序号 专利名 申请号 申请日 公开(公告)号 公开(公告)日 发明人
1 鉴定适于移植的细胞 CN00814824.4 2000-10-24 CN1420936A 2003-05-28 J·普赖斯; D·尤瓦诺格
发明涉及通过例如差异显示,对选择细胞的基因表达图谱与获自对照细胞的图谱进行比较,鉴定适于在移植治疗中修复神经损伤的多能细胞。
2 使用式探针的基于RCA的局部扩增方法 CN201480073057.2 2014-11-14 CN105980579A 2016-09-28 乌尔夫·兰德格伦; 陈磊
发明提供了用于进行包括至少两轮RCA的局部RCA反应的方法,其中第二RCA反应的产物附着并从而局限于第一RCA反应的产物,所述方法包括:(a)提供包含重复单体的多联体第一RCA产物;(b)将包含靶互补3’和5’末端区的可环化的寡核苷酸与所述第一RCA产物的单体直接或间接杂交,以便所述寡核苷酸的3’和5’末端并置地杂交以彼此直接或间接地连接,其中所述靶为所述第一RCA产物的单体或与其杂交的中间分子中的序列,并且其中所述可环化的寡核苷酸的靶互补末端区的长度为6个至16个核苷酸;(c)将所述可环化的寡核苷酸的末端直接或间接连接以环化寡核苷酸,从而提供用于第二RCA反应的模板,其中当所述末端间接连接时,(i)提供在可环化的寡核苷酸的3’与5’末端之间与第一RCA产物的单体杂交,以便其可连接于各自末端的间隙寡核苷酸,或通过聚合酶延伸可环化的寡核苷酸的杂交的3’末端以便延伸的3’末端可连接于杂交的5’末端,并且(ii)与单体直接或间接杂交的第二RCA模板的区域的总长度不长于32个核苷酸;和(d)使用(c)的所述第二RCA模板和用于所述第二RCA的引物进行第二RCA反应,以形成第二RCA产物,其中在所述第二RCA反应中,所述第二RCA模板保持附着于第一RCA产物,从而第二RCA产物附着于所述第一RCA产物。
3 用于确定并且验证常见的和罕见的染色体非整倍性的归一化染色体 CN201180022971.0 2011-04-14 CN102985561B 2015-04-01 里查德·P·拉瓦
发明提供了一种能够在包含胎儿和母体核酸的母体样品中检测单个或多个胎儿染色体非整倍性并且验证已作出正确的确定的方法。该方法适用于在多个样品中确定任何感兴趣的序列的拷贝数变异(CNV),这些样品包含来源于两个不同基因组的基因组核酸的混合物,并且已知或怀疑这两个不同基因组在一个或多个感兴趣的序列的量方面不同。该方法至少适用于无创性产前诊断的实施,并且适用于与健康个体对比患病的个体中序列表达差异有关的病状的诊断和监测。
4 用于确定并且验证常见的和罕见的染色体非整倍性的归一化染色体 CN201180022971.0 2011-04-14 CN102985561A 2013-03-20 里查德·P·拉瓦
发明提供了一种能够在包含胎儿和母体核酸的母体样品中检测单个或多个胎儿染色体非整倍性并且验证已作出正确的确定的方法。该方法适用于在多个样品中确定任何感兴趣的序列的拷贝数变异(CNV),这些样品包含来源于两个不同基因组的基因组核酸的混合物,并且已知或怀疑这两个不同基因组在一个或多个感兴趣的序列的量方面不同。该方法至少适用于无创性产前诊断的实施,并且适用于与健康个体对比患病的个体中序列表达差异有关的病状的诊断和监测。
5 多核苷酸扩增 CN200680044723.5 2006-11-29 CN101316937A 2008-12-03 A·塞茨
发明提供扩增样品中一群多核苷酸分子的方法,其特征在于包括下述步骤:a)获取样品或RNA并反转录整条RNA分子从而创制全长cDNA或获取全长cDNA的样品,b)用多核苷酸尾在3’端后在转录的cDNA的3’端加尾,c)用一对引物扩增cDNA,其中第一(3’)引物对cDNA的5’端特异,第二(51)引物对多核苷酸尾的上游部分和cDNA的3’多核苷酸尾上游的最近的1到10个核苷酸特异。
6 杂交部分控制寡核苷酸及其应用 CN02824501.6 2002-11-04 CN1602361A 2005-03-30 千钟润
发明涉及用于通过杂交进行靶核苷酸序列分析的寡核苷酸及该寡核苷酸的应用。该寡核苷酸具有以下通式结构。5′-Xp-Yq-Zr-3′或5’-Zr-Yq-Xp-3′,其中Xp表示第一杂交部分,该第一杂交部分具有与与其杂交的所述样品核酸中的所述靶核酸序列基本互补的特异性杂交核苷酸序列;Yq表示含有至少两个通用基或非识别碱基类似物的调控子部分;Zr表示具有预先选定的任意核苷酸序列的第二杂交部分;p,q和r表示核苷酸的数目;X,Y和Z为脱核糖核苷酸或核糖核苷酸。
7 一种尿液外泌体miRNA的分析方法 CN201610849797.1 2016-09-26 CN106399510A 2017-02-15 黄波; 王小中; 邹叶青; 刘静; 徐颜美; 闵清华
发明提供一种尿液外泌体miRNA的分析方法,包括尿液标本的收集,外泌体及其总RNA的提取,cDNA文库的建立及Illumina测序,测序结果的处理和注释,获取样本miRNA表达量的表达信息。通过高通量测序技术,对尿液标本外泌体miRNA分析处理,获取miRNA的表达信息;通过建立IgA肾病患者和健康对照者的数据库,利用靶基因功能预测深入研究差异表达的miRNA,深入研究这些差异表达的miRNA将有助于进一步阐明IgA肾病的发病及致病机理,为IgA肾病的诊断提供新的方法及理论基础。该方法设计合理可行,能够有效的建立一种无创的精准的差异表达的miRNA方法,为临床诊治工作提供新的思路。
8 多核苷酸扩增 CN200680044723.5 2006-11-29 CN101316937B 2016-05-25 A·塞茨
发明提供扩增样品中一群多核苷酸分子的方法,其特征在于包括下述步骤:a)获取样品或RNA并反转录整条RNA分子从而创制全长cDNA或获取全长cDNA的样品,b)用多核苷酸尾在3’端后在转录的cDNA的3’端加尾,c)用一对引物扩增cDNA,其中第一(3’)引物对cDNA的5’端特异,第二(51)引物对多核苷酸尾的上游部分和cDNA的3’多核苷酸尾上游的最近的1到10个核苷酸特异。
9 一种测定杂交稻新品种的特异性、一致性与稳定性的方法 CN201510148540.9 2015-03-31 CN104805182A 2015-07-29 魏传斌; 彭海; 陈红; 张静; 高利芬
发明公开了一种测定杂交稻新品种的特异性、一致性与稳定性的方法。所述方法包括:获得变异位点;确定待测水稻品种的测试区域;构建数据库;确定抽样量后,随机抽样混合并提取混合样本的DNA;制备引物;利用引物对混合样本的DNA进行扩增,扩增产物用于构建高通量测序文库;对高通量测序文库进行高通量测序,得到测序片段组;分析测序片段组,获得待测水稻品种基因型和杂株基因型;比较获得近似品种、变异位点和变异位点率;获得杂株品种后,计算杂株率;利用变异位点、变异位点率和杂株率,判断待测水稻品种特异性、一致性和稳定性。所述方法能够准确、完整地判断待测水稻品种的特异性、稳定性与一致性,且测试速度更快。
10 检测核基因组中与表型形状相关基因的方法 CN201310298676.9 2013-07-16 CN104293892A 2015-01-21 张德强; 王博文; 杜庆章
发明公开了一种检测核基因组中与表型性状相关基因的方法。该方法包括以下步骤:S1,测量F1代杂交群体的目标表型性状,选取极端的目标表型性状;S2,提取极端的目标表型性状个体的RNA,采用BSA法分组后构建表达谱基因芯片;S3,根据表达谱基因芯片的信息找出表达有差异的基因,该基因即为核基因组中与目标表型性状相关基因。应用本发明的技术方案,通过多次测量筛选F1代杂交群体的目标表型性状,从中挑选具有稳定极端目标表型性状的个体,应用BSA法混合分组构建基因池,从而突出目标表型性状的差异,结合基因芯片技术使大量基因同时进行杂交,通过分析芯片结果筛选出与目标表型性状相关的差异表达基因。
11 癌的基因标记 CN01811543.8 2001-06-21 CN1471587A 2004-01-28 M·米特苏哈施; H·卡姆巴拉; H·马特苏纳加; M·卡瓦穆拉
披露了一种用于诊断和鉴定新的或残留的癌的方法,该方法是用新鉴定的肺癌标记,包括多配体聚糖1、胶原1α2,和两种新的蛋白7013和7018。所述鉴定肺癌标记的方法涉及到来自患者的血液。预计会使用至少一种标记或者使用四种标记的任意组合。该方法可能还包括鉴定细胞蛋白-19。
12 Annealing regulation primer and its use JP2003551326 2002-09-19 JP4263612B2 2009-05-13 チョン,ゾン−ユン
13 Lung cancer for genetic markers JP2002504687 2001-06-21 JP2004500895A 2004-01-15 三橋 将人; 川村 雅文; 松永 浩子; 神原 秀記
シンデカン1、コラーゲン1α2、ならびに2つの新規タンパク質7013および7018を含む癌用の新規に同定されたマーカーを用いる新規または残留肺癌の診断および同定方法が開示される。 本方法は、患者からの血液における肺癌マーカーの判別を含む。 4つのうちの少なくとも1つのマーカー、またはそれらの任意の混合物を使用し得ることが想定される。 本方法は、サイトケラチン−19の判別も含み得る。
14 Improved method for the simultaneous identification and relative concentration measurement of discrimination-expressed mRNA JP2000556998 1999-06-30 JP2002519011A 2002-07-02 ジェイ グレゴー サトクリッフ; カルル ヴェー ハーゼル
(57)【要約】 mRNA集団中のmRNAの配列特異的同時同定のための改良方法によって、組織で発現されるほとんど全てのmRNAがゲル上の個別のバンドとして可視化され、ゲル上のバンドの濃度はmRNAの濃度に概ね一致する。 一般に、本方法は、3−末端部を固定するためにアンカープライマーを用いるcDNAの生成、その後のRNA合成のためにバクテリオファージ特異的プロモーターを含むベクターで前記cDNAからクローン化挿入物を生成、前記クローン化挿入物の直線化フラグメントの作製、cRNAの調製、5−RTプライマーセットを用いて前記cRNAからcDNAの転写、および3−PCRプライマーを用いてPCRの実施を含むが、前記3−PCRプライマーの配列は前記ベクターおよび5−PCRプライマーセットに由来し、5−PCRプライマーセットはcRNAからcDNAの転写に用いた5RTプライマーに由来する。 本方法によって、薬剤の投与に伴うmRNA発現の変化、または生理学的もしくは病理学的状態に付随するmRNA発現の変化を特定することができる。
15 Antisense transcriptomes of cells US13131413 2009-12-02 US09637779B2 2017-05-02 Bert Vogelstein; Kenneth W. Kinzler; Yiping He; Victor Velculescu; Nickolas Papadopoulos
Transcription in mammalian cells can be assessed at a genome-wide level, but it has been difficult to reliably determine whether individual transcripts are derived from the Plus- or Minus-strands of chromosomes. This distinction can be critical for understanding the relationship between known transcripts (sense) and the complementary antisense transcripts that may regulate them. Here we describe a technique that can be used to (i) identify the DNA strand of origin for any particular RNA transcript and (ii) quantify the number of sense and antisense transcripts from expressed genes at a global level. We examined five different human cell types and in each case found evidence for antisense transcripts in 2900 to 6400 human genes. The distribution of antisense transcripts was distinct from that of sense transcripts, was non-random across the genome, and differed among cell types. Antisense transcripts thus appear to be a pervasive feature of human cells, suggesting that they are a fundamental component of gene regulation.
16 Multidimensional morphological reconstruction of genome expression activity US12607577 2009-10-28 US07894997B2 2011-02-22 Michael D. Doyle; Maurice J. Pescitelli, Jr.; Betsey S. Williams; George S. Michaels
A method of morphological reconstruction of biological activity in a tissue sample maps biological data resulting from analysis of tissue samples onto a 3-D morphological rendering of the biological sample. Each slice in a set of histological slices, indexed by a first index, is micro dissected into micro samples indexed by a pair of first and second indices. The indices are utilized to spatially map biological data to the 3-D rendering.
17 Hybridization portion control oligonucleotide and its uses US10498108 2002-11-04 US20050164184A1 2005-07-28 Jong-Yoon Chun
The present invention relates to an oligonucleotide for analyzing a target nucleotide sequence by hybridization and its applications. The oligonucleotide has the following general structure: 5′-Xp—Yq-Zr-3′ or 5′-Zr—Yq-Xp-3′ wherein Xp represents a first hybridization portion having a specific hybridizing nucleotide sequence substantially complementary to said target nucleotide sequence in said sample nucleic acid to hybridize therewith; Yq represents a regulator portion comprising at least two universal bases or non-discriminatory base analogs; Zr represents a second hybridization portion having a pre-selected arbitrary nucleotide sequence; p, q and r represent the number of nucleotides; and X, Y and Z is deoxyribonucleotide or ribonucleotide.
18 Gene markers for lung cancer US10297277 2003-04-04 US20030215828A1 2003-11-20 Masato Mitsuhashi; Hiroko Matsunaga; Hideki Kambara; Masafumi Kawamura
A method for the diagnosis and identification of new or residual lung cancer is disclosed which uses newly identified markers for lung cancer including syndecan 1, collagen 1 alpha 2, and two novel proteins, 7013 and 7018. The method involves identification of the lung cancer markers is blood from a patient. It is envisioned that at least one marker may be used or any mixture of the four. The method may also include the identification of cytokeratin-19.
19 Annealing control primer system for regulating primer annealing specificity and its applications US10014496 2001-12-14 US20030152925A1 2003-08-14 Jong-Yoon Chun
The present invention is directed to a novel annealing control primer system (nullACP systemnull), for regulating primer annealing specificity during polymerase chain reaction (PCR). The principle of the ACP system is based on the composition of an oligonucleotide primer having 3null- and 5null-end distinct portions separated by a deoxyinosine group, which is a unique feature of this invention. The present invention also provides a process using the ACP system for performing two stage PCR amplifications to selectively amplify a target nucleic acid fragment from a nucleic acid or a mixture. The present invention also provides a method using the ACP system for detecting and cloning differentially expressed mRNAs in two or more nucleic acid samples. Kits containing ACP are included within the scope of the present invention. Furthermore, the present invention can be adapted to almost unlimited application in all fields of PCR-based technology.
20 Identification of cells for transplantation US10140463 2002-05-06 US20030036522A1 2003-02-20 Jack Price; Dafe Uwanogho
Pluripotent cells that are suitable for transplantation therapy, to repair neural damage, are identified, e.g. by differential display, from a gene expression profile for a selected cell, which can be compared with that obtained from a control cell.
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