1.一种分离的新抗原肽，其包含肿瘤特异性新表位，其中所述分离的新抗原肽不是天然多肽，其中所述新表位包含由下式表示的氨基酸序列的至少8个连续氨基酸：
AxByCz，
其中
每个A和C代表对应于所述天然多肽的氨基酸，
y为至少1，并且B代表所述天然多肽的氨基酸置换物或插入物，
x+y+z为至少8，
所述至少8个连续氨基酸包含By，并且
所述天然多肽由选自下组的基因编码：
(a)ABL1，其中AxByCz是
(i)
VADGLITTLHYPAPKRNKPTVYGVSPNYDKWEMERTDITMKHKLGGGQYGKVYEGVWKKYSLTVAVKTLKEDTMEVEEFLKEAAVMKEIKHPNLVQLLGVC，
(ii)
VADGLITTLHYPAPKRNKPTVYGVSPNYDKWEMERTDITMKHKLGGGQYGVVYEGVWKKYSLTVAVKTLKEDTMEVEEFLKEAAVMKEIKHPNLVQLLGVC，
(iii)
LLGVCTREPPFYIITEFMTYGNLLDYLRECNRQEVNAVVLLYMATQISSATEYLEKKNFIHRDLAARNCLVGENHLVKVADFGLSRLMTGDTYTAHAGAKF，
(iv)
SLTVAVKTLKEDTMEVEEFLKEAAVMKEIKHPNLVQLLGVCTREPPFYIIIEFMTYGNLLDYLRECNRQEVNAVVLLYMATQISSAMEYLEKKNFIHRDLA，或
(v)
STVADGLITTLHYPAPKRNKPTVYGVSPNYDKWEMERTDITMKHKLGGGQHGEVYEGVWKKYSLTVAVKTLKEDTMEVEEFLKEAAVMKEIKHPNLVQLLG；
(b)ALK，其中AxByCz是
(i)
SSLAMLDLLHVARDIACGCQYLEENHFIHRDIAARNCLLTCPGPGRVAKIADFGMARDIYRASYYRKGGCAMLPVKWMPPEAFMEGIFTSKTDTWSFGVLL，或
(ii)
QVAVKTLPEVCSEQDELDFLMEALIISKFNHQNIVRCIGVSLQSLPRFILMELMAGGDLKSFLRETRPRPSQPSSLAMLDLLHVARDIACGCQYLEENHFI；
(c)BRAF，其中AxByCz是
MIKLIDIARQTAQGMDYLHAKSIIHRDLKSNNIFLHEDLTVKIGDFGLATEKSRWSGSHQFEQLSGSILWMAPEVIRMQDKNPYSFQSDVYAFGIVLYELM；
(d)BTK，其中AxByCz是
MIKEGSMSEDEFIEEAKVMMNLSHEKLVQLYGVCTKQRPIFIITEYMANGSLLNYLREMRHRFQTQQLLEMCKDVCEAMEYLESKQFLHRDLAARNCLVND；
(e)EEF1B2，其中AxByCz是
MGFGDLKSPAGLQVLNDYLADKSYIEGYVPSQADVAVFEAVSGPPPADLCHALRWYNHIKSYEKEKASLPGVKKALGKYGPADVEDTTGSGAT；
(f)EGFR，其中AxByCz是
(i)
SLNITSLGLRSLKEISDGDVIISGNKNLCYANTINWKKLFGTSGQKTKIIRNRGENSCKATGQVCHALCSPEGCWGPEPRDCVSCRNVSRGRECVDKCNLL，或
(ii)
IPVAIKELREATSPKANKEILDEAYVMASVDNPHVCRLLGICLTSTVQLIMQLMPFGCLLDYVREHKDNIGSQYLLNWCVQIAKGMNYLEDRRLVHRDLAA；
(g)ERBB3，其中AxByCz是
ERCEVVMGNLEIVLTGHNADLSFLQWIREVTGYVLVAMNEFSTLPLPNLRMVRGTQVYDGKFAIFVMLNYNTNSSHALRQLRLTQLTEILSGGVYIEKNDK；
(h)ESR1，其中AxByCz是
(i)
HLMAKAGLTLQQQHQRLAQLLLILSHIRHMSNKGMEHLYSMKCKNVVPLYGLLLEMLDAHRLHAPTSRGGASVEETDQSHLATAGSTSSHSLQKYYITGEA，
(ii)
NQGKCVEGMVEIFDMLLATSSRFRMMNLQGEEFVCLKSIILLNSGVYTFLPSTLKSLEEKDHIHRVLDKITDTLIHLMAKAGLTLQQQHQRLAQLLLILSH，
(iii)
IHLMAKAGLTLQQQHQRLAQLLLILSHIRHMSNKGMEHLYSMKCKNVVPLCDLLLEMLDAHRLHAPTSRGGASVEETDQSHLATAGSTSSHSLQKYYITGE，
(iv)
IHLMAKAGLTLQQQHQRLAQLLLILSHIRHMSNKGMEHLYSMKCKNVVPLNDLLLEMLDAHRLHAPTSRGGASVEETDQSHLATAGSTSSHSLQKYYITGE，或
(v)
IHLMAKAGLTLQQQHQRLAQLLLILSHIRHMSNKGMEHLYSMKCKNVVPLSDLLLEMLDAHRLHAPTSRGGASVEETDQSHLATAGSTSSHSLQKYYITGE；
(i)FGFR3，其中AxByCz是
HRIGGIKLRHQQWSLVMESVVPSDRGNYTCVVENKFGSIRQTYTLDVLERCPHRPILQAGLPANQTAVLGSDVEFHCKVYSDAQPHIQWLKHVEVNGSKVG；
(j)FRG1B，其中AxByCz是
AVKLSDSRIALKSGYGKYLGINSDELVGHSDAIGPREQWEPVFQNGKMALSASNSCFIRCNEAGDIEAKSKTAGEEEMIKIRSCAEKETKKKDDIPEEDKG；
(k)HER2，其中AxByCz是
GSGAFGTVYKGIWIPDGENVKIPVAIKVLRENTSPKANKEILDEAYVMAGLGSPYVSRLLGICLTSTVQLVTQLMPYGCLLDHVRENRGRLGSQDLLNWCM；
(l)IDH1，其中AxByCz是
(i)
RVEEFKLKQMWKSPNGTIRNILGGTVFREAIICKNIPRLVSGWVKPIIIGHHAYGDQYRATDFVVPGPGKVEITYTPSDGTQKVTYLVHNFEEGGGVAMGM，
(ii)
RVEEFKLKQMWKSPNGTIRNILGGTVFREAIICKNIPRLVSGWVKPIIIGCHAYGDQYRATDFVVPGPGKVEITYTPSDGTQKVTYLVHNFEEGGGVAMGM，
(iii)
RVEEFKLKQMWKSPNGTIRNILGGTVFREAIICKNIPRLVSGWVKPIIIGGHAYGDQYRATDFVVPGPGKVEITYTPSDGTQKVTYLVHNFEEGGGVAMGM，或
(iv)
RVEEFKLKQMWKSPNGTIRNILGGTVFREAIICKNIPRLVSGWVKPIIIGSHAYGDQYRATDFVVPGPGKVEITYTPSDGTQKVTYLVHNFEEGGGVAMGM；
(m)KIT，其中AxByCz是
(i)
VEATAYGLIKSDAAMTVAVKMLKPSAHLTEREALMSELKVLSYLGNHMNIANLLGACTIGGPTLVITEYCCYGDLLNFLRRKRDSFICSKQEDHAEAALYK，或
(ii)
VEATAYGLIKSDAAMTVAVKMLKPSAHLTEREALMSELKVLSYLGNHMNIANLLGACTIGGPTLVITEYCCYGDLLNFLRRKRDSFICSKQEDHAEAALYK；
(n)MEK，其中AxByCz是
(i)
ISELGAGNGGVVFKVSHKPSGLVMARKLIHLEIKPAIRNQIIRELQVLHESNSPYIVGFYGAFYSDGEISICMEHMDGGSLDQVLKKAGRIPEQILGKVSI，或
(ii)
LGAGNGGVVFKVSHKPSGLVMARKLIHLEIKPAIRNQIIRELQVLHECNSLYIVGFYGAFYSDGEISICMEHMDGGSLDQVLKKAGRIPEQILGKVSIAVI；
(o)MYC，其中AxByCz是
(i)
MPLNVSFTNRNYDLDYDSVQPYFYCDEEENFYQQQQQSDLQPPAPSEDIWKKFELLPTPPLSPSRRSGLCSPSYVAVTPFSLRGDNDGG，
(ii)
FTNRNYDLDYDSVQPYFYCDEEENFYQQQQQSELQPPAPSEDIWKKFELLSTPPLSPSRRSGLCSPSYVAVTPFSLRGDNDGGGGSFSTADQLEMVTELLG，或
(iii)
TNRNYDLDYDSVQPYFYCDEEENFYQQQQQSELQPPAPSEDIWKKFELLPIPPLSPSRRSGLCSPSYVAVTPFSLRGDNDGGGGSFSTADQLEMVTELLGG；
(p)PDGFRa，其中AxByCz是
VAVKMLKPTARSSEKQALMSELKIMTHLGPHLNIVNLLGACTKSGPIYIIIEYCFYGDLVNYLHKNRDSFLSHHPEKPKKELDIFGLNPADESTRSYVILS；
(q)PIK3CA，其中AxByCz是
(i)
IEEHANWSVSREAGFSYSHAGLSNRLARDNELRENDKEQLKAISTRDPLSKITEQEKDFLWSHRHYCVTIPEILPKLLLSVKWNSRDEVAQMYCLVKDWPP，
(ii)
HANWSVSREAGFSYSHAGLSNRLARDNELRENDKEQLKAISTRDPLSEITKQEKDFLWSHRHYCVTIPEILPKLLLSVKWNSRDEVAQMYCLVKDWPPIKP，或
(iii)
LFINLFSMMLGSGMPELQSFDDIAYIRKTLALDKTEQEALEYFMKQMNDARHGGWTTKMDWIFHTIKQHALN；
(r)POLE，其中AxByCz是
QRGGVITDEEETSKKIADQLDNIVDMREYDVPYHIRLSIDIETTKLPLKFRDAETDQIMMISYMIDGQGYLITNREIVSEDIEDFEFTPKPEYEGPFCVFN；
(s)PTEN，其中AxByCz是
KFNCRVAQYPFEDHNPPQLELIKPFCEDLDQWLSEDDNHVAAIHCKAGKGQTGVMICAYLLHRGKFLKAQEALDFYGEVRTRDKKGVTIPSQRRYVYYYSY；
(t)RAC1，其中AxByCz是
MQAIKCVVVGDGAVGKTCLLISYTTNAFSGEYIPTVFDNYSANVMVDGKPVNLGLWDTAGQEDYDRLRPLSYPQTVGET；以及
(u)TP53，其中AxByCz是
(i)
IRVEGNLRVEYLDDRNTFRHSVVVPYEPPEVGSDCTTIHYNYMCNSSCMGSMNRRPILTIITLEDSSGNLLGRNSFEVRVCACPGRDRRTEEENLRKKGEP，
(ii)
TYSPALNKMFCQLAKTCPVQLWVDSTPPPGTRVRAMAIYKQSQHMTEVVRHCPHHERCSDSDGLAPPQHLIRVEGNLRVEYLDDRNTFRHSVVVPYEPPEV，
(iii)
EGNLRVEYLDDRNTFRHSVVVPYEPPEVGSDCTTIHYNYMCNSSCMGGMNQRPILTIITLEDSSGNLLGRNSFEVRVCACPGRDRRTEEENLRKKGEPHHE，
(iv)
EGNLRVEYLDDRNTFRHSVVVPYEPPEVGSDCTTIHYNYMCNSSCMGGMNWRPILTIITLEDSSGNLLGRNSFEVRVCACPGRDRRTEEENLRKKGEPHHE，或
(v)
PEVGSDCTTIHYNYMCNSSCMGGMNRRPILTIITLEDSSGNLLGRNSFEVCVCACPGRDRRTEEENLRKKGEPHHELPPGSTKRALPNNTSSSPQPKKKPL。
2.如权利要求1所述的分离的新抗原肽，其中所述天然多肽由EGFR、ERBB3或FGFR3基因编码，并且至少一个By在细胞外表达。
3.一种分离的新抗原肽，其包含肿瘤特异性新表位，其中所述分离的新抗原肽不是天然多肽，其中所述新表位包含由下式表示的氨基酸序列的至少8个连续氨基酸：
AxByCz
其中
每个A为对应于所述天然多肽的氨基酸；
By不存在；
每个C为由编码所述天然多肽的序列的移码编码的氨基酸；
x+y+z为至少8；
所述至少8个连续氨基酸包含至少一个Cz；并且
所述天然多肽由选自下组的基因编码：
(a)APC，其中Cz是
(i)
AKFQQCHSTLEPNPADCRVLVYLQNQPGTKLLNFLQERNLPPKVVLRHPKVHLNTMFRRPHSCLADVLLSVHLIVLRVVRLPAPFRVNHAVEW，
(ii)
APVIFQIALDKPCHQAEVKHLHHLLKQLKPSEKYLKIKHLLLKRERVDLSKLQ，或
(iii)MLQFRGSRFFQMLILYYILPRKVLQMDFLVHPA；
(b)ARID1A，其中Cz是
(i)
ALGPHSRISCLPTQTRGCILLAATPRSSSSSSSNDMIPMAISSPPKAPLLAAPSPASRLQCINSNSRITSGQWMAHMALLPSGTKGRCTACHTALGRGSLSSSSCPQPSPSLPASNKLPSLPLSKMYTTSMAMPILPLPQLLLSADQQAAPRTNFHSSLAETVSLHPLAPMPSKTCHHK，
(ii)
AHQGFPAAKESRVIQLSLLSLLIPPLTCLASEALPRPLLALPPVLLSLAQDHSRLLQCQATRCHLGHPVASRTASCILP，
(iii)
PILAATGTSVRTAARTWVPRAAIRVPDPAAVPDDHAGPGAECHGRPLLYTADSSLWTTRPQRVWSTGPDSILQPAKSSPSAAAATLLPATTVPDPSCPTFVSAAATVSTTTAPVLSASILPAAIPASTSAVPGSIPLPAVDDTAAPPEPAPLLTATGSVSLPAAATSAASTLDALPAGCVSSAPVSAVPANCLFPAALPSTAGAISRFIWVSGILSPLNDLQ，(iv)
PCRAGRRVPWAASLIHSRFLLMDNKAPAGMVNRARLHITTSKVLTLSSSSHPTPSNHRPRPLMPNLRISSSHSLNHHSSSPLSLHTPSSHPSLHISSPRLHTPPSSRRHSSTPRASPPTHSHRLSLLTSSSNLSSQHPRRSPSRLRILSPSLSSPSKLPIPSSASLHRRSYLKIHLGLRHPQPPQ，
(v)
RTNPTVRMRPHCVPFWTGRILLPSAASVCPIPFEACHLCQAMTLRCPNTQGCCSSWAS，或
(vi)
TNQALPKIEVICRGTPRCPSTVPPSPAQPYLRVSLPEDRYTQAWAPTSRTPWGAMVPRGVSMAHKVATPGSQTIMPCPMPTTPVQAWLEA；
(c)β2M，其中Cz是
(i)
RMERELKKWSIQTCLSARTGLSISCTTLNSPPLKKMSMPAV，或
(ii)LCSRYSLFLAWRLSSVLQRFRFTHVIQQRMESQIS；
(d)CDH1，其中Cz是
(i)
RSACVTVKGPLASVGRHSLSKQDCKFLPFWGFLEEFLLC，
(ii)
IQWGTTTAPRPIRPPFLESKQNCSHFPTPLLASEDRRETGLFLPSAAQKMKKAHFLKTWFRSNPTKTKKARFSTASLAKELTHPLLVSLLLKEKQDG，
(iii)
PTDPFLGLRLGLHLQKVFHQSHAEYSGAPPPPPAPSGLRFWNPSRIAHISQLLSWPQKTEERLGYSSHQLPRK，
(iv)
FCCSCCFFGGERWSKSPYCPQRMTPGTTFITMMKKEAEKRTRTLT，或
(v)
WRRNCKAPVSLRKSVQTPARSSPARPDRTRRLPSLGVPGQPWALGAAASRRCCCCCRSPLGSARSRSPATLALTPRATRSRCPGATWREAASWAE；
(e)GATA3，其中Cz是
(i)
PGRPLQTHVLPEPHLALQPLQPHADHAHADAPAIQPVLWTTPPLQHGHRHGLEPCSMLTGPPARVPAVPFDLHFCRSSIMKPKRDGYMFLKAESKIMFATLQRSSLWCLCSNH；或
(ii)
PRPRRCTRHPACPLDHTTPPAWSPPWVRALLDAHRAPSESPCSPFRLAFLQEQYHEA；
(f)MLL2，其中Cz是
TRRCHCCPHLRSHPCPHHLRNHPRPHHLRHHACHHHLRNCPHPHFLRHCTCPGRWRNRPSLRRLRSLLCLPHLNHHLFLHWRSRPCLHRKSHPHLLHLRRLYPHHLKHRPCPHHLKNLLCPRHLRNCPLPRHLKHLACLHHLRSHPCPLHLKSHPCLHHRRHLVCSHHLKSLLCPLHLRSLPFPHHLRHHACPHHLRTRLCPHHLKNHLCPPHLRYRAYPPCLWCHACLHRLRNLPCPHRLRSLPRPLHLRLHASPHHLRTPPHPHHLRTHLLPHHRRTRSCPCRWRSHPCCHYLRSRNSAPGPRGRTCHPGLRSRTCPPGLRSHTYLRRLRSHTCPPSLRSHAYALCLRSHTCPPRLRDHICPLSLRNCTCPPRLRSRTCLLCLRSHACPPNLRNHTCPPSLRSHACPPGLRNRICPLSLRSHPCPLGLKSPLRSQANALHLRSCPCSLPLGNHPYLPCLESQPCLSLGNHLCPLCPRSCRCPHLGSHPCRLS；
(g)PTEN，其中Cz是
(i)
SWKGTNWCNDMCIFITSGQIFKGTRGPRFLWGSKDQRQKGSNYSQSEALCVLL，
(ii)KRTKCFTFG，
(iii)PIFIQTLLLWDFLQKDLKAYTGTILMM，
(iv)QKMILTKQIKTKPTDTFLQILR，
(v)
GFWIQSIKTITRYTIFVLKDIMTPPNLIAELHNILLKTITHHS，
(vi)
NYSNVQWRNLQSSVCGLPAKGEDIFLQFRTHTTGRQVHVL，或
(vii)
YQSRVLPQTEQDAKKGQNVSLLGKYILHTRTRGNLRKSRKWKSM；
(h)TP53，其中Cz是
(i)
SSQNARGCSPRGPCTSSSYTGGPCTSPLLAPVIFCPFPENLPGQLRFPSGLLAFWDSQVCDLHVLPCPQQDVLPTGQDLPCAAVG，
(ii)
GAAPTMSAAQIAMVWPLLSILSEWKEICVWSIWMTETLFDIVWWCPMSRLRLALTVPPSTTTTCVTVPAWAA，(iii)
TGGPSSPSSHWKTPVVIYWDGTALRCVFVPVLGETGAQRKRISARKGSLTTSCPQGALSEHCPTTPAPLPSQRRNHWMENISPFRSVGVSASRCSES，
(iv)FHTPARHPRPRHGHLQAVTAHDGGCEALPPP，
(v)
CCPRTILNNGSLKTQVQMKLPECQRLLPPWPLHQQLLHRRPLHQPPPGPCHLLSLPRKPTRAATVSVWASCILGQPSL，
(vi)VRKHFQTYGNYFLKTTFCPPCRPKQWMI，或
(vii)
LARTPLPSTRCFANWPRPALCSCGLIPHPRPAPASAPWPSTSSHST；或
(i)VHL，其中Cz是
(i)
ELQETGHRQVALRRSGRPPKCAERPGAADTGAHCTSTDGRLKISVETYTVSSQLLMVLMSLDLDTGLVPSLVSKCLILRVK，
(ii)KSDASRLSGA，
(iii)RTAYFCQYHTASVYSERAMPPGCPEPSQA，
(iv)
TRASPPRSSSAIAVRASCCPYGSTSTASRSPTQRCRLARAAASTATEVTFGSSEMQGHTMGFWLTKLNYLCHLSMLTDSLFLPISHCQCIL，
(v)SSLRITGDWTSSGRSTKIWKTTQMCRKTWSG，或
(vi)
RRRRGGVGRRGVRPGRVRPGGTGRRGGDGGRAAAARAALGELARALPGHLLQSQSARRAARMAQLRRRAAALPNAAAWHGPPHPQLPRSPLALQRCRDTRWASG；
(j)ACVR2A，其中AxByCz是
(i)
GVEPCYGDKDKRRHCFATWKNISGSIEIVKQGCWLDDINCYDRTDCVEKKRQP，或
(ii)
GVEPCYGDKDKRRHCFATWKNISGSIEIVKQGCWLDDINCYDRTDCVEKKTALKYIFVAVRAICVMKSFLIFRRWKSHSPLQIQLHLSHPITTSCSIPWCHLC；
(k)C15ORF40，其中AxByCz是
TAEAVNVAIAAPPSEGEANAELCRYLSKVLELRKSDVVLDKVGLALFFFFFETKSCSVAQAGVQWRSLGSLQPPPPGFKLFSCLSFLSSWDYRRMPPCLANFCIFNRDGVSPCWSGWS；
(l)CNOT1，其中AxByCz是
(i)
LSVIIFFFVYIWHWALPLILNNHHICLMSSIILDCNSVRQSIMSVCFFFFSVIFSTRCLTDSRYPNICWFK，或
(ii)
LSVIIFFFVYIWHWALPLILNNHHICLMSSIILDCNSVRQSIMSVCFFFFCYILNTMFDR；
(m)EIF2B3，其中AxByCz或Cz是
VLVLSCDLITDVALHEVVDLFRAYDASLAMLMRKGQDSIEPVPGQKGKKKQWSSVTSLEWTAQERGCSSWLMKQTWMKSWSLRDPSYRSILEYVSTRVLWMPTSTV；
(n)EPHB2，其中AxByCz或Cz是
SIQVMRAQMNQIQSVEGQPLARRPRATGRTKRCQPRDVTKKTCNSNDGKKREWEKRKQILGGGGKYKEYFLKRILIRKAMTVLAGDKKGLGRFMRCVQSETKAVSLQLPLGR；
(o)ESRP1，其中AxByCz是
(i)
LDFLGEFATDIRTHGVHMVLNHQGRPSGDAFIQMKSADRAFMAAQKCHKKKHEGQIC，或
(ii)
LDFLGEFATDIRTHGVHMVLNHQGRPSGDAFIQMKSADRAFMAAQKCHKKT；
(p)FAM11B，其中AxByCz是
GALCKDGRFRSDIGEFEWKLKEGHKKIYGKQSMVDEVSGKVLEMDISKKKHYNRKISIKKLNRMKVPLMKLITRV；
(q)GBP3，其中AxByCz是
RERAQLLEEQEKTLTSKLQEQARVLKERCQGESTQLQNEIQKLQKTLKKKPRDICRIS；
(r)JAK1，其中AxByCz是
(i)
VNTLKEGKRLPCPPNCPDEVYQLMRKCWEFQPSNRTSFQNLIEGFEALLKTSN，或
(ii)
CRPVTPSCKELADLMTRCMNYDPNQRPFFRAIMRDINKLEEQNPDIVSEKNQQLKWTPHILKSAS；
(s)LMAN1，其中AxByCz是
(i)
DDHDVLSFLTFQLTEPGKEPPTPDKEISEKEKEKYQEEFEHFQQELDKKKRGIPEGPPRPPRAACGGNI，或(ii)
DDHDVLSFLTFQLTEPGKEPPTPDKEISEKEKEKYQEEFEHFQQELDKKKRNSRRATPTSKGSLRRKYLRV；
(t)MSH3，其中AxByCz是
(i)
TKSTLIGEDVNPLIKLDDAVNVDEIMTDTSTSYLLCISENKENVRDKKKGQHFYWHCGSAACHRRGCV，或(ii)
LYTKSTLIGEDVNPLIKLDDAVNVDEIMTDTSTSYLLCISENKENVRDKKRATFLLALWECSLPQARLCLIVSRTLLLVQS；
(u)NDUFC2，其中AxByCz是
(i)
LPPPKLTDPRLLYIGFLGYCSGLIDNLIRRRPIATAGLHRQLLYITAFFFCWILSCKT，或
(ii)
SLPPPKLTDPRLLYIGFLGYCSGLIDNLIRRRPIATAGLHRQLLYITAFFLLDIIL；
(v)RBM27，其中AxByCz是
NQSGGAGEDCQIFSTPGHPKMIYSSSNLKTPSKLCSGSKSHDVQEVLKKKTGSNEVTTRYEEKKTGSVRKANRMPKDVNIQVRKKQKHETRRKSKYNEDFERAWREDLTIKR；
(w)RPL22，其中AxByCz是
(i)MAPVKKLVVKGGKKKEASSEVHS，或
(ii)MAPVKKLVVKGGKKRSKF；
(x)SEC31A，其中AxByCz是
(i)
MPSHQGAEQQQQQHHVFISQVVTEKEFLSRSDQLQQAVQSQGFINYCQKKN，或
(ii)
MPSHQGAEQQQQQHHVFISQVVTEKEFLSRSDQLQQAVQSQGFINYCQKKLMLLRLNLRKMCGPF；
(y)SEC63，其中AxByCz是
(i)
AEVFEKEQSICAAEEQPAEDGQGETNKNRTKGGWQQKSKGPKKTAKSKKKETFKKKTYTCAITTVKATETKAGKWSRWE，或
(ii)
MAEVFEKEQSICAAEEQPAEDGQGETNKNRTKGGWQQKSKGPKKTAKSKKRNL；
(z)SLC35F5，其中AxByCz是
NIMEIRQLPSSHALEAKLSRMSYPVKEQESILKTVGKLTATQVAKISFFFALCGFWQICHIKKHFQTHKLL；
(aa)SMAP1，其中AxByCz是
(i)
YEKKKYYDKNAIAITNISSSDAPLQPLVSSPSLQAAVDKNKLEKEKEKKKGREKERKGARKAGKTTYS，或(ii)
KYEKKKYYDKNAIAITNISSSDAPLQPLVSSPSLQAAVDKNKLEKEKEKKRKRKREKRSQKSRQNHLQLKSCRRKISNWSLKKVPALKKLRSPLWIF；
(bb)TFAM，其中AxByCz是
(i)
IYQDAYRAEWQVYKEEISRFKEQLTPSQIMSLEKEIMDKHLKRKAMTKKKRVNTAWKTKKTSFSL，或
(ii)
IYQDAYRAEWQVYKEEISRFKEQLTPSQIMSLEKEIMDKHLKRKAMTKKKS；
(cc)TGFBR2，其中AxByCz是
(i)
KPQEVCVAVWRKNDENITLETVCHDPKLPYHDFILEDAASPKCIMKEKKKAW，或
(ii)
EKPQEVCVAVWRKNDENITLETVCHDPKLPYHDFILEDAASPKCIMKEKKSLVRLSSCVPVALMSAMTTSSSQKNITPAILTCC；
(dd)THAP5，其中AxByCz是
VPSKYQFLCSDHFTPDSLDIRWGIRYLKQTAVPTIFSLPEDNQGKDPSKKNPRRKTWKMRKKYAQKPSQKNHLY；
(ee)TTK，其中AxByCz是
GTTEEMKYVLGQLVGLNSPNSILKAAKTLYEHYSGGESHNSSSSKTFEKKGEKNDLQLFVMSDTTYKIYWTVILLNPCGNLHLKTTSL；以及(ff)XPOT，其中AxByCz是
QQLIRETLISWLQAQMLNPQPEKTFIRNKAAQVFALLFVTEYLTKWPKFFLTFSQ。
4.一种分离的新抗原肽，其包含肿瘤特异性新表位，其中所述分离的新抗原肽不是天然多肽，其中所述新表位包含由下式表示的氨基酸序列的至少8个连续氨基酸：
AxByCz
其中
每个A为对应于第一天然多肽的氨基酸；
每个C为对应于第二天然多肽或对应于所述第一天然多肽的隐蔽外显子或剪接变体的外显子的氨基酸，
每个B为不是对应于所述第一天然多肽、所述第二天然多肽或所述第一天然多肽的隐蔽外显子的氨基酸的氨基酸，并且
x+y+z为至少8，其中
y不存在，并且所述至少8个连续氨基酸包含至少一个Ax和至少一个Cz，或
y为至少1，并且所述至少8个连续氨基酸包含至少一个By，
其中：
(a)所述第一天然多肽由BCR基因编码，所述第二天然多肽由ABL基因编码，并且
(i)y为0，并且AxByCz是
ERAEWRENIREQQKKCFRSFSLTSVELQMLTNSCVKLQTVHSIPLTINKEEALQRPVASDFEPQGLSEAARWNSKENLLAGPSENDPNLFVALYDFVASG，或
(ii)y为1，并且AxByCz是
ELQMLTNSCVKLQTVHSIPLTINKEDDESPGLYGFLNVIVHSATGFKQSSKALQRPVASDFEPQGLSEAARWNSKENLLAGPSENDPNLFVALYDFVASGD；
(b)所述第一天然多肽由C11orf95基因编码，所述第二天然多肽由RELA基因编码，y为
1，并且AxByCz是
ISNSWDAHLGLGACGEAEGLGVQGAEEEEEEEEEEEEEGAGVPACPPKGPELFPLIFPAEPAQASGPYVEIIEQPKQRGMRFRYKCEGRSAGSIPGERSTD；
(c)所述第一天然多肽由CBFB基因编码并且所述第二天然多肽由MYH11基因编码，y为
0，并且AxByCz是
LQRLDGMGCLEFDEERAQQEDALAQQAFEEARRRTREFEDRDRSHREEMEVHELEKSKRALETQMEEMKTQLEELEDELQATEDAKLRLEVNMQALKGQF；
(d)所述第一天然多肽由CD74基因编码并且所述第二天然多肽由ROS1基因编码，y为0，并且AxByCz是
KGSFPENLRHLKNTMETIDWKVFESWMHHWLLFEMSRHSLEQKPTDAPPKAGVPNKPGIPKLLEGSKNSIQWEKAEDNGCRITYYILEIRKSTSNNLQNQ；
(e)所述第一天然多肽由EGFR基因编码并且所述第二天然多肽由以下基因编码：
(i)SEPT14基因，y为0，并且AxByCz是
LPQPPICTIDVYMIMVKCWMIDADSRPKFRELIIEFSKMARDPQRYLVIQLQDKFEHLKMIQQEEIRKLEEEKKQLEGEIIDFYKMKAASEALQTQLSTD；或
(ii)EGFR基因，y为1，并且AxByCz是
MRPSGTAGAALLALLAALCPASRALEEKKGNYVVTDHGSCVRACGADSYEMEEDGVRKCKKCEGPCRKVCNGIGIGEFKD；
(f)所述第一天然多肽由EML4基因编码，所述第二天然多肽由ALK基因编码，y为1，并且AxByCz是
SWENSDDSRNKLSKIPSTPKLIPKVTKTADKHKDVIINQAKMSTREKNSQVYRRKHQELQAMQMELQSPEYKLSKLRTSTIMTDYNPNYCFAGKTSSISDL
(g)所述第一天然多肽由FGFR3基因编码，所述第二天然多肽由TACC3基因编码，y为0，并且AxByCz是
EGHRMDKPANCTHDLYMIMRECWHAAPSQRPTFKQLVEDLDRVLTVTSTDVKATQEENRELRSRCEELHGKNLELGKIMDRFEEVVYQAMEEVQKQKELS，
(h)所述第一天然多肽由NAB基因编码，所述第二天然多肽由STAT6基因编码，y为至少
1，并且AxByCz是
RDNTLLLRRVELFSLSRQVARESTYLSSLKGSRLHPEELGGPPLKKLKQEATSKSQIMSLWGLVSKMPPEKVQRLYVDFPQHLRHLLGDWLESQPWEFLVGSDAFCC；
(i)所述第二天然多肽由ERG编码，y为0，并且
(i)所述第一天然多肽由NDRG1基因编码，并且AxByCz是
MSREMQDVDLAEVKPLVEKGETITGLLQEFDVQEALSVVSEDQSLFECAYGTPHLAKTEMTASSSSDYGQTSKMSPRVPQQDW，或
(ii)所述第一天然多肽由TMPRSS2基因编码，并且AxByCz是
MALNSEALSVVSEDQSLFECAYGTPHLAKTEMTASSSSDYGQTSKMSPRVPQQDW；
(j)所述第一天然多肽由PML基因编码，所述第二天然多肽由RARA基因编码，y为1，并且AxByCz是
(i)
VLDMHGFLRQALCRLRQEEPQSLQAAVRTDGFDEFKVRLQDLSSCITQGKAIETQSSSSEEIVPSPPSPPPLPRIYKPCFVCQDKSSGYHYGVSACEGCKG，或
(ii)
RSSPEQPRPSTSKAVSPPHLDGPPSPRSPVIGSEVFLPNSNHVASGAGEAAIETQSSSSEEIVPSPPSPPPLPRIYKPCFVCQDKSSGYHYGVSACEGCKG；
(k)所述第一天然多肽由RUNX1基因编码，所述第二天然多肽由CBFA2T1(RUNX1T1)基因编码，y为1，并且AxByCz是
VARFNDLRFVGRSGRGKSFTLTITVFTNPPQVATYHRAIKITVDGPREPRNRTEKHSTMPDSPVDVKTQSRLTPPTMPPPPTTQGAPRTSSFTPTTLTNGT；
(l)所述第一天然多肽由AR-v7基因编码，剪接变体的隐蔽外显子或外显子由AR-v7基因编码，y为0，并且AxByCz是
SCKVFFKRAAEGKQKYLCASRNDCTIDKFRRKNCPSCRLRKCYEAGMTLGEKFRVGNCKHLKMTRP。
5.一种分离的新抗原肽，其包含肿瘤特异性新表位，其中所述分离的新抗原肽不是天然多肽，其中所述新表位包含由下式表示的氨基酸序列的至少8个连续氨基酸：
AxByCz
其中
每个A为对应于第一天然多肽的氨基酸；
每个B为不是对应于所述第一天然多肽或第二天然多肽的氨基酸的氨基酸，
每个C为由编码第二天然多肽的序列的移码编码的氨基酸；
x+y+z为至少8，其中
y不存在，并且所述至少8个连续氨基酸包含至少一个Cz，或
y为至少1，并且所述至少8个连续氨基酸包含至少一个By和/或至少一个Cz；并且
(a)所述第一天然多肽由AC011997.1基因编码，所述第二天然多肽由LRRC69基因编码，y为1，并且AxByCz是
MAGAPPPASLPPCSLISDCCASNQRDSVGVGPSEPGNNIKICNESASRK
(b)所述第一天然多肽由EEF1DP3基因编码，所述第二天然多肽由FRY基因编码，y为1，并且AxByCz是
HGWRPFLPVRARSRWNRRLDVTVANGRSWKYGWSLLRVPQVNGIQVLNVSLKSSSNVISY，
(c)所述第一天然多肽由MAD1L1基因编码，所述第二天然多肽由MAFK基因编码，y为0，并且AxByCz是
RLKEVFQTKIQEFRKACYTLTGYQIDITTENQYRLTSLYAEHPGDCLIFKLRVPGSSVLVTVPGL，或
(d)所述第一天然多肽由PPP1R1B基因编码，所述第二天然多肽由STARD3基因编码，y为
1，并且AxByCz是
AEVLKVIRQSAGQKTTCGQGLEGPWERPPPLDESERDGGSEDQVEDPALSALLLRPRPPRPEVGAHQDEQAAQGADPRLGAQPACRGLPGLLTVPQPEPLLAPPSAA。
6.如权利要求1-5中任一项所述的分离的新抗原肽，其中所述分离的新抗原肽包含根据表1的序列。
7.如权利要求1-6中任一项所述的分离的新抗原肽，其中x+y+z为至多500、至多250、至多150、至多125或至多100。
8.如权利要求1-7中任一项所述的分离的新抗原肽，其中x+y+z为至少8、至少50、至少
100、至少200或至少300。
9.如权利要求1-8中任一项所述的分离的新抗原肽，其中z为至多500、至多250、至多
150、至多125或至多100。
10.如权利要求1-9中任一项所述的分离的新抗原肽，其中z为至少8、至少50、至少100、至少200或至少300。
11.如权利要求1-10中任一项所述的分离的新抗原肽，其中所述分离的新抗原肽的长度为约8至约500个氨基酸。
12.如权利要求11所述的分离的新抗原肽，其中所述分离的新抗原肽的长度为约8至约
100个氨基酸。
13.如权利要求12所述的分离的新抗原肽，其中所述分离的新抗原肽的长度为约8至约
50个氨基酸。
14.如权利要求13所述的分离的新抗原肽，其中所述分离的新抗原肽的长度为约15至约35个氨基酸。
15.如权利要求13所述的分离的新抗原肽，其中所述分离的新抗原肽的长度为约8至约
15个氨基酸。
16.如权利要求13所述的分离的新抗原肽，其中所述分离的新抗原肽的长度为约8至约
11个氨基酸。
17.如权利要求13所述的分离的新抗原肽，其中所述分离的新抗原肽的长度为9或10个氨基酸。
18.如权利要求1-17中任一项所述的分离的新抗原肽，其中所述分离的新抗原肽结合主要组织相容性复合物(MHC)I类。
19.如权利要求18所述的分离的新抗原肽，其中所述分离的新抗原肽以约500nM或更小的结合亲和力结合MHC I类。
20.如权利要求19所述的分离的新抗原肽，其中所述分离的新抗原肽以约250nM或更小的结合亲和力结合MHC I类。
21.如权利要求19所述的分离的新抗原肽，其中所述分离的新抗原肽以约50nM或更小的结合亲和力结合MHC I类。
22.如权利要求1-21中任一项所述的分离的新抗原肽，其中所述分离的新抗原肽的长度为约8至约30个氨基酸。
23.如权利要求22所述的分离的新抗原肽，其中所述分离的新抗原肽的长度为约8至约
25个氨基酸。
24.如权利要求23所述的分离的新抗原肽，其中所述分离的新抗原肽的长度为约15至约24个氨基酸。
25.如权利要求23所述的分离的新抗原肽，其中所述分离的新抗原肽的长度为约9至约
15个氨基酸。
26.如权利要求1-17和22-25中任一项所述的分离的新抗原肽，其中所述分离的新抗原肽结合MHC II类。
27.如权利要求26所述的分离的新抗原肽，其中所述分离的新抗原肽以1000nM或更小的结合亲和力结合MHC II类。
28.如权利要求27所述的分离的新抗原肽，其中所述分离的新抗原肽以约500nM或更小的结合亲和力结合MHC I类。
29.如权利要求1-28中任一项所述的分离的新抗原肽，其中所述分离的新抗原肽进一步包含侧翼氨基酸。
30.如权利要求29所述的分离的新抗原肽，其中所述侧翼氨基酸不是天然侧翼氨基酸。
31.如权利要求1-30中任一项所述的分离的新抗原肽，其中所述分离的新抗原肽的总长度为至少8、至少9、至少10、至少11、至少12、至少13、至少14、至少15、至少16、至少17、至少18、至少19、至少20、至少21、至少22、至少23、至少24、至少25、至少26、至少27、至少28、至少29、至少30、至少40、至少50、至少60、至少70、至少80、至少90、至少100、至少150、至少
200、至少250、至少300、至少350、至少400、至少450或至少500个氨基酸。
32.如权利要求1-31中任一项所述的分离的新抗原肽，其中所述分离的新抗原肽的总长度为至多8、至多9、至多10、至多11、至多12、至多13、至多14、至多15、至多16、至多17、至多18、至多19、至多20、至多21、至多22、至多23、至多24、至多25、至多26、至多27、至多28、至多29、至多30、至多40、至多50、至多60、至多70、至多80、至多90、至多100、至多150、至多
200、至多250、至多300、至多350、至多400、至多450或至多500个氨基酸。
33.如权利要求1-32中任一项所述的分离的新抗原肽，其中所述分离的新抗原肽为与至少第二新抗原肽连接的第一新抗原肽。
34.如权利要求33所述的分离的新抗原肽，其中所述分离的新抗原肽通过聚甘氨酸或聚丝氨酸接头与所述至少第二新抗原肽连接。
35.如权利要求33或34所述的分离的新抗原肽，其中所述第二新抗原肽以小于约
1000nM的结合亲和力结合MHC I类或II类。
36.如权利要求35所述的分离的新抗原肽，其中所述第二新抗原肽以小于约500nM的结合亲和力结合MHC I类或II类。
37.如权利要求35或36所述的分离的新抗原肽，其中分离的新抗原肽和所述第二新抗原肽与人白细胞抗原(HLA)-A、-B、-C、-DP、-DQ或-DR结合。
38.如权利要求35-37中任一项所述的分离的新抗原肽，其中所述分离的新抗原肽结合I类HLA，并且所述第二新抗原肽结合II类HLA。
39.如权利要求35-37中任一项所述的分离的新抗原肽，其中所述分离的新抗原肽结合II类HLA，并且所述第二新抗原肽结合I类HLA。
40.如权利要求35-37中任一项所述的分离的新抗原肽，其中所述分离的新抗原肽进一步包含增加体内半衰期、细胞靶向、抗原摄取、抗原处理、MHC亲和力、MHC稳定性、抗原呈递或其组合的修饰。
41.如权利要求40所述的分离的新抗原肽，其中所述修饰为与载体蛋白偶联、与配体偶联、与抗体偶联、PEG化、聚唾液酸化HES化、重组PEG模拟物、Fc融合、白蛋白融合、纳米颗粒附着、纳米颗粒包封、胆固醇融合、铁融合、酰化、酰胺化、糖基化、侧链氧化、磷酸化、生物素化、添加表面活性物质、添加氨基酸模拟物或添加非天然氨基酸。
42.如权利要求40或41所述的分离的新抗原肽，其中所述分离的新抗原肽进一步包含增加针对抗原呈递细胞的细胞靶向的修饰。
43.如权利要求42所述的分离的新抗原肽，其中所述抗原呈递细胞为树突细胞。
44.如权利要求43所述的分离的新抗原肽，其中使用DEC205、XCR1、CD197、CD80、CD86、CD123、CD209、CD273、CD283、CD289、CD184、CD85h、CD85j、CD85k、CD85d、CD85g、CD85a、CD141、CD11c、CD83、TSLP受体、Clec9a或CD1a标志物来靶向所述树突细胞。
45.如权利要求44所述的分离的新抗原肽，其中使用CD141、DEC205、Clec9a或XCR1标志物来靶向所述树突细胞。
46.如权利要求42-45中任一项所述的分离的新抗原肽，其中所述树突细胞为自体细胞。
47.如权利要求42-46中任一项所述的分离的新抗原肽，其中一种或多种所述树突细胞与T细胞结合。
48.如权利要求47所述的分离的新抗原肽，其中所述T细胞为自体T细胞。
49.如权利要求1-48中任一项所述的分离的新抗原肽，其中所述分离的新抗原肽不是表2中列出的分离的新抗原肽。
50.如权利要求1-48中任一项所述的分离的新抗原肽，其中所述分离的新抗原肽与表1或表2中列出的至少一种附加新抗原肽连接。
51.一种体内递送系统，其包含权利要求1-50中任一项所述的分离的新抗原肽。
52.如权利要求51所述的递送系统，其中所述递送系统包括细胞穿透肽、纳米颗粒包封、病毒样颗粒、脂质体或其任何组合。
53.如权利要求52所述的递送系统，其中所述细胞穿透肽为TAT肽、单纯疱疹病毒VP22、转运蛋白、Antp或其任何组合。
54.一种细胞，其包含权利要求1-50中任一项所述的分离的新抗原肽。
55.如权利要求54所述的细胞，其中所述细胞为抗原呈递细胞。
56.如权利要求55所述的细胞，其中所述细胞为树突细胞。
57.如权利要求54-56中任一项所述的细胞，其中所述细胞为自体细胞。
58.如权利要求54-57中任一项所述的细胞，其中所述细胞与T细胞结合。
59.如权利要求58所述的细胞，其中所述T细胞为自体T细胞。
60.一种组合物，其包含权利要求1-50中任一项所述的分离的新抗原肽。
61.如权利要求60所述的组合物，其中所述组合物包含至少2、至少3、至少4、至少5、至少6、至少7、至少8、至少9、至少10、至少11、至少12、至少13、至少14、至少15、至少16、至少
17、至少18、至少19、至少20、至少21、至少22、至少23、至少24、至少25、至少26、至少27、至少
28、至少29、至少30、至少40、至少50、至少60、至少70、至少80、至少90或至少100种根据表1或表2的包含肿瘤特异性新表位的所述分离的新抗原肽。
62.如权利要求61所述的组合物，其中所述组合物包含约2至约20种新抗原肽或约2至约30种新抗原肽。
63.如权利要求61或62所述的组合物，其中所述新抗原对个体受试者的肿瘤具有特异性。
64.如权利要求60-63中任一项所述的组合物，其中所述组合物进一步包含至少1、至少
2、至少3、至少4、至少5、至少6、至少7、至少8、至少9、至少10、至少11、至少12、至少13、至少
14、至少15、至少16、至少17、至少18、至少19、至少20、至少21、至少22、至少23、至少24或至少25、至少26、至少27、至少28、至少29、至少30、至少40、至少50、至少60、至少70、至少80、至少90或至少100种附加新抗原肽。
65.如权利要求64所述的组合物，其中所述组合物包含约4至约20种附加新抗原肽、约4至约30种附加新抗原肽。
66.如权利要求60-65中任一项所述的组合物，其中至少一种所述附加新抗原肽对个体受试者的肿瘤具有特异性。
67.如权利要求66所述的组合物，其中通过鉴定受试者肿瘤样品的基因组、外显子组和/或转录组与非肿瘤样品的基因组、外显子组和/或转录组之间的序列差异来选择所述受试者特异性新抗原肽。
68.如权利要求67所述的组合物，其中所述样品为新鲜的或福尔马林固定石蜡包埋的肿瘤组织、新鲜分离的细胞或循环肿瘤细胞。
69.如权利要求67或68所述的组合物，其中所述序列差异通过下一代测序来确定。
70.一种分离的多核苷酸，其编码权利要求1-50中任一项所述的分离的新抗原肽。
71.如权利要求70所述的分离的多核苷酸，其中所述多核苷酸为DNA。
72.如权利要求70所述的分离的多核苷酸，其中所述多核苷酸为RNA。
73.如权利要求72所述的分离的多核苷酸，其中所述RNA为自扩增RNA。
74.如权利要求72或73所述的分离的多核苷酸，其中对所述RNA进行修饰以增加稳定性，增加细胞靶向，提高翻译效率、佐剂性、胞质可及性，和/或降低细胞毒性。
75.如权利要求74所述的分离的多核苷酸，其中所述修饰为与载体蛋白偶联、与配体偶联、与抗体偶联、密码子优化、增加GC含量、掺入修饰的核苷、掺入5’-帽或帽类似物和/或掺入未掩蔽的聚A序列。
76.一种细胞，其包含权利要求70-75中任一项所述的多核苷酸。
77.一种载体，其包含权利要求70-75中任一项所述的多核苷酸。
78.如权利要求77所述的载体，其中所述多核苷酸与启动子可操作地连接。
79.如权利要求77或78所述的载体，其中所述载体为自扩增RNA复制子、质粒、噬菌体、转座子、粘粒、病毒或病毒粒子。
80.如权利要求79所述的载体，其中所述载体来源于腺相关病毒、疱疹病毒、慢病毒或其假型。
81.一种体内递送系统，其包含权利要求70-75中任一项所述的分离的多核苷酸。
82.如权利要求81所述的递送系统，其中所述递送系统包括球形核酸、病毒、病毒样颗粒、质粒、细菌质粒或纳米颗粒。
83.一种细胞，其包含权利要求77-82中任一项所述的载体或递送系统。
84.如权利要求83所述的细胞，其中所述细胞为抗原呈递细胞。
85.如权利要求84所述的细胞，其中所述细胞为树突细胞。
86.如权利要求85所述的细胞，其中所述细胞为未成熟的树突细胞。
87.一种组合物，其包含至少一种权利要求70-75中任一项所述的多核苷酸。
88.如权利要求87所述的组合物，其中所述组合物包含至少2、至少3、至少4、至少5、至少6、至少7、至少8、至少9、至少10、至少11、至少12、至少13、至少14、至少15、至少16、至少
17、至少18、至少19、至少20、至少21、至少22、至少23、至少24、至少25、至少26、至少27、至少
28、至少29、至少30、至少40、至少50、至少60、至少70、至少80、至少90或至少100种所述分离的多核苷酸。
89.如权利要求88所述的组合物，其中所述组合物包含约2至约20种所述分离的多核苷酸或约2至约30种所述分离的多核苷酸。
90.如权利要求87-89中任一项所述的组合物，其中所述新抗原肽由包含一种或多种所述分离的多核苷酸的载体编码。
91.如权利要求87-90中任一项所述的组合物，其中所述组合物进一步包含至少1、至少
2、至少3、至少4、至少5、至少6、至少7、至少8、至少9、至少10、至少11、至少12、至少13、至少
14、至少15、至少16、至少17、至少18、至少19、至少20、至少21、至少22、至少23、至少24、至少
25、至少26、至少27、至少28、至少29、至少30、至少40、至少50、至少60、至少70、至少80、至少
90或至少100种编码附加新抗原肽的附加新抗原多核苷酸。
92.如权利要求88-91中任一项所述的组合物，其中一种或多种所述附加新抗原肽由包含一种或多种所述附加新抗原多核苷酸的载体编码。
93.如权利要求91或92所述的组合物，其中所述组合物包含约4至约20种附加新抗原多核苷酸或约4至约30种附加新抗原多核苷酸。
94.如权利要求91或92所述的组合物，其中所述分离的多核苷酸和所述附加新抗原多核苷酸进行连接。
95.如权利要求94所述的组合物，其中所述多核苷酸使用编码聚甘氨酸或聚丝氨酸接头的核酸进行连接。
96.如权利要求87-95中任一项所述的组合物，其中至少一种所述附加新抗原肽对个体受试者的肿瘤具有特异性。
97.如权利要求96所述的组合物，其中通过鉴定受试者肿瘤样品的基因组、外显子组和/或转录组与非肿瘤样品的基因组、外显子组和/或转录组之间的序列差异来选择所述受试者特异性新抗原肽。
98.如权利要求97所述的组合物，其中所述样品为新鲜的或福尔马林固定石蜡包埋的肿瘤组织、新鲜分离的细胞或循环肿瘤细胞。
99.如权利要求97或98所述的组合物，其中所述序列差异通过下一代测序来确定。
100.一种T细胞受体(TCR)，其能够结合至少一种权利要求1-50中任一项所列出的新抗原肽或包含至少一种权利要求1-50中任一项所列出的新抗原肽的MHC-肽复合物。
101.如权利要求100所述的TCR，其中所述MHC-肽的MHC为MHC I类或II类。
102.如权利要求100或101所述的TCR，其中TCR为双特异性TCR，其进一步包含含有能够结合抗原的抗体或抗体片段的结构域。
103.如权利要求102所述的TCR，其中所述抗原为T细胞特异性抗原。
104.如权利要求102或103所述的TCR，其中所述抗原为CD3。
105.如权利要求104所述的TCR，其中所述抗体或抗体片段为抗CD3scFv。
106.一种嵌合抗原受体，其包含：(i)T细胞活化分子；(ii)跨膜区；以及(iii)抗原识别部分，其能够结合至少一种权利要求1-50中任一项所列出的新抗原肽或包含至少一种权利要求1-50中任一项所列出的新抗原肽的MHC-肽复合物。
107.如权利要求106所述的嵌合抗原受体，其中CD3-ζ为所述T细胞活化分子。
108.如权利要求106或107所述的嵌合抗原受体，其进一步包含至少一个共刺激信号转导结构域。
109.如权利要求106-108中任一项所述的嵌合抗原受体，其中所述信号转导结构域为CD28、4-1BB、ICOS、OX40、ITAM或FcεRI-γ。
110.如权利要求106-109中任一项所述的嵌合抗原受体，其中所述抗原识别部分能够在MHC I类或II类的情况下结合所述分离的新抗原肽。
111.如权利要求106-110中任一项所述的嵌合抗原受体，其包含CD3-ζ、CD28、CTLA-4、ICOS、BTLA、KIR、LAG3、CD137、OX40、CD27、CD40L、Tim-3、A2aR或PD-1跨膜区。
112.如权利要求106-111中任一项所述的嵌合抗原受体，其中所述新抗原肽位于肿瘤相关多肽的细胞外结构域中。
113.如权利要求106-112中任一项所述的嵌合抗原受体，其中所述MHC-肽的MHC为MHC I类或II类。
114.一种T细胞，其包含权利要求100-113中任一项所述的T细胞受体或嵌合抗原受体，任选地其中所述T细胞为辅助T细胞或细胞毒性T细胞。
115.如权利要求114所述的T细胞，其中所述T细胞为受试者的T细胞。
116.一种T细胞，其包含能够结合至少一种权利要求1-50中任一项所述的新抗原肽或包含至少一种权利要求1-50中任一项所述的新抗原肽的MHC-肽复合物的T细胞受体(TCR)，其中所述T细胞为从来自受试者的T细胞群分离的T细胞，所述T细胞已经与抗原呈递细胞和至少一种权利要求1-50中任一项所述的新抗原肽中的一种或多种一起温育足够的时间以活化所述T细胞。
117.如权利要求116所述的T细胞，其中所述T细胞为CD8+T细胞、辅助T细胞或细胞毒性T细胞。
118.如权利要求116或117所述的T细胞，其中所述来自受试者的T细胞群为来自受试者的CD8+T细胞群。
119.如权利要求116-118中任一项所述的T细胞，其中所述至少一种权利要求1-50中任一项所述的新抗原肽中的一种或多种为受试者特异性新抗原肽。
120.如权利要求116-119中任一项所述的T细胞，其中所述受试者特异性新抗原肽具有不同的肿瘤新表位，所述肿瘤新表位为对所述受试者的肿瘤具有特异性的表位。
121.如权利要求116-120中任一项所述的T细胞，其中所述受试者特异性新抗原肽为不存在于所述受试者的非肿瘤样品中的肿瘤特异性非沉默突变的表达产物。
122.如权利要求116-121中任一项所述的T细胞，其中所述受试者特异性新抗原肽与所述受试者的HLA蛋白结合。
123.如权利要求116-122中任一项所述的T细胞，其中所述受试者特异性新抗原肽以小于500nM的IC50与所述受试者的HLA蛋白结合。
124.如权利要求116-123中任一项所述的T细胞，其中活化的CD8+T细胞与所述抗原呈递细胞分离。
125.如权利要求116-124中任一项所述的T细胞，其中所述抗原呈递细胞为树突细胞或CD40L扩增的B细胞。
126.如权利要求116-125中任一项所述的T细胞，其中所述抗原呈递细胞为未转化的细胞。
127.如权利要求116-126中任一项所述的T细胞，其中所述抗原呈递细胞为未感染的细胞。
128.如权利要求116-127中任一项所述的T细胞，其中所述抗原呈递细胞是自体的。
129.如权利要求116-128中任一项所述的T细胞，其中所述抗原呈递细胞已经经过处理以从其表面剥离内源性MHC相关肽。
130.如权利要求129所述的T细胞，其中所述剥离内源性MHC相关肽的处理包括在约26℃培养所述细胞。
131.如权利要求129所述的T细胞，其中所述剥离内源性MHC相关肽的处理包括用温和的酸溶液处理所述细胞。
132.如权利要求116-131中任一项所述的T细胞，其中所述抗原呈递细胞已经与所述至少一种权利要求1-50中任一项所述的新抗原肽一起进行脉冲。
133.如权利要求132所述的T细胞，其中脉冲包括在至少约2μg/ml的所述至少一种权利要求1-50中任一项所述的新抗原肽中的每一种的存在下温育所述抗原呈递细胞。
134.如权利要求116-133中任一项所述的T细胞，其中分离的T细胞与抗原呈递细胞的比例在约30:1与300:1之间。
135.如权利要求116-134中任一项所述的T细胞，其中所述温育分离的T细胞群是在IL-
2和IL-7的存在下进行的。
136.如权利要求116-135中任一项所述的T细胞，其中所述MHC-肽的MHC为MHC I类或II类。
137.一种用于活化肿瘤特异性T细胞的方法，该方法包括：
(a)从受试者中分离T细胞群；以及
(b)将所述分离的T细胞群与抗原呈递细胞和至少一种权利要求1-50中任一项所述的新抗原肽一起温育足够的时间以活化所述T细胞。
138.如权利要求137所述的方法，其中所述T细胞为CD8+T细胞、辅助T细胞或细胞毒性T细胞。
139.如权利要求137或138所述的方法，其中所述来自受试者的T细胞群为来自受试者的CD8+T细胞群。
140.如权利要求137-139中任一项所述的方法，其中至少一种权利要求1-50中任一项所述的新抗原肽中的一种或多种为受试者特异性新抗原肽。
141.如权利要求137-140中任一项所述的方法，其中所述受试者特异性新抗原肽具有不同的肿瘤新表位，所述肿瘤新表位为对所述受试者的肿瘤具有特异性的表位。
142.如权利要求137-141中任一项所述的方法，其中所述受试者特异性新抗原肽为不存在于所述受试者的非肿瘤样品中的肿瘤特异性非沉默突变的表达产物。
143.如权利要求137-142中任一项所述的方法，其中所述受试者特异性新抗原肽与所述受试者的HLA蛋白结合。
144.如权利要求137-143中任一项所述的方法，其中所述受试者特异性新抗原肽以小于500nM的IC50与所述受试者的HLA蛋白结合。
145.如权利要求137-144中任一项所述的方法，其中所述方法进一步包括将所述活化的T细胞与所述抗原呈递细胞分离。
146.如权利要求137-145中任一项所述的方法，其中所述方法进一步包括测试所述活化的T细胞以证明针对至少一种权利要求1-50中任一项所述的新抗原肽的反应性。
147.如权利要求137-146中任一项所述的方法，其中所述抗原呈递细胞为树突细胞或CD40L扩增的B细胞。
148.如权利要求137-147中任一项所述的方法，其中所述抗原呈递细胞为未转化的细胞。
149.如权利要求137-148中任一项所述的方法，其中所述抗原呈递细胞为未感染的细胞。
150.如权利要求137-149中任一项所述的方法，其中所述抗原呈递细胞是自体的。
151.如权利要求137-150中任一项所述的方法，其中所述抗原呈递细胞已经经过处理以从其表面剥离内源性MHC相关肽。
152.如权利要求151所述的方法，其中所述剥离内源性MHC相关肽的处理包括在约26℃培养所述细胞。
153.如权利要求151所述的方法，其中所述剥离内源性MHC相关肽的处理包括用温和的酸溶液处理所述细胞。
154.如权利要求137-153中任一项所述的方法，其中所述抗原呈递细胞已经与所述至少一种权利要求1-50中任一项所述的新抗原肽一起进行脉冲。
155.如权利要求154所述的方法，其中脉冲包括在至少约2μg/ml的所述至少一种权利要求1-50中任一项所述的新抗原肽中的每一种的存在下温育所述抗原呈递细胞。
156.如权利要求137-155中任一项所述的方法，其中分离的T细胞与抗原呈递细胞的比例在约30:1与300:1之间。
157.如权利要求137-156中任一项所述的方法，其中所述温育分离的T细胞群是在IL-2和IL-7的存在下进行的。
158.如权利要求137-157中任一项所述的方法，其中所述MHC-肽的MHC为MHC I类或II类。
159.一种组合物，其包含通过权利要求137-158中任一项所述的方法产生的活化的肿瘤特异性T细胞。
160.一种治疗受试者的癌症的方法，该方法包括：向所述受试者施用治疗有效量的权利要求116-136中任一项所述的活化的肿瘤特异性T细胞，或通过权利要求137-158中任一项所述的方法产生的肿瘤特异性T细胞。
161.如权利要求160所述的方法，其中所述施用包括施用约106至1012、约108至1011或约
109至1010个活化的肿瘤特异性T细胞。
162.一种核酸，其包含与编码权利要求114-161中任一项所述的T细胞受体的多核苷酸可操作地连接的启动子。
163.如权利要求162所述的核酸，其中所述TCR能够在主要组织相容性复合物(MHC)I类或II类的情况下结合所述至少一种新抗原肽。
164.一种核酸，其包含与编码权利要求106-113中任一项所述的嵌合抗原受体的多核苷酸可操作地连接的启动子。
165.如权利要求164所述的核酸，其中所述抗原识别部分能够在主要组织相容性复合物(MHC)I类或II类的情况下结合所述至少一种新抗原肽。
166.如权利要求164所述的核酸，其中所述新抗原肽位于肿瘤相关多肽的细胞外结构域中。
167.如权利要求164-166中任一项所述的核酸，其包含CD3-ζ、CD28、CTLA-4、ICOS、BTLA、KIR、LAG3、CD137、OX40、CD27、CD40L、Tim-3、A2aR或PD-1跨膜区。
168.一种抗体或抗体片段，其能够结合至少一种权利要求1-50中任一项所述的新抗原肽或包含至少一种权利要求1-50中任一项所述的新抗原肽的MHC-肽复合物，任选地其中所述抗体片段为双特异性T细胞衔接器(BiTE)。
169.如权利要求168所述的抗体或抗体片段，其中所述抗体或抗体片段与所述至少一种新抗原肽的细胞外部分结合。
170.如权利要求168或169所述的抗体或抗体片段，其中
(a)所述天然多肽由β2M基因编码，其中Cz是
(i)
RMERELKKWSIQTCLSARTGLSISCTTLNSPPLKKMSMPAV，或
(ii)LCSRYSLFLAWRLSSVLQRFRFTHVIQQRMESQIS；
(b)所述天然多肽由EGFR基因编码，其中AxByCz是
IPVAIKELREATSPKANKEILDEAYVMASVDNPHVCRLLGICLTSTVQLIMQLMPFGCLLDYVREHKDNIGSQYLLNWCVQIAKGMNYLEDRRLVHRDLAA；
(c)所述天然多肽由BTK基因编码，其中AxByCz是
MIKEGSMSEDEFIEEAKVMMNLSHEKLVQLYGVCTKQRPIFIITEYMANGSLLNYLREMRHRFQTQQLLEMCKDVCEAMEYLESKQFLHRDLAARNCLVND；或
(d)所述天然多肽由ESR1基因编码，其中AxByCz是
(i)
HLMAKAGLTLQQQHQRLAQLLLILSHIRHMSNKGMEHLYSMKCKNVVPLYGLLLEMLDAHRLHAPTSRGGASVEETDQSHLATAGSTSSHSLQKYYITGEA，
(ii)
NQGKCVEGMVEIFDMLLATSSRFRMMNLQGEEFVCLKSIILLNSGVYTFLPSTLKSLEEKDHIHRVLDKITDTLIHLMAKAGLTLQQQHQRLAQLLLILSH，
(iii)
IHLMAKAGLTLQQQHQRLAQLLLILSHIRHMSNKGMEHLYSMKCKNVVPLCDLLLEMLDAHRLHAPTSRGGASVEETDQSHLATAGSTSSHSLQKYYITGE，
(iv)
IHLMAKAGLTLQQQHQRLAQLLLILSHIRHMSNKGMEHLYSMKCKNVVPLNDLLLEMLDAHRLHAPTSRGGASVEETDQSHLATAGSTSSHSLQKYYITGE，或
(v)
IHLMAKAGLTLQQQHQRLAQLLLILSHIRHMSNKGMEHLYSMKCKNVVPLSDLLLEMLDAHRLHAPTSRGGASVEETDQSHLATAGSTSSHSLQKYYITGE；以及
(e)所述天然多肽由HER2基因编码，其中AxByCz是
GSGAFGTVYKGIWIPDGENVKIPVAIKVLRENTSPKANKEILDEAYVMAGLGSPYVSRLLGICLTSTVQLVTQLMPYGCLLDHVRENRGRLGSQDLLNWCM；
(f)所述天然多肽由GATA3基因编码，其中Cz是
(i)
PGRPLQTHVLPEPHLALQPLQPHADHAHADAPAIQPVLWTTPPLQHGHRHGLEPCSMLTGPPARVPAVPFDLHFCRSSIMKPKRDGYMFLKAESKIMFATLQRSSLWCLCSNH，或
(ii)
PRPRRCTRHPACPLDHTTPPAWSPPWVRALLDAHRAPSESPCSPFRLAFLQEQYHEA；或
(g)所述第一天然多肽由TMPRSS2基因编码，所述第二天然多肽由ERG编码，y为0，并且AxByCz是
MALNSEALSVVSEDQSLFECAYGTPHLAKTEMTASSSSDYGQTSKMSPRVPQQDW。
171.如权利要求168-170中任一项所述的抗体或抗体片段，其中所述抗体或抗体片段为双特异性抗体或抗体片段。
172.如权利要求171所述的抗体或抗体片段，其中所述双特异性抗体或抗体片段的一个抗原结合结构域为抗CD3结合结构域。
173.一种修饰的细胞，其用权利要求162-172中任一项所述的核酸进行转染或转导。
174.如权利要求173所述的修饰的细胞，其中所述修饰的细胞为T细胞、肿瘤浸润淋巴细胞、NK-T细胞、表达TCR的细胞、CD4+T细胞、CD8+T细胞或NK细胞。
175.一种组合物，其包含权利要求100-113中任一项所述的T细胞受体或嵌合抗原受体。
176.一种组合物，其包含含有权利要求100-113中任一项所述的T细胞受体或嵌合抗原受体的自体受试者T细胞。
177.如权利要求175或176所述的组合物，其中所述组合物进一步包含免疫检查点抑制剂。
178.如权利要求177所述的组合物，其中所述组合物进一步包含至少两种免疫检查点抑制剂。
179.如权利要求177或178所述的组合物，其中每种所述免疫检查点抑制剂抑制选自下组的检查点蛋白：CTLA-4、PDL1、PDL2、PD1、B7-H3、B7-H4、BTLA、HVEM、TIM3、GAL9、LAG3、VISTA、KIR、2B4、CD160、CGEN-15049、CHK 1、CHK2、A2aR和B-7家族配体或其组合。
180.如权利要求177或178所述的组合物，其中每种所述免疫检查点抑制剂与选自下组的检查点蛋白的配体相互作用：CTLA-4、PDL1、PDL2、PD1、B7-H3、B7-H4、BTLA、HVEM、TIM3、GAL9、LAG3、VISTA、KIR、2B4、CD160、CGEN-15049、CHK 1、CHK2、A2aR和B-7家族配体或其组合。
181.如权利要求176-180中任一项所述的组合物，其中所述T细胞为PD-1和/或CTLA4敲除T细胞，任选地，其中所述PD-1和/或CTLA4敲除T细胞使用CRISPR系统产生。
182.如前述权利要求中任一项所述的组合物，其中所述组合物进一步包含免疫调节剂或佐剂。
183.如权利要求182所述的组合物，其中所述免疫调节剂为共刺激配体、TNF配体、Ig超家族配体、CD28、CD80、CD86、ICOS、CD40L、OX40、CD27、GITR、CD30、DR3、CD69或4-1BB。
184.如权利要求182所述的组合物，其中所述免疫调节剂为至少一种癌细胞或癌细胞提取物。
185.如权利要求184所述的组合物，其中所述癌细胞对于需要所述组合物的受试者是自体的。
186.如权利要求185所述的组合物，其中所述癌细胞已经经历裂解或已经暴露于UV辐射。
187.如权利要求182所述的组合物，其中所述组合物进一步包含佐剂。
188.如权利要求187所述的组合物，其中所述佐剂选自：聚(I:C)、聚-ICLC、STING激动剂、1018ISS、铝盐、Amplivax、AS15、BCG、CP-870,893、CpG7909、CyaA、dSLIM、GM-CSF、IC30、IC31、咪喹莫特、ImuFact IMP321、IS Patch、ISS、ISCOMATRIX、JuvImmune、LipoVac、MF59、单磷酰脂质A、Montanide IMS 1312 VG、Montanide ISA 206 VG、Montanide ISA 50 V2、Montanide ISA 51 VG、OK-432、OM-174、OM-197-MP-EC、ISA-TLR2激动剂、ONTAK、载体系统、PLG微粒、雷西莫特、SRL172、病毒颗粒和其他病毒样颗粒、YF-17D、VEGF trap、R848、β-葡聚糖、Pam3Cys、Pam3CSK4、丙烯酸或甲基丙烯酸聚合物、马来酸酐共聚物和QS21刺激子。
189.如权利要求187或188所述的组合物，其中所述组合物在施用于受试者时诱导体液反应。
190.如权利要求189所述的组合物，其中所述组合物在施用于受试者时诱导1型T辅助细胞。
191.一种抑制表达肿瘤特异性新表位的肿瘤细胞生长的方法，该方法包括使所述肿瘤细胞与权利要求1-190中任一项所述的肽、多核苷酸、递送系统、载体、组合物、抗体或细胞接触。
192.一种预防受试者的方法，该方法包括使所述受试者的细胞与权利要求1-190中任一项所述的肽、多核苷酸、递送系统、载体、组合物、抗体或细胞接触。
193.如权利要求192所述的方法，其中
(a)所述天然多肽由β2M基因编码，其中Cz是
(i)
RMERELKKWSIQTCLSARTGLSISCTTLNSPPLKKMSMPAV，或
(ii)LCSRYSLFLAWRLSSVLQRFRFTHVIQQRMESQIS；
(b)所述天然多肽由EGFR基因编码，其中AxByCz是
IPVAIKELREATSPKANKEILDEAYVMASVDNPHVCRLLGICLTSTVQLIMQLMPFGCLLDYVREHKDNIGSQYLLNWCVQIAKGMNYLEDRRLVHRDLAA；
(c)所述天然多肽由BTK基因编码，其中AxByCz是
MIKEGSMSEDEFIEEAKVMMNLSHEKLVQLYGVCTKQRPIFIITEYMANGSLLNYLREMRHRFQTQQLLEMCKDVCEAMEYLESKQFLHRDLAARNCLVND；或
(d)所述天然多肽由ESR1基因编码，其中AxByCz是
(i)
HLMAKAGLTLQQQHQRLAQLLLILSHIRHMSNKGMEHLYSMKCKNVVPLYGLLLEMLDAHRLHAPTSRGGASVEETDQSHLATAGSTSSHSLQKYYITGEA，
(ii)
NQGKCVEGMVEIFDMLLATSSRFRMMNLQGEEFVCLKSIILLNSGVYTFLPSTLKSLEEKDHIHRVLDKITDTLIHLMAKAGLTLQQQHQRLAQLLLILSH，
(iii)
IHLMAKAGLTLQQQHQRLAQLLLILSHIRHMSNKGMEHLYSMKCKNVVPLCDLLLEMLDAHRLHAPTSRGGASVEETDQSHLATAGSTSSHSLQKYYITGE，
(iv)
IHLMAKAGLTLQQQHQRLAQLLLILSHIRHMSNKGMEHLYSMKCKNVVPLNDLLLEMLDAHRLHAPTSRGGASVEETDQSHLATAGSTSSHSLQKYYITGE，或
(v)
IHLMAKAGLTLQQQHQRLAQLLLILSHIRHMSNKGMEHLYSMKCKNVVPLSDLLLEMLDAHRLHAPTSRGGASVEETDQSHLATAGSTSSHSLQKYYITGE；以及
(e)所述天然多肽由HER2基因编码，其中AxByCz是
GSGAFGTVYKGIWIPDGENVKIPVAIKVLRENTSPKANKEILDEAYVMAGLGSPYVSRLLGICLTSTVQLVTQLMPYGCLLDHVRENRGRLGSQDLLNWCM；
(f)所述天然多肽由GATA3基因编码，其中Cz是
(i)
PGRPLQTHVLPEPHLALQPLQPHADHAHADAPAIQPVLWTTPPLQHGHRHGLEPCSMLTGPPARVPAVPFDLHFCRSSIMKPKRDGYMFLKAESKIMFATLQRSSLWCLCSNH，或
(ii)
PRPRRCTRHPACPLDHTTPPAWSPPWVRALLDAHRAPSESPCSPFRLAFLQEQYHEA；或
(g)所述第一天然多肽由TMPRSS2基因编码，所述第二天然多肽由ERG编码，y为0，并且AxByCz是
MALNSEALSVVSEDQSLFECAYGTPHLAKTEMTASSSSDYGQTSKMSPRVPQQDW。
194.一种在有需要的受试者中治疗癌症或引发、增强或延长抗肿瘤反应的方法，该方法包括向所述受试者施用权利要求1-190中任一项所述的肽、多核苷酸、载体、组合物、抗体或细胞。
195.如权利要求191-194中任一项所述的方法，其中所述受试者是人。
196.如权利要求195所述的方法，其中所述受试者患有癌症。
197.如权利要求196所述的方法，其中所述癌症选自泌尿生殖系统癌症、妇科癌症、肺癌、胃肠癌、头颈癌、恶性胶质母细胞瘤、恶性间皮瘤、非转移性或转移性乳腺癌、恶性黑素瘤、Merkel细胞癌或骨与软组织肉瘤、血液肿瘤、多发性骨髓瘤、急性髓性白血病、慢性髓性白血病、骨髓增生异常综合征和急性淋巴细胞白血病、非小细胞肺癌(NSCLC)、乳腺癌、转移性结直肠癌、激素敏感性或激素难治性前列腺癌、结直肠癌、卵巢癌、肝细胞癌、肾细胞癌、胰腺癌、胃癌、食道癌、肝细胞癌、胆管细胞癌、头颈部鳞状细胞癌、软组织肉瘤和小细胞肺癌。
198.如权利要求191-197中任一项所述的方法，其中权利要求1-190中任一项所述的肽、多核苷酸、载体、组合物、抗体或细胞用于治疗根据表1或表2的相应的癌症。
199.如权利要求191-198中任一项所述的方法，其中权利要求1-190中任一项所述的肽、多核苷酸、载体、组合物、抗体或细胞用于治疗具有HLA类型的受试者，所述HLA类型为根据表1或表2的相应的HLA类型。
200.如权利要求191-199中任一项所述的方法，其中所述受试者已经经历手术切除所述肿瘤。
201.如权利要求191-200中任一项所述的方法，其中所述肽、多核苷酸、载体、组合物或细胞通过静脉内、腹腔内、瘤内、皮内或皮下施用来进行施用。
202.如权利要求201所述的方法，其中将所述肽、多核苷酸、载体、组合物或细胞施用于汇流入淋巴结盆的解剖部位。
203.如权利要求202所述的方法，其中施用进入多个淋巴结盆。
204.如权利要求191-203中任一项所述的方法，其中施用通过皮下或皮内途径进行。
205.如权利要求201所述的方法，其中施用肽。
206.如权利要求205所述的方法，其中施用是瘤内施用。
207.如权利要求201所述的方法，其中施用多核苷酸，任选地施用RNA。
208.如权利要求201或207所述的方法，其中所述多核苷酸通过静脉内施用。
209.如权利要求201所述的方法，其中所述细胞为T细胞或树突细胞。
210.如权利要求201或209所述的方法，其中所述肽或多核苷酸包含抗原呈递细胞靶向部分。
211.如权利要求201或209或210所述的方法，其中所述细胞为自体细胞。
212.如权利要求191-211中任一项所述的方法，其进一步包括向所述受试者施用至少一种免疫检查点抑制剂。
213.如权利要求212所述的方法，其中所述检查点抑制剂为生物治疗剂或小分子。
214.如权利要求212或213所述的方法，其中所述检查点抑制剂选自单克隆抗体、人源化抗体、全人源抗体和融合蛋白或其组合。
215.如权利要求212-214中任一项所述的方法，其中所述检查点抑制剂为PD-1抗体或PD-L1抗体。
216.如权利要求212-214中任一项所述的方法，其中所述检查点抑制剂选自伊匹单抗、曲美目单抗、纳武单抗、阿维鲁单抗、度伐鲁单抗、阿特珠单抗、派姆单抗及其任何组合。
217.如权利要求212-216中任一项所述的方法，其中所述检查点抑制剂抑制选自下组的检查点蛋白：CTLA-4、PDL1、PDL2、PD1、B7-H3、B7-H4、BTLA、HVEM、TIM3、GAL9、LAG3、VISTA、KIR、2B4、CD160、CGEN-15049、CHK 1、CHK2、A2aR和B-7家族配体及其任何组合。
218.如权利要求212-217中任一项所述的方法，其中所述检查点抑制剂与选自下组的检查点蛋白的配体相互作用：CTLA-4、PDL1、PDL2、PD1、B7-H3、B7-H4、BTLA、HVEM、TIM3、GAL9、LAG3、VISTA、KIR、2B4、CD160、CGEN-15049、CHK 1、CHK2、A2aR和B-7家族配体或其组合。
219.如权利要求212-218中任一项所述的方法，其中施用两种或更多种检查点抑制剂。
220.如权利要求219所述的方法，其中所述两种或更多种检查点抑制剂中的至少一种为PD-1抗体或PD-L1抗体。
221.如权利要求219所述的方法，其中所述两种或更多种检查点抑制剂中的至少一种选自伊匹单抗、曲美目单抗、纳武单抗、阿维鲁单抗、度伐鲁单抗、阿特珠单抗和派姆单抗。
222.如权利要求212-221中任一项所述的方法，其中所述检查点抑制剂和所述组合物同时或以任何顺序依次施用。
223.如权利要求222所述的方法，其中所述肽、多核苷酸、载体、组合物或细胞在所述检查点抑制剂之前施用。
224.如权利要求222所述的方法，其中所述肽、多核苷酸、载体、组合物或细胞在所述检查点抑制剂之后施用。
225.如权利要求222所述的方法，其中所述检查点抑制剂的施用在整个新抗原肽、多核苷酸、载体、组合物或细胞治疗期间是持续的。
226.如权利要求212-225中任一项所述的方法，其中将所述新抗原肽、多核苷酸、载体、组合物或细胞治疗施用于对检查点抑制剂治疗仅部分响应或不响应的受试者。
227.如权利要求191-226中任一项所述的方法，其中所述组合物通过静脉内或皮下施用。
228.如权利要求212-227中任一项所述的方法，其中所述检查点抑制剂通过静脉内或皮下施用。
229.如权利要求212-228中任一项所述的方法，其中所述检查点抑制剂在所述组合物的施用部位约2cm内皮下施用。
230.如权利要求229所述的方法，其中将所述组合物施用于与所述检查点抑制剂相同的引流淋巴结。
231.如权利要求191-230中任一项所述的方法，其进一步包括在用所述肽、多核苷酸、载体、组合物或细胞治疗之前、同时或之后向所述受试者施用附加治疗剂。
232.如权利要求231所述的方法，其中所述附加治疗剂为化学治疗剂、免疫调节药物、免疫代谢调节药物、靶向治疗、辐射、抗血管生成剂或减少免疫抑制的药剂。
233.如权利要求232所述的方法，其中所述化学治疗剂为烷化剂、拓扑异构酶抑制剂、抗代谢物或抗有丝分裂剂。
234.如权利要求231所述的方法，其中所述附加治疗剂为抗糖皮质激素诱导的肿瘤坏死因子家族受体(GITR)激动性抗体或抗体片段、依鲁替尼、多西紫杉醇、顺铂、CD40激动性抗体或抗体片段、IDO抑制剂或环磷酰胺。
235.如权利要求191-234中任一项所述的方法，其引发CD4+T细胞免疫反应或CD8+T细胞免疫反应。
236.如权利要求191-235中任一项所述的方法，其引发CD4+T细胞免疫反应和CD8+T细胞免疫反应。
237.一种用于刺激受试者的免疫反应的方法，该方法包括施用有效量的权利要求173-
190中任一项所述的修饰的细胞或组合物。
238.如权利要求237所述的方法，其中所述免疫反应为细胞毒性和/或体液免疫反应。
239.如权利要求237所述的方法，其中所述方法刺激受试者的T细胞介导的免疫反应。
240.如权利要求239所述的方法，其中所述T细胞介导的免疫反应是针对靶细胞。
241.如权利要求240所述的方法，其中所述靶细胞为肿瘤细胞。
242.如权利要求237-241中任一项所述的方法，其中所述修饰的细胞进行体内转染或转导。
243.如权利要求237-242中任一项所述的方法，其中所述修饰的细胞进行离体转染或转导。
244.如权利要求237-243中任一项所述的方法，其中所述修饰的细胞为自体受试者T细胞。
245.如权利要求244所述的方法，其中所述自体受试者T细胞从已接受新抗原肽或核酸疫苗的受试者获得。
246.如权利要求245所述的方法，其中所述新抗原肽或核酸疫苗包含至少一种个性化新抗原。
247.如权利要求246所述的方法，其中所述新抗原肽或核酸疫苗包含表1或表2中列出的至少一种附加新抗原肽。
248.如权利要求247所述的方法，其中所述受试者在接受所述新抗原肽或核酸疫苗之前和/或期间接受化学治疗剂、免疫调节药物、免疫代谢调节药物、靶向治疗或辐射。
249.如权利要求237-248中任一项所述的方法，其中所述受试者接受采用至少一种检查点抑制剂的治疗。
250.如权利要求237-249中任一项所述的方法，其中所述自体T细胞从已经接受至少一轮含有新抗原的T细胞治疗的受试者中获得。
251.如权利要求237-250中任一项所述的方法，其中所述方法进一步包括过继性T细胞治疗。
252.如权利要求251所述的方法，其中所述过继性T细胞治疗包含自体T细胞。
253.如权利要求252所述的方法，其中所述自体T细胞靶向肿瘤抗原。
254.如权利要求251或252所述的方法，其中所述过继性T细胞治疗进一步包含异体T细胞。
255.如权利要求254所述的方法，其中所述异体T细胞靶向肿瘤抗原。
256.如权利要求251-255中任一项所述的方法，其中在所述检查点抑制剂之前、在所述检查点抑制剂之后或与所述检查点抑制剂同时，施用所述过继性T细胞治疗。
257.一种用于评估权利要求173-190中任一项的功效的方法，该方法包括：(i)在施用所述修饰的细胞之前测量从所述受试者获得的第一样品中的靶细胞的数目或浓度，(ii)在施用所述修饰的细胞之后测量从所述受试者获得的第二样品中的靶细胞的数目浓度，以及(iii)确定与所述第一样品中的靶细胞的数目或浓度相比，所述第二样品中的靶细胞的数目或浓度的增加或减少。
258.如权利要求257所述的方法，其中通过监测临床结果；T细胞对抗肿瘤活性的增加、增强或延长；与治疗前的数目相比抗肿瘤T细胞或活化T细胞的数目的增加；B细胞活性；CD4+T细胞活性；或其组合来确定治疗功效。
259.如权利要求258所述的方法，其中通过监测生物标志物来确定治疗功效。
260.如权利要求259所述的方法，其中所述生物标志物选自CEA、Her-2/neu、膀胱肿瘤抗原、甲状腺球蛋白、甲胎蛋白、PSA、CA 125、CA19.9、CA 15.3、瘦素、催乳素、骨桥蛋白、IGF-II、CD98、肌成束蛋白、sPIgR、14-3-3η、肌钙蛋白I、循环肿瘤细胞RNA或DNA和b型利尿钠肽。
261.如权利要求258所述的方法，其中临床结果选自肿瘤消退；肿瘤缩小；肿瘤坏死；免疫系统引起的抗肿瘤反应；肿瘤扩张、复发或扩散；或其组合。
262.如权利要求258所述的方法，其中通过T细胞的存在或通过指示T细胞炎症的基因标记的存在或其组合来预测治疗效果。
263.一种在有需要的受试者中治疗癌症或引发、增强或延长抗肿瘤反应的方法，该方法包括向所述受试者施用：
(a)权利要求1-106中任一项所述的肽、多核苷酸、载体、组合物、抗体或细胞；以及(b)至少一种检查点抑制剂。
264.如权利要求263所述的方法，其进一步包括施用免疫调节剂或佐剂。
265.如权利要求264所述的方法，其中所述免疫调节剂或佐剂选自聚(I:C)、聚-ICLC、STING激动剂、1018 ISS、铝盐、Amplivax、AS15、BCG、CP-870,893、CpG7909、CyaA、dSLIM、GM-CSF、IC30、IC31、咪喹莫特、ImuFact IMP321、IS Patch、ISS、ISCOMATRIX、JuvImmune、LipoVac、MF59、单磷酰脂质A、Montanide IMS 1312 VG、Montanide ISA 206 VG、Montanide ISA 50 V2、Montanide ISA 51 VG、OK-432、OM-174、OM-197-MP-EC、ISA-TLR2激动剂、ONTAK、 载体系统、PLG微粒、雷西莫特、SRL172、病毒颗粒和其他病毒样颗粒、YF-
17D、VEGF trap、R848、β-葡聚糖、Pam3Cys、Pam3CSK4、丙烯酸或甲基丙烯酸聚合物、马来酸酐共聚物和QS21刺激子、共刺激配体、TNF配体、Ig超家族配体、CD28、CD80、CD86、ICOS、CD40L、OX40、CD27、GITR、CD30、DR3、CD69或4-1BB。
266.如权利要求265所述的方法，其中所述免疫调节剂或佐剂为聚-ICLC。
267.如权利要求263-266中任一项所述的方法，其中所述检查点抑制剂为抗PDl抗体或抗体片段。
268.如权利要求267所述的方法，其中所述抗PDl抗体或抗体片段为纳武单抗或派姆单抗。
269.如权利要求263-266中任一项所述的方法，其中所述检查点抑制剂为抗PD-L1抗体或抗体片段。
270.如权利要求267所述的方法，其中所述抗PD-L1抗体或抗体片段为阿维鲁单抗、度伐鲁单抗或阿特珠单抗。
271.如权利要求263-266中任一项所述的方法，其中所述检查点抑制剂为抗CTLA4抗体或抗体片段。
272.如权利要求271所述的方法，其中所述抗CTLA4抗体为伊匹单抗或曲美目单抗。
273.如权利要求263-272中任一项所述的方法，其中所述方法包括施用抗PDl抗体和抗CTLA4抗体。
274.如权利要求263-272中任一项所述的方法，其中在开始施用所述肽、多核苷酸、载体、组合物、抗体或细胞之前开始所述检查点抑制剂的施用。
275.如权利要求263-272中任一项所述的方法，其中在开始施用所述肽、多核苷酸、载体、组合物、抗体或细胞之后开始所述检查点抑制剂的施用。
276.如权利要求263-272中任一项所述的方法，其中在开始施用所述肽、多核苷酸、载体、组合物、抗体或细胞的同时开始所述检查点抑制剂的施用。
277.如权利要求263-276中任一项所述的方法，其中所述肽、多核苷酸、载体、组合物、抗体或细胞通过静脉内或皮下施用。
278.如权利要求263-276中任一项所述的方法，其中所述检查点抑制剂通过静脉内或皮下施用。
279.如权利要求263-278中任一项所述的方法，其中所述检查点抑制剂在所述肽、多核苷酸、载体、组合物、抗体或细胞的施用部位约2cm内皮下施用。
280.如权利要求279所述的方法，其中将所述肽、多核苷酸、载体、组合物、抗体或细胞施用于与所述检查点抑制剂相同的引流淋巴结。
281.一种试剂盒，其包含权利要求1-136、159或168-190中任一项所述的肽、多核苷酸、载体、组合物、抗体、细胞或组合物。
282.如权利要求191-256中任一项所述的方法，其中所述癌症选自：肾上腺癌、膀胱癌、乳腺癌、宫颈癌、结直肠癌、胶质母细胞瘤、头颈癌、肾嫌色细胞癌、肾透明细胞癌、肾乳头状细胞癌、肝癌、肺腺癌、肺鳞癌、卵巢癌、胰腺癌、黑素瘤、胃癌、子宫内膜癌和子宫癌肉瘤。
283.如权利要求191-256中任一项所述的方法，其中所述癌症选自：前列腺癌、膀胱癌、肺鳞癌、NSCLC、乳腺癌、头颈癌、肺腺癌、GBM、神经胶质瘤、CML、AML、幕上室管膜瘤、急性早幼粒细胞白血病、孤立性纤维瘤和克唑替尼抗性癌症。
284.如权利要求108所述的方法，其中所述癌症选自：CRC、头颈癌、胃癌、肺鳞癌、肺腺癌、前列腺癌、膀胱癌、胃癌、肾细胞癌和子宫癌。
285.如权利要求191-256中任一项所述的方法，其中所述癌症选自：黑素瘤、肺鳞癌、DLBCL、子宫癌、头颈癌、子宫癌、肝癌和CRC。
286.如权利要求191-256中任一项所述的方法，其中所述癌症选自：淋巴癌；伯基特淋巴瘤、神经母细胞瘤、前列腺腺癌、结直肠腺癌；子宫/子宫内膜腺癌；MSI+；子宫内膜浆液性癌；子宫内膜癌肉瘤-恶性中胚层混合瘤；神经胶质瘤；星形细胞瘤；GBM、与MDS相关的急性髓性白血病；慢性淋巴细胞白血病-小淋巴细胞淋巴瘤；骨髓增生异常综合征；急性髓性白血病；乳腺管腔NS癌；慢性髓性白血病；胰腺导管癌；慢性粒单核细胞白血病；骨髓纤维化；
骨髓增生异常综合征；前列腺腺癌；原发性血小板增多症；和髓肌母细胞瘤。
287.如权利要求191-256中任一项所述的方法，其中所述癌症选自：结直肠癌、子宫癌、子宫内膜癌和胃癌。
288.如权利要求191-256中任一项所述的方法，其中所述癌症选自：宫颈癌、头颈癌、肛门癌、胃癌、伯基特淋巴瘤和鼻咽癌。
289.如权利要求191-256中任一项所述的方法，其中所述癌症选自：膀胱癌、结直肠癌和胃癌。
290.如权利要求191-256中任一项所述的方法，其中所述癌症选自：肺癌、CRC、黑素瘤、乳腺癌、NSCLC和CLL。
291.如权利要求191-256中任一项所述的方法，其中所述受试者为检查点抑制剂治疗的部分响应者或无响应者。
292.如权利要求191-256中任一项所述的方法，其中所述癌症选自：膀胱尿路上皮癌(BLCA)、乳腺浸润性癌(BRCA)、乳腺癌、宫颈鳞状细胞癌和宫颈腺癌(CESC)、慢性淋巴细胞白血病(CLL)、结直肠癌(CRC)、多形性胶质母细胞瘤(GBM)、头颈部鳞状细胞癌(HNSC)、肾乳头状细胞癌(KIRP)、肝细胞肝癌(LIHC)、肺腺癌(LUAD)、肺鳞状细胞癌(LUSC)、胰脏腺癌(PAAD)、前列腺癌、皮肤黑素瘤(SKCM)、胃腺癌(STAD)、甲状腺腺癌(THCA)和子宫体子宫内膜样癌(UCEC)。
293.如权利要求191-256中任一项所述的方法，其中所述癌症选自：结直肠癌、子宫癌、子宫内膜癌、胃癌和林奇综合征。
294.如权利要求293所述的方法，其中所述癌症为MSI+癌。