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基糖苷衍生物及其在治疗遗传性病症中的应用

阅读:969发布:2020-08-20

专利汇可以提供基糖苷衍生物及其在治疗遗传性病症中的应用专利检索,专利查询,专利分析的服务。并且本 发明 提供了如在本 说明书 中所定义的化学式Ia和Ib中所示出的多种新颖的 氨 基糖苷类,被设计成显现出终止密码子突变的通读的活性。本发明还提供了包含所述新颖的氨基糖苷类的多种药物组合物,以及其应用在 治疗 多个遗传性 疾病 和多个病症的多种用途,所述多个遗传性疾病和多个病症例如:与终止密码子突变相关的多个病症和多个疾病。,下面是基糖苷衍生物及其在治疗遗传性病症中的应用专利的具体信息内容。

1.一种化合物,其特征在于:所述化合物由化学式I表示:
化学式Ia
或是所述化学式I的一药学上可接受的盐,
其中:
所述虚线表示第6’位的一立体组态为R组态或S组态;
X1为或硫;
环I中的C4’与C5’之间的所述虚线的键结表示一单键或一双键;
环I中的C4’与C3’之间的所述虚线的键结表示一单键或一双键;
Rx、Ry1及Rz为各自独立的氢、烷基或环烷基或不存在,其中在C4’与C5’之间的所述虚线的键结为一双键的情况下至少Rz为不存在,以及在C4’与C3’之间的所述虚线的键结为一双键的情况下至少Ry1为不存在;
Ry2至Ry9以及Rw1至Rw3为各自独立地选自于氢、烷基、烯基、炔基、芳基、杂芳基以及环烷基,每个所述Ry2至Ry9以及Rw1至Rw3为取代的或未取代的,或者,每个所述Ry2至Ry9以及Rw1至Rw3可以为如在此所定义的R7至R9;
R1是选自于由氢、一取代或未取代的烷基、一取代或未取代的烯基、一取代或未取代的炔基、一取代或未取代的环烷基、一取代或未取代的芳基、一取代或未取代的杂芳基、一取代或未取代的烷芳基、一取代或未取代的基、一取代或未取代的酰氨基、酰基、羧酸根以及一饱和或不饱和及/或取代或未取代的羟烷基(例如-CH2-OH)所组成的一群组;
R2是选自于由氢、一取代或未取代的烷基、一取代或未取代的烯基、一取代或未取代的炔基、一取代或未取代的环烷基、一取代或未取代的芳基、一取代或未取代的杂芳基、一取代或未取代的烷芳基以及酰基所组成的一群组;
R3及R4为各自独立地选自于由氢、烷基、炔基、环烷基、杂脂环基、芳基、杂芳基、胺以及-OR16所组成的一群组,其中R16是独立地选自于一单糖部分、一寡糖部分、一取代或未取代的烷基、一取代或未取代的烯基、一取代或未取代的炔基、一取代或未取代的环烷基、一取代或未取代的芳基、一取代或未取代的杂芳基、一取代或未取代的烷芳基以及酰基或不存在,其中在C4’与C5’之间的所述虚线的键结为一双键的情况下R3可选地为不存在,在C4’与C3’之间的所述虚线的键结为一双键的情况下R4可选地为不存在;
R5及R6为各自独立地选自于由氢、烷基、烯基、炔基、环烷基、杂环脂基、芳基、杂芳基、胺以及-OR16所组成的一群组,其中R16是独立地选自于一单糖部分、一寡糖部分、一取代或未取代的烷基、一取代或未取代的烯基、一取代或未取代的炔基、一取代或未取代的环烷基、一取代或未取代的芳基、一取代或未取代的杂芳基、一取代或未取代的烷芳基以及酰基;以及
R7至R9为各自独立地选自于由氢、酰基、氨基取代的α-羟基酰基、一取代或未取代的烷基、一取代或未取代的烯基、一取代或未取代的炔基、一取代或未取代的环烷基、一取代或未取代的芳基、一取代或未取代的烷芳基、羧酸根、磺酰基(包括烷基磺酰基及芳基磺酰基)以及一细胞可渗透性基团所组成的一群组。
2.如权利要求1所述的化合物,其特征在于:R3至R6中的至少一个是-OR16。
3.如权利要求2所述的化合物,其特征在于:R16是芳基。
4.如权利要求1至3中任一项所述的化合物,其特征在于:R3至R6中的至少一个是选自于由苯氧基、1-蒽氧基、1-氧基、2-萘氧基、2-菲氧基以及9-菲氧基所组成的一群组。
5.如权利要求2所述的化合物,其特征在于:R16是一取代或未取代的杂芳基,并且R3至R6中的至少一个独立地为一取代或未取代的杂芳氧基。
6.如权利要求1或2所述的化合物,其特征在于:R3至R6中的至少一个独立地选自于由2-蒽氧基、2-呋喃氧基、2-吲哚氧基、2-萘氧基、2-吡啶氧基、2-嘧啶氧基、2-吡咯氧基、2-喹啉氧基、2-噻吩氧基、3-呋喃氧基、3-吲哚氧基、3-噻吩氧基、4-咪唑氧基、4-吡啶氧基、4-嘧啶氧基、4-喹啉氧基、5-甲基-2-噻吩氧基以及6-氯-3-吡啶氧基所组成的一群组。
7.如权利要求2所述的化合物,其特征在于:R16是一取代的芳基。
8.如权利要求1或2所述的化合物,其特征在于:R3至R6中的至少一个为-OR16,以及R16是独立地选自于由2-(N-乙氨基)苯基、2-(N-己氨基)苯基、2-(N-甲氨基)苯基、2,4-二甲氧基苯基、2-乙酰氨基苯基、2-氨基苯基、2-羧基苯基、2-氯苯基、2-乙氧基苯基、2-氟苯基、2-羟甲基苯基、2-羟基苯基、2-羟基苯基、2-甲氧基羰基苯基、2-甲氧基苯基、2-甲基苯基、2-N,N-二甲氨基苯基、2-三氟甲基苯基、3-(N,N-二丁氨基)苯基、3-(N,N-二乙氨基)苯基、3,4,
5-三甲氧基苯基、3,4-二氯苯基、3,4-二甲氧基苯基、3,5-二甲氧基苯基、3-氨基苯基、3-联苯基、3-羧基苯基、3-氯-4-甲氧基苯基、3-氯苯基、3-乙氧基羰基苯基、3-乙氧基苯基、3-氟苯基、3-羟甲基苯基、3-羟基苯基、3-异戊氧基苯基、3-异丁氧基苯基、3-异丙氧基苯基、3-甲氧基苯基、3-甲基苯基、3-N,N-二甲氨基苯基、3-甲苯基、3-三氟甲基苯基、4-(苄氧基)苯基、4-(异丙氧羰基)苯基、4-(N,N-二乙氨基)苯基、4-(N,N-二己氨基)苯基、4-(N,N-二异丙氨基)苯基、4-(N,N-二甲氨基)苯基、4-(N,N-二-n-戊氨基)苯基、4-(n-己氧羰基)苯基、4-(N-甲氨基)苯基、4-(三氟甲基)苯基、4-氨基苯基、4-苯氧基苯基、4-联苯基、4-丁氧基苯基、4-丁酰胺苯基、4-羧基苯基、4-氯苯基、4-乙氧基羰基苯基、4-己酰胺苯基、4-羟甲基苯基、4-羟基苯基、4-碘苯基、4-异丁基苯基、4-异丁酰胺苯基、4-异丙氧基苯基、4-异丙基苯基、4-甲氧基苯基、4-甲基苯基、4-n-己酰氨基苯基、4-n-己氧基苯基、4-n-正己基苯基、4-硝基苯基、4-硝基苯基、4-丙酰胺苯基、4-甲苯基、4-三氟甲基苯基以及4-戊酰氧基羰基苯基所组成的一群组。
9.如权利要求1至8中任一项所述的化合物,其特征在于:R3是-OR16,并且R16是氢。
10.如权利要求1至8中任一项所述的化合物,其特征在于:R3为-OR16,并且R16选自于由甲基、乙基、丙基、丁基、戊基、丙烯基、2-羟乙基、3-羟丙基、2,3-二羟丙基以及甲氧基甲基所组成的一群组。
11.如权利要求1或2所述的化合物,其特征在于:R3至R6中的至少一个是-OR16,并且R16独立地为酰基。
12.如权利要求1或11所述的化合物,其特征在于:R3至R6中的至少一个是-OR16,并且R16是所述单糖部分。
13.如权利要求1或12所述的化合物,其特征在于:所述单糖部分由化学式II所表示:
化学式II
其中:
所述曲线表示附接物的一位置
所述虚线表示第5”位的一立体组态为R组态或S组态;
X2是-OR13或-NR14R15;
每个R10、R11及R13是独立地选自于由氢、一取代或未取代的烷基、一取代或未取代的烯基、一取代或未取代的炔基、一取代或未取代的环烷基、一取代或未取代的芳基、一取代或未取代的杂芳基、一取代或未取代的烷芳基以及酰基所组成的一群组;
R12是选自于由氢、一取代或未取代的烷基、一取代或未取代的烯基、一取代或未取代的炔基、一取代或未取代的环烷基、一取代或未取代的芳基、一取代或未取代的杂芳基、一取代或未取代的烷芳基、一取代或未取代的氨基、一取代或未取代的酰氨基、酰基、羧酸根以及一饱和或不饱和的及/或取代的或未取代的羟烷基所组成的一群组;及
每个R14及R15是独立地选自于由氢、一取代或未取代的烷基、一取代或未取代的烯基、一取代或未取代的炔基、一取代或未取代的环烷基、一取代或未取代的芳基、一取代或未取代的杂芳基、一取代或未取代的烷芳基、酰基以及一细胞可渗透性基团,或替代地,当存在R14及R15时形成一杂环。
14.如权利要求12或13所述的化合物,其特征在于:所述化合物由化学式Ib表示:
化学式Ib。
15.如权利要求13或14所述的化合物,其特征在于:X2是-OR13。
16.如权利要求13或14所述的化合物,其特征在于:X2是-NR14R15。
17.如权利要求13至16中任一项所述的化合物,其特征在于:R12不是氢。
18.如权利要求13至16中任一项所述的化合物,其特征在于:R10、R11及R13中的至少一个为酰基。
19.如权利要求17所述的化合物,其特征在于:R10、R11及R13中的至少一个如果存在时则为酰基。
20.如权利要求1至19中任一项所述的化合物,其特征在于:X1为氧。
21.如权利要求1至20中任一项所述的化合物,其特征在于:环I中的C4’与C5’之间的键结为一单键。
22.如权利要求1至20中任一项所述的化合物,其特征在于:环I中的C4’与C5’之间的键结为一双键,并且Rx或R3为不存在。
23.如权利要求1至22中任一项所述的化合物,其特征在于:R1不是氢。
24.如权利要求23所述的化合物,其特征在于:R1是羟烷基。
25.如权利要求23所述的化合物,其特征在于:R1是羟甲基。
26.如权利要求23所述的化合物,其特征在于:R1是一取代或未取代的烷基、一取代或未取代的烯基或一取代或未取代的炔基。
27.如权利要求23所述的化合物,其特征在于:R1是选自于甲基、乙基、丙基、丁基以及戊基所组成的一群组。
28.如权利要求23所述的化合物,其特征在于:R1是芳基。
29.如权利要求28所述的化合物,其特征在于:R1是选自于由苯基、1-蒽基、1-萘基、2-萘基、2-菲基以及9-菲基所组成的一群组。
30.如权利要求23所述的化合物,其特征在于:R1是一取代或未取代的杂芳基。
31.如权利要求30所述的化合物,其特征在于:R1是选自于由2-蒽基、2-呋喃基、2-吲哚基、2-萘基、2-吡啶基、2-嘧啶基、2-吡咯基、2-喹啉基、2-噻吩基、3-呋喃基、3-吲哚基、3-噻吩基、4-咪唑基、4-吡啶基、4-嘧啶基、4-喹啉基、5-甲基-2-噻吩基以及6-氯-3-吡啶基所组成的一群组。
32.如权利要求23所述的化合物,其特征在于:R1是一取代的芳基。
33.如权利要求32所述的化合物,其特征在于:R1是选自于由2-(N-乙氨基)苯基、2-(N-己氨基)苯基、2-(N-甲氨基)苯基、2,4-二甲氧基苯基、2-乙酰氨基苯基、2-氨基苯基、2-羧基苯基、2-氯苯基、2-乙氧基苯基、2-氟苯基、2-羟甲基苯基、2-羟基苯基、2-羟基苯基、2-甲氧基羰基苯基、2-甲氧基苯基、2-甲基苯基、2-N,N-二甲氨基苯基、2-三氟甲基苯基、3-(N,N-二丁氨基)苯基、3-(N,N-二乙氨基)苯基、3,4,5-三甲氧基苯基、3,4-二氯苯基、3,4-二甲氧基苯基、3,5-二甲氧基苯基、3-氨基苯基、3-联苯基、3-羧基苯基、3-氯-4-甲氧基苯基、3-氯苯基、3-乙氧基羰基苯基、3-乙氧基苯基、3-氟苯基、3-羟甲基苯基、3-羟基苯基、3-异戊氧基苯基、3-异丁氧基苯基、3-异丙氧基苯基、3-甲氧基苯基、3-甲基苯基、3-N,N-二甲氨基苯基、3-甲苯基、3-三氟甲基苯基、4-(苄氧基)苯基、4-(异丙氧羰基)苯基、4-(N,N-二乙氨基)苯基、4-(N,N-二己氨基)苯基、4-(N,N-二异丙氨基)苯基、4-(N,N-二甲氨基)苯基、4-(N,N-二-n-戊氨基)苯基、4-(n-己氧羰基)苯基、4-(N-甲氨基)苯基、4-(三氟甲基)苯基、4-氨基苯基、4-苯氧基苯基、4-联苯基、4-丁氧基苯基、4-丁酰胺苯基、4-羧基苯基、4-氯苯基、
4-乙氧基羰基苯基、4-己酰胺苯基、4-羟甲基苯基、4-羟基苯基、4-碘苯基、4-异丁基苯基、
4-异丁酰胺苯基、4-异丙氧基苯基、4-异丙基苯基、4-甲氧基苯基、4-甲基苯基、4-n-己酰氨基苯基、4-n-己氧基苯基、4-硝基苯基、4-硝基苯基、4-丙酰胺苯基、4-甲苯基、4-三氟甲基苯基以及4-戊酰氧基羰基苯基所组成的一群组。
34.如权利要求23所述的化合物,其特征在于:R1是氨基。
35.如权利要求34所述的化合物,其特征在于:R1是选自于由-NH2、-NHCH3、-N(CH3)2、-NH-CH2-CH2-NH2、-NH-CH2-CH2-OH以及-NH-CH2-CH(OCH3)2。
36.如权利要求1至23中任一项所述的化合物,其特征在于:R2是氢。
37.如权利要求1至23中任一项所述的化合物,其特征在于:R2是烷基,且优选地选自于由甲基、乙基以及丙基所组成的一群组。
38.如权利要求1至23中任一项所述的化合物,其特征在于:R2是酰基。
39.如权利要求1至23中任一项所述的化合物,其特征在于:R7是选自于由氢、(R/S)-4-氨基2-羟基丁酰基(AHB)、(R/S)-3-氨基-2-羟基丙酸根(AHP)、(R/S)-3-氨基-2-羟基丙酰基、5-氨基戊酰基、5-羟基戊酰基、甲酰基、-C(=O)-O-甲基、-C(=O)-O-乙基、-C(=O)-O-苄基、-β-氨基-α-羟基丙酰基、-δ-氨基-α-羟基戊酰基、-β-苄氧基羰氨基-α羟基丙酰基、-δ-苄氧基羰基氨基-α羟基戊酰基、甲基磺酰基、苯磺酰基、苯甲酰基、丙基、异丙基、-(CH2)
2NH2、-(CH2)3NH2、-CH2CH(NH2)CH3、-(CH2)4NH2、-(CH2)5NH2、-(CH2)2NH-乙基、-(CH2)2NH(CH2)
2NH2、-(CH2)3NH(CH2)3NH2、-(CH2)3NH(CH2)4NH(CH2)3NH2、-CH(-NH2)CH2(OH)、-CH(-OH)CH2(NH2)、-CH(-OH)-(CH2)2(NH2)、-CH(-NH2)-(CH2)2(OH)、-CH(-CH2NH2)-(CH2OH)、-(CH2)4NH(CH2)3NH2、-(CH2)2NH(CH2)2NH(CH2)2NH2、-(CH2)2N(CH2CH2NH2)2、-CH2-C(=O)NH2、-CH(CH3)-C(=O)NH2、-CH2-苯基、-CH(i-丙基)-C(=O)NH2、-CH(苄基)-C(=O)NH2、-(CH2)2OH、-(CH2)3OH以及-CH(CH2OH)2所组成的一群组。
40.如权利要求35至38中任一项所述的化合物,其特征在于:R7是选自于由氢、(R/S)-4-氨基2-羟基丁酰基(AHB)、(R/S)-3-氨基-2-羟基丙酸根(AHP)、(R/S)-3-氨基-2-羟基丙酰基、5-氨基戊酰基、5-羟基戊酰基、甲酰基、-C(=O)-O-甲基、-C(=O)-O-乙基、-C(=O)-O-苄基、-β-氨基-α-羟基丙酰基、-δ-氨基-α-羟基戊酰基、-β-苄氧基羰氨基-α羟基丙酰基、-δ-苄氧基羰基氨基-α羟基戊酰基、甲基磺酰基、苯磺酰基、苯甲酰基、丙基、异丙基、-(CH2)
2NH2、-(CH2)3NH2、-CH2CH(NH2)CH3、-(CH2)4NH2、-(CH2)5NH2、-(CH2)2NH-乙基、-(CH2)2NH(CH2)
2NH2、-(CH2)3NH(CH2)3NH2、-(CH2)3NH(CH2)4NH(CH2)3NH2、-CH(-NH2)CH2(OH)、-CH(-OH)CH2(NH2)、-CH(-OH)-(CH2)2(NH2)、-CH(-NH2)-(CH2)2(OH)、-CH(-CH2NH2)-(CH2OH)、-(CH2)4NH(CH2)3NH2、-(CH2)2NH(CH2)2NH(CH2)2NH2、-(CH2)2N(CH2CH2NH2)2、-CH2-C(=O)NH2、-CH(CH3)-C(=O)NH2、-CH2-苯基、-CH(i-丙基)-C(=O)NH2、-CH(苄基)-C(=O)NH2、-(CH2)2OH、-(CH2)3OH以及-CH(CH2OH)2所组成的一群组。
41.如权利要求1至23中任一项所述的化合物,其特征在于:每个R8及R9是独立地选自于由氢、(R/S)-4-氨基2-羟基丁酰基(AHB)、(R/S)-3-氨基-2-羟基丙酸根(AHP)、(R/S)-3-氨基-2-羟基丙酰基、5-氨基戊酰基、5-羟基戊酰基、甲酰基、-COO-甲基、-COO-乙基、-COO-苄基、-β-氨基-α-羟基丙酰基、-δ-氨基-α-羟基戊酰基、-β-苄氧基羰氨基-α羟基丙酰基、-δ-苄氧基羰基氨基-α羟基戊酰基、甲基磺酰基、苯磺酰基、苯甲酰基、丙基、异丙基、-(CH2)
2NH2、-(CH2)3NH2、-CH2CH(NH2)CH3、-(CH2)4NH2、-(CH2)5NH2、-(CH2)2NH-乙基、-(CH2)2NH(CH2)
2NH2、-(CH2)3NH(CH2)3NH2、-(CH2)3NH(CH2)4NH(CH2)3NH2、-CH(-NH2)CH2(OH)、-CH(-OH)CH2(NH2)、-CH(-OH)-(CH2)2(NH2)、-CH(-NH2)-(CH2)2(OH)、-CH(-CH2NH2)-(CH2OH)、-(CH2)4NH(CH2)3NH2、-(CH2)2NH(CH2)2NH(CH2)2NH2、-(CH2)2N(CH2CH2NH2)2、-CH2-C(=O)NH2、-CH(CH3)-C(=O)NH2、-CH2-苯基、-CH(i-丙基)-C(=O)NH2、-CH(苄基)-C(=O)NH2、-(CH2)2OH、-(CH2)3OH以及-CH(CH2OH)2所组成的一群组。
42.如权利要求35至38中任一项所述的化合物,其特征在于:每个R8及R9是独立地选自于由氢、(R/S)-4-氨基2-羟基丁酰基(AHB)、(R/S)-3-氨基-2-羟基丙酸根(AHP)、(R/S)-3-氨基-2-羟基丙酰基、5-氨基戊酰基、5-羟基戊酰基、甲酰基、-COO-甲基、-COO-乙基、-COO-苄基、-β-氨基-α-羟基丙酰基、-δ-氨基-α-羟基戊酰基、-β-苄氧基羰氨基-α羟基丙酰基、-δ-苄氧基羰基氨基-α羟基戊酰基、甲基磺酰基、苯磺酰基、苯甲酰基、丙基、异丙基、-(CH2)
2NH2、-(CH2)3NH2、-CH2CH(NH2)CH3、-(CH2)4NH2、-(CH2)5NH2、-(CH2)2NH-乙基、-(CH2)2NH(CH2)
2NH2、-(CH2)3NH(CH2)3NH2、-(CH2)3NH(CH2)4NH(CH2)3NH2、-CH(-NH2)CH2(OH)、-CH(-OH)CH2(NH2)、-CH(-OH)-(CH2)2(NH2)、-CH(-NH2)-(CH2)2(OH)、-CH(-CH2NH2)-(CH2OH)、-(CH2)4NH(CH2)3NH2、-(CH2)2NH(CH2)2NH(CH2)2NH2、-(CH2)2N(CH2CH2NH2)2、-CH2-C(=O)NH2、-CH(CH3)-C(=O)NH2、-CH2-苯基、-CH(i-丙基)-C(=O)NH2、-CH(苄基)-C(=O)NH2、-(CH2)2OH、-(CH2)3OH以及-CH(CH2OH)2所组成的一群组。
43.如权利要求39或40所述的化合物,其特征在于:每个R8及R9是独立地选自于由氢、(R/S)-4-氨基2-羟基丁酰基(AHB)、(R/S)-3-氨基-2-羟基丙酸根(AHP)、(R/S)-3-氨基-2-羟基丙酰基、5-氨基戊酰基、5-羟基戊酰基、甲酰基、-COO-甲基、-COO-乙基、-COO-苄基、-β-氨基-α-羟基丙酰基、-δ-氨基-α-羟基戊酰基、-β-苄氧基羰氨基-α羟基丙酰基、-δ-苄氧基羰基氨基-α羟基戊酰基、甲基磺酰基、苯磺酰基、苯甲酰基、丙基、异丙基、-(CH2)2NH2、-(CH2)3NH2、-CH2CH(NH2)CH3、-(CH2)4NH2、-(CH2)5NH2、-(CH2)2NH-乙基、-(CH2)2NH(CH2)2NH2、-(CH2)3NH(CH2)3NH2、-(CH2)3NH(CH2)4NH(CH2)3NH2、-CH(-NH2)CH2(OH)、-CH(-OH)CH2(NH2)、-CH(-OH)-(CH2)2(NH2)、-CH(-NH2)-(CH2)2(OH)、-CH(-CH2NH2)-(CH2OH)、-(CH2)4NH(CH2)3NH2、-(CH2)2NH(CH2)2NH(CH2)2NH2、-(CH2)2N(CH2CH2NH2)2、-CH2-C(=O)NH2、-CH(CH3)-C(=O)NH2、-CH2-苯基、-CH(i-丙基)-C(=O)NH2、-CH(苄基)-C(=O)NH2、-(CH2)2OH、-(CH2)3OH以及-CH(CH2OH)2所组成的一群组。
44.如权利要求1至41中任一项所述的化合物,其特征在于:所述氨基取代的α-羟基酰基为(S)-4-氨基-2-羟基丁酰基(AHB)。
45.如权利要求1至44中任一项所述的化合物,其特征在于:所述细胞可渗透性基团为胍基。
46.如权利要求1至45中任一项所述的化合物,其特征在于:当R16、R10、R11或R13为酰基时,所述酰基是选自于具有2至18个原子酰基所组成的一群组,可选地,所述烃酰基被卤代、硝基、羟基、胺、氰基、硫氰基及烷氧基中的一种或多种所取代。
47.如权利要求1至45中任一项所述的化合物,其特征在于:当R16、R10、R11或R13为酰基时,所述酰基是衍生自选自于一饱和或不饱和及/或取代或未取代的脂肪族羧酸、乙酸、丙酸、丁酸、异丁酸、叔丁基乙酸、戊酸、异戊酸、己酸、辛酸、癸酸、十二酸、月桂酸、三癸酸、肉豆蔻酸、十五烷酸、棕榈酸、十七酸、硬脂酸丙烯酸、巴豆酸、十一碳烯酸、十八烯酸、己炔酸、庚炔酸、辛炔酸、一饱和或不饱和的脂环族羧酸、环丁烷羧酸、环戊烷羧酸、环戊烯羧酸、甲基环戊烯羧酸、环己烷羧酸、二甲基环己烷羧酸、二丙基环己烷羧酸、一饱和或不饱和的脂环族脂肪族羧酸、环戊乙酸、环戊丙酸、环己乙酸、环己丁酸、甲基环己乙酸、一取代或未取代的芳香族羧酸、苯甲酸、甲苯酸、萘甲酸、乙基苯甲酸、异丁基苯甲酸、甲基丁基苯甲酸、芳香族脂肪族羧酸、苯乙酸、苯丙酸、苯戊酸、肉桂酸、苯丙炔酸、萘乙酸、卤代烷氧基烃羧酸、硝基烷氧基烃羧酸、羟基烷氧基烃羧酸、氨基烷氧基烃羧酸、氰基烷氧基烃羧酸、硫氰基烷氧基羧酸、单乙酸、二乙酸、三氯乙酸、1,2,3,4,5,6-六氯环己烷羧酸、1,2-二溴-4-甲基环己烷羧酸、1,6-二溴-3-甲基环己烷羧酸、1-溴-3,5-二甲基环己烷羧酸、2-氯环己烷羧酸、4-氯环己烷羧酸、2,3-二溴-2-甲基环己烷羧酸、2,4,6-三硝基苯甲酸、2,5-二溴-2-甲基环己烷羧酸、2-溴-4-甲基环己烷羧酸、2-硝基-1-甲基-环丁羧酸、3,4-二硝基苯甲酸、3,
5-二硝基苯甲酸、3-溴-2,2,3-三甲基环戊烷羧酸、3-溴-2-甲基环己烷羧酸、3-溴-3-甲基环己烷羧酸、4-溴-2-甲基环己烷羧酸、5-溴-2-甲基环己烷羧酸、‘4、4-二氯苯甲酸、4,5-二溴-2-甲基环己烷羧酸、5-溴-2-甲基环己烷羧酸、6-溴-2-甲基环己烷羧酸、5,6-二溴-2-甲基环己烷羧酸、6-溴-3-甲基环己烷羧酸、茴香酸、氰乙酸、氰丙酸、乙氧基甲酸(乙基碳酸)、没食子酸、尿黑酸、邻氯苯酸、间氯苯酸以及对氯苯酸、乳酸、甲羟戊酸、邻硝基苯甲酸、间硝基苯甲酸以及对羟基苯甲酸、杨酸、莽草酸、硫氰基乙酸、三甲氧基苯甲酸、三甲氧基肉桂酸、藜芦酸、α-及β-氯丙酸、α-及γ-溴丁酸、α-及δ-碘戊酸以及β-间苯二甲酸所组成的一群组。
48.一种药物组合物,其特征在于:所述药物组合物包括:如权利要求1至47中任一项所述的化合物;以及一药学上可接受的载体。
49.如权利要求1至47所述的化合物或如权利要求48所述的组合物,其特征在于:所述化合物或组合物应用于治疗一遗传性疾病,所述遗传性疾病具有一提前终止密码子截短突变及/或一蛋白质截短的表现型。
50.如权利要求49所述的化合物或组合物,其特征在于:所述遗传性疾病是选自于由囊性纤维化(CF)、杜兴氏肌肉营养不良(DMD)、共济失调毛细血管扩张症、胡勒综合症、A型血友病、B型血友病、乌谢尔综合症、戴萨克斯症、贝克肌肉营养不良症(BMD)、先天性肌肉营养不良症(CMD)、第七因子缺乏症、家族性心房颤动症、黑利-黑利病、麦卡德尔病、粘多糖病、肾病性胱氨酸病、多囊肾病、蕾特氏综合症、脊髓性肌肉萎缩症(SMA)、胱氨酸症、严重大疱性表皮松解症、爪费综合症、X染色体关联的肾源性尿崩症(XNDI)、X染色体关联的视网膜色素病变及癌症所组成的一群组。

说明书全文

基糖苷衍生物及其在治疗遗传性病症中的应用

[0001] 技术领域及背景技术
[0002] 本发明在其一些实施例中涉及氨基糖苷类,及更具体地,但不限于涉及多个新颖的氨基糖苷衍生物及其在增加具有一终止密码子突变的一基因的一表达和/或在多个遗传性病症的治疗的用途。
[0003] 许多人类遗传性疾病是由多个无义突变所引起的,其中所述三个终止密码子(UAA、UAG或UGA)中的一者取代氨基酸编码密码子,导致所述转译的提前终止,并且最终成为多个截短的失活蛋白质。目前,已知有数百个这样的无义突变,并且有几个被证明可以解释某些致命疾病的病例,包括:例如囊性纤维化(CF)、杜兴氏肌肉营养不良(DMD)、共济失调毛细血管扩张症、胡勒综合症、A型血友病、B型血友病、戴萨克斯症、乌谢尔综合症、严重大疱性表皮松解症等,对于所述多个疾病中的许多疾病,目前尚无有效的治疗方法。
[0004] 一些氨基糖苷化合物已经显示出在多个遗传性疾病的治疗中具有治疗价值,因为它们诱导多个核糖体通读多个终止密码子突变的活性,从部分的信使核糖核酸(mRNA)分子中产生多个全长蛋白质。
[0005] 氨基糖苷类是多个高度有效的广谱抗生素,常用于多个危及生命的感染的治疗。多个氨基糖苷类抗生素,例如:巴龙霉胺(参见图1)的作用机制已被接受为参与与所述原核生物的核糖体的相互作用,以及更具体地,参与与所述16S核糖体RNA的所述解码A位点的结合,所述结合导致蛋白质转译的抑制以及干扰所述转译的保真度。
[0006] 细菌核糖体结构测定的几项成果连同多个细菌A位点寡核苷酸模型的晶体及多个核磁共振(NMR)结构,提供了有用的信息用以理解多个原核细胞中的所述解码机制以及理解氨基糖苷类如何引起所述遗传密码的有害的误读。所述多个研究和其他研究已产生所述假设:所述A位点对于一非同源mRNA与tRNA的复合物的所述亲和在氨基糖苷结合后增加,阻止了所述核糖体有效地区分非同源和同源复合物。
[0007] 在真核生物中由氨基糖苷类产生的终止抑制的所述增强被认为是类似于在原核生物中的所述氨基糖苷类在蛋白质合成期间干扰转译保真度的活性,即某些氨基糖苷类与所述核糖体A位点的所述结合可能诱导多个组态变化,所述多个组态变化稳定多个接近同源的mRNA与tRNA的复合物,而非插入所述释放因子。氨基糖苷类已经显示出抑制以多个显着不同的效率(UGA>UAG>UAA)抑制各种终止密码子,并且发现所述抑制功效进一步取决于所述终止密码子的紧邻的下游的所述第四个核苷酸的所述身份(C>U>A≥G)以及所述终止密码子的周围的所述局部序列的上下文。
[0008] 一有效的通读药物的所述多个期望特征是口服,并且对细菌极少或没有影响。如同任何非必要的抗生素的使用,通读药物的抗菌活性是不被期望的,特别是相对于所述胃肠道(GI)的生物群,由于扰乱所述胃肠道生物群平衡以及抗性的出现所引起的所述多个不利的影响。在这方面,除了上述的多个限制之外,大多数临床氨基糖苷类对于多个细菌核糖体具有很大的选择性,并且不会对多个人类细胞的多个细胞质核糖体产生一显着影响。
[0009] 为了克服上述的多个限制,生物制药产业正在通过针对无义通读的活性来筛选大型化学资料库,寻找多个新颖的终止密码子突变抑制药物。
[0010] 囊性纤维化跨膜传导调节蛋白(CFTR)终止密码子突变的氨基糖苷介导抑制的第一个实验证明了所述CFTR基因中发现的多个提前终止密码子突变可被所述庆大霉素家族的多个成员以及遗传霉素 (G-418)所抑制(参见图1),如通过在多个支气管上皮细胞株中的全长功能性CFTR的所述出现来测量。
[0011] 从携带一人类CFTR-G542X转基因的多个CFTR-/-转基因小鼠突变体的多个肠道组织的多个抑制实验显示出使用庆大霉素以及较小程度的妥布霉素的治疗使得被处理的小鼠的所述多个腺体中导致人类CFTR蛋白的所述出现。最重要的是,多个使用双盲、安慰剂对照、交叉试验的临床研究显示,庆大霉素可以抑制多个受感染患者的多个终止密码子突变,以及所述庆大霉素治疗改善了一组19名携带多个CFTR终止密码子突变的患者中的跨越所述鼻粘膜的跨膜电导。多个氨基糖苷类对于其它遗传性疾病的所述治疗潜力被测试在多个体外系统、培养的细胞株或多个动物模型,所述多个遗传性疾病包括杜兴氏肌肉营养不良、胡勒综合症、肾源性尿崩症、肾病性胱氨酸病、视网膜色素病变以及共济失调毛细血管扩张症。
[0012] 然而,使用氨基糖苷类作为多个药物的所述主要限制之一是它们对多个哺乳动物的高毒性,通常表现在肾脏(肾毒性)和朵相关(耳毒性)疾病上。所述毒性的所述起源被假定是由不同因素及机制的一组合所引起的,例如:与多个磷脂的多个相互作用、多个磷脂酶的抑制以及多个自由基的所述形成。虽然被认为对多个细菌核糖体有选择性,但大多数的氨基糖苷类也结合至所述真核生物A位点,但以低于所述细菌A位点的多个亲和力的多个亲和力来结合。对于所述多个药剂的所述高毒性,在多个哺乳动物细胞中的转译的所述抑制也是所述多个可能的原因之一。增加它们的细胞毒性的另一个因素是它们在所述12S核糖体核糖核酸(rRNA)的A位点上与所述线粒体核糖体的结合,所述12S核糖体核糖核酸的A位点的序列非常近似于所述细菌A位点。
[0013] 许多研究试图理解以及提出减轻与氨基糖苷类相关的所述毒性的方法,包括多个抗化剂的所述使用以减少多个自由基平,以及聚-L-天冬氨酸及达托霉素的所述使用以降低氨基糖苷类与多个磷脂相互作用的所述活性。近来已证实巨蛋白(一种多配体内吞受体,所述多配体内吞受体在所述多个肾近端小管以及所述内耳中特别丰富)在氨基糖苷类的所述摄取中的作用。与氨基糖苷竞争与巨蛋白结合的多个激动剂的所述给药也在氨基糖苷的摄取以及毒性上引起一减少。另外,改变所述给药时刻表和/或氨基糖苷类在给药上的所述方式已被研究作为降低毒性的多个手段。
[0014] 尽管为了减少氨基糖苷类毒性作出了广泛的努力,但除了所述给药时刻表的改变之外,很少的结果已成熟到用于抑制多个终止密码子突变的氨基糖苷类的所述给药的多个标准临床实践和多个标准临床程序中。例如:与所述多个体外系统相比,在多个临床试验中,庆大霉素的亚毒性剂量的所述使用可能导致在所述体内实验中获得的所述降低的通读效率。所述氨基糖苷遗传霉素(也被称为G-418硫酸盐或简称G-418,参见图1)在多个体外转译至转录系统中显示出所述最佳的终止抑制活性。然而,庆大霉素作为一治疗剂的用途是不可能的,因为即使在非常低的浓度下它也是致命的。例如:与庆大霉素,新霉素和卡那霉素的LD50为2.5至5.0毫克/毫升(mg/ml)相比,G-418对于多个人类纤维母细胞的LD50为0.04毫克/毫升。
[0015] 所述多个真核生物核糖体对于一些氨基糖苷类药物,例如:G-418以及庆大霉素的所述增加的敏感性是令人感兴趣的,但由于缺乏关于它们与多个真核生物核糖体相互作用的足够的结构性数据,因此直到现在仍无法合理解释。由于G-418即使在多个非常低的浓度下仍是极其有毒的,目前庆大霉素是已在各种动物模型以及临床试验中测试的唯一的氨基糖苷类。尽管一些研究显示,由于阿米卡星以及巴龙霉胺在多个培养的细胞中的毒性相对较低,阿米卡星以及巴龙霉胺可代替庆大霉素用于终止密码子突变抑制疗法,但是仍未有使用所述多个氨基糖苷类的临床试验被报道。
[0016] 迄今为止,几乎所有的抑制实验都是使用临床的市售的氨基糖苷类来进行,然而只有有限数量的氨基糖苷类,包括庆大霉素、阿米卡星以及妥布霉素在临床使用作为用于在人类中内部给药的多个抗生素。其中,妥布霉素不具有终止密码子突变抑制活性,以及庆大霉素是在多个动物模型及临床试验中已被测试用于终止密码子突变抑制活性的唯一的氨基糖苷类。最近,一组新霉胺衍生物被显示可促进来自于多个脊髓性肌肉萎缩症(SPA)患者的纤维母细胞中的SMN蛋白的通读;然而,所述多个化合物最初被设计为抗生素,并且没有任何对于进一步改进这些衍生物的通读活性的结论。
[0017] WO 2007/113841及WO2012/066546公开了巴龙霉胺衍生的氨基糖苷类,所述氨基糖苷类被设计为展现高度的多个提前终止密码子突变的通读活性,同时在多个哺乳动物细胞中发挥低细胞毒性及低抗微生物活性,而因此可被用于多个遗传性疾病的所述治疗。这类巴龙霉胺衍生的氨基糖苷类药物的设计是通过对所述巴龙霉胺的核心进行某些操作来实现的,可以提高通读活性并且降低毒性活性以及抗菌活性。所述多个操作是在所述巴龙霉胺的核心的几个位置上进行。
[0018]
[0019] 巴龙霉胺
[0020] 在这些的示例性的所述巴龙霉胺的核心的所述多个操作已在所述多个出版物中教导,包括所述氨基糖苷的核心的第6’位的一羟基;在所述氨基糖苷的核心的第3’位、第5位和/或第6位上的一个或多个单糖部分或一寡糖部分的引入;在所述巴龙霉胺的核心的第1位上的一(S)-4-氨基-2-羟基丁酰基(AHB)部分的引入;在第6’位上的氢被烷基的取代,例如:甲基取代基;以及在第5”位上的烷基的引入。
[0021] 额外的背景技术包括Nudelman,I.等人,生物有机与药物化学快报(Bioorg Med Chem Lett),2006.16(24):第6310至5页;Hobbie,S.N.等人,核酸研究(Nucleic Acids Res),2007.35(18):第6086-93页;Kondo,J.等人,化学生物化学(Chembiochem),2007.8(14):第1700至9;Rebibo-Sabbah,A.等人,人类遗传学(Hum Genet),2007.122(3-4):第373至81页;Azimov,R.等人,美国生理学杂志-肾脏生理学(Am J Physiol Renal Physiol),2008.295(3):第F633-41;Hainrichson,M.等人,有机与生物分子化学(Org Biomol Chem),
2008年第6卷第2期:227-39;Hobbie,S.N.等人,美国国家科学院院刊(Proc Natl Acad Sci U S A),2008.105(52):第20888至93页;Hobbie,S.N.等人,美国国家科学院院刊(Proc Natl Acad Sci U S A),2008.105(9):第3244至9页;Nudelman,I.等人,高级合成与催化(Adv.Synth.Catal),2008.350:第1682至1688页;Nudelman,I.等人,药物化学杂志(J Med Chem),2009.52(9):第2836至45页;Venkataraman,N.等人,公共科学图书馆·生物(PLoS Biol),2009.7(4):第e95页;Brendel,C.等人,分子医学杂志(柏林)(J Mol Med(Berl)),
2010.89(4):第389-98页;Goldmann,T.等人,眼科与视觉科学研究(Invest Ophthalmol Vis Sci),2010.51(12):第6671至80页;Malik,V.等人,神经系统疾病的治疗进展(Ther Adv Neurol Disord),2010.3(6):第379-89页;Nudelman,I.等人,生物有机与药物化学快报(Bioorg.Med.Chem.Lett),2010.18(11):第3735至46页;Warchol,M.E.等人,耳鼻咽喉头颈外科的目前意见(Curr Opin Otolaryngol Head Neck Surg),2010.18(5):第454至8页;
Lopez-Novoa,J.M.等人,国际肾脏学(Kidney Int),2011.79(1):第33至45页;Rowe,S.M.等人,分子医学杂志(柏林)(J Mol Med(Berl)),2011.89(11):第1149至61页;Vecsler,M.等人,公共科学图书馆·综合(PLoS One),2011.6(6):第e20733;美国专利第3,897,412号、第
4,024,332号、第4,029,882号以及第3,996,205号;Greenberg等人,美国化学学会杂志(J.Am.Chem.Soc.),1999,121,6527至6541;Kotra等人,抗微生物制剂和化学疗法
(antimicrobial agents and chemotherapy),2000,第3249至3256页;Haddad等人,美国化学学会杂志(J.Am.Chem.Soc.),2002,124,3229至3237;Kandasamy,J.等人,药物化学杂志(J.Med.Chem.).2012,55,第10630至10643;Duscha,S.等人,M生物(MBio),2014,5(5),第e01827至14;Huth,M.E.等人,临床调查杂志(J Clin Invest.),2015,125(2),第583至92页;Shulman,E.等人,生物化学杂志(J Biol Chem),2014,289(4),第2318至30页;以及法国专利第2,427,341号、日本专利第04046189号,所有这些文件的所述多个教导通过引用并入本文,如同在此完全阐述一样。

发明内容

[0022] 本发明涉及氨基糖苷类,其可以有利地用于多个遗传性疾病的治疗,通过展现出高度的多个提前终止密码子突变的通读活性,在多个哺乳动物细胞中产生低毒性和低抗微生物活性,以及改善的生物利用度和/或细胞可渗透性。所述目前公开的氨基糖苷类的特征在于一核心结构,所述核心结构是基于巴龙霉胺的环I、环II以及任选的环III。
[0023] 根据本发明的一些实施例的一个方面,一种化合物,所述化合物由化学式I表示:
[0024]
[0025] 化学式Ia
[0026] 或是所述化学式I的一药学上可接受的盐,
[0027] 其中:
[0028] 所述虚线表示第6’位的一立体组态为R组态或S组态;
[0029] X1为氧或硫;
[0030] 环I中的C4’与C5’之间的所述虚线的键结表示一单键或一双键;
[0031] 环I中的C4’与C3’之间的所述虚线的键结表示一单键或一双键;
[0032] Rx、Ry1及Rz为各自独立的氢、烷基或环烷基或不存在,其中在C4’与C5’之间的所述虚线的键结为一双键的情况下至少Rz为不存在,以及在C4’与C3’之间的所述虚线的键结为一双键的情况下至少Ry1为不存在;
[0033] Ry2至Ry9以及Rw1至Rw3为各自独立地选自于氢、烷基、烯基、炔基、芳基、杂芳基以及环烷基,每个所述Ry2至Ry9以及Rw1至Rw3为取代的或未取代的,或替代地,每个所述Ry2至Ry9以及Rw1至Rw3可以为如在此所定义的R7至R9;
[0034] R1是选自于由氢、一取代或未取代的烷基、一取代或未取代的烯基、一取代或未取代的炔基、一取代或未取代的环烷基、一取代或未取代的芳基、一取代或未取代的杂芳基、一取代或未取代的烷芳基、一取代或未取代的氨基、一取代或未取代的酰氨基、酰基、羧酸根以及一饱和或不饱和及/或取代或未取代的羟烷基(例如-CH2-OH)所组成的一群组;
[0035] R2是选自于由氢、一取代或未取代的烷基、一取代或未取代的烯基、一取代或未取代的炔基、一取代或未取代的环烷基、一取代或未取代的芳基、一取代或未取代的杂芳基、一取代或未取代的烷芳基以及酰基所组成的一群组;
[0036] R3及R4为各自独立地选自于由氢、烷基、炔基、环烷基、杂脂环基、芳基、杂芳基、胺以及-OR16所组成的一群组,其中R16是独立地选自于一单糖部分、一寡糖部分、一取代或未取代的烷基、一取代或未取代的烯基、一取代或未取代的炔基、一取代或未取代的环烷基、一取代或未取代的芳基、一取代或未取代的杂芳基、一取代或未取代的烷芳基以及酰基或不存在,其中在C4’与C5’之间的所述虚线的键结为一双键的情况下R3可选地为不存在,在C4’与C3’之间的所述虚线的键结为一双键的情况下R4可选地为不存在;
[0037] R5及R6为各自独立地选自于由氢、烷基、烯基、炔基、环烷基、杂环脂基、芳基、杂芳基、胺以及-OR16所组成的一群组,其中R16是独立地选自于一单糖部分、一寡糖部分、一取代或未取代的烷基、一取代或未取代的烯基、一取代或未取代的炔基、一取代或未取代的环烷基、一取代或未取代的芳基、一取代或未取代的杂芳基、一取代或未取代的烷芳基以及酰基;以及
[0038] R7至R9为各自独立地选自于由氢、酰基、氨基取代的α-羟基酰基、一取代或未取代的烷基、一取代或未取代的烯基、一取代或未取代的炔基、一取代或未取代的环烷基、一取代或未取代的芳基、一取代或未取代的烷芳基、羧酸根、磺酰基(包括烷基磺酰基及芳基磺酰基)以及一细胞可渗透性基团所组成的一群组。
[0039] 应当注意的是,在本文中,环I,II和III(如果存在的话)的所述立体组态可以是任何可能的相容构型,并且因此不限于本文所示的所述通式中的所述多个环的所述图示,多个示例性的立体组态在下文中给出。
[0040] 根据本文所述的任何实施例中的一些实施例,R3、R4、R5、R6中的至少一个是-OR16。
[0041] 根据本文所述的任何实施例中的一些实施例,R16是芳基。
[0042] 根据本文所述的任何实施例中的一些实施例,R3、R4、R5、R6中的至少一个是选自于由苯氧基、1-蒽氧基、1-氧基、2-萘氧基、2-菲氧基以及9-菲氧基所组成的一群组。
[0043] 根据本文所述的任何实施例中的一些实施例,R16是一取代或未取代的杂芳基,并且R3、R4、R5、R6中的至少一个独立地为一取代或未取代的杂芳氧基。
[0044] 根据本文所述的任何实施例中的一些实施例,R3、R4、R5以及R6中的至少一个独立地选自于由2-蒽氧基、2-呋喃氧基、2-吲哚氧基、2-萘氧基、2-吡啶氧基、2-嘧啶氧基、2-吡咯氧基、2-喹啉氧基、2-噻吩氧基、3-呋喃氧基、3-吲哚氧基、3-噻吩氧基、4-咪唑氧基、4-吡啶氧基、4-嘧啶氧基、4-喹啉氧基、5-甲基-2-噻吩氧基以及6-氯-3-吡啶氧基所组成的一群组。
[0045] 根据本文所述的任何实施例中的一些实施例,R16是一取代的芳基。
[0046] 根据本文所述的任何实施例中的一些实施例,R3、R4、R5以及R6中的至少一个为-OR16,以及R16是独立地选自于由2-(N-乙氨基)苯基、2-(N-己氨基)苯基、2-(N-甲氨基)苯基、2,4-二甲氧基苯基、2-乙酰氨基苯基、2-氨基苯基、2-羧基苯基、2-氯苯基、2-乙氧基苯基、2-氟苯基、2-羟甲基苯基、2-羟基苯基、2-羟基苯基、2-甲氧基羰基苯基、2-甲氧基苯基、2-甲基苯基、2-N,N-二甲氨基苯基、2-三氟甲基苯基、3-(N,N-二丁氨基)苯基、3-(N,N-二乙氨基)苯基、3,4,5-三甲氧基苯基、3,4-二氯苯基、3,4-二甲氧基苯基、3,5-二甲氧基苯基、
3-氨基苯基、3-联苯基、3-羧基苯基、3-氯-4-甲氧基苯基、3-氯苯基、3-乙氧基羰基苯基、3-乙氧基苯基、3-氟苯基、3-羟甲基苯基、3-羟基苯基、3-异戊氧基苯基、3-异丁氧基苯基、3-异丙氧基苯基、3-甲氧基苯基、3-甲基苯基、3-N,N-二甲氨基苯基、3-甲苯基、3-三氟甲基苯基、4-(苄氧基)苯基、4-(异丙氧羰基)苯基、4-(N,N-二乙氨基)苯基、4-(N,N-二己氨基)苯基、4-(N,N-二异丙氨基)苯基、4-(N,N-二甲氨基)苯基、4-(N,N-二-n-戊氨基)苯基、4-(n-己氧羰基)苯基、4-(N-甲氨基)苯基、4-(三氟甲基)苯基、4-氨基苯基、4-苯氧基苯基、4-联苯基、4-丁氧基苯基、4-丁酰胺苯基、4-羧基苯基、4-氯苯基、4-乙氧基羰基苯基、4-己酰胺苯基、4-羟甲基苯基、4-羟基苯基、4-碘苯基、4-异丁基苯基、4-异丁酰胺苯基、4-异丙氧基苯基、4-异丙基苯基、4-甲氧基苯基、4-甲基苯基、4-n-己酰氨基苯基、4-n-己氧基苯基、4-n-正己基苯基、4-硝基苯基、4-硝基苯基、4-丙酰胺苯基、4-甲苯基、4-三氟甲基苯基以及4-戊酰氧基羰基苯基所组成的一群组。
[0047] 根据本文所述的任何实施例中的一些实施例,R3是-OR16,并且R16是氢。
[0048] 根据本文所述的任何实施例中的一些实施例,R3为-OR16,并且R16选自于由甲基、乙基、丙基、丁基、戊基、丙烯基、2-羟乙基、3-羟丙基、2,3-二羟丙基以及甲氧基甲基所组成的一群组。
[0049] 根据本文所述的任何实施例中的一些实施例,R3、R4、R5以及R6中的至少一个或每一个是-OR16,并且R16独立地为酰基。
[0050] 根据本文所述的任何实施例中的一些实施例,R3、R4、R5以及R6中的每一个是OR16,并且R16是氢。
[0051] 根据本文所述的任何实施例中的一些实施例,R3、R4、R5、R6中的至少一个是OR16,并且R16是所述单糖部分。
[0052] 根据本文所述的任何实施例中的一些实施例,所述单糖部分由化学式II所表示:
[0053]
[0054] 化学式II
[0055] 其中:
[0056] 所述曲线表示附接物的一位置;
[0057] 所述虚线表示第5”位的一立体组态为R组态或S组态;
[0058] X2是-OR13或-NR14R15;
[0059] 每个R10、R11及R13是独立地选自于由氢、一取代或未取代的烷基、一取代或未取代的烯基、一取代或未取代的炔基、一取代或未取代的环烷基、一取代或未取代的芳基、一取代或未取代的杂芳基、一取代或未取代的烷芳基以及酰基所组成的一群组;
[0060] R12是选自于由氢、一取代或未取代的烷基、一取代或未取代的烯基、一取代或未取代的炔基、一取代或未取代的环烷基、一取代或未取代的芳基、一取代或未取代的杂芳基、一取代或未取代的烷芳基、一取代或未取代的氨基、一取代或未取代的酰氨基、酰基、羧酸根以及一饱和或不饱和的及/或取代的或未取代的羟烷基所组成的一群组;及
[0061] 每个R14及R15是独立地选自于由氢、一取代或未取代的烷基、一取代或未取代的烯基、一取代或未取代的炔基、一取代或未取代的环烷基、一取代或未取代的芳基、一取代或未取代的杂芳基、一取代或未取代的烷芳基、酰基以及一细胞可渗透性基团,或替代地,当存在R14及R15时形成一杂环。
[0062] 未显示在化学式II中的多个取代基,例如:第6’、1”、2”、3”、4”和5”位的取代基通常是氢,尽管是其他取代基,例如但不限于:如Ry2至Ry9所定义的也包括在内。
[0063] 根据本文所述的任何实施例中的一些实施例,所述化合物由化学式Ib表示:
[0064]
[0065] 化学式Ib。
[0066] 未显示在化学式Ib中的多个取代基,例如:第6’、1”、2”、3”、4”和5”位的取代基通常是氢,尽管是其他取代基,例如但不限于:如Ry2至Ry9所定义的也包括在内。
[0067] 根据本文所述的任何实施例中的一些实施例,X2是-OR13。
[0068] 根据本文所述的任何实施例中的一些实施例,X2是-NR14R15。
[0069] 根据本文所述的任何实施例中的一些实施例,R12不是氢。
[0070] 根据本文所述的任何实施例中的一些实施例,R10、R11及R13中的至少一个如果存在时则为酰基。
[0071] 根据本文所述的任何实施例中的一些实施例,X1为氧。
[0072] 根据本文所述的任何实施例中的一些实施例,环I中的C4’与C5’之间的所述键结为一单键。
[0073] 根据本文所述的任何实施例中的一些实施例,环I中的C4’与C5’之间的所述键结为一双键,并且Rx或R3,以及Rz为不存在。
[0074] 根据本文所述的任何实施例中的一些实施例,环I中的C4’与C3’之间的所述键结为一单键。
[0075] 根据本文所述的任何实施例中的一些实施例,环I中的C4’与C3’之间的所述键结为一双键,并且Rx或R4,以及R3为不存在。
[0076] 根据本文所述的任何实施例中的一些实施例,R1不是氢。
[0077] 根据本文所述的任何实施例中的一些实施例,R1是羟烷基。
[0078] 根据本文所述的任何实施例中的一些实施例,R1是羟甲基。
[0079] 根据本文所述的任何实施例中的一些实施例,R1是一取代或未取代的烷基、一取代或未取代的烯基或一取代或未取代的炔基。
[0080] 根据本文所述的任何实施例中的一些实施例,R1是选自于甲基、乙基、丙基、丁基以及戊基所组成的一群组。
[0081] 根据本文所述的任何实施例中的一些实施例,R1是或包括芳基。
[0082] 根据本文所述的任何实施例中的一些实施例,R1选自苯基、1-蒽基、1-萘基、2-萘基、2-菲基以及9-菲基。
[0083] 根据本文所述的任何实施例中的一些实施例,R1是或包括一取代或未取代的芳基。
[0084] 根据本文所述的任何实施例中的一些实施例,R1是选自于由苯基、1-蒽基、1-萘基、2-萘基、2-菲基以及9-菲基所组成的一群组。
[0085] 根据本文所述的任何实施例中的一些实施例,R 1是或包括一取代或未取代的杂芳基。
[0086] 根据本文所述的任何实施例中的一些实施例,R1是选自于由2-蒽基、2-呋喃基、2-吲哚基、2-萘基、2-吡啶基、2-嘧啶基、2-吡咯基、2-喹啉基、2-噻吩基、3-呋喃基、3-吲哚基、3-噻吩基、4-咪唑基、4-吡啶基、4-嘧啶基、4-喹啉基、5-甲基-2-噻吩基以及6-氯-3-吡啶基所组成的一群组。
[0087] 根据本文所述的任何实施例中的一些实施例,R1是或包括一取代的芳基。
[0088] 根据本文所述的任何实施例中的一些实施例,R1是选自于由2-(N-乙氨基)苯基、2-(N-己氨基)苯基、2-(N-甲氨基)苯基、2,4-二甲氧基苯基、2-乙酰氨基苯基、2-氨基苯基、
2-羧基苯基、2-氯苯基、2-乙氧基苯基、2-氟苯基、2-羟甲基苯基、2-羟基苯基、2-羟基苯基、
2-甲氧基羰基苯基、2-甲氧基苯基、2-甲基苯基、2-N,N-二甲氨基苯基、2-三氟甲基苯基、3-(N,N-二丁氨基)苯基、3-(N,N-二乙氨基)苯基、3,4,5-三甲氧基苯基、3,4-二氯苯基、3,4-二甲氧基苯基、3,5-二甲氧基苯基、3-氨基苯基、3-联苯基、3-羧基苯基、3-氯-4-甲氧基苯基、3-氯苯基、3-乙氧基羰基苯基、3-乙氧基苯基、3-氟苯基、3-羟甲基苯基、3-羟基苯基、3-异戊氧基苯基、3-异丁氧基苯基、3-异丙氧基苯基、3-甲氧基苯基、3-甲基苯基、3-N,N-二甲氨基苯基、3-甲苯基、3-三氟甲基苯基、4-(苄氧基)苯基、4-(异丙氧羰基)苯基、4-(N,N-二乙氨基)苯基、4-(N,N-二己氨基)苯基、4-(N,N-二异丙氨基)苯基、4-(N,N-二甲氨基)苯基、
4-(N,N-二-n-戊氨基)苯基、4-(n-己氧羰基)苯基、4-(N-甲氨基)苯基、4-(三氟甲基)苯基、
4-氨基苯基、4-苯氧基苯基、4-联苯基、4-丁氧基苯基、4-丁酰胺苯基、4-羧基苯基、4-氯苯基、4-乙氧基羰基苯基、4-己酰胺苯基、4-羟甲基苯基、4-羟基苯基、4-碘苯基、4-异丁基苯基、4-异丁酰胺苯基、4-异丙氧基苯基、4-异丙基苯基、4-甲氧基苯基、4-甲基苯基、4-n-己酰氨基苯基、4-n-己氧基苯基、4-硝基苯基、4-硝基苯基、4-丙酰胺苯基、4-甲苯基、4-三氟甲基苯基以及4-戊酰氧基羰基苯基所组成的一群组。
[0089] 根据本文所述的任何实施例中的一些实施例,R1是否包括胺基。
[0090] 根据本文所述的任何实施例中的一些实施例,R1是选自于由-NH2、-NHCH3、-N(CH3)2、-NH-CH2-CH2-NH2、-NH-CH2-CH2-OH以及-NH-CH2-CH(OCH3)2。
[0091] 根据本文所述的任何实施例中的一些实施例,R2是氢。
[0092] 根据本文所述的任何实施例中的一些实施例,R2是烷基,且优选地选自于由甲基、乙基以及丙基所组成的一群组。
[0093] 根据本文所述的任何实施例中的一些实施例,R2是酰基。
[0094] 根据本文所述的任何实施例中的一些实施例,R7是选自于由氢、(R/S)-4-氨基2-羟基丁酰基(AHB)、(R/S)-3-氨基-2-羟基丙酸根(AHP)、(R/S)-3-氨基-2-羟基丙酰基、5-氨基戊酰基、5-羟基戊酰基、甲酰基、-C(=O)-O-甲基、-C(=O)-O-乙基、-C(=O)-O-苄基、-β-氨基-α-羟基丙酰基、-δ-氨基-α-羟基戊酰基、-β-苄氧基羰氨基-α羟基丙酰基、-δ-苄氧基羰基氨基-α羟基戊酰基、甲基磺酰基、苯磺酰基、苯甲酰基、丙基、异丙基、-(CH2)2NH2、-(CH2)3NH2、-CH2CH(NH2)CH3、-(CH2)4NH2、-(CH2)5NH2、-(CH2)2NH-乙基、-(CH2)2NH(CH2)2NH2、-(CH2)3NH(CH2)3NH2、-(CH2)3NH(CH2)4NH(CH2)3NH2、-CH(-NH2)CH2(OH)、-CH(-OH)CH2(NH2)、-CH(-OH)-(CH2)2(NH2)、-CH(-NH2)-(CH2)2(OH)、-CH(-CH2NH2)-(CH2OH)、-(CH2)4NH(CH2)3NH2、-(CH2)2NH(CH2)2NH(CH2)2NH2、-(CH2)2N(CH2CH2NH2)2、-CH2-C(=O)NH2、-CH(CH3)-C(=O)NH2、-CH2-苯基、-CH(i-丙基)-C(=O)NH2、-CH(苄基)-C(=O)NH2、-(CH2)2OH、-(CH2)3OH以及-CH(CH2OH)2所组成的一群组。
[0095] 根据本文所述的任何实施例中的一些实施例,每个R8及R9是独立地选自于由氢、(R/S)-4-氨基2-羟基丁酰基(AHB)、(R/S)-3-氨基-2-羟基丙酸根(AHP)、(R/S)-3-氨基-2-羟基丙酰基、5-氨基戊酰基、5-羟基戊酰基、甲酰基、-COO-甲基、-COO-乙基、-COO-苄基、-β-氨基-α-羟基丙酰基、-δ-氨基-α-羟基戊酰基、-β-苄氧基羰氨基-α羟基丙酰基、-δ-苄氧基羰基氨基-α羟基戊酰基、甲基磺酰基、苯磺酰基、苯甲酰基、丙基、异丙基、-(CH2)2NH2、-(CH2)3NH2、-CH2CH(NH2)CH3、-(CH2)4NH2、-(CH2)5NH2、-(CH2)2NH-乙基、-(CH2)2NH(CH2)2NH2、-(CH2)3NH(CH2)3NH2、-(CH2)3NH(CH2)4NH(CH2)3NH2、-CH(-NH2)CH2(OH)、-CH(-OH)CH2(NH2)、-CH(-OH)-(CH2)2(NH2)、-CH(-NH2)-(CH2)2(OH)、-CH(-CH2NH2)-(CH2OH)、-(CH2)4NH(CH2)3NH2、-(CH2)2NH(CH2)2NH(CH2)2NH2、-(CH2)2N(CH2CH2NH2)2、-CH2-C(=O)NH2、-CH(CH3)-C(=O)NH2、-CH2-苯基、-CH(i-丙基)-C(=O)NH2、-CH(苄基)-C(=O)NH2、-(CH2)2OH、-(CH2)3OH以及-CH(CH2OH)2所组成的一群组。
[0096] 根据本文所述的任何实施例中的一些实施例,所述氨基取代的α-羟基酰基为(S)-4-氨基-2-羟基丁酰基(AHB)。
[0097] 根据本文所述的任何实施例中的一些实施例,所述细胞可渗透性基团为胍基。
[0098] 根据本文所述的任何实施例中的一些实施例,在所述多个相对应的实施例中任一个所述的一未取代的芳基是选自于由苯基、1-蒽基、1-萘基、2-萘基、2-菲基以及9-菲基所组成的一群组。
[0099] 根据本文所述的任何实施例中的一些实施例,在所述多个相对应的实施例中任一个中的取代或未取代的杂芳基选自于由2-蒽基、2-呋喃基、2-吲哚基、2-萘基、2-吡啶基、2-嘧啶基、2-吡咯基、2-喹啉基、2-噻吩基、3-呋喃基、3-吲哚基、3-噻吩基、4-咪唑基、4-吡啶基、4-嘧啶基、4-喹啉基、5-甲基-2-噻吩基以及6-氯-3-吡啶基所组成的一群组。
[0100] 根据本文所述的任何实施例中的一些实施例,在所述多个相对应的实施例中任一个中的一取代的芳基选自于由2-(N-乙氨基)苯基、2-(N-己氨基)苯基、2-(N-甲氨基)苯基、2,4-二甲氧基苯基、2-乙酰氨基苯基、2-氨基苯基、2-羧基苯基、2-氯苯基、2-乙氧基苯基、
2-氟苯基、2-羟甲基苯基、2-羟基苯基、2-羟基苯基、2-甲氧基羰基苯基、2-甲氧基苯基、2-甲基苯基、2-N,N-二甲氨基苯基、2-三氟甲基苯基、3-(N,N-二丁氨基)苯基、3-(N,N-二乙氨基)苯基、3,4,5-三甲氧基苯基、3,4-二氯苯基、3,4-二甲氧基苯基、3,5-二甲氧基苯基、3-氨基苯基、3-联苯基、3-羧基苯基、3-氯-4-甲氧基苯基、3-氯苯基、3-乙氧基羰基苯基、3-乙氧基苯基、3-氟苯基、3-羟甲基苯基、3-羟基苯基、3-异戊氧基苯基、3-异丁氧基苯基、3-异丙氧基苯基、3-甲氧基苯基、3-甲基苯基、3-N,N-二甲氨基苯基、3-甲苯基、3-三氟甲基苯基、4-(苄氧基)苯基、4-(异丙氧羰基)苯基、4-(N,N-二乙氨基)苯基、4-(N,N-二己氨基)苯基、4-(N,N-二异丙氨基)苯基、4-(N,N-二甲氨基)苯基、4-(N,N-二-n-戊氨基)苯基、4-(n-己氧羰基)苯基、4-(N-甲氨基)苯基、4-(三氟甲基)苯基、4-氨基苯基、4-苯氧基苯基、4-联苯基、4-丁氧基苯基、4-丁酰胺苯基、4-羧基苯基、4-氯苯基、4-乙氧基羰基苯基、4-己酰胺苯基、4-羟甲基苯基、4-羟基苯基、4-碘苯基、4-异丁基苯基、4-异丁酰胺苯基、4-异丙氧基苯基、4-异丙基苯基、4-甲氧基苯基、4-甲基苯基、4-n-己酰氨基苯基、4-n-己氧基苯基、4-硝基苯基、4-硝基苯基、4-丙酰胺苯基、4-甲苯基、4-三氟甲基苯基以及4-戊酰氧基羰基苯基所组成的一群组。
[0101] 根据本文所述的任何实施例中的一些实施例,本文在任何相应的实施例中描述的酰基是选自于具有2至18个原子酰基所组成的一群组,可选地,所述烃酰基被卤代、硝基、羟基、胺、氰基、硫氰基及烷氧基中的一种或多种所取代。
[0102] 根据本文所述的任何实施例中的一些实施例,所述酰基是衍生自选自于一饱和或不饱和及/或取代或未取代的脂肪族羧酸、乙酸、丙酸、丁酸、异丁酸、叔丁基乙酸、戊酸、异戊酸、己酸、辛酸、癸酸、十二酸、月桂酸、三癸酸、肉豆蔻酸、十五烷酸、棕榈酸、十七酸、硬脂酸丙烯酸、巴豆酸、十一碳烯酸、十八烯酸、己炔酸、庚炔酸、辛炔酸、一饱和或不饱和的脂环族羧酸、环丁烷羧酸、环戊烷羧酸、环戊烯羧酸、甲基环戊烯羧酸、环己烷羧酸、二甲基环己烷羧酸、二丙基环己烷羧酸、一饱和或不饱和的脂环族脂肪族羧酸、环戊乙酸、环戊丙酸、环己乙酸、环己丁酸、甲基环己乙酸、一取代或未取代的芳香族羧酸、苯甲酸、甲苯酸、萘甲酸、乙基苯甲酸、异丁基苯甲酸、甲基丁基苯甲酸、芳香族脂肪族羧酸、苯乙酸、苯丙酸、苯戊酸、肉桂酸、苯丙炔酸、萘乙酸、卤代烷氧基烃羧酸、硝基烷氧基烃羧酸、羟基烷氧基烃羧酸、氨基烷氧基烃羧酸、氰基烷氧基烃羧酸、硫氰基烷氧基羧酸、单乙酸、二乙酸、三氯乙酸、1,2,3,4,5,6-六氯环己烷羧酸、1,2-二溴-4-甲基环己烷羧酸、1,6-二溴-3-甲基环己烷羧酸、
1-溴-3,5-二甲基环己烷羧酸、2-氯环己烷羧酸、4-氯环己烷羧酸、2,3-二溴-2-甲基环己烷羧酸、2,4,6-三硝基苯甲酸、2,5-二溴-2-甲基环己烷羧酸、2-溴-4-甲基环己烷羧酸、2-硝基-1-甲基-环丁羧酸、3,4-二硝基苯甲酸、3,5-二硝基苯甲酸、3-溴-2,2,3-三甲基环戊烷羧酸、3-溴-2-甲基环己烷羧酸、3-溴-3-甲基环己烷羧酸、4-溴-2-甲基环己烷羧酸、5-溴-
2-甲基环己烷羧酸、‘4、4-二氯苯甲酸、4,5-二溴-2-甲基环己烷羧酸、5-溴-2-甲基环己烷羧酸、6-溴-2-甲基环己烷羧酸、5,6-二溴-2-甲基环己烷羧酸、6-溴-3-甲基环己烷羧酸、茴香酸、氰乙酸、氰丙酸、乙氧基甲酸(乙基碳酸)、没食子酸、尿黑酸、邻氯苯酸、间氯苯酸以及对氯苯酸、乳酸、甲羟戊酸、邻硝基苯甲酸、间硝基苯甲酸以及对羟基苯甲酸、水杨酸、莽草酸、硫氰基乙酸、三甲氧基苯甲酸、三甲氧基肉桂酸、藜芦酸、α-及β-氯丙酸、α-及γ-溴丁酸、α-及δ-碘戊酸以及β-间苯二甲酸所组成的一群组。
[0103] 根据本发明的一些实施例的一个方面,提供了一种药物组合物,所述药物组合物包括在所述多个实施例中的任一个实施例所述的化合物及其任何的组合,以及一药学上可接受的载体。
[0104] 根据本文所述的任何实施例中的一些实施例,所述药物组合物被包装在一包装材料中,并且印刷在包装材料中或包装材料上进行辨识,用于具有一提前终止密码子截短突变和/或一蛋白质截短表现型的一遗传性疾病的所述治疗。
[0105] 根据本发明一些实施例的一个方面,提供了用于治疗具有一提前终止密码子截短突变和/或一蛋白质截短表现型的一遗传性疾病的方法,所述方法包括向一有需要的个体给药如所述多个实施例中任一个所述的化合物及其任何的组合的一治疗有效量
[0106] 根据本发明一些实施例的一个方面,提供了一种如所述多个实施例中的任一个实施例及其任何的组合中所述的化合物,用于具有一提前终止密码子截短突变和/或一蛋白质截短表现型的一遗传性疾病的所述治疗。
[0107] 根据本发明一些实施例的一个方面,提供了一种如所述多个实施例中的任一个实施例及其任何的组合中所述的化合物的用途,在用于治疗具有一提前终止密码子截短突变和/或一蛋白质截短表现型的一遗传性疾病的一药剂的所述制造。
[0108] 根据本文所述的任何实施例中的一些实施例,所述遗传性疾病是选自于由囊性纤维化(CF)、杜兴氏肌肉营养不良(DMD)、共济失调毛细血管扩张症、胡勒综合症、A型血友病、B型血友病、乌谢尔综合症、戴萨克斯症、贝克肌肉营养不良症(BMD)、先天性肌肉营养不良症(CMD)、第七因子缺乏症、家族性心房颤动症、黑利-黑利病、麦卡德尔病、粘多糖病、肾病性胱氨酸病、多囊肾病、蕾特氏综合症、脊髓性肌肉萎缩症(SMA)、胱氨酸症、严重大疱性表皮松解症、爪费综合症、X染色体关联的肾源性尿崩症(XNDI)、X染色体关联的视网膜色素病变及癌症所组成的一群组。
[0109] 根据本发明一些实施例的一个方面,提供了一种增加具有一提前终止密码子突变的一基因的所述表达水平的方法,所述方法包括:在所述多个相对应的实施例中的任何一个及其任何的组合中所述的一化合物存在的情况下将所述基因转译成一蛋白质。
[0110] 根据本发明的一些实施例的一个方面,提供了一种如所述多个相对应的实施例中的任何一个及其任何的组合中所述的化合物,所述化合物是用于增加具有一提前终止密码子突变的基因的所述表达水平。
[0111] 根据本发明的一些实施例的一个方面,提供了一种如所述多个相对应的实施例中的任何一个及其任何的组合中所述的化合物的用途,所述用途在用于增加具有一提前终止密码子突变的一基因的所述基因表达水平的一药剂中的一制备。
[0112] 根据本文所述的任何实施例中的一些实施例,所述提前终止密码子突变具有选自由UGA、UAG及UAA所组成的一群组的一核糖核酸(RNA)编码。
[0113] 根据本文所述的任何实施例中的一些实施例,所述蛋白质是在一细胞质转译系统中转译。
[0114] 根据本文所述的任何实施例中的一些实施例,所述化合物是以一突变抑制量来使用。
[0115] 根据本文所述的任何实施例中的一些实施例,所述化合物在一真核生物细胞质转译系统中的一转译抑制的IC50大于所述化合物在一核糖体转译系统中转译抑制的IC50。
[0116] 根据本文所述的任何实施例中的一些实施例,所述化合物在真核生物细胞质转译系统中的转译抑制的IC50大于所述化合物在原核生物转译系统中转译抑制的IC50。
[0117] 除非另加说明,否则本文所使用的所有技术术语和/或科学术语都具有与本发明所属领域的普通技术人员通常所理解的相同的含意。虽然本发明的实施方式可以通过类似或等同于本发明的实施方式所述的任何方法和材料实施或测试,本发明的实施方式、列举的方法和/或材料已在下面描述。在冲突的情况下,将以本专利说明书包括定义以控制。此外,材料、方法和实施方式仅是举例性质,并且不必然用以限制。附图说明
[0118] 在此描述的本发明的一些实施例仅通过举例的方式并参考多个附图描述,通过详细说明附图具体的参考资料,应当强调所示的细节仅为举例,用以说明本发明实施例的目的。基于这点,结合所述附图及描述使得本领域技术人员能清楚的实施本发明的实施例。
[0119] 在附图中:
[0120] 图1(背景技术)示出一些已知的氨基糖苷类家族的所述多个化学结构;
[0121] 图2A至2C示出比较条形图,所述比较条形图显示了所述蕾特氏综合症的引起提前终止密码子突变R168X(图2A)、R270X(图2B)以及R294X(图2C)的多个通读水平,如根据本发明的一些实施例的多个示例性化合物中所测量和计算的,基于将所述萤火虫萤光/海肾萤光的表达比率与在野生型(WT)中所观察到的所述多个表达比率相比,以一浓度为0.3毫摩尔浓度(mM)以及1毫摩尔浓度以及对照组样本(不添加化合物)与多个表达HEK293细胞接触
[0122] 图3A至3C示出比较性条形图,所述比较条形图显示了所述蕾特氏综合症引起的提前终止密码子突变R168X(图3A)、R270X(图3B)以及R294X(图3C)的多个通读水平,如根据本发明的一些实施例的多个示例性化合物中所测量和计算的,基于将在所述对照组样本(100%)的所述萤火虫萤光/海肾萤光的表达比率的分数,以及与在野生型中所观察到的所述多个表达比率相比,以一浓度为0.3毫摩尔浓度以及1毫摩尔浓度以及对照组样本(未加入化合物)与表达多个HEK293细胞接触;
[0123] 图4A至4F示出了对于根据本发明的一些实施例的多个示例性化合物NB144、NB145以及NB146以一浓度范围为0至50微摩尔浓度(μM)进行的囊性纤维化G542X无义突变抑制的剂量反应的多个无细胞测定的多个结果,其中图4A显示出在所述野生型序列的下游中发现的所述萤火虫萤光素酶的所述表达水平,图4B显示出在所述G542X突变序列的下游中发现的所述萤火虫萤光素酶的所述表达水平,图4C显示出在所述野生型序列的上游中发现的所述海肾荧光素酶的所述表达水平,图4D显示出在所述G542X突变序列的上游中发现的所述海肾荧光素酶的所述表达水平,图4E显示出在野生型序列中测量的所述萤火虫萤光/海肾萤光的所述表达比率,图4F显示出在所述G542X突变序列中测量的所述萤火虫萤光/海肾萤光表达比率;
[0124] 图5A至5B示出了对于根据本发明的一些实施例的多个示例性化合物NB144、NB145以及NB146以一浓度范围为0至50微摩尔浓度进行的囊性纤维化G542X无义突变抑制的剂量反应的多个无细胞测定的多个结果,其中图5A显示出在所述突变序列的下游中发现的所述萤火虫萤光素酶的所述表达水平,作为所述对照组实验(未加入化合物)中的所述表达水平的一分率,以及图5B显示出在所述突变序列的下游及上游中发现的所述萤火虫萤光/海肾萤光的所述表达比率,作为所述对照组实验(未加入化合物)中的所述表达水平的一分率;
[0125] 图6A至6F示出了对于根据本发明的一些实施例的多个示例性化合物NB150、NB151以及NB152以一浓度范围为0至50微摩尔浓度进行的囊性纤维化G542X无义突变抑制的剂量反应的多个无细胞测定的多个结果,其中图6A显示出在所述野生型序列的下游中发现的所述萤火虫萤光素酶的所述表达水平,图6B显示出在所述G542X突变序列的下游中发现的所述萤火虫萤光素酶的所述表达水平,图6C显示出在所述野生型序列的上游中发现的所述海肾荧光素酶的所述表达水平,图6D显示出在所述G542X突变序列的上游中发现的所述海肾荧光素酶的所述表达水平,图6E显示出在野生型序列中测量的所述萤火虫萤光/海肾萤光的所述表达比率,图6F显示出在所述G542X突变序列中测量的所述萤火虫萤光/海肾萤光表达比率;
[0126] 图7A至7B示出了对于根据本发明的一些实施例的多个示例性化合物NB150、NB151以及NB152以一浓度范围为0至50微摩尔浓度进行的囊性纤维化G542X无义突变抑制的剂量反应的多个无细胞测定的多个结果,其中图7A显示出在所述突变序列的下游中发现的所述萤火虫萤光素酶的所述表达水平,作为所述对照组实验(未加入化合物)中的所述表达水平的一分率,以及图7B显示出在所述突变序列的下游及上游中发现的所述萤火虫萤光/海肾萤光的所述表达比率,作为所述对照组实验中的所述表达水平的一分率;
[0127] 图8A至8C示出了对于根据本发明的一些实施例的多个示例性化合物NB144、NB145、NB146、NB150、NB151以及NB152以一浓度为5微摩尔浓度进行的蕾特氏综合症R168X(图8A)、R270X(图8B)以及R294X(图8C)的无义突变抑制的剂量反应的多个无细胞测定的多个结果,显示萤出所述萤火虫萤光/海肾萤光表达比率为对所述对照组样本(未添加化合物;100%)所测量的所述萤火虫萤光/海肾萤光的一表达比率的一分率。
[0128] 图9A至9B示出了化合物35(上方的光谱)及化合物36(下方的光谱)的氢核磁共振(1H NMR)的磁各向异性的光谱,显示了所述核磁共振氢谱中的所述指定质子的化学位移值的所述差异(图9A)以及相对应的MaNP扇区规则(图9B)。
[0129] 图10示出了多个比较图,显示出由化合物1(-■-)、NB153(-▲-)以及NB155(-Δ-)在表示USH1遗传性疾病的R3X无义突变的构建体中所诱导的体外终止密码子的多个抑制水平。
[0130] 图11A至11D示出了多个比较图,显示出由NB74(-Δ-)、NB156(-▲-)以及庆大霉素(--■--)(左)以及NB124(-Δ-)、NB157(-▲-)以及庆大霉素(--■--)(右)在表示R3X(USH1)(图11A)、R245X(USH1)(图11B)、Q70X(HS)(图11C)以及G542X(CF)(图11D)的无义构建体中所诱导的多个体外终止密码子的多个抑制水平。
[0131] 图12A示出了多个比较终止密码子突变的通读图,显示出作为野生型与NB156的一浓度函数的通读百分比(通读至海肾萤光为50%),并比较几种不同的突变的所述通读;
[0132] 图12B示出了多个比较终止密码子突变的通读图,显示出作为NB156浓度的一函数,从未处理的对照组到暴露在NB156后的通读的倍数增加,并比较几种不同突变的所述通读;
[0133] 图13A示出了多个比较终止密码子突变的通读图,显示出作为野生型与NB157的一浓度函数的通读百分比(通读至海肾萤光为50%),并比较几种不同的突变的所述通读;和[0134] 图13B示出了多个比较终止密码子突变的通读图,显示出作为NB157浓度的一函数,从未处理的对照组到暴露在NB157后的通读的倍数增加,并比较几种不同突变的所述通读。

具体实施方式

[0135] 本发明在其一些实施例中涉及氨基糖苷类,及更具体地,但不限于涉及新颖的氨基糖苷的多个衍生物及其在增加具有一终止密码子突变的一基因的一表达和/或在多个遗传性病症的治疗的用途。
[0136] 具体而言,本发明在本发明的一些实施例中涉及一种新颖的氨基糖苷类化合物,所述氨基糖苷类化合物衍生自巴龙霉胺,所述巴龙霉胺在哺乳动物细胞中表现出高度的多个提前终止密码子突变的通读活性并同时产生低毒性,以及其特征在于改善的生物利用度和/或细胞可渗透性。本发明的多个实施例进一步为多种包含有所述多个化合物的多个药物组合物,以及所述多个药物组合物在多个遗传性疾病的治疗中的多种用途,本发明的多个实施方式进一步为多种制备所述多个化合物的方法。
[0137] 参考所述多个附图和所附的多个描述能更好地理解本发明的所述多个原理和操作。
[0138] 在详细说明本发明的至少一个实施方式之前,应当理解本发明不限定于在以下的描述或所示例的多个实施例的所述多个细节的应用。本发明能够以其他实施方式或以各种方法来实施或应用。同样,应该理解本文使用的措辞和术语是为了说明目的,不应视为限制。
[0139] 如上所述,所述使用氨基糖苷类作为多个治疗剂主要是因为所述氨基糖苷类的高毒性而受到限制。在多个遗传性疾病的治疗的背景下,这样的一用途进一步受到所述氨基糖苷类所展现的所述抗菌活性的限制,所述抗菌活性也可以转化为毒性。
[0140] 与氨基糖苷类相关的其他限制包括低生物利用度,所述低生物利用度通常地需要一静脉给药或皮下给药,并且进入多个真核细胞的可渗透性差,所述多个真核细胞通常需要多个高剂量的给药,而所述高剂量的给药与副作用相关联。氨基糖苷类的所述高水溶性和极性被认为限制了所述氨基糖苷类通过多个肠道组织的吸光度以及所述氨基糖苷类通过多个细胞膜的可渗透性。
[0141] 如上文所进一步讨论,在巴龙霉胺结构上的几个结构操作已产生了合成的氨基糖苷类,已经显示出在多个哺乳动物细胞中产生低毒性时发挥改善的多个提前终止密码子突变的通读活性。WO 2007/113841以及WO 2012/066546描述了这样的氨基糖苷类,其通过引用并入本文,如同在本文中充分阐述。
[0142] 在进一步破译所述氨基糖苷类的所述结构与活性的关系时,在尝试进一步改善所述氨基糖苷类在多个遗传性疾病的背景下的治疗效果,本发明人已在所述巴龙霉胺的结构上的不同位置设计了许多额外的修饰,所述结构通过化学式I及Ia集中地表示在本文。
[0143] 在将本发明予以实践的同时,制备示例性的新颖的氨基糖苷类的多个结构。如下述多个实施例部分所证明,使用所述多个化合物以展现出多个致病性无义突变的高度通读活性以及降低的毒性。
[0144] 所述多个化合物:
[0145] 根据本发明一些实施例的一个方面,提供了多个新颖的氨基糖苷(AMG)化合物(本文也称为“多个氨基糖苷衍生物”),由化学式Ia集中地表示:
[0146]
[0147] 化学式Ia
[0148] 其中:
[0149] 所述虚线表示第6’位的一立体组态为R组态或S组态;
[0150] X1为氧或硫;
[0151] 环I中的C4’与C5’之间的所述虚线的键结表示一单键或一双键;
[0152] 环I中的C4’与C3’之间的所述虚线的键结表示一单键或一双键;
[0153] Rx、Ry1及Rz为各自独立的氢、烷基、烯基、炔基、烷芳基、芳杂环芳基、环烷基或不存在,其中在C4’与C5’之间的所述虚线的键结为一双键的情况下至少Rz为不存在,以及在C4’与C3’之间的所述虚线的键结为一双键的情况下至少Ry1为不存在;
[0154] Ry2至Ry9以及Rw1至Rw3为各自独立地选自于氢、烷基、烯基、炔基、烷芳基、芳基、杂芳基以及环烷基,每个所述Ry2至Ry9以及Rw1至Rw3为取代的或未取代的,或替代地,每个所述Ry2至Ry9以及Rw1至Rw3可以为如在此所定义的R7至R9;
[0155] R1是选自于由氢、一取代或未取代的烷基、一取代或未取代的烯基、一取代或未取代的炔基、一取代或未取代的环烷基、一取代或未取代的芳基、一取代或未取代的杂芳基、一取代或未取代的烷芳基、一取代或未取代的氨基、一取代或未取代的酰氨基、酰基、羧酸根以及一饱和或不饱和及/或取代或未取代的羟烷基(例如-CH2-OH)所组成的一群组;
[0156] R2是选自于由氢、一取代或未取代的烷基、一取代或未取代的烯基、一取代或未取代的炔基、一取代或未取代的环烷基、一取代或未取代的芳基、一取代或未取代的杂芳基、一取代或未取代的烷芳基以及酰基所组成的一群组;
[0157] R3及R4为各自独立地选自于由氢、烷基、炔基、环烷基、杂脂环基、芳基、杂芳基、胺以及-OR16所组成的一群组,其中R16是独立地(当R3至R6中的2个或多个为所述-OR16时)选自于氢、一单糖部分、一寡糖部分、一取代或未取代的烷基、一取代或未取代的烯基、一取代或未取代的炔基、一取代或未取代的环烷基、一取代或未取代的芳基、一取代或未取代的杂芳基、一取代或未取代的烷芳基以及酰基或不存在,其中在C4’与C5’之间的所述虚线的键结为一双键的情况下R3可选地为不存在,在C4’与C3’之间的所述虚线的键结为一双键的情况下R4可选地为不存在;
[0158] R7至R9为各自独立地选自于由氢、酰基、氨基取代的α-羟基酰基、一取代或未取代的烷基、一取代或未取代的烯基、一取代或未取代的炔基、一取代或未取代的环烷基、一取代或未取代的芳基、一取代或未取代的烷芳基、羧酸根、磺酰基(包括烷基磺酰基及芳基磺酰基)以及一细胞可渗透性基团所组成的一群组。
[0159] 根据本文所述的任何实施例中的一些实施例,所述化合物是一假二糖,所述假二糖具有如代学式Ia所示的环I和环II。
[0160] 在所述多个实施例中,R3至R6中没有一个是-OR16,其中R16是一单糖部分或一寡糖部分。
[0161] 在所述多个实施例的一些实施例中,R3至R6中的一个或多个或全部是-OR16。
[0162] 在所述多个实施例的一些实施例中,R3至R6中的一个或多个或全部是-OR16,以及R16独立地是可被取代或未被取代的芳基。在这些实施例中,R3至R6中的一个或多个或全部为如在此所定义的芳氧基。
[0163] 在所述多个实施例的一些实施例中,所述芳基是未取代的,使得R3至R6中的一个或多个或全部可以是独立地作为非限制性的多个示例为:苯氧基、1-蒽氧基、1-萘氧基、2-萘氧基、2-菲氧基以及9-菲氧基。
[0164] 在所述多个实施例的一些实施例中,在-OR16中的一个或多个中的一个或多个芳基为一取代的芳基,使得R3至R6中的一个或多个或全部可以是独立地作为非限制性的多个示例为芳氧基,其中所述芳基为2-(N-乙氨基)苯基、2-(N-己氨基)苯基、2-(N-甲氨基)苯基、2,4-二甲氧基苯基、2-乙酰氨基苯基、2-氨基苯基、2-羧基苯基、2-氯苯基、2-乙氧基苯基、
2-氟苯基、2-羟甲基苯基、2-羟基苯基、2-羟基苯基、2-甲氧基羰基苯基、2-甲氧基苯基、2-甲基苯基、2-N,N-二甲氨基苯基、2-三氟甲基苯基、3-(N,N-二丁氨基)苯基、3-(N,N-二乙氨基)苯基、3,4,5-三甲氧基苯基、3,4-二氯苯基、3,4-二甲氧基苯基、3,5-二甲氧基苯基、3-氨基苯基、3-联苯基、3-羧基苯基、3-氯-4-甲氧基苯基、3-氯苯基、3-乙氧基羰基苯基、3-乙氧基苯基、3-氟苯基、3-羟甲基苯基、3-羟基苯基、3-异戊氧基苯基、3-异丁氧基苯基、3-异丙氧基苯基、3-甲氧基苯基、3-甲基苯基、3-N,N-二甲氨基苯基、3-甲苯基、3-三氟甲基苯基、4-(苄氧基)苯基、4-(异丙氧羰基)苯基、4-(N,N-二乙氨基)苯基、4-(N,N-二己氨基)苯基、4-(N,N-二异丙氨基)苯基、4-(N,N-二甲氨基)苯基、4-(N,N-二-n-戊氨基)苯基、4-(n-己氧羰基)苯基、4-(N-甲氨基)苯基、4-(三氟甲基)苯基、4-氨基苯基、4-苯氧基苯基、4-联苯基、4-丁氧基苯基、4-丁酰胺苯基、4-羧基苯基、4-氯苯基、4-乙氧基羰基苯基、4-己酰胺苯基、4-羟甲基苯基、4-羟基苯基、4-碘苯基、4-异丁基苯基、4-异丁酰胺苯基、4-异丙氧基苯基、4-异丙基苯基、4-甲氧基苯基、4-甲基苯基、4-n-己酰氨基苯基、4-n-己氧基苯基、4-n-正己基苯基、4-硝基苯基、4-硝基苯基、4-丙酰胺苯基、4-甲苯基、4-三氟甲基苯基以及4-戊酰氧基羰基苯基。
[0165] 在所述多个实施例的一些实施例中,R3至R6中的一个或多个或全部是-OR16,并且R16独立地为可以被取代或未被取代的杂芳基。在这些实施例中,R3至R6中的一个或多个或全部是如本文所定义的杂芳氧基。
[0166] 在一些实施例中,R3至R6中的一个或多个或全部可以是独立地作为非限制性的多个示例为:2-蒽氧基,2-呋喃氧基,2-吲哚氧基,2-萘氧基,2-吡啶氧基,2-嘧啶氧基,2-吡咯氧基,2-喹啉氧基,2-噻吩氧基,3-呋喃氧基,3-吲哚氧基,3-噻吩氧基,4-咪唑氧基,4-吡啶氧基,4-嘧啶氧基,4-喹啉氧基,5-甲基-2-噻吩氧基和6-氯-3-吡啶。
[0167] 在本文所述的任何实施例中的一些实施例中,R3是如本文所述的芳氧基或杂芳氧基。
[0168] 在本文所述的任何实施例中的一些实施例中,R3是-OR16,并且R16是一取代或未取代的烷基或烯基,例如:甲基、乙基、丙基、丁基、戊基、丙烯基、2-羟乙基、3-羟丙基、2,3-二羟丙基以及甲氧基甲基。
[0169] 在本文所述的任何实施例中的一些实施例中,R3是-OR16,并且R16是氢。
[0170] 在本文所述的任何实施例中的一些实施例中,R4是-OR16,并且R16是氢。
[0171] 在本文所述的任何实施例中的一些实施例中,每个R3及R4为-OR16,并且R16为氢。
[0172] 在此描述的任何实施例中的一些实施例中,R3至R6中的一个或多个或全部是-OR16。
[0173] 在所述多个实施例的一些实施例中,在每个R3至R6中,R16是氢。
[0174] 在所述多个实施例的一些实施例中,在R3至R6中的一个或多个或全部中,R16不是氢。
[0175] 在本文所述的任何实施例中的一些实施例中,当在R3至R6中的一个或多个或全部为-OR16,并且当所述R16部分中的一个或多个或全部不是氢时,每个R3至R6的R16可以相同或不同。
[0176] 在所述多个实施例的一些实施例中,当在R3至R6中的一个或多个或全部不是氢,R16可以独立地为,例如:如本文所述的烷基、烯基、炔基、环烷基、芳基或杂芳基,可选地,各自为被取代的。
[0177] 在本文所述的任何实施例中的一些实施例中,在R3至R6中,R16独立地为酰基,在所述相应的位置上形成酯(羧酸酯)。
[0178] 在本文中,术语“酰基”描述为一个-C(=O)-R’基团,其中R’如本文所述。
[0179] 在本文所述的任何实施例中的一些实施例中,在本文所述的任何实施例中的一些实施例中,当R16为酰基时,R’为如本文所述的烃链,可选地为被取代的烃链。在一些实施例中,所述烃链的长度为2至18个碳原子。在一些实施例中,所述酰基是具有2至18个碳原子的烃基酰基,可选地,被一个或多个卤代、硝基、羟基、胺、氰基、硫代氰基以及烷氧基取代。
[0180] 这里,术语“烃”或“烃基”描述了包括一有机部分,所述有机部分包括一个碳原子链作为所述有机部分的一基本骨架,所述碳原子链在本文中也被称为一主链,主要由氢原子取代。所述烃可以是饱和的或非饱和的,所述烃由脂肪族、脂环族和/或芳香族部分组成,并且任选地,可以被一个或多个取代基(不是氢)取代。一个取代烃可以有一个或多个取代基,凭此,每个取代基可以独立地为,例如:烷基、环烷基、烯基、炔基、芳基、杂芳基、氨基、卤化物、磺酸、亚砜、磷酸盐、羟基、烷氧基、芳氧基、硫代巯基、硫代烷氧基、硫代芳氧基、氰基、硝基、偶氮、叠氮化物,磺胺、羧基、硫代氨基甲酸酯、尿素、硫脲、氨基甲酸酯、酰胺以及酰肼,以及本文所述的任何其它的取代基。
[0181] 可选地,所述烃部分可以被一个或多个杂原子间隔,所述杂原子包括但不限于:一个或多个氧、氮(取代或未取代的,如本文对于-NR’-所定义的)和/或多个硫原子。
[0182] 在任何的所述多个实施例中的一些实施例涉及一种烃,所述烃不被任何的杂原子间隔,所述烃在所述烃的主链中亦不包含杂原子,并且可以是一种亚烷基链,或者包括以任何顺序彼此共价连接的烷基、环烷基、芳基、烯烃和/或炔烃。
[0183] 在本文所述的任何实施例的一些实施例中,当R16是酰基时,所述酰基可以衍生自羧酸,使得在所述相应的位置上形成的所述酯是衍生自例如:一饱和或不饱和的和/或取代的脂肪族羧酸、一饱和或不饱和的脂环族羧酸、一饱和或不饱和的脂环族脂族羧酸、芳香族羧酸、卤代烷氧基烃羧酸;硝基烷氧基烃羧酸;羟基烷氧基烃羧酸;氨基-烷氧基烃羧酸;氰基烷氧基烃羧酸;硫代氰基烷氧基烃羧酸;以及单乙酸;二乙酸、三氯乙酸;1,2,3,4,5,6-六氯环己烷羧酸、1,2-二溴-4-甲基环己烷羧酸、1,6-二溴-3-甲基环己烷羧酸、1-溴-3,5-二甲基环己烷羧酸、2-氯环己烷羧酸、4-氯环己烷羧酸、2,3-二溴-2-甲基环己烷羧酸、2,4,6-三硝基苯甲酸、2,5-二溴-2-甲基环己烷羧酸、2-溴-4-甲基环己烷羧酸、2-硝基-1-甲基-环丁烷羧酸、3,4-二硝基苯甲酸、3,5-二硝基苯甲酸、3-溴-2,2,3-三甲基环戊烷羧酸、3-溴-2-甲基环己烷羧酸、3-溴-3-甲基环己烷羧酸、4-溴-2-甲基环己烷羧酸、5-溴-2-甲基环己烷羧酸、‘4,4-二氯二苯乙醇酸、4,5-二溴-2-甲基环己烷羧酸、5-溴-2-甲基环己烷羧酸、6-溴-2-甲基环己烷羧酸、5,6-二溴-2-甲基环己烷羧酸、6-溴-3-甲基环己烷羧酸、茴香酸、氰基乙酸、氰基丙酸、乙氧基甲酸(碳酸氢乙酯)、没食子酸、尿黑酸、邻对氯苯甲酸、间对氯苯甲酸以及对氯苯甲酸、乳酸、甲羟戊酸、邻硝基苯甲酸、间硝基苯甲酸、对硝基苯甲酸、对羟基苯甲酸、水杨酸、莽草酸、硫代氰基乙酸、三甲氧基苯甲酸、三甲氧基肉桂酸、藜芦酸、α-氯丙酸和β-氯丙酸、α-溴丁酸和β-溴丁酸和α-碘代酸酸和δ-碘代酸酸、β-二羟甲基酸。其中所述脂肪族羧酸包括但不限于:乙酸、丙酸、丁酸、异丁酸、叔丁基乙酸、戊酸、异戊酸、己酸、辛酸、癸酸、十二烷酸、月桂酸、十三烷酸、肉豆蔻酸、十五烷酸、棕榈酸、鞭草酸、硬脂酸、丙烯酸、巴豆酸、十一碳烯酸、油酸、己炔酸、庚炔酸、辛炔酸;所述脂环族羧酸包括但不限于:
环丁烷羧酸、环戊烷羧酸、环戊烯羧酸、甲基环戊烯羧酸、环己烷羧酸、二甲基环己烷羧酸、二丙基环己烷羧酸;所述脂环族脂族羧酸包括但不限于:环戊烷乙酸、环戊烷丙酸、环己烷乙酸、环己烷丁酸、甲基环己烷乙酸、苯甲酸、甲苯甲酸、萘甲酸、乙基苯甲酸酸、异丁基苯甲酸、甲基丁基苯甲酸;所述芳香族羧酸包括但不限于:苯乙酸、苯甲酸、苯丙酸、苯戊酸、肉桂酸、苯丙醇酸、萘乙酸。
[0184] 在本文所述的任何实施例中的一些实施例中,当R7至R9中的一个或多个为酰基时,所述酰基使得R’为烷基或烷芳基或芳基,其中各自为可选地被一个或多个氨基取代基所取代。
[0185] 在一些实施例中,R是一取代的烷基,并且在一些实施例中,R在相对于羰基的所述α位置处被所述羟基所取代,使得所述酰基为α-羟基-酰基。
[0186] 在一些实施例中,所述α-羟基-酰基进一步被一个或多个氨基取代,并且是氨基取代的α-羟基-酰基。
[0187] 如本文所述,在一些实施例中的酰基,相对于所述酰基,所述多个氨基取代基可以是例如:所述R部分的一个或多个位置β、γ、δ和/或ω。
[0188] 示例性的氨基取代的α-羟基-酰基,包括但不限于:所述(S)-4-氨基-2-羟基丁酰基部分,所述(S)-4-氨基-2-羟基丁酰基部分在本文中也被称为AHB。根据本发明的一些实施方式,所述AHB部分的一替代物可以是所述α-羟基-β-氨基丙酰基(AHP)部分。额外的示例性的氨基取代的α-羟基酰基包括但不限于:L-(-)-γ-氨基-α-羟丁酰基,L(-)-δ-氨基-α-羟基戊酰基,L-(-)-β-苄氧基羰基氨基-α-羟基丙酰基,L-(-)-δ-苄氧基羰基氨基-α-羟基戊酰基。
[0189] 本文中应当注意,根据本发明的一些实施例,其它部分沿着一个展现任何立体化学的低碳烷基参与(多个)羰基、(多个)羟基以及(多个)氨基的组合,所述的其他部分被考虑在AHB和/或AHP的位置作为多个可选的取代基,所述包括AHB和/或AHP包括例如:2-氨基-3-羟基丁酰基,3-氨基-2-羟基戊酰基以及5-氨基-3-羟基己酰基等。
[0190] 在本文所述的任何实施例中的一些实施例中,R3至R6中的一个或多个不同于-OR 16。在本文所述的任何实施例中的一些实施例中,R3至R6中的一个或多个是氢。
[0191] 在本文所述的任何实施例中的一些实施例中,R3是氢。
[0192] 在本文所述的任何实施例中的一些实施例中,R4是氢。
[0193] 在本文所述的任何实施例中的一些实施例中,R3及R4各自为氢。
[0194] 在本文所述的任何实施例中的一些实施例中,R3至R6中的一个或多个是-OR16,并且R16独立地是如本文所定义的一单糖部分或一寡糖部分,使得所述化合物是假三糖、假四糖、假五糖以及假六糖等
[0195] 只要在本文所述的任何实施例中的一些实施例中,对于一种假三糖,中的一个或多个是-OR16,并且R16是一单糖部分或一寡糖部分,并且R3至R6中的一个或多个不是-OR16,其中R16是一单糖部分或一寡糖部分,则R3至R6中的一个或多个不是-OR16,其中R16是一单糖部分或一寡糖部分可以如本文对于R3至R6所述的各个实施例中的任一个。
[0196] 本文所使用的术语“单糖”,如本领域所习知,是指一种简单形式的糖,所述糖是由一单一糖分子所组成,所述单一糖分子不能通过水解而进一步被分解。多个单糖的最常见的多个例子包括:葡萄糖(右旋糖)、果糖、半乳糖以及核糖。多个单糖可以根据所述碳水化合物的多个碳原子的所述数目进行分类,即:丙糖具有3个碳原子,例如:甘油及二羟基丙;四糖具有4个碳原子,例如:赤藓糖、苏阿糖及赤藓酮糖;戊糖具有5个碳原子、例如:阿拉伯糖、来苏糖、核糖、木糖、核酮糖以及木酮糖;己糖具有6个碳原子、例如:阿洛糖、阿卓糖、半乳糖、葡萄糖、古洛糖、杜糖、甘露糖、塔罗糖、果糖、阿洛酮糖、山梨糖和塔格糖;庚糖具有7个碳原子,例如:甘露庚酮糖、景天庚酮糖;辛糖具有8个碳原子,例如:2-酮基-3-脱氧甘露辛酸酯;壬糖具有9个碳原子,例如:唾液糖;以及癸糖具有10个碳原子。多个单糖是多个寡糖的所述多个结构单元,如同蔗糖(普通糖)以及其他多糖(例如纤维素淀粉)。
[0197] 如本文所使用的术语“寡糖”是指一种包含两个或多个单糖单元的化合物,如本文所定义的,这些单糖单元经由糖基键(-O-)彼此连接。优选地,所述寡糖包括2至6个单糖,更优选地,所述寡糖包括2至4个单糖,并且最优选地,所述寡糖是一个双糖部分,所述双糖部分具有两个单糖单元。
[0198] 在本文所述的任何实施例中的一些实施例中,所述单糖是一个戊糖部分,如例如,由化学式II所表示。替代地,所述单糖部分是己糖。进一步替代地,所述单糖部分不是戊糖或己糖,例如:在美国专利第3,897,412号中所述的一种己糖部分。
[0199] 在本文所述的任何实施例中的一些实施例中,所述单糖部分是一个核糖,由化学式II所表示:
[0200]
[0201] 化学式II
[0202] 其中:
[0203] 所述曲线表示附接物的一位置;
[0204] 所述虚线表示第5”位的一立体组态为R组态或S组态;
[0205] X2是-OR13或-NR14R15;
[0206] 每个R10、R11及R13是独立地选自于由氢、一取代或未取代的烷基、一取代或未取代的烯基、一取代或未取代的炔基、一取代或未取代的环烷基、一取代或未取代的芳基、一取代或未取代的杂芳基、一取代或未取代的烷芳基以及酰基所组成的一群组;
[0207] R12是选自于由氢、一取代或未取代的烷基、一取代或未取代的烯基、一取代或未取代的炔基、一取代或未取代的环烷基、一取代或未取代的芳基、一取代或未取代的杂芳基、一取代或未取代的烷芳基、一取代或未取代的氨基、一取代或未取代的酰氨基、酰基、一羧酸根以及一饱和或不饱和的及/或取代的或未取代的羟烷基所组成的一群组;及
[0208] 每个R14及R15是独立地选自于由氢、一取代或未取代的烷基、一取代或未取代的烯基、一取代或未取代的炔基、一取代或未取代的环烷基、一取代或未取代的芳基、一取代或未取代的杂芳基、一取代或未取代的烷芳基、酰基以及一细胞可渗透性基团,或替代地,当存在R14及R15时形成一杂环。
[0209] 在一些实施例中,X2是-OR13
[0210] 在一些实施例中,X2是-NR14R15。
[0211] 在本文所述的任何实施例中的一些实施例中,R12不是氢。在所述多个实施例的一些实施例中,R12是烷基、环烷基或芳基,以及在一些实施例中,R12是烷基,优选地,为一低碳烷基,例如:甲基。
[0212] 在一些实施例中,R12为如本文所定义的R1。
[0213] 在本文所述的任何实施例中的一些实施例中,在R3至R6中的一个或多个为-OR16,并且R16是一单糖部分或一寡糖部分,如本文的任何的所述多个相应的实施例中所述,在所述单糖或寡糖部分/多个部分中的所述多个羟基的一个或多个被酰基所取代,形成酯(羧酸根)。
[0214] 在本文所述的任何实施例中的一些实施例中,R3至R6中的一个是-OR16,并且R16是一单糖部分,使得所述合物为一种假三糖。
[0215] 在本文所述的任何实施例中的一些实施例中,对于一种假三糖,如本文所述,R10至R11,若R13存在的话以及R13,中的一个或多个或全部可以是酰基。
[0216] 在本文所述的任何实施例中的一些实施例中,对于一种假三糖,R3至R6中的一个或多个或全部为-OR16,使得在R3至R6中的一个中,R16为一单糖部分,并且在其他实施例中,R16为本文所定义的(例如,氢,酰基)。
[0217] 在本文所述的任何实施例中的一些实施例中,R5为-OR16,其中R16是一单糖部分。
[0218] 在所述多个实施例的一些实施例中,所述化合物由化学式Ib表示:
[0219]
[0220] 化学式Ib
[0221] 所述多个变量如本文所述的化学式Ia和II,包括它们的任何组合。
[0222] 在本文的任何实施例中所述的化学式Ia和Ib中,X1是氧。
[0223] 在本文所述的任何实施例中的一些实施例中,环I中的C4’与C5’之间的键结为一单键。
[0224] 在本文所述的任何实施例中的一些实施例中,环I中的C4’与C5’之间的键结为一双键。在所述多个实施例的一些实施例中,Rx及Rz不存在。替代地,R3和Rz不存在。
[0225] 在本文所述的任何实施例中的一些实施例中,环I中的C4’与C3’之间的键结为一单键。
[0226] 在本文所述的任何实施例中的一些实施例中,环I中的C4’与C3’之间的键结为一双键。在所述多个实施例的一些实施例中,Rx和Ryl不存在。替代地,R4和Ryl不存在。
[0227] 在本文所述的任何实施例中的一些实施例中,若存在Rx,Rz,Ryl中的一个/多个或全部,Ry2至Ry9以及Rw1至Rw3是氢。
[0228] 在本文所述的任何实施例中的一些实施例中,R1不是氢。
[0229] 在本文所述的任何实施例中的一些实施例中,R1为羟烷基,其中所述烷基可进一步地被取代或不被取代。
[0230] 在本文所述的任何实施例中的一些实施例中,R1是羟甲基。
[0231] 在本文所述的任何实施例中的一些实施例中,R1为烷基、烯基或炔基,各自为取代的或未取代的。
[0232] 在本文所述的任何实施例中的一些实施例中,R1为烷基,优选地为低碳烷基,例如:甲基、乙基、丙基、丁基或戊基。
[0233] 在本文所述的任何实施例中的一些实施例中,R1是或包括可被取代或未被取代的芳基。在一些实施例中,R1为未取代的芳基,以及作为非限制性实例,可以为:苯基、1-蒽基、1-萘基、2-萘基、2-菲基或9-菲基。
[0234] 在一些实施例中,R1为一取代的芳基,并且作为非限制性实例,可以为:2-(N-乙氨基)苯基、2-(N-己氨基)苯基、2-(N-甲氨基)苯基、2,4-二甲氧基苯基、2-乙酰氨基苯基、2-氨基苯基、2-羧基苯基、2-氯苯基、2-乙氧基苯基、2-氟苯基、2-羟甲基苯基、2-羟基苯基、2-羟基苯基、2-甲氧基羰基苯基、2-甲氧基苯基、2-甲基苯基、2-N,N-二甲氨基苯基、2-三氟甲基苯基、3-(N,N-二丁氨基)苯基、3-(N,N-二乙氨基)苯基、3,4,5-三甲氧基苯基、3,4-二氯苯基、3,4-二甲氧基苯基、3,5-二甲氧基苯基、3-氨基苯基、3-联苯基、3-羧基苯基、3-氯-4-甲氧基苯基、3-氯苯基、3-乙氧基羰基苯基、3-乙氧基苯基、3-氟苯基、3-羟甲基苯基、3-羟基苯基、3-异戊氧基苯基、3-异丁氧基苯基、3-异丙氧基苯基、3-甲氧基苯基、3-甲基苯基、3-N,N-二甲氨基苯基、3-甲苯基、3-三氟甲基苯基、4-(苄氧基)苯基、4-(异丙氧羰基)苯基、
4-(N,N-二乙氨基)苯基、4-(N,N-二己氨基)苯基、4-(N,N-二异丙氨基)苯基、4-(N,N-二甲氨基)苯基、4-(N,N-二-n-戊氨基)苯基、4-(n-己氧羰基)苯基、4-(N-甲氨基)苯基、4-(三氟甲基)苯基、4-氨基苯基、4-苯氧基苯基、4-联苯基、4-丁氧基苯基、4-丁酰胺苯基、4-羧基苯基、4-氯苯基、4-乙氧基羰基苯基、4-己酰胺苯基、4-羟甲基苯基、4-羟基苯基、4-碘苯基、4-异丁基苯基、4-异丁酰胺苯基、4-异丙氧基苯基、4-异丙基苯基、4-甲氧基苯基、4-甲基苯基、4-n-己酰氨基苯基、4-n-己氧基苯基、4-硝基苯基、4-硝基苯基、4-丙酰胺苯基、4-甲苯基、4-三氟甲基苯基以及4-戊酰氧基羰基苯基。
[0235] 在本文所述的任何实施例中的一些实施例中,R1为或包括一取代或未取代的杂芳基,并且作为多个非限制性实例,可以是:2-蒽基、2-呋喃基、2-吲哚基、2-萘基、2-吡啶基、2-嘧啶基、2-吡咯基、2-喹啉基、2-噻吩基、3-呋喃基、3-吲哚基、3-噻吩基、4-咪唑基、4-吡啶基、4-嘧啶基、4-喹啉基、5-甲基-2-噻吩基以及6-氯-3-吡啶基。
[0236] 在本文所述的任何实施例中的一些实施例中,R1是或包括如本文所定义的胺,并且作为多个非限制性实例,可以为:-NH2、-NHCH3、-N(CH3)2、-NH-CH2-CH2-NH2、-NH-CH2-CH2-OH以及-NH-CH2-CH(OCH3)2。
[0237] 在本文所述的任何实施例中的一些实施例中,R1是烷基,并且在一些实施例中,所述R1是具有1至4个碳原子的低碳烷基,包括但不限于:甲基、乙基、丙基、丁基、异丙基以及异丁基。
[0238] 在本文所述的任何实施例中的一些实施例中,R1是一未取代的烷基。
[0239] 在本文所述的任何实施例中的一些实施例中,R1是甲基。
[0240] 替代地,在本文所述的任何实施例中的一些实施例中,R1为环烷基,包括但不限于:环丙基、环丁基、环戊基以及环己基。
[0241] 进一步替代地,在本文所述的任何实施例中的一些实施例中,R1是芳基,例如:取代或未取代的苯基。多个非限制性实例包括:未取代的苯基以及甲苯。
[0242] 进一步替代地,在本文所述的任何实施例中的一些实施例中,R1是烷芳基,例如:一取代或未取代的苄基。
[0243] 在本文所述的任何实施例中的一些实施例中,R1不是烷基、环烷基以及芳基。
[0244] 在本文所述的任何实施例中的一些实施例中,R1不是烷基、环烷基以及芳基,其中每个烷基、环烷基以及芳基是未取代的。
[0245] 在本文所述的任何实施例中的一些实施例中,R1不是甲基。
[0246] 在本文所述的任何实施例中的一些实施例中,R2是氢。
[0247] 在本文所述的任何实施例中的一些实施例中,R2不是氢。
[0248] 在本文所述的任何实施例中的一些实施例中,R2为酰基,如本文所述在此位置形成酯。
[0249] 在一些实施例中,R2是烷基,优选地选自于由甲基、乙基以及丙基所组成的群组。
[0250] 在本文所述的任何实施例中的一些实施例中,R2是烷基,并且在所述多个实施例的一些实施例中,R2是一取代的烷基,例如:被一个或多个氨基取代的烷基(氨基烷基)。
[0251] 在本文所述的任何实施例中的一些实施例中,R2是如本文所定义的取代或未取代的烷基或如本文所定义的取代或未取代的环烷基。
[0252] 在本文所述的任何实施例中的一些实施例中,R2是如本文所定义的一取代或未取代的芳基。
[0253] 在本文所述的任何实施例中的一些实施例中,R1是羟烷基并且R2是氢。
[0254] 在本文所述的任何实施例中的一些实施例中,R1是羟烷基,并且R2是酰基。
[0255] 在本文所述的任何实施例中的一些实施例中,若存在R7至R9以及R14至R15中的一个或多个时独立地为如本文所述的烷基、细胞可渗透性基团、或酰基,例如:如本文所述的α-羟基酰基或被氨基取代的α-羟基酰基。
[0256] 在本文所述的任何实施例中的一些实施例中,若存在R7至R9以及R14以及R15中的一个或多个时是磺酰基,例如:烷基磺酰基或芳基磺酰基。
[0257] 若存在由R7至R9以及R14以及R15中的一个或多个所表示的多个示例性部分时为包括但不限于:氢、(R/S)-4-氨基2-羟基丁酰基(AHB)、(R/S)-3-氨基-2-羟基丙酸根(AHP)、(R/S)-3-氨基-2-羟基丙酰基、5-氨基戊酰基、5-羟基戊酰基、甲酰基、-C(=O)-O-甲基、-C(=O)-O-乙基、-C(=O)-O-苄基、-β-氨基-α-羟基丙酰基、-δ-氨基-α-羟基戊酰基、-β-苄氧基羰氨基-α羟基丙酰基、-δ-苄氧基羰基氨基-α羟基戊酰基、甲基磺酰基、苯磺酰基、苯甲酰基、丙基、异丙基、-(CH2)2NH2、-(CH2)3NH2、-CH2CH(NH2)CH3、-(CH2)4NH2、-(CH2)5NH2、-(CH2)2NH-乙基、-(CH2)2NH(CH2)2NH2、-(CH2)3NH(CH2)3NH2、-(CH2)3NH(CH2)4NH(CH2)3NH2、-CH(-NH2)CH2(OH)、-CH(-OH)CH2(NH2)、-CH(-OH)-(CH2)2(NH2)、-CH(-NH2)-(CH2)2(OH)、-CH(-CH2NH2)-(CH2OH)、-(CH2)4NH(CH2)3NH2、-(CH2)2NH(CH2)2NH(CH2)2NH2、-(CH2)2N(CH2CH2NH2)2、-CH2-C(=O)NH2、-CH(CH3)-C(=O)NH2、-CH2-苯基、-CH(i-丙基)-C(=O)NH2、-CH(苄基)-C(=O)NH2、-(CH2)2OH、-(CH2)3OH以及-CH(CH2OH)2。
[0258] 在本文所述的任何实施例中的一些实施例中,R7是氢、(R/S)-4-氨基2-羟基丁酰基(AHB)、(R/S)-3-氨基-2-羟基丙酰基、5-氨基戊酰基、5-羟基戊酰基、甲酰基、-C(=O)-O-甲基、-C(=O)-O-乙基、-C(=O)-O-苄基、-β-氨基-α-羟基丙酰基、-δ-氨基-α-羟基戊酰基、-β-苄氧基羰氨基-α羟基丙酰基、-δ-苄氧基羰基氨基-α羟基戊酰基、甲基磺酰基、苯磺酰基、苯甲酰基、丙基、异丙基、-(CH2)2NH2、-(CH2)3NH2、-CH2CH(NH2)CH3、-(CH2)4NH2、-(CH2)5NH2、-(CH2)2NH-乙基、-(CH2)2NH(CH2)2NH2、-(CH2)3NH(CH2)3NH2、-(CH2)3NH(CH2)4NH(CH2)
3NH2、-CH(-NH2)CH2(OH)、-CH(-OH)CH2(NH2)、-CH(-OH)-(CH2)2(NH2)、-CH(-NH2)-(CH2)2(OH)、-CH(-CH2NH2)-(CH2OH)、-(CH2)4NH(CH2)3NH2、-(CH2)2NH(CH2)2NH(CH2)2NH2、-(CH2)2N(CH2CH2NH2)2、-CH2-C(=O)NH2、-CH(CH3)-C(=O)NH2、-CH2-苯基、-CH(i-丙基)-C(=O)NH2、-CH(苄基)-C(=O)NH2、-(CH2)2OH、-(CH2)3OH或-CH(CH2OH)2。
[0259] 在本文所述的任何实施例中的一些实施例中,R7不是氢、(R/S)-4-氨基2-羟基丁酰基(AHB)以及(R/S)-3-氨基-2-羟基丙酸根(AHP)。
[0260] 在本文所述的任何实施例中的一些实施例中,R7不是氢,并且在所述多个实施例的一些实施例中,R7不是如本文所定义的氨基取代的α-羟基酰基。
[0261] 在本文所述的任何实施例中的一些实施例中,R7不是本文所述的烷基、环烷基、芳基以及细胞可渗透性的基团。
[0262] 在本文所述的任何实施例中的一些实施例中,R8和R9中的一个或两个独立地为氢、(R/S)-4-氨基2-羟基丁酰基(AHB)、(R/S)-3-氨基-2-羟基丙酸酯(AHP)、(R/S)-3-氨基-2-羟基丙酰基、5-氨基戊酰基、5-羟基戊酰基、甲酰基、-COO-甲基、-COO-乙基、-COO-苄基、-β-氨基-α-羟基丙酰基、-δ-氨基-α-羟基戊酰基、-β-苄氧基羰氨基-α羟基丙酰基、-δ-苄氧基羰基氨基-α羟基戊酰基、甲基磺酰基、苯磺酰基、苯甲酰基、丙基、异丙基、-(CH2)2NH2、-(CH2)3NH2、-CH2CH(NH2)CH3、-(CH2)4NH2、-(CH2)5NH2、-(CH2)2NH-乙基、-(CH2)2NH(CH2)2NH2、-(CH2)3NH(CH2)3NH2、-(CH2)3NH(CH2)4NH(CH2)3NH2、-CH(-NH2)CH2(OH)、-CH(-OH)CH2(NH2)、-CH(-OH)-(CH2)2(NH2)、-CH(-NH2)-(CH2)2(OH)、-CH(-CH2NH2)-(CH2OH)、-(CH2)4NH(CH2)3NH2、-(CH2)2NH(CH2)2NH(CH2)2NH2、-(CH2)2N(CH2CH2NH2)2、-CH2-C(=O)NH2、-CH(CH3)-C(=O)NH2、-CH2-苯基、-CH(i-丙基)-C(=O)NH2、-CH(苄基)-C(=O)NH2、-(CH2)2OH、-(CH2)3OH以及-CH(CH2OH)2。
[0263] 在本文所述的任何实施例中的一些实施例中,氨基取代的α-羟基酰基为(S)-4-氨基-2-羟基丁酰基(AHB)。
[0264] 在本文所述的任何实施例中的一些实施例中,每个R7至R9不是氢、(R/S)-4-氨基2-羟基丁酰基(AHB)以及(R/S)-3-氨基-2-羟基丙酸酯(AHP)。
[0265] 在本文所述的任何实施例中的一些实施例中,每个R7至R9不是氢,并且在所述多个实施例的一些实施例中,每个R7至R9不是如本文所定义的氨基取代的α-羟基酰基。
[0266] 在本文所述的任何实施例中的一些实施例中,如本文所述,每个R7至R9不是如本文所示的烷基、环烷基、芳基以及细胞可渗透性的基团。
[0267] 在本文中,带有氢以外的一取代基的胺在本文中称为一“改性氨基取代基”或简称为一“改性胺”。
[0268] 根据本发明的一些实施例,若存在所述多个氨基糖苷结构的第1位(R7)、第2’位(R8)、第3位(R9)或第5”位(R14或R15)中的一个或两个氨基取代基,由代学式Ia以及代学式Ib所表示的氨基糖苷结构被修饰成包括一疏水性部分,例如:烷基、环烷基、烷芳基和/或芳基,或在生理pH下带正电,并且可增加所述化合物的细胞渗透性(在本文中也可互换地作为“细胞可渗透性的基团”或“渗透细胞的基团”),如本文定义的嘌呤基或胍基,或替代地为:肼、酰肼、硫代酰肼、尿素以及硫脲。
[0269] 在本文所述的任何实施例中的一些实施例中,若存在R7至R9以及R14和R15中的一个或多个时是如本文所定义的一细胞可渗透性基团,并且在一些实施例中,所述R7至R9以及R14和R15中的一个或多个是如本文所定义的胍基。
[0270] 在本文所述的任何实施例中的一些实施例中,若存在R7至R9以及R14和R15中的一个或多个时是一疏水部分,例如:烷基、环烷基、烷芳基和/或芳基。
[0271] 在本文所述的任何实施例中的一些实施例中,若存在R7至R9以及R14和R15中的一个或多个时,没有一个是疏水部分,例如:烷基、环烷基、烷芳基和/或芳基。
[0272] 在本文所述的任何实施例中的一些实施例中,若存在R7至R9以及R14和R15中的一个或多个时,没有一个是如本文所定义的细胞可渗透性基团。
[0273] 在本文所述的任何实施例中的一些实施例中,若存在R7至R9以及R14和R15中的一个或多个时,没有一个是如本文所述的一经过修饰的氨基。
[0274] 在本文所述的任何实施例的一些实施例中,若R7至R9以及R14和R15中的一个或多个是如本文所定义的酰基,并且在所述多个实施例的一些实施例中,所述酰基可以独立地为如本文所定义的氨基取代的α-羟基酰基。
[0275] 在本文所述的任何实施例中的一些实施例中,每当一变量被定义为一未取代的芳基、所述未取代的芳基可以是,例如:苯基、1-蒽基、1-萘基、2-萘基、2-菲基和/或9-菲基。
[0276] 在本文所述的任何实施例中的一些实施例中,每当一变量定义为一取代或未取代的杂芳基时,所述杂芳基可以是例如:2-蒽基、2-呋喃基、2-吲哚基、2-萘基、2-吡啶基、2-嘧啶基、2-吡咯基、2-呋喃基、2-喹啉基、2-噻吩基、3-呋喃基、3-吲哚基、3-噻吩基、4-咪唑基、4-吡啶基、4-嘧啶基、4-喹啉基、5-甲基-2-噻吩基和/或6-氯-3-吡啶基。
[0277] 在本文所述的任何实施例中的一些实施例中,每当一变量被定义为一取代的芳基,所述芳基可以是例如2-(N-乙氨基)苯基、2-(N-己氨基)苯基、2-(N-甲氨基)苯基、2,4-二甲氧基苯基、2-乙酰氨基苯基、2-氨基苯基、2-羧基苯基、2-氯苯基、2-乙氧基苯基、2-氟苯基、2-羟甲基苯基、2-羟基苯基、2-羟基苯基、2-甲氧基羰基苯基、2-甲氧基苯基、2-甲基苯基、2-N,N-二甲氨基苯基、2-三氟甲基苯基、3-(N,N-二丁氨基)苯基、3-(N,N-二乙氨基)苯基、3,4,5-三甲氧基苯基、3,4-二氯苯基、3,4-二甲氧基苯基、3,5-二甲氧基苯基、3-氨基苯基、3-联苯基、3-羧基苯基、3-氯-4-甲氧基苯基、3-氯苯基、3-乙氧基羰基苯基、3-乙氧基苯基、3-氟苯基、3-羟甲基苯基、3-羟基苯基、3-异戊氧基苯基、3-异丁氧基苯基、3-异丙氧基苯基、3-甲氧基苯基、3-甲基苯基、3-N,N-二甲氨基苯基、3-甲苯基、3-三氟甲基苯基、4-(苄氧基)苯基、4-(异丙氧羰基)苯基、4-(N,N-二乙氨基)苯基、4-(N,N-二己氨基)苯基、4-(N,N-二异丙氨基)苯基、4-(N,N-二甲氨基)苯基、4-(N,N-二-n-戊氨基)苯基、4-(n-己氧羰基)苯基、4-(N-甲氨基)苯基、4-(三氟甲基)苯基、4-氨基苯基、4-苯氧基苯基、4-联苯基、4-丁氧基苯基、4-丁酰胺苯基、4-羧基苯基、4-氯苯基、4-乙氧基羰基苯基、4-己酰胺苯基、4-羟甲基苯基、4-羟基苯基、4-碘苯基、4-异丁基苯基、4-异丁酰胺苯基、4-异丙氧基苯基、4-异丙基苯基、4-甲氧基苯基、4-甲基苯基、4-n-己酰氨基苯基、4-n-己氧基苯基、4-硝基苯基、4-硝基苯基、4-丙酰胺苯基、4-甲苯基、4-三氟甲基苯基以及4-戊酰氧基羰基苯基。
[0278] 在本文所述的任何实施例中的一些实施例中,化学式Ia或Ib中的第1位(R7,环II)上的所述氨基取代基是如本文所述的经修饰的胺,使得R7不是氢。
[0279] 在所述多个实施例的一些实施例中,R7可以是如本文所定义的烷基、环烷基、烷芳基、芳基、酰基或氨基取代的α-羟基酰基,如例如:(S)-4-氨基-2-羟基丁酰基(AHB)或(S)-氨基-2-羟基丙酰基(AHP)。
[0280] 在所述多个实施例的一些实施例中,其中R7是一烷基,所述烷基可以是例如:具有1至4个碳原子的低碳烷基,例如但不限于:甲基、乙基、丙基、丁基、异丙基以及异丁基,可选地,各自如本文所述的被取代。
[0281] 在所述多个实施例的一些实施例中,所述烷基独立地为一未取代的烷基,例如但不限于:乙基、丙基以及异丙基。
[0282] 在所述多个实施例的一些实施例中,所述烷基独立地为一取代的甲基,例如但不限于烷芳基,例如:苄基。
[0283] 替代地,R7是环烷基,并且所述环烷基可以是例如:环丙基、环丁基、环戊基以及环己基。
[0284] 进一步可选地,R7是芳基,并且所述芳基可以是例如:一取代或未取代的苯基。多个非限制性实例包括:未取代的苯基以及甲苯。
[0285] 在本文所述的任何实施例中的一些实施例中,R7是如本文所述的烷基、环烷基或芳基。
[0286] 在所述多个实施例的一些实施例中,R1为烷基、环烷基或芳基,并且优选地为如本文所定义的烷基。
[0287] 在所述多个实施例的一些实施例中,R1为烷基、环烷基或芳基,以及优选地为如本文所定义的烷基,R3是-OR16,并且R16为氢(使得R3为羟基)。
[0288] 在本文所述的任何实施例中的一些实施例中,R7是烷基,以及在一些实施例中,R7是具有1至4个碳原子的一低碳烷基。
[0289] 在一些实施例中,R7是烷基,例如:乙基、丙基、丁基、异丙基、异丁基、叔丁基,可选地,各自为被取代的。
[0290] 在一些实施例中,R7是甲基或乙基,并且优选地为一取代的甲基或乙基。在所述多个实施例的一些实施例中,所述甲基或乙基被取代,例如:被环烷基或芳基所取代。所述多个取代基在本领域中也分别被称为烷基环烷基以及烷芳基。一示例性的烷芳基是苄基(-CH2-苯基)。
[0291] 在一些实施例中,R7是丙基或异丙基。
[0292] 在一些实施例中,R7是苄基。
[0293] 在本文所述的任何实施例中的一些实施例中,R7是如本文所定义的一细胞可渗透性基团,以及在一些实施例中,R7是胍基。
[0294] 在本文所述的任何实施例中的一些实施例中,R1是烷基、环烷基或芳基,并且优选地为如本文所定义的烷基,以及R7是如本文所定义的烷基,优选地,乙基、丙基、异丙基或苄基。
[0295] 在本文所述的任何实施例中的一些实施例中,R1是烷基、环烷基或芳基,以及优选地如本文所定义的烷基;R7是如本文所定义的烷基,优选地为乙基、丙基、异丙基或苄基;以及R3是氢。
[0296] 在本文所述的任何实施例中的一些实施例中,R1是烷基、环烷基或芳基,以及优选地为如本文所定义的烷基;R7是如本文所定义的一细胞可渗透性基团,优选地为胍或鸟嘌呤;以及R3是氢。
[0297] 在本文所述的任何实施例中的一些实施例中,R1是烷基、环烷基或芳基,以及优选地为如本文所定义的烷基;R7是如本文所定义的一细胞可渗透性基团,优选地为胍或鸟嘌呤,更优选地为胍(胍基)。
[0298] 多个示例性假二糖的化合物为NB144、NB145、NB146以及NB150(请参见表1)。
[0299] 在本文所述的任何实施例中的一些实施例中,R7是氢或是一部分,例如:(S)-4-氨基-2-羟基丁酰基(AHB)或(S)-4-氨基-2-羟基丙酰基(AHP)。
[0300] 在所述多个实施例的一些实施例中,将一经过修饰的氨基引入一第三糖部分(环III;例如:作为化学式Ia中的R5)中的所述化合物内。
[0301] 本文的任何实施例所述的化学式Ia及其任何组合被包括在涉及化学式Ib的所述多个实施例中。
[0302] 在化学式Ib的任何实施例中的一些实施例中,R1是如本文所定义的烷基。
[0303] 在化学式Ib的任何实施例中的一些实施例中,R2和R7如本文的任何的所述相应的多个实施例中所述的化学式Ia。
[0304] 在化学式Ib的任何实施例中的一些实施例中,R3、R4以及R6各自为氢。
[0305] 在所述多个实施例的一些实施例中,R7是烷基、环烷基或芳基,以及优选地为如本文所述的烷基。
[0306] 在一些实施例中,R1为烷基、环烷基或芳基,以及优选地为如本文所定义的烷基;R7是如本文所定义的烷基,优选地为乙基、丙基、异丙基或苄基;以及R5是化学式II的一单糖部分,其中R14及R15都是氢。
[0307] 一示例性化合物是NB147(参见表1)。
[0308] 在化学式Ib的任何实施例中的一些实施例中,R7是如本文所定义的氢、酰基或氨基取代的α-羟基-酰基。
[0309] 在所述多个实施例的一些实施例中,X是-NR14R15;而R14及R15中的一个不是氢。在所述多个实施例的一些实施例中,R14及R15中的一个是一细胞可渗透性基团,例如:胍基。替代地,R14及R15中的一个为烷基、环烷基或芳基,例如:对于R7的所述多个实施例中的任一个所定义的烷基、环烷基或芳基。
[0310] 在本文所述的任何实施例中的一些实施例中,R1是烷基、环烷基或芳基,以及优选地如本文所定义的烷基;R7是如本文所定义的氢或被氨基取代的羟基-酰基;R5是化学式II的一单糖部分;X是-NR14R15;以及R15是胍基(胍基(guanidinyl));胍基(guanidyl))。
[0311] 在所述多个实施例的一些实施例中,R14是氢。
[0312] 多个示例性化合物是NB151以及NB152(参见表1)。
[0313] 本文的任何实施例中的一些实施例所述的化学式Ib中,X是-NR14R15;以及R14是氢或甲基,除非另有特别说明。
[0314] 本文的任何实施例中的一些实施例所述的化学式Ib中,X是-NR14R15;以及R14是氢。
[0315] 在本文的任何实施例中的一些实施例所述的化学式Ib中,X是-NR14R15;以及R15是如本文所定义的酰基。
[0316] 在本文的任何实施例中的一些实施例所述的化学式Ib中,X是-NR14R15;以及R14及R15中的一个或两个是如在本文中所定义的所述多个术语:一取代或未取代的烷基、一取代或未取代的环烷基、一取代或未取代的芳基、一取代或未取代的烷芳基、或一取代或未取代的杂芳基,或酰基。
[0317] 在本文的任何实施例中的一些实施例所述的化学式Ib中,X是-NR14R15;以及R14及R15共同形成一含氮杂环,例如但不限于:吗啉、哌啶和哌嗪。
[0318] 在本文的任何实施例中的一些实施例所述的化学式Ib中,X是-OR13;以及R13为如本文的任何的所述多个相应的实施例中所定义的R16。在所述多个实施例的一些实施例中,本文的任何的所述相应的多个实施例中所述,R13是酰基,所述酰基在第5”位上形成酯。
[0319] 在本文的任何实施例中的一些实施例所述的化学式Ia及Ib以及其任何组合中,第6’位的所述立体组态为R组态。
[0320] 在本文的任何实施例中的一些实施例所述的化学式Ib以及其任何组合中,第5’位的所述立体组态为S组态。
[0321] 以下的表1示出了根据本发明一些实施例的多个示例性化合物。
[0322] 表1
[0323]
[0324]
[0325]
[0326] (表1续)
[0327] 多个额外的示例性化合物包括在本文中称为NB153、NB155、NB156、NB157、NB154、NB158以及NB159的多个化合物,所述多个化合物的所述多个结构在以下的所述多个示例部分中示出。
[0328] 多个额外的示例性化合物包括在本文中称为多个多酯化化合物的多个化合物,其中R3至R6中的一个或多个、或两个或以上的为-OR16,以及若存在R16、R2以及R13中的一个或多个时独立地是酰基,所述酰基在所述相应的位置上形成酯,使得所述化合物包含至少两个酯。所述多个示例的化合物的结构在以下的所述多个实施例部分中的方案14中示出。
[0329] 根据本发明的任何实施例中的一些实施例,排除在本发明的范围之外的是本领域已知的多个化合物,包括本申请的所述背景技术部分中所引用的任何的所述文献,本申请包括化学式Ia或Ib。
[0330] 排除在本发明实施例范围之外的多个示例性化合物包括但不限于:庆大霉素、遗传霉素、福贴霉素、阿泊拉霉素、阿贝卡星、地贝卡星、遗传霉素(G-418,G418)、羟丁胺卡那霉素、卡那霉素、利维霉素、巴龙霉胺、链霉素以及妥布霉素。
[0331] 排除在本发明的实施例的范围之外的其它示例性化合物包括:由化学式Ia所示的多个化合物,其中R2是氢,以及R7是氢,AHB或AHP,或如在WO 2007/113841以及WO 2012/066546中所定义的AHB及AHP的多个等价物;以及由化学式Ib所表示的多个化合物,其中R2是氢,以及R7是氢、AHB或AHP,或如在WO 2007/113841以及WO 2012/066546中所定义的AHB及AHP的多个等价物,以及R14及R15各自为氢。
[0332] 根据本发明的一些实施例,当R2为氢时,则R7不是氢,AHB或AHP,或如WO 2007/113841以及WO 2012/066546中定义的AHB和AHP的多个等价物,和/或若存在中R14及R15的一个或两个,所述R14及R15的一个或两个不是氢。
[0333] 根据本发明的一些实施例,所述氨基糖苷结构的第1位或第5”位的一个或两个为如本文所定义的一经过修饰的氨基,使得R7和/或R14以及R15中的一个或两个不是氢。
[0334] 排除在本发明范围之外的所述多个示例性化合物的多个化学结构列于以下的表2中。
[0335] 表2
[0336]
[0337]
[0338]
[0339]
[0340]
[0341]
[0342] 表2(续)
[0343] 根据本发明的一些实施方式,排除在本实施例的所述范围之外的还有由化学式I’a所表示的多个化合物如下:
[0344]
[0345] 化学式I’a
[0346] 其中:
[0347] 所述虚线表示第6’位的一立体组态为R组态或S组态;
[0348] R’1是烷基、环烷基、烷芳基或芳基;
[0349] R’2是OR’,其中R’是选自于如本文所述的氢、一取代或未取代的烷基、一取代或未取代的环烷基、一取代或未取代的芳基、一取代或未取代的杂芳基、一取代或未取代的烷芳基以及酰基;
[0350] R’4是选自于氢、酰基、被氨基取代的α-羟基酰基、一取代或未取代的烷基、一取代或未取代的环烷基、一取代或未取代的芳基、一取代或未取代的烷芳基以及一细胞可渗透性基团,例如:脒基或胍基;以及
[0351] R’3是氢或由化学式II’表示的一个单糖:
[0352]
[0353] 化学式II’
[0354] 其中所述曲线表示一附接物的位置;以及
[0355] R’5及R’6为各自独立地选自氢、一取代或未取代的烷基、一取代或未取代的环烷基、一取代或未取代的芳基、一取代或未取代的烷芳基、一取代或未取代的杂芳基、酰基和一细胞可渗透性基团如脒基和胍基、或替代地,R’5与R’6一起形成一个杂环,
[0356] 其中当R’2是氢时,R’4不是氢、AHB或AHP,和/或若存在R’5和/或R’6中的至少一个时,所述R’5和/或R’6中的至少一个不是氢。
[0357] 根据本发明的一些实施例,排除在本实施例的范围之外的还有由化学式I’b表示的多个化合物如下:
[0358]
[0359] 化学式I’b
[0360] 或所述化学式I’b的一药学上可接受的盐,
[0361] 其中:
[0362] 所述虚线表示第6’位的一立体组态为R组态或S组态;
[0363] R’1选自于氢、烷基、环烷基或芳基;
[0364] R2为-OR’,其中R’是选自于氢、一取代或未取代的烷基、一取代或未取代的环烷基、一取代或未取代的芳基、一取代或未取代的杂芳基、一取代或未取代的烷芳基以及酰基;
[0365] R’4是选自于氢、酰基、被氨基取代的α-羟基酰基、一取代或未取代的烷基、一取代或未取代的环烷基、一取代或未取代的芳基、一取代或未取代的烷芳基以及一细胞可渗透性基团;
[0366] R’6和R’7为各自独立地选自氢、一取代或未取代的烷基、一取代或未取代的环烷基、一取代或未取代的芳基、一取代或未取代的烷芳基、一取代或未取代的杂芳基、酰基以及一细胞可渗透性基团,或替代地,R’5及R’6共同形成一个杂环;以及
[0367] R’8是烷基、环烷基或芳基,
[0368] 其中当R’2是氢时,R’4不是氢、AHB或AHP,和/或若存在R’6和/或R’7中的至少一个时,所述R’6和/或R’7中的至少一个不是氢。
[0369] 在本文所述的任何实施例中的一些实施例中,排除在本发明的所述范围之外的是表1所示的所述多个化合物。
[0370] 根据本文所述的任何实施例中的一些实施例,如本文所述的一种化合物是由化学式Ic所表示:
[0371]
[0372] 化学式Ic
[0373] 或所述化学式Ic的一药学上可接受的盐,
[0374] 其中:
[0375] 所述虚线表示第6’位的一立体组态为R组态或S组态;
[0376] X1为氧或硫;
[0377] Rx、Ry1及Rz为各自独立的氢、烷基或环烷基;
[0378] Ry2至Ry9以及Rw1至Rw3为各自独立地选自于氢、烷基、烯基、炔基、芳基、杂芳基以及环烷基,每个所述Ry2至Ry9以及Rw1至Rw3为取代的或未取代的,或者,每个所述Ry2至Ry9以及Rw1至Rw3可以为如在此所定义的R7至R9;
[0379] R1是一取代或未取代的羟基烷基(例如:-CH2-OH);
[0380] R2是选自于由如本文对于化学式Ia所述的氢、一取代或未取代的烷基、一取代或未取代的烯基、一取代或未取代的炔基、一取代或未取代的环烷基、一取代或未取代的芳基、一取代或未取代的杂芳基、一取代或未取代的烷芳基以及酰基所组成的一群组;
[0381] R3至R6为各自独立地选自于由如化学式Ia中的任何的所述对应的多个实施例中所述的氢、烷基、炔基、环烷基、杂脂环基、芳基、杂芳基、胺基以及-OR16所组成的一群组,其中R16是独立地选自于一单糖部分、一寡糖部分、一取代或未取代的烷基、一取代或未取代的烯基、一取代或未取代的炔基、一取代或未取代的环烷基、一取代或未取代的芳基、一取代或未取代的杂芳基、一取代或未取代的烷芳基以及酰基所组成的一群组;以及
[0382] R7至R9为各自独立地选自于由如化学式Ia中的任何的所述对应的多个实施例中所述的氢、酰基、氨基取代的α-羟基酰基、一取代或未取代的烷基、一取代或未取代的烯基、一取代或未取代的炔基、一取代或未取代的环烷基、一取代或未取代的芳基、一取代或未取代的烷芳基、羧酸根、磺酰基(包括烷基磺酰基及芳基磺酰基)以及一细胞可渗透性基团所组成的一群组。
[0383] 在所述多个实施例的一些实施例中,R3至R6中的一个或多个是由如化学式Ia及Ib中的任何的所述对应的多个实施例中所述的一单糖或一寡糖。
[0384] 在化学式Ic的任何实施例中的一些实施例中:
[0385] X1为氧;
[0386] Rx、Ry1及Rz各自为氢;
[0387] Ry2至Ry9以及Rw1至Rw3各自为氢;
[0388] R2是选自于由如本文对于化学式Ia或Ib所述的氢、一取代或未取代的烷基、一取代或未取代的烯基、一取代或未取代的炔基、一取代或未取代的环烷基、一取代或未取代的芳基、一取代或未取代的杂芳基、一取代或未取代的烷芳基以及酰基所组成的一群组;
[0389] R3至R6为各自独立地选自于由如化学式Ia中的任何的所述对应的多个实施例中所述的氢、烷基、炔基、环烷基、杂脂环基、芳基、杂芳基、胺基以及-OR16所组成的一群组,其中R16是独立地选自于一单糖部分、一寡糖部分、一取代或未取代的烷基、一取代或未取代的烯基、一取代或未取代的炔基、一取代或未取代的环烷基、一取代或未取代的芳基、一取代或未取代的杂芳基、一取代或未取代的烷芳基以及酰基所组成的一群组;以及
[0390] R7至R9为各自独立地选自于由如化学式Ia或Ib中的任何的所述对应的多个实施例中所述的氢、酰基、氨基取代的α-羟基酰基、一取代或未取代的烷基、一取代或未取代的烯基、一取代或未取代的炔基、一取代或未取代的环烷基、一取代或未取代的芳基、一取代或未取代的烷芳基、羧酸根、磺酰基(包括烷基磺酰基及芳基磺酰基)以及一细胞可渗透性基团所组成的一群组。
[0391] 在化学式Ic的任何实施例中的一些实施例:
[0392] X1为氧;
[0393] Rx、Ry1及Rz各自为氢;
[0394] Ry2至Ry9以及Rw1至Rw3各自为氢;
[0395] R2是氢;
[0396] R3至R6各自独立地是-OR16,其中R16是氢;以及
[0397] R7至R9各自独立地选自于由如化学式Ia或Ib中的任何的所述对应的多个实施例中所述的氢、酰基、氨基取代的α-羟基酰基、一取代或未取代的烷基、一取代或未取代的烯基、一取代或未取代的炔基、一取代或未取代的环烷基、一取代或未取代的芳基、一取代或未取代的烷芳基以及一细胞可渗透性基团所组成的一群组。
[0398] 在化学式Ic的任何实施例中的一些实施例中:
[0399] X1为氧;
[0400] Rx、Ryl以及Rz各自为氢;
[0401] Ry2至Ry9以及Rw1至Rw3各自为氢;
[0402] R2为氢;
[0403] R3、R4以及R6各自独立地为-OR16,其中R16为氢;
[0404] R5是如本文所述的化学式II所示的一单糖,其中X2优选地为如化学式Ia或Ib中的任何的所述对应的多个实施例中所述的-NR14R15;以及
[0405] R7至R9各自独立地选自于由如化学式Ia或Ib中的任何的所述对应的多个实施例中所述的氢、酰基、氨基取代的α-羟基酰基、一取代或未取代的烷基、一取代或未取代的烯基、一取代或未取代的炔基、一取代或未取代的环烷基、一取代或未取代的芳基、一取代或未取代的烷芳基以及一细胞可渗透性基团所组成的一群组。
[0406] 由化学式Ic所示的多个化合物在本文中也称为“含有二醇的”多个化合物。
[0407] 由化学式Ic涵盖的多个示例性化合物包括:NB153、NB155、NB156以及NB157,所述多个示例性化合物的所述多个结构在以下的所述多个实施例部分中示出。
[0408] 根据本文所述的任何实施例中的一些实施例,如本文所述的一种化合物是由化学式Id所表示:
[0409] 化学式Id
[0410]
[0411] 或是所述化学式Id的一药学上可接受的盐,
[0412] 其中:
[0413] 所述虚线表示第6’位的一立体组态为R组态或S组态;
[0414] X1是氧或硫;
[0415] Rx、Ryl至Ry9以及Rw1至Rw3各自独立地选自氢、烷基、烯基、炔基、芳基、杂芳基以及环烷基,每个所述Rx、Ryl至Ry9以及Rw1至Rw3为取代或未取代的,或替代地,每个所述Rx、Ryl至Ry9以及Rw1至Rw3可以如在此所定义的R7至R9;
[0416] R1选自是选自于由如化学式Ia或Ib中的任何的所述对应的多个实施例中所述的氢、一取代或未取代的烷基、一取代或未取代的烯基、一取代或未取代的炔基、一取代或未取代的环烷基、一取代或未取代的芳基、一取代或未取代的杂芳基、一取代或未取代的烷芳基、一取代或未取代的氨基基、一取代或未取代的酰胺基、酰基、一羧酸根以及一饱和或不饱和及/或取代或未取代的羟烷基(例如-CH2-OH)所组成的一群组;
[0417] R2是选自于由如化学式Ia或Ib中的任何的所述对应的多个实施例中所述的氢、一取代或未取代的烷基、一取代或未取代的烯基、一取代或未取代的炔基、一取代或未取代的环烷基、一取代或未取代的芳基、一取代或未取代的杂芳基、一取代或未取代的烷芳基以及酰基;
[0418] R4至R6为各自独立地选自于由氢、烷基、炔基、环烷基、杂脂环基、芳基、杂芳基、胺基以及-OR16所组成的一群组,其中R16是独立地选自于如化学式Ia或Ib中的任何的所述对应的多个实施例中所述的氢、一单糖部分、一寡糖部分、一取代或未取代的烷基、一取代或未取代的烯基、一取代或未取代的炔基、一取代或未取代的环烷基、一取代或未取代的芳基、一取代或未取代的杂芳基、一取代或未取代的烷芳基以及酰基;以及
[0419] R7至R9为各自独立地选自于由如化学式Ia或Ib中的任何的所述对应的多个实施例中所述的氢、酰基、氨基取代的α-羟基酰基、一取代或未取代的烷基、一取代或未取代的烯基、一取代或未取代的炔基、一取代或未取代的环烷基、一取代或未取代的芳基、一取代或未取代的烷芳基、羧酸根、磺酰基(包括烷基磺酰基及芳基磺酰基)以及本文所定义的一细胞可渗透基团所组成的一群组。
[0420] 在所述多个实施例的一些实施例中,R4至R6中的一个或多个是如化学式Ia或Ib中的任何的所述对应的多个实施例中所述的一单糖或一寡糖。
[0421] 在化学式Id的任何实施例中的一些实施例中:
[0422] X1为氧;
[0423] Rx、Ryl至Ry9以及Rw1至Rw3各自为氢;
[0424] R1是选自于由如化学式Ia或Ib中的任何的所述对应的多个实施例中所述的氢、一取代或未取代的烷基、一取代或未取代的烯基、一取代或未取代的炔基、一取代或未取代的环烷基、一取代或未取代的芳基、一取代或未取代的杂芳基、一取代或未取代的烷芳基、一取代或未取代的氨基基、一取代或未取代的酰胺基、酰基、一羧酸根以及一饱和或不饱和及/或取代或未取代的羟烷基(例如-CH2-OH)所组成的一群组;
[0425] R2是选自于由如化学式Ia或Ib中的任何的所述对应的多个实施例中所述的氢、一取代或未取代的烷基、一取代或未取代的烯基、一取代或未取代的炔基、一取代或未取代的环烷基、一取代或未取代的芳基、一取代或未取代的杂芳基、一取代或未取代的烷芳基以及酰基所组成的一群组;
[0426] R4至R6各自独立地为-OR16,其中R16是独立地选自于如化学式Ia或Ib中的任何的所述对应的多个实施例中所述的氢、一单糖部分、一寡糖部分、一取代或未取代的烷基、一取代或未取代的烯基、一取代或未取代的炔基、一取代或未取代的环烷基、一取代或未取代的环烷基、一取代或未取代的环烷基芳基、一取代或未取代的杂芳基、一取代或未取代的烷芳基和酰基;以及
[0427] R7至R9为各自独立地选自于由如化学式Ia或Ib中的任何的所述对应的多个实施例中所述的氢、酰基、氨基取代的α-羟基酰基、一取代或未取代的烷基、一取代或未取代的烯基、一取代或未取代的炔基、一取代或未取代的环烷基、一取代或未取代的芳基、一取代或未取代的烷芳基、羧酸根、磺酰基(包括烷基磺酰基及芳基磺酰基)以及一细胞可渗透性基团所组成的一群组。
[0428] 在化学式Id的任何实施例中的一些实施例中:
[0429] X1为氧;
[0430] Rx、Ryl至Ry9以及Rw1至Rw3各自为氢;
[0431] 如本文所述,R1为氢、烷基、环烷基或芳基,并且如本文所述优选地为氢或一低碳烷基;
[0432] R2是氢;
[0433] R4至R6各自独立地为-OR16,其中R16为氢;以及
[0434] R7至R9为各自独立地选自于由如化学式Ia或Ib中的任何的所述对应的多个实施例中所述的氢、酰基、氨基取代的α-羟基酰基、一取代或未取代的烷基、一取代或未取代的烯基、一取代或未取代的炔基、一取代或未取代的环烷基、一取代或未取代的芳基、一取代或未取代的烷芳基以及一细胞可渗透性基团所组成的一群组。
[0435] 在化学式Id的任何实施例中的一些实施例中:
[0436] X1为氧;
[0437] Rx、Ryl至Ry9以及Rw1至Rw3各自为氢;
[0438] 如本文所述,R1为氢、烷基、环烷基或芳基,并且如本文所述优选地为氢或一低碳烷基;
[0439] R2是氢;
[0440] R4至R6各自独立地为-OR16,其中R16为氢;
[0441] R5是如本文所述的化学式II所示的一单糖,其中X2优选地为如化学式Ia或Ib中的任何的所述对应的多个实施例中所述的-NR14R15;以及
[0442] R7至R9各自独立地选自于由如化学式Ia或Ib中的任何的所述对应的多个实施例中所述的氢、酰基、氨基取代的α-羟基酰基、一取代或未取代的烷基、一取代或未取代的烯基、一取代或未取代的炔基、一取代或未取代的环烷基、一取代或未取代的芳基、一取代或未取代的烷芳基以及一细胞可渗透性基团所组成的一群组。
[0443] 由化学式Id所示的多个化合物在本文中也被称为“包含不饱和葡萄糖胺(环I)的”多个化合物。由化学式Id涵盖的多个示例性化合物包括:NB154、NB158以及NB159,所述多个化合物的所述多个结构在以下的实施例部分中给出。
[0444] 根据本文所述的任何实施例中的一些实施例,如本文所述的一种化合物是由化学式Ie所表示:
[0445]
[0446] 化学式Ie
[0447] 或是所述化学式Ie的一药学上可接受的盐,
[0448] 其中:
[0449] 所述虚线表示第6’位的一立体组态为R组态或S组态;
[0450] X1为氧或硫;
[0451] Rx、Ryl以及Rz各自独立地为氢、烷基或环烷基;
[0452] Ry2至Ry9以及Rw1至Rw3各自独立地选自氢、烷基、烯基、炔基、芳基、杂芳基以及环烷基,每个所述Ry2至Ry9以及Rw1至Rw3为取代或未取代的,或替代地,各自可以为如在此所定义的R7至R9;
[0453] R1是选自于由如化学式Ia或Ib中的任何的所述对应的多个实施例中所述的氢、一取代或未取代的烷基、一取代或未取代的烯基、一取代或未取代的炔基、一取代或未取代的环烷基、一取代或未取代的芳基、一取代或未取代的杂芳基、一取代或未取代的烷芳基、一取代或未取代的氨基基、一取代或未取代的酰胺基、酰基、一羧酸根以及一饱和或不饱和及/或取代或未取代的羟烷基(例如-CH2-OH)所组成的一群组;
[0454] R2是选自于由如化学式Ia中的任何的所述对应的多个实施例中所述的氢、一取代或未取代的烷基、一取代或未取代的烯基、一取代或未取代的炔基、一取代或未取代的环烷基、一取代或未取代的芳基、一取代或未取代的杂芳基、一取代或未取代的烷芳基以及酰基;
[0455] R3至R6为各自独立地选自于由如化学式Ia中的任何的所述对应的多个实施例中所述的氢、烷基、烯基、炔基、环烷基、杂环脂基、芳基、杂芳基、胺基以及-OR16所组成的一群组,其中R16是独立地选自于一单糖部分、一寡糖部分、一取代或未取代的烷基、一取代或未取代的烯基、一取代或未取代的炔基、一取代或未取代的环烷基、一取代或未取代的芳基、一取代或未取代的杂芳基、一取代或未取代的烷芳基以及一酰基,其中R3-R6中的至少一个是-OR16;以及
[0456] R7至R9为各自独立地选自于由如化学式Ia或Ib中的任何的所述对应的多个实施例中所述的氢、酰基、一氨基取代的α-羟基酰基、一取代或未取代的烷基、一取代或未取代的烯基、一取代或未取代的炔基、一取代或未取代的环烷基、一取代或未取代的芳基、一取代或未取代的烷芳基、羧酸根、磺酰基(包括烷基磺酰基及芳基磺酰基)以及一细胞可渗透性基团所组成的一群组,
[0457] 其中R3至R6中的一个或多个中的至少两个R2及-OR16为-OR16,所述-OR16为酰基。
[0458] 在所述多个实施例的一些实施例中,R3至R6中的一个或多个是如本文关于式Ia和Ib各自实施例中任一项所述的单糖或寡糖。
[0459] 在化学式Ie的任何实施例中的一些实施例中:
[0460] X1为氧;
[0461] Rx、Ryl以及Rz各自为氢;
[0462] Ry2至Ry9以及Rw1至Rw3各自为氢;
[0463] R1为选自于由如化学式Ia或Ib中的任何的所述对应的多个实施例中所述的氢、一取代或未取代的烷基、一取代或未取代的烯基、一取代或未取代的炔基、一取代或未取代的环烷基、一取代或未取代的芳基、一取代或未取代的杂芳基、一取代或未取代的烷芳基、一取代或未取代的氨基基、一取代或未取代的酰胺基、酰基、一羧酸根以及一饱和或不饱和及/或取代或未取代的羟烷基(例如-CH2-OH)所组成的一群组;
[0464] R2是酰基;
[0465] R3至R6各自独立地为-OR16。其中R16独立地选自于如化学式Ia或Ib中的任何的所述对应的多个实施例中所述的氢、一单糖部分、一寡糖部分、一取代或未取代的烷基、一取代或未取代的烯基、一取代或未取代的炔基、一取代或未取代的环烷基、一取代或未取代的芳基、一取代或未取代的杂芳基、一取代或未取代的烷芳基以及酰基。R3至R6中的至少一个为-OR16,其中R16为酰基;以及
[0466] R7至R9为各自独立地选自于如化学式Ia或Ib中的任何的所述对应的多个实施例中所述的氢、酰基、氨基取代的α-羟基酰基、一取代或未取代的烷基、一取代或未取代的烯基、一取代或未取代的炔基、一取代或未取代的环烷基、一取代或未取代的芳基、一取代或未取代的烷芳基、羧酸根、磺酰基(包括烷基磺酰基及芳基磺酰基)以及一细胞可渗透性基团。
[0467] 在化学式Ie的任何实施例中的一些实施例中:
[0468] X1为氧;
[0469] Rx、Ryl以及Rz各自为氢;
[0470] Ry2至Ry9以及Rw1至Rw3各自为氢;
[0471] R1是氢、烷基、环烷基或芳基,以及优选地为氢或如本文所述的一低碳烷基;
[0472] R2是酰基;
[0473] R3、R5以及R6各自独立地为-OR16,其中R16为酰基;
[0474] R4为-OR16,其中R16为氢或酰基;以及
[0475] R7至R9为各自独立地选自于由如化学式Ia或Ib中的任何的所述对应的多个实施例中所述的氢、酰基、氨基取代的α-羟基酰基、一取代或未取代的烷基、一取代或未取代的烯基、一取代或未取代的炔基、一取代或未取代的环烷基、一取代或未取代的芳基、一取代或未取代的烷芳基以及一细胞可渗透性基团所组成的一群组。
[0476] 在化学式Ie的任何实施例中的一些实施例中:
[0477] X1为氧;
[0478] Rx、Ryl以及Rz各自为氢;
[0479] Ry2至Ry9以及Rw1至Rw3各自为氢;
[0480] R1为氢、烷基、环烷基或芳基,以及优选地为如本文所述的氢或低碳烷基;
[0481] R2是酰基;
[0482] R3以及R4各自独立地为-OR16,其中R16为酰基;
[0483] R4为-OR16,其中R16为氢或酰基;以及
[0484] R5为如本文所述的由化学式II表示的一单糖,其中X2优选地为如本文对于化学式Ia或Ib的各个相应实施例中的任一个所述的-NR14R15;以及
[0485] R7至R9为各自独立地选自于由如化学式Ia或Ib中的任何的所述对应的多个实施例中所述的氢、酰基、氨基取代的α-羟基酰基、一取代或未取代的烷基、一取代或未取代的烯基、一取代或未取代的炔基、一取代或未取代的环烷基、一取代或未取代的芳基、一取代或未取代的烷芳基以及一细胞可渗透性基团所组成的一群组。
[0486] 由化学式Ie所示的多个化合物在本文中也被称为“多酯化的”多个化合物。
[0487] 由化学式Ie涵盖的多个示例性化合物包括以下的所述多个实施例部分中的方案14中所示的所述多个化合物。
[0488] 对于本文所述的任何实施例及其任何组合,所述化合物可以在一盐的一形式,例如:一药学上可接受的盐。
[0489] 如本文所用,所述短语“药学上可接受的盐”是指所述母体化合物的一带电种类及所述带电种类的反离子,所述反离子通常是用于修饰所述母体化合物的所述溶解特性和/或减少对于一生物体的任何显着的刺激,同时不消除所述给药的化合物的生物学活性以及多个性质。如本文所述的一化合物的一药学上可接受的盐可以替代地在所述化合物的所述合成期间形成,例如:从一反应混合物或重结晶化合物中分离所述化合物的所述过程。
[0490] 在本发明的一些实施例的上下文中,本文所述的所述多个化合物的一药学上可接受的盐可以任选地为一酸加成盐,所述酸加成盐包括所述化合物的至少一个性(例如:胺和/或胍)基团,其中所述碱性基团是在一带正电荷的形式(例如:其中所述碱性基团被质子化),与至少一种衍生自所述被选定的碱的反离子组合,以形成一药学上可接受的盐。
[0491] 因此本文所述的多个化合物的所述多个酸加成盐可以为在所述化合物的一个或多个碱性基团与一种酸的一个或多个当量之间所形成的多个复合物。
[0492] 取决于所述化合物中的所述(多个)带电基团与所述盐中的所述反离子之间的所述化学计量的多个比例,所述多个酸加成盐可以是多个单加成盐或多个多加成盐。
[0493] 如本文所使用的所述短语“单加成盐”是指一种盐,其中所述化合物的所述反离子及所述带电形式之间的所述化学计量比为1:1,使得所述加成盐在每摩尔当量的化合物中包含1摩尔当量的所述反离子。
[0494] 如本文所使用的所述短语“单加成盐”是指一种盐,其中所述化合物的所述反离子及所述带电形式之间的所述化学计量比大于1:1,并且为例如:2:1、3:1、4:1等,使得所述加成盐在每摩尔当量的化合物中包含2摩尔当量或更多摩尔当量的反离子。
[0495] 一个非限制性的一药学上可接受的盐的一例子可以是铵阳离子或胍阳离子及所述铵阳离子或胍阳离子的一个酸加成盐。
[0496] 所述多个酸加成盐可以包括各种有机酸无机酸,例如但不限于:提供盐酸加成盐的盐酸、提供氢溴酸加成盐的氢溴酸、提供乙酸加成的乙酸盐,提供抗坏血酸加成盐的抗坏血酸、提供苯磺酸加成盐的苯磺酸、提供樟脑磺酸加成盐的樟脑磺酸、提供柠檬酸加成盐的柠檬酸、提供马来酸加成盐的马来酸、提供苹果酸加成盐的苹果酸、提供甲磺酸(甲磺酸盐)加成盐的甲磺酸、提供萘磺酸加成盐的萘磺酸、提供草酸加成盐的草酸、提供磷酸的磷酸酸加成盐、提供对甲苯磺酸加成盐的甲苯磺酸、提供琥珀酸加成盐的琥珀酸、提供硫酸加成盐的硫酸、提供酒石酸加成盐的酒石酸以及提供三氟乙酸加成盐的三氟乙酸。如同所述多个术语在本文中所定义的,所述多个酸加成盐中的每一种可以是一个单加成盐或一个多加成盐。
[0497] 本发明的实施例进一步涵盖本文所述化合物的任何对映异构体、非对映异构体、前体药物、溶剂合物、水合物和/或药学上可接受的盐。
[0498] 本文使用的术语“对映异构体”是指仅通过彼此的完全翻转/反射(镜像)而与它的对应物是可重合的化合物的立体异构体。由于它们像右手和左手一样互相对应,对映异构体据说具有“手性”。除了当存在于自身具有手性的一环境如所有的生命体系中时,对映异构体具有相同的化学特性和物理特性。在本发明的多个实施例的上下文中,一化合物可以展现出一个或多个手性中心,每个所述手性中心展现出一个R组态或一个N组态以及任何组合,并且根据本发明的一些实施例的多个化合物,可以具有它们的任何手性中心并呈现一个R组态或一个N组态。
[0499] 如本文所使用的术语“非对映异构体”是指彼此不是对映异构体的立体异构体。非对映异构是发生在当一种化合物的两种或更多种立体异构体在一个或多个但不是全部的所述相等(相关)立体中心处具有不同组态,并且彼此不是镜像。当两个非对映异构体在仅一个立体中心上彼此不同时,它们是差向异构体。每个立体中心(手性中心)产生两种不同的组态,因此产生两种不同的立体异构体。在本发明的上下文中,本发明的多个实施例涵盖具有多个手性中心的化合物,所述多个化合物以立体组态的任何组合形式出现,即任何非对映异构体。
[0500] 根据本文所述的任何实施例中的一些实施例,每一个第6’位及第5”位(若存在)中的一立体组态独立地为一个R组态或一个S组态。
[0501] 根据本文所述的任何实施例中的一些实施例,第6’位的一立体组态是一个R组态。
[0502] 根据本文所述的任何实施例中的一些实施例,若存在第5”位的一立体组态时为一个S组态。
[0503] 根据本文所述的任何实施例中的一些实施例,第6’位的立体组态是一个R配置,并且若存在第5”位的一立体组态时为一个R配置或一个S配置。
[0504] 根据本文所述的任何实施例中的一些实施例,第6’位的一立体组态是一个R配置,并且若存在第5”位的一立体组态时为一个S配置。
[0505] 术语“前体药物”是指一种在体内被转化为所述活性化合物(所述活性母体药物)的药物。前体药物通常用于促进所述母体药物的所述给药。它们可以,例如:通过口服施用成为生物可利用的而母体药物却不能。与所述母体药物相比,所述前体药物在多个药物组合物中也可具有改善的溶解度。前体药物也通常被用于实现所述活性化合物在体内的一持续性释放。一前体药物的一例子可以是但不限制于本发明中的一化合物,所述化合物具有一个或多个羧酸部分,所述羧酸部分被作为一种酯(所述“前体药物”)而给药。这样的一前体药物在体内被水解,从而提供所述游离化合物(所述母体药物),所述被选定的酯可影响所述前体药物的所述溶解特性以及所述水解速率两者。
[0506] 术语“溶剂化物”是指由一溶质(本发明的所述化合物)和一溶剂所组成的可变化学计量(例如:二-、三-、四-、五-、六-等)的一复合物,因此所述溶剂不影响所述溶质的所述生物活性。多个适合的溶剂包括例如:乙醇、乙酸等。
[0507] 术语“水合物”是指如上文所定义的一种溶剂化物,其中所述溶剂是水。
[0508] 如本文所使用的术语“羟基”或“羟基”是指一个-OH基团。
[0509] 如本文所使用的术语“胺基”描述了一个-NR’R”以及每个R’及R“独立地为如本文所定义的所述多个术语:氢、烷基、烯基、炔基、环烷基、杂脂环基、芳基、杂芳基、烷芳基、烷杂芳基或酰基。替代地、R’及R“中的一个或两个可以是例如:羟基、烷氧基、羟烷基、三卤代烷基、环烷基、烯基、炔基、芳基、杂芳基、杂脂环基、氨基、卤化物、磺酸化合物、亚砜、磷酸化合物、羟基、烷氧基、芳氧基、巯基、硫代烷氧基、硫代芳氧基、氰基、硝基、偶氮、磺酰胺、羰基、C-羧酸酯、O-羧酸酯、N-硫代氨基甲酸酯、O-硫代氨基甲酸酯、脲、硫脲、N-氨基甲酸酯、O-氨基甲酸酯、C-酰胺、N-酰胺、脒基、胍以及肼。
[0510] 如本文所用,术语“烷基”描述了一种脂族烃,所述脂族烃包括直链和多个支链基团。所述烷基可以具有1至20个碳原子,或1至10个碳原子,并且可以是支链或非支链的。根据本发明的一些实施例,所述烷基是一低(或较低的)碳烷基,具有1至4个碳原子(即甲基、乙基、丙基以及丁基)。
[0511] 每当本文提出的一数字范围如“1至10”,它暗示所述基团,在此情况下为所述烷基,可包含1个碳原子、2个碳原子、3个碳原子等,直到以及包括10个碳原子。在一些实施例中,所述烷基是一低碳烷基,包括1至6个或1至4个碳原子。
[0512] 烷基可以被取代或未被取代。当被取代时,所述取代基可以是例如:烷基(形成一支链烷基)、烯基、炔基、环烷基、芳基、杂芳基、杂脂环基、卤代、三卤代烷基、羟基、烷氧基以及羟烷基,所述多个术语如下文所定义的。被芳基取代的烷基在本文中也被称为“烷芳基”,所述烷芳基的实例是苄基。
[0513] 每当描述“烷基”时,所述烷基也可以被烯基或炔基取代。如本文所使用的术语“烷基”还涵盖饱和或不饱和的烃,因此所述术语还包括烯基以及炔基。
[0514] 术语“烯基”描述了如本文所定义的一不饱和烷基,所述不饱和烷基具有至少两个碳原子和至少一个碳碳双键,例如:烯丙基、乙烯基、3-丁烯基、2-丁烯基、2-己烯基以及异丙烯。如上文所述,所述烯基可以被一个或多个取代基所取代或未被取代。
[0515] 如本文所定义的术语“炔基”是一不饱和烷基,所述不饱和烷基具有至少两个碳原子以及至少一个碳碳三键。如上文所述,所述炔基可以被一个或多个取代基所述取代或未被取代。
[0516] 术语“环烷基”是指全碳单环或稠环(即共享一对相邻的碳原子的多个环),支链或非支链的基团,所述基团包含3个或以上的碳原子,其中所述多个环中的一个或多个不具有一完全地共轭的π电子系统,并且可以进一步被取代或未被取代。多个示例性的环烷基包括例如:环丙基、环丁基、环戊基、环己基或环十二烷基。所述环烷基可以被取代或未被取代。当被取代时,所述取代基可以是例如:烷基、烯基、炔基、环烷基、芳基、杂芳基、杂脂环基、卤代、三卤代烷基、羟基、烷氧基以及羟烷基中的一个或多个,如同在下文中定义的所述多个术语。
[0517] 术语“芳基”描述具有一完全共轭π电子系统的全碳单环或稠环多环的(即共享一对相邻的碳原子的多个环)基团。所述芳基可以未被取代或被一个或多个取代基取代。当被取代时,所述取代基可以是例如:烷基、烯基、炔基、环烷基、芳基、杂芳基、杂脂环基、卤代、三卤代烷基、羟基、烷氧基以及羟烷基中的一个或多个,如同在下文中定义的所述多个术语。
[0518] 术语“杂芳基”描述在环中具有一种或多种原子,如,例如氮、氧和硫的基团,以及额外地具有一完全共轭π电子系统的单环或稠环(即共享一对相邻的碳原子的多个环)基团。杂芳基的多个实例但非限制性地包括吡咯、呋喃、噻吩、咪唑、恶唑、噻唑、吡唑、吡啶、嘧啶、喹啉、异喹啉以及嘌呤,多个代表性的例子为噻二唑、吡啶、吡咯、恶唑、吲哚、嘌呤等。所述杂芳基可以是未取代的或被一个或多个取代基取代。当被取代时,所述取代基可以是例如:烷基、烯基、炔基、环烷基、芳基、杂芳基、杂脂环基、卤代、三卤代烷基、羟基、烷氧基以及羟烷基中的一个或多个,如同在下文中所定义的所述多个术语。
[0519] 如本文所使用的术语“杂脂环族”描述在所述(多个)环中具有一个或多个原子,例如:氮、氧及硫的一个单环或稠环基团。所述多个环也可以具有一个或多个双键。然而,所述多个环没有完全共轭π电子系统。多个代表性的例子为吗啉、哌啶、哌嗪、四氢呋喃、四氢吡喃等。所述杂脂环可以被取代或未被取代。当被取代时,所述取代基可以是例如:烷基、烯基、炔基、环烷基、芳基、杂芳基、杂脂环基、卤代、三卤代烷基、羟基、烷氧基以及羟烷基中的一个或多个,如同在下文中所定义的所述多个术语。
[0520] 本文使用的术语“卤化物”是指一个卤原子的所述阴离子,即离子(F-)、氯离子(CI-)以及碘离子(I-)。
[0521] 术语“卤代”是指刉氟(F)、氯(Cl)、溴(Br)以及碘(I)原子作为多个取代基。
[0522] 术语“醇盐”是指R’-O-阴离子,其中R’为如以上所定义的。
[0523] 术语“烷氧基”是指-OR’基团,其中R’是如本文所定义的烷基或环烷基。
[0524] 术语“芳氧基”是指-OR’基团,其中R’是如本文所定义的芳基。
[0525] 术语“杂芳氧基”是指-OR’基团,其中R’是如本文所定义的杂芳基。
[0526] 术语“硫代烷氧基”是指-SR’基团,其中R’是如本文所定义的烷基或环烷基。
[0527] 术语“硫代芳氧基”是指-SR’基团,其中R’是如本文所定义的芳基。
[0528] 术语“硫代杂芳氧基”是指-SR’基团,其中R’是如本文所定义的杂芳基。
[0529] 如本文所使用的术语“羟烷基”是指一个烷基如本文所定义的被一个或多个羟基所取代,例如:羟甲基、2-羟乙基以及4-羟戊基。
[0530] 如本文所使用的术语“氨基烷基”是指一个烷基如本文所定义的被一个或多个氨基取代。
[0531] 本文所使用的术语“烷氧基烷基”是指一烷基被一个或多个烷氧基所取代,例如:甲氧基甲基、2-甲氧基乙基、4-乙氧基丁基、正丙氧基乙基和叔丁基乙基。
[0532] 术语“三卤代烷基”是指-CX3,其中X是如本文所定义的卤素。一示例性的卤代烷基为CF3。
[0533] 一个“胍基(guanidine)”或“胍基(guanidine)”或“胍基(guanidinyl)”或“胍基(guanidyl)”基团是指-RaNC(=NRd)-NRbRc基团,其中Ra、Rb、Rc以及Rd中的每一个可以是各自为如本文所定义的R’及R”。
[0534] 一个“脒基(guanyl)”或“鸟嘌呤(guanine)”基团是指RaRbNC(=NRd)-基团,其中Ra,Rb以及Rd各自为如本文所定义的R’及R”。
[0535] 在本文所述的任何实施例中的一些实施例中,所述胍基为-NH-C(=NH)-NH2。
[0536] 在本文所述的任何实施例中的一些实施例中,所述脒基为H2N-C(=NH)-基团。
[0537] 本文所述的任何一种胺(包括经修饰的胺)、胍以及鸟嘌呤基团以它们的一游离碱的形式存在,但代表涵盖它们的在生理pH下和/或它们的盐中的离子化的形式,例如:如本文所述的它们的一药学上可接受的盐。
[0538] 每当本文所述的烷基、环烷基、芳基、烷芳基、杂芳基、杂脂环基、酰基以及任何其它部分被取代、它包括一个或多个取代基、各自可以独立地为但不限于:羟基、烷氧基、硫羟基、硫代烷氧基、芳氧基、硫代芳氧基、烷芳基、烯基、炔基、磺酸盐、亚砜、硫代硫酸盐、硫酸盐、亚硫酸盐、硫代亚硫酸盐、膦酸盐、氰基、硝基、偶氮、磺酰胺、羰基、硫代羰基、C-羧酸盐、O-羧酸盐、N-硫代氨基甲酸盐、硫代氨基甲酸酯、氧代、硫代氧基、肟、酰基、酰卤、偶氮、叠氮化物、脲、硫脲、N-氨基甲酸酯、O-氨基甲酸酯、C-酰胺、N-酰胺、脒基、胍基、肼和酰肼,如同在本文所定义的所述多个术语。
[0539] 术语“氰基”描述一个-C≡N基团。
[0540] 术语“硝基”描述一个-NO2基团。
[0541] 术语“硫酸盐”描述一个-O-S(=O)2-OR’末端基,如所述术语在上文中所定义,或一个-O-S(=O)2-O-连接基团,如上文所定义的所述多个短语,其中R’如上文所定义的。
[0542] 术语“硫代硫酸盐”描述一个-O-S(=S)(=O)-OR’末端基或一个-O-S(=S)(=O)-O-连接基团,如上文所定义的所述多个短语,其中R’如上文所定义的。
[0543] 术语“亚硫酸酯”描述一个-O-S(=O)-O-R’末端基或一个-O-S(=O)-O-连接基团,如上文所定义的所述多个短语,其中R’如上文所定义的。
[0544] 术语“硫代亚硫酸盐”描述了-O-S(=S)-O-R’末端基或一个-O-S(=S)-O-连接基团,如上文所定义的所述多个短语,其中R’如上文所定义的。
[0545] 术语“亚磺酸根”描述了-S(=O)-OR’末端基或一个-S(=O)-O-连接基团,如上文所定义的所述多个短语,其中R’如上文所定义的。
[0546] 术语“亚砜”或“亚磺酰基”描述一个-S(=O)R’末端基或一个-S(=O)-连接基团,如上文所定义的所述多个短语,其中R’如上文所定义的。
[0547] 术语“磺酸酯”或“磺酰基”描述一个-S(=O)2-R’末端基或一个-S(=O)2-连接基团,如上文所定义的所述多个短语,其中R’如本文所定义的。
[0548] 术语“S-磺酰胺”描述了-S(=O)2-NR’R”末端基或一个-S(=O)2-NR’-连接基团,如上文所定义的所述多个短语,其中R’以及R”为如本文所定义的。
[0549] 术语“N-磺酰胺”描述了R’S(=O)2-NR”-末端基或一个-S(=O)2-NR’-连接基团,如上文所定义的所述多个短语,其中R’以及R”如本文所定义。
[0550] 如本文所使用的术语“羰基”或“碳酸酯”描述一个-C(=O)-R’末端基或一个-C(=O)-连接基团,如上文所定义的所述多个短语,其中R’如本文所定义的。
[0551] 如本文所用,术语“硫代羰基”描述一个-C(=S)-R’末端基或一个-C(=S)-连接基团,如这些短语如上文所定义,其中R’如本文所定义的。
[0552] 如本文所使用的术语“氧代”描述一个(=O)基团,其中一氧原子通过一双键连接到所述指定位置上的原子(例如碳原子)。
[0553] 如本文所使用的术语“硫代氧基”描述一个(=S)基团,其中一硫原子通过一双键连接到所述指定位置处的原子(例如碳原子)。
[0554] 术语“肟”描述了=N-OH末端基团或α=N-O-连接基团,如上文所定义的所述多个短语。
[0555] 术语“酰基卤”描述了-(C=O)R””基团,其中R””是如上文所定义的卤化物。
[0556] 术语“偶氮”或“重氮”描述一个-N=NR’末端基或一个-N=N-连接基团,如上文所定义的所述多个短语,其中R’如上文所定义的。
[0557] 术语“叠氮化物”描述一个-N3末端基。
[0558] 如本文所使用的术语“羧酸盐”涵盖C-羧酸盐以及O-羧酸盐。
[0559] 术语“C-羧酸酯”描述一个-C(=O)-OR’末端基或一个-C(=O)-O-连接基团,如上文所定义的所述多个短语,其中R’如本文所定义的。
[0560] 术语“O-羧酸酯”描述一个-OC(=O)R’末端基或一个-OC(=O)-连接基团,如上文所定义的所述多个短语,其中R’如本文所定义的。
[0561] 羧酸盐可以是线性或环状的。当为环状时,R’和所述碳原子在C-羧酸酯中连接在一起以形成一个环,并且所述基团也被称为内酯。替代地,R’和氧在O-羧酸酯中连接在一起以形成一个环。例如:当所形成的环中的一原子与另一个基团连接时,多个环状羧酸酯可以用作一连接基团。
[0562] 如本文所使用的术语“硫代羧酸酯”涵盖C-硫代羧酸酯以及O-硫代羧酸酯。
[0563] 术语“C-硫代羧酸酯”描述一个-C(=S)-OR’末端基或一个-C(=S)-O-连接基团,如上文所定义的所述多个短语,其中R’如本文所定义的。
[0564] 术语“O-硫代羧酸酯”描述一个-OC(=S)R’末端基或一个-OC(=S)-连接基团,如上文所定义的所述多个短语,其中R’如本文所定义的。
[0565] 硫代羧酸盐可以是线性或环状的。当环状时,R’与所述碳原子在C-硫代羧酸酯中连接在一起以形成一个环,并且所述基团也被称为硫代内酯。替代地,R’与O连接在一起形成O-硫代羧酸酯中的一个环。环硫代羧酸酯可用作一个连接基团,例如:当所述形成的环中的一个原子与另一个基团连接时。
[0566] 如本文所使用的术语“氨基甲酸酯”涵盖N-氨基甲酸酯以及O-氨基甲酸酯。
[0567] 术语“N-氨基甲酸酯”描述一个R”OC(=O)-NR’-末端基或一个-OC(=O)-NR’-连接基团,如上文所定义的所述多个短语,其中R’以及R”为如本文所定义的。
[0568] 术语“O-氨基甲酸酯”描述一个-OC(=O)-NR’R”末端基或一个-OC(=O)-NR’-连接基团,如上文所定义的所述多个短语,其中R’以及R”为如本文所定义的。
[0569] 氨基甲酸酯可以是线性或环状的。当为环状时,,R’与所述碳原子连接在一起以在O-氨基甲酸酯中形成一个环。替代地,R’与氧连接在一起以在N-氨基甲酸酯中形成一个环。多个环氨基甲酸酯可以用作一个连接基团,例如:当所述形成的环中的一个原子与另一个基团连接时。
[0570] 如本文所使用的术语“氨基甲酸酯”涵盖N-氨基甲酸酯以及O-氨基甲酸酯。
[0571] 如本文所使用的术语“硫代氨基甲酸酯”涵盖N-硫代氨基甲酸酯以及O-硫代氨基甲酸酯。
[0572] 术语“O-硫代氨基甲酸酯”描述一个-OC(=S)-NR’R”末端基或一个-OC(=S)-NR’-连接基团,如上文所定义的所述多个短语,其中R’以及R”为如本文所定义的。
[0573] 术语“N-硫代氨基甲酸酯”描述一个R“OC(=S)NR’-末端基或一个-OC(=S)NR’-连接基团,如上文所定义的所述多个短语,其中R’以及R”为如本文所定义的。
[0574] 多个硫代氨基甲酸酯可以是线性或环状的,如本文对氨基甲酸酯所述。
[0575] 本文使用的术语“二硫代氨基甲酸酯”包括S-二硫代氨基甲酸酯和N-二硫代氨基甲酸酯。
[0576] 术语“S-二硫代氨基甲酸酯”描述一个-SC(=S)-NR’R”末端基或一个-SC(=S)NR’-连接基团,如上文所定义的所述多个短语,其中R’以及R”如在此定义。
[0577] 术语“N-二硫代氨基甲酸酯”描述一个R“SC(=S)NR’-末端基或一个-SC(=S)NR’-连接基,如上文所定义的所述多个短语,其中R’以及R”如定义于此。
[0578] 术语“脲”,所述脲在本文中也被称为“脲基”,所述脲描述一个-NR’C(=O)-NR”R”’末端基或一个-NR’C(=O)-NR”-连接基团,如上文所定义的所述多个短语,其中R’以及R”为如本文所定义,并且R”’为如本文对于R’以及R”所定义。
[0579] 术语“硫脲”(在本文中也称为“硫脲基”)描述了-NR’-C(=S)-NR“R”‘末端基或一个-NR’-C(=S)-NR”-连接基团,如本文所定义的R’,R”以及R”’。
[0580] 如本文所使用的术语“酰胺”涵盖C-酰胺以及N-酰胺。
[0581] 术语“C-酰胺”描述一个-C(=O)-NR’R”末端基或一个-C(=O)-NR’-连接基团,如上文所定义的所述多个短语,其中R’以及R”为如本文所定义的。
[0582] 术语“N-酰胺”描述了一个R’C(=O)-NR”-末端基或一个R’C(=O)-N-连接基团,如上文所定义的所述多个短语,其中R’以及R”为如本文所定义的。
[0583] 术语“肼”描述一个-NR’-NR”R”‘末端基或一个-NR’-NR”连接基团,如上文所定义的所述多个短语,其中R’,R”以及R”’为如本文所定义的。
[0584] 如本文所用,术语“酰肼”描述一个-C(=O)-NR’-NR”R”’末端基或一个-C(=O)-NR’-NR”-连接基团,因为这些短语是如上文所定义,其中R’、R”以及R”’为如本文所定义的。
[0585] 如本文所用,术语“硫代酰肼”描述一个-C(=S)-NR’-NR”R”’末端基或一个-C(=S)-NR’-NR”-连接基团,因为这些短语是如上文所定义,其中R’、R”以及R”’为如本文所定义的。
[0586] 多个工序:
[0587] 进一步根据本发明的多个实施例,提供了多种制备如本文所述的多个化合物的方法。
[0588] 所述多个方法通常地通过提供一个巴龙霉胺衍生物,并且向所述巴龙霉胺衍生物引入一期望的修饰,从而获得如本文所述的一种假二糖化合物来实现。
[0589] 如本文所述的多种制备多个假三糖化合物的方法通常地通过设计合适的受体氨基糖苷分子以及相应的多个供体分子来实现,如在氨基糖苷类的领域中所习知的。
[0590] 通常地,根据本发明的一些实施例的多个假三糖化合物的所述合成,使用合适的受体和供体分子,以及允许所述供体和所述受体的一受保护衍生物与所述供体的一受保护衍生物发生反应,并且去除所述保护基以获得一个所需的化学式Ia的假三糖。
[0591] 术语“受体”在本文中用于描述衍生自巴龙霉胺的所述骨架结构,所述巴龙霉胺在在第C3’位、第C4’位、第C6位或第C5位,优选地为第C5位,所述第C5位具有一个可用(未保护的)羟基,所述羟基在一糖基化反应的期间是易反应的,并且可以接受一个糖基。
[0592] 术语“供体”在本文中用于描述所述糖基,所述糖基与所述受体反应以形成所述最终的假三糖化合物。
[0593] 如本文所使用术语“糖基”是指通过从一单糖的所述半缩醛官能团中去除所述羟基而获得的一化学基团。
[0594] 根据本发明的一些实施例,设计所述多个供体以及多个受体以形成所需的多个化合物。以下描述本发明的所述方面的一些实施方式,表示了制备本文所述的所述化合物的多个示例性子集的多个示例性过程。制备根据本发明一些实施例的多个示例性化合物的更详细的方法在以下的所述多个实施例部分中示出。
[0595] 根据本发明的一些实施例的多个假三糖化合物的所述多个合成,通常地包括(i)通过在存在于所述巴龙霉胺支架上的多个选定位置处的一个或多个羟基和氨基的选择性保护来制备一种受体化合物,留下所述选定的位置(例如:C5)未被保护,而因此自由地接受如本文所定义的一个供体(糖基)化合物;(ii)通过选择性保护存在于糖基上的选定位置上的一个或多个羟基和胺来制备一供体化合物,留下一个位置未受保护,而因此自由地与本文定义的受体化合物偶联;(iii)使所述供体及所述受体进行一偶联反应;以及(iii)去除所述多个保护基,从而得到所需的化合物。
[0596] 如本文所用的短语“保护基团”是指被取代或被修饰的基团,使得在所述多个反应条件下(例如,如本文所述的一偶联反应)阻断其官能性,并且防止其与其它基团反应。一个被保护基团是通过去除所述取代基或通过重新修饰来重新产生。
[0597] 当使用一个“氨基保护基团”或“羟基保护基团”时,它表示一保护基团被连接或被用于修饰所述相应的基团以产生所述受保护的基团。
[0598] 如本文所使用的短语“保护基团”是指一种取代基或一种修饰,所述取代基或所述修饰通常地被用于在所述化合物上的其它官能团反应时阻断或保护一特定的官能团。所述保护基被选定以释放所述取代基或被重新修饰,从而产生所需的未保护基团。
[0599] 例如,一个“氨基保护基团(amino-protecting group)”或“胺保护基团(amine-protecting group)”是连接到一个氨基上的一取代基或一个氨基的修饰,其阻断或保护所述化合物中的所述氨基的官能团﹐并且防止它参与多个化学反应。所述氨基保护基团是通过所述取代基的去除或通过重新产生氨基的一修饰来去除所述氨基保护基。
[0600] 多个合适的氨基保护基团包括:叠氮化物(叠氮基)、N-邻苯二甲酰亚胺、N-乙酰基、N-三氟乙酰基、N-叔丁氧基羰基(BOC)、N-苄氧羰基(CBz)以及N-9-芴基亚甲氧基羰基(Fmoc)。
[0601] 一个“羟基保护基”或“羟基保护基”是指一个取代基或一个修饰,所述取代基或修饰阻断或保护所述羟基的官能团,并且阻止所述羟基的官能团参与化学反应,所述羟基保护基是通过所述取代基的去除或通过重新产生羟基的一修饰来去除。
[0602] 多个合适的羟基保护基包括:异亚丙基缩酮以及环己酮二甲基缩酮(形成一个具有两个相邻的羟基的1,3-二氧杂环己烷)、4-甲氧基-1-甲基苯(形成具有两个相邻羟基的1,3-二氧杂环己烷)、O-乙酰基、O-氯乙酰基、O-苯甲酰基以及O-甲烷基。
[0603] 对于多个保护基团及其用途的一般描述,请参见T.W.Greene,有机合成中的保护基(Protective Groups in Organic Synthesis),John Wiley&Sons,纽约,1991。
[0604] 根据一些实施例,所述多个氨基保护的基团包括:一个叠氮基(N3-)和/或一个N-邻苯二甲酰亚氨基,并且所述多个羟基保护基包括:O-乙酰基(AcO-)、O-苯甲酰基(BzO-)和/或O-氯乙酰基。
[0605] 本文应当注意,当应用时,一个“保护基团”是指一个部分,在所述部分中,保护一化合物上的一个反应性官能团,或同时保护多于一个官能团,例如:在两个相邻的官能团的情况下,例如:可以通过一个异亚丙基缩酮一次性地保护两个羟基。
[0606] 在一些实施例中,所述供体化合物是一个受保护的单糖,所述单糖可以由所述通用的化学式III表示:
[0607] 在一些实施例中,所述供体化合物是一个受保护的单糖,所述单糖可以由所述通用的化学式III表示,在所述化学式III的第1”位处具有一离去基团,标记为L,以及任选地具有如本文所定义的位于第5”位的一取代基R12:
[0608]
[0609] 化学式III
[0610] 其中:
[0611] L是一个离去基团;
[0612] OT是一个供体保护的羟基;
[0613] R12为如本文所定义的化学式Ib(如在化学式III所示的所述第5”位处的所述组态是一非限制性实例);以及
[0614] D是化学式Ib所定义的-NR14R15的一保护或未保护的形式,其中当化学式Ib中的R14以及R15都是氢时,D是一供体保护的胺基。
[0615] 如本文所使用的短语“离去基团”描述一个不稳定原子、基团或化学部分,所述离去基团在一化学反应过程中轻易从一有机分子中脱离,而所述脱离通常地为通过所述离开原子、基团或部分的所述相对稳定性所促使。通常地,一强酸的所述共轭碱基的任何基团都可以作为一离去基团。根据一些本发明的多个实施例,多个合适的离去基团的多个代表性实例包括但不限于:三氯乙酰亚胺基、乙酸根、甲苯磺酸根、三氟甲磺酸根、磺酸根、叠氮基、卤基、羟基、硫羟基、烷氧基、氰酸根、硫氰酸根、硝基以及氰基。
[0616] 根据本发明的一些实施例,每个所述供体的多个羟基保护基是O-苯甲酰基,以及在R15或R17中的所述供体的多个羟基保护基是叠氮基,但也考虑其它保护基。
[0617] 应当注意的是,当R14以及R15中的一个不是氢时,它可以被保护或不受保护。典型地,当R6以及R7之一是鸟嘌呤或胍时,可以使用适合于所述多个反应条件(例如:与一受体的一偶联反应的多个反应条件)的一保护基。可选地,所述鸟嘌呤或胍为不受保护的。当R14以及R15中的一个是烷基、芳基或环烷基时,通常地,化学式III中的D为NR14R15的一未受保护的形式。
[0618] 根据本发明的一些实施例,所述供体化合物的所述结构设定了所述供体化合物中的环III的所述绝对结构,即化学式Ib中的所述第5”位的所述立体组态以及R14、R15以及R12的所述类型。
[0619] 适用于制备本文所述的多个化合物的多个示例性的受体分子由化学式IV表示:
[0620]
[0621] 化学式IV
[0622] 其中:
[0623] 所述虚线表示第6’位的一立体组态为R组态或S组态;
[0624] OP是一受体保护的羟基;
[0625] AP是一受体保护的胺团;
[0626] R1为如本文所定义的化学式Ia或Ib;
[0627] A为一受体保护的羟基(OP);或根据所述多个基团的所述化学性质及所述多个反应条件,可以是定义OR2的其他基团之一,不管是受保护的还是未受保护的。
[0628] 并且B是一受体保护的氨基,若R7在化学式Ia时是氢,或可以是定义R7的所述多个基团中的一受保护或未受保护的形式。
[0629] 根据本发明的一些实施例,所述受体羟基保护基团为O-乙酰基。
[0630] 根据本发明的一些实施例,所述供体氨基保护基为叠氮基,但也考虑了其他保护基。
[0631] 所述多个受体羟基保护基团以及所述多个受体氨基保护基团在所述多个受体的所述不同的位置中可以是相同的或不同的位置。
[0632] 在一些实施例中,例如:在R7不是H的情况下,在所述B部分与所述供体反应之前,通过产生所述B部分来制备所述受体。
[0633] 根据本发明的一些实施例,所述受体化合物的所述结构决定了所生成的化合物中环I和环II的所述绝对结构。
[0634] 在一些实施例中,根据本发明的一些实施例,化学式Ia的多个假二糖化合物的所述合成是使用化学式V的氨基保护的化合物来实现:
[0635]
[0636] 化学式V
[0637] 其中:
[0638] 所述虚线表示第6’位的一立体组态为R组态或S组态;
[0639] AP为一受体保护的氨基;
[0640] R1为如本文所定义的化学式Ia;
[0641] A为如本文所述的一受体保护的羟基(OP);或根据所述多个基团的所述化学性质和所述多个反应条件,可以是定义OR2的其他基团之一,不管是受保护的还是未受保护的。
[0642] 在制备本发明的多个实施例进一步涵盖在本发明的多个实施例的所述多个化合物的多个工序的上下文中所述的任何的所述中间体化合物。
[0643] 多个治疗用途
[0644] 如本领域所习知的,导致多个遗传性疾病的多个等位基因的约三分之一携带多个提前终止(停止)密码子(PTC),所述提前终止密码子导致所述多个截短蛋白质的所述制备。一种可能的治疗方法涉及这种提前终止密码子的通读的所述诱导和/或促进,以使能够合成多个全长蛋白质。多个提前终止密码子起源于突变或来自异常剪接,所述突变例如:无义突变、移码缺失以及插入,所述异常剪接产生具有多个截短阅读框的多个信使核糖核酸(mRNA)亚型。由于显性失活性效应或功能获得性效应,所述多个突变可导致截短、无功能的或有害的多个蛋白质的所述产生。
[0645] 通常地,通过抑制子的多个转运核糖核酸(tRNA)可以达到多个提前终止密码子的通读,所述抑制子的多个转运核糖核酸为多个降低转译终止效率的因子,例如:针对所述多个转译终止因子的多个小干扰核糖核酸(siRNA),以及靶向所述无义突变区域的核糖核酸的反义片断。本发明的所述多个目的之一为提供一种药理学治疗方法,旨在在患有与至少一种提前终止密码子突变相关的至少一种遗传性疾病的一个体中达到多个足够水平的多个功能性蛋白质。根据本发明的实施例,所提供的治疗方法旨在诱导和/或促进引起多个PTC的所述疾病的转译通读,以允许多个全长功能性蛋白质的所述合成和表达。
[0646] 如上所述,已经达到多个临床试验的一种广泛的研究的方法是基于通过影响所述核糖体解码位点的多个药物的通读,例如:氨基糖苷类抗生素;然而,当以高浓度使用和/或长期使用时,氨基糖苷类具有多个严重的不良副作用。本文所示的所述多个化合物被设计为表现出诱导和/或促进具有这些的一突变的一生物体中的一提前终止密码子突变的通读,同时表现出最小的不良作用。这样的活性使得所述多个化合物适合用作多个治疗活性剂,用于与提前终止密码子突变相关的多个遗传性疾病上的所述治疗。
[0647] 如在以下的所述多个实施例部分中所证明,由本发明的多个实施例所涵盖的多个示例性化合物事实上展现出一提前终止密码子突变抑制活性,而因此可用于诱导以一致病性提前终止密码子突变为特征的多个基因的通读,以及因此在治疗与一提前终止密码子突变相关的相对应的多个遗传性疾病或多个病症方面展现出可用性。
[0648] 根据本发明一些实施例的一个方面,本文所示的任何化合物具有化学式Ia或Ib,包括所述多个化合物及其任何组合的任何的所述相应的多个实施例(并且包括由化学式IC、Id以及Ie所表示的多个化合物),用于诱导和/或促进一提前终止密码子突变的通读和/或用于增加具有一提前终止密码子突变的一基因的一表达,和/或用于一药物的所述制造,所述药物用于诱导和/或促进一提前终止密码子突变的通读和/或增加具有一提前终止密码子突变的一基因的一表达。
[0649] 根据本发明的一些实施例的一个方面,本文所示的具有化学式Ia或Ib的所述多个化合物中的任一个,包括所述多个化合物及所述多个化合物的任何组合的所述多个相应的实施例的任一个(并且包括由化学式IC、Id以及Ie所表示的多个化合物),用于与一提前终止密码子突变相关的一遗传性疾病的所述治疗,或用于一药物的所述制造,所述药物用于与一提前终止密码子突变相关的一遗传性疾病上的所述治疗。
[0650] 亦考虑到所述多个提前终止密码子突变中的任一个。在一些实施例中,所述多个突变为具有UGA、UAG或UAA的核糖核酸(RNA)编码的所述多个突变。
[0651] 根据本文所述的任何实施例中的一些实施例,所述蛋白质是在一细胞质转译系统中转译。
[0652] 根据本文所述的任何实施例中的一些实施例,所述蛋白质是在一细胞质转译系统中转译。
[0653] 根据本文所述的任何实施例中的一些实施例,所述化合物在一真核生物细胞质转译系统中的一转译抑制的IC50大于所述化合物在一核糖体转译系统中转译抑制的IC50。
[0654] 根据本文所述的任何实施例中的一些实施例,所述化合物在一真核生物细胞质转译系统中的一转译抑制的IC50大于所述化合物在一核糖体转译系统中转译抑制的IC50。
[0655] 根据本发明的一些实施例的一个方面,本文所示的具有化学式Ia或Ib的所述多个化合物中的任一个,包括所述多个化合物及其任何组合的所述多个相应的实施例的任一个(并且包括由化学式IC、Id以及Ie所表示的多个化合物),用于与一提前终止密码子突变相关的一遗传性疾病的所述治疗,或用于一药物的所述制造,所述药物用于与一提前终止密码子突变相关的一遗传性疾病上的所述治疗。
[0656] 根据本发明一些实施例的一个方面,提供了治疗与一提前终止密码子突变相关的一遗传性疾病的方法。根据本发明的这一方面,通过为有需要的个体给药一种或多种本文所示的所述多个化合物的一治疗有效量的方法,所述多个化合物具有化学式Ia或Ib,包括所述多个化合物的任何的所述相应的多个实施例及其任何组合(以及包括由化学式IC、Id和Ie所表示的多个化合物)。
[0657] 如本文所用,术语“治疗”包括终止,基本上抑制、减慢或逆转病症的所述进程,基本上改善病症的临床或心理症状或基本上预防病症的临床或心理症状的出现。
[0658] 如本文所使用的短语“治疗有效量”描述了给药的所述聚合物的一用量,所述用量将在一定程度上缓解被治疗的所述病症的一种或多种症状。
[0659] 如本文所使用的短语“遗传性病症”是指由一种或多种缺陷基因所引起的多个慢性病症,所述多种缺陷基因通常是从父母遗传的,并且可以在当一种缺陷隐性基因的两个健康携带者繁殖时意外地发生,或当所述缺陷基因为显性时。多个遗传性疾病可以发生在不同的遗传模式中,其中包括所述常染色体显性模式,其中只需要所述基因的一个突变拷贝便影响一后代,而常染色体隐性模式,其中所述基因的两个拷贝必须为突变的才影响一后代。
[0660] 如本文所使用的短语“遗传性病症(genetic disorder)”涵盖遗传性病症(genetic disorder)、遗传性疾病(genetic disease)、遗传性病症(genetic condition)或遗传综合症(genetic syndrome)。
[0661] 根据本发明的任何实施例中的一些实施例,所述遗传性病症(genetic disorder)、遗传性疾病(genetic disease)、遗传性病症(genetic condition)或遗传综合症(genetic syndrome)涉及具有一提前终止密码子突变的一基因,在本文中也称为一截短突变和/或一无义突变,所述截短突变和/或所述无义突变导致其不正确的转译。所述不适当的转译制造一功能失调的必需蛋白质或引起一必需蛋白质的合成的一减少或一消除。在本发明的一些实施例的上下文中,在本发明的多个实施例的所述范围中被考虑的多个遗传性病症是指与一提前终止密码子突变和/或蛋白质截短表现型相关的多个遗传性病症。
[0662] 根据本发明的任何一个实施例中的一些实施例,与一提前终止密码子突变和/或一蛋白质截短表现型相关的一遗传性病症可通过诱导和/或促进在完整但其它缺陷的转录物(信使核糖核酸)中的所述突变的通读来治疗,也就是说,通过诱导和/或促进所述无义突变的抑制(所述提前终止密码子突变和/或所述截短突变)。在本发明的实施例的上下文中,一遗传性疾病是可以通过通读诱导和/或促进的多个化合物来治疗的。
[0663] 多种用于与一提前终止密码子突变和/或一蛋白质截短表现型相关的一遗传性病症的鉴定的方法在本领域中是习知的,并且包括全基因组或部分基因组解析、遗传生物标志物检测、表现型分类以及遗传信息分析。
[0664] 所述多个方法通常导致成对的突变型/野生型(WT)序列,并且所述多对可用于多个已知的方法学以鉴定所述遗传性疾病是否与一提前终止密码子突变和/或一蛋白质截短表现型相关联。
[0665] 通过本领域众所周知的多个方法可以建立用于治疗所述多个遗传性疾病的多个化合物的一通读诱导/促进活性。
[0666] 例如将包含被所述突变基因(所述导致遗传病症的基因)的一序列中断的两个报告基因的一质体被切断至多个全细胞或一个无细胞的系统中的一蛋白质表达平台,并且测量在一测试的化合物的存在下的所述两个基因的所述表达水平之间的所述比例,通常地以多个浓度以及多个重复测试,并且与所述野生型的表达水平比例和/或在不含受试化合物的所述对照组样本中的所述表达水平比例的比较。
[0667] 应当注意,对于通读活性的所述实验模型,即含有所述提前终止密码子突变的基因的所述核苷酸序列,是鉴定与一提前终止密码子突变和/或一蛋白质截断表现型相关联的一遗传性病病的所述工序中的一副产物,并且进一步地指出,随着基因组数据采集的所述多个巨大进步,所述工序现在完全在本领域的所述多个技术人员的技术能力之内,并且一旦建立了一候选药物的所述作用机制,如在已经显示出与一提前终止密码子突变和/或一蛋白质截短表现型相关联的多个遗传性疾病的情况下,完全在本领域技术人员的技术能力范围内,以鉴定、表征以及评估本文所示的所述多个通读诱导化合物的任一个的功效、选择性以及安全性。通过所述药物开发的所述多个常规过程,在本领域技术人员的技术范围内进一步采用本文所示的所述多个通读诱导化合物。
[0668] 用于测试一提前终止密码子突变和/或一截短突变的通读的多个方法学是本领域已知的,所述通读在本文被称为通读活性,并且在以下的多个实施例部分中提供了几种示例性的实验方法,通过该方法,根据本发明的一些实施例,可以表征所述多个通读诱导化合物。应该理解,可以使用其他方法来表征多个通读诱导化合物,并且所述多个方法也被考虑在本发明的范围之内。多个方法,例如本文所提供的方法还可以适用于高通量筛选技术,所述高通量筛选技术可以在一相对较短的时间段内测定数千种化合物。
[0669] 本领域技术人员将会理解,就用作多个药物的安全性而言,许多体外方法学可用于表征本文所述提供的多个通读诱导化合物,并且根据它们的细胞毒性与其功效评估所述多个候选药物。本领域技术人员也理解许多体外方法可以被用来表征本文所述提供的用于真核与原核选择性的所述多个通读诱导化合物,并且所述多个方法学也可以适用于高通量筛选技术,所述高通量筛选技术可以测定相对较多的化合物很短的时间。
[0670] 与至少一个提前终止密码子或其他无义突变的所述存在相关联的遗传性病症(disorder)、疾病(disease)、病症(condition)以及综合征(syndromes)的非限制性实例包括:癌症、蕾特氏综合症、囊性纤维化(CF)、贝克肌肉营养不良症(BMD)、先天性肌肉营养不良症(CMD)、杜兴氏肌肉营养不良(DMD)、第七因子缺乏症、家族性心房颤动症、黑利-黑利病、A型血友病、B型血友病、胡勒综合症、路易斯巴综合征(共济失调毛细血管扩张症,AT)、麦卡德尔病、粘多糖病、肾病性胱氨酸病、多囊肾病、第I型、第II型及第III型脊髓性肌肉萎缩症(SMA)、戴萨克斯症、乌谢尔综合症、胱氨酸病、严重大疱性表皮松解症、爪费综合症、X染色体关联的肾源性尿崩症(XNDI)以及X染色体关联的视网膜色素病变。
[0671] 与至少一提前终止密码子或其他无义突变的存在相关的额外的遗传性病症(disorder)、疾病(disease)、病症(condition)以及综合征(syndromes)列出在“抑制无义突变作为治疗遗传性疾病的治疗方法(Suppression of nonsense mutations as a 
therapeutic approach to treat genetic diseases)”,由Kim M.Keeling、K.M Bedwell、D.M.所著,威利跨学科评论:核糖核酸(Wiley Interdisciplinary Reviews:RNA),2011,2(6),第837至852页;“癌症症状和治疗的终止密码子的通读(Cancer syndromes and therapy by stop-codon readthrough)”,由Bordeira- R.等人所著,分子医学的
发展趋势(Trends in Molecular Medicine),2012,18(11),第667至678页、第667至678页以及其中引用的任何参考文献,其全部通过引用整体并入本文。
[0672] 在本文所述的任何方法和用途中,本文所述的多个化合物可以被用作自己本身或形成一药物组合物中的一部分,所述药物组合物还包含如本文所定义的一药学上可接受的载体。
[0673] 根据本发明一些实施例的一个方面,提供了一药物组合物,所述药物组合物包括作为一活性成分的本文所述的多个新颖的化合物中的任一个以及一药学上可接受的载体。
[0674] 如本文所使用的“药物组合物”是指本文所示的所述多个化合物的一制备,与其他化学成分,例如:药学上可接受的以及多个合适的载体以及赋形剂。一药物组合物的所述目的是促进一化合物对于生物体的给药。
[0675] 在下文中,术语“药学上可接受的载体”是指不会对一生物体造成显着刺激并且不会消除所述给药的化合物的所述生物学活性及性质的一载体或一稀释剂。多个载体的实施例包括但不限于:丙二醇、盐水、乳液以及有机溶剂与水的混合物,以及固体(例如粉状)及气体载体。
[0676] 本文中的术语“赋形剂”是指被加入到一药物组合物中以进一步促进一化合物的给药的一惰性物质。非限制性地,多个赋形剂的实施例包括:碳酸、磷酸钙、各种糖以及各种淀粉、纤维素衍生物、明胶、植物油以及聚乙二醇。
[0677] 用于多种药物的配制及给药的多个技术可以在“雷明顿药学科学(Remington's Pharmaceutical Sciences)”,麦克出版有限公司(Mack Publishing Co.),伊斯顿,宾夕法尼亚,的最新版本中找到,其通过引用并入本文。
[0678] 本发明的多个药物组合物可以通过本领域所习知的多个工序来制备,例如:通过常规混合、溶解、制粒、糖衣丸制作、研磨、乳化、包封、包埋或冻干过程。
[0679] 因此,本发明所用的药物组合物可以利用一种或多种生理可接受的载体,以常规方式配制,所述生理可接受的载体包括促进本文所示的所述多个化合物加工为药学可以使用的制剂的赋形剂和辅助剂。合适的制剂取决于预期的用途(如美容相对于疾病或疾病状况的治疗)和所选的施用或给药途径。
[0680] 根据一些实施例,所述给药以口服实现。对于口服给药,本文所示的所述多个化合物可以通过与本领域已知的药学可接受载体组合来容易地制备。对于要治疗患者的口服摄入,所述多个载体能使本文所示的所述多个化合物配制为片剂、丸剂、舌下组合物、糖丸、胶囊、液体、凝胶、糖浆、浆、混悬液等,用于经由一患者口部摄取。口服使用的多个药物制剂可以使用一固体赋形剂取得,若需要,在添加合适的助剂后,可选地将所得的混合物研磨并加工颗粒混合物,以获得片剂或糖丸核(dragee core)。多个合适的赋形剂为,特别是:填充剂,如糖类,包括乳糖、蔗糖、甘露醇或山梨醇;纤维素制品,例如玉米淀粉、小麦淀粉、稻米淀粉、马铃薯淀粉、明胶、黄芪胶、甲基纤维素、轻丙基甲基纤维素、羧甲基纤维素钠和/或聚乙烯吡咯烷酮(PVP)。若需要,可以添加崩解剂,如交联聚乙烯吡咯烷酮、琼脂或海藻酸或其盐,如藻酸钠。
[0681] 可以口服使用的药物制剂包括由明胶制成的推入配合胶囊(push-fit capsule)以及由明胶以及一增塑剂,例如:甘油或山梨醇所制作的多个软性密封胶囊。所述推入配合胶囊可以包含与填料混合的所述多个活性成分:填充剂,所述填料例如:乳糖;结合剂,如淀粉;和/或润滑剂,如滑石或硬脂酸镁;以及任选的稳定剂。在多个软性胶囊中,所述多个化合物可以溶于或悬浮于多个合适的液体中,例如:脂肪油、液体石蜡或液体聚乙二醇。此外,可以添加多个稳定剂,所有用于口服给药的制剂应当为适合于所述选定的给药途径的多个剂量。
[0682] 对于注射剂,本文中所示的所述多个化合物可以配制在多个水溶液中,优选地在多个生理性相容的缓冲液中,例如:汉克氏溶液(Hanks’s solution)、林格溶液(Ringer’s solution)或生理缓冲盐水,具有或不具有多个有机溶剂,例如:丙二醇、聚乙二醇。
[0683] 对于透粘膜给药,多个渗透剂被使用在所述制剂中,所述多个渗透剂在本领域通常是习知的。
[0684] 多个糖丸核通常提供有多个合适的包衣。对于所述目的,可以使用多个浓缩糖溶液,所述多个浓缩糖溶液可以任选地包含阿拉伯树胶、滑石、聚乙烯吡咯烷酮、卡波普凝胶、聚乙二醇和/或二氧化、漆溶液和合适的有机溶剂或溶剂混合物。可以将染料或颜料添加至所述多个片剂或糖丸包衣,以用于鉴定或表征活性化合物剂量的不同组合。
[0685] 对于颊部给药(buccal administration),所述多个组合物可以采用以常规方式配制的多个片剂或锭剂的所述形式。
[0686] 对于吸入给药,将本文所述的所述多个化合物便利地以气溶胶喷雾的形式传送,所述气雾剂由加压的包装释放或从喷雾器释放(通常地包含),在所述的加压包装中使用了适宜的抛射剂如二氯二氟甲烷、三氯氟甲烷、二氯四氟乙烷、二氧化碳或其它适宜的抛射剂。对于加压气雾剂,可以通过提供释放定量计量来确定单位剂量。用于一吸入器或吹入器的例如明胶的胶囊和药筒可以配制成包含本文所示的所述多个化合物以及一合适的粉末基质的粉末混合物,所述粉末基质例如但不限于:乳糖或淀粉。
[0687] 本文所示的所述多个化合物可以配制用于肠胃外给药,例如通过快速浓注或连续输注。用于注射的多个制剂可以以单位剂量的形式表示,例如:在安瓿或在多剂量容器中,可选地添加防腐剂。所述多个组合物可以是在油性或水性载体中的多个悬浮液、多个溶液或多个乳液,并且可以包含多个配制剂,例如:悬浮剂、稳定剂和/或分散剂。
[0688] 用于肠胃外给药的多个药物组合物包括所述多个化合物制剂的水溶性形式。额外地,本文所示的所述多个化合物的多个悬浮液可以制备适当的油性注射悬浮液以及乳剂(例如:油包水,水包油或在油乳剂中的油包水)。多个合适的亲脂性溶剂或载体包括:脂肪油例如芝麻油,或合成的脂肪酸酯,例如:油酸乙酯、甘油三酯或脂质体。注射水悬浮液可含有增加所述悬浮液粘性的多个物质,例如:羧甲基纤维素钠、山梨糖醇或葡聚糖。可选地,所述悬浮液还可以包含多个合适的稳定剂或试剂,所述稳定剂或试剂增加如本文所示的所述多个化合物的所述溶解度以允许高度浓缩的多个溶液的所述制备。
[0689] 替代地,本文所示的所述多个化合物可以是在粉末的形式,用于在使用前与一合适的载体组成构体,例如:无菌无热原的水。
[0690] 本文所示的所述多个化合物还可以使用例如:常规的栓剂基质来配制成直肠组合物,例如:常规栓剂或保留灌肠剂,所述常规的栓剂基质例如:可可脂或其它甘油酯。
[0691] 本文所述的多个药物组合物还可以包括多个合适的凝胶相载体或赋形剂,所述多个载体或赋形剂的多个实例包括但不限于:碳酸钙、磷酸钙、各种糖、淀粉、纤维素衍生物、明胶以及聚合物,例如:聚乙二醇。
[0692] 适合用于本发明的上下文的多个药物组合物包括多个组合物,其中包含有效达到所述预期目的的一用量的所述多个活性成分。更具体地说,一治疗有效量是指本文所示的所述多个化合物有效预防、减轻或改善所述病症的多个症状,或延长被治疗的所述个体的所述存活的一用量。
[0693] 一治疗有效量的测定完全在本领域技术人员的能力范围内,特别是根据本文提供的所述详细的公开内容。
[0694] 在本发明的多个实施例中的方法中所使用的方法中的本文所示的任何化合物,所述治疗有效量或剂量可以首先从多个动物的多个活性测定中评估。例如:可以在多个动物模型中配制一剂量以达到一循环的浓度范围,所述浓度范围包括通过多个活性测定(例如:所述多个测试化合物的所述浓度,所述浓度达到所述截短突变的一基本的通读)所测定的所述多个突变抑制水平,所述多个信息可以用来更准确地测定多个人体中的多个有用的剂量。
[0695] 本文所示的所述多个化合物的毒性及治疗功效可以通过在多个实验动物中的多个标准药物程序来测定,例如:通过测定所述EC50(观察到其最大效果的50%时的一化合物的所述浓度)以及LD50(在50%的测试动物中引起死亡的致死剂量)用于主题化合物,从所述多个活性测定及多个动物研究中获得的所述数据可用于配制用于人类的一剂量范围。
[0696] 所述剂量可以根据所采用的所述剂型以及所使用的给药途径而变化。所述确切的剂型、给药途径以及剂量可以由所述个别的医生根据所述患者的状况来选择。(请参见例如:Fingl等人,1975,在“治疗学的药理学基础(The Pharmacological Basis  of Therapeutics)”,第1章,第1页)。
[0697] 剂量以及间隔可以单独地调节以提供足以维持所述多个期望效果的如本文所示的所述多个化合物的血浆水平,称为所述最小有效浓度(MEC)。每种制剂的所述最小有效浓度会不同,但可以从体外数据评估;例如:达到具有一截短突变的所述整个基因的50至90%的表达所需要的所述多个化合物的所述浓度(即所述通读突变密码子)。达到所述最小有效浓度所需的多个剂量会取决于多个个体特征以及给药途径。多个高效能液相层析(HPLC)测定或多个生物测定可用于测定多个血浆浓度。
[0698] 多个剂量间隔也可以使用所述最小有效浓度值来测定。应该使用一种方案来给药多个制剂,所述方案在所述时间的10至90%中维持多个血浆水平高于所述最小有效浓度,优选地为30至90%,最优选地为50至90%。
[0699] 取决于将被治疗的所述慢性病症的所述严重性及反应性,剂量也可以是上文所述的一缓释组合物的一单次定期给药,其中周期性治疗的过程持续数日至数周,或者直到在所述周期性治疗期间实现足够的改善,或达到所述病症状态的实质性减少。
[0700] 当然,将被给药的一组合物的所述用量将取决于将被治疗的所述个体、所述痛苦的所述严重性、所述给药方式、所述处方医生的所述判断等。如果需要,本发明的多个组合物可以存在于一包装或一分配装置中,例如:一FDA(美国食品和药物管理局)批准的套组,所述套组可以包含一种或多种包含所述活性成分的多个单位剂型。所述包装可以例如:包括金属或塑料箔,例如但不限于:一泡罩包装或一加压容器(用于吸入)。所述包装或分配器装置可伴随有多个说明给药,所述包装或分配器还可以伴随有所述容器相关联的一注意事项,所述注意事项是以由管理多个药品的制造、使用或销售的一政府机构所规定的一形式,所述注意事项反映由对用于人类的多个组合物的所述形式的批准或兽医管理的所述机构的批准。所述注意事项例如,可能是由美国食品和药物管理局批准用于多个处方药的标签或一批准的产品说明书。多个组合物包括根据所发明的多个实际例的一化合物,如上文所详述,所述多个组合物还被制备为被配制在一相容性药物载体中,放置在一合适的容器中,并且标记用于一指定的病症或诊断的治疗。
[0701] 因此,在一些实施例中,将所述药物组合物包装在一包装材料中,并且以在所述包装材料中或所述包装材料上的印刷物来识别,用于如本文所定义的一遗传性病症和的所述治疗上/或本文所述的任何用途。
[0702] 在一些实施例中,所述药物组合物是用于本文定义的一遗传性病症的所述治疗和/或本文所述的任何用途。
[0703] 在本文所述的任何组合物、方法和用途中,所述多个化合物可以与其它试剂组合使用,所述其他试剂是用于所述遗传性疾病的所述治疗和/或诱导或促进一提前终止密码子突变的通读活性和/或增加如本文所述的具有一提前终止密码子突变的一基因的表达。
[0704] 由于主要针对于治疗被定义为慢性的多个遗传性疾病,本文所示的所述多个化合物或多个含有所述多个化合物的多个药物组合物被预期在所述个体被治疗的整个生命周期中给药。因此,包含所述多个化合物的多个药物组合物的所述给药方式应该是容易以及舒适的给药,优选地通过自我给药,并且使得将会对所述患者的健康以及生活过程中造成最小的代价。
[0705] 本文所示的所述多个化合物或包含所述多个化合物的多个药物组合物的所述重复性及周期性给药可以实现为例如:以一天为周期,即每天一次,更优选地以一周为周期,即每周一次,更优选以一个月为周期进行给药,即每月一次,最优选地每隔数月实现一次给药(例如:每1.5个月、2个月、3个月、4个月、5个月或甚至6个月)。
[0706] 如上文所讨论的,使用目前已知的多个氨基糖苷类作为多个截短突变通读药物的一些限制与它们主要是抗菌的事实有关(用作多个抗生素药剂)。任何抗菌药剂的长期使用是高度不必要的,甚至会危及生命,因为它会改变肠道微生物菌群,这可能会导致或恶化其他医疗条件,例如:炎症性肠病的扩散,并可能导致某些微生物的病原菌株的抗药性的出现。
[0707] 在一些实施例中,本文所示的所述多个化合物基本上不具有抗菌活性。“无抗菌活性”是指所述多个化合物对一特定菌株的所述最小抑制浓度(MIC)远高于被认为是对于所述菌株的一抗生素的一化合物的所述浓度。此外,所述多个化合物的所述最小抑制浓度显着高于发挥截短突变抑制活性所需的所述浓度。
[0708] 基本上无杀菌作用,本文所示的所述多个化合物不造成上述的多个不良作用,因此可以通过多个吸收途径给药,所述多个吸收途径可能包含未被靶向的良性和/或有益微生物,因此甚至可能需要提供它们的保护。由于本文所示的所述多个化合物可以重复给药并且在生命期间内不引起任何与抗菌相关的多个不利的累积效应,本文所示的所述多个化合物的此重要特征使得所述多个化合物成为对抗慢性疾病的多个特别有效的药物,并且可以进一步地口服或经直肠给药,即通过所述胃肠道,此为对于治疗多个慢性疾病的一药物的一个非常有用以及重要的特征。
[0709] 根据一些实施例,本文所示的所述多个化合物被选定和/或设计以与所述原核细胞转译系统相比,对于多个真核细胞转译系统具有选择性,即所述化合物在多个真核细胞中表现出更高的活性,例如:哺乳动物(人类)的活性与在多个原核细胞中的活性相比,所述多个原核细胞例如:细菌。不受任何特定理论的束缚,本文所述的多个化合物已知当所述核糖体参与转译一基因时,通过结合所述16S核糖体核糖核酸的所述A位点而作用,本文所述的化合物被认为相较于对所述原核生物的核糖体A位点以及与其原核生物对应物类似的所述线粒体核糖体A位点,本文所述的化合物对所述真核生物核糖体A位点具有一高度的选择性,或对所述真核生物A位点具有选择性。
[0710] 如本文所用的术语“约”是指±10%。
[0711] 术语“包括(comprises)”、“包括(comprising)”、“包括(includes)”、“包含(including)”、“具有(having)”及其词形变化是指“包括但不限于”。
[0712] 所述术语“由…组成(consisting of)”意思是“包括及不限于”。
[0713] 术语“基本上由......组成(essentially consisting of)”是指组合物、方法或结构可包括额外的成分、步骤及/或部件,但只有当额外的成分、步骤及/或部件实质上不改变所要求保护的组合物、方法或结构的基本特征及新特征。
[0714] 本文所用的单数形式“一(a)”,“一(an)”以及“所述(the)”除非在上下文另有明确指出,否则本发明可包括复数个参考物。例如:术语“一化合物(a compound)”或“至少一化合物(at least one compound)”可以包括多个化合物,包括它们的混合物。在整个本申请中,本发明的多个实施例可以结合参考文献以一范围格式来呈现。应当理解,范围格式的描述仅仅是为了方便和简洁,不应被解释为对本发明范围的严格的限制。因此,对范围的描述应当被认为是具体公开的所有可能的子范围以及所述范围内的各个数值,例如:描述一范围像是“从1到6(from 1 to 6)”应被理解为揭露多个子范围像是“从1到3(from 1 to 3)”、“从1到4(from 1 to 4)”、“从1到5(from 1 to 5)”、“从2到4(from 2 to 4)”、“从2到6(from 2 to 6)”、“从3到6(from 3 to 6)”等;亦揭露在此范围内的各个数字,例如:1、2、3、4、5和6.无论范围的宽度如何都适用于此。
[0715] 除非上下文另外明确指示,只要在此指示的任何数值范围,其意指包括在所指示的范围内所限制的任何数字(分数或整数),包括所限制的范围。所述多个短语第一指示数字和第二指示数字的“的范围(range)/的范围(ranging)/之间的范围(ranges between)”,以及“范围(range)/范围(ranging)/范围(ranges from)”从第一指示数字“到(to)”、“直到(up to)”、“直到(until)”、“通过(through)”(或另外的类似的范围指示项)第二指示数字在本文中互换地使用,并且表示包括所述第一和所述第二指示数字以及它们之间的所有分数和整数。
[0716] 本文中所使用的术语“方法”是指用于完成一特定任务的方式(manner),手段(means),技术(technique)和程序(procedures),所述给定任务包括但不限于那些方式,手段,技术和程序,其是已知的,或是从已知的方式,手段,技术或程序很容易地被化学,药理,生物,生化及医学领域从业者所开发。
[0717] 预期在本申请成熟的一专利寿命期间,将发现许多相关的遗传性疾病及病症;所述术语的范围意在包括所有类似的新的病症及疾病。
[0718] 可以理解,本发明的某些特征,为了清楚阐明,描述在独立的实施例的上下文中,也可以是在一单一实施例中以组合提供。相反,本发明的各种特征,为了简明,在一单一实施例的上下文中描述,也可以单独或以任何合适的子组合或以适合于本发明的任何其它描述的实施方式来提供。在各种实施例的上下文中描述的部分特征不应被认为是那些实施例的主要特征,除非所述实施例在没有这些组件的情况下不运作。
[0719] 如上文描绘和下文权利要求部分所要求的本发明的各种实施例和各个方面可在下文的多个实施例中找到实验支持。
[0720] 多个实例
[0721] 现在请参考以下实例,连同以上的多个描述一起以一非限制性方式说明本发明的一些实施例。
[0722] 实例1
[0723] 根据本发明的一些实施例的包含细胞可渗透性基团的多个示例性化合物的多个化学合成
[0724] 通常,氨基糖苷类(AGs)抗生素在生理性pH值下为带电的,因此它们在通过所述胃肠道的吸收方面受到限制,因此通常地通过注射给药。此外,氨基糖苷类对多个真核细胞表现出有限的可渗透性,所述多个真核细胞需要以多个较高的剂量给药以克服所述细胞摄取限制,所述细胞摄取限制反过来会导致多个不良作用,并且限制它们在转化治疗中的应用。本实例中描述的所述化合物是为了解决所述多个问题而设计的。
[0725] 为了减轻所述胃肠道吸收问题,已将多个烷基/芳基连接到一假单糖衍生的氨基糖苷的所述第N1位上的所述假二糖支架上。制备多个示例性化合物NB144、NB145、NB146以及NB147(请参见本文表1)以在所述第N-1位分别展现异丙基、苄基、丙基以及丙基取代基。
[0726] 为了减轻所述细胞摄取限制,以多个细胞可渗透基团制备一系列的化合物以增加所述化合物的细胞摄取。通过在所述支架上的不同位置引入一细胞可渗透性基团来制备所述多个化合物,所述细胞可渗透性基团例如:胍基。
[0727] 以下是多种用于制备根据本发明的一些实施例的多个示例性化合物的方法,所述多个示例性化合物在上文表1中示出。
[0728] 多个化合物NB144、NB145以及NB146的所述合成分两个步骤实现,从化合物1开始,(如先前在Baasov等人,生物有机与药物化学快报(Bioorg.Med.Chem.Lett.),2010,18,第3735至3746页所报导的方法来制备)。如在以下的一基本方案2中所示,(多个试剂与多个条件:
[0729] (i)RCHO、H2O、1摩尔浓度(M)的HCl、NaBCNH3或RCHO、MeOH、NaBH4O℃;(ii)PMe3、NaOH、THF、室温)。
[0730] 方案2
[0731]
[0732] 以氢化钠在水中进行伯胺与脂族醛的单烷基化,而在苯甲醛的情况下使用甲醇/NaBH4。所述步骤的所述总产率为单烷基化/苄基化产物2a至c(方案2)的35至58%。然后进行所述施陶丁格反应以获得在68至85%的高产率的最终化合物NB144、NB145以及NB146。
[0733] NB144的合成:
[0734]
[0735] NB144
[0736] 根据以上所示的方案2来制备NB144,从所述前体化合物1开始。在0℃下将化合物1(0.5克,1.2毫摩尔浓度(mmol))在水(15毫升)中溶解并且搅拌15分钟,以及滴加1摩尔浓度的盐酸溶液以调节所述反应混合物的所述pH至约2至3。将约2当量的异丁醛(0.2毫升)加入所述反应混合物中,并且在室温下搅拌15分钟。将所得溶液冷却至0℃,并且加入NaBCNH3(30毫克,1.5当量)并通过TLC监测进程。在1小时的反应后,重复所述类似的工序,直至起始材料被消耗为所需产物。完成后,将所述反应混合物蒸发并且进行管柱层析以获得所述单烷基化产物,化合物2a(0.2克,35%)。将化合物2a溶解于THF(5毫升)与NaOH水溶液(1毫摩尔浓度,5.0毫升)的一混合物中。将所述混合物在室温下搅拌10分钟,随后加入PMe3(1摩尔浓度的THF溶液,2.0毫升,2.0毫摩尔浓度)。通过TLC[CH2Cl2/MeOH/H2O/MeNH2(在EtOH中33%的溶液)10:15:6:15]监测所述反应进程,所述TLC表示在1小时内完成,通过在一硅胶短柱上进行管柱层析来纯化所述产物。使用以下的所述多个溶剂洗涤所述管柱:THF(200毫升)、CH2Cl2(200毫升)、EtOAc(100毫升)以及MeOH(200毫升)。然后以MeNH2(在EtOH中33%的溶液)与MeOH(8:2)的一混合物洗脱所述产物。将包含所述产物的多个部分合并并且蒸发至干燥。将所述残余物重新溶于一少量的水中,并且再次蒸发(2-3次重复)以提供所述游离胺+
形式的NB144。通过将上述产物通过一短柱Amberlite CG50(NH4形式)来获得所述分析上的纯产物。首先以MeOH/H2O(3:2)的一混合物洗涤所述管柱,然后用MeOH/H2O/NH4OH(8:1:1)的一混合物洗脱所述产物,以得到如题的化合物NB144(0.150克,85%)。对于所述多个储存及生物测试,将NB144转化为其硫酸盐形式:将所述游离碱溶于水中,以H2SO4(0.1当量浓度(N))将所述pH调节至约7.0并且冻干。
[0737] 氢核磁共振(1H NMR)(500兆赫兹,CD3OD):“环I”:δH=1.21(d,3H,J=6.0赫兹,CH3)、2.70(dd,1H,J1=3.4,J2=10.0赫兹,H-2’)、3.21(t,1H,J=10.0赫兹,H-4’)、3.48(t,1H,J=9.0赫兹,H-3’)、3.81(dd,1H,J1=3.4,J2=10.0赫兹,H-5’)、4.09(m,1H,H-6’)、5.16(d,1H,J=2.5赫兹,H-1’);“环II”:δH=1.11(m,1H,H-2ax)、2.14(td,1H,J1=4.5,J2=12.5赫兹,H-2eq)、2.46(m,1H,H-1)、2.71(m,1H,H-3)、3.19(m,2H,H-4以及H-6)、3.44(t,1H,J=
9.1赫兹,H-5)。所述光谱中的所述多个额外的波峰被辨识为如下:δH=0.96(t,3H,J=3.1赫兹)、0.97(t,3H,J=3.2赫兹)、1.79(m,1H),2.32(m,1H)、2.56(m,1H)。
[0738] 碳13核磁共振(13C NMR)(125兆赫兹,CD3OD):δC=16.6、20.8、20.9、29.0、34.6、51.5、55.8、57.4、58.9、67.8、73.6、75.8、76.5(2C)、77.8、90.9、103.2(C-1’)。
[0739] 基体辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI TOFMS):对于C17H36N3O7([M+H]+)的计算的m/e::394.2;测量的:m/e:394.1。
[0740] NB145的合成:
[0741]
[0742] NB145
[0743] 根据以上所示的方案2来制备NB145,从所述前体化合物1开始。将化合物1(0.5克,1.2毫摩尔浓度)以及苯甲醛(0.3克,4毫摩尔浓度)在室温下在甲醇(15毫升)中溶解并且搅拌15分钟,将所得溶液冷却至0℃,并且加入NaBH4(100毫克)并通过TLC监测进程。完成后,将所述反应混合物蒸发并且进行管柱层析以获得所述单苄基化合物2b,所述单苄基化合物
2b在0.3克,50%的产率。将化合物2b溶解于THF(5毫升)与NaOH水溶液(1毫摩尔浓度,5.0毫升)的一混合物中。将所述混合物在室温下搅拌10分钟,随后加入PMe3(1摩尔浓度的THF溶液,2.0毫升,2.0毫摩尔浓度)。通过TLC[CH2Cl2/MeOH/H2O/MeNH2(在EtOH中33%的溶液)10:
15:6:15]监测所述反应进程,所述TLC表示在1小时内完成,通过在一硅胶短柱上进行管柱层析来纯化所述产物。使用以下的所述多个溶剂洗涤所述管柱:THF(200毫升)、CH2Cl2(200毫升)、EtOAc(100毫升)以及MeOH(200毫升)。然后以MeNH2(在EtOH中33%的溶液)与MeOH(8:2)的一混合物洗脱所述产物。将包含所述产物的多个部分合并并且蒸发至干燥。将所述残余物重新溶于一少量的水中,并且再次蒸发(2-3次重复)以提供所述游离胺形式的
NB145。通过将上述产物通过一短柱Amberlite CG50(NH4+形式)来获得所述分析上的纯产物。首先以MeOH/H2O(3:2)的一混合物洗涤所述管柱,然后用MeOH/H2O/NH4OH(8:1:1)的一混合物洗脱所述产物,以得到NB145(0.200克,75%产率)。对于所述多个储存及生物测试,将NB145转化为其硫酸盐形式:将所述游离碱溶于水中,以H2SO4(0.1当量浓度(N))将所述pH调节至约7.0并且冻干。
[0744] 氢核磁共振(500兆赫兹,CD3OD):“环I”:δH=1.21(d,3H,J=6.0赫兹,CH3)、2.73(dd,1H,J1=4.6,J2=10.3赫兹,H-2’)、3.23(t,1H,J=10.0赫兹,H-4’)、3.49(t,1H,J=9.0赫兹,H-3’)、3.82(dd,1H,J1=3.4,J2=10.0赫兹,H-5’)、4.12(m,1H,H-6’)、5.18(d,1H,J=2.5赫兹,H-1’);“环II”:δH=1.15(m,1H,H-2ax)、2.23(td,1H,J1=4.5,J2=12.5赫兹,H-
2eq)、2.56(m,1H,H-1)、2.70(m,1H,H-3)、3.22(t,1H,J=9.2赫兹,H-6)、3.28(t,1H,J=9.0赫兹,H-4)、3.43(t,1H,J=9.1赫兹,H-5)。所述光谱中的所述多个额外的波峰被辨识为如下:δH=3.65(d,1H,J=12.5赫兹)、3.92(d,1H,J=12.5赫兹)、7.28-7.37(m,5H,Ar)。
[0745] 碳13核磁共振(125兆赫兹,CD3OD):δC=16.4、34.2、51.1、51.6、57.2、57.8、67.6、73.2、75.7、76.3、76.4、77.7、90.2、102.9(C-1’)、128.3(Ar)、129.4(Ar)、129.6(Ar)、140.3(Ar)。
[0746] 基体辅助激光解吸电离飞行时间质谱:对于C20H34N3O7([M+H]+)的计算的m/e::428.2;测量的:m/e:428.1。
[0747] NB146的合成:
[0748]
[0749] NB146
[0750] 根据以上所示的方案2来制备NB146,从所述前体化合物1开始。在0℃下将化合物1(0.5克,1.2毫摩尔浓度)在水(15毫升)中溶解并且搅拌15分钟,以及滴加1摩尔浓度的盐酸溶液以调节所述反应混合物的所述pH至约2至3。将约2当量的丙醛(0.2毫升)加入所述反应混合物中,并且在室温下搅拌15分钟。将所得溶液冷却至0℃,并且加入NaBCNH3(30毫克,1.5当量)并通过TLC监测进程。在1小时的反应后,重复所述类似的工序,直至起始材料被消耗为所需产物。完成后,将所述反应混合物蒸发并且进行管柱层析以获得化合物2c,所述化合物2c在0.325克(58%)。
[0751] 氢核磁共振(500兆赫兹,CD3OD):“环I”:δH=1.27(d,3H,J=6.0赫兹,CH3)、3.09(dd,1H,J1=4.2,J2=10.5赫兹,H-2’)、3.39(dd,1H,J1=8.7,J2=10.0赫兹,H-4’)、3.94(m,2H,H-3’以及H-5’)、4.04(m,1H,H-6’)、5.73(d,1H,J=3.5赫兹,H-1’);“环II”:δH=1.26(m,1H,H-2ax)、2.31(td,1H,J1=4.5,J2=12.5赫兹,H-2eq)、2.54(m,1H,H-1)、3.15(m,
1H,H-3)、3.46-3.54(m,3H,H-4,H-5以及H-6)。所述光谱中的所述多个额外的波峰被辨识为如下:δH=0.98(t,3H,J=7.2赫兹)、1.56(m,2H)、2.53(m,1H)、2.72(m,1H).
[0752] 碳13核磁共振(125兆赫兹,CD3OD):δC=11.9、18.1、23.6、32.6(C-2)、49.7、57.9、61.7、64.7、69.4、72.3、74.3、75.2、76.7、78.6、80.7,98.6(C-1’).基体辅助激光解吸电离+
飞行时间质谱:对于C16H30N7O7([M+H])的计算的m/e:432.2;测量的m/e:432.2。
[0753] 将化合物2c(0.325克,0.75毫摩尔浓度)溶解于THF(5毫升)与NaOH水溶液(1毫摩尔浓度,5.0毫升)的一混合物中。将所述混合物在室温下搅拌10分钟,随后加入PMe3(1摩尔浓度的THF溶液,2.0毫升,2.0毫摩尔浓度)。通过TLC[CH2Cl2/MeOH/H2O/MeNH2(在EtOH中33%的溶液)10:15:6:15]监测所述反应进程,所述TLC表示在1小时内完成,通过在一硅胶短柱上进行管柱层析来纯化所述产物。使用以下的所述多个溶剂洗涤所述管柱:THF(200毫升)、CH2Cl2(200毫升)、EtOAc(100毫升)以及MeOH(200毫升)。然后以20%的MeNH2(在EtOH中
33%的溶液)与80%的MeOH的一混合物洗脱所述产物。将包含所述产物的多个部分合并并且蒸发至干燥。将所述残余物重新溶于一少量的水中,并且再次蒸发(2-3次重复)以提供所述游离胺形式的NB146。通过将上述产物通过一短柱Amberlite CG50(NH4+形式)来获得所述分析上的纯产物。首先以MeOH/H2O(3:2)的一混合物洗涤所述管柱,然后用MeOH/H2O/NH4OH(8:1:1)的一混合物洗脱所述产物,以得到NB145(0.175克,68%产率)。对于所述多个储存及生物测试,将NB146转化为其硫酸盐形式:将所述游离碱溶于水中,以H2SO4(0.1当量浓度(N))将所述pH调节至约7.0并且冻干。
[0754] 氢核磁共振(500兆赫兹,CD3OD):“环I”:δH=1.21(d,3H,J=6.0赫兹,CH3)、2.71(dd,1H,J1=4.2,J2=10.3赫兹,H-2’)、3.21(t,1H,J=10.0赫兹,H-4’)、3.48(t,1H,J=9.6赫兹,H-3’)、3.81(dd,1H,J1=3.4,J2=10.0赫兹,H-5’)、4.09(m,1H,H-6’)、5.16(d,1H,J=2.5赫兹,H-1’);“环II”:δH=1.10(m,1H,H-2ax)、2.14(td,1H,J1=4.5,J2=12.5赫兹,H-
2eq)、2.49(m,1H,H-1)、2.69(m,1H,H-3)、3.20(m,2H,H-4以及H-6)、3.44(t,1H,J=9.1赫兹,H-5)。所述光谱中的所述多个额外的波峰被辨识为如下:δH=0.97(t,3H,J=7.2赫兹)、
1.57(m,2H)、2.49(m,1H)、2.71(m,1H)。
[0755] 碳13核磁共振(125兆赫兹,CD3OD):δC=11.9、16.6、23.7、34.6(C-2)、49.7、51.4、57.4、58.9、67.8、73.5、75.8、76.5、76.6、77.8、90.8、103.2(C-1’)。
[0756] 基体辅助激光解吸电离飞行时间质谱:对于C16H34N3O7([M+H]+)的计算的m/e::380.2;测量的:m/e:380.1。
[0757] NB147的合成:
[0758]
[0759] NB147
[0760] NB147是根据以下所示的方案3来制备(多个试剂及多个条件:a)5.5当量Ac2O,Py,-20℃,24小时;b)BF3·OEt2、MS、CH2Cl2、-30℃,3小时;c)THF、0.5摩尔浓度的NaOH,60℃,24小时;d)PMe3、NaOH、THF,室温),从化合物2c(所述NB146的所述前体,请参见以上的方案2)开始。
[0761] 方案3
[0762]
[0763] 简要地,将化合物2c选择性乙酰化,以得到所需的受体A,然后如前所述,以三氯乙酰亚胺酸对供体B进行糖基化(Nudelman,I.等人,生物有机与药物化学快报(Bioorg.Med.Chem.Lett.),2006,16,第6310至6315页)以在91%的分离产率下提供所述相应的三糖C。两个随后的去保护化步骤包括:以强碱(NaOH,60℃)处理去除所有的所述酯及酰胺的保护,以及以施陶丁格反应将叠氮化物转化为胺,以两步骤在产率为81%下得到所述目标NB147。所述最终产品以及所有中间体均通过所有标准分析技术进行了表征,所述标准分析技术包括:氢(1H)、碳13(13C)以及二维核磁共振(2D-NMR),以及一维全相关光谱学(1D-TOXY)来确定所述多个产物的所述多个结构。
[0764] NB147的合成:
[0765] 将化合物2c(750毫克,1.0当量)溶解于无水吡啶(8毫升)中并冷却至-20℃。在此温度下,逐滴加入乙酸酐(2.0毫升,5.6当量)并使反应在-20℃下进行。通过TLC监测所述反应进程,所述TLC在17小时内显示完成。将所述反应混合物以EtOAc稀释,并以NaHCO3水溶液、HCl(2%)、NaHCO3饱和水溶液以及盐水来萃取。将多个合并的有机层经无水硫酸镁(MgSO4)干燥并且浓缩。通过硅胶管柱层析纯化所述粗产物,得到化合物A(600毫克,产率54%)。将无水CH2Cl2(15毫升)加入至一粉末状火焰干燥的4埃 分子筛(2.0克)中,然后加入所述受体A(500毫克,1.0当量)以及所述已知供体B(2.5克,4.0当量)。将所述反应混合物在室温下搅拌10分钟,以及然后冷却至-30℃。在此温度下,加入催化量的BF3·Et2O(0.15毫升),并且将所述混合物在-30℃下搅拌,并且通过TLC监测所述反应进程,所述TLC表明60分钟内完成。以乙酸乙酯稀释所述反应混合物,并且以饱和的NaHCO3及盐水洗涤。将所述合并的有机层以硫酸镁干燥、蒸发,并且进行管柱层析(EtOAc/己烷),以得到产率为
91%的所述如题的化合物C(715毫克)。将来自上述步骤的化合物C(715毫克)溶解于最少量的THF中,并且用0.5摩尔浓度的NaOH溶液处理,并且在60℃下回流过夜。之后将所述反应混+
合物冷却至室温并且蒸发至干燥。通过DOWEX-H离子交换管柱纯化所述粗产物,以得到产率为95%的所述如题的化合物D(400毫克)。
[0766] 氢核磁共振(500兆赫兹,CD3OD):“环I”:δH=1.25(d,3H,J=6.0赫兹,CH3)、3.12(dd,1H,J1=3.4,J2=10.0赫兹,H-2’)、3.34(t,1H,J=9.0赫兹,H-4’)、3.96(m,1H,H-3’以及H-5’)、4.04(m,1H,H-6’)、6.00(d,1H,J=3.2赫兹,H-1’);“环II”:δH=1.20(m,1H,H-2ax)、2.27(td,1H,J1=4.5,J2=12.5赫兹,H-2eq)、2.54(m,1H,H-1)、3.24(t,1H,J=9.0赫兹,H-6)、3.50(m,1H,H-3)、3.64(t,1H,J=9.5赫兹,H-5)、3.72(t,1H,J=9.0赫兹,H-4);
“环III”:δH=3.48-3.59(m,2H,H-5”以及H-5”)、4.01(m,1H,H-4”)、4.05(m,1H,H-3”)4.15(m,1H,H-2”)、5.36(s,1H,H-1”)。所述光谱中的所述多个额外的波峰被辨识为如下:δH=
0.98(t,3H,J=7.2赫兹)、1.55(m,2H)、2.50(m,1H)、2.70(m,1H)。
[0767] 碳13核磁共振(125兆赫兹,CD3OD):δC=11.9、17.9、23.8、32.7、49.7、54.4、58.0、62.3、64.9、69.3、72.5、72.6、74.4、75.1、76.3(2C)、76.9、82.4、86.2、97.3(C-1’)、110.7(C-1”)。
[0768] 基体辅助激光解吸电离飞行时间质谱:对于C21H37N10O10([M+H]+)的计算的m/e::589.2;测量的:m/e:589.1。
[0769] 在来自上述步骤的化合物D(380mg,1.0当量)在THF(3毫升)及NaOH水溶液(1毫摩尔浓度,5毫升)的一混合物中的一搅拌溶液中加入PMe3(在THF中为1摩尔浓度的溶液,5毫升,7.8当量浓度)。通过TLC[CH2Cl2/MeOH/H2O/MeNH2(在EtOH中为33%的溶液),10:15:6:15]监测所述反应的所述进程,所述TLC表示在3小时内完成,通过在一硅胶短柱上进行快速层析来纯化所述产物。使用以下的所述多个溶剂洗涤所述管柱:THF(100毫升)、CH2Cl2(100毫升)、EtOAc(50毫升)以及MeOH(100毫升)。然后以5%的MeNH2溶液(在EtOH中33%的溶液)与80%的MeOH的所述混合物洗脱所述产物。将包含所述产物的多个部分合并并且在真空下蒸发。通过将上述产物通过一短柱Amberlite CG50(NH4+形式)来获得所述分析上的纯产物。
首先以水洗涤所述管柱,然后用10%的NH4OH水溶液的一混合物洗脱所述产物,以生产NB147(230毫克,67%产率)。对于所述多个储存及生物测试,将NB147转化为其硫酸盐形式:
将所述游离碱溶解于水中,以H2SO4(0.1当量浓度)将所述pH调节至约7.0并且冻干以得到NB147的所述硫酸盐。
[0770] 氢核磁共振(500兆赫兹,CD3OD):“环I”:δH=1.22(d,3H,J=6.0赫兹,CH3)、2.61(dd,1H,J1=3.4,J2=9.0赫兹,H-2’)、3.23(t,1H,J=10.0赫兹,H-4’)、3.54(t,1H,J=9.6赫兹,H-3’)、3.81(dd,1H,J1=3.4,J2=10.0赫兹,H-5’)、4.12(m,1H,H-6’)、5.20(d,1H,J=3.5赫兹,H-1’);“环II”:δH=1.12(m,1H,H-2ax)、2.10(td,1H,J1=4.5,J2=12.5赫兹,H-
2eq)、2.49(m,1H,H-1)、2.75(m,1H,H-3)、3.32(t,1H,J=9.0赫兹,H-6)、3.38(t,1H,J=9.5赫兹,H-4)、3.52(t,1H,J=9.0赫兹,H-5);“环III”δH:2.80(dd,1H,J1=7.0,J2=13.5赫兹,H-5”)、2.94(dd,1H,J1=4.3,J2=13.5赫兹,H-5”)、3.86(m,1H,H-4”)、3.96(t,1H,J=5.4赫兹,H-3”)、4.07(m,1H,H-2”)、5.26(d,1H,J=2.6赫兹,H-1”)。所述光谱中的所述多个额外的波峰被辨识为如下:δH=0.97(t,3H,J=7.2赫兹)、1.53(m,2H)、2.49(m,1H)、2.71(m,
1H)。
[0771] 碳13核磁共振(125兆赫兹,CD3OD):δc=11.9、16.7、23.7、34.7(C-2)、45.2、49.7、52.5、57.9、58.6、67.9、72.5、73.6、75.3、76.3、76.4、76.7、84.9、85.6、87.1、102.0(C-1’)、
110.3(C-1”)。
[0772] 基体辅助激光解吸电离飞行时间质谱:对于C21H43N4O10([M+H]+)的计算的m/e::511.2;测量的:m/e:511.1。
[0773] NB150的合成(以其TFA酸加成盐显示):
[0774]
[0775] NB150
[0776] 根据下文所示的方案4,从化合物1开始制备NB150。简要地,通过保护的胍基化试剂以及Et3N作为一个碱进行所述游离的N-1胺的所述胍基化,以得到所述期望的化合物3。通过TFA进行Boc去保护化以生产在所述胍部分上具有多个游离胺的化合物4。最后,使用施陶丁格反应来去除所述叠氮化物的保护,得到所述最终产物NB150(方案4,多个试剂与多个条件:(a)Et3N、H2O/二恶烷,81%(b)TFA、CH2Cl2,0℃→25℃(c)(i)PMe3、THF、NaOH 0.1摩尔浓度,(ii)以在MeOH中的2%TFA的一混合物从所述离子交换管柱中以两步骤在产率为83%下洗脱出所述产物。
[0777] 方案4
[0778]
[0779] (NB150被显示为其TFA酸加成盐)
[0780] 将在H2O(1毫升)中的化合物1(2.69克,1当量)的一溶液中加入1,4-二恶烷(5毫升)以及N,N’-二Boc-N”三氟甲磺酰基胍(4.05克,1.5当量),因此所述溶液保持相对地澄清。在5分钟后,在室温下加入NEt3(3mL,3当量)。在24小时后,蒸发所述1,4-二恶烷,以CHCl3(3×10毫升)萃取所述剩余的残余物以及H2O,以H2O以及盐水洗涤,并以硫酸镁干燥。通过快速管柱层析在硅胶上(CHCl3/MeOH)的化合物3(3.51克,81%)分离所述胍基化产物。
[0781] 氢核磁共振(500兆赫兹,CDCl3):‘环I’:δH=5.37(d,1H,J=3.6赫兹,H-1)、4.03(t,1H,J=9.7赫兹,H-3)、4.04-4.00(m,1H,H-6)、3.81(dd,1H,J=9.7,5.7赫兹,H-5)、3.58(t,1H,J=9.3赫兹,H-4)、3.37(dd,1H,J=10.5,4.2赫兹,H-2)、1.31(d,3H,J=5.7赫兹,CH3-6);‘环II’:δH=4.19-4.10(m,1H,H-1)、3.67(t,1H,J=9.2赫兹,H-5)、3.54-3.47(m,1H,H-3)、3.41-3.32(m,2H,H-4,H-6)、2.40(dt,1H,J=12.5,4.1赫兹,H-2eq)、1.50(dd,1H,J=19.7,8.8赫兹,H-2ax);所述光谱中的所述多个额外的波峰被辨识为如下:δH=11.46(s,1H,NH)、8.54(d,1H,J=7.0赫兹,NH)、1.49(s,9H,Boc)、1.48(s,9H,Boc)。
[0782] 碳13核磁共振(125兆赫兹,CDCl3):δC=162.7、157.2、153.2、98.7(C1’)、84.0(Boc)、82.2、80.3(Boc)、77.2(C5)、76.3、74.1(C4’)、73.6(C5’)、72.3(C3’)、70.3(C6’)、63.6、59.4(C3)、50.1(C1)、33.0(C2)、28.4(Boc)、28.2(Boc)、19.3(CH3-6’)。
[0783] 基体辅助激光解吸电离飞行时间质谱:对于C24H41N9O11([M+H]+)的计算的m/e:632.6;测量的m/e:632.6。
[0784] 在10℃下将化合物3(498毫克,1当量)在CH2Cl2(15毫升)中的一溶液中滴加TFA(6毫升),并且使得在所述反应混合物的所述添加后达到所述室温。通过TLC(CH2Cl2/MeOH 8:2)监测所述反应进程,所述TLC表示在3小时内完成。将所述反应混合物蒸发至干燥,以得到所述粗产物4(686毫克),所述粗产物进行所述施陶丁格反应。
[0785] 在化合物4(686毫克,1当量)在THF(3.0毫升)及NaOH水溶液(1毫摩尔浓度,5.0毫升)的一混合物中的一搅拌溶液中滴加PMe3(在THF中为1摩尔浓度的溶液,0.55毫升,8当量浓度),并且进一步搅拌所述混合物过夜。通过TLC(TFA/MeOH 1:49)监测所述反应的完成,将以上的混合物通过Amberlite CG50(NH4+形式)的一硅胶短柱以获得所述纯产物。使用以下的所述多个溶剂洗涤所述管柱:正己烷、THF、EtOAc、MeOH以及CH3CN。然后以TFA/MeOH(1:49)的一混合物洗脱所述产物,以生产NB150。对于所述多个储存及生物测试,将NB150溶解于水中,并且冻干以得到所述NB150的所述TFA盐(701毫克,对两个步骤为83%)。
[0786] 氢核磁共振(500兆赫兹,MeOD):‘环I’:δH=5.41(d,1H,J=4.1赫兹,H-1)、4.25(qd,1H,J=6.2,1.8赫兹,H-6)、3.93(dd,1H,J=10.2,2.2赫兹,H,5)、3.81(dd,1H,J=10.6,8.9赫兹,H-4)、3.39至3.27(m,2H)、1.22(d,3H,J=6.4赫兹,CH3-6);‘环II’:δH=3.72(t,1H,J=9.6赫兹,H-5)、3.62至3.52(m,2H,H-1,H-6)、3.48-3.35(m,2H,H-3,H-4)、2.30(dt,1H,J=12.4,4.1赫兹,H-2eq)、1.71(dd,1H,J=24.9,12.3赫兹,H-2ax)。
[0787] 碳13核磁共振(125兆赫兹,MeOD):δC=159.2、100.1(C1’)、85.6(C5)、77.0(C5’)、76.5、76.3(C4)、72.2、71.8(C4’)、66.0(C6’)、56.4、52.9、51.0(C3)、32.1(C2)、15.7(CH3-
6’)。
[0788] 基体辅助激光解吸电离飞行时间质谱:对于C14H29N5O7([M+H]+)的计算的m/e:380.4;测量的m/e:380.8。
[0789] NB151和NB152通过以供体5在两个不同的受体6及7之间的多个糖基化反应来制备,所述供体5如以下的方案5所示包含胍基,然后进行多个去保护化的步骤。
[0790] 方案5
[0791]
[0792] 方案5中的受体6及7的所述合成是根据多个先前公布的程序进行(Nudelman,I.等人,生物有机与药物化学(Bioorg.Med.Chem.),2010,18,第3735至3746页)。供体5的所述合成由已知的核糖衍生物A完成(先前在Nudelman,I.等人,生物有机与药物化学快报(Bioorg.Med.Chem.Lett),2006,16,第6310至6315页),如以下的所述方案6中所示。
[0793] 通过使用一锅式反应中的两个化学步骤,将化合物A转化为化合物B:通过H2,Pd/C将叠氮化物还原为胺;所得的胺与胍试剂的所述反应,并且将Et3N作为一个碱,以得到所需的化合物B。接下来的所述两个步骤是以N-溴代琥珀酰亚胺(NBS)对STol的去保护化以取得化合物C,以及三氯乙酰亚胺酯基团的取代以取得所述最终活性供体5(方案6,多个试剂和条件:(a)H2、Pd/C、DIPEA,95%(b)NBS、丙酮/H2O,-25℃,83%(c)CC13CN、K2CO3,0℃→25℃,50%的供体5)。
[0794] 方案6
[0795]
[0796] 通过搅拌化合物A(6.87克,1当量)在EtOAc(15毫升)N,N’-二Boc-N”三氟甲磺酰基胍(5.48克,1当量;按照Santana,A.G.等人,有机化学杂志(J.Org.Chem.),2010,75(15),第5371至5374页)的一溶液制备供体5,加入20摩尔%的Pd/C(5%w/w)及二乙基异丙胺
(DIPEA)(2.71克,1.5当量)。进行三次真空/氢气循环,并且在一H2气体(气球)下进一步将所述混合物搅拌过夜。通过TLC(EtOAc/己烷1:4)指示所述反应的所述完成。然后将所述反应混合物通过一 垫盘来过滤,将所述垫盘以乙酸乙酯洗涤两次,并蒸发所述合并的
滤液。所述残余物的管柱层析(EtOAc/己烷15:85)得出所述所需的胍基化化合物B(9.44克,
95%产率)。
[0797] 氢核磁共振(400兆赫兹,CDCl3):δH=11.48(s,1H,NH)、8.73(t,1H,J=4.4赫兹,NH)、7.91(dd,4HJ=10.0,8.8赫兹,STol)、7.51(t,4H,J=8.6赫兹,Bz)、7.35(dd,4H,J=7.9赫兹,Bz)、7.17(d,2H,J=7.8赫兹,Bz)、5.65(t,1H,J=4.5赫兹,H-2)、5.52(d,1H,J=
4.0赫兹,H-1)、5.38(t,1H,J=5.4赫兹,H-3)、4.48(dt,1H,J=7.3,5.3赫兹,H-4)、3.90(ddd,1H,J=13.6,5.5,4.5赫兹,H-5)、3.55-3.44(m,1H,H-5’)、1.49(s,9H,Boc)、1.45(s,
9H,Boc)。
[0798] 碳13核磁共振(125兆赫兹,CDCl3):δC=21.3(STol)、43.1(C-5)、72.9(C-3)、75.1(C-2)、79.4、80.2(C-4)、83.3、88.9(C-1)、127.7、128.5(2C)、129.2(2C)、129.9、130.1、133.5(2C)、134.7、139.1、153.1(Boc)、156.5(Boc)、163.5(Boc)、165.1(Bz)、165.3(Bz)。
[0799] 基体辅助激光解吸电离飞行时间质谱:对于C37H43N3O9S([M+H]+)的计算的m/e:706.8;测量的m/e:706.6。
[0800] 将化合物B(3克,1当量)在丙酮/H2O(50:5毫升)的一混合物中的一搅拌溶液冷却至-25℃。搅拌10分钟后,分次加入NBS(3克,4当量)。通过TLC(EtOAc/己烷1:4)监测所述反应的所述进程,所述TLC表示在1.5小时内完成。在此阶段中,以EtOAc(50毫升)稀释所述反应物,以NaHCO3(2×30毫升)萃取所述稀释的溶液,然后以饱和氯化钠(NaCl)溶液洗将涤所述有机层,并以无水硫酸镁干燥。将所述溶剂蒸发至干燥并进行管柱层析(EtOAc/己烷1:4),以得到化合物C(13.3克,83%)。
[0801] 基体辅助激光解吸电离飞行时间质谱:对于C30H37N3O10([M+H]+)的计算的m/e:600.6;测量的m/e:600.9。
[0802] 将化合物C的一搅拌溶液(6.66克,1当量)在蒸馏的CH2Cl2(85毫升)中的在氩气气体下冷却至0℃。搅拌10分钟后,滴加CCl3CN(12.82克,8当量),然后加入K2CO3(4.6克,3当量)并且加入干燥的硫酸镁(8.5克)。在0℃下搅拌30分钟后,使所述混合物升温至室温并且搅拌过夜。通过TLC(EtOAc/己烷1:4)指示所述反应的所述完成。然后将所述反应混合物通过一 垫盘来过滤,以EtOAc将所述反应混合物洗涤两次,并且蒸发所述多个合并的滤液。所述残余物的管柱层析(EtOAc/己烷15:85+1毫升Et3N)得到所需的供体5(4克,
48%)。
[0803] 氢核磁共振(500兆赫兹,CDCl3):δH=11.41(s,1H,NH)、8.67(s,1H,NH)、8.64(t,1H,J=5.4赫兹,NH)、7.96(dd,2H,J=8.2,1.1赫兹,Bz)、7.90(dd,2H,J=8.2,1.0赫兹,Bz)、7.56(t,1H,J=7.5赫兹,Bz)、7.51(t,1H,J=7.5赫兹,Bz)、7.40(t,2H,J=7.9赫兹,Bz)、7.33(t,2H,J=7.9赫兹,Bz)、6.54(s,1H,H-1)、5.91(d,1H,J=4.8赫兹,H-2)、5.68(dd,1H,J=7.0,4.9赫兹,H-3)、4.71(td,1H,J=7.2,4.7赫兹,H-4)、4.03(ddd,1H,J=
14.0,6.3,4.9赫兹,H-5)、3.79(ddd,1H,J=13.9,7.3,4.9赫兹,H-5’)、1.43(s,9H,Boc)、
1.41(s,9H,Boc)。
[0804] 碳13核磁共振(125兆赫兹,CDCl3):δC=28.1(Boc)、28.3(Boc)、43.5(C5)、72.6(C3)、74.9(C2)、80.9(C4)、102.7(C1)、128.5、128.6、129.9、130.0、133.5、133.7、153.0、156.6、160.6、163.5、165.0、165.4。
[0805] 基体辅助激光解吸电离飞行时间质谱:对于C32H37Cl3N4O10([M+H]+)的计算的m/e:745.0;测量的m/e:745.5。
[0806] NB151(以其TFA酸加成盐显示)的合成:
[0807]
[0808] NB151
[0809] 根据下文所示的方案7,从所述受体6以及供体5开始制备NB151。(多个试剂与多个条件:(a)BF3·Et2O、CH2Cl2,-30℃,54%(b)MeNH2,52%(c)TFA、CH2Cl2,0℃→25℃(d)(i)PMe3、THF、NaOH 0.1摩尔浓度,(ii)以在MeOH中的2%TFA的一混合物从所述离子交换管柱中以两步骤在产率为85%下洗脱出所述产物。)
[0810] 方案7
[0811]
[0812] (NB151显示为其TFA酸加成盐)
[0813] 将无水CH2Cl2(19毫升)加入一粉末火焰干燥的4埃的分子筛(1.6克)中,然后是受体6(142毫克,1当量)的加入以及供体5(546毫克,3当量)。将所述混合物冷却至-50℃,并且滴加BF3·Et2O。通过TLC(EtOAc/己烷3:7)监测所述反应的所述进程,并且表示所述反应在30分钟内完成。以EtOAc稀释所述反应物,并且通过 的一垫盘过滤。以EtOAc彻底洗
涤所述 后,合并所述多个洗液,并且蒸发至干燥。通过快速层析(EtOAc/己烷3:7)纯化所述粗产物,以得到化合物A(496毫克,40%)。
[0814] 氢核磁共振(500兆赫兹,CDCl3):‘环I’:δH=5.92(d,1H,J=4.0赫兹,H-1)、5.38(dd,1H,J=10.7,9.3赫兹,H-3)、4.98(dd,1H,J=6.7,2.0赫兹,H-6)、4.95(dd,1H,J=10.5,9.3赫兹,H-4)、4.45(dd,1H,J=10.6,2.0赫兹,H-5)、3.80(dd,1H,J=10.9,3.9赫兹,H-2)、1.24(d,3H,J=6.7赫兹,CH3-6);‘环II’:δH=5.02(t,1H,J=9.9赫兹,H-6)、3.83(t,
1H,J=9.4赫兹,H-5)、3.74(t,1H,J=9.7赫兹,H-4)、3.58-3.46(m,2H,H-1,H-3)、2.38(dt,
1H,J=13.2,4.7赫兹,H-2eq)、1.48(dd,1H,J=26.5,12.9赫兹,H-2ax);‘环III’:δH=5.62(d,1H,J=4.3赫兹,H-1)、5.57(s,1H,H-3)、5.30(dd,1H,J=7.3,5.2赫兹,H-2)、4.58(dt,
1H,J=7.4,2.7赫兹,H-4)、4.06(ddd,1H,J=14.5,6.0,3.9赫兹,H-5)、3.59(ddd,1H,J=
13.8,8.4,3.8赫兹,H-5);所述光谱中的所述多个额外的波峰被辨识为如下:δH=11.53(s,
1H,NH)、8.72(dd,1H,J=6.2,4.2赫兹,NH)、7.92-7.87(m,4H,Bz)、7.57-7.49(m,2H,Bz)、
7.39-7.32(m,4H,Bz)、2.07(s,3H,Ac)、2.05(s,3H,Ac)、2.04(s,3H,Ac)、1.69(s,3H,Ac)、
1.54(s,9H,Boc)、1.46(s,9H,Boc)。
[0815] 碳13核磁共振(125兆赫兹,CDCl3):δC=170.2(Ac)、170.2(Ac)、170.1(Ac)、169.9(Ac)、165.6(Bz)、165.2(Bz)、163.5,156.4,153.4,133.8(Bz)、133.6(Bz)、129.9(Bz)、129.8(Bz)、128.6(Bz)、128.5(Bz)、108.1(C3”)、96.5(C1’)、80.1(C5)、79.5(C4”)、77.5(C4)、74.7(C1”)、73.7(C6)、72.2(C2”)、71.1(C3’)、70.2(C5’)、69.2(C4’)、68.7(C6’)、
61.6(C2’)、58.9,58.6,43.8(C5”)、32.4(C2)、28.3(Boc)、28.3(Boc)、21.3(Ac)、21.0(Ac)、
20.9(Ac)、20.7(Ac)、13.7(CH3-6’)。
[0816] 基体辅助激光解吸电离飞行时间质谱:对于C51H64N12O20([M+H]+)的计算的m/e:1166.1;测量的m/e:1166.1。
[0817] 在室温下将化合物A(495毫克)溶解于MeNH2(33%溶液,EtOH,20毫升)的一溶液中过夜。通过TLC(MeOH/EtOAc 1:4)指示所述反应的所述完成。然后,将所述反应混合物蒸发至干燥。将所述粗产物进行管柱层析(MeOH/EtOAc 1:4)以生产化合物B(175毫克,52%)。
[0818] 氢核磁共振(500兆赫兹,MeOD):‘环I’:δH=5.95(d,1H,J=3.0赫兹,H-1)、4.03-3.99(m,1H,H-5)、3.98-3.90(m,2H,H-3,H-6)、3.38(t,1H,J=8.9赫兹,H-4)、3.17(dd,1H,J=10.6,5.2赫兹,H-2)、1.24(d,3H,J=4.5赫兹,CH3-6);‘环II’:δH=3.69(t,1H,J=10.0赫兹,H-4)、3.62(t,1H,J=9.6赫兹,H-5)、3.54(ddd,1H,J=15.4,10.9,4.4赫兹,H-1)、3.48-
3.40(m,1H,H-3)、3.37(t,J=9.9赫兹,H-6)、2.21(dt,1H,J=11.7,4.0赫兹,H-2eq)、1.32(dd,1H,J=26.2,13.1赫兹,H-2ax);‘环III’:δH=5.35(s,1H,H-1)、4.21(d,1H,J=4.3赫兹,H-2)、4.06-3.99(m,1H,H-3)、3.85(dd,1H,J=14.2,1.1赫兹,H-4)、3.43(dd,1H,J=
13.9,1.3赫兹,H-5);所述光谱中的所述多个额外的波峰被辨识为如下:
[0819] δH=1.55(s,9H,Boc)、1.49(s,9H,Boc)。
[0820] 碳13核磁共振(125兆赫兹,MeOD):δC=164.4、157.7、154.0、111.4(C1”)、97.6(C1’)、85.2(C5)、81.6、77.6、77.0(C4)、76.4(C2”)、75.0、74.4、73.0、72.4、69.7、64.6、62.1、61.5、45.0(C5”)、33.3(C2)、28.6(Boc)、28.4(Boc)、18.3(CH3-6’)。
[0821] 基体辅助激光解吸电离飞行时间质谱:对于C29H48N12O14([M+Na]+)的计算的m/e:811.7;测量的m/e:811.8。
[0822] 在-10℃下在CH2Cl2(10毫升)中的化合物B(175毫克,1当量)的一溶液中滴加TFA(3.2毫升),并且使得在所述反应混合物的所述添加后达到所述室温。通过TLC(CH2Cl2/MeOH 8:2)监测所述反应进程,所述TLC表示在3小时内完成。将所述反应混合物蒸发至干燥,以得到所述粗产物C(185毫克),所述粗产物进行所述施陶丁格反应。
[0823] 化合物C(185毫克,1当量)的一搅拌溶液在THF(3毫升)及NaOH水溶液(1毫摩尔浓度,5.0毫升)的一混合物中滴加PMe3(在THF中为1摩尔浓度的溶液,3毫升,7.8当量浓度),并且进一步搅拌所述混合物过夜。通过TLC(TFA/MeOH 1:49)监测所述反应的完成,将以上的混合物通过Amberlite CG50(NH4+形式)的一硅胶短柱以获得所述纯产物。使用以下的所述多个溶剂洗涤所述管柱:正己烷、THF、EtOAc、MeOH以及CH3CN。然后以TFA/MeOH(1:49)的一混合物洗脱所述产物,以生产NB151。对于所述多个储存及生物测试,将NB151溶解于水中,并且冻干以得到NB151的所述TFA盐(574毫克,对两个步骤为85%)。
[0824] 氢核磁共振(500兆赫兹,MeOD):‘环I’:δH=5.54(d,1H,J=4.0赫兹,H-1)、4.30-4.20(m,1H,H-6)、3.90(dd,1H,J=9.6,1.9赫兹,H-5)、3.83(t,1H,J=9.6赫兹,H-3)、3.40-
3.29(m,2H,H-2,H-4)、1.20(d,3H,J=7.3赫兹,CH3-6);‘环II’:δH=3.97(t,1H,J=9.8赫兹,H-4)、3.82(t,1H,J=8.9赫兹,H-5)、3.64(t,1H,J=9.7赫兹,H-6)、3.51(ddd,1H,J=
18.4,14.2,8.3赫兹,H-1)、3.31-3.21(m,1H,H-3)、2.48(dt,1H,J=12.6,3.9赫兹,H-2eq)、
1.85(dd,1H,J=25.1,12.3赫兹,H-2ax);‘环III’:δH=5.31(d,1H,J=4.0赫兹,H-1)、4.09(t,1H,J=4.9赫兹,H-2)、4.06-3.97(m,2H,H-3,H-4)、3.56-3.46(m,2H,H-5)。
[0825] 碳13核磁共振(125兆赫兹,MeOD):δC=159.1、110.9(C1”)、98.5(C1’)、85.1、82.5、82.0(C4)、77.5(C5’)、75.6(C2”)、73.6(C6)、71.8、71.7、71.3、66.2(C6’)、55.8、50.9(C1)、50.9(C3)、44.5(C5”)、29.6(C2)、15.85(CH3-C6’)。
[0826] 基体辅助激光解吸电离飞行时间质谱:对于C19H38N6O10([M+H]+)的计算的m/e:511.5;测量的m/e:511.9。
[0827] NB152的合成(以其TFA酸加成盐显示):
[0828]
[0829] 如方案7所示,从所述受体7以及供体5开始制备NB152。(多个试剂与多个条件:(a)BF3·Et2O、CH2Cl2,-30℃,40%(b)MeNH2,78%(c)TFA、CH2Cl2,0℃→25℃(d)(i)PMe3、THF、NaOH 0.1摩尔浓度,(ii)以在MeOH中的2%TFA的一混合物从所述离子交换管柱中以两步骤在产率为88%下洗脱出所述产物。)
[0830] 方案7
[0831]
[0832] (NB152显示为其TFA酸加成盐)
[0833] 将无水CH2Cl2(78毫升)加入一粉末火焰干燥的4埃的分子筛(5.85克)中,然后是受体7(755毫克,1当量)的加入以及供体5(2.3克,3当量)。将所述混合物冷却至-50℃,并且滴加BF3·Et2O。通过TLC(EtOAc/己烷3:7)监测所述反应的所述进程,并且表示所述反应在10分钟内完成。以EtOAc稀释所述反应物,并且通过 的一垫盘过滤。以EtOAc彻底洗涤所述 后,合并所述多个洗液,并且蒸发至干燥。通过快速层析(EtOAc/己烷3:7)纯化所述粗产物,以得到化合物A(496毫克,40%)。
[0834] 氢核磁共振(500兆赫兹,CDCl3):‘环I’:δH=5.90(d,1H,J=3.9赫兹,H-1)、5.39(t,J=10.4赫兹,1H)、4.98(dd,1H,J=12.2,8.0赫兹,H-4)、4.48(d,1H,J=10.6赫兹,H-5)、3.79(dd,1H,J=10.7,3.9赫兹,H-2)、1.24(d,3H,J=6.7赫兹,CH3-6);‘环II’:δH=4.91(t,1H,J=10.1赫兹,H-6)、4.03-3.96(m,1H,H-1)、3.93(t,1H,J=9.2赫兹,H-5)、3.71(t,
1H,J=9.4赫兹,H-4)、3.64-3.54(m,1H,H-3)、2.54(dt,1H,J=12.6,4.1赫兹,H-2eq)、1.35(dd,1H,J=24.8,12.3赫兹,H-2ax);‘环III’:δH=5.69(d,1H,J=4.0赫兹,H-1)、5.61(s,
1H,H-3)、5.37(dd,1H,J=7.0,5.4赫兹,H-2)、4.57(dd,1H,J=8.3,4.8赫兹,H-4)、4.11-
4.01(m,1H,H-5)、3.61-3.50(m,1H,H-5);所述光谱中的所述多个额外的波峰被辨识为如下:δH=11.54(s,1H)、8.72(t,J=4.3赫兹,1H)、7.99-7.78(m,6H,Bz)、7.42-7.30(m,4H,Bz)、5.18(dd,1H,J=6.7,5.0赫兹)、3.54-3.45(m,2H)、2.14-2.02(m,1H)、1.57-1.52(m,
1H)、2.29(s,3H,Ac)、2.21(s,3H,Ac)、2.07(s,3H,Ac)、2.06(s,3H,Ac)、2.05(s,3H,Ac)、
1.54(s,9H,Boc)、1.45(s,9H,Boc)。
[0835] 碳13核磁共振(125兆赫兹,CDCl3):δC=177.1、170.2(Ac)、170.1(Ac)、170.0(Ac)、169.9(Ac)、165.5(Bz)、165.1(Bz)、164.1、157.3、153.6、133.7(Bz)、129.7(Bz)、128.8(Bz)、108.1(C3”)、96.6(C1’)、80.5(C5)、78.9(C4”)、77.7(C4)、74.8(C1”)、73.3(C6)、
72.2、71.5、70.9、70.4(C5’)、68.6(C4’)、61.6(C2’)、58.7(C3)、49.0(C1)、43.8(C5”)、32.9(C2)、28.3(Boc)、28.1(Boc)、21.0(Ac)、20.9(Ac)、20.5(Ac)、13.9(CH3-6’)。
[0836] 基体辅助激光解吸电离飞行时间质谱:对于C57H73N13O23([M+H]+)的计算的m/e:1309.3;所得到的m/e 1309.7。
[0837] 将化合物A(50毫克)在室温下溶解于MeNH2(33%溶液,EtOH,2毫升)的一溶液中过夜。通过TLC(MeOH/EtOAc 1:4)指示所述反应的所述完成。然后,将所述反应混合物蒸发至干燥。将所述粗产物进行管柱层析(MeOH/EtOAc 1:49)以生产化合物B(27毫克,78%)。
[0838] 氢核磁共振(500兆赫兹,MeOD):‘环I’:δH=5.98(d,1H,J=2.8赫兹,H-1)、4.08-3.91(m,2H,H-5,H-6)、3.96(t,1H,J=9.5赫兹,H-3)、3.36(t,1H,J=9.6赫兹,H-4)、3.18(dd,1H,J=10.8,5.2赫兹,H-2)、1.26(d,3H,J=3.9赫兹,CH3-6);‘环II’:δH=3.63-3.72(m,2H,H-1,H-4,H-5)、3.54-3.58(m,1H,H-1)、3.34-3.38(m,2H,H-3,H-6)、2.15(dt,1H,J=
12.9,4.0赫兹,H-2eq)、1.48(dd,1H,J=25.0,12.7赫兹,H-2ax);‘环III’:δH=5.37(s,1H,H-1)、4.19(d,1H,J=4.0赫兹,H-2)、4.01(s,1H,H-3)、3.88(d,1H,J=15.2赫兹,H-4)、3.38(d,2H,J=14.4赫兹,H-5);所述光谱中的所述多个额外的波峰被辨识为如下:δH=4.15(dd,1H,J=3.9,8.8赫兹)、3.53-3.44(m,2H)、2.13-1.99(m,1H)、1.92-1.82(m,1H)、1.54(s,9H,Boc)、1.47(s,9H,Boc)。
[0839] 碳13核磁共振(125兆赫兹,MeOD):δC=177.4,164.5,157.7(Boc)、154.0(Boc)、111.4(C1”)、97.6(C1’)、86.1,81.6,80.5,77.1,76.5(C2”)、75.7(C5”)、75.1,74.5,73.2,
72.3,70.2,69.4,64.6(C2’)、61.9(C1)、50.5,47.5,45.3,34.7,32.1(C2)、28.4(Boc)、26.3(Boc)、18.1(CH3-6’)。
[0840] 基体辅助激光解吸电离飞行时间质谱::对于C33H55N13O16([M+Na]+)的计算的m/e:912.8;测量的m/e:912.7。
[0841] 在-10℃下在CH2Cl2(3.3毫升)中的化合物B(109毫克,1当量)的一溶液中滴加TFA(1.3毫升),并且使得在所述反应混合物的所述添加后达到所述室温。通过TLC(CH2Cl2/MeOH 8:2)监测所述反应进程,所述TLC表示在2小时内完成。将所述反应混合物蒸发至干燥,以得到所述粗产物C(169毫克),所述粗产物进行所述施陶丁格反应。
[0842] 化合物C(169毫克,1当量)的一搅拌溶液在THF(3毫升)及NaOH水溶液(1毫摩尔浓度,5.0毫升)的一混合物中滴加PMe3(在THF中为1摩尔浓度的溶液,2.74毫升,7.8当量浓度),并且进一步搅拌所述混合物过夜。通过TLC(TFA/MeOH 1:49)监测所述反应的完成,将以上的混合物通过Amberlite CG50(NH4+形式)的一硅胶短柱以获得所述纯产物。使用以下的所述多个溶剂洗涤所述管柱:正己烷、THF、EtOAc、MeOH以及CH3CN。然后以TFA/MeOH(1:49)的一混合物洗脱所述产物,以生产NB152。对于所述多个储存及生物测试,将NB152溶解于水中,并且冻干以得到NB152的所述TFA盐(350毫克,对两个步骤为88%)。
[0843] 氢核磁共振(500兆赫兹,MeOD):‘环I’:δH=5.52(d,1H,J=3.9赫兹,H-1)、4.22(d,1H,J=5.8赫兹,H-6)、3.88(d,1H,J=9.1赫兹,H-5)、3.81(t,1H,J=9.6赫兹,H-4)、3.36-3.28(m,2H,H-2,H-3)、1.19(d,3H,J=6.32赫兹,CH3-6);‘环II’:δH=3.93-3.83(m,
2H,H-1,H-4)、3.75(t,1H,J=9.1赫兹,H-5)、3.60(t,1H,J=9.7赫兹,H-6)、3.45-3.37(m,
1H,H-3)、2.20(dt,1H,J=13.1,3.8赫兹,H-2eq)、1.69(dd,1H,J=25.2,12.4赫兹,H-2ax);
‘环III’:δH=5.28(d,1H,J=3.5赫兹,H-1)、4.07(t,1H,J=4.3赫兹,H-2)、4.04-3.96(m,
2H,H-3,H-4)、3.49(t,2H,J=5.2赫兹,H-5);所述光谱中的所述多个额外的波峰被辨识为如下:δH=4.21(dd,1H,J=4.5,8.9赫兹)、3.14-3.01(m,2H)、2.15-2.03(m,1H)、2.03-1.97(m,1H)。
[0844] 碳13核磁共振(125兆赫兹,MeOD):δC=176.2、159.2、111.2(C1”)、98.5(C1’)、86.0(C5)、82.44、82.1、77.4、75.8(C2”)、74.7(C6)、71.8、71.8、71.4(C4’)、71.0(C6’)、
66.2、55.9、51.4(C3)、49.8、44.5(C5”)、37.8、32.7、31.7(C2)、15.9(CH3-6’)。
[0845] 基体辅助激光解吸电离飞行时间质谱:对于C23H45N7O11([M+H]+)的计算的m/e:612.6;测量的m/e:612.9。
[0846] 实例2
[0847] 在实例1的多个化合物的基于细胞的测定中的通读活性
[0848] 实验方法:
[0849] 如例如美国专利第8,895,519号及Vecsler,M.等人,[公共科学图书馆·综合(PLoS ONE),2011,6(6)第e20733页]所述,使用在所述选定的基因中携带的一突变的多个报告质体来测试根据本发明的多个实施例的所述多个测试化合物多个无义突变(通读活性)的抑制。
[0850] 简要地,通过所述多个质体转染多个HEK-293T细胞,在转染后24小时裂解所述多个细胞,并且测试所述萤火虫萤光素酶以及海肾萤光素酶的所述多个表达水平。多个野生型(WT)质体表达萤火虫萤光素酶及海肾荧光素酶两者,而多个突变质体由于所述插入序列中所发现的所述终止密码子而仅表达海肾萤光素酶。在所述多个测试化合物的多个通读活性测定中,在转染后6小时将所述多个化合物加入到所述多个细胞悬浮液中。若所述多个化合物对所述提前的无义/终止密码子突变施加抑制,则表达所述萤火虫萤光素酶,以及观察到所述萤火虫萤光素酶在表达上的一个倍数变化。
[0851] 结果:
[0852] 为了测定所述多个测试化合物是否可以在多个人类细胞中的多个致病性无义突变中诱导所述功能性抑制,测试了从导致蕾特氏综合症的天然地存在的多个提前终止密码子突变的多个互补脱氧核糖核酸(cDNA)对萤火虫萤光素酶以及海肾萤光素酶的所述合成。在所有情况下,所述多个突变引入整码的赭石(UGA)终止密码子代替精氨酸残基R168X,R270X以及R294X突变,并分别产生UGAG,UGAA以及UGAU四核苷酸终止信号
[0853] 使用表1中列出的所述多个化合物所测试的多个蕾特氏综合征突变的通读活性,并且基于多个萤火虫萤光/海肾萤光比值来计算所述突变抑制,以在没有一测试化合物(对照组)的情况下获得相同的比率标准化所述数值,并将所述结果到在所述野生型中观察到的表达水平。通常,由于所述海肾萤光的报告基因位于所述测试基因的上游,并且所述萤火虫萤光报告基因位于下游,所以可以通过计算下游表达与上游表达的比率(萤火虫萤光/海肾萤光的表达比率)来量化通读活性,以及注意所述比率的比例(百分比)相对于使用所述野生型序列的多个相同的测量,即作为所述野生型所观察到的所述表达水平比率的多个标准化分数。替代地,可以相对于在所述对照实验中观察到的所述萤火虫萤光/海肾萤光的表达比率(无通读诱导化合物)标准化所述萤火虫萤光/海肾萤光的表达比率。由于所述野生型中的所述萤火虫萤光/海肾萤光表达比率对所述通读诱导化合物的所述存在基本上为不敏感的,并且所述对照组实验基本上对所述通读诱导化合物的存在也是不敏感的,如同没有存在任何通读诱导化合物,所以所述两种标准化方法预期会表现出多个类似的趋势,如下文所示的所述多个结果中所示。
[0854] 使用多个相同的化合物以及对照组测量相同的萤火虫萤光/海肾萤光的多个表达比率,但使用所述野生型序列将表明所述多个测试化合物对一般表达水平的所述影响,不论所述通读活性,从而指示所述测试化合物是否施加蛋白质合成抑制活性,如同多个典型的氨基糖苷类抗生素,所述多个野生型测量值也表示所述实验误差。
[0855] 因此,根据本发明的一些实施例,若一已知的通读诱导化合物发挥一些通读活性,则与所述对照组中所观察到的萤火虫萤光/海肾萤光表达比率相比,所述多个测量将显示一个庞大的所述萤火虫萤光/海肾萤光表达比率(没有通读-诱导化合物)以及一个高比例性数值(量级为一百个百分比)。若没有通读活性,则预期所述失活化合物以及所述对照组的所述萤火虫萤光/海肾萤光的多个表达比率将会是绝对地小的,并且按类似的比例地,得到大约为100%的一个数值。
[0856] 图2A至2C表示比较性条形图,所述比较性条形图显示针对表1中所示的所述多个化合物测量及计算的引起多个提前终止密码子突变R168X(图2A)、R270X(图2B)以及R294X(图2C)的所述蕾特氏综合征的多个通读水平,所述多个化合物在0.3毫摩尔浓度和1毫摩尔浓度的一浓度与多个表达细胞接触,以及与对照组样本(不加入化合物)接触,基于所述多个萤火虫萤光/海肾萤光表达比率与所述野生型中观察到的所述多个表达比率。
[0857] 图3A至3C表示比较性条形图,所述比较性条形图显示针对表1中所示的所述多个化合物测量及计算的引起多个提前终止密码子突变R168X(图3A)、R270X(图3B)以及R294X(图3C)的所述蕾特氏综合征的多个通读水平,所述多个化合物在0.3毫摩尔浓度以及1毫摩尔浓度的一浓度与多个表达细胞接触,以及与对照组样本(不加入化合物)接触,基于所述多个萤火虫萤光/海肾萤光表达比率与所述野生型中观察到的所述多个表达比率。
[0858] 从图2A至2C可以看出,根据本发明的一些实施例的所述多个示例性化合物在全部三种蕾特氏综合征突变模型中展现一显着并且剂量依赖性的通读活性。化合物NB150及NB151在0.3毫摩尔浓度和1毫摩尔浓度剂量下表示出类似于所述氨基糖苷类抗生素剂G418(遗传霉素)所述显示的所述水平的通读活性。所述结果可能与所述G418的所述显着的细胞毒性有关,而G418又与一总体有限的通读水平相关。
[0859] 从图3A至3C可以看出,所述通读活性与对照组(多个未处理的细胞)比较在多个野生型细胞中不受影响(约100%);然而,在全部三种蕾特氏综合征突变模型中,所述不同的处理对所述通读活性(>100%)具有一显着的及剂量依赖性的影响。化合物NB150、NB151及NB152在0.3毫摩尔浓度和1毫摩尔浓度剂量下表示出类似于所述氨基糖苷类抗生素剂G418(遗传霉素)所述显示的所述水平的通读活性。所述结果可能与所述G418的所述显着的细胞毒性有关,而G418又与一总体有限的通读水平相关。
[0860] 实例3
[0861] 实例1的多个化合物的无细胞试验中的通读活性
[0862] 实验方法:
[0863] 将所述多个质体在体外转录,并使用多个兔类网织红细胞(TNT混合物)来转译,以及然后测试所述萤火虫及海肾萤光素酶的所述多个表达水平。多个野生型质体表达萤火虫萤光素酶及海肾荧光素酶两者,而多个突变质体由于所述插入序列中所发现的所述终止密码子而仅表达海肾萤光素酶。在所述多个测试化合物的多个通读活性测定中,在转染后6小时将所述多个化合物加入到所述多个细胞悬浮液中。若所述多个化合物对所述提前的无义/终止密码子突变施加抑制,则表达所述萤火虫萤光素酶,并且观察所述萤火虫萤光素酶在表达上的一个倍数变化。
[0864] 结果:
[0865] 使用表1中列出的化合物测试囊性纤维化(CF)突变G542X的通读活性,并且基于多个萤火虫萤光/海肾萤光表达比值计算突变抑制,并相对于所述野生型和所述对照组样本的表达水平标准化(没有测试化合物)。
[0866] 图4A至4F表示对于根据本发明的实施例的三个示例性化合物NB144、NB145以及NB146在0至50微摩尔浓度的一浓度范围下进行的所述囊性纤维化G542X无义突变抑制的剂量应答无细胞测定的所述多个结果,其中图4A显示在所述野生型序列的下游发现的所述萤火虫萤光素酶的所述表达水平,图4B显示在所述G542X突变序列的下游发现的所述萤火虫萤光素酶的所述表达水平,图4C显示在所述野生型序列的上游发现的所述海肾荧光素酶的所述表达水平,图4D显示在所述G542X突变序列的上游发现的所述海肾荧光素酶的所述表达水平,图4E显示在所述野生型序列中测量的所述萤火虫萤光/海肾萤光的表达比率,图4F显示在所述G542X突变序列中测量的所述萤火虫萤光/海肾萤光表达比率。
[0867] 从图4A至4F可以看出,所述野生型序列的上游或下游的所述表达水平对于所述多个测试化合物的所述浓度非常不敏感,在高浓度的所述多个测试化合物下,所述多个表达水平具有一相对地小的下降,可能是因为所述多个测试化合物的所述多个残余的蛋白质合成抑制作用(请参见图4A、4C以及4E)。在鲜明的对比下,所述突变序列的下游的所述多个表达水平显示出一强烈的剂量依赖性应答,所述应答在所述突变序列的上游未被看见(参见图4B以及4D),因此所述下游至上游的表达水平比率(萤火虫萤光/海肾萤光表达比率)也展现出一强烈的剂量依赖性应答,表示所述多个测试化合物的所述突变抑制活性(图4F)。
[0868] 图5A至5B表示对于根据本发明的多个实施例的三个示例性化合物NB144、NB145及NB146在0至50微摩尔浓度的一浓度范围下进行的所述囊性纤维化G542X无义突变抑制的剂量应答无细胞测定的所述多个结果,其中图5A显示在所述突变序列的下游发现的所述萤火虫萤光素酶的所述表达水平,作为在所述对照组实验中(未加入化合物)展现的所述表达水平的一分数,在突变序列下游发现的萤火虫萤光素酶的表达水平,以及图5B显示了所述突变序列的下游及上游的所述萤火虫萤光/海肾萤光表达比率,作为所述对照组实验中的所述表达水平的一分数。
[0869] 从图5A至5B可以看出,根据本发明的多个实施例,所述三个示例性化合物的所述突变抑制活性对于全部三个化合物是剂量依赖性的,以及特别是NB146,所述NB146也显示更多的蛋白质合成抑制作用(请参见4A、4C以及4E),特别是对于所述萤火虫萤光素酶基因。
[0870] 图6A至6F表示对于根据本发明的实施例的三个示例性化合物NB150、NB151以及NB152在0至50微摩尔浓度的一浓度范围下进行的所述囊性纤维化G542X无义突变抑制的剂量应答无细胞测定的所述多个结果,其中图6A显示在所述野生型序列的下游发现的所述萤火虫萤光素酶的所述表达水平,图6B显示在所述G542X突变序列的下游发现的所述萤火虫萤光素酶的所述表达水平,图6C显示在所述野生型序列的上游发现的所述海肾荧光素酶的所述表达水平,图6D显示在所述G542X突变序列的上游发现的所述海肾荧光素酶的所述表达水平,图6E显示在所述野生型序列中测量的所述萤火虫萤光/海肾萤光的表达比率,图6F显示在所述G542X突变序列中测量的所述萤火虫萤光/海肾萤光表达比率。
[0871] 图7A至7B表示对于根据本发明的多个实施例的三个示例性化合物NB150,NB151以及NB152在0至50微摩尔浓度的一浓度范围下进行的所述囊性纤维化G542X无义突变抑制的剂量应答无细胞测定的所述多个结果,其中图7A显示在所述突变序列的下游发现的所述萤火虫萤光素酶的所述表达水平,作为在所述对照组实验中(未加入化合物)展现的所述表达水平的一分数,在突变序列下游发现的萤火虫萤光素酶的表达水平,以及图7B显示了所述突变序列的下游及上游的所述萤火虫萤光/海肾萤光表达比率,作为所述对照组实验中的所述表达水平的一分数。
[0872] 从图6A至F以及图7A至B可以看出,化合物NB150、NB151以及NB152也表现出类似于图4A至F以及图5A至B中的多个示例性化合物NB144、NB145及NB146所观察到的基本的突变抑制活性。图4A至F和图5A至B,即一显着的剂量依赖性通读活性,所述剂量依赖性通读活性在某种程度上与蛋白质合成抑制相关,如NB152可以看出,特别是对于所述海肾萤光素酶基因。
[0873] 图8A至8C表示对于根据本发明的实施例的六种示例性化合物NB144、NB145、NB146、NB150、NB151以及NB152在一浓度为5微摩尔浓度下所进行的蕾特氏综合征R168X(图
8A)、R270X(图8B)以及R294X(图8C)无义突变抑制的无细胞测定的结果。如本文所示,当与所述对照组(未经处理的多个细胞提取物)比较时,所述野生型的细胞提取物不受影响(约
100%);然而,在所有三种蕾特氏综合征突变模型中,不同的处理对于所述通读活性具有一显着影响(>>>100%)。
[0874] 从图8A至8C可以看出,所述多个测试化合物的所述通读活性显着地比起所述蛋白质合成抑制效果更为显着,证明了所测试的多个示例性化合物在表现出一相对地较低程度的所述抑制性副作用的同时,抑制所述多个无义突变的有效性。在所述Nl取代的多个衍生物中,与NB144以及NB145相比,NB146展现出一更好的活性;并且在所述多个胍衍生物中,所述假三糖NB152展现出与NB150及NB151相比的一更高的活性。这些数据表明,在所述第N1位的一疏水部分的包含对于氨基糖苷类的所述生物学效应具有一显着影响。
[0875] 实例4
[0876] 根据本发明一些实施例的示例性的包含二醇氨基糖苷的化学合成
[0877] 一般技术:
[0878] 核磁共振光谱(包括氢(1H)、碳13(13C)、无畸变极化转移增益法(DEPT)、二维关联能谱法(2D-COSY)、一维全相关光谱学(ID TOCSY)、异核多量子关系(HMQC)、多键碳氢关系谱(HMBC))常规地记录在Bruker AvanceTM 500光谱仪上,被报道的多个化学位移(以百万分之一(ppm)计算)相对于以CDC13作为所述溶剂以及以MeOD(δ=3.35)作为所述溶剂的内部的Me4Si(δ=0.0)。在一Bruker Avance TM 500光谱仪上以125.8兆赫兹记录碳13核磁共振光谱,并且相对于CDCl3(δ=77.00)的所述溶剂信号或MeOD的所述溶剂信号(δ=49.0)的被报道的多个化学位移(以百万分之一计)。
[0879] 通过在电子喷雾电离(ESI)下的一台Bruker Daltonix Apex 3质谱仪或通过一台TSQ-70B质谱仪(Finnigan Mat)来获得多个质谱分析。
[0880] 通过在硅胶60F254(0.25毫米,默克(Merck))上的TLC来监测多个反应,并且通过以10%H2SO4(800毫升)中包含(NH4)Mo7O24·4H2O(120克)以及(NH4)2Ce(NO3)6(5克)的一黄色溶液来炭化及可视化多个点。
[0881] 快速管柱层析法是在硅胶60(70至230孔)上进行。
[0882] 除非另有说明,所有反应均在一氩气气体下以多个无水溶剂来进行。
[0883] G418(遗传霉素)以及庆大霉素是购自西格玛(Sigma)。除非另有说明,所有其他的化学品以及生物化学品均从多个商业来源中获得。
[0884] 基本上如上文所述和下文进一步的细节来制备如下表3所示的多个化合物NB153、NB155、NB156以及NB157。
[0885] 所有结构均通过各种一维及二维的核磁共振技术的一组合来证实,所述一维及二维的核磁共振技术包括:一维全相关光谱学,二维关联能谱法,二维氢-碳13多键碳氢关系谱以及多键碳氢关系谱。
[0886] 表3
[0887]
[0888]
[0889] (表三续)
[0890] 假二糖NB153及NB155的多个合成:
[0891] NB153及NB155假二糖在所述6’,7’-二醇的第C6'位是两个非对映异构体,分别展现出6’-(R)组态以及6’-(S)组态。
[0892] 化合物NB153及NB155的所述多个合成在以下的方案8中说明。
[0893] 方案8
[0894]
[0895] 多个试剂及多个条件:(i)(a)TIPSC1、DMF、4-DMAP,0至25℃,83%;(b)PMBCl、NaH、DMF,0至25℃,84%;(ii)(a)TBAF、THF,0至25℃,88%;(b)IBX、EtOAc,80℃,85%;(c)CH3P(Ph)3I、n-BuLi、THF,0至25℃,56%;(iii)K2OsO4·2H2O、NMO、丙酮/H2O/t-BuOH,93%(3:1比率);(iv)(a)DDQ,CH2Cl2/H2O;(b)Ac2O、Py,0至25℃,两步骤为91%;(c)NaOMe,MeOH,60%;(v)PMe3、THF、NaOH(0.1摩尔浓度)、73%[NB153];78%[NB155]。
[0896] 简要地,所述过叠氮基(perazido)衍生物18由TIPSC1选择性保护,所述多个剩余的羟基由多个对甲氧基苄基(PMB)所保护以得到19。以TBAF对于甲硅烷基的选择性去保护化,然后以2-碘苯甲酸(IBX)以及维蒂希(Wittig)反应来进行氧化作用以得到所述末端烯烃20。二羟基化所述烯烃20以提供所述二醇21作为多个6-非对映异构体的一不可分离的混合物。以2,3-二氯-5,6-二氰对苯醌(DDQ)对21的处理后,进行乙酰化(Ac2O)及脱乙酰化(NaOMe)步骤以得到多个6’-非对映异构体的所述混合物(约3:1比率),其中所述多个6’-非对映异构体的所述混合物是通过管柱层析成功地分离,以得到所述主要的非对映异构体22及所述次要的非对映异构体23。在第6’位的所述绝对构型通过使用所述氢核磁共振磁各向异性来指定,如下所述,所述1H-核磁共振磁各向异性分别对于所述主要和次要非对映异构体建立6-(R)-和6-(S)-组态。所述两种非对映异构体22及23分别地进行施陶丁格反应以分别制造所述多个假二糖NB153及NB155。
[0897] (2R,3S,4R,5R,6S)-5-叠氮基-6-(((1R,2R,3S,4R,6S)-4,6-二叠氮基-2,3-二羟基环己基)氧基)-2-(羟甲基)四氢-2H-吡喃-3,4-二醇(化合物18):化合物18根据先前公开的工序[Nyffeler等人,美国化学学会杂志(J.Am.Chem.Soc.),2002,124,第10773至10778页]。简要地,将所述巴龙霉胺(1.0克,3.0毫摩尔浓度)、NaHCO3(3.1克,36.9毫摩尔浓度)以及硫酸(II)(6毫克,0.24毫摩尔浓度)溶解于水(5.0毫升)中。加入由Tf2O(4.6毫升,27.6毫摩尔浓度)及NaN3(3.6克,55.7毫摩尔浓度)所制备的三氟甲磺酰基叠氮化物的贮备溶液,然后是甲醇(40毫升)的加入以达到所述均质的溶液。在室温下剧烈地搅拌所述反应混合物(蓝色),并且通过蓝色到绿色的所述变化来监测所述反应的所述完成。搅拌48小时后,TLC(EtOAc/MeOH 95:5)分析表示所述反应的所述完成。将所述多个溶剂蒸发至干燥,并将所述残余物进行管柱层析(EtOAc 100%),从而获得化合物18(650毫克,52%的产率)。
[0898] 氢核磁共振(500兆赫兹,MeOD):‘环I’:δ=H5.69(d,1H,J=3.7赫兹,H-1)、3.99(ddd,1H,J=9.9,4.1,2.6赫兹,H-5)、3.94(dd,1H,J=10.2,9.1赫兹,H-3)、3.84(dd,1H,J=11.9,2.3赫兹,H-6)、3.78(dd,1H,J=11.8,4.4赫兹,H-6)、3.46(dd,1H,J=9.7,9.3赫兹,H-4)、3.13(dd,1H,J=10.5,3.7赫兹,H-2);‘环II’:δH3.80(t,1H,J=8.8赫兹,H-5)、3.77-3.67(m,3H,H-1,H-3,H-4)、3.56(t,1H,J=9.6赫兹,H-6)、2.59-2.48(m,1H)、1.68(dd,1H,J=26.3,12.7赫兹,H-2)。
[0899] 碳13核磁共振(125兆赫兹,MeOD):δ=C99.3(C1’)、80.7、77.8(C5)、77.7(C6)、73.9(C5’)、72.4(C3’)、71.6、64.8(C2’)、62.1(C6’)、61.6、60.9、33.1(C2)。
[0900] 基体辅助激光解吸电离飞行时间质谱:对于C12H19N9O7([M+K]+)的计算的m/e:440.3;测量的m/e:440.2。
[0901] (((2R,3S,4R,5R,6S)-5-叠氮基-6-(((1R,2R,3S,4R,6S)-4,6-二叠氮基-2,3-二甲氧基苄基)氧基)环己基)氧基)-3,4-二((4-甲氧苄基)氧基)四氢-2H-吡喃-2-基)甲氧基)三异丙基硅烷(化合物19)的合成:
[0902] 将化合物18(11.6克,28.9毫摩尔浓度)溶解于无水DMF(80毫升)并冷却至0℃。滴加三异丙基甲硅烷基氯(TIPSCl,8毫升,37.3毫摩尔浓度),然后是4-DMAP的加入(10.6克,86.7毫摩尔浓度)。在搅拌下使所述反应混合物达到所述室温,并通过TLC(EtOAc/己烷7:3)监测所述反应进程,所述TLC表示在5小时内完成。所述反应混合物以乙酸乙酯(50毫升)以及H2O(20毫升)稀释,并分离所述两层。所述水层以乙酸乙酯(4×30毫升)充分地洗涤,所述多个合并的有机层以饱和的氯化钠溶液洗涤,并且以无水硫酸镁来干燥。将溶剂蒸发至干燥,并且将所述残余物进行管柱层析(EtOAc/己烷25:75),以得到所述相应的甲硅烷基醚(18a)(13.3克,83%)。
[0903] 氢核磁共振(500兆赫兹,CDCl3):‘环I’:δ=H5.14(d,1H,J=4.0赫兹,H-1)、4.09-4.02(m,2H,H-3,H-6)、3.98(td,1H,J1=8.0,J2=4.5赫兹,H-5)、3.82(dd,1H,J1=9.5,J2=8.0赫兹,H-6)、3.66(t,1H,J=9.0赫兹,H-4)、3.48(dd,1H,J1=10.5,J2=4.0赫兹,H-
2);‘环II’:δ=H3.52(t,1H,J=8.0赫兹,H-5)、3.47-3.37(m,2H,H-1,H-6)、3.34-3.22(m,
2H,H-3,H-4)、2.29(dt,1H,J1=12.0,J2=4.0赫兹,H-2eq)、1.47(ddd,1H,J1=J2=J3=
12.0赫兹,H-2ax);所述光谱中的所述多个额外的波峰被辨识为如下:δ=H1.16-1.09(m,
3H,TIPS)、1.07(s,12H,TIPS)、1.06(s,6H,TIPS)。
[0904] 碳13核磁共振(125兆赫兹,CDCl3):δ=C99.3(C1’)、83.4(C4)、76.1(C5)、75.5(C6)、75.1(C4’)、72.6(C3’)、69.6(C5’)、66.0(C6’)、63.5(C2’)、59.8(C1)、58.9(C3)、32.1(C2)、17.9(2C,TIPS)、11.8(TIPS).。
[0905] 基体辅助激光解吸电离飞行时间质谱:对于C21H39N9O7Si([M+Na]+)的计算的m/e:580.6;测量的m/e:580.3。
[0906] 在0℃下在上述甲硅烷基醚18a(9.82克,17.6毫摩尔浓度)和氢化钠(3.38克,140毫摩尔浓度)在DMF(200毫升)溶液中的一搅拌溶液中加入对甲氧基氯化苄(14.3毫升,105.3毫摩尔浓度)。通过TLC(EtOAc/己烷3:7)监测所述反应进程。在8小时后完成所述反应,并且分成多个小部分地加入以终止所述反应。以乙酸乙酯(100毫升)稀释所述混合物,并且以水(2×50毫升)洗涤。所述多个合并的水层以乙醚(2×50毫升)萃取;将所述多个合并的有机层以无水硫酸镁来干燥,并蒸发至干燥。通过管柱层析(EtOAc/己烷8:92)以纯化残余物,从而获得化合物19(15.28克,84%)。
[0907] 氢核磁共振(500兆赫兹,CDCl3):‘环I’:δ=H5.45(d,1H,J=3.5赫兹,H-1)、3.94(m,2H,H-3,H-5)、3.88-3.78(m,2H,H-6)、3.59(t,1H,J=9.5赫兹,H-4)、3.17(dd,1H,J1=10.5,J2=3.5赫兹,H-2);‘环II’:δ=H3.56-3.42(m,2H,H-4,H-5)、3.41-3.32(m,1H,H-1)、
3.32-3.20(m,2H,H-3,H-6)、2.17(dt,1H,J1=12.5,J2=4.0赫兹,H-2eq)、1.34(ddd,1H,J1=J2=J3=12.5赫兹,H-2ax);所述光谱中的所述多个额外的波峰被辨识为如下:δ=H7.21(d,2H,J=8.0赫兹,PMB)、7.17(d,6H,J=8.0赫兹,PMB)、6.85-6.72(m,8H,PMB)、4.86(d,
1H,J=10.0赫兹,PMB)、4.80-4.65(m,6H,PMB)、4.61(d,1H,J=10.0赫兹,PMB)、3.74-3.68(m,12H,PMB)、1.04-0.94(m,21H,TIPS)。
[0908] 碳13核磁共振(125兆赫兹,CDCl3):δ=C159.5(PMB)、159.4(PMB)、159.3(PMB)、159.2(PMB)、130.7(PMB)、130.3(PMB)、130.2(PMB)、129.9(PMB)、129.8(PMB)、129.7(PMB)、
129.3(PMB)、128.7(PMB)、113.9(2C、PMB)、97.5(C1’)、84.5、84.4、79.8、77.9(C4’)、76.9、
75.6(PMB)、75.2(PMB)、74.9(PMB)、74.5(PMB)、72.9、63.5(C2’)、62.3(C6’)、60.3(C1)、
59.5、55.3(4C、PMB)、32.4(C2)、18.1(2C、TIPS)、12.1(TIPS)。
[0909] 基体辅助激光解吸电离飞行时间质谱:对于C53H71N9O11Si([M+Na]+)的计算的m/e:1061.2;测量的m/e:1061.6。
[0910] (2R,3S,4R,5S,6S)-3-叠氮-2-(((1R,2R,3S,4R,6S)-4,6-二叠氮基-2,3-二((4-甲氧基苄基)氧基)环己基)氧基)-4,5-二((4-甲氧基苄基)氧基)-6-乙烯基四氢-2H-吡喃(化合物20)的合成:在0℃下化合物19(19.82克,19毫摩尔浓度)在THF(230毫升)中的一搅拌溶液中加入TBAF(11.05毫升,38.1毫摩尔浓度),并且通过TLC(EtOAc/己烷2:3)监测所述反应进程。在19小时后,将所述溶剂蒸发至干燥,并且将所述得到的残余物进行管柱层析(EtOAc/己烷3:7),以获得所述相应的6’-醇(14.74克,88%)。
[0911] 氢核磁共振(500兆赫兹,CDCl3):‘环I’:δ=H5.51(d,1H,J=4.0赫兹,H-1)、3.98(dt,1H,J1=8.0,J2=2.0赫兹,H-5)、3.92(t,1H,J=10.0赫兹,H-3)、3.70(dd,1H,J1=12.0,J2=2.0赫兹,H-6)、3.64(dd,1H,J1=12.0,J2=2.0赫兹,H-6)、3.49(dd,1H,J1=
10.0,J2=8.0赫兹,H-4)、3.17(dd,1H,J1=10.0,J2=4.0赫兹,H-2);‘环II’:δ=H3.53-
3.44(m,2H,H-4,H-5)、3.38(ddd,1H,J1=12.5,J2=10.0,J3=4.5赫兹,H-1)、3.34-3.24(m,2H,H-3,H-6)、2.20(dt,1H,J1=12.5,J2=4.5赫兹,H-2eq)、1.36(ddd,1H,J1=J2=J3=12.5赫兹,H-2ax);所述光谱中的所述多个额外的波峰被辨识为如下:δ=H7.23(d,2H,J=8.0赫兹,PMB)、7.20-7.14(m,6H,PMB)、6.83-6.75(m,8H,PMB)、4.89(d,1H,J=10.0赫兹,PMB)、4.80-4.68(m,6H,PMB)、4.55(d,1H,J=10.0赫兹,PMB)、3.73-3.7(m,12H,PMB)。
[0912] 碳13核磁共振(125兆赫兹,CDCl3):δ=C159.5(PMB)、159.4(2C、PMB)、159.2(PMB)、130.2(PMB)、130.1(2C、PMB)、129.9(PMB)、129.8(PMB)、129.6(2C、PMB)、128.8(PMB)、114.0(2C、PMB)、113.9(2C、PMB)、97.6(C1’)、84.4、84.3、79.8(C3’)、77.4、75.6(PMB)、75.2(PMB)、75.1(PMB)、74.6(PMB)、72.0(C5’)、63.3(C2’)、61.4(C6’)、60.3(C1)、59.5、55.3(3C、PMB)、32.4(C2)。
[0913] 基体辅助激光解吸电离飞行时间质谱:对于C44H51N9O11([M+Na]+)的计算的m/e:903.3;测量的m/e:903.9。
[0914] 向来自上述反应的所述6’-醇(100毫克,0.11毫摩尔浓度)在乙酸乙酯(5毫升)的一溶液中一次性加入IBX(95毫克,0.33毫摩尔浓度)。所述产生的悬浮液在80℃下加热并且剧烈地搅拌,如TLC(EtOAc/己烷2:3)所示,完成所述反应(3.5小时)后,将所述反应冷却至室温并且通过 过滤。以乙酸乙酯(2×50毫升)彻底洗涤所述 以及在减压下蒸发所述多个合并的有机层。将所述粗产物进行快速管柱层析(EtOAc/己烷35:65),从而获得6’-醛(85毫克,85%)。
[0915] 氢核磁共振(500兆赫兹,CDCl3):‘环I’:δ=H9.53(s,1H,H-6)、5.56(d,1H,J=4.0赫兹,H-1)、4.60(d,1H,J=10.0赫兹,H-4)、3.98(dd,1H,J1=J2=10.0赫兹,H-3)、3.52-3.45(m,1H,H-5)、3.17(dd,1H,J1=10.0,J2=4.0赫兹,H-2);‘环II’:δ=H3.53-3.43(m,
2H,H-4,H-5)、3.37(ddd,1H,J1=12.0,J2=10.0,J3=4.0赫兹,H-1)、3.33-3.24(m,2H,H-
3,H-6)、2.20(dt,1H,J1=12.5,J2=4.0赫兹,H-2eq)、1.35(ddd,1H,J1=J2=J3=12.5赫兹,H-2ax);所述光谱中的所述多个额外的波峰被辨识为如下:δ=H7.23(d,2H,J=8.0赫兹,PMB)、7.19-7.10(m,6H,PMB)、6.83-6.72(m,8H,PMB)、4.89(d,1H,J=10.0赫兹,PMB)、
4.80-4.64(m,6H,PMB)、4.51(d,1H,J=10.0赫兹,PMB)、3.73(s,3H,PMB)、3.71(s,6H,PMB)、
3.70(s,3H,PMB)。
[0916] 碳13核磁共振(125兆赫兹,CDCl3):δ=C197.3(CHO)、159.7(PMB)、159.6(2C,PMB)、159.2(PMB)、130.2(PMB)、130.0(PMB)、129.9(2C,PMB)、129.7(PMB)、129.6(PMB)、129.3(PMB)、128.6(PMB)、114.1(PMB)、114.0(3C,PMB)、97.5(C1’)、84.3,84.2,79.8(C3’)、
78.0,77.6,75.6(PMB)、75.5(PMB)、75.2(C4’)、75.1(PMB)、74.8(PMB)、62.8(C2’)、60.2(C1)、59.1,55.4(PMB)、55.3(PMB)、32.21(C2)。
[0917] 基体辅助激光解吸电离飞行时间质谱:对于C44H49N9O11([M+Na]+)的计算的m/e:902.3;测量的m/e:902.3。
[0918] 在0℃下向甲基三苯基碘化磷(70毫克,0.19毫摩尔浓度)在无水THF的一冷却的悬浮液中逐滴加入n-BuLi(在己烷中为1.6摩尔浓度,136微升),并且在0℃下将所述得到的黄色溶液再搅拌30分钟。然后在0℃下加入来自所述先前的步骤的在无水THF(0.3毫升)中的所述6’-醛(61毫克,0.069毫摩尔浓度),以及使所述反应在室温下再额外的搅拌1.5小时。如TLC(EtOAc/己烷2:3)所示,所述反应完成后,以饱和的NHCl溶液猝灭所述反应。分离所述多层,并且所述水层以乙醚(2×10毫升)萃取,以盐水洗涤所述多个合并的有机层,经无水硫酸镁干燥并蒸发至干燥。通过快速层析(EtOAc/己烷2.5:7.5)纯化所述粗产物,从而获得化合物20(27毫克,56%)。
[0919] 氢核磁共振(500兆赫兹,CDCl3):‘环I’:δ=H5.83-5.74(m,1H,H-6)、5.47(d,1H,J=4.0赫兹,H-1)、5.37(d,1H,J=16.5赫兹,H-7反式)、5.21(d,1H,J=9.5赫兹,H-7顺式)、4.49(dd,1H,J1=9.5,J2=7.5赫兹,H-5)、3.90(t,1H,J=9.5赫兹,H-3)、3.25-3.14(m,2H,H-2,H-4);‘环II’:δ=H3.54-3.44(m,2H,H-4,H-5)、3.38(ddd,1H,J1=12.0,J2=9.5,J3=
4.0赫兹,H-1)、3.34-3.25(m,2H,H-3,H-6)、2.21(dt,1H,J1=12.5,J2=4.0赫兹,H-2eq)、
1.38(ddd,1H,J1=J2=J3=12.5赫兹,H-2ax);所述光谱中的所述多个额外的波峰被辨识为如下:δ=H7.25-7.09(m,8H,PMB)、6.84-6.73(m,8H,PMB)、4.88(d,1H,J=10.0赫兹,PMB)、4.77(dd,2H,J=10.0,2.5赫兹,PMB)、4.74-4.66(m,3H,PMB)、4.59(d,1H,J=10.5赫兹,PMB)、4.52(d,1H,J=10.5赫兹,PMB)、3.73(s,3H,PMB)、3.72(s,6H,PMB)、3.71(s,3H,PMB)。
[0920] 碳13核磁共振(125兆赫兹,CDCl3):δ=C159.5(PMB)、159.4(2C、PMB)、159.2(PMB)、134.9(C6’)、130.3(PMB)、130.2(2C、PMB)、129.9(2C、PMB)、129.6(2C、PMB)、128.7(PMB)、118.8(C7’)、114.0(PMB)、113.9(2C、PMB)、97.6(C1’)、84.4、84.3、82.4(C4’)、79.4(C3’)、77.6、75.6(PMB)、75.3(PMB)、75.0(PMB)、74.6(PMB)、72.7(C5’)、63.4(C2’)、60.3(C1)、59.3、55.4(PMB)、55.3(PMB)、32.3(C2)。
[0921] 基体辅助激光解吸电离飞行时间质谱:对于C45H51N9O10([M+Na]+)的计算的m/e:900.9;测量的m/e:900.5。
[0922] 1-((2R,3S,4R,5R,6S)-5-叠氮基-6-(((1R,2R,3S,4R,6S)-4,6-二叠氮基-2,3-二((4-甲氧基苄基)氧基)环己基)氧基)-3,4-二((4-甲氧基芐基)氧基)四氢-2H-吡喃-2-基)乙烷-1,2-二醇(化合物21)的合成:向化合物20(383毫克,依次加入0.436毫摩尔浓度)在丙酮(5毫升)中的一搅拌溶液中加入水(1.5毫升)以及t-BuOH(5毫升)、K2OsO4·2H2O(16毫克,0.043毫摩尔浓度)以及NMO(181微升)。通过TLC(EtOAc/己烷2:3)监测所述反应的所述进程,所述TLC表示在24小时内完成。然后将所述溶剂蒸发至干燥;将所述残余物溶解于已加入Na2S2O3的一水溶液的EtOAc中。分离所述多层,以盐水洗涤所述有机相,以硫酸镁干燥并蒸发。将所述粗产物进行管柱层析(EtOAc/己烷1:1),从而获得化合物21(370毫克,93%),所述化合物21作为一个6’-非对映异构体混合物。
[0923] (2R,3S,4R,5R,6S)-5-叠氮基-6-(((1R,2R,3S,4R,6S)-4,6-二叠氮基-2,3-二羟基环己基)氧基)-2-((R)-1,2-二羟乙基)四氢-2H-吡喃-3,4-二醇(化合物22)以及(2R,3S,4R,5R,6S)-5-叠氮基-6-(((1R,2R,3S,4R,6S)-4,6-二叠氮基-2,3-二羟基环己基)氧基)-
2-((S)-1,2-二羟基乙基)四氢-2H-吡喃-3,4-二醇(化合物23)的合成:在室温下在二氯甲烷以及水(20:1体积/体积,15毫升)中将以上的化合物21(220毫克,1.0当量)与2,3-二氯-
5,6-二氰基-1,4-苯醌(DDQ)(383毫克,6当量)搅拌。在DDQ的所述加入后,立即形成一种深绿色的电荷转移复合物,并且随着所述反应的进行,缓慢地褪色成橙色。TLC(EtOAc/MeOH 
98:2)显示所述反应在15小时内完成。然后蒸发所述溶剂,以及将所述残余物加载到所述硅胶管柱上而无需事先处理。由于如题的所述化合物的高极性,所述管柱层析仅允许部分的所述DDQ反应副产物的所述去除。因此,为了获得所述分析上的纯产物,将包含所述产物的多个部分合并、蒸发,然后将所述残余物进行如下的过乙酰化以及脱乙酰化步骤。将以上的所述粗物质溶解于无水吡啶(5毫升)中,并且冷却至0℃。逐滴加入乙酸酐(0.73毫升,9当量),然后是4-DMAP(0.621克,6当量)的所述加入。如TLC(EtOAc/己烷2:3)所示,所述反应完成后(2小时),以EtOAc(20毫升)稀释所述反应物,并且以5%HCl溶液、饱和的NaHCO3以及盐水洗涤,并且以无水硫酸镁干燥。将所述溶剂蒸发至干燥,并将所述残余物进行管柱层析(EtOAc/己烷3:7),从而获得所述相应的过乙酸酯,作为6’-非对映异构体的一个不可分离的混合物(150毫克,两步骤为91%)。
[0924] 将以上的所述过乙酸酯(215毫克,0.314毫摩尔浓度)溶解于无水MeOH(5毫升)中,并且在室温下将NaOMe(152毫克,2.81毫摩尔浓度)一次性加入到所述搅拌的溶液中。通过TLC(EtOAc/MeOH 95:5)监测所述反应进程,所述TLC表示在4小时内完成。所述反应混合物通过一短硅胶柱,并且以MeOH洗脱所述产物,带有所述化合物的多个部分被合并、蒸发,并将述粗产物进行一额外的管柱层析(EtOAc/MeOH 99:1),所述管柱层析允许所述两个非对映异构体:所述主要(Rf=0.36)以及次要(Rf=0.2)的完全分离。如下所述,所述主要非对映异构体后来被指定为6’-(R)-非对映异构体(化合物22),而所述次要异构体为6’-(S)-非对映异构体(化合物23)。
[0925] 主要非对映异构体(22):氢核磁共振(500兆赫兹,MeOD):‘环I’:δ=H5.68(d,1H,J=4.0赫兹,H-1)、4.04(dd,1H,J1=9.5,J2=4.0赫兹,H-4)、3.97-3.92(m,1H,H-6)、3.93(t,1H,J=10.0赫兹,H-3)、3.79(dd,1H,J=11.5,3.5赫兹,H-7)、3.70(dd,1H,J1=11.5,J2=7.0赫兹,H-7)、3.58(t,1H,J=9.5赫兹,H-5)、3.13(dd,1H,J1=10.0,J2=4.0赫兹,H-2);‘环II’:δ=H3.57-3.47(m,3H,H-3,H-4,H-5)、3.44(ddd,1H,J1=16.5,J2=8.5,J3=
4.0赫兹,H-1)、3.29(t,1H,J=9.5赫兹,H-6)、2.26(dt,1H,J1=12.5,J2=4.0赫兹,H-
2eq)、1.43(ddd,1H,J1=J2=J3=12.5赫兹,H-2ax)。
[0926] 碳13核磁共振(125兆赫兹,MeOD):δ=C99.1(C1')、80.5、77.9(C6)、77.9、74.8(C6')、73.7(C4')、72.9(C5')、72.3(C3')、64.5(C2')、64.3(C7')、61.7(C1)、61.0、33.3(C2)
[0927] 基体辅助激光解吸电离飞行时间质谱:对于C13H27N3O8([M+H]+)的计算的m/e:432.3;测量的m/e:432.8。
[0928] 次要非对映异构体(23):氢核磁共振(500兆赫兹,MeOD):环I’:δ=H5.72(d,1H,J=3.6赫兹,H-1)、4.00(ddd,1H,J1=6.8,J2=6.0,J3=1.1赫兹,H-6)、3.97-3.91(m,2H,H-5,H-3)、3.74-3.67(m,2H,H-7,H-7)、3.64-3.59(m,1H,H-4)、3.10(dd,1H,J1=10.5,J2=
3.7赫兹,H-1);‘环II’:δ=H3.57-3.50(m,2H,H-1,H-6)、3.45-3.37(m,2H,H-3,H-4)、3.26(t,1H,J=9.5赫兹,H-5)、2.24(dt,1H,J1=12.8,J2=4.4赫兹,H-2eq)、1.40(ddd,1H,J1=J2=J3=12.5赫兹,H-2ax)。
[0929] 碳13核磁共振(125兆赫兹,MeOD):δ=C99.1(C-1')、80.1(C-4)、78.0(C-6)、77.8(C-5)、73.1(C-5')、72.3(C-3')、71.3(C-4')、70.8(C-6’)、65.3(C-7')、64.4(C-2')、61.7(C-3)、61.1(C-1)、33.3(C-2)。
[0930] 基体辅助激光解吸电离飞行时间质谱:对于C13H27N3O8([M+H]+)的计算的m/e:432.3;计算的m/e 432.8。
[0931] (2R,3S,4R,5R,6S)-5-氨基-6-(((1R,2R,3S,4R,6S)-4,6-二氨基-2,3-二羟基环己基)氧基)-2-((R)-1,2-二羟基乙基)四氢-2H-吡喃-3,4-二醇[NB153((R)-非对映异构体)]:向化合物22(82毫克,0.19毫摩尔浓度)在THF(3毫升)以及NaOH水溶液(1毫摩尔浓度,5毫升)中的一搅拌溶液中加入PMe3(在0.15mL,2.5毫摩尔浓度的THF溶液中为1摩尔浓度)。
通过TLC[CH2Cl2/MeOH/H2O/MeNH2(在EtOH中为33%的溶液),10:15:6:15]监测所述反应进程,所述TLC表示在1小时内完成。此后在一短硅胶柱上通过快速层析纯化所述反应混合物,用以下的溶剂洗涤所述管柱:THF(100毫升)、CH2Cl2(100毫升)、EtOH(50毫升)以及MeOH(100毫升)。然后以在80%MeOH中的5%MeNH2溶液(在EtOH中为33%溶液)的一混合物洗脱所述产物。将多个包含所述产物的部分合并,并且在真空下蒸发。通过将上述产物通过一短柱Amberlite CG50(NH4+形式)获得所述纯产物。首先,以水洗涤所述管柱,然后以在水中的
10%NH4OH的一混合物洗脱所述产物,从而获得NB153(49.0毫克,73%)。对于储存和生物测试,将NB153转化为其硫酸盐形式,如下:将所述游离碱的形式溶解于水中,以硫酸镁(0.1当量浓度)将所述pH调节至6.7,并且冻干以提供白色泡沫状的NB153的所述硫酸盐固体。
[0932] 氢核磁共振(500兆赫兹,MeOD,-NH2形式):‘环I’:δ=H5.18(d,1H,J=4.0赫兹,H-1)、3.98-3.93(m,1H,H-6)、3.90(dd,1H,J1=10.0,J2=4.0赫兹,H-4)、3.76(dd,1H,J1=
11.5,J2=4.0赫兹,H-7)、3.70(dd,1H,J1=11.5,J2=6.0赫兹,H-7)、3.51(t,1H,J=10.0赫兹,H-3)、3.44(m,1H,H-5)、2.74(dd,1H,J1=10.0,J2=4.0赫兹,H-2);‘环II’:δ=H3.43(t,1H,J=9.0赫兹,H-5)、3.20(t,1H,J=9.0赫兹,H-4)、3.10(t,1H,J=9.5赫兹,H-6)、
2.77(ddd,1H,J1=10.5,J2=9.0,J3=5.0赫兹,H-3)、2.66(ddd,1H,J1=10.5,J2=9.5,J3=5.0赫兹,H-1)、2.02(dt,1H,J1=12.5,J2=4.0赫兹,H-2eq)、1.22(ddd,1H,J1=J2=J3=12.5赫兹,H-2ax)。
[0933] 碳13核磁共振(125兆赫兹,MeOD):δC102.9(C-1’)、90.0(C-4)、78.2(C-6)、77.5,75.6(C-3’)、74.3(C-4’)、73.6(C-6’)、73.3,63.3(C-7’)、57.1(C-2’)、52.4(C-3)、51.3(C-
1)、36.7(C2)。
[0934] 基体辅助激光解吸电离飞行时间质谱:对于C13H27N3O8([M+H]+)的计算的m/e:354.3;测量的m/e:354.8。
[0935] (2R,3S,4R,5R,6S)-5-氨基-6-(((1R,2R,3S,4R,6S)-4,6-二氨基-2,3-二羟基环己基)氧基)-2-((S)-1,2-二羟乙基)四氢-2H-吡喃-3,4-二醇[NB155((S)-非对映异构体)]的生成:向化合物23(52毫克,0.12毫摩尔浓度)在THF(3毫升)以及NaOH水溶液(1毫摩尔浓度,5毫升)中的一搅拌溶液中加入PMe3(在0.15毫升,2.5毫摩尔浓度的THF溶液中为1摩尔浓度)。通过TLC[CH2Cl2/MeOH/H2O/MeNH2(在EtOH中为33%的溶液),10:15:6:15]监测所述反应进程,所述TLC表示在1小时内完成。此后在一短硅胶柱上通过快速层析纯化所述反应混合物,用以下的溶剂洗涤所述管柱:THF(100毫升)、CH2Cl2(100毫升)、EtOH(50毫升)以及MeOH(100毫升)。然后以在80%MeOH中的5%MeNH2溶液(在EtOH中为33%溶液)的一混合物洗脱所述产物。将多个包含所述产物的部分合并,并且在真空下蒸发。通过将上述产物通过一短柱Amberlite CG50(NH4+形式)获得所述纯产物。首先,以水洗涤所述管柱,然后以在水中的10%NH4OH的一混合物洗脱所述产物,从而获得NB155(36.0毫克,78%)。对于储存和生物测试,将NB155转化为其硫酸盐形式,如下:将所述游离碱的形式溶解于水中,以硫酸镁(0.1当量浓度)将所述pH调节至6.7,并且冻干以提供白色泡沫状的NB155的所述硫酸盐固体。
[0936] 氢核磁共振(500兆赫兹,MeOD,-NH2形式):‘环I’:δ=H5.28(d,1H,J=3.8赫兹,H-1’)、3.97(td,1H,J1=7.1,J2=1.0赫兹,H-6’)、3.89-3.82(m,1H,H-4’)、3.63(d,2H,J=
7.2赫兹,H-7’,H-7’)、3.59-3.51(m,2H,H-5’,H-3’)、2.72(m,1H,H-2’);‘环II’:δ=H3.41(t,1H,J=9.1赫兹,H-5)、3.20(t,1H,J=9.2赫兹,H-4)、3.08(t,1H,J=9.4赫兹,H-6)、
2.74(m,1H,H-3)、2.64(ddd,1H,J1=12.2,J2=9.7,J3=4.1赫兹,H-1)、2.00(dt,1H,J1=
12.9,J2=4.1赫兹,H-2eq)、1.21(ddd,1H,J1=J2=J3=12.3赫兹,H-2ax)。
[0937] 碳13核磁共振(125兆赫兹,MeOD):δ=C102.9(C-1’)、89.6(C-4)、79.0(C-6)、77.9(C-5)、75.8(C-3’)、72.3(C-4’)、71.1(C-5’)、70.2(C-6’)、63.2(C-7’)、57.1(C-2’)、52.4(C-1)、51.4(C-3)、37.7(C-2)。
[0938] 基体辅助激光解吸电离飞行时间质谱:对于C13H27N3O8([M+H]+)的计算的m/e:354.3;测量的m/e:354.8。
[0939] 假三糖NB156以及NB157的多个合成:
[0940] 多个化合物NB156以及NB157的所述多个合成在以下的方案9中说明,并且通过使用与NB153以及NB155基本上相同的多个化学转化,从所述中间体化合物22实现所述多个化合物NB156以及NB157的所述多个合成。
[0941] 方案9
[0942]
[0943] 多个试剂及多个条件:(i)Ac2O、Py.,-20℃,53%;(ii)BF3-OEt2、CH2Cl2,-30℃,85%of 27,93%of 28;(iii)(a)MeNH2,室温(r.t.),80%(R=H),98%(R=CH3);(b)PMe3、THF、NaOH(0.1M)、60%of NB156、64%of NB157。
[0944] 简要地,在低温下以Ac2O对化合物22的区域选择性乙酰化得到所述相应的C5受体化合物24。为了24的所述糖基化,所述多个三氯乙酸酯供体25以及26分别以85%和93%的分离产率提供所述相应的假三糖27以及28,仅作为β-端基异构体。以甲胺处理后进行施陶丁格反应以得到NB156以及NB157。
[0945] NB156的合成:
[0946] (2R,3S,4R,5R,6S)-6-(((1R,2S,3S,4R,6S)-3-乙酰氧基-4,6-二叠氮基-2-羟基环己基)氧基)-5-叠氮基-2-((R)-1,2-二乙酰氧乙基)四氢-2H-吡喃-3,4-二基二乙酸酯(24):将化合物22(370毫克,0.857毫摩尔浓度)溶解于无水吡啶(8毫升)中并且冷却至-20℃。逐滴加入乙酸酐(0.45毫升,4.8毫摩尔浓度)并使所述反应能在-20℃下进行。通过TLC监测所述反应进程,所述TLC表示在17小时内完成。以EtOAc稀释所述反应混合物,并且以HCl水溶液(2%)、饱和NaHCO3水溶液以及盐水萃取。将所述多个合并的有机层以无水硫酸镁干燥并浓缩。通过硅胶管柱层析(EtOAc/己烷3:7)纯化所述粗产物,得到化合物24(292毫克,53%产率)。
[0947] 氢核磁共振(500兆赫兹,CDCl3):‘环I’:δ=H5.45(dd,1H,J1=10.5,J2=9.3赫兹,H-3’)、5.37(d,1H,J=3.5赫兹,H-1’)、5.19(ddd,1H,J1=7.6,J2=4.0,J3=2.0赫兹,H-6’)、5.07(dd,1H,J1=10.4,J2=9.2赫兹,H-4’)、4.40(dd,1H,J1=10.5,J2=1.8赫兹,H-5’)、4.31(dd,1H,J1=12.0,J2=4.1赫兹,H-7’)、4.19-4.08(m,1H,H-7’)、3.63-3.56(m,1H,H-2’);‘环II’:δ=H4.91(dd,1H,J1=12.8,J2=7.1赫兹,H-6)3.66(td,1H,J1=9.6,J2=3.5赫兹,H-5)、3.53(ddd,1H,J1=12.4,J2=10.1,J3=4.5赫兹,H-1)、3.45(dd,1H,J1=
19.1,J2=9.2赫兹,H-4)、3.38-3.31(m,1H,H-3)、2.38(dt,1H,J1=13.2,J2=4.4赫兹,H-
2eq)、1.58(ddd,1H,J1=J2=J3=12.6赫兹,H-2ax)。所述光谱中的所述多个额外的波峰被辨识为如下:δ=H2.17(s,3H,CH3CO)、2.08(d,9H,J=1.5赫兹,CH3CO)、2.04(s,3H,CH3CO)。
[0948] 碳13核磁共振(125兆赫兹,CDCl3):δ=C170.7(C=O)、170.6(C=O)、170.2(C=O)、170.0(C=O)、169.9(C=O)、98.5(C-1’)、82.9(C-4)、75.1(C-6)、74.6(C-5)、71.4(C-3’)、70.0(C-6’)、69.9(C-5’)、68.9(C-4’)、61.8(C-7’)、61.5(C-2’)、58.2(C-3)、58.0(C-
1)、32.0(C-2)、20.96(CH3)、20.92(CH3)、20.89(CH3)、20.86(CH3)、20.8(CH3)、20.7(CH3)。
[0949] 基体辅助激光解吸电离飞行时间质谱:对于C23H31N9O13([M+Na]+)的计算的m/e:664.20;测量的m/e:664.20。
[0950] (2S,3S,4S,5R)-2-(((1S,2S,3R,5S,6R)-2-乙酰氧基-3,5-二叠氮基-6-(((2S,3R,4R,5S,6R)-4,5-二乙酰氧基-3-叠氮基-6-((R)-1,2-二乙酰氧基乙基)四氢-2H-吡喃-
2-基)环己基)氧基)-5-(叠氮甲基)四氢呋喃-3,4-二基二苯甲酸酯(27):将无水CH2Cl2(15毫升)加入至一粉末状火焰干燥的4埃的分子筛(2.0克)中,随后加入受体化合物24(292毫克,0.455毫摩尔浓度)以及供体化合物25(1.0克,1.9毫摩尔浓度)。将所述反应混合物在室温下搅拌10分钟,然后冷却至-30℃。加入催化量的BF3-Et2O(50微升),并且在-30℃下搅拌所述混合物;通过TLC监测所述反应进程,所述TLC表示在60分钟内完成。以乙酸乙酯稀释所述反应混合物,并且以饱和NaHCO3以及盐水洗涤。将所述合并的有机层以硫酸镁干燥、蒸发,并且进行管柱层析(EtOAc/己烷)以获得所述化合物27(393毫克,85%产率)。
[0951] 氢核磁共振(500兆赫兹,CDCl3):’环I’:δ=H5.87(d,1H,J=3.8赫兹,H-1)、5.42-5.34(m,1H,H-3)、5.24-5.13(m,1H,H-6)、5.10-5.03(m,1H,H-4)、4.54(dd,1H,J1=10.5,J2=2.2赫兹,H-5)、4.33(dd,1H,J1=12.0,J2=4.1赫兹,H-7)、4.20(dd,1H,J1=11.9,J2=
7.8赫兹,H-7)、3.50(dd,1H,J1=10.9,J2=3.8赫兹,H-2);‘环II’:δ=H5.01(t,1H,J=
10.0赫兹,H-6)、3.87(t,1H,J=9.3赫兹,H-5)、3.71(t,1H,J=9.5赫兹,H-4)、3.57-3.48(m,2H,H-1,H-3)、2.38(dt,1H,J1=12.9,J2=4.3赫兹,H-2eq)、1.52(ddd,1H,J1=J2=J3=12.7赫兹,H-2ax);‘环III’:δ=H5.61(s,1H,H-1)、5.57(d,1H,J=4.7赫兹,H-2)、5.42-
5.35(m,1H,H-3)、4.59-4.47(m,1H,H-4)、3.63-3.55(m,2H,H-5,H-5)。所述光谱中的所述多个额外的波峰被辨识为如下:δ=H7.93(d,2H,J=7.1赫兹,Ar)、7.87(d,2H,J=7.1赫兹,Ar)、7.54(dt,2H,J1=19.0,J2=7.4赫兹,Ar)、7.39(t,2H,J=7.8赫兹,Ar)、7.34(t,2H,J=7.8赫兹,Ar)、2.29(s,3H,CH3)、2.08-2.04(m,12H,4xCH3)。
[0952] 碳13核磁共振(125兆赫兹,CDCl3):δ=C170.7(C=O)、170.1(C=O)、170.08(C=O)、170.06(C=O)、169.9(C=O)、165.5(Ar)、165.2(Ar)、133.8(Ar)、133.7(Ar)、129.8(Ar)、129.7(Ar)、128.8(Ar)、128.68(Ar)、128.63(Ar)、128.5(Ar)、107.7(C-1”)、96.1(C-1’)、80.9(C-4”)、79.8(C-5)、77.2(C-4)、74.5(C-2”)、73.9(C-6)、72.0(C-3’)、70.7(C-
3”)、69.9(C-6’)、69.2(C-5’)、68.8(C-4’)、61.5(C-7’)、61.4(C-2’)、58.9(C-3)、58.3(C-
1)、53.1(C-5”)、32.1(C-2)、21.04(CH3)、21.03(CH3)、20.8(CH3)、20.7(CH3)、20.6(CH3)。
[0953] 基体辅助激光解吸电离飞行时间质谱:对于C42H46N12O18([M+Na]+)的计算的m/e:1029.31;测量的m/e:1029.29。
[0954] (2R,3S,4R,5R,6S)-氨基-6-(((1R,2R,3S,4R,6S)-4,6-二氨基2-(((2S,3S,4R,5R)-5-(氨基甲基)-3,4-二羟基四氢呋喃-2-基)氧基)-3-羟基环己基)氧基)-2-((R)-1,2-二羟基乙基)四氢-2H-吡喃-3,4-二醇(NB156):以MeNH2(在EtOH中33%的溶液,15毫升)的一溶液处理所述糖基化产物27(393毫克0.390毫摩尔浓度),通过TLC监测所述反应进程(EtOAc/MeOH 85:15),所述TLC表示在12小时内完成。将所述反应混合物蒸发至干燥,并且进行管柱层析(MeOH/EtOAc 2:8),从而得到产率为80%的所述相应的完全地脱酯化的过叠氮基衍生物(183毫克)。
[0955] 氢核磁共振(500兆赫兹,MeOD):‘环I’:δ=H5.89(d,1H,J=3.8赫兹,H-1)、3.97(dd,1H,J1=9.7,J2=4.6赫兹,H-5)、3.84(dd,2H,J1=12.0,J2=7.1赫兹,H-6,H-3)、3.69(d,1H,J=8.5赫兹,H-7)、3.60(dd,1H,J1=11.6,J2=6.4赫兹,H-7)、3.45(dd,1H,J1=10.0,J2=8.7赫兹,H-4)、3.06(dd,1H,J1=10.6,J2=4.4赫兹,H-2);‘环II’:δ=H3.62-
3.54(m,2H,H-4,H-5)、3.50-3.43(m,1H,H-3)、3.40-3.33(m,1H,H-1)、3.33-3.26(m,1H,H-
6)、2.12(dt,1H,J1=13.3,J2=4.4赫兹,H-2eq)、1.29(ddd,1H,J1=J2=J3=12.4赫兹,H-
2ax);‘环III’:δ=H5.28(d,1H,J=0.8赫兹,H-1)、4.11(dd,1H,J1=4.4,J2=0.8赫兹,H-
2)、3.98(dd,1H,J1=7.4,J2=4.2赫兹,H-3)、3.94(dd,1H,J1=7.0,J2=3.4赫兹,H-4)、
3.49(dd,1H,J1=13.3,J2=2.8赫兹,H-5)、3.41(dd,1H,J1=13.1,J2=6.3赫兹,H-5)。
[0956] 碳13核磁共振(125兆赫兹,MeOD):δ=C111.2(C-1”)、97.4(C-1’)、85.2(C-4)、82.3(C-5’)、77.6(C-6)、76.8(C-5)、76.3(C-2”)、74.6(C-6’)、73.3(C-3”)、73.2(C-4’)、
72.7(C-4”)、72.5(C-3’)、64.7(C-2’)、64.1(C-7’)、61.9(C-3)、61.4(C-1)、54.5(C-5”)、
33.1(C-2)。
[0957] 基体辅助激光解吸电离飞行时间质谱:对于C18H28N12O11([M+Na]+)的计算的m/e:611.20;测量的m/e:611.19。
[0958] 向来自上述反应的过叠氮基衍生物(183毫克,0.311毫摩尔浓度)在THF(3毫升)以及NaOH水溶液(1毫摩尔浓度,5毫升)中的一混合物中加入PMe3(在0.22毫升,3.0毫摩尔浓度的THF溶液中为1摩尔浓度)。通过TLC[CH2Cl2/MeOH/H2O/MeNH2(在EtOH中为33%的溶液),10:15:6:15]监测所述反应进程,所述TLC表示在1小时内完成。此后在一短硅胶柱上通过快速层析纯化所述反应混合物,用以下的溶剂洗涤所述管柱:THF(100毫升)、CH2Cl2(100毫升)、EtOH(50毫升)以及MeOH(100毫升)。然后以在80%MeOH中的5%MeNH2溶液(在EtOH中为
33%溶液)的一混合物洗脱所述产物。将多个包含所述产物的部分合并,并且在真空下蒸发。通过将上述产物通过一短柱Amberlite CG50(NH4+形式)获得所述纯产物。首先,以水洗涤所述管柱,然后以在水中的10%NH4OH的一混合物洗脱所述产物,以获得NB156(90毫克,
60%)。
[0959] 对于储存和生物测试,将NB156转化为其硫酸盐形式,如下:将所述游离碱的形式溶解于水中,以硫酸镁(0.1当量浓度)将所述pH调节至6.7,并且冻干以提供白色泡沫状的NB156的所述硫酸盐固体。
[0960] 氢核磁共振(500兆赫兹,MeOD):‘环I’:δ=H5.18(d,1H,J=3.6赫兹,H-1)、3.91(dt,1H,J1=6.3,J2=3.9赫兹,H-6)、3.85(dd,1H,J1=10.2,J2=2.8赫兹,H-5)、3.70(dd,1H,J1=11.5,J2=3.7赫兹,H-7)、3.64(dd,1H,J1=11.5,J2=6.4赫兹,H7)、3.50(dd,1H,J1=10.0,J2=9.0赫兹,H-3)、3.40(t,1H,J=9.5赫兹,H-4)、2.60(dd,1H,J=10.2,3.3赫兹,H-2);‘环II’:δ=H3.44(t,1H,J=9.2赫兹,H-5)、3.33(dd,1H,J1=11.0,J2=7.6赫兹,H-4)、3.13(t,1H,J=9.5赫兹,H-6)、2.79-2.70(m,1H,H-3)、2.60(td,1H,J1=9.4,J2=4.4赫兹,H-1)、1.93(dt,1H,J1=13.0,J2=4.0赫兹,H-2eq)、1.16(ddd,1H,J1=J2=J3=12.4赫兹,H-2ax);‘环III’:δ=H5.20(d,1H,J=2.7赫兹,H-1)、4.04(dd,1H,J1=5.1,J2=2.8赫兹,H-2)、3.95-3.90(m,1H,H-3)、3.83(dt,1H,J1=5.3,J2=3.4赫兹,H-4)、2.89(dd,1H,J1=13.2,J2=4.0赫兹,H-5)、2.75(dd,1H,J1=13.2,J2=7.3赫兹,H-5)。
[0961] 碳13核磁共振(125兆赫兹,MeOD):δ=C110.6(C-1”)、101.7(C-1’)、86.8(C-4)、85.5(C-5)、84.7(C-4”)、78.8(C-6)、76.2(C-2”)、75.3(C-3’)、74.7(C-5’)、73.8(C-6’)、
73.0(C-4’)、72.5(C-3”)、63.4(C-7’)、57.5(C-2’)、52.5(C-3)、52.3(C-1)、45.2(C-5”)、
37.5(C-2)。
[0962] 基体辅助激光解吸电离飞行时间质谱:对于C18H36N4O11([M+H]+计算的m/e 485.24;测量的m/e:485.19。
[0963] NB157的合成:
[0964] (2S,3S,4S,5R)-2-(((1S,2S 3R,5S,6R)-2-乙酰氧基-3,5-二叠氮基-6(((2S,3R,4R,5S,6R)-4,5-二乙酰氧基-3-叠氮基-6-((R)-1,2-二乙酰氧基乙基)四氢-2H-吡喃-2-基)氧基)环己基)氧基)-5-((S)-1-叠氮基乙基)四氢呋喃-3,4-二基二苯甲酸酯(化合物
28):将无水CH2Cl2(15毫升)加入至一粉末状火焰干燥的4埃的分子筛(2.0克)中,随后加入受体化合物24(265毫克,0.413毫摩尔浓度)以及供体化合物26(0.895克,1.65毫摩尔浓度)。将所述反应混合物在室温下搅拌10分钟,然后冷却至-30℃。加入催化量的BF3-Et2O(50微升),并且在-30℃下搅拌所述混合物;通过TLC监测所述反应进程,所述TLC表示在60分钟内完成。以乙酸乙酯稀释所述反应混合物,并且以饱和NaHCO3以及盐水洗涤。将所述合并的有机层以硫酸镁干燥、蒸发,并且进行管柱层析(EtOAc/己烷)以获得产率为93%的所述化合物28(393毫克)。
[0965] 氢核磁共振(600兆赫兹,CDCl3):’环I’:δ=H5.88(d,1H,J=4.0赫兹,H-1)、3.58(dd,1H,J1=10.7,J2=4.0赫兹,H-2)、5.36(dd,1H,J1=10.6,J2=9.3赫兹,H-3)、5.07(dd,1H,J1=10.5,J2=9.3赫兹,H-4)、4.53(dd,1H,J1=10.6,J2=2.2赫兹,H-5)、5.18(ddd,1H,J1=7.5,J2=4.1,J3=2.2赫兹,H-6)、4.33(dd,1H,J1=12.0,J2=3.9赫兹,H-7)、4.19(dd,1H,J1=12.1,J2=7.6赫兹,H-7);‘环II’:δ=H5.01(t,1H,J=9.9赫兹,H-6)、
3.84(t,1H,J=9.4赫兹,H-5)、3.71(t,1H,J=9.5赫兹,H-4)、3.52(ddd,2H,J1=12.5,J2=
10.0,J3=4.6赫兹,H-1,H-3)、2.39(dt,1H,J1=5.2,J2=4.5赫兹,H-2eq)、1.52(ddd,1H,J1=J2=J3=12.7赫兹,H-2ax);‘环III’:δ=H5.60(t,2H,J=2.3赫兹,H-1,H-2)、5.41(dd,1H,J1=7.6,J2=4.9赫兹,H-3)、4.33(t,1H,J=7.3赫兹,H-4)、3.77-3.64(m,1H,H-
5)、1.24(d,3H,J=6.8赫兹,6-CH3)。所述光谱中的所述多个额外的波峰被辨识为如下:δ=H7.92-7.89(m,2H,Ar)、7.89-7.85(m,2H,Ar)、7.60-7.50(m,2H,Ar)、7.39(t,2H,J=7.8赫兹,Ar)、7.34(t,2H,J=7.9赫兹,Ar)、2.41-2.35(m,3H,CH3)、2.08(s,3H,CH3)、2.07(s,3H,CH3)、2.07(s,3H,CH3)、2.05(s,3H,CH3)。
[0966] 碳13核磁共振(151兆赫兹,CDCl3):δ=C170.7(C=O)、170.3(C=O)、170.07(C=O)、170.03(C=O)、169.9(C=O)、165.5(Ar)、165.0(Ar)、133.8(Ar)、133.7(Ar)、129.8(Ar)、129.7(Ar)、128.8(Ar)、128.6(Ar)、128.58(Ar)、128.56(Ar)、107.8(C-1”)、96.1(C-1’)、84.6(C-4”)、79.7(C-5)、77.6(C-4)、74.7(C-2”)、73.7(C-6)、72.0(C-3”)、71.0(C-3)、
70.0(C-6’)、69.2(C-4’)、68.9(C-5’)、61.7(C-2’)、61.5(C-7’)、59.6(C-5”)、58.9(C-1)、
58.5(C-3)、32.2(C-2)、21.1(CH3)、21.0(CH3)、20.8(CH3)、20.79(CH3)、20.78(CH3)、15.8(C-
6”、CH3)。
[0967] 基体辅助激光解吸电离飞行时间质谱:对于C43H48N12O18([M+Na]+)的计算的m/e:1043.32;测量的m/e:1043.30。
[0968] (2R,3S,4R,5R,6S)-5-氨基-6-(((1R,2R,3S,4R,6S)-4,6-二氨基-2-(((2S,3S,4R,5R)-5-((S)-1-氨基乙基)-3,4-二羟基四氢呋喃-2-基)氧基)-3-羟基环己基)氧基)-2-((R)-1,2-二羟基乙基)四氢-2H-吡喃-3,4-二醇(NB157):以MeNH2(33%的EtOH溶液,15毫升)的一溶液处理糖基化产物化合物28(0.393克,0.384毫摩尔浓度),通过TLC(EtOAc/MeOH 
85:15)监测所述反应进程,所述TLC表示在12小时内完成。将所述反应混合物蒸发至干燥并进行管柱层析(MeOH/EtOAc 2:8)以98%的产率得到所述相应的完全地脱酯化的过叠氮基衍生物(230毫克)。
[0969] 氢核磁共振(600兆赫兹,MeOD):‘环I’:δ=H5.98(d,1H,J=3.8赫兹,H-1)、3.11(dd,1H,J1=10.5,J2=3.8赫兹,H-2)、4.03(dd,1H,J1=9.7,J2=4.5赫兹,H-4)、3.96-3.88(m,2H,H-3,H-6)、3.50(dd,1H,J1=10.0,J2=8.8赫兹,H-5)、3.75(dd,1H,J1=11.2,J2=2.5赫兹,H-7)、3.66(dd,1H,J1=11.6,J2=6.5赫兹,H-7);‘环II’:δ=H3.69-3.64(m,
1H,H-4)、3.60(t,1H,J=8.9赫兹,H-5)、3.52(ddd,1H,J1=12.3,J2=9.7,J3=4.4赫兹,H-
3)、3.42(ddd,1H,J1=11.9,J2=9.7,J3=4.4赫兹,H-1)、3.38-3.33(m,1H,H-6)、2.18(dt,
1H,J1=12.6,J2=4.4赫兹,H-2eq)、1.52-1.17(m,1H,H-2ax);‘环III’:δ=H5.31(d,1H,J=0.5赫兹,H-1)、4.17(dd,1H,J1=4.8,J2=0.6赫兹,H-2)、4.10(dd,1H,J1=7.2,J2=4.7赫兹,H-3)、3.78-3.70(m,1H,H-4)、3.69-3.57(m,1H,H-5)、1.33(d,3H,J=6.7赫兹,6-CH3)。
[0970] 碳13核磁共振(151兆赫兹,MeOD):δ=C110.79(C-1”)、97.41(C-1’)、86.03(C-4”)、85.24(C-5)、77.47(C-6)、76.76(C-4)、76.47(C-2”)、74.60(C-6’)、73.42(C-3)、73.31(C-4’)、72.77(C-3”)、72.60(C-3’)、64.66(C-2’)、64.13(C-7’)、61.96(C-1)、61.51(C-
5’)、60.86(C-5”)、33.17(C-2)、16.06(C-6”,CH3)。
[0971] 基体辅助激光解吸电离飞行时间质谱:对于C19H30N12O11([M+Na]+)的计算的m/e:625.22;测量的m/e:625.20。
[0972] 向来自上述反应的过叠氮基衍生物(230毫克,0.381毫摩尔浓度)在THF(3毫升)以及NaOH水溶液(1毫摩尔浓度,5毫升)中的一混合物中加入PMe3(在0.22毫升,3.0毫摩尔浓度的THF溶液中为1摩尔浓度)。通过TLC[CH2Cl2/MeOH/H2O/MeNH2(在EtOH中为33%的溶液),10:15:6:15]监测所述反应进程,所述TLC表示在1小时内完成。此后在一短硅胶柱上通过快速层析纯化所述反应混合物,用以下的溶剂洗涤所述管柱:THF(100毫升)、CH2Cl2(100毫升)、EtOH(50毫升)以及MeOH(100毫升)。然后以在80%MeOH中的5%MeNH2溶液(在EtOH中为
33%溶液)的一混合物洗脱所述产物。将多个包含所述产物的部分合并,并且在真空下蒸+
发。通过将上述产物通过一短柱Amberlite CG50(NH4形式)获得所述纯产物。首先,以水洗涤所述管柱,然后以在水中的10%NH4OH的一混合物洗脱所述产物,以获得NB157(123毫克,
64%)。
[0973] 对于储存和生物测试,如下将NB157转化成其硫酸盐形式:将游离碱形式溶解于水中,用硫酸镁(0.1N)将所述pH调节至6.7并冻干以提供NB157的硫酸盐,为白色泡沫状固体。
[0974] 氢核磁共振(600兆赫兹,MeOD):‘环I’:δ=H5.25(d,1H,J=3.6赫兹,H-1)、4.00-3.94(m,1H,H-6)、3.90(dd,1H,J1=9.9,J2=3.5赫兹,H-5)、3.56-3.50(m,1H,H-3)、3.47(dd,1H,J1=18.3,J2=8.8赫兹,H-4)、2.66(dd,1H,J1=10.3,J2=3.5赫兹,H-2)、3.76(dd,1H,J1=11.5,J2=3.7赫兹,H-7)、3.70(dd,1H,J1=11.5,J2=6.4赫兹,H-7);‘环II’:
δ=H3.48(dd,1H,J1=15.9,J2=6.7赫兹,H-5)、3.37(dd,1H,J1=16.5,J2=7.2赫兹,H-
4)、3.18(dd,1H,J1=13.1,J2=5.6赫兹,H-6)、2.78(dd,1H,J1=9.9,J2=8.2赫兹,H-3)、
2.64(dd,1H,J1=22.9,J2=10.3赫兹,H-1)、1.96(dt,1H,J1=7.8,J2=3.7赫兹,H-2eq)、
1.23(ddd,1H,J1=J2=J3=12.5赫兹,H-2ax);‘环III’:δ=H5.26(d,1H,J=2.7赫兹,H-
1)、4.05(d,1H,J=1.8赫兹,H-2)、4.01(t,1H,J=5.7赫兹,H-3)、3.56(t,1H,J=6.3赫兹,H-4)、3.01-2.86(m,1H,H-5)、1.16(d,3H,J=6.4赫兹,6-CH3)。
[0975] 碳13核磁共振(151兆赫兹,MeOD):δ=C109.78(C-1”)、101.67(C-1’)、88.61(C-4”)、86.80(C-4)、84.86(C-5)、78.70(C-6)、76.28(C-2”)、75.46(C-3’)、74.72(C-5’)、
73.79(C-6’)、73.07(C-4’)、72.30(C-3”)、63.43(C-7’)、57.55(C-2’)、52.53(C-3)、52.35(C-1)、50.68(C-5”)、49.85(C-4)、37.64(C-2)、19.37(C-6”,CH3)。
[0976] 基体辅助激光解吸电离飞行时间质谱:计算值C19H38N4On([M+H]+)m/e 498.25;测量值m/e 499.26。
[0977] 测定NB153以及NB155的第6’位的绝对组态:
[0978] 为了测定NB153以及NB155中所述侧链C6’-醇的所述绝对立体化学,合成了所述的C6’-非对映异构体醇31,如方案10所示。
[0979] 方案10
[0980]
[0981] 在所述多个仲醇上的保护基的所述变化被认为将改善方案8中的所述途径中所经历的各种合成步骤中的所述中间产物的所述多个产率以及分离。方案10中所示的苄基保护替代了方案8中的所述PMB保护。因此,TIPS保护的化合物18a的所述苄基化后,以TBAF进行甲硅烷基去保护化,以提供总产率良好的所述6’-醇29。戴斯-马丁氧化剂(DMP)氧化作用提供了所述相应的醛,以维蒂希试剂处理所述相应的醛以提供所述末端烯烃30。接着进行二羟基化步骤,然后是所述伯醇的选择性苄基化,以得到所需的6’-醇31,作为两种6’-非对映异构体的一混合物。尝试通过以几种不同溶剂体系的柱色谱来分离所述混合物被证明是不成功的,并且发现在咪唑的所述存在下,以叔丁基二甲基氯硅烷(TBDMSCl)对所述混合物31的所述甲硅烷基化进行得非常缓慢,并且对所述主要的6'-非对映异构体具有选择性。利用所述优点,所述主要非对映异构体32的所述甲硅烷基化产物可以被分离出其纯的形式。以TBAF对32的处理制造所述期望的产物31,所述产物31是用于组态判定。
[0982] 为了判定在化合物31中的第6'位的所述绝对立体化学,所述主要非对映异构体31在存在DCC、4-DMAP以及CSA6的情况下个别地与(R)-2-甲氧基-2-(1-萘基)丙酸(R)-MαNP]33以及[(S)-MαNP]34的绝对立体化学结合,以得到如方案11中所示的所述相应的酯类(R,X)-MαNF 35以及(S,X)-MαNP 36。
[0983] 方案11
[0984]
[0985] ((2R,3S,4R,5R,6S)-5-叠氮基-3,4-二(苄氧基)-6-(((1R,2R,3S,4R,6S)-4,6-二叠氮基-2,3-二(苄氧基)环己基)氧基)四氢-2H-吡喃-2-基)甲醇(29):在0℃下向所述甲硅烷基醚化合物18a(0.2克,0.358毫摩尔浓度)以及氢化钠(0.114克,4.75毫摩尔浓度)在DMF(5毫升)溶液中的一搅拌溶液中加入对甲氧基氯化苄(0.255毫升,2.14毫摩尔浓度)。通过TLC(EtOAc/己烷3:7)监测所述反应进程。在8小时后完成所述反应,并且分成多个小部分地加入冰块以终止所述反应。以乙酸乙酯(30毫升)稀释所述混合物,并且以水(2×50毫升)洗涤。所述多个合并的水层以乙醚(2×50毫升)萃取;将所述多个合并的有机层以无水硫酸镁来干燥,并蒸发至干燥。通过管柱层析(EtOAc/己烷8:92)以纯化残余物,从而生产过苯甲基化的甲硅烷基醚(0.243克,74%)。
[0986] 氢核磁共振(500兆赫兹,CDCl3):‘环I’:δ=H5.46(d,1H,J=3.3赫兹,H-1)、3.97(dd,1H,J1=17.7,J2=8.2赫兹,H-3,H-5)、3.90(d,1H,J=11.6,H-6)、3.84(d,1H,J=11.0,H-6)、3.72-3.53(m,1H,H-4)、3.19(dd,1H,J1=10.6,J2=4.4赫兹,H-2);‘环II’:δ=H3.53(m,2H,H-4,H-5)、3.40(td,1H,J1=9.9,J2=5.3赫兹,H-1)、3.30(ddd,2H,J1=17.6,J2=15.1,J3=9.2赫兹,H-3,H-6)、2.21(dd,1H,J1=8.2,J2=4.2赫兹,H-2eq)、1.34(dt,
1H,J1=J2=J3=12.9赫兹,H-2ax);所述光谱中的所述多个额外的波峰被辨识为如下:δ=H7.28(m,20H,Bn)、4.94(m,2H,O(CH2)Bn)、4.80(m,6H,O(CH2)Bn)、1.14-0.95(m,21H,TIPS)。
[0987] 碳13核磁共振(125兆赫兹,CDCl3):δC138.54(Bn)、138.17(Bn)、138.03(Bn)、137.49(Bn)、128.61(Bn)、128.58(Bn)、128.55(Bn)、128.31(Bn)、128.28(Bn)、128.14(Bn)、
127.99(Bn)、127.78(Bn)、127.72(Bn)、127.10(Bn)、97.7(C1’)、84.8、84.62、80.2、
77.376.0、75.7、75.2、74.9、72.9、63.5(C2’)、62.3(C6)、60.4(C1)、59.5、32.5(C2)、18.2(TIPS)、18.1(TIPS)、12.1(TIPS)。
[0988] 在0℃下向从上述步骤的过苯甲基化的甲硅烷基醚化合物(9.24克,10.0毫摩尔浓度)在THF(100毫升)中的一搅拌溶液中加入TBAF(9.0毫升,31.0毫摩尔浓度),并且通过TLC(EtOAc/己烷2:3)监测所述反应进程。在15小时后,将所述溶剂蒸发至干燥,并且将所述得到的残余物进行管柱层析(EtOAc/己烷3:7),以获得所述相应的6’-醇(7.0克,91%)。
[0989] 氢核磁共振(500兆赫兹,CDCl3):‘环I’:δ=H5.60(d,1H,J=3.8赫兹,H-1)、4.11(d,1H,J=10.0赫兹,H-5)、4.05(t,1H,J=9.7赫兹,H-3)、3.83(dd,1H,J1=12.0,J2=2.0赫兹,H-6)、3.76(dd,1H,J1=12.1,J2=2.9赫兹,H-6)、3.69-3.57(m,1H,H-4)、3.28(dd,1H,J1=10.6,J2=4.6赫兹,H-2);‘环II’:δ=H3.60-3.57(m,2H,H-4,H-5)、3.55-3.46(m,
1H,H-1)、3.46-3.37(m,2H,H-3,H-6)、2.31(dt,1H,J1=13.2,J2=4.5赫兹,H-2eq)、1.47(ddd,1H,J1=J2=J3=10.6赫兹,H-2ax);所述光谱中的所述多个额外的波峰被辨识为如下:δ=H7.52-7.28(m,20H,Bn)、5.04(d,1H,J=10.8赫兹,O(CH2)Bn)、4.93(dd,2H,J1=
10.7,J2=6.0赫兹,O(CH2)Bn)、4.90-4.86(m,3H,O(CH2)Bn)、4.84(d,1H,J=10.5赫兹,O(CH2)Bn)、4.71(d,1H,J=11.2赫兹,O(CH2)Bn)。
[0990] 碳13核磁共振(125兆赫兹,CDCl3):δ=C138.0(Bn)、138.0(Bn)、137.8(Bn)、137.3(Bn)、128.6(Bn)、128.6(Bn)、128.5(Bn)、128.2(Bn)、128.1(Bn)、128.1(Bn)、128.0(Bn)、128.0(Bn)、127.7(Bn)、127.1(Bn)、97.7(C1’)、84.7、84.5、80.1(C3’)、77.6、77.5、76.0、
75.6、75.3、75.0、72.0(C5’)、63.4(C2’)、61.4(C6’)、60.3、59.4、32.4(C2)。
[0991] (2R,3R,4R,5R,6R)-3-叠氮基-4,5-二(苄氧基)-2-(((1R,2R,3S,4R,6S)-4,6-二叠氮-2,3-二(芐氧基)环己基)氧基)-6-乙烯基四氢-2H-吡喃(30):向6'-醇29(1.0克,1.31毫摩尔)在所述6’-醇29(1.0克,0.31毫摩尔浓度)在乙酸乙酯(5毫升)的一溶液中一次性加入IBX(95毫克,0.33毫摩尔浓度)。所述产生的悬浮液在80℃下加热并且剧烈地搅拌,如TLC(EtOAc/己烷2:3)所示,完成所述反应(3.5小时)后,将所述反应冷却至室温并且通过过滤。以乙酸乙酯(2×50毫升)彻底洗涤所述 以及在减压下蒸发所述多个合并的有机层。将所述粗产物进行快速管柱层析(EtOAc/己烷35:65),从而生产所述6’-醛(0.925毫克,92%)。
[0992] 氢核磁共振(500兆赫兹,CDCl3):‘环I’:δ=H9.62(s,1H,H-6(CHO))、5.62(s,1H,H-1)、4.69(d,1H,J=9.9赫兹,H-4)、4.01(t,1H,J=9.3赫兹,H-3)、3.56(dd,1H,J1=18.0,J2=9.1赫兹,H-5)、3.19(d,1H,J=14.0,H-2);‘环II’:δ=H3.56(dd,2H,J1=18.0,J2=9.1赫兹,H-4,H-5)、3.44(d,1H,J=11.7赫兹,H-1)、3.37(t,2H,J=8.2赫兹,H-3,H-6)、
2.28(d,1H,J1=10.2赫兹,H-2eq)、1.44(ddd,1H,J1=J2=J3=14.0赫兹,H-2ax);所述光谱中的所述多个额外的波峰被辨识为如下:δ=H7.27(m,20H,Bn)、5.00(d,1H,J=10.9赫兹,O(CH2)Bn)、4.92-4.75(m,6H,O(CH2)Bn)、4.63(d,1H,J=10.7赫兹,O(CH2)Bn)。
[0993] 碳13核磁共振(125兆赫兹,CDCl3):δ=C197.2(CHO)、138.0(Bn)、137.5(Bn)、137.3(Bn)、137.1(Bn)、128.7(Bn)、128.6(Bn)、128.6(Bn)、128.6(Bn)、128.3(Bn)、128.3(Bn)、128.2(Bn)、128.1(Bn)、97.6(C1’)、84.6、84.3、80.1(C3’)、78.4、77.7、76.1、75.8、
75.3、75.2、62.8(C2’)、60.3、59.1(C1)、32.2(C2)。
[0994] 在0℃下向甲基三苯基碘化磷(0.966克,2.7毫摩尔浓度)在无水THF的一冷却的悬浮液中逐滴加入n-BuLi(在己烷中为1.6摩尔浓度,0.32毫升),并且在0℃下将所述得到的黄色溶液再搅拌30分钟。然后在0℃下加入来自所述先前的步骤的在无水THF(0.3毫升)中的所述6’-醛(0.822克,1.08毫摩尔浓度),以及使所述反应在室温下再额外的搅拌1.5小时。如TLC(EtOAc/己烷2:3)所示,所述反应完成后,以饱和的NH4Cl溶液猝灭所述反应。分离所述多层,并且所述水层以乙醚(2×10毫升)萃取,以盐水洗涤所述多个合并的有机层,经无水硫酸镁干燥并蒸发至干燥。通过快速层析(EtOAc/己烷2.5:7.5)纯化所述粗产物,从而获得化合物30(0.4克,50%)。
[0995] 氢核磁共振(400兆赫兹,CDCl3):‘环I’:δ=H5.89(ddd,1H,J1=17.2,J2=10.4,J3=6.8赫兹,H-6)、5.56(d,1H,J=3.9赫兹,H-1)、5.47(d,1H,J=17.2赫兹,H-7反式)、5.33-5.27(m,1H,H-7cis)、4.64-4.56(m,1H,H-5)、4.09(m,H-3)、3.32-3.27(m,2H,H-2,H-
4);‘环II’:δ=H3.69-3.56(m,2H,H-4,H-5)、3.54-3.45(m,1H,H-1)、3.45-3.35(m,2H,H-3,H-6)、2.31(dt,1H,J1=13.2,J2=4.5赫兹,H-2eq)、1.49(ddd,1H,J1=J2=J3=12.6赫兹,H-2ax);所述光谱中的所述多个额外的波峰被辨识为如下:δ=H7.32-7.29(m,20H,Bn)、
5.02(d,1H,J=10.9赫兹,O(CH2)Bn)、4.94(dd,1H,J1=9.9,J2=5.4赫兹,O(CH2)Bn)、4.89(d,1H,J=6.6赫兹,O(CH2)Bn)、4.83(dd,2H,J=10.7,8.5赫兹,O(CH2)Bn)、4.73(d,1H,J=
10.9赫兹,O(CH2)Bn)、4.67(d,1H,J=10.9赫兹,O(CH2)Bn)、4.64-4.56(m,1H,O(CH2)Bn)。
[0996] 碳13核磁共振(100兆赫兹,CDCl3):δ=C138.2(Bn)、138.0(Bn)、138.0(Bn)、137.4(Bn)、134.9(Bn)、128.6(Bn)、128.5(Bn)、128.5(Bn)、128.5(Bn)、128.3(Bn)、128.2(Bn)、128.1(Bn)、127.9(Bn)、127.9(Bn)、127.7(Bn)、127.0(Bn)、118.9(C7’)、97.7(C1’)、84.7、
84.5、82.7(C4’)、79.7(C3’)、77.7、76.05、75.6、75.3、75.0、72.7(C5’)、63.4(C2’)、60.3(C1)、59.3、32.4(C2)。
[0997] 1-((2R,3S,4R,5R,6S)-5-叠氮基-3,4-二(苄氧基)-6-(((1R,2R,3S,4R,6S)-4,6-二叠氧基-2,3-二(苄氧基)环己基)氧基)四氢-2H-吡喃-2-基)-2-(苄氧基)乙醇(31)的合成:向在丙酮(10毫升)中的化合物30(402毫克,0.53毫摩尔浓度)的一搅拌溶液中依次加入水(3毫升)以及t-BuOH(5毫升),K2OsO4·2H2O(16毫克,0.051毫摩尔浓度)以及NMO(0.22毫升)。通过TLC(EtOAc/己烷2:3)监测所述反应的所述进程,所述TLC表示在24小时内完成。然后将所述溶剂蒸发至干燥;将所述残余物溶解于已加入Na2S2O3的一水溶液的EtOAc中。分离所述多层,以盐水洗涤所述有机相,以硫酸镁干燥并蒸发。将所述粗产物进行管柱层析(EtOAc/己烷1:1),从而获得二羟基化产物(300毫克,72%),所述二羟基化产物作为一个6’-非对映异构体混合物。
[0998] 将来自上述步骤的二羟基化化合物(0.3克,0.378毫摩尔浓度)与Bu2SnO(0.103克,0.413毫摩尔)在甲苯/MeOH(10:1,7毫升)中的一混合物回流3小时并且在减压下浓缩。向所述残余物在甲苯(3毫升)的一溶液中加入四丁基溴化铵(0.122克,0.378毫摩尔浓度)以及BnBr(0.09毫升,0.756毫摩尔浓度)。在85℃下将所述混合物搅拌过夜,并且加入CH2Cl2(10毫升)以及饱和NaHCO3(2毫升)淬灭。通过一 垫盘过滤后,以H2O、盐水(5毫升)洗
涤所述有机相(3毫升),以硫酸镁干燥,并且在减压下浓缩。通过管柱色谱(EtOAc/己烷2:3)纯化所述粗产物,以得到所述化合物31(0.280克,84%),所述化合物31作为6’-非对映异构体混合物。
[0999] (1-((2S,3S,4R,5R,6S)-5-叠氮基-3,4-二(苄氧基)-6-(((1R,2R,3S,4R,6S)-4,6-二叠氮基-2,3-二(苄氧基)环己基)氧基)四氢-2H-吡喃-2-基)-2-苄氧基)乙氧基)(叔丁基)二甲基硅烷(32)的合成:将化合物31(205毫克,0.232毫摩尔浓度)溶解于无水DMF(5毫升)中并且冷却至0℃。加入叔丁基二甲基甲硅烷基氯(TBSCl,45毫克,0.298毫摩尔浓度),随后加入咪唑(39毫克,0.572毫摩尔浓度)。在搅拌下使所述反应混合物达到室温,并且通过TLC(EtOAc/己烷3:7)监测所述反应进程。从TLC,反应甚至在延长反应时间(24小时)后仍未完成,以及在此阶段下,通过加入乙酸乙酯(10毫升)以及H2O(10毫升)的混合物来终止所述反应,并且分离所述两层。所述水层以乙酸乙酯(4×30毫升)充分地洗涤,所述多个合并的有机层以饱和氯化钠溶液洗涤,并且以无水硫酸镁干燥。将所述溶剂蒸发至干燥,并且将所述残余物进行管柱层析(EtOAc/己烷25:75)以生产相应的甲硅烷基醚(32)(85毫克,
23%),所述甲硅烷基醚(32)作为一种纯的主要非对映异构体。
[1000] 1-((2R,3S,4R,5R,6S)-5-叠氮基-3,4-二(苄氧基)-6-(((1R,2R,3S,4R,6S)-4,6-二叠氮基-2,3-二(苄氧基)环己基)氧基)四氢-2H-吡喃-2-基)-2-(苄氧基)乙醇(31作为纯的主要非对映异构体):在室温下向化合物32(60毫克,0.06毫摩尔浓度)在THF(3毫升)中的一搅拌溶液中加入TBAF(0.052毫升,0.179毫摩尔浓度),并且在50℃下将所述反应回流过夜。如TLC(EtOAc/己烷2:3)所示,在所述反应完成后,将所述溶剂蒸发至干燥,并且将所得的残余物进行柱色谱(EtOAc/己烷3:7),得到单一非对映异构体31(52毫克,95%)。
[1001] 氢核磁共振(500兆赫兹,CDCl3):‘环I’:δ=H5.53(d,1H,J=3.9赫兹,H-1)、4.17(dd,1H,J1=10.0,J2=2.4赫兹,H-5)、4.12(m,1H,H-6)、3.96(dd,1H,J1=10.3,J2=8.9赫兹,H-3)、3.69-3.61(m,1H,H-4)、3.50-3.45(m,2H,H-7,H-7)、3.22(dd,1H,J1=10.3,J2=3.9赫兹,H-2)、3.59(BrS,1H,6’-OH);‘环II’:δ=H3.58-3.49(m,2H,H-4,H-5)、3.44-3.11(m,3H,H-1,H-3,H-6)、2.23(dt,1H,J1=13.2,J2=4.5赫兹,H-2eq)、1.38(ddd,1H,J1=J2=J3=12.6赫兹,H-2ax);所述光谱中的所述多个额外的波峰被辨识为如下:δ=H7.29-
7.23(m,25H,Bn)、4.98(d,1H,J=10.8赫兹,O(CH2)Bn)、4.92-4.74(m,6H,O(CH2)Bn)、4.65(d,1H,J=11.1赫兹,O(CH2)Bn)、4.42(q,2H,J=11.9赫兹,O(CH2)Bn)。
[1002] 碳13核磁共振(125兆赫兹,CDCl3):δ=C138.0(Bn)、138.0(Bn)、137.9(Bn)、137.7(Bn)、137.3(Bn)、128.6(Bn)、128.6(Bn)、128.5(Bn)、128.5(Bn)、128.5(Bn)、128.3(Bn)、128.1(Bn)、128.1(Bn)、128.0(Bn)、127.9(Bn)、127.8(Bn)、127.7(Bn)、127.6(Bn)、127.0(Bn)、97.4(C1’)、84.6、84.4、80.8、78.4(C4’)、77.5、76.0(Bn)、75.6(Bn)、75.3(Bn)、74.6(Bn)、73.4(Bn)、71.8、71.6、71.2(C7’)、63.3(C2’)、60.2(C1)、59.5(C3)、32.4(C2)。
[1003] (R,X)-酯的合成:在0℃下在CH2Cl2(3毫升)中搅拌(R)-2-甲氧基-2-(1-萘基)丙酸[(R)-MαNP](0.01克,0.04毫摩尔浓度)、4-二甲基氨基吡啶(DMAP,0.06克,0.049毫摩尔浓度)、10-樟脑磺酸(CSA,0.002克,0.008毫摩尔浓度)以及1,3-二环己基碳二亚胺(DCC,0.047克,0.22毫摩尔浓度)。将来自上述的所述主要的醇31(0.038克,0.043毫摩尔浓度)溶解于CH2Cl2(2毫升)中,缓慢地加入到上述搅拌的混合物中,并且在室温下将所述反应放置
72小时。以EtOAc稀释所述混合物,并且以1%HCl溶液、饱和NaHCO3以及盐水洗涤。将所述合并的有机层以硫酸镁干燥,蒸发并且进行管柱层析(EtOAc/己烷),以生产所需的酯(R,X)-
35(0.008克,17%)。
[1004] 氢核磁共振(600兆赫兹,CDCl3):‘环I’:δ=H5.55(dd,1H,J=9.9,3.7赫兹,H-6)、4.87(d,1H,J=3.4赫兹,H-1)、3.86(d,1H,J=10.0赫兹,H-4)、3.50-3.46(m,1H,H-7)、3.38(d,1H,J=10.2赫兹,H-3)、3.36-3.32(m,1H,H-7)、1.55-1.50(m,1H,H-5)、1.28(dd,1H,J1=10.4,J2=3.9赫兹,H-2)、‘环II’:δ=H3.51(d,1H,J1=9.7赫兹,H-6)、3.43(dt,3H,J1=
12.1,J2=7.8赫兹,H-4,H-5,H-3)、3.25(ddd,1H,J1=12.6,J2=10.0,J3=4.6赫兹,H-1)、
2.23(dd,1H,J1=10.9,J2=6.5赫兹,H-2eq)、1.46-1.39(m,1H,H-2ax);所述光谱中的所述多个额外的波峰被辨识为如下:δ=8.39(d,1H,J=8.7赫兹,Ar)、7.80-7.75(m,2H,Ar)、
7.63(d,1H,J=6.4赫兹,Ar)、7.54(t,2H,J=7.6赫兹,Ar)、7.47-7.40(m,2H,Ar)、7.38(d,
2H,J=7.1赫兹,Ar)、7.37-7.33(m,2H,Ar)、7.32-7.27(m,9H,Ar)、7.23(ddd,4H,J1=6.5,J2=4.7,J3=2.2赫兹,Ar)、7.20(d,3H,J=8.0赫兹,Ar)、7.09(ddd,1H,J1=8.5,J2=6.8,J3=1.5赫兹,Ar)、7.06-7.02(m,1H,Ar)、6.96-6.92(m,2H,Ar)、5.01(d,1H,J=11.2赫兹,O(CH2)Bn)、4.88(d,2H,J=4.1赫兹,O(CH2)Bn)、4.84(d,1H,J=10.8赫兹,O(CH2)Bn)、4.59(d,1H,J=11.4赫兹,O(CH2)Bn)、4.50(d,1H,J=11.3赫兹,O(CH2)Bn)、4.44(d,1H,J=11.8赫兹,O(CH2)Bn)、4.25(d,1H,J=11.9赫兹,O(CH2)Bn)、3.99(d,1H,J=11.3赫兹,O(CH2)Bn)、3.71(d,1H,J=11.3赫兹,O(CH2)Bn)、3.07(s,1H,OCH3)、2.02(s,3H,CH3)。
[1005] 碳13核磁共振(125兆赫兹,CDCl3):δ=C173.3(Ar)、138.5(Ar)、138.4(Ar)、137.9(Ar)、137.7(Ar)、137.3(Ar)135.3(Ar)、134.2(Ar)、131.8(Ar)、130.1(Ar)、128.9(Ar)、128.65(Ar)、128.62(Ar)、128.5(Ar)、128.46(Ar)、128.44(Ar)、128.22(Ar)、128.22(Ar)、
127.76(Ar)、127.71(Ar)、127.5(Ar)、127.4(Ar)、127.2(Ar)、126.7(Ar)、126.4(Ar)、126.3(Ar)、126.2(Ar)、124.8(Ar)、99.7(C1’)、84.5、84.43(s)、81.1、79.8、77.0、76.7、76.1、
75.1、74.2、74.2、73.7、72.7、70.2、69.8、61.8、60.2、59.1、50.7、32.3、31.1、29.8、21.5(CH3)。
[1006] (S,X)-酯(36)的合成:在0℃下在CH2Cl2(3毫升)中搅拌(S)-2-甲氧基-2-(1-萘基)丙酸[(S)-MαNP](0.007克,0.03毫摩尔浓度)、4-二甲基氨基吡啶(DMAP,0.005克,0.04毫摩尔浓度)、10-樟脑磺酸(CSA,0.001克,0.004毫摩尔浓度)以及1,3-二环己基碳二亚胺(DCC,0.034克,0.16毫摩尔浓度)。将来自上述的所述主要的醇31(0.028克,0.031毫摩尔浓度)溶解于CH2Cl2(2毫升)中,缓慢地加入到上述搅拌的混合物中,并且在室温下将所述反应放置
72小时。以EtOAc稀释所述混合物,并且以1%HCl溶液、饱和NaHCO3以及盐水洗涤。将所述合并的有机层以硫酸镁干燥,蒸发并且进行管柱层析(EtOAc/己烷),以生产所需的酯(S,X)-
36(0.007克,20%)。
[1007] 氢核磁共振(600兆赫兹,CDCl3):‘环I’:δ=H5.49(dd,1H,J=8.5,4.4赫兹,H-6)、5.17(d,1H,J=3.8赫兹,H-1)、4.04(d,1H,J=10.0赫兹,H-4)、3.58(t,1H,J=9.8赫兹,H-
3)、3.25(d,1H,J=8.5赫兹,H-7)、3.22(dd,1H,J1=10.7,J2=4.6赫兹,H-7)、2.34(dd,1H,J1=17.0,J2=6.3赫兹,H-5)、2.12-2.02(m,1H,H-2)‘环II’:δ=H3.51(dt,2H,J1=17.8,J2=9.3赫兹,H-4,H-5)、3.46-3.37(m,2H,H-1,H-6)、3.33-3.27(m,1H,H-3)、2.25(dt,1H,J1=13.2,J2=4.5赫兹,H-2eq)、1.43(ddd,1H,J1=J2=J3=12.6赫兹,H-2ax);所述光谱中的所述多个额外的波峰被辨识为如下:δ=H8.08(d,1H,J=8.8赫兹,Ar)、7.89(d,1H,J=
7.3赫兹,)、7.76(dd,2H,J1=15.9,J2=8.1赫兹,Ar)、7.46(t,2H,J=7.5赫兹,)、7.44-
7.41(m,1H,Ar)、7.39(d,1H,J=7.5赫兹,Ar)、7.36(t,2H,J=7.3赫兹,Ar)、7.34-7.27(m,
8H,Ar)、7.25-7.23(m,2H,Ar)、7.23-7.19(m,6H,Ar)、7.16(t,1H,J=7.1赫兹,Ar)、7.14-
7.09(m,3H,Ar)、6.91-6.87(m,2H,Ar)、5.01(d,1H,J=11.1赫兹,O(CH2)Bn)、4.90-4.79(m,
3H,O(CH2)Bn)、4.63(q,2H,J=11.1赫兹,O(CH2)Bn)、4.22-4.15(m,2H,O(CH2)Bn)、4.12(d,
1H,J=11.0赫兹,O(CH2)Bn)、3.66(d,1H,J=11.0赫兹,O(CH2)Bn)、3.29(S,3H,OCH3)、1.97(s,3H,CH3)。
[1008] 碳13核磁共振(125兆赫兹,CDCl3):δ=C172.7(Ar)、138.3(Ar)、138.0(Ar)、137.9(Ar)、137.7(Ar)、137.3(Ar)134.1(Ar)、130.5(Ar)、129.3(Ar)、129.1(Ar)、128.6(Ar)、128.6(Ar)、128.4(Ar)、128.4(Ar)、128.3(Ar)、128.3(Ar)、128.2(Ar)、127.9(Ar)、127.7(Ar)、127.7(Ar)、127.6(Ar)、127.6(Ar)、127.5(Ar)、126.9(Ar)、126.1(Ar)、125.6(Ar)、
125.1(Ar)、125.1(Ar)、124.6(Ar)、97.1(C1’)、84.5(C5)、84.5(C4)、81.2,80.1(C3’)、77.9(C5’)、77.3,77.0(C4)、76.1,75.2,74.8,74.4,74.3(C6’)、72.8,70.4(C4’)、69.4(C7’)、
62.5(C2’)、60.2(C3)、59.1(C1)、51.4(OCH3)、32.3(C2)、29.85,21.9(CH3)。
[1009] 接着由氢核磁共振磁各向异性测定在第6’位(用X表示)的所述绝对立体化学,所述磁各向异性是基于扇区规则7,并且取决于所述核磁共振光谱中的所述多个指定的质子的化学位移的多个数值的所述差异(请参见图9A至B)。如图9A所示,H-5’(-0.82)的化学位移[Δδ=δ(R,X)-δ(S,X)]的所述差异为负值,而对于H-7’、7’(+0.23,+0.10)为正值。根据图9B所示的所述扇区规则,所述多个结构(R,X)-MαNP 35以及(S,X)-MαNP 36)被设置为使得OMaNP位于前面,而H-6’位于后面,同时所述Δδ正值以及Δδ负值部分分别位于所述右侧和左侧。这些数据证实在化合物31中的所述6’碳原子处的所述R组态(X=R)。
[1010] 所述研究证实所述主要以及次要非对映异构体化合物NB153以及NB155在第6’位展现(R)-以及(E)-组态:6’-(R)-NB153以及6’-(S)-NB155。
[1011] 示例5
[1012] 实施例4的多个示例性化合物的多个活性测定
[1013] 所述实验测定程序以及结果测定是基本上如同上文和下文中以及以下更详细的描述来进行。
[1014] 材料与方法:
[1015] 在所有的生物测试中,所有测试的氨基糖苷类都是在它们的硫酸盐形式[所述硫酸盐类的分子量(Mw)(克/摩尔(gr/mol))如下:化合物1-437.1、NB74-564.3、NB124-605.9、NB153-526.8、NB155-512.2、NB156-705.9、NB157-746.6、G418-692.7、庆大霉素-653.2]。
[1016] 多个双荧光素酶通读测定:
[1017] 通过退火下列互补寡核苷酸对,产生源自PCDH15、CFTR以及IDUA互补脱氧核糖核酸的多个脱氧核糖核酸片段,包括所述测试的无义突变或所述相应的野生型(wt)密码子以及4至6个上游及下游侧翼密码子:
[1018] 乌谢尔综合症:
[1019] 质体(p.)R3X突变型(mut)/野生型(wt)
[1020] 5’-GATCCCAGAAGATGTTTT/CGACAGTTTTATCTCTGGACAGAGCT-3’以及5’-CTGTCAGAGATAAAACTGTCA/GAAACATCTTCTG-3’;
[1021] 质体R245X突变型/野生型:
[1022] 5’GATCCAAAATCTGAATGAGAGGT/CGAACCACCACCACCACCCTCGAGCT-3’以及5’-CGAGGGTGGTGGTGGTTGTTCG/ACCTCTCATTCAGATTTTG-3’;
[1023] 囊性纤维化:
[1024] 质体G542X突变型/野生型:
[1025] 5’-TCGACCAATATAGTTCTTT/GGAGAAGGTGGAATCGAGCT-3’以及5’-CGATTCCACCTTCTCA/GAAGAACTATATTGG-3’;
[1026] 胡勒综合症:
[1027] 质体Q70X突变型/野生型:
[1028] 5’-TCGACCCTCAGCTGGGACT/CAGCAGCTCAACCTCGAGCT-3’以及5’-CGAGGTTGAGCTGCTA/GGTCCCAGCTGAGG-3’。
[1029] 将多个片段整码插入到所述p2Luc质体的所述BamHI和SacI之间的p2Luc质体在BamHI与SacI(第R3X及第R245X)或是SalI与Sacl(所有其余的)限制性位点之间的所述多位点接头。对于所述多个体外通读测定,加入所述多个测试的氨基糖苷类并使用所述TNT网织红细胞裂解物快速偶联转录/转译系统来转录以及转译所述获得的质体,使用所述双荧光素酶报告基因检测系统(PromegaTM)在30℃下保温90分钟后测定萤光素酶活性,如先前所述计算终止密码子的通读[Grentzmann等人,核糖核酸(RNA)1998,4,479至486]。
[1030] 多个蛋白质转译抑制测试:
[1031] 根据制造商的操作流程,通过使用用于具有pBESTluc质体(Promega)的环状脱氧核糖核酸的大肠杆菌S30提取物在偶联转录/转译测定中定量出所述多个不同的氨基糖苷类对原核生物的体外转译的抑制,多个转译反应(25微升)包含不同浓度的所述测试的氨基糖苷,在37℃下保温60分钟,在冰上冷却5分钟,并以一稀释试剂(三磷酸盐缓冲液(25毫摩尔浓度,pH7.8)、DTT(2毫摩尔浓度)、1,2-二氨基环己烷四乙酸酯(2毫摩尔浓度)、甘油(10%)、Triton X-100(1%)以及BSA(1毫克每升(mg mL-1))稀释所述测试的氨基糖苷至多个96孔板中。根据制造商的操作流程,通过使用具有一萤光素酶T7对照组脱氧核糖核酸质体(Promega)的 T7快速偶联转录/转译系统来量化真核生物的体外转译的抑制。含有不同浓度的所述测试的氨基糖苷的多个转译反应(25微升)在30℃下保温60分钟,在冰上冷却5分钟,以所述稀释试剂稀释所述测试的氨基糖苷,并且转移到所述96孔板中。在原核生物以及真核生物系统两者中,在加入萤光素酶测定试剂(50微升;Promega)后立即测量所述冷光,并且以一FLx800荧光酶标仪(Biotek)记录所述光线发射。通过使用Grafit 5软件将浓度与响应曲线拟合至少两个独立实验的所述数据来获得所述半数最大抑制浓度(IC 50)的多个数值。
[1032] 多个抗菌活性测试:
[1033] 通过使用根据多个国家实验室标准委员会(NCCLS)的所述双微量稀释方法所测量所述多个最小抑制浓度(MIC)数值,来测定在两种代表性菌株中的革兰氏阴性菌(大肠杆菌(E.coli)R477-100)以及革兰氏阳性菌(枯草芽孢杆菌(B.subtilis)ATCC-6633)中测定多个比较性的抗菌活性。(NCCLS.国家实验室标准委员会,用于抗菌敏感性测试的执行标准。第五个信息补充:批准的标准M100-S5;维拉诺瓦,宾夕法尼亚州:NCCLS,1994)。所有的实验以三重复进行,并且在三个不同的实验中获得多个类似的结果。
[1034] 结果:
[1035] 图10示出了多个比较图,显示出由化合物1(-■-)、NB153(-▲-)以及NB155(-Δ-)在表示USH1遗传性疾病的R3X无义突变的构建体中所诱导的体外终止密码子的多个抑制水平。
[1036] 所述多个比较性PTC抑制活性测试显示在化合物1上的C7’-羟基(NB153)的安装显着地增加所述化合物1的体外通读活性,并且比NB155的效果更显着。所述多个数据显示出一改善的活性是归因于所述额外的羟基,并且进一步强调了在RNA靶标识别中第6’位的立体化学的所述作用。NB155与化合物1中所观察到的稍高的活性表明NB155中额外的7’-羟基可以克服第6’位处的所述组态的缺失。
[1037] 针对先前公开的化合物NB74及NB124评估化合物NB156及NB157中的所述额外的7’-羟基的所述影响,所述NB74及NB124不同于NB156及NB157是在于所述7’-羟基的不存在,如下所示。
[1038]
[1039] NB74:R=氢(H)
[1040] NB124:R=甲基(Me)
[1041] 使用多个双荧光素酶报告质体的一集合来测试活性,所述多个双荧光素酶报告质体包括不同序列,所述不同序列围绕分别来自于强调USH1、CF以及MPS I-H的PCDH15、CFTR以及IDUA基因的多个提前终止密码子竞争,所述多个示例性的无义报导是对于USH1为R3X及R245X、对于CF为G542X以及对于MPS I-H为Q70X。
[1042] 所述获得的数据在图11A至D中示出,图11A至D示出了多个比较图,显示出由NB74(-Δ-)、NB156(-▲-)以及庆大霉素(--■--)(左)以及NB124(-Δ-)、NB157(-▲-)以及庆大霉素(--■--)(右)在表示R3X(USH1)(图11A)、R245X(USH1)(图11B)、Q70X(HS)(图11C)以及G542X(CF)(图11D)的无义构建体中所诱导的多个体外终止密码子的多个抑制水平。所述多个结果是至少三次独立实验的多个平均值。
[1043] 如清楚地在图11A至D中所示,NB153中所显示的C7’-羟基的所述正面影响也保留在所述多个假三糖中。在所有测试的突变中,NB156的所述通读活性显着地优于其所述结构上相关的NB74的所述通读活性,以及NB157的所述活性优于其所述结构上相关的NB124。此外,在所有测试的突变中,NB156及NB157的所述多个活性均明显地优于所述临床药物的庆大霉素的所述活性。
[1044] 为了评估对真核生物的细胞质核糖体的所述特异性,使用多个偶联转录/转译测定来测定化合物NB74、NB124、NB156以及NB157在真核生物系统中的比较性蛋白转译抑制。
[1045] 在所有的生物测试中,所有的氨基糖苷类(AGs)均在它们的硫酸盐形式,以及所述浓度指的是每种氨基糖苷类的所述游离胺形式。如先前所述,通过使用活性萤光素酶检测在多个偶联转录/转译测定中定量所述真核生物及原核生物的多个半数最大抑制值(IC50真核以及IC50原核)。使用所述双微量稀释法测定最小抑制浓度(MIC)的多个数值。
[1046] 所述获得的数据如下表4所示。
[1047] 表4
[1048]
[1049]
[1050] 所述获得的数据表示,NB157(半数最大抑制浓度值IC 50真核=1.2微摩尔浓度)抑真核制真核生物转译的所述功效大于NB156的所述功效(IC 50 =13.9微摩尔浓度)以及庆大霉素的所述功效(IC 50真核=62微摩尔浓度),类似于图11A至D中所示的所述PTC抑制活性。
此外,NB156及NB157对于真核生物的核糖体比起与它们的结构上相关的多个化合物NB74及NB124更具特异性,分别是所述多个化合物NB74及NB124的1.85倍以及1.25倍。这些数据表示,NB156及NB157的所述上升的PTC抑制活性与它们对真核生物的核糖体的增加的特异性相关联。
[1051] 表4中的所述测量的IC50Pro及多个MIC的数值显示出NB156及NB157抑制所述原核生物的核糖体的所述功效及它们伴随的抗菌活性分别与其结构上相关的化合物NB74及NB124非常类似。所述多个化合物在细菌核糖体上的所述观察到的类似的影响表明NB156及NB157比庆大霉素及G418具有更低的耳毒性。
[1052] 因此,在本文所示的一个新颖的药效基团点7’-羟基作为所述葡萄糖胺环(环I)的一个宝贵的结构组件,所述结构组件显着地影响真核生物对原核生物的选择性以及所述伴随的PTC抑制活性。
[1053] 基本上如上所述地进行多个进一步的测定,并且所述获得的数据中的一些数据被示出在图12A至13B。
[1054] 在所述多个测定中,测试了一大批的终止密码子突变在NB156及NB157的存在下的所述通读。简要地,使用每种特定的互补的脱氧核糖核酸(cDNA)的所述野生型(WT)序列作为对照组,并且使用在一双荧光素酶测定中带有所述多个终止密码子突变的多个质体,以多个递增的剂量测试NB156及NB157对于所述无义突变的多个通读性质。使用所述野生型或无义突变制备衍生自多个不同的互补脱氧核糖核酸的多个脱氧核糖核酸片段,其中来自于所述突变或野生型密码子的所述多个序列被4至6个上游及下游的侧翼密码子包围。将所述互补脱氧核糖核酸序列插入到每个序列的所述p2luc质体的所述多位点接头中。
[1055] 以下的表5显示出所述多个测试的突变及与所述多个测试的突变相关的所述多个遗传性疾病。
[1056] 表5
[1057]
[1058]
[1059] 图12A示出了多个比较终止密码子突变的通读图,显示出作为野生型与NB156的一浓度函数的通读百分比(通读至海肾萤光为50%),并比较所述多个突变G542X、W392X、R1282X、Q2522X、R3X、Q70X、R578X、R168X、R245X、R31X、mdX、R270X、R3381X、R553X、Q251X以及R294X的所述通读。
[1060] 图12B示出了多个比较终止密码子突变的通读图,显示出作为NB156浓度的一函数,从未处理的对照组到暴露在NB156后的通读的倍数增加,并比较所述多个突变G542X、W392X、R1282X、Q2522X、R3X、Q70X、R578X、R168X、R245X、R31X、mdx、R270X、R3381X、R553X、Q251X以及R294X的所述通读。
[1061] 图13A示出了多个比较终止密码子突变的通读图,显示出作为野生型与NB157的一浓度函数的通读百分比(通读至海肾萤光为50%),并比较所述多个突变G542X、W392X、R1282X、Q2522X、R3X、Q70X、R578X、R168X、R245X、R31X、mdX、R270X、R3381X、R553X、Q251X以及R294X(请参见以上的表5)的所述通读。
[1062] 图13B示出了多个比较终止密码子突变的通读图,显示出作为NB157浓度的一函数,从未处理的对照组到暴露在NB157后的通读的倍数增加,并比较所述多个突变G542X、W392X、R1282X、Q2522X、R3X、Q70X、R578X、R168X、R245X、R31X、mdX、R270X、R3381X、R553X、Q251X以及R294X(请参见以上的表5)的所述通读。
[1063] 在多个额外的比较测定中,将NB156的所述终止密码子突变的通读活性与NB74的所述终止密码子突变的通读活性进行比较,在所有测试的突变中显示NB156比NB74更有活性。
[1064] 所述多个数据进一步证明了NB156及NB157对各种终止密码子突变的所述通读活性。
[1065] 示例6:
[1066] 根据本发明一些实施例的多个包含不饱和葡萄糖胺(环I)的示例性化合物:
[1067] 通过在环I(葡萄糖胺环)插入不饱和度来进行多个氨基糖苷结构的多个示例性的新颖的修饰。通过C4’-OH或C3’,C4’-羟基的所述缺失在环I上的不饱和的同时引入被认为使所述环在所述结合口袋内相对地“自由”移动,用于与G1408的更好的伪配对相互作用以及改善与A1491的π与π堆积。
[1068] 化学合成:
[1069] 合成以下的所述多个示例性氨基糖化合物NB154、NB158以及
[1070] NB159:
[1071]
[1072] NB154
[1073]
[1074] 所有结构均通过各种一维以及二维的核磁共振技术的一组合以及质谱的来确认和表征,所述一维以及二维的核磁共振技术包括:一维全相关光谱学、二维关联能谱法、二维氢与碳13的异核多量子关系以及多键碳氢关系谱。
[1075] NB154的合成:
[1076] 以下方案12描述了NB154的所述合成。
[1077] 方案12
[1078]
[1079] 简要地,所述合成从巴龙霉胺开始,所述巴龙霉胺如前所述是在酸性(HCl/MeOH)水解下从市售的帕莫米星硫酸盐中获得。最初地,如上文进一步所详细描述,通过在CuSO4的所述存在下从三氟甲磺酸酐以及NaN3在原位产生三氟甲磺酰基叠氮化物的所述手段,将巴龙霉胺转化为所述三叠氮化物以生产巴龙霉胺过叠氮化物(18)。在获得所述巴龙霉胺过叠氮化物期间,在多个酸性条件下使用苯甲醛二甲基缩醛将所述多个4’,6’-OH基团转化为相应的亚苄基缩醛(bebzylidene acetal)(42)。在碱性条件下将其他的羟基在乙酸酐的存在下转化为乙酸酯(43)。在温和的酸性环境下将化合物43中的所述亚芳基基团的去保护化导致二醇44的所述形成,所述二醇44进行多个进一步的后功能性转化以生产所述期望的化合物。为了区分所述4’-OH以及6’-OH基团以进行选择性氧化作用,通过以叔丁基二苯基氯硅烷(TBDPSCl)作选择性保护,化合物43中的所述6’-OH基团被保护为其甲硅烷基醚45,而在碱性条件(Et3N)下使用甲磺酰氯(MsCl)将所述另一个羟基掩蔽为甲磺酸酯,从而以多个优异的产率获得化合物46。
[1080] 在使用TBAF对所述甲硅烷基去保护化的期间,为了避免多个4’-OM酯官能团的所述水解,以AcOH缓冲所述TBAF反应混合物,以及获得所述6’-OH官能分子47,使多个4’-OM酯与所述分子结合。所述C-6’羟基的DMP氧化,接着在一锅式反应中在碱性条件下同时消除多个4’-OM酯,导致以良好产率形成相应的α,β-不饱和醛48。化合物48在卢切(Luche)还原条件下得到烯丙基醇49,所述烯丙基醇49以NaOMe处理,然后是施陶丁格反应生产所述假二糖NB154。
[1081] 1,3,2’-过叠氮基-巴龙霉胺(18)的合成:将巴龙霉胺硫酸盐在多个酸性条件下(HCl/MeOH)水解为巴龙霉胺,通过从三氟甲磺酸酐以及在CuSO4的存在下的NaN 3的所述原位生成的所述三氟甲磺酰基叠氮化物,将巴龙霉胺转化为三叠氮化物。
[1082] 三氟甲磺酰基叠氮化物的产生:在0℃下向NaN3(3.6克,18当量)在水(9.0毫升)以及甲苯(9.0毫升)的一剧烈搅拌的溶液中滴加三氟甲磺酸酐(4.6毫升,9.0当量),并且在0℃下将所述反应混合物搅拌30分钟。此后将所述温度升高至10℃,并且将所述双相系统搅拌2小时。然后逐滴加入饱和的NaHCO3水溶液直至所述气体评估停止。分离所述多个相,并且以甲苯(2×9毫升)萃取所述水相,所述多个合并的有机层被用于所述重氮转移反应。
[1083] 重氮转移反应:将巴龙霉胺(1.0克,1.0当量)、NaHCO3(3.1克,12.0当量)以及硫酸铜(II)溶解于水(5.0毫升)中,加入三氟甲磺酸叠氮贮备溶液,然后是甲醇(40毫升)的所述加入,从而获得一均质溶液。在室温下剧烈地搅拌所述蓝色反应混合物,由蓝色变为绿色表示出胺的完全转化。搅拌48小时后,TLC(EtOAc/MeOH 95:5)分析表示所述反应的所述完成,此后将所述溶剂蒸发至干燥,并将所述残余物进行管柱层析(EtOAc 100%)。
[1084] 氢核磁共振(500兆赫兹,MeOD):‘环I’:δH=5.69(d,1H,J=3.7赫兹,H-1)、3.99(ddd,1H,J=9.9,4.1,2.6赫兹,H-5)、3.94(dd,1H,J=10.2,9.1赫兹,H-3)、3.84(dd,1H,J=11.9,2.3赫兹,H-6)、3.78(dd,1H,J=11.8,4.4赫兹,H-6)、3.46(dd,1H,J=9.7,9.3赫兹,H-4)、3.13(dd,1H,J=10.5,3.7赫兹,H-2);‘环II’:δH=3.80(t,1H,J=8.8赫兹,H-5)、3.77-3.67(m,3H,H-1,H-3,H-4)、3.56(t,1H,J=9.6赫兹,H-6)、2.59-2.48(m,1H)、1.68(dd,1H,J=26.3,12.7赫兹,H-2)。
[1085] 碳13核磁共振(125兆赫兹,MeOD):δC=99.3(C1’)、80.7、77.8(C5)、77.7(C6)、73.9(C5’)、72.4(C3’)、71.6、64.8(C2’)、62.1(C6’)、61.6、60.9、33.1(C2)。
[1086] 基体辅助激光解吸电离飞行时间质谱:对于C12H19N9O7([M+K]+)的计算的m/e:440.3;测量的m/e:440.2)。
[1087] 4’,6’-O-亚苄基-1,2’,3-三叠氮基-巴龙霉胺(42)的制备:将化合物18(1克,2.49毫摩尔浓度)溶解于无水DMF(20毫升)中,并且加入苯甲醛二甲基缩醛(0.87毫升,5.79毫摩尔浓度)以及一催化量的CSA。在60℃下搅拌所述反应混合物,通过TLC(EtOAc 60%,己烷40%)监测所述反应进程,所述TLC表示在2小时内所述反应的所述完成。以EtOAc稀释所述反应混合物,并且以饱和NaHCO3以及盐水溶液萃取。所述多个合并的有机层以硫酸镁干燥、过滤,并且在减压下浓缩。通过快速层析(EtOAc/己烷1:1)纯化所述粗产物以得到化合物42(1.0克,产率为83%)。
[1088] 氢核磁共振(600兆赫兹,MeOD):‘环I’:δH=5.69(d,1H,J=3.5赫兹,H-1)、4.27(dd,1H,J1=10.0,J2=5.0赫兹,H-6)、4.20(td,1H,J1=10.1,J2=5.0赫兹,H-6)、4.15(t,1H,J=9.7赫兹,H-3)、3.81(t,1H,J=10.1赫兹,H-5)、3.59(t,1H,J=9.56赫兹,H-4)、3.31(dd,1H,J1=10.4,J2=4.6赫兹,H-2);‘环II’:δH=3.57(t,1H,J=8.2赫兹,H-5)、3.54-
3.48(m,2H,H-3,H-4)、3.45(ddd,1H,J=14.7,11.3,5.5赫兹,H-1)、3.31(t,1H,J=9.7赫兹,H-6)、2.28(dt,1H,J1=8.5,J2=3.9赫兹,H-2eq)、1.46(ddd,1H,J1=J2=J3=12.3赫兹,H-2ax);所述光谱中的所述多个额外的波峰被辨识为如下:7.58-7.50(m,2H)、7.43-7.35(m,3H,Ar)、7.43-7.35(m,3H,Ar)、5.63(s,1H,PhCH)。
[1089] 碳13核磁共振(150兆赫兹,MeOD):δc=139.10(Ar)、129.98(Ar)、129.07(Ar)、127.56(Ar)、103.14(PhCH)、100.36(C-1’)、83.06、81.33、77.82、77.81、69.85(C-5’)、
69.59(C-6’)、65.23(s)、64.58(s)、61.76(s)、60.95(s)、33.21(C-2)。
[1090] 基体辅助激光解吸电离飞行时间质谱:对于C19H24N9O7([M+H]+)的计算的m/e:490.4;测量的m/e:490.0。
[1091] 4’,6’-O-亚苄基-1,2’,3-三叠氮基-过乙酰基巴龙霉胺(43)的制备:将化合物42(1.4克,2.94毫摩尔浓度)溶解于无水吡啶(8毫升)中,并且加入乙酸酐(1.4毫升,14.8毫摩尔浓度),并且加入4-DMAP(3.2克,26.1毫摩尔浓度)。通过TLC监测所述反应进程,所述TLC表示在4小时内完成。以EtOAc稀释所述反应混合物,并且以HCl水溶液(2%)、饱和NaHCO3水溶液以及盐水萃取。将所述合并的有机层以无水硫酸镁干燥并且浓缩。通过硅胶柱层析(EtOAc/己烷4:6)纯化所述粗产物以得到43(1.32克,产率为73%)。
[1092] 氢核磁共振(600兆赫兹,MeOD):‘环I’:δH=5.57(dd,1H,J1=10.3,J2=9.6Hz,H-3)、5.15(d,1H,J=3.2Hz,H-1)、4.31(dt,2H,J1=13.0,J2=5.0Hz,H-5,H-6)、3.73(dd,1H,J1=14.4,J2=5.6Hz,H-6)、3.62(t,1H,J=9.3Hz,H-4)、3.24(dd,1H,J1=10.5,J2=4.0Hz,H-2);‘环II’:δH=5.17(t,1H,J=9.7Hz,H-5)、4.92(t,1H,J=10.0Hz,H-6)、3.74-3.56(m,
2H,H-4,H-1)、3.46(ddd,1H,J1=12.2,J2=10.1,J3=4.9Hz,H-3)、2.43(dt,1HJ1=13.0,J2=4.5Hz,H-2)、1.59(ddd,1H,J1=25.8,J2=12.8Hz,H-2);所述光谱中的所述多个额外的波峰被辨识为如下:δH=7.44(dt,J1=5.0,J2=3.0Hz,2H,Ar)、7.39-7.30(m,3H,Ar)、5.49(s,
1H,PhCH)。
[1093] 碳13核磁共振(150兆赫兹,CDCl3):δc=170.06(C=O)、169.76(C=O)、169.37(C=O)、136.93(Ar)、129.26(Ar)、128.36(Ar)、126.30(Ar)、101.74(PhCH)、100.22(C-1’)、79.17(C-4’)、78.72(C-4)、74.27(C-6)、73.72(C-5)、68.69(C-6’)、68.63(C-3’)、63.51(C-
5’)、61.46(C-2’)、58.29(C-3)、57.68(C-1)、31.77(C-2)、20.87(CH3CO)、20.67(CH3CO)、
20.64(CH3CO)。
[1094] (1S,2S,3R,4S,6R)-3-(((2S,3R,4R,5S,6R)-4-乙酰氧基-3-叠氮基-5-羟基-6-(羟基甲基)四氢-2H-吡喃-2-基)氧基)-4,6-二叠氮基环己烷-1,2-二基二乙酸酯(44):将化合物43(1.32克,2.14毫摩尔浓度)溶解于AcOH/H2O(5:1,10毫升),并且在60℃下对所述溶液搅拌过夜。如TLC所示,所述反应完成后,通过蒸发去除所述乙酸水溶液。将所述粗残余物溶解于EtOAc中,并且以饱和NaHCO3水溶液以及盐水萃取。将所述多个合并的有机层以无水硫酸镁干燥并且浓缩,通过硅胶管柱层析(EtOAc/己烷6:4)纯化所述粗产物以得到44(771毫克,68%产率)。
[1095] 氢核磁共振(600兆赫兹,CDCl3):‘环I’:δH=5.28(t,1H,J=9.9赫兹,H-3)、5.13(d,1H,J=3.6赫兹,H-1)、4.09(d,1H,J=10.0赫兹,H-4)、3.95-3.79(m,2H,H-6,H-6)、3.67(t,
1H,J=9.1赫兹,H-5)、3.28(dd,1H,J1=10.3,J2=3.5赫兹,H-2);‘环II’:δH=5.12(t,1H,J=9.8赫兹,H-5)、4.91(t,1H,J=10.0赫兹,H-6)、3.73-3.67(m,1H,H-3)、3.63(t,1H,J=
9.7赫兹,H-4)、3.52(td,1H,J=12.1,4.6赫兹,H-1)、2.42(dt,1H,J1=13.2,J2=4.4赫兹,H-2)、1.59(ddd,1H,J1=J2=J3=12.6赫兹,H-2);所述光谱中的所述多个额外的波峰被辨识为如下:δ=2.15(s,3H,CH3C=O)、2.11-2.02(m,6H,CH3C=O)。
[1096] 碳13核磁共振(150兆赫兹,CDCl3):δc=171.78(C=O)、170.10(C=O)、169.73(C=O)、99.33(C-1’)、78.79(C-4)、74.21(C-6)、73.68(C-5)、73.03(C-3’)、72.62(C-4’)、69.45(C-5’)、61.64(C-6’)、61.02(C-2’)、58.71(C-1)、57.65(C-3)、31.98(C-2)、21.06(CH3CO)、20.72(CH3CO)、20.66(CH3CO)。
[1097] (1S,2S,3R,4S,6R)-3-(((2S,3R,4S)-4-乙酰氧基-3-叠氮基-6-甲酰基-3,4-二氢-2H-吡喃-2-基)氧基)-4,6-二叠氮基环己烷-1,2-二基二乙酸酯(48):在0℃下向化合物
47(88毫克,0.145毫摩尔浓度)在CH2Cl2(3毫升)中的一搅拌溶液中一次性加入DMP(123毫克,0.289毫摩尔浓度),并且在0℃下将所得的混合物搅拌40分钟。然后使所述反应混合物达到室温并再搅拌3小时。如TLC所示,所述反应完成后,在室温下一次性加入Et3N(0.2毫升),并且将所述混合物搅拌30分钟。此后,以EtOAc稀释所述反应混合物,并且以水洗涤,接着以盐水洗涤。将所述多个合并的有机层以无水硫酸镁干燥并且浓缩,通过硅胶管柱层析(EtOAc/己烷3:7)纯化所述粗产物以得到48(50毫克,产率为68%)。
[1098] 氢核磁共振(600兆赫兹,CDCl3):‘环I’:δH=5.93(d,1H,J=2.6赫兹,H-4)、5.76(dd,1H,J1=9.4,J2=2.4赫兹,H-3)、5.38(d,1H,J=2.6赫兹,H-1)、3.71(dd,1H,J1=9.4,J2=2.7赫兹,H-2);‘环II’:δH=5.13(t,1H,J=9.9赫兹,H-5)、4.90(t,1H,J=10.0赫兹,H-6)、3.82(t,1H,J=9.8赫兹,H-4)、3.60(ddd,1H,J1=12.6,J2=10.2,J3=4.6赫兹,H-1)、
3.42(ddd,1H,J1=12.6,J2=10.0,J3=4.6赫兹,H-3)、2.31(dt,1H,J1=13.5,J2=4.6赫兹,H-2)、1.49(ddd,1H,J1=J2=J3=12.7赫兹,H-2);所述光谱中的所述多个额外的波峰被辨识为如下:δ=9.24(s,1H,CHO)、2.14(s,3H,CH3CO)、2.08(s,3H,CH3CO)、2.06(s,3H,CH3CO)。
[1099] 碳13核磁共振(150兆赫兹,CDCl3):δc=185.12(CHO)、170.01(C=O)、169.87(C=O)、169.48(C=O)、148.79(C-5’)、116.71(C-4’)、98.98(C-1’)、79.20(C-4)、73.99(C-6)、73.25(C-5)、66.43(C-3’)、59.14(C-3)、58.50(C-2’)、57.84(C-1)、32.14(C-2)、20.91(CH3CO)、20.69(CH3CO)、20.64(CH3CO)。
[1100] (1S,2S,3R,4S,6R)-3-(((2S,3R,4S)-4-乙酰氧基-3-叠氮基-6-(羟基甲基)-3,4-二氢-2H-吡喃-2-基)氧基)-4,6-二叠氮基环己烷-1,2-二基二乙酸酯(49):向搅拌的醛48(1.0克,1.97毫摩尔浓度)在无水MeOH(10毫升)中的溶液中,冷却至0℃,依次加入CeCl 3·3H 2O(734毫克,1.97毫摩尔浓度)以及NaBH4(74毫克,1.95毫摩尔浓度)。通过TLC(EtOAc/己烷2:3)监测所述反应进程,所述TLC表示在1小时内完成。将所述MeOH完全蒸发并且加入H2O,以EtOAc萃取所述水层,将所述多个合并的有机层以盐水洗涤,以硫酸镁干燥、蒸发至干燥,通过管柱层析(硅胶,EtOAc/己烷)纯化以生产相应的烯丙醇49(960毫克,96%)。
[1101] 氢核磁共振(600兆赫兹,CDCl3):‘环I’:δH=5.44(d,1H,J=5.9,H-3)、5.25(d,1H,J=2.4赫兹,H-1)、5.03(d,1H,J=2.7赫兹,H-4)、4.09-3.96(m,2H,H-6,H-6)、3.58(dd,1H,J1=7.0,J2=2.5赫兹,H-2);‘环II’:δH=5.12(t,1H,J=9.9赫兹,H-5)、4.89(t,1H,J=10.0赫兹,H-6)、3.79(t,1H,J=9.8赫兹,H-4)、3.69-3.54(m,1H,H-1)、3.48(ddd,1H,J1=
12.6,J2=10.0,J3=4.6赫兹,H-3)、2.30(dt,1H,J1=13.4,J2=4.5赫兹,H-2eq)、1.44(ddd,1H,J1=J2=J3=12.8赫兹,H-2ax);所述光谱中的所述多个额外的波峰被辨识为如下:δH=2.57(brs,1H,6’-OH)、2.06(s,3H,CH3)、2.04(s,6H,CH3)。
[1102] 碳13核磁共振(150兆赫兹,CDCl3):δC=170.0(CH3-CO)、169.9(CH3-CO)、169.4(CH3-CO)、152.6(C5’)、98.3(C1’)、96.3(C4’)、78.8(C4)、73.9(C6)、73.3(C5)、66.6(C3’)、61.7(C6’)、59.3(C3)、58.9(C2’)、57.8(C1)、32.3(C2)、21.0(CH3)、20.6(CH3)、20.5(CH3)。
[1103] (1S,2R,3R,4S,6R)-4,6-二叠氮基-3-(((2S,3R,4S)-3-叠氮基-4-羟基-6-(羟基甲基)-3,4-二氢-2H-吡喃-2-基)氧基)环己烷-1,2-二醇(50):在氩气气体下(960毫克,1.88毫摩尔浓度)向醇49在无水MeOH(15毫升)中的一搅拌溶液中加入NaOMe(459毫克,8.49毫摩尔浓度)。通过TLC(EtOAc/己烷3:2)监测所述反应进程,所述TLC表示在6小时内完成。
然后将所述反应混合物通过一硅胶管柱垫盘,并且以MeOH洗涤。将所述多个合并的有机层蒸发至干燥,通过管柱层析(硅胶,EtOAc/己烷)纯化以得到化合物50(700毫克,97%)。
[1104] 氢核磁共振(500兆赫兹,MeOD):‘环I’:δH=5.80(d,1H,J=2.5赫兹,H-1)、5.03(dt,1H,J1=2.5,J2=1.0赫兹,H-4)、4.47-4.39(m,1H,H-3)、4.06-3.96(m,2H,H-6)、3.42(dd,1H,J1=8.0,J2=2.5赫兹,H-2);‘环II’:δH=3.61(t,1H,J=9.5赫兹,H-4)、3.52(t,1H,J=9.5赫兹,H-5)、3.46(ddd,1H,J1=12.5,J2=9.5,J3=4.5赫兹,H-3)、3.43-3.37(m,
1H,H-1)、3.26(t,1H,J=9.5赫兹,H-6)、2.16(dt,1H,J1=12.5,J2=4.5赫兹,H-2eq)、1.29(ddd,1H,J1=J2=J3=12.5赫兹,H-2ax)。
[1105] 碳13核磁共振(125兆赫兹,MeOD):δC=152.6、100.5(C4’)、99.6(C1’)、81.7(C4)、77.9(C6)、77.6(C5)、64.9(C3’)、63.8(C2’)、62.0(C1)、61.9(C6’)、61.6(C3)、33.7(C2)。
[1106] 基体辅助激光解吸电离飞行时间质谱:对于C12H17N9O6([M+Na]+)的计算的:m/e 406.3;测量的m/e:406.3。
[1107] (1S,2R,3R,4S,6R)-4,6-二氨基-3-(((2S,3R,4S)-3-氨基-4-羟基-6-(羟基甲基)-3,4-二氢-2H-吡喃-2-基)氧基)环己烷-1,2-二醇(NB154):向化合物50(256毫克,1.0当量)在THF(3.0毫升)以及NaOH水溶液(1毫摩尔浓度,5.0毫升)中的一混合物中加入PMe3(THF溶液中为1摩尔浓度,0.55毫升,7.8当量)。通过TLC[CH2Cl2/MeOH/H2O/MeNH2(在EtOH中为33%的溶液),10:15:6:15]监测所述反应进程,所述TLC表示在3.5小时内完成。此后在一短硅胶柱上通过快速层析纯化所述反应混合物,用以下的溶剂洗涤所述管柱:THF(100毫升)、CH2Cl2(100毫升)、EtOH(50毫升)以及MeOH(100毫升)。然后以在80%MeOH中的5%MeNH2溶液(在EtOH中为33%溶液)的一混合物洗脱所述产物。将多个包含所述产物的部分合并,并且在真空下蒸发。通过将上述产物通过一短柱Amberlite CG50(NH4+形式)获得所述纯产物。首先,以水洗涤所述管柱,然后以在水中的10%NH4OH的一混合物洗脱所述产物,以获得NB154(184毫克,90%)。
[1108] 对于储存和生物测试,如下将NB154转化成其硫酸盐形式:将所述游离碱形式溶解于水中,以硫酸镁(0.1N)将所述pH调节至7并冻干以提供NB154的所述硫酸盐。
[1109] 氢核磁共振(500兆赫兹,MeOD):‘环I’:δH=5.40(d,1H,J=2.5赫兹,H-1)、4.98(d,1H,J=3.0赫兹,H-4)、4.06(dd,1H,J1=7.0,J2=3.0赫兹,H-3)、4.01-3.91(m,2H,H-6)、2.92(dd,1H,J1=7.0,J2=2.5赫兹,H-2);‘环II’:δH=3.41-3.35(m,2H,H-4,H-5)、3.09(t,
1H,J=9.5赫兹,H-6)、2.76-2.70(m,1H,H-3)、2.66(ddd,1H,J1=12.5,J2=10.0,J3=4.5赫兹,H-1)、2.03(dt,1H,J1=12.5,J2=4.5赫兹,H-2eq)、1.24(ddd,1H,J1=J2=J3=12.5赫兹,H-2ax)。
[1110] 碳13核磁共振(125兆赫兹,MeOD):δC=152.6,101.8(C1’)、101.5(C4’)、86.7,78.8(C6)、77.7,68.0(C3’)、62.5(C6’)、55.6(C2’)、52.4(C3)、51.2(C1)、36.6(C2)。
[1111] 基体辅助激光解吸电离飞行时间质谱:对于C12H23N3O6([M+H]+)的计算的m/e:306.3;测量的m/e:306.8。
[1112] NB158及NB159的合成:
[1113] 如方案13所示制备NB158及NB159。
[1114] 方案13:
[1115]
[1116] 简要地,假三糖NB158及NB159的所述合成由所述相应的受体51完成,所述受体51是使用在吡啶中的乙酸酐在低温(-20℃)下从50的区域选择性的乙酰化中获得。在受体51与具有催化量的BF3·OEt2的三氯乙酰亚胺酯供体52和53糖基化反应期间,作为相应的β-异头物以多个极好的产率专一地提供所述受保护的假三糖54及55。以甲胺对假三糖54及55的所述全面的酯的去保护化,并且以所述施陶丁格反应将多个叠氮化物转化为多个相应的胺类产生化合物NB158及NB159。
[1117] ((2S,3R,4S)-4-乙酰氧基-2-(((1R,2S,3S,4R,6S)-3-乙酰氧基-4,6-二叠氮基-2-羟基环己基)氧基)-3-叠氮基-3,4-二氢-2H-吡喃-6-基)甲基乙酸酯(51):将化合物50(700毫克,1.82毫摩尔浓度)溶解于无水吡啶(8毫升)中并且冷却至-20℃。在此温度下,逐滴加入乙酸酐(0.6毫升,6.19毫摩尔浓度)并且在-20℃下进行所述反应。通过TLC监测所述反应进程,所述TLC表示在17小时内完成。以EtOAc稀释所述反应混合物,并且以NaHCO3、HCl(2%)、饱和NaHCO3水溶液以及盐水的水溶液萃取。将所述多个合并的有机层以无水硫酸镁干燥并浓缩。所述粗产物通过硅胶管柱层析纯化以得到51(520毫克,56%)。
[1118] 氢核磁共振(600兆赫兹,CDCl3):‘环I’:δH=5.62(d,1H,J=8.7,H-3)、5.59(d,1H,J=2.8赫兹,H-1)、5.03(d,1H,J=2.7赫兹,H-4)、4.52(q,2H,J=13.4赫兹,H-6,H-6)、3.77(dd,1H,J1=8.7,J2=2.8赫兹,H-2);‘环II’:δH=4.86(t,1H,J=9.9赫兹,H-6)、3.69(td,1H,J1=9.5,J2=4.3赫兹,H-5)、3.58(t,1H,J=9.5赫兹,H-4)、3.50(ddd,1H,J1=12.6,J2=10.0,J3=4.6赫兹,H-1)、3.37(ddd,1H,J1=12.6,J2=9.8,J3=4.6赫兹,H-3)、2.28(dt,
1H,J1=13.5,J2=4.6赫兹,H-2eq)、1.43(ddd,1H,J1=J2=J3=12.6赫兹,H-2ax);所述光谱中的所述多个额外的波峰被辨识为如下:δH=2.17(s,3H,CH3)、2.12(s,3H,CH3)、2.10(s,
3H,CH3)。
[1119] 碳13核磁共振(150兆赫兹,CDCl3):δC=170.9(CH3-CO)、170.4(CH3-CO)、170.4(CH3-CO)、148.2(C5’)、99.1(C4’)、98.8(C1’)、83.1(C4)、75.7(C6)、74.7(C5)、67.4(C3’)、62.4(C6’)、59.7(C2’)、59.1(C3)、58.0(C1)、32.6(C2)、21.1(CH3)、20.9(CH3)、20.9(CH3)。
[1120] 糖基化产物(54)的制备:将无水CH2Cl2(15毫升)加入至一粉末状火焰干燥的4埃的分子筛(2.0克)中,随后是所述受体51(270毫克,0.53毫摩尔浓度)以及供体52(1.115克,2.11毫摩尔浓度)的所述加入。将所述反应混合物在室温下搅拌10分钟,然后冷却至-30℃。
在此温度下,加入催化量的BF3-Et2O(0.1毫升),并且在-30℃下搅拌所述混合物,以及通过TLC监测所述反应进程,所述TLC表示在60分钟内完成。以乙酸乙酯稀释所述反应混合物,并且以饱和NaHCO3以及盐水洗涤。将所述合并的有机层以硫酸镁干燥、蒸发,并且进行管柱层析(EtOAc/己烷)以获得产率为80%的所述化合物54(370毫克)。
[1121] 氢核磁共振(600兆赫兹,CDCl3):‘环I’:δH=5.69(d,1H,J=2.3,H-1)、5.43(dd,1H,J1=6.4,J2=4.0赫兹,H-3)、5.07(d,1H,J=3.3赫兹,H-4)、4.55(q,2H,J=13.3赫兹,H-
6,H-6)、3.92(dd,1H,J1=6.8,J2=2.3赫兹,H-2);‘环II’:δH=5.0(t,1H,J=10.1赫兹,H-
6)、3.87(t,1H,J=9.4赫兹,H-5)、3.79(t,1H,J=9.6赫兹,H-4)、3.49(ddd,1H,J1=12.2,J2=10.0,J3=4.3赫兹,H-1)、3.43(ddd,1H,J1=12.1,J2=9.8,J3=4.5赫兹,H-3)、2.34-
2.22(m,1H,H-2eq)、1.45(ddd,1H,J1=J2=J3=12.7赫兹,H-2ax);‘环III’:δH=5.56(d,
1H,J=1.1赫兹,H-1)、5.55-5.53(m,1H,H-2)、5.44(dd,1H,J1=6.8,J2=5.3赫兹,H-3)、
4.57-4.49(m,1H,H-4)、3.66(dd,1H,J1=13.5,J2=3.6赫兹,H-5)、3.56(dd,1H,J1=13.3,J2=6.0赫兹,H-5);所述光谱中的所述多个额外的波峰被辨识为如下:δH=7.93(t,2H,J=
4.2赫兹,Ar)、7.88(dd,2H,J1=8.3,J2=1.2赫兹,Ar)、7.59-7.50(m,2H,Ar)、7.39(t,2H,J=7.9赫兹,Ar)、7.34(t,2H,J=7.9赫兹,Ar)、2.29(s,3H,CH3)、2.10(s,3H,CH3)、2.09(s,
3H,CH3)。
[1122] 碳13核磁共振(150兆赫兹,CDCl3):δC=170.3(CH3-CO)、170.1(CH3-CO)、170.0(CH3-CO)、165.5(C6H5-CO)、165.2(C6H5-CO)、149.3(C5’)、133.8(Ar)、133.7(Ar)、129.7(Ar)、129.7(Ar)、128.8(Ar)、128.7(Ar)、128.6(Ar)、128.5(Ar)、107.5(C1”)、97.9(C1’)、97.8(C4’)、80.8(C4”、C4)、78.9(C5)、74.7(C2”)、73.9(C6)、71.7(C3’)、66.8(C3”)、62.3(C6’)、59.8(C3)、59.3(C2’)、58.4(C1)、52.7(C5”)、32.5(C2)、21.1(CH3)、20.9(CH3)、20.8(CH3)。
[1123] 化合物56的制备:以MeNH2(33%的EtOH溶液,15毫升)的一溶液处理糖基化产物化合物54(370毫克,0.422毫摩尔浓度),通过TLC(EtOAc/MeOH 85:15)监测所述反应进程,所述TLC表示在12小时内完成。将所述反应混合物蒸发至干燥并进行管柱层析(MeOH/EtOAc 2:8)以97%的产率得到所述相应的完全去保护化的过叠氮基衍生物56(237毫克)。
[1124] 氢核磁共振(600兆赫兹,MeOD):‘环I’:δH=5.83(d,1H,J=2.5,H-1)、5.02(dd,1H,J1=1.8,J2=1.1Hz,H-4)、4.35(dd,1H,J1=4.4,J2=2.4Hz,H-3)、4.05-3.94(m,2H,H-
6,H-6)、3.53(dd,1H,J1=7.6,J2=4.2Hz,H-2);‘环II’:δH=3.70(t,1H,J=9.7Hz,H-4)、
3.62(t,1H,J=9.1Hz,H-5)、3.49-3.41(m,1H,H-3)、3.39(dt,1H,J1=9.8,J2=4.9Hz,H-1)、
3.37-3.34(m,1H,H-6)、2.12(dt,1H,J1=13.0,J2=4.5Hz,H-2eq)、1.23(ddd,1H,J1=J2=J3=12.5Hz,H-2ax);‘环III’:δH=5.37(d,1H,J=1.3Hz,H-1)、4.16(dd,1H,J1=4.7,J2=
1.3Hz,H-2)、4.10(dd,1H,J1=7.7,J2=4.2Hz,H-3)、4.02(dd,1H,J1=7.0,J2=2.7Hz,H-
4)、3.59(dd,1H,J1=13.3,J2=3.2Hz,H-5)、3.50(dd,1H,J1=13.2,J2=6.4Hz,H-5);
[1125] 碳13核磁共振(150兆赫兹,MeOD):δC=152.8(C5’)、111.1(C1”)、100.1(C4’)、98.8(C1’)、83.9(C5)、82.4(C4”)、79.7(C4)、77.5(C6)、76.2(C2”)、72.4(C3”)、65.3(C3’)、
64.0(C2’)、62.1(C6’)、61.9(C1)、61.7(C3)、54.2(C5”)、33.5(C2)。
[1126] NB158的制备:向化合物56(237毫克,0.438毫摩尔浓度)在THF(3毫升)以及NaOH水溶液(1毫摩尔浓度,5毫升)的一搅拌溶液中加入PMe3(在3.5毫升,40.1毫摩尔浓度的THF溶液中为1摩尔浓度)。通过TLC[CH2Cl2/MeOH/H2O/MeNH2(在EtOH中为33%的溶液),10:15:6:15]监测所述反应进程,所述TLC表示在3小时内完成。此后在一短硅胶柱上通过快速层析纯化所述反应混合物,用以下的溶剂洗涤所述管柱:THF(100毫升)、CH2Cl2(100毫升)、EtOH(50毫升)以及MeOH(100毫升)。然后以在80%MeOH中的5%MeNH2溶液(在EtOH中为33%溶液)的一混合物洗脱所述产物。将多个包含所述产物的部分合并,并且在真空下蒸发。通过将上述产物通过一短柱Amberlite CG50(NH4+形式)获得所述纯产物。首先,以水洗涤所述管柱,然后以在水中的10%NH4OH的一混合物洗脱所述产物,从而获得NB158(138毫克,75%)。
[1127] 对于储存和生物测试,将NB158转化为其硫酸盐形式,如下:将所述游离碱的形式溶解于水中,以硫酸镁(0.1当量浓度)将所述pH调节至6.7,并且冻干以提供白色泡沫状的NB158的所述硫酸盐固体。
[1128] 氢核磁共振(600兆赫兹,MeOD):‘环I’:δH=5.40(d,1H,J=2.0,H-1)、5.01(d,1H,J=3.7赫兹,H-4)、4.04(t,1H,J=5.3赫兹,H-3)、4.0(s,2H,H-6,H-6)、3.09(dd,1H,J1=5.1,J2=1.9赫兹,H-2);‘环II’:δH=3.57-3.50(m,2H,H-4,H-5)、3.19(t,1H,J=9.1赫兹,H-6)、2.79(ddd,1H,J1=12.5,J2=9.3,J3=4.3赫兹,H-3)、2.67(ddd,1H,J1=11.8,J2=
9.9,J3=4.1赫兹,H-1)、2.04(dt,1H,J1=8.3,J2=6.2赫兹,H-2eq)、1.24(ddd,1H,J1=J2=J3=12.3赫兹,H-2ax);‘环III’:δH=5.29(s,1H,H-1)、4.14(d,1H,J=5.4赫兹,H-2)、4.06-
4.02(m,1H,H-3)、3.92-3.87(m,1H,H-4)、2.98(dd,1H,J1=13.0,J2=4.4赫兹,H-5)、2.84(dd,1H,J1=12.9,J2=8.4赫兹,H-5);
[1129] 碳13核磁共振(150兆赫兹,MeOD):δC=153.4(C5’)、110.6(C1”)、100.5(C4’,C1’)、84.9(C5)、84.45(C4)、84.41(C4”)、78.9(C6)、76.3(C2”)、72.8(C3”)、67.8(C3’)、62.3(C6’)、55.0(C2’)、52.5(C1)、51.4(C3)、45.4(C5”)、37.2(C2)。
[1130] 糖基化产物(55)的制备:将无水CH2Cl2(15毫升)加入至一粉末状火焰干燥的4埃的分子筛(2.0克)中,随后是所述受体51(265毫克,0.520毫摩尔浓度)以及供体53(1.12克,2.06毫摩尔浓度)的所述加入。将所述反应混合物在室温下搅拌10分钟,然后冷却至-30℃。
在此温度下,加入催化量的BF3-Et2O(0.1毫升),并且在-30℃下搅拌所述混合物,以及通过TLC监测所述反应进程,所述TLC表示在60分钟内完成。以乙酸乙酯稀释所述反应混合物,并且以饱和NaHCO3以及盐水洗涤。将所述合并的有机层以硫酸镁干燥、蒸发,并且进行管柱层析(EtOAc/己烷)以获得产率为64%的所述化合物55(295毫克)。
[1131] 氢核磁共振(600兆赫兹,CDCl3):‘环I’:δH=5.69(d,1H,J=2.4,H-1)、5.42(dd,1H,J1=6.7,J2=3.8赫兹,H-3)、5.06(d,1H,J=3.0赫兹,H-4)、4.54(q,2H,J=13.3赫兹,H-
6,H-6)、3.96(dd,1H,J1=6.8,J2=2.5赫兹,H-2);‘环II’:δH=4.99(t,1H,J=9.9赫兹,H-
6)、3.87(t,1H,J=9.5赫兹,H-5)、3.78(t,1H,J=9.5赫兹,H-4)、3.50(ddd,1H,J1=12.6,J2=10.1,J3=4.6赫兹,H-1)、3.41(ddd,1H,J1=12.5,J2=9.7,J3=4.6赫兹,H-3)、2.28(dt,
1H,J1=13.2,J2=4.6赫兹,H-2eq)、1.44(ddd,1H,J1=J2=J3=12.7赫兹,H-2ax);‘环III’:
δH=5.58(s,1H,H-1)、5.54(d,1H,J=4.9赫兹,H-2)、5.44(dd,1H,J1=7.5,J2=5.1赫兹,H-
3)、4.31(dd,1H,J1=7.1,J2=6.0赫兹,H-4)、3.67(p,1H,J=6.7赫兹,H-5)、1.31(d,3H,J=
6.8赫兹,6-CH3);所述光谱中的所述多个额外的波峰被辨识为如下:δH=7.89(ddt,4H,J1=
14.3,J2=8.4,J3=1.4赫兹,Ar)、7.57-7.50(m,2H,Ar)、7.40-7.32(m,4H,Ar)、2.35(s,3H,CH3)、2.10(s,3H,CH3)、2.08(s,3H,CH3)。
[1132] 碳13核磁共振(150兆赫兹,CDCl3):δC=170.3(CH3-CO)、170.2(CH3-CO)、170.1(CH3-CO)、165.5(C6H5-CO)、165.0(C6H5-CO)、149.3(C5’)、133.76(Ar)、133.71(Ar)、129.75(Ar)、129.69(Ar)、128.8(Ar)、128.66(Ar)、128.61(Ar)、128.5(Ar)、107.2(C1”)、97.88(C1’)、97.87(C4’)、80.7(C4”)、81.0(C4)、78.2(C5)、74.6(C2”)、73.7(C6)、71.9(C3’)、66.9(C3”)、62.3(C6’)、59.7(C3)、59.5(C2’)、58.8(C5”)、58.4(C1)、32.5(C2)、21.08(CH3)、21.01(CH3)、20.8(CH3)、15.6(6”-CH3)。
[1133] 化合物57的制备:以MeNH2(33%的EtOH溶液,15毫升)的一溶液处理糖基化产物化合物55(295毫克,0.331毫摩尔浓度),通过TLC(EtOAc/MeOH 85:15)监测所述反应进程,所述TLC表示在12小时内完成。将所述反应混合物蒸发至干燥并进行管柱层析(MeOH/EtOAc 2:8)以99%的产率得到所述相应的完全去保护化的过叠氮基衍生物57(180毫克)。
[1134] 氢核磁共振(600兆赫兹,MeOD):‘环I’:δH=5.91(d,1H,J=2.6,H-1)、5.06(d,1H,J=2.3赫兹,H-4)、4.42(ddt,1H,J1=8.0,J2=2.7,J3=1.4,赫兹,H-3)、4.07-3.99(m,2H,H-6,H-6)、3.55(dd,1H,J1=7.9,J2=3.6赫兹,H-2);‘环II’:δH=3.74(t,1H,J=9.6赫兹,H-4)、3.66(t,1H,J=9.0赫兹,H-5)、3.47(ddd,2H,J1=12.1,J2=8.2,J3=3.3赫兹,H-1,H-3)、3.42-3.40(m,1H,H-6)、2.17(dt,1H,J1=13.2,J2=4.4赫兹,H-2eq)、1.28(ddd,1H,J1=J2=J3=12.3赫兹,H-2ax);‘环III’:δH=5.41(d,1H,J=1.9赫兹,H-1)、4.22-4.18(m,2H,H-2,H-3)、3.81(dd,1H,J1=9.2,J2=3.2赫兹,H-4)、3.72-3.66(m,1H,H-5)、1.40(d,3H,J=
6.8赫兹,6-CH3);
[1135] 碳13核磁共振(150兆赫兹,MeOD):δC=152.5(C5’)、110.5(C1”)、100.3(C4’)、98.6(C1’)、86.3(C4”)、83.4(C4)、79.4(C4)、77.4(C6)、76.2(C2”)、72.6(C3”)、65.3(C3’)、
64.0(C2’)、62.1(C6’)、61.9(C1)、61.7(C3)、60.6(C5”)、33.5(C2)、16.0(6”-CH3)。
[1136] NB159的制备:向化合物57(180毫克,0.324毫摩尔浓度)在THF(3毫升)以及NaOH水溶液(1毫摩尔浓度,5毫升)的一搅拌溶液中加入PMe3(在3.5毫升,40.1毫摩尔浓度的THF溶液中为1摩尔浓度)。通过TLC[CH2Cl2/MeOH/H2O/MeNH2(在EtOH中为33%的溶液),10:15:6:15]监测所述反应进程,所述TLC表示在3小时内完成。此后在一短硅胶柱上通过快速层析纯化所述反应混合物,用以下的溶剂洗涤所述管柱:THF(100毫升)、CH2Cl2(100毫升)、EtOH(50毫升)以及MeOH(100毫升)。然后以在80%MeOH中的5%MeNH2溶液(在EtOH中为33%溶液)的一混合物洗脱所述产物。将多个包含所述产物的部分合并,并且在真空下蒸发。通过将上述产物通过一短柱Amberlite CG50(NH4+形式)获得所述纯产物。首先,以水洗涤所述管柱,然后以在水中的10%NH4OH的一混合物洗脱所述产物,从而获得NB159(110毫克,76%)。
[1137] 对于储存和生物测试,将NB159转化为其硫酸盐形式,如下:将所述游离碱的形式溶解于水中,以硫酸镁(0.1当量浓度)将所述pH调节至6.7,并且冻干以提供白色泡沫状的NB159的所述硫酸盐固体。
[1138] 氢核磁共振(600兆赫兹,MeOD):‘环I’:δH=5.39(s,1H,H-1)、5.01(d,1H,J=3.4赫兹,H-4)、4.02(t,1H,J=4.0赫兹,H-3)、4.0(d,2H,J=2.7H-6,H-6)、3.07(d,1H,J=6.2赫兹,H-2);‘环II’:δH=3.54(dd,2H,J1=20.3,J2=10.7赫兹,H-4,H-5)、3.18(t,1H,J=9.3赫兹,H-6)、2.79(ddd,1H,J1=12.8,J2=6.9,J3=4.0赫兹,H-3)、2.67(ddd,1H,J1=
9.6,J2=5.1,J3=3.9赫兹,H-1)、2.04(dt,1H,J1=13.1,J2=4.3赫兹,H-2eq)、1.24(ddd,
1H,J1=J2=J3=12.3赫兹,H-2ax);‘环III’:δH=5.29(s,1H,H-1)、4.11(dd,1H,J1=14.7,J2=6.2赫兹,H-2,H-3)、3.59-3.54(m,1H,H-4)、2.98(t,1H,J=5.8赫兹,H-5)、1.19(d,3H,J=7.9赫兹,6-CH3);
[1139] 碳13核磁共振(150兆赫兹,MeOD):δC=153.4(C5’)、109.8(C1”)、100.4(C1’)、100.3(C4’)、88.5(C4”)、84.5(C4)、84.0(C5)、78.8(C6)、76.4(C2”)、72.9(C3”)、67.8(C3’)、62.4(C6’)、55.0(C2’)、52.6(C1)、51.4(C3)、51.3(C5”)、37.2(C2)、18.9(6”-CH3)。
[1140] 通读活性:
[1141] 基本上如本文所述的进行多个比较性体外PTC抑制活性测定,初步比较显示NB154具有比起巴龙霉胺高达接近3.5倍的通读活性,并且具有与NB82类似的活性。
[1142] 基本上如本文所述的进行多个比较性体外PTC抑制活性测定,进一步显示NB158及NB159两者与它们的相应的结构上相关的化合物NB30及NB118相比,NB158及NB159两者均表现出一类似或略低的活性。
[1143] 然而,如下表6所示,NB154,NB158及NB159的所述测量的原核蛋白质合成抑制以及伴随的所述抗菌活性显着地低于所述相应的巴龙霉胺、NB30以及NB118的所述抗菌活性,表明所述多个化合物可能表现出极低的毒性。
[1144] 表6
[1145]
[1146] 示例7:
[1147] 根据本发明一些实施例的多个多酯化示例性化合物:
[1148] 以改善细胞通透性为目标,在先前所描述的氨基糖苷类上引入了的一额外的化学修饰。所述修饰涉及所述氨基糖苷的两个或以上的羟基的所述多酯化,以生成一前体药物型的化合物。所述策略的所述合理性在于:(i)将任何疏水性R-基团连接至所述化合物将会改善所述化合物的脂质疏松性而因此增加所述细胞概率以及摄取;(ii)细胞内酯酶将会水解所述前体药物以再次生成所述活性药物;以及(iii)所需的前体药物的所述多个药物代谢动力学性质可以得到改善。
[1149] 最初地,合成三种G418多酯化衍生物:所述聚苯甲酸衍生物、Bz-G418、聚异丁酸酯衍生物、iBut-G418以及聚乙酸酯衍生物Ac-G418。然后还使用所述相同的合成的操作流程合成Bz-NB124。及下的方案14表示所述多个化合物的所述多个化学结构。
[1150] 方案14
[1151]
[1152] 多种多酯化G418化合物的合成:
[1153] 所述最终化合物63、65以及67(分别为苯甲酰基(Bz)-G418、异丁基(iBut)-G418以及乙酰氧基(Ac)-G418)的多个合成是从商业的G418进行,并且在方案15中说明。
[1154] 方案15
[1155]
[1156] 多个反应与多个条件:(a)Boc2O、H2O/MeOH、Et3N,50℃,57%(b)RCOCl、Py、4-DMAP,72%(c)TFA、DCM,72%.
[1157] 首先,将G418在其游离氨基上进行Boc保护化,从而获得化合物61,所述化合物61用作后来的多个酯化衍生物的中间体以及由TFA的多个叔丁氧羰基去保护步骤。所述Boc的保护策略的所述选择来自于进行进一步的选择性去保护化而不修饰所述多个酯官能团的所述需要。将所得多个最终化合物63、65以及67转化为多个TFA加成盐,所述多个TFA加成盐防止所述胺类与所述酯官能团反应。
[1158] G418与二叔丁醇/二碳酸酯的反应生产过叔丁氧基羰基化产物以及三叔丁氧基羰基化产物的一混合物,通过柱层析从中分离出全部的叔丁氧基羰基化产物61。在化合物61的所述分离后,将所述合成分成三个不同的合成路径(请参见方案15)。分别以苯甲酰氯,乙酰氯和异丁酰氯进行化合物61的多个酯化反应以得到所述化合物62、64以及66。在50℃下加热所述反应混合物期间获得化合物62,所述酯化反应后然后是通过TFA对所述多个Boc保护基团的去除,从而得到化合物63、65以及67。在所有获得的化合物中,所述4”羟基保持游离,推测是由于所述叔羟基的一较低的反应性。
[1159] 化合物61的制备:向G418(5克,10.06毫摩尔浓度)在20毫升MeOH:H2O(1:1)中的一搅拌溶液中滴加Et3N(120毫摩尔浓度),然后是二碳酸二叔丁酯(13.095克,60毫摩尔浓度)的加入。将所述反应混合物加热至50℃并搅拌过夜。通过TLC[MeOFI/EtOAc,1:9]监测所述反应的所述进程,所述TLC表示在24小时内完成。此后,蒸发MeOH,并且以EtOAc萃取所述剩余的水溶液,以盐水洗涤并且以硫酸镁干燥。所述残余物(EtOAc/己烷,100%EtOAc)的管柱层析得到化合物1(3.96克,57%),所述化合物1为一白色固体。
[1160] 氢核磁共振(500兆赫兹,MeOD):δ=5.45(d,1H,J=9.6赫兹,H-1’)、5.21(d,1H,J=2.3赫兹,H-1”)、4.25-4.01(m,4H)、3.79(dd,J=9.9,2.8赫兹,1H)、3.63(t,J=8.4赫兹,1H)、3.47(m,6H)、3.24-3.17(m,1H)2.94(s,3H,NCH3-C3”)、2.14-1.92(m,1H,H-2)、1.44(m,
4H,H-2,CH3-C4”)、1.24(d,J=6.2赫兹,3H)。所述光谱中的所述多个额外的波峰被辨识为如下:δ1.44(m,36H,Boc)。
[1161] 碳13核磁共振(126兆赫兹,MeOD):δ=159.30(氨基甲酸酯)、159.03(氨基甲酸酯)、158.62(氨基甲酸酯)、158.05(氨基甲酸酯)、100.08(C-1”)、99.09(C-1’)、82.33、81.27(ROC(CH3)3)、80.84(ROC(CH3)3)、80.20(ROC(CH3)3)、77.19(ROC(CH3)3)、75.02、74.71、
73.70、73.52、73.26、71.08、70.93、68.70、66.14、61.53、60.20、59.00、56.80、28.85(ROC(CH3)3)、28.84(ROC(CH3)3)、28.84(ROC(CH3)3)、28.83(ROC(CH3)3)、28.83(ROC(CH3)3)、
28.82(ROC(CH3)3)、28.79(ROC(CH3)3)、28.74(ROC(CH3)3)、22.58、22.14。
[1162] 基体辅助激光解吸电离飞行时间质谱:对于C40H72N4O18([M+Na]+)计算的m/e 919.48;测量的m/e:919.79。
[1163] 化合物62的制备:将化合物61(0.6克,0.668毫摩尔浓度)溶解于无水吡啶(15毫升)中。在搅拌下将所述溶液在冰浴中冷却,并且滴加苯甲酰氯(3毫升,8.02毫摩尔浓度)。去除所述冰浴,加入4-DMAP(催化剂),并且将所述反应混合物加热至60℃并且放置过夜。通过TLC(EtOAc/己烷5:5)监测所述反应的所述进程,如TLC所示,所述反应完成后,以EtOAc稀释所述反应混合物,并且以5%HCl溶液、NaHCO3以及盐水洗涤。将所述合并的有机层以硫酸镁干燥、蒸发,随后进行所述残余物(EtOAc/己烷,4:6)的管柱层析,从而得到化合物62(0.687克,72%),所述化合物62为一白色固体。
[1164] 氢核磁共振(500兆赫兹,CDCl3):‘环I’:δ=5.49(d,1H,J=4.9赫兹,H-1)、4.89-4.77(m,2H,H-3,H-4)、4.69-4.31(m,1H,H-6)、4.01(dd,1H,J=9.8,3.3赫兹,H-5)、3.72(dd,1H,J=11.4,3.1赫兹,H-2)、1.57-0.63(m,3H,H-7).‘环II’:δ=5.45(dd,1H,J=7.6,
3.5赫兹,H-4)、5.19(dd,1H,J=14.8,4.8赫兹,H-5)、4.08-3.96(m,1H,H-6)、3.24-2.98(m,
2H,H-1,H-3)、1.92-1.66(m,1H,H-2eq)、.57-0.63(m,1H,H-2ax)‘环III’:δ=5.47(dd,1H,J=7.9,1.5赫兹,H-2)、5.32(d,1H,J=4.0赫兹,H-1)、4.43(dd,1H,J=11.6,1.7赫兹,H-3)、δ3.44(d,1H,J=12.9赫兹,H-5)、2.89(s,3H,NCH3-C3”)、2.57(d,1H,J=13.2赫兹,H-5)、
1.57-0.63(m,3H,CH3-C4”)。所述光谱中的所述多个额外的波峰被辨识为如下:δ=8.13-
7.20(m,25H,Ph)、1.57-0.63(m,36H,Boc)
[1165] 碳13核磁共振(126兆赫兹,CDCl3):δ=165.83(C=O)、165.75(C=O)、165.34(C=O)、165.12(C=O)、165.07(C=O)、155.00(氨基甲酸酯)、154.84(氨基甲酸酯)、154.73(氨基甲酸酯)、154.67(氨基甲酸酯)、133.76(Ph)、133.66(Ph)、133.58(Ph)、133.41(Ph)、133.38(Ph)、133.22(Ph)、133.12(Ph)、132.95(Ph)、132.90(Ph)、130.15(Ph)、130.03(Ph)、
129.99(Ph)、129.96(Ph)、129.90(Ph)、129.77(Ph)、129.41(Ph)、129.30(Ph)、128.79(Ph)、
128.75(Ph)、128.67(Ph)、128.61(Ph)、128.54(Ph)、128.32(Ph)、128.23(Ph)、128.03(Ph)、
98.12(C-1”)、96.84(C-1’)、80.18(C-5)、79.88(ROC(CH3)3)、79.76(ROC(CH3)3)、79.52(ROC(CH3)3)、79.44ROC(CH3)3)、79.43(ROC(CH3)3)、79.36(C-6’)、78.54(C-5’)75.84(C-6)、
73.03(C-4)、72.39(C-2”)、70.75(C-4’)、70.04(C-3’)、69.05(C-4)69.20(C-5”)、55.67(s)、54.80(C-3”)、53.37(s)、52.89(C-3)、52.50(C-1)、49.15(C-2’)、49.13(s)、49.02(s)、
41.26(NCH3-C3”)、31.54(s)、30.32(s)、29.62(s)、28.44(Boc)、28.21(Boc)、28.20(Boc)、
28.18(ROC(CH3)3)、28.15(ROC(CH3)3)、28.09(ROC(CH3)3)、28.02(ROC(CH3)3)、27.89(ROC(CH3)3)、27.88(ROC(CH3)3)、27.86(C-6’-CH3)、22.29,20.84(C-4”-CH3)。
[1166] 基体辅助激光解吸电离飞行时间质谱:对于C75H92N4O23([M+Na]+)计算的m/e 1440.55;测量值m/e 1440.41。
[1167] G418-Bz(63)的制备:将化合物62(0.687克,0.523毫摩尔浓度)溶解于新鲜蒸馏的DCM(7毫升)中,在冰浴上冷却,并且滴加TFA(2毫升)。使所述反应混合物达到室温,通过TLC(Et3N/MeOH 1:9)监测所述反应进程,并表示所述反应在4小时内完成。此后将所述反应混合物蒸发至干燥以生产G418-Bz。对于储存和生物测试,将G418-Bz溶解于水以及甲醇中,并且冻干以得到G418-Bz的所述TFA盐(0.511克,72%)。
[1168] 氢核磁共振(500兆赫兹,MeOD):‘环I’:δ=5.72(dd,1H,J=7.6,4.8赫兹,H-3)、5.60(dd,1H,J=6.7,6.0赫兹,H-4)、5.47(bs,1H,H-1)、5.40-5.36(m,1H,H-6)、4.47(dd,
1H,J=5.9,4.6赫兹,H-5)、3.76(dd,1H,J=3.7,1.6赫兹,H-2)、1.35(d,3H,J=3.6赫兹,H-
7).‘环II’:δ=5.64(d,1H,J=8.1赫兹,H-5)、4.55(s,1H,H-4)、4.30(s,1H,H-6)、δ3.86-
3.67(m,2H,H-3,H-1)2.55(dt,1H,J=12.5,4.2赫兹,H-2eq)、2.12(q,1H,J=12.8赫兹,H-
2ax).‘环III’:δ=5.34(dd,1H,J=10.2,3.3赫兹,H-2)、5.29(d,1H,J=4.1赫兹,H-1)、
3.82(d,1H,J=10.3赫兹,H-3)、δ3.76(d,1H,J=15.1赫兹,H-5)、3.13(d,1H,J=12.2赫兹,H-5)、δ2.89(s,1H)、2.89(s,3H,NCH3-C3”)、1.26(s,3H,CH3-C4”)。所述光谱中的所述多个额外的波峰被辨识为如下:δ=8.16(d,2HJ=7.5赫兹,Ph)、8.03(dd,5H,J=16.4,7.5赫兹,Ph)、7.93(d,2H,J=7.7赫兹,Ph)、7.70(dd,3H,J=13.9,7.5赫兹,Ph)、7.57(dt,6H,J=
12.2,5.8赫兹,Ph)、7.47-7.25(m,10H,Ph)。
[1169] 碳13核磁共振(126兆赫兹,MeOD):δ=167.17(C=O)、166.89(C=O)、166.84(C=O)、166.42(C=O)、166.41(C=O)、163.61(TFA)、163.33(TFA)、163.06(TFA)、162.78(TFA)、135.21(Ph)、134.93(Ph)、134.89(Ph)、134.78(Ph)、134.56(Ph)、134.22(Ph)、134.03(Ph)、
131.00(Ph)、130.98(Ph)、130.95(Ph)、130.85(Ph)、130.76(Ph)、130.71(Ph)、130.59(Ph)、
130.47(Ph)、130.33(Ph)、130.22(Ph)、129.95(Ph)、129.76(Ph)、129.67(Ph)、129.63(Ph)、
129.58(Ph)、129.51(Ph)、129.46(Ph)、104.39(C-1”)、99.84(C-1’)、83.40(C-5)、76.05(C-
5’)、71.73(C-2”)、71.64(C-3’)70.77(C-5)、70.44(C-6)、69.05(C-4)68.50(C-4’)、63.51(C-5”)、52.46(C-3)50.18(C-3”)、50.10(C-2’)、49.62(C-1)36.05(NCH3-C3”)、29.15(C-
2)、22.27(C-6’-CH3)、16.94(C-4”-CH3)。
[1170] 基体辅助激光解吸电离飞行时间质谱:C55H60N4O15([M+H]+)的计算的m/e:1017.08;测量的m/e:1018.18。
[1171] 化合物64的制备:将化合物61(0.5克,0.557毫摩尔浓度)溶解于无水吡啶(15毫升)中。在搅拌下将所述溶液在冰浴中冷却,并且滴加异丁酰氯(0.7毫升,6.684毫摩尔浓度)。去除所述冰浴,加入4-DMAP(催化剂),并且将所述反应混合物加热至60℃并且放置过夜。通过TLC(EtOAc/己烷4:6)监测所述反应的所述进程,如TLC所示,所述反应完成后,以EtOAc稀释所述反应混合物,并且以5%HCl溶液、NaHCO3以及盐水洗涤。将所述合并的有机层以硫酸镁干燥、蒸发,随后进行所述残余物(EtOAc/己烷,3:7)的管柱层析,从而得到化合物64(0.490克,75%),所述化合物64为一白色固体。
[1172] 氢核磁共振(500兆赫兹,CDCl3):‘环I’:δ=5.27(dd,1H,J=11.8,3.5赫兹,H-3)、5.05(d,1H,J=3.7赫兹,H-1)、5.00-4.96(m,2H,H-6,H-4)、4.59-4.54(m,1H,H-5)、3.27(d,
1H,J=11.9赫兹,H-2)、1.45-1.01(m,3H,H-7).‘环II’:δ=4.94(dd,1H,J=9.7,8.3赫兹,H-5)、4.81-4.73(m,1H,H-6)、4.24-4.18(m,1H,H-4)、4.00-3.90(m,1H,H-1,H-3)、1.45-
1.01(m,2H,H-2eq,H-2ax).‘环III’:δ=4.98(d,1H,J=4.7赫兹,H-1)、4.89-4.85(m,1H,H-
2)、3.55(dd,1H,J=11.4,1.4赫兹,H-3)、3.38(dd,1H,J=4.0,2.5赫兹,H-5)、3.32(dd,1H,J=13.6,1.6赫兹,H-5)、2.96(s,3H,NCH3-C3”)、1.45-1.01(m,3H,CH3-C4”)。所述光谱中的所述多个额外的波峰被辨识为如下:δ=6.76(d,1H,J=1.3赫兹,RNHCOOR)、5.85(d,1H,J=
2.1赫兹,RNHCOOR)、5.83(d,1H,J=2.3赫兹,RNHCOOR)、5.72(d,1H,J=4.3赫兹,RNHCOOR)、
1.45-1.01(m,71H,Boc,i-But)。
[1173] 碳13核磁共振(126兆赫兹,CDCl3):δ=175.90(C=O)、175.50(C=O)、175.45(C=O)、175.39(C=O)、174.73(C=O)、157.49(氨基甲酸酯)、156.54(氨基甲酸酯)、156.16(氨基甲酸酯)、155.79(氨基甲酸酯)、99.41(C-1”)、99.01(C-1’)、83.09(s)、82.29(s)、81.73(C-6)、79.93(ROC(CH3)3)、79.79(ROC(CH3)3)、79.76(ROC(CH3)3)、79.64(ROC(CH3)3)、79.45(C-4)、77.40(s)、75.69(s)、74.74(C-5)、74.42(s)、73.50(s)、71.20(C-6’)、71.10(s)、70.59(C-3”)、70.51(s)、70.10(C-5”)、69.73(s)、69.05(C-4)、68.98(s)、68.91(C-2”)、
68.37(C-4’)、67.47(s)、67.25(C-3’)、65.38(C-2’)、55.72(s)、54.52(C-5’)、52.60(s)、
52.53(d、J=17.3赫兹)、50.83(C-3)、49.23(C-1)、41.20(N-CH3)、34.17(i-But)、34.10(i-But)、34.04(i-But)、33.98(i-But)、33.74(i-But)、29.91(s)、29.61(C-2)、28.40(i-But)、
28.36(i-But)、28.34(i-But)、28.30(i-But)、28.26(i-But)、28.18(i-But)、22.90(s)、
18.83(ROC(CH3)3)、18.73(ROC(CH3)3)、18.72(ROC(CH3)3)、18.61(ROC(CH3)3)、18.58(ROC(CH3)3)、18.49(ROC(CH3)3)、18.34(C-6’-CH3)、17.91(C-4”-CH3)。
[1174] 基体辅助激光解吸电离飞行时间质谱:对于C60H102N4O23([M+Na]+)的计算的m/e:1270.46;测量的m/e:1270.42。
[1175] G418-i-But(65)的制备:将化合物64(0.490g,0.42毫摩尔浓度)溶解于新鲜蒸馏的DCM(10毫升)中,在冰浴上冷却,并且滴加TFA(2毫升)。使所述反应混合物达到室温,通过TLC(Et3N/MeOH 1:9)监测所述反应进程,并表示所述反应在4小时内完成。此后将所述反应混合物蒸发至干燥以生产G418-i-But。对于储存和生物测试,将G418-i-But溶解于水以及甲醇中,并且冻干以得到G418-i-But的所述TFA盐(0.408克,78%)。
[1176] 氢核磁共振(500兆赫兹,MeOD):‘环I’:δ=5.38(dd,1H,J=8.8,6.2赫兹,H-3)、5.25(d,1H,J=5.9赫兹,H-1)、5.23-5.16(m,H,H-6)、5.07(dd,1H,J=6.6,6.1赫兹,H-4)、
4.09(dd,1H,J=6.0,5.3赫兹,H-5)、3.62(dd,1H,J=4.6,2.0赫兹,H-2)、1.31(d,3H,J=
6.7赫兹,H-7).‘环II’:δ=5.50(dd,1H,J=11.3,7.3赫兹,H-5)、4.21-4.14(m,2H,H-4,H-
6)、3.70(m,2H,H-1.H-3)、2.61-2.54(m,1H,H-2,eq)、2.17(ddd,J=12.69,1H,H-2,ax).‘环III’:δ=5.29(d,1H,J=3.1赫兹,H-1)、5.21(dd,1H,J=8.8,2.7赫兹,H-2)、3.66(d,1H,J=9.7赫兹,H-3)、3.74(d,1H,J=13.0赫兹,H-5)、3.45(d,1H,J=12.5赫兹,H-5)、2.88(s,
3H,NCH3-C3”)、1.38(s,3H,CH3-C4”)。所述光谱中的所述多个额外的波峰被辨识为如下:δ=1.21(m,35H,i-But)。
[1177] 碳13核磁共振(126兆赫兹,MeOD):δ=177.35(C=O)、177.3(C=O177.19(C=O)、176.83(C=O)、176.67(C=O)、163.22(TFA)、162.94(TFA)、162.66(TFA)、162.38(TFA)、
121.44(TFA)、119.12(TFA)、116.80(TFA)、114.47(TFA)、97.77(C-1”)、92.81(C-1’)、81.81(C-6)、77.48(C-4)、76.61(C-5’)、74.59(C-5)、70.03(C-3’)、69.71(C-6’)、69.24(C-5”)、
69.05(C-4)、68.27(C-2”)、67.26(C-4’)、63.62(C-3”)、51.66(C-2’)、50.29(C-3)、49.86(C-1)、35.56(NCH3-C3”)、35.22(i-But)、35.18(i-But)、34.93(i-But)、34.87(i-But)、
34.80(i-But)、28.61(C-2)、27.71(s)、23.19(s)、19.27(i-But)、19.24(i-But)、19.18(i-But)、19.16(i-But)、19.10(i-But)、18.98(i-But)、18.72(i-But)、18.67(C-6’-CH3)、
16.20(C-4”-CH3)。
[1178] 基体辅助激光解吸电离飞行时间质谱:对于C36H63N4O13计算的m/e777.9;测量的m/e:777.54。
[1179] 化合物66的制备:将化合物61(0.3克,0.334毫摩尔浓度)溶解于无水吡啶(8毫升)中。在搅拌下将所述溶液在冰浴中冷却,并且滴加乙酰氯(0.3毫升,4.008毫摩尔浓度)。去除所述冰浴,加入4-DMAP(催化剂),并且将所述反应混合物加热至60℃并且放置过夜。通过TLC(EtOAc/己烷6.5:4.5)监测所述反应的所述进程,如TLC所示,所述反应完成后,以EtOAc稀释所述反应混合物,并且以5%HCl溶液、NaHCO3以及盐水洗涤。将所述合并的有机层以硫酸镁干燥、蒸发,随后进行所述残余物(EtOAc/己烷,5:5)的管柱层析,从而得到化合物66(0.25克,68%),所述化合物66为一白色固体。
[1180] 1H核磁共振(500兆赫兹,CDCl3):‘环I’:δ=5.38(d,1H,J=11.5赫兹,H-1)、5.20(dd,1H,J=2.4,1.3赫兹,H-3)、4.60(dd,1H,J=11.4,3.5赫兹,H-4)、4.45(dd,1H,J=11.8,1.3赫兹,H-4)、4.14-4.09(m,1H,H-5)、3.31(dd,1H,J=12.4,1.0赫兹,H-2)、1.46-
1.20(m,3H,H-7).‘环II’:δ=3.95-3.68(m,3H,H-4,H-5,H-6)、3.65-3.20(m,2H,H-1,H-3)、
2.73-2.49(m,1H,H-2)、2.46-2.26(m,1H,H-2).‘环III’:δ=5.20-5.18(m,2H,H-1,H-2)、
4.18-4.12(m,1H,H-3)、3.80-3.73(m,1H,H-5)、3.57-3.51(m,1H,H-5)、2.94(s,3H,NCH3-C3”)、1.46-1.20(m,3H,CH3-C4”)。所述光谱中的所述多个额外的波峰被辨识为如下:δ=
6.74(s,1H,RNHCOOR)、5.90(s,1H,RNHCOOR)、5.88(s,1H,RNHCOOR)、5.52(s,2H,RNHCOOR)、
2.13-1.92(m,12H,Ac)、1.47-1.21(m,36H,Boc)。
[1181] 13C核磁共振(126兆赫兹,CDCl3):δ=170.76(C=O)、170.59(C=O)、169.70(C=O)、169.31(C=O)、157.65(氨基甲酸酯)、156.98(氨基甲酸酯)、156.42(氨基甲酸酯)、155.63(氨基甲酸酯)、99.48(C-1”)、98.39(C-1’)、85.88(C-6)、82.50(C-4)、80.04(s)、
79.95(ROC(CH3)3)、79.80(ROC(CH3)3)、79.64(ROC(CH3)3)、79.38(ROC(CH3)3)、79.29(s)、
75.66(C-5)、74.32(s)、71.89(C-3’)、70.58(C-2’)、70.35(C-5’)、70.32(C-2”)、70.29(C-
3”)、69.05(C-4)、68.70(C-6’)、60.35(C-5”)、54.37(C-4’)、50.28(C-3)、50.08(C-1)、
41.19(N-CH3)、30.50(C-2)、28.38(ROC(CH3)3)、28.34(ROC(CH3)3)、28.29(ROC(CH3)3)、
28.27(ROC(CH3)3)、28.21(ROC(CH3)3)、28.14(ROC(CH3)3)、22.93(s)、21.70(C-4”-CH3)、
20.82(Ac)、20.72(Ac)、20.70(Ac)、20.63(Ac)、14.13(C-6’-CH3)。
[1182] 基体辅助激光解吸电离飞行时间质谱:对于C48H80N4O22([M+Na]+)计算的m/e 1088.16;测量的m/e:1088.27。
[1183] G418-Ac(67)的制备:将化合物66(0.25克,0.23毫摩尔浓度)溶解于新鲜蒸馏的DCM(5毫升)中,在冰浴上冷却,并且滴加TFA(1毫升)。使所述反应混合物达到室温,通过TLC(Et3N/MeOH 1:9)监测所述反应进程,并表示所述反应在4小时内完成。此后将所述反应混合物蒸发至干燥以生产G418-Ac。对于储存和生物测试,将G418-Ac溶解于水以及甲醇中,并且冻干以得到G418-Ac的所述TFA盐(0.19克,73%)。
[1184] 氢核磁共振(500兆赫兹,MeOD):‘环I’:δ=5.28(d,1H,J=3.8赫兹,H-1)、5.08(dd,1H,J=10.5,9.3赫兹,H-3)、4.67(dd,1H,J=10.0,8.8赫兹,H-4)、4.62-4.60(m,1H,H-6)、4.02(dd,1H,J=10.0,1.5赫兹,H-5)、3.40(dd,1H,J=10.9,3.7赫兹,H-2)、0.89(d,3HJ=6.1赫兹,H-7’).).‘环II’:δ=3.82-3.77(m,3H,H-4,H-5,H-6)、3.56-3.46(m,2H,H-1,H-
3)、2.52(dd,1H,J=8.0,4.0赫兹,H-2)、2.00-1.90(m,1H,H-2).‘环III’:δ=5.28(d,1H,J=4.2赫兹,H-1)、5.14(dd,1H,J=11.2,3.1赫兹,H-2)、3.66(d,1H,J=11.0赫兹,H-3)、
3.90(d,1H,J=6.9赫兹,H-5)、3.56-3.46(m,1H,H-52.76)、(s,3H,NCH3-C3”)、1.26(s,3H,CH3-C4”)。所述光谱中的所述多个额外的波峰被辨识为如下:δ=2.08(s,3H,乙酸)、2.00(s,3H,乙酸)、1.97(s,3H,乙酸)、1.97(s,3H,乙酸)。
[1185] 碳13核磁共振(126兆赫兹,MeOD):δ=171.65(羰基)、171.43(羰基)、171.09(羰基)、162.93(TFA)、162.64(TFA)、162.36(TFA)、162.05(TFA)、121.33(TFA)、119.00(TFA)、116.68(TFA)、114.36(TFA)、99.35(C-1’)、97.99(C-1”)、84.02(C-6)、83.43(C-4)、75.15(C-5)、73.17(C-5’)、70.85(C-6’)、70.62(C-2”)、70.16(C-3’)、69.57(C-4’)、69.09(C-
5”)、69.05(C-4)、62.74(C-3”)、53.44(C-2’)、49.87(C-3)、49.73(C-1)、35.81(N-CH3)、
29.19(C-2)、22.05(C-4”-CH3)、21.04(乙酸)、20.96(乙酸)、20.69(乙酸)、20.50(乙酸)、
13.81(C-7’)。
[1186] 基体辅助激光解吸电离飞行时间质谱:C28H48N4O14([M+Na]+)的计算的([M+Na]+)m/e 664.32;测量的m/e:664.32。
[1187] Bz-NB124的合成:
[1188] 如以下的方案16中所描绘的来制备NB124的一示例性多酯化形式,所述NB124以多苄基酯类为特征以及在本文中也被称为NB124-Bz酯或Bz-NB124。
[1189] 方案16
[1190]
[1191] 通过先前所述来合成所述起始材料NB124[Kandasamy等人,药物化学杂志(J.Med.Chem.)2012]。NB124作为其游离胺的形式通过Boc保护所有氨基产生化合物71作进一步修饰。接着,通过以苯甲酰氯的处理,将所述多个仲羟基转化为所述多个相应的苯甲酸酯以生产化合物72。最后,通过用TFA处理进行Boc-去保护,得到所需化合物NB124-Bz,所述NB124-Bz作为所述TFA盐。
[1192] 化合物71的制备:
[1193] 向NB124(0.5克,1.036毫摩尔浓度)在10毫升MeOH:H2O(1:1)中的一搅拌溶液中滴加Et3N(8.289毫摩尔浓度),然后是二碳酸二叔丁酯(4克,18.648毫摩尔浓度)的加入。将反应混合物加热至50℃并搅拌过夜。通过TLC[MeOFI/EtOAc,1:9]监测所述反应的所述进程,所述TLC表示在24小时内完成。此后,蒸发MeOH,并且以EtOAc萃取所述剩余的水溶液,以盐水洗涤并且以硫酸镁干燥。所述残余物(EtOAc/己烷,100%EtOAc)的管柱层析得到化合物71(0.580克,60%),所述化合物71为一白色固体。
[1194] 氢核磁共振(500兆赫兹,MeOD):δ=5.52(s,1H,H-1’)、5.16(s,1H,H-1”)、4.12(m,3H)、3.89(dd,J=10.0,3.0赫兹,1H)、3.78(d,J=6.3赫兹,2H)、3.68-3.48(m,6H)、3.43(dd,J=15.6,7.4赫兹,1H)、3.33-3.24(m,1H)、1.96(d,J=15.6赫兹,1H)、1.51-1.47(m,
40H,Boc)1.27(dd,6H,J=10.2,4.0赫兹,C6’-CH3,C5”-CH3)。
[1195] 碳13核磁共振(126兆赫兹,MeOD):δ=157.27(氨基甲酸酯)、157.03(氨基甲酸酯)、156.85(Carbamate)、156.78(氨基氨基甲酸酯酸酯)、109.99(C-1”)、96.61(C-1’)、86.23、84.35、82.32、79.38、78.78、77.17、74.09、73.66、72.83、72.30、70.49、70.11、
69.28、66.91、62.86、60.09、55.20、55.12、51.03、49.64、34.47、29.46、29.31、27.46(氨基甲酸酯)、27.44(氨基甲酸酯)、27.33(氨基甲酸酯)、26.09、26.07、15.65、13.04。
[1196] 基体辅助激光解吸电离飞行时间质谱:对于C39H70N4O18([M+Na]+)计算的m/e 905.99;测量的m/e:905.61。
[1197] 化合物72的制备:
[1198] 将化合物71(0.195克,0.129毫摩尔浓度)溶解于无水吡啶(8毫升)中。在搅拌下将所述溶液在冰浴中冷却,并且滴加苯甲酰氯(0.2毫升,1.552毫摩尔浓度)。去除所述冰浴,加入4-DMAP(催化剂),并且将所述反应混合物加热至50℃并且放置过夜。通过TLC(EtOAc/己烷1:1)监测所述反应的所述进程,如TLC所示,所述反应完成后,以EtOAc稀释所述反应混合物,并且以5%HCl溶液、NaHCO3以及盐水洗涤。将所述合并的有机层以硫酸镁干燥、蒸发,随后进行所述残余物(EtOAc/己烷,1:1)的管柱层析,从而得到化合物70(0.269克,80%),所述化合物70为一白色固体。
[1199] 氢核磁共振(500兆赫兹,CDCl3):‘环I’:δ=5.81(d,1H,J=4.1赫兹,H-1)、5.55(dd,1HJ=10.5,9.0赫兹,H-3)、5.49(dd,1HJ=5.6,4.3赫兹,H-4)、5.26-5.21(m,1H,H-6)、4.61(dd,1H,J=9.4,2.1赫兹,H-5)、4.42(dd,1H,J=7.3,1.1赫兹,H-2)、1.55(d,3HJ=6.5赫兹,H-7).‘环II’:δ=5.40(dd,1H,J=3.6,2.0赫兹,H-4)、5.27(dd,1H,J=3.5,1.4赫兹,H-5)、4.13-4.05(m,1H,H-6)、3.93-3.84(m,2H,H-1,H-3)、1.55(dd,1H,J=4.9,1.1赫兹,H-
2eq)、1.24-1.20(m,1H,H-2ax).‘环III’:δ=5.39(d,1H,J=4.7赫兹,H-1)、5.28(dd,1H,J=12.8,6.1赫兹,H-3)、5.10(dd,1H,J=9.5,4.6赫兹,H-2)、3.76-3.64(m,1H,H-4)、1.55(d,1H,J=6.5赫兹,H-5)、1.22(d,3H,J=6.3赫兹,H-6)。所述光谱中的所述多个额外的波峰被辨识为如下:δ=8.14-7.13(m,30H,Ph)、1.51(s,9H,Boc)、1.39(s,9H,Boc)、1.25(s,
9H,Boc)、1.12(s,9H,Boc)。
[1200] 碳13核磁共振(101兆赫兹,CDCl3):δ=166.39(C=O)、165.94(C=O)、165.49(C=O)、165.36(C=O)、164.94(C=O)、164.41(C=O)、155.59(氨基甲酸酯)、155.28(氨基甲酸酯)、155.05(氨基甲酸酯)、154.78(氨基甲酸酯)、133.44(Ph)、133.36(Ph)、133.23(Ph)、133.05(Ph)、132.95(Ph)、130.38(Ph)、130.24(Ph)、129.96(Ph)、129.88(Ph)、129.82(Ph)、
129.55(Ph)、129.31(Ph)、129.11(Ph)、128.96(Ph)、128.87(Ph)、128.78(Ph)、128.29(Ph)、
128.22(Ph)、128.13(Ph)、107.44(C-1”)、97.30(C-1’)、82.93(C-6)、81.67、80.03(ROC(CH3)3)、79.56(ROC(CH3)3)、79.40(ROC(CH3)3)、79.19(ROC(CH3)3)、78.32(C-3)、75.77(C-
4)、75.68(C-3”)75.15(C-5)、72.48(C-4’)、70.02(C-2”)、70.69(C-6’)、70.07(C-5’)、
69.94(C-3’)、60.33(C-4”)、53.26(C-2’)、50.2(C-5”)49.68(C-3)、47.64(C-1)、34.82(C-
2)、28.47(ROC(CH3)3)、28.42(ROC(CH3)3)、27.95(ROC(CH3)3)、27.80(ROC(CH3)3)、20.97(C-
7’)、17.73(C-6”)、14.18(C-6”)。
[1201] 基体辅助激光解吸电离飞行时间质谱:对于C81H94N4O24([M+Na]+)计算的m/e 1530.81;测量的m/e:1530.81。
[1202] NB124-Bz的制备:将化合物72(0.189克,0.125毫摩尔浓度)溶解于新鲜蒸馏的DCM(5毫升)中,在冰浴上冷却并滴加TFA(1毫升)。使反应混合物达到室温。通过TLC(Et 3N/MeOH 1:99)监测反应的扩展,这表明4小时后反应完成。将反应混合物蒸发至干,得到NB124-Bz。对于储存和生物测试,将NB124-Bz溶解于水和甲醇中并冻干,得到NB124-Bz的TFA盐(0.191克,97%)。
[1203] 氢核磁共振(500兆赫兹,MeOD):‘环I’:δ=6.53(d,1H,J=3.8赫兹,H-1)、6.10(dd,1HJ=10.6,9.9赫兹,H-3)、5.76(dd,1HJ=10.1,9.2赫兹,H-4)、5.53-5.47(m,1H,H-6)、4.53(dd,1H,J=9.8,3.9赫兹,H-5)、4.09(d,1HJ=13.5赫兹,H-2)、1.46(d,3H,J=3.2赫兹,H-7).‘环II’:δ=5.51(dd,1H,J=10.0,8.6赫兹,H-4)、4.85-4.81(m,1H,H-5)、4.47(dd,1H,J=10.1,8.2赫兹,H-6)、3.88-3.77(m,2H,H-1,H-3)、2.68-2.61(m,1H,H-2)、2.19-
2.09(m,1H,H-2).‘环III’:δ=5.77(s,1H,H-1)、5.50(dd,1H,J=8.8,4.3赫兹,H-3)、5.40(dd,1H,J=3.5,0.4赫兹,H-2)、4.10(dd,1H,J=10.0,8.6赫兹,H-4)、3.52-3.46(m,1H,H-
5)、0.96(d,3H,J=6.6赫兹,H-6)。所述光谱中的所述多个额外的波峰被辨识为如下:δ=
8.03-7.81(m,Ph)、7.65-7.24(m,Ph)、7.01(m,Ph)。
[1204] 碳13核磁共振(126兆赫兹,MeOD):δ=167.31(C=O)、167.13(C=O)、166.92(C=O)、166.76(C=O)、165.67(C=O)、165.14(C=O)、163.27(TFA)、162.99(TFA)、162.70(TFA)、162.43(TFA)、135.04(Ph)、134.91(Ph)、134.90(Ph)、134.87(Ph)、134.84(Ph)、134.57(Ph)、134.03(Ph)、130.97(Ph)、130.82(Ph)、130.70(Ph)、130.51(Ph)、129.95(Ph)、
129.86(Ph)、129.69(Ph)、129.67(Ph)、129.60(Ph)、129.58(Ph)、129.50(Ph)、129.45(Ph)、
129.34(Ph)、129.24(Ph)、129.02(Ph)、121.29(TFA)、118.98(TFA)、116.66(TFA)、114.35(TFA)、107.23(C-1”)、92.70(C-1’)、81.08(C-5)、80.78(C-2’)、76.93(C-6)、76.76(C-2”)、
75.28(C-4)、72.95(C-3”)、72.48(C-5’)、71.82(C-3’)、71.48(C-6’)、70.92(C-4’)、53.85(C-4”)、52.34(C-5”)、50.26(C-3)、50.04(C-1)、29.28(C-2)、16.61(C-7’)、14.19(C-6”)。
[1205] 基体辅助激光解吸电离飞行时间质谱:对于C61H62N4O16([M+Na]+)的计算的m/e 1129.42;测量的m/e:1129.42。
[1206] 虽然本发明已经结合其特定实施例进行了描述,但是显而易见的是,许多备选方案,修饰以及变化对本领域技术人员来说是显而易见的。因此,本发明旨在涵盖所有落入所述权利要求的精神和范围内的所有这样的备选方案,修饰以及变化。
[1207] 在本说明书中提及的所有出版物,专利和专利申请以其整体作为参考文献并入本说明书中,其程度如同各独立的出版物、专利或专利申请案被明确地且个别地标示为以引用的方式并入本文中。此外,本申请中任何参考文献的引用或证明不应被解释为承认所述参考文献可作为本发明的现有技术。本申请中标题部分在本文中用于使本说明书容易理解,而不应被解释为必要的限制。
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