다수의 목표 유전자를 검출할 수 있는 특이성 조건을 만족하는 유효한 프라이머 세트와 프루브 세트를 동시에 디자인하는 방법 |
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| 申请号 | KR1020160080872 | 申请日 | 2016-06-28 | 公开(公告)号 | KR101889146B1 | 公开(公告)日 | 2018-08-17 |
| 申请人 | 发明人 | ||||||
| 摘要 | 본발명은다수의목표유전자를검출할수 있는특이성조건을만족하는유효한프라이머세트와프루브세트를한꺼번에빠르게설계할수 있도록한 방법에관한것으로서, 상기방법은, 대규모 DNA 서열데이터베이스에대한하둡기반의오프라인연산을통해가능한모든유전자쌍에대해특이성조건을만족하는후보프라이머집합과프루브집합을추출하는제 1 단계; 상기제 1단계에서추출한후보프라이머집합과프루브집합을이용하여특이성검사를할 수있는색인구조를메인메모리상에서구성하는제 2 단계; 상기제 2 단계에서구성된색인구조를이용하여사용자에의해주어진다수의목표유전자들의각각을검출할수 있는싱글/페어필터링제약조건들을만족하는유효한프라이머집합과프루브집합을온라인연산을통해빠르게검색한후, 각표적유전자를위한최적의프라이머쌍과프루브만을선별하여웹 페이지로출력하는제3 단계를포함한다. | ||||||
| 权利要求 | |||||||
| 说明书全文 | |||||||
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