首页 / 专利库 / 化学元素和化合物 / / 免疫球蛋白结合蛋白质和使用其的亲和载体

免疫球蛋白结合蛋白质和使用其的亲和载体

阅读:574发布:2020-05-08

专利汇可以提供免疫球蛋白结合蛋白质和使用其的亲和载体专利检索,专利查询,专利分析的服务。并且本 发明 提供在酸性条件下的 抗体 解离率提高的源自蛋白L的免疫球蛋白结合 蛋白质 和使用其的亲和载体。所述免疫球蛋白结合蛋白质至少包含1个免疫球蛋白结合结构域的变异体,以及所述亲和载体包含固相载体,所述固相载体结合有该免疫球蛋白结合蛋白质。该免疫球蛋白结合结构域的变异体由与序列号1~9的任一个所示的 氨 基酸序列具有至少85%的同源性且具有赋予的变异的氨基酸序列构成,具有免疫球蛋白κ链结合活性。,下面是免疫球蛋白结合蛋白质和使用其的亲和载体专利的具体信息内容。

1.一种免疫球蛋白结合蛋白质,包含至少1个免疫球蛋白结合结构域的变异体,该免疫球蛋白结合结构域的变异体由与序列号1~9的任一个所示的基酸序列具有至少85%的同源性的氨基酸序列且具有选自以下的(a)~(n)中的至少1个变异的氨基酸序列构成,具有免疫球蛋白κ链结合活性:
(a)相当于序列号9所示的氨基酸序列的16位的位置的氨基酸残基取代为其它氨基酸残基或缺失,或者在该位置之前或之后的位置插入氨基酸残基;
(b)相当于序列号9所示的氨基酸序列的18位的位置的氨基酸残基取代为其它氨基酸残基或缺失,或者在该位置之前或之后的位置插入氨基酸残基;
(c)相当于序列号9所示的氨基酸序列的20位的位置的氨基酸残基取代为其它氨基酸残基或缺失,或者在该位置之前或之后的位置插入氨基酸残基;
(d)相当于序列号9所示的氨基酸序列的26位的位置的氨基酸残基取代为其它氨基酸残基或缺失,或者在该位置之前或之后的位置插入氨基酸残基;
(e)相当于序列号9所示的氨基酸序列的28位的位置的氨基酸残基取代为其它氨基酸残基或缺失,或者在该位置之前或之后的位置插入氨基酸残基;
(f)相当于序列号9所示的氨基酸序列的30位的位置的氨基酸残基取代为其它氨基酸残基或缺失,或者在该位置之前或之后的位置插入氨基酸残基;
(g)相当于序列号9所示的氨基酸序列的32位的位置的氨基酸残基取代为其它氨基酸残基或缺失,或者在该位置之前或之后的位置插入氨基酸残基;
(h)相当于序列号9所示的氨基酸序列的34位的位置的氨基酸残基取代为其它氨基酸残基或缺失,或者在该位置之前或之后的位置插入氨基酸残基;
(i)相当于序列号9所示的氨基酸序列的35位的位置的氨基酸残基取代为其它氨基酸残基或缺失,或者在该位置之前或之后的位置插入氨基酸残基;
(j)相当于序列号9所示的氨基酸序列的38位的位置的氨基酸残基取代为其它氨基酸残基或缺失,或者在该位置之前或之后的位置插入氨基酸残基;
(k)相当于序列号9所示的氨基酸序列的42位的位置的氨基酸残基取代为其它氨基酸残基或缺失,或者在该位置之前或之后的位置插入氨基酸残基;
(l)相当于序列号9所示的氨基酸序列的54位的位置的氨基酸残基取代为其它氨基酸残基或缺失,或者在该位置之前或之后的位置插入氨基酸残基;
(m)相当于序列号9所示的氨基酸序列的57位的位置的氨基酸残基取代为其它氨基酸残基或缺失,或者在该位置之前或之后的位置插入氨基酸残基;
(n)相当于序列号9所示的氨基酸序列的70位的位置的氨基酸残基取代为其它氨基酸残基或缺失,或者在该位置之前或之后的位置插入氨基酸残基。
2.根据权利要求1所述的免疫球蛋白结合蛋白质,其中,
所述(a)的变异是相当于序列号9所示的氨基酸序列的16位的位置的氨基酸残基取代为其它氨基酸残基,
所述(b)的变异是相当于序列号9所示的氨基酸序列的18位的位置的氨基酸残基取代为其它氨基酸残基,
所述(c)的变异是相当于序列号9所示的氨基酸序列的20位的位置的氨基酸残基取代为其它氨基酸残基,
所述(d)的变异是相当于序列号9所示的氨基酸序列的26位的位置的氨基酸残基取代为其它氨基酸残基,
所述(e)的变异是相当于序列号9所示的氨基酸序列的28位的位置的氨基酸残基取代为其它氨基酸残基,
所述(f)的变异是相当于序列号9所示的氨基酸序列的30位的位置的氨基酸残基取代为其它氨基酸残基,
所述(g)的变异是相当于序列号9所示的氨基酸序列的32位的位置的氨基酸残基取代为其它氨基酸残基,
所述(h)的变异是相当于序列号9所示的氨基酸序列的34位的位置的氨基酸残基取代为其它氨基酸残基,
所述(i)的变异是相当于序列号9所示的氨基酸序列的35位的位置的氨基酸残基取代为其它氨基酸残基,
所述(j)的变异是相当于序列号9所示的氨基酸序列的38位的位置的氨基酸残基取代为其它氨基酸残基,
所述(k)的变异是相当于序列号9所示的氨基酸序列的42位的位置的氨基酸残基取代为其它氨基酸残基,
所述(l)的变异是相当于序列号9所示的氨基酸序列的54位的位置的氨基酸残基取代为其它氨基酸残基,
所述(m)的变异是相当于序列号9所示的氨基酸序列的57位的位置的氨基酸残基取代为其它氨基酸残基,
所述(n)的变异是相当于序列号9所示的氨基酸序列的70位的位置的氨基酸残基取代为其它氨基酸残基。
3.根据权利要求1或2所述的免疫球蛋白结合蛋白质,其中,所述其它氨基酸残基为Gln、Asp、Lys、Arg或His。
4.根据权利要求1~3中任一项所述的免疫球蛋白结合蛋白质,其中,所述免疫球蛋白结合结构域的变异体由与序列号1~9的任一个所示的氨基酸序列具有至少85%的同源性且在选自相当于序列号9所示的氨基酸序列的16位、18位、20位、26位、28位、30位、32位、34位、35位、38位、42位、54位、57位和70位的位置中的至少1个位置具有选自Gln、Asp、Lys、Arg和His的氨基酸残基的氨基酸序列构成。
5.根据权利要求1~4中任一项所述的免疫球蛋白结合蛋白质,其中,所述免疫球蛋白结合结构域的变异体由与序列号1~9的任一个所示的氨基酸序列具有至少85%的同源性且具有以下的(a’)~(q’)的任一个的氨基酸序列构成:
(a’)相当于序列号9所示的氨基酸序列的16位的位置的His;
(b’)相当于序列号9所示的氨基酸序列的18位的位置的His;
(c’)相当于序列号9所示的氨基酸序列的20位的位置的His;
(d’)相当于序列号9所示的氨基酸序列的26位的位置的Arg;
(e’)相当于序列号9所示的氨基酸序列的28位的位置的His;
(f’)相当于序列号9所示的氨基酸序列的30位的位置的His;
(g’)相当于序列号9所示的氨基酸序列的32位的位置的His;
(h’)相当于序列号9所示的氨基酸序列的34位的位置的His;
(i’)相当于序列号9所示的氨基酸序列的35位的位置的Arg;
(j’)相当于序列号9所示的氨基酸序列的38位的位置的Lys;
(k’)相当于序列号9所示的氨基酸序列的42位的位置的Lys;
(l’)相当于序列号9所示的氨基酸序列的54位的位置的Gln;
(m’)相当于序列号9所示的氨基酸序列的57位的位置的His;
(n’)相当于序列号9所示的氨基酸序列的70位的位置的His;
(o’)该(d’)、(h’)、(i’)、(k’)和(l’)的组合;
(p’)该(d’)、(i’)、(k’)、(l’)和(m’)的组合;
(q’)该(d’)、(g’)、(i’)、(k’)和(l’)的组合。
6.根据权利要求1~5中任一项所述的免疫球蛋白结合蛋白质,其中,所述序列号1~9的任一个所示的氨基酸序列为序列号9所示的氨基酸序列。
7.根据权利要求1~6中任一项所述的免疫球蛋白结合蛋白质,其中,所述至少85%的同源性为至少90%的同源性。
8.根据权利要求1~7中任一项所述的免疫球蛋白结合蛋白质,其中,包含2个以上的所述免疫球蛋白结合结构域的变异体。
9.一种多核苷酸,编码权利要求1~8中任一项所述的免疫球蛋白结合蛋白质。
10.一种载体,包含权利要求9所述的多核苷酸。
11.一种转化体,包含权利要求10所述的载体。
12.一种亲和载体,包含固相载体和结合于该固相载体的权利要求1~8中任一项所述的免疫球蛋白结合蛋白质。
13.一种抗体或其片段的分离方法,使用权利要求12所述的亲和载体。
14.一种免疫球蛋白结合蛋白质的制造方法,包括使权利要求1~8中任一项所述的免疫球蛋白结合蛋白质在权利要求11所述的转化体或无细胞蛋白质合成系统中表达,或者化学合成。
15.一种方法,是免疫球蛋白结合结构域的变异体的制造方法,包括对由序列号1~9的任一个所示的氨基酸序列或与它们具有至少85%的同源性的氨基酸序列构成且具有免疫球蛋白κ链结合活性的多肽加入选自以下的(a)~(n)中的至少1个变异:
(a)相当于序列号9所示的氨基酸序列的16位的位置的氨基酸残基取代为其它氨基酸残基或缺失,或者在该位置之前或之后的位置插入氨基酸残基;
(b)相当于序列号9所示的氨基酸序列的18位的位置的氨基酸残基取代为其它氨基酸残基或缺失,或者在该位置之前或之后的位置插入氨基酸残基;
(c)相当于序列号9所示的氨基酸序列的20位的位置的氨基酸残基取代为其它氨基酸残基或缺失,或者在该位置之前或之后的位置插入氨基酸残基;
(d)相当于序列号9所示的氨基酸序列的26位的位置的氨基酸残基取代为其它氨基酸残基或缺失,或者在该位置之前或之后的位置插入氨基酸残基;
(e)相当于序列号9所示的氨基酸序列的28位的位置的氨基酸残基取代为其它氨基酸残基或缺失,或者在该位置之前或之后的位置插入氨基酸残基;
(f)相当于序列号9所示的氨基酸序列的30位的位置的氨基酸残基取代为其它氨基酸残基或缺失,或者在该位置之前或之后的位置插入氨基酸残基;
(g)相当于序列号9所示的氨基酸序列的32位的位置的氨基酸残基取代为其它氨基酸残基或缺失,或者在该位置之前或之后的位置插入氨基酸残基;
(h)相当于序列号9所示的氨基酸序列的34位的位置的氨基酸残基取代为其它氨基酸残基或缺失,或者在该位置之前或之后的位置插入氨基酸残基;
(i)相当于序列号9所示的氨基酸序列的35位的位置的氨基酸残基取代为其它氨基酸残基或缺失,或者在该位置之前或之后的位置插入氨基酸残基;
(j)相当于序列号9所示的氨基酸序列的38位的位置的氨基酸残基取代为其它氨基酸残基或缺失,或者在该位置之前或之后的位置插入氨基酸残基;
(k)相当于序列号9所示的氨基酸序列的42位的位置的氨基酸残基取代为其它氨基酸残基或缺失,或者在该位置之前或之后的位置插入氨基酸残基;
(l)相当于序列号9所示的氨基酸序列的54位的位置的氨基酸残基取代为其它氨基酸残基或缺失,或者在该位置之前或之后的位置插入氨基酸残基;
(m)相当于序列号9所示的氨基酸序列的57位的位置的氨基酸残基取代为其它氨基酸残基或缺失,或者在该位置之前或之后的位置插入氨基酸残基;
(n)相当于序列号9所示的氨基酸序列的70位的位置的氨基酸残基取代为其它氨基酸残基或缺失,或者在该位置之前或之后的位置插入氨基酸残基。
16.一种亲和载体的制造方法,包括将权利要求1~8中任一项所述的免疫球蛋白结合蛋白质固定于固相载体。

说明书全文

免疫球蛋白结合蛋白质和使用其的亲和载体

技术领域

[0001] 本发明涉及免疫球蛋白结合蛋白质、使用其的亲和载体以及使用该亲和载体的抗体或其片段的分离方法。

背景技术

[0002] 抗体近年来被广泛利用于研究用试剂、抗体医药等。这些试剂、医药用的抗体通常通过亲和色谱进行纯化。抗体的亲和纯化通常使用固定化有作为与免疫球蛋白特异性结合的物质的配体的柱。该配体通常使用蛋白A、蛋白G、蛋白L等免疫球蛋白结合蛋白质。
[0003] 抗体的亲和纯化中,一般而言,首先在中性条件下使抗体吸附于柱后,通过清洗而除去杂质,接着将柱曝露于酸性条件,使所吸附的抗体从配体解离、洗脱。对于抗体的洗脱,由于在强酸性条件下抗体有时受到变性等损伤,因此,优选尽可能在温和的酸性条件下进行。另一方面,在温和的酸性条件下时,抗体不易从柱洗脱,因此,抗体的纯化效率降低。期望改善在温和的酸性条件下抗体从亲和柱的解离行为。
[0004] 蛋白A是从相对较早一直使用的配体蛋白质,提高在温和的酸性条件下的抗体解离行为的技术也从较早一直在研究。例如,在专利文献1中,通过对蛋白质A的E结构域导入部位特异性突变,提高在较温和的酸性条件(pH4.5附近)下的抗体解离行为。
[0005] 蛋白L由于与免疫球蛋白轻链κ结构域结合,因此,使用于Fab、单链抗体(scFv)等低分子抗体的纯化。关于改变为亲和配体用的蛋白L的报告少。例如,专利文献2和3中记载了包含蛋白L的结构域或其变异体的免疫球蛋白κ链结合性多肽。专利文献4中记载了具有蛋白L的免疫球蛋白轻链κ结构域结合性肽的选自基酸序列的15位、16位、17位和18位中的1个以上的氨基酸残基被取代的氨基酸序列且其酸解离pH与取代导入前相比移至中性侧的免疫球蛋白κ链可变区域结合性肽。专利文献5中记载了包含在蛋白L的免疫球蛋白结合结构域的氨基酸序列中选自第7位、第13位、第22位和第29位中的部位的至少2个以上被赖氨酸以外的性氨基酸或具有羟基的氨基酸取代的氨基酸序列的免疫球蛋白结合结构域的碱稳定性优异。
[0006] 现有技术文献
[0007] 专利文献
[0008] 专利文献1:日本专利第5229888号公报
[0009] 专利文献2:国际公开公报第2016/096643号
[0010] 专利文献3:美国专利第6884629号公报
[0011] 专利文献4:国际公开公报第2016/121703号
[0012] 专利文献5:国际公开公报第2017/069158号

发明内容

[0013] 以往的亲和载体在温和的酸性条件下抗体的纯化效率不充分,寻求一种用于作为亲和配体使用的在温和的酸性条件下的抗体解离率提高的源自蛋白L的免疫球蛋白结合结构域。本发明提供在温和的酸性条件下的抗体解离率提高的包含源自蛋白L的免疫球蛋白结合结构域的变异体的免疫球蛋白结合蛋白质和使用其的亲和载体。
[0014] 本发明提供以下内容。
[0015] 一种免疫球蛋白结合蛋白质,包含至少1个免疫球蛋白结合结构域的变异体,[0016] 该免疫球蛋白结合结构域的变异体由与序列号1~9的任一个所示的氨基酸序列具有至少85%的同源性的氨基酸序列且具有选自以下的(a)~(n)中的至少1个变异的氨基酸序列构成,具有免疫球蛋白κ链结合活性:
[0017] (a)相当于序列号9所示的氨基酸序列的16位的位置的氨基酸残基取代为其它氨基酸残基或缺失,或者在该位置之前或之后的位置插入氨基酸残基;
[0018] (b)相当于序列号9所示的氨基酸序列的18位的位置的氨基酸残基取代为其它氨基酸残基或缺失,或者在该位置之前或之后的位置插入氨基酸残基;
[0019] (c)相当于序列号9所示的氨基酸序列的20位的位置的氨基酸残基取代为其它氨基酸残基或缺失,或者在该位置之前或之后的位置插入氨基酸残基;
[0020] (d)相当于序列号9所示的氨基酸序列的26位的位置的氨基酸残基取代为其它氨基酸残基或缺失,或者在该位置之前或之后的位置插入氨基酸残基;
[0021] (e)相当于序列号9所示的氨基酸序列的28位的位置的氨基酸残基取代为其它氨基酸残基或缺失,或者在该位置之前或之后的位置插入氨基酸残基;
[0022] (f)相当于序列号9所示的氨基酸序列的30位的位置的氨基酸残基取代为其它氨基酸残基或缺失,或者在该位置之前或之后的位置插入氨基酸残基;
[0023] (g)相当于序列号9所示的氨基酸序列的32位的位置的氨基酸残基取代为其它氨基酸残基或缺失,或者在该位置之前或之后的位置插入氨基酸残基;
[0024] (h)相当于序列号9所示的氨基酸序列的34位的位置的氨基酸残基取代为其它氨基酸残基或缺失,或者在该位置之前或之后的位置插入氨基酸残基;
[0025] (i)相当于序列号9所示的氨基酸序列的35位的位置的氨基酸残基取代为其它氨基酸残基或缺失,或者在该位置之前或之后的位置插入氨基酸残基;
[0026] (j)相当于序列号9所示的氨基酸序列的38位的位置的氨基酸残基取代为其它氨基酸残基或缺失,或者在该位置之前或之后的位置插入氨基酸残基;
[0027] (k)相当于序列号9所示的氨基酸序列的42位的位置的氨基酸残基取代为其它氨基酸残基或缺失,或者在该位置之前或之后的位置插入氨基酸残基;
[0028] (l)相当于序列号9所示的氨基酸序列的54位的位置的氨基酸残基取代为其它氨基酸残基或缺失,或者在该位置之前或之后的位置插入氨基酸残基;
[0029] (m)相当于序列号9所示的氨基酸序列的57位的位置的氨基酸残基取代为其它氨基酸残基或缺失,或者在该位置之前或之后的位置插入氨基酸残基;
[0030] (n)相当于序列号9所示的氨基酸序列的70位的位置的氨基酸残基取代为其它氨基酸残基或缺失,或者在该位置之前或之后的位置插入氨基酸残基。
[0031] 另外,本发明提供编码所述免疫球蛋白结合蛋白质的多核苷酸。
[0032] 另外,本发明提供包含所述多核苷酸的载体。
[0033] 另外,本发明提供包含所述载体的转化体。
[0034] 另外,本发明提供包含固相载体和结合于该固相载体的所述免疫球蛋白结合蛋白质的亲和载体。
[0035] 另外,本发明提供使用所述亲和载体的抗体或其片段的分离方法。
[0036] 另外,本发明提供包括使所述免疫球蛋白结合蛋白质在所述转化体或无细胞蛋白质合成系统中表达,或者化学合成的免疫球蛋白结合蛋白质的制造方法。
[0037] 另外,本发明提供以下内容:
[0038] 一种方法,是免疫球蛋白结合结构域的变异体的制造方法,包括对由序列号1~9的任一个所示的氨基酸序列或与它们具有至少85%的同源性的氨基酸序列构成且具有免疫球蛋白κ链结合活性的多肽加入选自以下的(a)~(n)中的至少1个变异:
[0039] (a)相当于序列号9所示的氨基酸序列的16位的位置的氨基酸残基取代为其它氨基酸残基或缺失,或者在该位置之前或之后的位置插入氨基酸残基;
[0040] (b)相当于序列号9所示的氨基酸序列的18位的位置的氨基酸残基取代为其它氨基酸残基或缺失,或者在该位置之前或之后的位置插入氨基酸残基;
[0041] (c)相当于序列号9所示的氨基酸序列的20位的位置的氨基酸残基取代为其它氨基酸残基或缺失,或者在该位置之前或之后的位置插入氨基酸残基;
[0042] (d)相当于序列号9所示的氨基酸序列的26位的位置的氨基酸残基取代为其它氨基酸残基或缺失,或者在该位置之前或之后的位置插入氨基酸残基;
[0043] (e)相当于序列号9所示的氨基酸序列的28位的位置的氨基酸残基取代为其它氨基酸残基或缺失,或者在该位置之前或之后的位置插入氨基酸残基;
[0044] (f)相当于序列号9所示的氨基酸序列的30位的位置的氨基酸残基取代为其它氨基酸残基或缺失,或者在该位置之前或之后的位置插入氨基酸残基;
[0045] (g)相当于序列号9所示的氨基酸序列的32位的位置的氨基酸残基取代为其它氨基酸残基或缺失,或者在该位置之前或之后的位置插入氨基酸残基;
[0046] (h)相当于序列号9所示的氨基酸序列的34位的位置的氨基酸残基取代为其它氨基酸残基或缺失,或者在该位置之前或之后的位置插入氨基酸残基;
[0047] (i)相当于序列号9所示的氨基酸序列的35位的位置的氨基酸残基取代为其它氨基酸残基或缺失,或者在该位置之前或之后的位置插入氨基酸残基;
[0048] (j)相当于序列号9所示的氨基酸序列的38位的位置的氨基酸残基取代为其它氨基酸残基或缺失,或者在该位置之前或之后的位置插入氨基酸残基;
[0049] (k)相当于序列号9所示的氨基酸序列的42位的位置的氨基酸残基取代为其它氨基酸残基或缺失,或者在该位置之前或之后的位置插入氨基酸残基;
[0050] (l)相当于序列号9所示的氨基酸序列的54位的位置的氨基酸残基取代为其它氨基酸残基或缺失,或者在该位置之前或之后的位置插入氨基酸残基;
[0051] (m)相当于序列号9所示的氨基酸序列的57位的位置的氨基酸残基取代为其它氨基酸残基或缺失,或者在该位置之前或之后的位置插入氨基酸残基;
[0052] (n)相当于序列号9所示的氨基酸序列的70位的位置的氨基酸残基取代为其它氨基酸残基或缺失,或者在该位置之前或之后的位置插入氨基酸残基。
[0053] 另外,本发明提供包括将所述免疫球蛋白结合蛋白质固定于固相载体的亲和载体的制造方法。
[0054] 本发明的免疫球蛋白结合蛋白质对免疫球蛋白κ链的结合活性高且在酸性条件下的抗体解离率高,因此,作为亲和配体有用。

具体实施方式

[0055] 以下记载本发明的例示性的实施方式。
[0056] [1]一种免疫球蛋白结合蛋白质,包含至少1个免疫球蛋白结合结构域的变异体,[0057] 该免疫球蛋白结合结构域的变异体由与序列号1~9的任一个所示的氨基酸序列具有至少85%的同源性的氨基酸序列且具有选自以下的(a)~(n)中的至少1个变异的氨基酸序列构成,具有免疫球蛋白κ链结合活性:
[0058] (a)相当于序列号9所示的氨基酸序列的16位的位置的氨基酸残基取代为其它氨基酸残基或缺失,或者在该位置之前或之后的位置插入氨基酸残基;
[0059] (b)相当于序列号9所示的氨基酸序列的18位的位置的氨基酸残基取代为其它氨基酸残基或缺失,或者在该位置之前或之后的位置插入氨基酸残基;
[0060] (c)相当于序列号9所示的氨基酸序列的20位的位置的氨基酸残基取代为其它氨基酸残基或缺失,或者在该位置之前或之后的位置插入氨基酸残基;
[0061] (d)相当于序列号9所示的氨基酸序列的26位的位置的氨基酸残基取代为其它氨基酸残基或缺失,或者在该位置之前或之后的位置插入氨基酸残基;
[0062] (e)相当于序列号9所示的氨基酸序列的28位的位置的氨基酸残基取代为其它氨基酸残基或缺失,或者在该位置之前或之后的位置插入氨基酸残基;
[0063] (f)相当于序列号9所示的氨基酸序列的30位的位置的氨基酸残基取代为其它氨基酸残基或缺失,或者在该位置之前或之后的位置插入氨基酸残基;
[0064] (g)相当于序列号9所示的氨基酸序列的32位的位置的氨基酸残基取代为其它氨基酸残基或缺失,或者在该位置之前或之后的位置插入氨基酸残基;
[0065] (h)相当于序列号9所示的氨基酸序列的34位的位置的氨基酸残基取代为其它氨基酸残基或缺失,或者在该位置之前或之后的位置插入氨基酸残基;
[0066] (i)相当于序列号9所示的氨基酸序列的35位的位置的氨基酸残基取代为其它氨基酸残基或缺失,或者在该位置之前或之后的位置插入氨基酸残基;
[0067] (j)相当于序列号9所示的氨基酸序列的38位的位置的氨基酸残基取代为其它氨基酸残基或缺失,或者在该位置之前或之后的位置插入氨基酸残基;
[0068] (k)相当于序列号9所示的氨基酸序列的42位的位置的氨基酸残基取代为其它氨基酸残基或缺失,或者在该位置之前或之后的位置插入氨基酸残基;
[0069] (l)相当于序列号9所示的氨基酸序列的54位的位置的氨基酸残基取代为其它氨基酸残基或缺失,或者在该位置之前或之后的位置插入氨基酸残基;
[0070] (m)相当于序列号9所示的氨基酸序列的57位的位置的氨基酸残基取代为其它氨基酸残基或缺失,或者在该位置之前或之后的位置插入氨基酸残基;
[0071] (n)相当于序列号9所示的氨基酸序列的70位的位置的氨基酸残基取代为其它氨基酸残基或缺失,或者在该位置之前或之后的位置插入氨基酸残基。
[0072] [2]根据[1]所述的免疫球蛋白结合蛋白质,其中,
[0073] 上述(a)的变异是相当于序列号9所示的氨基酸序列的16位的位置的氨基酸残基取代为其它氨基酸残基,
[0074] 上述(b)的变异是相当于序列号9所示的氨基酸序列的18位的位置的氨基酸残基取代为其它氨基酸残基,
[0075] 上述(c)的变异是相当于序列号9所示的氨基酸序列的20位的位置的氨基酸残基取代为其它氨基酸残基,
[0076] 上述(d)的变异是相当于序列号9所示的氨基酸序列的26位的位置的氨基酸残基取代为其它氨基酸残基,
[0077] 上述(e)的变异是相当于序列号9所示的氨基酸序列的28位的位置的氨基酸残基取代为其它氨基酸残基,
[0078] 上述(f)的变异是相当于序列号9所示的氨基酸序列的30位的位置的氨基酸残基取代为其它氨基酸残基,
[0079] 上述(g)的变异是相当于序列号9所示的氨基酸序列的32位的位置的氨基酸残基取代为其它氨基酸残基,
[0080] 上述(h)的变异是相当于序列号9所示的氨基酸序列的34位的位置的氨基酸残基取代为其它氨基酸残基,
[0081] 上述(i)的变异是相当于序列号9所示的氨基酸序列的35位的位置的氨基酸残基取代为其它氨基酸残基,
[0082] 上述(j)的变异是相当于序列号9所示的氨基酸序列的38位的位置的氨基酸残基取代为其它氨基酸残基,
[0083] 上述(k)的变异是相当于序列号9所示的氨基酸序列的42位的位置的氨基酸残基取代为其它氨基酸残基,
[0084] 上述(l)的变异是相当于序列号9所示的氨基酸序列的54位的位置的氨基酸残基取代为其它氨基酸残基,
[0085] 上述(m)的变异是相当于序列号9所示的氨基酸序列的57位的位置的氨基酸残基取代为其它氨基酸残基,
[0086] 上述(n)的变异是相当于序列号9所示的氨基酸序列的70位的位置的氨基酸残基取代为其它氨基酸残基。
[0087] [3]根据[1]或[2]所述的免疫球蛋白结合蛋白质,其中,上述其它氨基酸残基为Gln、Asp、Lys、Arg或His。
[0088] [4]根据[1]~[3]中任一项所述的免疫球蛋白结合蛋白质,其中,上述免疫球蛋白结合结构域的变异体由与序列号1~9的任一个所示的氨基酸序列具有至少85%的同源性且在选自相当于序列号9所示的氨基酸序列的16位、18位、20位、26位、28位、30位、32位、34位、35位、38位、42位、54位、57位和70位的位置中的至少1个位置具有选自Gln、Asp、Lys、Arg和His中的氨基酸残基的氨基酸序列构成。
[0089] [5]根据[1]~[4]中任一项所述的免疫球蛋白结合蛋白质,其中,上述免疫球蛋白结合结构域的变异体由与序列号1~9的任一个所示的氨基酸序列具有至少85%的同源性且具有以下的(a’)~(q’)的任一个的氨基酸序列构成:
[0090] (a’)相当于序列号9所示的氨基酸序列的16位的位置的His;
[0091] (b’)相当于序列号9所示的氨基酸序列的18位的位置的His;
[0092] (c’)相当于序列号9所示的氨基酸序列的20位的位置的His;
[0093] (d’)相当于序列号9所示的氨基酸序列的26位的位置的Arg;
[0094] (e’)相当于序列号9所示的氨基酸序列的28位的位置的His;
[0095] (f’)相当于序列号9所示的氨基酸序列的30位的位置的His;
[0096] (g’)相当于序列号9所示的氨基酸序列的32位的位置的His;
[0097] (h’)相当于序列号9所示的氨基酸序列的34位的位置的His;
[0098] (i’)相当于序列号9所示的氨基酸序列的35位的位置的Arg;
[0099] (j’)相当于序列号9所示的氨基酸序列的38位的位置的Lys;
[0100] (k’)相当于序列号9所示的氨基酸序列的42位的位置的Lys;
[0101] (l’)相当于序列号9所示的氨基酸序列的54位的位置的Gln;
[0102] (m’)相当于序列号9所示的氨基酸序列的57位的位置的His;
[0103] (n’)相当于序列号9所示的氨基酸序列的70位的位置的His;
[0104] (o’)该(d’)、(h’)、(i’)、(k’)和(l’)的组合;
[0105] (p’)该(d’)、(i’)、(k’)、(l’)和(m’)的组合;
[0106] (q’)该(d’)、(g’)、(i’)、(k’)和(l’)的组合。
[0107] [6]根据[1]~[5]中任一项所述的免疫球蛋白结合蛋白质,其中,上述序列号1~9的任一个所示的氨基酸序列为序列号9所示的氨基酸序列。
[0108] [7]根据[1]~[6]中任一项所述的免疫球蛋白结合蛋白质,其中,上述至少85%的同源性为至少90%的同源性。
[0109] [8]根据[1]~[7]中任一项所述的免疫球蛋白结合蛋白质,包含2个以上的上述免疫球蛋白结合结构域的变异体。
[0110] [9]一种多核苷酸,编码[1]~[8]中任一项所述的免疫球蛋白结合蛋白质。
[0111] [10]一种载体,包含[9]所述的多核苷酸。
[0112] [11]一种转化体,包含[10]所述的载体。
[0113] [12]一种亲和载体,包含固相载体和结合于该固相载体的[1]~[8]中任一项所述的免疫球蛋白结合蛋白质。
[0114] [13]一种抗体或其片段的分离方法,使用[12]所述的亲和载体。
[0115] [14]一种免疫球蛋白结合蛋白质的制造方法,包括使[1]~[8]中任一项所述的免疫球蛋白结合蛋白质在[11]所述的转化体或无细胞蛋白质合成系统中表达,或者化学合成。
[0116] [15]一种方法,是免疫球蛋白结合结构域的变异体的制造方法,包括对由序列号1~9的任一个所示的氨基酸序列或与它们具有至少85%的同源性的氨基酸序列构成且具有免疫球蛋白κ链结合活性的多肽加入选自以下的(a)~(n)中的至少1个变异:
[0117] (a)相当于序列号9所示的氨基酸序列的16位的位置的氨基酸残基取代为其它氨基酸残基或缺失,或者在该位置之前或之后的位置插入氨基酸残基;
[0118] (b)相当于序列号9所示的氨基酸序列的18位的位置的氨基酸残基取代为其它氨基酸残基或缺失,或者在该位置之前或之后的位置插入氨基酸残基;
[0119] (c)相当于序列号9所示的氨基酸序列的20位的位置的氨基酸残基取代为其它氨基酸残基或缺失,或者在该位置之前或之后的位置插入氨基酸残基;
[0120] (d)相当于序列号9所示的氨基酸序列的26位的位置的氨基酸残基取代为其它氨基酸残基或缺失,或者在该位置之前或之后的位置插入氨基酸残基;
[0121] (e)相当于序列号9所示的氨基酸序列的28位的位置的氨基酸残基取代为其它氨基酸残基或缺失,或者在该位置之前或之后的位置插入氨基酸残基;
[0122] (f)相当于序列号9所示的氨基酸序列的30位的位置的氨基酸残基取代为其它氨基酸残基或缺失,或者在该位置之前或之后的位置插入氨基酸残基;
[0123] (g)相当于序列号9所示的氨基酸序列的32位的位置的氨基酸残基取代为其它氨基酸残基或缺失,或者在该位置之前或之后的位置插入氨基酸残基;
[0124] (h)相当于序列号9所示的氨基酸序列的34位的位置的氨基酸残基取代为其它氨基酸残基或缺失,或者在该位置之前或之后的位置插入氨基酸残基;
[0125] (i)相当于序列号9所示的氨基酸序列的35位的位置的氨基酸残基取代为其它氨基酸残基或缺失,或者在该位置之前或之后的位置插入氨基酸残基;
[0126] (j)相当于序列号9所示的氨基酸序列的38位的位置的氨基酸残基取代为其它氨基酸残基或缺失,或者在该位置之前或之后的位置插入氨基酸残基;
[0127] (k)相当于序列号9所示的氨基酸序列的42位的位置的氨基酸残基取代为其它氨基酸残基或缺失,或者在该位置之前或之后的位置插入氨基酸残基;
[0128] (l)相当于序列号9所示的氨基酸序列的54位的位置的氨基酸残基取代为其它氨基酸残基或缺失,或者在该位置之前或之后的位置插入氨基酸残基;
[0129] (m)相当于序列号9所示的氨基酸序列的57位的位置的氨基酸残基取代为其它氨基酸残基或缺失,或者在该位置之前或之后的位置插入氨基酸残基;
[0130] (n)相当于序列号9所示的氨基酸序列的70位的位置的氨基酸残基取代为其它氨基酸残基或缺失,或者在该位置之前或之后的位置插入氨基酸残基。
[0131] [16]根据[15]所述的制造方法,其中,
[0132] 上述(a)的变异是相当于序列号9所示的氨基酸序列的16位的位置的氨基酸残基取代为其它氨基酸残基,
[0133] 上述(b)的变异是相当于序列号9所示的氨基酸序列的18位的位置的氨基酸残基取代为其它氨基酸残基,
[0134] 上述(c)的变异是相当于序列号9所示的氨基酸序列的20位的位置的氨基酸残基取代为其它氨基酸残基,
[0135] 上述(d)的变异是相当于序列号9所示的氨基酸序列的26位的位置的氨基酸残基取代为其它氨基酸残基,
[0136] 上述(e)的变异是相当于序列号9所示的氨基酸序列的28位的位置的氨基酸残基取代为其它氨基酸残基,
[0137] 上述(f)的变异是相当于序列号9所示的氨基酸序列的30位的位置的氨基酸残基取代为其它氨基酸残基,
[0138] 上述(g)的变异是相当于序列号9所示的氨基酸序列的32位的位置的氨基酸残基取代为其它氨基酸残基,
[0139] 上述(h)的变异是相当于序列号9所示的氨基酸序列的34位的位置的氨基酸残基取代为其它氨基酸残基,
[0140] 上述(i)的变异是相当于序列号9所示的氨基酸序列的35位的位置的氨基酸残基取代为其它氨基酸残基,
[0141] 上述(j)的变异是相当于序列号9所示的氨基酸序列的38位的位置的氨基酸残基取代为其它氨基酸残基,
[0142] 上述(k)的变异是相当于序列号9所示的氨基酸序列的42位的位置的氨基酸残基取代为其它氨基酸残基,
[0143] 上述(l)的变异是相当于序列号9所示的氨基酸序列的54位的位置的氨基酸残基取代为其它氨基酸残基,
[0144] 上述(m)的变异是相当于序列号9所示的氨基酸序列的57位的位置的氨基酸残基取代为其它氨基酸残基,
[0145] 上述(n)的变异是相当于序列号9所示的氨基酸序列的70位的位置的氨基酸残基取代为其它氨基酸残基。
[0146] [17]根据[15]或[16]所述的制造方法,其中,上述其它氨基酸残基为Gln、Asp、Lys、Arg或His。
[0147] [18]根据[15]~[17]中任一项所述的制造方法,其中,
[0148] 上述至少1个变异为以下的(a’)~(q’)的任一个:
[0149] (a’)相当于序列号9所示的氨基酸序列的16位的位置的氨基酸残基取代为His;
[0150] (b’)相当于序列号9所示的氨基酸序列的18位的位置的氨基酸残基取代为His;
[0151] (c’)相当于序列号9所示的氨基酸序列的20位的位置的氨基酸残基取代为His;
[0152] (d’)相当于序列号9所示的氨基酸序列的26位的位置的氨基酸残基取代为Arg;
[0153] (e’)相当于序列号9所示的氨基酸序列的28位的位置的氨基酸残基取代为His;
[0154] (f’)相当于序列号9所示的氨基酸序列的30位的位置的氨基酸残基取代为His;
[0155] (g’)相当于序列号9所示的氨基酸序列的32位的位置的氨基酸残基取代为His;
[0156] (h’)相当于序列号9所示的氨基酸序列的34位的位置的氨基酸残基取代为His;
[0157] (i’)相当于序列号9所示的氨基酸序列的35位的位置的氨基酸残基取代为Arg;
[0158] (j’)相当于序列号9所示的氨基酸序列的38位的位置的氨基酸残基取代为Lys;
[0159] (k’)相当于序列号9所示的氨基酸序列的42位的位置的氨基酸残基取代为Lys;
[0160] (l’)相当于序列号9所示的氨基酸序列的54位的位置的氨基酸残基取代为Gln;
[0161] (m’)相当于序列号9所示的氨基酸序列的57位的位置的氨基酸残基取代为His;
[0162] (n’)相当于序列号9所示的氨基酸序列的70位的位置的氨基酸残基取代为His;
[0163] (o’)该(d’)、(h’)、(i’)、(k’)和(l’)的组合;
[0164] (p’)该(d’)、(i’)、(k’)、(l’)和(m’)的组合;
[0165] (q’)该(d’)、(g’)、(i’)、(k’)和(l’)的组合。
[0166] [19]根据[15]~[18]中任一项所述的制造方法,其中,上述序列号1~9的任一个所示的氨基酸序列为序列号9所示的氨基酸序列。
[0167] [20]根据[15]~[19]中任一项所述的制造方法,其中,上述至少85%的同源性为至少90%的同源性。
[0168] [21]根据[15]~[20]中任一项所述的制造方法,其中,上述免疫球蛋白结合结构域的变异体与亲本结构域(親ドメイン)相比,在酸性条件下的抗体解离行为提高。
[0169] [22]根据[15]~[21]中任一项所述的制造方法,其中,进一步包括使加入了上述变异的多肽在[11]所述的转化体或无细胞蛋白质合成系统中表达,或者化学合成。
[0170] [23]一种亲和载体的制造方法,包括将作为配体的[1]~[8]中任一项所述的免疫球蛋白结合蛋白质固定于固相载体。
[0171] 本说明书中,氨基酸序列、核苷酸序列的同源性可以使用Karlin和Altschul的算法BLAST(Pro.Natl.Acad.Sci.USA,1993,90:5873-5877)来决定。基于该BLAST算法开发了被称为BLASTN、BLASTX、BLASTP、TBLASTN和TBLASTX的程序(J.Mol.Biol.,1990,215:403-410)。使用这些程序时,使用各程序的默认参数。这些解析方法的具体的方法是公知的(参照www.ncbi.nlm.nih.gov)。
[0172] 本说明书中,关于氨基酸序列和核苷酸序列的“至少85%的同源性”是指85%以上的同源性、优选90%以上的同源性、更优选95%以上的同源性、进一步优选97%以上的同源性、进一步优选98%以上的同源性、再进一步优选99%以上的同源性。另外,关于氨基酸序列和核苷酸序列的“至少90%的同源性”是指90%以上的同源性、优选95%以上的同源性、进一步优选97%以上的同源性、进一步优选98%以上的同源性、再进一步优选99%以上的同源性。
[0173] 本说明书中,氨基酸序列和核苷酸序列上的“相当的位置”可以通过将目标序列和参照序列(例如序列号9所示的氨基酸序列)以对各氨基酸序列或核苷酸序列中存在的保守氨基酸残基或核苷酸给予最大的同源性的方式排列(比对)来决定。比对可以使用公知的算法执行,其顺序是本领域技术人员公知的。例如,比对可以通过以默认设定使用Clustal W多重比对程序(Thompson,J.D.et al,1994,Nucleic Acids Res.,22:4673-4680)来进行。Clustal W例如可以在欧洲生物信息学研究所(European Bioinformatics Institute:EBI[www.ebi.ac.uk/index.html])、国立遗传学研究所经营的日本DNA数据库(DDBJ
[www.ddbj.nig.ac.jp/Welcome-j.html])的网站上利用。
[0174] 本说明书中,氨基酸残基也以以下的缩写记载:丙氨酸(Ala或A)、精氨酸(Arg或R)、天冬酰胺(Asn或N)、天冬氨酸(Asp或D)、半胱氨酸(Cys或C)、谷氨酰胺(Gln或Q)、谷氨酸(Glu或E)、甘氨酸(Gly或G)、组氨酸(His或H)、异亮氨酸(Ile或I)、亮氨酸(Leu或L)、赖氨酸(Lys或K)、甲硫氨酸(Met或M)、苯丙氨酸(Phe或F)、脯氨酸(Pro或P)、丝氨酸(Ser或S)、苏氨酸(Thr或T)、色氨酸(Trp或W)、酪氨酸(Tyr或Y)、缬氨酸(Val或V);和任意的氨基酸残基(Xaa或X)。另外,本说明书中,肽的氨基酸序列依照常规方法,以氨基末端(以下称为N末端)位于左侧、羧基末端(以下称为C末端)位于右侧的方式记载。
[0175] 本说明书中,相对于氨基酸序列的特定位置的“前”和“后”的位置分别是指与该特定位置的N末端侧和C末端侧邻接的位置。例如,在特定位置的“前”和“后”的位置插入氨基酸残基时,插入后的氨基酸残基配置于与该特定位置的N末端侧和C末端侧邻接的位置。
[0176] 本说明书中,蛋白L是指由大芬戈尔德菌(Finegoldia magna)生产的蛋白质的1种即蛋白L。
[0177] 本说明书中,“免疫球蛋白结合蛋白质”是指对免疫球蛋白(或抗体或者抗体的片段)具有结合活性的蛋白质。本说明书中,“免疫球蛋白”(Ig)包含IgG、IgA、IgD、IgE、IgM和它们的亚类等任意类型的免疫球蛋白。本说明书中的“抗体”是指免疫球蛋白或包含抗原识别部位的其片段,例如,可包含IgG、IgA、IgD、IgE、IgM和它们的亚类等任意类型的免疫球蛋白、其片段、它们的变异体等。另外,本说明书中的“抗体”也可以为人源化抗体等嵌合抗体、抗体复合体和包含抗原识别部位的其它免疫球蛋白修饰体等。另外,本说明书中的“抗体的片段”可以为包含抗原识别部位的抗体的片段,也可以为不包含抗原识别部位的抗体的片段。作为不包含抗原识别部位的抗体的片段,例如可举出仅由免疫球蛋白的Fc区域构成的蛋白质、Fc融合蛋白质和它们的变异体、修饰体等。
[0178] 本说明书中“免疫球蛋白结合结构域”是指免疫球蛋白结合蛋白质中所含的单独具有免疫球蛋白(或抗体或者抗体的片段)结合活性的多肽的功能单元。作为该“免疫球蛋白结合结构域”的例子,可举出对免疫球蛋白的κ链具有结合活性的结构域,例如蛋白L的免疫球蛋白结合结构域和具有免疫球蛋白κ链结合活性的它们的变异体。
[0179] 作为该蛋白L的免疫球蛋白结合结构域的例子,可举出大芬戈尔德菌(Finegoldia magna)312株产生的蛋白L的B1结构域、B2结构域、B3结构域、B4结构域和B5结构域,大芬戈尔德菌3316株产生的蛋白L的C1结构域、C2结构域、C3结构域和C4结构域,其中,更优选C1结构域、C2结构域、C3结构域和C4结构域。蛋白L的B1结构域由序列号1所示的氨基酸序列构成。蛋白L的B2结构域由序列号2所示的氨基酸序列构成。蛋白L的B3结构域由序列号3所示的氨基酸序列构成。蛋白L的B4结构域由序列号4所示的氨基酸序列构成。蛋白L的B5结构域由序列号5所示的氨基酸序列构成。蛋白L的C1结构域由序列号6所示的氨基酸序列构成。蛋白L的C2结构域由序列号7所示的氨基酸序列构成。蛋白L的C3结构域由序列号8所示的氨基酸序列构成。蛋白L的C4结构域由序列号9所示的氨基酸序列构成。这些蛋白L的免疫球蛋白结合结构域彼此的氨基酸序列的类似性高。表1示出序列号1~9所示的蛋白L的结构域的氨基酸序列的比对。
[0180] [表1]
[0181]
[0182] 作为该蛋白L的免疫球蛋白结合结构域的变异体的例子,可举出由与序列号1~9的任一个所示的氨基酸序列具有至少85%的同源性的氨基酸序列构成且具有免疫球蛋白κ链结合活性的多肽。优选可举出由与序列号6~9的任一个所示的氨基酸序列具有至少85%的同源性的氨基酸序列构成且具有免疫球蛋白κ链结合活性的多肽作为该蛋白L的免疫球蛋白结合结构域的变异体的例子。
[0183] 本说明书中,免疫球蛋白结合结构域或免疫球蛋白结合蛋白质的“在酸性条件下的抗体解离行为”是指酸性条件下、优选pH3.0的条件下的该结构域或蛋白质和抗体的解离率的高低。另外,本说明书中,“抗体解离行为的提高”是指抗体的解离率变得更高。结构域和抗体的解离率可以通过后述的试验例1中记载的方法来测定。
[0184] 1.免疫球蛋白结合蛋白质
[0185] 本发明的免疫球蛋白结合蛋白质包含至少1个源自蛋白L的免疫球蛋白结合结构域的免疫球蛋白结合结构域的变异体(以下也称为本发明的变异体)。本发明的变异体可以通过对作为亲本结构域的源自蛋白L的免疫球蛋白结合结构域或其变异体加入规定的变异而得到。本发明的变异体具有免疫球蛋白κ链结合性且与亲本结构域相比酸性条件下的抗体解离行为提高。具有本发明的变异体的本发明的免疫球蛋白结合蛋白质可以作为亲和载体的配体使用。
[0186] 作为本发明的变异体的亲本结构域,可举出源自蛋白L的免疫球蛋白结合蛋白质,例如蛋白L的C1结构域、C2结构域、C3结构域、C4结构域、B1结构域、B2结构域、B3结构域、B4结构域、B5结构域和它们的变异体。其中,优选C1结构域、C2结构域、C3结构域、C4结构域和它们的变异体,更优选C4结构域和其变异体。
[0187] 可作为该亲本结构域使用的蛋白L的B1~B5结构域和C1~C4结构域是分别由序列号1~9所示的氨基酸序列构成的多肽。作为可作为本发明的变异体的亲本结构域使用的蛋白L的B1~B5结构域和C1~C4结构域的变异体,可举出由与序列号1~9的任一个所示的氨基酸序列具有至少85%的同源性的氨基酸序列构成且具有免疫球蛋白κ链结合活性的多肽。
[0188] 可作为该亲本结构域使用的蛋白L的免疫球蛋白结合结构域的变异体可以通过对蛋白L的免疫球蛋白结合结构域的氨基酸序列实施氨基酸残基的插入、删除、取代或缺失、氨基酸残基的化学修饰等改变而制作。作为氨基酸残基的插入、删除、取代或缺失的手段,可举出对编码该结构域的多核苷酸的部位特异性突变(Site-specific mutaion)等公知的手段。
[0189] 因此,作为本发明中的优选的亲本结构域的例子,可举出由序列号1~9的任一个所示的氨基酸序列或与序列号1~9的任一个所示的氨基酸序列具有至少85%的同源性的氨基酸序列构成且具有免疫球蛋白κ链结合活性的多肽。作为更优选的亲本结构域的例子,可举出由序列号6~9的任一个所示的氨基酸序列或与序列号6~9的任一个所示的氨基酸序列具有至少85%的同源性的氨基酸序列构成且具有免疫球蛋白κ链结合活性的多肽。作为进一步优选的亲本结构域的例子,可举出由序列号9所示的氨基酸序列或与序列号9所示的氨基酸序列具有至少85%的同源性的氨基酸序列构成且具有免疫球蛋白κ链结合活性的多肽。
[0190] 本发明的免疫球蛋白结合蛋白质中所含的本发明的变异体是对上述亲本结构域的氨基酸序列导入选自以下的(a)~(n)中的至少1个变异而得到的多肽且保持免疫球蛋白κ链结合活性:
[0191] (a)相当于序列号9所示的氨基酸序列的16位的位置的氨基酸残基取代为其它氨基酸残基或缺失,或者在该位置之前或之后的位置插入氨基酸残基;
[0192] (b)相当于序列号9所示的氨基酸序列的18位的位置的氨基酸残基取代为其它氨基酸残基或缺失,或者在该位置之前或之后的位置插入氨基酸残基;
[0193] (c)相当于序列号9所示的氨基酸序列的20位的位置的氨基酸残基取代为其它氨基酸残基或缺失,或者在该位置之前或之后的位置插入氨基酸残基;
[0194] (d)相当于序列号9所示的氨基酸序列的26位的位置的氨基酸残基取代为其它氨基酸残基或缺失,或者在该位置之前或之后的位置插入氨基酸残基;
[0195] (e)相当于序列号9所示的氨基酸序列的28位的位置的氨基酸残基取代为其它氨基酸残基或缺失,或者在该位置之前或之后的位置插入氨基酸残基;
[0196] (f)相当于序列号9所示的氨基酸序列的30位的位置的氨基酸残基取代为其它氨基酸残基或缺失,或者在该位置之前或之后的位置插入氨基酸残基;
[0197] (g)相当于序列号9所示的氨基酸序列的32位的位置的氨基酸残基取代为其它氨基酸残基或缺失,或者在该位置之前或之后的位置插入氨基酸残基;
[0198] (h)相当于序列号9所示的氨基酸序列的34位的位置的氨基酸残基取代为其它氨基酸残基或缺失,或者在该位置之前或之后的位置插入氨基酸残基;
[0199] (i)相当于序列号9所示的氨基酸序列的35位的位置的氨基酸残基取代为其它氨基酸残基或缺失,或者在该位置之前或之后的位置插入氨基酸残基;
[0200] (j)相当于序列号9所示的氨基酸序列的38位的位置的氨基酸残基取代为其它氨基酸残基或缺失,或者在该位置之前或之后的位置插入氨基酸残基;
[0201] (k)相当于序列号9所示的氨基酸序列的42位的位置的氨基酸残基取代为其它氨基酸残基或缺失,或者在该位置之前或之后的位置插入氨基酸残基;
[0202] (l)相当于序列号9所示的氨基酸序列的54位的位置的氨基酸残基取代为其它氨基酸残基或缺失,或者在该位置之前或之后的位置插入氨基酸残基;
[0203] (m)相当于序列号9所示的氨基酸序列的57位的位置的氨基酸残基取代为其它氨基酸残基或缺失,或者在该位置之前或之后的位置插入氨基酸残基;
[0204] (n)相当于序列号9所示的氨基酸序列的70位的位置的氨基酸残基取代为其它氨基酸残基或缺失,或者在该位置之前或之后的位置插入氨基酸残基。
[0205] 例如,本发明的变异体通过对由序列号1~9的任一个所示的氨基酸序列构成的多肽导入选自上述(a)~(n)中的至少1个变异而制造。或者本发明的变异体通过对由与序列号1~9的任一个所示的氨基酸序列具有至少85%的同源性的氨基酸序列构成且具有免疫球蛋白κ链结合活性的蛋白L免疫球蛋白结合结构域变异体的多肽导入选自上述(a)~(n)中的至少1个变异而制造。优选该(a)~(i)和(l)~(n)的位置的变异后的氨基酸残基以及该(j)和(k)的位置的变异前的氨基酸残基是因从中性向酸性条件下的变化而电荷状态发生变化的氨基酸。所制造的本发明的变异体具有免疫球蛋白κ链结合活性,作为免疫球蛋白结合结构域发挥作用。另外,本发明的变异体与变异前的结构域(亲本结构域)相比,酸性条件下的抗体解离行为提高,因此,可以适当地作为亲和配体使用。
[0206] 优选上述(a)的变异是相当于序列号9所示的氨基酸序列的16位的位置的氨基酸残基取代为其它氨基酸残基。该其它氨基酸残基优选为Gln、Asp、Lys、Arg或His,更优选为His。更优选上述(a)的变异是相当于序列号9所示的氨基酸序列的16位的位置的Ile取代为His。
[0207] 优选上述(b)的变异是相当于序列号9所示的氨基酸序列的18位的位置的氨基酸残基取代为其它氨基酸残基。该其它氨基酸残基优选为Gln、Asp、Lys、Arg或His,更优选为His。更优选上述(b)的变异是相当于序列号9所示的氨基酸序列的18位的位置的Val取代为His。
[0208] 优选上述(c)的变异是相当于序列号9所示的氨基酸序列的20位的位置的氨基酸残基取代为其它氨基酸残基。该其它氨基酸残基优选为Gln、Asp、Lys、Arg或His,更优选为His。更优选上述(c)的变异是相当于序列号9所示的氨基酸序列的20位的位置的Leu取代为His。
[0209] 优选上述(d)的变异是相当于序列号9所示的氨基酸序列的26位的位置的氨基酸残基取代为其它氨基酸残基。该其它氨基酸残基优选为Gln、Asp、Lys、Arg或His,更优选为Arg。更优选上述(d)的变异是相当于序列号9所示的氨基酸序列的26位的位置的Lys取代为Arg。
[0210] 优选上述(e)的变异是相当于序列号9所示的氨基酸序列的28位的位置的氨基酸残基取代为其它氨基酸残基。该其它氨基酸残基优选为Gln、Asp、Lys、Arg或His,更优选为His。更优选上述(e)的变异是相当于序列号9所示的氨基酸序列的28位的位置的Gln取代为His。
[0211] 优选上述(f)的变异是相当于序列号9所示的氨基酸序列的30位的位置的氨基酸残基取代为其它氨基酸残基。该其它氨基酸残基优选为Gln、Asp、Lys、Arg或His,更优选为His。更优选上述(f)的变异是相当于序列号9所示的氨基酸序列的30位的位置的Ala取代为His。
[0212] 优选上述(g)的变异是相当于序列号9所示的氨基酸序列的32位的位置的氨基酸残基取代为其它氨基酸残基。该其它氨基酸残基优选为Gln、Asp、Lys、Arg或His,更优选为His。更优选上述(g)的变异是相当于序列号9所示的氨基酸序列的32位的位置的Phe取代为His。
[0213] 优选上述(h)的变异是相当于序列号9所示的氨基酸序列的34位的位置的氨基酸残基取代为其它氨基酸残基。该其它氨基酸残基优选为Gln、Asp、Lys、Arg或His,更优选为His。更优选上述(h)的变异是相当于序列号9所示的氨基酸序列的34位的位置的Gly取代为His。本发明的变异体具有该(h)的变异时,优选组合具有选自上述(a)~(g)和下述(i)~(n)中的任1个以上的变异。
[0214] 优选上述(i)的变异是相当于序列号9所示的氨基酸序列的35位的位置的氨基酸残基取代为其它氨基酸残基。该其它氨基酸残基优选为Gln、Asp、Lys、Arg或His,更优选为Arg。更优选上述(i)的变异是相当于序列号9所示的氨基酸序列的35位的位置的Thr取代为Arg。
[0215] 优选上述(j)的变异是相当于序列号9所示的氨基酸序列的38位的位置的氨基酸残基取代为其它氨基酸残基。该其它氨基酸残基优选为Gln、Asp、Lys、Arg或His,更优选为Lys。更优选上述(j)的变异是相当于序列号9所示的氨基酸序列的38位的位置的Glu取代为Lys。
[0216] 优选上述(k)的变异是相当于序列号9所示的氨基酸序列的42位的位置的氨基酸残基取代为其它氨基酸残基。该其它氨基酸残基优选为Gln、Asp、Lys、Arg或His,更优选为Lys。更优选上述(k)的变异是相当于序列号9所示的氨基酸序列的42位的位置的Glu取代为Lys。
[0217] 优选上述(l)的变异是相当于序列号9所示的氨基酸序列的54位的位置的氨基酸残基取代为其它氨基酸残基。该其它氨基酸残基优选为Gln、Asp、Lys、Arg或His,更优选为Gln。更优选上述(l)的变异是相当于序列号9所示的氨基酸序列的54位的位置的Asn取代为Gln。
[0218] 优选上述(m)的变异是相当于序列号9所示的氨基酸序列的57位的位置的氨基酸残基取代为其它氨基酸残基。该其它氨基酸残基优选为Gln、Asp、Lys、Arg或His,更优选为His。更优选上述(m)的变异是相当于序列号9所示的氨基酸序列的57位的位置的Tyr取代为His。
[0219] 优选上述(n)的变异是相当于序列号9所示的氨基酸序列的70位的位置的氨基酸残基取代为其它氨基酸残基。该其它氨基酸残基优选为Gln、Asp、Lys、Arg或His,更优选为His。更优选上述(n)的变异是相当于序列号9所示的氨基酸序列的70位的位置的Ile取代为His。
[0220] 作为上述(a)~(n)的变异或其组合的适当的例子,可举出(a)、(b)、(c)、(e)、(f)、(g)、(h)、(j)、(k)、(m)或(n)的单独变异;(d)、(h)、(i)、(k)和(l)的组合;(d)、(i)、(k)、(l)和(m)的组合;以及(d)、(g)、(i)、(k)和(l)的组合。作为更适当的例子,可举出I16H、V18H、L20H、Q28H、A30H、F32H、G34H、E38K、E42K、Y57H或I70H的单独变异;K26R、G34H、T35R、E42K和N54Q的组合;K26R、T35R、E42K、N54Q和Y57H的组合以及K26R、F32H、T35R、E42K和N54Q的组合。
[0221] 作为使亲本结构域变异的手段,可举出对编码该亲本结构域的多核苷酸以产生期望的氨基酸残基的取代、缺失、插入等的方式导入变异的方法。作为用于对多核苷酸导入变异的具体的方法,可举出部位特异性突变、同源重组法、SOE(重叠延伸拼接法,splicing by overlap extension)-PCR法(Gene,1989,77:61-68)等,它们的详细顺序是本领域技术人员公知的。
[0222] 作为通过上述顺序得到的本发明的变异体的例子,可举出由与序列号1~9的任一个所示的氨基酸序列具有至少85%的同源性且具有选自上述(a)~(n)中的至少1个变异的氨基酸序列构成,具有免疫球蛋白κ链结合活性的多肽。
[0223] 作为本发明的变异体的优选的例子,可举出由与序列号1~9的任一个所示的氨基酸序列具有至少85%的同源性且在选自相当于序列号9所示的氨基酸序列的16位、18位、20位、26位、28位、30位、32位、34位、35位、38位、42位、54位、57位和70位的位置中的至少1个位置具有选自Gln、Asp、Lys、Arg和His中的氨基酸残基的氨基酸序列构成,具有免疫球蛋白κ链结合活性的多肽。
[0224] 作为本发明的变异体的更优选的例子,可举出由与序列号1~9的任一个所示的氨基酸序列具有至少85%的同源性且至少具有以下的(a’)~(q’)的任一个的氨基酸序列构成,具有免疫球蛋白κ链结合活性的多肽:
[0225] (a’)相当于序列号9所示的氨基酸序列的16位的位置的His;
[0226] (b’)相当于序列号9所示的氨基酸序列的18位的位置的His;
[0227] (c’)相当于序列号9所示的氨基酸序列的20位的位置的His;
[0228] (d’)相当于序列号9所示的氨基酸序列的26位的位置的Arg;
[0229] (e’)相当于序列号9所示的氨基酸序列的28位的位置的His;
[0230] (f’)相当于序列号9所示的氨基酸序列的30位的位置的His;
[0231] (g’)相当于序列号9所示的氨基酸序列的32位的位置的His;
[0232] (h’)相当于序列号9所示的氨基酸序列的34位的位置的His;
[0233] (i’)相当于序列号9所示的氨基酸序列的35位的位置的Arg;
[0234] (j’)相当于序列号9所示的氨基酸序列的38位的位置的Lys;
[0235] (k’)相当于序列号9所示的氨基酸序列的42位的位置的Lys;
[0236] (l’)相当于序列号9所示的氨基酸序列的54位的位置的Gln;
[0237] (m’)相当于序列号9所示的氨基酸序列的57位的位置的His;
[0238] (n’)相当于序列号9所示的氨基酸序列的70位的位置的His;
[0239] (o’)该(d’)、(h’)、(i’)、(k’)和(l’)的组合;
[0240] (p’)该(d’)、(i’)、(k’)、(l’)和(m’)的组合;
[0241] (q’)该(d’)、(g’)、(i’)、(k’)和(l’)的组合。
[0242] 作为本发明的变异体的进一步优选的例子,可举出由与序列号1~9的任一个所示的氨基酸序列具有至少85%的同源性且具有上述(a’)、(b’)、(c’)、(e’)、(f’)、(g’)、(h’)、(j’)、(k’)、(m’)和(n’)的任1个,或者(d’)、(h’)、(i’)、(k’)和(l’)的组合;(d’)、(i’)、(k’)、(l’)和(m’)的组合;或者(d’)、(g’)、(i’)、(k’)和(l’)的组合的氨基酸序列构成,具有免疫球蛋白κ链结合活性的多肽。
[0243] 作为本发明的变异体的进一步选的例子,可举出由与序列号9所示的氨基酸序列具有至少85%的同源性且具有上述(a’)~(q’)的任一个的氨基酸序列构成,具有免疫球蛋白κ链结合活性的多肽。作为本发明的变异体的进一步优选的例子,可举出由序列号10~23的任一个所示的氨基酸序列构成的多肽。
[0244] 本发明的免疫球蛋白结合蛋白质只要包含1个以上上述本发明的变异体即可。优选本发明的免疫球蛋白结合蛋白质包含2个以上、更优选3个以上、进一步优选4个以上本发明的变异体。另一方面,本发明的免疫球蛋白结合蛋白质优选包含12个以下、更优选8个以下、进一步优选7个以下本发明的变异体。例如,本发明的免疫球蛋白结合蛋白质优选包含2~12个、更优选3~8个、进一步优选4~7个本发明的变异体。本发明的免疫球蛋白结合蛋白质包含2个以上本发明的变异体时,这些变异体可以为相同种类,也可以为不同种类,优选为相同种类。
[0245] 本发明的免疫球蛋白结合蛋白质也可以包含上述本发明的变异体以外的对免疫球蛋白κ链具有结合活性的其它免疫球蛋白结合结构域。作为该其它结构域的例子,可举出上述(a)~(n)所示的任一个变异均不具有的蛋白L的免疫球蛋白结合结构域或其变异体。
[0246] 作为本发明的免疫球蛋白结合蛋白质的优选的例子,可举出由选自序列号10~23中的1种或2种以上的氨基酸序列呈直链状连接有2~12个、更优选3~8个、进一步优选4~7个的氨基酸序列构成的多肽,作为更优选的例子,可举出由呈直链状连接的2~12个、更优选3~8个、进一步优选4~7个的序列号10~23的任一个氨基酸序列构成的多肽。然而,本发明的蛋白质的优选的例子并不限定于这些。
[0247] 2.免疫球蛋白结合蛋白质的制造
[0248] 本发明的免疫球蛋白结合蛋白质可以通过该领域中公知的手法,例如基于氨基酸序列的化学合成法、重组法等来制造。例如,本发明的免疫球蛋白结合蛋白质可以利用Frederick M.Ausbel等人的Current Protocols In Molecular Biology、Sambrook等人编辑的Molecular Cloning(Cold Spring Harbor Laboratory Press,3rd edition,2001)等中记载的公知的基因重组技术来制造。即,通过将含有编码本发明的免疫球蛋白结合蛋白质的多核苷酸的表达载体转化至大肠杆菌等宿主,并将得到的重组体在适当的液体培养基中进行培养,由此能够由培养后的细胞大量且经济地取得目标蛋白质。作为优选的表达载体,能够在宿主细胞内复制的已知的载体均可使用,例如可举出美国专利第5151350号说明书中记载的质粒、Sambrook等人编辑的Molecular Cloning(Cold Spring Harbor Laboratory Press,3rd edition,2001)等中记载的质粒。另外,作为用于转化的宿主,没有特别限定,可以使用大肠杆菌等细菌、真菌类、昆虫细胞、哺乳类细胞等用于表达重组蛋白质的公知的宿主。为了通过对宿主中导入核酸而使宿主转化,可以根据各宿主而使用该技术领域中已知的任一方法,例如,可以利用Sambrook等人编辑的Molecular Cloning(Cold Spring Harbor Laboratory Press,3rd edition,2001)等中记载的公知的方法。将得到的转化体(例如细菌等细胞)培养而回收表达的蛋白质的方法是本领域技术人员熟知的。或者本发明的免疫球蛋白结合蛋白质也可以使用无细胞蛋白质合成系统进行表达。
[0249] 因此,本发明还提供编码本发明的免疫球蛋白结合蛋白质的多核苷酸(DNA等)、包含其的载体以及包含它们的转化体。
[0250] 3.亲和载体
[0251] 本发明的免疫球蛋白结合蛋白质可以作为亲和配体使用。通过将本发明的免疫球蛋白结合蛋白质固定于固相载体,能够制造以该本发明的免疫球蛋白结合蛋白质作为配体的亲和载体。该亲和载体为以源自蛋白L的免疫球蛋白结合蛋白质为配体的载体,具有免疫球蛋白κ链结合活性。另外,该亲和载体与以野生型蛋白L、其结构域为配体的载体相比,酸性条件下的抗体解离行为提高。
[0252] 作为本发明的亲和载体中所含的固相载体的形状,可以为粒子、膜、板、管、针状、纤维状等任意形态。该载体可以为多孔性,也可以为非多孔性。这些载体可以作为填充床使用,或者也可以以悬浮形态使用。悬浮形态包含作为流动层(expanded bed)和纯悬浮物已知的形态,该形态中粒子能够自由运动。在整体柱(monolith)、填充床和流动层的情况下,分离顺序通常依照利用浓度梯度的以往的色谱法。在纯悬浮物的情况下,使用间歇法。优选该载体为填充剂。或者载体也可以为芯片、毛细管或过滤器这样的形态。
[0253] 在一个实施方式中,该固相载体的粒径优选为20μm以上且200μm以下。例如在载体为合成聚合物的情况下,粒径优选为20μm以上,更优选为30μm以上,且优选为100μm以下,更优选为80μm以下,例如优选为20~100μm,进一步优选为30~80μm。例如在载体为多糖的情况下,粒径优选为50μm以上,更优选为60μm以上,且优选为200μm以下,更优选为150μm以下,例如优选为50~200μm,进一步优选为60~150μm。如果粒径小于20μm时,则高流速下柱压变高,不耐实用。如果粒径超过200μm,则有时免疫球蛋白结合于亲和载体的量(结合容量)差。应予说明,本说明书中的“粒径”是指通过激光衍射散射式粒度分布测定装置得到的体积平均粒径,更详细而言,是指通过依据ISO 13320和JIS Z 8825-1的激光衍射法测定的体积平均粒径。具体而言,是指利用激光散射衍射法粒度分布测定装置(例如LS 13 320,Beckman Coulter株式会社等)测定粒径分布,使用Fluid R.I.Real 1.333、Sample R.I.Real 1.54 Imaginary 0等作为光学模型,测定体积基准的粒度分布而求出的平均粒径。
[0254] 在一个实施方式中,该固相载体优选为多孔,优选具有50m2/g以上,更优选具有80m2/g以上,且优选具有150m2/g以下,更优选具有130m2/g以下,例如优选具有50~150m2/g,更优选具有80~130m2/g的比表面积。在此,如果比表面积小于50m2/g,则有时结合容量差,另一方面,如果超过150m2/g,则载体的强度差,有时在高流速下载体被破坏,柱压上升。
应予说明,本说明书中的“比表面积”是指利用压汞仪得到的细孔径10~5000nm的细孔所具有的表面积除以粒子的干燥重量而得的值。
[0255] 在一个实施方式中,该固相载体的体积平均细孔径优选为100nm以上且1400nm以下。例如在载体为合成聚合物的情况下,体积平均细孔径优选为100nm以上,更优选为200nm以上,且优选为400nm以下,更优选为300nm以下,例如优选为100~400nm,进一步优选为200~300nm。例如在载体为多糖的情况下,体积平均细孔径优选为500nm以上,更优选为800nm以上,且优选为1400nm以下,更优选为1200nm以下,例如优选为500~1400nm,进一步更优选为800~1200nm。在此,如果体积平均细孔径小于100nm,则有时高流速下的结合容量降低变得显著,另一方面,如果超过1400nm,则不论流速均有结合容量降低的情况。应予说明,本说明书中的“体积平均细孔径”是指利用压汞仪得到的细孔径10~5000nm的细孔的体积平均细孔径。
[0256] 该固相载体满足上述范围的粒径、比表面积和细孔径分布时,成为纯化对象溶液的流路的粒子间的间隙和粒子内的较大的细孔径与纯化对象分子的结合表面积的平衡达到最佳化,高流速下的结合容量被维持在高平。
[0257] 作为该固相载体的材质,例如为具有亲水性表面的聚合物,例如为通过亲水化处理而在外表面(以及存在的情况下也在内表面)具有羟基(-OH)、羧基(-COOH)、氨基羰基(-CONH2,或N取代型)、氨基(-NH2,或取代型)、或者低聚或聚乙烯基的聚合物。在一个实施方式中,该聚合物可以为对聚甲基丙烯酸酯、聚丙烯酰胺、聚苯乙烯、聚乙烯醇系等合成聚合物进行亲水化处理而得的聚合物,优选为对由多官能(甲基)丙烯酸酯、二乙烯基苯等多官能单体交联的共聚物这样的合成聚合物进行亲水化处理而得的聚合物。该聚合物可通过公知的方法而容易地制造(例如参照J.MATER.CHEM1991,1(3),371-374的方法)。或者,也可使用TOYOPEARL(东曹公司)这样的市售品。其它实施方式的聚合物为葡聚糖、淀粉纤维素、普鲁兰多糖、琼脂糖等多糖类。该多糖类可通过公知的方法而容易地制造(例如参照日本专利第4081143号中记载的方法)。或者,也可使用Sepharose(GE Healthcare Bioscience公司)这样的市售品。在其它实施方式中,也可以为二氧化、氧化锆等无机载体。
[0258] 在一个实施方式中,作为用作该固相载体的多孔性粒子的一个具体例,例如可举出含有20~50质量%的交联性乙烯基单体与3~80质量%的含有环氧基的乙烯基单体、20~80质量%的含有二醇基的乙烯基单体的共聚物,粒径为20~80μm,比表面积为50~150m2/g,体积平均细孔径为100~400nm的多孔性有机聚合物粒子。
[0259] 应予说明,将该固相载体利用压汞仪测定时的细孔径10~5000nm的细孔的渗入体积(细孔体积)优选为1.3mL/g以上且7.0mL/g以下。例如在载体为合成聚合物的情况下,细孔体积优选为1.3mL/g以上,且优选为7.0mL/g以下,更优选为5.0mL/g以下,进一步优选为2.5mL/g以下,例如优选为1.3~7.0mL/g,更优选为1.3~5.0mL/g,进一步优选为1.3~
2.5mL/g。另外,例如在载体为多糖的情况下,细孔体积优选为3.0~6.0mL/g。
[0260] 作为配体(即本发明的免疫球蛋白结合蛋白质)向该固相载体的结合方法,可以使用将蛋白质固定于载体的一般的方法来进行。例如可举出使用具有羧基的载体,利用N-羟基琥珀酸酰亚胺使该羧基活化而与配体的氨基反应的方法;使用具有氨基或羧基的载体,在水溶性二亚胺等脱水缩合剂存在下与配体的羧基或氨基反应而形成酰胺键的方法;使用具有羟基的载体,用溴化氰等卤化氰使其活化而与配体的氨基反应的方法;将载体的羟基甲苯磺酰化或三氟乙烷磺酰化而与配体的氨基反应的方法;利用双环氧化物、表氯醇等将环氧基导入载体而与配体的氨基、羟基或硫醇基反应的方法;使用具有环氧基的载体,与配体的氨基或羟基或硫醇基反应的方法等。上述中,从实施反应的水溶液中的稳定性的观点考虑,优选介由环氧基使配体结合的方法。
[0261] 环氧基开环而生成的开环环氧基即羟基起到如下作用:将载体表面亲水化而防止蛋白质等的非特异吸附,并且在水中提高载体的韧性,防止高流速下的载体的破坏。因此,在使配体固定化后的载体中存在未与配体结合的残余的环氧基时,优选使该残余的环氧基开环。作为载体中的环氧基的开环方法,例如可举出在水溶剂中利用酸或碱在加热或室温下搅拌该载体的方法。另外,可以利用巯基乙醇、硫代甘油等具有巯基的封闭剂(blocking agent)、单乙醇胺等具有氨基的封闭剂使环氧基开环。更优选的开环环氧基是利用硫代甘油使载体中所含的环氧基开环而得到的开环环氧基。硫代甘油具有如下优点:作为原料与巯基乙醇等相比毒性低,并且加成了硫代甘油的环氧开环基与利用具有氨基的封闭剂的开环基相比,非特异吸附低,而且动态结合量变高。
[0262] 也可以根据需要在固相载体与配体之前导入任意长度的分子(间隔区(spacer))。作为间隔区的例子,可举出聚亚甲基链、聚乙二醇链、糖类等。
[0263] 本发明的亲和载体由于具有酸性条件下的抗体解离行为提高的配体,因此,可以在对抗体造成变性等损伤少的较温和的酸性条件,优选pH3.0~4.0的条件下使结合于配体的抗体高效地洗脱。另外,本发明的亲和载体由于使用具有免疫球蛋白κ链结合活性的配体,因此,不仅能够用于IgG、IgM、IgA、IgD、IgE等免疫球蛋白的纯化,而且也能够用于Fab、单链抗体(scFv)等低分子抗体的纯化。
[0264] 4.抗体或其片段的分离方法
[0265] 对本发明的一个实施方式的抗体或其片段(以下仅表述为抗体)的分离方法进行说明。本实施方式的抗体的分离方法优选包括如下工序:对固定有本发明的免疫球蛋白结合蛋白质的亲和载体通液含有抗体的试样,使抗体吸附于该载体的工序(第一工序),以及使该抗体从该载体洗脱的工序(第二工序)。
[0266] 在该第一工序中,在抗体吸附于配体(本发明的免疫球蛋白结合蛋白质)的条件下使含有抗体的试样流过填充有本发明的亲和载体的柱等。在该第一工序中,试样中的抗体以外的物质大部分不吸附于配体而通过柱。然后,根据需要为了将较弱地保持于配体的一部分物质除去,可以将载体用含有NaCl等盐的中性缓冲液清洗。
[0267] 在该第二工序中,流过pH3.0~4.0的适当的缓冲液,使吸附于配体的抗体洗脱。通过回收该洗脱液,能够从试样分离抗体。
[0268] 在本发明的抗体的分离方法的一个实施方式中,所分离的抗体作为抗体医药使用。因此,在一个实施方式中,本发明提供使用本发明的亲和载体的抗体医药的制造方法。该方法的顺序除使用含有目标抗体医药的试样以外,基本上与上述的抗体的分离方法的顺序同样。
[0269] 实施例
[0270] 以下,举出实施例对本发明进一步具体地进行说明。另外,以下的记载概括地表示本发明的方式,在没有特别理由的情况下,本发明不受该记载限定。
[0271] 实施例1免疫球蛋白κ链结合蛋白质(KBP1~14)的制作
[0272] 从人工基因合成制造商获得将编码包含多个由序列号10~23的任一个所示的氨基酸序列构成的免疫球蛋白结合结构域变异体(变异结构域)的蛋白质的基因分别编入pET-24a(+)载体而得的质粒。将这些质粒转化至大肠杆菌感受态细胞BL21(DE3)(NEW ENGLAND BioLabs制)而得到转化细胞。
[0273] 将得到的转化细胞在37℃培育到吸光度(OD600)达到约10为止。然后,以终浓度成为1mM的方式添加IPTG(Sigma-Aldrich制),进一步在37℃培育4小时,使重组型免疫球蛋白κ链结合蛋白质表达。回收细胞,在pH9.5的Tris缓冲液中破碎。利用阴离子交换色谱(Q-SepharoseFF,GE Healthcare Bioscience公司制)和阳离子交换色谱(SP-SepharoseFF,GE Healthcare Bioscience公司制)从得到的细胞破碎液纯化重组免疫球蛋白结合蛋白质。将纯化的免疫球蛋白结合蛋白质对于10mM柠檬酸缓冲液pH6.6透析16小时。利用SDS-PAGE确认的重组型免疫球蛋白结合蛋白质的纯度为95%以上。将所纯化的重组型免疫球蛋白κ链结合蛋白质分别设为KBP1~14。
[0274] 比较例1免疫球蛋白κ轻链结合蛋白质(KBP0)的制作
[0275] 使用编入有编码包含多个由序列号9所示氨基酸序列构成的野生型免疫球蛋白结合结构域的蛋白质的基因的质粒,通过与实施例1同样的顺序制造重组型免疫球蛋白κ链结合蛋白质KBP0。
[0276] 将实施例1和比较例1中制作的免疫球蛋白κ链结合蛋白质(KBP0~14)的结构示于表2。
[0277] 试验例1免疫球蛋白结合蛋白质的抗体解离率的测定
[0278] 测定酸性条件下的实施例1和比较例1中制作的免疫球蛋白结合蛋白质从人类IgG的解离率。测定使用装填有IgG Sepharose 6 Fast Flow(GE Healthcare公司制)的柱(以下为IgG柱)以以下的顺序进行。首先将IgG柱设置于AKTAprime plus(GE Healthcare公司制),用20mM磷酸钠(和光纯药工业公司制)/150mM氯化钠(和光纯药工业公司制)水溶液(结合缓冲液)使IgG柱平衡化。使实施例1或比较例1的免疫球蛋白结合蛋白质流过该IgG柱,使其吸附于柱。将柱用结合缓冲液清洗后,使其与pH3.0的50mM柠檬酸钠水溶液、接着与pH2.5的50mM柠檬酸钠水溶液接触,使该免疫球蛋白结合蛋白质从IgG Sepharose 6 Fast Flow解离。使用PrimeView Evaluation(GE Healthcare公司制)测定所解离的该免疫球蛋白结合蛋白质的峰面积。通过下述式算出实施例1或比较例1的免疫球蛋白结合蛋白质在pH3.0下的抗体解离率。
[0279] 在pH3.0下的抗体解离率=A/(A+B)
[0280] A:在pH3.0下解离的免疫球蛋白结合蛋白质的峰面积
[0281] B:在pH2.5下解离的免疫球蛋白结合蛋白质的峰面积
[0282] 将结果示于表2。包含变异结构域的蛋白质KBP1~14与包含野生型结构域的蛋白质KBP0相比,在pH3.0下的抗体解离率高。此外,由在pH3.0条件下和pH2.5条件下的峰测定值评价的免疫球蛋白结合蛋白质与抗体的解离量的总量在KBP0和KBP1~14中同等。由这些结果可知,包含变异结构域的KBP1~14在pH3.0的酸性条件下的抗体解离行为提高。通过使用了这些变异结构域的亲和试验,显示即使在pH3.0左右的较温和的条件下也能够使抗体从配体高效地解离。
[0283] [表2]
[0284]
高效检索全球专利

专利汇是专利免费检索,专利查询,专利分析-国家发明专利查询检索分析平台,是提供专利分析,专利查询,专利检索等数据服务功能的知识产权数据服务商。

我们的产品包含105个国家的1.26亿组数据,免费查、免费专利分析。

申请试用

分析报告

专利汇分析报告产品可以对行业情报数据进行梳理分析,涉及维度包括行业专利基本状况分析、地域分析、技术分析、发明人分析、申请人分析、专利权人分析、失效分析、核心专利分析、法律分析、研发重点分析、企业专利处境分析、技术处境分析、专利寿命分析、企业定位分析、引证分析等超过60个分析角度,系统通过AI智能系统对图表进行解读,只需1分钟,一键生成行业专利分析报告。

申请试用

QQ群二维码
意见反馈