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用于治疗具有非典型BRAF突变的癌症的组合物和方法

阅读:847发布:2020-05-12

专利汇可以提供用于治疗具有非典型BRAF突变的癌症的组合物和方法专利检索,专利查询,专利分析的服务。并且本 发明 尤其提供了用于在携带非典型BRAF突变(即非V600E/K BRAF突变)的受试者中 治疗 或缓解癌症的影响的方法、药物组合物和 试剂 盒 ,所述方法、药物组合物和试剂盒包含ERK 抑制剂 。还提供了用于鉴定将从包含ERK抑制剂的疗法中受益的患有非典型BRAF突变癌症的受试者的方法。,下面是用于治疗具有非典型BRAF突变的癌症的组合物和方法专利的具体信息内容。

1.用于在携带非V600E/K BRAF突变的受试者中治疗或缓解癌症的影响的方法,该方法包括向受试者施用有效量的ERK抑制剂或其药学上可接受的盐。
2.根据权利要求1的方法,其中ERK抑制剂选自BVD-523、SCH-722984(Merck&Co.)、SCH-
772984(Merck&Co.)、SCH-900353(MK-8353)(Merck&Co.)、LY3214996(Lilly)、AEZS-140(Aeterna Zentaris)、AEZS-131(Aeterna Zentaris)、AEZS-136(Aeterna Zentaris)、LTT-
462(Novartis)、RG-7842(Genentech)、CC-90003(Celgene)、KIN-4050(Kinentia)及其组合。
3.根据权利要求1的方法,其中ERK抑制剂是BVD-523。
4.根据权利要求1的方法,其中非V600E/K BRAF突变是激酶活化的突变、激酶受损的突变或激酶未知的突变及其组合。
5.根据权利要求4的方法,其中激酶活化的突变选自R462I、I463S、G464E、G464R、G464V、G466A、G469A、N581S、E586K、F595L、L597Q、L597R、L597S、L597V、A598V、T599E、V600R、K601E、S602D、A728V及其组合。
6.根据权利要求4的方法,其中激酶受损的突变选自G466E、G466R、G466V、Y472C、K483M、D594A、D594E、D594G、D594H、D594N、D594V、G596R、T599A、S602A及其组合。
7.根据权利要求4的方法,其中激酶未知的突变选自T440I、S467L、G469E、G469R、G469S、G469V、L584F、L588F、V600_K601delinsE、S605I、Q609L、E611Q及其组合。
8.根据权利要求1的方法,其中非V600E/K BRAF突变选自D594、G469、K601E、L597、T599重复、L485W、F247L、G466V、BRAF融合、BRAF-AGAP3重排、BRAF外显子15剪接变体及其组合。
9.根据权利要求1的方法,其中受试者是哺乳动物
10.根据权利要求9的方法,其中哺乳动物选自人、灵长类动物、农场动物和家养动物。
11.根据权利要求9的方法,其中哺乳动物是人。
12.根据权利要求1的方法,其中癌症是实体瘤癌症或血液癌症。
13.根据权利要求1的方法,其中癌症选自胶质母细胞瘤、黑素瘤、胆管癌、小细胞癌、结肠直肠癌、前列腺癌阴道癌、血管肉瘤、非小细胞肺癌、阑尾癌、鳞状细胞癌、唾液管癌、腺样囊性癌、小肠癌和胆囊癌。
14.根据权利要求13的方法,其中癌症选自小肠癌、非小细胞肺癌、胆囊癌和鳞状细胞癌。
15.根据权利要求1的方法,其进一步包括向受试者施用选自MEK抑制剂、RAF抑制剂、HDAC抑制剂及其组合的至少一种另外的治疗剂。
16.根据权利要求15的方法,其中MEK抑制剂选自炭疽毒素、蒽醌(Golden 
Biotechnology)、ARRY-142886(6-(4-溴-2-氯-苯基基)-7-氟-3-甲基-3H-苯并咪唑-5-羧酸(2-羟基-乙基)-酰胺)(Array BioPharma)、ARRY-438162(Array BioPharma)、贝美替尼(MEK162,ARRY-1662)、AS-1940477(Astellas)、AS-703988(Merck KGaA)、bentamapimod(Merck KGaA)、BI-847325(Boehringer Ingelheim)、E-6201(Eisai)、GDC-
0623(Hoffmann-La Roche)、GDC-0973(考比替尼)(Hoffmann-La Roche)、L783277(Merck)、炭疽毒素的致死因子部分、MEK162(Array BioPharma)、PD 098059(2-(2'-氨基-3'-甲氧苯基)-氧-4-)(Pfizer)、PD 184352(CI-1040)(Pfizer)、PD-0325901(Pfizer)、PD318088(Pfizer)、PD334581(Pfizer)、6-甲氧基-7-(3-吗啉-4-基-丙氧基)-4-(4-苯氧基-苯基氨基)-喹啉-3-甲腈、4-[3-氯-4-(1-甲基-1H-咪唑-2-基硫烷基)-苯基氨基]-6-甲氧基-7-(3-吗啉-4-基-丙氧基)-喹啉-3-甲腈、pimasertib(Santhera Pharmaceuticals)、RDEA119(Ardea Biosciences/Bayer)、瑞美替尼(AstraZeneca)、RG422(Chugai Pharmaceutical Co.)、R0092210(Roche)、R04987655(Hoffmann-La Roche)、R05126766(Hoffmann-La Roche)、司美替尼(AZD6244)(AstraZeneca)、SL327(Sigma)、TAK-733(Takeda)、曲美替尼(Japan Tobacco)、U0126(1,4-二氨基-2,3-二氰基-1,4-双(2-氨基苯硫基)丁二烯)(Sigma)、WX-554(Wilex)、YopJ多肽(Mittal等人,2010)、其药学上可接受的盐及其组合。
17.根据权利要求15的方法,其中RAF抑制剂选自AAL881(Novartis)、AB-024(Ambit Biosciences)、ARQ-736(ArQule)、ARQ-761(ArQule)、AZ628(Axon Medchem BV)、BAY 43-
9006索拉非尼、BeiGene-283(BeiGene)、BUB-024(MLN 2480)(Sunesis&Takeda)、b-raf抑制剂(Sareum)、BRAF激酶抑制剂(Selexagen Therapeutics)、BRAF siRNA  313(tacaccagcaagctagatgca)和523(cctatcgttagagtcttcctg)(Liu等人,2007)、CHIR-265(Novartis)、CTT239065(Institute of Cancer Research)、达拉非尼(GSK2118436)、DP-
4978(Deciphera Pharmaceuticals)、HM-95573(Hanmi)、GDC-0879(Genentech)、GW-5074(Sigma Aldrich)、ISIS 5132(Novartis)、L779450(Merck)、LBT613(Novartis)、LXH254(Novartis)、LErafAON(NeoPharm,Inc.)、LGX-818(Novartis)、帕唑帕尼
(GlaxoSmithKline)、PLX3202(Plexxikon)、PLX4720(Plexxikon)、PLX5568(Plexxikon)、PLX3603(Daiichi Sankyo)、PLX8394(Daiichi Sankyo)、RAF-265(Novartis)、RAF-365(Novartis)、REDX0535(RedX  Pharma  Plc)、瑞戈非尼(Bayer  Healthcare Pharmaceuticals,Inc.)、RO  5126766(Hoffmann-La  Roche)、SB-590885
(GlaxoSmithKline)、SB699393(GlaxoSmithKline)、索拉非尼(Onyx Pharmaceuticals)、TAK 632(Takeda)、TL-241(Teligene)、维拉非尼(RG7204或PLX4032)(Daiichi Sankyo)、XL-281(Exelixis)、ZM-336372(AstraZeneca)、其药学上可接受的盐及其组合。
18.根据权利要求15的方法,其中HDAC抑制剂选自贝司他(PCI-24781)、吉诺司他、恩替司他、扶林司他、CI-994、CUDC-101、恩替司他、BML-210、M344、NVP-LAQ824、帕比司他、Pracinosat(SB939)、Mocetinostat、Resminostat、罗米地辛、贝利诺司他、其药学上可接受的盐及其组合。
19.根据权利要求1的方法,其进一步包括向受试者施用选自抗体、抗体片段、抗体缀合物、细胞毒性剂、毒素、放射性核素、免疫调控剂、光活化治疗剂、放射增敏剂、激素、抗血管生成剂及其组合的至少一种另外的治疗剂。
20.根据权利要求19的方法,其中抗体、其片段或其缀合物选自利妥昔单抗(Rituxan)、布伦妥昔单抗维多汀(Adcetriz)、阿多曲妥珠单抗艾坦肽(Kadcyla)、西妥昔单抗(Erbitux)、贝伐单抗(Avastin)、替伊莫单抗(Zevalin)、维多珠单抗(Entyvio)、伊匹单抗(Yervoy)、纳武单抗(Opdivo)、派姆单抗(Keytruda)、阿伦单抗、阿特朱单抗(Tecentriq)、阿维鲁单抗(Bavencio)、德鲁瓦单抗(Imfinzi)、B-701、奥法木单抗、阿托珠单抗(Gazyva)、帕尼单抗、plozalizumab、BI-754091、OREG-103、COM-701、BI-754111及其组合。
21.根据权利要求19的方法,其中细胞毒性剂选自环磷酰胺、甲氯乙胺、尿嘧啶氮芥、美法仑、苯丁酸甲氯乙胺、异环磷酰胺、卡莫司汀、洛莫司汀、链脲霉素、白消安、替莫唑胺、顺铂、卡铂、奥沙利铂、奈达铂、沙铂、三硝酸四铂、阿霉素、柔红霉素、伊达比星、米托蒽醌、甲氨蝶呤、培美曲塞、6-巯基嘌呤、达卡巴嗪、氟达拉滨、5-氟尿嘧啶、阿拉伯糖胞嘧啶、卡培他滨、吉西他滨、地西他滨、长春花生物、紫杉醇(Taxol)、多西他赛(Taxotere)、依沙贝比隆(Ixempra)、放线菌素、蒽环类、缬沙星、表柔比星、博来霉素、普卡霉素、丝裂霉素、其药学上可接受的盐、前药及其组合。
22.根据权利要求19的方法,其中毒素是白喉毒素或其部分。
23.根据权利要求19的方法,其中放射性核素选自I-125、At-211、Lu-177、Cu-67、I-
131、Sm-153、Re-186、P-32、Re-188、In-114m、Y-90及其组合。
24.根据权利要求19的方法,其中免疫调控剂选自粒细胞集落刺激因子(G-CSF)、LAG-
3、IMP-321、JCAR-014、ASLAN-002(BMS-777607)、干扰素、咪喹莫特和来自细菌的细胞膜组分、IL-2、IL-7、IL-12、CCL3、CCL26、CXCL7、合成的胞嘧啶磷酸苷(CpG)、免疫检查点抑制剂及其组合。
25.根据权利要求19的方法,其中放射增敏剂选自米索硝唑、甲硝唑、替拉帕明、反式丁香酸钠及其组合。
26.根据权利要求19的方法、其中激素选自前列腺素、白三烯、前列环素、血栓烷、淀粉纤维素、抗苗勒管激素、脂联素、促肾上腺皮质激素、血管紧张素原、血管紧张素、血管加压素、心房肽、脑钠尿肽、降血素、胆囊收缩素、促肾上腺皮质激素释放激素、脑啡肽、内皮素、促红细胞生成素、促卵泡激素、甘丙肽、胃泌素、生长激素释放肽、胰高血糖素、促性腺激素释放激素、生长激素释放激素、人绒毛膜促性腺激素、人胎盘促泌素、生长激素、抑制素、胰岛素、生长调节素、瘦素、促脂素、促黄体生成素、黑素细胞刺激激素、胃动素、食欲素、催产素、胰多肽、甲状旁腺激素、催乳素、催乳素释放激素、松弛素、肾素、分泌素、生长抑素、血小板生成素、促甲状腺激素、睾丸酮、脱氢表雄酮、雄烯二酮、二氢睾丸酮、固酮、雌二醇、雌酮、雌三醇、皮质醇、孕酮、骨化三醇、骨化二醇、他莫昔芬(Nolvadex)、阿那曲唑(Arimidex)、来曲唑(Femara)、氟司韦特(Faslodex)及其组合。
27.根据权利要求19的方法、其中抗血管生成剂选自2-甲氧基雌二醇、血管抑制素、贝伐单抗、软骨衍生的血管生成抑制因子、内皮抑素、IFN-α、IL-12、伊曲康唑、利诺米特、血小板因子4、催乳素、SU5416、苏拉明、他克莫尼、替加仑、四硫代钼酸盐、沙利度胺、血小板反应蛋白、血小板反应蛋白、TNP-470、齐夫-阿柏西普、其药学上可接受的盐、前药及其组合。
28.根据权利要求19的方法,其中另外的治疗剂是PI3K/Akt途径的抑制剂。
29.根据权利要求28的方法、其中PI3K/Akt途径的抑制剂选自A-674563(CAS#552325-
73-2)、AGL 2263、AMG-319(Amgen,Thousand Oaks,CA)、AS-041164(5-苯并[1,3]二恶唑-5-基亚甲基-噻唑烷-2,4-二酮)、AS-604850(5-(2,2-二氟-苯并[1,3]二恶唑-5-基亚甲基)-噻唑烷-2,4-二酮)、AS-605240(5-喹喔啉-6-亚甲基-1,3-噻唑烷-2,4-二酮)、AT7867(CAS#
857531-00-1)、苯并咪唑系列,Genentech(Roche Holdings Inc.,South San Francisco,CA)、BML-257(CAS#32387-96-5)、BVD-723、CAL-120(Gilead Sciences,Foster City,CA)、CAL-129(Gilead Sciences)、CAL-130(Gilead Sciences)、CAL-253(Gilead Sciences)、CAL-263(Gilead Sciences)、CAS#612847-09-3、CAS#681281-88-9、CAS#75747-14-7、CAS#
925681-41-0、CAS#98510-80-6、CCT128930(CAS#885499-61-6)、CH5132799(CAS#1007207-
67-1)、CHR-4432(Chroma Therapeutics,Ltd.,Abingdon,UK)、FPA 124(CAS#902779-59-
3)、GS-1101(CAL-101)(Gilead Sciences)、GSK 690693(CAS#937174-76-0)、H-89(CAS#
127243-85-0)、Honokiol、IC87114(Gilead Science)、IPI-145(Intellikine Inc.)、KAR-
4139(Karus Therapeutics,Chilworth,UK)、KAR-4141(Karus Therapeutics)、KIN-1(Karus Therapeutics)、KT 5720(CAS#108068-98-0)、米替福新、MK-2206二盐酸化物(CAS#
1032350-13-2)、ML-9(CAS#105637-50-1)、盐酸纳曲通、OXY-111A(NormOxys Inc.,Brighton,MA)、perifosine、PHT-427(CAS#1191951-57-1)、PI3激酶δ抑制剂,Merck KGaA(Merck&Co.,Whitehouse Station,NJ)、PI3激酶δ抑制剂,Genentech(Roche Holdings Inc.)、PI3激酶δ抑制剂,Incozen(Incozen Therapeutics,Pvt.Ltd.,Hydrabad,India)、PI3激酶δ抑制剂2,Incozen(Incozen Therapeutics)、PI3激酶抑制剂,Roche-4(Roche Holdings Inc.)、PI3激酶抑制剂,Roche(Roche Holdings Inc.)、PI3激酶抑制剂,Roche-5(Roche Holdings Inc.)、PI3-α/δ抑制剂,Pathway Therapeutics(Pathway Therapeutics Ltd.,South San Francisco,CA)、PI3-δ抑制剂,Cellzome(Cellzome AG,Heidelberg,Germany)、PI3-δ抑制剂,Intellikine(Intellikine Inc.,La Jolla,CA)、PI3-δ抑制剂,Pathway Therapeutics-1(Pathway Therapeutics Ltd.)、PI3-δ抑制剂,Pathway Therapeutics-2(Pathway Therapeutics Ltd.)、PI3-δ/γ抑制剂,Cellzome(Cellzome AG)、PI3-δ/γ抑制剂,Cellzome(Cellzome  AG)、PI3-δ/γ抑制剂,Intellikine(Intellikine Inc.)、PI3-δ/γ抑制剂,Intellikine(Intellikine Inc.)、PI3-δ/γ抑制剂,Pathway Therapeutics(Pathway Therapeutics Ltd.)、PI3-δ/γ抑制剂,Pathway Therapeutics(Pathway Therapeutics Ltd.)、PI3-γ抑制剂,Evotec(Evotec)、PI3-γ抑制剂,Cellzome(Cellzome AG)、PI3-γ抑制剂,Pathway Therapeutics(Pathway Therapeutics Ltd.)、PI3Kδ/γ抑制剂,Intellikine-1(Intellikine Inc.)、PI3Kδ/γ抑制剂,Intellikine-1(Intellikine Inc.)、pictilisib(Roche Holdings Inc.)、PIK-90(CAS#677338-12-4)、SC-103980(Pfizer,New  York,NY)、SF-1126(Semafore Pharmaceuticals,Indianapolis,IN)、SH-5、SH-6、四氢姜黄素、TG100-115(Targegen Inc.,San Diego,CA)、曲西瑞宾、X-339(Xcovery,West Palm Beach,FL)、XL-499(Evotech,Hamburg,Germany)、其药学上可接受的盐及其组合。
30.用于在受试者中治疗或缓解癌症的影响的方法,包括:
(a)鉴定携带非V600E/K BRAF突变的患有癌症的受试者;和
(b)对受试者施用有效量的ERK抑制剂或其药学上可接受的盐。
31.根据权利要求30的方法,其中ERK抑制剂选自BVD-523、SCH-722984(Merck&Co.)、SCH-772984(Merck&Co.)、SCH-900353(MK-8353)(Merck&Co.)、LY3214996(Lilly)、AEZS-
140(Aeterna Zentaris)、AEZS-131(Aeterna Zentaris)、AEZS-136(Aeterna Zentaris)、LTT-462(Novartis)、RG-7842(Genentech)、CC-90003(Celgene)、KIN-4050(Kinentia)及其组合。
32.根据权利要求30的方法,其中ERK抑制剂是BVD-523。
33.根据权利要求30的方法,其中非V600E/K BRAF突变是激酶活化的突变、激酶受损的突变或激酶未知的突变及其组合。
34.根据权利要求33的方法,其中激酶活化的突变选自R462I、I463S、G464E、G464R、G464V、G466A、G469A、N581S、E586K、F595L、L597Q、L597R、L597S、L597V、A598V、T599E、V600R、K601E、S602D、A728V及其组合。
35.根据权利要求33的方法,其中激酶受损的突变选自G466E、G466R、G466V、Y472C、K483M、D594A、D594E、D594G、D594H、D594N、D594V、G596R、T599A、S602A及其组合。
36.根据权利要求33的方法,其中激酶未知的突变选自T440I、S467L、G469E、G469R、G469S、G469V、L584F、L588F、V600_K601delinsE、S605I、Q609L、E611Q及其组合。
37.根据权利要求30的方法,其中受试者是哺乳动物。
38.根据权利要求37的方法,其中哺乳动物选自人、灵长类动物、农场动物和家养动物。
39.根据权利要求37的方法,其中哺乳动物是人。
40.根据权利要求30的方法,其中癌症是实体瘤癌症或血液癌症。
41.根据权利要求30的方法,其中癌症选自胶质母细胞瘤、黑素瘤、胆管癌、小细胞肺癌、结肠直肠癌、前列腺癌、阴道癌、血管肉瘤、非小细胞肺癌、阑尾癌、鳞状细胞癌、唾液管癌、腺样囊性癌、小肠癌和胆囊癌。
42.根据权利要求41的方法,其中癌症选自小肠癌、非小细胞肺癌、胆囊癌和鳞状细胞癌。
43.根据权利要求30的方法,其中步骤(a)包括:
(i)从受试者获得生物样品;和
(ii)筛选样品以确定受试者是否具有非V600E/K BRAF突变。
44.根据权利要求30的方法,其进一步包括向受试者施用选自MEK抑制剂、RAF抑制剂、HDAC抑制剂及其组合的至少一种另外的治疗剂。
45.根据权利要求44的方法,其中MEK抑制剂选自炭疽毒素、蒽醌(Golden 
Biotechnology)、ARRY-142886(6-(4-溴-2-氯-苯基氨基)-7-氟-3-甲基-3H-苯并咪唑-5-羧酸(2-羟基-乙氧基)-酰胺)(Array BioPharma)、ARRY-438162(Array BioPharma)贝美替尼(MEK162,ARRY-1662)、AS-1940477(Astellas)、AS-703988(Merck KGaA)、bentamapimod(Merck KGaA)、BI-847325(Boehringer Ingelheim)、E-6201(Eisai)、GDC-0623(Hoffmann-La Roche)、GDC-0973(考比替尼)(Hoffmann-La Roche)、L783277(Merck)、炭疽毒素的致死因子部分、MEK162(Array BioPharma)、PD 098059(2-(2'-氨基-3'-甲氧苯基)-氧萘-4-酮)(Pfizer)、PD 184352(CI-1040)(Pfizer)、PD-0325901(Pfizer)、PD318088(Pfizer)、PD334581(Pfizer)、6-甲氧基-7-(3-吗啉-4-基-丙氧基)-4-(4-苯氧基-苯基氨基)-喹啉-
3-甲腈、4-[3-氯-4-(1-甲基-1H-咪唑-2-基硫烷基)-苯基氨基]-6-甲氧基-7-(3-吗啉-4-基-丙氧基)-喹啉-3-甲腈、pimasertib(Santhera Pharmaceuticals)、RDEA119(Ardea Biosciences/Bayer)、瑞美替尼(AstraZeneca)、RG422(Chugai Pharmaceutical Co.)、R0092210(Roche)、R04987655(Hoffmann-La Roche)、R05126766(Hoffmann-La Roche)、司美替尼(AZD6244)(AstraZeneca)、SL327(Sigma)、TAK-733(Takeda)、曲美替尼(Japan Tobacco)、U0126(1,4-二氨基-2,3-二氰基-1,4-双(2-氨基苯硫基)丁二烯)(Sigma)、WX-
554(Wilex)、YopJ多肽(Mittal等人,2010)、其药学上可接受的盐及其组合。
46.根据权利要求44的方法,其中RAF抑制剂选自AAL881(Novartis)、AB-024(Ambit Biosciences)、ARQ-736(ArQule)、ARQ-761(ArQule)、AZ628(Axon Medchem BV)、BAY 43-
9006索拉非尼、BeiGene-283(BeiGene)、BUB-024(MLN 2480)(Sunesis&Takeda)、b-raf抑制剂(Sareum)、BRAF激酶抑制剂(Selexagen Therapeutics)、BRAF siRNA  313(tacaccagcaagctagatgca)和523(cctatcgttagagtcttcctg)(Liu等人,2007)、CHIR-265(Novartis)、CTT239065(Institute of Cancer Research)、达拉非尼(GSK2118436)、DP-
4978(Deciphera Pharmaceuticals)、HM-95573(Hanmi)、GDC-0879(Genentech)、GW-5074(Sigma Aldrich)、ISIS 5132(Novartis)、L779450(Merck)、LBT613(Novartis)、LXH254(Novartis)、LErafAON(NeoPharm,Inc.)、LGX-818(Novartis)、帕唑帕尼
(GlaxoSmithKline)、PLX3202(Plexxikon)、PLX4720(Plexxikon)、PLX5568(Plexxikon)、PLX3603(Daiichi Sankyo)、PLX8394(Daiichi Sankyo)、RAF-265(Novartis)、RAF-365(Novartis)、REDX0535(RedX  Pharma  Plc)、瑞戈非尼(Bayer  Healthcare Pharmaceuticals,Inc.)、RO  5126766(Hoffmann-La  Roche)、SB-590885
(GlaxoSmithKline)、SB699393(GlaxoSmithKline)、索拉非尼(Onyx Pharmaceuticals)、TAK 632(Takeda)、TL-241(Teligene)、维拉非尼(RG7204或PLX4032)(Daiichi Sankyo)、XL-281(Exelixis)、ZM-336372(AstraZeneca)、其药学上可接受的盐及其组合。
47.根据权利要求44的方法,其中HDAC抑制剂选自艾贝司他(PCI-24781)、吉诺司他、恩替司他、扶林司他、CI-994、CUDC-101、恩替司他、BML-210、M344、NVP-LAQ824、帕比司他、Pracinosat(SB939)、Mocetinostat、Resminostat、罗米地辛、贝利诺司他、其药学上可接受的盐及其组合。
48.根据权利要求30的方法,其进一步包括向受试者施用选自抗体或其片段、细胞毒性剂、毒素、放射性核素、免疫调控剂、光活化治疗剂、放射增敏剂、激素、抗血管生成剂及其组合的至少一种另外的治疗剂。
49.根据权利要求48的方法,其中抗体、其片段或其缀合物选自利妥昔单抗(Rituxan)、布伦妥昔单抗维多汀(Adcetriz)、阿多曲妥珠单抗艾坦肽(Kadcyla)西妥昔单抗(Erbitux)、贝伐单抗(Avastin)、替伊莫单抗(Zevalin)、维多珠单抗(Entyvio)、伊匹单抗(Yervoy)、纳武单抗(Opdivo)、派姆单抗(Keytruda)、阿伦单抗阿特朱单抗(Tecentriq)、阿维鲁单抗(Bavencio)、德鲁瓦单抗(Imfinzi)、B-701、奥法木单抗、阿托珠单抗(Gazyva)帕尼单抗、plozalizumab、BI-754091、OREG-103、COM-701、BI-754111及其组合。
50.根据权利要求48的方法,其中细胞毒性剂选自环磷酰胺、甲氯乙胺、尿嘧啶氮芥、美法仑、苯丁酸甲氯乙胺、异环磷酰胺、卡莫司汀、洛莫司汀、链脲霉素、白消安、替莫唑胺、顺铂、卡铂、奥沙利铂、奈达铂、沙铂、三硝酸四铂、阿霉素、柔红霉素、伊达比星、米托蒽醌、甲氨蝶呤、培美曲塞、6-巯基嘌呤、达卡巴嗪、氟达拉滨、5-氟尿嘧啶、阿拉伯糖胞嘧啶、卡培他滨、吉西他滨、地西他滨、长春花生物碱、紫杉醇(Taxol)、多西他赛(Taxotere)、依沙贝比隆(Ixempra)、放线菌素、蒽环类、缬沙星、表柔比星、博来霉素、普卡霉素、丝裂霉素、其药学上可接受的盐、前药及其组合。
51.根据权利要求48的方法,其中毒素是白喉毒素或其部分。
52.根据权利要求48的方法,其中放射性核素选自I-125、At-211、Lu-177、Cu-67、I-
131、Sm-153、Re-186、P-32、Re-188、In-114m、Y-90及其组合。
53.根据权利要求48的方法,其中免疫调控剂选自粒细胞集落刺激因子(G-CSF)、LAG-
3、IMP-321、JCAR-014、ASLAN-002(BMS-777607)、干扰素、咪喹莫特和来自细菌的细胞膜组分、IL-2、IL-7、IL-12、CCL3、CCL26、CXCL7、合成的胞嘧啶磷酸鸟苷(CpG)、免疫检查点抑制剂及其组合。
54.根据权利要求48的方法,其中放射增敏剂选自米索硝唑、甲硝唑、替拉帕明、反式丁香酸钠及其组合。
55.根据权利要求48的方法、其中激素选自前列腺素、白三烯、前列环素、血栓烷、淀粉纤维素、抗苗勒管激素、脂联素、促肾上腺皮质激素、血管紧张素原、血管紧张素、血管加压素、心房肽、脑钠尿肽、降血钙素、胆囊收缩素、促肾上腺皮质激素释放激素、脑啡肽、内皮素、促红细胞生成素、促卵泡激素、甘丙肽、胃泌素、生长激素释放肽、胰高血糖素、促性腺激素释放激素、生长激素释放激素、人绒毛膜促性腺激素、人胎盘促泌素、生长激素、抑制素、胰岛素、生长调节素、瘦素、促脂素、促黄体生成素、黑素细胞刺激激素、胃动素、食欲素、催产素、胰多肽、甲状旁腺激素、催乳素、催乳素释放激素、松弛素、肾素、分泌素、生长抑素、血小板生成素、促甲状腺激素、睾丸酮、脱氢表雄酮、雄烯二酮、二氢睾丸酮、醛固酮、雌二醇、雌酮、雌三醇、皮质醇、孕酮、骨化三醇、骨化二醇、他莫昔芬(Nolvadex)、阿那曲唑(Arimidex)、来曲唑(Femara)、氟司韦特(Faslodex)及其组合。
56.根据权利要求48的方法、其中抗血管生成剂选自2-甲氧基雌二醇、血管抑制素、贝伐单抗、软骨衍生的血管生成抑制因子、内皮抑素、IFN-α、IL-12、伊曲康唑、利诺米特、血小板因子4、催乳素、SU5416、苏拉明、他克莫尼、替加仑、四硫代钼酸盐、沙利度胺、血小板反应蛋白、血小板反应蛋白、TNP-470、齐夫-阿柏西普、其药学上可接受的盐、前药及其组合。
57.根据权利要求48的方法,其中另外的治疗剂是PI3K/Akt途径的抑制剂。
58.根据权利要求57的方法、其中PI3K/Akt途径的抑制剂选自A-674563(CAS#552325-
73-2)、AGL 2263、AMG-319(Amgen,Thousand Oaks,CA)、AS-041164(5-苯并[1,3]二恶唑-5-基亚甲基-噻唑烷-2,4-二酮)、AS-604850(5-(2,2-二氟-苯并[1,3]二恶唑-5-基亚甲基)-噻唑烷-2,4-二酮)、AS-605240(5-喹喔啉-6-亚甲基-1,3-噻唑烷-2,4-二酮)、AT7867(CAS#
857531-00-1)、苯并咪唑系列,Genentech(Roche Holdings Inc.,South San Francisco,CA)、BML-257(CAS#32387-96-5)、BVD-723、CAL-120(Gilead Sciences,Foster City,CA)、CAL-129(Gilead Sciences)、CAL-130(Gilead Sciences)、CAL-253(Gilead Sciences)、CAL-263(Gilead Sciences)、CAS#612847-09-3、CAS#681281-88-9、CAS#75747-14-7、CAS#
925681-41-0、CAS#98510-80-6、CCT128930(CAS#885499-61-6)、CH5132799(CAS#1007207-
67-1)、CHR-4432(Chroma Therapeutics,Ltd.,Abingdon,UK)、FPA 124(CAS#902779-59-
3)、GS-1101(CAL-101)(Gilead Sciences)、GSK 690693(CAS#937174-76-0)、H-89(CAS#
127243-85-0)、Honokiol、IC87114(Gilead Science)、IPI-145(Intellikine Inc.)、KAR-
4139(Karus Therapeutics,Chilworth,UK)、KAR-4141(Karus Therapeutics)、KIN-1(Karus Therapeutics)、KT 5720(CAS#108068-98-0)、米替福新、MK-2206二盐酸化物(CAS#
1032350-13-2)、ML-9(CAS#105637-50-1)、盐酸纳曲通、OXY-111A(NormOxys Inc.,Brighton,MA)、perifosine、PHT-427(CAS#1191951-57-1)、PI3激酶δ抑制剂,Merck KGaA(Merck&Co.,Whitehouse Station,NJ)、PI3激酶δ抑制剂,Genentech(Roche Holdings Inc.)、PI3激酶δ抑制剂,Incozen(Incozen Therapeutics,Pvt.Ltd.,Hydrabad,India)、PI3激酶δ抑制剂2,Incozen(Incozen Therapeutics)、PI3激酶抑制剂,Roche-4(Roche Holdings Inc.)、PI3激酶抑制剂,Roche(Roche Holdings Inc.)、PI3激酶抑制剂,Roche-5(Roche Holdings Inc.)、PI3-α/δ抑制剂,Pathway Therapeutics(Pathway Therapeutics Ltd.,South San Francisco,CA)、PI3-δ抑制剂,Cellzome(Cellzome AG,Heidelberg,Germany)、PI3-δ抑制剂,Intellikine(Intellikine Inc.,La Jolla,CA)、PI3-δ抑制剂,Pathway Therapeutics-1(Pathway Therapeutics Ltd.)、PI3-δ抑制剂,Pathway Therapeutics-2(Pathway Therapeutics Ltd.)、PI3-δ/γ抑制剂,Cellzome(Cellzome AG)、PI3-δ/γ抑制剂,Cellzome(Cellzome  AG)、PI3-δ/γ抑制剂,Intellikine(Intellikine Inc.)、PI3-δ/γ抑制剂,Intellikine(Intellikine Inc.)、PI3-δ/γ抑制剂,Pathway Therapeutics(Pathway Therapeutics Ltd.)、PI3-δ/γ抑制剂,Pathway Therapeutics(Pathway Therapeutics Ltd.)、PI3-γ抑制剂,Evotec(Evotec)、PI3-γ抑制剂,Cellzome(Cellzome AG)、PI3-γ抑制剂,Pathway Therapeutics(Pathway Therapeutics Ltd.)、PI3Kδ/γ抑制剂,Intellikine-1(Intellikine Inc.)、PI3Kδ/γ抑制剂,Intellikine-1(Intellikine Inc.)、pictilisib(Roche Holdings Inc.)、PIK-90(CAS#677338-12-4)、SC-103980(Pfizer,New  York,NY)、SF-1126(Semafore Pharmaceuticals,Indianapolis,IN)、SH-5、SH-6、四氢姜黄素、TG100-115(Targegen Inc.,San Diego,CA)、曲西瑞宾、X-339(Xcovery,West Palm Beach,FL)、XL-499(Evotech,Hamburg,Germany)、其药学上可接受的盐及其组合。
59.鉴定将从ERK抑制剂或其药学上可接受的盐的疗法中受益的患有癌症的受试者的方法,该方法包括:
(a)从受试者获得生物样品;和
(b)筛选样品以确定受试者是否具有非V600E/K BRAF突变,
其中非V600E/K BRAF突变的存在证实受试者将从ERK抑制剂或其药学上可接受的盐的疗法中受益。
60.根据权利要求59的方法,其中ERK抑制剂选自BVD-523、SCH-722984(Merck&Co.)、SCH-772984(Merck&Co.)、SCH-900353(MK-8353)(Merck&Co.)、LY3214996(Lilly)、AEZS-
140(Aeterna Zentaris)、AEZS-131(Aeterna Zentaris)、AEZS-136(Aeterna Zentaris)、LTT-462(Novartis)、RG-7842(Genentech)、CC-90003(Celgene)、KIN-4050(Kinentia)及其组合。
61.根据权利要求59的方法,其中ERK抑制剂是BVD-523。
62.根据权利要求59的方法,其中非V600E/K BRAF突变是激酶活化的突变、激酶受损的突变或激酶未知的突变及其组合。
63.根据权利要求62的方法,其中激酶活化的突变选自R462I、I463S、G464E、G464R、G464V、G466A、G469A、N581S、E586K、F595L、L597Q、L597R、L597S、L597V、A598V、T599E、V600R、K601E、S602D、A728V及其组合。
64.根据权利要求62的方法,其中激酶受损的突变选自G466E、G466R、G466V、Y472C、K483M、D594A、D594E、D594G、D594H、D594N、D594V、G596R、T599A、S602A及其组合。
65.根据权利要求62的方法,其中激酶未知的突变选自T440I、S467L、G469E、G469R、G469S、G469V、L584F、L588F、V600_K601delinsE、S605I、Q609L、E611Q及其组合。
66.根据权利要求59的方法,其中受试者是哺乳动物。
67.根据权利要求66的方法,其中哺乳动物选自人、灵长类动物、农场动物和家养动物。
68.根据权利要求66的方法,其中哺乳动物是人。
69.根据权利要求59的方法,其中癌症是实体瘤癌症或血液癌症。
70.根据权利要求59的方法,其中癌症选自胶质母细胞瘤、黑素瘤、胆管癌、小细胞肺癌、结肠直肠癌、前列腺癌、阴道癌、血管肉瘤、非小细胞肺癌、阑尾癌、鳞状细胞癌、唾液管癌、腺样囊性癌、小肠癌和胆囊癌。
71.根据权利要求70的方法,其中癌症选自小肠癌、非小细胞肺癌、胆囊癌和鳞状细胞癌。
72.根据权利要求59的方法,其进一步包括将ERK抑制剂或其药学上可接受的盐施用给具有非V600E/K BRAF突变的受试者。
73.根据权利要求72的方法,其进一步包括向受试者施用选自MEK抑制剂、RAF抑制剂、HDAC抑制剂及其组合的至少一种另外的治疗剂。
74.根据权利要求73的方法,其中MEK抑制剂选自炭疽毒素、蒽醌(Golden 
Biotechnology)、ARRY-142886(6-(4-溴-2-氯-苯基氨基)-7-氟-3-甲基-3H-苯并咪唑-5-羧酸(2-羟基-乙氧基)-酰胺)(Array BioPharma)、ARRY-438162(Array BioPharma)贝美替尼(MEK162,ARRY-1662)、AS-1940477(Astellas)、AS-703988(Merck KGaA)、bentamapimod(Merck KGaA)、BI-847325(Boehringer Ingelheim)、E-6201(Eisai)、GDC-0623(Hoffmann-La Roche)、GDC-0973(考比替尼)(Hoffmann-La Roche)、L783277(Merck)、炭疽毒素的致死因子部分、MEK162(Array BioPharma)、PD 098059(2-(2'-氨基-3'-甲氧苯基)-氧萘-4-酮)(Pfizer)、PD 184352(CI-1040)(Pfizer)、PD-0325901(Pfizer)、PD318088(Pfizer)、PD334581(Pfizer)、6-甲氧基-7-(3-吗啉-4-基-丙氧基)-4-(4-苯氧基-苯基氨基)-喹啉-
3-甲腈、4-[3-氯-4-(1-甲基-1H-咪唑-2-基硫烷基)-苯基氨基]-6-甲氧基-7-(3-吗啉-4-基-丙氧基)-喹啉-3-甲腈、pimasertib(Santhera Pharmaceuticals)、RDEA119(Ardea Biosciences/Bayer)、瑞美替尼(AstraZeneca)、RG422(Chugai Pharmaceutical Co.)、R0092210(Roche)、R04987655(Hoffmann-La Roche)、R05126766(Hoffmann-La Roche)、司美替尼(AZD6244)(AstraZeneca)、SL327(Sigma)、TAK-733(Takeda)、曲美替尼(Japan Tobacco)、U0126(1,4-二氨基-2,3-二氰基-1,4-双(2-氨基苯硫基)丁二烯)(Sigma)、WX-
554(Wilex)、YopJ多肽(Mittal等人,2010)、其药学上可接受的盐及其组合。
75.根据权利要求73的方法,其中RAF抑制剂选自AAL881(Novartis)、AB-024(Ambit Biosciences)、ARQ-736(ArQule)、ARQ-761(ArQule)、AZ628(Axon Medchem BV)、BAY 43-
9006索拉非尼、BeiGene-283(BeiGene)、BUB-024(MLN 2480)(Sunesis&Takeda)、b-raf抑制剂(Sareum)、BRAF激酶抑制剂(Selexagen Therapeutics)、BRAF siRNA  313(tacaccagcaagctagatgca)和523(cctatcgttagagtcttcctg)(Liu等人,2007)、CHIR-265(Novartis)、CTT239065(Institute of Cancer Research)、达拉非尼(GSK2118436)、DP-
4978(Deciphera Pharmaceuticals)、HM-95573(Hanmi)、GDC-0879(Genentech)、GW-5074(Sigma Aldrich)、ISIS 5132(Novartis)、L779450(Merck)、LBT613(Novartis)、LXH254(Novartis)、LErafAON(NeoPharm,Inc.)、LGX-818(Novartis)、帕唑帕尼
(GlaxoSmithKline)、PLX3202(Plexxikon)、PLX4720(Plexxikon)、PLX5568(Plexxikon)、PLX3603(Daiichi Sankyo)、PLX8394(Daiichi Sankyo)、RAF-265(Novartis)、RAF-365(Novartis)、REDX0535(RedX  Pharma  Plc)、瑞戈非尼(Bayer  Healthcare Pharmaceuticals,Inc.)、RO  5126766(Hoffmann-La  Roche)、SB-590885
(GlaxoSmithKline)、SB699393(GlaxoSmithKline)、索拉非尼(Onyx Pharmaceuticals)、TAK 632(Takeda)、TL-241(Teligene)、维拉非尼(RG7204或PLX4032)(Daiichi Sankyo)、XL-281(Exelixis)、ZM-336372(AstraZeneca)、其药学上可接受的盐及其组合。
76.根据权利要求73的方法,其中HDAC抑制剂选自艾贝司他(PCI-24781)、吉诺司他、恩替司他、扶林司他、CI-994、CUDC-101、恩替司他、BML-210、M344、NVP-LAQ824、帕比司他、Pracinosat(SB939)、Mocetinostat、Resminostat、罗米地辛、贝利诺司他、其药学上可接受的盐及其组合。
77.根据权利要求72的方法,其进一步包括向具有非V600E/K BRAF突变的受试者施用选自抗体、抗体片段、抗体缀合物、细胞毒性剂、毒素、放射性核素、免疫调控剂、光活化治疗剂、放射增敏剂、激素、抗血管生成剂及其组合的至少一种另外的治疗剂。
78.根据权利要求77的方法,其中抗体、其片段或其缀合物选自利妥昔单抗(Rituxan)、布伦妥昔单抗维多汀(Adcetriz)、阿多曲妥珠单抗艾坦肽(Kadcyla)西妥昔单抗(Erbitux)、贝伐单抗(Avastin)、替伊莫单抗(Zevalin)、维多珠单抗(Entyvio)、伊匹单抗(Yervoy)、纳武单抗(Opdivo)、派姆单抗(Keytruda)、阿伦单抗阿特朱单抗(Tecentriq)、阿维鲁单抗(Bavencio)、德鲁瓦单抗(Imfinzi)、B-701、奥法木单抗、阿托珠单抗(Gazyva)帕尼单抗、plozalizumab、BI-754091、OREG-103、COM-701、BI-754111及其组合。
79.根据权利要求77的方法,其中细胞毒性剂选自环磷酰胺、甲氯乙胺、尿嘧啶氮芥、美法仑、苯丁酸甲氯乙胺、异环磷酰胺、卡莫司汀、洛莫司汀、链脲霉素、白消安、替莫唑胺、顺铂、卡铂、奥沙利铂、奈达铂、沙铂、三硝酸四铂、阿霉素、柔红霉素、伊达比星、米托蒽醌、甲氨蝶呤、培美曲塞、6-巯基嘌呤、达卡巴嗪、氟达拉滨、5-氟尿嘧啶、阿拉伯糖胞嘧啶、卡培他滨、吉西他滨、地西他滨、长春花生物碱、紫杉醇(Taxol)、多西他赛(Taxotere)、依沙贝比隆(Ixempra)、放线菌素、蒽环类、缬沙星、表柔比星、博来霉素、普卡霉素、丝裂霉素、其药学上可接受的盐、前药及其组合。
80.根据权利要求77的方法,其中毒素是白喉毒素或其部分。
81.根据权利要求77的方法,其中放射性核素选自I-125、At-211、Lu-177、Cu-67、I-
131、Sm-153、Re-186、P-32、Re-188、In-114m、Y-90及其组合。
82.根据权利要求77的方法,其中免疫调控剂选自粒细胞集落刺激因子(G-CSF)、LAG-
3、IMP-321、JCAR-014、ASLAN-002(BMS-777607)、干扰素、咪喹莫特和来自细菌的细胞膜组分、IL-2、IL-7、IL-12、CCL3、CCL26、CXCL7、合成的胞嘧啶磷酸鸟苷(CpG)、免疫检查点抑制剂及其组合。
83.根据权利要求77的方法,其中放射增敏剂选自米索硝唑、甲硝唑、替拉帕明、反式丁香酸钠及其组合。
84.根据权利要求77的方法、其中激素选自前列腺素、白三烯、前列环素、血栓烷、淀粉纤维素、抗苗勒管激素、脂联素、促肾上腺皮质激素、血管紧张素原、血管紧张素、血管加压素、心房肽、脑钠尿肽、降血钙素、胆囊收缩素、促肾上腺皮质激素释放激素、脑啡肽、内皮素、促红细胞生成素、促卵泡激素、甘丙肽、胃泌素、生长激素释放肽、胰高血糖素、促性腺激素释放激素、生长激素释放激素、人绒毛膜促性腺激素、人胎盘促泌素、生长激素、抑制素、胰岛素、生长调节素、瘦素、促脂素、促黄体生成素、黑素细胞刺激激素、胃动素、食欲素、催产素、胰多肽、甲状旁腺激素、催乳素、催乳素释放激素、松弛素、肾素、分泌素、生长抑素、血小板生成素、促甲状腺激素、睾丸酮、脱氢表雄酮、雄烯二酮、二氢睾丸酮、醛固酮、雌二醇、雌酮、雌三醇、皮质醇、孕酮、骨化三醇、骨化二醇、他莫昔芬(Nolvadex)、阿那曲唑(Arimidex)、来曲唑(Femara)、氟司韦特(Faslodex)及其组合。
85.根据权利要求77的方法、其中抗血管生成剂选自2-甲氧基雌二醇、血管抑制素、贝伐单抗、软骨衍生的血管生成抑制因子、内皮抑素、IFN-α、IL-12、伊曲康唑、利诺米特、血小板因子4、催乳素、SU5416、苏拉明、他克莫尼、替加仑、四硫代钼酸盐、沙利度胺、血小板反应蛋白、血小板反应蛋白、TNP-470、齐夫-阿柏西普、其药学上可接受的盐、前药及其组合。
86.根据权利要求77的方法,其中另外的治疗剂是PI3K/Akt途径的抑制剂。
87.根据权利要求86的方法、其中PI3K/Akt途径的抑制剂选自A-674563(CAS#552325-
73-2)、AGL 2263、AMG-319(Amgen,Thousand Oaks,CA)、AS-041164(5-苯并[1,3]二恶唑-5-基亚甲基-噻唑烷-2,4-二酮)、AS-604850(5-(2,2-二氟-苯并[1,3]二恶唑-5-基亚甲基)-噻唑烷-2,4-二酮)、AS-605240(5-喹喔啉-6-亚甲基-1,3-噻唑烷-2,4-二酮)、AT7867(CAS#
857531-00-1)、苯并咪唑系列,Genentech(Roche Holdings Inc.,South San Francisco,CA)、BML-257(CAS#32387-96-5)、BVD-723、CAL-120(Gilead Sciences,Foster City,CA)、CAL-129(Gilead Sciences)、CAL-130(Gilead Sciences)、CAL-253(Gilead Sciences)、CAL-263(Gilead Sciences)、CAS#612847-09-3、CAS#681281-88-9、CAS#75747-14-7、CAS#
925681-41-0、CAS#98510-80-6、CCT128930(CAS#885499-61-6)、CH5132799(CAS#1007207-
67-1)、CHR-4432(Chroma Therapeutics,Ltd.,Abingdon,UK)、FPA 124(CAS#902779-59-
3)、GS-1101(CAL-101)(Gilead Sciences)、GSK 690693(CAS#937174-76-0)、H-89(CAS#
127243-85-0)、Honokiol、IC87114(Gilead Science)、IPI-145(Intellikine Inc.)、KAR-
4139(Karus Therapeutics,Chilworth,UK)、KAR-4141(Karus Therapeutics)、KIN-1(Karus Therapeutics)、KT 5720(CAS#108068-98-0)、米替福新、MK-2206二盐酸化物(CAS#
1032350-13-2)、ML-9(CAS#105637-50-1)、盐酸纳曲通、OXY-111A(NormOxys Inc.,Brighton,MA)、perifosine、PHT-427(CAS#1191951-57-1)、PI3激酶δ抑制剂,Merck KGaA(Merck&Co.,Whitehouse Station,NJ)、PI3激酶δ抑制剂,Genentech(Roche Holdings Inc.)、PI3激酶δ抑制剂,Incozen(Incozen Therapeutics,Pvt.Ltd.,Hydrabad,India)、PI3激酶δ抑制剂2,Incozen(Incozen Therapeutics)、PI3激酶抑制剂,Roche-4(Roche Holdings Inc.)、PI3激酶抑制剂,Roche(Roche Holdings Inc.)、PI3激酶抑制剂,Roche-5(Roche Holdings Inc.)、PI3-α/δ抑制剂,Pathway Therapeutics(Pathway Therapeutics Ltd.,South San Francisco,CA)、PI3-δ抑制剂,Cellzome(Cellzome AG,Heidelberg,Germany)、PI3-δ抑制剂,Intellikine(Intellikine Inc.,La Jolla,CA)、PI3-δ抑制剂,Pathway Therapeutics-1(Pathway Therapeutics Ltd.)、PI3-δ抑制剂,Pathway Therapeutics-2(Pathway Therapeutics Ltd.)、PI3-δ/γ抑制剂,Cellzome(Cellzome AG)、PI3-δ/γ抑制剂,Cellzome(Cellzome  AG)、PI3-δ/γ抑制剂,Intellikine(Intellikine Inc.)、PI3-δ/γ抑制剂,Intellikine(Intellikine Inc.)、PI3-δ/γ抑制剂,Pathway Therapeutics(Pathway Therapeutics Ltd.)、PI3-δ/γ抑制剂,Pathway Therapeutics(Pathway Therapeutics Ltd.)、PI3-γ抑制剂,Evotec(Evotec)、PI3-γ抑制剂,Cellzome(Cellzome AG)、PI3-γ抑制剂,Pathway Therapeutics(Pathway Therapeutics Ltd.)、PI3Kδ/γ抑制剂,Intellikine-1(Intellikine Inc.)、PI3Kδ/γ抑制剂,Intellikine-1(Intellikine Inc.)、pictilisib(Roche Holdings Inc.)、PIK-90(CAS#677338-12-4)、SC-103980(Pfizer,New  York,NY)、SF-1126(Semafore Pharmaceuticals,Indianapolis,IN)、SH-5、SH-6、四氢姜黄素、TG100-115(Targegen Inc.,San Diego,CA)、曲西瑞宾、X-339(Xcovery,West Palm Beach,FL)、XL-499(Evotech,Hamburg,Germany)、其药学上可接受的盐及其组合。
88.用于在携带非V600E/K BRAF突变的受试者中治疗或缓解癌症的影响的药物组合物,该组合物包含药学上可接受的载体或稀释剂和有效量的ERK抑制剂或其药学上可接受的盐。
89.根据权利要求88的药物组合物,其中ERK抑制剂选自BVD-523、SCH-722984(Merck&Co.)、SCH-772984(Merck&Co.)、SCH-900353(MK-8353)(Merck&Co.)、LY3214996(Lilly)、LY3214996(Lilly)、AEZS-140(Aeterna Zentaris)、AEZS-131(Aeterna Zentaris)、AEZS-
136(Aeterna Zentaris)、LTT-462(Novartis)、RG-7842(Genentech)、CC-90003(Celgene)、KIN-4050(Kinentia)及其组合。
90.根据权利要求88的药物组合物,其中ERK抑制剂是BVD-523。
91.根据权利要求88的药物组合物,其中非V600E/K BRAF突变是激酶活化的突变、激酶受损的突变或激酶未知的突变及其组合。
92.根据权利要求91的药物组合物,其中激酶活化的突变选自R462I、I463S、G464E、G464R、G464V、G466A、G469A、N581S、E586K、F595L、L597Q、L597R、L597S、L597V、A598V、T599E、V600R、K601E、S602D、A728V及其组合。
93.根据权利要求91的药物组合物,其中激酶受损的突变选自G466E、G466R、G466V、Y472C、K483M、D594A、D594E、D594G、D594H、D594N、D594V、G596R、T599A、S602A及其组合。
94.根据权利要求91的药物组合物,其中激酶未知的突变选自T440I、S467L、G469E、G469R、G469S、G469V、L584F、L588F、V600_K601delinsE、S605I、Q609L、E611Q及其组合。
95.根据权利要求88的药物组合物,其中受试者是哺乳动物。
96.根据权利要求95的药物组合物,其中哺乳动物选自人、灵长类动物、农场动物和家养动物。
97.根据权利要求95的药物组合物,其中哺乳动物是人。
98.根据权利要求88的药物组合物,其中癌症是实体瘤癌症或血液癌症。
99.根据权利要求88的药物组合物,其中癌症选自胶质母细胞瘤、黑素瘤、胆管癌、小细胞肺癌、结肠直肠癌、前列腺癌、阴道癌、血管肉瘤、非小细胞肺癌、阑尾癌、鳞状细胞癌、唾液管癌、腺样囊性癌、小肠癌和胆囊癌。
100.根据权利要求99的药物组合物,其中癌症选自小肠癌、非小细胞肺癌、胆囊癌和鳞状细胞癌。
101.根据权利要求88的药物组合物,其中组合物口服或通过注射施用给受试者。
102.根据权利要求88的药物组合物,其中组合物以片剂施用给受试者。
103.根据权利要求88的药物组合物,其进一步包含选自MEK抑制剂、RAF抑制剂、HDAC抑制剂及其组合的至少一种另外的治疗剂。
104.根据权利要求103的药物组合物,其中MEK抑制剂选自炭疽毒素、蒽醌(Golden Biotechnology)、ARRY-142886(6-(4-溴-2-氯-苯基氨基)-7-氟-3-甲基-3H-苯并咪唑-5-羧酸(2-羟基-乙氧基)-酰胺)(Array BioPharma)、ARRY-438162(Array BioPharma)贝美替尼(MEK162,ARRY-1662)、AS-1940477(Astellas)、AS-703988(Merck KGaA)、bentamapimod(Merck KGaA)、BI-847325(Boehringer Ingelheim)、E-6201(Eisai)、GDC-0623(Hoffmann-La Roche)、GDC-0973(考比替尼)(Hoffmann-La Roche)、L783277(Merck)、炭疽毒素的致死因子部分、MEK162(Array BioPharma)、PD 098059(2-(2'-氨基-3'-甲氧苯基)-氧萘-4-酮)(Pfizer)、PD 184352(CI-1040)(Pfizer)、PD-0325901(Pfizer)、PD318088(Pfizer)、PD334581(Pfizer)、6-甲氧基-7-(3-吗啉-4-基-丙氧基)-4-(4-苯氧基-苯基氨基)-喹啉-
3-甲腈、4-[3-氯-4-(1-甲基-1H-咪唑-2-基硫烷基)-苯基氨基]-6-甲氧基-7-(3-吗啉-4-基-丙氧基)-喹啉-3-甲腈、pimasertib(Santhera Pharmaceuticals)、RDEA119(Ardea Biosciences/Bayer)、瑞美替尼(AstraZeneca)、RG422(Chugai Pharmaceutical Co.)、R0092210(Roche)、R04987655(Hoffmann-La Roche)、R05126766(Hoffmann-La Roche)、司美替尼(AZD6244)(AstraZeneca)、SL327(Sigma)、TAK-733(Takeda)、曲美替尼(Japan Tobacco)、U0126(1,4-二氨基-2,3-二氰基-1,4-双(2-氨基苯硫基)丁二烯)(Sigma)、WX-
554(Wilex)、YopJ多肽(Mittal等人,2010)、其药学上可接受的盐及其组合。
105.根据权利要求103的药物组合物,其中RAF抑制剂选自AAL881(Novartis)、AB-024(Ambit Biosciences)、ARQ-736(ArQule)、ARQ-761(ArQule)、AZ628(Axon Medchem BV)、BAY 43-9006索拉非尼、BeiGene-283(BeiGene)、BUB-024(MLN 2480)(Sunesis&Takeda)、b-raf抑制剂(Sareum)、BRAF激酶抑制剂(Selexagen Therapeutics)、BRAF siRNA 313(tacaccagcaagctagatgca)和523(cctatcgttagagtcttcctg)(Liu等人,2007)、CHIR-265(Novartis)、CTT239065(Institute of Cancer Research)、达拉非尼(GSK2118436)、DP-
4978(Deciphera Pharmaceuticals)、HM-95573(Hanmi)、GDC-0879(Genentech)、GW-5074(Sigma Aldrich)、ISIS 5132(Novartis)、L779450(Merck)、LBT613(Novartis)、LXH254(Novartis)、LErafAON(NeoPharm,Inc.)、LGX-818(Novartis)、帕唑帕尼
(GlaxoSmithKline)、PLX3202(Plexxikon)、PLX4720(Plexxikon)、PLX5568(Plexxikon)、PLX3603(Daiichi Sankyo)、PLX8394(Daiichi Sankyo)、RAF-265(Novartis)、RAF-365(Novartis)、REDX0535(RedX  Pharma  Plc)、瑞戈非尼(Bayer  Healthcare Pharmaceuticals,Inc.)、RO  5126766(Hoffmann-La  Roche)、SB-590885
(GlaxoSmithKline)、SB699393(GlaxoSmithKline)、索拉非尼(Onyx Pharmaceuticals)、TAK 632(Takeda)、TL-241(Teligene)、维拉非尼(RG7204或PLX4032)(Daiichi Sankyo)、XL-281(Exelixis)、ZM-336372(AstraZeneca)、其药学上可接受的盐及其组合。
106.根据权利要求103的药物组合物,其中HDAC抑制剂选自艾贝司他(PCI-24781)、吉诺司他、恩替司他、扶林司他、CI-994、CUDC-101、恩替司他、BML-210、M344、NVP-LAQ824、帕比司他、Pracinosat(SB939)、Mocetinostat、Resminostat、罗米地辛、贝利诺司他、其药学上可接受的盐及其组合。
107.根据权利要求88的药物组合物,其进一步包括选自抗体或其片段、细胞毒性剂、毒素、放射性核素、免疫调控剂、光活化治疗剂、放射增敏剂、激素、抗血管生成剂及其组合的至少一种另外的治疗剂。
108.根据权利要求107的药物组合物,其中抗体、其片段或其缀合物选自利妥昔单抗(Rituxan)、布伦妥昔单抗维多汀(Adcetriz)、阿多曲妥珠单抗艾坦肽(Kadcyla)西妥昔单抗(Erbitux)、贝伐单抗(Avastin)、替伊莫单抗(Zevalin)、维多珠单抗(Entyvio)、伊匹单抗(Yervoy)、纳武单抗(Opdivo)、派姆单抗(Keytruda)、阿伦单抗阿特朱单抗(Tecentriq)、阿维鲁单抗(Bavencio)、德鲁瓦单抗(Imfinzi)、B-701、奥法木单抗、阿托珠单抗(Gazyva)帕尼单抗、plozalizumab、BI-754091、OREG-103、COM-701、BI-754111及其组合。
109.根据权利要求107的药物组合物,其中细胞毒性剂选自环磷酰胺、甲氯乙胺、尿嘧啶氮芥、美法仑、苯丁酸甲氯乙胺、异环磷酰胺、卡莫司汀、洛莫司汀、链脲霉素、白消安、替莫唑胺、顺铂、卡铂、奥沙利铂、奈达铂、沙铂、三硝酸四铂、阿霉素、柔红霉素、伊达比星、米托蒽醌、甲氨蝶呤、培美曲塞、6-巯基嘌呤、达卡巴嗪、氟达拉滨、5-氟尿嘧啶、阿拉伯糖胞嘧啶、卡培他滨、吉西他滨、地西他滨、长春花生物碱、紫杉醇(Taxol)、多西他赛(Taxotere)、依沙贝比隆(Ixempra)、放线菌素、蒽环类、缬沙星、表柔比星、博来霉素、普卡霉素、丝裂霉素、其药学上可接受的盐、前药及其组合。
110.根据权利要求107的药物组合物,其中毒素是白喉毒素或其部分。
111.根据权利要求107的药物组合物,其中放射性核素选自I-125、At-211、Lu-177、Cu-
67、I-131、Sm-153、Re-186、P-32、Re-188、In-114m、Y-90及其组合。
112.根据权利要求107的药物组合物,其中免疫调控剂选自粒细胞集落刺激因子(G-CSF)、LAG-3、IMP-321、JCAR-014、ASLAN-002(BMS-777607)、干扰素、咪喹莫特和来自细菌的细胞膜组分、IL-2、IL-7、IL-12、CCL3、CCL26、CXCL7、合成的胞嘧啶磷酸鸟苷(CpG)、免疫检查点抑制剂及其组合。
113.根据权利要求107的药物组合物,其中放射增敏剂选自米索硝唑、甲硝唑、替拉帕明、反式丁香酸钠及其组合。
114.根据权利要求107的药物组合物、其中激素选自前列腺素、白三烯、前列环素、血栓烷、淀粉纤维素、抗苗勒管激素、脂联素、促肾上腺皮质激素、血管紧张素原、血管紧张素、血管加压素、心房肽、脑钠尿肽、降血钙素、胆囊收缩素、促肾上腺皮质激素释放激素、脑啡肽、内皮素、促红细胞生成素、促卵泡激素、甘丙肽、胃泌素、生长激素释放肽、胰高血糖素、促性腺激素释放激素、生长激素释放激素、人绒毛膜促性腺激素、人胎盘促泌素、生长激素、抑制素、胰岛素、生长调节素、瘦素、促脂素、促黄体生成素、黑素细胞刺激激素、胃动素、食欲素、催产素、胰多肽、甲状旁腺激素、催乳素、催乳素释放激素、松弛素、肾素、分泌素、生长抑素、血小板生成素、促甲状腺激素、睾丸酮、脱氢表雄酮、雄烯二酮、二氢睾丸酮、醛固酮、雌二醇、雌酮、雌三醇、皮质醇、孕酮、骨化三醇、骨化二醇、他莫昔芬(Nolvadex)、阿那曲唑(Arimidex)、来曲唑(Femara)、氟司韦特(Faslodex)及其组合。
115.根据权利要求107的药物组合物,其中抗血管生成剂选自2-甲氧基雌二醇、血管抑制素、贝伐单抗、软骨衍生的血管生成抑制因子、内皮抑素、IFN-α、IL-12、伊曲康唑、利诺米特、血小板因子4、催乳素、SU5416、苏拉明、他克莫尼、替加仑、四硫代钼酸盐、沙利度胺、血小板反应蛋白、血小板反应蛋白、TNP-470、齐夫-阿柏西普、其药学上可接受的盐、前药及其组合。
116.根据权利要求107的药物组合物,其中另外的治疗剂是PI3K/Akt途径的抑制剂。
117.根据权利要求116的药物组合物,其中PI3K/Akt途径的抑制剂选自A-674563(CAS#
552325-73-2)、AGL 2263、AMG-319(Amgen,Thousand Oaks,CA)、AS-041164(5-苯并[1,3]二恶唑-5-基亚甲基-噻唑烷-2,4-二酮)、AS-604850(5-(2,2-二氟-苯并[1,3]二恶唑-5-基亚甲基)-噻唑烷-2,4-二酮)、AS-605240(5-喹喔啉-6-亚甲基-1,3-噻唑烷-2,4-二酮)、AT7867(CAS#857531-00-1)、苯并咪唑系列,Genentech(Roche Holdings Inc.,South San Francisco,CA)、BML-257(CAS#32387-96-5)、BVD-723、CAL-120(Gilead Sciences,Foster City,CA)、CAL-129(Gilead Sciences)、CAL-130(Gilead Sciences)、CAL-253(Gilead Sciences)、CAL-263(Gilead Sciences)、CAS#612847-09-3、CAS#681281-88-9、CAS#75747-
14-7、CAS#925681-41-0、CAS#98510-80-6、CCT128930(CAS#885499-61-6)、CH5132799(CAS#
1007207-67-1)、CHR-4432(Chroma Therapeutics,Ltd.,Abingdon,UK)、FPA 124(CAS#
902779-59-3)、GS-1101(CAL-101)(Gilead Sciences)、GSK690693(CAS#937174-76-0)、H-
89(CAS#127243-85-0)、Honokiol、IC87114(Gilead Science)、IPI-145(Intellikine Inc.)、KAR-4139(Karus Therapeutics,Chilworth,UK)、KAR-4141(Karus Therapeutics)、KIN-1(Karus Therapeutics)、KT 5720(CAS#108068-98-0)、米替福新、MK-2206二盐酸化物(CAS#1032350-13-2)、ML-9(CAS#105637-50-1)、盐酸纳曲通、OXY-111A(NormOxys Inc.,Brighton,MA)、perifosine、PHT-427(CAS#1191951-57-1)、PI3激酶δ抑制剂,Merck KGaA(Merck&Co.,Whitehouse Station,NJ)、PI3激酶δ抑制剂,Genentech(Roche Holdings Inc.)、PI3激酶δ抑制剂,Incozen(Incozen Therapeutics,Pvt.Ltd.,Hydrabad,India)、PI3激酶δ抑制剂2,Incozen(Incozen Therapeutics)、PI3激酶抑制剂,Roche-4(Roche Holdings Inc.)、PI3激酶抑制剂,Roche(Roche Holdings Inc.)、PI3激酶抑制剂,Roche-5(Roche Holdings Inc.)、PI3-α/δ抑制剂,Pathway Therapeutics(Pathway Therapeutics Ltd.,South San Francisco,CA)、PI3-δ抑制剂,Cellzome(Cellzome AG,Heidelberg,Germany)、PI3-δ抑制剂,Intellikine(Intellikine Inc.,La Jolla,CA)、PI3-δ抑制剂,Pathway Therapeutics-1(Pathway Therapeutics Ltd.)、PI3-δ抑制剂,Pathway Therapeutics-2(Pathway Therapeutics Ltd.)、PI3-δ/γ抑制剂,Cellzome(Cellzome AG)、PI3-δ/γ抑制剂,Cellzome(Cellzome  AG)、PI3-δ/γ抑制剂,Intellikine(Intellikine Inc.)、PI3-δ/γ抑制剂,Intellikine(Intellikine Inc.)、PI3-δ/γ抑制剂,Pathway Therapeutics(Pathway Therapeutics Ltd.)、PI3-δ/γ抑制剂,Pathway Therapeutics(Pathway Therapeutics Ltd.)、PI3-γ抑制剂,Evotec(Evotec)、PI3-γ抑制剂,Cellzome(Cellzome AG)、PI3-γ抑制剂,Pathway Therapeutics(Pathway Therapeutics Ltd.)、PI3Kδ/γ抑制剂,Intellikine-1(Intellikine Inc.)、PI3Kδ/γ抑制剂,Intellikine-1(Intellikine Inc.)、pictilisib(Roche Holdings Inc.)、PIK-90(CAS#677338-12-4)、SC-103980(Pfizer,New  York,NY)、SF-1126(Semafore Pharmaceuticals,Indianapolis,IN)、SH-5、SH-6、四氢姜黄素、TG100-115(Targegen Inc.,San Diego,CA)、曲西瑞宾、X-339(Xcovery,West Palm Beach,FL)、XL-499(Evotech,Hamburg,Germany)、其药学上可接受的盐及其组合。
118.根据权利要求103或107的药物组合物,其是包含ERK抑制剂和另外的治疗剂的单位剂型。
119.根据权利要求103或107的药物组合物,其中ERK抑制剂为第一单位剂型并且另外的治疗剂为与第一单位剂型分开的第二单位剂型。
120.根据权利要求103或107的药物组合物,其中将ERK抑制剂和另外的治疗剂共同施用给受试者。
121.根据权利要求103或107的药物组合物,其中将ERK抑制剂和另外的治疗剂逐次地施用给受试者。
122.根据权利要求121的药物组合物,其中ERK抑制剂在另外的治疗剂的施用之前或之后施用给受试者。
123.用于在携带非V600E/K BRAF突变的受试者中治疗或缓解癌症的影响的方法,该方法包括向受试者施用有效量的BVD-523或其药学上可接受的盐。
124.用于在受试者中治疗或改善癌症的影响的方法,包括:
(a)鉴定携带非V600E/K BRAF突变的患有癌症的受试者;和
(b)向受试者施用有效量的BVD-523或其药学上可接受的盐。
125.用于鉴定将从BVD-523或其药学上可接受的盐的疗法中受益的患有癌症的受试者的方法,该方法包括:
(a)从受试者获得生物样品;和
(b)筛选样品以确定受试者是否具有非V600E/K BRAF突变,
其中非V600E/K BRAF突变的存在证实受试者将从BVD-523或其药学上可接受的盐疗法中受益。
126.用于在携带非V600E/K BRAF突变的受试者中治疗或缓解癌症的影响的药物组合物,该组合物包含药学上可接受的载体或稀释剂和有效量的BVD-523或其药学上可接受的盐。
127.用于在携带非V600E/K BRAF突变的受试者中治疗或缓解癌症的影响的试剂盒,该试剂盒包括根据权利要求88、103和107中任一项的药物组合物及包装在一起的其使用说明书
128.根据权利要求15、44、73或103的方法,其中RAF抑制剂选自厄洛替尼(Tarceva)、吉非替尼(Iressa)、甲磺酸伊替尼(Gleevec)、拉帕替尼(Tyverb)、苹果酸舒尼替尼(Sutent)、其药学上可接受的盐及其组合。
129.根据权利要求15、44、73或103的方法,其中RAF抑制剂选自LXH254(Novartis)、PLX3603(Daiichi Sankyo)、PLX8394(Daiichi Sankyo)、REDX0535(RedX Pharma Plc)、其药学上可接受的盐及其组合。
130.根据权利要求15、44、73或103所述的方法,其中HDAC抑制剂选自扶林司他、帕诺比司他、罗米地辛、贝利司他、其药学上可接受的盐及其组合。
131.根据权利要求19、48或107的方法,其中抗体、其片段或其缀合物选自利妥昔单抗(Rituxan)、布伦妥昔单抗维多汀(Adcetriz)、阿多曲妥珠单抗艾坦肽(Kadcyla)、伊匹单抗(Yervoy)、纳武单抗(Opdivo)、派姆单抗(Keytruda)、阿伦单抗阿特朱单抗(Tecentriq)、德鲁瓦单抗(Imfinzi)、奥法木单抗、阿托珠单抗(Gazyva)、帕尼单抗(Panitumumab)及其组合。
132.根据权利要求28、57、87或116的方法,其中PI3K/Akt途径的抑制剂是BVD-723。

说明书全文

用于治疗具有非典型BRAF突变的癌症的组合物和方法

[0001] 相关申请的交叉引用
[0002] 本申请要求2017年5月16日提交的美国临时专利申请号62/506,995的权益,其全部内容通过引用并入本文。
[0003] 公开领域
[0004] 本公开涉及使用一种或多种抗癌剂治疗或缓解具有非典型基因突变的癌症的影响的方法、试剂盒和药物组合物。
[0005] 通过参考并入序列表
[0006] 本申请包含对基酸和/或核酸序列的参考,所述氨基酸和/或核酸序列已经同时提交为序列表文本文件“2391211.txt”,文件大小为246KB,于2018年5月15日创建。根据37C.F.R.§1.52(e)(5),上述序列表通过引用全文并入本文。
[0007] 发明背景
[0008] 丝裂原活化蛋白激酶(MAPK)或RAS/RAF/MEK/ERK信号传导负责涉及控制增殖、分化和细胞凋亡的几种细胞信号传导途径。发现MAPK细胞信号传导途径在人类癌症中被破坏,通常是由于KRAS、NRAS或BRAF基因的活化突变。已经开发出选择性BRAF抑制剂,例如维罗非尼(vemurafenib)和达拉非尼(dabrafenib),以靶向BRAF突变肿瘤。例如,维罗非尼被批准用于具有BRAF V600E突变的不可切除或转移性黑色素瘤,并且对BRAF V600E突变的检测已成为预测对维罗非尼、达拉非尼和曲美替尼(trametinib)治疗有应答的护理标准。
[0009] 尽管V600E突变是在许多肿瘤类型中观察到的最常见的BRAF突变,但是Catolog of Somatic Mutations in Cancer(COSMIC)数据库已经报道了BRAF基因的外显子11和15内的100多个其他突变。在V600密码子以外的BRAF突变的临床重要性在很大程度上尚不清楚。
[0010] 鉴于上述情况,需要新颖的治疗剂,该治疗剂将靶向携带除V600E以外的BRAF突变的细胞类型中的MAPK途径。本申请旨在满足这些和其他需求。

发明内容

[0011] 根据一个方面,本公开提供了用于在具有非V600E/K BRAF突变的受试者中治疗或缓解癌症的影响的方法,该方法包括向受试者施用有效量的ERK抑制剂或其药学上可接受的盐。
[0012] 根据一些实施方案,ERK抑制剂选自BVD-523、SCH-722984(Merck&Co.)、SCH-772984(Merck&Co.)、SCH-900353(MK-8353)(Merck&Co.)、LY3214996(Lilly)、AEZS-140(Aeterna Zentaris)、AEZS-131(Aeterna Zentaris)、AEZS-136(Aeterna Zentaris)、LTT-
462(Novartis)、RG-7842(Genentech)、CC-90003(Celgene)、KIN-4050(Kinentia)及其组合。
[0013] 根据一些实施方案,ERK抑制剂是BVD-523。
[0014] 根据一些实施方案,非V600E/K BRAF突变是激酶活化的突变、激酶受损的突变或激酶未知的突变及其组合。
[0015] 根据一些实施方案,激酶活化的突变选自R462I、I463S、G464E、G464R、G464V、G466A、G469A、N581S、E586K、F595L、L597Q、L597R、L597S、L597V、A598V、T599E、V600R、K601E、S602D、A728V及其组合。
[0016] 根据一些实施方案,激酶受损的突变选自G466E、G466R、G466V、Y472C、K483M、D594A、D594E、D594G、D594H、D594N、D594V、G596R、T599A、S602A及其组合。
[0017] 根据一些实施方案,激酶未知的突变选自T440I、S467L、G469E、G469R、G469S、G469V、L584F、L588F、V600_K601delinsE、S605I、Q609L、E611Q及其组合。
[0018] 根据一些实施方案,非V600E/K BRAF突变选自D594、G469、K601E、L597、T599重复、L485W、F247L、G466V、BRAF融合、BRAF-AGAP3重排、BRAF外显子15剪接变体及其组合。
[0019] 根据一些实施方案,受试者是哺乳动物
[0020] 根据一些实施方案,哺乳动物选自人、灵长类动物、农场动物和家养动物。
[0021] 根据一些实施方案,哺乳动物是人。
[0022] 根据一些实施方案,癌症是实体瘤癌症或血液癌症。
[0023] 根据一些实施方案,癌症选自胶质母细胞瘤、黑素瘤、胆管癌、小细胞癌、结肠直肠癌、前列腺癌阴道癌、血管肉瘤、非小细胞肺癌、阑尾癌、鳞状细胞癌、唾液管癌、腺样囊性癌、小肠癌和胆囊癌。
[0024] 根据一些实施方案,癌症选自小肠癌、非小细胞肺癌、胆囊癌和鳞状细胞癌。
[0025] 根据一些实施方案,该方法进一步包括向受试者施用选自MEK抑制剂、RAF抑制剂、HDAC抑制剂及其组合的至少一种另外的治疗剂。
[0026] 根据一些实施方案,MEK抑制剂选自炭疽毒素、蒽醌(Golden Biotechnology)、ARRY-142886(6-(4-溴-2-氯-苯基氨基)-7-氟-3-甲基-3H-苯并咪唑-5-羧酸(2-羟基-乙基)-酰胺)(Array BioPharma)、ARRY-438162(Array BioPharma)贝美替尼(binimetinib)(MEK162,ARRY-1662)、AS-1940477(Astellas)、AS-703988(Merck KGaA)、bentamapimod(Merck KGaA)、BI-847325(Boehringer Ingelheim)、E-6201(Eisai)、GDC-0623(Hoffmann-La Roche)、GDC-0973(考比替尼(cobimetinib))(Hoffmann-La Roche)、L783277(Merck)、炭疽毒素的致死因子部分、MEK162(Array BioPharma)、PD 098059(2-(2'-氨基-3'-甲氧苯基)-氧-4-)(Pfizer)、PD 184352(CI-1040)(Pfizer)、PD-0325901(Pfizer)、PD318088(Pfizer)、PD334581(Pfizer)、6-甲氧基-7-(3-吗啉-4-基-丙氧基)-4-(4-苯氧基-苯基氨基)-喹啉-3-甲腈、4-[3-氯-4-(1-甲基-1H-咪唑-2-基硫烷基)-苯基氨基]-6-甲氧基-7-(3-吗啉-4-基-丙氧基)-喹啉-3-甲腈、pimasertib(pimasertib)(Santhera Pharmaceuticals)、RDEA119(Ardea Biosciences/Bayer)、瑞美替尼(refametinib)(AstraZeneca)、RG422(Chugai Pharmaceutical Co.)、R0092210(Roche)、R04987655(Hoffmann-La Roche)、R05126766(Hoffmann-La Roche)、司美替尼(selumetinib)
(AZD6244)(AstraZeneca)、SL327(Sigma)、TAK-733(Takeda)、曲美替尼(trametinib)(Japan Tobacco)、U0126(1,4-二氨基-2,3-二氰基-1,4-双(2-氨基苯硫基)丁二烯)
(Sigma)、WX-554(Wilex)、YopJ多肽(Mittal等人,2010)、其药学上可接受的盐及其组合。
[0027] 根据一些实施方案,RAF抑制剂选自AAL881(Novartis)、AB-024(Ambit Biosciences)、ARQ-736(ArQule)、ARQ-761(ArQule)、AZ628(Axon Medchem BV)、BAY 43-
9006索拉非尼、BeiGene-283(BeiGene)、BUB-024(MLN 2480)(Sunesis&Takeda)、b-raf抑制剂(Sareum)、BRAF激酶抑制剂(Selexagen Therapeutics)、BRAF siRNA  313
(tacaccagcaagctagatgca)和523(cctatcgttagagtcttcctg)(Liu等人,2007)、CHIR-265(Novartis)、CTT239065(Institute of Cancer Research)、达拉非尼(GSK2118436)、DP-
4978(Deciphera Pharmaceuticals)、HM-95573(Hanmi)、GDC-0879(Genentech)、GW-5074(Sigma Aldrich)、ISIS 5132(Novartis)、L779450(Merck)、LBT613(Novartis)、LXH254(Novartis)、LErafAON(NeoPharm,Inc.)、LGX-818(Novartis)、帕唑帕尼(pazopanib)(GlaxoSmithKline)、PLX3202(Plexxikon)、PLX4720(Plexxikon)、PLX5568(Plexxikon)、PLX3603(Daiichi Sankyo)、PLX8394(Daiichi Sankyo)、RAF-265(Novartis)、RAF-365(Novartis)、REDX0535(RedX Pharma Plc)、瑞戈非尼(regorafenib)(Bayer Healthcare Pharmaceuticals,Inc.)、RO  5126766(Hoffmann-La  Roche)、SB-590885
(GlaxoSmithKline)、SB699393(GlaxoSmithKline)、索拉非尼(sorafenib)(Onyx 
Pharmaceuticals)、TAK 632(Takeda)、TL-241(Teligene)、维拉非尼(vemurafenib)(RG7204或PLX4032)(Daiichi Sankyo)、XL-281(Exelixis)、ZM-336372(AstraZeneca)、其药学上可接受的盐及其组合。
[0028] 根据一些实施方案,HDAC抑制剂选自贝司他(Abexinostat)(PCI-24781)、吉诺司他(Givinostat)、恩替司他(Entinostat)、扶林司他(Vorinostat)、CI-994、CUDC-101、恩替司他(Entinostat)、BML-210、M344、NVP-LAQ824、帕比司他(Panobinostat)、Pracinosat(SB939)、Mocetinostat、Resminostat、罗米地辛(Romidepsin)、贝利诺司他(Belinostat)、其药学上可接受的盐及其组合。
[0029] 根据一些实施方案,该方法进一步包括向受试者施用选自抗体、抗体片段、抗体缀合物、细胞毒性剂、毒素、放射性核素、免疫调控剂、光活化治疗剂、放射增敏剂、激素、抗血管生成剂及其组合的至少一种另外的治疗剂。
[0030] 根据一些实施方案,抗体、其片段或其缀合物选自利妥昔单抗(Rituxan)、布伦妥昔单抗维多汀(Brentuximab Vedotin)(Adcetriz)、阿多曲妥珠单抗艾坦肽(Ado-trastuzumab emtansine)(Kadcyla)西妥昔单抗(Erbitux)、贝伐单抗(bevacizumab)(Avastin)、替伊莫单抗(Ibritumomab)(Zevalin)、维多珠单抗(vedolizumab)(Entyvio)、伊匹单抗(Ipilimumab)(Yervoy)、纳武单抗(Nivolumab)(Opdivo)、派姆单抗
(pembrolizumab)(Keytruda)、阿伦单抗(Alemtuzamab)阿特朱单抗(atezolizumab)
(Tecentriq)、阿维鲁单抗(avelumab)(Bavencio)、德鲁瓦单抗(durvalumab)(Imfinzi)、B-
701、奥法木单抗(Ofatumumab)、阿托珠单抗(Obinutuzumab)(Gazyva)帕尼单抗
(Panitumumab)、plozalizumab、BI-754091、OREG-103、COM-701、BI-754111及其组合。
[0031] 根据一些实施方案,细胞毒性剂选自环磷酰胺、甲氯乙胺、尿嘧啶氮芥、美法仑、苯丁酸甲氯乙胺、异环磷酰胺、卡莫司汀、洛莫司汀、链脲霉素、白消安、替莫唑胺、顺铂、卡铂、奥沙利铂、奈达铂、沙铂、三硝酸四铂、阿霉素、柔红霉素、伊达比星、米托蒽醌、甲氨蝶呤、培美曲塞、6-巯基嘌呤、达卡巴嗪、氟达拉滨、5-氟尿嘧啶、阿拉伯糖胞嘧啶、卡培他滨、吉西他滨、地西他滨、长春花生物、紫杉醇(Taxol)、多西他赛(Taxotere)、依沙贝比隆(Ixempra)、放线菌素、蒽环类、缬沙星、表柔比星、博来霉素、普卡霉素、丝裂霉素、其药学上可接受的盐、前药及其组合。
[0032] 根据一些实施方案,毒素是白喉毒素或其部分。
[0033] 根据一些实施方案,放射性核素选自I-125、At-211、Lu-177、Cu-67、I-131、Sm-153、Re-186、P-32、Re-188、In-114m、Y-90及其组合。
[0034] 根据一些实施方案,免疫调控剂选自粒细胞集落刺激因子(G-CSF)、LAG-3、IMP-321、JCAR-014、ASLAN-002(BMS-777607)、干扰素、咪喹莫特和来自细菌的细胞膜组分、IL-
2、IL-7、IL-12、CCL3、CCL26、CXCL7、合成的胞嘧啶磷酸苷(CpG)、免疫检查点抑制剂及其组合。
[0035] 根据一些实施方案,放射增敏剂选自米索硝唑、甲硝唑、替拉帕明、反式丁香酸钠及其组合。
[0036] 根据一些实施方案,激素选自前列腺素、白三烯、前列环素、血栓烷、淀粉纤维素、抗苗勒管激素、脂联素、促肾上腺皮质激素、血管紧张素原、血管紧张素、血管加压素、心房肽(atriopeptin)、脑钠尿肽、降血素、胆囊收缩素、促肾上腺皮质激素释放激素、脑啡肽、内皮素、促红细胞生成素、促卵泡激素、甘丙肽、胃泌素、生长激素释放肽、胰高血糖素、促性腺激素释放激素、生长激素释放激素、人绒毛膜促性腺激素、人胎盘促泌素、生长激素、抑制素、胰岛素、生长调节素(somatomedin)、瘦素、促脂素、促黄体生成素、黑素细胞刺激激素、胃动素、食欲素、催产素、胰多肽、甲状旁腺激素、催乳素、催乳素释放激素、松弛素、肾素、分泌素、生长抑素(somatostain)、血小板生成素、促甲状腺激素、睾丸酮、脱氢表雄酮、雄烯二酮、二氢睾丸酮、固酮、雌二醇、雌酮、雌三醇、皮质醇、孕酮、骨化三醇、骨化二醇、他莫昔芬(Nolvadex)、阿那曲唑(Arimidex)、来曲唑(Femara)、氟司韦特(Faslodex)及其组合。
[0037] 根据一些实施方案,抗血管生成剂选自2-甲氧基雌二醇、血管抑制素、贝伐单抗、软骨衍生的血管生成抑制因子、内皮抑素、IFN-α、IL-12、伊曲康唑、利诺米特、血小板因子4、催乳素、SU5416、苏拉明、他克莫尼、替加仑、四硫代钼酸盐、沙利度胺、血小板反应蛋白、血小板反应蛋白、TNP-470、齐夫-阿柏西普、其药学上可接受的盐、前药及其组合。
[0038] 根据一些实施方案,另外的治疗剂是PI3K/Akt途径的抑制剂。
[0039] 根据一些实施方案,PI3K/Akt途径的抑制剂选自A-674563(CAS#552325-73-2)、AGL 2263、AMG-319(Amgen,Thousand Oaks,CA)、AS-041164(5-苯并[1,3]二恶唑-5-基亚甲基-噻唑烷-2,4-二酮)、AS-604850(5-(2,2-二氟-苯并[1,3]二恶唑-5-基亚甲基)-噻唑烷-2,4-二酮)、AS-605240(5-喹喔啉-6-亚甲基-1,3-噻唑烷-2,4-二酮)、AT7867(CAS#857531-
00-1)、苯并咪唑系列,Genentech(Roche Holdings Inc.,South San Francisco,CA)、BML-
257(CAS#32387-96-5)、BVD-723、CAL-120(Gilead Sciences,Foster City,CA)、CAL-129(Gilead Sciences)、CAL-130(Gilead Sciences)、CAL-253(Gilead Sciences)、CAL-263(Gilead Sciences)、CAS#612847-09-3、CAS#681281-88-9、CAS#75747-14-7、CAS#925681-
41-0、CAS#98510-80-6、CCT128930(CAS#885499-61-6)、CH5132799(CAS#1007207-67-1)、CHR-4432(Chroma Therapeutics,Ltd.,Abingdon,UK)、FPA 124(CAS#902779-59-3)、GS-
1101(CAL-101)(Gilead Sciences)、GSK 690693(CAS#937174-76-0)、H-89(CAS#127243-
85-0)、Honokiol、IC87114(Gilead Science)、IPI-145(Intellikine Inc.)、KAR-4139(Karus Therapeutics,Chilworth,UK)、KAR-4141(Karus Therapeutics)、KIN-1(Karus Therapeutics)、KT 5720(CAS#108068-98-0)、米替福新(Miltefosine)、MK-2206二盐酸化物(CAS#1032350-13-2)、ML-9(CAS#105637-50-1)、盐酸纳曲通、OXY-111A(NormOxys Inc.,Brighton,MA)、perifosine、PHT-427(CAS#1191951-57-1)、PI3激酶δ抑制剂,Merck KGaA(Merck&Co.,Whitehouse Station,NJ)、PI3激酶δ抑制剂,Genentech(Roche Holdings Inc.)、PI3激酶δ抑制剂,Incozen(Incozen Therapeutics,Pvt.Ltd.,Hydrabad,India)、PI3激酶δ抑制剂2,Incozen(Incozen Therapeutics)、PI3激酶抑制剂,Roche-4(Roche Holdings Inc.)、PI3激酶抑制剂,Roche(Roche Holdings Inc.)、PI3激酶抑制剂,Roche-5(Roche Holdings Inc.)、PI3-α/δ抑制剂,Pathway Therapeutics(Pathway Therapeutics Ltd.,South San Francisco,CA)、PI3-δ抑制剂,Cellzome(Cellzome AG,Heidelberg,Germany)、PI3-δ抑制剂,Intellikine(Intellikine Inc.,La Jolla,CA)、PI3-δ抑制剂,Pathway Therapeutics-1(Pathway Therapeutics Ltd.)、PI3-δ抑制剂,Pathway Therapeutics-2(Pathway Therapeutics Ltd.)、PI3-δ/γ抑制剂,Cellzome(Cellzome AG)、PI3-δ/γ抑制剂,Cellzome(Cellzome  AG)、PI3-δ/γ抑制剂,Intellikine(Intellikine Inc.)、PI3-δ/γ抑制剂,Intellikine(Intellikine Inc.)、PI3-δ/γ抑制剂,Pathway Therapeutics(Pathway Therapeutics Ltd.)、PI3-δ/γ抑制剂,Pathway Therapeutics(Pathway Therapeutics Ltd.)、PI3-γ抑制剂,Evotec(Evotec)、PI3-γ抑制剂,Cellzome(Cellzome AG)、PI3-γ抑制剂,Pathway Therapeutics(Pathway 
Therapeutics Ltd.)、PI3Kδ/γ抑制剂,Intellikine-1(Intellikine Inc.)、PI3Kδ/γ抑制剂,Intellikine-1(Intellikine Inc.)、pictilisib(Roche Holdings Inc.)、PIK-90(CAS#677338-12-4)、SC-103980(Pfizer,New  York,NY)、SF-1126(Semafore 
Pharmaceuticals,Indianapolis,IN)、SH-5、SH-6、四氢姜黄素、TG100-115(Targegen Inc.,San Diego,CA)、曲西瑞宾(Triciribine)、X-339(Xcovery,West Palm Beach,FL)、XL-499(Evotech,Hamburg,Germany)、其药学上可接受的盐及其组合。
[0040] 根据一个方面,本公开内容提供了用于在受试者中治疗或缓解癌症的影响的方法,包括:(a)鉴定携带非V600E/K BRAF突变的患有癌症的受试者;和(b)对受试者施用有效量的ERK抑制剂或其药学上可接受的盐。
[0041] 根据一些实施方案,ERK抑制剂选自BVD-523、SCH-722984(Merck&Co.)、SCH-772984(Merck&Co.)、SCH-900353(MK-8353)(Merck&Co.)、LY3214996(Lilly)、AEZS-140(Aeterna Zentaris)、AEZS-131(Aeterna Zentaris)、AEZS-136(Aeterna Zentaris)、LTT-
462(Novartis)、RG-7842(Genentech)、CC-90003(Celgene)、KIN-4050(Kinentia)及其组合。
[0042] 根据一些实施方案,ERK抑制剂是BVD-523。
[0043] 根据一些实施方案,非V600E/K BRAF突变是激酶活化的突变、激酶受损的突变或激酶未知的突变及其组合。
[0044] 根据一些实施方案,激酶活化的突变选自R462I、I463S、G464E、G464R、G464V、G466A、G469A、N581S、E586K、F595L、L597Q、L597R、L597S、L597V、A598V、T599E、V600R、K601E、S602D、A728V及其组合。
[0045] 根据一些实施方案,激酶受损的突变选自G466E、G466R、G466V、Y472C、K483M、D594A、D594E、D594G、D594H、D594N、D594V、G596R、T599A、S602A及其组合。
[0046] 根据一些实施方案,激酶未知的突变选自T440I、S467L、G469E、G469R、G469S、G469V、L584F、L588F、V600_K601delinsE、S605I、Q609L、E611Q及其组合。
[0047] 根据一些实施方案,受试者是哺乳动物。
[0048] 根据一些实施方案,哺乳动物选自人、灵长类动物、农场动物和家养动物。
[0049] 根据一些实施方案,哺乳动物是人。
[0050] 根据一些实施方案,癌症是实体瘤癌症或血液癌症。
[0051] 根据一些实施方案,癌症选自胶质母细胞瘤、黑素瘤、胆管癌、小细胞肺癌、结肠直肠癌、前列腺癌、阴道癌、血管肉瘤、非小细胞肺癌、阑尾癌、鳞状细胞癌、唾液管癌、腺样囊性癌、小肠癌和胆囊癌。
[0052] 根据一些实施方案,癌症选自小肠癌、非小细胞肺癌、胆囊癌和鳞状细胞癌。
[0053] 根据一些实施方案,该方法进一步包括:(i)从受试者获得生物样品;和(ii)筛选样品以确定受试者是否具有非V600E/K BRAF突变。
[0054] 根据一些实施方案,该方法进一步包括向受试者施用选自MEK抑制剂、RAF抑制剂、HDAC抑制剂及其组合的至少一种另外的治疗剂。
[0055] 根据一些实施方案,MEK抑制剂选自炭疽毒素、蒽醌(Golden Biotechnology)、ARRY-142886(6-(4-溴-2-氯-苯基氨基)-7-氟-3-甲基-3H-苯并咪唑-5-羧酸(2-羟基-乙氧基)-酰胺)(Array BioPharma)、ARRY-438162(Array BioPharma)贝美替尼(MEK162,ARRY-1662)、AS-1940477(Astellas)、AS-703988(Merck KGaA)、bentamapimod(Merck KGaA)、BI-
847325(Boehringer Ingelheim)、E-6201(Eisai)、GDC-0623(Hoffmann-La Roche)、GDC-
0973(考比替尼)(Hoffmann-La Roche)、L783277(Merck)、炭疽毒素的致死因子部分、MEK162(Array BioPharma)、PD 098059(2-(2'-氨基-3'-甲氧苯基)-氧萘-4-酮)(Pfizer)、PD 184352(CI-1040)(Pfizer)、PD-0325901(Pfizer)、PD318088(Pfizer)、PD334581(Pfizer)、6-甲氧基-7-(3-吗啉-4-基-丙氧基)-4-(4-苯氧基-苯基氨基)-喹啉-3-甲腈、4-[3-氯-4-(1-甲基-1H-咪唑-2-基硫烷基)-苯基氨基]-6-甲氧基-7-(3-吗啉-4-基-丙氧基)-喹啉-3-甲腈、pimasertib(Santhera Pharmaceuticals)、RDEA119(Ardea 
Biosciences/Bayer)、瑞美替尼(refametinib)(AstraZeneca)、RG422(Chugai 
Pharmaceutical Co.)、R0092210(Roche)、R04987655(Hoffmann-La Roche)、R05126766(Hoffmann-La Roche)、司美替尼(selumetinib)(AZD6244)(AstraZeneca)、SL327(Sigma)、TAK-733(Takeda)、曲美替尼(trametinib)(Japan Tobacco)、U0126(1,4-二氨基-2,3-二氰基-1,4-双(2-氨基苯硫基)丁二烯)(Sigma)、WX-554(Wilex)、YopJ多肽(Mittal等人,
2010)、其药学上可接受的盐及其组合。
[0056] 根据一些实施方案,RAF抑制剂选自AAL881(Novartis)、AB-024(Ambit Biosciences)、ARQ-736(ArQule)、ARQ-761(ArQule)、AZ628(Axon Medchem BV)、BAY 43-
9006索拉非尼、BeiGene-283(BeiGene)、BUB-024(MLN 2480)(Sunesis&Takeda)、b-raf抑制剂(Sareum)、BRAF激酶抑制剂(Selexagen Therapeutics)、BRAF siRNA  313
(tacaccagcaagctagatgca)和523(cctatcgttagagtcttcctg)(Liu等人,2007)、CHIR-265(Novartis)、CTT239065(Institute of Cancer Research)、达拉非尼(GSK2118436)、DP-
4978(Deciphera Pharmaceuticals)、HM-95573(Hanmi)、GDC-0879(Genentech)、GW-5074(Sigma Aldrich)、ISIS 5132(Novartis)、L779450(Merck)、LBT613(Novartis)、LXH254(Novartis)、LErafAON(NeoPharm,Inc.)、LGX-818(Novartis)、帕唑帕尼
(GlaxoSmithKline)、PLX3202(Plexxikon)、PLX4720(Plexxikon)、PLX5568(Plexxikon)、PLX3603(Daiichi Sankyo)、PLX8394(Daiichi Sankyo)、RAF-265(Novartis)、RAF-365(Novartis)、REDX0535(RedX  Pharma  Plc)、瑞戈非尼(Bayer  Healthcare 
Pharmaceuticals,Inc.)、RO  5126766(Hoffmann-La  Roche)、SB-590885
(GlaxoSmithKline)、SB699393(GlaxoSmithKline)、索拉非尼(Onyx Pharmaceuticals)、TAK 632(Takeda)、TL-241(Teligene)、维拉非尼(RG7204或PLX4032)(Daiichi Sankyo)、XL-281(Exelixis)、ZM-336372(AstraZeneca)、其药学上可接受的盐及其组合。
[0057] 根据一些实施方案,HDAC抑制剂选自艾贝司他(PCI-24781)、吉诺司他、恩替司他、扶林司他、CI-994、CUDC-101、恩替司他、BML-210、M344、NVP-LAQ824、帕比司他、Pracinosat(SB939)、Mocetinostat、Resminostat、罗米地辛、贝利诺司他、其药学上可接受的盐及其组合。
[0058] 根据一些实施方案,该方法进一步包括向受试者施用选自抗体或其片段、细胞毒性剂、毒素、放射性核素、免疫调控剂、光活化治疗剂、放射增敏剂、激素、抗血管生成剂及其组合的至少一种另外的治疗剂。
[0059] 根据一些实施方案,抗体、其片段或其缀合物选自利妥昔单抗(Rituxan)、布伦妥昔单抗维多汀(Adcetriz)、阿多曲妥珠单抗艾坦肽(Kadcyla)西妥昔单抗(Erbitux)、贝伐单抗(Avastin)、替伊莫单抗(Zevalin)、维多珠单抗(Entyvio)、伊匹单抗(Yervoy)、纳武单抗(Opdivo)、派姆单抗(Keytruda)、阿伦单抗阿特朱单抗(Tecentriq)、阿维鲁单抗(Bavencio)、德鲁瓦单抗(Imfinzi)、B-701、奥法木单抗、阿托珠单抗(Gazyva)帕尼单抗、plozalizumab、BI-754091、OREG-103、COM-701、BI-754111及其组合。
[0060] 根据一些实施方案,细胞毒性剂选自环磷酰胺、甲氯乙胺、尿嘧啶氮芥、美法仑、苯丁酸甲氯乙胺、异环磷酰胺、卡莫司汀、洛莫司汀、链脲霉素、白消安、替莫唑胺、顺铂、卡铂、奥沙利铂、奈达铂、沙铂、三硝酸四铂、阿霉素、柔红霉素、伊达比星、米托蒽醌、甲氨蝶呤、培美曲塞、6-巯基嘌呤、达卡巴嗪、氟达拉滨、5-氟尿嘧啶、阿拉伯糖胞嘧啶、卡培他滨、吉西他滨、地西他滨、长春花生物碱、紫杉醇(Taxol)、多西他赛(Taxotere)、依沙贝比隆(Ixempra)、放线菌素、蒽环类、缬沙星、表柔比星、博来霉素、普卡霉素、丝裂霉素、其药学上可接受的盐、前药及其组合。
[0061] 根据一些实施方案,毒素是白喉毒素或其部分。
[0062] 根据一些实施方案,放射性核素选自I-125、At-211、Lu-177、Cu-67、I-131、Sm-153、Re-186、P-32、Re-188、In-114m、Y-90及其组合。
[0063] 根据一些实施方案,免疫调控剂选自粒细胞集落刺激因子(G-CSF)、LAG-3、IMP-321、JCAR-014、ASLAN-002(BMS-777607)、干扰素、咪喹莫特和来自细菌的细胞膜组分、IL-
2、IL-7、IL-12、CCL3、CCL26、CXCL7、合成的胞嘧啶磷酸鸟苷(CpG)、免疫检查点抑制剂及其组合。
[0064] 根据一些实施方案,放射增敏剂选自米索硝唑、甲硝唑、替拉帕明、反式丁香酸钠及其组合。
[0065] 根据一些实施方案,激素选自前列腺素、白三烯、前列环素、血栓烷、淀粉纤维素、抗苗勒管激素、脂联素、促肾上腺皮质激素、血管紧张素原、血管紧张素、血管加压素、心房肽、脑钠尿肽、降血钙素、胆囊收缩素、促肾上腺皮质激素释放激素、脑啡肽、内皮素、促红细胞生成素、促卵泡激素、甘丙肽、胃泌素、生长激素释放肽、胰高血糖素、促性腺激素释放激素、生长激素释放激素、人绒毛膜促性腺激素、人胎盘促泌素、生长激素、抑制素、胰岛素、生长调节素、瘦素、促脂素、促黄体生成素、黑素细胞刺激激素、胃动素、食欲素、催产素、胰多肽、甲状旁腺激素、催乳素、催乳素释放激素、松弛素、肾素、分泌素、生长抑素、血小板生成素、促甲状腺激素、睾丸酮、脱氢表雄酮、雄烯二酮、二氢睾丸酮、醛固酮、雌二醇、雌酮、雌三醇、皮质醇、孕酮、骨化三醇、骨化二醇、他莫昔芬(Nolvadex)、阿那曲唑(Arimidex)、来曲唑(Femara)、氟司韦特(Faslodex)及其组合。
[0066] 根据一些实施方案,抗血管生成剂选自2-甲氧基雌二醇、血管抑制素、贝伐单抗、软骨衍生的血管生成抑制因子、内皮抑素、IFN-α、IL-12、伊曲康唑、利诺米特、血小板因子4、催乳素、SU5416、苏拉明、他克莫尼、替加仑、四硫代钼酸盐、沙利度胺、血小板反应蛋白、血小板反应蛋白、TNP-470、齐夫-阿柏西普、其药学上可接受的盐、前药及其组合。
[0067] 根据一些实施方案,另外的治疗剂是PI3K/Akt途径的抑制剂。
[0068] 根据一些实施方案,PI3K/Akt途径的抑制剂选自A-674563(CAS#552325-73-2)、AGL 2263、AMG-319(Amgen,Thousand Oaks,CA)、AS-041164(5-苯并[1,3]二恶唑-5-基亚甲基-噻唑烷-2,4-二酮)、AS-604850(5-(2,2-二氟-苯并[1,3]二恶唑-5-基亚甲基)-噻唑烷-2,4-二酮)、AS-605240(5-喹喔啉-6-亚甲基-1,3-噻唑烷-2,4-二酮)、AT7867(CAS#857531-
00-1)、苯并咪唑系列,Genentech(Roche Holdings Inc.,South San Francisco,CA)、BML-
257(CAS#32387-96-5)、BVD-723、CAL-120(Gilead Sciences,Foster City,CA)、CAL-129(Gilead Sciences)、CAL-130(Gilead Sciences)、CAL-253(Gilead Sciences)、CAL-263(Gilead Sciences)、CAS#612847-09-3、CAS#681281-88-9、CAS#75747-14-7、CAS#925681-
41-0、CAS#98510-80-6、CCT128930(CAS#885499-61-6)、CH5132799(CAS#1007207-67-1)、CHR-4432(Chroma Therapeutics,Ltd.,Abingdon,UK)、FPA 124(CAS#902779-59-3)、GS-
1101(CAL-101)(Gilead Sciences)、GSK 690693(CAS#937174-76-0)、H-89(CAS#127243-
85-0)、Honokiol、IC87114(Gilead Science)、IPI-145(Intellikine Inc.)、KAR-4139(Karus Therapeutics,Chilworth,UK)、KAR-4141(Karus Therapeutics)、KIN-1(Karus Therapeutics)、KT 5720(CAS#108068-98-0)、米替福新、MK-2206二盐酸化物(CAS#
1032350-13-2)、ML-9(CAS#105637-50-1)、盐酸纳曲通、OXY-111A(NormOxys Inc.,Brighton,MA)、perifosine、PHT-427(CAS#1191951-57-1)、PI3激酶δ抑制剂,Merck KGaA(Merck&Co.,Whitehouse Station,NJ)、PI3激酶δ抑制剂,Genentech(Roche Holdings Inc.)、PI3激酶δ抑制剂,Incozen(Incozen Therapeutics,Pvt.Ltd.,Hydrabad,India)、PI3激酶δ抑制剂2,Incozen(Incozen Therapeutics)、PI3激酶抑制剂,Roche-4(Roche Holdings Inc.)、PI3激酶抑制剂,Roche(Roche Holdings Inc.)、PI3激酶抑制剂,Roche-5(Roche Holdings Inc.)、PI3-α/δ抑制剂,Pathway Therapeutics(Pathway Therapeutics Ltd.,South San Francisco,CA)、PI3-δ抑制剂,Cellzome(Cellzome AG,Heidelberg,Germany)、PI3-δ抑制剂,Intellikine(Intellikine Inc.,La Jolla,CA)、PI3-δ抑制剂,Pathway Therapeutics-1(Pathway Therapeutics Ltd.)、PI3-δ抑制剂,Pathway Therapeutics-2(Pathway Therapeutics Ltd.)、PI3-δ/γ抑制剂,Cellzome(Cellzome AG)、PI3-δ/γ抑制剂,Cellzome(Cellzome  AG)、PI3-δ/γ抑制剂,Intellikine(Intellikine Inc.)、PI3-δ/γ抑制剂,Intellikine(Intellikine Inc.)、PI3-δ/γ抑制剂,Pathway Therapeutics(Pathway Therapeutics Ltd.)、PI3-δ/γ抑制剂,Pathway Therapeutics(Pathway Therapeutics Ltd.)、PI3-γ抑制剂,Evotec(Evotec)、PI3-γ抑制剂,Cellzome(Cellzome AG)、PI3-γ抑制剂,Pathway Therapeutics(Pathway 
Therapeutics Ltd.)、PI3Kδ/γ抑制剂,Intellikine-1(Intellikine Inc.)、PI3Kδ/γ抑制剂,Intellikine-1(Intellikine Inc.)、pictilisib(Roche Holdings Inc.)、PIK-90(CAS#677338-12-4)、SC-103980(Pfizer,New  York,NY)、SF-1126(Semafore 
Pharmaceuticals,Indianapolis,IN)、SH-5、SH-6、四氢姜黄素、TG100-115(Targegen Inc.,San Diego,CA)、曲西瑞宾、X-339(Xcovery,West Palm Beach,FL)、XL-499(Evotech,Hamburg,Germany)、其药学上可接受的盐及其组合。
[0069] 根据一个方面,本公开内容提供了鉴定将从ERK抑制剂或其药学上可接受的盐的疗法中受益的患有癌症的受试者的方法,该方法包括:(a)从受试者获得生物样品;和(b)筛选样品以确定受试者是否具有非V600E/K BRAF突变,
[0070] 其中非V600E/K BRAF突变的存在证实受试者将从ERK抑制剂或其药学上可接受的盐的疗法中受益。
[0071] 根据一些实施方案,ERK抑制剂选自BVD-523、SCH-722984
[0072] (Merck&Co.)、SCH-772984(Merck&Co.)、SCH-900353(MK-8353)
[0073] (Merck&Co.)、LY3214996(Lilly)、AEZS-140(Aeterna Zentaris)、AEZS-131[0074] (Aeterna Zentaris)、AEZS-136(Aeterna Zentaris)、LTT-462(Novartis)、RG-7842(Genentech)、CC-90003(Celgene)、KIN-4050(Kinentia)及其组合。
[0075] 根据一些实施方案,ERK抑制剂是BVD-523。
[0076] 根据一些实施方案,非V600E/K BRAF突变是激酶活化的突变、激酶受损的突变或激酶未知的突变及其组合。
[0077] 根据一些实施方案,激酶活化的突变选自R462I、I463S、G464E、G464R、G464V、G466A、G469A、N581S、E586K、F595L、L597Q、L597R、L597S、L597V、A598V、T599E、V600R、K601E、S602D、A728V及其组合。
[0078] 根据一些实施方案,激酶受损的突变选自G466E、G466R、G466V、Y472C、K483M、D594A、D594E、D594G、D594H、D594N、D594V、G596R、T599A、S602A及其组合。
[0079] 根据一些实施方案,激酶未知的突变选自T440I、S467L、G469E、G469R、G469S、G469V、L584F、L588F、V600_K601delinsE、S605I、Q609L、E611Q及其组合。
[0080] 根据一些实施方案,受试者是哺乳动物。
[0081] 根据一些实施方案,哺乳动物选自人、灵长类动物、农场动物和家养动物。
[0082] 根据一些实施方案,哺乳动物是人。
[0083] 根据一些实施方案,癌症是实体瘤癌症或血液癌症。
[0084] 根据一些实施方案,癌症选自胶质母细胞瘤、黑素瘤、胆管癌、小细胞肺癌、结肠直肠癌、前列腺癌、阴道癌、血管肉瘤、非小细胞肺癌、阑尾癌、鳞状细胞癌、唾液管癌、腺样囊性癌、小肠癌和胆囊癌。
[0085] 根据一些实施方案,癌症选自小肠癌、非小细胞肺癌、胆囊癌和鳞状细胞癌。
[0086] 根据一些实施方案,该方法进一步包括将ERK抑制剂或其药学上可接受的盐施用给具有非V600E/K BRAF突变的受试者。
[0087] 根据一些实施方案,该方法进一步包括向受试者施用选自MEK抑制剂、RAF抑制剂、HDAC抑制剂及其组合的至少一种另外的治疗剂。
[0088] 根据一些实施方案,MEK抑制剂选自炭疽毒素、蒽醌(Golden Biotechnology)、ARRY-142886(6-(4-溴-2-氯-苯基氨基)-7-氟-3-甲基-3H-苯并咪唑-5-羧酸(2-羟基-乙氧基)-酰胺)(Array BioPharma)、ARRY-438162(Array BioPharma)贝美替尼(MEK162,ARRY-1662)、AS-1940477(Astellas)、AS-703988(Merck KGaA)、bentamapimod(Merck KGaA)、BI-
847325(Boehringer Ingelheim)、E-6201(Eisai)、GDC-0623(Hoffmann-La Roche)、GDC-
0973(考比替尼)(Hoffmann-La Roche)、L783277(Merck)、炭疽毒素的致死因子部分、MEK162(Array BioPharma)、PD 098059(2-(2'-氨基-3'-甲氧苯基)-氧萘-4-酮)(Pfizer)、PD 184352(CI-1040)(Pfizer)、PD-0325901(Pfizer)、PD318088(Pfizer)、PD334581(Pfizer)、6-甲氧基-7-(3-吗啉-4-基-丙氧基)-4-(4-苯氧基-苯基氨基)-喹啉-3-甲腈、4-[3-氯-4-(1-甲基-1H-咪唑-2-基硫烷基)-苯基氨基]-6-甲氧基-7-(3-吗啉-4-基-丙氧基)-喹啉-3-甲腈、pimasertib(Santhera Pharmaceuticals)、RDEA119(Ardea 
Biosciences/Bayer)、瑞美替尼(AstraZeneca)、RG422(Chugai Pharmaceutical Co.)、R0092210(Roche)、R04987655(Hoffmann-La Roche)、R05126766(Hoffmann-La Roche)、司美替尼(AZD6244)(AstraZeneca)、SL327(Sigma)、TAK-733(Takeda)、曲美替尼(Japan Tobacco)、U0126(1,4-二氨基-2,3-二氰基-1,4-双(2-氨基苯硫基)丁二烯)(Sigma)、WX-
554(Wilex)、YopJ多肽(Mittal等人,2010)、其药学上可接受的盐及其组合。
[0089] 根据一些实施方案,RAF抑制剂选自AAL881(Novartis)、AB-024(Ambit Biosciences)、ARQ-736(ArQule)、ARQ-761(ArQule)、AZ628(Axon Medchem BV)、BAY 43-
9006索拉非尼、BeiGene-283(BeiGene)、BUB-024(MLN 2480)(Sunesis&Takeda)、b-raf抑制剂(Sareum)、BRAF激酶抑制剂(Selexagen Therapeutics)、BRAF siRNA  313
(tacaccagcaagctagatgca)和523(cctatcgttagagtcttcctg)(Liu等人,2007)、CHIR-265(Novartis)、CTT239065(Institute of Cancer Research)、达拉非尼(GSK2118436)、DP-
4978(Deciphera Pharmaceuticals)、HM-95573(Hanmi)、GDC-0879(Genentech)、GW-5074(Sigma Aldrich)、ISIS 5132(Novartis)、L779450(Merck)、LBT613(Novartis)、LXH254(Novartis)、LErafAON(NeoPharm,Inc.)、LGX-818(Novartis)、帕唑帕尼
(GlaxoSmithKline)、PLX3202(Plexxikon)、PLX4720(Plexxikon)、PLX5568(Plexxikon)、PLX3603(Daiichi Sankyo)、PLX8394(Daiichi Sankyo)、RAF-265(Novartis)、RAF-365(Novartis)、REDX0535(RedX  Pharma  Plc)、瑞戈非尼(Bayer  Healthcare 
Pharmaceuticals,Inc.)、RO  5126766(Hoffmann-La  Roche)、SB-590885
(GlaxoSmithKline)、SB699393(GlaxoSmithKline)、索拉非尼(Onyx Pharmaceuticals)、TAK 632(Takeda)、TL-241(Teligene)、维拉非尼(RG7204或PLX4032)(Daiichi Sankyo)、XL-281(Exelixis)、ZM-336372(AstraZeneca)、其药学上可接受的盐及其组合。
[0090] 根据一些实施方案,HDAC抑制剂选自艾贝司他(PCI-24781)、吉诺司他、恩替司他、扶林司他、CI-994、CUDC-101、恩替司他、BML-210、M344、NVP-LAQ824、帕比司他、Pracinosat(SB939)、Mocetinostat、Resminostat、罗米地辛、贝利诺司他、其药学上可接受的盐及其组合。
[0091] 根据一些实施方案,该方法进一步包括向具有非V600E/K BRAF突变的受试者施用选自抗体、抗体片段、抗体缀合物、细胞毒性剂、毒素、放射性核素、免疫调控剂、光活化治疗剂、放射增敏剂、激素、抗血管生成剂及其组合的至少一种另外的治疗剂。
[0092] 根据一些实施方案,抗体或其片段选自利妥昔单抗(Rituxan)、布伦妥昔单抗维多汀(Adcetriz)、阿多曲妥珠单抗艾坦肽(Kadcyla)西妥昔单抗(Erbitux)、贝伐单抗(Avastin)、替伊莫单抗(Zevalin)、维多珠单抗(Entyvio)、伊匹单抗(Yervoy)、纳武单抗(Opdivo)、派姆单抗(Keytruda)、阿伦单抗阿特朱单抗(Tecentriq)、阿维鲁单抗
(Bavencio)、德鲁瓦单抗(Imfinzi)、B-701、奥法木单抗、阿托珠单抗(Obinutuzumab)(Gazyva)帕尼单抗、plozalizumab、BI-754091、OREG-103、COM-701、BI-754111及其组合。
[0093] 根据一些实施方案,细胞毒性剂选自环磷酰胺、甲氯乙胺、尿嘧啶氮芥、美法仑、苯丁酸甲氯乙胺、异环磷酰胺、卡莫司汀、洛莫司汀、链脲霉素、白消安、替莫唑胺、顺铂、卡铂、奥沙利铂、奈达铂、沙铂、三硝酸四铂、阿霉素、柔红霉素、伊达比星、米托蒽醌、甲氨蝶呤、培美曲塞、6-巯基嘌呤、达卡巴嗪、氟达拉滨、5-氟尿嘧啶、阿拉伯糖胞嘧啶、卡培他滨、吉西他滨、地西他滨、长春花生物碱、紫杉醇(Taxol)、多西他赛(Taxotere)、依沙贝比隆(Ixempra)、放线菌素、蒽环类、缬沙星、表柔比星、博来霉素、普卡霉素、丝裂霉素、其药学上可接受的盐、前药及其组合。
[0094] 根据一些实施方案,毒素是白喉毒素或其部分。
[0095] 根据一些实施方案,放射性核素选自I-125、At-211、Lu-177、Cu-67、I-131、Sm-153、Re-186、P-32、Re-188、In-114m、Y-90及其组合。
[0096] 根据一些实施方案,免疫调控剂选自粒细胞集落刺激因子(G-CSF)、LAG-3、IMP-321、JCAR-014、ASLAN-002(BMS-777607)、干扰素、咪喹莫特和来自细菌的细胞膜组分、IL-
2、IL-7、IL-12、CCL3、CCL26、CXCL7、合成的胞嘧啶磷酸鸟苷(CpG)、免疫检查点抑制剂及其组合。
[0097] 根据一些实施方案,放射增敏剂选自米索硝唑、甲硝唑、替拉帕明、反式丁香酸钠及其组合。
[0098] 根据一些实施方案,激素选自前列腺素、白三烯、前列环素、血栓烷、淀粉纤维素、抗苗勒管激素、脂联素、促肾上腺皮质激素、血管紧张素原、血管紧张素、血管加压素、心房肽、脑钠尿肽、降血钙素、胆囊收缩素、促肾上腺皮质激素释放激素、脑啡肽、内皮素、促红细胞生成素、促卵泡激素、甘丙肽、胃泌素、生长激素释放肽、胰高血糖素、促性腺激素释放激素、生长激素释放激素、人绒毛膜促性腺激素、人胎盘促泌素、生长激素、抑制素、胰岛素、生长调节素、瘦素、促脂素、促黄体生成素、黑素细胞刺激激素、胃动素、食欲素、催产素、胰多肽、甲状旁腺激素、催乳素、催乳素释放激素、松弛素、肾素、分泌素、生长抑素、血小板生成素、促甲状腺激素、睾丸酮、脱氢表雄酮、雄烯二酮、二氢睾丸酮、醛固酮、雌二醇、雌酮、雌三醇、皮质醇、孕酮、骨化三醇、骨化二醇、他莫昔芬(Nolvadex)、阿那曲唑(Arimidex)、来曲唑(Femara)、氟司韦特(Faslodex)及其组合。
[0099] 根据一些实施方案,抗血管生成剂选自2-甲氧基雌二醇、血管抑制素、贝伐单抗、软骨衍生的血管生成抑制因子、内皮抑素、IFN-α、IL-12、伊曲康唑、利诺米特、血小板因子4、催乳素、SU5416、苏拉明、他克莫尼、替加仑、四硫代钼酸盐、沙利度胺、血小板反应蛋白、血小板反应蛋白、TNP-470、齐夫-阿柏西普、其药学上可接受的盐、前药及其组合。
[0100] 根据一些实施方案,另外的治疗剂是PI3K/Akt途径的抑制剂。
[0101] 根据一些实施方案,PI3K/Akt途径的抑制剂选自A-674563(CAS#552325-73-2)、AGL 2263、AMG-319(Amgen,Thousand Oaks,CA)、AS-041164(5-苯并[1,3]二恶唑-5-基亚甲基-噻唑烷-2,4-二酮)、AS-604850(5-(2,2-二氟-苯并[1,3]二恶唑-5-基亚甲基)-噻唑烷-2,4-二酮)、AS-605240(5-喹喔啉-6-亚甲基-1,3-噻唑烷-2,4-二酮)、AT7867(CAS#857531-
00-1)、苯并咪唑系列,Genentech(Roche Holdings Inc.,South San Francisco,CA)、BML-
257(CAS#32387-96-5)、BVD-723、CAL-120(Gilead Sciences,Foster City,CA)、CAL-129(Gilead Sciences)、CAL-130(Gilead Sciences)、CAL-253(Gilead Sciences)、CAL-263(Gilead Sciences)、CAS#612847-09-3、CAS#681281-88-9、CAS#75747-14-7、CAS#925681-
41-0、CAS#98510-80-6、CCT128930(CAS#885499-61-6)、CH5132799(CAS#1007207-67-1)、CHR-4432(Chroma Therapeutics,Ltd.,Abingdon,UK)、FPA 124(CAS#902779-59-3)、GS-
1101(CAL-101)(Gilead Sciences)、GSK 690693(CAS#937174-76-0)、H-89(CAS#127243-
85-0)、Honokiol、IC87114(Gilead Science)、IPI-145(Intellikine Inc.)、KAR-4139(Karus Therapeutics,Chilworth,UK)、KAR-4141(Karus Therapeutics)、KIN-1(Karus Therapeutics)、KT 5720(CAS#108068-98-0)、米替福新、MK-2206二盐酸化物(CAS#
1032350-13-2)、ML-9(CAS#105637-50-1)、盐酸纳曲通、OXY-111A(NormOxys Inc.,Brighton,MA)、perifosine、PHT-427(CAS#1191951-57-1)、PI3激酶δ抑制剂,Merck KGaA(Merck&Co.,Whitehouse Station,NJ)、PI3激酶δ抑制剂,Genentech(Roche Holdings Inc.)、PI3激酶δ抑制剂,Incozen(Incozen Therapeutics,Pvt.Ltd.,Hydrabad,India)、PI3激酶δ抑制剂2,Incozen(Incozen Therapeutics)、PI3激酶抑制剂,Roche-4(Roche Holdings Inc.)、PI3激酶抑制剂,Roche(Roche Holdings Inc.)、PI3激酶抑制剂,Roche-5(Roche Holdings Inc.)、PI3-α/δ抑制剂,Pathway Therapeutics(Pathway Therapeutics Ltd.,South San Francisco,CA)、PI3-δ抑制剂,Cellzome(Cellzome AG,Heidelberg,Germany)、PI3-δ抑制剂,Intellikine(Intellikine Inc.,La Jolla,CA)、PI3-δ抑制剂,Pathway Therapeutics-1(Pathway Therapeutics Ltd.)、PI3-δ抑制剂,Pathway Therapeutics-2(Pathway Therapeutics Ltd.)、PI3-δ/γ抑制剂,Cellzome(Cellzome AG)、PI3-δ/γ抑制剂,Cellzome(Cellzome  AG)、PI3-δ/γ抑制剂,Intellikine(Intellikine Inc.)、PI3-δ/γ抑制剂,Intellikine(Intellikine Inc.)、PI3-δ/γ抑制剂,Pathway Therapeutics(Pathway Therapeutics Ltd.)、PI3-δ/γ抑制剂,Pathway Therapeutics(Pathway Therapeutics Ltd.)、PI3-γ抑制剂,Evotec(Evotec)、PI3-γ抑制剂,Cellzome(Cellzome AG)、PI3-γ抑制剂,Pathway Therapeutics(Pathway 
Therapeutics Ltd.)、PI3Kδ/γ抑制剂,Intellikine-1(Intellikine Inc.)、PI3Kδ/γ抑制剂,Intellikine-1(Intellikine Inc.)、pictilisib(Roche Holdings Inc.)、PIK-90(CAS#677338-12-4)、SC-103980(Pfizer,New  York,NY)、SF-1126(Semafore 
Pharmaceuticals,Indianapolis,IN)、SH-5、SH-6、四氢姜黄素、TG100-115(Targegen Inc.,San Diego,CA)、曲西瑞宾、X-339(Xcovery,West Palm Beach,FL)、XL-499(Evotech,Hamburg,Germany)、其药学上可接受的盐及其组合。
[0102] 根据一方面,本公开内容提供了用于在携带非V600E/K BRAF突变的受试者中治疗或缓解癌症的影响的药物组合物,该组合物包含药学上可接受的载体或稀释剂和有效量的ERK抑制剂或其药学上可接受的盐。
[0103] 根据一些实施方案,ERK抑制剂选自BVD-523、SCH-722984(Merck&Co.)、SCH-772984(Merck&Co.)、SCH-900353(MK-8353)(Merck&Co.)、LY3214996(Lilly)、LY3214996(Lilly)、AEZS-140(Aeterna Zentaris)、AEZS-131(Aeterna Zentaris)、AEZS-136(Aeterna Zentaris)、LTT-462(Novartis)、RG-7842(Genentech)、CC-90003(Celgene)、KIN-4050(Kinentia)及其组合。
[0104] 根据一些实施方案,ERK抑制剂是BVD-523。
[0105] 根据一些实施方案,非V600E/K BRAF突变是激酶活化的突变、激酶受损的突变或激酶未知的突变及其组合。
[0106] 根据一些实施方案,激酶活化的突变选自R462I、I463S、G464E、G464R、G464V、G466A、G469A、N581S、E586K、F595L、L597Q、L597R、L597S、L597V、A598V、T599E、V600R、K601E、S602D、A728V及其组合。
[0107] 根据一些实施方案,激酶受损的突变选自G466E、G466R、G466V、Y472C、K483M、D594A、D594E、D594G、D594H、D594N、D594V、G596R、T599A、S602A及其组合。
[0108] 根据一些实施方案,激酶未知的突变选自T440I、S467L、G469E、G469R、G469S、G469V、L584F、L588F、V600_K601delinsE、S605I、Q609L、E611Q及其组合。
[0109] 根据一些实施方案,受试者是哺乳动物。
[0110] 根据一些实施方案,哺乳动物选自人、灵长类动物、农场动物和家养动物。
[0111] 根据一些实施方案,哺乳动物是人。
[0112] 根据一些实施方案,癌症是实体瘤癌症或血液癌症。
[0113] 根据一些实施方案,癌症选自胶质母细胞瘤、黑素瘤、胆管癌、小细胞肺癌、结肠直肠癌、前列腺癌、阴道癌、血管肉瘤、非小细胞肺癌、阑尾癌、鳞状细胞癌、唾液管癌、腺样囊性癌、小肠癌和胆囊癌。
[0114] 根据一些实施方案,癌症选自小肠癌、非小细胞肺癌、胆囊癌和鳞状细胞癌。
[0115] 根据一些实施方案,组合物口服或通过注射施用给受试者。
[0116] 根据一些实施方案,组合物以片剂施用给受试者。
[0117] 根据一些实施方案,药物组合选自MEK抑制剂、RAF抑制剂、HDAC抑制剂及其组合的至少一种另外的治疗剂。
[0118] 根据一些实施方案,MEK抑制剂选自炭疽毒素、蒽醌(Golden Biotechnology)、ARRY-142886(6-(4-溴-2-氯-苯基氨基)-7-氟-3-甲基-3H-苯并咪唑-5-羧酸(2-羟基-乙氧基)-酰胺)(Array BioPharma)、ARRY-438162(Array BioPharma)贝美替尼(MEK162,ARRY-1662)、AS-1940477(Astellas)、AS-703988(Merck KGaA)、bentamapimod(Merck KGaA)、BI-
847325(Boehringer Ingelheim)、E-6201(Eisai)、GDC-0623(Hoffmann-La Roche)、GDC-
0973(考比替尼)(Hoffmann-La Roche)、L783277(Merck)、炭疽毒素的致死因子部分、MEK162(Array BioPharma)、PD 098059(2-(2'-氨基-3'-甲氧苯基)-氧萘-4-酮)(Pfizer)、PD 184352(CI-1040)(Pfizer)、PD-0325901(Pfizer)、PD318088(Pfizer)、PD334581(Pfizer)、6-甲氧基-7-(3-吗啉-4-基-丙氧基)-4-(4-苯氧基-苯基氨基)-喹啉-3-甲腈、4-[3-氯-4-(1-甲基-1H-咪唑-2-基硫烷基)-苯基氨基]-6-甲氧基-7-(3-吗啉-4-基-丙氧基)-喹啉-3-甲腈、pimasertib(Santhera Pharmaceuticals)、RDEA119(Ardea 
Biosciences/Bayer)、瑞美替尼(AstraZeneca)、RG422(Chugai Pharmaceutical Co.)、R0092210(Roche)、R04987655(Hoffmann-La Roche)、R05126766(Hoffmann-La Roche)、司美替尼(AZD6244)(AstraZeneca)、SL327(Sigma)、TAK-733(Takeda)、曲美替尼(Japan Tobacco)、U0126(1,4-二氨基-2,3-二氰基-1,4-双(2-氨基苯硫基)丁二烯)(Sigma)、WX-
554(Wilex)、YopJ多肽(Mittal等人,2010)、其药学上可接受的盐及其组合。
[0119] 根据一些实施方案,RAF抑制剂选自AAL881(Novartis)、AB-024(Ambit Biosciences)、ARQ-736(ArQule)、ARQ-761(ArQule)、AZ628(Axon Medchem BV)、BAY 43-
9006索拉非尼、BeiGene-283(BeiGene)、BUB-024(MLN 2480)(Sunesis&Takeda)、b-raf抑制剂(Sareum)、BRAF激酶抑制剂(Selexagen Therapeutics)、BRAF siRNA  313
(tacaccagcaagctagatgca)和523(cctatcgttagagtcttcctg)(Liu等人,2007)、CHIR-265(Novartis)、CTT239065(Institute of Cancer Research)、达拉非尼(GSK2118436)、DP-
4978(Deciphera Pharmaceuticals)、HM-95573(Hanmi)、GDC-0879(Genentech)、GW-5074(Sigma Aldrich)、ISIS 5132(Novartis)、L779450(Merck)、LBT613(Novartis)、LXH254(Novartis)、LErafAON(NeoPharm,Inc.)、LGX-818(Novartis)、帕唑帕尼
(GlaxoSmithKline)、PLX3202(Plexxikon)、PLX4720(Plexxikon)、PLX5568(Plexxikon)、PLX3603(Daiichi Sankyo)、PLX8394(Daiichi Sankyo)、RAF-265(Novartis)、RAF-365(Novartis)、REDX0535(RedX  Pharma  Plc)、瑞戈非尼(Bayer  Healthcare 
Pharmaceuticals,Inc.)、RO  5126766(Hoffmann-La  Roche)、SB-590885
(GlaxoSmithKline)、SB699393(GlaxoSmithKline)、索拉非尼(Onyx Pharmaceuticals)、TAK 632(Takeda)、TL-241(Teligene)、维拉非尼(RG7204或PLX4032)(Daiichi Sankyo)、XL-281(Exelixis)、ZM-336372(AstraZeneca)、其药学上可接受的盐及其组合。
[0120] 根据一些实施方案,HDAC抑制剂选自艾贝司他(PCI-24781)、吉诺司他、恩替司他、扶林司他、CI-994、CUDC-101、恩替司他、BML-210、M344、NVP-LAQ824、帕比司他、Pracinosat(SB939)、Mocetinostat、Resminostat、罗米地辛、贝利诺司他、其药学上可接受的盐及其组合。
[0121] 根据一些实施方案,药物组合物进一步包含选自抗体或其片段、细胞毒性剂、毒素、放射性核素、免疫调控剂、光活化治疗剂、放射增敏剂、激素、抗血管生成剂及其组合的至少一种另外的治疗剂。
[0122] 根据一些实施方案,抗体、其片段或其缀合物选自利妥昔单抗(Rituxan)、布伦妥昔单抗维多汀(Adcetriz)、阿多曲妥珠单抗艾坦肽(Kadcyla)西妥昔单抗(Erbitux)、贝伐单抗(Avastin)、替伊莫单抗(Zevalin)、维多珠单抗(Entyvio)、伊匹单抗(Yervoy)、纳武单抗(Opdivo)、派姆单抗(Keytruda)、阿伦单抗阿特朱单抗(Tecentriq)、阿维鲁单抗(Bavencio)、德鲁瓦单抗(Imfinzi)、B-701、奥法木单抗、阿托珠单抗(Gazyva)帕尼单抗、plozalizumab、BI-754091、OREG-103、COM-701、BI-754111及其组合。
[0123] 根据一些实施方案,细胞毒性剂选自环磷酰胺、甲氯乙胺、尿嘧啶氮芥、美法仑、苯丁酸甲氯乙胺、异环磷酰胺、卡莫司汀、洛莫司汀、链脲霉素、白消安、替莫唑胺、顺铂、卡铂、奥沙利铂、奈达铂、沙铂、三硝酸四铂、阿霉素、柔红霉素、伊达比星、米托蒽醌、甲氨蝶呤、培美曲塞、6-巯基嘌呤、达卡巴嗪、氟达拉滨、5-氟尿嘧啶、阿拉伯糖胞嘧啶、卡培他滨、吉西他滨、地西他滨、长春花生物碱、紫杉醇(Taxol)、多西他赛(Taxotere)、依沙贝比隆(Ixempra)、放线菌素、蒽环类、缬沙星、表柔比星、博来霉素、普卡霉素、丝裂霉素、其药学上可接受的盐、前药及其组合。
[0124] 根据一些实施方案,毒素是白喉毒素或其部分。
[0125] 根据一些实施方案,放射性核素选自I-125、At-211、Lu-177、Cu-67、I-131、Sm-153、Re-186、P-32、Re-188、In-114m、Y-90及其组合。
[0126] 根据一些实施方案,免疫调控剂选自粒细胞集落刺激因子(G-CSF)、LAG-3、IMP-321、JCAR-014、ASLAN-002(BMS-777607)、干扰素、咪喹莫特和来自细菌的细胞膜组分、IL-
2、IL-7、IL-12、CCL3、CCL26、CXCL7、合成的胞嘧啶磷酸鸟苷(CpG)、免疫检查点抑制剂及其组合。
[0127] 根据一些实施方案,放射增敏剂选自米索硝唑、甲硝唑、替拉帕明、反式丁香酸钠及其组合。
[0128] 根据一些实施方案,激素选自前列腺素、白三烯、前列环素、血栓烷、淀粉纤维素、抗苗勒管激素、脂联素、促肾上腺皮质激素、血管紧张素原、血管紧张素、血管加压素、心房肽、脑钠尿肽、降血钙素、胆囊收缩素、促肾上腺皮质激素释放激素、脑啡肽、内皮素、促红细胞生成素、促卵泡激素、甘丙肽、胃泌素、生长激素释放肽、胰高血糖素、促性腺激素释放激素、生长激素释放激素、人绒毛膜促性腺激素、人胎盘促泌素、生长激素、抑制素、胰岛素、生长调节素、瘦素、促脂素、促黄体生成素、黑素细胞刺激激素、胃动素、食欲素、催产素、胰多肽、甲状旁腺激素、催乳素、催乳素释放激素、松弛素、肾素、分泌素、生长抑素、血小板生成素、促甲状腺激素、睾丸酮、脱氢表雄酮、雄烯二酮、二氢睾丸酮、醛固酮、雌二醇、雌酮、雌三醇、皮质醇、孕酮、骨化三醇、骨化二醇、他莫昔芬(Nolvadex)、阿那曲唑(Arimidex)、来曲唑(Femara)、氟司韦特(Faslodex)及其组合。
[0129] 根据一些实施方案,抗血管生成剂选自2-甲氧基雌二醇、血管抑制素、贝伐单抗、软骨衍生的血管生成抑制因子、内皮抑素、IFN-α、IL-12、伊曲康唑、利诺米特、血小板因子4、催乳素、SU5416、苏拉明、他克莫尼、替加仑、四硫代钼酸盐、沙利度胺、血小板反应蛋白、血小板反应蛋白、TNP-470、齐夫-阿柏西普、其药学上可接受的盐、前药及其组合。
[0130] 根据一些实施方案,另外的治疗剂是PI3K/Akt途径的抑制剂。
[0131] 根据一些实施方案,PI3K/Akt途径的抑制剂选自A-674563(CAS#552325-73-2)、AGL 2263、AMG-319(Amgen,Thousand Oaks,CA)、AS-041164(5-苯并[1,3]二恶唑-5-基亚甲基-噻唑烷-2,4-二酮)、AS-604850(5-(2,2-二氟-苯并[1,3]二恶唑-5-基亚甲基)-噻唑烷-2,4-二酮)、AS-605240(5-喹喔啉-6-亚甲基-1,3-噻唑烷-2,4-二酮)、AT7867(CAS#857531-
00-1)、苯并咪唑系列,Genentech(Roche Holdings Inc.,South San Francisco,CA)、BML-
257(CAS#32387-96-5)、BVD-723、CAL-120(Gilead Sciences,Foster City,CA)、CAL-129(Gilead Sciences)、CAL-130(Gilead Sciences)、CAL-253(Gilead Sciences)、CAL-263(Gilead Sciences)、CAS#612847-09-3、CAS#681281-88-9、CAS#75747-14-7、CAS#925681-
41-0、CAS#98510-80-6、CCT128930(CAS#885499-61-6)、CH5132799(CAS#1007207-67-1)、CHR-4432(Chroma Therapeutics,Ltd.,Abingdon,UK)、FPA 124(CAS#902779-59-3)、GS-
1101(CAL-101)(Gilead Sciences)、GSK 690693(CAS#937174-76-0)、H-89(CAS#127243-
85-0)、Honokiol、IC87114(Gilead Science)、IPI-145(Intellikine Inc.)、KAR-4139(Karus Therapeutics,Chilworth,UK)、KAR-4141(Karus Therapeutics)、KIN-1(Karus Therapeutics)、KT 5720(CAS#108068-98-0)、米替福新、MK-2206二盐酸化物(CAS#
1032350-13-2)、ML-9(CAS#105637-50-1)、盐酸纳曲通、OXY-111A(NormOxys Inc.,Brighton,MA)、perifosine、PHT-427(CAS#1191951-57-1)、PI3激酶δ抑制剂,Merck KGaA(Merck&Co.,Whitehouse Station,NJ)、PI3激酶δ抑制剂,Genentech(Roche Holdings Inc.)、PI3激酶δ抑制剂,Incozen(Incozen Therapeutics,Pvt.Ltd.,Hydrabad,India)、PI3激酶δ抑制剂2,Incozen(Incozen Therapeutics)、PI3激酶抑制剂,Roche-4(Roche Holdings Inc.)、PI3激酶抑制剂,Roche(Roche Holdings Inc.)、PI3激酶抑制剂,Roche-5(Roche Holdings Inc.)、PI3-α/δ抑制剂,Pathway Therapeutics(Pathway Therapeutics Ltd.,South San Francisco,CA)、PI3-δ抑制剂,Cellzome(Cellzome AG,Heidelberg,Germany)、PI3-δ抑制剂,Intellikine(Intellikine Inc.,La Jolla,CA)、PI3-δ抑制剂,Pathway Therapeutics-1(Pathway Therapeutics Ltd.)、PI3-δ抑制剂,Pathway Therapeutics-2(Pathway Therapeutics Ltd.)、PI3-δ/γ抑制剂,Cellzome(Cellzome AG)、PI3-δ/γ抑制剂,Cellzome(Cellzome  AG)、PI3-δ/γ抑制剂,Intellikine(Intellikine Inc.)、PI3-δ/γ抑制剂,Intellikine(Intellikine Inc.)、PI3-δ/γ抑制剂,Pathway Therapeutics(Pathway Therapeutics Ltd.)、PI3-δ/γ抑制剂,Pathway Therapeutics(Pathway Therapeutics Ltd.)、PI3-γ抑制剂,Evotec(Evotec)、PI3-γ抑制剂,Cellzome(Cellzome AG)、PI3-γ抑制剂,Pathway Therapeutics(Pathway 
Therapeutics Ltd.)、PI3Kδ/γ抑制剂,Intellikine-1(Intellikine Inc.)、PI3Kδ/γ抑制剂,Intellikine-1(Intellikine Inc.)、pictilisib(Roche Holdings Inc.)、PIK-90(CAS#677338-12-4)、SC-103980(Pfizer,New  York,NY)、SF-1126(Semafore 
Pharmaceuticals,Indianapolis,IN)、SH-5、SH-6、四氢姜黄素、TG100-115(Targegen Inc.,San Diego,CA)、曲西瑞宾、X-339(Xcovery,West Palm Beach,FL)、XL-499(Evotech,Hamburg,Germany)、其药学上可接受的盐及其组合。
[0132] 根据一些实施方案,药物组合物是包含ERK抑制剂和另外的治疗剂的单位剂型。
[0133] 根据一些实施方案,药物组合物ERK抑制剂为第一单位剂型和另外的治疗剂为与第一单位剂型分开的第二单位剂型。
[0134] 根据一些实施方案,将ERK抑制剂和另外的治疗剂共同施用给受试者。
[0135] 根据一些实施方案,将ERK抑制剂和另外的治疗剂逐次地施用给受试者。
[0136] 根据一些实施方案,ERK抑制剂在另外的治疗剂的施用之前或之后施用给受试者。
[0137] 根据一方面,本公开内容提供了用于在携带非V600E/K BRAF突变的受试者中治疗或缓解癌症的影响的方法,该方法包括向受试者施用有效量的BVD-523或其药学上可接受的盐。
[0138] 根据一方面,本公开内容提供了用于在受试者中治疗或改善癌症的影响的方法,包括:(a)鉴定携带非V600E/K BRAF突变的患有癌症的受试者;和(b)向受试者施用有效量的BVD-523或其药学上可接受的盐。
[0139] 根据一方面,本公开内容提供了用于鉴定将从BVD-523或其药学上可接受的盐的疗法中受益的患有癌症的受试者的方法,该方法包括:(a)从受试者获得生物样品;和(b)筛选样品以确定受试者是否具有非V600E/K BRAF突变,其中非V600E/K BRAF突变的存在证实受试者将从BVD-523或其药学上可接受的盐疗法中受益。
[0140] 根据一方面,本公开内容提供了用于在携带非V600E/K BRAF突变的受试者中治疗或缓解癌症的影响的药物组合物,该组合物包含药学上可接受的载体或稀释剂和有效量的BVD-523或其药学上可接受的盐。
[0141] 根据一方面,本公开内容提供了用于在携带非V600E/K BRAF突变的受试者中治疗或缓解癌症的影响的试剂盒,该试剂盒包括根据权利要求88、103和107中任一项的药物组合物及包装在一起的其使用说明书
[0142] 根据一些实施方案,RAF抑制剂选自厄洛替尼(Tarceva)、吉非替尼
[0143] (Iressa)、甲磺酸伊替尼(Gleevec)、拉帕替尼(Tyverb)、苹果酸舒尼替尼(Sutent)、其药学上可接受的盐及其组合。
[0144] 根据一些实施方案,RAF抑制剂选自LXH254(Novartis)、PLX3603(Daiichi Sankyo)、PLX8394(Daiichi Sankyo)、REDX0535(RedX Pharma Plc)、其药学上可接受的盐及其组合。
[0145] 根据一些实施方案,HDAC抑制剂选自扶林司他、帕诺比司他、罗米地辛、贝利司他、其药学上可接受的盐及其组合。
[0146] 根据一些实施方案,抗体、其片段或其缀合物选自利妥昔单抗(Rituxan)、布伦妥昔单抗维多汀(Adcetriz)、阿多曲妥珠单抗艾坦肽(Kadcyla)、伊匹单抗(Yervoy)、纳武单抗(Opdivo)、派姆单抗(Keytruda)、阿伦单抗阿特朱单抗(Tecentriq)、德鲁瓦单抗(Imfinzi)、奥法木单抗、阿托珠单抗(Gazyva)、帕尼单抗及其组合。
[0147] 根据一些实施方案,PI3K/Akt途径的抑制剂是BVD-723。
[0148] 附图的简要说明
[0149] 图1显示了丝裂原活化蛋白激酶(MAPK)途径的示意图。
[0150] 图2显示了用BVD-523治疗的患者的应答。包括通过RECIST v1.1测量的所有患病患者,他们接受了一剂或更多的研究治疗以及一次以上的治疗中肿瘤评估。应答被测量为每个靶病变最长直径的总和相对于基线的变化。实线指示根据RECIST v1.1对于部分应答的阈值。缩写:GBM,胶质母细胞瘤;NSCLC,非小细胞肺癌;CRC,结肠直肠癌。指示了与每个患者的癌症相关的非典型BRAF突变。
[0151] 图3显示了按组分类的游泳者图(Swimmer’s plot)中的治疗持续时间。第一组的成员是在除结肠直肠癌(CRC)和非小细胞肺癌(NSCLC)以外的任何肿瘤类型中具有任何BRAF突变,并且先前未接受过MAPK途径抑制剂的治疗的任何患者。第2组的成员是在CRC中具有任何BRAF突变,先前未接受MAPK途径抑制剂的治疗的患者。第3组的成员是患有具有BRAF V600E/K突变的肿瘤,该肿瘤对MAPK抑制剂治疗无效的患者。第6组的成员是具有在NSCLC中存在的任何BRAF突变的患者。如图3所示,包括所有28名患者通过横线表示,每个受试者一个横线。从组的顶部(最长治疗持续时间)到底部(最短治疗持续时间)说明了每个组中每个受试者的治疗持续时间。平轴表示患者在研究中的持续时间(天)。图3还显示了根据RECIST v1.1为每个患者实现的应答应类型(菱形=部分应答;圆圈=稳定疾病;垂直线=进展性疾病;三形=未评估)。
[0152] 图4显示了因BRAF突变而破坏的游泳者图中的治疗持续时间。包括所有根据RECIST v1.1应答标准测量的28位患者,以及未通过RECIST v1.1评估的其他患者(菱形=部分应答;圆圈=稳定疾病;竖线=进展性疾病;三角形=未评估)。
[0153] 发明详述
[0154] 根据一个方面,本公开提供了用于在携带非V600E/K BRAF突变的受试者中治疗或缓解癌症的影响的方法,该方法包括向受试者施用有效量的ERK抑制剂或其药学上可接受的盐。
[0155] 如本文所用,术语“V600E/K BRAF突变”,与受试者中的癌症有关,及其语法变化,是指在编码人BRAF(SEQ ID NO:2)的基因中包含非同义取代突变的癌细胞,所述非同义取代突变导致在BRAF的氨基酸位置600的氨基酸缬氨酸(V)被取代为谷氨酸(E)或赖氨酸(K)。如本文所用,术语“携带非V600E/K BRAF突变”,与受试者中的癌症有关,及其语法变化,是指癌细胞包含不是V600E/K BRAF突变的体细胞突变。如本文所用,所有BRAF突变均基于人野生型序列(SEQ ID NO:2)。本文也包括来自其他物种的直系同源物。
[0156] 如本文所用,术语“治疗”,“在治疗”、“处理”及其语法变化是指使个体受试者接受方法、方案、过程或措施,其中希望在受试者例如患者中获得生理学应答或结果。特别地,本发明的方法和组合物可以用于减缓疾病症状的发展或延迟疾病或病况的发作,或者中止疾病发展的进程。然而,因为每个被治疗的受试者可能对特定的治疗方法、方案、过程或措施没有应答,所以治疗不需要在各个或每个受试者或受试者群体例如患者群体中实现所需的生理应答或结果。因此,给定的受试者或受试者群体,例如患者群体可能对治疗没有应答或应答不足。
[0157] 如本文所用,术语“缓解”及其语法变化是指降低受试者中疾病症状的严重性。
[0158] 如本文所用,“受试者”是哺乳动物,优选地地人。除了人以外,在本发明范围内的哺乳动物的类别包括例如农场动物、家养动物、实验动物等。农场动物的一些实例包括、猪、马、山羊等。家养动物的一些实例包括狗,猫等。实验动物的一些实例包括灵长类动物、大鼠、小鼠、兔子、豚鼠等。
[0159] 如本文所用,术语本文所公开的化合物或组合物的“有效量”或“治疗有效量”是当施用给受试者时足以实现如本文所述的有益或所需结果的此类化合物或组合物的量。有效的剂型、施用方式和剂量可以凭经验确定,并且这种确定在本领域技术范围内。本领域技术人员应理解,剂量将随施用途径,排泄速率,治疗持续时间,施用的任何其他药物的特征,哺乳动物例如人类患者的年龄、大小和种类,以及医学和兽医学领域众所周知的类似因素而变化。通常,根据本发明的化合物或组合物的合适剂量将是该组合物的这样的量,其是有效产生所需作用的最低剂量。本发明化合物或组合物的有效剂量可以全天以适当的间隔分开以两个、三个、四个、五个、六个或更多个亚剂量施用。
[0160] 根据一些实施方案,ERK抑制剂选自BVD-523、SCH-722984(Merck&Co.)、SCH-772984(Merck&Co.)、SCH-900353(MK-8353)(Merck&Co.)、LY3214996(Lilly)、AEZS-140(Aeterna Zentaris)、AEZS-131(Aeterna Zentaris)、AEZS-136(Aeterna Zentaris)、LTT-
462(Novartis)、RG-7842(Genentech)、CC-90003(Celgene)、KIN-4050(Kinentia)及其组合。根据一些实施方案,ERK抑制剂是BVD-523。
[0161] 在本发明中,BVD-523是根据式(I)的化合物:
[0162]
[0163] 及其药学上可接受的盐。BVD-523是一种高效的、选择性的、可逆的、ATP竞争性的ERK1/2抑制剂。BVD-523可以根据例如美国专利号7,354,939中公开的方法进行合成,其通过引用并入本文。BVD-523的两个对映异构体的对映异构体和外消旋混合物也包括在本发明的范围内。BVD-523是其作用机理被认为例如与某些其他ERK1/2抑制剂例如SCH772984是独特的和不同的ERK1/2抑制剂。例如,其他ERK1/2抑制剂(例如SCH772984)抑制ERK的自磷酸化(Morris等人,2013),而BVD-523允许ERK的自磷酸化同时仍抑制ERK。
[0164] 根据一些实施方案,受试者的癌症在BRAF基因中具有体细胞突变。如本文所用,“体细胞突变”是指在不注定要成为生殖细胞的任何细胞中发生的变化。突变可以是例如取代、缺失、插入或融合。下表1显示了BRAF突变的分布概况,如Sanger数据库所示。
[0165] 表1
[0166]
[0167] 在大约66%黑色素瘤中发现了BRAF突变(Davies等人,2002;Brose等人,2002;Hocket等人,2007),并且在其他癌症中相对更低的百分比,36%甲状腺肿瘤和10%结肠癌(Xu等人,2003;Fransen等人,2004)。最普遍的BRAF突变发生在人野生型蛋白激酶(SEQ ID NO:2)的氨基酸600处,通过用谷氨酸取代缬氨酸产生突变体B-RafV600E,其占BRAF突变的约80%(Davies等人,2002;Hocker等人,2007)。与野生型B-Raf的基础活性相比,B-RafV600E激酶结构域具有500倍高的激酶活性(Wan等人,2004)。在黑素瘤中鉴定出的其他BRAF突变中,V600K和V600D/R也很常见,并且分别代表所有BRAF突变的16%和3%(Long等人,2011)。除黑色素瘤外,BRAF突变在许多其他癌症中也很常见,包括甲状腺乳头状癌、卵巢癌和结肠直肠癌。(Wellbrock等人,2004)。在一项研究中,在5/24(21%)的结肠直肠癌细胞系中发现了BRAF剪接变体(剪接第14和15外显子)(Seth等人,2009)。
[0168] 来自Sanger数据库的下表2显示了人肿瘤中BRAF突变的分布和频率
[0169] 表2
[0170]
[0171]
[0172] 下表3显示了BRAF的选择的核酸和氨基酸序列。这些序列可以用于鉴定具有突变BRAF基因型的受试者的方法中(例如在以下阐述的方法中)。
[0173] 表3
[0174]
[0175]
[0176] 鉴定核酸例如上述鉴定的BRAF基因中突变的方法是本领域已知的。核酸可获自生物样品。在本发明中,生物学样品包括但不限于血液、血浆、尿液、皮肤、唾液和活检样品。通过本领域已知的常规程序和方法从受试者获得生物样品。
[0177] 用于鉴定突变的方法的非限制性实例包括PCR、测序、杂交捕获、溶液内捕获、分子倒置探针、荧光原位杂交(FISH)测定法及其组合。
[0178] 多种测序方法是本领域已知的。这些包括但不限于Sanger测序(也称为双脱氧测序)和例如Metzker 2005中公开的多种合成测序(SBS)方法、通过杂交测序、通过连接测序(例如WO2005021786)、通过降解测序(例如,美国专利号5,622,824和6,140,053)和纳米孔测序(其可从Oxford Nanopore Technologies,UK商购获得)。在深度测序技术中,在测序过程中多次读取序列中的给定核苷酸。深度测序技术公开在例如美国专利公开号20120264632和国际专利公开号WO2012125848中。
[0179] 用于检测突变的基于PCR的方法是本领域已知的并且采用PCR扩增,其中样品中的每个靶序列具有独特的、序列特异性引物的相应对。例如,聚合酶链反应-限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)方法允许在通过PCR扩增基因组序列后快速检测突变。该突变通过用特异性限制性核酸内切酶的消化来区分并通过电泳来鉴定。参见,例如Ota等人,2007。还可以使用实时PCR检测突变。参见,例如国际申请公开号WO2012046981。
[0180] 杂交捕获方法是本领域中已知的并且在例如美国专利公开号20130203632和美国专利号8389219和8288520中公开。这些方法基于靶基因组区域对用户设计的寡核苷酸的选择性杂交。杂交可以是与固定化在高密度或低密度微阵列上的寡核苷酸(阵列捕获),或者是与用配体(例如生物素)修饰的寡核苷酸的溶液相杂交,所述配体随后可以固定化在固体表面例如珠上(溶液中捕获)。
[0181] 分子倒置探针(MIP)方法是本领域已知的并且例如在Absalan等人,2008中公开。此类方法使用MIP分子,其是特殊的“挂”探针(Nilsson等人,1994)用于基因分型。MIP分子是线性寡核苷酸,包含特定区域、通用序列、限制位点和Tag(索引)序列(16-22bp)。在这种方法中,MIP在目的遗传标志物/SNP的周围直接杂交。MIP方法也可以使用与基因组DNA平行杂交的许多“挂锁”探针组(Hardenbol等人,2003)。在完美匹配的情况下,通过进行构型反转(如技术名称所暗示的)并创建环状分子来连接基因组同源区域。第一次限制性酶切后,所有分子均用通用引物进行扩增。再次限制性酶切扩增子以确保用于在微阵列上杂交的短片段。标记产生的短片段,并通过Tag序列与阵列上的cTag(索引的互补链)杂交。在形成Tag-cTag双链体后,检测到信号。
[0182] 根据一些实施方案,非V600E/K BRAF突变是激酶活化的突变、激酶受损的突变、激酶未知的突变及其组合。如本文所用,术语“激酶活化的突变”及其语法变化是指相对于野生型激酶,突变引起突变的激酶的激酶活性升高。如本文所用,术语“激酶受损的突变”及其语法变化是指相对于野生型激酶,突变引起突变的激酶的激酶活性降低。如本文所用,术语“激酶未知的突变”及其语法变化是指突变体激酶的活性是未知的或者突变的激酶的活性约等于野生型激酶的激酶活性。(参见Zheng,G.等人,Clinical detection and categorization of uncommon and concomitant mutations involving BRAF,BMC 
Cancer,(2015)15:779,通过引用整体并入本文)
[0183] 根据一些实施方案,BRAF激酶活化的突变选自R462I、I463S、G464E、G464R、G464V、G466A、G469A、N581S、E586K、F595L、L597Q、L597R、L597S、L597V、A598V、T599E、V600R、K601E、S602D、A728V及其组合。根据一些实施方案,BRAF激酶受损的突变选自G466E、G466R、G466V、Y472C、K483M、D594A、D594E、D594G、D594H、D594N、D594V、G596R、T599A、S602A及其组合。根据一些实施方案,BRAF激酶未知的突变选自T440I、S467L、G469E、G469R、G469S、G469V、L584F、L588F、V600_K601delinsE、S605I、Q609L、E611Q及其组合。如本文所用,所有BRAF突变均基于人野生型序列(SEQ ID NO:2)。本文也包括来自其他物种的直系同源物。
[0184] 在本发明中,用于治疗非V600E/K BRAF突变的方法和组合物对携带单个突变和一个或多个突变的疾病状态有效。实际上,本文公开的(或下文鉴定的)任何单个突变或突变的任何组合都可以用组合物或根据本发明的方法进行处理(例如,非V600E/K突变的任何组合或者非V600E/K突变和V600E/K突变的任何组合)。
[0185] 根据一些实施方案,非V600E/K BRAF突变选自D594、G469、K601E、L597、T599重复、L485W、F247L、G466V、BRAF融合、BRAF-AGAP3重排、BRAF外显子15剪接变体及其组合。
[0186] 如本文所用,氨基酸取代突变的注释包括以下的封闭形式:野生型氨基酸;位置;取代的氨基酸(例如K601E)。如本文所用,氨基酸取代的注释还包括以下的开放式形式:野生型氨基酸;位置(例如G469)。如本文所用,开放式注释包括任何氨基酸的取代。例如,G469突变揭示了位置469的甘氨酸被氨基酸A、R、N、D、C、Q、E、H、I、L、K、M、F、P、S、T、W、Y、V中任何一个取代。也如本文所用,封闭的注释包括被任何氨基酸取代,并且优选地被所述取代的氨基酸取代。例如,K601E突变揭示了位置601的赖氨酸被氨基酸A、R、N、D、C、Q、E、G、H、I、L、M、F、P、S、T、W、Y、V,以及更优选地被氨基酸E取代。本文所用的封闭注释的使用不应解释为将本公开内容限制为具体说明的氨基酸取代。
[0187] 根据一些实施方案,包含携带非V600E/K BRAF突变的癌症的受试者是哺乳动物。根据一些实施方案,所述哺乳动物选自人、灵长类动物、农场动物和家养动物。根据一些实施方案,哺乳动物是人。
[0188] 根据一些方面,本公开内容提供了实体癌和血液癌。实体癌的非限制性实例包括肾上腺皮质癌、肛癌、膀胱癌、骨癌(例如骨肉瘤)、脑癌、乳腺癌、类癌、癌(carcinoma)、宫颈癌、结肠癌、子宫内膜癌、食道癌、肝外胆汁导管癌、尤因家族癌、颅外生殖细胞癌、眼癌、胆囊癌、胃癌、生殖细胞瘤、妊娠滋养细胞肿瘤、头颈癌、下咽癌、胰岛细胞癌、肾癌、大肠癌、喉癌、白血病、嘴唇和口腔癌、肝肿瘤/癌、肺肿瘤/癌、淋巴瘤、恶性间皮瘤、默克尔细胞癌、蕈样肉芽肿、骨髓增生异常综合征、骨髓增生性疾病、鼻咽癌、神经母细胞瘤、口腔癌、口咽癌、骨肉瘤、卵巢上皮癌、卵巢生殖细胞癌、胰腺癌、鼻旁窦和鼻腔癌、甲状旁腺癌、阴茎癌、垂体癌、浆细胞瘤、前列腺癌、横纹肌肉瘤、直肠癌、肾细胞癌、肾盂和输尿管的移行细胞癌、唾液腺癌、塞氏综合征、皮肤癌(如皮肤T细胞淋巴瘤、卡波西肉瘤、肥大细胞瘤和黑色素瘤)、小肠癌、软组织肉瘤、胃癌、睾丸癌、胸腺瘤、甲状腺癌、尿道癌、子宫癌、阴道癌、外阴癌和威尔姆斯瘤。
[0189] 血液癌症的例子包括但不限于白血病,例如成人/儿童急性淋巴细胞白血病、成人/儿童急性髓细胞白血病、慢性淋巴细胞性白血病、慢性骨髓性白血病、和毛细胞白血病、淋巴瘤例如与艾滋病有关的淋巴瘤、皮肤T细胞淋巴瘤、成年/儿童霍奇金淋巴瘤、蕈样真菌病、成年/儿童非霍奇金淋巴瘤、原发性中枢神经系统淋巴瘤、塞氏综合征、皮肤T细胞淋巴瘤和Waldenstrom巨球蛋白血症、以及其他增生性病症例如慢性骨髓增生性疾病、朗格汉斯细胞组织细胞增生症、多发性骨髓瘤/浆细胞瘤、骨髓增生异常综合征和骨髓增生异常/骨髓增生性肿瘤。
[0190] 根据一些实施方案,受试者的癌症选自胶质母细胞瘤、黑素瘤、胆管癌、小细胞肺癌、结肠直肠癌、前列腺癌、阴道癌、血管肉瘤、非小细胞肺癌、阑尾癌、鳞状细胞癌、唾液管癌、腺样囊性癌、小肠癌和胆囊癌。优选地,癌症选自小肠癌、非小细胞肺癌、胆囊癌和鳞状细胞癌。
[0191] 根据一些方面,本公开提供了向受试者施用至少一种另外的丝裂原活化蛋白激酶(MAPK)途径抑制剂。根据一些实施方案,至少一种另外的治疗剂选自MEK抑制剂、RAF抑制剂、HDAC抑制剂、ERK抑制剂及其组合。
[0192] 如本文所用,“丝裂原活化蛋白激酶(MAPK)途径抑制剂”是调控例如降低MAPK途径中蛋白质的活性、表达或磷酸化从而导致细胞生长减少或细胞死亡增加的任何物质。
[0193] 哺乳动物MAPK级联的概述在图1中显示。关于MAPK途径的细节在例如Akinleye等人,2013中进行了综述。简言之,关于图1中的ERK1/2模(浅紫色框),MAPK 1/2信号传导级联通过配体与受体酪氨酸激酶(RTK)的结合而被活化。活化的受体募集并磷酸化衔接蛋白Grb2和SOS,后两者然后与膜结合的GTPase Ras相互作用并引起其活化。Ras以其活化的GTP结合形式募集并活化Raf激酶(A-Raf、B-Raf和C-Raf/RaF-1)。活化的Raf激酶活化MAPK 1/2(MKK1/2),其进而催化ERK1/2的活化序列Thr-Glu-Tyr中苏氨酸和酪氨酸残基的磷酸化。对于JNK/p38模块(图1中的黄色框),上游激酶MAP3K(例如MEKK1/4、ASK1/2和MLK1/2/3)活化MAP2K3/6(MKK3/6)、MAP2K4(MKK4)和MAP2K7(MKK7)。然后,这些MAP2K活化JNK蛋白激酶,包括JNK1、JNK2和JNK3以及p38α/β/γ/Δ。为了执行其功能,JNK活化多个转录因子,包括c-Jun、ATF-2、NF-ATc1、HSF-1和STAT3。关于ERK5模块(图1中的蓝色框),MAP2K5(MKK5)上游的激酶是MEKK2和MEKK3。MEK5最具特征的下游靶标是ERK5,也称为大MAP激酶1(BMK1),因为它是其他MAPK大小的两倍。
[0194] MAPK途径抑制剂的非限制性实例包括RAS抑制剂、RAF抑制剂、MEK抑制剂、ERK1/2抑制剂、其药学上可接受的盐及其组合。
[0195] 如本文所用,“RAS抑制剂”是指(i)例如通过与RAS结合而与RAS直接相互作用和(ii)降低RAS的表达或活性的那些物质。非限制性的示例性RAS抑制剂包括但不限于法呢基转移酶抑制剂(例如,替吡法尼(tipifarnib)和洛那法尼(lonafarnib))、含法呢基基团的小分子(例如,salirasib和TLN-4601)、由Maurer(Maurer等人,2012)公开的DCAI、由Shima(Shima等,2013)公开的Kobe0065和Kobe2602、HBS 3(Patgiri等人,2011)和AIK-4(Allinky)。
[0196] 如本文所用,“RAF抑制剂”是指(i)例如通过与RAF结合而与RAF直接相互作用和(ii)降低RAF的表达或活性的那些物质,例如A-RAF、B-RAF和C-RAF(Raf-1)。非限制性示例性RAF抑制剂包括:
[0197] 化合物7 (Li等人),
[0198] 化合物9 (同上),
[0199] 化合物10 (同上),
[0200] 化合物13 (同上),
[0201] 化合物14 (同上),
[0202] 化合物15 (同上),
[0203] 化合物16 (同上),
[0204] 化合物18 (同上),
[0205] 化合物19 (同上),
[0206] 化合物20 (同上),
[0207] 化合物21 (同上),
[0208] 化合物22 (同上),
[0209] 化合物23 (同上),
[0210] 化合物24 (同上),
[0211] 化合物25 (同上),
[0212] 化合物26 (同上),
[0213] 化合物27 (同上),
[0214] 化合物28 (同上),
[0215] 化合物30 (同上),
[0216] 化合物31 (同上),
[0217] 化合物32 (同上),
[0218] 化合物33 (同上),
[0219] 化合物34 (同上),
[0220] 化合物35 (同上),
[0221] 化合物36 (同上),
[0222] 化合物37 (同上),
[0223] 化合物38 (同上),
[0224] 化合物39 (同上),化合物40 (同上),
[0225] AAL881(Novartis);AB-024(Ambit Biosciences),ARQ-736(ArQule),ARQ-761(ArQule),AZ628(Axon Medchem BV),BAY 43-9006索拉非尼,BaiGene-283(BeiGene),BUB-024(MLN 2480)(Sunesis&Takeda),b-raf抑制剂(Sareum),BRAF激酶抑制剂(Selexagen Therapeutics),BRAF  siRNA  313(tacaccagcaagctagatgca)和523
(cctatcgttagagtcttcctg)(Liu等人,2007),CHIR-265(Novartis),CTT239065(Institute of Cancer Research),达拉非尼(GSK2118436),DP-4978(Deciphera Pharmaceuticals),HM-95573(Hanmi),GDC-0879(Genentech),GW-5074(Sigma Aldrich),ISIS 5132
(Novartis),L779450(Merck),LBT613(Novartis),LXH254(Novartis),LErafAON
(NeoPharm,Inc.),LGX-818(Novartis),帕唑帕尼(GlaxoSmithKline),PLX3202
(Plexxikon),PLX4720(Plexxikon),PLX5568(Plexxikon),PLX3603(Daiichi Sankyo),PLX8394(Daiichi Sankyo),RAF-265(Novartis),RAF-365(Novartis),REDX0535(RedX Pharma Plc),瑞戈非尼(Bayer Healthcare Pharmaceuticals,Inc.),RO 5126766(Hoffmann-La Roche),SB-590885(GlaxoSmithKline),SB699393(GlaxoSmith Kline),索拉非尼(Onyx Pharmaceuticals),TAK 632(Takeda),TL-241(Teligene),威罗非尼(RG7204或PLX4032)(Daiichi Sankyo),XL-281(Exelixis),ZM-336372(AstraZeneca),其药学可接受的可盐及其组合。
[0226] 根据一些实施方案,RAF抑制剂包括泛抑制剂;其非限制性实例包括厄洛替尼(Tarceva)、吉非替尼(Iressa)、甲磺酸伊马替尼(Gleevec)、拉帕替尼(Tyverb)、苹果酸舒尼替尼(Sutent)其药学可接受的可盐及其组合。
[0227] 如本文所用,“MEK抑制剂”是指(i)例如通过与MEK结合而与MEK直接相互作用,和(ii)降低MEK的表达或活性的那些物质。因此,在MEK上游起作用的抑制剂,例如RAS抑制剂和RAF抑制剂,不是根据本发明的MEF抑制剂。MEK抑制剂的非限制性实例包括炭疽毒素、蒽醌(Golden Biotechnology)、ARRY-142886(6-(4-溴-2-氯-苯基氨基)-7-氟-3-甲基-3H-苯并咪唑-5-羧酸(2-羟基-乙氧基)-酰胺)(Array BioPharma)、ARRY-438162(Array BioPharma)、贝美替尼(MEK162,ARRY-1662)、AS-1940477(Astellas)、AS-703988(Merck KGaA)、bentamapimod(Merck KGaA)、BI-847325(Boehringer Ingelheim)、E-6201(Eisai)、GDC-0623(Hoffmann-La Roche)、GDC-0973(考比替尼)(Hoffmann-La Roche)、L783277(Merck)、炭疽毒素的致死因子部分、MEK162(Array BioPharma)、PD 098059(2-(2'-氨基-
3'-甲氧苯基)-氧萘-4-酮)(Pfizer)、PD 184352(CI-1040)(Pfizer)、PD-0325901
(Pfizer)、pimasertib(Santhera Pharmaceuticals)、RDEA119(Ardea Biosciences/Bayer)、瑞美替尼(AstraZeneca)、RG422(Chugai Pharmaceutical Co.)、R0092210(Roche)、R04987655(Hoffmann-La Roche)、R05126766(Hoffmann-La Roche)、司美替尼(AZD6244)(AstraZeneca)、SL327(Sigma)、TAK-733(Takeda)、曲美替尼(Japan Tobacco)、U0126(1,4-二氨基-2,3-二氰基-1,4-双(2-氨基苯硫基)丁二烯)(Sigma)、WX-554(Wilex)、YopJ多肽(Mittal等人,2010)、其药学上可接受的盐及其组合。
[0228] 如本文所用,“ERK1/2抑制剂”是指(i)例如通过与ERK1/2结合而与ERK1和/或ERK2直接相互作用,和(ii)降低ERK1和/或ERK2蛋白激酶的表达或活性的那些物质。因此,在ERK1/2上游起作用的抑制剂,例如MEK抑制剂和RAF抑制剂,不是根据本发明的ERK1/2抑制剂。ERK1/2抑制剂的非限制性实例包括AEZS-131(Aeterna Zentaris)、AEZS-136(Aeterna Zentaris),BVD-523,SCH-722984(Merck&Co.)、SCH-772984(Merck&Co.)、SCH-900353(MK-8353)(Merck&Co.)、LY3214996(Lilly)、其药学上可接受的盐及其组合。
[0229] 如本文所用,“HDAC抑制剂”是指(i)例如通过与HDAC结合而与组蛋白脱乙酰基酶(HDAC)直接相互作用,和(ii)降低HDAC的表达或活性的那些物质。HDAC抑制剂的非限制性例子包括艾贝司他(PCI-24781)、吉诺司他、恩替司他、扶林司他、CI-994、CUDC-101、恩替司他、BML-210、M344、NVP-LAQ824、帕比司他、Pracinosat(SB939)、Mocetinostat、Resminostat、罗米地辛、贝利诺司他、其药学上可接受的盐及其组合。
[0230] 根据一些实施方案,HDAC抑制剂选自扶林司他、帕比司他、罗米地辛、贝利诺司他、其药学上可接受的盐及其组合。
[0231] 在另一方面,该方法进一步包括向受试者施用有效治疗或改善癌症的影响的至少一种另外的治疗剂。所述另外的治疗剂可以选自抗体、抗体片段、抗体缀合物、细胞毒性剂、毒素、放射性核素、免疫调控剂、光活化治疗剂、放射增敏剂、激素、抗血管生成剂及其组合。
[0232] 如本文所用,“抗体”涵盖天然存在的免疫球蛋白以及非天然存在的免疫球蛋白,包括例如单链抗体、嵌合抗体(例如人源化鼠抗体)和杂缀合物抗体(例如双特异性抗体)。抗体的片段包括结合抗原的那些(例如,Fab'、F(ab')2、Fab、Fv和rIgG)。还参见,例如,Pierce Catalog and Handbook,1994-1995(Pierce Chemical Co.,Rockford,Ill);Kuby,J.,Immunology,3rd Ed.,W.H.Freeman&Co.,New York(1998)。术语抗体还包括二价或双特异性分子、双抗体、三抗体和四抗体。术语“抗体”还包括多克隆和单克隆抗体。
[0233] 可用于本发明的治疗性抗体的实例包括利妥昔单抗(Rituxan)、布伦妥昔单抗维多汀(Adcetriz)、阿多曲妥珠单抗艾坦肽(Kadcyla)、西妥昔单抗(Erbitux)、贝伐单抗(Avastin)、替伊莫单抗(Zevalin)、维多珠单抗(Entyvio)、伊匹单抗(Yervoy)、纳武单抗(Opdivo)、派姆单抗(Keytruda)、阿伦单抗(Alemtuzamab)阿特朱单抗(Tecentriq)、阿维鲁单抗(Bavencio)、德鲁瓦单抗(Imfinzi)、B-701、奥法木单抗、阿托珠单抗(Gazyva)帕尼单抗、plozalizumab、BI-754091、OREG-103、COM-701、BI-754111及其组合。
[0234] 根据一些实施方案,所述抗体、其片段或其缀合物选自利妥昔单抗(Rituxan)、布伦妥昔单抗维多汀(Adcetriz)、阿多曲妥珠单抗艾坦肽(Kadcyla)、伊匹单抗(Yervoy)、纳武单抗(Opdivo)、派姆单抗(Keytruda)、阿伦单抗阿特朱单抗(Tecentriq)、德鲁瓦单抗(Imfinzi)、奥法木单抗、阿托珠单抗(Gazyva)帕尼单抗及其组合。
[0235] 根据本发明的细胞毒剂包括DNA破坏剂、抗代谢物、抗微管剂、抗生素剂等。DNA破坏剂包括烷基化剂、铂基试剂、嵌入剂和DNA复制的抑制剂。DNA烷基化剂的非限制性实例包括环磷酰胺、甲氯乙胺、尿嘧啶氮芥、美法仑、苯丁酸甲氯乙胺、异环磷酰胺、卡莫司汀、洛莫司汀、链脲霉素、白消安、替莫唑胺、其药学上可接受的盐、前药及其组合。铂基试剂的非限制性实例包括顺铂、卡铂、奥沙利铂、奈达铂、沙铂、三硝酸四铂、其药学上可接受的盐、前药及其组合。插入剂的非限制性实例包括阿霉素、柔红霉素、伊达比星、米托蒽醌、其药学上可接受的盐、前药及其组合。DNA复制的抑制剂的非限制性实例包括伊立替康、托泊替康、氨水碱、依托泊苷、依托泊苷磷酸酯、替尼泊苷、其药学上可接受的盐、前药及其组合。抗代谢物包括叶酸拮抗剂,例如甲氨蝶呤和培美曲塞(premetrexed);嘌呤拮抗剂,例如6-巯嘌呤、达卡巴嗪和氟达拉滨;和嘧啶拮抗剂,例如5-氟尿嘧啶、阿拉伯糖基胞嘧啶、卡培他滨,吉西他滨、地西他滨、其药学上可接受的盐、前药及其组合。抗微管剂包括但不限于长春花生物碱、紫杉醇 多西他赛 和依沙贝比隆 抗生素试剂包括但不限于放线菌素、蒽环类、缬沙星、表柔比星、博来霉素、普卡霉素、丝裂霉素、其药学上可接受的盐、前药及其组合。
[0236] 根据一些实施方案,细胞毒性剂选自环磷酰胺、甲氯乙胺、尿嘧啶氮芥、美法仑、苯丁酸甲氯乙胺、异环磷酰胺、卡莫司汀、洛莫司汀、链脲霉素、白消安、替莫唑胺、顺铂、卡铂、奥沙利铂、奈达铂、沙铂、三硝酸四铂、阿霉素、柔红霉素、伊达比星、米托蒽醌、甲氨蝶呤、培美曲塞、6-巯基嘌呤、达卡巴嗪、氟达拉滨、5-氟尿嘧啶、阿拉伯糖胞嘧啶、卡培他滨、吉西他滨、地西他滨、长春花生物碱、紫杉醇(Taxol)、多西他赛(Taxotere)、依沙贝比隆(Ixempra)、放线菌素、蒽环类、缬沙星、表柔比星、博来霉素、普卡霉素、丝裂霉素、其药学上可接受的盐、前药及其组合。
[0237] 根据本发明的细胞毒性剂还包括PI3K/Akt途径的抑制剂。PI3K/Akt途径的抑制剂的非限制性实例包括A-674563(CAS#552325-73-2)、AGL 2263、AMG-319(Amgen,Thousand Oaks,Calif)、AS-041164(5-苯并[1,3]二恶唑-5-基亚甲基-噻唑烷-2,4-二酮)、AS-604850(5-(2,2-二氟-苯并[1,3]二恶唑-5-基亚甲基)-噻唑烷-2,4-二酮)、AS-605240(5-喹喔啉-6-亚甲基-1,3-噻唑烷-2,4-二酮)、AT7867(CAS#857531-00-1)、苯并咪唑系列,Genentech(Roche Holdings Inc.,South San Francisco,Calif)、BML-257(CAS#32387-96-5)、BVD-
723、CAL-120(Gilead Sciences,Foster City,Calif)、CAL-129(Gilead Sciences)、CAL-
130(Gilead Sciences)、CAL-253(Gilead Sciences)、CAL-263(Gilead Sciences)、CAS#
612847-09-3、CAS#681281-88-9、CAS#75747-14-7、CAS#925681-41-0、CAS#98510-80-6、CCT128930(CAS#885499-61-6)、CH5132799(CAS#1007207-67-1)、CHR-4432(Chroma Therapeutics,Ltd.,Abingdon,UK)、FPA 124(CAS#902779-59-3)、GS-1101(CAL-101)(Gilead Sciences)、GSK690693(CAS#937174-76-0)、H-89(CAS#127243-85-0)、Honokiol、IC87114(Gilead Science)、IPI-145(Intellikine Inc.)、KAR-4139(Karus 
Therapeutics,Chilworth,UK)、KAR-4141(Karus Therapeutics)、KIN-1(Karus 
Therapeutics)、KT 5720(CAS#108068-98-0)、米替福新、MK-2206二盐酸化物(CAS#
1032350-13-2)、ML-9(CAS#105637-50-1)、盐酸纳曲通、OXY-111A(NormOxys Inc.,Brighton,Mass.)、perifosine、PHT-427(CAS#1191951-57-1)、PI3激酶δ抑制剂,Merck KGaA(Merck&Co.,Whitehouse Station,NJ)、PI3激酶δ抑制剂,Genentech(Roche Holdings Inc.)、PI3激酶δ抑制剂,Incozen(Incozen Therapeutics,Pvt.Ltd.,Hydrabad,India)、PI3激酶δ抑制剂2,Incozen(Incozen Therapeutics)、PI3激酶抑制剂,Roche-4(Roche Holdings Inc.)、PI3激酶抑制剂,Roche(Roche Holdings Inc.)、PI3激酶抑制剂,Roche-5(Roche Holdings Inc.)、PI3-α/δ抑制剂,Pathway Therapeutics(Pathway Therapeutics Ltd.,South San Francisco,CA)、PI3-δ抑制剂,Cellzome(Cellzome AG,Heidelberg,Germany)、PI3-δ抑制剂,Intellikine(Intellikine Inc.,La Jolla,CA)、PI3-δ抑制剂,Pathway Therapeutics-1(Pathway Therapeutics Ltd.)、PI3-δ抑制剂,Pathway Therapeutics-2(Pathway Therapeutics Ltd.)、PI3-δ/γ抑制剂,Cellzome(Cellzome AG)、PI3-δ/γ抑制剂,Cellzome(Cellzome  AG)、PI3-δ/γ抑制剂,Intellikine(Intellikine Inc.)、PI3-δ/γ抑制剂,Intellikine(Intellikine Inc.)、PI3-δ/γ抑制剂,Pathway Therapeutics(Pathway Therapeutics Ltd.)、PI3-δ/γ抑制剂,Pathway Therapeutics(Pathway Therapeutics Ltd.)、PI3-γ抑制剂,Evotec(Evotec)、PI3-γ抑制剂,Cellzome(Cellzome AG)、PI3-γ抑制剂,Pathway Therapeutics(Pathway 
Therapeutics Ltd.)、PI3Kδ/γ抑制剂,Intellikine-1(Intellikine Inc.)、PI3Kδ/γ抑制剂,Intellikine-1(Intellikine Inc.)、pictilisib(Roche Holdings Inc.)、PIK-90(CAS#677338-12-4)、SC-103980(Pfizer,New  York,NY)、SF-1126(Semafore 
Pharmaceuticals,Indianapolis,IN)、SH-5、SH-6、四氢姜黄素、TG100-115(Targegen Inc.,San Diego,Calif)、曲西瑞宾、X-339(Xcovery,West Palm Beach,F1a)、XL-499(Evotech,Hamburg,Germany)、其药学上可接受的盐及其组合。
[0238] 在本发明中,BVD-723是根据式(II)的化合物:
[0239]
[0240] 及其药学上可接受的盐。BVD-723是PI3Kγ的选择性抑制剂。BVD-723可以根据例如美国专利申请公开号2016/0214980进行合成,通过引用将其全部内容并入本文。BVD-723的两个对映异构体的对映异构体和外消旋混合物也包括在本发明的范围内。
[0241] 在本发明中,术语“毒素”是指植物或动物来源的抗原性毒物或毒液。一个例子是白喉毒素或其部分。
[0242] 在本发明中,术语“放射性核素”是指例如通过静脉内或口服施用给患者的放射性物质,之后其通过患者的正常代谢渗透到靶器官或组织中,在那里其递送局部辐射以短时间。放射性核素的例子包括但不限于I-125、At-211、Lu-177、Cu-67、I-131、Sm-153、Re-186、P-32、Re-188、In-114m和Y-90。
[0243] 在本发明中,术语“免疫调控剂”是指通过增强或降低免疫系统产生抗体或致敏细胞的能来改变免疫应答的物质,所述抗体或致敏细胞识别并与引发其产生的抗原反应。免疫调控剂可以是重组的、合成的或天然的制备物,并且包括细胞因子、皮质类固醇、细胞毒性剂、胸腺素和免疫球蛋白。某些免疫调控剂天然存在于体内,并且其中某些可以在药物制备物中获得。免疫调控剂的实例包括但不限于粒细胞集落刺激因子(G-CSF)、LAG-3、IMP-
321、JCAR-014、ASLAN-002(BMS-777607)、干扰素、咪喹莫特和来自细菌的细胞膜级分、IL-
2、IL-7、IL-12、CCL3、CCL26、CXCL7、合成的胞嘧啶磷酸鸟苷(CpG)、免疫检查点抑制剂及其组合。
[0244] 在本发明中,术语“光活化治疗剂”是指在暴露于光后变得有活性的化合物和组合物。在例如美国专利申请序列号2011/0152230A1“Photoactive Metal Nitrosyls For Blood Pressure Regulation And Cancer Therapy”中公开了光活化治疗剂的某些实例。
[0245] 在本发明中,术语“放射增敏剂”是指使肿瘤细胞对放射疗法更敏感的化合物。放射增敏剂的实例包括米索硝唑、甲硝唑、替拉帕明和反式丁香酸钠及其组合。
[0246] 在本发明中,术语“激素”是指由身体某一部分中的细胞释放的,影响在身体另一部分中的细胞的物质。激素的实例包括但不限于前列腺素、白三烯、前列环素、血栓烷、淀粉纤维素、抗苗勒管激素、脂联素、促肾上腺皮质激素、血管紧张素原、血管紧张素、血管加压素、心房肽、脑钠尿肽、降血钙素、胆囊收缩素、促肾上腺皮质激素释放激素、脑啡肽、内皮素、促红细胞生成素、促卵泡激素、甘丙肽、胃泌素、生长激素释放肽、胰高血糖素、促性腺激素释放激素、生长激素释放激素、人绒毛膜促性腺激素、人胎盘促泌素、生长激素、抑制素、胰岛素、生长调节素、瘦素、促脂素、促黄体生成素、黑素细胞刺激激素、胃动素、食欲素、催产素、胰多肽、甲状旁腺激素、催乳素、催乳素释放激素、松弛素、肾素、分泌素、生长抑素、血小板生成素、促甲状腺激素、睾丸酮、脱氢表雄酮、雄烯二酮、二氢睾丸酮、醛固酮、雌二醇、雌酮、雌三醇、皮质醇、孕酮、骨化三醇和骨化二醇。
[0247] 一些化合物干扰某些激素的活性或停止某些激素的产生。这些激素干扰性化合物包括但不限于他莫昔芬 阿那曲唑 来曲唑 和氟司韦特 这些化合物也在本发明中激素的含义之中。
[0248] 如本文所用,“抗血管生成”剂是指减少或抑制新血管生长的物质,例如,血管内皮生长因子(VEGF)的抑制剂和内皮细胞迁移的抑制剂。抗血管生成剂包括但不限于2-甲氧基雌二醇、血管抑制素、贝伐单抗、软骨衍生的血管生成抑制因子、内皮抑素、IFN-α、IL-12、伊曲康唑、利诺米特、血小板因子4、催乳素、SU5416、苏拉明、他克莫尼、替加仑、四硫代钼酸盐、沙利度胺、血小板反应蛋白、血小板反应蛋白、TNP-470、齐夫-阿柏西普、其药学上可接受的盐、前药及其组合。
[0249] 根据一个方面,本公开内容提供了用于在受试者中治疗或缓解的癌症的影响的方法,包括:(a)鉴定携带非V600E/K BRAF突变的患有癌症的受试者;和(b)对受试者施用有效量的ERK抑制剂或其药学上可接受的盐。
[0250] 根据一个实施方案,ERK抑制剂选自BVD-523、SCH-722984(Merck&Co.)、SCH-772984(Merck&Co.)、SCH-900353(MK-8353)(Merck&Co.)、LY3214996(Lilly)、AEZS-140(Aeterna Zentaris)、AEZS-131(Aeterna Zentaris)、AEZS-136(Aeterna Zentaris)、LTT-
462(Novartis)、RG-7842(Genentech)、CC-90003(Celgene)、KIN-4050(Kinentia)及其组合。根据一个实施方案,ERK抑制剂是BVD-523。在该实施方案的一个方面中,BVD-523或其药学上可接受的盐以还包含药学上可接受的载体或稀释剂的药物组合物的形式进行施用。
[0251] 根据一个方面,本公开内容提供了鉴定携带非V600E/K BRAF突变的患有癌症的受试者的方法,包括(i)从受试者获得生物学样品;和(ii)筛选样品以确定受试者是否具有非V600E/K BRAF突变。
[0252] 合适和优选的主题如本文所公开。在该实施方案中,方法可以用于治疗上文公开的癌症,包括具有以上鉴定的突变背景的那些癌症。鉴定此类突变的方法也如上所述。
[0253] 在本发明中,生物学样品包括但不限于血液、血浆、尿液、皮肤、唾液和活检样品。通过本领域已知的常规程序和方法从受试者获得生物样品。鉴定突变的方法的非限制性实例包括PCR、测序、杂交捕获、溶液内捕获、分子倒置探针、荧光原位杂交(FISH)测定及其组合。
[0254] 根据一个实施方案,方法进一步包括向该受试者施用选自MEK抑制剂、RAF抑制剂、HDAC抑制剂及其组合的至少一种另外的治疗剂。合适和优选的主题如本文所公开。在该实施方案中,方法可用于使用一种或多种上文公开的另外的治疗剂来治疗上文公开的癌症,包括具有上文鉴定的突变背景的那些癌症。鉴定此类突变的方法也如上所述。
[0255] 根据一个方面,本公开内容提供了用于鉴定将从ERK抑制剂或其药学上可接受的盐的疗法中受益的患有癌症的受试者的方法,该方法包括:(a)从受试者获得生物样品;和(b)筛选样品以确定受试者是否具有非V600E/K BRAF突变,其中非V600E/K BRAF突变的存在证实受试者将从ERK抑制剂或其药学上可接受的盐的疗法中受益。根据一些实施方案,方法进一步包括向受试者施用ERK抑制剂或其药学上可接受的盐。根据一些实施方案,方法进一步包括向受试者施用至少一种另外的治疗剂。在该实施方案中,方法可用于鉴定在上述癌症中的上文鉴定的突变背景。鉴定此类突变的方法也如上所述。在该实施方案中,所鉴定的患者将受益于其的ERK抑制剂如上所述。另外的治疗剂如上所述。合适和优选的主题如上所述。
[0256] 根据一个方面,本公开内容提供了用于在受试者中治疗或缓解癌症的影响的方法,包括:(a)鉴定携带非V600E/K BRAF突变的患有癌症的受试者;和(b)向受试者施用有效量的BVD-523或其药学上可接受的盐。根据一个方面,本公开内容提供了用于鉴定将从BVD-523或其药学上可接受的盐的疗法中受益的患有癌症的受试者的方法,该方法包括:(a)从受试者获得生物样品;和(b)筛选样品以确定受试者是否具有非V600E/K BRAF突变,其中非V600E/K BRAF突变的存在证实受试者将从BVD-523或其药学上可接受的盐的疗法中受益。
在这些实施方案中,方法可用于鉴定在上述癌症中的上文鉴定的突变背景。鉴定此类突变的方法也如上所述。合适和优选的主题如上所述。
[0257] 本公开内容的另一方面提供了用于在携带非V600E/K BRAF突变的受试者中治疗或改善癌症的影响的试剂盒。根据一些实施方案,试剂盒包含有效量的如上所述的ERK抑制剂,和任选地如上所述的另外的治疗剂。
[0258] 试剂盒还可包括用于本发明的每种抗癌剂(其可以例如以药物组合物的形式)和其他反应剂(例如,缓冲剂、平衡盐溶液等)的合适的储存容器,例如安瓿、小瓶、试管等,用于向受试者施用抗癌剂。本发明的抗癌剂和其他反应剂可以以任何方便的形式存在于试剂盒中,例如以溶液或粉末形式。试剂盒可进一步包括包装容器,任选地具有用于容纳药物组合物和其他任选试剂的一个或多个隔区。
[0259] 在本发明中,本发明的抗癌剂包括包含本文所公开的该抗癌剂的药物组合物的“有效量”或“治疗有效量”是当施用于受试者时,足以实现本文所述有益的或所需的结果的这种试剂或组合物的量。有效的剂型、施用方式和剂量可以凭经验确定,并且这种确定在本领域技术范围内。本领域技术人员应理解,剂量将随施用途径,排泄速率,治疗持续时间,在施用的任何其他药物的特征,哺乳动物例如人类患者的年龄、大小和种类,以及医学和兽医学领域众所周知的类似因素而变化。通常,根据本发明的试剂或组合物的合适剂量将是试剂或组合物的这样的量,其是有效产生所需的作用的最低剂量。本发明的试剂或组合物的有效剂量可以全天以适当的间隔分开以两个、三个、四个、五个、六个或更多个亚剂量施用。
[0260] 本文公开的BVD-523、RAF抑制剂、ERK抑制剂或另一种抗癌剂的剂量的非限制性实例为每天约1mg/kg至约2400mg/kg,例如每天约1mg/kg至约1200mg/kg、每天75mg/kg至约300mg/kg,包括每天约1mg/kg至约100mg/kg。此类试剂的其他代表性剂量包括约1mg/kg、
5mg/kg、10mg/kg、15mg/kg、20mg/kg、25mg/kg、30mg/kg、35mg/kg、40mg/kg、45mg/kg、50mg/kg、60mg/kg、70mg/kg、75mg/kg、80mg/kg、90mg/kg、100mg/kg、125mg/kg、150mg/kg、175mg/kg、200mg/kg、250mg/kg、300mg/kg、400mg/kg、500mg/kg、600mg/kg、700mg/kg、800mg/kg、
900mg/kg、1000mg/kg、1100mg/kg、1200mg/kg、1300mg/kg、1400mg/kg、1500mg/kg、1600mg/kg、1700mg/kg、1800mg/kg、1900mg/kg、2000mg/kg、2100mg/kg、2200mg/kg和2300mg/kg每天。本文公开的BVD-523、RAF抑制剂、ERK抑制剂或另外的抗癌剂的有效剂量可以全天以适当的间隔分开以两个、三个、四个、五个、六个或更多个亚剂量施用。
[0261] 本发明的BVD-523、RAF抑制剂、ERK抑制剂或另外的治疗剂或者包含其的药物组合物可以以任何所需和有效的方式施用:用于口服摄取,或作为软膏或滴剂用于局部施用给眼,或以任何适当方式(例如腹膜内、肿瘤内、皮下、局部、皮内、吸入、肺内、直肠、阴道、舌下、肌肉内、静脉内、动脉内、鞘内或淋巴管内)进行肠胃外或其他施用。此外,可以将本发明的BVD-523、RAF抑制剂或另外的治疗剂或者包含其的药物组合物与其他治疗联合施用。如果需要,可以将本发明的BVD-523、RAF抑制剂或另外的治疗剂或者包含其的药物组合物包封或以其他方式保护以免受胃或其他分泌物。
[0262] 本发明的药物组合物包含一种或多种活性成分,例如治疗剂,与一种或多种药学上可接受的稀释剂或载体以及任选的一种或多种其他化合物、药物、成分和/或材料混合。不管选择的施用途径如何,通过本领域技术人员已知的常规方法将本发明的试剂/化合物配制成药学上可接受的剂型。参见,例如,Remington,The Science and Practice of Pharmacy(21st Edition,Lippincott Williams and Wilkins,Philadelphia,Pa)。
[0263] 药学上可接受的稀释剂或载体是本领域众所周知的(参见,例如,Remington,The Science and Practice of Pharmacy(21st Edition,Lippincott Williams and Wilkins,Philadelphia,Pa)和The National Formulary(American Pharmaceutical Association,Washington,D.C.)),并且包括糖(例如乳糖、蔗糖、甘露醇和山梨糖醇),淀粉,纤维素制备物,磷酸钙(例如磷酸二钙、磷酸三钙和磷酸氢钙),柠檬酸钠,水,水溶液(例如,盐水、氯化钠注射液、林格注射液、葡萄糖注射液、葡萄糖和氯化钠注射液、乳酸林格氏注射液),醇类(例如乙醇、丙醇和苄醇),多元醇(例如甘油、丙二醇和聚乙二醇),有机酯(例如油酸乙酯和甘油三酸酯),生物可降解的聚合物(例如聚丙交酯-聚乙交酯、聚(原酸酯)和聚(酐)),弹性基质,脂质体,微球,油(例如玉米、胚芽、橄榄、蓖麻、芝麻、籽和花生),可可脂,蜡(例如栓剂蜡),石蜡酮,滑石,硅酸酯等。在与制剂的其他成分相容并且对受试者无害的意义上,用于本发明药物组合物中的每种药学可接受的稀释剂或载体必须是“可接受的”。适用于所选剂型和预期施用途径的稀释剂或载体是本领域众所周知的,并且用于所选剂型和施用方法的可接受的稀释剂或载体可以使用本领域的普通技术来确定。
[0264] 本发明的药物组合物可以任选地包含药物组合物中常用的其他成分和/或材料。这些成分和材料在本领域中是众所周知的,并且包括(1)填充剂或增量剂,例如淀粉、乳糖、蔗糖、葡萄糖、甘露醇和硅酸;(2)粘合剂,例如羧甲基纤维素、藻酸盐、明胶、聚乙烯吡咯烷酮、羟丙基甲基纤维素、蔗糖和阿拉伯胶;(3)保湿剂,如甘油;(4)崩解剂,例如琼脂、酸钙、马铃薯或木薯淀粉、海藻酸、某些硅酸盐、淀粉羟乙酸钠、交联的羧甲基纤维素钠和碳酸钠;(5)缓溶剂,如石蜡;(6)吸收促进剂,例如季铵化合物;(7)润湿剂,例如鲸蜡醇和单硬脂酸甘油酯;(8)吸收剂,例如高岭土膨润土;(9)润滑剂,例如滑石、硬脂酸钙、硬脂酸镁、固体聚乙二醇和月桂基硫酸钠;(10)悬浮剂,例如乙氧基化异硬脂醇、聚氧乙烯山梨糖醇和失水山梨醇酯、微晶纤维素、偏氢氧化、膨润土、琼脂和黄蓍胶;(11)缓冲剂;(12)赋形剂,例如乳糖、奶糖、聚乙二醇、动植物脂肪、油、蜡、石蜡、可可脂、淀粉、黄蓍胶、纤维素衍生物、聚乙二醇、硅酮、膨润土、硅酸、滑石、水杨酸盐、氧化锌、氢氧化铝、硅酸钙和聚酰胺粉;(13)惰性稀释剂,例如水或其他溶剂;(14)防腐剂;(15)表面活性剂;(16)分散剂;(17)控释或吸收延迟剂,例如羟丙基甲基纤维素、其他聚合物基质、生物可降解的聚合物、脂质体、微球、单硬脂酸铝、明胶和蜡;(18)遮光剂;(19)佐剂;(20)润湿剂;(21)乳化悬浮剂;(22)增溶剂和乳化剂,例如乙醇、异丙醇、碳酸乙酯、乙酸乙酯、苄醇、苯甲酸苄酯、丙二醇、1,3-丁二醇、油(尤其是棉籽、花生、玉米、胚芽、橄榄、蓖麻和芝麻油)、甘油、四氢呋喃醇、聚乙二醇和失水山梨醇的脂肪酸酯;(23)推进剂,例如氯氟和挥发性未取代的烃,例如丁烷和丙烷;(24)抗氧化剂;(25)使制剂与预期接受者的血液等渗的试剂,例如糖和氯化钠;(26)增稠剂
(27)包衣材料,例如卵磷脂;和(28)甜味剂调味剂着色剂、芳香剂和防腐剂。在与制剂的其他成分相容并且对受试者无害的意义上,每种这样的成分或材料必须是“可接受的”。适用于所选剂型和预期施用途径的成分和材料是本领域众所周知的,并且可以使用本领域普通技术来确定用于所选剂型和施用方法的可接受的成分和材料。
[0265] 适用于口服施用的本发明药物组合物可以是胶囊、扁囊剂、丸剂、片剂、粉末、颗粒、在水性或非水性液体中的溶液或悬浮液、水包油或油包水型液体乳剂、驰剂或糖浆、锭剂、大丸剂、舐剂或糊剂。这些制剂可以通过本领域已知的方法,例如通过常规的锅包衣、混合、制粒或冻干方法来制备。
[0266] 可以例如通过将一种或多种活性成分与一种或多种药学上可接受的稀释剂或载体以及任选地一种或多种填充剂、增量剂、粘合剂、保湿剂、崩解剂、溶液阻滞剂、吸收促进剂、润湿剂、吸收剂、润滑剂和/或着色剂混合来制备用于口服施用的固体剂型(胶囊、片剂、丸剂、糖衣丸、粉末、颗粒等)。可以使用合适的赋形剂将相似类型的固体组合物用作软和硬填充明胶胶囊中的填充剂。片剂可以任选地与一种或多种辅助成分一起通过压制或模制制成。可以使用合适的粘合剂、润滑剂、惰性稀释剂、防腐剂、崩解剂、表面活性剂或分散剂来制备压制的片剂。模制片剂可以通过在合适的机器中模制来制备。片剂和其他固体剂型,例如糖衣丸、胶囊、丸剂和颗粒,可以任选地用包衣和衣壳,例如肠溶衣和药物配制领域众所周知的其他包衣进行刻痕或制备。它们也可以被配制为提供其中的活性成分的缓慢或受控释放。它们可以例如通过保留细菌的过滤器的过滤来灭菌。这些组合物还可以任选地包含遮光剂,并且可以是这样的组合物,使得它们仅或优选地在胃肠道的特定部分中任选地以延迟的方式释放活性成分。活性成分也可以是微囊形式。
[0267] 用于口服施用的液体剂型包括药学上可接受的乳剂、微乳剂、溶液、悬浮剂液、糖浆和驰剂。液体剂型可包含本领域通常使用的合适的惰性稀释剂。除惰性稀释剂外,口服组合物还可包含佐剂,例如润湿剂、乳化和悬浮剂、甜味剂、调味剂、着色剂、芳香和防腐剂。悬浮液可以含有悬浮试剂。
[0268] 用于直肠或阴道施用的本发明药物组合物可以以栓剂形式存在,其可以通过将一种或多种活性成分与一种或多种合适的无刺激性稀释剂或载体混合来制备,所述无刺激性稀释剂或载体在室温下为固体,但在人体温度下为液体,并且因此会在直肠或阴道腔内融化并释放活性化合物。适用于阴道施用的本发明药物组合物还包括阴道栓、棉塞、乳膏、凝胶、糊剂、泡沫或喷雾制剂,其含有本领域已知合适的药学上可接受的稀释剂或载体。
[0269] 用于局部或透皮施用的剂型包括粉末、喷雾剂、软膏、糊剂、乳膏、洗剂、凝胶、溶液、贴剂、滴剂和吸入剂。活性剂/化合物可以在无菌条件下与合适的药学上可接受的稀释剂或载体混合。软膏、糊剂、乳膏和凝胶可以包含赋形剂。粉末和喷雾剂可以包含赋形剂和推进剂。
[0270] 适用于肠胃外施用的本发明药物组合物可包含一种或多种试剂/化合物与以下组合:一种或多种药学上可接受的无菌等渗水性或非水性溶液、分散液、悬浮液或乳液,或者可以就在使用前重构为无菌可注射溶液或分散液的无菌粉末,其可以包含合适的抗氧化剂、缓冲液、溶质(使制剂与预期接受者的血液等渗),或者悬浮剂或增稠剂。可以例如通过使用包衣材料,在分散液的情况下通过维持所需的粒径以及通过使用表面活性剂来维持适当的流动性。这些药物组合物还可包含合适的佐剂,例如润湿剂、乳化剂和分散剂。也可能需要包括等渗剂。另外,可通过包含延迟吸收的试剂来引起可注射药物形式的延长吸收。
[0271] 在某些情况下,为了延长药物(例如,药物制剂)的作用,需要减慢其从皮下或肌肉内注射的吸收。这可以通过使用水溶性差的结晶或无定形材料的液体悬浮液来实现。
[0272] 然后,活性剂/药物的吸收速率取决于其溶解速率,而溶解速率又取决于晶体尺寸和晶体形式。备选地,可以通过将活性剂/药物溶解或悬浮在油性媒介物中来实现肠胃外施用的试剂/药物的延迟吸收。可通过在生物可降解的聚合物中形成活性成分的微胶囊基质来制备可注射的贮库形式。取决于活性成分与聚合物的比例以及所使用的特定聚合物的性质,可以控制活性成分释放的速率。还可以通过将药物截留在与身体组织相容的脂质体或微乳剂中来制备可注射储库的制剂。可注射材料可以例如通过保留细菌的过滤器的过滤而进行灭菌。
[0273] 制剂可以存在于单位剂量或多剂量的密封的容器中,例如安瓿和小瓶,并且可以在冻干条件下储存,仅需要在使用前立即添加无菌液体稀释剂或载体,例如注射用水。临时注射溶液和悬浮液可以由上述类型的无菌粉末、颗粒和片剂制备。
[0274] 提供以下实施例以进一步示例说明本发明的方法。这些实施例仅是说明性的并无意以任何方式限制本发明的范围。
[0275] 实施例1
[0276] 以下实施例显示了BVD-523的实体瘤1b期试验的结果。图2中描绘的瀑布图提供了人类临床试验患者信息的图示,显示了每个个体患者对BVD-523治疗的应答,以肿瘤负担变化%进行测量。患者通常每天两次(BID)接受600mg,如果通过其他缓和医疗无法控制副作用,则某些患者接受降级剂量300mg–400mg BID。
[0277] 如图2所示,使用Response Evaluation Criteria in Solid Tumors 1.1版(RECIST v1.1),在28位可评估患者中评估对BVD-523的肿瘤应答。一名患者未同时接受两次靶病变扫描,因此未进行评估。图上的水平轴用作每个患者的基线测量。垂直轴是相对于基线的最大百分比变化的测量;即,根据RECIST v1.1通过放射学测量的肿瘤负担的生长或减少的百分比。放射学测量包括计算机断层扫描(CT)扫描并且极少数情况下包括磁共振成像(MRI)。
[0278] 由图2表示的肿瘤负荷数据从图左侧的最差值(即,肿瘤负荷的最大进展)到图右侧的最佳值(即,肿瘤负荷的最大减少)来排列。先前已描述了用于测量靶病变的RECIST v1.1应答标准。(参见Eisenhauer,E.A.等人,New response evaluation criteria in solid tumours:Revised RECIST guideline(version 1.1),European J.of Cancer 45,228-247(2009),通过引用整体并入本文)。应答标准如下:
[0279] 完全应答(CR)-所有靶病变的消失;
[0280] 部分应答(PR)-以基线总和直径为参考,靶病变的直径总和降低至少30%;如在图2中所示,用水平线指示部分应答的30%降低阈值。
[0281] 进展性疾病(PD)-以研究中的最小和(如果是研究中的最小值,包括基线总和)作为参考,靶病变的直径总和增加至少20%。除了相对增加20%外,总和还必须显示至少5mm的绝对增加(注意:一个或多个新病变的出现也被视为进展);
[0282] 稳定疾病(SD)–以研究时最小的总直径作为参考,既没有足够的收缩符合PR,也没有足够的增长符合PD。
[0283] 图2还显示了测量每位患者肿瘤负担的癌症或器官的类型,以及患者肿瘤样品中鉴定出的非典型BRAF突变的类型。在代表的28位患者中,有13位患者肿瘤包含BRAF D594突变(7位是D594G,6位是D594N);1位患者肿瘤包含BRAF F247L突变;1位患者肿瘤包括BRAF基因与核因子IC(NFIC)基因融合(即BRAF-NFIC融合突变);1位患者肿瘤包含BRAF G466V突变;5位患者肿瘤包含BRAF G469突变(1位是G469V,4位是G469A);3位患者肿瘤包含BRAF K601E突变;1位患者肿瘤包含BRAF L485W突变;3位患者肿瘤包含BRAF L597突变(一位不明确,2位是L597Q),并且2位患者肿瘤包含T599重复。对于每位患者,BRAF突变的类型通过颜色代码和癌症类型来指示(见图2)。
[0284] 五位PR患者的靶病变总数相对于基线减少了35%至100%。这些患者表现出:包含L485W突变的胆囊肿瘤;包含G469A突变的头/颈部鳞状细胞瘤;包含BRAF L597Q突变或BRAF T599复制的非小细胞肺癌;以及包含BRAF G469A突变的小肠肿瘤。19位患者表现出稳定的疾病。初次评估时三位患者表现出进展性疾病。(见图2)。因此,BVD-523治疗出人意料地导致了具有非典型(即非V600E/K)BRAF突变的28位患者中24位的部分应答或稳定疾病。
[0285] 图3显示了按组分类的游泳者图的治疗持续时间。第1组的成员是具有在除结肠直肠癌(CRC)和非小细胞肺癌(NSCLC)以外的任何肿瘤类型中的任何BRAF突变,并且先前未接受过MAPK途径抑制剂的治疗的任何患者。第2组的成员是具有在CRC中的任何BRAF突变,先前未接受过MAPK途径抑制剂的治疗的患者。第3组的成员是患有具有BRAF V600E/K突变的肿瘤,该肿瘤对MAPK抑制剂治疗无效的患者。第6组的成员是具有在NSCLC中存在的任何BRAF突变的患者。如图3所示,包括所有28位患者通过横线表示,每个受试者一个横线。从组的顶部(最长治疗持续时间)到底部(最短治疗持续时间)说明了每个组中每个受试者的治疗持续时间。水平轴表示患者在研究中的持续时间(天)。图3还显示了根据RECIST v1.1为每个患者实现的应答类型(菱形=部分应答;圆圈=稳定疾病;垂直线=进展性疾病;三角形=未评估)。
[0286] 图4显示了在因BRAF突变破坏的瀑布图中的治疗持续时间。包括所有根据RECIST v1.1应答标准测量的28位患者,以及未通过RECIST v1.1评估的其他患者(菱形=部分应答;圆圈=稳定疾病;竖线=进展性疾病;三角形=未评估)。对于携带相同BRAF突变的肿瘤,在中断之前BVD-523治疗的平均持续时间为:D594,73.6天;G469,208.14天;K601E,50.25天;L597,73.3天;T599 Dup,63.5天。对于代表特定BRAF突变的单个患者,治疗持续时间为:L485W,304天;F247L,84天;G466V,77天;BRAF融合,65天;BRAF-AGAP3重排,43天;BRAF外显子15剪接变体,15天。通过对癌症患者进行BRAF突变的基因组筛选,并在对这些突变(作为驱动突变)进行完整的体外表征之前对其进行治疗,BVD-523被证明可用于研究和发现携带BRAF中突变的患者的有效治疗选择。患者的临床人群和功效主要不是由肿瘤类型决定,而是由ERK 1/2激酶活化上游的酶如BRAF的突变状态决定。
[0287] 总之,所提供的实施例提供了来自新型ERK抑制剂BVD-523的实体瘤1b期试验的数据,用于治疗患有携带非典型BRAF突变的癌症的患者。连续的每天两次用BVD-523进行治疗在几位患者中产生抗肿瘤作用,并且不仅限于任何一种特定的癌症类型或非典型的BRAF突变。
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[0371] 该申请中引用的所有文件都通过引用并入本文,如同在此全文引用一样。
[0372] 尽管这里已经描述了本发明的示例说明性实施方案,但是应该理解本发明不限于所描述的实施方案,并且本领域技术人员可以在不背离本发明的范围或精神的情况下做出多种其他改变或修改
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