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取代的核苷和核苷酸类似物

阅读:852发布:2020-09-01

专利汇可以提供取代的核苷和核苷酸类似物专利检索,专利查询,专利分析的服务。并且本 发明 公开了具有受保护的 磷酸 酯的核苷酸类似物,合成具有受保护的磷酸酯的核苷酸类似物的方法以及利用具有受保护的磷酸酯的核苷酸类似物来 治疗 诸如 病毒感染 、癌症和/或寄生虫病等的 疾病 和/或疾病状态的方法。,下面是取代的核苷和核苷酸类似物专利的具体信息内容。

1.通式(II)化合物,或者其药物可接受的盐或前药:
其中每个 独立地为双键或单键;
A2选自C()、O()和S(硫);
B2为任选取代的杂环基或其衍生物
D2选自C=CH2、CH2、O(氧)、S(硫)、CHF和CF2;
R19选自氢、任选取代的烷基、任选取代的环烷基、任选取代的芳烷基、二烷基基亚烷基、烷基-C(=O)-、芳基-C(=O)-、氧基烷基-C(=O)-、芳氧基烷基-C(=O)-、烷基磺酰基、芳基磺酰基、芳烷基磺酰基、 -O-连接的氨基酸、二磷酸酯、三磷酸酯或其衍生物;
20 21
R 和R 独立地选自氢、任选取代的C1-6烷基、任选取代的C2-6烯基、任选取代的C2-6炔
20 21 20 21
基和任选取代的C1-6卤代烷基,前提是R 和R 中至少一个不为氢;或者R 和R 一起形成选自C3-6环烷基、C3-6环烯基、C3-6芳基和C3-6杂芳基的基团;
22 27 a2 a2 b2 a2 a2
R 和R 独立地选自氢、卤素、-NH2、-NHR 、NR R 、-OR 、-SR 、-CN、-NC、-N3、-NO2、-c2 a2 b2 c2 a2 a2 a2 a2 a2 b2
N(R )-NR R 、-N(R )-OR 、-S-SR 、-C(=O)R 、-C(=O)OR 、-C(=O)NR R 、-O-C(=a2 a2 b2 c2 a2 b2 a2 a2
O)OR 、-O-C(= O)NR R 、-N(R )-C( = O)NR R 、-S(= O)R 、S( =O)2R ,-O-S( =a2 b2 c2 a2 b2
O)2NR R ,-N(R )-S(=O)2NR R 、任选取代的C1-6烷基、任选取代的C2-6烯基、任选取代的C2-6炔基和-O-连接的氨基酸;
23 24 25 a2 a2 b2 a2 a2
R 、R 和R 独立地不存在或选自氢、卤素、-NH2、-NHR 、NR R 、-OR 、-SR 、-CN、-c2 a2 b2 c2 a2 a2 a2 a2
NC、-N3、-NO2、-N(R )-NR R 、-N(R )-OR 、-S-SR 、-C(=O)R 、-C(=O)OR 、-C(=O)a2 b2 a2 a2 a2 b2 c2 a2 b2
NR R 、-O-(C=O)R 、-O-C(=O)OR 、-O-C(=O) R 、-N(R )-C(=O)NR R 、-S(=O)a2 a2 a2 b2 c2 a2 b2
R 、S(=O)2R 、-O-S(=O)2NR R 、-N(R )-S(=O)2NR R 、任选取代的C1-6烷基、任选取
24 25
代的C2-6烯基、任选取代的C2-6炔基、任选取代的芳烷基和-O-连接的氨基酸;或者R 和R一起形成-O-C(=O)-O-;
26 a2 a2 b2 a2 a2
R 不存在或选自氢、卤素、-NH2、-NHR 、NR R 、-OR 、-SR 、-CN、-NC、-N3、-NO2、-N(c2 a2 b2 c2 a2 a2 a2 a2 a2 b2
R )-NR R 、-N(R )-OR 、-S-SR 、-C(=O)R 、-C(=O)OR 、-C(=O)NR R 、-O-C(=a2 a2 b2 c2 a2 b2 a2 a2
O)OR 、-O-C(= O)NR R 、-N(R )-C( = O)NR R 、-S(= O)R 、S( =O)2R 、-O-S( =a2 b2 c2 a2 b2
O)2NR R 、-N(R )-S(=O)2NR R 、任选取代的C1-6烷基、任选取代的C2-6烯基、任选取代的C2-6炔基、任选取代的卤代烷基、任选取代的羟基烷基和-O-连接的氨基酸,或者当由
25 25 26
表示的连接R 的键为双键时,则R 为C2-6亚烷基并且R 不存在;
a2 b2 c2
R 、R 和R 各自独立地选自氢、任选取代的烷基、任选取代的烯基、任选取代的炔基、任选取代的芳基、任选取代的杂芳基、任选取代的芳烷基和任选取代的杂芳基(C1-6烷基);
R28选自O-、-OH、任选取代的芳氧基或芳基-O-、 烷基-C(=
O)-O-CH2-O-、烷基-C(=O)-S-CH2CH2-O-和-N-连接的氨基酸;
29 -
R 选 自O、-OH、芳 氧 基 或芳 基-O-、 烷 基-C( =
O)-O-CH2-O-、烷基-C(=O)-S-CH2CH2-O-和-N-连接的氨基酸;
30 31
每个R 和每个R 独立地为-C≡N或任选取代的取代基,所述取代基选自C1-8有机基羰基、C1-8烃氧基羰基和C1-8有机基氨基羰基;
32
每个R 为氢或任选取代的C1-6烷基;
每个n独立地为1或2;并且
28 29 30 31 32
如果R 和R 都为 则每个R 、每个R 、每个R 和每个n能
够相同或不同。
2 2
2.如权利要求1所述的化合物,其中A 为C(碳),D 为O(氧),并且由 所示的
两个键都为单键。
22
3.如权利要求1至2中任一权利要求所述的化合物,其中R 选自氢、卤
a2
素、-OR 、-CN、-N3和任选取代的C1-6烷基;
23 a2
R 不存在或选自氢、卤素、-OR 和任选取代的C1-6烷基;
24 a2
R 不存在或选自氢、卤素、-NH2、-OR 、-N3、任选取代的C1-6烷基和-O-连接的氨基酸;
25 a2
R 选自氢、卤素、-OR ,、-CN、-NC、任选取代的C1-6烷基和-O-连接的氨基酸;以及
26
R 选自氢、卤素、任选取代的C1-6烷基、任选取代的卤代烷基、任选取代的羟基烷基。
25 26
4.如权利要求1至3中任一权利要求所述的化合物,其中R 和R 中至少一个为卤素。
25 26
5.如权利要求1至3中任一权利要求所述的化合物,其中R 和R 都为卤素。
27
6.如权利要求1至5中任一权利要求所述的化合物,其中R 选自氢、卤素和任选取代的C1-6烷基。
19
7.如权利要求1至6中任一权利要求所述的化合物,其中R 选自氢、单磷酸酯、二磷酸酯和三磷酸酯。
19
8.如权利要求1至6中任一权利要求所述的化合物,其中R 为
28 29
9. 如 权 利 要 求 8所 述 的 化 合 物,其 中R 和 R 中 至 少 一 个 为
30 31
10.如权利要求9所述的化合物,其中R 为-C≡N,并且R 为任选取代的C1-8烃氧基羰基或任选取代的C1-8有机基氨基羰基。
30 31
11.如权利要求9所述的化合物,其中R 和R 都为任选取代的C1-8有机基羰基或任选取代的C1-8烃氧基羰基。
30 31
12.如权利要求9所述的化合物,其中n为2,R 和R 都为任选取代的C1-8烃氧基羰
32
基,以及R 为任选取代的C1-6烷基。
13.如权利要求9至12中任一权利要求所述的化合物,其中
选自:
28 29
14.如权利要求8至13中任一权利要求所述的化合物,其中R 和R 中至少一个为
15.如权利要求8至13中任一权利要求所述的化合物,其中R28和R29中至少一个为-N-连接的氨基酸。
16.如权利要求15所述的化合物,其中所述-N-连接的氨基酸具有结构:
33
R 为氢或任选取代的C1-4烷基;
34
R 选自氢、任选取代的C1-6烷基、任选取代的芳基、任选取代的芳基(C1-6烷基)和任选取代的卤代烷基;
35
R 为氢或任选取代的C1-6烷基;以及
36
R 选自任选取代的C1-6烷基、任选取代的C6芳基、任选取代的C10芳基和任选取代的C3-6环烷基。
33 36
17.如权利要求16所述的化合物,其中R 为氢,以及R 为任选取代的C1-6烷基。
28 29
18.如权利要求16所述的化合物,其中R 和R 中至少一个为
28 29
19.如权利要求8所述的化合物,其中R 和R 都为 并且其
中每个R30、每个R31、每个R32和每个n能够相同或不同。
20.如权利要求8所述的化合物,其中R28和R29都为O。
21.如权利要求1至20中任一权利要求所述的化合物,其中R24和R25中至少一个为-ORa2或-O-连接的氨基酸,并且其中Ra2为氢。
22.如权利要求21所述的化合物,其中所述-O-连接的氨基酸选自丙氨酸、天冬酰胺、天冬氨酸、半胱氨酸、谷氨酸、谷氨酰胺、甘氨酸、脯氨酸、丝氨酸、酪氨酸、精氨酸、组氨酸、异亮氨酸、亮氨酸、赖氨酸、蛋氨酸、苯基丙氨酸、苏氨酸、色氨酸和缬氨酸。
23.如权利要求21所述的化合物,其中所述-O-连接的氨基酸选自-O-连接的α-氨基酸、-O-连接的β-氨基酸、-O-连接的γ-氨基酸和-O-连接的δ-氨基酸。
24.如权利要求1至23中任一权利要求所述的化合物,其中B2选自:
其中:
RA2为氢或卤素;
B2
R 为氢、任选取代的C1-6烷基或任选取代的C3-8环烷基;
C2
R 为氢或氨基;
D2
R 选自氢、卤素、任选取代的C1-6烷基、任选取代的C2-6烯基和任选取代的C2-6炔基;
E2
R 选自氢、卤素、任选取代的C1-6烷基、任选取代的C2-6烯基和任选取代的C2-6炔基;以及
2 F2 F2
Y 为N或CR ,其中R 能够选自氢、卤素、任选取代的C1-6烷基、任选取代的C2-6烯基和任选取代的C2-6炔基。
20 21
25.如权利要求1至24中任一权利要求所述的化合物,其中R 为甲基或CF3;并且R为氢。
26.如权利要求1所述的化合物,其中通式(II)化合物选自:
27.通式(I)化合物,或其药物可接受的盐或前药:
其中:
1
A 选自C(碳)、O(氧)和S(硫);
1
B 为任选取代的杂环碱基或其衍生物;
1
D 选自C=CH2、CH2、O(氧)、S(硫)、CHF和CF2;
1
R 选自氢、任选取代的烷基、任选取代的环烷基、任选取代的芳烷基、二烷基氨基亚烷基、烷基-C(=O)-、芳基-C(=O)-、烃氧基烷基-C(=O)-、芳氧基烷基-C(=O)-、烷基磺酰基、芳基磺酰基、芳烷基磺酰基、 -O-连接的氨基酸、二磷酸酯、三磷酸酯或其衍生物;
2 3
R 和R 各自独立地选自氢、任选取代的C1-6烷基、任选取代的C2-6烯基、任选取代的C2-6
2 3 2 3
炔基和任选取代的C1-6卤代烷基,前提是R 和R 中至少一个不为氢;或者R 和R 一起形成选自C3-6环烷基、C3-6环烯基、C3-6芳基和C3-6杂芳基的基团;
4 7 9 a1 a1 b1 a1 a1
R、R 和R 独立地选自氢、卤素、-NH2、-NHR 、NR R 、-OR 、-SR 、-CN、-NC、-N3、-NO2c1 a1 b1 c1 a1 a1 a1 a1 a1 b1
、-N(R )-NR R 、-N(R )-OR 、-S-SR 、-C(=O)R 、-C(=O)OR 、-C(=O)NR R 、-O-(Ca1 a1 a1 b1 c1 a1 b1 a1
=O)R 、-O-C(=O)OR 、-O-C(=O)NR R 、-N(R )-C(=O)NR R 、-S(=O)R 、S(=a1 a1 b1 c1 a1 b1
O)2R 、-O-S(=O)2NR R 、-N(R )-S(=O)2NR R 、任选取代的C1-6烷基、任选取代的C2-6烯基、任选取代的C2-6炔基、任选取代的芳烷基和-O-连接的氨基酸;
5 6 a1 a1 b1 a1 a1
R 和R 独立地不存在或选自氢、卤素、-NH2、-NHR 、NR R 、-OR 、-SR 、-CN、-NC、-N3、-Nc1 a1 b1 c1 a1 a1 a1 a1 a1 b1
O2、-N(R )-NR R 、-N(R )-OR 、-S-SR 、-C(=O)R 、-C(=O)OR 、-C(=O)NR R 、-O-C(=a1 a1 b1 c1 a1 b1 a1 a1
O)OR 、-O-C(= O)NR R 、-N(R )-C( = O)NR R 、-S(= O)R 、S( =O)2R 、-O-S( =a1 b1 c1 a1 b1
O)2NR R 、-N(R )-S(=O)2NR R 、任选取代的C1-6烷基、任选取代的C2-6烯基、任选取代的
6 7
C2-6炔基和-O-连接的氨基酸;或者R 和R 一起形成-O-C(=O)-O-;
8 a1
R 为卤素、-OR 、任选取代的C1-6烷基、任选取代的C2-6烯基、任选取代的C2-6炔基和任选取代的C1-6卤代烷基;
a1 b1 c1
R 、R 和R 各自独立地选自氢、任选取代的烷基、任选取代的烯基、任选取代的炔基、任选取代的芳基、任选取代的杂芳基、任选取代的芳烷基和任选取代的杂芳基(C1-6烷基);
10 -
R 选自O、-OH、任选取代的芳氧基或芳基-O-、 烷基-C(=
O)-O-CH2-O-、烷基-C(=O)-S-CH2CH2-O-和-N-连接的氨基酸;
R11选自O-、-OH、芳氧基或芳基-O-、 烷基-C(=O)-O-CH2-O-、
烷基-C(=O)-S-CH2CH2-O-和-N-连接的氨基酸;
每个R12和每个R13独立地为-C≡N或任选取代的取代基,所述取代基选自C1-8有机基羰基、C1-8烃氧基羰基和C1-8有机基氨基羰基;
每个R14为氢或任选取代的C1-6烷基;以及
每个m独立地为1或2;
10 11 12 13 14
并且如果R 和R 都为 则每个R 、每个R 、每个R 和每个m
能够相同或不同。
1 1
28.如权利要求27所述的化合物,其中A 为C(碳),以及D 为O(氧)。
4
29.如权利要求27至28中任一权利要求所述的化合物,其中R 选自氢、卤
a1
素、-OR 、-CN、-N3和任选取代的C1-6烷基;
5 a1
R 不存在或选自氢、卤素、-OR 和任选取代的C1-6烷基;
6 a1
R 不存在或选自氢、卤素、-NH2、-OR 、-N3、任选取代的C1-6烷基和-O-连接的氨基酸;
7 a1
R 选自氢、卤素、-OR 、-CN、-NC、任选取代的C1-6烷基和-O-连接的氨基酸;以及
9
R 选自氢、卤素和任选取代的C1-6烷基。
1
30.如权利要求27至29中任一权利要求所述的化合物,其中R 选自氢、单磷酸酯、二磷酸酯和三磷酸酯。
1
31.如权利要求27至29中任一权利要求所述的化合物,其中R 为
10 11
32.如权利要求31所述的化合物,其中R 和R 中至少一个为
12 13
33.如权利要求32所述的化合物,其中R 为-C≡N,并且R 为任选取代的C1-8烃氧基羰基或任选取代的C1-8有机基氨基羰基。
12 13
34.如权利要求32所述的化合物,其中R 和R 都为任选取代的C1-8有机基羰基或任选取代的C1-8烃氧基羰基。
12 13
35.如权利要求32所述的化合物,其中m为2,R 和R 都为任选取代的C1-8烃氧基羰
14
基,以及R 为任选取代的C1-6烷基。
36.如权利要求32至35中任一权利要求所述的化合物,其中 选
自:
10 11
37.如权利要求31至36中任一权利要求所述的化合物,其中R 和R 中至少一个为
38.如权利要求27至37中任一权利要求所述的化合物,其中所述-N-连接的氨基酸具有结构:
15
R 为氢或任选取代的C1-4烷基;
16
R 选自氢、任选取代的C1-6烷基、任选取代的芳基、任选取代的芳基(C1-6烷基)和任选取代的卤代烷基;
17
R 为氢或任选取代的C1-6烷基;以及
18
R 选自任选取代的C1-6烷基、任选取代的C6芳基、任选取代的C10芳基和任选取代的C3-6环烷基。
15 18
39.如权利要求38所述的化合物,其中R 为氢,以及R 为任选取代的C1-6烷基。
40.如权利要求38所述的化合物,其中R10和R11中至少一个为
41.如权利要求31所述的化合物,其中R10和R11都为 并且其中
12 13 14
每个R 、每个R 、每个R 和每个m能够相同或不同。
10 11
42.如权利要求31所述的化合物,其中R 和R 都为O。
6 7
43.如权利要求27至42中任一权利要求所述的化合物,其中R 和R 中至少一个a1 a1
为-OR 或-O-连接的氨基酸,并且其中R 为氢。
44.如权利要求43所述的化合物,其中所述-O-连接的氨基酸选自丙氨酸、天冬酰胺、天冬氨酸、半胱氨酸、谷氨酸、谷氨酰胺、甘氨酸、脯氨酸、丝氨酸、酪氨酸、精氨酸、组氨酸、异亮氨酸、亮氨酸、赖氨酸、蛋氨酸、苯基丙氨酸、苏氨酸、色氨酸和缬氨酸。
45.如权利要求43所述的化合物,其中所述-O-连接的氨基酸选自-O-连接的α-氨基酸、-O-连接的β-氨基酸、-O-连接的γ-氨基酸和-O-连接的δ-氨基酸。
1
46.如权利要求27至45中任一权利要求所述的化合物,其中B 选自:
其中:
A1
R 为氢或卤素;
B1
R 为氢、任选取代的C1-6烷基或任选取代的C3-8环烷基;
C1
R 为氢或氨基;
D1
R 选自氢、卤素、任选取代的C1-6烷基、任选取代的C2-6烯基和任选取代的C2-6炔基;
E1
R 选自氢、卤素、任选取代的C1-6烷基、任选取代的C2-6烯基和任选取代的C2-6炔基;以及
1 F1 F1
Y 为N或CR ,其中R 能够选自氢、卤素、任选取代的C1-6烷基、任选取代的C2-6烯基和任选取代的C2-6炔基。
2 3
47.如权利要求27至46中任一权利要求所述的化合物,其中R 为甲基或CF3;并且R为氢。
8
48.如权利要求27至47中任一权利要求所述的化合物,其中R 为甲基。
49.药物组合物,其包含权利要求1至48中任一权利要求所述的化合物,以及药物可接受的载体、稀释剂、赋形剂或其组合。
50.权利要求1至48中任一权利要求所述的化合物或权利要求49所述的药物组合物,所述化合物或药物组合物在治疗肿瘤疾病、病毒疾病或寄生虫病中的用途。
51.如权利要求50所述的化合物或组合物,其中所述用途为治疗癌症。
52.如权利要求50所述的化合物或组合物,其中所述用途为治疗白血病。
53.如权利要求50所述的化合物或组合物,其中所述用途为治疗病毒感染
54.如权利要求53所述的化合物或组合物,其中所述病毒感染是由选自以下病毒引起的:腺病毒、α病毒科、虫媒病毒、星状病毒、布尼亚病毒科、冠状病毒科、丝状病毒科、黄病毒科、嗜肝病DNA毒科、疱疹病毒科、α-疱疹病毒亚科、β-疱疹病毒亚科、γ-疱疹病毒亚科、诺沃克病毒、星状病毒科、杯状病毒科、正粘病毒科、副粘病毒科、副粘病毒、腮腺炎病毒、麻疹病毒、乳多空病毒科、细小病毒科、小RNA病毒科、疫病毒科,心脏病毒科、肠道病毒科、柯萨奇病毒、脊髓灰质炎病毒、鼻病毒科、藻DNA病毒科、痘病毒科、呼肠孤病毒科、轮状病毒,逆转录病毒科、A型逆转录病毒、免疫缺陷病毒、白血病病毒、禽类肉瘤病毒、弹状病毒、疹病毒科和披盖病毒科。
55.如权利要求53所述的化合物或组合物,其中所述用途为治疗丙型肝炎病毒感染或HIV病毒感染。
56.如权利要求50所述的化合物或组合物,其中所述用途为治疗寄生虫病。
57.如权利要求56所述的化合物或组合物,其中所述用途为治疗Chagas病。

说明书全文

取代的核苷和核苷酸类似物

背景技术

技术领域

[0001] 本发明涉及化学、生物化学和药学领域。更特别地,本发明公开了具有受保护的磷酸酯的核苷酸类似物,药物组合物和合成该核苷酸类似物的方法,所述组合物包含一种或多种具有受保护的磷酸酯的核苷酸类似物。本发明还公开了利用具有受保护的磷酸酯的核苷酸类似物治疗疾病和/或疾病条件的方法。
[0002] 相关技术描述
[0003] 核苷类似物是已经显示在体内和体外具有抗病毒和抗癌活性的一类化合物,并因此已经是广泛研究的用于治疗病毒感染和癌症的课题。核苷类似物治疗无活性的化合物,其通过宿主或病毒酶来转化成它们各自的活性抗代谢物,反过来,其抑制在病毒或细胞繁殖中参与聚合酶。通过诸如加入一个或多个磷酸酯基团或其与其它代谢过程组合等的各种机制发生活化。
[0004] 发明简述
[0005] 本发明公开的实施方案涉及通式(I)化合物,其药物可接受的盐、前药或前药酯。
[0006] 本发明公开的另一实施方案涉及通式(II)化合物,其药物可接受的盐、前药或前药酯。
[0007] 本发明公开的某些实施方案涉及合成通式(I)化合物的方法。
[0008] 本发明公开的其它实施方案涉及合成通式(II)化合物的方法。
[0009] 本发明公开的实施方案涉及药物组合物,所述药物组合物能够包含一种或多种通式(I)化合物和通式(II)化合物、药物可接受的载体、稀释剂、赋形剂或其组合。在制备用于治疗患有肿瘤疾病、病毒感染或寄生虫病的个体的药物中能够使用通式(I)化合物和通式(II)化合物的药物组合物。通式(I)化合物和通式(II)化合物的药物组合物能够用于治疗肿瘤疾病、病毒感染或寄生虫病。
[0010] 本发明公开的某些实施方案涉及改善或治疗肿瘤疾病的方法,所述方法能够包括向患有肿瘤疾病的个体给予治疗有效量的一种或多种通式(I)化合物和通式(II)化合物,或包含一种或多种通式(I)化合物和通式(II)化合物的药物组合物。在制备用于治疗患有肿瘤疾病的个体的药物中能够使用通式(I)化合物和通式(II)化合物。通式(I)化合物和通式(II)化合物能够用于治疗肿瘤疾病。
[0011] 本发明公开的其它实施方案涉及抑制肿瘤生长的方法,所述方法能够包括向患有肿瘤的个体给予治疗有效量的一种或多种通式(I)化合物和通式(II)化合物,或包含一种或多种通式(I)化合物和通式(II)化合物的药物组合物。
[0012] 本发明公开的其它实施方案还涉及改善或治疗病毒感染的方法,所述方法能够包括向患有病毒感染的个体给予治疗有效量的一种或多种通式(I)化合物和通式(II)化合物,或包含一种或多种通式(I)化合物和通式(II)化合物的药物组合物。在制备用于治疗患有病毒感染的个体的药物中能够使用通式(I)化合物和通式(II)化合物。通式(I)化合物和通式(II)化合物能够用于治疗病毒感染。
[0013] 本发明公开的其它实施方案还涉及改善或治疗寄生虫病的方法,所述方法能够包括向患有寄生虫病的个体给予治疗有效量的一种或多种通式(I)化合物和通式(II)化合物,或包含一种或多种通式(I)化合物和通式(II)化合物的药物组合物。在制备用于治疗患有寄生虫病的个体的药物中能够使用通式(I)化合物和通式(II)化合物。通式(I)化合物和通式(II)化合物能够用于治疗寄生虫病。附图说明
[0014] 图1显示用于制备2’,5’-二甲基核苷和核苷酸的方法,其中基为尿嘧啶或嘌呤。
[0015] 图2显示用于制备2’,5’-二甲基核苷和核苷酸,其中碱基为胞嘧啶、尿嘧啶、腺嘌呤或鸟嘌呤。
[0016] 图3显示用于制备2’,5’-二甲基-腺苷磷酸酯的方法。
[0017] 发明详述
[0018] 除非另有说明,本文所使用的技术和科学术语与本领域技术人员所通常理解的意思相同。除非另有说明,所有专利申请、公开申请和其它出版物整体并入本文作为参考。如果本文中的术语具有多种定义,除非另有说明,以本节中的为准。
[0019] 没有限制,本文所述使用的诸如R1、R1a和R1等的“R”基团表示能够与所指出的原子连接的取代基。R基团非限制性的实例包括但不限于氢、烷基、烯基、炔基、环烷基、环烯基、环炔基、芳基、杂芳基、杂脂环基、芳烷基、杂芳烷基、(杂脂环基)烷基、羟基、受保护的羟基、基、芳氧基、酰基、酯、巯基、氰基、卤素、硫代羰基、O-基甲酰基、N-氨基甲酰基、O-硫代氨基甲酰基、N-硫代氨基甲酰基、C-酰胺基、N-酰胺基、S-磺酰胺基、N-磺酰胺基、C-羧基、受保护的C-羧基、O-羧基、异氰酸基、硫氰酸基、异硫氰酸基、硝基、甲烷基、烃硫基、亚硫酰基、磺酰基、卤代烷基、卤代烃氧基、三卤甲烷磺酰基、三卤甲烷磺酰胺基和氨基,其包括单取代的氨基和双取代的氨基,以及上述基团的受保护的衍生物。R基团可以被取代或不被取代。如果两个“R”基团与相同的原子或相邻的原子共价连接,则它们可以如本文所定义的合在一起形成环烷基、环烯基、环炔基、芳基、杂芳基或杂脂环基。例如,没有限制,如果NR’R”基团中的R’和R”指明是合在一起的,其是指它们在它们的末端原子处互相共价结合形成包含氮的环:
[0020]
[0021] 当基团被描述成“任选取代”时,则该基团可被一个或多个所指出的取代基取代或不取代。同样,当基团被描述成“未取代或取代”,如果取代,则取代基选自一个或多个所指出的取代基。如果没有指出取代基,则是指所指出的“任选取代的”或“取代的”基团可以被一个或多个选自以下的基团各自地并独立地取代:烷基、烯基、炔基、环烷基、环烯基、环炔基、芳基、杂芳基、杂脂环基、芳烷基、杂芳烷基、(杂脂环基)烷基、羟基、受保护的羟基、烃氧基、芳氧基、酰基、酯、巯基、烷硫基、芳硫基、氰基、卤素、硫代羰基、O-氨基甲酰基、N-氨基甲酰基、O-硫代氨基甲酰基、N-硫代氨基甲酰基、C-酰胺基、N-酰胺基、S-磺酰胺基、N-磺酰胺基、C-羧基、受保护的C-羧基、O-羧基、异氰酸基、硫氰酸基、异硫氰酸基、硝基、甲硅烷基、烃硫基、亚硫酰基、磺酰基、卤代烷基、卤代烃氧基、三卤甲烷磺酰基、三卤甲烷磺酰胺基、氨基,其包括单取代的氨基和双取代的氨基,以及上述基团的受保护的衍生物。这些取代基中的每个取代基还能够被进一步取代。
[0022] 如本文所使用的“Ca至Cb”(其中“a”和“b”为整数)是指烷基、烯基或炔基中的原子数,或者是指环烷基、环烯基、环炔基、芳基、杂芳基或杂脂环基的环中的碳原子数。也就是说,烷基、烯基、炔基、环烷基的环、环烯基的环、环炔基的环、芳基的环、杂芳基的环和杂脂环基的环能够含有“a”至“b”(包括界限)个碳原子。因此,例如,“C1至C4烷基”是指所有1至4个碳的烷基,即CH3-、CH3CH2-、CH3CH2CH2-、(CH3)2CH-、CH3CH2CH2CH2-、CH3CH2CH(CH3)-和(CH3)3C-。如果对于烷基、烯基、炔基、环烷基、环烯基、环炔基、芳基、杂芳基或杂脂环基没有指定“a”和“b”,则假定其是这些定义中最大的范围。
[0023] 如本文所使用的“烷基”是指直链或支链的烃链,其包含完全饱和(不含双键或三键)的烃基。烷基可具有1至20个碳原子(当其在本文中出现时,例如“1至20”的数字范围是指所给定范围的每个整数,例如“1至20个碳原子”是指烷基可由1个碳原子、2个碳原子、3个碳原子等直至并包括20个碳原子组成,尽管该定义也覆盖了其中术语“烷基”没有指定数字范围的情况)。烷基可为中等尺寸的具有1至10个碳原子的烷基。烷基也可为具有1至6个碳原子的低级烷基。化合物的烷基可指定为“C1-C6烷基”或类似的指定。仅举例说明,“C1-C4烷基”表示烷基链中具有1至4个碳原子,即烷基链选自甲基、乙基、丙基、异丙基、正丁基、异丁基、仲丁基和叔丁基。仅举例说明,“C1-C6烷基”是指烷基链中具有1至6个碳原子。典型的烷基包括但不限于甲基、乙基、丙基、异丙基、丁基、异丁基、叔丁基、戊基、己基等。烷基可被取代或不被取代。
[0024] 如本文所使用的“烯基”是指在直链或支链烃链中含有一个或多个双键的烷基。烯基可被取代或不被取代。
[0025] 如本文所使用的“炔基”是指在直链或支链烃链中含有一个或多个三键的烷基。炔基可被取代或不被取代。
[0026] 如本文所使用的“环烷基”是指完全饱和(没有双键和三键)的单环或多环烃还体系。当其由两个以上的环组成时,所述环可以稠合的方式连接在一起。环烷基能够在环中含有3至10个原子或3至8个原子。环烷基可被取代或不被取代。典型的环烷基包括但不限于环丙基、环丁基、环戊基、环己基等。
[0027] 如本文所使用的“环烯基”是指单环或多环烃环体系,其在至少一个环中包含一个或多个双键;如果存在多于一个环,则双键不能遍及所有的环形成完全离域的π电子体系(否则该基团将是本文所定义的“芳基”)。当其由两个环组成时,所述环可以稠合的方式连接在一起。环烯基可不被取代或被取代。
[0028] 如本文所使用的“环炔基”是指单环或多环烃环体系,其在至少一个包含一个或多个三键。如果存在多于一个三键,该三键不能遍及所有的环形成完全离域的π电子体系。当有两个以上的环组成时,所述环可以以稠合的方式连接在一起。环炔基可不被取代或被取代。
[0029] 如本文所使用的“芳基”是指碳(所有的碳)的单环或多环的芳环体系(包括,其中两个碳环共享一个化学键的稠合体系),所述体系遍及所有的环具有完全离域的π电子体系。芳基中的碳原子数能够变化。例如,芳基能够是C6-C14芳基,C6-C10芳基或C6芳基。芳基的实例包括但不限于苯、和甘菊环。芳基可以被取代或不被取代。
[0030] 如本文所使用的“杂芳基”是指单环或多环芳环体系(具有完全离域的π电子体系的环体系),其含有一个或多个杂原子,即除碳以外的元素包括但不限于氮、氧和硫。杂芳基环中的原子数能够变化。例如,杂芳基在环中能够含有4至14个碳原子。此外,术语“杂芳基”包括稠合环体系,其中,诸如至少一个芳环和至少一个杂芳环或者两个杂芳环等的两个环分享至少一个化学键。杂芳环的实例包括但不限于呋喃、呋咱、噻吩、苯并噻吩、呔嗪、吡咯、噁唑、苯并唑、1,2,3-噁二唑、1,2,4-噁二唑、噻唑、1,2,3-噻二唑、1,2,4-噻二唑、苯并噻唑、咪唑、苯并咪唑、吲哚、吲唑、吡唑、苯并吡唑、异噁唑、苯并异噁唑、异噻唑、三唑、苯并三唑、噻二唑、四唑、吡啶、哒嗪、嘧啶、呲嗪、嘌呤、蝶啶、喹啉、异喹啉、喹唑啉、喹喔啉、噌啉和三嗪。杂芳基可被取代或不被取代。
[0031] 如本文所使用的“杂脂环”或“杂脂环基”是指三元、四元、五元、六元、七元、八元、九元、十元和最高至18元的单环、双环和三环体系,其中碳原子与1至5个杂原子一起构成所述环体系。杂环可任选含有一个或多个不饱和键,然而所述不饱和键处于的方式使遍及所有的环没有发生完全离域的π电子体系。杂原子独立地选自氧、硫和氮。杂环可还含有一个或多个羰基或者硫代羰基功能性,从而使该定义包括氧代体系和硫代体系,例如内酰胺、内酯、环状亚胺、环状硫代亚胺、环状氨基甲酸酯等。当由两个以上的环组成时,所述环可以稠合的方式连接在一起。此外,杂脂环中的任意氮可被季铵化。杂脂环基或杂脂环基团可不被取代或被取代。这样的“杂脂环”或“杂脂环基”的实例包括但不限于1,3-二氧芑、1,3-二噁烷、1,4-二噁烷、1,2-二氧戊环、1,3-二氧戊环、1,4-二氧戊环、1,3-氧硫杂环己烯、1,4-氧硫杂环己二烯、1,3-氧硫杂环戊烷、1,3-二硫杂环戊二烯、1,3-二硫戊环、1,4-氧硫杂环己烯、四氢-1,4-噻嗪、2H-1,2-噁嗪、来酰亚胺、琥珀酰亚胺、巴比妥酸、硫代巴比妥酸、二氧代哌嗪、乙内酰脲、二氢尿嘧啶、三噁烷、六氢-1,3,5-三嗪、咪唑啉、咪唑烷、异噁唑啉、异噁唑烷、噁唑啉、噁唑烷、噁唑烷、噻唑啉、噻唑烷、吗啉、氧杂环丙烷、哌啶N-氧化物、哌啶、哌嗪、吡咯烷、吡咯烷酮、吡咯烷酮(pyrrolidione)、4-哌啶酮、吡唑啉、吡唑烷、2-氧代吡咯烷、四氢吡喃、4H-吡喃、四氢硫代吡喃、硫代吗啉、硫代吗啉亚砜、硫代吗啉砜以及它们的苯并稠合类似物(例如苯并咪唑烷酮、四氢喹啉、3,4-亚甲二氧基苯基)。
[0032] 芳烷基”为通过低级亚烷基连接的作为取代基的芳基。芳烷基中的低级亚烷基和芳基可以被取代或不被取代。实例包括但不限于苄基、取代的苄基、2-苯基烷基、3-苯基烷基和萘基烷基。
[0033] “杂芳烷基”是通过低级亚烷基连接的作为取代基的杂芳基。杂芳烷基中的低级亚烷基和杂芳基可以被取代或不被取代。实例包括但不限于2-噻吩基烷基、3-噻吩基烷基、呋喃基烷基、噻吩基烷基、吡咯基烷基、吡啶基烷基、异噁唑基烷基和咪唑基烷基,以及它们的取代的和苯并稠合的类似物。
[0034] “(杂脂环基)烷基”是通过低级亚烷基连接的作为取代基的杂环基或杂脂环基。(杂脂环基)烷基中的低级亚烷基和杂环或杂环基可以被取代或不被取代。实例包括但不限于四氢-2H-吡喃-4-基)甲基、(哌啶-4-基)乙基、(哌啶-4-基)丙基、(四氢-2H-硫代吡喃-4-基)甲基和(1,3-噻嗪-4-基)甲基。
[0035] “低级亚烷基”是直链的连接基团,其通过它们末端碳原子形成键来连接分子碎片。实例包括但不限于亚甲基(-CH2-)、亚乙基(-CH2CH2-)、亚丙基(-CH2CH2CH2-)和亚丁基(-CH2CH2CH2CH2-)。低级亚烷基可被取代或不被取代。
[0036] 如本文所使用的“烃氧基”是指通式-OR,其中R为如上文所定义的烷基、烯基、炔基、环烷基、环烯基、环炔基、芳基、杂芳基、杂脂环基、芳烷基或(杂脂环基)烷基。实例包括甲氧基、乙氧基、正丙氧基、1-甲基乙氧基(异丙氧基)、正丁氧基、异丁氧基、仲丁氧基、叔丁氧基、苯氧基等。烃氧基可被取代或不被取代。
[0037] 如本文所使用的“酰基”是指通过羰基连接的作为取代基的氢、烷基、烯基、炔基或芳基。实例包括甲酰基、乙酰基、丙酰基、苯甲酰基和丙烯酰基。酰基可被取代或不被取代。
[0038] 如本文所使用的“羟基烷基”是指其中一个或多个氢原子被羟基代替的烷基。羟基烷基的实例包括但不限于2-羟基乙基、3-羟基丙基、2-羟基丙基和2,2-二羟基乙基。羟基烷基可被取代或不被取代。
[0039] 如本文所使用的“卤代烷基”是指其中一个或多个氢原子被卤素代替的烷基(例如单卤代烷基、二卤代烷基和三卤代烷基)。这样的基团包括但不限于氯甲基、氟甲基、二氟甲基、三氟甲基和1-氯-2-氟甲基、2-氟异丁基。卤代烷基可被取代或不被取代。
[0040] 如本文所使用的“卤代烃氧基”是指其中一个或多个氢原子被卤素代替的烃氧基(例如单卤代烃氧基、二卤代烃氧基和三卤代烃氧基)。这样的基团包括但不限于氯甲氧基、氟甲氧基、二氟甲氧基、三氟甲氧基和1-氯-2-氟甲氧基、2-氟异丁氧基。卤代烃氧基可被取代或不被取代。
[0041] “烃硫基”是指“-SR”基团,其中R能够为氢、烷基、烯基、炔基、环烷基、环烯基、环炔基、芳基、杂芳基、杂脂环基、芳烷基或(杂脂环基)烷基。烃硫基可被取代或不被取代。
[0042] “亚硫酰基”是指“-S(=O)-R”,其中R与烃硫基中所定义的R基团相同。亚硫酰基可被取代或不被取代。
[0043] “磺酰基”是指“SO2R”基团,其中R与烃硫基中所定义的R基团相同。磺酰基可被取代或不被取代。
[0044] “O-羧基”是指“RC(=O)O-”基团,其中R能够为如本文所定义的氢、烷基、烯基、炔基、环烷基、环烯基、环炔基、芳基、杂芳基、杂脂环基、芳烷基或(杂脂环基)烷基。O-羧基可被取代或不被取代。
[0045] 术语“酯”和“C-羧基”是指“-C(=O)OR”基团,其中R能够与O-羧基中所定义的R基团相同。酯和C-羧基可被取代或不被取代。
[0046] “硫代羰基”是指“-C(=S)R”基团,其中R能够与O-羧基中所定义的R基团相同。硫代羰基可被取代或不被取代。
[0047] “三卤甲烷磺酰基”是指“X3CSO2-”基团,其中X为卤素。
[0048] “三卤甲烷磺酰胺基”是指“X3CS(O)2RN-”基团,其中X为卤素并且R与O-羧基中所定义的R基团相同。
[0049] 如本文所使用的术语“氨基”是指-NH2基团。
[0050] 如本文所使用的术语“羟基”是指-OH基团。
[0051] “氰基”是指“-CN”基团。
[0052] 如本文所使用的术语“叠氮基”是指-N3基团。
[0053] “异氰酸基”是指“-NCO”基团。
[0054] “硫氰酸基”是指“-CNS”基团。
[0055] “异硫氰酸基”是指“-NCS”基团。
[0056] “巯基”是指“-SH”基团。
[0057] “羰基”是指C=O基团。
[0058] “S-磺酰胺基”是指“-SO2NRARB”基团,其中RA和RB能够与O-羧基中所定义的R相同。S-磺酰胺基可被取代或不被取代。
[0059] “N-磺酰胺基”是指“RBSO2N(RA)-”基团,其中RA和RB能够与O-羧基中所定义的R相同。N-磺酰胺基可被取代或不被取代。
[0060] “O-氨基甲酰基”是指“-OC(=O)NRARB”基团,其中RA和RB能够与O-羧基中所定义的R相同。O-氨基甲酰基可被取代或不被取代。
[0061] “N-氨基甲酰基”是指“RBOC(=O)NRA-”基团,其中RA和RB能够与O-羧基中所定义的R相同。N-氨基甲酰基可被取代或不被取代。
[0062] “O-硫代氨基甲酰基”是指“-OC(=S)-NRARB”基团,其中RA和RB能够与O-羧基中所定义的R相同。O-硫代氨基甲酰基可被取代或不被取代。
[0063] “N-硫代氨基甲酰基”是指“RBOC(=S)NRA-”基团,其中RA和RB能够与O-羧基中所定义的R相同。N-硫代氨基甲酰基可被取代或不被取代。
[0064] “C-酰胺基”是指“-C(=O)NRARB”基团,其中RA和RB能够与O-羧基中所定义的R相同。C-酰胺基可被取代或不被取代。
[0065] “N-酰胺基”是指“RBC(=O)NRA-”基团,其中RA和RB能够与O-羧基中所定义的R相同。N-酰胺基可被取代或不被取代。
[0066] 如本文所使用的“有机基羰基”是指通式-C(=O)R’的基团,其中R’能够为烷基、烯基、炔基、环烷基、环烯基、环炔基、芳基、杂芳基、杂脂环基、芳烷基或(杂脂环基)烷基。有机基羰基能够被取代或不被取代。
[0067] 如本文所使用的术语“烃氧基羰基”是指通式-C(=O)OR’的基团,其中R’能够与关于有机基羰基所定义的R’相同。烃氧基羰基能够被取代或不被取代。
[0068] 如本文所使用的“有机基氨基羰基”是指通式C(=O)NR’R”的基团,其中R’和R”能够各自独立地选自与关于有机基羰基所定义的取代基相同的取代基。有机基氨基羰基能够被取代或不被取代。
[0069] 如本文所使用的术语“菊芋糖基(levulinoyl)”是指-C(=O)CH2CH2C(=O)CH3基团。
[0070] 如本文所使用的术语“卤原子”是指元素周期表中第七周期的任一放射性稳定的原子,例如氟、氯、溴或碘,其中氟和氯是优选的。
[0071] 当取代基的数目不确定时(例如卤代烷基),可存在一个或多个取代基。例如“卤代烷基”可包含一个或多个相同或不同的卤素。另一实例,“C1-C3烃氧基苯基”可包含一个或多个相同或不同的含有一个、两个或三个原子的烃氧基。
[0072] 如本文所使用的术语“核苷”是指由连接至诸如嘌呤的9位和嘧啶的1位等的杂环碱基、其互变异构体或其衍生物的具体位置或杂环碱基衍生物的等同位置的任意戊糖或改性的戊糖部分组成的化合物。实例包括但不限于包含核糖部分的核糖核苷和包含脱氧核糖部分的脱氧核糖核苷。例如核苷能够为核苷药物类似物。
[0073] 如本文所使用的术语“核苷药物类似物”是指由具有治疗活性的核苷组成的化合物,所述治疗活性例如抗病毒活性、抗肿瘤活性、抗寄生虫活性和/或抗菌活性。
[0074] 如本文所使用的术语“核苷酸”是指具有在核苷衍生物的5’-位或等同位置取代的磷酸酯的核苷。
[0075] 如本文所使用的术语“杂环碱基”是指嘌呤、嘧啶以及其衍生物。术语“嘌呤”是指取代的嘌呤,其互变异构体和其类似物。相似地,术语“嘧啶”是指取代的嘧啶、其互变异构体和其类似物。嘌呤的实例包括但不限于嘌呤、腺嘌呤、鸟嘌呤、次黄嘌呤、黄嘌呤、可可碱、咖啡因、尿酸和异鸟嘌呤。嘧啶的实例包括但不限于胞嘧啶、胸腺嘧啶、尿嘧啶及其衍生物。嘌呤类似物的实例为1,2,4-三氮唑-3-甲酰胺。
[0076] 杂环碱基的其它无限制的实例包括二氨基嘌呤、8-氧代-N6-甲基腺嘌呤、7-脱4 4 6 6
氮黄嘌呤、7-脱氮鸟嘌呤、N,N-ethanocytosin、N,N-ethano-2,6-二氨基嘌呤、5-甲基胞嘧啶、5-氟尿嘧啶、5-溴尿嘧啶、假异胞嘧啶、异胞嘧啶、异鸟嘌呤和其它在美国专利第
5,432,272号和第7,125,855号中所述的杂环碱基,所述专利通过引用引入本文,用于公开另外的杂环碱基的限制性目的。
[0077] 术语“-O-连接的氨基酸”是指通过其主链羧基官能团连接至所示部分的氨基酸。当将氨基酸连接时,作为羧基官能团的-OH区段的部分的氢不存在并且通过剩余的氧来连接氨基酸。-O-连接的氨基酸能够在存在于氨基酸酸上任意氮基团处被保护。例如,-O-连接的氨基酸能够含有酰胺基团或氨基甲酸酯基团。合适的氨基酸保护基团包括但不限于苄氧羰基(Cbz)、对甲氧基苄基羰基(Moz或MeOZ)、叔丁基氧基羰基(BOC)、9-芴甲氧羰基(FMOC)、苄基(Bn)、对甲氧基苄基(PMB)、3,4-二甲氧基苄基(DMPM)以及甲苯磺酰基(Ts)。
术语“-N-连接的氨基酸”是指指通过其主链氨基或单取代的氨基连接至所示部分的氨基酸。当将氨基酸连接在-N-连接的氨基酸中时,作为主链氨基或单取代的氨基的部分的氢之一不存在并且通过氮连接氨基酸。-N-连接的氨基酸能够在存在于氨基酸中的任意羟基或羧基处被保护。合适的氨基酸保护基团包括但不限于甲酯、乙酯、丙酯、苄酯、叔丁酯、甲硅烷基酯、原酸酯和噁唑啉。如本文所使用的术语“氨基酸”是指任意的氨基酸(标准的氨基酸和非标准的氨基酸),其包括但不限于α-氨基酸、β-氨基酸、γ-氨基酸和δ-氨基酸。合适的氨基酸的实例包括但不限于丙氨酸、天冬酰胺、天冬氨酸、半胱氨酸、谷氨酸、谷氨酰胺、甘氨酸、脯氨酸、丝氨酸、酪氨酸、精氨酸、组氨酸、异亮氨酸、亮氨酸、赖氨酸、蛋氨酸、苯基丙氨酸、苏氨酸、色氨酸和缬氨酸。
[0078] 术语“衍生物”、“变体”或其它类似的术语是指是其它化合物的类似物的化合物。
[0079] 本文所使用的术语“保护基团”是指为了避免分子中存在的基团经历不期望的化学反应而加入至分子上的任意原子或原子基团。保护基团部分的实例描述在T.W Greene and P.G.M.Wuts,有机合成中的保护基团(Protective Groups in Organic Synthesis),3.Ed.John Wiley & Sons(1999)和J.F.W.McOmie,有机化学中的保护基团(Protective Groups in Organic Chemistry)Plenum Press(1973)中。两篇文献通过引用引入本文,用于公开合适的保护基团的限制性目的。可以以下方式来选择保护基团:它们对特定的反应条件是稳定的并且使用本领域已知的技术在方便的阶段容易被除去。保护基团的非限制性列表包括苄基;取代的苄基;烷基羰基(例如叔丁氧基羰基(BOC));芳基烷基羰基(例如苄基氧基羰基、苯甲酰基);取代的甲醚(例如甲氧基甲醚);取代的乙醚;取代的苄醚;四氢吡喃基醚;甲硅烷基醚(例如三甲基甲硅烷基、三乙基甲硅烷基、三异丙基甲硅烷基、叔丁基二甲基甲硅烷基或叔丁基二苯基甲硅烷基);酯(例如安息香酸酯);碳酸酯(例如甲氧基甲基碳酸酯);磺酸酯(例如甲苯磺酸酯、甲磺酸酯);脂肪族缩酮(例如二甲基缩);
环状缩酮(例如1,3-二噁烷或1,3-二氧戊环);脂肪族缩醛;环状缩醛;脂肪族半缩醛;环状半缩醛以及环状二硫代缩酮(例如1,3-二噻烷或1,3-二噻茂烷)。
[0080] 本文所使用的“离去基团”是指在化学反应中能够被另一原子代替的任意原子或部分。更具体地,在某些实施方案中,“离去基团”是指在亲核取代反应中被代替的原子或部分。在某些实施方案中,“离去基团”任意原子或部分,其为强酸的结合碱。合适的离去基团的实例包括但不限于甲苯磺酸酯和卤素。例如在有机化学(Organic Chemistry),2d ed,Francis Carey(1992),328-331,有机化学(Introduction to Organic Chemistry),第2版,Andrew Streitwieser and Clayton Heathcock(1981),169-171页;和有机化学(Organic Chemistry),第5版,John McMurry(2000),398和408页中能够发现离去基团的非限制性特性和实例,上述文献通过引用并入本文,用于公开离去基团的特性和实例的限制性目的。
[0081] 除非另有说明,本文所使用的用于保护基团、氨基酸和其它化合物的缩写与它们通常的习惯、公认的缩写或IUPAC-IUB生物化学系统命名委员会的缩写一致(参见Biochem.1972 11:942-944)。
[0082] “前药”是指体内转化成母药的药剂。在某些情况下,前药经常是有用的,这是由于它们可比母药更容易进行给药。例如它们通过口服给药可以是生物可利用的,而母药不是。相对于母药,前药在药物组合物中也可以具有改善的溶解性。前药的实例包括具有一个或多个连接至母药(例如通式I化合物和/或通式II化合物)的生物不稳定的基团的化合物。例如,能够将一个或多个生物不稳定的基团连接至母药的官能团(例如,将一个或多个生物不稳定的基团连接至磷酸酯)。当连接多于一个基团时,能够将生物不稳定能够连接(例如通过共价键)至氧或杂原子,所述杂原子例如单磷酸酯、二磷酸酯、三磷酸酯和/或含有碳、氮或硫的稳定的磷酸酯类似物(在下文中称作“磷酸酯”)中的磷。例如,如果通过将一个或多个基团连接至磷酸酯来形成前药,则生物不稳定的基团在主体中的除去产生磷酸酯。形成前药的生物不稳定基团的除去能够通过各种方法完成,所述方法包括但不限于氧化、还原、氨基化、脱氨基化、羟基化、脱羟基化、解、脱水、烷基化、脱烷基化、酰基化、脱酰基、磷酸化、脱磷酸化、水化和/或脱水。没有限制,前药的实例为作为酯(所述“前药”)给药的化合物,从而容易通过其中水溶解性对流动性不利的细胞膜进行传送,但是一旦在其中水溶解性对流动性有利的细胞内部,则代谢水解成羧酸-活性实体。前药的另一实例可包含连接至酸基团的短肽(聚氨基酸),其中肽被代谢或裂解从而显现出活性部分。前药部* * * *
分的另一实例包括以下部分:R、RC(=O)OCH2-、RC(=O)SCH2CH2-、RC(=O)SCHR’NH-、苯基-O-、N-连接的氨基酸、O-连接的氨基酸、肽、碳水化合物、脂质,其中每个R能够独立地选自烷基、烯基、炔基、芳基、芳烷基、酰基、磺酸酯、脂质、-N-连接的氨基酸、-O-连接的氨基酸,肽和胆固醇。前药可为碳酸酯。碳酸酯能够为环状碳酸酯。环状碳酸酯能够包含处于两个羟基之间的羰基从而形成五元或六元环。例如,在前药的设计(Design of Prodrugs)(由H.Bundgaard,Elsevier编辑,1985)中描述了合适的前药衍生物的选择和制备的常规步骤,该文献通过引用并入本文用于记载合适的前药衍生物的步骤和制备的限制目的。
[0083] 术语“前药酯”是指通过添加任意的某些在生理条件下水解的形成酯的基团所形成的本文所公开的化合物的衍生物。前药酯基团的实例包括特戊酰氧基甲基、乙酰氧基甲基、2-苯并[C]呋喃酮亚基、茚满基和甲氧基甲基,以及本领域已知的其它基团,包括(5-R-2-氧代-1,3-二氧杂环戊烯-4-基)甲基。例如,在T.Higuchi and V.Stella,“作为新型递送系统的前药(Pro-drugs as Novel Delivery Systems)”,Vol.14,A.C.S.Symposium Series,American Chemical Society(1975)和“药物设计中的生物可逆的载体:理论和应用(Bioreversible Carriers in Drug Design:Theory and Application)”,由E.B.Roche编辑,Pergamon Press:New York,14-21(1987)(提供用作含有羧基的化合物的前药酯的实例)能够发现前药酯的其它实例。上述参考文献各自通过引用并入本文用于公开能够形成前药酯的形成酯的基团的限制目的。
[0084] 术语“药物可接受的盐”是指化合物的盐,所述化合物的盐对将其给予的生物体不会产生明显的刺激并且不会消除化合物的生物活性和性质。在某些实施方案中,所述盐为化合物的酸加成盐。能够通过将化合物与无机酸反应来获得药物盐,所述无机酸例如氢卤酸、(例如盐酸氢溴酸)、硫酸硝酸、磷酸等。也能够通过将化合物与有机酸反应来获得药物盐,所述有机酸例如脂肪族羧酸或芳香族羧酸,或者脂肪族磺酸或芳香族磺酸,例如乙酸、琥珀酸、乳酸、苹果酸、酒石酸柠檬酸抗坏血酸、烟酸、甲磺酸、乙磺酸、对甲苯磺酸、水杨酸或萘磺酸。还能够通过将化合物与碱反应以形成盐来获得药物盐,所述盐例如铵盐;诸如钠盐或盐等的碱金属盐;诸如盐或镁盐等的碱土金属盐;有机碱的盐,所述有机碱例如二环己胺、N-甲基-D-葡糖胺、三(羟基甲基)甲胺、C1-C7烷基胺、环己胺、三乙醇胺、乙二胺;和与氨基酸的盐,所述氨基酸例如精氨酸、赖氨酸等。
[0085] 应理解的是,在本文所述的具有一个或多个手性中心的任意化合物中,如果没有明确指出绝对的立体化学,则每个中心可独立地为R构型或S构型或其化合物。因此,本文所提供的化合物可为光学纯(enantiomerically pure)或为立体异构体的混合物。此外,应理解的是,在本文所述的具有一个或多个的生成能够定义为E或Z的几何异构体双键的任意化合物中,每个双键可独立地为E或Z或其混合物。类似地,也旨在包括所有互变异构形式。
[0086] 本文所公开的实施方案涉及通式(I)化合物,或其药物可接受的盐或前药:
[0087]
[0088] 其中:A1能够选自C(碳)、O(氧)和S(硫);B1能够为任选取代的杂环碱基或其1 1
衍生物;D 能够选自C=CH2、CH2、O(氧)、S(硫)、CHF和CF2;R 能够为氢、任选取代的烷基、任选取代的环烷基、任选取代的芳烷基、二烷基氨基亚烷基、烷基-C(=O)-、芳基-C(=O)-、烃氧基烷基-C(=O)-、芳氧基烷基-C(=O)-、烷基磺酰基、芳基磺酰基、芳烷基磺酰基、 -O-连接的氨基酸、二磷酸酯、三磷酸酯或其衍生物;
[0089] R2和R3能够各自独立地选自氢、任选取代的C1-6烷基、任选取代的C2-6烯基、任选2 3 2
取代的C2-6炔基和任选取代的C1-6卤代烷基,前提是R 和R 中的至少一个不为氢;或者R
3 4 7 9
和R 一起形成选自C3-6环烷基、C3-6环烯基、C3-6芳基和C3-6杂芳基的基团;R、R 和R 能a1 a1 b1 a1 a1 c1 a1 b1
够独立地选自氢、卤素、-NH2、-NHR 、NR R 、-OR 、-SR 、-CN、-NC、-N3、-NO2、-N(R )-NR R 、c1 a1 a1 a1 a1 a1 b1 a1
-N(R )-OR 、-S-SR 、-C(=O)R 、-C(=O)OR 、-C(=O)NR R 、-O-(C=O)R 、-O-C(=a1 a1 b1 c1 a1 b1 a1 a1
O)OR 、-O-C(= O)NR R 、-N(R )-C( = O)NR R 、-S(= O)R 、S( =O)2R 、-O-S( =a1 b1 c1 a1 b1
O)2NR R 、-N(R )-S(=O)2NR R 、任选取代的C1-6烷基、任选取代的C2-6烯基、任选取代
5 6
的C2-6炔基、任选取代的芳烷基和-O-连接的氨基酸;R 和R 能够独立地不存在或者独立a1 a1 b1 a1 a1 c1 a1 b1
地选自氢、卤素、-NH2、-NHR 、NR R 、-OR 、-SR 、-CN、-NC、-N3、-NO2、-N(R )-NR R 、-N(Rc1 a1 a1 a1 a1 a1 b1 a1
)-OR 、-S-SR 、-C(=O)R 、-C(=O)OR 、-C(=O)NR R 、-O-C(=O)OR 、-O-C(=O)a1 b1 c1 a1 b1 a1 a1 a1 b1 c1
NR R 、-N(R )-C(=O)NR R 、-S(=O)R 、S(=O)2R 、-O-S(=O)2NR R 、-N(R )-S(=a1 b1
O)2NR R 、任选取代的C1-6烷基、任选取代的C2-6烯基、任选取代的C2-6炔基和-O-连接的氨
6 7 8 a1
基酸;或者R 和R 一起形成-O-C(=O)-O-;R 能够为卤素、-OR 、任选取代的C1-6烷基、任a1 b1 c1
选取代的C2-6烯基、任选取代的C2-6炔基和任选取代的C1-6卤代烷基;R 、R 和R 能够各自独立地选自氢、任选取代的烷基、任选取代的烯基、任选取代的炔基、任选取代的芳基、任
10 -
选取代的杂芳基、任选取代的芳烷基和任选取代的杂芳基(C1-6烷基);R 能够选自O、-OH、任选取代的芳氧基或芳基-O-、 烷基-C(=O)-O-CH2-O-、烷基-C(=
11 -
O)-S-CH2CH2-O-和-N-连接的氨基酸;R 能够选自O、-OH、任选取代的芳氧基或芳基-O-、烷基-C(=O)-O-CH2-O-、烷基-C(=O)-S-CH2CH2-O-和-N-连接的氨
12 13
基酸,每个R 和每个R 能够独立地为-C≡N或任选取代的取代基,所述取代基选自C1-8
14
有机基羰基、C1-8烃氧基羰基和C1-8有机基氨基羰基;每个R 能够为氢或任选取代的C1-6烷
10 11 12
基;每个m能够独立地为1或2,并且如果R 和R 均为 每个R 、每个
R13、每个R14和每个m能够相同或不同。
[0090] 在实施方案中,m能够为1。在另一实施方案中,m能够为2。在某些实施方案中,A1能够为碳。在某些实施方案中,D1能够为氧。在实施方案中,A1能够为碳并且D1能够为氧。在其它实施方案中,A1能够为碳,D1能够为氧并且m能够为1。在实施方案中,A1能够为碳,D1能够为氧和m能够为2。
[0091] 在某些实施方案中,所述任选取代的C1-6烷基能够选自甲基、乙基、正丙基、异丙基、正丁基、异丁基、叔丁基、戊基和己基。在实施方案中,所述任选取代的C1-6烷基能够为2 3 2 8
甲基。在实施方案中,R 能够为甲基并且R 能够为氢。在某些实施方案中,R 和R 能够均为甲基。在某些实施方案中,所述任选取代的C1-6烃氧基能够选自甲氧基、乙氧基、正丙氧基、异丙氧基、正丁氧基、异丁氧基和叔丁氧基。在实施方案中,所述任选取代的C1-6卤代烷
2 3
基能够为三氟甲基。在某些实施方案中,R 能够为三氟甲基并且R 能够为氢。在某些实施
2 8
方案中,R 能够为三氟甲基并且R 能够甲基。
[0092] 在某些实施方案中,通式(I)化合物能够为核苷或核苷衍生物。在实施方案中,R1能够为氢。在某些实施方案中,通式(I)化合物能够为核苷酸或核苷酸衍生物。在实施方1 1 1
案中,R 能够为单磷酸酯。在另一实施方案中,R 能够为二磷酸酯。在另一实施方案中,R能够为三磷酸酯。
[0093] 在另一实施方案中,R1能够为 当R1为 时,R10和R11能-
够均为O。在某些实施方案中,为了易于进入细胞内,能够用合适的部分来抵消
核苷酸或核苷酸衍生物的磷酸酯上的电荷。在某些实施方案中,所述部分能够为
-O-萘酚和/或诸如本文所公开的那些-N-连接的
氨基酸。
10 11
[0094] 在某些实施方案中,R 和R 中的至少一个能够为12 13
上的取代基能够变化。在某些实施方案中,R 能够为-C≡N并且R
能够为诸如-C(=O)OCH3等的任选取代的C1-8烃氧基羰基。在其它实施方案中,R12能够为-C≡N并且R13能够为任选取代的C1-8有机基氨基羰基,例如-C(=O)NHCH2CH3和-C(=O)NHCH2CH2苯基。在其它实施方案中,R12和R13能够均为任选取代的C1-8有机基羰基。在实施方案中,R12和R13能够均为-C(=O)CH3。在其它实施方案中,R12和R13能够为任选取代的C1-8烃氧基羰基。在实施方案中,R12和R13能够均为C(=O)OCH3或C(=O)OCH2CH3。在实施方案中,R12和R13能为任选取代的C1-8烃氧基羰基,例如-C(=O)OCH2CH3,并且m能够为2。在某些实施方案,包括本段的这些实施方案中,R14能够为任选取代的C1-6-烷基。在实施方案,包括本段的这些实施方案中,R14能够为甲基或叔丁基。
[0095] 合适的 的实例包括但不限于以下基团:
[0096]
[0097] 在实施方案中,R10和/或R11能够为
[0098] 在另一实施方案中,R10和/或R11能够为
[0099] 在另一实施方案中,R10和/或R11能够为
[0100] 在另一实施方案中,R10和/或R11能够为
[0101] 在一实施方案中,R10和/或R11能够为
[0102] 在某些实施方案中,R10和R11能够均为 其中每个R12、每13 14 10 11
个R 、每个R 和每个m能够相同或不同。在某些实施方案中,当R 和R 能够均为
10 11 10 11
时,R 和R 能够相同。在其它实施方案中,当R 和R 能够均为
10 11
时,R 和R 能够不同。
[0103] 在实施方案中,R10和R11中的至少一个能够为-N-连接的氨基酸。各种不同的氨基酸能被用作R10或R11的取代基。在某些实施方案中,R10或R11能够具有结构15 16
其中:R 能够为氢或任选取代的C1-4烷基;R 能够选自氢、任选取代的C1-6烷基、任选取代
17
的芳基、任选取代的芳基(C1-6烷基)和卤代烷基;R 能够为氢或任选取代的C1-6烷基;并
18
且R 能够选自任选取代的C1-6烷基、任选取代的C6芳基、任选取代的C10芳基和任选取代
15 16
的C3-6环烷基。在实施方案中,R 能够为氢。在某些实施方案中,R 能够为任选取代的C1-6
17
烷基,例如甲基。在实施方案中,R 能够为氢或任选取代的C1-6烷基,例如甲基。在某些实
18 18
施方案中,R 能够为任选取代的C1-6烷基。在实施方案中,R 能够为甲基。
[0104] 合适的 的一实例包括但不限于 在某些实施方案中,氨基酸能够处于L构型。在其它实施方案中,氨基酸能够处于D构型。例如, 能够为
例如 能够在本文所公开的实施方案中使用的另外合适的氨基酸
描述在Cahard et al.,药物化学中的小综述(Mini-Reviews in Medicinal Chemistry),
2004,4:371-381和McGuigan et al.,J.Med.Chem.,2008,51(18):5807-5812中,所述文献通过引用并入本文用于描述另外合适的氨基酸的限制性目的。
10 11
[0105] 在某些实施方案中,R 和R 中的至少一个能够为-N-连接的氨基酸,例如本文10 11 10
所描述的那些,并且R 和R 中的另一个能够为 在其它实施方案中,R
11 10 11
和R 中的至少一个能够为-N-连接的氨基酸,例如本文所描述的那些,并且R 和R 中
10 11
的另一个能够为 在某些实施方案中,R 和R 中的至少一个能够为
10 10 11
在实施方案中,R 能够为 在某些实施方案中,R 和R
10
中的至少一个能够为-N-连接的氨基酸。在实施方案中,R 能够为 并且
R11能够为-N-连接的氨基酸。在另一实施方案中,当R11为-N-连接的氨基酸时,R10不能为
1 1
[0106] 取代基B 也能够变化。在某些实施方案中,B 能够选自:
[0107]A1 B1
[0108] 其中,R 能够为氢或卤素;R 能够为氢、任选取代的C1-6烷基或任选取代的C3-8C1 D1环烷基;R 能够为氢或氨基;R 能够为氢、卤素、任选取代的C1-6烷基、任选取代的C2-6烯E1
基和任选取代的C2-6炔基;R 能够为氢、卤素、任选取代的C1-6烷基、任选取代的C2-6烯
1 F1 F1
基和任选取代的C2-6炔基;并且Y 能够为N(氮)或CR ,其中R 能够选自氢、卤素、任选取代的C1-6烷基、任选取代的C2-6烯基和任选取代的C2-6炔基。在某些实施方案中,B1能够为 在其它实施方案中,B1能够为 在其它实施方案
1 E 1
中,B 能够为 在实施方案中,R 能够为氢。在其它实施方案中,B 能够为
1 A1 B1
在实施方案中,Y 能够为氮;R 能够为氢并且R 能够为氢。在另一实施
1 F1 F1
方案中,Y 能够为CR ,其中R 能够选自氢、卤素、任选取代的C1-6烷基、任选取代的C2-6烯A1 B1 1
基和任选取代的C2-6炔基;R 能够为氢并且R 能够为氢。当B 为上文所示的任意的前述
1 1
部分时,在某些实施方案中,A 能够为碳。在实施方案中,B 能够为上文所示的任意的前述
1 1
部分,A 能够为碳并且D 能够为氧。
[0109] 在某些实施方案中,R4能够选自氢、卤素、-ORa1、-CN、-N3和任选取代的C1-6烷基。5 a1
在某些实施方案中,R 能够不存在或选自氢、卤素、-OR 和任选取代的C1-6烷基。在某些实
6 a1
施方案中,R 能够不存在或选自氢、卤素、-NH2、-OR 、-N3、任选取代的C1-6烷基和-O-连接的
7 a1
氨基酸。在某些实施方案中,R 能够不存在或选自氢、卤素、-OR 、-CN、-NC、任选取代的C1-6
6 a1 a1
烷基和-O-连接的氨基酸。在实施方案中,R 能够为-OR 、其中R 为氢。在另一实施方案
6 7 a1 a1
中,R 能够为-O-连接的氨基酸。在某些实施方案中,R 能够为-OR ,其中R 为氢。在其
7 7
它实施方案中,R 能够为C1-6烃氧基,例如甲氧基。在其它实施方案中,R 能够为-O-连接
6 7 7
的氨基酸。在某些实施方案中,R 和R 能够为羟基。在其它实施方案中,R 能够为羟基并
6
且R 能够为-O-连接的氨基酸。合适的-O-连接的氨基酸的非限制性举例包括但不限于以下的氨基酸:丙氨酸、天冬酰胺、天冬氨酸、半胱氨酸、谷氨酸、谷氨酰胺、甘氨酸、脯氨酸、丝氨酸、酪氨酸、精氨酸、组氨酸、异亮氨酸、亮氨酸、赖氨酸、蛋氨酸、苯基丙氨酸、苏氨酸、色氨酸和缬氨酸。在实施方案中,所述-O-连接的氨基酸能够为缬氨酸。在某些实施方案中。
所述-O-连接的氨基酸能够选自-O-连接的α-氨基酸、-O-连接的β-氨基酸、-O-连接的γ-氨基酸和-O-连接的δ-氨基酸。在实施方案中,所述-O-连接的氨基酸能够处于
9
L构型。在某些实施方案中,R 能够选自氢、卤素和任选取代的C1-6烷基。
[0110] 在某些实施方案中,通式(I)化合物能够为抗肿瘤剂。在其它实施方案中,通式(I)化合物能够为抗病毒剂。在其它实施方案中,通式(I)化合物能够为抗寄生虫剂。
[0111] 本文所公开的实施方案涉及通式(II)化合物,或者其药物可接受的盐或前药:
[0112]
[0113] 其中每个 能够独立地为双键或单键;A2能够选自C(碳)、O(氧)和S(硫);B2能够为任选取代的杂环碱基或其衍生物;D2能够选自C=CH2、CH2、O(氧)、S(硫)、CHF和CF2;R19能够为氢、任选取代的烷基、任选取代的环烷基、任选取代的芳烷基、二烷基氨基亚烷基、烷基-C(=O)-芳基-C(=O)-、烃氧基烷基-C(=O)-、芳氧基烷基-C(=O)-、烷基磺酰基、芳基磺酰基、芳烷基磺酰基、 -O-连接的氨基酸、二磷酸酯、三磷酸酯
20 21
或其衍生物;R 和R 能够各自独立地选自氢、任选取代的C1-6烷基、任选取代的C2-6烯基、
20 21
任选取代的C2-6炔基和任选取代的C1-6卤代烷基,前提是R 和R 中的至少一个不为氢;或
20 21 22 27
者R 和R 一起形成选自C3-6环烷基、C3-6环烯基、C3-6芳基和C3-6杂芳基的基团;R 和Ra2 a2 b2 a2 a2 c2 a2 b2
独立地选自氢、卤素、-NH2、-NHR 、NR R 、-OR 、-SR 、-CN、-NC、-N3、-NO2、-N(R )-NR R 、-Nc2 a2 a2 a2 a2 a2 b2 a2
(R )-OR 、-S-SR 、-C(=O)R 、-C(=O)OR 、-C(=O)NR R 、-O-C(=O)OR 、-O-C(=O)a2 b2 c2 a2 b2 a2 a2 a2 b2 c2
NR R 、-N(R )-C(=O)NR R 、-S(=O)R 、S(=O)2R 、-O-S(=O)2NR R 、-N(R )-S(=a2 b2
O)2NR R 、任选取代的C1-6烷基、任选取代的C2-6烯基、任选取代的C2-6炔基和-O-连接的氨
23 24 25 a2 a2 b2 a2 a2
基酸;R 、R 和R 能够独立地不存在或选自氢、卤素、-NH2、-NHR 、NR R 、-OR 、-SR 、-Cc2 a2 b2 c2 a2 a2 a2 a2
N、-NC、-N3、-NO2、-N(R )-NR R 、-N(R )-OR 、-S-SR 、-C(=O)R 、-C(=O)OR 、-C(=O)a2 b2 a2 a2 a2 b2 c2 a2 b2
NR R 、-O-C(=O)R 、-O-C(=O)OR 、-O-C(=O)NR R 、-N(R )-C(=O)NR R 、-S(=a2 a2 a2 b2 c2 a2 b2
O)R 、S(=O)2R 、-O-S(=O)2NR R 、-N(R )-S(=O)2NR R 、任选取代的C1-6烷基、任选
24
取代的C2-6烯基、任选取代的C2-6炔基、任选取代的芳烷基和-O-连接的氨基酸;或者R 和
25 26 a2 a2 b2 a2
R 一起形成-O-C(=O)-O-;R 能够不存在或选自氢、卤素、-NH2、-NHR 、NR R 、-OR 、-SRa2 c2 a2 b2 c2 a2 a2 a2 a2
、-CN、-NC、-N3、-NO2、-N(R )-NR R 、-N(R )-OR 、-S-SR 、-C(=O)R 、-C(=O)OR 、-C(=a2 b2 a2 a2 b2 c2 a2 b2 a2
O)NR R 、-O-C(=O)OR 、-O-C(=O)NR R 、-N(R )-C(=O)NR R 、-S(=O)R 、S(=a2 a2 b2 c2 a2 b2
O)2R 、-O-S(=O)2NR R 、-N(R )-S(=O)2NR R 、任选取代的C1-6烷基、任选取代的C2-6烯基、任选取代的C2-6炔基、任选取代的卤代烷基、任选取代的羟基烷基和-O-连接的氨基
25 25 26 a2
酸,或者当 所示的连接至R 的键是双键时,则R 为C2-6亚烷基并且R 不存在;R 、b2 c2
R 和R 能够各自独立地选自氢、任选取代的烷基、任选取代的烯基、任选取代的炔基、任选取代的芳基、任选取代的杂芳基、任选取代的芳烷基和任选取代的杂芳基(C1-6烷基);
[0114] R28能够选自O-、-OH、任选取代的芳基氧基或芳基-O-、烷基-C(=O)-O-CH2-O-、烷基-C(=O)-S-CH2CH2-O-和-N-连接的氨基酸;R29能够选自O-、-OH、任选取代的芳氧基或芳基-O-、 烷基-C(=O)-O-CH2-O-、烷
基-C(=O)-S-CH2CH2-O-和-N-连接的氨基酸;每个R30和每个R31能够独立地为-C≡N或任选取代的取代基,该取代基选自C1-8有机基羰基、C1-8烃氧基羰基和C1-8有机基氨基羰基;
每个R32能够为氢或任选取代的C1-6烷基;并且每个n能够独立地为1或2,并且如果R28和
29 30 31 32
R 均为 则每个R 、每个R 、每个R 和每个n能够相同或不同。
[0115] 在实施方案中,n能够为1。在另一实施方案中,n能够为2。在某些实施方案中,2 2
A 能够为碳。在某些实施方案中,D 能够为氧。在实施方案中,每个 能够为单键。在
2 2 2
实施方案中,A 能够为碳,D 能够为氧并且每个 能够为单键。在其它实施方案中,A 能
2 2
够为碳,D 能够为氧,每个 能够为单键并且n能够为1。在实施方案中,A 能够为碳,
2
D 能够为氧,每个 能够为单键并且n能够为2。
[0116] 在某些实施方案中,所述任选取代的C1-6烷基能够选自甲基、乙基、正丙基、异丙基、正丁基、异丁基、叔丁基、戊基和己基。在实施方案中,所述任选取代的C1-6烷基能够为20 21
甲基。例如,在实施方案中,R 能够为甲基并且R 能够为氢。在某些实施方案中,所述任选取代的C1-6烃氧基能够选自甲氧基、乙氧基、正丙氧基、异丙氧基、正丁氧基、异丁氧基和叔丁氧基。在某些实施方案中,所述任选取代的C1-6卤代烷基能够为三氟甲基。在实施方
20 21
案中,R 能够为三氟甲基并且R 能够为氢。
[0117] 在某些实施方案中,通式(II)化合物能够为核苷或核苷衍生物。在实施方案中,19
R 能够为氢。在某些实施方案中,通式(II)化合物能够为核苷酸或核苷酸衍生物。在
19 19
实施方案中,R 能够为单磷酸酯。在另一实施方案中,R 能够为二磷酸酯。在另一实施
19 19 19
方案中,R 能够为三磷酸酯。在另一实施方案中,R 能够为 当R 为
28 29 -
R 和R 能够均为O。在某些实施方案中,抵消核苷酸或核苷酸衍生物的磷酸酯的电荷可
28 29
促进核苷酸和核苷酸类似物进入细胞中。在某些实施方案中,R 和R 能够各自独立地为 -O-萘酚和/或-N-连接的氨基酸。在某
28 29 28
些实施方案中,R 和R 中的至少一个能够为 在实施方案中,R 能够为
28 29
在某些实施方案中,R 和R 中的至少一个能够为-N-连接的氨基酸。在
28 29
实施方案中,R 能够为 并且R 能够为-N-连接的氨基酸,例如本文所公开
28 29
的那些。在另一实施方案中,当R 为 时,R 不能为-N-连接的氨基酸。
28 29
[0118] 在 实 施 方 案 中,R 和R 中 的 至 少 一 个 能 够 为30 31
上的取代基能够变化。在某些实施方案中,R 能够为-C≡N并且R 能
够为任选取代的C1-8烃氧基羰基,例如-C(=O)OCH3。在其它实施方案中,R30能够为-C≡N并且R31能够为任选取代的C1-8有机基氨基羰基,例如-C(=O)NHCH2CH3和-C(=O)NHCH2CH2苯基。在其它实施方案中,R30和R31能够均为任选取代的C1-8有机基羰基。在实施方案中,R30和R31能够均为-C(=O)CH3。在其它实施方案中,R30和R31能够均为任选取代的C1-8烃氧基羰基。在实施方案中,R30和R31能够均为-C(=O)OCH3或-C(=O)OCH2CH3。在实施方案中,R30和R31能够均为任选取代的C1-8烃氧基羰基,例如-C(=O)OCH2CH3,并且n能够为
2。在某些实施方案,包括本段中的那些实施方案中,R32能够为任选取代的C1-6烷基。在实施方案,包括本段中的那些实施方案中R32能够为甲基或叔丁基。 基
团的实例包括但不限于以下基团:
[0119]
[0120] 在实施方案中,R28和R29中的至少一个能够为 在另一28 29 28
实施方案中,R 和R 中的至少一个能够为 在另一实施方案中,R
29 28 29
和R 中的至少一个能够为 在另一实施方案中,R 和R 中的
28 29
至少一个能够为 在某些实施方案中,R 和R 中的至少一个能
28 29
够为 在某些实施方案中,R 和R 能够均为
30 31 32 28
其中每个R 、每个R 、每个R 和每个n能够相同或不同。在实施方案中,当R 和
29 28 29 28 29
R 为 R 和R 能够相同。在另一实施方案中,当R 和R 为
R28和R29能够不同。
[0121] 在某些实施方案中,R28和R29中的至少一个能够为-N-连接的氨基酸。合适的氨基酸包括本文所公开的那些。在某些实施方案中,-N-连接的氨基酸能够具有结构33 34
其中:R 能够为氢或任选取代的C1-4烷基;R 能够选自氢、任选取代的C1-6烷
基、任选取代的芳基、任选取代的芳基(C1-6烷基)和任选取代的卤代烷基;R35能够为氢或任选取代的C1-6烷基;并且R36能够选自任选取代的C1-6烷基、任选取代的C6芳基、任选取代的C10芳基和任选取代的C3-6环烷基。在实施方案中,R33能够为氢。在某些实施方案中,R34能够为任选取代的C1-6烷基,例如甲基。在实施方案中,R35能够为氢或任选取代的C1-6烷基。
在实施方案中,R35能够为甲基。在某些实施方案中,R36能够为任选取代的C1-6烷基。
[0122] 合适的-N-连接的氨基酸的一实例为 在某些实施方案中,氨基酸能够处于L构型。在其它实施方案中,氨基酸能够处于D构型。例如, 能够为
例如
[0123] 各种任选取代的杂环碱基和任选取代的杂环碱基衍生物能够存在于通式(II)化合物中。合适的任选取代的杂环碱基和任选取代的杂环碱基衍生物的实例显示如下。
[0124]A2 B2
[0125] 其中:R 能够为氢或卤素;R 能够为氢、任选取代的C1-6烷基或任选取代的C3-8环C2 D2烷基;R 能够为氢或氨基;R 能够为氢、卤素、任选取代的C1-6烷基、任选取代的C2-6烯基和E2
任选取代的C2-6炔基;R 能够为氢、卤素、任选取代的C1-6烷基、任选取代的C2-6烯基和任选
2 F2 F2
取代的C2-6炔基;并且Y 能够为N(氮)或CR ,其中R 能够选自氢、卤素、任选取代的C1-6烷
2
基、任选取代的C2-6烯基和任选取代的C2-6炔基。在某些实施方案中,B 能够为
2 2
在其它实施方案中,B 能够为 在其它实施方案中,B 能够为 在其
2 2 A2 B2
它实施方案中,B 能够为 在实施方案中,Y 能够为氮;R 能够为氢并且R
2 F2 F2
能够为氢。在另一实施方案中,Y 能够为CR ,其中R 能够选自氢、卤素、任选取代的C1-6A2 B2
烷基、任选取代的C2-6烯基和任选取代的C2-6炔基;R 能够为氢并且R 能够为氢。在某些
2 2 2
实施方案中,当B 为上文所示的任意前述部分时,A 能够为碳。在实施方案中,B 能够为上
2 2 2
文所示的任意前述部分,A 能够为碳并且D 能够为氧。在某些实施方案中,B 能够为上文
2 2
所示的任意前述部分,A 能够为碳,D 能够为氧并且每个 能够为单键。
22 a2
[0126] 在某些实施方案中,R 能够选自氢、卤素、-OR 、-CN、-N3和任选取代的C1-6烷基。23 a2
在某些实施方案中,R 能够不存在或选自氢、卤素、-OR 和任选取代的C1-6烷基。在某些实
24 a2
施方案中,R 能够不存在或选自氢、卤素、-NH2、-OR 、-N3、任选取代的C1-6烷基和-O-连接
24 a2 a2 24
的氨基酸。在某些实施方案中,R 能够为-OR ,其中R 为氢。在其它实施方案中,R 能
25 a2
够为-O-连接的氨基酸。在某些实施方案中,R 能够选自氢、卤素、-OR 、-CN、-NC、任选取
25 a2 a2
代的C1-6烷基和-O-连接的氨基酸。在某些实施方案中,R 能够为-OR ,其中R 为氢。在
25 25
其它实施方案中,R 能够为C1-6烃氧基,例如甲氧基。在其它实施方案中,R 能够为-O-连
24 25 25
接的氨基酸。在某些实施方案中,R 和R 能够均为羟基。在其它实施方案中,R 能够为
24
羟基并且R 能够为-O-连接的氨基酸。合适的-O-连接的氨基酸如本文所述。在某些实
26
施方案中,R 能够选自氢、卤素、任选取代的C1-6烷基、任选取代的卤代烷基、任选取代的羟
25 25 26
基烷基,并且由 所示的连接至R 的键为双键,R 为C2-6烯基并且R 不存在。在某些
27
实施方案中,R 能够选自氢、卤素和任选取代的C1-6烷基。
[0127] 在某些实施方案中,R25和R26中的至少一个能够为卤素。在其它实施方案中,R2526
和R 能够均为卤素。
[0128] 通式(II)化合物的实例显示如下。
[0129]
[0130] 在某些实施方案中,B1和B2不能为任选取代的吡啶基、任选取代的三环杂环基、任选取代的哌嗪基、任选取代的吡咯并嘧啶酮、用脒取代的三唑、任选取代的吡啶并嘧啶。在1 2
某些实施方案中,B 和B 不能是连接至1’-位的在以下文献中所公开的任意部分:美国申请2006-0229265(于2006年3月30日提交)、2005-0203044(于2005年1月25日提交)
和2007-0258921(于2007年4月30日提交);美国专利7,268,119(于2007年2月14日
提交)、6,815,542(于2002年12月13日提交)、6,495,677(于2000年6月16日提交)、
7,081,449(于2001年7月3日提交)、6,130,326(于1999年4月14日提交)、6,552,183(于
2000年8月7日提交)、6,573,248(于2001年12月31日提交)、6,642,206(于2002年4月9日提交)、5,767,097(于1996年1月23日提交);国际公开WO 2004/106356(于2004年5月27日提交)、WO 2004/080466(于2003年3月7日提交)、WO 03/039523(于2002年11月5日提交);以及加拿大专利02252144(于1998年10月26日提交)。
[0131] 如前所述,在某些实施方案中,抵消磷酸酯基团上的电荷可通过使通式(I)和(II)化合物更亲油来促进通式(I)和(II)化合物对细胞膜的渗透。此外,相信连接至磷酸酯的诸如 等的2,2-二取代的-酰基(氧基烷基)通过抑制化合物的降解来赋予对通式(I)化合物和通式(II)化合物的增加的血浆稳定性。一旦进入细胞内部,通过酰基的酶水解,能够容易由酯酶除去连接至磷酸酯的2,
2-二取代的-酰基(氧基烷基)。然后,磷酸酯上的所述基团的剩余部分能够通过消去来去除。常规的反应流程显示在方案1a中。
[0132] 方案1a
[0133]
[0134] 本文所公开的2,2-二取代的-酰基(氧基烷基)的另一益处是2,2-二取代的-酰α基(氧基烷基)的所述基团的剩余部分的消去速率是可改进的。取决于如方案1a中的Rβ
和R 所示的2-碳上的取代基的特性,消去速率可由几秒调节至几小时。因此,如果必要,为了提高细胞的摄取,2,2-二取代的-酰基(氧基烷基)的剩余部分的除去能够被延缓,但一旦进入细胞内容易被消去。一旦除去磷酸酯的氧原子上的基团,所获得的核苷酸类似物具有单磷酸酯。因此,初始的细胞内磷酸化的必要性不再是获得生物活性磷酸化形式的先决条件。
[0135] 合成
[0136] 可以各种方法来制备通式(I)化合物和通式(II)化合物以及本文所述的那些化合物。通式(I)化合物和通式(II)化合物的常规合成路线和用于合成通式(I)化合物和通式(II)化合物的起始材料显示在方案1-3和图1-3中。所示的路线仅是示例性,而不旨在以任何方式显示权利要求的保护范围,也不旨在解释他们。本领域的技术人员能够认可所公开的合成的改进并基于本文的公开来设计可选择的路线;所有的这样的改进和可选择的路线在权利要求的范围内。
[0137] 方案2
[0138]
[0139] 形成通式(I)化合物的一方法显示在方案2中,其中R2、R3、R4、R5、R6、R7、R8、R9、A1、1 1 1a
B 和D 如本文所公开能够相同,并且R 能够为氢或保护基团。合适的保护基团的实例包括但不限于任选取代的苯甲酰基和甲硅烷基醚,例如三甲基甲硅烷基(TMS)、叔丁基二甲基甲硅烷基(TBDMS)、三异丙基甲硅烷基(TIPS)和叔丁基二苯基甲硅烷基(TBDPS)。此外,在
4a 5a 6a 7a 9a 1a 1a 1a 4 5 6 7 9 1 1 1
方案2,R 、R 、R 、R 、R 、A 、B 和D 能够分别与R、R、R、R、R、A、B 和D 相同,或者
4 5 6 7 9 1 1 1 4
能够分别各自为R、R、R、R、R、A、B 和D 的保护形式。通过保护形式能够改变用于R、
5 6 7 9 1 1 1
R、R、R、R、A、B 和D 的本文所列举的取代基以包含一个或多个保护基团。例如,羟基上的氢可与保护基团交换,两个羟基可环化形成缩醛或原酸酯,NH基上的氢可与保护基团交
1
换和/或-NH2基上的一个或两个氢可用一个或多个保护基团代替。另外,在方案2中,LG能够是合适的离去基团,例如本文所公开的那些。
[0140] 通过由D-葡萄糖的加成/环化反应能够形成五元杂环。在某些实施方案中,五元杂环能够是任选取代的核糖。在其它实施方案中,五元杂环能够是任选取代的脱氧核糖。或者,能够使用可商购的双丙酮-α-阿洛糖。
[0141] 使用本领域技术人员已知的方法来将5’-OH氧化成醛。合适的氧化剂包括但不限于戴斯-马丁氧化剂、TPAP/NMO(叔丙基过钌酸铵/N-甲基吗啉N-氧化物)、斯文氧化剂、PCC(氯铬酸吡啶鎓盐)和/或PDC(重铬酸吡啶鎓盐)、高碘酸钠、柯林斯试剂、硝酸铈铵CAN、Na2Cr2O7水溶液、硅藻土上的Ag2CO3、热的HNO3的甘醇二甲醚水溶液、O2-吡啶CuCl、Pb(OAc)4-吡啶和苯甲酰基过氧化物-NiBr2。
[0142] 能够使用本领域技术人员已知的方法将任选取代的C1-6烷基、任选取代的C2-6烯基、任选取代的C2-6炔基或任选取代的C1-6卤代烷基加入至5’-碳。例如,使用本领域技术人员已知的烷基化方法例如通过使用有机金属部分能够将任选取代的C1-6烷基或任选取代的C1-6卤代烷基加入至5’-碳。合适的有机金属部分的非限制性举例包括有机镁化合物、有机锂化合物、有机化合物、有机酸盐化合物、有机锌和有机钯化合物、金属羰基、茂金属、碳宾络合物(carbine complexes)和准金属(例如,有机烷和有机硅烷)。在某些实施方案中,有机金属部分能够为有机镁化合物。有机镁化合物能够为任选取代的C1-6烷基或任选取代的C1-6卤代烷基卤化镁,例如MeMgBr。
[0143] 如果已经不存在,还能够使用本领域技术人员已知的方法来完成任选取代的C1-6烷基加入至2’-位。在某些实施方案中,当在2’-位上存在羟基时,能够使用一种或多种合适的方法将羟基氧化成酮。例如,使用一种或多种氧化剂来讲羟基氧化成酮。合适的氧化剂包括但不限于酸性重铬酸盐、KMnO4、Br2、MnO2、四氧化钌、琼斯试剂、柯林斯试剂、科里试剂、重铬酸吡啶鎓盐、斯文氧化剂、DMSO、三氟乙酸酐(TFAA)以及本文之前所述的那些氧化剂。在实施方案中,氧化剂能够是戴斯-马丁氧化剂或DMSO和TFAA。
[0144] 使用本领域技术人员已知的方法能够将任选取代的C1-6烷基加入至2’-碳。在某些实施方案中,使用诸如本文所述的那些合适的有机金属部分将2’-碳烷基化。在实施方案中,有机金属部分能够是MeMgBr。
[0145] 使用本领域技术人员已知的方法能够将1’-位处的取代基转化成合适的离去基团,例如,通过水解反应然后使用合适的诸如乙酸酐等的合适的试剂进行乙酰基化能够将1’-位转化成合适的离去基团。作为另一实例,通过在酸性条件下将缩醛转化成半缩醛随后使用合适的试剂(例如乙酸酐)进行乙酰基化能够将1’-位转化成合适的离去基团。
[0146] 使用催化剂能够将任选取代的杂环碱基或任选取代的杂环碱基衍生物加入至1’-位。合适的催化剂是本领域已知的。在实施方案中,催化剂能够为三氟甲磺酸三甲基硅酯(trimethylsilyl trifluoromethanesulfonate)。为了促进反应,在某些实施方案中,在碱的存在下能够发生任选取代的杂环碱基或任选取代的杂环碱基衍生物的加入。合适的碱的实例包括基于胺的碱,例如三乙胺、1,8-二氮杂双环[5.4.0]十一碳-7-烯(DBU)和
1,5-二氮双环[4.3.0]壬-5-烯(DBN)。加入任选取代的杂环碱基或任选取代的杂环碱基
1
衍生物之后,在除去可能存在的任意保护基团后,能够获得其中R 为H的通式(I)化合物。
[0147] 如果需要和/或期望,2’、3’和4’-位存在的羟基上存在的任意羟基能够用一个或多个合适的保护基团保护。能够使用独立的保护基团来保护羟基。或者,两个相邻的羟基能够环化形成缩醛或原酸酯。在某些实施方案中,某些羟基能够用独立的保护基团来保护并且气体羟基能够通过形成缩醛或原酸酯来保护。
[0148] 或者,如果在五元杂环上已经存在任选取代的杂环碱基或任选取代的杂环碱基衍生物,则如以下在方案3中所示,能够将任选取代的C1-6烷基或任选取代的C1-6卤代烷基2 3 4 5 6 7 8 9 1 1 1
(例如CF3)加入至5’-位。取代基R、R、R、R、R、R、R、R、A、B 和D 能够与本文所公
4a 5a 6a 7a 9a 1a 1a 1a 4 5 6 7 9 1 1 1
开的相同,并且R 、R 、R 、R 、R 、A 、B 和D 能够分别与R、R、R、R、R、A、B 和D 相
4 5 6 7 9 1 1 1 1a
同,或者能够分别各自为R、R、R、R、R、A、B 和D 的保护形式。R 能够为氢或保护基团,包括本文中所描述的那些。
[0149]
[0150] 如本文所述,能够使用如本文所公开的那些合适的氧化剂将5’-位处的羟基氧化成醛。能够使用合适的烷基化方法将任选取代的C1-6烷基或任选取代的C1-6卤代烷基加入至5’-位。合适的烷基化方法如本文所描述。在实施方案中,能够使用诸如有机镁化合物等的有机金属试剂将5’-位烷基化。
[0151] 如果任选取代的C1-6烷基在2’-位上已经存在,则能够使用本领域技术人员已知的方法来加入所述任选取代的C1-6烷基。例如,在某些实施方案中,当在2’-位上存在羟基时,能够使用一种或多种合适的方法将羟基氧化成酮。在实施方案中,能够使用本文所公开的一种或多种氧化剂将羟基氧化成酮。使用本领域技术人员已知的技术能够将任选取代的C1-6烷基加入至2’-碳。在某些实施方案中,能够使用诸如本文所公开的那些合适的有机金属部分将2’-碳烷基化。在实施方案中,有机金属部分能够为MeMgBr。
[0152] 如果需要和/或期望,在形成通式(I)化合物的过程中,能够使用一个或多个合适的保护基团来保护任选取代的杂环碱基或任选取代的杂环碱基衍生物。例如,能够使用一个或多个合适的保护基团来保护连接至任选取代的杂环碱基和/或任选取代的杂环碱基衍生物的环上的一个或多个氨基和/或环中存在的任意-NH。在实施方案中,能够使用一个或多个三芳基甲基保护基团来保护任选取代的杂环碱基和/或任选取代的杂环碱基衍生物。三芳基甲基保护基团的非限制性举例为三苯甲基、单甲氧基三苯甲基(MMTr)、4,4’-二甲氧基三苯甲基(DMTr)、4,4’,4”-三甲氧基三苯甲基(TMTr)、4,4’,4”-三-(苯甲酰基氧基)三苯甲基(TBTr)、4,4’,4”-三(4,5-二氯苯二甲酰亚氨基)三苯甲基(CPTr)、
4,4’,4”-三(菊芋糖基氧基)三苯甲基(TLTr)、对甲氧基苯基-1-萘基苯基甲基、二邻甲氧基苯基-1-萘基甲基、对甲苯基二苯基甲基、3-(咪唑基甲基)-4,4’-二甲氧基三苯甲基、9-苯基呫吨-9-基(Pixyl)、9-(对甲氧基苯基)呫吨-9-基(Mox)、4-癸基氧基三苯甲基、4-十六基氧基三苯甲基、4,4’-双十八烷基三苯甲基、9-(4-十八烷基氧基苯基)呫吨-9-基、1,1-二-(4-甲氧基苯基)-1’-芘基甲基、4,4’,4”-三-(叔丁基苯基)甲基(TTTr)和4,4’-二-3,5-己二烯氧基三苯甲基。还能够使用包括本文所述的那些保护基团在内的一个或多个合适的保护基团来保护5元杂环上的任意保护基团。
[0153] 在如方案2和3所示的常规反应流程中,能够在不同的时间除去保护基团并加入其它保护基团,例如在5’-位处形成醛之前;在5’-位的烷基化之后;在2’-位的氧化之前;在2’-位的烷基化之后;在加入任选取代的杂环碱基或任选取代的杂环碱基衍生物之前和/或在加入任选取代的杂环碱基或任选取代的杂环碱基衍生物之后。由于反应条件,因此保护基团的去除和替换是有用的。保护基团可有助于避免不期望的副反应和/或使期望产物容易分离。
[0154] 如方案4所示,能够将磷酸酯基加入至5’-位。取代基R2、R3、R4、R5、R6、R7、R8、R9、1 1 1 4a 5a 6a 7a 9a 1a 1a 1a 4
A、B 和D 能够与本文所公开的相同,并且R 、R 、R 、R 、R 、A 、B 和D 能够分别与R、
5 6 7 9 1 1 1 4 5 6 7 9 1 1 1
R、R、R、R、A、B 和D 相同,或者能够分别各自为R、R、R、R、R、A、B 和D 的保护形式。
[0155]
[0156] 能够使用各种方法来将磷酸酯基加入至5’-位。合适的方法描述在“核酸化学中的通用方法(Current Protocals in Nucleic Acid Chemistry)Donald E.Bergstrom,核酸化学中的通用方法中的核苷磷酸化和相关的改进(Nucleoside Phosphorylation and Related Modifications in Current Protocals in Nucleic Acid Chemistry),第1章,(2008)John Wiley & Sons,Inc.”中。例如,能够通过亚磷酰胺化和氧化方法来形成5’-位处的磷酸酯。
[0157] 为了加入 其中R10和R11中的一个为 R10和R11中的另一个为-N-连接的氨基酸,能够将(O-苯基-N-连接的氨基酸))磷酰氨基卤化物与核苷或核
2 3 8
苷衍生物的5’-位反应,所述核苷或核苷衍生物例如 其中R、R 和R 能够
4a 5a 6a 7a 9a 1a 1a 1a 4 5 6 7 9 1 1
与前文定义相同,并且R 、R 、R 、R 、R 、A 、B 和D 能够分别与R、R、R、R、R、A、B 和
1 4 5 6 7 9 1 1 1
D 相同,或者能够分别各自为R、R、R、R、R、A、B 和D 的保护形式。能够使用各种氨基酸来形成-N-连接的氨基酸。在某些实施方案中,氨基酸能够具有以下结构
15a 16a 17a 18a 15 16 17 18
其中R 、R 、R 和R 能够与本文关于通式(I)所述的R 、R 、R 和R 相同。如果需要和/或期望,能够使用诸如本文所述的那些保护基团等的一个或多个保护基团来保护5元杂环上存在的任意羟基。在某些实施方案中,能够使用一个或多个保护基团来保护2’-位和3’-位上的任意羟基。例如,当5’元杂环在2’-位和3’-位处具有羟基时,能够通过形成缩醛或原酸酯来保护氧。
[0158] 能够按照与下述文献所述的方法相似的方法来合成2,2-二取代的-酰基(氧基12a 13a 14a a 12 13
烷基)的羟基前体 其中R 、R 、R 和m 分别与本文所述的R 、R 、
14
R 和m相同:Ora,et al.,J.Chem.Soc.Perkin Trans.2,2001 6:881-5; P.et al.,Helv.Chim.Acta.2002 85:1859-76; P.et al.,Lett.Org.Chem.,2004,1:
183-88和 P.et al.,BioconJugate Chem.,2005 16(6):1564-71,所有的文献在此通过引用整体并入本文。
[0159] 羟基前体的实例能够包括以下化合物:
[0160]
[0161] 为了加入 其中R10和R11中的一个为 R10和R11中的另一个为-N-连接的氨基酸,能够将亚磷酸二苯酯与本文所述的一个或多个羟基前体、
2 3 8 4a
核苷或核苷衍生物(例如 其中R、R 和R 能够与前文定义相同,并且R 、
5a 6a 7a 9a 1a 1a 1a 4 5 6 7 9 1 1 1
R 、R 、R 、R 、A 、B 和D 能够分别与R、R、R、R、R、A、B 和D 相同,或者能够分别各
4 5 6 7 9 1 1 1
自为R、R、R、R、R、A、B 和D 的保护形式)、氨基酸和合适的氧化剂反应以形成通式(I)化合物。如前文讨论,能够使用包括本文所述的那些氨基酸在内的各种氨基酸。同样地,能够使用任何合适的氧化剂。在实施方案中,氧化剂能够为四氯化碳(CCl4)。在某些实施方案中,诸如CCl4等的氧化剂将磷从(III)至氧化(V)。
[0162] 还能够使用各种方法来加入 其中R10和R11为 在某些实施方案中,能够将亚磷酸二苯酯与本文所述的一个或多个羟基前体、核苷或核苷衍生物(例如 其中R2、R3和R8能够与前文定义相同,并且R4a、R5a、R6a、R7a、R9a、
1a 1a 1a 4 5 6 7 9 1 1 1 4 5 6
A 、B 和D 能够分别与R、R、R、R、R、A、B 和D 相同,或者能够分别各自为R、R、R、
7 9 1 1 1
R、R、A、B 和D 的保护形式)和合适的氧化剂反应。
[0163] 如果期望和/或需要,能够使用包括本文所描述的那些保护基团在内的一个或多个合适的保护基团来保护存在于5元杂环上的任选取代的杂环碱基、任选取代的杂环碱基衍生物和/或任意的羟基。例如,能够用独立的保护基团,作为缩醛和/或原酸酯来保护任意的羟基。类似地,能够使用诸如一个或多个三芳基甲基保护基团等的一个或多个合适的保护基团来保护连接至任选取代的杂环碱基和/或任选取代的杂环碱基衍生物的环的一个或多个氨基和/或在环中存在的-NH。如本文所讨论的,在形成通式(I)化合物的过程中能够在不同的时间去除、替代并交换保护基团。例如,当将 加入至5’-位时,能够使用各种保护基团来保护任选取代的杂环碱基和/或任选取代的杂环碱基衍生物。合适的保护基团是本领域技术人员已知的,包括本文所述的那些。在加入磷酸酯基的过程中,在不同时间能够除去在任选取代的杂环碱基和/或任选取代的杂环碱基衍生物上存在的保护基团并加入其它保护基团。同样地,在加入 的过程中,在不同时间能够除去和/或改变存在于任选取代的5元杂环上的任意保护基团。在某些实例中,由于反应条件的原因,保护基团的除去和替换是有用的。保护基团还能够有助于避免不想要的副反应和/或容易分离期望产物。
[0164] 在其中任选取代的杂环在2’-位处已经具有任选取代的C1-6烷基的情况下,需要在2’-位处加入任选取代的C1-6烷基的步骤可忽略。
[0165]
[0166] 使用本文所公开的与制备通式(I)化合物的方法相似的方法来制备通式(II)化合物。如方案5所示,使用一个或多个合适的试剂已经将5’-位氧化成醛后,能够将任选取代的C1-6烷基、任选取代的C2-6烯基、任选取代的C2-6炔基或任选取代的C1-6卤代烷基加入22 23 24 25 26 27 2 2 2 22a 23a
至5’-位。取代基R 、R 、R 、R 、R 、R 、A、B 和D 能够与本文所公开的相同,R 、R 、
24a 25a 26a 27a 2a 2a 2a 22 23 24 25 26 27 2 2 2
R 、R 、R 、R 、A 、B 和D 能够分别与R 、R 、R 、R 、R 、R 、A、B 和D,或者能够分
22 23 24 25 26 27 2 2 2 19a
别各自为R 、R 、R 、R 、R 、R 、A、B 和D 的保护形式。取代基R 能够为氢或者保护基
2
团,并且LG 能够为合适的离去基团。合适的保护基团包括但不限于任选取代的苯甲酰基和甲硅烷基醚,例如三甲基甲硅烷基(TMS)、叔丁基二甲基甲硅烷基(TBDMS)、三异丙基甲硅烷基(TIPS)和叔丁基二苯基甲硅烷基(TBDPS)。
[0167] 如果在5元杂环上已经不存在任选取代的杂环碱基或任选取代的杂环碱基衍生物,能够使用本领域技术人员已知的方法来加入任选取代的杂环碱基或任选取代的杂环碱基。例如,使用本领域技术人员已知的方法能够将1’-位处的取代基转化成合适的离去基团,例如离核体。一实例,通过水解反应随后使用诸如乙酸酐等的合适试剂进行乙酰化能够将1’-位转化成合适的离去基团。另一实例,通过在酸性条件下将缩醛转化成半缩醛随后用合适的试剂(例如乙酸酐)进行乙酰化能够将1’-位转化成合适的离去基团。
[0168] 使用催化剂能够将任选取代的杂环碱基或任选取代的杂环碱基衍生物加入至1’-位。合适的催化剂是本技术领域已知的。在实施方案中,所述催化剂能够为三氟甲磺酸三甲基硅酯。为了促进反应,在某些实施方案中,能够在碱的存在下加入任选取代的杂环碱基或任选取代的杂环碱基衍生物。合适的碱的实例包括基于胺的碱,例如三乙胺、1,8-二氮杂双环[5.4.0]十一碳-7-烯(DBU)和1,5-二氮双环[4.3.0]壬-5-烯(DBN)。加入任选取代的杂环碱基或任选取代的杂环碱基衍生物之后,在除去可能存在的任意保护基团
19
后,能够获得其中R 为H的通式(I)化合物。
[0169] 能够使用与用于加入本文所述的 相同或相似的方法来将 部分加入至5’-位。在某些实施方案中,当R28和R29其中之一为-N-连接的氨基酸,氨基酸能
33a 34a 35a 36a 33
够具有结构 其中R 、R 、R 和R 能够与本文所述的通式(II)的R 、
34 35 36 28 29
R 、R 和R 相同。在实施方案中,当R 和R 其中之一为 时,羟基
30a 31a 32a a 30
前体能够具有结构 其中R 、R 、R 和n 分别与本文所述的R 、
R31、R32和n相同。合适的具有结构 的羟基前体的实例和获得它们的
方法与前文所述相同。
[0170] 如果期望和/或需要,在合成通式(II)化合物的过程中,能够使用包括本文所述的那些保护基团在内的一个或多个合适的保护基团来保护存在于5元杂环上的任选取代的杂环碱基、任选取代的杂环碱基衍生物和/或任意羟基。例如,能够使用独立的保护基团作为缩醛和/或原酸酯来保护任何羟基。相似地,能够使用诸如一个或多个三芳基甲基保护基团等的一个或多个合适的保护基团来保护连接至任选取代的杂环碱基和/或任选取代的杂环碱基衍生物的环上的一个或多个氨基和/或存在于环中的任意-NH。如本文所讨论的,在形成通式(II)化合物的过程中的不同时间,例如在加入 的过程中,能够除去、替代和交换保护基团。
[0171] 药物组合物
[0172] 本文所述的实施方案涉及药物组合物,其能够包含治疗有效量的一种或多种本文所述的化合物(例如通式(I)化合物和/或通式(II)化合物)以及药物可接受的载体、稀释剂、赋形剂或其组合。
[0173] 术语“药物组合物”是指本文所述的化合物与具有诸如稀释剂或载体等的其它化学成分的混合物。药物组合物便于将所述化合物给予有机体。本领域存在多种化合物给药方法,所述方法包括但不限于口服给药、肌肉内给药、眼内给药、鼻内给药、静脉内给药、注射给药、气雾给药、肠胃外给药和局部给药。还能够通过将化合物与有机或无机酸反应来获得药物组合物,所述有机或无机酸例如盐酸、氢溴酸、硫酸、硝酸、磷酸、甲磺酸、乙磺酸、对甲苯磺酸、水杨酸等。通常将药物组合物调整适应于给药的具体计划途径。
[0174] 术语“生理学可接受的”定义为没有破坏化合物的生物活性和特性的载体、稀释剂或赋形剂
[0175] 如本文所述的“载体”是指促进化合物进入细胞或组织的化合物。例如,没有限制,二甲基亚砜(DMSO)通常是可采用的载体,其促进许多有机化合物被吸收入个体的细胞或组织中。
[0176] 如本文所述的“稀释剂”是指药物组合物中缺少药物活性但可为药物上必需或期望的成分。例如,对于制备或给药体积太小而效大的药物,稀释剂可用于增大体积。其可以是用于溶解药物的液体从而通过注射、吞咽或吸入进行给药。本领域中稀释剂的常用形式为缓冲水溶液,例如,没有限制,模拟人血液成分的磷酸盐缓冲液。
[0177] 如本文所使用的“赋形剂”是指加入药物组合物中的惰性物质,其没有限制地用于对组合物提供体积、粘稠度、稳定性、粘合能力、润滑性、分解能力等。“稀释剂”是赋形剂的一个类型。
[0178] 药物组合物能够本身给予人类患者,或者在药物组合物中与其它活性成分(在组合疗法中)、载体、稀释剂、赋形剂或其组合混合。合适的剂型取决于所选择的给药途径。本文所述化合物的用于剂型和给药的技术是本领域技术人员已知的。
[0179] 可以已知的方法来制备本文所述的药物组合物,例如通过常规的混合、溶解、粒化、制成糖衣丸、磨细、乳化、包封、包裹或制成片剂等方法。此外,以有效量来含有活性成分从而实现其预期目的。可使用药物相配的反离子,以盐的形式提供在本文所公开的药物组合中所使用的许多化合物。
[0180] 例如,合适的给药途径包括口服给药、直肠给药、局部经粘膜给药肠内给药;肠胃外递送,其包括肌肉注射、皮下注射、静脉注射、髓内注射,以及鞘内注射,直接心室内注射,腹腔注射,鼻腔注射,眼内注射或气雾吸入。
[0181] 还可以局部方式而不是全身的方式将化合物给予个体,所述局部方式例如通常以存储或持续释放制剂的形式将化合物直接注射至感染区域。此外,以靶药物递送系统的形式将化合物给予个体,例如以涂覆组织特异性抗体的脂质体的形式。脂质体将会被靶向并选择性地被器官摄取。
[0182] 如果期望,组合物可存在于包装或分配装置中,该装置可包含含有活性成分的一个或多个单位剂量形式。例如,该包装可包含金属或塑料箔,例如泡罩。该包装或分配装置可附带给药说明。该包装或分配装置还可附带与管理药物生产、使用或销售的政府机构制定的容器形式有关的通告,该通告反映的是该机构对用于人或动物给药的药物形式的批准。例如,这种通告可以是由美国食品和药品管理局对处方药批准的标志或批准的产品说明书。还可以制备包含在相配的药物载体中配制的本文公开的化合物的组合物,将其装在合适的容器中并标明其对所示疾病状态的治疗。
[0183] 用途的方法
[0184] 本文公开的一实施方案涉及治疗和/或改善疾病或疾病状态的方法,所述方法能够包括对个体给予治疗有效量的一种或多种本文所述的化合物(例如通式(I)化合物和/或通式(II)化合物),或包含本文所述化合物的药物组合物。
[0185] 本文所公开的某些实施方案涉及改善或治疗肿瘤疾病的方法,所述方法能够包括对患有肿瘤疾病的个体给予治疗有效量的一种或多种本文所述的化合物(例如通式(I)化合物和/或通式(II)化合物)或包含一种或多种本文所述的化合物的药物组合物。在实施方案中,肿瘤疾病能够为癌症。在某些实施方案中,肿瘤疾病能够为诸如固体瘤等的肿瘤。在实施方案中,肿瘤疾病能够为白血病。白血病的实例包括但不限于急性淋巴细胞白血病(ALL)、急性髓系白血病(AML)和少年骨髓白血病(JMML)。
[0186] 本文所公开的实施方案涉及抑制肿瘤生长的方法,所述方法能够包括对具有肿瘤的个体给予治疗有效量的一种或多种本文所述的化合物或包含一种或多种本文所述的化合物的药物组合物。
[0187] 本文所公开的其它实施方案涉及改善或治疗病毒感染的方法,所述方法包括对患有病毒感染的个体给予治疗有效量的一种或多种本文所述的化合物或包含一种或多种本文所述的化合物的药物组合物。在实施方案中,所述病毒感染能够由选自以下的病毒引起的:腺病毒、α病毒科、虫媒病毒、星状病毒、布尼亚病毒科、冠状病毒科、丝状病毒科、黄病毒科、嗜肝病DNA毒科、疱疹病毒科、α-疱疹病毒亚科、β-疱疹病毒亚科、γ-疱疹病毒亚科、诺沃克病毒、星状病毒科、杯状病毒科、正粘病毒科、副粘病毒科、副粘病毒、腮腺炎病毒(Rubulavirus)、麻疹病毒、乳多空病毒科、细小病毒科、小RNA病毒科、疫病毒科(Aphthoviridae),心脏病毒科(Cardioviridae)、肠道病毒科、柯萨奇病毒、脊髓灰质炎病毒、鼻病毒科、藻DNA病毒科、痘病毒科、呼肠孤病毒科、轮状病毒,逆转录病毒科、A型逆转录病毒、免疫缺陷病毒、白血病病毒、禽类肉瘤病毒、弹状病毒、疹病毒科(Rubiviridae)和/或披盖病毒科。在实施方案中,病毒感染是丙型肝炎病毒感染。在另一实施方案中,病毒感染为HIV感染。
[0188] 本文公开的一实施方案涉及改善或治疗寄生虫病的方法,所述方法能够包括对患有寄生虫病的个体给予治疗有效量的一种或多种本文所述的化合物或包含一种或多种本文所述的化合物的药物组合物。在实施方案中,寄生虫病能够是Chagas病。
[0189] 如本文所使用的“个体”是指其是治疗、观察或实验对象的动物。“动物”包括冷血和温血脊椎动物和无脊椎动物,例如鱼类、贝类、爬行动物、尤其是,哺乳动物。“哺乳动物”非限制性地包括小鼠、大鼠、兔、豚鼠、犬科动物、猫科动物、绵羊,山羊,,马,诸如猴子等的灵长类动物,黑猩猩和类人猿,特别是人。
[0190] 本文所使用的“治疗(treating)”、“治疗(treatment)”、“治疗的(therapeutic)”或“疗效(therapy)”不一定是指疾病或疾病状态的完全治愈或消除。疾病或疾病状态的任何不期望的迹象或症状的任何缓解在任意程度上能够被认为是治疗和/或疗效。而且,治疗可包括可使患者的总体良好的感觉或面貌变坏的行为。
[0191] 术语“治疗有效量”用来表示显现所示生物或药物反应的活性化合物或药剂的量。例如化合物的治疗有效量能够是需要预防、减轻或改善疾病症状量,或者是延长正被治疗个体的存活的量。该反应可发生在组织、体系、动物或人中并包括正被治疗的疾病的症状的缓解。治疗有效量的确定在本领域技术人员的能力范围内,特别是根据本文提供的详细公开。需要作为剂量的本文所公开的化合物的治疗有效量将取决于给药途径、正被治疗的动物类型(包括人)和正在考虑的具体动物的身体特性。能够调整剂量已达到期望的效果,但其将取决于如下因素,例如体重、饮食、同服的药物和本医学领域技术人员可认识到的其它因素。
[0192] 对于本领域的技术人员来说是显而易见的,待给予的有效的体内剂量和给药的特别形式将根据年龄、体重、痛苦的严重程度和所治疗的哺乳动物的种类、所采用的具体化合物以及所采用的这些化合物的具体用途而变化(参见例如Fingl et al.1975,“治疗的药理学根据(The Pharmacological Basis of Therapeutics)”,特别参考Ch.1,p.1,该文献通过引用整体并入本文)。本领域的技术人员能够使用常规的药理学方法来实现有效剂量水平的确定,即需要实现期望效果的剂量水平。通常,人对产品的临床应用刚开始处于低剂量水平,之后剂量水平提高直至实现期望的效果。或者,能够使用可接受的体外研究,使用所设置的药理学方法通过现有的方面来设置有效的剂量和给药途径。
[0193] 尽管将基于药物试验来确定具体的剂量,但在大多数情况下,能够做出关于剂量的某些概括。例如,对于成年人患者,日剂量使用可以为每种活性成分的口服剂量0.01mg至3000mg,优选1mg至700mg,例如5mg至200mg.根据患者的需要,剂量可以一次给予或在一天或多天的过程中两次或多次给予。在某些实施方案中,将化合物给药连续治疗的一段时间,例如一个星期或更长时间,或者数月或数年。
[0194] 例如,如果已经将化合物的人用剂量设置用于至少某些条件,则将使用那些相同的剂量,或使用所设置的人用剂量的约0.1%至500%,更优选约25%至250%。对于新发现的药物组合物,如果没有设置人用剂量,则能够由在动物体中的毒性研究和效力研究所限定的ED50或ID50值或者者源自体内或体外研究的其它合适值来推定合适的人用剂量。
[0195] 在药物可接受的盐的给药的情况下,可作为游离碱来计算剂量。本领域的技术人员应理解的是,在某些条件下,必需以超过或甚至远超过上述优选剂量范围的量将本文所公开的化合物进行给药从而有效并积极地治疗特别严重的疾病或感染。
[0196] 可独立调节剂量和间隔时间来提供足以保持调节效果的活性部分的血浆水平,或最低有效浓度(MEC)。对于每种化合物,MEC将变化,但是能够由体外数据来评价。达到MEC必需的剂量将取决于给药的单独性质和途径。然而,能够使用HPLC测定和生物测定来确定血浆浓度。
[0197] 还能够使用MEC值来确定剂量间隔时间。使用如下方案来给予组合物:将高于MEC的血浆水平保持10%-90%,优选30%-90%,更优选50%-90%的时间。在局部给药或选择性摄取的情况下,药物的优选局部浓度与血浆浓度无关。
[0198] 应注意的是,由于毒性或有机功能障碍主治医师应知道如何和何时终止、中断或调整给药。相反地,如果临床反应不合适(排出毒性),则主治医师还应知道将治疗调节至高水平。在治疗所关注的异常中,给药剂量的数值将随着待治疗的疾病条件的严重性和给药途径而变化。例如,部分地通过标准预后评价方法来评价疾病条件的严重性。此外,剂量和可能的剂量频率也会根据年龄、体重和个体患者的反应而变化。可以在兽药中使用与上述讨论相称的体系。
[0199] 在非人动物研究中,潜在的产品的应用以高剂量水平开始,然后降低剂量直至不再达到期望的效果或不利的副作用消失。取决于期望的作用和治疗指征,剂量在宽范围内变化。或者,如本领域技术人员可理解的,剂量可以患者的表面积为基础并根据患者的表面积来计算。
[0200] 能够使用已知的方法来评价本文所公开的化合物的效力和毒性。例如,通过确定具体化合物或共享特定化学部分的化合物子集体外对细胞系(例如哺乳动物,优选人细胞系)的毒性来建立其毒理学。这样的研究结果通常对动物,例如哺乳动物,或更优选人的毒性是预见性的。或者,可使用已知的方法来确定动物模型中的具体化合物的毒性,所述动物模型例如小鼠、大鼠、兔或猴。可使用数个公认的方法来确定具体化合物的效力,公认的方法例如体外方法、动物模型或人临床试验。
[0201] 几乎每类疾病状态都存在公认的体外模型,所述疾病状态包括但不限于癌症、心血管疾病和各种免疫功能障碍。相似地,可使用可接受的动物模型来确定治疗这些疾病状态的化学品的效力。当选择模型来确定效力时,本领域的状态能够指导本领域的技术人员去选择合适的模型、剂量和给药途径以及方案。当然,也能够使用人临床试验来确定化合物在人体中的效力。实施例
[0202] 在下述实施例中更详细地公开了另外的实施方案,这些实施例不旨在以任何方式限制权利要求的范围。
[0203] 实施例
[0204] 在下述实施例中更详细地公开了另外的实施方案,这些实施例不旨在以任何方式限制权利要求的范围。
[0205] 实施例1
[0206] 3-乙酰氧基-2-氰基-2-(羟基甲基)丙酸甲酯(1)
[0207]
[0208] 2-氰基-3-羟基-2-羟基甲基丙酸甲酯。将甲醛(66.7mmol,2.0g)作为20%水溶液(10g)加入至浴上的1,4-二噁烷(30mL)中。加入氰基乙酸甲酯(30.3mmol,2.12mL)和Et3N(0.61mmol,0.61mL的1mol L-1的THF溶液),并将混合物搅拌20分钟。加入另一部分的Et3N(0.61mmol)并除去冰浴。将混合物在室温下搅拌1.5h。然后将混合物用水(200mL)稀释并用苯(3×50mL)萃取以除去副产物。将水相在30℃减压蒸发至初始体积的1/4并用乙酸乙酯萃取5次。将组合的萃取物用Na2SO4干燥并蒸发成透明油状。收率为72%(4.82g)。不进行表征直接将化合物用于接下来的步骤。
[0209] 5-氰基-1-乙氧基-1-甲基-1,3-二噁烷5-羧酸甲酯。将2-氰基-3-羟基-2-羟基甲基丙酸甲酯(23.3mmol,3.7g)溶解在干THF(8mL)中并加入原乙酸三乙酯(34.9mmol,6.55mL)。加入催化量的浓硫酸(0.70mmol,37μL)并将混合物在室温下搅拌过夜。将混合物倒入搅拌的冰冷的NaHCO3溶液(5%,50mL)中。将产物萃取在Et2O(2×50mL)中,并将萃取物用饱和NaCl水溶液洗涤并用Na2SO4干燥。将溶剂蒸发并通过硅胶色谱进行纯化,所述硅胶色谱应用从5%乙酸乙酯的二氯甲烷溶液至纯乙酸乙酯的阶式梯度。以42%收率(5.33g)获得透明油状的开始结晶的产物。
[0210] 主要的非对映异构体的1H NMR(CDCl3)4.34(d,J=7.0Hz,2H,-CH2O-),4.03(d,J = 8.5Hz,2H,-CH2O-),3.84(s,3H,OMe),3.54(q,J = 7.2Hz,2H,-CH2CH3),1.55(s,13
3H,-CH3),1.25(t,J=7.2,3H,-CH2CH3)。主要的非对映异构体的 C NMR(CDCl3)164.8(C= O),117.0(CN),111.4(C2),62.3(C4 和 C6),59.1(-CH2CH3),53.9(-OCH3),42.4(C5),
22.3(2-CH3),15.0(CH2CH3)。
[0211] 3-乙酰氧基-2-氰基-2-(羟基甲基)丙酸甲酯。将5-氰基-2-乙氧基-2-甲基-1,3-二噁烷-5-羧酸甲酯(2.18mmol,0.50g)溶解在乙酸和水的混合物(4∶1,v/v,
20mL)中并将混合物室温搅拌2h,之后将混合物蒸发至干燥,并且将剩余物用水共蒸发3次。通过用含有5%MeOH的二氯甲烷洗脱的硅胶色谱来纯化产物。收率为52%(0.23g)。
1
H NMR(CDCl3)4.53(d,J=11.0Hz,1H,-CH2OAc),4.50(d,J=11.0Hz,1H,-CH2OAc),4.04(d,J=6.5Hz,2H,-CH2OH),3.91(s,3H,-OMe),2.90(t,J=6.5Hz,-OH),2.16(s,3H,-C(O)CH3)。
13
C NMR(CDCl3)170.4(C = O),166.0(C = O),116.0(CN),63.1(-CH2OH),62.3(-CH2OAc),
54.1(-OMe),51.0(C2),20.6(-C(O)CH3)。
[0212] 实施例2
[0213] 2-氰基-3-(乙基氨基)-2-(羟基甲基)-3-氧代丙基乙酸酯(2)
[0214]
[0215] 2-氰基-3-(2-苯基乙基氨基)-2-(羟基甲基)-3-氧代丙基乙酸酯(2b)
[0216]
[0217] 根据在 P.; E.;Tomperi,J.;Ora,M.;Oivanen,M.;H.,Helve.Chim.Acta.2002 85:1869-1876中描述的方法来制备2-氰基-3-(2-苯基乙基氨基)-2-(羟基甲基)-3-氧代丙基乙酸酯,所述文献通过引用并入本文用于描述合成并纯化2-氰基-3-(2-苯基乙基氨基)-2-(羟基甲基)-3-氧代丙基乙酸酯的限制性目的。
[0218] 实施例3
[0219] 2-乙酰基-2-(羟基甲基)-3-氧代丁基乙酸酯(3)
[0220]
[0221] 实施例4
[0222] 2-乙酰基-2-(羟基甲基)-3-氧代丁基三甲基乙酸酯(4)
[0223]
[0224] 实施例5
[0225] 2-乙酰基-2-羟基甲基-3-氧代丁基乙酸酯(5)
[0226]
[0227] 2-乙氧基-2-甲基-1,3-二噁烷-5,5-二羧酸二乙酯。将浓H2SO4(1.3mmol;71μL)加入至2,2-二(羟基甲基)丙二酸二乙酯(43.5mmol,9.6g)与原乙酸三乙酯(65.2mmol;11.9mL)在无水THF(15mL)的混合物中。将反应进行一整夜并将混合物倒入5%NaHCO3的冰冷溶液(50mL)中。将产物用二乙醚(2×50mL)萃取,用饱和NaCl水溶液(2×50mL)洗涤并用Na2SO4干燥。将溶剂蒸发并将粗产物在用二氯甲烷和甲醇的混合物(95∶5,v/v)洗
1
脱的硅胶柱上进行纯化。以89%收率(11.3g)获得透明油状的产物。H NMR δH(500MHz,CDCl3):4.30-4.36(m,6H,4-CH2,6-CH2 和 5-COOCH2Me),4.18(q,J = 7.1Hz,5-COOCH2Me),
3.54(q,J=7.10Hz,2H,2-OCH2Me),1.46(s,3H,2-CH3),1.32(t,J=7.10Hz,3H,2-OCH2Me),
13
1.27(t,J=7.1Hz,3H,5-COOCH2Me),1.26(t,J=7.1Hz,3H,5-COOCH2Me)。 C NMR(500MHz,CDCl3):δ=168.0和167.0(5-COOEt),111.1(C2),62.0和61.9(5-COOCH2Me),61.6(C4和C6),58.7(2-OCH2Me),52.3(C5),22.5(2-Me),15.1(2-OCH2CH3),14.0和13.9(5-COOCH2CH3)。
[0228] 2-(乙酰氧基甲基)-2-(羟基甲基)丙二酸二乙酯。将2-乙氧基-2-甲基-1,3-二噁烷-5,5-二羧酸二乙酯(17.9mmol;5.2g)溶解在80%乙酸水溶液(30mL)中并室温静置2h。将溶液蒸发至干燥并将剩余物用水共蒸发3次。通过用乙酸乙酯的二氯甲烷溶液(8∶92,v/v)洗脱的硅胶柱色谱将产物进行纯化。以75%收率(3.6g)获得黄色油状的
1
产物。H NMR δH(500MHz,CDCl3):4.76(s,2H,CH2OAc),4.26(q,J=7.10Hz,4H,OCH2Me),
4.05(d,J=7.10Hz,2H,CH2OH),2.72(t,J=7.1Hz,1H,CH2OH),2.08(s,3H,Ac),1.27(t,J
13
=7.10Hz,6H,OCH2CH3)。 C NMR(500MHz,CDCl3):δ=170.9(C=O Ac),168.1(2×C=O丙二酸酯),62.3和62.2(CH2OH和CH2OAc),61.9(2×OCH2CH3)59.6(螺C),20.7(CH3Ac),
14.0(2×OCH2CH3)。
[0229] 实施例6
[0230] 2.2-二(乙氧基羰基)-3-羟基丙基三甲基乙酸酯(6)
[0231]
[0232] 2,2-二(乙氧基羰基)-3-(4,4’-二甲氧基三苯甲基氧基)丙基三甲基乙酸酯。将2,2-二(羟基甲基)丙二酸二乙酯与1当量的4,4’-二甲氧基三苯甲基氯化物在含有
1当量吡啶的1,4-二噁烷中反应。用特戊酰氯(0.83mL,6.75mmol)将2-(4,4’-二甲氧基三苯甲基氧基甲基)-2-(羟基甲基)丙二酸二乙酯(2.35g,4.50mmol)在含有3当量吡啶(1.09mL,13.5mmol)的无水MeCN(10mL)中进行酰基化。室温三天后,将反应用MeOH(20mL)-
淬火并进行常规的CH2Cl2/aq HCO3 处理。硅胶色谱(EtOAc/己烷 1∶1,v/v)得到为黄
1
色浆汁的2.47g(90%)的期望产物。H NMR(CDCl3,200MHz):7.13-7.39[m,9H,(MeO)2Tr];
6.81(d,4H,[MeO]2Tr);4.71(s,2H,CH2OPiv);4.15(q,J=7.1,4H,OCH2CH3);3.78[s,6H,(CH3O)2Tr];3.67(s,2H,CH2ODMTr);1.27(t,J=7.1,6H,OCH2CH3);1.02[s,9H,COC(CH3)3]。
[0233] 2,2-二(乙氧基羰基)-3-羟基丙基三甲基乙酸酯。将2,2-二(乙氧基羰基)-3-(4,4’-二甲氧基三苯甲基氧基)丙基三甲基乙酸酯(2.47g,4.07mmol)在CH2Cl2和MeOH(20mL)的4∶1混合物中的溶液室温用TFA(2.00mL,26.0mmol)处理4h以除去二甲氧基三苯甲基基团。将混合物用吡啶(2.30mL,28.6mmol)中和,进行CH2Cl2/aq处理并用硅胶色谱(EtOAc/己烷 3∶7,v/v)进行纯化从而获得1.15g(93%)的期望产物。
1
H NMR(CDCl3,200MHz):4.59(s,2H,CHXOPiv);4.25(q,J=7.1,4H,OCH2CH3);4.01(s,2H,+ +
CH2OH);1.28(t,J=7.1,6H,OCH2CH3);1.18[s,9H,COC(CH3)3].ESI-MS :m/z 305.4([MH]),+ + +
322.6([MNH4]),327.6([MNa]),343.5([MK])。
[0234] 实施例7
[0235] 2-乙酰氧基甲基-2-羟基甲基丙二酸二乙酯(7)
[0236]
[0237] 2-(叔丁基二甲基甲硅烷基氧基甲基)-2-羟基甲基丙二酸二乙酯(7a)。将2,2-二(羟基甲基)丙二酸二乙酯(28.3mmol;6.23g)从无水吡啶中共蒸发两次并将其溶解在相同溶剂(20mL)中。分批加入叔丁基二甲基氯硅烷(25.5mmol;3.85g)的无水吡啶(10mL)溶液。将反应进行4天。将混合物蒸发成固体泡沫体,然后将其在水(200mL)和DCM(4×100mL)之间保持平衡。将有机相用Na2SO4干燥。通过用10%乙酸乙酯的DCM
1
溶液洗脱的硅胶色谱将产物进行纯化。收率为78%。H NMR(CDCl3)δ4.18-4.25(m,4H,OCH2Me),4.10(s,2H,CH2OSi),4.06(s,2H,CH2OH),2.63(br s,1H,OH),1.26(t,J=7.0Hz,
13
6H,OCH2CH3),0.85(s,9H,Si-SMe3),0.05(s,6H,Me-Si)。 C NMR(CDCl3)δ169.2(C=O),
63.3(CH2OH),62.8(CH2OSi),61.6( 螺 C),61.4(OCH2Me),25.6[C(CH3)3],18.0(Si-CMe3),+
14.0(OCH2CH3),-3.6(Si-CH3).MS[M+H] 观测335.7,计算335.2;[M+Na]观测357.6,计算
357.2。
[0238] 2-(叔丁基二甲基甲硅烷基氧基甲基)-2-甲基硫代甲基丙二酸二乙酯(7b)。将化合物7a(19.7mmol;6.59g)溶解在乙酸酐(40mL)、乙酸(12.5mL)和DMSO(61mL)的混合物中,并将混合物搅拌过夜。将反应用冷的Na2CO3(290ml 10%水溶液)稀释而终止。然后将产物在二乙醚(4×120mL)中萃取。将组合的有机相用Na2SO4干燥。使用DCM作为洗1
脱液通过硅胶色谱将产物进行纯化。收率为91%。H NMR(CDCl3)δ4.61(s,2H,OCH2S),
4.14-4.19(m,4H,OCH2Me),4.06(s,2H,CH2OSi),4.00(s,2H,CH2OCH2SMe),2.06(SCH3),
13
1.22(t,J=7.0Hz,6H,OCH2CH3),0.83(s,9H,Si-SMe3),0.02(s,6H,Me-Si). C NMR(CDCl3)δ168.3(C=O),75.6(CH2S),65.7(CH2OCH2SMe),61.4(CH2OSi),61.2(螺C),60.9(OCH2Me),+
25.6[C(CH3)3],18.0(Si-CMe3),14.0(OCH2CH3),13.7(SCH3),-3.6(Si-CH3).MS[M+H] 观测+
395.4,计算395.2;[M+Na] 观测417.6,计算417.2。
[0239] 2-乙酰氧基甲基-2-(叔丁基二甲基甲硅烷基氧基甲基)丙二酸二乙酯(7c)。在通氮下,将化合物7b(17.9mmol;7.08g)溶解在无水DCM(96mL)中。分三次加入硫酰-1
氯(21.5mmol;1.74mL的1.0mol L 的DCM溶液),并将混合物在通氮下搅拌70分钟。减压除去溶剂并将剩余物溶解在无水DCM(53mL)中。加入乙酸钾(30.9mmol;3.03g)和二苯并-18-冠-6(13.5mmol;4.85g)的DCM溶液(50mL),并将混合物搅拌一个半小时。加入乙酸乙酯(140mL),将有机相用水(2×190mL)洗涤并用Na2SO4干燥。使用DCM作为洗
1
脱液通过硅胶色谱将产物进行纯化。收率为71%。H NMR(CDCl3)δ5.24(s,2H,OCH2O),
4.15-4.22(m,4H,OCH2Me),4.13(s,2H,CH2OSi),4.08(s,2H,CH2OAc),2.08(Ac),1.26(t,J=
13
8.0Hz,6H,OCH2CH3),0.85(s,9H,Si-SMe3),0.04(s,6H,Me-Si)。C NMR(CDCl3)δ170.2(Ac),
168.0(C = O),89.3(OCH2O),67.5(CH2OAc),61.4(OCH2Me),61.1(CH2OSi),60.2( 螺 C),+
25.6[C(CH3)3],21.0(Ac),18.1(Si-CMe3),14.0(OCH2CH3),-5.7(Si-CH3)。MS[M+Na] 观测
429.6,计算429.2。
[0240] 2-乙酰氧基甲基-2-羟基甲基丙二酸二乙酯(7)。将化合物7c(7.2mmol;2.93g)溶解在无水THF(23mL)中并加入三乙胺三氟化氢(8.64mmol;1.42mL)。将混合物搅拌一个-1星期。加入三乙基乙酸铵(13mL的2.0mol L 溶液)水溶液。将混合物蒸发至干燥并使用
1
含有2%-5%MeOH的DCM作为洗脱液,通过硅胶色谱将剩余物进行纯化。收率为74%。H NMR(CDCl3)δ5.25(s,2H,OCH2O),4.16-4.29(m,6H,OCH2Me和CH2OAc),4.13(s,2H,CH2OH),+
2.10(Ac),1.81(br s,1H,OH),1.26(t,J=9.0Hz,6H,OCH2CH3)。MS[M+Na] 观测315.3,计算315.1。
[0241] 实施例8
[0242] 3’-O-菊芋糖基-N4-(4-甲氧基三苯甲基)-2’-O-甲基胞苷(8e)
[0243]
[0244] 5’-O-(叔丁基二甲基甲硅烷基)-2’-O-甲基胞苷(8b)。将2’-O-甲基胞苷(8a;18.4mmol;4.74g)从无水吡啶中共蒸发两次,用P2O5干燥(24h)并在无水吡啶(20mL)中溶解。加入叔丁基二甲基氯硅烷(TBDMSCl;20.2mmol;3.05g),并将化合物在室温下搅动过夜。将未反应的TBDMSCl用MeOH淬火,将混合物蒸发至干燥并将剩余物进行氯仿/NaHCO3水溶液处理。用Na2SO4干燥的粗产物的收率是几乎定量的(nearly quantitative)。不
1
进行进一步的纯化将其用于氨基的4-甲氧基三苯甲基化。H NMR(CDCl3):δ8.14(d,J=
7.5Hz,1H,H6),6.00(d,J=1.1Hz;1H,H1’),6.82(d,J=7.5Hz,1H,H5),4.22(dd,J=8.0和5.1Hz,1H,H3’),4.09(dd,J=11.8和1.8Hz,1H,H5’),3.97(m,1H,H4’),3.87(dd,J=
11.8和1.6,1H,H5”),3.73(dd,J=5.1和1.0Hz,1H,H2’),3.67(s,3H,2’-OMe),0.94(s,
9H,Me3C-Si),0.13(s,3H,Me-Si),0.13(s,3H,Me-Si)。
4
[0245] 5’-O-{叔丁基二甲基甲硅烷基)-N-{4-甲氧基三苯甲基)-2’-O-甲基胞苷(8c).将化合物8b(18.4mmol;6.84g)从无水吡啶中共蒸发两次,并将其溶解在相同的溶剂(20mL)中。加入4-甲氧基三苯甲基氯(18.4mmol;5.69g)并将混合物在45℃搅动24h。加入MeOH(20mL),将混合物蒸发至干燥并将剩余物进行氯仿/NaHCO3水溶液处理。使用含有2%-5%MeOH的DCM的硅胶色谱得到为固体泡沫体的化合物8c,其开始于2’-O-甲基
1
胞苷,总收率46%。H NMR(CDCl3)δ7.91(d,J=7.7Hz,1H,H6),7.26-7.33(m,6H,MMTr),
7.21-7.23(m,4H,MMTr),7.13-7.15(m,2H,MMTr),6.82-6.85(m,2H,MMTr),6.77(br.s,
1H,NH),5.99(s,1H,H1’),5.00(d,J = 7.7Hz,1H,H5),4.12(m,1H,H3’),4.02(dd,J =
11.9和1.2Hz,1H,H5’),3.86-3.88(m,1H,H4’),3.81(dd,J=11.9和1.2Hz,1H,H5”),
3.81(s,3H,MeO-MMTr),3.72-3.74(m,4H,H2’和2’-OMe),2.63(br s,1H,3’-OH),0.75(s,
13
9H,Me3C-Si),-0.03(s,3H,Me-Si),-0.05(s,3H,Me-Si)。 C NMR(CDCl3)δ165.6(C4),
158.7(MMTr),155.1(C2),144.4(MMTr),144.3(MMTr),140.9(C6),136.0(MMTr),
130.0(MMTr),128.6(MMTr),128.3(MMTr),127.5(MMTr),113.6(MMTr),94.2(C5),
87.6(C1’),83.9(C2’),83.7(C4’),70.5(MMTr),66.8(C3’),60.5(C5’),58.8(2’-OMe),
55.2(MMTr),25.8(TBDMS),18.3(TBDMS),-5.6(TBDMS),-5.7(TBDMS)。
[0246] 5’-O-(叔丁基二甲基甲硅烷基)-3’-O-菊芋糖基-N4-(甲氧基三苯甲基)-2’-O-甲基胞苷(8d)。将乙酰丙酸(21.6mmol;2.51g)溶解在无水二噁烷并在1小时内在0℃分批加入二环己基碳二亚胺(11.1mmol;2.28g)。将混合物加热以降低其粘度,然后将其过滤成化合物8c(8.46mmol;5.45g)的吡啶(18mL)溶液。将混合物搅动过夜,蒸发至干燥并将剩余物进行DCM/NaHCO3处理。将有机相用Na2SO4干燥,蒸发至干燥并使
1
用含有1%MeOH的DCM作为洗脱液,通过硅胶色谱将剩余物进行纯化。收率为86%。H NMR(CDCl3)δ7.81(d,J=7.7Hz,1H,H6),7.27-7.34(m,6H,MMTr),7.22-7.23(m,4,MMTr),
7.14-7.15(m,2H,MMTr),6.84-6.86(m,2H,MMTr),6.80(br.s,1H,NH),6.07(d,J=1.5Hz,
1H,H1’),4.99(d,J = 1.1Hz,1H,H5),4.97(dd,J = 7.9 和 5.0Hz,1H,H3’),4.21(m,
1H,H2’),3.99-4.01(m,2H,H4’和H5’),3.81(s,3H,MeO-MMTr),3.70(dd,J =12.0 和
1.3Hz,1H,H5”),3.57(s,3H,2’-OMe),2.63-2.83(m,4H,Lev),2.21(s,3H,Lev),0.74(s,
13
9H,Me3C-Si),-0.05(s,3H,Me-Si),-0.07(s,3H,Me-Si)。 C NMR(CDCl3)δ206.1(Lev),
172.0(Lev),165.5(C4),158.7(MMTr),155.1(C2),144.4(MMTr),144.3(MMTr),140.7(C6),
136.0(MMTr),130.0(MMTr),128.6(MMTr),128.3(MMTr),127.5(MMTr),113.6(MMTr),
94.4(C5),88.4(C1’),82.5(C2’),81.3(C4’),70.6(MMTr),69.1(C3’),60.8(C5’),
58.9(2’-OMe),55.2(MMTr),37.8(Lev),29.8(Lev),27.8(Lev),25.7(TBDMS),18.2(TBDMS),-5.7(TBDMS),-5.8(TBDMS)。
[0247] 3’-O-菊芋糖基-N4-(4-甲氧基三苯甲基)-2’-O-甲基胞苷(8e)。将化合物8d(3.40mmol;2.52g)溶解在含有叔丁基氟化铵的THF(48mL)与AcOH(9mL)的混合物中。
将混合物搅动两天,然后蒸发至干燥。将剩余物溶解在EtOAc(50mL)中,用水、NaHCO3水
1
溶液和盐水洗涤,并用Na2SO4干燥。以实际定量收率获得为白色泡沫体的化合物8e。H NMR(CDCl3)δ7.22-7.34(m,11H,H6 和 MMTr),7.12-7.15(m,2H,MMTr),6.89(br.s,1H,NH),6.83-6.85(m,2H,MMTr),5.41(d,J=5.0Hz,1H,H1’),5.31(dd,J=4.6和4.7,1H,H4’)5.07(d,J=7.6Hz,1H,H5),4.58(dd,J=5.0和5.0Hz,1H,H3’),4.18(m,1H,H2’),
3.90(d,J=12.7Hz,1H,H5’),3.81(s,3H,MeO-MMTr),3.71(dd,J=12.7和4.7Hz,1H,H5”),3.45(s,3H,2’-OMe),2.75-2.80(m,2H,Lev),2.63-2.66(m,2H,lev),2.20(s,3H,Lev)。
[0248] 2’-O-甲基胞苷5’-[O-苯基-N-(5-2-甲氧基-1-甲基-2-氧代乙基)]氨基磷酸酯(8)
[0249]
[0250] 3’-O-菊芋糖基-N4-(4-甲氧基三苯甲基)-2’-O-甲基胞苷5’-[O-苯基-N-(S-2-甲氧基-1-甲基-2-氧代乙基)]氨基磷酸酯(8f)。将用P2O5干燥2天的
化合物8e(2.58mmol;1.62g)溶解在无水吡啶(5mL)中,并在通氮下加入二苯基亚磷酸酯(3.09mmol;595μL)。半个小时后,将在无水吡啶(1mL)和MeCN(6mL)的混合物中的细心干燥的L-丙氨酸甲基酯(3.94mmol;0.55g)加入。加入CCl4(15mL)和三乙胺(18.1mmol;2.54mL),然后将反应进行70min。减压除去挥发物并通过DCM中的MeOH含量从1%增加至10%的硅胶色谱将剩余物进行纯化。以70%收率获得为白色泡沫体的化合
1
物8f。H NMR(CDCl3)RP和SP非对映异构体的混合物δ7.02-7.35(m,17H,MMTr和Ph),
4
6.80-6.85(m,3H,MMTr和NH),5.99和6.02(2×d,J=3.2Hz,1H,H1’),4.90-5.00(m,2H,H3’和 H4’),3.88-4.43(m,4H,H5,H2’,H5’,H5”),3.80(s,3H,MMTr),3.68-3.75(m,1H,α
H -Ala,3.63和3.64(2×s,3H,MeO-Ala),3.46和3.52(2×s,3H,2’-OMe),2.74-2.81(m,
2H,Lev),2.59-2.64(m,2H,Lev),2.19和2.20(2×s,3H,Lev),1.88(br s,1H,NH-P),1.27和1.31(2×d,J=7.1Hz,Me Ala)。
[0251] 2’-O-甲基胞苷5’[O-苯基-N-(S-2-甲氧基-1-甲基-2-氧代乙基)]氨基磷酸酯(8)。将化合物8f(1.81mmol;1.57g)溶解在水合肼(7.2mmol;350μL)、吡啶(11.5mL)和AcOH(2.88mL)的混合物中并将反应进行5小时。减压除去挥发物并将剩余物溶解在DCM(50mL)中,并用水、NaHCO3水溶液和盐水洗涤。将有机相用Na2SO4干燥,蒸发至干燥并使用含有4%-6%MeOH的DCM作为洗脱液通过硅胶色谱将剩余物进行纯化。
[0252] 将纯化的产物溶解在80%AcOH水溶液(8mL)中,并将混合物在55℃进行2h并再在65℃进行4.5h。将混合物蒸发至干燥并将剩余物从水中共蒸发两次,然后使用7%至1
20%MeOH的DCM溶液梯度洗脱通过硅胶色谱进行纯化。8的总收率为50%。H NMR(CDCl3)两个非对映异构体的混合物δ7.64和7.68(2×d,J=7.4,1H,H6),7.26-7.33(m,2H,Ph),
7.20-7.24(m,2H,Ph),7.13-7.16(m,1H,Ph),6.32(br s,2H,NH2),5.90和5.94(2×s,1H,H1’),5.69和5.82(2×d,J=7.4,1H,H5),4.35-4.55(m,2H,H5’和H5”),4.12-4.18(m,
2H,H3’和H4’),3.98-4.08(m,2H,α-H-Ala和3’-OH),3.72-3.76(m,1H,2’-OMe),3.67和3.68(2×s,3H,MeO-Ala),3.58和3.60(2×s,3H,2’-OMe),2.45(br s,1H,NH-P),1.37
13
和1.39(2×d,J=7.2Hz,3H,Me-Ala)。 C NMR(CDCl3)δ174.2(C=O Ala),166.0(C4),
155.9(C2),150.5(Ph),140.6(C6),129.8(Ph),125.1(Ph),120(Ph),95.1(C5),88.4(C1’),
83.4(C2’),81.4(C4’),68.1(C3’),65.1(C5’),58.6(2’-OMe),52.5(MeO-Ala),
31 +
50.3(C-Ala),20.7(Me-Ala)。 P NMR δ3.1和3.3.HRMS[M+H] 观测499.1590,计 算+ +
499.1583;[M+Na] 观测521.1438,计算521.1408,[M+K] 观测537.1149,537.1147。
[0253] 实施例9
[0254] 2’,5’-C-二甲基腺苷(9)的制备
[0255]
[0256] 步骤1.5-O-苯甲酰基-1,2-O-异亚丙基-5-C-甲基-3-O-萘基-D-呋喃核糖的制备
[0257]
[0258] 向干燥的1,2;5,6-O-二(异亚丙基)-α-D-异呋喃糖(23.83g,91.55mmol)的无水THF(62mL)溶液中加入粉末状的KOH(36g,642.86mmol),并在室温下搅拌30-40min,然后加入2-(溴甲基)萘(21g),并在通氮下搅拌4-6小时。之后将反应混合物用水淬火并用乙酸乙酯(3×60mL)萃取。将组合有机相用硫酸钠干燥并浓缩成粗剩余物(43.38g),用乙酸(187mL)和水(84mL)将该粗剩余物室温处理14h。在低于35℃的良好真空下将反应混合物浓缩得到粗剩余物,将该粗剩余物用己烷-乙酸乙酯(4∶1)和二氯甲烷-甲醇(10∶1)洗脱的硅胶柱进行处理从而得到纯的为浆汁的3-O-萘基-1,2;5,6-O-二(异亚丙基)-α-D-异呋喃糖(36.57g,100%)。
[0259] 向用冰浴冷却的干燥的3-O-萘基-1,2;5,6-O-二(异亚丙基)-α-D-异呋喃糖(36.57g,101.3mmol)的1,4-二噁烷(214mL)与水(534mL)的混合物冷溶液中加入高碘酸钠(NaIO4)(32g,149.61mmol),并在相同温度下搅拌50分钟。然后将反应混合物用乙酸乙酯(4×50mL)萃取,并将组合有机相用无水硫酸钠干燥并浓缩成粗剩余物,将该粗剩余物在良好真空下干燥数小时并不进行进一步纯化而直接用在接下来的反应中。向用无水冰丙酮冷却至-78℃的上述干燥的粗剩余物(33.38g,101mmol)的无水乙醚(80mL)冷溶液中分批缓慢地加入甲基溴化镁(100mL)(3M的乙醚溶液),并在通氮下,在-78℃至室温搅拌过夜。然后将反应混合物用饱和氯化铵溶液缓慢淬火,并用乙酰乙酸酯(4×60mL)萃取。将组合有机相用无水硫酸钠干燥并将滤液浓缩成1,2-O-异亚丙基-5-C-甲基-3-O-萘基-D-呋喃核糖(28.55g,83.21mmol,82.1%)的粗剩余物,将该粗剩余物在良好的真空下干燥2-3h,并在DMAP(1.01g,8.32mmol)的无水吡啶(80-100mL)溶液的存在下室温用苯甲酰氯(12.87g,91.53mmoL)处理过夜。将反应混合物用甲醇淬火并浓缩成粗剩余物,将该粗剩余物倒入10%碳酸氢钠水溶液中并用乙酸乙酯(4×50mL)萃取。将组合有机相浓缩并用甲苯(3×50mL)共蒸发成粗剩余物,将该粗剩余物用己烷-乙酸乙酯(100∶1,10∶1和4∶1)洗脱的硅胶柱进行处理从而得到纯的5-O-苯甲酰基-1,2-O-异亚丙基-5-C-甲基-3-O-萘基-D-呋喃核糖(22.58g,50.50mmol,61%)。
[0260] 步骤2.5-O-苯甲酰基-2-C,2-O-二脱氢-1-O,5-C-二甲基-3-O-萘基-D-呋喃核糖的制备
[0261]
[0262] 向干燥的5-O-苯甲酰基-1,2-O-异亚丙基-5-C-甲基-3-O-萘基-D-呋喃核糖(13.58g,30.37mmol)的无水甲醇(100mL)溶液中加入4N HCl的1,4-二噁烷(4.9mL)溶液并室温搅拌12h。将反应混合物用三乙胺中和至pH=7.0并浓缩成粗剩余物,将该粗剩余物倒入10%碳酸氢钠水溶液中并用二氯甲烷(4×20mL)萃取。将组合有机相浓缩并用甲苯共蒸发成粗剩余物,将该粗剩余物用己烷-乙酸乙酯(4∶1)洗脱的硅胶柱进行处理从而得到纯5-O-苯甲酰基-1-O,5-C-二甲基-3-O-萘基-D-呋喃核糖(12.60g,29.93mmol,98.5%)。向用无水冰丙酮冷却至-75℃的DMSO(12.72mL,178.32mmol)的二氯甲烷(50mL)冷溶液中加入三氟乙酸酐(TFAA)(7.6mL,53.87mmol)并在相同温度下搅拌30分钟。一次加入5-O-苯甲酰基-1-O,5-C-二甲基-3-O-萘基-D-呋喃核糖(12.60g,29.93mmol)的无水二氯甲烷(10mL)溶液,然后将其加热至-20℃至-15℃,并在相同温度下搅拌2h,随后加入三乙胺(20mL)并加热至室温(RT),并室温搅拌1h。然后将反应混合物用水淬火,并用二氯甲烷(3×50mL)萃取。将组合有机相用硫酸钠干燥,并将滤液浓缩成粗剩余物,将剩余物用己烷-乙酸乙酯(20∶1和1∶1)洗脱的硅胶短柱进行处理从而得到为非晶固体的5-O-苯甲酰基-2-C,2-O-二脱氢-1-O,5-C-二甲基-3-O-萘基-D-呋喃核糖(10.03g,
23.90mmol,80%)。
[0263] 步骤3.2,3,5-O-三苯甲酰基-1-O,2,5-C-三甲基-D-呋喃核糖的制备。
[0264]
[0265] 向用无水冰丙酮冷却至-30℃至-15℃的干燥的5-O-苯甲酰基-2-C,2-O-二脱氢-1-O,5-C-二甲基-3-O-萘基-D-呋喃核糖(7.76g,18.52mmol)的无水四氢呋喃(THF)(50ml)与无水乙醚(30mL)的混合物冷溶液中缓慢加入甲基溴化镁(CH3MgBr)(35mL)(3.0M的醚溶液),并在通氮下在相同温度下搅拌6h,然后从-15℃至室温过夜。将反应混合物用饱和氯化铵水溶液小心淬火,并用乙酸乙酯(4×60mL)萃取。将组合有机相浓缩并用甲苯(3×20mL)共蒸发成粗剩余物,将该粗剩余物通过用己烷-乙酸乙酯(20∶1)和二氯甲烷-甲醇(10∶1)洗脱的硅胶柱进行处理得到为浆汁的纯的5-O-苯甲酰基-3-O-萘基-1-O,2,5-C-三甲基-D-呋喃核糖(5.32g,16.12mmol,87%)。
[0266] 向干燥的5-O-苯甲酰基-2-C,2-O-二脱氢-3-O-萘基-1-O,2,5-C-三甲基-D-呋喃核糖(10.03g,30.39mmol)和DMAP(1g,8.20mmoL)的无水吡啶(28mL)溶液中加入苯甲酰基氯(11.65g,9.62mL,82.88mmol)并在室温通氮搅拌过夜。然后将反应混合物用甲醇淬火并浓缩成粗剩余物,将该粗剩余物倒入10%碳酸氢钠水溶液中,并用乙酸乙酯(3×20mL)萃取。将组合有机相浓缩并用甲苯共蒸发成粗剩余物,将该粗剩余物通过用己烷-乙酸乙酯(50∶1和10∶1)洗脱的硅胶短柱进行处理得到为非晶固体的纯的2,5-O-二苯甲酰基-3-O-萘基-1-O,2,5-C-三甲基-D-呋喃核糖(9.17g,65%)。
[0267] 向2,5-O-二苯甲酰基-3-O-萘基-1-O,2,5-C-三甲基-D-呋喃核糖(9.17g,17.04mmol)的二氯甲烷(20mL)与水(1mL)混合物溶液加入DDQ(4.45g,19.60mmol)并室温搅拌6h。将反应混合物用二氯甲烷(100mL)稀释,倒入10%碳酸氢钠水溶液中,将有机相分离并将水相用二氯甲烷(3×50mL)萃取。将组合有机相用饱和碳酸氢钠水溶液洗涤直至除去所有的DDQ。将有机相浓缩并用甲苯共蒸发成粗剩余物,将该粗剩余物在DMAP(650mg)的无水吡啶(20mL)溶液的存在下室温用BzCl(4.88g,34.69mmol)进一步处理过夜。然后将反应混合物用甲醇淬火并浓缩成粗剩余物,将该剩余物倒入饱和碳酸氢钠溶液并用乙酸乙酯(4×50mL)萃取。将组合有机相用无水硫酸钠干燥并将滤液浓缩成粗剩余物,将该粗剩余物通过用己烷-乙酸乙酯(30∶1和1O∶1)洗脱的硅胶短柱进行处理得到纯的非晶固体的2,3,5-O-三苯甲酰基-1-O,2,5-C-三甲基-D-呋喃核糖(4.21g,8.38mmol,49.20%)。
[0268] 步骤4:2,3,5-O-三苯甲酰基-1-O,2,5-C-三甲基-D-呋喃核糖的制备。
[0269]
[0270] 向用冰浴冷却的干燥的2,3,5-O-三苯甲酰基-1-O,2,5-C-三甲基-D-呋喃核糖(2.43g,4.84mmol)的乙酸酐(10mL)冷溶液中加入乙酸酐(10mL)和浓硫酸(H2SO4)(95-98%)(243μL)的冷混合物,并在相同温度搅拌1h。然后将反应混合物倒入饱和碳酸氢钠水溶液中搅拌直至混合物的pH为7,并用乙酸乙酯(3×30mL)萃取。将组合有机相浓缩并用甲苯(3×15mL)共蒸发成粗剩余物,将该粗剩余物用己烷-乙酸乙酯(20∶1和10∶1)洗脱的硅胶柱进行处理得到1-O-乙酰基-2,5-C-二甲基-2,3,5-O-三苯甲酰基-D-呋喃核糖(1.6g,3.02mmol,62%)。
[0271] 步骤5:2’,5’-C-二甲基腺苷的制备
[0272]
[0273] 向用冰浴冷却的N6-苯甲酰基腺嘌呤(99mg,0.415mmol)和1-O-乙酰基-2,5-C-二甲基-2,3,5-O-三苯甲酰基-D-呋喃核糖(220mg,0.415mmol)的无水ACN(5mL)冷溶液中加入TMSOTf(165μL)并在相同温度下搅拌1h。然后将反应混合物用三乙胺中和并浓缩成粗剩余物,将该粗剩余物用甲醇-氨(7N)室温进一步处理4天。然后将反应混合物浓缩并用甲苯共蒸发成粗剩余物,将该粗剩余物用二氯甲烷-甲醇(10∶1和6∶1)洗脱的硅胶短柱进行处理得到为非晶固体的纯的2’,5’-C-二甲基腺苷。
[0274] 实施例10
[0275] 2’,5’-二甲基胞苷(10)的制备
[0276]
[0277] 将在新蒸馏的1,1,1,3,3,3-六甲基硅氮烷(30mL)中的N4-乙酰基胞嘧啶(576mg,3.76mmol)和(NH4)2SO4(20mg)搅拌悬浮液在氮气下加热回流过夜。将透明溶液真空蒸发,并加入无水甲苯(20mL)随后将其蒸馏掉。将所获得的粗二-(三甲基甲硅烷基)衍生物溶解在无水乙腈(30mL),并加入1-O-乙酰基-2,5-C-二甲基-2,3,5-O-三苯甲酰基-D-呋喃核糖(1.0g,1.88mmol)。在氮气下将混合物在冰水浴中冷却,然后强力搅拌下逐滴加入TMSOTf(0.5mL)。将所得到的均相浅黄色溶液搅拌过夜。TLC显示仍存在大量的物质。将混合物在冰水浴中冷却,并逐滴加入另一组TMSOTf(0.5ml)。将所得到的混合物进一步搅拌过夜。通过加入10%NaHCO3(20mL)将反应小心淬火,并另搅拌15min。将沉淀物过滤并将滤液用DCM(60mL×2)萃取。将组合有机相用盐水洗涤并用无水Na2SO4干燥。溶剂蒸发后,通过用PE∶EA=2∶1洗脱的硅胶色谱将剩余物纯化以得到为泡沫固体的N4-乙酰基-2,
5-C-二甲基-2,3,5-O-三苯甲酰基胞苷(660mg,56.1%)。
[0278] 将N4-乙酰基-2,5-C-二甲基-2,3,5-O-三苯甲酰基胞苷(660mg,1.05mmol)溶解在用NH3饱和的无水MeOH中。将混合物加热至60℃-70℃同时在密封管中持续搅拌两天。真空除去溶剂并将剩余物通过制备型HPLC纯化得到2,5-C-二甲基胞苷(120mg,41.93%和
22mg,7.7%)。2,5-C-二甲基胞苷(非对映异构体1)的1H NMR:(MeOD):δ7.73-7.75(d,J=8.0Hz,1H),6.04(s,1H),5.64-5.66(d,J=8.0Hz,1H),4.05-4.07(dd,J1=2.4Hz,J2=4.8Hz,1H),3.93-3.99(m,1H),3.90(d,J=2.4Hz,1H),1.23-1.24(d,J= 6.4Hz,3H)D
1.16(s,3H)。
[0279] 实施例11
[0280] 2’,5’-二甲基尿苷(11)的制备
[0281]
[0282] 利用与实施例10中所述的相似的方法制备2,5-C-二甲基尿苷。2,5-C-二甲基1
尿苷(非对映异构体2)的 H NMR:(MeOD):δ7.73-7.75(d,J=8.0Hz,1H),6.01(s,1H),
5.63-5.65(d,J=8.0Hz,1H),4.08-4.10(dd,J1=2.0Hz,J2=5.6Hz,1H),4.06(d,J=
2.0Hz,1H),3.96-4.00(m,1H),1.21-1.22(d,J=6.4Hz,3H)□1.18(s,3H)。
[0283] 实施例12
[0284] 2’-脱氧-2’-氟-5’-C-甲基腺苷(12)的制备
[0285]
[0286] 步骤1.3’,N6-二(4,4’-二甲氧基三苯甲基)-5’-O-(叔丁基二甲基甲硅烷基)-2’-脱氧-2’-氧腺苷的制备。
[0287]
[0288] 将 0.27g(1.0mmol) 的 2’- 脱 氧 -2’- 氟 腺 苷、DMAP(244mg,2.0mmol) 和TBDMS-Cl(1.1mmol,181mg)在无水吡啶(15mL)中的混合物室温搅拌过夜,然后在30℃搅拌8小时。加入DMTr-Cl(1.0g,3mmol)然后将混合物在56℃搅拌3天,冷却至0℃并用水(1.5mL)淬火。将所得到的混合物室温搅拌2小时,用乙酸乙酯稀释,用盐水洗涤3次,并用硫酸钠干燥。通过用20%-35%乙酸乙酯的己烷溶液的硅胶色谱得到为白色泡沫体的746mg的3’,N6-二(4,4’-二甲氧基三苯甲基)-5’-O-(叔丁基二甲基甲硅烷基)-2’-脱氧-2’-氟腺苷。
[0289] 步骤2.3’,N6-二(4,4’-二甲氧基三苯甲基)-5’-脱氢-2’-脱氧-2’-氟腺苷的制备。
[0290]
[0291] 将3’,N6-二(4,4’-二甲氧基三苯甲基)-5’-O-(叔丁基二甲基甲硅烷基)-2’-脱氧-2’-氟腺苷(0.73g,0.74mmol)和TBAF(1.0M的THF溶液,1.5mL)的THF(6mL)溶液室温静置过夜然后室温浓缩。通过用丙酮-己烷(2∶3)的硅胶色谱得到为白色固体的5’-羟基产物,将该产物溶解在无水DCM(12mL)中。加入吡啶(0.9mL)和戴斯-马丁氧化剂(0.39g)。在氩气下将反应混合物在25℃搅拌2小时,用DCM稀释,用10%Na2S2O3洗涤两次,并盐水洗涤1次。通过用丙酮-己烷(1∶3至2∶3)的硅胶色谱获得606mg的3’,
6
N-二(4,4’-二甲氧基三苯甲基)-5’-脱氢-2’-脱氧-2’-氟腺苷。
[0292] 步骤3.2’-脱氧-2’-氟-5’(R和S)-C-甲基腺苷的合成。
[0293]
[0294] 在氩气下,在0℃向3’,N6-二(4,4’-二甲氧基三苯甲基)-5’-脱氢-2’-脱氧-2’-氟腺苷(600mg,0.686mmol)的THF(7mL)溶液中加入MeMgBr(1.4M的THF溶液,2mL)。在氩气下,将反应混合物在0℃搅拌过夜。再加入MeMgBr(1.4mL)并将反应混合物在0℃搅拌2小时,然后在室温搅拌30分钟。冷却至0℃后,将反应混合物用10%硫酸铵非常缓慢地淬火,用乙酸乙酯稀释,并用10%硫酸铵洗涤2次,用10%碳酸氢钠洗涤1次。通
6
过用丙酮-己烷(1∶3至2∶3)的硅胶色谱得到315mg的3’,N-二(4,4’-二甲氧基三苯甲基)-2’-脱氧-2’-氟-5’(R和S)-C-甲基腺苷(216mg的位于TLC上部的异构体和
99mg的两种异构体的混合物,其均为白色固体)。
[0295] 将3’,N6-二(4,4’-二甲氧基三苯甲基)-2’-脱氧-2’-氟-5’(R或S)-C-甲基腺苷(位于TLC上部的异构体,215mg)溶解在5mL的THF、8mL的AcOH和5mL的水中。将溶液在30℃搅拌15小时,浓缩至干燥并用甲苯共蒸发3次。通过用10%-12%MeOH的DCM溶剂液的硅胶色谱得到为白色固体的55mg的2’-脱氧-2’-氟-5’(R或S)-C-甲基腺苷;1
H NMR(DMSO)δ1.16(d,J=6.4Hz,1H),3.79-3.85(m,2H,H4’和H5’),4.45(ddd,JH,H=
6.4和3.2Hz,JH,F=16.4Hz,1H,H3’),5.26(d,J=6.0Hz,1H,OH),5.40(ddd,JH,H=4.0和3.2Hz,JHF=53.2Hz,1H,H2’),5.68(d,J=6.0Hz,1H,OH),6.23(dd,JH,H=3.2Hz,JH,F=15.6Hz,1H,H1’),7.38(s,2H,NH2),8.15(s,1H,H8),8.41(s,1H,H2)。
[0296] 将3’,N6-二(4,4’-二甲氧基三苯甲基)-2’-脱氧-2’-氟-5’(R和S)-C-甲基腺苷(作为多数部分的上部异构体和作为少数部分的下部异构体,99mg)溶解在3mL的THF、3mL的AcOH和3mL的水中并在室温搅拌过夜。在旋转蒸发仪上除去THF并将剩余的溶液在45℃下加热45分钟,浓缩并用甲苯共蒸发3次。通过用10%-12%MeOH的DCM溶液的硅胶色谱得到22mg的2’-脱氧-2’-氟-5’(R和S)-C-甲基腺苷。
[0297] 实施例13
[0298] 2’-脱氧-2’-氟-5’-C-甲基胞苷(13)的制备
[0299]
[0300] 步骤1.3-O-,N4-二(4-甲氧基三苯甲基)-5’-O-(叔丁基二甲基甲硅烷基)-2’-脱氧-2’-氟胞苷的制备。
[0301]
[0302] 将2’-脱氧-2’-氟胞苷(20.0g,81.6mmol)和TBDMS-Cl(14.8g,97.9mmol)的无水吡啶(200mL)溶液室温搅拌过夜并浓缩。将剩余物用乙酸乙酯稀释,用盐水洗涤,用无水Na2SO4干燥并浓缩以得到为白色固体的24g(82%)的5’-O-(叔丁基二甲基甲硅烷基)-2’-脱氧-2’-氟胞苷。
[0303] 向MMTr-Cl(13g,41.7mmol)、5’-O-(叔丁基二甲基甲硅烷基)-2’-脱氧-2’-氟胞苷(5g,13.9mmol)和三甲基吡啶(19g,153mmol)的无水DCM(50mL)溶液中加入硝酸(7g,41.7mmol)。将反应混合物室温搅拌过夜,过滤和用饱和NaHCO3和盐水洗涤。将有机层用Na2SO4干燥并浓缩。通过用乙酸乙酯-石油醚(1∶2至1∶1)的硅胶色谱得到11g(87%)
4
的3’-O-,N-二(4-甲氧基三苯甲基)-5’-O-(叔丁基二甲基甲硅烷基)-2’-脱氧-2’-氟胞苷。
4
[0304] 步骤2.3-O-,N-二(4-甲氧基三苯甲基)-5’-C,5’-O-二脱氢-2’-脱氧-2’-氟胞苷的制备。
[0305]4
[0306] 在0℃向3’-O-,N-二(4-甲氧基三苯甲基)-5’-O-(叔丁基二甲基甲硅烷基)-2’-脱氧-2’-氟胞苷(11g,12mmol)的无水THF(100mL)溶液中逐滴加入TBAF(24mL,1.0M的THF溶液)。将溶液室温搅拌过夜,然后室温真空除去溶剂。将剩余物溶解在乙酸乙酯中,用水和盐水洗涤,用Na2SO4干燥并浓缩。通过用丙酮/石油醚(1∶3)的硅胶色谱
4
以得到9g(93%)的3’-O-,N-二(4-甲氧基三苯甲基)-2’-脱氧-2’-氟胞苷。在N2下
4
在0℃向3’-O-,N-二(4-甲氧基三苯甲基)-2’-脱氧-2’-氟胞苷(4g,5mmol)的无水DCM(30mL)溶液加入吡啶(6mL,15eq)和戴斯-马丁氧化剂(2.6g,6mmol)。将反应混合物室温搅拌2小时,用乙酸乙酯稀释,用10%Na2S2O3洗涤两次,然后用盐水洗涤,用无水Na2SO4干燥并浓缩。通过用丙酮-石油醚(1∶3至2∶3)的硅胶色谱得到3.5g(87%)的3-O-,
4
N-二(4-甲氧基三苯甲基)-5’-C,5’-O-二脱氢-2’-脱氧-2’-氟胞苷。
[0307] (13)
[0308] 步骤3.2’-脱氧-2’-氟-5(R和S)-C-甲基胞苷的制备。
[0309]
[0310] 在冰EtOH浴中,在N2下向3-O-,N4-二(4-甲氧基三苯甲基)-5’-C,5’-O-二脱氢-2’-脱氧-2’-氟胞苷(3g,3.8mmol)的无水THF(50mL)溶液中逐滴加入MeMgBr(3.0M的乙醚溶液,15.2mmol)。将反应混合物室温搅拌5小时,用饱和NH4Cl淬火,用乙酸乙酯稀释,用盐水洗涤,用无水Na2SO4干燥并浓缩以得到粗产物。通过用丙酮-石油醚(1∶34
至2∶3)的硅胶色谱得到1.8g(58%)的纯3-O-,N-二(4-甲氧基三苯甲基)-2’-脱
氧-2’-氟-5’(R或S)-C-甲基胞苷。
[0311] 将3-O-,N4-二(4-甲氧基三苯甲基)-2’-脱氧-2’-氟-5’(R或S)-C-甲基胞苷(600mg,0.75mmol)的AcOH/H2O(v/v 4∶1,20mL)溶液在50℃搅拌过夜。将溶液浓缩,用水稀释,用乙酸乙酯萃取两次并浓缩至干燥。通过在反相HPLC上色谱和之后的在手性HPLC1
上的色谱得到2’-脱氧-2’-氟-5’(R或S)-C-甲基胞苷(30mg,16%);H NMR(CD3OD):
δ8.16(d,J=7.6Hz,1H,H6),5.99(dd,J=17.6Hz,1.2Hz,1H,H1’),5.92(d,J=7.6Hz,
1H,H5),5.06-4.92(m,1H,H2’),4.28(ddd,JH,H= 8.4,4.4Hz,JH,F= 21.6Hz,1H,H3’),
4.02(dq,J=4.0,2.8Hz,1H,H5’),3.87(dd,J=8.0,2.0Hz,1H,H4’),1.38(d,J=6.4Hz,
3H,Me)。
[0312] 实施例14
[0313] 2’-脱氧-2’,2’-二氟-5’(S)-C-甲基胞苷(14)的制备
[0314]
[0315] 步骤1.3-O-,N4-二(4-甲氧基三苯甲基)-5’-O-(叔丁基二甲基甲硅烷基)-2’-脱氧-2’,2’-二氧胞苷的制备。
[0316]
[0317] 在N2下,在0℃向2’-脱氧-2’,2’-二氟胞苷盐酸盐(17.0g,57.7mmol)的无水吡啶(100mL)溶液中加入TBDMS-Cl(10.5g,69.3mmol)。将反应混合物室温搅拌过夜,浓缩,用乙酸乙酯稀释,用盐水洗涤,用无水Na2SO4干燥并浓缩得到为白色固体的5’-O-(叔丁基二甲基甲硅烷基)-2’-脱氧-2’,2’-二氟胞苷(21g,96%)。
[0318] 向5’-O-(叔丁基二甲基甲硅烷基)-2’-脱氧-2’,2’-二氟胞苷(5g,13.5mmol)的无水DCM(50mL)溶液中加入MMTr-Cl(13g,41mmol,3eq),随后加入AgNO3(7g,41mmol)和三甲基吡啶(19g,153mmol)。在N2下将反应混合物室温搅拌过夜,过滤,用饱和NaHCO3洗涤然后用盐水洗涤。将有机层用Na2SO4干燥并浓缩。通过用乙酸乙酯-石油醚(1∶3至4
1∶2)的硅胶色谱得到3-O-,N-二(4-甲氧基三苯甲基)-5’-O-(叔丁基二甲基甲硅烷基)-2’-脱氧-2’,2’-二氟胞苷(11g,83%)。
4
[0319] 步骤2.3-O-,N-二(4-甲氧基三苯甲基)-5’-C,5’-O-二脱氢-2’-脱氧-2’,2’-二氯胞苷的制备。
[0320]
[0321] 在0℃向3-O-,N4-二(4-甲氧基三苯甲基)-5’-O-(叔丁基二甲基甲硅烷基)-2’-脱氧-2’,2’-二氟胞苷(10.0g,10.8mmol)的无水THF(40mL)溶液中逐滴加入TBAF(1M的THF溶液,21.6mL)。将所得溶液室温搅拌过夜,浓缩,用乙酸乙酯稀释,用盐水洗涤,用无水Na2SO4干燥并浓缩。通过用乙酸乙酯-DCM(1∶10至1∶5)的硅胶色谱得到
4
3-O-,N-二(4-甲氧基三苯甲基)-2’-脱氧-2’,2’-二氟胞苷(4.4g,50%)。
[0322] 在N2下,向用冷水冷却的无水吡啶(960μL,12mmol)的无水DMSO(10mL)搅拌溶液中加入TFA(460μL,6mmol)。加入后,将TFA/吡啶溶液加热至室温,并在N2下加入至用冷水4
冷却的3-O-,N-二(4-甲氧基三苯甲基)-2’-脱氧-2’,2’-二氟胞苷(8.1g,10mmol)和DCC(6.2g,30mmol)的无水DMSO(30mL)搅拌溶液。将反应混合物室温搅拌过夜,用水(20mL)淬火,室温搅拌1h并用EA稀释。将沉淀物过滤并用EA洗涤。将组合EA溶液用盐水洗涤,用无水Na2SO4干燥并浓缩以得到剩余物,将该剩余物通过硅胶柱(PE/EA=1/1至1/3)纯
4
化得到3-O-,N-二(4-甲氧基三苯甲基)-5’-C,5’-O-二脱氢-2’-脱氧-2’,2’-二氟胞苷(6.2g,76%)。
[0323] 步骤3.3-O-,N4-二(4-甲氧基三苯甲基)-5’-脱氢-2’-脱氧-2’,2’-二氟胞苷的制备。
[0324]4
[0325] 在N2下向在冰乙醇浴中的粗3-O-,N-二(4-甲氧基三苯甲基)-5’-脱氢-2’-脱氧-2’,2’-二氟胞苷(6.0g,7.4mmol)的无水THF(30mL)溶液中逐滴加入MeMgBr(3.0M的乙醚溶液,10mL,30mmol)。将反应混合物室温搅拌过夜,用饱和NH4Cl淬火,用乙酸乙酯稀释,用盐水洗涤,用无水Na2SO4干燥并浓缩。通过使用乙酸乙酯-石油醚(1∶3至1∶1)的硅4
胶色谱得到3.6g的3-O-,N-二(4-甲氧基三苯甲基)-2’-脱氧-2’,2’-二氟-5’-C-甲基胞苷(59%)。
[0326] 步骤4.2’-脱氧-2’,2’-二氟-5’(S)-C-甲基胞苷的制备。
[0327]
[0328] 将3-O-,N4-二(4-甲氧基三苯甲基)-2’-脱氧-2’,2’-二氟-5’(R和S)-C-甲基胞苷(3g,3.65mmol)的AcOH/H2O(20mL,v/v 4∶1)溶液在50℃搅拌过夜。除去溶剂后,将剩余物用水稀释,用乙酸乙酯萃取两次并浓缩。通过反相HPLC色谱得到为白色固体的1
0.3g(30%)的2’-脱氧-2’,2’-二氟-5’(S)-C-甲基胞苷;H NMR(CD3OD)δ7.93(d,J=
7.6MHz,1H,H6),6.24(t,JH,F=8.0Hz,1H,H1’),5.95(d,J=7.6MHz,1H,H5),4.26(dt,JH,H=8.4Hz,JH,F=12.4Hz,1H,H3’),4.03(dq,J=4.0,2.7Hz,1H,H5’),3.74(dd,J=8.4,
2.8Hz,1H,H4’),1.37(d,J=6.4MHz,3H)。
[0329] 实施例15
[0330] 2’-脱氧-2’,2’-二氟-5’(R)-C-甲基胞苷(15)
[0331]
[0332] 步骤1.3-O,N4-二(4-甲氧基三苯甲基)-2’-脱氧-2’,2’-二氟-5’(R)-甲基胞苷的制备。
[0333]
[0334] 在氩气下,在0℃向粗3-O-,N4-二(4-甲氧基三苯甲基)-5’-脱氢-2’-脱氧-2’,2’-二氟胞苷(580mg,0.72mmol)的无水THF(8mL)溶液中逐滴加入MeMgBr(1.4M的THF溶液,2.6mL,3.6mmol)。将反应混合物室温搅拌3小时,用冰冷却,用(NH4)2SO4水溶液淬火,用乙酸乙酯稀释,用(NH4)2SO4水溶液洗涤四次,然后用盐水洗涤,用无水Na2SO4干燥并浓缩。通过用乙酸乙酯-己烷(55∶45至70∶30)的硅胶色谱得到317mg的3-O-,N4-二(4-甲氧基三苯甲基)-2’-脱氧-2’,2’-二氟-5’(S)-C-甲基胞苷和44mg的3-O-,N4-二(4-甲氧基三苯甲基)-2’-脱氧-2’,2’-二氟-5’(R)-C-甲基胞苷。
[0335] 步骤2.2’-脱氧-2’,2’-二氟-5’(R)-C-甲基胞苷的制备
[0336]
[0337] 在40℃将3-O-,N4-二(4-甲氧基三苯甲基)-2’-脱氧-2’,2’-二氟-5’(R)-C-甲基胞苷(44mg 0.53mmol)的AcOH/H2O(3mL,v/v 4∶1)溶液搅拌过夜。除去溶剂后,将剩余物用甲苯共蒸发两次。通过用10%-15%MeOH的DCM溶液的硅胶色谱得到为白色固体的9mg的2’-脱氧-2’,2’-二氟-5’(R)-C-甲基胞苷。
[0338] 实施例16
[0339] 2’-脱氧-2’-氟-5’(S)-C-甲基腺苷(16)的制备
[0340]6
[0341] 步骤1.5’-O-(叔丁基二甲基甲硅烷基)-2’-脱氧-3’-O,N-二(4,4’-二甲氧基三苯甲基)-2’-氟腺苷的制备
[0342]
[0343] 将在无水吡啶(15mL)中的0.27g(1.0mmol)的2’-脱氧-2’-氟腺苷、DMAP(244mg,2.0mmol)和TBDMS-Cl(1.1mmol,181mg)的混合物室温搅拌过夜,然后在30℃搅拌8h。加入DMTr-Cl(1.0g,3mmol)并将混合物在56℃搅拌3天,冷却至0℃并用水(1.5mL)淬火。
将所得混合物室温搅拌2h,用乙酸乙酯稀释,用盐水洗涤三次并用硫酸钠干燥。通过用
20%-35%乙酸乙酯的己烷溶液的硅胶色谱得到746mg的5’-O-(叔丁基二甲基甲硅烷
6
基)-2’-脱氧-3’-O,N-二(4,4’-二甲氧基三苯甲基)-2’-氟腺苷。
[0344] 步骤2.2’-脱氧-5’-C,5’-O-二脱氢-3’-O,N6-二(4,4’-二甲氧基三苯甲基)-2’-氟腺苷的制备
[0345]
[0346] 将5’-O-(叔丁基二甲基甲硅烷基)-2’-脱氧-3’,N6-二(4,4’-二甲氧基三苯甲基)-2’-氟腺苷(0.73g,0.74mmol)和TBAF(1.0M的THF溶液,1.5mL)的THF(6mL)溶液室温搅拌过夜,然后在室温浓缩。通过用丙酮-己烷(2∶3)的硅胶色谱得到为白色固体的5’-羟基产物,将该产物溶解在无水DCM(12mL)中。加入吡啶(0.9mL)和戴斯-马丁氧化剂(0.39g)。在氩气下将反应混合物在25℃搅拌2h,用DCM稀释,用10%Na2S2O3洗涤两次并用盐水洗涤1次。通过用丙酮-己烷(1∶3至2∶3)的硅胶色谱得到为白色泡沫体的
6
606mg的2’-脱氧-5’-C,5’-O-二脱氢-3’-O,N-二(4,4’-二甲氧基三苯甲基)-2’-氟腺苷。
[0347] 步骤3.2’-脱氧-2’-氟-5’(R和S)-C-甲基腺苷的制备
[0348]
[0349] 在0℃,在氩气下向2’-脱氧-5’-C,5’-O-二脱氢-3’-O,N6-二(4,4’-二甲氧基三苯甲基)-2’-氟腺苷(600mg,0.686mmol)的THF(7mL)溶液中加入MeMgBr(1.4M的THF溶液,2mL)。在氩气下,将反应混合物在0℃搅拌过夜。加入更多的MeMgBr(1.4mL)并将反应混合物在0℃搅拌2h,然后在室温搅拌30分钟。冷却至0℃后,将反应混合物用10%硫酸铵非常缓慢地淬火,用乙酸乙酯稀释并用10%硫酸铵洗涤两次并用10%碳酸氢钠洗涤1次。通过用丙酮-己烷(1∶3至2∶3)的硅胶色谱得到均为白色泡沫体的315mg的3’-O,6
N-二(4,4’-二甲氧基三苯甲基)-2’-脱氧-2’-氟-5’(R和S)-C-甲基腺苷(216mg的
5’(S)-异构体)和99mg的5’(S)-异构体与5’(R)-异构体的混合物。
[0350] 将3’-O,N6-二(4,4’-二甲氧基三苯甲基)-2’-脱氧-2’-氟-5’(S)-C-甲基腺苷(位于TLC的上部,215mg)溶解在5mL的THF、8mL的AcOH和5mL的水中。将溶液在30℃搅拌15h,浓缩至干燥并用甲苯共蒸发3次。通过用10%-12%MeOH的DCM溶液的硅
1
胶色谱得到为白色固体的55mg的2’-脱氧-2’-氟-5’(S)-C-甲基腺苷;H NMR(DMSO)δ1.16(d,J=6.4Hz,1H),3.79-3.85(m,2H,H4’和H5’),4.45(ddd,JH,H=6.4和3.2Hz,JH,F=16.4Hz,1H,H3’),5.26(d,J=6.0Hz,1H,OH),5.40(ddd,JH,H=4.0和3.2Hz,JH,F=
53.2Hz,1H,H2’),5.68(d,J=6.0Hz,1H,OH),6.23(dd,JH,H=3.2Hz,JH,F=15.6Hz,1H,H1’),7.38(s,2H,NH2),8.15(s,1H,H8),8.41(s,1H,H2)。
[0351] 将2’-脱氧-3’,N6-二(4,4’-二甲氧基三苯甲基)-2’-氟-5’(R和S)-C-甲基腺苷(作为多数部分的上部异构体和作为少数部分的下部异构体,99mg)溶解在3mL的THF、3mL的AcOH和3mL的水中,并室温搅拌过夜。在旋转蒸发仪上除去THF,将剩余的溶液在45℃加热45min,浓缩,用甲苯共蒸发3次。通过用10-12%MeOH的DCM溶液的硅胶色谱得到为白色固体的22mg的2’-脱氧-2’-氟-5’(R和S)-C-甲基腺苷。
[0352] 实施例17
[0353] 2’-脱氧-2’-氟-5’-C-甲基胞苷(17)的制备
[0354]4
[0355] 步骤1.5’-O-(叔丁基二甲基甲硅烷基)-2’-脱氧-3-O,N-二(4-甲氧基三苯甲基)-2’-氟胞苷的制备
[0356]
[0357] 将2’-脱氧-2’-氟胞苷(20.0g,81.6mmol)和TBDMS-Cl(14.8g,98.2mmol)的无水吡啶(200mL)溶液室温搅拌过夜然后浓缩。将剩余物用乙酸乙酯稀释,用盐水洗涤,用无水Na2SO4干燥并浓缩得到为白色固体的24g(82%)的5’-O-(叔丁基二甲基甲硅烷基)-2’-脱氧-2’-氟胞苷。
[0358] 将硝酸银(7g,41.2mmol)加入至MMTr-Cl(13g,42.2mmol)、5’-O-(叔丁基二甲基甲硅烷基)-2’-脱氧-2’-氟胞苷(5g,13.9mmol)与三甲基吡啶(19g,157mmol)的无水DCM(50mL)溶液中。将反应混合物室温搅拌过夜,过滤,并用饱和NaHCO3和盐水洗涤。将有机层用Na2SO4干燥并浓缩。通过用乙酸乙酯-石油醚(1∶2至1∶1)的硅胶色谱得到4
11.5g(91%)的5’-O-(叔丁基二甲基甲硅烷基)-2’-脱氧-3’-O-N-二(4-甲氧基三苯甲基)-2’-氟胞苷。
[0359] 步骤2.2’-脱氧-5’-C,5’-O-二脱氢-3-O-,N4-二(4-甲氧基三苯甲基)-2’-氟胞苷的制备
[0360]
[0361] 在0℃向5’-O-(叔丁基二甲基甲硅烷基)-2’-脱氧-3’-O-,N4-二(4-甲氧基三苯甲基)-2’-氟胞苷(11g,12.2mmol)的无水THF(100mL)溶液中逐滴加入TBAF(24.4mL,1.0M的THF溶液)。将溶液室温搅拌过夜,然后室温真空除去溶剂。将剩余物溶解在乙酸乙酯中,用水和盐水洗涤,用Na2SO4干燥并浓缩。通过用丙酮/石油醚(1∶3)的凝胶色谱
4
得到9g(93%)的2’-脱氧-3’-O-,N-二(4-甲氧基三苯甲基)-2’-氟胞苷。
[0362] 在N2下,在0℃向2’-脱氧-3’-O-,N4-二(4-甲氧基三苯甲基)-2’-氟胞苷(4g,5.0mmol)的无水DCM(30mL)溶液中加入吡啶(6mL)和戴斯-马丁氧化剂(2.6g,6.1mmol)。
将室温搅拌2h,用乙酸乙酯稀释,用10%Na2S2O3洗涤两次然后用盐水洗涤,用无水Na2SO4干燥并浓缩。通过用丙酮-石油醚(1∶3至2∶3)的硅胶色谱得到3.5g(87%)的2’-脱
4
氧-5’-C,5’-O-二脱氢-3-O-,N-二(4-甲氧基三苯甲基)-2’-氟胞苷。
[0363] 步骤3.2’-脱氧-2’-氟-5’(R和S)-C-甲基胞苷的制备
[0364]
[0365] 在N2下,在冰EtOH浴中向2’-脱氧-5’-C,5’-O-二脱氢-3-O-,N4-二(4-甲氧基三苯甲基)-2’-氟胞苷(3g,3.8mmol)的无水THF(50mL)溶液中逐滴加入MeMgBr(3.0M的乙醚溶液,5.1mL)。将反应混合物室温搅拌5h,用NH4Cl淬火,用乙酸乙酯稀释,用盐水洗涤,用无水Na2SO4干燥并浓缩得到粗产物(一种异构体是主要的)。通过用丙酮-石油醚4
(1∶3至2∶3)的硅胶色谱得到1.8g(58%)的2’-脱氧-3-O-,N-二(4-甲氧基三苯
甲基)-2’-氟-5’-C-甲基胞苷。
[0366] 将2’-脱氧-3-O-,N4-二(4-甲氧基三苯甲基)-2’-氟-5’-C-甲基胞苷(600mg,0.75mmol)的AcOH/H2O(v/v 4∶1,20mL)溶液在50℃搅拌过夜。将溶液浓缩,用水稀释,用乙酸乙酯萃取两次并浓缩至干燥。通过反相HPLC色谱和接下来的SFC分离得到为白色
1
固体的30mg(16%)的2’-脱氧-2’-氟-5’(S)-C-甲基胞苷;H NMR(CD3OD):δ8.16(d,J=7.6Hz,1H,H6),5.99(dd,J=17.6Hz,1.2Hz,1H,H1’),5.92(d,J=7.6Hz,1H,H5),
5.06-4.92(m,1H,H2’),4.28(ddd,JH,H=8.4,4.4Hz,JH,F=21.6Hz,1H,H3’),4.02(dq,J=4.0,2.8Hz,1H,H5’),3.87(dd,J=8.0,2.0Hz,1H,H4’),1.38(d,J=6.4Hz,3H,Me)。
[0367] 实施例18
[0368] 2’-脱氧-2’-氟-5’-C-甲基阿糖胞苷(18)的制备
[0369]
[0370] 步骤1.5’-O-(叔丁基二甲基甲硅烷基)-2’-脱氧-3’-O,N4-二(4-甲氧基三苯甲基)-2’-氟阿糖胞苷的制备
[0371]
[0372] 在N2下,在0℃向2’-脱氧-2’-氟阿糖胞苷(1.0g,4.08mmol)的无水吡啶(10mL)溶液中加入TBSCl(738mg,4.9mmol),并室温搅拌过夜。TLC显示反应结束。然后,减压蒸发掉吡啶。将剩余物用EA稀释,用水和盐水洗涤,用无水Na2SO4干燥并真空浓缩得到为白色固体的5’-O-(叔丁基二甲基甲硅烷基)-2’-脱氧-2’-氟阿糖胞苷(1.3g,89%)。
[0373] 向5’-O-(叔丁基二甲基甲硅烷基)-2’-脱氧-2’-氟阿糖胞苷(1.3g,3.6mmol)的无水DCM(15mL)溶液中加入MMTrCl(3.38g,10.8mmol),加入AgNO3(1.82g,10.8mmol)和三甲基吡啶(54ml,396mmol)。将反应混合物在N2下室温搅拌过夜,TLC显示反应完善,然后将反应混合物过滤,并用饱和NaHCO3溶液洗涤并用盐水洗涤。真空浓缩得到剩余物,将剩余物通过硅胶(己烷/EA=2/1至1/1)纯化得到5’-O-(叔丁基二甲基甲硅烷基)-2’-脱氧-3’-O,N4-二(4-甲氧基三苯甲基)-2’-氟阿糖胞苷(2.3g,71%)。
[0374] 步骤2.2’-脱氧-5-C,5’-O-二脱氢-3’-O,N4-二(4-甲氧基三苯甲基)-2’-氟阿糖胞苷的制备
[0375]
[0376] 在0℃向5’-O-(叔丁基二甲基甲硅烷基)-2’-脱氧-3’-O,N4-二(4-甲氧基三苯甲基)-2’-氟阿糖胞苷(2.3g,2.54mmol)的无水THF(20mL)溶液中逐滴加入TBAF(508ml,1M的THF溶液,5.08mmol)并室温搅拌过夜。TLC显示反应结束。然后室温真空除去溶剂。
向剩余物中加入EA,用水洗涤,然后用盐水洗涤,用无水Na2SO4干燥并真空浓缩得到剩余物,通过硅胶(己烷/EA=1∶3)将剩余物纯化得到2’-脱氧-3’-O,N4-二(4-甲氧基三苯甲基)-2’-氟阿糖胞苷(1.7g,85%)。
[0377] 在N2下,在0℃向2’-脱氧-3’-O,N4-二(4-甲氧基三苯甲基)-2’-氟阿糖胞苷(1.7g,2.15mmol)的无水CH2Cl2(15mL)溶液中加入吡啶(2.55mL,32.3mmol)和戴斯-马丁氧化剂(1.1g,1.2eq)。将反应混合物室温搅拌2h,TLC显示反应结束。然后,将反应混合物用EA稀释。将有机层用10%Na2S2O3洗涤两次,然后用水和盐水洗涤,用无水Na2SO4干燥并真空浓缩得到剩余物,将该剩余物通过硅胶(己烷/EA=1/3)纯化得到2’-脱氧-5-C,4
5’-O-二脱氢-3’-O,N-二(甲氧基三苯甲基)-2’-氟阿糖胞苷(1.15g,68%)。
[0378] 步骤3.2’-脱氧-2’-氟-5’-C-甲基阿糖胞苷的制备
[0379]4
[0380] 在N2下,向用冰EtOH浴冷却的2’-脱氧-5-C,5’-(9-二脱氢-3’-O,N-二(4-甲氧基三苯甲基)-2’-氟阿糖胞苷(1.15g,1.46mmol,1eq)的无水THF(25mL)溶液中逐滴加入MeMgBr(4.17mL,5.84mmol)。将反应混合物室温搅拌5h,TLC显示反应结束。然后将用饱和NH4Cl淬火。将EA加入至混合物中用于萃取。将有机层用水洗涤,然后用盐水洗涤,用无水Na2SO4干燥并真空浓缩得到剩余物,将剩余物通过硅胶(己烷/EA=1/1至1/3)进4
行纯化得到2’-脱氧-3’-O,N-二(4-甲氧基三苯甲基)-2’-氟-5’-C-甲基阿糖胞苷(1.0g,85%)。
4
[0381] 将2’-脱氧-3’-O,N-二(4-甲氧基三苯甲基)-2’-氟-5’-C-甲基阿糖胞苷(200mg,0.24mmol)的AcOH/H2O(v/v=4∶1,10mL)溶液在50℃搅拌过夜。TLC显示反应结束。将溶剂真空蒸发并将剩余物用水稀释,用EA萃取两次以除去某些杂质。将水层真空浓缩得到剩余物,将剩余物通过用5%-12%MeOH的DCM溶液的硅胶色谱纯化得到2’-脱1
氧-2’-氟-5’-C-甲基阿糖胞苷(61mg)。H NMR(DMSO-d6):1.14(d,J=8.0Hz,3H),3.53(t,J = 5.2Hz,3H),3.74(br s,1H),4.11-4.35(m,1H),4.79-5.00(m,2H),5.71-5.82(m,2H),
6.01,6.07(每个d,J=3.6Hz,1H),7.57&7.74(每个dd,J=1.6,7.6Hz,1H)。
[0382] 实施例19
[0383] 2’-脱氧-2’,2’-二氟-5’(S)-C-甲基胞苷(19)的制备
[0384]
[0385] 步骤1.5’-O-(叔丁基二甲基甲硅烷基)-2’-脱氧-2’,2’-二氟-3’-O-,N4-二(4-甲氧基三苯甲基)胞苷的制备
[0386] 在N2下,向2’-脱氧-2’,2’-二氟胞苷(51.0g,170.7mmol)的无水吡啶(500mL)冰冷溶液中分小批加入TBSCl(32g,208mmol)。将反应混合物室温搅拌过夜。真空除去溶剂并将剩余物用EA(1000mL)稀释,用水和盐水洗涤。将有机层分离,用无水Na2SO4干燥并过滤。将滤液真空浓缩得到为白色固体的粗的5’-O-(叔丁基二甲基甲硅烷基)-2’-脱氧-2’,2’-二氟胞苷(63g,96%),将其不进行纯化直接使用。
[0387] 在N2下,向5’-O-(叔丁基二甲基甲硅烷基)-2’-脱氧-2’,2’-二氟胞苷(60g,160mmol)、AgNO3(77.8g,510mmol)和三甲基吡啶(159.8g,1.32mol)的无水DCM(800mL)的混合物中分小批加入MMTrCl(156.8g,510mmol)。将反应混合物室温搅拌过夜。将反应混合物通过布氏漏斗过滤并将滤液用饱和NaHCO3溶液洗涤,随后用盐水洗涤。将有机层分离,用无水Na2SO4干燥并过滤。将滤液真空浓缩得到剩余物,将剩余物通过硅胶柱(PE/EA=3/1至2/1)进行纯化得到粗的5’-O-(叔丁基二甲基甲硅烷基)-2’-脱氧-2’,2’-二
4
氟-3’-O-,N-二(4-甲氧基三苯甲基)胞苷(200g)。
[0388] 步骤2.2’-脱氧-5’-C,5’-O-二脱氢-2’,2’-二氟-3’-O-,N4-二(4-甲氧基三苯甲基)胞苷的制备
[0389]
[0390] 在N2下,向5’-O-(叔丁基二甲基甲硅烷基)-2’-脱氧-2’,2’-二氟-3’-O-,4
N-二(4-甲氧基三苯甲基)胞苷(200g,210mmol)的无水THF(322mL)冰冷溶液中逐滴加入TBAF(1M的THF溶液,330mmol)。将反应混合物室温搅拌过夜。除去溶剂并将剩余物溶解在EA(800mL)中。将溶液用水和盐水洗涤。将有机层分离,用无水Na2SO4干燥并过滤。将滤液真空浓缩得到剩余物,将剩余物通过硅胶柱(CH2Cl2/EA=10/1至5/1)纯化得到2’-脱
4 1
氧-2’,2’-二氟-3’-O-,N-二(4-甲氧基三苯甲基)胞苷(128g,73%);H NMR(400MHz)(CDCl3):δ7.45-7.39(m,4H),7.35-6.91(m,29H),6.76(dd,J=8.8Hz,2.4Hz,4H),6.24(t,J=8.0Hz,1H),4.93(d,J =8.0Hz,1H),4.20(dd,J=15.2Hz,9.2Hz,1H),3.72(d,J =
4.0Hz,6H),3.27(d,J=13.2Hz,1H),2.84(d,J=12.4Hz,1H)。
[0391] 在10℃向吡啶(2.85g,36mmol)的无水DMSO(30mL)溶液中逐滴加入TFA(2.05g,18mmol)。将混合物室温搅拌直至形成透明溶液。在10℃将溶液逐滴加入至2’-脱氧-2’,
4
2’-二氟-3’-O-,N-二(4-甲氧基三苯甲基)胞苷(24.2g,30mmol)和DCC(18.6g,90mmol)的无水DMSO溶液中。如通过TLC检测,将混合物室温搅拌12小时。将混合物用水(200mL)淬火并在10℃搅拌1小时。通过过滤将沉淀物除去并将滤液用EtOAc(1000ml)萃取。将组合有机层用盐水(200mL)洗涤并用无水Na2SO4干燥。将溶液浓缩并将剩余物通过柱子(硅胶,EtOAc∶石油醚=1/1至2/1)纯化得到2’-脱氧-5’-C,5’-O-二脱氢-2’,2’-二
4
氟-3’-O-,N-二(4-甲氧基三苯甲基)胞苷(21g,88%),不进行进一步的纯化而将其直接用于下一步骤。
[0392] 步骤3.2’-脱氧-2’,2’-二氟-5’-C-甲基胞苷的制备
[0393]
[0394] 在N2下,向2’-脱氧-5’-C,5’-O-二脱氢-2’,2’-二氟-3’-O-,N4-二(4-甲氧基三苯甲基)胞苷(21g,26.08mmol)的无水THF(200mL)冰EtOH浴冷溶液中逐滴加入MeMgBr(3M的乙醚溶液,31.3mL,78.23mmol)。将反应混合物室温搅拌过夜。将混合物用饱和NH4Cl淬火并用EA(500mL×3)萃取。将组合的有机层用无水Na2SO4干燥并浓缩。将所得到的剩余物通过硅胶柱(EA∶PE=10/1至3/2)纯化得到2’-脱氧-2’,2’-二氟-3’-O-,4
N-二(4-甲氧基三苯甲基)-5’-C-甲基胞苷(13g,61%,多数部分∶少数部分=93∶7);
1
H NMR(400MHz)(CDCl3):δ7.41-7.05(m,27H),6.77-6.74(m,4H),6.22(t,J=8.8Hz,1H),
4.91(d,J=7.6Hz,1H),4.20-4.15(m,1H),3.74-3.69(m,6H),3.03-3.00(m,1H),0.98(d,J=7.2Hz,3H)。
[0395] 将2’-脱氧-2’,2’-二氟-3’-O-,N4-二(4-甲氧基三苯甲基)-5’-C-甲基胞苷(4.1g,5mmol)溶解在50mL的AcOH/H2O(v/v=4∶1)中。将混合物在50℃搅拌过夜。真空除去溶剂并将剩余物用水(30mL)稀释,用EA(20mL×2)萃取以除去某些杂质。通过柱分离1
后得到2’-脱氧-2’,2’-二氟-5’(S)-C-甲基胞苷(1.2g,87%)。H NMR(400Hz)(MeOD):
δ7.93(d,J=7.6Hz,1H),6.24(t,J=7.6Hz,1H),5.95(d,J=7.6Hz,1H),4.30-4.22(m,
1H),4.05-4.00(m,1H),3.74(dd,J=8.4Hz,2.8Hz,1H),1.37(d,J=6.4Hz,3H)。
[0396] 实施例20
[0397] 2’-脱氧-2’,2’-二氟-5’(R)-C-甲基胞苷(20)的制备
[0398]
[0399] 在N2下,向2’-脱氧-5’-C,5’-O-二脱氢-2’,2’-二氟-3’-O-,N4-二(4-甲氧基三苯甲基)胞苷(6.0g,7.4mmol)的无水THF(30mL)冰EtOH浴冰溶液中逐滴加入MeMgBr(3M的乙醚溶液)(10mL,30mmol)。加入后,将反应混合物室温搅拌过夜。然后将反应用饱和NH4Cl淬火。将混合物用EA(100mL×2)萃取。将组合的有机层用无水Na2SO4干燥并浓缩得到剩余物,将剩余物通过硅胶柱(PE/EA=3/1至1/1)进行纯化得到2’-脱氧-2’,4
2’-二氟-3’-O-,N-二(4-甲氧基三苯甲基)-5’(R和S)-C-甲基胞苷(3.6g,58.8%);
1
H NMR(400MHz,CDCl3):δ7.48-7.08(m,26H),6.80-6.84(m,4H),6.28(t,J=8.8Hz,1H),
4.99(d,J = 7.6Hz,1H),4.25-4.20(m,1H),3.81-3.79(m,7H),3.77(s,3H),3.12-3.07(m,
1H),1.05(d,J=6.8Hz,3H)。
[0400] 将2’-脱氧-2’,2’-二氟-3’-O-,N4-二(4-甲氧基三苯甲基)-5’(R和S)-C-甲基胞苷(3g,3.65mmol)溶解在20mL的ACOH/H2O(v/v=4∶1)中。将混合物在50℃搅拌过夜。真空除去溶剂并将剩余物用水(10mL)稀释并用EA(10mL×2)洗涤。将水层冻干并将剩余物用制备型SFC进行纯化得到2’-脱氧-2’,2’-二氟-5’(S)-C-甲基胞苷(300mg,29.7%)和2’-脱氧-2’,2’-二氟-5’(R)-C-甲基胞苷(80mg,7.9%),两者均为白色固
1
体。5’(R)-异构体:H NMR(400Hz,CD3OD):δ7.89(d,J=7.6Hz,1H),6.19(t,J=7.6Hz,
1H),5.91(d,J = 7.6Hz,1H),4.17-4.25(m,1H),3.97-3.99(m,1H),3.69(dd,J = 8.4Hz,+ +
2.8Hz,1H),1.32(d,J=6.4Hz,3H)。ESI-MS:m/z 555[2M+H],278[M+H]。
[0401] 实施例21
[0402] 2’-脱氧-2’,2’-二氟-5’(S)-C-甲基尿苷(21)的制备
[0403]
[0404] 将2’-脱氧-2’,2’-二氟-5’(S)-C-甲基胞苷(1g,3.6mmol)、乙酸酐(2.2g,21.6mmol)、4-(二甲基氨基)吡啶(DMAP,12mg,0.1mmol)和吡啶(20mL)的溶液搅拌直至起始材料消失。将混合物用饱和NaHCO3水溶液淬火。将水层用EA萃取,并将有机层用盐水洗涤,用干燥MgSO4,并真空浓缩。将粗产物通过快速柱色谱纯化得到收率为93%的1.35g的
2’-脱氧-3’,5’-二乙酰基-2’,2’-二氟-5’(S)-C-甲基胞苷。
[0405] 在密封烧瓶中将2’-脱氧-3’,5’-二乙酰基-2’,2’-二氟-5’(S)-C-甲基胞苷(1g,2.48mmol)的DME(30mL)和H2O(20mL)溶液在125℃加热9h。蒸发易挥发物并通过剩余物的色谱得到为无色固体的600mg的2’-脱氧-3’,5’-二乙酰基-2’,2’-二氟-5’(S)-C-甲基尿苷(67%),将所得到的无色固体溶解在20mL的饱和NH3/MeOH溶液中。将混合物在0℃搅拌过夜。真空除去溶剂,通过硅胶快速柱色谱纯化得到440mg(95%)的2’-脱氧-2’,2’-二氟-5’(S)-C-甲基尿苷;1H NMR(400Hz)(DMSO-d6):δ11.55(s,1H),7.86(d,J=8Hz,1H),6.26(d,J=4.8Hz,1H),6.03(t,J=7.8Hz,1H),5.22(d,J=
5.2Hz,1H),4.17-4.13(m,1H),3.85-3.81(m,1H),3.65(dd,J=8.4Hz,2.8Hz,1H),1.18(d,J=6.8Hz,3H)。
[0406] 实施例22
[0407] 2’-脱氧-2’,2’-二氟-5-乙炔基-5’(S)-C-甲基胞苷(22)的制备
[0408]
[0409] 步骤1.2’-脱氧-3’,5’-O-二乙酰基-2’,2’-二氟-5-碘-5’(S)-C-甲基胞苷的制备
[0410]
[0411] 将2’-脱氧-2’,2’-二氟-5’(S)-C-甲基胞苷(1g,3.6mmol)、乙酸酐(2.2g,21.6mmol)、4-(二甲基氨基)吡啶(DMAP,12mg,0.1mmol)和吡啶(20mL)的溶液搅拌直至起始材料消失。将混合物用饱和NaHCO3水溶液淬火。将水层用二乙醚萃取并将有机层用水洗涤,用MgSO4干燥并真空浓缩。将粗产物通过快速柱色谱进行纯化得到收率93%的1.35g
4
的2’-脱氧-2’,2’-二氟-5’(S)-C-甲基-3’,5’-O,N-三乙酰基胞苷。
[0412] 将2’-脱氧-2’,2’-二氟-5’(S)-C-甲基-3’,5’-O,N4-三乙酰基胞苷(1.5g,3.7mmol)溶解在I2(3g,11.8mmol)的甲醇(300mL)溶液中。将反应回流并用TLC监测。一旦结束,加入少量的硫代硫酸钠从而将反应淬火。除去溶剂并将剩余物通过硅胶柱色谱纯化得到收率27%的500mg的2’-脱氧-3’,5’-O-二乙酰基-2’,2’-二氟-5-碘-5’(S)-C-甲基胞苷。
[0413] 步骤2.2’-脱氧-2’,2’-二氟-5-乙炔基-5’-C-甲基胞苷的制备
[0414]
[0415] 将2’-脱氧-3’,5’-O-二乙酰基-2’,2’-二氟-5-碘-5’(S)-C-甲基胞苷(500mg,1.03mmol)、乙酸酐(648mg,6.1mmol)、4-(二甲基氨基)吡啶(DMAP,12mg,0.1mmol)和吡啶(20mL)的溶液搅拌直至起始材料消失。将混合物用饱和NaHCO3水溶液淬火。将水层用二乙醚萃取并将有机层用水洗涤,用MgSO4干燥,并真空浓缩。将粗产物通过快速柱色谱纯化得到收率92%的500mg的2’-脱氧-2’,2’-二氟-5-碘-5’(S)-C-甲基-3’,5’-O-,N4-三乙酰基胞苷。
[0416] 向三乙胺(303mg,3eq)的CH3CN(30mL)除氮气溶液中加入乙炔基三甲基硅烷(196mg,2eq)、2’-脱氧-2’-脱氧-2’,2’-二氟-5-碘-5’(S)-C-甲基-3’,5’-O-,N4-三乙酰基胞苷(500mg,1eq)、Pd(PPh3)2Cl2(8.4mg,0.012eq)和CuI(2.3mg,0.012eq),并将混合物在25℃搅拌12h。除去溶剂后,将剩余物过滤,浓缩并通过用PE∶EtOAc(2∶1)洗脱的硅胶快速柱色谱进行纯化得到为白色固体的200mg(42%)的2’-脱氧-2’,2’-二氟-5’(S)-C-甲基-3’,5’-O-,N4-三乙酰基-5-(三甲基甲硅烷基乙炔基)胞苷,将其溶解在20mL的饱和NH3/MeOH溶液中。将混合物室温搅拌过夜。真空除去溶剂。通过硅胶快速柱色谱纯化得到110mg(91%)是2’-脱氧-2’,2’-二氟-5-乙炔基-5’-C-甲基胞苷;1H NMR(400Hz)(MeOD-d4):δ8.34(s,1H),6.18(t,J = 7.6Hz,1H),4.26-4.19(m,1H),4.00-3.98(m,1H),3.84(s,1H),3.72(dd,J=8.4Hz,2.8Hz,1H),1.34(d,J=6.8Hz,3H)。
[0417] 实施例23
[0418] 2’-脱氧-2’,2’-二氟-5-乙基-5’(S)-C-甲基胞苷(23)的制备
[0419]
[0420] 在25℃向2’-脱氧-2’,2’-二氟-5-乙炔基-5’(S)-C-甲基胞苷(50mg)的EA(50mL)溶液中加入Pd/C(50mg)。在H2气氛下,将混合物在1大气压下搅拌4h。真空除去溶剂。通过硅胶快速柱色谱纯化得到40mg的2’-脱氧-2’,2’-二氟-5-乙基-5’-C-甲基胞苷(79%),1H NMR(400Hz)(MeOD-d4):δ7.80(s,1H),6.21(t,J=7.6Hz,1H),4.29-4.21(m,1H),4.03-3.95(m,1H),3.71(dd,J=8 8Hz,2.8Hz,1H),2.35(q,2H),1.34(d,J=6.8Hz,
3H),1.17(t,J=7.4Hz,3H)。
[0421] 实施例24
[0422] 2’-脱氧-2’,2’-二氟-5’(S)-C-甲基胸苷(24)的制备
[0423]
[0424] 步骤1.2’-脱氧-3’,5’-二乙酰基-2’,2’-二氟-5-碘-5’-C-甲基尿苷的制备
[0425]
[0426] 将2’-脱氧-2’,2’-二氟-5’(S)-C-甲基尿苷(200mg,0 72mmol)、乙酸酐(466mg,4.3mmol)、4-(二甲基氨基)吡啶(DMAP,12mg,0.1mmol)和吡啶(20mL)的溶液搅拌直至起始材料消失。将混合物用饱和NaHCO3水溶液淬火。将水层用二乙醚萃取并将有机层用水洗涤,用MgSO4干燥并真空浓缩。通过快速柱色谱纯化粗产物得到收率91%的236mg的2’-脱氧-3’,5’-二乙酰基-2’,2’-二氟-5’(S)-C-甲基尿苷。
[0427] 将在25mL的MeCN中的230mg(0 64mmol)的2’-脱氧-3’,5’-二乙酰基-2’,2’-二氟-5’(S)-C-甲基尿苷、210mg(0.83mmol)的I2和766mg的CAN混合物在环境温度下搅拌。当碘化结束(通过TLC监测)时减压蒸发掉溶剂。将所得到的剩余物用乙酸乙酯(15mL)、5%NaHSO3/H2O(5mL)和饱和NaCl/H2O(5mL)的冷混合物处理。将有机层分离并将水层用EtOAc萃取。将粗产物通过硅胶柱色谱纯化得到收率80%的245mg的2’-脱氧-3’,
5’-二乙酰基-2’,2’-二氟-5-碘-5’(S)-C-甲基尿苷。
[0428] 步骤2.2’-脱氧-2’,2’-二氟-5’(S)-C-甲基胸苷的制备
[0429]
[0430] 将2’-脱氧-3’,5’-二乙酰基-2’,2’-二氟-5-碘-5’(S)-C-甲基尿苷(245mg,0 5mmol)和Pd(PPh3)Cl2(40mg)在无水THF(30mL)中的混合物在Ar气氛下回流10min。然后用注射器通过隔膜逐滴加入AlMe3并将溶液回流过夜。冷却至室温后,将水(20mL)加入至反应中,并将混合物用DCM萃取。将萃取物干燥并进行减压蒸发。将剩余物通过制备型TLC进行纯化得到收率26%的2’-脱氧-3’,5’-二乙酰基-2’,2’-二氟-5(S)’-C-甲基胸苷(50mg)。
[0431] 将2’-脱氧-3’,5’-二乙酰基-2’,2’-二氟-5’(S)-C-甲基胸苷(50mg,mmol)溶解在20mL的饱和NH3/MeOH溶液中。将混合物在0℃搅拌过夜。真空除去溶剂。通过硅胶快速柱色谱进行纯化得到30mg的2’-脱氧-2’,2’-二氟-5’(S)-C-甲基胸苷1
(77 % );H NMR(400Hz)(DMSO-d6):δ7.57(s,1H),6.11(t,J = 8Hz,1H),4.30-4.22(m,
1H),4.02-3.96(m,1H),3.70(dd,J=8.4Hz,2.8Hz,1H),1.87(s,3H),1.33(d,J=6.4Hz,
3H)。
[0432] 实施例25
[0433] 2’-脱氧-2’,2’-二氟-5-乙烯基-5’(S)-C-甲基胞苷(25)的制备
[0434]
[0435] 在25℃向2’-脱氧-2’,2’-二氟-5-乙炔基-5’-C-甲基胞苷(30mg,1eq)的EA(50mL)溶液中加入Lindlar Pd(30mg)。然后在H2气氛下,将混合物在1大气压下搅拌4h。真空除去溶剂。通过硅胶快速柱色谱进行纯化得到22mg的2’-脱氧-2’,2’-二氟-5-乙
1
烯基-5’(S)-C-甲基胞苷(73%)。H NMR(400Hz)(MeOD-d4):δ8.24(s,1H),6.51(m,1H),
6.21(t,J=14.5Hz,1H),5.61(dd,J=17.2Hz,1.2Hz,1H),5.27(dd,J=10.8Hz,1.2Hz,
1H),4.32-4.24(m,1H),4.04-4.00(m,1H),3.74(dd,J = 8.8Hz,2.8Hz,1H),1.35(d,J =
6.8Hz,3H)。
[0436] 实施例26
[0437] 2’-脱氧-2’,2’-二氟-5’(S)-C-甲基-5-乙烯基尿苷(26)的制备
[0438]
[0439] 向PdCl2(PPh3)2(15.8mg,0.022mmol)的乙腈(10mL)溶液中加入2’-脱氧-3’,5’-O-二乙酰基-2’,2’-二氟-5-碘-5’(S)-C-甲基尿苷(110mg,0.23mmol)和乙烯基三丁基锡烷(143mg,0.45mmol)。将混合物加热至回流并搅拌过夜,通过硅藻土过滤并减压蒸发以除去溶剂。将油状剩余物通过硅胶柱色谱纯化得到收率50%的50mg的2’-脱氧-3’,5’-O-二乙酰基-2’,2’-二氟-5-乙烯基-5’(S)-C-甲基尿苷,将所得到的产物溶解在20mL的饱和NH3/MeOH溶液中。将混合物在0℃搅拌过夜。真空除去溶剂。通过硅胶快速柱色谱进行纯化得到20mg的产物,将产物通过硅胶快速柱色谱进一步纯化得到7mg的
1
2’-脱氧-2’,2’-二氟-5’(S)-C-甲基-5-乙烯基尿苷(18%);H NMR(400Hz)(DMSO-d6):
δ8.17(s,1H),6.50(dd,J=17.6Hz,11.2Hz,1H),6.16(t,J=7Hz,1H),6.16(t,J=7Hz,
1H),5.97(d,J=17.6Hz,1H),5.20(d,J=11.2Hz,1H),4.35-4.27(m,1H),4.04-3.98(m,
1H),3.75(d,J=8.8Hz,1H),1.34(d,J=6.4Hz,3H)。
[0440] 实施例27
[0441] 2’-脱氧-2’,2’-二氟-5-乙基-5’(S)-C-甲基尿苷(27)的制备
[0442]
[0443] 将2’-脱氧-3’,5’-O-二乙酰基-2’,2’-二氟-5-(三甲基甲硅烷基乙炔基)-5’(S)-C-甲基尿苷(79mg,0.18mmol)溶解在饱和NH3/MeOH(20mL)中。将混合物在25℃搅拌20h。除去溶剂并将粗产物溶解在MeOH(10mL)中。加入Pd/C(5%,10mg)并在H2(1atm)下将混合物在25℃搅拌30h。然后通过过滤除去催化剂并将滤液蒸发至干燥。将剩余物通过硅胶柱(DCM/MeOH=1∶10)纯化得到2’-脱氧-2’,2’-二氟-5-乙基-5’(S)-C-甲1
基尿苷(19mg,36%经历两步),H NMR(400Hz,D2O)δ7.41(s,1H),6.02(t,J=8Hz,1H),
4.15-4.23(m,1H),3.93(dd,J1= 4 4Hz,J2=6.4Hz,1H),3.68(dd,J1 =4.4Hz,J2 =
8.4Hz,1H),2.15(q,J = 7.2Hz,2H),1.17(d,J = 6.4Hz,3H),0.91(t,J = 7.2Hz,3H);
+
LCMS(ESI):307[M+H]。
[0444] 实施例28
[0445] 2’-脱氧-5’(S)-C-甲基-2’,2’,5-三氟尿苷(28)的制备
[0446]
[0447] 将2’-脱氧-3’,5’-O-二乙酰基-2’,2’-二氟-5-碘-5’(S)-C-甲基尿苷(320mg,0.66mmol)、六甲基二锡(429mg,1.32mmol)、二(三苯基膦)二氯化钯(46mg,0.066mmol)和1,4-二噁烷(20mL)在80℃搅拌2h。一旦结束,在45℃减压除去溶剂,并将剩余物在制备型TLC上进行纯化得到收率71%的245mg的2’-脱氧-3’,5’-O-二乙酰基-2’,2’-二氟-5-(三甲基甲锡烷基)-5’(S)-C-甲基尿苷。
[0448] 向干燥的圆底烧瓶(25mL)中加入2’-脱氧-3’,5’-O-二乙酰基-2’,2’-二氟-5-(三甲基甲锡烷基)-5’(S)-C-甲基尿苷(245mg,0.47mmol)、MeCN(15mL)和Selectfluor(177mg,0.51mmol)。将混合物在55℃搅拌10h,在这一过程中反应过程由TLC跟踪,直至起始材料消耗完(~10h)。除去溶剂并通过柱色谱将粗混合物纯化得到50mg的
2’-脱氧-3’,5’-O-二乙酰基-5’(S)-C-甲基-2’,2’,5-三氟尿苷(30%)。
[0449] 将2’-脱氧-3’,5’-O-二乙酰基-5’(S)-C-甲基-2’,2’,5-三氟尿苷(50mg,mmol)溶解在20mL的饱和NH3/MeOH溶液中。将混合物在0℃搅拌过夜。真空除去溶剂。通1
过硅胶快速柱色谱得到30mg的2’-脱氧-5’(S)-C-甲基-2’,2’,5-三氟尿苷(77%);H NMR(400Hz)(MeOD-d4):δ8.25(d,J=6.8Hz,1H),6.10(t,J=6.8Hz,1H),4.31-4.22(m,
19
1H),4.02-3.97(m,1H),3.72(dd,J = 8.4Hz,2.4Hz,1H),1.33(d,J = 6.4Hz,3H);F NMR(400Hz)(MeOD-d4):δ-121.15(t,J=44.7Hz,2F),δ-169.89(s,1F)。
[0450] 实施例29
[0451] 2’-脱氧-2’,2’-二氟-5’-O-异丁酰-5’(S)-C-甲基胞苷(29)的制备[0452]
[0453] 向2’-脱氧-2’,2’-二氟-3’-O,N4-二(4’-甲氧基三苯甲基)-5’(S)-C-甲基胞苷(1.64g,2mmol)、异丁酸(211mg,2.4mmol)、DMAP(0.12g,1mmol)和DCM(20mL)的混合物中加入EDCI(1.15g,6mmol)。通过TLC监测,在N2下将混合物室温搅拌16小时。然后将混合物用饱和NaHCO3水溶液洗涤,随后用盐水洗涤。将有机层用Na2SO4干燥并浓缩。除去溶剂并将剩余物通过柱子(PE∶EA=1∶1)进行纯化得到2’-脱氧-2’,2’-二氟-3’-O,4
N-二(4’-甲氧基三苯甲基)-5’-O-异丁酰-5’(S)-C-甲基胞苷(1.2g,67%)。
[0454] 将2’-脱氧-2’,2’-二氟-3’-O,N4-二(4’-甲氧基三苯甲基)-5’-O-异丁酰-5’(S)-C-甲基胞苷(900mg)溶解在80%HOAc(20mL)中。通过TLC监测,将混合物在60℃搅拌过夜。减压除去溶剂并将剩余物通过制备型HPLC(HCOOH体系)纯化得到为白色固体的2’-脱氧-2’,2’-二氟-5’-O-异丁酰-5’(S)-C-甲基胞苷(120mg,35%);1H NMR(D2O,
400M Hz)δ7.46(d,J = 7.6Hz,1H),6.24(t,J = 8.0Hz,1H),6.15(d,J = 7.6Hz,1H),
5.28(dt,J1=6.4Hz,J2=11.2Hz,1H),4.31(dt.J1=8Hz,J2=12.8Hz,1H),4.15(dd,J1=4.4Hz,J2=8.0Hz,1H),2.67-2.74(m,1H),1.42(d,J=6.8Hz,3H),1.18-1.21(m,6H),+ + +
ESI-LCMS:m/z 348[M+H],370[M+Na],717[2M+Na]。
[0455] 实施例30
[0456] 2’-脱氧-2’,2’-二氟-5’(S)-C-甲基-3’-O-(L-缬氨酰)胞苷(30)的制备[0457]
[0458] 将(N-叔丁氧基羰基)-L-缬氨酸(0.78g,3.6mmol)和CDI(0.58g,3.6mmol)悬浮在无水THF(15mL)中。将混合物室温搅拌1小时,然后升温至50℃。连续搅拌30分钟。然后将混合物冷却至室温,并在室温将溶液逐滴加入至2’-脱氧-2’,2’-二氟-5’(S)-C-甲基胞苷(0.90g,3.25mmol)、DMAP(37mg,0.3mmol)和TEA(10mL)的无水DMF(20mL)溶液中。加入后,将混合物室温搅拌20h,然后减压浓缩除去THF和TEA。之后将溶液在EA中稀释并用盐水洗涤。将有机层用Na2SO4干燥。将溶剂浓缩并将剩余物通过柱子(纯EA)纯化得到为白色泡沫体的3’-O-(N-叔丁氧基羰基)-L-缬氨酰)-2’-脱氧-2’,2’-二氟-5’(S)-C-甲基胞苷(1.04g,67%),将该泡沫体溶解在HCl的EA溶液(4N,150mL)中。将混合物室温搅拌10h。除去溶剂以得到粗产物,将该粗产物通过中性制备型HPLC进行进一步纯化得到为白色固体的2’-脱氧-2’,2’-二氟-5’(S)-C-甲基-3’-O-(L-缬氨酰)胞苷(410mg,
50%);1H NMR(400MHz,D2O)δ7.80(d,J=7.6Hz,1H),6.29(t,J=8.8Hz,1H),6.13(d,J= 7.6Hz,1H),5.49-5.56(m,1H),4.24-4.27(m,2H),4.07-4.13(m,1H),2.40-2.48(m,1H),+
1.31(d,J = 6.4Hz,3H),1.07(dd,J1 = 7.2Hz,J2 = 11.2Hz,6H);ESI-MS:753[2M+H],+
377[M+H]。
[0459] 实施例31
[0460] 2’-脱氧-2’,2’-二氟-5’(S)-C-甲基-5’-O-(L-缬氨酰)胞苷(31)的制备[0461]4
[0462] 在N2下,向2’-脱氧-2’,2’-二氟-3’-O,N-二(4-甲氧基三苯甲基)-5’(S)-C-甲基 胞 苷(2.0g,2.43mmol)、EDCI(933mg,4.86mmol) 和DMAP(179mg,1.46mmol) 的 无 水DCM(20mL)混合物中加入N-Boc-L-Val(529mg,2.43mmol)。将反应混合物室温搅拌2h。将反应混合物用饱和NaHCO3溶液洗涤并随后用盐水洗涤。将有机层分离,用无水Na2SO4干燥并过滤。将滤液真空浓缩以得到剩余物,将剩余物用硅胶柱(PE/EA=3/1至2/1)进行纯化4
得到5’-O-(N-(叔丁氧基羰基)-L-缬氨酰)-2’-脱氧-2’,2’-二氟-3’-O,N-二(4-甲氧基三苯甲基)-5’(S)-C-甲基胞苷(1.4g,56%)。
[0463] 向5’-O-(N-(叔丁氧基羰基)-L-缬氨酰)-2’-脱氧-2’,2’-二氟-3’-O,4
N-二(4-甲氧基三苯甲基)-5’(S)-C-甲基胞苷(1.1g,1.08mmol)的EA(5mL)溶液中加入4N的HCl/EA(15mL)。将反应混合物室温搅拌过夜,浓缩成剩余物,将该剩余物通过制备型HPLC(HCOOH体系)进行纯化得到为白色固体的2’-脱氧-2’,2’-二氟-5’(S)-C-甲
1
基-5’-O-(L-缬氨 酰)胞苷(55mg,13.6% );H NMR(400Hz)(D2O):δ8.29(S,0.8H),
7.47(d,J=7.6Hz,1H),5.99(t,J=8.0Hz,1H),5.92(d,J=7.6Hz,1H),5.32-5.25(m,
1H),4.25-4.17(m,1H),3.98-3.93(m,2H),2.25-2.17(m,1H),1.29(t,J = 6.4Hz,3H),
0.88(d,J=6.8Hz,1H),0.85(d,J=6.8Hz,1H)。
[0464] 实施例32
[0465] 2’-脱氧-2’,2’-二氟-3’,5’-O-二(异丁酰)-5’(S)-C-甲基胞苷(32)的制备
[0466]
[0467] 将2’-脱氧-2’,2’-二氟-3’-O-,N4-二(4-甲氧基三苯甲基)-5’-C-甲基胞苷(5g,6.08mmol)溶解在30mL的AcOH/H2O(v/v=4∶1)中。将混合物室温搅拌5h。真空除去溶剂,并将剩余物通过硅胶柱(PE/EA=1/1至1/5)纯化得到2’-脱氧-2’,2’-二4 1
氟-N-(4-甲氧基三苯甲基)-5’(S)-C-甲基胞苷(2.1g,60%)。H NMR(400Hz)(DMSO):
δ8.56(S,1H),7.62(d,J = 8.0Hz,1H),7.26-7.09(m,13H),6.80(d,J = 8.8Hz,1H),
6.25(d,J=7.6Hz,1H),6.13(d,J=6.8Hz,1H),5.91(t,J=8.4Hz,1H),5.05-5.03(m,
1H),4.08-4.04(m,1H),3.77-3.75(m,1H),3.68(s,3H),3.51(dd,J = 8.0,2.8Hz,1H),
1.12(d,J=6.8Hz,1H)。
[0468] 在N2下,向2’-脱氧-2’,2’-二氟-N4-(4-甲氧基三苯甲基)-5’(S)-C-甲基胞苷(2.0g,3.64mmol)、EDCI(1.4g,7.28mmol)和DMAP(270mg,2.18mmol)的无水DCM(20mL)混合物中加入异丁酸(961mg,10.92mmol)。将反应混合物室温搅拌3h。将反应混合物用饱和NaHCO3溶液洗涤,随后用盐水洗涤。将有机层分离,用无水Na2SO4干燥并过滤。将滤液真空浓缩得到剩余物,将该剩余物通过硅胶柱(PE/EA=3/1至2/1)纯化得到2’-脱4
氧-2’,2’-二氟-3’,5’-O-二(异丁酰)-N-(4-甲氧基三苯甲基)-5’(S)-C-甲基胞苷(1.8g,71.7%),将该产物溶解在20mL的AcOH/H2O(v/v=4∶1)中。将混合物在50℃搅拌过夜。真空除去溶剂并将剩余物通过制备型HPLC进行纯化得到2’-脱氧-2’,2’-二
1
氟-3’,5’-O-二(异丁酰-5’(S)-C-甲基胞苷(480mg,48%)。H NMR(400Hz)(MeOD):
δ7.84(d,J=7.6Hz,1H),6.27(t,J=8.8Hz,1H),6.15(d,J=7.6Hz,1H),5.36-5.28(m,
1H),5.25-5.18(m,1H),4.30(dd,J = 6.8,4.4Hz,1H),2.75-2.67(m,1H),2.65-2.54(m,
1H),1.33(d,J=6.8Hz,1H),1.21-1.15(m,12H)。
[0469] 可选择的方法
[0470]
[0471] 将2’-脱氧-2’,2’-二氟-5’(S)-C-甲基胞苷(0.8g,2.89mmol)溶解在20mL的4
DMF-DMA中。将混合物室温搅拌2h。真空除去溶剂得到粗的2’-脱氧-2’,2’-二氟-N-(N,N-二甲基氨基亚甲基)-5’-C-甲基胞苷(998mg),将其不进行进一步纯化而直接用于接下来的步骤。
[0472] 向2’-脱氧-2’,2’-二氟-N4-(N,N-二甲基氨基亚甲基)-5’-C-甲基胞苷(950mg,2.86mmol)、EDCI(1.1g,5.72mmol)和DMAP(210mg,1.72mmol)的无水DMF(10mL)混合物中加入异丁酸(756mg,8.58mmol)。将反应混合物室温搅拌5h。将反应组合。然后向溶液中加入EDCI(1.1g,5.72mmol)、DMAP(210mg,1.72mmol)和异丁酸(756mg,8.58mmol)并在室温搅拌过夜。将反应混合物用EA稀释,用水和盐水洗涤。将有机层分离,用无水Na2SO4干燥
4
并过滤。将滤液浓缩以得到粗的2’-脱氧-2’,2’-二氟-3’,5’-O-二(异丁酰)-N-(N,N-二甲基氨基亚甲基)-5’(S)-C-甲基胞苷(750mg),将其不进行进一步纯化而直接用于接下来的步骤。
[0473] 将2’-脱氧-2’,2’-二氟-3’,5’-O-二(异丁酰)-N4-(N,N-二甲基氨基亚甲基)-5’(S)-C-甲基胞苷(700mg,1.48mmol)溶解在10mL的AcOH/H2O(v/v=4∶1)中。将混合物在50℃搅拌过夜。真空除去溶剂,并剩余物通过制备型HPLC进行纯化得到1
2’-脱氧-2’,2’-二氟-3’,5’-O-二(异丁酰)-5’(S)-C-甲基胞苷(220mg,35.6%)。H NMR(400Hz)(MeOD):δ7.62(d,J=7.6Hz,1H),6.32(t,J=8.8Hz,1H),5.96(d,J=7.6Hz,
1H),5.30-5.25(m,1H),5.24-5.17(m,1H),4.25(dd,J = 6.8,4.0Hz,1H),2.73-2.66(m,
1H),2.64-2.57(m,1H),1.34(d,J=7.2Hz,1H),1.22-1.17(m,12H)。
[0474] 实施例33
[0475] 2’-脱氧-2’,2’-二氟-5’(S)-C-乙基胞苷(33)的制备
[0476]
[0477] 在N2下,向2’-脱氧-5’-C,5’-O-二脱氢-2’,2’-二氟-3’-O-,N4-二(4-甲氧基三苯甲基)胞苷(3g,3.72mmol)的无水THF(10mL)冰EtOH浴冷溶液中逐滴加入EtMgBr(3M的乙醚溶液)(5mL,15mmol)。将反应混合物室温搅拌过夜。将混合物用饱和NH4Cl淬火。将产物用EA(50mL×2)萃取。将组合的有机层用无水Na2SO4干燥并浓缩得到剩余物,将剩余4
物通过硅胶柱(PE/EA=3/1至1/1)进行纯化得到2’-脱氧-2’,2’-二氟-3’-O-,N-二(4-甲氧基三苯甲基)-5’(S)-C-乙基胞苷(1.7g,54.6%)。
[0478] 将2’-脱氧-2’,2’-二氟-3’-O-,N4-二(4-甲氧基三苯甲基)-5’(S)-C-乙基胞苷(1.3g,1.56mmol)溶解在15mL的AcOH/H2O(v/v=4∶1)。将混合物在50℃搅拌过夜。真空除去溶剂并将剩余物用水(3mL)稀释,用EA(2mL×2)萃取以除去某些杂质。将水1
层进行制备型HPLC分离得到2’-脱氧-2’,2’-二氟-5’(S)-C-乙基胞苷(42mg,5%);H NMR(400Hz)(MeOD):δ7.91(d,J=7.6Hz,1H),6.18(t,J=8.0Hz,1H),5.90(d,J=7.6Hz,
1H),4.28-4.22(m,1H),3.78(dd,J = 8.4Hz,2.4Hz,1H),3.69-3.66(m,1H),1.70-1.64(m,
2H),1.03(t,J=7.2Hz,3H)。
[0479] 实施例34
[0480] 2’-脱氧-2’,2’-二氟-5’(R)-C-乙基胞苷(34)的制备
[0481]
[0482] 在N2下,向CrO3(478mg,4.79mmol)的无水DCM(15mL)冰冷悬浮液中加入无水吡啶(0.77mL,9.57mmol)和Ac2O(0.45mL,4.79mmol)。将混合物室温搅拌约10分钟直至混合物4
变成均相。将混合物冷却至0℃,并加入2’-脱氧-2’,2’-二氟-3’-O-,N-二(4-甲氧基三苯甲基)-5’(S)-C-乙基胞苷(1.0g,1.2mmol)的无水DCM(5mL)溶液。将所得到的混合物室温搅拌过夜。通过HPLC测定反应结束。将反应混合物用EA(100mL)稀释,用NaHCO3溶液洗涤两次并用盐水洗涤。将有机层分离,用无水Na2SO4干燥并过滤。将滤液真空浓缩得到剩余物,将剩余物通过硅胶柱(EA/PE=1/2)进行纯化得到期望的2’-脱氧-5’-C,
4
5’-O-二脱氢-2’,2’-二氟-3’-O-,N-二(4-甲氧基三苯甲基)-5’-C-乙基胞苷(505mg,
50.6%)。
4
[0483] 在N2下,向2’-脱氧-5’-C,5’-O-二脱氢-2’,2’-二氟-3’-O-,N-二(4-甲氧基三苯甲基)-5’-C-乙基胞苷(505mg,0.605mmol)的95%EtOH(10mL)冰冷溶液中加入NaBH4(46mg,1.21mmol)。将反应混合物室温搅拌7h。蒸发掉溶剂。将剩余物用EA(30mL)稀释,用饱和NaHCO3和盐水洗涤。将有机层分离,用无水Na2SO4干燥并浓缩得到剩余物,4
将该剩余物通过制备型TLC进行纯化得到2’-脱氧-2’,2’-二氟-3’-O-,N-二(4-甲氧基三苯甲基)-5’-C-乙基胞苷(320mg,63.1%),将剩余物溶解在10mL的AcOH/H2O(v/v=4∶1)中。将混合物在50℃搅拌过夜。真空除去溶剂,并将剩余物用水(3mL)稀释,用EA(2mL×2)萃取以除去某些杂质。将浓缩的剩余物通过用DCM/MeOH=10∶1洗脱的硅胶柱进行纯化得到产物(80mg,S∶R=3∶7),将60mg的产物进行SFC分离得到2’-脱
1
氧-2’,2’-二氟-5’(R)-C-乙基胞苷(17mg,S∶R=7∶93)。H NMR(400Hz)(MeOD):
δ7.89(d,J=7.6Hz,0.07H),7.91(d,J=7.6Hz,1H),6.20(t,J=8.0Hz,1H),5.89(d,J=7.6Hz,1H),4.33-4.25(m,1H),3.84-3.79(m,2H),1.66-1.51(m,2H),1.01(t,J=7.2Hz,
3H)。
[0484] 实施例35
[0485] 5’(S)-C-烯丙基-2’-脱氧-2’,2’-二氟胞苷(35)的制备
[0486]
[0487] 在N2下,向2’-脱氧-5’-C,5’-O-二脱氢-2’,2’-二氟-3’-O-,N4-二(4-甲氧基三苯甲基)胞苷(3g,3.72mmol)的无水THF(10mL)冰EtOH浴冷溶液中逐滴加入烯丙基溴化镁(1M的THF溶液)(15mL,15mmol)。将反应混合物室温搅拌过夜。将混合物用饱和NH4Cl淬火。将产物用EA(50mL×2)萃取。将组合的有机层用无水Na2SO4干燥并浓缩得到剩余物,将该剩余物通过硅胶柱(PE/EA=3/1至1/1)纯化得到5’-C-烯丙基-2’-脱氧-5’-C,4
5’-O-二脱氢-2’,2’-二氟-3’-O-,N-二(4-甲氧基三苯甲基)胞苷(1.1g,34.9%),将其溶解在15mL的AcOH/H2O(v/v=4∶1)中。将混合物在50℃搅拌过夜。真空除去溶剂,并将剩余物用水(3mL)稀释,用EA(2mL×2)萃取以除去某些杂质。将水层进行SFC分离以
1
得到5’(S)-C-烯丙基-2’-脱氧-2’,2’-二氟胞苷(5mg,1.3%);H NMR(400Hz)(D2O):
δ7.50(d,J=7.6Hz,1H),5.94(t,J=7.6Hz,1H),5.81(d,J=7.6Hz,1H),5.70-5.59(m,
1H),4.98-4.90(m,2H),4.17-4.08(m,1H),3.75-3.68(m,2H),2.25-2.15(m,2H) 和 3’-O-,
4
N-二(4-甲氧基三苯甲基)-5’(R)-C-烯丙基-2’-脱氧-2’,2’-二氟胞苷(5mg,1.3%)。
[0488] 实施例36
[0489] 2’-脱氧-2’,2’-二氟-5’(S)-C-丙基胞苷(36)的制备
[0490]
[0491] 在N2下,向2’-脱氧-5’-C,5’-O-二脱氢-2’,2’-二氟-3’-O-,N4-二(4-甲氧基三苯甲基)胞苷(3g,3.72mmol)的无水THF(10mL)冰浴冷溶液中逐滴加入PrMgBr(2M的THF溶液)(8mL,16mmol)。将反应混合物室温搅拌过夜。将混合物用饱和NH4Cl淬火。将产物用EA(50mL×2)萃取。将组合有机层用无水Na2SO4干燥并浓缩得到剩余物,将剩余物通过硅胶柱(PE/EA=3/1至1/1)纯化得到为混合物的2’-脱氧-2’,2’-二氟-3’-O-,N4-二(4-甲氧基三苯甲基)-5’-丙基胞苷(1.3g,41.1%)。
[0492] 将2’-脱氧-2’,2’-二氟-3’-O-,N4-二(4-甲氧基三苯甲基)-5’-丙基胞苷(1.3g,1.53mmol)溶解在15mL的ACOH/H2O(v/v=4∶1)中。将混合物在50℃搅拌过夜。真空除去溶剂,并将剩余物用水(3mL)稀释,用EA(2mL×2)萃取以除去某些杂质。将水层进行SFC分离,并进行HPLC分离后得到2’-脱氧-2’,2’-二氟-5’(S)-丙基胞苷(30mg,6%)。1H NMR(400Hz)(MeOD):δ7.58(dd,J=7.6Hz,3.6Hz,1H),6.04-5.99(m,1H),5.89(dd,J=
7.6Hz,3.6Hz,1H),4.23-4.15(m,1H),3.75-3.73(m,2H),1.47-1.21(m,6H),0.78-0.74(m,
4
3H)和3’-O-,N-二(4-甲氧基三苯甲基)-2’-脱氧-2’,2’-二氟-5’(R)-丙基胞苷(5mg,1%)。
[0493] 实施例37
[0494] 5’-O-乙酰基-2’-脱氧-2’,2’-二氟-5’(S)-C-甲基胞苷(37)的制备[0495]4
[0496] 在冰水环境下,在0℃向2’-脱氧-2’,2’-二氟-3’-O-,N-二(4-甲氧基三苯甲基)-5’(S)-C-乙基胞苷(1g,1.2mmol)、EDCI(1g,5.2mmol)和DMAP(1g,8.2mmol)的DCM(100mL)溶液中分批加入乙酸(0.5g,8.3mmol),然后室温约10℃搅拌1小时。然后,将反应混合物用水(100mL)洗涤,并用DCM(50mL)萃取两次。将有机层浓缩得到粗的期望的4
5’-O-乙酰基-2’-脱氧-2’,2’-二氟-3’-O-,N-二(4-甲氧基三苯甲基)-5’(S)-C-甲基胞苷,将其不进行纯化直接用于接下来的步骤。将5’-O-乙酰基-2’-脱氧-2’,2’-二
4
氟-3’-O-,N-二(4-甲氧基三苯甲基)-5’(S)-C-甲基胞苷溶解在AcOH∶H2O(50mL,80%)中。将反应混合物在60℃搅拌过夜。然后浓缩并通过制备型HPLC进行纯化得到为白色固
1
体的5’-O-乙酰基-2’-脱氧-2’,2’-二氟-5’(S)-C-甲基胞苷(210mg);HNMR(CD3OD,
400MHz)δppm:7.65(d,J=7.6Hz,1H),6.23(t,J=8.4Hz,1H),5.95(d,J=7.6Hz,1H),
5.22(m,1H),4.09(m,1H),3.90(dd,J1=4.8Hz,J2=6.4Hz,1H),2.08(s,3H),1.37(d,J=+ +
6.4Hz,3H).ESI-LCMS:m/z 320[M+H],639[2M+H]。
[0497] 实施例38
[0498] 2’-脱氧-3’,5’-O-二乙酰基-2’,2’-二氟-5’(S)-C-甲基胞苷(38)的制备[0499]
[0500] 向2’-脱氧-2’,2’-二氟-5’(S)-C-甲基胞苷(1g,3.6mmol)的DMF(10mL)搅拌溶液中加入DMF-DMA(10mL)。通过LCMS检测将混合物在60℃搅拌2小时。然后将溶剂减4
压除去以得到2’-脱氧-2’,2’-二氟-N-(N,N-二甲基氨基亚甲基)-5’(S)-C-甲基胞苷(1.1g)。
4
[0501] 向2’-脱氧-2’,2’-二氟-N-(N,N-二甲基氨基亚甲基)-5’(S)-C-甲基胞苷(0.5g,粗制的)的吡啶(20mL)搅拌溶液中加入DMAP(122mg,1mmol)和乙酰酐(1.02g,10mmol)。通过LCMS检测将混合物室温搅拌4小时。然后将溶剂减压除去以得到2’-脱
4
氧-3’,5’-O-二乙酰基-2’,2’-二氟-N-(N,N-二甲基氨基亚甲基)-5’(S)-C-甲基胞苷(1.8g),将其溶解在50mL的80%HOAc中并通过LCMS检测在50℃搅拌4小时。除去溶剂并将剩余物用制备型HPLC(HCOOH体系)进行纯化得到为白色固体的2’-脱氧-3’,
5’-O-二乙酰基-2’,2’-二氟-5’(S)-C-甲基胞苷(280mg,对于3个步骤为43%);1H NMR(CD3OD,400M Hz)δ7.65(d,J=7.6Hz,1H),6.32(t,J=8.8Hz,1H),5.98(d,J=7.6Hz,
1H),5.23-5.31(m,1H),5.18-5.22(m,1H),4.22(dd,J1 = 4Hz,J2 = 6.4Hz,1H),2.16(s,+ +
3H),2.09(s,3H),1.34(d,J=6.4Hz,3H);ESI-LCMS:m/z 362[M+H],723[2M+H]。
[0502] 实施例39
[0503] 2’-脱氧-2’,2’-二氟-5’(S)-C-甲基-3’,5’-O,N4-三乙酰基胞苷(39)的制备
[0504]
[0505] 向2’-脱氧-2’,2’-二氟-5’(S)-C-甲基胞苷(100mg,0.36mmol)的吡啶(5mL)搅拌溶液中加入Ac2O(153mg,1.44mmol)和DMAP(15mg,0.12mmol)。通过LCMS检测将混合物室温搅拌3小时。然后将混合物用EA稀释并用盐水洗涤。将有机层用Na2SO4干燥并浓缩。将剩余物通过制备型TLC(PE∶EA=2∶1)进行纯化得到为白色固体的2’-脱氧-2’,
4
2’-二氟-5’(S)-C-甲基-3’,5’-O,N-三乙酰基胞苷(80mg,55%)。1H NMR(CDCl3,
400M Hz)δ9.41(br s,1H),7.90(dd,J1=2.0Hz,J2=7.2Hz,1H),7.53(d,J=7.2Hz,
1H),6.46(dd,J1= 6Hz,J2= 10.4Hz,1H),5.17-5.24(m,2H),4.14(dd,J1= 4.0Hz,J2=5.6Hz,1H),2.28(s,3H),2.18(s,3H),2.12(s,3H),1.38(d,J=6.8Hz,3H);ESI-MS:m/z + +
404[M+H],807[2M+H]。
[0506] 实施例40
[0507] 2’-脱氧-2’,2’-二氟-5’(S)-C-甲基-5’-O-丙酰胞苷(40)的制备
[0508]4
[0509] 在0℃向2’-脱氧-2’,2’-二氟-3’-O-,N-二(4-甲氧基三苯甲基)-5’(S)-C-甲基胞苷(1g,1.2mmol)、EDCI(1g,5.2mmol)和DMAP(1g,8.2mmol)的DCM(100mL)溶液中分批加入丙酸(0.5g,6.8mmol),然后在室温(约10℃)下搅拌1小时。随后,将反应混合物用水(100mL)洗涤并用DCM(50mL)萃取两次。将有机层浓缩得到2’-脱氧-2’,2’-二4
氟-3’-O-,N-二(4-甲氧基三苯甲基)-5’(S)-C-甲基-5’-O-丙酰胞苷,将其不进行纯化直接用于接下来的步骤。
4
[0510] 将2’-脱氧-2’,2’-二氟-3’-O-,N-二(4-甲氧基三苯甲基)-5’(S)-C-甲基-5’-O-丙酰胞苷溶解在AcOH∶H2O(50mL,80%)中。将反应混合物在60℃搅拌过夜,然后浓缩并通过制备型HPLC进行纯化以得到为白色固体的期望的2’-脱氧-2’,2’-二1
氟-5’(S)-C-甲 基-5’-O-丙 酰 胞 苷(180mg)。HNMR(CD3OD,400MHz)δppm:7.65(d,J = 7.6Hz,1H),6.23(t,J = 8.4Hz,1H),5.94(d,J = 7.6Hz,1H),5.19-5.25(m,1H),
4.04-4.12(m,1H),3.91(dd,J1=4.8Hz,J2=7.6Hz,1H),2.39(q,J=7.6Hz,2H),1.36(d,+ +
J=6.4Hz,3H),1.13(m,J=7.6Hz,3H).ESI-LCMS:m/z 334[M+H],667[2M+H]。
[0511] 实施例41
[0512] 2’-脱氧-2’,2’-二氟-3’,5’-O-二丙酰-5’(S)-C-甲基胞苷(41)的制备[0513]
[0514] 向2’-脱氧-2’,2’-二氟-5’(S)-C-甲基胞苷(1g,3.6mmol)的DMF(10mL)搅拌溶液中加入DMF-DMA(10mL)。通过LCMS检测将混合物在60℃搅拌2小时。然后减压除去4
溶剂得到粗的2’-脱氧-2’,2’-二氟-N-(N,N-二甲基氨基亚甲基)-5’(S)-C-甲基胞苷(1.1g)。
[0515] 向2’-脱氧-2’,2’-二氟-N4-(N,N-二甲基氨基亚甲基)-5’(S)-C-甲基胞苷(0.5g,粗制的)的吡啶(20mL)搅拌溶液中加入DMAP(12mg,0.1mmol)和丙酰酐(1.3g,10mmol)。通过LCMS检测将混合物室温搅拌4小时。然后,减压除去溶剂得到粗制的2’-脱
4
氧-2’,2’-二氟-N-(N,N-二甲基氨基亚甲基)-3’,5’-O-二丙酰-5’(S)-C-甲基胞苷(1.9g)。
[0516] 将粗的2’-脱氧-2’,2’-二氟-N4-(N,N-二甲基氨基亚甲基)-3’,5’-O-二丙酰-5’(S)-C-甲基胞苷(1.9g)溶解在50mL的80%HOAc中并在50℃搅拌4小时。除去溶剂并通过制备型HPLC(HCOOH体系)纯化剩余物得到为白色固体的2’-脱氧-2’,2’-二氟-3’,5’-O-二丙酰-5’(S)-C-甲基胞苷(205mg,对于三个步骤为29%);1H NMR(CD3OD,400M Hz)δ7.65(d,J = 7.6Hz,1H),6.31(t,J = 8.8Hz,1H),5.97(d,J = 7.6Hz,1H),
5.25-5.31(m,1H),5.19-5.24(m,1H),4.23(dd,J1= 4Hz,J2 = 6.8Hz,1H),2.48(q,J =
7.6Hz,2H),2.40(q,J = 7.6Hz,2H),1.34(d,J = 6.4Hz,3H),1.15(t,J = 7.6Hz,3H),+ + +
1.13(t,J=7.6Hz,3H);ESI-LCMS:m/z 390[M+H],412[M+Na],779[2M+H]。
[0517] 实施例42
[0518] 5’(S)-C-甲基阿糖胞苷(42)的制备
[0519]4
[0520] 步骤1.2’,3’-O,N-三(4-甲氧基三苯甲基)阿糖胞苷的制备
[0521]
[0522] 在N2下,向阿糖胞苷(20.0g,82.2mmol)的无水吡啶(200mL)冷冻溶液中分小批加入TBSCl(14.9g,98.7mmol)。将反应混合物室温搅拌过夜。真空除去溶剂,并将剩余物用EA(300mL)稀释,用水和盐水洗涤。将有机层分离,用无水Na2SO4干燥并过滤。将滤液真空浓缩得到为白色固体的5’-O-(叔丁基二甲基甲硅烷基)阿糖胞苷(25.1g,85.4%),将其不进一步纯化直接使用。
[0523] 在N2下,向5’-O-(叔丁基二甲基甲硅烷基)阿糖胞苷(15.0g,41.96mmol)、AgNO3(43.5g,252mmol)和三甲基吡啶(61g,503.5mmol)的无水DCM(300mL)混合物中分小批加入MMTrCl(77.7g,252mmol)。在N2下,将反应混合物室温搅拌两天。通过布氏漏斗将反应混合物过滤。将滤液用饱和NaHCO3溶液洗涤,随后用盐水洗涤。将有机层分离,用无水Na2SO4干燥并过滤。将滤液真空浓缩得到剩余物,将剩余物通过硅胶柱(PE/EA=2/1)4
纯化得到5’-O-(叔丁基二甲基甲硅烷基)-2’,3’-O,N-三(4-甲氧基三苯甲基)阿糖胞苷(33.5g,67.9%)。
[0524] 在N2下,向5’-O-(叔丁基二甲基甲硅烷基)-2’,3’-O,N4-三(4-甲氧基三苯甲基)阿糖胞苷(12.0g,10.2mmol)的无水THF(80mL)冰冷溶液中逐滴加入TBAF(1M的THF溶液)(20.5mL,20.5mmol)。将反应混合物室温搅拌过夜。除去溶剂以得到剩余物。将剩余物溶解在EA(200mL)中,并用水和盐水洗涤。将有机层分离,用无水Na2SO4干燥并过滤。将滤液真空浓缩以得到剩余物,将剩余物通过硅胶柱(PE/EA=6/1至2/1)纯化得到2’,3’-O,4
N-三(4-甲氧基三苯甲基)阿糖胞苷(9.8g,90.5%)。
[0525] 步骤2.5’-脱氢-2’,3’-O,N4-三(4-甲氧基三苯甲基)阿糖胞苷的制备[0526]
[0527] 在N2下,向在无水DCM(20mL)中的无水吡啶(2.0mL)和戴斯-马丁氧化剂(3.2g,4
7.55mmol)冰冷混合物中加入2’,3’-O,N-三(4-甲氧基三苯甲基)阿糖胞苷(4.0g,
3.77mmol)的10mL无水DCM溶液。将反应混合物室温搅拌过夜。将反应混合物用EA(100mL)稀释,用Na2S2O3洗涤两次并用盐水洗涤。将有机层分离,用无水Na2SO4干燥并过滤。将滤
4
液真空浓缩得到5’-C,5’-O-二脱氢-2’,3’-O,N-三(4-甲氧基三苯甲基)阿糖胞苷(3.8g,95%),其不进行进一步纯化而直接使用。
[0528] 步骤3.5’-C-甲基阿糖胞苷的制备
[0529]
[0530] 在N2下,向5’-C,5’-O-二脱氢-2’,3’-O,N4-三(4-甲氧基三苯甲基)阿糖胞苷(2.0g,1.89mmol)的无水THF(10mL)冰冷溶液中逐滴加入MeMgBr(3M的乙醚溶液)(3.2mL,9.43mmol)。将反应混合物室温搅拌5h。通过HPLC检测反应结束。将混合物冷却至0℃并用饱和NH4Cl淬火。将产物用EA(100mL×2)萃取。将组合的有机层用Na2SO4干燥并浓缩以
4
得到粗的5’(S)-C-甲基-2’,3’-O,N-三(4-甲氧基三苯甲基)阿糖胞苷(1.4g,68.9%)。
[0531] 将5’-C-甲基-2’,3’-O,N4-三(4-甲氧基三苯甲基)阿糖胞苷(700mg,0.65mmol)溶解在10mL的AcOH/H2O(v/v=4∶1)中。将混合物在50℃搅拌过夜。真空除去溶剂并剩余物用水(3mL)稀释,用EA(2mL×2)萃取以除去某些杂质。将水层进行制备型HPLC分1
离。HPLC分离后得到5’(S)-C-甲基阿糖胞苷(40mg,23.5%)。H NMR(400Hz)(MeOD):
δ7.96(d,J=7.6Hz,1H),6.20(d,J=4.0Hz,1H),5.91(d,J=7.2Hz,1H),4.20(dd,J=
4.0Hz,2.4Hz,1H),4.10(t,J=2.8Hz,1H),4.01-4.07(m,1H),3.75(dd,J=4.0Hz,3.2Hz,
1H),1.33(d,J=6.4Hz,3H)。
[0532] 实施例43
[0533] 5’(R)-C-甲基阿糖胞苷(43)的制备
[0534]4
[0535] 步骤1.5’-C,5’-O-二脱氢-5’-C-甲基-2’,3’-O,N-三(4-甲氧基三苯甲基)阿糖胞苷的制备
[0536]
[0537] 在N2下,向CrO3(279mg,2.79mmol)的无水DCM(5mL)冰冷悬浮液中加入无水吡啶(0.45mL,5.59mmol)和Ac2O(0.28mL,2.79mmol)。将混合物室温搅拌约10min直至混合物变成均相。将混合物冷却至0℃并加入5’(S)-C-甲基-2’,3’-O,N4-三(4-甲氧基三苯甲基)阿糖胞苷(1.0g,0.93mmol)的无水DCM(5mL)溶液。将所得到的混合物室温搅拌过夜。通过HPLC检测反应结束。将反应混合物用EA(100mL)稀释,用NaHCO3溶液洗涤两次并用盐水洗涤。将有机层分离,用无水Na2SO4干燥并过滤。将滤液真空浓缩以得到剩余物,将剩余物通过硅胶柱(丙酮/PE=1/2)进行纯化得到5’-C,5’-O-二脱氢-5’-C-甲基-2’,
3’-O,N4-三(4-甲氧基三苯甲基)阿糖胞苷(548mg,55%)。
[0538] 步骤2.5’-脱氢-5’(R)-C-甲基阿糖胞苷的制备
[0539]
[0540] 在N2下,向5’-C,5’-O-二脱氢-5’-C-甲基-2’,3’-O,N4-三(4-甲氧基三苯甲基)阿糖胞苷(540mg,0.505mmol)的95%EtOH(10mL)冰冷溶液中加入NaBH4(39mg,1.01mmol)。将反应混合物室温搅拌7h。通过HPLC检测反应结束。蒸发掉溶剂。将剩余物用EA(30mL)稀释,用饱和NaHCO3和盐水洗涤。将有机层分离,用无水Na2SO4干燥并浓缩得
4
到粗的5’-C-甲基-2’,3’-O,N-三(4-甲氧基三苯甲基)阿糖胞苷(480mg,88%)。
[0541] 将5’-C-甲基-2’,3’-O,N4-三(4-甲氧基三苯甲基)阿糖胞苷(480mg,0.45mmol)溶解在10mL的AcOH/H2O(v/v=4∶1)中。将混合物在50℃搅拌过夜。真空除去溶剂并将剩余物用水(3mL)稀释,用EA(2mL×2)萃取以除去某些杂质。将水层进行制备型HPLC1
分离。HPLC分离后得到5’(R)-C-甲基阿糖胞苷(30mg,26%)。H NMR(400Hz)(MeOD):
δ7.84(d,J=7.6Hz,1H),6.18(d,J=3.6Hz,1H),5.91(d,J=7.6Hz,1H),4.28(t,J=
2.0Hz,1H),4.17(dd,J=3.6Hz,1.6Hz,1H),4.03-4.09(m,1H),3.75(dd,J=5.2Hz,2.4Hz,
1H),1.32(d,J=6.4Hz,3H)。
[0542] 实施例44
[0543] 1-O-乙酰基-2,5(S)-C-二甲基-2,3,5-O-三苯甲酰基-D-呋喃核糖(44)的制备[0544]
[0545] 步骤1.1(α)-O,2-C-二甲基-D-呋喃核糖的制备
[0546]
[0547] 在N2下,向用干冰冷却的2-C,2-O-二脱氢-1(α)-O-甲基-3,5-O-(1,1,3,3-四异丙基-1,3-二硅氧烷二基)-D-呋喃糖苷(根据公开的方法制备,46.0g,113.9mmol)的THF(300mL)溶液中逐滴加入CH3MgBr的乙醚溶液(3.0M,113.9mL,341.6mmol)。将混合物升温至室温并搅拌2h。将混合物用饱和NH4Cl淬火。将产物用EA(200×2)萃取。将组合的有机层用无水Na2SO4干燥并过滤。将滤液真空浓缩以得到为浆汁的1(α)-O,5-C-二甲基-3,5-O-(1,1,3,3-四异丙基-1,3-二硅氧烷二基)-D-呋喃糖苷(42.1g,88.0%),其不进行进一步纯化而直接使用。
[0548] 向1(α)-O,2-C-二甲基-3,5-O-(1,1,3,3- 四异丙基-1,3-二 硅氧烷 二基)-D-呋喃糖苷(42.1g,100.2mmol)的无水THF(200mL)溶液中分小批加入TBAF(52.6g,200.5mmol)。将混合物室温搅拌过夜。除去溶剂并将剩余物通过硅胶柱(EA/MeOH=100/1)纯化得到为浆汁的1(α)-O,2-C-二甲基-D-呋喃糖苷(16.5g,92.4%);1HNMR(400MHz)(MeOD):δ4.56(s,1H),3.87-3.90(m,1H),3.60-3.77(m,2H),3.52(d,J=6.0Hz),3.43(s,
3H),1.25(s,3H)。
[0549] 步骤2.2,3-O-二苯甲酰基-1(α)-O,2-C-二甲基-D-呋喃核糖的制备
[0550]
[0551] 在N2下,向1(α)-O,2-C-二甲基-D-呋喃糖苷(11.0g,61.8mmol)的无水吡啶(100mL)冰冷溶液中分小批加入TBSCl(11.2g,74.2mmol)。将反应混合物室温搅拌4h。将混合物在冰浴中冷却并加入BzCl(17.4g,124mmol)。将混合物室温搅拌过夜。将溶剂用EA(300mL)稀释并用饱和NaHCO3洗涤。将有机层分离,用无水Na2SO4干燥并过滤。将滤液真空浓缩得到粗制的浆汁。将粗制的浆汁通过快速柱色谱(PE/EA=20/1至10/1)纯化得到3-O-苯甲酰基-5-O-(叔丁基二甲基甲硅烷基)-1(α)-O,2-C-二甲基-D-呋喃糖苷(21.4g,87.2%);1HNMR(400MHz)(CDCl3):δ8.05(d,J=7.2Hz,2H),7.56(t,J=7.2Hz,1H),7.44(t,J = 6.4Hz,2H),4.98(d,J = 4.0Hz,1H),4.58(s,1H),4.18(m,1H),
3.90-3.93(m,1H),3.47(s,1H),3.11(s,1H),1.47(s,3H),0.91(s,9H),0.10(d,J=2.0Hz,
3H)。
[0552] 向TEA(54.6g,540mmol)和DMAP(6.6g,54.0mmol)的无水DCM(200mL)冰冷混合物中加入BzCl(15.2g,108.0mmol)随后加入3-O-苯甲酰基-5-O-(叔丁基二甲基甲硅烷基)-1(α)-O,2-C-二甲基-D-呋喃糖苷(21.4g,54.0mmol)。将反应混合物室温搅拌2天。将混合物用DCM(200mL)稀释,然后用水和饱和NaHCO3洗涤。将有机层分离,用Na2SO4干燥并过滤。将滤液真空浓缩得到粗制的浆汁。将该粗制的浆汁通过快速柱色谱(PE/EA=50/1至20/1)纯化得到为浆汁的5-O-(叔丁基二甲基甲硅烷基)-2,3-O-二苯甲酰基-1(α)-O,
2-C-二甲基-D-呋喃糖苷(24.5g,90.7%);1HNMR(400MHz)(CDCl3):δ8.11(m,2H),
7.75-7.77(m,2H),7.54-7.57(m,1H),7.38-7.45(m,3H),7.13-7.15(m,1H),5.35(d,J =
2.8Hz,1H),5.28(s,1H),4.27(m,1H),3.95-3.97(m,1H),3.40(s,1H),1.77(s,3H),0.92(s,
9H),0.12(d,J=2.0Hz,3H)。
[0553] 向5-O-(叔丁基二甲基甲硅烷基)-2,3-O-二苯甲酰基-1(α)-O,2-C-二甲基-D-呋喃糖苷(24.5g,49.0mmol)的THF(200mL)冰冷溶液中逐滴加入1M TBAF的THF溶液(58.8mL,58.8mmol)。将混合物在该温度搅拌2h。向混合物中加入HOAc以将溶液中和至微酸性。之后,除去溶剂并将剩余物通过快速柱色谱(PE/EA=20/1至8/1)进行纯化得到为浆汁的2,3-O-二苯甲酰基-1(α)-O,2-C-二甲基-D-呋喃核糖(15.2g,80.4%);1HNMR(400MHz)(CDCl3):δ8.11-8.13(dd,J1=5.2Hz,J2=7.2Hz,2H),7.79-7.82(dd,J1=
0.8Hz,J2=8.0Hz,2H),7.57-7.61(t,J=7.2Hz,1H),7.41-7.46(m,3H),7.17-7.21(t,J=8.0Hz,2H),5.30(s,1H),5.28(d,J=4.4Hz,1H),4.34(q,J=4.0Hz,1H),3.94-4.04(m,
2H),3.43(s,3H),2.29(w,1H),1.79(s,3H)。
[0554] 步骤3.2,3-O-二苯甲酰基-5-C-甲基-1(α)-O,2-C-二甲基-D-呋喃核糖的制备
[0555]
[0556] 在N2下,向用冰浴冷却的戴斯-马丁氧化剂(15.7g,37.0mmol)的无水DCM(200mL)悬浮液中加入2,3-O-二苯甲酰基-1(α)-O,2-C-二甲基-D-呋喃核糖(11.0g,28.5mmol)的无水DCM(50mL)溶液。将反应混合物室温搅拌过夜。将混合物用乙醚(500mL)稀释并用饱和Na2S2O3(22.51g,142.3mmol)洗涤。将有机层分离,用无水MgSO4干燥并过滤。将滤液在低于30℃的温度真空浓缩得到为白色泡沫体的2,3-O-二苯甲酰基-5-C,5-O-二脱氢-1(α)-O,2-C-二甲基-D-呋喃核糖(9.5g,96.4%)。
[0557] 向冷却至-78℃的无水乙醚(310mL)中逐滴加入TiCL4(10.85mL,18.75g,98.86mmol)。向所得到的黄色醚合物中缓慢加入3.0M CH3MgBr的乙醚溶液(33.0mL,
32.9mmol),然后将反应混合物升温至-30℃,之后逐滴加入2,3-O-二苯甲酰基-5-C,
5-O-二脱氢-1(α)-O,2-C-二甲基-D-呋喃核糖(9.5g,24.7mmol)的乙醚(30mL)溶液。
在-30℃至-10℃经历4h后,TLC分析显示完全转化,将反应分离并将水相用3×150mL的乙醚萃取。将组合的有机层用水洗涤,用无水MgSO4干燥,过滤并浓缩成浆汁。将浆汁通过硅胶柱(PE/EA=20/1至10/1)纯化得到为泡沫固体的2,3-O-二苯甲酰基-1(α)-O,2,5-C-三甲基-D-呋喃核糖(7.1g,71.7%);1HNMR(400MHz)(CDCl3):δ8.13(d,J=4.4Hz,2H),
7.09(d,J=4.4Hz,2H),7.36-7.47(m,5H),7.11(t,J=1.6Hz),5.40(d,J=4.0Hz,1H),
5.28(d,J=8.4Hz,1H),4.10-4.15(m,2H),3.42(s,3H),2.36(w,1H),1.77(s,3H),1.27(d,J=8.4Hz,3H)。
[0558] 步骤4.1-O-乙酰基-2,3,5-O-三苯甲酰基-2,5-C-二甲基-D-呋喃核糖的制备[0559]
[0560] 在N2下,向2,3-O-二苯甲酰基-1(α)-O,2,5-C-三甲基-D-呋喃核糖(2.0g,5.0mmol)的无水吡啶(20mL)冰冷溶液中加入BzCl(1.05g,7.5mmol)。将室温搅拌过夜。除去溶剂并将剩余物通过硅胶柱(PE/EA=50/1至30/1)纯化。得到为白色泡沫固体的2,
3,5-O-三苯甲酰基-1(α)-0,2,5-C-三甲基-Z)-呋喃核糖(1.5g,60%);1HNMR(400MHz)(CDCl3):δ8.18(d,J=7.2Hz,2H),8.06(d,J=7.2Hz,2H),7.36-7.71(m,9H),7.11(t,J=7.6Hz,2H),5.60(m,1H),5.56(d,J=5.2Hz,1H),4.44(t,J=4.8Hz,1H),3.43(s,1H),
1.79(s,1H),1.48(d,J=6.4Hz,3H)。
[0561] 向用水浴冷却的2,3,5-O-三苯甲酰基-1(α)-O,2,5-C-三甲基-D-呋喃核糖(1.5g,3.0mmol)的HOAc(10mL)和AC2O(1mL)溶液中逐滴加入0.5mL浓H2SO4。将混合物室温搅拌3h。将混合物倒入冰水中并将沉淀物通过过滤收集。将固体饼溶解在EA(50mL)中并用饱和NaHCO3(30mL×2)洗涤。将有机层分离,用无水Na2SO4干燥并过滤。将滤液真空浓缩得到为白色泡沫固体的1-O-乙酰基-2,5(S)-C-二甲基-2,3,5-O-三苯甲酰基-D-呋喃核糖(1.4g,88.6%);1HNMR(400MHz)(CDCl3):δ7.87-8.02(m,5H),7.06-7.63(m,10H),6.73+6.55(s,1H),5.84(d,J=8.0Hz,0.5H),5.64(d,J=3.6Hz,0.5H),5.30-5.51(m,1H),
4.41-4.50(m,1H),1.94+1.86(s,3H),1.76+1.71(s,3H),1.41+1.33(d,J=6.8Hz,3H)。
[0562] 实施例45
[0563] 1-O-乙酰基-2,5(R)-C-二甲基-2,3,5-O-三苯甲酰基-D-呋喃核糖(45)的制备[0564]
[0565] 在N2下,向2,3-O-二苯甲酰基-1(α)-O,2,5-C-三甲基-D-呋喃核糖(2.0g,5.0mmol)、PNBA(3.3g,19.9mmol)和Ph3P(5.2g,19.9mmol)的无水THF(50mL)冰冷溶液中逐滴加入DEAD(3.48g,19.9mmol)。将所得到的混合物在室温搅拌过夜。除去溶剂并将剩余物通过硅胶柱(PE/EA=30/1至20/1)纯化。得到为白色泡沫固体的2,3-O-二苯甲酰基-1(α)-O,2,5-C-三甲基-5-O-(4-硝基苯甲酰基)-D-呋喃核糖(1.4g,51.0%);
1HNMR(400MHz)(CDCl3):δ8.13-8.21(m,4H),8.11-8.13(dd,Ji=0.8Hz,J2=8.0Hz,2H),
7.70-7.73(dd,J1=0.8Hz,J2=8.0Hz,2H),7.61(t,J=7.2Hz,1H),7.38-7.45(m,3H),
7.13(t,J= 8.0Hz,2H),5.59(m,1H),5.33(s,1H),5.27(d,J = 5.2Hz,1H),4.47(t,J =
5.2Hz,1H),3.44(s,3H),1.80(s,3H),1.51-1.56(dd,J1=6.4Hz,J2=12.8Hz,3H)。
[0566] 向2,3-O-二苯甲酰基-1(α)-O,2,5-C-三甲基-5-O-(4-硝基苯甲酰基)-D-呋喃核糖(1.4g,2.5mmol)的HOAc(10mL)和Ac2O(1mL)水冷溶液中逐滴加入0.5mL的浓H2SO4。将混合物室温搅拌3h。将混合物倒入冰水中并通过过滤收集沉淀。将固体饼重新溶解在EA(50mL)中并用饱和NaHCO3(30mL×2)洗涤。将有机层分离,用无水Na2SO4干燥并过滤。将滤液真空浓缩得到为白色泡沫固体的1-O-乙酰基-2,3-O-二苯甲酰基-2,5(R)-C-二甲基-5-O-(4-硝基苯甲酰基)-D-呋喃核糖(1.3g,89.6%);1HNMR(400MHz)(CDCl3):δ7.91-8.20(m,7H),7.12-7.67(m,7H),6.75+6.56(s,1H),5.75(d,J = 8.4Hz,
0.5H),5.57(m,0.5H),5.37(m,1H),4.43-4.50(m,1H),2.16+1.97(s,3H),1.78+1.73(s,
3H),1.48+1.38(d,J=6.8Hz,3H)。
[0567] 实施例46
[0568] 1-O-乙酰基-5-C-甲基-2,3,5-O-三苯甲酰基-D-呋喃核糖(46)的制备
[0569]
[0570] 步骤1.1-O,5-C-二甲基-2,3-O-异亚丙基-D-呋喃核糖的制备
[0571]
[0572] 向D-核 糖(200g,1.33mol) 的 丙 酮(760mL)和MeOH(760mL) 溶 液 中 加 入浓HCl(20mL),并将溶液回流18h。将反应冷却,用吡啶中和,倒入H2O(2L)中,并用Et2O(3×400mL)萃取。将组合的有机层用饱和CuSO4水溶液(300mL)洗涤,用MgSO4干燥然后蒸发。将剩余物蒸馏得到为无色油状的2,3-O-异亚丙基-1-O-甲基-D-呋喃核糖(180.5g,56.5%)。
[0573] 在N2下,向戴斯-马丁氧化剂(487.3g,1.15mol)的无水DCM(800L)冰冷悬浮液中逐滴加入2,3-O-异亚丙基-1-O-甲基-D-呋喃核糖(180.5g,883.85mmol)的无水DCM(200mL)溶液。将所得到的混合物室温搅拌过夜,然后用Et2O(2L)稀释。将混合物用饱和Na2SO3水溶液(3×600mL)洗涤。将有机层分离,用无水MgSO4干燥并过滤。将滤液真空浓缩得到为浆汁的5-C,5-O-二脱氢-2,3-O-异亚丙基-1-O-甲基-D-呋喃核糖(161.7g,90.48%),其不进行进一步纯化而直接用于接下来的步骤。
[0574] 在N2下,在50℃向5-C,5-O-二脱氢-2,3-O-异亚丙基-1-O-甲基-D-呋喃核糖(161.7g,799.70mmol)的无水THF(3.0L)溶液中加入3M MeMgBr的乙醚溶液(800mL,2.40mol)。加入后,在4h期间将反应混合物加热至0℃。将混合物用饱和NH4Cl水溶液淬火并将产物用EA(2×2.0L)萃取。将组合的有机层用无水MgSO4干燥并过滤。将滤液真空浓缩得到浆汁,将该浆汁通过硅胶柱(PE/EA=30/1至10/1)纯化得到为无色浆汁的1-O,
5-C-二甲基-2,3-O-异亚丙基-D-呋喃核糖(120.3g,69.4%)。
[0575] 步骤2.5-O-苯甲酰基-1-O,5-C-二甲基-D-呋喃核糖的制备
[0576]
[0577] 在N2下,向1-O,5-C-二甲基-2,3-O-异亚丙基-D-呋喃核糖(20.0g,92.06mmol)和DMAP(1.12g,9.21mmol)的无水吡啶(150mL)冰冷溶液中逐滴加入BzCl(19.41g,138.1mmol)。将反应混合物室温搅拌过夜。向混合物中加入EA(300mL),然后用水(200mL)和饱和NaHCO3水溶液(200mL)洗涤。将有机层分离,用无水Na2SO4干燥并过滤。将滤液真空浓缩得到剩余物,将剩余物通过柱子(PE/EA=30/1至10/1)纯化得到为浆汁的5-O-苯甲酰基-1-O,5-C-二甲基-2,3-O-异亚丙基-D-呋喃核糖(20.7g,69.7%)。
[0578] 在0℃,将5-O-苯甲酰基-1-O,5-C-二甲基-2,3-O-异亚丙基-D-呋喃核糖(20.7g,67.14mmol)加入至TFA(180mL)和H2O(20mL)溶液中。将所得到的混合物在0℃搅拌3h。TLC显示没有起始材料剩余。在0℃真空除去溶剂。将剩余物溶解在DCM(200mL)中,并用饱和NaHCO3水溶液(2×150mL)洗涤。将有机层分离,用无水Na2SO4干燥并过滤。将滤液真空浓缩得到浆汁的5-O-苯甲酰基-1-O,5-C-二甲基-D-呋喃核糖(12.0g),其不进行进一步纯化直接使用。
[0579] 步骤3.1-O-乙酰基-2,3,5-O-三苯甲酰基-5-C-甲基-D-呋喃核糖的制备[0580]
[0581] 将粗的5-O-苯甲酰基-1-O,5-C-二甲基-D-呋喃核糖(12.0g,42.51mmol)溶解在无水吡啶中并用冰浴冷却。将DMAP(0.52,4.25mmol)和BzCl(14.9g,106.27mmol)加入至混合物中,然后室温搅拌过夜。将EA(300mL)加入至中混合物然后用水(200mL)和饱和NaHCO3水溶液(200mL)洗涤。将有机层分离,用无水Na2SO4干燥并过滤。将滤液真空浓缩得到剩余物,将剩余物通过柱子(PE/EA=30/1至10/1)纯化得到为浆汁的1-O,5-C-二甲基-2,3,5-O-三苯甲酰基-D-呋喃核糖(15.5g,74.34%)。
[0582] 向1-O,5-C-二甲基-2,3,5-O-三苯甲酰基-D-呋喃核糖(15.5g,31.6mmol)的HOAc(50mL)和Ac2O(5mL)水冷(10℃)混合物中逐滴加入饱和H2SO4(2.5mL)。将所得到的混合物室温搅拌5h,然后倒入冰水中。通过过滤收集沉淀。将收集的固体溶解在EA(100mL)中并用饱和NaHCO3水溶液(100mL)洗涤。将有机层分离,用无水Na2SO4干燥并过滤。将滤液真空浓缩得到剩余物,将剩余物通过柱子(PE/EA=30/1至20/1)纯化得到为泡沫固体的1-O-乙酰基-5-C-甲基-2,3,5-O-三苯甲酰基-D-呋喃核糖(10.5g,64.02%)。
[0583] 实施例47
[0584] 5’(S)-C-甲基腺苷(47)的制备
[0585]
[0586] 在N2下,向1-O-乙酰基-5(S)-C-甲基-2,3,5-O-三苯甲酰基-D-呋喃核糖(8.0g,15.43mmol)和腺嘌呤(3.13g,23.14mmmol)的无水MeCN(100mL)冰冷溶液中逐滴加入1M SnCl4的无水MeCN溶液(38.6mL,38.6mmol)。将混合物室温搅拌过夜,然后通过NaHCO3水溶液淬火。将产物用EA(2×100mL)萃取。将组合的有机层用无水Na2SO4干燥并过滤。将滤液真空浓缩得到剩余物,将剩余物通过硅胶柱纯化得到8.0g的2’,3’,5’-O-三苯甲酰基-5’-C-甲基腺苷,将其溶解在甲醇(100mL)中,并在0℃用NH3饱和1h,然后室温搅拌过夜。减压除去溶剂并将剩余物重新溶解在400mL的饱和NH3水溶液中。将混合物室温搅拌过夜并除去溶剂。将剩余物通过制备型HPLC进行纯化得到5’(S)-C-甲基腺苷(1.5g,
34.5%)。
[0587] 实施例48
[0588] 5’(S)-C-甲基鸟苷(48)的制备
[0589]
[0590] 在氩气下,将N2-乙酰基鸟嘌呤(10.65g,81.00mmol)、无水吡啶(50mL)和HMDS(300mL)的混合物加热回流2h以获得透明溶液。真空小心除去溶剂,并将剩余物在2
高真空下干燥1h。向含有全硅烷化的N-乙酰基鸟苷的烧瓶中加入无水甲苯(100mL)和
1-O-乙酰基-5(S)-C-甲基-2,3,5-O-三苯甲酰基-D-呋喃核糖(10.5g,20.25mmol)。室温向所得混合物中缓慢加入TMSOTf(18.0g,81.00mmol)同时强力搅拌。在氩气下,搅拌回流6h后,将反应混合物冷却至室温并用饱和NaHCO3水溶液淬火。将有机层分离,并将水层用DCM(2×150mL)萃取。将组合的有机层用盐水洗涤,并用无水MgSO4干燥。过滤掉MgSO4,真空蒸发除去溶剂得到浅黄色泡沫体(13.1g)。将8.0g的泡沫固体通过制备型HPLC进
2
行纯化得到4.4g(95%纯度)的N-乙酰基-5’(S)-C-甲基-2,3,5-O-三苯甲酰基鸟苷,将其溶解在甲醇(100mL)中,用NH3饱和并室温搅拌过夜。减压除去溶剂并将剩余物重新溶解在400mL饱和NH3水溶液中。将混合物室温搅拌过夜并将溶剂浓缩至约150mL。将沉淀物通过过滤收集并真空干燥得到为白色固体的5’(S)-C-甲基鸟苷(550mg,30.7%);
1
H NMR(400MHz)(MeOD):δ7.88(s,1H),5.76(d,J=7.2Hz,1H),4.64(t,J=6.0Hz,1H),
4.30(d,J=4.4Hz,1H),4.03-4.01(m,1H),3.93(s,1H),1.24(d,J=6.4Hz,3H)。
[0591] 实施例49
[0592] 1-O-乙酰基-2,3-O-二苯甲酰基-5(R)-C-甲基-5-O-(4-硝基苯甲酰基)-D-呋喃核糖(49)的制备
[0593]
[0594] 步骤1.1-O,5-C-二甲基-5-O-(4-硝基苯甲酰基)-D-呋喃核糖的制备
[0595]
[0596] 在N2 下,向1-O,5-C-二 甲 基-2,3-O- 异 亚 丙 基-D-呋 喃 核 糖 (25.0g,114.55mmol)、PNBA(76.57g,458.19mmol) 和 Ph3P(120.18g,458.19mmol) 的 无 水THF(600mL)冰冷溶液中逐滴加入DEAD(79.79g,458.19mmol)。将反应混合物室温搅拌过夜。除去溶剂并将剩余物通过硅胶柱(PE/EA=50/1至20/1)纯化得到为浅黄色浆汁的1-O,5-C-二甲基-2,3-O-异亚丙基-5-O-(4-硝基苯甲酰基)-D-呋喃核糖(21.3g,
50.62%)。
[0597] 在0℃,将1-O,5-C-二甲基-2,3-O-异亚丙基-5-O-(4-硝基苯甲酰基)-D-呋喃核糖(16.3g,44.37mmol)加入至TFA(90mL)和H2O(10mL)的溶液中。将所得到的混合物在0℃搅拌3h。TLC显示没有起始材料剩余。在0℃真空除去溶剂。将剩余物溶解在DCM(150mL)中并用饱和NaHCO3(2×150mL)水溶液洗涤。将有机层分离,用无水Na2SO4干燥并过滤。将滤液真空浓缩得到浆汁,将该浆汁通过硅胶柱(PE/EA=15/1至5/1)纯化得到为浆汁的1-O,5-C-二甲基-5-O-(4-硝基苯甲酰基)-D-呋喃核糖(7.0g,48.2%)。
[0598] 步骤2.1-O-乙酰基-2,3-O-二苯甲酰基-5-C-甲基-5-O-(4-硝基苯甲酰基)-D-呋喃核糖的制备
[0599]
[0600] 将1-O,5-C-二甲基-5-O-(4-硝基苯甲酰基)-D-呋喃核糖(7.0g,21.39mmol)溶解在无水吡啶(50mL)中并用冰浴冷却。将DMAP(0.26,2.14mmol)和BzCl(7.52g,53.47mmol)加入至混合物中,然后室温搅拌过夜。将EA(200mL)加入至混合物中,然后用水(100mL)和饱和NaHCO3(100mL)水溶液洗涤。将有机层分离,用无水Na2SO4干燥并过滤。
将滤液真空浓缩得到剩余物,将剩余物通过柱子(PE/EA=30/1至10/1)纯化得到为浆汁的2,3-O-二苯甲酰基-1-O,5-C-二甲基-5-O-(4-硝基苯甲酰基)-D-呋喃核糖(9.2g,
80.33%)。
[0601] 向用水浴冷却的2,3-O-二苯甲酰基-1-O,5-C-二甲基-5-O-(4-硝基苯甲酰基)-D-呋喃核糖(9.2g,17.18mmol)的HOAc(30mL)和Ac2O(3mL)溶液中逐滴加入1.5mL的浓H2SO4。将混合物室温搅拌3h。将混合物倒入冰水中并将沉淀物通过过滤收集。将固体饼再溶解在EA(50mL)中并用饱和NaHCO3(30mL×2)洗涤。将有机层分离,用无水Na2SO4干燥并过滤。将滤液真空浓缩得到为白色泡沫固体的1-O-乙酰基-2,3-O-二苯甲酰1
基-5(R)-C-甲基-5-O-(4-硝基苯甲酰基)-D-呋喃核糖(8.1g,83.7%)。H NMR(400MHz)(CDCl3):δ8.83-8.18(m,4H),8.05-7.96(m,2H),7.86-7.82(m,2H),7.86-7.82(m,
2H),7.59-7.49(m,2H),7.45-7.40(m,2H),6.75(d,J = 4.4Hz,0.3H),6.42(s,0.7H),
5.86-5.83(m,0.7H),5.74-70(m,1H),5.54-4.92(m,1.3H),4.64-4.61(m,1H),2.20(s,2H),
2.16(s,1H),1.54(d,J=6.8Hz,1H),1.49(d,J=6.4Hz,2H)。
[0602] 实施例50
[0603] 5’(R)-C-甲基腺苷(50)的制备
[0604]6
[0605] 在氩气下,将N-苯甲酰基腺苷(2.39g,20mmol)和N,O-二(三甲基甲硅烷基)乙酰胺(9.78mL,40mmol)的无水乙腈(50mL)混合物加热回流1h并冷却至室温。加入1-O-乙酰基-2,3-O-二苯甲酰基-5(R)-C-甲基-5-O-(4-硝基苯甲酰基)-D-呋喃核糖(1.5g,2.89mmol)的无水乙腈(50mL)溶液,随后加入三氟甲磺酸三甲基硅酯(1.36g,7.5mmol)。
将所得混合物加热回流过夜,用冰冷却,用乙酸乙酯稀释,用碳酸氢钠水溶液洗涤,用无水Na2SO4干燥并浓缩。通过采用10%-15%乙酸乙酯的DCM溶液的硅胶色谱得到3.62g的2’,
3’-O-二苯甲酰基-5’(R)-C-甲基-5’-O-(4-硝基苯甲酰基)腺苷。
[0606] 将2’,3’-O-二苯甲酰基-5’(R)-C-甲基-5’-O-(4-硝基苯甲酰基)腺苷(3.62g)的甲醇(300mL)溶液和28%氨水溶液(30mL)室温搅拌过夜。除去溶剂并将剩余物再溶解在28%NH3水溶液(250mL)中。将混合物室温搅拌2天并除去溶剂。通过从MeOH/DCM中沉淀得到为白色固体的0.59g的5’(R)-C-甲基腺苷。将滤液浓缩并通过采用10%-14%MeOH的DCM溶液的硅胶色谱得到为白色固体的0.68g的5’(R)-C-甲基腺苷。总收率为1
1.27g。H NMR(CD3OD):δ8.31(s,1H),8.18(s,1H),5.95(d,J=6.4Hz,1H),4.73(q,J1=
5.2Hz,J2=6.8Hz,1H),4.27(dd,J1=2.4Hz,J2=5.2Hz,1H),4.01(t,J=2.4Hz,1H),
3.97-3.91(m,1H),1.25(d,J=6.4Hz,3H)。
[0607] 实施例516
[0608] 2’,3’-甲氧基亚甲基-5’-O,N-(4’-甲氧基三苯甲基)-5’(R)-甲基腺苷(51)的制备
[0609]
[0610] 将在1,4-二噁烷(11.2mL)中的5’(R)-C-甲基腺苷(890mg,3.17mmol)、原甲酸三甲酯(9mL)和对甲苯磺酸一水合物(904mg,4.75mmol)的混合物室温搅拌24h,用冰冷却,通过加入三乙胺(1mL)淬火并浓缩。通过采用5%-6%MeOH的DCM溶液的硅胶色谱得到716mg的2’,3’-O-甲氧基亚甲基-5’(R)-C-甲基腺苷。
[0611] 在50℃将2’,3’-O-甲氧基亚甲基-5’(R)-C-甲基腺苷(715mg,2.21mmol)和4-甲氧基三苯甲基氯(1.03g,3.32mmol)的吡啶(14mL)溶液搅拌20h,用乙酸乙酯稀释,用盐水洗涤三次。蒸发掉溶剂并将剩余物通过采用25%-55%乙酸乙酯的己烷溶液的硅胶色
6
谱得到352mg的5’-O,N-二(4’-甲氧基三苯甲基)-2’,3’-甲氧基亚甲基-5’(R)-甲
6
基腺苷和为泡沫固体的634mg的2’,3’-甲氧基亚甲基-5’-O,N-(4’-甲氧基三苯甲基)-5’(R)-甲基腺苷。
[0612] 实施例52
[0613] 2’,3’-甲氧基亚甲基-5’-O,N6-(4’-甲氧基三苯甲基)-5’(S)-甲基腺苷(52)的制备
[0614]
[0615] 通过与实施例48-2所述方法相似的方法,由5’(S)-C-甲基腺苷制备377mg的6
5’-O,N-二(4’-甲氧基三苯甲基)-2’,3’-甲氧基亚甲基-5’(S)-甲基腺苷和为泡沫
6
固体的750mg的2’,3’-甲氧基亚甲基-5’-O,N-(4’-甲氧基三苯甲基)-5’(S)-甲基腺苷。
[0616] 实施例53
[0617] 2’,5’(R和S)-C-二甲基腺苷(53)的制备
[0618]
[0619] 步骤1.5’-O-(叔丁基二甲基甲硅烷基)-2’,3’-O-(甲氧基亚甲基)-2’-C-甲基腺苷的制备
[0620]
[0621] 向干燥的2’-C-甲基腺苷(720mg,2.56mmol)和原甲酸三甲酯(7.22mL)的无水1,4-二噁烷(9mL)溶液中加入对甲苯磺酸(374mg),在氮气下室温搅拌过夜。将反应混合物用甲醇-氨(7N)中和至pH为5-6,并浓缩成粗剩余物,将该粗剩余物用甲醇-二氯甲烷(2∶1,10mL)再溶解并室温搅拌过夜。然后将以上反应混合物浓缩成粗剩余物,将该粗剩余物通过采用二氯甲烷-甲醇(10∶1)洗脱的硅胶短柱得到为非晶固体的纯的化合物
2’,3’-O-(甲氧基亚甲基)-2’-C-甲基腺苷(720mg,87%)。两异构体1H-NMR(DMSO-d6,
500MHz):δ8.36(s,1H),8.20(s,1H),8.15(s,1H),7.31(s,2H,NH2),6.41(s,1H),6.22(s,
0.3H),6.15(s,0.3H),5.40-5.37(m,1.05H,H-1’),4.64(d,0.3H),4.59(d,0.93H,J =
4.10Hz),4.28(dd,0.93H),4.20(dd,0.3H),3.80-3.76(dt,1.1H),3.72-3.67(dt,1.08H),
3.39(s,2.7H,OCH3),3.23(s,0.6H),1.14(s,0.4H,2’-CH3),1.03(s,2.84H,2’-CH3)。
[0622] 向干燥的2’,3’-O-(甲氧基亚甲基)-2’-C-甲基腺苷(720mg,2.22mmol)和咪唑(348mg,5.12mmol)的无水DMF(5mL)溶液中加入叔丁基二甲基氯硅烷(579mg,3.84mmol),并在氮气下室温搅拌过夜。然后将反应混合物浓缩成粗剩余物,并用甲苯共蒸发。将上述粗剩余物通过采用二氯甲烷-甲醇(10∶1)洗脱的硅胶短柱以得到为非晶固体的纯的5’-O-(叔丁基二甲基甲硅烷基)-2’,3’-O-(甲氧基亚甲基)-2’-C-甲基腺苷(1.09g,
100%)。
[0623] 步骤2.2’,3’-O-(甲氧基亚甲基)-N6-(4-甲氧基三苯甲基)-2’-C-甲基腺苷的制备
[0624]
[0625] 向干燥的5’-O-(叔丁基二甲基甲硅烷基)-2’,3’-O-(甲氧基亚甲基)-2’-C-甲基腺苷(1.09g,2.49mmol)、三乙胺(703μL)和DMAP(290mg)的无水二氯甲烷(5mL)溶液中加入MMTrCl(1.15g,3.74mmol),并在氮气下,在45℃-50℃搅拌过夜。在45℃-50℃搅拌16h后,加入另一部分MMTrCl(1.15g),并继续在相同温度搅拌共48h。然后将反应混合物浓缩成粗产物,并用甲苯共蒸发。将上述粗剩余物通过采用己烷-乙酸乙酯(4∶1)洗脱的硅胶短柱以得到为非晶固体的纯的5’-O-(叔丁基二甲基甲硅烷基)-2’,3’-O-(甲氧6
基亚甲基)-N-(4-甲氧基三苯甲基)-2’-C-甲基腺苷(1.10g,62%)。
6
[0626] 向干燥的5’-O-(叔丁基二甲基甲硅烷基)-2’,3’-O-(甲氧基亚甲基)-N-(4-甲氧基三苯甲基)-2’-C-甲基腺苷(1.1g,1.55mmol)的四氢呋喃(THF)(6mL)溶液中加入四丁基氟化铵水合物(349mg),并在氮气下室温搅拌过夜。然后将反应混合物浓缩成粗剩余物,将该粗剩余物通过采用二氯甲烷-甲醇(10∶1)洗脱的硅胶短柱得到为非晶固体的纯6
的2’,3’-O-(甲氧基亚甲基)-N-(4-甲氧基三苯甲基)-2’-C-甲基腺苷(610mg,66%)。
[0627] 步骤3.2’,5’-C-二甲基-2’,3’-O-(甲氧基亚甲基)-N6-(4-甲氧基三苯甲基)腺苷的制备
[0628]
[0629] 向在无水二氯甲烷(15mL)和无水吡啶(1.02mL)混合物中的干燥的2’,3’-O-(甲6
氧基亚甲基)-N-(4-甲氧基三苯甲基)-2’-C-甲基腺苷(610mg,1.02mmol)溶液中加入戴斯-马丁氧化剂(647mg,1.53mmol),并在氮气下室温搅拌2h。将反应混合物用饱和碳酸氢钠水溶液和10%Na2S2O3水溶液的混合物淬火。将有机相分离并将水相用二氯甲烷(3×20mL)萃取。将组合有机相用无水硫酸钠干燥并浓缩成粗剩余物,将该粗剩余物通过采用己烷-乙酸乙酯(1∶1和1∶2)和随后的二氯甲烷-甲醇(10∶1)洗脱的硅胶短柱以
6
得到为非晶固体的纯的5’-C,5’-O-二脱氢-2’,3’-O(甲氧基亚甲基)-N-(4-甲氧基三
1
苯甲基)-2’-C-甲基腺苷(200mg,33%)。两异构体:H-NMR(CDCl3,500MHz):δ9.5(s,1H,CH=O),9.49(s,1H,CH=O),3.79(s,2OCH3),3.39(s,2.7H,OCH3),1.14(s,0.4H,2’-CH3),
1.03(s,2.84H,2’-CH3)。
[0630] 向用冰-氯化钠浴冷却至-20℃的干燥的5’-C,5’-O-二脱氢-2’,3’-O-(甲氧6
基亚甲基)-N-(4-甲氧基三苯甲基)-2’-C-甲基腺苷(350mg,0.59mmol)的无水四氢呋喃(3-5mL)冷溶液中加入甲基溴化镁(0.80mL,3.0M的乙醚溶液),并在氮下,在-20℃至室温搅拌过夜。然后将反应混合物用饱和氯化铵淬火并浓缩以除去四氢呋喃,并用乙酸乙酯萃取(3×20mL)。将组合有机相浓缩并用甲苯共蒸发成粗剩余物。将上述粗剩余物通过用己烷-乙酸乙酯(1∶2)洗脱的硅胶短柱得到为非晶固体的纯2’,5’-C-二甲基-2’,
6
3’-O-(甲氧基亚甲基)-N-(4-甲氧基三苯甲基)腺苷(170mg,47%)。
[0631] 步骤4.2’,5’-C-二甲基腺苷的制备
[0632]
[0633] 将在甲醇(6mL)、乙酸(3mL)和水(1mL)的混合物中的2’,5’-C-二甲基-2’,6
3’-O-(甲氧基亚甲基)-N-(4-甲氧基三苯甲基)腺苷(110mg,0.181mmol)溶液在50℃搅拌16h。然后将反应混合物浓缩并用甲苯共蒸发成粗剩余物,将该粗剩余物通过采用二氯甲烷-甲醇(10∶1和6∶1)洗脱的硅胶短柱得到为非晶固体的纯的2’,5’-C-二甲基腺苷
1
(40mg,75%)。两异构体A和B,A与B的比率为1.77:H-NMR(CD3OD,500MHz):δ8.57(s,
1H,异构体-A),8.55(s,1H,异构体-B),8.20(s,1H,异构体-A),8.19(s,1H,异构体-B),
6.09(s,1H,H’-1,异构体-A),6.07(s,1H,H’-1,异构体-B),4.58(s,0.8H),4.30-4.28(m,
4H),4.19(d,1H),4.08-4.07(dq,1H),3.97(dd,1H),3.88(dd,1H),1.36(d,3H,5’-CH3,异构体-A,J=6.6Hz),1.33(d,3H,5’-CH3,异构体-B,J=6.9Hz),0.90(s,3H,2’-CH3,异构体-A),0.89(s,3H,2’-CH3,异构体-B)。ESI-MS(阳性模式):295[M],318[M+Na]。
[0634] 实施例54
[0635] 2’,5’(S)-C-二甲基腺苷(54)的制备
[0636]
[0637] 在氩下,将N6-苯甲酰基腺苷(1.46g,6.12mmol)和N,O-二(三甲基甲硅烷基)乙酰胺(2.95mL,12.24mmol)在无水乙腈(15mL)中的混合物加热回流45min并冷却至室温。加入1-O-乙酰基-5(S)-C-甲基-5-O-(4-硝基苯甲酰基)-2,3,5-O-三苯甲酰基-D-呋喃核糖(1.63g,3.06mmol)的无水乙腈(15mL)溶液,随后加入三氟甲磺酸三甲基硅酯(0.86mL,4.59mmol)。将所得到的混合物加热回流过夜,用冰冷却,用乙酸乙酯稀释,用碳酸氢钠水溶液洗涤,用无水Na2SO4干燥并浓缩。通过采用10%-15%乙酸乙酯的DCM溶液的硅胶色谱得到1.60g的5’(S)-C-甲基-2’,3’,5’-O-三苯甲酰基腺苷。
[0638] 将5’(S)-C-甲基-2’,3’,5’-O-三苯甲酰基腺苷(1.58g)的甲醇(150mL)溶液和28%氨水溶液(50mL)室温搅拌过夜。除去溶剂,并将剩余物再溶解在28%NH3水溶液(130mL)中。将混合物室温搅拌3天并除去溶剂。通过采用12%-14%MeOH的DCM溶液的硅胶色谱得到为白色固体的619mg的2’,5’(S)-C-二甲基腺苷;1H NMR(CD3OD):δ8.55(s,1H),8.19(s,1H),6.07(s,1H),4.29(d,J=8.4Hz,1H),4.26(m,1H),3.97(dd,J1=8.4Hz,J2=2.4Hz5IH),1.33(d,J=6.8Hz,3H),0.89(s,3H)。
[0639] 实施例55
[0640] 2’,5’(R)-C-二甲基腺苷(55)的制备
[0641]
[0642] 在氩下,将N6-苯甲酰基腺苷(1.75g,7.3mmol)和N,O-二(三甲基甲硅烷基)乙酰胺(3.6mL,14.6mmol)在无水乙腈(18mL)中的混合物加热回流45min并冷却至室温。加入1-O-乙酰基-5(S)-C-甲基-5-O-(4-硝基苯甲酰基)-2,3,5-O-三苯甲酰基-D-呋喃核糖(2.11g,3.65mmol)的无水乙腈(18mL)溶液,随后加入三氟甲磺酸三甲基硅酯(1.02mL,5.48mmol)。将所得到混合物加热回流过夜,用冰冷却,用乙酸乙酯稀释,用碳酸氢钠水溶液洗涤,用无水Na2SO4干燥并浓缩。通过采用10%-15%乙酸乙酯的DCM溶液的硅胶色谱得到1.81g的5’(R)-C-甲基-5’-O-(4-硝基苯甲酰基)-2’,3’,5’-O-三苯甲酰基腺苷。
[0643] 5’(R)-C-甲基-5’-O-(4-硝基苯甲酰基)-2’,3’,5’-O-三苯甲酰基腺苷(2.04g)的甲醇(200mL)溶液和28%氨水溶液(65mL)室温搅拌过夜。除去溶剂,并将剩余物再溶解在28%NH3水溶液(240mL)中。将混合物室温搅拌2天,并除去溶剂。将沉淀物用20%MeOH的DCM溶液洗涤,然后用MeOH洗涤以得到为白色固体的402mg的2’,5’(R)-C-二甲基腺苷。通过采用10%-14%MeOH的DCM溶液的硅胶色谱得到为白色固体的397mg的1
2’,5’(R)-C-二甲基腺苷。总收率为779mg。H NMR(CD3OD):δ8.59(s,1H),8.19(s,1H),
6.09(s,1H),4.19(d,J=8.8Hz,1H),4.06(dq,1H),3.88(dd,J1=8.8Hz,J2=2.4Hz,1H),
1.36(d,J=6.8Hz,3H),0.90(s,3H)。
[0644] 实施例56
[0645] 5’(R)-C-甲基鸟苷(56)的制备
[0646]
[0647] 向1-O-乙酰基-2,3-O-二苯甲酰基-5(R)-C-甲基-5-O-(4-硝基苯甲酰基)-D-呋喃核糖(969mg,1.72mmol)、2-氨基-6-氯嘌呤(0,32g,1.87mmol)和DBU(0.77mL,
5.10mmol)的无水乙腈(20mL)溶液中逐滴加入三氟甲磺酸三甲基硅酯(1.25mL,
6.88mmol)。将所得到的反应混合物在65℃搅拌过夜,冷却,用乙酸乙酯稀释,用10%碳酸氢钠洗涤并用硫酸钠干燥。通过采用10%-15%乙酸乙酯的DCM溶液的硅胶色谱得到为白色固体的0.62g的1-(2-氨基-6-氯嘌呤-N9-基)-2,3-O-二苯甲酰基-5(R)-C-甲基-5-O-(4-硝基苯甲酰基)-β-D-呋喃核糖,将该产物溶解在7M NH3的MeOH溶液中并室温静置过夜并浓缩。采用10%-15%MeOH的DCM溶液的硅胶色谱得到为白色固体的260mg的1-(2-氨基-6-氯嘌呤-N9-基)-5(R)-C-甲基-β-D-呋喃核糖。
[0648] 向在MeOH(5mL)中的1-(2-氨基-6-氯嘌呤-N9-基)-5(R)-C-甲基-β-D-呋喃核糖(253mg,0.8mmol)和巯基乙醇(2.28mL,4.0mmol)的混合物中加入0.5M NaOMe的MeOH溶液(8mL,4.0mmol)。将所得到的混合物回流过夜,冷却,用AcOH中和。采用乙腈/水的反相HPLC得到为白色固体的5’(R)-C-甲基鸟苷(167mg);1H NMR(DMSO-d6)δ1.08(d,J=6.8Hz,3H),3.16(d,J=4.8Hz,1H),3.7(t,J=3.2Hz,1H),3.73-3.79(m,
1H),4.06-4.10(m,2H),4.30-4.34(m,1H),5.34(d,J=5.2Hz,1H),5.68(d,J=5.6Hz,1H),
6.47(br s,2H),7.95(s,1H),10.72(br s,1H)。
[0649] 实施例57
[0650] 5’(R)-C-甲基胞苷(57)的制备
[0651]
[0652] 将在无水乙腈(2mL)中的N4-苯甲酰基胞嘧啶(215mg,1.0mmol)和N,O-二(三甲基甲硅烷基)乙腈(0.49mL,2.0mmol)回流30min并冷却。加入1-O-乙酰基-2,3-O-二苯甲酰基-5(R)-C-甲基-5-O-(4-硝基苯甲酰基)-D-呋喃核糖(289mg,0.5mmol)的乙腈(2mL)溶液,随后加入四氯化锡(0.24mL,2.0mmol)。将所得到的反应混合物回流过夜,冷却,用乙酸乙酯稀释,用10%碳酸氢钠洗涤并用硫酸钠干燥。采用10%-20%乙酸乙酯4
的DCM溶液的硅胶色谱得到2’,3’-O,N-三苯甲酰基-5’(R)-C-甲基-5’-O-(4-硝基苯甲酰基)胞苷,将其溶解在7.0M NH3/MeOH中并室温静置3h。将溶液浓缩并将剩余物溶解在29%氨水溶液中并室温静置3天。蒸发掉挥发物并将剩余物进行反相HPLC纯化以得到
122mg的5’(R)-C-甲基胞苷。
[0653] 实施例58
[0654] 5’(S)-C-甲基腺苷5’-[苯基(甲氧基-L-丙氨酰氧基)]磷酸酯(58)的制备[0655]
[0656] 在氩气下,向2’,3’-O-甲氧基亚甲基-N6-(4-甲氧基三苯甲基)-5’(S)-甲基腺苷(60mg,0.1mmol)的THF(1mL)溶液中加入1.0M t-BuMgBr的THF溶液(0.25mL,0.25mmol)。将所得到的溶液室温搅拌30min,并加入苯基(甲氧基-L-丙氨酰氧基)磷酸酯(85mg,
0.3mmol)。将反应混合物室温搅拌3天,用冰冷却,用水淬火,用乙酸乙酯稀释,用盐水洗涤三次。采用乙酸乙酯/己烷(1∶1至2∶1)的硅胶色谱得到为白色固体的4种异构体
的混合物。将产物溶解在80%甲酸(5mL)中并室温静置过夜。室温蒸发掉溶剂并用MeOH/甲苯共蒸发三次。通过采用10%-15%MeOH的DCM溶液的硅胶色谱,随后通过采用乙腈/水的反相HPLC进行再纯化得到为白色固体的9.5mg的5’(S)-C-甲基腺苷5’-[苯基
1
(甲氧基-L-丙氨酰氧基)]磷酸酯;H NMR(CD3OD)δ1.28(d,J=6.8Hz,3H),1.44(d,J=
6.4Hz,3H),3.65(s,3H),3.89-3.93(m,1H),4.01-4.04(m,1H),4.45-4.47(m,1H),4.70(t,J=6.0Hz,1H),4.58-5.98(d,J=6.8Hz,1H),7.12-7.33(m,6H),8.19(s,1H),8.31(s,1H);
31
P NMR(CD3OD)δ3.39。
[0657] 实施例59
[0658] 5’(R)-C-甲基腺苷5’-[苯基(甲氧基-L-丙氨酰氧基)]磷酸酯(59)的制备[0659]
[0660] 在氩气下,向2’,3’-O-甲氧基亚甲基-N6-(4-甲氧基三苯甲基)-5’(R)-甲基腺苷(60mg,0.1mmol)的THF(1mL)溶液中加入1.0M t-BuMgBrdTHF溶液(0.25mL,0.25mmol)。将所得溶液室温搅拌30min并加入苯基(甲氧基-L-丙氨酰氧基)氯磷酸酯(85mg,0.3mmol)。将反应混合物室温搅拌3天,用冰冷却,用水淬火,用乙酸乙酯稀释并用盐水洗涤三次。采用乙酸乙酯/己烷(1∶1至2∶1)的硅胶色谱得到为白色固体的4种异构体的混合物。
将产物溶解在80%甲酸(5mL)中并室温静置过夜。室温蒸发掉溶剂并用MeOH/甲苯共蒸发三次。通过采用10%-15%MeOH的DCM溶液的硅胶色谱,随后通过采用乙腈/水的反相HPLC再纯化得到为白色固体的12mg的5’(R)-C-甲基腺苷5’-[苯基(甲氧基-L-丙氨酰
1
氧基)]磷酸酯;H NMR(CD3OD)δ1.24(d,J=6.8Hz,3H),1.52(d,J=6.4Hz,3H),3.66(s,
3H),3.91-3.97(m,1H),4.05-4.08(m,1H),4.35(t,J=4.4Hz,1H),4.52(t,J=4.8Hz,1H),
31
4.82-4.85(m,1H),6.04(d,J= 5.6Hz,1H),7.10-7.31(m,6H),8.2(s,1H),8.29(s,1H);P NMR(CD3OD)δ3.72。
[0661] 实施例60
[0662] 2’,5’(S)-C-二甲基腺苷5’-[苯基(甲氧基-L-丙氨酰氧基)]磷酸酯(60)的制备
[0663]6
[0664] 步骤1.2’,3’-O-甲氧基亚甲基-N-(4’-甲氧基三苯甲基)-5’(S)-甲基腺苷的制备
[0665]
[0666] 将在1,4-二噁烷(7mL)中的2,5’(S)-C-二甲基腺苷(585mg,1.98mmol)、原甲酸三甲酯(5.6mL)和对甲苯磺酸一水合物(565mg,2.97mmol)的混合物在30℃搅拌24h,用冰冷却,通过加入三乙胺(1mL)淬火并浓缩。采用5%-7%MeOH的DCM溶液的硅胶色谱得到716mg的2’,3’-O-甲氧基亚甲基-2,5’(S)-C-二甲基腺苷。
[0667] 将2’,3’-O-甲氧基亚甲基-2,5’(S)-C-二甲基腺苷(575mg,1.71mmol)和4-甲氧基三苯甲基氯(714mg,2.32mmol)的吡啶(16mL)溶液室温搅拌3天。再另外加入4-甲氧基三苯甲基氯(72mg),并将混合物在40℃加热24h。再另外加入144mg的4-甲氧基三苯甲基。将混合物在50℃加热24h,用乙酸乙酯稀释,用盐水洗涤三次。蒸发掉溶剂并将剩余物通过采用25%-60%乙酸乙酯的己烷溶液的硅胶色谱得到为非晶固体的151mg的5’-O,6
N-二(4’-甲氧基三苯甲基)-2’,3’-O-甲氧基亚甲基-5’(S)-甲基腺苷和489mg的2’,
6
3’-O-甲氧基亚甲基-N-(4’-甲氧基三苯甲基)-5’(S)-甲基腺苷。
[0668] 步骤2.2’,5’(S)-C-二甲基腺苷5’-[苯基(甲氧基-L-丙氨酰氧基)]磷酸酯的制备
[0669]
[0670] 在氩气下,向2’,5’(S)-C-二甲基-2’,3’-O-甲氧基亚甲基-N6-(4-甲氧基三苯甲基)腺苷(60mmg,0.1mmol)的THF(1mL)溶液中加入1.0M t-BuMgBr的THF溶液(0.25mL,0.25mmol)。将所得到的溶液室温搅拌30min,并加入苯基(甲氧基-L-丙氨酰氧基)氯磷酸酯(85mg,0.3mmol)。将反应混合物室温搅拌3天,用冰冷却,用水淬火,用乙酸乙酯稀释,用盐水洗涤三次。通过采用乙酸乙酯/己烷(1∶1至2∶1)的硅胶色谱得到为白色固体的四种异构体的混合物。将产物溶解在80%甲酸(5mL)中并室温静置过夜。室温蒸发掉溶剂并用MeOH/甲苯共蒸发三次。通过采用10%-15%MeOH的DCM溶液的硅胶色谱,随后通过采用乙腈/水的反相HPLC进行再纯化得到为白色固体的6.8mg的2’,5’(S)-C-二甲基
1
腺苷5’-[苯基(甲氧基-L-丙氨酰氧基)]磷酸酯;H NMR(CD3OD)δ0.95(d,J-4.4Hz,3H),
1.21(dd,J-1.2,7.2Hz,1H),1.30(dd,J-0.8,7.2Hz,1H),1.55(dd,J = 1.6,6.8Hz,1H),
2.32(s,1H),3.58(s,1H),3.64(s,2H),3.82-3.99(m,1H),4.07-4.11(m,1H),4.27&4.36(每个 d,J = 8.8,8.4Hz,1H),4.99-5.05(m,1H),6.10&6.13(2×s,1H),7.1-7.39(m,7H),
31
8.18&8.19(2×s,1H),8.29&8.31(2×s,1H);P NMR(CD3OD)δ3.59,3.74。
[0671] 实施例61
[0672] 2’,5’(R)-C-二甲基腺苷5’-[苯基(甲氧基-L-丙氨酰氧基)]磷酸酯(61)的制备
[0673]6
[0674] 步骤1.2’,3’-O-甲氧基亚甲基-N-(4’-甲氧基三苯甲基)-5’(R)-甲基腺苷的制备
[0675]
[0676] 将在1,4-二噁烷(4.8mL)中的2,5’(R)-C-二甲基腺苷(395mg,1.34mmol)、原甲酸三甲酯(3.8mL)和对甲苯磺酸一水合物(382mg,2.01mmol)的混合物在30℃搅拌24h,用冰冷却,通过加入三乙胺(1mL)淬火并浓缩。通过采用5%-7%MeOH的DCM溶液的硅胶色谱得到360mg的2’,3’-O-甲氧基亚甲基-2,5’(R)-C-二甲基腺苷。
[0677] 将2’,3’-O-甲氧基亚甲基-2,5’(R)-C-二甲基腺苷(357mg,1.06mmol)和4-甲氧基三苯甲基氯(444mg,1.44mmol)的吡啶(10mL)溶液室温搅拌3天。再加入222mg的4-甲氧基三苯甲基氯。将混合物在50℃加热24h,用乙酸乙酯稀释,用盐水洗涤三次。蒸发掉溶剂,并将剩余物通过采用25%-60%乙酸乙酯的己烷溶液的硅胶色谱分析得到为非晶
6
固体的142mg的5’-O,N-二(4’-甲氧基三苯甲基)-2’,3’-O-甲氧基亚甲基-5’(R)-甲
6
基腺苷和301mg的2’,3’-O-甲氧基亚甲基-N-(4’-甲氧基三苯甲基)-5’(R)-甲基腺苷。
[0678] 步骤2.2’,5’(R)-C-二甲基腺苷5’-[苯基(甲氧基-L-丙氨酰氧基)]磷酸酯的制备
[0679]
[0680] 在氩气下,向2’,5’(R)-C-二甲基-2’,3’-O-甲氧基亚甲基-N6-(4-甲氧基三苯甲基)腺苷(61mg,0.1mmol)的THF(1mL)溶液中加入1.0M t-BuMgBr的THF溶液(0.25mL,0.25mmol)。将所得到的溶液室温搅拌30min并加入苯基(甲氧基-L-丙氨酰氧基)氯磷酸酯(85mg,0.3mmol)。将反应混合物室温搅拌3天,用冰冷却,用水淬火,用乙酸乙酯稀释,用盐水洗涤三次。通过用乙酸乙酯/己烷(1∶1至2∶1)的硅胶色谱得到为白色固体的4种异构体的混合物。将产物溶解在80%甲酸(5mL)中并室温搅拌过夜。室温蒸发掉溶剂并用MeOH/甲苯共蒸发三次。采用乙腈/水的反相HPLC得到为白色固体的
16.1mg的2’,5’(R)-C-二甲基腺苷5’-[苯基(甲氧基-L-丙氨酰氧基)]磷酸酯。异构体A:1H NMR(CD3OD)δ0.89(s,3H),1.27(dd,J=1.2,7.2Hz,3H),1.61(d,J=6.4,3H),
2.32(s,2H),3.96-4.02(m,2H),4.09(d,J = 9.2Hz,1H),4.96-5.00(m,1H),3.65(s,3H),
3.94-4.02(m,2H),4.09(d,J = 9.2Hz,1H),4.96(m,1H),7.09-7.32(m,7H),8.20(s,1H),
8.25(s,1H);31P NMR(CD3OD)δ3.73;异构体B:1H NMR(CD3OD)δ0.94&0.98(每个s,3H),
1.25(d,J = 10.4Hz,3H),1.50(d,J = 6.8,3H),2.32(s,1H),3.55(s,3H),3.92-4.01(m,
2H),4.26(d,J = 9.2Hz,1H),6.09(s,1H),7.08-7.36(m,7H),8.21(s,1H),8.2(s,1H);31P NMR(CD3OD)δ3.61,3.70。
[0681] 实施例62
[0682] 2’-O-(叔丁基二甲基甲硅烷基)-3’-脱氧-5’(R,S)-0-甲基-N4-(4-甲氧基三苯甲基)胞苷(62)的制备
[0683]
[0684] 步骤1.N4-乙酰基-2’-O-(叔丁基二甲基甲硅烷基)-5’-O-(4,4’-二甲氧基三苯甲基)胞苷的制备
[0685]
[0686] 将胞苷(100.0g,0.41mol)溶解在DMF(500ml)中,加入乙酸酐(42.5ml,45.9g,0.45mol)并将整体放置24h。蒸发掉溶剂,将剩余物与甲醇(40ml)一起煮沸并冷却。将晶
4
体过滤并干燥得到N-乙酰基胞苷(102g,87.0%)。
[0687] 向在冰浴中冷却的N4-乙酰基胞苷(65.0g,0.228mol)的无水吡啶(600mL)溶液中加入DMTrCl(84.7g,0.251mol)。将反应混合物室温搅拌过夜。向用冰浴冷却的反应混合物中加入THF(600ml)和AgNO3(58.1g,0.342mmol)。然后加入TBSCl(51.5g,0.342mmol),并将反应混合物室温搅拌过夜。将反应混合物过滤,真空除去溶剂以得到剩余物,将该剩余物用EtOAc(500mL)稀释并用水(200ml)和盐水(200ml)洗涤。将有机层分离,用无水Na2SO4干燥,并将滤液浓缩成浆汁。将该浆汁通过硅胶色谱(用PE∶EA=5∶1至3∶1洗脱)4
纯化得到为黄色固体的N-乙酰基-2’-O-(叔丁基二甲基甲硅烷基)-5’-O-(4,4’-二
1
甲氧基三苯甲基)胞苷(80g,50%)。H NMR(CDCl3)δ8.39(d,J=7.6Hz,1H),7.34(dd,J1=1.6Hz,J2=8.4Hz,2H),7.21-7.27(m,6H),7.02(d,J=7.2Hz,1H),6.80(dd,J1 =
2.0Hz,J2=6.8Hz,4H),5.82(d,J=1.2Hz,1H),4.26-4.32(m,1H),4.20(dd,J1=1.2Hz,J2=4.4Hz,1H),4.00-4.02(m,1H),3.74(d,J=1.6Hz,6H),3.43-3.53(m,2H),2.32(d,J=9.6Hz,1H),2.18(s,3H),0.86(s,9H),0.22(s,3H),0.11(s,3H)。
[0688] 步骤2.N4-乙酰基-2’-O-(叔丁基二甲基甲硅烷基)-3’-脱氧-5’-O-(4,4’-二甲氧基三苯甲基)胞苷的制备
[0689]4
[0690] 将N-乙酰基-2’-O-(叔丁基二甲基甲硅烷基)-5’-O-(4,4’-二甲氧基三苯甲基)胞苷(50.0g,71.3mmol)和DMAP(26.1g,213.9mmol)溶解在ACN(2000ml)中,并在氮气下,室温逐滴加入PTCCl(18.5g,106.9mmol),然后将室温搅拌过夜。之后,真空除去溶剂以得到剩余物,将该剩余物用稀释EtOAc(500mL)并用水(200ml)和盐水(200ml)洗涤。将有机层分离并用无水Na2SO4干燥。将滤液浓缩成浆汁,将该浆汁通过硅胶色谱(用PE∶EA4
=5∶1至3∶1稀释)纯化得到为黄色固体的N-乙酰基-2’-O-(叔丁基二甲基甲硅烷基)-5’-O-(4,4’-二甲氧基三苯甲基)-3’-O-(苯氧基硫羰基)胞苷(27.0g,45.2%)。
4
[0691] 在氮气下,室温向N-乙酰基-2’-O-(叔丁基二甲基甲硅烷基)-5’-O-(4,4’-二甲氧基三苯甲基)-3’-O-(苯氧基硫羰基)胞苷(24.0g,28.7mmol)和AIBN(5.1g,31.6mmol)的无水甲苯(1000ml)溶液中逐滴加入(Bu)3SnH(16.7g,57.3mmol),然后将反应混合物在120℃回流10h。真空除去溶剂以得到剩余物,将剩余物用EtOAc(500mL)稀释并用水(200ml)和盐水(200ml)洗涤。将有机层分离并用无水Na2SO4干燥,并将滤液浓缩成浆汁,将该浆汁通过硅胶色谱(用PE∶EA=8∶1至5∶1洗脱)进行纯化得到为黄色固体的4
N-乙酰基-2’-O-(叔丁基二甲基甲硅烷基)-3’-脱氧-5’-O-(4,4’-二甲氧基三苯甲基)胞苷(16.0g,81.6%)。
[0692] 步骤3.2’-O-(叔丁基二甲基甲硅烷基)-3’-脱氧-5’-O-(4,4’-二甲氧基三苯4
甲基)-N-(4-甲氧基三苯甲基)胞苷的制备
[0693]
[0694] 将N4-乙酰基-2’-O-(叔丁基二甲基甲硅烷基)-3’-脱氧-5’-O-(4,4’-二甲氧基三苯甲基)胞苷(11.0g,16.0mmol)的NH3/MeOH(300ml)溶液室温搅拌过夜。真空除去溶剂以得到剩余物,将该剩余物通过硅胶色谱(用PE∶E=1∶1至1∶3洗脱)进行纯化得到为黄色固体的2’-O-(叔丁基二甲基甲硅烷基)-3’-脱氧-5’-O-(4,4’-二甲氧基三苯甲基)胞苷(6.0g,58.2%)。1HNMR(400MHz)(CDCl3)δ8.09(d,J=7.2Hz,1H),7.35(d,J=8.8Hz,2H),7.21-7.26(m,7H),6.77(dd,J1=1.2Hz,J2=8.8Hz,4H),5.70(s,1H),5.18(d,J = 7.2Hz,1H),4.50-4.51(m,1H),4.33(d,J = 3.6Hz,1H),3.72(s,6H),3.55(dd,J1 =
2.0Hz,J2=11.2Hz,1H),3.26(dd,J1=3.6Hz,J2=10.8Hz,1H),1.97(s,1H),1.94(s,
1H),1.63(dd,J1=4.4Hz,J2=12.4Hz,1H),0.81(s,9H),0.14(s,3H),0.04(s,3H)。
[0695] 在氮气下,室温向2’-O-(叔丁基二甲基甲硅烷基)-3’-脱氧-5’-O-(4,4’-二甲氧基三苯甲基)胞苷(6.0g,9.3mmol)、AgNO3(4.7g,28.0mmol)和MMTrCl(8.6g,28.0mmol)的无水DCM(150ml)溶液中逐滴加入三甲基吡啶(16.9g,139.5mmol)。然后将反应混合物在50℃回流12h。将反应混合物过滤,真空除去溶剂以得到剩余物,将该剩余物通过硅胶色谱(用PE∶EA=5∶1至3∶1洗脱)进行纯化得到为黄色固体的2’-O-(叔丁基二甲基
甲硅烷基)-3’-脱氧-5’-O-(4,4’-二甲氧基三苯甲基)-N4-(4-甲氧基三苯甲基)胞苷(8.0g,93.7%)。1HNMR(400MHz)(CDCl3):δ7.84(dd,J=2.8Hz,7.6Hz,1H),6.62-7.20(m,
27H),5.20(d,J=4.8Hz,1H),4.57(dd,J1=7.6Hz,J2=12.0Hz,1H),4.40(d,J=8.8Hz,
1H),4.28(d,J=2.8Hz,1H),3.64-3.68(m,9H),3.41-3.45(m,1H),3.23(ddd,J=3.2Hz,
11.2Hz,1H),1.88-1.91(m,1H),1.55-1.61(m,1H),1.19(s,9H),0.14(s,3H),0.05(s,3H)。
[0696] 步骤4.2’-O-(叔丁基二甲基甲硅烷基)-3’-脱氧-5’C,5’-O-二脱氢-N4-(4-甲氧基三苯甲基)胞苷的制备
[0697]
[0698] 将2’-O-(叔丁基二甲基甲硅烷基)-3’-脱氧-5’-O-(4,4’-二甲氧基三苯甲基)-N4-(4-甲氧基三苯甲基)胞苷(6.0g,6.6mmol)的80%AcOH(200mL)溶液室温搅拌7h。将反应混合物用NaHCO3中和至pH=7,然后用EtOAc(100mL)稀释,用水(100ml)和盐水(100ml)洗涤。将有机层分离,并用无水Na2SO4干燥,并将滤液浓缩成浆汁,将该浆汁通过硅胶色谱(用PE∶EA=3∶1至2∶1洗脱)进行纯化得到2’-O-(叔丁基二甲基甲
硅烷基)-3’-脱氧-N4-(4-甲氧基三苯甲基)胞苷(2.9g,72.5%);1HNMR(400MHz)(CDCl3)δ7.29(d,J=7.6Hz,1H),7.15-7.25(m,10H),7.12(d,J=24Hz,2H),6.75(d,J=8.8Hz,
2H),5.28(d,J = 2.4Hz,1H),4.99(d,J-7.6Hz,1H),4.59-4.62(m,1H),4.36-4.40(m,
1H),3.88(dd,J = 2.0Hz,12.0Hz,1H),3.73(s,3H),3.54(dd,J1 = 3.2Hz,12.0Hz,1H),
2.00-2.03(m,1H),1.70-1.76(m,1H),0.78(s,9H),0.02(s,3H),0.01(s,3H)。
[0699] 在氮气下,在冰浴中,向2’-O-(叔丁基二甲基甲硅烷基)-3’-脱氧-N4-(4-甲氧基三苯甲基)胞苷(2.9g,4.7mmol)、吡啶(19g,238mmol)和无水DCM(20ml)的混合物中逐滴加入戴斯-马丁氧化剂(3.0g,7.2mmol)的无水DCM(20ml)溶液,然后将反应混合物室温搅拌过夜。将反应混合物过滤,并将滤液用饱和Na2S2O3溶液(20ml)洗涤。将有机层用盐水洗涤(20ml),用无水Na2SO4干燥,并将滤液浓缩成浆汁,将该浆汁通过硅胶色谱(先用PE∶EA=3∶1随后用PE∶EA=1∶1洗脱)进行纯化得到为黄色固体的2’-O-(叔丁基二甲基4
甲硅烷基)-3’-脱氧-5’C,5’-O-二脱氢-N-(4-甲氧基三苯甲基)胞苷(1.5g,51.9%);
1
HNMR(400MHz)(CDCl3)δ9.68(s,1H),7.35(d,J=7.6Hz,1H),7.06-7.23(m,11H),6.75(d,J= 8.8Hz,4H),5.57(s,1H),4.99(d,J= 7.6Hz,1H),4.81(dd,J= 6.4Hz,10.4Hz,1H),
4.53(d,J=2.0Hz,1H),3.73(s,3H),2.05(dd,J=2.0Hz,5.2Hz,1H),1.71-1.78(m,1H),
0.82(s,9H),0.11(s,3H),0.05(s,3H)。
[0700] 步骤5.2’-O-(叔丁基二甲基甲硅烷基)-3’-脱氧-5’-C-甲基-N4-(4-甲氧基三苯甲基)胞苷的制备
[0701]
[0702] 在氮气下,在-20℃向2’-O-(叔丁基二甲基甲硅烷基)-3’-脱氧-5’C,5’-O-二4
脱氢-N-(4-甲氧基三苯甲基)胞苷(0.85g,4.66mmol)的无水THF(10ml)溶液中逐滴加入MeMgBr(2.8ml,8.50mmol)。然后升温至室温并搅拌过夜。将反应混合物用饱和NH4Cl溶液缓慢淬火,然后用EA(20mL×3)萃取。将组合有机相用无水Na2SO4干燥并将滤液浓缩成浆汁,将该浆汁通过硅胶色谱(先用PE∶EA=5∶1随后用PE∶EA=3∶1洗脱)进行纯
4
化得到为黄色固体的2’-O-(叔丁基二甲基甲硅烷基)-3’-脱氧-5’-C-甲基-N-(4-甲氧基三苯甲基)胞苷(0.31g,35.6%),将该产物进行SFC分离以得到2’-O-(叔丁基二甲
4
基甲硅烷基)-3’-脱氧-5’(S)-C-甲基-N-(4-甲氧基三苯甲基)胞苷和2’-O-(叔丁基
4
二甲基甲硅烷基)-3’-脱氧-5’(R)-C-甲基-N-(4-甲氧基三苯甲基)胞苷。将在SFC中
1
具有更短保留时间的异构体定为5’(S)-异构体;H NMR(400MHz)(CDCl3)δ7.18-7.28(m,
10H),7.11(d,J1=8.8Hz,2H),6.80,(d,J=8.8Hz,3H),5.15(d,J=3.6Hz,1H),4.99(d,J = 7.6Hz,1H),4.75-4.79(m,1H),4.17-4.20(m,1H),4.05-4.07(m,1H),3.88(br,1H),
3.78(s,3H),2.18-2.25(m,1H),1.72-1.78(m,1H),1.09(d,J = 6.4Hz,1H),0.82(s,9H),
0.02(s,3H),0.00(s,3H)。将在SFC中具有更长保留时间的异构体定为5’(R)-异构体;
1
H NMR(400MHz)(CDCl3)δ7.15-7.26(m,10H),7.07(d,J=8.8Hz,2H),6.25(d,J=8.8Hz,
3H),5.31(d,J=2.4Hz,1H),4.93(d,J=6.8Hz,1H),4.57-4.59(m,1H),4.11-4.16(m,1H),
3.72(s,3H),3.63-3.66(m,1H),1.78-1.85(m,1H),1.70-1.75(m,1H),1.15(d,J = 6.4Hz,
3H),0.79(s,9H),0.02(s,3H),0.00(s,3H)。
[0703] 实施例63
[0704] 3’-脱氧-5’(R)-C-甲基胞苷5’-[苯基(甲氧基-L-丙氨酰氧基)]磷酸酯(63)的制备
[0705]
[0706] 在氩气下,向2’-(叔丁基二甲基甲硅烷基)-3’-脱氧-5’(R)-甲基-N4-(4-甲氧基三苯甲基)胞苷(63mmg,0.1mmol)的THF(1mL)溶液中加入1.0Mt-BuMgBr的THF溶液(0.25mL)。将所得到的溶液室温搅拌30min并加入苯基(甲氧基-L-丙氨酰氧基)氯磷酸酯(0.34g,1.2mmol)。将反应混合物室温搅拌过夜,用冰冷却,用水淬冷,用乙酸乙酯稀释并用盐水洗涤三次。采用乙酸乙酯/己烷(1∶1至2∶1)的硅胶色谱得到为白色固体的四种异构体的混合物。将产物溶解在80%甲酸(5mL)中并室温静置过夜。室温蒸发掉溶剂并用MeOH/甲苯共蒸发三次。通过采用1%甲酸的乙腈/水溶液的反相HPLC纯化,随后通过采用10%-15%MeOH的DCM溶液的硅胶色谱得到为白色固体的13mg的3’-脱氧-5’(R)-C-甲
1
基胞苷5’-[苯基(甲氧基-L-丙氨酰氧基)磷酸酯;H NMR(DMSOd6)δ1.17-1.39(m,
7H),1.72-1.94(m,3H),2.29(s,1H),3.54,3.59( 每 个 s,3H),3.82-3.91(m,1H),4.12(br s,1H),4.22-4.32(m,2H),4.54-4.59(m,1H),5.57-5.76(m,s,1H4H),5.97-6.04(m,1H),
31
7.14-7.46(m,10H),7.72(d,J=7.6Hz,1H),8.13(s,1H),12.84(br s,1H);P NMR(DMSOd6)δ3.9,4.08。
[0707] 实施例64
[0708] 3’-脱氧-5’(S)-C-甲基胞苷5’-[苯基(甲氧基-L-丙氨酰氧基)]磷酸酯(64)的制备
[0709]
[0710] 在氩气下,向2’-(叔丁基二甲基甲硅烷基)-3’-脱氧-5’(S)-甲基-N4-(4-甲氧基三苯甲基)胞苷(94mmg,0.1mmol)的THF(1mL)溶液中加入1.0M t-BuMgBr的THF溶液(0.38mL)。将所得到的溶液室温搅拌30min,并加入苯基(甲氧基-L-丙氨酰氧基)氯磷酸酯(0.51g,1.8mmol)。将反应混合物室温搅拌过夜,用冰冷却,用水淬火,用乙酸乙酯稀释,用盐水洗涤三次。采用乙酸乙酯/己烷(1∶1至2∶1)的硅胶色谱得到为白色固体的四种异构体的混合物。将产物溶解在80%甲酸(5mL)中并室温静置过夜。室温蒸发掉溶剂并用MeOH/甲苯共蒸发三次。通过采用1%甲酸的乙腈/水溶液的反相HPLC纯化,随后通过采用10%-15%MeOH的DCM溶液的硅胶色谱得到为白色固体的12mg的3’-脱氧-5’(S)-C-甲
1
基胞苷5’-[苯基(甲氧基-L-丙氨酰氧基)]磷酸酯;H NMR(DMSOd6)δ1.20(d,J=6.0Hz,
3H),1.29(d,J = 7.2Hz,3H),1.77-1.93(m,2H),2.29(s,2H),3.05(s,3H),3.79-3.86(m,
1H),4.12-4.15(m,2H),4.64-4.67(m,1H),5.55(br s,1H),5.62-5.76(m,3H),6.06(dd,J=
31
10.4Hz,1H),7.12-7.39(m,12H),7.66(d,J=7.2Hz,1H);P NMR(DMSOd6)δ3.32,3.65。
[0711] 实施例65
[0712] 5’(S)-C-甲基阿糖胞苷5’-[苯基(甲氧基-L-丙氨酰氧基)]磷酸酯(65)的制备
[0713]
[0714] 在氩气下,向5’(S)-甲基-2’,3’-O,N4-三(4-甲氧基三苯甲基)阿糖胞苷(212mg,0.2mmol)的THF(2mL)溶液中加入1.0M t-BuMgBr的THF溶液(0.45mL)。将所得到的溶液室温搅拌15min并加入苯基(甲氧基-L-丙氨酰氧基)氯磷酸酯(0.17g,0.6mmol)。将反应混合物室温搅拌4天,用冰冷却,用水淬火,用乙酸乙酯稀释,用盐水洗涤三次。通过采用乙酸乙酯/己烷(1∶1至3∶1)的硅胶色谱得到为白色固体的四种异构体的混合物(132mg)。将产物溶解在80%甲酸(5mL)中并在40℃-50℃静置4h。室温蒸发掉并用MeOH/甲苯共蒸发三次。通过采用乙腈/水的反相HPLC纯化,随后通过采用15%-30%MeOH的DCM溶液的硅胶色谱得到为白色固体的31mg的5’(S)-C-甲基阿糖胞苷5’-[苯基(甲氧基-L-丙氨酰氧基)]磷酸酯。异构体A:1H NMR(CD3OD)δ1.29-1.33(m,5H),1.51(d,J=6.4Hz,3H),3.22(m,1H),3.66(s,3H),3.8-3.82(m,1H),3.98-4.06(m,2H),4.16-4.18(m,
1H),5.66(d,J = 7.6Hz,1H),6.18(d,J = 3.6Hz,1H),7.14-7.34(m,6H),7.93(d,J =
7.2Hz,1H),8.32(br s,1H);31P NMR(CD3OD)δ3.3;异构体B:1H NMR(CD3OD)δ1.32-1.33(m,
6H),3.63(s,3H),3.73-3.79(m,1H),3.97-4.03(m,2H),4.16-4.17(m,1H),4.77-4.83(m,
1H),5.85(d,J = 7.6Hz,1H),6.21(d,J = 3.6Hz,1H),7.14-7.39(m,6H),7.99(d,J =
7.2Hz,1H),8.24(br s,1H);31P NMR(CD3OD)δ4.07。
[0715] 实施例66
[0716] 5’(S)-C-甲基腺苷-5’-基二(S-特戊酰基-2-硫乙基)磷酸酯(66)的制备[0717]
[0718] 在氩气下,向2’,3’-O-甲氧基亚甲基-5’(S)-甲基-N6-(4-甲氧基三苯甲基)腺苷(120mg,0.2mmol)的乙腈(0.4mL)溶液中加入二(S-特戊酰基-2-硫乙基)N,N-二异丙基亚磷酰胺(136mg,0.3mmol),0.25mmol),随后加入0.45M四唑的乙腈溶液(1.5mL,0.66mmol)。将所得到的溶液室温搅拌1.5h,冷却至-40℃并加入mCPBA(69mg,0.4mmol)的DCM(0.75mL)溶液。将混合物升温至室温并搅拌10min,用乙酸乙酯稀释,用10%Na2S2O3洗涤两次并用盐水洗涤。通过采用15%-25%乙酸乙酯的DCM溶液的硅胶色谱得到140mg的纯化产物,将该产物溶解在80%AcOH(8mL)中并将溶液在50℃加热24h。蒸发掉溶剂并将剩余物通过采用7%-10%MeOH的DCM溶液的硅胶色谱得到为白色固体的5’(S)-C-甲基腺苷-5’-基二(S-特戊酰基-2-硫乙基)磷酸酯(61mg);1H NMR(CDCl3)δ1.21(s,
18H),1.45(d,J = 6.4Hz,3H),3.02-3.11(m,4H),3.94-4.07(m,4H),4.16-4.18(m,1H),
4.58-4.75(m,3H),5.91(br s,2H),5.94(d,J=6.0Hz,1H),6.05-6.15(br s,1H),8.07(s,
1H),8.26(s,1H)。
[0719] 实施例67
[0720] 5’(R)-C-甲基腺苷-5’-基二(S-特戊酰基-2-硫乙基)磷酸酯(67)的制备[0721]
[0722] 在氩气下,向2’,3’-O-甲氧基亚甲基-5’(R)-甲基-N6-(4-甲氧基三苯甲基)腺苷(238mg,0.4mmol)的乙腈(0.8mL)溶液中加入二(S-特戊酰基-2-硫乙基)N,N-二异丙基亚磷酰胺(272mg,0.6mmol),随后加入0.45M四唑的乙腈溶液(3.0mL,1.32mmol)。将所得到溶液室温搅拌3h,冷却至-40℃并加入mCPBA(172mg,1.0mmol)的DCM(2mL)溶液。将混合物升温至室温并搅拌10min,用乙酸乙酯稀释,用10%Na2S2O3洗涤两次并用盐水洗涤。通过采用25%-35%乙酸乙酯的DCM溶液的硅胶色谱得到326mg的纯化的产物,将207mg的产物溶解在80%AcOH(12mL)中并将溶液在50℃加热24h。蒸发掉溶剂并将剩余物通过采用5%-7%MeOH的DCM溶液的硅胶色谱得到为白色固体的5’(R)-C-甲基腺苷-5’-基
1
二(S-特戊酰基-2-硫乙基)磷酸酯(105mg);H NMR(CDCl3)δ1.17(s,9H),1.23(s,9H),
1.51(d,J = 6.4Hz,3H),3.04-3.13(m,4H),4.02-4.10(m,4H),4.21-4.22(m,1H),4.46(t,J=3.6Hz,1H),4.62(t,J=5.2Hz,1H),4.74-4.78(m,1H),6.00(br s,2H),6.06(d,J=
4.8Hz,1H),8.17(s,1H),8.26(s,1H)。
[0723] 实施例68
[0724] 2’,5’(S)-C-二甲基腺苷-5’-基二(S-特戊酰基-2-硫乙基)磷酸酯的制备(68)
[0725]
[0726] 在氩气下,向2’,3’-O-甲氧基亚甲基-2’,5’(S)-二甲基-N6-(4-甲氧基三苯甲基)腺苷(122mg,0.2mmol)的乙腈(0.4mL)溶液中加入二(S-特戊酰基-2-硫乙基)N,N-二异丙基亚磷酰胺(136mg,0.3mmol),随后加入0.45M四唑的乙腈溶液(1.5mL,0.66mmol)。将所得到的溶液室温搅拌3h,冷却至-40℃并加入mCPBA(86mg,0.5mmol)的DCM(1mL)溶液。将混合物升温至室温并搅拌10min,用乙酸乙酯稀释,用10%Na2S2O3洗涤两次并用盐水洗涤。通过采用25%-35%乙酸乙酯的DCM溶液的硅胶色谱得到纯化的产物,将该产物溶解在80%AcOH(10mL)中并将溶液在50℃加热24h。蒸发掉溶剂并将剩余物采用4%-7%MeOH的DCM溶液的硅胶色谱得到为白色固体的2’,5’(S)-C-二甲基腺苷-5’-基二(S-特
1
戊酰基-2-硫乙基)磷酸酯(68mg);H NMR(CDCl3)δ1.02(s,3H),1.22,1.24(2×s,每个
9H),1.49(d,J = 6.8Hz,3H),3.14-3.20(m,4H),4.01(t,J = 5.6Hz,1H),4.12-4.20(m,
5H),4.43-4.46(m,1H),4.73(br s,1H),4.83-4.88(m,1H),5.64(br s,2H),5.97(s,1H),
7.95(s,1H),8.33(s,1H)。
[0727] 实施例69
[0728] 2’,5’(R)-C-二甲基腺苷-5’-基二(S-特戊酰基-2-硫乙基)磷酸酯的制备(69)
[0729]
[0730] 在氩气下,向2’,3’-O-甲氧基亚甲基-2’,5’(R)-二甲基-N6-(4-甲氧基三苯甲基)腺苷(183mg,0.3mmol)的乙腈(0.6mL)溶液中加入二(S-特戊酰基-2-硫乙基)N,N-二异丙基亚磷酰胺(204mg,0.45mmol),随后加入0.45M四唑的乙腈溶液(2.2mL,0.99mmol)。将所得到溶液室温搅拌3h,冷却至-40℃并加入mCPBA(129mg,0.75mmol)的DCM(1.5mL)溶液。将混合物升温至室温并搅拌10min,用乙酸乙酯稀释,用10%Na2S2O3洗涤两次并用盐水洗涤。通过采用25%-35%乙酸乙酯的DCM溶液的硅胶色谱得到纯化的产物,将该产物溶解在80%AcOH(10mL)中,并将溶液在50℃加热24h。蒸发掉溶剂并将剩余物通过采用4%-7%MeOH的DCM溶液的硅胶色谱得到为白色固体的2’,5’(R)-C-二甲基腺苷-5’-基二(S-特戊酰基-2-硫乙基)磷酸酯(85mg);1H NMR(CDCl3)δ1.01(s,3H),1.20,
1.24(2×s,每个9H),1.56(d,=6.8Hz,3H),3.14-3.19(m,4H),4.01-4.19(m,7H),4.36(s,
1H),4.79-4.83(m,1H),5.7(br s,2H),6.15(s,1H),8.13(s,1H),8.35(s,1H)。
[0731] 实施例70
[0732] 5’-烷基化的核苷5’-三磷酸酯合成的常规步骤
[0733] 在离心管中,将1,2,3-三唑(41mg,0.6mmol)溶解在1ml的无水CH3CN和88μl的无水三乙胺的混合物中。将溶液冷却至0℃并加入POCl3(19μl,0.2mmol)。将混合物涡流旋转并在5℃放置20min。将白色沉淀离心并将上清液加入至在10ml烧瓶中的0.1mmol的无水核苷中。将反应混合物在+5℃保持2小时,然后加入三(四丁基铵)焦磷酸酯(360mg,0.4mmol)。将反应室温保持2小时以上,并蒸发掉溶剂。将剩余物溶解在80%HCOOH中并在环境温度放置2小时。将甲酸蒸发,将剩余物分散在6ml的水和3ml的DCM中。将有机部分分离并将水性部分用DCM(2×3ml)萃取。将含有靶标NTP的水性部分加载在离子交换柱HiLoad 16/10 Q Sepharose High Performance上。将靶标NTP用在50mmol TRIS-缓冲液(pH 8)中的0至1M NaCl梯度洗脱。收集相应的部分并通过在Synergi 4u Hydro-RP
80A 100×21上的TEAB-缓冲液(pH 8.5)中的0%至40%甲醇的线性梯度的RP色谱进行脱盐。将含有靶标NTP的部分从水中冻干(3×5ml)。
[0734] 使用常规步骤合成以下核苷5’-三磷酸酯。
[0735] 2’,5’(S)-C-二甲基腺苷5’-三磷酸酯
[0736]
[0737] MS:534.1(M-1).H1 NMR(D2O):0.83(s,3H, 甲 基 );1.13(t,34H,Et3N- 盐 );1.36-1.37(d,3H, 甲 基 );3.02-3.08(dd,22H,Et3N- 盐 );3.96-3.99(m,1H,4’-H),
4.20-4.22(d,1H,5’-H);4.60-4.63(m,1H,H-3’);6.10(s,1H,H-1’);8.10和8.31(s,1H,腺嘌呤).31P NMR(D2O):-8.75(d,1P);-11.45(d,IP),-22.48(t,1P)。
[0738] 2’,5’(R)-C-二甲基腺苷5’-三磷酸酯
[0739]1
[0740] MS:534.4(M-1).H NMR(D2O):0.85(s,3H, 甲 基 );1.15(t,29H,Et3N- 盐 );1.39-1.40(s,3H, 甲 基 );3.04-3.10(dd,18H,Et3N- 盐 );3.92-3.94(m,1H,4’-H),
31
4.29-4.27(d,1H,5’-H,J=9.2Hz);6.04(s,1H,H-1’);8.12和8.46(s,1H,腺嘌呤). P NMR(D2O):-8.58(bs,1P);-11.09(d,1P),-22.15(t,1P)。
[0741] 2’-脱氧-2’2’-二氟-5’(S)-乙炔基胞啶5’-三磷酸酯
[0742]
[0743] MS:526.2(M-1).H1 NMR(D2O):1.15(t,16H,Et3N- 盐 );2.89-3.05(dd,10H,Et3N- 盐 );4.10-4.12(d,1H,4’-H),4.68-4.90(m,1H,5’-H,J = 9.2Hz);5.14-5.16(d,31
1H,H-3’);6.03-6.05(d,1H,H-5);6.16-6.20(t,1H,H-1’);7.74-7.76(d,1H,H-6) P NMR(D2O):-9.58(bs,1P);-11.65(d,1P),-21.92(bs,1P)。
[0744] 2’-脱氧-2’2’-二氟-5’(S)-乙基胞啶5’-三磷酸酯
[0745]
[0746] MS:529.9(M-I).H1 NMR(D2O):0.84-0.88(t,3H,CH2CH3);1.14(t,16H,Et3N-盐);1.71-1.84(m,2H,CH2CH3);3.03-3.09(dd,12H,Et3N- 盐 );3.97-4.00(d,1H,4’-H),
4.30-4.36(m,1H,5’-H);4.45-4.50(m,1H,H-3’);6.05-6.07(d,1H,H-5);6.10-6.14(m,
31
1H,H-1’);7.81-7.83(d,1H,H-6). PNMR(D2O):-10.15(d,1P);-11.20(d,1P),-22.45(t,
1P)。
[0747] 5’(S)-甲基阿糖胞苷5’-三磷酸酯
[0748]
[0749] MS:496.0(M-I).H1 NMR(D2O):1.14(t,15H,Et3N- 盐 );1.33(d,1H, 甲 基 ),3.04-3.10(dd,12H,Et3N- 盐 );3.67-3.70(m,1H,4’-H),4.12-4.16(m,1H,5’-H);
4.29-4.32(m,1H,H-3’);4.50-4.60(m,1H,H-2’);6.03-6.05(d,1H,H-5);6.10-6.11(d,
31
1H,H-1’);7.90-7.92(d,1H,H-6). P NMR(D2O):-10.15(d,1P);-11.30(d,1P),-22.54(t,
1P)。
[0750] 5’(S)-甲基腺苷5’-三磷酸酯
[0751]
[0752] MS:520.1(M-1).H1 NMR(D2O):1.23-1.24(s,3H,甲基);1.11(t,3OH,Et3N-盐);3.01-3.07(dd,18H,Et3N-盐);4.06(bs,1H,4’-H),4.45-4.53(m,2H);6.00(d,1H,H-1’);
31
8.09和8.45(s,1H,腺嘌呤). P NMR(D2O):-9.75(d,1P);-11.41(d,1P),-22.54(t,1P)。
[0753] 2’-脱氧-2’2’-二氟-5’(S)-甲基胞苷5’-三磷酸酯
[0754]
[0755] MS:516.0(M-1).H1 NMR(D2O):1.15(t,25H,Et3N- 盐 );1.36-1.37(d,3H,CH3);3.04-3.10(dd,16H,Et3N- 盐 );3.83-3.85(d,1H,4’-H),4.35-4.58(m,2H),6.02-6.04(d,
31
1H,H-5);6.11-6.14(m,1H,H-1’);7.81-7.83(d,1H,H-6). P NMR(D2O):-9.50(bs,
1P);-11.30(d,1P),-22.33(t,1P)。
[0756] 其它示例性的化合物
[0757] 通过与前述实施例相似的规程和方法制备的化合物包括,例如,如表1所示的化合物。表1所示的化合物仅是示例性的并不旨在或者不能够将它们解释成以任何方式对权利要求的范围进行限制。
[0758] 表1:示例性的化合物
[0759]
[0760]
[0761]
[0762]
[0763]
[0764]
[0765]
[0766]
[0767]
[0768]
[0769]
[0770]
[0771]
[0772]
[0773]
[0774] 实施例71
[0775] HCV复制子测定
[0776] 在稳定的HCV复制RNA细胞系,AVA5(基因型1b,亚基因复制子,Blight,et al.,Sci.2000 290:1972)中测定测试化合物的抗病毒活性(Okuse,et al.,Antivir.Res.200565:23)。三天中每天将化合物加入至正在分裂的培养物中。通常培养物以30%-50%融合开始测定并在处理的最后一天达到融合。处理后72小时测定细胞内HCV RNA水平和细胞毒性。
[0777] 使用HCV RNA水平和细胞毒性的四个平行培养物样品(在96-孔板上)。使用总共12个未处理的对照培养物和用α-干扰素(浓度:10IU/mL,3.3IU/mL,1.1IU/mL和0.37IU/mL)和2′C-Me-C(浓度:30μM,10μM,3.3μM和1.1μM)处理的每个浓度三个平行培养物样品作为测定对照。
[0778] 采用常规的印迹杂交方法测定细胞内HCV RNA水平,其中在每个独立的培养物中将HCV RNA水平标准化至β-肌动蛋白RNA的水平(Okuse,et al.,Antivir.Res.2005 65:23)。采用确定的中性红染料摄取法来测定细胞毒性(Korba和Gerin,Antivir.Res.1992
19:55;Okuse,et al.,Antivir.Res.2005 65:23)。以在未处理的培养物中测定的RNA平均水平的百分数来表达在处理的培养物中的HCV RNA水平。将在510nM(A510)的内在染料吸收用作定量分析。
[0779] 将化合物以10mM溶解在100%组织培养级DMSO(Sigma,Inc.)中。在独立的试管中制备足以用于一次每天处理的测试化合物小份并将所有材料在-20℃贮存。对于该测试,将化合物室温悬浮在培养基中,并迅速将其加入至细胞培养物中。在具有分离测定对照的两组中分别分析化合物。以10μM、3.3μM、1.1μM和0.37μM的浓度操作测试化合物的浓度。使用浓度响应曲线来确定CC50、EC50和EC90。
[0780] 结果显示化合物8a和9具有活性并具有1.0至10的EC50(μM)。其它示例性化合物的抗病毒活性显示在表2中,其中‘A’表示EC50小于5μM,‘B’表示EC50小于30μM,以及‘C’表示EC50小于200μM。
[0781] 表2:示例性的化合物的活性(C<200μM,B<30μM,A<5μM)
[0782]
[0783]
[0784]
[0785]
[0786]
[0787] 实施例72
[0788] 稳定性研究
[0789] 细胞提取物的制备。将10×106的人前列腺癌细胞(PC3)在0℃用10mL的RIPA-缓冲液[15mM Tris-HCl pH 7.5、120mM NaCl、25mM KCl、2mM EDTA、2mM EGTA、0.1%脱氧胆酸、0.5%Triton X-100、0.5%PMSF,并补充了完全蛋白酶抑制剂混合物(Roche Diagnostics GmBH,德国)]处理10min。大多数的细胞被低渗处理破坏并将剩余的细胞机械破坏。将所获得细胞提取物离心(900rpm,10min),并将沉淀物丢弃。将提取物在-20℃贮存。
[0790] 细胞提取物中的核苷酸和核苷酸类似物的稳定性。如上所述制备细胞提取物-1 -1(1mL),将其用9倍体积的HEPES缓冲液(0.02mol L ,pH 7.5,I=0.1mol L ,利用NaCl)稀释。将核苷类似物或核苷酸类似物(0.1mg)加入至3mL的该HEPES缓冲液细胞提取物中并将混合物保持在22±1℃下。以合适的间隔取出150μL小份,用SPARTAN 13A(0.2μm)稀释并在冰浴中冷却。将该小份立即用HPLC-ESI质谱(Hypersil RP 18,4.6×20cm,5μm)分析。对于开始的10min,使用含有4%MeCN的0.1%甲酸水溶液洗脱,然后在40min内通过线性梯度将MeCN含量增加至50%。
[0791] 核苷和核苷酸类似物对猪肝酯酶的稳定性。将核苷类似物或核苷酸类似物(1mg)-1以及3mg(48单位)的Sigma猪肝酯酶(66H7075)溶解在3mL的HEPES缓冲液(0.02mol L ,-1
pH 7.5,I=0.1mol L ,利用NaCl)中。按照用于细胞提取物的以上描述进行稳定性测试。
[0792] 人血清中的稳定性测试。按照用于全细胞提取物的描述进行人血清中的稳定性测-1 -1试。在用HEPES缓冲液(0.02mol L ,pH 7.5,I=0.1mol L ,利用NaCl)1∶1稀释的血清中进行测定。
[0793] 应理解的是,本领域的技术人员能够进行多种不同的修改而不背离本公开的精神。因此应清楚理解的是本发明公开的形式仅是示例性的并不旨在限制本公开的范围。
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