
[0561] 对人TREM2的BLAST分析鉴别到18种相关的同源物。这些同源物包括自然杀伤(NK)细胞受体NK-p44(NCTR2)、聚免疫球蛋白受体(pIgR)、CD300E、CD300A、CD300C、以及TREML1/TLT1。最接近的同源物鉴别为NCTR2,其在IgV结构域内与TREM2具有相似性(图1A)。BLAST分析还将TREM蛋白与其他IgV家族蛋白进行比较(图1B)。
[0562] TREM2也与TREM1相关。通过双向blast生成TREM1和TREM2的氨基酸序列的比对(图2)。这也限于IgV结构域。
[0563] 结合TREM2的细胞外结构域(具体地是细胞外结构域(SEQ ID NO:1的氨基酸残基19-174))的抗体使用小鼠杂交瘤技术、噬菌体展示技术、和酵母展示技术来生成。然后针对其结合表达TREM2的细胞的能力并且针对其活化TREM2信号传导和在体内在细胞中和在完整动物中起作用的能力对抗体进行筛选,如以下在实施例2-48中所描述的。例如,可产生靶向IgV结构域(氨基酸残基29-112)的激动剂抗TREM2抗体。IgV结构域结合到靶标,并且通过受体的多聚化导致活化。因此,这些结构域是激动性抗体的合理靶标。它们也是高度相异的。
[0564] 结果
[0565] 抗TREM2抗体产生
[0566] 免疫程序
[0567] 快速初免法:使用以下程序对四只50天龄的雌性BALB/c小鼠进行免疫。在19天的时间段内给予含有人TREM2抗原但是不含佐剂的一系列皮下水性注射液。将小鼠关养在来自Lab Products的通风架系统中。在第19天对全部四只小鼠进行安乐死,并且收获淋巴细胞以用于杂交瘤细胞系生成。
[0568] 标准方法:使用以下程序对四只50天龄的雌性BALB/c小鼠、NZB/W小鼠或Trem2tm1(KOMP)Vlcg小鼠进行免疫。将小鼠关养在来自Lab Products的通风架系统中。使用混合在CpG-ODN佐剂中的人TREM2抗原以25μg蛋白抗原/小鼠(125μL总体积/小鼠)每3周对小鼠进行腹膜内注射。在第二次加强之后七天通过隐静脉切开来进行测试放血。通过间接ELISA测定来测试测试放血(免疫血清),以确定对于融合应答最好的两只小鼠。小鼠可需要第3次和第4次加强以及加强之后7天进行的另一次测试放血以在融合之前评估滴度。当抗体滴度足够高时,通过侧尾静脉对应答最好的两只小鼠给予最终静脉内加强。IV加强之后四天对小鼠进行安乐死以用于融合。收获脾并且在融合过程中使用从脾分离的淋巴细胞来产生杂交瘤。
[0569] HTV方法
[0570] 根据Bates等人,Biotechniques 2006,40(2):199-208和Hazen等人,Landes Bioscience 2014,6:1,95-107使用以下程序对十只雌性Trem2tm1(KOMP)Vlcg小鼠进行免疫。将小鼠关养在来自Lab Products的通风架系统中。通过BlueSky技术产生不含内毒素的重组DNA构建体。将人Trem2-Dap12融合蛋白亚克隆到pCAGGS-Kan质粒中,并且从Kerafast购买pUNO-mGMCSF和pUNO-mFlt3La质粒。将在PBS中的质粒DNA在温暖的林格氏溶液(Ringer’s solution)中稀释至小鼠体重的10%,并且转移到具有29G针的3ml注射器。对于水动力尾部静脉注射(HTV),在热垫上使用异氟烷对小鼠进行轻度麻醉,并且将DNA在6-10秒内弹丸注射到侧尾静脉中。使小鼠在热垫上恢复2分钟,并且在注射之后观察任何急性作用10分钟。多至每周五次对小鼠进行加强。通过使用间接Elisa在第4次加强后5天对小鼠进行测试放血来评估对Trem2抗原的免疫应答。具有最好的IgG滴度的小鼠将用于杂交瘤发育。
[0571] 杂交瘤发育
[0572] 按照标准Roche方案,分离淋巴细胞并且在聚乙二醇(PEG 1500)的存在下与鼠SP2/0骨髓瘤细胞融合。使用单一步骤克隆方法(HAT选择)培养融合细胞。此方法使用半固体基于甲基纤维素的HAT选择性培养基来将杂交瘤选择和克隆组合到一个步骤中。单细胞衍生的杂交瘤在半固体培养基上生长以形成单克隆集落。在融合事件之后十天,将948个所得的杂交瘤克隆转移到96孔组织培养板并且在含有HT的培养基中生长,直至达到中对数生长(5天)为止。
[0573] 杂交瘤筛选
[0574] 在筛选抗原(初级筛选)上通过间接ELISA测试来自948个杂交瘤的组织培养上清液,并且使用山羊抗IgG/IgM(H&L)-HRP二抗针对IgG和IgM抗体两者进行探测,并且使用TMB底物来显色。将此测定中>0.2OD的克隆用于下一轮测试中。在筛选抗原上对阳性培养物进行再测试以确认分泌,并且在非相关抗原(人转铁蛋白)上对阳性培养物进行再测试以消除非特异性或“粘性”mAb并排除假阳性。通过抗体捕获ELISA对感兴趣的全部克隆进行同种型分型以确定它们是IgG同种型或IgM同种型。
[0575] 杂交瘤细胞培养
[0576] 转移到96孔板后,将感兴趣的杂交瘤细胞系维持在24孔培养板中的培养物中32天。这称为稳定性期,并且测试克隆是否保持稳定和分泌。在此稳定期时间期间,由感兴趣的全部克隆制备临时冷冻的细胞系备份以供于-80℃存储(存活6个月)。在此时间段期间针对分泌和特异性周期性地测试杂交瘤。
[0577] 亚克隆
[0578] 对顶部杂交瘤细胞系(克隆)进行亚克隆以确保单克隆性。通过再次使用单一步骤克隆系统对亲本克隆进行铺板来执行亚克隆。将24个与90个之间的亚克隆转移到96板培养板。通过间接ELISA和抗体捕获ELISA筛选亚克隆。将每个亲本的顶部亚克隆用于在培养物中进行扩增。对<50%无性系的任何亲本克隆执行第二轮的亚克隆。
[0579] 然后针对TREM2结合筛选抗体。针对阻断配体结合的能力和诱导、增强、或以其他方式增加多种细胞类型中的配体诱导的TREM2活性的能力对结合到人TREM2阳性的抗体进行测试。每种抗体的同种型和分组类别(bin category)在表1中列出。在表1中,“ND”是指分组类别未确定的抗体。
[0580] 表1:抗TREM2抗体
[0581]
[0582]
[0583]
[0584] 抗体重链和轻链可变结构域序列
[0585] 使用标准技术,确定编码所生成的抗体的轻链可变结构域和重链可变结构域的氨基酸序列。抗体的EU或Kabat轻链HVR序列在表2A中列出。抗体的EU或Kabat轻链HVR共有序列在表2B中列出。抗体的EU或Kabat重链HVR序列在表3A中列出。抗体的EU或Kabat重链HVR共有序列在表3B中列出。抗体的EU或Kabat轻链框架(FR)序列在表4A中列出。抗体的EU或Kabat重链框架(FR)序列在表4B中列出。EU或Kabat重链HVR
[0586] 表2A:EU或Kabat轻链HVR序列
[0587]
[0588]
[0589]
[0590] 表2B:EU或Kabat轻链HVR共有序列
[0591]
[0592] 表3A:EU或Kabat重链HVR序列
[0593]
[0594]
[0595]
[0596] 表3B:EU或Kabat重链HVR共有序列
[0597]
[0598]
[0599] 表4A:EU或Kabat轻链框架序列
[0600]
[0601]
[0602]
[0603]
[0604]
[0605] 表4B:EU或Kabat轻链框架序列
[0606]
[0607]
[0608]
[0609]
[0610] TREM2抗体结合的表征
[0611] TREM2抗体的初始表征涉及确定其结合在巨噬细胞和其他原代人或小鼠免疫细胞上表达的TREM2的能力。收获细胞,在96孔板中以105个/ml铺板,洗涤,并且在中在含有10-50ug/ml Mab和Fc阻断试剂的100μl PBS中孵育1小时。然后洗涤细胞两次,并且在冰中在含有5μg/ml PE偶联的二抗的100μl PBS中孵育30分钟。在冷PBS中洗涤细胞两次,并且在BD FACS Canto上获取。使用FlowJo(TreeStar)软件版本10.0.7执行数据分析和平均荧光强度(MFI)值或阳性细胞%的计算。
[0612] 抗体7E5和2H8例如展示与表达重组小鼠TREM2的小鼠细胞系(BWZ T2)的结合,如通过由FACS分析检测的阳性TREM2抗体染色指示的(黑色轮廓图)(图3A)。阴性同种型对照(抗体mIgG1)不展示结合。抗体7E5和2H8展示与WT(TREM+/+)骨髓衍生的小鼠巨噬细胞(BMMac,mMac)但是不与TREM2缺陷(TREM2-/-)小鼠巨噬细胞(BMMac,mMacs)的抗体结合(图
3B)。图3C示出证明TREM2抗体7E5与表达重组小鼠TREM2的BWZ细胞但是不与亲本BWZ细胞的剂量依赖性结合的剂量应答曲线。抗体10A9、10C1、和8F8展示与表达重组人TREM2(图4A)的人细胞系(293)和与原代人树突细胞(hDC)(图4B)两者的结合。
[0613] 由TREM2抗体1H7、2F6、2H8、3A7、3B10、7E5、7F8、8F8、以及11H5结合的小鼠细胞类型的平均荧光强度(MFI)值在表5中列出。将与亲本细胞系(BWZ亲本)和与过表达小鼠TREM2的BWZ细胞(BWZmT2)的结合进行比较。所述表还描绘与野生型原代巨噬细胞(WT BMMACS)相比,与TREM2缺陷的原代小鼠巨噬细胞(KO BMMACS)的结合。表5中的结果指示抗体1H7、2F6、2H8、3A7、3B10、7E5、7F8、8F8、以及11H5特异性地结合到在细胞膜上过表达小鼠TREM2的细胞系,但是不结合不表达TREM2的对照细胞系。所述抗体还结合到小鼠原代巨噬细胞。与小鼠原代细胞的结合是特异性的,因为它没有在衍生自TREM2KO小鼠或具有同种型对照抗体mIgG1的原代细胞上检测到。
[0614] 在表5中,“mIgG1”是指同种型对照抗体,“NT”是指非处理对照,“仅2°Ab”是指仅二抗对照,“RDT2”是指可商业获得的抗TREM2抗体(R&D目录号F7E57291),并且“ND”是指未确定。
[0615] 表5:结合到小鼠细胞的抗TREM2抗体
[0616]
[0617] 由TREM2抗体1A7、3A2、3B10、6G12、6H6、7A9、7B3、8A1、8E10、8F11、8F8、9F5、9G1、9G3、10A9、10C1、11A8、12D9、12E2、12F9、以及12G6结合的人细胞类型的平均荧光强度(MFI)值在表6中列出。将与亲本细胞系(HEK亲本)和与过表达人TREM2的HEK细胞(HEKhT2)的结合进行比较。所述表还描绘与原代人树突细胞(hDC)和巨噬细胞(hMAC)的结合。表6中的结果指示抗体1A7、3A2、3B10、6G12、6H6、7A9、7B3、8A1、8E10、8F11、8F8、9F5、9G1、9G3、10A9、
10C1、11A8、12D9、12E2、12F9、以及12G6特异性地结合到在细胞膜上过表达人TREM2的细胞系,但是不结合不表达TREM2的对照细胞系。所述抗体还结合到人原代树突细胞和巨噬细胞。与人原代细胞的结合是特异性的,因为它没有在同种型对照抗体mIgG1、mIgG2a、mIgG2b的情况下检测到。
[0618] 在表6中,“培养基”是指仅培养基对照,“仅2°抗体”是指仅二抗对照,“mIgG1”是指小鼠IgG1同种型对照抗体,“mIgG2a”是指小鼠IgG2a同种型对照抗体,“mIgG2b”是指小鼠IgG2b同种型对照抗体,“mIgM”是指小鼠IgM同种型对照抗体,“rIgG1”是指大鼠IgG1同种型对照抗体,“RIgG2a”是指大鼠IgG2a同种型对照抗体,“RIgG2b”是指大鼠IgG2b同种型对照抗体,并且“ND”是指未确定。
[0619] 表6中:结合到人细胞的抗TREM2抗体
[0620]
[0621]
[0622]
[0623] 抗体人源化
[0624] 抗体人源化用于转化在不同物种中生成的抗体以通过序列和结构关系与人抗体最佳地相似,以便在人施用中防止免疫原性。来自不同物种的抗体共享允许非人抗体的特异性决定区(SDR)移植到人抗体框架上的特征性序列和结构特征。这使得非人抗体保持特异性。人源化过程涉及非人抗体序列和特征(包括框架区和SDR)的鉴定。使用以下准则来对抗体进行人源化:1)非人抗体与已知人抗体之间的框架区的相似性百分比,2)非人抗体与已知人抗体之间的SDR的长度相似性,3)用于生成人抗体的框架区的基因,以及4)人抗体框架在人源化中的先前使用并用作治疗剂。框架区和SDR长度的相似性是重要的,因为差异可生成可改变抗体的特异性的抗体结构差异。已知用于生成人抗体的框架的特定基因对于抗体的稳定性或特异性是有益的或有害的,并且因此被选择性地使用或避免。最后,具有良好半衰期的耐受性很好的先前成功的人源化框架(包括在人治疗剂中使用的那些)是未来成功的人源化的可能候选物。
[0625] 如表7A和表7B所示,针对抗体4D11、7C5、6G12、8F11、8E10、7E5、7F8、8F8、1H7、2H8、3A2、3A7、3B10、4F11、6H6、7A9、7B3、8A1、9F5、9G1、9G3、10A9、11A8、12D9、12F9、10C1、7E9、以及8C1中的每一种鉴别人源化轻链和重链可变区序列。在表7A和表7B中,粗体字母指示CDR序列。
[0626] 表7A:人源化轻链可变区序列
[0627]
[0628]
[0629]
[0630]
[0631]
[0632]
[0633]
[0634]
[0635]
[0636]
[0637]
[0638]
[0639]
[0640]
[0641]
[0642]
[0643]
[0644]
[0645]
[0646]
[0647]
[0648]
[0649] 表7B:人源化重链可变区序列
[0650]
[0651]
[0652]
[0653]
[0654]
[0655]
[0656]
[0657]
[0658]
[0659]
[0660]
[0661]
[0662]
[0663]
[0664]
[0665]
[0666]
[0667]
[0668]
[0669]
[0670]
[0671]
[0672]
[0673]
[0674] 抗体9F5的人源化
[0675] 鼠抗TREM2抗体9F5(T2-9F5.1)的重链可变区(VH)和轻链可变区(VL)序列用作对NCBI网站上的IgBLAST程序的输入(Ye等人Nucleic Acids Research 41:W34-W40(2013))。IgBLAST取鼠VH或VL序列并且将其与已知人种系序列的文库进行比较。所使用的数据库是IMGT人VH基因(F+ORF,273个种系序列)和IMGT人VLκ基因(F+ORF,74个种系序列)。对于2F5抗体VL,选择人种系IGKV2-29(等位基因2)作为良好的受体序列,并且从在 国际免
疫遗传学信息 (the international ImMunoGeneTics information )处
编译的人连接区序列选择人轻链IGKJ2(等位基因1)连接区(J基因)(图4C)。对于2F5抗体VH,选择人种系IGHV1-46(等位基因1)作为良好的受体序列,并且从在 国际免疫遗
传学信息 处编译的人连接区序列选择人重链IGHJ4(等位基因1)连接区(J基因)(图
4D)。根据AbM定义(AbM抗体建模软件)定义抗体VL和VH的互补决定区(CDR)。
[0676] 可能需要改变对应于亲本鼠序列的人种系框架(即,VH和VL中的非CDR残基)位置以优化人源化抗体的结合。每个人源化序列的潜在变化在图4C和图4D中指出。
[0677] 图4C和图4D示出人源化形式的抗TREM2抗体9F5的序列。在抗体9F5的VL结构域的CDR-L1中,Asp30c-Gly30d具有高潜力进行脱酰胺作用,接着进行异天冬氨酸形成(图4C)。
[0678] 在此位点处的翻译后修饰可影响抗体与其靶标的结合。9F5可被人源化,并且然后在最终步骤中NG可改变为例如QG,并且进行测试以确定结合是否维持(图4C)。在CDR-L2中,Asn53基于序列和构象具有低潜力进行脱酰胺作用,但是可显示低水平的脱酰胺作用并且可改变以减少脱酰胺作用风险(图4C)。基于以上的变体VL序列在表7A中列出。
[0679] 在抗体9F5的VH结构域中,存在两个Asn(Asn 58和Asn 98),其基于序列和构象具有低潜力进行脱酰胺作用,并且可显示低水平的这些翻译后修饰(图4D)。此外,Asn 58和Asn 98可改变以减少脱酰胺作用风险(图4D)。在CDR-H1中,Trp33可能是暴露于溶剂的,并且具有潜力进行氧化作用,尤其在压力条件下(图4D)。因此,Trp33可改变以减少氧化作用风险。在CDR-H2中,Asp54-Gly55具有中等潜力进行异天冬氨酸形成(图4D)。因此,在Asp54-Gly55处的翻译后修饰可影响抗体与其靶标的结合。9F5可被人源化,并且然后在最终步骤中DG可改变为例如EG或其他氨基酸,并且进行测试以确定结合是否维持。基于以上的变体VH序列在表7B中列出。
[0680] 实施例2:TREM2抗体的表位定位
[0681] 测试TREM2抗体跨越整个人TREM2(SEQ ID NO:1)和小鼠TREM2(SEQ ID NO:2)结合15-mer或25-mer肽的能力。另外,通过鸟枪诱变定位抗TREM2抗体9F5(MAb)、T21-9(Fab)、T22(Fab)、以及T45-10(Fab)的表位。
[0682] 方法
[0683] 基于人TREM2的序列(SEQ ID NO:1)合成线性15-mer肽,其中具有14个残基重叠。此外,基于人TREM2的序列(SEQ ID NO:1)或小鼠TREM2的序列(SEQ ID NO:2)合成线性25-mer肽,其中具有单一残基移位。在基于ELISA的方法中测试TREM2抗体与合成的肽中的每一个的结合。在此测定中,将肽阵列与一抗溶液一起孵育(在4℃下孵育过夜)。在洗涤之后,在
25℃下将肽阵列与1/1000稀释的抗体过氧化物酶偶联物(SBA,目录号2010-05)一起孵育一小时。在洗涤之后,添加过氧化物酶底物2,2'-连氮基-二-3-乙基苯并噻唑啉磺酸酯(ABTS)和2μl/ml的3%H2O2。一小时之后,测量显色。使用电荷耦合器件(CCD)照相机图像处理系统对显色进行定量。
[0684] 可替代地,为了重建靶标分子的表位,合成环状和组合肽的文库。通过与专有亲水性聚合物制剂接枝、接着使用二环己基碳二亚胺(DCC)和N-羟基苯并三唑(HOBt)与叔丁氧基羰基-六亚甲基二胺(BocHMDA)反应并且随后使用三氟乙酸(TFA)进行Boc基团的裂解来获得氨基官能化的聚丙烯支持物。使用标准Fmoc肽合成来通过定制改良的JANUS液体处理站(Perkin Elmer)在氨基官能化的固体支持物上合成肽。
[0685] 使用Pepscan的专有的支架上的化学合成肽(Pepscan's  proprietary Chemically linked Peptides on Scaffolds,CLIPS)技术来进行结构模拟物的合成。
CLIPS技术允许将肽构成单环和双环。将CLIPS模板偶合到半胱氨酸残基。将肽中的多个半胱氨酸的侧链偶合到一个或两个CLIPS模板。例如,在碳酸氢铵(20mM,pH 7.8)/乙腈(1:3(v/v))中溶解0.5mM的mP2CLIPS(2,6-双(溴甲基)吡啶)溶液。将此溶液添加到肽阵列上。
CLIPS模板将结合到如存在于肽阵列的固相结合肽中的两个半胱氨酸的侧链(具有3μl孔的
455孔板)。在溶液中轻轻摇动肽阵列30至60分钟,同时完全覆盖在溶液中。最后,使用过量的H2O充分洗涤肽阵列,并且在70℃下在PBS(pH7.2)中的含有1%SDS/0.1%β-巯基乙醇的破坏缓冲液中进行超声处理30分钟,接着在H2O中再进行超声处理45分钟。以相似的方式制备携带T3CLIPS(2,4,6-三(溴甲基)吡啶)的肽,但是现在使用三个半胱氨酸。
[0686] 环状肽:长度17的约束肽。位置2-16是源自靶标序列的15-mer。天然Cys残基被乙酰氨基甲基(ACM)保护。位置1和17是通过mP2CLIPS部分连接的Cys。组合肽(不连续模拟物):长度33的约束肽。位置2-16和位置18-32是源自具有被ACM保护的天然Cys残基的靶标序列的15-mer肽。位置1、17和33是通过T3CLIPS部分连接的Cys。
[0687] 在基于PEPSCAN的ELISA中测试抗体与合成的肽中的每一个的结合。将肽阵列与由实验优化浓度的测试抗体和阻断溶液构成的测试抗体溶液(例如,在PBS/1%Tween80中的4%马血清、5%卵清蛋白(w/v))一起孵育。在4℃下将肽阵列与测试抗体溶液一起孵育过夜。在使用洗涤缓冲液(1×PBS,0.05%Tween80)充分洗涤之后,在25℃下将肽阵列与1/
1000稀释的适当的抗体过氧化物酶偶联物一起孵育一小时。在使用洗涤缓冲液洗涤之后,添加过氧化物酶底物2,2'-连氮基-二-3-乙基苯并噻唑啉磺酸酯(ABTS)和2μl/ml的3%H2O2。一小时之后,测量显色。使用电荷耦合器件(CCD)照相机和图像处理系统对显色进行定量。
[0688] 可替代地,使用质谱法来鉴定构象表位。为了以高分辨率确定抗TREM2抗体结合到的TREM2蛋白上的构象表位的关键残基,将抗体/抗原复合物与氘化交联剂一起孵育并且经受多酶促蛋白水解裂解。在交联肽富集之后,通过高分辨率质谱(nLC-Orbitrap MS)分析样品,并且使用XQuest软件分析所生成的数据。具体地,通过将等摩尔的TREM2抗原和抗体溶液(各自在5μl中是4μM)混合来生成TREM2ECD/抗体复合物。在乙腈/水(1:1,v/v)、TFA 0.1%(K200MALDI试剂盒)中将1μl所获得的混合物与由重结晶的芥子酸基质构成的1μl基质(10mg/ml)混合。混合之后,将1μl的每个样品点样在MALDI板(SCOUT 384)上。在室温下结晶之后,将板引入在MALDI质谱仪中并且立即进行分析。以一式三份重复所述分析。以预测的分子量检测代表单体抗体、抗原、和抗体以及抗原/抗体复合物的峰。
[0689] 然后确定构象结合中的表位是否与通过蛋白水解生成的非结构化的C1q肽竞争。具体地,为了确定TREM2ECD/抗体复合物是否可与线性肽竞争,使用固定胃蛋白酶消化TREM2ECD抗原。将10μM浓度的25μl抗原与5μM固定胃蛋白酶混合,并且在室温下孵育30分钟。孵育时间之后,对样品进行离心并且移取上清液。通过线性模式的高质量MALDI质谱控制蛋白水解的完成。优化胃蛋白酶蛋白水解,以便获得1000-3500Da范围的大量肽。接下来,将通过蛋白水解生成的5μl的抗原肽与5μl的抗体(8μM)混合,并且在37℃下孵育6小时。抗体与TREM2抗原肽孵育之后,将5μl的混合物与5μl的完整TREM2抗原(4μM)混合,使得最终混合物含有2μM/2μM/2.5μM的TREM2/抗体/TREM2抗原肽。使用具有标准氮激光器的CovalX’s HM3相互作用模块并且集中在范围是0至2000kDa的不同质量上,执行MALDI ToF MS分析。对于所述分析,将以下参数应用于质谱仪:线性和阳性模式;离子源1:20kV;离子源2:17kV;脉冲离子提取:400ns;对于HM3:增益电压:3.14kV;增益电压:3.14kV;加速电压:20kV。为了校准仪器,应用使用胰岛素、BSA和IgG的簇集的外部校准。针对每个样品,分析3个点(300个激光照射/点)。所呈现的光谱对应于300个激光照射的总和。使用Complex Tracker分析软件版本2.0(CovalX公司)分析MS数据。为了鉴定结合到抗体的TREM2的构象表位,使用化学交联、高质量MALDI质谱和nLCOrbitrap质谱,在抗原与抗体之间的相互作用界面遵循以下程序。将5μl的样品抗原(4μM浓度)与5μl的样品抗体(4μM浓度)混合,以便获得具有2μM/2μM最终浓度的抗体/抗原混合物。在37℃下孵育混合物180分钟。在第一步骤中,将1mg的二琥珀酰胺辛二酸盐H12(DSS-H12)交联剂与1mg的二琥珀酰胺辛二酸盐D12(DSS-D12)交联剂混合。将2mg所制备的与1ml的DMF混合,以便获得2mg/ml的DSS H12/D12溶液。将先前制备的10μl的抗体/抗原混合物与所制备的1μl的交联剂d0/d12溶液(2mg/ml)混合。将溶液在室温下孵育180分钟,以便实现交联反应。
[0690] 为了有助于蛋白水解,需要使存在于蛋白质中的二硫键还原。将交联样品与20μl的碳酸氢铵(25mM,pH 8.3)混合。混合之后,将2.5μl的DTT(500mM)添加到溶液中。然后在55℃下孵育混合物1小时。孵育之后,添加2.5μl的碘乙酰胺(iodioacetamide)(1M),之后在暗室中在室温下孵育1小时。孵育之后,通过添加用于蛋白水解的120μl缓冲液来以1/5稀释溶液。将145μl的还原的/烷基化的交联样品与2μl的胰蛋白酶(Sigma,T6567)混合。在37℃下孵育蛋白水解混合物过夜。对于a-胰凝乳蛋白酶蛋白水解,蛋白水解的缓冲液是Tris-HCL100mM,CaCl2 10mM,pH7.8。将145μl的还原的/烷基化的交联复合物与2μl的200μMα-胰凝乳蛋白酶混合并且在30℃下孵育过夜。对于此分析,使用与Orbitrap质谱组合的nLC。使用Xquest版本2.0和stavrox软件分析交联剂肽。然后鉴定肽和交联氨基酸。
[0691] 结果
[0692] 确定26种抗TREM2抗体的TREM2结合区。人和/或小鼠TREM2内的结合区在表8A和表8B中列出。
[0693] 表8A:人TREM2的TREM2抗体结合区
[0694]
[0695]
[0696] 表8B:小鼠TREM2的TREM2抗体结合区
[0697]
[0698] 如表8A所指示的,抗体5A2和7D1显示专一地对于人TREM2的两个细胞外结构域(包括IgV结构域)内的肽的稳健结合。如表8A所指示的,抗体5A2和7D1识别的肽对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基35-49和140-150并且具有以下氨基酸序列:SCPYDSMKHWGRRKA和DLWFPGESESF。
[0699] 如表8A所指示的,抗体8E10显示专一地对于人TREM2的细胞外IgV结构域内的肽的稳健结合。如表8A所指示的,抗体8E10识别的肽对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基39-49和63-77并且具有以下氨基酸序列:DSMKHWGRRKA和VVSTHNLWLLSFLRR。
[0700] 如表8A和表8B所指示的,抗体2H8显示专一地对于人和小鼠TREM2的细胞外IgV结构域内的肽的稳健结合。如表8A所指示的,抗体2H8识别的人TREM2肽对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基51-61并且具有以下氨基酸序列:CRQLGEKGPCQ。如表8B所指示的,抗体2H8识别的小鼠TREM2肽对应于SEQ ID NO:2的氨基酸残基51-61并且具有以下氨基酸序列:CRQLGEEGPCQ。
[0701] 如表8A所指示的,抗体18E4显示专一地对于人TREM2的细胞外结构域内的肽的稳健结合。如表8A所指示的,抗体18E4识别的肽对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基55-62、104-109、和148-158并且具有以下氨基酸序列:GEKGPCQR、DAGLYQ、和ESFEDAHVEHS。此外,确定参与结合的关键序列对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基151-155并且具有以下氨基酸序列:
EDAHV。
[0702] 如表8A所指示的,抗体44A8显示专一地对于人TREM2的细胞外结构域内的肽的稳健结合。如表8A所指示的,抗体44A8识别的肽对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基55-62、104-109、和160-166并且具有以下氨基酸序列:GEKGPCQR、DAGLYQ、和SRSLLEG。此外,确定参与结合的关键序列对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基162-165并且具有以下氨基酸序列:SLLE。
[0703] 如表8A所指示的,抗体18D8显示专一地对于人TREM2的细胞外结构域内的肽的稳健结合。如表8A所指示的,抗体18D8识别的肽对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基55-65和124-134并且具有以下氨基酸序列:GEKGPCQRVVS和VLVEVLADPLD。
[0704] 如表8A所指示的,抗体49E12和11D7显示专一地对于人TREM2的细胞外结构域内的肽的稳健结合。如表8A所指示的,抗体49E12和11D7识别的肽对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基63-73和156-170并且具有以下氨基酸序列:VVSTHNLWLLS和EHSISRSLLEGEIPF。
[0705] 如表8A所指示的,抗体6H6显示专一地对于人TREM2的细胞外结构域内的肽的稳健结合。如表8A所指示的,抗体6H6识别的肽对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基117-133并且具有以下氨基酸序列:EADTLRKVLVEVLADPL。
[0706] 如表8A所指示的,抗体8C3、7E9、12F9、9G1、9G3、11A8、以及7B3显示专一地对于人TREM2的细胞外结构域内的肽的稳健结合。如表8A所指示的,抗体8C3、7E9、12F9、9G1、9G3、11A8、以及7B3识别的肽对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基137-146并且具有以下氨基酸序列:DAGDLWFPGE。
[0707] 如表8A和表8B所指示的,抗体3B10和8F8显示专一地对于人和小鼠TREM2的细胞外结构域内的肽的稳健结合。如表8A所指示的,抗体3B10和8F8识别的人TREM2肽对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基139-147并且具有以下氨基酸序列:GDLWFPGES。如表8B所指示的,抗体3B10和8F8识别的小鼠TREM2肽对应于SEQ ID NO:2的氨基酸残基139-147并且具有以下氨基酸序列:GDLWVPEES。此外,抗体3B10和8F8识别的人和小鼠肽具有以下氨基序列:GDLW[F/V]P[G/E]ES(SEQ ID NO:884)。
[0708] 如表8A所指示的,抗体11H5、6G12、10A9、10C1、以及3A2显示专一地对于人TREM2的细胞外结构域内的肽的稳健结合。如表8A所指示的,抗体11H5、6G12、10A9、10C1、以及3A2识别的肽对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基139-149并且具有以下氨基酸序列:GDLWFPGESES。
[0709] 如表8A和表8B所指示的,抗体2F6显示专一地对于人和小鼠TREM2的细胞外结构域内的肽的稳健结合。如表8A所指示的,抗体2F6识别的人TREM2肽对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基139-149并且具有以下氨基酸序列:GDLWFPGESES。如表8B所指示的,抗体2F6识别的小鼠TREM2肽对应于SEQ ID NO:2的氨基酸残基139-147并且具有以下氨基酸序列:GDLWVPEES。
[0710] 如表8A所指示的,抗体1B4、29F6、7B11、40D5、45D6、29F7、以及21D10显示专一地对于人和小鼠TREM2的细胞外结构域内的肽的稳健结合。如表8A所指示的,抗体1B4、29F6、7B11、40D5、45D6、29F7、以及21D10识别的肽对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基140-146并且具有以下氨基酸序列:DLWFPGE。此外,确定参与结合的关键序列对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基140-143并且具有以下氨基酸序列:DLWF。
[0711] 如表8A和表8B所指示的,抗体3A7和7E5显示专一地对于人和小鼠TREM2的细胞外结构域内的肽的稳健结合。如表8A所指示的,抗体3A7和7E5识别的人TREM2肽对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基142-152并且具有以下氨基酸序列:WFPGESESFED。如表8B所指示的,抗体3A7和7E5识别的小鼠TREM2肽对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基142-152并且具有以下氨基酸序列:WVPEESSSFEG。
[0712] 如表8A所指示的,抗体6H2显示专一地对于人TREM2的细胞外结构域内的肽的稳健结合。如表8A所指示的,抗体6H2识别的肽对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基146-154并且具有以下氨基酸序列:ESESFEDAH。此外,确定参与结合的关键氨基酸残基对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基S149和F150。
[0713] 如表8A所指示的,抗体12G6和9F5显示专一地对于人TREM2的细胞外结构域内的肽的稳健结合。如表8A所指示的,抗体12G6和9F5识别的肽对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基149-157并且具有以下氨基酸序列:SFEDAHVEH。
[0714] 如表8A所指示的,抗体2A7和9B4显示专一地对于人TREM2的细胞外结构域内的肽的稳健结合。如表8A所指示的,抗体2A7和9B4识别的肽对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基154-161并且具有以下氨基酸序列:HVEHSISR。
[0715] 鸟枪诱变表位定位
[0716] 使用TREM2蛋白的丙氨酸扫描文库执行抗TREM2抗体(9F5(MAb)、T21-9(Fab)、T22(Fab)、以及T45-10(Fab))的鸟枪诱变表位定位。使编码全长hTREM2-Dap12嵌合体的TREM2-Dap12表达构建体经受高通量丙氨酸扫描诱变(在Davidson和Doranz,2014Immunology 143,13-20中概述)以生成综合突变文库。将代表TREM2细胞外结构域的TREM2的残基19至
174中的每一个主要突变为丙氨酸,而丙氨酸密码子突变为丝氨酸。总体上,生成154种TREM2突变体表达构建体,进行序列确认并且排列到384孔板中,每孔一种突变体。
[0717] 将排列在384孔微板中的TREM2突变文库克隆单个地转染到HEK-293T细胞中并且使其表达22小时。然后将细胞与在10%正常山羊血清(NGS)(Sigma-Aldrich,St.Louis,MO)中稀释的指示MAb或Fab一起孵育。在进行文库筛选之前,使用针对表达野生型TREM2的细胞的独立的免疫荧光滴定曲线确定一级MAb和Fab浓度以确保信号在线性检测范围内。使用在10%NGS中的3.75μg/ml AlexaFluor488偶联的二抗(Jackson ImmunoResearch 
Laboratories,Westgrove,PA,目录号115-545-003)检测MAb,而使用在10%NGS中的7.50μg/ml AlexaFluor488偶联的二抗(Jackson ImmunoResearch Laboratories,Westgrove,PA,目录号109-546-006)检测Fab。使用PBS-/-洗涤细胞两次并且重悬浮在具有0.1%BSA(Sigma-Aldrich,St.Louis,MO)的Cellstripper(Cellgro,Manassas,VA)中。使用
Intellicyt高通量流式细胞仪(HTFC,Intellicyt,Albuquerque,NM)检测平均细胞荧光。通过减去来自mock转染对照的信号并且归一化到来自野生型TREM2转染对照的信号来计算相对于野生型TREM2蛋白反应性的针对每种突变体克隆体的MAb和Fab反应性。
[0718] 如果关键克隆体内的突变残基不支持测试MAb或Fab的反应性但是支持其他测试抗体的反应性,则所述突变残基鉴别为对于MAb或Fab表位是关键的。此反筛选策略有助于排除局部错折叠或具有表达缺陷的TREM2突变体。
[0719] 图4E描绘在筛选中鉴定的所有关键残基的平均结合反应性和范围。所述范围是一式两份实验结合值之间的差值。一级关键残基鉴别为其中突变对于测试抗体结合是阴性的(Fab T21-9对于WT的结合<30%;MAb 9F5和Fab T22和T45-10对于WT的结合<20%)但是对于其他测试抗体是阳性的(>70%WT)的残基。
[0720] 对于抗体结合重要的氨基酸残基在表8C中列出。
[0721] 表8C:参与抗TREM2抗体MAb和Fab结合的残基
[0722]抗体 关键TREM2残基 二级TREM2残基
9F5MAb E151;D152;H154;以及E156  
T21-9Fab K42和H114  
T22Fab K42;G45;以及H114 H43;W44;以及E117
T45-10Fab R77 H67和T88
[0723] 如表8C所指示的,参与通过MAb 9F5进行的结合的关键TREM2残基对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基E151、D152、H154、以及E156。参与通过Fab T21-9进行的结合的关键TREM2残基对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基K42和H114。参与通过Fab 122进行的结合的关键TREM2残基对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基K42、G45、和H114;并且参与通过Fab T22进行的结合的二级残基对应于氨基酸残基H43、W44、和E117。参与通过Fab T45-10进行的结合的关键TREM2残基对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基R77;并且参与通过Fab T45-10进行的结合的二级残基对应于氨基酸残基H67和T88。参与通过Fab T22和Fab T45-10进行的结合的二级残基在较小程度上对总体结合能量做出贡献。
[0724] 实施例3:TREM2抗体诱导Syk磷酸化
[0725] 脾酪氨酸激酶(Syk)是通过使若干底物磷酸化、从而有助于形成导致细胞活化和炎性过程的信号传导复合物来在TREM2下游起作用的细胞内信号传导分子。通过培养小鼠巨噬细胞并且测量细胞提取物中的Syk蛋白的磷酸化状态确定激动剂TREM2抗体诱导Syk活化的能力。
[0726] 使来自野生型(WT)小鼠、来自TREM2敲除(KO)小鼠、和来自缺少功能性Fc受体共同γ链基因(FcgR KO;REF:Takai T 1994.Cell76(3):519-29)的表达的小鼠的骨髓衍生的巨噬细胞(BMDM)在1%血清RPMI中饥饿4小时,并且然后使用PBS-EDTA从组织培养皿取出,使用PBS洗涤,并且计数。在冰上使用全长TREM2抗体2F6、11H5、2H8、1H7、3A7、3B10、7F8、以及7E5或使用对照抗体(10A9或msIgG1同种型对照)包覆细胞15分钟。在使用冷PBS洗涤之后,在山羊抗人IgG的存在下在37℃下孵育细胞,进行指示的时间段。在刺激之后,使用裂解缓冲液(1%v/v NP-40%、50Mm Tris-HCl(pH 8.0)、150mM NaCl、1mM EDTA、1.5mM MgCl2、
10%甘油,加上蛋白酶和磷酸酶抑制剂)使细胞裂解,接着在4℃下在16,000g下离心10min以去除不可溶物质。然后使用抗Syk抗体(针对BMDM的N-19或针对人DC的4D10,Santa Cruz Biotechnology)使裂解物免疫沉淀。通过SDS-PAGE分级沉淀的蛋白质,转移到PVDF膜并且使用抗磷酸酪氨酸抗体(4G10,Millipore)进行探测。为了确认所有底物被充分免疫沉淀,使用抗Syk抗体(Abcam,针对BMDM)或抗Syk(Novus Biological,针对人DC)对免疫印迹进行再探测。使用增强的化学发光(ECL)系统(GE healthcare)执行可视化,如所描述的(例如,Peng等人,(2010)Sci Signal.,3(122):ra38)。
[0727] 如图5A所示,TREM2抗体2F6、11H5、2H8、1H7、3A7、3B10、7F8、以及7E5诱导BMDM中的TREM2介导的Syk磷酸化。由抗体7E5、3A7、和2F6诱导的Syk磷酸化是TREM2特异性的,因为当TREM2KO BMDM用作对照时,Syk磷酸化不被诱导(图5B)。由抗体7E5和3A7诱导的Syk磷酸化不需要Fc受体共同γ链(FcgR),因为当FcgR KO BMDM用作对照时,Syk磷酸化不被诱导(图5B)。对照抗体10A9和msIgG1不诱导显著量的Syk磷酸化。基于这些结果,TREM2抗体2F6、
11H5、2H8、1H7、3A7、3B10、7F8、以及7E5充当诱导巨噬细胞中的Syk磷酸化的激动剂抗体。
[0728] 实施例4:当通过表达Fcγ受体的相邻细胞簇集时TREM2抗体诱导Syk磷酸化。
[0729] 脾酪氨酸激酶(Syk)的活化通过使两种或更多种TREM2受体与抗体交联、从而有助于形成导致细胞活化和炎性过程的信号传导复合物来促进。体内交联通过表达高亲和力Fc受体(FcR)的相邻细胞(诸如B细胞和其他白细胞)介导(White AL Cancer Immunol Immunother(2013)62:941–948;Wilson NS 2011,Cancer Cell 19,101–113;
Bartholomaeus P J Immunol 2014;192:2091-2098)。
[0730] Fc受体通过抗体簇集诱导Syk活化的能力通过在表达Fc受体的细胞的存在下培养小鼠巨噬细胞并且测量细胞提取物中的Syk蛋白的磷酸化状态来确定。使来自野生型(WT)小鼠和来自TREM2敲除(KO)小鼠的骨髓衍生的巨噬细胞(BMDM)在1%血清RPMI中饥饿4小时,并且然后使用PBS-EDTA从组织培养皿取出,使用PBS洗涤,并且计数。在冰上使用全长TREM2抗体2F6、11H5、2H8、1H7、3A7、3B10、7F8、以及7E5或对照抗体(10A9或msIgG1同种型对照)包覆细胞15分钟。在使用冷PBS洗涤之后,将细胞与表达Fc受体并且如下先前制备的戊二醛固定的细胞在37℃下孵育5分钟。简而言之,根据制造商的方案使用MACS微珠(CD19+B细胞分离试剂盒Miltenyi Biotec)使Fc受体表达细胞进行从小鼠脾分离B细胞或可替代地分离过表达FcR2b和FcR3的P815细胞系。在室温下使用0.05%戊二醛固定2×106个细胞/ml细胞1分钟,使用1μM甘胺酸使反应停止并且然后使用PBS充分洗涤细胞。在刺激之后,使用裂解缓冲液(1%v/v NP-40%、50Mm Tris-HCl(pH 8.0)、150mM NaCl、1mM EDTA、1.5mM MgCl2、10%甘油,加上蛋白酶和磷酸酶抑制剂)使细胞裂解,接着在4℃下在16,000g下离心10min以去除不可溶物质。然后使用抗Syk抗体(针对BMDM的N-19或针对人DC的4D10,Santa Cruz Biotechnology)使裂解物免疫沉淀。通过SDS-PAGE分级沉淀的蛋白质,转移到PVDF膜并且使用抗磷酸酪氨酸抗体(4G10,Millipore)进行探测。为了确认所有底物被充分免疫沉淀,使用抗Syk抗体(Abcam,针对BMDM)或抗Syk(Novus Biological,针对人DC)对免疫印迹进行再探测。使用增强的化学发光(ECL)系统(GE healthcare)执行可视化,如所描述的(例如,Peng等人,(2010)Sci Signal.,3(122):ra38)。
[0731] 与同种型对照msIgG1相比,TREM2抗体3A7和7E5在用P815细胞簇集之后在BMDM中诱导TREM-2介导的Syk磷酸化,而抗体8F8和2F6不活化Syk磷酸化(图6A)。抗体3A7和7E5诱导的Syk磷酸化是TREM2特异性的,因为当TREM2KO BMDM用作对照时,Syk磷酸化不被诱导(图6A)。与同种型对照msIgG1相比,TREM2抗体2F6、3A7、和7E5在用原代脾B细胞簇集之后在BMDM中诱导TREM-2介导的Syk磷酸化,而抗体8F8不活化Syk磷酸化(图6B)。基于这些结果,TREM2抗体7E5、3A7、和2F6是激动剂抗体,所述抗体当通过表达Fcγ受体的相邻细胞簇集时在原代巨噬细胞中诱导Syk磷酸化。
[0732] 实施例5:TREM2抗体在体外和体内诱导DAP12磷酸化
[0733] 小鼠巨噬细胞中的DAP12磷酸化
[0734] TREM2通过DAP12进行信号传导,从而在下游导致PI3K和其他细胞内信号的活化。通过培养小鼠巨噬细胞并且测量细胞提取物中的DAP12蛋白的磷酸化状态确定TREM2抗体诱导DAP12活化的能力。在使用抗体刺激之前,使小鼠野生型(WT)骨髓衍生的巨噬细胞(BMDM)和TREM2敲除(KO)BMDM在1%血清RPMI中饥饿4h。在冰中将15×106个细胞与全长
TREM2抗体或对照抗体一起孵育15min。洗涤细胞并且在山羊抗人IgG的存在下在37℃下孵育,进行指示的时间段。在刺激之后,使用裂解缓冲液(1%v/v正十二烷基-β-D-麦芽糖苷、
50Mm Tris-HCl(pH 8.0)、150mM NaCl、1mM EDTA、1.5mM MgCl2、10%甘油,加上蛋白酶和磷酸酶抑制剂)使细胞裂解,接着在4℃下在16,000g下离心10min以去除不可溶物质。使用第二TREM2抗体(R&D Systems)使细胞裂解物免疫沉淀。通过SDS-PAGE分级沉淀的蛋白质,转移到PVDF膜并且使用抗磷酸酪氨酸Ab(4G10,Millipore)进行探测。将膜剥离并且使用抗DAP12抗体(Cells Signaling,D7G1X)进行再探测。用于TREM2免疫沉淀的每种细胞裂解物含有等量的蛋白质,如对照抗体(抗肌动蛋白,Santa Cruz)所指示的。
[0735] 如图7A和图7B所示,DAP12与TREM2共沉淀并且在与TREM2抗体11H5、2F6、3A7、7E5、以及3B10一起孵育的WT巨噬细胞中磷酸化,但是不在与抗体11A2、4G3、12F9、以及7A9或同种型对照msIgG1一起孵育的WT巨噬细胞中磷酸化(图7A和图7B)。作为对照,在与抗体2F6或7E5一起孵育的TREM2KO(TREM2-/-)巨噬细胞中没有观察到DAP12磷酸化(图7B)。这些结果证明TREM2抗体2F6和7E5是激动剂抗体,所述抗体以TREM2特异性方式诱导TREM2相关的DAP12的磷酸化,因为DAP12磷酸化在TREM2缺陷BMDM中不存在。
[0736] 体内DAP12磷酸化
[0737] 在布鲁尔巯基乙酸盐(Brewer’s Thioglycollate)诱导的腹膜巨噬细胞上并且测量细胞提取物中的DAP12蛋白的磷酸化状态确定TREM2抗体诱导DAP12活化的能力。在第0天对C57Bl6小鼠腹膜内(i.p.)注射3ml的3%布鲁尔巯基乙酸盐。在第3天,对小鼠腹膜内(i.p.)注射同种型对照抗体(CTR抗体)mIgG1(克隆MOPC-21,Bioxcell)或注射抗TREM2抗体7E5,进行15分钟(图7C和图7D)或进行24小时(图7E和图7F)。使用4mL盐溶液通过腹膜灌洗收获腹膜腔(PEC)细胞并且使用PBS洗涤。然后使用裂解缓冲液(1%v/v正十二烷基-β-D-麦芽糖苷、50Mm Tris-HCl(pH 8.0)、150mM NaCl、1mM EDTA、1.5mM MgCl2、10%甘油,加上蛋白酶和磷酸酶抑制剂)使细胞裂解,接着在4℃下在16,000g下离心10min以去除不可溶物质。将从每个小鼠样品回收的裂解物分开并且使用第二TREM2抗体(R&D Systems)或使用与珠粒直接偶联的同种型对照大鼠IgG2b抗体使其免疫沉淀。通过SDS-PAGE分级沉淀的蛋白质,转移到PVDF膜并且使用抗磷酸酪氨酸Ab(4G10,Millipore)进行探测。将膜剥离并且使用抗DAP12抗体(Cells Signaling,D7G1X)进行再探测。用于TREM2免疫沉淀的每种细胞裂解物也使用对照抗体(抗肌动蛋白,Santa Cruz)进行探测。腹膜液包含表达高水平的TREM2的细胞以及其他细胞类型(例如,嗜酸性粒细胞),并且所收获的细胞的数量可变化。因此,将免疫沉淀之后回收的一些裂解物加载在凝胶上并且使用抗肌动蛋白进行印迹。
[0738] 此印迹给出裂解的细胞(TREM2+细胞和TREM2-细胞)的总量的指示。图7D和图7F所示的图指示使用抗TREM2抗体7E5刺激进行体内刺激之后相对于CTR抗体刺激的TREM2相关的DAP12磷酸化的倍数变化(FC)。基于DAP12相关的TREM2的量对磷酸化的TREM2相关的DAP12进行归一化。
[0739] 先前示出抗TREM2抗体7E5的体外交联(通过表达FcR的细胞)诱导TREM2的簇集并且诱导TREM2相关的DAP12磷酸化。图7C-图7F中的结果指示DAP12与TREM2共沉淀并且在来自使用抗体7E5处理对的小鼠的腹膜细胞中磷酸化,但是不在使用同种型对照抗体(msIgG1)处理的小鼠的腹膜细胞中磷酸化。所述结果证明TREM2抗体7E5是激动剂抗体,所述抗体以TREM-2特异性方式诱导TREM2相关的DAP12的磷酸化,因为DAP12磷酸化在使用对照抗体处理的小鼠中不存在。
[0740] 实施例6:板结合的TREM2抗体诱导TREM2依赖性NFAT启动子
[0741] 在NFAT(活化T细胞的核因子)启动子的控制下使用荧光素酶报告基因评价板结合的全长抗TREM2抗体活化小鼠或人TREM2依赖性基因的能力。使用小鼠TREM2和DAP12并且使用Cignal Lenti NFAT-荧光素酶病毒(Qiagen)感染衍生自小鼠胸腺淋巴瘤T淋巴细胞的细胞系BW5147.G.1.4( TIB48TM)。可替代地,使用人TREM2/DAP12融合蛋白并且使用Cignal Lenti NFAT-荧光素酶病毒(Qiagen)感染BW5147.G.1.4细胞系。作为信号传导的阳性对照,将PMA(0.05ug/ml)和离子霉素(0.25uM)一起添加。将抗TREM2和同种型对照抗体溶解在PBS中,以10ug/ml的浓度铺板在组织培养板上并且在4℃下孵育过夜以使抗体吸收到板。在洗涤板之后,将细胞铺板在板结合的抗体上并且孵育6小时。通过将OneGlo试剂(Promega)添加到每个孔并且在室温下在板振荡器上孵育3min来测量荧光素酶活性。使用BioTek酶标仪测量荧光素酶信号。细胞由于内源性配体的存在或由于自发性受体聚集而显示出强直性TREM2依赖性信号传导,这导致在额外的刺激不存在下的TREM2信号传导。
[0742] 如图8A所示,与同种型对照(msIgG1)相比,抗TREM2抗体2F6、3A7、7E5、7F8、8F8、以及11H5增加表达小鼠TREM2的细胞中的荧光素酶活性,这指示所述抗体能够诱导TREM2依赖性基因转录。如图8B所示,与同种型对照(msIgG1)相比,抗TREM2抗体9F5、9G3、11A8、12D9、12F9、12G6、3C1、以及4D7增加表达人TREM2的细胞中的荧光素酶活性,这指示所述抗体能够诱导TREM2依赖性基因转录。图8A和图8B中的虚线指示没有刺激的情况下TREM2活性的水平。图8C和图8D示出板结合的磷脂酰丝氨酸(PS)和鞘磷脂(SM)也在表达小鼠TREM2(图8C)的细胞中并且在表达人TREM2(图8D)的细胞中诱导NFAT启动子信号传导。据信,PS和SM是TREM2的天然配体。因此,图8A-图8D中的结果指示激动剂抗TREM2抗体可模拟TREM2的天然配体。
[0743] 实施例7:TREM2配体诱导TREM2依赖性NFAT启动子
[0744] 使用实施例6所述的基于细胞的荧光素酶报告蛋白系统评价天然TREM2配体活化小鼠或人TREM2依赖性基因的能力。使用增加浓度的磷脂酰丝氨酸(PS)、鞘磷脂(SM)和人APOE变体APOE2、APOE3、和APOE4过夜涂覆板。在洗涤板之后,对细胞进行铺板并且在37℃下孵育6小时。然后通过添加OneGlo试剂(Promega)测量荧光素酶活性,如实施例6所描述的。如先前所述,PS、SM、和APOE变体提供TREM2依赖性信号传导的活化。
[0745] 另外,通过ELISA评价APO变体APOE2、APOE3、和APOE4蛋白结合重组人TREM2蛋白的能力。在4℃下将2μg/ml的ApoE蛋白过夜涂覆在高结合的ELISA板上。在第2天,使用在1X PBS中的0.05%Tween洗涤板三次。然后在室温下使用3%乳阻断板1小时。使用20nM的TREM2-Fc蛋白孵育板。然后在室温下洗涤板3次并且使用二抗山羊抗人Fc HRP孵育1小时。
再次在室温下洗涤板三次并且将100μL的TMB添加到每个孔。在反应完成之后,每孔添加50μL的2N硫酸以使反应停止。在630和450nm下使用酶标仪读取板。
[0746] 图8E示出板结合的APOE2、APOE3、和APOE4也在表达人TREM2的细胞中诱导NFAT启动子活性。据信,不同的APOE亚型是TREM2的天然配体。图8F示出在ELISA测定中不同的APOE等位基因(APOE2、APOE3和APOE4)结合到重组TREM2蛋白。因此,所述结果指示激动性抗TREM2抗体可模拟TREM2的天然配体。
[0747] 实施例8:可溶性TREM2抗体诱导TREM2依赖性基因
[0748] 在NFAT(活化T细胞的核因子)启动子的控制下使用荧光素酶报告基因评价可溶性全长抗TREM2抗体活化小鼠或人TREM2依赖性基因的能力。使用小鼠TREM2和DAP12并且使用Cignal Lenti NFAT-荧光素酶病毒(Qiagen)感染衍生自小鼠胸腺淋巴瘤T淋巴细胞的细胞系BW5147.G.1.4( TIB48TM)。可替代地,使用人TREM2/DAP12融合蛋白并且使用Cignal Lenti NFAT-荧光素酶病毒(Qiagen)感染BW5147.G.1.4细胞系。作为信号传导的阳性对照,将PMA(0.05ug/ml)和离子霉素(0.25uM)一起添加。将细胞与可溶性抗TREM2和同种型对照抗体一起孵育6小时,并且通过将OneGlo试剂(Promega)添加到每个孔并且在室温下在板振荡器上孵育3min来测量荧光素酶活性。使用BioTek酶标仪测量荧光素酶信号。细胞由于内源性配体的存在或由于自发性受体聚集而显示出强直性TREM2依赖性信号传导,这导致TREM2信号传导。
[0749] 如图9A所示,与同种型对照(msIgG1)相比,可溶性全长抗TREM2抗体2F6、3A7、3B10、7E5、8F8、以及11H5增加表达小鼠TREM2的细胞的荧光素酶活性,这指示所述抗体是能够诱导TREM2依赖性基因转录的激动剂抗体。相比之下,可溶性全长抗TREM2抗体1H7、2H8、和7F8似乎充当阻断强直性TREM2信号传导的拮抗剂。图9A中的虚线指示没有刺激的情况下TREM2活性的水平。
[0750] 如图9B所示,与同种型对照(msIgG1)相比,抗TREM2抗体9F5、12F9、2C7、2F5、3C1、以及4D7增加表达人TREM2的细胞的荧光素酶活性,这指示所述抗体是能够诱导TREM2依赖性基因转录的激动剂抗体。相比之下,可溶性全长抗TREM2抗体(诸如10A9和10C1)似乎充当阻断强直性TREM2信号传导的拮抗剂。图9B中的虚线指示没有刺激的情况下TREM2活性的水平。
[0751] 图9C示出通过增加可溶性全长抗TREM2抗体7E5的浓度诱导的荧光素酶活性的剂量应答曲线,从而指示对于基因表达的影响是剂量依赖性的并且EC50是大约1.52nM。
[0752] 与图8C和图8D中的结果一起考虑,图9A-图9C中的结果指示可溶性激动剂抗TREM2抗体可以与板结合的磷脂酰丝氨酸(PS)(据信它是TREM2的天然配体)相似的程度诱导基因表达。
[0753] 实施例9:可溶性TREM2抗体增强TREM2的天然配体的活性的能力的分析
[0754] 在NFAT(活化T细胞的核因子)启动子的控制下使用荧光素酶报告基因测量基因表达的活化来评价可溶性全长抗TREM2抗体增强小鼠TREM2或人TREM2的天然配体的活性的能力。使用小鼠TREM2和DAP12并且使用Cignal Lenti NFAT-荧光素酶病毒(Qiagen)感染衍生自小鼠胸腺淋巴瘤T淋巴细胞的细胞系BW5147.G.1.4( TIB48TM)。可替代地,使用人TREM2/DAP12融合蛋白并且使用Cignal Lenti NFAT-荧光素酶病毒(Qiagen)感染
BW5147.G.1.4细胞系。将细胞与可溶性抗TREM2和同种型对照抗体一起在预先涂覆有增加浓度的磷脂酰丝氨酸(PS)或鞘磷脂(SM)的板上孵育6小时。通过将OneGlo试剂(Promega)添加到每个孔并且在室温下在板振荡器上孵育3min来测量荧光素酶活性。使用BioTek酶标仪测量荧光素酶信号。
[0755] 另外,通过ELISA评价可溶性全长抗TREM2抗体增强APOE3与重组人TREM2蛋白的结合的能力。在4℃下将1μg/ml的ApoE蛋白过夜涂覆在高结合的ELISA板上。在第2天,使用在1X PBS中的0.05%Tween洗涤板三次。然后在室温下使用3%乳阻断板1小时。使用每孔20nM的TREM2-Fc蛋白和15μg/ml或5μg/ml的TREM2抗体孵育板。然后在室温下洗涤板三次并且使用二抗山羊抗人Fc HRP孵育1小时。再次在室温下洗涤板三次并且将100μL的TMB添加到每个孔。在反应完成之后,每孔添加50μL的2N硫酸以使反应停止。在630和450nm下使用酶标仪读取板。
[0756] 如图10A和图10B所示,与同种型对照(msIgG1)相比,可溶性全长抗TREM2抗体7E5增加表达小鼠TREM2的细胞中的磷脂酰丝氨酸(PS)的效能和最大作用。与同种型对照(msIgG1)相比,7E5还增加表达小鼠TREM2的细胞中的鞘磷脂(SM)的最大作用(图10C和图
10D)。这些结果指示抗体7E5还能够增强由PS和SM(据信,它们是TREM2的天然配体)诱导的TREM2依赖性基因转录。
[0757] 如图10E所示,与同种型对照(msIgG1)相比,抗TREM2抗体3A7、2F6、11H5、以及8F8增加表达小鼠TREM2的细胞中的磷脂酰丝氨酸(PS)的最大作用,这指示这些抗体能够增强天然配体(诸如PS)诱导TREM2依赖性基因转录。
[0758] 图10F示出相比于激动性抗TREM2抗体7E5,商业抗TREM2抗体(R&D目录号F7E57291)抑制鞘磷脂(SM)的活性。
[0759] 如图11A所示,可溶性全长抗TREM2抗体9F5增加表达人TREM2的细胞中的磷脂酰丝氨酸(PS)的最大作用。此结果指示抗体9F5能够增强由PS(据信,它是TREM2的天然配体)诱导的TREM2依赖性基因转录。作为对照,小鼠IgG1同种型抗体不具有作用(图11B)。
[0760] 与抗体9F5相似,与同种型对照(msIgG1)相比,抗TREM2抗体7B3、9G1、9G3、11A8、12F9、3B10、以及8F8也增加表达人TREM2的细胞中的磷脂酰丝氨酸(PS)的最大作用(图11C和图11D)。这些结果指示这些抗体能够增强由天然配体(诸如PS)诱导的TREM2依赖性基因转录。
[0761] 如图11E和图11F所示,在ELISA结合测定中,可溶性全长抗TREM2抗体9F5增加重组人TREM2与APOE3的结合的强度。所述结果指示抗体9F5能够使与TREM2的天然配体的结合稳定。相比之下,其他抗体(诸如抗体9G3)拮抗TREM2与APOE3的结合。作为对照,小鼠IgG1同种型抗体不具有作用。
[0762] 将图8A-图8F和图9A-图9C中的结果一起考虑,这些结果证明激动性抗TREM2抗体与TREM2的天然配体(诸如PS、SM、和APOE)协同作用来增强TREM2依赖性基因转录,因为由激动性抗TREM2抗体和TREM2配体的组合诱导的TREM2依赖性基因转录的增加的水平大于当由单独抗TREM2抗体和单独TREM2配体诱导的水平相加在一起时所期待的TREM2依赖性基因转录的累积水平。
[0763] 实施例10:TREM2抗体诱导巨噬细胞杀伤
[0764] 在先天免疫细胞(例如,骨髓衍生的巨噬细胞)中评价可溶性非交联的抗TREM2抗体的拮抗性功能性。
[0765] 在20ng/ml M-CSF和10μg/ml的可溶性非交联的抗TREM2抗体1H7、2F6、2H8、2A7、7E5、7F8、8F8、R&D(R&D目录号F7E57291)或作为同种型对照的小鼠IgG1(mIgG1)或大鼠IgG2b(R IgG2b)的存在下将从C57Bl6小鼠获得的骨髓衍生的巨噬细胞铺板在非组织培养物处理的96孔板上。每种条件一式三份进行铺板。3天后使用CellTiter- 试剂盒
(Promega)执行细胞活力分析。使用GEN5TM 2.04软件使用BioTek SynergyTM酶标仪读取板。
[0766] 在图12A中,虚线指示使用非处理的巨噬细胞(即,没有添加抗体)获得的平均细胞活力。0%参考指示当巨噬细胞在M-CSF不存在下进行培养时获得的平均细胞活力。
[0767] 当使用可溶性非交联的抗TREM2抗体评价巨噬细胞细胞活力时,结果指示在3天培养之后抗体1H7、2H8、和7F8以及商业抗体R&D使细胞活力降低约50%。相比之下,抗体3A7、7E5、2F6、以及8F8对于原代巨噬细胞不具有显著的细胞毒性作用。
[0768] 实施例11:TREM2增加免疫细胞的存活
[0769] 体外细胞存活
[0770] 为了评价抗TREM2抗体增强体外细胞存活的能力,将FcgRI、FcgRIII、和FceRI受体的γ链亚基缺陷的巨噬细胞(Fcgr1KO小鼠,REF:Takai T,Li M,Sylvestre D,Clynes R,Ravetch J.(1994).Cell,76:519-529)在板结合的抗TREM2抗体的存在下进行培养,并且当细胞在亚于最佳的生长条件中培养时确定细胞活力。
[0771] 通过使用冷PBS冲洗胫骨和股骨骨髓细胞来获得来自FcgR1KO小鼠(Taconic,模型584)的鼠骨髓前体细胞。在使用PBS一次洗涤之后,使用ACK裂解缓冲液(Lonza)使红细胞裂解,使用PBS洗涤两次并且以0.5x106个细胞/ml重悬浮在具有指示量的产生巨噬细胞的M-CSF(Peprotech)的完全RPMI培养基(10%FCS,青霉素/链霉素,Gln,neAA)中。为了分析骨髓衍生的巨噬细胞的细胞活力,如上制备细胞并且以2.5x104个/200μl铺板在具有在非组织培养物处理的板中的亚于最佳量的M-CSF(10ng/ml)的96孔板中,持续两天。然后使用
ToxGloTM试剂盒(Promega)定量细胞并且将发光确定为细胞活力的量度。所有实验在抗TREM2抗体或同种型对照抗体的存在或不存在下实施。
[0772] 如图12B所示,使TREM2受体与板结合的抗TREM2抗体7E5、2F6、3A7、以及8F8交联增加在亚于最佳的培养条件中具有代谢活性的巨噬细胞的数量。事实上,与同种型对照(mIgG1)相比和与非处理巨噬细胞(虚线)相比,与板结合的抗TREM2抗体7E5、2F6、3A7、以及
8F8的孵育使细胞活力增加约50%。
[0773] 体内细胞存活
[0774] 为了评价抗TREM2抗体增加体内免疫细胞的数量的能力,对C57Bl6小鼠腹膜内(IP)注射抗TREM2抗体7E5或小鼠IgG1同种型对照抗体,并且然后通过FACS定量大脑中免疫细胞的数量。
[0775] 三至四只小鼠/组接受40mg/kg抗TREM2抗体7E5或同种型对照抗体mIgG1(克隆MOPC-21,Bioxcell)的IP注射。48小时后,收获整个大脑,使用PBS冲洗,在37℃下在含有
1mg/ml胶原酶的PBS中孵育并且通过细胞过滤器(cell strainer)进行处理以获得单细胞悬浮液。然后在冰上将细胞与抗CD45-PerCp-Cy7、抗CD11b-PerCP-Cy5.5、抗Gr1-FITC抗体以及细胞活力染料(Life Technologies,目录号L34957)一起孵育30min,然后使用冷FACS缓冲液洗涤两次。然后通过FACS分析4%PFA固定的样品。在BD FACSCantoTM II细胞仪(Becton Dickinson)上获取数据并且使用FlowJo软件进行分析。
[0776] 如图12C所示,与使用同种型对照抗体进行的处理相比,使用抗TREM2抗体7E5进行的处理增加大脑或与大脑相关联的血管中的共表达标志物CD11b和Gr1的免疫细胞的数量。与同种型对照或非处理细胞(约4000个细胞)相比,仅使用抗TREM2抗体7E5进行的处理诱导平均而言50%那样多的CD11b+Gr1+细胞(约6,000)的募集。单核细胞/巨噬细胞谱系的细胞定义为对于表面标志物CD11b和Gr1是阳性的。
[0777] 实施例12:诱导基因表达或增强由天然配体或由与天然配体的结合诱导的基因表达的TREM2激动性抗体的概述
[0778] 图9A和图9B概述以上实施例3-11所述的功能性研究的结果。抗TREM2抗体展示呈溶液形式或在抗体簇集(即,通过板结合)之后在调控表达人TREM2(表9A)或小鼠TREM2(表9B)的细胞中的TREM2依赖性基因表达方面的激动性或拮抗性活性,如通过荧光素酶报告基因或通过调控与TREM2的结合的强度所测量的。如表9A和表9B所指示的,TREM2抗体的子组在板结合时显示出激动性活性。TREM2抗体的另一个子组在呈溶液形式时显示出激动性活性。TREM2抗体的第三个子组显示出可溶性非交联抗体的拮抗性作用。某些抗TREM2抗体增加重组TREM2蛋白与配体(例如,APOE3)的结合,而其他抗TREM2抗体降低重组TREM2蛋白与配体(例如,APOE3)的结合。
[0779] 在表9A中,“培养基”是指仅培养基对照,“mIgG1”是指小鼠IgG1同种型对照抗体,“mIgG2a”是指小鼠IgG2a同种型对照抗体,“mIgG2b”是指小鼠IgG2b同种型对照抗体,“rIgG1”是指大鼠IgG1同种型对照抗体,“RIgG2a”是指大鼠IgG2a同种型对照抗体,“RIgG2b”是指大鼠IgG2b同种型对照抗体,“P+I”是指PMA/离子霉素对照,并且“ND”是指未确定。
[0780] 表9A:使用人TREM2的TREM2抗体功能性研究
[0781]
[0782]
[0783]
[0784] 在表9B中,“mIgG1”和“rIgG2b”是指同种型对照抗体,“NT”是指非处理对照,“RDT2”是指来自R&D(R&D目录号F7E57291)的商业抗TREM2抗体,“PMA”是指仅PMA阳性对照,“ND”是指未确定,并且“BMMAc杀伤溶液”是指降低的骨髓衍生的巨噬细胞活力(由于增加的巨噬细胞杀伤)。
[0785] 表9B:使用小鼠TREM2的TREM2抗体功能性研究
[0786]
[0787] 实施例13:TREM2抗体增加免疫细胞的募集和体内促炎信号的诱导的作用的分析[0788] 免疫细胞的募集
[0789] 评价TREM2抗体在抗体单独的或与LPS组合的腹膜内(IP)施用之后调控C57Bl6小鼠的腹膜腔(PEC)中的炎性细胞(嗜中性粒细胞、单核细胞、和巨噬细胞)的募集的能力。如图13A所述对四只小鼠/组进行处理。简而言之,小鼠首先接受40mg/kg抗TREM2抗体7E5、抗体8F8、或同种型对照抗体mIgG1(克隆MOPC-21,Bioxcell)的IP注射。十四小时后,小鼠接受4mg/kg LPS或作为对照的PBS的IP注射。LPS或PBS注射后六小时,如所述的从PEC收获细胞(参见,例如,Gawish R等人,2014FASEB J)并且通过FACS进行分析。对于FACS分析,在冰上将PEC细胞与抗CD11b-Pacific Blue、抗CD11c PeCy7、抗MCH-II-APCCy7、抗Gr1-FITC、抗Ly6G-PE以及活力染料(Life Technologies,目录号L34957)一起孵育1小时,然后使用FACS缓冲液洗涤两次。然后获取4%PFA固定的样品。在BD FACS CANTO II细胞仪(Becton 
Dickinson)上获取数据并且使用FlowJo软件进行分析。
[0790] 如图13B和图13C所示,与使用对照抗体进行的处理相比,使用抗TREM2抗体7E5进行的处理增加在PEC中募集的嗜中性粒细胞的数量。抗TREM2抗体7E5对于嗜中性粒细胞募集的作用在LPS的存在下更明显,从而指示抗TREM2抗体7E5与LPS在PEC中募集嗜中性粒细胞方面协同作用。如图13D和图13E所示,与使用对照抗体进行的处理相比,使用抗TREM2抗体8F8进行的处理不增加在PEC中募集的嗜中性粒细胞的数量。嗜中性粒细胞定义为对于表面标志物Ly6G和Gr1是阳性的。
[0791] 如图13F、图13G、图13H、以及图13I所示,与使用对照抗体进行的处理相比,使用抗TREM2抗体7E5或8F8进行的处理不增加在PEC中募集的驻留型巨噬细胞的数量。驻留型巨噬细胞定义为对于表面标志物CD11b是阳性的,并且对于表面标志物F4/80是高度阳性的。
[0792] 如图13J、图13K、图13L、以及图13M所示,与使用对照抗体进行的处理相比,使用抗TREM2抗体7E5和8F8进行的处理增加在PEC中募集的小的浸润性巨噬细胞的数量。抗TREM2抗体7E5和8F8对于小的浸润性巨噬细胞募集的作用在LPS的存在下不增加,从而指示单独的抗TREM2抗体7E5和8F8足以在PEC中募集小的浸润性巨噬细胞。小的浸润性巨噬细胞定义为对于表面标志物CD11b是阳性的,并且对于表面标志物F4/80是中等阳性的。使用学生T检验计算图13A-图13M中的统计值,*Pval<0.05,**Pval<0.01,***Pval<0.001。
[0793] 先前的结果证明抗TREM2抗体7E5诱导体内激动性活性,并且抗TREM2抗体8F8充当体内阻断抗体。图13A至图13M中的结果指示抗体7E5诱导注射LPS的小鼠的腹膜中的体内嗜中性粒细胞积累,而抗体8F8注射在LPS诱导的白血病期间减少嗜中性粒细胞(和浸润性巨噬细胞)的积累。所述结果确认抗体8F8是体内阻断抗体。
[0794] 促炎信号的诱导
[0795] 评价TREM2抗体在抗体单独的或与LPS组合的腹膜内(IP)施用之后调控C57Bl6小鼠的腹膜腔(PEC)中的促炎细胞因子(CCL4、IL-1β、和MCP-1)的产生的能力。如图13N所述对小鼠进行处理。简而言之,小鼠在第0天接受40mg/kg抗TREM2抗体7E5、抗体8F8、或同种型对照抗体mIgG1(克隆MOPC-21,Bioxcell)的IP注射。在第1天,小鼠接受4mg/kg LPS或作为对照的PBS的IP注射。LPS或PBS注射之后1.5小时,通过细胞计数珠粒阵列(CBA)测量来自小鼠的血清样品中的CCL4、IL-1β、和MCP-1(CCL2)的浓度。
[0796] 如图13O至图13Q所示,抗TREM2抗体7E5诱导体内CCL4、IL-1β、和MCP-1的增强的产生。然而,抗TREM2抗体8F8不诱导CCL4、IL-1β、或MCP-1产生的体内增加(图13O至图13Q)。
[0797] 实施例14:TREM2抗体增加小鼠中的可溶性TREM2的水平
[0798] 据信,TREM2的细胞外部分可脱落为可溶性形式(sTREM2),并且因此可在血浆和脑脊髓液(CSF)中检测。还据信,与健康对照个体相比,在患有阿尔茨海默氏病或额颞叶痴呆的个体中,CSF中的sTREM2的量减少。
[0799] 为了确定存在于注射抗TREM2抗体7E5之后2天、4天、8天和15天的小鼠的血清中的抗TREM2抗体的量,利用标准ELISA方法。简而言之,在4℃下在碳酸盐涂覆缓冲液(pH 9.6)中以100uL/孔使用0.1ug/孔重组小鼠TREM2蛋白过夜涂覆ELISA板。然后洗涤板并且在室温下使用在PBS中的3%脱脂乳粉末阻断1小时,并且然后进行洗涤。在PBS-Tween中滴定小鼠血清样品,以100uL/孔添加到板,并且在振荡下在37℃下孵育1小时。使用山羊抗小鼠IgG1-HRP二抗检测抗TREM2抗体,并且使用TMB底物显色。将限定量的抗TREM2抗体7E5掺入在天然小鼠的血清中并且进行滴定以获得校准曲线。结果描绘在图14中,并且指示抗体7E5在小鼠的血清中的半衰期是大约9.3天。
[0800] 为了确定抗TREM2抗体对于小鼠中的sTREM2的血清水平的作用,在注射可溶性抗TREM2抗体7E5之后2天、4天、8天以及15天测量存在于来自小鼠的血液样品中的sTREM2的量。使用标准ELISA方法测量sTREM2的血清水平。简而言之,在4℃下使用2μg/ml的100μl的捕获抗TREM2抗体(ADI-9)过夜涂覆Immulon ELISA 96孔板。在第二天早上,使用200μl洗涤缓冲液(PBS+0.05%Tween-20)洗涤板三次。然后在定轨振荡器上在室温下通过添加300μl结合缓冲液(PBS+1%BSA)阻断板1h。随后将血清样品(1:12稀释)和标准物(重组小鼠TREM2,R&D Systems)添加在100μl结合缓冲液中,并且在室温下孵育板1h。然后使用200μl洗涤缓冲液洗涤板三次。以1:10,000将检测生物素酰化的大鼠抗TREM2(R&D Systems,使用来自Life Technologies Pierce的微NHS-Peg4-生物素酰化试剂盒进行生物素酰化)添加在100μl结合缓冲液中,并且在定轨振荡器上在室温下孵育1h。然后使用200μl洗涤缓冲液洗涤板三次。将结合缓冲液中的1:200的100μl链霉抗生物素蛋白-HRP(R&D Systems)添加到板并且在定轨振荡器上孵育20min。然后使用200μl洗涤缓冲液洗涤板三次,并且添加100μl TMB底物(Life Technologies Pierce)并且在板振荡器上孵育,直至显色为止。通过添加50μl硫酸使反应停止,并且使用Biotek Synergy H1酶标仪定量颜色。
[0801] 如图15所示,抗TREM2抗体7E5以剂量依赖性方式增加sTREM2在小鼠中的血清半衰期。此血清水平的增加可充当TREM2抗体的生物活性的生物标志物。
[0802] 实施例15:TREM2抗体降低TREM2的细胞表面水平
[0803] 据信,靶向在免疫细胞的表面上表达的某些ITIM/ITAM受体的抗体可降低单核细胞、巨噬细胞、树突细胞、和/或小神经胶质细胞上的受体的表面水平。
[0804] 评价抗TREM2抗体减少小鼠原代骨髓衍生的巨噬细胞(BMDM)上的TREM2的细胞表面表达的能力。在预先涂覆有增加浓度的磷脂酰丝氨酸(PS)或鞘磷脂(SM)(据信,它们是TREM2的天然配体)的96孔组织培养板中培养BMDM。添加Syk抑制剂(R408)或10ug/ml的可溶性抗TREM2抗体或同种型对照抗体。24小时后,针对细胞表面上的TREM2表达通过FACS分析BMDM。使用商业抗TREM2抗体(R&D目录号F7E57291)检测TREM2表达。
[0805] 如图16A所示,TREM2配体PS和SM两者均能够以剂量依赖性方式降低TREM2的细胞表面水平。TREM2的细胞表面水平在最有效的PS剂量下降低约75%(图16A)。SM的作用比PS较不明显。使用SM获得的TREM2的细胞表面水平的最大减少是约30%(图16A)。
[0806] 图16B证明单独使用可溶性抗TREM2抗体3A7或2F6进行的处理使TREM2的细胞表面水平降低约58%,这与在TREM2配体的情况下所看到的减少相似。R408是SYK抑制剂,其也降低TREM2细胞表面水平。所述结果指示通过脂质结合进行的TREM2信号传导的活化和由信号传导(SYK)抑制剂诱导的抑制两者均降低TREM2的细胞表面水平。相似地,TREM2抗体3A7和2F6也降低TREM2细胞表面水平。
[0807] 实施例16:抗TREM2抗体在阿尔茨海默氏病的小鼠模型中的作用的分析
[0808] 阿尔茨海默氏病的小鼠模型
[0809] APP/PS1小鼠含有APP和PSEN1两者的人转基因。APP人转基因包含瑞典突变(K670N,M671L),并且PSEN1人转基因包含L166P突变。两种转基因均在Thy1启动子的控制下。
[0810] 5XFAD小鼠过表达具有瑞典(K670N、M671L)、佛罗里达(I716V)、和伦敦(V717I)家族性阿尔茨海默氏病(FAD)突变的突变人APP(695)。5XFAD小鼠还过表达具有两个FAD突变M146L和L286V的人PS1。两种转基因均在小鼠Thy1启动子的控制下以驱动在大脑中的过表达并且再现阿尔茨海默氏病的主要特征。
[0811] Tg2576小鼠过表达携带瑞典突变(KM670/671NL)的突变体形式的APP(亚型695)。
[0812] 对于向4月龄的APP/PS1小鼠或5月龄的5xFAD小鼠的颅内注射,五只小鼠/组接受2ul如所述的抗TREM2抗体7E5或同种型对照抗体mIgG1(克隆MOPC-21,Bioxcell)的1或5mg/ml溶液的注射(Wilcock DM等人,(2003)J Neurosci 23:3745;Wilcock DM等人,(2004)Neurobiol Dis 15:11;Sudduth等人,(2013)J.Neurosci,33,9684。在手术当天,对小鼠进行称重,使用异氟烷进行麻醉,并且放置在立体定位装置(51733D数字双操纵器小鼠立体定位框架;Stoelting)中。制作中间矢状切口以使脑颅暴露,并且使用安装在立体定位框架中的牙钻在距离以下坐标的额叶皮层和海马体上钻四个钻孔:额叶皮层,前后径+1.7mm,侧向±2.0mm;海马体,前后径-2.7mm;侧向±2.5mm,均从前囟测量。将附接到含有待注射的溶液的10ml Hamilton注射器(Hamilton)的26规格针在前囟前侧下降3.0mm,并且在2min时间段内进行2μl注射。清理切口并且使用外科钉封闭。注射后三天,使用盐水灌注小鼠并且解剖大脑的右半球为额叶皮层、海马体、大脑的其他部分,并且快速冷冻。将剩下的一半浸入固定在新鲜制备的4%多聚甲醛中。
[0813] 对于3月龄的野生型(WT)小鼠或5xFAD转基因小鼠的全身治疗,对动物每周腹膜内注射50mg/kg 7E5抗体或小鼠IgG1同种型对照抗体,进行16周。在实验结束时,使用正常盐水灌注小鼠,并且提取整个大脑。将左半脑固定在4%多聚甲醛中24h,接着进行免疫组织化学。将右半脑解剖为额叶皮层、海马体和小脑,并且在液氮中快速冷冻。
[0814] 在体内大脑中的抗TREM2抗体处理之后细胞因子和趋化因子表达的分析
[0815] 在颅内(IC)施用抗TREM2抗体之后评价抗TREM2抗体调控APP/PS1小鼠和5XFAD小鼠的大脑的不同区域中的炎性基因表达的能力。
[0816] 根据制造商的说明书使用Trizol加RNA纯化系统(Ambion,Invitrogen)从左海马体提取RNA。使用BioSpec纳米分光光度计(Shimadzu)定量RNA,并且根据制造商的说明书使用cDNA高容量试剂盒(Applied Biosystems)反向转录cDNA。使用包含感兴趣的基因IL-1b、IL-6、TNFa、IL-12、YM-1、IL-1Ra、MRC1、IL-10、CD86、FCGR1B、CCL2、CCL3、CCR2、CXCL10、Gata3、Rorc、OPN、FLT1、CSF-1、MHC-II、AXL、以及TGFb的 基因表达探针的384孔微流体卡定制 测定(Applied Biosystems,Invitrogen)执行实时PCR。所有的基
因表达数据归一化为18S rRNA表达。使用ΔCT方法确定倍数变化。数据呈现为平均值±SEM。使用JMP统计分析程序(SAS)执行统计分析。在p值低于0.05的情况下指定统计显著性。
在适当的情况下,使用单因素ANOVA和双因素ANOVA沿时间过程检测处理差异和处理组内的差异。
[0817] 如图17A所示,使用抗TREM2抗体7E5进行的APP/PS1小鼠的处理显著地使IL-1b、IL-6、TNFa、以及CD86的表达增加大约2倍。FCGR1B的表达增加大约3倍,并且IL-10的表达增加大约4倍。相比之下,IL-1Ra的表达降低一半。IL-12、YM-1、MRC1、以及TGFB的表达保持不变。
[0818] 如图17B所示,使用抗TREM2抗体7E5进行的5XFAD小鼠的颅内注射在注射后72小时显著地使IL-1b、TNFa、YM-1、CD86、CCL2、CCL3、CCR2、CXCL10、Gata3以及Rorc的表达增加大约2倍。CCL5的表达增加大约3倍。TGF-β1的表达保持不变。如图17C所示,FLT1水平在7E5注射之后增加。使用包含IL-1b、TNFa、YM-1、IL-1Rn CD86、TGF-β1、CCL2、CCL3、CCL5、CCR2、CXCL10、Gata3、FLT1以及Rorc的 基因表达探针的TaqMan测定(Applied Biosystems,Invitrogen)和实时PCR测量在注射抗TREM2抗体7E5之后24小时和72小时
5XFAD小鼠的海马体中的促炎和抗炎基因的表达。
[0819] 向5xFAD小鼠每周注射抗体7E5三个月时间降低CD11c的水平,同时增加Fabp3的水平(图17D-图17P)。相比之下,CCL2、CXCL10、Rorc、Fabp5以及TNFa的水平增加。所述结果指示抗体7E5调控炎性信号传导并且因此可引发治疗性益处(图17D-图17P)。
[0820] 淀粉样蛋白β肽积累
[0821] 如上所述在将抗TREM2抗体颅内(IC)注射到APP/PS1小鼠中之后或在将抗TREM2抗体7E5腹膜内注射到5xFAD小鼠之后评价抗TREM2抗体减少大脑的不同区域中的淀粉样蛋白β(Aβ)肽的量的能力。对于Aβ肽的定量,使多聚甲醛固定的左半脑穿过一系列的10%、20%、和30%蔗糖溶液作为防冻保护,并且使用滑动切片机采集25μm冷冻水平切片并且在4℃下漂浮在含有叠氮化钠的PBS中保存。首先固定跨越估计的注射位点300μm间隔的切片并且通过甲酚紫染色以鉴别注射位点。对于所有随后的组织学和免疫组织化学,选择并分析跨越注射位点、100μm间隔开的六个切片。执行Aβ(兔多克隆抗体Aβ1–16;Invitrogen)的自由漂浮的免疫组织化学。使用Nikon elements BR软件计算阳性染色占据的面积百分比。
[0822] 为了测量蛋白质裂解物中的Aβ肽水平,使用两步骤提取方法从右额叶皮层提取蛋白质。首先,将大脑在含有完全蛋白酶和磷酸酶抑制剂(Pierce Biotechnology)的PBS中均质化。在4℃下将这些样品在16,000X g下离心1h。去除上清液并且成为“可溶性”提取物。将所得的沉淀在100μl的70%甲酸中均质化并且在4℃下在16,000X g下离心1h。去除上清液并且用1M Tris-HCl以1:20中和并且成为“不可溶”提取物。根据制造商的说明书使用二辛可宁酸(bicinchoninic acid)蛋白测定确定可溶性和不可溶提取物两者的蛋白质浓度。使用Meso-Scale Discovery复用ELISA系统来测量Abeta 38(Aβ38)、Abeta40(Aβ40)、和Abeta 42(Aβ42)(MSD)。根据制造商的说明书运行ELISA试剂盒。
[0823] 如图17Q所示,使用抗TREM2抗体7E5进行的处理显著地降低对于Aβ肽染色阳性的大脑的面积。在额叶皮层中,与使用抗TREM2抗体7E5处理的小鼠中的组织的大约2%相比,Aβ肽覆盖使用对照抗体处理的小鼠中的组织的大约4%。在海马体中,与使用抗TREM2抗体7E5处理的小鼠中的组织的大约2%相比,Aβ肽覆盖使用对照抗体处理的小鼠中的组织的大约3%。
[0824] 如图17R所示,使用抗TREM2抗体7E5进行的5xFAD小鼠的注射显著地降低对于Aβ肽染色阳性的大脑的面积。在额叶皮层中,与使用抗TREM2抗体7E5处理的小鼠中的组织的大约12.5%相比,Aβ肽覆盖使用对照抗体处理的小鼠中的组织的大约20%。在海马体中,与使用抗TREM2抗体7E5处理的小鼠中的组织的大约7.5%相比,Aβ肽覆盖使用对照抗体处理的小鼠中的组织的大约12%左右。
[0825] 如图17S-图17U所示,使用抗TREM2抗体7E5进行的5XFAD小鼠的注射显著地降低不可溶蛋白质裂解物中的Aβ42肽的水平,但是不显著地降低Aβ30肽的水平。存在小的但是并非显著的Aβ40肽的降低。图17S示出Aβ38肽的水平。图17T示出Aβ40肽的水平。图17U示出Aβ42肽的水平。
[0826] 小神经胶质细胞免疫染色
[0827] 在使用抗TREM2抗体进行处理之后,评价抗TREM2抗体调控颅内注射抗TREM2抗体的APP/PS1小鼠或每周外周注射抗TREM2抗体7E5三个月的5xFAD小鼠中的大脑的不同区域中的小神经胶质细胞的数量、形态、和活化状态的能力。如上所述对小鼠进行处理,灌注,并且针对组织学处理大脑样品。选择并分析跨越注射位点、间隔开100μm的六个切片。将切片在一抗CD11b抗体中孵育,在室温下以1:3,000(大鼠单克隆,AbD Serotec,Raleigh,NC)在DPBS中的4%山羊血清中静置并且然后在4℃下过夜。然后将切片在生物素酰化的二抗中孵育2小时。山羊抗兔IgG用于GFAP,并且山羊抗大鼠用于CD11b,两者均为1:3,000(Vector Laboratories,Burlingame,CA)。通过在亲和素(advidin)-生物素复合物(ABC)(Vector Laboratories,Burlingame,CA)中孵育1小时来实现二抗信号的扩增。对于显色,根据制造商的说明书使用载体二氨基联苯胺(DAB)过氧化物酶试剂盒(Vector Laboratories,Burlingame,CA)。将切片固定在载片上,静置以过夜风干,在乙醇梯度中脱水接着进行二甲苯孵育,并且使用DPX封固剂(Electron Microscopy Sciences,Hatfield,PA)用盖玻片覆盖。使用Nikon elements BR软件计算阳性染色占据的面积百分比。
[0828] 如图17V所示,在APPPS1小鼠中使用抗TREM2抗体7E5进行的IC注射显著地降低对于CD11b染色阳性的大脑的面积。在额叶皮层中,与使用抗TREM2抗体7E5处理的小鼠中的大约22%相比,CD11b阳性细胞占据使用对照抗体处理的小鼠中的组织的大约10%。在海马体中,与使用抗TREM2抗体7E5处理的小鼠中的组织的大约22%相比,CD11b+细胞占据使用对照抗体处理的小鼠中的组织的大约14%。
[0829] 如图17W所示,使用抗TREM2抗体7E5进行的5XFAD小鼠的全身处理显著地增加对于CD11b染色阳性的大脑的面积。在额叶皮层中,与当使用抗TREM2抗体7E5处理小鼠时的组织的大约23%相比,当使用对照抗体处理小鼠时,CD11b阳性细胞占据组织的大约12%。在海马体中,与当使用抗TREM2抗体7E5处理小鼠时的组织的大约32%相比,当使用对照抗体处理小鼠时,CD11b+细胞占据组织的大约18%。
[0830] 认知和运动功能确定
[0831] 为了评价抗TREM2抗体延迟、预防、或逆转阿尔茨海默氏病(AD)的认知缺陷的能力,使用5X FAD小鼠。使用50mg/kg抗TREM2抗体7E5或使用同种型对照抗体mIgG1(克隆MOPC-21,Bioxcell)每周对5X FAD小鼠进行处理,进行12周。在处理结束时,使用放射臂水迷宫和新物品认知测试针对认知缺陷的减少对小鼠进行测试。
[0832] 放射臂水迷宫
[0833] 放射臂水迷宫是空间学习和记忆任务,如在Wilcock等人,(2006)The Journal of Neuroscience,26:5340中所描述的。简而言之,在12周的抗体处理之后,使5X FAD小鼠经受2天放射臂水迷宫规范,接着进行1天的开放池可见平台任务。所述装置是如先前在Gordon等人,(2001).Neurobiol Aging 22:377中所描述的六臂迷宫。放射臂水迷宫任务如先前在Wilcock等人,(2004).J Neuroinflammation 1:24中所描述的运行。在第1天,在五个单元中的三个中运行15个试验。小鼠还在四只小鼠的同龄组中跑动,从而允许每个试验之间的短暂休息(当其他三只小鼠在跑动时)以及当四只小鼠的另一个同龄组在跑动时单元之间的较长间断。这允许快速测试老年小鼠而不会出现疲劳。此外,与在10-14天的每日大量试验相比,试验的间隔实施似乎增强获取速率。每个试验的开始臂不同,目标臂两天保持恒定。对于前11个试验,平台交替地可见并且然后隐藏,并且对于最后四个试验保持隐藏。在第2天,小鼠以与第1天完全相同的方式跑动,不同的是所有试验的平台是隐藏的。在1min时间范围内测量每个试验中的错误(不正确的臂进入)的数量。为了避免不活动小鼠造成的混乱,每20s小鼠未能做出臂选择,指定一个错误。对三个连续试验的每只小鼠的错误进行平均,从而产生每天进行的试验的五个单元。使用StatView(SAS Institute,Cary,NC)通过ANOVA统计地分析试验单元。在2天的放射臂水迷宫之后,小鼠在具有可见平台的开放池任务中接受15次试验,以鉴别在辐射臂迷宫中的较差分数是否可归因于感官或性能缺陷而不是记忆受损。在当前研究中,所有的小鼠在可见平台形式的迷宫上均表现良好,并且没有一个因为感官或性能缺陷而被排除。
[0834] 如图17X所示,使用抗TREM2抗体7E5进行的处理显著地改善5XFAD小鼠中的特殊学习和记忆缺陷。在最后的单元(9-10)中,与当使用抗TREM2抗体7E5处理时的小于1个错误相比,当使用对照抗体处理时,5xFAD小鼠平均出现3个错误(图17X)。
[0835] 新物品认知测试
[0836] 新物品认知测试(NORT)是用于测量阿尔茨海默氏病的小鼠模型中的认知异常的灵敏且可再现测试。在隔声房间中,将5X FAD小鼠放置在类似开放玻璃水族箱的透明盒中进行1小时的适应期,每次一只。在第二天,将他们重新引入在具有两个相同的干净石膏物品的盒中5min,所述物品放置在盒的两个不同的角落中以测量基线活性。四小时后,将物品中的一个使用具有相同大小和纹理的新物品替换,并且将小鼠重新引入到相同的笼中持续额外的5min以测试新物品识别。由对于不同处理不知情的操作员手动地记录小鼠在物品探索中所花费的时间。记录在物品中的每个处所花费的累积时间。物品的探索定义为在2cm的距离处将鼻子指向物品和/或使用鼻子接触物品。动物研究新物品所花费的总时间占总探索时间的百分比是识别记忆的量度。在基线处,小鼠在两个物品中的每一个处花费大约相等的时间,因为两者对于小鼠均是新的。在测试中,认知上健康的小鼠将新物品识别为“新的”,记住旧物品,并且因此花费更多的时间探索新物品(约70%-75%的时间)。
[0837] 阿尔茨海默氏病随时间在5xFAD小鼠中发展,从而导致记忆力受损,因此探索新物品的时间百分比更小(相比于正常)。使用针对重复测量的双因素ANOVA和post hoc Fisher’s PLSD检验来测试NORT的显著性。数据表示为平均值±s.e.m。
[0838] 如图17Y所示,在使用抗TREM2抗体7E5处理的5XFAD小鼠中观察到认知功能的改善。使用对照抗体处理的5XFAD小鼠在探索新物品上花费仅大约50%的时间,这指示高度未配对的认知功能。相比之下,使用抗TREM2抗体7E5处理的小鼠在探索新物品上花费67%的时间,这接近于在野生型(WT)小鼠中测量的正常认知功能,从而指示几乎完全恢复。Post hoc Fisher’s PLSD检验用于统计分析**=Pval<0.01。
[0839] Tg2576小鼠阿尔茨海默氏病模型
[0840] 为了评价抗TREM2抗体延迟、预防、或逆转阿尔茨海默氏病(AD)的发展的能力,使用Tg2576小鼠。Tg2576小鼠过表达携带瑞典突变(KM670/671NL)的突变形式的APP(亚型695)。从98-99周龄开始使用50mg/kg抗TREM2抗体7E5或使用同种型对照抗体mIgG1(克隆MOPC-21,Bioxcell)每周对小鼠进行处理。使用免疫组织化学并且通过组织提取物的ELISA针对Aβ斑负荷测试小鼠。还使用Morris水迷宫(空间学习和记忆任务)、放射臂水迷宫(空间学习和记忆任务)、Y迷宫(将自发交替定量为空间认知的量度)、开放领域中的新偏好、评估学习和记忆的操作性学习、以及恐惧条件反射测试小鼠的大脑中小神经胶质细胞的数量和认知缺陷的减少(mousebiology.org website;Wang等人,(2015)Cell.pii:S0092-8674(15)00127-0)。
[0841] 实施例17:肿瘤微环境中的TREM2表达
[0842] 使用悬浮在100ul PBS中的1x106个MC38或CT26结肠癌细胞或EMT-6鼠乳腺癌细胞皮下攻击3只C57Bl6或BALB/c小鼠(雌性,8周龄)的组。在植入之前使用异氟烷对动物进行麻醉。当肿瘤达到700-1000mm3的大小时,将肿瘤取出以通过FACS分析肿瘤微环境中的TREM2表达。作为对比,也分析携带肿瘤的小鼠的脾或天然小鼠的对照脾。对于通过FACS进行的表达分析,将肿瘤和脾在含有1mg/ml胶原酶的PBS中孵育,并且然后通过染色的细胞(cell strained)进行处理以获得单细胞悬浮液。然后在冰上将细胞与抗CD45-PerCp-Cy7、抗CD11b-PerCP-Cy5.5、抗CD3-PC、抗Gr1-FITC、抗NK1.1-PE、抗TREM2-APC抗体以及活力染料(Life Technologies,目录号L34957)一起孵育30min,然后使用冷FACS缓冲液洗涤两次。然后获取4%PFA固定的样品。在BD FACS CANTO II细胞仪(Becton Dickinson)上获取数据并且使用FlowJo软件进行分析。
[0843] 如图18所示,发现TREM2在约5%-20%的CD45+CD3-CD11b+Gr1-髓样细胞(其包括巨噬细胞、单核细胞、和树突细胞)中和在约5%-20%的浸润MC38、CT26和EMT6肿瘤的CD45+CD3-CD11b+Gr1+骨髓来源的抑制细胞(MDSC)中的细胞表面上表达。未发现TREM2在携带肿瘤的小鼠或天然小鼠的脾中表达。这些结果指示MC38、CT26、和EMT-6肿瘤刺激TREM2在髓样细胞的子组中的细胞表面表达。
[0844] 实施例18:TREM2缺陷小鼠中的肿瘤生长的分析
[0845] 使用悬浮在100ul PBS中的1x106个MC38结肠癌肿瘤细胞皮下攻击TREM2野生型(WT,n=11)和TREM2敲除(KO,n=14)小鼠的组(性别和年龄匹配的同窝出生小鼠,10+/-2周龄)。在植入之前使用异氟烷对小鼠进行麻醉。在第5天开始使用卡尺每两周一次监测肿瘤生长以测量肿瘤生长。实验的终点是2000mm3的肿瘤体积或60天。随时间的肿瘤大小(表达为体积,mm3)是结果测量值。
[0846] 图19A示出在肿瘤注射之后的较早时间点处(第8天),与野生型(WT)小鼠相比,平均肿瘤大小在TREM2敲除(KO)小鼠中显著地更小,而肿瘤大小的差异在较晚时间点处(第26天)变得不再统计上显著。与野生型(WT)小鼠相比,中值肿瘤生长在TREM2(KO)小鼠中减少(图19B)。这些结果表明TREM2促进肿瘤生长,并且在肿瘤进展的较早阶段中是特别突出的。
[0847] 实施例19:TREM2抗体在乳腺癌的小鼠模型中的抗癌作用的分析
[0848] 使用悬浮在100ul PBS中的5x106个EMT-6肿瘤细胞皮下攻击10只8周(+/-2周)龄的BALB/c小鼠的组。在植入之前使用异氟烷对动物进行麻醉。在第2天开始,在第1天、第4天、第8天、第15天、以及第22天对小鼠的组IP注射40mg/kg的抗TREM2抗体。在第4天开始使用卡尺每两周一次监测肿瘤生长以测量肿瘤生长。实验的终点是2000mm3的肿瘤体积或60天。肿瘤生长和存活%是结果测量值。肿瘤摄取和生长速率降低、肿瘤浸润免疫抑制巨噬细胞的数量减少、以及到肿瘤中的效应T细胞流入增加指示阻断性抗TREM2抗体的抗癌作用。
[0849] 实施例20:将TREM2抗体与针对抑制性检查点蛋白或抑制性细胞因子/趋化因子及其受体的抗体组合的组合疗法在乳腺癌的小鼠模型中的相加的抗肿瘤作用的分析
[0850] 使用悬浮在100ul PBS中的5x106个EMT-6肿瘤细胞皮下攻击10只8周(+/-2周)龄的BALB/c小鼠的组。在植入之前使用异氟烷对动物进行麻醉。在第2天开始,在第1天、第4天、第8天、第15天、以及第22天对小鼠的组IP注射40mg/kg的单独的抗TREM2抗体或在第8天和第11天与针对检查点蛋白的抗体(例如,抗PDL1mAb克隆10F.9G2和/或抗CTLA-4mAb克隆9H10)的组合。处理组包括抗TREM2;抗CTLA-4;抗TREM2+抗CTLA-4以及同种型对照。在第4天
3
开始使用卡尺每两周一次监测肿瘤生长以测量肿瘤生长。实验的终点是2000mm 的肿瘤体积或60天。肿瘤生长和存活%是结果测量值。使用组合疗法肿瘤生长降低和存活百分比增加指示抗TREM2抗体与抗检查点抗体具有相加或协同治疗性作用。针对检查点分子的拮抗性抗体包括针对PDL1、PDL2、PD1、CTLA-4、B7-H3、B7-H4、HVEM、BTLA、KIR、GAL9、TIM3、A2AR、LAG-3、以及磷脂酰丝氨酸(PS)的抗体。针对抑制性细胞因子的拮抗剂抗体包括针对CCL2、CSF-1和IL-2的抗体。
[0851] 实施例21:将TREM2抗体与活化刺激性检查点蛋白的抗体组合的组合疗法的相加的抗肿瘤作用的分析
[0852] 使用肿瘤细胞皮下攻击15只8周(+/-2周)龄的C57Bl6/NTac小鼠的组,如在实施例19中所描述的。在植入之前使用异氟烷对动物进行麻醉。在第2天开始,在第3天、第6天、和第9天对小鼠每3天腹膜内注射4个剂量单独的200ug抗TREM2抗体或与活化刺激性检查点蛋白的激动性抗体(例如,OX40或ICOS mAb)的组合。在第4天开始使用卡尺每两周一次监测肿瘤生长以测量肿瘤生长。实验的终点是2000mm3的肿瘤体积或60天。肿瘤生长和存活百分比是结果测量值。使用组合疗法肿瘤生长降低和存活百分比增加指示抗TREM2抗体与刺激性检查点抗体具有相加或协同治疗性作用。刺激性检查点抗体包括针对CD28、ICOS、CD137、CD27、CD40、以及GITR的激动性/刺激性抗体。
[0853] 实施例22:将TREM2抗体与刺激性细胞因子组合的组合疗法的相加的抗肿瘤作用的分析
[0854] 使用肿瘤细胞皮下攻击15只8周(+/-2周)龄的C57Bl6/NTac小鼠的组,如在实施例19中所描述的。在植入之前使用异氟烷对动物进行麻醉。在第2天开始,对小鼠每3天腹膜内注射4个剂量单独的200ug抗TREM2抗体或与刺激性细胞因子(例如,IL-12、IFN-a)的组合。
在第4天开始使用卡尺每两周一次监测肿瘤生长以测量肿瘤生长。实验的终点是2000mm3的肿瘤体积或60天。肿瘤生长和存活百分比是结果测量值。使用组合疗法肿瘤生长降低和存活百分比增加指示抗TREM2抗体与免疫刺激性细胞因子具有相加或协同治疗性作用。刺激性细胞因子包括IFN-a/b、IL-2、IL-12、IL-18、GM-CSF、以及G-CSF。
[0855] 实施例23:炎性疾病的模型中激动性TREM2抗体和/或TREM2双特异性抗体的治疗性用途的表征
[0856] 在炎性疾病的模型中测试激动性抗TREM2抗体和/或TREM2双特异性抗体的治疗性用途。例如,类风湿关节炎或在建立的另一种炎性疾病的模型中(Mizoguchi(2012)Prog Mol Biol Transl Sci.,105:263-320;以及Asquith等人,(2009)Eur J Immunol.39:2040-4)。
[0857] 实施例24:完整动物中针对EAE和双环己酮草酰二腙的体内保护
[0858] 对成年7-9周龄的雌性C57BL/6小鼠(从Charles River Laboratories获得)在尾巴基部中两侧注射含有100μg的髓鞘少突胶质细胞糖蛋白肽35-55(氨基酸MEVGWYRSPFSRVVHLYRNGK(SEQ ID NO:885);Seqlab)和1mg的在不完全弗氏佐剂(Difco)中的结核分枝杆菌H37Ra(Difco)的200μl的接种物。在免疫之后在第0天和在第2天注射百日咳毒素(200ng;List Bio-logical Laboratories)。如下对临床体征进行评分:0,没有临床体征;1,完全无力的尾巴;2,完全无力的尾巴和异常步态;3,一个后肢轻度瘫痪;4,完全后肢轻度瘫痪;以及5,前肢和后肢麻痹或垂死。仅使用在第14天具有疾病发作的小鼠(1或更大的临床评分)用于实验。在第一临床症状的当天或在任何其他所需的时间处对患有EAE疾病的小鼠中腹膜内或静脉内注射激动性抗TREM2抗体和/或TREM2双特异性抗体(PLoS Med(2007)4(4):e124)。
[0859] 对年轻或老年的野生型(WT)老鼠饲喂含有0.2%双环己酮草酰二腙(CPZ)粉末状草酸双(亚环己基酰肼)(Sigma-Aldrich)的标准饮食(Harlan)持续4周、6周或12周。对于组织学和免疫组织化学分析,在对小鼠灌注4%多聚甲醛(PFA)之后取出大脑,固定在4%PFA中24h,接着浸没在30%蔗糖中24-28h。为了评价髓鞘完整性和损害以及细胞增殖,使用抗MBP(1:100;Abcam,ab7349)、抗dMBP(1:2000;Millipore,ab5864)、抗βAPP(1:100;Invitrogen,51-2700)、抗SMI-31(1:1000;Covance,smi-31R)、抗Iba1(1:600;Wako,019-
19741)、抗BrdU(1:250;Abcam,7E5893)、抗GFAP(1:200;Invitrogen,13-0300)、抗iNOS(1:
100;BD Pharmingen,610329)、抗LPL(1:400,来自Dr.G.Olivecrona)以及抗MHC II(1:100;
BD Pharmingen,553549)对炎症切片或小鼠大脑进行染色。对于抗体的行为作用,使用透明聚苯乙烯外壳和计算机化光束器械针对运动活性分析小鼠。分析一般活性变量(总走动、垂直直立活动),连同情绪指数,包括花费的时间、行走的距离和进入。执行一套感觉运动测试以评估平衡(突出部和平台)、强度(倒置的挡板)、协调(杆和倾斜的挡板)以及动作的启动(行走启动)。使用旋转杆方案研究运动协调和平衡(Cantoni等人,Acta Neuropathol
(2015)129(3):429-47)。
[0860] 实施例25:建立的创伤性脑损伤的动物模型中激动性TREM2抗体和/或TREM2双特异性抗体的治疗性用途的表征
[0861] 在建立的创伤性脑损伤的动物模型中测试激动性抗TREM2抗体和/或TREM2双特异性抗体的治疗性用途(Tanaka,Y等人(2013)Neuroscience 231 49-60)。例如,使用诱导小神经胶质细胞和星形胶质细胞的活化的创伤性脑损伤的模型。使用八周或九周龄的雄性C57BL/6J WT小鼠或颗粒蛋白前体杂合小鼠(购自Charles River Laboratories或Jackson Laboratories)。通过腹膜内施用溶解在无菌盐水中的盐酸甲苯噻嗪(8mg/kg)和水合氯醛(300mg/kg)使小鼠进行麻醉,并且随后放置在立体定位装置(Narishige,Tokyo,Japan)中。在头皮中制作切口并且使脑颅暴露。从颅骨清理骨膜,使用牙钻在右大脑半球上钻孔,并且使用针尖去除硬脑膜。使用具有0.5mm外径的不锈插管在右半球中制作纵向刺伤。将插管定位在中线侧面1.3mm和前囟后部1mm处,并且引入到大脑中直至尖端达到2mm的深度为止。
然后将插管在尾部移动2mm(前囟3mm),并且然后旋转地移动2mm回到其初始位置。最后将插管从大脑取出并且缝合头皮伤口。
[0862] 可替代地,使用改进的落重装置(weight-drop device)(Chen,Y.等人,(1996)J.Neurotrauma 13,557–568)。具体地,在异氟烷麻醉之后,制作中线纵向切口并且使颅骨暴露。将聚四氟乙烯尖顶锥体(2-mm直径)放置在中间冠状平面中的中线侧面的1-2mm处。将头部手动地放置在适当位置中,并且将95-g重量从预定高度降落在锥体上,从而引起对左半球的病灶性损伤。在从麻醉恢复之后,将小鼠返回其具有术后护理并且自由获得食物和水的住所笼。假手术对照接受麻醉和仅皮肤切口。小鼠使用以250ul的体积/小鼠(计算为100ul/10克体重)在范围是4mg/ml至0.5mg/ml的抗体浓度下的通过腹膜内注射递送的
Trem2抗体进行处理。对照IgG抗体以4mg/ml的浓度注射。抗体在第-3天至创伤性脑损伤并且然后在第1天、第7天、第14天、第21天、第28天进行注射。在TBI之后1小时评价神经病学评分(NSS)(以限定并且确保所有组中相似的损伤严重性)并且然后在24小时并且在第3天、第
5天、第7天并且每周一次进行评价,直至随访结束为止(4周)。使用新物品认知测试在损伤之后第4天、第16天、第32天测试认知功能。
[0863] 如所述的执行神经病学严重性评分(NSS)(Beni-Adani,L.等人,(2001)J.Neurotrauma 25,324–333;Tsenter,J.等人,(2008)J.Neurotrauma 25,324–333)。具体地,NSS由10个个体任务组成,包括开放场地表现、横木行走、平衡、以及轻偏瘫评价,其反应运动功能、警觉性、和行为。针对执行任务失败给予一分,并且成功执行任务给予0分。创伤后1h的NSS反映初始损伤严重性。因此,恢复的程度(ΔNSS)计算为损伤后1h与任何随后的时间点处的初始NSS评分之间的差值。
[0864] 新物品认知测试(NORT)是用于测量TBI中的认知异常的灵敏且可再现测试。在隔声房间中,将小鼠放置在类似开放玻璃水族箱的透明盒中进行1h的适应期,每次一只。在第二天,将他们重新引入在具有两个相同的干净石膏物品的盒中5min,所述物品放置在盒的两个不同的角落中以测量基线活性。四小时后,将物品中的一个使用具有相同大小和纹理的新物品替换,并且将小鼠重新引入到相同的笼中进行额外的5min以测试新物品识别。由对于不同处理不知情的操作员手动地记录小鼠在物品探索中所花费的时间。记录在物品中的每个处所花费的累积时间。物品的探索定义为在2cm的距离处将鼻子指向物品和/或使用鼻子接触物品。动物研究新物品所花费的总探索时间占总探索时间的百分比是识别记忆的量度。在基线处,小鼠在两个物品处均花费约相等的时间,因为两者对于小鼠均是新的。在测试中,认知上健康的小鼠将新物品识别为“新的”,记住旧物品,并且因此花费更多的时间探索新物品(约70%-75%的时间)。TBI导致记忆力受损,因此探索新物品的时间百分比更小(相比于正常)。TBI的一定自发性恢复确实发生,并且可导致TBI小鼠在新物品处花费60%-65%的时间。对于统计分析,可使用可商业获得的计算机软件(SigmaStat 2.03,Systat Software,San Jose,CA,USA)。处理是自变量,并且TBI参数的结果是因变量。使用针对重复测量的双因素ANOVA和post hoc Fisher’s PLSD检验来测试NSS和NORT实验系列的显著性。数据表示为平均值±s.e.m。
[0865] 如图20所示,在使用不同剂量的抗TREM2抗体7E5处理的具有创伤性脑损伤的小鼠中观察到认知功能的剂量依赖性改善。认知功能使用NORT测试进行评估。处理组包括:1=40mg/Kg 7E5;2=20mg/Kg 7E5;3=10mg/Kg 7E5;4=5mg/Kg 7E5以及CTR=40mg/Kg同种型对照抗体mIgG1。NORT测试在损伤之后第32天执行。条形图表示小鼠研究新物品所花费的时间的百分比。“基线”条形图表示在探索两个相同的物品上花费的时间,其是相似的,无论小鼠所接受的处理如何。“测试”条形图表示在探索新物品上花费的时间。post hoc Fisher’s PLSD检验用于统计分析*=Pval<0.05。
[0866] 使用对照抗体处理的具有创伤性脑损伤的小鼠在探索新物品上花费仅57.4%±5.3%,这指示高度未配对的认知功能(图20)。相比之下,使用最高剂量的抗TREM2抗体7E5处理的小鼠在探索新物品上花费73.9%±5.4%的时间,这接近于正常认知功能,从而指示几乎完全恢复(图20)。
[0867] 实施例26:毒素诱导的损伤之后的神经炎症和神经元丧失的模型中激动性TREM2抗体和/或TREM2双特异性抗体的治疗性用途的表征
[0868] 在毒素诱导的损伤之后的神经炎症和神经元丧失的模型中测试激动性抗TREM2抗体和/或TREM2双特异性抗体的治疗性用途(Martens,LH等人,(2012)The Journal of Clinical Investigation,122,3955)。使用每天4次腹膜内注射MPTP(1-甲基-4-苯基-1,2,
3,6-四氢吡啶)、持续2天(4μg/g体重)(Sigma-Aldrich)或PBS处理三月龄的小鼠。根据标准方案使用激动性抗TREM2抗体和/或TREM2双特异性抗体处理小鼠,并且然后使用立体学计数进行分析以定量黑质致密部(SNpc)中的多巴胺神经元和小神经胶质细胞,如所描述的。
[0869] 实施例27:由激动性和/或双特异性TREM2抗体进行的BMDC诱导抗原特异性T细胞增殖的能力的增强
[0870] 据信,激动性抗TREM2抗体和/或TREM2双特异性抗体可增加骨髓衍生的树突细胞(BMDC)表达标志物CD83和CD86并且然后诱导抗原特异性T细胞增殖的能力。为了确定TREM2抗体是否诱导细胞表面标志物CD83和CD86在树突细胞上的表达,在PBS中将抗体在4℃下以2个或5个μg/ml铺板在12孔板中。在第二天使用PBS洗涤孔3次并且在第5天收获未成熟人DC并且以1百万个细胞/孔铺板并且在37℃下、5%CO2下在细胞因子不存在下孵育。48小时后在BD FACS Canto上执行CD86、CD83和CD11c(BD Biosciences)的FACS分析。使用FlowJo(TreeStar)软件版本10.0.7执行数据分析。可替代地,在第5天在没有细胞因子的培养基中将未成熟人树突细胞以100,000个细胞/孔铺板在U形底非TC处理的96孔板中。在有或没有
20μg/ml的LPS去除的抗人二抗(Jackson ImmunoResearch)的情况下以5μg/ml添加抗体。在抗体添加后48h执行CD86、CD83、和CD11c(BD Biosciences)的FACS分析,如先前所述的。可通过CFSE稀释确定由BMDC诱导的卵清蛋白(OVA)特异性T细胞应答。在培养6天之后通过MACS分离BMDC并且在GM-CSF(10ng/mL)的存在下在具有OVA(2或0.5mg/mL)和CpG DNA(100或25nM)的圆底96孔板中以1X104个细胞/孔铺板4h。通过使用Dynal小鼠CD4阴性分离试剂盒(Invitrogen)从OT-II转基因小鼠的脾和淋巴结分离CD4T细胞并且使用CFSE(最终
0.8mM)进行染色。在DC培养4h之后,将1X105个CFSE标记的CD4OT-II T细胞添加到每个孔中并且孵育72h。在培养之后,使用抗CD4单克隆抗体对细胞进行染色并且执行流式细胞术以检测门控的CD4OT-II T细胞的CFSE稀释。通过Flowjo软件(Treestar)执行数据分析以计算分裂百分比和分裂指数(Eur.J.Immunol.2012.42:176-185)。
[0871] 可替代地,在第5天将未成熟树突细胞(CD14-CD11c+LIN-)铺板在在前一天涂覆有2μg/ml抗体的12孔皿中。使用PBS洗涤板3次,然后添加T细胞。分离来自非自体供体的CD4+T细胞并且使用CFSE进行标记,然后以1:10的比率添加到DC。CD3/CD28Dynal珠粒充当阳性对照。在第5天后,针对CFSE稀释在BD FACSCanto II上通过流式细胞术分析共培养细胞。使用FlowJo(TreeStar)针对每个条件计算与CFSE低细胞相比的CFSE高细胞百分比。
[0872] 实施例28:TREM2抗体诱导CD83和CD86在人树突细胞(DC)上的表达并且诱导T细胞增殖
[0873] 为了评价抗TREM2抗体改变CD83和CD86的表达的能力,将板结合的抗体和可溶性抗体两者与树突细胞(DC)一起孵育,并且测量CD83、CD86、CCR7、以及磷酸化ERK的表达。为了评价抗TREM2抗体调节T细胞增殖的能力,将DC与T细胞和抗TREM2抗体一起孵育,并且测量T细胞增殖的水平。在PBS中将抗体在4C下以2或5ug/ml铺板在12孔板中过夜。在第二天使用PBS洗涤孔3次。在第5天,收获未成熟人DC并且以1百万个细胞/孔铺板并且在37C下、5%CO2下在细胞因子不存在下孵育。48小时后在BD FACS Canto上执行CD86、CD83、CD11c、HLA-DR、以及LIN的FACS分析(BD Biosciences)。使用FlowJo(TreeStar)软件版本10.0.7执行数据分析。针对CD11c+HLA-DR+LIN-细胞群体评价CD83、CD86、和CCR7的水平。对于细胞内ERK磷酸化,使用1%甲醛固定细胞,使用cytofix/cytoperm试剂盒(BD)进行透化,并且在使用PE-ERK抗体(BD)染色之后使用流式细胞术确定细胞内Erk磷酸化。
[0874] 可替代地,在第5天在没有细胞因子的培养基中将未成熟人树突细胞以100,000个细胞/孔铺板在U形底非TC处理的96孔板中。在有或没有在20μg/ml下的LPS去除的抗人二抗(Jackson ImmunoResearch)的情况下以5ug/ml添加抗体。在抗体添加后48h执行CD86、CD83、CD11c、HLA-DR、以及LIN的FACS分析(BD Biosciences),如先前所述的。另外,在第5天将未成熟树突细胞(CD14-CD11c+LIN-)铺板在在前一天涂覆有2μg/ml抗体的12孔皿中。使用PBS洗涤板3次,然后添加T细胞。分离来自非自体供体的CD4+T细胞并且使用CFSE进行标记,然后以1:10、1:50、或1:250的比率添加到DC。CD3/CD28Dynal珠粒充当阳性对照。在第5天后,针对CFSE稀释在BD FACSCanto II上通过流式细胞术分析共培养细胞。使用FlowJo(TreeStar)针对每个条件计算与CFSE低细胞相比的CFSE高细胞百分比。
[0875] 实施例29:由激动性和/或双特异性TREM2抗体进行的巨噬细胞中Toll样受体(TLR)应答的正常化和增加
[0876] 为了评价抗TREM2抗体改变TLR应答的能力,通过TREM2缺陷将骨髓衍生的巨噬细胞(BMDM)或原代腹膜巨噬细胞应答改变为TLR信号传导(Turnbull,IR等人,J Immunol2006;177:3520-3524)。据信,激动性抗TREM2抗体和/或TREM2双特异性抗体可使巨噬细胞中的TLR应答增加或正常化。为了引发原代巨噬细胞,通过腹膜内注射使用1.5ml的
2%巯基乙酸盐培养基对小鼠进行处理,并且然后通过腹腔灌洗分离细胞。为了生成BMDM,将总骨髓在补充有10%小牛血清、5%马血清、和6ng/ml重组人CSF-1(R&D Systems)的DMEM中进行培养。将细胞培养5-6天,并且使用PBS中的1m MEDTA使贴壁细胞脱离。使用以下可商业获得的抗体对细胞进行染色:抗CD11b、抗CD40、抗GR1(BD Pharmingen)、以及F4/80(Caltag Laboratories)。对BMDM进行重新铺板并且使其在37℃下贴附4h,并且然后添加TLR激动剂诸如LPS(马流产沙门氏菌(Salmonella abortus equi))、酵母多糖(酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae))、和CpG1826DNA(购自例如Sigma-Aldrich)。在刺激之后24h采集细胞培养上清液,并且根据制造商的方案使用小鼠IFN-a4、IFN-b、IL-6、IL-12p70、TNF、以及IL-10ELISA试剂盒(eBioscience)和VeriKine小鼠IFN-b ELISA试剂盒(PBL 
interferon source)确定培养上清液中的IFN-a4、IFN-b、IL-6、IL-12p70、以及TNF细胞因子浓度的水平。可替代地,可使用针对人或小鼠细胞因子的细胞计数珠粒阵列(BD 
Biosciences)或具有Meso scale discovery系统的V-PLEX人或小鼠细胞因子系统。可替代地,为了分析细胞因子分泌,在第5天收获具有指示基因型的BM衍生的巨噬细胞并且以105个细胞/孔铺板在96孔板上。然后使用指示浓度的LPS或酵母多糖刺激细胞。24小时后,收获细胞培养上清液并且使用细胞技术珠阵列试剂盒(BD,遵循制造商的说明书)针对炎性细胞因子(IL-12、IL-10、IFN-γ、TNFa、IL-6、MCP-1)的存在通过FACS进行分析。也通过FACS分析细胞以评估活力(DAPI)和表面标志物(CD11b、CD86)的表达。
[0877] 实施例30:TREM2增加来自巨噬细胞的炎性细胞因子的分泌
[0878] 当TREM2缺陷时骨髓衍生的巨噬细胞(BMDM)或原代腹膜巨噬细胞应答过程改变TLR信号传导(Turnbull,IR等人,J Immunol2006;177:3520-3524)。为了确定TREM2抗体是否诱导炎性细胞因子产生的变化,将小鼠野生型(WT)和TREM2敲除小鼠(KO)或TREM2杂合小鼠(HETS)与单独的抗体或与非饱和水平的TLR刺激物组合的抗体一起培养,并且在24-48h之后测量细胞因子的水平。为了生成BMDM,将来自野生型(WT)的总骨髓在补充有10%小牛血清、5%马血清、和50ng/ml重组小鼠CSF-1(R&D Systems)的RPMI中进行培养。将细胞培养
5天,并且使用PBS中的1mM EDTA使贴壁细胞脱离。以105个细胞/孔将BMDM铺板在96孔板上并且使其在37℃下贴附4h。然后将细胞暴露于单独的抗体,使用单独的TLR激动剂LPS(马流产沙门氏菌)或酵母多糖(酿酒酵母)在范围是0.01-100ng/ml(LPS)或0.01-100μg/ml(酵母多糖)的浓度下进行刺激或使用与Trem2抗体组合的LPS或酵母多糖进行刺激。可替代地,在具有或没有Trem2抗体的情况下在10ng/ml的细胞因子IL-4或50ng/ml的IFN-γ的存在下培养从WT和KO小鼠分离的巨噬细胞。在刺激之后24或48h采集细胞培养上清液,并且根据制造商的方案通过使用细胞计数珠粒阵列小鼠炎症试剂盒(BD)测量TNFa、IL-6、L-10、以及MCP-
1细胞因子的水平。
[0879] 实施例31:抗TREM2抗体对于炎性细胞因子产生的体内作用
[0880] 在布鲁尔巯基乙酸盐诱导的腹膜巨噬细胞上直接在体内刺激小鼠巨噬细胞,并且然后测量腹膜腔中的细胞因子的浓度。为了确定TREM2抗体是否诱导炎性细胞因子产生的变化,在第0天对野生型(WT)小鼠和TREM2敲除小鼠(KO)腹膜内注射3ml的3%布鲁尔巯基乙酸盐。在第3天,对小鼠腹膜内注射抗TREM2抗体7E5或同种型对照抗体(mIgG1),进行15min或24h。然后使用4ml盐溶液通过腹膜灌洗收获腹膜细胞并且使用PBS进行洗涤。根据制造商的方案通过使用细胞计数珠粒阵列小鼠炎症试剂盒(BD)测量TNFa和MCP-1/CCL2细胞因子的水平。
[0881] 如图21A和图21B所示,与使用同种型对照抗体处理的小鼠相比,当WT小鼠使用7E5抗体处理时,TNFa和CCL2的水平增加。具体地,与同种型对照处理小鼠相比,TNFa的浓度在使用抗体7E5处理的小鼠中增加约6倍(图21A)。与同种型对照处理小鼠相比,CCL2的浓度在使用抗体7E5处理的小鼠中增加约2倍(图21B)。当施用到KO小鼠时,7E5抗体不具有作用(图21A和图21B)。所述结果指示TNFa和CCL2的诱导对于TREM2是特异性的。
[0882] 实施例32:由激动性和/或双特异性TREM2抗体进行的骨髓衍生的髓样前体细胞中的抗炎细胞因子IL-10的抑制
[0883] 据信,在使用激动性抗TREM2抗体和/或TREM2双特异性抗体处理并且使用100ng/ml LPS(Sigma)进行刺激、通过与凋亡细胞共培养或通过相似的刺激之后,骨髓衍生的髓样前体细胞可显示抗炎细胞因子IL-10的降低。如下执行骨髓衍生的髓样前体细胞的分离。从成年6-8周龄的雌性C57BL/6小鼠(Charles River,Sulzfeld,Germany)并且从TREM2缺陷小鼠(KOMP储存库)、从后肢的胫骨和股骨的髓腔分离骨髓细胞。使用低渗溶液通过裂解执行红细胞的去除。在75cm2培养烧瓶(Greiner Bio-One)中在含有10%胎牛血清(Pan Biotech)和10ng/ml的GM-CSF(R&D Systems)的DMEM培养基(Invitrogen)中培养细胞。在
24h之后,采集未贴壁细胞并且重新接种在新鲜的75cm2培养烧瓶中。5天之后改变培养基并且对细胞培养额外的10-11天。在Trem2抗体的存在或不存在下培养细胞,在24h之后采集上清液,并且根据制造商的说明书(QuantikineM mouse IL-10,R&D Systems)通过IL-
10ELISA确定从细胞释放的IL-10的水平(JEM(2005),201;647–657;以及PLoS Medicine(2004),4|Issue 4|e124)。
[0884] 实施例33:由激动性和/或双特异性TREM2抗体进行的来自髓样谱系的细胞中吞噬作用的诱导
[0885] 据信激动性抗TREM2抗体和/或TREM2双特异性抗体可诱导对来自髓样谱系的细胞(诸如单核细胞、树突细胞、巨噬细胞以及小神经胶质细胞)中的以下各项的吞噬作用:凋亡神经元、神经组织碎片、非神经组织碎片、细菌、其他异物、以及致病性蛋白(任选地诸如Aβ肽、α突触核蛋白、Tau蛋白、TDP-43蛋白、朊病毒蛋白、亨廷顿蛋白)、RNA、翻译产物抗原(包括由甘氨酸-丙氨酸(GA)、甘氨酸-脯氨酸(GP)、甘氨酸-精氨酸(GR)、脯氨酸-丙氨酸(PA)、或脯氨酸-精氨酸(PR)构成的二肽重复序列(DPR肽))。双特异性抗体可以是识别TREM2抗原和第二抗原的抗体,所述第二抗原包括但不限于Aβ肽、抗原或α突触核蛋白抗原、或Tau蛋白抗原、或TDP-43蛋白抗原、或朊病毒蛋白抗原、或亨廷顿蛋白抗原、或RNA、翻译产物抗原(包括由甘氨酸-丙氨酸(GA)、甘氨酸-脯氨酸(GP)、甘氨酸-精氨酸(GR)、脯氨酸-丙氨酸(PA)、或脯氨酸-精氨酸(PR)构成的二肽重复序列(DPR肽))。从采集自成年C57BL/6小鼠的外周血分离单核细胞。低渗裂解缓冲液消耗红细胞。将细胞铺板在含有10%胎牛血清(Pan Biotech)的RPMI培养基(Invitrogen)中的培养皿上。在10%CO2中在37℃下培养细胞若干小时。在胰蛋白酶化之后,采集贴壁细胞,并且用于吞噬作用实验。
[0886] 从出生后3至5天(P3至P5)的C57BL/6小鼠的大脑制备小神经胶质细胞。简而言之,机械地去除脑膜,并且通过研磨解离细胞并且在补充有10%FCS(PAN Biotech GmbH)、1%葡萄糖(Sigma-Aldrich)、1%L-谷氨酰胺(GIBCO BRL)、以及1%青霉素/链霉素(GIBCO BRL)的基础培养基(BME;GIBCO BRL)中培养14天以形成汇合的神经胶质细胞单层。为了采集小神经胶质细胞,在旋转振荡器(200rpm)上振荡细胞2h。附接的星形胶质细胞用于免疫组织化学。将脱离的小神经胶质细胞接种在正常培养皿中1h,并且然后去除并且排除未贴壁的细胞。分离的小神经胶质细胞的纯度是约95%,如使用针对CD11b的抗体(BD Biosciences)通过流式细胞术分析确定的。在基础培养基中培养小神经胶质细胞,如先前所述的(Hickman SE等人,J Neurosci.2008年8月13日;28(33):8354-60;以及Microglia Methods and Protocols第1041卷)。从C57BL/6小鼠胚胎(E15-16)的大脑制备少突胶质细胞(即,神经元)和神经元富集的细胞。简而言之,分离大脑组织并且机械地分散,并且接种在预先涂覆有0.01mg/ml聚-L-鸟氨酸(Sigma-Aldrich)和10μg/ml层粘连蛋白(Sigma-
Aldrich)的培养皿中。在补充有2%B-27补充剂(GIBCO BRL)、1%葡萄糖(Sigma-Aldrich)、和1%FCS(PAN Biotech GmbH)的神经元条件培养基(BME;GIBCO BRL)中培养细胞。对细胞培养5-10天以获得形态学上成熟的少突胶质细胞。
[0887] 为了实施吞噬作用测定,将小神经胶质细胞、巨噬细胞或树突细胞与凋亡神经元、神经组织碎片、非神经组织碎片、细菌、其他异物、以及致病性蛋白一起培养。将神经元培养5-10天,然后以30nM的最终浓度添加冈田酸3h以诱导细胞凋亡。使用CellTracker CM-DiI膜染料(分子探针)标记神经元细胞膜。在孵育之后,洗涤凋亡神经元或吞噬作用的其他靶标两次并且以1:20的效应物/靶标比率添加到转导的小神经胶质细胞培养物。在添加凋亡神经元之后1h和24h,在共焦荧光显微镜(Leica)下计数具有吞噬神经元细胞膜的小神经胶质细胞的数量。在60放大率下在不同区域中对凋亡细胞进行计数。通过流式细胞术确认吞噬量。此外,在添加凋亡神经元之后24h、48h、或72h,采集细胞并且用于细胞因子的RT-PCR。
为了实施微球珠粒或细菌吞噬作用测定,使用抗TREM2激动性抗体处理小神经胶质细胞、巨噬细胞或树突细胞。在24h之后,添加1.00μm的红色荧光微球珠粒(Fluoresbrite多色红色微球;Polysciences公司)或者添加荧光标记的细菌1h。通过荧光显微镜分析通过小神经胶质细胞实现的对微球珠粒或荧光标记的细菌的吞噬作用。此外,从培养板采集小神经胶质细胞并且通过流式细胞术分析。确定具有吞噬珠粒的小神经胶质细胞的百分比。为了实施髓样吞噬作用测定,以20mM将HiLyteFluorTM647(Anaspec)-Aβ-(1–40)重悬浮在Tris/EDTA(pH 8.2)中,并且然后在37℃下在黑暗中孵育3天以促进聚集。在低血清(补充有胰岛素的
0.5%FBS)、LPS(50ng/ml)、IFNc(100个单位/ml)、以及抗TREM2激动性抗体中预处理小神经胶质细胞、巨噬细胞或树突细胞24h,之后添加聚集的荧光标记的aβ肽。添加100nM聚集的HiLyteFluorTM647–Ab-(1–40)(ASN NEURO(2010)2(3):157-170)后5h通过流式细胞计数分析确定髓样吞噬作用和TREM2的表面表达。以相似的方式实施对其他致病性蛋白的吞噬作用。
[0888] 实施例34:由激动性TREM2抗体或TREM2双特异性抗体进行的小神经胶质细胞、巨噬细胞、和树突细胞中的CCR7的诱导和向CCL19和CCL21的迁移
[0889] 据信抗TREM2抗体和/或TREM2/双特异性抗体可诱导小神经胶质细胞、巨噬细胞、和树突细胞中的CCR7和向CCL19和CCL21的迁移。将小神经胶质细胞、巨噬细胞或树突细胞与激动性抗TREM2抗体和/或TREM2/DAP12双特异性抗体或与对照抗体一起培养。在72h之后采集细胞,使用CCR7特异性抗体进行免疫标记,并且通过流式细胞术进行分析。为了确定增加CCR7表达的任何功能性结果,执行趋化性测定。使用激动性抗TREM2抗体和/或TREM2/DAP12双特异性抗体通过TREM2刺激小神经胶质细胞、巨噬细胞或树突细胞,并且放置在两腔室系统中。对向趋化因子配体CCL19和CCL21迁移的小神经胶质细胞的数量进行定量(JEM(2005),201,647–657)。对于趋化性测定,将小神经胶质细胞、巨噬细胞或树突细胞暴露于激动性抗TREM2抗体或TREM2/双特异性抗体并且使用1μg/ml LPS进行处理。将小神经胶质细胞、巨噬细胞或树突细胞转移到在下部腔室中含有具有100ng/ml CCL19或CCL21(均来自PeproTech)的450μl培养基的跨孔系统(3μm孔径过滤器;Millipore)的上部腔室中。在1h孵育时间段之后,通过显微镜(JEM(2005),201,647–657)在三个独立的区域中计数迁移到下部腔室的小神经胶质细胞、巨噬细胞或树突细胞的数量。
[0890] 实施例35:由激动性TREM2抗体和/或TREM2双特异性抗体进行的小神经胶质细胞、巨噬细胞、和树突细胞中的F-肌动蛋白的诱导
[0891] 据信激动性抗TREM2抗体或TREM2双特异性抗体可诱导小神经胶质细胞、巨噬细胞、和树突细胞中的F-肌动蛋白。将用TREM2转导或表达TREM2的感兴趣的小神经胶质细胞、巨噬细胞或树突细胞和其他细胞添加到培养板并且然后暴露于激动性抗TREM2抗体和/或TREM2双特异性抗体或对照抗体。在1h之后,固定细胞,阻断细胞并且然后使用Alexa Fluor 546偶联的鬼笔环肽(分子探针)染色,并且使用荧光染料标记F-肌动蛋白。通过具有40倍物镜的共焦激光扫描显微镜(Leica)采集图像。(JEM(2005),201,647–657)。
[0892] 实施例36:由激动性TREM2、DAP12、和/或TREM2/DAP12双特异性抗体进行的破骨细胞产生的诱导和增加的破骨细胞生成速率
[0893] 据信,激动性抗TREM2抗体和/或TREM2双特异性抗体可诱导破骨细胞产生并且增加破骨细胞生成的速率。将制备破骨细胞或骨髓衍生的单核细胞/巨噬细胞(BMM)前体细胞的RAW264.7细胞维持在补充有10%FBS(Atlantic Biologics,Atlanta,GA,USA)和青霉素-链霉素-谷氨酰胺(Mediatech)的RPMI-1640培养基(Mediatech)或另一种适当的培养基中。将具有添加到N末端的FLAG表位的TREM2B cDNA插入到IRES的逆转录病毒载体pMXpie上游,接着插入eGFP cDNA序列。根据制造商的方案使用Fugene 6(Roche)用pMXpie-FLAG TREM2B转染细胞。在2μg/ml的嘌呤霉素(Sigma)中选择细胞。通过使用流式细胞术针对抗FLAG M2单克隆抗体(Sigma)结合筛选稳定的嘌呤霉素抗性克隆,并且然后进行亚克隆并且维持在嘌呤霉素选择培养基上。
[0894] 将表达TREM2B的RAW264.7细胞以3000个细胞/孔接种在96孔板中的补充有10%FBS、青霉素-链霉素-谷氨酰胺、50ng/ml RANKL、以及20ng/ml M-CSF的α-MEM培养基中。将培养基每3天改变一次,暴露于抗TREM2激动性抗体,并且通过光学显微镜计数多核(至少三核)TRACP+破骨细胞的数量并且进行评分。为了确定复杂性和大小,通过核的数量(>10个或
3–10个核)对破骨细胞进行计数。还通过使用Image J软件(NIH)测量破骨细胞的表面积。此外,确定破骨细胞基因的表达水平。使用TRIzol试剂(Invitrogen)在不同时间点处从破骨细胞生成培养物提取总RNA。在使用SuperScript III试剂盒(Invitrogen)合成第一链cDNA之后,针对Nfatc1、Acp5、Ctsk、Calcr、以及Ccnd1执行实时定量PCR反应。计算靶标mRNA表达的相对定量并且归一化到亲环蛋白的表达,并且表示为(靶标基因的mRNA/亲环蛋白的
6
mRNA)3X10。(J.OF BONE AND MINERAL RESEARCH(2006),21,237–245;J Immunol 2012;
188:2612-2621)。
[0895] 可替代地,将BMM细胞以一式三份孔接种到板上,并且使用RANKL、M-CSF处理并且使用抗TREM2抗体和/或TREM2双特异性抗体或同种型匹配的对照单克隆抗体处理。将培养基每3天改变一次,直至大的多核细胞可视为止。在培养物中3天至5天之后,使用在PBS中的3.7%甲醛固定细胞10min。然后将板在PBS中洗涤两次,在50%丙酮和50%乙醇的溶液中孵育30s,并且使用PBS洗涤。使用来自Sigma的试剂盒(产品435)针对抗酒石酸酸性磷酸酶(TRAP)对细胞进行染色。然后通过光学显微镜对多核(多于两个核)TRAP阳性细胞进行计数,如所描述的(例如,Peng等人,(2010)Sci Signal.,3(122):ra38)。
[0896] 实施例37:老化、癫痫发作、脊髓损伤、视网膜营养不良、额颞叶痴呆、以及阿尔茨海默氏病的动物模型中激动性TREM2抗体和/或TREM2双特异性抗体的治疗性用途的表征[0897] 在老化、癫痫发作、脊髓损伤、视网膜营养不良、额颞叶痴呆、亨廷顿病、帕金森氏病、肌萎缩性侧索硬化症以及阿尔茨海默氏病的动物模型中测试激动性抗TREM2抗体和/或TREM2双特异性抗体的治疗性用途,如先前所描述的(例如,Beattie,MS等人,(2002)Neuron 36,375-386;Volosin,M等人,(2006)J.Neurosci.26,7756-7766;Nykjaer,A等人,(2005)Curr.Opin.Neurobiol.15,49-57;Jansen,P等人,(2007)Nat.Neurosci.10,1449-1457;
Volosin,M等人,(2008)J.Neurosci.28,9870-9879;Fahnestock,M等人,(2001)Mol.Cell Neurosci.18,210-220;Nakamura,K等人,(2007)Cell Death.Differ.14,1552-1554;Yune,T等人,(2007)Brain Res.1183,32-42;Wei,Y等人,(2007)Neurosci.Lett.429,169-174;
Provenzano,MJ等人,(2008)Laryngoscope 118,87-93;Nykjaer,A等人,(2004)Nature 
427,843-848;Harrington,AW等人,(2004)Proc.Natl.Acad.Sci.U.S.A.101,6226-6230;
Teng,HK等人,(2005)J.Neurosci.25,5455-5463;Jansen,P等人,(2007)Nat.Neurosci.10,
1449-1457;Volosin,M等人,(2008)J.Neurosci.28,9870-9879;Fan,YJ等人,(2008)Eur.J.Neurosci.27,2380-2390;Al-Shawi,R等人,(2008)Eur.J.Neurosci.27,2103-2114;
以及Yano,H等人,(2009)J.Neurosci.29,14790-14802)。
[0898] 实施例38:动脉粥样硬化的模型中激动性TREM2抗体和/或TREM2双特异性抗体的治疗性用途的表征
[0899] 在动脉粥样硬化的模型中测试激动性抗TREM2抗体和/或TREM2双特异性抗体的治疗性用途,如先前所描述的(例如,Lance,A等人,(2011)Diabetes,60,2285;以及Kjolby,M等人,(2012)Cell Metabolism 12,213-223)。
[0900] 实施例39:感染的模型中激动性TREM2抗体和/或TREM2双特异性抗体的治疗性用途的表征
[0901] 在感染的模型中测试激动性抗TREM2抗体和/或TREM2双特异性抗体的治疗性用途。例如,可使用正常小鼠中的单核细胞增多性李斯特菌(Listeria monocytogenes)或其他感染,如先前所描述的(例如,Yin,F等人,(2009)J.Exp.Med,207,117-128)。
[0902] 实施例40:筛选诱导指示PI3K途径的活化的TREM2、DAP12、SYk、ERK、以及AKT的磷酸化的抗TREM2和/或TREM2双特异性抗体
[0903] 使用PBS-EDTA从组织培养皿取出细胞(J774、RAW 264.7、BMM细胞、或破骨细胞),使用PBS洗涤并且进行计数。在冰上或在其他条件下将J774(40×106个)或RAW 264.7细胞6
(10×10个BMM或破骨细胞)与抗TREM2抗体和/或TREM2双特异性抗体或与同种型匹配的对照抗体在1μg/106个细胞下孵育20min。在冰冷的放射免疫沉淀测定(RIPA)缓冲液中使细胞裂解20min,接着在4℃在16,000g下离心10min以去除不可溶物质。将所得的上清液经受与所指示的抗体(DAP12、ERK、或AKT)和蛋白A-或蛋白G-琼脂糖(Sigma)的免疫沉淀反应。使用RIPA缓冲液充分洗涤珠粒,并且通过SDS-聚丙烯酰胺凝胶电泳(SDS-PAGE)使蛋白质分开。
然后通过蛋白质印迹将蛋白质转移到硝化纤维膜,与适当的抗体(特异性地识别磷酸化形式的DAP12、ERK、或AKT的抗体)一起孵育并且使用增强的化学发光(ECL)系统(Pierce)可视化,如所描述的(例如,Peng等人,(2010)Sci Signal.,3(122):ra38)。
[0904] 实施例41:筛选诱导钙流量的抗TREM2抗体和/或TREM2双特异性抗体
[0905] 使用含有HEPES的缓冲液[20mM HEPES(pH 7.3)、120mM NaCl、1mM CaCl、1mM MgCl、5mM KCl、葡萄糖(1mg/ml)、牛血清白蛋白(1mg/ml)]洗涤BMM细胞两次,接着在37℃下在0.05%Pluronic F-127(Invitrogen)和1μM Indo-1AM(Invitrogen)中孵育20min。使用HEPES缓冲液洗涤细胞两次并且然后使用抗TREM2抗体和/或TREM2双特异性抗体(16μg/ml)或使用对照抗体(16μg/ml)刺激并且通过分光光度计(PTL  Photon  Technology International)进行监测。根据制造商的说明书将Indo-1荧光发射转化为钙(Ca2+)(例如,Peng等人,(2010)Sci Signal.,3(122):ra38)。
[0906] 实施例42:筛选促进破骨细胞和/或小神经胶质细胞的存活的抗TREM2抗体和/或TREM2双特异性抗体
[0907] 通过使用冷PBS冲洗胫骨和股骨骨髓细胞来获得鼠骨髓前体。在使用PBS一次洗涤之后,使用ACK裂解缓冲液(Lonza)使红细胞裂解,使用PBS洗涤两次并且以0.5x106个细胞/ml悬浮在具有指示量的制备巨噬细胞的50ng/ml M-CSF或10ng/ml GM-CSF的完全RPMI培养基(10%FCS,青霉素/链霉素,Gln,neAA)中。对于M2型巨噬细胞,向培养细胞添加10ng/ml IL-4。对于M1型巨噬细胞,添加50ng/ml IFN-γ。在一些实验中,以1μg/ml-0.01ng/ml的浓度在第5天向细胞培养物添加LPS或酵母多糖。重组细胞因子通过Peprotech购买。为了分析BM衍生的巨噬细胞的活力,如上制备具有指示基因型的细胞并且在梯度浓度的MCSF中进行5
培养。在非组织培养物处理板中,将细胞以10个/200μl铺板在96孔板中(用于使用基于萤光素酶的测定的活力分析)或以0.5x106个/1ml铺板在6孔板中(用于台盼蓝排除细胞计
数)。在第3天添加含有新鲜M-CSF的培养基。在指示的时间点处,使用3mM EDTA使细胞从板轻轻脱离,并且使用Burker腔室进行计数。在一些实验中,使用CD11b抗体和DAPI也对细胞进行染色以用于FACS分析。可替代地,将细胞与ToxGlo试剂(Promega)一起直接孵育,并且确定荧光素酶活性。在一些实验中,在第5天从培养基抽取或不抽取MCSF,并且在36小时后通过FACS分析细胞活力。成熟破骨细胞培养物在具有RANKL和M-CSF的24孔皿中有差别。在4天之后,使用不含血清的培养基替代完全培养基以诱导凋亡。在过夜血清饥饿期间,使用RANKL、PBS、和抗TREM2抗体和/或TREM2双特异性抗体、或同种型匹配的对照抗体对细胞进行处理。将细胞固定在1%多聚甲醛中并且根据制造商的说明书使用基于TUNEL的试剂盒(Millipore公司)进行染色。使用具有20×放大率的Nikon TE2000-E显微镜对凋亡的核进行计数。结果表示为在两个孔的六个随机选择的视野中的凋亡细胞相对于总细胞数量的百分比,如所描述的(例如Peng等人,(2010)Sci Signal.,3(122):ra38)。使用原代小神经胶质细胞执行相似的测定。
[0908] 实施例43:TREM2增加巨噬细胞和树突细胞的存活
[0909] 为了评价TREM2在细胞存活中的作用,在Trem2抗体或其片段的存在下培养野生型(WT)、TREM2敲除(KO)、和TREM2杂合(Het)巨噬细胞和树突细胞,并且确定细胞活力。
[0910] 通过使用冷PBS冲洗胫骨和股骨骨髓细胞来获得来自TREM2WT、Het、和KO小鼠的鼠骨髓前体细胞。在使用PBS一次洗涤之后,使用ACK裂解缓冲液(Lonza)使红细胞裂解,使用PBS洗涤两次并且在0.5x106个细胞/ml下重悬浮在具有指示量的产生巨噬细胞的50ng/ml M-CSF或产生树突细胞的10ng/ml GM-CSF的完全RPMI培养基(10%FCS,青霉素/链霉素,Gln,neAA)中。对于M2型巨噬细胞,向培养细胞添加10ng/ml IL-4。对于M1型巨噬细胞,添加50ng/ml IFN-a。在一些实验中,在1μg/ml-0.01ng/ml的浓度范围下在第5天向细胞培养物添加LPS或酵母多糖。重组细胞因子购自Peprotech。为了分析骨髓衍生的巨噬细胞的活力,如上制备细胞并且在MCSF中进行培养。在非组织培养物处理板中,将细胞以105个/200μl铺板在96孔板中(用于使用基于萤光素酶的测定的活力分析)或以0.5x106个/1ml铺板在6孔板中(用于台盼蓝排除细胞计数)。在第3天添加含有新鲜M-CSF的培养基。在指示的时间点处,使用3mM EDTA使细胞从板轻轻脱离,并且使用Burker腔室(Burker chamber)进行计数。
对于活细胞的FACS分析,在50ng/ml MCSF中培养巨噬细胞6天(+MCSF)或在50ng/ml MCSF中培养巨噬细胞4天,之后去除MCSF,培养额外的36h(-MCSF)。使用CD11b抗体和DAPI对细胞进行染色。对于荧光素酶活力测定,在梯度浓度的生长因子GMCSF(树突细胞)、MCSF(M1巨噬细胞)、或MCSF+IL-4(M2巨噬细胞)中培养的第5天测量细胞活力。将细胞与ToxGlo试剂
(Promega)一起直接孵育,并且确定荧光素酶活性(发光)。对于在炎性介质IFN-a、LPS、或酵母多糖的存在下培养的成活的巨噬细胞的FACS分析,在第5天采集细胞并且使用CD11b抗体和DAPI进行染色。所有实验均在Trem2抗体或对照抗体或其片段的存在或不存在下实施。可替代地,对WT小鼠腹膜内(IP)注射40mg/kg或另一个剂量的TREM2或对照抗体,接着在12-
24h后IP注射2-4mg/kg LPS。6小时后从腹腔采集细胞并且使用以下标志物通过FACS进行分析;CD11b-PB;CD11c Pecy7;MHC-II APCcy7;Gr1FITC;Ly6G PE;Amcyan活/死细胞。
[0911] 实施例44:筛选使免疫/小神经胶质细胞调节模块内的基因表达的TREM2/TYROBP依赖性变化正常化的抗TREM2抗体和/或TREM2双特异性抗体
[0912] 通过慢病毒载体基因修饰来源于小鼠胚胎干细胞的小神经胶质细胞以过表达全长或缺少基于细胞内免疫受体酪氨酸的活化基序(ITAM)基序两者的截短形式的Tyrobp。小神经胶质细胞也来源于对于TREM2杂合的小鼠胚胎干细胞。为了评估响应于Tyrobp或TREM2的干扰的全基因组基因表达变化,从过表达以下的小鼠小神经胶质细胞、巨噬细胞或树突细胞和对于TREM2杂合的细胞以及来源于TREM2缺陷小鼠的细胞的RNA测序得出的基因表达数据:(1)媒介物、(2)全长Tyrobp、或(3)显性阴性的截短Tyrobp;或(4)过表达TREM2的敲低构建体,诸如SiRNA。对于全长Tyrobp和截短Tyrob的过表达分别鉴别到大约2,638种和3,415种不同表达的基因(Zhang等人,(2013)Cell 153,707–720)。与对照媒介物相比,来自过表达完整Tyrobp的小神经胶质细胞的大约99%的不同表达的基因下调。例如,与液胞/自体吞噬相关的658种基因以及涉及RNA代谢和细胞周期有丝分裂的基因通过活性Tyrobp下调,但是在表达显性阴性的截短Tyrobp的细胞中上调。相反地,液胞/自体吞噬途径和线粒体的大约2,856种基因在表达显性阴性的截短Tyrobp的小神经胶质细胞中选择性地上调。针对其引发与在正常小神经胶质细胞中和在过表达完整Tyrobp的小神经胶质细胞中、在表达显性阴性的截短Tyrobp的细胞(Zhang等人,(2013)Cell 153,707–720)中、在表达TREM2的敲低构建体的细胞中、或在对于TREM2杂合的细胞中观察到的相似的基因表达谱的能力筛选激动性抗TREM2抗体和/或TREM2双特异性抗体。选择能够改变基因表达网络的抗体。
[0913] 实施例45:TREM2抗体的抗癌作用的分析
[0914] 使用悬浮在100ul PBS中的肿瘤细胞(例如,1x105个至1x106个MC38、Lewis肺、或B16细胞)皮下攻击10只8周(+/-2周)龄的C57Bl6/NTac小鼠的组。在植入之前使用异氟烷对动物进行麻醉。在第2天开始,对小鼠的组每3天腹膜内注射4个剂量200ug的每种拮抗性抗TREM2抗体,诸如实施例38和实施例40所述的那些。在第4天开始使用卡尺每两周一次监测肿瘤生长以测量肿瘤生长。实验的终点是2000mm3的肿瘤体积或60天。肿瘤生长和存活百分比是结果测量值。肿瘤摄取和生长速率降低、肿瘤浸润免疫抑制巨噬细胞的数量减少、以及到肿瘤中的效应T细胞流入增加指示阻断抗TREM2抗体的抗癌作用。
[0915] 实施例46:将TREM2抗体与针对抑制性检查点蛋白或抑制性细胞因子/趋化因子及其受体的抗体组合的组合疗法的相加的抗癌作用的分析
[0916] 使用肿瘤细胞皮下攻击15只8周(+/-2周)龄的C57Bl6/NTac小鼠的组。在植入之前使用异氟烷对动物进行麻醉。在第2天开始,在第3天、第6天、和第9天对小鼠每3天腹膜内注射4个剂量单独的200ug抗TREM2抗体或与针对检查点蛋白的抗体(例如,抗PDL1mAb克隆10F.9G2和/或抗CTLA-4mAb克隆UC10-4F10-11)组合。治疗组包括抗TREM2;抗CTLA-4;抗PDL1;抗TREM2+抗CTLA-4;抗TREM2+抗PDL1;以及同种型对照。在第4天开始使用卡尺每两周一次监测肿瘤生长以测量肿瘤生长。实验的终点是2000mm3的肿瘤体积或60天。肿瘤生长和存活%是结果测量值。使用组合疗法肿瘤生长降低和存活%增加指示抗TREM2抗体与抗检查点抗体具有相加或协同治疗性作用。针对检查点分子的拮抗性抗体包括针对PDL1、PDL2、PD1、CTLA-4、B7-H3、B7-H4、HVEM、BTLA、KIR、GAL9、TIM3、A2AR、LAG-3、以及磷脂酰丝氨酸(PS)的抗体。针对抑制性细胞因子的拮抗剂抗体包括针对CCL2、CSF-1和IL-2的抗体。
[0917] 实施例47:将TREM2抗体与活化刺激性检查点蛋白的抗体组合的组合疗法的相加的抗肿瘤作用的分析
[0918] 使用肿瘤细胞皮下攻击15只8周(+/-2周)龄的C57Bl6/NTac小鼠的组。在植入之前使用异氟烷对动物进行麻醉。在第2天开始,在第3天、第6天、和第9天对小鼠每3天腹膜内注射4个剂量单独的200ug抗TREM2抗体或与活化刺激性检查点蛋白的激动性抗体(例如,OX40或ICOS mAb)的组合。在第4天开始使用卡尺每两周一次监测肿瘤生长以测量肿瘤生长。实验的终点是2000mm3的肿瘤体积或60天。肿瘤生长和存活百分比是结果测量值。使用组合疗法肿瘤生长降低和存活%增加指示抗TREM2抗体与刺激性检查点抗体具有相加或协同治疗性作用。刺激性检查点抗体包括针对CD28、ICOS、CD137、CD27、CD40、以及GITR的激动性/刺激性抗体。
[0919] 实施例48:TREM2抗体的抗中风作用的分析
[0920] 使用瞬时大脑中动脉闭塞(MCAO)(与人中风非常相似的模型)来诱导小鼠中的大脑梗塞。通过右侧颈总动脉的切口将单丝(70SPRe,Doccol Corp,USA)引入到颈内动脉中。在一系列的再灌注时间(第6小时、第12小时、第24小时、第2天、第7天以及第28天)的情况下使大脑中动脉闭塞30分钟。在第12小时和在第7天使用假手术动物核实手术作用。假手术动物在经历相同的手术程序而没有大脑中动脉闭塞。针对梗塞容积、急性炎性应答(第12小时再灌注)、促炎细胞因子TNFa、IL-1a、和IL-1b的转录、小神经胶质细胞活性(CD68、Iba1)、趋化因子CCL2(MCP1)、CCL3(MIP1a和趋化因子受体CX3CR1的转录以及CD3阳性T细胞的侵入测试使用激动性抗TREM2抗体或对照抗体处理的MCAO动物(Sieber等人(2013)PLoS ONE 8
(1):e52982.doi:10.1371/journal.pone.0052982.)。
[0921] 实施例49:抗TREM2抗体的抗阿尔茨海默氏病作用的分析
[0922] 为了评价抗TREM2抗体延迟、预防、或逆转阿尔茨海默氏病(AD)的发展的能力,使用5X FAD小鼠。5X FAD小鼠过表达具有瑞典(K670N、M671L)、佛罗里达(I716V)和伦敦(V717I)家族性阿尔茨海默氏病(FAD)突变的突变体人APP(695)以及含有两个FAD突变M146L和L286V的人PS1。两种转基因均通过小鼠Thy1启动子来调节以驱动在大脑上的过表达并且重现AD的主要特征。使用免疫组织化学并且通过组织提取物的ELISA测试测试使用激动性抗TREM2抗体或使用对照抗体处理的小鼠的Aβ斑负荷。它们还使用Morris水迷宫(空间学习和记忆任务)、放射臂水迷宫(空间学习和记忆任务)、Y迷宫(将自发交替定量为空间认知的量度)、开放领域中的新颖偏好、评估学习和记忆的操作性学习、以及恐惧条件反射测试它们大脑中小神经胶质细胞的数量和针对认知缺陷的减少(mousebiology.org 
website;Wang等人,(2015)Cell.pii:S0092-8674(15)00127-0)。
[0923] 实施例50:TREM2抗体在呼吸道感染中的保护性作用的分析
[0924] 为了评价TREM2抗体延迟、预防、或治疗细菌呼吸道感染的能力,使用涉及使用肺炎链球菌(Streptococcus pneumoniae)攻击C57Bl6小鼠的临床前小鼠模型。此模型涉及105CFU肺炎链球菌(S.pneumoniae)血清型3(ATCC 6303)的鼻内(i.n.)施用,如所描述的(参见,例如,Sharif O等人,2014PLoS Pathog.2014年6月;10(6):e1004167;以及
Schabbauer G等人,2010J Immunol 185:468-476)。在此模型中,约90%WT C57Bl6小鼠在感染后6天内死于感染。使用肺炎链球菌攻击十至十五只小鼠/组,并且与此同时从第0天开始每隔一天使用拮抗剂抗TREM2抗体进行处理。在使用肺炎链球菌攻击之前3小时施用第一剂量的抗TREM2抗体。每天监测小鼠持续15天以检查死亡事件。确定从细菌攻击存活的小鼠的%。在单独的实验中,还确定血液中和肺中细菌负荷和细胞因子表达的计数。感染之后24小时或48小时在含有EDTA的管中采集感染血液并且铺板在琼脂板上以对血浆中的细菌CFU进行计数。将血浆在-20℃下保存以用于通过ELISA进行的细胞因子分析。收获肺、均质化并且铺板在琼脂板上以对细菌CFU进行计数,或在裂解缓冲液中孵育30min并且分析上清夜以用于细胞因子测量。在单独的实验中,在细菌感染后40小时采集肺,固定在10%福尔马林中,并且包埋在石蜡中以用于H&E病理学分析。
[0925] 实施例51:TREM2抗体在败血症中的保护性作用的分析
[0926] 为了评价TREM2抗体延迟、预防、或治疗败血症的能力,使用涉及用LPS全身性攻击C57Bl6小鼠的临床前小鼠模型。此模型涉及37mg/ml LPS的腹膜内(i.p.)施用,如上所描述的(参见,例如,Gawish R等人,2014FASEB J)。在此模型中,>95%WT C57Bl6小鼠在LPS注射后40小时内死于感染。使用LPS攻击同龄组小鼠,并且与此同时从第0天开始每天使用拮抗剂抗TREM2抗体进行治疗。在使用LPS攻击之前3小时施用第一剂量的抗TREM2抗体。在白天期间每约4小时监测小鼠以检查死亡事件。确定从LPS攻击存活的小鼠的百分比。
[0927] 在单独的实验中,采集腹膜灌洗液(PLF)。将上清液在-20℃下保存以用于通过ELISA进行的细胞因子分析;对沉淀细胞进行计数以定量募集在腹膜腔中的炎性细胞。可实施相似的研究以测试TREM2抗体在感染的其他模型中的效力(参见,例如,Sun等人,(2013)Invest Ophthalmol Vis Sci.17;54(5):3451-62)。
[0928] 实施例52:TREM2抗体在急性和慢性结肠炎中的保护性作用的分析
[0929] 为了评价抗TREM2抗体延迟、预防、或治疗结肠炎的能力,使用急性或慢性结肠炎的临床前小鼠模型。对于DSS诱导的结肠炎,小鼠随意接受在饮用水中的3%DSS,持续8天。对于TNBS诱导的结肠炎,对小鼠进行麻痹并且使用在20%乙醇中的3mg TNBS(体积/体积)或作为对照的单独的媒介物的直肠内注射进行处理。对于慢性结肠炎模型,使用3个周期的
2%DSS对所有小鼠进行处理,持续5天,接着10天的恢复期。对于所有模型,每天监测体重损失、大便稠度、和粪便隐血的存在,并且用于计算疾病活性指数,如所描述的(参见,例如,Correale C,2013,Gastroenterology,2013年2月,第346-356页.e3)。从第0天开始每天使用拮抗剂抗TREM2抗体对同龄组的小鼠进行处理,并且经受DSS或TNBS施用。每天监测小鼠以检查体重损失、大便稠度、和粪便隐血的存在,每天监测并且用于计算疾病活性指数,如所描述的(参见,例如,S.Vetrano,Gastroenterology,135(2008),第173–184页)。在单独的实验中,采集粘膜损害的内窥镜和组织学图像以评价炎性细胞浸润和粘膜损害。可实施相似的研究以测试TREM2抗体在自身免疫(包括克罗恩氏病、炎症性肠病、和溃疡性结肠炎)的其他模型中的益处(参见,例如,Low等人,(2013)Drug Des Devel Ther.;7:1341-1357;以及Sollid等人,(2008)PLoS Med 5(9):e198)。
[0930] 实施例53:激动剂TREM2在伤口愈合中的保护性作用的分析
[0931] 为了评价抗TREM2抗体增加损伤之后结肠伤口修复的能力,使用结肠中活组织检查损伤的小鼠模型。在此模型中,将具有外操作鞘的内窥镜插入中降结肠,并且向肛管直肠连接处检查粘膜。然后,使用具有3French直径的柔性活组织检查钳去除整个粘膜和粘膜下层的单一全厚区域。使每只小鼠沿着结肠背侧在3-5个位点处具有活组织检查损伤(参见,例如,Seno H,2008,Proc Natl Acad Sci U S A.2009年1月6日;106(1):256-261)。在活组织检查损伤之后,使用激动剂抗TREM2抗体对同龄组的小鼠进行处理2或3天。每天监测小鼠,持续15天,以通过测量病灶的表面积检查体重损失和伤口愈合。
[0932] 实施例54:TREM2抗体在视网膜变性中的保护性作用的分析
[0933] AMD是外视网膜的变性疾病。认为炎症(具体地是炎性细胞因子和巨噬细胞)促成AMD疾病进展。在脉络膜小疣、布鲁赫氏膜(Bruch’s membrane)、脉络膜以及视网膜中记录巨噬细胞在AMD病灶附近的存在。巨噬细胞释放组织因子(TF)和血管内皮生长因子(VEGF),其触发显示脉络膜新血管形成的患者中新血管形成的扩张。存在于黄斑脉络膜中的巨噬细胞的类型随着年龄变化,从而与较年轻眼睛相比,在较年长眼睛中显示出升高水平的M2巨噬细胞。然而,与相似年龄的正常解剖眼睛相比,晚期AMD黄斑具有较高的M1与M2比例。(参见,例如,Cao X等人,(2011),Pathol Int 61(9):第528-35页)。这表明在AMD进展的晚期发作中眼睛中经典M1巨噬细胞活化之间的联系。视网膜小神经胶质细胞是也通常存在于内视网膜中的组织驻留型巨噬细胞。在损害事件中,小神经胶质细胞可活化并且充当炎症介质。活化的小神经胶质细胞已在AMD组织样品中检测到并且被提出作为导致AMD发病机制的炎性过程的一个潜在贡献者(Gupta等人,(2003)Exp Eye Res.,76(4):463-71.)。在一个或多个AMD模型中测试拮抗剂TREM2抗体预防、延迟、或逆转AMD的能力(参见,例如,Pennesi等人,(2012)Mol Aspects Med.;33(4):487-509)。记录总体炎性巨噬细胞(M1和/或活化的小神经胶质细胞)与AMD疾病进展相关并且因此表示拮抗剂TREM2抗体的治疗性靶标。可在青光眼和遗传形式的视网膜变性(诸如色素性视网膜炎)中实现相似的治疗性益处。
[0934] 在青光眼模型中测试TREM2抗体预防、延迟、或逆转青光眼中的视网膜神经节细胞变性的能力(参见,例如,El-Danaf等人,(2015).J Neurosci.11;35(6):2329-43)。同样,如在Chang等人,(2002)Vision Res.;42(4):517-25和在“Retinal Degeneration Rat Model Resource Availability of P23H and S334ter Mutant Rhodopsin Transgenic Rats and RCS Inbred and RCS Congenic Strains of Rats,”MM LaVail,2011年6月30日中所描述的测试REM2在遗传上诱导的视网膜变性和色素性视网膜炎中的治疗性益处。
[0935] 实施例55:TREM2抗体在脂肪生成和饮食诱导的肥胖症中的保护性作用的分析
[0936] 为了测试TREM2抗体在脂肪生成和肥胖症中的作用,使用高脂肪饮食(HFD)的小鼠模型(参见,例如,Park等人,(2015)Diabetes.64(1):117-27)。
[0937] 实施例56:TREM2抗体在疟疾中的保护性作用的分析
[0938] 非实质肝脏细胞中的TREM2表达与对疟疾物伯氏疟原虫(Plasmodium berghei)引起的肝脏阶段感染的抗性紧密相关( 等人,(2013)Proc Natl Acad Sci 26;110(48):19531-6)。不希望受到理论的束缚,据信TREM2抗体增加对伯氏疟原虫引起的肝脏阶段感染的抗性。如在 等人,(2013)Proc Natl Acad Sci 26;110(48):19531-6中
所描述的测试TREM2抗体增加对疟疾感染的抗性的能力。简而言之,通过解剖来自斯氏按蚊(Anopheles stephensi mosquitoes)的感染的唾液腺来获得表达GFP的伯氏疟原虫ANKA子孢子。以100μL含有104个子孢子的接种物/小鼠静脉内注射在RPMI培养基中的子孢子悬浮液。在注射或存活之后40h采集肝脏,并且追踪寄生物血症28天。对于实验大脑疟疾评分,在注射之后从第5天监测神经症状。
[0939] 实施例57:TREM2抗体在骨质疏松症中的保护性作用的分析
[0940] 骨是不断地被改造以支持钙体内稳态和结构需要的动态器官。破骨细胞是负责去除骨的有机和无机组分两者的细胞。破骨细胞衍生自巨噬细胞谱系中的造血祖细胞,并且响应于NFκB配体的肿瘤坏死因子家族细胞因子受体活化剂而进行分化。破骨细胞(唯一的骨再吸收细胞)对于骨质疏松症和骨硬化病的发病机制是重要的(Novack等人,(2008)Annual Rev Pathol.,3:457-84)。骨质疏松症是特征在于骨质量和密度降低(其可导致增加的骨折风险)的进行性骨病。它在停经之后的最初几年表现最多,此时骨转换加速,破骨细胞和成骨细胞两者的活性均增加。然而,由于再吸收和合成的过程中的失衡,净效应是骨损失,其主要是小梁的骨损失。因此,骨质疏松症中骨折的最普遍位点是腕部、股骨颈和脊椎体,其中小梁结构是总体骨强度的关键。引起骨质疏松症的破骨细胞分化加速和骨再吸收能力增加已在缺少TREM2表达的动物模型中进行描述(Otero等人(2012)J.Immunol.188,
2612-2621)。破骨细胞功能降低引起骨硬化病,其中骨质量增加并且骨髓空间消除,如在缺少DAP12ITAM信号传导接头并且引起破骨细胞样细胞分化的显著缺陷的动物模型中所观察到的(Koga等人,(2004)Nature 428:758-763)。不希望受到理论的束缚,据信施用本公开的抗TREM2抗体可预防、降低风险、和/或治疗骨质疏松症。在一些实施方案中,施用激动剂抗TREM2抗体可诱导患有骨硬化病的个体中的一种或多种TREM2活性(例如,DAP12磷酸化、Syk活化、和向破骨细胞的加速分化)(Peng等人(2010).Sci Signal.201018;3 122;以及Humphrey等人,(2006)J Bone Miner Res.,21(2):237-45)。
[0941] 实施例58:抗TREM2抗体在脊髓损伤的小鼠模型中的作用的分析
[0942] 在每组10只小鼠的2个组中使用总计20只C57/BL6小鼠。根据Han等人,Brain 2010,133:1026-42诱导脊髓损伤(SCI)。简而言之,对小鼠进行麻醉并且剃刮其背部并且使用聚维酮碘(Betadine)(Purdue产品LP)进行清理。在进行中线切口和T9椎骨的椎板切除术之后,在力设置在50千达因的情况下使用无限水平冲击器(Infinite Horizon Impactor)(PSI,Lexington,KY)诱导脊髓挫伤。在具有横向插入的硬钢夹具的框架中使脊柱稳定。仅包括具有400-800m的损伤移位的小鼠。在损伤之后,以多层封闭肌肉,闭合皮肤切口并且在切口区域上施加杆菌肽锌抗生素(Altana,Melville,NY)。
[0943] 测试小鼠的运动,直至损伤之后6周为止。每周一次以80mg/kg腹膜内注射抗TREM2抗体7E5和同种型对照抗体(对照IgG),包括在SCI诱导前24h进行的一次损伤前注射。
[0944] 为了测试运动技能,在称为Basso小鼠标尺(Basso Mouse Scale)(Basso等人,J Neurotrauma 2006,23:635-59)的10点标尺上测试跨步、肢体协调、和躯干稳定性的后肢性能。0-2的Basso小鼠标尺(BMS)评分涉及后肢麻痹;3-4涉及一定的脚踝运动;5-6涉及具有一定协调的负重和跨步;7-9涉及具有一致的协调跨步的高功能;并且其中9是正常。当小鼠具有5和以上(负重)的评分时,计算BMS子评分。这些表示良好的运动技能,包括脚底跨步的频率、后肢协调、跨步期间的脚掌位置、以及躯干稳定性和在运动期间的尾部定位。当BMS相同时,子评分可揭示各组之间的差值。在第一次注射之前和之后24h执行BMS,并且在此之后再次在每周注射之后24h每周执行。
[0945] 图22A和图22B中的结果示出使用抗TREM2抗体7E5进行的处理显著地但是瞬时地提高第7天和第10天的BMS评分。所述结果可由于损伤之后小神经胶质细胞功能对于组织恢复的差异作用引起。
[0946] 实施例59:TREM2抗体影响体内人树突细胞的存活的能力的分析
[0947] 根据制造商的手册使用RosetteSepTM人单核细胞富集混合物(Stem Cell Technoclogies)分离来自外周血单核细胞的单核细胞。在100ng/ml hGM-CSF和100ng/ml hIL-4的存在下在完全RPMI培养基(10%FCS、青霉素/链霉素、L-谷氨酰胺、MEM非必需氨基
6
酸、丙酮酸钠、1mM HEPES)中以1X10个细胞/ml培养单核细胞7天。以25,000个细胞/孔将人树突细胞铺板在96孔非组织培养物处理板中。在20ng/ml的hGM-CSF和20ng/ml的hIL-4的存在下添加各种浓度的抗TREM2抗体9F5或10μg/ml的抗TREM2抗体10A9。使用小鼠IgG1同种型对照抗体和仅培养基(没有添加物)作为对照。在3天之后,根据制造商的方案使用
CellTiter- (Promega)分析细胞活力。
[0948] 将人单核细胞衍生的树突细胞与抗TREM2抗体9F5或10A9一起孵育三天。与10μg/ml的抗体10A9的孵育使细胞存活降低至60%,而10μg/ml的抗体9F5没有显著地影响细胞存活(图23)。
[0949] 实施例60:TREM2抗体显示高于1%的外周浓度下的大脑或CSF水平
[0950] 通过腹膜内每周注射使用抗TREM2抗体或对照抗体对野生型(WT)或5XFAD小鼠的组长期性地进行处理四至十二周之间。每周采集血浆。在研究结束时,使用3%-5%异氟烷/氧气混合物对小鼠进行麻醉,直至无意识并且对于收缩反射无应答为止。通过鼻锥进行的递送在整个程序中维持异氟烷/氧气混合物。使小鼠仰卧并且制作通过腹部和隔膜的切口,从而暴露心脏。切割右心房以使血液流出,并且通过注射器和25规格针将20-30ml的无菌盐水注射到左心室中。在缓慢连贯的速度下递送盐水,直至去除所有血液并且肝脏看起来变白为止。然后从颅骨取出大脑并且放置在解剖显微镜下的无菌培养皿中。取出小脑、中脑、和后脑,并且通过经中线切割将大脑分为两个半球。采集海马体和额叶皮层并且急速冷冻。根据制造商的说明书在蛋白酶抑制剂的情况下使用冰冷的N-Per(Thermo Fisher)制备大脑裂解物。使用BCA测定(Thermo Fisher)测量裂解物中的蛋白质浓度。使用定制IgG Meso Scale Discovery测定测量血浆和大脑裂解物中的抗体水平,并且使用IgG浓度来测量抗体的大脑浓度百分比。
[0951] 实施例61:TREM2抗体改善慢性结肠炎的小鼠模型中的病变
[0952] 材料和方法
[0953] 使七周龄的雌性C57BL/6小鼠经受以下葡聚糖硫酸钠(DSS)方案。实验人员是不知情的,并且在第一个DSS周期之前在第-3天开始将抗TREM抗体7E5或对照抗体MOPC-21的抗体溶液以40mg/kg的浓度腹膜内(IP)注射到小鼠中,并且然后在整个实验中每周两次进行注射。在3天之后,使小鼠经受三个口服周期(7天)的1.5%DSS(分子量40kDa,MP Biomedicals,目录号160110,批次号Q1408),每个周期接着常规水的周期(7天)。基于体重、腹泻和粪便血的存在的评价使用疾病活性指数(DAI)评分每周两次对急性和慢性结肠炎的严重性进行评分。通过对以下各项的变化进行评分以确定DAI来获得五个等级(0–4)DAI:体重损失(0=没有损失;1=1%至5%;2=5%至10%;3=10%至20%;4=>20%);粪便稠度(0=正常;2=松散;4=腹泻);以及直肠出血(0=正常;2=隐性出血;4=大出血)。
[0954] 在血清采集和结肠内窥镜检查之后,在第35天对存活小鼠进行处死。此外,在测量结肠长度之后,将一半组织进行福尔马林固定并且包埋在石蜡中以用于组织学评价。
[0955] 结肠内窥镜检查提供使用不同的参数评价结肠炎的严重性的机会,所述不同的参数诸如粘膜变厚、出血、和偶尔的粒状粘膜表面、血管结构的丧失、以及血纤维蛋白的存在。基于炎症的这些内窥镜检查体征,在实验结束时,使用以下系统也通过内窥镜检查对炎症进行评分:结肠变厚(分数0=透明,1=中等,2=明显,3=非透明),血管模式的变化(分数0=正常,1=中等,2=明显,3=出血),可见的血纤维蛋白(0=没有,1=很少,2=明显,3=极度),粘膜表面的粒度(0=没有,1=中等,2=明显,3=极度)。对所有的子评分进行总结以获得0-12的总体结肠评分。
[0956] 结果
[0957] 葡聚糖硫酸钠(DSS)实验模型是最广泛使用的结肠炎小鼠模型。DSS是具有范围是5至1400kDa的高度可变分子量的水溶性、带负电荷的硫酸化多糖。DSS诱导肠道炎症的机制被认为是对大肠内衬的上皮单层的损害、从而使促炎肠道内容物(例如,细菌及其产物)散播到下层组织中的结果。末端和直肠部分是在此实验方案之后最受影响的结肠区段。
[0958] 与使用对照抗体处理的小鼠相比,使用抗TREM2抗体7E5处理的小鼠在第一个DSS周期之后显示显著减少的炎症症状。这些结果也在第二个和第三个DSS处理之后观察到(图24)。使用抗TREM2抗体7E5处理的小鼠在第一个DSS周期之后并且在整个研究过程中显示显著减少的体重损失(图24A)和疾病活性指数(图24B)。在实验结束时,对小鼠进行处死并且测量结肠的长度。注射抗TREM2抗体7E5的小鼠的结肠样品比注射对照抗体的小鼠的结肠样品显著地更长(图24C)。此结果还确认抗体7E5保护免受DSS诱导的结肠炎。另外,与使用对照抗体处理的小鼠相比,使用抗TREM2抗体7E5处理的小鼠显示显著更低的内窥镜检查评分(图24D)。
[0959] 所述结果证明使用抗TREM2抗体进行的处理显著地降低慢性DSS小鼠模型中的结肠炎的症状。此外,这些结果指示抗TREM2抗体(诸如本公开的那些抗体)可用作用于治疗溃疡性结肠炎的治疗剂。
[0960] 实施例62:TREM2抗体在人源化TREM2转基因小鼠中显示活性
[0961] 材料和方法
[0962] 为了获得在髓样谱系中表达人TREM2的小鼠,鉴别具有TREM2连同其他TREM家族成员和足够的侧接序列(在任一端部上至少10kb)的细菌人工染色体(BAC)克隆。使用UCSC基因组浏览器和在NCBI处的克隆DB鉴别具有TREM基因座的BAC克隆。准则用于鉴别具有除感兴趣的基因之外的最小10KB的侧接5'和3’序列的克隆,以使适当的基因表达的可能性最大化。
[0963] 从Invitrogen获得BAC克隆作为细菌穿刺培养物(bacterial stab culture)。使培养物生长并且使用标准技术分离DNA。在限制消化之后进行的琼脂糖凝胶电泳基于与UCSC基因组浏览器的序列的比较确认插入物的大小和完整性。另外,NCBI网络门户的克隆DB(其包括每个BAC的端部的序列以及感兴趣的相关人单核苷酸多态性)处查询BAC克隆的序列。
[0964] 基于以上策略,鉴别BAC克隆CTD-3222A20。此克隆包含人TREM2、人TREML2、人TREM1、人TREML1、以及人TREML4基因的完整序列。因为TREM基因家族存在于染色体6上的簇集内,所以由此BAC覆盖的连续区域(基于UCSC的hg38构造,从核苷酸41104901-41292419,跨越187,519个核苷酸)包含所有基因。
[0965] 利用标准原核注射技术通过将纯化的BAC DNA注射到C57BL6/j小鼠受精卵中来生成具有BAC克隆CTD-3222A20的转基因小鼠。将受精卵植入到雌性小鼠中。然后针对转基因的存在对来自植入小鼠的幼鼠进行基因分型。使这些建立者小鼠(founder mice)与非转基因小鼠进行交配,并且针对转基因的适当表达筛选后代。简而言之,从4-8周龄的小鼠获得血液,并且使用标准技术分离单核细胞。然后使用对于每种转基因(即,TREM2、TREM1、和TREML2)特异性的抗体通过FACS分析单核细胞。确认这些基因的表达。
[0966] 对于所述实验,对野生型小鼠(WT)或人源化TREM2 BAC转基因小鼠(huTREM2 Tg或Bac-Tg)腹膜内(IP)注射3%巯基乙酸盐。
[0967] 在第4天,从每只小鼠采集腹膜细胞。同时,收获骨髓以根据标准程序生成骨髓衍生的巨噬细胞。为了在巯基乙酸盐诱导的巨噬细胞刺激之后测量细胞因子产生,在涂覆有抗TREM2抗体9F5或对照小鼠抗体MOPC-21的板上孵育细胞约60h。通过细胞计数珠粒阵列(CBA,BD Biosciences)测量上清液中分泌的TNF-α。
[0968] 为了检查WT相对于huTREM2 Tg小鼠中的人相对于小鼠TREM2的表达,采集巯基乙酸盐诱导的巨噬细胞,并且使用标准细胞染色方案使用人TREM2特异性抗体9F5或10A9、使用小鼠TREM2特异性抗体2F5、或使用识别人和小鼠TREM2两者的抗TREM2抗体(R&D大鼠抗TREM2)进行染色。使用FACS Canto分析细胞,并且针对CD11b+和F4/80+对活细胞群体进行门控。通过FlowJo分析原始数据。
[0969] 对于来自WT或huTREM2 Tg小鼠的骨髓衍生的巨噬细胞的体外刺激,对10x106个细胞不进行刺激或使用抗TREM2抗体9F5或对照抗体MOPC-21进行刺激。然后使细胞裂解并且使用大鼠抗TREM2抗体(R&D Systems)进行免疫沉淀。在非还原条件下在SDS-凝胶上运行样品,并且使用标准程序使用抗磷酸化-酪氨酸(Millipore)和抗DAP12抗体(Cell signaling)执行蛋白质免疫印迹。
[0970] 结果
[0971] 图25A示出人TREM2 BAC转基因小鼠表达人TREM2,因为在巯基乙酸盐诱导的巨噬细胞上存在由人特异性抗TREM2抗体9F5和10A9实现的阳性TREM2结合,但是这些抗体未显示与仅表达小鼠TREM2的WT巨噬细胞的结合。
[0972] 在体外使用板结合的抗TREM2抗体9F5刺激来自人TREM2 BAC转基因小鼠的巯基乙酸盐诱导的巨噬细胞约60h诱导TNF-α分泌的显著增加(图25B)。相比之下,抗体9F5对于来自WT小鼠的巯基乙酸盐诱导的巨噬细胞不具有作用。
[0973] 另外,在体外使用抗TREM2抗体9F5刺激来自人TREM2 BAC转基因小鼠的骨髓衍生的巨噬细胞诱导Dap12磷酸化,而此作用未在对照抗体的情况下观察到(图25C)。
[0974] 图25中的结果指示抗TREM2抗体9F5可接合人TREM2并且诱导TREM2介导的信号传导。
[0975] 实施例63:TREM2抗体不结合体内可溶性TREM2
[0976] 材料和方法
[0977] 生成在髓样谱系中表达人TREM2的转基因BAC小鼠,如实施例62所描述的。
[0978] 以20mg/kg(n=3只动物/组)对人TREM2 BAC转基因小鼠(huTREM2 Tg)或野生型小鼠(WT)腹膜内注射抗TREM2抗体9F5、抗TREM2抗体T21-9、或同种型对照小鼠IgG1抗体。在使用标准程序进行注射之后两天采集血浆样品。使用特异性地检测人TREM2的定制ELISA检测来自WT或TREM2 BAC转基因小鼠的血浆中的可溶性TREM2。简而言之,在4℃下在高结合96孔ELISA板上孵育在PBS中的100ul的2ug/ml人TREM2特异性捕获抗体(8F11、msIgG)。在第二天,使用300ul洗涤缓冲液(PBS+0.05%Tween)洗涤板三次,并且添加300ul结合缓冲液(PBS+1%BSA)并且在室温(RT)下孵育至少一小时。在结合缓冲液中稀释血浆样品和标准物(重组人TREM2-FC,R&D Systems),添加到板并且在RT下孵育1小时。然后如之前再次洗涤板,并且在1:2000稀释下将生物素酰化的检测抗体(山羊抗人TREM2,R&D Systems)添加在结合缓冲液中并且在RT下孵育1h。再次洗涤板,并且在RT下在1:200稀释下与链霉抗生物素蛋白-HRP一起在结合缓冲液中孵育20min。再次洗涤板并且添加TMB底物并且进行孵育,直至显色为止。在添加2N硫酸之后使反应停止,并且在BioTek SynergyTM H1酶标仪上读取板。
[0979] 为了测试抗TREM2抗体9F5是否可结合到血浆中的可溶性TREM2,测试修改的ELISA设定。在4℃下用PBS中的100ul的9F5、T21-9或对照IgG抗体的2ug/ml溶液涂覆板过夜。在第二天,使用300ul洗涤缓冲液(PBS+0.05%Tween)洗涤板三次,并且添加300ul结合缓冲液(PBS+1%BSA)并且在室温(RT)下孵育至少一小时。在结合缓冲液中稀释来自未处理TREM2 BAC转基因小鼠的血浆样品,添加到板并且在RT下孵育1小时。然后如之前再次洗涤板,并且以1:2000(针对山羊IgG)或1:10,000(针对大鼠IgG)将生物素酰化的检测抗体(山羊抗人TREM2,R&D Systems或大鼠抗hu/ms TREM2,R&D Systems)添加在结合缓冲液中并且在RT下孵育1h。再次洗涤板,并且在RT下与1:200稀释在结合缓冲液中的链霉抗生物素蛋白-HRP一起孵育20min。再次洗涤板并且添加TMB底物并且进行孵育,直至显色为止。在添加2N硫酸之后使反应停止,并且在BioTek SynergyTM H1酶标仪上读取板。
[0980] 结果
[0981] 来自ELISA测定的结果显示注射T21-9TREM2抗体引发血浆中的可溶性人TREM2的水平的高度显著增加,而注射抗体9F5不增加血浆中的可溶性人TREM2的水平(图26A)。ELISA不可检测不表达人TREM2的WT小鼠中的任何可溶性TREM2,从而确认ELISA对于TREM2是特异性的并且不识别小鼠TREM2。这些结果指示相比于抗体T21-9,抗体9F5不能够增加体内可溶性TREM2的水平。
[0982] 假定抗体9F5可能不能增加血浆中的可溶性TREM2的水平,因为所述抗体不能够结合可溶性TREM2。将抗体9F5铺板在ELISA板上以确定此抗体是否可捕获来自血浆的内源性可溶性TREM2。同样,相比于显示与可溶性TREM2的结合的T21-9,抗体9F5仅显示与可溶性TREM2的微弱结合(图26B)。这些结果指示抗体9F5仅可微弱地结合到血浆中的可溶性TREM2,这解释抗体9F5不能够增加体内可溶性TREM2。
[0983] 概括地说,所述结果指示抗体9F5不可显著地结合到体内可溶性TREM2。这可能是有利的,因为认为可溶性TREM2是可清除TREM2抗体、从而使其不能够结合到细胞TREM2、并且因此降低TREM2抗体的效力的失活形式的TREM2受体。
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