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序号 专利名 申请号 申请日 公开(公告)号 公开(公告)日 发明人
241 新颖的RNA导向性核酸酶及其用途 CN201680072288.0 2016-10-07 CN108513579A 2018-09-07 J·M·奇拓尔; E·D·纳吉; K·H·特纳
本文提供了用于修饰靶DNA序列的系统、方法和组合物。更具体来说,提供了利用能够与靶序列和RNA导向性DNA核酸酶杂交的向导RNA切割真核细胞中的靶DNA的系统、方法和组合物。还提供了编码CRISPR复合物的一种或多种组分的载体和载体系统,以及设计和使用此类载体的方法。还提供了鉴定和验证新颖CRISPR系统的方法。
242 用于修饰SCN9A或SCN10A基因的基因编辑系统及其使用方法 CN202080038231.5 2020-04-10 CN113994009B 2025-05-06 S.萨伊曼; S.卡哈兰; A.耶恩; S.埃斯帕诺拉; S.J.斯宾塞
本文公开了用于体外或体内编辑电压控钠通道基因,例如钠电压门控通道α亚基9(SCN9A)或钠电压门控通道α亚基10(SCN10A)的高效基因编辑系统。本文所公开的基因编辑系统包含RNA引导的DNA核酸内切酶和特异性向导RNA。本文还提供了基因编辑系统修饰靶基因,从而减轻疼痛的用途。
243 一种原核生物来源的Mbp_Argonaute蛋白及其应用 CN202110581929.8 2021-05-25 CN113373129B 2022-07-26 马立新; 李文强; 王飞; 何如怡; 刘洋
发明公开了一种原核生物来源的Mbp_Argonaute蛋白及其应用,所述Mbp_Argonaute蛋白的基酸序列如SEQ ID NO:1或如与SEQ ID NO:1具有至少50%或至少80%同源性的序列所示。本发明合成了一种来源于耐冷原核生物Mucilaginibacter paludis的Argonaute蛋白基因,将该蛋白命名为MbpAgo,研究发现该MbpAgo对单链向导DNA具有结合活性,并且对与单链向导DNA互补配对的靶RNA和/或靶DNA具有核酸酶活性,因此可利用所述MbpAgo进行体内外靶向RNA编辑,进而对遗传材料进行特异性位点修饰。所述MbpAgo不仅可对高级结构的RNA进行修饰,而且不会影响动植物细胞的内源RNAi途径,为RNA编辑提供了一个全新的有工具,并且切割活性强,特异性好。
244 一种原核生物来源的Mbp_Argonaute蛋白及其应用 CN202110581929.8 2021-05-25 CN113373129A 2021-09-10 马立新; 李文强; 王飞; 何如怡; 刘洋
发明公开了一种原核生物来源的Mbp_Argonaute蛋白及其应用,所述Mbp_Argonaute蛋白的基酸序列如SEQ ID NO:1或如与SEQ ID NO:1具有至少50%或至少80%同源性的序列所示。本发明合成了一种来源于耐冷原核生物Mucilaginibacter paludis的Argonaute蛋白基因,将该蛋白命名为MbpAgo,研究发现该MbpAgo对单链向导DNA具有结合活性,并且对与单链向导DNA互补配对的靶RNA和/或靶DNA具有核酸酶活性,因此可利用所述MbpAgo进行体内外靶向RNA编辑,进而对遗传材料进行特异性位点修饰。所述MbpAgo不仅可对高级结构的RNA进行修饰,而且不会影响动植物细胞的内源RNAi途径,为RNA编辑提供了一个全新的有工具,并且切割活性强,特异性好。
245 表达带标签的PERK的细胞及其构建方法和应用 CN202411714189.0 2024-11-27 CN119639814A 2025-03-18 高飞; 陈思宇; 陈剑清
发明涉及一种构建表达带标签的PERK的细胞的方法,包括用Crispr/Cas9系统将编码标签的核酸敲入至PERK上的步骤。所述Crispr/Cas9系统包括向导RNA和修复结构,所述修复结构包括所述向导RNA靶向的区段和标签。本发明通过使用Crispr/Cas9系统将敲入HA标签敲入在U20S细胞系中,使PERK的C端带有血凝素标签。使用该细胞,我们可以通过观察内源性PERK行为来研究PERK相互作用、生理功能、药物筛选等,为研究PERK信号通路在神经退行性疾病、髓磷脂紊乱、肿瘤生长和癌症的病理生理学和疾病进展中起到重要作用。
246 用于检测沙氏菌的一步法CRISPR/Cas12b检测试剂盒及方法 CN202410188690.1 2024-02-20 CN117947195B 2024-11-22 龚建森; 张笛; 盛中伟; 许明; 董永毅; 张萍; 李婷婷; 窦新红; 吴坤; 陈莉
发明涉及生物检测领域,具体涉及一种用于检测沙氏菌的一步法CRISPR/Cas12b检测试剂盒及方法,所述试剂盒包括F引物、R引物、向导RNA、Cas12b蛋白、单链核酸报告分子;所述F引物的核苷酸序列如SEQ ID NO.2所示;所述R引物的核苷酸序列如SEQ ID NO.3所示;所述向导RNA的核苷酸序列如SEQ ID NO.16所示;所述单链核酸报告分子为5’‑/6‑FAM/TTTTTTTT/BHQ1/‑3’。本发明成功开发了一种沙门氏菌检测试剂盒,采用本发明的试剂盒进行检测,核酸扩增和检测同步进行,无需开盖检测。实验结果表明,本发明沙门氏菌检测系统具有较好的特异性和灵敏度。
247 通过靶向DMPK基因治疗肌营养不良症的方法 CN202080032034.2 2020-05-27 CN113785066B 2024-06-18 吉见英治; 大江智也; 山形哲也; 基思·M·康诺利
发明提供了包含下述基序列的多核苷酸:(a)编码核酸酶缺陷型CRISPR效应蛋白与转录阻遏物的融合蛋白的碱基序列,和(b)编码向导RNA的碱基序列,所述向导RNA靶向人类DMPK基因的表达调控区中SEQ ID NO:127、SEQ ID NO:46、SEQ ID NO:128、SEQ ID NO:129、SEQ ID NO:130、SEQ ID NO:131、SEQ ID NO:132、SEQ ID NO:88、SEQ ID NO:91、SEQ ID NO:133、SEQ ID NO:137、SEQ ID NO:117或SEQ ID NO:119所示的区域中长度为18至24个核苷酸的连续区域,所述多核苷酸预期可用于治疗肌营养不良症。
248 用于检测沙氏菌的一步法CRISPR/Cas12b检测试剂盒及方法 CN202410188690.1 2024-02-20 CN117947195A 2024-04-30 龚建森; 张笛; 盛中伟; 许明; 董永毅; 张萍; 李婷婷; 窦新红; 吴坤; 陈莉
发明涉及生物检测领域,具体涉及一种用于检测沙氏菌的一步法CRISPR/Cas12b检测试剂盒及方法,所述试剂盒包括F引物、R引物、向导RNA、Cas12b蛋白、单链核酸报告分子;所述F引物的核苷酸序列如SEQ ID NO.2所示;所述R引物的核苷酸序列如SEQ ID NO.3所示;所述向导RNA的核苷酸序列如SEQ ID NO.16所示;所述单链核酸报告分子为5’‑/6‑FAM/TTTTTTTT/BHQ1/‑3’。本发明成功开发了一种沙门氏菌检测试剂盒,采用本发明的试剂盒进行检测,核酸扩增和检测同步进行,无需开盖检测。实验结果表明,本发明沙门氏菌检测系统具有较好的特异性和灵敏度。
249 通过细胞外囊泡来递送CRISPR/MCAS9以用于基因组编辑 CN202080039873.7 2020-04-02 CN113923983B 2024-02-27 蔡后建
本文公开了一种用于基因编辑的融合蛋白,其包含Cas9结构域,所述Cas9结构域被配置成封装到外泌体中并定位至受体细胞的细胞核。还公开了包含编码所公开的Cas9融合蛋白的核酸序列的重组多核苷酸。还公开了包含所公开的多核苷酸的细胞。还公开了制备基因编辑组合物的方法,其涉及在适于产生封装向导RNA和融合蛋白的细胞外囊泡的条件下培养所公开的细胞。还公开了涉及封装所公开的Cas9融合蛋白和向导RNA的细胞外囊泡的基因编辑组合物。最后,本文还公开了用于在细胞中编辑基因的方法,其涉及使所述细胞与本文公开的基因编辑组合物接触
250 一种中高温Argonaute蛋白在特异性切割靶核酸中的应用 CN202211260452.4 2022-10-14 CN115975985A 2023-04-18 马立新; 王飞; 王珑瑜; 谢晓晨; 陈晚苹
发明公开了一种中高温Argonaute蛋白在特异性切割靶核酸中的应用,所述Argonaute蛋白的基酸序列如SEQ ID NO.1所示,编码该Argonaute蛋白的核苷酸序列如SEQ ID NO.2所示。本发明提供了上述Argonaute蛋白的体外合成方法,并发现该蛋白对两种向导5’OH‑gRNA和5’P‑gRNA具有结合活性,其能够利用这两种向导去切割靶ssDNA和利用5’OH‑gRNA去切割靶RNA,实现靶向DNA或靶向RNA编辑,同时还可切割质粒。因此,本发明为基于原核生物来源的Argonaute蛋白的基因克隆和分子检测提供了一种新的工具。
251 一种基于CRISPR/Cas12a系统的核酸检测试剂盒和检测方法 CN202211362447.4 2022-11-02 CN115948614A 2023-04-11 请求不公布姓名
发明属于病原核酸检测技术领域,具体公开了一种基于CRISPR/Cas12a系统的核酸检测试剂盒和检测方法,该试剂盒包括crDNA扩增引物对、Cas12a蛋白、用于变温扩增的DNA聚合酶、RNA聚合酶和单链DNA报告分子;所述crDNA扩增引物对包含启动子序列,用于扩增能够体外转录产生crRNA的转录模板,所述crRNA包括用于与所述Cas12a蛋白结合的锚定序列和用于靶向靶标序列的向导序列,所述向导序列的长度为43bp~75bp。本发明试剂盒无需额外提供RNA,有利于试剂盒的保存与运输,可用于POCT检测,适用于对各种病毒的现场快速高灵敏筛查,可最大程度遏止病毒的传播,具有广阔的应用前景。
252 基因编辑结果的预测方法、装置、电子设备、程序及介质 CN202210467922.8 2022-04-29 CN114783518A 2022-07-22 张翠芳; 苑淞; 张振中
本公开提供的基因编辑结果的预测方法、装置、电子设备、程序及介质,属于基因基因数据分析技术领域。所述方法包括:获取目标基因组的目标基因甲基化数据、目标基因序列数据以及所述目标基因序列数据相对应的向导RNA序列数据;根据所述目标基因甲基化数据、所述目标基因序列数据、所述向导RNA序列数据,构建基因编辑数据;将所述基因编辑数据输入至基因编辑结果预测模型进行预测。
253 使用基编辑器进行靶向诱变 CN201980087604.5 2019-11-04 CN113874501A 2021-12-31 梅钰; A·赫梅尔; Z·瓦格齐帕瓦拉; 高彩霞; 李超; 张瑞
发明涉及发现性状和产生具有改进表型的细胞系统的新方法。特别地,本发明提供了通过使用具有很少或没有脱靶效应的靶向诱变来开发具有优化农艺表型的植物的方法。靶向诱变是通过引入包含一系列靶向感兴趣核酸序列的向导RNA的基编辑复合物或STEME复合物来实现的。本发明还涉及通过本文所述的方法获得的细胞系统,以及包含向导RNA阵列的碱基编辑复合物或STEME复合物用于产生具有重要农艺表型的细胞系统和用于鉴定重要农艺表型的用途。
254 通过靶向DMPK基因治疗肌营养不良症的方法 CN202080032034.2 2020-05-27 CN113785066A 2021-12-10 吉见英治; 大江智也; 山形哲也; 基思·M·康诺利
发明提供了包含下述基序列的多核苷酸:(a)编码核酸酶缺陷型CRISPR效应蛋白与转录阻遏物的融合蛋白的碱基序列,和(b)编码向导RNA的碱基序列,所述向导RNA靶向人类DMPK基因的表达调控区中SEQ ID NO:127、SEQ ID NO:46、SEQ ID NO:128、SEQ ID NO:129、SEQ ID NO:130、SEQ ID NO:131、SEQ ID NO:132、SEQ ID NO:88、SEQ ID NO:91、SEQ ID NO:133、SEQ ID NO:137、SEQ ID NO:117或SEQ ID NO:119所示的区域中长度为18至24个核苷酸的连续区域,所述多核苷酸预期可用于治疗肌营养不良症。
255 一种基于CRISPR-Cas12a系统的运动发酵单胞菌基因组编辑方法及其应用 CN201910692112.0 2019-07-30 CN110358767B 2021-06-08 杨世辉; 沈威; 彭文舫; 马立新
发明属于基因编辑技术领域,尤其涉及一种基于CRISPR‑Cas12a系统的运动发酵单胞菌基因组编辑方法及其应用。旨在以运动发酵单胞菌Zymomonas mobilis ZM4为模式菌株,基于CRISPR‑Cas12a系统构建用于运动发酵单胞菌基因组编辑的方法,实现对基因组的定向编辑,为在该菌株中开展理性设计异源代谢途径及细胞工厂用于生物燃料生物材料的生产提供一套基因编辑工具,促进代谢工程等相关研究领域的发展。技术要点包括:构建诱导型表达的Cas12a重组菌株及含人工CRISPR表达单元的编辑质粒;设计向导RNA;将向导RNA引物序列退火后连接至编辑质粒中;将靶质粒转入感受态细胞表达编辑。
256 一种骨干质粒载体及应用 CN201410225914.8 2014-05-23 CN103981216A 2014-08-13 魏鹏程; 杨剑波; 秦瑞英; 李莉; 李浩; 马卉; 陆徐忠; 杨亚春; 倪大虎; 倪金龙; 宋丰顺
发明公开了一种骨干质粒载体,在该骨干质粒载体中:向导RNA表达框和Cas9核酸酶表达框位于同一双元载体中,向导RNA表达框由小麦TaU3p启动子、壮观霉素抗性基因、人工合成的sgRNA骨架序列和Poly-T终止子依次构成;Cas9核酸酶表达框由ZmUBI启动子、植物偏好密码子改造后的Cas9编码序列和35s终止子依次构成。本发明还提供了由所述骨干质粒载体构建的含有靶标序列的重组载体,用于作物基因打靶的应用。
257 一种鸡白痢沙氏菌基因组核苷酸的编辑方法及其组合物与应用 CN202510064006.3 2025-01-15 CN119736297A 2025-04-01 李晓磊
发明涉及生物医药技术领域,更具体而言,涉及一种鸡白痢沙氏菌基因组核苷酸的编辑方法及其组合物与应用。所述编辑方法包括使鸡白痢沙门氏菌基因组与一种或多种向导RNA以及包含可编程DNA结合蛋白接触,其中向导RNA靶向基编辑器以实现基因组核苷酸的改变。通过对特定位点靶向时对核酸酶的突变实验,找到了适合的LbCpf1变体,更加适用于靶向特定位点(例如PhnT基因特定基因靶标),相比较其他基因编辑蛋白(例如其他核酸酶或LbCpf1 WT)具有显著的编辑效率改善。
258 使用基编辑器进行靶向诱变 CN201980087604.5 2019-11-04 CN113874501B 2024-10-18 梅钰; A·赫梅尔; Z·瓦格齐帕瓦拉; 高彩霞; 李超; 张瑞
发明涉及发现性状和产生具有改进表型的细胞系统的新方法。特别地,本发明提供了通过使用具有很少或没有脱靶效应的靶向诱变来开发具有优化农艺表型的植物的方法。靶向诱变是通过引入包含一系列靶向感兴趣核酸序列的向导RNA的基编辑复合物或STEME复合物来实现的。本发明还涉及通过本文所述的方法获得的细胞系统,以及包含向导RNA阵列的碱基编辑复合物或STEME复合物用于产生具有重要农艺表型的细胞系统和用于鉴定重要农艺表型的用途。
259 一种印第安纳沙氏菌分子检测方法及试剂 CN202410188685.0 2024-02-20 CN117947194B 2024-09-20 张笛; 龚建森; 盛中伟; 沈海玉; 董永毅; 李婷婷; 吴坤; 许明; 窦新红; 王怡
发明涉及一种基于CRISPR的印第安纳沙氏菌检测试剂盒及其方法,所述试剂盒包括F引物、R引物、向导RNA、Cas12b蛋白、单链核酸报告分子;所述F引物的核苷酸序列如SEQ ID NO.10所示;所述R引物的核苷酸序列如SEQ ID NO.11所示;所述向导RNA的核苷酸序列如SEQ ID NO.23所示;所述单链核酸报告分子为5’‑/6‑FAM/CCCCCCCC/BHQ1/‑3’。本发明成功开发了一种印第安纳沙门氏菌检测试剂盒,采用本发明的试剂盒进行检测,核酸扩增和检测同步进行,无需开盖检测。实验结果表明,本发明印第安纳沙门氏菌检测系统具有较好的特异性和灵敏度。
260 用于即时核酸检测的组合物和方法 CN202280002216.4 2022-01-07 CN115335536B 2024-09-20 殷昊; 芦舒涵; 张楹; 佟晓晗; 张坤; 周溪; 张定宇
提供了用于简单、无仪器且灵敏的方法的组合物和方法,该方法能够对目的核酸分子进行快速、即时检测。这基于一个令人惊讶的发现,即扩增及基于CRISPR的切割和检测的相对效率可以调整为利于扩增,直到生成足够的扩增产物实现检测。示例方法包括设计向导RNA和引物以靶向非最优PAM序列,或序列工程化Cas核酸酶以降低其在与该向导RNA形成核糖核蛋白或者结合或切割底物核酸方面的活性。
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