经过特异性灭活丁子香酚和阿魏酸分解代谢的基因构建制备取代酚的生产菌株 |
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申请号 | CN99812907.0 | 申请日 | 1999-10-20 | 公开(公告)号 | CN1325444A | 公开(公告)日 | 2001-12-05 |
申请人 | 哈尔曼及赖默股份有限公司; | 发明人 | J·拉本霍尔斯特; A·斯坦比歇尔; H·普里菲尔特; J·奥维尔哈格; | ||||
摘要 | 本 发明 涉及转化的和/或诱变的单或多细胞 生物 体,其特征在于,丁子香酚和/或阿魏酸代谢的酶被灭活,使得中间产物松柏 醛 ,松柏醇,阿魏酸,香草醛和/或香 草酸 被积累。 | ||||||
权利要求 | 1.转化的和/或诱变的单细胞或多细胞生物,其特征在于丁子香 酚和/或阿魏酸分解代谢的酶被灭活,使得中间产物松柏醇,松柏醛, 阿魏酸,香草醛和/或香草酸积累。 |
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说明书全文 | 本发明涉及生产菌株的构建且涉及制备取代的甲氧基苯酚,特别 是香草醛的方法。DE-A4227076(制备取代的甲氧基苯酚的方法,及适用于该目 的的微生物)描述了使用一种新的假单胞菌属种类制备取代的甲氧基 苯酚。在该文中起始材料是丁子香酚且产物是阿魏酸、香草酸、松柏 醇和松柏醛。 由Rosazza等撰写(阿魏酸:一种丰富的芳香族天然产物:J.Ind. Microbiol.15:457-471)的使用阿魏酸可能的生物转化的综述也于 1995年出版。 在EP-A0845532中描述了来自假单胞菌属种类的合成松柏醇, 松柏醛,阿魏酸,香草酸和香草醛的基因和酶。 英国Norwich郡食品研究所在WO97/35999中描述了将反式-阿 魏酸转化成反式-阿魏酰-SCoA酯并随后转化成香草醛的酶及裂解 该酯的基因。1998年,该专利的内容以科技文献的形式出版(Gasson 等,1998,阿魏酸代谢成香草醛。生物学化学杂志,273:4163-4170: Narbad和Gasson 1998。在新分离的荧光假单胞菌菌株中使用新的 CoA-依赖型途径经香草醛代谢阿魏酸。微生物学,144:1397-1405)。 DE-A-19532317描述了使用拟无枝酸菌属种类经发酵从阿 魏酸以高产量获得香草醛。 已知方法的缺点在于它们仅能获得极低产量的香草醛或者使用 相当昂贵的起始化合物。尽管最后提到的方法(DE-A19532317) 确实实现了高产量,但使用假单胞菌属种类HR199和拟无枝酸菌属种 类HR167将丁子香酚生物转化成香草醛需要进行2步发酵,因此导致 相当昂贵和费时。 因此本发明的目的是构建能以一步方法相当廉价地将原材料丁 子香酚转化成香草醛的生物。 借助于构建单细胞的生产菌株或多细胞的生物实现该目的,该菌 株的特征在于丁子香酚和/或阿魏酸分解代谢的酶被灭活使得积累中 间产物松柏醇,松柏醛,阿魏酸,香草醛和/或香草酸。 该生产菌株可以是单细胞或多细胞。因此,本发明涉及微生物, 植物或动物。而且也可使用从生产品种获得的提取物。根据本发明, 优选使用单细胞生物。这些所述的生物可以是微生物或动物或植物细 胞。根据本发明,特别优选使用真菌和细菌。最优选的是细菌种类。 在其丁子香酚和/或阿魏酸分解代谢被改变后特别可使用的细菌是红 球菌属,假单胞菌属和埃希氏杆菌属的种类。 在最简单的情况下,已知的常规微生物学方法可用于分离根据本 发明使用的生物。 因此,可使用酶抑制剂改变丁子香酚和/或阿魏酸分解代谢中涉 及的蛋白质的酶活性。而且,经过突变编码这些蛋白质的基因可改变 丁子香酚和/或阿魏酸分解代谢中涉及的蛋白质的酶活性。该突变可 借助于传统方法以随机方式产生,例如经过使用紫外照射或诱导突变 的化学剂。 诸如缺失,插入和/或核苷酸交换的重组DNA方法同样适合于分 离新生物。因此,例如可使用其它的DNA元件(Ω元件)灭活该生物 的基因。合适的载体可用于以改变和/或灭活的基因结构取代完整基 因。在本文中,待灭活的基因,和用于灭活的DNA元件可借助于传统 克隆技术或借助于聚合酶链式反应(PCR)获得。 例如,在本发明的一个可能的实施方案中,可经过插入Ω元件或 导入缺失进入合适的基因中来改变丁子香酚分解代谢和阿魏酸分解 代谢。在本文中,可使用上述重组DNA方法灭活编码脱氢酶,合成酶, 水合酶-醛缩酶,硫解酶或脱甲基酶的基因的功能以便阻断相关酶的 生产。优选的是,该基因是编码松柏醇脱氢酶,松柏醛脱氢酶,阿魏 酰CoA合成酶,烯酰CoA水合酶-醛缩酶,β-酮硫解酶,香草醛脱氢 酶或香草酸脱甲基酶的基因。非常特别优选的是编码在EP-A 0845532中限定的氨基酸序列的基因和/或编码其等位变异体的核苷 酸序列。 因此本发明还涉及制备转化生物和突变体的基因结构。 优选采用编码脱氢酶,合成酶,水合酶-醛缩酶,硫解酶或脱甲 基酶的核苷酸序列被灭活的基因结构来分离该生物和突变体。特别优 选的是编码松柏醇脱氢酶,松柏醛脱氢酶,阿魏酰CoA合成酶,烯酰 CoA水合酶-醛缩酶,β-酮硫解酶,香草醛脱氢酶或香草酸脱甲基酶 的核苷酸序列被灭活的基因结构。极其优选的基因结构表现为图1a 至1r给出的结构,具有图2a至2r所示的核苷酸序列和/或编码其等 位变异体的核苷酸序列。在本文中,特别优选的是核苷酸序列1至 18。 本发明还包含这些基因结构的部分序列及其功能等同物。功能等 同物的意思应理解为该DNA的衍生物,其中个别的核苷酸碱基被交换 (摆动交换(Wobbel austausche))而不改变其功能。在蛋白质水平 上也可交换氨基酸而不导致其功能改变。 在该基因结构的上游和/或下游可插入一个或多个DNA序列。经 过克隆该基因结构,可获得适用于转化和/或转染生物和/或适用于接 合转移进生物的质粒或载体。 本发明还涉及用于制备根据本发明转化的生物和突变体的质粒 和/或载体。因而这些生物和突变体含有所述的基因结构。因此本发 明还涉及含有所说质粒和/或载体的生物。 质粒和/或载体的性质取决于其应用的对象。例如,为了用以Ω元 件灭活的基因取代假单胞菌中丁子香酚和/或阿魏酸分解代谢的完整 基因,所需的载体一方面可转移进假单胞菌中(经接合可转移的质 粒),但另一方面不能在这些生物中复制,因此在假单胞菌中是不稳 定的(所谓的自杀质粒)。借助于该质粒系统转移进假单胞菌的DNA 片段只有当它们经同源重组整合进细菌细胞基因组中时才能保留。 所述的基因结构,载体和质粒可用于制备不同的转化生物或突变 体。所说的基因结构可用于以改变的和/或灭活的基因结构取代完整 的核酸序列。在这种可经转化或转染或接合获得的细胞中,用改变的 和/或灭活的基因结构经同源重组取代完整的基因,因此所得的细胞 最终在其基因组中仅具有改变的和/或灭活的基因结构。以这种方 式,根据本发明优选可改变和/或灭活基因,以便有关生物能产生松 柏醇,松柏醛,阿魏酸,香草醛和/或香草酸。 在DE-A4227076和EP-A0845532中详细描述的菌株假单胞菌 属种类HR199(DSM7063)的突变体是根据本发明以这种方式构建的 生产菌株的例子,其中相应的基因结构特别是来自图1a至1r与图2a 至2r: 1.假单胞菌属种类HR199calAΩKm,含有ΩKm-灭活的calA基 因代替编码松柏醇脱氢酶的完整calA基因(图1a;图2a)。 2.假单胞菌属种类HR199calAΩGm,含有ΩGm灭活的calA基因 代替编码松柏醇脱氢酶的完整calA基因(图1b;图2b)。 3.假单胞菌属种类HR199calAΔ,含有缺失灭活的calA基因代 替编码松柏醇脱氢酶的完整calA基因(图1c;图2c)。 4.假单胞菌属种类HR199calBΩKm,含有ΩKm灭活的calB基因 代替编码松柏醛脱氢酶的完整calB基因(图1d;图2d)。 5.假单胞菌属种类HR199calBΩGm,含有ΩGm-灭活的calB基 因代替编码松柏醛脱氢酶的完整calB基因(图1e;图2e)。 6.假单胞菌属种类HR199calBΔ,含有缺失灭活的calB基因代 替编码松柏醛脱氢酶的完整calB基因(图1f;图2f)。 7.假单胞菌属种类HR199fcsΩKm,含有ΩKm-灭活的fcs基因代 替编码阿魏酰CoA合成酶的完整fcs基因(图1g;图2g)。 8.假单胞菌属种类HR199fcsΩGm,含有ΩGm灭活的fcs基因代 替编码阿魏酰-CoA合成酶的完整fcs基因(图1h;图2h)。 9.假单胞菌属种类HR199fcsΔ,含有缺失灭活的fcs基因代替 编码阿魏酰CoA合成酶的完整fcs基因(图1i;图2i)。 10.假单胞菌属种类HR199echΩKm,含有ΩKm灭活的ech基因代 替编码烯酰-CoA水合酶-醛缩酶的完整ech基因(图1j;图2j)。 11.假单胞菌属种类HR199echΩGm,含有ΩGm灭活的ech基因代 替编码烯酰-CoA水合酶-醛缩酶的完整ech基因(图1k;图2k)。 12.假单胞菌属种类HR199echΔ,含有缺失灭活的ech基因代替 编码烯酰-CoA水合酶-醛缩酶的完整ech基因(图11;图21)。 13.假单胞菌属种类HR199aatΩKm,含有ΩKm-灭活的aat基因 代替编码β-酮硫解酶的完整aat基因(图1m,图2m)。 14.假单胞菌属种类HR199aatΩGm,含有ΩGm-灭活的aat基因 代替编码β-酮硫解酶的完整aat基因(图1n;图2n)。 15.假单胞菌属种类HR199aatΔ,含有缺失灭活的aat基因代替 编码β-酮硫解酶的完整aat基因(图10;20)。 16.假单胞菌属种类HR199vdhΩKm,含有ΩKm-灭活的vdh基因 代替编码香草醛脱氢酶的完整vdh基因(图1p;图2p)。 17.假单胞菌属种类HR199vdhΩGm,含有ΩGm-灭活的vdh基因 代替编码香草醛脱氢酶的完整vdh基因(图1q;图2q)。 18.假单胞菌属种类HR199vdhΔ,含有缺失灭活的vdh基因代替 编码香草醛脱氢酶的完整vdh基因(图1r;图2r)。 19.假单胞菌属种类HR199vdhBΩKm,含ΩKm灭活的vdhB基因代 替编码香草醛脱氢酶Ⅱ的完整vdhB基因。 20.假单胞菌属种类HR199vdhBΩGm,含有ΩGm-灭活的vdhB基 因代替编码香草醛脱氢酶Ⅱ的完整vdhB基因。 21.假单胞菌属种类HR199vdhBΔ,含有缺失灭活的vdhB基因代 替编码香草醛脱氢酶Ⅱ的完整vdhB基因。 22.假单胞菌属种类HR199adHΩKm,含有ΩKm灭活的adh基因代 替编码乙醇脱氢酶的完整adH基因。 23.假单胞菌属种类HR199adhΩGm,含有ΩGm-灭活的adh基因 代替编码乙醇脱氢酶的完整adh基因。 24.假单胞菌属种类HR199adhΔ,含有缺失灭活的adh基因代替 编码乙醇脱氢酶的完整adh基因。 25.假单胞菌属种类HR199vanAΩKm,含有ΩKm灭活的vanA基因 代替编码香草酸脱甲基酶α-亚基的完整vanA基因。 26.假单胞菌属种类HR199vanAΩGm,含有ΩGm-灭活的vanA基 因代替编码香草酸脱甲基酶α-亚基的完整vanA基因。 27.假单胞菌属种类HR199vanAΔ,含有缺失灭活的vanA基因代 替编码香草酸脱甲基酶α-亚基的完整vanA基因。 28.假单胞菌属种类HR199vanBΩKm,含有ΩKm灭活的vanB基因 代替编码香草酸脱甲基酶β-亚基的完整vanB基因。 29.假单胞菌属种类HR199vanBΩGm,含有ΩGm-灭活的vanB基 因代替编码香草酸脱甲基酶β-亚基的完整vanB基因。 30.假单胞菌属种类HR199vanBΔ,含有缺失灭活的vanB基因代 替编码香草酸脱甲基酶β-亚基的完整vanB基因。 本发明还涉及有机化合物的生物技术制备方法。特别是该方法可 用于制备醇,醛和有机酸。后者优选是松柏醇,松柏醛,阿魏酸,香 草醛和香草酸。 上述生物用于该新方法。特别优选的生物包括细菌,特别是假单 胞菌属种类。具体地说,上述假单胞菌属种类优选用于下面的方法: 1.假单胞菌属种类HR199calAΩkm,假单胞菌属种类 HR199calAΩGm和假单胞菌属种类HR199calAΔ用于从丁子香酚制备 松柏醇。 2.假单胞菌属种类HR199calBΩKm,假单胞菌属种类 HR199calBΩGm和假单胞菌属种类HR199calBΔ用于从丁子香酚或松 柏醇制备松柏醛。 3.假单胞菌属种类HR199fcsΩKm,假单胞菌属种类 HR199fcsΩGm,假单胞菌属种类HR199fcsΔ,假单胞菌属种类 HR199echΩKm,假单胞菌属种类HR199echΩGm和假单胞菌属种类 HR199echΔ用于从丁子香酚或松柏醇或松柏醛制备阿魏酸。 4.假单胞菌属种类HR199vdhΩKm,假单胞菌属种类 HR199vdhΩGm,假单胞菌属种类HR199vdhΔ,假单胞菌属种类 HR199vdhΩGmvdhBΩKm,假单胞菌属种类HR199vdhΩKmvdhBΩGm,假 单胞菌属种类HR199vdhΔvdhBΩGm和假单胞菌属种类 HR199vdKΔvdhBΩKm用于从丁子香酚或松柏醇或松柏醛或阿魏酸制备 香草醛。 5.假单胞菌属种类HR199vanAΩKm,假单胞菌属种类 HR199vanAΩGm,假单胞菌属种类HR199vanAΔ,假单胞菌属种类 HR199vanBΩKm,假单胞菌属种类HR199vanBΩGm和假单胞菌属种类 HR199vanBΔ用于从丁子香酚或松柏醇或松柏醛或阿魏酸或香草醛制 备香草酸。 丁子香酚是优选的底物。然而,巴可加入其它底物或甚至用其它 底物代替丁子香酚。 根据本发明采用的用于该生物的合适营养培养基是合成的,半合 成的或复合培养基。这些培养基可包括含碳和含氮化合物,无机盐、 其中包括合适的痕量元素和维生素。 合适的含碳化合物是碳水化合物,碳氢化合物或有机标准化学 剂。可优选使用的化合物的例子是糖,醇或糖醇,有机酸或复合物混 合物。 优选的糖是葡萄糖。可优选使用的有机酸是柠檬酸或乙酸。复合 混合物的例子是麦芽提取物,酵母提取物,酪蛋白或酪蛋白水解产 物。 无机化合物是合适的含氮物质。其例子有硝酸盐和铵盐。也可使 用有机氮源。这些氮源包括酵母提取物,大豆粉、酪蛋白,酪蛋白水 解物和玉米浆。 可使用的无机盐的例子是硫酸盐,硝酸盐,氯化物,碳酸盐和磷 酸盐。所说的盐所含的金属优选是钠,钾,镁,锰,钙,锌和铁。 培养温度优选范围是50至100℃。特别优选的范围是从15至60 ℃,最优选22至37℃ 培养基的pH优选是2至12。特别优选的范围是4至8。 原则上,技术人员已知的任何生物反应器均可用于实施该新方 法。优先考虑的是适于浸没方法的任何装置。这意味着根据本发明可 采用具有或不具有机械混合装置的容器。后者的例子是摇动装置,泡 罩塔反应器或循环式反应器。前者优选包括所有已知的装配有任何设 计的搅拌器的装置。 可连续或分批实施该新方法。达到最大产量所需的发酵时间取决 于所用生物的具体特性。然而,原则上,发酵时间在2至200小时之 间。 下面更详细地解释本发明,在提及的实施例中: 利用丁子香酚的菌株假单胞菌属种类HR199(DSM7063)的突变 体是借助于插入Ω元件或导入缺失经特异性灭活丁子香酚分解代谢的 基因以靶向方式产生的。采用的Ω元件是编码对抗生素卡那霉素 (ΩKm)和庆大霉素(ΩGm)产生抗性的DNA片段。这些抗性基因是 使用标准方法从Tn5和质粒pBBR 1MCS-5分离出的。编码松柏醇脱氢 酶,松柏醛脱氢酶,阿魏酰-CoA合成酶,烯酰-CoA水合酶-醛缩 酶,β-酮硫解酶,香草醛脱氢酶,乙醇脱氢酶,香草醛脱氢酶Ⅱ和 香草酸脱甲基酶的基因calA,calB,fcs,ech,aat,vdh,adh,vdhB, vanA和vanB使用标准方法从菌株假单胞菌属种类HR199的基因组 DNA分离出并克隆进pBluescript SK-。借助于用合适的限制性核酸 内切酶消化,可从这些基因中去除DNA片段(缺失)或用Ω元件取代 (插入),导致各基因失活。以这种方式突变的基因重新克隆进可接 合转移的载体中并随后导入菌株假单胞菌属种类HR199。使用合适的 选择获得用新导入的失活基因取代了各有功能的野生型基因的转接 合子(transkonju-ganten)。以这种方式获得的插入和缺失突变体现 在仅具有各失活的基因。使用这一方法可获得仅具有一种缺陷基因的 突变体以及用该方式灭活了几种基因的多重突变体。这些突变体可用 于进行下列生物转化: a)将丁子香酚转化为松柏醇,松柏醛,阿魏酸,香草醛和/或香 草酸; b)将松柏醇转化成松柏醛,阿魏酸,香草醛和/或香草酸; c)将松柏醛转化成阿魏酸,香草醛和/或香草酸; d)将阿魏酸转化成香草醛和/或香草酸,和 e)将香草醛转化成香草酸。 材料和方法 生长细菌的条件 大肠杆菌的菌株在37℃下在Luria-Bertani(LB)或M9无机培养 基中繁殖(J.Sambrook,E.F.Fritsch和T.Maniatis,1989。分子 克隆;实验室手册,第2版,冷泉港实验室出版,纽约冷泉港)。假 单胞菌属种类的菌株在营养肉汤(NB,0.8%,wt/vol)或无机培养 基(MM)(H.G.Schlegel等,1961,微生物学报38:209-222)或HR 无机培养基(HR-MM)(J.Rabenhorst,1996,应用微生物学及生物技 术,46:470-474)中30℃下繁殖。阿魏酸,香草醛,香草酸和原儿 荼酸溶于二甲基甲砜并加入到各培养基中以得到0.1%(wt/vol)的终 浓度。丁子香酚可直接加入到培养基中以得到0.1%(vol/vol)的终 浓度或加入到MM琼脂板盖的滤纸(圆形滤纸595,Schleicher & Schuell,Dassel,德国)上。繁殖假单胞菌属种类的转接合子和突 变体时,分别使用终浓度为25μg/ml,100μg/ml和7.5μg/ml的 四环素,卡那霉素和庆大霉素。 培养上清液中代谢中间产物的定性和定量检测。 用高压液相色谱(Knauer HPLC)直接或用双蒸水稀释后分析培 养上清液。在Nucleosil 100 C18(7μm,250×4mm)上进行色谱。 0.1%(vol/vol)甲酸和乙腈用作溶剂。用于洗脱物质的梯度过程如 下: 00:00-06:30→26%乙腈 06:30-08:00→100%乙腈 08:00-12:00→100%乙腈 12:00-13:00→26%乙腈 13:00-18:00→26%乙腈 香草醛脱氢酶Ⅱ的纯化。 在4℃下进行纯化。 粗制提取物 将在丁子香酚中繁殖的假单胞菌属种类HRl99细胞在10mM磷酸 钠缓冲液pH6.0中洗涤,然后重悬于相同缓冲液中并在1000psi的 压力下通过弗氏压碎器(Amicon,silver Spring,美国马里兰州)2 次破碎细胞。对细胞匀浆物进行超速离心(1h,100,000xg,4℃), 所得的粗提物的可溶性部分从上清液中获得。 在DEAE葡聚糖纤维素上进行阴离子交换色谱: 粗提物的可溶部分在10mM磷酸钠缓冲液,pH6.0中透析过夜。 将透析产物上样到用10mM磷酸钠缓冲液pH6.0平衡过的DEAE- Sephacel柱(2.6cm×35cm,柱容器[BV]:186ml)上,其流速为0.8ml/ 分。用2倍BV的10mM磷酸钠缓冲液pH6.0冲洗柱。香草醛脱氢酶 Ⅱ(VDHⅡ)用在10mM磷酸钠缓冲液pH6.0(750ml)中从0到400 mM NaCl的线性盐梯度洗脱。收集10ml馏份。合并具有高VDHⅡ 活性的馏份以形成DEAE合并液。 测定香草醛脱氢酶活性 使用光学酶试验在30℃下测定VDH活性。体积为1ml的反应混 合物含0.1mmol磷酸钾(pH7.1),0.125μmol香草醛,0.5μmol NAD, 1.2μmol丙酮酸(钠盐),乳酸脱氢酶(IU;来自猪心)和酶溶液。 在λ=340mm下监测香草醛的氧化(ε香草醛=11.6cm2/μmol)。酶活 性以单位(U)表示,1U相应于每分钟转变1μmol香草醛的酶的量。 使用Lowry等(O.H.Lowry.N.J.Rosebrough,A.L.Farr和 R.J.Randall.1951,生物学化学杂志,193:265-275)的方法测定 样品中的蛋白质浓度。 测定松柏醇脱氢酶活性 根据Jaeger等(E.L.Jaeger,Eggeling和H.Sahm,1981.普通 微生物学.6:333-336)使用光学酶试验在30℃下测定CADH活性。体 积为1ml的反应混合物含有0.2mmol tris/HCL(pH9.0),0.4μmol 松柏醇,2μmol NAD,0.1mmol氨基脲和酶溶液。在λ=340nm下 监测NAD的减少(ε=6.3cm2/μmol)。酶活性用单位(U)来表示,lU 相应于每分钟转化1μmol底物的酶量。按Lowry等(0.H.Lowry,N.J. Rosebrough,A.L.Far和R.J.Randall,1951,生物学化学杂志, 193:265-275)的方法测定样品中的蛋白质浓度。 测定松柏醛脱氢酶的活性 使用光学酶试验在30℃下测定CALDH活性。体积为1ml的反应混 合物含有0.1mmol的tris/HCL(pH8.8),0.08μmol的松柏醛,2.7 μmol的NAD和酶溶液。在λ=400nm下监测松柏醛氧化成阿魏酸(ε=34 cm2/μmol)。酶活性以单位(U)表示,1U相应于每分钟转变1μmol 底物的酶量。按Lowry等(O.H.Lowry,N.J.Rosebrough,A.L.Far 和Randall,1951,生物学化学杂志,193:265-275)的方法测定样品 中的蛋白质浓度。 测定阿魏酰CoA合成酶(阿魏酸硫激酶)活性。 使用Zenk等(Zenk等,1980,生物化学年鉴,101:182-187) 改良的光学酶试验在30℃下测定FCS活性。体积为1ml的反应混合 物含有0.09mmol的磷酸钾(pH7.0),2.1μmol的MgCl2,0.7μmol 的阿魏酸,2μmol的ATP,0.4μmol的辅酶A和酶溶液。在λ=345nm 下监测从阿魏酸形成CoA酯(ε=10cm2/μmol)。酶活性以单位(U) 表示,1U相应于每分钟转化1μmol底物的酶量。使用Lowry等 (O.H.Lowry,N.J.Rosebrough,A.L.Farr和R.J.Randall,1951, 生物学化学杂志,193:265-275)的方法测定样品中的蛋白质浓度。 电泳方法 使用Stegemann等(Stegemann等,1973,Z.Naturforsch. 28c:722-732)的方法在7.4%(wt/vol)聚丙烯酰胺凝胶中天然条件 下或者使用Laemmli(Laemmli,U.K.1970,自然(伦敦)227:680- 685)的方法在11.5%(wt/vol)聚丙烯酰胺凝胶中在变性条件下分离 含蛋白质的提取物。Serva Blue R用于非特异性蛋白质染色。为了 特异性染色松柏醇脱氢酶,松柏醛脱氢酶和香草醛脱氢酶,将凝胶在 100mM KP缓冲液(pH7.0)中重新缓冲20分钟并随后在加入了0.08 %(wt/vol)NAD,0.04%(wt/vol)对硝基蓝四唑氯,0.003%(wt/vol) 吩嗪硫酸甲酯和1mM的各底物的相同缓冲液中30℃下温育直到看见 相应的颜色带。 将蛋白质从聚丙烯酰胺凝胶上转移到PVDF膜上。 使用半干快速印迹器具(B32/33,Biometra,Gttingen,德国) 按照厂家说明将蛋白质从SDS-聚丙烯酰胺凝胶转移到PVDF膜 (Waters-Millipore,Bedford,Mass,USA)上。 测定N端氨基酸序列 使用蛋白质肽测序仪(477A型,应用生物系统,Foster City, USA)和PTH分析仪按照厂商说明测定N-端氨基酸序列。 分离和操作DNA 使用Marmur的方法(J.Marmur,1961,分子生物学杂志,3:208- 218)分离基因组DNA。使用标准方法(J.E.Sambrook,F.Fritsch 和T.Maniatis,1989,分子克隆:实验室手册,第2版,冷泉港实验 室出版,纽约冷泉港)分离和分析其它质粒DNA和/或DNA限制性片 段。 转移DNA 使用Hanahan的方法(D.Hanahan,1983,分子生物学杂志, 166:557-580)制备和转化感受态的大肠杆菌细胞。在含有质粒的大 肠杆菌S17-1菌株(供体)和假单胞菌属种类菌株(受体)之间的 接合质粒转移在NB琼脂板上按Friedrich等的方法(B.Friedrich 等,1981,细菌学杂志,147:198-205)进行或借助于“微量互补法” 在含0.5%(wt/vol)葡萄糖酸作碳源及25μg四环素/ml或100μg卡 那霉素/ml的MM琼脂平板上进行。在这种情况下,将受体细胞以一个 方向进行接种划线。5分钟后,将供体菌株的细胞进行接种划线,这 些划线与受体接种划线相交叉。在30℃培养48h后,转接合子直接位 于交叉点下方生长,而供体菌株和受体菌株都不能生长。 杂交实验 在0.8%(wt/vol)琼脂糖凝胶上在50mM tris-50mM硼酸-1.25 mM EDTA缓冲液(pH8.5)中电泳分离DNA限制性酶切片段 (J.E.Sambrook,F.Fritsch和T.Maniatis.1989,分子克隆:实验 室手册。第2版,冷泉港实验室出版,纽约冷泉港)。将变性的DNA 从凝胶转移到带正电的尼龙膜(孔经:0.45μm,Pall Filtrationstechnik,Dreieich,德国)上,随后与生物素标记的 或洋地黄毒苷标记的DNA探针的杂交,及这些DNA探针的制备均使用 标准方法进行(J.E.Sambrook,F.Fritsch和T.Maniatis,1989,分 子克隆:实验室手册,第2版,冷泉港实验室出版社,纽约冷泉港)。 DNA测序: 按Sanger等(Sanger等1977,美国科学院学报74:5463-5467) 的双脱氧链终止法使用“LI-COR”DNA测序仪400L型(LI-COR公 司,生物技术部,Lincdn,NE,USA)并使用“含7-脱氮-2-脱氧鸟 苷三磷酸的热测序酶荧光标记的引物循环测序试剂盒”(Amersham 生命科学,Amersham International pls.,Little Chalfont, Buckinghamshire,英国)“非放射活性”测定核苷酸序列,在每种 情况按厂商说明书进行。 按Strauss等(E.C.Strauss等,1986,生物化学年鉴, 154:353-360)的“引物跳跃方法”使用合成寡核苷酸进行测序。 化学试剂,生化试剂和酶 从C.F.Boehringer & Shne(Mannheim,德国)或从 GIBCO/BRL(Eggenstein,德国)获得限制性酶,T4 DNA连接酶,λDNA 和酶及光学酶试验的底物。[γ-32P]ATP来自 Amersham/Buchler(Braunschweig,德国)。寡核苷酸从MWG- Btotech GmbH(Ebersberg,德国)获得。NA型琼脂糖从Pharmacia- LKB(Uppsala,Schweden)获得。所有其它的化学试剂来自Haarmann & Reimer(Holzminden,德国),E.Merch AG(Darmstadt,德国),Fluka Chemie(Buchs,瑞士),Serva Feinbiochemica(Heidelberg,德国) 或Sigma Chemie(Deisenhofen,德国)。 实施例 实施例1 构建介导卡那霉素(ΩKm)或庆大霉素(ΩGm)抗性的Ω元件 为丁构建ΩKm元件,以制备规模分离2099bp的转座子Tn5的 BglⅠ片段(E.A.Auerswald,G.Ludwig和H.Schaller.1981,Cold Spring Harb.Symp.Quant.Biol.45:107-113;E.Beck,G.Ludwig, E.A.Auerswald,B.Reiss和H.Schaller,1982,基因,19:327-336; P.Mazodier,P.Cossart,E.Giraud和F.Gasser,1985,核酸研究, 13:195-205)。经过用Bal 31核酸酶处理将片段缩短到大约990bp。 然后将这一仅含有卡那霉素抗性基因(编码氨基糖苷-3’-0-磷酸转移 酶)的片段连接到SmaⅠ切割的pSKsym DNA(含对称结构的多克隆位 点[SalⅠ,Hind Ⅲ,EcoRⅠ,SmaⅠ,EcoRⅠ,Hind Ⅲ,SalⅠ]的 pBluescript SK-衍生物)上。可作为SmaⅠ片段,EcoRⅠ片段,Hind Ⅲ片段或SalⅠ片段从所得的质粒中重新分离出ΩKm元件。 为了构建ΩGm元件,在制备规模上分离出质粒pBRIMCS-5的983 bp EaeⅠ片段(M.E.Kovach,P.H.Elzer,D.S.Hill,G.T.Robertson, M.A.Farris,R.M.Roop和K.M.Peterson,1995,基因166:175- 176),然后用绿豆核酸酶处理(逐渐消化单链DNA分子末端)。然 后将仅含庆大霉素抗性基因(编码庆大霉素-3-乙酰转移酶)的片 段连接到SmaⅠ-裂解的pSKsym DNA(见上文)上。可作为SmaⅠ片段, EcoRⅠ片段,HindⅢ片段或SalⅠ片段从所得质粒重新分离出ΩGm 元件。 实施例2 从假单胞菌属种类HRl99(DSM7063)克隆待插入Ω元件或缺失 灭活的基因。 单独从大肠杆菌S17-1菌株DSM10439和DSM10440克隆 fcs,ech,vdh和aat基因并使用质粒pE207和pE5-1(见EP-A- 0845532)。从这些质粒在制备规模上分离所述片段并按如下所述处 理: 为了克隆fcs基因,将来自质粒pE207的2350bp SalⅠ/EcoRⅠ 片段和来自质粒pE5-1的3700bp EcoRⅠ/SalⅠ片段一起在 pBluescript SK-中克隆使得2片段借助于EcoRⅠ端连接在一起。从 所得的杂种质粒在制备规模上分离6050bp SalⅠ片段并经过用Bal 31 核酸酶处理缩短到大约2480bp。PstⅠ连接子随后连接到该片段的末 端,用PstⅠ消化后,将该片段克隆进pBluescript SK-(pSKfcs)。 转化大肠杆菌XL1 blue后,所得的克隆表达fcs基因并表现出0.2 U/mg蛋白质的Fcs活性。 为了克隆ech基因,在制备规模上从质粒pE 207分离3800bp HindⅢ/EcoRⅠ片段并经过用Bal 31核酸酶处理缩短到大约1470 bp。然后,将EcoRⅠ连接子连接到该片段的末端,用EcoRⅠ消化后, 将该片段克隆进pBluescript SK-(pSkech)。 为了克隆vdh基因,在制备规模上从质粒pE207分离2350bp的 SalⅠ/EcoRⅠ片段。克隆进pBluescript SK-后,使用外切核酸酶Ⅲ/ 绿豆核酸酶系统将该片段在一端截短大约1530bp。然后将EcoRⅠ连 接子连接到该片段的末端,用EcoRⅠ消化后,将该片段克隆进 pBluescript SK-(pSKvdh)。转化大肠杆菌XL1 blue后,获得的克 隆表达VDH基因且表现出0.01U/mg蛋白质的VDH活性。 为了克隆aat基因,在制备规模上从质粒pE5-1分离3700bp EcoRⅠ/SalⅠ片段并经过用Bal 31核酸酶处理缩短到大约1590bp。然 然后将EcoRⅠ连接子连接到该片段的末端,用EcoRⅠ消化后,将该片 段克隆进pBluescript SK-(pSKaat)。 实施例3 经过插入Ω元件或经过缺失这些基因的部分区域灭活上述基因。 用BssHⅡ消化含fcs基因的质粒pSKfcs,导致从fcs基因切割 出1290bp的片段。随后重新连接,在pBluescript SK-中以克隆的 形式(pSKfcsΔ)获得fcs基因的缺失衍生物(fcsΔ)(见图1i和 2i)。另外,切除该片段后,将Ω元件ΩKm和ΩGm代替其连接进去。 这样产生了fcs基因的Ω-灭活衍生物(fcsΩKm,见图1g和2g)及 (fcsΩGm,见图1h和2h),它们均在pBluescript SK-中以克隆的 形式获得(pSKfcsΩKm和pSKfcsΩGm)。在其杂交质粒具有经缺失或经 Ω元件插入而失活的fcs基因的大肠杆菌克隆粗提物中不可能检测到 任何FCS活性。 用NruⅠ消化含ech基因的质粒pSKech,导致从ech基因切除了 53bp的片段及430bp的片段。重新连接后,ech基因的缺失衍生物 (echΔ,见图11和21)在pBluescript SK-中以克隆的形式获得 (pSKechΔ)。另外,切除该片段后,将Ω元件ΩKm和ΩGm代替其连接 进其中。结果产生ech基因的Ω-灭活衍生物(echΩKm和echΩGm), 它们在pBluescript SK-中以克隆的形式获得(pSKechΩKm和 pSKechΩGm)。 用BssHⅡ消化含vdh基因的质粒pSKvdh,导致从vdh基因切除 了210bp的片段。重新连接后,vdh基因的缺失衍生物(vdhΔ,见图10 和20)以克隆的形式在pBluescript SK-(pSK vdhΔ)中获得。另外, 切除该片段后,将Ω元件ΩKm和ΩGm代替其连接进入。结果产生vdh 基因的Ω-灭活衍生物(vdhΩKm和vdhΩGm),在pBluescript SK-中 以克隆的形式获得(pSKvdhΩKm,见图1m和2m)及(pSKvdhΩGm, 见图1n和2n)。在所得的大肠杆菌克隆的粗提物中不能检测到任何 VDH活性,该克隆中的杂交质粒具有经缺失或Ω元件插入灭活的vdh 基因。 用BssHⅡ消化含aat基因的质粒pSKaat,导致从aat基因中切 除了59bp的片段。重新连接后,aat基因的缺失衍生物(aatΔ,见图 1r和2r)在pBluescript SK-中以克隆的形式获得(pSKaatΔ)。另外, 切除该片段后,将Ω元件ΩKm和ΩGm代替其连接进入其中。结果产生 aat基因的Ω-灭活衍生物(aatΩKm,见图1p和2p)和(aatΩGm,见 图1q和2q),在pBluescript SK-中以克隆的形式获得(pSKaatΩKm 和pSKaatΩGm)。 实施例4 将Ω元件灭活的基因亚克隆进可接合转移的“自杀质粒”pSUP202 中。 为了用Ω-元件灭活的基因取代假单胞菌属种类HR199中的完整 基因,需要一种载体,一方面该载体可转移进假单胞菌中(可接合转 移的质粒),另一方面它在这些细菌中不能复制,因此在假单胞菌中 不稳定(“自杀质粒”)。使用这种质粒系统转移进假单胞菌中的DNA 片段只有借助于同源重组(RecA-依赖性重组)整合进细菌细胞的基因 组中才能保留。在这种情况下,使用“自杀质粒”pSUP202(Simon等, 1983,见A.Piihler,细菌-植物相互作用的分子遗传学,Springer Verlag,Berlin,Heidelberg,纽约,p98-106)。 用PstⅠ消化后,以质粒pSKfcsΩKm和pSKfcsΩGm分离灭活的基 因fcsΩKm和fcsΩGm并连接到PstⅠ-裂解的pSUP202DNA上。将连接 混合物转化进大肠杆菌S17-1。在分别还含卡那霉素或庆大霉素的含 四环素LB培养基中进行选择。获得其杂交质粒(pSUPfcsΩKm)含灭活 基因fcsΩKm的卡那霉素抗性转化子。庆大霉素抗性转化子的相应杂 交质粒(pSUPfcsΩGm)含灭活的基因fcsΩGm。 EcoRⅠ消化后,从质粒pSKechΩKm和pSKechΩGm分离灭活的基 因echΩKm和echΩGm并连接到EcoRⅠ裂解的pSUP202 DNA上。将连 接混合物转化进大肠杆菌S17-1。在分别还含卡那霉素或庆大霉素的 含四环素LB培养基上进行选择。获得其杂交质粒(pSUPechΩKm)含灭 活基因echΩKm的卡那霉素抗性转化子。庆大霉素抗性转化子的相应 杂交质粒(pSUPechΩGm)含灭活的基因echΩGm。 EcoRⅠ消化后,从质粒pSKvdhΩKm和pSKvdhΩGm分离灭活的基 因vdhΩKm和vdhΩGm并连接到EcoRⅠ-裂解的pSUP202DNA上。将连 接混合物转化进大肠杆菌S17-1。在分别还含卡那霉素或庆大霉素的 含四环素LB培养基上进行选择。获得其杂交质粒(pSUPvdhΩKm)含灭 活基因vdhΩKm的卡那霉素抗性转化子。庆大霉素抗性转化子的相应 杂交换粒(pSUPvdhΩGm)含灭活基因vdhΩGm。 EcoRⅠ消化后,从质粒pSKaatΩKm和pSKaatΩGm分离灭活基因 aatΩKm和aatΩGm并连接到EcoRⅠ裂解的pSUP202DNA上。将连接混 合物转化进大肠杆菌S17-1中。在分别还含卡那霉素或庆大霉素的 含四环素LB培养基上进行选择。获得其杂交质粒(pSUPaatΩKm)含灭 活基因aatΩKm的卡那霉素抗性转化子。庆大霉素抗性转化子的相应 杂交质粒(pSUPaatΩGm)含灭活的基因aatΩGm。 实施例5 将缺失灭活的基因亚克隆进具有“sacB选择系统”的可接合转移 “自杀质粒”PHE55中 为了用缺失灭活的基因取代假单胞菌属种类HR199中的完整基 因,需要具有在pSUP202的例子中已描述过的特性的载体。在缺失失 活基因的情况下,由于不存在选择假单胞菌属种类HR199中基因成功 取代的可能性,与Ω元件灭活基因相反,使用了另一选择系统。在“sacB 选择系统”中,取代的缺失失活基因被克隆进一种质粒中,该质粒除 抗生素抗性基因外还具有sacB基因。将该杂交质粒接合转移进假单 胞菌后,在完整基因在基因组中所处的位点处经同源重组整合质粒 (第一次交换)。这种产生的“杂基因型”菌株同时具有完整基因和 缺失失活基因,且被pHE55 DNA将这些基因互相分隔开。这些菌株表 现出由载体编码的抗性且也具有活性sacB基因。随后的目的是借助 于第二次同源重组事件将pHE55 DNA与完整基因一起分离出基因组 DNA(第二次交换)。这次重组事件产生的菌株仅具有失活的基因。 而且,pHE55编码的抗生素抗性和sacB基因均已丢失。如果将菌株在 含蔗糖的培养基上划线培养,见表达sacB基因的菌株的生长受抑制, 因为该基因产物将蔗糖转变成聚合物,而该聚合物积累于细胞周质 中。由于发生了第二次重组事件而不再携带sacB基因的细胞的生长 因此不受抑制。为了具有在表型上选择缺失灭活基因整合的可能性, 该基因不与完整基因交换,相反,使用的菌株待替换的基因已通过插 入Ω元件而被“标记”。当发生成功替换时,所得的菌株丧失由Ω元 件编码的抗生素抗性。 用PstⅠ消化后,从质粒pSKfcsΔ分离失活基因fcsΔ并连接到 PstⅠ-裂解的pHE55 DNA上。将连接混合物转化进大肠杆菌S17-1。 在含四环素的LB培养基上进行选择。获得四环素抗性转化子,其杂 交质粒(pHEfcsΔ)含灭活基因fcsΔ。 用EcoRⅠ消化后,从质粒pSKechΔ分离失活基因echΔ并用绿豆 核酸酶处理(产生钝末端)。将该片段连接到BamHⅠ-裂解的且用绿豆 核酸酶处理的pHE55 DNA上。将连接混合物转化进大肠杆菌S17-1。 在含四环素的LB培养基上进行选择。获得四环素抗性转化子,其杂 交质粒(pHEechΔ)含有失活基因echΔ。 用EcoRⅠ消化后,从质粒pSKvdhΔ分离失活基因vdhΔ并用绿豆 核酸酶处理。将该片段连接到BamHⅠ裂解的且用绿豆核酸酶处理过的 pHE55 DNA上。将连接混合物转化进大肠杆菌S17-1。在含四环素的 LB培养基上进行选择。获得四环素抗性转化子,其杂交质粒(pHEvdhΔ) 含有灭活的基因vdhΔ。 用EcoRⅠ消化后,从质粒pSKaatΔ分离出灭活基因aatΔ并用绿 豆核酸酶处理。将该片段连接到BamHⅠ裂解的并用绿豆核酸酶处理过 的pHE55 DNA上。将连接混合物转化进大肠杆菌S17-1。在含四环 素的LB培养基上进行选择。获得四环素抗性转化子,其杂交质粒 (phEaatΔ)含有灭活的基因aatΔ。 实施例6 产生假单胞菌属种类HR199菌株的突变体,其中经过插入Ω-元件 特异性灭活丁子香酚分解代谢基因。 在接合实验中菌株假单胞菌属种类HR199用作受体,其中下述含 有pSUP202杂交质粒的菌株大肠杆菌S17-1用作供体。转接合子在 含有相应于Ω元件之抗生素的含葡糖酸无机培养基上选择。可根据 pSUP202-编码的四环素抗性区分“同基因子”(通过2次交换用Ω 元件插入失活基因取代完整基因)和“杂基因子”(借助于单次交换 将杂交质粒整合进基因组)转接合子。 将假单胞菌属种类HR199分别与大肠杆菌S17-1(pSUPfcsΩKm) 和大肠杆菌S17-1(pSUPfcsΩGm)接合后获得突变的假单胞菌属种类 HR199fcsΩKm和假单胞菌属种类HR199fcsΩGm。经过DNA测序证实 完整fcs基因被ΩKm-灭活的或ΩGm-灭活的基因(分别为fcsΩKm和 fcsΩGm)取代。 将假单胞菌属种类HR199分别与大肠杆菌S17-1(pSUPechΩKm) 和大肠杆菌S17-1(pSUPechΩGm)接合后获得突变的假单胞菌属种类 HR199echΩKm假单胞菌属种类HR199echΩGm。经过DNA测序证实完 整的ech基因被ΩKm-灭活的或ΩGm-灭活的基因(分别为echΩkm和 echΩGm)取代。 将假单胞菌属种类HR199分别与大肠杆菌S17-1(pSUPvdhΩKm) 和大肠杆菌S17-1(pSUPvdhΩGm)接合后获得突变的假单胞菌属种类 HR199vdhΩKm和假单胞菌属种类HR199vdhΩGm。经过DNA测序证 实完整的vdh基因被ΩKm-灭活的或ΩGm-灭活的基因(分别为vdhΩ Km和vdhΩGm)取代。 将假单胞菌属种类HR199分别与大肠杆菌S17-1(pSUPaatΩ Km)和大肠杆菌S17-1(pSUPaatΩGm)接合后获得突变的假单胞 菌属种类HR199aatΩKm和假单胞菌属种类HR199aatΩGm。经过DNA 测序证实完整的aat基因被ΩKm-灭活的或ΩGm-灭活的基因(分别是 aatΩKm和aatΩGm)取代。 将假单胞菌属种类HR199fcsΩ Km与大肠杆菌S17-1(pSUPvdh ΩGm)接合后获得突变的假单胞菌属种类HR199fcsΩKm vdhΩGm。 经过DNA测序证实完整的vdh基因被ΩGm灭活的基因(vdhΩGm)取 代。 将假单胞菌属种类HR199vdhΩKm大肠杆菌S17-1(pSUPaatΩ Gm)接合后获得突变的假单胞菌属种类HR199vdh ΩKmaatΩGm。经 过DNA测序证实完整的aat基因被ΩGm-灭活的基因(aatΩGm)取代。 将假单胞菌属种类HR199vdhΩ Km与大肠杆菌S17-1(pSUPech ΩGm)接合后获得突变的假单胞菌属种类HR199vdhΩKmechΩGm。 经过DNA测序证实完整的ech基因被ΩGm灭活的基因(echΩGm)取 代。 实施例7 产生菌株假单胞菌属种类HR199的突变体, 其中经过缺失部分区域特异性灭活丁子香酚分解代谢的基因。 在接合实验中,菌株假单胞菌属种类HR199fcsΩKm,假单胞菌 属种类HR199echΩKm,假单胞菌属种类HR199vdhΩKm和假单胞菌 属种类HR199aatΩKm用作受体,下述含有pHE55杂交质粒的大肠杆 菌S17-1菌株用作供体。在除四环素(pHE55编码的抗性)外还含有 相应于Ω元件的抗生素的含葡糖酸无机培养基上选择“杂基因子”转 接合子。在含蔗糖的无机培养基上划线培养后,获得的转接合子经第 二次重组事件(第二次交换)删除了载体DNA。经过在不含抗生素或 含有相应于Ω元件的抗生素的无机培养基中划线培养,可鉴定出用缺 失灭活的基因(无抗生素抗性)取代了Ω元件灭活的基因的突变体。 将假单胞菌属种类HR199fcsΩKm与大肠杆菌S17-1(pHEfcs Δ)接合后获得突变的假单胞菌属种类HR199fcsΔ。经DNA测序证 实ΩKm灭活的基因(fcsΩKm)被缺失灭活的基因(fcsΔ)取代。 将假单胞菌属种类HR199echΩKm与大肠杆菌S17-1(pHEechΔ) 接合后获得突变的假单胞菌属种类HR199echΔ。经DNA测序证实Ω Km灭活的基因(echΩKm)被缺失灭活基因(echΔ)取代。 将假单胞菌属种类HR199vdhΩKm与大肠杆菌S17-1(pHEvdh Δ)接合后获得突变的假单胞菌属种类HR199vdhΔ。经DNA测序证 实ΩKm灭活的基因(vdhΩKm)被缺失灭活的基因(vdhΔ)取代。 将假单胞菌属种类HR199aatΩKm与大肠杆菌S17-1(pHEaat Δ)接合后获得突变的假单胞菌属种类HR199aatΔ。经过DNA测序 证实ΩKm-灭活的基因(aatΩKm)被缺失灭活的基因(aatΔ)取代。 实施例8 使用突变的假单胞菌属种类HR199vdhΩKm将丁子香酚生物转化 成香草醛。 菌株假单胞菌属种类HR199vdhΩKm在50ml含6mM丁子香酚的 HR-MM中繁殖到光密度为大约OD600nm=0.6。17小时后,在培养上 清中可检测到2.9mM的香草醛,1.4mM阿魏酸和0.4mM香草酸。 实施例9 使用突变的假单胞菌属种类HR199vdhΩGmaatΩKm将丁子香酚 生物转化成阿魏酸 菌株假单胞菌属种类HR199vdhΩGmaatΩkm在50ml含6mM丁子 香酚的HR-MM中繁殖到光密度为大约OD600nm=0.6。18小时后,在 培养上清中可检测到1.9mM香草醛,2.4mM阿魏酸和0.6mM香草酸。 实施例10 使用突变假单胞菌属种类HR199vdhΩGmaatΩKm将丁子香酚生 物转化成松柏醇。 菌株假单胞菌属种类HR199vdhΩGmaatΩKm在50ml含60mM丁 子香酚的HR-MM中繁殖到光密度大约为OD600nm=0.4。15小时后, 在培养物上清中可检测到1.7mM松柏醇,1.4mM香草醛,1.4mM阿魏 酸和0.2mM香草酸。 实施例11 使用突变的假单胞菌属种类HR199vdhΩKm在10 l发酵罐中从 丁子香酚发酵生产天然香草醛。 用100ml培养了24小时的预培养物接种生产发酵罐,其中该预 培养物在调至pH7.0且由12.5g甘油/l,10g酵母提取物/l和0.37g 乙酸/l组成的培养基中在摇床(120rpm)上32℃繁殖过。发酵罐含 有9.9 l下列组成的培养基:1.5g酵母提取物/l,1.6g KH2PO4/l, 0.2g NaCl/l,0.2g MgSO4/l。用氢氧化钠溶液将pH调节至pH7.0。 灭菌后,向培养基中加入4g丁子香酚。温度为32℃,通气为3NL/分, 搅拌速度为600rpm。用氢氧化钠溶液将pH维持在pH6.5。 在接种后4小时,开始连续加入丁子香酚使得在65小时后发酵 终止时,向培养物中加入了255g的丁子香酚。在发酵期间还加入40g 酵母提取物。发酵终止时,丁子香酚的浓度为0.2g/l。香草醛的含量 为2.6g/l。也存在3.4g的阿魏酸/l。 用诸如色谱,蒸馏和/或提取的已知物理方法分离以这种方式获 得的香草醛并用于制备天然调味品。 附图的说明 图1a至1r: 分离生物和突变体的基因结构 cclA*:松柏醇脱氢酶的部分失活基因 calB*:松柏醛脱氢酶的部分失活基因 fcs*:阿魏酰-CoA合成酶的部分失活基因 ech*:烯酰-CoA水合酶-醛缩酶的部分失活基因 vdh*:香草醛脱氢酶的部分失活基因 aat*:β-酮硫解酶的部分失活基因 尽管标记“*”的限制性酶裂解位点用于构建,但它们在所得的 构建体上不再具有功能。 图2a:calAΩKm基因结构的核苷酸序列 图2b:calAΩGm基因结构的核苷酸序列 图2c:calAΔ基因结构的核苷酸序列 图2d:calBΩKm基因结构的核苷酸序列 图2e:calBΩGm基因结构的核苷酸序列 图2f:calBΔ基因结构的核苷酸序列 图2g:fcsΩKm基因结构的核苷酸序列 图2h:fcsΩGm基因结构的核苷酸序列 图2i:fcsΔ基因结构的核苷酸序列 图2j:echΩKm基因结构的核苷酸序列 图2k:echΩGm基因结构的核苷酸序列 图2l:echΔ基因结构的核苷酸序列 图2m:vdhΩKm基因结构的核苷酸序列 图2n:vdhΩGm基因结构的核苷酸序列 图2o:vdhΔ基因结构的核苷酸序列 图2p:aatΩKm基因结构的核苷酸序列 图2q:aatΩGm基因结构的核苷酸序列 图2r:aatΔ基因结构的核苷酸序列 序列 CTGCAGCCAG GGCTGAAAAG GAGGGATTCA GTGAGGTCAT GAAGGGAGGG GACGGCGCCT 60 GGCTCCAATT GCTCGATGGC GCCGCGATTG AGTGTCTTGG GCGCGGTCTT GGAGAGTTCG 120 GCTAGGGAGA TAAATTTGCT GGCCATGGTG GCGGCCCCTG ATGGGTTGGA TGATTTTCTG 180 CATTCTGCAT CATGAAATTC ATGAAATCAT CACTTTTCGG GGGGTGGGTG CACGGGATTG 240 AAGGTTGCTA GGAGAGTGCA TTGCTCGTAA GCCCAGGAAG CACGCGGGTT TCAGGATGGT 300 GCATGGAAAT GGCATGAGCT TTGCTGGATA TGATTAGAGA CATTAACTAT TTTGGCGGAA 360 TGGAAGCACG ATTCCTCGCC CGGTAGAGCG GTAACCGCGA CATTCAGGAC CGTAAAAAGG 420 AAAGAGCATG CAA CTG ACC AAC AAG AAA ATC GTC GTC ACC GGA GTG TCC TCC 472 Met Gln Leu Thr Asn Lys Lys Ile Val Val Thr Gly Val Ser Ser 1 5 10 15 GGT ATC GGT GCC GAA ACT GCC CGC GTT CTG CGC TCT CAC GGC GCC ACA 520 Gly Ile Gly Ala Glu Thr Ala Arg Val Leu Arg Ser His Gly Ala Thr 20 25 30 GTG ATT GGC GTA GAT CGC AAC ATG CCG AGC CTG ACT CTG GAT GCT TTC 568 Val Ile Gly Val Asp Arg Asn Met Pro Ser Leu Thr Leu Asp Ala Phe 35 40 45 GTT CAG GCT GAC CTG AGC CAT CCT GAA GGC ATC GAT AAG GCC ATC GGG 616 Val Gln Ala Asp Leu Ser His Pro Glu Gly Ile Asp Lys Ala Ile 50 55 60 62 ACAGCAAGCG AACCGGAATT GCCAGCTGGG GCGCCCTCTG GTAAGGTTGG GAAGCCCTGC 676 AAAGTAAACT GGATGGCTTT CTTGCCGCCA AGGATCTGAT GGCGCAGGGG ATCAAGATCT 736 GATCAAGAGA CAGGATGAGG ATCGTTTCGC ATG ATT GAA CAA GAT GGA TTG CAC 790 Met Ile Glu Gln Asp Gly Leu His 1 5 GCA GGT TCT CCG GCC GCT TGG GTG GAG AGG CTA TTC GGC TAT GAC TGG 838 Ala Gly Ser Pro Ala Ala Trp Val Glu Arg Leu Phe Gly Tyr Asp Trp 10 15 20 GCA CAA CAG ACA ATC GGC TGC TCT GAT GCC GCC GTG TTC CGG CTG TCA 886 Ala Gln Gln Thr Ile Gly Cys Ser Asp Ala Ala Val Phe Arg Leu Ser 25 30 35 40 GCG CAG GGG CGC CCG GTT CTT TTT GTC AAG ACC GAC CTG TCC GGT GCC 934 Ala Gln Gly Arg Pro Val Leu Phe Val Lys Thr Asp Leu Ser Gly Ala 45 50 55 CTG AAT GAA CTG CAG GAC GAG GCA GCG CGG CTA TCG TGG CTG GCC ACG 982 Leu Asn Glu Leu Gln Asp Glu Ala Ala Arg Leu Ser Trp Leu Ala Thr 60 65 70 ACG GGC GTT CCT TGC GCA GCT GTG CTC GAC GTT GTC ACT GAA GCG GGA 1030 Thr Gly Val Pro Cys Ala Ala Val Leu Asp Val Val Thr Glu Ala Gly 75 80 85 AGG GAC TGG CTG CTA TTG GGC GAA GTG CCG GGG CAG GAT CTC CTG TCA 1078 Arg Asp Trp Leu Leu Leu Gly Glu Val Pro Gly Gln Asp Leu Leu Ser 90 95 100 TCT CAC CTT GCT CCT GCC GAG AAA GTA TCC ATC ATG GCT GAT GCA ATG 1126 Ser His Leu Ala Pro Ala Glu Lys Val Ser Ile Met Ala Asp Ala Met 105 110 115 120 CGG CGG CTG CAT ACG CTT GAT CCG GCT ACC TGC CCA TTC GAC CAC CAA 1174 Arg Arg Leu His Thr Leu Asp Pro Ala Thr Cys Pro Phe Asp His Gln 125 130 135 GCG AAA CAT CGC ATC GAG CGA GCA CGT ACT CGG ATG GAA GCC GGT CTT 1222 Ala Lys His Arg Ile Glu Arg Ala Arg Thr Arg Met Glu Ala Gly Leu 140 145 150 GTC GAT CAG GAT GAT CTG GAC GAA GAG CAT CAG GGG CTC GCG CCA GCC 1270 Val Asp Gln Asp Asp Leu Asp Glu Glu His Gln Gly Leu Ala Pro Ala 155 160 165 GAA CTG TTC GCC AGG CTC AAG GCG CGC ATG CCC GAC GGC GAG GAT CTC 1318 Glu Leu Phe Ala Arg Leu Lys Ala Arg Met Pro Asp Gly Glu Asp Leu 170 175 180 GTC GTG ACC CAT GGC GAT GCC TGC TTG CCG AAT ATC ATG GTG GAA AAT 1366 Val Val Thr His Gly Asp Ala Cys Leu Pro Asn Ile Met Val Glu Asn 185 190 195 200 GGC CGC TTT TCT GGA TTC ATC GAC TGT GGC CGG CTG GGT GTG GCG GAC 1414 Gly Arg Phe Ser Gly Phe Ile Asp Cys Gly Arg Leu Gly Val Ala Asp 205 210 215 CGC TAT CAG GAC ATA GCG TTG GCT ACC CGT GAT ATT GCT GAA GAG CTT 1462 Arg Tyr Gln Asp Ile Ala Leu Ala Thr Arg Asp Ile Ala Glu Glu Leu 220 225 230 GGC GGC GAA TGG GCT GAC CGC TTC CTC GTG CTT TAC GGT ATC GCC GCT 1510 Gly Gly Glu Trp Ala Asp Arg Phe Leu Val Leu Tyr Gly Ile Ala Ala 235 240 245 CCC GAT TCG CAG CGC ATC GCC TTC TAT CGC CTT CTT GAC GAG TTC TTC 1558 Pro Asp Ser Gln Arg Ile Ala Phe Tyr Arg Leu Leu Asp Glu Phe Phe 250 255 260 264 TGAGCGGGAC TCTGGGGTTC GAAATGACCG ACCAAGCGAC GCCCTG GCC GCG GTG 1613 Ala Ala Val 225 ATT GCA TTC ATG TGT GCT GAG GAG TCA CGT TGG ATC AAC GGC ATA AAT 1661 Ile Ala Phe Met Cys Ala Glu Glu Ser Arg Trp Ile Asn Gly Ile Asn 230 235 240 ATT CCA GTG GAC GGA GGT TTG GCA TCG ACC TAC GTG TAA GTTCGTGGAC 1710 Ile Pro Val Asp Gly Gly Leu Ala Ser Thr Tyr Val 245 250 255 GCCCTTTGCA CGCGCACTAT ATCTCTATGC AGCAGCTGAA AGCAGCTTTG GTTTTGATCG 1770 GAGGTAGCGG GCGGAAAGGT GCAGAATGTC TAAATAATAA AGGATTCTTG TGAAGCTTTA 1830 GTTGTCCGTA AACGAAAATA AAAATAAAGA GGAATGATAT GAAAGCAAGT AGATCAGTCT 1890 GCACTTTCAA AATAGCTACC CTGGCAGGCG CCATTTATGC AGCGCTGCCA ATGTCAGCTG 1950 CAAACTCGAT GCAGCTGGAT GTAGGTAGCT CGGATTGGAC GGTGCGTTGG GGACAACACC 2010 CTCAAGTATA GCCTTGCCTC TCGCCTGAAT GAGCAAGACT CAAGTCTGAC AAATGCGCCG 2070 ACTGTCAATG GTTATATCCG GATATTCAAA GTCAGGGTGA TCGTAACTTT GACCGGGGGC 2130 TTGGTATCCA ATCGTCTCGA TATTCTGGCT GCAG 2164 图2a: CTGCAGCCAG GGCTGAAAAG GAGGGATTCA GTGAGGTCAT GAAGGGAGGG GACGGCGCCT 60 GGCTCCAATT GCTCGATGGC GCCGCGATTG AGTGTCTTGG GCGCGGTCTT GGAGAGTTCG 120 GCTAGGGAGA TAAATTTGCT GGCCATGGTG GCGGCCCCTG ATGGGTTGGA TGATTTTCTG 180 CATTCTGCAT CATGAAATTC ATGAAATCAT CACTTTTCGG GGGGTGGGTG CACGGGATTG 240 AAGGTTGCTA GGAGAGTGCA TTGCTCGTAA GCCCAGGAAG CACGCGGGTT TCAGGATGGT 300 GCATGGAAAT GGCATGAGCT TTGCTGGATA TGATTAGAGA CATTAACTAT TTTGGCGGAA 360 TGGAAGCACG ATTCCTCGCC CGGTAGAGCG GTAACCGCGA CATTCAGGAC CGTAAAAAGG 420 AAAGAGCATG CAA CTG ACC AAC AAG AAA ATC GTC GTC ACC GGA GTG TCC TCC 472 Met Gln Leu Thr Asn Lys Lys Ile Val Val Thr Gly Val Ser Ser 1 5 10 15 GGT ATC GGT GCC GAA ACT GCC CGC GTT CTG CGC TCT CAC GGC GCC ACA 520 Gly Ile Gly Ala Glu Thr Ala Arg Val Leu Arg Ser His Gly Ala Thr 20 25 30 GTG ATT GGC GTA GAT CGC AAC ATG CCG AGC CTG ACT CTG GAT GCT TTC 568 Val Ile Gly Val Asp ArG Asn Met Pro Ser Leu Thr Leu Asp Ala Phe 35 40 45 GTT CAG GCT GAC CTG AGC CAT CCT GAGGGGAGAG GCGGTTTGCG TATTGGGCGC 622 Val Gln Ala Asp Leu Ser His Pro 50 55 ATGCATAAAA ACTGTTGTAA TTCATTAAGC ATTCTGCCGA CATGGAAGCC ATCACAAACG 682 GCATGATGAA CCTGAATCGC CAGCGGCATC AGCACCTTGT CGCCTTGCGT ATAATATTTG 742 CCCATGGACG CACACCGTGG AAACGGATGA AGGCACGAAC CCAGTTGACA TAAGCCTGTT 802 CGGTTCGTAA ACTGTAATGC AAGTAGCGTA TGCGCTCACG CAACTGGTCC AGAACCTTGA 862 CCGAACGCAG CGGTGGTAAC GGCGCAGTGG CGGTTTTCAT GGCTTGTTAT GACTGTTTTT 922 TTGTACAGTC TATGCCTCGG GCATCCAAGC AGCAAGCGCG TTACGCCGTG GGTCGATGTT 982 TGATGTTATG GAGCAGCAAC G ATG TTA CGC AGC AGC AAC GAT GTT ACG CAG 1033 Met Leu ArG Ser Ser Asn Asp Val Thr Gln 1 5 10 CAG GGC AGT CGC CCT AAA ACA AAG TTA GGT GGC TCA AGT ATG GGC ATC 1081 Gln Gly Ser Arg Pro Lys Thr Lys Leu Gly Gly Ser Ser Met Gly Ile 15 20 25 ATT CGC ACA TGT AGG CTC GGC CCT GAC CAA GTC AAA TCC ATG CGG GCT 1129 Ile Arg Thr Cys Arg Leu Gly Pro Asp Gln Val Lys Ser Met Arg Ala 30 35 40 GCT CTT GAT CTT TTC GGT CGT GAG TTC GGA GAC GTA GCC ACC TAC TCC 1177 Ala Leu Asp Leu Phe Gly Arg Glu Phe Gly Asp Val Ala Thr Tyr Ser 45 50 55 CAA CAT CAG CCG GAC TCC GAT TAC CTC GGG AAC TTG CTC CGT AGT AAG 1225 Gln His Gln Pro Asp Ser Asp Tyr Leu Gly Asn Leu Leu Arg Ser Lys 60 65 70 ACA TTC ATC GCG CTT GCT GCC TTC GAC CAA GAA GCG GTT GTT GGC GCT 1273 Thr Phe Ile Ala Leu Ala Ala Phe Asp Gln Glu Ala Val Val Gly Ala 75 80 85 90 CTC GCG GCT TAC GTT CTG CCC AGG TTT GAG CAG CCG CGT AGT GAG ATC 1321 Leu Ala Ala Tyr Val Leu Pro Arg Phe Glu Gln Pro Arg Ser Glu Ile 95 100 105 TAT ATC TAT GAT CTC GCA GTC TCC GGC GAG CAC CGG AGG CAG GGC ATT 1369 Tyr Ile Tyr Asp Leu Ala Val Ser Gly Glu His Arg Arg Gln Gly Ile 110 115 120 GCC ACC GCG CTC ATC AAT CTC CTC AAG CAT GAG GCC AAC GCG CTT GGT 1417 Ala Thr Ala Leu Ile Asn Leu Leu Lys His Glu Ala Asn Ala Leu Gly 125 130 135 GCT TAT GTG ATC TAC GTG CAA GCA GAT TAC GGT GAC GAT CCC GCA GTG 1465 Ala Tyr Val Ile Tyr Val Gln Ala Asp Tyr Gly Asp Asp Pro Ala Val 140 145 150 GCT CTC TAT ACA AAG TTG GGC ATA CGG GAA GAA GTG ATG CAC TTT GAT 1513 Ala Leu Tyr Thr Lys Leu Gly Ile Arg Glu Glu Val Met His Phe Asp 155 160 165 170 ATC GAC CCA AGT ACC GCC ACC TAA CAATTCGTTC AAGCCGAGAT CGGCTTCCCT 1567 Ile Asp Pro Ser Thr Ala Thr 175 177 G ATT GCA TTC ATG TGT GCT GAG GAG TCA CGT TGG ATC AAC GGC ATA AAT 1616 Ile Ala Phe Met Cys Ala Glu Glu Ser Arg Trp Ile Asn Gly Ile Asn 228 230 235 240 ATT CCA GTG GAC GGA GGT TTG GCA TCG ACC TAC GTG TAA GTTCGTGGAC 1665 Ile Pro Val Asp Gly Gly Leu Ala Ser Thr Tyr Val 245 250 255 GCCCTTTGCA CGCGCACTAT ATCTCTATGC AGCAGCTGAA AGCAGCTTTG GTTTTGATCG 1725 GAGGTAGCGG GCGGAAAGGT GCAGAATGTC TAAATAATAA AGGATTCTTG TGAAGCTTTA 1785 GTTGTCCGTA AACGAAAATA AAAATAAAGA GGAATGATAT GAAAGCAAGT AGATCAGTCT 1845 GCACTTTCAA AATAGCTACC CTGGCAGGCG CCATTTATGC AGCGCTGCCA ATGTCAGCTG 1905 CAAACTCGAT GCAGCTGGAT GTAGGTAGCT CGGATTGGAC GGTGCGTTGG GGACAACACC 1965 CTCAAGTATA GCCTTGCCTC TCGCCTGAAT GAGCAAGACT CAAGTCTGAC AAATGCGCCG 2025 ACTGTCAATG GTTATATCCG GATATTCAAA GTCAGGGTGA TCGTAACTTT GACCGGGGGC 2085 TTGGTATCCA ATCGTCTCGA TATTCTGGCT GCAG 2119 图2b: CTGCAGCCAG GGCTGAAAAG GAGGGATTCA GTGAGGTCAT GAAGGGAGGG GACGGCGCCT 60 GGCTCCAATT GCTCGATGGC GCCGCGATTG AGTGTCTTGG GCGCGGTCTT GGAGAGTTCG 120 GCTAGGGAGA TAAATTTGCT GGCCATGGTG GCGGCCCCTG ATGGGTTGGA TGATTTTCTG 180 CATTCTGCAT CATGAAATTC ATGAAATCAT CACTTTTCGG GGGGTGGGTG CACGGGATTG 240 AAGGTTGCTA GGAGAGTGCA TTGCTCGTAA GCCCAGGAAG CACGCGGGTT TCAGGATGGT 300 GCATGGAAAT GGCATGAGCT TTGCTGGATA TGATTAGAGA CATTAACTAT TTTGGCGGAA 360 TGGAAGCACG ATTCCTCGCC CGGTAGAGCG GTAACCGCGA CATTCAGGAC CGTAAAAAGG 420 AAAGAGCATG CAA CTG ACC AAC AAG AAA ATC GTC GTC ACC GGA GTG TCC TCC 472 Met Gln Leu Thr Asn Lys Lys Ile Val Val Thr Gly Val Ser Ser 1 5 10 15 GGT ATC GGT GCC GAA ACT GCC CGC GTT CTG CGC TCT CAC GGC GCC ACA 520 Gly Ile Gly Ala Glu Thr Ala Arg Val Leu Arg Ser His Gly Ala Thr 20 25 30 GTG ATT GGC GTA GAT CGC AAC ATG CCG AGC CTG ACT CTG GAT GCT TTC 568 Val Ile Gly Val Asp Arg Asn Met Pro Ser Leu Thr Leu Asp Ala Phe 35 40 45 GTT CAG GCT GAC CTG AGC CAT CCT GAA GGC ATC GATC AAC GGC ATA AAT 617 Val Gln Ala Asp Leu Ser His Pro Glu Gly Ile Asn Gly Ile Asn 50 55 58 240 ATT CCA GTG GAC GGA GGT TTG GCA TCG ACC TAC GTG TAA GTTCGTGGAC 666 Ile Pro Val Asp Gly Gly Leu Ala Ser Thr Tyr Val 245 250 255 GCCCTTTGCA CGCGCACTAT ATCTCTATGC AGCAGCTGAA AGCAGCTTTG GTTTTGATCG 726 GAGGTAGCGG GCGGAAAGGT GCAGAATGTC TAAATAATAA AGGATTCTTG TGAAGCTTTA 786 GTTGTCCGTA AACGAAAATA AAAATAAAGA GGAATGATAT GAAAGCAAGT AGATCAGTCT 846 GCACTTTCAA AATAGCTACC CTGGCAGGCG CCATTTATGC AGCGCTGCCA ATGTCAGCTG 906 CAAACTCGAT GCAGCTGGAT GTAGGTAGCT CGGATTGGAC GGTGCGTTGG GGACAACACC 966 CTCAAGTATA GCCTTGCCTC TCGCCTGAAT GAGCAAGACT CAAGTCTGAC AAATGCGCCG 1026 ACTGTCAATG GTTATATCCG GATATTCAAA GTCAGGGTGA TCGTAACTTT GACCGGGGGC 1086 TTGGTATCCA ATCGTCTCGA TATTCTGGCT GCAG 1120 图2c: GAATTCCGCG TATCGCCCGG TTCTATCAGC GGGCCGCTTT CGAAAGTCAT GGTGTTAGCC 60 GGTAGGGTCT TTTTCTTGGC CATGCTTGTT GCCTGAACCT TCGTTGACAT AGGGCAGAGG 120 TGCGTTTGCC GCTTCGCTTC GCGATGAACC GCATCGAGAT GCTGAGGTCA GGATTTTTCC 180 TTAACTCGCG TAAGCATTCT GTCATTTTTT TGGTGGCTTT GAACAGCCTG ATGAAAGGTG 240 GTCTCGCCCT TTGAGGCCGA TTCTTGGGCG CTTGGCGGCG TCGAAGCGAT GCTCCACTAC 300 CGATTAAGAT AATTAAAATA AGGAAACCGC ATGGTTTCTT ATGTGAATTT GTCTGGCATA 360 CTCCAGCTCA AGGGCAATTT TTGGGCTATT GGCTGAGCAG TTGCCTCTAT ATGGTTATTC 420 AGAATAACAA TTGACTCCTC AGGAGGTCAG CG ATG AGC ATT CTT GGT TTG AAT 473 Met Ser Ile Leu Gly Leu Asn 1 5 GGT GCC CCG GTC GGA GCT GAG CAG CTG GGC TCG GCT CTT GAT CGC ATG 521 Gly Ala Pro Val Gly Ala Glu Gln Leu Gly Ser Ala Leu Asp Arg Met 10 15 20 AAG AAG GCG CAC CTG GAG CAG GGG CCT GCA AAC TTG GAG CTG CGT CTG 569 Lys Lys Ala His Leu Glu Gln Gly Pro Ala Asn Leu Glu Leu ArG Leu 25 30 35 AGT AGG CTG GAT CGT GCG ATT GCA ATG CTT CTG GAA AAT CGT GAA GCA 617 Ser Arg Leu Asp Arg Ala Ile Ala Met Leu Leu Glu Asn Arg Glu Ala 40 45 50 55 ATT GCC GAC GCG GTT TCT GCT GAC TTT GGC AAT CGC AGC CGT GAG CAA 665 Ile Ala Asp Ala Val Ser Ala Asp Phe Gly Asn Arg Ser Arg Glu Gln 60 65 70 ACA CTG CTT TGC GAC ATT GCT GGC TCG GTG GCA AGC CTG AAG GAT AGC 713 Thr Leu Leu Cys Asp Ile Ala Gly Ser Val Ala Ser Leu Lys Asp Ser 75 80 85 CGC GAG CAC GTG GCC AAA TGG ATG GAG CCC GAA CAT CAC AAG GCG ATG 761 ArG Glu His Val Ala Lys Trp Met Glu Pro Glu His His Lys Ala Met 90 95 100 TTT CCA GGG GCG GAG GCA CGC GTT GAG TTT CAG CCG CTG GGT GTC GTT 809 Phe Pro Gly Ala Glu Ala Arg Val Glu Phe Gln Pro Leu Gly Val Val 105 110 115 GGG GTC ATT AGT CCC TGG AAC TTC CCT ATC GTA CTG GCC TTT GGG CCG 857 Gly Val Ile Ser Pro Trp Asn Phe Pro Ile Val Leu Ala Phe Gly Pro 120 125 130 135 CTG GCC GGC ATA TTC GCA GCA GGT AAT CGC GCC ATG CTC AAG CCG TCC 905 Leu Ala Gly Ile Phe Ala Ala Gly Asn Arg Ala Met Leu Lys Pro Ser 140 145 150 GAG CTT ACC CCG CGG ACT TCT GCC CTG CTT GCG GAG CTA ATT GCT CGT 953 Glu Leu Thr Pro Arg Thr Ser Ala Leu Leu Ala Glu Leu Ile Ala Arg 155 160 165 TAC TTC GAT GAA ACT GAG CTG ACT ACA GTG CTG GGC GAC GCT GAA GTC 1001 Tyr Phe Asp Glu Thr Glu Leu Thr Thr Val Leu Gly Asp Ala Glu Val 170 175 180 GGT GCG CTG TTC AGT GCT CAG CCT TTC GAT CAT CTG ATC TTC ACC GGC 1049 Gly Ala Leu Phe Ser Ala Gln Pro Phe Asp His Leu Ile Phe Thr Gly 185 190 195 GGC ACT GCC GTG GCC AAG CAC ATC ATG CGT GCC GCG GCG GAT AAC CTA 1097 Gly Thr Ala Val Ala Lys His Ile Met Arg Ala Ala Ala Asp Asn Leu 200 205 210 215 GTG CCC GTT ACC CTG GAA TTG GGT GGC AAA TCG CCG GTG ATC GTT TCC 1145 Val Pro Val Thr Leu Glu Leu Gly Gly Lys Ser Pro Val Ile Val Ser 220 225 230 CGC AGT GCA GAT ATG GCG GAC GTT GCA CAA CGG GTG TTG ACG GTG AAA 1193 Arg Ser Ala Asp Met Ala Asp Val Ala Gln ArG Val Leu Thr Val Lys 235 240 245 ACC TTC AAT GCC GGG CAA ATC TGT CTG GCA CCG GAC TAT GTG CTG CTG 1241 Thr Phe Asn Ala Gly Gln Ile Cys Leu Ala Pro Asp Tyr Val Leu Leu 250 255 260 CCG GAA GGGACAGCAA GCGAACCGGA ATTGCCAGCT GGGGCGCCCT CTGGTAAGGT 1297 Pro Glu 265 TGGGAAGCCC TGCAAAGTAA ACTGGATGGC TTTCTTGCCG CCAAGGATCT GATGGCGCAG 1357 GGGATCAAGA TCTGATCAAG AGACAGGATG AGGATCGTTT CGC ATG ATT GAA CAA 1412 Met Ile Glu Gln 1 GAT GGA TTG CAC GCA GGT TCT CCG GCC GCT TGG GTG GAG AGG CTA TTC 1460 Asp Gly Leu His Ala Gly Ser Pro Ala Ala Trp Val Glu Arg Leu Phe 5 10 15 20 GGC TAT GAC TGG GCA CAA CAG ACA ATC GGC TGC TCT GAT GCC GCC GTG 1508 Gly Tyr Asp Trp Ala Gln Gln Thr Ile Gly Cys Ser Asp Ala Ala Val 25 30 35 TTC CGG CTG TCA GCG CAG GGG CGC CCG GTT CTT TTT GTC AAG ACC GAC 1556 Phe Arg Leu Ser Ala Gln Gly Arg Pro Val Leu Phe Val Lys Thr Asp 40 45 50 CTG TCC GGT GCC CTG AAT GAA CTG CAG GAC GAG GCA GCG CGG CTA TCG 1604 Leu Ser Gly Ala Leu Asn Glu Leu Gln Asp Glu Ala Ala Arg Leu Ser 55 60 65 TGG CTG GCC ACG ACG GGC GTT CCT TGC GCA GCT GTG CTC GAC GTT GTC 1652 Trp Leu Ala Thr Thr Gly val Pro Cys Ala Ala Val Leu Asp Val Val 70 75 80 ACT GAA GCG GGA AGG GAC TGG CTG CTA TTG GGC GAA GTG CCG GGG CAG 1700 Thr Glu Ala Gly Arg Asp Trp Leu Leu Leu Gly Glu Val Pro Gly Gln 85 90 95 100 GAT CTC CTG TCA TCT CAC CTT GCT CCT GCC GAG AAA GTA TCC ATC ATG 1748 Asp Leu Leu Ser Ser His Leu Ala Pro Ala Glu Lys Val Ser Ile Met 105 110 115 GCT GAT GCA ATG CGG CGG CTG CAT ACG CTT GAT CCG GCT ACC TGC CCA 1796 Ala Asp Ala Met Arg Arg Leu His Thr Leu Asp Pro Ala Thr Cys Pro 120 125 130 TTC GAC CAC CAA GCG AAA CAT CGC ATC GAG CGA GCA CGT ACT CGG ATG 1844 Phe Asp His Gln Ala Lys His Arg Ile Glu Arg Ala Arg Thr Arg Met 135 140 145 GAA GCC GGT CTT GTC GAT CAGGAT GAT CTG GAC GAA GAG CAT CAG GGG 1892 Glu Ala Gly Leu Val Asp Gln Asp Asp Leu Asp Glu Glu His Gln Gly 150 155 160 CTC GCG CCA GCC GAA CTG TTC GCC AGG CTC AAG GCG CGC ATG CCC GAC 1940 Leu Ala Pro Ala Glu Leu Phe Ala Arg Leu Lys Ala Arg Met Pro Asp 165 170 175 180 GGC GAG GAT CTC GTC GTG ACC CAT GGC GAT GCC TGC TTG CCG AAT ATC 1988 Gly Glu Asp Leu Val Val Thr His Gly Asp Ala Cys Leu Pro Asn Ile 185 190 195 ATG GTG GAA AAT GGC CGC TTT TCT GGA TTC ATC GAC TGT GGC CGG CTG 2036 Met Val Glu Asn Gly Arg Phe Ser Gly Phe Ile Asp Cys Gly Arg Leu 200 205 210 GGT GTG GCG GAC CGC TAT CAG GAC ATA GCG TTG GCT ACC CGT GAT ATT 2084 Gly Val Ala Asp Arg Tyr Gln Asp Ile Ala Leu Ala Thr Arg Asp Ile 215 220 225 GCT GAA GAG CTT GGC GGC GAA TGG GCT GAC CGC TTC CTC GTG CTT TAC 2132 Ala Glu Glu Leu Gly Gly Glu Trp Ala Asp Arg Phe Leu Val Leu Tyr 230 235 240 GGT ATC GCC GCT CCC GAT TCG CAG CGC ATC GCC TTC TAT CGC CTT CTT 2180 Gly Ile Ala Ala Pro Asp Ser Gln Arg Ile Ala Phe Tyr Arg Leu Leu 245 250 255 260 GAC GAG TTC TTC TGA GCGGGACTCT GGGGTTCGAA ATGACCGACC AAGCGACGCC 2235 Asp Glu Phe Phe 264 CGC CAT GCC AAG CCT GTT CTC GTG CAA AGT CCT GTG GGT GAG TCG AAC 2283 His Ala Lys Pro Val Leu Val Gln Ser Pro Val Gly Glu Ser Asn 444 445 450 455 TTG GCG ATG CGC GCA CCC TAC GGA GAA GCG ATC CAC GGA CTG CTC TCT 2331 Leu Ala Met Arg Ala Pro Tyr Gly Glu Ala Ile His Gly Leu Leu Ser 460 465 470 GTC CTC CTT TCA ACG GAG TGT TAG AACCGTTGGT AGTGGTTTTG GACGGGCCCA 2385 Va1 Leu Leu Ser Thr Glu Cys 475 480 481 GGAGCATGCG CTTCTGGGCC CGTTTCTTGA GTATTCATTG GATAGTCACG CGTGGTAGCT 2445 TCGAGCCTGC ACAGCTGATG AGCACCCTGG AAGGCGCGCT GTACGCGGAC GACTGGGTTC 2505 ATCTTCGCCA TTCATGACGG AACTCCGTTC CCCAGTACCG CGATGACTAT TTTGCCTCTT 2565 CCGATGTCCG ATTCCACGCC GCCTGACGCT AAGCGGGGGC GGGGGCGCCC GCATCCCAGC 2625 CCAGACAGCA ACAAATGAGT AGGCTCTTGG ATGCCGCGGC GGCTGAGATT GGTAACGGCA 2685 ATTTCGTCAA TGTGACGATG GATTCGATTG CCCGTGCTGC CGGCGTCTCA AAAAAAACGC 2745 TGTACGTCTT GGTGGCGAGC AAGGAAGAAC TCATTTCCCG GTTAGTGGCT CGAGACATGT 2805 CCAACCTTGA GGAATTC 2822 图2d: GAATTCCGCG TATCGCCCGG TTCTATCAGC GGGCCGCTTT CGAAAGTCAT GGTGTTAGCC 60 GGTAGGGTCT TTTTCTTGGC CATGCTTGTT GCCTGAACCT TCGTTGACAT AGGGCAGAGG 120 TGCGTTTGCC GCTTCGCTTC GCGATGAACC GCATCGAGAT GCTGAGGTCA GGATTTTTCC 180 TTAACTCGCG TAAGCATTCT GTCATTTTTT TGGTGGCTTT GAACAGCCTG ATGAAAGGTG 240 GTCTCGCCCT TTGAGGCCGA TTCTTGGGCG CTTGGCGGCG TCGAAGCGAT GCTCCACTAC 300 CGATTAAGAT AATTAAAATA AGGAAACCGC ATGGTTTCTT ATGTGAATTT GTCTGGCATA 360 CTCCAGCTCA AGGGCAATTT TTGGGCTATT GGCTGAGCAG 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CTC AAG 2040 Glu His Arg Arg Gln Gly Ile Ala Thr Ala Leu Ile Asn Leu Leu Lys 120 125 130 CAT GAG GCC AAC GCG CTT GGT GCT TAT GTG ATC TAC GTG CAA GCA GAT 2088 His Glu Ala Asn Ala Leu Gly Ala Tyr Val Ile Tyr Val Gln Ala Asp 135 140 145 TAC GGT GAC GAT CCC GCA GTG GCT CTC TAT ACA AAG TTG GGC ATA CGG 2136 Tyr Gly Asp Asp Pro Ala Val Ala Leu Tyr Thr Lys Leu Gly Ile Arg 150 155 160 GAA GAA GTG ATG CAC TTT GAT ATC GAC CCA AGT ACC GCC ACC TAA CAA 2184 Glu Glu Val Met His Phe Asp Ile Asp Pro Ser Thr Ala Thr 165 170 175 177 TTCGTTCAAG CCGAGATCGG CTTCCCTG CAA AGT CCT GTG GGT GAG TCG AAC 2236 Gln Ser Pro Val Gly Glu Ser Asn 451 455 TTG GCG ATG CGC GCA CCC TAC GGA GAA GCG ATC CAC GGA CTG CTC TCT 2284 Leu Ala Met Arg Ala Pro Tyr Gly Glu Ala Ile His Gly Leu Leu Ser 460 465 470 GTC CTC CTT TCA ACG GAG TGT TAG AACCGTTGGT AGTGGTTTTG GACGGGCCCA 2338 Val Leu Leu Ser Thr Glu Cys 475 480 481 GGAGCATGCG CTTCTGGGCC CGTTTCTTGA GTATTCATTG GATAGTCACG CGTGGTAGCT 2398 TCGAGCCTGC ACAGCTGATG AGCACCCTGG AAGGCGCGCT 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GGT GCC CCG GTC GGA GCT GAG CAG CTG GGC TCG GCT CTT GAT CGC ATG 521 Gly Ala Pro Val Gly Ala Glu Gln Leu Gly Ser Ala Leu Asp Arg Met 10 15 20 AAG AAG GCG CAC CTG GAG CAG GGG CCT GCA AAC TTG GAG CTG CGT CTG 569 Lys Lys Ala His Leu Glu Gln Gly Pro Ala Asn Leu Glu Leu Arg Leu 25 30 35 AGT AGG CTG GAT CGT GCG ATT GCA ATG CTT CTG GAA AAT CGT GAA GCA 617 Ser Arg Leu Asp Arg Ala Ile Ala Met Leu Leu Glu Asn Arg Glu Ala 40 45 50 55 ATT GCC GAC GCG GTT TCT GCT GAC TTT GGC AAT CGC AGC CGT GAG CAA 665 Ile Ala Asp Ala Val Ser Ala Asp Phe Gly Asn Arg Ser Arg Glu Gln 60 65 70 ACA CTG CTT TGC GAC ATT GCT GGC TCG GTG GCA AGC CTG AAG GAT AGC 713 Thr Leu Leu Cys Asp Ile Ala Gly Ser Val Ala Ser Leu Lys Asp Ser 75 80 85 CGC GAG CAC GTG GCC AAA TGG ATG GAG CCC GAA CAT CAC AAG GCG ATG 761 Arg Glu His Val Ala Lys Trp Met Glu Pro Glu His His Lys Ala Met 90 95 100 TTT CCA GGG GCG GAG GCA CGC GTT GAG TTT CAG CCG CTG GGT GTC GTT 809 Phe Pro Gly Ala Glu Ala Arg Val Glu Phe Gln Pro Leu Gly Val Val 105 110 115 GGG 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GCT 1634 Gly Gly Glu Trp Ala Asp Arg Phe Leu Val Leu Tyr Gly Ile Ala Ala 235 240 245 CCC GAT TCG CAG CGC ATC GCC TTC TAT CGC CTT CTT GAC GAG TTC TTC 1682 Pro Asp Ser Gln Arg Ile Ala Phe Tyr Arg Leu Leu Asp Glu Phe Phe 250 255 260 264 TGAGCGGGAC TCTGGGGTTC GAAATGACCG ACCAAGCGAC GCCCCT GTT TTG CAA 1737 Val Leu Gln 563 565 TGG CGG TCG GCG AAA GTT GAT GCG CTG TAT CGT GGT GAA GAT CAA TCC 1785 Trp Arg Ser Ala Lys Val Asp Ala Leu Tyr Arg Gly Glu Asp Gln Ser 570 575 580 ATG CTG CGT GAC GAG GCC ACA CTG TGA GTTGGTCAGG GGGGGCTTAC 1832 Met Leu Arg Asp Glu Ala Thr Leu 585 589 TCGGCGTTTT CCGACACTGC GTTGGTTGCG GCAGTGCGCA CCCCCTGGAT TGATTGCGGG 1892 GGTGCCCTGT CGCTGGTGTC GCCTATCGAC TTAGGGGTAA AGGTCGCTCG CGAAGTTCTG 1952 ATGCGTGCGT CGCTTGAACC ACAAATGGTC GATAGCGTAC TCGCAGGCTC TATGGCTCAA 2012 GCAAGCTTTG ATGCTTACCT GCTCCCGCGG CACATTGGCT TGTACAGCGG TGTTCCCAAG 2072 TCGGTTCCGG CCTTGGGGGT GCAGCGCATT TGCGGCACAG GCTTCGAACT GCTTCGGCAG 2132 GCCGGCGAGC AGATTTCCCA AGGCGCTGAT CACGTGCTGT GTGTCGCGGG CTGCAG 2188 图2g: CTGCAGCCGA GCATCGATTG AGCACTTTAC CCAGCTGCGC TGGCTGACCA TTCAGAATGG 60 CCCGCGGCAC TATCCAATCT AAATCGATCT TCGGGCGCCG CGGGCATCAT GCCCGCGGCG 120 CTCGCCTCAT TTCAATCTCT AACTTGATAA AAACAGAGCT GTTCTCCGGT CTTGGTGGAT 180 CAAGGCCAGT CGCGGAGAGT CTCGAAGAGG AGAGTACAGT GAACGCCGAG TCCACATTGC 240 AACCGCAGGC ATCATCATGC TCTGCTCAGC CACGCTACCG CAGTGTGTCG ATTGGTCATC 300 CTCCGGTTGA GGTTACGCAA GACGCTGGAG GTATTGTCCG G ATG CGT TCT CTC GAG 356 Met Arg Ser Leu Glu 1 5 GCG CTT CTT CCC TTC CCG GGT CGA ATT CTT GAG CGT CTC GAG CAT TGG 404 Ala Leu Leu Pro Phe Pro Gly Arg Ile Leu Glu Arg Leu Glu His Trp 10 15 20 GCT AAG ACC CGT CCA GAA CAA ACC TGC GTT GCT GCC AGG GCG GCA AAT 452 Ala Lys Thr Arg Pro Glu Gln Thr Cys Val Ala Ala Arg Ala Ala Asn 25 30 35 GGG GAA TGG CGT CGT ATC AGC TAC GCG GAA ATG TTC CAC AAC GTC CGC 500 Gly Glu Trp Arg Arg Ile Ser Tyr Ala Glu Met Phe His Asn Val Arg 40 45 50 GCC ATC GCA CAG AGC TTG CTT CCT TAC GGA CTA TCG GCA GAG CGT CCG 548 Ala Ile Ala Gln Ser Leu Leu Pro Tyr Gly Leu Ser Ala Glu Arg Pro 55 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1100 GCGCGTTACG CCGTGGGTCG ATGTTTGATG TTATGGAGCA GCAACG ATG TTA CGC 1155 Met Leu Arg 1 AGC AGC AAC GAT GTT ACG CAG CAG GGC AGT CGC CCT AAA ACA AAG TTA 1203 Ser Ser Asn Asp Val Thr Gln Gln Gly Ser Arg Pro Lys Thr Lys Leu 5 10 15 GGT GGC TCA AGT ATG GGC ATC ATT CGC ACA TGT AGG CTC GGC CCT GAC 1251 Gly Gly Ser Ser Met Gly Ile Ile Arg Thr Cys Arg Leu Gly Pro Asp 20 25 30 35 CAA GTC AAA TCC ATG CGG GCT GCT CTT GAT CTT TTC GGT CGT GAG TTC 1299 Gln Val Lys Ser Met Arg Ala Ala Leu Asp Leu Phe Gly Arg Glu Phe 40 45 50 GGA GAC GTA GCC ACC TAC TCC CAA CAT CAG CCG GAC TCC GAT TAC CTC 1347 Gly Asp Val Ala Thr Tyr Ser Gln His Gln Pro Asp Ser Asp Tyr Leu 55 60 65 GGG AAC TTG CTC CGT AGT AAG ACA TTC ATC GCG CTT GCT GCC TTC GAC 1395 Gly Asn Leu Leu Arg Ser Lys Thr Phe Ile Ala Leu Ala Ala Phe Asp 70 75 80 CAA GAA GCG GTT GTT GGC GCT CTC GCG GCT TAC GTT CTG CCC AGG TTT 1443 Gln Glu Ala Val Val Gly Ala Leu Ala Ala Tyr Val Leu Pro Arg Phe 85 90 95 GAG CAG CCG CGT AGT GAG ATC TAT ATC TAT GAT CTC GCA GTC TCC GGC 1491 Glu Gln Pro Arg Ser Glu Ile Tyr Ile Tyr Asp Leu Ala Val Ser Gly 100 105 110 115 GAG CAC CGG AGG CAG GGC ATT GCC ACC GCG CTC ATC AAT CTC CTC AAG 1539 Glu His Arg Arg Gln Gly Ile Ala Thr Ala Leu Ile Asn Leu Leu Lys 120 125 130 CAT GAG GCC AAC GCG CTT GGT GCT TAT GTG ATC TAC GTG CAA GCA GAT 1587 His Glu Ala Asn Ala Leu Gly Ala Tyr Val Ile Tyr Val Gln Ala Asp 135 140 145 TAC GGT GAC GAT CCC GCA GTG GCT CTC TAT ACA AAG TTG GGC ATA CGG 1635 Tyr Gly Asp Asp Pro Ala Val Ala Leu Tyr Thr Lys Leu Gly Ile Arg 150 155 160 GAA GAA GTG ATG CAC TTT GAT ATC GAC CCA AGT ACC GCC ACC TAA CAA 1683 Glu Glu Val Met His Phe Asp Ile Asp Pro Ser Thr Ala Thr 165 170 175 177 TTCGTTCAAG CCGAGATCGG CTTCCCCT GTT TTG CAA TGG CGG TCG GCG AAA 1735 Val Leu Gln Trp Arg Ser Ala Lys 563 565 570 GTT GAT GCG CTG TAT CGT GGT GAA GAT CAA TCC ATG CTG CGT GAC GAG 1783 Val Asp Ala Leu Tyr Arg Gly Glu Asp Gln Ser Met Leu Arg Asp Glu 575 580 585 GCC ACA CTG TGA GTTGGTCAGG GGGGGCTTAC TCGGCGTTTT CCGACACTGC 1835 Ala Thr Leu 589 GTTGGTTGCG GCAGTGCGCA CCCCCTGGAT TGATTGCGGG GGTGCCCTGT CGCTGGTGTC 1895 GCCTATCGAC TTAGGGGTAA AGGTCGCTCG CGAAGTTCTG ATGCGTGCGT CGCTTGAACC 1955 ACAAATGGTC GATAGCGTAC TCGCAGGCTC TATGGCTCAA GCAAGCTTTG ATGCTTACCT 2015 GCTCCCGCGG CACATTGGCT TGTACAGCGG TGTTCCCAAG TCGGTTCCGG CCTTGGGGGT 2075 GCAGCGCATT TGCGGCACAG GCTTCGAACT GCTTCGGCAG GCCGGCGAGC AGATTTCCCA 2135 AGGCGCTGAT CACGTGCTGT GTGTCGCGGG CTGCAG 2171 图2h: CTGCAGCCGA GCATCGATTG AGCACTTTAC CCAGCTGCGC TGGCTGACCA TTCAGAATGG 60 CCCGCGGCAC TATCCAATCT AAATCGATCT TCGGGCGCCG CGGGCATCAT GCCCGCGGCG 120 CTCGCCTCAT TTCAATCTCT AACTTGATAA AAACAGAGCT GTTCTCCGGT CTTGGTGGAT 180 CAAGGCCAGT CGCGGAGAGT CTCGAAGAGG AGAGTACAGT GAACGCCGAG TCCACATTGC 240 AACCGCAGGC ATCATCATGC TCTGCTCAGC CACGCTACCG CAGTGTGTCG ATTGGTCATC 300 CTCCGGTTGA GGTTACGCAA GACGCTGGAG GTATTGTCCG G ATG CGT TCT CTC GAG 356 Met Arg Ser Leu Glu 1 5 GCG CTT CTT CCC TTC CCG GGT CGA ATT CTT GAG CGT CTC GAG CAT TGG 404 Ala Leu Leu Pro Phe Pro Gly Arg Ile Leu Glu Arg Leu Glu His Trp 10 15 20 GCT AAG ACC CGT CCA GAA CAA ACC TGC GTT GCT GCC AGG GCG GCA AAT 452 Ala Lys Thr Arg Pro Glu Gln Thr Cys Val Ala Ala Arg Ala Ala Asn 25 30 35 GGG GAA TGG CGT CGT ATC AGC TAC GCG GAA ATG TTC CAC AAC GTC CGC 500 Gly Glu Trp Arg Arg Ile Ser Tyr Ala Glu Met Phe His Asn Val Arg 40 45 50 GCC ATC GCA CAG AGC TTG CTT CCT TAC GGA CTA TCG GCA GAG CGT CCG 548 Ala Ile Ala Gln Ser Leu Leu Pro Tyr Gly Leu Ser Ala Glu Arg Pro 55 60 65 CTG CTT ATC GTC TCT GGA AAT GAC CTG GAA CAT CTT CAG CTG GCA TTT 596 Leu Leu Ile Val Ser Gly Asn Asp Leu Glu His Leu Gln Leu Ala Phe 70 75 80 85 GGG GCT ATG TAT GCG GGC ATT CCC TAT TGC CCG GTG TCT CCT GCT TAT 644 Gly Ala Met Tyr Ala Gly Ile Pro Tyr Cys Pro Val Ser Pro Ala Tyr 90 95 100 TCA CTG CTG TCG CAA GAT TTG GCG AAG CTG CGT CAC ATC GTA GGT CTT 692 Ser Leu Leu Ser Gln Asp Leu Ala Lys Leu Arg His Ile Val Gly Leu 105 110 115 CTG CAA CCG GGA CTG GTC TTT GCT GCC GAT GCA GCA CCT TTC CAG CGC 740 Leu Gln Pro Gly Leu Val Phe Ala Ala Asp Ala Ala Pro Phe Gln Arg 120 125 130 133 GCT GTT 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Val Gly Arg Ile Ile Gly Glu Leu Ser Ala Arg His Leu Lys Pro Ala 235 240 245 GTG CTG GAA TTA GGT GGT AAG GCT CCG TTC TTG GTC TTG GAC GAT GCC 823 Val Leu Glu Leu Gly Gly Lys Ala Pro Phe Leu Val Leu Asp Asp Ala 250 255 260 GAC CTC GAT GCG GCG GTC GAA GCG GCG GCC TTT GGT GCC TAC TTC AAT 871 Asp Leu Asp Ala Ala Val Glu Ala Ala Ala Phe Gly Ala Tyr Phe Asn 265 270 275 CAG GGT CAA ATC TGC ATG TCC ACT GAG CGT CTG ATT GTG ACA GCA GTC 919 Gln Gly Gln Ile Cys Met Ser Thr Glu Arg Leu Ile Val Thr Ala Val 280 285 290 295 GCA GAC GCC TTT GTT GAA AAG CTG GCG AGG AAG GTC GCC ACA CTG CGT 967 Ala Asp Ala Phe Val Glu Lys Leu Ala Arg Lys Val Ala Thr Leu Arg 300 305 310 GCT GGC GAT CCT AAT GAT CCG CAA TCG GTC TTG GGT TCG TTG ATT GAT 1015 Ala Gly Asp Pro Asn Asp Pro Gln Ser Val Leu Gly Ser Leu Ile Asp 315 320 325 GCC AAT GCA GGT CAA CGC ATC CAG GTT CTG GTC GAT GAT GCG CTC GGG 1063 Ala Asn Ala Gly Gln Arg Ile Gln Val Leu Val Asp Asp Ala Leu 330 335 340 342 GACAGCAAGC GAACCGGAAT TGCCAGCTGG GGCGCCCTCT GGTAAGGTTG 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Ser Gly Phe Ile Asp Cys Gly Arg Leu Gly Val Ala 200 205 210 215 GAC CGC TAT CAG GAC ATA GCG TTG GCT ACC CGT GAT ATT GCT GAA GAG 1907 Asp Arg Tyr Gln Asp Ile Ala Leu Ala Thr Arg Asp Ile Ala Glu Glu 220 225 230 CTT GGC GGC GAA TGG GCT GAC CGC TTC CTC GTG CTT TAC GGT ATC GCC 1955 Leu Gly Gly Glu Trp Ala Asp Arg Phe Leu Val Leu Tyr Gly Ile Ala 235 240 245 GCT CCC GAT TCG CAG CGC ATC GCC TTC TAT CGC CTT CTT GAC GAG TTC 2003 Ala Pro Asp Ser Gln Arg Ile Ala Phe Tyr Arg Leu Leu Asp Glu Phe 250 255 260 TTC TGA GCGGGACTCT GGGGTTCGAAATGACCGACC AAGCGACGCC CG GCC CAG 2057 phe Ala Gln 264 421 CGC GTC GAT TCG GGC ATT TGC CAT ATC AAT GGA CCG ACT GTG CAT GAC 2105 Arg Val Asp Ser Gly Ile Cys His Ile Asn Gly Pro Thr Val His Asp 425 430 435 GAG GCT CAG ATG CCA TTC GGT GGG GTG AAG TCC AGC GGC TAC GGC AGC 2153 Glu Ala Gln Met Pro Phe Gly Gly Val Lys Ser Ser Gly Tyr Gly Ser 440 445 450 TTC GGC AGT CGA GCA TCG ATT GAG CAC TTT ACC CAG CTG CGC TGG CTG 2201 Phe Gly Ser Arg Ala Ser Ile Glu His Phe Thr Gln Leu Arg 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Glu Glu His Gln Gly 150 155 160 CTC GCG CCA GCC GAA CTG TTC GCC AGG CTC AAG GCG CGC ATG CCC GAC 1291 Leu Ala Pro Ala Glu Leu Phe Ala Arg Leu Lys Ala Arg Met Pro Asp 165 170 175 180 GGC GAG GAT CTC GTC GTG ACC CAT GGC GAT GCC TGC TTG CCG AAT ATC 1339 Gly Glu Asp Leu Val Val Thr His Gly Asp Ala Cys Leu Pro Asn Ile 185 190 195 ATG GTG GAA AAT GGC CGC TTT TCT GGA TTC ATC GAC TGT GGC CGG CTG 1387 Met Val Glu Asn Gly Arg Phe Ser Gly Phe Ile Asp Cys Gly Arg Leu 200 205 210 GGT GTG GCG GAC CGC TAT CAG GAC ATA GCG TTG GCT ACC CGT GAT ATT 1435 Gly Val Ala Asp Arg Tyr Gln Asp Ile Ala Leu Ala Thr Arg Asp Ile 215 220 225 GCT GAA GAG CTT GGC GGC GAA TGG GCT GAC CGC TTC CTC GTG CTT TAC 1483 Ala Glu Glu Leu Gly Gly Glu Trp Ala Asp Arg Phe Leu Val Leu Tyr 230 235 240 GGT ATC GCC GCT CCC GAT TCG CAG CGC ATC GCC TTC TAT CGC CTT CTT 1531 Gly Ile Ala Ala Pro Asp Ser Gln Arg Ile Ala Phe Tyr Arg Leu Leu 245 250 255 260 GAC GAG TTC TTC TGA GCGGGACTCT GGGGTTCGAA ATGACCGACC AAGCGACGCC 1586 Asp Glu phe Phe 264 CA TTG AGG GCG CAA GAG GAG AAA TGG ATT GAC CAA GAG ATC GTG GCT 1633 Leu Arg Ala Gln Glu Glu Lys Trp Ile Asp Gln Glu Ile Val Ala 197 200 205 210 GTT ACG GAT GAA CAG TTC GAT TTA GAG GGC TACAAC AGT CGA GCA ATT 1681 Val Thr Asp Glu Gln Phe Asp Leu Glu Gly Tyr Asn Ser Arg Ala Ile 215 220 225 GAA CTG CCT CGG AAG GCA AAA TTG TTG ATC GTG ACA GTC ATC CGC GGC 1729 Glu Leu Pro Arg Lys Ala Lys Leu Leu Ile Val Thr Val Ile Arg Gly 230 235 240 CTA GCA GTC TTT GAA GCC CTT TCC CGA TTG AAG CCT GTT CAT TCT GGC 1777 Leu Ala Val Phe Glu Ala Leu Ser Arg Leu Lys Pro Val His Ser Gly 245 250 255 GGG GTG CAG ACT GCG GGC AAC AGC TGT GCC GTA GTG GAC GGC GCC GCG 1825 Gly Val Gln Thr Ala Gly Asn Ser Cys Ala Val Val Asp Gly Ala Ala 260 265 270 275 GCG GCT TTG GTG GCT CGA GAG TCG TCT GCG ACA CAG CCG GTC TTG GCT 1873 Ala Ala Leu Val Ala Arg Glu Ser Ser Ala Thr Gln Pro Val Leu Ala 280 285 290 AGG ATA CTG GCT ACC TCC GTA GTC GGG ATC GAG CCC GAG CAT ATG GGG 1921 Arg Ile Leu Ala Thr Ser Val Val Gly Ile Glu Pro Glu His Met Gly 295 300 305 CTC GGC CCT GCG CCC GCG ATT CGC CTG CTG CTT GCG CGT AGT GAT CTT 1969 Leu Gly Pro Ala Pro Ala Ile Arg Leu Leu Leu Ala Arg Ser Asp Leu 310 315 320 AGT TTG AGG GAT ATC GAC CTC TTT GAG ATA AAC GAG GCG CAG GCC GCC 2017 Ser Leu Arg Asp Ile Asp Leu Phe Glu Ile Asn Glu Ala Gln Ala Ala 325 330 335 CAA GTT CTA GCG GTA CAG CAT GAA TTG GGT ATT GAG CAC TCA AAA CTT 2065 Gln Val Leu Ala Val Gln His Glu Leu Gly Ile Glu His Ser Lys Leu 340 345 350 355 AAT ATT TGG GGC GGG GCC ATT GCA CTT GGA CAC CCG CTT GCC GCG ACC 2113 Asn Ile Trp Gly Gly Ala Ile Ala Leu Gly His Pro Leu Ala Ala Thr 360 365 370 GGA TTG CGT CTC TGC ATG ACC CTC GCT CAC CAA TTG CAA GCT AAT AAC 2161 Gly Leu Arg Leu Cys Met Thr Leu Ala His Gln Leu Gln Ala Asn Asn 375 380 385 TTT CGA TAT GGA ATT GCC TCG GCA TGC ATT GGT GGG GGA CAG GGG ATG 2209 Phe Arg Tyr Gly Ile Ala Ser Ala Cys Ile Gly Gly Gly Gln Gly Met 390 395 400 GCG GTT CTT TTA GAG AAT CCC CAC TTC GGT TCG TCC TCT GCA CGA AGT 2257 Ala Val Leu Leu Glu Asn Pro His Phe Gly Ser Ser Ser Ala Arg Ser 405 410 415 TCG ATG ATT AAC AGA GTT GAC CAC TAT CCA CTG AGC TAA CGGGCATCTC 2306 Ser Met Ile Asn Arg Val Asp His Tyr Pro Leu Ser 420 425 430 431 CTTTGTTGCT TTGAGGTGGC GCACGAAGGA GGGCTCGAAA ATCTCTGCTA AAAACAAGAA 2366 GAAGGAACAG GGAACATGAT TAGTTTCGCT CGTATGGCAG AAAGTTTAGG AGTCCAGGCT 2426 AAACTTGCCC TTGCCTTCGC ACTCGTATTA TGTGTCGGGC TGATTGTTAC CGGCACGGGT 2486 TTCTACAGTG TACATACCTT GTCAGGGTTG GTGGGAATTC 2526 图2p: GAATTCCGCG GTCGGCGAAA GTTGATGCGC TGTATCGTGG TGAAGATCAA TCCATGCTGC 60 GTGACGAGGC CACACT GTG AGT TGG TCA GGG GGG GCT TAC TCG GCG TTT TCC 112 Met Ser Trp Ser Gly Gly Ala Tyr Ser Ala Phe Ser 1 5 10 GAC ACT GCG TTG GTT GCG GCA GTG CGC ACC CCC TGG ATT GAT TGC GGG 160 Asp Thr Ala Leu Val Ala Ala Val Arg Thr Pro Trp Ile Asp Cys Gly 15 20 25 GGT GCC CTG TCG CTG GTG TCG CCT ATC GAC TTA GGG GTA AAG GTC GCT 208 Gly Ala Leu Ser Leu Val Ser Pro Ile Asp Leu Gly VaI Lys Val Ala 30 35 40 CGC GAA GTT CTG ATG CGT GCG TCG CTT GAA CCA CAA ATG GTC GAT AGC 256 Arg Glu Val Leu Met Arg Ala Ser Leu Glu Pro Gln Met Val Asp Ser 45 50 55 60 GTA CTC GCA GGC TCT ATG GCT CAA GCA AGC TTT GAT GCT TAC CTG CTC 304 Val Leu Ala Gly Ser Met Ala Gln Ala Ser Phe Asp Ala Tyr Leu Leu 65 70 75 CCG CGG CAC ATT GGC TTG TAC AGC GGT GTT CCC AAG TCG GTT CCG GCC 352 Pro Arg His Ile Gly Leu Tyr Ser Gly Val Pro Lys Ser Val Pro Ala 80 85 90 TTG GGG GTG CAG CGC ATT TGC GGC ACA GGC TTC GAA CTG CTT CGG CAG 400 Leu Gly Val Gln Arg Ile Cys Gly Thr Gly Phe Glu Leu Leu Arg Gln 95 100 105 GCC GGC GAG CAG ATT TCC CAA GGC GCT GAT CAC GTG CTG TGT GTC GCG 448 Ala Gly Glu Gln Ile Ser Gln Gly Ala Asp His Val Leu Cys Val Ala 110 115 120 GCA GAG TCC ATG TCG CGT AAC CCC ATC GCG TCG TAT ACA CAC CGG GGC 496 Ala Glu Ser Met Ser Arg Asn Pro Ile Ala Ser Tyr Thr His Arg Gly 125 130 135 140 GGG TTC CGC CTC GGT GCG CCC GTT GAG TTC AAG GAT TTT TTG TGG GAG 544 Gly Phe Arg Leu Gly Ala Pro Val Glu Phe Lys Asp Phe Leu Trp Glu 145 150 155 GCA TTG TTT GAT CCT GCT CCA GGA CTC GAC ATG ATC GCT ACC GCA GAA 592 Ala Leu Phe Asp Pro Ala Pro Gly Leu Asp Met Ile Ala Thr Ala Glu 160 165 170 AAC CTG GGGGAGAGGC GGTTTGCGTA TTGGGCGCAT GCATAAAAAC TGTTGTAATT 648 Asn Leu 174 CATTAAGCAT TCTGCCGACA TGGAAGCCAT CACAAACGGC ATGATGAACC TGAATCGCCA 708 GCGGCATCAG CACCTTGTCG CCTTGCGTAT AATATTTGCC CATGGACGCA CACCGTGGAA 768 ACGGATGAAG GCACGAACCC AGTTGACATA AGCCTGTTCG GTTCGTAAAC TGTAATGCAA 828 GTAGCGTATG CGCTCACGCA ACTGGTCCAG AACCTTGACC GAACGCAGCG GTGGTAACGG 888 CGCAGTGGCG GTTTTCATGG CTTGTTATGA CTGTTTTTTT GTACAGTCTA TGCCTCGGGC 948 ATCCAAGC AGCAAGCGCG TTACGCCGTG GGTCGATGTTTG ATGTTATGGA GCAGCAACG 1007 ATG TTA CGC AGC AGC AAC GAT GTT ACG CAG CAG GGC AGT CGC CCT AAA 1055 Met Leu Arg Ser Ser Asn Asp Val Thr Gln Gln Gly Ser Arg Pro Lys 1 5 10 15 ACA AAG TTA GGT GGC TCA AGT ATG GGC ATC ATT CGC ACA TGT AGG CTC 1103 Thr Lys Leu Gly Gly Ser Ser Met Gly Ile Ile Arg Thr Cys Arg Leu 20 25 30 GGC CCT GAC CAA GTC AAA TCC ATG CGG GCT GCT CTT GAT CTT TTC GGT 1151 Gly Pro Asp Gln Val Lys Ser Met Arg Ala Ala Leu Asp Leu Phe Gly 35 40 45 CGT GAG TTC GGA GAC GTA GCC ACC TAC TCC CAA CAT CAG CCG GAC TCC 1199 Arg Glu Phe Gly Asp Val Ala Thr Tyr Ser Gln His Gln Pro Asp Ser 50 55 60 GAT TAC CTC GGG AAC TTG CTC CGT AGT AAG ACA TTC ATC GCG CTT GCT 1247 Asp Tyr Leu Gly Asn Leu Leu Arg Ser Lys Thr Phe Ile Ala Leu Ala 65 70 75 80 GCC TTC GAC CAA GAA GCG GTT GTT GGC GCT CTC GCG GCT TAC GTT CTG 1295 Ala Phe Asp Gln Glu Ala Val Val Gly Ala Leu Ala Ala Tyr Val Leu 85 90 95 CCC AGG TTT GAG CAG CCG CGT AGT GAG ATC TAT ATC TAT GAT CTC GCA 1343 Pro Arg Phe Glu Gln Pro Arg Ser Glu Ile Tyr Ile Tyr Asp Leu Ala 100 105 110 GTC TCC GGC GAG CAC CGG AGG CAG GGC ATT GCC ACC GCG CTC ATC AAT 1391 Val Ser Gly Glu His Arg Arg Gln Gly Ile Ala Thr Ala Leu Ile Asn 115 120 125 CTC CTC AAG CAT GAG GCC AAC GCG CTT GGT GCT TAT GTG ATC TAC GTG 1439 Leu Leu Lys His Glu Ala Asn Ala Leu Gly Ala Tyr Val Ile Tyr Val 130 135 140 CAA GCA GAT TAC GGT GAC GAT CCC GCA GTG GCT CTC TAT ACA AAG TTG 1487 Gln Ala Asp Tyr Gly Asp Asp Pro Ala Val Ala Leu Tyr Thr Lys Leu 145 150 155 160 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ATC GAC TTA GGG GTA AAG GTC GCT 208 Gly Ala Leu Ser Leu Val Ser Pro Ile Asp Leu Gly Val Lys Val Ala 30 35 40 CGC GAA GTT CTG ATG CGT GCG TCG CTT GAA CCA CAA ATG GTC GAT AGC 256 Arg Glu Val Leu Met Arg Ala Ser Leu Glu Pro Gln Met Val Asp Ser 45 50 55 60 GTA CTC GCA GGC TCT ATG GCT CAA GCA AGC TTT GAT GCT TAC CTG CTC 304 Val Leu Ala Gly Ser Met Ala Gln Ala Ser Phe Asp Ala Tyr Leu Leu 65 70 75 CCG CGG CAC ATT GGC TTG TAC AGC GGT GTT CCC AAG TCG GTT CCG GCC 352 Pro Arg His Ile Gly Leu Tyr Ser Gly Val Pro Lys Ser Val Pro Ala 80 85 90 TTG GGG GTG CAG CGC ATT TGC GGC ACA GGC TTC GAA CTG CTT CGG CAG 400 Leu Gly Val Gln Arg Ile Cys Gly Thr Gly Phe Glu Leu Leu Arg Gln 95 100 105 GCC GGC GAG CAG ATT TCC CAA GGC GCT GAT CAC GTG CTG TGT GTC GCG 448 Ala Gly Glu Gln Ile Ser Gln Gly Ala Asp His Val Leu Cys Val Ala 110 115 120 GCA GAG TCC ATG TCG CGT AAC CCC ATC GCG TCG TAT ACA CAC CGG GGC 496 Ala Glu Ser Met Ser Arg Asn Pro Ile Ala Ser Tyr Thr His Arg Gly 125 130 135 140 GGG TTC CGC CTC GGT GCG CCC 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TTGCCCTTGC CTTCGCACTC GTATTATGTG 2460 TCGGGCTGAT TGTTACCGGC ACGGGTTTCT ACAGTGTACA TACCTTGTCA GGGTTGGTGG 2520 GAATTC 2526 序列17 GAATTCCGCG GTCGGCGAAA GTTGATGCGC TGTATCGTGG TGAAGATCAA TCCATGCTGC 60 GTGACGAGGC CACACTGTGA GTTGGTCAGG GGGGGCTTAC TCGGCGTTTT CCGACACTGC 120 GTTGGTTGCG GCAGTGCGCA CCCCCTGGAT TGATTGCGGG GGTGCCCTGT CGCTGGTGTC 180 GCCTATCGAC TTAGGGGTAA AGGTCGCTCG CGAAGTTCTG ATGCGTGCGT CGCTTGAACC 240 ACAAATGGTC GATAGCGTAC TCGCAGGCTC TATGGCTCAA GCAAGCTTTG ATGCTTACCT 300 GCTCCCGCGG CACATTGGCT TGTACAGCGG TGTTCCCAAG TCGGTTCCGG CCTTGGGGGT 360 GCAGCGCATT TGCGGCACAG GCTTCGAACT GCTTCGGCAG GCCGGCGAGC AGATTTCCCA 420 AGGCGCTGAT CACGTGCTGT GTGTCGCGGC AGAGTCCATG TCGCGTAACC CCATCGCGTC 480 GTATACACAC CGGGGCGGGT TCCGCCTCGG TGCGCCCGTT GAGTTCAAGG ATTTTTTGTG 540 GGAGGCATTG TTTGATCCTG CTCCAGGACT CGACATGATC GCTACCGCAG AAAACCTGGG 600 GGAGAGGCGG TTTGCGTATT GGGCGCATGC ATAAAAACTG TTGTAATTCA TTAAGCATTC 660 TGCCGACATG GAAGCCATCA CAAACGGCAT GATGAACCTG AATCGCCAGC GGCATCAGCA 720 CCTTGTCGCC TTGCGTATAA TATTTGCCCA 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