专利汇可以提供代谢物组学和病毒诊断套件专利检索,专利查询,专利分析的服务。并且本 发明 提供了诊断面板,其包括用于检测指示病毒存在的至少一种 生物 标志的测试; 试剂 盒 ,其包括诊断面板、使用 说明书 、取得并将样品应用于面板的材料、以及生物标志 水 平及其含义的描述;检测 疾病 存在的方法,该方法通过取得个体样品,将样品应用于包括至少一种指示疾病的生物标志的诊断面板,检测至少一种生物标志的存在,将生物标志的水平与基线进行比较,并确定个体是否患有疾病;确定疾病阶段、监测疾病 治疗 进展、确定病毒抑制或反弹以及检测潜伏病毒的方法。,下面是代谢物组学和病毒诊断套件专利的具体信息内容。
1.一种诊断面板,所述诊断面板包含用于检测指示病毒存在的至少一种生物标志的测试。
2.如权利要求1所述的诊断面板,其中所述至少一种生物标志是选自下组的代谢物,该组由以下组成:1,3-尿酸二甲酯、左旋葡聚糖、1-甲基烟酰胺、代谢物1、2-羟基异丁酸酯、2-氧化戊二酸酯、3-氨基异丁酸酯、3-羟基丁酸酯、3-羟基异戊酸酯、3-吲哚硫酸酯、4-羟基苯乙酸酯、4-羟基苯基乳酸、4-吡啶酸氧盐、乙酸盐、乙酰乙酸盐、丙酮、己二酸盐、丙氨酸、尿囊素、天冬酰胺、甜菜碱、肉毒碱、柠檬酸盐、肌肉素、肌酸酐、二甲胺、乙醇胺、甲酸盐、海藻糖、富马酸盐、葡萄糖、谷氨酰胺、甘氨酸、代谢物2、代谢物3、马尿酸盐、组氨酸、次黄嘌呤、异亮氨酸、乳酸盐、亮氨酸、赖氨酸、甘露醇、代谢物4、代谢物5、代谢物6、N,N-二甲基甘氨酸、O-乙酰肉毒碱、泛酸盐、丙二醇、焦谷氨酸盐、丙酮酸盐、喹啉酸酯、丝氨酸、琥珀酸盐、蔗糖、代谢物7、牛磺酸、苏氨酸、葫芦巴碱、三甲胺-N-氧化物、色氨酸、酪氨酸、尿嘧啶、尿素、缬氨酸、木糖、顺乌头酸、肌醇、反式乌头酸、1-甲基组氨酸、3-甲基组氨酸、抗坏血酸盐、苯乙酰谷氨酰胺、4-羟脯氨酸、葡糖酸盐、半乳糖、半乳糖醇、植物半乳糖、乳糖、苯基丙氨酸、脯氨酸甜菜碱、三甲胺、丁酸盐、丙酸盐、异丙醇、甘露糖、3-甲基黄嘌呤、乙醇、苯酸盐、谷氨酸盐、甘油、鸟苷、鸟嘌呤、黄嘌呤、尿酸、腺苷、肌苷、肌苷酸、CO2、H2O、N-氨基甲酰-β-丙氨酸、β-丙氨酸、氨、β-氨基异丁酸、腐胺、亚精胺、精胺、甲硫氨酸、S-腺苷甲硫氨酸、脱去羧基的S-腺苷甲硫氨酸、精氨酸、鸟氨酸、腐胺、N1-乙酰亚精胺、N1-乙酰精胺、elF5A(Lys)、elF5A(Dhp)、elF5A(Hpu)、N1N2-二乙酰精胺、3-氨基丙醛、3-乙酰氨基丙醛、丙烯醛、FDP-赖氨酸蛋白质、苏式-Ds-异柠檬酸盐、草酰-琥珀酸盐、2-氧代-戊二酸盐、草酰-乙酸盐、L-谷氨酸盐、2-羟基-戊二酸盐、乙酰基-CoA、顺乌头酸、D-异柠檬酸盐、α-酮戊二酸盐、琥珀酰基-CoA、苹果酸盐、(-)O-乙酰-肉毒碱、衣康酸盐、乙醇酸盐、乙醛酸盐、草酸盐、草酰基-CoA、甲酸基-CoA、葡萄糖6-磷酸盐(G6P)、果糖6-磷酸盐(F6P)、果糖1,6-磷酸氢盐(F1,
6BP)、甘油醛3-磷酸盐(GADP)、二羟基丙酮磷酸盐(DHAP)、1,3-双磷酸甘油酸(1,3BPG)、3-磷酸甘油酸(3PG)、2-磷酸甘油酸(2PG)、磷酸烯醇丙酮酸(PEP)、D-葡萄糖、D-葡糖酸-1,5-内酯、D-葡糖酸盐、α-D-甘露糖6-P、D-甘露糖、D-果糖、D-山梨糖醇、甘油酮-P、sn-甘油-3P、D-甘油醛、1,2丙烷-二醇、2-羟基丙醛、3-P-丝氨酸、3-P-羟基丙酮酸盐、D-甘油酸盐、羟基丙酮酸盐、L-丙氨酸、L-丙氨酰基-tRNA、L-谷氨酸盐、2-氧化戊二酸酯、L-乳酸盐、D-乳酸盐、三磷酸腺苷(ATP)、二磷酸腺苷(ADP)、H+、琥珀酸盐、O2、NADH、NAD+、NADP+、NADPH、6-磷酸葡糖酸内酯、6-磷酸葡糖酸盐、核酮糖-5-磷酸盐、核糖-5-磷酸盐、木酮糖-5-磷酸盐、甘油醛3-磷酸盐、景天庚酮糖7-磷酸盐、果糖6-磷酸盐、赤藓糖4-磷酸盐、木酮糖5-磷酸盐、D-核酮糖、D-核糖醇、D-核糖、L-核酮糖、景天庚酮糖1,7P2、3-氧代-6-P-己酮糖、L-鸟氨酸、氨甲酰磷酸、L-瓜氨酸、精氨琥珀酸、L-精氨酸、L-天冬氨酸盐、单磷酸腺苷(AMP)、焦磷酸盐、
2
反式-Δ -烯酰基-CoA、L-β-羟烷基CoA、β-酮乙基CoA、FADH2、酰基-CoA、丙酰基-CoA、肌苷一磷酸(IMP)、黄苷一磷酸(XMP)、鸟苷一磷酸(GMP)、黄苷、腺苷酸琥珀酸、尿苷、尿苷一磷酸(UMP)、胸苷、胸腺嘧啶、脱氧核糖-1-磷酸盐、脱氧胸苷一磷酸(dTMP)、脱氧胞苷、脱氧胞苷一磷酸(dCMP)、棕榈酸视黄酯、棕榈酸盐、棕榈基-CoA、异维A酸酯、β-葡糖苷酸、视黄醛、β-胡萝卜素、视黄酸、骨化二醇、25-羟基麦角钙化醇、骨化三醇、甲基钴胺素、5’-脱氧腺苷钴胺素、α-CECH、NH4+、α-酮戊二酸盐、草酰乙酸盐、谷氨酸盐γ-半醛、Δ1-吡咯啉-5-羧酸盐、瓜氨酸、NH3、N5,N10-亚甲基THF、3-磷酸甘油酸盐、α-酮丁酸盐、α-氨基-β-酮丁酸盐、氨基丙酮、半胱亚磺酸、β-亚磺酰基丙酮酸盐、亚硫酸氢盐、亚硫酸盐、硫酸盐、谷胱甘肽、亚牛磺酸、腺苷5’-磷酰硫酸、3’-磷酸腺苷5’-磷酰硫酸、同型半胱氨酸、α-酮-β-戊酸甲酯、α-酮异己酸、α-酮异戊酸酯、α-甲基丁酰基-CoA、甲基巴豆酰基-CoA、3-甲基-3-羟基丁酸酰基-CoA、2-甲基乙酰乙酰基-CoA、异戊酰基-CoA、3-甲基巴豆酰基-CoA、3-甲基戊烯二酰-CoA、
3-羟基-3-甲基戊二酰-CoA、乙酰乙酸盐、异丁酰基CoA、甲基丙烯基-CoA、3-羟基异丁酰基-CoA、甲基丙二酸单醛、p-羟基苯基丙酮酸盐、尿黑酸盐、4-马来酰乙酰乙酸盐、4-延胡索酰乙酰乙酸盐、富马酸盐、3-羟基三甲基赖氨酸、4-N-三甲氨基丁醛、γ-丁酰甜菜碱、尿刊酸
5
酯、4-咪唑啉酮-5-丙酸盐、N-亚胺代甲基-L-谷氨酸盐、N-亚胺甲基-四氢叶酸盐、组胺、N-甲酸基-犬尿素、犬尿素、犬尿胺酸、3-羟基犬尿素、邻氨基苯甲酸盐、3-羟基邻氨基苯甲酸盐、戊二酰基-CoA、乙酰乙酰基-CoA及其组合。
3.如权利要求1所述的诊断面板,其中所述病毒选自下组,该组由以下组成:人类免疫缺陷病毒(HIV)、单纯疱疹病毒(HSV-1和HSV-2)、人类T淋巴细胞病毒(HTLV)、约翰坎宁安病毒(JC病毒)、水泡性口炎病毒(VSV)、丙型肝炎病毒(HCV)、乙型肝炎病毒(HBV)、寨卡病毒、登革热病毒、基孔肯亚病毒、埃博拉病毒、腺相关病毒、爱知病毒、澳洲蝙蝠狂犬病病毒、BK多瘤病毒、版纳病毒、巴马森林病毒、布尼奥罗病毒、拉克罗斯布尼亚病毒(Bunyavirus La Crosse)、北美野兔布尼亚病毒、猕猴疱疹病毒、金迪普拉病毒、Cosavirus A、牛痘病毒、柯萨奇病毒、克里米亚-刚果出血热病毒、多里病毒、道格比病毒、杜文哈格病毒、东部马脑炎病毒、埃可病毒、脑心肌炎病毒、艾巴氏病毒、欧洲蝙蝠狂犬病毒、庚型肝炎病毒、汉坦病毒、亨德拉病毒、甲型肝炎病毒、戊型肝炎病毒、丁型肝炎病毒、马痘病毒、人类腺病毒、人星状病毒、人冠状病毒、人巨细胞病毒、人肠道病毒68、人肠道病毒70、人类疱疹病毒6、人类疱疹病毒7、人类疱疹病毒8、人乳头瘤病毒(HPV)1、HPV 2、HPV 16、HPV 18、人副流感病毒、人类细小病毒B19、人类呼吸道合胞病毒、人鼻病毒、人类严重急性呼吸系统综合症(SARS)冠状病毒、人泡沫反转录病毒、人环曲病毒、甲型流感病毒、乙型流感病毒、丙型流感病毒、伊斯法罕病毒、JC多瘤病毒、日本脑炎病毒、呼宁砂粒样病毒、KI多瘤病毒、昆津病毒、拉哥斯蝙蝠病毒、维多利亚湖马尔堡病毒、兰加特病毒、拉沙病毒、洛兹达雷病毒、跳跃病病毒、淋巴细胞性脉络丛脑膜炎病毒、马丘波病毒、马雅罗病毒、中东呼吸综合征(MERS)冠状病毒、麻疹病毒、孟戈脑心肌炎病毒、默克尔细胞多瘤病毒、莫科拉病毒、传染性软疣病毒、猴痘病毒、腮腺炎病毒、墨累山谷脑炎病毒、纽约病毒、尼帕病毒、诺沃克病毒、阿尼昂尼昂病毒、Orf病毒、奥罗普切病毒、皮秦德病毒、脊髓灰质炎病毒、庞塔托鲁静脉病毒、普马拉病毒、狂犬病病毒、裂谷热病毒、罗莎病毒A、罗斯河病毒、轮状病毒A、轮状病毒B、轮状病毒C、风疹病毒、鹭山病毒、萨利病毒A、白蛉热西西里病毒、扎幌病毒、塞姆利基森林病毒、汉城病毒、猴泡沫病毒、猴病毒5、辛德毕斯病毒、南汉普顿病毒、圣路易斯脑炎病毒、蜱传播的玻瓦桑病毒、细环病毒、托斯卡纳病毒、Ulukuniemi病毒、牛痘病毒、水痘带状疱疹病毒、天花病毒、委内瑞拉马脑炎病毒、水泡性口炎病毒、西部马脑炎病毒、WU多瘤病毒、西尼罗病毒、雅巴猴肿瘤病毒、雅巴样疾病病毒和黄热病病毒。
4.如权利要求1所述的诊断面板,其中所述面板包括扁平微孔板的支撑结构。
5.如权利要求1所述的诊断面板,其中所述面板被封装在壳体中。
6.如权利要求1所述的诊断面板,其中所述面板进一步包括感测所述至少一种生物标志的浓度的传感器。
7.一种试剂盒,所述试剂盒包含诊断面板、使用说明书、取得并将样品应用于所述面板的材料、以及生物标志水平及其含义的描述,所述诊断面板包括用于检测指示病毒存在的至少一种生物标志的测试。
8.如权利要求7所述的试剂盒,其中所述至少一种生物标志是选自下组的代谢物,该组由以下组成:1,3-尿酸二甲酯、左旋葡聚糖、1-甲基烟酰胺、代谢物1、2-羟基异丁酸酯、2-氧化戊二酸酯、3-氨基异丁酸酯、3-羟基丁酸酯、3-羟基异戊酸酯、3-吲哚硫酸酯、4-羟基苯乙酸酯、4-羟基苯基乳酸、4-吡啶酸氧盐、乙酸盐、乙酰乙酸盐、丙酮、己二酸盐、丙氨酸、尿囊素、天冬酰胺、甜菜碱、肉毒碱、柠檬酸盐、肌肉素、肌酸酐、二甲胺、乙醇胺、甲酸盐、海藻糖、富马酸盐、葡萄糖、谷氨酰胺、甘氨酸、代谢物2、代谢物3、马尿酸盐、组氨酸、次黄嘌呤、异亮氨酸、乳酸盐、亮氨酸、赖氨酸、甘露醇、代谢物4、代谢物5、代谢物6、N,N-二甲基甘氨酸、O-乙酰肉毒碱、泛酸盐、丙二醇、焦谷氨酸盐、丙酮酸盐、喹啉酸酯、丝氨酸、琥珀酸盐、蔗糖、代谢物7、牛磺酸、苏氨酸、葫芦巴碱、三甲胺-N-氧化物、色氨酸、酪氨酸、尿嘧啶、尿素、缬氨酸、木糖、顺乌头酸、肌醇、反式乌头酸、1-甲基组氨酸、3-甲基组氨酸、抗坏血酸盐、苯乙酰谷氨酰胺、4-羟脯氨酸、葡糖酸盐、半乳糖、半乳糖醇、植物半乳糖、乳糖、苯基丙氨酸、脯氨酸甜菜碱、三甲胺、丁酸盐、丙酸盐、异丙醇、甘露糖、3-甲基黄嘌呤、乙醇、苯酸盐、谷氨酸盐、甘油、鸟苷、鸟嘌呤、黄嘌呤、尿酸、腺苷、肌苷、肌苷酸、CO2、H2O、N-氨基甲酰-β-丙氨酸、β-丙氨酸、氨、β-氨基异丁酸、腐胺、亚精胺、精胺、甲硫氨酸、S-腺苷甲硫氨酸、脱去羧基的S-腺苷甲硫氨酸、精氨酸、鸟氨酸、腐胺、N1-乙酰亚精胺、N1-乙酰精胺、elF5A(Lys)、elF5A(Dhp)、elF5A(Hpu)、N1N2-二乙酰精胺、3-氨基丙醛、3-乙酰氨基丙醛、丙烯醛、FDP-赖氨酸蛋白质、苏式-Ds-异柠檬酸盐、草酰-琥珀酸盐、2-氧代-戊二酸盐、草酰-乙酸盐、L-谷氨酸盐、2-羟基-戊二酸盐、乙酰基-CoA、顺乌头酸、D-异柠檬酸盐、α-酮戊二酸盐、琥珀酰基-CoA、苹果酸盐、(-)O-乙酰-肉毒碱、衣康酸盐、乙醇酸盐、乙醛酸盐、草酸盐、草酰基-CoA、甲酸基-CoA、葡萄糖6-磷酸盐(G6P)、果糖6-磷酸盐(F6P)、果糖1,6-磷酸氢盐(F1,6BP)、甘油醛3-磷酸盐(GADP)、二羟基丙酮磷酸盐(DHAP)、1,3-双磷酸甘油酸(1,3BPG)、3-磷酸甘油酸(3PG)、2-磷酸甘油酸(2PG)、磷酸烯醇丙酮酸(PEP)、D-葡萄糖、D-葡糖酸-1,5-内酯、D-葡糖酸盐、α-D-甘露糖6-P、D-甘露糖、D-果糖、D-山梨糖醇、甘油酮-P、sn-甘油-3P、D-甘油醛、1,
2丙烷-二醇、2-羟基丙醛、3-P-丝氨酸、3-P-羟基丙酮酸盐、D-甘油酸盐、羟基丙酮酸盐、L-丙氨酸、L-丙氨酰基-tRNA、L-谷氨酸盐、2-氧化戊二酸酯、L-乳酸盐、D-乳酸盐、三磷酸腺苷(ATP)、二磷酸腺苷(ADP)、H+、琥珀酸盐、O2、NADH、NAD+、NADP+、NADPH、6-磷酸葡糖酸内酯、
6-磷酸葡糖酸盐、核酮糖-5-磷酸盐、核糖-5-磷酸盐、木酮糖-5-磷酸盐、甘油醛3-磷酸盐、景天庚酮糖7-磷酸盐、果糖6-磷酸盐、赤藓糖4-磷酸盐、木酮糖5-磷酸盐、D-核酮糖、D-核糖醇、D-核糖、L-核酮糖、景天庚酮糖1,7P2、3-氧代-6-P-己酮糖、L-鸟氨酸、氨甲酰磷酸、L-瓜氨酸、精氨琥珀酸、L-精氨酸、L-天冬氨酸盐、单磷酸腺苷(AMP)、焦磷酸盐、反式-Δ2-烯酰基-CoA、L-β-羟烷基CoA、β-酮乙基CoA、FADH2、酰基-CoA、丙酰基-CoA、肌苷一磷酸(IMP)、黄苷一磷酸(XMP)、鸟苷一磷酸(GMP)、黄苷、腺苷酸琥珀酸、尿苷、尿苷一磷酸(UMP)、胸苷、胸腺嘧啶、脱氧核糖-1-磷酸盐、脱氧胸苷一磷酸(dTMP)、脱氧胞苷、脱氧胞苷一磷酸(dCMP)、棕榈酸视黄酯、棕榈酸盐、棕榈基-CoA、异维A酸酯、β-葡糖苷酸、视黄醛、β-胡萝卜素、视黄酸、骨化二醇、25-羟基麦角钙化醇、骨化三醇、甲基钴胺素、5’-脱氧腺苷钴胺素、α-CECH、NH4+、α-酮戊二酸盐、草酰乙酸盐、谷氨酸盐γ-半醛、Δ1-吡咯啉-5-羧酸盐、瓜氨酸、NH3、N5,N10-亚甲基THF、3-磷酸甘油酸盐、α-酮丁酸盐、α-氨基-β-酮丁酸盐、氨基丙酮、半胱亚磺酸、β-亚磺酰基丙酮酸盐、亚硫酸氢盐、亚硫酸盐、硫酸盐、谷胱甘肽、亚牛磺酸、腺苷5’-磷酰硫酸、3’-磷酸腺苷5’-磷酰硫酸、同型半胱氨酸、α-酮-β-戊酸甲酯、α-酮异己酸、α-酮异戊酸酯、α-甲基丁酰基-CoA、甲基巴豆酰基-CoA、3-甲基-3-羟基丁酸酰基-CoA、2-甲基乙酰乙酰基-CoA、异戊酰基-CoA、3-甲基巴豆酰基-CoA、3-甲基戊烯二酰-CoA、3-羟基-3-甲基戊二酰-CoA、乙酰乙酸盐、异丁酰基CoA、甲基丙烯基-CoA、3-羟基异丁酰基-CoA、甲基丙二酸单醛、p-羟基苯基丙酮酸盐、尿黑酸盐、4-马来酰乙酰乙酸盐、4-延胡索酰乙酰乙酸盐、富马酸盐、3-羟基三甲基赖氨酸、4-N-三甲氨基丁醛、γ-丁酰甜菜碱、尿刊酸酯、4-咪唑啉酮-5-丙酸盐、N-亚胺代甲基-L-谷氨酸盐、N5-亚胺甲基-四氢叶酸盐、组胺、N-甲酸基-犬尿素、犬尿素、犬尿胺酸、3-羟基犬尿素、邻氨基苯甲酸盐、3-羟基邻氨基苯甲酸盐、戊二酰基-CoA、乙酰乙酰基-CoA及其组合。
9.一种检测疾病存在的方法,所述方法包括以下步骤:
取得个体样本;
将所述样品应用于包括至少一种指示疾病的生物标志的诊断面板;
检测至少一种生物标志的存在;
将所述生物标志的水平与基线进行比较;以及
确定所述个体是否患有疾病。
10.如权利要求9所述的方法,其中所述至少一种生物标志是选自下组的代谢物,该组由以下组成:1,3-尿酸二甲酯、左旋葡聚糖、1-甲基烟酰胺、代谢物1、2-羟基异丁酸酯、2-氧化戊二酸酯、3-氨基异丁酸酯、3-羟基丁酸酯、3-羟基异戊酸酯、3-吲哚硫酸酯、4-羟基苯乙酸酯、4-羟基苯基乳酸、4-吡啶酸氧盐、乙酸盐、乙酰乙酸盐、丙酮、己二酸盐、丙氨酸、尿囊素、天冬酰胺、甜菜碱、肉毒碱、柠檬酸盐、肌肉素、肌酸酐、二甲胺、乙醇胺、甲酸盐、海藻糖、富马酸盐、葡萄糖、谷氨酰胺、甘氨酸、代谢物2、代谢物3、马尿酸盐、组氨酸、次黄嘌呤、异亮氨酸、乳酸盐、亮氨酸、赖氨酸、甘露醇、代谢物4、代谢物5、代谢物6、N,N-二甲基甘氨酸、O-乙酰肉毒碱、泛酸盐、丙二醇、焦谷氨酸盐、丙酮酸盐、喹啉酸酯、丝氨酸、琥珀酸盐、蔗糖、代谢物7、牛磺酸、苏氨酸、葫芦巴碱、三甲胺-N-氧化物、色氨酸、酪氨酸、尿嘧啶、尿素、缬氨酸、木糖、顺乌头酸、肌醇、反式乌头酸、1-甲基组氨酸、3-甲基组氨酸、抗坏血酸盐、苯乙酰谷氨酰胺、4-羟脯氨酸、葡糖酸盐、半乳糖、半乳糖醇、植物半乳糖、乳糖、苯基丙氨酸、脯氨酸甜菜碱、三甲胺、丁酸盐、丙酸盐、异丙醇、甘露糖、3-甲基黄嘌呤、乙醇、苯酸盐、谷氨酸盐、甘油、鸟苷、鸟嘌呤、黄嘌呤、尿酸、腺苷、肌苷、肌苷酸、CO2、H2O、N-氨基甲酰-β-丙氨酸、β-丙氨酸、氨、β-氨基异丁酸、腐胺、亚精胺、精胺、甲硫氨酸、S-腺苷甲硫氨酸、脱去羧基的S-腺苷甲硫氨酸、精氨酸、鸟氨酸、腐胺、N1-乙酰亚精胺、N1-乙酰精胺、elF5A(Lys)、elF5A(Dhp)、elF5A(Hpu)、N1N2-二乙酰精胺、3-氨基丙醛、3-乙酰氨基丙醛、丙烯醛、FDP-赖氨酸蛋白质、苏式-Ds-异柠檬酸盐、草酰-琥珀酸盐、2-氧代-戊二酸盐、草酰-乙酸盐、L-谷氨酸盐、2-羟基-戊二酸盐、乙酰基-CoA、顺乌头酸、D-异柠檬酸盐、α-酮戊二酸盐、琥珀酰基-CoA、苹果酸盐、(-)O-乙酰-肉毒碱、衣康酸盐、乙醇酸盐、乙醛酸盐、草酸盐、草酰基-CoA、甲酸基-CoA、葡萄糖6-磷酸盐(G6P)、果糖6-磷酸盐(F6P)、果糖1,6-磷酸氢盐(F1,6BP)、甘油醛3-磷酸盐(GADP)、二羟基丙酮磷酸盐(DHAP)、1,3-双磷酸甘油酸(1,3BPG)、3-磷酸甘油酸(3PG)、2-磷酸甘油酸(2PG)、磷酸烯醇丙酮酸(PEP)、D-葡萄糖、D-葡糖酸-1,5-内酯、D-葡糖酸盐、α-D-甘露糖6-P、D-甘露糖、D-果糖、D-山梨糖醇、甘油酮-P、sn-甘油-3P、D-甘油醛、1,
2丙烷-二醇、2-羟基丙醛、3-P-丝氨酸、3-P-羟基丙酮酸盐、D-甘油酸盐、羟基丙酮酸盐、L-丙氨酸、L-丙氨酰基-tRNA、L-谷氨酸盐、2-氧化戊二酸酯、L-乳酸盐、D-乳酸盐、三磷酸腺苷(ATP)、二磷酸腺苷(ADP)、H+、琥珀酸盐、O2、NADH、NAD+、NADP+、NADPH、6-磷酸葡糖酸内酯、
6-磷酸葡糖酸盐、核酮糖-5-磷酸盐、核糖-5-磷酸盐、木酮糖-5-磷酸盐、甘油醛3-磷酸盐、景天庚酮糖7-磷酸盐、果糖6-磷酸盐、赤藓糖4-磷酸盐、木酮糖5-磷酸盐、D-核酮糖、D-核糖醇、D-核糖、L-核酮糖、景天庚酮糖1,7P2、3-氧代-6-P-己酮糖、L-鸟氨酸、氨甲酰磷酸、L-瓜氨酸、精氨琥珀酸、L-精氨酸、L-天冬氨酸盐、单磷酸腺苷(AMP)、焦磷酸盐、反式-Δ2-烯酰基-CoA、L-β-羟烷基CoA、β-酮乙基CoA、FADH2、酰基-CoA、丙酰基-CoA、肌苷一磷酸(IMP)、黄苷一磷酸(XMP)、鸟苷一磷酸(GMP)、黄苷、腺苷酸琥珀酸、尿苷、尿苷一磷酸(UMP)、胸苷、胸腺嘧啶、脱氧核糖-1-磷酸盐、脱氧胸苷一磷酸(dTMP)、脱氧胞苷、脱氧胞苷一磷酸(dCMP)、棕榈酸视黄酯、棕榈酸盐、棕榈基-CoA、异维A酸酯、β-葡糖苷酸、视黄醛、β-胡萝卜素、视黄酸、骨化二醇、25-羟基麦角钙化醇、骨化三醇、甲基钴胺素、5’-脱氧腺苷钴胺素、α-CECH、NH4+、α-酮戊二酸盐、草酰乙酸盐、谷氨酸盐γ-半醛、Δ1-吡咯啉-5-羧酸盐、瓜氨酸、NH3、N5,N10-亚甲基THF、3-磷酸甘油酸盐、α-酮丁酸盐、α-氨基-β-酮丁酸盐、氨基丙酮、半胱亚磺酸、β-亚磺酰基丙酮酸盐、亚硫酸氢盐、亚硫酸盐、硫酸盐、谷胱甘肽、亚牛磺酸、腺苷5’-磷酰硫酸、3’-磷酸腺苷5’-磷酰硫酸、同型半胱氨酸、α-酮-β-戊酸甲酯、α-酮异己酸、α-酮异戊酸酯、α-甲基丁酰基-CoA、甲基巴豆酰基-CoA、3-甲基-3-羟基丁酸酰基-CoA、2-甲基乙酰乙酰基-CoA、异戊酰基-CoA、3-甲基巴豆酰基-CoA、3-甲基戊烯二酰-CoA、3-羟基-3-甲基戊二酰-CoA、乙酰乙酸盐、异丁酰基CoA、甲基丙烯基-CoA、3-羟基异丁酰基-CoA、甲基丙二酸单醛、p-羟基苯基丙酮酸盐、尿黑酸盐、4-马来酰乙酰乙酸盐、4-延胡索酰乙酰乙酸盐、富马酸盐、3-羟基三甲基赖氨酸、4-N-三甲氨基丁醛、γ-丁酰甜菜碱、尿刊酸酯、4-咪唑啉酮-5-丙酸盐、N-亚胺代甲基-L-谷氨酸盐、N5-亚胺甲基-四氢叶酸盐、组胺、N-甲酸基-犬尿素、犬尿素、犬尿胺酸、3-羟基犬尿素、邻氨基苯甲酸盐、3-羟基邻氨基苯甲酸盐、戊二酰基-CoA、乙酰乙酰基-CoA及其组合。
11.如权利要求9所述的方法,其中所述疾病是选自下组的病毒,该组由以下组成:人类免疫缺陷病毒(HIV)、单纯疱疹病毒(HSV-1和HSV-2)、人类T淋巴细胞病毒(HTLV)、约翰坎宁安病毒(JC病毒)、水泡性口炎病毒(VSV)、丙型肝炎病毒(HCV)、乙型肝炎病毒(HBV)、寨卡病毒、登革热病毒、基孔肯亚病毒、埃博拉病毒、腺相关病毒、爱知病毒、澳洲蝙蝠狂犬病病毒、BK多瘤病毒、版纳病毒、巴马森林病毒、布尼奥罗病毒、拉克罗斯布尼亚病毒、北美野兔布尼亚病毒、猕猴疱疹病毒、金迪普拉病毒、Cosavirus A、牛痘病毒、柯萨奇病毒、克里米亚-刚果出血热病毒、多里病毒、道格比病毒、杜文哈格病毒、东部马脑炎病毒、埃可病毒、脑心肌炎病毒、艾巴氏病毒、欧洲蝙蝠狂犬病毒、庚型肝炎病毒、汉坦病毒、亨德拉病毒、甲型肝炎病毒、戊型肝炎病毒、丁型肝炎病毒、马痘病毒、人类腺病毒、人星状病毒、人冠状病毒、人巨细胞病毒、人肠道病毒68、人肠道病毒70、人类疱疹病毒6、人类疱疹病毒7、人类疱疹病毒8、人乳头瘤病毒(HPV)1、HPV 2、HPV 16、HPV 18、人副流感病毒、人类细小病毒B19、人类呼吸道合胞病毒、人鼻病毒、人类严重急性呼吸系统综合症(SARS)冠状病毒、人泡沫反转录病毒、人环曲病毒、甲型流感病毒、乙型流感病毒、丙型流感病毒、伊斯法罕病毒、JC多瘤病毒、日本脑炎病毒、呼宁砂粒样病毒、KI多瘤病毒、昆津病毒、拉哥斯蝙蝠病毒、维多利亚湖马尔堡病毒、兰加特病毒、拉沙病毒、洛兹达雷病毒、跳跃病病毒、淋巴细胞性脉络丛脑膜炎病毒、马丘波病毒、马雅罗病毒、中东呼吸综合征(MERS)冠状病毒、麻疹病毒、孟戈脑心肌炎病毒、默克尔细胞多瘤病毒、莫科拉病毒、传染性软疣病毒、猴痘病毒、腮腺炎病毒、墨累山谷脑炎病毒、纽约病毒、尼帕病毒、诺沃克病毒、阿尼昂尼昂病毒、Orf病毒、奥罗普切病毒、皮秦德病毒、脊髓灰质炎病毒、庞塔托鲁静脉病毒、普马拉病毒、狂犬病病毒、裂谷热病毒、罗莎病毒A、罗斯河病毒、轮状病毒A、轮状病毒B、轮状病毒C、风疹病毒、鹭山病毒、萨利病毒A、白蛉热西西里病毒、扎幌病毒、塞姆利基森林病毒、汉城病毒、猴泡沫病毒、猴病毒5、辛德毕斯病毒、南汉普顿病毒、圣路易斯脑炎病毒、蜱传播的玻瓦桑病毒、细环病毒、托斯卡纳病毒、Ulukuniemi病毒、牛痘病毒、水痘带状疱疹病毒、天花病毒、委内瑞拉马脑炎病毒、水泡性口炎病毒、西部马脑炎病毒、WU多瘤病毒、西尼罗病毒、雅巴猴肿瘤病毒、雅巴样疾病病毒和黄热病病毒。
12.如权利要求9所述的方法,其中所述检测步骤包括使用选自下组的方法,该组由以下组成:液相色谱法、气相色谱法、液相色谱法-质谱分析法、气相色谱法-质谱分析法、高效液相色谱法-质谱分析法、毛细管电泳法-质谱分析法、核磁共振谱法(NMR)、拉曼光谱学和红外光谱法。
13.如权利要求9所述的方法,其中所述样品选自下组,该组由以下组成:血液、血浆、尿液、唾液、眼泪、组织和脑脊髓液(CSF)。
14.一种确定疾病阶段的方法,所述方法包括以下步骤:
取得个体样本;
将所述样品应用于包括至少一种指示疾病的生物标志的诊断面板;
检测至少一种生物标志的存在;
将所述生物标志的水平与已知的阶段水平进行比较;以及
确定所述个体疾病的阶段。
15.如权利要求14所述的方法,其中所述至少一种生物标志是选自下组的代谢物,该组由以下组成:1,3-尿酸二甲酯、左旋葡聚糖、1-甲基烟酰胺、代谢物1、2-羟基异丁酸酯、2-氧化戊二酸酯、3-氨基异丁酸酯、3-羟基丁酸酯、3-羟基异戊酸酯、3-吲哚硫酸酯、4-羟基苯乙酸酯、4-羟基苯基乳酸、4-吡啶酸氧盐、乙酸盐、乙酰乙酸盐、丙酮、己二酸盐、丙氨酸、尿囊素、天冬酰胺、甜菜碱、肉毒碱、柠檬酸盐、肌肉素、肌酸酐、二甲胺、乙醇胺、甲酸盐、海藻糖、富马酸盐、葡萄糖、谷氨酰胺、甘氨酸、代谢物2、代谢物3、马尿酸盐、组氨酸、次黄嘌呤、异亮氨酸、乳酸盐、亮氨酸、赖氨酸、甘露醇、代谢物4、代谢物5、代谢物6、N,N-二甲基甘氨酸、O-乙酰肉毒碱、泛酸盐、丙二醇、焦谷氨酸盐、丙酮酸盐、喹啉酸酯、丝氨酸、琥珀酸盐、蔗糖、代谢物7、牛磺酸、苏氨酸、葫芦巴碱、三甲胺-N-氧化物、色氨酸、酪氨酸、尿嘧啶、尿素、缬氨酸、木糖、顺乌头酸、肌醇、反式乌头酸、1-甲基组氨酸、3-甲基组氨酸、抗坏血酸盐、苯乙酰谷氨酰胺、4-羟脯氨酸、葡糖酸盐、半乳糖、半乳糖醇、植物半乳糖、乳糖、苯基丙氨酸、脯氨酸甜菜碱、三甲胺、丁酸盐、丙酸盐、异丙醇、甘露糖、3-甲基黄嘌呤、乙醇、苯酸盐、谷氨酸盐、甘油、鸟苷、鸟嘌呤、黄嘌呤、尿酸、腺苷、肌苷、肌苷酸、CO2、H2O、N-氨基甲酰-β-丙氨酸、β-丙氨酸、氨、β-氨基异丁酸、腐胺、亚精胺、精胺、甲硫氨酸、S-腺苷甲硫氨酸、脱去羧基的S-腺苷甲硫氨酸、精氨酸、鸟氨酸、腐胺、N1-乙酰亚精胺、N1-乙酰精胺、elF5A(Lys)、elF5A(Dhp)、elF5A(Hpu)、N1N2-二乙酰精胺、3-氨基丙醛、3-乙酰氨基丙醛、丙烯醛、FDP-赖氨酸蛋白质、苏式-Ds-异柠檬酸盐、草酰-琥珀酸盐、2-氧代-戊二酸盐、草酰-乙酸盐、L-谷氨酸盐、2-羟基-戊二酸盐、乙酰基-CoA、顺乌头酸、D-异柠檬酸盐、α-酮戊二酸盐、琥珀酰基-CoA、苹果酸盐、(-)O-乙酰-肉毒碱、衣康酸盐、乙醇酸盐、乙醛酸盐、草酸盐、草酰基-CoA、甲酸基-CoA、葡萄糖6-磷酸盐(G6P)、果糖6-磷酸盐(F6P)、果糖1,6-磷酸氢盐(F1,6BP)、甘油醛3-磷酸盐(GADP)、二羟基丙酮磷酸盐(DHAP)、1,3-双磷酸甘油酸(1,3BPG)、3-磷酸甘油酸(3PG)、2-磷酸甘油酸(2PG)、磷酸烯醇丙酮酸(PEP)、D-葡萄糖、D-葡糖酸-1,5-内酯、D-葡糖酸盐、α-D-甘露糖6-P、D-甘露糖、D-果糖、D-山梨糖醇、甘油酮-P、sn-甘油-3P、D-甘油醛、1,
2丙烷-二醇、2-羟基丙醛、3-P-丝氨酸、3-P-羟基丙酮酸盐、D-甘油酸盐、羟基丙酮酸盐、L-丙氨酸、L-丙氨酰基-tRNA、L-谷氨酸盐、2-氧化戊二酸酯、L-乳酸盐、D-乳酸盐、三磷酸腺苷(ATP)、二磷酸腺苷(ADP)、H+、琥珀酸盐、O2、NADH、NAD+、NADP+、NADPH、6-磷酸葡糖酸内酯、
6-磷酸葡糖酸盐、核酮糖-5-磷酸盐、核糖-5-磷酸盐、木酮糖-5-磷酸盐、甘油醛3-磷酸盐、景天庚酮糖7-磷酸盐、果糖6-磷酸盐、赤藓糖4-磷酸盐、木酮糖5-磷酸盐、D-核酮糖、D-核糖醇、D-核糖、L-核酮糖、景天庚酮糖1,7P2、3-氧代-6-P-己酮糖、L-鸟氨酸、氨甲酰磷酸、L-瓜氨酸、精氨琥珀酸、L-精氨酸、L-天冬氨酸盐、单磷酸腺苷(AMP)、焦磷酸盐、反式-Δ2-烯酰基-CoA、L-β-羟烷基CoA、β-酮乙基CoA、FADH2、酰基-CoA、丙酰基-CoA、肌苷一磷酸(IMP)、黄苷一磷酸(XMP)、鸟苷一磷酸(GMP)、黄苷、腺苷酸琥珀酸、尿苷、尿苷一磷酸(UMP)、胸苷、胸腺嘧啶、脱氧核糖-1-磷酸盐、脱氧胸苷一磷酸(dTMP)、脱氧胞苷、脱氧胞苷一磷酸(dCMP)、棕榈酸视黄酯、棕榈酸盐、棕榈基-CoA、异维A酸酯、β-葡糖苷酸、视黄醛、β-胡萝卜素、视黄酸、骨化二醇、25-羟基麦角钙化醇、骨化三醇、甲基钴胺素、5’-脱氧腺苷钴胺素、α-CECH、NH4+、α-酮戊二酸盐、草酰乙酸盐、谷氨酸盐γ-半醛、Δ1-吡咯啉-5-羧酸盐、瓜氨酸、NH3、N5,N10-亚甲基THF、3-磷酸甘油酸盐、α-酮丁酸盐、α-氨基-β-酮丁酸盐、氨基丙酮、半胱亚磺酸、β-亚磺酰基丙酮酸盐、亚硫酸氢盐、亚硫酸盐、硫酸盐、谷胱甘肽、亚牛磺酸、腺苷5’-磷酰硫酸、3’-磷酸腺苷5’-磷酰硫酸、同型半胱氨酸、α-酮-β-戊酸甲酯、α-酮异己酸、α-酮异戊酸酯、α-甲基丁酰基-CoA、甲基巴豆酰基-CoA、3-甲基-3-羟基丁酸酰基-CoA、2-甲基乙酰乙酰基-CoA、异戊酰基-CoA、3-甲基巴豆酰基-CoA、3-甲基戊烯二酰-CoA、3-羟基-3-甲基戊二酰-CoA、乙酰乙酸盐、异丁酰基CoA、甲基丙烯基-CoA、3-羟基异丁酰基-CoA、甲基丙二酸单醛、p-羟基苯基丙酮酸盐、尿黑酸盐、4-马来酰乙酰乙酸盐、4-延胡索酰乙酰乙酸盐、富马酸盐、3-羟基三甲基赖氨酸、4-N-三甲氨基丁醛、γ-丁酰甜菜碱、尿刊酸酯、4-咪唑啉酮-5-丙酸盐、N-亚胺代甲基-L-谷氨酸盐、N5-亚胺甲基-四氢叶酸盐、组胺、N-甲酸基-犬尿素、犬尿素、犬尿胺酸、3-羟基犬尿素、邻氨基苯甲酸盐、3-羟基邻氨基苯甲酸盐、戊二酰基-CoA、乙酰乙酰基-CoA及其组合。
16.如权利要求14所述的方法,其中所述疾病是选自下组的病毒,该组由以下组成:人类免疫缺陷病毒(HIV)、单纯疱疹病毒(HSV-1和HSV-2)、人类T淋巴细胞病毒(HTLV)、约翰坎宁安病毒(JC病毒)、水泡性口炎病毒(VSV)、丙型肝炎病毒(HCV)、乙型肝炎病毒(HBV)、寨卡病毒、登革热病毒、基孔肯亚病毒、埃博拉病毒、腺相关病毒、爱知病毒、澳洲蝙蝠狂犬病病毒、BK多瘤病毒、版纳病毒、巴马森林病毒、布尼奥罗病毒、拉克罗斯布尼亚病毒、北美野兔布尼亚病毒、猕猴疱疹病毒、金迪普拉病毒、Cosavirus A、牛痘病毒、柯萨奇病毒、克里米亚-刚果出血热病毒、多里病毒、道格比病毒、杜文哈格病毒、东部马脑炎病毒、埃可病毒、脑心肌炎病毒、艾巴氏病毒、欧洲蝙蝠狂犬病毒、庚型肝炎病毒、汉坦病毒、亨德拉病毒、甲型肝炎病毒、戊型肝炎病毒、丁型肝炎病毒、马痘病毒、人类腺病毒、人星状病毒、人冠状病毒、人巨细胞病毒、人肠道病毒68、人肠道病毒70、人类疱疹病毒6、人类疱疹病毒7、人类疱疹病毒8、人乳头瘤病毒(HPV)1、HPV 2、HPV 16、HPV 18、人副流感病毒、人类细小病毒B19、人类呼吸道合胞病毒、人鼻病毒、人类严重急性呼吸系统综合症(SARS)冠状病毒、人泡沫反转录病毒、人环曲病毒、甲型流感病毒、乙型流感病毒、丙型流感病毒、伊斯法罕病毒、JC多瘤病毒、日本脑炎病毒、呼宁砂粒样病毒、KI多瘤病毒、昆津病毒、拉哥斯蝙蝠病毒、维多利亚湖马尔堡病毒、兰加特病毒、拉沙病毒、洛兹达雷病毒、跳跃病病毒、淋巴细胞性脉络丛脑膜炎病毒、马丘波病毒、马雅罗病毒、中东呼吸综合征(MERS)冠状病毒、麻疹病毒、孟戈脑心肌炎病毒、默克尔细胞多瘤病毒、莫科拉病毒、传染性软疣病毒、猴痘病毒、腮腺炎病毒、墨累山谷脑炎病毒、纽约病毒、尼帕病毒、诺沃克病毒、阿尼昂尼昂病毒、Orf病毒、奥罗普切病毒、皮秦德病毒、脊髓灰质炎病毒、庞塔托鲁静脉病毒、普马拉病毒、狂犬病病毒、裂谷热病毒、罗莎病毒A、罗斯河病毒、轮状病毒A、轮状病毒B、轮状病毒C、风疹病毒、鹭山病毒、萨利病毒A、白蛉热西西里病毒、扎幌病毒、塞姆利基森林病毒、汉城病毒、猴泡沫病毒、猴病毒5、辛德毕斯病毒、南汉普顿病毒、圣路易斯脑炎病毒、蜱传播的玻瓦桑病毒、细环病毒、托斯卡纳病毒、Ulukuniemi病毒、牛痘病毒、水痘带状疱疹病毒、天花病毒、委内瑞拉马脑炎病毒、水泡性口炎病毒、西部马脑炎病毒、WU多瘤病毒、西尼罗病毒、雅巴猴肿瘤病毒、雅巴样疾病病毒和黄热病病毒。
17.如权利要求14所述的方法,其中所述检测步骤包括使用选自下组的方法,该组由以下组成:液相色谱法、气相色谱法、液相色谱法-质谱分析法、气相色谱法-质谱分析法、高效液相色谱法-质谱分析法、毛细管电泳法-质谱分析法、核磁共振谱法(NMR)、拉曼光谱学和红外光谱法。
18.如权利要求14所述的方法,其中所述样品选自下组,该组由以下组成:血液、血浆、尿液、唾液、眼泪、组织和脑脊髓液(CSF)。
19.一种监测疾病治疗进展的方法,所述方法包括以下步骤:
取得个体样本;
将所述样品应用于包括至少一种指示疾病的生物标志的诊断面板;
检测至少一种生物标志的存在;
将所述生物标志的水平与基线进行比较;以及
确定所述治疗是否有效逆转或预防所述疾病。
20.如权利要求19所述的方法,其中所述至少一种生物标志是选自下组的代谢物,该组由以下组成:1,3-尿酸二甲酯、左旋葡聚糖、1-甲基烟酰胺、代谢物1、2-羟基异丁酸酯、2-氧化戊二酸酯、3-氨基异丁酸酯、3-羟基丁酸酯、3-羟基异戊酸酯、3-吲哚硫酸酯、4-羟基苯乙酸酯、4-羟基苯基乳酸、4-吡啶酸氧盐、乙酸盐、乙酰乙酸盐、丙酮、己二酸盐、丙氨酸、尿囊素、天冬酰胺、甜菜碱、肉毒碱、柠檬酸盐、肌肉素、肌酸酐、二甲胺、乙醇胺、甲酸盐、海藻糖、富马酸盐、葡萄糖、谷氨酰胺、甘氨酸、代谢物2、代谢物3、马尿酸盐、组氨酸、次黄嘌呤、异亮氨酸、乳酸盐、亮氨酸、赖氨酸、甘露醇、代谢物4、代谢物5、代谢物6、N,N-二甲基甘氨酸、O-乙酰肉毒碱、泛酸盐、丙二醇、焦谷氨酸盐、丙酮酸盐、喹啉酸酯、丝氨酸、琥珀酸盐、蔗糖、代谢物7、牛磺酸、苏氨酸、葫芦巴碱、三甲胺-N-氧化物、色氨酸、酪氨酸、尿嘧啶、尿素、缬氨酸、木糖、顺乌头酸、肌醇、反式乌头酸、1-甲基组氨酸、3-甲基组氨酸、抗坏血酸盐、苯乙酰谷氨酰胺、4-羟脯氨酸、葡糖酸盐、半乳糖、半乳糖醇、植物半乳糖、乳糖、苯基丙氨酸、脯氨酸甜菜碱、三甲胺、丁酸盐、丙酸盐、异丙醇、甘露糖、3-甲基黄嘌呤、乙醇、苯酸盐、谷氨酸盐、甘油、鸟苷、鸟嘌呤、黄嘌呤、尿酸、腺苷、肌苷、肌苷酸、CO2、H2O、N-氨基甲酰-β-丙氨酸、β-丙氨酸、氨、β-氨基异丁酸、腐胺、亚精胺、精胺、甲硫氨酸、S-腺苷甲硫氨酸、脱去羧基的S-腺苷甲硫氨酸、精氨酸、鸟氨酸、腐胺、N1-乙酰亚精胺、N1-乙酰精胺、elF5A(Lys)、elF5A(Dhp)、elF5A(Hpu)、N1N2-二乙酰精胺、3-氨基丙醛、3-乙酰氨基丙醛、丙烯醛、FDP-赖氨酸蛋白质、苏式-Ds-异柠檬酸盐、草酰-琥珀酸盐、2-氧代-戊二酸盐、草酰-乙酸盐、L-谷氨酸盐、2-羟基-戊二酸盐、乙酰基-CoA、顺乌头酸、D-异柠檬酸盐、α-酮戊二酸盐、琥珀酰基-CoA、苹果酸盐、(-)O-乙酰-肉毒碱、衣康酸盐、乙醇酸盐、乙醛酸盐、草酸盐、草酰基-CoA、甲酸基-CoA、葡萄糖6-磷酸盐(G6P)、果糖6-磷酸盐(F6P)、果糖1,6-磷酸氢盐(F1,6BP)、甘油醛3-磷酸盐(GADP)、二羟基丙酮磷酸盐(DHAP)、1,3-双磷酸甘油酸(1,3BPG)、3-磷酸甘油酸(3PG)、2-磷酸甘油酸(2PG)、磷酸烯醇丙酮酸(PEP)、D-葡萄糖、D-葡糖酸-1,5-内酯、D-葡糖酸盐、α-D-甘露糖6-P、D-甘露糖、D-果糖、D-山梨糖醇、甘油酮-P、sn-甘油-3P、D-甘油醛、1,
2丙烷-二醇、2-羟基丙醛、3-P-丝氨酸、3-P-羟基丙酮酸盐、D-甘油酸盐、羟基丙酮酸盐、L-丙氨酸、L-丙氨酰基-tRNA、L-谷氨酸盐、2-氧化戊二酸酯、L-乳酸盐、D-乳酸盐、三磷酸腺苷(ATP)、二磷酸腺苷(ADP)、H+、琥珀酸盐、O2、NADH、NAD+、NADP+、NADPH、6-磷酸葡糖酸内酯、
6-磷酸葡糖酸盐、核酮糖-5-磷酸盐、核糖-5-磷酸盐、木酮糖-5-磷酸盐、甘油醛3-磷酸盐、景天庚酮糖7-磷酸盐、果糖6-磷酸盐、赤藓糖4-磷酸盐、木酮糖5-磷酸盐、D-核酮糖、D-核糖醇、D-核糖、L-核酮糖、景天庚酮糖1,7P2、3-氧代-6-P-己酮糖、L-鸟氨酸、氨甲酰磷酸、L-瓜氨酸、精氨琥珀酸、L-精氨酸、L-天冬氨酸盐、单磷酸腺苷(AMP)、焦磷酸盐、反式-Δ2-烯酰基-CoA、L-β-羟烷基CoA、β-酮乙基CoA、FADH2、酰基-CoA、丙酰基-CoA、肌苷一磷酸(IMP)、黄苷一磷酸(XMP)、鸟苷一磷酸(GMP)、黄苷、腺苷酸琥珀酸、尿苷、尿苷一磷酸(UMP)、胸苷、胸腺嘧啶、脱氧核糖-1-磷酸盐、脱氧胸苷一磷酸(dTMP)、脱氧胞苷、脱氧胞苷一磷酸(dCMP)、棕榈酸视黄酯、棕榈酸盐、棕榈基-CoA、异维A酸酯、β-葡糖苷酸、视黄醛、β-胡萝卜素、视黄酸、骨化二醇、25-羟基麦角钙化醇、骨化三醇、甲基钴胺素、5’-脱氧腺苷钴胺素、α-CECH、NH4+、α-酮戊二酸盐、草酰乙酸盐、谷氨酸盐γ-半醛、Δ1-吡咯啉-5-羧酸盐、瓜氨酸、NH3、N5,N10-亚甲基THF、3-磷酸甘油酸盐、α-酮丁酸盐、α-氨基-β-酮丁酸盐、氨基丙酮、半胱亚磺酸、β-亚磺酰基丙酮酸盐、亚硫酸氢盐、亚硫酸盐、硫酸盐、谷胱甘肽、亚牛磺酸、腺苷5’-磷酰硫酸、3’-磷酸腺苷5’-磷酰硫酸、同型半胱氨酸、α-酮-β-戊酸甲酯、α-酮异己酸、α-酮异戊酸酯、α-甲基丁酰基-CoA、甲基巴豆酰基-CoA、3-甲基-3-羟基丁酸酰基-CoA、2-甲基乙酰乙酰基-CoA、异戊酰基-CoA、3-甲基巴豆酰基-CoA、3-甲基戊烯二酰-CoA、3-羟基-3-甲基戊二酰-CoA、乙酰乙酸盐、异丁酰基CoA、甲基丙烯基-CoA、3-羟基异丁酰基-CoA、甲基丙二酸单醛、p-羟基苯基丙酮酸盐、尿黑酸盐、4-马来酰乙酰乙酸盐、4-延胡索酰乙酰乙酸盐、富马酸盐、3-羟基三甲基赖氨酸、4-N-三甲氨基丁醛、γ-丁酰甜菜碱、尿刊酸酯、4-咪唑啉酮-5-丙酸盐、N-亚胺代甲基-L-谷氨酸盐、N5-亚胺甲基-四氢叶酸盐、组胺、N-甲酸基-犬尿素、犬尿素、犬尿胺酸、3-羟基犬尿素、邻氨基苯甲酸盐、3-羟基邻氨基苯甲酸盐、戊二酰基-CoA、乙酰乙酰基-CoA及其组合。
21.如权利要求19所述的方法,其中所治疗的疾病是选自下组的病毒,该组由以下组成:人类免疫缺陷病毒(HIV)、单纯疱疹病毒(HSV-1和HSV-2)、人类T淋巴细胞病毒(HTLV)、约翰坎宁安病毒(JC病毒)、水泡性口炎病毒(VSV)、丙型肝炎病毒(HCV)、乙型肝炎病毒(HBV)、寨卡病毒、登革热病毒、基孔肯亚病毒、埃博拉病毒、腺相关病毒、爱知病毒、澳洲蝙蝠狂犬病病毒、BK多瘤病毒、版纳病毒、巴马森林病毒、布尼奥罗病毒、拉克罗斯布尼亚病毒、北美野兔布尼亚病毒、猕猴疱疹病毒、金迪普拉病毒、Cosavirus A、牛痘病毒、柯萨奇病毒、克里米亚-刚果出血热病毒、多里病毒、道格比病毒、杜文哈格病毒、东部马脑炎病毒、埃可病毒、脑心肌炎病毒、艾巴氏病毒、欧洲蝙蝠狂犬病毒、庚型肝炎病毒、汉坦病毒、亨德拉病毒、甲型肝炎病毒、戊型肝炎病毒、丁型肝炎病毒、马痘病毒、人类腺病毒、人星状病毒、人冠状病毒、人巨细胞病毒、人肠道病毒68、人肠道病毒70、人类疱疹病毒6、人类疱疹病毒7、人类疱疹病毒8、人乳头瘤病毒(HPV)1、HPV 2、HPV 16、HPV 18、人副流感病毒、人类细小病毒B19、人类呼吸道合胞病毒、人鼻病毒、人类严重急性呼吸系统综合症(SARS)冠状病毒、人泡沫反转录病毒、人环曲病毒、甲型流感病毒、乙型流感病毒、丙型流感病毒、伊斯法罕病毒、JC多瘤病毒、日本脑炎病毒、呼宁砂粒样病毒、KI多瘤病毒、昆津病毒、拉哥斯蝙蝠病毒、维多利亚湖马尔堡病毒、兰加特病毒、拉沙病毒、洛兹达雷病毒、跳跃病病毒、淋巴细胞性脉络丛脑膜炎病毒、马丘波病毒、马雅罗病毒、中东呼吸综合征(MERS)冠状病毒、麻疹病毒、孟戈脑心肌炎病毒、默克尔细胞多瘤病毒、莫科拉病毒、传染性软疣病毒、猴痘病毒、腮腺炎病毒、墨累山谷脑炎病毒、纽约病毒、尼帕病毒、诺沃克病毒、阿尼昂尼昂病毒、Orf病毒、奥罗普切病毒、皮秦德病毒、脊髓灰质炎病毒、庞塔托鲁静脉病毒、普马拉病毒、狂犬病病毒、裂谷热病毒、罗莎病毒A、罗斯河病毒、轮状病毒A、轮状病毒B、轮状病毒C、风疹病毒、鹭山病毒、萨利病毒A、白蛉热西西里病毒、扎幌病毒、塞姆利基森林病毒、汉城病毒、猴泡沫病毒、猴病毒5、辛德毕斯病毒、南汉普顿病毒、圣路易斯脑炎病毒、蜱传播的玻瓦桑病毒、细环病毒、托斯卡纳病毒、Ulukuniemi病毒、牛痘病毒、水痘带状疱疹病毒、天花病毒、委内瑞拉马脑炎病毒、水泡性口炎病毒、西部马脑炎病毒、WU多瘤病毒、西尼罗病毒、雅巴猴肿瘤病毒、雅巴样疾病病毒和黄热病病毒。
22.如权利要求19所述的方法,其中所述检测步骤包括使用选自下组的方法,该组由以下组成:液相色谱法、气相色谱法、液相色谱法-质谱分析法、气相色谱法-质谱分析法、高效液相色谱法-质谱分析法、毛细管电泳法-质谱分析法、核磁共振谱法(NMR)、拉曼光谱学和红外光谱法。
23.如权利要求19所述的方法,其中所述样品选自下组,该组由以下组成:血液、血浆、尿液、唾液、眼泪、组织和脑脊髓液(CSF)。
24.如权利要求19所述的方法,其中所述治疗选自下组,该组由以下组成:CRISPR Cas9、CRISPR Cfp1、ZFN、TALEN、基于白蛋白的编辑器、C2c1、C2c3、TevCas9、古细菌Cas9、CasY.1-CasY.6、CasX gRNA、Argonaute内切核酸酶gDNA、阿巴卡韦、无环鸟苷、阿昔洛韦、阿德福韦、金刚烷胺、安普那韦、安普利近、阿比朵尔、阿扎那韦、立普妥、巴拉维尔(balavir)、西多福韦、双汰芝、度鲁特韦、地瑞那韦、地拉韦啶、去羟肌苷、二十二烷醇、依度尿苷(edoxudine)、依非韦伦、恩曲他滨、恩夫韦地、恩替卡韦、依克利沃(ecoliever)、泛昔洛韦、福米韦生、福沙那韦、膦甲酸钠、磷乙酸钠(fosfonet)、融合抑制剂、更昔洛韦、伊巴他滨(ibacitabine)、异丙肌苷(imunovir)、碘苷、咪喹莫特、茚地那韦、肌苷、干扰素、I型干扰素、II型干扰素、III型干扰素、拉米夫定、洛匹那韦、洛韦胺、马拉韦罗、吗啉胍、美替沙腙、奈非那韦(nelfinavir)、奈韦拉平、多吉美(nexavir)、硝唑尼特、核苷类似物、诺维尔、奥司他韦、聚乙二醇干扰素α-2a、喷昔洛韦、帕拉米韦、普利康那利(pleconaril)、鬼臼毒素、雷特格韦、利巴韦林、金刚乙胺、利托那韦、嘧啶、沙奎那韦、索非布韦、特拉匹韦、替诺福韦、替诺福韦酯、替拉那韦、三氟胸苷、三协唯(trizivir)、醋胺金刚烷、特鲁瓦达、伐昔洛韦、缬更昔洛韦、维克韦罗(vicriviroc)、阿糖腺苷、韦拉米啶(viramidine)、扎西他滨、扎那米韦、齐多夫定及其组合。
25.如权利要求19所述的方法,所述方法进一步包括基于生物标志水平调整所述治疗以改善在所述个体中的作用的步骤。
26.一种确定病毒抑制或反弹的方法,所述方法包括以下步骤:
取得携带病毒的个体样品,所述个体接受选自由基因编辑疗法、抗病毒治疗或其组合组成的组的治疗;
将所述样品应用于包括至少一种指示疾病的生物标志的诊断面板;
检测至少一种生物标志的存在;
将所述生物标志的水平与基线进行比较;以及
确定潜伏病毒是否已被激活。
27.如权利要求26所述的方法,其中所述至少一种生物标志是选自下组的代谢物,该组由以下组成:1,3-尿酸二甲酯、左旋葡聚糖、1-甲基烟酰胺、代谢物1、2-羟基异丁酸酯、2-氧化戊二酸酯、3-氨基异丁酸酯、3-羟基丁酸酯、3-羟基异戊酸酯、3-吲哚硫酸酯、4-羟基苯乙酸酯、4-羟基苯基乳酸、4-吡啶酸氧盐、乙酸盐、乙酰乙酸盐、丙酮、己二酸盐、丙氨酸、尿囊素、天冬酰胺、甜菜碱、肉毒碱、柠檬酸盐、肌肉素、肌酸酐、二甲胺、乙醇胺、甲酸盐、海藻糖、富马酸盐、葡萄糖、谷氨酰胺、甘氨酸、代谢物2、代谢物3、马尿酸盐、组氨酸、次黄嘌呤、异亮氨酸、乳酸盐、亮氨酸、赖氨酸、甘露醇、代谢物4、代谢物5、代谢物6、N,N-二甲基甘氨酸、O-乙酰肉毒碱、泛酸盐、丙二醇、焦谷氨酸盐、丙酮酸盐、喹啉酸酯、丝氨酸、琥珀酸盐、蔗糖、代谢物7、牛磺酸、苏氨酸、葫芦巴碱、三甲胺-N-氧化物、色氨酸、酪氨酸、尿嘧啶、尿素、缬氨酸、木糖、顺乌头酸、肌醇、反式乌头酸、1-甲基组氨酸、3-甲基组氨酸、抗坏血酸盐、苯乙酰谷氨酰胺、4-羟脯氨酸、葡糖酸盐、半乳糖、半乳糖醇、植物半乳糖、乳糖、苯基丙氨酸、脯氨酸甜菜碱、三甲胺、丁酸盐、丙酸盐、异丙醇、甘露糖、3-甲基黄嘌呤、乙醇、苯酸盐、谷氨酸盐、甘油、鸟苷、鸟嘌呤、黄嘌呤、尿酸、腺苷、肌苷、肌苷酸、CO2、H2O、N-氨基甲酰-β-丙氨酸、β-丙氨酸、氨、β-氨基异丁酸、腐胺、亚精胺、精胺、甲硫氨酸、S-腺苷甲硫氨酸、脱去羧基的S-腺苷甲硫氨酸、精氨酸、鸟氨酸、腐胺、N1-乙酰亚精胺、N1-乙酰精胺、elF5A(Lys)、elF5A(Dhp)、elF5A(Hpu)、N1N2-二乙酰精胺、3-氨基丙醛、3-乙酰氨基丙醛、丙烯醛、FDP-赖氨酸蛋白质、苏式-Ds-异柠檬酸盐、草酰-琥珀酸盐、2-氧代-戊二酸盐、草酰-乙酸盐、L-谷氨酸盐、2-羟基-戊二酸盐、乙酰基-CoA、顺乌头酸、D-异柠檬酸盐、α-酮戊二酸盐、琥珀酰基-CoA、苹果酸盐、(-)O-乙酰-肉毒碱、衣康酸盐、乙醇酸盐、乙醛酸盐、草酸盐、草酰基-CoA、甲酸基-CoA、葡萄糖6-磷酸盐(G6P)、果糖6-磷酸盐(F6P)、果糖1,6-磷酸氢盐(F1,6BP)、甘油醛3-磷酸盐(GADP)、二羟基丙酮磷酸盐(DHAP)、1,3-双磷酸甘油酸(1,3BPG)、3-磷酸甘油酸(3PG)、2-磷酸甘油酸(2PG)、磷酸烯醇丙酮酸(PEP)、D-葡萄糖、D-葡糖酸-1,5-内酯、D-葡糖酸盐、α-D-甘露糖6-P、D-甘露糖、D-果糖、D-山梨糖醇、甘油酮-P、sn-甘油-3P、D-甘油醛、1,
2丙烷-二醇、2-羟基丙醛、3-P-丝氨酸、3-P-羟基丙酮酸盐、D-甘油酸盐、羟基丙酮酸盐、L-丙氨酸、L-丙氨酰基-tRNA、L-谷氨酸盐、2-氧化戊二酸酯、L-乳酸盐、D-乳酸盐、三磷酸腺苷(ATP)、二磷酸腺苷(ADP)、H+、琥珀酸盐、O2、NADH、NAD+、NADP+、NADPH、6-磷酸葡糖酸内酯、
6-磷酸葡糖酸盐、核酮糖-5-磷酸盐、核糖-5-磷酸盐、木酮糖-5-磷酸盐、甘油醛3-磷酸盐、景天庚酮糖7-磷酸盐、果糖6-磷酸盐、赤藓糖4-磷酸盐、木酮糖5-磷酸盐、D-核酮糖、D-核糖醇、D-核糖、L-核酮糖、景天庚酮糖1,7P2、3-氧代-6-P-己酮糖、L-鸟氨酸、氨甲酰磷酸、L-瓜氨酸、精氨琥珀酸、L-精氨酸、L-天冬氨酸盐、单磷酸腺苷(AMP)、焦磷酸盐、反式-Δ2-烯酰基-CoA、L-β-羟烷基CoA、β-酮乙基CoA、FADH2、酰基-CoA、丙酰基-CoA、肌苷一磷酸(IMP)、黄苷一磷酸(XMP)、鸟苷一磷酸(GMP)、黄苷、腺苷酸琥珀酸、尿苷、尿苷一磷酸(UMP)、胸苷、胸腺嘧啶、脱氧核糖-1-磷酸盐、脱氧胸苷一磷酸(dTMP)、脱氧胞苷、脱氧胞苷一磷酸(dCMP)、棕榈酸视黄酯、棕榈酸盐、棕榈基-CoA、异维A酸酯、β-葡糖苷酸、视黄醛、β-胡萝卜素、视黄酸、骨化二醇、25-羟基麦角钙化醇、骨化三醇、甲基钴胺素、5’-脱氧腺苷钴胺素、α-CECH、NH4+、α-酮戊二酸盐、草酰乙酸盐、谷氨酸盐γ-半醛、Δ1-吡咯啉-5-羧酸盐、瓜氨酸、NH3、
5 10
N ,N -亚甲基THF、3-磷酸甘油酸盐、α-酮丁酸盐、α-氨基-β-酮丁酸盐、氨基丙酮、半胱亚磺酸、β-亚磺酰基丙酮酸盐、亚硫酸氢盐、亚硫酸盐、硫酸盐、谷胱甘肽、亚牛磺酸、腺苷5’-磷酰硫酸、3’-磷酸腺苷5’-磷酰硫酸、同型半胱氨酸、α-酮-β-戊酸甲酯、α-酮异己酸、α-酮异戊酸酯、α-甲基丁酰基-CoA、甲基巴豆酰基-CoA、3-甲基-3-羟基丁酸酰基-CoA、2-甲基乙酰乙酰基-CoA、异戊酰基-CoA、3-甲基巴豆酰基-CoA、3-甲基戊烯二酰-CoA、3-羟基-3-甲基戊二酰-CoA、乙酰乙酸盐、异丁酰基CoA、甲基丙烯基-CoA、3-羟基异丁酰基-CoA、甲基丙二酸单醛、p-羟基苯基丙酮酸盐、尿黑酸盐、4-马来酰乙酰乙酸盐、4-延胡索酰乙酰乙酸盐、富马酸盐、3-羟基三甲基赖氨酸、4-N-三甲氨基丁醛、γ-丁酰甜菜碱、尿刊酸酯、4-咪唑啉酮-5-丙酸盐、N-亚胺代甲基-L-谷氨酸盐、N5-亚胺甲基-四氢叶酸盐、组胺、N-甲酸基-犬尿素、犬尿素、犬尿胺酸、3-羟基犬尿素、邻氨基苯甲酸盐、3-羟基邻氨基苯甲酸盐、戊二酰基-CoA、乙酰乙酰基-CoA及其组合。
28.如权利要求26所述的方法,其中所述病毒选自下组,该组由以下组成:人类免疫缺陷病毒(HIV)、单纯疱疹病毒(HSV-1和HSV-2)、人类T淋巴细胞病毒(HTLV)、约翰坎宁安病毒(JC病毒)、水泡性口炎病毒(VSV)、丙型肝炎病毒(HCV)、乙型肝炎病毒(HBV)、寨卡病毒、登革热病毒、基孔肯亚病毒、埃博拉病毒、腺相关病毒、爱知病毒、澳洲蝙蝠狂犬病病毒、BK多瘤病毒、版纳病毒、巴马森林病毒、布尼奥罗病毒、拉克罗斯布尼亚病毒、北美野兔布尼亚病毒、猕猴疱疹病毒、金迪普拉病毒、Cosavirus A、牛痘病毒、柯萨奇病毒、克里米亚-刚果出血热病毒、多里病毒、道格比病毒、杜文哈格病毒、东部马脑炎病毒、埃可病毒、脑心肌炎病毒、艾巴氏病毒、欧洲蝙蝠狂犬病毒、庚型肝炎病毒、汉坦病毒、亨德拉病毒、甲型肝炎病毒、戊型肝炎病毒、丁型肝炎病毒、马痘病毒、人类腺病毒、人星状病毒、人冠状病毒、人巨细胞病毒、人肠道病毒68、人肠道病毒70、人类疱疹病毒6、人类疱疹病毒7、人类疱疹病毒8、人乳头瘤病毒(HPV)1、HPV 2、HPV 16、HPV 18、人副流感病毒、人类细小病毒B19、人类呼吸道合胞病毒、人鼻病毒、人类严重急性呼吸系统综合症(SARS)冠状病毒、人泡沫反转录病毒、人环曲病毒、甲型流感病毒、乙型流感病毒、丙型流感病毒、伊斯法罕病毒、JC多瘤病毒、日本脑炎病毒、呼宁砂粒样病毒、KI多瘤病毒、昆津病毒、拉哥斯蝙蝠病毒、维多利亚湖马尔堡病毒、兰加特病毒、拉沙病毒、洛兹达雷病毒、跳跃病病毒、淋巴细胞性脉络丛脑膜炎病毒、马丘波病毒、马雅罗病毒、中东呼吸综合征(MERS)冠状病毒、麻疹病毒、孟戈脑心肌炎病毒、默克尔细胞多瘤病毒、莫科拉病毒、传染性软疣病毒、猴痘病毒、腮腺炎病毒、墨累山谷脑炎病毒、纽约病毒、尼帕病毒、诺沃克病毒、阿尼昂尼昂病毒、Orf病毒、奥罗普切病毒、皮秦德病毒、脊髓灰质炎病毒、庞塔托鲁静脉病毒、普马拉病毒、狂犬病病毒、裂谷热病毒、罗莎病毒A、罗斯河病毒、轮状病毒A、轮状病毒B、轮状病毒C、风疹病毒、鹭山病毒、萨利病毒A、白蛉热西西里病毒、扎幌病毒、塞姆利基森林病毒、汉城病毒、猴泡沫病毒、猴病毒5、辛德毕斯病毒、南汉普顿病毒、圣路易斯脑炎病毒、蜱传播的玻瓦桑病毒、细环病毒、托斯卡纳病毒、Ulukuniemi病毒、牛痘病毒、水痘带状疱疹病毒、天花病毒、委内瑞拉马脑炎病毒、水泡性口炎病毒、西部马脑炎病毒、WU多瘤病毒、西尼罗病毒、雅巴猴肿瘤病毒、雅巴样疾病病毒和黄热病病毒。
29.如权利要求26所述的方法,其中所述检测步骤包括使用选自下组的方法,该组由以下组成:液相色谱法、气相色谱法、液相色谱法-质谱分析法、气相色谱法-质谱分析法、高效液相色谱法-质谱分析法、毛细管电泳法-质谱分析法、核磁共振谱法(NMR)、拉曼光谱学和红外光谱法。
30.如权利要求26所述的方法,其中所述样品选自下组,该组由以下组成:血液、血浆、尿液、唾液、眼泪、组织和脑脊髓液(CSF)。
31.如权利要求26所述的方法,其中所述基因编辑疗法选自下组,该组由以下组成:
CRISPR Cas9、CRISPR Cfp1、ZFN、TALEN、基于白蛋白的编辑器、C2c1、C2c3、TevCas9、古细菌Cas9、CasY.1-CasY.6、CasX gRNA、或Argonaute内切核酸酶gDNA及其组合。
32.如权利要求26所述的方法,其中所述抗病毒疗法选自下组,该组由以下组成:阿巴卡韦、无环鸟苷、阿昔洛韦、阿德福韦、金刚烷胺、安普那韦、安普利近、阿比朵尔、阿扎那韦、立普妥、巴拉维尔、西多福韦、双汰芝、度鲁特韦、地瑞那韦、地拉韦啶、去羟肌苷、二十二烷醇、依度尿苷、依非韦伦、恩曲他滨、恩夫韦地、恩替卡韦、依克利沃、泛昔洛韦、福米韦生、福沙那韦、膦甲酸钠、磷乙酸钠、融合抑制剂、更昔洛韦、伊巴他滨、异丙肌苷、碘苷、咪喹莫特、茚地那韦、肌苷、干扰素、I型干扰素、II型干扰素、III型干扰素、拉米夫定、洛匹那韦、洛韦胺、马拉韦罗、吗啉胍、美替沙腙、奈非那韦、奈韦拉平、多吉美、硝唑尼特、核苷类似物、诺维尔、奥司他韦、聚乙二醇干扰素α-2a、喷昔洛韦、帕拉米韦、普利康那利、鬼臼毒素、雷特格韦、利巴韦林、金刚乙胺、利托那韦、嘧啶、沙奎那韦、索非布韦、特拉匹韦、替诺福韦、替诺福韦酯、替拉那韦、三氟胸苷、三协唯、醋胺金刚烷、特鲁瓦达、伐昔洛韦、缬更昔洛韦、维克韦罗、阿糖腺苷、韦拉米啶、扎西他滨、扎那米韦、齐多夫定及其组合。
33.如权利要求26所述的方法,所述方法进一步包括,如果潜伏病毒被激活,针对所述潜伏病毒对所述个体进行治疗的步骤。
34.一种检测潜伏病毒的方法,所述方法包括以下步骤:
取得个体样本;
将所述样品应用于包括至少一种指示疾病的生物标志的诊断面板;
检测至少一种生物标志的存在;
将所述生物标志的水平与基线进行比较;以及
确定潜伏病毒是否存在于所述个体中。
35.如权利要求34所述的方法,其中所述至少一种生物标志是选自下组的代谢物,该组由以下组成:1,3-尿酸二甲酯、左旋葡聚糖、1-甲基烟酰胺、代谢物1、2-羟基异丁酸酯、2-氧化戊二酸酯、3-氨基异丁酸酯、3-羟基丁酸酯、3-羟基异戊酸酯、3-吲哚硫酸酯、4-羟基苯乙酸酯、4-羟基苯基乳酸、4-吡啶酸氧盐、乙酸盐、乙酰乙酸盐、丙酮、己二酸盐、丙氨酸、尿囊素、天冬酰胺、甜菜碱、肉毒碱、柠檬酸盐、肌肉素、肌酸酐、二甲胺、乙醇胺、甲酸盐、海藻糖、富马酸盐、葡萄糖、谷氨酰胺、甘氨酸、代谢物2、代谢物3、马尿酸盐、组氨酸、次黄嘌呤、异亮氨酸、乳酸盐、亮氨酸、赖氨酸、甘露醇、代谢物4、代谢物5、代谢物6、N,N-二甲基甘氨酸、O-乙酰肉毒碱、泛酸盐、丙二醇、焦谷氨酸盐、丙酮酸盐、喹啉酸酯、丝氨酸、琥珀酸盐、蔗糖、代谢物7、牛磺酸、苏氨酸、葫芦巴碱、三甲胺-N-氧化物、色氨酸、酪氨酸、尿嘧啶、尿素、缬氨酸、木糖、顺乌头酸、肌醇、反式乌头酸、1-甲基组氨酸、3-甲基组氨酸、抗坏血酸盐、苯乙酰谷氨酰胺、4-羟脯氨酸、葡糖酸盐、半乳糖、半乳糖醇、植物半乳糖、乳糖、苯基丙氨酸、脯氨酸甜菜碱、三甲胺、丁酸盐、丙酸盐、异丙醇、甘露糖、3-甲基黄嘌呤、乙醇、苯酸盐、谷氨酸盐、甘油、鸟苷、鸟嘌呤、黄嘌呤、尿酸、腺苷、肌苷、肌苷酸、CO2、H2O、N-氨基甲酰-β-丙氨酸、β-丙氨酸、氨、β-氨基异丁酸、腐胺、亚精胺、精胺、甲硫氨酸、S-腺苷甲硫氨酸、脱去羧基的S-腺苷甲硫氨酸、精氨酸、鸟氨酸、腐胺、N1-乙酰亚精胺、N1-乙酰精胺、elF5A(Lys)、elF5A(Dhp)、elF5A(Hpu)、N1N2-二乙酰精胺、3-氨基丙醛、3-乙酰氨基丙醛、丙烯醛、FDP-赖氨酸蛋白质、苏式-Ds-异柠檬酸盐、草酰-琥珀酸盐、2-氧代-戊二酸盐、草酰-乙酸盐、L-谷氨酸盐、2-羟基-戊二酸盐、乙酰基-CoA、顺乌头酸、D-异柠檬酸盐、α-酮戊二酸盐、琥珀酰基-CoA、苹果酸盐、(-)O-乙酰-肉毒碱、衣康酸盐、乙醇酸盐、乙醛酸盐、草酸盐、草酰基-CoA、甲酸基-CoA、葡萄糖6-磷酸盐(G6P)、果糖6-磷酸盐(F6P)、果糖1,6-磷酸氢盐(F1,6BP)、甘油醛3-磷酸盐(GADP)、二羟基丙酮磷酸盐(DHAP)、1,3-双磷酸甘油酸(1,3BPG)、3-磷酸甘油酸(3PG)、2-磷酸甘油酸(2PG)、磷酸烯醇丙酮酸(PEP)、D-葡萄糖、D-葡糖酸-1,5-内酯、D-葡糖酸盐、α-D-甘露糖6-P、D-甘露糖、D-果糖、D-山梨糖醇、甘油酮-P、sn-甘油-3P、D-甘油醛、1,
2丙烷-二醇、2-羟基丙醛、3-P-丝氨酸、3-P-羟基丙酮酸盐、D-甘油酸盐、羟基丙酮酸盐、L-丙氨酸、L-丙氨酰基-tRNA、L-谷氨酸盐、2-氧化戊二酸酯、L-乳酸盐、D-乳酸盐、三磷酸腺苷(ATP)、二磷酸腺苷(ADP)、H+、琥珀酸盐、O2、NADH、NAD+、NADP+、NADPH、6-磷酸葡糖酸内酯、
6-磷酸葡糖酸盐、核酮糖-5-磷酸盐、核糖-5-磷酸盐、木酮糖-5-磷酸盐、甘油醛3-磷酸盐、景天庚酮糖7-磷酸盐、果糖6-磷酸盐、赤藓糖4-磷酸盐、木酮糖5-磷酸盐、D-核酮糖、D-核糖醇、D-核糖、L-核酮糖、景天庚酮糖1,7P2、3-氧代-6-P-己酮糖、L-鸟氨酸、氨甲酰磷酸、L-瓜氨酸、精氨琥珀酸、L-精氨酸、L-天冬氨酸盐、单磷酸腺苷(AMP)、焦磷酸盐、反式-Δ2-烯酰基-CoA、L-β-羟烷基CoA、β-酮乙基CoA、FADH2、酰基-CoA、丙酰基-CoA、肌苷一磷酸(IMP)、黄苷一磷酸(XMP)、鸟苷一磷酸(GMP)、黄苷、腺苷酸琥珀酸、尿苷、尿苷一磷酸(UMP)、胸苷、胸腺嘧啶、脱氧核糖-1-磷酸盐、脱氧胸苷一磷酸(dTMP)、脱氧胞苷、脱氧胞苷一磷酸(dCMP)、棕榈酸视黄酯、棕榈酸盐、棕榈基-CoA、异维A酸酯、β-葡糖苷酸、视黄醛、β-胡萝卜素、视黄酸、骨化二醇、25-羟基麦角钙化醇、骨化三醇、甲基钴胺素、5’-脱氧腺苷钴胺素、α-CECH、NH4+、α-酮戊二酸盐、草酰乙酸盐、谷氨酸盐γ-半醛、Δ1-吡咯啉-5-羧酸盐、瓜氨酸、NH3、N5,N10-亚甲基THF、3-磷酸甘油酸盐、α-酮丁酸盐、α-氨基-β-酮丁酸盐、氨基丙酮、半胱亚磺酸、β-亚磺酰基丙酮酸盐、亚硫酸氢盐、亚硫酸盐、硫酸盐、谷胱甘肽、亚牛磺酸、腺苷5’-磷酰硫酸、3’-磷酸腺苷5’-磷酰硫酸、同型半胱氨酸、α-酮-β-戊酸甲酯、α-酮异己酸、α-酮异戊酸酯、α-甲基丁酰基-CoA、甲基巴豆酰基-CoA、3-甲基-3-羟基丁酸酰基-CoA、2-甲基乙酰乙酰基-CoA、异戊酰基-CoA、3-甲基巴豆酰基-CoA、3-甲基戊烯二酰-CoA、3-羟基-3-甲基戊二酰-CoA、乙酰乙酸盐、异丁酰基CoA、甲基丙烯基-CoA、3-羟基异丁酰基-CoA、甲基丙二酸单醛、p-羟基苯基丙酮酸盐、尿黑酸盐、4-马来酰乙酰乙酸盐、4-延胡索酰乙酰乙酸盐、富马酸盐、3-羟基三甲基赖氨酸、4-N-三甲氨基丁醛、γ-丁酰甜菜碱、尿刊酸酯、4-咪唑啉酮-5-丙酸盐、N-亚胺代甲基-L-谷氨酸盐、N5-亚胺甲基-四氢叶酸盐、组胺、N-甲酸基-犬尿素、犬尿素、犬尿胺酸、3-羟基犬尿素、邻氨基苯甲酸盐、3-羟基邻氨基苯甲酸盐、戊二酰基-CoA、乙酰乙酰基-CoA及其组合。
36.如权利要求34所述的方法,其中所述疾病是选自下组的病毒,该组由以下组成:人类免疫缺陷病毒(HIV)、单纯疱疹病毒(HSV-1和HSV-2)、人类T淋巴细胞病毒(HTLV)、约翰坎宁安病毒(JC病毒)、水泡性口炎病毒(VSV)、丙型肝炎病毒(HCV)、乙型肝炎病毒(HBV)、寨卡病毒、登革热病毒、基孔肯亚病毒、埃博拉病毒、腺相关病毒、爱知病毒、澳洲蝙蝠狂犬病病毒、BK多瘤病毒、版纳病毒、巴马森林病毒、布尼奥罗病毒、拉克罗斯布尼亚病毒、北美野兔布尼亚病毒、猕猴疱疹病毒、金迪普拉病毒、Cosavirus A、牛痘病毒、柯萨奇病毒、克里米亚-刚果出血热病毒、多里病毒、道格比病毒、杜文哈格病毒、东部马脑炎病毒、埃可病毒、脑心肌炎病毒、艾巴氏病毒、欧洲蝙蝠狂犬病毒、庚型肝炎病毒、汉坦病毒、亨德拉病毒、甲型肝炎病毒、戊型肝炎病毒、丁型肝炎病毒、马痘病毒、人类腺病毒、人星状病毒、人冠状病毒、人巨细胞病毒、人肠道病毒68、人肠道病毒70、人类疱疹病毒6、人类疱疹病毒7、人类疱疹病毒8、人乳头瘤病毒(HPV)1、HPV 2、HPV 16、HPV 18、人副流感病毒、人类细小病毒B19、人类呼吸道合胞病毒、人鼻病毒、人类严重急性呼吸系统综合症(SARS)冠状病毒、人泡沫反转录病毒、人环曲病毒、甲型流感病毒、乙型流感病毒、丙型流感病毒、伊斯法罕病毒、JC多瘤病毒、日本脑炎病毒、呼宁砂粒样病毒、KI多瘤病毒、昆津病毒、拉哥斯蝙蝠病毒、维多利亚湖马尔堡病毒、兰加特病毒、拉沙病毒、洛兹达雷病毒、跳跃病病毒、淋巴细胞性脉络丛脑膜炎病毒、马丘波病毒、马雅罗病毒、中东呼吸综合征(MERS)冠状病毒、麻疹病毒、孟戈脑心肌炎病毒、默克尔细胞多瘤病毒、莫科拉病毒、传染性软疣病毒、猴痘病毒、腮腺炎病毒、墨累山谷脑炎病毒、纽约病毒、尼帕病毒、诺沃克病毒、阿尼昂尼昂病毒、Orf病毒、奥罗普切病毒、皮秦德病毒、脊髓灰质炎病毒、庞塔托鲁静脉病毒、普马拉病毒、狂犬病病毒、裂谷热病毒、罗莎病毒A、罗斯河病毒、轮状病毒A、轮状病毒B、轮状病毒C、风疹病毒、鹭山病毒、萨利病毒A、白蛉热西西里病毒、扎幌病毒、塞姆利基森林病毒、汉城病毒、猴泡沫病毒、猴病毒5、辛德毕斯病毒、南汉普顿病毒、圣路易斯脑炎病毒、蜱传播的玻瓦桑病毒、细环病毒、托斯卡纳病毒、Ulukuniemi病毒、牛痘病毒、水痘带状疱疹病毒、天花病毒、委内瑞拉马脑炎病毒、水泡性口炎病毒、西部马脑炎病毒、WU多瘤病毒、西尼罗病毒、雅巴猴肿瘤病毒、雅巴样疾病病毒和黄热病病毒。
37.如权利要求34所述的方法,其中所述检测步骤包括使用选自下组的方法,该组由以下组成:液相色谱法、气相色谱法、液相色谱法-质谱分析法、气相色谱法-质谱分析法、高效液相色谱法-质谱分析法、毛细管电泳法-质谱分析法、核磁共振谱法(NMR)、拉曼光谱学和红外光谱法。
38.如权利要求34所述的方法,其中所述样品选自下组,该组由以下组成:血液、血浆、尿液、唾液、眼泪、组织和脑脊髓液(CSF)。
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