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一种RNAi技术联合小剂量ALA诱导肿瘤细胞原卟啉IX积聚的方法

阅读:632发布:2020-05-11

专利汇可以提供一种RNAi技术联合小剂量ALA诱导肿瘤细胞原卟啉IX积聚的方法专利检索,专利查询,专利分析的服务。并且本 发明 公开了一种RNAi技术联合小剂量5‑ 氨 基 酮 戊酸(ALA)诱导 肿瘤 细胞原卟啉IX(PpIX)积聚的方法,是在外源性添加小剂量ALA的同时,利用RNAi基因沉默技术抑制亚 铁 螯合酶(FECH)的表达,从而使得外源性ALA所诱导产生的内源性PpIX能够更有效地积聚在肿瘤细胞。本发明还提供了上述RNAi所用的三个双链siRNA 片段 ,对FECH具有很高的沉默效率。利用本发明的方法和双链siRNA片段,可在只使用小剂量外源性ALA的情况下,即可获得大量的PpIX并使其积聚在肿瘤细胞,实现肿瘤病灶的标示,尤其是对于早期肿瘤的标示,具有显著的意义。,下面是一种RNAi技术联合小剂量ALA诱导肿瘤细胞原卟啉IX积聚的方法专利的具体信息内容。

1.一种利用RNAi技术联合小剂量ALA诱导肿瘤细胞原卟啉IX积聚的试剂盒,其特征在于,包含有ALA和利用RNAi技术沉默抑制亚螯合酶FECH表达所需的试剂;该试剂盒的使用方法是在外源性添加小剂量ALA的同时,利用RNAi技术沉默抑制亚铁螯合酶FECH的表达,从而使得外源性ALA所诱导产生的内源性PpIX能够更有效地积聚在肿瘤细胞;其中,所述利用RNAi技术沉默抑制亚铁螯合酶FECH表达所用的双链siRNA的反义链的核苷酸序列与靶基因部分或全部互补,双链siRNA的正义链与反义链部分或全部互补;所述沉默抑制亚铁螯合酶FECH的表达是利用双链740FECH-siRNA、1072FECH-siRNA和3389FECH-siRNA中的任一个或三者联用;所述双链740FECH-siRNA、1072FECH-siRNA和3389FECH-siRNA的反义链的核苷酸序列分别与SEQ ID NO.1所示序列的740、1072、3389位开始的一段核苷酸序列互补;所述双链740FECH-siRNA、1072FECH-siRNA和3389FECH-siRNA的核苷酸序列分别如SEQ ID NO.2~
7所示。
2.根据权利要求1所述试剂盒,其特征在于,所述添加小剂量ALA是指体外细胞实验中低于或等于0.1mM 的ALA浓度,或动物实验中低于或等于1毫克/公斤体重的ALA浓度。
3.一种干扰抑制亚铁螯合酶FECH表达的双链siRNA,其特征在于,为双链740FECH-siRNA、1072FECH-siRNA和3389FECH-siRNA中的任一个或三者的组合;所述双链740FECH-siRNA、1072FECH-siRNA和3389FECH-siRNA的核苷酸序列分别如SEQ ID NO.2~7所示。
4.权利要求3所述双链siRNA在制备肿瘤诊断试剂方面的应用。

说明书全文

一种RNAi技术联合小剂量ALA诱导肿瘤细胞原卟啉IX积聚的

方法

技术领域

[0001] 本发明属于生物医药技术领域。更具体地,涉及一种RNAi技术联合小剂量ALA诱导肿瘤细胞原卟啉IX积聚的方法

背景技术

[0002] 癌症已成为威胁人类健康和生命的一大杀手,而癌症的发现往往都已处于中晚期,约75%的患者就诊时肿瘤已到进展期,肿瘤已发生转移。而早期癌症病灶的发现对癌症的治疗具有至关重要的意义,但是目前大部分癌症均缺乏早期症状及有效的诊断方法。
[0003] 肿瘤选择性积聚原卟啉IX(Pp1X)已被证实伴随于成瘤过程的早期,可发生在有或无外源性5-戊酸(5-Aminolevulinic acid,ALA)诱导的情况下。研究发现,亚螯合酶(FECH)可催化二价铁嵌入原卟啉IX(PpIX)生成血红素,而很多类型肿瘤的亚铁螯合酶(FECH)活较正常细胞为低,所以将PpIX转化为血红素减少,从而导致肿瘤组织中PpIX增多,在此基础上,使用合适波长能量光源激发肿瘤内部蓄积的PpIX后,比较不同组织部位的PpIX荧光含量及分布差异,就可发现早期微小癌灶。
[0004] 目前,国内外一直采用大剂量外源性5-氨基酮戊酸(5-Aminolevulinic acid,ALA)的方式来增加肿瘤细胞内PpIX的合成量,以便标示肿瘤病灶。而因为部分肿瘤的FECH活性并未明显降低,故能够将外源性ALA诱导产生的细胞内源性PpIX转化为血红素,从而使PpIX迅速流失,因此该方式往往只能产生低浓度的肿瘤PpIX,必须使用更大剂量的ALA,才能产生足够的Pp1X在肿瘤组织积聚。采用大剂量使用5-氨基酮戊酸(ALA)的方式,不仅存在上述的缺陷,而且大剂量的ALA用量还极易产生严重的全身尤其神经毒副作用
[0005] 发明人前期研究利用RNAi技术阻断FECH基因的表达,在此基础上辅小剂量的外源性ALA,通过增加合成、减少去路的双重效能的方式以提高肿瘤细胞原卟啉IX积聚浓度,从而改善了单用大剂量外源性ALA的模式难收集较高浓度的PpIX的方法上的不足。但是,在利用RNAi技术阻断FECH表达的效能方面,目前所使用单段siRNA的方法仍有很大的改进空间,虽然理论上使用单段siRNA可达到很高的基因敲减率,但是以我们多年的实际操作经验及实验结果分析可知,实际工作中该方法一般只能达到约60~65%范围平的基因敲减率,因此,在此基础上辅以小剂量外源性ALA标示肿瘤病灶的效果不甚理想,尤其是针对早期病灶的标示。
[0006] 因提高RNAi技术阻断FECH表达的效能是提高肿瘤细胞PpIX积聚浓度的最关键的环节,因此,探索更有效地提高对肿瘤细胞FECH基因的敲减率的方法,已成为此技术领域中的一项重大挑战。

发明内容

[0007] 本发明要解决的技术问题是克服现有RNAi技术结合小剂量外源性ALA标示肿瘤病灶技术的缺陷和不足,提供一种更有效的RNAi技术联合小剂量ALA诱导肿瘤细胞原卟啉IX积聚的方法,该方法利用RNAi技术沉默抑制亚铁螯合酶(FECH)的表达,从而使得外源性ALA所诱导产生的内源性PpIX能够更有效地积聚在肿瘤细胞,达到使用小剂量外源性ALA即可有效标示肿瘤病灶的目的,提高肿瘤的检出率。
[0008] 本发明的目的是提供一种RNAi技术联合小剂量ALA诱导肿瘤细胞原卟啉IX积聚的方法。
[0009] 本发明另一目的是提供上述方法中所使用的RNAi干扰序列及其在肿瘤诊断方面的应用。
[0010] 本发明上述目的通过以下技术方案实现:
[0011] 一种RNAi技术联合小剂量ALA诱导肿瘤细胞原卟啉IX积聚的方法,是在外源性添加小剂量ALA的同时,利用RNAi技术沉默抑制亚铁螯合酶FECH的表达,从而使得外源性ALA所诱导产生的内源性PpIX能够更有效地积聚在肿瘤细胞;其中,所述利用RNAi技术沉默抑制亚铁螯合酶FECH表达所用的双链siRNA的反义链的核苷酸序列与靶基因部分或全部互补,双链siRNA的正义链与反义链部分或全部互补。
[0012] 进一步地,所述沉默抑制亚铁螯合酶FECH的表达是利用双链740FECH-siRNA、1072FECH-siRNA和3389FECH-siRNA中的任一个或三者联用;所述740FECH-siRNA、
1072FECH-siRNA和3389FECH-siRNA的反义链的核苷酸序列分别与SEQ ID NO.1所示序列的
740、1072、3389位开始的一段核苷酸序列互补;该段互补的核苷酸序列由18~29个连续的核苷酸组成。
[0013] 优选地,所述该段互补的核苷酸序列由19~25个连续的核苷酸组成。
[0014] 更优选地,所述该段互补的核苷酸序列由19~23个连续的核苷酸组成。
[0015] 最优选地,所述该段互补的核苷酸序列由19个连续的核苷酸组成。
[0016] 另外,优选地,所述双链siRNA片段的两条链的3’端含有二核苷酸,而且这二核苷酸最好是uu。
[0017] 具体地,作为一种优选的实施方案,所述双链740FECH-siRNA、1072FECH-siRNA和3389FECH-siRNA的核苷酸序列分别如SEQ ID NO.2~7所示。即如下所示:
[0018] (1)双链740FECH-siRNA
[0019] 正义链740FECH-S1(如SEQ ID NO.2所示):
[0020] 5'GCAGCUUAAAUGCCAUUUAUU 3'(第二条链);
[0021] 反义链740FECH-AS1(如SEQ ID NO.3所示):
[0022] 3'UUCGUCGAAUUUACGGUAAAU 5'(第一条链,与SEQ ID NO.1所示序列的740~758位核苷酸互补)。(SEQ ID NO.1所示序列的740~758位核苷酸:gcagcttaaatgccattta)。
[0023] (2)双链1072FECH-siRNA
[0024] 正义链1072FECH-S2(如SEQ ID NO.4所示):
[0025] 5'GGUCCUCAAACAGACGAAUUU 3'(第二条链);
[0026] 反义链1072FECH-AS2(如SEQ ID NO.5所示):
[0027] 3'UUCCAGGAGUUUGUCUGCUUA 5'(第一条链,与SEQ ID NO.1所示序列的1072~1090位核苷酸互补)。(SEQ ID NO.1所示序列的1072~1090位核苷酸:ggtcctcaaacagacgaat)。
[0028] (3)双链3389FECH-siRNA
[0029] 正义链3389FECH-S3(如SEQ ID NO.6所示):
[0030] 5'CAGGCAAAGAGGAAUUUAUUU 3'(第二条链);
[0031] 反义链3389FECH-AS4(如SEQ ID NO.7所示):
[0032] 3'UUGUCCGUUUCUCCUUAAAUA 5'(第一条链,与与SEQ ID NO.1所示序列的3389~3407位核苷酸互补)。(SEQ  ID  NO.1所示序列的3389~3407位核苷酸:
caggcaaagaggaatttat)。
[0033] 另外,进一步地,上述的添加小剂量ALA是指本发明所述之体外细胞实验中低于或等于0.1mM的ALA浓度,或本发明所述之动物实验中低于或等于1毫克/公斤体重的ALA浓度。
[0034] 另外,根据所述的内容,一种干扰抑制亚铁螯合酶FECH表达的双链siRNA也在本发明的保护范围之内,所述双链siRNA为双链740FECH-siRNA、1072FECH-siRNA和3389FECH-siRNA中的任一个或三者的组合;所述双链740FECH-siRNA、1072FECH-siRNA和3389FECH-siRNA的核苷酸序列分别如SEQ ID NO.2~7所示。
[0035] 而且,上述双链siRNA在制备肿瘤诊断试剂方面的应用也应在本发明的保护范围之内。这种核酸分子可以单独使用或与其它物质结合使用时可作为药物和/或诊断试剂。例如,这项发明的核酸分子可能包含给药的运输载体,包括脂质体,载体和稀释剂及它们的盐和/或这种载体是药学中被接受的某种剂型。
[0036] 上述双链siRNA还可用于制备药物组合物,这个组合含有一个或多个本发明的核酸分子,即所述的双链siRNA,核酸分子位于一个可接受的载体中,如稳定剂,缓冲剂等类似物质。
[0037] 上述的药物组合物也可以制造成口服的片剂,胶囊或酏剂,直肠给药的栓剂,可注射给药的无菌溶液,悬浮液,和其它已知的复合体
[0038] 另外,上述运输载体,即运输该核酸分子(双链siRNA)的载体最好是表达载体,并且最好能提供特异性的或靶向的运输方式。
[0039] 本发明具有以下有益效果:
[0040] 本发明提供了一种有效诱导肿瘤细胞原卟啉IX积聚的方法,并且只需使用小剂量的外源性ALA,具体方法是在外源性添加小剂量ALA的同时,利用RNAi技术沉默抑制亚铁螯合酶FECH的表达,从而使得大量的PpIX积聚在肿瘤细胞。
[0041] 同时,本发明提供了上述RNAi所用的双链siRNA片段,即740FECH-siRNA、1072FECH-siRNA和3389FECH-siRNA,对FECH具有很高的沉默效率,利用其沉默处理的同时,添加小剂量外源性ALA,即可快速、有效地使得PpIX大量积聚在肿瘤细胞,可实现肿瘤病灶的标示,尤其是对于早期肿瘤的标示,具有显著的意义。
附图说明
[0042] 图1为荧光定量PCR检测FECH基因表达水平的结果。
[0043] 图2为Western blot转膜时的叠放顺序。
[0044] 图3为Western blot结果。
[0045] 图4为荧光定量光谱仪检测转染siRNA和/或加ALA处理后的MDA-MB-435细胞内的PpIX浓度。
[0046] 图5为显微荧光定量检测0.1mM ALA处理后MDA-MB-435细胞内的PpIX的积聚情况。
[0047] 图6为显微荧光定量检测50nM 3389-FECH-siRNA处理后MDA-MB-435细胞内的PpIX的积聚情况。
[0048] 图7为显微荧光定量检测50nM 3389-FECH-siRNA处理MDA-MB-435细胞后,再加上0.1mM剂量的ALA细胞内的PpIX的积聚情况。
[0049] 图8为显微荧光定量检测50nM 3389-FECH-siRNA处理MDA-MB-435细胞后,再加上1mM剂量的ALA,细胞内的PpIX的积聚情况。
[0050] 图9为激光共聚焦显微镜检查肿瘤细胞内积聚的PpIX荧光。
[0051] 图10为动物实验的肿瘤组织所产生的PpIX红色荧光观察结果。

具体实施方式

[0052] 以下结合说明书附图和具体实施例来进一步说明本发明,但实施例并不对本发明做任何形式的限定。除非特别说明,本发明采用的试剂、方法和设备为本技术领域常规试剂、方法和设备。
[0053] 除非特别说明,以下实施例所用试剂和材料均为市购。
[0054] 以下实施例中所用细胞株为人乳腺癌细胞株MDA-MB-435。
[0055] 所用培养基:DMEM培养基、胎血清(FBS)、0.25%胰酶-EDTA(Trypsin-EDTA)、磷酸缓冲液(PBS)、青链霉素双抗溶液(Penicillin-Streptomycin)均购自Gibco公司。
[0056] 所用试剂:阳离子脂质体转染试剂盒(Transmessenger kit,Qiagen公司)、阴性对照siRNA(negative control siRNA,Qiagen)、Trizol(Invitrogen公司)、 RT Master Mix kit(TaKaRa)、 Premix EX TaqTM II kit(TaKaRa)、 基因表达试剂盒(美国应用生物系统公司)、增强型BCA蛋白浓度测定试剂盒(碧天)、抗体Anti-FECH(Santa Cruz)、抗体anti-GAPDH(Santa Cruz)、30%甲叉双丙烯酰胺(30%Acrylamide/Bis Solution,Bio-rad)、TEMED(Bio-rad)、细胞裂解液(Bio-rad)、磷酸酶抑制剂(Bio-rad)。
[0057] 所用仪器:水套式CO2培养箱(Forma II Water Jacketed CO2Incubator,Thermo)、激光共聚焦显微镜、倒置显微镜、Spectra Max M2多功能酶标仪、ABI Prism 7000型荧光定量PCR仪等均为市购。
[0058] 另外,以下实施例中所用的统计学方法:采用spss 15.0统计软件进行统计学处理,实验结果(均数±标准差)表示。应用组间t检验,p<0.05有统计学意义,纵坐标每个值代表三次独立实验平均值。
[0059] 实施例1FECH-siRNA的设计
[0060] 以NCBI网站上的序列NM_000140.2(核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示)为根据,设计了3个双链siRNA片段,分别为740FECH-siRNA、1072FECH-siRNA和3389FECH-siRNA,其核苷酸序列分别如SEQ ID NO.2~7所示:
[0061] 1、双链740FECH-siRNA
[0062] (1)740FECH-S1(如SEQ ID NO.2所示):
[0063] 5'GCAGCUUAAAUGCCAUUUAUU 3'(正义链,第二条链);
[0064] (2)740FECH-AS1(如SEQ ID NO.3所示):
[0065] 3'UUCGUCGAAUUUACGGUAAAU 5'(反义链,第一条链,与SEQ ID NO.1所示序列的740~758位核苷酸互补)。
[0066] (SEQ ID NO.1所示序列的740~758位核苷酸:gcagcttaaatgccattta)。
[0067] 2、双链1072FECH-siRNA
[0068] (1)1072FECH-S2(如SEQ ID NO.4所示):
[0069] 5'GGUCCUCAAACAGACGAAUUU 3'(正义链,第二条链);
[0070] (2)1072FECH-AS2(如SEQ ID NO.5所示):
[0071] 3'UUCCAGGAGUUUGUCUGCUUA 5'(反义链,第一条链,与SEQ ID NO.1所示序列的1072~1090位核苷酸互补)。
[0072] (SEQ ID NO.1所示序列的1072~1090位核苷酸:ggtcctcaaacagacgaat)。
[0073] 3、双链3389FECH-siRNA
[0074] (1)3389FECH-S3(如SEQ ID NO.6所示):
[0075] 5'CAGGCAAAGAGGAAUUUAUUU 3'(正义链,第二条链);
[0076] (2)3389FECH-AS4(如SEQ ID NO.7所示):
[0077] 3'UUGUCCGUUUCUCCUUAAAUA 5'(反义链,第一条链,与与SEQ ID NO.1所示序列的3389~3407位核苷酸互补)。
[0078] (SEQ ID NO.1所示序列的3389~3407位核苷酸:caggcaaagaggaatttat)。
[0079] 实施例2FECH-siRNA处理人乳腺癌细胞株MDA-MB-435细胞后亚铁螯合酶基因的mRNA表达水平
[0080] 1、细胞培养
[0081] (1)人乳腺癌细胞株MDA-MB-435培养液条件为90%DMEM培养基+10%FBS+1%双抗(青霉素100IU/ml+链霉素100μg/ml),于恒温细胞培养箱(37℃,5%CO2)中培养。
[0082] (2)待细胞生长至85%左右时用0.25%胰蛋白酶/0.02%EDTA消化传代培养。取对数生长期的细胞用阳离子脂质体转染试剂盒(Transmessenger kit)进行转染。
[0083] 2、细胞转染
[0084] (1)细胞分组,实验共设6组,分别为:
[0085] 1)只加转染剂处理组(阴性对照组);
[0086] 2)单用0.1mM ALA组;
[0087] 3)50nM PCTsiRNA+0.1mM ALA组:是740FECH-siRNA、1072FECH-siRNA和3389FECH-siRNA的混合siRNAs;
[0088] 4)50nM 740FECH-siRNA+0.1mM ALA组;
[0089] 5)50nM 1072FECH-siRNA+0.1mM ALA组;
[0090] 6)50nM 3389FECH-siRNA+0.1mM ALA组。
[0091] (2)细胞转染siRNA及加ALA处理
[0092] 1)将对数生长期的MDA-MB-435单细胞悬液按2×105/孔接种至6孔板,用含双链霉素Penicillin-Streptomycin的完全培养基培养24小时。
[0093] 2)24h后待细胞融合度达到60%进行转染,用转染试剂盒内的buffer将各组siRNA浓度稀释至0.1ug/μL。按表1所示进行操作:
[0094] 表1
[0095]
[0096]
[0097] 3)将以上各组分用移液枪吹打三次混匀,室温(15℃~25℃),静置5min。
[0098] 4)向以上6组的管中各加入转染剂(Transmessenger)8.8μL。
[0099] 5)用移液枪吹打五次混匀,室温(15℃~25℃),静置10min。
[0100] 6)从细胞培养箱取出六孔板,去掉旧的培养基,用PBS洗两次。
[0101] 7)每孔加500μL DMEM培养基(不含血清不含双抗),然后相应每孔直接加入以上混合液100μL,使得每孔总体积为600μL,混合摇匀。
[0102] 8)在正常培养情况下孵育12h。
[0103] 9)孵育12h后,去除旧的培养基每孔直接加入2ml DMEM完全培养基。
[0104] 10)接种48h后进行二次转染,去除旧的培养基后,操作同上。
[0105] 11)100mM ALA的配制:精确称取16.76mg的ALA,溶于1ml PBS。
[0106] 12)接种72h后,去除旧的培养基,用PBS洗两次,每次2ml。之后加入1ml无血清无双抗的DMEM培养基,相应组加0.1mM ALA,即从100mM ALA吸取1μL,加入ALA后,轻轻摇匀。
[0107] 13)ALA作用4个小时,进行定量PCR。
[0108] 3、荧光定量PCR
[0109] (1)分别利用FECH基因(FECH-1、FECH-2、FECH-3)引物和GAPDH引物,进行荧光定量PCR。
[0110] 上述引物的序列如下,均由invitrogen公司合成。其核苷酸序列如下所示:
[0111] FECH基因引物:
[0112] 上游引物:atggaggtggaagtcaggtg
[0113] 下游引物:gtcatgaggtctcggtccaa
[0114] 内参基因GAPDH引物:
[0115] 上游引物:agcctcaagatcatcagc
[0116] 下游引物:gagtccttccacgatacc
[0117] (2)从转染的细胞中提取总RNA
[0118] 转染72h后,细胞融合度达到90%,按照下面实验步骤提取细胞的总RNA:
[0119] 1)预冷Trizol、氯仿、异丙醇、乙醇
[0120] 2)吸掉细胞培养基,用预冷的PBS洗2次,加1ml Trizol,反复吹打,然后转移至无RNA酶的1.5ml的EP管中,室温静置5min;
[0121] 3)加200μL氯仿,上下用力颠倒15s,室温静置3min;
[0122] 4)离心12000rpm,4℃,15min;
[0123] 5)吸取上清液至新的1.5ml的EP管中,加异丙醇500μL,上下轻柔颠倒15s,室温静置10min;
[0124] 6)离心12000rpm,4℃,10min;
[0125] 7)去掉上清液,加入1ml的无水乙醇轻柔漂洗沉淀;
[0126] 8)离心7500rpm,4℃,5min;
[0127] 9)去掉液体,加入1ml的80%乙醇轻柔漂洗沉淀;
[0128] 10)7500rpm,4℃,5min;
[0129] 11)去掉上清液,干燥RNA 5min;
[0130] 12)加入15μL的0.1%DEPC灭菌水溶解。
[0131] (3)总RNA逆转录为cDNA
[0132] 1)总RNA浓度的测定:将各个样品稀释50倍,用UV板分别测定每个样品在260nm和280nm的吸亮度,选择OD260/OD280的比值为1.7至2.2之间的样品进行下一步实验;根据以下公式计算总RNA的浓度:总RNA(μg/μl)=40×OD260×50/1000。
[0133] 2)各样品取500ng的总RNA按照Takara的逆转录试剂盒 RT Master Mix的说明书,用随机引物进行逆转录成cDNA,于-20℃保存。
[0134] (4)PCR扩增人FECH基因
[0135] 1)将逆转录后的cDNA稀释3倍后,各取1μl的cDNA稀释液进行PCR扩增;实验重复3次。
[0136] 2)扩增体系如下:
[0137]
[0138]
[0139] 其中,上下游引物混合液的终浓度为10μM。
[0140] 在0.2ml PCR管中加入下列组分后,充分混匀。
[0141] 3)扩增条件如下:95℃30s,40循环(95℃5s、61℃30s)。
[0142] (5)Taqman荧光定量PCR按 基因表达试剂盒说明操作。
[0143] 4、实验结果
[0144] 荧光定量PCR检测FECH基因表达水平的结果如附图1所示。图中,从左至右依次为:
[0145] (1)NCT:只加转染剂处理组(阴性对照组);
[0146] (2)ALA:单用0.1mM ALA组;
[0147] (3)PCTsiRNA:50nM PCTsiRNA+0.1mM ALA组:是740FECH-siRNA、1072FECH-siRNA和3389FECH-siRNA的混合siRNAs;
[0148] (4)740siRNA:50nM 740FECH-siRNA+0.1mM ALA组;
[0149] (5)1072siRNA:50nM 1072FECH-siRNA+0.1mM ALA组;
[0150] (6)3389siRNA:50nM 3389FECH-siRNA+0.1mM ALA组。
[0151] 结果显示:PCTsiRNA+0.1mM ALA组、50nM 740FECH-siRNA+0.1mM ALA组、50nM 1072FECH-siRNA+0.1mM ALA组及50nM 3389FECH-siRNA+0.1mM ALA组,在抑制FECH mRNA表达方面的作用,分别和只加转染剂处理组及单用0.1mM ALA组比较,均有统计学的明显差异(P<0.01),说明PCTsiRNA+0.1mM ALA组、50nM 740FECH-siRNA+0.1mM ALA组、50nM 
1072FECH-siRNA+0.1mM ALA组、及50nM 3389FECH-siRNA+0.1mM ALA组敲减FECH mRNA表达的作用明显高于只加转染剂处理组及单用0.1mM ALA这两组。而且,PCTsiRNA组敲减FECH mRNA表达的作用明显高于740siRNA、1072siRNA和3389siRNA这三组。
[0152] 实施例3FECH-siRNA处理人乳腺癌细胞株MDA-MB-435细胞后亚铁螯合酶基因的蛋白表达水平
[0153] 1、本实施例用Western blotting法检测实施例2中各组细胞FECH蛋白表达水平,方法如下:
[0154] (1)提取总蛋白:收集二次转染后的MDA-MB-435细胞,按照以下方法提取细胞总蛋白(整个过程在上进行):
[0155] 1)去除培养液,用预冷的PBS洗2次。
[0156] 2)每孔加入加100μl含PMSF的裂解液,用刮刀来回滑动,使裂解液和细胞充分接触
[0157] 3)充分裂解后,将细胞裂解液移至500μl的离心管,4℃,12000g离心10分钟,取上清移至新的离心管。
[0158] 4)用考斯亮蓝法测定总蛋白的浓度。
[0159] 2、Western blot:按照以下步骤进行western blot:
[0160] 1)制10%的SDS-PAGE凝胶:先加10%分离胶,用去离子水密封胶顶部,然后凝固20分钟;倒掉水,用滤纸吸干,然后加5%的浓缩胶,迅速插入加样梳,再用浓缩胶液将气泡排除,再凝固30分钟即可。
[0161] 2)SDS-PAGE电泳:各样品总蛋白上样量为90μg。
[0162] 3)转膜:将滤纸、海绵垫、放置于电转液中,浸泡30-60min,同时准备与大小与凝胶相同的PVDF膜(蛋白分子量大于100kD用0.45μm的PVDF膜,小于100kD的则用0.2μm的PVDF膜),在甲醇中提前浸泡20s,使PVDF膜半透明,然后用ddH2O洗2次,然后放置于转移液中泡30min,或更久。SDS-PAGE完成后,取下分离胶,将分离胶,PVDF膜以及两层滤纸按顺序放好,放到放好海绵的黑白板上。(即:从黑色负极端依次从下至上为:海绵垫/滤纸/胶/PVDF膜/滤纸/海绵垫。)
[0163] 使用Bio-Rad的标准湿式转膜装置,设定转膜电流为300mA,转膜时间为90分钟。电转时要释放很多热量,所以槽内要放入专用的冰盒,整个电泳槽置于盛有冰的盆中,叠放顺序如图2所示。
[0164] 4)封闭:转膜完成后,立即将PVDF膜用TBS洗涤2次,5min/次;膜吸干后放入封闭液中,在摇床上缓慢摇动,室温封闭90min。封闭结束后,用TBST洗3次,10min/次。
[0165] 5)一抗孵育:用TBST配制anti-FECH抗体(稀释比为1:300)和anti-GAPDH抗体(稀释比为1:1000),将膜放入其中,在摇床上缓慢摇动孵育(常温1h→4℃过夜→常温1h)。孵育结束后,用TBST洗3次,10min/次。
[0166] 6)二抗孵育:用TBST配制相应的二抗(稀释比为1:3000),将膜放入其中,在摇床上缓慢摇动孵育(常温2h)。孵育结束后,用TBST洗3次,10min/次。
[0167] 7)ECL显影:ECL Western Blotting Substrate reagent试剂盒,A液和B液按1:1混合两种分光底物,均匀铺在膜上,作用1分钟。用凝胶成像系统ChemiDoc XRS拍照。
[0168] 2、Western Blot结果如附图3所示。图3中,从左至右依次为:
[0169] (1)NCT:只加转染剂处理组(阴性对照组);
[0170] (2)ALA:单用0.1mM ALA组;
[0171] (3)740siRNA:50nM 740FECH-siRNA+0.1mM ALA组;
[0172] (4)1072siRNA:50nM 1072FECH-siRNA+0.1mM ALA组;
[0173] (5)3389siRNA:50nM 3389FECH-siRNA+0.1mM ALA组;
[0174] (6)PCTsiRNA:50nM PCTsiRNA+0.1mM ALA组:是740FECH-siRNA、1072FECH-siRNA和3389FECH-siRNA的混合siRNAs。
[0175] 结果显示:PCTsiRNA+0.1mM ALA组、50nM 740FECH-siRNA+0.1mM ALA组、50nM 1072FECH-siRNA+0.1mM ALA组及50nM 3389FECH-siRNA+0.1mM ALA组,分别和只加转染剂处理组及单用0.1mM ALA组比较,对FECH基因在蛋白水平的抑制作用明显增加,均有统计学的明显差异(P<0.01).说明PCTsiRNA+0.1mM ALA组、50nM 740FECH-siRNA+0.1mM ALA组、
50nM1072FECH-siRNA+0.1mM ALA组、及50nM 3389FECH-siRNA+0.1mM ALA组对FECH基因在蛋白水平的抑制作用远强于只加转染剂处理组及单用0.1mM ALA组。而且,PCTsiRNA组对FECH基因在蛋白水平的抑制作用远强于740siRNA、1072siRNA和3389siRNA这三组。
[0176] 实施例4用FECH-siRNA处理人乳腺癌细胞株MDA-MB-435细胞后在细胞内检测到的PpIX浓度
[0177] 1、细胞培养,同实施例2。
[0178] 2、细胞转染
[0179] (1)细胞分组
[0180] 同实施例2,实验共设6组,分别为:
[0181] 1)只加转染剂处理组(阴性对照组);
[0182] 2)单用0.1mM ALA组;
[0183] 3)50nMPCTsiRNA+0.1mM ALA组:是740FECH-siRNA、1072FECH-siRNA和3389FECH-siRNA的混合siRNAs;
[0184] 4)50nM 740FECH-siRNA+0.1mM ALA组;
[0185] 5)50nM 1072FECH-siRNA+0.1mM ALA组;
[0186] 6)50nM 3389FECH-siRNA+0.1mM ALA组。
[0187] (2)细胞转染siRNA及加ALA处理,同实施例2,不同之处仅在于在最后ALA作用4个小时后,是作相关定量检测(而不是定量PCR)。
[0188] 3、荧光定量光谱仪检测
[0189] 荧光定量光谱仪检测转染siRNA和/或加ALA处理后的MDA-MB-435细胞内的PpIX浓度,结果如附图4所示。图4中,从左至右依次为:
[0190] (1)只加转染剂处理组(阴性对照组);
[0191] (2)单用0.1mM ALA组;
[0192] (3)50nMPCTsiRNA+0.1mM ALA组:
[0193] 是740FECH-siRNA、1072FECH-siRNA和3389FECH-siRNA的混合siRNAs;
[0194] (4)50nM 740FECH-siRNA+0.1mM ALA组;
[0195] (5)50nM 1072FECH-siRNA+0.1mM ALA组;
[0196] (6)50nM 3389FECH-siRNA+0.1mM ALA组。
[0197] 结果显示,用0.1mM的ALA处理后不能诱导明显的PpIX在肿瘤细胞内积聚,但如果用50nM 3389-FECH-siRNA+0.1mM ALA处理MDA-MB-435细胞,在肿瘤细胞内积聚的PpIX浓度比单用ALA处理组要高出近50倍。而且,其他两组(50nM 740FECH-siRNA+0.1mM ALA组、50nM 1072FECH-siRNA+0.1mM ALA组)也都显著高于单用ALA处理组。
[0198] 因此,分别利用本发明所提供的三个双链siRNA和小剂量ALA联用,均可大幅提高肿瘤细胞内积聚的PpIX浓度,而且三个双链siRNA联用效果更好。
[0199] 4、显微荧光定量检测
[0200] 分别利用0.1mM ALA、50nM 3389FECH-siRNA(单用siRNA阻断FECH表达)的处理、50nM 3389FECH-siRNA+0.1mM ALA(siRNA阻断FECH表达+ALA)的处理,以及50nM 3389FECH-siRNA+1mM ALA(siRNA阻断FECH表达+ALA)的处理,显微荧光定量检测处理后MDA-MB-435细胞内的PpIX的积聚情况。
[0201] 结果如附图5~8所示。
[0202] (1)阴性对照组(单用0.1mM ALA)的显微荧光定量检查的结果如附图5所示:X轴代表背景杂散光,y轴代表PpIX荧光。scatter plots图显示代表PpIX荧光强度的荧光斑点峰值很低,只有约25个PpIX计量单位/每毫秒。
[0203] (2)如图6所示,用50nM 3389-FECH-siRNA处理MDA-MB-435细胞后,代表PpIX荧光强度的荧光斑点峰值高达250个PpIX计量单位/每毫秒。
[0204] 检查的结果表明:单用siRNA阻断肿瘤细胞亚铁螯合酶的表达就可以导致PpIX在肿瘤细胞内积聚,产生有诊断性价值的PpIX红色荧光。
[0205] (3)如图7所示,联用50nM 3389FECH-siRNA+0.1mM ALA处理MDA-MB-435细胞后,可以在肿瘤细胞内检测到PpIX荧光斑点峰值约达490个PpIX计量单位/每毫秒.[0206] (4)如图8所示,用50nM 3389-FECH-siRNA处理MDA-MB-435细胞后,再加上1mM剂量的ALA,可诱导更高浓度的PpIX在肿瘤细胞内积聚,代表PpIX荧光强度的荧光斑点峰值高达3000个PpIX计量单位/每毫秒。
[0207] 这些结果表明了:与单用ALA处理组相比,先用siRNA处理再加上同等剂量的ALA,可诱导肿瘤细胞合成更高产量的内源性PpIX。
[0208] 5、激光共聚焦显微镜检测
[0209] 利用激光共聚焦显微镜检查肿瘤细胞内积聚的PpIX荧光,同时还设置了阴性对照siRNA组,目的是为了证明有效的实验组siRNA没有脱靶作用而设计的一段与实验组siRNA核苷酸数目相同,但打乱序列,并经过“BLAST”证实与人类基因无关的一段siRNA。
[0210] 结果如附图9所示。肿瘤细胞先用siRNA处理再加上0.05mM的极低剂量的ALA,可以在肿瘤细胞内观察到很强的PpIX红色荧光(图9C),而单用ALA组(图9A)和阴性对照siRNA加ALA组(图9B)则观察不到PpIX荧光。
[0211] 实施例5动物体内试验
[0212] 1、材料及仪器
[0213] siRNA由本发明人设计后交由广州锐博生物有限公司合成;ALA购自Sigma-Aldrich Corporation,Beijing local agent,China;阳离子类脂DOTAP、胆固醇Cholesterol、二硬脂酰磷脂酰胆DSPC、二油酰磷脂酰乙醇胺DOPE、叶酸修饰聚乙二醇磷脂DSPE-PEG(2000)-Folate购自美国avanti磷脂公司,HP1100型高效液相色谱仪(Agilent,美国),Nano Series Zen 4003ZetaSizer(Malvern instruments,英国),SPI3800N series SPA-400型原子力显微镜(日本)。
[0214] 2、脂质体各组份摩尔比如表2所示:
[0215] 表2脂质体的组成和配方(1000μl脂质体)
[0216]
[0217] 3、包裹siRNA脂质体的制备:
[0218] 1)安装好旋转蒸发仪的各部件,使得仪器稳固,装上接受瓶,用卡口卡牢,打开冷凝水。将阳离子类脂DOTAP,胆固醇Cholesterol,二硬脂酰磷脂酰胆碱DSPC,二油酰磷脂酰乙醇胺DOPE,叶酸修饰聚乙二醇磷脂DSPE-PEG(2000)-Folate按以上配方的摩尔比溶解在氯仿中混合溶解后加入烧瓶中,装好烧瓶,用卡口卡牢。
[0219] 2)打开水电源,抽真空,待烧瓶吸住后,用升降控制开关将烧瓶置于水浴内。
[0220] 3)打开旋转蒸发仪的电源,转速旋钮慢慢往右旋,调整至稳定的转速。
[0221] 4)加热水浴,设定加热温度58℃。
[0222] 5)在设定温度下旋转蒸发,待烧瓶内液体挥发完全,瓶壁上形成一层均匀薄膜.[0223] 6)蒸发完后使用升降控制开关使烧瓶离开水浴,关闭转速旋钮,停止旋转,打开真空活塞,通大气,取下烧瓶,关闭水泵。在烧瓶内加入2ml PBS溶液以溶解薄膜,[0224] 7)在摇床上避光振摇过夜,
[0225] 8)通过脂质体挤压器,制成100nm~120nm的ALA脂质体。
[0226] 9)测脂质体纳米颗粒的平均粒径、多分散系数以及zeta电位后4℃保存。
[0227] 4、动物实验过程
[0228] (1)选取5周龄雌性裸鼠36只,每组6只,用DMEM培养基制备细胞悬液,皮下注射细7
胞悬液0.2ml(每毫升细胞悬液含有MDA-MB-435细胞1×10个),在SPF级中饲养。
[0229] (2)待肿瘤长至5mm大小时,动物标记好,开始进行实验。
[0230] (3)动物分组处理,共设6组,分别如下:
[0231] 1)单用50μL转染剂瘤内注射组(空白对照组);
[0232] 2)单用1mg/kg ALA瘤内注射组;
[0233] 3)0.067nmol/g of PCTsiRNA+1mg/kg ALA瘤内注射组;
[0234] 4)0.067nmol/g of 740FECH-siRNA+1mg/kg ALA瘤内注射组;
[0235] 5)0.067nmol/g of 1072FECH-siRNA+1mg/kg ALA瘤内注射组;
[0236] 6)0.067nmol/g of 3389FECH-siRNA+1mg/kg ALA瘤内注射组。
[0237] (4)经上处理后用小动物成像仪检测裸鼠体内PpIX荧光。
[0238] 5、结果
[0239] (1)单用50μL转染剂组、单用ALA组的裸鼠均看不到肿瘤组织所产生的PpIX荧光。
[0240] 而联用FECH-siRNA和1mg每公斤体重浓度的小剂量的ALA后,直接用肉眼就能在裸鼠活体上观察到肿瘤组织所产生的PpIX红色荧光(如附图9所示)。
[0241] (2)统计结果如表3所示
[0242] 表3
[0243]
[0244]
[0245] 生物医学实验有一个特点,很多体外实验数据很不错,但一旦进入动物体内实验其效果就大打折扣了,所以,就采用外源性ALA的方式来增加肿瘤细胞内PpIX的合成量以便标示肿瘤病灶而言,实现体内试验的肿瘤灶的PpIX积蓄量才是硬指标,本发明利用RNAi技术成功阻断了亚铁螯合酶基因的表达,在此基础上辅以1mg/kg的极小剂量的外源性ALA,就能达到极佳的肿瘤荧光定位的效果。
[0246] 本发明以纯天然的内源性PpIX作为荧光标示剂,所获得的实验数据会更加客观可信,因为在生命科学的领域中,以原生态的方式做研究是应该被优先考虑的,原生态方式是指被研究对象如肿瘤细胞等并没有被任何外来物标记,其各种生物过程并没有受到外来因素的干扰,不会因为被研究而失真,属真实天然环境下的行为,所以具备将来应用于人体的潜在优势,将PpIX介导的肿瘤荧光成像技术开发成为筛检早期肿瘤的首选方法之一,将会有巨大的医疗及商业价值。
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