1.分离的、合成的或重组的核酸序列，其中所述核酸序列是
SEQ ID NO:1的核酸序列，其具有在编码氨基酸残基4的密码子处由ACC变为CGC的核苷酸残基改变。
2.扩增编码具有木聚糖酶、甘露聚糖酶和/或葡聚糖酶活性的多肽的权利要求1所述的核酸序列的方法，包括用扩增引物序列对扩增模板核酸，所述扩增引物序列对能够扩增权利要求1所述的序列。
3.表达盒、或载体，其包括这样的核酸序列，所述核酸序列由权利要求1所述的序列组成。
4.转化细胞，其含有权利要求1所述序列的核酸，或权利要求3所述的表达盒、或载体，其中所述细胞是细菌细胞、哺乳动物细胞、真菌细胞、或昆虫细胞。
5.转化细胞，其含有权利要求1所述序列的核酸，或权利要求3所述的表达盒、或载体，其中所述细胞是酵母细胞。
6.分离的、合成的或重组的多肽，其具有木聚糖酶、甘露聚糖酶和/或葡聚糖酶活性，其中所述多肽由SEQ ID NO:2所述的氨基酸序列组成，并且具有在氨基酸残基4处从T(或thr或苏氨酸)变为R(或arg或精氨酸)的氨基酸残基改变。
7.权利要求6所述的多肽的蛋白质制剂，其中所述蛋白质制剂是液体、固体或凝胶。
8.权利要求6所述的多肽和第二结构域的异二聚体，其中所述第二结构域是多肽以及所述异二聚体是融合蛋白，或所述第二结构域是表位或标记。
9.权利要求6所述的多肽的同型二聚体，以及所述同型二聚体是融合蛋白。
10.固定化多肽，其中所述多肽是权利要求6所述的多肽，其中所述多肽被固定化在木屑、纸、细胞、金属、树脂、聚合物、陶瓷、玻璃、微电极、石墨颗粒、珠子、凝胶、板、阵列或毛细管上。
11.制备抗木聚糖酶和/或抗葡聚糖酶抗体的方法，其包括以足以产生体液免疫应答的量给予非人动物权利要求1所述的核酸序列编码的多肽，从而制备抗木聚糖酶和/或抗葡聚糖酶抗体。
12.制备抗木聚糖酶和/或抗葡聚糖酶抗体的方法，其包括以足以产生体液免疫应答的量给予非人动物权利要求6所述的多肽，从而制备抗木聚糖酶和/或抗葡聚糖酶抗体。
13.产生重组多肽的方法，其包括下列步骤：(a)提供与启动子可操作地连接的核酸，其中所述核酸是权利要求1所述的序列；和(b)在允许所述多肽表达的条件下表达(a)的所述核酸，从而产生重组多肽，以及用(a)的所述核酸转化宿主细胞，随后表达(a)的所述核酸，从而在转化细胞中产生重组多肽。
14.用于鉴定具有木聚糖酶、甘露聚糖酶和/或葡聚糖酶活性的多肽的方法，其包括：
(a)提供权利要求6所述的多肽；
(b)提供木聚糖酶、甘露聚糖酶和/或葡聚糖酶底物；和
(c)将(a)的所述多肽与(b)的所述底物接触，并且检测底物量的降低或反应产物量的增加，其中底物量的降低或反应产物量的增加检测出具有木聚糖酶、甘露聚糖酶和/或葡聚糖酶活性的多肽。
15.用于鉴定木聚糖酶、甘露聚糖酶和/或葡聚糖酶底物的方法，其包括：
(a)提供权利要求6所述的多肽；
(b)提供测试底物；和
(c)将(a)的所述多肽与(b)的所述测试底物接触，并且检测底物量的降低或反应产物量的增加，其中底物量的降低或反应产物量的增加鉴定出作为木聚糖酶、甘露聚糖酶和/或葡聚糖酶底物的测试底物。
16.确定测试化合物是否与多肽特异性结合的方法，其包括：
(a)在允许核酸翻译为多肽的条件下表达核酸或具有核酸的载体，其中所述核酸由权利要求1所述的序列组成；
(b)提供测试化合物；
(c)将所述多肽与所述测试化合物接触；和
(d)确定(b)的所述测试化合物是否与所述多肽特异性结合。
17.确定测试化合物是否与多肽特异性结合的方法，其包括：
(a)提供权利要求6所述的多肽；
(b)提供测试化合物；
(c)将(a)所述的多肽与(b)所述的测试化合物接触；和
(d)确定(b)的所述测试化合物是否与(a)的所述多肽特异性结合。
18.用于鉴定木聚糖酶、甘露聚糖酶和/或葡聚糖酶活性的调节剂的方法，其包括：
(a)提供权利要求6所述的多肽；
(b)提供测试化合物；
(c)将(a)的所述多肽与(b)的所述测试化合物接触，并测量木聚糖酶、甘露聚糖酶和/或葡聚糖酶活性，其中在存在所述测试化合物的情况下测量的木聚糖酶、甘露聚糖酶和/或葡聚糖酶活性与不存在所述测试化合物的情况下的活性相比的变化提供了所述测试化合物调节木聚糖酶、甘露聚糖酶和/或葡聚糖酶活性的确定。
19.权利要求18所述的方法，其中所述木聚糖酶、甘露聚糖酶和/或葡聚糖酶活性，通过提供木聚糖酶、甘露聚糖酶和/或葡聚糖酶底物，并检测底物量的降低或反应产物量的增加，或底物量的增加或反应产物量的降低来测量，其中与没有所述测试化合物时底物或反应产物的量相比，有所述测试化合物时底物量的降低或反应产物量的增加鉴定出作为木聚糖酶、甘露聚糖酶和/或葡聚糖酶活性的激活剂的所述测试化合物。
20.权利要求19所述的方法，其中与没有所述测试化合物时底物或反应产物量相比，有所述测试化合物时底物量的增加或反应产物量的降低鉴定出作为木聚糖酶、甘露聚糖酶和/或葡聚糖酶活性的抑制剂的所述测试化合物。
21.计算机系统，其包括处理器和数据存储设备，或已经存储了多肽序列或核酸序列的计算机可读介质，其中所述数据存储设备或计算机可读介质上已经存储了多肽序列或核酸序列，其中所述多肽序列是权利要求6所述的多肽的氨基酸序列、权利要求1所述的核酸序列编码的多肽，
其中所述系统进一步具有序列比对算法和数据存储设备，所述数据存储设备上已经存储了至少一个参考序列，或进一步具有在所述序列中鉴定一个或多个特征的鉴定器，以及所述序列比对算法是表明多态性的计算机程序。
22.用于鉴定序列中的特征的方法，其包括：(a)使用鉴定序列中的一个或多个特征的计算机程序读取所述序列，其中所述序列是多肽序列或核酸序列，其中所述多肽序列是权利要求6所述的多肽的氨基酸序列、权利要求1所述的核酸序列编码的多肽；和(b)用所述计算机程序鉴定所述序列中的一个或多个特征。
23.将第一序列与第二序列进行比较的方法，其包括：(a)通过使用比较序列的计算机程序读取所述第一序列和所述第二序列，其中所述第一序列是多肽序列或核酸序列，其中所述多肽序列是权利要求6所述的多肽的氨基酸序列、权利要求1所述的核酸序列编码的多肽；和(b)用所述计算机程序确定所述第一序列和所述第二序列之间的差异，
其中确定所述第一序列和所述第二序列之间差异的步骤进一步包括鉴定多态性的步骤，
以及所述方法进一步具有鉴定序列中的一个或多个特征的鉴定器，以及其中所述第一序列的所述读取使用计算机程序，并鉴定所述序列中的一个或多个特征。
24.在编码具有木聚糖酶、甘露聚糖酶和/或葡聚糖酶活性的多肽的核酸中修饰密码子以增加其在宿主细胞中表达的方法，所述方法包括：
(a)提供编码具有木聚糖酶、甘露聚糖酶和/或葡聚糖酶活性的多肽的核酸，所述核酸以权利要求1所述的序列表示；和
(b)鉴定(a)的所述核酸中非优选或较不优选的密码子，并用优选的或中度使用的密码子来代替之，所述优选或中度使用的密码子与被代替的密码子编码相同的氨基酸，其中优选密码子是在宿主细胞的基因的编码序列中过度表现的密码子，以及非优选或较不优选密码子是在宿主细胞的基因的编码序列中表现不足的密码子，从而修饰所述核酸以增加其在宿主细胞中的表达。
25.在编码木聚糖酶、甘露聚糖酶和/或葡聚糖酶多肽的核酸中修饰密码子的方法，所述方法包括：
(a)提供编码具有木聚糖酶、甘露聚糖酶和/或葡聚糖酶活性的多肽的核酸，所述核酸以权利要求1所述的序列表示；和
(b)鉴定(a)的核酸中的密码子，并用不同的密码子来代替它，所述不同的密码子与被代替的密码子编码相同的氨基酸，从而修饰在编码木聚糖酶、甘露聚糖酶和/或葡聚糖酶的核酸中的密码子。
26.在编码具有木聚糖酶、甘露聚糖酶和/或葡聚糖酶活性的多肽的核酸中修饰密码子以降低其在宿主细胞中的表达的方法，所述方法包括：
(a)提供编码木聚糖酶、甘露聚糖酶和/或葡聚糖酶多肽的核酸，所述核酸以权利要求1所述的序列表示；和
(b)鉴定(a)的核酸中的至少一个优选密码子，并用非优选的或较不优选的密码子来代替它，所述非优选或较不优选的密码子与被代替的密码子编码相同的氨基酸，其中优选密码子是在宿主细胞的基因的编码序列中过度表现的密码子，以及非优选或较不优选的密码子是在宿主细胞的基因的编码序列中表现不足的密码子，从而修饰所述核酸以降低其在宿主细胞中的表达，
其中所述宿主细胞是细菌细胞、真菌细胞、昆虫细胞、植物细胞或哺乳动物细胞。
27.权利要求26所述的方法，其中所述宿主细胞是酵母细胞。
28.产生核酸文库的方法，所述核酸文库编码多个被修饰的木聚糖酶、甘露聚糖酶和/或葡聚糖酶活性位点或底物结合位点，其中所述被修饰的活性位点或底物结合位点来源于第一核酸，所述第一核酸具有编码第一活性位点或第一底物结合位点的序列，所述方法包括：
(a)提供第一核酸，其编码第一活性位点或第一底物结合位点，其中所述第一核酸序列由权利要求1所述的序列组成，以及所述核酸编码木聚糖酶、甘露聚糖酶和/或葡聚糖酶活性位点或木聚糖酶、甘露聚糖酶和/或葡聚糖酶底物结合位点；
(b)提供一组诱变寡核苷酸，其在第一核酸的多个目标密码子处编码天然发生的氨基酸变体；和
(c)使用所述组诱变寡核苷酸，产生一组编码活性位点或编码底物结合位点的变体核酸，其在被诱变的每一氨基酸密码子处编码一定范围的氨基酸变异，从而产生编码多个被修饰的木聚糖酶、甘露聚糖酶和/或葡聚糖酶活性位点或底物结合位点的核酸文库。
29.权利要求28所述的方法，其中诱变(a)的第一核酸是通过选自如下方法的方法：优化的定向进化系统、基因位点饱和诱变(GSSM)、合成连接重装配(SLR)、易错PCR、重排、寡核苷酸定向突变、装配PCR、有性PCR诱变、体内诱变、盒式诱变、位点特异性诱变、基因重装配、重组、硫代磷酸酯修饰的DNA诱变、含尿嘧啶的模板诱变、缺口双重诱变、点错配修复诱变、修复缺陷型宿主株诱变、化学诱变、放射诱变、缺失诱变、限制选择诱变、限制纯化诱变、人工基因合成、整体诱变、嵌合核酸多聚体生成或其组合。
30.权利要求28所述的方法，其中诱变(a)的第一核酸是通过选自回归整体诱变、指数整体诱变的方法。
31.权利要求28所述的方法，其中诱变所述(a)的第一核酸是通过回归序列重组。
32.制备小分子的方法，包括：
(a)提供多个能合成或修饰小分子的生物合成酶，其中所述酶中的一种酶是这样的核酸编码的木聚糖酶、甘露聚糖酶和/或葡聚糖酶，所述核酸由权利要求1所述的序列组成；
(b)为(a)的至少一种酶提供底物；和
(c)将(b)的底物与所述酶在促进多个生物催化反应的条件下通过一系列生物催化反应进行反应，以产生小分子。
33.修饰小分子的方法，包括：
(a)提供木聚糖酶、甘露聚糖酶和/或葡聚糖酶，其中所述酶是权利要求6所述的多肽或由权利要求1所述序列的核酸编码的多肽；
(b)提供小分子；和
(c)将(a)的酶与(b)的小分子在促进木聚糖酶、甘露聚糖酶和/或葡聚糖酶催化的酶促反应的条件下进行反应，从而通过木聚糖酶、甘露聚糖酶和/或葡聚糖酶酶促反应修饰小分子，
其中所述方法由为(a)的所述酶提供多个小分子底物，从而产生通过由木聚糖酶、甘露聚糖酶和/或葡聚糖酶催化的至少一种酶促反应产生的被修饰小分子的文库组成。
34.权利要求33所述的方法，进一步包括多种其它的酶，在有助于所述酶的多个生物催化反应的条件下使用，以形成由多个酶促反应产生的被修饰小分子的文库，其中任选地所述方法进一步包括测试所述文库以确定所述文库中是否存在表现出期望活性的特定被修饰小分子的步骤，以及任选地所述文库的所述测试进一步包括系统地去除所有但保留一个用于产生文库中多个被修饰小分子中的一部分的生物催化反应的步骤，其是通过测试被修饰小分子的所述部分中存在或不存在具有期望活性的特定被修饰小分子，并鉴定出产生具有期望活性的特定修饰小分子的至少一个特定生物催化反应。
35.确定木聚糖酶、甘露聚糖酶和/或葡聚糖酶的功能片段的方法，包括如下步骤：
(a)提供木聚糖酶、甘露聚糖酶和/或葡聚糖酶，其中所述酶是权利要求6所述的多肽或由权利要求1所述序列组成的核酸编码的多肽；和
(b)从(a)的序列删除多个氨基酸残基，并测试剩余子序列的木聚糖酶、甘露聚糖酶和/或葡聚糖酶活性，从而确定木聚糖酶、甘露聚糖酶和/或葡聚糖酶的功能片段，
其中所述木聚糖酶、甘露聚糖酶和/或葡聚糖酶活性通过提供木聚糖酶、甘露聚糖酶和/或葡聚糖酶底物并检测底物量的减少或反应产物量的增加来测量。
36.通过使用实时代谢流分析进行新的或修饰的表型的全细胞工程改造的方法，所述方法包括：
(a)通过修饰细胞的遗传组成产生修饰的细胞，其中所述遗传组成通过将由权利要求1所述序列组成的核酸加入到所述细胞来修饰；
(b)培养所述修饰的细胞以产生多个修饰的细胞；
(c)通过实时监控(b)的细胞培养物来测量所述细胞的至少一个代谢参数；和
(d)分析(c)的数据，以确定被测量的参数是否与在类似条件下未修饰细胞中的参照测量值不同，从而使用实时代谢流量分析鉴定所述细胞中的工程改造的表型，
其中所述细胞的遗传组成通过在所述细胞中序列的删除或序列的修饰，或敲除基因的表达来修饰，
以及所述方法进一步包括选择具有新工程改造的表型的细胞，以及培养被选择的细胞，从而产生具有新工程改造的表型的新细胞株。
37.嵌合多肽，其包含至少第一结构域，至少第二结构域和木聚糖酶、甘露聚糖酶和/或葡聚糖酶催化结构域(CD)，其中所述第一结构域是信号肽(SP)，其中所述第二结构域是由权利要求6所述的多肽的氨基酸序列组成的异源多肽或肽，其中所述异源多肽或肽与信号肽(SP)之间没有天然的联系，其中所述信号肽(SP)的来源不是木聚糖酶、甘露聚糖酶和/或葡聚糖酶，以及所述异源多肽或者肽在所述信号肽(SP)或所述木聚糖酶、所述甘露聚糖酶和/或所述葡聚糖酶催化结构域(CD)的氨基末端、羧基末端或者羧基和氨基末端。
38.分离的、合成的或者重组的核酸，其编码权利要求37所述的嵌合多肽。
39.增加木聚糖酶、甘露聚糖酶和/或葡聚糖酶多肽的耐热性或热稳定性的方法，所述方法包括糖基化木聚糖酶、甘露聚糖酶和/或葡聚糖酶，其中所述多肽是权利要求6所述多肽或由权利要求1所述序列组成的核酸编码的多肽，从而增加木聚糖酶、甘露聚糖酶和/或葡聚糖酶的耐热性或热稳定性。
40.在细胞中过量表达重组木聚糖酶、甘露聚糖酶和/或葡聚糖酶的方法，包括使载体表达，所述载体具有权利要求1所述的核酸序列，或编码权利要求6所述多肽的核酸序列，其中过量表达通过使用高活性启动子、双顺反子载体或通过所述载体的基因扩增来实现。
41.产生转基因植物的方法，包括：
(a)将异源核酸序列引入细胞中，其中所述异源核酸序列是权利要求1所述的序列，或编码权利要求6所述多肽的核酸，从而产生转化的植物细胞；
(b)从所述转化的细胞产生转基因植物，
其中(a)的所述异源核酸序列的所述引入是通过植物细胞原生质体的电穿孔或微注射，或(a)的所述异源核酸序列的所述引入是通过DNA颗粒轰击或通过应用根癌农杆菌(Agrobacterium tumefaciens)宿主直接到植物组织。
42.在植物细胞中表达异源核酸序列的方法，包括：
(a)用与启动子可操作地连接的异源核酸序列转化所述植物细胞，其中所述异源核酸序列是权利要求1所述的序列，或编码权利要求6所述多肽的核酸序列；
(b)在所述异源核酸序列在所述植物细胞中表达的条件下使所述植物生长。
43.水解、液化、分解或破坏含木聚糖、纤维素或半纤维素的组合物的方法，包括：
(a)提供具有木聚糖酶、甘露聚糖酶和/或葡聚糖酶活性的多肽，其中所述多肽由权利要求6所述的多肽的氨基酸序列组成，或所述多肽由权利要求1所述序列组成的核酸编码；
(b)提供含木聚糖、纤维素或半纤维素的组合物；和
(c)在其中所述木聚糖酶、甘露聚糖酶和/或葡聚糖酶水解、液化、分解或破坏含木聚糖、纤维素或半纤维素的组合物的条件下，将(a)的多肽与(b)的组合物接触，
其中所述组合物选自植物细胞、细菌细胞、酵母细胞、昆虫细胞或动物细胞。
44.面团或面包制品，其包含具有木聚糖酶、甘露聚糖酶和/或葡聚糖酶活性的多肽，其中所述多肽由权利要求6所述的多肽的氨基酸序列组成，或所述多肽由权利要求1所述序列组成的核酸编码。
45.面团调理的方法，其包括在足以调理所述面团的条件下，使面团或面包制品与具有木聚糖酶、甘露聚糖酶和/或葡聚糖酶活性的至少一种多肽接触，其中所述多肽由权利要求
6所述的多肽的氨基酸序列组成，或所述多肽由由权利要求1所述序列组成的核酸编码。
46.饮料，其包含具有木聚糖酶、甘露聚糖酶和/或葡聚糖酶活性的多肽，其中所述多肽由权利要求6所述的多肽的氨基酸序列组成，或所述多肽由权利要求1所述序列组成的核酸编码。
47.饮料生产的方法，包括在足以降低饮料粘性的条件下将具有木聚糖酶、甘露聚糖酶和/或葡聚糖酶活性的至少一种多肽施用到饮料或饮料前体，其中所述多肽由权利要求6所述的多肽的氨基酸序列组成，或所述多肽由权利要求1所述序列组成的核酸编码，其中，所述饮料或饮料前体是麦芽汁或啤酒。
48.食物、饲料或营养补充物，其包含具有木聚糖酶、甘露聚糖酶和/或葡聚糖酶活性的多肽，其中所述多肽由权利要求6所述的多肽的氨基酸序列组成，或所述多肽由权利要求1所述序列组成的核酸编码。
49.可食用的酶输送基质，其包含具有木聚糖酶、甘露聚糖酶和/或葡聚糖酶活性的多肽，其中所述多肽由权利要求6所述的多肽的氨基酸序列组成，或所述多肽由权利要求1所述的序列组成的核酸编码，
其中所述木聚糖酶、甘露聚糖酶和/或葡聚糖酶是热稳定的。
50.清洁剂组合物，其包含具有木聚糖酶、甘露聚糖酶和/或葡聚糖酶活性的多肽，其中所述多肽由权利要求6所述的多肽的氨基酸序列组成，或所述多肽由权利要求1所述的序列组成的核酸编码。
51.药物组合物，其包含具有木聚糖酶、甘露聚糖酶和/或葡聚糖酶活性的多肽，其中所述多肽由权利要求6所述的多肽的氨基酸序列组成，或所述多肽由权利要求1所述的序列组成的核酸编码。
52.在纸、纸制品、木材、木浆、木制品、木材再生组合物或纸再生组合物中减少木质素量或溶解木质素的方法，包括使所述纸、纸制品、木材、木浆、木制品、木材再生组合物或纸再生组合物与具有木聚糖酶、甘露聚糖酶和/或葡聚糖酶活性的多肽接触，其中所述多肽由权利要求6所述的多肽的氨基酸序列组成，或所述多肽由权利要求1所述的序列组成的核酸编码。
53.水解生物质中纤维素、半纤维素或木聚糖的方法，包括使所述生物质与具有木聚糖酶、甘露聚糖酶和/或葡聚糖酶活性的多肽接触，其中所述多肽由权利要求6所述的多肽的氨基酸序列组成，或所述多肽由权利要求1所述的序列组成的核酸编码。
54.水解木材、木制品、纸浆、纸制品或废纸中纤维素、半纤维素或木聚糖的方法，包括使所述木材、木制品、纸浆、纸制品或废纸与具有木聚糖酶、甘露聚糖酶和/或葡聚糖酶活性的多肽接触，其中所述多肽由权利要求6所述的多肽的氨基酸序列组成，或所述多肽由权利要求1所述的序列组成的核酸编码。
55.纸、大麻或亚麻浆酶促脱色的方法，包括使所述纸、大麻或亚麻浆与木聚糖酶、甘露聚糖酶和/或葡聚糖酶和漂白剂接触，其中所述木聚糖酶、甘露聚糖酶和/或葡聚糖酶由权利要求6所述的多肽的氨基酸序列表示，或所述木聚糖酶、甘露聚糖酶和/或葡聚糖酶由权利要求1所述的序列组成的核酸编码，
其中所述漂白剂是氧或过氧化氢。
56.脱色木质纤维素浆的方法，包括使所述木质纤维素浆与木聚糖酶、甘露聚糖酶和/或葡聚糖酶接触，其中所述木聚糖酶、甘露聚糖酶和/或葡聚糖酶由权利要求6所述的多肽的氨基酸序列表示，或所述木聚糖酶、甘露聚糖酶和/或葡聚糖酶由权利要求1所述的序列组成的核酸编码。
57.纸、废纸、纸再生产品的酶促脱墨的方法，包括使所述纸、废纸、纸再生产品与木聚糖酶、甘露聚糖酶和/或葡聚糖酶接触，其中所述木聚糖酶、甘露聚糖酶和/或葡聚糖酶由权利要求6所述的多肽的氨基酸序列表示，或所述木聚糖酶、甘露聚糖酶和/或葡聚糖酶由权利要求1所述的序列组成的核酸编码。
58.从非接触性印刷废纸或非接触性和接触性印刷废纸的混合物中脱去墨粉的方法，包括使所述非接触性印刷废纸或非接触性和接触性印刷废纸的混合物与木聚糖酶、甘露聚糖酶和/或葡聚糖酶接触，其中所述木聚糖酶、甘露聚糖酶和/或葡聚糖酶由权利要求6所述的多肽的氨基酸序列表示，或所述木聚糖酶、甘露聚糖酶和/或葡聚糖酶由权利要求1所述的序列组成的核酸编码。
59.脱色织物或纺织品的方法，包括使所述织物或纺织品与木聚糖酶、甘露聚糖酶和/或葡聚糖酶在适于使纺织品变白的条件下接触，其中所述木聚糖酶、甘露聚糖酶和/或葡聚糖酶由权利要求6所述的多肽的氨基酸序列表示，或所述木聚糖酶、甘露聚糖酶和/或葡聚糖酶由权利要求1所述的序列组成的核酸编码，
其中所述织物或纺织品是非棉纤维素织物或纺织品。
60.权利要求59所述的方法，其中所述织物或纺织品是纱或布料。
61.报纸脱色或脱墨的方法，包括使所述报纸与木聚糖酶、甘露聚糖酶和/或葡聚糖酶接触，其中所述木聚糖酶、所述甘露聚糖酶和/或所述葡聚糖酶由权利要求6所述的多肽的氨基酸序列表示，或所述木聚糖酶、甘露聚糖酶和/或葡聚糖酶由权利要求1所述的序列组成的核酸编码。
62.生物质，其包含由权利要求6所述的多肽的氨基酸序列组成的多肽，或由权利要求1所述的序列组成的核酸编码的多肽。
63.木材、木浆、木制品或纸制品，其包含由权利要求6所述的多肽的氨基酸序列组成的多肽，或由权利要求1所述的序列组成的核酸编码的多肽。
64.纸浆、报纸或废纸，其包含由权利要求6所述的多肽的氨基酸序列组成的多肽，或由权利要求1所述的序列组成的核酸编码的多肽。
65.织物或纺织品，其包含由权利要求6所述的多肽的氨基酸序列组成的多肽，或由权利要求1所述的序列组成的核酸编码的多肽，
其中所述织物或纺织品是非棉纤维素织物或纺织品。
66.权利要求65所述的织物或纺织品，其中所述织物或纺织品是纱或布料。
67.减少木材或木制品中木质素的方法，包括使所述木材或木制品与具有木聚糖酶、甘露聚糖酶和/或葡聚糖酶活性的多肽接触，其中所述多肽由权利要求6所述的多肽的氨基酸序列组成，或所述多肽由权利要求1所述的序列组成的核酸编码。
68.在高温和碱性pH条件下减少生物质中木质素的方法，所述方法包括：
(a)提供具有木聚糖酶、甘露聚糖酶和/或葡聚糖酶活性的至少一种多肽，其中所述多肽在由至少85℃的温度和至少pH11的碱性pH组成的条件下保持木聚糖酶、甘露聚糖酶和/或葡聚糖酶活性，
其中所述多肽是由权利要求6所述的多肽的氨基酸序列组成的木聚糖酶、甘露聚糖酶和/或葡聚糖酶，或所述木聚糖酶、甘露聚糖酶和/或葡聚糖酶由权利要求1所述的序列组成的核酸编码；
(b)提供含木质素的生物质；以及
(c)使所述生物质在至少85℃的温度和至少pH11的碱性pH的条件下与(a)的所述多肽接触，其中所述多肽减少生物质中的所述木质素。
69.在高温和碱性pH条件下减少木材、木浆、或纸中木质素的方法，所述方法包括：
(a)提供具有木聚糖酶、甘露聚糖酶和/或葡聚糖酶活性的至少一种多肽，其中所述多肽在由至少85℃的温度和至少pH11的碱性pH组成的条件下保持木聚糖酶、甘露聚糖酶和/或葡聚糖酶活性，
其中所述多肽是由权利要求6所述的多肽的氨基酸序列组成的木聚糖酶、甘露聚糖酶和/或葡聚糖酶，或所述木聚糖酶、甘露聚糖酶和/或葡聚糖酶由权利要求1所述的序列组成的核酸编码；
(b)提供含木质素的木材、木浆、或纸；以及
(c)使所述木材、木浆、或纸在至少85℃的温度和至少pH11的碱性pH的条件下与(a)的所述多肽接触，其中所述多肽减少木材、木浆、或纸中的所述木质素。
70.在高温和碱性pH条件下处理生物质的方法，所述方法包括：
(a)提供具有木聚糖酶、甘露聚糖酶和/或葡聚糖酶活性的至少一种多肽，其中所述多肽在至少85℃的温度和至少pH11的碱性pH的条件下保持木聚糖酶、甘露聚糖酶和/或葡聚糖酶活性，
其中所述多肽是由权利要求6所述的多肽的氨基酸序列组成的木聚糖酶、甘露聚糖酶和/或葡聚糖酶，或所述木聚糖酶、甘露聚糖酶和/或葡聚糖酶由权利要求1所述的序列组成的核酸编码；
(b)提供生物质；以及
(c)使所述生物质在至少85℃的温度和至少pH11的碱性pH的条件下与(a)的所述多肽接触，
其中所述多肽催化所述生物质中的化合物的水解，
以及其中所述生物质是软木材和硬木材，或所述生物质源自软木材和硬木材；
以及其中，在所述处理后，所述浆料具有至少10％或至少32％的稠度。
71.在高温和碱性pH条件下处理木材、木浆、或纸的方法，所述方法包括：
(a)提供具有木聚糖酶、甘露聚糖酶和/或葡聚糖酶活性的至少一种多肽，其中所述多肽在至少85℃的温度和至少pH11的碱性pH的条件下保持木聚糖酶、甘露聚糖酶和/或葡聚糖酶活性，
其中所述多肽是由权利要求6所述的多肽的氨基酸序列组成的木聚糖酶、甘露聚糖酶和/或葡聚糖酶，或所述木聚糖酶、甘露聚糖酶和/或葡聚糖酶由权利要求1所述的序列组成的核酸编码；
(b)提供木材、木浆、或纸；以及
(c)使所述木材、木浆、或纸在至少85℃的温度和至少pH11的碱性pH的条件下与(a)的所述多肽接触，
其中所述多肽催化所述木材、木浆、或纸中的化合物的水解，
以及其中所述木材、木浆、或纸是软木材和硬木材，或所述木材、木浆、或纸源自软木材和硬木材；
以及其中，在所述处理后，所述浆料具有至少10％或至少32％的稠度。
72.在高温和碱性pH条件下对生物质脱色的方法，所述方法包括：
(a)提供具有木聚糖酶、甘露聚糖酶和/或葡聚糖酶活性的至少一种多肽，其中所述多肽在至少85℃的温度和至少pH11的碱性pH的条件下保持木聚糖酶、甘露聚糖酶和/或葡聚糖酶活性，
其中所述多肽是由权利要求6所述的多肽的氨基酸序列组成的木聚糖酶、甘露聚糖酶和/或葡聚糖酶，或所述木聚糖酶、甘露聚糖酶和/或葡聚糖酶由权利要求1所述的序列组成的核酸编码；
(b)提供所述生物质；以及
(c)使所述生物质在至少85℃的温度和至少pH11的碱性pH的条件下与(a)的所述多肽接触，
其中所述多肽催化所述生物质中的化合物的水解，从而对所述生物质漂白。
73.在高温和碱性pH条件下对木材、木浆、或纸脱色的方法，所述方法包括：
(a)提供具有木聚糖酶、甘露聚糖酶和/或葡聚糖酶活性的至少一种多肽，其中所述多肽在至少85℃的温度和至少pH11的碱性pH的条件下保持木聚糖酶、甘露聚糖酶和/或葡聚糖酶活性，
其中所述多肽是由权利要求6所述的多肽的氨基酸序列组成的木聚糖酶、甘露聚糖酶和/或葡聚糖酶，或所述木聚糖酶、甘露聚糖酶和/或葡聚糖酶由权利要求1所述的序列组成的核酸编码；
(b)提供木材、木浆、或纸；以及
(c)使所述木材、木浆、或纸在至少85℃的温度和至少pH11的碱性pH的条件下与(a)的所述多肽接触，
其中所述多肽催化所述木材、木浆、或纸中的化合物的水解，从而对所述木材、木浆、或纸漂白。
74.在高温和碱性pH条件下减少生物质漂白过程中漂白化学品的使用的方法，所述方法包括：
(a)提供具有木聚糖酶、甘露聚糖酶和/或葡聚糖酶活性的至少一种多肽，其中所述多肽在至少85℃的温度和至少pH11的碱性pH的条件下保持木聚糖酶、甘露聚糖酶和/或葡聚糖酶活性，
其中所述多肽是由权利要求6所述的多肽的氨基酸序列组成的木聚糖酶、甘露聚糖酶和/或葡聚糖酶，或所述木聚糖酶、甘露聚糖酶和/或葡聚糖酶由权利要求1所述的序列组成的核酸编码；
(b)提供生物质；以及
(c)使所述生物质在至少85℃的温度和至少pH11的碱性pH的条件下与(a)的所述多肽接触，
其中所述多肽催化所述生物质中的化合物的水解，从而对所述生物质生物漂白并且减少漂白过程中漂白化学品的使用；
其中所述漂白化学品选自氯、二氧化氯、苛性碱、过氧化物或其任意组合。
75.在高温和碱性pH条件下减少木材、木浆、或纸漂白过程中漂白化学品的使用的方法，所述方法包括：
(a)提供具有木聚糖酶、甘露聚糖酶和/或葡聚糖酶活性的至少一种多肽，其中所述多肽在至少85℃的温度和至少pH11的碱性pH的条件下保持木聚糖酶、甘露聚糖酶和/或葡聚糖酶活性，
其中所述多肽是由权利要求6所述的多肽的氨基酸序列组成的木聚糖酶、甘露聚糖酶和/或葡聚糖酶，或所述木聚糖酶、甘露聚糖酶和/或葡聚糖酶由权利要求1所述的序列组成的核酸编码；
(b)提供木材、木浆、或纸；以及
(c)使所述木材、木浆、或纸在至少85℃的温度和至少pH11的碱性pH的条件下与(a)的所述多肽接触，
其中所述多肽催化所述木材、木浆、或纸中的化合物的水解，从而对所述木材、木浆、或纸生物漂白并且减少漂白过程中漂白化学品的使用；
其中所述漂白化学品选自氯、二氧化氯、苛性碱、过氧化物或其任意组合。
76.在高温和碱性pH条件下纸或浆料脱墨的方法，所述方法包括：
(a)提供具有木聚糖酶、甘露聚糖酶和/或葡聚糖酶活性的至少一种多肽，其中所述多肽在至少85℃的温度和至少pH11的碱性pH的条件下保持木聚糖酶、甘露聚糖酶和/或葡聚糖酶活性，
其中所述多肽是由权利要求6所述的多肽的氨基酸序列组成的木聚糖酶、甘露聚糖酶和/或葡聚糖酶，或所述木聚糖酶、甘露聚糖酶和/或葡聚糖酶由权利要求1所述的序列组成的核酸编码；
(b)提供含墨的纸或浆料；以及
(c)使所述纸或浆料在至少85℃的温度和至少pH11的碱性pH的条件下与(a)的所述多肽接触，
其中所述多肽催化所述纸或浆料中的化合物的水解，从而促进所述纸或浆料的脱墨。
77.在高温和碱性pH条件下从木材、木浆、或纸中释放木质素的方法，所述方法包括：
(a)提供具有木聚糖酶、甘露聚糖酶和/或葡聚糖酶活性的至少一种多肽，其中所述多肽在至少85℃的温度和至少pH11的碱性pH的条件下保持木聚糖酶、甘露聚糖酶和/或葡聚糖酶活性，
其中所述多肽是由权利要求6所述的多肽的氨基酸序列组成的木聚糖酶、甘露聚糖酶和/或葡聚糖酶，或所述木聚糖酶、甘露聚糖酶和/或葡聚糖酶由权利要求1所述的序列组成的核酸编码；
(b)提供含木质素的木材、木浆、或纸；以及
(c)使(b)的所述木材、木浆、或纸在至少85℃的温度和至少pH11的碱性pH的条件下与(a)的所述多肽接触，
其中所述多肽催化木材、木浆、或纸中的化合物的水解，从而促进木质素从所述木材、木浆、或纸的释放；
其中在所述处理后，所述浆料具有10％的稠度。
78.包含生物质和多肽的组合物，所述多肽具有木聚糖酶、甘露聚糖酶和/或葡聚糖酶活性，其中所述多肽由权利要求6所述的多肽的氨基酸序列组成，或所述多肽由权利要求1所述的序列组成的核酸编码，
其中所述生物质是软木材和硬木材，或所述生物质源自软木材和硬木材。
79.包含木材、木浆、或纸和多肽的组合物，所述多肽具有木聚糖酶、甘露聚糖酶和/或葡聚糖酶活性，其中所述多肽由权利要求6所述的多肽的氨基酸序列组成，或所述多肽由权利要求1所述的序列组成的核酸编码，
其中所述木材、木浆、或纸是软木材和硬木材，或所述木材、木浆、或纸源自软木材和硬木材。
80.权利要求69、71、73和75-77中任一项所述的方法，其中所述纸是纸制品。
81.权利要求79所述的组合物，其中所述纸是纸制品。
82.权利要求80所述的方法，其中所述纸制品是纸浆。
83.权利要求80所述的方法，其中所述纸制品是牛皮纸浆。
84.权利要求81所述的组合物，其中所述纸制品是纸浆。
85.权利要求81所述的组合物，其中所述纸制品是牛皮纸浆。
86.制造醇的方法，包括使含木聚糖、纤维素或半纤维素的组合物与具有木聚糖酶、甘露聚糖酶和/或葡聚糖酶活性的多肽接触，其中所述多肽由权利要求6所述的多肽的氨基酸序列组成，或所述多肽由权利要求1所述的序列组成的核酸编码，
以及所述方法进一步包括发酵，
以及所述醇是乙醇。
87.酶混合物，其包含权利要求6所述的多肽和一种或更多种其它酶，其中所述一种或更多种其它酶是纤维素酶、脂肪酶、酯酶、蛋白酶或内糖苷酶、角质酶、过氧化物酶、过氧化氢酶、漆酶、淀粉酶、葡萄糖淀粉酶、果胶酶、还原酶、氧化酶、木质素酶、阿拉伯树胶酶、半纤维素酶、木葡聚糖酶、木聚糖酶、甘露聚糖酶和/或葡聚糖酶、聚半乳糖醛酸酶、鼠李糖半乳糖醛酸聚糖酶、半乳聚糖酶、纤维二糖水解酶和/或转谷氨酰胺酶。
88.酶混合物，其包含权利要求6所述的多肽和一种或更多种其它酶的混合物，其中所述一种或更多种其它酶是纤维素酶、脂肪酶、酯酶、蛋白酶或内糖苷酶、角质酶、过氧化物酶、过氧化氢酶、漆酶、淀粉酶、葡萄糖淀粉酶、果胶酶、还原酶、氧化酶、木质素酶、阿拉伯树胶酶、半纤维素酶、木葡聚糖酶、木聚糖酶、甘露聚糖酶和/或葡聚糖酶、聚半乳糖醛酸酶、鼠李糖半乳糖醛酸聚糖酶、半乳聚糖酶、纤维二糖水解酶和/或转谷氨酰胺酶。
89.酶混合物，其包含权利要求6所述的多肽和一种或更多种其它酶，其中所述一种或更多种其它酶是β-葡聚糖酶、果胶乙酰基酯酶、鼠李糖半乳糖醛酸聚糖乙酰酯酶、果胶裂解酶和/或果胶甲基酯酶。
90.酶混合物，其包含权利要求6所述的多肽和一种或更多种其它酶的混合物，其中所述一种或更多种其它酶是β-葡聚糖酶、果胶乙酰基酯酶、鼠李糖半乳糖醛酸聚糖乙酰酯酶、果胶裂解酶和/或果胶甲基酯酶。
91.权利要求87-88任一项所述的酶混合物，其中所述氧化酶是酚氧化酶，和所述淀粉酶是支链淀粉酶。
92.权利要求89-90任一项所述的酶混合物，其中所述β-葡聚糖酶是内-β-1,4-葡聚糖酶或内-β-1,3(4)-葡聚糖酶。
93.包含醇和具有木聚糖酶、甘露聚糖酶和/或葡聚糖酶活性的多肽的组合物，其中所述多肽由权利要求6所述的多肽的氨基酸序列组成，或所述多肽由权利要求1所述的序列组成的核酸编码；或所述组合物包含权利要求87-90任一项的酶混合物，
以及所述醇是乙醇。
94.隐形眼镜清洗液，其包含具有木聚糖酶、甘露聚糖酶和/或葡聚糖酶活性的多肽，或权利要求87-90中任一项的酶混合物，其中所述多肽由权利要求6所述的多肽的氨基酸序列组成，或所述多肽由权利要求1所述的序列组成的核酸编码。
95.废物处理溶液，其包含具有木聚糖酶、甘露聚糖酶和/或葡聚糖酶活性的多肽，或权利要求87-90中任一项的酶混合物，其中所述多肽由权利要求6所述的多肽的氨基酸序列组成，或所述多肽由权利要求1所述的序列组成的核酸编码。
96.肥皂或液体肥皂，其包含具有木聚糖酶、甘露聚糖酶和/或葡聚糖酶活性的多肽，其中所述多肽由权利要求6所述的多肽的氨基酸序列组成，或所述多肽由权利要求1所述的序列组成的核酸编码。
97.口香糖、含片或糖果，其包含具有木聚糖酶、甘露聚糖酶和/或葡聚糖酶活性的多肽，其中所述多肽由权利要求6所述的多肽的氨基酸序列组成，或所述多肽由权利要求1所述的序列组成的核酸编码。
98.嵌合糖苷酶、木聚糖酶和/或葡聚糖酶，其包含权利要求6所述的多肽的氨基酸序列和至少一个异源糖结合模块(CBM)，其中所述CBM选自CBM3a、CBM3b、CBM4、CBM6、CBM22或X14。
99.嵌合糖苷酶、木聚糖酶和/或葡聚糖酶，其包含权利要求6所述的多肽的氨基酸序列的嵌合糖苷酶、木聚糖酶和/或葡聚糖酶和至少一个异源糖结合模块(CBM)，其中所述CBM选自CBM3a、CBM3b、CBM4、CBM6、CBM22或X14。
100.嵌合糖苷酶、木聚糖酶和/或葡聚糖酶，其包含至少一个异源糖结合模块(CBM)，其中所述CBM是权利要求6所述的多肽的氨基酸序列的糖结合模块序列。
101.设计具有新的糖结合特异性或糖结合特异性提高的嵌合糖苷酶、木聚糖酶、甘露聚糖酶和/或葡聚糖酶的方法，其包括将异源或另外的内源糖结合模块(CBM)插入糖苷酶中，其中所述CBM是权利要求6所述的多肽的氨基酸序列的糖结合模块序列。
102.水解任意有机化合物、植物或木材或木制品或木材副产品、纸制品或废纸或纸副产品中的木聚糖、纤维素或半纤维素的方法，包括应用权利要求87-90中任一项所述的酶混合物和/或权利要求6的多肽。
103.权利要求102所述的方法，其中所述木材副产品是废木料，并且所述纸制品是纸浆。
104.液体组合物，其包含醇和权利要求6的多肽。
105.液体组合物，其包含醇和权利要求87所述的酶混合物。
106.权利要求104或权利要求105所述的液体组合物，其中所述醇是乙醇、丙醇、丁醇和/或甲醇。
107.权利要求104或105所述的液体组合物，其包含燃料、合成液体或气体，或含在燃料、合成液体或气体中。
108.权利要求106所述的液体组合物，其包含燃料、合成液体或气体，或含在燃料、合成液体或气体中。
109.权利要求104或105所述的液体组合物，其包含生物燃料或合成气，或含在生物燃料或合成气中。
110.权利要求106所述的液体组合物，其包含生物燃料或合成气，或含在生物燃料或合成气中。
111.权利要求87所述的酶混合物，其包含内切葡聚糖酶、寡聚酶I、CBH1、CBH2、阿拉伯呋喃糖苷酶、木聚糖酶和寡聚酶II，其中这些酶中的一种是权利要求6的多肽。
112.克隆运载体，其包括这样的核酸序列，所述核酸序列由权利要求1所述的序列组成，其中所述克隆运载体选自病毒载体、质粒、噬菌体、噬菌粒、黏粒、或人工染色体。
113.权利要求112所述的克隆运载体，其中所述黏粒是F黏粒。
114.权利要求112或权利要求113所述的克隆运载体，其中所述病毒载体选自腺病毒载体、逆转录病毒载体或腺相关病毒载体，或所述人工染色体由细菌人工染色体(BAC)、噬菌体P1衍生的载体(PAC)、酵母人工染色体(YAC)或哺乳动物人工染色体(MAC)组成。
115.转化细胞，其含有由权利要求1所述序列组成的核酸，或权利要求112所述的克隆运载体，其中所述细胞是细菌细胞、哺乳动物细胞、真菌细胞、或昆虫细胞。
116.转化细胞，其含有由权利要求1所述序列组成的核酸，或权利要求112所述的克隆运载体，其中所述细胞是酵母细胞。