专利汇可以提供山羊资源群体的构建方法专利检索,专利查询,专利分析的服务。并且本 发明 属于群体遗传资源库的构建领域,提供了一种科学地山羊资源群体库的构建方法,提供了一个山羊参考家系构建案例,涉及两个国家级遗传资源品种——大足黑山羊和内蒙古绒山羊(阿拉善型)。该资源群体构建利用大足黑山羊和内蒙古绒山羊(阿拉善型)正、反交,F1避免亲缘关系随机交配,使孟德尔遗传性状出现分离,然后利用基因组手段 定位 山羊经济性状QTL或功能基因,为山羊育种提供相对精确的遗传标记。该遗传资源库包括山羊群体、系谱信息 数据库 、表型性状数据库、DNA样本库、RNA样本库和遗传变异信息数据库。,下面是山羊资源群体的构建方法专利的具体信息内容。
1.一种山羊遗传资源库构建方法,涉及研究国家遗传资源大足黑山羊和内蒙古绒山羊
(阿拉善型)性状机理的参考家系的构建,其特征在于:
一、拟定资源群体构建方案,制定基本体征信息记录表、产绒性能记录表、产肉性能记
录表、繁殖性能记录表、皮用性能记录表等,准备样本采集试剂耗材,实验人员分组;
二、按照资源群体构建方案要求购买无血缘关系亲代大足黑山羊和内蒙古绒山羊(阿
拉善型),分别用大足黑山羊公羊(D)与内蒙古绒山羊(I)母羊进行正交,大黑山羊母羊(D)与内蒙古绒山羊公羊(I)进行反交得到F1代,正、反交系后代公、母羊避免亲缘关系进行随机交配得到F2代;
三、体型组成员在山羊出生时、2月龄(断奶)、6月龄、12月龄和24月龄分别对资源群体所有个体进行基本体征普查和记录;
四、绒研组每年在山羊脱绒季节进行抓绒,并测定产绒性能所涉及的所有性状指标并
记录在案;
五、肉研组在资源群体山羊屠宰时测定并记录所有产肉性能记录表涉及的指标,并负
责采集各组织样品;
六、繁殖组负责执行涉及资源群体的同情发情技术,制定配种方案和系谱记录,并采集
繁殖性能记录表的所列繁殖性状参数;
七、皮研组负责采集所有资源群体个体皮用性能记录表所涉及的指标;
八、采血组在6月龄采集颈静脉血液(可多次采集),分别采用肝素钠抗凝、ACD抗凝和
EDTA-Na2抗凝,对血样进行编号并登记相关内容;
九、实验处理组Ⅰ负责对采血组和肉研组采集的样品进行基因组DNA和组织样RNA提
取,核对样品ID号并保存样本备用;
十、实验处理组Ⅱ负责挖掘资源群体个体SNP、SV和CNV变异数据;
十、建立系谱信息数据库:根据繁殖的配种信息相关记录建立资源群体信息数据库;
十一、建立组织样本库:将肉研组采集的组织样本装入无菌冻存管中,管身注明ID号、
组织名、采集日期等,所有组织样本按照一定顺序置于液氮保存,以备DNA或RNA提取;
十二、建立资源群体DNA样本库:将实验处理组提取的样本基因组DNA核对编号后分别
保存于-80℃超低温冰箱中(每个个体保存2份基因组DNA样本);
十三、建立资源群体RNA样本库:将实验处理组提取的RNA样本核对编号后保存于液氮
中备用;
十四、建立遗传变异信息数据库:将实验处理组Ⅱ的变异数据分类型存放于FTP服务
器;
十五、建立资源群体表型性状数据库:包括纸质版数据库和电子档数据库;2. 纸质版
数据库按照不同类别统一封存存放;电子档数据库基于纸质版记录,通过Access软件制定完成,并且刻录光盘保存;3. 并由专职研究人员负责数据库的记录管理工作;
十六、建立大足黑山羊和内蒙古绒山羊(阿拉善型)参考家系总数据库(简称为DIRF数
据库):总数据库包括系谱信息数据库、组织样品库、表型性状数据库、DNA数据库、RNA数据库和遗传变异信息数据库,汇编总数据库目录,制定总数据库查看领用规则和管理办法。
2.根据权利要求1所述大足黑山羊和内蒙古绒山羊(阿拉善型)参考家系构建方法,其
特征在于:步骤一资源群体构建方案涉及两种国家遗传资源山羊品种无血缘关系正、反交,正、反交后代避免亲缘关系随机交配;准备工作包括配种记录表、基本体征信息记录表、产绒性能记录表、产肉性能记录表、繁殖性能记录表、皮用性能记录表的制定;实验人员分组为体型组、绒研组、肉研组、繁殖组、皮研组、采血组、实验处理组Ⅰ和Ⅱ。
3.根据权利要求1所述大足黑山羊和内蒙古绒山羊(阿拉善型)参考家系构建方法,其
特征在于:步骤三体型组采集的性状包括:被毛颜色、肤色、体躯、角型、肉垂、皱纹、胡须、鼻部、胫部、耳型、蹄质、蹄型、四肢、乳房形状、乳头是否均匀、有无副乳头、角长(cm)、耳长(cm)、耳宽(cm)、体高(cm)、体重(kg)、胸围(cm)、管围(cm)、腰角宽(cm)、睾丸围(cm)、头长(cm)、头宽(cm)、体长(cm)、胸宽(cm)、胸深(cm)、十字部高(cm)。
4.根据权利要求1所述大足黑山羊和内蒙古绒山羊(阿拉善型)参考家系构建方法,其
特征在于:步骤四绒研组采集的性状包括:毛色、绒色、绒毛比、羊绒长度(μm)、羊绒细度
2
(μm)、羊绒密度(根/cm)、绒层高度(cm)、羊绒强度(CN),净绒率。
5.根据权利要求1所述大足黑山羊和内蒙古绒山羊(阿拉善型)参考家系构建方法,
其特征在于:步骤五肉研组采集的性状包括:初生重(g)、育肥始重(kg)、断奶重(kg)、育肥终重(kg)、6月龄重(kg)、宰前活重(kg)、周岁龄重(kg)、胴体重(kg)、18月龄重(kg)、屠宰率、成年重(24月龄)(kg)、胴体净肉率、胴体品质、背膘厚(cm)、肉色(5分制)、眼肌面积
2
(cm)、大理石花纹(12分制)、肋肉厚(GR值)、脂肪色泽(7分制)、肉骨比、失水率、PH值、贮藏损失率、嫩度(剪切力)、瘦肉率、肉骨比。
6.根据权利要求1所述大足黑山羊和内蒙古绒山羊(阿拉善型)参考家系构建方法,其
特征在于:步骤六中繁殖组收集的性状包括:产羔类型、羔羊性别、胎次、初生重(g)、子叶<1cm、子叶≥2-3cm、子叶≥1-2cm、子叶≥4-5cm、子叶≥3-4cm、子叶≥5cm、胎盘重(g)、子叶宽径(cm)、睾丸围(cm)、精子密度、射精量(μL)、精子活力、精子畸形率、顶体完整率、精子活力、精子生存指数、精液PH值、精液渗透压、GOT(谷草转氨酶)释放量、受胎率。
7.根据权利要求1所述大足黑山羊和内蒙古绒山羊(阿拉善型)参考家系构建方法,
其特征在于:步骤七皮研组收集的性状包括:毛卷性状、丝性、毛卷大小、毛长测定、花案面积、花案清晰度、被毛密度、皮张厚度、正身面积、板质、毛色、花纹宽度、弯曲、图案、光泽、毛色均匀度、皮张面积、皮重。
8.根据权利要求1所述大足黑山羊和内蒙古绒山羊(阿拉善型)参考家系构建方法,其
特征在于:步骤八采血组每次采集血液5ml,至少采集三次,分别置于肝素钠抗凝、ACD抗凝和EDTA-Na2抗凝。
9.根据权利要求1所述大足黑山羊和内蒙古绒山羊(阿拉善型)参考家系构建方法,其
特征在于:步骤九实验处理组Ⅰ采取酚-氯提取法提取基因组DNA,采用天根试剂盒提取组织RNA,然后分别填写DNA样本信息表和RNA样本信息表。
10.根据权利要求1所述大足黑山羊和内蒙古绒山羊(阿拉善型)参考家系构建方法,
其特征在于:步骤十的实验处理组Ⅱ利用全基因组测序和高密度芯片筛查单核苷酸多态性(Single nucleotide polymorphism, SNP)、结构变异(Structural variation, SV)和拷贝数变异(Copy number variation, CNV)等信息,这些信息按照不同类别和个体ID号存放于FTP服务器。
11.根据权利要求1所述大足黑山羊和内蒙古绒山羊(阿拉善型)参考家系构建方法,
其特征在于:步骤九、十二的组织样和RNA样均保存于液氮中。
12.根据权利要求1所述大足黑山羊和内蒙古绒山羊(阿拉善型)参考家系构建方法,
其特征在于:步骤九的DNA样保存于-80℃冰箱中。
13.根据权利要求1所述大足黑山羊和内蒙古绒山羊(阿拉善型)参考家系构建方法,
其特征在于:步骤十五中建立的表型性状数据库包括纸质版档案、录入的电子档Access数据库和刻录的光盘资料。
14.根据权利要求1所述大足黑山羊和内蒙古绒山羊(阿拉善型)参考家系构建方法,
其特征在于:步骤十六DIRF参考家系数据库包括系谱信息数据库、组织样品库、表型性状数据库、DNA数据库、RNA数据库和变异信息数据库,汇编总数据库目录,制定总数据库查看领用规则和管理办法。
15.一种大足黑山羊和内蒙古绒山羊(阿拉善型)参考家系构建方法,其特征在于:构
建了大足黑山羊和内蒙古绒山羊(阿拉善型)参考家系,构建了大足黑山羊和内蒙古绒山羊(阿拉善型)遗传资源库。
16.如权利要求1-15中任意一项所述方法或步骤在构建其他山羊群体遗传资源库中
的应用。
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