1.分离的、合成的或重组的核酸(多核苷酸)，其包含：
(a)，编码至少一个多肽的核酸(多核苷酸)，其中所述核酸包含与SEQ ID NO：1、SEQ ID NO：3、SEQ ID NO：5、SEQ ID NO：7、SEQ ID NO：9、SEQ ID NO：11、SEQID NO：13、SEQ ID NO：15、SEQ ID NO：17、SEQ ID NO：19、SEQ ID NO：21、SEQID NO：23、SEQ ID NO：25、SEQ ID NO：27、SEQ ID NO：29、SEQ ID NO：31、SEQID NO：33、SEQ ID NO：35、SEQ ID NO：37、SEQ ID NO：39、SEQ ID NO：41、SEQID NO：43、SEQ ID NO：45、SEQ ID NO：47、SEQ ID NO：49、SEQ ID NO：51、SEQID NO：53、SEQ ID NO：55、SEQ ID NO：57、SEQ ID NO：59、SEQ ID NO：61、SEQID NO：63、SEQ ID NO：65、SEQ ID NO：67、SEQ ID NO：69、SEQ ID NO：71、SEQID NO：73、SEQ ID NO：75、SEQ ID NO：77、SEQ ID NO：79、SEQ ID NO：81、SEQID NO：83、SEQ ID NO：85、SEQ ID NO：87、SEQ ID NO：89、SEQ ID NO：91、SEQID NO：93、SEQ ID NO：95、SEQ ID NO：
97、SEQ ID NO：99、SEQ ID NO：101、SEQID NO：103、SEQ ID NO：105、SEQ ID NO：107、SEQ ID NO：109、SEQ ID NO：111、SEQ ID NO：113、SEQ ID NO：115、SEQ ID NO：117、SEQ ID NO：
119、SEQ IDNO：121、SEQ ID NO：123、SEQ ID NO：125、SEQ ID NO：127、SEQ ID NO：129、SEQ ID NO：131、SEQ ID NO：133、SEQ ID NO：135、SEQ ID NO：137、SEQ IDNO：139、SEQ ID NO：
141、SEQ ID NO：143、SEQ ID NO：145、SEQ ID NO：147、SEQ ID NO：149、SEQ ID NO：151、SEQ ID NO：153、SEQ ID NO：155、SEQ IDNO：157、SEQ ID NO：159、SEQ ID NO：161、SEQ ID NO：163、SEQ ID NO：165、SEQ ID NO：167、SEQ ID NO：169、SEQ ID NO：171、SEQ ID NO：
173、SEQ IDNO：175、SEQ ID NO：177、SEQ ID NO：179、SEQ ID NO：181、SEQ ID NO：183、SEQ ID NO：185、SEQ ID NO：187、SEQ ID NO：189、SEQ ID NO：191、SEQ IDNO：193、SEQ ID NO：
195、SEQ ID NO：197、SEQ ID NO：199、SEQ ID NO：201、SEQ ID NO：203、SEQ ID NO：205、SEQ ID NO：207、SEQ ID NO：209、SEQ IDNO：211、SEQ ID NO：213、SEQ ID NO：215、SEQ ID NO：217、SEQ ID NO：219、SEQID NO：221、SEQ ID NO：223、SEQ ID NO：225、SEQ ID NO：227、SEQ ID NO：229、SEQ ID NO：231、SEQ ID NO：233、SEQ ID NO：235、SEQ ID NO：237、SEQ IDNO：239、SEQ ID NO：241、SEQ ID NO：243、SEQ ID NO：245、SEQ ID NO：247、SEQ ID NO：
249、SEQ ID NO：251、SEQ ID NO：253、SEQ ID NO：255、SEQ IDNO：257、SEQ ID NO：259、SEQ ID NO：261、SEQ ID NO：263、SEQ ID NO：265、SEQ ID NO：267、SEQ ID NO：269、SEQ ID NO：
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871、SEQ ID NO：873、SEQ IDNO：875、SEQ ID NO：877、SEQ ID NO：879、SEQ ID NO：881、SEQ ID NO：883、SEQ ID NO：885、SEQ ID NO：887、SEQ ID NO：889、SEQ ID NO：891、SEQ IDNO：
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915、SEQ ID NO：917、SEQ ID NO：919、SEQ IDNO：921、SEQ ID NO：923、SEQ ID NO：925、SEQ ID NO：927、SEQ ID NO：929、SEQ ID NO：931、SEQ ID NO：933、SEQ ID NO：935、SEQ ID NO：
937、SEQ IDNO：939、SEQ ID NO：941、SEQ ID NO：943、SEQ ID NO：945、SEQ ID NO：947、SEQ ID NO：949、SEQ ID NO：951、SEQ ID NO：953、SEQ ID NO：955、SEQ IDNO：957、SEQ ID NO：
959、SEQ ID NO：96I、SEQ ID NO：963、SEQ ID NO：965、SEQ ID NO：967、SEQ ID NO：969、SEQ ID NO：971、SEQ ID NO：973和/或SEQ IDNO：975的核酸(多核苷酸)序列具有至少约50％、51％、52％、53％、54％、55％、56％、57％、58％、59％、60％、61％、62％、63％、64％、
65％、66％、67％、68％、69％、70％、71％、72％、73％、74％、75％、76％、77％、78％、79％、
80％、81％、82％、83％、84％、85％、86％、87％、88％、89％、90％、91％、92％、93％、94％、
95％、96％、97％、98％、99％或更大或完全(100％)序列同一性的序列，其中所述核酸编码至少一个具有转移酶活性，例如转氨酶活性，例如d-氨基酸转移酶活性或ω-转氨酶活性，和/或氧化还原酶活性，例如脱氢酶活性，例如d-氨基酸脱氢酶活性的多肽，或编码能产生转移酶特异性抗体，例如转氨酶，例如d-氨基酸转移酶，和/或氧化还原酶，例如脱氢酶，例如d-氨基酸脱氢酶特异性抗体的多肽或肽(充当表位或免疫原的多肽或肽)，
(b)，(a)的核酸(多核苷酸)，其中所述序列同一性如下测定：(A)通过用序列比较
算法进行分析或通过视觉检测，或(B)在至少约20、30、40、50、75、100、150、200、250、300、
350、400、450、500、550、600、650、700、750、800、850、900、950、1000、1050、1100、1150或更多个残基的区域内，或在cDNA、转录物(mRNA)或基因的全长区域内；
(c)，(a)或(b)的核酸(多核苷酸)，其中所述序列比较算法是BLAST第2.2.2版算
法，其中过滤设置被设置为blastall-p blastp-d″nr pataa″-F F，并且所有其它选项被设置为默认；
(d)，编码至少一个多肽或肽的核酸(多核苷酸)，其中所述核酸包含这样的序列，其在严格条件下与包含SEQ ID NO：1、SEQ ID NO：3、SEQ ID NO：5、SEQ IDNO：7、SEQ ID NO：9、SEQ ID NO：11、SEQ ID NO：13、SEQ ID NO：15、SEQ IDNO：17、SEQ ID NO：19、SEQ ID NO：
21、SEQ ID NO：23、SEQ ID NO：25、SEQ IDNO：27、SEQ ID NO：29、SEQ ID NO：31、SEQ ID NO：33、SEQ ID NO：35、SEQ IDNO：37、SEQ ID NO：39、SEQ ID NO：41、SEQ ID NO：43、SEQ ID NO：45、SEQ IDNO：47、SEQ ID NO：49、SEQ ID NO：51、SEQ ID NO：53、SEQ ID NO：55、SEQ IDNO：57、SEQ ID NO：59、SEQ ID NO：61、SEQ ID NO：63、SEQ ID NO：65、SEQ IDNO：67、SEQ ID NO：69、SEQ ID NO：71、SEQ ID NO：73、SEQ ID NO：75、SEQ IDNO：77、SEQ ID NO：79、SEQ ID NO：81、SEQ ID NO：83、SEQ ID NO：85、SEQ IDNO：87、SEQ ID NO：89、SEQ ID NO：91、SEQ ID NO：93、SEQ ID NO：95、SEQ IDNO：97、SEQ ID NO：99、SEQ ID NO：101、SEQ ID NO：103、SEQ ID NO：105、SEQID NO：107、SEQ ID NO：109、SEQ ID NO：111、SEQ ID NO：113、SEQ ID NO：115、SEQ ID NO：117、SEQ ID NO：119、SEQ ID NO：121、SEQ ID NO：123、SEQ IDNO：125、SEQ ID NO：127、SEQ ID NO：129、SEQ ID NO：131、SEQ ID NO：133、SEQ ID NO：135、SEQ ID NO：137、SEQ ID NO：139、SEQ ID NO：141、SEQ IDNO：143、SEQ ID NO：145、SEQ ID NO：147、SEQ ID NO：149、SEQ ID NO：151、SEQ ID NO：153、SEQ ID NO：155、SEQ ID NO：157、SEQ ID NO：159、SEQ IDNO：161、SEQ ID NO：163、SEQ ID NO：165、SEQ ID NO：167、SEQ ID NO：169、SEQ ID NO：171、SEQ ID NO：173、SEQ ID NO：175、SEQ ID NO：177、SEQ IDNO：179、SEQ ID NO：181、SEQ ID NO：183、SEQ ID NO：185、SEQ ID NO：187、SEQ ID NO：189、SEQ ID NO：
191、SEQ ID NO：193、SEQ ID NO：195、SEQ IDNO：197、SEQ ID NO：199、SEQ ID NO：201、SEQ ID NO：203、SEQ ID NO：205、SEQ ID NO：207、SEQ ID NO：209、SEQ ID NO：211、SEQ ID NO：
213、SEQ IDNO：215、SEQ ID NO：217、SEQ ID NO：219、SEQ ID NO：221、SEQ ID NO：223、SEQ ID NO：225、SEQ ID NO：227、SEQ ID NO：229、SEQ ID NO：231、SEQ IDNO：233、SEQ ID NO：
235、SEQ ID NO：237、SEQ ID NO：239、SEQ ID NO：241、SEQ ID NO：243、SEQ ID NO：245、SEQ ID NO：247、SEQ ID NO：249、SEQ IDNO：251、SEQ ID NO：253、SEQ ID NO：255、SEQ ID NO：
257、SEQ ID NO：259、SEQ ID NO：261、SEQ ID NO：263、SEQ ID NO：265、SEQ ID NO：267、SEQ IDNO：269、SEQ ID NO：271、SEQ ID NO：273、SEQ ID NO：275、SEQ ID NO：277、SEQ ID NO：279、SEQ ID NO：281、SEQ ID NO：283、SEQ ID NO：285、SEQ IDNO：287、SEQ ID NO：289、SEQ ID NO：291、SEQ ID NO：293、SEQ ID NO：295、SEQ ID NO：297、SEQ ID NO：299、SEQ ID NO：301、SEQ ID NO：303、SEQ IDNO：305、SEQ ID NO：307、SEQ ID NO：309、SEQ ID NO：311、SEQ ID NO：313、SEQID NO：315、SEQ ID NO：317、SEQ ID NO：319、SEQ ID NO：321、SEQ ID NO：323、SEQ ID NO：325、SEQ ID NO：327、SEQ ID NO：329、SEQ ID NO：331、SEQ IDNO：333、SEQ ID NO：335、SEQ ID NO：337、SEQ ID NO：339、SEQ ID NO：341、SEQ ID NO：343、SEQ ID NO：345、SEQ ID NO：347、SEQ ID NO：349、SEQ IDNO：351、SEQ ID NO：353、SEQ ID NO：355、SEQ ID NO：357、SEQ ID NO：359、SEQ ID NO：361、SEQ ID NO：363、SEQ ID NO：365、SEQ ID NO：367、SEQ IDNO：369、SEQ ID NO：371、SEQ ID NO：373、SEQ ID NO：375、SEQ ID NO：377、SEQ ID NO：379、SEQ ID NO：381、SEQ ID NO：383、SEQ ID NO：385、SEQ IDNO：387、SEQ ID NO：389、SEQ ID NO：391、SEQ ID NO：393、SEQ ID NO：395、SEQ ID NO：397、SEQ ID NO：
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869、SEQ ID NO：871、SEQ ID NO：873、SEQ ID NO：875、SEQ ID NO：877、SEQ ID NO：879、SEQ ID NO：881、SEQ ID NO：883、SEQ ID NO：885、SEQ IDNO：887、SEQ ID NO：889、SEQ ID NO：891、SEQ ID NO：893、SEQ ID NO：895、SEQ ID NO：897、SEQ ID NO：899，SEQ ID NO：
901、SEQ ID NO：903、SEQ IDNO：905、SEQ ID NO：907、SEQ ID NO：909、SEQ ID NO：911、SEQ ID NO：913、SEQID NO：915、SEQ ID NO：917、SEQ ID NO：919、SEQ ID NO：921、SEQ ID NO：
923、SEQ ID NO：925、SEQ ID NO：927、SEQ ID NO：929、SEQ ID NO：931、SEQ IDNO：933、SEQ ID NO：935、SEQ ID NO：937、SEQ ID NO：939、SEQ ID NO：941、SEQ ID NO：943、SEQ ID NO：
945、SEQ ID NO：947、SEQ ID NO：949、SEQ IDNO：951、SEQ ID NO：953、SEQ ID NO：955、SEQ ID NO：957、SEQ ID NO：959、SEQ ID NO：961、SEQ ID NO：963、SEQ ID NO：965、SEQ ID NO：
967、SEQ IDNO：969、SEQ ID NO：971、SEQ ID NO：973和/或SEQ ID NO：975的核酸(多核苷酸)序列的核酸杂交，
其中所述多肽或肽具有转移酶活性，例如转氨酶活性，例如d-氨基酸转移酶活性或
ω-转氨酶活性，和/或氧化还原酶活性，例如脱氢酶活性，例如d-氨基酸脱氢酶活性，或能产生转移酶特异性抗体，例如转氨酶，例如d-氨基酸转移酶，和/或氧化还原酶，例如脱氢酶，例如d-氨基酸脱氢酶特异性抗体(充当表位或免疫原的多肽或肽)，
并且所述严格条件包括在约65℃的温度下在0.2×SSC中洗涤约15分钟的洗涤步骤；
(e)，(a)至(d)任一项的核酸(多核苷酸)，其具有至少约20、25、30、50、75、100、125、
150、175、200、225、300、350、400、450、500、550、600、650、700、750、800、850、900、950、1000、
1050、1100、1150或更多个核苷酸残基的长度，或者基因或转录物的全长；
(g)，编码至少一个多肽的核酸(多核苷酸)，所述多肽具有转移酶活性，例如转氨酶活性，例如d-氨基酸转移酶活性或ω-转氨酶活性，和/或氧化还原酶活性，例如脱氢酶活性，例如d-氨基酸脱氢酶活性，其中所述多肽包含SEQ ID NO：2、SEQ ID NO：4、SEQ ID NO：
6、SEQ ID NO：8、SEQ ID NO：10、SEQ ID NO：12、SEQID NO：14、SEQ ID NO：16、SEQ ID NO：
18、SEQ ID NO：20、SEQ ID NO：22、SEQID NO：24、SEQ ID NO：26、SEQ ID NO：28、SEQ ID NO：30、SEQ ID NO：32、SEQID NO：34、SEQ ID NO：36、SEQ ID NO：38、SEQ ID NO：40、SEQ ID NO：42、SEQID NO：44、SEQ ID NO：46、SEQ ID NO：48、SEQ ID NO：50、SEQ ID NO：52、SEQID NO：54、SEQ ID NO：56、SEQ ID NO：58、SEQ ID NO：60、SEQ ID NO：62、SEQID NO：64、SEQ ID NO：66、SEQ ID NO：68、SEQ ID NO：70、SEQ ID NO：72、SEQID NO：74、SEQ ID NO：76、SEQ ID NO：78、SEQ ID NO：80、SEQ ID NO：82、SEQID NO：84、SEQ ID NO：86、SEQ ID NO：88、SEQ ID NO：90、SEQ ID NO：92、SEQID NO：94、SEQ ID NO：96、SEQ ID NO：98、SEQ ID NO：100、SEQ ID NO：102、SEQID NO：104、SEQ ID NO：106、SEQ ID NO：108、SEQ ID NO：110、SEQ ID NO：
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46或表55的一个、几个或全部修饰的SEQ ID NO：220、SEQ ID NO：222、SEQID NO：224、SEQ ID NO：226、SEQ ID NO：228、SEQ ID NO：230、SEQ ID NO：232、SEQ ID NO：234、SEQ ID NO：
236、SEQ ID NO：238、SEQ ID NO：240、SEQ IDNO：242、SEQ ID NO：244、SEQ ID NO：246、SEQ ID NO：248、SEQ ID NO：250、SEQ ID NO：252、SEQ ID NO：254、SEQ ID NO：256、SEQ ID NO：
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750、SEQ ID NO：752、SEQ ID NO：754、SEQ ID NO：756、SEQ ID NO：758、SEQ ID NO：760、SEQ ID NO：762、SEQ IDNO：764、SEQ ID NO：766、SEQ ID NO：768、SEQ ID NO：770、SEQ ID NO：772、SEQ ID NO：774、SEQ ID NO：776、SEQ ID NO：778、SEQ ID NO：780、SEQ IDNO：782、SEQ ID NO：784、SEQ ID NO：786、SEQ ID NO：788、SEQ ID NO：790、SEQ ID NO：792、SEQ ID NO：794、SEQ ID NO：796、SEQ ID NO：798、SEQ IDNO：800、SEQ ID NO：802、SEQ ID NO：804、SEQ ID NO：808、SEQ ID NO：808、SEQ ID NO：810、SEQ ID NO：812、SEQ ID NO：814、SEQ ID NO：816、SEQ IDNO：818、SEQ ID NO：820、SEQ ID NO：822、SEQ ID NO：824、SEQ ID NO：826、SEQ ID NO：828、SEQ ID NO：830、SEQ ID NO：832、SEQ ID NO：834、SEQ IDNO：836、SEQ ID NO：838、SEQ ID NO：840、SEQ ID NO：842、SEQ ID NO：844、SEQ ID NO：846、SEQ ID NO：
848、SEQ ID NO：850、SEQ ID NO：852、SEQ IDNO：854、SEQ ID NO：856、SEQ ID NO：858、SEQ ID NO：860、SEQ ID NO：862、SEQ ID NO：864、SEQ ID NO：866、SEQ ID NO：868、SEQ ID NO：
870、SEQ IDNO：872、SEQ ID NO：874、SEQ ID NO：876、SEQ ID NO：878、SEQ ID NO：880、SEQ ID NO：882、SEQ ID NO：884、SEQ ID NO：886、SEQ ID NO：888、SEQ IDNO：890、SEQ ID NO：
892、SEQ ID NO：894、SEQ ID NO：896、SEQ ID NO：898、SEQ ID NO：900、SEQ ID NO：902、SEQ ID NO：904、SEQ ID NO：906、SEQ IDNO：908、SEQ ID NO：910、SEQ ID NO：912、SEQ ID NO：914、SEQ ID NO：916、SEQ ID NO：918、SEQ ID NO：920、SEQ ID NO：922、SEQ ID NO：
924、SEQ IDNO：926、SEQ ID NO：928、SEQ ID NO：930、SEQ ID NO：932、SEQ ID NO：934、SEQ ID NO：936、SEQ ID NO：938、SEQ ID NO：940、SEQ ID NO：942、SEQ IDNO：944、SEQ ID NO：
946、SEQ ID NO：948、SEQ ID NO：950、SEQ ID NO：952、SEQ ID NO：954、SEQ ID NO：956、SEQ ID NO：958、SEQ ID NO：960、SEQ IDNO：962、SEQ ID NO：964、SEQ ID NO：966、SEQ ID NO：968、SEQ ID NO：970、SEQ ID NO：972、SEQ ID NO：974和/或SEQ ID NO：976的序列，或其酶促活性片段；
(i)，(A)、(a)至(h)任一项的并且编码多肽的核酸(多核苷酸)，所述多肽具有至少
一个保守性氨基酸置换并且保留其转移酶活性，例如转氨酶活性，例如d-氨基酸转移酶活性，或ω-转氨酶活性，和/或氧化还原酶活性，例如脱氢酶活性，例如d-氨基酸脱氢酶活性；或(B)、(i)(A)的核酸，其中所述至少一个保守性氨基酸置换包括用另一类似特征的氨基酸置换氨基酸；或者，保守性置换包括：用另一脂肪族氨基酸替换脂肪族氨基酸；用苏氨酸替换丝氨酸或反之亦然；用另一酸性残基替换酸性残基；用另一含有酰胺基团的残基替换含有酰胺基团的残基；用另一碱性残基交换碱性残基；或用另一芳香族残基替换芳香族残基；
(j)，(a)至(i)任一项的、编码多肽的核酸(多核苷酸)，所述多肽具有转移酶活性，例如转氨酶活性，例如d-氨基酸转移酶活性或ω-转氨酶活性，和/或氧化还原酶活性，例如脱氢酶活性，例如d-氨基酸脱氢酶活性但缺少信号序列、前原结构域、结合结构域和/或其它结构域；
(k)，(j)的核酸(多核苷酸)，其中所述结合结构域包括下列或由下列组成：NAD、
NAD(P)、钙、硫胺素、FAD、锌、DNA和/或硫辛酰结合结构域；
(l)，(a)至(k)任一项的、编码多肽的核酸(多核苷酸)，所述多肽具有转移酶活性，例如转氨酶活性，例如d-氨基酸转移酶活性或ω-转氨酶活性，和/或氧化还原酶活性，例如脱氢酶活性，例如d-氨基酸脱氢酶活性，进一步包括异源序列；
(m)，(l)的核酸(多核苷酸)，其中所述异源序列包括编码下列的序列或由编码下列
的序列组成：(A)、异源信号序列、异源结构域、异源结合结构域、异源锚定结构域、异源催化结构域(CD)或其组合；(B)、(l)的序列，其中所述异源信号序列、结合结构域或催化结构域(CD)得自异源酶；或者(C)、标记、表位、靶向肽、可切割序列、可检测部分或酶；
(n)，(m)的核酸(多核苷酸)，其中所述异源结合结构域包括下列或由下列组成：NAD、NAD(P)、钙、硫胺素、FAD、锌、DNA和/或硫辛酰结合结构域；
(o)，(m)的核酸(多核苷酸)，其中所述异源信号序列将编码的蛋白靶向液泡、内质网、叶绿体或淀粉颗粒；或
(p)，核酸序列(多核苷酸)，其与(a)至(o)任一项的序列全部(完全)互补。
2.权利要求1的分离的、合成的或重组的核酸，其中所述转移酶，例如转氨酶，例如
d-氨基酸转移酶，和/或氧化还原酶，例如脱氢酶，例如d-氨基酸脱氢酶活性包括催化化学基团的转移，催化转氨作用，催化下列反应：D-丙氨酸+2-氧化戊二酸＜＝＞丙酮酸+D-谷氨酸，和/或催化氧化还原反应，催化氢原子的去除，和/或催化下列反应：D-氨基酸+H2O+受体＜＝＞2-含氧酸+NH3+还原的受体。
3.权利要求1的分离的、合成的或重组的核酸，其中(a)所述转移酶活性，例如转氨酶
活性，例如d-氨基酸转移酶活性，和/或氧化还原酶活性，例如脱氢酶活性，例如d-氨基酸脱氢酶活性是热稳定的；或(b)所述多肽在包括0℃至约20℃、约20℃至约37℃、约37℃至约50℃、约50℃至约70℃、约70℃至约75℃、约75℃至约80℃、约80℃至约85℃、约85℃至约90℃、约90℃至约95℃、约95℃至约100℃、约100℃至约110℃或更高的温度范围的条件下保持转移酶活性，例如转氨酶活性，例如d-氨基酸转移酶活性或ω-转氨酶活性，和/或氧化还原酶活性，例如脱氢酶活性，例如d-氨基酸脱氢酶活性。
4.权利要求1的分离的、合成的或重组的核酸，其中(a)所述转移酶活性，例如转氨酶
活性，例如d-氨基酸转移酶活性，和/或氧化还原酶活性，例如脱氢酶活性，例如d-氨基酸脱氢酶活性是耐热的；或(b)所述多肽在暴露于约0℃至约20℃、约20℃至约37℃、约
37℃至约50℃、约50℃至约70℃、约70℃至约75℃、约75℃至约80℃、约80℃至约85℃、约85℃至约90℃、约90℃至约95℃、约95℃至约100℃、约100℃至约110℃或更高的范围内的温度后保持转移酶活性，例如转氨酶活性，例如d-氨基酸转移酶活性或ω-转氨酶活性，和/或氧化还原酶活性，例如脱氢酶活性，例如d-氨基酸脱氢酶活性。
5.权利要求1的分离的、合成的或重组的核酸，其中所述转移酶活性，例如转氨酶活
性，例如d-氨基酸转移酶活性，和/或氧化还原酶活性，例如脱氢酶活性，例如d-氨基酸脱氢酶活性在包括约pH 6.5、pH 6、pH 5.5、pH 5、pH 4.5、pH 4.0、pH 3.5、pH 3.0或更小的(酸性更大的)pH的酸性条件下保持活性，或者在暴露于包括约pH 6.5、pH 6、pH 5.5、pH
5、pH 4.5、pH 4.0、pH 3.5、pH 3.0或更小的(酸性更大的)pH的酸性条件后保持转移酶活性，例如转氨酶活性，例如d-氨基酸转移酶活性或ω-转氨酶活性；或者所述转氨酶活性是催化异丁胺向异丁醛转化的ω-转氨酶活性；和/或氧化还原酶活性，例如脱氢酶活性，例如d-氨基酸脱氢酶活性。
6.权利要求1的分离的、合成的或重组的核酸，其中所述转移酶活性，例如转氨酶活
性，例如d-氨基酸转移酶活性，和/或氧化还原酶活性，例如脱氢酶活性，例如d-氨基酸脱氢酶活性在包括约pH 7、pH 7.5、pH 8.0、pH 8.5、pH 9、pH 9.5、pH 10、pH 10.5、pH 11、pH 11.5、pH 12、pH 12.5或更大(碱性更大)的碱性条件下保持活性，或者在暴露于包括约pH 7、pH 7.5、pH 8.0、pH 8.5、pH 9、pH 9.5、pH 10、pH 10.5、pH 11、pH 11.5、pH 12、pH 12.5或更大(碱性更大)的碱性条件后保持转移酶活性，例如转氨酶活性，例如d-氨基酸转移酶活性，和/或氧化还原酶活性或ω-转氨酶活性，例如脱氢酶活性，例如d-氨基酸脱氢酶活性。
7.核酸探针，用于鉴定编码多肽的核酸，所述多肽具有转移酶活性，例如转氨酶活性，例如d-氨基酸转移酶活性，和/或氧化还原酶活性或ω-转氨酶活性，例如脱氢酶活性，例如d-氨基酸脱氢酶活性，其中所述探针包含权利要求1-6任一项所述核酸的至少约10、
15、20、25、30、35、40、45、50、55、60、65、70、75、100、125、150、175、200、225个或更多个连续碱基。
8.扩增引物对，用于扩增编码多肽的核酸，所述多肽具有转移酶活性，例如转氨酶活
性，例如d-氨基酸转移酶活性，和/或氧化还原酶活性或ω-转氨酶活性，例如脱氢酶活性，例如d-氨基酸脱氢酶活性，其中(a)，所述引物对能够扩增包含权利要求1-6任一项所述序列的核酸；或者(b)，(a)的引物对，其中扩增引物对的成员包含寡核苷酸，所述寡核苷酸包含所述序列的至少约10至50个连续碱基，或所述序列的约10、11、12、13、14、15、16、
17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35个或更多个连续碱基。
9.扩增引物对，其中所述引物对包含第一成员和第二成员，所述第一成员具有权利要
求1-6任一项所述序列的约前(5’)10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、
25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35个或更多个残基所示的序列，以及所述第二成员具有所述第一成员互补链的约前(5’)10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、
26、27、28、29、30、31、32、33、34、35个或更多个残基所示的序列。
10.编码转移酶，例如转氨酶，例如d-氨基酸转移酶，和/或氧化还原酶，例如脱氢酶，例如d-氨基酸脱氢酶的核酸，其应用权利要求8或权利要求9所述的扩增引物对通过多核苷酸的扩增而产生，其中任选地所述扩增通过聚合酶链反应(PCR)进行。
11.权利要求10的编码转移酶，例如转氨酶，例如d-氨基酸转移酶，和/或氧化还原
酶，例如脱氢酶，例如d-氨基酸脱氢酶的核酸，其中所述核酸通过基因文库的扩增而产生，其中任选地所述基因文库是环境文库。
12.扩增编码多肽的核酸的方法，所述多肽具有转移酶活性，例如转氨酶活性，例如
d-氨基酸转移酶活性，和/或氧化还原酶活性或ω-转氨酶活性，例如脱氢酶活性，例如d-氨基酸脱氢酶活性，所述方法包括用权利要求8或权利要求9的扩增引物序列对扩增模板核酸。
13.表达盒、载体或克隆运载体，其包含含有权利要求1-6任一项所述序列的核酸，其
中任选地所述克隆运载体包括病毒载体、质粒、噬菌体(phage)、噬菌粒、黏粒、F黏粒、噬菌体(bacteriophage)或人工染色体。
14.权利要求13的克隆运载体，其中所述病毒载体包括腺病毒载体、逆转录病毒载体
或腺伴随病毒载体，或者所述人工染色体包括细菌人工染色体(BAC)、噬菌体P1衍生的载体(PAC)、酵母人工染色体(YAC)或哺乳动物人工染色体(MAC)。
15.转化细胞，其包含具有权利要求1所述序列的核酸，或包括权利要求13或权利要
求14所述的表达盒、载体或克隆运载体，其中任选地所述细胞是细菌细胞、哺乳动物细胞、真菌细胞、酵母细胞、昆虫细胞或植物细胞。
16.转基因非人动物，其包括具有权利要求1-6任一项所述序列的核酸，或者包括权利
要求13或权利要求14所述的表达盒、载体或克隆运载体，或者权利要求15所述的转化细胞，其中任选地所述动物是小鼠、大鼠、兔、绵羊、猪、鸡、山羊、鱼或牛。
17.转基因植物、植物部分或植物种子，其包括具有权利要求1所述序列的核酸，其中
任选地所述植物是玉米植株、高粱植株、马铃薯植株、番茄植株、小麦植株、油料种子植株、油菜籽植株、大豆植株、稻植株、大麦植株、草类、棉花植株、棉籽植株、棕榈、芝麻植株、花生植株、向日葵植株或烟草植株。
18.反义寡核苷酸，其包含与权利要求1中任一种所述序列互补的核酸序列，或能够与
权利要求1中任一种所述序列在严格条件下杂交的核酸序列，其中任选地所述反义寡核苷酸长度为约10至50、约20至60、约30至70、约40至80或约60至100个碱基，
以及任选地所述严格条件包括这样的洗涤步骤，其包含在约65℃温度下于0.2×SSC
中洗涤约15分钟。
19.双链抑制RNA(RNAi)分子，其包括权利要求1-6任一项所述序列的子序列，其中
任选地所述RNAi长度为约10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、
28、29或30或更多个双链体核苷酸。
20.抑制转移酶，例如转氨酶，例如d-氨基酸转移酶，和/或氧化还原酶，例如脱氢酶，例如d-氨基酸脱氢酶信息在细胞中翻译或者抑制转移酶，例如转氨酶，例如d-氨基酸转移酶，和/或氧化还原酶，例如脱氢酶，例如d-氨基酸脱氢酶在细胞中表达的方法，所述方法包括给予所述细胞或在所述细胞中表达权利要求18所述的反义寡核苷酸或权利要求19所述的双链抑制RNA(iRNA)分子。
21.分离的、合成的或重组的多肽或肽，其具有转移酶活性，例如转氨酶活性，例如
d-氨基酸转移酶活性或ω-转氨酶活性，和/或氧化还原酶活性，例如脱氢酶活性，例如d-氨基酸脱氢酶活性，其
(a)，包含与SEQ ID NO：2、SEQ ID NO：4、SEQ ID NO：6、SEQ ID NO：8、SEQ ID NO：10、SEQ ID NO：12、SEQ ID NO：14、SEQ ID NO：16、SEQ ID NO：18、SEQ ID NO：20、SEQ ID NO：
22、SEQ ID NO：24、SEQ ID NO：26、SEQ ID NO：28、SEQ ID NO：30、SEQ ID NO：32、SEQ ID NO：34、SEQ ID NO：36、SEQ ID NO：38、SEQ ID NO：40、SEQ ID NO：42、SEQ ID NO：44、SEQ ID NO：46、SEQ ID NO：48、SEQ ID NO：50、SEQ ID NO：52、SEQ ID NO：54、SEQ ID NO：56、SEQ ID NO：58、SEQ ID NO：60、SEQ ID NO：62、SEQ ID NO：64、SEQ ID NO：66、SEQ ID NO：
68、SEQ ID NO：70、SEQ ID NO：72、SEQ ID NO：74、SEQ ID NO：76、SEQ ID NO：78、SEQ ID NO：80、SEQ ID NO：82、SEQ ID NO：84、SEQ ID NO：86、SEQ ID NO：88、SEQ ID NO：90、SEQ ID NO：92、SEQ ID NO：94、SEQ ID NO：96、SEQ ID NO：98、SEQ ID NO：100、SEQ ID NO：102、SEQ ID NO：104、SEQ ID NO：106、SEQ IDNO：108、SEQ ID NO：110、SEQ ID NO：112、SEQ ID NO：114、SEQ ID NO：116、SEQID NO：118、SEQ ID NO：120、SEQ ID NO：122、SEQ ID NO：124、SEQ ID NO：126、SEQ ID NO：128、SEQ ID NO：130、SEQ ID NO：132、SEQ ID NO：134、SEQ IDNO：136、SEQ ID NO：138、SEQ ID NO：140、SEQ ID NO：142、SEQ ID NO：143、SEQ ID NO：
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870、SEQ ID NO：872、SEQ ID NO：874、SEQ IDNO：876、SEQ ID NO：878、SEQ ID NO：880、SEQ ID NO：882、SEQ ID NO：884、SEQ ID NO：886、SEQ ID NO：888、SEQ ID NO：890、SEQ ID NO：
892、SEQ IDNO：894、SEQ ID NO：896、SEQ ID NO：898、SEQ ID NO：900、SEQ ID NO：902、SEQ ID NO：904、SEQ ID NO：906、SEQ ID NO：908、SEQ ID NO：910、SEQ IDNO：912、SEQ ID NO：
914、SEQ ID NO：916、SEQ ID NO：918、SEQ ID NO：920、SEQ ID NO：922、SEQ ID NO：924、SEQ ID NO：926、SEQ ID NO：928、SEQ IDNO：930、SEQ ID NO：932、SEQ ID NO：934、SEQ ID NO：936、SEQ ID NO：938、SEQ ID NO：940、SEQ ID NO：942、SEQ ID NO：944、SEQ ID NO：
946、SEQ IDNO：948、SEQ ID NO：950、SEQ ID NO：952、SEQ ID NO：954、SEQ ID NO：956、SEQ ID NO：958、SEQ ID NO：960、SEQ ID NO：962、SEQ ID NO：964、SEQ IDNO：966、SEQ ID NO：
968、SEQ ID NO：970、SEQ ID NO：972、SEQ ID NO：974和/或SEQ ID NO：976的氨基酸序列具有至少约50％、51％、52％、53％、54％、55％、56％、57％、58％、59％、60％、61％、62％、
63％、64％、65％、66％、67％、68％、69％、70％、71％、72％、73％、74％、75％、76％、77％、
78％、79％、80％、81％、82％、83％、84％、85％、86％、87％、88％、89％、90％、91％、92％、
93％、94％、95％、96％、97％、98％、99％或更多或具有100％(完全)序列同一性的氨基酸序列，或其酶促活性片段，其中(i)或(ii)的所述多肽或肽具有转移酶活性，例如转氨酶活性，例如d-氨基酸转移酶活性或ω-转氨酶活性，和/或氧化还原酶活性，例如脱氢酶活性，例如d-氨基酸脱氢酶活性，或者所述多肽或肽能产生转移酶特异性抗体，例如转氨酶，例如d-氨基酸转移酶，和/或氧化还原酶，例如脱氢酶，例如d-氨基酸脱氢酶特异性抗体(充当表位或免疫原的多肽或肽)，
(b)，(a)的多肽或肽和/或其酶促活性子序列(片段)，其中所述序列同一性如下测
定：(A)通过用序列比较算法进行分析或通过视觉检测，或(B)在至少约20、25、30、35、40、
45、50、55、60、75、100、150、200、250、300或更多个氨基酸残基的区域内，或者在所述多肽或肽或酶的全长内，
(c)，(a)或(b)的多肽或肽，其中所述序列同一性通过用序列比较算法进行分析或通
过视觉检测而测定，并且任选地所述序列比较算法是BLAST第2.2.2版算法，其中过滤设置被设置为blastall-p blastp-d″nr pataa″-F F，并且所有其它选项被设置为默认；
(d)，由权利要求1至6任一项所述核酸编码的氨基酸序列和/或其酶促活性子序列
(片段)，其中所述多肽具有(i)转移酶活性，例如转氨酶活性，例如d-氨基酸转移酶活性或ω-转氨酶活性，和/或氧化还原酶活性，例如脱氢酶活性，例如d-氨基酸脱氢酶活性，或(ii)具有免疫原活性，原因在于它能产生与具有(a)的序列的多肽特异性结合的抗体；
(e)，(a)至(d)任一项的氨基酸序列，并且包括至少一个氨基酸残基保守性置换，并且所述多肽或肽保留转移酶活性，例如转氨酶活性，例如d-氨基酸转移酶活性，和/或氧化还原酶活性，例如脱氢酶活性，例如d-氨基酸脱氢酶活性；
(e)，(d)的氨基酸序列，其中所述保守性置换包括用另一脂肪族氨基酸替换脂肪族氨
基酸；用苏氨酸替换丝氨酸或反之亦然；用另一酸性残基替换酸性残基；用另一含有酰胺基团的残基替换含有酰胺基团的残基；用另一碱性残基交换碱性残基；或用另一芳香族残基替换芳香族残基，或其组合，
(f)，(e)的氨基酸序列，其中所述脂肪族残基包括丙氨酸、缬氨酸、亮氨酸、异亮氨酸或其合成等同物；所述酸性残基包括天冬氨酸、谷氨酸或其合成等同物；所述含有酰胺基团的残基包括天冬氨酸、谷氨酸或其合成等同物；所述碱性残基包括赖氨酸、精氨酸或其合成等同物；或者，所述芳香族残基包括苯丙氨酸、酪氨酸或其合成等同物；
(g)，(a)至(f)任一项的多肽，其具有转移酶活性，例如转氨酶活性，例如d-氨基酸转移酶活性或ω-转氨酶活性，和/或氧化还原酶活性，例如脱氢酶活性，例如d-氨基酸脱氢酶活性但缺少信号序列、前原结构域、结合结构域和/或其它结构域，
(h)，(g)的多肽，其中所述结合结构域包括下列或由下列组成：NAD、NAD(P)、钙、硫胺素、FAD、锌、DNA和/或硫辛酰结合结构域；
(i)，(a)至(h)任一项的多肽，其具有转移酶活性，例如转氨酶活性，例如d-氨基酸转移酶活性或ω-转氨酶活性，和/或氧化还原酶活性，例如脱氢酶活性，例如d-氨基酸脱氢酶活性，进一步包括异源序列；
(j)，(i)的多肽，其中所述异源序列包括下列或由下列组成：(A)，异源信号序列、异源结构域、异源结合结构域、异源锚定结构域、异源催化结构域(CD)或其组合；(B)，(A)的序列，其中所述异源信号序列、结合结构域或催化结构域(CD)得自异源酶；和/或(C)，标记、表位、靶向肽、可切割序列、可检测部分或酶；
(k)，(i)或(j)的多肽，其中所述异序列或所述异源结合结构域包括下列或由下列组
成：NAD、NAD(P)、钙、硫胺素、FAD、锌、DNA和/或硫辛酰结合结构域；
(l)，(j)的多肽，其中所述异源信号序列将编码的蛋白靶向液泡、内质网、叶绿体或淀粉颗粒；或
(m)，包含由权利要求1至6任一项所述核酸序列编码的氨基酸序列。
22.权利要求21的分离的、合成的或重组的多肽，其中所述转移酶，例如转氨酶，例如d-氨基酸转移酶，和/或氧化还原酶，例如脱氢酶，例如d-氨基酸脱氢酶活性包括催化化学基团的转移，催化转氨作用，催化下列反应：D-丙氨酸+2-氧化戊二酸＜＝＞丙酮酸+D-谷氨酸，和/或催化氧化还原反应，催化氢原子的去除，和/或催化下列反应：D-氨基酸+H2O+受体＜＝＞2-含氧酸+NH3+还原的受体；或者所述转氨酶活性是催化异丁胺向异丁醛转化的ω-转氨酶活性。
23.权利要求21中任一种分离的、合成的或重组的多肽，其中所述转移酶活性，例如转氨酶活性，例如d-氨基酸转移酶活性，和/或氧化还原酶活性，例如脱氢酶活性，例如d-氨基酸脱氢酶活性是热稳定的，并且任选地所述多肽在包括0℃至约20℃、约20℃至约37℃、约37℃至约50℃、约50℃至约70℃、约70℃至约75℃、约75℃至约80℃、约80℃至约
85℃、约85℃至约90℃、约90℃至约95℃、约95℃至约100℃、约100℃至约110℃或更高的温度范围的条件下保持转移酶活性，例如转氨酶活性，例如d-氨基酸转移酶活性或ω-转氨酶活性，和/或氧化还原酶活性，例如脱氢酶活性，例如d-氨基酸脱氢酶活性。
24.权利要求21中任一种分离的、合成的或重组的多肽，其中所述转移酶活性，例如转氨酶活性，例如d-氨基酸转移酶活性，和/或氧化还原酶活性，例如脱氢酶活性，例如d-氨基酸脱氢酶活性是耐热的；并且任选地所述多肽在暴露于约0℃至约20℃、约20℃至约
37℃、约37℃至约50℃、约50℃至约70℃、约70℃至约75℃、约75℃至约80℃、约80℃至约85℃、约85℃至约90℃、约90℃至约95℃、约95℃至约100℃、约100℃至约110℃或更高的范围内的温度后保持转移酶活性，例如转氨酶活性，例如d-氨基酸转移酶活性或ω-转氨酶活性，和/或氧化还原酶活性，例如脱氢酶活性，例如d-氨基酸脱氢酶活性，
其中任选地所述耐热性包括在被加热至高温后保持37℃下转移酶，例如转氨酶，例如
d-氨基酸转移酶，和/或氧化还原酶，例如脱氢酶，例如d-氨基酸脱氢酶的比活性的至少一半，或者任选地所述耐热性包括在被加热至高温后将37℃下的比活性保持在每毫克蛋白约500至约1200单位范围内，并且任选地所述高温是至少约0℃至约20℃、约20℃至约
37℃、约37℃至约50℃、约50℃至约70℃、约70℃至约75℃、约75℃至约80℃、约80℃至约85℃、约85℃至约90℃、约90℃至约95℃、约95℃至约100℃、约100℃至约110℃或更高。
25.权利要求21中任一种分离的、合成的或重组的多肽，其中所述转移酶活性，例如转氨酶活性，例如d-氨基酸转移酶活性，和/或氧化还原酶活性，例如脱氢酶活性，例如d-氨基酸脱氢酶活性在包括约pH 6.5、pH 6、pH 5.5、pH 5、pH4.5、pH 4.0、pH 3.5、pH 3.0或更小的(酸性更大的)pH的酸性条件下保持活性，或者在暴露于包括约pH 6.5、pH 6、pH 5.5、pH 5、pH 4.5、pH 4.0、pH 3.5、pH 3.0或更小的(酸性更大的)pH的酸性条件后保持转移酶活性，例如转氨酶活性，例如d-氨基酸转移酶活性或ω-转氨酶活性；和/或氧化还原酶活性，例如脱氢酶活性，例如d-氨基酸脱氢酶活性。
26.权利要求21中任一种分离的、合成的或重组的多肽，其中所述转移酶活性，例如转氨酶活性，例如d-氨基酸转移酶活性，和/或氧化还原酶活性，例如脱氢酶活性，例如d-氨基酸脱氢酶活性在包括约pH 7、pH 7.5、pH 8.0、pH 8.5、pH 9、pH 9.5、pH 10、pH 10.5、pH
11、pH 11.5、pH 12、pH 12.5或更大(碱性更大)的碱性条件下保持活性，或者在暴露于包括约pH 7、pH 7.5、pH 8.0、pH 8.5、pH 9、pH 9.5、pH 10、pH 10.5、pH 11、pH 11.5、pH 12、pH 12.5或更大(碱性更大)的碱性条件后保持转移酶活性，例如转氨酶活性，例如d-氨基酸转移酶活性或ω-转氨酶活性，和/或氧化还原酶活性，例如脱氢酶活性，例如d-氨基酸脱氢酶活性。
27.分离的、合成的或重组的多肽，其包含权利要求21至26任一项的多肽并且缺少信
号序列或前原序列。
28.分离的、合成的或重组的多肽，其包含权利要求21至27任一项的多肽，并且具有异源信号序列或异源前原序列。
29.权利要求21至28任一项的分离的、合成的或重组的多肽，其中所述转移酶活性，例如转氨酶活性，例如d-氨基酸转移酶活性，和/或氧化还原酶活性，例如脱氢酶活性，例如d-氨基酸脱氢酶活性包括下列范围内的约37℃下的比活性：每毫克蛋白约100至约1000单位、每毫克蛋白约500至约750单位、每毫克蛋白约500至约1200单位或每毫克蛋白约
750至约1000单位。
30.权利要求21至29任一项的分离的、合成的或重组的多肽，其中所述多肽包含至少
一个糖基化位点或进一步包含多糖，其中任选地所述糖基化是N-连接的糖基化，并且任选地所述多肽在巴斯德毕赤酵母或粟酒裂殖酵母中表达后被糖基化。
31.蛋白制剂，其包含权利要求21至30任一项的多肽，其中所述蛋白制剂包括液体、固体或凝胶。
32.异源二聚体，其包含权利要求21至30任一项的多肽和第二结构域，其中任选地所
述第二结构域是多肽并且所述异源二聚体是融合蛋白，或者任选地所述第二结构域是表位或标记。
33.同源二聚体，其包含权利要求21至30任一项的多肽，并且任选地所述同源二聚体
是融合蛋白。
34.固定化多肽，其中所述多肽包括权利要求21至30任一项的多肽，其中任选地所述
多肽被固定化在木屑、纸、细胞、金属、树脂、聚合物、陶瓷、玻璃、微电极、石墨颗粒、珠子、凝胶、板、阵列或毛细管上。
35.分离的、合成的或重组的抗体，其与权利要求21至30任一项的多肽特异性结合，其中任选地所述抗体是单克隆或多克隆抗体，或是单链抗体。
36.杂交瘤，其包含如权利要求35所述的抗体。
37.阵列，其包括：固定化多肽，其中所述多肽包括权利要求21至30任一项的多肽；固定化核酸，其中所述核酸包括权利要求1至6任一项的核酸；权利要求35的抗体；或其组合。
38.分离或鉴定具有转移酶活性，例如转氨酶活性，例如d-氨基酸转移酶活性或ω-转
氨酶活性，和/或氧化还原酶活性，例如脱氢酶活性，例如d-氨基酸脱氢酶活性的多肽的方法，所述方法包括如下步骤：
(a)提供权利要求35的抗体；
(b)提供包含多肽的样品；和
(c)将步骤(b)的样品与步骤(a)的抗体在所述抗体能与所述多肽特异性结合的条件
下接触，从而分离或鉴定具有转移酶活性，例如转氨酶活性，例如d-氨基酸转移酶活性或ω-转氨酶活性，和/或氧化还原酶活性，例如脱氢酶活性，例如d-氨基酸脱氢酶活性的多肽。
39.制备抗转移酶，例如抗转氨酶，例如抗d-氨基酸转移酶，和/或抗氧化还原酶，例如抗脱氢酶，例如抗d-氨基酸脱氢酶抗体的方法，所述方法包括以足以产生体液免疫应答的量给予非人动物权利要求1至6任一项的核酸，从而制备抗转移酶，例如抗转氨酶，例如抗d-氨基酸转移酶，和/或抗氧化还原酶，例如抗脱氢酶，例如抗d-氨基酸脱氢酶抗体。
40.制备抗转移酶，例如抗转氨酶，例如抗d-氨基酸转移酶，和/或抗氧化还原酶，例如抗脱氢酶，例如抗d-氨基酸脱氢酶抗体的方法，所述方法包括以足以产生体液免疫应答的量给予非人动物权利要求21至30任一项的多肽，从而制备抗转移酶，例如抗转氨酶，例如抗d-氨基酸转移酶，和/或抗氧化还原酶，例如抗脱氢酶，例如抗d-氨基酸脱氢酶抗体。
41.产生重组多肽的方法，包括如下步骤：(a)提供与启动子可操作地连接的核酸，其
中所述核酸包含权利要求1至6任一项的序列；和(b)在允许所述多肽表达的条件下表达步骤(a)的核酸，从而产生重组多肽，并且任选地所述方法进一步包括用步骤(a)的核酸转化宿主细胞，随后表达步骤(a)的核酸，从而在转化细胞中产生重组多肽。
42.鉴定具有转移酶活性，例如转氨酶活性，例如d-氨基酸转移酶活性或ω-转氨酶活
性，和/或氧化还原酶活性，例如脱氢酶活性，例如d-氨基酸脱氢酶活性的多肽的方法，所述方法包括：
(a)提供权利要求21至30任一项的多肽；
(b)提供转移酶，例如转氨酶，例如d-氨基酸转移酶，和/或氧化还原酶，例如脱氢酶，例如d-氨基酸脱氢酶底物；和
(c)将所述多肽与步骤(b)的底物接触，并且检测底物量的减少或反应产物量的增加，
其中所述底物量的减少或所述反应产物量的增加检测出具有转移酶活性，例如转氨酶活性，例如d-氨基酸转移酶活性或ω-转氨酶活性，和/或氧化还原酶活性，例如脱氢酶活性，例如d-氨基酸脱氢酶活性的多肽。
43.鉴定转移酶，例如转氨酶，例如d-氨基酸转移酶或ω-转氨酶活性，和/或氧化还
原酶，例如脱氢酶，例如d-氨基酸脱氢酶底物的方法，所述方法包括：
(a)提供权利要求21至30任一项的多肽；
(b)提供测试底物；和
(c)将步骤(a)的多肽与步骤(b)的测试底物接触，并且检测底物量的减少或反应产物
量的增加，其中所述底物量的减少或所述反应产物量的增加鉴定出作为转移酶，例如转氨酶，例如d-氨基酸转移酶，和/或氧化还原酶，例如脱氢酶，例如d-氨基酸脱氢酶底物的所述测试底物。
44.确定测试化合物是否与多肽特异性结合的方法，所述方法包括：
(a)在允许核酸翻译为多肽的条件下表达核酸或包含所述核酸的载体，其中所述核酸
具有权利要求1至6任一项的序列；
(b)提供测试化合物；
(c)将所述多肽与所述测试化合物接触；和
(d)确定步骤(b)的测试化合物是否与所述多肽特异性结合。
45.确定测试化合物是否与多肽特异性结合的方法，所述方法包括：
(a)提供权利要求21至30任一项的多肽；
(b)提供测试化合物；
(c)将所述多肽与所述测试化合物接触；和
(d)确定步骤(b)的测试化合物是否与所述多肽特异性结合。
46.鉴定转移酶活性，例如转氨酶活性，例如d-氨基酸转移酶活性，和/或氧化还原酶
活性或ω-转氨酶活性，例如脱氢酶活性，例如d-氨基酸脱氢酶活性的调节剂的方法，所述方法包括：
(a)提供权利要求21至30任一项的多肽；
(b)提供测试化合物；
(c)将步骤(a)的多肽与步骤(b)的测试化合物接触，并测量所述转移酶，例如转氨酶，例如d-氨基酸转移酶，和/或氧化还原酶，例如脱氢酶，例如d-氨基酸脱氢酶的活性，其中在存在所述测试化合物的情况下测量的转移酶活性，例如转氨酶活性，例如d-氨基酸转移酶活性，和/或氧化还原酶活性，例如脱氢酶活性，例如d-氨基酸脱氢酶活性与不存在所述测试化合物的情况下的活性相比的变化，确定了所述测试化合物调节所述转移酶活性，例如转氨酶活性，例如d-氨基酸转移酶活性，和/或氧化还原酶活性，例如脱氢酶活性，例如d-氨基酸脱氢酶活性，
其中任选地，所述转移酶活性，例如转氨酶活性，例如d-氨基酸转移酶活性，和/或
氧化还原酶活性，例如脱氢酶活性，例如d-氨基酸脱氢酶活性，通过提供转移酶，例如转氨酶，例如d-氨基酸转移酶，和/或氧化还原酶，例如脱氢酶，例如d-氨基酸脱氢酶底物，并检测所述底物量的减少或所述反应产物量的增加，或所述底物量的增加或所述反应产物量的减少来测量，其中任选地与没有测试化合物时底物或反应产物的量相比，有测试化合物时所述底物量的减少或所述反应产物量的增加鉴定出作为转移酶活性，例如转氨酶活性，例如d-氨基酸转移酶活性或ω-转氨酶活性，和/或氧化还原酶活性，例如脱氢酶活性，例如d-氨基酸脱氢酶活性的激活剂的测试化合物，
其中任选地，与没有测试化合物时底物或反应产物量相比，有测试化合物时所述底物
量的增加或所述反应产物量的减少鉴定出作为转移酶活性，例如转氨酶活性，例如d-氨基酸转移酶活性或ω-转氨酶活性，和/或氧化还原酶活性，例如脱氢酶活性，例如d-氨基酸脱氢酶活性的抑制剂的测试化合物。
47.计算机系统，所述计算机系统包括处理器和其上已经存储了多肽序列或核酸序列
的数据存储设备或计算机可读介质，其中所述数据存储设备或计算机可读介质上已经存储了多肽序列或核酸序列，其中所述多肽序列包括权利要求21至30任一项的氨基酸序列、权利要求1至6任一项的核酸序列编码的多肽，
其中任选地，所述系统进一步包括序列比对算法和数据存储设备，所述数据存储设备
上已经存储了至少一个参考序列，或者任选地进一步包括鉴定器，所述鉴定器鉴定所述序列中一个或多个特征，
并且任选地，所述序列比对算法包括指出多态现象的计算机程序。
48.鉴定序列中的特征的方法，包括如下步骤：(a)使用鉴定序列中的一个或多个特征
的计算机程序读取所述序列，其中所述序列包括多肽序列或核酸序列，其中所述多肽序列包括权利要求21至30任一项的氨基酸序列、权利要求1至6任一项的核酸序列编码的多
肽；和(b)用所述计算机程序鉴定所述序列中的一个或多个特征。
49.将第一序列与第二序列进行比较的方法，包括如下步骤：(a)通过使用比较序列的
计算机程序读取所述第一序列和第二序列，其中所述第一序列包括多肽序列或核酸序列，其中所述多肽序列包括权利要求21至30任一项的氨基酸序列、权利要求1至6任一项的
核酸序列编码的多肽；和(b)用所述计算机程序确定所述第一序列和所述第二序列之间的差异，
其中任选地，确定所述第一序列和所述第二序列之间差异的步骤进一步包括鉴定多态
性的步骤，
并且任选地，所述方法进一步包括鉴定序列中的一个或多个特征的鉴定器，并且任选
地所述方法进一步包括使用计算机程序读取所述第一序列和鉴定所述序列中的一个或多个特征。
50.从环境样品中分离或回收核酸的方法，所述核酸编码具有转移酶活性，例如转氨酶活性，例如d-氨基酸转移酶活性或ω-转氨酶活性，和/或氧化还原酶活性，例如脱氢酶活性，例如d-氨基酸脱氢酶活性的多肽，所述方法包括如下步骤：
(a)提供权利要求7的多核苷酸探针；
(b)从所述环境样品中分离核酸或处理所述环境样品，以便所述样品中的核酸可达到
与步骤(a)的多核苷酸探针杂交；
(c)将步骤(b)的分离的、合成的或重组的核酸或处理的环境样品与步骤(a)的多核苷
酸探针结合；和
(d)分离与步骤(a)的多核苷酸探针特异性杂交的核酸，从而从所述环境样品中分离
或回收编码具有转移酶活性，例如转氨酶活性，例如d-氨基酸转移酶活性或ω-转氨酶活性，和/或氧化还原酶活性，例如脱氢酶活性，例如d-氨基酸脱氢酶活性的多肽的核酸，其中任选地，所述环境样品包括水样品、液体样品、土壤样品、空气样品或生物样品；
并且任选地，所述生物样品源自细菌细胞、原生动物细胞、昆虫细胞、酵母细胞、植物细胞、真菌细胞或哺乳动物细胞。
51.从环境样品中分离或回收核酸的方法，所述核酸编码具有转移酶活性，例如转氨酶活性，例如d-氨基酸转移酶活性或ω-转氨酶活性，和/或氧化还原酶活性，例如脱氢酶活性，例如d-氨基酸脱氢酶活性的多肽，所述方法包括如下步骤：
(a)提供权利要求8或权利要求9的扩增引物对；
(b)从所述环境样品中分离核酸或处理所述环境样品，以便所述样品中的核酸可达到
与所述扩增引物对杂交；和
(c)将步骤(b)的核酸与步骤(a)的扩增引物对结合，并从所述环境样品扩增核酸，从
而从环境样品分离或回收编码具有转移酶活性，例如转氨酶活性，例如d-氨基酸转移酶活性或ω-转氨酶活性，和/或氧化还原酶活性，例如脱氢酶活性，例如d-氨基酸脱氢酶活性的多肽的核酸。
52.产生编码具有转移酶活性，例如转氨酶活性，例如d-氨基酸转移酶活性或ω-转氨
酶活性，和/或氧化还原酶活性，例如脱氢酶活性，例如d-氨基酸脱氢酶活性的多肽的核酸的变体的方法，所述方法包括如下步骤：
(a)提供包含权利要求1至6任一项的序列的模板核酸；和
(b)在所述模板序列中修饰、缺失或者添加一个或者多个核苷酸，或其组合，以产生所述模板核酸的变体，
其中任选地，所述方法进一步包括表达所述变体核酸，以产生变体转移酶，例如转氨
酶，例如d-氨基酸转移酶，和/或氧化还原酶，例如脱氢酶，例如d-氨基酸脱氢酶多肽，并且任选地，所述修饰、添加或者缺失由包括易错PCR、重排、寡核苷酸定向诱变、装配PCR、有性PCR诱变、体内诱变、盒式诱变、回归整体诱变、指数整体诱变、位点特异性诱变、基因重装配、基因位点饱和诱变(GSSM)、合成连接重装配(SLR)或其组合的方法来引入，或者所述修饰、添加或者缺失通过包括下述的方法引入：重组、回归序列重组、硫代磷酸酯-修饰的DNA诱变、含尿嘧啶的模板诱变、缺口二重诱变、点错配修复诱变、修复-缺陷型宿主株诱变、化学诱变、放射诱变、缺失诱变、限制-选择诱变、限制-纯化诱变、人工基因合成、整体诱变、嵌合核酸多聚体生成和其组合，
其中任选地，所述方法被反复重复，直到产生与所述模板核酸编码的多肽相比具有改
变的或不同的活性或者改变的或不同的稳定性的转移酶，例如转氨酶，例如d-氨基酸转移酶，和/或氧化还原酶，例如脱氢酶，例如d-氨基酸脱氢酶，
其中任选地，所述变体转移酶，例如转氨酶，例如d-氨基酸转移酶，和/或氧化还原酶，例如脱氢酶，例如d-氨基酸脱氢酶多肽是耐热的，并且在暴露于高温之后保留一些活性，或者任选地，与模板核酸编码的转移酶，例如转氨酶，例如d-氨基酸转移酶，和/或氧化还原酶，例如脱氢酶，例如d-氨基酸脱氢酶相比，所述变体转移酶，例如转氨酶，例如d-氨基酸转移酶，和/或氧化还原酶，例如脱氢酶，例如d-氨基酸脱氢酶多肽具有增加的糖基化，或者任选地，所述变体转移酶，例如转氨酶，例如d-氨基酸转移酶，和/或氧化还原酶，例如脱氢酶，例如d-氨基酸脱氢酶多肽，在高温下具有转移酶活性，例如转氨酶活性，例如d-氨基酸转移酶活性或ω-转氨酶活性，和/或氧化还原酶活性，例如脱氢酶活性，例如d-氨基酸脱氢酶活性，其中由所述模板核酸编码的所述转移酶，例如转氨酶，例如d-氨基酸转移酶，和/或氧化还原酶，例如脱氢酶，例如d-氨基酸脱氢酶在高温下没有活性，
其中任选地，所述方法被反复重复，直到产生具有与所述模板核酸的密码子使用有所
改变的密码子使用的转移酶，例如转氨酶，例如d-氨基酸转移酶，和/或氧化还原酶，例如脱氢酶，例如d-氨基酸脱氢酶编码序列，
其中任选地，所述方法被反复重复，直到产生具有比所述模板核酸的信息表达或稳定
性更高或更低水平的信息表达或稳定性的转移酶，例如转氨酶，例如d-氨基酸转移酶，和/或氧化还原酶，例如脱氢酶，例如d-氨基酸脱氢酶基因。
53.在编码具有转移酶活性，例如转氨酶活性，例如d-氨基酸转移酶活性或ω-转氨酶
活性，和/或氧化还原酶活性，例如脱氢酶活性，例如d-氨基酸脱氢酶活性的多肽的核酸中修饰密码子以增加其在宿主细胞中表达的方法，所述方法包括：
(a)提供编码具有转移酶活性，例如转氨酶活性，例如d-氨基酸转移酶活性或ω-转
氨酶活性，和/或氧化还原酶活性，例如脱氢酶活性，例如d-氨基酸脱氢酶活性的多肽的核酸，其包括权利要求1至6任一项的序列；和，
(b)鉴定步骤(a)的核酸中非优选或较不优选的密码子并且用优选的或中度使用的密
码子来代替之，所述优选的或中度使用的密码子编码与被代替的密码子相同的氨基酸，其中优选密码子是在所述宿主细胞的基因的编码序列中过度表现的密码子以及非优选或较不优选密码子是在所述宿主细胞的基因的编码序列中表现不足的密码子，从而修饰所述核酸以增加其在宿主细胞中的表达。
54.在编码转移酶，例如转氨酶，例如d-氨基酸转移酶，和/或氧化还原酶，例如脱氢
酶，例如d-氨基酸脱氢酶多肽的核酸中修饰密码子的方法，所述方法包括：
(a)提供编码具有转移酶活性，例如转氨酶活性，例如d-氨基酸转移酶活性或ω-转
氨酶活性，和/或氧化还原酶活性，例如脱氢酶活性，例如d-氨基酸脱氢酶活性的多肽的核酸，其包含权利要求1至6任一项的序列；和，
(b)鉴定步骤(a)的核酸中的密码子，并用不同的密码子来代替之，所述不同的密码
子编码与所述被代替的密码子相同的氨基酸，从而修饰在编码转移酶，例如转氨酶，例如d-氨基酸转移酶，和/或氧化还原酶，例如脱氢酶，例如d-氨基酸脱氢酶的核酸中的密码子。
55.在编码转移酶，例如转氨酶，例如d-氨基酸转移酶，和/或氧化还原酶，例如脱氢
酶，例如d-氨基酸脱氢酶多肽的核酸中修饰密码子以增加其在宿主细胞中表达的方法，所述方法包括：
(a)提供编码转移酶，例如转氨酶，例如d-氨基酸转移酶，和/或氧化还原酶，例如脱氢酶，例如d-氨基酸脱氢酶多肽的核酸，其包含权利要求1至6任一项的序列；和，
(b)鉴定步骤(a)的核酸中非优选或较不优选的密码子并且用优选的或中度使用的密
码子来代替之，所述优选或中度使用的密码子编码与被代替的密码子相同的氨基酸，其中优选密码子是在所述宿主细胞的基因的编码序列中过度表现的密码子以及非优选或较不优选的密码子是在所述宿主细胞的基因的编码序列中表现不足的密码子，从而修饰所述核酸以增加其在宿主细胞中的表达。
56.在编码具有转移酶活性，例如转氨酶活性，例如d-氨基酸转移酶活性或ω-转氨酶
活性，和/或氧化还原酶活性，例如脱氢酶活性，例如d-氨基酸脱氢酶活性的多肽的核酸中修饰密码子以降低其在宿主细胞中表达的方法，所述方法包括：
(a)提供编码转移酶，例如转氨酶，例如d-氨基酸转移酶，和/或氧化还原酶，例如脱氢酶，例如d-氨基酸脱氢酶多肽的核酸，其包含权利要求1至6任一项的序列；和
(b)鉴定步骤(a)的核酸中的至少一个优选密码子，并用非优选的或较不优选的密码
子来代替之，所述非优选或较不优选的密码子编码与被代替的密码子相同的氨基酸，其中优选密码子是在所述宿主细胞的基因的编码序列中过度表现的密码子，以及非优选或较不优选的密码子是在所述宿主细胞的基因的编码序列中表现不足的密码子，从而修饰所述核酸以降低其在所述宿主细胞中的表达，
其中任选地，所述宿主细胞是细菌细胞、真菌细胞、昆虫细胞、酵母细胞、植物细胞或哺乳动物细胞。
57.产生核酸文库的方法，所述核酸文库编码多个被修饰的转移酶，例如转氨酶，例如d-氨基酸转移酶，和/或氧化还原酶，例如脱氢酶，例如d-氨基酸脱氢酶活性位点或底物结合位点，其中被修饰的活性位点或底物结合位点来源于第一核酸，所述第一核酸包含编码第一活性位点或第一底物结合位点的序列，所述方法包括：
(a)提供第一核酸，其编码第一活性位点或第一底物结合位点，其中所述第一核酸序
列包含在严格条件下与权利要求1至6任一项的序列或其子序列杂交的序列，以及所述核酸编码转移酶，例如转氨酶，例如d-氨基酸转移酶，和/或氧化还原酶，例如脱氢酶，例如d-氨基酸脱氢酶活性位点或转移酶，例如转氨酶，例如d-氨基酸转移酶，和/或氧化还原酶，例如脱氢酶，例如d-氨基酸脱氢酶底物结合位点；
(b)提供一组诱变寡核苷酸，其在所述第一核酸的多个目标密码子处编码天然存在的
氨基酸变体；和，
(c)使用该组诱变寡核苷酸，产生一组编码活性位点或编码底物结合位点的变体核酸，其在被诱变的每一氨基酸密码子处编码一定范围的氨基酸变异，从而产生编码多个被修饰的转移酶，例如转氨酶，例如d-氨基酸转移酶，和/或氧化还原酶，例如脱氢酶，例如d-氨基酸脱氢酶活性位点或底物结合位点的核酸文库。
58.权利要求57的方法，包括通过包括如下的方法诱变步骤(a)的第一核酸或变体：
优化的定向进化系统、基因位点饱和诱变(GSSM)、合成连接重装配(SLR)、易错PCR、重排、寡核苷酸定向突变、装配PCR、有性PCR诱变、体内诱变、盒式诱变、回归整体诱变、指数整体诱变、位点特异性诱变、基因再装配、重组、回归序列重组、硫代磷酸酯修饰的DNA诱变、含尿嘧啶的模板诱变、缺口双重诱变、点错配修复诱变、修复缺陷型宿主株诱变、化学诱变、放射诱变、缺失诱变、限制选择诱变、限制纯化诱变、人工基因合成、整体诱变、嵌合核酸多聚体生成及其组合。
59.制备小分子的方法，包括：
(a)提供多种能合成或修饰小分子的生物合成酶，其中所述酶中的一种酶包含由包含
权利要求1至6任一项的序列的核酸编码的转移酶，例如转氨酶，例如d-氨基酸转移酶，和/或氧化还原酶，例如脱氢酶，例如d-氨基酸脱氢酶；
(b)为步骤(a)的至少一种酶提供底物；和
(c)将步骤(b)的底物与所述酶在能促进多个生物催化反应的条件下进行反应，以通
过一系列生物催化反应产生小分子。
60.修饰小分子的方法，包括：
(a)提供转移酶，例如转氨酶，例如d-氨基酸转移酶，和/或氧化还原酶，例如脱氢酶，例如d-氨基酸脱氢酶，其中所述酶包含权利要求21至30任一项的多肽，或由包含权利要求1至6任一项的序列的核酸编码的多肽；
(b)提供小分子；和
(c)将步骤(a)的酶与步骤(b)的小分子在能促进由所述转移酶，例如转氨酶，例如
d-氨基酸转移酶，和/或氧化还原酶，例如脱氢酶，例如d-氨基酸脱氢酶催化的酶促反应的条件下进行反应，从而通过转移酶，例如转氨酶，例如d-氨基酸转移酶，和/或氧化还原酶，例如脱氢酶，例如d-氨基酸脱氢酶酶促反应修饰小分子
其中任选地，所述方法包括提供步骤(a)的酶的多个小分子底物，从而产生通过由转
移酶，例如转氨酶，例如d-氨基酸转移酶，和/或氧化还原酶，例如脱氢酶，例如d-氨基酸脱氢酶催化的至少一种酶促反应产生的被修饰小分子的文库。
61.权利要求60的方法，进一步包括多种其它的酶，在有助于所述酶的多个生物催化
反应的条件下使用，以形成由多个酶促反应产生的被修饰小分子的文库，其中任选地所述方法进一步包括测试所述文库以确定所述文库中是否存在表现出期望活性的特定被修饰小分子的步骤，以及任选地测试所述文库的步骤进一步包括系统地去除所有但保留一个用于产生文库中多个被修饰小分子中的一部分的生物催化反应，其是通过测试被修饰小分子的所述部分中存在或不存在具有期望活性的特定被修饰小分子，并鉴定出产生具有期望活性的特定被修饰小分子的至少一个特定生物催化反应。
62.确定转移酶，例如转氨酶，例如d-氨基酸转移酶，和/或氧化还原酶，例如脱氢酶，例如d-氨基酸脱氢酶的功能片段的方法，包括如下步骤：
(a)提供转移酶，例如转氨酶，例如d-氨基酸转移酶，和/或氧化还原酶，例如脱氢酶，例如d-氨基酸脱氢酶，其中所述酶包含权利要求21至30任一项的多肽，或由包含权利要求1至6任一项的序列的核酸编码的多肽；和
(b)从步骤(a)的序列删除多个氨基酸残基，并测试剩余子序列的转移酶活性，例如转
氨酶活性，例如d-氨基酸转移酶活性或ω-转氨酶活性，和/或氧化还原酶活性，例如脱氢酶活性，例如d-氨基酸脱氢酶活性，从而确定转移酶，例如转氨酶，例如d-氨基酸转移酶，和/或氧化还原酶，例如脱氢酶，例如d-氨基酸脱氢酶的功能片段，
其中任选地，所述转移酶活性，例如转氨酶活性，例如d-氨基酸转移酶活性，和/或氧化还原酶活性，例如脱氢酶活性，例如d-氨基酸脱氢酶活性通过提供转移酶，例如转氨酶，例如d-氨基酸转移酶，和/或氧化还原酶，例如脱氢酶，例如d-氨基酸脱氢酶底物并检测所述底物量的减少或反应产物量的增加来测量。
63.通过使用实时代谢流分析进行新的或修饰的表型的全细胞工程改造的方法，所述
方法包括：
(a)通过修饰细胞的遗传组成制备修饰的细胞，其中所述遗传组成通过将包含权利要
求1至6中任一项所述序列的核酸加入到细胞来修饰；
(b)培养所述修饰的细胞以产生多个修饰的细胞；
(c)通过实时监测步骤(b)的细胞培养物来测量所述细胞的至少一个代谢参数；和
(d)分析步骤(c)的数据，以确定被测量的参数是否与在类似条件下未修饰细胞中的
参照测量值不同，从而使用实时代谢流量分析鉴定细胞中的工程改造的表型，
其中任选地，所述细胞的遗传组成通过包括在所述细胞中序列的删除或序列的修饰，
或敲除基因的表达的方法来修饰，
以及任选地，所述方法进一步包括选择含有新工程改造的表型的细胞，以及任选地进
一步包括培养被选择的细胞，从而产生包含新工程改造的表型的新细胞株。
64.包含至少第一结构域和至少第二结构域的嵌合多肽，所述第一结构域包含信号肽
(SP)，所述第二结构域包含含有权利要求21至30中任一项的氨基酸序列或其子序列的异源多肽或肽，其中所述异源多肽或肽与所述信号肽(SP)之间没有天然的联系，其中任选地所述信号肽(SP)的来源不是转移酶，例如转氨酶，例如d-氨基酸转移酶，和/或氧化还原酶，例如脱氢酶，例如d-氨基酸脱氢酶，并且任选地所述异源多肽或者肽在信号肽(SP)或转移酶，例如转氨酶，例如d-氨基酸转移酶，和/或氧化还原酶，例如脱氢酶，例如d-氨基酸脱氢酶催化结构域(CD)的氨基末端、羧基末端或者两种末端。
65.编码嵌合多肽的分离的、合成的或者重组的核酸，其中所述嵌合多肽包含至少第一结构域和至少第二结构域，所述第一结构域含有信号肽(SP)，所述第二结构域包含异源多肽或者肽，其中所述信号肽(SP)包含如权利要求64中所述的信号序列。
66.增加转移酶，例如转氨酶，例如d-氨基酸转移酶，和/或氧化还原酶，例如脱氢酶，例如d-氨基酸脱氢酶多肽的耐热性或热稳定性的方法，所述方法包括糖基化转移酶，例如转氨酶，例如d-氨基酸转移酶，和/或氧化还原酶，例如脱氢酶，例如d-氨基酸脱氢酶，其中所述多肽包括权利要求21至30中任一项的多肽，或由包含权利要求1至6中任一项的
序列的核酸编码的多肽，或其酶促活性片段，从而增加所述转移酶，例如转氨酶，例如d-氨基酸转移酶，和/或氧化还原酶，例如脱氢酶，例如d-氨基酸脱氢酶多肽的耐热性或热稳定性。
67.在细胞中过量表达重组的转移酶，例如转氨酶，例如d-氨基酸转移酶，和/或氧化
还原酶，例如脱氢酶，例如d-氨基酸脱氢酶的方法，所述方法包括表达含有权利要求1至6中任一项所述的核酸序列或编码权利要求21至30中任一项的多肽的核酸或其酶促活性片段的载体，其中过量表达通过使用高活性启动子、双顺反子载体或通过所述载体的基因扩增来实现。
68.制备转基因植物的方法，所述方法包括：
(a)将异源核酸序列引入细胞中，从而产生转化的植物细胞，其中所述异源核酸序列包括权利要求1至6中任一项的序列，或编码权利要求21至30中任一项的多肽的核酸，或其酶促活性片段；
(b)从所述转化的细胞产生转基因植物，
其中任选地，步骤(a)进一步包括通过植物细胞原生质体的电穿孔或微注射而引入所
述异源核酸序列，
并且任选地，步骤(a)包括通过DNA颗粒轰击或通过使用根癌农杆菌宿主而直接将所
述异源核酸序列引入到植物组织。
69.在植物细胞中表达异源核酸序列的方法，所述方法包括：
(a)用与启动子可操作地连接的异源核酸序列转化所述植物细胞，其中所述异源核酸
序列包括权利要求1至6中任一项的序列，或编码权利要求21至30中任一项的多肽的核
酸，或其酶促活性片段；
(b)在所述异源核酸序列在所述植物细胞中表达的条件下使所述植物生长。
70.面团、面包或烘焙产品和/或面团、面包或烘焙产品前体，其包含具有转移酶活性，例如转氨酶活性，例如d-氨基酸转移酶活性或ω-转氨酶活性，和/或氧化还原酶活性，例如脱氢酶活性，例如d-氨基酸脱氢酶活性的多肽，其中所述多肽包含权利要求21至30中任一项的氨基酸序列，或者所述多肽由包含权利要求1至6中任一项的序列的核酸编码，或其酶促活性片段，或权利要求88的酶混合物或鸡尾酒。
71.饮料和饮料前体，其包含具有转移酶活性，例如转氨酶活性，例如d-氨基酸转移酶活性或ω-转氨酶活性，和/或氧化还原酶活性，例如脱氢酶活性，例如d-氨基酸脱氢酶活性的多肽，其中所述多肽包含权利要求21至30中任一项的氨基酸序列，或者所述多肽由包含权利要求1至6中任一项的序列的核酸编码，或其酶促活性片段，或权利要求88的酶混合物或鸡尾酒。
72.饮料生产的方法，包括将至少一个多肽——所述多肽具有转移酶活性，例如转氨酶活性，例如d-氨基酸转移酶活性或ω-转氨酶活性，和/或氧化还原酶活性，例如脱氢酶活性，例如d-氨基酸脱氢酶活性，其中所述多肽包含权利要求21至30中任一项的氨基酸序列，或者所述多肽由包含权利要求1至6中任一项的序列的核酸编码，或其酶促活性片段，或权利要求88的酶混合物或鸡尾酒——施用到饮料或饮料前体，
其中任选地，所述饮料或饮料前体是麦芽汁或啤酒。
73.饲料、食品、食品或饲料添加剂、食品或饲料补充物、或食物助剂或食物补充物，其包含具有转移酶活性，例如转氨酶活性，例如d-氨基酸转移酶活性或ω-转氨酶活性，和/或氧化还原酶活性，例如脱氢酶活性，例如d-氨基酸脱氢酶活性的多肽，其中所述多肽包含权利要求21至30中任一项的氨基酸序列，或者所述多肽由包含权利要求1至6中任一
项的序列的核酸编码，或其酶促活性片段，或权利要求88的酶混合物或鸡尾酒，
其中任选地，其中任选地所述饲料、食品、食品或饲料添加剂、食品或饲料补充物、或食物助剂进一步包含选自如下的载体：谷物胚芽，无油谷物胚芽、干草、紫花苜蓿、梯牧草、大豆壳、向日葵花籽粕和小麦次粉，
并且任选地，所述载体可包含无油谷物胚芽，或者任选地所述转移酶，例如转氨酶，例如d-氨基酸转移酶，和/或氧化还原酶，例如脱氢酶，例如d-氨基酸脱氢酶被糖基化，以在压丸条件下提供热稳定性，并且任选地所述输送基质通过对含有谷物胚芽和转移酶，例如转氨酶，例如d-氨基酸转移酶，和/或氧化还原酶，例如脱氢酶，例如d-氨基酸脱氢酶的混合物进行压丸而形成，并且任选地所述压丸条件包括蒸汽的应用，并且任选地所述压丸条件包括应用超过约80℃的温度约5分钟并且所述酶保持每毫克酶至少350到大约900单位的比活性。
74.细粒、小球或颗粒，其包含具有转移酶活性，例如转氨酶活性，例如d-氨基酸转移酶活性或ω-转氨酶活性，和/或氧化还原酶活性，例如脱氢酶活性，例如d-氨基酸脱氢酶活性的多肽，其中所述多肽包含权利要求21至30中任一项的氨基酸序列，或者所述多肽由包含权利要求1至6中任一项的序列的核酸编码，或其酶促活性片段，或权利要求88的酶混合物或鸡尾酒，
其中任选地，所述转移酶，例如转氨酶，例如d-氨基酸转移酶，和/或氧化还原酶，例如脱氢酶，例如d-氨基酸脱氢酶是热稳定的。
75.清洁组合物，其包含具有转移酶活性，例如转氨酶活性，例如d-氨基酸转移酶活性或ω-转氨酶活性，和/或氧化还原酶活性，例如脱氢酶活性，例如d-氨基酸脱氢酶活性的多肽，其中所述多肽包含权利要求21至30中任一项的氨基酸序列，或者所述多肽由包含权利要求1至6中任一项的序列的核酸编码，或其酶促活性片段，或权利要求88的酶混合物或鸡尾酒，
其中任选地，所述清洁组合物是洗涤剂、消毒剂或清洁剂，或者其中任选地，所述清洁组合物用于清洁织物、洗盘碗、洗衣服、口腔清洁、假牙清洁和隐形眼镜。
76.制药(药物)组合物，其包含具有转移酶活性，例如转氨酶活性，例如d-氨基酸转
移酶活性或ω-转氨酶活性，和/或氧化还原酶活性，例如脱氢酶活性，例如d-氨基酸脱氢酶活性的多肽，其中所述多肽包含权利要求21至30中任一项的氨基酸序列，或者所述多肽由包含权利要求1至6中任一项的序列的核酸编码，或其酶促活性片段，或权利要求88的酶混合物或鸡尾酒。
77.处理木材、木制品、纸、纸制品、浆、浆制品、废纸或纸再生组合物的方法，所述方法包括：用具有转移酶活性，例如转氨酶活性，例如d-氨基酸转移酶活性或ω-转氨酶活性，和/或氧化还原酶活性，例如脱氢酶活性，例如d-氨基酸脱氢酶活性的多肽与所述木材、木制品、纸、纸制品、浆、浆制品、废纸或纸再生组合物接触，其中所述多肽包含权利要求21至
30中任一项的氨基酸序列，或者所述多肽由包含权利要求1至6中任一项的序列的核酸编码，或其酶促活性片段，或权利要求88的酶混合物或鸡尾酒，
其中任选地，所述处理包括减少或溶解木质素(去木质素作用)、漂白或脱色和/或脱
墨。
78.生物质、木材、木浆、木制品、纸浆、纸制品、报纸或废纸，其包含具有权利要求21至
30中任一项的氨基酸序列的多肽，或者由包含权利要求1至6中任一项的序列的核酸编码的多肽，或其酶促活性片段，或权利要求88的酶混合物或鸡尾酒。
79.织物、纱、布料或纺织品，其包含具有权利要求21至30中任一项的氨基酸序列的多肽，或者由包含权利要求1至6中任一项的序列的核酸编码的多肽，或其酶促活性片段，或权利要求88的酶混合物或鸡尾酒，
其中任选地，所述织物、纱、布料或纺织品包括非棉纤维素织物、纱、布料或纺织品。
80.处理有机物质的方法，其包括：
(a)提供至少一种多肽——所述多肽具有转移酶活性，例如转氨酶活性，例如d-氨基
酸转移酶活性或ω-转氨酶活性，和/或氧化还原酶活性，例如脱氢酶活性，例如d-氨基酸脱氢酶活性，具有权利要求21至30中任一项的氨基酸序列，或者所述转移酶，例如转氨酶，例如d-氨基酸转移酶，和/或氧化还原酶，例如脱氢酶，例如d-氨基酸脱氢酶由包含权利要求1至6中任一项的序列的核酸编码，或其酶促活性片段，或权利要求88的酶混合物或鸡尾酒；
(b)提供有机物质；和
(c)使(b)的有机物质与步骤(a)的多肽接触，
其中任选地，所述有机物质是生物质、木材、木浆、牛皮纸浆、纸、纸制品或纸浆，
并且其中任选地，所述生物质、木材、木浆、牛皮纸浆、纸、纸制品或纸浆包括软木和硬木，或者所述木材、木浆、牛皮纸浆、纸、纸制品或纸浆源自软木和硬木。
81.包含有机物质的组合物，所述有机物质包含具有转移酶活性，例如转氨酶活性，例如d-氨基酸转移酶活性或ω-转氨酶活性，和/或氧化还原酶活性，例如脱氢酶活性，例如d-氨基酸脱氢酶活性的多肽，其中所述多肽具有权利要求21至30中任一项的氨基酸序列，或者所述多肽由包含权利要求1至6中任一项的序列的核酸编码，或其酶促活性片段，或权利要求88的酶混合物或鸡尾酒，
其中任选地，所述有机物质是生物质、木材、木浆、牛皮纸浆、纸、纸制品或纸浆，
并且其中任选地，所述生物质、木材、木浆、牛皮纸浆、纸、纸制品或纸浆包括软木和硬木，或者所述木材、木浆、牛皮纸浆、纸、纸制品或纸浆源自软木和硬木。
82.制造醇的方法，包括使有机物质与具有转移酶活性，例如转氨酶活性，例如d-氨基酸转移酶活性或ω-转氨酶活性，和/或氧化还原酶活性，例如脱氢酶活性，例如d-氨基酸脱氢酶活性的多肽或其酶促活性片段，或权利要求88的酶混合物或鸡尾酒接触，其中所述多肽具有权利要求21至30中任一项的氨基酸序列，或者所述多肽由包含权利要求1至6
中任一项的序列的核酸编码，
其中任选地，所述有机物质是生物质、木材、木浆、牛皮纸浆、纸、纸制品或纸浆，
并且其中任选地，所述生物质、木材、木浆、牛皮纸浆、纸、纸制品或纸浆包括软木和硬木，或者所述木材、木浆、牛皮纸浆、纸、纸制品或纸浆源自软木和硬木，
并且任选地所述方法进一步包括发酵，
并且任选地所述醇是或包括乙醇。
83.组合物，其包含醇和具有转移酶活性，例如转氨酶活性，例如d-氨基酸转移酶活性或ω-转氨酶活性，和/或氧化还原酶活性，例如脱氢酶活性，例如d-氨基酸脱氢酶活性的多肽，或其酶促活性片段，或权利要求88的酶混合物或鸡尾酒，其中所述多肽具有权利要求21至30中任一项的氨基酸序列，或者所述多肽由包含权利要求1至6中任一项的序列
的核酸编码，
并且任选地所述醇是或包括乙醇。
84.废物处理溶液，其包含具有转移酶活性，例如转氨酶活性，例如d-氨基酸转移酶活性或ω-转氨酶活性，和/或氧化还原酶活性，例如脱氢酶活性，例如d-氨基酸脱氢酶活性的多肽，或其酶促活性片段，或权利要求88的酶混合物或鸡尾酒，其中所述多肽具有权利要求21至30中任一项的氨基酸序列，或者所述多肽由包含权利要求1至6中任一项的序
列的核酸编码。
85.口香糖、止咳糖或糖果，其包含具有转移酶活性，例如转氨酶活性，例如d-氨基酸转移酶活性或ω-转氨酶活性，和/或氧化还原酶活性，例如脱氢酶活性，例如d-氨基酸脱氢酶活性的多肽，或其酶促活性片段，或权利要求88的酶混合物或鸡尾酒，其中所述多肽具有权利要求21至30中任一项的氨基酸序列，或者所述多肽由包含权利要求1至6中任
一项的序列的核酸编码。
86.嵌合转移酶，例如转氨酶，例如d-氨基酸转移酶，和/或氧化还原酶，例如脱氢酶，例如d-氨基酸脱氢酶，其包含(a)，权利要求21至30中任一项的氨基酸序列和至少一个异源结合结构域；或(b)，(a)的嵌合转移酶，例如转氨酶，例如d-氨基酸转移酶或ω-转氨酶活性，和/或氧化还原酶，例如脱氢酶，例如d-氨基酸脱氢酶，其中任选地所述结合结构域包括：NAD、NAD(P)、钙、硫胺素、FAD、锌、DNA和/或硫辛酰结合结构域。
87.设计具有新的结合特异性或提高的结合特异性的嵌合糖苷酶、转移酶，例如转氨
酶，例如d-氨基酸转移酶，和/或氧化还原酶，例如脱氢酶，例如d-氨基酸脱氢酶的方法，其包括将异源或另外的内源结合结构域插入到糖苷酶中，其中所述结合模块包括权利要求
21至30中任一项的氨基酸序列的结合子序列，或包含NAD、NAD(P)、钙、硫胺素、FAD、锌、DNA和/或硫辛酰结合结构域的结合子序列。
88.酶混合物或“鸡尾酒”，其包含：(a)，至少一种权利要求21至30中任一项的酶和一种或更多种其它酶；(b)，(a)的酶混合物或鸡尾酒，其中所述一种或更多种其它酶是另一种转移酶，例如转氨酶，例如d-氨基酸转移酶，和/或氧化还原酶，例如脱氢酶，例如d-氨基酸脱氢酶，甘露聚糖酶和/或葡聚糖酶、纤维素酶、脂肪酶、酯酶、蛋白酶或内糖苷酶、内-β-1，4-葡聚糖酶、β-葡聚糖酶、内-β-1，3(4)-葡聚糖酶、角质酶、过氧化物酶、过氧化氢酶、漆酶、淀粉酶、葡萄糖淀粉酶、果胶酶、消旋酶、表异构酶、异构酶、氧化还原酶、还原酶、氧化酶、酚氧化酶、木质素酶、支链淀粉酶、阿拉伯树胶酶、半纤维素酶、甘露聚糖酶、木葡聚糖酶、木聚糖酶、甘露聚糖酶和/或葡聚糖酶、果胶乙酰基酯酶、鼠李糖半乳糖醛酸聚糖乙酰酯酶、聚半乳糖醛酸酶、鼠李糖半乳糖醛酸聚糖酶、半乳聚糖酶、果胶裂解酶、果胶甲基酯酶、纤维二糖水解酶和/或转谷氨酰胺酶。
89.液体组合物，其包含(a)，醇和权利要求21至30中任一项的多肽，或权利要求88
的酶混合物或鸡尾酒；(b)，(a)的液体组合物，其中所述醇是或包括乙醇、丙醇、丁醇和/或甲醇；(c)，(a)或(b)的液体组合物，其包括燃料、生物燃料、生物柴油、合成的液体或气体或合成气或包含在燃料、生物燃料、生物柴油、合成的液体或气体或合成气中。
90.制备丙酮酸和/或D-谷氨酸的方法，其包括
(a)提供D-丙氨酸和2-氧化戊二酸；
(b)提供权利要求21至30中任一项的多肽；和
(c)在其中所述多肽催化反应：D-丙氨酸+2-氧化戊二酸＜＝＞丙酮酸+D-谷氨酸的
条件下将(b)的多肽与D-丙氨酸+2-氧化戊二酸接触。
91.制备2-含氧酸的方法，其包括
(i)，(a)提供D-氨基酸+H2O+受体；
(b)提供权利要求21至30中任一项的转氨酶多肽；和
(c)在其中所述多肽催化反应：D-氨基酸+H2O+受体＜＝＞2-含氧酸+NH3+还原的受
体的条件下将(b)的多肽与D-氨基酸+H2O+受体接触；或
(ii)，(i)的方法，其中所述受体是苯醌；
(iii)，(ii)的方法，其中所述苯醌是1，2-苯醌或1，4-苯醌或泛醌、泛癸利酮或辅酶Q。
92.将氨基从氨基酸转移至α-酮酸的方法，其包括
(i)，(a)，提供氨基酸；
(b)，提供权利要求21至30中任一项的转氨酶多肽；和
(c)，在其中所述多肽催化将氨基酸转化成α-酮酸的条件下使(b)的多肽与所述氨基
酸接触；或
(ii)，(i)的方法，其中所述转氨酶活性包括催化将外消旋氨基酸混合物转化成基本上光学纯的α-酮酸。
93.从α-酮酸转移制备氨基酸的方法，其包括
(i)，(a)，提供α-酮酸；
(b)，提供权利要求21至30中任一项的转氨酶多肽；和
(c)，在其中所述多肽催化将α-酮酸转化成氨基酸的条件下使(b)的多肽与α-酮酸
接触；
(ii)，(i)的方法，其中所述转氨酶活性包括催化将外消旋α-酮类混合物转化成基本
上光学纯的D-或L-氨基酸；或
(iii)，(i)或(ii)的方法，其中丁酮二酸被转化成天冬氨酸，或α-酮戊二酸被转化
成戊二酸，或α-酮异戊酸被转化成L-缬氨酸；或所述转氨酶活性是ω转氨酶活性，其将异丁胺转化成异丁醛。
94.催化将胺转化成酮的方法，其包括
(i)，(a)，提供胺；
(b)，提供权利要求21至30中任一项的转氨酶多肽；和
(c)，在其中所述多肽催化将胺转化成酮的条件下使(b)的多肽与胺接触，其中所述胺
不在色氨酸中或不来自色氨酸(假定第二氨基酸不是色氨酸，或者假定所述胺不在色氨酸中或不来自色氨酸)；
(ii)，(i)的方法，其中所述转氨酶活性包括催化将手性胺转化成酮；或
(iii)，(i)或(ii)的方法，其中所述胺是ω-胺。
95.催化氨基酸合成的方法，其包括
(i)，(a)，提供氨基酸和酮酸，其中所述氨基酸不是色氨酸；
(b)，提供权利要求21至30中任一项的转氨酶多肽；和
(c)，在其中产生第二氨基酸和丙酮酸的条件下将(b)的多肽与所述氨基酸和酮酸接
触，其中所述第二氨基酸不是色氨酸(假定第二氨基酸不是色氨酸)；或
(ii)，(i)的方法，其进一步包括在适于产生不与转氨酶反应的化合物的条件下使所述丙酮酸与乙酰乳酸合酶反应；
(iii)，(ii)的方法，其中所述不与转氨酶反应的化合物是乙酰乳酸或3-羟基丁酮；或者，第一氨基酸是丙氨酸或L-天冬氨酸，或者所述酮酸是2-丁酮酸或三甲基丙酮酸；或者，所述第二氨基酸是2-氨基丁酸或叔亮氨酸。