定义
在本
申请中,“一”和“一个”用于指单个和多个对象。
如本文所用,“大约”或“基本上”通常提供不受限于精确数字的余地。例如,如在上下文多肽序列的长度中所使用的,“约”或“基本上”表示该多肽不限于所列举的
氨基酸数目。只要存在诸如结合活性之类的功能活性,就可以包括在N-末端或C-末端添加或减去的一些氨基酸。
如本文所用,与一种或多种其他治疗剂“组合”
给药包括以任何顺序的同时(共同)和连续给药。
如本文所用,“载体”包括药学上可接受的载体、赋形剂或稳定剂,其在所采用的剂量和浓度下对暴露于其的细胞或
哺乳动物无毒。药学上可接受的载体通常是pH缓冲水溶液。药学上可接受的载体的实例包括但不限于缓冲剂,例如
磷酸盐、
柠檬酸盐和其他
有机酸;抗
氧化剂,其包括
抗坏血酸;低分子量(少于约10个残基)多肽;蛋白,例如血清
白蛋白、明胶或免疫球蛋白;亲水性
聚合物,例如聚乙烯吡咯烷
酮;氨基酸,例如甘氨酸、谷氨酰胺、天冬酰胺、精氨酸或赖氨酸;单糖、
二糖和其他
碳水化合物,包括
葡萄糖、甘露糖或糊精;螯合剂,例如EDTA;糖醇,例如甘露醇或山梨糖醇;成盐的抗衡离子,例如钠;和/或非离子
表面活性剂,例如 聚乙二醇(PEG)和
如本文所用,“药学上可接受的载体和/或稀释剂”包括任何和所有
溶剂、分散介质、包衣抗细菌和抗
真菌剂、等渗剂和吸收延迟剂等。这种介质和药剂用于药物活性物质的用途是本领域众所周知的。除非任何常规介质或药剂与活性成分不相容,否则考虑将其用于治疗组合物中。补充活性成分也可以掺入组合物中。
以剂量单位形式配制肠胃外组合物特别有利,以易于给药和剂量均匀。本文所用的剂
量单位形式是指适合作为待治疗的哺乳动物受试者的单位剂量的物理上离散的单位。每个单元包含预定量的活性物质,该活性物质经计算可与所需的药物载体一起产生所需的治疗效果。本发明的剂量单位形式的规范由(a)活性物质的独特特性和要实现的特定治疗效果、以及(b)在配制这种活性物质的领域中固有的局限性直接决定,所述活性物质用于治疗患有身体健康受损的疾病的活体受试者的疾病。
将主要活性成分与合适的药学上可接受的载体以单位剂型混合以于有效量方便有效
地给药。单位剂型可以例如包含0.5μg至约2000mg范围内的量的主要活性化合物。以比例表示,活性化合物通常以约载体的0.5μg/ml存在。在包含补充活性成分的组合物的情况下,所述剂量通过参考所述成分的常规剂量和给药方式来确定。
术语“MUC1生长因子受体”(MGFR)是功能定义,意指MUC1受体的与活化配体例如生长因子或修饰酶诸如切割酶相互作用的部分,以促进
细胞增殖。MUC1的MGFR区域是最接近细胞表面的胞外部分,并且由MGFR的主要序列(PSMGFR)的大部分或全部定义。MGFR既包括未修饰的肽,也包括经过酶修饰的肽,例如磷
酸化、糖基化等。本发明的结果与这样的机制是一致的,在该机制中,使该部分在MUC1裂解后可与配体接触在与致瘤相关的位点上,导致部分或全部IBR从细胞中释放出来。MGFR也称为MUC1*。
术语“MUC1生长因子受体的主要序列”(PSMGFR)或“FLR”是在某些情况下定义大部分或全部MGFR的肽序列,以及如下面所定义的肽序列的功能变体和片段。PSMGFR定义为下表1中列出的SEQ ID NO:3,并且其所有功能性变体和片段具有最多20个氨基酸取代的任何整数值(即1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19或20)和/或在其N端和/或C端最大20个氨基酸的整数值添加或缺失。在以上文本中,“功能性变体或片段”是指具有与SEQ ID NO:3的肽特异性结合或以其他方式特异性相互作用的能力的此类变异体或片段、与SEQ ID NO:3的肽特异性结合或以其他方式特异性相互作用的配体。PSMGFR的一个实例(SEQ NO:3的PSMGFR肽的功能变体,称为nat-PSMGFR-指“天然”)是SEQ ID NO:11(称为var-PSMGFR),与nat-PSMGFR不同,它包括-SPY-序列而不是天然-SRY-(请参见
序列表中的粗体文本)。与天然形式相比,Var-PSMGFR可能具有增强的构象
稳定性,这对于某些应用(例如抗体生产)可能很重要。PSMGFR既包括未修饰的肽,也包括经过酶修饰(例如磷酸化、糖基化等)的肽。
如本文所用,术语“PSMGFR”是MUC1生长因子受体的一级序列的首字母缩写,如下所述:
GTINVHDVETQFNQYKTEAASRYNLTISDVSVSDVPFPFSAQSGA(SEQ ID NO:3)。就这一点而言,“N-
10PSMGFR”、“N-15PSMGFR”或“N-20PSMGFR”中的“N数”是指在PSMGFR的N端已缺失的氨基酸残基的数目。同样,“C-10PSMGFR”、“C-15PSMGFR”或“C-20PSMGFR”中的“C数”是指在PSMGFR的C端已缺失的氨基酸残基的数目。
如本文所用,“MUC1*的胞外结构域”是指MUC1蛋白的缺少
串联重复结构域的胞外部分。
在大多数情况下,MUC1*是切割产物,其中MUC1*部分由没有串联重复的短胞外结构域、跨膜结构域和
细胞质尾部组成。MUC1切割的确切
位置可能未知,也许是因为它似乎可以被一种以上的酶切割。MUC1*的胞外结构域将包含PSMGFR序列的大部分,但可能具有额外的10-20个N端氨基酸。
如本文所用,编号为1-10的“NME家族蛋白”或“NME家族成员蛋白”是组合在一起的蛋白,因为它们都具有至少一个NDPK(核苷酸二磷酸激酶)结构域。在某些情况下,NDPK结构域在能够催化ATP转化为ADP方面不起作用。NME蛋白以前称为NM23蛋白,编号为H1和H2。最近,已鉴定多达十(10)个NME家族成员。在此,术语NM23和NME是可互换的。在本文中,术语NME1、NME2、NME5、NME6、NME7、NME8和NME9用于指天然蛋白以及NME变体。在某些情况下,这些变体在大肠杆菌中表达更好或更可溶、比天然序列蛋白更易溶。例如,本说明书中使用的NME7可以表示天然蛋白或变体,例如NME7-AB,其具有优异的商业适用性,因为变体允许在大肠杆菌中可溶性、适当折叠的蛋白高产表达。NME7-AB主要由NME7 A和B结构域组成,但缺少DM10结构域(SEQ ID NO:12)的大部分,其位于天然蛋白的N端。本文所指的“NME1”可与“NM23-H1”互换。还希望本发明不受NME蛋白的确切序列限制。突变体NME1-S 120G,也称为NM23-S
120G,在整个申请中可以互换使用。优选S120G突变体和P96S突变体,因为它们偏爱二聚体形成,但是在本文中可以称为NM23二聚体、NME1二聚体或二聚体NME1或二聚体NM23。
如本文所指,NME7是指具有约42kDa的分子量的天然NME7。
“NME7家族”是指全长NME7以及分子量为约30kDa、33kDa的天然存在的或人工产生的裂解形式、或分子量为约25kDa的裂解形式、缺少或部分缺少DM10前导序列(SEQ ID NO:12)的变体,其是由SEQ ID NO:5代表的NME7的大约氨基酸1-95的NME7,例如NME7b、NME7-X1、NME7-AB或重组NME7蛋白或其变体,其序列可能会改变以允许有效表达或增加产量、
溶解度或其他性质,从而使NME7更有效或在商业上更可行。“NME7家族”还可以包括“NME7-AB样”蛋白,其是在癌细胞中表达的30至33kDa范围内的蛋白。
如本文所用,“诱导分化或抑制干细胞多能性或干细胞生长”的药剂是指单独或组合导致干细胞处于始发状态或处于幼稚状态的蛋白、小分子或核酸,以分化或抑制干细胞多能性或干细胞生长。此类药剂的实例包括SMAD抑制剂和Dorsomorphin。
如本文所用,相对于始发干细胞,“在幼稚状态下抑制上调基因的表达或活性”的药剂是指单独或组合的蛋白、小分子或核酸,其在幼稚干细胞中引起对通常上调基因的抑制。这种药剂的实例包括siRNA、反义核酸和小分子。
如本文所用,相对于始发细胞,“在幼稚状态下增加下调基因的表达或活性”的药剂是指单独或组合的蛋白、小分子或核酸,其在幼稚干细胞中引起对通常下调基因的上调。这样的药剂的实例包括编码指示分化的蛋白的基因,例如波形蛋白、纤连蛋白和NF1、还有微RNA例如miR-145。
如本文所用,相对于成纤维细胞,“在幼稚状态下抑制上调基因的表达或活性”的药剂是指单独或组合的蛋白、小分子或核酸,其在幼稚干细胞中引起对通常上调基因的抑制。这类药剂的实例包括对多能基因OCT4、SOX2、KLF4或c-Myc特异的反义核酸或siRNA,以及编码波形蛋白、纤连蛋白、NF1的基因或基因产物本身。
如本文所用,相对于成纤维细胞,“在幼稚状态下增加下调基因的表达或活性”的药剂是指单独或组合的蛋白、小分子或核酸,其在幼稚干细胞中引起对通常下调基因的上调。这样的药剂的实例包括编码下调基因的核酸或蛋白本身,以及诱导分化的药剂例如SMAD抑制剂、Dorsomorphin等。
如本文所用,“促进多能性”或“使
体细胞回复至干样或癌样状态”的药剂是指单独或组合的蛋白、小分子或核酸,其诱导或抑制某些基因的表达,使遗传标记转变为更类似于干细胞或癌细胞的遗传标记。实例包括但不限于NME1二聚体、NME7、NME7-X1、NME7-AB、2i、5i;抑制MBD3、CHD4、BRD4或JMJD6表达的核酸如siRNA;与人NME1、NME2、NME5、NME6、NME7、NME 8或NME9,优选与容纳NDPK结构域的区域具有高度序列同源性的
微生物NME蛋白。
如本文所用,关于称为“小分子”的药剂,其可以是分子量在50Da与2000Da之间、更优选在150Da与1000Da之间、还更优选在200Da和750Da之间的合成化学或基于化学的分子。
如本文所用,关于被称为“天然产物”的药剂,其可以是化学分子或生物分子,只要该分子存在于自然界即可。
如本文所用,术语“癌症”可包括但不限于:胆道癌;膀胱癌;脑癌,包括胶质母细胞瘤和髓母细胞瘤;乳腺癌;
宫颈癌;绒毛膜癌;结肠癌;子宫内膜癌;食道癌;胃癌;血液
肿瘤,包括急性淋巴细胞性白血病和骨髓性白血病;多发性骨髓瘤;
艾滋病相关的白血病和成人T细胞白血病淋巴瘤;上皮内肿瘤,包括Bowen病和Paget病;肝癌;肺癌;淋巴瘤,包括霍奇金氏病和淋巴细胞性淋巴瘤;神经母细胞瘤;
口腔癌,包括鳞状细胞癌;卵巢癌,包括上皮细胞、基质细胞、生殖细胞和间充质细胞引起的卵巢癌;胰腺癌;前列腺癌;结肠癌;直肠癌;肉瘤,包括平滑肌肉瘤、横纹肌肉瘤、脂肪肉瘤、纤维肉瘤和骨肉瘤;
皮肤癌,包括黑色素瘤、Kaposi肉瘤、基底细胞癌和鳞状细胞癌;睾丸癌,包括生殖肿瘤,例如精原细胞瘤、非精原细胞瘤(畸胎瘤、绒毛膜癌)、基质瘤和生殖细胞瘤;甲状腺癌,包括甲状腺腺癌和髓样癌;肾癌,包括腺癌和Wilms肿瘤。优选的癌症是;乳腺癌、前列腺癌、结肠癌、肺癌、卵巢癌、
结直肠癌和脑癌。良性或恶性形式的肿瘤也被认为处于癌性状态之内。
如本文所述的术语“
癌症治疗”可包括但不限于:化学疗法、放射疗法、辅助疗法或前述方法的任何组合。可能变化的治疗方面包括但不限于:剂量、给药定时、或持续时间或疗法;
并且可能会或可能不会与其他治疗(可能在剂量、定时或持续时间上有所不同)组合使用。
癌症的另一种治疗方法是手术,可以单独使用或与任何上述治疗方法结合使用。医学领域的普通技术人员可以确定适当的治疗。
如本文所用,“炎性疾病”或病症是指以免疫应答为特征的疾病或病症,所述免疫应答在特定区域中涉及非特异性免疫应答。这种疾病或病症可以包括但不限于,类风湿关节炎、炎性肠综合征、Crohn病、骨关节炎、哮喘、皮炎、牛皮癣、囊性纤维化、移植后迟发和慢性实体器官排斥反应、多发性硬化症、系统性红斑狼疮、Sjogren综合征、Hashimoto甲状腺炎、多发性肌炎、硬皮病、Addison病、白癜风、恶性贫血、肾小球肾炎、肺纤维化、自身免疫性糖尿病、糖尿病视网膜病变、鼻炎、缺血再灌注损伤、血管成形术后再狭窄、慢性阻塞性肺疾病(COPD)、Graves病、胃肠道过敏、结膜炎、动脉粥样硬化、冠状动脉疾病、心绞痛、癌症转移、小动脉疾病或线粒体疾病。
如本文所用,“身体样品”是指获自受试者的任何身体组织或体液样品。优选的是体液,例如淋巴液、唾液、血液、尿液、乳汁和乳腺分泌物等。在某些
实施例中,血液是优选的。可以通过标准方法获得用于本文所述的各种方法的组织和/或细胞的样品,所述标准方法包括但不限于:组织活检,包括穿孔活检和细胞刮取、针头活检以及通过吸气或其它方法收集血液或其他体液。
如本文所用,“受试者”是指哺乳动物,并且优选地是指具有可以通过将本发明的组合物给予于受试者内的部位来治疗的疾病的任何哺乳动物(优选地,人)。例子包括人类,非人类的灵长类动物、牛、
马、猪、
绵羊、山羊、狗或猫。通常,本发明针对与人类一起使用。
如本文所用,“MUC1阳性癌症”或“MUC1*阳性癌症”是指以MUC1的异常表达为特征的癌症,其中异常可以是指MUC1基因或基因产物过度表达,或MUC1或MUC1*的正常表达模式的丧失,在
健康状态下,该表达模式仅限于细胞的顶端边界或
导管的腔边缘、或裂解并从细胞表面脱落的MUC1量的增加。
序列表自由文本
关于除a、g、c、t以外的核苷酸符号的使用,它们遵循WIPO标准ST.25附录2表1中列出的惯例,其中k表示t或g;n代表a、c、t或g;m代表a或c;r代表a或g;s代表c或g;w代表a或t,并且y代表c或t。
MTPGTQSPFF LLLLLTVLTV VTGSGHASST PGGEKETSAT QRSSVPSSTE KNAVSMTSSV
LSSHSPGSGS STTQGQDVTL APATEPASGS AATWGQDVTS VPVTRPALGS TTPPAHDVTS APDNKPAPGS TAPPAHGVTS APDTRPAPGS TAPPAHGVTS APDTRPAPGS TAPPAHGVTS APDTRPAPGS TAPPAHGVTS APDTRPAPGS TAPPAHGVTS APDTRPAPGS TAPPAHGVTS APDTRPAPGS TAPPAHGVTS APDTRPAPGS TAPPAHGVTS APDTRPAPGS TAPPAHGVTS APDTRPAPGS TAPPAHGVTS APDTRPAPGS TAPPAHGVTS APDTRPAPGS TAPPAHGVTS APDTRPAPGS TAPPAHGVTS APDTRPAPGS TAPPAHGVTS APDTRPAPGS TAPPAHGVTS APDTRPAPGS TAPPAHGVTS APDTRPAPGS TAPPAHGVTS APDTRPAPGS TAPPAHGVTS APDTRPAPGS TAPPAHGVTS APDTRPAPGS TAPPAHGVTS APDTRPAPGS TAPPAHGVTS APDTRPAPGS TAPPAHGVTS APDTRPAPGS TAPPAHGVTS APDTRPAPGS TAPPAHGVTS APDTRPAPGS TAPPAHGVTS APDTRPAPGS TAPPAHGVTS APDTRPAPGS TAPPAHGVTS APDTRPAPGS TAPPAHGVTS APDTRPAPGS TAPPAHGVTS APDTRPAPGS TAPPAHGVTS APDTRPAPGS TAPPAHGVTS APDTRPAPGS TAPPAHGVTS APDTRPAPGS TAPPAHGVTS APDTRPAPGS TAPPAHGVTS APDTRPAPGS TAPPAHGVTS APDTRPAPGS TAPPAHGVTS APDTRPAPGS TAPPAHGVTS APDTRPAPGS TAPPAHGVTS APDTRPAPGS TAPPAHGVTS AP DTRPAPGS TAPPAHGVTS APDTRPAPGS TAPPAHGVTS APDNRPALGS TAPPVHNVTS ASGSASGSAS TLVHNGTSAR ATTTPASKST PFSIPSHHSD TPTTLASHST KTDASSTHHS SVPPLTSSNH STSPQLSTGV SFFFLSFHIS NLQFNSSLED PSTDYYQELQ RDISEMFLQI YKQGGFLGLS NIKFRPGSVV VQLTLAFREG TINVHDVETQ FNQYKTEAAS RYNLTISDVS VSDVPFPFSA QSGAGVPGWG IALLVLVCVL VALAIVYLIA LAVCQCRRKN YGQLDIFPAR DTYHPMSEYP TYHTHGRYVP PSSTDRSPYE
KVSAGNGGSSLSYTNPAVAAASANL(SEQ ID NO:1)描述了全长MUC1受体(Mucin 1前体,Genbank登录号:P15941)。
GTIN VHD VETQFNQ YKTE A AS RYNLTIS D VS VS D VPFPFS AQS G AG VPGWGIALLVL
VCVLVALAIVYLIALAVCQCRRKNYGQLDIFPARDTYHPMSEYPTY HTHGRYVP PS S TDRS P YEKVS
AGNGGS S LS YTNP A V AAAS ANL(SEQ ID NO:2)描述了截短的MUC1受体同种型,其在N端具有nat-PSMGFR,包括全长MUC1受体的跨膜和胞质序列。
GTIN VHD VETQFNQ YKTE A AS RYNLTIS D VS VS D VPFPFS AQS G A(SEQ ID NO:3)
描述了MUC1生长因子受体的天然一级序列的胞外结构域(nat-PSMGFR-“PSMGFR”的实例)。
QFNQ YKTE A AS RYNLTIS D VS VS D VPFPFS AQS G A(SEQ ID NO:4)描述了PSMGFR
的N-10肽,其中N端的10个氨基酸已被去除。
DPETMNHS ERF VFIAE W YDPN AS LLRR YELLF YPGDGS VEMHD VKNHRTFLKRTKYDNLHLE
DLFIGNKVNVFSRQLVLIDYGDQYTARQLGSRKEKTL ALIKPDAISKAGEIIEIINKAGFTITKLKMMMLSRKEALDFHVDHQSRPFFNELIQFIT TGPIIAMEILRDDAI CE WKRLLGP ANS G V ARTD AS ES IR
ALFGTDGIRN A AHGPDS F AS AAREMELFFPS S GGC GPANTAKFTNCTCCIVKPHAVSEGMLNTLYSVHFVNRRAMFIFLMYFMYRK(SEQ ID NO:5)描述了NME7氨基酸序列(NME7:GENBANK登录号
AB209049)。
MEKTLALIKPDAISKAGEIIEIINKAGFTITKLKMMMLSRKEALDFHVDHQSRP FFNELIQFITTGPIIAM
EILRDDAICEWKRLLGPANSGVARTDASESIRALFGTDGIR NAAHGPDSFASAAREMELFFPSSGGCGPANTAKFTNCTCCIVKPHAVSEGLLGKI LMAIRDAGFEISAMQMFNMDRVNVEEFYEVYKGVVTEYHDMVTEMYSGPCVAM EIQQNNATKTFREFCGPADPEIARHLRPGTLRAIFGKTKIQNAVHCTDLPEDGLLE VQYFFKILDN(SEQ ID NO:6)描述了人NME7-AB。
MMMLSRKEALDFHVDHQSRPFFNELIQFITTGPIIAMEILRDDAICEWKRLLGP ANS GV ARTD AS ES
IR ALFGTDGIRN AAHGPDS FAS AAREMELFFPS S GGC GP ANT AKFTNCTCCIVKPHAVSEGLLGKILMAIRDAGFEISAMQMFNMDRVNV EEFYEVYKGVVTEYHDMVTEMYSGPCVAMEIQQNNATKTFREFCGPADPEIARH LRPGTLRAIFGKTKIQNAVH CTDLPEDGLLEVQYFFKILDN*(SEQ ID NO:7)描述了人NME7-X1。
MEKTLALIKPDAISKAGEIIEIINKAGFTITKLKMMMLSRKEALDFHVDHQSRP FFNELIQFITTGPIIAM
EILRDDAICEWKRLLGPANSGVARTDASESIRALFGTDGIR NAAH GPDS FAS A AREMELFF-(SEQ ID NO:8)描述了人NME7-A1。
MPSSGGCGPANTAKFTNCTCCrVKPHAVSEGLLGKILMAIRDAGFEISAMQM FNMDRVNVEEFYEVYKGVV
TEYHDMVTEMYSGPCVAMEIQQNNATKTFREFCG PADP EIARHLRPGTLRAIFGKTKIQNAVHCTDLPEDGLLEVQYFFKILDN(SEQ ID NO:9)描述了人NME7-B3。
AIFGKTKIQNAVHCTDLPEDGLLEVQYFF(SEQ ID NO:10)描述了B3,其是NME7B肽3(B结构
域)。
GTIN VHD VETQFNQ YKTE A AS P YNLTIS D VS VS D VPFPFS AQS G A(SEQ ID NO:
11)描述了具有增强的稳定性的MUC1生长因子受体的天然一级序列的“SPY”功能变体的胞外结构域(var-PSMGFR-“PSMGFR”的一个实例)。
MNHSERFVFIAEWYDPNASLLRRYELLFYPGDGSVEMHDVKNHRTFLKRTK YDNLHLEDLFIGNKVNVFSR
QLVLIDYGDQYTARQLGSRK(SEQ ID NO:12)描述了NME7的DM10结构域。
癌细胞和干细胞
干细胞和癌细胞有很多共同点。现在,研究人员发现,未分化干细胞的许多标志物实际上也是癌细胞的标志物。相反,许多曾经被认为是癌症标志物的分子标志物现在被重新定义为干细胞标志物。例如,我们发现先前被鉴定为转移性癌症标志物的CXCR4是幼稚干细胞的标志物。癌细胞还被表征为经历上皮到间充质转变(EMT),其中上皮细胞终末分化,而间充质细胞分化程度较低,并且是干细胞样细胞(Mani etal.,2008)。肿瘤学家长期以来一直观察到,随着癌症分期的进展,受累组织的细胞看起来越来越不成熟或不分化,看起来更像干细胞。病理学家使用分化程度的表观来对癌症分期进行分类,早期癌症被分类为中度分化,而侵袭性或转移性癌症则被分类为低度分化。
此外,我们先前已经报道了我们的发现,即介导所有癌症的75%以上生长的生长因子
受体MUC1*存在于100%的多能人类干细胞上(Hikita et al.,2008;Smagghe et al.,
2013)。最近,我们发现了一种生长因子NME7AB,它可以结合并激活MUC1*的生长、存活和自我更新功能(Carter et al.,2016)。通过在含有NME7AB作为唯一生长因子的基本培养基中进行培养,可以将人类干细胞维持在多能状态。在NME7AB中培养的干细胞保持在称为幼稚的最早状态。NME7AB存在于第3天的人桑椹胚的每个细胞中,其中所有细胞都处于最早的幼稚状态。到人类囊胚的第5天时,NME7AB局限于内细胞团,根据定义,这些细胞是幼稚的。NME7AB在人囊胚的第5天后应关闭,除非在睾丸中发现。然而,我们发现NME7以与NME7AB和NME7-X1相对应的截短形式在侵袭性和转移性癌症中表达(WO2015/023694)。我们证明了向常规癌细胞中添加NME7AB使其可以从少至50种植入的癌细胞转变为更具转移性的癌细胞,从而在动物体内形成肿瘤,而非转移性癌细胞则需要4-6M植入的细胞才能形成肿瘤。此外,向动物注射NME7AB会导致植入的癌细胞转移。这些数据进一步在分子水平上在干细胞与癌细胞之间,更特别地在侵袭性或转移性癌症与幼稚干细胞之间建立了功能联系。
这些结果暗示促进干细胞多能性的途径与促进癌症的途径相同。抑制干细胞多能性或
生长、或诱导干细胞分化的药剂是当给予于患者时预防或治疗癌症的有效抗癌剂。
发明人已经表明,将干细胞转化或维持为幼稚状态的药剂能够将癌细胞转变为更具转
移性的状态。因此,幼稚干细胞在许多方面与侵袭性或转移性癌细胞相似。这些结果暗示促进幼稚干细胞多能性的途径与促进癌细胞转移的途径相同。预测是,抑制幼稚干细胞多能性或生长、或诱导干细胞分化的药剂是当给予于患者时是预防或治疗转移性癌症的有效抗癌剂。
幼稚干细胞和始发干细胞之间的巨大差异表明,这两种不同类型的干细胞多能生长并
抵抗通过不同途径的分化。因此,抑制幼稚干细胞的多能性或增殖而不抑制始发状态干细胞多能性或增殖或对始发状态干细胞具有较轻微作用的候选药物,是在治疗或预防侵袭性或转移性癌症方面最有效的候选药物。
在本发明的一方面,在可以是候选药物的药剂的存在下培养干细胞,观察到该药剂抑
制干细胞多能性或生长、或诱导干细胞分化,并且所述药剂给予患者用于预防或治疗癌症。
在本发明的一方面,干细胞是人的。在另一方面,干细胞处于幼稚状态。在某些情况下,通过在NME1二聚体、NME7、NME7AB、NME7-X1中培养或通过其他报道的将干细胞保持在更幼稚状态的方法,干细胞可以保持在幼稚状态(Silva et al.,2008;Hanna et al.,2010;Gafni et al.,2013;Theunissen et al.,2014;Ware et al.,2014)。在又一方面,观察到该药剂抑制幼稚干细胞而不是始发状态干细胞的多能性或生长,或诱导幼稚干细胞而不是始发状态干细胞的分化,或者该药剂对始发状态干细胞的作用较小,并且将该药剂给予有发展风险或已诊断患有转移性癌症的患者。因为我们发现所有多能干细胞均为MUC1*阳性,并且幼稚干细胞表达NME7AB,所以如上所述鉴定的药剂对于治疗MUC1*阳性、NME7AB阳性或NME7-X1阳性癌症将是最有效的。
癌症术语
如本文所用,术语癌症“迁移”和“侵袭”是同义词,并且是转移性癌细胞的特征。
本文所用的迁移测定是指用诸如胶原蛋白、纤连蛋白等的胞外基质蛋白包被表面,将
癌细胞接种到该表面上,但是将其从区域移出或限制它们接种到区域上,然后在细胞进入限制空间时照相,或者在存在有效抑制剂的情况下抑制细胞进入限制空间。其中将细胞从区域中移出的迁移测定称为刮擦测定或伤口测定,将限制细胞在区域中铺板的迁移测定本文中称为platypus测定。
如本文所用,转移性癌症包括已经浸润或侵袭邻近组织、或者已经转移到淋巴结、或者已经转移到除了原始癌症的器官之外的器官中的癌症。如本文所用,术语转移性癌症包括已知容易转移的那些癌症。例如,具有一定皮肤深度的黑色素瘤在统计学上将在可预测的时间内转移。另一个实例是胰腺癌,已知会在可预测的时间内转移,尤其是转移到肝脏。
病理学家具有评估肿瘤侵袭性或转移潜力的两种主要方法。一种方法是分配等级或阶
段。1级意味着肿瘤细胞看起来最像正常细胞,称为分化良好。分化良好的癌细胞生长缓慢。
2级意味着肿瘤处于中等分化,因此生长较快。3级意味着肿瘤细胞看起来非常异常且分化差,这是生长最快的癌细胞。
病理学家还基于活检组织的分析和其他诊断技术,使用对肿瘤评分的TNM系统。“T”代表延伸到邻近组织,“N”代表淋巴结受累,“M”代表转移到远端器官。具体来说,T评分的范围是0-4,其中零表示没有肿瘤迹象,而4则涉及已经扩展到相邻组织的大肿瘤。N评分在0-3的范围内,其中N0表示没有淋巴结受累的证据,N1表示癌症已经扩散到附近的淋巴结或少量淋巴结。N2和N3表示肿瘤已扩散到更多的淋巴结和/或更远的淋巴结。M得分为0或1,其中M0表示没有转移的证据,而M1表示癌症已经扩散到远处的器官或除起源器官以外的器官。
药物筛选
在此,我们描述了治疗剂,和鉴定用于预防或治疗癌症、转移性癌症或用于预防癌症复发的治疗剂的方法。在一个实施例中,这些治疗剂用于预防或治疗MUC1阳性、MUC1*阳性、NME7阳性、NME7AB阳性或NME7-X1阳性的癌症。我们已经确定,控制幼稚干细胞的生长和多能性的
信号传导途径不同于控制始发干细胞的生长和多能性的信号传导途径。此外,我们发现介导幼稚干细胞生长或多能性的相同途径也介导癌细胞的生长和转移能力。我们发现抑制干细胞多能性或生长、或诱导干细胞分化的药剂是抑制癌细胞增殖的药剂,当给予于患者时,它们是预防或治疗癌症的有效药剂。抑制幼稚干细胞多能性或生长、或诱导幼稚干细胞分化的药剂是抑制癌细胞迁移(其是转移性癌症的特征)的药剂,当给予于患者时,将是预防或治疗侵袭性或转移性癌症的有效抗癌剂。抑制幼稚干细胞而不是始发干细胞的多能性或生长、或诱导幼稚干细胞而不是始发干细胞分化的药剂,或对始发干细胞的影响小得多的药剂是预防或治疗侵袭性或转移性癌症的有效药剂。
因此,鉴定治疗剂以治疗处于发展风险或诊断为癌症的患者:1)培养多能状态干细胞;
2)使多能干细胞群体与候选药物接触;3)鉴定抑制多能干细胞的多能性或生长、或诱导多能干细胞分化的候选药物;4)得出结论,抑制多能干细胞的多能性或生长、或诱导多能干细胞分化的候选药物是抗癌剂。
鉴定治疗剂以治疗处于发展风险或诊断为转移性癌症的患者:1)培养幼稚状态干细
胞;2)使干细胞与候选药物接触;3)鉴定抑制幼稚干细胞多能性或生长、或诱导幼稚干细胞分化的候选药物;4)得出结论,抑制幼稚干细胞多能性或生长、或诱导幼稚干细胞分化的候选药物是用于治疗或预防侵袭性癌症或癌症转移的抗癌剂。
替代地,为了鉴定治疗剂以治疗处于发展风险或诊断为转移性癌症的患者:1)培养幼
稚状态干细胞,并可选地平行培养始发状态干细胞;2)使两个干细胞群体都与候选药物接触;3)鉴定抑制幼稚干细胞但可选地不是始发干细胞多能性或生长、或诱导幼稚干细胞但可选地不是始发干细胞分化、或对始发干细胞的影响小得多的候选药物;4)得出结论,抑制幼稚干细胞但可选地不是始发干细胞多能性或生长、或诱导幼稚干细胞但可选地不是始发干细胞分化、或对始发干细胞影响较小的候选药物,是用于治疗或预防癌症转移的抗癌剂。
以这些方式筛选以评估其作为抗癌剂或抗转移剂的潜力的药剂可以是任何形式,包括
但不限于小分子、天然产物、抗体、抗体片段、文库或抗体或抗体片段、肽、肽模拟物、核酸、反义核酸、DNA、RNA、编码或非编码、抑制性RNA、细菌和微生物。在本发明的一方面,干细胞是人源的。在本发明的另一方面,干细胞是灵长类动物源的。在本发明的又一方面,干细胞是哺乳动物源的。在本发明的又一方面,干细胞是啮齿动物源的。
在本发明的另一方面,通过鉴定在幼稚干细胞中而不在始发干细胞中上调的基因来鉴
定新颖抗癌或抗转移性药物靶标。在本发明的另一方面,通过鉴定在幼稚干细胞中而不在始发干细胞中上调的微RNA,鉴定了新颖抗癌或抗转移性药物靶标。
药物筛选结果
WO2009/042815公开了在直接结合测定中,一系列的咔啉分子抑制了MUC1*的胞外结构
域和NME蛋白尤其是NME1二聚体和NME7AB之间的相互作用。我们先前还表明,抑制MUC1*-NME相互作用的同一系列咔啉也抑制癌细胞的生长。我们测试了一组包含十个小分子的小分子,其中包括三个咔啉(图1)以及生物制剂的与始发状态干细胞相比抑制幼稚干细胞多能性或生长的能力。我们先前证明抗MUC1*单克隆抗体E6或对应于MUC1*胞外域的合成肽FLR(也称为PSMGFR),通过抑制MUC1*-NME7AB或MUC1*-NME1相互作用抑制癌症和干细胞多能性和生长。我们还测试了新颖抗NME7抗体#56和#61;我们以前曾证明,它们抑制NME7AB的能力,使其将常规癌细胞转化为转移性癌细胞,尽管#61比#56更有效得多。我们先前还表明,一些咔啉小分子通过抑制MUC1*-NME7AB或MUC1*-NME1相互作用来抑制癌症的生长。
JQ1是据报道抑制BRD4的小分子,并且已经显示出抑制癌细胞迁移和癌细胞增殖,但是没有报道对干细胞有任何作用。在存在和不存在干细胞生长因子的情况下进行干细胞筛选测定:NME7AB用于生长幼稚干细胞,或FGF用于生长始发干细胞。如果存在同源的生长因子,则生物学分子或小分子将必须与生长因子竞争才能获得效果。因此,我们预计当缺少生长因子(用于始发干细胞的FGF或用于幼稚干细胞的NME7AB或NMEl二聚体)时,会有更多的影响。结果总结在图2的表中。目测确定化合物对干细胞的影响并将化合物分级为0-4,其中4为最大影响,0为不可观察的影响。观察到的主要影响是从多能干细胞形态(一种小圆形细胞的鹅卵石模式,具有较大细胞核细胞质比)到分化干细胞形态(一种细长、较大且扁平的细胞,具有较小细胞核细胞质比)的变化。一些化合物还严重抑制干细胞的生长。将化合物添加至幼稚状态干细胞或始发状态干细胞的终浓度为6uM。在这种特殊情况下,通过在含有NME7AB或NME1二聚体的培养基中进行培养,将幼稚状态干细胞保持为幼稚状态。但是,可以使用其他方法,例如2i和5i(Silva et al.,2008,Nichols and Smith,2009,Theunissen et al.,2014)将干细胞维持在更幼稚的状态。在这种情况下,尽管已知任何含bFGF的培养基都能将干细胞保持在始发状态,但在bFGF中、MEF层上培养了始发状态干细胞。
我们已经表明JQI对幼稚干细胞生长具有抑制作用,但对始发干细胞生长没有抑制作
用。此外,先前的研究表明JQ1具有抗炎作用(Belkina et al,2013;Meng et al,2014)。因此,本研究中鉴定出的化合物也应具有抗炎作用,并可用于治疗
肥胖症、哮喘、慢性消化性溃疡、结核、类风湿性关节炎、慢性
牙周炎、溃疡性结肠炎和克罗恩病、慢性鼻窦炎、慢性活动性
肝炎等的
炎症。
在所测试的十个小分子和四种生物剂中,除了MN1130对始发化干细胞集落具有适度的
影响外,没有一个对始发干细胞有任何影响。但是,当在幼稚干细胞上测试相同的药剂时,四种生物制剂中的三种和三种咔啉中的两种会深远抑制干细胞多能性和生长并诱导分化。
注意,这些药剂诱导的幼稚干细胞的形态变化与干细胞开始分化时发生的形态变化一致(用虚线表示)。细胞变扁平,呈更大的纺锤形,细胞核与细胞质的比例降低。
除了图1中所示的小分子外,还测试了抗MUC1*Fab、FLR肽又名PSMGFR肽以及抗NME7抗
体#56和#61。图2总结了这些候选药物在幼稚干细胞与始发干细胞中的表现,其中证实的药物命中是该化合物诱导幼稚干细胞分化但对FGF-培养的始发干细胞没有影响或影响较小的药物。图3-10显示了用小分子、Fab、MUC1*胞外域肽“FLR”或小分子处理的干细胞的照片。
图3-6显示没有药剂或化合物显著诱导始发状态干细胞的分化。然而,图7-10显示几种药剂诱导幼稚状态干细胞的分化。分化部分由虚线表示。具体而言,在这些浓度下,抗MUC1*E6 Fab、FLR肽、抗NME7#61、MN572、MN0642和MN1130均可诱导幼稚状态干细胞分化,并被预测为有效的癌症抑制剂和癌症转移抑制剂。可以将它们给予患者以预防或治疗癌症或转移性癌症。已经显示E6 Fab抑制所有MUC1*阳性癌细胞的生长。另外,显示抗MUC1*E6 Fab在动物中强烈抑制MUC1*阳性肿瘤生长。类似地,化合物MN0642已经显示出在体外抑制癌细胞的生长。FLR(PSMGFR)肽和抗NME7#61已显示抑制正常癌细胞向转移性癌细胞的转化。
测试了与本发明化合物没有相似但据报道抑制癌症生长或迁移的几种其他小分子,并
发现其抑制了干细胞特别是幼稚干细胞的多能性、或生长,或诱导其分化。例如,据报道,一个与咔啉不相似的小分子JQ1(+)(图1)可抑制炎症(Belkina et al.,2013)、癌症多能性(Fillippakopoulos et al.,2010)和癌细胞迁移(Tang et al.,2013)。据报道,JQ1(+)抑制BRD4,其无活性对映体JQ1(-)没有作用(Fillippakopoulos et al.,2010)。据报道,BRD4是NME7的调节剂,是癌基因c-Myc的调节剂,并且是在癌细胞和干细胞中过表达某些基因的超级增强子的成分。目前,尚不清楚BRD4的这些声称功能中哪一个是正确的。用JQ1(+)、非活性立体异构体JQ1(-)、BRD4特异性siRNA或JMJD6特异性siRNA处理始发状态干细胞3天。
这些药剂似乎均未诱导始发状态干细胞的分化,但JQ1(+)可能对始发状态干细胞集落的大小有适度的影响(图11),并且还似乎引起了一些异常形态(图12)。但是,JQ1(+)显著诱导幼稚状态干细胞分化并抑制其生长(图14E-F、15E-F和16E-F)。无论是将幼稚干细胞培养在NME7AB(图13-14)还是NME1二聚体(图15-16)中,JQ1(+)都能抑制幼稚干细胞多能性和生长,并诱导分化。由于JQ1(+)是炎症、癌细胞迁移和癌细胞增殖的已知抑制剂,因此这些结果表明,有效治疗炎症或预防或治疗癌症的药剂还抑制幼稚干细胞多能性或生长、或诱导干细胞分化。因此,抑制幼稚干细胞多能性或生长、或诱导干细胞分化的药剂也是炎症的有效治疗或癌症的预防或治疗。
然后我们测试了扩大的药剂组,包括已知抑制癌症生长或迁移的药剂(图17)(Horm et al.,2012;Meng&Yue,2014;Zhen et al.,2014),这是侵袭性或转移性癌症的特征。我们还合成了一系列新颖的小分子,在干细胞药物筛选测定中对其进行了测试,然后在一系列生物学测定中对其进行了测试,以测试其抑制癌细胞迁移、侵袭或增殖的能力。干细胞筛选和生物学测定的结果总结在图18A-18E的表中。
图19A-19P显示了对照干细胞,或向其中添加了已知的抗迁移化合物地塞米松和
SU11274的干细胞的照片。
癌细胞的强迁移是癌细胞侵袭其他组织和转移的特征。典型的迁移测定包括用纤连蛋
白、胶原蛋白等涂覆细胞培养板,铺板癌细胞并贯穿细胞形成疤痕,并测量癌细胞侵袭空隙所花费的时间。提供更可靠数据的另一种方法是Platypus系统,它是一种特殊的多孔细胞培养板,带有并列设置的塞子组,其在每个孔的中心都阻塞了一个圈。在塞子到位的同时将癌细胞铺板,然后在细胞附着到板表面后将其取出。将候选药物添加到每个孔中,然后根据时间拍摄照片,以
跟踪候选药物对癌细胞迁移或侵袭的抑制作用。在我们的癌细胞迁移测定中,已使用Image J
软件对已迁移到空白空间中的细胞数量进行了量化。总结这种癌细胞迁移测定结果的条形图如图20所示。将已知的抗迁移化合物的效果与抗MUC1*Fab E6和前几个小分子前导相比较。癌细胞迁移测定的结果如图21所示。癌细胞迁移测定的照片和总结其活性的条形图如图22所示。与已知的抗迁移分子SU11274相比,两种新颖的小分子MN1186和MN1194的作用如图22A-22U所示。图22V是示出对于多种化合物在0、24小时或48小时的时间测量的癌细胞迁移抑制的图。图22W是示出小分子的抑制作用随其浓度变化关系的图。图22X是示出如何测量和计算本发明的小分子的IC 50的图。
所有人多能干细胞均为MUC1*阳性。幼稚状态干细胞还表达原始生长因子NME7AB,它是MUC1*的活化配体。乳腺癌细胞系T47D来自转移性乳腺癌患者。T47D细胞表达任何市售细胞系中最高水平的MUC1*。我们发现T47D细胞还表达NME7AB和另一种剪接异构体NME7-X1,它们都是激活MUC1*生长因子受体的生长因子。
首先在筛选干细胞药物的抑制干细胞多能性或增殖的能力的测定中鉴定命中化合物。
然后,我们测试命中物抑制癌细胞迁移、侵袭(这是转移性癌症的特征)的能力,然后我们最终测试了命中物抑制癌细胞增殖的能力。结果是抑制干细胞多能性和/或增殖的化合物也抑制了癌细胞的迁移、侵袭性和/或增殖。这些研究表明,本发明的化合物抑制多种癌细胞的迁移和/或侵袭。已显示本发明的化合物抑制DU145(MUC1*+/NME7AB+++/NME7-Xl+++)前列腺癌细胞、和SK-OV-3(MUC1*+)卵巢癌细胞、A549(MUC1*LO)肺癌细胞、PC-3(MUC1*-/NME7AB+++/NME7-X1+++)前列腺癌细胞、CHL-1(MUC1*+/NME7+)黑色素瘤细胞、OV-90(MUC1*-)卵巢癌细胞、CAPAN-2(MUC1*+)胰腺癌细胞、ZR-75-1(MUC1*++)乳腺癌细胞以及其他细胞的迁移、侵袭和/或增殖。
还使用先前报道的癌细胞迁移或侵袭抑制剂,例如BRD4抑制剂JQ1+及其非活性对映体
JQ1-、c-Met抑制剂SU11274以及图17所示其它等,进行了小分子抑制癌细胞迁移或增殖的研究。这些化合物中的一些在某种程度上抑制了癌细胞的迁移或侵袭,但是大多数化合物也抑制了成纤维细胞(这是正常健康细胞的替代物)的生长,这意味着它们可能对患者产生毒
副作用。
本发明化合物的生物学测试数据显示在图18A-18E中。
随着癌症治疗变得更加有针对性,目标是开发优先抑制癌细胞的增殖、迁移或侵袭性,同时对正常健康细胞产生最小影响的治疗剂。没有“正常”细胞系,因为正常的终末分化细胞不会像干细胞或癌细胞那样不断分裂。但是,成纤维细胞比干细胞分化程度更高,但能够在规定的时间内自我复制。我们测试了选择的本发明化合物以确定这些化合物是否仅仅是细胞毒性的,或者它们是否选择性地影响干细胞,重要的是癌细胞,而不是正常的健康细胞。在这里,我们使用成纤维细胞作为正常细胞的替代物。由于成纤维细胞不会改
变形态,因此该测定的读数仅是化合物对增殖的影响。在将6uM的测试化合物分别添加到正在生长的人成纤维细胞中之后48或72小时拍摄照片。对每种化合物对成纤维细胞增殖的作用进行评分,其中“+”表示抑制25%的成纤维细胞生长、“++”表示抑制50%的生长、“+++”表示抑制
75%的生长。图23A-23D显示了培养中的人成纤维细胞的照片,仅用0.2%DMSO处理作为对照。图24A-24F显示了在终浓度为500nM时,JQ1+(图24A-24C)与非活性对映体JQ1-(图24D-
24F)对人幼稚状态干细胞(图24A、24D)、人始发状态干细胞(图24B、24E)或人成纤维细胞(图24C、24F)的作用的照片。可以看出,JQ1+对成纤维细胞的作用与对始发状态干细胞的作用相同,这表明它比不影响后来的成纤维细胞祖细胞的化合物具有更多的副作用。图25A-
25F显示了先前已知的癌细胞迁移抑制剂JQ1和SU11274与导致现在成为本发明化合物的衍生物的原始命中物,对人成纤维细胞祖细胞生长的影响的照片。从图中可以看出,本发明的大多数新颖化合物对成纤维细胞的生长几乎没有影响。它们对始发状态干细胞的影响也很小或没有,但对幼稚状态干细胞(我们认为这是癌细胞的替代物)的抑制作用最大。本发明的化合物强烈抑制幼稚干细胞的多能性和增殖以及癌细胞的迁移和增殖,但是对成纤维细胞祖细胞几乎没有影响或通常没有影响,这一事实表明该化合物不是细胞毒性剂。相反,其他先前报道的癌细胞迁移抑制剂对成纤维细胞祖细胞的作用与对干细胞和癌细胞的作用相同,这表明它们可能对患者产生毒性副作用。
实验表明,本发明的新化合物通过诱导成熟(也称为分化)来抑制干细胞和癌细胞两者
的多能性、增殖和/或迁移。用本发明的化合物处理过的幼稚干细胞的RT-PCR测量表明,本发明的化合物诱导分化标志物的上调。因用本发明化合物以浓度依赖方式处理而增加表达的基因是纤连蛋白和波形蛋白和NF1,纤连蛋白和波形蛋白均随着干细胞的分化而增加,而NF1是在干细胞开始分化为神经系时首先增加的基因之一。响应于用本发明的化合物处理,纤连蛋白、波形蛋白或NF1表达增加的事实表明,该化合物诱导分化,而终末分化的细胞不自我复制。因此,诱导分化标志物的本发明化合物可用于治疗癌症,因为根据定义,癌细胞已经去分化,这使得它们能够连续自我复制。当用本发明的化合物治疗癌细胞时,在癌症中上调的E-钙粘着蛋白下调。注意,先前已知的癌细胞迁移和增殖抑制剂JQ1+和SU11274不会引起分化标志物的上调,即诱导干细胞分化。类似地,本发明的新颖化合物诱导癌细胞的分化。转移标志物E-钙黏着蛋白的表达减少,分化标志物纤连蛋白、波形蛋白和NF1的表达增加。
本发明的新颖化合物是高度特异性的。它们特异性抑制干细胞和癌细胞的多能性和/
或增殖。本发明的新颖化合物对MUC1*阳性和/或NME7AB或NME7-X1阳性的癌症最有效。尽管我们发现NMEl二聚体、NME7AB和NME7-X1都是MUC1*生长因子受体的活化配体,并且它们结合到其胞外结构域,但我们已经获得了充分的证据表明NME7AB和NME7-X1都具有其他结合伴侣并且可以发挥致癌作用,独立于MUC1*。
NME7AB是使最早的幼稚干细胞生长的天然生长因子。单独使用NME7AB足以满足幼稚人
干细胞的生长和多能性要求。在人第3天的囊胚中,所有细胞均对NME7AB呈阳性。到第5天,NME7AB细胞仅限于内细胞团,根据定义,该细胞团包含幼稚状态干细胞。虽然NME7AB在所有幼稚干细胞中都有表达,但据报道除了睾丸外它在成年组织中没有表达。但是,我们在所有检查过的转移性癌症中都发现了它。我们已经表明,幼稚干细胞和癌细胞都分泌NME7AB和NME7-X1。我们显示了,在干细胞和癌细胞中,NME7AB和NME7-X1都与MUC1*的胞外域结合,并通过配体诱导的MUC1*胞外域的二聚化激活多能性和生长。我们进行的大量免疫组化研究表明,NME7AB和NME7-X1两者在癌细胞中过表达,表达的增加与肿瘤的分期有关。PCR实验表明,本发明的化合物引起癌细胞中NME7AB和NME7-X1表达的降低。
分析了先导化合物的构效关系(SAR),并设计和合成了新颖衍生物化合物,目的是提高功效、降低IC50(半数最大作用的浓度)和提高溶解度。这些化合物的结构显示为化合物编号MN1292-MN1471。图18A-18E的表显示了用这些化合物中的每一种进行的生物学测定的结果。图26-35显示了化合物对幼稚状态干细胞、始发状态干细胞或成纤维细胞的作用的照片。抑制干细胞多能性尤其是幼稚状态多能性,但不影响成纤维细胞等成熟细胞的化合物预计将是有效的抗癌治疗剂。从图18的列表数据中可以看出,许多新化合物MN1292-MN1471有效抑制癌细胞的迁移和增殖,其IC50处于低纳摩尔范围。在干细胞筛选中,这些化合物抑制幼稚干细胞多能性,但对更成熟的始发状态干细胞或更成熟的成纤维细胞几乎没有影响或没有影响。图36-45显示了照片、曲线图和IC50曲线,其量化了这些新化合物对癌细胞迁移的影响。
进一步的药物化学技术和构效关系的分析导致开发了甚至更有效和更具选择性的癌
细胞迁移、侵袭和增殖抑制剂。数据表明,从构效关系中获得的药物化学技术和知识导致该组化合物的IC50浓度大大降低。例如,MN1413将幼稚干细胞多能性和增殖抑制了100%或得分为“4”,而对更成熟的始发状态干细胞没有影响,并且对成纤维细胞也没有影响,而成纤维细胞是正常细胞的替代物。MN1413将癌细胞迁移抑制了83%,IC50为100nM,并且将癌细胞增殖抑制了约50%。MN1423将幼稚干细胞多能性和增殖抑制了100%,或得分为“4”,但对始发状态干细胞或成纤维细胞没有影响。MN1423抑制癌细胞迁移84%,IC50为12nM,抑制癌细胞增殖50%。MN1428还可以将幼稚干细胞多能性和增殖抑制100%,或得分为“4”,但对始发状态干细胞或成纤维细胞没有影响。MN1428将癌细胞迁移抑制了79%,IC50为7nM。这些化合物的干细胞药物筛选结果示于图46-64。这些图证明了这些化合物抑制幼稚干细胞的多能性和增殖的能力,而实际上对始发状态干细胞或成纤维细胞没有影响,其中成纤维细胞是正常健康细胞的模拟物。图65-88显示了照片和曲线图,显示了这些化合物对癌细胞迁移或侵袭的影响,并且曲线图显示了每种化合物的IC50。
值得注意的是,本发明的化合物抑制肿瘤细胞的迁移和侵袭,并且这种活性与癌细胞
对于普通癌症生长因子受体MUC1*是阳性还是阴性无关。回想一下,100%的幼稚干细胞是MUC1*阳性。大多数癌症也是MUC1*阳性。我们已经表明,本发明的化合物抑制了MUC1*癌细胞系的癌细胞迁移,包括T47D乳腺癌细胞、BT20三阴性乳腺癌细胞、BT474-Res2耐化疗HER2阳性乳腺癌细胞、SKOV3卵巢癌细胞、DU145前列腺癌细胞和Capan2胰腺癌细胞以及其他许多癌细胞。然而,本发明的化合物还显示出抑制某些MUC1*阴性前列腺癌细胞的迁移。例如,本发明的化合物抑制PC3前列腺癌细胞和HCT-116MUC1*阴性结肠癌细胞的迁移和增殖。
这些数据与本发明化合物通过诱导诱导分化的关键基因的表达来阻断癌细胞侵袭性
的机制一致,这通过迁移和侵袭来证明。用本发明化合物处理的幼稚干细胞的RT-PCR测量显示了分化标志物的上调。由于用本发明化合物以浓度依赖性方式处理而增加表达的基因,为纤连蛋白、波形蛋白和NF1,它们都是分化的标志物。
除了与分化相关的典型基因外,我们还观察了用本发明化合物处理后,特定的超级增
强子基因在干细胞和癌细胞中都表达。在胚胎干细胞中,所有介体成分的大约40%仅堆积在数百个增强子位点,因此被称为超级增强子。与典型增强子相比,超级增强子使靶基因的表达增加了许多倍,因此,这种方法可以迅速执行关键的细胞命运决定,例如在干细胞的情况下,是全能生长还是分化。在关键的细胞命运决定(例如干细胞是否应该全能生长或分化)中的失控,将对胚胎的发育有着灾难性的后果。研究人员最近发现,这种超增强子现象只发生在干细胞和癌细胞中。这些超增强的基因构成了主ON/OFF
开关,可以在干样或癌性去分化状态与分化状态之间来回切换。我们假设在更成熟的始发状态干细胞中而不是幼稚干细胞中由超级增强子上调的基因,将是干细胞和癌细胞两者分化的关键介体。癌细胞会去分化,因此诱导分化会抑制癌细胞的生长和转移。在始发状态干细胞中而不是幼稚干细胞中超上调的基因包括LIN7A、VLDLR、GNAS、ZIC5、HES3、BDNF、FBXL17、RHOC、KLHL4、GREB1L、EXT1、FEZF1、SULF1、BRD2、CDH9和LRRTM2。特别感兴趣的是BRD2、HES3、GNAS,BRD2本身通过与染色质的相互作用来调节1,450个其他基因的表达,HES3调节基本的螺旋-环-螺旋转录因子,GNAS介导了许多对分化至关重要的因子的活性。增加这些基因或上面列出的任何其他超级增强子基因表达的化合物,将通过诱导其分化来抑制癌症。此外,我们最近发现,β-连环蛋白是干细胞分化的关键调节因子。活化的核β-连环蛋白的表达减少会诱导干细胞分化。由于在技术上难以量化核和活化的β-连环蛋白,因此通常测量AXIN2作为β-连环蛋白的替代物,因为AXIN2的表达直接由核的、活化的β-连环蛋白驱动。我们和其他人已经表明,微RNA-145(miR-145)的表达增加是干细胞分化开始的预兆(Xu,N,et al.MicroRNA-
145Regulates OCT4,SOX2,and KLF4 and Represses Pluripotency in Human Embryonic Stem Cells.Cell.137(4),p647-658,15May 2009.DOI:10.1016/j.cell.2009.02.038;and Smagghe et al PLoS ONE 2013)。Smagghe和Mo(Cancer Res:70(1);378-87,2010)报告说,miR-145表达的增加会抑制肿瘤细胞的迁移和侵袭。他们报道了miR-145直接抑制肿瘤转移基因MUC1,并通过扩展MUC1*抑制了活化的β-连环蛋白的表达。
我们使用RT-PCR来测量其中一些超级增强子基因的表达变化,即AXIN2(活化的β-连环蛋白的替代物)、miR-145、MUC1和MUC1*配体NME7AB和NME7-X1。这些实验表明,本发明的化合物诱导了作为分化的关键介体的超级增强子的几个靶基因的表达。另外,本发明的化合物抑制了AXIN2的表达,并且通过延伸抑制了β-连环蛋白(其诱导分化)的表达(图89A-89B)。
另外,本发明的化合物抑制了MUC1*配体NME7AB和NME7-X1的表达,我们已经证明它们诱导了体外和动物体内的癌症转移(图90)。本发明的化合物还增加了miR-145的表达,miR-145已显示出诱导分化并抑制肿瘤细胞的侵袭性和迁移。图91A-91C显示了用化合物MN1413、MN1423和1428处理的幼稚状态干细胞的RT-PCR测量图。可以看出,这些化合物增加了miR-
145的表达。图92A-92C显示了用化合物MN1413、MN1423和1428处理的T47D癌细胞的RT-PCR测量图。可以看出,这些化合物也增加了miR-145在癌细胞中的表达。因此,本发明化合物通过诱导对分化至关重要的基因(其中一些基因是超级增强子靶基因)和miR-145的表达,同时降低β-连环蛋白、MUC1及其生长因子NME7AB的表达,而至少部分地抑制肿瘤细胞迁移和侵袭。本发明的新颖化合物是用于治疗或预防癌症和转移性癌症的有效药剂。本发明的新颖化合物对于治疗MUC1*阳性和/或NME7AB或NME7-X1阳性的癌症将是最有效的。在本发明的一方面,测试来自患者的生物样品中是否存在MUC1*、NME7AB或NME7-X1,并且在发现患者的癌症对于MUC1*、NME7AB或NME7-X1呈阳性时,将本发明的化合物以适合于预防或治疗癌症的量给予于患者。在一种情况下,对患者样品进行测试,例如PCR,以确定编码MUC1、NME7或NME7-X1的核酸的量。在本发明的一方面,如果那些基因的表达与人多能干细胞中的表达相当或更高,则认为该患者的癌症为MUC1*阳性、NME7AB阳性或NME7-X1阳性。在本发明的另一方面,如果那些基因的表达等于或大于那些细胞中EEF1A1表达的0.5%,则认为患者的癌症为MUC1*阳性、NME7AB阳性或NME7-X1阳性。在本发明的又一方面,如果患者的组织样本与结合至PSMGFR肽或N-10肽的抗体接触,并染色组织而病理学家标准评分为1-4(“+–++++”),则认为该患者的癌症为MUC1*阳性。在本发明的另一方面,如果患者的组织标本与结合NME7的B3肽的抗体接触,并染色组织而病理学家标准评分为1-4(“+–++++”),则认为该患者的癌症为NME7AB阳性或NME7-X1阳性。
化合物
以下列出了用于治疗或预防癌症的示例性化合物。总结以下示例性化合物的表列于图
18A-18E。
本文描述了用于治疗或预防癌症或癌症转移的化合物。在本文所述化合物的上下文
中,应用以下定义:
在本说明书的上下文中,除非另有说明,否则“烷基”取代基或取代基中的烷基部分可以是线性或支化的,或者可以是或包括一个或多个环烷基。合适的烷基基团包括但不限于Cl-C9烷基基团、C1-C6烷基基团、C1-C4烷基基团以及C1-C3烷基基团。烷基基团/部分的实例包括甲基、乙基、正丙基、异丙基、正丁基、异丁基、叔丁基、正戊基、2,4,4-三甲基戊基、2-甲基环戊基、环戊基甲基和环烷基基团/部分,如下例示。除非另有说明,否则所有烷基基团均可被取代或未被取代。
“烷基”是指不包含杂
原子的烷基基团。因此,该表达包括直链烷基基团,例如甲基、乙基、丙基、丁基、戊基、己基、庚基、辛基、壬基、癸基、十一烷基、十二烷基等。该表达还包括直链烷基基团的支链异构体,包括但不限于以下以示例方式提供的:-CH(CH3)2、-H(CH3)(CH2CH3)、-CH(CH2CH3)2、-C(CH3)3、-C(CH2CH3)3、-CH2CH(CH3)2、CH2CH(CH3)(CH2CH3)、-CH2CH(CH2CH3)2、-CH2C(CH3)3、-CH2C(CH2CH3)3、-CH(CH3)、-CH(CH3)(CH2CH3)、-CH2CH2CH(CH3)2、-CH2CH2CH(CH3)(CH2CH3)、-CH2CH2CH(CH2CH3)2、-CH2CH2C(CH3)3、-CH2CH2C(CH2CH3)3、-CH(CH3)CH2-CH(CH3)2、-CH(CH3)CH(CH3)CH(CH3)2、-CH(CH2CH3)CH(CH3)CH(CH3)(CH2CH3)和其他。
“卤素”或“卤代”是指氯、溴、氟和碘基团。术语“卤代烷基”是指被一个或多个卤素原子取代的烷基。术语“卤代烷氧基”是指被一个或多个卤素原子取代的烷氧基。
“卤代烷基”取代基或取代基中的卤代烷基部分是指其中一个或多个(例如一个、两个、三个、四个或五个)氢原子被卤素原子(即氯、溴、氟和碘原子)独立地取代的烷基基团或部分。合适的卤代烷基基团包括但不限于卤代(C1-C3)烷基和卤代(C1-C)烷基。卤代烷基基团/部分的实例包括氟甲基、二氟甲基、三氟甲基和2,2,2-三氟乙基。
“环烷基”取代基或取代基中的环烷基部分是指含有例如3至8个碳原子的饱和
烃基环,其实例包括环丙基、环丁基、环戊基和环己基。除非另有说明,否则环烷基取代基或部分可包括单环、双环(例如稠环或螺环)和多环烃基环。“环烷基”取代基或取代基中的环烷基部分包括环丙基、环丁基、环戊基和环己基。
“杂烷基”取代基或取代基中的杂烷基部分是指以下烷基基团或部分:其中1至4个仲或叔碳原子(包括该基团或部分通过其附接到分子的其余部分的任何仲或叔碳原子)是仲碳原子的情况下独立地被选自氮、氧和硫的杂原子取代;是叔碳原子的情况下被氮独立地取代。杂烷基基团/部分的实例包括甲氧基、甲氨基、甲基磺酰基、乙氧基、乙氨基、二甲氨基、乙基磺酰基、丙氧基、甲氧基乙基、丙氨基、甲基乙氨基、丙基磺酰基、甲基磺酰基乙基、四氢吡喃基氧基,N-甲基吡咯烷基和如下例示的杂环烷基基团/部分。
“杂环烷基”取代基或取代基中的杂环烷基部分是指以下环烷基基团或部分:其中1至4个仲或叔碳原子(包括该基团或部分通过其附接到分子的其余部分的任何仲或叔碳原子)是仲碳原子的情况下独立地被选自氮、氧和硫的杂原子取代;是叔碳原子的情况下被氮独立地取代。杂环烷基基团/部分的实例包括四氢呋喃基、吡咯烷基、四氢噻吩基、四氢吡喃基、哌啶基、哌嗪基、吗啉基和硫代吗啉基。
“烯基”取代基基团或取代基中的烯基部分是指具有一个或多个碳-碳双键的不饱和烷基基团或部分。合适的“烯基”包括但不限于C1-C9烯基、C1-C6烯基、C1-C4烯基和C1-C3烯基。烯基基团/部分的实例包括乙烯基、丙烯基、1-丁烯基、2-丁烯基、1-戊烯基、1-己烯基、
1,3-丁二烯基、1,3-戊二烯基、1,4-戊二烯基、1,4-己二烯基和如下例示的环烯基基团/部分。
“环烯基”取代基或取代基中的环烯基部分是指具有一个或多个碳-碳双键并且含有例如3至8个碳原子的不饱和烃基环,其实例包括环戊-1-烯-1-基、环己-1-烯-1-基和环己-1,
3-二烯-1-基。除非另有说明,否则环烯基取代基或部分可以包括单环、双环(例如稠环或螺环)和多环烃基环。
“杂烯基”取代基或取代基中的杂烯基部分是指以下烯基基团或部分:其中1至4个仲或叔碳原子(包括该基团或部分通过其附接到分子的其余部分的任何仲或叔碳原子)是仲碳原子的情况下独立地被选自氮、氧和硫的杂原子取代;是叔碳原子的情况下被氮独立地取代。杂烯基基团/基团的实例包括乙烯氧基、乙烯基氨基、乙烯基磺酰基、乙烯氧基乙基和如下例示的杂环烯基基团/部分。
“杂环烯基”取代基或取代基中的杂环烯基部分是指以下环烯基基团或部分:其中1至4个仲或叔碳原子(包括该基团或部分通过其附接到分子的其余部分的任何仲或叔碳原子)是仲碳原子的情况下独立地被选自氮、氧和硫的杂原子取代;是叔碳原子的情况下被氮独立地取代。杂环烯基基团/部分的实例包括二氢吡喃基和二氢呋喃基。
“炔基”取代基基团或取代基中的炔基部分是指具有一个或多个碳-碳三键的不饱和烷基基团或部分。炔基基团/部分的实例包括乙炔基、炔丙基、丁-1-炔基和丁-2-炔基。
“杂炔基”取代基或取代基中的杂炔基部分是指以下炔基基团或部分:其中1至4个仲或叔碳原子(包括该基团或部分通过其附接到分子的其余部分的任何仲或叔碳原子)是仲碳原子的情况下独立地被选自氮、氧和硫的杂原子取代;是叔碳原子的情况下被氮独立地取代。杂炔基基团/部分的实例包括乙炔氧基和炔丙基氨基。
“芳基”取代基或取代基中的芳基部分包括单环芳香烃和多环稠环芳香烃。芳基基团/部分的实例包括苯基、
萘基、蒽基和菲基。
“杂芳基”取代基或取代基中的杂芳基部分包括单环芳香基团和多环稠环芳香基团,其中1至4个环原子独立地选自氮、氧和硫,其余的环原子是碳。杂芳基基团/部分的实例包括以下:
出于本发明的目的,部分的组合称为一个基团的情况下,例如,芳基烷基、芳基烯基、芳基炔基、烷基芳基、烯基芳基或炔基芳基,最后提及的部分包含该基团通过附接到分子的其余部分的原子。芳基烷基的实例是苄基。环烷基烷基的实例是环丙基甲基。
当有关称为一个基团的部分的组合使用前缀“杂”时,例如“杂(芳基烷基)”,组合内的任何或所有部分可以是杂部分。因此,术语“杂(芳基烷基)”涵盖杂芳基-烷基、芳基-杂烷基和杂芳基-杂烷基。杂(芳烷基)基团/部分的实例包括吡啶基甲基、苯氧基、N-苯胺基和吡啶基氧基乙基。
在说明基团可以被取代的情况下,该基团可以被例如独立地选自以下的一个或多个取
代:卤素、三氟甲基、甲基羧基、乙基羧基、甲氧基、乙氧基、C1-C6烷氧基、C1-C6烷基、-OH、-SH、-NH2、-N3、-CN、-NO2、-CHO、-COOH、-CONH2、-C(=NH)NH2或-SO3H。
一方面,本发明公开了具有式1的化合物:
R1是H、任选取代的C1-C6烷基;任选取代的C3-C4环烷基;任选取代的C2-C6烯基;任选取代的C1-C6烷氧基;任选取代的C6-C12芳基;具有1-4个独立地选自N、S和O的环原子的任选取代的C1-C9杂芳基;任选取代的C7-C15芳基烷基,例如但不限于苄基或α-甲基苄基;具有1至4个独立地选自N、S和O的环原子的任选取代的C2-C15杂芳基烷基;任选取代的C7-C15芳基烯基;任选取代的C3-C8环烷基;或任选取代的C4-C8环烷基烷基;
R2是氢、C1-C6烷氧基(例如但不限于甲氧基或乙氧基)、三氟甲基、卤素、甲基羧基、乙基羧基、任选取代的C1-C6烷基、OH、-SH、-NH2、-N3、-CN、-NO2、-CHO、-COOH、-CONH2、-C(=NH)NH2或-SO3H;
其中,“取代的”是指被独立地选自以下的一个或多个取代:卤素、三氟甲基、甲基羧基、乙基羧基、甲氧基、乙氧基、C1-C6烷氧基、C1-C6烷基、-OH、-OCH3、-OC2H5、-O-C1-C4烷基、-SH、-NH2、-N3、-CN、-NO2、-CHO、-COOH、-CONH2、-C(=NH)NH2或-SO3H。
在一个实施例中,R1可以是C2-C4烷基或C3-C4环烷基。
在一个实施例中,R1可以是甲基。
在一个实施例中,R1可以是乙基、异丙基、环丙基或异丁基。
在一个实施例中,R1可以是乙基、异丙基、环丙基。
在一个实施例中,R2可以是H、卤素或甲基。
在一个实施例中,R2可以是H、F、C或Me。
在一个实施例中,R2可以是H。
在一个实施例中,R1是乙基、异丙基、环丙基或异丁基,以及R2是氢、卤素、三氟甲基、甲基羧基、乙基羧基、C1-C6烷氧基(例如但不限于甲氧基和乙氧基)、C1-C6烷基、-OH、-SH、-NH2、-N3、-CN、-NO2、-CHO、-COOH、-CONH2、-C(=NH)NH2或-SO3H。
在另一个实施例中,R1是乙基、异丙基、环丙基或异丁基,以及R2是氢、卤素、三氟甲基、甲基羧基、乙基羧基、C1-C6烷氧基(例如但不限于甲氧基和乙氧基)、C1-C6烷基、-OH、-NH2、-CN、-CHO、-COOH或-CONH2。
在另一个实施例中,R1是乙基或异丙基或环丙基,以及R2是氢、卤素、三氟甲基、甲基羧基、乙基羧基、C1-C6烷氧基(例如但不限于甲氧基和乙氧基)或C1-C6烷基。
在一个方面,本发明公开了具有式2的化合物:
R1是H、任选取代的C1-C6烷基;任选取代的C2-C6烯基;任选取代的C1-C6烷氧基;任选取代的C6-C12芳基;具有1至4个独立地选自N、S和O的环原子的任选取代的C1-C9杂芳基;任选取代的C7-C15芳基烷基(例如但不限于苄基或α-甲基苄基);具有1至4个独立地选自N、S和O的环原子的任选取代的C2-C15杂芳基烷基;任选取代的C7-C15芳基烯基;任选取代的C3-C8环烷基;或任选取代的C4-C8环烷基烷基;
R2是氢、C1-C6烷氧基(例如但不限于甲氧基或乙氧基)、三氟甲基、卤素、甲基羧基、乙基羧基、任选取代的C1-C6烷基、OH、-SH、-NH2、-N3、-CN、-NO2、-CHO、-COOH、-CONH2、-C(=NH)NH2或-SO3H;
Z1是键、-NH-、-O-、-S-、-CH(CH3)-、-(CH2)n-、-C3-C7环烷基-CH2-、-CH=CH-、-CO-、-SO-、-SO2-或-C(=NH)-、-CH2NH(CO)-、-CH2NH(CO)O-、-CH2NH(CO)NH-;-(CH2)nNH(CO)-、-(CH2)nNH(CO)O-;-(CH2)mNH(CO)NH-;-C3-C7环烷基-CH2NH(CO)-、-C3-C7环烷基-CH2NCH3(CO)-、-C3-C7环烷基-CH2NH(CO)O-、-C3-C7环烷基-CH2NCH3(CO)O-、-C3-C7环烷基-CH2NH(CO)NH-、-C3-C7环烷基-CH2NCH3(CO)NH-、-(CH2)nN(CH2CH2C6H5)-或任选取代的C6-C12芳基;
Z3是-OH、-OCH3、-O-C1-C6烷基、-O-CH2C6H5、-NH2、-NH(C1-C6烷基)、-N(C1-C6烷基)
2、-C1-C6烷基;
R3是H、任选取代的C1-C9烷基、C2-C6烯基;任选取代的C6-C12芳基、具有1至4个独立地选自N、S和O的环原子的任选取代的C1-C9杂芳基;任选取代的C7-C15芳基烷基(例如但不限于苄基或α-甲基苄基);或任选取代的C3-C7环烷基;-(CH2)n-NH(CO)O-(C1-C6烷基);-CH2O(CH2)p-NH(CO)O-(C1-C6)烷基;-(CH2)P-NHCO-(CH2)m-NH(CO)O-Cl-C6烷基);-NH(CO)O-叔丁基;-O-叔丁基;或-叔丁基;CONH-芳基;
m=l-5;n=l-8;p=1-9;
其中,“取代的”是指被独立地选自以下的一个或多个取代:卤素、三氟甲基、甲基羧基、乙基羧基、甲氧基、乙氧基、C1-C6烷氧基、C1-C6烷基、-OH、-OCH3、-OC2H5、-O-C1-C4烷基、-SH、-NH2、-N3、-CN、-NO2、-CHO、-COOH、-CONH2、-C(=NH)NH2或-SO3H。
在一个实施例中,R1可以是H,C1-C4烷基(例如甲基、乙基、异丙基、异丁基),苯基,卤素、甲基羧基、甲氧基、乙氧基、甲基取代的苯基;杂芳基、吡啶基、苄基或α-甲基苄基。
在一个实施例中,R1可以是H或C2-C4烷基。
在一个实施例中,R1可以是H。
在一个实施例中,R2可以是H、卤素、甲基或甲氧基。
在一个实施例中,Z1可以是键、-NH-、-CH2-、-(CH2)2-、-(CH2)3-、-CH=CH-、取代的苯基、-CH2NH(CO)O-、-(CH2)2NH(CO)O-、-(CH2)3NH(CO)O-、-(CH2)4NH(CO)O-、-(CH2)5NH(CO)O-、-CH2NH(CO)-、-CH(CH3)NH(CO)O-、-CH2NH(CO)NH-、-CH2NH(CO)CH2NH(CO)O-、-CH2O(CH2)2NH(CO)O-或-环己基-CH2NH(CO)O-。
在一个实施例中,Z3可以是-OH、-OCH3、-O-C1-C6烷基、-NH2、-N(C1-C6烷基)2或-C1-C6烷基。
在一个实施例中,R3可以是乙基,丁基,异丁基,戊基,2,4,4-三甲基戊基,庚基,辛基,苯基,被甲基、乙基、卤素、乙氧基或甲氧基取代的苯基。
在一个实施例中,R1是异丁基,并且R3是-NH(CO)O-叔丁基,R2可以是氢、卤素、三氟甲基、甲基羧基、乙基羧基、甲氧基、乙氧基、C1-C6烷氧基、C1-C6烷基、-OH、-SH、-NH2、-N3、-CN、-NO2、-CHO、-COOH、-CONH2、-C(=NH)NH2或-SO3H。
在一个实施例中,R1是异丁基,Z1是环己基甲基,R3是-NH(CO)O-叔丁基,R2可以是氢、卤素、三氟甲基、甲基羧基、乙基羧基、C1-C6烷氧基(例如但不限于甲氧基和乙氧基)、C1-C6烷基、-OH、-SH、-NH2、-N3、-CN、-NO2、-CHO、-COOH、-CONH2、-C(=NH)NH2或-SO3H。
在一个实施例中,R1是异丁基,Z1是C1-C5烷基,R3是-NH(CO)O-叔丁基或-NH(CO)CH2-异丙基,R2可以是氢、卤素、三氟甲基、甲基羧基、乙基羧基、C1-C6烷氧基(例如但不限于甲氧基和乙氧基)、C1-C6烷基、-OH、-SH、-NH2、-N3、-CN、-NO2、-CHO、-COOH、-CONH2、-C(=NH)NH2或-SO3H。
在一个实施例中,R1是异丁基,R3是-NH(CO)O-叔丁基,以及R2是氢、卤素、三氟甲基、甲基羧基、乙基羧基、C1-C6烷氧基(例如但不限于甲氧基和乙氧基)、C1-C6烷基、-OH、-SH、-NH2、-N3、-CN、-NO2、-CHO、-COOH、-CONH2、-C(=NH)NH2或-SO3H。
在一个实施例中,R1是乙基、异丁基、异丙基、苄基,Z1是(CH2)4-9-,R3是-NH(CO)O-叔丁基,R2是氢、卤素、三氟甲基、甲基羧基、乙基羧基、甲氧基、乙氧基、C1-C6烷氧基、C1-C6烷基、-OH、-SH、-NH2、-N3、-CN、-NO2、-CHO、-COOH、-CONH2、-C(=NH)NH2或-SO3H。
在一个实施例中,Z1是(CH2)4-9-,R3是-NH(CO)O-叔丁基,R2可以是氢,R1是被氢、卤素、三氟甲基、甲基羧基、乙基羧基、C1-C6烷氧基(例如但不限于甲氧基和乙氧基)、C1-C6烷基、-OH、-SH、-NH2、-N3、-CN、-NO2、-CHO、-COOH、-CONH2、-C(=NH)NH2或-SO3H取代的苯环。
在一个实施例中,Z1是环己基甲基或C3-C7环烷基-CH2-基团,R3是-NH(CO)O-叔丁基,R1是异丁基,R2是卤素、甲基或甲氧基。
在一个方面,本发明公开了具有式3的化合物:
R1是H、任选取代的C1-C6烷基;任选取代的C2-C6烯基;任选取代的C1-C6烷氧基;任选取代的C6-C12芳基;具有1至4个独立地选自N、S和O的环原子的任选取代的C1-C9杂芳基;任选取代的C7-C15芳基烷基(例如但不限于苄基或α-甲基苄基);具有1至4个独立地选自N、S和O的环原子的任选取代的C2-C15杂芳基烷基;任选取代的C7-C15芳基烯基;任选取代的未取代的C3-C8环烷基;或任选取代的C4-C8环烷基烷基;
R2是氢、C1-C6烷氧基(例如但不限于甲氧基或乙氧基)、三氟甲基、卤素、甲基羧基、乙基羧基、任选取代的C1-C6烷基、OH、-SH、-NH2、-N3、-CN、-NO2、-CHO、-COOH、-CONH2、-C(=NH)NH2或-SO3H;
G1是键、-NH-、-O-、-S-、-CH(CH3)-、-(CH2)n-、-C3-C7环烷基、-C3-C7环烷基-CH2-、-CH=CH-、-CO-、-SO-、-SO2-或-C(=NH)-、-CH2NH(CO)-、-CH2NH(CO)O-、-CH2NH(CO)NH-、-(CH2)nNH(CO)-、-(CH2)nNH(CO)O-、-(CH2)mNH(CO)NH-;-C3-C7环烷基-NH(CO)-、-C3-C7环烷基-CH2NH(CO)O-、-C3-C7环烷基-NH(CO)NH-、-N(CH2CH2C6H5)-、-C3-C7环烷基-CH2-(例如但不限于-环己基-CH2-);
Z2是键、-NH-、-O-、-S-、-CH(CH3)-、-(CH2)n-、-CH=CH-、-CO-、-SO-、-SO2-或-C(=NH)-、-CH2NH(CO)-、-CH2NH(CO)O-、-CH2NH(CO)NH-;-(CH2)pNH(CO)-、-(CH2)pNH(CO)O-、-(CH2)pNH(CO)NH-;-C3-C7环烷基-NH(CO)-、-C3-C7环烷基-NCH3(CO)-、-C3-C7环烷基-CH2NH(CO)O-、-C3-C7环烷基-CH2NCH3(CO)O-、-C3-C7环烷基-NH(CO)NH-、-C3-C7环烷基-NCH3(CO)NH-、-N(CH2CH2C6H5)-;或任选取代的C6-C12芳基;
Z3是-OH、-OCH3、-O-C1-C6烷基、-O-CH2C6H5、-NH2、-NH(C1-C6烷基)、-N(C1-C6烷基)
2、-C1-C6烷基;
R5是H、甲基或任选取代的C1-C6烷基;
R4是H、任选取代的C1-C9烷基(例如但不限于叔丁基);任选取代的C2-C6烯基;任选取代的C6-C12芳基(例如但不限于任选取代的萘基);具有1至4个独立地选自N、S和O的环原子的任选取代的C1-C9杂芳基;任选取代的C7-C15芳基烷基(例如但不限于苄基或α-甲基苄基);任选取代的C3-C7环烷基;-(CH2)p-NH(CO)O-(C1-C6烷基);-CH2O(CH2)p-NH(CO)O-(C1-C6)烷基;-(CH2)p-NHCO-(CH2)n-NH(CO)O-C1-C6烷基);-NH(CO)O-叔丁基;或-O-叔丁基;
m=l-5;n=l-8;p=1-9;
其中,“取代的”是指被独立地选自以下的一个或多个取代:卤素、三氟甲基、甲基羧基、乙基羧基、C1-C6烷氧基(例如但不限于甲氧基、乙氧基)、C1-C6烷基、-OH、-OCH3、-OC2H5、-O-C1-C4烷基、-SH、-NH2、-N3、-CN、-NO2、-CHO、-COOH、-CONH2、-C(=NH)NH2或-SO3H。
在一个实施例中,R1可以是氢,C1-C4烷基(如甲基、乙基、异丙基、异丁基),苄基,杂芳基(例如吡啶基、苯基)和被卤素、三氟甲基、甲氧基、氰基或二烷基氨基取代的苯基。
在一个实施例中,R1可以是H或C1-C4烷基。
在一个实施例中,R1可以是H。
在一个实施例中,R2可以是氢、卤素、甲基或甲氧基。
在一个实施例中,R2可以是H。
在一个实施例中,Z2可以是O、NH、-CH2-、-(CH2)2-、-(CH2)3-、-(CH2)4-、-(CH2)5-、-CH(CH3)-、-CH2NH(CO)CH2-、-CH2O(CH2)2-、-环己基-CH2-或键。
在一个实施例中,Z2可以是O。
在一个实施例中,Z3可以是-OH、-OCH3、-O-C1-C6烷基、-NH2、-N(C1-C6烷基)2或-C1-C6烷基。
在一个实施例中,G1是(CH2)-、-(CH2)2-、-(CH2)3-、-(CH2)4-、-(CH2)5-、-
CH2OCH2CH2-、-CH(CH3)-、-CH2NHCOCH2-或-环己基-CH2-。
在一个实施例中,G1是-环己基-CH2-。
在一个实施例中,R5可以是氢、卤素、或2-苯基乙基。
在一个实施例中,R5是甲基。
在一个实施例中,R4可以是任选取代的苯基、萘基、苄基,取代的异丙基或叔丁基。
在一个实施例中,R4可以是C4烷基,如叔丁基。
在一个实施例中,Z2和R4一起是-O-C1-C4烷基,例如-O-C4烷基,如,-O-叔丁基。
在一个实施例中,R1是异丁基,R5是氢,Z2是氧以及R4是叔丁基,G1没有氧,R2是氢、卤素、三氟甲基、甲基羧基、乙基羧基、C1-C6烷氧基(例如但不限于甲氧基和乙氧基)、C1-C6烷基、-OH、-SH、-NH2、-N3、-CN、-NO2、-CHO、-COOH、-CONH2、-C(=NH)NH2或-SO3H。
在另一个实施例中,R1是异丁基,R5是氢,Z2是氧,R4是叔丁基,G1是环己基甲基,R2是氢、卤素、三氟甲基、甲基羧基、乙基羧基、C1-C6烷氧基(例如但不限于甲氧基和乙氧基)、C1-C6烷基、-OH、-SH、-NH2、-N3、-CN、-NO2、-CHO、-COOH、-CONH2、-C(=NH)NH2或-SO3H。
在另一个实施例中,R1是异丁基,R5是氢,Z2是氧或CH2,R4是叔丁基或异丙基,G1是C1-C5亚烃基,R2是氢、卤素、三氟甲基、甲基羧基、乙基羧基、C1-C6烷氧基(例如但不限于甲氧基和乙氧基)、C1-C6烷基、-OH、-SH、-NH2、-N3、-CN、-NO2、-CHO、-COOH、-CONH2、-C(=NH)NH2或-SO3H。
在一个实施例中,R1是异丁基,R5是氢,Z2是氧,R4是叔丁基,以及R2可以是氢、卤素、三氟甲基、甲基羧基、乙基羧基、C1-C6烷氧基(例如但不限于甲氧基和乙氧基)、C1-C6烷基、-OH、-SH、-NH2、-N3、-CN、-NO2、-CHO、-COOH、-CONH2、-C(=NH)NH2或-SO3H。
在一个实施例中,R1是乙基、异丁基、异丙基或苄基,R5是氢,Z2是氧,R4是叔丁基,G1是(CH2)4-9-,R2是氢、卤素、三氟甲基、甲基羧基、乙基羧基、C1-C6烷氧基(例如但不限于甲氧基和乙氧基)、C1-C6烷基、-OH、-SH、-NH2、-N3、-CN、-NO2、-CHO、-COOH、-CONH2、-C(=NH)NH2或-SO3H。
在一个实施例中,R5是氢,Z2是氧,R4是叔丁基,G1是(CH2)4-9-,R2是氢,R1是被氢、卤素、三氟甲基、甲基羧基、乙基羧基、C1-C6烷氧基(例如但不限于甲氧基和乙氧基)、C1-C6烷基、-OH、-SH、-NH2、-N3、-CN、-NO2、-CHO、-COOH、-CONH2、-C(=NH)NH2或-SO3H取代的苯环。
在另一个实施例中,R5是氢,Z2是氧,R4是叔丁基,R1是异丁基,R2是卤素、甲基或甲氧基,G1是环己基甲基或C3-C7环烷基-CH2-基团。
在一个方面,本发明公开了具有式4的化合物:
R1是H、任选取代的C1-C6烷基;任选取代的C2-C6烯基;任选取代的C1-C6烷氧基;任选取代的C6-C12芳基;具有1至4个独立地选自N、S和O的环原子的任选取代的C1-C9杂芳基;任选取代的C7-C15芳基烷基(例如但不限于苄基或α-甲基苄基);具有1至4个独立地选自N、S和O的环原子的任选取代的C2-C15杂芳基烷基;任选取代的C7-C15芳基烯基;任选取代的C3-C8环烷基;或任选取代的C4-C8环烷基烷基;
R2是氢、C1-C6烷氧基(例如但不限于甲氧基或乙氧基)、三氟甲基、卤素、甲基羧基、乙基羧基、任选取代的C1-C6烷基、OH、-SH、-NH2、-N3、-CN、-NO2、-CHO、-COOH、-CONH2、-C(=NH)NH2或-SO3H;
G1是键、-NH-、-O-、-S-、-CH(CH3)-、-(CH2)n-、-C3-C7环烷基、-C3-C7环烷基-CH2-、-CH=CH-、-CO-、-SO-、-SO2-或-C(=NH)-、-CH2NH(CO)-、-CH2NH(CO)O-、-CH2NH(CO)NH-、-(CH2)nNH(CO)-、-(CH2)nNH(CO)O-、-(CH2)mNH(CO)NH-;-C3-C7环烷基-NH(CO)-、-C3-C7环烷基-CH2NH(CO)O-、-C3-C7环烷基-NH(CO)NH-、-N(CH2CH2C6H5)-、-C3-C7环烷基-CH2-(例如但不限于-环己基-CH2-);
Z2是键、-NH-、-O-、-S-、-CH(CH3)-、-(CH2)n-;-CH=CH-、-CO-、-SO-、-SO2-或-C(=NH)-、-CH2NH(CO)-、-CH2NH(CO)O-、-CH2NH(CO)NH-;-(CH2)pNH(CO)-、-(CH2)pNH(CO)O-、-(CH2)pNH(CO)NH-;-C3-C7环烷基-NH(CO)-、-C3-C7环烷基-CH2NH(CO)O-、-C3-C7环烷基-NH(CO)NH-或-N(CH2CH2C6H5)-;
Z3是-OH、-OCH3、-O-C1-C6烷基、-OCH2C6H5、-NH2、-NH(C1-C6烷基)、-N(C1-C6烷基)2、-C1-C6烷基;
R5是H、甲基或任选取代的C1-C6烷基;
X是H、C1-C3烷基或C1-C3芳基烷基;
m=l-5;n=l-8;p=1-9;
其中,“取代的”是指被独立地选自以下的一个或多个取代:卤素、三氟甲基、甲基羧基、乙基羧基、甲氧基、乙氧基、C1-C6烷氧基、C1-C6烷基、-OH、-OCH3、-OC2H5、-O-C1-C4烷基、-SH、-NH2、-N3、-CN、-NO2、-CHO、-COOH、-CONH2、-C(=NH)NH2或-SO3H。
在一个实施例中,R1可以是氢,甲基,乙基,异丙基,异丁基,苄基,杂芳基(例如吡啶基、苯基)和被卤素、甲基、三氟甲基、甲氧基、氰基或二烷基氨基取代的苯基。
在一个实施例中,R1可以是H或C1-C4烷基。
在一个实施例中,R1可以是H。
在一个实施例中,R2可以是氢、卤素、甲基或甲氧基。
在一个实施例中,R是H。
在一个实施例中,G1可以是-CH2-、-(CH2)2-、-(CH2)3-、-(CH2)4-、-(CH2)5-、-
CH2OCH2CH2-、-CH(CH3)-、-CH2NHCOCH2-、-CH2O(CH2)2-、-环己基-CH2-或键。在一个实施例中,G1是-环己基-CH2-。
在一个实施例中,Z2可以是O、NH、-CH2-或键。
在一个实施例中,Z2可以是O。
在一个实施例中,Z3可以是-OH、-OCH3、-O-C1-C6烷基、-NH2、-N(C1-C6烷基)2或-C1-C6烷基。
在一个实施例中,Z3可以是C1-C4烷基。
在一个实施例中,Z3是甲基。
在一个实施例中,R5可以是氢或甲基。
在一个实施例中,R5是甲基。
在一个实施例中,X可以是氢或甲基。
在一个实施例中,X是甲基。
在一个实施例中,R1是异丁基,R5是氢,X是甲基,Z2是氧,G1是一条跨越4-9个键长并且没有氧原子的链,R2是氢、卤素、三氟甲基、甲基羧基、乙基羧基、C1-C6烷氧基(例如但不限于甲氧基和乙氧基)、C1-C6烷基、-OH、-SH、-NH2、-N3、-CN、-NO2、-CHO、-COOH、-CONH2、-C(=NH)NH2或-SO3H。
在另一个实施例中,R1是异丁基,R5是氢,X是甲基,Z2是氧,G1是环己基甲基,R2是氢、卤素、三氟甲基、甲基羧基、乙基羧基、C1-C6烷氧基(例如但不限于甲氧基和乙氧基)、C1-C6烷基、-OH、-SH、-NH2、-N3、-CN、-NO2、-CHO、-COOH、-CONH2、-C(=NH)NH2或-SO3H。
在另一个实施例中,R1是异丁基,R5是氢,X是甲基或氢,Z2是氧或CH2,G1是C1-5亚甲基基团,R2是氢、卤素、三氟甲基、甲基羧基、乙基羧基、C1-C6烷氧基(例如但不限于甲氧基和乙氧基)、C1-C6烷基、-OH、-SH、-NH2、-N3、-CN、-NO2、-CHO、-COOH、-CONH2、-C(=NH)NH2或-SO3H。
在另一个实施例中,R1是异丁基,R5是氢,X是甲基,Z2是氧,G1是4-9个键长的连接子(linker),以及R2是氢、卤素、三氟甲基、甲基羧基、乙基羧基、C1-C6烷氧基(例如但不限于甲氧基和乙氧基)、C1-C6烷基、-OH、-SH、-NH2、-N3、-CN、-NO2、-CHO、-COOH、-CONH2、-C(=NH)NH2或-SO3H。
在另一个实施例中,R1是乙基、异丁基、异丙基、苄基,R5是氢,X是甲基,Z2是氧,G1是(CH2)4-9-,R2是氢、卤素、三氟甲基、甲基羧基、乙基羧基、C1-C6烷氧基(例如但不限于甲氧基和乙氧基)、C1-C6烷基、-OH、-SH、-NH2、-N3、-CN、-NO2、-CHO、-COOH、-CONH2、-C(=NH)NH2或-SO3H。
在一个实施例中,R5是氢,X是甲基,Z2是氧,G1是(CH2)4-9-,R2是氢,R1是被氢、卤素、三氟甲基、甲基羧基、乙基羧基、甲氧基、乙氧基、C1-C6烷氧基、C1-C6烷基、-OH、-SH、-NH2、-N3、-CN、-NO2、-CHO、-COOH、-CONH2、-C(=NH)NH2或-SO3H取代的苯环。
在另一个实施例中,R5是氢,X是甲基,Z2是氧,R1是异丁基,R2是卤素、甲基或甲氧基,G1是环己基甲基或C3-C7环烷基-CH2-基团。
在一个方面,本发明公开了具有式5的化合物:
R1是H、任选取代的C1-C6烷基;任选取代的C2-C6烯基;任选取代的C1-C6烷氧基;任选取代的C6-C12芳基;具有1至4个独立地选自N、S和O的环原子的任选取代的C1-C9杂芳基;任选取代的C7-C15芳基烷基(例如但不限于苄基或α-甲基苄基);具有1至4个独立地选自N、S和O的环原子的任选取代的C2-C15杂芳基烷基;任选取代的芳基烯基;任选取代的C3-C8环烷基;或任选取代的C4-C8环烷基烷基;
R2是氢、C1-C6烷氧基(例如但不限于甲氧基或乙氧基)、三氟甲基、卤素、甲基羧基、乙基羧基、任选取代的C1-C6烷基、OH、-SH、-NH2、-N3、-CN、-NO2、-CHO、-COOH、-CONH2、-C(=NH)NH2或-SO3H;
G2是键、-NH-、-O-、-S-、-CH(CH3)-、-(CH2)n-、-CH=CH-、-CO-、-SO-、-SO2-或-C(=NH)-、-CH2NH(CO)-、-CH2NH(CO)O-、-CH2NH(CO)NH-;-(CH2)nNH(CO)-、-(CH2)nNH(CO)O-、-(CH2)mNH(CO)NH-;-C3-C7环烷基(例如但不限于-环己基-)或-N(CH2CH2C6H5)-;
Z2是键、-NH-、-O-、-S-、-CH(CH3)-、-(CH2)n-;-CH=CH-、-CO-、-SO-、-SO2-或-C(=NH)-、-CH2NH(CO)-、-CH2NH(CO)O-、-CH2NH(CO)NH-;-(CH2)pNH(CO)-、-(CH2)pNH(CO)O-、-(CH2)pNH(CO)NH-;-C3-C7环烷基-NH(CO)-、-C3-C7环烷基-CH2NH(CO)O-、-C3-C7环烷基-NH(CO)NH-或-N(CH2CH2C6H5)-;
Z3是-OH、-OCH3、-O-C1-C6烷基、-OCH2C6H5、-NH2、-NH(C1-C6烷基)、-N(C1-C6烷基)2、-C1-C6烷基;
R5是H、甲基或任选取代的C1-C6烷基;
X是H、C1-C3烷基或C1-C3芳基烷基;
m=l-5;n=l-8;p=1-9;
其中,“取代的”是指被独立地选自以下的一个或多个取代:卤素、三氟甲基、甲基羧基、乙基羧基、甲氧基、乙氧基、C1-C6烷氧基、C1-C6烷基、-OH、-OCH3、-OC2H5、-O-C1-C4烷基、-SH、-NH2、-N3、-CN、-NO2、-CHO、-COOH、-CONH2、-C(=NH)NH2或-SO3H。
在一个实施例中,R1可以是氢,C1-C4烷基(如甲基、乙基、异丙基、异丁基),苄基,杂芳基(例如吡啶基、苯基),被卤素、三氟甲基、甲基、甲氧基、氰基或二烷基氨基取代的苯基。
在一个实施例中,R1可以是H或C1-C4烷基。
在一个实施例中,R1可以是H。
在一个实施例中,R2可以是氢、卤素、甲基或甲氧基。
在一个实施例中,R2是H。
在一个实施例中,G2可以是键、-(CH2)-、-(CH2)2-、-(CH2)3-、-(CH2)4-、-CH2OCH2-、-CH(CH3)-、-CH2NHCO-或-环己基-。
在一个实施例中,G2是环己基。
在一个实施例中,Z2是O、CH2或NH。
在一个实施例中,Z2是O。
在一个实施例中,Z3可以是-OH、-OCH3、-O-C1-C6烷基、-NH2、-N(C1-C6烷基)2或-C1-C6烷基。
在一个实施例中,Z3是C1-C4烷基。
在一个实施例中,Z3是甲基。
在一个实施例中,R5可以是氢或甲基。
在一个实施例中,R5是甲基。
在一个实施例中,X可以是氢或甲基。
在一个实施例中,X是甲基。
在一个实施例中,R1是异丁基,R5是氢,Z2是氧,R5是氢,X是甲基,G2没有氧,R2是氢、卤素、三氟甲基、甲基羧基、乙基羧基、甲氧基、乙氧基、C1-C6烷氧基、C1-C6烷基、-OH、-SH、-NH2、-N3、-CN、-NO2、-CHO、-COOH、-CONH2、-C(=NH)NH2或-SO3H。
在另一个实施例中,R1是异丁基,R5是氢,X是甲基,Z2是氧,G2是环己基,R2是氢、卤素、三氟甲基、甲基羧基、乙基羧基、甲氧基、乙氧基、C1-C6烷氧基、C1-C6烷基、-OH、-SH、-NH2、-N3、-CN、-NO2、-CHO、-COOH、-CONH2、-C(=NH)NH2或-SO3H。
在另一个实施例中,R1是异丁基,Z2是氧或CH2,R5是氢或甲基,X是甲基,G2键或-
(CH2)1-4-、R2是氢、卤素、三氟甲基、甲基羧基、乙基羧基、C1-C6烷氧基(例如甲氧基和乙氧基)、C1-C6烷基、-OH、-SH、-NH2、-N3、-CN、-NO2、-CHO、-COOH、-CONH2、-C(=NH)NH2或-SO3H。
在另一个实施例中,R1是异丁基,Z2是氧,R5是氢,X是甲基,以及R2是氢、卤素、三氟甲基、甲基羧基、乙基羧基、甲氧基、乙氧基、C1-C6烷氧基、C1-C6烷基、-OH、-SH、-NH2、-N3、-CN、-NO2、-CHO、-COOH、-CONH2、-C(=NH)NH2或-SO3H。
在另一个实施例中,R1是乙基、异丁基、异丙基、苄基,Z2是氧,R5是氢,X是甲基,G2是(CH2)2-5,R2可以是氢、卤素、三氟甲基、甲基羧基、乙基羧基、C1-C6烷氧基(例如但不限于甲氧基和乙氧基)、C1-C6烷基、-OH、-SH、-NH2、-N3、-CN、-NO2、-CHO、-COOH、-CONH2、-C(=NH)NH2或-SO3H。
在另一个实施例中,R5是氢,X是甲基,Z2是氧,G2是(CH2)2-5,R2是氢,R1是被氢、卤素、三氟甲基、甲基羧基、乙基羧基、甲氧基、乙氧基、C1-C6烷氧基、C1-C6烷基、-OH、-SH、-NH2、-N3、-CN、-NO2、-CHO、-COOH、-CONH2、-C(=NH)NH2或-SO3H取代的苯环。
在另一个实施例中,R5是氢,X是甲基,Z2是氧,R1是异丁基,R2是卤素、甲基或甲氧基,G2是环己基或C3-C7环烷基-CH2-基团。
在一个方面,本发明公开了具有式6的化合物:
R1是H、任选取代的C1-C6烷基;任选取代的C2-C6烯基;任选取代的C1-C6烷氧基;任选取代的C6-C12芳基;具有1至4个独立地选自N、S和O的环原子的任选取代的C1-C9杂芳基;任选取代的C7-C15芳基烷基(例如但不限于苄基或α-甲基苄基);具有1至4个独立地选自N、S和O的环原子的任选取代的C2-C15杂芳基烷基;任选取代的C7-C15芳基烯基;任选取代的C3-C8环烷基;或任选取代的C4-C8环烷基烷基;
R2是氢、C1-C6烷氧基(例如但不限于甲氧基或乙氧基)、三氟甲基、卤素、甲基羧基、乙基羧基、任选取代的C1-C6烷基、OH、-SH、-NH2、-N3、-CN、-NO2、-CHO、-COOH、-CONH2、-C(=NH)NH2或-SO3H;
R5是H、甲基或任选取代的C1-C6烷基;
X是H、C1-C3烷基或C1-C3芳基烷基;
Z2是键、-NH-、-O-、-S-、-CH(CH3)-、-(CH2)n-;-CH=CH-、-CO-、-SO-、-SO2-、-C(=NH)-、-CH2NH(CO)-、-CH2NH(CO)O-、-CH2NH(CO)NH-;-(CH2)nNH(CO)-、-(CH2)nNH(CO)O-、-(CH2)mNH(CO)NH-;-C3-C7环烷基-NH(CO)-、-C3-C7环烷基-CH2NH(CO)O-、-C3-C7环烷基-NH(CO)NH-或-N(CH2CH2C6H5)-;
Z3是-OH、-OCH3、-O-C1-C6烷基、-OCH2C6H5、-NH2、-NH(C1-C6烷基)、-N(C1-C6烷基)2、-C1-C6烷基;
m=l-5;n=l-8;
其中,“取代的”是指被独立地选自以下的一个或多个取代:卤素、三氟甲基、甲基羧基、乙基羧基、甲氧基、乙氧基、C1-C6烷氧基、C1-C6烷基、-OH、-OCH3、-OC2H5、-O-C1-C4烷基、-SH、-NH2、-N3、-CN、-NO2、-CHO、-COOH、-CONH2、-C(=NH)NH2或-SO3H。
在一个实施例中,R1可以是异丙基或异丁基。
在一个实施例中,R1是H。
在一个实施例中,R2可以是H、卤素或甲基。
在一个实施例中,R2是H。
在一个实施例中,R5可以是H。
在一个实施例中,X可以是甲基。
在一个实施例中,Z2可以是O。
在一个实施例中,Z3可以是-OH、-OCH3、-O-C1-C6烷基、-NH2、-N(C1-C6烷基)2或-C1-C6烷基。
在一个实施例中,Z3可以是C1-C4烷基。
在一个实施例中,Z3是甲基。
在一个实施例中,R1是异丁基,R5是氢,Z2是氧,X是氢,以及R2是氢、卤素、三氟甲基、甲基羧基、乙基羧基、C1-C6烷氧基(例如但不限于甲氧基和乙氧基)、C1-C6烷基、-OH、-SH、-NH2、-N3、-CN、-NO2、-CHO、-COOH、-CONH2、-C(=NH)NH2或-SO3H。
在另一个实施例中,R1是异丙基,R5是氢,Z2是氧,R4是叔丁基,以及R2是氢、卤素、三氟甲基、甲基羧基、乙基羧基、C1-C6烷氧基(例如但不限于甲氧基和乙氧基)、C1-C6烷基、-OH、-SH、-NH2、-N3、-CN、-NO2、-CHO、-COOH、-CONH2、-C(=NH)NH2或-SO3H。
在另一个实施例中,R1是异丁基或异丙基,R5是氢或甲基,Z2是氧,X是氢,以及R2是氢、卤素、三氟甲基、甲基羧基、乙基羧基、C1-C6烷氧基(例如但不限于甲氧基和乙氧基)、C1-C6烷基、-OH、-SH、-NH2、-N3、-CN、-NO2、-CHO、-COOH、-CONH2、-C(=NH)NH2或-SO3H。
在另一个实施例中,R1是异丁基或异丙基,R5是氢,Z2是-CH2-或氧,X是氢或CH3,以及R2是氢、卤素、三氟甲基、甲基羧基、乙基羧基、C1-C6烷氧基(例如但不限于甲氧基和乙氧基)、C1-C6烷基、-OH、-SH、-NH2、-N3、-CN、-NO2、-CHO、-COOH、-CONH2、-C(=NH)NH2或-SO3H。
在一个方面,本发明公开了具有式7的化合物:
R1是H、任选取代的C1-C6烷基;C3-C4环烷基;任选取代的C2-C6烯基;任选取代的C1-C6烷氧基;任选取代的C6-C12芳基;具有1至4个独立地选自N、S和O的环原子的任选取代的C1-C9杂芳基;任选取代的C7-C15芳基烷基(例如但不限于苄基或α-甲基苄基);具有1至4个独立地选自N、S和O的环原子的任选取代的C2-C15杂芳基烷基;任选取代的C7-C15芳基烯基;
任选取代的C3-C8环烷基;或任选取代的C4-C8环烷基烷基;
R2是氢、C1-C6烷氧基(例如但不限于甲氧基或乙氧基)、三氟甲基、卤素、甲基羧基、乙基羧基、任选取代的C1-C6烷基、OH、-SH、-NH2、-N3、-CN、-NO2、-CHO、-COOH、-CONH2、-C(=NH)NH2或-SO3H;
R8是H、任选取代的C1-C6烷基;C3-C4环烷基;任选取代的C2-C6烯基;任选取代的C1-C6烷氧基;任选取代的C6-C12芳基;具有1至4个独立地选自N、S和O的环原子的任选取代的C1-C9杂芳基;任选取代的C7-C15芳基烷基(例如但不限于苄基或α-甲基苄基);具有1至4个独立地选自N、S和O的环原子的任选取代的C2-C15杂芳基烷基;任选取代的C7-C15芳基烯基;
任选取代的C3-C8环烷基;或任选取代的C4-C8环烷基烷基;
其中,“取代的”是指被独立地选自以下的一个或多个取代:卤素、三氟甲基、甲基羧基、乙基羧基、甲氧基、乙氧基、C1-C6烷氧基、C1-C6烷基、-OH、-OCH3、-OC2H5、-O-C1-C4烷基、-SH、-NH2、-N3、-CN、-NO2、-CHO、-COOH、-CONH2、-C(=NH)NH2或-SO3H。
在一个实施例中,R1可以是C2-C4烷基或C3-C4环烷基。
在一个实施例中,R1可以是乙基、异丙基或异丁基。
在一个实施例中,R1可以是乙基或异丙基。
在一个实施例中,R2可以是H、卤素或甲基。
在一个实施例中,R2可以是H、F、C或Me。
在一个实施例中,R2是H。
在一个实施例中,R8是H。
在一个实施例中,R8是Me。
在一个实施例中,R1是乙基、异丙基或异丁基,以及R2是氢、卤素、三氟甲基、甲基羧基、乙基羧基、C1-C6烷氧基(例如但不限于甲氧基和乙氧基)、C1-C6烷基、-OH、-SH、-NH2、-N3、-CN、-NO2、-CHO、-COOH、-CONH2、-C(=NH)NH2或-SO3H。
在另一个实施例中,R1是乙基、异丙基或异丁基,R2是氢、卤素、三氟甲基、甲基羧基、乙基羧基、C1-C6烷氧基(例如但不限于甲氧基和乙氧基)、C1-C6烷基、-OH、-NH2、-CN、-CHO、-COOH或-CONH2。
在另一个实施例中,R1是乙基或异丙基,以及R2是氢、卤素、三氟甲基、甲基羧基、乙基羧基、C1-C6烷氧基(例如但不限于甲氧基和乙氧基)或C1-C6烷基。
在一个方面,本发明公开了具有式8的化合物:
其中,X是O、NH、S或CH2;
Y是O、N-Rl、N-CH2-R1、CH-R1或CH-CH2-R1;
R0是H或C1-C5烷基
R1是H、Cl-5烷基、任选取代的芳基或任选取代的杂芳基;
R2是H或任选取代的芳基;
R3是H或C1-3烷基;
m是0或1;以及
n是0或1;
其中,“取代的”是指被独立地选自以下的一个或多个取代:卤素、三氟甲基、甲基羧基、乙基羧基、甲氧基、乙氧基、C1-C6烷氧基、C1-C6烷基、-OH、-OCH3、-OC2H5、-O-C1-C4烷基、-SH、-NH2、-N3、-CN、-NO2、-CHO、-COOH、-CONH2、-C(=NH)NH2或-SO3H。
在一些实施例中,X可以是O。替代地,X可以是CH2。
在一些实施例中,Y可以是O、N-R1或CH-R1。在一些实施例中,Y可以是N-R1。替代地,Y可以是CH-R1。
在一些实施例中,R0是H或甲基。
在一些实施例中,R1是H、任选取代的芳基或任选取代的杂芳基;以及R2是H。替代地,R1可以是H,以及R2是任选取代的芳基。
在R1和R2的上下文中,术语“任选取代的芳基”可以指苯基或取代的苯基。取代的芳基或苯基可以指被选自以下的一个或多个(如1-3个或1-2个)取代的芳基或苯基:卤素、甲氧基、甲基、氨基和硝基。
在R1的上下文中,术语“任选取代的杂芳基”可以指任选取代的吡啶基、噻唑基、咪唑基或嘧啶基。杂芳基可以被选自以下的一个或多个(如1-3个或1-2个)取代:卤素、甲氧基、甲基、氨基和硝基。
在一些实施例中,R1是甲基、苯基、4-吡啶基、3-吡啶基、2-吡啶基、4-氨基苯基、4-氟苯基、4-甲氧基苯基、4-吡啶基、3-吡啶基、2-吡啶基、4-嘧啶基、4-硝基苯基、2-噻唑基、4-(2-甲基)吡啶基、2-咪唑基、4-咪唑基或1-咪唑基
在一些实施例中,R3是H或甲基。
在一个实施例中,Y是N-Rl;R0是CH3;X是O或NH;R1是苯基、甲基或吡啶基(例如4-吡啶基、3-吡啶基或2-吡啶基);R2是H;R3是H;m是1;以及n是1。
在一个实施例中,Y是CH-R1;R0是CH3;X是O或NH;R1是苯基,被卤素、氨基、甲氧基或硝基取代的苯基(例如4-氨基苯基、4-氟苯基、4-甲氧基苯基和4-硝基苯基),吡啶基(例如4-吡啶基、3-吡啶基、2-吡啶基),嘧啶基(例如4-嘧啶基),2-噻唑基,4-(2-甲基)吡啶基,4-吡啶基甲基,2-咪唑基,4-咪唑基或1-咪唑基;R2是H;R3是H;m是1;以及n是0或1。
在一个实施例中,Y是O;R0是CH3;X是O;R2是H;R3是H;m是1;以及n是1。
在一个实施例中,Y是CH-R1;R0是CH3;X是O;R1是H;R2是H;R3是H;m是1;以及n是1。
如本文例示,式8的化合物可以选自MN1420、MN1427、MN1428、MN1429、MN1430、MN1432、MN1433、MN1434、MN1435、MN1436、MN1437、MN1438、MN1439、MN1440、MN1441、MN1442、MN1444、MN1445、MN1447、MN1448、MN1449、MN1450、MN1451、MN1452、MN1453、MN1454、MN1455、MN1456、MN1457、MN1458、MN1459、MN1460或MN1461。
在一个实施例中,Y是N-Rl;X是O;R0是H或CH3;R1是苯基、甲基、4-吡啶基、3-吡啶基或
2-吡啶基;R2是H;R3是H;m是1;以及n是1。
在一个实施例中,Y是N-Rl;X是NH;R0是H或CH3;R1是苯基、2-吡啶基或3-吡啶基;R2是H;R3是H;m是1;以及n是1。
在一个实施例中,Y是CH-R1;X是NH;R0是CH3;R1是4-吡啶基或2-吡啶基;R2是H;R3是H;
n是1;以及m是1。
在一个实施例中,Y是CH-R1;X是O;R0是CH3;R1是苯基、4-吡啶基、H、叔丁基-CON(CH3)-CH2-、3-吡啶基,4-嘧啶基、2-嘧啶基、4-硝基苯基、2-噻唑基、3-氟苯基、4-甲氧基苯基、4-(2-甲基)吡啶基、4-吡啶基甲基、4-吡啶基、2-咪唑基、4-咪唑基、1-咪唑基或4-氨基苯基。
在一个方面,本发明公开了具有式9的化合物:
其中,Q为杂芳基;
R0是H或C1-4烷基;
X是O、NH、CH2;
R5是H或CH3;以及
n是1、2或3。
在一些实施例中,Q可以是单环或双环杂芳基。例如,Q可以是含有1-2个氮原子的单环或双环杂芳基。Q可以是吡啶、异喹啉、吲哚或氮杂吲哚。
在一些实施例中,R0可以是H或CH3。例如,R0可以是CH3。
在一个实施例中,X是O。
在一个实施例中,R5是H。
如本文例示,式9的化合物可以选自MN1462、MN1463、MN1465、MN1468、MN1467和MN1466。
在一个方面,本发明公开了具有式10的化合物:
其中,R0是H或C1-4烷基;
X是O、NH或CH2;
R5是H或C1-4烷基;
G是NH、-CH=CH-、O或S;以及
n是1或2。
为了说明目的,杂环部分在位置2或3处连接。
在一些实施例中,R0是H或CH3。例如,R0可以是CH3。
在一个实施例中,X是O。
在一些实施例中,R5是H或CH3。例如,R5可以是H。
在一些实施例中,G是NH是-CH=CH-。
如本文例示,式10的化合物可以选自MN1462、MN1463和MN1465。
在一个方面,本发明公开了具有式11的化合物:
其中,R0是H或C1-4烷基;
X是O、CH2或NH;
R4是H、CH3、OH、NH2;
R5是H或C1-4烷基;以及
n是1-3。
在一些实施例中,R0是H或CH3。例如,R0是CH3。
在一些实施例中,X是O。
在一些实施例中,R5是H或CH3。例如,R5可以是H。
在一些实施例中,R4是H。
如本文例示,式11的化合物可以选自MN1468、MN1467和MN1466。
在一个方面,本发明公开了具有式12的化合物:
其中,R0是H或C1-4烷基;
X是O、NH或CH2;以及
Y是N或CH。
在一些实施例中,R0是H或CH3。例如,R0是CH3。
在一些实施例中,X是O。
在一些实施例中,Y是CH或N。
如本文例示,式12的化合物可以选自MN1431和MN1464。
在一个方面,本发明公开了具有式13的化合物:
其中,R0是H或C1-4烷基;以及
X是O、NH或CH2。
在一些实施例中,R0是H或CH3。例如,R0是CH3。
在一些实施例中,X是O。
在一个实施例中,R0是CH3以及X是O。
如本文例示,式13的化合物是MN1434。
在一个方面,本发明公开了具有式14的化合物:
其中,R0是H或C1-4烷基;以及
X是O、NH或CH2。
在一些实施例中,R0是H或CH3。例如,R0是CH3。
在一些实施例中,X是O。
在一个实施例中,R0是CH3;以及X是O。
如本文例示,式14的化合物是MN1460。
在一个方面,本发明公开了具有式15的化合物:
R1是H、任选取代的C1-C6烷基;任选取代的C2-C6烯基;任选取代的C1-C6烷氧基;任选取代的C6-C12芳基;具有1至4个独立地选自N、S和O的环原子的任选取代的C1-C9杂芳基;任选取代的C7-C15芳基烷基(例如但不限于苄基或α-甲基苄基);具有1至4个独立地选自N、S和O的环原子的任选取代的C2-C15杂芳基烷基;任选取代的C7-C15芳基烯基;任选取代的C3-C8环烷基;或任选取代的C4-C8环烷基烷基;
R2是氢、C1-C6烷氧基(例如但不限于甲氧基或乙氧基)、三氟甲基、卤素、甲基羧基、乙基羧基、任选取代的C1-C6烷基、-OH、-SH、-NH2、-N3、-CN、-NO2、-CHO、-COOH、-CONH2、-C(=NH)NH2或-SO3H;
R5是H、甲基、乙基、C1-C6烷基、C1-C3芳基烷基或2-苯乙基;
Z2是键、-NH-、-O-、-S-、-CH(CH3)-、-CH2-、-(CH2)n-、-CH=CH-、-CO-、-SO-、-SO2-、-C(=NH)-、-CH2NH(CO)-、-CH2NH(CO)O-、-CH2NH(CO)NH-;-(CH2)nNH(CO)-、-(CH2)mNH(CO)O-、-(CH2)mNH(CO)NH-;
R4是H、任选取代的C1-C9烷基(例如但不限于叔丁基);任选取代的C2-C6烯基;任选取代的C6-C12芳基(例如但不限于任选取代的苯基);具有1至4个独立地选自N、S和O的环原子的任选取代的C1-C9杂芳基;任选取代的C7-C15芳基烷基(例如但不限于苄基或α-甲基苄基);-O-叔丁基;
m=l-5;n=l-8;
其中,“取代的”是指被独立地选自以下的一个或多个取代:卤素、三氟甲基、甲基羧基、乙基羧基、甲氧基、乙氧基、C1-C6烷氧基、C1-C6烷基、-OH、-SH、-NH2、-N3、-CN、-NO2、-CHO、-COOH、-CONH2、-C(=NH)NH2或-SO3H。
在一个实施例中,R1可以是异丙基或异丁基。
在一个实施例中,R1可以是H。
在一个实施例中,R2可以是H、卤素或甲基。
在一个实施例中,R5可以是H或CH3。例如,R5是CH3。
在一个实施例中,R4是叔丁基。
在一个实施例中,Z2可以是O。
在一个实施例中,Z2可以是-NH-。
在一个实施例中,R1是异丁基,R5是氢,Z2是氧,R4是叔丁基,
以及R2是氢、卤素、三氟甲基、甲基羧基、乙基羧基、C1-C6烷氧基(例如但不限于甲氧基和乙氧基)、C1-C6烷基、OH、-SH、-NH2、-N3、-CN、-NO2、-CHO、-COOH、-CONH2、-C(=NH)NH2或-SO3H。
在另一个实施例中,R1是异丙基,R5是氢,Z2是氧,R4是叔丁基。
在另一个实施例中,R1是H,以及R5是CH3。例如,R1可以是H;R5可以是CH3;R2可以是H、卤素或甲基;Z2可以是-O-或-NH-;以及R4可以是C4烷基(例如叔丁基)。
,以及R2是氢、卤素、三氟甲基、甲基羧基、乙基羧基、C1-C6烷氧基(例如但不限于甲氧基和乙氧基)、C1-C6烷基、OH、-SH、-NH2、-N3、-CN、-NO2、-CHO、-COOH、-CONH2、-C(=NH)NH2或-SO3H。
在另一个实施例中,R1是异丁基或异丙基,R5是氢或甲基,Z2是氧,R4是叔丁基,以及R2是氢、卤素、三氟甲基、甲基羧基、乙基羧基、C1-C6烷氧基(例如但不限于甲氧基和乙氧基)、C1-C6烷基、-OH、-SH、-NH2、-N3、-CN、-NO2、-CHO、-COOH、-CONH2、-C(=NH)NH2或-SO3H。
在另一个实施例中,R1是异丁基或异丙基,R5是氢,Z2是-CH2-或氧,R4是叔丁基或CH3,以及R2是氢、卤素、三氟甲基、甲基羧基、乙基羧基、C1-C6烷氧基(例如但不限于甲氧基和乙氧基)、C1-C6烷基、-OH、-SH、-NH2、-N3、-CN、-NO2、-CHO、-COOH、-CONH2、-C(=NH)NH2或-SO3H。
在一个方面,本发明公开了具有式16的化合物:
G3是CH或N;
R1是H、任选取代的C1-C6烷基;任选取代的C2-C6烯基;任选取代的C1-C6烷氧基;任选取代的C6-C12芳基;具有1至4个独立地选自N、S和O的环原子的任选取代的C1-C9杂芳基;任选取代的C7-C15芳基烷基(例如但不限于苄基或α-甲基苄基);具有1至4个独立地选自N、S和O的环原子的任选取代的C2-C15杂芳基烷基;任选取代的C7-C15芳基烯基;任选取代的C3-C8环烷基;或任选取代的C4-C8环烷基烷基;
R2是氢、C1-C6烷氧基(例如但不限于甲氧基或乙氧基)、三氟甲基、卤素、甲基羧基、乙基羧基、任选取代的C1-C6烷基、-OH、-SH、-NH2、-N3、-CN、-NO2、-CHO、-COOH、-CONH2、-C(=NH)NH2或-SO3H;
R5是甲基、乙基、C1-C6烷基、C1-C3芳基烷基或2-苯乙基;
Z2是键、-NH-、-O-、-S-、-CH(CH3)-、-CH2-、-(CH2)n-、-CH=CH-、-CO-、-SO-、-SO2-、-C(=NH)-、-CH2NH(CO)-、-CH2NH(CO)O-、-CH2NH(CO)NH-;-(CH2)nNH(CO)-、-(CH2)nNH(CO)O-、-(CH2)mNH(CO)NH-;
R4是H、任选取代的C1-C9烷基(例如但不限于叔丁基);任选取代的C2-C6烯基;任选取代的C6-C12芳基(例如但不限于任选取代的苯基);具有1至4个独立地选自N、S和O的环原子的任选取代的C1-C9杂芳基;任选取代的C7-C15芳基烷基(例如但不限于苄基或α-甲基苄基);-O-叔丁基;
m=l-5;n=l-8;
其中,“取代的”是指被独立地选自以下的一个或多个取代:卤素、三氟甲基、甲基羧基、乙基羧基、甲氧基、乙氧基、C1-C6烷氧基、C1-C6烷基、-OH、-SH、-NH2、-N3、-CN、-NO2、-CHO、-COOH、-CONH2、-C(=NH)NH2或-SO3H。
在一个实施例中,G3可以是H或N。
在一个实施例中,R1可以是C1-4烷基,例如但不限于甲基、乙基、丙基、丁基和环丙基。
在一个实施例中,R1可以是异丙基或异丁基。
在一个实施例中,R1可以是甲基。
在一个实施例中,R1可以是乙基。
在一个实施例中,R1可以是环丙基。
在一个实施例中,R1可以是H。
在一个实施例中,R2可以是H、卤素或甲基。
在一个实施例中,R5可以是H或CH3。例如,R5可以是CH3。
在一个实施例中,R5可以是乙基。
在一个实施例中,R4是叔丁基。
在一个实施例中,Z2可以是-O-或-NH-。例如,Z2可以是O。替代地,Z2可以是-NH-。
在一个实施例中,R5是甲基;Z2是-O-;以及R4是叔丁基。
在一个实施例中,R5是甲基;Z2是-NH-;以及R4是叔丁基。
在一个实施例中,R5是H;Z2是-O-;以及R4是叔丁基。例如,R1也是Cl-3烷基;和/或R2是H或甲基。
在一个实施例中,R1是Cl-4烷基;R2是H、卤素或甲基;R5是甲基;Z2是-O-;R4是叔丁基。
在本上下文中,G3可以是CH。
]在一个实施例中,G3是N,R1是异丁基,R5是氢,Z2是氧,R4是叔丁基,以及R2是氢、卤素、三氟甲基、甲基羧基、乙基羧基、C1-C6烷氧基(例如但不限于甲氧基和乙氧基)、C1-C6烷基、-OH、-SH、-NH2、-N3、-CN、-NO2、-CHO、-COOH、-CONH2、-C(=NH)NH2或-SO3H。
在另一个实施例中,G3是N,R1是异丁基或异丙基,R5是氢或甲基,Z2是氧,R4是叔丁基,以及R2是氢、卤素、三氟甲基、甲基羧基、乙基羧基、C1-C6烷氧基(例如但不限于甲氧基和乙氧基)、C1-C6烷基、-OH、-SH、-NH2、-N3、-CN、-NO2、-CHO、-COOH、-CONH2、-C(=NH)NH2或-SO3H。
在另一个实施例中,G3是N,R1是异丁基或异丙基,R5是氢,Z2是-CH2-或氧,R4是叔丁基或CH3,以及R2是氢、卤素、三氟甲基、甲基羧基、乙基羧基、C1-C6烷氧基(例如但不限于甲氧基和乙氧基)、C1-C6烷基、-OH、-SH、-NH2、-N3、-CN、-NO2、-CHO、-COOH、-CONH2、-C(=NH)NH2或-SO3H。
在一个方面,本发明公开了具有式17的化合物:
R1是H、任选取代的C1-C6烷基;任选取代的C2-C6烯基;任选取代的C1-C6烷氧基;任选取代的C6-C12芳基;具有1至4个独立地选自N、S和O的环原子的任选取代的C1-C9杂芳基;任选取代的C7-C15芳基烷基(例如但不限于苄基或α-甲基苄基);具有1至4个独立地选自N、S和O的环原子的任选取代的C2-C15杂芳基烷基;任选取代的C7-C15芳基烯基;任选取代的C3-C8环烷基;或任选取代的C4-C8环烷基烷基;
R2是氢、C1-C6烷氧基(例如但不限于甲氧基或乙氧基)、三氟甲基、卤素、甲基羧基、乙基羧基、任选取代的C1-C6烷基、OH、-SH、-NH2、-N3、-CN、-NO2、-CHO、-COOH、-CONH2、-C(=NH)NH2或-SO3H;
R5是H、甲基、乙基、C1-C6烷基、C1-C3芳基烷基或2-苯乙基;
Z2是键、-NH-、-O-、-S-、-CH(CH3)-、-CH2-、-(CH2)n-、-CH=CH-、-CO-、-SO-、-SO2-、-C(=NH)-、-CH2NH(CO)-、-CH2NH(CO)O-、-CH2NH(CO)NH-;-(CH2)nNH(CO)-、-(CH2)nNH(CO)O-、-(CH2)mNH(CO)NH-;
R4是H、任选取代的C1-C9烷基(例如但不限于叔丁基);任选取代的C2-C6烯基;任选取代的C6-C12芳基(例如但不限于任选取代的苯基);具有1至4个独立地选自N、S和O的环原子的任选取代的C1-C9杂芳基;任选取代的C7-C15芳基烷基(例如但不限于苄基或α-甲基苄基);-O-叔丁基;
m=l-5;n=l-8;
其中,“取代的”是指被独立地选自以下的一个或多个取代:卤素、三氟甲基、甲基羧基、乙基羧基、甲氧基、乙氧基、C1-C6烷氧基、C1-C6烷基、-OH、-SH、-NH2、-N3、-CN、-NO2、-CHO、-COOH、-CONH2、-C(=NH)NH2或-SO3H。
在一个实施例中,R1可以是异丙基或异丁基。
在一个实施例中,R1可以是H。
在一个实施例中,R2可以是H、卤素或甲基。例如,R2可以是H。
在一个实施例中,R5可以是H或CH3。例如,R5可以是CH3。
在一个实施例中,R4是叔丁基。
在一个实施例中,Z2可以是-O-或-NH-。例如,Z2可以是O。替代地,Z2可以是-NH-。
在一个实施例中,R5是甲基;Z2是-O-;以及R4是叔丁基。
在一个实施例中,R5是甲基;Z2是-NH-;以及R4是叔丁基。
在一个实施例中,R1是异丁基,R5是氢,Z2是氧,R4是叔丁基,以及R2是氢、卤素、三氟甲基、甲基羧基、乙基羧基、C1-C6烷氧基(例如但不限于甲氧基和乙氧基)、C1-C6烷基、-OH、-SH、-NH2、-N3、-CN、-NO2、-CHO、-COOH、-CONH2、-C(=NH)NH2或-SO3H。
在另一个实施例中,R1是异丙基,R5是氢,Z2是氧,R4是叔丁基,以及R2是氢、卤素、三氟甲基、甲基羧基、乙基羧基、C1-C6烷氧基(例如但不限于甲氧基和乙氧基)、C1-C6烷基、-OH、-SH、-NH2、-N3、-CN、-NO2、-CHO、-COOH、-CONH2、-C(=NH)NH2或-SO3H。
在另一个实施例中,R1是异丁基或异丙基,R5是氢或甲基,Z2是氧,R4是叔丁基,以及R2是氢、卤素、三氟甲基、甲基羧基、乙基羧基、C1-C6烷氧基(例如但不限于甲氧基和乙氧基)、C1-C6烷基、-OH、-SH、-NH2、-N3、-CN、-NO2、-CHO、-COOH、-CONH2、-C(=NH)NH2或-SO3H。
在另一个实施例中,R1是异丁基或异丙基,R5是氢,Z2是-CH2-或氧,R4是叔丁基或CH3,以及R2是氢、卤素、三氟甲基、甲基羧基、乙基羧基、C1-C6烷氧基(例如但不限于甲氧基和乙氧基)、C1-C6烷基、-OH、-SH、-NH2、-N3、-CN、-NO2、-CHO、-COOH、-CONH2、-C(=NH)NH2或-SO3H。
在另一个实施例中,R1是H;R2是H;R5是CH3;Z2是-O-或-NH-;以及R4是C4烷基(例如叔丁基)。
化学同类物的合成途径
使用先前在文献中描述的熟知的
有机化学技术合成本申请中描述的化合物(参见反应
方案)。
环化方法A-E:在各种溶剂和
温度下,使用1,1,1,1,3,3,3-六氟异丙醇(Lewis酸)或三
氟乙酸(Bronsted酸),将未取代的色胺和取代的色胺与脂肪族和芳香族
醛在Pictet-
Spangler型杂环化反应中反应,以提供在R1和R2处取代的四氢-β-咔啉。偶联方法F-H:然后将四氢-β-咔啉的
碱性仲氮与
羧酸(在
偶联剂存在下)、酰氯在碱存在下酰化或与异氰酸酯酰化,生成脲。
关于用于本文所述的每个同类物所用的具体合成方法,参见物理数据和合成方法表。
反应方案
实验方法
所有溶剂和
试剂均购自Sigma-Aldrich、Fisher Scientific或其他商业供应商,使用
时未经进一步纯化。用于NMR实验的所有氘代溶剂均购自Sigma-Aldrich,使用时未经进一步纯化。所有1H NMR实验均使用Varian 400MHz Unity Inova NMR
光谱仪进行。1H NMR光谱是通过16次扫描获得的,使用延迟时间(dl)=1秒。光谱宽度为=20ppm(从-3ppm到20ppm)。
NMR实验由Custom NMR Services(美艾尔(Ayer),马萨诸塞州(MA))进行。使用LC/MS进行质谱实验。通常在二氯甲烷中以1mg/mL的浓度制备样品,每次采集注射1uL。质谱实验由布朗大学(普罗维登斯(Providence),罗得岛州(Rl))的Tun-Li Shen博士进行。通过使用
Hydracid Papers 1-6(Micro Essential Laboratory-Brookly,纽约州)或使用Fisher Scientific pH计(型号AB15)来确定pH测量值。使用附接到KD Scientific 100型注射
泵的Hamilton 10mL气密
注射器进行试剂的受控添加。所有惰性气氛均使用压缩氩气(超高纯度-Igo’s Welding Supply-沃特敦(Watertown),马萨诸塞州(MA))作为气球,使用附接到针头上的Perfectum针头连接器或在Sigma-Aldrich Atmos手套袋中实现。实验室玻璃器皿由Sigma-Aldrich、Ace glass、Chemglass或VWR Scientific生产。使用Sigma-Aldrich
硅胶(230-400目,等级60,目录#717185)进行硅胶纯化。使用EMD TLC硅胶60F254板(2.5x
7.5cm,cat.#1153410001)进行TLC。通过I2-硅胶或UV光使TLC
可视化。使用Luna 5u C18(2)
100A柱(50x 2.00mm,Phenomenex)在Agilent HP 1090HPLC上进行高效液相色谱(HPLC)分析,并使用标准溶剂梯度程序在254nm和220nm处进行UV检测;溶剂A为0.4%TFA的水溶液;
溶剂B为0.4%TFA的乙腈溶液;HPLC梯度:5%B(0-0.5min),100%B(斜坡0.5-5min),100%B(5-7min),5%B(7-7.01min),5%B(7.01-9min)。
合成例1(通过方法D环化)
将色胺(1.00g,6.26mmol)、4-甲酰基苯
甲酸甲酯(1.03g,6.24mmol)和4A分子筛
(0.76g)悬浮在1,2-二氯乙烯(DCE)(30mL)中。将三氟乙酸(TFA)(285mg,2.50mmol)加入到混合物中,并使反应回流,得到亮棕色沉淀。将混合物冷却至30℃,并通过玻璃
棉塞除去4A分子筛。用饱和NaHCO3(15mL)淬灭溶液,并用EtOAc(50mL)稀释。用饱和NaCl洗涤有机层并干燥(无水MgSO4)。
真空除去溶剂,得到浅棕色固体。通过快速柱色谱法进一步纯化该物质:
用MeOH、EtOAc和己烷(1∶3∶6)洗脱。合并含有产物的级分,得到浅棕色固体(0.80g,42%产率;TLCRf=0.129(10%MeOH/30%EtOAc/己烷);HPLC Rt=3.254min)。该中间体用于合成以下化合物:Mn0642和MN1210。
合成例3:MN1179(通过方法B环化)
将色胺(5.00g,31.2mmol)加入到
甲苯(100mL)中。将2-苯基丙醛(4.2mL,31.2mmol)和TFA(0.60mL,7.8mmol)加入到混合物中。搅拌反应并回流过夜,使用Dean-Stark分水器以除去水。将反应冷却至室温,加入EtOAc(100mL),并用饱和NaHCO3(3x 25mL)洗涤有机层,然后用NaCl(25mL)洗涤。真空除去溶剂,得到棕色固体。将固体溶解在EtOAc(50mL)中,加入庚烷(50mL),并将反应物置于
冰上。过滤溶液,并干燥剩余物质。将固体溶于CH2Cl2中,并用真空快速色谱法进一步纯化:5个级分,由0%、1%、3%、5%和5%MeOH的CH2Cl2溶液组成。合并含有产物的级分,真空除去溶剂,得到固体(5.10g,59.1%产率;TLC Rf=0.34(3%MeOH/CH2Cl2);HPLC Rt=3.187min)。该中间体用于合成以下化合物:MN1130、MN1135、MN1151、MN1152和MN1171。
合成例4:MN1180(通过方法A环化)
将色胺(1.6g,10mmol)溶于1,1,1,3,3,3-六氟-2-异丙醇(16mL)中,并通过注射器加入到异戊醛(1.3mL;12mmol)中。将反应物加热至回流18.5小时,并在氮气惰性气氛下搅拌。
蒸发溶剂,并在真空下与CHCl3(3x 50mL)共沸。加入己烷(16mL),并将混合物在浴中超声
10min,然后搅拌过夜。过滤混合物,得到固体(1.9g)。通过与5N NH4OH(10mL)搅拌
研磨20分钟,进一步纯化物质。过滤所得物,然后用H2O(2x 20mL)洗涤。过滤所得固体,并在真空干燥器中干燥,得到固体(1.60g,71.0%产率;TLC Rf=0.30(10%MeOH/1%NH4OH/CH2Cl2);HPLC Rt=3.081min。该中间体用于合成以下化合物:
合成例5:MN1180(通过方法C环化)
将色胺(8.0g,50mmol)溶于CH2Cl2(400mL),并在氩气惰性气氛下放置20min。将异戊醛(5.36mL,50.0mmol)加入到溶液中,并将反应置于-80℃的冰浴中20min。在15分钟内逐滴加入TFA(38.3mL)。从水浴中移出反应物,允许其温热至室温,并搅拌20hr。蒸发溶剂,得到黑色油状物。将油状物溶解在CH2Cl2(250mL)中,且加入1N NaOH并摇动。收集沉淀物并在真空干燥器中干燥以提供17.9g的橄榄色粉末(TFA盐)。将TFA盐从回流的乙腈中重结晶。用冷ACN(~20mL)洗涤收集的固体并干燥,得到结晶固体(9.3g,54%产率;TLC Rf=0.30)。
(10%MeOH/l%NH4OH/CH2Cl2);HPLC Rt=3.099min)。该中间体用于合成以下化合物:
MN1132、MN1133,、MN1137、MN1138、MN1157、MN1186、MN1189、MN1190、MN1194、MN1195、MN1197、MN1203、MN1206、MN1207、MN1208、MN1209、MN1212、MN1213、MN1214、MN1220、MN1221、MN1222、MN1223、MN1224、MN1225、MN1226、MN1231、MN1232、MN1246。
合成例7:MN1130(通过方法H偶联)
将1-(1-苯乙基)-2,3,4,9-四氢-1H-吡啶并[3,4-b]吲哚(276mg,1.00mmol)溶解于
CHCl3(50mL)中并在氮气惰性气氛下冰浴10min。通过注射器添加异氰酸丁酯(170μL,
1.50mmol)。从冰浴中移出反应物,并允许其温热至室温10min。HPLC表明反应在1hr完成。蒸发反应物并在真空下干燥。将剩余物溶于EtOAc(100mL)中,用1M柠檬酸(3x 25mL)、饱和NaHCO3(3x 25mL)和饱和NaCl(25mL)洗涤。干燥(无水Na2SO4)有机层,过滤,并在真空下蒸发,得到灰白色固体(339mg)。通过与40%EtOAc/60%己烷(3mL)搅拌研磨1hr,进一步纯化物质,然后通过研磨收集产物。通过与40%EtOAc/60%己烷(3mL)搅拌1hr来重复研磨。过滤所得固体,并在真空干燥器中干燥,得到白色固体(138mg,36.7%产率;TLC Rf=0.46(40%EtOAc的己烷溶液);HPLC Rt=4.598min);MS m/z 375.2412(100%相对整数)。该方法用于合成以下化合物:MN733、MN1130、MN1131、MN1158、MN1160、MN1169、MN1171、MN1172、MN1184。
合成例8:MN1132(通过方法G偶联)
将1-异丁基-2,3,4,9-四氢-1H-吡啶并[3,4-b]吲哚(228mg,1.00mmol)溶解于CH2Cl2
(10mL)中并在氮气惰性气氛下冰浴6min。通过注射器加入辛酰氯(170μL,1.00mmol),然后直接加入三乙胺(TEA)(140μL,1.00mmol)。从冰浴中移出反应物,并允许其温热至室温
10min。HPLC表明反应在10min完成。用EtOAc(100mL)稀释溶液,用1N HCl(3x 25mL)、饱和NaHCO3(3x 25mL)和饱和NaCl(25mL)洗涤。干燥(无水Na2SO4)有机层,过滤,并在真空下蒸发。将所得油状物溶解在CH2Cl2(5mL)中,并在真空下除去溶剂。用己烷(3mL)洗涤油状剩余物,除去顶部任何可溶于己烷的杂质。该物质通过硅胶色谱法进一步纯化:5个级分(每个
200mL),由0%、5%、10%、15%和20%EtOAc的己烷溶液组成。合并含有产物的级分,真空除去溶剂,得到油状物。将该油状物溶于CH2Cl2(~1mL)中,并在冰浴中缓慢蒸发,得到白色固体。高真空下干燥固体,得到黄色油状物(236mg,67.0%产率;TLC Rf=0.28(10%EtOAc的己烷溶液);HPLC Rt=5.299min);1H NMR(CDCl3,0.003%v/v TMS,400MHz):δ0.85-1.10(9H,m),1.20-1.40(8H,m),1.55-1.80(5H,m),2.30-2.55(2H,dq),2.65-2.90(2H,m),3.45-
3.55(1H,m),4.00-4.10(1H,dd),5.87(1H,t),7.10(1H,t),7.15(1H,t),7.30(1H,d),7.47(1H,d),7.80(1H,br s)。该方法用于合成以下化合物:MN0477、MN0642、MN0908、MN1132、MN1133、MN1135、MN1137、MN1138、MN1152、MN1156、MN1157、MN1188、MN1193、MN1197、MN1203、MN1206、MN1207、MN1208、MN1209、MN1210、MN1211、MN1212、MN1213、MN1214、MN1216、MN1217、MN1218、MN1219。
合成例11:MN1186(通过方法F偶联)
将1-异丁基-2,3,4,9-四氢-1H-吡啶并[3,4-b]吲哚·TFA盐(410mg,1.20mmol)、1-乙
基-3-(3-二甲基氨基丙基)碳二亚胺-HCl(EDC-HCl)(230mg,1.20mmol)、4-二甲基亚氨基吡啶(DMAP)(13mg,0.12mmol)、羟基苯并三唑(HOBT)(61mg,0.40mmol)和Boc-甘氨酸(210mg,
1.20mmol)全部溶解在乙腈(ACN)(1.5mL)、二甲基甲酰胺(DMF)(6mL)和二异丙基乙胺
(DIEA)(240μL,1.44mmol)中。将溶液搅拌17小时。用EtOAc(100mL)稀释溶液,用1N HCl(3x
25mL)、饱和NaHCO3(3x 25mL)和饱和NaCl(25mL)洗涤。干燥(无水Na2SO4)有机层,过滤,并在真空下蒸发,得到油状物。该物质通过硅胶色谱法进一步纯化,使用:9个级分(200mL),由
0%、1%、2%、4%、4%、5%、5%、5%和5%EtOAc的CH2Cl2溶液组成。合并含有产物的级分,真空下干燥溶剂,得到白色固体(331mg,71.6%产率;TLC Rf=0.59(10%EtOAc的CH2Cl2溶液);HPLC Rt=4.577min);1H NMR(CDCl3,0.003%v/v TMS,400MHz):δH 0.95(3H,d)1.10(3H,d),1.45(9H,s),1.55-1.85(3H,m),2.70-2.93(2H,m),3.40-3.55(1H,m),3.87-4.20(3H,m),5.60(1H,brs),5.80(1H,dt),7.05-7.20(2H,m),7.30(1H,d),7.45(1H,d),7.80
(1H,br s)。
以类似于MN1186的方式合成以下化合物:MN1462、MN1463、MN1464、MN1465、MN1466、MN1467、MN1468、MN1469、MN1470和MN1471。
合成例25:MN1254(通过方法E环化)
通过旋转并用热风枪加热将色胺(1.60g,10mmol)溶解在EtOAc(5mL)中直至溶解。然后加入4-氯
苯甲醛(1.48g,10.5mmol)。旋转反应容器并用热风枪加热溶解。席夫碱中间体在2分钟内沉淀。将反应混合物冷却至室温,并在
烧结玻璃上收集中间体席夫碱,然后在真空下干燥,得到2.36g作为棕褐色粉末的中间体。将席夫碱溶解在乙腈/无水
乙醇(12.5mL/
12.5mL)中。加入4N HCl的二恶烷溶液(4mL,16mmol)。将溶液加热至回流,这时环化产物的HCl盐开始沉淀。然后将反应混合物冷却至-20℃,并在烧结玻璃上收集固体。将产物1-(4-氯苯基)-2,3,4,9-四氢-1H-吡啶并[3,4-b]吲哚
盐酸盐在真空下干燥,得到2.16g灰白色粉末,产率为85%(全部68%):Mp:163-165C(游离碱)。
合成例27:MN0716(吲哚同类物合成)
N-(4-叔丁基苄基)-2-(1H-吲哚-3-基)乙胺:在色胺(1.5g,9.4mmol)的无水EtOH
(15mL)溶液中加入4-叔丁基苯甲醛(2.0mL,12mmol)。搅拌反应物1h,然后冷却至0℃,然后加入NaBH4(750mg,19mmol)。将溶液在0℃下搅拌1h。真空浓缩溶液,然后在高真空下干燥。
然后用1N HCl(~20mL)淬灭反应,然后加入EtOAc(100mL)以形成沉淀。用固体K2CO3使混合物为碱性(pH 10)。分离层,经Na2O4干燥并蒸发,得到300mg油状物。通过首先添加1N HCl(10mL)来纯化该物质,然后添加EtOAc(50mL)以使N-(4-叔丁基苄基)-2-(1H-吲哚-3-基)乙胺沉淀为固体:260mg(9%产率);HPLC Rt(2.757min)。
在N-(4-叔丁基苄基)-2-(1H-吲哚-3-基)乙胺(100mg,0.327mmol)的CH2Cl2冰冷溶液
中加入异氰酸乙酯(26uL,0.327mmol)(在1.5mL CH2Cl2中冷却至0℃)。将反应物在0℃搅拌
5min。1h后,然后加入0.2当量的异氰酸乙酯,并再搅拌30min。用CH2Cl2稀释溶液并用饱和NaHCO3洗涤。将溶液在硅胶上用色谱法分析,用己烷/乙酸乙酯[2∶1至1∶1]洗脱,得到
129mg,100%产物产率;HPLC Rt 4.664min;TLC Rf 0.16,10%EtOAc的CH2Cl2溶液。该方法用于合成以下化合物:MN0716、MN0733和MN1058、
合成例28:MN1292
将6-氟-1-异丁基-2,3,4,9-四氢-1H-吡啶并[3,4-b]吲哚(246mg,1.00mmol)、1-乙基-
3-(3-二甲氨基丙基)碳二亚胺-HCl(EDC-HCl)(192mg,1.00mmol)、4-二甲氨基吡啶(DMAP)(12mg,0.10mmol)、羟基苯并三唑(HOBT)(51mg,0.33mmol)和5-(叔丁氧基羰基氨基)戊酸(217mg,1.00mmol)全部溶解在乙腈(ACN)(1.25mL)、二甲基甲酰胺(DMF)(5mL)和二异丙基乙胺(DIEA)(200μL,1.20mmol)中。将反应物在RT下搅拌18小时。用EtOAc(100mL)稀释反应混合物,用饱和NaCl(2x 50mL)、1M柠檬酸(3x 25mL)、饱和NaHCO3(3x 25mL)和饱和NaCl(50mL)洗涤。干燥(无水Na2SO4)有机层,过滤,并在真空下蒸发。将该物质通过硅胶色谱法进一步纯化,使用:3个级分(200mL),由己烷27.5%EtOAc的己烷溶液和35%EtOAc的己烷溶液组成。合并含有产物的级分,并真空蒸发溶剂,得到固体(269mg,60.4%产率;TLC Rf=0.14(30%EtOAc的己烷溶液);HPLC Rt=4.683min)。
合成例29:MN1293
将7-氟-1-异丁基-2,3,4,9-四氢-1H-吡啶并[3,4-b]吲哚(246mg,1.00mmol)、1-乙基-
3-(3-二甲氨基丙基)碳二亚胺-HCl(EDC-HCl)(192mg,1.00mmol)、4-二甲氨基吡啶(DMAP)(12mg,0.10mmol)、羟基苯并三唑(HOBT)(51mg,0.33mmol)和反-4-((叔丁氧基羰基氨基)甲基)环己烷羧酸(257mg,1.00mmol)全部溶解在乙腈(ACN)(1.25mL)、二甲基甲酰胺(DMF)(5mL)和二异丙基乙胺(DIEA)(200μL,1.20mmol)中。将反应物在RT下搅拌18小时。用EtOAc(100mL)稀释反应混合物,用饱和NaCl(2x 50mL)、1M柠檬酸(3x 25mL)、饱和NaHCO3(3x
25mL)和饱和NaCl(50mL)洗涤。干燥(无水Na2SO4)有机层,过滤,并在真空下蒸发。将该物质通过硅胶(25-30g)色谱法进一步纯化,使用:3个级分(200mL),由己烷、25%EtOAc的己烷溶液和30%EtOAc的己烷溶液组成。合并含有产物的级分,并真空蒸发溶剂,得到固体(280mg,
57.7%产率;TLC Rf=0.21(30%EtOAc的己烷溶液);HPLC Rt=4.885min)。
合成例30:MN1294
将1-异丁基-2,3,4,9-四氢-1H-吡啶并[3,4-b]吲哚(228mg,1.00mmol)、1-乙基-3-(3-二甲氨基丙基)碳二亚胺-HCl(EDC-HCl)(192mg,1.00mmol)、4-二甲氨基吡啶(DMAP)(12mg,
0.10mmol)、羟基苯并三唑(HOBT)(51mg,0.33mmol)和3,5,5-三甲基己酸(158mg,1.00mmol)全部溶解在乙腈(ACN)(1.25mL)、二甲基甲酰胺(DMF)(5mL)和二异丙基乙胺(DIEA)(200μL,
1.20mmol)中。将反应物在RT下搅拌18小时。用EtOAc(100mL)稀释反应混合物,用饱和NaCl(2x 50mL)、1M柠檬酸(3x 25mL)、饱和NaHCO3(3x 25mL)和饱和NaCl(50mL)洗涤。干燥(无水Na2SO4)有机层,过滤,并在真空下蒸发。将该物质通过硅胶(25-30g)色谱法进一步纯化,使用:3个级分(200mL),由己烷、10%EtOAc的己烷溶液和17%EtOAc的己烷溶液组成。合并含有产物的级分,并真空蒸发溶剂,得到固体(315mg,85.5%产率;TLC Rf=0.12(10%EtOAc的己烷溶液);HPLC Rt=5.271min)。
合成例31:MN1305
将6-氟-1-异丙基-2,3,4,9-四氢-1H-吡啶并[3,4-b]吲哚(232mg,1.00mmol)、1-乙基-
3-(3-二甲氨基丙基)碳二亚胺-HCl(EDC-HCl)(192mg,1.00mmol)、4-二甲氨基吡啶(DMAP)(12mg,0.10mmol)、羟基苯并三唑(HOBT)(51mg,0.33mmol)和boc-甘氨酸(175mg,1.00mmol)全部溶解在乙腈(ACN)(1.25mL)、二甲基甲酰胺(DMF)(5mL)和二异丙基乙胺(DIEA)(200μL,
1.20mmol)中。将反应物在RT下搅拌48小时。用EtOAc(100mL)稀释反应混合物,用饱和NaCl(2x 50mL)、1M柠檬酸(3x 25mL)、饱和NaHCO3(3x 25mL)和饱和NaCl(50mL)洗涤。干燥(无水Na2SO4)有机层,过滤,并在真空下蒸发。将该物质通过硅胶(25-30g)色谱法进一步纯化,使用:2个级分(200mL),由己烷和50%EtOAc的己烷溶液组成。合并含有产物的级分,并真空蒸发溶剂,得到固体(360mg,92.4%产率;TLC Rf=0.59(50%EtOAc的己烷);HPLC Rt=
4.386min)。
MN1306-6-氟-异丙基咔啉与戊酸衍生物
将6-氟-1-异丙基-2,3,4,9-四氢-1H-吡啶并[3,4-b]吲哚(232mg,1.00mmol)、1-乙基-
3-(3-二甲氨基丙基)碳二亚胺-HCl(EDC-HCl)(192mg,1.00mmol)、4-二甲氨基吡啶(DMAP)(12mg,0.10mmol)、羟基苯并三唑(HOBT)(51mg,0.33mmol)和boc-戊酸(217mg,1.00mmol)全部溶解在乙腈(ACN)(1.25mL)、二甲基甲酰胺(DMF)(5mL)和二异丙基乙胺(DIEA)(200μL,
1.20mmol)中。将反应物在RT下搅拌48小时。用EtOAc(100mL)稀释反应混合物,用饱和NaCl(2x 50mL)、1M柠檬酸(3x 25mL)、饱和NaHCO3(3x 25mL)和饱和NaCl(50mL)洗涤。干燥(无水Na2SO4)有机层,过滤,并在真空下蒸发。将该物质通过硅胶(25-30g)色谱法进一步纯化,使用:2个级分(200mL),由己烷和50%EtOAc的己烷溶液组成。合并含有产物的级分,并真空蒸发溶剂,得到固体(355mg,82.3%产率;TLC Rf=0.24(50%EtOAc的己烷溶液);HPLC Rt=
4.504min)。
合成例32:MN1307
将6-氟-1-异丙基-2,3,4,9-四氢-1H-吡啶并[3,4-b]吲哚(232mg,1.00mmol)、1-乙基-
3-(3-二甲氨基丙基)碳二亚胺-HCl(EDC-HCl)(192mg,1.00mmol)、4-二甲氨基吡啶(DMAP)(12mg,0.10mmol)、羟基苯并三唑(HOBT)(51mg,0.33mmol)和boc-氨甲环酸(257mg,
1.00mmol)全部溶解在乙腈(ACN)(1.25mL)、二甲基甲酰胺(DMF)(5mL)和二异丙基乙胺
(DIEA)(200μL,1.20mmol)中。将反应物在RT下搅拌48小时。用EtOAc(100mL)稀释反应混合物,用饱和NaCl(2x 50mL)、1M柠檬酸(3x 25mL)、饱和NaHCO3(3x 25mL)和饱和NaCl(50mL)洗涤。干燥(无水Na2SO4)有机层,过滤,并在真空下蒸发。将该物质通过硅胶(25-30g)色谱法进一步纯化,使用:2个级分(200mL),由己烷和50%EtOAc的己烷溶液组成。合并含有产物的级分,并真空蒸发溶剂,得到固体(391mg,82.9%产率;TLC Rf=0.36(50%EtOAc的己烷溶液);HPLC Rt=4.712min)。
合成例33:MN1308
将1-异丁基-2,3,4,9-四氢-1H-吡啶并[3,4-b]吲哚(456mg,2.00mmol)、1-乙基-3-(3-二甲氨基丙基)碳二亚胺-HCl(EDC-HCl)(383mg,2.00mmol)、4-二甲氨基吡啶(DMAP)(24mg,
0.20mmol)、羟基苯并三唑(HOBT)(102mg,0.66mmol)和(S)-2-(叔丁氧羰基氨基)-6-(2,2,
2-三氟乙酰胺基)己酸(684mg,2.00mmol)全部溶解在乙腈(ACN)(2.5mL)、二甲基甲酰胺(DMF)(10mL)和二异丙基乙胺(DIEA)(400μL,2.40mmol)中。将反应物在RT下搅拌18小时。用EtOAc(100mL)稀释反应混合物,用饱和NaCl(2x 50mL)、1M柠檬酸(3x 25mL)、饱和NaHCO3(3x 25mL)和饱和NaCl(50mL)洗涤。干燥(无水Na2SO4)有机层,过滤,并在真空下蒸发。将该物质通过硅胶(25-30g)色谱法进一步纯化,使用:己烷(200mL)冲洗,3个级分(200mL),由
20%、25%和30%EtOAc的己烷溶液组成。合并含有产物的级分,并真空蒸发溶剂,得到固体(820mg,74%产率;TLC Rf=0.10(25%EtOAc的己烷溶液);HPLC Rt=4.743min)。
合成例34:MN1309
(2S)-1-(1-异丁基-3,4-二氢-1H-吡啶基[3,4-b]吲哚-2(9H)-基)-1-氧代-6-(2,2,2-
三氟乙酰胺基)己-2-基氨基甲酸叔丁酯(553mg,1.00mmol)溶于MeOH(100mL)中。将K2CO3(690mg,5.00mmol)加入到溶液中。将溶液回流18hr。真空除去溶剂并将所得油状物溶于EtOAc(100mL)中。用1M NaOH(25mL)和饱和NaCl(25mL)洗涤溶液。干燥(无水Na2SO4)有机层,过滤,并在真空下蒸发,得到固体(371mg,81.2%产率;TLC Rf=0.05(5%MeOH的CH2C12溶液+1%NH4OH);HPLC Rt=3.909和3.955min(非对映体))。
合成例35:MN1310
将1-异丁基-2,3,4,9-四氢-1H-吡啶并[3,4-b]吲哚(456mg,2.00mmol)、1-乙基-3-(3-二甲氨基丙基)碳二亚胺-HCl(EDC-HCl)(383mg,2.00mmol)、4-二甲氨基吡啶(DMAP)(24mg,
0.20mmol)、羟基苯并三唑(HOBT)(102mg,0.66mmol)和(R)-2-(叔丁氧羰基氨基)-5-(环己氧基)-5-氧戊酸(659mg,2.00mmol)全部溶解在乙腈(ACN)(2.5mL)、二甲基甲酰胺(DMF)(10mL)和二异丙基乙胺(DIEA)(400μL,2.40mmol)中。将反应物在RT下搅拌18小时。用EtOAc(100mL)稀释反应混合物,用饱和NaCl(2x 50mL)、1M柠檬酸(3x 25mL)、饱和NaHCO3(3x
25mL)和饱和NaCl(50mL)洗涤。干燥(无水Na2SO4)有机层,过滤,并在真空下蒸发。将该物质通过硅胶(25-30g)色谱法进一步纯化,使用:4个级分(200mL),由己烷、15%EtOAc的己烷溶液、17.5%EtOAc的己烷溶液和22.5%EtOAc的己烷溶液组成。合并含有产物的级分,并真空蒸发溶剂,得到固体(808mg,74.9%产率;TLC Rf=0.20(20%EtOAc的己烷溶液);HPLC Rt=
5.269min)。
合成例36:MN1311
将1-异丁基-2,3,4,9-四氢-1H-吡啶并[3,4-b]吲哚(457mg,2.00mmol)、1-乙基-3-(3-二甲氨基丙基)碳二亚胺-HCl(EDC-HCl)(383mg,2.00mmol)、4-二甲氨基吡啶(DMAP)(24mg,
0.20mmol)、羟基苯并三唑(HOBT)(102mg,0.66mmol)和(S)-4-(苄氧基)-2-(叔丁氧基羰基氨基)丁酸(619mg,2.00mmol)全部溶解在乙腈(ACN)(2.5mL)、二甲基甲酰胺(DMF)(10mL)和二异丙基乙胺(DIEA)(400μL,2.40mmol)中。将反应物在RT下搅拌18小时。用EtOAc(100mL)稀释反应混合物,用饱和NaCl(2x 50mL)、1M柠檬酸(3x 25mL)、饱和NaHCO3(3x 25mL)和饱和NaCl(50mL)洗涤。干燥(无水Na2SO4)有机层,过滤,并在真空下蒸发。将该物质通过硅胶(25-30g)色谱法进一步纯化,使用:4个级分(200mL),由己烷、15%EtOAc的己烷溶液、20%EtOAc的己烷溶液和25%EtOAc的己烷溶液组成。合并含有产物的级分,并真空蒸发溶剂,得到固体(688mg,66.2%产率;TLC Rf=0.34(30%EtOAc的己烷溶液);HPLC Rt=5.107min)。
合成例37:MN1312
将1-异丁基-2,3,4,9-四氢-1H-吡啶并[3,4-b]吲哚(228mg,1.00mmol)、1-乙基-3-(3-二甲氨基丙基)碳二亚胺-HCl(EDC-HCl)(192mg,1.00mmol)、4-二甲氨基吡啶(DMAP)(12mg,
0.10mmol)、羟基苯并三唑(HOBT)(51mg,0.33mmol)和(R)-5-氨基-2-(叔丁氧羰基氨基)-5-氧戊酸(246mg,1.00mmol)全部溶解在乙腈(ACN)(1.25mL)、二甲基甲酰胺(DMF)(5mL)和二异丙基乙胺(DIEA)(200μL,1.20mmol)中。将反应物在RT下搅拌18小时。用EtOAc(100mL)稀释反应混合物,用饱和NaCl(2x 50mL)、1M柠檬酸(3x 25mL)、饱和NaHCO3(3x 25mL)和饱和NaCl(50mL)洗涤。干燥(无水Na2SO4)有机层,过滤,并在真空下蒸发。将该物质通过硅胶(25-
30g)色谱法进一步纯化,使用:4个级分(200mL),由CH2Cl2,4%、4.5%和5%MeOH的CH2Cl2溶液组成。合并含有产物的级分,并真空蒸发溶剂,得到固体(264mg,57.8%产率;TLC Rf=
0.05(4%MeOH的CH2Cl2溶液);HPLCRt=4.149min)。
合成例38:MN1317
将1-异丁基-2,3,4,9-四氢-1H-吡啶并[3,4-b]吲哚(158.5mg,0.694mmol)、1-乙基-3-(3-二甲氨基丙基)碳二亚胺-HCl(EDC-HCl)(133mg,0.694mmol)、4-二甲氨基吡啶(DMAP)(8.5mg,0.0694mmol)、羟基苯并三唑(HOBT)(35mg,0.229mmol)和3-((叔丁氧基羰基氨基)甲基)环
丁烷羧酸(159mg,0.694mmol)全部溶解在乙腈(867.5μL)、二甲基甲酰胺(DMF)(3.47mL)和二异丙基乙胺(DIEA)(134μL,0.833mmol)中。将反应物在RT下搅拌17小时。用EtOAc(100mL)稀释反应混合物,用饱和NaCl(2x 50mL)、1M柠檬酸(3x 25mL)、饱和NaHCO3(3x 25mL)和饱和NaCl(50mL)洗涤。干燥(无水Na2SO4)有机层,过滤,并在真空下蒸发。将该物质通过硅胶(25-30g)色谱法进一步纯化,使用:4个级分(200mL),由己烷、20%EtOAc的己烷溶液、25%EtOA的己烷溶液c和32%EtOAc的己烷溶液组成。合并含有产物的级分,并真空蒸发溶剂,得到固体(149mg,48.8%产率;TLC Rf=0.12(25%EtOAc的己烷溶液);HPLC Rt=
4.713min)。
合成例39:MN1318
将1-异丁基-2,3,4,9-四氢-1H-吡啶并[3,4-b]吲哚(158.5mg,0.694mmol)、1-乙基-3-(3-二甲氨基丙基)碳二亚胺-HCl(EDC-HCl)(133mg,0.694mmol)、4-二甲氨基吡啶(DMAP)(8.5mg,0.0694mmol)、羟基苯并三唑(HOBT)(35mg,0.229mmol)和2-(反-4-(叔丁氧基羰基氨基)环己基)乙酸(178mg,0.694mmol)全部溶解在乙腈(867.5μL)、二甲基甲酰胺(DMF)(3.47mL)和二异丙基乙胺(DIEA)(134μL,0.833mmol)中。将反应物在RT下搅拌17小时。用EtOAc(100mL)稀释反应混合物,用饱和NaCl(2x 50mL)、1M柠檬酸(3x 25mL)、饱和NaHCO3(3x 25mL)和饱和NaCl(50mL)洗涤。干燥(无水Na2SO4)有机层,过滤,并在真空下蒸发。将该物质通过硅胶(25-30g)色谱法进一步纯化,使用:4个级分(200mL),由己烷、20%EtOAc的己烷溶液、25%EtOAc的己烷溶液和32%EtOAc的己烷溶液组成。合并含有产物的级分,并真空蒸发溶剂,得到固体(163mg,50.2%产率;TLC Rf=0.17(25%EtOAc的己烷溶液);HPLC Rt=
4.870min)。
合成例40:MN1319
将1-异丁基-2,3,4,9-四氢-1H-吡啶并[3,4-b]吲哚(158.5mg,0.694mmol)、1-乙基-3-(3-二甲氨基丙基)碳二亚胺-HCl(EDC-HCl)(133mg,0.694mmol)、4-二甲氨基吡啶(DMAP)(8.5mg,0.0694mmol)、羟基苯并三唑(HOBT)(35mg,0.229mmol)和3-(反-4-(叔丁氧基羰基氨基)环己基)丙酸(188mg,0.694mmol)全部溶解在乙腈(867.5μL)、二甲基甲酰胺(DMF)(3.47mL)和二异丙基乙胺(DIEA)(134μL,0.833mmol)中。将反应物在RT下搅拌17小时。用EtOAc(100mL)稀释反应混合物,用饱和NaCl(2x 50mL)、1M柠檬酸(3x 25mL)、饱和NaHCO3(3x 25mL)和饱和NaCl(50mL)洗涤。干燥(无水Na2SO4)有机层,过滤,并在真空下蒸发。将该物质通过硅胶(25-30g)色谱法进一步纯化,使用:4个级分(200mL),由己烷、20%EtOAc的己烷溶液、25%EtOAc的己烷溶液和32%EtOAc的己烷溶液组成。合并含有产物的级分,并真空蒸发溶剂,得到固体(176mg,52.7%产率;TLC Rf=0.13(25%EtOAc的己烷溶液);HPLC Rt=
4.984min)。
合成例41:MN1320
将1-异丁基-2,3,4,9-四氢-1H-吡啶并[3,4-b]吲哚(158.5mg,0.694mmol)、1-乙基-3-(3-二甲氨基丙基)碳二亚胺-HCl(EDC-HCl)(133mg,0.694mmol)、4-二甲氨基吡啶(DMAP)(8.5mg,0.0694mmol)、羟基苯并三唑(HOBT)(35mg,0.229mmol)和4-(反-4-(叔丁氧基羰基氨基)甲基)
苯甲酸(174mg,0.694mmol)全部溶解在乙腈(867.5μL)、二甲基甲酰胺(DMF)(3.47mL)和二异丙基乙胺(DIEA)(134μL,0.833mmol)中。将反应物在RT下搅拌17小时。用EtOAc(100mL)稀释反应混合物,用饱和NaCl(2x 50mL)、1M柠檬酸(3x 25mL)、饱和NaHCO3(3x 25mL)和饱和NaCl(50mL)洗涤。干燥(无水Na2SO4)有机层,过滤,并在真空下蒸发。将该物质通过硅胶(25-30g)色谱法进一步纯化,使用:4个级分(200mL),由己烷、20%EtOAc的己烷溶液、25%EtOAc的己烷溶液和32%EtOAc的己烷溶液组成。合并含有产物的级分,并真空蒸发溶剂,得到固体(162mg,50.6%产率;TLC Rf=0.10(25%EtOAc的己烷溶液);HPLC Rt=
4.771min)。
合成例42:MN1321
将1-异丁基-2,3,4,9-四氢-1H-吡啶并[3,4-b]吲哚(158.5mg,0.694mmol)、1-乙基-3-(3-二甲氨基丙基)碳二亚胺-HCl(EDC-HCl)(133mg,0.694mmol)、4-二甲氨基吡啶(DMAP)(8.5mg,0.0694mmol)、羟基苯并三唑(HOBT)(35mg,0.229mmol)和-反-4-((叔丁氧基羰基(甲基)氨基)甲基)环己烷羧酸(188mg,0.694mmol)全部溶解在乙腈(867.5μL)、二甲基甲酰胺(DMF)(3.47mL)和二异丙基乙胺(DIEA)(134μL,0.833mmol)中。将反应物在RT下搅拌17小时。用EtOAc(100mL)稀释反应混合物,用饱和NaCl(2x 50mL)、1M柠檬酸(3x 25mL)、饱和NaHCO3(3x 25mL)和饱和NaCl(50mL)洗涤。干燥(无水Na2SO4)有机层,过滤,并在真空下蒸发。将该物质通过硅胶(25-30g)色谱法进一步纯化,使用:4个级分(200mL),由己烷、20%EtOAc的己烷溶液、25%EtOAc的己烷溶液和30%EtOAc的己烷溶液组成。合并含有产物的级分,并真空蒸发溶剂,得到固体(165mg,49.4%产率;TLC Rf=0.15(25%EtOAc的己烷溶液);HPLC Rt=5.096min)。
合成例43:MN1322
将1-异丁基-2,3,4,9-四氢-1H-吡啶并[3,4-b]吲哚(228mg,1.00mmol)、1-乙基-3-(3-二甲氨基丙基)碳二亚胺-HCl(EDC-HCl)(192mg,1.00mmol)、4-二甲氨基吡啶(DMAP)(12mg,
0.10mmol)、羟基苯并三唑(HOBT)(51mg,0.33mmol)和boc-氨甲环酸(250mg,1.00mmol)全部溶解在乙腈(1.25mL)、二甲基甲酰胺(DMF)(5mL)和二异丙基乙胺(DIEA)(200μL,1.20mmol)中。将反应物在RT下搅拌18小时。用EtOAc(100mL)稀释反应混合物,用饱和NaCl(2x 50mL)、
1M柠檬酸(3x 25mL)、饱和NaHCO3(3x 25mL)和饱和NaCl(50mL)洗涤。干燥(无水Na2SO4)有机层,过滤,并在真空下蒸发。将该物质通过硅胶(25-30g)色谱法进一步纯化,使用:3个级分(200mL),由25%、35%和40%EtOAc的己烷溶液组成。合并含有产物的级分,并真空蒸发溶剂,得到固体(250mg,55.1%产率;TLC Rf=0.19(30%EtOAc的己烷溶液);HPLC Rt=
4.739min)。
合成例44:MN1329
将(4R)-环己基-4-(叔丁氧基羰基氨基)-5-(1-异丁基-3,4-二氢-1H-吡啶基[3,4-b]
吲哚-2(9H)-基)-5-氧戊酸酯(540mg,1.00mmol)溶于MeOH(18.4mL)中。将H2O(5.3mL)和LiOH(210mg,5mmol)加入混合物中并搅拌。四小时后,真空除去75%的溶剂。将混合物转移至分液漏斗中,并用H2O(25mL)稀释。用乙醚(4x 25mL)洗涤溶液。用1N HCl(5mL)酸化水层至pH 2(通过pH
试纸测定),用CH2Cl2(4x 50mL)萃取。真空除去溶剂,得到白色固体(369mg,
80.7%产率;TLC Rf=0.59(5%MeOH的CH2Cl2溶液+1%HOAc);HPLC Rt=4.304min。
合成例45:MN1330
将1-异丁基-7-甲氧基-2,3,4,9-四氢-1H-吡啶并[3,4-b]吲哚(159mg,0.614mmol)、1-乙基-3-(3-二甲氨基丙基)碳二亚胺-HCl(EDC-HCl)(118mg,0.614mmol)、4-二甲氨基吡啶(DMAP)(7.5mg,0.0614mmol)、羟基苯并三唑(HOBT)(31mg,0.203mmol)和反-4-(Boc-甲基氨甲基)环己烷羧酸(167mg,0.614mmol)全部溶解在乙腈(768μL)、二甲基甲酰胺(DMF)
(3.07mL)和二异丙基乙胺(DIEA)(122μL,0.737mmol)中。将反应物在RT下搅拌17小时。用EtOAc(100mL)稀释反应混合物,用饱和NaCl(2x 50mL)、1M柠檬酸(3x 25mL)、饱和NaHCO3(3x 25mL)和饱和NaCl(50mL)洗涤。干燥(无水Na2SO4)有机层,过滤,并在真空下蒸发。将该物质通过硅胶(25-30g)色谱法进一步纯化,使用:4个级分(200mL),由己烷、30%EtOAc的己烷溶液、40%EtOAc的己烷溶液和50%EtOAc的己烷溶液组成。合并含有产物的级分,并真空蒸发溶剂,得到固体(218mg,69.4%产率;TLCRf=0.33(40%EtOAc的己烷溶液);HPLC Rt=
5.031min)。
合成例46:MN1331
将1-异丁基-6-甲氧基-2,3,4,9-四氢-1H-吡啶并[3,4-b]吲哚(159mg,0.614mmol)、1-乙基-3-(3-二甲氨基丙基)碳二亚胺-HCl(EDC-HCl)(118mg,0.614mmol)、4-二甲氨基吡啶(DMAP)(7.5mg,0.0614mmol)、羟基苯并三唑(HOBT)(31mg,0.203mmol)和反-4-(Boc-甲基氨甲基)环己烷羧酸(167mg,0.614mmol)全部溶解在乙腈(768μL)、二甲基甲酰胺(DMF)
(3.07mL)和二异丙基乙胺(DIEA)(122μL,0.737mmol)中。将该反应物在RT下搅拌17小时。用EtOAc(100mL)稀释反应混合物,用饱和NaCl(2x 50mL)、1M柠檬酸(3x 25mL)、饱和NaHCO3(3x 25mL)和饱和NaCl(50mL)洗涤。干燥(无水Na2SO4)有机层,过滤,并在真空下蒸发。将该物质通过硅胶(25-30g)色谱法进一步纯化,使用:4个级分(200mL),由己烷、15%EtOAc的己烷溶液、25%EtOAc的己烷溶液和35%EtOAc的己烷溶液组成。合并含有产物的级分,并真空蒸发溶剂,得到固体(159mg,50.6%产率;TLC Rf=0.15(30%EtOAc的己烷溶液);HPLC Rt=
4.986min)。
合成例47:MN1332
将1-异丁基-7-甲基-2,3,4,9-四氢-1H-吡啶并[3,4-b]吲哚·HCl(171mg,
0.614mmol)、1-乙基-3-(3-二甲氨基丙基)碳二亚胺-HCl(EDC-HCl)(118mg,0.614mmol)、4-二甲氨基吡啶(DMAP)(7.5mg,0.0614mmol)、羟基苯并三唑(HOBT)(31mg,0.203mmol)和反-
4-(Boc-甲基氨甲基)环己烷羧酸(167mg,0.614mmol)全部溶解在乙腈(768μL)、二甲基甲酰胺(DMF)(3.07mL)和二异丙基乙胺(DIEA)(122μL,0.737mmol)中。将反应物在RT下搅拌17小时。用EtOAc(100mL)稀释反应混合物,用饱和NaCl(2x 50mL)、1M柠檬酸(3x 25mL)、饱和NaHCO3(3x 25mL)和饱和NaCl(50mL)洗涤。干燥(无水Na2SO4)有机层,过滤,并在真空下蒸发。将该物质通过硅胶(25-30g)色谱法进一步纯化,使用:3个级分(200mL),由20%、25%和
35%EtOAc的己烷溶液组成。合并含有产物的级分,真空下干燥溶剂,得到固体(238mg,
78.2%产率;TLC Rf=0.22(30%EtOAc的己烷溶液);HPLC Rt=5.231min);LCMS+ESI(14.555-14.672min),496.3594(M+l),518.3415(M+23);1H NMR(CDCI3,0.003%v/v TMS,
400MHz):δH 0.90-1.15(9H,m),1.46(9H,s),1.52-1.94(10H,m),2.56(1H,t),2.72-2.90(5H,m),2.97-3.21(2H,m),3.42-3.54(1H,m),4.10(1H,d),5.88(1H,q),7.05(1H,dd),
7.28-7.39(2H,m),7.97(1H,br s)。
合成例48:MN1333
将1-异丁基-6-甲基-2,3,4,9-四氢-1H-吡啶并[3,4-b]吲哚(150mg,0.614mmol)、1-乙基-3-(3-二甲氨基丙基)碳二亚胺-HCl(EDC-HCl)(118mg,0.614mmol)、4-二甲氨基吡啶(DMAP)(7.5mg,0.0614mmol)、羟基苯并三唑(HOBT)(31mg,0.203mmol)和反-4-(Boc-甲基氨甲基)环己烷羧酸(167mg,0.614mmol)全部溶解在乙腈(768μL)、二甲基甲酰胺(DMF)
(3.07mL)和二异丙基乙胺(DIEA)(122μL,0.737mmol)中。将反应物在RT下搅拌17小时。用EtOAc(100mL)稀释反应混合物,用饱和NaCl(2x 50mL)、1M柠檬酸(3x 25mL)、饱和NaHCO3(3x 25mL)和饱和NaCl(50mL)洗涤。干燥(无水Na2SO4)有机层,过滤,并在真空下蒸发。将该物质通过硅胶(25-30g)色谱法进一步纯化,使用:4个级分(200mL),由己烷、15%EtOAc的己烷溶液、25%EtOAc的己烷溶液和35%EtOAc的己烷溶液组成。合并含有产物的级分,并真空蒸发溶剂,得到固体(233mg,76.6%产率;TLCRf=0.32(30%EtOAc的己烷溶液);HPLC Rt=
5.238min)。
合成例49:MN1334
将1-异丙基-6-甲基-2,3,4,9-四氢-1H-吡啶并[3,4-b]吲哚(140mg,0.614mmol)、1-乙基-3-(3-二甲氨基丙基)碳二亚胺-HCl(EDC-HCl)(118mg,0.614mmol)、4-二甲氨基吡啶(DMAP)(7.5mg,0.0614mmol)、羟基苯并三唑(HOBT)(31mg,0.203mmol)和反-4-(Boc-甲基氨甲基)环己烷羧酸(167mg,0.614mmol)全部溶解在乙腈(768μL)、二甲基甲酰胺(DMF)
(3.07mL)和二异丙基乙胺(DIEA)(122μL,0.737mmol)中。将反应物在RT下搅拌17小时。用EtOAc(100mL)稀释反应混合物,用饱和NaCl(2x 50mL)、1M柠檬酸(3x 25mL)、饱和NaHCO3(3x 25mL)和饱和NaCl(50mL)洗涤。干燥(无水Na2SO4)有机层,过滤,并在真空下蒸发。将该物质通过硅胶(25-30g)色谱法进一步纯化,使用:4个级分(200mL),由己烷、30%EtOAc的己烷溶液、40%EtOAc的己烷溶液和50%EtOAc的己烷溶液组成。合并含有产物的级分,并真空蒸发溶剂,得到固体(191mg,64.6%产率;TLCRf=0.35(40%EtOAc的己烷溶液);HPLC Rt=
5.081min)。
合成例50:MN1335
将7-氯-异丁基-2,3,4,9-四氢-1H-吡啶并[3,4-b]吲哚(161mg,0.614mmol)、1-乙基-
3-(3-二甲氨基丙基)碳二亚胺-HCl(EDC-HCl)(118mg,0.614mmol)、4-二甲氨基吡啶(DMAP)(7.5mg,0.0614mmol)、羟基苯并三唑(HOBT)(31mg,0.203mmol)和反-4-(Boc-甲基氨甲基)环己烷羧酸(167mg,0.614mmol)全部溶解在乙腈(768μL)、二甲基甲酰胺(DMF)(3.07mL)和二异丙基乙胺(DIEA)(122μL,0.737mmol)中。将反应物在RT下搅拌17小时。用EtOAc(100mL)稀释反应混合物,用饱和NaCl(2x 50mL)、1M柠檬酸(3x 25mL)、饱和NaHCO3(3x 25mL)和饱和NaCl(50mL)洗涤。干燥(无水Na2SO4)有机层,过滤,并在真空下蒸发。将该物质通过硅胶(25-30g)色谱法进一步纯化,使用:4个级分(200mL),由己烷、15%EtOAc的己烷溶液、25%EtOAc的己烷溶液和35%EtOAc的己烷溶液组成。合并含有产物的级分,真空下干燥溶剂,得到固体(250mg,78.9%产率;TLC Rf=0.30(30%EtOAc的己烷溶液);HPLC Rt=5.282min);
LCMS+ESI(14.672-14.905min),516.3049(M+l),538.2867(M+23);1H NMR(CDCI3,0.003%v/v TMS,400MHz):δH 0.94-1.15(8H,m),1.41(9H,S),1.60-1.94(10H,m),2.55(1H,t),
2.71-2.91(5H,m),3.00-3.18(2H,m),3.48(1H,t),4.07(1H,d),5.79-5.91(1H,m),6.92
(1H,m),7.10(1H,s),7.32(1H,d),7.66(1H,br s)。
合成例51:MN1336
将6-氯-1-异丁基-2,3,4,9-四氢-1H-吡啶并[3,4-b]吲哚·TFA盐(221mg,
0.614mmol)、1-乙基-3-(3-二甲氨基丙基)碳二亚胺-HCl(EDC-HCl)(118mg,0.614mmol)、4-二甲氨基吡啶(DMAP)(7.5mg,0.0614mmol)、羟基苯并三唑(HOBT)(31mg,0.203mmol)和反-
4-(Boc-甲基氨甲基)环己烷羧酸(167mg,0.614mmol)全部溶解在乙腈(768μL)、二甲基甲酰胺(DMF)(3.07mL)和二异丙基乙胺(DIEA)(244μL,1.47mmol)中。将反应物在RT下搅拌17小时。用EtOAc(100mL)稀释反应混合物,用饱和NaCl(2x 50mL)、1M柠檬酸(3x 25mL)、饱和NaHCO3(3x 25mL)和饱和NaCl(50mL)洗涤。干燥(无水Na2SO4)有机层,过滤,并在真空下蒸发。将该物质通过硅胶(25-30g)色谱法进一步纯化,使用:己烷(200mL)冲洗,3个级分(200mL),由25%、30%和35%EtOAc的己烷溶液组成。合并含有产物的级分,并真空蒸发溶剂,得到固体(92mg,29.0%产率;TLC Rf=0.20(30%EtOAc的己烷溶液);HPLC Rt=
5.278min)。
合成例52:MN1337
将7-氟-异丁基-2,3,4,9-四氢-1H-吡啶并[3,4-b]吲哚(151mg,0.614mmol)、1-乙基-
3-(3-二甲氨基丙基)碳二亚胺-HCl(EDC-HCl)(118mg,0.614mmol)、4-二甲氨基吡啶(DMAP)(7.5mg,0.0614mmol)、羟基苯并三唑(HOBT)(31mg,0.203mmol)和反-4-(Boc-甲基氨甲基)环己烷羧酸(167mg,0.614mmol)全部溶解在乙腈(768μL)、二甲基甲酰胺(DMF)(3.07mL)和二异丙基乙胺(DIEA)(122μL,0.737mmol)中。将反应物在RT下搅拌17小时。用EtOAc(100mL)稀释反应混合物,用饱和NaCl(2x 50mL)、1M柠檬酸(3x 25mL)、饱和NaHCO3(3x 25mL)和饱和NaCl(50mL)洗涤。干燥(无水Na2SO4)有机层,过滤,并在真空下蒸发。将该物质通过硅胶(25-30g)色谱法进一步纯化,使用:4个级分(200mL),由己烷、15%EtOAc的己烷溶液、25%EtOAc的己烷溶液和35%EtOAc的己烷溶液组成。合并含有产物的级分,并真空蒸发溶剂,得到固体(159mg,51.8%产率;TLC Rf=0.28(30%EtOAc的己烷溶液);HPLC Rt=5.124min)。
合成例53:MN1338
将6-氟-1-异丁基-2,3,4,9-四氢-1H-吡啶并[3,4-b]吲哚(151mg,0.614mmol)、1-乙
基-3-(3-二甲氨基丙基)碳二亚胺-HCl(EDC-HCl)(118mg,0.614mmol)、4-二甲氨基吡啶(DMAP)(7.5mg,0.0614mmol)、羟基苯并三唑(HOBT)(31mg,0.203mmol)和反-4-(Boc-甲基氨甲基)环己烷羧酸(167mg,0.614mmol)全部溶解在乙腈(768μL)、二甲基甲酰胺(DMF)
(3.07mL)和二异丙基乙胺(DIEA)(122μL,0.737mmol)中。将反应物在RT下搅拌17小时。用EtOAc(100mL)稀释反应混合物,用饱和NaCl(2x 50mL)、1M柠檬酸(3x 25mL)、饱和NaHCO3(3x 25mL)和饱和NaCl(50mL)洗涤。干燥(无水Na2SO4)有机层,过滤,并在真空下蒸发。将该物质通过硅胶(25-30g)色谱法进一步纯化,使用:4个级分(200mL),由己烷、30%EtOAc的己烷溶液、40%EtOAc的己烷溶液和50%EtOAc的己烷溶液组成。合并含有产物的级分,并真空蒸发溶剂,得到固体(100mg,32.6%产率;TLC Rf=0.42(40%EtOAc的己烷溶液);HPLC Rt=
5.106min)。
合成例54:MN1339
将7-氟-1-异丙基-2,3,4,9-四氢-1H-吡啶并[3,4-b]吲哚(143mg,0.614mmol)、1-乙
基-3-(3-二甲氨基丙基)碳二亚胺-HCl(EDC-HCl)(118mg,0.614mmol)、4-二甲氨基吡啶(DMAP)(7.5mg,0.0614mmol)、羟基苯并三唑(HOBT)(31mg,0.203mmol)和反-4-(Boc-甲基氨甲基)环己烷羧酸(167mg,0.614mmol)全部溶解在乙腈(768μL)、二甲基甲酰胺(DMF)
(3.07mL)和二异丙基乙胺(DIEA)(122μL,0.737mmol)中。将反应物在RT下搅拌17小时。用EtOAc(100mL)稀释反应混合物,用饱和NaCl(2x 50mL)、1M柠檬酸(3x 25mL)、饱和NaHCO3(3x 25mL)和饱和NaCl(50mL)洗涤。干燥(无水Na2SO4)有机层,过滤,并在真空下蒸发。将该物质通过硅胶(25-30g)色谱法进一步纯化,使用:4个级分(200mL),由己烷、30%EtOAc的己烷溶液、40%EtOAc的己烷溶液和50%EtOAc的己烷溶液组成。合并含有产物的级分,并真空蒸发溶剂,得到固体(148mg,49.6%产率;TLC Rf=0.32(40%EtOAc的己烷溶液);HPLC Rt=
4.966min)。
合成例55:MN1340
将6-氟-1-异丙基-2,3,4,9-四氢-1H-吡啶并[3,4-b]吲哚(65mg,0.280mmol)、1-乙基-
3-(3-二甲氨基丙基)碳二亚胺-HCl(EDC-HCl)(54mg,0.280mmol)、4-二甲氨基吡啶(DMAP)(3.4mg,0.028mmol)、羟基苯并三唑(HOBT)(14mg,0.092mmol)和反-4-(Boc-甲基氨甲基)环己烷羧酸(76mg,0.280mmol)全部溶解在乙腈(350μL)、二甲基甲酰胺(DMF)(1.40mL)和二异丙基乙胺(DIEA)(56μL,0.336mmol)中。将反应物在RT下搅拌17小时。用EtOAc(100mL)稀释反应混合物,用饱和NaCl(2x 50mL)、1M柠檬酸(3x 25mL)、饱和NaHCO3(3x 25mL)和饱和NaCl(50mL)洗涤。干燥(无水Na2SO4)有机层,过滤,并在真空下蒸发。将该物质通过硅胶(25-
30g)色谱法进一步纯化,使用:4个级分(200mL),由己烷、30%EtOAc的己烷溶液、40%EtOAc的己烷溶液和50%EtOAc的己烷溶液组成。合并含有产物的级分,并真空蒸发溶剂,得到固体(94mg,69.1%产率;TLC Rf=0.28(40%EtOAc的己烷溶液);HPLC Rt=4.947min)。
合成例56:MN1341
将1-异丙基-2,3,4,9-四氢-1H-吡啶并[3,4-b]吲哚(132mg,0.614mmol)、1-乙基-3-
(3-二甲氨基丙基)碳二亚胺盐-HCl(EDC-HCl)(118mg,0.614mmol)、4-二甲氨基吡啶(DMAP)(7.5mg,0.0614mmol)、羟基苯并三唑(HOBT)(31mg,0.203mmol)和反-4-(Boc-甲基氨甲基)环己烷羧酸(167mg,0.614mmol)全部溶解在乙腈(768μL)、二甲基甲酰胺(DMF)(3.07mL)和二异丙基乙胺(DIEA)(122μL,0.737mmol)中。将反应物在RT下搅拌17小时。用EtOAc(100mL)稀释反应混合物,用饱和NaCl(2x 50mL)、1M柠檬酸(3x 25mL)、饱和NaHCO3(3x 25mL)和饱和NaCl(50mL)洗涤。干燥(无水Na2SO4)有机层,过滤,并在真空下蒸发。将该物质通过硅胶(25-30g)色谱法进一步纯化,使用:4个级分(200mL),由己烷、30%EtOAc的己烷溶液、40%EtOAc的己烷溶液和50%EtOAc的己烷溶液组成。合并含有产物的级分,并真空蒸发溶剂,得到固体(215mg,74.9%产率;TLC Rf=0.12(30%EtOAc的己烷溶液);HPLC Rt=4.928min)。
合成例57:MN1352
将1-环丙基-2,3,4,9-四氢-1H-吡啶并[3,4-b]吲哚(178mg,0.84mmol)、1-乙基-3-(3-二甲氨基丙基)碳二亚胺-HCl(EDC-HCl)(161mg,0.84mmol)、4-二甲氨基吡啶(DMAP)
(10.3mg,0.084mmol)、羟基苯并三唑(HOBT)(42mg,0.277mmol)和反-4-(Boc-甲基氨甲基)环己烷羧酸(228mg,0.84mmol)全部溶解在乙腈(1.05μL)、二甲基甲酰胺(DMF)(4.2mL)和二异丙基乙胺(DIEA)(167μL,1.01mmol)中。将反应物在RT下搅拌17小时。用EtOAc(100mL)稀释反应混合物,用饱和NaCl(2x 50mL)、1M柠檬酸(3x 25mL)、饱和NaHCO3(3x 25mL)和饱和NaCl(50mL)洗涤。干燥(无水Na2SO4)有机层,过滤,并在真空下蒸发。将该物质通过硅胶(25-
30g)色谱法进一步纯化,使用:4个级分(200mL),由己烷、25%EtOAc的己烷溶液、35%EtOAc的己烷溶液和45%EtOAc的己烷溶液组成。合并含有产物的级分,并真空蒸发溶剂,得到固体(316mg,80.8%产率;TLC Rf=0.27(40%EtOAc的己烷溶液);HPLC Rt=4.851min)。
合成例58:MN1353
将1-环丁基-2,3,4,9-四氢-1H-吡啶并[3,4-b]吲哚(190mg,0.84mmol)、1-乙基-3-(3-二甲氨基丙基)碳二亚胺-HCl(EDC-HCl)(161mg,0.84mmol)、4-二甲氨基吡啶(DMAP)
(10.3mg,0.084mmol)、羟基苯并三唑(HOBT)(42mg,0.277mmol)和反-4-(Boc-甲基氨甲基)环己烷羧酸(228mg,0.84mmol)全部溶解在乙腈(1.05μL)、二甲基甲酰胺(DMF)(4.2mL)和二异丙基乙胺(DIEA)(167μL,1.01mmol)中。将反应物在RT下搅拌17小时。用EtOAc(100mL)稀释反应混合物,用饱和NaCl(2x 50mL)、1M柠檬酸(3x 25mL)、饱和NaHCO3(3x 25mL)和饱和NaCl(50mL)洗涤。干燥(无水Na2SO4)有机层,过滤,并在真空下蒸发。将该物质通过硅胶(25-
30g)色谱法进一步纯化,使用:4个级分(200mL),由己烷、25%EtOAc的己烷溶液、30%EtOAc的己烷溶液和40%EtOAc的己烷溶液组成。合并含有产物的级分,并真空蒸发溶剂,得到固体(370mg,75.7%产率;TLC Rf=0.32(40%EtOAc的己烷溶液);HPLC Rt=5.002min)。
合成例59:MN1355中间体
将色胺(4.00g,25.0mmol)溶解在10%水的MeOH溶液中(总共25mL)。经由注射器添加丙醛(2.7mL,37.4mmol),然后通过注射剂缓慢添加浓H2SO4(1.4mL)(当心放热)。将反应物回流过夜。将反应物冷却至室温,用
氢氧化铵碱化,得到固体。将该固体收集在漏斗上并用己烷(2x15 mL)洗涤,再用乙醚(2x20 mL)洗涤。蒸发滤液,得到粗产物,将其溶于EtOAc(20mL)中并过滤。蒸发滤液并将剩余物溶于Et2O(20mL)中,通过0.45um PTFE过滤,蒸发,得到2.0g固体。
合成例59:MN1355
将1-乙基-2,3,4,9-四氢-1H-吡啶并[3,4-b]吲哚(168mg,0.84mmol)、1-乙基-3-(3-二甲氨基丙基)碳二亚胺-HCl(EDC-HCl)(161mg,0.84mmol)、4-二甲氨基吡啶(DMAP)(10.3mg,
0.084mmol)、羟基苯并三唑(HOBT)(42mg,0.277mmol)和反-4-(Boc-甲基氨甲基)环己烷羧酸(228mg,0.84mmol)全部溶解在乙腈(1.05mL)、二甲基甲酰胺(DMF)(4.2mL)和二异丙基乙胺(DIEA)(167μL,1.01mmol)中。将反应物在RT下搅拌17小时。用EtOAc(100mL)稀释反应混合物,用饱和NaCl(2x 50mL)、1M柠檬酸(3x 25mL)、饱和NaHCO3(3x 25mL)和饱和NaCl(50mL)洗涤。干燥(无水Na2SO4)有机层,过滤,并在真空下蒸发。将该物质通过硅胶(25-30g)色谱法进一步纯化,使用:4个级分(200mL),由己烷、30%EtOAc的己烷溶液、40%EtOAc的己烷溶液和50%EtOAc的己烷溶液组成。合并含有产物的级分,并真空蒸发溶剂,得到固体(229mg,60.1%产率;TLC Rf=0.21(40%EtOAc的己烷溶液);HPLC Rt=4.812min)。
合成例60:MN1356
将1-异丁基-8-甲基-2,3,4,9-四氢-1H-吡啶并[3,4-b]吲哚(204mg,0.84mmol)、1-乙
基-3-(3-二甲氨基丙基)碳二亚胺-HCl(EDC-HCl)(161mg,0.84mmol)、4-二甲氨基吡啶(DMAP)(10.3mg,0.084mmol)、羟基苯并三唑(HOBT)(42mg,0.277mmol)和反-4-(Boc-甲基氨甲基)环己烷羧酸(228mg,0.84mmol)全部溶解在乙腈(1.05mL)、二甲基甲酰胺(DMF)
(4.2mL)和二异丙基乙胺(DIEA)(167μL,1.01mmol)中。将反应物在RT下搅拌17小时。用EtOAc(100mL)稀释反应混合物,用饱和NaCl(2x 50mL)、1M柠檬酸(3x 25mL)、饱和NaHCO3(3x 25mL)和饱和NaCl(50mL)洗涤。干燥(无水Na2SO4)有机层,过滤,并在真空下蒸发。将该物质通过硅胶(25-30g)色谱法进一步纯化,使用:4个级分(200mL),由己烷、20%EtOAc的己烷溶液、25%EtOAc的己烷溶液和35%EtOAc的己烷溶液组成。合并含有产物的级分,并真空蒸发溶剂,得到固体(266mg,63.9%产率;TLC Rf=0.22(30%EtOAc的己烷溶液);HPLC Rt=
5.247min)。
合成例61:MN1357
将1-异丁基-5-甲基-2,3,4,9-四氢-1H-吡啶并[3,4-b]吲哚(204mg,0.84mmol)、1-乙
基-3-(3-二甲氨基丙基)碳二亚胺-HCl(EDC-HCl)(161mg,0.84mmol)、4-二甲氨基吡啶(DMAP)(10.3mg,0.084mmol)、羟基苯并三唑(HOBT)(42mg,0.277mmol)和反-4-(Boc-甲基氨甲基)环己烷羧酸(228mg,0.84mmol)全部溶解在乙腈(1.05mL)、二甲基甲酰胺(DMF)
(4.2mL)和二异丙基乙胺(DIEA)(167μL,1.01mmol)中。将反应物在RT下搅拌17小时。用EtOAc(100mL)稀释反应混合物,用饱和NaCl(2x 50mL)、1M柠檬酸(3x 25mL)、饱和NaHCO3(3x 25mL)和饱和NaCl(50mL)洗涤。干燥(无水Na2SO4)有机层,过滤,并在真空下蒸发。将该物质通过硅胶(25-30g)色谱法进一步纯化,使用:4个级分(200mL),由己烷、20%EtOAc的己烷溶液、25%EtOAc的己烷溶液和35%EtOAc的己烷溶液组成。合并含有产物的级分,并真空蒸发溶剂,得到固体(370mg,88.9%产率;TLC Rf=0.22(30%EtOAc的己烷溶液);HPLC Rt=
5.197min)。
合成例62:MN1358
将1-异丁基-9-甲基-2,3,4,9-四氢-1H-吡啶并[3,4-b]吲哚(204mg,0.84mmol)、1-乙
基-3-(3-二甲氨基丙基)碳二亚胺-HCl(EDC-HCl)(161mg,0.84mmol)、4-二甲氨基吡啶(DMAP)(10.3mg,0.084mmol)、羟基苯并三唑(HOBT)(42mg,0.277mmol)和反-4-(Boc-甲基氨甲基)环己烷羧酸(228mg,0.84mmol)全部溶解在乙腈(1.05mL)、二甲基甲酰胺(DMF)
(4.2mL)和二异丙基乙胺(DIEA)(167μL,1.01mmol)中。将反应物在RT下搅拌17小时。用EtOAc(100mL)稀释反应混合物,用饱和NaCl(2x 50mL)、1M柠檬酸(3x 25mL)、饱和NaHCO3(3x 25mL)和饱和NaCl(50mL)洗涤。干燥(无水Na2SO4)有机层,过滤,并在真空下蒸发。将该物质通过硅胶(25-30g)色谱法进一步纯化,使用:4个级分(200mL),由己烷、20%EtOAc的己烷溶液、25%EtOAc的己烷溶液和35%EtOAc的己烷溶液组成。合并含有产物的级分,并真空蒸发溶剂,得到固体(327mg,78.5%产率;TLC Rf=0.31(30%EtOAc的己烷溶液);HPLC Rt=
5.312min)。
合成例63:MN1359
将8-氯-1-异丁基-2,3,4,9-四氢-1H-吡啶并[3,4-b]吲哚·TFA盐(168mg,0.84mmol)、
1-乙基-3-(3-二甲氨基丙基)碳二亚胺-HCl(EDC-HCl)(81mg,0.42mmol)、4-二甲氨基吡啶(DMAP)(5.1mg,0.042mmol)、羟基苯并三唑(HOBT)(21mg,0.139mmol)和反-4-(Boc-甲基氨甲基)环己烷羧酸(114mg,0.42mmol)全部溶解在乙腈(525μL)、二甲基甲酰胺(DMF)(2.1mL)和二异丙基乙胺(DIEA)(83μL,0.50mmol)中。将反应物在RT下搅拌17小时。用EtOAc(100mL)稀释反应混合物,用饱和NaCl(2x 50mL)、1M柠檬酸(3x 25mL)、饱和NaHCO3(3x 25mL)和饱和NaCl(50mL)洗涤。干燥(无水Na2SO4)有机层,过滤,并在真空下蒸发。将该物质通过硅胶(25-30g)色谱法进一步纯化,使用:4个级分(200mL),由己烷、20%EtOAc的己烷溶液、25%EtOAc的己烷溶液和35%EtOAc的己烷溶液组成。合并含有产物的级分,并真空蒸发溶剂,得到固体(183mg,84.4%产率;TLC Rf=0.32(30%EtOAc的己烷溶液);HPLC Rt=5.321min)。
合成例64:MN1360
将5-氯-1-异丁基-2,3,4,9-四氢-1H-吡啶并[3,4-b]吲哚·TFA盐(158mg,0.42mmol)、
1-乙基-3-(3-二甲氨基丙基)碳二亚胺-HCl(EDC-HCl)(81mg,0.42mmol)、4-二甲氨基吡啶(DMAP)(5.1mg,0.042mmol)、羟基苯并三唑(HOBT)(21mg,0.139mmol)和反-4-(Boc-甲基氨甲基)环己烷羧酸(114mg,0.42mmol)全部溶解在乙腈(525μL)、二甲基甲酰胺(DMF)(2.1mL)和二异丙基乙胺(DIEA)(83μL,0.50mmol)中。将反应物在RT下搅拌17小时。用EtOAc(100mL)稀释反应混合物,用饱和NaCl(2x 50mL)、1M柠檬酸(3x 25mL)、饱和NaHCO3(3x 25mL)和饱和NaCl(50mL)洗涤。干燥(无水Na2SO4)有机层,过滤,并在真空下蒸发。将该物质通过硅胶(25-30g)色谱法进一步纯化,使用:4个级分(200mL),由己烷、20%EtOAc的己烷溶液、25%EtOAc的己烷溶液和35%EtOAc的己烷溶液组成。合并含有产物的级分,并真空蒸发溶剂,得到固体(135mg,62.3%产率;TLC Rf=0.19(30%EtOAc的己烷溶液);HPLC Rt=5.327min)。
62.3%yield;TLC Rf=0.19(30%EtOAc in Hexane);HPLC Rt=5.327min).
合成例65:MN1369
将Boc-N-甲基-氨甲环酸(176mg,0.65mmol)和四甲基氟代脲六氟磷酸酯(TFFH)
(198mg,0.75mmol)溶解在1,2-二氯乙烷(DCE)(2.25mL)和二异丙基乙胺(DIEA)(372uL,
2.25mmol)。将其在室温下搅拌30分钟,然后加入1-异丁基-2,3,4,9-四氢-1H-吡啶并[3,4-b]吲哚-3-羧酸甲酯(143mg,0.5mmol)。将反应物在80℃下回流1小时,然后加入Boc-N-甲基-氨甲环酸(176mg,0.65mmol)、四甲基氟代脲六氟磷酸酯(TFFH)(198mg,0.75mmol)、二异丙基乙胺(372uL,2.25mmol)和1,2-二氯乙烷(2.25mL)。将其在80℃回流1.5小时,然后与甲苯(3x 50mL)共沸。通过硅胶色谱法进一步纯化粗产物:回收产物为固体(141mg,52%)。
合成例65:MN1342
将色胺(801mg,5mmol)溶于1,1,1,3,3,3-六氟异丙醇(HFIP)(8mL)中,然后通过注射器添加环丙烷甲醛(415uL,5.5mmol)。将反应物回流过夜。真空浓缩所得物并与CHCl3(3x
50mL)共沸。将所得粗产物用己烷(2x 10mL)研磨,并将固体收集在
过滤器上(899mg,85%)。
合成例66:MN1362(EDC偶联)
将L-1,2,3,4-四氢-B-咔啉-3-羧酸甲酯·HCl(267mg,1.00mmol)、4-二甲氨基吡啶
(DMAP)(12mg,0.1mmol)、羟基苯并三唑(HOBT)(51mg,0.33mmol)和反-4-(Boc-甲基氨甲基)环己烷羧酸(271mg,1.00mmol)全部溶解在乙腈(1.25mL)、二甲基甲酰胺(DMF)(5mL)和二异丙基乙胺(DIEA)(396μL,2.4mmol)中。将反应物在RT下搅拌17小时。用EtOAc(100mL)稀释反应混合物,用饱和NaCl(2x 50mL)、1M柠檬酸(3x 25mL)、饱和NaHCO3(3x 25mL)和饱和NaCl(50mL)洗涤。干燥(无水Na2SO4)有机层,过滤,并在真空下蒸发。将该物质通过硅胶(25-30g)色谱法进一步纯化,使用:由己烷和EtOAc的己烷溶液组成的级分(200mL)。合并含有产物的级分,并真空蒸发溶剂,得到固体(280mg,57.9%产率;TLCRf=0.14(40%EtOAc的己烷溶液);HPLC Rt=4.507min)。
合成例67:MN1363(EDC偶联)
将2-(2,3,4,9-四氢-1H-茚并[2,1-c]吡啶-1-基)乙酸乙酯·HCl(160mg,0.42mmol)、
1-乙基-3-(3-二甲氨基丙基)碳二亚胺盐-HCl(EDC-HCl)(81mg,0.42mmol)、4-二甲氨基吡啶(DMAP)(5.1mg,0.042mmol)、羟基苯并三唑(HOBT)(21mg,0.139mmol)和反-4-(Boc-甲基氨甲基)环己烷羧酸(114mg,0.42mmol)全部溶解在乙腈(525μL)、二甲基甲酰胺(DMF)(2.1mL)和二异丙基乙胺(DIEA)(83μL,0.50mmol)中。将反应物在RT下搅拌17小时。用EtOAc(100mL)稀释反应混合物,用饱和NaCl(2x 50mL)、1M柠檬酸(3x 25mL)、饱和NaHCO3(3x
25mL)和饱和NaCl(50mL)洗涤。干燥(无水Na2SO4)有机层,过滤,并在真空下蒸发。将该物质通过硅胶(25-30g)色谱法进一步纯化,使用:4个级分(200mL),由己烷、35%EtOAc的己烷溶液、45%EtOAc的己烷溶液和65%EtOAc的己烷溶液组成。合并含有产物的级分,并真空蒸发溶剂,得到固体(116mg,54.1%产率;TLC Rf=0.20(40%EtOAc的己烷溶液);HPLC Rt=
4.846min)。
合成例68:中间体(HFIP环化)
将6-甲基色胺(380mg,2.18mmol)溶解在1,1,1,3,3,3-六氟异丙醇(3.5mL)中。通过注
射器添加环丙烷甲醛(96μL,2.62mmol)。将反应物置于60℃的
铝加热
块中16小时。真空除去溶剂并与CHCl3(3x 50mL)共沸。过滤产物,真空干燥,得到固体(413mg,83.7%产率;TLC Rf=0.23(5%MeOH的CH2Cl2溶液+1%NH3);HPLC Rt=2.942min。
合成例69:中间体(HFIP环化)
将6-氯色胺(424mg,2.18mmol)溶解在1,1,1,3,3,3-六氟异丙醇(3.5mL)中。通过注射
器添加环丙烷甲醛(196μL,2.62mmol)。将反应物置于60℃的铝加热块中16小时。真空除去溶剂并与CHCl3(3x 50mL)共沸。过滤产物,真空干燥,得到固体(414mg,77.0%产率;TLC Rf=0.20(5%MeOH的CH2Cl2溶液+1%NH3);HPLC Rt=3.102min。
合成例70:中间体(HFIP环化)
将6-甲基色胺(370mg,2.12mmol)溶解在HFIP(3.4mL)中。加入异丁醛,并将反应物在60℃下回流16小时。将反应物在真空下浓缩并与CHCl3(3x 50mL)共沸。过滤所得物并真空干燥,得到固体(164mg,29.2%产率;TLC Rf=0.20(5%MeOH的CH2Cl2溶液+1%NH3);HPLC Rt=
3.095min。
合成例71:中间体(TFA环化)
将6-氯色胺(500mg,2.57mmol)溶解在CH2Cl2(21mL)中。通过注射器将异丁醛(234uL,
2.57mmol)加入溶液中,并将混合物置于
干冰丙醇浴中5min。在6min内将TFA(1.97mL,
25.7mmol)滴加到反应混合物中,然后从冰浴中移出并允许其温热至RT。将反应物与甲苯(3x 50mL)共沸并用乙醚(5x 10mL)研磨,得到白色固体(793mg,85.1%产率;TLC Rf=0.25(5%MeOH的CH2Cl2溶液+1%NH3);HPLC Rt=3.156min)。
合成例72:中间体(HFIP环化)
将5-甲基色胺(172mg,1.00mmol)溶解在1,1,1,3,3,3-六氟异丙醇(1.6mL)中。通过注
射器添加环丙烷甲醛(90μL,1.0mmol)。16hr后,真空除去溶剂,并将所得固体与CHCl3(3x
50mL)共沸。将固体溶解在EtOH(5mL)和Et2O(60mL)中,将1N HCl的Et2O溶液(1.2mL)加入溶液。过滤产物,真空干燥,得到固体(138mg,61.0%产率;TLC Rf=0.21(5%MeOH的CH2Cl2溶液+1%NH3);HPLC Rt=2.910min。
合成例73:MN1369(使用TFFH的替代偶联方法)
将1-异丁基-2,3,4,9-四氢-1H-茚并[2,l-c]吡啶-3-羧酸甲酯(143mg,0.50mmol)、反-
4-(Boc-甲基氨基甲基)环己烷羧酸(352mg,1.30mmol)和四甲基氟代脲六氟磷酸酯(TFFH)(396mg,1.50mmol)溶解在1,2-二氯乙烷(DCE)(4.50mL)和二异丙基乙胺(DIEA)(744uL,
4.50mmol)中并搅拌90分钟。将反应混合物与甲苯(3x 50mL)共沸。将该物质通过硅胶(25-
30g)色谱法进一步纯化,使用:5个级分(200mL),由CH2Cl2、6%EtOAc的CH2Cl2溶液、10%EtOAc的CH2Cl2溶液、15%EtOAc的CH2Cl2溶液和20%EtOAc的CH2Cl2溶液组成。合并含有产物的级分,并真空蒸发溶剂,得到固体(190mg)。将该物质通过硅胶(25-30g)色谱法进一步纯化,使用:6个级分(200mL),由己烷、25%EtOAc的己烷溶液、30%EtOAc的己烷溶液、35%EtOAc的己烷溶液、40%EtOAc的己烷溶液和65%EtOAc的己烷溶液组成。合并含有产物的级分,并真空蒸发溶剂,得到固体(141mg,52.3%产率;TLCRf=0.29(40%EtOAc的己烷溶液);
HPLC Rt=4.910min)。
合成例74:MN1370(酯
水解)
将2-(2-(反-4-((叔丁氧基羰基(甲基)氨基)甲基)环己烷羰基)-2,3,4,9-四氢-1H-吡
啶并[3,4-b]吲哚-1-基)乙酸乙酯(77mg,0.15mmol)溶解在MeOH(2.76mL)中,并通过注射器将H2O(800uL)添加到混合物中。将LiOH(32mg,0.75mmol)加入到混合物中。1hr后通过HPLC认定反应完成,并在真空下蒸发溶剂。在H2O(25mL)中溶解固体,用乙醚(4x 50mL)洗涤。用
1N HCl(5mL)酸化水层。用CH2Cl2(4x 50mL)萃取产物,干燥(无水MgSO4),过滤,并真空蒸发,得到固体(66mg,91%产率;TLC Rf=0.17(2%MeOH的CH2Cl2溶液+1%HOAc);HPLC Rt=
4.373min)。
合成例75:MN1371(酯水解)
将2-(反-4-((叔丁氧基羰基(甲基)氨基)甲基)环己烷羰基)-1-异丁基-2,3,4,9-四
氢-1H-吡啶并[3,4-b]吲哚-3-羧酸甲酯(81mg,0.15mmol)溶解在MeOH(4.76mL)中,并通过注射器将H2O(800uL)添加到混合物中。将LiOH(32mg,0.75mmol)和二甲基甲酰胺(DMF)(2mL)加入到混合物中。23hr后通过HPLC认定反应完成,并在
通风橱下蒸发溶剂。在H2O(35mL)中溶解固体,用乙醚(4x 50mL)洗涤。用1N HCl(7mL)酸化水层。用CH2Cl2(4x 50mL)萃取产物,干燥(无水MgSO4),过滤,并真空蒸发,得到固体(66mg,74%产率;TLC Rf=0.36(2%MeOH的CH2Cl2溶液+1%HOAc);HPLC Rt=4.506min)。
合成例76:MN1372(酯水解)
将2-(反-4-((叔丁氧基羰基(甲基)氨基)甲基)环己烷羰基)-2,3,4,9-四氢-1H-吡啶
并[3,4-b]吲哚-3-羧酸甲酯(73mg,0.15mmol)溶解在MeOH(2.76mL)中,并通过注射器将H2O(800uL)添加到混合物中。将LiOH(32mg,0.75mmol)加入到混合物中。1hr后通过HPLC认定反应完成,并在真空下蒸发溶剂。在H2O(25mL)中溶解固体,用乙醚(4x 50mL)洗涤。用1N HCl(5mL)酸化水层。用CH2Cl2(4x 50mL)萃取产物,干燥(无水MgSO4),过滤,并真空蒸发,得到固体(63mg,89%产率;TLC Rf=0.15(2%MeOH的CH2Cl2溶液+1%HOAc溶液);HPLC Rt=
4.216min)。
合成例77:中间体(H2SO4环化)
将6-氯色胺(389mg,2.00mmol)溶解在10%水的MeOH溶液中(2mL)。通过注射器加入丙
醛(216uL mL,3.00mmol),然后通过注射器缓慢加入浓H2SO4(1.4mL)。将反应物回流17hr。将反应物冷却至室温,然后用氢氧化铵碱化,得到固体。用己烷(2x 15mL)和Et2O(2x 20mL)研磨溶液。过滤所得物并蒸发滤液。将所得固体溶解在EtOAc(20mL)中并过滤。将滤液溶于Et2O(15mL)中,用0.45umPTFE过滤,并在通风橱下干燥。在
氨水(3mL)中溶解所得物并用EtOAc(2x 10mL)萃取。用EtOAc(8mL)萃取产物,并用H2O(3mL)、1N NaOH(1mL)和饱和NaCl(3mL)洗涤。干燥所得物,过滤,并在真空下除去溶剂。将固体溶解在乙醚(10mL)中并过滤。
蒸发滤液,得到固体(161mg,34.3%产率;TLC Rf=0.19(5%MeOH的CH2Cl2溶液+1%NH3);
HPLC Rt=3.071min)。
合成例78:中间体(TFA环化)
将6-甲基色胺(360.7mg,2.07mmol)溶解在CH2Cl2(16mL)中。搅拌混合物,同时通过注射器加入丙醛(180uL,2.48mmol),使溶液变澄清。将反应混合物在干冰/2-丙醇浴中冷却
5min,然后在8min内通过注射器滴加10%TFA的CH2Cl2溶液(4.76mL)。将反应物搅拌17hr,并使其缓慢温热至RT。浓缩混合物并真空干燥,得到棕色固体。用ACN(2x 2mL)和EtOAc(2mL)研磨所得物。在过滤器上收集固体并真空干燥,得到灰白色固体(395mg,61.3%产率;TLC Rf=0.14(5%MeOH的CH2Cl2溶液+1%NH3);HPLC Rt=2.933min。
合成例79:中间体(TFA环化)
将4-甲基色胺(348mg,2.00mmol)溶解在CH2Cl2(16mL)中。搅拌混合物,同时通过注射器加入丙醛(174uL,2.40mmol),使溶液变澄清并搅拌5min。将反应混合物在干冰丙醇浴中冷却5min,然后在8min内通过注射器滴加10%TFA的CH2Cl2溶液(4.6mL)。将反应物搅拌
17hr,并允许其缓慢温热至RT。浓缩混合物并真空干燥,得到棕色固体。用乙醚(25x 10mL)和ACN(10mL)研磨所得物。在过滤器上收集固体并真空干燥,得到灰白色固体(443mg,103%产率;TLC Rf=0.14(5%MeOH的CH2Cl2溶液+1%NH3);HPLC Rt=2.916min。
合成例80:中间体(TFA环化)
将4-甲基色胺(174mg,1.00mmol)溶解在CH2Cl2(8mL)中。将异丁醛(90uL,1.0mmol)加入溶液中,并将混合物置于干冰/2-丙醇浴中5min。在2min内将TFA(765uL,10mmol)滴加到反应混合物中。从干冰浴中移出反应物,并允许其温热至RT 1hr。真空除去溶剂并真空干燥所得红色油状物质。将所得物与甲苯(3x 50mL)共沸并用Et2O(2x 6mL)和ACN研磨,得到固体(183mg,56.2%产率;TLCRf=0.26(5%MeOH的CH2Cl2溶液+1%NH3);HPLC Rt=3.009min)。
合成例81:MN1377(EDC偶联)
将7-氯-1-异丙基-2,3,4,9-四氢-1H-吡啶并[3,4-b]吲哚·TFA盐(181mg,0.50mmol)、
1-乙基-3-(3-二甲氨基丙基)碳二亚胺-HCl(EDC-HCl)(96mg,0.50mmol)、4-二甲氨基吡啶(DMAP)(6mg,0.05mmol)、羟基苯并三唑(HOBT)(51mg,0.165mmol)和反-4-(Boc-甲基氨甲基)环己烷羧酸(136mg,0.50mmol)全部溶解在乙腈(625μL)、二甲基甲酰胺(DMF)(2.5mL)和二异丙基乙胺(DIEA)(100uL,0.60mmol)中。将反应物在RT下搅拌17小时。用EtOAc(100mL)稀释反应混合物,用饱和NaCl(2x 50mL)、1M柠檬酸(3x 25mL)、饱和NaHCO3(3x 25mL)和饱和NaCl(50mL)洗涤。干燥(无水Na2SO4)有机层,过滤,并在真空下蒸发。将该物质通过硅胶(25-30g)色谱法进一步纯化,使用:4个级分(200mL),由己烷、30%EtOAc的己烷溶液、40%EtOAc的己烷溶液和45%EtOAc的己烷溶液组成。合并含有产物的级分,并真空蒸发溶剂,得到固体(200mg,79.7%产率;TLC Rf=0.29(40%EtOAc的己烷溶液);HPLC Rt=5.103min)。
合成例82:MN1378(EDC偶联)
将7-氯-1-乙基-2,3,4,9-四氢-1H-吡啶并[3,4-b]吲哚(117mg,0.50mmol)、1-乙基-3-(3-二甲氨基丙基)碳二亚胺-HCl(EDC-HCl)(96mg,0.50mmol)、4-二甲氨基吡啶(DMAP)(6mg,0.05mmol)、羟基苯并三唑(HOBT)(51mg,0.165mmol)和反-4-(Boc-甲基氨甲基)环己烷羧酸(136mg,0.50mmol)全部溶解在乙腈(625μL)、二甲基甲酰胺(DMF)(2.5mL)和二异丙基乙胺(DIEA)(100uL,0.60mmol)中。将反应物在RT下搅拌17小时。用EtOAc(100mL)稀释反应混合物,用饱和NaCl(2x 50mL)、1M柠檬酸(3x 25mL)、饱和NaHCO3(3x 25mL)和饱和NaCl(50mL)洗涤。干燥(无水Na2SO4)有机层,过滤,并在真空下蒸发。将该物质通过硅胶(25-30g)色谱法进一步纯化,使用:4个级分(200mL),由己烷、30%EtOAc的己烷溶液、40%EtOAc的己烷溶液和45%EtOAc的己烷溶液组成。合并含有产物的级分,并真空蒸发溶剂,得到固体(187mg,76.6%产率;TLC Rf=0.18(40%EtOAc的己烷溶液);HPLC Rt=4.978min)。
合成例83:MN1379(EDC偶联)
将7-氯-1-环丙基-2,3,4,9-四氢-1H-吡啶并[3,4-b]吲哚(123mg,0.50mmol)、1-乙基-
3-(3-二甲氨基丙基)碳二亚胺-HCl(EDC-HCl)(96mg,0.50mmol)、4-二甲氨基吡啶(DMAP)(6mg,0.05mmol)、羟基苯并三唑(HOBT)(51mg,0.165mmol)和反-4-(Boc-甲基氨甲基)环己烷羧酸(136mg,0.50mmol)全部溶解在乙腈(625uL)、二甲基甲酰胺(DMF)(2.5mL)和二异丙基乙胺(DIEA)(100uL,0.60mmol)中。将反应物在RT下搅拌17小时。用EtOAc(100mL)稀释反应混合物,用饱和NaCl(2x 50mL)、1M柠檬酸(3x 25mL)、饱和NaHCO3(3x 25mL)和饱和NaCl(50mL)洗涤。干燥(无水Na2SO4)有机层,过滤,并在真空下蒸发。将该物质通过硅胶(25-30g)色谱法进一步纯化,使用:4个级分(200mL),由己烷、30%EtOAc的己烷溶液、40%EtOAc的己烷溶液和45%EtOAc的己烷溶液组成。合并含有产物的级分,并真空蒸发溶剂,得到固体(128mg,51.2%产率;TLC Rf=0.23(40%EtOAc的己烷溶液);HPLC Rt=5.008min)。
合成例84:MN1380(EDC偶联)
将1-异丙基-7-甲基-2,3,4,9-四氢-1H-吡啶并[3,4-b]吲哚·HC1(132mg,0.50mmol)、
1-乙基-3-(3-二甲氨基丙基)碳二亚胺-HCl(EDC-HCl)(96mg,0.50mmol)、4-二甲氨基吡啶(DMAP)(6mg,0.05mmol)、羟基苯并三唑(HOBT)(51mg,0.165mmol)和反-4-(Boc-甲基氨甲基)环己烷羧酸(136mg,0.50mmol)全部溶解在乙腈(625uL)、二甲基甲酰胺(DMF)(2.5mL)和二异丙基乙胺(DIEA)(200uL,1.20mmol)中。将反应物在RT下搅拌17小时。用EtOAc(100mL)稀释反应混合物,用饱和NaCl(2x 50mL)、1M柠檬酸(3x 25mL)、饱和NaHCO3(3x 25mL)和饱和NaCl(50mL)洗涤。干燥(无水Na2SO4)有机层,过滤,并在真空下蒸发。将该物质通过硅胶(25-30g)色谱法进一步纯化,使用:4个级分(200mL),由己烷、32%EtOAc的己烷溶液、42%EtOAc的己烷溶液和65%EtOAc的己烷溶液组成。合并含有产物的级分,并真空蒸发溶剂,得到固体(200mg,83.0%产率;TLC Rf=0.25(40%EtOAc的己烷溶液);HPLC Rt=5.034min)。
合成例85:MN1381(EDC偶联)
将1-乙基-7-甲基-2,3,4,9-四氢-1H-吡啶并[3,4-b]吲哚·TFA盐(164mg,0.50mmol)、
1-乙基-3-(3-二甲氨基丙基)碳二亚胺-HCl(EDC-HCl)(96mg,0.50mmol)、4-二甲氨基吡啶(DMAP)(6mg,0.05mmol)、羟基苯并三唑(HOBT)(51mg,0.165mmol)和反-4-(Boc-甲基氨甲基)环己烷羧酸(136mg,0.50mmol)全部溶解在乙腈(625uL)、二甲基甲酰胺(DMF)(2.5mL)和二异丙基乙胺(DIEA)(100uL,0.60mmol)中。将反应物在RT下搅拌17小时。用EtOAc(100mL)稀释反应混合物,用饱和NaCl(2x 50mL)、1M柠檬酸(3x 25mL)、饱和NaHCO3(3x 25mL)和饱和NaCl(50mL)洗涤。干燥(无水Na2SO4)有机层,过滤,并在真空下蒸发。将该物质通过硅胶(25-30g)色谱法进一步纯化,使用:4个级分(200mL),由己烷、32%EtOAc的己烷溶液、42%EtOAc的己烷溶液和50%EtOAc的己烷溶液组成。合并含有产物的级分,并真空蒸发溶剂,得到固体(202mg,86.4%产率;TLC Rf=0.21(40%EtOAc的己烷溶液);HPLC Rt=4.913min)。
合成例86:MN1382(EDC偶联)
将1-环丙基-7-甲基-2,3,4,9-四氢-1H-吡啶并[3,4-b]吲哚(113mg,0.50mmol)、1-乙
基-3-(3-二甲氨基丙基)碳二亚胺-HCl(EDC-HCl)(96mg,0.50mmol)、4-二甲氨基吡啶
(DMAP)(6mg,0.05mmol)、羟基苯并三唑(HOBT)(51mg,0.165mmol)和反-4-(Boc-甲基氨甲基)环己烷羧酸(136mg,0.50mmol)全部溶解在乙腈(625uL)、二甲基甲酰胺(DMF)(2.5mL)和二异丙基乙胺(DIEA)(100uL,0.60mmol)中。将反应物在RT下搅拌17小时。用EtOAc(100mL)稀释反应混合物,用饱和NaCl(2x 50mL)、1M柠檬酸(3x 25mL)、饱和NaHCO3(3x 25mL)和饱和NaCl(50mL)洗涤。干燥(无水Na2SO4)有机层,过滤,并在真空下蒸发。将该物质通过硅胶(25-30g)色谱法进一步纯化,使用:4个级分(200mL),由己烷、32%EtOAc的己烷溶液、42%EtOAc的己烷溶液和50%EtOAc的己烷溶液组成。合并含有产物的级分,并真空蒸发溶剂,得到固体(217mg,90.5%产率;TLC Rf=0.26(40%EtOAc的己烷溶液);HPLC Rt=4.939min)。
合成例:MN1376中间体(TFA环化)
将4-甲基色胺(174mg,1.00mmol)溶解在CH2Cl2(8mL)中。搅拌混合物,同时通过注射器加入异丁醛(91uL,1.00mmol),使溶液变澄清并搅拌5min。将反应混合物在干冰丙醇浴中冷却5min,然后在2min内通过注射器滴加三氟乙酸(765uL,10.00mmol)。将反应物搅拌1hr,并允许其缓慢温热至RT。浓缩混合物并真空干燥,得到红色固体。将所得物与甲苯(3x 50mL)共沸,并与乙醚(2x 6mL)和ACN(10mL)一起研磨。在过滤器上收集固体并真空干燥,得到1-异丙基-5-甲基-2,3,4,9-四氢-1H-吡啶并[3,4-b]吲哚(183mg,56.2%产率;TLC Rf=0.71(20%MeOH的CH2Cl2溶液+1%NH3);HPLC Rt=3.064min。
合成例:MN1383(EDC偶联)
将1-异丙基-5-甲基-2,3,4,9-四氢-1H-吡啶并[3,4-b]吲哚(171mg,0.50mmol)、1-乙
基-3-(3-二甲氨基丙基)碳二亚胺-HCl(EDC-HCl)(96mg,0.50mmol)、4-二甲氨基吡啶
(DMAP)(6mg,0.05mmol)、羟基苯并三唑(HOBT)(25mg,0.165mmol)和反-4-(Boc-甲基氨甲基)环己烷羧酸(136mg,0.50mmol)全部溶解在乙腈(625uL)、二甲基甲酰胺(DMF)(2.5mL)和二异丙基乙胺(DIEA)(100uL,0.60mmol)中。将反应物在RT下搅拌17小时。用EtOAc(100mL)稀释反应混合物,用饱和NaCl(2x 50mL)、1M柠檬酸(3x 25mL)、饱和NaHCO3(3x 25mL)和饱和NaCl(50mL)洗涤。干燥(无水Na2SO4)有机层,过滤,并在真空下蒸发。将该物质通过硅胶(25-30g)色谱法进一步纯化,使用:3个级分(200mL),由己烷、32%EtOAc的己烷溶液、42%EtOAc的己烷溶液和50%EtOAc的己烷溶液组成。合并含有产物的级分,并真空蒸发溶剂,得到固体(155mg,64.4%产率;TLC Rf=0.28(40%EtOAc的己烷溶液);HPLC Rt=4.993min)。
合成例88:MN1384(EDC偶联)
将1-乙基-5-甲基-2,3,4,9-四氢-1H-吡啶并[3,4-b]吲哚·TFA盐(164mg,0.50mmol)、
1-乙基-3-(3-二甲氨基丙基)碳二亚胺-HCl(EDC-HCl)(96mg,0.50mmol)、4-二甲氨基吡啶(DMAP)(6mg,0.05mmol)、羟基苯并三唑(HOBT)(51mg,0.165mmol)和反-4-(Boc-甲基氨甲基)环己烷羧酸(136mg,0.50mmol)全部溶解在乙腈(625uL)、二甲基甲酰胺(DMF)(2.5mL)和二异丙基乙胺(DIEA)(100uL,0.60mmol)中。将反应物在RT下搅拌17小时。用EtOAc(100mL)稀释反应混合物,用饱和NaCl(2x 50mL)、1M柠檬酸(3x 25mL)、饱和NaHCO3(3x 25mL)和饱和NaCl(50mL)洗涤。干燥(无水Na2SO4)有机层,过滤,并在真空下蒸发。将该物质通过硅胶(25-30g)色谱法进一步纯化,使用:4个级分(200mL),由己烷、32%EtOAc的己烷溶液、42%EtOAc的己烷溶液和50%EtOAc的己烷溶液组成。合并含有产物的级分,并真空蒸发溶剂,得到固体(203mg,86.9%产率;TLC Rf=4.877(40%EtOAc的己烷溶液);HPLC Rt=0.19min)。
合成例89:MN1385(EDC偶联)
将5-环丙基-5-甲基-2,3,4,9-四氢-1H-吡啶并[3,4-b]吲哚(131mg,0.50mmol)、1-乙
基-3-(3-二甲氨基丙基)碳二亚胺盐-HCl(EDC-HCl)(96mg,0.50mmol)、4-二甲氨基吡啶(DMAP)(6mg,0.05mmol)、羟基苯并三唑(HOBT)(51mg,0.165mmol)和反-4-(Boc-甲基氨甲基)环己烷羧酸(136mg,0.50mmol)全部溶解在乙腈(625uL)、二甲基甲酰胺(DMF)(2.5mL)和二异丙基乙胺(DIEA)(200uL,1.20mmol)中。将反应物在RT下搅拌17小时。用EtOAc(100mL)稀释反应混合物,用饱和NaCl(2x 50mL)、1M柠檬酸(3x 25mL)、饱和NaHCO3(3x 25mL)和饱和NaCl(50mL)洗涤。干燥(无水Na2SO4)有机层,过滤,并在真空下蒸发。将该物质通过硅胶(25-30g)色谱法进一步纯化,使用:4个级分(200mL),由己烷、32%EtOAc的己烷溶液、42%EtOAc的己烷溶液和50%EtOAc的己烷溶液组成。合并含有产物的级分,并真空蒸发溶剂,得到固体(212mg,88.4%产率;TLC Rf=0.26(40%EtOAc的己烷溶液);HPLC Rt=4.909min)。
合成例90:MN1386(氨基甲酸酯形成)
将(1-异丙基-3,4-二氢-1H-吡啶基[3,4-b]吲哚-2(9H)-基)(反-4-((甲氨基)甲基)环
己基)甲酮(110mg,0.30mmol)溶解于CH2Cl2(4.5mL)中,并在冰浴中冷却5min。向溶液中滴加氯甲酸异丙酯(150uL,0.30mmol)、然后是三乙胺(TEA)(167uL,1.20mmol)。将反应混合物温热至RT并蒸发溶剂。将所得固体溶解在EtOAc(200mL)中,并用1N NaOH(3x 50mL)、1N HCl(3x 50mL)和饱和NaCl(50mL)洗涤。干燥(无水Na2SO4)有机层,过滤,并在真空下蒸发。将该物质通过硅胶(25-30g)色谱法进一步纯化,使用由己烷和EtOAc的己烷溶液组成的级分(200mL)。合并含有产物的级分,并真空蒸发溶剂,得到固体(131mg,96.3%产率;TLC Rf=
0.43(50%EtOAc的己烷溶液);HPLC Rt=4.769min)。
合成例91:MN1387(氨基甲酸酯形成)
将(1-异丙基-3,4-二氢-1H-吡啶基[3,4-b]吲哚-2(9H)-基)(反-4-((甲氨基)甲基)环
己基)甲酮(110mg,0.30mmol)溶解于CH2Cl2(4.5mL)中,并在冰浴中冷却5min。向溶液中滴加氯甲酸苄酯(176uL,0.30mmol)、然后是三乙胺(TEA)(167uL,1.20mmol)。将反应混合物温热至RT并蒸发溶剂。将所得固体溶解在EtOAc(200mL)中,并用1N NaOH(3x 50mL)、1N HCl(3x
50mL)和饱和NaCl(50mL)洗涤。干燥(无水Na2SO4)有机层,过滤,并在真空下蒸发。将该物质通过硅胶(25-30g)色谱法进一步纯化,使用由己烷和EtOAc的己烷溶液组成的级分
(200mL)。合并含有产物的级分,并真空蒸发溶剂,得到固体(138mg,91.7%产率;TLC Rf=
0.46(50%EtOAc的己烷溶液);HPLC Rt=4.891min)。
合成例92:MN1388(酰胺形成)
将(1-异丙基-3,4-二氢-1H-吡啶基[3,4-b]吲哚-2(9H)-基)(反-4-((甲氨基)甲基)环
己基)甲酮(220mg,0.60mmol)溶解于CH2Cl2(9mL)中,并在冰浴中冷却5min。向溶液中滴加丙酰氯(53uL,0.60mmol)和三乙胺(TEA)(335uL,2.4mmol)。将反应混合物温热至RT并蒸发溶剂。将所得固体溶解在EtOAc(200mL)中,并用1N NaOH(1x 25mL)、1N HCl(1x 25mL)和饱和NaCl(50mL)洗涤。干燥(无水Na2SO4)有机层,过滤,并在真空下蒸发。将该物质通过硅胶(25-
30g)色谱法进一步纯化,使用:4个级分(200mL),由己烷、75%EtOAc的己烷溶液、90%EtOAc的己烷溶液和EtOAc组成。合并含有产物的级分,并真空蒸发溶剂,得到固体(201mg,76.6%产率;TLC Rf=0.14(70%EtOAc的己烷溶液);HPLC Rt=4.292min)。
合成例93:MN1389(酰胺形成)
将(1-异丙基-3,4-二氢-1H-吡啶基[3,4-b]吲哚-2(9H)-基)(反-4-((甲氨基)甲基)环
己基)甲酮(220mg,0.60mmol)溶解于CH2Cl2(9mL)中,并在冰浴中冷却5min。向溶液中滴加3,
3-二甲基丁酰氯(84uL,0.60mmol)和三乙胺(TEA)(335uL,2.4mmol)。将反应混合物温热至RT并蒸发溶剂。将所得固体溶解在EtOAc(200mL)中,并用1N NaOH(1x 25mL)、1N HCl(1x
25mL)和饱和NaCl(50mL)洗涤。干燥(无水Na2SO4)有机层,过滤,并在真空下蒸发。将该物质通过硅胶(25-30g)色谱法进一步纯化,使用:4个级分(200mL),由己烷、50%EtOAc的己烷溶液、60%EtOAc的己烷溶液和70%EtOAc的己烷溶液组成。合并含有产物的级分,并真空蒸发溶剂,得到固体(230mg,82.3%产率;TLC Rf=0.17(50%EtOAc的己烷溶液);HPLC Rt=
4.723min)。
合成例94:MN1390(酰胺形成)
将(1-异丙基-3,4-二氢-1H-吡啶基[3,4-b]吲哚-2(9H)-基)(反-4-((甲氨基)甲基)环
己基)甲酮(220mg,0.60mmol)溶解于CH2Cl2(9mL)中,并在冰浴中冷却5min。向溶液中滴加苯乙酰氯(80uL,0.60mmol)和三乙胺(TEA)(335uL,2.4mmol)。将反应混合物温热至RT并蒸发溶剂。将所得固体溶解在EtOAc(200mL)中,并用1N NaOH(1x 25mL)、1N HCl(1x 25mL)和饱和NaCl(50mL)洗涤。干燥(无水Na2SO4)有机层,过滤,并在真空下蒸发。将该物质通过硅胶(25-30g)色谱法进一步纯化,使用:4个级分(200mL),由己烷、60%EtOAc的己烷溶液、70%EtOAc的己烷溶液和80%EtOAc的己烷溶液组成。合并含有产物的级分,并真空蒸发溶剂,得到固体(221mg,75.8%产率;TLC Rf=0.15(60%EtOAc的己烷溶液);HPLC Rt=4.569min)。
合成例95:MN1391(脲的形成)
将(1-异丙基-3,4-二氢-1H-吡啶基[3,4-b]吲哚-2(9H)-基)(反-4-((甲氨基)甲基)环
己基)甲酮(129mg,0.35mmol)溶解于CHCl3(8.75mL)中,并在冰浴中氮气惰性气氛下冷却
5min。将异氰酸乙酯(56uL,0.7mmol)加入溶液中,并将反应混合物温热至RT。浓缩混合物并在真空下干燥。将该物质通过硅胶(25-30g)色谱法进一步纯化,使用:4个级分(200mL),由CH2Cl2、3%EtOAc的CH2Cl2溶液、4%EtOAc的CH2Cl2溶液和5%EtOAc的CH2Cl2溶液组成。合并含有产物的级分,并真空蒸发溶剂,得到固体(138mg,89.9%产率;TLC Rf=0.23(4%MeOH的CH2Cl2溶液);HPLC Rt=4.178min)。
合成例96:MN1392(Boc基团取代)
将(1-异丙基-3,4-二氢-1H-吡啶基[3,4-b]吲哚-2(9H)-基)(反-4-((甲氨基)甲基)环
己基)甲酮(129mg,0.35mmol)溶解于CHCl3(8.75mL)中,并在冰浴中氮气惰性气氛下冷却
5min。将异氰酸叔丁酯(82uL,0.7mmol)加入溶液中,并将反应混合物温热至RT。浓缩混合物并在真空下干燥。将该物质通过硅胶(25-30g)色谱法进一步纯化,使用:4个级分(200mL),由己烷、50%EtOAc的己烷溶液、60%EtOAc的己烷溶液和70%EtOAc的己烷溶液组成。合并含有产物的级分,并真空蒸发溶剂,得到固体(152mg,93.1%产率;TLC Rf=0.14(50%EtOAc的己烷溶液);HPLC Rt=4.524min)。
合成例97:MN1393(Boc基团取代)
将(1-异丙基-3,4-二氢-1H-吡啶基[3,4-b]吲哚-2(9H)-基)(反-4-((甲氨基)甲基)环
己基)甲酮(129mg,0.35mmol)溶解于CHCl3(8.75mL)中,并在冰浴中氮气惰性气氛下冷却
5min。将异氰酸苯酯(76uL,0.7mmol)加入溶液中,并将反应混合物温热至RT。浓缩混合物并在真空下干燥。将该物质通过硅胶(25-30g)色谱法进一步纯化,使用:4个级分(200mL),由己烷、50%EtOAc的己烷溶液、60%EtOAc的己烷溶液和70%EtOAc的己烷溶液组成。合并含有产物的级分,并真空蒸发溶剂,得到固体(144mg,84.5%产率;TLC Rf=0.13(50%EtOAc的己烷溶液);HPLC Rt=4.484min)。
合成例98:MN1394(EDC偶联)
将1-甲基-2,3,4,9-四氢-1H-吡啶并[3,4-b]吲哚(186mg,1.00mmol)、1-乙基-3-(3-二甲氨基丙基)碳二亚胺-HCl(EDC-HCl)(192mg,1.00mmol)、4-二甲氨基吡啶(DMAP)(12mg,
0.1mmol)、羟基苯并三唑(HOBT)(51mg,0.33mmol)和反-4-(Boc-甲基氨甲基)环己烷羧酸(271mg,1.00mmol)全部溶解在乙腈(1.25mL)、二甲基甲酰胺(DMF)(5mL)和二异丙基乙胺(DIEA)(200uL,1.20mmol)中。将反应物在RT下搅拌17小时。用EtOAc(100mL)稀释反应混合物,用饱和NaCl(2x 50mL)、1M柠檬酸(3x 25mL)、饱和NaHCO3(3x 25mL)和饱和NaCl(50mL)洗涤。干燥(无水Na2SO4)有机层,过滤,并在真空下蒸发。将该物质通过硅胶(25-30g)色谱法进一步纯化,使用:4个级分(200mL),由己烷、40%EtOAc的己烷溶液、己烷中的52%EtOAc和
60%EtOAc的己烷溶液组成。合并含有产物的级分,并真空蒸发溶剂,得到固体(342mg,
77.9%产率;TLC Rf=0.31(50%EtOAc的己烷溶液);HPLC Rt=4.672min)。
合成例99:MN1395(EDC偶联)
将2,3,4,9-四氢-1H-吡啶并[3,4-b]吲哚(172mg,1.00mmol)、1-乙基-3-(3-二甲氨基
丙基)碳二亚胺-HCl(EDC-HCl)(192mg,1.00mmol)、4-二甲氨基吡啶(DMAP)(12mg,
0.1mmol)、羟基苯并三唑(HOBT)(51mg,0.33mmol)和反-4-(Boc-甲基氨甲基)环己烷羧酸(271mg,1.00mmol)全部溶解在乙腈(1.25mL)、二甲基甲酰胺(DMF)(5mL)和二异丙基乙胺(DIEA)(200uL,1.20mmol)中。将反应物在RT下搅拌17小时。用EtOAc(100mL)稀释反应混合物,用饱和NaCl(2x50mL)、1M柠檬酸(3x 25mL)、饱和NaHCO3(3x 25mL)和饱和NaCl(50mL)洗涤。干燥(无水Na2SO4)有机层,过滤,并在真空下蒸发。将该物质通过硅胶(25-30g)色谱法进一步纯化,使用:4个级分(200mL),由己烷、40%EtOAc的己烷溶液、60%EtOAc的己烷溶液和
70%EtOAc的己烷溶液组成。合并含有产物的级分,并真空蒸发溶剂,得到固体(339mg,
79.7%产率;TLC Rf=0.23(50%EtOAc的己烷溶液);HPLC Rt=4.555min)。
合成例100:MN1396(还原胺化)
将(1-异丙基-3,4-二氢-1H-吡啶基[3,4-b]吲哚-2(9H)-基)(反-4-((甲氨基)甲基)环
己基)甲酮(110mg,0.30mmol)和NaBH(OAc)3(95mg,0.45mmol)溶解于1,2-二氯乙烷(1,2-DCE)(3mL)中。加入丙醛(22uL,0.30mmol),将混合物加热至80℃并搅拌4.5hr。用EtOAc(50mL)和1M K2CO3稀释反应混合物。用EtOAc(2x 50mL)萃取水层,并合并水层。用饱和NaCl(20mL)洗涤EtOAc层,干燥(无水Na2SO4),过滤,并在真空下蒸发。将该物质通过硅胶(25-
30g)色谱法进一步纯化,使用:5个级分(200mL),由CH2Cl2、4%MeOH的CH2Cl2溶液+1%NH3、
5%MeOH的CH2Cl2溶液+1%NH3、7%MeOH的CH2Cl2溶液+1%NH3和9%MeOH的CH2Cl2溶液+1%NH3组成。合并含有产物的级分,并真空蒸发溶剂,得到固体(50mg,40.7%产率;TLC Rf=
0.26(5%MeOH的CH2Cl2溶液+1%NH3);HPLC Rt=3.735min)。
合成例101:MN1397(还原胺化)
将(1-异丙基-3,4-二氢-1H-吡啶基[3,4-b]吲哚-2(9H)-基)(反-4-((甲氨基)甲基)环
己基)甲酮(110mg,0.30mmol)溶解在1,2-二氯乙烷(3mL)中。将3,3-二甲基丁醛(38uL,
0.30mmol)和NaBH(OAc)3(64mg,0.45mmol)添加至溶液,搅拌,并加热至80℃保持30min。用EtOAc(50mL)稀释溶液,并用1M K2CO3(25mL)洗涤。用EtOAc(2x 50mL)萃取产物,用饱和NaCl(1x 20mL)洗涤,干燥(无水Na2SO4)并过滤。真空蒸发溶剂,得到固体(154mg,114%产率;TLC Rf=0.15(5%MeOH的CH2Cl2溶液);HPLC Rt=4.044min。
合成例102:MN1398(还原胺化)
将(1-异丙基-3,4-二氢-1H-吡啶基[3,4-b]吲哚-2(9H)-基)(反-4-((甲氨基)甲基)环
己基)甲酮(110mg,0.30mmol)溶解于1,2-二氯乙烷(3mL)中。将异戊醛(33uL,0.30mmol)和NaBH(OAc)3(64mg,0.45mmol)添加至溶液,搅拌,并加热至80℃30min。用EtOAc(50mL)稀释溶液,并用1M K2CO3(25mL)洗涤。用EtOAc(2x 50mL)萃取产物,用饱和NaCl(1x 20mL)洗涤,干燥(无水Na2SO4)并过滤。真空蒸发溶剂,得到固体(132mg,101%产率;TLC Rf=0.46(10%MeOH的CH2Cl2溶液);HPLC Rt=3.972min。
合成例102:MN1399(酰胺形成)
将(1-异丙基-3,4-二氢-1H-吡啶并[3,4-b]吲哚-2(9H)-基)(反-4-((甲氨基)甲基)环
己基)甲酮(110mg,0.30mmol)和NaHB(OAc)3(95mg,0.45mmol)溶解于1,2-二氯乙烷(1,2-DCE)(3mL)中。加入苯甲醛(31uL,0.30mmol),将混合物加热至80℃并搅拌4.5hr。用EtOAc(50mL)和1M H2CO3稀释反应混合物。用EtOAc(2x 50mL)萃取水层并合并水层。用饱和NaCl(20mL)洗涤EtOAc层,干燥(无水Na2SO4),过滤,并在真空下蒸发。将该物质通过硅胶(25-
30g)色谱法进一步纯化,使用:6个级分(200mL),由CH2Cl2、1%MeOH的CH2Cl2溶液+1%NH3、
2%MeOH的CH2Cl2溶液+1%NH3、3%MeOH的CH2Cl2溶液+1%NH3、4%MeOH的CH2Cl2溶液+1%NH3和5%MeOH的CH2Cl2溶液+1%NH3组成。合并含有产物的级分,并真空蒸发溶剂,得到固体(83mg,60.4%产率;TLC Rf=0.26(5%MeOH的CH2Cl2溶液+1%NH3);HPLC Rt=3.929min)。
合成例104:MN1400(Boc裂解)
将(反-4-(1-异丙基-2,3,4,9-四氢-1H-吡啶并[3,4-b]吲哚-2-羰基)环己基)甲基(甲
基)氨基甲酸叔丁酯(2.2814g,4.88mmol)溶解在CH2Cl2(30mL)中。将三氟乙酸(TFA)(30mL)添加到溶液中并在30分钟时在真空下浓缩。将所得物溶于H2O(80mL)和CH2Cl2(100mL)中并用10M NaOH(1mL)碱化。用CH2Cl2(2x100mL)萃取产物,干燥(无水MgSO4),过滤,真空除去溶剂,得到灰白色/黄色固体(1.667g)。将该固体溶于冷乙腈(ACN)(2x 5mL)中,搅拌30秒,并过滤。蒸发溶剂,得到固体(1.38g)。将该固体溶于RT ACN(5mL)中,搅拌30秒,并过滤。蒸发溶剂,得到固体。在RT下在RT ACN(5mL)中搅拌固体4min。蒸发溶剂,得到固体(707mg,
39.4%产率;TLC Rf=0.16(10%MeOH的CH2Cl2溶液+1%NH3);HPLC Rt=3.559min)。
合成例105:MN1401(EDC偶联)
将2,3,4,9-四氢-1H-吡啶并[3,4-b]吲哚-3-甲酰胺(215mg,1.00mmol)、1-乙基-3-(3-二甲氨基丙基)碳二亚胺-HCl(EDC-HCl)(192mg,1.00mmol)、4-二甲氨基吡啶(DMAP)(12mg,
0.1mmol)、羟基苯并三唑(HOBT)(51mg,0.33mmol)和反-4-(Boc-甲基氨甲基)环己烷羧酸(271mg,1.00mmol)全部溶解在乙腈(1.25mL)、二甲基甲酰胺(DMF)(5mL)和二异丙基乙胺(DIEA)(200μL,1.20mmol)中。将反应物在RT下搅拌17小时。用EtOAc(100mL)稀释反应混合物,用饱和NaCl(2x 50mL)、1M柠檬酸(3x 25mL)、饱和NaHCO3(3x 25mL)和饱和NaCl(50mL)洗涤。干燥(无水Na2SO4)有机层,过滤,并在真空下蒸发。将该物质通过硅胶(25-30g)色谱法进一步纯化,使用:7个级分(200mL),由CH2Cl2、3%MeOH的CH2Cl2溶液、4%MeOH的CH2Cl2溶液、4.5%MeOH的CH2Cl2溶液、5%MeOH的CH2Cl2溶液和6%MeOH的CH2Cl2溶液组成。合并含有产物的级分,并真空蒸发溶剂,得到固体(210mg,44.8%产率;TLC Rf=0.15(4%MeOH的CH2Cl2溶液);HPLC Rt=4.089min)。
合成例106:MN1402(EDC偶联)
将2,3,4,9-四氢-1H-吡啶并[3,4-b]吲哚-3-羧酸苄酯(306mg,1.00mmol)、1-乙基-3-
(3-二甲氨基丙基)碳二亚胺-HCl(EDC-HCl)(192mg,1.00mmol)、4-二甲氨基吡啶(DMAP)(12mg,0.1mmol)、羟基苯并三唑(HOBT)(51mg,0.33mmol)和反-4-(Boc-甲基氨甲基)环己烷羧酸(271mg,1.00mmol)全部溶解在乙腈(1.25mL)、二甲基甲酰胺(DMF)(5mL)和二异丙基乙胺(DIEA)(200μL,1.20mmol)中。将反应物在RT下搅拌17小时。用EtOAc(100mL)稀释反应混合物,用饱和NaCl(2x 50mL)、1M柠檬酸(3x 25mL)、饱和NaHCO3(3x 25mL)和饱和NaCl(50mL)洗涤。干燥(无水Na2SO4)有机层,过滤,并在真空下蒸发。将该物质通过硅胶(25-30g)色谱法进一步纯化,使用:4个级分(200mL),由己烷、30%EtOAc的己烷溶液、40%EtOAc的己烷溶液和55%EtOAc的己烷溶液组成。合并含有产物的级分,并真空蒸发溶剂,得到固体(246mg,43.9%产率;TLC Rf=0.24(40%EtOAc的己烷溶液);HPLC Rt=4.919min)。
合成例107:MN1403(EDC偶联)
将3-甲基-2,3,4,9-四氢-1H-吡啶并[3,4-b]吲哚(186mg,1.00mmol)、1-乙基-3-(3-二甲氨基丙基)碳二亚胺-HCl(EDC-HCl)(192mg,1.00mmol)、4-二甲氨基吡啶(DMAP)(12mg,
0.1mmol)、羟基苯并三唑(HOBT)(51mg,0.33mmol)和反-4-(Boc-甲基氨甲基)环己烷羧酸(271mg,1.00mmol)全部溶解在乙腈(1.25mL)、二甲基甲酰胺(DMF)(5mL)和二异丙基乙胺(DIEA)(200uL,1.20mmol)中。将反应物在RT下搅拌17小时。用EtOAc(100mL)稀释反应混合物,用饱和NaCl(2x 50mL)、1M柠檬酸(3x 25mL)、饱和NaHCO3(3x 25mL)和饱和NaCl(50mL)洗涤。干燥(无水Na2SO4)有机层,过滤,并在真空下蒸发。将该物质通过硅胶(25-30g)色谱法进一步纯化,使用:4个级分(200mL),由己烷、30%EtOAc的己烷溶液、50%EtOAc的己烷溶液和60%EtOAc的己烷溶液组成。合并含有产物的级分,并真空蒸发溶剂,得到固体(352mg,
80.1%产率;TLC Rf=0.30(50%EtOAc的己烷溶液);HPLC Rt=4.674min)。
合成例108:MN1404(HFIP环化)
将α-甲基色胺(174mg,1.00mmol)溶解在六氟-2-丙醇(HFIP)(1.6mL)中。将多聚甲醛
(30mg,1.0mmol)溶于HFIP(1.0mL)中,并以每份250uL滴加至前述溶液中。在90分钟内,将反应混合物与CHCl3(3x 50mL)共沸,得到固体(188mg,101%产率;TLC Rf=0.31(10%MeOH的CH2Cl2溶液+1%NH3);HPLC Rt=2.717min。
合成例109:MN1405(HFIP环化)
将D-
色氨酸苄酯(400mg,1.36mmol)溶解在六氟-2-丙醇(HFIP)(2.2mL)中。将多聚甲醛(45mg,1.49mmol)溶于HFIP(1.61mL)中,在1hr内以每份340uL滴加至前述溶液中并搅拌。
20hr后,真空除去溶剂。将反应混合物与CHCl3(3x50mL)共沸,真空干燥得到固体(3.0mg,
0.72%产率;TLC Rf=0.26(5%MeOH的CH2Cl2溶液+1%NH3);HPLC Rt=3.505min。
合成例110:MN1406(酯到酰胺)
使用热风枪在真空下将三氟甲磺酸镧(III)(La(OTf)3)(80mg,0.136mmol)加热至200+
℃。将氩气回填到管中,并添加L-1,2,3,4-四氢-B-咔啉-3-羧酸甲酯·HCl(520mg,
1.95mmol)。将固体溶解在2N NH3的EtOH溶液(12mL)中。将反应混合物加盖并加热至60℃保持48hr。将混合物冷却至RT,用0.45um注射器过滤,并在真空下干燥。加入La(TFl)3(80mg,
0.136mmol),并在90℃加热20min。将滤液溶解在2N NH3的EtOH溶液中,并在60℃加热3天。
蒸发溶剂并将所得固体溶于H2O(50mL)和EtOAc(20mL)中,用EtOAc(25mL)洗涤,并用H2O(2x
10mL)萃取。蒸发水层。将该物质通过硅胶(25-30g)色谱法进一步纯化,使用由CH2Cl2和MeOH和l%NH3的CH2Cl2溶液组成的级分(400mL)。合并含有产物的级分,并真空蒸发溶剂,得到固体(48mg,11.4%产率;TLC Rf=0.26(10%MeOH的CH2Cl2溶液+1%NH3);HPLC Rt=
1.460min)。
合成例111:MN1407(酯到羧酸)
将L-1,2,3,4-四氢-B-咔啉-3-羧酸甲酯·Hcl(532mg,2.00mmol)溶解于1N NaOH
(20mL)中,并加热至回流30min。将所得物转移到锥形瓶中,并置于冰浴中。冷却后,盐
固化,加入1N HCl(23mL)直至pH为5并保留沉淀。在烧结玻璃上收集白色固体。将该固体在干燥器中干燥过夜,并在高真空下进一步干燥2天,得到固体(396mg,91.6%产率;TLC Rf=0.60(丁醇:水:乙酸[3:1:1]);HPLC Rt=2.418min)。
合成例112:MN1408(酯到酰胺)
在烘箱中将三氟甲磺酸镧(III)(La(OTf)3)(20mg,0.0341mmol)加热至113-114℃
30min。将物质置于高真空下,用热风枪加热2-3分钟,并在真空下冷却至RT。向混合物中加入L-1,2,3,4-四氢-B-咔啉-3-羧酸甲酯·HCl(130mg,0.30mmol),真空干燥30min,并用热风枪短暂加热至约150℃。将反应混合物在60℃加热2hr,得到粘稠的白色溶液。将该溶液置于冰浴中,并在烧结玻璃上收集白色晶体。用冷H20(3mL)洗涤固体并在2天内真空干燥,得到固体(101mg,88.1%产率;TLC Rf=0.42(10%MeOH的CH2Cl2溶液+1%NH3);HPLC Rt=
2.404min。
合成例113:MN1409(EDC偶联)
将2,3,4,9-四氢-1H-吡啶并[3,4-b]吲哚-3-羧酸乙酯(181mg,0.74mmol)、1-乙基-3-
(3-二甲氨基丙基)碳二亚胺盐-HCl(EDC-HCl)(150mg,0.78mmol)、4-二甲氨基吡啶(DMAP)(10mg,0.078mmol)、羟基苯并三唑(HOBT)(40mg,0.26mmol)和反-4-(Boc-甲基氨甲基)环己烷羧酸(212mg,0.78mmol)全部溶解在乙腈(975μL)、二甲基甲酰胺(DMF)(3.9mL)和二异丙基乙胺(DIEA)(156μL,0.94mmol)中。将反应物在RT下搅拌5天。用EtOAc(100mL)稀释反应混合物,用饱和NaCl(2x 50mL)、1M柠檬酸(3x 25mL)、饱和NaHCO3(3x 25mL)和饱和NaCl(50mL)洗涤。干燥(无水Na2SO4)有机层,过滤,并在真空下蒸发。将该物质通过硅胶(25-30g)色谱法进一步纯化,使用:5个级分(200mL),由己烷、30%EtOAc的己烷溶液、37%EtOAc的己烷溶液、40%EtOAc的己烷溶液和50%EtOAc的己烷溶液组成。合并含有产物的级分,并真空蒸发溶剂,得到固体(100mg,27.2%产率;TLC Rf=0.18(40%EtOAc的己烷溶液);HPLC Rt=
4.680min)。
合成例114:MN1410(EDC偶联)
将2,3,4,9-四氢-1H-吡啶并[3,4-b]吲哚-3-羧酸异丙酯(201mg,0.78mmol)、1-乙基-
3-(3-二甲氨基丙基)碳二亚胺-HCl(EDC-HCl)(150mg,0.78mmol)、4-二甲氨基吡啶(DMAP)(10mg,0.078mmol)、羟基苯并三唑(HOBT)(40mg,0.26mmol)和反-4-(Boc-甲基氨甲基)环己烷羧酸(212mg,0.78mmol)全部溶解在乙腈(975uL)、二甲基甲酰胺(DMF)(3.9mL)和二异丙基乙胺(DIEA)(156uL,0.94mmol)中。将反应物在RT下搅拌5天。用EtOAc(100mL)稀释反应混合物,用饱和NaCl(2x 50mL)、1M柠檬酸(3x 25mL)、饱和NaHCO3(3x 25mL)和饱和NaCl(50mL)洗涤。用EtOAc(100mL)稀释反应混合物,用饱和NaCl(2x 50mL)、1M柠檬酸(3x
25mL)、饱和NaHCO3(3x 25mL)和饱和NaCl(50mL)洗涤。干燥(无水Na2SO4)有机层,过滤,并在真空下蒸发。将该物质通过硅胶(25-30g)色谱法进一步纯化,使用:5个级分(200mL),由己烷、30%EtOAc的己烷溶液、37%EtOAc的己烷溶液、40%EtOAc的己烷溶液和50%EtOAc的己烷溶液组成。合并含有产物的级分,并真空蒸发溶剂,得到固体(125mg,31.3%产率;TLC Rf=0.21(40%EtOAc的己烷溶液);HPLC Rt=4.790min)。
合成例115:MN1411(EDC偶联)
将(S)-N-甲基-2,3,4,9-四氢-1H-吡啶并[3,4-b]吲哚-3-甲酰胺(200mg,0.872mmol)、
4-二甲氨基吡啶(DMAP)(10.6mg,0.087mmol)、羟基苯并三唑(HOBT)(88mg,0.576mmol)和反-4-(Boc-甲基氨甲基)环己烷羧酸(237mg,0.872mmol)全部溶解在乙腈(1.1mL)、二甲基甲酰胺(DMF)(8mL)和二异丙基乙胺(DIEA)(396μL,2.4mmol)中。将反应物在RT下搅拌2天,然后在60℃下搅拌6hr。用EtOAc(100mL)稀释反应混合物,用饱和NaCl(2x 50mL)、1M柠檬酸(3x 25mL)、饱和NaHCO3(3x 25mL)和饱和NaCl(50mL)洗涤。干燥(无水Na2SO4)有机层,过滤,并在真空下蒸发。用己烷(20mL)研磨所得物,并用20%EtOAc的己烷溶液(20mL)洗脱。真空蒸发溶剂,得到固体(200mg,47.5%产率;TLC Rf=0.32(5%MeOH的CH2Cl2溶液);HPLC Rt=
4.187min。
合成例116:MN1412(脲的形成)
将(1-异丁基-3,4-二氢-1H-吡啶基[3,4-b]吲哚-2(9H)-基)(反-4-((甲氨基)甲基)环
己基)甲酮(114mg,0.30mmol)溶解于CHCl3(7.5mL)中,并在冰浴中冷却5min。将异氰酸叔丁酯(68uL,0.60mmol)加入溶液中,并将反应混合物搅拌10min。从冰浴中移出反应物并温热至RT。浓缩混合物并在真空下干燥。将该物质通过硅胶(25-30g)色谱法进一步纯化,使用:4个级分(200mL),由己烷、40%EtOAc的己烷溶液、70%EtOAc的己烷溶液和80%EtOAc的己烷溶液组成。合并含有产物的级分,并真空蒸发溶剂,得到固体(50mg,34.7%产率;TLC Rf=
0.37(60%EtOAc的己烷溶液);HPLC Rt=4.703min)。
合成例117:MN1413(脲形成)
将(1-环丙基-3,4-二氢-1H-吡啶基[3,4-b]吲哚-2(9H)-基)(反-4-((甲氨基)甲基)环
己基)甲酮(1.803g,5.1mmol)溶解于CHCl3(50mL)中并在冰浴中冷却5min。将异氰酸叔丁酯(1.16mL,10.2mmol)加入溶液中,并将反应混合物搅拌20min。浓缩混合物并真空干燥,得到固体(2.6969g)。将该物质通过硅胶(160g)色谱法进一步纯化,使用:6个级分(1L),由己烷、
30%EtOAc的己烷溶液、40%EtOAc的己烷溶液、50%EtOAc的己烷溶液、60%EtOAc的己烷溶液和70%EtOAc的己烷溶液组成。合并含有产物的级分,并真空蒸发溶剂,得到灰白色固体(2.0442mg,86.3%产率;TLC Rf=0.22(60%EtOAc的己烷溶液);HPLC Rt=4.410min);LCMS(ESI)m/z:[M+H]+Calcd for C28H40N4O2 464.6428;Found 465.3244;1H NMR(CDCl3,
0.003%v/v TMS,400MHz):δH0.40-0.50(m,1H),0.57-0.80(m,3H),1.00-1.15(m,2H),
1.20-1.27(m,1H),1.35(s,9H),1.50-1.70(m,3H),1.75-1.85(m,3H),1.95(d,1H),2.56(t,
1H),2.85(s,4H),3.13(d,2H),3.56-3.70(m,1H),4.10-4.23(m,2H),5.20(d,1H),7.01(dd,
1H),7.16(dd,1H),7.33(d,1H),7.46(d,1H),8.02(s,1H)。
合成例118:MN1414(脲形成)
将(1-乙基-3,4-二氢-1H-吡啶基[3,4-b]吲哚-2(9H)-基)(反-4-((甲氨基)甲基)环己
基)甲酮(73mg,0.20mmol)溶解于CHCl3(5mL)中并在冰浴中冷却5min。将异氰酸叔丁酯(46uL,0.40mmol)加入溶液中,并将反应混合物搅拌10min。从冰浴中移出反应物并温热至RT。浓缩混合物并在真空下干燥。将该物质通过硅胶(25-30g)色谱法进一步纯化,使用:4个级分(200mL),由己烷、40%EtOAc的己烷溶液、70%EtOAc的己烷溶液和80%EtOAc的己烷溶液组成。合并含有产物的级分,并真空蒸发溶剂,得到固体(63mg,69.6%产率;TLC Rf=
0.17(60%EtOAc的己烷溶液);HPLC Rt=4.414min)。
合成例119:MN1415(硫脲形成)
将(1-异丙基-3,4-二氢-1H-吡啶并[3,4-b]吲哚-2(9H)-基)(反-4-((甲氨基)甲基)环
己基)甲酮(92mg,0.25mmol)溶解于CHCl3(6.25mL)中。将异硫氰酸叔丁酯(38.5uL,
0.303mmol)搅拌过夜。在21hr,将聚合物结合的三(2-氨乙基)胺(188mg,0.75mmol)加入反应物中,以与过量的异硫氰酸酯反应。在22hr,通过0.45um PTFE过滤器过滤反应物。真空蒸发溶剂,然后在高真空下干燥。将该物质通过硅胶(25-30g)色谱法进一步纯化,使用:4个级分(200mL),由己烷、40%EtOAc的己烷溶液、45%EtOAc的己烷溶液和50%EtOAc的己烷溶液组成。合并含有产物的级分,并真空蒸发溶剂,得到固体(101mg,83.7%产率;TLC Rf=0.17(50%EtOAc的己烷溶液);HPLC Rt=4.760min)。
合成例120:MN1416(Boc裂解)
将(反-4-(1-异丁基-2,3,4,9-四氢-1H-吡啶并[3,4-b]吲哚-2-羰基)环己基)甲基(甲
基)氨基甲酸叔丁酯(330mg,0.685mmol)溶于CH2Cl2(10mL)和TFA(10mL)。将反应物搅拌10分钟,除去溶剂,并将所得物置于高真空下。将所得固体在搅拌下悬浮在H2O(50mL)和CH2Cl2(50mL)中。加入10N NaOH直至溶液为碱性,并用CH2Cl2(3x 50mL)萃取产物,干燥(无水MgSO4)并过滤。真空移除溶剂,得到固体(250mg,48.2%产率;TLC Rf=0.24(10%MeOH的CH2Cl2溶液+1%NH3);HPLC Rt=3.689min。
合成例121:MN1417(Boc裂解)
将(反-4-(1-乙基-2,3,4,9-四氢-1H-吡啶[3,4-b]吲哚-2-羰基)环己基)甲基(甲基)
氨基甲酸叔丁酯(212mg,0.467mmol)溶于CH2Cl2(10mL)和TFA(10mL)。将反应物搅拌10分钟,除去溶剂,并将所得物置于高真空下。将所得固体在搅拌下悬浮在H2O(50mL)和CH2Cl2(50mL)中。加入10N NaOH直至溶液为碱性,并用CH2Cl2(3x 50mL)萃取产物,干燥(无水MgSO4)并过滤。真空移除溶剂,得到固体(146mg,88.4%产率;TLC Rf=0.19(10%MeOH的CH2Cl2溶液+1%NH3);HPLC Rt=3.407min。
合成例122:MN1418(Boc热裂解)
将(反-4-(1-环丙基-2,3,4,9-四氢-1H-吡啶并[3,4-b]吲哚-2-羰基)环己基)甲基(甲
基)氨基甲酸叔丁酯(308,0.66mmol)在铝块中净相(neat)加热至225℃保持38min。冷却到RT后,将所得油状物放置在真空下,得到粉末状浅棕色固体(225mg,93.3%产率;TLC Rf=
0.21(10%MeOH的CH2Cl2溶液+1%NH3);HPLC Rt=3.461min。
合成例123:MN1421(α-甲基色胺环化)
将(R)-α-甲基色胺(990mg,5.68mmol)溶解在1,1,1,3,3,3-六氟异丙醇(9.1mL)中。在
28min内将2.0M多聚甲醛(2.85mL)的HFIP溶液滴加到溶液中。真空浓缩反应混合物并与CHCl3(3x 100mL)共沸,得到固体(1.053g)。用ACN(6mL)研磨固体,过滤并真空干燥,得到固体(919mg,86.7%产率;TLC Rf=0.27(10%MeOH的CH2Cl2溶液+1%NH3);HPLC Rt=
2.660min)。
合成例124:MN1422(EDC偶联)
将(R)-3-甲基-2,3,4,9-四氢-1H-吡啶并[3,4-b]吲哚(867.5mg,4.66mmol)、1-乙基-
3-(3-二甲氨基丙基)碳二亚胺-HCl(EDC-HCl)(983mg,5.13mmol)、4-二甲氨基吡啶(DMAP)(57mg,0.466mmol)、羟基苯并三唑(HOBT)(236mg,1.54mmol)和反-4-(Boc-甲基氨甲基)环己烷羧酸(1.264mg,4.66mmol)全部溶解在乙腈(5.8mL)、二甲基甲酰胺(DMF)(23mL)和二异丙基乙胺(DIEA)(925uL,5.59mmol)中。将反应物在RT下搅拌17小时。用EtOAc(250mL)稀释反应混合物,用饱和NaCl(2x 50mL)、1M柠檬酸(3x 25mL)、饱和NaHCO3(3x 25mL)和饱和NaCl(50mL)洗涤。干燥(无水Na2SO4)有机层,过滤,并在真空下蒸发,得到固体(1.9213g,
93.8%产率;TLC Rf=0.26(50%MeOH的己烷溶液);HPLC Rt=4.633min。
合成例125:MN1423(脲形成)
将((R)-3-甲基-3,4-二氢-1H-吡啶基[3,4-b]吲哚-2(9H)-基)(反-4-((甲氨基)甲基)
环己基)甲酮(1.14g,3.36mmol)溶解于CHCl3(50mL)中并放置在冰浴中。通过注射器将异氰酸叔丁酯(767uL,6.72mmol)加入溶液中。在20min时认定反应完成。真空浓缩反应混合物并真空干燥,得到固体(1.64g)。将该物质通过硅胶(160g)色谱法进一步纯化,使用:6个级分(200mL),由己烷、50%EtOAc的己烷溶液、60%EtOAc的己烷溶液、70%EtOAc的己烷溶液、
80%EtOAc的己烷溶液和90%EtOAc的己烷溶液组成。合并含有产物的级分,并真空蒸发溶剂,得到固体(1.28g,87.0%产率;TLC Rf=0.20(70%EtOAc的己烷溶液);HPLC Rt=
4.259min);LCMS(ESI)m/z:[M+H]+Calcd for C26H38N4O2 438.6055;Found 439.3105;1H NMR(CDCl3,0.003%v/v TMS,400MHz):δH 1.00-1.30(m,5H),1.35(s,9H),1.45-1.55(m,
3H),1.55-1.70(m,3H),1.75-1.90(m,4H),2.50-2.63(m,1H),2.65-2.77(m,1H),2.82(s,
3H),3.00-3.10(m,1H),3.12(d,2H),4.00-4.20(m,2H),4.55-4.65(m,1H),5.40-5.50(m,
2H),7.07(dd,1H),7.15(dd,1H),7.31(d,1H),7.44(d,1H),7.93(s,1H)。
合成例126:中间体(酯形成)
在氩气惰性气氛下,使用
冷凝器,将4-[(乙氨基)甲基)环己烷-1-羧酸盐酸盐(500mg,
2.26mmol)溶解在1.25M HCl的EtOH溶液(10mL,12.5mmol)中,加热并在78℃下搅拌。然后将溶液回流48hr,得到固体。将固体溶于EtOH(10mL)中并
旋转蒸发,得到白色固体。用EtOAc(100mL)溶解固体并用1M K2CO3(2x 10mL)、饱和NaCl(10mL)洗涤,真空蒸发,得到油状物(564mg,99%产率;HPLC(200nm)Rt=2.540min)。
合成例127:中间体(脲形成)
将4-((乙氨基)甲基)环己烷羧酸乙酯(564mg,2.26mmol)溶解于CHCl3(20mL)中并在冰
浴中冷却。将异氰酸叔丁酯(387uL,3.39mmol)添加到溶液中,并在2min内将三乙胺(TEA)逐滴添加到溶液中。将反应混合物从冰浴中移出,在RT下搅拌45min。旋转蒸发反应混合物,并在高真空下干燥。将所得物溶解在EtOAc(100mL)中,并用1M柠檬酸(3x 25mL)、1M NaCO3(3x
25mL)和饱和NaCl(50mL)洗涤。用Na2SO4干燥所得物,过滤,旋转蒸发,得到油状物。高真空下干燥油状物,结晶并得得到固体(677mg,96.0%产率;HPLC-ELSD Rt=4.306min)。
合成例128:中间体(酯水解)
将4-((3-叔丁基-1-乙基脲基)甲基)环己烷羧酸乙酯(677mg,2.17mmol)溶解于1N
NaOH(10mL,10mmol)中并加热至90℃,同时在氩气惰性气氛下搅拌。2hr后,将10M NaOH(3mL,30mmol)和EtOH(3mL)添加至反应混合物。将混合物在80℃加热1hr,然后允许其冷却至RT。旋转蒸发该溶液,并将所得物溶于H2O(6mL)中,并用冷浓H2SO4酸化至pH为2。用EtOAc(3x 200mL)和1N HCl(2x 20mL)萃取产物。用35mL饱和NaCl+1N HCl洗涤有机层并用Na2SO4干燥。在高真空下蒸发溶剂,得到固体(370mg,60%产率;HPLC(200nm)[顺式/反式(1∶2)]Rt=3.563,3.475min)。
合成例129:MN1424(EDC偶联)
将6,7,8,9-四氢-5H-吡啶并[2,3-b:5,4-c’]二吡啶(250mg,1.44mmol)、1-乙基-3-(3-二甲氨基丙基)碳二亚胺-HCl(EDC-HCl)(331mg,1.73mmol)、4-二甲氨基吡啶(DMAP)(18mg,
0.144mmol)、羟基苯并三唑(HOBT)(74mg,0.48mmol)和反-4-(Boc-甲基氨甲基)环己烷羧酸(392mg,1.44mmol)全部溶解在乙腈(1.8mL)、二甲基甲酰胺(DMF)(7.2mL)和二异丙基乙胺(DIEA)(357uL,2.16mmol)中。将反应物在RT下搅拌20小时。用EtOAc(100mL)稀释反应混合物,用以下洗涤:饱和NaCl(2x 50mL),0.2M 2-(N-吗啉代)乙磺酸(MES)、pH 7缓冲液(2x
25mL),饱和NaHCO3(3x 25mL)和饱和NaCl(50mL)。干燥(无水Na2SO4)有机层,过滤,并在真空下蒸发,得到固体(408mg)。将产物溶解在EtOAc(20mL)中,并用1M柠檬酸(3x 50mL)并用EtOAc(10mL)洗涤。将10M NaOH添加到溶液中直至pH为7.8。用EtOAc(3x 100mL)萃取产物,干燥(无水Na2SO4),过滤,并在通风橱下蒸发。将该物质通过硅胶(25-30g)色谱法进一步纯化,使用:6个级分(200mL),由CH2Cl2、2%MeOH的CH2Cl2溶液、4%MeOH的CH2Cl2溶液、6%MeOH的CH2Cl2溶液、8%MeOH的CH2Cl2溶液和10%MeOH的CH2Cl2溶液组成。合并含有产物的级分,并真空蒸发溶剂,得到固体(217mg,35.3%产率;TLC Rf=0.19(4%MeOH的CH2Cl2溶液);
HPLC Rt=3.579min)。
合成例130:MN1425(EDC偶联)
将1-乙基-2,3,4,9-四氢-1H-吡啶并[3,4-b]吲哚(100mg,0.50mmol)、1-乙基-3-(3-二甲氨基丙基)碳二亚胺-HCl(EDC-HCl)(105mg,0.55mmol)、4-二甲氨基吡啶(DMAP)(6mg,
0.05mmol)、羟基苯并三唑(HOBT)(25mg,0.165mmol)和反-4-(3-叔丁基-1-乙基脲基)甲基)环己烷羧酸(136mg,0.50mmol)全部溶解在乙腈(625uL)、二甲基甲酰胺(DMF)(2.5mL)和二异丙基乙胺(DIEA)(100uL,0.60mmol)中。将反应物在RT下搅拌48小时。用EtOAc(100mL)稀释反应混合物,用饱和NaCl(2x 50mL)、1M柠檬酸(3x 25mL)、饱和NaHCO3(3x 25mL)和饱和NaCl(50mL)洗涤。干燥(无水Na2SO4)有机层,过滤,并在真空下蒸发,将该物质通过硅胶(25-
30g)色谱法进一步纯化,使用:5个级分(200mL),由己烷、40%EtOAc的己烷溶液、50%EtOAc的己烷溶液和60%EtOAc的己烷溶液组成。合并含有产物的级分,并真空蒸发溶剂,得到固体(73mg)。将该物质通过硅胶(25-30g)色谱法进一步纯化,使用:5个级分(200mL),由CH2Cl2、12%EtOAc的CH2Cl2溶液、22%EtOAc的CH2Cl2溶液、25%EtOAc的CH2Cl2溶液和35%EtOAc的CH2Cl2溶液组成。合并含有产物的级分,并真空蒸发溶剂,得到固体(81mg,34.7%产率;TLC Rf=0.30(60%EtOAc的己烷溶液);HPLC[顺/反(1:4)]Rt=4.648,4.514min)。
合成例131:MN1426(EDC偶联)
将1-环丙基-2,3,4,9-四氢-1H-吡啶并[3,4-b]吲哚(106mg,0.50mmol)、1-乙基-3-(3-二甲氨基丙基)碳二亚胺-HCl(EDC-HCl)(105mg,0.55mmol)、4-二甲氨基吡啶(DMAP)(6mg,
0.05mmol)、羟基苯并三唑(HOBT)(25mg,0.165mmol)和反-4-((3-叔丁基-1-乙基脲基)甲基)环己烷羧酸(136mg,0.50mmol)全部溶解在乙腈(625uL)、二甲基甲酰胺(DMF)(2.5mL)和二异丙基乙胺(DIEA)(100uL,0.60mmol)中。将反应物在RT下搅拌48小时。用EtOAc(100mL)稀释反应混合物,用饱和NaCl(2x 50mL)、1M柠檬酸(3x 25mL)、饱和NaHCO3(3x 25mL)和饱和NaCl(50mL)洗涤。干燥(无水Na2SO4)有机层,过滤,并在真空下蒸发。将该物质通过硅胶(25-30g)色谱法进一步纯化,使用:4个级分(200mL),由己烷、40%EtOAc的己烷溶液、50%EtOAc的己烷溶液和60%EtOAc的己烷溶液组成。合并含有产物的级分,并真空蒸发溶剂,得到固体(142mg)。将该物质通过硅胶(25-30g)色谱法进一步纯化,使用:5个级分(200mL),由CH2Cl2、10%EtOAc的CH2Cl2溶液、20%EtOAc的CH2Cl2溶液、25%EtOAc的CH2Cl2溶液和35%EtOAc的CH2Cl2溶液组成。合并含有产物的级分,并真空蒸发溶剂,得到固体(85mg,35.5%产率;TLC Rf=0.37(60%EtOAc的己烷溶液);HPLC[顺/反(1:4)]Rt=4.687,4.554min)。
合成例132:MN1443(脲形成)
将氮杂咔啉中间体(114mg,0.26mmol)溶于CHCl3(20mL)和二异丙基乙胺(DIEA)
(100uL,0.60mmol)。经由注射器将异氰酸叔丁酯(32uL,0.286mmol)添加至溶液。将反应物在RT下搅拌45min。旋转蒸发反应混合物,并在高真空下干燥。将所得物通过硅胶(25-30g)色谱法纯化,使用:4个级分(200mL),由CH2Cl2、2%EtOAc的CH2Cl2溶液、5%EtOAc的CH2Cl2溶液和8%EtOAc的CH2Cl2溶液组成。合并含有产物的级分,并真空蒸发溶剂。然后将产物溶于EtOAc(100mL)中,并用以下洗涤:1M NaOH(3x 20mL),pH 7.0、0.2M MES缓冲液(3x 20mL),
1MNaOH(1x 20mL)和盐水(1x 25mL)。干燥(无水Na2SO4)有机层,过滤,并在真空下蒸发,得到固体(70mg,63.3%产率;TLC Rf=0.15(5%MeOH的CH2Cl2溶液);HPLC Rt=3.212min。
例:EDC偶联,与柠檬酸、NaHCO3处理-MN1420-EDC偶联
将4-苯基哌啶(161mg,1.00mmol)、1-乙基-3-(3-二甲氨基丙基)碳二亚胺-HCl(EDC-
HCl)(192mg,1.00mmol)、4-二甲氨基吡啶(DMAP)(12mg,0.1mmol)、羟基苯并三唑(HOBT)(51mg,0.33mmol)和反-4-(Boc-甲基氨基甲基)环己烷羧酸(271mg,1.00mmol)全部溶解在乙腈(1.25mL)、二甲基甲酰胺(DMF)(5mL)和二异丙基乙胺(DIEA)(200uL,1.20mmol)中。将反应物在RT下搅拌17小时。用EtOAc(100mL)稀释反应混合物,用饱和NaCl(2x 50mL)、1M柠檬酸(3x 25mL)、饱和NaHCO3(3x 25mL)和饱和NaCl(50mL)洗涤。干燥(无水Na2SO4)有机层,过滤,并在真空下蒸发,将该物质通过硅胶(25-30g)色谱法进一步纯化,使用:4个级分(200mL),由己烷、25%EtOAc的己烷溶液、30%EtOAc的己烷溶液和35%EtOAc的己烷溶液组成。合并含有产物的级分,并真空蒸发溶剂,得到固体(330mg,79.6%产率;TLC Rf=0.39(50%EtOAc的己烷溶液);HPLC Rt=4.702min)。
MN1429、MN1430、MN1431、MN1432、MN1434、MN1449、MN1450、MN1451、MN1452、MN1453和MN1454的制备与MN1420类似。
例:EDC偶联,与MES缓冲液、NaHCO3处理:MN1428-EDC偶联
将4-(4-吡啶基)哌啶(65mg,0.40mmol)、1-乙基-3-(3-二甲氨基丙基)碳二亚胺-HCl
(EDC-HCl)(84mg,0.44mmol)、4-二甲氨基吡啶(DMAP)(5mg,0.04mmol)、羟基苯并三唑(HOBT)(20mg,0.132mmol)和反-4-(Boc-甲基氨甲基)环己烷羧酸(82mg,0.30mmol)全部溶解在乙腈(500mL)、二甲基甲酰胺(DMF)(2mL)和二异丙基乙胺(DIEA)(79uL,0.48mmol)中。
将反应物在RT下搅拌17hr。用EtOAc(100mL)稀释反应混合物,用以下洗涤:饱和NaCl(2x
50mL)、0.M MES、pH 7缓冲液(3x 25mL),饱和NaHCO3(3x 25mL)和饱和NaCl(50mL)。干燥(无水Na2SO4)有机层,过滤,并在真空下蒸发,将该物质通过硅胶(25-30g)色谱法进一步纯化,使用:4个级分(200mL),由CH2Cl2、2%MeOH的CH2Cl2溶液、4%MeOH的CH2Cl2溶液和5%MeOH的CH2Cl2溶液组成。合并含有产物的级分,并真空蒸发溶剂,得到固体(124mg,99.5%产率;TLC Rf=0.22(4%MeOH的CH2Cl2溶液);HPLC Rt=3.409min)。
MN 1427、MN 1447和MN1448的制备与MN1428类似。
合成例:MN1428T(甲苯磺酰基)
将甲基((4-(4-(吡啶-4-基)哌啶-1-羰基)环己基)甲基)氨基甲酸叔丁酯(3.3066g,
7.9568mmol)溶解在乙醚(250mL)中,然后通过0.45um PTFE注射器过滤器过滤。将该溶液与溶于乙醚(150mL)中的
对甲苯磺酸(1.5144g,7.956mmol)合并,得到沉淀。浓缩混合物并在真空下干燥。将所得物从
沸腾的乙腈(10mL)中重结晶,快速冷却,并在漏斗上收集所得固体。然后将其从沸腾的乙腈(20mL)中再次重结晶,在3天内缓慢冷却至RT,并倾析出母液。在RT下用乙腈(5mL)冲洗固体,在漏斗上收集,并在真空干燥器中干燥16hr,得到白色固体(2.08g,44.5%产率;HPLC Rt=3.329min)。
DCC偶联与K2CO3处理例:MN1433-EDC偶联
合成例MN1433(DCC偶联)
将1-甲基哌嗪(100mg,1.00mmol)、N,N’-二环己基碳二亚胺(227mg,1.10mmol)、1-羟基苯并三唑(51mg,0.33mmol)和反-4-(Boc-甲基氨基甲基)环己烷羧酸(271mg,1.00mmol)全部溶解在乙腈(10.0mL)中。将反应物在RT下搅拌16小时。除去所得沉淀,在漏斗上收集,并在真空下蒸发滤液。将来自滤液的所得油状物溶于EtOAc(5mL)中,并通过0.22um PTFE注射器式过滤器过滤,然后用EtOAc(95mL)稀释。用1M K2CO3(3x 33mL)和盐水(1x 50mL)洗涤该溶液。干燥(无水Na2SO4)有机层,过滤,并在真空下蒸发,将该物质通过硅胶(25-30g)色谱法进一步纯化,使用:5个级分(200mL),由CH2Cl2+1%NH3、1%MeOH的CH2Cl2溶液+1%NH3、2%MeOH的CH2Cl2溶液+1%NH3、5%MeOH的CH2Cl2溶液+1%NH3和10%MeOH的CH2Cl2溶液+1%NH3组成。合并含有产物的级分,并真空蒸发溶剂,得到油状物(319mg,90.2%产率;TLC Rf=
0.16(4%MeOH的CH2Cl2溶液+1%NH3);HPLC Rt=3.133min)。以类似方式合成以下化合物:
MN1433、MN1437、MN1438、MN1455、MN1456、MN1457、MN1458、MN1459、MN1460。
DCC偶联与NaOH/MOPS/HCl处理例:MN1456-DCC偶联
将4-(哌啶-4-基甲基)吡啶(88mg,0.5mmol)和反-4-(Boc-甲基氨基甲基)环己烷羧酸
(136mg,0.5mmol)均溶解在乙腈(5mL)中,然后加入N,N’-二环己基碳二亚胺(DCC)(113mg,
0.55mmol)之前。在24小时,通过烧结玻璃过滤反应物,并在真空下除去溶剂,得到固体。将所得固体溶解在EtOAc(100mL)中,并用1N NaOH(3x 25mL)和pH 8 0.2M MOPS缓冲液(3x
20mL)洗涤。用0.1N HCl(3x 50mL)萃取产物,用10N NaOH(5mL)碱化,用CH2Cl2(3x 50mL)萃取,并用盐水(30mL)洗涤。干燥(无水MgSO4)有机层,过滤,真空下蒸发溶剂,并在真空下干燥所得固体。将该物质通过硅胶(25-30g)色谱法进一步纯化,使用:4个级分(200mL),由己烷、35%丙酮的己烷溶液、50%丙酮的己烷溶液和65%丙酮的己烷溶液组成。合并含有产物的级分,并真空蒸发溶剂,得到固体(46mg,21%产率;TLC Rf=0.29(5%MeOH的CH2Cl2溶液);HPLC-200nm Rt=3.401min)。
MN1456、MN1457、MN1458、MN1459和MN1460的制备与MN1455类似。
DCC偶联,与NaOH/盐
水处理例:MN1435-EDC偶联
将1-(4-吡啶)哌嗪(326mg,2.00mmol)、羟基苯并三唑(HOBT)(101mg,0.66mmol)、N,N’-二环己基碳二亚胺(DCC)(454mg,2.2mmol)和Boc-反-4-(氨基甲基)环己烷-1-羧酸(515mg,
2.00mmol)全部溶解在乙腈(100mL)中。将反应物在RT下搅拌72hr。过滤反应混合物并真空蒸发滤液。将所得物溶于EtOAc(8mL)中并使用注射器通过0.22um PTFE过滤器过滤。用EtOAc(100mL)稀释滤液并用1M MaOH(3x 25mL)和饱和NaCl(50mL)洗涤。干燥(无水Na2SO4)有机层,过滤,并在真空下蒸发。将该物质通过硅胶(25-30g)色谱法进一步纯化,使用:3个级分(200mL),由CH2Cl2+1%NH3、5%MeOH的CH2Cl2溶液+1%NH3、12%MeOH的CH2Cl2溶液+1%NH3和20%MeOH的CH2Cl2溶液+1%NH3组成。合并含有产物的级分,并真空蒸发溶剂,得到固体(755.5mg,93.8%产率;TLC Rf=0.33(10%MeOH的CH2Cl2溶液+1%NH3);HPLC-200nm Rt=
3.137min)。
MN1436、MN1437和MN1438的合成类似于MN1435。
叔丁基脲同类物的合成例:MN1439-偶联、Boc裂解、脲形成方案。
MN1435 Boc裂解
将甲基(((ls,4s)-4-(4-(吡啶-4-基)哌嗪-1-羰基)环己基)甲基)氨基甲酸叔丁酯
(652.8mg,1.62mmol)溶于CH2Cl2(7mL),然后加入三氟乙酸(7mL)。将反应物搅拌20min,然后用甲苯(100mL)稀释并蒸发。将所得剩余物溶于1,4-二恶烷(25mL)中并在真空下蒸发。将其真空干燥,得到固体(1.401g,201%产率[剩余TFA];TLC Rf=0.24(10%MeOH的CH2Cl2溶液+
1%NH3);HPLC-200nm Rt=0.846min。
MN1439一脲形成