本发明涉及一种鉴定由病原微生物所表达的抗原多肽的方法；包 含所述多肽的疫苗；制备所述多肽的重组方法；和针对所述多肽的 治疗用抗体。

微生物引起的大量致死或致弱的疾病，影响着全世界数百万人。 控制微生物的现有方法包括应用抗微生物制剂(抗生素)和消毒剂。 它们被证明是有问题的，由于暴露在这些制剂的环境中所形成的显 著的选择性压力导致了耐药性微生物的产生，这些微生物能够躲避 抗微生物制剂的作用。例如，近来已发现微生物对三氯生产生了耐 药性，而在家庭及工业环境中使用的许多消毒剂中都添加有三氯生。

一个越来越引起争议的问题是许多重要的病原微生物进化出了对 抗生素的耐药株。

例如，但并不限于所举的例子，估计全世界超过5千万人感染了 耐药的结核病(TB)(数字来自世界卫生组织，1998)。过去使用抗 生素治疗结核病依赖于单一药物(如乙硫异烟胺)，因此产生了较高 频率的耐药性。由于这个原因，现在治疗结核病采用联合用药。但 即使联合用药进行治疗，由至少对一种用于治疗结核病的药物产生 耐药性的菌株所引起的治疗失败的比率仍然接近50％。导致TB的 分枝杆菌是一种慢性生长的细菌，需要花费很长时间消灭它。所以， 联合用药若要产生疗效，TB患者必须每天服用组合药物至少6个月。 病人通常必须每天服用两种或更多种药物，并需要相当长的治疗期 限。许多病人仅是断续服药而没有完成彻底根除分枝杆菌感染的全 部疗程。再者，TB与艾滋病感染有密切联系，因而TB的产生是与 免疫抑制紧密相关的。

抗TB的疫苗已经应用了许多年。作为一种对潜在的可能感染TB 的大量人群的安全和廉价的预防手段，卡介苗(BCG)已在长时间 内广泛应用于全世界。BCG是从牛分枝杆菌获得的减毒活疫苗。但 是预防接种对TB感染的效果不大，所以BCG对全面控制这一疾病 的作用是有限的。

金黄色葡萄球菌是病原微生物对抗生素产生耐药性的另一个例 子。金黄色葡萄球菌是一种通常寄居在约20-40％普通健康人鼻腔上 皮内表面的细菌，也常在人皮肤上发现，通常不会引起疾病。但在 某些场合，特别是当皮肤受损时，这种细菌能引起感染。在医院里 这是一个特殊的问题，因为在那里病人会进行外科手术和/或服用免 疫抑制药物。这些病人由于他们所接受的治疗更易受金黄色葡萄球 菌的感染。近年来已产出现了金黄色葡萄球菌的耐药株。对甲氧苯 青霉素的耐药株已很普遍，这些耐药株也对另外几种抗生素有耐药 性。目前对金黄色葡萄球菌还没有有效的预防接种措施。在美国， 每年两百万住院感染中的13％是由金黄色葡萄球菌感染引起的。这 表示260,000人感染金黄色葡萄球菌，其中60-80,000人死亡。

因此，金黄色葡萄球菌是一种重要的人类病原菌，能引起许多威 胁生命的疾病，包括败血症、心内膜炎、关节炎和中毒性休克。其 致病力是由其微生物的多样性及其致病成分的毒力决定的。致病原 因是多因素的，任何单一致病成分均不能解释一个特定的感染，见 Projan，S.J.& Novick，R.P.(1997)著《人类疾病中的葡萄球菌》 (Crossley，K.B.& Archer，G.L.，eds.)pp.55-81。

在感染初期，及发展阶段，微生物的需要及其环境发生改变，相 应地，金黄色葡萄球菌所产生的致病毒素随之发生改变。在感染开 始时，病原体粘附于宿主组织是关键性的，于是便产生了大量与在 细胞表面粘附相关的蛋白质，包括胶原结合蛋白、血纤蛋白原结合 蛋白和纤粘连蛋白结合蛋白。病原体还具有产生能减少吞噬作用或 是干扰细胞被循环抗体识别的因子的能力，从而逃避宿主的防御系 统。

通常，感染病灶会发展为一个脓肿，其中细菌大量滋生。金黄色 葡萄球菌通过产生一定数量的感受肽能监测其自身的细胞密度。肽 的积累以及所伴随的生理变化，引起细胞的营养不足，从而使细胞 所产生的致病毒素从粘附素转变为引起浸润和组织穿透的组分。这 包括多种溶血素、蛋白酶和其他降解酶等。

在任何感染过程中，金黄色葡萄球菌所产生的致病毒素是随环境 和生理刺激而改变的。这些刺激取决于体内局部的环境并随着感染 的进程而改变。由于对体内的情况所知甚少，并且某些毒素组分似 乎仅能在体内的环境下产生，所以一些可能成为疫苗的组分不能为 早期的技术所发现。

近代药物历史中最重要的发展之一是疫苗的发展，其对各种病原 微生物的感染提供了预防性保护。许多疫苗是由灭活的或减毒的病 原制成的，然后注射给个体。经免疫的个体通过产生体液(抗体) 和细胞(溶细胞的T细胞，CTL’s)应答而做出反应。例如，肝炎 疫苗的制备是通过加热灭活病毒和用像甲醛这样的交联剂处理。减 毒病原的一个代表例子是由活病原弱化产生的脊髓灰质炎疫苗。

但是对特定疾病应用减毒疫苗是存在顾虑的，因为缺乏对于减毒 过程的本质和条件的病理学知识的了解。这个问题对于特定病毒制 剂而言尤其突出，这是因为病毒，特别是逆转录病毒，具有错误倾 向的复制周期，导致含有病毒的基因产生能够传代的突变，其结果 是被用做疫苗的抗原决定簇的发生改变。替代使用灭活的或减毒的 病原的一种方法是鉴别出免疫系统对其特别敏感的病原表位。由此， 许多由病原微生物在感染过程中产生的致病毒素，对于开发具有保 护个体免于受到特定致病微生物感染作用的疫苗是特别有用的。

发展亚单位疫苗(疫苗其免疫原是由特定的病原微生物表达的一 个蛋白质或复合体的一个片段或亚基)已经成为医学研究的焦点。 对鉴别出用于发展亚单位疫苗的候选分子的需求，显然不仅仅是因 为近来抗生素耐药性的出现已经成为用传统化学疗法控制致病微生 物的严重障碍。已经发展了许多方法来确定有可能用作疫苗的抗原 多肽。在此举一个方法以作说明。许多年来已知肿瘤细胞能产生一 些肿瘤细胞特异性抗原，其中一些出现在肿瘤细胞表面。免疫系统 识别这些抗原并将其作为外来物，然后产生针对自身抗原的抗体， 这叫自身抗体或自身抗血清。

这种技术之一是重组表达克隆抗原的血清学识别，简写成 SEREX。

典型地说，这一技术包括从肿瘤组织中提取RNA，然后从分离 的总RNA中的选择性富集mRNA。mRNA用病毒逆转录酶反转录 为cDNA。这样合成的cDNA再被克隆进入一个表达载体，并且转 化进入一个适当的细菌株。转化的细菌被接种到一个营养适宜的琼 脂平板上，在适宜的生长条件下，亚克隆的cDNA在细菌细胞中由 表达载体来表达。应用基于噬菌体的表达载体可导致细胞自然溶解， 例如λ噬菌体或基于噬菌粒的载体，通过它们的溶解循环引起细胞 溶解。释放的多肽被转移至一种合适的膜支持物(如硝酸纤维素， 尼龙)，并暴露于从最初自其分离肿瘤组织的病人中获得的自身抗血 清。免疫筛选法可以用于从病人肿瘤组织中鉴定出过量表达或不恰 当表达的基因。

我们使用这种技术来鉴定感染过程中由病原微生物所表达的抗原 多肽。感染中产生的自身抗血清，被用于筛选一个由基因组DNA产 生的表达文库，以鉴定和克隆抗原。

本发明最广义的方面是涉及在感染中由病原微生物表达的抗原多 肽的鉴定。

按照本发明的第一方面，提供一种用于鉴定抗原多肽的方法，包 括：

(i)提供一个编码病原微生物的基因或部分基因序列的核酸文 库；

(ii)转化/转染所述核酸文库至一种宿主细胞；

(iii)提供有助于表达所述的转化/转染的基因或部分基因序列 的条件；

(iv)将所述基因/部分基因序列表达的多肽与从感染或曾经感 染过所述致病微生物的动物获得的自身抗血清相作用；以及

(v)纯化编码与所述自身抗血清相结合的多肽或部分多肽的核 酸。

在本发明的优选方法中，所述的文库包含一个病原微生物的基因 组DNA。

理想的所述病原微生物是细菌。

更优选地，所述的细菌微生物是从以下选择出来的：

金黄色葡萄球菌；表皮葡萄球菌；粪肠球菌；结核分枝杆菌；B 族链球菌；肺炎链球菌；幽门螺杆菌；淋病奈瑟氏球菌；A族链球 菌；布氏疏螺旋体；粗球孢菌；荚膜组织胞浆菌；B型脑膜炎奈瑟 氏球菌；弗氏志贺氏菌；大肠杆菌；流感嗜血菌。

更优选地，所述病原微生物是葡萄球菌属细菌。理想的病原生物 体是金黄色葡萄球菌或表皮葡萄球菌。

在本发明的一个更优选的实施方案中，所述核酸文库是一个λ文 库，理想地，是一个λ表达文库。

按照本发明的第二个方面，提供了含有一个DNA序列的核酸分 子，所述DNA序列选自：

(i)如SEQ ID NO：1-13中代表的DNA序列；

(ii)与上述(i)中确定的SEQ ID NO：1-13所示序列杂交并 编码一种致病微生物所表达的多肽的DNA序列，以及

(iii)由(i)和(ii)中所确定的DNA序列的遗传密码所产 生的简并DNA序列。

在本发明的一个更优选的实施方案中，所述核酸分子是基因组 DNA。

在本发明的一个优选的实施方案中，提供了一种分离的核酸分 子，所述核酸分子在严格杂交条件下与SEQ ID NO：1-13中所示序列 退火。

严格的杂交/漂洗条件是本领域的公知常识。例如，核酸杂交体 在0.1％×SSC，0.1％SDS中60℃下漂洗后是稳定的。本领域公知，如 果已知核酸的序列，可以计算出最佳的杂交条件。例如，根据要进 行杂交的核酸的GC含量，能将杂交条件确定下来。请阅Sambrook等 (1989)著《分子克隆实验手册》。一个用于计算给定的同源核酸分子 间杂交所需严格条件的普遍公式为：

Tm＝81.5℃+16.6Log[Na+]+0.41[％G+C]-0.63(％甲酰胺)

按照本发明的第三个方面，提供至少一种依照本发明的方法所鉴 定的多肽。

在本发明的一个优选的实施方案中，根据本发明前面所述的任一 方面或实施方案，所述多肽与一种微生物的感染致病力相关。

更优选地，所述多肽至少是SEQ ID NO：14-19之一或一部分。

按照本发明的第四个方面，提供了一种核酸分子，其特征在于所 述的核酸分子是一个载体的一部分，所述载体适于促进由所述核酸 分子编码的多肽的重组表达。

在本发明的一个优选的实施方案中，所说的载体是一种适应于进 行原核基因表达的表达载体。或者，所述表达载体适应于进行真核 基因表达。

典型地，所述的适应性包括，例如但不限于，提供介导细胞特异 性表达的转录控制序列(启动子序列)。这些启动子序列可以是细胞 特异性的，可诱导的或组成性的。

启动子是本领域所知的术语，为了清楚的目的，仅举一个例子， 但不限于此例，以说明其如下的特征。增强子元件是顺式作用的核 酸序列，通常位于一个基因的转录起始位点的5’端(增强子也可 出现在基因序列的3’端或者甚至位于内含子序列内部，因此其不 受位置的约束)。增强子的功能是增加与增强子连接的基因的转录频 率。增强子的活性是响应与增强子元件特异性结合的反式作用转录 因子(多肽)。转录因子的结合/活性(请看《真核转录因子》，David S Latchman，Academic Press Ltd，San Diego著)依赖于多种环境因素 包括，例如但不限于，中间代谢产物(如葡萄糖，脂质)，环境作用 因子(如光，热)。

启动子元件还包括TATA框和RNA聚合酶起始选择(RIS)序列， 其功能是选择转录起始位点。这些序列也结合于多肽上，所述多肽， 和其他事物一起，促进RNA聚合酶对转录起始点的选择。

适应性也包括提供选择标志和自动复制序列，两者均有助于所述 载体在真核细胞或原核宿主中的维持。自动维持的载体称为附加载 体。

促进载体编码基因表达的适应性包括提供转录终止/多聚腺苷酸 序列。还包括提供内部核糖体进入位点(IRES)，其功能是最大表达 排列在二顺反子或多顺反子表达盒中的载体编码基因。

这些适应性在本领域是熟知的。这里有一系列关于表达载体的构 建和重组DNA的通用技术的出版物。请看，Sambrook等(1989)著 《分子克隆实验手册》，冷泉港实验室，冷泉港，NY和其中的参考 文献；Marston，F(1987)著《DNA克隆技术》；一本IRL出版的实 用手册，Vol III IRL，英国牛津，《DNA克隆》：F M Ausubel等著，《分 子生物学中的通用方案》，John Wiley & Sons，Inc.(1994)。

按照本发明的另外方面，提供了一种生产前述任一方面或实施方 案所述多肽的方法，包括：

(i)提供一种用本发明的载体转化/转染的细胞；

(ii)在利于制备所述多肽的条件下培养所述细胞；以及

(iii)从所述细胞或其生长环境中纯化所述多肽。

在本发明的优选方法中，所述载体编码并因此为所述重组多肽提 供一种促进所述多肽纯化的分泌信号。

按照本发明的第五个方面，本发明提供了一种用载体转化或转染 的细胞或细胞系。

在本发明的一个优选的实施方案中，所述细胞是原核细胞。或者， 所述细胞是选自真菌、昆虫、两栖动物、哺乳动物、植物的真核细 胞。

按照本发明的另一方面，提供了一种疫苗，所述疫苗包含至少一 种本发明的多肽。

理想地，所述疫苗还包含载体和/或佐剂。

载体和佐剂是以下述方式表述。某些多肽或肽抗原含有B-细胞 表位但没有T细胞表位。通过在多肽/肽中加入T细胞表位，或通过 将多肽/肽结合到一种含有多个T细胞表位的免疫原性载体蛋白上， 如血兰蛋白或破伤风毒素，能大大增强免疫应答。结合物由抗原呈 递细胞摄取，加工，并通过人白细胞抗原(HLA’s)II类分子呈递。 这使得在T细胞的帮助下将针对源自载体表位的T细胞的特异性传 递给对原始的抗原多肽/肽具有特异性的B细胞。这能增加抗体产生、 分泌和同型转化。

佐剂是能够通过调节免疫细胞活性而增加对抗原的特异性免疫应 答的一种物质或程序。佐剂的例子包括，例如但不限于，共刺激分 子的激动抗体、弗氏佐剂、胞壁酰二肽、脂质体。因此佐剂是一种 免疫调节剂。载体是一种免疫原性分子，当与第二个分子结合后会 增强针对后者的免疫应答。

本发明另一方面提供了一种方法，所述方法包括通过对一种动物 施用至少一种本发明的多肽或其一部分，或本发明的疫苗，使所述 动物产生抵抗一种病原微生物的免疫力。

在本发明的一个优选的方法中，所述动物是人。

优选地，疫苗或抗原多肽能通过静脉内注射，肌肉注射，或皮下 注射等直接注射接种。进一步地，疫苗或抗原多肽，或许还可以口 服。

优选地，疫苗能抵抗金黄色葡萄球菌。

疫苗也可能抵抗表皮葡萄球菌。

显然，疫苗或抗原多肽对于控制或减轻除了人以外的其它动物的 病情也是有效的，例如，但不限于例子，家庭宠物，家畜，马匹。

按照本发明的其它方面，还提供了一种抗体或至少其一个有效结 合部分，所述抗体结合至少一种本发明的多肽。

在本发明的一个优选实施方案中，所述抗体是一种多克隆或单克 隆抗体，其中所述抗体对所述多肽具有特异性。

或者，所述抗体是一种通过重组方法产生的嵌合抗体，其包含所 述抗体的可变区与人类抗体的不变或恒定区。

在本发明的另一个替代实施方案中，所述抗体是通过重组方法产 生的人源化抗体，是所述抗体的互补决定区域与一种人抗体的恒定 区(C)和可变(V)区的读框的结合。

优选地，所述抗体被给予了一种标志，包括一种传统的标记或标 签，例如放射性和/或荧光和/或表位的标记或标签。

优选地，针对所述的多肽的所述人源化的单克隆抗体，是由一种 适合于转化或转染原核细胞或真核细胞的表达载体所产生的融合多 肽。

抗体，也叫做免疫球蛋白，是一种对外来分子(抗原)具有特异 性的蛋白分子。免疫球蛋白(Ig)是一类结构相关蛋白质，包括两 对多肽链，一对是轻(L)(低分子量)链(κ或λ)，一对是重(H)链(γ， α，μ，δ和ε)，所有四条链通过二硫键结合在一起。重链和轻链都 有结合抗原的区域，并且在Ig分子之间是高度可变的。另外，重链 和轻链包括非可变或恒定区域。

轻链包括两个结构域。羧基-末端结构域在一种类型的轻链中是 基本相同的，因此被称为“恒定”(C)区。氨基-末端结构域在轻链 和轻链间是变化的并构成抗体的结合位点。因为它的可变性，它被 称为“可变”(V)区。

Ig分子的重链分几个类型，α，μ，δ，ε，和γ(其中还分几个 亚型)。装配好的Ig分子包括一个或多个由相同的两条重链和轻链 组成的单位，并从它拥有的重链获得它的名称。这样，Ig便分成5 个型：IgA，IgM，IgD，IgE和IgG(并因重链的不同而分成4个亚型， 例如，IgG1，IgG2，IgG3和IgG4)。关于抗体结构和它们的不同功 能的更详细的解释，可以参考《抗体的应用：一本实验室手册》，冷 泉港实验室出版。

嵌合抗体是重组抗体，其中小鼠或大鼠抗体的所有可变区与人抗 体的恒定区结合。人源化的抗体是重组杂交抗体，它融合了来自于 啮齿类抗体的可变区的互补决定区与人抗体可变区的框区。也用了 人抗体的恒定区。互补决定区(CDRs)位于抗体的重链和轻链的N- 末端结构域，可变区的主要变化多集中在CDRs。这些区域构成位 于抗体分子表面的环状结构。这些环状结构在抗体和抗原之间提供 结合表面。

非人类动物的抗体可引起对外来抗体产生免疫应答，并由此被从 血液循环中清除。注射到人机体中的嵌合抗体和人源化抗体具有弱 的抗原性，因为在重组杂交抗体中啮齿类(即异类)抗体的量减少， 而人的抗体区域不会引起免疫应答。它使得针对该抗体的免疫应答 减弱，并减少了对抗体的清除。这显然对于应用治疗性抗体治疗人 类疾病来说是很需要的。人源化抗体被设计为具有更少“异类”抗 体区域，因此与嵌合抗体相比，人源化抗体是更弱的免疫原。

本发明的另一方面是提供一种载体，所述载体适用于按照本发明 表达人源化的或嵌合体的抗体。

本发明进一步提供了一种细胞或细胞系，所述细胞或细胞系用编 码本发明的人源化的或嵌合体的抗体的载体转化或转染。

本发明进一步提供了一种制备本发明的人源化或嵌合抗体的方 法，其包括：

(i)提供用一个载体转化或转染的一种细胞，所述载体包括一 种编码本发明的人源化或嵌合体抗体的核酸分子；

(ii)在有利于制造所述抗体的条件下使所述细胞增殖；以及

(iii)从所述细胞中或它的生长环境中纯化所述抗体。

本发明进一步提供了一种杂交瘤细胞系，其可产生如前所描述的 单克隆抗体。

本发明进一步提供了一种用杂交瘤细胞系生产本发明的单克隆抗 体的方法。

本发明进一步提供了制备一种能产生本发明的单克隆抗体的杂交 瘤细胞系的一种方法，它包括以下步骤：

i)用一种免疫原免疫一种具有免疫活性的哺乳动物，所述免疫 原包含至少一种具有如SEQ.ID No 14-19中所示的氨基酸序列的多 肽或其片段；

ii)将接受免疫的免疫活性动物的淋巴细胞与骨髓瘤细胞融合形 成杂交瘤细胞；

iii)根据与步骤(i)中的氨基酸序列的结合活性筛选出由步骤 (ii)中的杂交瘤细胞产生的单克隆抗体；

iv)培养杂交瘤细胞以使其增殖和/或分泌所述单克隆抗体；以 及

v)从培养上清液中回收单克隆抗体。

优选地，上述具免疫活性的哺乳动物是小鼠。或者，上述具免疫 活性的哺乳动物是大鼠。

使用杂交瘤细胞产生单克隆抗体是本领域所熟知的。用于产生单 克隆抗体的方法是由Kohler和Milstein，(自然256，495-497(1975))， 和由Donillard和Hoffman(《免疫学概要》V.II中的“关于杂交的 基本原理”，Schwartz编辑1981，该文献列入相关参考)公布的。

本发明进一步提供了应用抗体制造一种药物，以治疗金黄色葡萄 球菌引起的败血症、食物中毒或皮肤损坏。

本发明进一步提供了应用本发明的抗体制造一种药物，以治疗表 皮葡萄球菌引起的败血症、腹膜炎或心内膜炎。

显然，按照本发明的方法鉴定的多肽将促进治疗性抗体的生产， 所述抗体能够用于一些由病原体感染引起的疾病，例如，败血症、 结核病、细菌相关性食物中毒、血液感染、腹膜炎、心内膜炎、脓 毒症、脑膜炎、肺炎、胃溃疡、淋病、链球菌喉炎、链球菌相关中 毒性休克、坏死性筋膜炎、脓庖病，组织胞浆菌病、莱姆病、胃肠 炎、痢疾、志贺菌病。

如前所述，病原微生物引起广泛的不同类型的疾病。例如但不限 于下表所列的一些病原微生物及其引起的疾病。 微生物 引起的疾病 金黄色葡萄球菌 脓毒病，食物中毒，败血症 表皮葡萄球菌 腹膜炎，败血症，心内膜炎，其它医 院-相关的疾病 粪肠球菌 心内膜炎，膀胱炎，外伤感染 结核分枝杆菌 结核病 B族链球菌 脓毒病，脑膜炎，肺炎，膀胱感染 肺炎链球菌 肺炎，脑膜炎 幽门螺杆菌 胃溃疡 淋病奈瑟氏球菌 淋病 A族链球菌 链球菌喉炎，坏死性筋膜炎，脓泡病， 链球菌中毒休克综合症 布氏疏螺旋体 莱姆病 粗球孢菌 肺炎 荚膜组织胞浆菌 组织胞浆病，肺炎 B型脑膜炎奈瑟氏球菌 脑膜炎 弗氏志贺氏菌 胃肠炎，志贺菌痢疾，痢疾 大肠杆菌 食物中毒，胃肠炎 流感嗜血菌 脑膜炎，肺炎，关节炎，蜂窝织炎

现仅举例说明本发明的一个实施方案并以下述材料、方法、SEQ ID NO：1-19和表1作为参考。

材料和方法

应用一种S.aureus 8325/4基因组DNA的λZAP表达文库。它包 括从经过Sau3A部分消化的全部基因组DNA得到的2-10kb的片段。 它被克隆进载体的BamH1位点。这个文库包括＞10倍基因组的范 围。通过对在一个直径9厘米的Petri碟上的大约20,000个噬菌斑 形成单位的初筛挑选噬菌斑对文库进行探测。铺皿所用的细胞，对 细胞的处理，铺皿过程和缓冲液配制均严格参照制造商(Stratagene) 提供的操作手册进行。铺皿细胞，大肠杆菌XL1-Blue MRF’，用噬 菌体感染并放进3ml含有10mM硫酸镁的上层LB琼脂液中，铺在 含10mM硫酸镁的LB平皿上。然后将平皿在42℃孵育4小时。将 一个直径8.5厘米的纤维素滤膜片(之前浸泡在10mM的IPTG中并 在空气中干燥)放在每个平皿上，并做出定位标志。然后将平皿进 一步在37℃孵育3.5小时。将滤膜移去并用TBST缓冲液漂洗，然 后在含有6％w/v脱脂奶粉和3％v/v猪血清(Sigma)的TBST中4℃ 下封闭过夜。血清是用于封闭滤膜上的所有蛋白A的克隆。滤膜然 后用含有病人血清(1/5000稀释)的封闭液在室温下放置处理90分 钟。抗血清从处于严重金黄色葡萄球菌感染的恢复期的病人中获得。 滤膜然后在TBST中漂洗3次，每次10分钟。第二抗体用的是结合 碱性磷酸酶的山羊抗人全IgG(Sigma)，1/30,000稀释于封闭液中 室温孵育30分钟。滤膜然后按上述方法漂洗，并用标准比色法程序 进一步处理。

有交叉反应的噬菌斑被定位在琼脂平皿上，被挑入0.2ml的含有 0.02ml三氯甲烷的噬菌体缓冲液中。确定每个被挑入的噬菌斑的效 价，然后每个平皿上大约接种200个噬菌斑。如上所述进行噬菌斑 的挑选和筛选以得到单一的，纯的交叉反应克隆。

然后纯的克隆被接种(1μl)到平皿上，产生一个直径0.5厘米 的汇合的噬菌斑。每块平皿上可接种30个单独的克隆。进行一次噬 菌斑挑选，并用一种适当的血清对滤膜进行探测。这样能够检测克 隆与其他病人的血清，未被感染的供体血清和抗蛋白A血清的交叉 反应性。采用制造商的方案(Stratagene)将克隆切下以在XLOLR 大肠杆菌中插入一个噬菌粒。进行一个质粒的小量制备，基因组插 入的大小由限制性图谱决定。使用针对载体序列的引物，通过DNA 测序对克隆插入进行鉴定，所述引物允许测序通过插入位点。通过 将所获得得序列与公共结构域数据库进行比较，可确定所克隆的基 因的性质。

杂交溶液/条件

典型地，杂交条件是用4-6倍的SSPE(20倍的SSPE含有175.3 克NaCl，88.2克NaH2PO4H2O和7.4克的EDTA，溶解至1升，并 且调节pH至7.4)；5-10倍的封闭溶液(50倍的封闭溶液含有5克400 型的水溶性聚蔗糖，Pharmacia)，5克聚乙烯吡咯烷酮和5克牛血清 白蛋白；100μg-1.0mg/ml超声处理的鲑鱼/鲱鱼精DNA；0.1-1.0％ 的十二烷基硫酸钠；任选地，40-60％去离子甲酰胺。杂交温度依核 酸靶序列的GC含量的不同而变化，但典型地是介于42-65℃之间。

表1在人血清中识别金黄色葡萄球菌的克隆 病人血清    克隆    编码的蛋白  位点数目     A     1    γ溶血素B和C亚基     1     A     3    Atl     2     A     4    γ溶血素B和C亚基     1     A     5    γ溶血素B和C亚基     1     A     7    新的推定的蛋白酶(ORF1新抗原类似    物)     7     A     8    新核酸酶(Yisk)     5     A     9    新自溶素     6     A     10    γ溶血素B和C亚基     1     A     11    Atl     2     A     14    γ溶血素B和C亚基     1     A     15    γ溶血素B和C亚基     1     A     S1    新的推定的蛋白酶(ORF1新抗原类似    物)     7     A     S5    新表面蛋白     12     A     S17    γ溶血素B和C亚基     1     A     S18    新的推定的蛋白酶(ORF1新抗原类似    物)     7     A     S19    新自溶素     6     A     S20    新表面蛋白/毒素     13     A     S21    γ溶血素B和C亚基     1     A     S25    γ溶血素B和C亚基     1     A     S29    血纤蛋白原结合蛋白     3     A     S44     新表面蛋白     12     A     S45     Atl     2     A     S55     Atl     2     A     S64     Atl     2     A     S66     Atl     2     B     2     新外毒素(外毒素2类似物)     8     C     1     凝固酶     4     C     2     凝固酶     4     C     3     凝固酶     4     C     4     凝固酶     4     C     5     凝固酶     4     C     6     凝固酶     4     C     7     凝固酶     4     C     8     凝固酶     4     C     9     凝固酶     4     C     10     凝固酶     4     C     11     凝固酶     4     C     13     凝固酶     4     C     14     凝固酶     4     C     15     凝固酶     4     C     19     凝固酶     4     C     20     凝固酶     4     C     25     凝固酶     4     E     6     新表面蛋白     9/10     E     7     新表面蛋白     9/10     E     11     γ溶血素B和C亚基     1     F     1     新外毒素(外毒素2类似物)     8     F     2     新外毒素(外毒素2类似物)     8     F     3     新外毒素(外毒素2类似物)     8     F     4     新外毒素(外毒素2类似物)     8     F     5     新溶血素(YjfD)     11

序列表

                        序列表 <110>谢菲尔德大学 <120>抗原多肽 <130>toxin <140> <141> <160>32 <170>PatentIn Ver.2.1 <210>1 <211>2260 <212>DNA <213>Staphylococcus aureus <400>1 gatcttaatg aaagagtgac tgatgcctta gcaattgcta gttgtatcaa tgcgcatccg   60 tatgtcaaag gagaactttg cgtgtccgat gacttaacgt atacgacagg ttattttgcc   120 gctgctaaaa ttggttacca tcgattattt gatattaaac cagttaatac gagatatgga   180 ggcagaataa tatttgtgga cgattgtatt gatttaaatc attacatatc atttttagaa   240 agcacaccga agcaagttgt ttatgaaacg gtataggggt tttagtatga catcaaaaga   300 tattactcaa attagtgtca ttgctgcgat tttaaccatt ttggcagttt tgaaaatacc   360 gtccattata ccaggattag attttcaatt atctgcaccg gcagcattat tgatattagc   420 tttctttgga attaaaaagt actttttagg tggattatta tctagcctat tattactagt   480 atttggcgta tttaatccaa ttaatgtgat tatctctatt atatttagag ttatagctat   540 tgcagttgtt tatttattga aaataaatgt actatcatta gttttagcaa gtgtattagg   600 cagtttggta tataggctac tattatctat tattttaaat ttacctgtgt gggtagtgtt   660 gttaaacgcg attccaggcg taatattcac tttaattgta gctattcctt tatatctcac   720 attgagaaaa agaatggcag tattactaag ataataaatc aaaacacggt cgtcacaatt   780 actgttggcg accgtgtttt actagctatt tattgttttc agtttctttt gtatctaaca   840 atttcacttt gtgattttcc caatcaattt catatgttga tttaaatgtt ctagttttaa   900 agtttttata atttgcgcct gcccagtaga agccattcca acgaatttgg tataaatcca   960 tttcacgttg ataagttact gtaattttag attttttagc gccatcttgt ctgtgtgata   1020 gtacgcttaa aaattctgga ttgaagttac ttctagataa taatggcatt tggtgttgcg   1080 ctatgaagtt ttggccagcg tatgcactgc tttgtctgcc agctaagaag agttcattac   1140 catatgttgg gtggaagcta tctcttccat aaggtcccca accattattc ataattttat   1200 gtgcttcaac tccccagcca acatttttat aatttgtgtt gcgacttaat gttgttctgt   1260 aactttcttg tttataatta attgtttcag aaaaagctgt atttccatta agtccaccag   1320 ataaaccatt agagatacta atgtcaccac caaatgtata gcctaaagta ttttgaactt   1380 gaaactcttc attttgattt tttggtgcat aatcaacgac gtttactgaa tcattagatt   1440 gtgagcttat agatacattg tatttagctc cccaatataa ttttgaaaag tcatagtcat   1500 taggattagg tttcacaaag cctgagttaa tattcccagt agctttaagt actaaagtat   1560 ctttatcata acttttatct ttgatgaaat taaatgttaa aatctgtgaa attttaaatt   1620 tatcagaatc tgctgtggct gttgttttgt ataaagtaac tttgtcatcg acttttttta   1680 cgctgactgg tgttatttta ccttcagcat tagcagtacc agaaagtaat aataatgcca   1740 tagatgtagc aacggatgat ttgactaatt tattcatttt catatcaatt ctgtcctttc   1800 accttgattt catgagtctt ccaattgacc tcgtatttca cagtatagtt tctatttaca   1860 aatgcattat ggactctatg tccgtctaaa taactgttgc cataatgcgt tgatctttta   1920 atggcatgag tgacatccat gtttcttccg taagtaattt caaattcgct tgtatcgctt   1980 gaaccttttt catgagatac tgtggcgata aatgaagggt taaatccact ttgtacaaga   2040 ggtggtaact cactgtctgg aacgaaataa tctctaggat ctttactatg aggtttgtag   2100 cctacaaata aatcgctatc aaaggctgat ttttgacctg attcagtggc gaatgaattc   2160 gctttgacgc cccataaaac actttttgag ttttgttgtt ctacttcact tacataattt   2220 tgttgtgtat agctaatcga tttagaatag ttaaatgatc                         2260 <210>2 <211>2902 <212>DNA <213>Staphylococcus aureus <400>2 gatcgtataa tcgaaacagc accaacggat tacttatctt ggggtgtcgg tgcagtcggt   60 aaccctagat tcatcaatgt tgaaatcgta cacacacacg actatgcttc atttgcacgt   120 tcaatgaata actatgctga ctatgcagct acacaattac aatattatgg tttaaaacca   180 gacagtgctg agtatgatgg aaatggtaca gtatggactc actacgctgt aagtaaatat   240 ttaggtggta ctgaccatgc cgatccacat ggatatttaa gaagtcataa ttatagttat   300 gatcaattat atgacttaat taatgaaaaa tatttaataa aaatgggtaa agtggcgcca   360 tggggtacgc aatctacaac tacccctact acaccatcaa aaccaacaac accgtcgaaa   420 ccatcaactg gtaaattaac agttgctgca aacaatggtg tcgcacaaat caaaccaaca   480 aatagtggtt tatatactac tgtatacgac aaaactggta aagcaactaa tgaagttcaa   540 aaaacatttg ctgtatctaa aacagctaca ttaggtaatc aaaaattcta tcttgttcaa   600 gattacaatt ctggtaataa atttggttgg gttaaagaag gcgatgtggt ttacaacaca   660 gctaaatcac ctgtaaatgt aaatcaatca tattcaatca aacctggtac gaaactttat   720 acagtacctt ggggtacatc taaacaagtt gctggtagtg tgtctggctc tggaaaccaa   780 acatttaagg cttcaaagca acaacaaatt gataaatcaa tttatttata tggctctgtg   840 aatggtaaat ctggttgggt aagtaaagca tatttagttg atactgctaa acctacgcct   900 acaccaacac ctaagccatc aacacctaca acaaataata aattaacagt ttcatcatta   960 aacggtgttg ctcaaattaa tgctaaaaac aatggcttat tcactacagt ttatgacaaa   1020 actggtaagc caacgaaaga agttcaaaaa acatttgctg taacaaaaga agcaagttta   1080 ggtggaaaca aattctactt agttaaagat tacaatagtc caactttaat tggttgggtt   1140 aaacaaggtg acgttattta taacaatgca aaatcacctg taaatgtaat gcaaacatat   1200 acagtaaaac caggcactaa attatattca gtaccttggg gcacttataa acaagaagct   1260 ggtgcagttt ctggtacagg taaccaaact tttaaagcga ctaagcaaca acaaattgat   1320 aaatctatct atttatttgg aactgtaaat ggtaaatctg gttgggtaag taaagcatat   1380 ttagctgtac ctgctgcacc taaaaaagca gtagcacaac caaaaacagc tgtaaaagct   1440 tatactgtta ctaaaccaca aacgactcaa acagttagca agattgctca agttaaacca   1500 aacaacactg gtattcgtgc ttctgtttat gaaaaaacag cgaaaaacgg tgcgaaatat   1560 gcagaccgta cgttctatgt aacaaaagag cgtgctcatg gtaatgaaac gtatgtatta   1620 ttaaacaata caagccataa catcccatta ggttggttca atgtaaaaga cttaaatgtt   1680 caaaacttag gcaaagaagt taaaacgact caaaaatata ctgttaataa atcaaataac   1740 ggcttatcaa tggttccttg gggtactaaa aaccaagtca ttttaacagg caataacatt   1800 gctcaaggta catttaatgc aacgaaacaa gtatctgtag gcaaagatgt ttatttatac   1860 ggtactatta ataaccgcac tggttgggta aatgcaaaag atttaactgc accaactgct   1920 gtgaaaccaa ctacatcagc tgccaaagat tataactaca cttatgtaat taaaaatggt   1980 aatggttatt actatgtaac accaaattct gatacagcta aatactcatt aaaagcattt   2040 aatgaacaac cattcgcagt tgttaaagaa caagtcatta atggacaaac ttggtactat   2100 ggtaaattat ctaacggtaa attagcatgg attaaatcaa ctgatttagc taaagaatta   2160 attaagtata atcaaacagg tatggcatta aaccaagttg ctcaaataca agctggttta   2220 caatataaac cacaagtaca acgtgtacca ggtaagtgga caggtgctaa ctttaatgat   2280 gttaagcatg caatggatac gaagcgttta gctcaagatc cagcattaaa atatcaattc   2340 ttacgcttag accaaccaca aaatatttct attgataaaa ttaatcaatt cttaaaaggt   2400 aaaggtgtat tagaaaacca aggtgctgca tttaacaaag ctgctcaaat gtatggcatt   2460 aatgaagttt atcttatctc acatgcccta ttagaaacag gtaacggtac ttctcaatta   2520 gcgaaaggtg cagatgtagt gaacaacaaa gttgtaacta actcaaacac gaaataccat   2580 aacgtatttg gtattgctgc atatgataac gatcctttac gtgaaggtat taaatatgct   2640 aaacaagctg gttgggacac agtatcaaaa gcaatcgttg gtggtgctaa attcatcggc   2700 aactcatatg taaaagctgg tcaaaataca ctttacaaaa tgagatggaa tcctgcacat   2760 ccaggaacac accaatatgc tacagatgta gattgggcta acatcaatgc taaaatcatc   2820 aaaggctact atgataaaat tggcgaagtc ggcaaatact tcgacatccc acaatataaa   2880 taagcaacat gaacatagga tc                                            2902 <210>3 <211>2792 <212>DNA <213>Staphylococcus aureus <400>3 gatcaactta atataatgaa ttcggcaaca gaagagcatc atcataaaga ttatattaaa   60 ctatataatt taggtggcgg tgctgctaaa aaaattgcaa tagaggtttt attggggaag   120 gataaagtca ttcagaaaaa atacgtgcat attttaccta gtaaagaagg gtacatgtta   180 ccaattaata aaaatgtgta cgaagaatta gaaagaacga ttgagaacaa tggtcatgaa   240 gctgatttga atgtacgtat gacttattat cataatgtaa gtcgcaaaca acaggaagtt   300 atattaaaag gtcaaatcga ccgttttaat acttataata ataaagaaat ttatgatttg   360 cagtttatct aaaaattgat ttaagagggt agttgtttat tgcgaaaaat atcattcaat   420 tttaatgaaa taatggcgtc attactataa aatattactt tatgttgtaa tgcatttttc   480 tataagatag aactaaaagg aggggcaaag atgcaaatta gacaaataca tcaacatgac   540 tttgctcaag tggaccagtt aattagaacg gcatttgaaa atagtgaaca tggttatggt   600 aatgaatcag agctagtaga ccaaattcgt ctaagtgata cgtatgacaa taccttagaa   660 ttagtagctg ttcttcaaaa tgaagttgta gggcacggtt tactaagtga agtttatctt   720 gataacgagg cacaacggga aattggatta gtgttagcac ctgtatctgt tgatattcat   780 catcaaaata aaggtattgg gaagcgattg attcaagcat tagaacgaga agcaatatta   840 aaaggatata attttatcag tgtattagga tggccgacgt attatgccaa tctaggatat   900 caacgcgcaa gtatgtacga catttatcca ccatatgatg gtataccaga cgaagcgttt   960 ttaattaaag aattaaaagt gaacagttta gcgggaaaaa caggtaccat aaattacaca   1020 tctgcttttg aaaaaatatg atttcaagct aggattacat taggtagagt tcatattaat   1080 aataaaaaat gtttgcaatc aaatcgtacg ttgtcgtttg taattcttaa aatagcaata   1140 aataaaatgt ttgttagtaa agtattattg tggataataa aatatcgata caaattaatt   1200 gctataatgc aattttagtg tataattcca ttaacagaga ttaaatatat ctttaaaggg   1260 tatatagtta atataaaatg actttttaaa aagagggaat aaaatgaata tgaagaaaaa   1320 agaaaaacac gcaattcgga aaaaatcgat tggcgtggct tcagtgcttg taggtacgtt   1380 aatcggtttt ggactactca gcagtaaaga agcagatgca agtgaaaata gtgttacgca   1440 atctgatagc gcaagtaacg aaagcaaaag taatgattca agtagcgtta gtgctgcacc   1500 taaaacagac gacacaaacg tgagtgatac taaaacatcg tcaaacacta ataatggcga   1560 aacgagtgtg gcgcaaaatc cagcacaaca ggaaacgaca caatcatcat caacaaatgc   1620 aactacggaa gaaacgccgg taactggtga agctactact acgacaacga atcaagctaa   1680 tacaccggca acaactcaat caagcaatac aaatgcggag gaattagtga atcaaacaag   1740 taatgaaacg acttctaatg atactaatac agtatcatct gtaaattcac ctcaaaattc   1800 tacaaatgcg gaaaatgttt caacaacgca agatacttca actgaagcaa caccttcaaa   1860 caatgaatca gctccacaga gtacagatgc aagtaataaa gatgtagtta atcaagcggt   1920 taatacaagt gcgcctagaa tgagagcatt tagtttagcg gcagtagctg cagatgcacc   1980 ggcagctggc acagatatta cgaatcagtt gacgaatgtg acagttggta ttgactctgg   2040 tacgactgtg tatccgcacc aagcaggtta tgtcaaactg aattatggtt tttcagtgcc   2100 taattctgct gttaaaggtg acacattcaa aataactgta cctaaagaat taaacttaaa   2160 tggtgtaact tcaactgcta aagtgccacc aattatggct ggagatcaag tattggcaaa   2220 tggtgtaatc gatagtgatg gtaatgttat ttatacattt acagactatg taaatactaa   2280 agatgatgta aaagcaactt tgaccatgcc cgcttatatt gaccctgaaa atgttaaaaa   2340 gacaggtaat gtgacattgg ctactggcat aggtagtaca acagcaaaca aaacagtatt   2400 agtagattat gaaaaatatg gtaagtttta taacttatct attaaaggta caattgacca   2460 aatcgataaa acaaataata cgtatcgtca gacaatttat gtcaatccaa gtggagataa   2520 cgttattgcg ccggttttaa caggtaattt aaaaccaaat acggatagta atgcattaat   2580 agatcagcaa aatacaagta ttaaagtata taaagtagat aatgcagctg atttatctga   2640 aagttacttt gtgaatccag aaaactttga ggatgtcact aatagtgtga atattacatt   2700 cccaaatcca aatcaatata aagtagagtt taatacgcct gatgatcaaa ttacaacacc   2760 gtatatagta gttgttaatg gtcatattga tc                                 2792 <210>4 <211>2478 <212>DNA <213>Staphylococcus aureus <400>4 gatcgaattg aacgaagcat ttgcttctca aacgattgca tctattaaag aagtaggtct   60 agatatatca cgtacgaatg tgaatggtgg cgctattgct ttaggtcatc cattaggtgc   120 tacaggcgca atgttaaccg cgcgtttact taatgaaatg ggtagacgtc ccgatagccg   180 ttacggcatg gttacgatgt gtattggtgt cggcatgggt gcagctgcta tatttgaata   240 tgtgcgttag aatggttgat tttggatgaa gcggattcgt tttgttattg aatgaagtag   300 gctgaagttg aagccagttg aagttgaagc gggttgaagc aatttcgttt tattaatgaa   360 gctgtgtgaa atatagtgat tgaacaaaaa agtggtttaa tgggatggtg gttatttccg   420 ttttagaatt taacatttac acgtctaatt ttaatcattg ttttaaattt tatgaatcga   480 agccctttga tttaataata tttgctaatg ctagtaactt atctgattgt tcatgtttaa   540 aataaagaaa accactcaca tcagtgtgtg ttcgaactag acttgtaagt tccagttcgg   600 cacgactttc taaagcaatt attattgctg tgattgtcgt atatcactta gatgtgcgtg   660 gtttatttta ataggttagt aatatattag gtcatgttat gtttaagact ataatgaata   720 aataatttag aaatatgctt ccgattgttc gatgctttaa ttcagttaga agcatcatag   780 aatgcatgat tactgttgta aagatacgta atgttttgta ttgactgtat gtctttggat   840 agagttacaa acttattttg ttactctagg cccatatgtc gcagtaccat ctgcatgtgt   900 tgttacattg tatgcatttg ttttacttgg cttcttgtat gtcgggcgag ctccgtatga   960 cacttgaccg tttgcatgtg ttgttacgtt gtatgcattt gttttgcttg gcttgttttg   1020 tgttgggcga gcgccatatg atacttggcc gtttccatgt gttgttacgt tatatgcgtt   1080 tgttttgctt ggcttgtttt gtgtcggacg agctccgtat gatacttggc cgtttgcatg   1140 tgttgttaca ttgtatgcat tcgtttcgct tggcttcttg tatgtcggac gagctccgta   1200 tgatacttga ccatttgcat gtgttgttac gttatatgca tttgtttctg atggcttatt   1260 gaatcttggt ctcgcttcat atccaaatgt tccatcgttg tattcacgga tacctgtacc   1320 agcatctcta tatttaacat atttaggtgt tttgttaaat tgcggtctcg gaccatattg   1380 agaagcttct gttgtttcag ttgcttgagg tttaacttca atatcacttg attctccttg   1440 agtacctttt aacgttgatt cagtaccttg tggttttatt tcaagtttag atgagctacc   1500 ttcaagacct tctaaaatag ggttcgttaa cggtgggttt gtataattat tgcttaatga   1560 tgggccgctt tgttccattg ttagaaaatc gggaccttga acgatttcac cttgtaccgt   1620 tttattttcc atcgttggat attccggacc ttttacaatt tcacctgtaa ttgtgccctg   1680 tggaatttta actaatggtt gtgcaactgg ttgtgttgtt tcttcagctt taccagccgt   1740 agttttaacc tcttgttggt tatcaacttt aggtgcttga ggttcttcaa ctttcttctc   1800 ttcttttact actggcgatt ttgtttcagt ttctccgtat tttttgacag ttttcttttt   1860 ccaagaatca tctgcttctt taactgcttt tttcgtttct tcaactaatt tatcaaaatt   1920 aggtttatta tcactatttg ttttatagtt atgtgttgta ggattatatt tcgttataga   1980 tttcggtcta ttttgtttag tttccataaa gaaatcatca ataattgaat ttaagtcatc   2040 aatcatttct tttttaatac gttcatttgt aattttatgt ggattgtctg tatctccaag   2100 gattaagtcc agttttgctc gtaactcttt cgcgtgctcc ccataatcct tatcaccata   2160 atatgataca actaatgtat caatttcaga tacgagatcg tatacttcct tagttgcttt   2220 atcttcttct gctgcattaa aagttttcaa gtctgaattc ttatccttaa tatctttaac   2280 ttctctgtga aaatcatcca gtgctctctt taatgcatcc tgtagttcat tgtattcttt   2340 catcgaaagt tcttctaaat tatatttatg aaaattagcc atttttaaat ctgtacgagg   2400 attttctttt ttataatttg cataccattg tttataatct tcatattgag atttctttct   2460 ctccaaaaga tattgatc                                                 2478 <210>5 <211>2070 <212>DNA <213>Staphylococcus aureus <400>5 tgacgctgct tttgtaaata catataattt ttccacttca tgatttaatt cgttcgcatg   60 atctttgtaa tttctaccaa aagcaatcac attattcgga ggtgttactg gtggtaaaaa   120 ttcaatgtca ttaaatgaaa ttttatagtc ttcagctttg ccgctatctt ctgctgctac   180 aactgcttta cgtacttgtt cttgaaaatc taaagtatga ttttgttgta aaccagctaa   240 caatgtttta ggatggaaat ctccttctgc aaagtcagca aatacttgtg ttaaatccca   300 tacagcatct tcgcgtttta ctttaacgcc atatgaagtt ttgtcattat acttgaatga   360 taagaatttc attcattctc aactcctcgt ctttatctta attcacatta taactttttt   420 cgttatcaaa taacaaataa ataagtaaga caattttgaa aatgagttgt gttcattctg   480 ctacaaggac tttgcactta atcgaaatta ttttttattc ttttgaaaat caaaatacta   540 tagttgcaat gtaccaaatt tgaagaagta taaataacct ttaacttctt tattaagaat   600 cgtttgaagc gtattttgat aatatttcat ctgtatctta tatttatttt ttaattgtgt   660 accaatttct tcatctgtca tcccacggcg acgattaaat gcatcggttt tatagtctac   720 aaaataatgc acaccatctt taacaaagat taagtcaatc ataccttgaa taattgagac   780 gtcttcgtct ccttgtggca attggtcaac taatgcttgg ttaactacaa acggtaattc   840 acgataaact tgctctgctt cagcaataat cgaatataac tcactattga taaatgtcat   900 tatttcatcc atacggatat cttttttcgc atctgcttcg ataatatgtt tatcgattaa   960 tccatcgata tactgatgta actcaacttc agatatgcgt tcttttttga atggtaaatg   1020 ttgcatcact gtatgcatta acgtaccaat ttcattcgct tttcgtttac cttgttcact   1080 tagaaattta ggtcgttcat acgttgaaaa accgatacga tattgcctta ctcgttcgta   1140 acttgtgcca ctttcttctg tttcatattg tcttttcaat tcagaaacag attgttttga   1200 gggcttttta gtatcattta catatggata tcgataatca agttggtgtt taatttgtgc   1260 tttaacatct tcattaccat tttgcatagt ttctaattga ttaaccgaac gatattcatc   1320 attatctaaa atggtttctg tagacacatc ttcaaagtac acaattgaaa tatttacatt   1380 cggacgacta ctatcttcaa tttgtgctat atctttttca aattttaaat catctggaat   1440 tgacgcagat tgatgtttag ataaaatact ataaataaga tggaacggat ttggtgaagt   1500 taatcgttca ttgacagcaa tgtgctcacc agaaatagac aattgctcta gttctagtaa   1560 tgatttatca tttttcactc taccaattaa ataaagttgt tctttcgctc ttgttaatgc   1620 tacatagact aatcgcattt cttctgacac aagttctttt tcggcaacag ctctatatgc   1680 aaccgaagct aaagatggaa atgccatttc tttatccaca tcaaaataat ccattccgag   1740 accaaattgc tgatttaaaa taactggttg tttcaaatca cgtttattaa aatcttttga   1800 caatccagaa taaatgacaa atggaaactc tagaccttta ctactatgaa ttgtcatcat   1860 tctaacgaca ttatcgtttg gaccaactac attttcctca ccaaaatctt tgcctctttc   1920 aatcaattca tcgataaaac gaataaattg atataaacct ctaaaacttg aattctcaaa   1980 ctcgatagct ttattaaata aaccataaag atttgcacgt cgtccacgtc caccaataag   2040 tccactaaag tattgaataa cataatgatc                                    2070 <210>6 <211>2394 <212>DNA <213>Staphylococcus aureus <400>6 gatcagattt attagacagt attccagata tacccacacc aaagccagaa aagacgttaa   60 cacttggtaa aggtaatgga ttgttaagtg gattattaaa tgctgatggt aatgtatctt   120 tgcctaaagc gggggaaacg ataaaagaac attggttgcc gatatctgta attgttggtg   180 caatgggtgt actaatgatt tggttatcac gacgcaataa gttgaaaaat aaagcataat   240 tatattgggg gaagagcatc tatatatttt tttaagtata taagacgtct tatttcccct   300 taatttattg tgaagtatat gcaaaatgca atgaatagat tgtccatcat tttaacgtta   360 taatgaattt aacgacttag aactacacaa gtaaaggaga atgaagatgt ctcgaaaaac   420 ggcgctatta gttttggata tgcaagaagg tatagcgagt agtgtaccta gaataaaaaa   480 tattattaaa gcgaatcaga gagcaattga agcagcaaga caacatcgaa taccagtcat   540 tttcatacgt ttagtgttag ataagcattt taatgatgtc tcctcgagta ataaagtgtt   600 ttcaacaatt aaagctcaag gatatgcgat tactgaagca gatgcatcta cacgaatact   660 tgaagattta gcaccactag aagatgagcc gattatttct aagcgacgct ttagcgcatt   720 tacaggtagt tacttggaag tttatttacg tgcaaatgat attaatcatt tagtattaac   780 gggtgtctct acaagtggag ctgtattgag cacggcatta gaaagtgtag ataaagacta   840 ttatattact gttttagaag atgctgttgg tgatagatca gatgataaac atgactttat   900 tattgaacaa attttatcac gctcatgtga cattgaatcc gtagagtcat ggaaaagtag   960 tttatagtta atataacgtc aattaaagct cggcagtaat gtttgagaat aagtacattt   1020 gctcatattt ataaaatgtg tgagatggca attgaaacgg atatgatgag gaacatttga   1080 acataaaata atatatttat ataaaacgac ccgaggcgtt cgaactgaat gcctcgggtt   1140 taattgaata agaaatcgga cttatgaaca gaaatatgtt taagtccgaa ctccttgttt   1200 atacttataa attttacggg tttaatataa tacttattta cctgtaatat atgataattc   1260 ttcagcggca gctgcgttga tagttctatg agaaatgata cctaatcctt taacattgga   1320 ttctgaaata acgatagaac catcactgtt aactttttca acaaatgcta catgaccgta   1380 atgttgatct gcaccaaatt gtccagcctc aaatacaaca gcagcatgac gttttggtgt   1440 atgacttact tgataatcac ggtattgagc tcgattattc caattatgtg catcacctaa   1500 atcacctgag atagatgtac caaattgttt catacggtta tatacgtacc aagtacattg   1560 gccatgtgga tatggcatac tatcagatac ctcacggaaa ggtttgaatt catctgatga   1620 atcatcataa tccttgatag aacgttcata tttatctaaa tctggcatgc gttcatcgtc   1680 aaactgagtt aattgatagt gtttaataat actgtttaat ttcttagcat agtttggatc   1740 tgtagcatat gttttagata agtgtgatgt tgcatcttta taagaatcgg cttccgattt   1800 ccatgttggt ttataaattg ttcgattgcc atcaatacca tttttaataa ggtcagagta   1860 atcttttagt gattctttcg tgcttggata ttttcggaat ccagcattaa tactatacaa   1920 ttgattacca tcagcttcta atgtgttaaa aggaacagaa ttcccttcaa aagcaccttt   1980 gataccgaat aaattatggt ttggtgactt agctaaagca ctacgacctg agtcagattc   2040 taagattgct tgggcaatca tgacagacgc ataaatatcg ttatcttgac caatgcgatg   2100 tgcatcttta gcaattgatt tgacaaattg acgtgtatct tttgagtcaa caacgttaaa   2160 ttgtccgcta tcatcattgt tagatatact aggatctgtt tcgaataatg atgttgcacg   2220 tgtatccttt tgattaacat cgttattgaa tgattgagca ggtttagatt tatgtttcaa   2280 ttcatcttgt gttggtaact gtggattctt tgtattagat ttttcatttt tgtctttttt   2340 agattgagat gcataatctt tttgtgtttt ctttgcatct tcactgtatt gatc         2394 <210>7 <211>2033 <212>DNA <213>Staphylococcus aureus <400>7 gatctggaac aggtttcatt gtcggtaaaa atacaattgt taccaacaag catgtcgttg   60 caggtatgga aattggtgca catattatag cgcatcccaa tggtgaatat aataatggcg   120 gattttataa agttaaaaaa attgtccgtt attcaggtca agaagatatt gccattctac   180 atgtggaaga taaagctgtt catccaaaaa acaggaattt taaagattac acaggcattt   240 taaaaatagc atcagaagct aaagaaaatg aacgcatttc aattgttggc tatccagaac   300 catatataaa taaatttcaa atgtatgagt caacaggaaa agtgctgtca gttaaaggca   360 acatgattat tactgatgct ttcgtagaac caggcaactc aggttcagct gtatttaaca   420 gtaaatacga agttgtaggt gttcactttg gtggaaacgg ccctggaaat aaaagtacaa   480 aaggatatgg tgtttatttc tctcctgaaa ttaagaaatt cattgcagat aacacagata   540 aataaatcct tacatagata aatgatttta aaaattaaca acaaactcaa caattcaaat   600 catctctgtg attccattta ttcgaaatga ttaaaaaaaa taaaacttca aaaagctaac   660 attataatta tacaaatact tagaggagca gaaaaatgaa taaaaatata atcatcaaaa   720 gtattgcagc attgacgatt ttaacatcaa taactggtgt cggcacaaca atggttgaag   780 gtattcaaca aacagccaaa gccgaaaata ctgttaaaca aattacaaat acaaatgttg   840 caccatacag tggtgttaca tggatgggcg ctggaacagg atttgtagtt ggaaatcata   900 caatcattac caataaacat gttacctatc acatgaaagt cggtgatgaa atcaaagcac   960 atcctaatgg tttttataat aacggtggtg gactttataa agttactaag attgtagatt   1020 atcctggtaa agaagatatt gcggttgtac aagttgaaga aaaatcaaca caaccaaaag   1080 gtagaaaatt caaagatttc actagtaaat ttaatatagc atcagaagct aaagaaaatg   1140 aacctatatc agtcattggt tatccaaatc ctaatggaaa taaactacaa atgtatgaat   1200 caactggtaa agtattatca gtgaatggga atatagtgtc ttcggatgca attattcagc   1260 ctggtagctc tggttcacct atattaaata gtaaacacga agctattggt gtaatctatg   1320 ccggtaataa gccatcaggt gaaagcacaa gaggatttgc tgtttatttc tctcctgaaa   1380 ttaagaaatt cattgcagat aatttagata aataattaaa acttagacat tcacccaatc   1440 ctgacaaaat atactataac taacatttat taatatatat tgcattattt aatatgcatc   1500 aaagccaatc aacgattgat tttcaccaac tcaattgttg attggtttta tttatgtatg   1560 aatgaacaac tttttgacat cattaagaat ataaatgatt ttgaaagcat ttgaaagcta   1620 caacatttct ataaaatttt tcaataacaa ttgcgccact aaaactcaaa atttccacca   1680 ccaacatcca aattatcaac atcgcaacat aaccaaatgt tataataaat ctattacaca   1740 aagagataaa ttacttatgc aaaggcggag gaatcacatg tctattactg aaaaacaacg   1800 tcagcaacaa gctgaattac ataaaaaatt atggtcgatt gcgaatgatt taagagggaa   1860 catggatgcg agtgaattcc gtaattacat tttaggcttg attttctatc gcttcttatc   1920 tgaaaaagcc gaacaagaat atgcagatgc cttgtcaggt gaagacatca cgtatcaaga   1980 agcatgggca gatgaagaat atcgtgaaga cttaaaagca gaattaattg atc          2033 <210>8 <211>2794 <212>DNA <213>Staphylococcus aureus <400>8 gatcaaacgt tgcttaactt ctttttaatg cttaaaaatt atttcaaagg cacatagaaa   60 cgctatatta atctcatact cactcattat tttttgctta aattacttaa taatacttca   120 ataattgtta aaaggggttt aatgtgatta tcttagaacg ccatctataa tgatgttgta   180 tgattcaaat tacgtaaaaa gacaatcgaa tataatatag attggagcat acaattatga   240 aaatgagaac aattgctaaa accagtttag cactagggct tttaacaaca ggcgcaatta   300 cagtaacgac gcaatcggtc aaagcagaaa aaatacaatc aactaaagtt gacaaagtac   360 caacgcttaa agcagagcga ttagcaatga taaacataac agcaggtgca aattcagcga   420 caacacaagc agctaacaca agacaagaac gcacgcctaa actcgaaaag gcaccaaata   480 ctaatgagga aaaaacctca gcttccaaaa tagaaaaaat atcacaacct aaacaagaag   540 agcagaaaac gcttaatata tcagcaacgc cagcgcctaa acaagaacaa tcacaaacga   600 caaccgaatc cacaacgccg aaaactaaag tgacaacacc tccatcaaca aacacgccac   660 aaccaatgca atctactaaa tcagacacac cacaatctcc aaccataaaa caagcacaaa   720 cagatatgac tcctaaatat gaagatttaa gagcgtatta tacaaaaccg agttttgaat   780 ttgaaaagca gtttggattt atgctcaaac catggacgac ggttaggttt atgaatgtta   840 ttccaaatag gttcatctat aaaatagctt tagttggaaa agatgagaaa aaatataaag   900 atggacctta cgataatatc gatgtattta tcgttttaga agacaataaa tatcaattga   960 aaaaatattc tgtcggtggc atcacgaaga ctaatagtaa aaaagttaat cacaaagtag   1020 aattaagcat tactaaaaaa gataatcaag gtatgatttc acgcgatgtt tcagaataca   1080 tgattactaa ggaagagatt tccttgaaag agcttgattt taaattgaga aaacaactta   1140 ttgaaaaaca taatctttac ggtaacatgg gttcaggaac aatcgttatt aaaatgaaaa   1200 acggtgggaa atatacgttt gaattacaca aaaaactgca agagcatcgt atggcagacg   1260 tcatagatgg cactaatatt gataacattg aagtgaatat aaaataatca tgacattctc   1320 taaatagaag ctgtcatcgg aaaaacaaga agttaagtga caacggttta catgttgctt   1380 agcttctttt attatgcgta atgatgtaaa aagacgaata ttcatttgtt tgtaaaagtg   1440 gcatttctat gtcttaaaag tgacgaaact tcaaatgtgc caagtgttga atcacatcaa   1500 aatcattttt atttaacgaa cattatggat ttcttaattt acttaacgat gattcaaata   1560 tagttaaaca aggtttaatg tgaatggagc aatacgccat ctataataaa gctgtatgat   1620 tcaatgaatg taatcgaaca aatctaataa ttacgaatgg agcatacaac tatgaaaata   1680 acaacgattg ctaaaacaag tttagcacta ggccttttaa caacaggtgt aatcacaacg   1740 acaacgcaag cagcaaacgc gacaacacta tcttccacta aagtggaagc accacaatca   1800 acaccgccct caactaaaat agaagcaccg caatcaaaac caaacgcgac aacaccgccc   1860 tcaactaaag tagaagcacc gcaacaaaca gcaaatgcga caacaccgcc ttcaactaaa   1920 gtgacaacac ctccatcaac aaacacgcca caaccaatgc aatctactaa atcagacaca   1980 ccacaatcgc caaccacaaa acaagtacca acagaaataa atcctaaatt taaagattta   2040 agagcgtatt atacgaaacc aagtttagaa tttaaaaatg agattggtat tattttaaaa   2100 aaatggacga caataagatt tatgaatgtt gtcccagatt atttcatata taaaattgct   2160 ttagttggta aagatgataa aaaatatggt gaaggagtac ataggaatgt cgatgtattt   2220 gtcgttttag aagaaaataa ttacaatctg gaaaaatatt ctgtcggtgg tatcacaaag   2280 agtaatagta aaaaagttga tcacaaagca ggagtaagaa ttactaagga agataataaa   2340 ggtacaatct ctcatgatgt ttcagaattc aagattacta aagaacagat ttccttgaaa   2400 gaacttgatt ttaaattgag aaaacaactt attgaaaaaa ataatctgta cggtaacgtt   2460 ggttcaggta aaattgttat taaaatgaaa aacggtggaa agtacacgtt tgaattgcac   2520 aaaaaattac aagaaaatcg catggcagat gtcatagatg gcactaatat tgataacatt   2580 gaagtgaata taaaataatc atgacattct ctaaatagaa gctgtcatcg gaaaaacaag   2640 aagttaagtg acaacggcct acatgttgct tagcttcttt tgttatgttc gatgatttga   2700 gaacccgaat tttcgatggg tccaaatatg acgtggaaga gacctgaatt tatctgtaaa   2760 tccctatcta tcgggtgtga agcacaacgg gatc                               2794 <210>9 <211>505 <212>DNA <213>Staphylococcus aureus <400>9 gatcatagcg caccaaactc tcgtccaatt gattttgaaa tgaaaaagaa agatggaact   60 caacagtttt atcattatgc aagttctgtt aaacctgcta gagttatttt cactgattca   120 aaaccagaaa ttgaattagg attacaatca ggtcaatttt ggagaaaatt tgaagtttat   180 gaaggtgaca aaaagttgcc aattaaatta gtatcatacg atactgttaa agattatgct   240 tacattcgct tctctgtatc aaacggaaca aaagctgtta aaattgttag ttcaacacac   300 ttcaataaca aagaagaaaa atacgattac acattaatgg aattcgcaca accaatttat   360 aacagtgcag ataaattcaa aactgaagaa gattataaag ctgaaaaatt attagcgcca   420 tataaaaaag cgaaaacact agaaagacaa gtttatgaat taaataaaat tcaagataaa   480 cttcctgaaa aattaaaggc tgagt                                         505 <210>10 <211>673 <212>DNA <213>Staphylococcus aureus <400>10 gatcaaacta aaacacaaac tgctcataca gttaaaacag cacaaactgc tcaagaacaa   60 aataaagttc aaacacctgt taaagatgtt gcaacagcga aatctgaaag caacaatcaa   120 gctgtaagtg ataataaatc acaacaaact aacaaagtta caaaacataa cgaaacgcct   180 aaacaagcat ctaaagctaa agaattacca aaaactggtt taacttcagt tgataacttt   240 attagcacag ttgccttcgc aacacttgcc cttttaggtt cattatcttt attacttttc   300 aaaagaaaag aatctaaata aatcatcgtc acactcataa cttaatatat tttttatttt   360 aaattttatt taacctatgt catagatatt tcataatcta taacataggt tatttttttt   420 ataaaataac gttgcaatta actaacattt caatgtcaat acaagtaatc aattgataat   480 gattatcagt tgataatata caattaggag ttgtttctac aacatgaaca aacagcaaaa   540 agaatttaaa tcattttatt caattagaaa gtcatcacta ggcgtgcatc tgtagcaatt   600 agtacacttt tattattaat gtcaaatggc gaagcacaag ccagcagctt gaagaaaaca   660 ggtggtccaa ttc                                                      673 <210>11 <211>2238 <212>DNA <213>Staphylococcus aureus <400>11 gatcttcagc ttgatgtttt cgtttgatta aattggtaaa atagaaacgc aatccacaaa   60 aatggcaagc actaaaataa tgtttggggg tgcttgtgct tttgtggatt gcggtcgatt   120 atttatattg catgatttga ttaatttgat tgattatatt ggacatgatg gtgttggcgg   180 gatgcgttgt tgctagtcgc gggctttgtc cactccacat atgtattaac tctttgtcgc   240 cgatgtttgc tgcggctttt cttatgctac ttgttagctc attttgtatt ggataatctg   300 ggatatcgcc ttcgtattgg gacatttctt cgataaacct attgttgata ccgcgtgcaa   360 gctttccact aaacgctttt gtaatgactg tatctgtttc tttactattt ataattgcat   420 ctcgcagtag ttctgatgca ttactgtctt gtgatgttaa aaatgcggtg cccatttgta   480 ccccttctgc acctaagaca atacttgcca aaactcctct accatccata attccaccag   540 cggcaatgac cggaattgaa acgacatcta caatttgtgg cactaaagat attgttccaa   600 ccataggtaa ttgattttta ggttttaaaa atgaaccacg atgtccacct gcttcactac   660 cttgagcaac gatagcatcc atacccgctt tttcattcgc aatagcttca tcaacacttg   720 ttgctgtacc tataagtttg acattcgctg ctttcaacct gcttataatc tgttcgcttg   780 gaattccaaa agtaaaacaa catacaggca cttgcttttt aattatcgta tcaatatgac   840 acttaaattg ttgttcttcg gtaattttta caaccggctc ttctaaatgt aatgcgcgtc   900 gataaggttt taaccatgca ttcatatttt caatttgact actggtatat gattgttgac   960 ttggtacaaa gacatttacg ccaaaagaat ttgacgttaa ttggcgtaca taatctattt   1020 catcttccaa ttgctgcgta ttaaagtaac ctgcgcctat tgtgcctaac ccaccactgt   1080 tacttactga tgcaactaat ttcggtgtcg tacttcctgc catacctgct tgtataattg   1140 gatattcaat acttaacatt tgagtaagtc gattcttatt ccacatagct gttcgctcct   1200 tatatagata cgttgcgatt tttccgttgt tgaaattgaa tttgctgttg agaaagtttt   1260 tctttttcct ttttatccat ctcatcttca atttccatac ctaataattc ttcaattaag   1320 tcttcatgtg acactatcgc ttcagtacca ccaaattcgt ccaacacaat tgctaaatgt   1380 tttctagaaa tagtcatctt acgtaatacc cattcagctt tattgtgttc attcacaaat   1440 aatggcttag ctgaatagtt tgtaatttga ttttcttttt tattactcca agccaacaga   1500 tatttagaat gaaacacccc aataatgtta tcaatatctc cctcgtacac tggatatcta   1560 gtgtatggct tattcataac cgtttcataa acttcttcgt atgtcgcatt tgaagcaaat   1620 gccgtcacat taattctagg tgttgtatct acatctttta cttttaaatt ttcaaaatta   1680 atgacacctt ccaacctact cgtctcaatt tcatttaaag caccttcatg tccagcaatt   1740 gctaacattg ttttaaattc ttcttttgaa aattgatgtt cttgaggttg gcccttagat   1800 aaacttcgat taatactgtc cgtcaactta tttaaaagta atgtgatagg acggaacaca   1860 atgacacaaa tattaataat tggatataca agccttgtta ttttatctgg aaatgttgca   1920 gcgacagact tgggaatcac ttcggagatc aaaatgataa caactgttaa aacagctgat   1980 gcaataccaa cgctaatccc ccaacgtaaa gccataattg taacaagtgt tggtaataaa   2040 atattcgcga cattattccc aattagaatc gttgtaataa actcacttgg tttttcaagt   2100 aactttacaa tgccttttgc ttttttatca cctttgtcag cttcagtttt aaattttgct   2160 ttattggcag ccgttaatgc cgtctcgctt cctgaaaaga aaaacgaaat aaatatcaat   2220 ataattatgg caatgatc                                                 2238 <210>12 <211>7975 <212>DNA <213>Staphylococcus aureus <400>12 gatcaaacga caattattaa ttcgttaacg tttactgaaa cagtaccaaa tagaagttat   60 gcaagagcaa gtgcgaatga aatcactagt aaaacagtta gtaatgtcag tcgtactgga   120 aataatgcca atgtcacagt aactgttact tatcaagatg gaacaacatc aacagtgact   180 gtacctgtaa agcatgtcat tccagaaatc gttgcacatt cgcattacac tgtacaaggc   240 caagacttcc cagcaggtaa tggttctagt gcatcagatt actttaagtt atctaatggt   300 agtgacattg cagatgcaac tattacatgg gtaagtggac aagcgccaaa taaagataat   360 acacgtattg gtgaagatat aactgtaact gcacatatct taattgatgg cgaaacaacg   420 ccgattacga aaacagcaac atataaagta gtaagaactg taccgaaaca tgtctttgaa   480 acagccagag gtgttttata cccaggtgtt tcagatatgt atgatgcgaa acaatatgtt   540 aagccagtaa ataattcttg gtcgacaaat gcgcaacata tgaatttcca atttgttgga   600 acatatggtc ctaacaaaga tgttgtaggc atatctactc gtcttattag agtgacatat   660 gataatagac aaacagaaga tttaactatt ttatctaaag ttaaacctga cccacctaga   720 attgacgcaa actctgtgac atataaagca ggtcttacaa accaagaaat taaagttaat   780 aacgtattaa ataactcgtc agtaaaatta tttaaagcag ataatacacc attaaatgtc   840 acaaatatta ctcatggtag cggttttagt tcggttgtga cagtaagtga cgcgttacca   900 aatggcggaa ttaaagcaaa atcttcaatt tcaatgaaca atgtgacgta tacgacgcaa   960 gacgaacatg gtcaagttgt tacagtaaca agaaatgaat ctgttgattc aaatgacagt   1020 gcaacagtaa cagtgacacc acaattacaa gcaactactg aaggcgctgt atttattaaa   1080 ggtggcgacg gttttgattt cggacacgta gaaagattta ttcaaaaccc gccacatggg   1140 gcaacggttg catggcatga tagtccagat acatggaaga atacagtcgg taacactcat   1200 aaaactgcgg ttgtaacatt acctaatggt caaggtacgc gtaatgttga agttccagtc   1260 aaagtttatc cagttgctaa tgcaaaggcg ccatcacgtg atgtgaaagg tcaaaatttg   1320 actaatggaa cggatgcgat gaactacatt acatttgatc caaatacaaa cacaaatggt   1380 atcactgcag catgggcaaa tagacaacaa ccaaataacc aacaagcagg cgtgcaacat   1440 ttaaatgtcg atgtcacata tccaggtatt tcagctgcta aacgagttcc tgttactgtt   1500 aatgtatatc aatttgaatt ccctcaaact acttatacga caacggttgg aggcacttta   1560 gcaagtggta cgcaagcatc aggatatgca catatgcaaa atgctactgg tttaccaaca   1620 gatggattta cgtataaatg gaatcgtgat actacaggta caaatgacgc aaactggtca   1680 gctatgaata aaccgaatgt ggctaaagtc gttaacgcaa aatatgacgt catctataac   1740 ggacatactt ttgcaacatc tttaccagcg aaatttgtag taaaagatgt gcaaccagcg   1800 aaaccaactg tgactgaaac agcggcagga gcgattacaa ttgcacctgg agcaaaccaa   1860 acagtgaata cacatgccgg taacgtaacg acatacgctg ataaattagt tattaaacgt   1920 aatggtaacg ttgtgacgac atttacacgt cgcaataata cgagtccatg ggtgaaagaa   1980 gcatctgcag caactgtagc aggtattgct ggaactaata atggtattac tgttgcagca   2040 ggtactttca accctgctga tacaattcaa gttgttgcaa cgcaaggaag cggagagaca   2100 gtgagtgatg agcaacgtag tgatgatttc acagttgtcg caccacaacc gaaccaagcg   2160 actactaaga tttggcaaaa tggtcatatt gatatcacgc ctaataatcc atcaggacat   2220 ttaattaatc caactcaagc aatggatatt gcttacactg aaaaagtggg taatggtgca   2280 gaacatagta agacaattaa tgttgttcgt ggtcaaaata atcaatggac aattgcgaat   2340 aagcctgact atgtaacgtt agatgcacaa actggtaaag tgacgttcaa tgccaatact   2400 ataaaaccaa attcatcaat cacaattact ccgaaagcag gtacaggtca ctcagtaagt   2460 agtaatccaa gtacattaac tgcaccggca gctcatactg tcaacacaac tgaaattgtg   2520 aaagattatg gttcaaatgt aacagcagct gaaattaaca atgcagttca agttgctaat   2580 aaacgtactg caacgattaa aaatggcaca gcaatgccta ctaatttagc tggtggtagc   2640 acaacgacga ttcctgtgac agtaacttac aatgatggta gtactgaaga agtacaagag   2700 tccattttca caaaagcgga taaacgtgag ttaatcacag ctaaaaatca tttagatgat   2760 ccagtaagca ctgaaggtaa aaagccaggt acaattacgc agtacaataa tgcaatgcat   2820 aatgcgcaac aacaaatcaa tactgcgaaa acagaagcac aacaagtgat taataatgag   2880 cgtgcaacac cacaacaagt ttctgacgca ctaactaaag ttcgtgcagc acaaactaag   2940 attgatcaag ctaaagcatt acttcaaaat aaagaagata atagccaatt agtaacgtct   3000 aaaaataact tacaaagttc tgtgaaccaa gtaccatcaa ctgctggtat gacgcaacaa   3060 agtattgata actataatgc gaagaagcgt gaagcagaaa ctgaaataac tgcagctcaa   3120 cgtgttattg acaatggcga tgcaactgca caacaaattt cagatgaaaa acatcgtgtc   3180 gataacgcat taacagcatt aaaccaagcg aaacatgatt taactgcaga tacacatgcc   3240 ttagagcaag cagtgcaaca attgaatcgc acaggtacaa cgactggtaa gaagccggca   3300 agtattactg cttacaataa ttcgattcgt gcacttcaaa gtgacttaac aagtgctaaa   3360 aatagcgcta atgctattat tcaaaagcca ataagaacag tacaagaagt gcaatctgcg   3420 ttaacaaatg taaatcgtgt caatgagcga ttaacgcaag caattaatca attagtacct   3480 ttagctgata atagtgcttt aaaaactgct aagacgaaac ttgatgaaga aatcaataaa   3540 tcagtaacta ctgatggtat gacacaatca tcaatccaag catatgaaaa tgctaaacgt   3600 gcgggtcaaa cagaatcaac aaatgcacaa aatgttatta acaatggtga tgcgactgac   3660 caacaaattg ccgcagaaaa aacaaaagta gaagaaaaat ataatagctt aaaacaagca   3720 attgctggat taactccaga cttggcacca ttacaaactg caaaaactca gttgcaaaat   3780 gatattgatc agccaacgag tacgactggt atgacaagcg catctattgc agcatttaat   3840 gaaaaacttt cagcagctag aactaaaatt caagaaattg atcgtgtatt agcctcacat   3900 ccagatgttg cgacaatacg tcaaaacgtg acagcagcga atgccgctaa atcagcactt   3960 gatcaagcac gtaatggctt aacagtcgat aaagcgcctt tagaaaatgc gaaaaatcaa   4020 ctacaatata gtattgacac gcaaacaagt acaactggta tgacacaaga ctctataaat   4080 gcatacaatg cgaagttaac agctgcacgt aataagattc aacaaatcaa tcaagtatta   4140 gcaggttcac cgactgtaga acaaattaat acaaatacgt ctacagcaaa tcaagctaaa   4200 tctgatttag atcatgcacg tcaagcttta acaccagata aagcgccgct tcaaactgcg   4260 aaaacgcaat tagaacaaag cattaatcaa ccaacggata caacaggtat gacgaccgct   4320 tcgttaaatg cgtacaacca aaaattacaa gcagcgcgtc aaaagttaac tgaaattaat   4380 caagtgttga atggcaaccc aactgtccaa aatatcaatg ataaagtgac agaggcaaac   4440 caagctaagg atcaattaaa tacagcacgt caaggtttaa cattagatag acagccagcg   4500 ttaacaacat tacatggtgc atctaactta aaccaagcac aacaaaataa tttcacgcaa   4560 caaattaatg ctgctcaaaa tcatgctgcg cttgaaacaa ttaagtctaa cattacggct   4620 ttaaatactg cgatgacgaa attaaaagac agtgttgcgg ataataatac aattaaatca   4680 gatcaaaatt acactgacgc aacaccagct aataaacaag cgtatgataa tgcagttaat   4740 gcggctaaag gtgtcattgg agaaacgact aatccaacga tggatgttaa cacagtgaac   4800 caaaaagcag catctgttaa atcgacgaaa gatgctttag atggtcaaca aaacttacaa   4860 cgtgcgaaaa cagaagcaac aaatgcgatt acgcatgcaa gtgatttaaa ccaagcacaa   4920 aagaatgcat taacacaaca agtgaatagt gcacaaaacg tgcaagcagt aaatgatatt   4980 aaacaaacga ctcaaagctt aaatactgct atgacaggtt taaaacgtgg cgttgctaat   5040 cataaccaag tcgtacaaag tgataattat gtcaacgcag atactaataa gaaaaatgat   5100 tacaacaatg catacaacca tgcgaatgac attattaatg gtaatgcaca acatccagtt   5160 ataacaccaa gtgatgttaa caatgcttta tcaaatgtca caagtaaaga acatgcattg   5220 aatggtgaag ctaagttaaa tgctgcgaaa caagaagcga atactgcatt aggtcattta   5280 aacaatttaa ataatgcaca acgtcaaaac ttacaatcgc aaattaatgg tgcgcatcaa   5340 attgatgcag ttaatacaat taagcaaaat gcaacaaact tgaatagtgc aatgggtaac   5400 ttaagacaag ctgttgcaga taaagatcaa gtgaaacgta cagaagatta tgcggatgca   5460 gatacagcta aacaaaatgc atataacagt gcagtttcaa gtgccgaaac aatcattaat   5520 caaacaacaa atccaacgat gtctgttgat gatgttaatc gtgcaacttc agctgttact   5580 tctaataaaa atgcattaaa tggttatgaa aaattagcac aatctaaaac agatgctgca   5640 agagcaattg atgcattacc acatttaaat aatgcacaaa aagcagatgt taaatctaaa   5700 attaatgctg catcaaatat tgctggcgta aatactgtta aacaacaagg tacagattta   5760 aatacagcga tgggtaactt gcaaggtgca atcaatgatg aacaaacgac gcttaatagt   5820 caaaactatc aagatgcgac acctagtaag aaaacagcat acacaaatgc ggtacaagct   5880 gcgaaagata ttttaaataa atcaaatggt caaaataaaa cgaaagatca agttactgaa   5940 gcgatgaatc aagtgaattc tgctaaaaat aacttagatg gtacgcgttt attagatcaa   6000 gcgaagcaaa cagcaaaaca gcagttaaat aatatgacgc atttaacaac tgcacaaaaa   6060 acgaatttaa caaaccaaat taatagtggt actactgtcg ctggtgttca aacggttcaa   6120 tcaaatgcca atacattaga tcaagccatg aatacgttaa gacaaagtat tgccaacaaa   6180 gatgcgacta aagcaagtga agattacgta gatgctaata atgataagca aacagcatat   6240 aacaacgcag tagctgctgc tgaaacgatt attaatgcta atagtaatcc agaaatgaat   6300 ccaagtacga ttacacaaaa agcagagcaa gtgaatagtt ctaaaacggc acttaacggt   6360 gatgaaaact tagctgctgc aaaacaaaat gcgaaaacgt acttaaacac attgacaagt   6420 attacagatg ctcaaaagaa caatttgatt agtcaaatta ctagtgcgac aagagtgagt   6480 ggtgttgata ctgtaaaaca aaatgcgcaa catctagacc aagctatggc tagcttacag   6540 aatggtatta acaacgaatc tcaagtgaaa tcatctgaga aatatcgtga tgctgataca   6600 aataaacaac aagagtatga taatgctatt actgcagcga aagcgatttt aaataaatcg   6660 acaggtccaa acactgcgca aaatgcagtt gaagcagcat tacaacgtgt taataatgcg   6720 aaagatgcat tgaatggtga tgcaaaatta attgcagctc aaaacgcagc gaaacaacat   6780 ttaggtactt taacgcatat cactacagct caacgtaatg atttaacaaa tcaaatttca   6840 caagctacaa acttagctgg tgttgaatct gttaaacaaa atgcgaatag tttagatggt   6900 gctatgggta acttacaaac ggctatcaac gataagtcag gaacattagc gagccaaaac   6960 ttcttggatg ctgatgagca aaaacgtaat gcatacaatc aagctgtatc agcagccgaa   7020 accattttaa ataaacaaac tggaccgaat acagcgaaaa cagcagtcga acaagcactt   7080 aataatgtta ataatgcgaa acatgcatta aatggtacgc aaaacttaaa caatgcgaaa   7140 caagcagcga ttacagcaat caatggcgca tctgatttaa atcaaaaaca aaaagatgca   7200 ttaaaagcac aagctaatgg tgctcaacgc gtatctaatg cacaagatgt acagcacaat   7260 gcgactgaac tgaacacggc aatgggcaca ttaaaacatg ccatcgcaga taagacgaat   7320 acgttagcaa gcagtaaata tgttaatgcc gatagcacta aacaaaatgc ttacacaact   7380 aaagttacca atgctgaaca tattattagc ggtacgccaa cggttgttac gacaccttca   7440 gaagtaacag ctgcagctaa tcaagtaaac agcgcgaaac aagaattaaa tggtgacgaa   7500 agattacgtg aagcaaaaca aaacgccaat actgctattg atgcattaac acaattaaat   7560 acacctcaaa aagctaaatt aaaagaacaa gtgggacaag ccaatagatt agaagacgta   7620 caaactgttc aaacaaatgg acaagcattg aacaatgcaa tgaaaggctt aagagatagt   7680 attgctaacg aaacaacagt caaaacaagt caaaactata cagacgcaag tccgaataac   7740 caatcaacat ataatagcgc tgtgtcaaat gcgaaaggta tcattaatca aactaacaat   7800 ccgactatgg atactagtgc gattacccaa gctacaacac aagtgaataa tgctaaaaat   7860 ggtttaaacg gtgctgaaaa cttaagaaat gcacaaaaca ctgctaagca aaacttaaat   7920 acattatcac acttaacaaa taaccaaaaa tctgccatct catcacaaat tgatc        7975 <210>13 <211>2001 <212>DNA <213>Staphylococcus aureus <400>13 gatcatggca ttgtatttaa tgcaagtcta cctttgtaca aagatgccat ccatcaaaaa   60 ggatcaatgc gcagtaatga caatggtgat gatatgagta tgatggtggg tacagtgctg   120 agtggctttg aatatcgagc gcaaaaagaa aagtatgata acttatataa attcttcaaa   180 gaaaatgaaa agaaatatca atatacaggc tttacaaaag aggcaattaa caagacacaa   240 aatgtcggat ataaaaatga atatttttat attacatact cttctagaag tttaaaagaa   300 tatcgaaagt attatgaacc actgattcga aaaaatgata aagaatttaa agaaggaatg   360 gaacgagcaa gaaaagaagt gaattacgct gcaaatacag atgctgttgc tacacttttt   420 tctactaaga aaaactttac taaagacaat acagtagatg atgtaatcga actaagtgat   480 aaattatata atttaaaaaa taaaccagat aaatctacaa tcacaataca aatagggaaa   540 cccactatta atactaagaa agccttttat gatgataatc gtccaataga atatggggtg   600 cacagtaaag atgaataaaa ttaatgatag ggatttaaca gaattaagta gttactgggt   660 ttatcaaaat attgatataa aaaaagaatt taaagttaat ggaaaaaggt ttaaacaagt   720 agacagttat aatgatgata agaatagtaa tttgaatggt gctgctgata ttaaaatata   780 tgagttatta gatgataaaa gtaaaccaac tggtcaacag acaataattt atcaaggaac   840 atctaatgag gcaattaatc caaataatcc attaaaatca tcggggtttg gagatgattg   900 gctccaaaat gctaaattaa tgaataatga taatgaaagc acagattatt taaagcaaac   960 agatcaatta tcaaatcaat ataaaataaa gttagaagat gcagatagat tatcaaatag   1020 tgatttttta aaaaaatata gaatggaatc aagtaacttc aaaaacaaaa ccattgtggc   1080 ggatggcggt aattcggaag gcggtgcagg agcaaaatat caaggagcga aacatccgaa   1140 tgaaaaagtt gttgctactg actcagcaat gattccttat gctgcttggc agaaatttgc   1200 tagaccacgc tttgataata tgattagttt taatagtacc aacgatttat taacatggtt   1260 acaagatcca ttcatcaaag atatgccagg aaaacgcgtt aacattaatg atggtgtgcc   1320 caggttagat actttaatag acagccatgt aggttataaa aggaagttaa atagaaaaga   1380 taacacatac gatactgtac cactaatcaa aataaagtcg gtaaaagata cagaaattaa   1440 aaatggaaaa aaagtaaaaa agactattaa cataacatta gatatggatg ggcgaattcc   1500 aataaatgtt tggacaggag attcgattgc acgttctgga agaggaactt taattaaact   1560 taatttagaa aatcttgatg cgttgagtaa actgattact ggtgaaacaa gtggtatgtt   1620 agcagaatgc gtaatctttt taaatgaaag ttttaacatc tcagaaaatg aaaataaaaa   1680 ttttgcagat agaaagaaac aattatcaga aggatttaag gataagatta acttatttca   1740 gttagaagaa atggaaagaa ctttaattag taaaataaac tcacttgaag aagttgcaga   1800 tgaaacaata gaaagtatta gtgctgttaa acacttatta cctgattttg cattggatgc   1860 attaaaagaa agaattaatg agttgtttaa aggtataaaa tcttttatag aaaaagtgta   1920 tgatagtata gataatgaaa ttttagaaat tttcaaaaat atagatcacg acttcagaga   1980 tggagtatct gaagaaatga t                                             2001 <210>14 <211>106 <212>PRT <213>Staphylococcus aureus <400>14 Asp Gln Thr Lys Thr Gln Thr Ala His Thr Val Lys Thr Ala Gln Thr   1               5                  10                  15 Ala Gln Glu Gln Asn Lys Val Gln Thr Pro Val Lys Asp Val Ala Thr

         20                  25                  30 Ala Lys Ser Glu Ser Asn Asn Gln Ala Val Ser Asp Asn Lys Ser Gln

     35                  40                  45 Gln Thr Asn Lys Val Thr Lys His Asn Glu Thr Pro Lys Gln Ala Ser

 50                  55                  60 Lys Ala Lys Glu Leu Pro Lys Thr Gly Leu Thr Ser Val Asp Asn Phe  65                  70                  75                  80 Ile Ser Thr Val Ala Phe Ala Thr Leu Ala Leu Leu Gly Ser Leu Ser

             85                  90                  95 Leu Leu Leu Phe Lys Arg Lys Glu Ser Lys

        100                 105 <210>15 <211>960 <212>PRT <213>Staphylococcus aureus <400>15 Asp Arg Ile Ile Glu Thr Ala Pro Thr Asp Tyr Leu Ser Trp Gly Val   1               5                  10                  15 Gly Ala Val Gly Asn Pro Arg Phe Ile Asn Val Glu Ile Val His Thr

         20                  25                  30 His Asp Tyr Ala Ser Phe Ala Arg Ser Met Asn Asn Tyr Ala Asp Tyr

     35                  40                  45 Ala Ala Thr Gln Leu Gln Tyr Tyr Gly Leu Lys Pro Asp Ser Ala Glu

 50                  55                  60 Tyr Asp Gly Asn Gly Thr Val Trp Thr His Tyr Ala Val Ser Lys Tyr  65                  70                  75                  80 Leu Gly Gly Thr Asp His Ala Asp Pro His Gly Tyr Leu Arg Ser His

             85                  90                  95 Asn Tyr Ser Tyr Asp Gln Leu Tyr Asp Leu Ile Asn Glu Lys Tyr Leu

        100                 105                 110 Ile Lys Met Gly Lys Val Ala Pro Trp Gly Thr Gln Ser Thr Thr Thr

    115                 120                 125 Pro Thr Thr Pro Ser Lys Pro Thr Thr Pro Ser Lys Pro Ser Thr Gly

130                 135                 140 Lys Leu Thr Val Ala Ala Asn Asn Gly Val Ala Gln Ile Lys Pro Thr 145                 150                 155                 160 Asn Ser Gly Leu Tyr Thr Thr Val Tyr Asp Lys Thr Gly Lys Ala Thr

            165                 170                 175 Asn Glu Val Gln Lys Thr Phe Ala Val Ser Lys Thr Ala Thr Leu Gly

        180                 185                 190 Asn Gln Lys Phe Tyr Leu Val Gln Asp Tyr Asn Ser Gly Asn Lys Phe

    195                 200                 205 Gly Trp Val Lys Glu Gly Asp Val Val Tyr Asn Thr Ala Lys Ser Pro

210                 215                 220 Val Asn Val Asn Gln Ser Tyr Ser Ile Lys Pro Gly Thr Lys Leu Tyr 225                 230                 235                 240 Thr Val Pro Trp Gly Thr Ser Lys Gln Val Ala Gly Ser Val Ser Gly

            245                 250                 255 Ser Gly Asn Gln Thr Phe Lys Ala Ser Lys Gln Gln Gln Ile Asp Lys

        260                 265                 270 Ser Ile Tyr Leu Tyr Gly Ser Val Asn Gly Lys Ser Gly Trp Val Ser

    275                 280                 285 Lys Ala Tyr Leu Val Asp Thr Ala Lys Pro Thr Pro Thr Pro Thr Pro

290                 295                 300 Lys Pro Ser Thr Pro Thr Thr Asn Asn Lys Leu Thr Val Ser Ser Leu 305                 310                 315                 320 Asn Gly Val Ala Gln Ile Asn Ala Lys Asn Asn Gly Leu Phe Thr Thr

            325                 330                 335 Val Tyr Asp Lys Thr Gly Lys Pro Thr Lys Glu Val Gln Lys Thr Phe

        340                 345                 350 Ala Val Thr Lys Glu Ala Ser Leu Gly Gly Asn Lys Phe Tyr Leu Val

    355                 360                 365 Lys Asp Tyr Asn Ser Pro Thr Leu Ile Gly Trp Val Lys Gln Gly Asp

370                 375                 380 Val Ile Tyr Asn Asn Ala Lys Ser Pro Val Asn Val Met Gln Thr Tyr 385                 390                 395                 400 Thr Val Lys Pro Gly Thr Lys Leu Tyr Ser Val Pro Trp Gly Thr Tyr

            405                 410                 415 Lys Gln Glu Ala Gly Ala Val Ser Gly Thr Gly Asn Gln Thr Phe Lys

        420                 425                 430 Ala Thr Lys Gln Gln Gln Ile Asp Lys Ser Ile Tyr Leu Phe Gly Thr

    435                 440                 445 Val Asn Gly Lys Ser Gly Trp Val Ser Lys Ala Tyr Leu Ala Val Pro

450                 455                 460 Ala Ala Pro Lys Lys Ala Val Ala Gln Pro Lys Thr Ala Val Lys Ala 465                 470                 475                 480 Tyr Thr Val Thr Lys Pro Gln Thr Thr Gln Thr Val Ser Lys Ile Ala

            485                 490                 495 Gln Val Lys Pro Asn Asn Thr Gly Ile Arg Ala Ser Val Tyr Glu Lys

        500                 505                 510 Thr Ala Lys Asn Gly Ala Lys Tyr Ala Asp Arg Thr Phe Tyr Val Thr

    515                 520                 525 Lys Glu Arg Ala His Gly Asn Glu Thr Tyr Val Leu Leu Asn Asn Thr

530                 535                 540 Ser His Asn Ile Pro Leu Gly Trp Phe Asn Val Lys Asp Leu Asn Val 545                 550                 555                 560 Gln Asn Leu Gly Lys Glu Val Lys Thr Thr Gln Lys Tyr Thr Val Asn

            565                 570                 575 Lys Ser Asn Asn Gly Leu Ser Met Val Pro Trp Gly Thr Lys Asn Gln

        580                 585                 590 Val Ile Leu Thr Gly Asn Asn Ile Ala Gln Gly Thr Phe Asn Ala Thr

    595                 600                 605 Lys Gln Val Ser Val Gly Lys Asp Val Tyr Leu Tyr Gly Thr Ile Asn

610                 615                 620 Asn Arg Thr Gly Trp Val Asn Ala Lys Asp Leu Thr Ala Pro Thr Ala 625                 630                 635                 640 Val Lys Pro Thr Thr Ser Ala Ala Lys Asp Tyr Asn Tyr Thr Tyr Val

            645                 650                 655 Ile Lys Asn Gly Asn Gly Tyr Tyr Tyr Val Thr Pro Asn Ser Asp Thr

        660                 665                 670 Ala Lys Tyr Ser Leu Lys Ala Phe Asn Glu Gln Pro Phe Ala Val Val

    675                 680                 685 Lys Glu Gln Val Ile Asn Gly Gln Thr Trp Tyr Tyr Gly Lys Leu Ser

690                 695                 700 Asn Gly Lys Leu Ala Trp Ile Lys Ser Thr Asp Leu Ala Lys Glu Leu 705                 710                 715                 720 Ile Lys Tyr Asn Gln Thr Gly Met Ala Leu Asn Gln Val Ala Gln Ile

            725                 730                 735 Gln Ala Gly Leu Gln Tyr Lys Pro Gln Val Gln Arg Val Pro Gly Lys

        740                 745                 750 Trp Thr Gly Ala Asn Phe Asn Asp Val Lys His Ala Met Asp Thr Lys

    755                 760                 765 Arg Leu Ala Gln Asp Pro Ala Leu Lys Tyr Gln Phe Leu Arg Leu Asp

770                 775                 780 Gln Pro Gln Asn Ile Ser Ile Asp Lys Ile Asn Gln Phe Leu Lys Gly 785                 790                 795                 800 Lys Gly Val Leu Glu Asn Gln Gly Ala Ala Phe Asn Lys Ala Ala Gln

            805                 810                 815 Met Tyr Gly Ile Asn Glu Val Tyr Leu Ile Ser His Ala Leu Leu Glu

        820                 825                 830 Thr Gly Asn Gly Thr Ser Gln Leu Ala Lys Gly Ala Asp Val Val Asn

    835                 840                 845 Asn Lys Val Val Thr Asn Ser Asn Thr Lys Tyr His Asn Val Phe Gly

850                 855                 860 Ile Ala Ala Tyr Asp Asn Asp Pro Leu Arg Glu Gly Ile Lys Tyr Ala 865                 870                 875                 880 Lys Gln Ala Gly Trp Asp Thr Val Ser Lys Ala Ile Val Gly Gly Ala

            885                 890                 895 Lys Phe Ile Gly Asn Ser Tyr Val Lys Ala Gly Gln Asn Thr Leu Tyr

        900                 905                 910 Lys Met Arg Trp Asn Pro Ala His Pro Gly Thr His Gln Tyr Ala Thr

    915                 920                 925 Asp Val Asp Trp Ala Asn Ile Asn Ala Lys Ile Ile Lys Gly Tyr Tyr

930                 935                 940 Asp Lys Ile Gly Glu Val Gly Lys Tyr Phe Asp Ile Pro Gln Tyr Lys 945                 950                 955                 960 <210>16 <211>386 <212>PRT <213>Staphylococcus aureus <400>16 Asp Gln Tyr Ser Glu Asp Ala Lys Lys Thr Gln Lys Asp Tyr Ala Ser   1               5                  10                  15 Gln Ser Lys Lys Asp Lys Asn Glu Lys Ser Asn Thr Lys Asn Pro Gln

         20                  25                  30 Leu Pro Thr Gln Asp Glu Leu Lys His Lys Ser Lys Pro Ala Gln Ser

     35                  40                  45 Phe Asn Asn Asp Val Asn Gln Lys Asp Thr Arg Ala Thr Ser Leu Phe

 50                  55                  60 Glu Thr Asp Pro Ser Ile Ser Asn Asn Asp Asp Ser Gly Gln Phe Asn  65                  70                  75                  80 Val Val Asp Ser Lys Asp Thr Arg Gln Phe Val Lys Ser Ile Ala Lys

             85                  90                  95 Asp Ala His Arg Ile Gly Gln Asp Asn Asp Ile Tyr Ala Ser Val Met

        100                 105                 110 Ile Ala Gln Ala Ile Leu Glu Ser Asp Ser Gly Arg Ser Ala Leu Ala

    115                 120                 125 Lys Ser Pro Asn His Asn Leu Phe Gly Ile Lys Gly Ala Phe Glu Gly

130                 135                 140 Asn Ser Val Pro Phe Asn Thr Leu Glu Ala Asp Gly Asn Gln Leu Tyr 145                 150                 155                 160 Ser Ile Asn Ala Gly Phe Arg Lys Tyr Pro Ser Thr Lys Glu Ser Leu

            165                 170                 175 Lys Asp Tyr Ser Asp Leu Ile Lys Asn Gly Ile Asp Gly Asn Arg Thr

        180                 185                 190 Ile Tyr Lys Pro Thr Trp Lys Ser Glu Ala Asp Ser Tyr Lys Asp Ala

    195                 200                 205 Thr Ser His Leu Ser Lys Thr Tyr Ala Thr Asp Pro Asn Tyr Ala Lys

210                 215                 220 Lys Leu Asn Ser Ile Ile Lys His Tyr Gln Leu Thr Gln Phe Asp Asp 225                 230                 235                 240 Glu Arg Met Pro Asp Leu Asp Lys Tyr Glu Arg Ser Ile Lys Asp Tyr

            245                 250                 255 Asp Asp Ser Ser Asp Glu Phe Lys Pro Phe Arg Glu Val Ser Asp Ser

        260                 265                 270 Met Pro Tyr Pro His Gly Gln Cys Thr Trp Tyr Val Tyr Asn Arg Met

    275                 280                 285 Lys Gln Phe Gly Thr Ser Ile Ser Gly Asp Leu Gly Asp Ala His Asn

290                 295                 300 Trp Asn Asn Arg Ala Gln Tyr Arg Asp Tyr Gln Val Ser His Thr Pro 305                 310                 315                 320 Lys Arg His Ala Ala Val Val Phe Glu Ala Gly Gln Phe Gly Ala Asp

            325                 330                 335 Gln His Tyr Gly His Val Ala Phe Val Glu Lys Val Asn Ser Asp Gly

        340                 345                 350 Ser Ile Val Ile Ser Glu Ser Asn Val Lys Gly Leu Gly Ile Ile Ser

    355                 360                 365 His Arg Thr Ile Asn Ala Ala Ala Ala Glu Glu Leu Ser Tyr Ile Thr

370                 375                 380 Gly Lys 385 <210>17 <211>325 <212>PRT <213>Staphylococcus aureus <400>17 Met Lys Met Asn Lys Leu Val Lys Ser Ser Val Ala Thr Ser Met Ala   1               5                  10                  15 Leu Leu Leu Leu Ser Gly Thr Ala Asn Ala Glu Gly Lys Ile Thr Pro

         20                  25                  30 Val Ser Val Lys Lys Val Asp Asp Lys Val Thr Leu Tyr Lys Thr Thr

     35                  40                  45   Ala Thr Ala Asp Ser Asp Lys Phe Lys Ile Ser Gln Ile Leu Thr Phe

 50                  55                  60 Asn Phe Ile Lys Asp Lys Ser Tyr Asp Lys Asp Thr Leu Val Leu Lys  65                  70                  75                  80 Ala Thr Gly Asn Ile Asn Ser Gly Phe Val Lys Pro Asn Pro Asn Asp

             85                  90                  95 Tyr Asp Phe Ser Lys Leu Tyr Trp Gly Ala Lys Tyr Asn Val Ser Ile

        100                 105                 110 Ser Ser Gln Ser Asn Asp Ser Val Asn Val Val Asp Tyr Ala Pro Lys

    115                 120                 125 Asn Gln Asn Glu Glu Phe Gln Val Gln Asn Thr Leu Gly Tyr Thr Phe

130                 135                 140 Gly Gly Asp Ile Ser Ile Ser Asn Gly Leu Ser Gly Gly Leu Asn Gly 145                 150                 155                 160 Asn Thr Ala Phe Ser Glu Thr Ile Asn Tyr Lys Gln Glu Ser Tyr Arg

            165                 170                 175 Thr Thr Leu Ser Arg Asn Thr Asn Tyr Lys Asn Val Gly Trp Gly Val

        180                 185                 190 Glu Ala His Lys Ile Met Asn Asn Gly Trp Gly Pro Tyr Gly Arg Asp

    195                 200                 205 Ser Phe His Pro Thr Tyr Gly Asn Glu Leu Phe Leu Ala Gly Arg Gln

210                 215                 220 Ser Ser Ala Tyr Ala Gly Gln Asn Phe Ile Ala Gln His Gln Met Pro 225                 230                 235                 240 Leu Leu Ser Arg Ser Asn Phe Asn Pro Glu Phe Leu Ser Val Leu Ser

            245                 250                 255 His Arg Gln Asp Gly Ala Lys Lys Ser Lys Ile Thr Val Thr Tyr Gln

        260                 265                 270 Arg Glu Met Asp Leu Tyr Gln Ile Arg Trp Asn Gly Phe Tyr Trp Ala

    275                 280                 285 Gly Ala Asn Tyr Lys Asn Phe Lys Thr Arg Thr Phe Lys Ser Thr Tyr

290                 295                 300 Glu Ile Asp Trp Glu Asn His Lys Val Lys Leu Leu Asp Thr Lys Glu 305                 310                 315                 320 Thr Glu Asn Asn Lys

            325 <210>18 <211>157 <212>PRT <213>Staphylococcus aureus <400>18 Ser Phe Asn Tyr Ser Lys Ser Ile Ser Tyr Thr Gln Gln Asn Tyr Val   1               5                  10                  15 Ser Glu Val Glu Gln Gln Asn Ser Lys Ser Val Leu Trp Gly Val Lys

         20                  25                  30 Ala Asn Ser Phe Ala Thr Glu Ser Gly Gln Lys Ser Ala Phe Asp Ser

     35                  40                  45 Asp Leu Phe Val Gly Tyr Lys Pro His Ser Lys Asp Pro Arg Asp Tyr

 50                  55                  60 Phe Val Pro Asp Ser Glu Leu Pro Pro Leu Val Gln Ser Gly Phe Asn  65                  70                  75                  80 Pro Ser Phe Ile Ala Thr Val Ser His Glu Lys Gly Ser Ser Asp Thr

             85                  90                  95 Ser Glu Phe Glu Ile Thr Tyr Gly Arg Asn Met Asp Val Thr His Ala

        100                 105                 110 Ile Lys Arg Ser Thr His Tyr Gly Asn Ser Tyr Leu Asp Gly His Arg

    115                 120                 125 Val His Asn Ala Phe Val Asn Arg Asn Tyr Thr Val Lys Tyr Glu Val

130                 135                 140 Asn Trp Lys Thr His Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asn 145                 150                 155 <210>19 <211>345 <212>PRT <213>Staphylococcus aureus <400>19 Ile Ile Ala Ile Ile Ile Leu Ile Phe Ile Ser Phe Phe Phe Ser Gly   1               5                  10                  15 Ser Glu Thr Ala Leu Thr Ala Ala Asn Lys Ala Lys Phe Lys Thr Glu

         20                  25                  30 Ala Asp Lys Gly Asp Lys Lys Ala Lys Gly Ile Val Lys Leu Leu Glu

     35                  40                  45 Lys Pro Ser Glu Phe Ile Thr Thr Ile Leu Ile Gly Asn Asn Val Ala

 50                  55                  60 Asn Ile Leu Leu Pro Thr Leu Val Thr Ile Met Ala Leu Arg Trp Gly  65                  70                  75                  80 Ile Ser Val Gly Ile Ala Ser Ala Val Leu Thr Val Val Ile Ile Leu

             85                  90                  95 Ile Ser Glu Val Ile Pro Lys Ser Val Ala Ala Thr Phe Pro Asp Lys

        100                 105                 110 Ile Thr Arg Leu Val Tyr Pro Ile Ile Asn Ile Cys Val Ile Val Phe

    115                 120                 125 Arg Pro Ile Thr Leu Leu Leu Asn Lys Leu Thr Asp Ser Ile Asn Arg

130                 135                 140 Ser Leu Ser Lys Gly Gln Pro Gln Glu His Gln Phe Ser Lys Glu Glu 145                 150                 155                 160 Phe Lys Thr Met Leu Ala Ile Ala Gly His Glu Gly Ala Leu Asn Glu

            165                 170                 175 Ile Glu Thr Ser Arg Leu Glu Gly Val Ile Asn Phe Glu Asn Leu Lys

        180                 185                 190 Val Lys Asp Val Asp Thr Thr Pro Arg Ile Asn Val Thr Ala Phe Ala

    195                 200                 205 Ser Asn Ala Thr Tyr Glu Glu Val Tyr Glu Thr Val Met Asn Lys Pro

210                 215                 220 Tyr Thr Arg Tyr Pro Val Tyr Glu Gly Asp Ile Asp Asn Ile Ile Gly 225                 230                 235                 240 Val Phe His Ser Lys Tyr Leu Leu Ala Trp Ser Asn Lys Lys Glu Asn

            245                 250                 255 Gln Ile Thr Asn Tyr Ser Ala Lys Pro Leu Phe Val Asn Glu His Asn

        260                 265                 270 Lys Ala Glu Trp Val Leu Arg Lys Met Thr Ile Ser Arg Lys His Leu

    275                 280                 285 Ala Ile Val Leu Asp Glu Phe Gly Gly Thr Glu Ala Ile Val Ser His

290                 295                 300 Glu Asp Leu Ile Glu Glu Leu Leu Gly Met Glu Ile Glu Asp Glu Met 305                 310                 315                 320 Asp Lys Lys Glu Lys Glu Lys Leu Ser Gln Gln Gln Ile Gln Phe Gln

            325                 330                 335 Gln Arg Lys Asn Arg Asn Val Ser Ile

        340                 345 <210>20 <211>133 <212>PRT <213>Staphylococcus aureus <400>20 Met Asn Lys Gln Gln Lys Glu Phe Lys Ser Phe Tyr Ser Ile Arg Lys   1               5                  10                  15 Ser Ser Leu Gly Val Ala Ser Val Ala Ile Ser Thr Leu Leu Leu Leu

         20                  25                  30 Met Ser Asn Gly Glu Ala Gln Ala Ala Ala Glu Glu Thr Gly Gly Thr

     35                  40                  45 Asn Thr Glu Ala Gln Pro Lys Thr Glu Ala Val Ala Ser Pro Thr Thr

 50                  55                  60 Thr Ser Glu Lys Ala Pro Glu Thr Lys Pro Val Ala Asn Ala Val Ser  65                  70                  75                  80 Val Ser Asn Lys Glu Val Glu Ala Pro Thr Ser Glu Thr Lys Glu Ala

             85                  90                  95 Lys Glu Val Lys Glu Val Lys Ala Pro Lys Glu Thr Lys Glu Val Lys

        100                 105                 110 Pro Ala Ala Lys Ala Thr Asn Asn Thr Tyr Pro Ile Leu Asn Gln Glu

    115                 120                 125 Leu Ile Arg Ser Asp

130 <210>21 <211>205 <212>PRT <213>Staphylococcus aureus <400>21 Asp His Gly Ile Val Phe Asn Ala Ser Leu Pro Leu Tyr Lys Asp Ala   1               5                  10                  15 Ile His Gln Lys Gly Ser Met Arg Ser Asn Asp Asn Gly Asp Asp Met

         20                  25                  30 Ser Met Met Val Gly Thr Val Leu Ser Gly Phe Glu Tyr Arg Ala Gln

     35                  40                  45 Lys Glu Lys Tyr Asp Asn Leu Tyr Lys Phe Phe Lys Glu Asn Glu Lys

 50                  55                  60 Lys Tyr Gln Tyr Thr Gly Phe Thr Lys Glu Ala Ile Asn Lys Thr Gln  65                  70                  75                  80 Asn Val Gly Tyr Lys Asn Glu Tyr Phe Tyr Ile Thr Tyr Ser Ser Arg

             85                  90                  95 Ser Leu Lys Glu Tyr Arg Lys Tyr Tyr Glu Pro Leu Ile Arg Lys Asn

        100                 105                 110 Asp Lys Glu Phe Lys Glu Gly Met Glu Arg Ala Arg Lys Glu Val Asn

    115                 120                 125 Tyr Ala Ala Asn Thr Asp Ala Val Ala Thr Leu Phe Ser Thr Lys Lys

130                 135                 140 Asn Phe Thr Lys Asp Asn Thr Val Asp Asp Val Ile Glu Leu Ser Asp 145                 150                 155                 160 Lys Leu Tyr Asn Leu Lys Asn Lys Pro Asp Lys Ser Thr Ile Thr Ile

            165                 170                 175 Gln Ile Gly Lys Pro Thr Ile Asn Thr Lys Lys Ala Phe Tyr Asp Asp

        180                 185                 190 Asn Arg Pro Ile Glu Tyr Gly Val His Ser Lys Asp Glu

    195                 200                 205 <210>22 <211>510 <212>PRT <213>Staphylococcus aureus <400>22 Asp His Tyr Val Ile Gln Tyr Phe Ser Gly Leu Ile Gly Gly Arg Gly   1               5                  10                  15 Arg Arg Ala Asn Leu Tyr Gly Leu Phe Asn Lys Ala Ile Glu Phe Glu

         20                  25                  30 Asn Ser Ser Phe Arg Gly Leu Tyr Gln Phe Ile Arg Phe Ile Asp Glu

     35                  40                  45 Leu Ile Glu Arg Gly Lys Asp Phe Gly Glu Glu Asn Val Val Gly Pro

 50                  55                  60 Asn Asp Asn Val Val Arg Met Met Thr Ile His Ser Ser Lys Gly Leu  65                  70                  75                  80 Glu Phe Pro Phe Val Ile Tyr Ser Gly Leu Ser Lys Asp Phe Asn Lys

             85                  90                  95 Arg Asp Leu Lys Gln Pro Val Ile Leu Asn Gln Gln Phe Gly Leu Gly

        100                 105                 110 Met Asp Tyr Phe Asp Val Asp Lys Glu Met Ala Phe Pro Ser Leu Ala

    115                 120                 125 Ser Val Ala Tyr Arg Ala Val Ala Glu Lys Glu Leu Val Ser Glu Glu

130                 135                 140 Met Arg Leu Val Tyr Val Ala Leu Thr Arg Ala Lys Glu Gln Leu Tyr 145                 150                 155                 160 Leu Ile Gly Arg Val Lys Asn Asp Lys Ser Leu Leu Glu Leu Glu Gln

            165                 170                 175 Leu Ser Ile Ser Gly Glu His Ile Ala Val Asn Glu Arg Leu Thr Ser

        180                 185                 190 Pro Asn Pro Phe His Leu Ile Tyr Ser Ile Leu Ser Lys His Gln Ser

    195                 200                 205 Ala Ser Ile Pro Asp Asp Leu Lys Phe Glu Lys Asp Ile Ala Gln Ile

210                 215                 220 Glu Asp Ser Ser Arg Pro Asn Val Asn Ile Ser Ile Val Tyr Phe Glu 225                 230                 235                 240 Asp Val Ser Thr Glu Thr Ile Leu Asp Asn Asp Glu Tyr Arg Ser Val

            245                 250                 255 Asn Gln Leu Glu Thr Met Gln Asn Gly Asn Glu Asp Val Lys Ala Gln

        260                 265                 270 Ile Lys His Gln Leu Asp Tyr Arg Tyr Pro Tyr Val Asn Asp Thr Lys

    275                 280                 285 Lys Pro Ser Lys Gln Ser Val Ser Glu Leu Lys Arg Gln Tyr Glu Thr

290                 295                 300 Glu Glu Ser Gly Thr Ser Tyr Glu Arg Val Arg Gln Tyr Arg Ile Gly 305                 310                 315                 320 Phe Ser Thr Tyr Glu Arg Pro Lys Phe Leu Ser Glu Gln Gly Lys Arg

            325                 330                 335 Lys Ala Asn Glu Ile Gly Thr Leu Met His Thr Val Met Gln His Leu

        340                 345                 350 Pro Phe Lys Lys Glu Arg Ile Ser Glu Val Glu Leu His Gln Tyr Ile

    355                 360                 365 Asp Gly Leu Ile Asp Lys His Ile Ile Glu Ala Asp Ala Lys Lys Asp

370                 375                 380 Ile Arg Met Asp Glu Ile Met Thr Phe Ile Asn Ser Glu Leu Tyr Ser 385                 390                 395                 400 Ile Ile Ala Glu Ala Glu Gln Val Tyr Arg Glu Leu Pro Phe Val Val

            405                 410                 415 Asn Gln Ala Leu Val Asp Gln Leu Pro Gln Gly Asp Glu Asp Val Ser

        420                 425                 430 Ile Ile Gln Gly Met Ile Asp Leu Ile Phe Val Lys Asp Gly Val His

    435                 440                 445 Tyr Phe Val Asp Tyr Lys Thr Asp Ala Phe Asn Arg Arg Arg Gly Met

450                 455                 460 Thr Asp Glu Glu Ile Gly Thr Gln Leu Lys Asn Lys Tyr Lys Ile Gln 465                 470                 475                 480 Met Lys Tyr Tyr Gln Asn Thr Leu Gln Thr Ile Leu Asn Lys Glu Val

            485                 490                 495 Lys Gly Tyr Leu Tyr Phe Phe Lys Phe Gly Thr Leu Gln Leu

        500                 505                 510 <210>23 <211>124 <212>PRT <213>Staphylococcus aureus <400>23 Met Lys Phe Leu Ser Phe Lys Tyr Asn Asp Lys Thr Ser Tyr Gly Val   1               5                  10                  15 Lys Val Lys Arg Glu Asp Ala Val Trp Asp Leu Thr Gln Val Phe Ala

         20                  25                  30 Asp Phe Ala Glu Gly Asp Phe His Pro Lys Thr Leu Leu Ala Gly Leu

     35                  40                  45 Gln Gln Asn His Thr Leu Asp Phe Gln Glu Gln Val Arg Lys Ala Val

 50                  55                  60 Val Ala Ala Glu Asp Ser Gly Lys Ala Glu Asp Tyr Lys Ile Ser Phe  65                  70                  75                  80 Asn Asp Ile Glu Phe Leu Pro Pro Val Thr Pro Pro Asn Asn Val Ile

             85                  90                  95 Ala Phe Gly Arg Asn Tyr Lys Asp His Ala Asn Glu Leu Asn His Glu

        100                 105                 110 Val Glu Lys Leu Tyr Val Phe Thr Lys Ala Ala Ser

    115                 120 <210>24 <211>180 <212>PRT <213>Staphylococcus aureus <400>24 Ser Gly Thr Gly Phe Ile Val Gly Lys Asn Thr Ile Val Thr Asn Lys   1               5                  10                  15 His Val Val Ala Gly Met Glu Ile Gly Ala His Ile Ile Ala His Pro

         20                  25                  30 Asn Gly Glu Tyr Asn Asn Gly Gly Phe Tyr Lys Val Lys Lys Ile Val

     35                  40                  45 Arg Tyr Ser Gly Gln Glu Asp Ile Ala Ile Leu His Val Glu Asp Lys

 50                  55                  60 Ala Val His Pro Lys Asn Arg Asn Phe Lys Asp Tyr Thr Gly Ile Leu  65                  70                  75                  80 Lys Ile Ala Ser Glu Ala Lys Glu Asn Glu Arg Ile Ser Ile Val Gly

             85                  90                  95 Tyr Pro Glu Pro Tyr Ile Asn Lys Phe Gln Met Tyr Glu Ser Thr Gly

        100                 105                 110 Lys Val Leu Ser Val Lys Gly Asn Met Ile Ile Thr Asp Ala Phe Val

    115                 120                 125 Glu Pro Gly Asn Ser Gly Ser Ala Val Phe Asn Ser Lys Tyr Glu Val

130                 135                 140 Val Gly Val His Phe Gly Gly Asn Gly Pro Gly Asn Lys Ser Thr Lys 145                 150                 155                 160 Gly Tyr Gly Val Tyr Phe Ser Pro Glu Ile Lys Lys Phe Ile Ala Asp

            165                 170                 175 Asn Thr Asp Lys

        180 <210>25 <211>239 <212>PRT <213>Staphylococcus aureus <400>25 Met Asn Lys Asn Ile Ile Ile Lys Ser Ile Ala Ala Leu Thr Ile Leu   1               5                  10                  15 Thr Ser Ile Thr Gly Val Gly Thr Thr Met Val Glu Gly Ile Gln Gln

         20                  25                  30 Thr Ala Lys Ala Glu Asn Thr Val Lys Gln Ile Thr Asn Thr Asn Val

     35                  40                  45 Ala Pro Tyr Ser Gly Val Thr Trp Met Gly Ala Gly Thr Gly Phe Val

 50                  55                  60 Val Gly Asn His Thr Ile Ile Thr Asn Lys His Val Thr Tyr His Met  65                  70                  75                  80 Lys Val Gly Asp Glu Ile Lys Ala His Pro Asn Gly Phe Tyr Asn Asn

             85                  90                  95 Gly Gly Gly Leu Tyr Lys Val Thr Lys Ile Val Asp Tyr Pro Gly Lys

        100                 105                 110 Glu Asp Ile Ala Val Val Gln Val Glu Glu Lys Ser Thr Gln Pro Lys

    115                 120                 125 Gly Arg Lys Phe Lys Asp Phe Thr Ser Lys Phe Asn Ile Ala Ser Glu

130                 135                 140 Ala Lys Glu Asn Glu Pro Ile Ser Val Ile Gly Tyr Pro Asn Pro Asn 145                 150                 155                 160 Gly Asn Lys Leu Gln Met Tyr Glu Ser Thr Gly Lys Val Leu Ser Val

            165                 170                 175 Asn Gly Asn Ile Val Ser Ser Asp Ala Ile Ile Gln Pro Gly Ser Ser

        180                 185                 190 Gly Ser Pro Ile Leu Asn Ser Lys His Glu Ala Ile Gly Val Ile Tyr

    195                 200                 205 Ala Gly Asn Lys Pro Ser Gly Glu Ser Thr Arg Gly Phe Ala Val Tyr

210                 215                 220 Phe Ser Pro Glu Ile Lys Lys Phe Ile Ala Asp Asn Leu Asp Lys 225                 230                 235 <210>26 <211>470 <212>PRT <213>Staphylococcus aureus <400>26 Met Gly Cys Thr Val Lys Met Asn Lys Ile Asn Asp Arg Asp Leu Thr   1               5                  10                  15 Glu Leu Ser Ser Tyr Trp Val Tyr Gln Asn Ile Asp Ile Lys Lys Glu

         20                  25                  30 Phe Lys Val Asn Gly Lys Arg Phe Lys Gln Val Asp Ser Tyr Asn Asp

     35                  40                  45 Asp Lys Asn Ser Asn Leu Asn Gly Ala Ala Asp Ile Lys Ile Tyr Glu

 50                  55                  60 Leu Leu Asp Asp Lys Ser Lys Pro Thr Gly Gln Gln Thr Ile Ile Tyr  65                  70                  75                  80 Gln Gly Thr Ser Asn Glu Ala Ile Asn Pro Asn Asn Pro Leu Lys Ser

             85                  90                  95 Ser Gly Phe Gly Asp Asp Trp Leu Gln Asn Ala Lys Leu Met Asn Asn

        100                 105                 110 Asp Asn Glu Ser Thr Asp Tyr Leu Lys Gln Thr Asp Gln Leu Ser Asn

    115                 120                 125 Gln Tyr Lys Ile Lys Leu Glu Asp Ala Asp Arg Leu Ser Asn Ser Asp

130                 135                 140 Phe Leu Lys Lys Tyr Arg Met Glu Ser Ser Asn Phe Lys Asn Lys Thr 145                 150                 155                 160 Ile Val Ala Asp Gly Gly Asn Ser Glu Gly Gly Ala Gly Ala Lys Tyr

            165                 170                 175 Gln Gly Ala Lys His Pro Asn Glu Lys Val Val Ala Thr Asp Ser Ala

        180                 185                 190 Met Ile Pro Tyr Ala Ala Trp Gln Lys Phe Ala Arg Pro Arg Phe Asp

    195                 200                 205 Asn Met Ile Ser Phe Asn Ser Thr Asn Asp Leu Leu Thr Trp Leu Gln

210                 215                 220 Asp Pro Phe Ile Lys Asp Met Pro Gly Lys Arg Val Asn Ile Asn Asp 225                 230                 235                 240 Gly Val Pro Arg Leu Asp Thr Leu Ile Asp Ser His Val Gly Tyr Lys

            245                 250                 255 Arg Lys Leu Asn Arg Lys Asp Asn Thr Tyr Asp Thr Val Pro Leu Ile

        260                 265                 270 Lys Ile Lys Ser Val Lys Asp Thr Glu Ile Lys Asn Gly Lys Lys Val

    275                 280                 285 Lys Lys Thr Ile Asn Ile Thr Leu Asp Met Asp Gly Arg Ile Pro Ile

290                 295                 300 Asn Val Trp Thr Gly Asp Ser Ile Ala Arg Ser Gly Arg Gly Thr Leu 305                 310                 315                 320 Ile Lys Leu Asn Leu Glu Asn Leu Asp Ala Leu Ser Lys Leu Ile Thr

            325                 330                 335 Gly Glu Thr Ser Gly Met Leu Ala Glu Cys Val Ile Phe Leu Asn Glu

        340                 345                 350 Ser Phe Asn Ile Ser Glu Asn Glu Asn Lys Asn Phe Ala Asp Arg Lys

    355                 360                 365 Lys Gln Leu Ser Glu Gly Phe Lys Asp Lys Ile Asn Leu Phe Gln Leu

370                 375                 380 Glu Glu Met Glu Arg Thr Leu Ile Ser Lys Ile Asn Ser Leu Glu Glu 385                 390                 395                 400 Val Ala Asp Glu Thr Ile Glu Ser Ile Ser Ala Val Lys His Leu Leu

            405                 410                 415 Pro Asp Phe Ala Leu Asp Ala Leu Lys Glu Arg Ile Asn Glu Leu Phe

        420                 425                 430 Lys Gly Ile Lys Ser Phe Ile Glu Lys Val Tyr Asp Ser Ile Asp Asn

    435                 440                 445 Glu Ile Leu Glu Ile Phe Lys Asn Ile Asp His Asp Phe Arg Asp Gly

450                 455                 460 Val Ser Glu Glu Met Met 465                 470 <210>27 <211>306 <212>PRT <213>Staphylococcus aureus <400>27 Met Lys Lys Lys Asp Gly Thr Gln Gln Phe Tyr His Tyr Ala Ser Ser   1               5                  10                  15 Val Lys Pro Ala Arg Val Ile Phe Thr Asp Ser Lys Pro Glu Ile Glu

         20                  25                  30 Leu Gly Leu Gln Ser Gly Gln Phe Trp Arg Lys Phe Glu Val Tyr Glu

     35                  40                  45 Gly Asp Lys Lys Leu Pro Ile Lys Leu Val Ser Tyr Asp Thr Val Lys

 50                  55                  60 Asp Tyr Ala Tyr Ile Arg Phe Ser Val Ser Asn Gly Thr Lys Ala Val  65                  70                  75                  80 Lys Ile Val Ser Ser Thr His Phe Asn Asn Lys Glu Glu Lys Tyr Asp

             85                  90                  95 Tyr Thr Leu Met Glu Phe Ala Gln Pro Ile Tyr Asn Ser Ala Asp Lys

        100                 105                 110 Phe Lys Thr Glu Glu Asp Tyr Lys Ala Glu Lys Leu Leu Ala Pro Tyr

    115                 120                 125 Lys Lys Ala Lys Thr Leu Glu Arg Gln Val Tyr Glu Leu Asn Lys Ile

130                 135                 140 Gln Asp Lys Leu Pro Glu Lys Leu Lys Ala Glu Tyr Lys Lys Lys Leu 145                 150                 155                 160 Glu Asp Thr Lys Lys Ala Leu Asp Glu Gln Val Lys Ser Ala Ile Thr

            165                 170                 175 Glu Phe Gln Asn Val Gln Pro Thr Asn Glu Lys Met Thr Asp Leu Gln

        180                 185                 190 Asp Thr Lys Tyr Val Val Tyr Glu Ser Val Glu Asn Asn Glu Ser Met

    195                 200                 205 Met Asp Thr Phe Val Lys His Pro Ile Lys Thr Gly Met Leu Asn Gly

210                 215                 220 Lys Lys Tyr Met Val Met Glu Thr Thr Asn Asp Asp Tyr Trp Lys Asp 225                 230                 235                 240 Phe Met Val Glu Gly Gln Arg Val Arg Thr Ile Ser Lys Asp Ala Lys

            245                 250                 255 Asn Asn Thr Arg Thr Ile Ile Phe Pro Tyr Val Glu Gly Lys Thr Leu

        260                 265                 270 Tyr Asp Ala Ile Val Lys Val His Val Lys Thr Ile Asp Tyr Asp Gly

    275                 280                 285 Gln Tyr His Val Arg Ile Val Asp Lys Glu Ala Phe Thr Lys Ala His

290                 295                 300 Thr Asp 305 <210>28 <211>2659 <212>PRT <213>Staphylococcus aureus <400>28 Asp Gln Thr Thr Ile Ile Asn Ser Leu Thr Phe Thr Glu Thr Val Pro   1               5                  10                  15 Asn Arg Ser Tyr Ala Arg Ala Ser Ala Asn Glu Ile Thr Ser Lys Thr

         20                  25                  30 Val Ser Asn Val Ser Arg Thr Gly Asn Asn Ala Asn Val Thr Val Thr

     35                  40                  45 Val Thr Tyr Gln Asp Gly Thr Thr Ser Thr Val Thr Val Pro Val Lys

 50                  55                  60 His Val Ile Pro Glu Ile Val Ala His Ser His Tyr Thr Val Gln Gly  65                  70                  75                  80 Gln Asp Phe Pro Ala Gly Asn Gly Ser Ser Ala Ser Asp Tyr Phe Lys

             85                  90                  95 Leu Ser Asn Gly Ser Asp Ile Ala Asp Ala Thr Ile Thr Trp Val Ser

        100                 105                 110 Gly Gln Ala Pro Asn Lys Asp Asn Thr Arg Ile Gly Glu Asp Ile Thr

    115                 120                 125 Val Thr Ala His Ile Leu Ile Asp Gly Glu Thr Thr Pro Ile Thr Lys

130                 135                 140 Thr Ala Thr Tyr Lys Val Val Arg Thr Val Pro Lys His Val Phe Glu 145                 150                 155                 160 Thr Ala Arg Gly Val Leu Tyr Pro Gly Val Ser Asp Met Tyr Asp Ala

            165                 170                 175 Lys Gln Tyr Val Lys Pro Val Asn Asn Ser Trp Ser Thr Asn Ala Gln

        180                 185                 190 His Met Asn Phe Gln Phe Val Gly Thr Tyr Gly Pro Asn Lys Asp Val

    195                 200                 205 Val Gly Ile Ser Thr Arg Leu Ile Arg Val Thr Tyr Asp Asn Arg Gln

210                 215                 220 Thr Glu Asp Leu Thr Ile Leu Ser Lys Val Lys Pro Asp Pro Pro Arg 225                 230                 235                 240 Ile Asp Ala Asn Ser Val Thr Tyr Lys Ala Gly Leu Thr Asn Gln Glu

            245                 250                 255 Ile Lys Val Asn Asn Val Leu Asn Asn Ser Ser Val Lys Leu Phe Lys

        260                 265                 270 Ala Asp Asn Thr Pro Leu Asn Val Thr Asn Ile Thr His Gly Ser Gly

    275                 280                 285 Phe Ser Ser Val Val Thr Val Ser Asp Ala Leu Pro Asn Gly Gly Ile

290                 295                 300 Lys Ala Lys Ser Ser Ile Ser Met Asn Asn Val Thr Tyr Thr Thr Gln 305                 310                 315                 320 Asp Glu His Gly Gln Val Val Thr Val Thr Arg Asn Glu Ser Val Asp

            325                 330                 335 Ser Asn Asp Ser Ala Thr Val Thr Val Thr Pro Gln Leu Gln Ala Thr

        340                 345                 350 Thr Glu Gly Ala Val Phe Ile Lys Gly Gly Asp Gly Phe Asp Phe Gly

    355                 360                 365 His Val Glu Arg Phe Ile Gln Asn Pro Pro His Gly Ala Thr Val Ala

370                 375                 380 Trp His Asp Ser Pro Asp Thr Trp Lys Asn Thr Val Gly Asn Thr His 385                 390                 395                 400 Lys Thr Ala Val Val Thr Leu Pro Asn Gly Gln Gly Thr Arg Asn Val

            405                 410                 415 Glu Val Pro Val Lys Val Tyr Pro Val Ala Asn Ala Lys Ala Pro Ser

        420                 425                 430 Arg Asp Val Lys Gly Gln Asn Leu Thr Asn Gly Thr Asp Ala Met Asn

    435                 440                 445 Tyr Ile Thr Phe Asp Pro Asn Thr Asn Thr Asn Gly Ile Thr Ala Ala

450                 455                 460 Trp Ala Asn Arg Gln Gln Pro Asn Asn Gln Gln Ala Gly Val Gln His 465                 470                 475                 480 Leu Asn Val Asp Val Thr Tyr Pro Gly Ile Ser Ala Ala Lys Arg Val

            485                 490                 495 Pro Val Thr Val Asn Val Tyr Gln Phe Glu Phe Pro Gln Thr Thr Tyr

        500                 505                 510 Thr Thr Thr Val Gly Gly Thr Leu Ala Ser Gly Thr Gln Ala Ser Gly

    515                 520                 525 Tyr Ala His Met Gln Asn Ala Thr Gly Leu Pro Thr Asp Gly Phe Thr

530                 535                 540 Tyr Lys Trp Asn Arg Asp Thr Thr Gly Thr Asn Asp Ala Asn Trp Ser 545                 550                 555                 560 Ala Met Asn Lys Pro Asn Val Ala Lys Val Val Asn Ala Lys Tyr Asp

            565                 570                 575 Val Ile Tyr Asn Gly His Thr Phe Ala Thr Ser Leu Pro Ala Lys Phe

        580                 585                 590 Val Val Lys Asp Val Gln Pro Ala Lys Pro Thr Val Thr Glu Thr Ala

    595                 600                 605 Ala Gly Ala Ile Thr Ile Ala Pro Gly Ala Asn Gln Thr Val Asn Thr

610                 615                 620 His Ala Gly Asn Val Thr Thr Tyr Ala Asp Lys Leu Val Ile Lys Arg 625                 630                 635                 640 Asn Gly Asn Val Val Thr Thr Phe Thr Arg Arg Asn Asn Thr Ser Pro

            645                 650                 655 Trp Val Lys Glu Ala Ser Ala Ala Thr Val Ala Gly Ile Ala Gly Thr

        660                 665                 670 Asn Asn Gly Ile Thr Val Ala Ala Gly Thr Phe Asn Pro Ala Asp Thr

    675                 680                 685 Ile Gln Val Val Ala Thr Gln Gly Ser Gly Glu Thr Val Ser Asp Glu

690                 695                 700 Gln Arg Ser Asp Asp Phe Thr Val Val Ala Pro Gln Pro Asn Gln Ala 705                 710                 715                 720 Thr Thr Lys Ile Trp Gln Asn Gly His Ile Asp Ile Thr Pro Asn Asn

            725                 730                 735 Pro Ser Gly His Leu Ile Asn Pro Thr Gln Ala Met Asp Ile Ala Tyr

        740                 745                 750 Thr Glu Lys Val Gly Asn Gly Ala Glu His Ser Lys Thr Ile Asn Val

    755                 760                 765 Val Arg Gly Gln Asn Asn Gln Trp Thr Ile Ala Asn Lys Pro Asp Tyr

770                 775                 780 Val Thr Leu Asp Ala Gln Thr Gly Lys Val Thr Phe Asn Ala Asn Thr 785                 790                 795                 800 Ile Lys Pro Asn Ser Ser Ile Thr Ile Thr Pro Lys Ala Gly Thr Gly

            805                 810                 815 His Ser Val Ser Ser Asn Pro Ser Thr Leu Thr Ala Pro Ala Ala His

        820                 825                 830 Thr Val Asn Thr Thr Glu Ile Val Lys Asp Tyr Gly Ser Asn Val Thr

    835                 840                 845 Ala Ala Glu Ile Asn Asn Ala Val Gln Val Ala Asn Lys Arg Thr Ala

850                 855                 860 Thr Ile Lys Asn Gly Thr Ala Met Pro Thr Asn Leu Ala Gly Gly Ser 865                 870                 875                 880 Thr Thr Thr Ile Pro Val Thr Val Thr Tyr Asn Asp Gly Ser Thr Glu

            885                 890                 895 Glu Val Gln Glu Ser Ile Phe Thr Lys Ala Asp Lys Arg Glu Leu Ile

        900                 905                 910 Thr Ala Lys Asn His Leu Asp Asp Pro Val Ser Thr Glu Gly Lys Lys

    915                 920                 925 Pro Gly Thr Ile Thr Gln Tyr Asn Asn Ala Met His Asn Ala Gln Gln

930                 935                 940 Gln Ile Asn Thr Ala Lys Thr Glu Ala Gln Gln Val Ile Asn Asn Glu 945                 950                 955                 960 Arg Ala Thr Pro Gln Gln Val Ser Asp Ala Leu Thr Lys Val Arg Ala

            965                 970                 975 Ala Gln Thr Lys Ile Asp Gln Ala Lys Ala Leu Leu Gln Asn Lys Glu

        980                 985                 990 Asp Asn Ser Gln Leu Val Thr Ser Lys Asn Asn Leu Gln Ser Ser Val

    995                1000                1005 Asn Gln Val Pro Ser Thr Ala Gly Met Thr Gln Gln Ser Ile Asp Asn    1010                1015                1020 Tyr Asn Ala Lys Lys Arg Glu Ala Glu Thr Glu Ile Thr Ala Ala Gln 1025               1030                1035                1040 Arg Val Ile Asp Asn Gly Asp Ala Thr Ala Gln Gln Ile Ser Asp Glu

           1045                1050                1055 Lys His Arg Val Asp Asn Ala Leu Thr Ala Leu Asn Gln Ala Lys His

       1060                1065                1070 Asp Leu Thr Ala Asp Thr His Ala Leu Glu Gln Ala Val Gln Gln Leu

   1075                1080                1085 Asn Arg Thr Gly Thr Thr Thr Gly Lys Lys Pro Ala Ser Ile Thr Ala    1090                1095                1100 Tyr Asn Asn Ser Ile Arg Ala Leu Gln Ser Asp Leu Thr Ser Ala Lys 1105               1110                1115                1120 Asn Ser Ala Asn Ala Ile Ile Gln Lys Pro Ile Arg Thr Val Gln Glu

           1125                1130                1135 Val Gln Ser Ala Leu Thr Asn Val Asn Arg Val Asn Glu Arg Leu Thr

       1140                1145                1150 Gln Ala Ile Asn Gln Leu Val Pro Leu Ala Asp Asn Ser Ala Leu Lys

   1155                1160                1165 Thr Ala Lys Thr Lys Leu Asp Glu Glu Ile Asn Lys Ser Val Thr Thr    1170                1175                1180 Asp Gly Met Thr Gln Ser Ser Ile Gln Ala Tyr Glu Asn Ala Lys Arg 1185               1190                1195                1200 Ala Gly Gln Thr Glu Ser Thr Asn Ala Gln Asn Val Ile Asn Asn Gly

           1205                1210                1215 Asp Ala Thr Asp Gln Gln Ile Ala Ala Glu Lys Thr Lys Val Glu Glu

       1220                1225                1230 Lys Tyr Asn Ser Leu Lys Gln Ala Ile Ala Gly Leu Thr Pro Asp Leu

   1235                1240                1245 Ala Pro Leu Gln Thr Ala Lys Thr Gln Leu Gln Asn Asp Ile Asp Gln    1250                1255                1260 Pro Thr Ser Thr Thr Gly Met Thr Ser Ala Ser Ile Ala Ala Phe Asn 1265               1270                1275                1280 Glu Lys Leu Ser Ala Ala Arg Thr Lys Ile Gln Glu Ile Asp Arg Val

           1285                1290                1295 Leu Ala Ser His Pro Asp Val Ala Thr Ile Arg Gln Asn Val Thr Ala

       1300                1305                1310 Ala Asn Ala Ala Lys Ser Ala Leu Asp Gln Ala Arg Asn Gly Leu Thr

   1315                1320                1325 Val Asp Lys Ala Pro Leu Glu Asn Ala Lys Asn Gln Leu Gln Tyr Ser    1330                1335                1340 Ile Asp Thr Gln Thr Ser Thr Thr Gly Met Thr Gln Asp Ser Ile Asn 1345               1350                1355                1360 Ala Tyr Asn Ala Lys Leu Thr Ala Ala Arg Asn Lys Ile Gln Gln Ile

           1365                1370                1375 Asn Gln Val Leu Ala Gly Ser Pro Thr Val Glu Gln Ile Asn Thr Asn

       1380                1385                1390 Thr Ser Thr Ala Asn Gln Ala Lys Ser Asp Leu Asp His Ala Arg Gln

   1395                1400                1405 Ala Leu Thr Pro Asp Lys Ala Pro Leu Gln Thr Ala Lys Thr Gln Leu    1410                1415                1420 Glu Gln Ser Ile Asn Gln Pro Thr Asp Thr Thr Gly Met Thr Thr Ala 1425               1430                1435                1440 Ser Leu Asn Ala Tyr Asn Gln Lys Leu Gln Ala Ala Arg Gln Lys Leu

           1445                1450                1455 Thr Glu Ile Asn Gln Val Leu Asn Gly Asn Pro Thr Val Gln Asn Ile

       1460                1465                1470 Asn Asp Lys Val Thr Glu Ala Asn Gln Ala Lys Asp Gln Leu Asn Thr

   1475                1480                1485 Ala Arg Gln Gly Leu Thr Leu Asp Arg Gln Pro Ala Leu Thr Thr Leu    1490                1495                1500 His Gly Ala Ser Asn Leu Asn Gln Ala Gln Gln Asn Asn Phe Thr Gln 1505               1510                1515                1520 Gln Ile Asn Ala Ala Gln Asn His Ala Ala Leu Glu Thr Ile Lys Ser

           1525                1530                1535 Asn Ile Thr Ala Leu Asn Thr Ala Met Thr Lys Leu Lys Asp Ser Val

       1540                1545                1550 Ala Asp Asn Asn Thr Ile Lys Ser Asp Gln Asn Tyr Thr Asp Ala Thr

   1555                1560                1565 Pro Ala Asn Lys Gln Ala Tyr Asp Asn Ala Val Asn Ala Ala Lys Gly    1570                1575                1580 Val Ile Gly Glu Thr Thr Asn Pro Thr Met Asp Val Asn Thr Val Asn 1585               1590                1595                1600 Gln Lys Ala Ala Ser Val Lys Ser Thr Lys Asp Ala Leu Asp Gly Gln

           1605                1610                1615 Gln Asn Leu Gln Arg Ala Lys Thr Glu Ala Thr Asn Ala Ile Thr His

       1620                1625                1630 Ala Ser Asp Leu Asn Gln Ala Gln Lys Asn Ala Leu Thr Gln Gln Val

   1635                1640                1645 Asn Ser Ala Gln Asn Val Gln Ala Val Asn Asp Ile Lys Gln Thr Thr    1650                1655                1660 Gln Ser Leu Asn Thr Ala Met Thr Gly Leu Lys Arg Gly Val Ala Asn 1665               1670                1675                1680 His Asn Gln Val Val Gln Ser Asp Asn Tyr Val Asn Ala Asp Thr Asn

           1685                1690                1695 Lys Lys Asn Asp Tyr Asn Asn Ala Tyr Asn His Ala Asn Asp Ile Ile

       1700                1705                1710 Asn Gly Asn Ala Gln His Pro Val Ile Thr Pro Ser Asp Val Asn Asn

   1715                1720                1725 Ala Leu Ser Asn Val Thr Ser Lys Glu His Ala Leu Asn Gly Glu Ala    1730                1735                1740 Lys Leu Asn Ala Ala Lys Gln Glu Ala Asn Thr Ala Leu Gly His Leu 1745               1750                1755                1760 Asn Asn Leu Asn Asn Ala Gln Arg Gln Asn Leu Gln Ser Gln Ile Asn

           1765                1770                1775 Gly Ala His Gln Ile Asp Ala Val Asn Thr Ile Lys Gln Asn Ala Thr

       1780                1785                1790 Asn Leu Asn Ser Ala Met Gly Asn Leu Arg Gln Ala Val Ala Asp Lys

   1795                1800                1805 Asp Gln Val Lys Arg Thr Glu Asp Tyr Ala Asp Ala Asp Thr Ala Lys    1810                1815                1820 Gln Asn Ala Tyr Asn Ser Ala Val Ser Ser Ala Glu Thr Ile Ile Asn 1825               1830                1835                1840 Gln Thr Thr Asn Pro Thr Met Ser Val Asp Asp Val Asn Arg Ala Thr

           1845                1850                1855 Ser Ala Val Thr Ser Asn Lys Asn Ala Leu Asn Gly Tyr Glu Lys Leu

       1860                1865                1870 Ala Gln Ser Lys Thr Asp Ala Ala Arg Ala Ile Asp Ala Leu Pro His

   1875                1880                1885 Leu Asn Asn Ala Gln Lys Ala Asp Val Lys Ser Lys Ile Asn Ala Ala    1890                1895                1900 Ser Asn Ile Ala Gly Val Asn Thr Val Lys Gln Gln Gly Thr Asp Leu 1905               1910                1915                1920 Asn Thr Ala Met Gly Asn Leu Gln Gly Ala Ile Asn Asp Glu Gln Thr

           1925                1930                1935 Thr Leu Asn Ser Gln Asn Tyr Gln Asp Ala Thr Pro Ser Lys Lys Thr

       1940                1945                1950 Ala Tyr Thr Asn Ala Val Gln Ala Ala Lys Asp Ile Leu Asn Lys Ser

   1955                1960                1965 Asn Gly Gln Asn Lys Thr Lys Asp Gln Val Thr Glu Ala Met Asn Gln    1970                1975                1980 Val Asn Ser Ala Lys Asn Asn Leu Asp Gly Thr Arg Leu Leu Asp Gln 1985               1990                1995                2000 Ala Lys Gln Thr Ala Lys Gln Gln Leu Asn Asn Met Thr His Leu Thr

           2005                2010                2015 Thr Ala Gln Lys Thr Asn Leu Thr Asn Gln Ile Asn Ser Gly Thr Thr

       2020                2025                2030 Val Ala Gly Val Gln Thr Val Gln Ser Asn Ala Asn Thr Leu Asp Gln

   2035                2040                2045 Ala Met Asn Thr Leu Arg Gln Ser Ile Ala Asn Lys Asp Ala Thr Lys    2050                2055                2060 Ala Ser Glu Asp Tyr Val Asp Ala Asn Asn Asp Lys Gln Thr Ala Tyr 2065               2070                2075                2080 Asn Asn Ala Val Ala Ala Ala Glu Thr Ile Ile Asn Ala Asn Ser Asn

           2085                2090                2095 Pro Glu Met Asn Pro Ser Thr Ile Thr Gln Lys Ala Glu Gln Val Asn

       2100                2105                2110 Ser Ser Lys Thr Ala Leu Asn Gly Asp Glu Asn Leu Ala Ala Ala Lys

   2115                2120                2125 Gln Asn Ala Lys Thr Tyr Leu Asn Thr Leu Thr Ser Ile Thr Asp Ala    2130                2135                2140 Gln Lys Asn Asn Leu Ile Ser Gln Ile Thr Ser Ala Thr Arg Val Ser 2145               2150                2155                2160 Gly Val Asp Thr Val Lys Gln Asn Ala Gln His Leu Asp Gln Ala Met

           2165                2170                2175 Ala Ser Leu Gln Asn Gly Ile Asn Asn Glu Ser Gln Val Lys Ser Ser

       2180                2185                2190 Glu Lys Tyr Arg Asp Ala Asp Thr Asn Lys Gln Gln Glu Tyr Asp Asn

   2195                2200                2205 Ala Ile Thr Ala Ala Lys Ala Ile Leu Asn Lys Ser Thr Gly Pro Asn    2210                2215                2220 Thr Ala Gln Asn Ala Val Glu Ala Ala Leu Gln Arg Val Asn Asn Ala 2225               2230                2235                2240 Lys Asp Ala Leu Asn Gly Asp Ala Lys Leu Ile Ala Ala Gln Asn Ala

           2245                2250                2255 Ala Lys Gln His Leu Gly Thr Leu Thr His Ile Thr Thr Ala Gln Arg

       2260                2265                2270 Asn Asp Leu Thr Asn Gln Ile Ser Gln Ala Thr Asn Leu Ala Gly Val

   2275                2280                2285 Glu Ser Val Lys Gln Asn Ala Asn Ser Leu Asp Gly Ala Met Gly Asn    2290                2295                2300 Leu Gln Thr Ala Ile Asn Asp Lys Ser Gly Thr Leu Ala Ser Gln Asn 2305               2310                2315                2320 Phe Leu Asp Ala Asp Glu Gln Lys Arg Asn Ala Tyr Asn Gln Ala Val

           2325                2330                2335 Ser Ala Ala Glu Thr Ile Leu Asn Lys Gln Thr Gly Pro Asn Thr Ala

       2340                2345                2350 Lys Thr Ala Val Glu Gln Ala Leu Asn Asn Val Asn Asn Ala Lys His

   2355                2360                2365 Ala Leu Asn Gly Thr Gln Asn Leu Asn Asn Ala Lys Gln Ala Ala Ile    2370                2375                2380 Thr Ala Ile Asn Gly Ala Ser Asp Leu Asn Gln Lys Gln Lys Asp Ala 2385               2390                2395                2400 Leu Lys Ala Gln Ala Asn Gly Ala Gln Arg Val Ser Asn Ala Gln Asp

           2405                2410                2415 Val Gln His Asn Ala Thr Glu Leu Asn Thr Ala Met Gly Thr Leu Lys

       2420                2425                2430 His Ala Ile Ala Asp Lys Thr Asn Thr Leu Ala Ser Ser Lys Tyr Val

   2435                2440                2445 Asn Ala Asp Ser Thr Lys Gln Asn Ala Tyr Thr Thr Lys Val Thr Asn    2450                2455                2460 Ala Glu His Ile Ile Ser Gly Thr Pro Thr Val Val Thr Thr Pro Ser 2465               2470                2475                2480 Glu Val Thr Ala Ala Ala Asn Gln Val Asn Ser Ala Lys Gln Glu Leu

           2485                2490                2495 Asn Gly Asp Glu Arg Leu Arg Glu Ala Lys Gln Asn Ala Asn Thr Ala

       2500                2505                2510 Ile Asp Ala Leu Thr Gln Leu Asn Thr Pro Gln Lys Ala Lys Leu Lys

   2515                2520                2525 Glu Gln Val Gly Gln Ala Asn Arg Leu Glu Asp Val Gln Thr Val Gln    2530                2535                2540 Thr Asn Gly Gln Ala Leu Asn Asn Ala Met Lys Gly Leu Arg Asp Ser 2545               2550                2555                2560 Ile Ala Asn Glu Thr Thr Val Lys Thr Ser Gln Asn Tyr Thr Asp Ala

           2565                2570                2575 Ser Pro Asn Asn Gln Ser Thr Tyr Asn Ser Ala Val Ser Asn Ala Lys

       2580                2585                2590 Gly Ile Ile Asn Gln Thr Asn Asn Pro Thr Met Asp Thr Ser Ala Ile

   2595                2600                2605 Thr Gln Ala Thr Thr Gln Val Asn Asn Ala Lys Asn Gly Leu Asn Gly    2610                2615                2620 Ala Glu Asn Leu Arg Asn Ala Gln Asn Thr Ala Lys Gln Asn Leu Asn 2625               2630                2635                2640 Thr Leu Ser His Leu Thr Asn Asn Gln Lys Ser Ala Ile Ser Ser Gln

           2645                2650                2655 Ile Asp Arg <210>29 <211>496 <212>PRT <213>Staphylococcus aureus <400>29 Met Asn Met Lys Lys Lys Glu Lys His Ala Ile Arg Lys Lys Ser Ile   1                   5              10                  15 Gly Val Ala Ser Val Leu Val Gly Thr Leu Ile Gly Phe Gly Leu Leu

         20                  25                  30 Ser Ser Lys Glu Ala Asp Ala Ser Glu Asn Ser Val Thr Gln Ser Asp

     35                  40                  45 Ser Ala Ser Asn Glu Ser Lys Ser Asn Asp Ser Ser Ser Val Ser Ala

 50                  55                  60 Ala Pro Lys Thr Asp Asp Thr Asn Val Ser Asp Thr Lys Thr Ser Ser  65                  70                  75                  80 Asn Thr Asn Asn Gly Glu Thr Ser Val Ala Gln Asn Pro Ala Gln Gln

             85                  90                  95 Glu Thr Thr Gln Ser Ser Ser Thr Asn Ala Thr Thr Glu Glu Thr Pro

        100                 105                 110 Val Thr Gly Glu Ala Thr Thr Thr Thr Thr Asn Gln Ala Asn Thr Pro

    115                 120                 125 Ala Thr Thr Gln Ser Ser Asn Thr Asn Ala Glu Glu Leu Val Asn Gln

130                 135                 140 Thr Ser Asn Glu Thr Thr Phe Asn Asp Thr Asn Thr Val Ser Ser Val 145                 150                 155                 160 Asn Ser Pro Gln Asn Ser Thr Asn Ala Glu Asn Val Ser Thr Thr Gln

            165                 170                 175 Asp Thr Ser Thr Glu Ala Thr Pro Ser Asn Asn Glu Ser Ala Pro Gln

        180                 185                 190 Ser Thr Asp Ala Ser Asn Lys Asp Val Val Asn Gln Ala Val Asn Thr

    195                 200                 205 Ser Ala Pro Arg Met Arg Ala Phe Ser Leu Ala Ala Val Ala Ala Asp

210                 215                 220 Ala Pro Ala Ala Gly Thr Asp Ile Thr Asn Gln Leu Thr Asn Val Thr 225                 230                 235                 240 Val Gly Ile Asp Ser Gly Thr Thr Val Tyr Pro His Gln Ala Gly Tyr

            245                 250                 255 Val Lys Leu Asn Tyr Gly Phe Ser Val Pro Asn Ser Ala Val Lys Gly

        260                 265                 270 Asp Thr Phe Lys Ile Thr Val Pro Lys Glu Leu Asn Leu Asn Gly Val

    275                 280                 285 Thr Ser Thr Ala Lys Val Pro Pro Ile Met Ala Gly Asp Gln Val Leu

290                 295                 300 Ala Asn Gly Val Ile Asp Ser Asp Gly Asn Val Ile Tyr Thr Phe Thr 305                 310                 315                 320 Asp Tyr Val Asn Thr Lys Asp Asp Val Lys Ala Thr Leu Thr Met Pro

            325                 330                 335 Ala Tyr Ile Asp Pro Glu Asn Val Lys Lys Thr Gly Asn Val Thr Leu

        340                 345                 350 Ala Thr Gly Ile Gly Ser Thr Thr Ala Asn Lys Thr Val Leu Val Asp

    355                 360                 365 Tyr Glu Lys Tyr Gly Lys Phe Tyr Asn Leu Ser Ile Lys Gly Thr Ile

370                 375                 380 Asp Gln Ile Asp Lys Thr Asn Asn Thr Tyr Arg Gln Thr Ile Tyr Val 385                 390                 395                 400 Asn Pro Ser Gly Asp Asn Val Ile Ala Pro Val Leu Thr Gly Asn Leu

            405                 410                 415 Lys Pro Asn Thr Asp Ser Asn Ala Leu Ile Asp Gln Gln Asn Thr Ser

        420                 425                 430 Ile Lys Val Tyr Lys Val Asp Asn Ala Ala Asp Leu Ser Glu Ser Tyr

    435                 440                 445 Phe Val Asn Pro Glu Asn Phe Glu Asp Val Thr Asn Ser Val Asn Ile

450                 455                 460 Thr Phe Pro Asn Pro Asn Gln Tyr Lys Val Glu Phe Asn Thr Pro Asp 465                 470                 475                 480 Asp Gln Ile Thr Thr Pro Tyr Ile Val Val Val Asn Gly His Ile Asp

            485                 490                 495 <210>30 <211>541 <212>PRT <213>Staphylococcus aureus <400>30 Asp Gln Tyr Leu Leu Glu Arg Lys Lys Ser Gln Tyr Glu Asp Tyr Lys   1                   5              10                  15 Gln Trp Tyr Ala Asn Tyr Lys Lys Glu Asn Pro Arg Thr Asp Leu Lys

         20                  25                  30 Met Ala Asn Phe His Lys Tyr Asn Leu Glu Glu Leu Ser Met Lys Glu

     35                  40                  45 Tyr Asn Glu Leu Gln Asp Ala Leu Lys Arg Ala Leu Asp Asp Phe His

 50                  55                  60 Arg Glu Val Lys Asp Ile Lys Asp Lys Asn Ser Asp Leu Lys Thr Phe  65                  70                  75                  80 Asn Ala Ala Glu Glu Asp Lys Ala Thr Lys Glu Val Tyr Asp Leu Val

             85                  90                  95 Ser Glu Ile Asp Thr Leu Val Val Ser Tyr Tyr Gly Asp Lys Asp Tyr

        100                 105                 110 Gly Glu His Ala Lys Glu Leu Arg Ala Lys Leu Asp Leu Ile Leu Gly

    115                 120                 125 Asp Thr Asp Asn Pro His Lys Ile Thr Asn Glu Arg Ile Lys Lys Glu

130                 135                 140 Met Ile Asp Asp Leu Asn Ser Ile Ile Asp Asp Phe Phe Met Glu Thr 145                 150                 155                 160 Lys Gln Asn Arg Pro Lys Ser Ile Thr Lys Tyr Asn Pro Thr Thr His

            165                 170                 175 Asn Tyr Lys Thr Asn Ser Asp Asn Lys Pro Asn Phe Asp Lys Leu Val

        180                 185                 190 Glu Glu Thr Lys Lys Ala Val Lys Glu Ala Asp Asp Ser Trp Lys Lys

    195                 200                 205 Lys Thr Val Lys Lys Tyr Gly Glu Thr Glu Thr Lys Ser Pro Val Val

210                 215                 220 Lys Glu Glu Lys Lys Val Glu Glu Pro Gln Ala Pro Lys Val Asp Asn 225                 230                 235                 240 Gln Gln Glu Val Lys Thr Thr Ala Gly Lys Ala Glu Glu Thr Thr Gln

            245                 250                 255 Pro Val Ala Gln Pro Leu Val Lys Ile Pro Gln Gly Thr Ile Thr Gly

        260                 265                 270 Glu Ile Val Lys Gly Pro Glu Tyr Pro Thr Met Glu Asn Lys Thr Val

    275                 280                 285 Gln Gly Glu Ile Val Gln Gly Pro Asp Phe Leu Thr Met Glu Gln Ser

290                 295                 300 Gly Pro Ser Leu Ser Asn Asn Tyr Thr Asn Pro Pro Leu Thr Asn Pro 305                 310                 315                 320 Ile Leu Glu Gly Leu Glu Gly Ser Ser Ser Lys Leu Glu Ile Lys Pro

            325                 330                 335 Gln Gly Thr Glu Ser Thr Leu Lys Gly Thr Gln Gly Glu Ser Ser Asp

        340                 345                 350 Ile Glu Val Lys Pro Gln Ala Thr Glu Thr Thr Glu Ala Ser Gln Tyr

    355                 360                 365 Gly Pro Arg Pro Gln Phe Asn Lys Thr Pro Lys Tyr Val Lys Tyr Arg

370                 375                 380 Asp Ala Gly Thr Gly Ile Arg Glu Tyr Asn Asp Gly Thr Phe Gly Tyr 385                 390                 395                 400 Glu Ala Arg Pro Arg Phe Asn Lys Pro Ser Glu Thr Asn Ala Tyr Asn

            405                 410                 415 Val Thr Thr His Ala Asn Gly Gln Val Ser Tyr Gly Ala Arg Pro Thr

        420                 425                 430 Tyr Lys Lys Pro Ser Glu Thr Asn Ala Tyr Asn Val Thr Thr His Ala

    435                 440                 445 Asn Gly Gln Val Ser Tyr Gly Ala Arg Pro Thr Gln Asn Lys Pro Ser

450                 455                 460 Lys Thr Asn Ala Tyr Asn Val Thr Thr His Gly Asn Gly Gln Val Ser 465                 470                 475                 480 Tyr Gly Ala Arg Gln Ala Gln Asn Lys Pro Ser Lys Thr Asn Ala Tyr

            485                 490                 495 Asn Val Thr Thr His Ala Asn Gly Gln Val Ser Tyr Gly Ala Arg Pro

        500                 505                 510 Thr Tyr Lys Lys Pro Ser Lys Thr Asn Ala Tyr Asn Val Thr Thr His

    515                 520                 525 Ala Asp Gly Thr Ala Thr Tyr Gly Pro Arg Val Thr Lys

530                 535                 540 <210>31 <211>356 <212>PRT <213>Staphylococcus aureus <400>31 Met Lys Met Arg Thr Ile Ala Lys Thr Ser Leu Ala Leu Gly Leu Leu   1               5                  10                  15 Thr Thr Gly Ala Ile Thr Val Thr Thr Gln Ser Val Lys Ala Glu Lys

         20                  25                  30 Ile Gln Ser Thr Lys Val Asp Lys Val Pro Thr Leu Lys Ala Glu Arg

     35                  40                  45 Leu Ala Met Ile Asn Ile Thr Ala Gly Ala Asn Ser Ala Thr Thr Gln

 50                  55                  60 Ala Ala Asn Thr Arg Gln Glu Arg Thr Pro Lys Leu Glu Lys Ala Pro  65                  70                  75                  80 Asn Thr Asn Glu Glu Lys Thr Ser Ala Ser Lys Ile Glu Lys Ile Ser

             85                  90                  95 Gln Pro Lys Gln Glu Glu Gln Lys Thr Leu Asn Ile Ser Ala Thr Pro

        100                 105                 110 Ala Pro Lys Gln Glu Gln Ser Gln Thr Thr Thr Glu Ser Thr Thr Pro

    115                 120                 125 Lys Thr Lys Val Thr Thr Pro Pro Ser Thr Asn Thr Pro Gln Pro Met

130                 135                 140 Gln Ser Thr Lys Ser Asp Thr Pro Gln Ser Pro Thr Ile Lys Gln Ala 145                 150                 155                 160 Gln Thr Asp Met Thr Pro Lys Tyr Glu Asp Leu Arg Ala Tyr Tyr Thr

            165                 170                 175 Lys Pro Ser Phe Glu Phe Glu Lys Gln Phe Gly Phe Met Leu Lys Pro

        180                 185                 190 Trp Thr Thr Val Arg Phe Met Asn Val Ile Pro Asn Arg Phe Ile Tyr

    195                 200                 205 Lys Ile Ala Leu Val Gly Lys Asp Glu Lys Lys Tyr Lys Asp Gly Pro

210                 215                 220 Tyr Asp Asn Ile Asp Val Phe Ile Val Leu Glu Asp Asn Lys Tyr Gln 225                 230                 235                 240 Leu Lys Lys Tyr Ser Val Gly Gly Ile Thr Lys Thr Asn Ser Lys Lys

            245                 250                 255 Val Asn His Lys Val Glu Leu Ser Ile Thr Lys Lys Asp Asn Gln Gly

        260                 265                 270 Met Ile Ser Arg Asp Val Ser Glu Tyr Met Ile Thr Lys Glu Glu Ile

    275                 280                 285 Ser Leu Lys Glu Leu Asp Phe Lys Leu Arg Lys Gln Leu Ile Glu Lys

290                 295                 300 His Asn Leu Tyr Gly Asn Met Gly Ser Gly Thr Ile Val Ile Lys Met 305                 310                 315                 320 Lys Asn Gly Gly Lys Tyr Thr Phe Glu Leu His Lys Lys Leu Gln Glu

            325                 330                 335 His Arg Met Ala Asp Val Ile Asp Gly Thr Asn Ile Asp Asn Ile Glu

        340                 345                 350 Val Asn Ile Lys

    355 <210>32 <211>313 <212>PRT <213>Staphylococcus aureus <400>32 Met Glu His Thr Thr Met Lys Ile Thr Thr Ile Ala Lys Thr Ser Leu   1               5                  10                  15 Ala Leu Gly Leu Leu Thr Thr Gly Val Ile Thr Thr Thr Thr Gln Ala

         20                  25                  30 Ala Asn Ala Thr Thr Leu Ser Ser Thr Lys Val Glu Ala Pro Gln Ser

     35                  40                  45 Thr Pro Pro Ser Thr Lys Ile Glu Ala Pro Gln Ser Lys Pro Asn Ala

 50                  55                  60 Thr Thr Pro Pro Ser Thr Lys Val Glu Ala Pro Gln Gln Thr Ala Asn  65                  70                  75                  80 Ala Thr Thr Pro Pro Ser Thr Lys Val Thr Thr Pro Pro Ser Thr Asn

             85                  90                  95 Thr Pro Gln Pro Met Gln Ser Thr Lys Ser Asp Thr Pro Gln Ser Pro

        100                 105                 110 Thr Thr Lys Gln Val Pro Thr Glu Ile Asn Pro Lys Phe Lys Asp Leu

    115                 120                 125 Arg Ala Tyr Tyr Thr Lys Pro Ser Leu Glu Phe Lys Asn Glu Ile Gly

130                 135                 140 Ile Ile Leu Lys Lys Trp Thr Thr Ile Arg Phe Met Asn Val Val Pro 145                 150                 155                 160 Asp Tyr Phe Ile Tyr Lys Ile Ala Leu Val Gly Lys Asp Asp Lys Lys

            165                 170                 175 Tyr Gly Glu Gly Val His Arg Asn Val Asp Val Phe Val Val Leu Glu

        180                 185                 190 Glu Asn Asn Tyr Asn Leu Glu Lys Tyr Ser Val Gly Gly Ile Thr Lys

    195                 200                 205 Ser Asn Ser Lys Lys Val Asp His Lys Ala Gly Val Arg Ile Thr Lys

210                 215                 220 Glu Asp Asn Lys Gly Thr Ile Ser His Asp Val Ser Glu Phe Lys Ile 225                 230                 235                 240 Thr Lys Glu Gln Ile Ser Leu Lys Glu Leu Asp Phe Lys Leu Arg Lys

            245                 250                 255 Gln Leu Ile Glu Lys Asn Asn Leu Tyr Gly Asn Val Gly Ser Gly Lys

        260                 265                 270 Ile Val Ile Lys Met Lys Asn Gly Gly Lys Tyr Thr Phe Glu Leu His

    275                 280                 285 Lys Lys Leu Gln Glu Asn Arg Met Ala Asp Val Ile Asp Gly Thr Asn

290                 295                 300 Ile Asp Asn Ile Glu Val Asn Ile Lys 305                 310