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生物组合物和方法

阅读:1027发布:2020-05-30

专利汇可以提供生物组合物和方法专利检索,专利查询,专利分析的服务。并且提供了施加于 植物 、植物部位和植物 种子 上的 微 生物 组合物,其用于改善植物抗病性和/或其他有利的植物性状,特别是对由镰孢菌种引起的大豆猝死综合征(SDS)和/或由腐霉菌种引起的 疾病 的抗性或耐受性。还提供了制备微生物组合物或制剂的方法以及将微生物组合物或制剂施加于植物、植物部位或植物种子上或施加于生长培养基中的方法,以增加或改善植物抗病性和/或其他有利的植物性状。,下面是生物组合物和方法专利的具体信息内容。

1.一种分离的绿针假单胞菌菌株,其以ATCC登录号PTA-123716保藏。
2.一种分离的假单胞菌菌株,其中所述假单胞菌菌株具有与SEQ ID NO:1有至少
99.5%、至少99.55%、至少99.6%、至少99.65%、至少99.7%、至少99.75%、至少99.8%、至少99.85%、至少99.9%、至少99.95%或100%同一性的16S rDNA序列,并且其中当用所述假单胞菌菌株处理作物植物或将所述作物植物与所述假单胞菌菌株结合在一起时,所述假单胞菌菌株赋予所述作物植物正面的农业性状或益处。
3.一种分离的假单胞菌菌株,其中所述假单胞菌菌株具有与以ATCC登录号PTA-123716保藏的绿针假单胞菌菌株的对应基因组序列有至少99%、至少99.1%、至少99.2%、至少
99.3%、至少99.4%、至少99.5%、至少99.55%、至少99.6%、至少99.65%、至少99.7%、至少99.75%、至少99.8%、至少99.85%、至少99.9%、至少99.95%或100%同一性的全基因组序列(或部分基因组序列),并且其中所述假单胞菌菌株赋予用所述假单胞菌菌株处理或与所述假单胞菌菌株结合在一起的作物植物正面的农业性状或益处。
4.如权利要求2或3所述的分离的假单胞菌菌株,其中所述正面的农业性状或益处是相对于对照植物而言,疾病严重程度或症状减轻。
5.如权利要求2或3所述的分离的假单胞菌菌株,其中所述假单胞菌菌株是如权利要求
1所述的绿针假单胞菌菌株的子代。
6.一种如权利要求1所述的绿针假单胞菌的功能性变体。
7.一种如权利要求1-5中任一项所述的绿针假单胞菌或假单胞菌菌株或分离株的纯或基本上纯的培养物或群体。
8.一种组合物,其包含生物菌株或分离株和农业上可接受的载剂,其中所述微生物菌株或分离株具有与SEQ ID NO:1有至少99.5%、至少99.55%、至少99.6%、至少99.65%、至少99.7%、至少99.75%、至少99.8%、至少99.85%、至少99.9%或至少99.95%同一性的
16S rDNA序列。
9.一种组合物,其包含微生物菌株或分离株和农业上可接受的载剂,其中所述微生物菌株或分离株具有与SEQ ID NO:1有至少99.9%或至少99.95%同一性的16S rDNA序列。
10.如权利要求8或9所述的组合物,其中所述微生物菌株或分离株具有与SEQ ID NO:1有100%同一性的16S rDNA序列。
11.如权利要求8-10中任一项所述的组合物,其中所述微生物菌株或分离株具有与以ATCC登录号PTA-123716保藏的细菌菌株或分离株的对应部分基因组序列或全基因组序列有至少99%、至少99.1%、至少99.2%、至少99.3%、至少99.4%、至少99.5%、至少
99.55%、至少99.6%、至少99.65%、至少99.7%、至少99.75%、至少99.8%、至少99.85%、至少99.9%、至少99.95%或100%同一性的部分基因组序列或全基因组序列。
12.一种组合物,其包含微生物菌株或分离株和农业上可接受的载剂,其中所述微生物菌株或分离株具有与以ATCC登录号PTA-123716保藏的细菌菌株或分离株的对应部分基因组序列或全基因组序列有至少99%、至少99.1%、至少99.2%、至少99.3%、至少99.4%、至少99.5%、至少99.55%、至少99.6%、至少99.65%、至少99.7%、至少99.75%、至少
99.8%、至少99.85%、至少99.9%、至少99.95%或100%同一性的部分基因组序列或全基因组序列。
13.如权利要求8-12中任一项所述的组合物,其中所述微生物菌株或分离株是绿针假单胞菌。
14.如权利要求8-13中任一项所述的组合物,其中所述微生物菌株或分离株是以ATCC登录号PTA-123716保藏的细菌菌株或分离株。
15.如权利要求8-14中任一项所述的组合物,其中所述农业上可接受的载剂赋予所述组合物至少一种有利的特征。
16.如权利要求15所述的组合物,其中所述改善的特征是相对于缺乏所述农业上可接受的载剂的对照组合物而言,功效、稳定性、湿润性、流动性或在植物、植物部位或种子上的涂布性得到改善。
17.如权利要求8-16中任一项所述的组合物,其中所述农业上可接受的载剂包含湿润剂或分散剂。
18.如权利要求8-16中任一项所述的组合物,其中所述农业上可接受的载剂包含粘结剂或粘着剂。
19.如权利要求8-18中任一项所述的组合物,其中所述农业上可接受的载剂包含溶剂和非水性共溶剂。
20.如权利要求8-19中任一项所述的组合物,其还包含杀虫剂
21.如权利要求20所述的组合物,其中所述杀虫剂是杀真菌剂、除草剂、杀昆虫剂、杀疥虫剂、杀螨剂线虫剂或杀腹足动物剂中的一种或多种。
22.如权利要求21所述的组合物,其中所述杀虫剂选自由以下组成的组:种菌唑、甲霜灵、嘧菌酯、丙硫菌唑、甲霜灵、氟嘧菌酯、可尼丁、坚强芽孢杆菌、拜赖青霉、绿木霉和解淀粉芽孢杆菌。
23.如权利要求9-22中任一项所述的组合物,其还包含植物营养素或肥料
24.如权利要求9-23中任一项所述的组合物,其中所述组合物被配制成固体。
25.如权利要求24所述的组合物,其中所述组合物被配制成粉末、冻干物、丸粒或颗粒。
26.如权利要求9-23中任一项所述的组合物,其中所述组合物被配制成液体或凝胶。
27.如权利要求26所述的组合物,其中所述组合物被配制成乳液、胶体、悬浮液或溶液。
28.如权利要求9-27中任一项所述的组合物,其还包含脂壳寡糖(LCO)、壳寡糖(CO)、产生LCO的细菌和真菌以及几丁质化合物中的一种或多种。
29.如权利要求9-28中任一项所述的组合物,其还包含类黄腐殖酸、富里酸、茉莉酸或其衍生物、亚油酸或其衍生物、亚麻酸或其衍生物、卡里金和葡糖酸内酯中的一种或多种。
30.如权利要求9-29中任一项所述的组合物,其中所述微生物菌株或分离株以每毫升或每克至少103cfu的浓度存在于所述组合物中。
31.如权利要求9-30中任一项所述的组合物,其包含所述微生物菌株或分离株的纯或基本上纯的群体。
32.如权利要求9-31中任一项所述的组合物,其中所述组合物赋予用所述组合物处理或与所述组合物结合在一起的作物植物正面的农业性状或益处,其中所述正面的农业性状或益处是相对于对照植物而言,疾病严重程度或症状减轻。
33.一种试剂盒或容器,其包含或含有如权利要求9-32中任一项所述的组合物。
34.一种植物、植物部位或植物种子,其与如权利要求9-32中任一项所述的组合物相结合在一起。
35.一种植物、植物部位或植物种子,所述植物、植物部位或植物种子的至少一部分上施加或涂布有包含微生物菌株或分离株的组合物,其中所述微生物菌株或分离株相对于所述植物、植物部位或植物种子是异源的并且具有与SEQ ID NO:1有至少99.9%同一性的16S rDNA序列。
36.如权利要求35所述的植物、植物部位或植物种子,其中所述组合物施加或涂布于所述植物、植物部位或植物种子的外表面的至少一部分上。
37.如权利要求35或36所述的植物、植物部位或植物种子,其中所述植物、植物部位或植物种子是转基因的。
38.一种植物、植物部位或植物种子,所述植物、植物部位或植物种子的至少一部分上施加或涂布有包含微生物菌株或分离株的组合物,其中所述微生物菌株或分离株相对于所述植物、植物部位或植物种子是异源的并且具有与以ATCC登录号PTA-123716保藏的细菌菌株或分离株的对应部分基因组序列或全基因组序列有至少99%、至少99.1%、至少99.2%、至少99.3%、至少99.4%、至少99.5%、至少99.55%、至少99.6%、至少99.65%、至少
99.7%、至少99.75%、至少99.8%、至少99.85%、至少99.9%、至少99.95%或100%同一性的部分基因组序列或全基因组序列。
39.如权利要求38所述的植物、植物部位或植物种子,其中所述组合物施加或涂布于所述植物、植物部位或植物种子的外表面的至少一部分上。
40.如权利要求38所述的植物、植物部位或植物种子,其中所述植物、植物部位或植物种子是转基因的。
41.一种植物种子,其外表面的至少一部分上具有包含微生物菌株或分离株的组合物,其中所述微生物菌株或分离株相对于所述植物种子是异源的,并且其中所述微生物菌株或分离株具有以下中的任一者或两者:
(i)与以ATCC登录号PTA-123716保藏的细菌菌株或分离株的对应部分基因组序列或全基因组序列有至少99%、至少99.1%、至少99.2%、至少99.3%、至少99.4%、至少99.5%、至少99.55%、至少99.6%、至少99.65%、至少99.7%、至少99.75%、至少99.8%、至少
99.85%、至少99.9%、至少99.95%或100%同一性的部分基因组序列或全基因组序列,以及
(ii)与SEQ ID NO:1有至少99.5%、至少99.55%、至少99.6%、至少99.65%、至少
99.7%、至少99.75%、至少99.8%、至少99.85%、至少99.9%、至少99.95%或100%同一性的16S rDNA序列。
42.如权利要求41所述的植物种子,其中所述植物种子是双子叶植物种子。
43.一种如权利要求42所述的大豆植物种子。
44.一种包括或含有如权利要求38-43中任一项所述的植物种子的袋子或容器。
45.一种从如权利要求38-43中任一项所述的植物种子生长或发育的植物。
46.如权利要求45所述的植物,其中所述植物的疾病严重程度或症状相对于从未用所述微生物菌株或分离株处理的植物种子生长或发育的对照植物减轻。
47.如权利要求46所述的植物,其中所述植物的由镰孢菌种引起的猝死综合征(SDS)的严重程度或症状相对于从未用所述微生物菌株或分离株处理的植物种子生长或发育的对照植物减轻。
48.一种方法,其包括:
将组合物施加于植物、植物部位或植物种子上,所述组合物包含微生物菌株或分离株和农业上可接受的载剂,
其中所述微生物菌株或分离株相对于所述植物、植物部位或植物种子是异源的,并且其中所述微生物菌株或分离株具有以下中的任一者或两者:
(i)与以ATCC登录号PTA-123716保藏的细菌菌株或分离株的对应部分基因组序列或全基因组序列有至少99%、至少99.1%、至少99.2%、至少99.3%、至少99.4%、至少99.5%、至少99.55%、至少99.6%、至少99.65%、至少99.7%、至少99.75%、至少99.8%、至少
99.85%、至少99.9%、至少99.95%或100%同一性的部分基因组序列或全基因组序列,以及
(ii)与SEQ ID NO:1有至少99.5%、至少99.55%、至少99.6%、至少99.65%、至少
99.7%、至少99.75%、至少99.8%、至少99.85%、至少99.9%、至少99.95%或100%同一性的16S rDNA序列。
49.如权利要求48所述的方法,其中所述微生物菌株或分离株具有与SEQ ID NO:1有
100%同一性的16S rDNA序列。
50.如权利要求49所述的方法,其中所述微生物菌株或分离株是以ATCC登录号PTA-
123716保藏的细菌菌株或分离株。
51.如权利要求48-50中任一项所述的方法,其中所述施加步骤包括将所述组合物涂布到所述植物、植物部位或植物种子的外表面的至少一部分上。
52.如权利要求48-51中任一项所述的方法,其中所述施加步骤包括将所述组合物涂布到所述植物种子的外表面的至少一部分上。
53.如权利要求52所述的方法,其中所述植物种子是大豆种子。
54.如权利要求48-53中任一项所述的方法,其中所述施加步骤包括用所述组合物进行固体基质引发、吸涨、涂布、喷洒、滚动、搅拌、滴注、浸泡、浸渍、喷粉或包封。
55.如权利要求48-54中任一项所述的方法,其中将所述组合物施加于作物植物上,并且其中所述组合物包含有效量的所述微生物菌株或分离株,以使得所述作物植物的疾病严重程度或症状相对于未用所述组合物处理的对照植物减轻。
56.如权利要求55所述的方法,其中所述组合物包含有效量的所述微生物菌株或分离株,以使得所述作物植物的由镰孢菌种引起的猝死综合征(SDS)的严重程度或症状相对于未用所述组合物处理的对照植物减轻。
57.如权利要求48-55中任一项所述的方法,其中将所述组合物施加于植物部位或植物种子上,并且其中所述组合物包含有效量的所述微生物菌株或分离株,以使得种植后从所述植物部位或植物种子生长、发育或再生的作物植物的疾病严重程度或症状减轻。
58.如权利要求57所述的方法,其中所述组合物包含有效量的所述微生物菌株或分离株,以使得从所述植物部位或植物种子生长、发育或再生的作物植物的由镰孢菌种引起的猝死综合征(SDS)的严重程度或症状相对于从未用所述组合物处理的植物部位或植物种子生长、发育或再生的对照植物减轻。
59.一种增加作物植物的抗病性的方法,其包括:
(a)种植植物部位或种子,其中所述植物部位或种子至少部分地涂布有包含微生物菌株或分离株和农业上可接受的载剂的组合物,其中所述微生物菌株或分离株相对于所述植物、植物部位或植物种子是异源的,并且
其中所述微生物菌株或分离株具有以下中的任一者或两者:
(i)与以ATCC登录号PTA-123716保藏的细菌菌株或分离株的对应部分基因组序列或全基因组序列有至少99%、至少99.1%、至少99.2%、至少99.3%、至少99.4%、至少99.5%、至少99.55%、至少99.6%、至少99.65%、至少99.7%、至少99.75%、至少99.8%、至少
99.85%、至少99.9%、至少99.95%或100%同一性的部分基因组序列或全基因组序列,以及
(ii)与SEQ ID NO:1有至少99.5%、至少99.55%、至少99.6%、至少99.65%、至少
99.7%、至少99.75%、至少99.8%、至少99.85%、至少99.9%、至少99.95%或100%同一性的16SrDNA序列,以及
(b)使所述作物植物从所述植物部位或种子生长或再生。
60.如权利要求59所述的方法,其还包括:
(c)从所述作物植物收获种子。
61.如权利要求59或60所述的方法,其中所述作物植物在SDS疾病压下具有以下改善的性状中的一种或多种:产量增加、生物量增加、叶面积增加、每英亩的蒲式数增加、每株植物的种子重量增加、种子数量增加、豆荚长度增加、饱满豆荚的数量增加、豆荚数量增加、营养素含量改善、抗伏倒性较强、根长增加、植物生长或活力改善、耐逆性增加、收获指数增加和每英亩的蒲式耳数增加。
62.一种增加作物植物的抗病性的方法,其包括:
(a)将包含微生物菌株或分离株和农业上可接受的载剂的组合物施加于所述作物植物上,
其中所述微生物菌株或分离株相对于所述作物植物是异源的,并且其中所述微生物菌株或分离株具有以下中的任一者或两者:
(i)与以ATCC登录号PTA-123716保藏的细菌菌株或分离株的对应部分基因组序列或全基因组序列有至少99%、至少99.1%、至少99.2%、至少99.3%、至少99.4%、至少99.5%、至少99.55%、至少99.6%、至少99.65%、至少99.7%、至少99.75%、至少99.8%、至少
99.85%、至少99.9%、至少99.95%或100%同一性的部分基因组序列或全基因组序列,以及
(ii)与SEQ ID NO:1有至少99.5%、至少99.55%、至少99.6%、至少99.65%、至少
99.7%、至少99.75%、至少99.8%、至少99.85%、至少99.9%、至少99.95%或100%同一性的16SrDNA序列,以及
(b)使所述作物植物生长或发育。
63.如权利要求62所述的方法,其还包括:
(c)从所述作物植物收获种子。
64.如权利要求62或63所述的方法,其中所述组合物是以叶处理的方式施加。
65.如权利要求62-64中任一项所述的方法,其中所述作物植物在SDS疾病压力下具有以下性状中的一种或多种:产量增加、生物量增加、叶面积增加、每英亩的蒲式耳数增加、每株植物的种子重量增加、种子数量增加、豆荚长度增加、饱满豆荚的数量增加、豆荚数量增加、营养素含量改善、抗伏倒性较强、根长增加、植物生长或活力改善、耐逆性增加、收获指数增加和每英亩的蒲式耳数增加。
66.一种减轻作物植物的疾病严重程度或症状的方法,其包括:
(a)将包含微生物菌株或分离株和农业上可接受的载剂的组合物施加于与所述作物植物相关联的生长培养基中,
其中所述微生物菌株或分离株相对于所述作物植物是异源的,并且其中所述微生物菌株或分离株具有以下中的任一者或两者:
(i)与以ATCC登录号PTA-123716保藏的细菌菌株或分离株的对应部分基因组序列或全基因组序列有至少99%、至少99.1%、至少99.2%、至少99.3%、至少99.4%、至少99.5%、至少99.55%、至少99.6%、至少99.65%、至少99.7%、至少99.75%、至少99.8%、至少
99.85%、至少99.9%、至少99.95%或100%同一性的部分基因组序列或全基因组序列,以及
(ii)与SEQ ID NO:1有至少99.5%、至少99.55%、至少99.6%、至少99.65%、至少
99.7%、至少99.75%、至少99.8%、至少99.85%、至少99.9%、至少99.95%或100%同一性的16SrDNA序列,以及
(b)使所述作物植物生长或发育。
67.如权利要求66所述的方法,其还包括:
(c)从所述作物植物收获种子。
68.如权利要求66或67所述的方法,其中将所述组合物以滴注、喷洒、灌溉土壤浇灌方式施加于所述生长培养基中。
69.如权利要求66-68中任一项所述的方法,其中所述生长培养基是土壤。
70.如权利要求66-69中任一项所述的方法,其中所述作物植物在SDS疾病压力下具有以下性状中的一种或多种:产量增加、生物量增加、叶面积增加、每英亩的蒲式耳数增加、每株植物的种子重量增加、种子数量增加、豆荚长度增加、饱满豆荚的数量增加、豆荚数量增加、营养素含量改善、抗伏倒性较强、根长增加、植物生长或活力改善、耐逆性增加、收获指数增加和每英亩的蒲式耳数增加。
71.一种增加作物植物的抗病性的方法,其包括:
(a)将包含微生物菌株或分离株和农业上可接受的载剂的组合物施加于与植物部位或植物种子相关联的生长培养基中,其中所述微生物菌株或分离株相对于所述作物植物是异源的,并且其中所述微生物菌株或分离株具有以下中的任一者或两者:
(i)与以ATCC登录号PTA-123716保藏的细菌菌株或分离株的对应部分基因组序列或全基因组序列有至少99%、至少99.1%、至少99.2%、至少99.3%、至少99.4%、至少99.5%、至少99.55%、至少99.6%、至少99.65%、至少99.7%、至少99.75%、至少99.8%、至少
99.85%、至少99.9%、至少99.95%或100%同一性的部分基因组序列或全基因组序列,以及
(ii)与SEQ ID NO:1有至少99.5%、至少99.55%、至少99.6%、至少99.65%、至少
99.7%、至少99.75%、至少99.8%、至少99.85%、至少99.9%、至少99.95%或100%同一性的16SrDNA序列,以及
(b)使所述作物植物从所述植物部位或植物种子生长或再生。
72.如权利要求71所述的方法,其还包括:
(c)从所述作物植物收获种子。
73.如权利要求71或72所述的方法,其中将所述组合物以滴注、喷洒、灌溉或土壤浇灌方式施加于所述生长培养基中。
74.如权利要求71-73中任一项所述的方法,其中所述生长培养基是土壤。
75.如权利要求71-74中任一项所述的方法,其中所述组合物在所述植物部位或植物种子被种植到所述生长培养基中之前、同时或之后施加于所述生长培养基中。
76.如权利要求71-75中任一项所述的方法,其中所述作物植物在SDS疾病压力下具有以下性状中的一种或多种:产量增加、生物量增加、叶面积增加、每英亩的蒲式耳数增加、每株植物的种子重量增加、种子数量增加、豆荚长度增加、饱满豆荚的数量增加、豆荚数量增加、营养素含量改善、抗伏倒性较强、根长增加、植物生长或活力改善、耐逆性增加、收获指数增加和每英亩的蒲式耳数增加。
77.一种修饰的微生物菌株,其具有与SEQ ID NO:1有至少99.9%、至少99.95%或
100%同一性的16S rDNA序列,其中当用所述修饰的微生物菌株处理作物植物或将所述作物植物与所述修饰的微生物菌株结合在一起时,所述修饰的微生物菌株赋予所述作物植物正面的农业性状或益处。
78.一种修饰的微生物菌株,其具有与以ATCC登录号PTA-123716保藏的细菌菌株或分离株的对应部分基因组序列或全基因组序列有至少99%、至少99.1%、至少99.2%、至少
99.3%、至少99.4%、至少99.5%、至少99.55%、至少99.6%、至少99.65%、至少99.7%、至少99.75%、至少99.8%、至少99.85%、至少99.9%或至少99.95%同一性的部分基因组序列或全基因组序列,其中当用所述修饰的微生物菌株处理作物植物或将作物植物与所述修饰的微生物菌株结合在一起时,所述修饰的微生物菌株赋予所述作物植物正面的农业性状或益处。

说明书全文

生物组合物和方法

[0001] 相关申请的引用
[0002] 本申请要求2017年1月3日提交的美国临时申请号62/441,918和2017年1月24日提交的美国临时申请号62/449,974的权益,所述临时申请各自以全文引用的方式并入本文
中。
[0003] 序列表的并入
[0004] 文件中所含的名为“MONS407WO_ST25.txt”的序列表在此以电子方式提交并且以引用的方式并入本文,所述序列表如在Microsoft Windows操作系统中测量是3千字节并且
创建于2018年1月2日。

技术领域

[0005] 本公开涉及用于保护植物免受由一种或多种植物病原体引起的感染和/或减轻由一种或多种植物病原体引起的疾病严重程度或症状的包含微生物的组合物,以及用那些组
合物处理植物、植物部位或土壤的方法。

背景技术

[0006] 一些微生物,包括细菌和真菌,可以在某些环境下正面地影响植物健康和生长,并且改善作物植物的抗病性。有益的微生物可以改善施肥、营养素有效性或吸收、改善土壤特征,调节植物生长或提供生物杀虫剂生物防治活性。然而,微生物在一些情况下也可能负面地影响植物,并且现有的微生物产品有时表现出不一致的性能或最小的作物益处。
[0007] 本领域中一直需要开发出可以用于改善在多种农田环境和生长条件中的植物生长和作物植物的抗病性或疾病耐受性,和/或减轻由植物病原体引起的感染或疾病严重程
度或症状的新型微生物组合物和方法。
发明内容
[0008] 在一个方面中,提供分离的绿针假单胞菌(Pseudomonas chlororaphis)菌株,其以ATCC登录号PTA-123716保藏。分离的假单胞菌(Pseudomonas)菌株可以具有与SEQ ID 
NO:1有至少99.5%、至少99.55%、至少99.6%、至少99.65%、至少99.7%、至少99.75%、至少99.8%、至少99.85%、至少99.9%、至少99.95%或100%同一性的16S rDNA序列,并且其中当将作物植物用假单胞菌菌株处理或与假单胞菌菌株结合在一起时,假单胞菌菌株赋予
作物植物正面的农业性状或益处。分离的假单胞菌菌株可以具有与本文中提供的绿针假单
胞菌菌株有至少99%、至少99.1%、至少99.2%、至少99.3%、至少99.4%、至少99.5%、至少99.55%、至少99.6%、至少99.65%、至少99.7%、至少99.75%、至少99.8%、至少
99.85%、至少99.9%、至少99.95%或100%同一性的全基因组序列(或部分基因组序列),并且其中假单胞菌菌株赋予用假单胞菌菌株处理或与假单胞菌菌株结合在一起的作物植
物正面的农业性状或益处。在一个实例中,正面的农业性状或益处包括相对于对照植物
言,对大豆猝死综合征(“SDS”)的抗性增加。分离的假单胞菌菌株可以是本文中提供的绿针假单胞菌菌株的子代。在其他实施方案中,提供绿针假单胞菌菌株或分离株的功能性变体。
在其他实施方案中,提供绿针假单胞菌菌株或假单胞菌菌株或分离株的纯或基本上纯的培
养物或群体。
[0009] 在另一个方面中,提供一种组合物,其包含微生物菌株或分离株和农业上可接受的载剂,其中微生物菌株或分离株具有与SEQ ID NO:1有至少99.9%或至少99.95%同一性
的16S rDNA序列。微生物菌株或分离株可以具有与SEQ ID NO:1有99.9%或至少99.95%同
一性的16S rDNA序列,或微生物菌株或分离株可以具有与SEQ ID NO:1有100%同一性的
16S rDNA序列。组合物可以包含以下微生物菌株或分离株,其具有与以ATCC登录号PTA-
123716保藏的细菌菌株或分离株的对应部分基因组序列或全基因组序列有至少99%、至少
99.1%、至少99.2%、至少99.3%、至少99.4%、至少99.5%、至少99.55%、至少99.6%、至少99.65%、至少99.7%、至少99.75%、至少99.8%、至少99.85%、至少99.9%、至少
99.95%或100%同一性的部分基因组序列或全基因组序列。
[0010] 在另一个方面中,提供一种组合物,其包含微生物菌株或分离株和农业上可接受的载剂,其中微生物菌株或分离株具有与以ATCC登录号PTA-123716保藏的细菌菌株或分离
株的对应部分基因组序列或全基因组序列有至少99%、至少99.1%、至少99.2%、至少
99.3%、至少99.4%、至少99.5%、至少99.55%、至少99.6%、至少99.65%、至少99.7%、至少99.75%、至少99.8%、至少99.85%、至少99.9%、至少99.95%或100%同一性的部分基因组序列或全基因组序列。微生物菌株或分离株可以是绿针假单胞菌菌株或分离株。细菌
菌株或分离株可以ATCC登录号PTA-123716保藏。在某些实施方案中,提供农业上可接受的
载剂,其可赋予组合物至少一种有利的特征,如相对于缺乏农业上可接受的载剂的对照组
合物而言,功效、稳定性、湿润性、流动性或向植物、植物部位或种子上的涂布性得到改善。
在其他实施方案中,组合物可以包含湿润剂或分散剂、粘结剂或粘着剂、溶剂和非水性共溶剂。组合物可以还包含杀虫剂;杀真菌剂、除草剂、杀昆虫剂、杀疥虫剂(miticide)、杀螨剂线虫剂和/或杀腹足动物剂(gastropodicide);以及/或者植物营养素或肥料。在一些实施方案中,杀虫剂是选自由以下组成的组:坚强芽孢杆菌(Bacillus firmus)、可尼丁(clothianidin)、唑菌胺酯(pyraclostrobin)、甲霜灵(metalaxyl)、氟唑菌酰胺
(fluxapyroxad)、吡虫啉(imidacloprid)、氟吡菌酰胺(fluopyram)、日本根瘤菌
(Bradyrhizobia japonocium)、脂壳寡糖(lipo-chitoologilosaccharide)、拜赖青霉
(Penicillium bilaiae)、绿木霉(Trichoderma virens)、解淀粉芽孢杆菌(Bacillius 
amyloliquefaciens)、染料木黄(genistein)和黄豆苷元(daidzein)。所提供的组合物可以配制成固体;粉末、冻干物、丸粒或颗粒;液体或凝胶;或乳液、胶体、悬浮液或溶液。
[0011] 组合物可以还包含脂壳寡糖(LCO)、壳寡糖(CO)、产生LCO的细菌或真菌和几丁质化合物中的一种或多种;和/或类黄酮、腐殖酸、富里酸(fulvic acid)、茉莉酸(jasmonic acid)或其衍生物、亚油酸或其衍生物、亚麻酸或其衍生物、卡里金(karrikin)和葡糖酸内酯中的一种或多种。在某些实施方案中,组合物可以包含在每毫升或每克至少103cfu的浓
度下的微生物菌株或分离株。组合物可以包含微生物菌株或分离株的纯的或基本上纯的群
体。在某些实施方案中,提供以下组合物,其赋予用所述组合物处理或与所述组合物结合在一起的作物植物正面的农业性状或益处,如相对于对照植物,对SDS的抗性或耐受性增加。
[0012] 在另一个方面中,提供一种试剂盒或容器,其包括或含有本文中提供的组合物。
[0013] 在其他方面中,提供一种与组合物结合在一起的植物、植物部位或植物种子,如在至少一部分外表面上施加或涂布有包含微生物菌株或分离株的组合物的植物、植物部位或植物种子,其中所述微生物菌株或分离株相对于所述植物、植物部位或植物种子是异源的
并且具有与SEQ ID NO:1有至少99.5%、至少99.55%、至少99.6%、至少99.65%、至少
99.7%、至少99.75%、至少99.8%、至少99.85%、至少99.9%同一性的16S rDNA序列。在某些实施方案中,组合物可以施加或涂布在植物、植物部位或植物种子的至少一部分外表面
上。在一些实施方案中,植物、植物部位或植物种子是转基因的。还提供一种在至少一部分外表面上施加或涂布有包含微生物菌株或分离株的组合物的植物、植物部位或植物种子,
其中所述微生物菌株或分离株相对于所述植物、植物部位或植物种子是异源的并且具有与
以ATCC登录号PTA-123716保藏的细菌菌株或分离株的对应部分基因组序列或全基因组序
列有至少99%、至少99.1%、至少99.2%、至少99.3%、至少99.4%、至少99.5%、至少
99.55%、至少99.6%、至少99.65%、至少99.7%、至少99.75%、至少99.8%、至少99.85%、至少99.9%、至少99.95%或100%同一性的部分基因组序列或全基因组序列。
[0014] 在某些实施方案中,组合物可以施加或涂布在植物、植物部位或植物种子的至少一部分外表面上。在一些实施方案中,植物、植物部位或植物种子是转基因的。实施方案可以包括在至少一部分外表面上具有包含微生物菌株或分离株的组合物的植物种子,其中所
述微生物菌株或分离株相对于所述植物种子是异源的,并且其中所述微生物菌株或分离株
具有与以ATCC登录号PTA-123716保藏的细菌菌株或分离株的对应部分基因组序列或全基
因组序列有至少99%、至少99.1%、至少99.2%、至少99.3%、至少99.4%、至少99.5%、至少99.55%、至少99.6%、至少99.65%、至少99.7%、至少99.75%、至少99.8%、至少
99.85%、至少99.9%、至少99.95%或100%同一性的部分基因组序列或全基因组序列,和/或与SEQ ID NO:1有至少99.5%、至少99.55%、至少99.6%、至少99.65%、至少99.7%、至少99.75%、至少99.8%、至少99.85%、至少99.9%、至少99.95%或100%同一性的16S 
rDNA序列。植物种子可以包括例如双子叶植物种子,如来自大豆、紫花苜蓿、向日葵、花、加拿大油菜(canola)、糖用甜菜或蔬菜植物的植物种子。
[0015] 根据另一个方面,提供一种袋子或容器,其包括或含有用本文中提供的组合物处理或涂布的植物种子或植物部位。
[0016] 在其他方面中,提供从用本文中提供的微生物菌株或分离株涂布、处理或与本文中提供的微生物菌株或分离株结合在一起的植物种子或植物部位生长或发育的植物。在一
些实施方案中,植物可以表现出相对于从未用所述微生物菌株或分离株涂布、处理或不与
所述微生物菌株或分离株结合在一起的植物种子或植物部位生长或发育的对照植物增加
的抗病性。在一些实施方案中,提供以下植物,其对由镰孢菌(Fusarium)种引起的猝死综合征(SDS)的抗性相对于从未用所述微生物菌株或分离株处理的植物种子生长或发育的对照
植物增加。
[0017] 在另一个方面中,提供以下方法,其包括:将组合物施加于植物、植物部位或植物种子,所述组合物包含微生物菌株或分离株和农业上可接受的载剂,其中所述微生物菌株或分离株相对于所述植物、植物部位或植物种子是异源的,并且其中所述微生物菌株或分
离株具有与以ATCC登录号PTA-123716保藏的细菌菌株或分离株的对应部分基因组序列或
全基因组序列有至少99%、至少99.1%、至少99.2%、至少99.3%、至少99.4%、至少
99.5%、至少99.55%、至少99.6%、至少99.65%、至少99.7%、至少99.75%、至少99.8%、至少99.85%、至少99.9%、至少99.95%或100%同一性的部分基因组序列或全基因组序
列,和/或与SEQ ID NO:1有至少99.5%、至少99.55%、至少99.6%、至少99.65%、至少
99.7%、至少99.75%、至少99.8%、至少99.85%、至少99.9%、至少99.95%或100%同一性的16S rDNA序列。在一些实施方案中,微生物菌株或分离株具有与SEQ ID NO:1有100%同
一性的16S rDNA序列。在一些实施方案中,微生物菌株或分离株是以ATCC登录号PTA-
123716保藏的细菌菌株或分离株。施加步骤可以包括将组合物涂布到植物、植物部位或植
物种子的至少一部分外表面上。
[0018] 在某些实施方案中,方法可以包括将组合物施加于双子叶植物种子,如大豆、棉花、加拿大油菜、糖用甜菜、紫花苜蓿、向日葵或蔬菜种子。在其他实施方案中,施加步骤可以包括用组合物进行固体基质引发、吸涨、涂布、喷洒、滚动、搅拌、滴液、浸泡、浸渍、喷粉、浇灌或封装。在一些实施方案中,可以将组合物施加于作物植物,其中组合物包含有效量的微生物菌株或分离株以使得作物植物的抗病性相对于未用组合物处理的对照植物增加。组
合物可以包含有效量的微生物菌株或分离株以使得作物植物对由镰孢菌种引起的猝死综
合征(SDS)的抗性相对于未用组合物处理的对照植物相比增加。可以将组合物施加于植物
部位或植物种子,并且组合物可以包含有效量的微生物菌株或分离株以增加在种植后从所
述植物部位或植物种子生长、发育或再生的作物植物的抗病性。在某些实施方案中,组合物包含有效量的微生物菌株或分离株以使得从所述植物部位或植物种子生长、发育或再生的
作物植物对由镰孢菌种引起的猝死综合征(SDS)的抗性相对于从未用组合物处理的植物部
位或植物种子生长、发育或再生的对照植物增加。
[0019] 在其他方面中,提供用于增加作物植物的抗病性的方法,其包括:(a)种植植物部位或种子,其中所述植物部位或种子至少部分地涂布有包含微生物菌株或分离株和农业上
可接受的载剂的组合物,其中所述微生物菌株或分离株相对于所述植物、植物部位或植物
种子是异源的,并且其中所述微生物菌株或分离株具有与以ATCC登录号PTA-123716保藏的
细菌菌株或分离株的对应部分基因组序列或全基因组序列有至少99%、至少99.1%、至少
99.2%、至少99.3%、至少99.4%、至少99.5%、至少99.55%、至少99.6%、至少99.65%、至少99.7%、至少99.75%、至少99.8%、至少99.85%、至少99.9%、至少99.95%或100%同一性的部分基因组序列或全基因组序列,和/或与SEQ ID NO:1有至少99.5%、至少99.55%、至少99.6%、至少99.65%、至少99.7%、至少99.75%、至少99.8%、至少99.85%、至少
99.9%、至少99.95%或100%同一性的16S rDNA序列,和(b)使作物植物从植物部位或种子生长或再生。方法可以还包括以下步骤:(c)从作物植物收获种子。在某些实施方案中,通过本文中提供的方法生产的作物植物可以在SDS疾病压下表现出以下性状中的一种或多
种:生物量增加、每英亩的蒲式数增加、每样地或每株植物的粒重增加、营养素含量改善、抗倒伏性较强、根长增加、植物生长或活力改善、耐逆性(stress tolerance)增加、收获指数增加、鲜穗重量增加、穗直径增加、穗长增加、种子数量增加、豆荚、圆荚或果的数量增加、种子重量增加、种子大小增加和每英亩的蒲式耳数增加。
[0020] 在另一个方面中,提供增加作物植物的抗病性的方法,其包括:(a)将组合物施加于作物植物,所述组合物包含微生物菌株或分离株和农业上可接受的载剂,其中所述微生
物菌株或分离株相对于所述作物植物是异源的,并且其中所述微生物菌株或分离株具有与
以ATCC登录号PTA-123716保藏的细菌菌株或分离株的对应部分基因组序列或全基因组序
列有至少99%、至少99.1%、至少99.2%、至少99.3%、至少99.4%、至少99.5%、至少
99.55%、至少99.6%、至少99.65%、至少99.7%、至少99.75%、至少99.8%、至少99.85%、至少99.9%、至少99.95%或100%同一性的部分基因组序列或全基因组序列,和/或与SEQ ID NO:1有至少99.5%、至少99.55%、至少99.6%、至少99.65%、至少99.7%、至少
99.75%、至少99.8%、至少99.85%、至少99.9%、至少99.95%或100%同一性的16S rDNA序列,和(b)使作物植物生长或发育。在某些实施方案中,方法可以还包括:(c)从作物植物收获种子。在一些实施方案中,组合物可以以叶处理剂的方式施加。在一些实施方案中,通过本文中提供的方法生产的作物植物可以在SDS疾病压力下表现出以下性状中的一种或多
种:生物量增加、每英亩的蒲式耳数增加、每块样地或每株植物的粒重增加、营养素含量改善、抗倒伏性较强、根长增加、植物生长或活力改善、耐逆性增加、收获指数增加、鲜穗重量增加、穗直径增加、穗长增加、种子大小增加、种子数量增加、豆荚、圆荚或角果的数量增加、种子重量增加和每英亩的蒲式耳数增加。
[0021] 在一些方面中,提供增加作物植物的抗病性的方法,其包括:(a)将组合物施加于与作物植物结合在一起的生长培养基,所述组合物包含微生物菌株或分离株和农业上可接
受的载剂,其中所述微生物菌株或分离株相对于所述作物植物是异源的,并且其中所述微
生物菌株或分离株具有与以ATCC登录号PTA-123716保藏的细菌菌株或分离株的对应部分
基因组序列或全基因组序列有至少99%、至少99.1%、至少99.2%、至少99.3%、至少
99.4%、至少99.5%、至少99.55%、至少99.6%、至少99.65%、至少99.7%、至少99.75%、至少99.8%、至少99.85%、至少99.9%、至少99.95%或100%同一性的部分基因组序列或全基因组序列,和/或与SEQ ID NO:1有至少99.5%、至少99.55%、至少99.6%、至少
99.65%、至少99.7%、至少99.75%、至少99.8%、至少99.85%、至少99.9%、至少99.95%或100%同一性的16S rDNA序列,和(b)使作物植物生长或发育。在某些实施方案中,方法可以还包括:(c)从作物植物收获种子。实施方案可以包括其中组合物施加于生长培养基或土壤(如通过滴液、喷洒、灌溉或土壤浇灌)的方法。
[0022] 在其他方面中,提供增加作物植物的抗病性的方法,其包括:(a)将组合物施加于与植物部位或植物种子相关联的生长培养基,所述组合物包含微生物菌株或分离株和农业
上可接受的载剂,其中所述微生物菌株或分离株相对于所述作物植物是异源的,并且其中
所述微生物菌株或分离株具有与以ATCC登录号PTA-123716保藏的细菌菌株或分离株的对
应部分基因组序列或全基因组序列有至少99%、至少99.1%、至少99.2%、至少99.3%、至少99.4%、至少99.5%、至少99.55%、至少99.6%、至少99.65%、至少99.7%、至少
99.75%、至少99.8%、至少99.85%、至少99.9%、至少99.95%或100%同一性的部分基因组序列或全基因组序列,和/或与SEQ ID NO:1有至少99.5%、至少99.55%、至少99.6%、至少99.65%、至少99.7%、至少99.75%、至少99.8%、至少99.85%、至少99.9%、至少
99.95%或100%同一性的16S rDNA序列,和(b)使作物植物从植物部位或植物种子生长或
再生。在某些实施方案中,方法可以还包括:(c)从作物植物收获种子。在一些实施方案中,组合物可以以滴液、喷洒、灌溉或土壤浇灌的方式施加于生长培养基。在某些实施方案中,生长培养基可以是土壤。组合物可以在植物部位或植物种子被种植到生长培养基中之前、
同时或之后施加于生长培养基。
[0023] 通过所提供的方法生产的作物植物可以在SDS疾病压力下表现出以下性状中的一种或多种:生物量增加、每英亩的蒲式耳数增加、每块样地或每株植物的粒重增加、营养素含量改善、抗倒伏性较强、根长增加、植物生长或活力改善、耐逆性增加、收获指数增加、鲜穗重量增加、穗直径增加、穗长增加、种子大小增加、种子数量增加、豆荚、圆荚或角果的数量增加、种子重量增加和每英亩的蒲式耳数增加。
[0024] 在另一个方面中,提供一种修饰的微生物菌株,其具有与SEQ ID NO:1有至少99.5%、至少99.55%、至少99.6%、至少99.65%、至少99.7%、至少99.75%、至少99.8%、至少99.85%、至少99.9%、至少99.95%或100%同一性的16S rDNA序列,其中当将作物植物用所述修饰的微生物菌株处理或与所述修饰的微生物菌株结合在一起时,所述修饰的微
生物菌株赋予作物植物正面的农业性状或益处。其他实施方案提供一种修饰的微生物菌
株,其具有与以ATCC登录号PTA-123716保藏的细菌菌株或分离株的对应部分基因组序列或
全基因组序列有至少99%、至少99.1%、至少99.2%、至少99.3%、至少99.4%、至少
99.5%、至少99.55%、至少99.6%、至少99.65%、至少99.7%、至少99.75%、至少99.8%、至少99.85%、至少99.9%或至少99.95%同一性的全基因组序列(或部分基因组序列),其
中将作物植物用所述修饰的微生物菌株处理或与所述修饰的微生物菌株结合在一起时,所
述修饰的微生物菌株赋予作物植物正面的农业性状或益处。

具体实施方式

[0025] 根据一些实施方案,提供包含微生物菌株或分离株的组合物,发现并鉴别出当与作物植物结合在一起和/或施加于作物植物时,所述微生物菌株或分离株赋予作物植物正
面的农业性状或益处。这类正面的农业性状或益处可以包括抗病性、疾病防治、疾病耐受
性、植物生长增加和/或作物植物产量增加。更具体地说,微生物菌株或分离株可以是命名为MON 201510并且以ATCC登录号PTA-123716保藏的具体细菌或绿针假单胞菌菌株或分离
株,或具有一个或多个相同或类似特征(如赋予或给予作物植物相同或类似的正面的农业
性状或益处的能力)的紧密相关的假单胞菌菌株或分离株。如本文中所描述,分离的MON 
201510菌株已显示正面地给予大豆植物对大豆猝死综合征(“SDS”)的抗性。因此,提供包含分离的MON 201510和紧密相关的菌株的组合物,其用于与作物植物、植物部位或种子结合
在一起,或用于与作物植物、植物部位或植物种子相关联的生长培养基或土壤,如本文中进一步提供,以增加对一种或多种真菌疾病(如SDS或镰孢菌疾病)的抗性。
[0026] 如本文中所使用,在本文中提供的微生物菌株或分离株的情况下,术语植物关于植物病原体或由植物病原体引起的植物疾病的“抗性”和“增加的抗性”包括相对于未处理的对照植物减轻(i)植物病原体对植物的感染和/或(ii)由植物病原体引起的植物疾病严
重程度或症状的任何作用模式(及其组合),其可能是归因于以下或由以下所致,例如,(a)微生物菌株或分离株诱导植物增加的抗病性或疾病耐受性,(b)微生物菌株或分离株产生
针对病原体的杀真菌或其他拮抗性化合物,和/或(c)微生物菌株或分离株排除或减少植物
宿主组织的植物病原体。因此,如本文中所使用,在本文中提供的微生物菌株或分离株的情况下并且关于例如植物病原体、真菌病原体、镰孢菌、植物疾病、真菌疾病或SDS的术语植物的“抗性”和“增加的抗性”意图包括任何方式和模式的植物疾病严重程度或一个或多个症状的减轻和/或植物病原体对植物的感染的任何减轻,如通过任何测量或观察确定,无论作用模式如何。
[0027] 猝死综合征(SDS)是在许多商业大豆生产区域(例如北美洲和南美洲)中的严重疾病,导致显著的产量损失。如本领域中已知,SDS是由镰孢菌属真菌种引起的,如北美洲的枝状镰孢菌(F.virguliforme)以及南美洲的巴氏镰孢菌(F.brasiliense)、库氏镰孢菌
(F.cuneirostrum)、图氏镰孢菌(F.tucumaniae)和枝状镰孢菌。当在大豆作物中检测到病
原体时,对植物活力和产量的损害由于症状(包括坏死、萎黄病、枯萎和死亡)而可能是不可逆的。因此,本公开通过提供赋予增加的对土源性病原体(包括例如镰孢菌、腐霉菌
(Pythium)、疫霉菌(Phytophthora)和丝核菌(Rhizoctonia))的抗性或耐受性的微生物菌
株或分离株而代表本领域中的重要的进步。特别是,微生物菌株或分离株可以有效地赋予
植物增加的抗病性或疾病耐受性,所述疾病包括由真菌和/或镰孢菌病原体(如枝状镰孢菌
(Fv)、巴氏镰孢菌、库氏镰孢菌、费氏镰孢菌(Fusarium phaseoli)和/或图氏镰孢菌,或更具体地说,枝状镰孢菌)引起的大豆SDS。
[0028] 因此,在一个实施方案中,如本文中提供的包含MON 201510或相关微生物菌株或分离株的组合物可以用于给予作物植物(如大豆)对由镰孢菌物种或病原体引起的大豆SDS
的抗病性或疾病耐受性,所述镰孢菌物种或病原体如枝状镰孢菌(Fv)、巴氏镰孢菌、库氏镰孢菌、费氏镰孢菌和/或图氏镰孢菌,或更具体地说,枝状镰孢菌。因此,本公开的包含菌株或分离株的组合物可以施加于植物、植物部位或种子和/或与植物、植物部位或种子结合在一起,以赋予对大豆SDS和/或镰孢菌引起的疾病的抗性或耐受性。
[0029] 大豆的土源性疾病的其他实例包括炭腐病、镰孢菌根腐病、茎褐腐病、大豆茎溃疡、腐霉菌根腐病、疫霉菌根腐病、丝核菌根腐病和炭腐病。由用本文中提供的微生物菌株和分离株处理所致的增加的抗病性或疾病耐受性可以保护作物植物避免与疾病相关联的
产量损失。用本文中提供的微生物菌株或分离株处理的植物可以表现出与未处理的对照植
物相比,疾病严重程度减轻,并且因此在疾病压力(如SDS)下表现出与未用微生物菌株或分离株处理的对照植物相比优异的表现。已显示本文中提供的分离的MON 201510正面地给予
大豆植物对由病原体不规则腐霉菌(Pythium irregular)引起的早期幼苗疾病的抗性。因
此,一个实施方案是如本文中提供的包含MON201510或相关微生物菌株或分离株的组合物,其可以用于给予作物植物(如大豆)对由腐霉菌种或病原体(如不规则腐霉菌)引起的早期
幼苗疾病的抗病性或疾病耐受性。在一个实施方案中,包含菌株或分离株的组合物可以施
加于植物、植物部位或种子和/或与植物、植物部位或种子结合在一起,以赋予对腐霉菌引起的疾病的抗性或耐受性。
[0030] 在一个实施方案中,组合物可以包含假单胞菌菌株或分离株,其与命名为MON 201510并且以ATCC登录号PTA-123716保藏的分离的绿针假单胞菌菌株紧密相关并且关于
作物植物具有一个或多个类似的特征,如在施加于作物植物或与作物植物结合在一起时给
予作物植物相同或类似的正面的农业性状或益处的能力。16S rRNA编码DNA(16S rDNA)序
列的测序和比较是已用于确定微生物菌株或分离株的系统发生或分类学的方法,其还可以
用于定义紧密相关的微生物种、菌株或分离株。因此,两种或更多种不同的微生物或细菌菌株或分离株的16S rDNA序列之间的同一性百分比可以用于指示其与具体已知的分类学的
相关性,其中同一性百分比越高表明所述两种或更多种微生物菌株或分离株之间的关系越
紧密。两种紧密相关的微生物菌株或分离株之间的高相似性或相关性还可以表明类似的给
予作物植物相同或类似的正面的农业性状或益处的能力。因此,根据一些实施方案,提供包含假单胞菌菌株或分离株(如绿针假单胞菌菌株或分离株)的组合物,所述假单胞菌菌株或
分离株与分离的MON 201510菌株紧密相关并且具有与分离的MON 201510菌株的16S rDNA
序列(SEQ ID NO:1)具有高同一性百分比如与分离的MON 201510菌株的16S rDNA序列(SEQ 
ID NO:1)具有至少99.5%、至少99.55%、至少99.6%、至少99.65%、至少99.7%、至少
99.75%、至少99.8%、至少99.85%、至少99.9%、至少99.95%或100%同一性的16S rDNA序列,以用于与如本文中进一步提供的作物植物、植物部位或种子(如大豆植物、植物部位或种子)结合在一起。
[0031] 不受理论约束,通常可以预期与所保藏的MON 201510菌株相比具有相同或几乎相同的基因组和/或16S序列的紧密相关联的假单胞菌菌株或分离株关于作物植物具有一个
或多个类似的特征,如在施加于作物植物或与作物植物结合在一起时给予或赋予作物植物
相同或类似的正面的农业性状或益处的能力。实际上,在假单胞菌微生物的基因组和/或
16S序列中相对于MON 201510菌株的许多突变可能相对于其给予或赋予作物植物相同或类
似的正面的农业性状或益处(如SDS抗性或耐受性)的能力是惰性的。
[0032] 鉴于两种或更多种紧密相关的微生物菌株或分离株更可能在与作物植物结合在一起或施加于作物植物时给予或赋予作物植物相同或类似的正面的农业性状或益处,给予
或赋予与分离的MON 201510菌株相同或类似的正面的农业性状或益处的紧密相关的假单
胞菌菌株或分离株(如相关的绿针假单胞菌菌株或分离株)可能与分离的MON 201510菌株
的16S rDNA序列(SEQ ID NO:1)具有较高16S rDNA序列同一性,如至少99.9%、至少
99.95%或100%同一性。
[0033] 所比对的微生物菌株或分离株的全基因组序列(或部分基因组序列)的测序和比较还可以用于确定微生物菌株或分离株的系统发生、分类学或分类,其可以用于进一步定
义紧密相关的微生物物种、菌株或分离株。鉴于用于比较的序列长度是大型的,与其他序列比较对比,两种或更多种微生物菌株或分离株的全基因组序列(或部分基因组序列)可以提
供所述两种或更多种微生物菌株之间的特异性和相关性程度。因此,所比对的两种或更多
种不同的微生物或细菌菌株或分离株的全基因组序列(或部分基因组序列)之间的同一性
百分比可以用于指示其彼此之间的相关性,其中同一性百分比越高表明所述两种或更多种
菌株或分离株之间的关系越紧密。在紧密相关的假单胞菌菌株或分离株的基因组序列中相
对于分离的MON 201510假单胞菌菌株的许多突变和差异可能在功能上是惰性的,并且因此
不改变紧密相关的假单胞菌菌株给予或赋予作物植物正面的农业性状或益处的特征或能
力。因此,根据许多实施方案,提供包含假单胞菌菌株或分离株(如绿针假单胞菌菌株或分离株)的组合物,所述假单胞菌菌株或分离株与分离的MON 201510菌株紧密相关并且具有
与以ATCC登录号PTA-123716保藏的分离的MON 201510菌株的对应全基因组序列(或部分基
因组序列)具有高同一性百分比如与分离的MON 201510菌株的全基因组序列(或部分基因
组序列)具有至少99%、至少99.1%、至少99.2%、至少99.3%、至少99.4%、至少99.5%、至少99.55%、至少99.6%、至少99.65%、至少99.7%、至少99.75%、至少99.8%、至少
99.85%、至少99.9%、至少99.95%或100%同一性的全基因组序列(或部分基因组序列),并且/或者其可以与作物植物、植物部位或种子(如双子叶植物或大豆植物、植物部位或种
子)结合地使用和/或施加于所述作物植物、植物部位或种子以给予或赋予作物植物正面的
性状或益处。关于两种或更多种微生物菌株的基因组或16S rDNA序列之间的序列比较,术
语“对应”是指最佳比对序列。因此,如果第一微生物菌株的一个基因组序列相对于第一微生物菌株的所有其他基因组序列与第二微生物菌株的基因组序列是最佳比对的,那么第一
微生物菌株的这个基因组序列将与第二微生物菌株的基因组序列“对应”。
[0034] 微生物菌株或分离株可以包括天然存在的假单胞菌菌株或分离株,或者相对于分离的MON 201510菌株的基因组和/或16S rDNA序列具有一个或多个突变、缺失、添加、插入、重排等的非天然存在和/或突变型菌株。
[0035] 如本文中关于两个或更多个核苷酸或蛋白质序列使用的术语“同一性百分比”、“同一性%”或“百分比同一性”是通过以下方式计算:(i)在比较窗口内比较两个最佳比对序列,(ii)确定两个序列中存在相同核酸基(对于核苷酸序列)或基酸残基(对于蛋白
质)的位置数,以得到匹配位置数,(iii)将匹配位置数除以比较窗口中的总位置数,以及
(iv)将这一商数乘以100%,得到同一性百分比。如果在不指定具体比较窗口的情况下相对于参考序列计算“同一性百分比”,那么通过将比对区域内的匹配位置数除以参考序列的总长度来确定同一性百分比。因此,如本文中使用,当两个序列(查询和主题)是最佳比对的
(在其比对中允许存在间隙)时,查询序列的“同一性百分比”等于两个序列之间的相同位置数除以查询序列在其长度(或比较窗口)上的总位置数,然后乘以100%。除序列同一性或类似性以外,紧密相关的假单胞菌微生物菌株或分离株可以进一步定义成能够给予或赋予作
物植物正面的性状或益处,如增加的抗病性,包括增加的对SDS的抗性。
[0036] 如本文中描述的与植物、植物部位植物种子结合在一起或施加于植物、植物部位植物种子的微生物菌株或分离株可以定义成关于植物、植物部位或植物种子是异源的或异
源施加的。关于植物、植物部位或植物种子或生长培养基或土壤的术语“异源”或“异源施加”是指在自然界中和在将微生物菌株或分离株与植物、植物部位或植物种子或生长培养
基或土壤结合在一起或施加于植物、植物部位或植物种子或生长培养基或土壤之前,在这
类植物、植物部位或植物种子上或中或在这类生长培养基或土壤中不能检测到存在的微生
物菌株或分离株。因此,根据一些实施方案,提供以下组合物,其包含与植物、植物部位或植物种子(如双子叶植物或大豆植物)结合在一起的微生物菌株或分离株,其中所述微生物菌
株或分离株相对于植物、植物部位或植物种子是异源的。根据一些实施方案,提供以下组合物,其包含与植物生长培养基或土壤相关联的微生物菌株或分离株,其中所述生长培养基
或土壤相对于微生物菌株或分离株是异源的。提供以下方法,其中微生物菌株或分离株可
以异源施加于植物、植物部位或植物种子,如双子叶植物,包括大豆植物。还提供以下方法,其中微生物菌株或分离株可以异源施加于生长培养基或土壤。这类微生物菌株或分离株可
以异源施加于植物、植物部位或植物种子处、附近或周围的生长培养基或土壤,或生长培养基或土壤中将种植植物部位或植物种子的区域处、附近或周围的生长培养基或土壤。
[0037] 除序列同一性或类似性以外,紧密相关的假单胞菌微生物菌株或分离株可以进一步定义成能够给予或赋予作物植物正面的性状或益处,如植物的增加的产量、生长、耐逆性和/或真菌或SDS疾病耐受性或抗性。紧密相关的假单胞菌微生物菌株或分离株还可以具有
类似的生物化学、分子、分泌或代谢特征或活性。
[0038] 可以使用本领域中已知的任何标准或已知的静态干燥或液体发酵技术制备微生物培养物,以用于本文中的微生物组合物中。微生物培养的最佳条件可以取决于具体菌株。
本领域的技术人员将能够确定合适的营养素和条件。微生物可以在培养基上的好液体培
养物中生长,所述培养基含有可以被微生物吸收并且支持有效的细胞生长的源、氮源和
无机盐来源。碳源可以包括己糖,如葡萄糖,并且可以使用其他易于吸收的来源,如氨基酸。
许多无机和蛋白质材料可以用作生长过程中的氮源。氮源可以包括氨基酸和尿素,以及氨、无机硝酸盐和铵、维生素、嘌呤、嘧啶、酵母提取物、肉提取物、朊蛋白胨、大豆粉酪蛋白水解产物、烧酒糟残液等。可以并入营养培养基中的无机矿物质为能够产生、锌、、锰、镁、、钴、、钠、钼酸根、磷酸根、硫酸根、氯离子、酸根和类似离子的盐。
[0039] 根据本公开的实施方案,提供以下组合物,其包含如本文中提供的微生物或细菌菌株或分离株的各种制剂。这类制剂可以包括各种盐、填充剂、粘结剂、溶剂、载剂、赋形剂、助剂和/或其他组分或成分,如下文中所述的其他组分或成分。本公开的组合物中每种组分的量和浓度可以取决于许多因素,如组合物将施加的材料的类型、大小和体积;组合物中微生物的一种或多种类型;组合物中微生物的数目;组合物中微生物的稳定性;储存条件(例如温度相对湿度、持续时间)等。本领域的技术人员将理解如何确定本公开的微生物组合物的各种制剂组分的可接受的、有效的并且合适的量和浓度。在一些实施方案中,本公开的组合物可以包含一种或多种以约1%至99%或更多(基于组合物的总重量或体积,按重量或
体积计)的量/浓度的载剂。例如,本公开的组合物可以包含一种或多种以约1%、2%、3%、
4%、5%、6%、7%、8%、9%、10%、15%、20%、25%、30%、35%、40%、45%、50%、55%、
60%、65%、70%、75%、80%、85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、
99%或99.5%或更多(按重量或体积计)的量或浓度的载剂和/或其他组分。微生物菌株或
分离株可以以任何一种或多种合适的形式存在于组合物或制剂中。
[0040] 组合物和制剂可以包含本文中描述的微生物菌株或分离株的纯的或基本上纯的群体或培养物。微生物菌株或分离株的纯的群体或培养物是指不含或基本上不含其他微生
物污染的菌株或分离株的群体或培养,使得所述群体或培养物在序列同一性方面具有足够
的遗传均匀性,并且从中取得的不同传代培养物将对农作物植物表现出基本上相同的表现
型和/或作用。根据一些实施方案,微生物菌株或分离株可以是“纯化的”并且纯化的微生物菌株或分离株可以与一种或多种其他成分组合以形成组合物或制剂。本领域中已知的任何
合适的方法可以用于分离和/或纯化具体微生物菌株或分离株以形成微生物菌株或分离株
的纯或基本上纯的群体或培养物,如通过菌落或克隆选择。或者,微生物菌株或分离株可以与其他微生物混合至不同程度或比例。根据一些实施方案,微生物菌株或分离株可以以存
在于组合物或制剂中的全部微生物群体的10-30%之间、10-40%之间、10-50%之间、20-
40%之间、30-50%之间、大于50%、大于60%、大于70%、大于80%、大于90%、大于95%、大于96%、大于97%、大于98%、大于99%或大于99.5%的量或浓度存在于组合物或制剂中。
如果菌株或分离株占存在于组合物中的全部微生物群体的大于95%,使得至少95%、至少
96%、至少97%、至少98%、至少99%、至少99.5%、至少99.9%或至少99.95%的从中取得的传代培养物表现出相同的基因型和表现型,那么组合物包含微生物菌株或分离株的“基
本上纯的”群体或培养物。如果菌株或分离株占存在于组合物中全部微生物群体的100%,使得100%的从中取得的传代培养物表现出相同的基因型和表现型,那么组合物包含微生
物菌株或分离株的“纯的”群体或培养物。
[0041] 根据一些实施方案,组合物和制剂可以包含“有效量”、“有效浓度”和/或“有效剂量”的微生物菌株或分离株,以在与作物植物结合地使用时给予作物植物正面的性状或益处,如增加的抗病性或其他性状。微生物菌株或分离株的有效量/浓度/剂量可以取决于许
多因素,如组合物或制剂将施加的种子或植物材料的类型、大小和体积;所需益处、性状或作用的量值;组合物或制剂中微生物的稳定性或施加于植物、植物部位或植物种子的时间;
组合物或制剂中其他成分的同一性和量;向种子、植物材料、土壤或生长培养基的施加方
式;和相关储存条件(例如温度、相对湿度、储存持续时间、光照等)。本领域的技术人员可以使用剂量-反应实验或其他已知的方法确定有效量/浓度/剂量。
[0042] 根据一些实施方案,微生物菌株或分离株可以以在每克或每毫升约1×101到约1×1015个菌落形成单位(cfu)范围内的量或浓度存在于组合物中。例如,微生物菌株或分离
株可以以每克或每毫升组合物至少1×101、至少1×102、至少1×103、至少1×104、至少1×
105、至少1×106、至少1×107、至少1×108、至少1×109、至少1×1010、至少1×1011、至少1×
12 13 14 15
10 、至少1×10 、至少1×10 或至少1×10 (或更多)cfu的量或浓度存在于组合物中。如
本文中使用,术语“菌落形成单位”或“cfu”是指当条件(例如温度、湿度、营养素有效性、pH值等)有利于萌发和/或微生物生长时,能够在合适的生长培养基或底物(例如土壤)上或中
繁殖的微生物细胞或孢子。
[0043] 根据其他实施方案,微生物菌株或分离株可以以在组合物的约0.1%到100%(按重量计)、或组合物的约0.1%到约90%、或约1%到约90%、或约0.1%到约80%、或约0.1%到约70%、或约0.1%到约60%、或约0.1%到约50%、或约0.1%到约40%、或约0.1%到约
30%、或约0.1%到约20%(按重量计)范围内的量或浓度存在于组合物中。例如,微生物菌株或分离株可以以组合物的约0.1%、0.2%、0.3%、0.4%、0.5%、0.6%、0.7%、0.8%、
0.9%、1%、1.25%、1.5%、1.75%、2%、2.25%、2.5%、2.75%、3%、3.25%、3.5%、
3.75%、4%、4.25%、4.5%、4.75%、5%、6%、7%、8%、9%、10%、11%、12%、13%、14%、
15%、16%、17%、18%、19%、20%、21%、22%、23%、24%、25%、26%、27%、28%、29%、
30%、35%、40%、45%、50%、55%、60%、65%、70%、75%、80%、85%、90%、95%、96%、
97%、98%或99%或更多(按重量计)的量或浓度存在。根据一些实施方案,微生物菌株或分离株的量/浓度是组合物的约1%到约25%、约5%到约20%、约5%到约15%、约5%到约
10%或约8%到约12%(按重量计)。
[0044] 组合物可以包含本文中描述的分离的微生物菌株或分离株。如果微生物菌株已从环境中移除和/或纯化,那么其是“分离的”。这类“分离的”微生物菌株可以是分离的MON 
201510菌株(以ATCC登录号PTA-123716保藏的代表性样品)或其任何功能性变体。类似地,
“分离株”是已从天然环境移除和/或纯化的具体微生物菌株。微生物菌株或分离株如MON 
201510分离株的“功能性变体”可以定义成其满足以下条件的菌株或其子代:具有高序列同一性(例如与16S rDNA序列具有至少99.5%或至少99.9%同一性(或更大)和/或与微生物
菌株或分离株(如MON 201510菌株)的全基因组序列(或部分基因组序列)具有至少99%同
一性(或更大),如上所述),并且具有或表现出与微生物菌株或分离株(如分离的MON 
201510菌株)相同或类似的功能特征。例如,与分离的MON 201510菌株类似,功能性变体可以给予或赋予作物植物正面的性状或益处,如植物的抗病性、产量、生长和/或耐逆性增加,和/或植物本身或通过增加的营养素有效性和/或改善的土壤特征实现的营养素吸收增加。
相对于分离的MON201510菌株,这类功能性变体可以表现出在相同或较小的范围或程度上
相同或类似的功能特征,如至少70%、至少75%、至少80%、至少85%、至少90%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、至少99%或100%的范围或程度的功能特征。
[0045] 在一些实施方案中,组合物可以包含修饰的微生物菌株。如本文中使用,术语“修饰的微生物菌株”是指从本文中提供的菌株或分离株修饰的微生物菌株。修饰的微生物菌株可以通过任何一种或多种合适的方法产生,包括(但不限于)对菌株或分离株的任何基因
组内的多核苷酸的诱发突变,包括(但不限于)化学诱发突变;菌株或分离株内任何基因组
内的一个或多个核苷酸的插入或缺失,或其组合;菌株或分离株内任何基因组内的至少一
个DNA片段的反转;菌株或分离株内任何基因组的重排;纯合或杂合多核苷酸片段向菌株或分离株内任何基因组中的普遍性或特异性转导;一种或多种噬菌体向菌株或分离株的任何
基因组中的引入;导致将稳定且自主复制的染色体外DNA引入到菌株或分离株中的任何菌
株或分离株的转型;由与任何不同微生物菌株的缀合引起的对菌株或分离株内任何基因组
或全部DNA组成的任何变化;和前述的任何组合。术语“修饰的微生物菌株”包括具有以下的菌株或分离株:(a)一个或多个异源核苷酸序列,(b)从自然界分离的核苷酸序列的一个或
多个非天然存在的拷贝(即,衍生修饰的微生物菌株的微生物菌株中天然存在的基因的额
外拷贝),(c)通过例如删除核苷酸序列而缺乏天然参考菌株中原本可存在的一个或多个核
苷酸序列,和(d)添加的染色体外DNA。在一些实施方案中,“修饰的微生物菌株”包含两个或更多个核苷酸序列(例如两个或更多个不天然存在于相同微生物菌株或分离株中的天然存
在的基因)的组合,或包含在不同于天然基因座的基因座处从自然界分离的核苷酸序列。
[0046] 本公开的组合物还可以包含农业上可接受的载剂以及微生物菌株或分离株。如本文中使用,关于包含微生物菌株或分离株的微生物组合物的载剂、材料、成分或物质的术语“农业上可接受”意指载剂、材料、成分或物质视情况而定(i)至少出于使用微生物组合物的目的而与微生物组合物的其他成分相容,(ii)可以包括在微生物组合物中以有效并且可行
地将微生物菌株或分离株递送到植物、植物部位、植物种子或植物生长培养基(例如土壤)
中,(iii)通常不与自然界中的微生物菌株或分离株(至少在它将使用的形式方面)结合,和(iv)对组合物将结合在一起或施加的植物、植物部位或植物种子无害(至少在它将施加于
植物、植物部位或植物种子或与植物、植物部位或植物种子结合在一起的方式和量方面)。
[0047] “载剂”定义为任何可以与微生物菌株或分离株一起使用和/或组合以改善微生物菌株或分离株对植物、植物部位或植物种子的递送或有效性的物质或材料。农业上可接受
的载剂可以包括土壤相容载剂、种子相容载剂和/或叶子相容载剂。如本文中使用,术语“土壤相容载剂”是指可以添加或施加于土壤而对植物产量、土壤结构、土壤排水等不引起/具有不当副作用的材料。术语“种子相容载剂”是指可以添加或施加于种子而对种子、种子萌发、从种子生长的植物等不引起/具有不当副作用的材料。术语“叶子相容载剂”是指可以添加或施加于植物或植物部位的地面上部分而对植物产量、植物健康等不引起/具有不当副
作用的材料。合适的载剂材料的选择将取决于一个或多个预期应用和存在于组合物中的一
种或多种微生物。可以选择和/或组合一种或多种载剂材料以提供呈液体、凝胶、浆料或固体形式的组合物或制剂。在一些实施方案中,组合物可以包含一种或多种液体和/或凝胶载剂,和/或一种或多种水性和/或非水性溶剂。如本文中使用,术语“非水性”可以指包含不多于痕量水(例如不多于0.5重量%水)的组合物、溶剂或物质。
[0048] 根据一些实施方案,组合物可以呈固体或粉末形式并且/或者包含一种或多种固体载剂。例如,组合物可以包含一种或多种粉末(例如可湿性粉剂)和/或颗粒。可用于本公开的组合物中的固体载剂的非限制性实例包括泥基粉末和颗粒、冷冻干燥的粉末、喷雾
干燥的粉末及其组合。
[0049] 可以包括于本公开的组合物中的载剂的其他实例可以见于Burges,H.D.,Formulation of Microbial Biopesticides:Beneficial Microorganisms,Nematodes 
and Seed Treatments,Springer Science&Business Media(2012)以及Inoue和
Horikoshi,J.FERMENTATION BIOENG.71(3):194(1991),它们的内容和公开内容以引用的
方式并入本文中。
[0050] 在一些实施方案中,组合物可以是中液体或凝胶形式并且/或者包含一种或多种液体和/或凝胶载剂。组合物或制剂中农业上可接受的载剂可以包含适合于培养组合物中
的一种或多种微生物的生长培养基或肉汤。例如,组合物可以包含察氏培养基(Czapek-Dox medium)、甘油酵母提取物、甘露醇酵母提取物、铃薯葡萄糖肉汤和/或YEM培养基。市售载剂可以根据制造商建议的量或浓度使用。
[0051] 组合物可以包含一种或多种各种溶剂,如一种或多种有机、无机、非水性和/或水性溶剂。无机溶剂的实例包括癸烷、十二烷、己醚和壬烷。市售有机溶剂的实例包括十五烷、ISOPAR M、ISOPAR V和ISOPAR L(Exxon Mobil)。可以包括在组合物和制剂中的溶剂的其他实例可以见于Burges,同上;Inoue和Horikoshi,同上,它们的内容和公开内容以引用的方
式并入本文中。根据一些实施方案,水性溶剂(如水)可以与共溶剂组合,如乳酸乙酯、大豆油酸甲酯/乳酸乙酯共溶剂共混物(例如,STEPOSOL,购自Stepan)、异丙醇、丙酮、1,2-丙二醇、正烷基吡咯烷酮(例如AGSOLEX系列,购自ISP)、石油基油(例如AROMATIC系列和
SOLVESSO系列,购自Exxon Mobil)、异链烷流体(例如ISOPAR系列,购自Exxon Mobil)、环链烷烃流体(例如NAPPAR 6,购自Exxon mobil)、矿油精(例如VARSOL系列,购自Exxon 
Mobil)和矿物油(例如石蜡油)。根据一些实施方案,组合物可以包含一种或多种除水性溶
剂或水以外的共溶剂。这类一种或多种共溶剂可以包括例如非水性溶剂,如一种或多种前
述非水性溶剂。
[0052] 根据一些实施方案,组合物,包括制剂,可以具有在约4.5到约9.5范围内的所需pH值。本公开的组合物可以包含本领域中已知的任何一种或多种合适的pH缓冲剂。例如,组合物可以具有在约6到约8范围内的pH值,或约5、5.5、6、6.5、7、7.5、8或8.5的pH值。为了维持所需pH值,在一些实施方案中,组合物可以在缓冲溶液中包含一种或多种缓冲剂。可以选择pH缓冲剂以提供pH值小于10,通常是约4.5到约9.5、约6到约8、或约7的水性组合物。适用于多种pH值范围的缓冲溶液是本领域中已知的。
[0053] 组合物可以包含一种或多种增稠剂、流变改性剂或稳定化剂(“稳定剂”)。稳定剂的实例包括阴离子多糖和纤维素衍生物。稳定剂可以包含例如粘土、二氧化或胶态亲水性二氧化硅。可商购获得的稳定剂的非限制性实例包括KELZAN CC(Kelco)、甲基纤维素羧甲基纤维素和2-羟乙基纤维素、羟甲基纤维素、高岭土、麦芽糖糊精、麦芽提取物、微晶纤维素和吸湿性聚合物。可商购获得的胶态亲水性二氧化硅的非限制性实例是AEROSIL
(Evonik)。稳定剂还可以包括单糖、二糖或糖醇,如麦芽糖、海藻糖、乳糖、蔗糖、纤维二糖、甘露醇、木糖醇或山梨糖醇及其任何组合。稳定剂组分可以占组合物的约0.05重量%到约
10重量%。例如,稳定剂组分可以占组合物的约0.1重量%到约5重量%、约0.1重量%到约2重量%或约0.1重量%到约1重量%。
[0054] 本公开的组合物可以包含任何一种或多种合适的防沉剂,包括(但不限于)聚乙酸乙烯酯;具有不同水解度的聚乙烯醇;聚乙烯吡咯烷酮;聚丙烯酸酯;基于丙烯酸酯、多元醇或聚酯的涂料体系粘结剂,其可以溶解或分散于水中;两种或更多种单体的共聚物,如丙烯酸、甲基丙烯酸、衣康酸、马来酸、富马酸、马来酸酐、乙烯基吡硌烷酮;烯键式不饱和单体,如乙烯、丁二烯、异戊二烯、氯丁二烯、苯乙烯、二乙烯基苯、邻甲基苯乙烯或对甲基苯乙烯;
卤代乙烯,如氯乙烯和偏二氯乙烯;乙烯基酯,如乙酸乙烯酯、丙酸乙烯酯或硬脂酸乙烯酯;
乙烯基甲基酮或丙烯酸或甲基丙烯酸与一元醇或多元醇的酯,如丙烯酸甲酯、甲基丙烯酸
甲酯、丙烯酸乙酯、甲基丙烯酸乙烯酯、丙烯酸十二烷基酯、甲基丙烯酸月桂酯、丙烯酸癸酯、甲基丙烯酸N,N-二甲基氨基-乙酯、甲基丙烯酸2-羟乙酯、甲基丙烯酸2-羟丙基酯或甲基丙烯酸缩水甘油酯;不饱和二羧酸的二乙酯或单酯、(甲基)丙烯酰基酰胺基-N-羟甲基甲醚;酰胺或腈,如丙烯酰胺、甲基丙烯酰胺、N-羟甲基(甲基)丙烯酰胺、丙烯腈、甲基丙烯腈、N取代的马来酰亚胺;和醚,如乙烯基丁基醚、乙烯基异丁基醚或乙烯基苯基醚;及其组合。
[0055] 在一些实施方案中,组合物可以包含一种或多种氧化控制组分,其可以包括一种或多种抗氧化剂(例如以下中的一种或多种:抗坏血酸、棕榈酸抗坏血酸酯、硬脂酸抗坏血酸酯、抗坏血酸钙、类胡萝卜素、硫辛酸、酚类化合物(例如一种或多种类黄酮、黄酮和/或黄酮醇)、抗坏血酸钾、抗坏血酸钠、一种或多种硫醇(例如谷胱甘肽、硫辛酸和/或N-乙酰半胱氨酸)、生育酚、一种或多种生育三烯酚、泛醌和/或尿酸)和/或一种或多种除氧剂如抗坏血酸和/或碳酸氢钠
[0056] 在一些实施方案中,组合物可以包含一种或多种UV保护剂,如一种或多种芳香族氨基酸(例如色氨酸、酪氨酸)、类胡萝卜素、肉桂酸酯、木质素磺酸盐(例如木质素磺酸钙、木质素磺酸钠)、黑色素、杀枝曲菌素(mycosporines)、多酚和/或水杨酸酯)。UV保护剂的非限制性实例包括Borregaard LignoTechTM木质素磺酸盐(例如Borresperse 3A、
Borresperse CA、Borresperse NA、Marasperse AG、Norlig A、Norlig 11D、Ufoxane 3A、Ultrazine NA、Vanisperse CB;Borregaard Lignotech,Sarpsborg,Norway)及其组合。参见例如BURGES,FORMULATION OF MICROBIAL BIOPESTICIDES:BENEFICIAL MICROORGANISMS,NEMATODES AND SEED TREATMENTS(Springer Science&Business Media)(2012)。
[0057] 在一些实施方案中,组合物可以包含一种或多种农业上可接受的聚合物,如琼脂、藻酸盐、角叉菜胶、纤维素、瓜耳豆胶、刺槐豆胶、甲基纤维素、果胶、聚己酸内酯、聚交酯、聚乙烯醇、聚乙烯吡咯烷酮、羧甲基纤维素钠、淀粉和/或黄原胶。在一个方面中,一种或多种聚合物是天然聚合物(例如琼脂、淀粉、藻酸盐、果胶、纤维素等)、合成聚合物、可生物降解的聚合物(例如聚己酸内酯、聚交酯、聚乙烯醇等)或其组合。对于适用于本文中描述的组合物的聚合物的非限制性列表,参见例如Pouci等人,Am.J.Agri.&Biol.Sci.,3(1):299-314(2008),它的内容和公开内容以引用的方式并入本文中。
[0058] 在一些实施方案中,组合物可以包含一种或多种农业上可接受的分散剂,其可以包括一种或多种表面活性剂和/或湿润剂。分散剂可以用于维持悬浮液中粒子或细胞的均
质或均匀分布,如微生物菌株或分离株的均匀或均质分布,其可以特别适用于微生物的固
体或干燥制剂和/或发酵物的液体制剂。除了维持微生物在最终组合物或制剂中以及在将
组合物或制剂施加于植物、植物部位或植物种子期间的均匀分布以外,分散剂或湿润剂还
可以在微生物组合物的配制期间促进微生物与微生物制剂或组合物的其他成分和溶剂的
混合并且避免粒子的聚集或团聚或者向容器壁的附着等。分散剂可以减少类似粒子的内
聚、液体的表面张力、两种液体之间的界面张力和/或液体与固体之间的界面张力。组合物可以包含主要分散剂以及一种或多种次要分散剂,并且主要和次要分散剂可以是不同类型
(例如非离子型、阳离子型、阴离子型和/或两性离子型)。湿润剂可以与施加于土壤特别是疏水性土壤的组合物一起使用,以改善水向土壤中的渗入和/或透入。湿润剂或分散剂可以是助剂、油、表面活性剂、缓冲剂、酸化剂或其组合。湿润剂或分散剂可以是表面活性剂,如一种或多种非离子表面活性剂、一种或多种阳离子表面活性剂、一种或多种阴离子表面活
性剂、一种或多种两性离子表面活性剂或其任何组合。
[0059] 一种或多种合适的分散剂的选择将取决于一个或多个预期应用和组合物中存在的一种或多种微生物,但通常对于接种组合物中的一种或多种微生物和施加组合物的一个
或多个植物部位几乎没有或没有毒性。在一些实施方案中,将选择一种或多种分散剂以湿
润和/或乳化一种或多种土壤。分散剂的非限制性实例包括AtloxTM(例如4916、4991;Croda International PLC,Edison,NJ)、Atlox METASPERSETM(Croda International PLC,
Edison,NJ)、BIO- (例如N系列,如N1-3、N1-7、N1-5、N1-9、N23-3、N2.3-6.5、N25-3、N25-7、N25-9、N91-2.5、N91-6、N91-8;Stepan Company,Northfield,IL)、 非离
子表面活性剂(例如DA-4、DA-6和DA-9;Stepan Company,Northfield,IL)、 粉
末(Akzo Nobel Surface Chemistry LLC,Chicago,IL)、MULTIWETTM表面活性剂(例如MO-
85P-PW-(AP);Croda International PLC,Edison,NJ)、 L-77(Helena 
Chemical Company,Collierville,TN)、SPANTM表面活性剂(例如20、40、60、65、80和85;
Croda Inc.,Edison NJ)、TAMOLTM分散剂(The Dow Chemical Company,Midland,MI)、
TERGITOLTM表面活性剂(例如TMN-6和TMN-100X;The Dow Chemical Company,Midland,MI)、TERSPERSE表面活性剂(例如2001、2020、2100、2105、2158、2700、4894和4896;Hunstman Corp.,The Woodlands,TX)、TRITONTM表面活性剂(例如X-100;The Dow Chemical Company,Midland,MI)、 表面活性剂(例如 20、21、22、23、28、40、60、61、65、80、
81和85;Croda International PLC,Edison,NJ)及其组合。湿润剂的非限制性实例包括
磺酸盐、烷基萘磺酸盐(例如烷基萘磺酸钠)、异丙基萘磺酸盐(例如,异丙基萘磺酸钠)和/或丁基萘磺酸盐(例如正丁基萘磺酸钠)。分散剂的其他实例可见于BAIRD和ZUBLENA.1993.SOIL FACTS:USING WETTING AGENTS(NONIONIC SURFACTANTS)ON SOIL(North Carolina Cooperative Extension Service Publication AG-439-25)(1993);BURGES,FORMULATION OF MICROBIAL BIOPESTICIDES:BENEFICIAL MICROORGANISMS,NEMATODES AND SEE D TREATMENTS(Springer Science&Business Media)(2012);和MCCARTY,WETTING AGENTS(Clemson University Cooperative Extension Service Publication)(2001)。
[0060] 阴离子表面活性剂的非限制性实例包括一种或多种烷基羧酸盐(例如硬脂酸钠)、醇醚羧酸盐、酚醚羧酸盐、烷基硫酸盐(例如烷基月桂基硫酸盐和/或月桂基硫酸钠)、烷基醚硫酸盐、醇硫酸盐、醇醚硫酸盐、烷基酰胺基醚硫酸盐、烷基芳基醚硫酸盐、烷基芳基聚醚硫酸盐、烷基芳基硫酸盐、烷基芳基磺酸盐、烷基磺酸盐、烷基酰胺磺酸盐、芳基磺酸盐、烷基苯磺酸盐、烷基二苯基氧化物磺酸盐、α-烯烃磺酸盐、烷基萘磺酸盐、石蜡磺酸盐、磺基琥珀酸盐、烷基磺基琥珀酸盐、烷基醚磺基琥珀酸盐、烷基酰胺磺基琥珀酸盐、醇或聚烷氧基化烷醇的单或二磺基琥珀酸酯、烷基磺基琥珀酸盐、烷基磺基乙酸盐、烷基磷酸盐、烷基醚磷酸盐、聚烷氧基化烷基醇或烷基酚的单或二磷酸酯、酰基肌氨酸盐、酰基羟乙基磺酸盐、N-乙酰基牛磺酸盐、N-乙酰基-N-烷基牛磺酸盐、苯磺酸盐、异丙苯磺酸盐、磺基琥珀酸二辛基钠、乙氧基化磺基琥珀酸盐、木质素磺酸盐、直链烷基苯磺酸盐、单甘油酯硫酸盐、全氟丁烷磺酸盐、全氟辛烷磺酸盐、磷酸酯、甲苯磺酸盐和/或二甲苯磺酸盐)、离子表面活性剂(例如一种或多种醚、乙二醇醚、乙醇酰胺、磺酰基酰胺、醇、酰胺、醇乙氧基化物、甘油酯、乙二醇酯、甘油酯和乙二醇酯的乙氧基化物、糖基烷基聚葡萄糖苷、聚氧乙烯化脂肪酸、烷醇胺缩合物、烷醇酰胺、叔炔二醇、聚氧乙烯化硫醇、羧酸酯、聚氧乙烯化聚氧丙二醇、脱水山梨糖醇脂肪酸酯、脱水山梨糖醇脂肪酸乙氧基化物和/或脱水山梨糖醇肪酸酯乙氧基化物)、
非离子表面活性剂(例如一种或多种醇乙氧基化合物、烷醇酰胺、烷醇胺缩合物、羧酸酯、鲸蜡硬脂醇、鲸蜡醇、椰油酰胺DEA、十二烷基二甲基胺氧化物、乙醇酰胺、甘油酯和乙二醇酯的乙氧基化物、环氧乙烷聚合物、环氧乙烷-环氧丙烷共聚物、葡萄糖苷烷基醚、甘油烷基醚(例如)、甘油酯、乙二醇烷基醚(例如聚氧乙二醇烷基醚、聚丙二醇烷基醚)、乙二醇烷基酚醚(例如聚氧乙二醇烷基酚醚)、乙二醇酯、单月桂酸甘油酯(monolaurin)、五乙二醇单十二烷基醚、泊洛沙姆(poloxamer)、聚胺、聚甘油聚蓖麻油酸酯、聚山梨醇酯、聚氧基乙烯化脂肪酸、聚氧基乙烯化硫醇、聚氧基乙烯化聚氧基丙二醇、聚氧乙二醇脱水山梨糖醇烷基酯、聚乙二醇-聚丙二醇共聚物、聚氧乙二醇辛基酚醚(例如Triton X-100)、聚乙烯吡咯烷酮、糖基烷基聚葡萄糖苷、磺酰基酰胺、脱水山梨糖醇脂肪酸醇乙氧基化物、脱水山梨糖醇脂肪酸酯乙氧基化物、脱水山梨糖醇脂肪酸酯、叔炔乙二醇和/或TWEEN 80)、苯乙烯丙烯酸类聚合物、改性苯乙烯丙烯酸类聚合物和/或两性离子表面活性剂(例如3-[(3-胆酰胺丙基)二
甲基铵基]-1-丙烷磺酸酯、椰油酰胺丙基甜菜碱、椰油酰胺丙基羟基磺酸甜菜碱、磷脂酰丝氨酸、磷脂酰乙醇胺、磷脂酰胆碱和/或一种或多种鞘磷脂。阴离子表面活性剂可以是水溶性阴离子表面活性剂、水不溶性阴离子表面活性剂或水溶性阴离子表面活性剂与水不溶性
阴离子表面活性剂的组合。
[0061] 市售阴离子表面活性剂的其他非限制性实例包括十二烷基硫酸钠(Na-DS、SDS)、MORWET D-425(烷基萘磺酸盐缩合物的钠盐,购自Akzo Nobel)、MORWET D-500(烷基萘磺酸盐缩合物与嵌段共聚物的钠盐,购自Akzo Nobel)、十二烷基苯磺酸钠(Na-DBSA)
(Aldrich)、二磺酸二苯基氧、萘甲缩合物、DOWFAX(Dow)、二己基磺基琥珀酸盐和二辛基磺基琥珀酸盐、 烷基萘磺酸盐缩合物及其盐。
[0062] 非离子表面活性剂的非限制性实例包括脱水山梨糖醇酯、乙氧基化脱水山梨糖醇酯、烷氧基化烷基酚、烷氧基化醇、嵌段共聚物醚和羊毛脂衍生物。根据一个方面,表面活性剂包含烷基醚嵌段共聚物。水不溶性非离子表面活性剂的其他非限制性实例包括烷基和芳
基:甘油醚、乙二醇醚、乙醇酰胺、磺酰基酰胺、醇、酰胺、醇乙氧基化物(例如TERGITOLTM15-S表面活性剂,如TERGITOLTM15-S-9(The Dow Chemical Company,Midland,MI))、甘油酯、乙二醇酯、甘油酯和乙二醇酯的乙氧基化物、糖基烷基聚葡萄糖苷、聚氧乙烯化脂肪酸、烷醇胺缩合物、烷醇酰胺、叔炔乙二醇、聚氧乙烯化硫醇、羧酸酯、鲸蜡硬脂醇、鲸蜡醇、椰油酰胺DEA、十二烷基二甲基胺氧化物、乙醇酰胺、环氧乙烷聚合物、环氧乙烷-环氧丙烷共聚物、葡萄糖苷烷基醚、甘油烷基醚、甘油酯、乙二醇烷基醚(例如聚氧乙二醇烷基醚或聚氧丙二醇烷基醚)、乙二醇烷基酚醚(例如聚氧乙二醇烷基酚醚)、单月桂酸甘油酯、五乙二醇单十二烷基醚、泊洛沙姆、聚胺、聚甘油聚蓖麻油酸酯、聚山梨醇酯、聚氧基乙烯化脂肪酸、聚氧基乙烯化硫醇、聚氧基乙烯化聚氧基丙二醇、聚氧乙二醇脱水山梨糖醇烷基酯、聚乙二醇-聚丙二醇共聚物、聚氧乙二醇辛基酚醚、聚乙烯吡咯烷酮、糖基烷基聚葡萄糖苷、磺酰基酰胺、脱水山梨糖醇脂肪酸醇乙氧基化物、脱水山梨糖醇脂肪酸酯乙氧基化物、脱水山梨糖醇脂
肪酸酯和/或叔炔乙二醇、聚氧乙烯化聚氧丙二醇、脱水山梨糖醇肪酸酯或其组合。还包括EO/PO嵌段共聚物(EO是环氧乙烷,PO是环氧丙烷)、EO聚合物和共聚物、聚胺和聚乙烯吡咯烷酮。
[0063] 水溶性非离子表面活性剂的其他非限制性实例包括脱水山梨糖醇脂肪酸醇乙氧基化物和脱水山梨糖醇脂肪酸酯乙氧基化物。市售非离子表面活性剂的其他非限制性实例
包括SPAN 20、SPAN 40、SPAN 80、SPAN 65和PAN 85(Aldrich);TWEEN 20、TWEEN 40、TWEEN 
60、TWEEN 80和TWEEN 85(Aldrich);IGEPAL CA-210、IGEPAL CA-520、IGEPAL CA-720、
IGEPAL CO-210、IGEPAL CO-520、IGEPAL CO-630、IGEPAL CO-720、IGEPAL CO-890和IGEPAL DM-970(购自Aldrich);Triton X-100(Aldrich);BRIJ S10、BRIJ S20、BRIJ 30、BRIJ 52、BRIJ 56、BRIJ 58、BRIJ 72、BRIJ 76、BRIJ 78、BRIJ 92V、BRIJ 97和BRIJ 98(Aldrich);
PLURONIC L-31、PLURONIC L-35、PLURONIC L-61、PLURONIC L-81、PLURONIC L-64、
PLURONIC L-121、PLURONIC 10R5、PLURONIC 17R4和PLURONIC 31R1(Aldrich);Atlas G-
5000和Atlas G-5002L(Croda);ATLOX 4912和ATLOX 4912-SF(Croda);以及SOLUPLUS
(BASF)、LANEXOL AWS(Croda)。组合物可以包含至少一种或多种非离子表面活性剂,如至少一种水不溶性非离子表面活性剂、至少一种水溶性非离子表面活性剂或其组合。在另一个
方面中,组合物包含具有长度基本上相同的烃链的非离子表面活性剂的组合。
[0064] 阳离子表面活性剂的非限制性实例包括单烷基季胺、脂肪酸酰胺表面活性剂、酰胺基胺、咪唑啉和聚合阳离子表面活性剂。根据一些实施方案,组合物包含一种或多种pH依赖性胺、季铵阳离子、烷基三甲基铵盐(例如鲸蜡基三甲基溴化铵、鲸蜡基三甲基氯化铵)、氯化鲸蜡基吡啶、苯扎氯铵、苄索氯铵、5-溴-5-硝基-1,3-二噁烷、二甲基双十八烷基氯化铵、三甲基十六烷基溴化铵(cetrimonium bromide)、双十八烷基二甲基溴化铵和/或二氢
氯化奥替尼啶(octenidine dihydrochloride)及其组合。
[0065] 两性离子表面活性剂的非限制性实例包括一种或多种甜菜碱和/或一种或多种磺基甜菜碱、3-[(3-胆酰胺基丙基)二甲基铵基]-1-丙烷磺酸酯、椰油酰胺丙基甜菜碱、椰油酰胺丙基羟基磺基甜菜碱、磷脂酰丝氨酸、磷脂酰乙醇胺、磷脂酰胆碱和鞘磷脂以及其组
合。
[0066] 表面活性剂还可以包括皂、有机硅表面活性剂和硅树脂基消泡剂,其用作硅树脂基和矿物油基消泡剂中的表面活性剂。在另一个方面中,组合物还可以包含脂肪酸的碱金
属盐(例如脂肪酸的水溶性碱金属盐和/或脂肪酸的水不溶性碱金属盐)。
[0067] 在一些实施方案中,组合物可以包含至少5g/L、至少10g/L、至少15g/L、至少20g/L、至少25g/L、至少30g/L、至少35g/L、至少40g/L、至少45g/L或至少50g/L的一种或多种分散剂。在一些实施方案中,分散剂可以是约1到约100g/L、约5到约75g/L或约20到约50g/L。分散剂的量还可以表示成组合物的重量百分比,如组合物的约0.5重量%到约20重量%、约
0.5重量%到约10重量%、约0.5重量%到约5重量%、约0.5重量%到约8重量%、约0.5重
量%到约5重量%或约1重量%到约4重量%。
[0068] 在一些实施方案中,组合物可以包含一种或多种农业上可接受的干燥剂或干燥粉末,如硬脂酸钙、一种或多种粘土、石墨、硬脂酸镁、硫酸镁、奶粉、一种或多种二氧化硅粉末、大豆卵磷脂和/或滑石。干燥剂的其他非限制性实例包括 疏水性热解法二
氧化硅粉末(Evonik Corporation,Parsippany,NJ)、 粉末(BYK-Chemie 
GmbH,Wesel,Germany)、 粉末(INCOTEC Inc.,Salinas,CA)、 二
氧化硅粉末(Evonik Corporation,Parsippany,NJ)及其组合。干燥剂的其他实例可以见于
BURGES,FORMULATION OF MICROBIAL BIOPESTICIDES:BENEFICIAL MICROORGANISMS,NEMATODES AND SEED TREATMENTS(Springer Science&Business Media)(2012)。
[0069] 在一些实施方案中,组合物可以包含一种或多种防冻剂。例如,防冻剂可以包括乙二醇、酒精、丁二醇、戊二醇、甘露醇、山梨糖醇、甘油(丙三醇)、丙二醇和/或尿素中的一种或多种。防冻剂可以在至少5g/L、至少10g/L、至少15g/L、至少20g/L、至少30g/L、至少40g/L、至少50g/L、至少60g/L、至少70g/L或至少80g/L,如约1到约150g/L、约10到约100g/L或约20到约80g/L的浓度下存在于组合物中。
[0070] 在一些实施方案中,组合物可以包含一种或多种功能化树枝状聚合物以增强组合物的功效和/或稳定性。功能化树枝状聚合物的种类的非限制性实例包括聚(酰胺基胺)
(PAMAM,第0-7代)、聚(酰胺基胺-有机硅树脂)(PAMAMOS)、聚丙烯亚氨啶(polypropylene imidine))(PPI,第0-5代)、聚(苯甲基醚)(Frechet型)、Arobols(Newkome型)、聚(苯基乙炔)和表面工程化树枝状聚合物(例如聚乙二醇化树枝状聚合物、糖树枝状聚合物、肽功能
化树枝状聚合物和半乳糖功能化树枝状聚合物)。树枝状聚合物可以占组合物的至少0.1重
量%到10重量%或更多,或约1重量%到约10重量%。
[0071] 在一些实施方案中,组合物可以包含一种或多种消泡剂。消泡剂的实例包括不含有机硅树脂或硅树脂的化合物。市售消泡剂产品的非限制性实例包括Break-Thru OE441
(Evonik)、Break-Thru AF9905(Evonik)、AGNIQUE DF 6889(Cognis)、AGNIQUE DFM111S
(Cognis)、BYK-016(BYK)、FG-10消泡乳液(Dow Corning)、1520-US(Dow Corning)、1510-US(Dow Corning)、SAG 1538(Momentive)和SAG 1572(Momentive)。
[0072] 在一些实施方案中,组合物可以包含一种或多种结晶抑制剂。例示性结晶抑制剂包括丙烯酸系共聚物、聚乙二醇、聚乙二醇氢化蓖麻油及其任何组合。结晶抑制剂可以在例如组合物的约1重量%到约10重量%的浓度下存在。
[0073] 在一些实施方案中,组合物可以包含一种或多种粘性改性剂和/或种子流动剂。粘性改性剂的实例包括腐殖酸盐、富里酸盐、腐殖素和木质素盐,如腐殖酸的钠盐或钾盐。流动剂可以包含一种或多种液体润滑剂、固体润滑剂、液体乳液或固体润滑剂的悬浮液。流动剂的非限制性实例包括例如润滑剂,如油脂、天然和合成蜡、石墨、滑石、氟聚合物(例如聚四氟乙烯)和固体润滑剂,如二硫化钼和二硫化钨。在一些情况下,流动剂包含蜡材料。可以并入液体种子处理组合物中的蜡材料的非限制性实例包括植物和动物来源的蜡,如巴西棕
榈蜡、小烛树蜡、小冠巴西棕蜡、蜂蜡、鲸蜡,和石油来源的蜡如石蜡。例如,在一些情况下,流动剂可以包含巴西棕榈蜡。在一些情况下,流动剂可以包含油,如大豆油。
[0074] 在一些实施方案中,组合物可以包含一种或多种其他赋形剂,其改善组合物与底物或表面(如植物种子或其他植物材料)的粘着,诸如以提供底物或表面的成功涂布或以其
他方式给予粘着或涂布改善的特征。可以向组合物中添加其他物质(例如着色剂)以提供底
物或表面(如植物种子或其他植物材料的外表面)的成功涂布的视觉指示。
[0075] 本公开的组合物可以包含任何合适的一种或多种颜料或一种或多种效果颜料。效果颜料,在本领域中有时也称为“珠光颜料”,是一类在作为涂料施加时提供反射性、光泽和/或珠光效果的材料。在一些情况下,效果颜料呈包含基底材料和金属氧化物涂料的粉末形式。例如,效果颜料可以包含基底材料,其包括(但不限于)滑石、硅酸盐材料(例如母)、粘土矿物、碳酸钙、高岭土、金云母、矾土和类似物质。在一些情况下,基底材料包含亲水性材料。基底材料可以涂布有一层半透明的金属氧化物层,包括但不限于二氧化、氧化铁、氧化铬或氧化锆。或者,在一些情况下,效果颜料包含金属粉末或金属薄片。金属粉末或金属薄片可以包含金属,包括(但不限于)、铜、青铜。在一些情况下,效果颜料包含硅酸盐基基底。可以并入干燥粉末涂料中的颗粒状硅酸盐的非限制性实例包括涂布有二氧化钛
的云母(例如SUNMICA FINE WHITE 2800102,其可从Sun Chemical Corp.商购获得)、来自
BASF Corporation的MAGNA PEARL、LUMINA和MEARLIN颜料、来自PhibroChem的PHIBRO 
PEARL和来自Aakash Chemicals的IRIDESIUM 120。在一些情况下,干燥粉末效果颜料的平
均粒度是约1到约25微米。
[0076] 除本文中描述的微生物菌株或分离株以外,在一些实施方案中,组合物和制剂可以还包含一种或多种杀虫剂。杀虫剂包括化学杀虫剂和生物杀虫剂或生物防治剂。杀虫剂
的各种类型包括杀螨剂、杀昆虫剂、杀线虫剂、杀真菌剂、杀腹足动物剂、除草剂、杀病毒剂、杀菌剂及其组合。生物杀虫剂或生物防治剂可以包括细菌、真菌、有益线虫和表现出杀虫活性的病毒。组合物可以包含其他用于害虫防治的试剂,如微生物提取物、植物生长活性剂
和/或植物防护剂。
[0077] 除微生物菌株或分离株以外,在一些实施方案中,组合物和制剂可以包含一种或多种化学杀螨剂、杀昆虫剂和/或杀线虫剂。化学杀螨剂、杀昆虫剂和/或杀线虫剂的非限制性实例可以包括一种或多种氨基甲酸酯、二酰胺、大环内酯、新烟碱、有机磷酸盐、苯基吡唑、除虫菊酯、多杀菌素、合成拟除虫菊酯、季酮酸和/或特特拉姆酸(tetramic acid)。可以适用于本公开的组合物中的化学杀螨剂、杀昆虫剂和杀线虫剂的非限制性实例包括阿维菌
素(abamectin)、氟丙菊酯(acrinathrin)、涕灭威(aldicarb)、涕灭砜威(aldoxycarb)、α-氯氰菊酯(alpha-cypermethrin)、高效氟氯氰菊酯(betacyfluthrin)、联苯菊酯
(bifenthrin)、三氟氯氰菊酯(cyhalothrin)、氯氰菊酯(cypermethrin)、溴氰菊酯
(deltamethrin)、克非卡特(csfenvalcrate)、醚菊酯(etofenprox)、甲氰菊酯
(fenpropathrin)、氰戊菊酯(fenvalerate)、氟氰菊酯(flucythrinate)、噻唑硫磷
(fosthiazate)、λ-三氟氯氰菊酯、γ-三氟氯氰菊酯、氯菊酯(permethrin)、τ-氟胺氰菊酯(tau-fluvalinate)、四氟苯菊酯(transfluthrin)、ξ-氯氰菊酯、氟氯氰菊酯
(cyfluthrin)、联苯菊酯、七氟菊酯(tefluthrin)、娃白灵(eflusilanat)、苄螨醚
(fubfenprox)、除虫菊酯、苄呋菊酯(resmethrin)、吡虫啉(imidacloprid)、啶虫脒
(acetamiprid)、噻虫嗪(thiamethoxam)、烯啶虫胺(nitenpyram)、噻虫啉(thiacloprid)、呋虫胺(dinotefuran)、可尼丁(clothianidin)、氯噻啉(imidaclothiz)、氟啶脲
(chlorfluazuron)、除虫脲(diflubenzuron)、虱螨脲(lufenuron)、氟苯脲
(teflubenzuron)、杀铃脲(triflumuron)、双苯氟脲(novaluron)、氟虫脲(flufenoxuron)、氟铃脲(hexaflumuron)、双三氟虫脲(bistrifluoron)、多氟脲(noviflumuron)、扑虱灵
(buprofezin)、灭蝇胺(cyromazine)、甲氧虫酰肼(methoxyfenozide)、虫酰肼
(tebufenozide)、氯虫酰肼(halofenozide)、环虫酰肼(chromafenozide)、硫丹
(endosulfan)、芬普尼(fipronil)、乙虫腈(ethiprole)、吡嗪氟虫腈吡啶氟虫腈
(pyrafluprole)、(pyriprole)、氟虫酰胺(flubendiamide)、氯虫苯甲酰胺
(chlorantraniliprole)(例如Rynaxypyr)、cyazypyr、甲氨基阿维菌素(emamectin)、甲氨基阿维菌素苯甲酸盐、阿维菌素、伊维菌素(ivermectin)、密灭汀(milbemectin)、雷皮菌素(lepimectin)、吡螨胺(tebufenpyrad)、唑螨酯(fenpyroximate)、哒螨灵(pyridaben)、喹螨醚(fenazaquin)、嘧螨醚(pyrimidifen)、唑虫酰胺(tolfenpyrad)、三氯杀螨醇
(dicofol)、腈吡螨酯(cyenopyrafen)、丁氟螨酯(cyflumetofen)、灭螨醌(acequinocyl)、嘧螨酯(fluacrypyrin)、联苯肼酯(bifenazate)、丁醚脲(diafenthiuron)、乙螨唑
(etoxazole)、四螨嗪(clofentezine)、多杀菌素(spinosad)、苯螨噻(triarathen)、(三氯杀螨砜tetradifon)、克螨特(propargite)、噻螨酮(hexythiazox)、溴螨酯
(bromopropylate)、灭螨猛(chinomethionat)、双甲脒(amitraz)、氟虫吡隆
(pyrifluquinazon)、吡蚜酮(pymetrozine)、氟啶虫酰胺(flonicamid)、蚊蝇醚
(pyriproxyfen)、苯虫醚(diofenolan)、溴虫腈(chlorfenapyr)、氰氟虫腙
(metaflumizone)、茚虫威(indoxacarb)、毒死蜱(chlorpyrifos)、螺螨酯
(spirodiclofen)、螺甲螨酯(spiromesifen)、螺虫乙酯(spirotetramat)、啶虫丙醚
(pyridalyl)、皮棘托拉姆(spinctoram)、乙酰甲胺磷(acephate)、三唑磷(triazophos)、丙溴磷(profenofos)、杀线威(oxamyl)、乙基多杀菌素(spinetoram)、克线磷(fenamiphos)、苯线皮考噻霍斯(fenamipclothiahos)、4-{[(6-氯吡啶-3-基)甲基](2,2-二氟乙基)氨基}
呋喃-2(5H)-酮、3,5-双取代-1,2,4-噁二唑化合物、3-苯基-5-(噻吩-2-基)-1,2,4-噁二
唑、硫线磷(cadusaphos)、西维因(carbaryl)、克百威(carbofuran)、灭线磷
(ethoprophos)、硫双威(thiodicarb)、涕灭威(aldicarb)、涕灭砜威(aldoxycarb)、甲胺磷(metamidophos)、灭虫威(methiocarb)、氟啶虫胺腈(sulfoxaflor)、甲胺磷
(methamidophos)、氰虫酰胺(cyantraniliprole)和替噁唑酚(tioxazofen)以及其组合。化学杀螨剂、杀昆虫剂和/或杀线虫剂的其他非限制性实例可以包括以下中的一种或多种:阿维菌素、涕灭威、涕灭砜威、联苯菊酯、克百威、氯虫苯甲酰胺(chlorantraniliporle)、噻虫胺(chlothianidin)、氟氯氰菊酯、三氟氯氰菊酯、氯氰菊酯、氰虫酰胺、溴氰菊酯、呋虫胺、甲氨基阿维菌素、乙虫腈、克线磷、芬普尼、氟虫双酰胺、噻唑硫磷、吡虫啉、伊维菌素虫菌素、λ-三氟氯氰菊酯、密灭汀、烯啶虫胺、杀线威、氯氰菊酯、乙基多杀菌素、多杀菌素、螺螨酯(spirodichlofen)、螺虫乙酯、七氟菊酯、噻虫啉、噻虫嗪和/或硫双威以及其组合。
[0078] 在一些实施方案中可以包括在或用于组合物中的杀螨剂、杀昆虫剂和杀线虫剂的其他非限制性实例可以见于Steffey和Gray,Managing Insect Pests,ILLINOIS AGRONOMY 
HANDBOOK(2008);以及Niblack,Nematodes,ILLINOIS AGRONOMY HANDBOOK(2008),它们的内容和公开内容以引用的方式并入本文中。可以适用于本文中公开的组合物的市售杀昆虫剂的非限制
性实例包括CRUISER(Syngenta,Wilmington,Delaware)、GAUCHO和PONCHO(Gustafson,
Plano,Texas)。这些和其他市售杀昆虫剂中的活性成分可以包括噻虫嗪、可尼丁和吡虫啉。
市售杀螨剂、杀昆虫剂和/或杀线虫剂可以根据制造商建议的量或浓度使用。
[0079] 根据一些实施方案,组合物和制剂可以包含一种或多种生物杀虫微生物,其存在和/或输出对于螨虫、昆虫和/或线虫具有毒性。例如,组合物可以包含以下中的一种或多
种:坚强芽孢杆菌I-1582、蕈状芽孢杆菌(Bacillus mycoides)AQ726、NRRL B-21664、球孢白僵菌(Beauveria  bassiana)ATCC-74040、球孢白僵菌ATCC-74250、伯克氏菌种
A396sp.nov.rinojensis、NRRL B-50319、铁杉下色杆菌(Chromobacterium subtsugae)
NRRL B-30655、越橘色杆菌菌NRRL B-50880、黄杆菌(Flavobacterium)H492、NRRL B-
50584、金龟子绿僵菌(Metarhizium anisopliae)F52(也称为金龟子绿僵菌菌株52、金龟子绿僵菌菌株7、金龟子绿僵菌菌株43和/或金龟子绿僵菌BIO-1020、TAE-001;以DSM 3884、DSM 3885、ATCC 90448、SD 170和ARSEF 7711保藏)、玫烟色拟青霉(Paecilomyces 
fumosoroseus)FE991及其组合。
[0080] 根据一些实施方案,组合物和制剂可以包含一种或多种化学杀菌剂。化学杀真菌剂的非限制性实例可以包括一种或多种芳香族烃、苯并噻二唑、羧酸酰胺、吗啉、苯基酰胺、膦酸酯、噻唑烷、噻吩、苯醌外部抑制剂和甲氧基丙烯酸酯(strobilurin),如嘧菌酯、甲香菌酯、丁香菌酯(coumoxystrobin)、醚菌胺、烯肟菌酯、氟嘧菌酯、醚菌酯(kresoxim-
methyl)、苯氧菌胺、肟醚菌胺、啶氧菌酯、唑菌胺酯、唑胺菌酯(pyrametostrobin)、唑菌酯(pyraoxystrobin)、吡菌苯威(pyribencarb)、肟菌酯(trifloxystrobin)、2-[2-(2,5-二甲基-苯氧基甲基)-苯基]-3-甲氧基-丙烯酸甲酯和2-(2-(3-(2,6-二氯苯基)-1-甲基-亚烯
丙基氨基氧基甲基)-苯基)-2-甲氧基亚氨基-N-甲基乙酰胺;氨甲酰,如苯胺基甲酰(例如
苯霜灵(benalaxyl)、苯霜灵-M、麦锈灵、联苯吡菌胺(bixafen)、啶酰菌胺(boscalid)、萎锈灵(carboxin)、甲呋酰胺(fenfuram)、环酰菌胺(fenhexamid)、氟酰胺(flutolanil)、氟唑菌酰胺(fluxapyroxad)、呋吡菌胺(furametpyr)、吡唑萘菌胺(isopyrazam)、异噻菌胺
(isotianil)、精苯霜灵(kiralaxyl)、灭锈胺(mepronil)、甲霜灵、高效甲霜灵(metalaxyl-M)(精甲霜灵(mefenoxam))、呋酰胺(ofurace)、恶霜灵、氧化萎锈灵、氟唑菌苯胺
(penflufen)、吡噻菌胺(penthiopyrad)、氟唑环菌胺(sedaxane)、克枯烂、噻呋灭、噻酰菌胺(tiadinil)、2-氨基-4-甲基-噻唑-5-苯胺基甲酰、N-(4'-三氟甲基硫代联苯基-2-基)-
3-二氟甲基-1-甲基-1H-吡唑-4-氨甲酰、N-(2-(1,3,3-三甲基丁基)-苯基)-1,3-二甲基-
5-氟-1H-吡唑-4-氨甲酰、羧酸吗啉(例如烯酰吗啉、氟吗啉、丁吡吗啉(pyrimorph))、苯甲酸酰胺(例如氟联苯菌(flumetover)、氟吡菌胺(fluopicolide)、氟吡菌酰胺(fluopyram)、苯酰菌胺(zoxamide))、加普胺(carpropamid)、双氯氰菌胺(dicyclomet)、双炔酰菌胺
(mandiproamid)、环酰菌胺(fenehexamid)、土霉素(oxytetracyclin)、硅噻菌胺
(silthiofam)和N-(6-甲氧基-吡啶-3-基)环丙烷甲酸酰胺、螺噁茂胺(spiroxamine)、唑类如三唑(例如阿扎康唑(azaconazole)、联苯三唑醇(bitertanol)、糠菌唑
(bromuconazole)、环丙唑醇(cyproconazole)、苯醚甲环唑(difenoconazole)、烯唑醇
(diniconazole)、烯唑醇-M、氟环唑(epoxiconazole)、腈苯唑(fenbuconazole)、氟喹唑
(fluquinconazole)、氟硅唑(flusilazole)、粉唑醇(flutriafol)、己唑醇
(hexaconazole)、亚胺唑(imibenconazole)、种菌唑(ipconazole)、叶菌唑(metconazole)、腈菌唑(myclobutanil)、恶咪唑(oxpoconazole)、多效唑(paclobutrazole)、戊菌唑
(penconazole)、丙环唑(propiconazole)、丙硫菌唑(prothioconazole)、硅氟唑
(simeconazole)、戊唑醇(tebuconazole)、四氟醚唑(tetraconazole)、三唑酮
(triadimefon)、三唑醇(triadimenol)、灭菌唑(triticonazole)、烯效唑(uniconazole))和咪唑(例如氰霜唑(cyazofamid)、抑霉唑(imazalil)、稻瘟酯(pefurazoate)、咪鲜胺
(prochloraz)、氟菌唑(triflumizol));杂环化合物,如吡啶(例如氟啶胺(fluazinam)、啶斑肟(pyrifenox)(cf.D1b)、3-[5-(4-氯-苯基)-2,3-二甲基-异噁唑啉-3-基]-吡啶、3-[5-(4-甲基-苯基)-2,3-二甲基-异噁唑啉-3-基]-吡啶)、嘧啶(例如布瑞莫(bupirimate)、嘧
菌环胺(cyprodinil)、二氟林(diflumetorim)、氯苯嘧啶醇(fenarimol)、嘧菌腙
(ferimzone)、嘧菌胺(mepanipyrim)、氯草定(nitrapyrin)、噻菌醇(nuarimol)、嘧霉胺
(pyrimethanil))、哌嗪(例如嗪氨灵(triforine))、吡咯(例如拌种咯(fenpiclonil)、咯菌腈(fludioxonil))、吗啉(例如敌吗啉(aldimorph)、吗菌灵(dodemorph)、乙酸吗菌灵、丁苯吗啉(fenpropimorph)、克啉菌(tridemorph))、哌啶(例如苯锈定(fenpropidin));二酰亚胺(例如氟酰亚胺(fluoroimid)、异菌脲(iprodione)、腐霉利(procymidone)、乙烯菌核利(vinclozolin))、非芳香族5元杂环(例如噁唑菌酮(famoxadone)、咪唑菌酮
(fenamidone)、氟噻唑菌腈(flutianil)、辛噻酮(octhilinone)、烯丙苯噻唑
(probenazole)、S-5-氨基-2-异丙基-3-氧-4-邻甲苯基-2,3-二氢-吡唑-1-硫代甲酸烯丙
酯)、阿拉酸式苯-S-甲基(acibenzolar-S-methyl)、唑嘧菌胺(ametoctradin)、安美速
(amisulbrom)、敌菌灵(anilazin)、杀稻瘟菌素-S(blasticidin-S)、敌菌丹(captafol)、克菌丹(captan)、灭螨猛(chinomethionat)、棉隆(dazomet)、咪菌威(debacarb)、哒菌酮
(diclomezine)、野燕枯(difenzoquat)、野燕枯硫酸二甲酯(difenzoquat-
methylsulfate)、稻瘟酰胺(fenoxanil)、灭菌丹(Folpet)、奥啉酸(oxolinic acid)、派丙灵(piperalin)、丙氧喹啉(proquinazid)、咯喹酮(pyroquilon)、喹氧灵(quinoxyfen)、咪唑嗪(triazoxide)、三环唑(tricyclazole)、2-丁氧基-6-碘-3-丙基色-4-酮、5-氯-1-(4,
6-二甲氧-嘧啶-2-基)-2-甲基-1H-苯并咪唑和5-氯-7-(4-甲基哌啶-1-基)-6-(2,4,6-三
氟苯基)-[1,2,4]三唑并-[1,5-a]嘧啶;苯并咪唑,如多菌灵(carbendazim);以及其他活性物质,如胍类(例如,胍、多果定(dodine)、多果定游离碱、双胍辛胺(guazatine)、乙酸双胍辛胺、双辛胍胺(iminoctadine))、乙酸双辛胍胺和双胍三辛烷基苯磺酸盐(iminoctadine-tris(albesilate));抗生素(例如,春雷霉素(kasugamycin)、盐酸春雷霉素水合物、链霉素、多氧霉素(polyoxine)和井冈霉素A(validamycin A));硝基苯基衍生物(例如,乐杀螨(binapacryl)、氯硝胺(dicloran)、敌螨通(dinobuton)、敌螨普(dinocap)、酞菌酯
(nitrothal-isopropyl)、四氯硝基苯(tecnazen));有机金属化合物(例如,三苯基盐,如三苯基乙酸锡(fentin-acetate)、三苯基氯化锡(fentin chloride)、三苯基氢氧化锡
(fentin  hydroxide));含硫杂环化合物(例如,二噻农(dithianon)、稻瘟灵
(isoprothiolane));有机磷化合物(例如,敌瘟磷(edifenphos)、乙膦酸(fosetyl)、异稻瘟净(iprobenfos)、亚磷酸(phosphorus acid)和它的盐、吡菌磷(pyrazophos)、甲基立枯磷(tolclofos-methyl));有机氯化合物(例如,百菌清(chlorothalonil)、抑菌灵
(dichlofluanid)、双氯酚(dichlorophen)、磺菌按(flusulfamide)、六氯苯
(hexachlorobenzene)、戊菌隆(pencycuron)、五氯酚(pentachlorphenole)和它的盐、四氯苯酞(phthalide)、五氯硝基苯(quintozene)、甲基硫菌灵(thiophanate-methyl)、硫菌灵、甲苯氟磺胺(tolylfluanid)、N-(4-氯-2-硝基-苯基)-N-乙基-4-甲基-苯磺酰胺;以及无机活性物质(例如,Bordeaux混合物、乙酸铜、氢氧化铜、氧氯化铜、碱式硫酸铜、硫);以及其组合。在一个方面中,一些实施方案中的组合物包含阿拉酸式苯-S-甲基、嘧菌酯、苯霜灵、联苯吡菌胺、啶酰菌胺、多菌灵、环丙唑醇、烯酰吗啉、氟环唑、咯菌腈、氟吡菌酰胺、氟嘧菌酯、氟噻唑菌腈、氟酰胺、氟唑菌酰胺、三乙膦酸铝(fosetyl-Al)、种菌唑、吡唑萘菌胺、醚菌酯、精甲霜灵、甲霜灵、叶菌唑、腈菌唑、肟醚菌胺、氟唑菌苯胺、吡噻菌胺、啶氧菌酯、丙环唑、丙硫菌唑、唑菌胺酯、氟唑环菌胺、硅噻菌胺、戊唑醇、噻苯达唑、噻呋灭、硫菌灵、甲基立枯磷、肟菌酯和灭菌唑以及其组合。
[0081] 对于组合物中可以包括的杀真菌剂的其他实例,参见例如Bradley,Managing Diseases,ILLINOIS AGRONOMY HANDBOOK(2008),其内容和公开内容以引用的方式并入本文中。
[0082] 在一些实施方案中,适用于组合物的杀真菌剂可以表现出针对一种或多种包括(但不限于)疫霉菌、丝核菌、镰孢菌、腐霉菌、拟茎点霉菌、菌核菌或层锈菌以及其组合的真菌植物病原体的活性。可以适用于组合物的市售杀真菌剂的非限制性实例包括
RIVAL或ALLEGIANCE FL或LS(Gustafson,Plano,Texas)、WARDEN RTA
(Agrilance,St.Paul,Minnesota)、APRON XL、APRON MAXX RTA或RFC、MAXIM 4FS或XL
(Syngenta,Wilmington,Delaware)、CAPTAN(Arvesta,Guelph,Ontario)和PROTREAT
(Nitragin Argentina,Buenos Ares,Argentina)。这些和其他杀真菌剂中的活性成分包括
(但不限于)咯菌腈、精甲霜灵、嘧菌酯和甲霜灵。市售杀真菌剂可以根据制造商建议的量和浓度使用。
[0083] 根据一些实施方案,组合物和制剂可以包含一种或多种合适的生物杀虫微生物,其存在和/或输出对至少一种真菌、细菌或其两者具有毒性。例如,组合物可以包含以下中的一种或多种:杧果白粉寄生孢(Ampelomyces quisqualis)AQ  (Intrachem Bio 
GmbH&Co.KG,Germany)、黄曲霉(Aspergillus flavus)AFLA- (Syngenta Crop 
Protection,Inc.,CH)、出芽短梗霉(Aureobasidium pullulans) (bio-
ferm GmbH,Germany)、短小芽孢杆菌(Bacillus pumilus)AQ717(NRRL B-21662)、短小芽孢杆菌NRRL B-30087、芽孢杆菌AQ175(ATCC 55608)、芽孢杆菌AQ177(ATCC55609)、枯草芽孢杆菌(Bacillus subtilis)AQ713(NRRL B-21661)、枯草芽孢杆菌AQ743(NRRL B-21665)、解淀粉芽孢杆菌(Bacillus amyloliquefaciens)FZB24、解淀粉芽孢杆菌FZB42、解淀粉芽孢
杆菌NRRL B-50349、解淀粉芽孢杆菌TJ1000(也称为1BE,分离株ATCC BAA-390)、枯草芽孢杆菌ATCC 55078枯草芽孢杆菌ATCC 55079、苏云金芽孢杆菌(Bacillus thuringiensis)
AQ52(NRRL B-21619)、橄榄假丝酵母(Candida oleophila)I-182(例如来自Ecogen Inc.,
USA的 )、齐藤假丝酵母(Candida saitoana) (以与溶菌酶的混合
物的形式;BASF,USA)和 (ArystaLife Science,Ltd.,Cary,NC)、粉红粘帚霉
(Clonostachys rosea f.catenulata)(还称为链孢粘帚菌(Gliocladium catenulatum))
J1446( Verdera,Finland)、小盾壳霉(Coniothyrium minitans)
(Prophyta,Germany)、板栗疫病菌(Cryphonectria parasitica)(CNICM,
France)、浅白隐球菌(Cryptococcus albidus)YIELD  (Anchor  Bio-
Technologies,South Africa)、尖孢镰刀菌(Fusarium oxysporum)
(S.I.A.P.A.,Italy)和 (Natural Plant Protection,France)、核果梅
奇酵母(Metschnikowia fructicola) (Agrogreen,Israel)、双胞镰孢
(Microdochium dimerum) (Agrauxine,France)、白色麝香霉(Muscodor 
albus)NRRL 30547、粉红麝香霉(Muscodor roseus)NRRL 30548、大伏革菌(Phlebiopsis 
gigantea) (Verdera,Finland)、絮绒假酶菌(Pseudozyma flocculosa)
(Plant Products Co.Ltd.,Canada)、寡雄腐霉(Pythium oligandrum)
DV74( Remeslo SSRO,Biopreparaty,Czech Rep.)、大虎杖
(Reynoutria sachlinensis)(例如, Marrone BioInnovations,USA)、链霉
菌NRRL B-30145、链霉菌M1064、鲜黄链霉菌(Streptomyces galbus)NRRL 30232、利迪链霉菌(Streptomyces lydicus)WYEC 108(ATCC 55445)、紫黑链霉菌(Streptomyces 
violaceusniger)YCED 9(ATCC 55660;DE-THATCH- DECOMP- 和THATCH
Idaho Research Foundation,USA)、链霉菌WYE 53(ATCC 55750;DE-
THATCH- DECOMP- 和THATCH Idaho Research Foundation,USA)、黄
色篮状菌(Talaromyces flavus)V117b( Prophyta,Germany)、棘孢木霉
(Trichoderma asperellum)SKT-1(ECO- Kumiai Chemical Industry Co.,Ltd.,
Japan)、黑绿木霉(Trichoderma  atroviride)LC52( Agrimm 
Technologies Ltd,NZ)、哈茨木霉(Trichoderma harzianum)T-22(
der Firma BioWorks Inc.,USA)、哈茨木霉TH-35(ROOT  Mycontrol Ltd.,
Israel)、哈茨木霉T-39( Mycontrol Ltd.,Israel;TRICHODERMA 
Makhteshim Ltd.,Israel)、哈茨木霉ICC012和绿色木霉(Trichoderma viride)
TRICHOPEL(Agrimm Technologies Ltd,NZ)、哈茨木霉ICC012和绿色木霉ICC080(
WP,Isagro Ricerca,Italy)、多孢木霉(Trichoderma polysporum)和哈茨
木霉( BINAB  Bio-Innovation AB,Sweden)、子座木霉(Trichoderma 
stromaticum) (C.E.P.L.A.C.,Brazil)、绿木霉(Trichoderma virens)GL-
21( Certis LLC,USA)、绿木霉G1-3(ATCC 57678)、绿木霉G1-21(Thermo 
Trilogy Corporation,Wasco,CA)、绿木霉G1-3和解淀粉芽孢杆菌FZB24、绿木霉G1-3和解
淀粉芽孢杆菌NRRL B-50349、绿木霉G1-3和解淀粉芽孢杆菌TJ1000、绿木霉G1-21和解淀粉芽孢杆菌FZB24、绿木霉G1-21和解淀粉芽孢杆菌NRRL B-50349、绿木霉G1-21和解淀粉芽孢杆菌TJ1000、绿色木霉 (Ecosense Labs.(India)Pvt.Ltd.,India,BIO-
F,T.Stanes&Co.Ltd.,Indien)、绿色木霉TV1(Agribiotec srl,Italy)、绿色木霉
ICC080和或奥德曼细基格孢(Ulocladium oudemansii)HRU3(BOTRY- Botry-Zen 
Ltd,NZ)以及其组合。
[0084] 在一些实施方案中,组合物可以包含一种或多种化学杀腹足动物剂。化学杀腹足动物剂的非限制性实例包括一种或多种磷酸铁、四聚乙醛、灭梭威和/或盐。适用于组合物的市售杀腹足动物剂的实例包括 M-PsTM、MESUROL  MESUROL75-
及其组合。可以包括在本公开的组合物中的杀腹足
动物剂的其他实例可见于Capinera,Handbook of Vegetable Pests(2001),其内容和公开
内容以引用的方式并入本文中。市售杀腹足动物剂可以根据制造商建议的量和浓度使用。
[0085] 除微生物菌株和分离株以外,在一些实施方案中,组合物和制剂可以包含一种或多种合适的化学除草剂。除草剂可以是出芽前除草剂、芽后除草剂或其组合。化学除草剂的非限制性实例可以包含一种或多种乙酰辅酶A羧化酶(ACCase)抑制剂、乙酰乳酸合成酶
(ALS)抑制剂、乙酰苯胺、乙酰羟酸合成酶(AHAS)抑制剂、光系统Ⅱ抑制剂、光系统Ⅰ抑制剂、原卟啉原氧化酶(PPO或Protox)抑制剂、类胡萝卜素生物合成抑制剂、烯醇丙酮酸草酸-
3-磷酸合成酶(EPSPS)抑制剂、谷氨酰胺合成酶抑制剂、二氢叶酸合成酶抑制剂、有丝分裂抑制剂、4-羟苯基-丙酮酸-双氧化酶(4-HPPD)抑制剂、合成生长素、生长素除草剂盐、生长素运输抑制剂、核酸抑制剂和/或其一种或多种盐、酯、外消旋混合物和/或拆分异构体。可以适用于本公开的组合物中的化学除草剂的非限制性实例包括2,4-二氯苯氧基乙酸(2,4-
D)、2,4,5-2,4-三氯苯氧基乙酸(2,4,5-T)、莠灭净(ametryn)、胺唑草酮(amicarbazone)、氯丙嘧啶酸(aminocyclopyrachlor)、乙草胺(acetochlor)、三氟羧草醚(acifluorfen)、甲草胺(alachlor)、阿特拉津(atrazine)、唑啶草酮(azafenidin)、苯达松(bentazon)、吡草酮(benzofenap)、比芬诺(bifenox)、除草定(bromacil)、溴苯腈(bromoxynil)、丁草胺
(butachlor)、氟丙嘧草酯(butafenacil)、丁氧环酮(butroxydim)、唑草酮
(carfentrazone-ethyl)、氯嘧磺隆(chlorimuron)、绿麦隆(chlorotoluro)、烯草酮
(clethodim)、游离炔草酸(clodinafop)、异恶草酮(clomazone)、氰草津(cyanazine)、噻草酮(cycloxydim)、氰氟草酸(cyhalofop)、甜菜安(desmedipham)、敌草净(desmetryn)、麦草畏(dicamba)、禾草灵(diclofop)、恶唑隆(dimefuron)、吡氟酰草胺(diflufenican)、敌草隆(diuron)、氟硫草定(dithiopyr)、乙氧呋草黄(ethofumesate)、恶唑禾草灵
(fenoxaprop)、甲酰胺磺隆(foramsulfron)、吡氟禾草灵(fluazifop)、精吡氟禾草灵
(fluazifop-P)、氟噻草胺(flufenacet)、伏草隆(fluometuron)、氟哒嗪草酯(flufenpyr-ethyl)、氟烯草酸(flumiclorac)、氟烯草酸-戊基、丙炔氟草酸(flumioxazin)、乙羧氟草醚(fluoroglycofen)、氟噻甲草酯(fluthiacet-methyl)、氟磺胺草醚(fomesafen)、氟磺胺草醚、草甘膦(glyphosate)、草铵膦(glufosinate)、氯吡嘧磺隆(halosulfuron)、吡氟氯禾灵(haloxyfop)、环嗪酮(hexazinone)、碘甲磺隆(iodosulfuron)、茚嗪氟草胺(indaziflam)、甲氧咪草烟(imazamox)、咪唑喹啉酸(imazaquin)、咪草烟(imazethapyr)、碘苯腈
(ioxynil)、异丙隆(isoproturon)、异恶唑草酮(isoxaflutole)、乳氟禾草灵(lactofen)、利谷隆(linuron)、2甲4氯丙酸(mecoprop)、精2甲4氯丙酸(mecoprop-P)、甲基二磺隆
(mesosulfuron)、甲基磺草酮(mesotrion)、苯嗪草酮(metamitron)、吡唑草胺
(metazochlor)、甲基苯噻隆(methibenzuron)、异丙甲草胺(metolachlor)(和S-异丙甲草
胺)、甲氧隆(metoxuron)、嗪草酮(metribuzin)、绿谷隆(monolinuron)、丙炔噁草酮
(oxadiargyl)、噁草酮(oxadiazon)、乙氧氟草醚(oxyfluorfen)、甜菜宁(phenmedipham)、丙草胺(pretilachlor)、环苯草酮(profoxydim)、扑灭通(prometon)、扑草净(prometry)、毒草胺(propachlor)、敌稗(propanil)、噁草酸(propaquizafop)、异丙草胺
(propisochlor)、丙苯磺隆(propoxycarbazone)、吡草醚(pyraflufen-ethyl)、氯草敏
(pyrazon)、吡唑特(pyrazolynate)、苄草唑(pyrazoxyfen)、哒草特(pyridate)、喹禾灵
(quizalofop)、精喹禾灵(quizalofop-P)(例如,喹禾灵-乙基、喹禾灵-P-乙基、游离炔草酸(clodinafop-propargyl)、氰氟草酯(cyhalofop-butyl)、禾草灵(diclofop-methyl)、精恶唑禾草灵(fenoxaprop-P-ethyl)、精吡氟禾草灵(fluazifop-P-butyl)、氟吡甲禾灵
(haloxyfop-methyl)、高效氟吡甲禾灵(haloxyfop-R-methyl))、苯嘧磺草胺
(saflufenacil)、烯禾啶(sethoxydim)、环草隆(siduron)、西玛津(simazine)、西草净
(simetryn)、磺草酮(sulcotrione)、甲磺草胺(sulfentrazone)、丁噻隆(tebuthiuron)、环磺酮(tembotrione)、吡喃草酮(tepraloxydim)、特草定(terbacil)、特丁通(terbumeton)、特丁津(terbuthylazine)、萨克多敏(thaxtomin)(例如,美国专利号7,989,393中描述的萨克多敏)、甲基噻烯卡巴腙(thiencarbazone-methyl)、噻吩草胺(thenylchlor)、三甲苯草酮(tralkoxydim)、三氯吡氧乙酸(triclopyr)、草达津(trietazine)、三氟啶磺隆
(trifloxysulfuron)、苯吡唑草酮(tropramezone)、其盐和酯;其外消旋混合物和拆分异构体以及其组合。在一些实施方案中,组合物可以包含乙草胺、烯草酮、麦草畏、丙炔氟草胺、氟磺胺草醚、草甘膦、草胺磷、甲基磺草酮、喹禾灵、苯嘧磺草胺、磺草酮、S-3100和/或2,4-D以及其组合。
[0086] 在一些实施方案中可以包括在组合物中的除草剂的其他实例可以见于Hager,Weed Management,Illinois Agronomy Handbook(2008);以及Loux等人,Weed Control 
Guide for Ohio,Indiana and Illinois(2015),它们的内容和公开内容以引用的方式并
入本文中。市售除草剂可以根据制造商建议的量或浓度使用。
[0087] 除微生物菌株或分离株以外,在一些实施方案中,组合物和制剂可以还包含一种或多种合适的杀病毒剂。
[0088] 除微生物菌株或分离株以外,在一些实施方案中,组合物和制剂可以包含一种或多种生物杀虫或除草微生物,其存在和/或输出视情况而定对至少一种昆虫、植物(杂草)或致植物病病毒具有毒性。
[0089] 可以包括在或用于组合物中的生物杀虫剂的其他实例可以见于BURGES,同上;HALL和MENN,BIOPESTICIDES:USE AND DELIVERY(Humana Press)(1998);McCoy等人,Entomogenous fungi,CRC HANDBOOK OF NATURAL PESTICIDES.MICROBIAL PESTICIDES,PART A.ENTOMOGENOUS PROTOZOA AND FUNGI(C.M.Inoffo编),第5卷:151-236(1988);SAMSON等人,ATLAS OF ENTOMOPATHOGENIC FUNGI(Springer-Verlag,Berlin)(1988);以及deFaria和Wraight,Mycoinsecticides and Mycoacaricides:A comprehensive list with worldwide coverage and international 
classification of formulation types,BIOL.CONTROL(2007),它们的内容和公开内容以引用的方式并入本文中。在某些实施方案中,生物防治微生物可以包含以下各属的细菌:放线菌(Actinomycetes)、土壤杆菌(Agrobacterium)、节杆菌(Arthrobacter)、产碱杆菌
(Alcaligenes)、金杆菌(Aureobacterium)、固氮菌(Azobacter)、芽孢杆菌、拜叶林克氏菌(Beijerinckia)、短芽孢杆菌(Brevibacillus)、伯克氏菌、色杆菌、梭状芽孢杆菌
(Clostridium)、棍状杆菌(Clavibacter)、丛毛单胞菌(Comamonas)、棒状杆菌
(Corynebacterium)、短小杆菌(Curtobacterium)、肠杆菌(Enterobacter)、黄杆菌、葡糖杆菌(Gluconobacter)、嗜氢菌(Hydrogenophaga)、克雷伯氏菌(Klebsiella)、甲基杆菌
(Methylobacterium)、类芽孢杆菌(Paenibacillus)、巴斯德芽菌(Pasteuria)、光杆状菌
(Photorhabdus)、叶杆菌(Phyllobacterium)、假单胞菌、根瘤菌(Rhizobium)、沙雷氏菌
(Serratia)、鞘氨醇杆菌(Sphingobacterium)、寡养单胞菌(Stenotrophomonas)、贪噬菌
(Variovorax)和嗜线虫致病杆菌(Xenorhabdus)或其任何组合。根据一些实施方案,生物杀虫微生物可以包括解淀粉芽孢杆菌、蜡样芽胞杆菌(Bacillus cereus)、坚强芽孢杆菌、芽孢杆菌、地衣芽孢杆菌(Bacillus lichenformis)、短小芽孢杆菌、球形芽孢杆菌(Bacillus sphaericus)、枯草芽孢杆菌(Bacillus  subtilis)、苏云金芽孢杆菌、色素杆菌
(Chromobacterium suttsuga)、穿刺巴斯德芽菌(Pasteuria penetrans)、Pasteuria 
usage和萤光假单胞菌(Pseudomona fluorescen)。根据一些实施方案,生物杀虫微生物可
以包含以下各属的真菌:链格孢(Alternaria)、白粉寄生孢(Ampelomyces)、曲霉、短梗霉(Aspergillus)、白僵菌(Beauveria)、刺盘孢(Colletotrichum)、盾壳霉(Coniothyrium)、粘帚菌(Gliocladium)、绿僵菌(Metarhizium)、麝香霉(Muscodor)、拟青霉
(Paecilomyces)、木霉(Trichoderma)、核瑚菌(Typhula)、单格孢(Ulocladium)和轮枝孢菌(Verticillium)。在另一个方面中,真菌是球孢白僵菌、小盾壳霉、绿粘帚菌、白色麝香霉、淡紫色拟青霉(Paecilomyces lilacinus)或多孢木霉(Trichoderma polysporum)。
[0090] 除微生物菌株或分离株以外,在一些实施方案中,组合物和制剂可以还包含一种或多种生物杀灭剂。可以包括或使用生物杀灭组分以防止组合物中的真菌和/或细菌生长,特别是在组合物被存储放置时防止其生长。生物杀灭剂的实例包括基于二氯芬或苯甲醇半
缩甲醛的化合物、苯并异噻唑啉酮和鼠李糖脂。市售生物杀灭剂的非限制性实例包括
ACTICIDE(THOR)、PROXEL(Arch Chemical)和ZONIX(Jeneil)。
[0091] 除微生物菌株或分离株之外,在一些实施方案中,组合物和制剂可以包含一种或多种合适的一种或多种农业上有利的剂,如生长刺激剂、营养素、植物信号分子或生物活性剂。
[0092] 除微生物菌株或分离株以外,在一些实施方案中,组合物和制剂可以还包含一种或多种有利的生物刺激剂。生物刺激剂可以增强代谢和/或生理学过程,如呼吸作用、光合作用、核酸吸收、离子吸收、营养素递送或其组合。可以包括在或用于组合物中的生物刺激剂的非限制性实例可以包括海藻提取物(例如泡叶藻(ascophyllum nodosum))、细菌提取
物(例如一种或多种固氮生物、磷酸盐溶解微生物和/或生物杀虫剂的提取物)、真菌提取
物、腐殖酸(例如腐殖酸钾)、富里酸、肌醇和/或甘氨酸以及其任何组合。根据一些实施方案,生物刺激剂可以包含一种或多种固氮螺菌(Azospirillum)提取物(例如,包含巴西固氮螺菌(A.brasilense)INTA Az-39的培养基的提取物)、一种或多种慢生根瘤菌(Brady根瘤
菌)提取物(例如,包含以下的培养基的提取物:埃氏慢生根瘤菌(B.elkanii)SEMIA 501、埃氏慢生根瘤菌SEMIA 587、埃氏慢生根瘤菌SEMIA 5019、慢生大豆根瘤菌NRRL B-50586(还
作为NRRL B-59565保藏)、慢生大豆根瘤菌NRRL B-50587(还作为NRRL B-59566保藏)、慢生大豆根瘤菌NRRL B-50588(还作为NRRL B-59567保藏)、慢生大豆根瘤菌NRRL B-50589(还
作为NRRL B-59568保藏)、慢生大豆根瘤菌NRRL B-50590(还作为NRRL B-59569保藏)、慢生大豆根瘤菌NRRL B-50591(还作为NRRL B-59570保藏)、慢生大豆根瘤菌NRRL B-50592(还
作为NRRL B-59571保藏)、慢生大豆根瘤菌NRRL B-50593(还作为NRRL B-59572保藏)、慢生大豆根瘤菌NRRL B-50594(还作为NRRL B-50493保藏)、慢生大豆根瘤菌NRRL B-50608、慢
生大豆根瘤菌NRRL B-50609、慢生大豆根瘤菌NRRL B-50610、慢生大豆根瘤菌NRRL B-
50611、慢生大豆根瘤菌NRRL B-50612、慢生大豆根瘤菌NRRL B-50726、慢生大豆根瘤菌
NRRL B-50727、慢生大豆根瘤菌NRRL B-50728、慢生大豆根瘤菌NRRL B-50729、慢生大豆根瘤菌NRRL B-50730、慢生大豆根瘤菌SEMIA 566、慢生大豆根瘤菌SEMIA 5079、慢生大豆根瘤菌SEMIA 5080、慢生大豆根瘤菌USDA 6、慢生大豆根瘤菌USDA 110、慢生大豆根瘤菌USDA 
122、慢生大豆根瘤菌USDA 123、慢生大豆根瘤菌USDA 127、慢生大豆根瘤菌USDA 129和/或慢生大豆根瘤菌USDA  532C)、一种或多种根瘤菌提取物(例如,包含豌豆根瘤菌
(R.leguminosarum)SO12A-2的培养基的提取物)、一种或多种中华根瘤菌提取物(例如,包
含弗氏中华根瘤菌(S.fredii)CCBAU114和/或弗氏中华根瘤菌USDA 205的培养基的提取
物)、一种或多种青霉(Penicillium)提取物(例如,包含以下的培养基的提取物:比莱青霉(P.bilaiae)ATCC 18309、比莱青霉ATCC 20851、比莱青霉ATCC 22348、比莱青霉NRRL 
50162、比莱青霉NRRL 50169、比莱青霉NRRL 50776、比莱青霉NRRL 50777、比莱青霉NRRL 
50778、比莱青霉NRRL 50777、比莱青霉NRRL 50778、比莱青霉NRRL 50779、比莱青霉NRRL 
50780、比莱青霉NRRL 50781、比莱青霉NRRL 50782、比莱青霉NRRL 50783、比莱青霉NRRL 
50784、比莱青霉NRRL 50785、比莱青霉NRRL 50786、比莱青霉NRRL 50787、比莱青霉NRRL 
50788、比莱青霉RS7B-SD1、短密青霉(P.brevicompactum)AgRF18、变灰青霉(P.canescens)ATCC 10419、扩展青霉(P.expansum)ATCC  24692、扩展青霉YT02、费拉塔纳姆青霉
(P.fellatanum)ATCC 48694、加斯特氏青霉(P.gaestrivorus)NRRL 50170、光孢青霉
(P.glabrum)DAOM 239074、光孢青霉CBS 229.28、微紫青霉(P.janthinellum)ATCC 10455、鲁里木青霉(P.lanosocoeruleum)ATCC 48919、放射青霉(P.radicum)ATCC 201836、放射青霉FRR 4717、放射青霉FRR 4719、放射青霉N93/47267和/或雷斯青霉(P.raistrickii)ATCC 
10490)、一种或多种假单胞菌提取物(例如,包含恶臭假单胞菌(P.jessenii)PS06的培养基的提取物)、一种或多种杀螨、杀昆虫和/或杀线虫提取物(例如,包含以下的培养基的提取物:坚强芽孢杆菌I-1582、蕈状芽孢杆菌AQ726、NRRL B-21664;球孢白僵菌ATCC-74040、球孢白僵菌ATCC-74250、伯克氏菌种A396sp.nov.rinojensis、NRRL B-50319、铁杉下色杆菌NRRL B-30655、越橘色杆菌NRRL B-50880、黄杆菌H492、NRRL B-50584、金龟子绿僵菌F52(还称为金龟子绿僵菌菌株52、金龟子绿僵菌菌株7、金龟子绿僵菌菌株43和金龟子绿僵菌
BIO-1020、TAE-001;作为DSM 3884、DSM 3885、ATCC 90448、SD 170和ARSEF 7711保藏)和/或玫烟色拟青霉FE991)和/或一种或多种杀真菌提取物(例如,包含以下的培养基的提取
物:杧果白粉寄生孢AQ (Intrachem Bio GmbH&Co.KG,Germany)、黄曲霉AFLA-
(Syngenta Crop Protection,Inc.,CH)、出芽短梗霉 (bio-
ferm GmbH,Germany)、短小芽孢杆菌AQ717(NRRL B-21662)、短小芽孢杆菌NRRL B-30087、芽孢杆菌AQ175(ATCC 55608)、芽孢杆菌AQ177(ATCC 55609)、枯草芽孢杆菌AQ713(NRRL B-
21661)、枯草芽孢杆菌AQ743(NRRL B-21665)、解淀粉芽孢杆菌FZB24、解淀粉芽孢杆菌NRRL B-50349、解淀粉芽孢杆菌TJ1000(还称为1BE,分离株ATCC BAA-390)、苏云金芽孢杆菌AQ52(NRRL B-21619)、橄榄假丝酵母I-82(例如, Ecogen Inc.,USA)、齐藤假丝酵母
(以与溶菌酶的混合物的形式;BASF,USA)和 (ArystaLife 
Science,Ltd.,Cary,NC)、粉红粘帚霉(还称为链孢粘帚菌)J1446( Verdera,
Finland)、小盾壳霉 (Prophyta,Germany)、板栗疫病菌(CNICM,France)、浅
白隐球菌YIELD  (Anchor Bio-Technologies,South Africa)、尖孢镰刀菌
(S.I.A.P.A.,Italy)和 (Natural Plant Protection,
France)、核果梅奇酵母 (Agrogreen,Israel)、双胞镰孢
(Agrauxine,France)、白色麝香霉NRRL 30547、粉红麝香霉NRRL30548、大伏革菌
(Verdera,Finland)、絮绒假酶菌 (Plant Products Co.Ltd.,
Canada)、寡雄腐霉DV74( Remeslo SSRO,Biopreparaty,Czech Rep.)、
大虎杖(例如, Marrone BioInnovations,USA)、链霉菌NRRL B-30145、链霉
菌M1064、鲜黄链霉菌NRRL 30232、利迪链霉菌WYEC 108(ATCC 55445)、紫黑链霉菌YCED 9(ATCC 55660;DE-THATCH- DECOMP- 和THATCH  Idaho Research 
Foundation,USA)、链霉菌WYE 53(ATCC 55750;DE-THATCH- DECOMP- 和THATCH 
Idaho Research Foundation,USA)、黄色篮状菌V117b(
Prophyta,Germany)、棘孢木霉SKT-1(ECO- Kumiai Chemical Industry Co.,
Ltd.,Japan)、黑绿木霉LC52( Agrimm Technologies Ltd,NZ)、哈茨木霉T-
22( der Firma BioWorks Inc.,USA)、哈茨木霉TH-35(ROOT 
Mycontrol Ltd.,Israel)、哈茨木霉T-39( Mycontrol Ltd.,Israel;
TRICHODERMA Makhteshim Ltd.,Israel)、哈茨木霉ICC012和绿色木霉TRICHOPEL
(Agrimm Technologies Ltd,NZ)、哈茨木霉ICC012和绿色木霉ICC080( WP,
Isagro Ricerca,Italy)、多孢木霉和哈茨木霉( BINAB Bio-Innovation AB,
Sweden)、子座木霉 (C.E.P.L.A.C.,Brazil)、绿木霉GL-21(
Certis LLC,USA)、绿木霉G1-3、ATCC 57678、绿木霉G1-21(Thermo 
Trilogy Corporation,Wasco,CA)、绿木霉G1-3和解淀粉芽孢杆菌FZB2、绿木霉G1-3和解淀粉芽孢杆菌NRRL B-50349、绿木霉G1-3和解淀粉芽孢杆菌TJ1000、绿木霉G1-21和解淀粉芽孢杆菌FZB24、绿木霉G1-21和解淀粉芽孢杆菌NRRL B-50349、绿木霉G1-21和解淀粉芽孢杆菌TJ1000、绿色木霉 (Ecosense Labs.(India)Pvt.Ltd.,Indien,BIO-
F,T.Stanes&Co.Ltd.,Indien)、绿色木霉TV1(Agribiotec srl,Italy),绿色木霉
ICC080和/或奥德曼细基格孢HRU3(BOTRY- Botry-Zen Ltd,NZ))以及其组合。
[0093] 除微生物菌株或分离株以外,在一些实施方案中,组合物和制剂可以还包含一种或多种生物活性成分。生物活性成分的非限制性实例包括植物生长调节剂、植物信号分子、生长促进剂、微生物刺激分子、生物分子、土壤改良剂、养分、植物养分强化剂等,如脂壳寡糖(LCO)、壳寡糖(CO)、几丁质化合物、类黄酮、茉莉酸或其衍生物(例如,茉莉酸酯)、细胞分裂素、生长素、赤霉素、脱落酸、乙烯、油菜素甾醇、水杨酸盐、常量营养素和微量营养素、亚油酸或其衍生物、亚麻酸或其衍生物、卡里金等)和包括各种细菌和/或真菌菌株的有利微
生物(例如,根瘤菌种、慢生根瘤菌种、中华根瘤菌种、固氮根瘤菌种、球囊霉(Glomus)种、巨孢囊霉(Gigaspora)种、膜盘菌(Hymenoscyphous)种、树粉孢(Oidiodendron)种、蜡蘑
(Laccaria)种、豆马勃(Pisolithus)种、须腹菌(Rhizopogon)种、硬皮马勃(Scleroderma)种、丝核菌(Rhizoctonia)种、不动杆菌(Acinetobacter)种、节杆菌种、丛孢菌
(Arthrobotrys)种、曲霉种、固氮螺菌种、芽孢杆菌种、伯克氏菌种、假丝酵母菌(Candida)种、金色单胞菌(Chryseomonas)种、肠杆菌种、正青霉(Eupenicillium)种、微小杆菌
(Exiguobacterium)种、克雷伯氏菌种、克吕沃尔菌(Kluyvera)种、微杆菌
(Microbacterium)种、毛霉(Mucor)种、拟青霉(Paecilomyces)种、类芽孢杆菌种、青霉种、假单胞菌种、沙雷氏菌种、寡养单胞菌种、链霉菌种、链孢囊菌(Streptosporangium)种、斯瓦米纳杆菌(Swaminathania)种、硫杆菌(Thiobacillus)种、Torulospora种、弧菌(Vibrio)种、黄色杆菌(Xanthobacter)种、黄单胞菌(Xanthomonas)种等)及其组合。
[0094] 可包括在本公开的组合物中的真菌的非限制性实例包括绿粘帚霉(Gliocladium virens)ATCC 52045、绿粘帚霉GL-21、根内球囊霉(Glomus intraradices)RTI-801、金龟子绿僵菌F52、PENI、棘孢木霉SKT-1、棘孢木霉ICC 012、黑绿木霉LC52、黑绿木霉CNCM1-1237、顶孢木霉(Trichoderma fertile)JM41R、盖姆斯木霉(Trichoderma gamsii)ICC 080、钩状木霉(Trichoderma hamatum)ATCC52198、哈茨木霉ATCC 52445、哈茨木霉KRL-AG2、哈茨木霉T-22、哈茨木霉TH-35、哈茨木霉T-39、哈茨木霉ICC012、里氏木霉(Trichoderma reesi)ATCC 28217、绿木霉ATCC 58678、绿木霉Gl-3、绿木霉GL-21、绿木霉G-41、绿色木霉
(Trichoderma viridae)ATCC52440、绿色木霉ICC080、绿色木霉TV1及其组合,以及基于内转录间隔区(ITS)和/或细胞色素c氧化酶(CO1)序列同一性,与任何前述真菌菌株具有至少
75%、80%、85%、90%、95%、96%、97%、97.5%、98%、98.5%、99%、99.5%、99.6%、
99.7%、99.8%或99.9%或更高序列同一性的微生物。
[0095] 可以包括在本公开的组合物中的菌根真菌的非限制性实例包括菌根菌株,如珍珠巨孢囊霉(Gigaspora margarita)、聚丛球囊霉(Glomus aggregatum)、巴西球囊霉(Glomus brasilianum)、明球囊霉(Glomus clarum)、沙漠球囊霉(Glomus deserticola)、幼套球囊霉(Glomus etunicatum)、根内球囊霉(Glomus intraradices)、单孢球囊霉(Glomus 
monosporum)、摩西球囊霉(Glomus mosseae)、双色蜡蘑(Laccaria bicolor)、红蜡蘑
(Laccaria laccata)、巴西类球囊霉(Paraglomus brazilianum)、彩色豆马勃(Pisolithus tinctorius)、阿米尔氏须腹菌(Rhizopogon amylopogon)、富尔维氏须腹菌(Rhizopogon 
fulvigleba)、浅黄根须腹菌(Rhizopogon luteolus)、长毛须腹菌(Rhizopogon 
villosuli)、光硬皮马勃和橙黄硬皮马勃以及其组合。
[0096] 在一些实施方案中,组合物可以包含一种或多种脂壳寡糖(LCO)、壳寡糖(CO)和/或几丁质化合物。LCO,有时称为共生结瘤(Nod)信号(或Nod因子)或Myc因子,由具有在非还原末端缩合的N连接的脂肪酰基链的β-l,4连接的N-乙酰基-D-葡萄糖胺(“GlcNAc”)残基的寡聚糖主链组成。如本领域中所理解,LCO在主链中的GlcNAc残基数目、脂肪酰基链的长度和饱和度以及还原和非还原糖残基的取代方面不同。参见例如Denarie等人,
Ann.Rev.Biochem.65:503(1996);Diaz等人,Mol.Plant-Microbe Interactions 13:268
(2000);Hungria等人,Soil Biol.Biochem.29:819(1997);Hamel等人,Planta 232:787
(2010);以及Prome等人,Pure&Appl.Chem.70(1):55(1998),它们的内容和公开内容以引用的方式并入本文中。
[0097] LCO可以由任何合适的来源合成或获得。参见例如WO2005/063784、WO 2007/117500和WO 2008/071674,它们的内容和公开内容以引用的方式并入本文中。在一些方面
中,合成LCO可以具有天然存在的LCO的基本结构,但含有一个或多个修饰或取代,如
Spaink,Crit.Rev.Plant Sci.54:257(2000)中描述的那些。LCO和用于构建LCO的前体(例
如,CO,其本身可以适用作生物活性成分)可以由遗传工程化的有机体合成。参见例如
Samain等人,Carbohydrate Res.302:35(1997);Cottaz等人,Meth.Eng.7(4):311(2005);
以及Samain等人,J.Biotechnol.72:33(1999)(例如其中图1,其显示可以在具有基因
nodBCHL的不同组合的大肠杆菌中重组产生的CO的结构),它们的内容和公开内容以引用的
方式并入本文中。
[0098] LCO(及其衍生物)可以以各种纯度形式包括或用于组合物中,并且可以单独使用或以产生LCO的细菌或真菌的培养物的形式使用。例如, (可从Monsanto 
Company(St.Louis,MO)商购获得)含有产生LCO的慢生大豆根瘤菌的培养物。提供基本上纯
的LCO的方法包括从LCO和微生物的混合物去除微生物细胞,或如例如美国专利号5,549,
718中所描述通过LCO溶剂相分离接着进行HPLC色谱来继续分离和纯化LCO分子。纯化可以
通过重复HPLC增强并且被纯化的LCO分子可以冷冻干燥以便长期储存。根据一些实施方案,包括在本公开的组合物中的一种或多种LCO的纯度是至少0.1%、0.5%、1%、2%、3%、4%、
5%、10%、15%、20%、25%、30%、35%、40%、45%、50%、55%、60%、65%、70%、75%、
80%、85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%。在一些实施方案中,组合物和方法可以包含LCO的类似物、衍生物、水合物、异构体、盐和/或溶剂合物。
LCO可以以任何合适的一个或多个量/一个或多个浓度并入本公开的组合物中。例如,本公
开的组合物包含约1×10-20M到约1×10-1M的一种或多种LCO。例如,本公开的组合物可以包
-20 -19 -18 -17 -16 -15 -14 -13
含约1×10 M、1×10 M、1×10 M、1×10 M、1×10 M、1×10 M、1×10 M、1×10 M、1
×10-12M、1×10-11M、1×10-10M、1×10-9M、1×10-8M、1×10-7M、1×10-6M、1×10-5M、1×10-4M、1×10-3M、1×10-2M、1×10-1M的一种或多种LCO。在一个方面中,LCO浓度是1×10-14M到1×10-
5M、1×10-12M到1×10-6M或1×10-10M到1×10-7M。在一个方面中,LCO浓度是1×10-14M到1×
-5 -12 -6 -10 -7
10 M、1×10 M到1×10 M或1×10 M到1×10 M。LCO的量/浓度可以是有效给予植物正面
的性状或益处如增强施加组合物的植物的抗病性、生长和/或产量的量。根据一些实施方
案,LCO量/浓度在无组合物的一种或多种其他成分(如CO和/或一种或多种杀虫剂)的有利
贡献的情况下不有效提高植物的产量。
[0099] 除微生物菌株或分离株以外,在一些实施方案中,组合物和制剂可以包含任何合适的CO,可能以及一种或多种LCO。CO因为其缺乏特征在于LCO的脂肪酸侧链而与LCO不同。
CO,有时称为N-乙酰基壳寡糖,也由GlcNAc残基构成,但是具有使得其与几丁质分子[(C8-H13NO5)n,CAS编号1398-61-4]和壳聚糖分子[(C5H11NO4)n,CAS编号9012-76-4]不同的侧链装饰。参见例如D’Haeze等人,Glycobiol.12(6):79R(2002);Demont-Caulet等人,Plant 
Physiol.120(1):83(1999);Hanel等人,Planta 232:787(2010);Muller等人,Plant 
Physiol.124:733(2000);Robina等人,Tetrahedron 58:521-530(2002);Rouge等人,
Docking of Chitin Oligomers and Nod Factors on Lectin Domains of the LysM-RLK 
Receptors in the Medicago-Rhizobium Symbiosis,The Molecular Immunology of 
Complex Carbohydrates-3(Springer  Science,2011);Van der Holst等人,
Curr.Opin.Struc.Biol.11:608(2001);以及Wan等人,Plant Cell21:1053(2009),它们的
内容和公开内容以引用的方式并入本文中。CO可以由任何合适的来源获得。例如,CO可以来源于LCO。例如,在一个方面中,本公开的组合物可以包含一种或多种来源于由以下菌株获得(即,分离和/或纯化)的LCO的CO:固氮根瘤菌、慢生根瘤菌(慢生大豆根瘤菌)、中慢生根瘤菌(Mesorhizobium)、根瘤菌(例如豌豆根瘤菌)、中华根瘤菌(例如苜蓿中华根瘤菌)或米氏真菌(mycorhizzal fungi)(例如根内球囊霉)。或者,CO可以是合成的。用于制备重组CO的方法是本领域中已知的。参见例如Cottaz等人,Meth.Eng.7(4):311(2005);Samain等人,Carbohydrate Res.302:35(1997);以及Samain等人,J.Biotechnol.72:33(1999),它们的
内容和公开内容以引用的方式并入本文中。
[0100] 在一些实施方案中,CO(及其衍生物)可以以各种纯度形式包括或用于组合物中,并且可以单独使用或以共同生产CO的细菌或真菌的培养物形式使用。根据一些实施方案,
包括在组合物中的一种或多种CO的纯度可以是至少0.1%、0.5%、1%、2%、3%、4%、5%、
6%、7%、8%、9%、10%、15%、20%、30%、40%、50%、60%、70%、75%、80%、85%、90%、
91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%、99.5%或更高。应理解,本公开的组合物和方法可以包含CO的水合物、异构体、盐和/或溶剂合物。CO可以以任何合适的一个或多个量/一个或多个浓度并入本公开的组合物中。例如,本公开的组合物可以包含约1×10-20M到1×10-1M,如约1×10-20M、1×10-19M、1×10-18M、1×10-17M、1×10-16M、1×10-15M、1×10-14M、
1×10-13M、1×10-12M、1×10-11M、1×10-10M、1×10-9M、1×10-8M、1×10-7M、1×10-6M、1×10-
5 -4 -3 -2 -1 -14
M、1×10 M、1×10 M、1×10 M或1×10 M的一种或多种CO。例如,CO浓度可以是1×10 M
到1×10-5M、1×10-12M到1×10-6M或1×10-10M到1×10-7M。CO的量/浓度可以是有效给予或赋
予植物正面的性状或益处如增强土壤微生物环境、营养素吸收或增加施加组合物的植物的
生长和/或产量的量。根据一些实施方案,CO量/浓度可能在无组合物的一种或多种其他成
分(如LCO和/或一种或多种接种物、生物分子、营养素或杀虫剂)的有利贡献的情况下不有
效增强植物的生长。
[0101] 在一些实施方案中,组合物可以包含一种或多种合适的几丁质化合物,如几丁质(IUPAC:N-[5-[[3-乙酰基氨基-4,5-二羟基-6-(羟甲基)噁烷-2-基]甲氧基甲基]-2-[[5-
乙酰基氨基-4,6-二羟基-2-(羟甲基)噁烷-3-基]甲氧基甲基]-4-羟基-6-(羟甲基)噁烷-
3-基]乙酰胺)、壳聚糖(IUPAC:5-氨基-6-[5-氨基-6-[5-氨基-4,6-二羟基-2(羟甲基)噁
烷-3-基]氧基-4-羟基-2-(羟甲基)噁烷-3-基]氧基-2(羟甲基)噁烷-3,4-二醇)以及其异
构体、盐和溶剂合物。
[0102] 几丁质和壳聚糖,是真菌细胞壁以及昆虫和甲壳动物的外骨骼的主要组分,由GlcNAc残基组成。几丁质和壳聚糖可以商购获得或由昆虫、甲壳动物壳或真菌细胞壁制备。
用于制备几丁质和壳聚糖的方法是本领域中已知的。参见例如美国专利号4,536,207(由甲
壳动物壳制备)和5,965,545(由蟹壳和市售壳聚糖的水解制备);和Pochanavanich等人,
Lett.Appl.Microbiol.35:17(2002)(由真菌细胞壁制备)。
[0103] 可以获得脱乙酰几丁质和壳聚糖,其脱乙酰范围为小于35%到大于90%并且覆盖宽范围的分子量,例如小于15kD的低分子量壳聚糖低聚物和0.5到2kD的几丁质低聚物;分
子量为约15kD的“实用级”壳聚糖;和高达70kD的高分子量壳聚糖。被配制用于种子处理的几丁质和壳聚糖组合物是可商购的。市售产品包括例如 (Plant Defense 
Boosters,Inc.)和BEYONDTM(Agrihouse,Inc.)。
[0104] 除微生物菌株或分离株以外,在一些实施方案中,组合物和制剂可以包含一种或多种合适的类黄酮,包括(但不限于)花青素、黄酮、查耳酮、香豆素、黄烷酮、二氢黄酮醇、黄烷和异黄酮,以及其类似物、衍生物、水合物、异构体、聚合物、盐和溶剂合物。类黄酮是酚类化合物,其具有由三个碳桥连接的两个芳族环的通式结构。类黄酮的类别是本领域中已知
的。参见例如Jain等人,J.Plant Biochem.&Biotechnol.11:1(2002);和Shaw等人,
Environ.Microbiol.11:1867(2006),它们的内容和公开内容以引用的方式并入本文中。若干类黄酮化合物是可商购的。类黄酮化合物可以从植物或种子分离,例如,如美国专利5,
702,752、5,990,291和6,146,668中所描述。类黄酮化合物还可以通过遗传工程化有机体,如酵母产生。参见例如Ralston等人,Plant Physiol.137:1375(2005)。
[0105] 除微生物菌株或分离株以外,在一些实施方案中,组合物和制剂可以包含一种或多种黄烷酮,如紫铆素、圣草酚、橙皮素、橙皮苷、高圣草酚、异樱花素、柚皮素、柚皮苷、松属素、枸橘苷、樱花素、樱花苷和/或sterubin中的一种或多种;一种或多种黄烷酮醇,如二氢山柰酚和/或花旗松素;一种或多种黄烷,如一种或多种黄烷-3-醇(例如,儿茶素(C)、3-没食子酸儿茶素(Cg)、表儿茶素(EC)、表没食子儿茶素(EGC)、3-没食子酸表儿茶素(ECg)、3-没食子酸表没食子儿茶素(EGCg)、表阿夫儿茶精、非瑟酮醇、没食子酸儿茶素(GC)、3-没食子酸没食子酸儿茶素(GCg)、guibourtinidol、mesquitol、刺槐亭醇、茶黄素-3-没食子酸盐、茶黄素-3'-没食子酸盐、茶黄素-3,3'-二没食子酸酯、茶红素)、黄烷-4-醇(例如,
apiforol和/或luteoforol)和/或黄烷-3,4-二醇(例如,无色花青素(leucocyanidin)、无
色花飞燕草色素(leucodelphinidin)、白漆苷元(leucofisetinidin)、无色锦葵色素
(leucomalvidin)、无色天竺葵色素(luecopelargonidin)、无色甲基花青素
(leucopeonidin)、无色刺槐定(leucorobinetinidin)、黑金合欢素(melacacidin)和/或
teracacidin)和/或其二聚体、三聚体、低聚物和/或聚合物(例如,一种或多种原花青素
(proanthocyanidin));一种或多种异类黄酮,如一种或多种异黄酮或类黄酮衍生物(例如,鹰嘴豆素A、大豆苷元、芒柄花黄素(formononetin)、金雀异黄素(genistein)和/或黄豆黄素(glycitein))、异黄烷(例如,雌马酚(equol)、ionchocarpane和/或laxifloorane)、异黄烷二醇、异黄酮(isoflavene)(例如,光甘草素(glabrene)、haginin  D和/或2-
methoxyjudaicin)、香豆雌酚(coumestan)(例如,迈斯托醇(coumestrol)、plicadin和/或蟛蜞菊内脂(wedelolactone))、紫檀素(pterocarpan)、roetonoid、新类黄酮(例如,红厚壳烯酮内酯(calophyllolide)、卡顿尔苷元(coutareagenin)、黄檀色烯
(dalbergichromene)、黄檀素(dalbergin)、尼夫伊丁(nivetin))和/或紫檀碱(例如,比图卡频(bitucarpin)A、比图卡频B、艾里布雷丁(erybraedin)A、艾里布雷丁B、阿比西尼亚刺桐素(erythrabyssin)II、艾第拉比新(erthyrabissin)-1、erycristagallin、glycinol、glyceollidin、大豆抗毒素(glyceollin)、glycyrrhizol、高丽槐素(maackiain)、美迪紫檀素(medicarpin)、morisianine、orientanol、菜豆素(phaseolin)、豌豆素(pisatin)、
striatine、三叶豆紫檀苷(trifolirhizin))以及其组合。类黄酮及其衍生物可以以任何合适的形式包括于组合物中,包括(但不限于)多晶和结晶形式。类黄酮可以以任何合适的一
个或多个量或一个或多个浓度包括在组合物中。一种或多种类黄酮的量/浓度可以是可以
通过在土壤微生物上活动或其他手段直接有效给予植物益处诸如以便提高植物营养和/或
产量的量。根据一些实施方案,类黄酮量/浓度可能在无组合物的一种或多种其他成分(如
LCO、CO和/或一种或多种杀虫剂)的有利贡献的情况下不有效提高植物的营养或产量。
[0106] 除微生物菌株或分离株以外,在一些实施方案中,组合物和制剂可以包含一种或多种合适的非类黄酮nod诱导物诱导物,包括但不限于茉莉酸([1R-[1α,2β(Z)]]-3-氧代-
2-(戊烯基)环庚烷乙酸;JA)、亚油酸((Z,Z)-9,12-十八碳二烯酸)和/或亚麻酸((Z,Z,Z)-
9,12,15-十八碳三烯酸),以及其类似物、衍生物、水合物、异构体、聚合物、盐和溶剂合物。
茉莉酸及其甲酯茉莉酸甲酯(MeJA),统称为茉莉酸酯,是在一些植物(例如小麦)、真菌(例如可可球二孢菌(Botryodiplodia theobromae)、藤仓赤霉(Gibbrella fujikuroi))、酵母(例如酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae))和细菌(例如大肠杆菌(Escherichia 
coli))中天然存在的基于类十八烷的化合物。亚油酸和亚麻酸可以在茉莉酸的生物合成的
过程中产生。报告茉莉酸酯、亚油酸和亚麻酸(及其衍生物)是根际细菌的nod基因表达或
LCO产生的诱导物。参见例如Mabood等人PLANT PHYSIOL.BIOCHEM.44(11):759(2006);
Mabood等人,AGR.J.98(2):289(2006);Mabood等人,FIELD CROPS RES.95(2-3):412
(2006);以及Mabood和Smith,Linoleic and linolenic acid induce the expression of nod genes in Bradyrhizobium japonicum USDA 3,PLANT BIOL.(2001)。
[0107] 可以包括或用于组合物中的茉莉酸、亚油酸和亚麻酸的衍生物包括其酯、酰胺、糖苷和盐。代表性酯是其中亚油酸、亚麻酸或茉莉酸的羧基由--COR基团置换的化合物,其中R是--OR1基团,其中R1是:烷基,如C1-C8非支链或支链烷基,例如甲基、乙基或丙基;链烯基,如C2-C8非支链或支链烯基;炔基,如C2-C8非支链或支链炔基;具有例如6到10个碳原子的芳基;或具有例如4到9个碳原子的杂芳基,其中杂芳基中的杂原子可以是例如N、O、P或S。代表性酰胺是其中亚油酸、亚麻酸或茉莉酸的羧基由--COR基团置换的化合物,其中R是NR2R3基团,其中R2和R3各自独立地是:氢;烷基,如C1-C8非支链或支链烷基,例如甲基、乙基或丙基;链烯基,如C2-C8非支链或支链烯基;炔基,如C2-C8非支链或支链炔基;具有例如6到10个碳原子的芳基;或具有例如4到9个碳原子的杂芳基,其中杂芳基中的杂原子可以是例如N、O、P或S。酯可以通过由已知的方法制备,如酸催化亲核加成,其中羧酸与醇在催化量的无机酸存在下反应。酰胺还可以通过已知的方法制备,如通过使羧酸与合适的胺在偶合剂(如二环己基碳二亚胺(DCC))存在下、在中性条件下反应。亚油酸、亚麻酸和茉莉酸的合适的盐包括例如碱加成盐。可以用作制备这些化合物的代谢上可接受的盐的碱的碱包括来源于阳离子
(如碱金属阳离子(例如钾和钠)和碱土金属阳离子(例如钙和镁))的碱。这些盐可以通过混
合亚油酸、亚麻酸或茉莉酸的溶液与碱溶液来制备。盐可以从溶液沉淀出并且通过过滤收
集,或可以通过其他手段如溶剂蒸发来回收。
[0108] 非类黄酮nod基因诱导物可以以任何合适的一个或多个量/一个或多个浓度并入组合物中。例如,非类黄酮nod基因诱导物的量/浓度可以是有效给予或赋予植物正面的性
状或益处如提高施加组合物的植物的抗病性、生长和/或产量的量。根据一些实施方案,非类黄酮nod基因诱导物的量/浓度可能在无组合物的一种或多种其他成分(如LCO、CO和/或
一种或多种杀虫剂)的有利贡献的情况下不有效提高植物的生长和/或产量。
[0109] 除微生物菌株或分离株以外,在一些实施方案中,组合物和制剂可能包含一种或多种卡力金(karrakin),包括但不限于2H-氟[2,3-c]吡喃-2-酮,以及其类似物、衍生物、水合物、异构体、聚合物、盐和溶剂合物。卡力金的生物学上可接受的盐的实例包括用生物学上可接受的酸形成的酸加成盐,其实例包括盐酸盐、氢溴化物、硫酸盐或硫酸氢盐、磷酸盐或磷酸氢盐、乙酸盐、苯甲酸盐、琥珀酸盐、富马酸盐、马来酸盐、柠檬酸盐、酒石酸盐、葡糖酸盐、甲磺酸盐、苯磺酸盐和对甲苯磺酸盐。其他生物学上可接受的金属盐可以包括与碱的碱金属盐,其实例包括钠和钾盐。卡力金可以以任何合适的一个或多个量或一个或多个浓
度并入在组合物中。例如,卡力金的量/浓度可以是有效给予或赋予植物正面的性状或益处如提高施加组合物的植物的抗病性、生长和/或产量的量或浓度。在一个方面中,卡力金的量/浓度可能在无组合物的一种或多种其他成分(如LCO、CO和/或一种或多种杀虫剂)的有
利贡献的情况下不有效提高植物的抗病性、生长和/或产量。
[0110] 在一些实施方案中,本公开的组合物可以包含一种或多种腐殖酸(例如一种或多种褐煤腐殖酸、褐煤腐殖酸、泥灰腐殖酸和水提取腐殖酸)。在一些实施方案中,组合物可以包含腐殖酸铵、腐殖酸硼、腐殖酸钾和/或腐殖酸钠。在一些实施方案中,腐殖酸铵、腐殖酸硼、腐殖酸钾和腐殖酸钠中的一种或多种不包括在本公开的组合物中。可能适用于本
公开的实施方案中的腐殖酸的非限制性实例包括MDL编号MFCD00147177(CAS编号1415-93-
6)、MDL编号MFCD00135560(CAS编号68131-04-4)、MDL编号MFCS22495372(CAS编号68514-
28-3)、CAS编号93924-35-7和CAS编号308067-45-0。在一些实施方案中,本公开的组合物可以包含一种或多种富里酸(例如一种或多种风化褐煤富里酸、褐煤富里酸、泥灰富里酸富里酸和/或水提取富里酸)。在一些实施方案中,组合物可以包含富里酸铵、富里酸硼、富里酸钾和/或富里酸钠。在一些实施方案中,富里酸铵、富里酸硼、富里酸钾和富里酸钠中的一种或多种不包括在本公开的组合物中。可适用于本公开的实施方案中的富里酸的非限制性实
例包括MDL编号MFCD09838488(CAS编号479-66-3)。在一些实施方案中,本公开的组合物可
以包含一种或多种甜菜碱(例如三甲基甘氨酸)。在一些实施方案中,本公开的组合物可以
包含一种或多种胨(例如细菌胨、肉胨、奶胨、蔬菜胨和酵母胨)。
[0111] 在一些实施方案中,本公开的组合物可以包含一种或多种吸湿性聚合物(例如吸湿性琼脂、白蛋白、藻酸盐、角叉菜胶、纤维素、胶(例如纤维素胶、瓜耳豆胶、阿拉伯树胶、风车子胶(gum combretum)、黄原胶(xantham gum))、甲基纤维素、尼龙、果胶、聚丙烯酸、聚己内酯、聚碳酸酯、聚乙二醇(PEG)、聚乙烯亚胺(PEI)、聚交酯、聚甲基丙烯酸甲酯(PMA)、聚氨基甲酸酯、聚乙烯醇(PVA)、聚乙烯吡咯烷酮(PVP)、丙二醇、羧甲基纤维素钠和/或淀粉)。聚合物的非限制性实例包括AGRIMERTM聚合物(例如30、AL-10LC、AL-22、AT/ATF、VA 3E、VA 3l、VA 5E、VA 5l、VA 6、VA6E、VA 7E、VA 7l、VEMA AN-216、VEMA AN-990、VEMA AN-1200、VEMA AN-1980、VEMA H-815MS;Ashland Specialty Ingredients,Wilmington,DE)、EASYSPERSETM聚合物(Ashland Specialty Ingredients,Wilmington,DE);DISCOTMAG聚合物(例如L-250、L-280、L-285、L-286、L-320、L-323、L-517、L-519、L-520、L800;Incotec Inc.,Salinas,TM
CA)、 聚合物(Bri-Chem Supply Ltd.,Calgary,Alberta,CA)、SEEDWORX 聚合
物(例如Bio 200;Aginnovation,LLC,Walnut Groove,CA)、 黄原胶粉末,如
PRE- Rapid-3粉末(TIC Gums,White Marsh,MD)及其组合。
聚合物的其他实例可见于Pouci等人,AM.J.AGRIC.BIOL.SCI.3(1):299(2008)中。
[0112] 除微生物菌株或分离株以外,在一些实施方案中,组合物和制剂可以包含一种或多种花青素和/或黄酮,如以下中的一种或多种:花青素、飞燕草色素、锦葵色素、花葵素、甲基花青素、矮牵牛素(petunidin)、黄酮(例如芹菜素(apigenin)、黄岑素(baicalein)、白杨黄素(chrysin)、7,8-二羟基黄酮、地奥司明(diosmin)、黄酮哌酯(flavoxate)、6-羟基黄酮、木犀草素(luteolin)、野黄岑素(scutellarein)、柑桔黄酮和/或次黄芩素)和/或黄酮醇(例如黄柏苷、黄芪苷、杜鹃黄素、杜鹃黄苷、漆黄素、furanoflavonols galangin、棉黄素、3-羟基黄酮、金丝桃苷、淫羊藿苷、异槲皮素、山柰甲黄素、山柰苷、山柰酚、异鼠李亭、桑色素、杨梅黄酮、杨梅苷、柚皮黄素、pachypodol、吡喃黄酮醇(pyranoflavonol)槲皮素、quericitin、甲基鼠李素、鼠李亭、刺槐素、芸香苷、绣线菊苷、曲克芦丁(troxerutin)和/或zanthorhamnin)以及其组合。
[0113] 除微生物菌株或分离株以外,在一些实施方案中,组合物和制剂可以包含葡糖酸内酯和/或其类似物、衍生物、水合物、异构体、聚合物、盐和/或溶剂合物。葡糖酸内酯可以任何合适的一个或多个量/一个或多个浓度并入在组合物中。例如,葡糖酸内酯的量/浓度
可以是有效给予或赋予植物正面的性状或益处如提高施加组合物的植物的抗病性、生长
和/或产量的量。在一个方面中,葡糖酸内酯的量/浓度可能在无组合物的一种或多种其他
成分(如LCO、CO和/或一种或多种杀虫剂)的有利贡献的情况下不有效提高植物的抗病性、
生长和/或产量。
[0114] 除微生物菌株或分离株以外,在一些实施方案中,组合物和制剂可以包含一种或多种合适的营养素和/或肥料,如有机酸(例如乙酸、柠檬酸、乳酸、苹果酸、牛磺酸等)、常量矿物质(例如磷、钙、镁、钾、钠、铁等)、痕量矿物质(例如硼、钴、氯、铬、铜、氟、碘、铁、锰、钼、硒、锌等)、维生素(例如维生素A、复合维生素B(即,维生素B1、维生素B2、维生素B3、维生素B5、维生素B6、维生素B7、维生素B8、维生素B9、维生素B12、胆碱)、维生素C、维生素D、维生素E、维生素K)和/或类胡萝卜素(α-胡萝卜素、β-胡萝卜素、玉米黄质、叶黄素、番茄红素、玉米黄素等)以及其组合。在一个方面中,本公开的组合物可以包含植物或微生物的常量营养素和微量营养素,包括磷、硼、氯、铜、铁、锰、钼和/或锌。根据一些实施方案,组合物可以包含一种或多种有利的微量营养素。用于本文中描述的组合物的微量营养素的非限制性实例可以
包括维生素(例如维生素A、复合维生素B(即,维生素B1、维生素B2、维生素B3、维生素B5、维生素B6、维生素B7、维生素B8、维生素B9、维生素B12、胆碱)、维生素C、维生素D、维生素E、维生素K)、类胡萝卜素(α-胡萝卜素、β-胡萝卜素、玉米黄质、叶黄素、番茄红素、玉米黄素等)、常量矿物质(例如,磷、钙、镁、钾、钠、铁等)、痕量矿物质(例如,硼、钴、氯化物、铬、铜、氟化合物、碘、铁、锰、钼、硒、锌等)、有机酸(例如,乙酸、柠檬酸、乳酸、苹果酸、牛磺酸等)以及其组合。在具体方面中,组合物可以包含磷、硼、氯、铜、铁、锰、钼和/或锌以及其组合。对于包含磷的组合物,设想可以使用任何合适的磷源。例如,磷可以来源于磷酸岩来源,如磷酸一铵、磷酸二铵、磷酸一钙、过磷酸钙、三过磷酸钙和/或多磷酸铵,有机含磷来源,或能够由一种或多种微生物(例如,拜赖青霉)溶液化的磷来源。
[0115] 用于施加于植物、植物部位或植物种子表面的微生物组合物可以含有一种或多种粘结剂、粘合剂或粘合剂聚合物(“粘着剂”),如一种或多种麦芽糖糊精、胶(例如纤维素胶、瓜耳豆胶、阿拉伯树胶、风车子胶、黄原胶)、一种或多种单糖、二糖、寡糖或多糖、糖醇、蛋白质、胨、油(例如矿物油、橄榄油花生油、豆油和/或向日葵油)和/或合成聚合物,如聚乙烯吡咯烷酮(PVP)或聚乙二醇(PEG)。这类粘着剂可以包括石蜡烃溶剂。
[0116] 在一些实施方案中,本文中提供的微生物组合物可以包含一种或多种麦芽糖糊精(例如具有约3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24或25的右旋糖当量值(DEV)的一种或多种麦芽糖糊精)。根据一些实施方案,微生物组合物可以包含
一种或多种具有约5到约6、7、8、9、10、11、12、14、15、16、17、18、19或20,约10到约11、12、14、
15、16、17、18、19或20,或约15到约16、17、18、19或20的DEV的麦芽糖糊精。根据一些实施方案,微生物组合物可以包含具有约5到约6、7、8、9、10、11、12、14、15、16、17、18、19或20,约10到约11、12、14、15、16、17、18、19或20,或约15到约16、17、18、19或20的DEV的麦芽糖糊精的组合。麦芽糖糊精的非限制性实例包括 M040(DEV=5;分子量=3600;Grain 
Processing Corporation、Muscatine、IA)、 M100(DEV=10;分子量=1800;
Grain Processing Corporation、Muscatine、IA)、 M150(DEV=15;分子量=
1200;Grain Processing Corporation、Muscatine、IA)、 M180(DEV=18;分
子量=1050;Grain Processing Corporation、Muscatine、IA)、 M200(DEV=
20;分子量=900;Grain Processing Corporation、Muscatine、IA)、 M250
(DEV=25;分子量=720;Grain Processing Corporation、Muscatine、IA);MALTRIN 
M580(DEV=16.5-19.9;Grain Processing Corporation、Muscatine、IA);MALTRIN 
M585(DEV=15.0-19.9;Grain Processing Corporation、Muscatine、IA);MALTRIN 
M600(DEV=20.0-23.0;Grain Processing Corporation、Muscatine、IA); Plus 
15DE(Ingredion Inc.、Westchester、IL);以及其组合。
[0117] 根据另一广泛方面,提供包含具有植物、植物部位或植物种子的组合物,本文中描述的微生物菌株或分离株与所述植物、植物部位或植物种子结合在一起或施加于所述植物、植物部位或植物种子。根据本文中描述的实施方案,可以用组合物或制剂处理或与组合物或制剂结合在一起的植物或作物植物可以包括多种单子叶(单子叶植物)和双子叶(双子
叶植物)农业植物。实例可以包括中耕作物,如大豆、棉花、加拿大油菜、糖用甜菜、紫花苜蓿和蔬菜。其他实例包括:苋科(例如牛皮菜、菠菜、糖用甜菜、奎奴亚藜)、菊科(例如朝鲜蓟、紫菀、甘菊、菊苣、菊花、大丽花、雏菊、紫锥花、一枝黄花、银胶菊、莴苣、金盏花、红花、向日葵、百日草)、十字花科(例如芝麻菜、花茎甘蓝、白菜、抱子甘蓝、卷心菜、花椰菜、芸苔、羽衣甘蓝、日本萝卜、独行菜、辣根、无头甘蓝、芥菜、萝卜、油菜籽、芜菁甘蓝、芜菁、芥末、水田芥、拟南芥)、葫芦科(例如棱瓜、黄瓜、香蜜瓜、甜瓜、南瓜(例如小青南瓜、胡桃南瓜、夏南瓜)、西瓜、西葫芦)、蝶形花科(例如紫花苜蓿、豆子、角豆树、苜蓿、瓜尔豆、小扁豆、豆科灌木、豌豆、花生、大豆、罗望子、黄芪胶、野豌豆)、锦葵科(例如可可豆、棉花、榴莲、木槿、红麻、可乐果、秋葵)、禾本科(例如竹、大麦、玉米、fonio、草坪植物(例如,巴哈雀稗、狗牙根、蓝草、野牛草、蜈蚣草、牛毛草或结缕草)、小米、燕麦、观赏禾草、水稻、黑麦、高粱甘蔗、黑小麦、小麦和其他禾谷类作物、蓼科(例如荞麦)、蔷薇科(例如杏仁、苹果、杏子、黑莓、蓝莓、樱桃、桃子、李子、榅桲、悬钩子、玫瑰花、草莓)、茄科(例如灯笼椒、智利辣椒、茄子、矮牵牛、马铃薯、烟草、番茄)和葡萄科(例如葡萄)。还提供取自或来源于任何前述植物的植物部位或植物种子。
[0118] 如本文所用,“植物部位”是指植物的任何器官或完整组织,诸如分生组织、枝器官/结构(例如,叶、茎和节)、根、花或花器官/结构(例如,苞片、萼片、花瓣、雄蕊、心皮、花药和胚珠)、种子(例如,胚芽、胚乳和种皮)、果实(例如,成熟子房)、繁殖体、或其他植物组织(例如,维管组织、皮组织、基本组织等)、或其任何部分。植物部位可以是有生活力的、无有生活力的、可再生的和/或不可再生的,并且植物部位可以在一些情况下发育、再生和/或生长成一棵植物,视情况而定。“繁殖体”可以包括能够成生长成为全部植物的任何植物部位,并且根据具体植物种可以包括例如插枝、根茎和块茎。可以用微生物组合物处理或与微生物组合物结合在一起的植物部位可以还包括其他培养的植物组织或繁殖材料,如体细胞
和愈伤组织,其可以再生、发育或生长成一棵植物。
[0119] 植物、植物部位或植物种子可以是转基因的或非转基因的和/或含有一种或多种遗传变化或突变。“植物”是指在任何一个发育阶段的植物,包括胚芽、幼苗和成熟植物,无论是从种子生长或发育,从培养的组织再生,还是以任何方式繁殖。
[0120] 在一些实施方案中,可以用微生物组合物处理或与微生物组合物结合在一起的植物、植物部位或植物种子可以包括商业产品,如植物种子由Monsanto Company(St.Louis,
MO)出售,或其他产品,如以
RIB ROUNDUP  VT DOUBLE  VT TRIPLE 
BOLLGARD  ROUNDUP READY 2 、 ROUNDUP 
2XTENDTM、INTACTA RR2 VISTIVE  和/或XTENDFLEXTM商标名称出售或分配
的商业种子。
[0121] 如本文中使用,关于本文中描述的微生物组合物或菌株/分离株和植物、植物部位或植物种子的短语“与...结合”,“与...结合在一起”或“与其相关”是指至少毗连或紧密接近微生物组合物或菌株/分离株和植物、植物部位或植物种子。这种毗连可以通过将微生物组合物或菌株/分离株接触或施加于植物、植物部位或植物种子,如通过用微生物组合物喷洒或涂布植物、植物部位或植物种子,通过以叶涂覆的方式涂覆到一个或多个植物地上组
织,和/或通过将微生物组合物施加到在植物、植物部位或植物种子种植、生长或将种植或生长的部位置处、附近或周围的土壤或生长培养基来实现。根据许多实施方案,微生物组合物以涂层的形式施加到植物部位或植物种子的外表面,其可以作为植物部位或植物种子的
最外层或全部层存在。根据其他实施方案,微生物组合物可以以叶喷洒或土壤浇灌或施加
的方式来施加在植物作物基部处或附近。根据一些实施方案,微生物组合物可以在植物种
子的种植之前、与其同时或在其之后施加在植物在土壤中或地上的位置处或附近。
[0122] 从用微生物组合物处理或与其结合在一起的种子生长的植物和/或在发育的任何一个或多个阶段用微生物组合物处理的植物可以具有改善的农业性状或特征,诸如增加的
抗病性、疾病耐受性、疾病防治、生长、茁壮、可直立性耐逆性、抗倒伏性和/或产量。此类植物还可具有一种或多种其他有益性状,如增加或改善的生物量、碳水化合物生物合成、叶绿素含量、耐寒性、耐旱性、耐盐性、植物高度、叶长、叶质量、叶数、叶表面积、叶片体积、营养素吸收(如钙、镁、氮、磷和/或钾吸收)、光合作用速率、根面积、根直径、根长、根质量、根结瘤(如结节质量、结节数、结节体积)、根数、根表面积、根体积、耐盐性、种子萌发、幼苗出苗、枝条直径、枝条长度、枝条质量、枝条数、枝条表面积、枝条体积、扩展和/或气孔导度。改善的性状可以直接由于改善的营养素有效性和/或土壤性状。相较于未用微生物组合物处理
的对照植物,这类性状可以增加或改善至少5%、10%、15%、20%、25%、30%、35%、40%、
45%、50%、55%、60%、65%、70%、75%、80%、85%、90%、95%、100%、105%、110%、
115%、120%、125%、150%、175%或200%(或更高)。
[0123] 从用微生物处理或与微生物结合在一起的种子生长的植物和/或在发育的任何一个或多个阶段用本文中描述的微生物组合物处理的植物可具有一个或多个改善的植物性
状或特征。这类改善的性状可以包括以下中的一种或多种:抗病性增加、疾病防治、产量增加、生物量增加、每英亩的蒲式耳数增加、每块样地或每株植物的粒重增加、营养素含量改善、抗倒伏性较强、根长增加、植物生长或活力改善、耐逆性增加、收获指数增加、鲜穗重量增加、穗长增加、穗直径增加、穗重量增加、种子大小增加、种子数量增加、豆荚、圆荚或角果的数量增加、种子重量增加和/或每英亩的蒲式耳数增加(或其他测量领域)。这类植物可具有抗病性,相较于未用微生物组合物处理的对照植物,其在疾病条件下改善产量至少1%、
2%、3%、4%、5%、10%、15%、20%、25%、30%、35%、40%、45%、50%、55%、60%、65%、
70%、75%、80%、85%、90%、95%、100%、105%、110%、115%、120%、125%、150%、175%或200%(或更多)。根据一些实施方案,抗病性可以导致这类植物产量增加或改善至少每亩
0.5、1、1.5、2、2.5、3、3.5、4、4.5、5、5.5、6、6.5、7、7.5、8、8.5、9、9.5、10、11、12、13、14或15蒲式耳。
[0124] 根据另一个方面,提供用于制造微生物组合物和制剂的方法。可以应用或使用任何合适的添加顺序将微生物菌株或分离株与一种或多种合适的成分、载剂、溶剂、杀虫剂等组合。如上所述,可以将多种不同的载剂、分子,溶剂等可与微生物菌株或分离株组合以制造组合物或制剂。添加顺序和成分的合适组合可取决于在储存、分配或使用期间维持组合
物或制剂中微生物菌株或分离株的活力的能力。可以选择或设计组合物或制剂以在储存、
分配和/或放置或者与植物、植物部位或植物种子结合在一起的使用期间维持微生物菌株
或分离株的活力、稳定性和/或储存期。
[0125] 还提供对植物部位或植物种子施加微生物组合物的方法。还提供对植物部分或植物种子施用微生物组合物的方法。微生物组合物可以以覆盖植物部位或植物种子的至少一
些、大部分或全部外表面的涂层的形式施加。微生物组合物的涂层可以呈一个或多个层,如一个、两个、三个、四个、五个或更多个层施加,并且可以构成多个层中的至少一个。将微生物组合物以作为与一个或多个其他涂层不同的层的形式施加到植物部位或植物种子可以
允许某些物质如杀菌剂、杀真菌剂等与微生物组合物分离或隔绝以改善微生物菌株或分离
株的存活或活力。涂层厚度可以变化,如厚度在约1.5到约3.5μm范围内。微生物组合物可以以液体或粉末的形式施加于植物部位或植物种子。根据一些实施方案,微生物组合物或涂
层可以包含每个植物部位或植物种子约10到约1×1015个菌落形成单位(cfu),如每个植物
部位或植物种子至少1×102、1×103、1×104、1×105、1×106、1×107、1×108、1×109、1×
1010、1×1011、1×1012或1×1013(或更多)cfu。
[0126] 根据施加方式,微生物组合物可以在20℃、21℃、22℃、23℃、24℃、25℃、26℃、27℃、28℃、29℃和/或30℃下、可能甚至在干燥或除湿之后是无定形液体或固体,并且具有50%、55%、60%、65%、70%、75%、80%或85%(或更多)相对湿度。
[0127] 本领域已知许多用于将液体或粉末组合物或制剂施加到固体表面如植物材料或种子的外表面的方法,如固体基质引发、吸涨、涂布、喷雾、喷洒,如通过冷冻干燥、喷雾干燥或喷雾冷冻干燥、滴液、浸泡、浸渍、喷粉或封装,其还可以将组合物或制剂引入植物材料的一个或多个内部组织,如植物部位或种子的一个或多个内部组织中。可以使用喷嘴或旋转
盘施加组合物。可以在将材料或种子在合适的设备件(如转筒或盘式制粒机)中搅拌的同时
将组合物喷洒到植物材料或种子上。或者,组合物可以在施加于植物材料之前被冷冻干燥、喷雾干燥或喷雾冷冻干燥。可以使用将预定批大小的材料和组合物输送到转筒、混合器或
盘式造粒机中的分批或半分批系统,其中可以在使植物材料或种子被均匀施加或涂布的速
率下将已知体积的微生物组合物引入到处理设备中。
[0128] 在一些实施方案中,微生物组合物可通过本领域已知的任何标准处理方法施用于植物或植物材料,例如一个或多个植物部位或植物种子,所述方法包括但不限于上面列出
的那些和其他标准或常规方法,如在容器(例如瓶子或袋子)中混合、机械施加、翻滚、喷洒、浸渍、固体基质引发等。也可以使用其他常规涂覆方法和机械,如流化床技术、辊磨法、旋转式种子处理器和鼓式涂布机。任何常规的活性或惰性材料可用于将种子与种子处理组合物
接触,如常规的膜涂布材料,包括但不限于水基膜涂布材料。根据一些实施方案,通过将本文所述的组合物施用于圆形容器的内壁、添加植物材料并且将容器旋转使得材料与组合物
接触来涂布植物材料(例如,植物部位或种子),这个过程在本领域中被称为“容器涂布”。还可以使用连续处理系统,其被校准以在与连续材料流(例如植物种子)成比例的预定速率下
施加组合物。种子涂布方法和针对其应用的设备公开于例如美国专利号5,918,413、5,891,
246、5,554,445、5,389,399、5,107,787、5,080,925、4,759,945和4,465,017等等,它们的内容和公开内容以引用的方式并入本文中。
[0129] 根据一些实施方案,用于施加于植物或植物材料如植物部位或种子的包含微生物菌株或分离株的组合物可以通过使用固体基质引发来引入到织物材料上或中。例如,可以
将一定量的处理组合物与固体基质材料混合,并且可以将植物材料放置成与固体基质材料
接触,持续一段时间,以使处理微生物被引入到植物材料。然后可以任选地将植物材料与固体基质材料分开并且储存或使用,或者可以直接种植固体基质材料加种子/植物部位的混
合物。固体基质材料可以包括聚丙烯酰胺、淀粉、粘土、二氧化硅、矾土、土壤、沙、聚脲、聚丙烯酸酯和/或任何能够吸收或吸附处理组合物一段时间然后将组合物释放到植物材料中或
上的材料。确保微生物和固体基质材料彼此相容是适用的。
[0130] 根据其他实施方案,可以通过在处理组合物中涨来用微生物组合物处理植物材料,如植物部位或种子。例如,可以将植物材料直接在处理组合物中浸渍一段时间。在植物材料浸渍的时间段内,植物材料可以吸收或吸涨一部分处理组合物。可以例如通过摇动、滚动、翻滚或其他手段来搅动植物材料与处理组合物的混合物。在吸收后,可以将植物材料与处理组合物分开并且任选地干燥、储存和/或种植。
[0131] 在一些实施方案中,还可以用膜外覆层包裹处理的种子以保护杀线虫涂层。这类外覆层是本领域中已知的并且可以使用常规的流化床和鼓薄涂布技术应用。外覆层可以施
加于已用上文所述的任何种子处理技术处理的种子,包括但不限于固体基质引发、吸涨、涂布和喷洒或通过本领域已知的任何其他种子处理技术。
[0132] 在将微生物组合物施加于植物材料,如植物部位或植物种子之后,可以任选地干燥或部分干燥植物材料。
[0133] 施加于植物种子表面的微生物组合物的量可以变化,但在每个种子约0.05mg组合物到每个种子约1mg组合物,或每个种子约0.05到约0.5mg组合物的范围内。微生物组合物
还可以以每千克植物材料(例如种子)约0.5到约10毫升组合物范围内的量施加。
[0134] 在一些实施方案中,微生物组合物可以在将种子播种之前施加于植物种子。这样,可以在例如中央位置处理种子,然后被分配用于种植。这可以使得种植种子的人避免与处理和施加种子处理组合物结合在一起的难度和努力,使得可以以常规用于未处理种子的方
法种植处理的种子。
[0135] 还可以以任何合适的一个或多个量或一个或多个浓度如在每千克植物材料(例如种子)约0.5到约10克干燥混合物的量使用或施加干燥粉末(例如包含硬脂酸镁、硫酸镁、硬脂酸钙、绿坡缕石土、蒙脱土、石墨、奶粉、二氧化硅(例如,热解法二氧化硅、疏水性涂布的二氧化硅和/或沉淀二氧化硅)、大豆卵磷脂和/或滑石)。
[0136] 在一些实施方案中,微生物组合物可以包含一种或多种单糖(例如阿洛糖、阿卓糖、阿拉伯糖、果糖、半乳糖、葡萄糖、古洛糖、iodose、来苏糖、甘露糖、核糖、塔罗糖、苏糖和/或木糖)。根据一些实施方案,微生物组合物不包含葡萄糖。在一些实施方案中,微生物组合物包含一种或多种二糖(例如纤维二糖、壳二糖、龙胆二糖、gentiobiulose、异麦芽糖、曲二糖、乳糖、乳果糖、昆布二糖、麦芽糖(例如,麦芽糖一水合物、无水麦芽糖)、麦芽酮糖、甘露二糖、蜜二糖、车前二糖、黑曲霉糖、巴拉金糖、芸香糖、rutinulose、槐糖、蔗糖、海藻糖、松二糖和/或木二糖)。在一些实施方案中,组合物可以包含一种或多种低聚糖(例如低聚果糖、低聚半乳糖、低聚甘露糖和/或棉子糖)。在一些实施方案中,组合物可以包含一种或多种糖醇(例如阿糖醇、赤藓醇、岩藻糖醇、半乳糖醇、甘油、艾杜糖醇、肌醇、异麦芽糖醇(isomalt)、乳糖醇、麦芽糖醇、麦芽四糖醇、麦芽三糖醇、甘露醇、聚甘醇(polyglycitol)、核糖醇、山梨糖醇、苏糖醇、庚牙醇和/或木糖醇)。
[0137] 根据一些实施方案,微生物组合物可以在种植植物部位或植物种子之前1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、15、18、21、24、27、30、33、36、39、42、45或48小时或更长时间施加于植物部位或植物种子。微生物组合物可以在种植植物部位或植物种子之前至少1、2、3、4、5、6、
7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、20、21、22、23、24、28、32、36、40、44、48、52、56、60、
64、68、72、76、80、84、88、92、96或100周施加于植物部位或植物种子。根据一些实施方案,微生物组合物可以在种植之前1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、
21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41或42个月或更长时间施加于植物部位或植物种子。根据其他实施方案,微生物组合物可以在种植前至少1、
2、3、4或5年施加于植物部位或植物种子。
[0138] 根据一些实施方案,微生物组合物可以是两种或更多种可以组合或分别施加于植物或植物材料如植物部位或植物种子的组合物或制剂中的一种。例如,微生物组合物或制
剂可以与含有粘着剂的组合物或制剂合并,之后将合并的组合物/制剂施加于植物材料如
植物、植物部位或植物种子。当使用两种组合物时,两种组合物之间的重量或体积比可以是约1:20到约20:1、约1:10到约10:1,或约1:5、1:3、1:2、2:1、3:1或5:1变化的。可以将微生物组合物和另外的组合物混合并同时施用于植物材料,或者可以连续施用两种或更多种组合
物中的一种(即,可以首先施用微生物组合物或另外的组合物,然后施用另一种),这可在植物材料上产生涂层。例如,另外的组合物可以在先前施加的微生物组合物周围提供保护层,或者可以首先施加另外的组合物以改善微生物组合物与植物材料的结合或粘附。如果合并
的组合物可能导致微生物降解或丧失活力,那么可以在施用于植物材料之前混合两种或更
多种组合物。根据一些实施方案,包含微生物菌株或分离株的固体或干燥制剂或粉末可以
在一种或多种液体溶剂中重构,以用于进一步与其他成分一起配制和/或施加于植物、植物部位或植物种子。微生物组合物还可以与许多可商购获得的种子修整机如PERIDIAMTM、
PRECISETM等合并以用于用种子修整机将合并的组合物施加于植物、植物部位或植物种子。
[0139] 进一步提供了用于将微生物组合物施用于植物的叶组织或生长培养基或土壤的方法,其可包括将微生物组合物施加于植物根或根组织。“生长培养基”可以包括土壤和本领域已知的任何其他培养基,其通过提供用于根生长的培养基、基质或底物来允许植物生
长。微生物组合物可以在种植之前、与种植时间同时或接近种植时间,例如在垄沟内,或在种植之后(包括在植物生长的后期阶段)施加于生长培养基或土壤。根据一些实施方案,微
生物组合物可以直接施加于种植种子或植物根区处、附近或周围的土壤。根据一些实施方
案,微生物组合物可以直接施加于植物叶组织(例如叶、茎等)。
[0140] 微生物组合物向植物或土壤或生长培养基的这种施加可以使用本领域已知的任何方法或设备进行,包括但不限于手动喷洒器、机械洒水器或喷洒器、加压喷洒器、注射、移植水系统、植物/根浸或通过灌溉包括滴灌。实际上,组合物可以通过喷洒、浇灌和/或其他液施方式施加于植物、种子和/或土壤或生长培养基周围。
[0141] 在一些实施方案中,包含微生物菌株或分离株的组合物可以用于改善植物的一种或多种农业性状。从用微生物组合物处理或与其结合在一起的种子生长的植物和/或在发
育的任何一个或多个阶段用微生物组合物处理的植物可以潜在的具有改善的农业特征,如
增加或改善的抗病性、生长、活力、耐逆性、萌发、可直立性、抗倒伏性、营养素吸收、植物营养素和/或产量。植物的改善的农业特征可以间接地由改善的营养素有效性和/或土壤特征
引起。因此,提供用于在田地或受控环境中种植用微生物组合物处理或与其结合在一起的
植物种子或可再生植物部位并且使植物从处理的植物种子或植物部位生长的方法。或者,
植物种子或可再生植物部位可以种植在田地或受控环境中,并且微生物组合物可以在种植
之前、期间或之后施用于种子处或种子附近的土壤,和/或微生物组合物可以在发育的后期阶段例如通过叶喷洒施加于植物。根据一些实施方案,提供用于通过种植已用微生物组合
物处理的种子或植物部位,或通过在种植植物和使植物从其生长、再生或发育之前、期间或之后将微生物组合物施加于土壤、种子或植物来改善植物的一个或多个农业性状如增加的
抗病性或疾病防治的方法。
[0142] 在一些实施方案中,通过这些方法生长的植物可以具有一个或多个改善的植物性状或特征,如抗病性或疾病耐受性改善。抗病性、疾病防治或疾病耐受性改善可以给予植物其他有利的性状或益处,如相较于对照植物增加的产量。在某些实施方案中,用本文中提供的微生物菌株或分离株处理的植物可以表现出相较于未处理的对照植物增加的对大豆SDS
或腐霉菌引起的疾病的抗性、防治或耐受性。相较于未用微生物组合物处理的对照植物,在疾病压力下,此类对植物疾病的抗性或耐受性以及其他植物产量性状或特征可以改善或增
加至少1%、2%、3%、5%、10%、15%、20%、25%、30%、35%、40%、45%、50%、55%、60%、
65%、70%、75%、80%、85%、90%、95%、100%、105%、110%、115%、120%、125%、150%、
175%或200%(或更多)。
[0143] 通过这些方法生产的成熟植物可以具有一个或多个另外的农业性状,如增加或改善的产率、生长、生物量、萌发、植物群丛计数(plant stand count)、抗倒伏性、碳水化合物生物合成、叶绿素含量、活的绿色植被或叶子、耐寒性、耐旱性、耐盐性、高度、叶长、叶质量、叶数、叶表面积、叶片体积、叶幕、营养素吸收(例如叶或其他植物组织中增加的铵、钙、镁、氮、硝酸盐、磷酸盐、铁、锰、磷、锌、钠、硼、铜、硫和/或钾吸收和/或存在)、光合作用速率、根面积、根直径、根长、根质量、根结瘤(如结节质量、结节数、结节体积)、根数、根表面积、根体积、耐盐性、种子萌发、幼苗出苗、枝条直径、枝条长度、枝条质量、枝条数、枝条表面积、枝条体积、扩展和/或气孔导度。相较于未用如本文所述的微生物组合物处理的对照植物,这类性状可以增加或改善至少1%、2%、3%、5%、10%、15%、20%、25%、30%、35%、40%、
45%、50%、55%、60%、65%、70%、75%、80%、85%、90%、95%、100%、105%、110%、
115%、120%、125%、150%、175%或200%(或更高)。
[0144] 通过本文中描述的方法生长的植物可以具有一种或多种改善的植物产量性状或特征:如产量增加、生物量增加、每块样地或每株植物的粒重增加、营养素含量改善、抗倒伏性较强、根长增加、植物生长或活力改善、耐逆性增加、收获指数增加、鲜穗重量增加、穗长增加、穗直径增加、穗重量增加、种子数量增加、种子重量增加、种子大小增加和/或每英亩(或根据其他面积测量)的蒲式耳数增加。相较于未用如本文所述的微生物组合物处理的对
照植物,这类植物产量性状或特征可以改善或增加至少1%、2%、3%、5%、10%、15%、
20%、25%、30%、35%、40%、45%、50%、55%、60%、65%、70%、75%、80%、85%、90%、
95%、100%、105%、110%、115%、120%、125%、150%、175%或200%(或更高)。
[0145] 根据一些实施方案,提供了用于在一个或多个地理位置或位置中将微生物菌株或分离株施加于植物、植物部位或植物种子或者与它们结合在一起或者施加于与植物、植物
部位或植物种子相关联的生长培养基或土壤的方法。微生物菌株或分离株可能对一个或多
个地理位置或位置的植物的抗病性有正面作用,这可能取决于特定的作物植物和在这些地
理位置或位置处每年环境条件的变量范围。可能对植物的抗病性产生影响的环境因素,如
病原体存在的范围、病原体载体、不同的土壤类型和化学性质、天气条件、周围的微生物组等,可以在位置之间有显著不同。因此,如本文所述的微生物菌株或分离株可以在一个或多个地理位置或位置中根据其在此类地理位置或位置处的活性和对植物特征的作用,如增加
的产量、耐逆性等,施加于植物、植物部位或植物种子或与其结合在一起。根据特定的地理位置和位置,可以使用不同种质或成熟组的作物植物。因此,包含微生物菌株或分离株的组合物可以施加于(例如涂布到)作物植物、植物部位或植物种子或与其结合在一起,所述作
物植物、植物部位或植物种子对于种植所述作物植物、植物部位或植物种子的具体地理位
置具有合适的种质和相对成熟度。
[0146] 根据一些实施方案,提供用于通过在一个或多个地理区域中将本公开的微生物菌株或分离株施加于植物、植物部位或植物种子或与它们结合在一起或者施加于与植物、植
物部位或植物种子相关联的生长培养基或土壤来改善作物植物的抗病性或疾病耐受性的
方法,所述地理区域包括但不限于以下的农业区域:阿富汗、阿根廷、澳大利亚、孟加拉国、白俄罗斯、玻利维亚、波斯尼亚和黑塞哥维那、巴西、加拿大、智利、中国、哥伦比亚、刚果、厄瓜多尔、埃及、埃塞俄比亚、欧洲(例如,以下中一个或多个的农业区域:奥地利、比利时、保加利亚、缅甸、克罗地亚、捷克共和国、塞浦路斯、丹麦、爱沙尼亚、芬兰、法国、德国、希腊、匈牙利、爱尔兰、意大利、拉脱维亚、立陶宛、卢森堡、马尔他、荷兰、波兰、葡萄牙、罗马尼亚、斯洛文尼亚、斯洛伐克、西班牙、瑞典、瑞士和/或联合王国)、岛、印度、印度尼西亚、伊朗、伊拉克、日本、哈萨克斯坦、肯尼亚、马拉维、墨西哥、摩洛哥、尼泊尔、尼日利亚、挪威、巴基斯坦、巴拉圭、秘鲁、菲律宾、俄国、塞尔维亚、南非、台湾、坦桑尼亚、泰国、土耳其、乌干达、乌克兰、乌兹别克斯坦、委内瑞拉、越南、赞比亚、津巴布韦和/或美国(例如以下中的一个或多个的农业区域:阿肯色州、科罗拉多州、爱达荷州、伊利诺斯州、印地安那州、爱荷华州、堪萨斯州、肯塔基州、路易斯安那州、马里兰州、密歇根州、明尼苏达州、密西西比州、密苏里州、蒙大拿州、内布拉斯加州、北卡罗来纳州、北达科他州、俄亥俄州、俄克拉荷马州、南达科塔州、田纳西州、得克萨斯州、华盛顿州和/或威斯康星州)。
[0147] 根据一些实施方案,提供用于通过在美国的一个或多个地理区域中将本公开的微生物菌株或分离株施加于双子叶植物或大豆植物、植物部位或植物种子或者与它们结合在
一起或施加于与双子叶植物或大豆植物、植物部位或植物种子相关联的生长培养基或土壤
以改善作物植物的抗病性来改善双子叶植物或大豆作物植物的植物生长和/或产量的方
法,诸如像在包括爱荷华州、密歇根州、明尼苏达州、南达科塔州和/或威斯康星州中的一个或多个的农业区域的北部区域;在包括伊利诺斯州(例如,伊利诺斯州北部和/或伊利诺斯
州中部)、印第安纳州(例如印第安纳州北部)、俄亥俄州和/或内布拉斯加州中的一个或多
个的农业区域的中部区域;和/或在包括阿肯色州、伊利诺斯州(如伊利诺斯州南部)、印第安纳州(如印第安纳州南部)、堪萨斯州、肯塔基州、路易斯安那州、密苏里州(如密苏里州中部和/或南部)、密西西比州(例如,密西西比州北部和/或南部)、北卡罗来纳州和/或田纳西州中一个或多个的农业区域的北部区域。北达科他州任选地还为部区域的一部分;堪萨斯
州(例如堪萨斯州北部)和/或密苏里州(例如密苏里州北部)可以任选地还为中部地区的一
部分;和/或亚拉巴马州(例如亚拉巴马州北部和/或南部部)、格鲁吉亚(例如格鲁吉亚北
和/或南部)、马里兰周、俄克拉荷马州、卡罗莱纳州南部、得克萨斯州和/或弗吉尼亚州任选地也可以为南部地区的一部分。
[0148] 根据一些实施方案,提供用于通过在一个或多个位置或地理位置中将本公开的微生物菌株或分离株施加于作物植物、植物部位或植物种子或与它们结合在一起或者施加于
与作物植物、植物部位或植物种子相关联的生长培养基或土壤来改善作物植物的抗病性的
方法,所述位置或地理位置具有一个或多个环境性质、特征或生长条件,所述环境性质、特征或生长条件可能在一年或生长季节内每个季度、每月、每月、每周或每天均不同,诸如较高或较低平均湿度、较高或较低平均降雨量、潮湿、干燥或干旱条件和/或各种土壤性质和特征。
[0149] 根据一些实施方案,提供用于通过在一个或多个位置或地理位置中将本公开的微生物菌株或分离株施加于作物植物、植物部位或植物种子或与它们结合在一起或者施加于
与作物植物、植物部位或植物种子相关联的生长培养基或土壤来改善作物植物的抗病性的
方法,所述位置或地理位置具有或预期具有疾病压力或增加的疾病压力,如增加的真菌、镰刀菌、腐霉菌和/或SDS疾病。
[0150] 根据一些实施方案,提供用于通过将本公开的微生物菌株或分离株施加于植物、植物部位或植物种子或与它们结合在一起或施加于与植物、植物部位、或植物种子相关联
的生长培养基或土壤来增加作物植物的抗病性的方法,其中相对于农业位置或区域的这种
特征的平均值,所述与植物、植物部位或植物种子相关联的生长培养基或土壤具有以下特
征中的一个或多个:较高或较低(包括相对量)砂、淤泥、粘土、壤土和/或有机物质、精细或粗糙的纹理、USDA土壤分类、较高或较低的电导率、较高或较低pH和/或pH缓冲容量,较高或较低的阳离子交换容量(CEC)、较高或较低的通气量、较高或较低的持水能力、较高或较低的排水、以及较高或较低的常量营养素和/或微量营养素如铵、硝酸盐、磷酸盐、钾、铁、锰、镁、钙、锌、钠、硼、铜、硫和/或硫酸盐,各自以各种已知的形式和化合物。植物生长培养基或土壤还可以根据前述土壤性质或特征中的一个或多个的测量、范围、程度和/或相对量或比率来定义,包括相对于对于作物植物来说是理想、最佳或正常的不足或优势。
[0151] 本公开的微生物组合物可以用于增加或提高作物植物在各种生长条件下的抗病性、植物生长和/或产量,包括但不限于营养不足(例如钙、铁、锰、镁、氮、磷、钾和/或硫不足)、湿度极限、pH值极限、端温度极限(例如平均白天温度低于60℃、61℃、62℃、63℃、64℃、65℃、66℃、67℃、68℃、69℃、70℃、71℃、72℃、73℃、74℃或75℃℃,平均白天温度高于
85℃、86℃、87℃、88℃、89℃、90℃、91℃、92℃、93℃、94℃、95℃、96℃、97℃、98℃、99℃、
100℃或更高,平均夜间温度低于50℃、51℃、52℃、53℃、54℃、55℃、56℃、57℃、58℃、59℃、60℃、61℃、62℃、63℃、64℃、65℃、66℃、67℃、68℃、69℃或70℃,平均夜间温度高于70℃、71℃、72℃、73℃、74℃、75℃、76℃、77℃、78℃、79℃、80℃、81℃、82℃、83℃、84℃、85℃或更高等)和干旱情况(例如在生长季节降雨量小于5、6、7、8、9、10、11、12、13、14或15英寸)。应理解,构成营养素不足、温度极限、干旱情况的任一决定因素均可解释植物种任何决定营养不足、极端温度、干旱情况等的因素可以说明生长的植物种/多样性,因为不同的种/种类可以具有不同的偏好和最佳产量必要条件。
[0152] 还提供包含微生物组合物的容器和试剂盒,其包含本文中描述的微生物组合物。试剂盒可以还包括其他组合物和使用微生物组合物的说明,如结合农场实践。容器可以包
括袋子或其他容器或包裹物,其含有本文中提供的微生物组合物的干燥制剂或粉末,并且
罐子或其他容器可以含有微生物组合物的液体制剂。还提供具有用微生物组合物处理或涂
布的种子或其他植物材料的袋子或其他容器或包裹物。
[0153] 生物材料的保藏
[0154] 出于专利程序和据此的法规(布达佩斯条约)的目的根据布达佩斯条约,纯化的本文鉴别为MON 201510的微生物菌株单培养物保藏于美国典型培养物保藏中心(ATCC),
10801University Blvd.,Manassas,VA 20110-2209。保藏物的登录号是PTA-123716。保藏
日期是2016年12月16日。微生物菌株已在确保培养物在本专利申请未决期间可根据
37C.F.R.§1.14和35U.S.C.§122供专利商标局长赋予权力的人员使用的情况下保藏。保藏
物表示基本上纯的所保藏菌株培养物。根据本申请或接续案的复本所提交国家的外国专利
法的规定,保藏物是可供使用的。然而,应理解,保藏物的可用性并不构成在违反政府授予的专利权下实践本发明的许可
[0155] 本文中提供的微生物可以具有保藏菌株的一个或多个鉴别特征并且具体地说,能够赋予如本文中描述的植物增加的抗病性的能力的鉴别特征。在一些实施方案中,本文中
提供的微生物包括如上所述的保藏微生物以及其突变体、变体或衍生物。
[0156] 实施例
[0157] 实施例1.MON 201510的来源和分离
[0158] 使用从美国爱荷华州当地的草原获得的土壤,从在受控环境中生长的作物植物的根际分离出微生物菌株MON 201510。通过连续稀释到R2A培养基(0.5g酪蛋白氨基酸、0.5g
右旋糖、0.5g蛋白胨、0.5g可溶性淀粉、0.5g酵母提取物、0.5g专用钠、0.3g K2HPO4、0.05g MgSO4·7H2O、15g琼脂和最终体积1000mL的水)来从收集的样品中分离出菌株。挑选出出从
超声处理的细胞浆液在培养基表面上形成的个别菌落以用于进一步分析。
[0159] 实施例2.MON 201510的鉴别和测序
[0160] 通过16S核糖体DNA(rDNA)测序鉴别MON 201510分离株是绿针假单胞菌。通过相关16S rDNA序列的全基因组下一代测序(NGS)和推演来确定16S rDNA序列。MON 201510分离
菌株的16S rDNA序列提供为SEQ ID NO:1。
[0161] 实施例3.对MON 201510进行的针对控制大豆猝死综合征(SDS)的生长室测定
[0162] 使分离的MON 201510菌株在液体培养物中生长,然后在使用前在15%甘油中冷冻。在播种时,将大豆种子以肉汤浇灌的方式用MON 201510分离菌株的解冻肉汤悬浮液处
理,并且在生长室内进行的接种疾病实验中的四项研究中进行评估。相同的大豆品种用于
所有实验(成熟组3.4)。使用灭菌的高粱颗粒(其已经预先由SDS病原体枝状镰孢菌定殖),
在即将种植前接种实验点。不处理和接种对照植物。使用顺序量表(1-6)在接种后五周进行疾病评估,其中1相当于无症状植物并且5相当于完全萎黄病和/或坏死的植物。评级6指示
未能萌芽。
[0163] 所有实验均利用随机完全区集设计。试验含有多个对照点,通过重复来取平均值。与对照植物比较微生物处理对SDS疾病严重程度的影响。如表1中所示,在所有四项研究中,相对于对照植物,从用MON 201510分离株肉汤处理的大豆种子生长的植物具有显著降低(p
≤0.1)的SDS疾病严重程度,平均降低1.9个评级点。
[0164] 表1:相较于对照物的SDS疾病严重程度评级点降低
[0165]微生物 研究1 研究2 研究3 研究4
MON 201510 1.4 1.3 2.2 2.8
[0166] 在用与上文所提供类似的设计进行的单独实验中,以土壤浇灌或种子处理的方式用浓缩的MON 201510分离菌株的解冻肉汤悬浮液处理大豆种子,并且在生长室中进行的接
种疾病实验中的两项研究中进行评估。如表2中所示,相对于具有两种类型施加的未处理的对照植物,从以种子处理或浇灌的方式用MON 201510分离株处理的种子生长的大豆植物具
有显著降低(p≤0.1)的SDS疾病严重程度,其中平均降低1.6个评级点,其在这项研究中与
通过标记用于大豆植物的市售杀真菌剂所提供的功效(资料未显示)相当。
[0167] 表2:相较于对照物的SDS疾病严重程度评级点降低
[0168]
[0169] 实施例4.对MON 201510的早期幼苗疾病测定
[0170] 在由早期幼苗疾病病原体畸雌腐霉感染的条件下,在田地中测试用MON 201510处理的大豆种子。在单行样地中的14个位置进行测试,其中未接收微生物的对照物配对并且
重复1次。这种配对样地、单行设计实现微生物处理与对照物的并行比较。所有样地在垄沟中用病原体接种。通过多光谱成像,在V3和V6下评估微生物处理对座位的影响,并且与对照植物比较。如表3中所示,在用病原体畸雌腐霉感染的条件下,相对于对照植物,从用MON 
201510分离株处理的大豆种子生长的植物具有增加的叶面积指数(LAI)。LAI定义为阔叶树
2 2
冠中每单位地表面积的一侧绿叶面积(LAI=叶面积/地表面积,m/m)。
[0171] 表3:在畸雌腐霉感染的条件下大豆LAI增加
[0172]微生物 LAI数据 p值
MON 201510 2.2 0.01
[0173] 尽管已参考某些实施方案公开本发明,但显而易见的是,可以在不偏离如本文中公开和如随附权利要求书提供的本发明的精神和范围的情况下作出修改和变化。此外,应
理解,虽然公开中的所有实施例说明了本发明的实施方案,但它们仅是作为非限制性实施
例而提供,因此不应视为限制由此说明的本发明的各个方面。本发明意图具有由本公开、以下权利要求书的语言及其任何等效物界定的全部范围。因此,附图和详述应被视为是说明
性的而不是限制性的。
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