1.一种组合物，包含纯化的细菌混合物，所述细菌混合物包含一种或多种选自下组的物种的细菌菌株：粪考拉杆菌(Phascolarctobacterium faecium)、溃疡梭杆菌(Fusobacterium ulcerans)、多利拟杆菌(Bacteroides dorei)、单形拟杆菌(Bacteroides uniformis)、罕见小球菌属(Subdoligranulum sp.)、帕拉普氏菌X(Paraprevotella xylaniphila)、约氏副拟杆菌(Parabacteroides johnsonii)、别样杆菌属(Alistipes sp.)、戈登副拟杆菌(Parabacteroides gordonii)、粘液真杆菌(Eubacterum limosum)、狄式副拟杆菌(Parabacteroides distasonis)、解纤维素拟杆菌(Bacteroides cellulosilyticus)、克拉氏拟杆菌(Bacteroides clarus)、粪厌氧棒状菌(Anaerostipes caccae)、赛尔氏拟杆菌(Bacteroides  salyersiae)、脆弱拟杆菌(Bacteroides fragilis)、单形拟杆菌(Bacteroides uniformis)、埃氏拟杆菌(Bacteroides eggerthii)、梭菌属(Clostridium sp.)、戈氏副拟杆菌(Parabacteroides goldsteinii)、拟杆菌属(Bacteroides sp.)、毛螺旋菌科细菌HGA0140(Lachnospiraceae bacterium HGA0140)、哈氏厚壁菌(Hungatella hathewayi)、拉瓦梭菌(Clostridium lavalense)、瘤胃球菌属(Ruminococcus sp.)和无害芽胞梭菌(Clostridium innocuum)。
2.如权利要求1所述的组合物，其特征在于，所述纯化的细菌混合物包含至少2种、至少
3种、至少4种、至少5种、至少6种、至少7种、至少8种、至少9种、至少10种、至少11种、至少12种、至少13种、至少14种、至少15种、至少16种、至少17种、至少18种、至少19种、至少20种、至少21种、至少22种、至少23种、至少24种、至少25种或至少26种细菌菌株。
3.一种组合物，包含纯化的细菌混合物，所述细菌混合物包含一种或多种选自下组的物种的细菌菌株：粪考拉杆菌、溃疡梭杆菌、多利拟杆菌、单形拟杆菌、罕见小球菌属、帕拉普氏菌X、约氏副拟杆菌、别样杆菌属、戈登副拟杆菌、粘液真杆菌、狄式副拟杆菌、解纤维素拟杆菌、克拉氏拟杆菌、粪厌氧棒状菌、赛尔氏拟杆菌、脆弱拟杆菌、单形拟杆菌、埃氏拟杆菌、梭菌属、戈氏副拟杆菌和拟杆菌属。
4.如权利要求3所述的组合物，其特征在于，所述纯化的细菌混合物包含至少2种、至少
3种、至少4种、至少5种、至少6种、至少7种、至少8种、至少9种、至少10种、至少11种、至少12种、至少13种、至少14种、至少15种、至少16种、至少17种、至少18种、至少19种、至少20种或至少21种细菌菌株。
5.一种组合物，包含纯化的细菌混合物，所述细菌混合物包含一种或多种选自下组的物种的细菌菌株：粪考拉杆菌、溃疡梭杆菌、多利拟杆菌、单形拟杆菌、罕见小球菌属、帕拉普氏菌X、约氏副拟杆菌、别样杆菌属、戈登副拟杆菌、粘液真杆菌和狄式副拟杆菌。
6.如权利要求5所述的组合物，其特征在于，所述纯化的细菌混合物包含至少2种、至少
3种、至少4种、至少5种、至少6种、至少7种、至少8种、至少9种、至少10种或至少11种细菌菌株。
7.一种组合物，包含纯化的细菌混合物，所述细菌混合物包含一种或多种选自下组的物种的细菌菌株：解纤维素拟杆菌、克拉氏拟杆菌、粪厌氧棒状菌、赛尔氏拟杆菌、脆弱拟杆菌、单形拟杆菌、埃氏拟杆菌、梭菌属、戈氏副拟杆菌、拟杆菌属、毛螺旋菌科细菌HGA0140、哈氏厚壁菌、拉瓦梭菌、瘤胃球菌属和无害芽胞梭菌。
8.如权利要求7所述的组合物，其特征在于，所述纯化的细菌混合物包含至少2种、至少
3种、至少4种、至少5种、至少6种、至少7种、至少8种、至少9种、至少10种、至少11种、至少12种、至少13种、至少14种或至少15种细菌菌株。
9.一种组合物，包含纯化的细菌混合物，所述细菌混合物包含一种或多种选自下组的物种的细菌菌株：解纤维素拟杆菌、克拉氏拟杆菌、粪厌氧棒状菌、赛尔氏拟杆菌、脆弱拟杆菌、单形拟杆菌、埃氏拟杆菌、梭菌属、戈氏副拟杆菌和拟杆菌属。
10.如权利要求9所述的组合物，其特征在于，所述纯化的细菌混合物包含至少2种、至少3种、至少4种、至少5种、至少6种、至少7种、至少8种、至少9种或至少10种细菌菌株。
11.一种组合物，包含纯化的细菌混合物，所述细菌混合物包含一种或多种选自下组的物种的细菌菌株：粪考拉杆菌、溃疡梭杆菌、罕见小球菌属和粘液真杆菌。
12.如权利要求11的组合物，其特征在于，所述纯化的细菌混合物包含至少2种、至少3种或至少4种细菌菌株。
13.一种组合物，包含纯化的细菌混合物，所述细菌混合物包含一种或多种选自下组的物种的细菌菌株：多利拟杆菌、单形拟杆菌、帕拉普氏菌X、约氏副拟杆菌、别样杆菌属、戈登副拟杆菌和狄式副拟杆菌。
14.如权利要求13所述的组合物，其特征在于，所述纯化的细菌混合物包含至少2种、至少3种、至少4种、至少5种、至少6种或至少7种细菌菌株。
15.一种组合物，包含纯化的细菌混合物，所述细菌混合物包含一种或多种细菌菌株，所述细菌菌株包含与SEQ ID NO:1、SEQ ID NO:2、SEQ ID NO:3、SEQ ID NO:4、SEQ ID NO:
5、SEQ ID NO:6、SEQ ID NO:7、SEQ ID NO:8、SEQ ID NO:9、SEQ ID NO:10、SEQ ID NO:11、SEQ ID NO:12、SEQ ID NO:13、SEQ ID NO:14、SEQ ID NO:15、SEQ ID NO:16、SEQ ID NO:
17、SEQ ID NO:18、SEQ ID NO:19、SEQ ID NO:20、SEQ ID NO:21、SEQ ID NO:22、SEQ ID NO:23、SEQ ID NO:24、SEQ ID NO:25或SEQ ID NO:26具有至少95％同源性的16S rDNA序列。
16.如权利要求15所述的组合物，其特征在于，所述纯化的细菌混合物包含至少2种、至少3种、至少4种、至少5种、至少6种、至少7种、至少8种、至少9种、至少10 种、至少11种、至少
12种、至少13种、至少14种、至少15种、至少16种、至少17种、至少18种、至少19种、至少20种、至少21种、至少22种、至少23种、至少24种、至少25种或至少26种细菌菌株。
17.一种组合物，包含纯化的细菌混合物，所述细菌混合物包含一种或多种细菌菌株，所述细菌菌株包含与SEQ ID NO:1、SEQ ID NO:2、SEQ ID NO:3、SEQ ID NO:4、SEQ ID NO:
5、SEQ ID NO:6、SEQ ID NO:7、SEQ ID NO:8、SEQ ID NO:9、SEQ ID NO:10、SEQ ID NO:11、SEQ ID NO:12、SEQ ID NO:13、SEQ ID NO:14、SEQ ID NO:15、SEQ ID NO:16、SEQ ID NO:
17、SEQ ID NO:18、SEQ ID NO:19、SEQ ID NO:20或SEQ ID NO:21具有至少95％同源性的
16S rDNA序列。
18.如权利要求17所述的组合物，其特征在于，所述纯化的细菌混合物包含至少2种、至少3种、至少4种、至少5种、至少6种、至少7种、至少8种、至少9种、至少10种、至少11种、至少
12种、至少13种、至少14种、至少15种、至少16种、至少17种、至少18种、至少19种、至少20种或至少21种细菌菌株。
19.一种组合物，包含纯化的细菌混合物，所述细菌混合物包含一种或多种细菌菌株，所述细菌菌株包含与SEQ ID NO:1、SEQ ID NO:2、SEQ ID NO:3、SEQ ID NO:4、SEQ ID NO:
5、SEQ ID NO:6、SEQ ID NO:7、SEQ ID NO:8、SEQ ID NO:9、SEQ ID NO:10或SEQ ID NO:11具有至少95％同源性的16S rDNA序列。
20.如权利要求19所述的组合物，其特征在于，所述纯化的细菌混合物包含至少2种、至少3种、至少4种、至少5种、至少6种、至少7种、至少8种、至少9种、至少10种或至少11种细菌菌株。
21.一种组合物，包含纯化的细菌混合物，所述细菌混合物包含一种或多种细菌菌株，所述细菌菌株包含与SEQ ID NO:12、SEQ ID NO:13、SEQ ID NO:14、SEQ ID NO:15、SEQ ID NO:16、SEQ ID NO:17、SEQ ID NO:18、SEQ ID NO:19、SEQ ID NO:20、SEQ ID NO:21、SEQ ID NO:22、SEQ ID NO:23、SEQ ID NO:24、SEQ ID NO:25或SEQ ID NO:26具有至少95％同源性的16S rDNA序列。
22.如权利要求21所述的组合物，其特征在于，所述纯化的细菌混合物包含至少2种、至少3种、至少4种、至少5种、至少6种、至少7种、至少8种、至少9种、至少10种、至少11种、至少
12种、至少13种、至少14种或至少15种细菌菌株。
23.一种组合物，包含纯化的细菌混合物，所述细菌混合物包含一种或多种细菌菌株，所述细菌菌株包含与SEQ ID NO:12、SEQ ID NO:13、SEQ ID NO:14、SEQ ID NO:15、SEQ ID NO:16、SEQ ID NO:17、SEQ ID NO:18、SEQ ID NO:19、SEQ ID NO:20或SEQ ID NO:21具有至少95％同源性的16S rDNA序列。
24.如权利要求23所述的组合物，其特征在于，所述纯化的细菌混合物包含至少2种、至少3种、至少4种、至少5种、至少6种、至少7种、至少8种、至少9种或至少10 种细菌菌株。
25.一种组合物，包含纯化的细菌混合物，所述细菌混合物包含一种或多种细菌菌株，所述细菌菌株包含与SEQ ID NO:1、SEQ ID NO:2、SEQ ID NO:5或SEQ ID NO:10具有至少
95％同源性的16S rDNA序列。
26.如权利要求25所述的组合物，其特征在于，所述纯化的细菌混合物包含至少2种、至少3种或至少4种细菌菌株。
27.一种组合物，包含纯化的细菌混合物，所述细菌混合物包含一种或多种细菌菌株，所述细菌菌株包含与SEQ ID NO:3、SEQ ID NO:4、SEQ ID NO:6、SEQ ID NO:7、SEQ ID NO:
8、SEQ ID NO:9或SEQ ID NO:11具有至少95％同源性的16S rDNA序列。
28.如权利要求27所述的组合物，其特征在于，所述纯化的细菌混合物包含至少2种、至少3种、至少4种、至少5种、至少6种或至少7种细菌菌株。
29.一种组合物，包含纯化的细菌混合物，所述细菌混合物包含一种或多种细菌菌株，所述细菌菌株包含与SEQ ID NO:27、SEQ ID NO:28、SEQ ID NO:29、SEQ ID NO:30、SEQ ID NO:31、SEQ ID NO:32、SEQ ID NO:33、SEQ ID NO:34、SEQ ID NO:35、SEQ ID NO:36、SEQ ID NO:37、SEQ ID NO:38、SEQ ID NO:39、SEQ ID NO:40、SEQ ID NO:41、SEQ ID NO:42、SEQ ID NO:43、SEQ ID NO:44、SEQ ID NO:45、SEQ ID NO:46、SEQ ID NO:47、SEQ ID NO:48、SEQ ID NO:49、SEQ ID NO:50、SEQ ID NO:51或SEQ ID NO:52具有至少95％同源性的16S rDNA序列。
30.如权利要求29所述的组合物，其特征在于，所述纯化的细菌混合物包含至少2种、至少3种、至少4种、至少5种、至少6种、至少7种、至少8种、至少9种、至少10种、至少11种、至少
12种、至少13种、至少14种、至少15种、至少16种、至少17种、至少18种、至少19种、至少20种、至少21种、至少22种、至少23种、至少24种、至少25种或至少26种细菌菌株。
31.一种组合物，包含纯化的细菌混合物，所述细菌混合物包含一种或多种细菌菌株，所述细菌菌株包含与SEQ ID NO:27、SEQ ID NO:28、SEQ ID NO:29、SEQ ID NO:30、SEQ ID NO:31、SEQ ID NO:32、SEQ ID NO:33、SEQ ID NO:34、SEQ ID NO:35、SEQ ID NO:36、SEQ ID NO:37、SEQ ID NO:38、SEQ ID NO:39、SEQ ID NO:40、SEQ ID NO:41、SEQ ID NO:42、SEQ ID NO:43、SEQ ID NO:44、SEQ ID NO:45、SEQ ID NO:46和SEQ ID NO:47具有至少95％同源性的16S rDNA序列。
32.如权利要求31所述的组合物，其特征在于，所述纯化的细菌混合物包含至少2种、至少3种、至少4种、至少5种、至少6种、至少7种、至少8种、至少9种、至少10种、至少11种、至少
12种、至少13种、至少14种、至少15种、至少16种、至少17种、至少18种、至少19种、至少20种或至少21种细菌菌株。
33.一种组合物，包含纯化的细菌混合物，所述细菌混合物包含一种或多种细菌菌株，所述细菌菌株包含与SEQ ID NO:27、SEQ ID NO:28、SEQ ID NO:29、SEQ ID NO:30、SEQ ID NO:31、SEQ ID NO:32、SEQ ID NO:33、SEQ ID NO:34、SEQ ID NO:35、SEQ ID NO:36或SEQ ID NO:37具有至少95％同源性的16S rDNA序列。
34.如权利要求33所述的组合物，其特征在于，所述纯化的细菌混合物包含至少2种、至少3种、至少4种、至少5种、至少6种、至少7种、至少8种、至少9种、至少10种或至少11种细菌菌株。
35.一种组合物，包含纯化的细菌混合物，所述细菌混合物包含一种或多种细菌菌株，所述细菌菌株包含与SEQ ID NO:38、SEQ ID NO:39、SEQ ID NO:40、SEQ ID NO:41、SEQ ID NO:42、SEQ ID NO:43、SEQ ID NO:44、SEQ ID NO:45、SEQ ID NO:46、SEQ ID NO:47、SEQ ID NO:48、SEQ ID NO:49、SEQ ID NO:50、SEQ ID NO:51或SEQ ID NO:52具有至少95％同源性的16S rDNA序列。
36.如权利要求35所述的组合物，其特征在于，所述纯化的细菌混合物包含至少2种、至少3种、至少4种、至少5种、至少6种、至少7种、至少8种、至少9种、至少10种、至少11种、至少
12种、至少13种、至少14种或至少15种细菌菌株。
37.一种组合物，包含纯化的细菌混合物，所述细菌混合物包含一种或多种细菌菌株，所述细菌菌株包含与SEQ ID NO:38、SEQ ID NO:39、SEQ ID NO:40、SEQ ID NO:41、SEQ ID NO:42、SEQ ID NO:43、SEQ ID NO:44、SEQ ID NO:45、SEQ ID NO:46或SEQ ID NO:47具有至少95％同源性的16S rDNA序列。
38.如权利要求37所述的组合物，其特征在于，所述纯化的细菌混合物包含至少2种、至少3种、至少4种、至少5种、至少6种、至少7种、至少8种、至少9种或至少10种细菌菌株。
39.一种组合物，包含纯化的细菌混合物，所述细菌混合物包含一种或多种细菌菌株，所述细菌菌株包含与SEQ ID NO:27、SEQ ID NO:28、SEQ ID NO:31或SEQ ID NO:36具有至少95％同源性的16S rDNA序列。
40.如权利要求39所述的组合物，其特征在于，所述纯化的细菌混合物包含至少2种、至少3种或至少4种细菌菌株。
41.一种组合物，包含纯化的细菌混合物，所述细菌混合物包含一种或多种细菌菌株，所述细菌菌株包含与SEQ ID NO:29、SEQ ID NO:30、SEQ ID NO:32、SEQ ID NO:33、SEQ ID NO:34、SEQ ID NO:35或SEQ ID NO:37具有至少95％同源性的16S rDNA序列。
42.如权利要求41所述的组合物，其特征在于，所述纯化的细菌混合物包含至少2种、至少3种、至少4种、至少5种、至少6种或至少7种细菌菌株。
43.如前述权利要求中任一项所述的组合物，其特征在于，所述一种或多种细菌菌株包含与所述SEQ ID NOs具有至少96％、至少97％、至少98％或至少99％同源性的16S rDNA序列。
44.如前述权利要求中任一项所述的组合物，其特征在于，至少50％的细菌菌株属于拟杆菌目。
45.如前述权利要求中任一项所述的组合物，其特征在于，所述一种或多种细菌菌株属于拟杆菌目，且一种或多种细菌菌株属于梭菌目。
46.如前述权利要求中任一项所述的组合物，其特征在于，至少25％的细菌菌株属于拟杆菌科。
47.如前述权利要求中任一项所述的组合物，其特征在于，一种或多种细菌菌株属于拟杆菌属。
48.如前述权利要求中任一项所述的组合物，其特征在于，所述组合物不包括属于拟杆菌目的细菌菌株。
49.如前述权利要求中任一项所述的组合物，其特征在于，一种或多种细菌菌株是孢子形成剂。
50.如前述权利要求中任一项所述的组合物，其特征在于，一种或多种细菌菌株是孢子形式。
51.如前述权利要求中任一项所述的组合物，其特征在于，所述组合物仅包含专性厌氧细菌菌株。
52.如前述权利要求中任一项所述的组合物，其特征在于，一种或多种细菌菌株不具有抗生素抗性基因。
53.如前述权利要求中任一项所述的组合物，其特征在于，所述抗生素抗性基因使所述细菌菌株对万古霉素具有抗性。
54.如前述权利要求中任一项所述的组合物，其特征在于，所述细菌菌株是人源细菌。
55.如前述权利要求中任一项所述的组合物，其特征在于，所述细菌菌株衍生自一种以上的人供体。
56.如前述权利要求中任一项所述的组合物，其特征在于，所述组合物诱导CD8+T细胞的增殖和/或积累。
57.如前述权利要求中任一项所述的组合物，其特征在于，所述组合物是药物组合物。
58.如前述权利要求中任一项所述的药物组合物，其特征在于，所述药物组合物包含药学上可接受的赋形剂。
59.如前述权利要求中任一项所述的药物组合物，其特征在于，所述药物组合物配制用于口服给药。
60.如前述权利要求中任一项所述的药物组合物，其特征在于，所述药物组合物配制用于直肠给药。
61.如前述权利要求中任一项所述的药物组合物，其特征在于，所述药物组合物配制用于递送至肠。
62.如前述权利要求中任一项所述的药物组合物，其特征在于，所述药物组合物配制用于递送至结肠。
63.如前述权利要求中任一项所述的药物组合物，其特征在于，一种或多种细菌菌株是冻干的。
64.如前述权利要求中任一项所述的药物组合物，其特征在于，所述药物组合物为胶囊形式。
65.如前述权利要求中任一项所述的药物组合物，其特征在于，所述药物组合物还包含pH敏感组合物，其包含一种或多种肠溶聚合物。
66.一种食品，包含前述权利要求中任一项所述的组合物和营养物。
67.如前述权利要求中任一项所述的组合物，其特征在于，所述组合物还包含一种或多种抗癌剂。
68.如前述权利要求中任一项所述的组合物，其特征在于，所述抗癌剂是化学治疗剂。
69.如前述权利要求中任一项所述的组合物，其特征在于，所述抗癌剂是癌症免疫治疗剂。
70.如前述权利要求中任一项所述的组合物，其特征在于，所述癌症免疫治疗剂是免疫检查点抑制剂。
71.如前述权利要求中任一项所述的组合物，其特征在于，所述免疫检查点抑制剂是PD-1抑制剂、PD-L-1抑制剂或CTLA-4抑制剂。
72.如前述权利要求中任一项所述的组合物，其特征在于，所述免疫检查点抑制剂是PD-1抑制剂。
73.如前述权利要求中任一项所述的组合物，其特征在于，所述免疫检查点抑制剂是CTLA-4抑制剂。
74.如前述权利要求中任一项所述的组合物，其特征在于，所述组合物还包含一种或多种细胞因子。
75.如前述权利要求中任一项所述的组合物，其特征在于，所述细胞因子是IL-2、IL-15或IL-21。
76.如前述权利要求中任一项所述的组合物，其特征在于，所述组合物还包含一种或多种共刺激剂。
77.如前述权利要求中任一项所述的组合物，其特征在于，所述共刺激剂是CD-28、OX-
40、4-1BB或CD40抗体。
78.如前述权利要求中任一项所述的组合物，其特征在于，所述组合物还包含一种或多种疫苗。
79.如前述权利要求中任一项所述的组合物，其特征在于，所述疫苗是树突细胞疫苗。
80.如前述权利要求中任一项所述的组合物，其特征在于，所述组合物与过继性细胞转移疗法组合。
81.如前述权利要求中任一项所述的组合物，其特征在于，所述过继性细胞转移疗法是使用工程化T细胞受体或嵌合抗原受体。
82.一种疫苗，包含前述权利要求中任一项所述的组合物和抗原。
83.如前述权利要求中任一项所述的疫苗，其特征在于，所述抗原是HIV抗原。
84.如前述权利要求中任一项所述的疫苗，其特征在于，所述抗原是肝炎抗原。
85.如前述权利要求中任一项所述的组合物，其特征在于，所述组合物还包含一种或多种抗炎剂。
86.如前述权利要求中任一项所述的组合物，其特征在于，所述抗炎剂是NSAID。
87.如前述权利要求中任一项所述的组合物，其特征在于，将所述组合物施用于受试者导致在所述受试者肠道中诱导CD8+T细胞的增殖和/或积累。
88.如前述权利要求中任一项所述的组合物，其特征在于，将所述组合物施用于受试者导致所述受试者肠道中IFNγ-γ产生的增加。
89.如前述权利要求中任一项所述的组合物，其特征在于，将所述组合物施用于受试者导致所述受试者肠道中存在施用的组合物的一种或多种细菌菌株。
90.如前述权利要求中任一项所述的组合物，其特征在于，施用的组合物的一种或多种细菌菌株先前未存在于所述受试者肠道中。
91.如前述权利要求中任一项所述的组合物，其特征在于，将所述组合物施用于受试者导致施用的组合物的一种或多种细菌菌株植入所述受试者肠道。
92.如前述权利要求中任一项所述的组合物，其特征在于，施用的组合物的一种或多种细菌菌株先前未植入所述受试者肠道。
93.如前述权利要求中任一项所述的组合物，其特征在于，将所述组合物施用于受试者导致所述受试者肠道中施用的组合物的细菌菌株的数量增加。
94.如前述权利要求中任一项所述的组合物，其特征在于，将所述组合物施用于受试者导致植入受试者肠道中的施用的组合物的细菌菌株的数量增加。
95.如前述权利要求中任一项所述的组合物，其特征在于，将所述组合物施用于受试者导致所述受试者肠道中施用的组合物的细菌菌株的量增加。
96.如前述权利要求中任一项所述的组合物，其特征在于，将所述组合物施用于受试者导致植入受试者肠道中的施用的组合物的细菌菌株的量增加。
97.一种治疗受试者疾病的方法，该方法包括以有效量将前述权利要求中任一项所述的组合物施用于受试者以治疗该疾病。
98.如权利要求97所述的方法，其特征在于，将所述组合物施用于受试者导致在受试者肠道中诱导CD8+T细胞的增殖和/或积累。
99.如前述权利要求中任一项所述的方法，其特征在于，与施用组合物前受试者肠道中CD8+T细胞的增殖和/或积聚相比，受试者肠道中CD8+T细胞的增殖和/或积累增加至少
10％、至少20％、至少30％、至少40％、至少50％、至少100％或至少200％。
100.如前述权利要求中任一项所述的方法，其特征在于，与施用组合物前受试者肠道中IFNγ-γ产生相比，将所述组合物施用于受试者导致受试者肠道中IFNγ-γ产生的增加。
101.如前述权利要求中任一项所述的方法，其特征在于，与施用组合物前受试者肠道中IFNγ-γ产生相比，将所述组合物施用于受试者导致受试者肠道中IFNγ-γ产生增加至少10％、至少20％、至少30％、至少40％、至少50％、至少100％或至少200％。
102.如前述权利要求中任一项所述的方法，其特征在于，所述受试者患有癌症。
103.如前述权利要求中任一项所述的方法，其特征在于，所述癌症是恶性肿瘤、神经胶质瘤、间皮瘤、黑色素瘤、淋巴瘤、白血病、腺癌、乳腺癌、卵巢癌、宫颈癌、成胶质细胞瘤、多发性骨髓瘤、前列腺癌、伯基特淋巴瘤、头颈癌、结肠癌、结直肠癌、非小细胞肺癌、小细胞肺癌、食道癌、胃癌、胰腺癌、肝胆癌、胆囊癌、小肠癌、直肠癌、肾癌、膀胱癌、前列腺癌、阴茎癌、尿道癌、睾丸癌、阴道癌、子宫癌、甲状腺癌、甲状旁腺癌、肾上腺癌、胰腺内分泌癌、类癌、骨癌、皮肤癌、视网膜母细胞瘤、霍奇金淋巴瘤、非霍奇金淋巴瘤、卡波西氏肉瘤、多中心卡斯特曼氏病、AIDS相关原发渗出性淋巴瘤、神经外胚层肿瘤或横纹肌肉瘤。
104.如前述权利要求中任一项所述的方法，其特征在于，所述癌症是前列腺癌、膀胱癌、非小细胞肺癌、尿路上皮癌、黑色素瘤或肾细胞癌。
105.如前述权利要求中任一项所述的方法，其特征在于，所述受试者正在进行放射治疗。
106.如前述权利要求中任一项所述的方法，还包括施用一种或多种抗癌剂。
107.如前述权利要求中任一项所述的方法，其特征在于，所述抗癌剂是化学治疗剂。
108.如前述权利要求中任一项所述的方法，其特征在于，所述抗癌剂是癌症免疫治疗剂。
109.如前述权利要求中任一项所述的方法，其特征在于，所述癌症免疫治疗剂是免疫检查点抑制剂。
110.如前述权利要求中任一项所述的方法，其特征在于，所述免疫检查点抑制剂是PD-
1抑制剂、PD-L-1抑制剂或CTLA-4抑制剂。
111.如前述权利要求中任一项所述的方法，其特征在于，所述免疫检查点抑制剂是PD-
1抑制剂。
112.如前述权利要求中任一项所述的方法，其特征在于，所述免疫检查点抑制剂是CTLA-4抑制剂。
113.如前述权利要求中任一项所述的方法，还包括施用一种或多种细胞因子。
114.如前述权利要求中任一项所述的方法，其特征在于，所述细胞因子是IL-2、IL-15或IL-21。
115.如前述权利要求中任一项所述的方法，还包括施用一种或多种共刺激剂。
116.如前述权利要求中任一项所述的方法，其特征在于，所述共刺激剂是CD-28、OX-
40、4-1BB或CD40抗体。
117.如前述权利要求中任一项所述的方法，还包括施用一种或多种疫苗。
118.如前述权利要求中任一项所述的方法，其特征在于，所述疫苗是树突细胞疫苗。
119.如前述权利要求中任一项所述的方法，还包括施用过继性细胞转移疗法。
120.如前述权利要求中任一项所述的方法，其特征在于，所述过继性细胞转移疗法是使用工程化T细胞受体或嵌合抗原受体。
121.如前述权利要求中任一项所述的方法，其特征在于，所述受试者患有传染病。
122.如前述权利要求中任一项所述的方法，其特征在于，所述传染病是细菌感染、病毒感染、寄生虫感染或真菌感染。
123.如前述权利要求中任一项所述的方法，其特征在于，所述传染病是病毒感染。
124.如前述权利要求中任一项所述的方法，其特征在于，所述病毒感染是HIV。
125.如前述权利要求中任一项所述的方法，其特征在于，所述受试者患有自身免疫疾病或过敏性疾病。
126.如前述权利要求中任一项所述的方法，其特征在于，所述组合物还包含一种或多种抗炎剂。
127.如前述权利要求中任一项所述的方法，其特征在于，所述抗炎剂是NSAID。
128.如前述权利要求中任一项所述的方法，其特征在于，所述组合物以一个以上剂量施用。
129.一种方法，该方法包括：
确定前述权利要求中任一项所述的组合物中的一种或多种细菌物种是否存在于受试者的肠中，
其中，如果小于100％、小于90％、小于80％、小于70％、小于60％、小于50％、小于40％、小于30％、小于20％、小于10％细菌物种存在，或者不存在细菌物种，将组合物施用于受试者。
130.一种试剂盒，用于实施权利要求129所述的伴随诊断方法，包括确定前述权利要求中任一项所述的组合物中的一种或多种细菌物种是否存在于受试者肠道中。
131.如权利要求130所述的方法，其特征在于，所述癌症治疗是癌症免疫治疗。
132.如前述权利要求中任一项所述的方法，其特征在于，所述受试者正在经历或将要经历癌症治疗。
133.一种用于确定预计受试者是否对癌症治疗呈积极反应的方法，该方法包括：
确定前述权利要求中任一项所述的组合物中的一种或多种细菌物种是否存在于受试者的肠中，
其中，如果小于100％、小于90％、小于80％、小于70％、小于60％、小于50％、小于40％、小于30％、小于20％、小于10％细菌物种存在，或者没有细菌物种存在，预计受试者不会对癌症治疗产生积极反应。
134.一种降低受试者中病毒感染风险的方法，该方法包括确定前述权利要求中任一项所述的组合物中的一种或多种细菌物种是否存在于受试者的肠道中，
其中，如果小于100％、小于90％、小于80％、小于70％、小于60％、小于50％、小于40％、小于30％、小于20％、小于10％细菌物种存在，或者没有细菌物种存在，则将组合物施用于受试者，从而降低受试者中病毒感染的风险。
135.如前述权利要求中任一项所述的方法，其特征在于，通过测序受试者的粪便物质来确定一种或多种细菌物种的存在。
136.如前述权利要求中任一项所述的方法，其特征在于，通过测序受试者的粪便物质的16S rDNA序列来确定一种或多种细菌物种的存在。
137.一种组合物，包含纯化的细菌混合物，所述细菌混合物包含一种或多种细菌菌株，所述细菌菌株包含与下列NCBI登录号的序列具有至少95％同源性的16S rDNA序列：
LN998073、KR822463、CP011531、NR_112945、NZ-ACWW00000000、AB331897、AB261128、NZ-CAEG00000000、AB470343、AB595134、HE974920、NR_112933、AB490801、NZ-ACWB00000000、AY608696、CR626927、AB247141、NR_112935、AB249652、NR_113076或AF139525。
138.如权利要求137所述的组合物，其特征在于，所述纯化的细菌混合物至少包含至少
2种、至少3种、至少4种、至少5种、至少6种、至少7种、至少8种、至少9种、至少10种、至少11种、至少12种、至少13种、至少14种、至少15种、至少16种、至少17种、至少18种、至少19种、至少20种或至少21种细菌菌株。
139.如权利要求137或138所述的组合物，其特征在于，所述一种或多种细菌菌株包含与所述登录号的序列具有至少96％、至少97％、至少98％或至少99％同源性的16S rDNA序列。
140.一种诱导或激活产生CD8+IFNγ的T细胞的组合物，该组合物包含：
从人粪便中收集的一种或多种纯化的细菌菌株，其具有对氨苄青霉素的抗性；或(i)的培养上清液。
141.如权利要求140所述的组合物，其特征在于，所述组合物包含纯化的细菌混合物，所述细菌混合物包含：
(a)属于选自下组的物种的一种或多种细菌菌株：
粪考拉杆菌，LN998073；
溃疡梭杆菌，KR822463；
多利拟杆菌，CP011531；
单形拟杆菌，NR_112945；
罕见小球菌属4_3_54A2FAA，NZ-ACWW00000000；
帕拉普氏菌X，AB331897；
约氏副拟杆菌，AB261128；
别样杆菌属JC136，NZ-CAEG00000000；
戈登副拟杆菌，AB470343；
粘液真杆菌，AB595134；
狄式副拟杆菌，HE974920；
解纤维素拟杆菌，NR_112933；
克拉氏拟杆菌，AB490801；
厌氧棒状菌属(Anaerostipes sp.)3_2_56FAA，NZ-ACWB00000000；
赛尔氏拟杆菌，AY608696；
脆弱拟杆菌，CR626927；
单形拟杆菌，AB247141；
埃氏拟杆菌，NR_112935；
梭菌属TM-40，AB249652；
戈氏副拟杆菌，NR_113076，和
拟杆菌属AR29，AF139525，或
(b)一种或多种细菌菌株，其包含与选自下组的物种的16S rRNA序列具有至少97％同源性的16S rRNA序列：
粪考拉杆菌，LN998073；
溃疡梭杆菌，KR822463；
多利拟杆菌，CP011531；
单形拟杆菌，NR_112945；
罕见小球菌属4_3_54A2FAA，NZ-ACWW00000000；
帕拉普氏菌X，AB331897；
约氏副拟杆菌，AB261128；
别样杆菌属JC136，NZ-CAEG00000000；
戈登副拟杆菌，AB470343；
粘液真杆菌，AB595134；
狄式副拟杆菌，HE974920；
解纤维素拟杆菌，NR_112933；
克拉氏拟杆菌，AB490801；
厌氧棒状菌属3_2_56FAA，NZ-ACWB00000000；
赛尔氏拟杆菌，AY608696；
脆弱拟杆菌，CR626927；
单形拟杆菌，AB247141；
埃氏拟杆菌，NR_112935；
梭菌属TM-40，AB249652；
戈氏副拟杆菌，NR_113076，和
拟杆菌属AR29，AF139525。
142.如权利要求140所述的组合物，其特征在于，所述组合物包含纯化的细菌混合物，其包含：
(a)属于选自下组的物种的一种或多种细菌菌株：
粪考拉杆菌，LN998073
溃疡梭杆菌，KR822463；
多利拟杆菌，CP011531；
单形拟杆菌，NR_112945；
罕见小球菌属4_3_54A2FAA，NZ-ACWW00000000；
帕拉普氏菌X，AB331897；
约氏副拟杆菌，AB261128；
别样杆菌属JC136，NZ-CAEG00000000；
戈登副拟杆菌，AB470343；
粘液真杆菌，AB595134，和
狄式副拟杆菌，HE974920，或
(b)一种或多种细菌菌株，其包含与属于下组的物种的16S rRNA序列具有至少97％同源性的16S rRNA序列：
粪考拉杆菌，LN998073；
溃疡梭杆菌，KR822463；
多利拟杆菌，CP011531；
单形拟杆菌，NR_112945；
罕见小球菌属4_3_54A2FAA，NZ-ACWW00000000；
帕拉普氏菌X，AB331897；
约氏副拟杆菌，AB261128；
别样杆菌属JC136，NZ-CAEG00000000；
戈登副拟杆菌，AB470343；
粘液真杆菌，AB595134，和
狄式副拟杆菌，HE974920。
143.如权利要求140-142中任一项所述的组合物，其特征在于，所述产生CD8+IFNγ的T细胞表达CD103或粒酶B。
144.如权利要求140-143中任一项所述的组合物，其特征在于，所述组合物激活免疫系统。
145.一种激活免疫系统的方法，该方法包括给受试者施用权利要求140-144中任一项所述的组合物。
146.一种激活产生CD8+IFNγ-γ的T细胞的方法，该方法包括给受试者施用权利要求
140-144中任一项所述的组合物。
147.一种诱导肠道中CD8+T细胞增殖和/或积累的方法，该方法包括给受试者施用权利要求140-144中任一项所述的组合物，其中，所述施用导致受试者肠道中诱导CD8+T细胞的增殖和/或积累。
148.一种治疗、辅助治疗和/或预防癌症或病毒感染的方法，该方法包括给受试者施用权利要求140-143中任一项所述的组合物，其中，所述施用导致治疗、辅助治疗和/或预防癌症或病毒感染。
149.一种疫苗组合物，含有衍生自权利要求140-144中任一项所述的组合物的细菌物种的成分和/或代谢物的抗原。
150.一种在受试者中诱导免疫应答的方法，该方法包括给受试者施用权利要求149所述的疫苗组合物，其中，所述施用导致诱导受试者免疫应答。
151.一种组合物，包含对权利要求140-144中任一项所述的组合物的任何细菌物种具有抗菌活性的化学物质，或结合权利要求140-144中任一项所述的组合物的任何细菌物种分泌的生理活性物质的化学物质。
152.一种抑制受试者中产生CD8+和IFNγ的T细胞的方法，该方法包括给受试者施用权利要求151所述的组合物。
153.一种预防、治疗或改善由受试者产生CD8+和IFNγ的T细胞的过度活化引起的疾病的方法，该方法包括给受试者施用权利要求151所述的组合物。
154.一种生理活性物质，其衍生自权利要求140-144中任一项所述的细菌物种。
155.一种如权利要求140-144中任一项所述的任一种细菌物种的细菌特异性抗原。
156.一种抗体，其特异性结合权利要求140-144中任一项所述的任一种细菌物种。
157.一种多核苷酸，用于检测权利要求140-144中任一项所述的任一种细菌物种的细菌特异性核苷酸序列。
158.一种动物模型，包含非人哺乳动物，其中所述非人哺乳动物的肠道已经接种权利要求140-144中任一项所述的细菌物种。
159.如权利要求158所述的动物模型，其特征在于，所述非人哺乳动物患有由产生CD8+IFNγ的T细胞的不规则性引起的疾病。
160.一种用于评估产生CD8+IFNγ的T细胞的活化的试剂盒，该试剂盒包括：肠上皮细胞，外周血单核细胞和权利要求140-144中任一项所述的细菌物种。
161.一种筛选源自人肠道细菌或细菌的生理活性物质的方法，其中所述物质诱导肠道中产生CD8+IFNγ的T细胞的活化，所述方法包括：
i允许非人类无菌动物摄取源自人体肠道细菌或细菌的生理活性物质；
ii检测非人无菌动物肠道中产生CD8+IFNγ的T细胞的数量或活性，
其中，如果检测到产生CD8+IFNγ的T细胞的活化，则将生理活性物质鉴定为能够激活产生CD8+IFNγ的T细胞。
162.一种筛选源自人肠道细菌或细菌的生理活性物质的方法，其中所述物质诱导肠道中产生CD8+IFNγ的T细胞的增殖或活化，所述方法包括：
将源自人肠道细菌或细菌的生理活性物质加入到包含肠上皮细胞和外周血单核细胞的系统中的肠上皮细胞；
检测所述系统中产生CD8+IFNγ的T细胞的数量或活性，
其中，如果检测到产生CD8+IFNγ的T细胞的活化，则生理活性物质被鉴定为能够激活产生CD8+IFNγ的T细胞的物质。
163.一种筛选诱导肠道中产生CD8+IFNγ的T细胞的活化的物质的方法，所述方法包括：
i将来源于细菌或包含在权利要求140-144中任一项所述的组合物中的细菌的生理活性物质加入到含有肠上皮细胞和外周血单核细胞的系统中；
ii添加测试物质；
iii检测所述系统中产生CD8+IFNγ的T细胞的数量或活性，
其中，如果检测到的产生CD8+IFNγ的T细胞的数量或活性增加，则将测试物质鉴定为诱导产生CD8+IFNγ的T细胞的活化的物质。
164.一种筛选诱导肠道中产生CD8+IFNγ的T细胞的活化的物质的方法，所述方法包括：
i将测试物质加至权利要求159所述的非人动物；
ii检测所述非人动物肠道中产生CD8+IFNγ的T细胞的数量或活性，
其中，如果在以上步骤中检测到的产生CD8+IFNγ的T细胞的数量或活性增加，则将测试物质鉴定为诱导产生CD8+IFNγ的T细胞的活化的物质。
165.一种用于刺激免疫的组合物，该组合物包含：作为活性成分的人肠细菌或源自通过权利要求161-164中任一项的筛选方法获得的细菌的生理活性物质。
166.如权利要求165所述的组合物，其特征在于，所述组合物诱导产生CD8+IFNγ的T细胞的活化。
167.一种疫苗组合物，包含作为活性成分的通过权利要求161-164中任一项所述的筛选方法获得的一种或多种人肠细菌，或对所述一种或多种人肠细菌特异的一种或多种抗原。
168.一种筛选具有诱导或加剧由产生CD8+IFNγ的T细胞引起的疾病的活性的物质的方法，所述方法包括：
允许测试物质被权利要求158所述的非人动物摄取；
检测所述非人动物中由产生CD8+IFNγ的T细胞引起的疾病相关损伤程度，
其中，当与未添加化合物或安慰剂时相比在以上步骤中检测到的损伤程度增加时，将测试物质鉴定为诱导由产生CD8+IFNγ的T细胞引起的疾病的物质。
169.一种用于诱导或加剧由产生CD8+IFNγ的T细胞引起的疾病的组合物，其特征在于，所述组合物包含通过权利要求168所述的筛选方法获得的物质作为活性成分。
170.一种包含经处理的人粪便样品的组合物，其中通过使人粪便样品与有效量的氨苄青霉素接触获得经处理的人粪便样品，并且其中经处理的人粪便样品诱导CD8+T细胞的增殖和/或积累。
171.一种治疗受试者疾病的方法，该方法包括给受试者施用有效量的权利要求170所述的组合物以治疗受试者的疾病。
172.如权利要求171所述的方法，其特征在于，所述疾病是癌症或感染。
173.一种用于确定人粪便样品是否诱导CD8+T细胞增殖和/或积累的方法，该方法包括：
用人粪便样品接种无菌小鼠；和
确定人粪便样品是否诱导无菌小鼠中CD8+T细胞的增殖和/或积累。
174.一种鉴定人粪便供体的方法，该方法包括：
用人受试者的粪便样品接种无菌小鼠；和
确定粪便样品是否诱导CD8+T细胞的增殖和/或积累，其中如果粪便样品诱导CD8+T细胞的增殖和/或积累，人受试者被鉴定为人粪便供体。
175.一种分析受试者淋巴细胞中标志物表达水平的方法，该方法包括：
分析标志物的表达水平，其中通过向受试者施用权利要求140-144中任一项所述的组合物诱导该标志物，其中所述标志物CD44、gp70 MC38肽(KSPWFTTL；(SEQ ID NO：53))-特异性TCRβ、肿瘤抗原衍生的配体特异性TCRβ、CD8、IFNγ和/或GzmB。
176.一种用于分析诱导后受试者淋巴细胞中标志物表达水平的试剂盒，其中通过向受试者施用权利要求140-144中任一项所述的组合物诱导所述标志物，其中所述标志物是CD44、gp70 MC38肽(KSPWFTTL；(SEQ ID NO：53))-特异性TCRβ、肿瘤抗原衍生的配体特异性TCRβ、CD8、IFNγ和/或GzmB。
177.一种筛选源自人肠道细菌或细菌的生理活性物质的方法，该方法包括：
允许携带肿瘤的非人动物摄取源自人肠道细菌或细菌的生理活性物质；
检测从携带肿瘤的非人动物分离的淋巴细胞中标记物的表达，
其中，如果检测到标记物表达水平的增加，则生理活性物质被鉴定为肿瘤的免疫刺激剂；和
其中，所述标记物是CD44、gp70 MC38肽(KSPWFTTL；(SEQ ID NO：53))-特异性TCRβ、肿瘤抗原衍生的配体特异性TCRβ、CD8、IFNγ和/或GzmB。
178.一种用免疫检查点抑制剂进行肿瘤治疗的伴随诊断方法，该方法包括:
在有或没有免疫检查点抑制剂共同施用的情况下通过将权利要求140-144中任一项所述的组合物施用于受试者，在诱导前后分析淋巴细胞中标记物的表达水平，
其中，如果与施用组合物之前相比，受试者淋巴细胞中标记物的表达水平增加至少
10％、至少20％、至少30％、至少40％、至少50％、至少100与或至少200％，共同施用权利要求140-144中任一项所述的组合物及抑制剂，继续治疗，
其中，如果与受试者的淋巴细胞中的表达水平相比，受试者的淋巴细胞中的表达水平没有增加，则中断共同施用抑制剂和权利要求140-144中任一项所述的组合物，或者在重复将权利要求140-144中任一项所述的组合物施用于受试者后重新分析。
179.如权利要求175、177或178中任一项所述的方法，还包括用结合肿瘤抗原衍生的配体特异性TCRβ的特异性抗体或结合肿瘤抗原衍生的配体特异性TCRβ的MHC多聚体分析淋巴细胞中肿瘤抗原衍生的配体特异性TCRβ的表达水平。
180.如权利要求179所述的方法用于采用免疫检查点抑制剂的肿瘤治疗，其中所述免疫检查点抑制剂是PD-1抑制剂、PD-L1抑制剂或CTLA-4抑制剂。
181.如权利要求179所述的方法，还包括评估受试者T细胞中的PD-1表达。
182.如权利要求179所述的方法，还包括评估受试者癌细胞中的PD-L1表达。
183.如权利要求179所述的方法，还包括评估受试者T细胞中的CTLA-4表达。
184.一种试剂盒，包含权利要求177-183中任一项所述的伴随诊断，其中所述试剂盒包含用于监测淋巴细胞中标志物表达水平的一种或多种分子，其中所述标志物是CD44、gp70 MC38肽(KSPWFTTL；(SEQ ID NO：NO：53))-特异性TCRβ、肿瘤抗原衍生的配体特异性TCRβ、CD8、IFNγ和/或GzmB。
185.一种用脾细胞中IFNγ产生程度评估免疫激活的方法，该方法包括给受试者施用权利要求140-144中任一项所述的组合物。
186.一种用脾细胞中IFNγ产生程度评估免疫激活的的试剂盒，该试剂盒包含：
一种或多种IFNγ标记物分子和权利要求140-144中任一项所述的一种或多种细菌物种。
187.一种通过筛选人肠道细菌或源自人肠道细菌的生理活性物质鉴定肿瘤免疫刺激剂的方法，该方法包括：
(i)允许携带肿瘤的非人动物摄取人肠道细菌或来自人肠道细菌的生理活性物质；和(ii)检测从携带肿瘤的非人动物分离的脾细胞中的IFNγ，
其中如果检测到IFNγ的诱导，则将人肠道细菌或生理活性物质鉴定为用于肿瘤的免疫刺激剂。
188.一种用免疫检查点抑制剂进行肿瘤治疗的伴随诊断方法，该方法包括：
在有或没有抑制剂共同施用的情况下通过将权利要求140-144中任一项所述的组合物施用于受试者，在诱导前后用脾细胞中IFNγ产生程度评估免疫激活，
其中，如果与施用组合物之前相比，受试者脾细胞中IFNγ产生程度增加至少10％、至少20％、至少30％、至少40％、至少50％、至少100与或至少200％，继续共同施用权利要求
140-144中任一项所述的组合物及抑制剂，
其中，如果受试者脾细胞中IFNγ产生程度没有增加，则中断共同施用抑制剂和权利要求140-144中任一项所述的组合物，或者在重复将权利要求140-144中任一项所述的组合物施用于受试者后重新分析。
189.如权利要求188所述的方法，还包括用特异性抗体或MHC多聚体分析脾细胞中治疗靶标的肿瘤抗原的表达水平。
190.如权利要求188所述的方法用于采用免疫检查点抑制剂进行肿瘤治疗，其中所述肿瘤抑制剂是PD-1抑制剂、PD-L1抑制剂或CTLA-4抑制剂。
191.如权利要求188所述的方法，还包括评估受试者T细胞中的PD-1表达。
192.如权利要求188所述的方法，还包括检查受试者癌细胞中的PD-L1表达。
193.如权利要求188所述的方法，还包括评估受试者T细胞中的CTLA-4表达。
194.一种用于实施权利要求185-193中任一项所述的伴随诊断方法的试剂盒，所述试剂盒包含一种或多种IFNγ标记物分子。
195.一种组合物，包含纯化的细菌混合物，所述细菌混合物包含一种或多种选自下组的物种的细菌菌株：粪考拉杆菌、梭杆菌属(Fusobacterium sp.)、多利拟杆菌、细菌IARFR67、瘤胃菌科细菌、帕拉普氏菌X、约氏副拟杆菌、拟杆菌属、戈登副拟杆菌、粘液真杆菌、狄式副拟杆菌、解纤维素拟杆菌、克拉氏拟杆菌、粪厌氧棒状菌、赛尔氏拟杆菌、脆弱拟杆菌、单形拟杆菌、埃氏拟杆菌、梭菌属、戈氏副拟杆菌、拟杆菌属、毛螺旋菌科细菌HGA0140、哈氏厚壁菌、拉瓦梭菌、瘤胃球菌属和无害芽胞梭菌。
196.如权利要求195所述的组合物，其特征在于，所述纯化的细菌混合物包含至少2种、至少3种、至少4种、至少5种、至少6种、至少7种、至少8种、至少9种、至少10种、至少11种、至少12种、至少13种、至少14种、至少15种、至少16种、至少17种、至少18种、至少19种、至少20种、至少21种、至少22种、至少23种、至少24种、至少25种或至少26种细菌菌株。
197.一种组合物，包含纯化的细菌混合物，所述细菌混合物包含一种或多种选自下组的物种的细菌菌株：粪考拉杆菌、梭杆菌属、多利拟杆菌、细菌IARFR67、瘤胃菌科细菌、帕拉普氏菌X、约氏副拟杆菌、拟杆菌属、戈登副拟杆菌、粘液真杆菌、狄式副拟杆菌、解纤维素拟杆菌、克拉氏拟杆菌、粪厌氧棒状菌、赛尔氏拟杆菌、脆弱拟杆菌、单形拟杆菌、埃氏拟杆菌、梭菌属、戈氏副拟杆菌和拟杆菌属。
198.如权利要求197所述的组合物，其特征在于，所述纯化的细菌混合物至少包含至少
2种、至少3种、至少4种、至少5种、至少6种、至少7种、至少8种、至少9种、至少10种、至少11种、至少12种、至少13种、至少14种、至少15种、至少16种、至少17种、至少18种、至少19种、至少20种或至少21种细菌菌株。
199.一种组合物，包含纯化的细菌混合物，所述细菌混合物包含一种或多种选自下组的物种的细菌菌株：粪考拉杆菌、梭杆菌属、多利拟杆菌、细菌IARFR67、瘤胃菌科细菌、帕拉普氏菌X、约氏副拟杆菌、拟杆菌属、戈登副拟杆菌、粘液真杆菌和狄式副拟杆菌。
200.如权利要求199所述的组合物，其特征在于，所述纯化的细菌混合物包含至少2种、至少3种、至少4种、至少5种、至少6种、至少7种、至少8种、至少9种、至少10种或至少11种细菌菌株。
201.一种组合物，包含纯化的细菌混合物，所述细菌混合物包含一种或多种选自下组的物种的细菌菌株：粪考拉杆菌、梭杆菌属、瘤胃菌科细菌和粘液真杆菌。
202.如权利要求201所述的组合物，其特征在于，所述纯化的细菌混合物包含至少2种、至少3种或至少4种细菌菌株。
203.一种组合物，包含纯化的细菌混合物，所述细菌混合物包含一种或多种选自下组的物种的细菌菌株：多利拟杆菌、细菌IARFR67、帕拉普氏菌X、约氏副拟杆菌、拟杆菌属、戈登副拟杆菌和狄式副拟杆菌。
204.如权利要求203所述的组合物，其特征在于，所述纯化的细菌混合物包含至少2种、至少3种、至少4种、至少5种、至少6种或至少7种细菌菌株。
205.一种组合物，包含纯化的细菌混合物，所述细菌混合物包含：
1)粪考拉杆菌或考拉杆菌属CAG:207；
2)溃疡梭杆菌或变异梭杆菌；
3)多利拟杆菌或福鲁克斯拟杆菌；
4)单形拟杆菌或拟杆菌属D20；
5)罕见小球菌属、成乳钌细菌(Ruthenibacterium lactatiformans)、瘤胃菌科细菌cv2或甲酸芽殖菌(Gemminger formicilis)；
6)帕拉普氏菌X；
7)约氏副拟杆菌；
8)别样杆菌属、替莫尼斯别样杆菌(Alistipes timonensis)或塞内加尔别样杆菌；
9)戈登副拟杆菌或副拟杆菌属HGS0025；
10)粘液真杆菌，和
11)副拟杆菌属CAG:2或狄式副拟杆菌。
206.一种组合物，包含纯化的细菌混合物，所述细菌混合物由以下组成：
1)粪考拉杆菌或考拉杆菌属CAG:207；
2)溃疡梭杆菌或变异梭杆菌；
3)多利拟杆菌或福鲁克斯拟杆菌；
4)单形拟杆菌或拟杆菌属D20；
5)罕见小球菌属、成乳钌细菌、瘤胃菌科细菌cv2或甲酸芽殖菌；
6)帕拉普氏菌X，6
7)约氏副拟杆菌；
8)别样杆菌属、替莫尼斯别样杆菌或塞内加尔别样杆菌；
9)戈登副拟杆菌或副拟杆菌属HGS0025；
10)粘液真杆菌，和
11)副拟杆菌属CAG:2或狄式副拟杆菌。
207.一种组合物，包含纯化的细菌混合物，所述细菌混合物包含两种或更多种细菌菌株，所述细菌菌株包含与SEQ ID NO:1、SEQ ID NO:2、SEQ ID NO:3、SEQ ID NO:4、SEQ ID NO:5、SEQ ID NO:6、SEQ ID NO:7、SEQ ID NO:8、SEQ ID NO:9、SEQ ID NO:10或SEQ ID NO:
11具有至少97％序列相同性的16S rDNA序列。
208.如权利要求207所述的组合物，其特征在于，所述纯化的细菌混合物包含至少2种、至少3种、至少4种、至少5种、至少6种、至少7种、至少8种、至少9种或至少10种细菌菌株。
209.一种组合物，包含纯化的细菌混合物，所述细菌混合物包含两种或更多种细菌菌株，所述细菌菌株包含与SEQ ID NO:54、SEQ ID NO:55、SEQ ID NO:56、SEQ ID NO:57、SEQ ID NO:58、SEQ ID NO:59、SEQ ID NO:60、SEQ ID NO:61、SEQ ID NO:62、SEQ ID NO:63或SEQ ID NO:64具有至少97％序列相同性的16S rDNA序列。
210.如权利要求209所述的组合物，其特征在于，所述纯化的细菌混合物包含至少2种、至少3种、至少4种、至少5种、至少6种、至少7种、至少8种、至少9种或至少10种细菌菌株。
211.一种组合物，包含纯化的细菌混合物，其包含：
包含与SEQ ID NO：1具有至少97％序列相同性的16S rDNA序列的细菌菌株；
包含与SEQ ID NO：2具有至少97％序列相同性的16S rDNA序列的细菌菌株；
包含与SEQ ID NO：3具有至少97％序列相同性的16S rDNA序列的细菌菌株；
包含与SEQ ID NO：4具有至少97％序列相同性的16S rDNA序列的细菌菌株；
包含与SEQ ID NO：5具有至少97％序列相同性的16S rDNA序列的细菌菌株；
包含与SEQ ID NO：6具有至少97％序列相同性的16S rDNA序列的细菌菌株；
包含与SEQ ID NO：7具有至少97％序列相同性的16S rDNA序列的细菌菌株；
包含与SEQ ID NO：8具有至少97％序列相同性的16S rDNA序列的细菌菌株；
包含与SEQ ID NO：9具有至少97％序列相同性的16S rDNA序列的细菌菌株；
包含与SEQ ID NO：10具有至少97％序列相同性的16S rDNA序列的细菌菌株；和包含与SEQ ID NO：11具有至少97％序列相同性的16S rDNA序列的细菌菌株。
212.一种组合物，包含纯化的细菌混合物，其包含：
包含与SEQ ID NO：54具有至少97％序列相同性的16S rDNA序列的细菌菌株；
包含与SEQ ID NO：55具有至少97％序列相同性的16S rDNA序列的细菌菌株；
包含与SEQ ID NO：56具有至少97％序列相同性的16S rDNA序列的细菌菌株；
包含与SEQ ID NO：57具有至少97％序列相同性的16S rDNA序列的细菌菌株；
包含与SEQ ID NO：58具有至少97％序列相同性的16S rDNA序列的细菌菌株；
包含与SEQ ID NO：59具有至少97％序列相同性的16S rDNA序列的细菌菌株；
包含与SEQ ID NO：60具有至少97％序列相同性的16S rDNA序列的细菌菌株；
包含与SEQ ID NO：61具有至少97％序列相同性的16S rDNA序列的细菌菌株；
包含与SEQ ID NO：62具有至少97％序列相同性的16S rDNA序列的细菌菌株；
包含与SEQ ID NO：63具有至少97％序列相同性的16S rDNA序列的细菌菌株；和包含与SEQ ID NO：64具有至少97％序列相同性的16S rDNA序列的细菌菌株。
213.一种组合物，包含由细菌菌株组成的纯化细菌混合物，所述细菌菌株包含与SEQ ID NO:1、SEQ ID NO:2、SEQ ID NO:3、SEQ ID NO:4、SEQ ID NO:5、SEQ ID NO:6、SEQ ID NO:7、SEQ ID NO:8、SEQ ID NO:9、SEQ ID NO:10和SEQ ID NO:11具有至少97％序列相同性的16S rDNA序列。
214.一种组合物，包含由细菌菌株组成的纯化细菌混合物，所述细菌菌株包含与SEQ ID NO:54、SEQ ID NO:55、SEQ ID NO:56、SEQ ID NO:57、SEQ ID NO:58、SEQ ID NO:59、SEQ ID NO:60、SEQ ID NO:61、SEQ ID NO:62、SEQ ID NO:63或SEQ ID NO:64具有至少97％序列相同性的16S rDNA序列。
215.一种组合物，包含纯化的细菌混合物，所述细菌混合物由以下组成：
包含与SEQ ID NO：1具有至少97％序列相同性的16S rDNA序列的细菌菌株；
包含与SEQ ID NO：2具有至少97％序列相同性的16S rDNA序列的细菌菌株；
包含与SEQ ID NO：3具有至少97％序列相同性的16S rDNA序列的细菌菌株；
包含与SEQ ID NO：4具有至少97％序列相同性的16S rDNA序列的细菌菌株；
包含与SEQ ID NO：5具有至少97％序列相同性的16S rDNA序列的细菌菌株；
包含与SEQ ID NO：6具有至少97％序列相同性的16S rDNA序列的细菌菌株；
包含与SEQ ID NO：7具有至少97％序列相同性的16S rDNA序列的细菌菌株；
包含与SEQ ID NO：8具有至少97％序列相同性的16S rDNA序列的细菌菌株；
包含与SEQ ID NO：9具有至少97％序列相同性的16S rDNA序列的细菌菌株；
包含与SEQ ID NO：10具有至少97％序列相同性的16S rDNA序列的细菌菌株；和包含与SEQ ID NO：11具有至少97％序列相同性的16S rDNA序列的细菌菌株。
216.一种组合物，包含纯化的细菌混合物，所述细菌混合物由以下组成：
包含与SEQ ID NO：54具有至少97％序列相同性的16S rDNA序列的细菌菌株；
包含与SEQ ID NO：55具有至少97％序列相同性的16S rDNA序列的细菌菌株；
包含与SEQ ID NO：56具有至少97％序列相同性的16S rDNA序列的细菌菌株；
包含与SEQ ID NO：57具有至少97％序列相同性的16S rDNA序列的细菌菌株；
包含与SEQ ID NO：58具有至少97％序列相同性的16S rDNA序列的细菌菌株；
包含与SEQ ID NO：59具有至少97％序列相同性的16S rDNA序列的细菌菌株；
包含与SEQ ID NO：60具有至少97％序列相同性的16S rDNA序列的细菌菌株；
包含与SEQ ID NO：61具有至少97％序列相同性的16S rDNA序列的细菌菌株；
包含与SEQ ID NO：62具有至少97％序列相同性的16S rDNA序列的细菌菌株；
包含与SEQ ID NO：63具有至少97％序列相同性的16S rDNA序列的细菌菌株；和包含与SEQ ID NO：64具有至少97％序列相同性的16S rDNA序列的细菌菌株。
217.如权利要求137-144或195-216中任一项所述的组合物，其特征在于，所述组合物是药物组合物。
218.如权利要求217所述的药物组合物，其特征在于，所述药物组合物包含药学上可接受的赋形剂。
219.如权利要求218所述的药物组合物，其特征在于，配制药物组合物用于口服给药。
220.如权利要求218或219所述的药物组合物，其特征在于，配制药物组合物用于直肠给药。
221.如权利要求218-220中任一项所述的药物组合物，其特征在于，配制所述药物组合物用于递送至肠。
222.如权利要求218-221中任一项所述的药物组合物，其特征在于，配制所述药物组合物用于递送至结肠。
223.如权利要求218-222中任一项所述的药物组合物，其特征在于，一种或多种细菌菌株是冻干的。
224.如权利要求218-223中任一项所述的药物组合物，其特征在于，药物组合物是胶囊形式。
225.如权利要求218-224中任一项所述的药物组合物，其特征在于，所述药物组合物还包含pH敏感性组合物，所述组合物包含一种或多种肠溶聚合物。
226.如权利要求217-225中任一项所述的组合物，其特征在于，所述组合物还包含一种或多种抗癌剂。