1.一种热循环方法，包括：
(a)提供样品容器，该样品容器包括与第二阶段反应区流体连接的第一阶段室，所述第二阶段反应区包括多个第二阶段反应孔；
(b)将样品引入所述样品容器；
(c)将所述样品容器插入仪器中，所述仪器包括温度控制元件；
(d)将所述温度控制元件和所述第一阶段室对准，以实现所述样品在所述第一阶段室中的热循环；
(e)在所述第一阶段反应室中进行所述样品的热循环之后，将来自所述样品的至少一部分的产物从所述第一阶段室移动到所述第二阶段反应区中的多个第二阶段反应孔中；以及
(f)将所述温度控制元件和所述第二阶段反应区对准，以实现所述第二阶段反应区中所述样品的该部分的热循环。
2.根据权利要求1所述的方法，其中，所述温度控制元件包括一个或多个加热器或冷却器装置，所述一个或多个加热器或冷却器装置选自由帕尔贴装置、电阻加热器、感应加热器、电磁加热器、薄膜加热器、印刷元件加热器、正温度系数加热器以及它们的组合所组成的组。
3.根据权利要求1所述的方法，其中，所述温度控制元件包括第一温度区和第二温度区，其中，所述第一温度区比所述第二温度区热。
4.根据权利要求3所述的方法，其中，步骤(f)包括相对于所述第二阶段反应区重复地平移所述温度控制元件。
5.根据权利要求3所述的方法，其中，步骤(f)包括相对于所述温度控制元件重复地平移所述第二阶段反应区。
6.根据权利要求3所述的方法，其中，所述仪器还包括擦拭器元件，并且步骤(d)还包括：使所述擦拭器元件与所述温度控制元件和所述第一阶段室对准，使得所述擦拭器元件的旋转移动将所述样品的第一部分从所述第一温度区的热控制移动到所述第二温度区的热控制，同时将所述样品的第二部分从所述第二温度区的热控制移动到所述第一温度区的热控制。
7.根据权利要求1所述的方法，其中，所述样品容器还包括样品制备区，所述样品制备区流体连接到所述第一阶段室，并且在步骤(d)之前，所述方法还包括：
将所述样品引入所述样品制备区；
使所述样品制备区与裂解装置接触以产生裂解物；
从所述裂解物中回收核酸；以及
将回收的核酸移动到所述第一阶段室中。
8.根据权利要求7所述的方法，其中，从所述样品中回收核酸还包括：
使所述裂解物与多个磁珠接触；
展开磁体以将所述磁珠与所述裂解物分离；
洗涤所述磁珠；
用所述磁体重新捕获所述磁珠；
使所述磁珠与洗脱缓冲液接触以从所述磁珠中释放核酸；以及
用所述磁体重新捕获所述磁珠并将洗脱的核酸与所述磁珠分离。
9.根据权利要求7所述的方法，其中，所述样品制备区和所述第一阶段室是所述样品容器内的单独室。
10.根据权利要求1所述的方法，其中，所述方法的步骤(f)还包括：将所述第二核酸扩增区与所述温度控制元件的所述第一温度区、且随后与所述第二温度区对准，以使所述第二核酸扩增区中的所述样品热循环。
11.根据权利要求10所述的方法，其中，所述方法的步骤在20分钟或更短、15分钟或更短、或优选地10分钟或更短的时间内完成。
12.根据权利要求1所述的方法，其中，所述第一核酸扩增区和所述第二核酸扩增区的每个热循环在8秒或更短、6秒或更短、或优选地4秒或更短的时间内完成。
13.根据权利要求1所述的方法，还包括：提供计算装置，所述计算装置被构造用于控制所述对准步骤并用于控制所述温度控制元件的温度。
14.一种用于热循环样品的仪器，所述样品被设置在柔性样品容器中，所述仪器包括：
第一加热器，邻近所述柔性样品容器的第一部分，用于将所述样品的第一部分调节至第一温度，
第二加热器，邻近所述柔性样品容器的第二部分，用于将所述样品的第二部分调节至第二温度，所述第二温度不同于所述第一温度，以及
擦拭器元件，其将所述样品的第一部分移动到所述柔性样品容器的第二部分，同时将所述样品的第二部分移动到所述柔性样品容器的第一部分，使得所述样品的多个部分同时地受到每个加热器的控制。
15.根据权利要求14所述的仪器，其中，所述擦拭器元件还包括叶片，所述叶片将所述样品分成至少两个不连续的区段，所述至少两个不连续的区段包括至少第一区段和第二区段，使得所述第一部分被包含在所述第一区段中且所述第二部分被包含在所述第二区段中。
16.根据权利要求14所述的仪器，其中，所述擦拭器元件在所述样品中产生涡流和漩涡，使得所述样品的第一部分处于所述第一加热器的控制下，所述样品的第二部分处于所述第二加热器的控制下，而所述样品的第三部分在第一加热器和所述第二加热器的控制之间转换。
17.根据权利要求14-16中任一项所述的仪器，其中，所述擦拭器元件将所述样品的多个部分重复地移动到所述样品容器的相对部分以热循环所述样品。
18.根据权利要求14所述的仪器，其中，样品器皿包括用于PCR的组分和核酸。
19.根据权利要求14所述的仪器，其中，所述擦拭器元件能移动以压缩所述柔性样品容器以排出所述样品的一部分，并且所述擦拭器元件在排出所述样品的该部分之前具有第一速度，而在排出所述样品的一部分之后具有较快的第二速度。
20.根据权利要求14所述的仪器，还包括被设置在所述擦拭器元件与所述柔性样品容器之间的可压缩构件，其中，所述可压缩构件朝向所述样品容器被偏置。
21.根据权利要求14所述的仪器，还包括与所述样品容器流体连接的阵列，所述阵列被构造成接收所述样品的至少一部分，以及
所述仪器还包括多个加热器，所述多个加热器能移动以顺序地影响所述阵列中的所述样品的该部分的温度。
22.一种用于热循环样品的仪器，包括：
接受器，用于定位柔性样品容器，所述柔性样品容器在所述仪器中具有至少第一反应室；
加热器组件，包括第一加热元件和第二加热元件；以及
平移器，机械地联接到所述接受器、所述柔性样品容器或所述加热器组件中的至少一个，以使所述第一反应室相对于所述加热器组件的第一加热元件和第二加热元件横向对准，使得所述第一反应室处于所述第一加热元件或所述第二加热元件中的至少一个的温度控制下；以及
其中，所述仪器被构造成使所述第一反应室与所述第一加热元件、且随后与所述第二加热元件重复地对准，以在所述至少一个反应室中热循环流体样品。
23.根据权利要求22所述的仪器，其中，所述第一加热元件被设定到约90℃-110℃范围内的温度，所述第二加热元件被设定到约55℃至约65℃范围内的温度。
24.根据权利要求22所述的仪器，其中，所述加热器组件联接到所述平移器，并且所述平移器被构造成相对于所述第一反应室横向地平移所述加热器组件，使得所述第一加热元件和所述第二加热元件能够在第一个反应室处限定受控温度区。
25.根据权利要求22所述的仪器，其中，所述接受器联接到所述平移器，并且所述平移器被构造成使所述接受器和位于其中的所述柔性样品容器相对于所述加热器组件横向地平移，使得所述第一加热元件和所述第二加热元件能够在第一反应室处限定受控温度区。
26.根据权利要求22所述的仪器，其中，所述柔性样品容器联接到所述平移器，并且所述平移器被构造成相对于所述加热器组件平移所述柔性样品容器，使得所述第一反应室处于所述第一加热元件和所述第二加热元件的温度控制下。
27.根据权利要求22所述的仪器，所述柔性样品容器还包括处在所述第一反应室下游的第二反应室，并且其中，所述平移器被构造成相对于所述加热器组件的第一加热元件和第二加热元件横向地对准所述第二反应室，使得所述第二反应室处于所述第一加热元件和所述第二加热元件的温度控制之下。
28.根据权利要求27所述的仪器，其中，所述第二反应室包括与所述第一反应室流体连接的各个扩增孔的阵列，所述阵列被构造成从所述第一反应室接收至少一部分扩增产物。
29.根据权利要求22所述的仪器，其中，所述接受器包括基本上平坦的表面，所述基本上平坦的表面中定位有一个或多个开口，以便允许所述加热器组件的第一加热元件和第二加热元件在被定位于所述接受器中时接触所述柔性样品容器的一个或多个部分。
30.根据权利要求22所述的仪器，其中，所述加热器组件包括第一加热元件、第二加热元件和第三加热元件。
31.根据权利要求30所述的仪器，其中，所述第一加热元件、所述第二加热元件和所述第三加热元件被线性地设置。
32.根据权利要求31所述的仪器，其中，所述第一加热元件和所述第三加热元件的温度被设定在约90℃-110℃的范围内，所述第二加热元件的温度被设定到约55℃到约65℃的温度。
33.一种热循环系统，包括：
接受器，用于在其中接收柔性样品容器，所述柔性样品容器具有第一阶段室，所述第一阶段室包括待在其中热循环的样品；
加热元件，包括被定位于所述柔性样品容器的第一侧上的至少第一温度区和第二温度区；以及
擦拭器元件，被定位于所述样品容器的第二侧上，所述擦拭器元件构造成用于接触所述第一阶段室以将所述样品分成至少第一部分和第二部分；
其中，所述接受器、所述加热元件、所述擦拭器元件或所述柔性样品容器中的一个或多个能移动，以便将所述第一阶段室相对于所述擦拭器元件和所述加热元件的第一温度区和第二温度区对准；以及
其中，所述擦拭器元件被构造成邻近所述第一阶段室旋转，以将所述样品的第一部分移动到所述第二部分，同时将所述样品的第二部分移动到所述第一部分，使得所述第一部分和第二部分处于所述加热元件的第一温度区和第二温度区的温度控制下。
34.根据权利要求33所述的热循环系统，其中，所述柔性样品容器包括样品制备区，其中，所述样品制备区是所述第一阶段室的上游之一，或者所述样品制备区和所述第一阶段室包括单个区。
35.根据权利要求34所述的热循环系统，其中，所述擦拭器元件被构造用于接触所述样品容器以在所述样品制备区中混合所述样品。
36.根据权利要求35所述的热循环系统，其中，所述擦拭器元件和所述加热元件协同工作以实现样品制备，并且还协同工作以实现核酸扩增。
37.根据权利要求33-36中任一项所述的热循环系统，其中，所述擦拭器元件在所述样品中产生涡流、漩涡和空化气泡中的一种或多种以裂解所述样品中的细胞。
38.根据权利要求33所述的热循环系统，其中，所述第一阶段室包括研磨元件以增强细胞裂解。
39.根据权利要求33所述的热循环系统，所述仪器还包括裂解部件，所述裂解部件被构造用于接触所述样品制备区，其中，所述裂解部件可选地是所述擦拭器元件的部件。
40.根据权利要求33所述的热循环系统，其中，所述擦拭器元件重复地将所述样品的第一部分移动到第二部分，同时移动所述样品的第二部分以热循环所述样品。
41.根据权利要求33所述的热循环系统，其中，所述柔性样品容器还包括位于所述第一阶段室下游的第二阶段室，并且其中，所述接受器、所述柔性样品容器、或所述加热元件中的一个或多个能移动，使得所述第二阶段室相对于所述加热元件对准，使得所述第二阶段室处于所述第一温度区和所述第二温度区的温度控制之下。
42.根据权利要求41所述的热循环系统，其中，所述第二阶段室包括流体连接到所述第一阶段室的各个扩增孔的阵列，所述阵列被构造成从所述第一阶段室接收至少一部分产物。
43.根据权利要求41所述的热循环系统，所述加热元件还包括至少第一温度区、第二温度区和第三温度区，其中，两个温度区对准以用于热循环所述第一阶段室，并且三个温度区一次一个地对准以用于热循环所述第二阶段室。
44.根据权利要求33-43中任一项所述的热循环系统，其中，所述接受器包括基本上平坦的表面，所述基本上平坦的表面中定位有一个或多个开口，以便允许所述加热元件接触所述柔性样品容器的一个或多个部分。
45.根据权利要求33-44中任一项所述的热循环系统，还包括光学阵列，所述光学阵列包括被构造用于从所述柔性样品容器的至少一部分收集光学数据的光源和相机元件。
46.根据权利要求33-45中任一项所述的热循环系统，其中，所述柔性样品容器包括含有核酸和用于核酸扩增的试剂的样品。
47.根据权利要求33-35中任一项所述的热循环系统，其中，所述擦拭器元件还包括一个或多个压力构件，所述压力构件被构造成向所述柔性样品容器的所述样品制备区和/或第一阶段室施加压力。
48.根据权利要求47所述的热循环系统，其中，所述一个或多个压力构件还包括能在所述柔性样品容器附近展开的至少一个磁体。
49.根据权利要求33所述的热循环系统，其中，所述擦拭器元件还包括能在所述柔性样品容器附近展开的至少一个磁体。
50.一种用于热循环样品的仪器，包括：
接受器，用于在所述仪器中定位柔性样品容器，所述柔性样品容器包括：
第一阶段室和第二阶段反应室，所述第二阶段反应室具有第二阶段反应孔的阵列；
加热元件，包括第一温度区和第二温度区，
其中，所述接受器、所述样品容器或所述加热元件中的一个或多个能移动，以便将所述第一阶段室和所述第二阶段反应室相对于加热元件对准；以及
其中，所述接受器和所述加热元件被构造成允许所述加热元件首先加热第一阶段室，然后加热所述第二阶段反应室，以在所述第一阶段室中进行热循环和核酸扩增，然后在所述第二阶段室中进行热循环和核酸扩增。
51.根据权利要求50所述的仪器，还包括：
擦拭器元件，具有至少一个叶片，被构造成接触所述第一阶段室并将所述第一阶段室分成至少第一容积和第二容积，
其中，所述加热元件在所述第一阶段室下方被对准，使得所述第一容积位于所述第一温度区上方，所述第二容积位于所述第二温度区上方，并且
其中，所述擦拭器元件被构造成旋转以将所述第一容积移动到所述第二温度区，同时将所述第二容积移动到所述第一温度区，使得所述第一容积和所述第二容积在每个所述温度区的控制下。
52.根据权利要求51所述的仪器，其中，所述柔性样品容器包括样品制备区。
53.根据权利要求52所述的仪器，其中，所述样品制备区位于所述第一阶段室的上游。
54.根据权利要求52所述的仪器，其中，所述样品制备区和所述第一阶段室包括单个室。
55.根据权利要求52所述的仪器，其中，所述擦拭器元件被构造成接触所述样品制备区。
56.一种用于热循环样品的仪器，包括：
接受器，用于在所述仪器中定位柔性样品容器，所述柔性样品容器包括：
至少一个反应室；
加热器组件，包括第一加热元件、第二加热元件和第三加热元件，其中所述第一加热元件和所述第三加热元件保持在高于所述第二加热元件的温度，并且
其中，所述仪器被构造成使所述至少一个反应室与所述第一加热元件、所述第二加热元件和所述第三加热元件对准，用于在所述至少一个反应室中热循环流体样品。
57.根据权利要求56所述的仪器，其中，所述第一加热元件和所述第三加热元件的温度被设定在约90℃-110℃的范围内，所述第二加热元件的温度被设定到约55℃-65℃的温度。
58.根据权利要求56所述的仪器，其中，所述第一加热元件和所述第三加热元件包括电阻加热元件，并且所述第二加热元件包括珀耳帖装置。
59.根据权利要求58所述的仪器，其中，所述第一加热元件或所述第三加热元件中的一个包括被放置在珀耳帖装置上的电阻加热元件。
60.根据权利要求56所述的仪器，其中，所述加热器组件包括圆形安装座，所述圆形安装座被构造成邻近所述柔性样品容器旋转。
61.根据权利要求56所述的仪器，其中，所述加热器组件包括线性安装座，所述线性安装座被构造成邻近所述柔性样品容器平移。
62.一种使用权利要求56-61中任一项所述的仪器的聚合酶链式反应方法，所述方法包括：
(a)提供包括至少一个反应室的所述样品容器，
(b)将样品引入所述反应室，其中，所述样品包括靶核酸、用于扩增靶核酸的至少一种引物、和热稳定DNA聚合酶，
(c)将所述样品容器插入所述仪器，
(d)将所述第一加热元件与所述反应室对准，然后将所述第二加热元件与所述反应室对准，且随后将所述第三加热元件与所述反应室对准，
其中，所述第一加热元件和所述第三加热元件被设定在变性温度，所述第二加热元件被设定在退火温度，以及
其中，步骤(d)包括变性、退火和伸长/变性循环中的一个；以及
(f)重复步骤(d)。
63.一种用于扩增在样品容器中提供的核酸的仪器，其中，所述核酸被构造在阵列中，所述仪器包括：
开口，用于接收所述样品容器，
多个加热器，每个加热器被设置在不同的温度，以及
移动器，用于将所述加热器按顺序地移动到邻近所述开口的位置，使得仅处在所述位置的所述加热器控制所述样品容器中的所述核酸的温度。
64.根据权利要求63所述的仪器，其中，所述样品容器还包括用于扩增核酸的部件，以及
多个加热器至少包括处于退火温度的第一加热器和处于变性温度的第二加热器。
65.根据权利要求64所述的仪器，其中，所述多个加热器还包括处于伸长温度的第三加热器。
66.根据权利要求64所述的仪器，其中，所述样品还包括被构造用于检测已扩增核酸的荧光实体，并且所述仪器还包括光电检测器，所述光电检测器被定位成检测来自所述阵列的荧光。
67.一种用于进行PCR的方法，包括：
(a)在样品器皿中提供PCR混合物，所述PCR混合物具有体积，
(b)热循环第一循环次数，所述第一循环次数中的每一次具有第一循环时间，(c)将所述样品容器中的所述PCR混合物的体积减少至第二体积，所述第二体积小于所述第一体积，并且
(d)热循环第二循环次数，所述第二循环次数中的每一次具有第二循环时间，所述第二循环时间短于所述第一循环时间。
68.根据权利要求67所述的方法，还包括：
(e)将所述样品容器中的所述PCR混合物的体积减少至第三体积，所述第三体积小于所述第二体积，并且
(f)热循环第三循环次数，所述第二循环次数中的每一次具有第三循环时间，所述第三循环时间短于所述第二循环时间。
69.根据权利要求67所述的方法，其中，所述样品器皿能压缩，并且减少步骤通过从所述样品器皿中排出所述样品的一部分来进行。
70.根据权利要求67所述的方法，其中所述样品器皿与至少两个温度区接触，并且热循环步骤包括在所述温度区之间移动所述样品。
71.根据权利要求67所述的方法，其中，所述样品器皿由在几个温度之间进行热循环的加热器来加热。
72.一种扩增样品中的核酸的方法，包括：
将流体样品引入容器的样品隔室中，所述流体样品包括靶核酸和用于扩增靶核酸的试剂；
将所述容器引入加热设备中，所述加热设备包括第一加热器、第二加热器和用于在所述样品隔室内移动所述流体样品的移动器，所述第一加热器被设定到第一温度，所述第二加热器被设定到第二温度，所述第一温度大于所述第二温度，所述样品隔室的第一部分被设置成邻近所述第一加热器，使得所述第一加热器在所述样品隔室的第一部分上展示热控制，所述样品隔室的第二部分被设置成邻近所述第二加热器，使得所述第二加热器在所述样品隔室的第二部分上展示热控制；以及
选择性地在所述样品隔室的第一部分与所述样品隔室的第二部分之间移动所述流体样品的至少一部分，使得所述样品的多个部分同时受每个所述加热器的控制。
73.一种扩增样品中的核酸的方法，包括：
(a)将流体样品引入容器的第一隔室中，所述流体样品包括靶核酸和用于扩增所述靶核酸的试剂，其中，所述第一隔室处于第一加热器的控制下，所述第一加热器被设定在低于退火温度的温度(低退火温度)，
(b)将所述第一加热器的温度升高至所述退火温度，
(c)将所述流体样品移动到容器的第二隔室中，其中，所述第二隔室在第二加热器的控制下，所述第二加热器被设定在高于伸长温度的温度(高伸长温度)，并在将所述流体样品移动到所述第二隔室中之后，降低所述第一加热器的温度达到所述低退火温度，(d)将所述第二加热器的温度降低到所述伸长温度，
(e)将所述第二加热器的温度升高到至少变性温度，以及
(f)重复步骤(a)至步骤(e)。
74.根据权利要求73所述的方法，其中，当重复步骤(a)时，将所述第二加热器的温度移动到所述高伸长温度。
75.根据权利要求73所述的方法，其中，所述低退火温度比所述退火温度低2至20度。
76.根据权利要求73所述的方法，其中，所述高伸长温度比所述伸长温度高2至10度。
77.根据权利要求73所述的方法，其中，步骤(e)包括将所述第二加热器的温度升高到高于所述变性温度的温度，并且一旦所述流体样品达到变性温度就重复步骤(a)。
78.一种用于热循环样品的仪器，包括：
接受器，用于在所述仪器中定位柔性样品容器，所述柔性样品容器具有第一阶段室；
加热元件，包括至少第一温度区和第二温度区，
其中，所述接受器和所述加热元件中的一个或多个能移动，以便将所述第一阶段室相对于所述加热元件的第一温度区和第二温度区定位；以及
其中，所述接受器和所述加热元件被构造成允许所述第一温度区和所述第二温度区控制所述第一阶段室的温度以实现其中的热循环和核酸扩增。
79.根据权利要求78所述的仪器，其中，所述柔性样品容器包括样品制备区。
80.根据权利要求79所述的仪器，其中，所述样品制备区域位于所述第一阶段室的上游。
81.根据权利要求79所述的仪器，其中，所述仪器还包括位于所述样品容器的第一侧上的擦拭器元件，所述擦拭器元件被构造成用于接触所述样品容器以混合所述样品制备区中和所述第一阶段室中的样品；以及
其中，所述接受器、所述擦拭器元件或所述加热元件中的一个或多个能移动，以便将所述柔性样品容器相对于所述擦拭器元件和所述加热元件定位；以及
其中，所述擦拭器元件和所述加热元件协同工作以实现样品制备，并且还协同工作以实现核酸扩增。
82.根据权利要求81所述的仪器，其中，所述擦拭器元件能在所述样品制备区与所述第一阶段室之间移动，并且所述加热元件能移动以在所述样品制备区和所述第一阶段室处限定受控温度区。
83.根据权利要求81所述的仪器，其中，所述接受器能相对于所述擦拭器元件和所述加热器移动，以在所述样品制备区和所述第一阶段室处提供混合和受限的温度区。
84.根据权利要求81所述的仪器，其中，所述接受器、所述擦拭器元件或所述加热元件中的至少两个能移动，以在所述样品制备区和所述第一阶段室处提供混合和限定的温度区。
85.根据权利要求81所述的仪器，其中，所述加热元件能移动到所述样品制备区以加热其中存在的样品，并且所述擦拭器元件具有至少一个叶片，所述叶片被构造成接触所述样品制备区并将所述样品混合以裂解所述样品中的细胞。
86.根据权利要求85所述的仪器，其中，所述擦拭器元件在所述样品中产生涡流、漩涡和空化气泡中的一种或多种以裂解所述样品中的细胞。
87.根据权利要求86所述的仪器，其中，所述样品制备区包括研磨元件以增强细胞裂解。
88.根据权利要求81所述的仪器，其中，所述擦拭器元件包括裂解部件。
89.根据权利要求78所述的仪器，其中，所述加热元件能定位在所述第一阶段室附近，使得所述样品的第一部分位于所述第一温度区附近，而所述样品的第二部分位于所述第二温度区附近，并且其中，所述仪器还包括具有至少一个叶片的擦拭器元件，所述至少一个叶片被构造成将所述第一阶段室分成至少两个不连续的区段，所述至少两个不连续的区段包括至少第一部分和第二部分，并且所述至少一个叶片被构造成能旋转以将所述样品的第一部分移动到所述第二温度区，同时将所述样品的第二部分移动到所述第一温度区，使得所述样品的第一部分和第二部分受每个所述温度区的控制。
90.根据权利要求89所述的仪器，其中，所述叶片将所述样品分成至少两个不连续的区段，所述至少两个不连续的区段包括至少第一区段和第二区段，使得所述第一部分被包含在所述第一区段中且所述第二部分被包含在所述第二区段中。
91.根据权利要求89所述的仪器，其中，所述擦拭器元件移动所述样品，使得所述样品的第一部分处于所述第一温度区的控制下，所述样品的第二部分处于所述第二温度区的控制下，而所述样品的第三部分在第一温度区和所述第二温度区的控制之间转换。
92.根据权利要求89-91中任一项所述的仪器，其中，所述擦拭器元件将所述样品的多个部分重复地移动到所述样品容器的相对部分以热循环所述样品。
93.根据权利要求78所述的仪器，所述容器还包括处在所述第一阶段室下游的第二核酸扩增区，并且其中，所述接受器和所述柔性样品容器或所述加热元件中的一个或多个能移动，以便将所述第二核酸扩增区相对于所述加热元件定位，以在所述第二核酸扩增区限定受控温度区。
94.根据权利要求93所述的仪器，其中，所述第二核酸扩增区包括与所述第一核酸扩增区流体连接的各个扩增孔的阵列，所述阵列被构造为接收所述样品的至少一部分。
95.根据权利要求94所述的仪器，所述容器包括位于所述第一阶段室与所述阵列之间的孔，其中，所述孔被构造成从所述第一阶段室接收已知体积的所述样品并将所述已知体积递送至所述阵列。
96.根据权利要求95所述的仪器，所述容器包括处在所述孔与所述阵列之间的稀释区，其中，所述稀释区被构造成从所述孔接收所述已知体积，用一定体积的流体稀释所述已知体积以产生稀释样品，并将稀释后的样品递送到所述阵列。
97.根据权利要求78所述的仪器，其中，所述接受器包括基本上平坦的表面，所述基本上平坦的表面中定位有一个或多个开口，以允许所述加热元件在插入所述接受器中时接触所述柔性样品容器的一个或多个部分。
98.根据权利要求78所述的仪器，还包括光学阵列，所述光学阵列包括被构造用于从所述容器的至少一部分收集光学数据的光源和相机元件。
99.根据权利要求78所述的仪器，其中，所述加热元件包括第一加热器部分、第二加热器部分和第三加热器部分。
100.根据权利要求99所述的仪器，其中，所述第一加热器部分是电阻加热器，所述第二加热器部分是珀耳帖装置，且所述第三加热器部分是电阻加热器。
101.根据权利要求100所述的仪器，其中，所述第三加热器部分包括处在珀耳帖装置上的电阻加热器，并且其中，所述电阻加热器用于加热所述第三加热器部分，且所述珀耳帖装置基本上同时用于冷却所述第三加热器部分。
102.根据权利要求101所述的仪器，其中，所述第一加热器部分、所述第二加热器部分和所述第三加热器部分被线性地设置。
103.根据权利要求78-102中任一项所述的仪器，还包括计算装置，所述计算装置被构造用于控制所述仪器的一个或多个组件和/或从所述仪器的一个或多个组件收集数据。
104.一种用于扩增样品中的核酸的仪器，所述仪器包括：
开口，用于接收柔性样品容器，所述柔性样品容器包括至少一个反应区，以及多个加热器，其中，每个所述加热器被构造成设定在不同的温度，并且其中，所述加热器被定位在基本上平面的安装座上，使得每个加热器能够与所述至少一个反应区按顺序地对准以加热或冷却其中的样品。
105.根据权利要求104所述的仪器，其中，所述基本上平面的安装座包括圆形安装座，所述圆形安装座被构造成邻近所述柔性样品容器旋转。
106.根据权利要求105所述的仪器，其中，所述圆形安装座被构造为沿顺时针和逆时针两个方向旋转。
107.一种柔性样品容器，包括：
反应室，具有多个反应孔的阵列，其中，所述阵列的每个孔流体连接到能选择性打开且能选择性密封的填充通道。
108.根据权利要求107所述的柔性样品容器，其中，所述柔性样品容器由第一膜层、至少部分地粘合到所述第一膜层的第二膜层、粘合到所述第二膜层和其中形成所述阵列的反应孔的卡层的一个表面的粘合剂层、粘合到第三外部膜层和所述卡层的相对表面的第二粘合剂层制成，
其中，所述填充通道是通过在所述第一膜层与所述第二膜层之间留下开放空间而形成的。
109.根据权利要求108所述的柔性样品容器，其中，所述填充通道由密封线限定，所述密封线将所述第一膜层和第二膜层围绕所述反应孔阵列密封在一起。
110.根据权利要求108所述的柔性样品容器，其中，所述填充通道通过由所述第二膜层和所述第一粘合剂层中的选择性切口形成的填充孔流体连接到所述阵列的每个孔。
111.根据权利要求110所述的柔性样品容器，其中，所述填充孔流体连接到孔填充通道，所述孔填充通道在所述阵列的孔附近和上方流动，其中，所述孔填充通道通过在邻近所述阵列的孔的所述卡层中形成切口以及在所述第二粘合剂层中形成另一切口来形成。
112.根据权利要求110所述的柔性样品容器，其中，所述填充孔流体连接到孔填充通道，所述孔填充通道流入所述阵列的孔中，其中，所述孔填充通道通过在所述第一粘合剂层中形成切口来形成，所述切口将所述填充孔流体连接到所述阵列的孔。
113.根据权利要求107所述的柔性样品容器，其中，所述填充通道能热密封。
114.根据权利要求113所述的柔性样品容器，其中，单个热密封件密封从一填充通道到多个填充通道的流动并将所述多个孔彼此密封。
115.根据权利要求107所述的柔性样品容器，其中，所述填充通道能通过在所述阵列上施加压力来密封。