首页 / 专利库 / 植物学 / 植物 / 大肠杆菌分子伴侣GroEL/ES在协助合成植物Rubisco中的应用

大肠杆菌分子伴侣GroEL/ES在协助合成植物Rubisco中的应用

阅读:484发布:2021-05-14

专利汇可以提供大肠杆菌分子伴侣GroEL/ES在协助合成植物Rubisco中的应用专利检索,专利查询,专利分析的服务。并且本 发明 公开了一种大肠杆菌分子伴侣GroEL/ES在协助合成 植物 Rubisco中的应用。本发明首先公开了大肠杆菌分子伴侣GroEL/ES的相关 生物 材料 在生物合成植物Rubisco中的应用;所述大肠杆菌分子伴侣GroEL/ES由GroEL蛋白和GroES蛋白组成。本发明进一步公开了生物合成植物Rubisco的方法。本发明构建了以大肠杆菌分子伴侣GroES/EL与植物分子伴侣作为分子伴侣系统共同在大肠杆菌MGM100菌株中合成拟南芥Rubisco的体系,可以有效合成拟南芥Rubisco,简化了拟南芥Rubisco的合成体系,为后续改造Rubisco提供了便利。,下面是大肠杆菌分子伴侣GroEL/ES在协助合成植物Rubisco中的应用专利的具体信息内容。

1.大肠杆菌分子伴侣GroEL/ES的相关生物材料在生物合成植物Rubisco中的应用;所述大肠杆菌分子伴侣GroEL/ES由GroEL蛋白和GroES蛋白组成,所述大肠杆菌分子伴侣GroEL/ES的相关生物材料为如下任一所述:
A1)所述GroEL蛋白和所述GroES蛋白;所述GroEL蛋白为序列16所示的核酸分子编码的蛋白质,所述GroES蛋白为序列17所示的核酸分子编码的蛋白质;
A2)编码A1)所述蛋白质的核酸分子;
A3)含有A2)所述核酸分子的表达盒;
A4)含有A2)所述核酸分子的重组载体,或含有A3)所述表达盒的重组载体;
A5)含有A2)所述核酸分子的重组微生物,或含有A3)所述表达盒的重组微生物;含有A4)所述重组载体的重组微生物。
2.根据权利要求1所述的应用,其特征在于:
所述A2)中编码所述GroEL蛋白的核酸分子为序列16所示,编码所述GroES蛋白的核酸分子为序列17所示。
3.权利要求1中所述的大肠杆菌分子伴侣GroEL/ES相关生物材料和植物分子伴侣的相关生物材料在生物合成植物Rubisco中的应用,
所述植物分子伴侣由Raf1、Raf2、RbcX2和BSD2蛋白组成,所述植物分子伴侣的相关生物材料为如下任一所述:
B1)所述Raf1蛋白、所述Raf2蛋白、所述RbcX2蛋白和所述BSD2蛋白;所述Raf1蛋白为序列11所示的核酸分子编码的蛋白质,所述Raf2蛋白为序列13所示的核酸分子编码的蛋白质,所述RbcX2蛋白为序列14所示的核酸分子编码的蛋白质,所述BSD2蛋白为序列15所示的核酸分子编码的蛋白质;
B2)编码B1)所述蛋白质的核酸分子;
B3)含有B2)所述核酸分子的表达盒;
B4)含有B2)所述核酸分子的重组载体,或含有B3)所述表达盒的重组载体;
B5)含有B2)所述核酸分子的重组微生物,或含有B3)所述表达盒的重组微生物;含有A4)所述重组载体的重组微生物。
4.含有编码权利要求1中所述的大肠杆菌分子伴侣GroEL/ES的核酸分子的大肠杆菌在生物合成植物Rubisco中的应用。
5.含有编码权利要求1中所述的大肠杆菌分子伴侣GroEL/ES的核酸分子的大肠杆菌和表达权利要求3中所述的植物分子伴侣的载体在生物合成植物Rubisco中的应用。
6.一种生物合成植物Rubisco的产品,其特征在于:所述产品为权利要求1中所述的大肠杆菌分子伴侣GroEL/ES的相关生物材料。
7.根据权利要求6所述的产品,其特征在于:所述产品还包括权利要求3中所述的植物分子伴侣的相关生物材料。
8.生物合成植物Rubisco的方法,其特征在于,包括如下步骤:
将编码权利要求3中所述的植物分子伴侣的核酸分子和植物Rubisco的大亚基基因和小亚基基因导入到含有编码权利要求1中所述的大肠杆菌分子伴侣GroEL/ES的核酸分子的大肠杆菌中,得到重组大肠杆菌,对重组大肠杆菌进行诱导培养,完成植物Rubisco的生物合成。
9.根据权利要求8所述的方法,其特征在于,所述诱导培养为利用阿拉伯糖进行诱导培养。
10.根据权利要求4或5所述的应用,或,权利要求8或9所述的方法,其特征在于:所述含有编码权利要求1中所述的大肠杆菌分子伴侣GroEL/ES的核酸分子的大肠杆菌为大肠杆菌MGM100。

说明书全文

大肠杆菌分子伴侣GroEL/ES在协助合成植物Rubisco中的

应用

技术领域

背景技术

[0002] 植物的光合作用是维持生物圈稳定的重要途经,通过一系列的反应将大气中的H2O和CO2转化成化合物,即CO2的固定。其中关键催化反应的酶为核糖-1,5-二磷酸羧化酶/加酶(ribulose-1,5-biphosphate carboxylase/oxygenase,简称Rubisco),但是Rubisco固定CO2的效率非常低,提高Rubisco的羧化酶活性成为提高作物产量的靶点。因此,研究Rubisco的生物合成及调控逐渐成为研究的热点和难点,因为Rubisco的生物合成需要复杂的分子伴侣系统协助其折叠和组装。
[0003] 因此,迫切需要开发一种新的、简单的分子伴侣系统替代叶绿体的分子伴侣素Cpn60在大肠杆菌中对Rubisco进行组装。

发明内容

[0004] 本发明所要解决的技术问题是找到一种新的分子伴侣以合成植物Rubisco。
[0005] 为解决上述技术问题,本发明首先提供了大肠杆菌分子伴侣GroEL/ES的相关生物材料在生物合成植物Rubisco中的应用;所述大肠杆菌分子伴侣GroEL/ES由GroEL蛋白和GroES蛋白组成,所述大肠杆菌分子伴侣GroEL/ES的相关生物材料为如下任一所述:
[0006] A1)所述GroEL蛋白和所述GroES蛋白;所述GroEL蛋白为序列16所示的核酸分子编码的蛋白质,所述GroES蛋白为序列17所示的核酸分子编码的蛋白质;
[0007] A2)编码A1)所述蛋白质的核酸分子;
[0008] A3)含有A2)所述核酸分子的表达盒;
[0009] A4)含有A2)所述核酸分子的重组载体,或含有A3)所述表达盒的重组载体;
[0010] A5)含有A2)所述核酸分子的重组微生物,或含有A3)所述表达盒的重组微生物;含有A4)所述重组载体的重组微生物。
[0011] 上述应用中,所述A2)中编码所述GroEL蛋白的核酸分子为序列16所示,编码所述GroES蛋白的核酸分子为序列17所示。
[0012] 本发明中,所述序列16所示的核酸分子由1638个核苷酸序列组成,编码序列为1-1638位;所述序列17所示的核酸分子由291个核苷酸序列组成,编码序列为1-291位。
[0013] 上述大肠杆菌分子伴侣GroEL/ES中GroEL蛋白和GroES蛋白是作为合成植物Rubisco的伴侣蛋白。
[0014] 本发明还提供了上述大肠杆菌分子伴侣GroEL/ES和植物分子伴侣的相关生物材料在生物合成植物Rubisco中的应用;所述植物分子伴侣由Raf1、Raf2、RbcX2和BSD2蛋白组成,所述植物分子伴侣的相关生物材料为如下任一所述:
[0015] B1)所述Raf1蛋白、所述Raf2蛋白、所述RbcX2蛋白和所述BSD2蛋白;所述Raf1蛋白为序列11所示的核酸分子编码的蛋白质,所述Raf2蛋白为序列13所示的核酸分子编码的蛋白质,所述RbcX2蛋白为序列14所示的核酸分子编码的蛋白质,所述BSD2蛋白为序列15所示的核酸分子编码的蛋白质;
[0016] B2)编码B1)所述蛋白质的核酸分子;
[0017] B3)含有B2)所述核酸分子的表达盒;
[0018] B4)含有B2)所述核酸分子的重组载体,或含有B3)所述表达盒的重组载体;
[0019] B5)含有B2)所述核酸分子的重组微生物,或含有B3)所述表达盒的重组微生物;含有A4)所述重组载体的重组微生物。
[0020] 上述应用中,所述A2)中编码所述Raf1蛋白的核酸分子为序列11所示,编码所述Raf2蛋白为序列13所示,编码所述RbcX2蛋白为序列14所示,编码所述BSD2蛋白为序列15所示。
[0021] 本发明中,所述序列11所示的核酸分子由1170个核苷酸序列组成,编码序列为1-1170位;所述序列13所示的核酸分子由516个核苷酸序列组成,编码序列为1-516位;所述序列14所示的核酸分子由429个核苷酸序列组成,编码序列为1-429位;所述序列15所示的核酸分子由246个核苷酸序列组成,编码序列为1-246位。
[0022] 本发明含有编码上述大肠杆菌分子伴侣GroEL/ES的核酸分子的大肠杆菌在生物合成植物Rubisco中的应用。
[0023] 本发明还提供了含有编码上述大肠杆菌分子伴侣GroEL/ES的核酸分子的大肠杆菌和和表达上述植物分子伴侣(BSD2、Raf1、Raf2和RbcX2)的载体在生物合成植物Rubisco中的应用。
[0024] 上述应用中,表达植物分子伴侣(BSD2、Raf1、Raf2和RbcX2)的载体可以为一个也可以为多个。
[0025] 在本发明具体的实施方式中,所述植物分子伴侣BSD2、Raf1、Raf2和RbcX2为拟南芥分子伴侣AtBSD2、AtRaf1、AtRaf2和AtRbcX2,其构建在同一个载体上,所述载体为pT7linker2-AtBSD2-AtRaf1-AtRaf2-AtRbcX2。所述pT7linker2-AtBSD2-AtRaf1-AtRaf2-AtRbcX2包含依次连接的序列12第1215-2053位所示的大肠杆菌p15A复制子、序列12第194-853位所示的氯霉素抗性基因、序列7第994-2076位所示的LacI阻遏蛋白基因、序列7第
4505-4547位所示的Linker1、串联的AtBSD2基因表达盒、AtRaf1基因表达盒、AtRaf2基因表达盒和AtRbcX2基因表达盒、序列7第1-51位所示的Linker2;所述AtBSD2基因表达盒包含依次连接的序列5第1-19位所示的T7启动子、序列5第20-44位所示的Lac操纵子、AtBSD2基因和序列1第475-517位所示的T7转录终止子,所述AtRaf1基因表达盒包含依次连接的序列5第1-19位所示的T7启动子、序列5第20-44位所示的Lac操纵子、AtRaf1基因和序列1第475-
517位所示的T7转录终止子,所述AtRaf2基因表达盒包含依次连接的序列5第1-19位所示的T7启动子、序列5第20-44位所示的Lac操纵子、AtRaf2基因和序列1第475-517位所示的T7转录终止子,所述AtRbcX2基因表达盒包含依次连接的序列5第1-19位所示的T7启动子、序列5第20-44位所示的Lac操纵子、AtRbcX2基因和序列1第475-517位所示的T7转录终止子。
[0026] 本发明还提供了一种生物合成植物Rubisco的产品。
[0027] 本发明生物合成植物Rubisco的产品为如下任一所示:
[0028] B1)上述大肠杆菌分子伴侣GroEL/ES的相关生物材料;
[0029] B2)上述大肠杆菌分子伴侣GroEL/ES的相关生物材料和上述植物分子伴侣的相关生物材料。
[0030] 本发明还提供了一种生物合成植物Rubisco的方法。
[0031] 本发明所述生物合成植物Rubisco的方法,包括如下步骤:
[0032] 将编码上述植物分子伴侣的核酸分子和植物Rubisco的大亚基基因和小亚基基因导入到含有编码上述大肠杆菌分子伴侣GroEL/ES的核酸分子的大肠杆菌中,得到重组大肠杆菌,对重组大肠杆菌进行诱导培养,完成植物Rubisco的生物合成。
[0033] 在本发明具体的实施方式中,所述植物Rubisco的大亚基基因的序列为序列4所示,所述植物Rubisco小亚基基因的序列为序列3所示,具体的,所述植物Rubisco的大亚基基因为拟南芥Rubisco的大亚基基因AtRbcL,所述植物Rubisco小亚基基因为拟南芥Rubisco小亚基基因AtRbcS,所述AtRbcS和AtRbcL构建在同一个载体上,所述载体为pTetlinker-AtRbcLS-AtRbcL,所述pTetlinker-AtRbcLS-AtRbcL包含依次连接的序列1第2574-3312位所示的大肠杆菌CDF复制子、序列1第1646-2434位所示的壮观霉素抗性基因、序列1第748-1371位所示的四环素抑制蛋白基因、序列1第265-295位所示的Linker1、串联的AtRbcS基因表达盒和AtRbcL基因表达盒、序列1第518-583位所示的Linker2;所述外源基因表达盒包含依次连接的序列1第296-386位所示的四环素诱导启动子、外源基因和序列1第475-517位所示的T7转录终止子;所述AtRbcS基因表达盒包含依次连接的序列1第296-
386位所示的四环素诱导启动子、AtRbcS基因和序列1第475-517位所示的T7转录终止子,所述AtRbcL基因表达盒包含依次连接的序列1第296-386位所示的四环素诱导启动子、AtRbcL基因和序列1第475-517位所示的T7转录终止子。
[0034] 本发明中,所述含有编码上述大肠杆菌分子伴侣GroEL/ES的核酸分子的大肠杆菌为大肠杆菌MGM100。
[0035] 本发明中,所述植物为拟南芥。
[0036] 本发明构建了以大肠杆菌分子伴侣GroES/EL与植物分子伴侣作为分子伴侣系统共同在大肠杆菌MGM100菌株中合成拟南芥Rubisco的体系,通过诱导大肠杆菌MGM100基因组上的GroEL/ES可以有效合成拟南芥Rubisco,避免了拟南芥Rubisco合成对叶绿体分子伴侣素Cpn60的依赖,极大的简化了拟南芥Rubisco的体外合成体系,为后续改造Rubisco和获取高羧化酶活性的Rubisco提供了便利。附图说明
[0037] 图1为大肠杆菌菌株MGM100的受到阿拉伯糖启动子pBAD的调控表达的示意图。
[0038] 图2为拟南芥Rubisco的合成;A为Western blot检测诱导后产物中的Rubisco的相对含量;左边条带为在MGM100中导入质粒1、质粒2和质粒3进行Rubisco的合成后检测Rubisco的合成量;右边为MGM1000中导入质粒1和质粒3进行Rubisco的合成后检测Rubisco的合成量;B为通过Rubisco酶活性测定检验Rubisco的相对含量;pCpn60/20为在MGM100中导入质粒1、质粒2和质粒3进行Rubisco的合成后检测活性;eGroEL/ES为MGM1000中导入质粒1和质粒3进行Rubisco的合成后检测活性。

具体实施方式

[0039] 以下的实施例便于更好地理解本发明,但并不限定本发明。下述实施例中所使用的实验方法如无特殊说明,均为常规方法。下述实施例中所用的材料、试剂等,如无特殊说明,均可从商业途径得到。
[0040] 实施例1质粒1:pTetlinker-AtRbcS-AtRbcL的构建
[0041] 一、构建pTetlinker载体
[0042] 一、构建pTetlinker载体
[0043] 1、用引物(pLCM1  For:cacggtcacactgcttccggta,pLCM1  Rev:gggatctcgaccgatgcccttgag)PCR扩增质粒pCDFDuet-1(购自addgene:http://
www.addgene.org/),得到扩增片段A(序列1第1499-3479位),所述扩增片段A包含大肠杆菌CDF复制子(序列1第2574-3312位)和壮观霉素抗性基因(序列1第1646-2434位)的表达盒。
[0044] 2、用引物(pJKR-Tet For:agggcatcggtcgagatccc Gagtagggaactgccaggcatcaa,pJKR-Tet Rev3:gtgcttctcgcctgaggttCCGTGTGCTTCTCGCCTGAGGTT)PCR扩增质粒pJKR-H-TetR(购自addgene:http://www.addgene.org/),得到扩增片段B(序列2),所述扩增片段B包含四环素抑制蛋白基因(序列2第1404-2027位)的表达盒和GFP基因表达盒(序列2第265-2128位),所述GFP基因表达盒包含四环素诱导启动子(序列2第265-355位)、GFP基因和T7转录终止子(序列2第2086-2128位)。
[0045] 3、将上述得到的扩增片段A和扩增片段B无缝克隆连接,得中间载体pLCM1-Tet-GFP。用100ng/L四环素诱导pLCM1-Tet-GFP表达,检测GFP可以正常被诱导表达。
[0046]
[0047] 4、人工合成序列1第250-596所示的TetRlink元件,其中,该TetRlink元件包含linker1(序列1第265-295位)、四环素诱导启动子(序列1第296-386位)、T7转录终止子(序列1第475-517位)和Linker2(序列1第518-583位);用引物(pTetR sy For:GCAAGTAAGGCCGACGAGCTTAA,pTetR sy Rev:GGTGTTAGCTGTGTCTCGCCAAGCTA)PCR扩增人工合成TetRlink元件,得到扩增片段C(序列1第250-596位)。
[0048] 5、用引物(pTet inter For:cgagacacagctaacaccacgtcgtccctat,pTet inter Rev:gctcgtcggccttacttgctagcagagttt)PCR扩增中间载体pLCM1-Tet-GFP,得到扩增片段D(序列1第1-268和第579-2479位),所述扩增片段D包含大肠杆菌CDF复制子((序列1第2574-3312位)和壮观霉素抗性基因(序列1第1646-2434位)的表达盒、四环素抑制蛋白基因(序列
1第748-1371位,与序列2第1404-2027位序列相同)的表达盒。
[0049] 6、将扩增片段C和扩增片段D无缝克隆连接,得到将中间载体pLCM1-Tet-GFP中GFP基因表达盒替换为TetRlink元件的质粒,命名为pTetlinker(具体序列如序列1所示),包含大肠杆菌CDF复制子((序列1第2574-3312位)、壮观霉素抗性基因(序列1第1646-2434位)、四环素抑制蛋白基因(序列1第748-1371位)、link1(序列1第265-295位)、四环素诱导启动子(序列1第296-386位)、T7转录终止子(序列1第475-517位)和Linker2(序列1第518-583位)
[0050] 二、根据要克隆外源基因的序列设计引物,以含有外源基因AtRbcS(序列3所示)的DNA分子为模板,利用引物进行扩增获得包含外源基因AtRbcS的片段将AtRbcS基因克隆进pTetlinker载体
[0051] 1、用引物(AtRbcS-Tetlinker  for:taagaaggagatatacat atgatggtctggaccccggtcaa,AtRbcS-Tetlinker rev:tcactcattagggttatgTTAcacggagcgcttgttggcgg)PCR扩增拟南芥AtRbcS基因,获得得到含有序列3所示的外源基因AtRbcS的扩增片段E;
[0052] 2、用引物(pTetRlinker For:CATAACCCTAATGAGTGAGCTAACTTACA,pTetRlinker Rev:CATATGTATATCTCCTTCTTAAAGTTAAATTTA)PCR扩增质粒pTetlinker,获得扩增片段F(序列1第419-3479位)。
[0053] 3、将扩增片段E和扩增片段F无缝克隆连接。
[0054] 4、转化大肠杆菌后,经过抗性筛选,挑选转化子验证并测序,确证外源基因被克隆到pTetlinker载体中,命名为pTetlinker-AtRbcS。
[0055] 三、根据要克隆外源基因的序列设计引物,以含有外源基因AtRbcL(序列4所示)的DNA分子为模板,利用引物进行扩增获得包含外源基因AtRbcL的片段将AtRbcL基因克隆进pTetlinker载体:
[0056] 1、用引物(AtRbcL-Tetlinker  for:taagaaggagatatacat atggttccacaaacagaaactaaa,AtRbcL-Tetlinker  rev:tcactcattagggttatg 
ttaaagtttgtcaatagtatcaaa)PCR扩增拟南芥AtRbcL基因,获得得到含有序列3所示的外源基因AtRbcL的扩增片段G。
[0057] 2、用引物(pTetRlinker For:CATAACCCTAATGAGTGAGCTAACTTACA,pTetRlinker Rev:CATATGTATATCTCCTTCTTAAAGTTAAATTTA)PCR扩增质粒pTetlinker,获得扩增片段F(序列1第419-3479位)。
[0058] 3、将扩增片段G和扩增片段F无缝克隆连接。
[0059] 4、转化大肠杆菌后,经过抗性筛选,挑选转化子验证并测序,确证外源基因被克隆到pTetlinker载体中,命名为pTetlinker-AtRbcL。
[0060] 四、AtRbcS和AtRbc L的串联获载体pTetlinker-AtRbcS-AtRbcL
[0061] 1、取pTetlinker-AtRbcS和pTetlinker-AtRbcL分别用PacI,SwaI配置如下反应体系,并在相应的酶活性最适温度下进行酶切反应,获得PacI酶切反应体系和SwaI酶切反应体系
[0062]
[0063] 2、将两个反应体系于65℃孵育20min使SwaI与PacI高温失活,得到SwaI酶切DNA产物和PacI酶切DNA产物;按如下体系加入相应组分(无需琼脂糖胶回收),对于SwaI酶切DNA产物需加入dGTP,对于PacI酶切DNA产物需加入dCTP,体系混匀后于25℃孵育30min,得到经T4 DNA聚合酶处理过的两个反应体系。
[0064]
[0065] 3、将经T4 DNA聚合酶处理过的两个反应体系于65℃孵育20min使T4 DNA聚合酶失活,然后两个体系各取5uL,等体积混合,放入PCR仪中加热至65℃,并逐步降温至10℃,使两个片段通过退火连接在一起,得到终产物。
[0066] 4、取终产物转化E.coli DH5α感受态细胞,隔日挑选单克隆菌斑进行PCR验证阳性的克隆,其中,使用Linker1和Linker  2序列两侧引物(pQTEV3U:5′-TATAAAAATAGGCGTATCACGAGG-3′和pQTEV3L:5′-CCAGTGATTT TTTTCTCCAT TTT-3′),退火温度59℃。
[0067] 验证阳性的克隆经测序确证后即为外源基因AtRbcL和AtRbcS串联表达载体,得质粒1:pTetlinker-AtRbcLS-AtRbcL。
[0068] 实施例2质粒2:pT7linker1-Cpn60α1β1/Cpn20的构建
[0069] 一、pT7linker1载体
[0070] 1、人工合成序列5所示的T7启动子-lac操纵子-T7终止子序列(该序列元件包含T7启动子(序列5第1-19位)、lac操纵子(序列5第20-44位)和T7转录终止子(序列5第161-203位))替换载本pQlinkN(Scheich,C.,Kummel,D.,Soumailakakis,D.,Heinemann,U.,Bussow,K.,Vectors for co-expression of an unrestricted number of proteins,Nucleic Acids Research,2007,Vol.35,No.6,e43.)中的Tac promoter-λt0 ter序列(如序列6所示)得pT7linker1载体,具体步骤如下:
[0071] 1、设计引物(T7 box for:gtcttgaggggttttttgagtaacaacaccatttaaatgga,T7 box rev:ctatagtgagtcgtattaacaattgaatctattataattgttatccgc)PCR扩增载体pQlinkN,得到序列7所示扩增片段H,所述扩增片段H包括LacI阻遏蛋白基因(序列7第994-2076位)的表达盒、大肠杆菌Col1复制子(序列7第2672-3260位)、苄青霉素抗性基因(序列7第3434-4291位)的表达盒、Linker1(序列7第4505-4547位)和Linker2(序列7第1-51位)。
[0072] 2、将扩增片段H与人工合成的序列5所示的T7启动子-lac操纵子-T7终止子序列无缝克隆连接,得到连接产物,体系同实施例1。
[0073] 3、取2μL连接产物转化大肠杆菌后,经过抗性筛选,挑选转化子验证并测序,得到的质粒命名为pT7linker1,其包括T7启动子(序列5第1-19位)、lac操纵子(序列5第20-44位)和T7转录终止子(序列5第161-203位)、LacI阻遏蛋白基因(序列7第994-2076)的表达盒、大肠杆菌Col1复制子(序列7第2672-3260位)、氨苄青霉素抗性基因(序列7第3434-4291位)的表达盒、Linker1(序列7第4505-4547位)和Linker2(序列7第1-51位)。
[0074] 二、根据要克隆外源基因的序列设计引物,构建质粒pT7linker1-Cpn60α1。具体如下:
[0075] 1、用引物(AtCpn60α1_Nde for:ggaattccatatgggagctaagagaatactatacggt和AtCpn60α1_BamH rev:ggaattccatatgggagctaagagaatactatacggt)PCR扩增序列8所示的拟南芥负责Rubisco折叠的分子伴侣素蛋白基因AtCPN60α,得到含有序列8所示的拟南芥负责Rubisco折叠的分子伴侣素蛋白基因AtCPN60α1的扩增片段I。
[0076] 2、将pT7linker1载体和扩增片段I均用NdeI和BamHI酶切:2μL 10×NEBuffer,1μL NdeI和1μL BamH,500ng DNA并用ddH2O补足至20μL,最终于37℃孵育2小时,并用gel回收试剂盒回收酶切后的pT7linker1载体和扩增片段I。
[0077] 3、用T4 DNA连接酶连接两个回收的酶切后的pT7linker1载体和扩增片段I,得到终产物。
[0078]
[0079] 4、取2μL终产物转化E.coli DH5α,隔日挑选单克隆菌斑进行PCR验证,使用使用Linker1和Linker  2序列两侧引物序列两侧引物 (pQTEV3U:5 ′-TATAAAAATAGGCGTATCACGAGG-3′和pQTEV3L:5′-CCAGTGATTT TTTTCTCCAT TTT-3′),退火温度59℃。
[0080] 5、转化大肠杆菌后,经过抗性筛选,挑选转化子验证并测序,确证外源基因CrCPN60α被克隆到pT7linker1载体中,命名为pT7linker1-AtCPN60α。
[0081] 三、根据要克隆外源基因的序列设计引物,构建质粒pT7linker1-AtCpn60β1。具体如下:
[0082] 1、用引物(AtCpn60β1_Nde I:ggaattccatatggcagcaaaggaattacatttcaac;AtCpn60β1_BamH I:cgcggatccttagtatccatatcctgagttgt)PCR扩增序列9所示的拟南芥负责Rubisco折叠的分子伴侣素蛋白基因AtCPN60β1,得到含有序列9所示的拟南芥负责Rubisco折叠的分子伴侣素蛋白基因AtCPN60β1的扩增片段J。
[0083] 2、将pT7linker1载体和扩增片段J均用NdeI和BamHI酶切:2μL 10×NEBuffer,1μL NdeI和1μL BamH,500ng DNA并用ddH2O补足至20μL,最终于37℃孵育2小时。并用gel回收试剂盒回收酶切后的pT7linker1载体和扩增片段I。
[0084] 3、用T4 DNA连接酶连接两个回收的酶切后的pT7linker1载体和扩增片段J,得到终产物,连接体系同上述步骤二的连接体系。
[0085] 4、取2μL终产物转化E.coli DH5α,隔日挑选单克隆菌斑进行PCR验证,Linker1和Linker 2序列两侧引物序列两侧引物(pQTEV3U:5′-TATAAAAATAGGCGTATCACGAGG-3′和pQTEV3L:5′-CCAGTGATTT TTTTCTCCAT TTT-3′),退火温度59℃。
[0086] 5、转化大肠杆菌后,经过抗性筛选,挑选转化子验证并测序,确证外源基因AtCPN60β1被克隆到pT7linker1载体中,命名为pT7linker1-AtCPN60β1。
[0087] 四、根据要克隆外源基因的序列设计引物,以含有外源基因Cpn20(序列10所示的核酸分子)的DNA分子为模板,用引物(Cpn20_Nde  I:ggaattccatatg gcttctgttgttgccccta,Cpn20_BamH I:cgcggatccctaagaaagtatagccatca)PCR扩增,获得PCR产物,Nde I和BamH I酶切PCR产物和pT7linker1载体,回收酶切后的产物,利用T4连接酶连接,得到的连接产物,转化后鉴定得质粒pT7linker1-Cpn20。
[0088] 1、用引物(AtCpn20_Nde I:ggaattccatatggcttctgttgttgccccta;AtCpn20_BamH I:cgcggatccctaagaaagtatagccatca)PCR扩增序列10所示的拟南芥负责Rubisco折叠的分子伴侣素蛋白基因AtCPN20,得到含有序列10所示的拟南芥负责Rubisco折叠的分子伴侣素蛋白基因AtCPN20的扩增片段L。
[0089] 2、将pT7linker1载体和扩增片段L均用NdeI和BamHI酶切:2μL 10×NEBuffer,1μL NdeI和1μL BamH,500ng DNA并用ddH2O补足至20μL,最终于37℃孵育2小时,并用gel回收试剂盒回收酶切后的pT7linker1载体和扩增片段L。
[0090] 3、用T4 DNA连接酶连接两个回收的酶切后的pT7linker1载体和扩增片段L,得到终产物,连接体系同上述步骤二的连接体系。
[0091] 4、取2μL终产物转化E.coli DH5α,隔日挑选单克隆菌斑进行PCR验证,Linker1和Linker 2序列两侧引物序列两侧引物(pQTEV3U:5′-TATAAAAATAGGCGTATCACGAGG-3′和pQTEV3L:5′-CCAGTGATTT TTTTCTCCAT TTT-3′),退火温度59℃。
[0092] 5、转化大肠杆菌后,经过抗性筛选,挑选转化子验证并测序,确证外源基因AtCPN20被克隆到pT7linker1载体中,命名为pT7linker1-AtCPN20。
[0093] 五、pT7linker1-Cpn60α1β1/Cpn20的构建
[0094] 1、取pT7linker1-Cpn60α1和pT7linker1-Cpn60β1分别用PacI,SwaI配置如下反应体系,并在相应的酶活性最适温度下进行酶切反应,获得PacI酶切反应体系和SwaI酶切反应体系
[0095]
[0096] 2、将两个反应体系于65℃孵育20min使SwaI与PacI高温失活,得到SwaI酶切DNA产物和PacI酶切DNA产物;按如下体系加入相应组分(无需琼脂糖胶回收),对于SwaI酶切DNA产物需加入dGTP,对于PacI酶切DNA产物需加入dCTP,体系混匀后于25℃孵育30min,得到经T4 DNA聚合酶处理过的两个反应体系。
[0097]
[0098]
[0099] 3、将经T4 DNA聚合酶处理过的两个反应体系于65℃孵育20min使T4 DNA聚合酶失活,然后两个体系各取5 uL,等体积混合,放入PCR仪中加热至65℃,并逐步降温至10℃,使两个片段通过退火连接在一起,得到终产物。
[0100] 4、取终产物转化E.coli DH5α感受态细胞,隔日挑选单克隆菌斑进行PCR验证阳性的克隆,其中,使用Linker1和Linker  2序列两侧引物(pQTEV3U:5′-TATAAAAATAGGCGTATCACGAGG-3′和pQTEV3L:5′-CCAGTGATTT TTTTCTCCAT TTT-3′),退火温度59℃。
[0101] 验证阳性的克隆经测序确证后即为外源基因Cpn60α1和Cpn60β1的串联载体,得质粒pT7linker1-Cpn60α1β1,重复以上4步将Cpn20再串联到外源基因CPN60α1、CPN60β1的串联载体pT7linker1-Cpn60α1β1上,得到外源基因CPN60α1、CPN60β1和Cpn20的串联载体,命名为pT7linker1-Cpn60α1β1/Cpn20。
[0102] 实施例3质粒3:pT7linker2-AtBSD2-AtRaf1-AtRaf2-AtRbcX2的构建
[0103] 一、构建pT7linker2载体
[0104] 1、合成引物(chl-p15A for:agcggtatcagctcactcaaaggcacggtcacactgcttccg,chl-p15A rev:aatggtttcttagacgtcaggtggccacaggtgcggttgctggc)PCR扩增质粒pACYC184(购自addgene:http://www.addgene.org/),得到序列12所示的扩增片段M,所述扩增片段M包含大肠杆菌p15A复制子(序列12第1215-2053位)和氯霉素抗性基因(序列12第194-853位)。
[0105] 2、设计引物(pT7linker1 for:cacctgacgtctaagaaaccatt,pT7linker1 rev:Cctttgagtgagctgataccgct)扩增pT7linker1载体,得到去除pT7linker1载体上的大肠杆菌Col1复制子(序列7第2672-3260位)、氨苄青霉素抗性基因(序列7第3434-4291位)的表达盒的扩增片段N。
[0106] 3、将扩增片段M和扩增片段N无缝克隆连接,得到连接产物,体系如实施例1中无缝克隆连接体系:
[0107] 4、取2μL连接产物转化大肠杆菌后,经过抗性筛选,挑选转化子验证并测序,得到的质粒命名为pT7linker 2,其包括T7启动子(序列5第1-19位)、lac操纵子(序列5第20-44位)和T7转录终止子(序列5第161-203位)、LacI阻遏蛋白基因(序列7第994-2076位)的表达盒、大肠杆菌p15A复制子(序列12第1215-2053位)和氯霉素抗性基因(序列12第194-853位)、Linker1(序列7第4505-4547位)和Linker2(序列7第1-51位)。
[0108] 二、根据要克隆外源基因的序列设计引物,以含有外源基因AtRaf1(序列11所示)的DNA分子为模板,利用引物进行扩增获得包含外源基因AtRaf1的片段将AtRaf1基因克隆进pT7linker2载体
[0109] 1、用引物(AtRaf1-T7linker2  For:agaaggagatatacatatg atgcaacagctctaccaacc,AtRaf1-T7linker2  Rev:gctttgttagcagccg 
tcagtcccagttctgatgacttgt)PCR扩增AtRaf1,得到含有序列11所示AtRaf1的扩增片段O。
[0110] 2、设计引物(pT7linker 2 for cggctgctaacaaagcccgaaagg,pT7linker2 rev:atgtatatctccttcttaaagtta)PCR扩增pT7linker2载体,得到扩增片段P。
[0111] 3、扩增片段O和扩增片段P进行无缝克隆连接,得到连接产物,无缝克隆连接体系同实施例2。
[0112] 4、取2μL连接产物转化大肠杆菌后,经过抗性筛选,挑选转化子验证并测序,得到的质粒命名为pT7linker2-AtRaf1。
[0113] 三、根据要克隆外源基因的序列设计引物,以含有外源基因AtRaf2(序列13所示)的DNA分子为模板,利用引物进行扩增获得包含外源基因AtRaf2的片段将AtRaf2基因克隆进pT7linker2载体
[0114] 1、用引物(AtRaf2-T7linker2 For:agaaggagatatacatatgatgtctaatctggcgcaggatt,AtRaf2-T7linker2 Rev:gctttgttagcagccgtcacgcccaagctcttttcctagg)PCR扩增基因AtRaf2,得到含有序列13所示AtRaf2的扩增片段Q。
[0115] 2、设计引物(pT7linker 2 for cggctgctaacaaagcccgaaagg,pT7linker2 rev:atgtatatctccttcttaaagtta)PCR扩增pT7linker2载体,得到扩增片段P。
[0116] 3、用T4 DNA连接酶连接两个回收的酶切后的pT7linker 2载体和扩增片段Q,得到终产物,连接体系同实施例2.
[0117] 4、取2μL终产物转化E.coli DH5α,隔日挑选单克隆菌斑进行PCR验证,使用Linker1和Linker2序列两侧引物序列两侧引物(pQTEV3U:5′-TATAAAAATAGGCGTATCACGAGG-3′和pQTEV3L:5′-CCAGTGATTT TTTTCTCCAT TTT-3′),退火温度59℃。
[0118] 5、转化大肠杆菌后,经过抗性筛选,挑选转化子验证并测序,确证外源基因AtRaf2被克隆到pT7linker2载体中,命名为pT7linker2-A tRaf2。
[0119] 四、根据要克隆外源基因的序列设计引物,以含有外源基因AtRbcX(序列14所示)的DNA分子为模板,利用引物进行扩增获得包含外源基因AtRbcX的片段将AtRbcX基因克隆进pT7linker2载体:
[0120] 1、用引物(AtRbcX-T7linker2 for:tatacatatgcggatgcatatccctgcgga,AtRbcX-T7linker2 rev:agccggatcctcacgcggcacccttgccggggc)PCR扩增AtRbcX,得到含有序列14所示AtRbcX的扩增片段R。
[0121] 2、将pT7linker 2载体和扩增片段R均用NdeI和BamHI酶切:2μL 10×NEBuffer,1μL NdeI和1μL BamH,500ng DNA并用ddH2O补足至20μL,最终于37℃孵育2小时,并用gel回收试剂盒回收酶切后的pT7linker 2载体和扩增片段R。
[0122] 3、用T4 DNA连接酶连接两个回收的酶切后的pT7linker 2载体和扩增片段R,得到终产物,连接体系同实施例2。
[0123] 4、取2μL终产物转化E.coli DH5α,隔日挑选单克隆菌斑进行PCR验证,使用Linker1和Linker2序列两侧引物序列两侧引物(pQTEV3U:5′-TATAAAAATAGGCGTATCACGAGG-3′和pQTEV3L:5′-CCAGTGATTT TTTTCTCCAT TTT-3′),退火温度59℃。
[0124] 5、转化大肠杆菌后,经过抗性筛选,挑选转化子验证并测序,确证外源基因AtRbcX被克隆到pT7linker2载体中,命名为pT7linker2-AtRbcX。
[0125] 五、根据要克隆外源基因的序列设计引物,以含有外源基因AtBSD2(序列15所示)的DNA分子为模板,利用引物进行扩增获得包含外源基因AtBSD2的片段将AtBSD2基因克隆进pT7linker2载体:
[0126] 1、用引物(AtBSD2-T7linker2 for:atatacatatggcaatagctccggagaca,AtBSD2-T7linker2 rev:gccggatccttagaaagcgctctggaagcc)PCR扩增AtBSD2,得到序列15所示AtBSD2的扩增片段S。
[0127] 2、将pT7linker 2载体和扩增片段S均用NdeI和BamHI酶切:2μL 10×NEBuffer,1μL NdeI和1μL BamH,500ng DNA并用ddH2O补足至20μL,最终于37℃孵育2小时,并用gel回收试剂盒回收酶切后的pT7linker 2载体和扩增片段S。
[0128] 3、用T4 DNA连接酶连接两个回收的酶切后的pT7linker 2载体和扩增片段S,得到终产物,连接体系同实施例2。
[0129] 4、取2μL终产物转化E.coli DH5α,隔日挑选单克隆菌斑进行PCR验证,使用Linker1和Linker2序列两侧引物序列两侧引物(pQTEV3U:5′-TATAAAAATAGGCGTATCACGAGG-3′和pQTEV3L:5′-CCAGTGATTT TTTTCTCCAT TTT-3′),退火温度59℃。
[0130] 5、转化大肠杆菌后,经过抗性筛选,挑选转化子验证并测序,确证外源基因AtBSD2被克隆到pT7linker2载体中,命名为pT7linker2-AtBSD2。
[0131] 六、多基因在pT7linker2载体中的串联,具体步骤如下:
[0132] 1、取克隆有不同外源基因pT7linker2载体(pT7linker2-AtRaf1和pT7linker2-AtRaf2)各500ng,用10μL不同的限制性内切酶体系进行酶切,两个载体分别使用SwaI(25℃,1h)和PacI(37℃,1h),获得SwaI酶切反应体系和PacI酶切反应体系。
[0133] 2、将两个反应体系均于65℃孵育20分钟使SwaI或PacI失活,得到SwaI酶切DNA产物和PacI酶切DNA产物;各取5μL DNA产物,加入0.5μL T4 DNA聚合酶,2μL 10×NEBuffer 2.1,对于SwaI酶切DNA产物加入100mM dGTP 0.5μL,对于PacI酶切DNA产物加入100mM dCTP 
0.5μL,并用ddH2O补足至20μL,最终于25℃孵育30分钟,得到经T4 DNA聚合酶处理过的两个反应体系。
[0134] 3、将经T4 DNA聚合酶处理过的两个反应体系等体积混合,放入PCR仪中加热至65℃,并逐步降温至10℃,使SwaI酶切DNA产物和PacI酶切DNA产物通过退火连接在一起,得到终产物。
[0135] 4、取2μL终产物转化E.coli DH5α,隔日挑选单克隆菌斑进行PCR验证,Linker1和Linker 2序列两侧引物序列两侧引物(pQTEV3U:5′-TATAAAAATAGGCGTATCACGAGG-3′和pQTEV3L:5′-CCAGTGATTT TTTTCTCCAT TTT-3′),退火温度59℃。
[0136] 验证阳性的克隆经测序确证后即为外源基因AtRaf1和AtRaf2的串联载体。重复以上4步将AtBSD2再串联到外源基因AtRaf1和AtRaf2的串联载体上,得到外源基因AtRaf1、AtRaf2和AtBSD2的串联载体。重复以上4步将AtRbcX再串联到外源基因AtRaf1、AtRaf2和AtBSD2的载体上,得到外源基因AtRaf1、AtRaf2、AtBSD2和AtRbcX的串联载体,得质粒3:pT7linker2-AtBSD2-AtRaf1-AtRaf2-AtRbcX2。
[0137] 实施例4拟南芥Rubisco的合成
[0138] 一、大肠杆菌MGM100
[0139] 大肠杆菌MGM100购于The  Coli  Genetic  Stock  Centre(http://cgsc2.biology.yale.edu/),groES和groEL被整合到大肠杆菌基因组中,受到阿拉伯糖启动子pBAD的调控表达。大肠杆菌MGM100菌株为groE操纵子的启动子被阿拉伯糖诱导型的pBAD启动子所替代的一类菌株。groE操纵子上含有编码GroEL,GroES等细胞生长所必须的基因,因此在普通的LB培养基中,MGM100菌株无法生长。当培养基中存在阿拉伯糖时,MGM100可正常生长。
[0140] 二、转化
[0141] 1、将实施例1的质粒1:pTetlinker-AtRbcS-AtRbcL、实施例2的质粒2:pT7linker1-Cpn60α1β1/Cpn20和实施例3的质粒3:pT7linker2-AtBSD2-AtRaf1-AtRaf2-AtRbcX2通过电击转化法导入大肠杆菌MGM100中,涂布含相应的抗生素平板筛选,获取阳性单菌落,作为pCpn60/20组;将实施例1的质粒1:pTetlinker-AtRbcS-AtRbcL和实施例3的质粒3:pT7linker2-AtBSD2-AtRaf1-AtRaf2-AtRbcX2通过电击转化法导入大肠杆菌MGM100中,涂布含相应的抗生素平板筛选,获取阳性单菌落,作为eGroEL/ES组;
[0142] 2、分别挑选上述两组的单菌落,接种至5ml LB液体培养基中(100mg/ml Kana+,100mg/ml Spe+,25mg/ml Chl+,0.02%阿拉伯糖),37℃,200rpm培养至OD600约0.4;
[0143] 3、分别加入阿拉伯糖至2.0%,加入1M IPTG至0.5mM的终浓度,37℃,200rpm,诱导3h;
[0144] 4、分别取出菌液,1000g,室温离心10min,弃上清。并用新鲜的LB液体培养基悬浮菌液,1000g,室温离心10min,弃上清;
[0145] 5、分别加入含相应抗生素的LB液体培养基,同时加入四环素至300ng/ul,23℃诱导20h;
[0146] 6、分别收集菌液,用100μl的Rubisco assay buffer I(100mM Tris-Cl pH7.5,10mM KCl,2mM Mg(OAc)2)悬浮菌液,超声取pCpn60/20组和eGroEL/ES组上清,进行后续酶活性测定和Western blot检测。其中,所述酶活性测定方法如下:
[0147] 1、取15μl超声后菌液上清,同时15μl的Rubisco assay buffer I作为对照;
[0148] 2.将上清加入Rubisco酶活测定反应体系Rubisco assay buffer II(Rubisco assay buffer I 7.25μl,1M NaHCO3 0.75μl,1M MgCl2 1μl,NaH14CO3 1μl;其中,Rubisco assay buffer I 20 mM MOPS-KOH(pH 7.5),100mM KCL,5mM Mg(OAc)2):
[0149] 3.加入5μl 25mM RuBP,混匀,室温反应5min;
[0150] 4.加入10μl醋酸,终止反应;
[0151] 5.打开离心管盖,移至预热到95℃的加热,烘干1-2h;
[0152] 6.加入100μl ddH2O,涡旋,加入1ml闪烁液,液闪仪每个样品扫描1min。
[0153] 所述Western blot检测:
[0154] 1、取15μl菌液,加入5x SDS loading buffer,95℃变性失活5min。取10μl的样品装载在12%SDS-PAGE上电泳,200V,55min。
[0155] 2、凝胶电泳结束后,将蛋白胶、硝化纤维膜、以及2张稍大于蛋白胶的滤纸浸泡在转膜缓冲液(50mM Tris,192mM Glycine,20%乙醇)5-10min。
[0156] 3、按照滤纸、硝化纤维膜、胶、滤纸的顺序由下至上依次叠加起来,形成一个三明治结构。每次叠加用玻璃棒按一个方向滚动赶走残余的气泡,然后置于半干转膜仪中进行恒流转膜,电流大小为膜的长x宽x0.8mA,时间为1h,保护电压为20v。若有多张胶,其电流为各个电流和。
[0157] 4、转膜结束后,将膜放入含有5%的脱脂奶粉的PBS缓冲液(137mM NaCl,2.68mM KCl,10mM Na2HPO4,1.47mM KH2PO4)中,室温慢速振荡封闭1h。
[0158] 5、倒掉封闭液,加入新鲜的含有5%的脱脂奶粉的PBS缓冲液,再加入适量一抗拟南芥Rubisco抗体,置于摇床慢速振荡,室温孵育1h或者4℃过夜。
[0159] 6、倒掉步骤4的反应液,用PBST缓冲液(137mM NaCl,2.68mM KCl,10mM Na2HPO4,1.47mM KH2PO4,0.1%Tween-20)冲洗3次,每次10min。
[0160] 7、加入新鲜的含有5%的脱脂奶粉的PBS缓冲液和适量二抗,置于摇床慢速振荡,室温孵育1h。
[0161] 8倒掉步骤6的反应液,用PBST缓冲液冲洗3次,每次10min。
[0162] 9、打开LAS4000,待仪器稳定后,将ECL膜置于玻璃平板上,放入LAS4000内用白光调节焦距。设置好参数后,取1mL ECL显色液(100mM Tris-HCl pH 8.5,2.5mM Luminol),加入7.5μL H2O2,混匀后用移液器均与涂布在硝化纤维膜上。选择合适程序进行曝光显影。
[0163] 通过以上检测,结果显示:通过对诱导后产物中Rubisco活性测定及Western blot检测可获得Rubisco在产物中的相对含量,结果如图2所示:pCpn60/20组和eGroEL/ES组均能合成有活性的Rubisco,表明不仅分子伴侣系统Cpn60/20可合成有活性的Rubisco,GroEL/ES系统也同样可以,即在Rubisco合成系统中可无需额外导入携带GroEL/ES的载体,直接通过诱导MGM100菌株基因组上的GroEL/ES就可以有效合成拟南芥Rubisco,极大简化拟南芥Rubisco的体外合成体系,为后续改造Rubisco,获取高效Rubisco提供便利。
[0164] 以上对本发明进行了详述。对于本领域技术人员来说,在不脱离本发明的宗旨和范围,以及无需进行不必要的实验情况下,可在等同参数、浓度和条件下,在较宽范围内实施本发明。虽然本发明给出了特殊的实施例,应该理解为,可以对本发明作进一步的改进。总之,按本发明的原理,本申请欲包括任何变更、用途或对本发明的改进,包括脱离了本申请中已公开范围,而用本领域已知的常规技术进行的改变。按以下附带的权利要求的范围,可以进行一些基本特征的应用。
高效检索全球专利

专利汇是专利免费检索,专利查询,专利分析-国家发明专利查询检索分析平台,是提供专利分析,专利查询,专利检索等数据服务功能的知识产权数据服务商。

我们的产品包含105个国家的1.26亿组数据,免费查、免费专利分析。

申请试用

分析报告

专利汇分析报告产品可以对行业情报数据进行梳理分析,涉及维度包括行业专利基本状况分析、地域分析、技术分析、发明人分析、申请人分析、专利权人分析、失效分析、核心专利分析、法律分析、研发重点分析、企业专利处境分析、技术处境分析、专利寿命分析、企业定位分析、引证分析等超过60个分析角度,系统通过AI智能系统对图表进行解读,只需1分钟,一键生成行业专利分析报告。

申请试用

QQ群二维码
意见反馈