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序号 专利名 申请号 申请日 公开(公告)号 公开(公告)日 发明人
161 基于CRISPR-Cas自催化放大网络的核酸检测方法及其应用 CN202011071868.2 2020-10-09 CN112251494A 2021-01-22 聂舟; 史铠; 雷春阳
申请提供了一种基于CRISPR‑Cas自催化放大网络的核酸检测方法,包括:提供待测样品,待测样品中含有靶标基因组序列;配制包括Cas蛋白、靶标向导RNA、荧光检测探针、辅助探针和缓冲液反应体系;荧光检测探针包括辅助探针向导RNA和杂交在辅助探针向导RNA上的修饰有可检测的标记物的至少一条寡核苷酸链探针;将待测样品加至反应体系中,经恒温定时反应,荧光检测探针上的至少一条寡核苷酸链探针被Cas蛋白反式切割,释放的辅助探针向导RNA引导Cas蛋白特异性结合辅助探针,形成正反馈回路系统,寡核苷酸链探针被切割后产生可检测信号,检测和获得检测结果。该核酸检测方法灵敏度高、特异性强。本申请还提供了其应用。
162 基于C2c1核酸酶的基因组编辑系统和方法 CN201811300251.6 2018-11-02 CN109337904B 2020-12-25 李伟; 周琪; 滕飞
发明涉及基因工程领域。具体而言,本发明涉及基于C2c1核酸酶的基因组编辑系统和方法。本发明还涉及可与不同C2c1核酸酶组合用于基因组编辑的人工向导RNA。
163 基于C2c1核酸酶的基因组编辑系统和方法 CN202011431478.1 2018-11-02 CN112961853B 2024-09-06 李伟; 周琪; 滕飞
发明涉及基因工程领域。具体而言,本发明涉及基于C2c1核酸酶的基因组编辑系统和方法。本发明还涉及可与不同C2c1核酸酶组合用于基因组编辑的人工向导RNA。
164 一种CRISPR文库筛选的方法 CN201680091302.1 2016-11-30 CN110402305B 2023-07-21 吴森; 胥春龙; 齐晓兰; 杜旭光; 邹慧影
提供了包含多个PB介导的CRISPR系统多核苷酸的基因组文库,其包含侧翼为最小的piggybac反向重复元件的最小向导RNA。还提供了使用所述多核苷酸文库进行体内基因组规模筛选的方法。
165 同源重组机制介导的精准序列替换基因编辑方法及其元件结构 CN202110325672.X 2021-03-26 CN112921038B 2022-08-02 许永汉; 林新春; 马传喜; 李金才; 胡晓渝; 王晓波; 武德传; 齐泽宇; 吕蔺; 蒋欣瑜; 桂昊
发明公开了同源重组机制介导的精准序列替换基因编辑方法及元件结构,所述方法包括:(1)以靶区段300‑400bp DNA序列为基础,其中插入或缺失多个DNA片断形成MsDFID序列,同时作为向导RNA和供体模板,也被称为MsDFID向导和供体RNA;(2)在所述MsDFID供体模板3’端连接成簇且规律间隔短重复DNA回文结构,即PCRISR,或Cas9向导RNA骨架,或大肠杆菌CRISPR‑Cas3回文重复序列。后面这三种序列均作为向导RNA骨架;(3)用上述融合序列构建供体载体,转化大肠杆菌,MsDFID供体模板内供体位点所含DNA片断插入或缺失被替换到靶区段对应位点。本发明成功实现以序列替换为唯一效果的基因编辑,解决当前基因编辑系统面临的几个主要问题:对PAM序列依赖、较高脱靶险和难以实现精准序列替换。
166 基于C2c1核酸酶的基因组编辑系统和方法 CN202011431478.1 2018-11-02 CN112961853A 2021-06-15 李伟; 周琪; 滕飞
发明涉及基因工程领域。具体而言,本发明涉及基于C2c1核酸酶的基因组编辑系统和方法。本发明还涉及可与不同C2c1核酸酶组合用于基因组编辑的人工向导RNA。
167 同源重组机制介导的精准序列替换基因编辑方法及其元件结构 CN202110325672.X 2021-03-26 CN112921038A 2021-06-08 许永汉; 林新春; 马传喜; 李金才; 胡晓渝; 王晓波; 武德传; 齐泽宇; 吕蔺; 蒋欣瑜; 桂昊
发明公开了同源重组机制介导的精准序列替换基因编辑方法及元件结构,所述方法包括:(1)以靶区段300‑400bp DNA序列为基础,其中插入或缺失多个DNA片断形成MsDFID序列,同时作为向导RNA和供体模板,也被称为MsDFID向导和供体RNA;(2)在所述MsDFID供体模板3’端连接成簇且规律间隔短重复DNA回文结构,即PCRISR,或Cas9向导RNA骨架,或大肠杆菌CRISPR‑Cas3回文重复序列。后面这三种序列均作为向导RNA骨架;(3)用上述融合序列构建供体载体,转化大肠杆菌,MsDFID供体模板内供体位点所含DNA片断插入或缺失被替换到靶区段对应位点。本发明成功实现以序列替换为唯一效果的基因编辑,解决当前基因编辑系统面临的几个主要问题:对PAM序列依赖、较高脱靶险和难以实现精准序列替换。
168 一种CRISPR文库筛选的方法 CN201680091302.1 2016-11-30 CN110402305A 2019-11-01 吴森; 胥春龙; 齐晓兰; 杜旭光; 邹慧影
提供了包含多个PB介导的CRISPR系统多核苷酸的基因组文库,其包含侧翼为最小的piggybac反向重复元件的最小向导RNA。还提供了使用所述多核苷酸文库进行体内基因组规模筛选的方法。
169 一种真核生物来源的Cs_Argonaute蛋白质及其应用 CN202410427777.X 2024-04-10 CN118256565A 2024-06-28 马立新; 王飞; 颜光波; 余晓岚; 李文强; 刘洋; 陈晚苹
发明公开了一种真核生物来源的Cs_Argonaute蛋白质及其应用,所述Cs_Argonaute蛋白质为基酸序列如SEQ ID NO:1所示的蛋白质,或为与SEQ ID NO:1所示序列的非催化活性位点具有至少90%序列一致性且功能相同的蛋白质;该Cs_Argonaute蛋白质不仅具有对单链向导DNA、RNA互补配对的靶RNA具有专一性核酸酶活性,而且具有对单链向导RNA互补配对的靶DNA具有核酸酶活性,更特别之处在于具有对单链向导DNA互补配对的靶DNA具有核酸酶活性,这在之前的研究中鲜有报道。本发明为基于真核生物来源的Argonaute蛋白质的基因编辑、修饰及分子检测提供了一种新的工具。
170 一种用于合成丙酸或L-酪酸的菌株 CN202410198243.4 2024-02-22 CN117887651A 2024-04-16 肖毅; 赵明涛
发明涉及一种用于合成丙酸或L‑酪酸的菌株,是通过在大肠杆菌中引入CRISPR/dCas9干扰系统CRISPRi,抑制丙酮酸脱羧酶复合物E1基因aceE的表达构建而得的菌株;所述CRISPRi由dCas9蛋白和向导RNA组成,所述向导RNA为序列如SEQ ID No.01‑SEQ ID No.14中任意一条所示的向导RNA。获得的菌株SPYR01‑15,可以将葡萄糖、木糖或者葡萄糖‑木糖混合物转化为丙酮酸。进一步改造菌株SPYR13、SPYR15,可以将木质素衍生的酚类化合物(苯酚和对香豆酸)与葡萄糖、木糖或者葡萄糖和木糖混合物转化为L‑酪氨酸。本发明所得菌株,丙酮酸的产量在2‑35g/L,L‑酪氨酸的产量在1‑21g/L。
171 基因编辑组合物及其用途 CN202410051319.0 2024-01-15 CN117568313A 2024-02-20 陆春菊; 吕锋华; 徐天宏; 赖祺; 李珏琬
发明涉及基因治疗药物领域,特别是涉及一种基因编辑组合物及其用途。本发明的基因编辑组合物包含:1)基编辑器融合蛋白,或编码所述碱基编辑器融合蛋白的核酸;2)向导RNA,或编码所述向导RNA的核酸,其中向导RNA包含间隔序列片段和scaffold序列片段,编码所述间隔序列片段的核苷酸序列如SEQ ID No.1‑71任一所示。本发明的基因编辑组合物可以在体外和体内高效编辑LPA基因,并可以在体内实现Apo(a)蛋白的部分或完全敲除。此外,本发明的基因编辑组合物可以在体外和体内高效编辑LPA基因的同时,没有发现脱靶效应,具备基因治疗的安全性。
172 一种小型高效的CRISPRa内源性基因转录激活工具 CN202310930746.1 2023-07-26 CN117165588A 2023-12-05 饶书权; 曹佳璇; 陈信文; 程辉; 程涛
申请涉及一种小型高效的CRISPRa内源性基因转录激活工具,具体为一种基于UniCas12f基因编辑系统改造的融合蛋白和向导RNA、以及包含所述融合蛋白和向导RNA的转录激活体系dCasMINI‑SAM。本申请还保护将所述改造的向导RNA和dCasMINI‑SAM体系用于内源基因转录激活调控,或用于在细胞内进行基因激活表达的应用。本申请的转录激活工具极大的改善了对内源性基因位点的激活效果,且可以同时对内源性多个基因同时进行激活,具有广阔的应用潜
173 目标DNA的编辑方法、编辑了目标DNA的细胞的制备方法及用于它们的DNA编辑系统 CN202180054310.X 2021-09-03 CN116157517A 2023-05-23 佐久间哲史; 山本卓; 西堀奈穗子; 吉间忠彦; 堀込一彦
一种编辑目标DNA的方法,其包括:使(1)含有TALE和核基转化酶的融合蛋白、以及(2)含有部分或全部丧失核酸酶活性的Cas9蛋白及其向导RNA的CRISPR‑Cas9系统与目标DNA接触,通过所述融合蛋白的核碱基转化酶活性,编辑所述目标DNA的目标位点的碱基的工序,所述融合蛋白中的TALE所识别的TALE识别序列或其互补序列经由7~31bp的链长的间隔区1存在于所述目标位点的5′侧,并且所述CRISPR‑Cas9系统中的向导RNA所识别的向导RNA目标序列以含有所述目标位点的互补碱基的方式存在。
174 用于治疗冠状病毒诱导疾病的一体式腺相关病毒 (AAV) 载体 CN202180026993.8 2021-03-11 CN115667512A 2023-01-31 伊丽莎白.齐斯伯格; 徐兴波; 迈克尔.齐斯伯格; 格尔德.哈森福斯; 谭小英
发明涉及治疗冠状病毒感染的新方法,特别是由MERS‑CoV、SARS‑CoV和SARS‑CoV‑2变体引起的感染。基于有效靶向和切割单链RNA病毒,本发明提供了Cas13d向导RNA,以将Cas13d蛋白向导至人源化冠状病毒科基因组中MERS‑CoV、SARS‑CoV和SARS‑CoV‑2之间保守区域的靶位点。本发明还提供了一种AAV载体,其包含这种Cas13d向导RNA表达盒,以及AAV载体用于治疗冠状病毒感染,尤其是COVID‑19感染。
175 一种基于CRISPR-Cas的一管法核酸检测方法及相应产品 CN202310978995.8 2023-08-04 CN119432841A 2025-02-14 请求不公布姓名
发明涉及一种基于CRISPR‑Cas的一管法核酸检测方法及相应产品,具体地,涉及一种基于Cas蛋白的检测方法,可不开盖添加试剂实现核酸扩增和检测。具体地,本发明提供了一种一管法的扩增和检测靶标核酸分子的体系,所述体系包含:等温扩增试剂、Cas蛋白,向导RNA,Cas蛋白反式切割报告分子,寡核苷酸或寡核苷酸类似物,所述寡核苷酸或寡核苷酸类似物可与所述向导RNA互补,形成封闭的向导RNA。本发明只使用了寡核苷酸或寡核苷酸类似物和两段变温条件,实现起来较为容易,可直接适配现有的荧光检测平台。
176 一种靶向TTR的saCas9 sgRNA及其修饰方式 CN202410897587.4 2024-07-05 CN119265190A 2025-01-07 张冰; 杨平; 吴硕
发明提供了一种靶向TTR的saCas9sgRNA及其修饰形式,所述经修饰的saCas9sgRNA包含20至22个核苷酸长度的向导RNA和77个核苷酸长度的sgRNA骨架,并且所述saCas9sgRNA的核苷酸序列包含至少一种化学修饰;并且所述靶向TTR的saCas9sgRNA包含在5’末端的向导RNA,所述向导RNA的序列是如SEQ ID NO:1‑9中任一种所示的核苷酸序列的至少20个、至少21个、或全部22个连续核苷酸。本发明提供的saCas9sgRNA可显著提高编辑活性、降低脱靶效率。
177 基于CRISPR/Cas12a的大白菜黑腐病检测方法及其相关材料和应用 CN202410766641.1 2024-06-14 CN118853665A 2024-10-29 于拴仓; 刘肖静; 张凤兰; 汪维红; 苏同兵; 李佩荣; 辛晓云; 赵岫云; 张德双; 余阳俊
发明公开了基于CRISPR/Cas12a的大白菜黑腐病检测方法及其相关材料和应用。具体公开了一种用于切割黑腐病rDNA‑ITS序列的Cas12a向导RNA分子,所述向导RNA分子包括靶向序列和结构序列,所述靶向序列的核酸序列为序列1的第4位‑第24位,所述结构的核酸序列为序列1的第25位‑第44位。使用向导RNA分子和及针对靶标设计的检测引物对待测样本进行Cas12a‑RPA检测,结果表明可快速、直观的检测到样本中是否含有目标基因组,可用于工农业生产。
178 基于CRISPR/Cas12a的大白菜根肿病检测方法及其相关材料和应用 CN202410766640.7 2024-06-14 CN118546930A 2024-08-27 于拴仓; 刘肖静; 李佩荣; 汪维红; 苏同兵; 辛晓云; 张凤兰; 赵岫云; 张德双; 余阳俊; 马涛
发明公开了基于CRISPR/Cas12a的大白菜根肿病检测方法及其相关材料和应用。具体公开了一种用于切割根肿病rDNA‑ITS序列的Cas12a向导RNA分子,所述向导RNA分子包括靶向序列和结构序列,所述靶向序列的核酸序列为序列1的第4位‑第24位,所述结构的核酸序列为序列1的第25位‑第44位。使用向导RNA分子和及针对靶标设计的检测引物对待测样本进行cas12a‑RPA检测,结果表明可快速、直观的检测到样本中是否含有目标基因组,可用于工农业生产。
179 用于敲除C5的CRISPR/Cas相关方法及组合物 CN202280073032.7 2022-10-28 CN118251491A 2024-06-25 基肖尔·德瓦拉拉贾-纳拉什姆哈; 洛里·莫顿; 埃万盖洛斯·普凡尼斯; 苏珊娜·哈特福德; 阿蒂-马亨德拉-普拉卡什·坎乔利亚; 萨拉·黑塞
提供了靶向C5基因座或基因的向导RNA和CRISPR/Cas系统、包含此类向导RNA或CRISPR/Cas系统的脂质纳米颗粒或病毒载体,以及包含此类向导RNA或系统的细胞或动物。还提供了使用这些CRISPR/Cas系统修饰或敲低或敲除C5基因座的方法,以及这些CRISPR/Cas系统在用于治疗和/或预防与C5相关的疾病、病症或病状和/或用于改善与此类疾病、病症或病状相关的至少一种症状的预防性和治疗性应用中的用途。
180 基因编辑组合物及其用途 CN202410051319.0 2024-01-15 CN117568313B 2024-04-26 陆春菊; 吕锋华; 徐天宏; 赖祺; 李珏琬
发明涉及基因治疗药物领域,特别是涉及一种基因编辑组合物及其用途。本发明的基因编辑组合物包含:1)基编辑器融合蛋白,或编码所述碱基编辑器融合蛋白的核酸;2)向导RNA,或编码所述向导RNA的核酸,其中向导RNA包含间隔序列片段和scaffold序列片段,编码所述间隔序列片段的核苷酸序列如SEQ ID No.1‑71任一所示。本发明的基因编辑组合物可以在体外和体内高效编辑LPA基因,并可以在体内实现Apo(a)蛋白的部分或完全敲除。此外,本发明的基因编辑组合物可以在体外和体内高效编辑LPA基因的同时,没有发现脱靶效应,具备基因治疗的安全性。
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