特定基因突变在检测垂体腺瘤的分子诊断和靶向治疗中的应用专利检索-分子靶向治疗癌症治疗疗法专利检索查询-专利查询网

特定基因突变在检测垂体腺瘤的分子诊断和靶向治疗中的应用

阅读：836发布：2020-05-13

专利汇可以提供特定基因突变在检测垂体腺瘤的分子诊断和靶向治疗中的应用专利检索，专利查询，专利分析的服务。并且本发明提供了特定基因突变在检测垂体腺瘤的分子诊断和靶向治疗中的应用。具体地，本发明提供了一类在垂体腺瘤患者体内特异的基因突变，实验结果表明，通过对此类基因突变的检测能够诊断垂体腺瘤患者。，下面是特定基因突变在检测垂体腺瘤的分子诊断和靶向治疗中的应用专利的具体信息内容。

权利要求

1.选自下组的基因或其检测试剂的用途，用于制备检测垂体腺瘤或其易感性的试剂盒:
ABCA4、ABCC12、ABHD17B、ACACA、ACSS2、ADAM15、ADAM2、ADAMTSL1、ADAMTSL4、ADCK3、ADGRV1、ADRBK1、AGT、AHCTF1、AKNAD1、ALDH5A1、ALS2、ANKRD65、ANKS3、ANXA9、AP2M1、APBB1、ARL5A、ARMC8、ARSD、ASH1L、ATXN7、BBS10、BCL11A、BCOR、BRAF、BRCA1、BRIP1、BRPF3、BSN、BTG1、C11orf84、C17orf96、C1QTNF2、C20orf194、C2orf54、C3、C9orf172、CACNA1B、CAMSAP3、CAPN1、CASP8AP2、CCBL1、CCDC134、CCDC155、CCDC159、CCDC160、CCDC178、CCDC62、CFAP46、CFAP74、CHD2、CHMP7、CHRNE、CLASP1、CLASP2、CLDN17、CLPB、CNN1、COG7、COL12A1、COL4A3、COL7A1、COPB1、COPRS、CPM、CREBBP、CSMD3、CTNND1、DCAF15、DDX5、DESI2、DFNB59、DGKZ、DLG1、DLGAP5、DOCK7、DOCK8、DYNC1H1、DYSF、EBPL、ECE2、EED、EIF4E1B、ENDOD1、ENKD1、ERC2、EXOSC2、FAM120A、FAM131A、FAM133A、FAM170B、FAM208A、FAM58A、FAM98A、FFAR2、FGD1、FGF4、FLG、FLG2、FOXD1、FOXN2、FRMD6、FRRS1、GABRE、GABRG2、GAS2L2、GDF9、GH1、GLB1L3、GLCE、GNA15、GNAS、GOLM1、GORAB、GPN1、GPR132、GPR182、GPRIN3、GRB10、GRK1、GSG2、GTF3C3、HADHA、HAVCR2、HDAC4、HDAC9、HECTD4、HGF、HIST1H1B、HIST1H2BA、HK2、HNF1A、HRH1、IARS、ICE1、IDE、IDS、IFT140、IFT52、IGSF10、IL18RAP、ILF3、IMPACT、INPP4A、IQSEC3、ITIH5、JAGN1、JMJD4、KBTBD13、KCNH2、KCP、KCTD19、KHDRBS2、KIAA0368、KIF14、KIF5A、KIR2DL5A,KIR2DL5B、KLHL35、KLHL41、KRT83、LAMA1、LARP6、LGI1、LHPP、LMNTD1、LPCAT2、LRFN5、LRP1、LRP10、LRP2、LRRC7、LTBP1、LTBP2、LXN、LY75,LY75-CD302、MAGEA3、MAGEB10、MALT1、MAP10、MAP2、MAP3K6、MAP7D3、MARK1、MAST4、MBLAC2、MCOLN1、MED1、MEN1、MGA、MGP、MRPS26、MRPS9、MSANTD4、MUC16、MXRA5、MYH10、MYH11、MYH4、MYO18B、NDST1、NDUFV1、NEK8、NFKB1、NLGN4X、NLRP11、NME5、NOS3、NPEPL1、NR3C1、NRAP、NRP2、NUFIP1、OASL、OBSL1、OMG、OPHN1、OR1S2、OR4A16、OR4B1、OR5D16、OR7A5、ORC4、PAK1IP1、PARPBP、PCSK6、PEG10、PEG3、PEX13、PHKB、PIK3C2G、PITPNM2、PJA2、PLCL2、PLIN2、PLXNB2、PNMAL1、POLR3B、PPAPDC1B、PPFIA3、PRAMEF19、PRKAA2、PRMT9、PROM2、PSTPIP2、PTPRS、RAD21L1、RAP1GAP2、RAPSN、RASSF9、RBFOX1、RBL1、RBM12、RECK、RFX7、RNF123、RNF216、RNMTL1、RPS3、RRP12、RUFY2、RUNX2、RYR1、SCN10A、SCN1A、SEC24B、SELT、SETD2、SF3B6、SIDT2、SIPA1、SKIDA1、SLC13A1、SLC22A6、SLC24A2、SLC25A16、SLC25A48、SLC33A1、SLC9A3R1、SLC9A8、SLCO1B1、SLCO1C1、SNUPN、SNX16、SOCS3、SOX4、SP100、SPEG、SPTA1、SRF、SSPO、STAG2、STAP2、STX19、SYK、SYNPO2、TADA2A、TAF1、TAF4、TAF5、TBL1X、TBX4、TBX5、TCL1A、TEDDM1、THOC6、TICRR、TLDC2、TMEM169、TMEM68、TMX1、TOR1B、TPP2、TRAPPC6A、TRIP11、TRIP12、TRNAU1AP、TSPAN6、TTC4、TTLL11、TTN、TUBGCP5、TUBGCP6、U2AF2、UBASH3B、UBFD1、UGT8、UHRF1BP1、UNKL、UPF1、UPRT、URGCP、UROC1、USH2A、USP11、USP29、USP40、USP48、USP7、USP8、UTRN、VPS37D、VWF、WASF2、WDR33、WIPI1、WNK1、WNK3、XIRP2、YIPF7、ZAK、ZBP1、ZCCHC24、ZDBF2、ZFHX2、ZMYM2、ZNF334、ZNF417、ZNF507、ZNF578、ZNF616、ZNF674、ZNF846、和ZNHIT2。
2.如权利要求1所述的用途，其特征在于，上述各基因含有表1中所示的突变位点；优选地，所述的试剂包括引物、探针、芯片、或抗体。
3.如权利要求1所述的用途，其特征在于，所述试剂盒含有一种或多种选自下组的试剂：
(a)针对靶基因的特异性引物；
(b)用于检测一种或多种所述突变位点的特异性探针；
(c)用于检测一种或多种所述突变位点的芯片；
(d)用于检测一种或多种所述突变位点所对应的氨基酸突变的特异性抗体。
4.一种分离的含突变位点的多核苷酸、或其检测试剂的用途，用于制备检测垂体腺瘤或其易感性的试剂盒，其中，所述的突变位点选自表1中一个或多个。
5.如权利要求4所示的用途，其特征在于，所述多核苷酸长度为8-5000bp，较佳地10-
3000bp，更佳地15-1000bp，最佳地18-500bp。
6.一种分离的氨基选序列，其特征在于，所述氨基选序列由选自下组的基因编码：
ABCA4、ABCC12、ABHD17B、ACACA、ACSS2、ADAM15、ADAM2、ADAMTSL1、ADAMTSL4、ADCK3、ADGRV1、ADRBK1、AGT、AHCTF1、AKNAD1、ALDH5A1、ALS2、ANKRD65、ANKS3、ANXA9、AP2M1、APBB1、ARL5A、ARMC8、ARSD、ASH1L、ATXN7、BBS10、BCL11A、BCOR、BRAF、BRCA1、BRIP1、BRPF3、BSN、BTG1、C11orf84、C17orf96、C1QTNF2、C20orf194、C2orf54、C3、C9orf172、CACNA1B、CAMSAP3、CAPN1、CASP8AP2、CCBL1、CCDC134、CCDC155、CCDC159、CCDC160、CCDC178、CCDC62、CFAP46、CFAP74、CHD2、CHMP7、CHRNE、CLASP1、CLASP2、CLDN17、CLPB、CNN1、COG7、COL12A1、COL4A3、COL7A1、COPB1、COPRS、CPM、CREBBP、CSMD3、CTNND1、DCAF15、DDX5、DESI2、DFNB59、DGKZ、DLG1、DLGAP5、DOCK7、DOCK8、DYNC1H1、DYSF、EBPL、ECE2、EED、EIF4E1B、ENDOD1、ENKD1、ERC2、EXOSC2、FAM120A、FAM131A、FAM133A、FAM170B、FAM208A、FAM58A、FAM98A、FFAR2、FGD1、FGF4、FLG、FLG2、FOXD1、FOXN2、FRMD6、FRRS1、GABRE、GABRG2、GAS2L2、GDF9、GH1、GLB1L3、GLCE、GNA15、GNAS、GOLM1、GORAB、GPN1、GPR132、GPR182、GPRIN3、GRB10、GRK1、GSG2、GTF3C3、HADHA、HAVCR2、HDAC4、HDAC9、HECTD4、HGF、HIST1H1B、HIST1H2BA、HK2、HNF1A、HRH1、IARS、ICE1、IDE、IDS、IFT140、IFT52、IGSF10、IL18RAP、ILF3、IMPACT、INPP4A、IQSEC3、ITIH5、JAGN1、JMJD4、KBTBD13、KCNH2、KCP、KCTD19、KHDRBS2、KIAA0368、KIF14、KIF5A、KIR2DL5A,KIR2DL5B、KLHL35、KLHL41、KRT83、LAMA1、LARP6、LGI1、LHPP、LMNTD1、LPCAT2、LRFN5、LRP1、LRP10、LRP2、LRRC7、LTBP1、LTBP2、LXN、LY75,LY75-CD302、MAGEA3、MAGEB10、MALT1、MAP10、MAP2、MAP3K6、MAP7D3、MARK1、MAST4、MBLAC2、MCOLN1、MED1、MEN1、MGA、MGP、MRPS26、MRPS9、MSANTD4、MUC16、MXRA5、MYH10、MYH11、MYH4、MYO18B、NDST1、NDUFV1、NEK8、NFKB1、NLGN4X、NLRP11、NME5、NOS3、NPEPL1、NR3C1、NRAP、NRP2、NUFIP1、OASL、OBSL1、OMG、OPHN1、OR1S2、OR4A16、OR4B1、OR5D16、OR7A5、ORC4、PAK1IP1、PARPBP、PCSK6、PEG10、PEG3、PEX13、PHKB、PIK3C2G、PITPNM2、PJA2、PLCL2、PLIN2、PLXNB2、PNMAL1、POLR3B、PPAPDC1B、PPFIA3、PRAMEF19、PRKAA2、PRMT9、PROM2、PSTPIP2、PTPRS、RAD21L1、RAP1GAP2、RAPSN、RASSF9、RBFOX1、RBL1、RBM12、RECK、RFX7、RNF123、RNF216、RNMTL1、RPS3、RRP12、RUFY2、RUNX2、RYR1、SCN10A、SCN1A、SEC24B、SELT、SETD2、SF3B6、SIDT2、SIPA1、SKIDA1、SLC13A1、SLC22A6、SLC24A2、SLC25A16、SLC25A48、SLC33A1、SLC9A3R1、SLC9A8、SLCO1B1、SLCO1C1、SNUPN、SNX16、SOCS3、SOX4、SP100、SPEG、SPTA1、SRF、SSPO、STAG2、STAP2、STX19、SYK、SYNPO2、TADA2A、TAF1、TAF4、TAF5、TBL1X、TBX4、TBX5、TCL1A、TEDDM1、THOC6、TICRR、TLDC2、TMEM169、TMEM68、TMX1、TOR1B、TPP2、TRAPPC6A、TRIP11、TRIP12、TRNAU1AP、TSPAN6、TTC4、TTLL11、TTN、TUBGCP5、TUBGCP6、U2AF2、UBASH3B、UBFD1、UGT8、UHRF1BP1、UNKL、UPF1、UPRT、URGCP、UROC1、USH2A、USP11、USP29、USP40、USP48、USP7、USP8、UTRN、VPS37D、VWF、WASF2、WDR33、WIPI1、WNK1、WNK3、XIRP2、YIPF7、ZAK、ZBP1、ZCCHC24、ZDBF2、ZFHX2、ZMYM2、ZNF334、ZNF417、ZNF507、ZNF578、ZNF616、ZNF674、ZNF846、和ZNHIT2；并且，所述的各基因具有表1中所示的各突变位点。
7.如权利要求6所述的分离的氨基选序列，其特征在于，所述氨基选序列具有表1中所示的氨基酸残基突变。
8.一种检测垂体腺瘤的试剂盒，其特征在于，所述试剂盒包括检测选自下组的基因的试剂：
ABCA4、ABCC12、ABHD17B、ACACA、ACSS2、ADAM15、ADAM2、ADAMTSL1、ADAMTSL4、ADCK3、ADGRV1、ADRBK1、AGT、AHCTF1、AKNAD1、ALDH5A1、ALS2、ANKRD65、ANKS3、ANXA9、AP2M1、APBB1、ARL5A、ARMC8、ARSD、ASH1L、ATXN7、BBS10、BCL11A、BCOR、BRAF、BRCA1、BRIP1、BRPF3、BSN、BTG1、C11orf84、C17orf96、C1QTNF2、C20orf194、C2orf54、C3、C9orf172、CACNA1B、CAMSAP3、CAPN1、CASP8AP2、CCBL1、CCDC134、CCDC155、CCDC159、CCDC160、CCDC178、CCDC62、CFAP46、CFAP74、CHD2、CHMP7、CHRNE、CLASP1、CLASP2、CLDN17、CLPB、CNN1、COG7、COL12A1、COL4A3、COL7A1、COPB1、COPRS、CPM、CREBBP、CSMD3、CTNND1、DCAF15、DDX5、DESI2、DFNB59、DGKZ、DLG1、DLGAP5、DOCK7、DOCK8、DYNC1H1、DYSF、EBPL、ECE2、EED、EIF4E1B、ENDOD1、ENKD1、ERC2、EXOSC2、FAM120A、FAM131A、FAM133A、FAM170B、FAM208A、FAM58A、FAM98A、FFAR2、FGD1、FGF4、FLG、FLG2、FOXD1、FOXN2、FRMD6、FRRS1、GABRE、GABRG2、GAS2L2、GDF9、GH1、GLB1L3、GLCE、GNA15、GNAS、GOLM1、GORAB、GPN1、GPR132、GPR182、GPRIN3、GRB10、GRK1、GSG2、GTF3C3、HADHA、HAVCR2、HDAC4、HDAC9、HECTD4、HGF、HIST1H1B、HIST1H2BA、HK2、HNF1A、HRH1、IARS、ICE1、IDE、IDS、IFT140、IFT52、IGSF10、IL18RAP、ILF3、IMPACT、INPP4A、IQSEC3、ITIH5、JAGN1、JMJD4、KBTBD13、KCNH2、KCP、KCTD19、KHDRBS2、KIAA0368、KIF14、KIF5A、KIR2DL5A,KIR2DL5B、KLHL35、KLHL41、KRT83、LAMA1、LARP6、LGI1、LHPP、LMNTD1、LPCAT2、LRFN5、LRP1、LRP10、LRP2、LRRC7、LTBP1、LTBP2、LXN、LY75,LY75-CD302、MAGEA3、MAGEB10、MALT1、MAP10、MAP2、MAP3K6、MAP7D3、MARK1、MAST4、MBLAC2、MCOLN1、MED1、MEN1、MGA、MGP、MRPS26、MRPS9、MSANTD4、MUC16、MXRA5、MYH10、MYH11、MYH4、MYO18B、NDST1、NDUFV1、NEK8、NFKB1、NLGN4X、NLRP11、NME5、NOS3、NPEPL1、NR3C1、NRAP、NRP2、NUFIP1、OASL、OBSL1、OMG、OPHN1、OR1S2、OR4A16、OR4B1、OR5D16、OR7A5、ORC4、PAK1IP1、PARPBP、PCSK6、PEG10、PEG3、PEX13、PHKB、PIK3C2G、PITPNM2、PJA2、PLCL2、PLIN2、PLXNB2、PNMAL1、POLR3B、PPAPDC1B、PPFIA3、PRAMEF19、PRKAA2、PRMT9、PROM2、PSTPIP2、PTPRS、RAD21L1、RAP1GAP2、RAPSN、RASSF9、RBFOX1、RBL1、RBM12、RECK、RFX7、RNF123、RNF216、RNMTL1、RPS3、RRP12、RUFY2、RUNX2、RYR1、SCN10A、SCN1A、SEC24B、SELT、SETD2、SF3B6、SIDT2、SIPA1、SKIDA1、SLC13A1、SLC22A6、SLC24A2、SLC25A16、SLC25A48、SLC33A1、SLC9A3R1、SLC9A8、SLCO1B1、SLCO1C1、SNUPN、SNX16、SOCS3、SOX4、SP100、SPEG、SPTA1、SRF、SSPO、STAG2、STAP2、STX19、SYK、SYNPO2、TADA2A、TAF1、TAF4、TAF5、TBL1X、TBX4、TBX5、TCL1A、TEDDM1、THOC6、TICRR、TLDC2、TMEM169、TMEM68、TMX1、TOR1B、TPP2、TRAPPC6A、TRIP11、TRIP12、TRNAU1AP、TSPAN6、TTC4、TTLL11、TTN、TUBGCP5、TUBGCP6、U2AF2、UBASH3B、UBFD1、UGT8、UHRF1BP1、UNKL、UPF1、UPRT、URGCP、UROC1、USH2A、USP11、USP29、USP40、USP48、USP7、USP8、UTRN、VPS37D、VWF、WASF2、WDR33、WIPI1、WNK1、WNK3、XIRP2、YIPF7、ZAK、ZBP1、ZCCHC24、ZDBF2、ZFHX2、ZMYM2、ZNF334、ZNF417、ZNF507、ZNF578、ZNF616、ZNF674、ZNF846、和ZNHIT2。
9.如权利要求8所示的试剂盒，其特征在于，所述试剂包括引物、探针、芯片、或抗体。
10.选自下组的基因或其调节剂的用途，用于制备预防和/或治疗垂体腺瘤的药物：
ABCA4、ABCC12、ABHD17B、ACACA、ACSS2、ADAM15、ADAM2、ADAMTSL1、ADAMTSL4、ADCK3、ADGRV1、ADRBK1、AGT、AHCTF1、AKNAD1、ALDH5A1、ALS2、ANKRD65、ANKS3、ANXA9、AP2M1、APBB1、ARL5A、ARMC8、ARSD、ASH1L、ATXN7、BBS10、BCL11A、BCOR、BRAF、BRCA1、BRIP1、BRPF3、BSN、BTG1、C11orf84、C17orf96、C1QTNF2、C20orf194、C2orf54、C3、C9orf172、CACNA1B、CAMSAP3、CAPN1、CASP8AP2、CCBL1、CCDC134、CCDC155、CCDC159、CCDC160、CCDC178、CCDC62、CFAP46、CFAP74、CHD2、CHMP7、CHRNE、CLASP1、CLASP2、CLDN17、CLPB、CNN1、COG7、COL12A1、COL4A3、COL7A1、COPB1、COPRS、CPM、CREBBP、CSMD3、CTNND1、DCAF15、DDX5、DESI2、DFNB59、DGKZ、DLG1、DLGAP5、DOCK7、DOCK8、DYNC1H1、DYSF、EBPL、ECE2、EED、EIF4E1B、ENDOD1、ENKD1、ERC2、EXOSC2、FAM120A、FAM131A、FAM133A、FAM170B、FAM208A、FAM58A、FAM98A、FFAR2、FGD1、FGF4、FLG、FLG2、FOXD1、FOXN2、FRMD6、FRRS1、GABRE、GABRG2、GAS2L2、GDF9、GH1、GLB1L3、GLCE、GNA15、GNAS、GOLM1、GORAB、GPN1、GPR132、GPR182、GPRIN3、GRB10、GRK1、GSG2、GTF3C3、HADHA、HAVCR2、HDAC4、HDAC9、HECTD4、HGF、HIST1H1B、HIST1H2BA、HK2、HNF1A、HRH1、IARS、ICE1、IDE、IDS、IFT140、IFT52、IGSF10、IL18RAP、ILF3、IMPACT、INPP4A、IQSEC3、ITIH5、JAGN1、JMJD4、KBTBD13、KCNH2、KCP、KCTD19、KHDRBS2、KIAA0368、KIF14、KIF5A、KIR2DL5A,KIR2DL5B、KLHL35、KLHL41、KRT83、LAMA1、LARP6、LGI1、LHPP、LMNTD1、LPCAT2、LRFN5、LRP1、LRP10、LRP2、LRRC7、LTBP1、LTBP2、LXN、LY75,LY75-CD302、MAGEA3、MAGEB10、MALT1、MAP10、MAP2、MAP3K6、MAP7D3、MARK1、MAST4、MBLAC2、MCOLN1、MED1、MEN1、MGA、MGP、MRPS26、MRPS9、MSANTD4、MUC16、MXRA5、MYH10、MYH11、MYH4、MYO18B、NDST1、NDUFV1、NEK8、NFKB1、NLGN4X、NLRP11、NME5、NOS3、NPEPL1、NR3C1、NRAP、NRP2、NUFIP1、OASL、OBSL1、OMG、OPHN1、OR1S2、OR4A16、OR4B1、OR5D16、OR7A5、ORC4、PAK1IP1、PARPBP、PCSK6、PEG10、PEG3、PEX13、PHKB、PIK3C2G、PITPNM2、PJA2、PLCL2、PLIN2、PLXNB2、PNMAL1、POLR3B、PPAPDC1B、PPFIA3、PRAMEF19、PRKAA2、PRMT9、PROM2、PSTPIP2、PTPRS、RAD21L1、RAP1GAP2、RAPSN、RASSF9、RBFOX1、RBL1、RBM12、RECK、RFX7、RNF123、RNF216、RNMTL1、RPS3、RRP12、RUFY2、RUNX2、RYR1、SCN10A、SCN1A、SEC24B、SELT、SETD2、SF3B6、SIDT2、SIPA1、SKIDA1、SLC13A1、SLC22A6、SLC24A2、SLC25A16、SLC25A48、SLC33A1、SLC9A3R1、SLC9A8、SLCO1B1、SLCO1C1、SNUPN、SNX16、SOCS3、SOX4、SP100、SPEG、SPTA1、SRF、SSPO、STAG2、STAP2、STX19、SYK、SYNPO2、TADA2A、TAF1、TAF4、TAF5、TBL1X、TBX4、TBX5、TCL1A、TEDDM1、THOC6、TICRR、TLDC2、TMEM169、TMEM68、TMX1、TOR1B、TPP2、TRAPPC6A、TRIP11、TRIP12、TRNAU1AP、TSPAN6、TTC4、TTLL11、TTN、TUBGCP5、TUBGCP6、U2AF2、UBASH3B、UBFD1、UGT8、UHRF1BP1、UNKL、UPF1、UPRT、URGCP、UROC1、USH2A、USP11、USP29、USP40、USP48、USP7、USP8、UTRN、VPS37D、VWF、WASF2、WDR33、WIPI1、WNK1、WNK3、XIRP2、YIPF7、ZAK、ZBP1、ZCCHC24、ZDBF2、ZFHX2、ZMYM2、ZNF334、ZNF417、ZNF507、ZNF578、ZNF616、ZNF674、ZNF846、和ZNHIT2。

说明书全文

特定基因突变在检测垂体腺瘤的分子诊断和靶向治疗中的

应用

技术领域

[0001] 本发明涉及生物医学领域，尤其涉及特定基因突变在检测垂体腺瘤的分子诊断和靶向治疗中的应用。

背景技术

[0002] 垂体腺瘤(Pituitary adenomas)是人体最常见的神经内分泌性肿瘤，也是最常见的脑肿瘤之一。功能性垂体腺瘤会异常分泌激素，导致患者出现不孕不育、肢端肥大、Cushing综合症、甲亢等显著的内分泌紊乱症状，进而严重损害心肝肾等重要脏器功能。垂体腺瘤发病隐匿，生长缓慢，当患者出现临床症状前往就诊时，肿瘤往往已体积巨大，或呈侵袭性生长，压迫邻近重要解剖结构，导致患者出现垂体功能低下、双眼视力下降和颅神经麻痹等神经功能缺失症状，甚至发展为不可逆神经功能损害，严重影响患者的生活质量，甚至危及生命。

[0003] 该病并非是一种简单的神经外科疾病，而是一种牵涉内分泌科、妇产科、男性科、眼科、放疗科、影像医学科等多学科的复杂疾病，在临床诊疗中仍存在诸多的瓶颈难题。垂体腺瘤的发病机制不清，早期诊断困难，如能早期诊断出垂体腺瘤，并对其采取分层的二级预防及诊治，对于及时终止因肿瘤异常分泌激素对患者心肝肾等重要脏器产生的严重功能损害、防止因肿瘤持续隐匿生长压迫所致的不可逆神经功能损害以及降低治疗风险均有着非常重要的临床意义。

[0004] 目前临床上用于确诊垂体腺瘤的核磁共振检查(MRI)，不仅费用较昂贵，难以用于临床病例的大规模筛检，且由于受到分辨率的限制，难以发现直径<0.5cm的微腺瘤。目前垂体腺瘤的临床治疗以手术切除为主，药物和立体定向放疗为辅，但只有少数患者通过这些方法获得治愈。大多数经治病例在较短的症状缓解期后出现肿瘤复发，因此临床上亟待新的治疗方法。此外对于不同种类的垂体腺瘤也应该采取不同的临床治疗策略。目前尚无特异性的分子诊断标记物可将它们进行鉴别诊断。故急需简便、价廉的垂体腺瘤早期诊断工具和针对性的靶向治疗方法。

发明内容

[0005] 本发明的目的在于提供一种特定基因突变在检测垂体腺瘤的分子诊断和靶向治疗中的应用。

[0006] 本发明的第一方面，提供了选自下组的基因或其检测试剂的用途，用于制备检测垂体腺瘤或其易感性的试剂盒:

[0007] ABCA4、ABCC12、ABHD17B、ACACA、ACSS2、ADAM15、ADAM2、ADAMTSL1、ADAMTSL4、ADCK3、ADGRV1、ADRBK1、AGT、AHCTF1、AKNAD1、ALDH5A1、ALS2、ANKRD65、ANKS3、ANXA9、AP2M1、APBB1、ARL5A、ARMC8、ARSD、ASH1L、ATXN7、BBS10、BCL11A、BCOR、BRAF、BRCA1、BRIP1、BRPF3、BSN、BTG1、C11orf84、C17orf96、C1QTNF2、C20orf194、C2orf54、C3、C9orf172、CACNA1B、CAMSAP3、CAPN1、CASP8AP2、CCBL1、CCDC134、CCDC155、CCDC159、CCDC160、CCDC178、CCDC62、CFAP46、CFAP74、CHD2、CHMP7、CHRNE、CLASP1、CLASP2、CLDN17、CLPB、CNN1、COG7、COL12A1、COL4A3、COL7A1、COPB1、COPRS、CPM、CREBBP、CSMD3、CTNND1、DCAF15、DDX5、DESI2、DFNB59、DGKZ、DLG1、DLGAP5、DOCK7、DOCK8、DYNC1H1、DYSF、EBPL、ECE2、EED、EIF4E1B、ENDOD1、ENKD1、ERC2、EXOSC2、FAM120A、FAM131A、FAM133A、FAM170B、FAM208A、FAM58A、FAM98A、FFAR2、FGD1、FGF4、FLG、FLG2、FOXD1、FOXN2、FRMD6、FRRS1、GABRE、GABRG2、GAS2L2、GDF9、GH1、GLB1L3、GLCE、GNA15、GNAS、GOLM1、GORAB、GPN1、GPR132、GPR182、GPRIN3、GRB10、GRK1、GSG2、GTF3C3、HADHA、HAVCR2、HDAC4、HDAC9、HECTD4、HGF、HIST1H1B、HIST1H2BA、HK2、HNF1A、HRH1、IARS、ICE1、IDE、IDS、IFT140、IFT52、IGSF10、IL18RAP、ILF3、IMPACT、INPP4A、IQSEC3、ITIH5、JAGN1、JMJD4、KBTBD13、KCNH2、KCP、KCTD19、KHDRBS2、KIAA0368、KIF14、KIF5A、KIR2DL5A,KIR2DL5B、KLHL35、KLHL41、KRT83、LAMA1、LARP6、LGI1、LHPP、LMNTD1、LPCAT2、LRFN5、LRP1、LRP10、LRP2、LRRC7、LTBP1、LTBP2、LXN、LY75,LY75-CD302、MAGEA3、MAGEB10、MALT1、MAP10、MAP2、MAP3K6、MAP7D3、MARK1、MAST4、MBLAC2、MCOLN1、MED1、MEN1、MGA、MGP、MRPS26、MRPS9、MSANTD4、MUC16、MXRA5、MYH10、MYH11、MYH4、MYO18B、NDST1、NDUFV1、NEK8、NFKB1、NLGN4X、NLRP11、NME5、NOS3、NPEPL1、NR3C1、NRAP、NRP2、NUFIP1、OASL、OBSL1、OMG、OPHN1、OR1S2、OR4A16、OR4B1、OR5D16、OR7A5、ORC4、PAK1IP1、PARPBP、PCSK6、PEG10、PEG3、PEX13、PHKB、PIK3C2G、PITPNM2、PJA2、PLCL2、PLIN2、PLXNB2、PNMAL1、POLR3B、PPAPDC1B、PPFIA3、PRAMEF19、PRKAA2、PRMT9、PROM2、PSTPIP2、PTPRS、RAD21L1、RAP1GAP2、RAPSN、RASSF9、RBFOX1、RBL1、RBM12、RECK、RFX7、RNF123、RNF216、RNMTL1、RPS3、RRP12、RUFY2、RUNX2、RYR1、SCN10A、SCN1A、SEC24B、SELT、SETD2、SF3B6、SIDT2、SIPA1、SKIDA1、SLC13A1、SLC22A6、SLC24A2、SLC25A16、SLC25A48、SLC33A1、SLC9A3R1、SLC9A8、SLCO1B1、SLCO1C1、SNUPN、SNX16、SOCS3、SOX4、SP100、SPEG、SPTA1、SRF、SSPO、STAG2、STAP2、STX19、SYK、SYNPO2、TADA2A、TAF1、TAF4、TAF5、TBL1X、TBX4、TBX5、TCL1A、TEDDM1、THOC6、TICRR、TLDC2、TMEM169、TMEM68、TMX1、TOR1B、TPP2、TRAPPC6A、TRIP11、TRIP12、TRNAU1AP、TSPAN6、TTC4、TTLL11、TTN、TUBGCP5、TUBGCP6、U2AF2、UBASH3B、UBFD1、UGT8、UHRF1BP1、UNKL、UPF1、UPRT、URGCP、UROC1、USH2A、USP11、USP29、USP40、USP48、USP7、USP8、UTRN、VPS37D、VWF、WASF2、WDR33、WIPI1、WNK1、WNK3、XIRP2、YIPF7、ZAK、ZBP1、ZCCHC24、ZDBF2、ZFHX2、ZMYM2、ZNF334、ZNF417、ZNF507、ZNF578、ZNF616、ZNF674、ZNF846、和ZNHIT2。

[0008] 在另一优选例中，上述各基因含有表1中所示的突变位点。

[0009] 在另一优选例中，所述的试剂包括引物、探针、芯片、或抗体。

[0010] 在另一优选例中，所述试剂盒含有一种或多种选自下组的试剂：

[0011] (a)针对靶基因的特异性引物；

[0012] (b)用于检测一种或多种所述基因突变位点的特异性探针；

[0013] (c)用于检测一种或多种所述基因突变位点的芯片；

[0014] (d)用于检测一种或多种所述基因突变位点所对应的氨基酸突变的特异性抗体。

[0015] 本发明的第二方面，提供了一种分离的含突变位点的多核苷酸、或其检测试剂的用途，用于制备检测垂体腺瘤或其易感性的试剂盒，其中，所述的突变位点选自表1中一个或多个。

[0016] 在另一优选例中，所述多核苷酸长度为8-5000bp，较佳地10-3000bp，更佳地15-1000bp，最佳地18-500bp。

[0017] 本发明的第三方面，提供了一种分离的氨基选序列，所述氨基选序列由选自下组的基因编码：

[0018] ABCA4、ABCC12、ABHD17B、ACACA、ACSS2、ADAM15、ADAM2、ADAMTSL1、ADAMTSL4、ADCK3、ADGRV1、ADRBK1、AGT、AHCTF1、AKNAD1、ALDH5A1、ALS2、ANKRD65、ANKS3、ANXA9、AP2M1、APBB1、ARL5A、ARMC8、ARSD、ASH1L、ATXN7、BBS10、BCL11A、BCOR、BRAF、BRCA1、BRIP1、BRPF3、BSN、BTG1、C11orf84、C17orf96、C1QTNF2、C20orf194、C2orf54、C3、C9orf172、CACNA1B、CAMSAP3、CAPN1、CASP8AP2、CCBL1、CCDC134、CCDC155、CCDC159、CCDC160、CCDC178、CCDC62、CFAP46、CFAP74、CHD2、CHMP7、CHRNE、CLASP1、CLASP2、CLDN17、CLPB、CNN1、COG7、COL12A1、COL4A3、COL7A1、COPB1、COPRS、CPM、CREBBP、CSMD3、CTNND1、DCAF15、DDX5、DESI2、DFNB59、DGKZ、DLG1、DLGAP5、DOCK7、DOCK8、DYNC1H1、DYSF、EBPL、ECE2、EED、EIF4E1B、ENDOD1、ENKD1、ERC2、EXOSC2、FAM120A、FAM131A、FAM133A、FAM170B、FAM208A、FAM58A、FAM98A、FFAR2、FGD1、FGF4、FLG、FLG2、FOXD1、FOXN2、FRMD6、FRRS1、GABRE、GABRG2、GAS2L2、GDF9、GH1、GLB1L3、GLCE、GNA15、GNAS、GOLM1、GORAB、GPN1、GPR132、GPR182、GPRIN3、GRB10、GRK1、GSG2、GTF3C3、HADHA、HAVCR2、HDAC4、HDAC9、HECTD4、HGF、HIST1H1B、HIST1H2BA、HK2、HNF1A、HRH1、IARS、ICE1、IDE、IDS、IFT140、IFT52、IGSF10、IL18RAP、ILF3、IMPACT、INPP4A、IQSEC3、ITIH5、JAGN1、JMJD4、KBTBD13、KCNH2、KCP、KCTD19、KHDRBS2、KIAA0368、KIF14、KIF5A、KIR2DL5A,KIR2DL5B、KLHL35、KLHL41、KRT83、LAMA1、LARP6、LGI1、LHPP、LMNTD1、LPCAT2、LRFN5、LRP1、LRP10、LRP2、LRRC7、LTBP1、LTBP2、LXN、LY75,LY75-CD302、MAGEA3、MAGEB10、MALT1、MAP10、MAP2、MAP3K6、MAP7D3、MARK1、MAST4、MBLAC2、MCOLN1、MED1、MEN1、MGA、MGP、MRPS26、MRPS9、MSANTD4、MUC16、MXRA5、MYH10、MYH11、MYH4、MYO18B、NDST1、NDUFV1、NEK8、NFKB1、NLGN4X、NLRP11、NME5、NOS3、NPEPL1、NR3C1、NRAP、NRP2、NUFIP1、OASL、OBSL1、OMG、OPHN1、OR1S2、OR4A16、OR4B1、OR5D16、OR7A5、ORC4、PAK1IP1、PARPBP、PCSK6、PEG10、PEG3、PEX13、PHKB、PIK3C2G、PITPNM2、PJA2、PLCL2、PLIN2、PLXNB2、PNMAL1、POLR3B、PPAPDC1B、PPFIA3、PRAMEF19、PRKAA2、PRMT9、PROM2、PSTPIP2、PTPRS、RAD21L1、RAP1GAP2、RAPSN、RASSF9、RBFOX1、RBL1、RBM12、RECK、RFX7、RNF123、RNF216、RNMTL1、RPS3、RRP12、RUFY2、RUNX2、RYR1、SCN10A、SCN1A、SEC24B、SELT、SETD2、SF3B6、SIDT2、SIPA1、SKIDA1、SLC13A1、SLC22A6、SLC24A2、SLC25A16、SLC25A48、SLC33A1、SLC9A3R1、SLC9A8、SLCO1B1、SLCO1C1、SNUPN、SNX16、SOCS3、SOX4、SP100、SPEG、SPTA1、SRF、SSPO、STAG2、STAP2、STX19、SYK、SYNPO2、TADA2A、TAF1、TAF4、TAF5、TBL1X、TBX4、TBX5、TCL1A、TEDDM1、THOC6、TICRR、TLDC2、TMEM169、TMEM68、TMX1、TOR1B、TPP2、TRAPPC6A、TRIP11、TRIP12、TRNAU1AP、TSPAN6、TTC4、TTLL11、TTN、TUBGCP5、TUBGCP6、U2AF2、UBASH3B、UBFD1、UGT8、UHRF1BP1、UNKL、UPF1、UPRT、URGCP、UROC1、USH2A、USP11、USP29、USP40、USP48、USP7、USP8、UTRN、VPS37D、VWF、WASF2、WDR33、WIPI1、WNK1、WNK3、XIRP2、YIPF7、ZAK、ZBP1、ZCCHC24、ZDBF2、ZFHX2、ZMYM2、ZNF334、ZNF417、ZNF507、ZNF578、ZNF616、ZNF674、ZNF846、和ZNHIT2；并且，所述的各基因具有表1中所示的各突变位点。

[0019] 在另一优选例中，所述氨基选序列具有表1中所示的氨基酸残基突变。

[0020] 本发明的第四方面，提供了一种检测垂体腺瘤的试剂盒，所述试剂盒包括检测选自下组的基因的试剂：

[0021] ABCA4、ABCC12、ABHD17B、ACACA、ACSS2、ADAM15、ADAM2、ADAMTSL1、ADAMTSL4、ADCK3、ADGRV1、ADRBK1、AGT、AHCTF1、AKNAD1、ALDH5A1、ALS2、ANKRD65、ANKS3、ANXA9、AP2M1、APBB1、ARL5A、ARMC8、ARSD、ASH1L、ATXN7、BBS10、BCL11A、BCOR、BRAF、BRCA1、BRIP1、BRPF3、BSN、BTG1、C11orf84、C17orf96、C1QTNF2、C20orf194、C2orf54、C3、C9orf172、CACNA1B、CAMSAP3、CAPN1、CASP8AP2、CCBL1、CCDC134、CCDC155、CCDC159、CCDC160、CCDC178、CCDC62、CFAP46、CFAP74、CHD2、CHMP7、CHRNE、CLASP1、CLASP2、CLDN17、CLPB、CNN1、COG7、COL12A1、COL4A3、COL7A1、COPB1、COPRS、CPM、CREBBP、CSMD3、CTNND1、DCAF15、DDX5、DESI2、DFNB59、DGKZ、DLG1、DLGAP5、DOCK7、DOCK8、DYNC1H1、DYSF、EBPL、ECE2、EED、EIF4E1B、ENDOD1、ENKD1、ERC2、EXOSC2、FAM120A、FAM131A、FAM133A、FAM170B、FAM208A、FAM58A、FAM98A、FFAR2、FGD1、FGF4、FLG、FLG2、FOXD1、FOXN2、FRMD6、FRRS1、GABRE、GABRG2、GAS2L2、GDF9、GH1、GLB1L3、GLCE、GNA15、GNAS、GOLM1、GORAB、GPN1、GPR132、GPR182、GPRIN3、GRB10、GRK1、GSG2、GTF3C3、HADHA、HAVCR2、HDAC4、HDAC9、HECTD4、HGF、HIST1H1B、HIST1H2BA、HK2、HNF1A、HRH1、IARS、ICE1、IDE、IDS、IFT140、IFT52、IGSF10、IL18RAP、ILF3、IMPACT、INPP4A、IQSEC3、ITIH5、JAGN1、JMJD4、KBTBD13、KCNH2、KCP、KCTD19、KHDRBS2、KIAA0368、KIF14、KIF5A、KIR2DL5A,KIR2DL5B、KLHL35、KLHL41、KRT83、LAMA1、LARP6、LGI1、LHPP、LMNTD1、LPCAT2、LRFN5、LRP1、LRP10、LRP2、LRRC7、LTBP1、LTBP2、LXN、LY75,LY75-CD302、MAGEA3、MAGEB10、MALT1、MAP10、MAP2、MAP3K6、MAP7D3、MARK1、MAST4、MBLAC2、MCOLN1、MED1、MEN1、MGA、MGP、MRPS26、MRPS9、MSANTD4、MUC16、MXRA5、MYH10、MYH11、MYH4、MYO18B、NDST1、NDUFV1、NEK8、NFKB1、NLGN4X、NLRP11、NME5、NOS3、NPEPL1、NR3C1、NRAP、NRP2、NUFIP1、OASL、OBSL1、OMG、OPHN1、OR1S2、OR4A16、OR4B1、OR5D16、OR7A5、ORC4、PAK1IP1、PARPBP、PCSK6、PEG10、PEG3、PEX13、PHKB、PIK3C2G、PITPNM2、PJA2、PLCL2、PLIN2、PLXNB2、PNMAL1、POLR3B、PPAPDC1B、PPFIA3、PRAMEF19、PRKAA2、PRMT9、PROM2、PSTPIP2、PTPRS、RAD21L1、RAP1GAP2、RAPSN、RASSF9、RBFOX1、RBL1、RBM12、RECK、RFX7、RNF123、RNF216、RNMTL1、RPS3、RRP12、RUFY2、RUNX2、RYR1、SCN10A、SCN1A、SEC24B、SELT、SETD2、SF3B6、SIDT2、SIPA1、SKIDA1、SLC13A1、SLC22A6、SLC24A2、SLC25A16、SLC25A48、SLC33A1、SLC9A3R1、SLC9A8、SLCO1B1、SLCO1C1、SNUPN、SNX16、SOCS3、SOX4、SP100、SPEG、SPTA1、SRF、SSPO、STAG2、STAP2、STX19、SYK、SYNPO2、TADA2A、TAF1、TAF4、TAF5、TBL1X、TBX4、TBX5、TCL1A、TEDDM1、THOC6、TICRR、TLDC2、TMEM169、TMEM68、TMX1、TOR1B、TPP2、TRAPPC6A、TRIP11、TRIP12、TRNAU1AP、TSPAN6、TTC4、TTLL11、TTN、TUBGCP5、TUBGCP6、U2AF2、UBASH3B、UBFD1、UGT8、UHRF1BP1、UNKL、UPF1、UPRT、URGCP、UROC1、USH2A、USP11、USP29、USP40、USP48、USP7、USP8、UTRN、VPS37D、VWF、WASF2、WDR33、WIPI1、WNK1、WNK3、XIRP2、YIPF7、ZAK、ZBP1、ZCCHC24、ZDBF2、ZFHX2、ZMYM2、ZNF334、ZNF417、ZNF507、ZNF578、ZNF616、ZNF674、ZNF846、和ZNHIT2。

[0022] 在另一优选例中，所述的各基因具有表1所示的突变位点。

[0023] 在另一优选例中，所述试剂包括引物、探针、芯片、或抗体。

[0024] 本发明的第五方面，提供了选自下组的基因或其调节剂的用途，用于制备预防和/或治疗垂体腺瘤的药物：

[0025] ABCA4、ABCC12、ABHD17B、ACACA、ACSS2、ADAM15、ADAM2、ADAMTSL1、ADAMTSL4、ADCK3、ADGRV1、ADRBK1、AGT、AHCTF1、AKNAD1、ALDH5A1、ALS2、ANKRD65、ANKS3、ANXA9、AP2M1、APBB1、ARL5A、ARMC8、ARSD、ASH1L、ATXN7、BBS10、BCL11A、BCOR、BRAF、BRCA1、BRIP1、BRPF3、BSN、BTG1、C11orf84、C17orf96、C1QTNF2、C20orf194、C2orf54、C3、C9orf172、CACNA1B、CAMSAP3、CAPN1、CASP8AP2、CCBL1、CCDC134、CCDC155、CCDC159、CCDC160、CCDC178、CCDC62、CFAP46、CFAP74、CHD2、CHMP7、CHRNE、CLASP1、CLASP2、CLDN17、CLPB、CNN1、COG7、COL12A1、COL4A3、COL7A1、COPB1、COPRS、CPM、CREBBP、CSMD3、CTNND1、DCAF15、DDX5、DESI2、DFNB59、DGKZ、DLG1、DLGAP5、DOCK7、DOCK8、DYNC1H1、DYSF、EBPL、ECE2、EED、EIF4E1B、ENDOD1、ENKD1、ERC2、EXOSC2、FAM120A、FAM131A、FAM133A、FAM170B、FAM208A、FAM58A、FAM98A、FFAR2、FGD1、FGF4、FLG、FLG2、FOXD1、FOXN2、FRMD6、FRRS1、GABRE、GABRG2、GAS2L2、GDF9、GH1、GLB1L3、GLCE、GNA15、GNAS、GOLM1、GORAB、GPN1、GPR132、GPR182、GPRIN3、GRB10、GRK1、GSG2、GTF3C3、HADHA、HAVCR2、HDAC4、HDAC9、HECTD4、HGF、HIST1H1B、HIST1H2BA、HK2、HNF1A、HRH1、IARS、ICE1、IDE、IDS、IFT140、IFT52、IGSF10、IL18RAP、ILF3、IMPACT、INPP4A、IQSEC3、ITIH5、JAGN1、JMJD4、KBTBD13、KCNH2、KCP、KCTD19、KHDRBS2、KIAA0368、KIF14、KIF5A、KIR2DL5A,KIR2DL5B、KLHL35、KLHL41、KRT83、LAMA1、LARP6、LGI1、LHPP、LMNTD1、LPCAT2、LRFN5、LRP1、LRP10、LRP2、LRRC7、LTBP1、LTBP2、LXN、LY75,LY75-CD302、MAGEA3、MAGEB10、MALT1、MAP10、MAP2、MAP3K6、MAP7D3、MARK1、MAST4、MBLAC2、MCOLN1、MED1、MEN1、MGA、MGP、MRPS26、MRPS9、MSANTD4、MUC16、MXRA5、MYH10、MYH11、MYH4、MYO18B、NDST1、NDUFV1、NEK8、NFKB1、NLGN4X、NLRP11、NME5、NOS3、NPEPL1、NR3C1、NRAP、NRP2、NUFIP1、OASL、OBSL1、OMG、OPHN1、OR1S2、OR4A16、OR4B1、OR5D16、OR7A5、ORC4、PAK1IP1、PARPBP、PCSK6、PEG10、PEG3、PEX13、PHKB、PIK3C2G、PITPNM2、PJA2、PLCL2、PLIN2、PLXNB2、PNMAL1、POLR3B、PPAPDC1B、PPFIA3、PRAMEF19、PRKAA2、PRMT9、PROM2、PSTPIP2、PTPRS、RAD21L1、RAP1GAP2、RAPSN、RASSF9、RBFOX1、RBL1、RBM12、RECK、RFX7、RNF123、RNF216、RNMTL1、RPS3、RRP12、RUFY2、RUNX2、RYR1、SCN10A、SCN1A、SEC24B、SELT、SETD2、SF3B6、SIDT2、SIPA1、SKIDA1、SLC13A1、SLC22A6、SLC24A2、SLC25A16、SLC25A48、SLC33A1、SLC9A3R1、SLC9A8、SLCO1B1、SLCO1C1、SNUPN、SNX16、SOCS3、SOX4、SP100、SPEG、SPTA1、SRF、SSPO、STAG2、STAP2、STX19、SYK、SYNPO2、TADA2A、TAF1、TAF4、TAF5、TBL1X、TBX4、TBX5、TCL1A、TEDDM1、THOC6、TICRR、TLDC2、TMEM169、TMEM68、TMX1、TOR1B、TPP2、TRAPPC6A、TRIP11、TRIP12、TRNAU1AP、TSPAN6、TTC4、TTLL11、TTN、TUBGCP5、TUBGCP6、U2AF2、UBASH3B、UBFD1、UGT8、UHRF1BP1、UNKL、UPF1、UPRT、URGCP、UROC1、USH2A、USP11、USP29、USP40、USP48、USP7、USP8、UTRN、VPS37D、VWF、WASF2、WDR33、WIPI1、WNK1、WNK3、XIRP2、YIPF7、ZAK、ZBP1、ZCCHC24、ZDBF2、ZFHX2、ZMYM2、ZNF334、ZNF417、ZNF507、ZNF578、ZNF616、ZNF674、ZNF846、和ZNHIT2。

[0026] 在另一优选例中，所述调节剂为拮抗剂或激活剂。

[0027] 在另一优选例中，所述拮抗剂抑制所述基因的表达或抑制所述基因表达产物(蛋白)的活性。

[0028] 在另一优选例中，所述激活剂促进所述基因的表达或提高所述基因表达产物(蛋白)的活性。

[0029] 在另一优选例中，所述的各基因具有表1中所示的突变位点。

[0030] 在另一优选例中，所述调节剂包括：小分子化合物、抗体、多肽、siRNA、miRNA等。

[0031] 应理解，在本发明范围内中，本发明的上述各技术特征和在下文(如实施例)中具体描述的各技术特征之间都可以互相组合，从而构成新的或优选的技术方案。限于篇幅，在此不再一一累述。

具体实施方式

[0032] 本发明人通过广泛而深入的研究，获得一类在垂体腺瘤患者体内特异的基因突变，实验结果表明，通过对此类基因突变的检测能够诊断垂体腺瘤患者。本发明还提供了此类突变的基因作为垂体腺瘤治疗靶点的应用。

[0033] 在描述本发明之前，应当理解本发明不限于所述的具体方法和实验条件，因为这类方法和条件可以变动。还应当理解本文所用的术语其目的仅在于描述具体实施方案，并且不意图是限制性的，本发明的范围将仅由所附的权利要求书限制。

[0034] 除非另外定义，否则本文中所用的全部技术与科学术语均具有如本发明所属领域的普通技术人员通常理解的相同含义。如本文所用，在提到具体列举的数值中使用时，术语“约”意指该值可以从列举的值变动不多于1％。例如，如本文所用，表述“约100”包括99和101和之间的全部值(例如，99.1、99.2、99.3、99.4等)。

[0035] 虽然在本发明的实施或测试中可以使用与本发明中所述相似或等价的任何方法和材料，本文在此处例举优选的方法和材料。

[0036] 具体地，本发明人通过对垂体腺瘤患者进行了大样本分析，选取了多个相关基因的突变位点，对这些突变位点进行基因分型、采用生物信息学软件分析两组间等位基因及基因型分布差异，并通过回归分析进一步校正分析，结果发现了一类与垂体腺瘤具有非常显著相关性的基因突变。

[0037] 当存在这些突变位点时，则说明所述样本中含有的突变基因为垂体腺瘤的易感基因或与垂体腺瘤相关联，可能是该疾病的风险位点，或与该疾病的风险位点相关联。通过对突变位点进行基因分型可以对待测个体的垂体腺瘤患病风险进行评估或辅助诊断待测个体是否为垂体腺瘤患者。

[0038] 基因突变

[0039] 基因突变(DNA序列变异，gene mutation)是由于DNA分子中发生碱基对的增添、缺失或替换，而引起的基因结构的改变。

[0040] 基因上发生基因突变的位点即为本文中的突变位点，在突变位点上可以发生碱基的增添、缺失或替换。

[0041] 如“chr11:g.67051695A>C”表示在人第11号染色体上的g.67051695位点由A突变为了C。

[0042] “chr11:g.64577368_64577374(GCGGGTC)>-”表示在人第11号染色体上的g.64577368至64577374位点的GCGGGTC缺失。

[0043] “chr19:g.14938120->T”表示在人第19号染色体上的g.14938120位点增添了碱基T。

[0044] 一类基因突变是SNV，即单核苷酸变异。

[0045] 单核苷酸变异(SNV)

[0046] 单核苷酸变异是人类基因组中的DNA序列变异，在各种生物学和生物医学的应用中获得了越来越多的重要性。SNVs可以用来探索人类种群进化历史、分析法医样品，因此在遗传学中发挥重要作用。药物遗传学利用这些DNA变异来阐明构成不同药物功效或不良事件的基础遗传因素。

[0047] 本发明涉及鉴定特定疾病的单核苷酸变异(SNVs)，其明确鉴定为与垂体腺瘤相关，因此，或者在疾病症状存在之前，可以对这些个体进行干预，例如饮食改变，锻炼和/或药物治疗。鉴定涉及垂体腺瘤的SNVs有助于更好的理解疾病过程，改善诊断试剂和治疗试剂。

[0048] 如本文所用，术语“SNV”是指在个体群体之间不同的人类基因组中特定位置上的单核苷酸变异。在本发明中，SNV可以通过它的名称或通过位于特定序列的位置来确定。如SNV“[G/A]”表示在该序列的该位置的核苷酸碱基(或等位基因)可以是鸟嘌呤或腺嘌呤。

[0049] 如本文所用，INDEL插入缺失标记，指的是两种亲本中在全基因组中的差异，相对另一个亲本而言，其中一个亲本的基因组中有一定数量的核苷酸插入或缺失。

[0050] 如本文所用，本发明公开的核苷酸序列包括所述核苷酸序列的互补序列。另外，术语“SNV”包括在一组等位基因中的任何等位基因。

[0051] 如本文所用，术语“等位基因”是指在定义SNV的核苷酸选择中特定的核苷酸。

[0052] 如本文所用，术语“风险等位基因”是指与垂体腺瘤疾病关联的等位基因。

[0053] 如本文所用，术语“单倍型”是指来自于两个或多个SNVs的具体等位基因的组合。

[0054] 如本文所用，术语“风险状态单倍型”是指与垂体腺瘤疾病相关联的单倍型。

[0055] 各具体基因及其所含的突变位点见表1。如无特殊说明，本发明中基因位点编号依据人类基因组序列(UCSC)hg19版本。

[0056] 含突变位点的多核苷酸

[0057] 本发明还提供了含本发明所述突变位点的多核苷酸。在本发明的一个优选地实施方式中，本发明还提供了含有所述多核苷酸的载体、宿主细胞。

[0058] 如本文所用，术语“多核苷酸”是指任何长度的核苷酸的多态式。多核苷酸可以含有脱氧核糖核苷酸、核糖核苷酸、和/或它们的类似物。多核苷酸可以具有任何三维结构，包括单链、双链和三螺旋分子结构，并且可以执行任何已知或未知的功能。如以下非限制性实施例：基因或基因片段，外显子，内含子，mRNA，tRNA，rRNA，siRNA，核酶，cDNA，重组多核苷酸，质粒，载体，分离的任何序列的DNA，分离的任何序列的RNA，核酸探针，引物。多核苷酸也可以包括经修饰的核酸分子，如甲基化核酸分子和核酸分子类似物。

[0059] 在另一优选例中，所述的多核苷酸本身还可以包括检测所述多核苷酸的检测试剂，包括引物、探针、扩增产物、或质粒。

[0060] 如本文所用，术语“基本分离的”或“分离的”多核苷酸是指基本没有天然的相关序列的多核苷酸。基本上没有是指至少50％、较优地至少70％、更优地至少80％或最优地至少90％不含其它天然相关物质。“分离的多核苷酸”还包括重组的多核苷酸。

[0061] 如本文所用，术语“在严格条件下杂交”意在描述杂交条件，在该条件下，彼此至少60％、65％、70％、75％、80％、85％、90％、95％或98％相同的核苷酸序列典型地彼此保持杂交。这些严格的条件是本领域技术人员已知的并且可以在Current Protocols in Molecular Biology，John Wiley&Sons，N.Y(1989)中找到。严格杂交的一个非限制性实例是在约45℃下在6x 氯化钠/柠檬酸钠(SSC)中杂交，接着在0.2xSSC，0.1％SDS中在50-65℃下一次或多次洗涤。

[0062] 如本文所用，术语“引物”是指在与模板配对，在DNA聚合酶的作用下能以其为起点进行合成与模板互补的DNA链的寡居核苷酸的总称。引物可以是天然的RNA、DNA，也可以是任何形式的天然核苷酸。引物甚至可以是非天然的核苷酸如LNA或ZNA等。引物“大致上”(或“基本上”)与模板上一条链上的一个特殊的序列互补。引物必须与模板上的一条链充分互补才能开始延伸，但引物的序列不必与模板的序列完全互补。比如，在一个3’端与模板互补的引物的5’端加上一段与模板不互补的序列，这样的引物仍大致上与模板互补。只要有足够长的引物能与模板充分的结合，非完全互补的引物也可以与模板形成引物-模板复合物，从而进行扩增。

[0063] 如本文所用，术语“载体”是指可以携带插入的DNA并且可以为维持在宿主细胞中的DNA分子。载体也可以为克隆载体，克隆媒介物等。术语“载体”包括主要功能为将核酸分子插入到细胞中的载体，主要功能在于复制核酸的复制载体，和用于转录和/或翻译DNA或RNA的表达载体，还包括提供多余一种上述功能的载体。

[0064] 如本文所用，术语“宿主细胞”是指单个细胞或细胞培养物，其可以是或已经是载体或核酸分子和/或蛋白质整合的接受体。宿主细胞包括单一宿主细胞的子代，并且由于天然的、随机的或有意突变，所述子代可能未必与亲代完全相同(在形态上或在总DNA互补序列上)。宿主细胞包括用本发明的多核苷酸转染的细胞。“分离的宿主细胞”是指已经与它来源的生物在物理上分离的宿主细胞。

[0065] 宿主细胞可以是原核细胞，如细菌细胞；或是低等真核细胞，如酵母细胞；或是高等真核细胞，如哺乳动物细胞。代表性例子有：大肠杆菌，链霉菌属的细菌细胞；真菌细胞如酵母；植物细胞；昆虫细胞；动物细胞等。

[0066] 用重组DNA转化宿主细胞可用本领域技术人员熟知的常规技术进行。当宿主为原核生物如大肠杆菌时，能吸收DNA的感受态细胞可在指数生长期后收获，用CaCl2法处理，所用的步骤在本领域众所周知。另一种方法是使用MgCl2。如果需要，转化也可用电穿孔的方法进行。当宿主是真核生物，可选用如下的DNA转染方法：磷酸钙共沉淀法，常规机械方法如显微注射、电穿孔、脂质体包装等。

[0067] 试剂盒及其用途

[0068] 本发明还包括可用于检测垂体腺瘤或其易感性的试剂盒，所述的试剂盒中可包括特异性扩增含突变位点的扩增产物的引物。更优选的，它还含有选自下组的试剂：(a)与突变位点结合的探针；(b)识别突变位点的限制性内切酶。

[0069] 应理解，在本发明首次揭示了本发明突变位点与垂体腺瘤的相关性之后，本领域技术人员可以方便地设计出可特异性扩增出含所述突变位点的扩增产物，然后通过测序等方法确定是否存在这些突变位点。

[0070] 通常，引物的长度为15-50bp，较佳地为20-30bp。虽然引物与模板序列完全互补是优选的，但是本领域技术人员知道，在引物与模板存在一定的不互补(尤其是引物的5’端)的情况下，也能够特异性地扩增(即仅扩增出所需的片段)。含有这些引物的试剂盒和使用这些引物的方法都在本发明范围之内，只要该引物扩增出的扩增产物含有本发明突变位点的对应位置。

[0071] 虽然扩增产物的长度没有特别限制，但是通常扩增产物的长度为100-3000bp，较佳地为150-2000bp，更佳地为200-1000bp。

[0072] 本发明的主要优点在于：

[0073] (1)本发明的首次揭示了一类垂体腺瘤相关的基因突变；

[0074] (2)本发明公开的基因突变和垂体腺瘤之间具有非常高的关联性，因此可以用于垂体腺瘤或其易感性的诊断。

[0075] (3)本发明揭示了一类可作为垂体腺瘤治疗的基因靶点。

[0076] 下面结合具体实施例，进一步详陈本发明。应理解，这些实施例仅用于说明本发明而不用于限制本发明的范围。下列实施例中未注明详细条件的实验方法，通常按照常规条件如美国Sambrook.J等著《分子克隆实验室指南》(黄培堂等译，北京：科学出版社，2002年)中所述的条件，或按照制造厂商所建议的条件。除非另外说明，否则百分比和份数按重量计算。以下实施例中所用的实验材料和试剂如无特别说明均可从市售渠道获得。

[0077] 实施例1

[0078] 本实施例中共选取了华山医院神经外科2010年至2015年确诊的125例垂体腺瘤的病人入组(包括20例无功能型，20例PRL型，20GH型，20例ACTH型，20例GT型，10例TSH型混合型)，对所有7种亚型的病人进行全外显子测序，获得突变基因谱，通过功能预测进行候选基因筛选。每位病人术前均未接受过手术及放疗或药物治疗，每位病人均术前诊断明确并且经术后病理证实。所有入组患者均签署知情同意书，本研究经过华山医院医疗与科研伦理委员会批准同意。

[0079] 经蝶内镜下垂体腺瘤切除术

[0080] 患者明确诊断后，均行经蝶内镜下垂体腺瘤切除术，术前肿瘤定位不明确者，术中均行神经导航定位。全麻成功后，患者取仰卧位，肩下垫枕，头后仰15度，头架固定，导航注册定位，术野常规消毒铺巾。内镜下用肾上腺素收敛双侧鼻粘膜，从蝶窦开口处切开鼻中隔粘膜约1cm，折断骨性鼻中隔推向对侧，暴露蝶窦前壁，咬开蝶窦前壁，形成直径1.5cm骨窗，导航下确定鞍底位置，磨开鞍底骨质，咬开此处形成直径1cm骨窗，电凝十字切开此处鞍底硬膜，根据术前MRI及导航定位探查肿瘤，先剥离肿瘤假包膜，行包膜外切除，尽量完整剥离肿瘤假包膜，达内镜下全切除。同时探查对侧正常垂体组织明确未见瘤灶，明确无脑脊液漏。严密止血后，用明胶海绵填塞瘤腔，人工硬膜封闭鞍底，双鼻腔填塞8cm膨胀海绵，鼻中隔复位。如有术中不明确肿瘤组织者，行术中快速冰冻病理切片明确。

[0081] 术后病理HE及免疫组化染色

[0082] 术中明确的肿瘤样本，部分放置于-80℃超低温冰箱冻存待后续实验，部分直接进行原代培养，余送病理进行HE及免疫组化染色。病理的最终诊断是经两名资深神经病理科医生根据HE染色及免疫组化结果评定完成。免疫组化使用含有90％以上的肿瘤细胞切片。先制备5微米的组织切片，依次放入二甲苯和酒精中进行脱蜡处理。脱蜡后将切片放入含有
3％过氧化氢的甲醇溶液20分钟，用于阻断内源性过氧化物酶(HRP)的活性。经过抗原修复后，将组织切片进行血清封闭，加一抗、二抗进行孵育。洗涤后，将按照ABC染色试剂盒说明书所述(Vector Laboratories公司)对组织切片进行染色，并使用DAB试剂盒(Vector Laboratories公司)检测HRP活性。将切片用苏木精复染，最后脱水封片。

[0083] 全外显子样本制备、测序及结果分析运行软件

[0084] (1)DNA提取

[0085] 对新鲜肿瘤组织或外周血样品，采用Qiagen公司的AllPrep DNA/RNA Mini试剂盒进行DNA提取。对福尔马林固定，石蜡包埋的样品，使用的QIAamp DNA FFPE Tissue试剂盒提取DNA(Qiagen，美国)。在进行DNA文库构建前，通过Qubit dsDNA HS Assay试剂盒与Qubit 2.0荧光计(Life Technologies公司)检测DNA的浓度和纯度。取出部分DNA进行Mass ARRAY分析(Sequenom公司)，与既定48个SNV的基因分型位点进行比对，再次确认肿瘤和对照血样本属同一患者来源。

[0086] (2)DNA文库建立及上机测序

[0087] 对检测合格的样本DNA进行文库制备。用Covaris E-220型超声波发生器(Covaris)将DNA随机打断至大小为200-300bp的片段，并用Agencourt AMPure XP磁珠(Beckman)对片段纯化，洗去杂质和未打碎片段。在片段两端分别连接用于鉴别的barcodes，得到目的片段。对转接连接产物(200-300bp)使用Agencourt AMPure XP珠粒进一步纯化并通过连接介导的聚合酶链式反应(LM-PCR)扩增。将由此产生的产物合并为初始文库。利用Illumina TruSeqTM(62Mb Illumina公司)外显子组富集试剂盒捕获获得的全外显子片段。捕获后的LM-PCR产物使用安捷伦2100生物分析仪(Agilent公司)来评估捕获效率及验证目的片段长度。建库完成的12对ACTH型垂体瘤及配对血样本利用HiSeq2500平台(Illumina公司)进行上机测序。

[0088] (3)结果分析软件及条件

[0089] 刚下机的测序原始数据首先经过FastQC v0.11.2(http://www.bioinf ormatics.bbsrc.ac.uk/projects/fastqc)进行严格的质量控制检查，用Trimmomatic v0.30软件过滤低质量序列。质控过滤后的序列通过BWA v0.7.7软件里的Burrows-Wheeler Aligner 算法(默认参数)与人类基因组序列(UCSC，hg19版本)进行对比，对比后的数据用Picard v1.110MarkDuplicate子程序(http://picard.sourceforge.net)进行去重复过程。然后再运用基因组分析工具包(GATK)v2.8-1的子程序Indel Realignment和
BaseRecalibrator分别对易发生比对错误的Indel区和碱基的质量进行矫正，外周血用来对比肿瘤排除个人germline突变。单核苷酸体细胞突变SNV用MuTect v1.1.5软件进行检测，具体参数设置为：污染率低于10％，最低碱基质量分数为20。体细胞插入缺失突变用VarScan v2.3.6软件来检测突变，默认参数：链过滤，最低碱基质量分数为20，肿瘤纯度
90％，拷贝数异常也用此软件来检测，参数设置为默认。之后的假阳性位点过滤按以下标准：①肿瘤样本和正常血样的最小测序深度都为10层；②肿瘤突变位点的测序深度应大于4层；肿瘤突变位点占的比例超过20％。以上的标准都用Perl脚本编写执行。假阳性过滤后的位点，再用可视化工具结合基因组学查看器(IGV，Broad研究所，剑桥，MA，USA)进行人工逐一检查。最后，所有高质量的突变位点用Annovar software软件注释RefSeq，dbSNV v138，
1000Genomes Project，以及COSMIC database v68等数据库，用于预测编码蛋白序列的改变(比如同义突变、错义突变、无义突变、剪切位点等)以及过滤人类较常见的突变位点。

[0090] 最终确定的突变位点如表1所示。

[0091] 表1

[0092]

[0093]

[0094]

[0095]

[0096]

[0097]

[0098]

[0099]

[0100]

[0101]

[0102]

[0103] 实施例2垂体腺瘤检测试剂盒

[0104] 基于本发明的突变位点与垂体腺瘤之间的相关性，使用本领域的常规方法设计了针对上表1中突变位点的引物，以病人的血液样本的DNA为模板进行扩增并检测。所制备的检测试剂盒中含有上述引物，以及PCR反应液。

[0105] 实施例3垂体腺瘤易感性辅助检测

[0106] 采用实施例2中的试剂盒以及通用方法，随机取500例已知患有垂体腺瘤的患者样本，以及500例未患垂体腺瘤的样本。将两组样本混合，并利用随机双盲的方法，检测所有样本中突变位点的存在情况，并将其与已知患有疾病的样本进行结果比对。

[0107] 检测结果显示有312例样本含有本发明突变位点，而其中277例为来自于患有垂体腺瘤的对象。

[0108] 由此可见，本发明的突变位点与垂体腺瘤有着非常强烈的相关性，而采用该突变位点可以对垂体腺瘤或其易感性进行有效的诊断、预测和评估。

[0109] 在本发明提及的所有文献都在本申请中引用作为参考，就如同每一篇文献被单独引用作为参考那样。此外应理解，在阅读了本发明的上述讲授内容之后，本领域技术人员可以对本发明作各种改动或修改，这些等价形式同样落于本申请所附权利要求书所限定的范围。

标题	发布/更新时间	阅读量
一种靶向TIGIT的miR-206作为肝癌诊断和治疗新型分子的用途	2020-05-14	481
一种靶向SALL4基因的脱氧核酶分子及在乳腺癌基因治疗中的应用	2020-05-14	861
用于癌症靶向治疗的小分子配体-药物轭合物	2020-05-11	918
用于靶向治疗免疫调节的MHC Ib类分子和肽的组合	2020-05-12	798
一种用于治疗分子靶向药物所致皮疹的中药组合物及其用途	2020-05-13	97
提高分子靶向治疗肝细胞癌的敏感性的分析方法	2020-05-13	401
特定基因突变在检测垂体腺瘤的分子诊断和靶向治疗中的应用	2020-05-13	836
提高分子靶向治疗肝细胞癌的敏感性的分析方法	2020-05-13	697
包含至少两个不同靶向实体的定制选择性和多特异性治疗分子的方法及其用途	2020-05-15	455
一种小分子肺癌靶向放射治疗剂及其制备方法	2020-05-11	909