专利汇可以提供表位序列专利检索,专利查询,专利分析的服务。并且本文公开的是多肽,包括表位,聚簇,和 抗原 。还公开包括所述多肽的组合物和它们的使用方法。,下面是表位序列专利的具体信息内容。
1.一种多肽,其包含一种选自由下述组成的组的组分:
(i) 具有如在表1B中公开的序列的多肽表位;
(ii) 包含(i)多肽的表位聚簇;
(iii) 具有与(i)或(ii)实质相似性的多肽;
(iv) 具有与(i)至(iii)中任何一种的功能相似性的多肽;和
(v) 编码(i)至(iv)中任何一种所述多肽的核酸。
2.权利要求1的多肽,其中所述多肽是免疫活性的。
3.权利要求1的多肽,其中所述多肽长度小于约30个氨基酸。
4.权利要求1的多肽,其中所述多肽长度为8-10个氨基酸。
5.权利要求1的多肽,其中所述实质或功能相似性包含增加至少一个 氨基酸。
6.权利要求5的多肽,其中所述至少一个增加的氨基酸是在所述多肽 的N末端。
7.权利要求1的多肽,其中所述实质或功能相似性包含替代至少一个 氨基酸。
8.权利要求1的多肽,其中所述多肽对HLA-A2分子具有亲和力。
9.权利要求8的多肽,其中所述亲和力是通过结合测定来确定的。
10.权利要求8的多肽,其中所述亲和力是通过测定表位识别的限制 性来确定的。
11.权利要求8的多肽,其中所述亲和力是通过预测算法来测定的。
12.权利要求1的多肽,所述多肽对HLA-B7或HLA-B51分子具有亲 和力。
13.权利要求1的多肽,其中所述多肽是一种管家表位。
14.权利要求1的多肽,其中所述多肽对应于肿瘤细胞上展示的一种 表位。
15.权利要求1的多肽,其中所述多肽对应于新脉管系统细胞上展示 的一种表位。
16.权利要求1的多肽,其中所述多肽是一种免疫表位。
17.权利要求1的多肽,其中所述多肽由核酸编码。
18.一种组合物,其包含权利要求1的多肽和一种药用佐剂,载体, 稀释剂或赋形剂。
19.权利要求18的组合物,其中所述佐剂是一种多核苷酸。
20.权利要求19的组合物,其中所述多核苷酸包含一种二核苷酸。
21.权利要求20的组合物,其中所述二核苷酸是CpG。
22.权利要求18的组合物,其中所述佐剂由一种多核苷酸编码。
23.权利要求18的组合物,其中所述佐剂是一种细胞因子。
24.权利要求23的组合物,其中所述细胞因子是GM-CSF。
25.权利要求18的组合物,其另外包含一种专职抗原呈递细胞 (pAPC)。
26.权利要求25的组合物,其中所述pAPC是一种树突细胞。
27.权利要求18的组合物,其另外包含一种第二表位。
28.权利要求27的组合物,其中所述第二表位是一种多肽。
29.权利要求27的组合物,其中所述第二表位是一种核酸。
30.权利要求27的组合物,其中所述第二表位是一种管家表位。
31.权利要求27的组合物,其中所述第二表位是一种免疫表位。
32.一种组合物,其包含权利要求1的核酸和一种药用佐剂,载体, 稀释剂或赋形剂。
33.一种重组构建体,其包含权利要求1的核酸。
34.权利要求33的构建体,其另外包含一种质粒,一种病毒载体,以 一种细菌载体或一种人工染色体。
35.权利要求33的构建体,其另外包含一种序列,所述序列编码选自 由第二表位,IRES,ISS,NIS和遍在蛋白质组成的组的至少一种特征。
36.一种纯化抗体,其与权利要求1的多肽特异性结合。
37.一种纯化抗体,其与包含权利要求1多肽的肽-MHC蛋白质复合 体特异性结合。
38.权利要求36或权利要求37的抗体,其中所述抗体是一种单克隆 抗体。
39.一种多聚体MHC-肽复合体,其包含权利要求1的多肽。
40.一种分离的T细胞,其表达一种对MHC-肽复合体特异性的T细 胞受体,所述复合体包含权利要求1的多肽。
41.权利要求40的T细胞,其是通过体外免疫产生的。
42.权利要求40的T细胞,其是从一种免疫动物分离的。
43.一种T细胞克隆,其包含权利要求40的T细胞。
44.一种T细胞多克隆群体,其包含权利要求40的T细胞。
45.一种药物组合物,其包含权利要求40的T细胞和一种药用佐剂, 载体,稀释剂或赋形剂。
46.一种分离的蛋白质分子,其包含对MHC-肽复合体特异性的T细 胞受体结合域,所述复合体包含权利要求1的表位。
47.权利要求46的蛋白质,其中所述蛋白质是多价体。
48.一种分离的核酸,其编码权利要求46的蛋白质。
49.一种重组构建体,其包含权利要求48的核酸。
50.一种表达重组构建体的宿主细胞,所述构建体包含权利要求1的 核酸,或者所述构建体编码一种包含对MHC-肽复合体特异性的T细胞受 体结合域的蛋白质分子。
51.权利要求50的宿主细胞,其中所述宿主细胞是一种树突细胞,巨 噬细胞,肿瘤细胞或肿瘤衍生的细胞。
52.权利要求50的宿主细胞,其中所述宿主细胞是一种细菌,真菌或 原生动物。
53.一种组合物,其含有权利要求50的宿主细胞和一种药用佐剂,载 体,稀释剂或赋形剂。
54.一种组合物,其包含至少一种组分,所述组分选自由下述组成的 组:权利要求1的表位;权利要求18,32或45的组合物,权利要求33 的构建体;权利要求40的T细胞,一种表达重组构建体的宿主细胞,所 述构建体包含一种编码对MHC-肽复合体特异性的T细胞受体结合域的核 酸,和一种包含它的组合物,和一种表达包含权利要求1的核酸的重组构 建体的宿主细胞和包含它的组合物。
55.一种治疗动物的方法,其包含:对动物给药权利要求54的组合物。
56.权利要求55的方法,其中所述给药步骤包括一种选自由经皮的, 结节内的,结节周围的,口服的,静脉内的,皮内的,肌内的,腹膜内的, 粘膜的,气溶胶吸入和滴注组成的组的递送方式。
57.权利要求55的方法,其另外包含一个测定步骤以确定表示一种靶 细胞或多种靶细胞状态的特性。
58.权利要求57的方法,其包含第一测定步骤和第二测定步骤,其中 所述第一测定步骤在所述给药步骤之前,并且其中所述第二测定步骤接着 所述给药步骤。
59.权利要求58的方法,其另外包含一个将在所述第一测定步骤中测 定的特性与在所述第二测定步骤中测定的特性比较的步骤以获得结果。
60.权利要求59的方法,其中所述结果是选自由免疫应答的迹象,靶 细胞数量的减小,包含靶细胞的肿瘤的质量或尺寸的减小,感染靶细胞的 胞内寄生物数量和浓度的减小组成的组。
61.一种评估免疫原性组合物的免疫原性的方法,其包含:对动物给 药权利要求54的组合物;和基于所述动物特性评估免疫原性。
62.权利要求61的方法,其中所述动物是MHC-转基因的。
63.一种评估免疫原性的方法,其包含:使用权利要求54的组合物体 外刺激T细胞;和基于所述T细胞特性评估免疫原性。
64.权利要求63的方法,其中所述刺激是原发刺激。
65.一种进行被动/过继免疫治疗的方法,其包含:将权利要求40的T 细胞,或一种表达重组构建体的宿主细胞,所述构建体包含一种编码对 MHC-肽复合体特异性的T细胞受体结合域的核酸,或一种表达包含权利 要求1核酸的重组构建体的宿主细胞与一种药用佐剂,载体,稀释剂或赋 形剂结合。
66.一种测定特异性T细胞频率的方法,其包含将T细胞与包含权利 要求1多肽的MHC-肽复合体接触的步骤。
67.权利要求66的方法,其中所述接触步骤包含选自由免疫,再刺激, 检测和计数组成的组的至少一种特征。
68.权利要求66的方法,其另外包含ELISPOT分析,有限稀释分析, 流式细胞计量术,原位杂交,聚合酶链反应或其任何组合。
69.一种评估免疫应答的方法,其包含在免疫步骤之前或之后实行的 权利要求66的方法。
70.一种评估免疫应答的方法,其包含:在使用包含权利要求1多肽 的MHC-肽复合体刺激步骤之前或之后测定频率,细胞因子产量,或T细 胞的溶细胞活性。
71.一种诊断疾病的方法,其包含:将受试者组织与选自由权利要求 40的T细胞,权利要求50的宿主细胞,权利要求36的抗体和权利要求 46的蛋白质组成的组的至少一种组分接触;和基于所述组织或所述组分的 特征诊断疾病。
72.权利要求71的方法,其中所述接触步骤体内发生。
73.权利要求71的方法,其中所述接触步骤体外发生。
74.一种制造疫苗的方法,包含:将选自由权利要求1的多肽;权利 要求18,32,45或53的组合物;权利要求33的构建体;权利要求40的 T细胞,和权利要求50的宿主细胞组成的组的至少一种组分与一种药用 佐剂,载体,稀释剂或赋形剂结合。
75.一种其上已经记录SEQ ID NOS:108-610中任何一个序列的计算 机可读介质,其在一种具有计算含有所述序列的分子的物理,生物化学, 免疫学或分子遗传特性的硬件或软件的机器中。
76.一种治疗动物的方法,其包含将权利要求55的方法与选自由放射 治疗,化学疗法,生物化学疗法和外科手术的组的至少一种治疗方式结合。
77.一种分离的多肽,其包含一种来源于靶相关抗原的表位聚簇,其 具有表68-73中公开的序列,其中所述氨基酸序列由至多约80%的所述抗 原氨基酸序列组成。
78.一种疫苗或免疫治疗产品,其包含权利要求77的多肽。
79.一种分离的多核苷酸,其编码权利要求77的多肽。
80.一种疫苗或免疫治疗产品,其包含权利要求79的多核苷酸。
81.权利要求79或80的多核苷酸,其中所述多核苷酸是DNA。
82.权利要求79或80的多核苷酸,其中所述多核苷酸是RNA。
本发明通常涉及肽,和编码肽的核酸,所述肽是靶相关抗原的有效表 位。更具体地,本发明涉及具有对I类MHC的高亲和力和由靶特异性蛋 白酶体产生的表位。
相关技术的描述
瘤形成与免疫系统
通常称为癌的肿瘤性疾病状态被认为是通常由一个生长不受控制的单 细胞引起。不受控制的生长状态典型地由一个多级过程引起,其中一系列 细胞系统衰竭,导致赘生性细胞的发生。产生的赘生性细胞迅速繁殖它自 身,形成一种或多种肿瘤,最终可导致宿主的死亡。
由于赘生性细胞的先祖共享宿主的遗传物质,赘生性细胞大多不受宿 主免疫系统攻击。在免疫监视期间,该过程中宿主免疫系统监视和定位外 源物质,在宿主免疫监视机器看来赘生性细胞为“自身”细胞。
病毒与免疫系统
与癌细胞相反,病毒感染涉及明显非自身抗原的表达。结果,免疫系 统以最小的临床后遗症成功对付了许多病毒感染。此外,对于导致严重疾 病的那些感染中的许多已经可以开发有效疫苗。已经成功使用多种疫苗方 法来抗击各种疾病。这些方法包括亚单位疫苗,其由通过重组DNA技术 生产的单独蛋白质组成。尽管有了这些进展,用作病毒疫苗的最小表位的 选择和有效给药仍然有问题。
除与表位选择有关的困难之外,存在已经进化逃避宿主免疫系统能力 的病毒的问题。许多病毒,特别是建立持久感染的病毒,如疱疹和痘病毒 家族的成员,产生免疫调制分子,其允许病毒逃避宿主免疫系统。这些免 疫调制分子对抗原呈递的作用可以通过将用于给药的选择表位作为免疫 原性组合物的目标来克服。为了更好理解赘生性细胞和病毒感染细胞与宿 主免疫系统的相互作用,下面接着讨论系统组分。
免疫系统起将对于一种生物内源的分子(“自身”分子)从对于该生物 外源或异质的物质(“非自身”分子)区别开来的作用。基于介导应答的 组分,免疫系统具有两类针对外物的适应性应答:体液应答和细胞介导应 答。体液应答是由抗体介导的,而细胞介导的应答涉及归类为淋巴细胞的 细胞。近来的抗癌和抗病毒策略已集中在调动宿主免疫系统作为一种抗癌 或抗病毒治疗或疗法的方法。
免疫系统在三个阶段中起作用来保护宿主免受外物伤害:识别阶段, 活化阶段和效应阶段。在识别阶段,免疫系统识别并发出信号体内存在外 源抗原或侵入物。外源抗原可以是例如来源于赘生性细胞的细胞表面标记 或病毒蛋白。一旦系统察觉到侵入物,响应于侵入物触发的信号,免疫系 统的抗原特异性细胞增殖并分化。最后阶段是效应阶段,其中免疫系统的 效应细胞应答并中和检测的侵入物。
一系列效应细胞实施对侵入物的免疫应答。一类效应细胞,B细胞产 生靶向宿主遇到的外源抗原的抗体。与补体系统结合,抗体指导携带靶抗 原的细胞或生物的破坏。另一类效应细胞是天然杀伤细胞(NK细胞),一 类淋巴细胞,其具有同时识别和破坏多种病毒感染的细胞以及恶性细胞类 型的能力。不大理解NK细胞识别靶细胞所使用的方法。
另一类效应细胞,T细胞,具有分类为三亚类的成员,每亚类在免疫 应答中发挥不同作用。辅助T细胞分泌细胞因子,其刺激产生有效免疫应 答所必需的其它细胞的增殖,而抑制性T细胞下调免疫应答。第三类T细 胞,细胞毒性T细胞(CTL),能够直接溶解在它表面呈递外源抗原的靶 细胞。
主要组织相容性复合体和T细胞目标识别
T细胞是在对特异性抗原信号的应答中发挥作用的抗原特异性免疫细 胞。B淋巴细胞和它们产生的抗体也是抗原特异性的实体。然而,不同于 B淋巴细胞,T细胞对游离或可溶形式的抗原不应答。为了T细胞对抗原 应答,需要将抗原加工成肽,其然后与主要组织相容性复合体(MHC)中 编码的呈递结构结合。该要求称为“MHC限制性”并且这是T细胞从“非 自身”细胞区分“自身”的机制。如果一种抗原不为可识别的MHC分子 所展示,T细胞将不识别和作用于该抗原信号。与可识别MHC分子结合 的肽的特异性T细胞与这些MHC-肽复合体结合,并进入免疫应答的下一 阶段。
存在两类MHC,I类MHC和II类MHC。T辅助细胞(CD4+)主要 与II类MHC蛋白质相互作用,而溶细胞的T细胞(CD8+)主要与I类 MHC蛋白质相互作用。两类MHC蛋白质都是跨膜蛋白质,它们大部分 结构在细胞外表面。此外,两类MHC蛋白质在它们的外部都具有肽结合 裂缝(binding cleft)。内源或外源蛋白质的小片段被结合在该裂缝中并呈 递于胞外环境中。
称为“专职抗原呈递细胞”(pAPCs)的细胞利用MHC蛋白质将抗原 展示给T细胞,但另外表达各种共同刺激分子,其取决于pAPC的分化/ 激活的具体状态。当与可识别MHC蛋白质结合的肽的特异性T细胞与 pAPCs上的这些MHC-肽复合体结合时,作用于T细胞的特异性共刺激分 子指导T细胞所采取的分化/激活途径。即,共刺激分子影响在未来遭遇 中当它进入免疫应答的下一阶段时T细胞将如何作用于抗原信号。
如上讨论,大多赘生性细胞被免疫系统忽略。大量努力正花在努力控 制宿主免疫系统以帮助对抗宿主中赘生性细胞的存在。一个该研究领域涉 及配制抗癌疫苗。
抗癌疫苗
患者的免疫系统是肿瘤学家抗癌的战斗中可利用的各种武器之一。在 各种努力中已经进行工作以使免疫系统抗击癌症或肿瘤性疾病。不幸地, 到此为止的结果大多是令人失望的。特别感兴趣的一个领域涉及生产和使 用抗癌疫苗。
为了生产疫苗或其它免疫原性组合物,必需将针对其可产生免疫应答 的抗原或表位引入受试者。尽管赘生性细胞是来源于正常细胞并因此在遗 传水平上与正常细胞基本上相同,但已知许多赘生性细胞呈递肿瘤相关抗 原(TuAAs)。理论上,受试者的免疫系统可以利用这些抗原来识别这些 抗原并攻击赘生性细胞。然而,实际上赘生性细胞通常看来似乎为宿主的 免疫系统所忽略。
已经开发许多不同策略试图生产具有抗赘生性细胞活性的疫苗。这些 策略包括使用肿瘤相关抗原作为免疫原。例如,美国专利号5,993,828描 述了一种通过对受试者给药有效剂量的一种组合物来产生针对尿肿瘤相 关抗原(Urinary Tumor Associated Antigen)特定亚基的免疫应答的方法, 所述组合物包含在细胞表面具有尿肿瘤相关抗原的灭活肿瘤细胞和至少 一种选自GM-2,GD-2,胎儿抗原和黑素瘤相关抗原的肿瘤相关抗原。因 此,本专利描述将完整的灭活肿瘤细胞用作抗癌疫苗中的免疫原。
使用抗癌疫苗的另一种策略涉及给药一种含有单独肿瘤抗原的组合 物。在一种方法中,将MAGE-A1抗原性肽用作免疫原(参见Chaux,P.,等, “Identification of Five MAGE-A1 Epitopes Recognized by Cytolytic T Lymphocytes Obtained by In Vitro Stimulation with Dendritic Cells Transduced with MAGE-A1,”J.Immunol.,163(5):2928-2936(1999))。 已经有几个将MAGE-A1肽用于接种的治疗实验,尽管该接种疗法的效力 有限。在Vose,J.M.,“TumorAntigens Recognized by T Lymphocytes,”10th European Cancer Conference,Day2,Sept.14,1999中讨论了这些试验中的 一些的结果。
在另一个用作疫苗的肿瘤相关抗原的实例中,Scheinberg等使用5次 注射I类相关的bcr-abl肽和辅助肽加上佐剂QS-21来治疗12位已经接受 干扰素(IFN)或羟脲的慢性髓细胞性白血病(CML)患者。Scheinberg, D.A.,等,“BCR-ABL Breakpoint Derived Oncogene Fusion Peptide Vaccines Generate Specific Immune Responses in Patients with Chronic Myelogenous Leukemia(CML)[摘要1665],American Society of Clinical Oncology 35th Annual Meeting,亚特兰大(1999)。引发了表示T-辅助细胞活性的增殖和 迟发型超敏反应(DTH)T细胞应答,但在新鲜血样中未观测到溶细胞的 杀伤T细胞活性。
在Cebon等和Scheibenbogen等的近来工作中看到尝试鉴定用作疫苗 的TuAAs的另外实例。Cebon等使用皮内给药的MART-126-35肽和以增大 剂量皮下或静脉内给予的IL-12免疫具有转移性黑素瘤的患者。最初的15 位患者中,注意到1位完全缓解,1位部分缓解,和1位混合应答。对于 T细胞产生的免疫测定包括DTH,其在使用或不使用IL-12的患者中发现。
在有临床益处(clinical benefit)迹象的患者中发现阳性CTL测定,但在 没有肿瘤退化的患者中未发现。Cebon等,“Phase I Studies of Immunization with Melan-A and IL-12 in HLA A2+Positive Patients with Stage III and IV Malignant Melanoma,”[摘要1671],American Society of Clinical Oncology 35th Annual Meeting,亚特兰大1999)。
Scheibenbogen等用4种I类HLA限制性酪氨酸酶肽免疫18位患者, 其中16位患者用转移性黑素瘤免疫和用佐剂免疫2位患者。Scheibenbogen 等“Vaccination with Tyrosinase peptides and GM-CSF in Metastatic Melanoma:a Phase II Trial,”[摘要1680],American Society of Clinical Oncology 35th Annual Meeting,亚特兰大(1999)。在4/15患者中,其中2 位用佐剂免疫和2位有肿瘤退化迹象的患者中观测到增强的CTL活性。 如在Cebon等的试验中,患有进行性疾病(progressive disease)的患者未 显示增强的免疫性。尽管到此为止花了各种努力来产生有效的抗癌疫苗, 仍未开发出该组合物。
抗病毒疫苗
保护免患病毒病的疫苗策略已经取得许多成功。或许这些中最显著的 是对抗疾病天花已取得的进步,天花已经被灭绝。脊髓灰质炎疫苗的成功 具有类似的重要性。
可将病毒疫苗分为三类:活减毒病毒疫苗,如对于天花的牛痘,萨宾 脊髓灰质炎病毒疫苗,和麻疹流行性腮腺炎和风疹;完全杀死或灭活的病 毒疫苗,如索尔克脊髓灰质炎病毒疫苗,甲型肝炎病毒疫苗和典型流感病 毒疫苗;和亚单位疫苗,如乙型肝炎。由于它们缺乏完整的病毒基因组, 亚单位疫苗比基于完整病毒的那些提供更大程度的安全性。
成功的亚单位疫苗的范例是基于病毒包膜蛋白的重组乙型肝炎疫苗。 尽管许多学术者对将超越单个蛋白质的还原论者亚单位概念推至单独表 位感兴趣,但该努力尚未产生许多成果。病毒疫苗研究也已集中在诱导抗 体应答,尽管也发生细胞应答。然而,许多亚单位制剂在产生CTL应答 方面特别差。
发明概述
引发专职抗原呈递细胞(pAPCs)展示靶细胞表位的先前方法已经简 单依赖于使pAPCs表达靶相关抗原(TAAs),或那些被认为具有对MHC I 类分子高亲和力的抗原的表位。然而,这类抗原的蛋白酶体加工导致在 pAPC上呈递的表位与靶细胞上的表位不相对应。
利用有效的细胞免疫应答要求pAPCs呈递相同的由靶细胞呈递的表 位的知识,本发明提供具有对MHC I高亲和力,并且与在周围细胞中活 跃的管家蛋白酶体的加工特异性相对应的表位。这些表位因此与在靶细胞 上呈递的那些相对应。将这类表位用于组合物,例如疫苗和其它免疫原性 组合物(包括药物组合物和免疫治疗性组合物)可以激活细胞免疫应答来 识别正确加工的TAA并可导致去除呈递这类表位的靶细胞。在一些实施 方案中,这里提供的管家表位可与免疫表位结合使用,产生细胞免疫应答, 其在干扰素诱导之前和之后都能够攻击靶细胞。在其它实施方案中将该表 位用于诊断和监测靶相关疾病和用于生产针对这类目的的免疫试剂。
本发明的实施方案涉及分离的(isolated)表位、抗原和/或多肽。分离 的抗原和/或多肽可以包括表位。优选的实施方案包括具有表1A或1B中 公开序列的表位或抗原。其它实施方案可包括一种包含来自表1A或1B 的多肽的表位聚簇。此外,多个实施方案包括一种与已经提及的表位、多 肽,抗原或聚簇实质上类似的多肽。其它优选的实施方案包括一种与上述 的任何一种功能相似的多肽。还有另外的实施方案涉及一种编码来自表1A 或1B和这里提及的所述表位、聚簇、抗原和多肽中任何一种的多肽的核 酸。
为了本发明的其它实施方案的下列总结和讨论的目的,参考“表位”、 “多种表位”或“来自表1A或1B的表位”可以包括,不限于所有前述 形式的表位,其包括具有表中或本文其它处所述序列的表位,包含这种表 位或多个表位的聚簇,与那些表位或聚簇具有实质上或功能相似性的多 肽,等等。
多肽或表位可以是免疫活性的。包含表位的多肽长度可以小于大约30 个氨基酸,更优选地,例如,多肽长度为8-10个氨基酸。物质(substantial) 或功能的相似性可包括例如增加至少一个氨基酸,和至少一个附加的氨基 酸可以是在多肽的N-末端。物质或功能的相似性可以包括替代至少一个氨 基酸。
表位,聚簇或包含它的多肽可具有对HLA-A2分子的亲和力。该亲和 力可以通过结合试验,表位识别限制性试验,预测算法等测定。表位,聚 簇或包含它的多肽可具有对HLA-B7,HLA-B51分子等的亲和力。
在优选的实施方案中,多肽可以是一种管家表位。该表位或多肽可对 应于在肿瘤细胞上展示的表位,对应于在新脉管系统(neovasculature)细 胞上展示的表位等。该表位或多肽可以是免疫表位。该表位,聚簇和/或多 肽可以是核酸。该表位,聚簇和/或多肽可以由核酸编码。
其它实施方案涉及组合物,包括药物组合物或免疫原性组合物,其包 含包括来源于表1A或1B的表位,聚簇,或包含它的多肽的多种多肽, 和药用佐剂,载体,稀释剂,赋形剂等。所述佐剂可以是多核苷酸。该多 核苷酸可包括二核苷酸,其例如可以是CpG。所述佐剂可以为一种多核苷 酸所编码。该佐剂可以是一种细胞因子,所述细胞因子例如可以是 GM-CSF。
药物组合物可另外包括一种专职抗原呈递细胞(pAPC)。pAPC例如 可以是树突细胞。药物组合物可另外包括第二表位。第二表位可以是多肽, 核酸,管家表位,免疫表位等。
还有另外的实施方案涉及组合物,包括药物组合物和免疫原性组合物, 其包括这里讨论的任何核酸,包括编码包含来自表1A或1B的表位或抗 原的多肽的那些核酸。这类组合物可包括药用佐剂,载体,稀释剂,赋形 剂等。
其它实施方案涉及包括如这里所描述的这种核酸的重组构建体,其包 括编码包含来自表1A或1B的表位或抗原的多肽的那些核酸。构建体可 另外包括质粒,病毒载体,人工染色体等。构建体可另外包括一种序列, 其编码至少一种特征(feature),例如,第二表位,IRES,ISS,NIS,遍 在蛋白质等。
另外的实施方案涉及纯化的抗体,其与至少一种表1A或1B中的表位 特异性结合。其它实施方案涉及与一种肽-MHC蛋白质复合体特异性结合 的纯化抗体,所述肽-MHC蛋白质复合体包含一种表1A或1B中公开的表 位或任何其它适当的表位。来源于任何实施方案的抗体可以是单克隆抗体 或多克隆抗体。
还有其它实施方案涉及多聚体MHC-肽复合体,其包括一种表位,如, 例如一种表1A或1B中公开的表位。同样,考虑对复合体特异性的抗体。
多种实施方案涉及表达对MHC-肽复合体特异性的T细胞受体的分离 的T细胞。所述复合体可包括一种表位,如,例如表1A或1B中公开的 表位。T细胞可以通过体外免疫生产并且可以从免疫动物中分离。多种实 施方案涉及T细胞克隆,包括克隆的T细胞,如上面讨论的那些。多种实 施方案还涉及T细胞的多克隆群体。该群体可包括例如如上所述的T细胞。
还有另外的实施方案涉及组合物,包括药物组合物和免疫原性组合物, 其包括例如如上所述的那些的T细胞和药用佐剂,载体,稀释剂,赋形剂 等。
本发明的多种实施方案涉及分离的蛋白质分子,其包含对MHC-肽复 合体特异性的T细胞受体的结合域。复合体可包括表1A或1B公开的表 位。蛋白质可以是多价体。其它实施方案涉及编码该蛋白质的分离的核酸。 还有另外的实施方案涉及包括该核酸的重组构建体。
本发明的其它实施方案涉及表达如在上和本文其它处所述的重组构建 体的宿主细胞,所述宿主细胞可以包括编码表位、聚簇或包含所述表位或 所述聚簇的多肽的构建体。表位或表位聚簇可以是例如那些公开于表1A 或1B中的一种或多种,和如另外所定义。宿主细胞可以是树突细胞,巨 噬细胞,肿瘤细胞,肿瘤衍生的细胞,细菌,真菌,原生动物等。多种实 施方案还涉及组合物,包括药物组合物和免疫原性组合物,其包括一种宿 主细胞,如在这里讨论的那些,和一种药用佐剂,载体,稀释剂,赋形剂 等。
还有其它实施方案涉及组合物,其包括免疫原性组合物,如例如疫苗 或免疫治疗组合物。该组合物包括至少一种组分,例如表1A或1B中公 开或在这里另外描述的表位;包括该表位的聚簇,包括该表位的抗原或多 肽;如上面和在这里描述的组合物;如上面和在这里描述的构建体,T细 胞,包含编码对MHC-肽复合物特异的T细胞受体结合结构域的核酸的构 建体和包括其的组合物,或如上面和在这里描述的宿主细胞,和包含其的 组合物。
另外的实施方案涉及治疗动物的方法。方法可包括对动物给药一种组 合物,包括药物组合物和免疫原性组合物,例如一种疫苗或免疫治疗组合 物,其包括如上面和在这里公开的那些。给药步骤可包括一种送递方式, 如,例如,经皮的,结节内的(intranodal),结节周围的(perinodal),口 服的,静脉内的,皮内的,肌内的,腹膜内的,粘膜的,气溶胶吸入,滴 注等。该方法可另外包括一测定步骤以测定一种靶细胞或多种靶细胞状态 的特征表现。方法可包括第一测定步骤和第二测定步骤,其中第一测定步 骤在给药步骤之前,并且其中第二测定步骤在给药步骤之后。方法可另外 包括一个比较第一测定步骤中测定的特性与第二测定步骤中测定的特性 以获得一个结果的步骤。该结果可以是例如免疫应答的迹象,靶细胞数量 的减小,包含靶细胞的肿瘤的质量或尺寸的减小,感染靶细胞的胞内寄生 物数量和浓度的减小等。
多种实施方案涉及评估组合物的免疫原性,所述组合物包括疫苗或免 疫治疗组合物。该方法可包括对动物给药一种疫苗或免疫治疗,如上面和 在这里别处描述的那些,和基于动物一种特性评估免疫原性。动物可以是 MHC-转基因的动物。
其它实施方案涉及评估免疫原性的方法,其包括用疫苗或免疫治疗组 合物,如上面和在这里别处描述的那些,体外刺激T细胞,和基于T细胞 的一种特性评估免疫原性。刺激可以是原发刺激(primary stimulation)。
还有另外的实施方案涉及进行被动/过继免疫治疗的方法。该方法可以 包括将T细胞或宿主细胞,如上面和在这里别处描述的那些,与药用佐剂, 载体,稀释剂,赋形剂等结合。
其它实施方案涉及测定特异性T细胞频率的方法,并可以包括将T细 胞与MHC-肽复合体或包含含有这样一种表位的聚簇或抗原的复合体接触 的步骤,所述MHC-肽复合体包含表1A或1B中公开的表位。接触步骤可 包含至少一种特征,例如,免疫,再刺激(restimulation),检测,计数等。 该方法可另外包括ELISPOT分析,有限稀释分析,流式细胞计量术,原 位杂交,聚合酶链反应,它们的任何组合等。
多种实施方案涉及评估免疫应答的方法。该方法可包括在免疫步骤之 前和之后实行的测定特异性T细胞频率的上述方法。
其它实施方案涉及评估免疫应答的方法。该方法可包括在用MHC-肽 复合体刺激之前和之后测定T细胞的频率,细胞因子产生量或溶细胞活 性,所述MHC-肽复合体包含一种表位,例如来自表1A或1B的表位,包 含该表位的聚簇或多肽。
另外的实施方案涉及诊断疾病的方法。方法包括将受试者组织与至少 一种组分接触,所述组分包括,例如T细胞,宿主细胞,抗体,蛋白质, 其包括上面和在这里别处描述的那些;和基于组织或组分的一种特征诊断 疾病。接触步骤可以例如在体内或体外发生。
还有其它实施方案涉及制备组合物包括例如疫苗的方法。方法可以包 括将至少一种组分与药用佐剂,载体,稀释剂,赋形剂等结合,例如组分 可以是表位,组合物,构建体,T细胞,宿主细胞;其包括上面和在这里 别处描述的那些中的任何一种,。
多种实施方案涉及其上已经记录SEQ ID NOS:108-610中任何一种序 列的计算机可读介质,其是在一种具有计算含有所述序列的分子的物理, 生物化学,免疫学,分子遗传特性的硬件或软件等的机器中。
还有其它实施方案涉及治疗动物的方法。方法可以包括结合治疗动物 的方法,其包括对动物给药一种疫苗或免疫治疗组合物,例如上面和在这 里别处所描述的,与至少一种治疗方式结合,所述治疗方式包括例如放射 治疗,化学疗法,生物化学疗法(biochemotherapy),外科手术等。
另外的实施方案涉及包括一种表位聚簇的分离的多肽。在优选的实施 方案中,该聚簇可以是来自含有如表68-73任何一个中所公开的序列的靶 相关抗原,其中氨基酸序列包括至多约80%的抗原氨基酸序列。
其它实施方案涉及免疫原性组合物,包括疫苗或免疫治疗产品,其包 括如上面和在这里别处描述的分离的肽。还有其它实施方案涉及一种分离 的的多核苷酸,其编码如上面和在这里别处描述的多肽。其它实施方案涉 及包括这些多核苷酸的疫苗或免疫治疗产品。该多核苷酸可以是DNA, RNA等。
还有其它的实施方案涉及包含一种递送装置的试剂盒和任何在上面和 在这里别处提及的实施方案。所述递送装置可以是导管,注射器,内泵或 外泵,贮器,吸入器,微量注射器,膜片(patch)和适合任何递送途径的 任何其它类似装置。如上所述,除了递送装置之外试剂盒还包括在这里公 开的实施方案中的任一种。例如,无限制地,试剂盒可以包括分离的表位, 多肽,聚簇,核酸,抗原,包括前述任何一种的药用组合物,抗体,T细 胞,T细胞受体,表位-MHC复合体,疫苗,免疫治疗剂等。试剂盒还可 包括物品如详细的使用说明书和其它任何类似的物品。
附图简述
图1A-1C是NY-ESO-1与几个相似蛋白质序列的序列对比。
图2图示用于递送核酸编码的表位的质粒疫苗主链。
图3A和3B是显示酪氨酸酶207-215和酪氨酸酶208-216HLA-A2结合试验 结果的FACS曲线。
图3C显示通过体外免疫诱导的人CTL针对酪氨酸酶表位的溶细胞活 性。
图4是由蛋白酶体切割SSX-231-68产生片段T=120min时刻的质谱。
图5显示HLA-A2:SSX-241-49与对照的结合曲线。
图6显示来源于SSX-241-49免疫的HLA-A2转基因小鼠的CTL对 SSX-241-49-脉冲目标的特异性溶解。
图7A,B和C显示T=60min时刻PSMA163-192蛋白酶体消化的等分部 分N-末端池测序(pool sequencing)的结果。
图8显示HLA-A2:PSMA168-177和HLA-A2:PSMA288-297与对照的结合曲 线。
图9显示T=60min时刻PSMA281-310蛋白酶体消化的等分部分N-末端 池测序的结果。
图10显示HLA-A2:PSMA461-469,HLA-A2:PSMA460-469和 HLA-A2:PSMA663-671与对照的结合曲线。
图11显示检测PSMA463-471-反应性HLA-A1+CD8+T细胞的基于 γ-IFN的ELISPOT试验结果。
图12显示用抗-HLA-A1mAb封闭在图10中使用的T细胞的活性, 其显示HLA-A1-限制性识别。
图13显示HLA-A2:PSMA663-671与对照的结合曲线。
图14显示HLA-A2:PSMA662-671与对照的结合曲线。
图15.比较在用不同剂量DNA通过不同注射途径免疫后的抗-肽CTL 应答。
图16.移植的gp33表达肿瘤在通过淋巴结内注射表达gp33表位的或 对照,质粒而免疫的小鼠中的生长。
图17.分别在淋巴结内和肌内注射后的不同时间通过实时PCR检测的 在注射或引流(draining)淋巴节中质粒DNA的量。
图18-70是描述来自在指示的底物序列上的消化物的质谱峰图谱的 蛋白酶体消化图谱。
优选实施方案的详述
定义
除非另外从使用这里的术语的上下文中清楚得知,为了本描述的目的 下面列出的术语应该通常具有指明的含义。
专职抗原呈递细胞(pAPC)-具有T细胞共刺激分子并能够诱导T 细胞应答的细胞。完全表征的pAPCs包括树突细胞,B细胞和巨噬细胞。
周围细胞——不是pAPC的细胞。
管家蛋白酶体——通常在周围细胞中活跃的蛋白酶体,通常在pAPCs 中不存在或没有强活性。
免疫蛋白酶体——通常在pAPCs中活跃的蛋白酶体;免疫蛋白酶体在 感染组织的一些周围细胞中也是活跃的。
表位——能够刺激免疫应答的分子或物质。在优选的实施方案中,按 照本定义的表位包括但不一定限于一种多肽和一种编码多肽的核酸,其中 所述多肽能够刺激免疫应答。在其它优选的实施方案中,按照本定义的表 位包括但不一定限于存在细胞表面的肽,所述肽非共价键地与I类MHC 的结合裂缝结合,这样它们可以与T细胞受体(TCR)相互作用。由I类 MHC提呈的表位可以是未成熟或成熟的形式。“成熟”是指区别于任何前 体(“未成熟的”)MHC表位,其可以包括或基本上由管家表位组成,还 包括通过加工去除的初级翻译产物中的其它序列,所述加工包括,但不限 于单独或任何联合地蛋白酶体消化,N-末端修剪(trimming)或外源酶活 性的作用。因此,成熟表位可以分别以被嵌入稍微更长多肽中的形式提供, 其免疫效能归因于,至少部分归因于嵌入的表位;或为其最终形式,其在 将被TCR识别的MHC结合裂缝中结合。
MHC表位——对哺乳动物I类或II类主要组织相容性复合体(MHC) 分子具有已知或预测结合亲和力的多肽。
管家表位——在一个优选的实施方案中,将管家表位定义为一种多肽 片段,其是一种MHC表位,并且展示在其中管家蛋白酶体活性突出的细 胞上。在另一个优选实施方案中,将管家表位定义为一种含有按照前述定 义的管家表位的多肽,其侧邻一个至几个附加的氨基酸。在另一个优选实 施方案中,将管家表位定义为一种编码按照前述定义的管家表位的核酸。
免疫表位——在一个优选实施方案中,将免疫表位定义为一种多肽片 段,其是一种MHC表位,并且展示在其中免疫蛋白酶体活性突出的细胞 上。在另一个优选实施方案中,将免疫表位定义为一种含有按照前述定义 的免疫表位的多肽,其侧邻一个至几个附加的氨基酸。在另一个优选实施 方案中,将免疫表位定义为一种包括一个表位聚簇序列,含有至少两个对 I类MHC具有已知或预测亲和力的多肽序列的多肽。在还有的另一个优 选实施方案中,将免疫表位定义为一种编码按照上述定义中任何一种的免 疫表位的核酸。
靶细胞——被疫苗和本发明方法所靶向的细胞。按照本定义的靶细胞 的实例包括但不一定限于:赘生性细胞和含有胞内寄生物的细胞,所述寄 生物例如病毒,细菌或原生动物。
靶相关抗原(TAA)-在靶细胞中存在的蛋白质或多肽。
肿瘤相关抗原(TuAA)-TAA,其中靶细胞是赘生性细胞。
HLA表位——对人I类或II类HLA复合体分子具有已知或预测结合 亲和力的多肽。
抗体——多克隆或单克隆天然免疫球蛋白(Ig),或任何完全或部分由 Ig结合域组成的分子,不管生物化学衍生的或通过使用重组DNA得到。 实施例包括,尤其是F(ab),单链Fv和Ig可变区-噬菌体外被蛋白融合。
编码——可扩充的(open-ended)术语以致编码特定氨基酸序列的核 酸可由确定那个(多)肽的密码子组成,但还可包含附加的序列,其是可 译的或用于控制转录,翻译或复制,或便于操作一些宿主的核酸构建体。
物质相似性——该术语用来指如通过检查序列判断以间接的方式不同 于参考序列的序列。尽管在简并位置的差异或在长度或任何非编码区组成 上的适度差异,编码相同氨基酸序列的核酸序列基本上相似。只是通过保 守置换或小的长度变化而相异的氨基酸序列基本上是相似的。另外,包含 在N-末端侧翼残基数量不同的管家表位,或在任一末端侧翼残基数量不同 的免疫表位和表位聚簇的氨基酸序列基本上是相似的。编码实质上相似的 氨基酸序列的核酸它们自己也实质上相似。
功能相似性——该术语用于指如通过检测生物或生物化学特性判断以 无意义的方式不同于参考序列的序列,尽管序列可能不是基本上相似。例 如,可将两种核酸用作针对相同序列但编码不同氨基酸序列的杂交探针。 即使它们通过非保守氨基酸置换而相异(因此不符合物质相似性的定义), 诱导交叉反应性CTL应答的两种肽在功能上相似。识别相同表位的成对 抗体或TCRs可以是在功能上彼此相似,尽管存在任何结构差异。在检验 免疫原性的功能相似性中,通常用“改变的”抗原免疫个体并检验引发应 答(Ab,CTL,细胞因子产生等)识别靶抗原的能力。因此,可以设计在 某些方面不同而保持相同功能的两种序列。该设计的序列变体在本发明的 实施方案中。
疫苗——该术语用于指那些免疫原性组合物,其能激发预防、治愈或 改善疾病的预防性和/或治疗性应答。
免疫原性组合物——该术语用于指能诱导免疫应答、反应、效果和/ 或事件的组合物。在一些实施方案中,该应答、反应、效果和/或事件可以 在例如体外或体内诱导。在这些实施方案中包括的是例如在细胞介导的免 疫中涉及的细胞的诱导、活化或扩展。这类细胞的一个实例是细胞毒性T 淋巴细胞(CTLs)。疫苗是一种类型的免疫原性组合物。这种组合物的其 它实例是体外诱导、活化或扩展CTLs的组合物。其它实例包括药物组合 物等。
表1A.包括实施例1-7,13,14中的表位的SEQ ID NOS.* SEQ ID NO 同一性 序列 1 Tyr 207-216 FLPWHRLFLL 2 酪氨酸酶蛋白 登记号**:P14679 登记号:NP_003138 登记号:NP_004467 登记号:NM_000372 登记号:NM_003147 登记号:NM_004476 3 SSX-2蛋白 4 PSMA蛋白 5 酪氨酸酶cDNA 6 SSX-2 cDNA 7 PSMA cDNA 8 Tyr 207-215 FLPWHRLFL 9 Tyr 208-216 LPWHRLFLL 10 SSX-2 31-68 YFSKEEWEKMKASEKIFYVYMKRKYEAMTKLGF KATLP 11 SSX-2 32-40 FSKEEWEKM 12 SSX-2 39-47 KMKASEKIF 13 SSX-2 40-48 MKASEKIFY 14 SSX-2 39-48 KMKASEKIFY 15 SSX-2 41-49 KASEKIFYV 16 SSX-2 40-49 MKASEKIFYV 17 SSX-2 41-50 KASEKIFYVY 18 SSX-2 42-49 ASEKIFYVY 19 SSX-2 53-61 RKYEAMTKL 20 SSX-2 52-61 KRKYEAMTKL 21 SSX-2 54-63 KYEAMTKLGF 22 SSX-2 55-63 YEAMTKLGF 23 SSX-2 56-63 EAMTKLGF SEQ ID NO 同一性 序列 24 HBV18-27 FLPSDYFPSV 25 HLA-B44结合剂 AEMGKYSFY 26 SSX-1 41-49 KYSEKISYV 27 SSX-3 41-49 KVSEKIVYV 28 SSX-4 41-49 KSSEKIVYV 29 SSX-5 41-49 KASEKIIYV 30 PSMA 163-192 AFSPQGMPEGDLVYVNYARTEDFFKLERDM 31 PSMA 168-190 GMPEGDLVYVNYARTEDFFKLER 32 PSMA 169-177 MPEGDLVYV 33 PSMA 168-177 GMPEGDLVYV 34 PSMA 168-176 GMPEGDLVY 35 PSMA 167-176 QGMPEGDLVY 36 PSMA 169-176 MPEGDLVY 37 PSMA 171-179 EGDLVYVNY 38 PSMA 170-179 PEGDLVYVNY 39 PSMA 174-183 LVYVNYARTE 40 PSMA 177-185 VNYARTEDF 41 PSMA 176-185 YVNYARTEDF 42 PSMA 178-186 NYARTEDFF 43 PSMA 179-186 YARTEDFF 44 PSMA 181-189 RTEDFFKLE 45 PSMA 281-310 RGIAFAVGLPSIPVHPIGYYDAQKLLEKMG 46 PSMA 283-307 LAEAVGLPSIPVHPIGYYDAQKLLE 47 PSMA 289-297 LPSIPVHPI 48 PSMA 288-297 GLPSIPVHPI 49 PSMA 297-305 IGYYDAQKL 50 PSMA 296-305 PIGYYDAQKL 51 PSMA 291-299 SIPVHPIGY 52 PSMA 290-299 PSIPVHPIGY 53 PSMA 292-299 IPVHPIGY 54 PSMA 299-307 YYDAQKLLE 55 PSMA 454-481 SSIEGNYTLRVDCTPLMYSLVHLTKEL 56 PSMA 456-464 IEGNYTLRV 57 PSMA 455-464 SIEGNYTLRV 58 PSMA 457-464 EGNYTLRV 59 PSMA 461-469 TLRVDCTPL 60 PSMA 460-469 YTLRVDCTPL 61 PSMA 462-470 LRVDCTPLM 62 PSMA 463-471 RVDCTPLMY 63 PSMA 462-471 LRVDCTPLMY 64 PSMA 653-687 FDKSNPIVLRMMNDQLMFLERAFIDPLGLPDRPFY 65 PSMA 660-681 VLRMMNDQLMFLERAFIDPLGL 66 PSMA 663-671 MMNDQLMFL 67 PSMA 662-671 RMMNDQLMFL 68 PSMA 662-670 RMMNDQLMF 69 Tyr 1-17 MLLAVLYCLLWSFQTSA 70 GP100蛋白2 登记号:P40967 71 MAGE-1蛋白 登记号:P43355 72 MAGE-2蛋白 登记号:P43356 SEQ ID NO 同一性 序列 73 MAGE-3蛋白 登记号:P43357 74 NY-ESO-1蛋白 登记号:P78358 75 LAGE-1a蛋白 登记号:CAA11116 76 LAGE-1b蛋白 登记号:CAA11117 77 PRAME蛋白 登记号:NP 006106 78 PSA蛋白 登记号:P07288 79 PSCA蛋白 登记号:O43653 80 GP100 cds 登记号:U20093 81 MAGE-1 cds 登记号:M77481 82 MAGE-2 cds 登记号:L18920 83 MAGE-3 cds 登记号:U03735 84 NY-ESO-1 cDNA 登记号:U87459 85 PRAME cDNA 登记号:NM_006115 86 PSA cDNA 登记号:NM_001648 87 PSCA cDNA 登记号:AF043498 88 CEA蛋白 登记号:P06731 89 CEA cDNA 登记号:NM_004363 90 Her2/Neu蛋白 登记号:P04626 91 Her2/Neu cDNA 登记号:M11730 92 SCP-1蛋白 登记号:Q15431 93 SCP-1 cDNA 登记号:X95654 94 SSX-4蛋白 登记号:O60224 95 SSX-4 cDNA 登记号:NM 005636 96 GAGE-1蛋白 登记号:Q13065 97 GAGE-1 cDNA 登记号:U19142 98 Suvivin蛋白 登记号:O15392 99 Survivin cDNA 登记号:NM_001168 100 Melan-A蛋白 登记号:Q16655 101 Melan-A cDNA 登记号:U06452 102 BAGE蛋白 登记号:Q13072 103 BAGE cDNA 登记号:U19180 104 PSA 59-67 WVLTAAHCI 105 腺激肽释放酶1 登记号:P06870 106 弹性蛋白酶2A 登记号:P08217 107 胰腺弹性蛋白酶IIB 登记号:NP_056933
表1B.包括实施例15-67中的表位的SEQ ID NOS.* SEQ ID NO 同一性 序列 108 Tyr 171-179 NIYDLFVWM 109 Tyr 173-182 YDLFVWMHYY 110 Tyr 174-182 DLFVWMHYY 111 Tyr 186-194 DALLGGSEI 112 Tyr 191-200 GSEIWRDIDF 113 Tyr 192-200 SEIWRDIDF 114 Tyr 193-201 EIWRDIDFA SEQ ID NO 同一性 序列 115 Tyr 407-416 LQEVYPEANA 116 Tyr 409-418 EVYPEANAPI 117 Tyr 410-418 VYPEANAPI 118 Tyr 411-418 YPEANAPI 119 Tyr 411-420 YPEANAPIGH 120 Tyr 416-425 APIGHNRESY 121 Tyr 417-425 PIGHNRESY 122 Tyr 417-426 PIGHNRESYM 123 Tyr 416-425 APIGHNRESY 124 Tyr 417-425 PIGHNRESY 125 Tyr 423-430 ESYMVPFI 126 Tyr 423-432 ESYMVPFIPL 127 Tyr 424-432 SYMVPFIPL 128 Tyr 424-433 SYMVPFIPL 129 Tyr 425-433 YMVPFIPLY 130 Tyr 426-434 MVPFIPLYR 131 Tyr 426-435 MVPFIPLYRN 132 Tyr 427-434 VPFIPLYR 133 Tyr 430-437 IPLYRNGD 134 Tyr 430-439 IPLYRNGDFF 135 Tyr 431-439 PLYRNGDFF 136 Tyr 431-440 PLYRNGDFFI 137 Tyr 434-443 RNGDFFISSK 138 Tyr 435-443 NGDFFISSK 139 Tyr 463-471 YIKSYLEQA 140 Tyr 466-474 SYLEQASRI 141 Tyr 469-478 EQASRIWSWL 142 Tyr 470-478 QASRIWSWL 143 Tyr 471-478 ASRIWSWL 144 Tyr 471-479 ASRIWSWLL 145 Tyr 473-481 RIWSWLLGA 146 CEA 92-100 GPAYSGREI 147 CEA 92-101 GPAYSGREII 148 CEA 93-100 PAYSGREI 149 CEA 93-101 PAYSGREII 150 CEA 93-102 PAYSGREIIY 151 CEA 94-102 AYSGREIIY 152 CEA 97-105 GREIIYPNA 153 CEA 98-107 REIIYPNASL 154 CEA 99-107 EIIYPNASL 155 CEA 99-108 EIIYPNASLL 156 CEA 100-107 IIYPNASL 157 CEA 100-108 IIYPNASLL 158 CEA 100-109 IIYPNASLLI 159 CEA 102-109 YPNASLLI 160 CEA 107-116 LLIQNIIQND 161 CEA 132-141 EEATGQFRVY 162 CEA 133-141 EATGQFRVY 163 CEA 141-149 YPELPKPSI SEQ ID NO 同一性 序列 164 CEA 142-149 PELPKPSI 165 CEA 225-233 RSDSVILNV 166 CEA 225-234 RSDSVILNVL 167 CEA 226-234 SDSVILNVL 168 CEA 226-235 SDSVILNVLY 169 CEA 227-235 DSVILNVLY 170 CEA 233-242 VLYGPDAPTI 171 CEA 234-242 LYGPDAPTI 172 CEA 235-242 YGPDAPTI 173 CEA 236-245 GPDAPTISPL 174 CEA 237-245 PDAPTISPL 175 CEA 238-245 DAPTISPL 176 CEA 239-247 APTISPLNT 177 CEA 240-249 PTISPLNTSY 178 CEA 241-249 TISPLNTSY 179 CEA 240-249 PTISPLNTSY 180 CEA 241-249 TISPLNTSY 181 CEA 246-255 NTSYRSGENL 182 CEA 247-255 TSYRSGENL 183 CEA 248-255 SYRSGENL 184 CEA 248-257 SYRSGENLNL 185 CEA 249-257 YRSGENLNL 186 CEA 251-259 SGENLNLSC 187 CEA 253-262 ENLNLSCHAA 188 CEA 254-262 NLNLSCHAA 189 CEA 260-269 HAASNPPAQY 190 CEA 261-269 AASNPPAQY 191 CEA 264-273 NPPAQYSWFV 192 CEA 265-273 PPAQYSWFV 193 CEA 266-273 PAQYSWFV 194 CEA 272-280 FVNGTFQQS 195 CEA 310-319 RTTVTTITVY 196 CEA 311-319 TTVTTITVY 197 CEA 319-327 YAEPPKPFI 198 CEA 319-328 YAEPPKPFIT 199 CEA 320-327 AEPPKPFI 200 CEA 321-328 EPPKPFIT 201 CEA 321-329 EPPKPFITS 202 CEA 322-329 PPKPFITS 203 CEA 382-391 SVTRNDVGPY 204 CEA 383-391 VTRNDVGPY 205 CEA 389-397 GPYECGIQN 206 CEA 391-399 YECGIQNEL 207 CEA 394-402 GIQNELSVD 208 CEA 403-411 HSDPVILNV 209 CEA 403-412 HSDPVILNVL 210 CEA 404-412 SDPVILNVL 211 CEA 404-413 SDPVILNVLY 212 CEA 405-412 DPVILNVL SEQ ID NO 同一性 序列 213 CEA 405-413 DPVILNVLY 214 CEA 408-417 ILNVLYGPDD 215 CEA 411-420 VLYGPDDPTI 216 CEA 412-420 LYGPDDPTI 217 CEA 413-420 YGPDDPTI 218 CEA 417-425 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VAQTGILWLLMNNCFLNL 607 BAGE 7-17 FLALSAQLLQA 608 BAGE 18-27 RLMKEESPVV 609 BAGE 2-27 AARAVFLALSAQLLQARLMKEESPVV 610 BAGE 30-39 RLEPEDGTAL
*SEQ ID NOS.108-602的任何一个可以用作本发明各种实施方案中任 一种中的表位。SEQ ID NOS.603-610的任一个可以用作含有表位或表位 聚簇的序列,如本发明各实施方案中所述。
**这里和从头到尾使用的所有登记号可以通过NCBI数据库访问,例 如通过万维网上的Entrez搜索和检索系统。
注意下列讨论阐明发明人对本发明操作的理解。然而,不意图用本讨 论将本专利限制于在后附权利要求中未阐明的任何具体操作理论。
在进行表位疫苗开发中,其他人已经产生基于MHC结合基序的预测 表位列表。这类肽可以是免疫原性的,但可能不对应任何天然产生的抗原 片段。因此,整个抗原将不引发类似的应答或使靶细胞对通过CTL的细 胞溶解敏感。因此该列表不区分可以用作疫苗的那些序列和不可以用作疫 苗的那些序列。测定这些预测表位中的哪些实际上是天然产生的努力已经 经常依赖于筛选它们与肿瘤浸润淋巴细胞(TIL)的反应性。然而,尽管 肿瘤(和慢性感染细胞)将通常呈递管家表位,但TIL强烈偏向于识别免 疫表位。因此,除非表位是由管家和免疫蛋白酶体两者生产,靶细胞将通 常不为用TIL-鉴定的表位诱导的CTL所识别。相反,本发明的表位是通 过特定蛋白酶体的作用产生,表明可以天然生产它们,并赋予它们适当的 用途。在PCT出版物WO 01/82963A2中更充分地阐明了管家和免疫表位 之间的差别对于疫苗设计的重要意义。考虑将在所述PCT出版物中公开的 教导和实施方案作为与本发明有关和关于本发明有用的支持原理和实施 方案。
本发明的表位包括或编码TAAs的多肽片段,其是通过管家或免疫蛋 白酶体进行蛋白酶体切割的前体或产物,并含有或包括对至少一个MHC I 等位基因具有已知或预测亲和力的序列。在一些实施方案中,所述表位包 括或编码长度约为6-25个氨基酸的多肽,其优选长度约为7-20个氨基酸, 更优选长度约为8-15个氨基酸,还更优选长度约为9或10个氨基酸。然 而,应当理解只要N-末端修剪可以产生MHC表位或它们不含有导致多肽 被引导远离蛋白酶体或被蛋白酶体破坏的序列,所述多肽可以更大。对于 免疫表位,如果更大的肽不含有这类序列,它们可以在pAPC中为免疫蛋 白酶体所加工。如果通过免疫蛋白酶体作用序列适合于促进表位C-末端的 释放,也可将管家表位内嵌于更长的序列中。上述讨论已经假定更长表位 的加工通过pAPC免疫蛋白酶体的作用进行。然而,加工还可以通过设计 一些其它机制来完成,如提供外源蛋白酶活性和适应的序列结果蛋白酶的 作用释放MHC表位。可以对这些表位序列进行计算机分析以计算物理, 生物化学,免疫学或分子遗传特性,如质量,等电点,预测电泳迁移率, 预测与其它MHC分子的结合,核酸探针的解链温度,反向翻译,与其它 序列的相似性或同源性等。
在构建编码本发明多肽表位的多核苷酸中,可以使用相关TAA的基因 序列,或者多核苷酸可以由任何对应的密码子组装。对于10个氨基酸的 表位,这可以组成大约106种不同序列,其取决于具体的氨基酸组成。尽 管大,这是一种相异(distinct)的和容易定义的集合,其表示>1018该长 度可能的多核苷酸中的一个很小部分,因此在一些实施方案中,在这里公 开的具体序列的等价物包括在列表序列上的这类相异的和容易定义的变 异。在选择这些序列中的具体一个用于疫苗过程中,如对于本领域技术人 员将是明显的,可以利用条件如密码子使用,自身互补性,限制位点,化 学稳定性等。
本发明意图生产肽表位。具体地,这些表位来源于AA序列,并对至 少一个MHC I等位基因具有已知或预测的亲和力。这类表位典型地与在 靶细胞或pAPCs上产生的那些相同。
包含活性表位的组合物
本发明的实施方案提供多肽组合物,其包括疫苗,治疗法,诊断学, 药理学和药物组合物。各种组合物包括新鉴定的TAAs的表位以及这些表 位的变体。本发明的其它实施方案提供编码本发明多肽表位的多核苷酸。 本发明另外提供用于表达适于纯化的多肽表位的载体。另外,本发明提供 用作抗肿瘤疫苗的在APC中表达多肽表位的载体。可以使用来源于表1 的任何表位或抗原,或编码它的核酸。其它实施方案涉及生产和使用各种 组合物的方法。
可以描述I类MHC-结合表位的总体结构,其在Madden,D.R.Annu. Rev.Immunol.13:587-622,1995中已经被更全面地综述。许多结合能产生 于MHC分子中的保守残基与肽的N-和C-末端之间的主链接触。产生另外 的主链接触但在MHC等位基因中不同。序列特异性是由所谓的锚定残基 的侧链与又在MHC等位基因中变化的口袋接触所赋予的。可以将锚定残 基分为主要的(primary)和次要的(secondary)。主要锚定位点显示强烈 优选相对严格定义的氨基酸残基组。次要位点显示较弱和/或较少严格定义 的优选残基,所述严格定义的优选可经常根据较少优选而不是较多优选来 更好地描述。另外,一些次要锚定位点中的残基根本不是总被定位与MHC 分子上的口袋接触。因此,存在一种肽亚型,其与特定的MHC分子结合 并在正在讨论中的位点处存在侧链-口袋接触,并且存在另一种亚型,其显 示与相同MHC分子的结合,所述结合不依赖于肽在MHC分子肽-结合沟 中呈现的构象。C-末端残基(PΩ;ω)优选是主要锚定残基。对于许多研 究更好的HLA分子(例如A2,A68,B27,B7,B35和B53)第二位置 (P2)也是一个锚定残基。然而,也已经观察到中央锚定残基,其包括 HLA-B8中的P3和P5,以及分别在鼠MHC分子H-2Db和H-2Kb中的P5 和PΩ(ω)-3。因为更稳定的结合通常将改善免疫原性,不管它们的位置, 在设计变体中优选锚定残基是保守的或最优化的。
由于锚定残基通常是位于表位末端附近,肽向上弯曲而到肽-结合沟 以外,其允许长度上的一些变化。对于HLA-A68已经发现8-11个氨基酸 的表位,对于HLA A2高达13个氨基酸。除锚定位置之间的长度变化之 外,已经报道单个残基平截和延伸并且分别在N-和C-末端。在非锚定残 基中,一些突出到沟以外,不与MHC分子发生接触但可以用来与TCR接 触,对于HLA-A2最经常是P1,P4和PΩ(ω)-1。其它非锚定残基可以 变成插入肽结合沟上边缘和TCR之间,与两者接触。这些侧链残基的精 确定位,和如此它们对结合,MHC精细构象和最终免疫原性的影响是高 度依赖序列的。对于高度免疫原性的表位,它必须不仅促进对于发生激活 稳定的足够的TCR结合,而且TCR还必须具有足够高的脱离速率 (off-rate)以便多个TCR分子可以顺序与相同的肽-MHC复合体相互作用 (Kalergis,A.M.等,Nature Immunol.2:229-234,2001)。因此,在没有 关于三元复合体另外信息的情况下,当设计变体时,在这些位置的保守和 非保守置换都值得考虑。
例如使用任何用于保守和非保守突变的技术和指南可以产生多肽表 位变体。变体可以衍生于与天然序列比较的一个或多个氨基酸的置换,缺 失或插入。氨基酸置换可以是用另一个具有相似结构和/或化学特性的氨基 酸置换一个氨基酸的结果,例如用丝氨酸置换苏氨酸。该置换被称为保守 氨基酸置换,并且所有适当的保守氨基酸置换被认为是一种发明的实施方 案。插入或缺失可以任选为大约1-4,优选1-2个氨基酸。通常优选保持 肽的“锚定位点”,其负责与正在讨论中的MHC分子结合。确实,在许多 情形中通过在锚定位点置换更多的优选残基可以改善肽的免疫原性 (Franco,等,Nature Immunology,1(2):145-150,2000)。在保持与原表 位充分的交叉反应性以构成有效疫苗的同时,通过用更大体积的氨基酸取 代在非锚定位点发现的小氨基酸也经常可以改善肽的免疫原性。通过常规 插入,缺失或置换序列中的氨基酸和检验产生的变体通过多肽表位显示的 活性可以测定允许的变异。由于多肽表位经常是9个氨基酸,优选对最短 的活性表位进行置换,例如9个氨基酸的表位。
还可以通过将任何序列加至多肽表位变体的N末端产生变体。这类 N-末端增加可以是从1个氨基酸直至至少25个氨基酸。因为肽表位经常 被pAPC中活泼的N-末端外肽酶修剪,必须理解所增加序列中的变异可以 对表位活性没有影响。在优选实施方案中,末尾的上游蛋白酶体切割位点 与MHC表位N-末端之间的氨基酸残基不包括脯氨酸残基。Serwold,T.等, Nature Immunol.2:644-651,2001。因此,可以从比优选9-链节(9-mer) I类基序更大的前体产生有效表位。
通常,就它们对应于在靶细胞或pACP表面上由MHC I实际展示的 表位而言肽是有效的。单个的肽对不同MHC分子可具有不同亲和力,与 一些结合良好,有些适当结合,还有些一点也不结合(表2)。传统上已将 MHC等位基因按照血清学反应性分类,所述血清学反应性不反映在相同 类型的等位基因中可以不同的肽-结合沟的结构。类似地,跨越类型(across type)可以共享结合特性;已经将基于共享结合特性的类群称为超类型 (supertype)。在人种群中存在许多MHC I等位基因;基于患者的基因型 可以选择对某些等位基因特异性的表位。
表2
酪氨酸酶207-216(SEQ ID NO.1)与各种MHC类型的预测结合 MHC I类型 *解离半衰期(min) A1 0.05 A*0201 1311. A*0205 50.4 A3 2.7 A*1101(部分A3超类型) 0.012 A24 6.0 B7 4.0 B8 8.0 B14(部分B27超类型) 60.0 B*2702 0.9 B*2705 30.0 B*3501(部分B7超类型) 2.0 B*4403 0.1 B*5101(部分B7超类型) 26.0 B*5102 55.0 B*5801 0.20 B60 0.40 B62 2.0
*HLA肽结合预测(万维网超文本传输协议“访问bimas.dcrt. nih.gov/molbio/hla_bin”)。
在本发明的另外实施方案中,可以将作为肽或编码多核苷酸的所述表 位作为药物组合物给药,例如,疫苗或免疫原性组合物,单独或与各种佐 剂,载体或赋形剂结合。应当指出,尽管术语疫苗可以贯穿这里的讨论中 使用,该概念可以与包括在这里提及的那些的任何其它药物组合物一起施 用或使用。特别有利的佐剂包括各种细胞因子和包含免疫刺激序列的寡核 苷酸(如在这里参考的同时待审的申请中所更详细地阐明)。另外,可将 编码表位的多核苷酸包含于病毒(例如牛痘或腺病毒)中或微生物宿主细 胞(例如沙门氏菌属(Salmonella)或单核细胞增生利斯特氏菌(Listeria monocytogenes))中,其随后被用作多核苷酸的载体(Dietrich,G.等Nat. Biotech.16:181-185,1998)。备选地,可以离体转化pAPC以表达所述表 位,或用肽表位脉冲以其自身作为疫苗给药。为了提高这些方法的效率, 可以用病毒或细菌载体携带编码的表位,或者与pAPC上发现的受体的配 体络合。类似地,肽表位可以与pAPC配体络合或偶联。一种疫苗可以包 括多于一个单个表位。
在PCT公开号WO01/82963和2000年4月28日提交的题为 “EPITOPE SYNCHRONIZATION IN ANTIGEN PRESENTING CELLS,” 的美国专利申请号09/560,465中公开了对于将表位和/或表位聚簇结合至 疫苗或药物组合物中的特别有利的策略。将在所述PCT出版物中公开的教 导和实施方案考虑作为涉及本发明和关于本发明有用的支持原理和实施 方案。在PCT公开号WO01/82963中和在2000年4月28号提交的题为 “EPITOPE CLUSTERS”的美国专利申请号09/561,571中公开了用于本发 明的表位聚簇。将在所述PCT出版物中公开的教导和实施方案考虑作为涉 及本发明和关于本发明有用的支持原理和实施方案。
本发明的优选实施方案是以使pAPC或pAPCs群体呈递对应于在特 定靶细胞上展示的表位的管家表位的疫苗和方法为目标。例如可使用表1 中的任何表位或抗原。在一个实施方案中,管家表位是由特定肿瘤类型的 管家蛋白酶体加工的TuAA表位。在另一个实施方案中,管家表位是由感 染病毒的细胞的管家蛋白酶体加工的病毒相关表位。这促进对靶细胞的特 异性T细胞应答。因为它们展示管家表位或免疫表位,对应于不同诱导状 态(攻击前或攻击后)pAPCs同时表达多种表位可以激发有效对抗靶细胞 的CTL应答。
通过含有在pAPC上呈递的管家和免疫表位,本实施方案可以最优化 对靶细胞的细胞毒性T细胞应答。通过双重表位表达,当肿瘤细胞在由IFN 的诱导下从管家蛋白酶体转换至免疫蛋白酶体时,pAPCs可以继续维持对 免疫类型表位的CTL应答,所述IFN例如可以通过肿瘤浸润CTLs产生。
在一个优选实施方案中,使用包括管家表位的疫苗免疫患者。许多优 选的TAAs专门与一种靶细胞相关,特别是在感染细胞的情形中。在另一 个实施方案中,许多优选的TAAs是在转化细胞中解除控制(deregulated) 的基因表达的结果,但在睾丸,卵巢和胎儿组织中也发现。在另一个实施 方案中,有效的TAAs在靶细胞中比在其它细胞中更高水平地表达。在其 它实施方案中,与其它细胞相比TAAs在靶细胞中不差异表达,但还是有 效的,因为它们与细胞的一种特定功能有关并将靶细胞从大多数其它周围 细胞区别开来;在这些实施方案中,也显示TAA的健康细胞可能被诱导 的T细胞应答并联攻击,但该附带损害被认为远比靶细胞导致的情形优 选。
疫苗以导致pAPC或pAPCs群体展示管家表位的有效浓度包含一种 管家表位。有利地,疫苗可包括多种管家表位或任选与一种或多种免疫表 位结合的一种或多种管家表位。疫苗制剂以足以导致pAPCs呈递表位的浓 度包含肽和/或核酸。制剂优选以大约1μg-1mg/100μl疫苗制剂的总浓度 包含表位。本发明可使用适于肽疫苗和/或核酸疫苗的常规剂量和定量给 药,该给药方法在本领域是被很好理解的。在一个实施方案中,对于成人 的单剂量可便利地为大约1μl至大约5000μl的该组合物,一次或多次给 药,例如间隔1周,2周,一个月或更长的2,3,4或更多剂量。参照结 节内方法专利胰岛素泵(insulin pump)每小时送递1μl(最低频率)。
这里公开的本发明的组合物和方法还意图将佐剂结合至制剂中以增 强疫苗的性能。具体地,设计将佐剂加入制剂以增强pAPCs的表位送递或 摄取。本发明考虑的佐剂为本领域中的技术人员已知并包括例如GMCSF, GCSF,IL-2,IL-12,BCG,破伤风毒素,骨桥蛋白和ETA-1。
在本发明的一些实施方案中,疫苗可包括一种重组生物,如被遗传改 造以在宿主中表达表位的病毒,细菌或寄生物。例如,单核细胞增生利斯 特氏菌,一种革兰氏阳性,兼性胞内细菌,是一种将TuAAs靶向免疫系 统的有效载体。在一个优选的实施方案中,可以改造该载体来表达一种管 家表位以诱导治疗应答。该生物感染的正常途径是通过肠并且可以口服递 送。在另一个实施方案中,可以使用一种编码针对TuAA的管家表位的腺 病毒(Ad)载体来诱导抗病毒或抗肿瘤应答。可以使用病毒构建体转导衍 生于骨髓的树突细胞并随后注射,或者可以直接通过皮下注射将病毒递送 至动物中以诱导有效的T-细胞应答。另一个实施方案使用一种重组牛痘病 毒,其被改造来编码相应于针对TAA的管家表位的氨基酸序列。携带小 基因构建体形式的含有适当核苷酸置换的构建体的牛痘病毒可以指导管 家表位的表达,导致针对表位的治疗性T细胞应答。
使用DNA免疫要求APCs摄取DNA并且表达编码的蛋白质或肽。 可以在DNA上编码离散的I类肽。通过用该构建体免疫,可使APCs表达 管家表位,其然后在细胞表面I类MHC上展示以刺激适当的CTL应答。 在PCT公开号WO01/82963和在2000年4月28提交的题为EXPRESSION VECTORS ENCODING EPITOPES OF TARGET-ASSOCIATED ANTIGENS的美国专利申请号09/561,572中已经描述了通常依赖于翻译 终止或非蛋白酶体蛋白酶以产生适当的管家表位末端的构建体。将在所述 PCT出版物中公开的教导和实施方案考虑作为涉及本发明和关于本发明 有用的支持原理和实施方案。
如所提及的,理想的是在更大的蛋白质前后序列中表达管家肽。即使 当少量的氨基酸存在表位末端以外也能检测到加工。小肽激素是通常从经 常尺寸大小约为60-120个氨基酸的较长的翻译产物蛋白水解加工而来。该 事实导致一些人设想这是可以有效翻译的最小尺寸。在一些实施方案中, 可将管家肽内嵌在至少约60个氨基酸的翻译产物中。在其它实施方案中 可将管家肽内嵌在至少约50,30或15个氨基酸的翻译产物中。
由于有差别的蛋白酶体加工,pAPC的免疫蛋白酶体产生与由周围体 细胞中的管家蛋白酶体产生的那些不同的肽。因此,在较大蛋白质的前后 序列中表达管家肽过程中,优选在APC中在不同于它全长天然序列的前 后序列中表达它,因为,作为管家表位,通常只能通过管家蛋白酶体从天 然蛋白质有效加工,所述管家蛋白酶体在APC中不活跃。为了在编码较 大蛋白质的DNA序列中编码管家表位,在编码表位的序列的任意一侧找 到允许免疫蛋白酶体适当切割以释放管家表位的侧翼区域是有用的。改变 所需管家表位N-末端和C-末端的侧翼氨基酸残基可以促进在APC中适当 切割和产生管家表位。可以从新设计并筛选内嵌管家表位的序列以确定哪 个可以被免疫蛋白酶体成功加工来释放管家表位。
备选地,另一种策略对于鉴定允许在APC中产生管家表位的序列是非 常有效的。一种邻接氨基酸序列可以从一种或多种管家表位从头至尾的排 列产生。使用表达该序列的构建体免疫动物,并评估产生的T细胞应答以 确定它对排列中一种或多种表位的特异性。由定义,这些免疫应答显示在 pAPC中被有效加工的管家表位。由此确定了该表位周围的必需的侧翼区 域。使用期望肽任意一侧约4-6个氨基酸的侧翼区域可以提供促进通过免 疫蛋白酶体的管家表位的蛋白酶体加工所必需的信息。因此,可以将保证 表位同步化的约16-22个氨基酸的序列有效插入或融合至任何蛋白质序列 以导致在APC中产生管家表位。在备选实施方案中,可以将整个头尾排 列的表位,或只是紧邻着正确加工管家表位的表位类似地从测试构建体转 移至疫苗载体。
在一个优选实施方案中,可以将管家表位内嵌在已知的免疫表位,或 这样的区段之间,从而提供适于加工的前后序列。管家和免疫表位的接合 点可以产生使免疫蛋白酶体释放管家表位所必需的前后序列,或优选包括 正确C-末端的更大片段。筛选构建体以证实产生了所需表位是有用的。管 家表位的结合点可以产生可以被免疫蛋白酶体切割的位点。本发明的一些 实施方案使用已知表位侧邻测试底物中的管家表位;在其它实施方案中, 使用如下所述的筛选来确定侧翼区域是任意序列还是天然侧翼序列的突 变体,在设计底物中是否使用蛋白酶体切割优选的知识。
尽管有利,在成熟表位N-末端的切割是不必需的,因为在细胞中存在 多种N-末端修剪活性,其能够在蛋白酶体加工之后产生成熟的表位N-末 端。优选该N-末端延伸小于大约25个氨基酸长度,并进一步优选该延伸 含有很少或没有脯氨酸残基。优选地,在筛选中,不仅对在表位末端(或 至少在它的C-末端)的切割给予考虑,而且对确保在表位内部的有限切割 给予考虑。
可以将鸟枪法用于设计测试底物并可提高筛选效率。在一个实施方案 中可以依次组合多种表位,单个表位可出现多次。可以筛选底物以确定可 以产生哪种表位。在其中一种特定表位是所关心的情形中,可以设计其中 它在多种不同前后序列中出现的底物。当将在多于一种前后序列中出现的 单个表位从底物释放时,可以使用附加的第二测试底物来确定哪个是被释 放和真正构成保证表位同时化的序列,所述第二测试底物中表位的特殊实 例(individual instances)被去除,禁止或是唯一的。
存在几种容易实行的筛选。一种优选的体外筛选利用蛋白酶体消化分 析,其使用纯化的免疫蛋白酶体,来确定所需的管家表位是否能从包含正 在讨论中的该序列的合成肽中释放出来。可以通过技术如质谱,HPLC和 N-末端池测序来测定获得切割的位置;如在题为METHOD OF EPITOPE DISCOVERY,EPITOPE SYNCHRONIZATION IN ANTIGEN PRESENTING CELLS的美国专利申请,PCT出版物,题为EPITOPE SEQUENCES的美国申请和临时美国专利申请中更详细地描述。
备选地,可以使用体内筛选如免疫或目标敏化(target sensitization)。 对于免疫使用可以表达正在讨论中的序列的核酸构建体。可以检验收获的 CTL识别呈递正在讨论中的管家表位的靶细胞的能力。通过用含成熟管家 表位的合成肽脉冲表达适当MHC分子的细胞极其容易获得这类靶细胞。 备选地,可以使用已知表达管家蛋白酶体的细胞和抗原,从所述抗原可内 源地或通过遗传工程衍生管家表位。为了将目标敏化用作筛子,可以使用 识别管家表位的CTL,或优选CTL克隆。在该情形中,它是表达内嵌的 管家表位的靶细胞(而不是在免疫期间的pAPC)并且它必须表达免疫蛋 白酶体。通常,可以使用一种适当的核酸构建体转化靶细胞以赋予内嵌管 家表位的表达。使用装载肽的脂质体或蛋白质转移试剂如BIOPORTERTM (Gene Therapy Systems,San Diego,CA)装载一种包含内嵌表位的合成肽 代表一种备选方案。
在WO01/82963和在2000年4月28日提交的题为“EXPRESSION VECTORS ENCODING EPITOPES OF TARGET-ASSOCIATED ANTIGENS”的美国专利申请号No.09/561,572中公开了关于用作依照本 发明疫苗的核酸构建体的另外指导。此外,PCT公开号WO03/063770;2002 年11月7日提交的美国专利申请号10/292,413;和在11/7/2001提交的题 为“EXPRESSION VECTORS ENCODING EPITOPES OF TARGET-ASSOCIATED ANTIGENS AND METHODS FOR THEIR DESIGN”的美国临时专利申请号60/336,968(律师备案号(attorney docket number)CTLIMM.022PR)中公开了依照本发明有用的表达载体和关于它 们设计的方法。将在所述PCT出版物中公开的教导和实施方案考虑作为涉 及本发明和关于本发明有用的支持原理和实施方案。
本发明的一个优选实施方案包括给药包括一种表位(或多种表位)的 疫苗以诱导治疗性免疫应答的方法。将疫苗以与本领域已知的标准疫苗递 送方案一致的方法对患者给药。给药TAAs表位的方法包括,不限于经皮 的,结节内的,结节周围的,口服的,静脉内的,皮内的,肌内的,腹膜 内的和粘膜给药,包括通过注射,滴注或吸入递送。在2002年1月17日 颁发的澳大利亚专利号739189;PCT公开号WO099/02183;标题都为“A METHOD OF INDUCING A CTL RESPONSE,”的1999年9月1日提交的 美国专利申请号09/380,534;和在2001年2月2日提交的其部分继续申请 美国专利申请号09/776,232(公开为20020007173);和PCT公开号 WO02/062368中公开了一种递送疫苗以引发CTL应答的特别有用的方法。 将在所述PCT出版物中公开的教导和实施方案考虑作为涉及本发明和关 于本发明有用的支持原理和实施方案。
试剂识别表位
在本发明的另一方面,考虑对表位和/或表位-MHC分子复合体具有 结合特异性的蛋白质,以及通过其可以表达它们的分离的细胞。在一组实 施方案中,这些试剂采取免疫球蛋白的方式:多克隆血清或单克隆抗体 (mAb),生产其的方法在本领域是众所周知的。产生对肽-MHC分子复 合体具有特异性的mAb在本领域是已知的。参见例如Aharoni等,Nature 351:147-150,1991;Andersen等Proc.Natl.Acad.Sci.USA 93:1820-1824, 1996;Dadaglio等Immunity 6:727-738,1997;Duc等Int.Immunol.5: 427-431,1993;Eastman等Eur.J.Immunol.26:385-393,1996;Engberg等 Immunotechnology 4:273-278,1999;Porgdor等Immunity 6:715-726,1997; Puri等J.Immunol.158:2471-2476,1997;和Polakova,K.,等J.Immunol. 165 342-348,2000。
在其它实施方案中,可将所述组合物用来体内和体外诱导和产生对任 何表位和/或表位-MHC复合体特异的T-细胞。在优选实施方案中,表位可 以是例如在表1中列出的那些中的任何一种或多种。因此,实施方案还涉 及和包括分离的T细胞,T细胞克隆,T细胞杂交瘤或含有衍生于克隆基 因的T细胞受体(TCR)结合域的蛋白质,以及表达该蛋白质的重组细胞。 该TCR衍生的蛋白质可以仅仅是TCR的胞外域,或与另外一种蛋白质的 部分的融合以赋予所需的性质或功能。该融合的一个实例是将TCR结合 域附着在抗体分子的恒定区以便产生二价分子。已经报道按照该常规模式 的分子的构建和活性,例如Plaksin,D.等J.Immunol.158:2218-2227,1997 和Lebowitz,M.S.等Cell Immunol.192:175-184,1999。在题为T CELL RECEPTORS AND THEIR USE IN THERAPEUTIC AND DIAGNOSTIC METHODS的美国专利5,830,755中也讨论了这类分子更多的常规构建和 使用。
通过标准免疫实验室动物可以容易地实现这类T细胞的生产,并且 通过用人靶细胞免疫或通过用抗原/表位免疫HLA-转基因动物可以获得对 人靶细胞的反应性。对于一些治疗方法,衍生于相同物种的T细胞是理想 的。尽管该细胞可以通过例如将鼠TCR克隆于如上所考虑的人T细胞中 产生,但体外免疫人细胞提供一种潜在地更快的选择。即使使用首次用于 实验的供体(naive donors),用于体外免疫的技术在本领域也是已知的, 例如Stauss等,Proc.Natl.Acad.Sci.USA 89:7871-7875,1992;Salgaller 等Cancer Res.55:4972-4979,1995;Tsai等,J.Immunol.158:1796-1802, 1997;和Chung等,J.Immunother.22:279-287,1999。
可以将这些分子的任一种与酶,放射化学试剂,荧光标签和毒素偶联, 以便用于诊断(成象或其它检测),监测和治疗与表位相关的致病疾病。
因此可以给药毒素偶联物以杀死肿瘤细胞,放射化学试剂可以促进表位阳 性肿瘤的成象,可将酶偶联物用于类似ELISA的试验来诊断癌症和证实在 活体解剖组织中的表位表达。在另一个实施方案中,在通过用表位和/或细 胞因子刺激完成扩增后,作为一种过继免疫治疗可以对患者给药如上阐明 的这样的T细胞。
包含表位的试剂
本发明的另一方面提供分离的表位-MHC复合体。在本发明这方面的 特别有利的实施方案中,复合体可以是可溶的,多亚基蛋白如在美国专利 号5,635,363(四聚体)或美国专利号6,015,884(Ig-二聚体)中描述的那 些。该试剂可用于检测和监测特异性的T细胞应答,和纯化这类T细胞。
还可将与表位肽络合的分离的MHC分子结合至平面脂双层或脂质体 中。这类组合物可用来体外或在脂质体的情形中,体内刺激T细胞。可将 共同刺激分子(例如B7,CD40,LFA-3)结合于相同组合物中,或者特别 是对于体外操作,可以通过抗-共同-受体的抗体(例如抗-CD28,抗-CD154, 抗-CD2)或细胞因子(例如IL-2,IL-12)来提供共同刺激。这样的T细 胞刺激可以在免疫治疗中构成接种,驱动T细胞体外扩增以接下来融合, 或构成T细胞功能测定中的一步。
表位,或更直接地它与MHC分子的复合体可以是在激活或读出步骤 或两者中抗原特异性T细胞的功能测定的重要组分。在当前本领域中T细 胞功能的许多种测定中(详细的方法可以在标准免疫学参考如Current Protocols in Immnology 1999 John Wiley & Sons Inc.,N.Y中发现)可以定 义两大类,测量许多细胞应答的那些和测量单独细胞应答的那些。尽管前 者传达应答强度的总体测量,但后者允许测定应答细胞的相对频率。测量 总体应答的试验的实例是细胞毒性测定,ELISA和检测细胞因子分泌的增 殖测定。测量单独细胞(或衍生于它们的小克隆)应答的测定包括有限稀 释分析(LDA),ELISPOT,未分泌细胞因子的流式细胞仪检测(在题为 “METHOD FOR ASSESSMENT OF THE MONONUCLEAR LEUKOCYTE IMMUNE SYSTEM”的美国专利号5,445,939和标题都为 “METHOD FOR THE ASSESSMENT OF THE MONONUCLEAR LEUKOCYTE IMMUNE SYSTEM,”的美国专利号5,656,446;和5,843,689 中描述,试剂是由Becton,Dickinson & Company以商品名 ‘FASTIMMUNE’出售并且用如上说明和提及的四聚体或Ig-二聚体检测 特异性的TCR。在Yee,C.等Current OPinion in Immunology,13:141-146, 2001中综述这些技术的相对优点。如对于本领域的一名技术人员将是明显 的,通过多种建立的基于核酸的技术,特别是原位和单细胞PCR技术可 以完成另外的检测特异性TCR的重排或表达。
这些功能测定可用来评估免疫的内源水平,对免疫刺激(例如疫苗) 的应答和监测贯穿疾病和治疗期间的免疫状态。除当测量免疫的内源水平 时,这些测定的任何一种假定预先的免疫步骤,不管体内或体外,其取决 于所论述问题的性质。使用上述本发明的各种实施方案或可以激发相似免 疫的其它形式的免疫原(例如pAPC-肿瘤细胞融合)可以进行该免疫。除 了能够检测关联TCR(cognate TCR)表达的PCR和四聚体/Ig-二聚体类型 的分析以外,这些测定通常受益于一步体外抗原刺激,其可以方便地使用 上述本发明的各种实施方案以便检测特定的功能活性(有时可以直接检测 高度溶细胞应答)。最后,检测溶细胞活性需要展示表位的靶细胞,其可 以使用本发明的各种实施方案产生。对于任何具体步骤选择的具体实施方 案取决于所论述的问题,使用的简易,成本等,但对于任何具体一组情形 一个实施方案对另一种的优势对于本领域的一名技术人员来说将是明显 的。
在传统上已将在该部分描述的肽MHC复合体理解为是非共价结合。 然而产生一个共价键是可能并且可以是有益的,例如通过编码作为单个蛋 白的表位和MHC重链或表位,β2-微球蛋白,和MHC重链(Yu,Y.L.Y., 等,J.Immunol.168:3145-3149,2002;Mottez,E.,等,J.Exp.Med.181: 493,1995;Dela Cruz,C.S.,等,Int.Immunol.12:1293,2000;Mage, M.G.,等,Proc.Natl.Acad.Sci.USA 89:10658,1992;Toshitani,K.,等, Proc.Natl.Acad.Sci.USA 93:236,1996;Lee,L.,等,Eur.J.Immunol.24: 2633,1994;Chung,D.H.,等,J.Immunol.163:3699,1999;Uger,R.A.和 B.H.Barber,J.Immunol.160:1598,1998;Uger,R.A.,等,J.Immunol.162: 6024,1999;和White,J.,等,J.Immunol.162:2671,1999。这类构建体可具 有优越的稳定性并且克服了在加工-呈递途径中的困难。它们可以类似方式 用于已经描述的疫苗,试剂和测定中。
肿瘤相关抗原
本发明的表位是衍生于TuAAs酪氨酸酶(SEQ ID NO.2),SSX-2, (SEQ ID NO.3),PSMA(前列腺-特异性膜抗原)(SEQ ID NO.4),MAGE-1, (SEQ ID NO.71),MAGE-2,(SEQ ID NO.72),MAGE-3,(SEQ ID NO.73), PRAME,(SEQ ID NO.77),PSA,(SEQ ID NO.78),PSCA,(SEQ ID NO.79), CEA(癌胚抗原)(SEQ ID NO.88),SCP-1(SEQ ID NO.92),GAGE-1(SEQ ID NO.96),survivin,(SEQ ID NO.98),Melan-A/MART-1(SEQ ID NO.100) 和BAGE(SEQ ID NO.102)。从它们的cDNA或完全编码(cds)序列,分 别为SEQ ID NOS.5-7,81-83,85-87,89,93,97,99,101和103可以确 定这十五种蛋白质的天然编码序列,或它们内部的任何区段。
酪氨酸酶是一种黑色素生物合成酶,其被认为是黑色素细胞分化的最 特异性的标记之一。酪氨酸酶在很少的几种细胞类型中表达,主要在黑色 素细胞中表达,并且经常在黑素瘤中发现高水平。在题为“METHOD FOR IDENTIFYING INDIVIDUALS SUFFERING FROM A CELLULAR ABNORMALITY SOME OF WHOSE ABNORMAL CELLS PRESENT COMPLEXES OF HLA-A2/TYROSINASE DERIVED PEPTIDES,AND METHODS FOR TREATING SAID INDIVIDUALS”的美国专利5,747,271 中教导了将酪氨酸酶用作TuAA。
GP100,也称为PMe117,也是一种在黑素瘤中高水平表达的黑色素 生物合成蛋白质。在题为“MELANOMAANTIGENS AND THEIR USE IN DIAGNOSTIC AND THERAPEUTIC METHODS,”的美国专利5,844,075 中公开了作为一种TuAA的GP100。
Melan-A,也称为MART-1(由T细胞识别的黑素瘤抗原),是另一种 在黑素瘤中高水平表达的黑素生物合成蛋白。Melan-A/MART-1作为TuAA 的用途在美国专利号5,874,560和5,994,523、标题均为“MELANOMA ANTIGENS AND THEIR USE IN DIAGNOSTIC AND THERAPFUTIC METHODS”,以及标题为“ISOLATED NUCLEIC ACID SEQUENCE CODING FOR A TUMOR REJECTION ANTIGEN PRECURSOR PROCES SED TO AT LEAST ONE TUMOR REJECTION ANTIGEN PRESENTED BY HLA-A2”的美国专利号5,620,886中进行了教导。
SSX-2,也称为Hom-Mel-40,是高度保守的癌-睾丸抗原家族的成员 (Gure,A.O.等Int.J. Cancer 72:965-971,1997)。在题为“ISOLATED NUCLEIC ACID MOLECULES WHICH ENCODE A MELANOMA SPECIFIC ANTIGEN AND USES THEREOF,”的美国专利6,025,191中教 导了将其鉴定为一种TuAA。在多种肿瘤中发现癌-睾丸抗原,但通常在除 睾丸以外的正常成人组织中不存在。已经发现在肿瘤细胞系中SSX家族的 不同成员的表达不同。由于在SSX家族成员之间高度的序列同一性,将产 生来自多于一个家族成员的相似表位并且其可以与MHC分子结合,因此 指向该家族一个成员的一些疫苗可以交叉反应和对该家族的其它成员有 效(参见下面实施例3)。
MAGE-1,MAGE-2,和MAGE-3是最初在黑素瘤(MAGE是黑素瘤 相关抗原的缩写)中发现但在许多肿瘤中发现的的另一个癌-睾丸抗原家族 的成员。在题为NUCLEOTIDE SEQUENCE ENCODING THE TUMOR REJECTION ANTIGEN PRECURSOR,MAGE-1的美国专利5,342,774和许 多后来专利中教导了将MAGE蛋白鉴定为TuAAs。当前在SWISS蛋白质 数据库中存在17条关于(人)MAGE的记录。在这些蛋白质中存在广泛 的相似性因此在许多情形中,来源于一种的表位可诱导针对其它家族成员 的交叉反应性应答。还未在肿瘤中观测到这些中的一些,最显著地 MAGE-H1和MAGE-D1,其分别在睾丸和脑,和骨髓基质细胞中表达。 由它们是在对其它MAGE蛋白质最小相似性之中的事实改善了在正常组 织上交叉反应性的可能性。
GAGE-1是癌睾丸抗原的GAGE家族的成员(Van den Eynde,B.,等.,J. Exp.Med.182:689-698,1995;美国专利号5,610,013;5648226;5,858,689; 6,013,481和6,069,001)。PubGene数据库目前列出了12种独特可获得成 员,它们中的一些同义已知为PAGE或XAGE。GAGE-1至GAGE-8具有 非常高度的序列同一性,所以大多数表位可以在该家族的多个成员中共 享。
BAGE是癌-睾丸抗原,其通常表达在黑素瘤、特别是转移性黑素瘤, 以及在肺癌、乳腺癌、膀胱癌,和头及颈的扁平细胞。在美国专利号5,683,88 标题为“TUMOR REJECTION ANTIGENS WHICH CORRESPOND TO AMINO ACID SEQUENCES IN TUMOR REJECTION ANTIGEN PRECURSOR BAGE,AND USES THEREOF”和5,571,711标题为 “ISOLATED NUCLEIC AICD MOLECULES CODING FOR BAGE TUMOR REJECTION ANTIGEN PRECURSORS”中教导了其用作TuAA。
NY-ESO-1,是一种在各种各样的肿瘤中发现的癌-睾丸抗原,也称为 CTAG-1(癌-睾丸抗原-1)和CAG-3(癌抗原-3)。在题为ISOLATED NUCLEIC ACID MOLECULE ENCODING AN ESOPHAGEAL CANCER ASSOCIATED ANTIGEN,THE ANTIGEN ITSELF,AND USES THEREOF 的美国专利5,804,381中公开了作为一种TuAA的NY-ESO-1。编码具有广 泛序列同一性的抗原的共生同源基因座(paralogous locus),LAGE-1a/s (SEQ ID NO.75)和LAGE-1b/L(SEQ ID NO.76)已经在公众可利用的人 基因组集群(assemblies)中公开,并且已经被推断是通过可变剪接(alternate splicing)产生的。另外,CT-2(或CTAG-2,癌-睾丸抗原-2)似乎是 LAGE-1b/L的等位基因,突变体或测序差异。由于广泛的序列同一性,许 多来源于NY-ESO-1的表位也可以诱导针对表达这些其它抗原的肿瘤的免 疫性。参见图1。蛋白质直至氨基酸70实际上是相同的。从71-134 NY-ESO-1和LAGE之间相同的最长长度是6个残基,但存在潜在交叉反 应序列。从135-180,NY-ESO和LAGE-1a/s除单个残基以外是相同的, 但由于可变剪接LAGE-1b/L是不相关的。CAMEL和LAGE-2抗原似乎是 来源于LAGE-1 mRNA,但是源于可变的读框(alternate reading frame), 因此产生不相关的蛋白质序列。新近,GenBank登记号AF277315.5,人 染色体X克隆RP5-865E18,RP5-1087L19,完全序列,报道了在该区域中 的三个独立的基因座,其标记为LAGE1(对应于基因组集群的CTAG-2), 加上LAGE2-A和LAGE2-B(两者对应于基因组集群的CTAG-1)。
PSMA(前列腺特异性膜抗原),在题为“PROSTATE-SPECIFIC MEMBRANES ANTIGEN”的美国专利5,538,866中描述的一种TuAA,是 由正常前列腺上皮细胞表达,并且在前列腺癌中高水平表达。也已经发现 它存在于非前列腺肿瘤的新脉管系统中。PSMA因此可以形成指向前列腺 癌和其它肿瘤的新脉管系统两者的疫苗的基础。在美国专利公开号 20030046714;PCT公开号WO02/069907;和在2001年3月7日提交的题 为“ANTI-NEOVASCULAR VACCINES FOR CANCER”的临时美国专利 申请号60/274,063和在2002年3月7日提交的题为 “ANTI-NEOVASCULAR PREPARATIONS FOR CANCER”的美国申请号 10/094,699,律师备案号CTLIMM.015A中更充分地描述这一后者概念。 将在所述出版物和申请中公开的教导和实施方案考虑作为涉及本发明和 关于本发明有用的支持原理和实施方案。简短地,当肿瘤生长时,它们吸收 (recruit)新血管的向内生长物(ingrowth)。这被认为对于维持生长是必 需的,因为未血管化的肿瘤中心通常坏死并且已经报道血管发生抑制剂导 致肿瘤退化。这些新血管,或新脉管系统,表达在建立的血管中未发现的 抗原,因此可以被特异性地瞄准。通过诱导针对新血管抗原的CTL可以 使血管破裂,中断养分流向肿瘤(和从肿瘤去除废弃物),导致退化。
如在题为“ISOLATED NUCLEIC ACID MOLECULE ENCODING ALTERNATIVELY SPLICED PRO STATE-SPECIFIC MEMBRANES ANTIGEN AND USES THEREOFOF”的美国专利5,935,818中所述,PSMA mRNA的可变剪接还导致一种在Met58处含有明显起始的蛋白质,从而删 除了假定的PSMA膜锚定区域。一种称为类PSMA蛋白的蛋白质,Genbank 登记号AF261715,与PSMA的氨基酸309-750几乎相同并且具有不同的 表达图谱(expression profile)。因此最优选的表位是含有位于氨基酸58-308 的N-末端的那些。
PRAME,也称为MAPE,DAGE和OIP4,最初是被作为一种黑素瘤 抗原观测。后来,它已被认为是一种CT抗原,但不像许多CT抗原(例 如MAGE,GAGE,和BAGE)它在急性骨髓白血病中表达。PRAME是 MAPE家族的一个成员,所述MAPE家族主要由假想蛋白质组成,PRAME 与这些假想蛋白质共有有限的序列相似性。在题为“ISOLATED NUCLEIC ACID MOLECULES CODING FOR TUMOR REJECTION ANTIGEN PRECURSOR DAGE AND USES THEREOF”的美国专利5,830,753中教导 了将PRAME用作一种TuAA。
PSA,前列腺特异性抗原,是激肽释放酶家族的一种肽酶和前列腺的 一种分化抗原。也已经报道在乳房组织中的表达。替代的名称包括 γ-seminoprotein,激肽释放酶3,seminogelase,seminin和P-30抗原。PSA 具有与各种可变剪接产物前列腺/腺激肽释放酶-1和-2以及激肽释放酶4 的高度序列同一性,其也在前列腺和乳房组织中表达。其它激肽释放酶通 常共享更小的序列同一性和具有不同的表达图谱。但是,在设计疫苗时应 该考虑可能通过任何特定表位激发的交叉反应性,以及表位将通过在非靶 组织中的加工(最通常由管家蛋白酶体加工)而被释放的可能性。
PSCA,前列腺干细胞抗原,也称为SCAH-2,是一种优选在前列腺上 皮细胞中表达和在前列腺癌中过量表达的分化抗原。在包括消化道的神经 内分泌细胞和肾的集合管的一些正常组织中发现低水平表达。在题为 “HUMAN STEM CELL ANTIGENS”的美国专利5,856,136中描述了 PSCA。
联会复合体蛋白1(SCP-1),也称为HOM-TES-14,是一种减数分裂 相关蛋白并且也是一种癌-睾丸抗原(Tureci,O.,等Proc.Natl.Acad.Sci. USA 95:5211-5216,1998)。作为一种癌抗原,它的表达不是受细胞周期调 节并且经常在神经胶质瘤,乳房,肾细胞和卵巢癌中发现它。它具有与肌 球蛋白的一些相似性,但具有足够小的同一性以致交叉反应表位不可直接 寻找(immediate prospect)。
纤连蛋白的ED-B结构域也是一种潜在的目标。纤连蛋白进行受发育 调节的可变剪接,主要在胎性癌组织中使用的单个外显子编码ED-B结构 域(Matsuura,H.和S.Hakomori Proc.Natl.Acad.Sci.USA 82:6517-6521, 1985;Carnemolla,B.等J.Cell Biol.108:1139-1148,1989;Loridon Rosa, B.等Cancer Res.50:1608-1612,1990;Nicolo,G.等Cell Differ.Dev.32: 401-408,1990;Borsi,L.等Exp.Cell Res.199:98-105,1992;Oyama,F.等 Cancer Res.53:2005-2011,1993;Mandel,U.等APMIS 102:695-702,1994; Farnoud,M.R.等Int.J.Cancer 61:27-34,1995;Pujuguet,P.等Am.J. Pathol.148:579-592,1996;Gabler,U.等Heart 75:358-362,1996;Chevalier, X.Br.J.Rheumatol.35:407-415,1996;Midulla,M.Cancer Res.60:164-169, 2000)。
ED-B结构域也在新脉管系统的纤连蛋白中表达(Kaczmarek,J.等Int. J.Cancer 59:11-16,1994;Castellani,P.等Int.J.Cancer 59:612-618,1994; Neri,D.等Nat.Biotech.15:1271-1275,1997;Karelina,T.V.和A.Z.Eisen Cancer Detect.Prev. 22:438-444,1998;Tarli,L.等Blood 94:192-198;1999; Castellani,P.等Acta Neurochir.(Wien)142:277-282,2000)。作为一种胎性 癌结构域,除被新脉管系统表达以外一般在由赘生性细胞表达的纤连蛋白 中发现ED-B结构域。因此,靶向ED-B结构域的CTL诱导疫苗可显示两 种作用机制:直接溶解肿瘤细胞和通过破坏肿瘤相关新脉管系统破坏肿瘤 的血液供给。因为CTL活性在停用疫苗后迅速衰减,对正常血管发生的 干扰可以最小。在题为“ANTI-NEOVASCULATURE VACCINES FOR CANCER”的临时美国专利申请号60/274,063和甚至在日期(2002年3月 7日)与本申请一起提交的题为“ANTI-NEOVASCULATURE PREPARATIONS FOR CANCER”的美国专利申请号10/094,699,律师备 案号CTLIMM.015A中描述了设计和检验靶向新脉管系统的疫苗。在题为 “HLA-TRANSGENIC MURINE TUMOR CELL LINE,”律师备案号 CTLIMM.028PR,2002年3月7日提交的临时美国专利申请号60/363,131 中公开了一种肿瘤细胞系。
癌胚抗原(CEA)是一种典型的癌胚蛋白,其最初在1965年被首先描 述(Gold和Freedman,J.Exp.Med.121:439-462,1965。更全的参考可以在 Online Medelian Inheritance in Man;记录*114890中找到)。它已经正式改 名为癌胚抗原相关细胞粘着分子5(CEACAM5)。它的表达与消化道和胎 结肠中的上皮层(epithelial lining)的腺癌强烈相关。CEA是免疫球蛋白 超基因家族的成员并且是CEA亚家族的定义成员(defining member)。
Survivin,也已知为杆状病毒含IAP重复的蛋白5(BIRC5),是具有 胎性癌模式表达的另一种蛋白。它是程序性细胞死亡蛋白(IAP)基因家 族的抑制剂的成员。它在癌症中广泛地过表达(Ambrosini,G.等.,Nat,Med, 3:917-921,1997;Velcuiscu V.E.等.,Nat.Genet.23:387-388,1999)和认为它 作为程序性细胞死亡抑制剂的功能有助于恶性表型。
HER2/NEU与表皮生长因子受体相关的癌基因(van de Vijver,等,New Eng.J.Med. 319:1239-1245,1988),并且显然与c-ERBB2癌基因相同(Di Fiore,等,Science 237:178-182,1987)。ERBB2的过量表达已经和前列腺癌 的致瘤性转化牵连。作为HER2,它在其它肿瘤中的乳腺癌的25-30%中被 扩增和过表达,所述其它肿瘤中表达水平与肿瘤的进攻性相关(Slamon,等, New Eng.J.Med. 344:783-792,2001)。在Online Medelian Inheritance in Man; 记录*164870中可获得更详细的描述。
如下列实施例中所描述鉴定和检验有效表位。然而这些实例是意图只 是用作说明目的,而不应该解释为是以任何方式限制本发明的范围。
实施例
实施例1
表位的制备
A.表位的人工生产
使用FMOC或tBOC固相合成方法合成含有SEQ ID NO:1,8,9, 11-23,26-29,32-44,47-54,56-63,66-68或108-602中任一个的氨基酸 序列的肽。合成后,在存在适当的保护清除剂的条件下,分别用三氟乙酸 或氟化氢将肽从它们的载体上切开。在通过蒸发去除酸后,用醚萃取肽以 去除清除剂,然后将粗制的沉淀的肽冻干。通过HPLC,序列分析,氨基 酸分析,平衡离子含量分析和其它适当的方法测定粗制肽的纯度。如果粗 制肽足够纯(大于或等于约90%纯度),它们可以原样使用。如果要求纯 化满足药物规范,使用下列各项的一种或组合来纯化肽:再沉淀;反相, 离子交换,尺寸排阻或疏水相互作用色谱法;或逆流分布。
药品制剂
在肠胃外可接受的水,有机或水-有机缓冲液或溶剂系统中配制GMP- 级的肽,其中它们保持物理和化学稳定以及生物有效性。通常,缓冲液或 缓冲液的组合或缓冲液与有机溶剂的组合是适当的。pH值范围典型地为 6-9。可以加入有机改性剂或其它赋形剂来帮助溶解和稳定肽。这些包括去 污剂,脂类,共溶剂,抗氧化剂,螯合剂和还原剂。在冻干产品的情形中, 可以加入蔗糖或甘露醇或其它冻干的酸类。通过膜过滤于它们最后的容器 -密封系统之中将肽溶液灭菌并冻干以备临床中溶解或保存至使用。
B.构建用作核酸疫苗的表达载体
下面介绍三类表位表达载体的构建。在PCT公开号WO01/82963和 在是为“EXPRESSION VECTORS ENCODING EPITOPES OF TARGET-ASSOCIATED ANTIGENS,”的美国专利申请号09/561,572中阐 明了这些设计的具体优势。在PCT公开号WO03/063770;2002年11月7 日提交的美国专利申请号10/292,413;和2001年11月7日提交的题为 “ EXPRESSION VECTORS ENCODING EPITOPES OF TARGET-ASSOCIATED ANTIGENS AND METHODS FOR THEIR DESIGN”的临时美国专利申请号60/336,968中公开了用于它们设计的另 外的载体策略。将在所述PCT出版物和申请中公开的教导和实施方案考虑 作为涉及本发明和关于本发明有用的支持原理和实施方案。
于是用质粒转染适当的大肠杆菌菌株并涂布在选择性培养基上。几个 克隆在悬浮培养中生长并且通过限制酶图谱鉴定阳性克隆。然后培养阳性 克隆,等分于储存小瓶中并储存在-70℃。
然后由这些细胞的样品进行质粒的小量制备(QIAprep Spin Mini-prep: Qiagen,Valencia,CA)并且使用自动荧光双脱氧测序分析证实构建体含有 所需序列。
B.1构建pVAX-EP1-IRES-EP2
综述:
该构建体的起始质粒是购自Invitrogen(Carlsbad,CA)的pVAX1。表 位EP1和EP2是由GIBCO BRL(Rockville,MD)合成。IRES是从购自 Clontech(Palo Alto,CA)的pIRES切断的。
步骤:
1用EcoRI和NotI消化pIRES。通过琼脂糖凝胶电泳分离消化片段, 并且从切断条带纯化IRES片段。
2用EcoRI和NotI消化pVAX1,并凝胶纯化pVAX1片段。
3然后将纯化的pVAX1和IRES片段连接在一起。
4用连接混合物转化感受态的大肠杆菌菌株DH5α。
5从产生的4个菌落进行小量制备。
6对小量制备的DNA进行限制酶消化分析。将一个含有IRES插入片 段的重组菌落用于进一步的EP1和EP2的插入。该中间构建体称为 pVAX-IRES。
7合成编码EP1和EP2的寡核苷酸。
8将EP1亚克隆至pVAX-IRES的AfIII和EcoRI位点之间,以构造 pVAX-EP1-IRES;
9将EP2亚克隆至pVAX-EP1-IRES的SalI和NotI位点之间,以构造 最后的构建体pVAX-EP1-IRES-EP2。
10通过DNA测序证实EP1-IRES-EP2插入片段的序列。
B2.构建pVAX-EP1-IRES-EP2-ISS-NIS
综述:
该构建体的起始质粒是pVAX-EP1-IRES-EP2(实施例1)。引入该构 建体的ISS(免疫刺激序列)是AACGTT,并且使用的NIS(代表核输入 序列(nuclear import sequence))是SV40 72bp重复序列。ISS-NIS是由 GIBCO BRL合成。参见图2。
步骤:
1用NruI消化pVAX-EP1-IRES-EP2;凝胶纯化线性化的质粒。
2合成ISS-NIS寡核苷酸。
3将纯化的线性化pVAX-EP1-IRES-EP2和合成的ISS-NIS连接在一 起。
4用连接产物转化感受态的大肠杆菌菌株DH5α。
5从产生的菌落进行小量制备。
6进行小量制备的限制酶消化。
7将含有插入片段的质粒测序
B3.构建pVAX-EP2-UB-EP1
综述:
该构建体的起始质粒是pVAX1(Invitrogen)。EP2和EP1是由GIBCO BRL合成。从酵母克隆在构建体中编码76个氨基酸的野生型遍在蛋白质。
步骤:
1使用酵母mRNA进行RT-PCR。设计引物来扩增酵母遍在蛋白质的 完整编码序列。
2使用琼脂糖凝胶电泳分析RT-PCR产物。凝胶纯化具有预测大小的 条带。
3将纯化的DNA条带在EcoRV位点亚克隆至pZERO1。将得到的克 隆命名为pZERO-UB。
4在进一步操作之前将几个pZERO-UB克隆测序以证实遍在蛋白质 序列。
5合成EP1和EP2。
6将EP2,遍在蛋白质和EP1连接并且将插入克隆至pVAX1的BamHI 和EcoRI位点中间,使它在CMV启动子的控制之下。
7通过DNA测序证实插入片段EP2-UB-EP1的序列。
实施例2
鉴定有效的表位变体
10-链节的FLPWHRLFLL(SEQ ID NO.1)被鉴定为一种有效表位。基 于该序列,制备许多变体。将在HLA结合试验(参见实施例3,部分6) 中显示活性的变体鉴定为有效,并随后结合于疫苗中。分析的增加结合稳 定性的变体是特别有用的,例如如在WO97/41440题为“Methods for Selecting and Producing T Cell Peptide Epitopes and Vaccines Incorporating Said Selected Epitopes”所述。将在所述PCT出版物中公开的教导和实施 方案考虑作为涉及本发明和关于本发明有用的支持原理和实施方案。
已经评估FLPWHRLFLL长度变体的HLA-A2结合。蛋白酶体消化分 析说明也产生9-链节FLPWHRLFL(SEQ ID NO.8)的C-末端。另外,9- 链节LPWHRLFLL(SEQ ID NO.9)也可由10-链节的N-末端修剪产生。两 者都被预测与HLA-A*0201分子结合,然而在这两个9-链节中, FLPWHRLFL显示更显著的结合并是优选的(参见图3A和B)。
体外蛋白酶体消化和N-末端池测序说明酪氨酸酶207-216(SEQ ID NO. 1)比酪氨酸酶207-215(SEQ ID NO.8)被更普遍地生产,然而较后的肽显示优 越的免疫原性,其在实现最佳疫苗设计中可能关注。将FLPWHRLFL,酪 氨酸酶207-215(SEQ ID NO.8)用于HLA-A2+血液的体外免疫以产生CTL(参 见下面CTL诱导培养)。在标准铬释放测定中将肽脉冲的T2细胞用作目 标,发现由酪氨酸酶207-215(SEQ ID NO.8)诱导的CTL同样很好地识别酪 氨酸酶207-216(SEQ ID NO.1)的目标(参见图3C)。这些CTL还识别HLA-A2 +,酪氨酸酶+肿瘤细胞系624.38和HTB64,但不识别624.28,624.38的 HLA-A2-衍生物(图3C)。因此体内产生的这两种表位的相对数量在疫苗 设计中不成为一个问题。
CTL诱导培养
通过在Ficoll-Hypaque中离心从血沉棕黄层(buffy coat)纯化来源于 正常供体的PBMCs。使用自身血浆(AP)进行所有的培养以避免暴露于 可能的异源病原体和FBS肽的识别。为了促进体外产生肽-特异性的CTL, 我们使用自身树突细胞(DC)作为APCs。如同所描述,产生DC并且用 DC和来源于PBMCs的肽诱导CTL(Keogh等,2001)。简短地,用GM-CSF 和IL-4培养富集单核细胞的细胞组分5天,并在含有2μg/ml CD40配体 的培养基中另外培养2天以诱导成熟。在24孔平板中2ml补充有10% AP,10ng/ml IL-7和20 IU/ml IL-2的RPMI中共培养2×106富集CD8+的 T淋巴细胞/孔和2×105肽脉冲的DC/孔。在第7和第14天用自身辐射的肽 脉冲的DC再刺激培养物。
如下构建FLPWHRLFL的序列变体。与来源于NIH/BIMAS MHC结 合预测程序(参见下面实施例3中的参考)的结合系数表(参见表3)一 致,通过将位置9的L,一个锚定位置改变成V可以改善结合。尽管通常 在更小程度上,通过在非锚定位置的改变也可改变结合。通常参照表3, 通过使用具有相对较大系数的残基可以提高结合。与它们对结合MHC的 影响无关,序列的改变还可改变免疫原性。因此如下可以改善结合和/或免 疫原性:
通过用F,L,M,W,或Y替换位置3的P;这些都是体积较大的残基, 其也可以改善免疫原性而与对结合的影响无关。具有胺和羟基的残基,分 别为Q和N,S和T,也可激发较强的交叉反应性应答。
通过用D或E替换位置4的W以改善结合,这加入负电也可使表位 更有免疫原性,而在一些情形中减小与天然表位的交叉反应性。备选地保 守替换F或Y可以激发交叉反应性应答。
通过用F替换位置5的H改善结合。可以将H视为部分带电,因此 在一些情形中电荷的损失可阻碍交叉反应性。替换在该位置充分带电残基 R或K可增强免疫原性而不破坏依赖电荷的交叉反应性。
通过用I,L,M,V,F,W,或Y替换位置6的R。如位置5的相同告诫 (caveats)和备选适用于这里。
通过用W或F替换位置7的L以改善结合。通过该模型(NIH算法) 通常不预测在该位置V,I,S,T,Q,或N替换减少结合亲和力,然而如上所 讨论可以是有利的。
Y和W,其是同等优选为位置1和8的Fs,可以激发有效的交叉反 应性。最后虽然朝体积大的方向的替换通常是偏向于改善免疫原性,按照 尺寸的对比,而不是本身体积大,是免疫原性的重要因素的理论,替换较 小残基如位置3-7的A,S和C可以是有效的。C中巯基的反应性可以引 入如在Chen,J.-L.,等J.Immunol.165:948-955,2000中所讨论的其它特性 中。
表3.对于HLA-A*0201*的9-链节系数表 文件“A 0201标准”的HLA系数表 氨基酸 类型 1st 2nd 3rd 4th 5th 6th 7th 8th 9th A 1.000 1.000 1.000 1.000 1.000 1.000 1.000 1.000 1.000 C 1.000 0.470 1.000 1.000 1.000 1.000 1.000 1.000 1.000 D 0.075 0.100 0.400 4.100 1.000 1.000 0.490 1.000 0.003 E 0.075 1.400 0.064 4.100 1.000 1.000 0.490 1.000 0.003 F 4.600 0.050 3.700 1.000 3.800 1.900 5.800 5.500 0.015 G 1.000 0.470 1.000 1.000 1.000 1.000 0.130 1.000 0.015 H 0.034 0.050 1.000 1.000 1.000 1.000 1.000 1.000 0.015 I 1.700 9.900 1.000 1.000 1.000 2.300 1.000 0.410 2.100 K 3.500 0.100 0.035 1.000 1.000 1.000 1.000 1.000 0.003 L 1.700 72.000 3.700 1.000 1.000 2.300 1.000 1.000 4.300 M 1.700 52.000 3.700 1.000 1.000 2.300 1.000 1.000 1.000 N 1.000 0.470 1.000 1.000 1.000 1.000 1.000 1.000 0.015 P 0.022 0.470 1.000 1.000 1.000 1.000 1.000 1.000 0.003 Q 1.000 7.300 1.000 1.000 1.000 1.000 1.000 1.000 0.003 R 1.000 0.010 0.076 1.000 1.000 1.000 0.200 1.000 0.003 S 1.000 0.470 1.000 1.000 1.000 1.000 1.000 1.000 0.015 T 1.000 1.000 1.000 1.000 1.000 1.000 1.000 1.000 1.500 V 1.700 6.300 1.000 1.000 1.000 2.300 1.000 0.410 14.000 W 4.600 0.010 8.300 1.000 1.000 1.700 7.500 5.500 0.015 Y 4.600 0.010 3.200 1.000 1.000 1.500 1.000 5.500 0.015
*将该表和公众可利用的其它可比较数据用于设计表位变体和确定一种特 定变体是否是在物质上相似,或是在功能上相似。
实施例3
聚簇分析(SSX-231-68)
1.表位聚簇区域预测:
计算机算法:基于H.G.Rammensee,J.Bachmann和S.Stevanovic的 书“MHC Ligands and Peptide Motifs”SYFPEITHI(因特网访问http:// syfpeithi.bmi-heidelberg.com/Scripts/MHCServer.dll/EpPredict.htm);和在 Parker,K.C.,等,J.Immunol.152:163,1994中描述的HLA肽结合预测 (NIH)(因特网访问http://bimas.dcrt.nih.gov/molbio/hla_bin);用来分析 SSX-2(GI:10337583)的蛋白质序列。如在2000年4月28日提交的题为 “EPITOPE CLUSTERS,”的美国专利号09/561,571中所充分描述的那样 定义表位聚簇(含有比具有高预测MHC亲和力的肽片段的平均密度高的 区域)。使用表位密度比率的截止值(cutoff)为2,分别使用SYFPETHI和 NIH算法定义5个和2个聚簇,并且肽记分截止值为16(SYFPETHI)和 5(NIH)。使用NIH算法得分最高的肽,SSX-241-49,具有估计>1000min 的解离半衰期,在NIH分析中不重叠任何其它预测的表位但确实与 SSX-257-65聚簇。
2.肽合成和表征:
通过MPS(Multiple Peptide Systems,San Diego,CA 92121)使用标准 固相化学合成SSX-231-68,YFSKEEWEKMKASEKIFYVYMKRKYEAMT KLGFKATLP(SEQID NO.10)。按照提供的“分析证明书”,该肽的纯度 为95%。
3.蛋白酶体消化:
使用在2000年4月28日提交的题为“METHOD OF EPITOPE DISCOVERY,”的美国专利申请号09/561,074中描述的蛋白酶体分离方案 从人红细胞分离蛋白酶体。将在所述PCT出版物和申请中公开的教导和实 施方案考虑作为涉及本发明和关于本发明有用的支持原理和实施方案。将 SDS-PAGE,蛋白质印迹,和ELISA用作质量控制测定。蛋白酶体的最终 浓度为4mg/ml,其是通过无干扰蛋白质测定法(Geno Technologies Inc.) 测定的。将蛋白酶体-70℃保存在25μl等分试样中。
将SSX-231-68溶解在Milli-Q水中,制备2mM母液,并将20μl等分 试样保存在-20℃。
从-70℃存储器取出1管蛋白酶体(25μl)并在冰上解冻。然后通过反 复吸取(将样品保持在冰上)将它与12.5μL 2mM的肽彻底混合。在混合 后立即取5μL样品并转移至含有1.25μL 10%TFA的试管中(TFA的终浓 度为2%);T=0min样品。然后开始并在37℃程控热控制器中进行蛋白酶 体消化反应。分别在15,30,60,120,180和240min取出另外的5μL 样品,如以前通过将样品加入1.25μL 10%TFA中终止反应。将样品保持 在冰上或冷冻直至通过MALDI-MS分析。为了HPLC分析和N-末端测序 所有的样品被保留和储存在-20℃。将单独的肽(没有蛋白酶体)用作空白 对照:2μL肽+4μL Tris缓冲液(20mM,pH7.6)+1.5μL TFA。
4.MALDI-TOF MS测量:
对于每个时间点首先将0.3μL基质溶液(10mg/ml α-氰基-4-羟基肉 桂酸的AcCN/H2O溶液(70∶30))施加于样品载玻片上,然后在载玻片上 将等体积的消化样品与基质溶液轻轻混合。在获得质谱前使载玻片室温空 气干燥3-5分钟。在用肽/蛋白质标样校准的Lasermat 2000 MALDI-TOF 质谱仪上进行MS。为了改善测量的准确度,将肽底物的分子离子量(MH +)用作内校准标准物。在图4中显示T=120min.消化样品的质谱。
5.MS数据分析和表位鉴定:
为了指定测量的质量峰,使用计算机程序MS-Product,一种来源于 UCSF Mass Spectrometry Facility(可访问http://prospector.ucsf.edu /ucsfhtml3.4/msprod.htm)的工具来产生所有可能的片段(N-和C-末端离 子,和内部片段)和它们对应的分子量。由于质谱仪的灵敏度,使用平均 分子量。如表4中总结,鉴定了在消化期间观测到的质量峰。
选择通过SYFPEITHI或NIH算法预测与HLA结合的具有8-10个氨 基酸长序列的共C末端片段来进一步研究。方法的消化和预测步骤可以以 任何顺序有效实行。尽管在此描述的蛋白酶体消化中使用的底物肽是特别 设计来包括预测的HLA-A2.1结合序列,但是可事后检测实际的消化产物 对其它MHC分子的实际或预测的结合。选择的结果在表5中显示。
表4.SSX-231-68质量峰鉴定 MS 峰(测量) 肽 序列 计算质量(MH+) 988.23 31-37 YFSKEEW 989.08 1377.68±2.38 31-40 YFSKEEWEKM 1377.68 1662.45±1.30 31-43 YFSKEEWEKMKAS 1663.90 2181.72±0.85 31-47 YFSKEEWEKMKASEKIF 2181.52 2346.6 31-48 YFSKEEWEKMKASEKIFY 2344.71 1472.16±1.54 38-49 EKMKASEKIFYV 1473.77 2445.78±1.18 31-49* YFSKEEWEKMKASEKIFYV 2443.84 2607. 31-50 YFSKEEWEKMKASEKIFYVY 2607.02 1563.3 50-61 YMKRKYEAMTKL 1562.93 3989.9 31-61 YFSKEEWEKMKASEKIFYVYMKRKYEAMTKL 3987.77 1603.74±1.53 51-63 MKRKYEAMTKLGF 1603.98 1766.45±1.5 50-63 YMKRKYEAMTKLGF 1767.16 1866.32±1.22 49-63 VYMKRKYEAMTKLGF 1866.29 4192.6 31-63 YFSKEEWEKMKASEKIFYVYMKRKYEAMTKLGF 4192.00 4392.1 31-65** YFSKEEWEKMKASEKIFYVYMKRKYEAMTKLGFKA 4391.25
黑体序列对应于预测与MHC结合的肽。
*仅仅基于质量该峰也可指定为肽32-50,然而,蛋白酶体只去除N-末端 氨基酸是不大可能的。N-末端测序(下面)证实确定为31-49。
**基于质量该片段也可能表示33-68。下面的N-末端测序与确定为31-65 一致。
表5.预测通过蛋白酶体产生片段的HLA结合 SEQ ID NO. 肽 HLA SYFPEITHI NIH 11 FSKEEWEKM B*3501 NP_ 90 12 KMKASEKIF B*08 17 <5 13 & (14) (K)MKASEKIFY A1 19(19) <5 15 & (16) (M)KASEKIFYV A*0201 22(16) 1017 B*08 17 <5 B*5101 22(13) 60 B*5102 NP 133 B*5103 NP 121 17 & (18) (K)ASEKIFYVY A1 34(19) 14 19 & (20) (K)RKYEAMTKL A*0201 15 <5 A26 15 NP B14 NP 45(60) B*2705 21 15 B*2709 16 NP B*5101 15 <5 21 22 23 KYEAMTKLGF YEAMTKLGF EAMTKLGF A1 16 <5 A24 NP 300 B*4403 NP 80 B*08 22 <5
_未预测
如表5所示,将真实序列(authentic sequence)附加在表位N-末端可 产生针对相同或不同MHC限制性元件的表位。特别注意(K) RKYEAMTKL(SEQ ID NOS 19和(20))与HLA-B14的配对,其中10- 链节具有比共-C-末端9-链节更长的预测解离半衰期。还注意10-链节 KYEAMTKLGF(SEQ ID NO.21)的情形,通过依赖于N-末端修剪以产 生针对HLA-B*4403和-B*08的表位其可用作对几种MHC类别有效的疫 苗。
6.HLA-A0201结合测定:
使用Stauss等的方法(Proc Natl Acad Sci USA 89(17):7871-5(1992)) 的改进测定候选表位KASEKIFYV,SSX-241-49,(SEQ ID NO.15)与 HLA-A2.1的结合。具体地,在它们表面表达空的或不稳定MHC分子的 T2细胞用Iscove的改进Dulbecco′s培养基(IMDM)洗涤两次,并于96 孔平底平板中以3×105细胞/200μl/孔的浓度在补充有3μg/ml人β2-微球蛋 白的无血清AIM-V培养基(Life Technologies,Inc.,Rockville,MD)中培养 过夜,并加入800,400,200,100,50,25,12.5和6.25μg/ml的肽。在 分配至平板前通过反复吸取将肽与细胞混合(备选地可将肽加入单独孔), 轻轻摇动平板2分钟。在37℃5%CO2的培养箱中温育。次日通过用无血 清RPMI培养基洗涤两次去除未结合的肽并加入饱和量的抗-I类HLA单 克隆抗体,异硫氰酸荧光素(FITC)-偶联的抗-HLAA2,A28(One Lambda, Canoga Park,CA)。在4℃温育30分钟后,用补充有0.5%BSA,0.05%(w/v) 叠氮化钠,pH7.4-7.6(染色缓冲液)的PBS洗涤细胞3次。(备选地可以 将W6/32(Sigma)用作抗-I类HLA单克隆抗体,用染色缓冲液洗涤细胞, 与偶联异硫氰酸荧光素(FITC)的羊F(ab’)抗鼠-IgG(Sigma)4℃温育 30min并如上洗涤3次)。将细胞再悬浮于0.5ml染色缓冲液中。通过使 用FACScan(Becton Dickinson,San Jose,CA)的流式细胞仪进行通过肽结 合稳定的表面HLA-A2.1分子的分析。如果流式细胞计量术不是立即实行, 可以通过加入四分之一体积的2%低聚甲醛并暗处保存在4℃来固定细胞。
实验的结果在图5中显示。发现SSX-241-49(SEQ ID NO.15)与 HLA-A2.1结合,其结合程度与用作阳性对照的已知A2.1结合物 FLPSDYFPSV(HBV18-27;SEQ ID NO:24)类似。将HLA-B44结合肽, AEMGKYSFY(SEQ ID NO:25)用作阴性对照。从阴性对照获得的荧光 与当在测定中不使用肽时获得的信号类似。阳性和阴性对照肽是选自 Current Protocols in Immunology p.18.3.2,John Wiley和Sons,New York, 1998的表18.3.1。
7.免疫原性:
A.小鼠体内免疫
麻醉并在尾底避开侧尾静脉,使用100μl含有100nmol的SSX-241-49 (SEQ ID NO.15)和20μg用50μl IFA(不完全弗氏佐剂)乳化的PBS中 的HTL表位肽皮下注射HHD1转基因A*0201小鼠(Pascolo,S.,等,J. Exp.Med.185:2043-2051,1997)。
B.制备刺激细胞(LPS胚细胞)
对于每组免疫小鼠使用来源于2只稚鼠(naive mice)的脾,处死未 免疫小鼠并将尸体放置于酒精中。使用无菌工具,刺穿小鼠左侧(较低的 中间部分)皮肤的上皮层,暴露腹膜。用乙醇饱和腹膜,无菌取出脾。将 脾放置于含有无血清培养基的培养皿中。通过使用来自3ml注射器的无菌 柱塞捣碎脾来分离脾细胞。漂洗皿孔,将脾细胞收集在50ml锥形管中的 无血清培养基中。将细胞离心(12000rpm,7min)并用RPMI洗涤一次。 在RPMI-10%FCS(胎牛血清)中再悬浮新鲜脾细胞至浓度为每ml 1×106 细胞。加入25g/ml脂多糖和7μg/ml葡聚糖硫酸酯。在含有5%CO2的37 ℃T-75烧瓶中将细胞温育3天。将脾胚细胞收集在50ml试管中,离心 (pellet)(12000rpm,7min),并在RPMI中再悬浮至3X107/ml。用50μg/ml 引发肽(priming peptide)室温脉冲胚细胞4小时,25μg/ml丝裂霉素C 37 ℃处理20min,并用DMEM洗涤三次。
C.体外刺激
在LPS刺激胚细胞3天后和肽加样的同一天,如上处死接触过抗原 的小鼠(免疫后14天)以取出脾。将3×106脾细胞与1×106 LPS胚细胞/ 孔在DMEM培养基的24孔平板中在5%CO2的条件下37℃共培养,所述 DMEM培养基补充有10%FCS,5×10-5 Mβ-巯基乙醇,100μg/ml链霉素 和100IU/ml青霉素。在第3天向培养物加入5%(vol/vol)ConA上清液并 在第7天在51Cr-释放测定中测定溶细胞活性。
D.测量CTL活性的铬释放测定
为了评估肽特异性溶解,将2×106 T2细胞与100μCi铬酸钠加上50 μg/ml肽一起37℃温育1小时。在温育期间,每15分钟将它们轻轻振荡。 在标记和加样后,用10ml DMEM-10%FCS将细胞洗涤3次,在流出上清 液后用新鲜的Kimwipe擦拭每个试管。将靶细胞再悬浮于DMEM-10% FBS浓度为1×105/ml。在DMEM-10%FCS中将效应细胞调整至1×107/ml 并在U-底96孔平板中制备100μl系列3倍稀释度的效应物。每孔加100μl 靶细胞。为了测定自发释放和最大释放,对于每个靶子准备含有100μl靶 细胞的6个附加孔。通过将靶细胞与100μl培养基温育来显示自发释放; 通过将靶细胞与100μl 2%SDS温育来显示最大释放。然后将平板600rpm 离心5分钟并在5%CO2和80%湿度条件下37℃温育4小时。在温育后, 然后将平板1200rpm离心5min。收获上清液并用γ计数器计数。如下测 定特异性裂解:%特异性释放=[(实验释放-自发释放)/(最大释放-自发 释放)]×100。
在图6中显示证明肽脉冲的靶细胞特异性裂解的铬释放测定的结果。 8.与其它SSX蛋白质的交叉反应性:
SSX-241-49(SEQ ID NO.15)与其它SSX蛋白质的相同区域共享高度序 列同一性。周围区域也通常已经十分保守。因此在所有5个序列中管家蛋 白酶体可以在V49之后切割。此外,预测SSX-241-49与HLA-A*0201结合 (参见表6)。通过用SSX-241-49免疫产生的CTL与表达其它SSX蛋白质 的肿瘤细胞交叉反应。
表6.SSX41-49-A*0201预测结合 SEQ ID NO. 家族成员 序列 SYFPEITHI 得分 NIH 得分 15 SSX-2 KASEKIFYV 22 1017 26 SSX-1 KYSEKISYV 18 1.7 27 SSX-3 KVSEKIVYV 24 1105 28 SSX-4 KSSEKIVYV 20 82 29 SSX-5 KASEKIIYV 22 175
实施例4
聚簇分析(PSMA163-192)
在433A ABI肽合成仪上使用标准固相F-moc化学合成一种肽, AFSPQGMPEGDLVYVNYARTEDFFKLERDM,PSMA163-192,(SEQ ID NO. 30),其含有来源于前列腺特异性膜抗原的A1表位聚簇,PSMA168-190(SEQ ID NO.31)。在侧链脱保护和从树脂切割后,在反相制备HPLC C4柱上以 下列条件:流速为4ml/min的线性AB梯度(5%B/min),其中洗脱剂A 是0.1%TFA水溶液并且洗脱剂B是0.1%TFA的乙腈溶液,运行首先溶解 在甲酸中,然后稀释在30%乙酸中的肽。将根据质谱分析,在时间16.642 min处的含有期望肽的组分汇集和冻干。然后基本上如上所述将该肽进行 蛋白酶体消化和质谱分析。在表7中总结来源于质谱的显著峰。
表7.PMSA163-192质量峰鉴定 肽 序列 计算质量(MH+) 163-177 AFSPQGMPEGDLVYV 1610.0 178-189 NYARTEDFFKLE 1533.68 170-189 PEGDLVYVNYARTEDFFKLE 2406.66 178-191 NYARTEDFFKLERD 1804.95 170-191 PEGDLVYVNYARTEDFFKLERD 2677.93 178-192 NYARTEDFFKLERDM 1936.17 163-176 AFSPQGMPEGDLVY 1511.70 177-192 VNYARTEDFFKLERDM 2035.30 163-179 AFSPQGMPEGDLVYVNY 1888.12 180-192 ARTEDFFKLERDM 1658.89 163-183 AFSPQGMPEGDLVYVNYARTE 2345.61 184-192 DFFKLERDM 1201.40 176-192 YVNYARTEDFFKLERDM 2198.48 167-185 QGMPEGDLVYVNYARTEDF 2205.41 178-186 NYARTEDFF 1163.22
黑体序列对应于预测与MHC结合的肽,参见表8。
N-末端池测序(pool sequence)分析
通过ABI 473A蛋白质测序仪(Applied Biosystems,Foster City,CA)将 蛋白酶体消化一小时的一个等分试样(参见上述实施例3部分3)进行N- 末端氨基酸序列分析。切割位点和效率的测定是基于测序循环(sequence cycle),蛋白质测序仪的重复产率和在分析序列中唯一的氨基酸的相对产 率的考虑。即如果唯一的(在分析序列中)残基X只出现在第n个循环中, 在它N-末端方向n-1个残基之前存在一个切割位点。除帮助解析在将质量 指定为序列中的任何错读,这些数据还提供一种比质谱更可靠的各种片段 相对产率的指示法。
对于PSMA163-192(SEQ ID NO.30)该池测序支持在V177后单一的主要 切割位点和几个次要切割位点,特别是在Y179后的一个。综述在图7A-C 中表示的结果显示下列各项:
第3循环的S表明底物N-末端的存在。
第5循环的Q表明底物N-末端的存在。
第1循环的N表明在V177后的切割。
第3循环的N表明在V175后的切割。注意表7中的片段176-192。
第5循环的T表明在V177后的切割。
第1至第3循环的T表明在R181,A180和Y179后愈加普通的切割。只 有这些的最后一项对应通过质谱检测的峰;163-179和180-192,参见表7。 缺少其它可表明它们是在比质谱中检测更小的片段上。
第4,第8,和第10循环的K表明分别在E183,Y179和V177后的切割,
所有这些对应通过质谱观测到的片段。参见表7。
第1和第3循环的A分别表明底物N-末端的存在和在V177后的切割。
在第4和第8循环的P表明底物N-末端的存在。
第6和第10循环的G表明底物N-末端的存在。
第7循环的M表明底物N-末端的存在和/或在F185后的切割。
第15循环的M表明在V177后的切割。
第1循环可以表明在D191后的切割,参见表7。
第4和第13循环的R表明在V177后的切割。
第2和第11循环的R表明在Y179后的切割。
第2,第6和第13循环的V分别表明在V175,M169后的切割和底物 N-末端的存在。注意表7中在176和170开始的片段。
第1,第2和第14循环的Y分别表明在V175,V177后的切割和底物 N-末端的存在。
第11和第12循环的L分别表明在V177后的切割和底物N-末端的存在, 是与其它数据最一致的解释。与质谱结果相比我们发现第2,第5和第9 循环的L分别与在Fz186,E183或M169,和Y179后的切割一致。参见表7。
表位鉴定
选择通过SYFPEITHI或NIH算法预测与HLA结合的具有8-10个 氨基酸长序列的共C-末端片段进一步分析。方法的消化和预测步骤可以以 任何顺序有效实行。尽管在此描述的蛋白酶体消化中使用的底物肽是特别 设计来包括预测的HLA-A1结合序列,但是可事后检测实际的消化产物对 其它MHC分子的实际或预测的结合。选择的结果在表8中显示。
表8.通过蛋白酶体产生的片段预测HLA结合 SEQ ID NO 肽 HLA SYFPEITHI NIH 32 & (33) (G)MPEGDLVYV A*0201 17(27) (2605) B*0702 20 <5 B*5101 22 314 34 & (35) 36 (Q)GMPEGDLVY MPEGDLVY A1 24(26) <5 A3 16(18) 36 B*2705 17 25 B*5101 15 NP_ 37 & (38) (P)EGDLVYVNY A1 27(15) 12 A26 23(17) NP 39 LVYVNYARTE A3 21 <5 40 & (41) (Y)VNYARTEDF A26 (20) NP B*08 15 <5 B*2705 12 50 42 43 NYARTEDFF YARTEDFF A24 NP_ 100 Cw*0401 NP 120 B*08 16 <5 44 RTEDFFKLE A1 21 <5 A26 15 NP
_未预测
HLA-A*0201结合测定:
基本上如实施例3中所述使用PSMA168-177,GMPEGDLVYV,(SEQ ID NO.33)进行HLA-A*0201结合研究。如图8所示,在即使比阳性对照肽 更低的浓度下该表位也显示显著的结合。在该测定中(并贯穿本公开内容) 用作对照的Melan-A肽,ELAGIGILTV实际上是天然序列(EAAGIGILTV) 的一种变体并且在该测定中显示高亲和力。
实施例5
聚簇分析(PSMA281-310)
在433A ABI肽合成仪上使用标准固相F-moc化学合成另一种肽, RGIAEAVGLPSIPVHPIGYYDAQKLLEKMG,PSMA281-310,(SEQ ID NO. 45),其含有来源于前列腺特异性膜抗原A1表位,PSMA283-307(SEQ ID NO. 46)。在侧链脱保护和从树脂切割后,在反相制备HPLC C18柱上以下列 条件:流速为4ml/min的线性AB梯度(5%B/min),其中洗脱剂A是0.1% TFA水溶液并且洗脱剂B是0.1%TFA的乙腈溶液,运行去离子水(ddH2O) 中的肽。将根据质谱分析,在时间17.061min处的含有期望肽的组分汇集 和冻干。然后基本上如上所述将肽进行蛋白酶体消化和质谱分析。在表9 中总结来源于质谱的显著峰。
表9.PSMA281-310质量峰鉴定
黑体序列对应于预测与MHC结合的肽,参见表10。
*只根据质量该峰也可以是296-310或288-303。
**只根据质量该峰也可以是298-307。HPLC与质谱的结合显示在一些较 后的时间点该峰是两种物质的混合物。
_只根据质量该峰也可以是289-298。
?只根据质量该峰也可以是281-295或294-306。
§只根据质量该峰也可以是297-303。
只根据质量该峰也可以是285-306。
#只根据质量该峰也可以是288-303。
N-末端池测序分析不支持任何这些备选的指定。
N-末端池测序分析
通过ABI 473A蛋白质测序仪(Applied Biosystems,Foster City,CA)将 蛋白酶体消化一小时的一个等分试样(参见上述实施例3部分3)进行N- 末端氨基酸序列分析。切割位点和效率的测定是基于测序循环(sequence cycle),蛋白质测序仪的重复产率和在分析序列中唯一的氨基酸的相对产 率的考虑。即如果唯一的(在分析序列中)残基X只出现在第n个循环中, 在它N-末端方向n-1个残基之前存在一个切割位点。除帮助解析在将质量 指定为序列中的任何错读,这些数据还提供一种比质谱更可靠的各种片段 相对产率的指示法。
对于PSMA281-310(SEQ ID NO.45)该池测序支持在其它次要切割位点 中的V287和I297后的两个主要切割位点。综述图9中表示的结果显示下列 各项:
第4和第11循环的S分别表明在V287后的切割和底物N-末端的存在。
第8循环的H表明在V287后的切割。相对于在10至11存在的高度 下降,在位置9和10处缺乏峰高的下降,而不是表示测序反应中潜伏状 态的峰可提示在A286和E285后也切割。
第2,第4和第7循环的D分别表明在Y299,I297和V294后的切割。 在表10中的任何片段中或在下面注释的备选指定中未观测到这最后的切 割。
第6循环的Q表明在I297后的切割。
第10和第12循环的M分别表明在Y299和I297后的切割。
表位鉴定
选择通过SYFPEITHI或NIH算法预测与HLA结合的具有8-10个 氨基酸长序列的共C-末端片段进一步分析。方法的消化和预测步骤可以以 任何顺序有效实行。尽管在此描述的蛋白酶体消化中使用的底物肽是特别 设计来包括预测的HLA-A1结合序列,但是可事后检测实际的消化产物对 其它MHC分子的实际或预测的结合。选择的结果在表10中显示。
表10.
通过蛋白酶体产生的片段:PSMA281-310预测HLA结合 SEQ ID NO. 肽 HLA SYFPEITHI NIH 47 & (48) (G)LPSIPVH PI A*0201 16(24) (24) B*0702/B7 23 12 B*5101 24 572 Cw*0401 NP_ 20 49 & (50) (P)IGYYDAQ KL A*0201 (16) <5 A26 (20) NP B*2705 16 25 B*2709 15 NP B*5101 21 57 Cw*0301 NP 24 51 & (52) 53 (P)SIPVHPI GY IPVHPIGY A1 21(27) <5 A26 22 NP A3 16 <5 B*5101 16 NP 54 YYDAQKLLE A1 22 <5
_未预测
如表10所示,将真实序列附加在表位N-末端经常可以产生对相同或 不同MHC限制性元件仍然有效,甚至更好的表位。注意例如(G) LPSIPVHPI与HLA-A*0201的配对,其中通过依赖于N-末端修剪以产生 针对HLA-B7,-B*5101,和Cw*0401的表位,可以将10-链节用作对几种 MHC类型有效的疫苗。
HLA-A*0201结合测定:
基本上如上面实施例3和4中所述使用PSMA288-297,GLPSIPVHPI, (SEQ ID NO.48)进行HLA-A*0201结合研究。如图8所示,在即使比阳 性对照肽更低的浓度下该表位也显示显著的结合。
实施例6
聚簇分析(PSMA454-481)
通过MPS(纯度>95%)合成另一种肽,SSIEGNYTLRVDCTPLMY SLVHLTKEL,PSMA454-481,(SEQ ID NO.55),其含有来源于前列腺特异性 膜抗原的表位聚簇,如上所述将其进行蛋白酶体消化和质谱分析。在表11 中总结来源于质谱的显著峰。
表11.PSMA454-481质量峰鉴定 MS峰(测量) 肽 序列 计算质量(MH+) 1238.5 454-464 SSIEGNYTLRV 1239.78 1768.38±0.60 454-469 SSIEGNYTLRVDCTPL 1768.99 1899.8 454-470 SSIEGNYTLRVDCTPLM 1900.19 1097.63±0.91 463-471 RVDCTPLMY 1098.32 2062.87±0.68 454-471* SSIEGNYTLRVDCTPLMY 2063.36 1153 472-481** SLVHNLTKEL 1154.36 1449.93±1.79 470-481 MYSLVHNLTKEL 1448.73
黑体序列对应于预测与MHC结合的肽,参见表12。
*只基于质量该峰同样可以充分指定为肽455-472,然而蛋白酶体只去除 N-末端氨基酸是不大可能的。如果问题重要可以通过N-末端测序解决它。
**基于质量该片段也可表示455-464。
表位鉴定
选择通过SYFPEITHI或NIH算法预测与HLA结合的具有8-10个 氨基酸长序列的共C-末端片段进一步分析。方法的消化和预测步骤可以以 任何顺序有效实行。尽管在此描述的蛋白酶体消化中使用的底物肽是特别 设计来包括预测的HLA-A2.1结合序列,但是可事后检测实际的消化产物 对其它MHC分子的实际或预测的结合。选择的结果在表12中显示。
表12.通过蛋白酶体产生的片段预测HLA结合 SEQ ID NO 肽 HLA SYFPEITHI NIH 56 & (57) (S)IEGNYTLRV A1 (19) <5 58 EGNYTLRV A*0201 16(22) <5 B*5101 15 NP_ 59 & (60) (Y)TLRVDCTPL A*0201 20(18) (5) A26 16(18) NP B7 14 40 B8 23 <5 B*2705 12 30 Cw*0301 NP (30) 61 LRVDCTPLM B*2705 20 600 B*2709 20 NP 62 & (63) (L)RVDCTPLMY A1 32(22) 125(13.5) A3 25 <5 A26 22 NP B*2702 NP (200) B*2705 13(NP) (1000)
_未预测
如表12所示,将真实序列附加在表位N-末端经常可以产生对相同或 不同MHC限制性元件仍然有效,甚至更好的表位。注意例如(L) RVDCTPLMY(SEQ ID NOS 62和(63))与HLA-B*2702/5的配对,其中 10-链节具有具体的(substantial)预测解离半衰期而共-C-末端9-链节没有。 还注意SIEGNYTLRV(SEQ ID NO 57),一种预测的HLA-A*0201表位的 情形,通过依赖于N-末端修剪产生表位可以将其用作对HLA-B*5101有 效的疫苗。
HLA-A*0201结合测定
基本上如上面实施例3中所述使用PSMA460-469,TLRVDCTPL,(SEQ ID NO.60)进行HLA-A*0201结合研究。如图10所示,发现该表位和 HLA-A2.1以与用作阳性对照的已知A2.1结合物FLPSDYFPSV(HBV18-27; SEQ ID NO:24)类似程度的结合。此外,PSMA461-469,(SEQ ID NO.59)几 乎也结合。
ELISPOT分析: PSMA463-471 ,(SEQ ID NO.62)
通过使用50μl/孔的4μg/ml在包被缓冲液(35mM碳酸氢钠,15mM 碳酸钠,pH9.5)中的鼠抗人γ-IFN单克隆抗体在4℃温育过夜,用捕捉抗 体将硝化纤维基底(nitrocellulose-backed)的微量滴定板的孔包被。通过 用PBS洗涤4次5min去除未结合抗体。然后通过加入200μl/孔含有10% 血清的RPMI培养基并在室温温育1小时封闭膜上的未结合位点。将抗原 刺激的CD8+T细胞,以1∶3的系列稀释接种于微量滴定板的孔中,使用 100μl/孔,从2×105细胞/孔开始。(先前的抗原刺激基本上是如 Scheibenbogen,C.等Int.J.Cancer 71:932-936,1997中所述)。将 PSMA462-471(SEQ ID NO.62)加至终浓度为10μg/ml,IL-2至100U/ml,并 且在5%CO2,水饱和空气中37℃培养细胞40小时。在该温育后,用200 μl/孔的含有0.05%吐温-20的PBS(PBS-吐温)洗涤6次。加入检测抗体, 50μl/孔的2g/ml在PBS+10%胎牛血清中的生物素化的鼠抗人γ-IFN单克 隆抗体,并将平板在室温温育2小时。通过用200μl PBS-吐温洗涤4次除 去未结合的检测抗体。将100μl抗生物素蛋白偶联的辣根过氧化物酶 (Pharmingen,San Diego,CA)加至每个孔,并在室温温育1小时。通过 用200μl PBS-吐温洗涤6次去除未结合酶。通过将20mg 3-amino 9-ethylcoarbasole药片溶解在2.5ml N,N-二甲基甲酰胺并将那个溶液加至 47.5ml 0.05M磷酸盐-柠檬酸盐缓冲液(pH5.0)来制备底物。在将以100 μl/孔分配底物并于室温温育平板之前立即将25μl 30%H2O2加入底物溶 液中。在显色后(通常15-30min),通过用水洗涤平板终止反应。风干平 板并使用立体显微镜对斑点计数。
图11显示检测PSMA463-471(SEQ ID NO.62)-反应性HLA-A1+CD8+T 细胞,其是先前在HLA-A1+CD8+T细胞与自身树突细胞加上肽的培养物 中产生。从不含肽的培养物中未检测到反应性(数据未显示)。在该情形 中可以看到肽反应性T细胞是以2.2×104分之一至6.7×104分之一的频率存 在于培养物中。由抗-HLA-A1单克隆抗体阻断γ-IFN产生的能力证明这确 实是一种HLA-A1-限制性应答;参见图12。
实施例7
聚簇分析(PSMA653-687)
通过MPS(纯度>95%)合成另一种肽,FDKSNPIVLRMMNDQLMF LERAFIDPLGLPDRPFY PSMA653-687,(SEQ ID NO.64),其含有来源于前 列腺特异性膜抗原的A2表位聚簇,PSMA660-681(SEQ ID NO 65),并如上 所述进行蛋白酶体消化和质谱分析。在表13中总结来源于质谱的显著峰。
表13.PSMA653-687质量峰鉴定 MS峰(测量) 肽 序列 计算质量(MH+) 906.17±0.65 681-687** LPDRPFY 908.05 1287.73±0.76 677-687** DPLGLPDRPFY 1290.47 1400.3±1.79 676-687 IDPLGLPDRPFY 1403.63 1548.0±1.37 675-687 FIDPLGLPDRPFY 1550.80 1619.5±1.51 674-687** AFIDPLGLPDRPFY 1621.88 1775.48±1.32 673-687* RAFIDPLGLPDRPFY 1778.07 2440.2±1.3 653-672 FDKSNPIVLRMMNDQLMFLE 2442.932 1904.63±1.56 672-687* ERAFIDPLGLPDRPFY 1907.19 2310.6±2.5 653-671 FDKSNPIVLRMMNDQLMFL 2313.82 2017.4±1.94 671-687 LERAFIDPLGLPDRPFY 2020.35 2197.43±1.78 653-670 FDKSNPIVLRMMNDQLMF 2200.66
黑体序列对应于预测与MHC结合的肽,参见表13。
*仅仅基于质量该峰同样可以充分指定为在654开始的肽,然而蛋白酶体 只去除N-末端氨基酸被认为不大可能。如果问题重要,可以通过N-末端 测序解决它。
**仅仅基于质量这些峰可以已指定为内部片段,但考虑到消化的总体模式 认为它不大可能。
表位鉴定
选择通过SYFPEITHI或NIH算法预测与HLA结合的具有8-10个 氨基酸长序列的共C-末端片段进一步分析。方法的消化和预测步骤可以以 任何顺序有效实行。尽管在此描述的蛋白酶体消化中使用的底物肽是特别 设计来包括预测的HLA-A2.1结合序列,但是可事后检测实际的消化产物 对其它MHC分子的实际或预测的结合。选择的结果在表14中显示。
表14.通过蛋白酶体产生的片段预测HLA结合 SEQ ID NO 肽 HLA SYFPEITHI NIH 66 & (67) (R)MMNDQLMF L A*0201 24(23) 1360(722) A*0205 NP_ 71(42) A26 15 NP B*2705 12 50 68 RMMNDQLMF B*2705 17 75
_未预测
如表14所示,将真实序列附加在表位N-末端经常可以产生对相同或 不同MHC限制性元件仍然有效,甚至更好的表位。注意例如(R) MMNDQLMFL(SEQ ID NOS.66和(67))与HLA-A*02的配对,其中10- 链节保持显著的(substantial)预测结合潜力。
HLA-A*0201结合测定
基本上如上面实施例3所述,使用PSMA663-671(SEQ ID NO.66)和 PSMA662-671,RMMNDQLMFL(SEQ NO.67)进行HLA-A*0201结合研究。 如图10,13和14所示,在即使比阳性对照肽(FLPSDYFPSV(HBV18-27); SEQ ID NO:24)低的浓度下该表位也显示显著的结合。尽管不是平行进行, 与对照的比较提示PSMA662-671(其在亲和力方面接近MelanA肽)具有这 两种PSMA肽的优越结合活性。
实施例8
用表位疫苗接种。
1.用肽疫苗接种:
A.结节内递送
使用为胰岛素递送开发的微型泵系统(MiniMed;Northridge,CA)将 一种制剂,其包含在含有抗菌剂,抗氧化剂和免疫调制细胞因子的水性缓 冲剂中的肽,连续几天注射于腹股沟淋巴结。为了模拟在自然感染中抗原 呈递的动力学选择该灌输周期。
B.控释
使用本领域已知的可控PLGA微球体递送肽制剂,所述PLGA微球 体改变肽的药物动力学和改善免疫原性。将该制剂注射或口服。
C.基因枪送递
制备一种肽制剂,其中将肽粘附在本领域已知的金微粒上。在基因枪 中递送颗粒,其被高速加速以便穿透皮肤,将颗粒携带至包含pAPCs的皮 肤组织中。
D.气溶胶送递
为了吸收于肺中适当的血管或淋巴组织之中将肽制剂作为一种本领 域已知的气溶胶吸入。
2.用核酸疫苗接种
使用微型泵系统,如MiniMed胰岛素泵将核酸疫苗注射于淋巴结中。 为了模拟在自然感染中抗原呈递的动力学,经几天的灌输周期递送一种核 酸构建体,其是在含有抗菌剂,抗氧化剂和免疫调制细胞因子的水性缓冲 剂中配制。
任选地,使用控释物质,如PLGA微球体或其它生物可降解物质递 送核酸构建体。将这些物质注射或口服。使用口服送递给予核酸疫苗,通 过吸收于GALT组织中引发免疫应答。备选地,使用基因枪递送核酸疫苗, 其中将核酸疫苗粘附在微细金颗粒上。为了吸收于肺中适当的血管或淋巴 组织之中,还可以将核酸构建体作为气溶胶吸入。
实施例9
测定表位疫苗的效力
1.四聚体分析:
使用I类四聚体分析来测定给药管家表位之前和之后动物中的T细胞 频率。对表位应答的T细胞克隆扩增表明表位由pAPCs呈递至T细胞。 在对动物给药表位之前和之后测量针对管家表位的特异性T细胞频率,以 确定表位是否呈递在pAPCs上。给药后表位特异性T细胞频率的增大表 明表位是在pAPC上呈递。
2.增殖测定:
在用管家表位接种动物大约24小时后,使用为亲和纯化而固定在磁 珠上的针对pAPCs上存在的特异性标记的单克隆抗体从PBMCs,脾细胞 或淋巴结细胞收获pAPCs。使用该技术从粗血液或脾细胞制剂富集 pAPCs。然后将富集的pAPCs用于针对T细胞克隆的增殖测定,所述T 细胞克隆是已经产生并且对所关心管家表位是特异性的。将pAPCs与T 细胞克隆共温育并通过测量T细胞放射性标记胸苷的掺入监测T细胞增殖 活性。增殖表明对管家表位特异性的T细胞正被pAPCs上的表位所刺激。
3.铬释放测定:
使用管家表位免疫人类患者或被遗传改造而表达人I类MHC的非人 类动物。将来源于免疫受试者的T细胞用于标准铬释放测定,其使用人肿 瘤目标或改造来表达相同I类MHC的目标。T细胞杀死目标表明患者中 T细胞的刺激将有效杀死表达相似TuAA的肿瘤。
实施例10
通过淋巴结内免疫用裸DNA诱导CTL应答是有效的。
为了定量比较由不同途径免疫诱导的CD8+CTL应答使用一种质粒 DNA疫苗(pEGFPL33A),其含有完全表征(well-characterized)的来源 于LCMV-糖蛋白(G)(gp33;氨基酸33-41)(Oehen,S.,等.Immunology 99,163-169 2000)的免疫显性CTL表位,因为该系统允许广泛评估抗病毒 CTL应答。用滴定剂量(200-0.02μg)的pEGFPL33A DNA或对照质粒 pEGFP-N3免疫几组2只C57BL/6小鼠,其被i.m.(肌内),i.d.(皮内),i.spl. (脾内),或i.ln.(淋巴结内)给药。阳性对照小鼠i.v.(静脉内)接收500pfu LCMV。免疫10天后,分离脾细胞并在体外第二次再刺激之后测定gp33 特异性CTL活性。如图15所示,当给药高剂量的pEFGPL33A DNA(200μg) 时,i.m.或i.d.免疫诱导微弱的可检测的CTL应答。相反,仅使用2μg pEFGPL33A DNAi.spl.和使用少至0.2μg pEFGPL33A DNA i.ln.给予来免 疫引发有效的gp33特异性CTL应答(图15;符号表示个体小鼠,并且显 示了三个类似实验中的一个)。使用对照pEGFP-N3 DNA免疫未引发任何 可检测的gp33特异性CTL应答(数据未显示)。
实施例11
淋巴结内DNA免疫引发抗肿瘤免疫性
为了检验在i.ln.免疫后引发的有效CTL应答是否能够赋予针对外周 肿瘤的保护,使用10μg pEFGPL33A DNA或对照pEGFP-N3 DNA以6天 的间隔免疫几组6只C57BL/6小鼠3次。在最后一次免疫5天后,将小块 表达gp33表位(EL4-33)的实体瘤s.c.转移至两胁腹并且每3-4天测量肿 瘤的生长。尽管在已经反复用对照pEGFP-N3 DNA免疫的小鼠中EL4-33 肿瘤生长良好(图16),用pEFGPL33A DNA i.ln.免疫的小鼠迅速铲除外 周EL4-33肿瘤(图16)。
实施例12
淋巴结中DNA含量的差异反映在淋巴结内和肌内注射后CTL应答中的差 异。
i.ln.或i.m.注射pEFGPL33A DNA,并在6,12,24,48小时和4 和30天后通过实时PCR评估注射或引流淋巴结的质粒含量。i.m.注射后, 在6,12和24小时,注射淋巴结的质粒DNA含量大约比引流淋巴结的质 粒DNA含量大3个数量级。在随后的时间点在引流淋巴结中未检测到质 粒DNA(图17)。这与i.ln.注射相比使用i.m.以取得相似水平的CTL活 性需要大3个数量级的剂量一致。同样i.ln.注射CD8-/-剔除小鼠,其不 发展针对该表位的CTL应答,显示从淋巴结清除DNA不是因为CD8+ CTL在淋巴结中杀死细胞。该观察也支持i.ln.给药将不激发对淋巴结的免 疫病理损伤的结论。
实施例13
对人给药针对黑素瘤的治疗疫苗DNA质粒制剂
在1%苯甲醇,1%乙醇,0.5mM EDTA,柠檬酸盐-磷酸盐,pH7.6 中配制SYNCHROTOPE TA2M,一种黑素瘤疫苗,其编码HLA-A2-限制 性酪氨酸酶表位SEQ ID NO.1和表位聚簇SEQ ID NO.69。为了装载至 MINIMED 407C灌输泵中,制备80,160和320μg DNA/ml的等分试样。 将SILHOUETTE灌输装置的导管置于通过超声成像显现的腹股沟淋巴结 中。泵和灌输装置装配最初是设计用于将胰岛素递送至糖尿病患者,对于 本申请用31mm导管替换通常的17mm导管。将灌输装置保持开放4天 (约96小时),灌输速率为大约25μl/小时,导致大约2.4ml的总灌输体 积。因此对于上述的3种浓度,每种灌输的总给药剂量分别是约200和400 μg;并可以为800μg。开始后来的灌输之前给灌输的受试者10天的休息 期。假定在给药后质粒DNA在淋巴结中持续滞留(如在实施例12中)和 在抗原消失后CTL通常的应答动力学,该时间表将足以保持免疫CTL应 答。
实施例14
评估表位对非靶组织的交叉反应性
如上所提及,PSA是蛋白酶的激肽释放酶家族的一个成员,其自身 是丝氨酸蛋白酶家族的一个亚型。虽然与PSA共享最大程度序列同一性的 该家族成员也共享相似的表达图谱,但仍然可能具有显著不同表达图谱的 蛋白质共享单独的表位序列。评估不希望有的交叉反应性的第一步是鉴定 共享序列。完成这个的一种方法是使用“Searchfor short nearly exact matches”选项对SWISSPROT或Entrez非冗余肽序列数据库进行BLAST 搜索表位序列;可在万维网(http://www)“ncbi.nlm.nih.gov/blast/index. html”上访问超文本传输协议。因此对SWISSPROT搜索SEQ ID NO.104, WVLTAAHCI(局限于人的记录),发现四个精确匹配,包括PSA。其它3 个是来源于激肽释放酶1(组织激肽释放酶),和弹性蛋白酶2A和2B。 虽然这9个氨基酸区段是相同的,但侧翼序列完全不同,特别是C-末端一 侧,提示可进行不同加工并因此从这些其它的蛋白质可能不释放相同的表 位。(请注意激肽释放酶命名是混乱的)。因此激肽释放酶1[登记号P06870] 是与在关于肿瘤-相关抗原部分中上面关于PSA段落中提及的那种[登记号 AAD13817]不同的一种蛋白质)。
可以以几种方法检验该可能性。可以将含有内嵌在这些蛋白质每一种 的前后序列中的表位序列的合成肽进行如上所述的体外蛋白酶体消化和 分析。备选地,为了确定表位是否被加工和呈递,在利用识别该表位的 CD8+T细胞的细胞毒性(或类似的)测定中可以将通过天然或重组表达来 表达这些其它蛋白质的细胞用作目标。
实施例16
表位
上述方法学,特别是在实施例3-7中,已应用于另外的合成肽底物, 如图18-70所归纳的,导致如下表15-67所述的另外的表位的鉴定。此 处使用的底物通常设计以鉴定产生HLA-A*0201结合表位的管家蛋白酶 体加工的产物,但可以预测另外的MHC-结合反应性,如上所讨论。然而, 公开了许多这类反应性,这些列表是用于解释的,而非穷举或限制性的。 还如上所讨论,在改变组合和顺序过程中可以使用分析物的单独组分。当 在底物的消化物产生在MALDI-TOF质谱不能良好飞行的片段时,允许定 量各种切割和可以在需要的部位解决质谱中的不明确的N-末端池测序也 可用于鉴定切割位点。由于这些优势,它被常规使用。尽管它优选在观察 的片段的C-末端基础上鉴定表位,也可以在邻近表位的观察的片段的N- 末端基础上鉴定表位。
并非所有的底物必需满足如实施例3中引用的表位聚簇的正式定义。 一些聚簇是如此大以致它更方便地使用扫描仅部分聚簇的底物。在其它情 形,底物扩展超过满足正式定义的聚簇以包括临近预测的表位或围绕与任 何聚簇无关的预测表位设计。在一些情形中,在设计合成底物前,实际结 合活性指示当确定HLA结合活性以选择具有预测亲和力的肽时制备何种 底物。
图18-70显示作为质谱峰图谱的在底物序列上的蛋白酶体消化分析 的结果。每个图表示来自判断为全部数据代表的消化的单独时间点,然而, 在表15-67中列出的一些表位是基于在说明的特定时间点未观察的片段 而鉴定的。如上所述,通过N-末端池测序消化物形成对序列的峰图谱。用 断线表示可能对应多于一个片段的峰。但是,表位鉴定由明确存在相关切 割而支持。
实施例15:酪氨酸酶171-203
表15
通过管家蛋白酶体消化显示的优选表位 表位 序列 Sequence ID No. HLA 类型 HLA结合预测_ SYFPEITHI NIH 171-179 NIYDLFVWM 108 A0201 17 93.656 A26 25 N/A A3 18 <5 173-182 174-182 YDLFVWMHYY DLFVWMHYY 109 110 A1 A1 17 16 <5 <5 A26 30 N/A A3 16 27 186-194 DALLGGSEI 111 A0201 17 <5 B5101 26 440 191-200 GSEIWRDIDF 112 A1 18 67.5 192-200 SEIWRDIDF 113 B08 16 <5 193-201 EIEWRDIDFA 114 A26 20 N/A
_从参考上述(参见实施例3)的两个结合预测程序得出的分数。还参 见图18。
实施例16:酪氨酸酶401-427
表16
通过管家蛋白酶体消化显示的优选表位 表位 序列 Sequeuce ID No. ELA类型 HLA结合预测_ SYFPEITHI NIH 407-416 LQEVYPEANA 115 A0203 18 N/A 409-418 EVYPEANAPI 116 A26 19 N/A A3 20 <5 410-418 VYPEANAPI 117 B5101 15 6.921 411-418 YPEANAPI 118 B5101 22 N/A 411-420 YPEANAPIGH 119 A1 16 <5 416-425 APIGHNRESY 120 A1 18 <5 A26 15 N/A 417-425 PIGHNRESY 121 A1 16 <5 A26 21 N/A A3 17 <5 417-426 PIGHNRESYM 122 A26 19 N/A
_从参考上述(参见实施例3)的两个结合预测程序得出的分数。还参 见图19。
实施例17:酪氨酸酶415-449
表17通过管家蛋白酶体消化显示的优选表位 表位 序列 Sequence ID No. HLA类型 HLA结合预测_ SYFPEITHI NIH 416-425 APIGHNRESY 120 A1 18 <5 A26 15 N/A A3 17 <5 B0702 15 N/A 417-425 PIGHNRESY 124 A1 16 <5 A26 21 N/A A3 17 <5 423-430 ESYMVPFI 125 B5101 17 N/A 423-432 ESYMVPFIPL 126 A26 18 N/A 424-432 SYMVPFIPL 127 B0702 16 N/A 424-433 SYMVPFIPLY 128 A1 19 <5 A26 15 N/A 425-433 YMVPFIPLY 129 A0201 18 <5 A1 23 5 A26 17 N/A 426-434 MVPFIPLYR 130 A3 18 <5 426-435 MVPFIPLYRN 131 A26 16 N/A 427-434 VPFIPLYR 132 B5101 18 N/A 430-437 IPLYRNGD 133 B08 16 <5 430-439 IPLYRNGDFF 134 B0702 18 N/A 431-439 PLYRNGDFF 135 A26 18 N/A A3 24 <5 431-440 PLYRNGDFFI 136 A0201 16 23.43 A3 17 <5 434-443 RNGDFFISSK 137 A3 20 <5 435-443 NGDFFISSK 138 A3 15 <5 B2705 15 5
_从参考上述(参见实施例3)的两个结合预测程序得出的分数。还参见图20。
实施例18:酪氨酸酶457-484
表18通过管家蛋白酶体消化显示的优选表位 表位 序列 Sequence ID No. HLA类型 HLA结合预测_ SYFPEITHI NIH 463-471 YIKSYLEQA 139 A0201 18 <5 A26 17 N/A 466-474 SYLEQASRI 140 B5101 16 <5 469-478 EQASRIWSWL 141 A26 17 N/A 470-478 QASRIWSWL 142 B5101 16 55 471-478 ASRIWSWL 143 B08 16 <5 471-479 ASRTWSWLL 144 B08 16 <5 473-481 RIWSWLLGA 145 A0201 19 13.04 A26 16 N/A A3 15 <5
_从参考上述(参见实施例3)的两个结合预测程序得出的分数。还参见图21。
实施例19:CEA 92-118
表19通过管家蛋白酶消化显示的优选表位 表位 序列 Sequenc e ID No. HLA类型 HLA结合预测_ SYFPEITHI NIH 92-100 GPAYSGREI 146 B0702 18 8 B08 15 <5 B5101 22 484 92-101 GPAYSGREII 147 B0702 18 12 93-100 PAYSGREI 148 B5101 22 N.A. 93-101 PAYSGREII 149 B5101 24 48.4 93-102 PAYSGREIIY 150 A1 19 <5 94-102 AYSGREIIY 151 A1 21 <5 97-105 GREIIYPNA 152 B2705 17 200 B2709 16 98-107 REIIYPNASL 153 A0201 16 <5 99-107 EIIYPNASL 154 A0201 21 <5 A26 28 N.A. A3 16 <5 B0702 15 6 B08 18 <5 B2705 16 <5 99-108 EIIYPNASLL 155 A0201 16 <5 A26 27 N.A. A3 17 <5 100-107 IIYPNASL 156 B08 15 <5 100-108 IIYPNASLL 157 A0201 23 15.979 A26 21 N.A. A24 N.A. <5 A3 23 <5 B08 15 <5 B1510 15 N.A. B2705 16 50 B2709 15 100-109 IIYPNASLLI 158 A0201 22 7.804 A3 20 <5 102-109 YPNASLLI 159 B5101 23 N.A. 107-116 LLIQNIIQND 160 A0201 18 <5 A26 17 N.A.
_从参考上述(参见实施例3)的两个结合预测程序得出的分数。还参见图22。
实施例20:CEA 131-159
表20通过管家蛋白酶体消化显示的优选表位 表位 序列 Sequenc e ID No. HLA类型 HLA结合预测_ SYFPEITHI NIH 132-141 EEATGQFRVY 161 A1 19 <5 A26 21 N.A. 133-141 EATGQFRVY 162 A1 22 <5 A26 23 N.A. B5101 16 <5 141-149 YPELPKPSI 163 B0702 20 <5 B5101 22 572 142-149 PELPKPSI 164 B08 16 <5
_从参考上述(参见实施例3)的两个结合预测程序得出的分数。还参见图23。
实施例21:CEA 225-251
表21通过管家蛋白酶体消化显示的优选表位 表位 序列 Sequenc e ID No. HLA类型 HLA结合预测_ SYFPEITHI NIH 225-233 RSDSVILNV 165 A0201 15 <5 A1 22 <5 B2709 15 N.A. 225-234 RSDSVILNVL 166 A0201 15 <5 226-234 SDSVILNVL 167 A0201 17 <5 226-235 SDSVILNVLY 168 A1 20 <5 227-235 DSVILNVLY 169 A1 22 <5 A26 18 N.A. 233-242 VLYGPDAPTI 170 A0201 25 56.754 A3 23 <5 234-242 LYGPDAPTI 171 A0201 15 <5 B5101 15 5.72 235-242 YGPDAPTI 172 B5101 22 N.A. 236-245 GPDAPTISPL 173 A0201 15 <5 B0702 23 24 237-245 PDAPTISPL 174 A0201 15 <5 A26 16 N.A. B2705 15 <5 238-245 DAPTISPL 175 B5101 25 N.A. 239-247 APTISPLNT 176 B0702 20 6 240-249 PTISPLNTSY 177 A1 22 <5 A26 24 N.A. 241-249 TISPLNTSY 178 A1 20 5 A26 24 N.A. A3 20 <5
_从参考上述(参见实施例3)的两个结合预测程序得出的分数。还参见图24。
实施例22:CEA239-270
表22通过管家蛋白酶体消化显示的优选表位 表位 序列 Sequenc e ID No. HLA类型 HLA结合预测_ SYFPEITHI NIH 240-249 PTISPLNTSY 179 A1 22 <5 A26 24 N.A. 241-249 TISPLNTSY 180 A1 20 5 A26 24 N.A. A3 20 <5 246-255 NTSYRSGENL 181 A26 19 N.A. 247-255 TSYRSGENL 182 B2705 15 50 248-255 SYRSGENL 183 B08 18 <5 248-257 SYRSGENLNL 184 B0702 14 <5 249-257 YRSGENLNL 185 A0201 15 <5 B0702 16 <5 B2705 27 2000 B2709 22 N.A. 251-259 SGENLNLSC 186 A1 19 <5 253-262 ENLNLSCHAA 187 A0203 19 <5 254-262 NLNLSCHAA 188 A0201 17 <5
_从参考上述(参见实施例3)的两个结合预测程序得出的分数。还参见图25。
实施例23:CEA259-286
表23通过管家蛋白酶体消化显示的优选表位 表位 序列 Sequenc e ID No. HLA类型 LA结合预测_ SYFPEITHI NIH 260-269 HAASNPPAQY 189 A1 15 <5 261-269 AASNPPAQY 190 A1 17 <5 A3 17 <5 264-273 NPPAQYSWFV 191 B0702 18 <5 265-273 PPAQYSWFV 192 B0702 18 <5 B5101 19 20 266-273 PAQYSWFV 193 B5101 18 N.A. 272-280 FVNGTFQQS 194 A26 18 N.A. A3 15 <5
_从参考上述(参见实施例3)的两个结合预测程序得出的分数。还参见图26。
实施例24:CEA 309-336
表24通过管家蛋白酶体消化显示的优选表位 表位 序列 Sequenc e ID No. HLA类型 HLA结合预测_ SYFPEITHI NIH 310-319 RTTVTTITVY 195 A1 22 <5 A26 24 N.A. A3 15 <5 311-319 TTVTTITVY 196 A1 22 <5 A26 24 N.A. B2705 15 5 319-327 YAEPPKPFI 197 A0201 17 <5 A1 17 18 B5101 22 286 319-328 YAEPPKPFIT 198 A1 16 45 320-327 AEPPKPFI 199 B08 16 <5 321-328 EPPKPFIT 200 B5101 16 N.A. 321-329 EPPKPFITS 201 B0702 16 <5 B5101 16 12.1 322-329 PPKPFITS 202 B08 16 <5
_从参考上述(参见实施例3)的两个结合预测程序得出的分数。还参见图27。
实施例25:CEA 381-408
表25通过管家蛋白酶体消化显示的优选表位 表位 序列 Sequenc e ID No. HLA类型 HLA结合预测_ SYFPEITHI NIH 382-391 SVTRNDVGPY 203 A1 18 <5 A26 24 N.A. A3 21 <5 383-391 VTRNDVGPY 204 A1 23 <5 A26 24 N.A. 389-397 GPYECGIQN 205 B5101 17 11 391-399 YECGIQNEL 206 A0201 17 <5 B2705 17 30 394-402 GIQNELSVD 207 A26 15 N.A. A3 16 <5
_从参考上述(参见实施例3)的两个结合预测程序得出的分数。还参见图28。
实施例26:CEA 403-429
表26通过管家蛋白酶体消化显示的优选表位 表位 序列 Sequenc e ID No. HLA类型 HLA结合预测_ SYFPEITHI NIH 403-411 HSDPVILNV 208 A0201 17 <5 A1 26 37.5 403-412 HSDPVILNVL 209 A0201 17 <5 A1 19 7.5 A26 15 N.A. A24 N.A. 8.064 B4402 17 N.A. 404-412 SDPVILNVL 210 A0201 17 <5 B4402 16 N.A. 404-413 SDPVILNVLY 211 A1 20 <5 405-412 DPVILNVL 212 B08 16 <5 B5101 24 N.A. 405-413 DPVILNVLY 213 A1 18 <5 A26 18 N.A. B5101 16 7.26 408-417 ILNVLYGPDD 214 A3 15 <5 411-420 VLYGPDDPTI 215 A0201 25 56.754 A3 20 <5 412-420 LYGPDDPTI 216 A0201 15 <5 A24 N.A. 60 413-420 YGPDDPTI 217 B5101 22 N.A. 417-425 DPTISPSYT 218 B0702 16 <5 418-427 PTISPSYTYY 219 A1 21 <5 A26 27 N.A. 419-427 TISPSYTYY 220 A1 19 5 A26 27 N.A.
_从参考上述(参见实施例3)的两个结合预测程序得出的分数。还参见图29。
实施例27:CEA 416-448
表27通过管家蛋白酶体消化显示的优选表位 表位 序列 Sequence ID No. HLA类型 HLA结合预测_ SYFPEITHI NIH 418-427 PTISPSYTYY 221 A1 21 <5 A26 27 N.A. 419-427 TISPSYTYY 222 A1 19 5 A26 27 N.A. A3 18 <5 419-428 TISPSYTYYR 223 A3 15 5.4 424-433 YTYYRPGVNL 224 A0201 18 <5 A24 N.A. <5 A26 20 N.A. 425-433 TYYRPGVNL 225 A0201 14 <5 A24 N.A. 200 B0702 16 <5 B2705 16 5 426-433 YYRPGVNL 226 B08 16 <5 426-435 YYRPGVNLSL 227 A0201 17 <5 B0702 15 <5 427-435 YRPGVNLSL 228 A0201 17 <5 B2705 26 2000 B2709 21 N.A. 428-435 RPGVNLSL 229 B08 17 <5 B5101 17 N.A. 428-437 RPGVNLSLSC 230 B0702 14 <5 430-438 GVNLSLSCH 231 A26 16 N.A. B2705 15 <5 431-440 VNLSLSCHAA 232 A0203 19 N.A. 432-440 NLSLSCHAA 233 A0201 16 <5
_从参考上述(参见实施例3)的两个结合预测程序得出的分数。还参见图30。
实施例28:CEA 437-464
表28通过管家蛋白酶体消化显示的优选表位 表位 序列 Sequence ID No. HLA类型 HLA结合预测_ SYFPEITHI NIH 438-447 HAASNPPAQY 234 A1 15 <5 439-447 AASNPPAQY 235 A1 17 <5 A3 17 <5 442-451 NPPAQYSWLI 236 B0702 17 8 443-451 PPAQYSWLI 237 B0702 17 <5 B5101 21 40 444-451 PAQYSWLI 238 B5101 20 N.A. 449-458 WLIDGNIQQH 239 A0201 17 <5 A26 17 N.A. A3 21 <5 450-458 LIDGNIQQH 240 A0201 16 <5 A26 19 N.A. A3 17 <5 450-459 LIDGNIQQHT 241 A0201 16 <5 A26 15 N.A.
_从参考上述(参见实施例3)的两个结合预测程序得出的分数。还参见图31。
实施例29:CEA 581-607
表29通过管家蛋白酶体消化显示的优选表位 表位 序列 Sequence ID No. HLA类型 HLA结合预测_ SYFPEITHI NIH 581-590 RSDPVTLDVL 242 A0201 16 <5 A1 19 7.5 A26 15 N.A. A24 N.A. 9.6 582-590 SDPVTLDVL 243 A0201 16 <5 582-591 SDPVTLDVLY 244 A1 19 <5 583-590 DPVTLDVL 245 B08 16 <5 B5101 25 N.A. 583-591 DPVTLDVLY 246 A1 17 <5 A26 18 N.A. B5101 16 6 588-597 DVLYGPDTPI 247 A26 16 N.A. 589-597 VLYGPDTPI 248 A0201 25 56.754 A3 17 6.75 B5101 17 11.44 596-605 PIISPPDSSY 249 A1 15 <5 A26 25 N.A. A3 22 <5 597-605 IISPPDSSY 250 A1 20 5 A26 24 N.A. A3 24 <5
_从参考上述(参见实施例3)的两个结合预测程序得出的分数。还参见图32。
实施例30:CEA 595-622
表30通过管家蛋白酶体消化显示的优选表位 表位 序列 Sequence ID No. HLA类型 HLA结合预测_ SYFPEITHI NIH 597-606 IISPPDSSYL 251 A0201 22 27.464 A26 21 N.A. A3 16 <5 B0702 14 <5 599-606 SPPDSSYL 252 B08 18 <5 B5101 17 N.A. 600-608 PPDSSYLSG 253 A1 16 <5 600-609 PPDSSYLSGA 254 B0702 17 <5 602-611 DSSYLSGANL 255 A26 16 N.A. 603-611 SSYLSGANL 256 A0201 15 <5 B2705 17 50 604-613 SYLSGANLNL 257 A0201 15 <5 A24 N.A. 300 605-613 YLSGANLNL 258 A0201 25 98.267 A26 19 N.A. A3 15 <5 B0702 16 <5 B08 17 <5 B2705 16 30 610-618 NLNLSCHSA 259 A0201 18 <5
_从参考上述(参见实施例3)的两个结合预测程序得出的分数。还参见图33。
实施例31:CEA 615-641
表31通过管家蛋白酶体消化显示的优选表位 表位 序列 Sequence ID No. HLA类型 HLA结合预测_ SYFPEITHI NIH 620-629 NPSPQYSWRI 260 B0702 19 8 622-629 SPQYSWRI 261 B08 15 5 B5101 20 N.A. 627-635 WRINGIPQQ 262 B2705 19 20 628-636 RINGIPQQH 263 A3 22 <5 B2705 16 <5 628-637 RINGIPQQHT 264 A0201 15 <5 631-639 GIPQQHTQV 265 A0201 19 9.563 632-639 IPQQHTQV 266 B5101 20 N.A.
_从参考上述(参见实施例3)的两个结合预测程序得出的分数。还参见图34。
实施例32:CEA 643-677
表32通过管家蛋白酶体消化显示的优选表位 表位 序列 Sequence ID No. HLA类型 HLA结合预测_ SYFPEITHI NIH 644-653 KITPNNNGTY 267 A1 20 5 A26 22 N.A. A3 25 <5 645-653 ITPNNNGTY 268 A1 22 <5 A26 21 N.A. A3 14 <5 647-656 PNNNGTYACF 269 A26 15 N.A. 648-656 NNNGTYACF 270 A26 17 N.A. 650-657 NGTYACFV 271 B5101 15 N.A. 661-670 ATGRNNSIVK 272 A3 20 <5 662-670 TGRNNSIVK 273 A3 18 <5 664-672 RNNSIVKSI 274 B2709 15 N.A. 666-674 NSIVKSITV 275 A0201 16 <5
_从参考上述(参见实施例3)的两个结合预测程序得出的分数。还参见图35。
实施例33:GAGE-1 6-32
表33通过管家蛋白酶体消化显示的优选表位 表位 序列 Sequence ID No. HLA 类型 HLA结合预测_ SYFPEITHI NIH 7-16 STYRPRPRRY 276 A1 23 <5 A26 21 N/A A3 15 <5 8-16 TYRPRPRRY 277 A1 19 <5 A3 15 <5 10-18 RPRPRRYVE 278 A3 17 <5 B0702 16 N/A B08 20 <5 16-23 YVEPPEMI 279 B5101 15 N/A 22-31 MIGPMRPEQF 280 A26 23 N/A A3 19 <5 23-31 IGPMRPEQF 281 B08 15 <5 24-31 GPMRPEQF 282 B5101 16 N/A
_从参考上述(参见实施例3)的两个结合预测程序得出的分数。还参见图36。
实施例34:GAGE-1 105-131
表34通过管家蛋白酶体消化显示的优选表位 表位 序列 Sequence ID No. HLA类型 HLA结合预测_ SYFPEITHI NIH 105-114 KTPEEEMRSH 283 A26 18 N/A 106-115 TPEEEMRSHY 284 A1 26 11.25 107-115 PEEEMRSHY 285 A1 26 <5 110-119 EMRSHYVAQT 286 A0201 15 <5 113-121 SHYVAQTGI 287 B5101 15 <5 115-124 YVAQTGILWL 288 A0201 23 108.769 A26 24 N/A A3 15 <5 116-124 VAQTGILWL 289 A0201 22 6.381 B08 16 <5 B2705 16 10 B5101 20 78.65 116-125 VAQTGILWLL 290 A0201 19 8.701 117-125 AQTGILWLL 291 A0201 17 373.362 B2705 16 200 118-126 QTGILWLLM 292 A26 19 N/A 118-127 QTGILWLLMN 293 A26 15 N/A 120-129 GILWLLMNNC 294 A26 15 N/A 121-129 ILWLLMNNC 295 A0201 15 161.227
_从参考上述(参见实施例3)的两个结合预测程序得出的分数。还参见图37。
实施例35:GAGE-1 122-137
表35通过管家蛋白酶体消化显示的优选表位 表位 序列 Sequence ID No. HLA 类型 HLA结合预测_ SYFPEITHI NIH 124-131 LLMNNCFL 296 B08 16 <5 123-131 WLLMNNCFL 297 A0201 22 1999.734 A26 16 N/A B08 17 <5 122-130 LWLLMNNCF 298 B2705 15 <5 121-130 ILWLLMNNCF 299 A26 18 N/A A3 17 10 121-129 ILWLLMNNC 295 A0201 15 161.227 120-129 GILWLLMNNC 294 A26 15 N/A 118-127 QTGILWLLMN 293 A26 15 N/A 118-126 QTGILWLLM 292 A26 19 N/A 117-125 AQTGILWLL 291 A0201 17 37.362 B2705 16 200 B4402 17 N/A 116-125 VAQTGILWLL 290 A0201 19 8.701 116-124 VAQTGILWL 289 A0201 22 6.381 B08 16 <5 B2705 16 10 B4402 15 N/A B5101 20 78.65 115-124 YVAQTGILWL 288 A0201 23 108.769 A26 24 N/A A3 15 <5 113-121 SHYVAQTGI 287 B5101 15 <5
_从参考上述(参见实施例3)的两个结合预测程序得出的分数。还参见图38。
实施例36:MAGE-1 51-77
表36通过管家蛋白酶体消化显示的优选表位 表位 序列 Sequence ID No. HLA类型 HLA结合预测_ SYFPEITHI NIH 62-70 SAFPTTINF 309 A26 15 N/A B4402 18 N/A B2705 17 25 61-70 ASAFPTTINF 310 B4402 15 N/A 60-68 GASAFPTTI 311 A0201 16 <5 B5101 25 220 57-66 SPQGASAFPT 312 B0702 19 N/A
_从参考上述(参见实施例3)的两个结合预测程序得出的分数。还参见图39。
实施例37:Mage-1 126-153
表37通过管家蛋白酶体消化显示的优选表位 表位 序列 Sequence ID No. HLA类型 HLA结合预测_ SYFPEITHI NIH 144-151 FGKASESL 313 B08 21 <5 143-151 IFGKASESL 314 A26 16 N/A B2705 15 <5 142-151 EIFGKASESL 315 A0201 20 <5 A26 29 N/A B4402 15 N/A 142-149 EIFGKASE 316 B08 16 <5 133-140 IKNYKHCF 317 B08 18 <5 132-140 VIKNYKHCF 318 A26 21 N/A B08 21 <5 131-140 SVIKNYKHCF 319 A26 23 N/A A3 18 <5 B4402 15 N/A 132-139 VIKNYKHC 320 B08 15 <5 131-139 SVIKNYKHC 321 A26 18 N/A 128-136 MLESVIKNY 322 A1 28 45 A26 24 N/A A3 17 <5 B4402 15 N/A 127-136 EMLESVIKNY 323 A1 15 <5 A26 23 N/A B4402 18 N/A 126-134 AEMLESVIK 324 A3 18 <5 B2705 15 30 B4402 16 N/A
_从参考上述(参见实施例3)的两个结合预测程序得出的分数。还参见图40。
实施例38:MAGE-2 272-299
表38通过管家蛋白酶体消化显示的优选表位 表位 序列 Sequence ID No. HLA类型 HLA结合预测_ SYFPEITHI NIH 274-283 GPRALIETSY 325 A1 15 <5 275-283 PRALIETSY 326 A1 15 <5 B2705 23 100 276-284 RALIETSYV 327 A0201 18 19.658 B5101 20 55 277-286 ALIETSYVKV 328 A0201 30 427.745 A26 18 N/A A3 21 <5 278-286 LIETSYVKV 329 A0201 23 <5 A26 17 N/A B5101 15 <5 278-287 LIETSYVKVL 330 A0201 22 <5 A26 22 N/A 279-287 IETSYVKVL 331 A0201 15 <5 B1510 15 N/A B5101 15 <5 280-289 ETSYVKVLH H 332 A26 21 N/A 282-291 SYVKVLHHT L 333 A0201 15 <5 283-291 YVKVLHHTL 334 A0201 19 <5 A26 20 N/A A3 15 <5 B08 21 <5 285-293 KVLHHTLKI 335 A0201 20 11.822 A3 18 <5 B5101 15 <5
_从参考上述(参见实施例3)的两个结合预测程序得出的分数。还参见图41。
实施例39:MAGE-2 287-3 14
表39通过管家蛋白酶体消化显示的优选表位 表位 序列 Sequence ID No. HLA类型 HLA结合预测_ SYFPEITHI NIH 303-311 PLHERALRE 336 A3 19 <5 B08 16 <5 302-309 PPLHERAL 337 B08 16 <5 B5101 18 N/A 301-309 YPPLHERAL 338 B0702 21 N/A B08 18 <5 B4402 15 N/A B5101 20 143 300-309 SYPPLHERAL 339 A0201 15 <5 B4402 18 N/A 299-307 ISYPPLHER 340 B2705 17 25 298-307 HISYPPLHER 341 A26 15 N/A 292-299 KIGGEPHI 342 B5101 15 N/A 291-299 LKIGGEPHI 343 A0201 17 <5 290-299 TLKIGGEPHI 344 A0201 18 <5
_从参考上述(参见实施例3)的两个结合预测程序得出的分数。还参见图42。
实施例40:Mage-3 287-314
表40通过管家蛋白酶体消化显示的优选表位 表位 序列 Sequence ID No. HLA类型 HLA结合预测_ SYFPEITHI NIH 303-311 PLHEWVLRE 345 A26 15 N/A 302-309 PPLHEWVL 346 B08 16 <5 B5101 19 N/A 301-309 YPPLHEWVL 347 B0702 21 N/A B08 17 <5 B5101 22 130 301-308 YPPLHEWV 348 B5101 22 N/A 300-308 SYPPLHEWV 349 A0201 15 <5 299-308 ISYPPLHEWV 350 A0201 15 6.656 298-307 HISYPPLHEW 351 A26 15 N/A 293-301 ISGGPHISY 352 A1 25 <5 292-301 KISGGPHISY 353 A1 20 <5 A26 23 N/A A3 21 5.4
_从参考上述(参见实施例3)的两个结合预测程序得出的分数。还参见图43。
实施例41:Melan-A 44-71
表41通过管家蛋白酶体消化显示的优选表位 表位 序列 Sequence ID No. HLA类型 HLA结合预测_ SYFPEITH I NIH 45-54 CWYCRRRNG Y 354 A1 16 <5 46-54 WYCRRRNGY 355 A1 16 <5 47-55 YCRRRNGYR 356 B08 15 <5 49-57 RRRNGYRAL 357 B08 17 <5 B2705 26 1800 B2709 24 N/A 51-60 RNGYRALMD K 358 A3 15 <5 52-60 NGYRALMDK 359 A3 18 <5 55-63 RALMDKSLH 360 B2705 16 <5 56-63 ALMDKSLH 361 B08 16 <5 55-64 RALMDKSLH V 362 A0201 17 <5 56-64 ALMDKSLHV 363 A0201 26 1055.104 A3 18 <5 B08 16 <5
_从参考上述(参见实施例3)的两个结合预测程序得出的分数。还参见图44。
实施例42:PRAME 274-301
表42通过管家蛋白酶体消化显示的优选表位 表位 序列 Sequence ID No. HLA类型 HLA结合预测_ SYFPEITH I NIH 275-284 YISPEKEEQY 364 A1 21 5 A26 23 N/A A3 20 <5 B4402 15 N/A 276-284 ISPEKEEQY 365 A1 19 <5 A26 15 N/A 277-285 SPEKEEQYI 366 B0702 17 N/A B5101 21 484 278-285 PEKEEQYI 367 B08 18 <5 279-288 EKEEQYIAQF 368 A26 24 N/A B4402 16 N/A 280-288 KEEQYIAQF 369 A26 17 N/A B2705 19 45 B4402 25 N/A 283-292 QYIAQFTSQF 370 A3 17 <5 B4402 15 N/A 284-292 YIAQFTSQF 371 A0201 15 <5 A26 24 N/A A3 19 <5 284-293 YIAQFTSQFL 372 A0201 22 74.314 A26 21 N/A 285-293 IAQFTSQFL 373 A0201 15 <5 B08 15 <5 B5101 19 78.65 286-295 AQFTSQFLSL 374 A0201 16 15.226 A26 15 N/A B0702 15 N/A A4402 18 N/A 287-295 QFTSQFLSL 375 A26 21 N/A 290-298 SQFLSLQCL 376 A0201 17 18.432 A26 16 N/A B2705 16 1000 B4402 15 N/A
_从参考上述(参见实施例3)的两个结合预测程序得出的分数。还参见图45。
实施例43:PRAME 434-463
表43通过管家蛋白酶体消化显示的优选表位 表位 序列 Sequence ID No. HLA类型 HLA结合预测_ SYFPEITHI NIH 439-448 VLYPVPLESY 377 A0201 20 <5 A1 21 5 A26 25 N/A A3 25 67.5 440-448 LYPVPLESY 378 A1 16 <5 446-455 ESYEDIHGTL 379 A26 16 N/A 448-457 YEDIHGTLHL 380 A1 18 <5 449-457 EDIHGTLHL 381 B2705 15 <5 451-460 IHGTLHLERL 382 A0201 16 <5
_从参考上述(参见实施例3)的两个结合预测程序得出的分数。还参见图46。
实施例44:PRAME 452-480
表44通过管家蛋白酶体消化显示的优选表位 表位 序列 Sequence ID No. HLA类型 HLA结合预测_ SYFPEITH I NIH 454-463 TLHLERLAYL 383 A0201 26 270.234 A26 21 N/A 455-463 LHLERLAYL 384 A0201 22 <5 B08 20 <5 B1510 21 N/A B2705 15 <5 456-463 HLERLAYL 385 B08 17 <5 456-465 HLERLAYLH A 386 A3 16 <5 A1 17 <5 458-467 ERLAYLHARL 387 A26 16 N/A 459-467 RLAYLHARL 388 A0201 24 21.362 B08 17 <5 B2705 18 90 B2709 15 N/A 459-468 RLAYLHARL R 389 A3 22 <5 460-467 LAYLHARL 390 B08 15 <5 B5101 20 N/A 460-468 LAYLHARLR 391 B5101 18 <5 461-470 AYLHARLREL 392 A0201 20 <5 B4402 16 N/A 462-470 YLHARLREL 393 A0201 28 45.203 B08 25 8 462-471 YLHARLRELL 394 A0201 22 48.151 A26 16 N/A 463-471 LHARLRELL 395 A0201 15 <5 B1510 22 N/A 464-471 HARLRELL 396 B08 30 320 B5101 17 N/A 464-472 HARLRELLC 397 B08 20 16 469-478 ELLCELGRPS 398 A3 15 <5 470-478 LLCELGRPS 399 A0201 15 <5
_从参考上述(参见实施例3)的两个结合预测程序得出的分数。还参见图47。
实施例45:PSA 143-169
表45通过管家蛋白酶体消化显示的优选表位 表位 序列 Sequence ID No. HLA类型 HLA结合预测_ SYFPEITHI NIH 144-153 QEPALGTTCY 400 A1 15 <5 145-153 EPALGTTCY 401 A1 17 <5 A26 17 N/A
+从参考上述(参见实施例3)的两个结合预测程序得出的分数。还参见图48。
实施例46:PSA 156-1883
表46通过管家蛋白酶体消化显示的优选表位 表位 序列 Sequence ID No. HLA类型 HLA结合预测+ SYFPEITHI NIH 162-171 PEEFLTPKKL 402 B4402 24 N.A. 163-171 EEFLTPKKL 403 A26 17 N.A. B4402 29 N.A. 165-173 FLTPKKLQC 404 A3 20 <5 B08 17 <5 165-174 FLTPKKLQCV 405 A0201 26 735.86 A26 15 N.A. 166-174 LTPKKLQCV 406 A0201 21 <5 A26 18 N.A. 167-174 TPKKLQCV 407 B08 16 <5 B5101 22 N.A. 167-175 TPKKLQCVD 408 B5101 15 <5 170-179 KLQCVDLHVI 409 A0201 24 34.433 A3 17 <5 171-179 LQCVDLHVI 410 A0201 15 <5 B5101 16 6.292
_从参考上述(参见实施例3)的两个结合预测程序得出的分数。还参见图49。
实施例47:PSCA 67-94
表47通过管家蛋白酶体消化显示的优选表位 表位 序列 Sequence ID No. HLA类型 HLA结合预测_ SYFPEITHI NIH 73-81 DSQDYYVGK 411 A3 15 <5 74-82 SQDYYVGKK 412 A1 16 <5 74-83 SQDYYVGKK N 413 A1 15 <5 76-84 DYYVGKKNI 414 B5101 19 23.426 77-84 YYVGKKNI 415 B08 16 <5 78-86 YVGKKNITC 416 A3 15 <5 78-87 YVGKKNITCC 417 A26 15 N/A
_从参考上述(参见实施例3)的两个结合预测程序得出的分数。还参见图50。
实施例48:PSMA 378-405
表48通过管家蛋白酶体消化显示的优选表位 表位 序列 Sequence ID No. HLA类型 HLA结合预测_ SYFPEITHI NIH 381-390 WVFGGIDPQS 418 A26 16 N/A A3 15 <5 385-394 GIDPQSGAAV 419 A0201 24 <5 A0203 17 N/A A1 15 10 A26 15 N/A A3 18 <5 386-394 IDPQSGAAV 420 A0201 15 <5 387-394 DPQSGAAV 421 B5101 22 N/A 387-395 DPQSGAAVV 422 B0702 18 N/A B5101 26 440 387-396 DPQSGAAVVH 423 A3 15 <5 388-396 PQSGAAVVH 424 A3 17 <5 389-398 QSGAAVVHEI 425 A0201 15 <5 390-398 SGAAVVHEI 426 A0201 19 <5 B5101 21 88 391-398 GAAVVHEI 427 B5101 23 N/A 391-399 GAAVVHEIV 428 A0201 17 <5 B5101 20 133.1 392-399 AAVVHEIV 429 B5101 19 N/A
_从参考上述(参见实施例3)的两个结合预测程序得出的分数。还参见图51。
实施例49:PAMA 597-623
表49通过管家蛋白酶体消化显示的优选表位 表位 序列 Sequence IK No. HLA类型 HLA结合预测_ SYFPEITHI NIH 597-605 CRDYAVVLR 430 B2705 22 N/A 598-607 RDYAVVLRK Y 431 A1 17 <5 A26 15 N/A A3 16 <5 599-607 DYAVVLRKY 432 A1 19 <5 A26 22 N/A 600-607 YAVVLRKY 433 B5101 17 N/A 602-611 VVLRKYADKI 434 A0201 17 <5 A3 18 <5 603-611 VLRKYADKI 435 A0201 22 <5 A3 16 <5 B08 19 <5 B5101 16 5.72 603-612 VLRKYADKIY 436 A1 17 <5 A26 19 N/A A3 19 <5 604-611 LRKYADKI 437 B08 17 <5 604-612 LRKYADKIY 438 A1 15 <5 B2705 19 N/A 605-614 RKYADKIYSI 439 A0201 16 <5 606-614 KYADKIYSI 440 A0201 20 <5 B08 17 <5 607-614 YADKIYSI 441 B5101 27 N/A
_从参考上述(参见实施例3)的两个结合预测程序得出的分数。还参见图52。
实施例50:PSMA 615-642
表50通过管家蛋白酶体消化显示的优选表位 表位 序列 Sequence ID No. HLA类型 HLA结合预测_ SYFPEITHI NIH 616-625 MKHPQEMKT Y 442 A1 19 <5 A26 16 N/A 617-625 KHPQEMKTY 443 A1 15 <5 A26 16 N/A 618-627 HPQEMKTYSV 444 A0201 15 <5 B0702 17 N/A
_从参考上述(参见实施例3)的两个结合预测程序得出的分数。还参见图53。
实施例51:SCP-1 57-86
表51通过管家蛋白酶体消化显示的优选表位 表位 序列 Sequence ID No. HLA类型 HLA结合预测_ SYFPEITHL NIH 62-71 IDSDPALQKV 445 A0201 19 <5 63-71 DSDPALQKV 446 A0201 17 <5 A1 20 7.5 A26 15 N/A B5101 15 5.324 67-76 ALQKVNFLPV 447 A0201 23 132.149 A3 16 <5 70-78 KVNFLPVLE 448 A3 18 <5 71-80 VNFLPVLEQV 449 A0201 16 <5 72-80 NFLPVLEQV 450 A0201 18 <5 75-84 PVLEQVGNSD 451 A3 18 <5 76-84 VLEQVGNSD 452 A1 15 <5 A3 16 <5
_从参考上述(参见实施例3)的两个结合预测程序得出的分数。还参见图54。
实施例52:SCP-1 201-227
表52通过管家蛋白酶体消化显示的优选表位 表位 序列 Sequence ID No. HLA类型 HLA结合预测_ SYFPEITHI NIH 202-210 YEREETRQV 453 A0201 16 <5 202-211 YEREETRQVY 454 A1 19 <5 A3 15 <5 A4402 22 N/A 203-211 EREETRQVY 455 A1 27 <5 A26 19 N/A B2705 20 N/A 203-212 EREETRQVYM 456 A26 17 N/A 204-212 REETRQVYM 457 B2705 15 N/A 211-220 YMDLNSNIEK 458 A1 17 25 213-221 DLNSNIEKM 459 A0201 20 <5 A26 28 N/A 216-226 SNIEKMITAF 460 A26 19 N/A B4402 19 N/A 217-225 NIEKMITAF 461 A26 26 N/A B2705 17 N/A B4402 16 N/A 218-225 IEKMITAF 462 B08 17 <5
_从参考上述(参见实施例3)的两个结合预测程序得出的分数。还参见图55。
实施例53:SCP-1 395-424
表53通过管家蛋白酶体消化显示的优选表位 表位 序列 Sequence ID No. HLA类型 HLA结合预测_ SYFPEITHI NIH 397-406 RLENYEDQLI 463 A0201 17 <5 A3 15 <5 398-406 LENYEDQLI 464 B4402 19 N/A 398-407 LENYEDQLII 465 B4402 19 N/A 399-407 ENYEDQLII 466 B5101 17 19.36 399-408 ENYEDQLIIL 467 A26 20 N/A 400-408 NYEDQLIIL 468 A1 16 <5 400-409 NYEDQLIILT 469 A1 16 <5 401-409 YEDQLIILT 470 A1 18 <5 B4402 16 N/A 401-410 YEDQLIILTM 471 A1 18 <5 B4402 16 N/A 402-410 EDQLIILTM 472 A26 18 N/A B2705 15 <5 406-415 IILTMELQKT 473 A0201 22 14.824 A26 16 N/A 407-415 ILTMELQKT 474 A0201 21 29.137
_从参考上述(参见实施例3)的两个结合预测程序得出的分数。还参见图56。
实施例54:SCP-1 416-442
表54通过管家蛋白酶体消化显示的优选表位 表位 序列 Sequence ID No. HLA类型 HLA结合预测_ SYFPEITHI NIH 424-432 KLTNNKEVE 475 A3 18 <5 424-433 KLTNNKEVEL 476 A0201 24 74.768 A26 18 N/A A3 18 <5 425-433 LTNNKEVEL 477 A0201 22 <5 A26 21 N/A B08 22 <5 429-438 KEVELEELKK 478 A3 17 <5 430-438 EVELEELKK 479 A1 18 90 A26 17 N/A A3 24 <5 B2705 15 <5 430-439 EVELEELKKV 480 A0201 15 <5 A26 21 N/A 431-439 VELEELKKV 481 A0201 20 80.217 A4402 15 N/A B5101 17 <5
_从参考上述(参见实施例3)的两个结合预测程序得出的分数。还参见图57。
实施例55:SCP-1 518-545
表55通过管家蛋白酶体消化显示的优选表位 表位 序列 Sequence ID No. HLA类型 HLA结合预测_ SYFPEITHI NIH 530-539 ETSDMTLELK 482 A26 21 N/A 531-539 TSDMTLELK 483 A1 16 15
_从参考上述(参见实施例3)的两个结合预测程序得出的分数。还参见图58。
实施例56:SCP-1 545-578
表56通过管家蛋白酶体消化显示的优选表位 表位 序列 Sequence ID No. HLA类型 HLA结合预测_ SYFPEITHI NHL 548-556 NKKQEERML 484 B08 20 <5 553-562 ERMLTQIENL 485 A26 19 N/A B4402 17 N/A 554-562 RMLTQIENL 486 A0201 24 64.335 B2705 21 150 B2709 17 N/A B4402 15 N/A 555-562 MLTQIENL 487 B08 16 <5 555-564 MLTQIENLQE 488 A3 16 <5 560-569 ENLQETETQL 489 A26 16 N/A 561-569 NLQETETQL 490 A0201 22 87.586 A26 19 N/A A3 15 <5 B08 18 <5 561-570 NLQETETQLR 491 A3 15 6
_从参考上述(参见实施例3)的两个结合预测程序得出的分数。还参见图59。
实施例57:SCP-1 559-585
表57通过管家蛋白酶体消化显示的优选表位 表位 序列 Sequence ID No. HLA类型 HLA结合预测_ SYFPEITHI NIH 567-576 TQLRNELEYV 492 A0201 16 161.729 568-576 QLRNELEYV 493 A0201 24 32.765 A3 16 <5 571-580 NELEYVREEL 494 A0201 16 <5 B4402 23 N/A 572-580 ELEYVREEL 495 A0201 17 <5 A26 23 N/A B08 20 <5 573-580 LEYVREEL 496 B08 19 <5 574-583 EYVREELKQK 497 A3 16 <5 575-583 YVREELKQK 498 A26 17 N/A A3 27 <5
_从参考上述(参见实施例3)的两个结合预测程序得出的分数。还参见图60。
实施例58:SCP-1 665-701
表58通过管家蛋白酶体消化显示的优选表位 表位 序列 Sequence ID No. HLA类型 HLA结合预测_ SYFPEITHI NIH 675-684 LLEEVEKAK V 499 A0201 27 31.026 676-684 LEEVEKAKV 500 A0201 15 <5 676-685 LEEVEKAKVI 501 A4402 22 N/A 677-685 EEVEKAKVI 502 B08 21 <5 B4402 24 N/A B5101 18 <5 681-690 KAKVIADEA V 503 A0201 15 <5 683-692 KVIADEAVK L 504 A0201 21 6.542 A26 22 N/A A3 25 <5 B4402 17 N/A 684-692 VIADEAVKL 505 A0201 26 20.473 A26 22 N/A A3 17 <5 B08 16 <5 B2705 15 N/A 685-692 IADEAVKL 506 B08 17 <5 B5101 21 N/A
_从参考上述(参见实施例3)的两个结合预测程序得出的分数。还参见图61。
实施例59:SCP-1 694-720
表59通过管家蛋白酶体消化显示的优选表位 表位 序列 Sequence ID No. HLA类型 HLA结合预测_ SYFPEITHI NIH 694-702 KEIDKRCQH 507 A3 16 <5 A4402 17 N/A 694-703 KEIDKRCQH K 508 A3 17 <5 B4402 15 N/A 695-703 EIDKRCQHK 509 A26 20 N/A A3 20 <5 695-704 EIDKRCQHKI 510 A0201 16 <5 A26 19 N/A 696-704 IDKRCQHKI 511 B08 17 <5 697-704 DKRCQHKI 512 B5101 16 N/A 698-706 KRCQHKIAE 513 B2705 16 60 698-707 KRCQHKIAE M 514 A26 15 N/A 699-707 RCQHKIAEM 515 A26 15 N/A B2705 18 9 701-710 QHKIAEMVA L 516 A26 15 N/A 702-710 HKIAEMVAL 517 A0201 15 <5 A26 16 N/A B4402 16 N/A 703-710 KIAEMVAL 518 B08 16 <5
_从参考上述(参见实施例3)的两个结合预测程序得出的分数。还参见图62。
实施例60:SCP-1 735-769
表60通过管家蛋白酶体消化显示的优选表位 表位 序列 Sequence ID No. HLA类型 HLA结合预测_ SYFPEITHL NIH 737-746 QEQSSLRASL 519 B4402 21 N.A. 738-746 EQSSLRASL 520 A26 22 N.A. B0702 15 6 739-746 QSSLRASL 521 B08 19 <5 741-750 SLRASLEIEL 522 A0201 24 <5 A26 17 N.A. A3 16 <5 742-750 LRASLEIEL 523 A0201 17 <5 B2705 23 2000 B2709 21 NA. 743-750 RASLEIEL 524 B5101 17 NA. 744-753 ASLEIELSNL 525 A0201 20 <5 A26 16 N.A. 745-753 SLEIELSNL 526 A0201 25 <5 A26 22 N.A. A3 15 <5 B08 18 <5 745-754 SLEIELSNLK 527 A1 15 18 A3 22 20 746-754 LEIELSNLK 528 B2705 16 30 B4402 15 N.A. 747-755 EIELSNLKA 529 A1 19 <5 A26 18 N.A. 749-758 ELSNLKAELL 530 A0201 17 <5 A26 22 N.A. 750-758 LSNLKAELL 531 B08 21 <5 751-760 SNLKAELLSV 532 A0201 21 <5 752-760 NLKAELLSV 533 A0201 26 5.599 A3 18 <5 B08 16 <5 752-761 NLKAELLSV K 534 A3 30 30 753-761 LKAELLSVK 535 A3 19 <5 753-762 LKAELLSVK K 536 A3 16 <5 754-762 KAELLSVKK 537 A3 18 <5 B2705 18 30 755-763 AELLSVKKQ 538 B4402 19 N.A.
_从参考上述(参见实施例3)的两个结合预测程序得出的分数。还参见图63。
实施例61:SCP-1 786-816
表61通过管家蛋白酶体消化显示的优选表位 表位 序列 Sequence ID No. HLA类型 HLA结合预测_ SYFPEITHI NIH 787-796 EKKDKKTQT F 539 A26 19 N/A B4402 15 N/A 788-796 KKDKKTQTF 540 B08 16 <5 B2705 16 <5 789-796 KDKKTQTF 541 B08 16 <5 797-806 LLETPDIYW K 542 A0201 16 <5 A3 21 90 798-806 LETPDIYWK 543 B2705 15 30 B4402 16 N/A 798-807 LETPDIYWK L 544 A0201 15 7.944 A26 15 N/A A4402 24 N/A 799-807 ETPDIYWKL 545 A26 31 N/A B4402 16 N/A 800-807 TPDIYWKL 546 B08 16 <5 B5101 19 N/A
_从参考上述(参见实施例3)的两个结合预测程序得出的分数。还参见图64。
实施例62:SCP-1 806-833
表62通过管家蛋白酶体消化显示的优选表位 表位 序列 Sequence ID No. HLA类型 HLA结合预测_ SYFPEITHI NI 809-817 SKAVPSQTV 547 A0201 17 <5 810-817 KAVPSQTV 548 B5101 19 N/A 812-821 VPSQTVSRNF 549 B0702 18 N/A 815-824 QTVSRNFTSV 550 A0201 16 <5 A26 16 N/A 816-824 TVSRNFTSV 551 A0201 16 11.426 A26 15 N/A A3 16 <5 816-825 TVSRNFTSVD 552 A3 20 <5 823-832 SVDHGISKDK 553 A3 21 <5
_从参考上述(参见实施例3)的两个结合预测程序得出的分数。还参见图65。
实施例63:SCP-1 826-853
表63通过管家蛋白酶体消化显示的优选表位 表位 序列 Sequence ID No. HLA类型 HLA结合预测_ SYFPEITHI NIH 829-838 SKDKRDYLWT 554 A1 18 <5 832-840 KRDYLWTSA 555 B2705 16 600 832-841 KRDYLWTSAK 556 A3 17 <5 833-841 RDYLWTSAK 557 A3 23 <5 B2705 18 15 835-843 YLWTSAKNT 558 A0201 16 284.517 835-844 YLWTSAKNTL 559 A0201 26 815.616 A26 16 N/A 837-844 WTSAKNTL 560 B08 20 <5 841-850 KNTLSTPLPK 561 A3 18 <5 842-850 NTLSTPLPK 562 A3 16 <5
_从参考上述(参见实施例3)的两个结合预测程序得出的分数。还参见图66。
实施例64:SCP-1832-859
表64通过管家蛋白酶体消化显示的优选表位 表位 序列 Sequence ID No. HLA类型 HLA结合预测_ SYFPEITHI NIH 832-840 KRDYLWTSA 563 B2705 16 600 832-841 KRDYLWTSA K 564 A3 17 <5 833-841 RDYLWTSAK 565 A3 23 <5 B2705 18 15 835-843 YLWTSAKNT 566 A0201 16 284.517 839-846 SAKNTLST 567 B08 16 <5 841-850 KNTLSTPLPK 568 A3 18 <5 842-850 NTLSTPLPK 569 A3 16 <5 843-852 TLSTPLPKAY 570 A1 16 <5 26 19 N/A A3 18 <5 B4402 17 N/A 844-852 LSTPLPKAY 571 A1 23 7.5 A4402 18 N/A
_从参考上述(参见实施例3)的两个结合预测程序得出的分数。还参见图67。
实施例65:SSX-2 1-27
表65通过管家蛋白酶体消化显示的优选表位 表位 序列 Sequence ID No. HLA类型 HLA结合预测_ SYFPEITHI NIH 5-12 DAFARRPT 572 B5101 18 N/A 7-15 FARRPTVGA 573 A0201 15 <5 8-17 ARRPTVGAQI 574 A3 18 <5 9-17 RRPTVGAQI 575 B2705 23 1800 B2709 23 N/A 10-17 RPTVGAQI 576 B5101 20 N/A 13-21 VGAQIPEKI 577 B5101 20 125.84 14-21 GAQIPEKI 578 B5101 25 N/A 15-24 AQIPEKIQKA 579 A0201 16 <5 16-24 QIPEKIQKA 580 A0201 21 6.442 A26 20 N/A B08 17 <5 16-25 QIPEKIQKAF 581 A26 24 N/A A3 16 <5 17-24 IPEKIQKA 582 B5101 19 N/A 17-25 IPEKIQKAF 583 B0702 19 N/A B08 15 <5 B2705 16 <5 18-25 PEKIQKAF 584 B08 16 <5
_从参考上述(参见实施例3)的两个结合预测程序得出的分数。参见图68。
实施例66:Survivin 116-142
表66通过管家蛋白酶体消化显示的优选表位 表位 序列 Sequence ID No. HLA类型 HLA结合预测_ SYFPEITHI NIH 116-124 ETNNKKKEF 585 A26 28 N/A B08 20 <5 117-124 TNNKKKEF 586 B08 16 <5 122-131 KEFEETAKKV 587 A0201 15 71.806 123-131 EFEETAKKV 588 A26 15 N/A B5101 15 5.324 127-134 TAKKVRRA 589 B5101 17 N/A 126-134 ETAKKVRRA 590 A26 24 N/A 128-136 AKKVRRAIE 591 B08 19 <5 129-138 KKVRRAIEQL 592 A0201 15 <5 130-138 KVRRAIEQL 593 A0201 19 <5 A26 23 N/A A3 22 <5 B08 17 <5 B2705 16 30 130-139 KVRRAIEQLA 594 A3 19 <5 131-138 VRRAIEQL 595 B08 17 <5
_从参考上述(参见实施例3)的两个结合预测程序得出的分数。还参见图69。
实施例67:BAGE 1-35
表67通过管家蛋白酶体消化显示的优选表位 表位 序列 Sequence ID No. HLA类型 HLA结合预测_ SYFPEITHI NIH 24-31 SPVVSWRL 596 B08 19 <5 B5101 17 N/A 21-29 KEESPVVSW 597 B4402 23 N/A 19-27 LMKEESPVV 598 A0201 22 5.024 B5101 15 <5 18-27 RLMKEESPVV 599 A0201 22 105.51 A3 18 <5 18-26 RLMKEESPV 600 A0201 21 257.342 A3 17 <5 14-22 LLQARLMKE 601 A0201 18 <5 A3 15 5 13-22 QLLQARLMKE 602 A0201 18 5 A26 15 N/A A3 15 <5
_从参考上述(参见实施例3)的两个结合预测程序得出的分数。还参见图70。
实施例68
表位聚簇
已知和预测的表位通常在蛋白质抗原序列中不均匀分布。如上所述, 我们已经将含有比(已知或预测)表位平均密度更高的序列区段定义为表 位聚簇。在表位聚簇的使用中是将它们的序列结合至在这里描述的蛋白酶 体消化分析中使用的底物肽中,或另外告知这类底物的选择和设计。还可 将表位聚簇用作疫苗组分。在PCT公开号WO01/82963;PCT公开号 WO03/057823;和题为EPITOPE CLUSTERS的美国专利申请 No.09/561,571和在题为“EPITOPE SYNCHRONIZATION IN ANTIGEN PRESENTING CELLS”的美国申请号10/026,066中发现表位聚簇定义和 使用的更详尽的讨论。此处提及的TAA的多数表位或表位聚簇先前已在 PCT申请号WO02/081646;专利申请号09/561,571;美国专利申请号 10/117,937;2001年11月7日提交的美国临时申请号60/337,017,和2002 年3月7日提交的60/363,210,全部题为“EPITOPE SEQUENCES”中公 开。将在所述出版物和申请中公开的教导和实施方案考虑作为涉及本发明 和关于本发明有用的支持原理和实施方案。
对于TuAA survivin(SEQ ID NO.98)和GAGE-1(SEQ ID NO.96), 下列各表(68-73)表示使用SYFPEITHI和NIH算法预测HLA-A2结合的 9-链节表位和重叠表位区域的表位密度,以及表位在整个蛋白中的表位密 度,和这两个密度的比率。(由上述定义该比率必须超过1以成为簇;要 求更高的这个比率值反映优选实施方案)。通过得分排列和通过它们在完 整蛋白序列中的第一个氨基位置鉴定单独的9-链节。编号来源于蛋白质的 每个可能的簇。将簇包含的完整序列内氨基酸位置范围表示为组成它的单 独预测表位的等级。
表68
Survivin的HLA-A2表位聚簇分析(NIH算法)
蛋白序列长度:142个氨基酸
9-链节数:134
NIH分数≥5的9-链节数:2 聚簇 AA 肽 列 起始位置 分数 肽/AAs 比率 (rank) 聚簇 全部蛋白 1 SEQ ID NO:603 13-28 1 2 13 20 10.26 4.919 0.125 0.014 8.875
表69
Survivin的HLA-A2表位聚簇分析(SYFPEITHI算法)
蛋白序列长度:142个氨基酸
9-链节数:134
SYFPEITHI分数≥15的9-链节数:10 聚簇 AA 肽列 起始位置分数 肽/AAs 比率 聚簇 全部蛋白 1 SEQ ID NO:603 13-28 5 4 13 20 17 18 0.125 0.070 1.775 2 SEQ ID NO:604 79-111 8 9 6 1 7 10 79 81 88 96 97 103 15 15 17 23 16 15 0.182 0.070 2.597 3 SEQ ID ON:605 130-141 2 3 130 133 19 19 0.167 0.070 2.381
表70
GAGE-1的HLA-A2表位聚簇分析(NIH算法)
蛋白序列长度:138个氨基酸
9-链节数:130
NIH分数≥5的9-链节数:5 聚簇 AA 肽列 起始位置 分数 肽/AAs 比率 聚簇 全部蛋白 1 SEQ ID NO:606 116-133 1 2 3 4 5 123 121 125 117 116 1999.734 161.227 49.834 37.362 6.381 0.278 0.036 7.667
表71
GAGE-1的HLA-A2表位聚簇分析(SYFPEITHI算法)
蛋白序列长度:138个氨基酸
9-链节数:130
SYFPEITHI分数≥5的9-链节数:6 聚簇 AA 肽列 起始位置 分数 肽/AAs 比率 聚簇 全部蛋白 1 SEQ ID NO:606 116-133 1 2 3 4 5 6 116 123 125 117 120 121 22 22 22 17 16 15 0.333 0.043 7.667
表72
BAGE的HLA-A2表位聚簇分析(NIH算法)
蛋白序列长度:43个氨基酸
包括的9-链节数:35
NIH分数≥5的9-链节数:4 聚簇 AA 肽 列 起始位置 分数 肽/AAs 比率 (rank) 聚簇 全部蛋白 1 SEQ ID NO:607 7-17 2 3 7 9 98.267 11.426 0.182 0.093 1.955 2 SEQ ID NO:608 18-27 1 4 18 19 257.342 5.024 0.200 0.093 2.151
表73
BAGE的HLA-A2表位聚簇分析(SYFPEITHI算法)
蛋白序列长度:43个氨基酸
包括的9-链节数:35
SYFPEITHI分数≥15的9-链节数:10 聚簇 AA 肽列 起始位置 分数 肽/AAs 比率 聚簇 全部蛋白 1 SEQ ID NO:609 2-27 6 9 1 3 5 4 7 2 2 6 7 9 11 14 18 19 18 16 23 21 19 18 21 22 0.308 0.233 1.323 2 SEQ ID NO:610 30-39 8 10 30 31 17 15 0.200 0.233 0.858
本发明的实施方案适用于并且考虑在这里提供的靶抗原序列中的变 异,其包括在可以通过万维网访问的各种数据库中公开的那些。具体地对 于在这里公开的具体序列,通过使用提供的登记号访问关于每种抗原的信 息可以发现序列中的变异。
酪氨酸酶蛋白;SEQ ID NO 2
1 MLLAVLYCLL WSFQTSAGHF PRACVSSKNL MEKECCPPWS GDRSPCGQLS GRGSCQNILL
61 SNAPLGPQFP FTGVDDRESW PSVFYNRTCQ CSGNFMGFNC GNCKFGFWGP NCTERRLLVR
121 RNIFDLSAPE KDKFFAYLTL AKHTISSDYV IPIGTYGQMK NGSTPMFNDI NIYDLFVWMH
181 YYVSMDALLG GSEIWRDIDF AHEAPAFLPW HRLFLLRWEQ EIQKLTGDEN FTIPYWDWRD
241 AEKCDICTDE YMGGQHPTNP NLLSPASFFS SWQIVCSRLE EYNSHQSLCN GTPEGPLRRN
301 PGNHDKSRTP RLPSSADVEF CLSLTQYESG SMDKAANFSP RNTLEGFASP LTGIADASQS
361 SMHNALHIYM NGTMSQVQGS ANDPIFLLHH AFVDSIFEQW LRRHRPLQEV YPEANAPIGH
421 NRESYMVPFI PLYRNGDFFI SSKDLGYDYS YLQDSDPDSF QDYIKSYLEQ ASRIWSWLLG
481 AAMVGAVLTA LLAGLVSLLC RHKRKQLPEE KQPLLMEKED YHSLYQSHL
SSX-2蛋白;SEQ ID NO 3
1 MNGDDAFARR PTVGAQIPEK IQKAFDDIAK YFSKEEWEKM KASEKIFYVY MKRKYEAMTK
61 LGFKATLPPF MCNKRAEDFQ GNDLDNDPNR GNQVERPQMT FGRLQGISPK IMPKKPAEEG
121 NDSEEVPEAS GPQNDGKELC PPGKPTTSEK IHERSGPKRG EHAWTHRLRE RKQLVIYEEI
181 SDPEEDDE
PSMA蛋白;SEQ ID NO 4
1 MWNLLHETDS AVATARRPRW LCAGALVLAG GFFLLGFLFG WFIKSSNEAT NITPKHNMKA
61 FLDELKAENI KKFLYNFTQI PHLAGTEQNF QLAKQIQSQW KEFGLDSVEL AHYDVLLSYP
121 NKTHPNYISI INEDGNEIFN TSLFEPPPPG YENVSDIVPP FSAFSPQGMP EGDLVYVNYA
181 RTEDFFKLER DMKINCSGKI VIARYGKVFR GNKVKNAQLA GAKGVILYSD PADYFAPGVK
241 SYPDGWNLPG GGVQRGNILN LNGAGDPLTP GYPANEYAYR RGIAEAVGLP SIPVHPIGYY
301 DAQKLLEKMG GSAPPDSSWR GSLKVPYNVG PGFTGNFSTQ KVKMHIHSTN EVTRIYNVIG
361 TLRGAVEPDR YVILGGHRDS WVFGGIDPQS GAAVVHEIVR SFGTLKKEGW RPRRTILFAS
421 WDAEEFGLLG STEWAEENSR LLQERGVAYI NADSSIEGNY TLRVDCTPLM YSLVHNLTKE
481 LKSPDEGFEG KSLYESWTKK SPSPEFSGMP RISKLGSGND FEVFFQRLGI ASGRARYTKN
541 WETNKFSGYP LYHSVYETYE LVEKFYDPMF KYHLTVAQVR GGMVFELANS IVLPFDCRDY
601 AVVLRKYADK IYSISMKHPQ EMKTYSVSFD SLFSAVKNFT EIASKFSERL QDFDKSNPIV
661 LRMMNDQLMF LERAFIDPLG LPDRPFYRHV IYAPSSHNKY AGESFPGIYD ALFDIESKVD
721 PSKAWGEVKR QIYVAAFTVQ AAAETLSEVA
人酪氨酸酶(眼皮白化病IA)(TYR),mRNA.;
ACCESSION NM_000372
VERSION NM_000372.1 GI:4507752
SEQ ID NO 2
/翻译=″MLLAVLYCLLWSFQTSAGHFPRACVSSKNLMEKECCPPWSGDRS
PCGQLSGRGSCQNILLSNAPLGPQFPFTGVDDRESWPSVFYNRTCQCSGNFMGFNCGN
CKFGFWGPNCTERRLLVRRNIFDLSAPEKDKFFAYLTLAKHTISSDYVIPIGTYGQMK
NGSTPMFNDINIYDLFVWMHYYVSMDALLGGSEIWRDIDFAHEAPAFLPWHRLFLLRW
EQEIQKLTGDENFTIPYWDWRDAEKCDICTDEYMGGQHPTNPNLLSPASFFSSWQIVC
SRLEEYNSHQSLCNGTPEGPLRRNPGNHDKSRTPRLPSSADVEFCLSLTQYESGSMDK
AANFSFRNTLEGFASPLTGIADASQSSMHNALHIYMNGTMSQVQGSANDPIFLLHHAF
VDSIFEQWLRRHRPLQEVYPEANAPIGHNRESYMVPFIPLYRNGDFFISSKDLGYDYS
YLQDSDPDSFQDYIKSYLEQASRIWSWLLGAAMVGAVLTALLAGLVSLLCRHKRKQLP
EEKQPLLMEKEDYHSLYQSHL″
SEQ ID NO 5
起始
1 atcactgtag tagtagctgg aaagagaaat ctgtgactcc aattagccag ttcctgcaga
61 ccttgtgagg actagaggaa gaatgctcct ggctgttttg tactgcctgc tgtggagttt
121 ccagacctcc gctggccatt tccctagagc ctgtgtctcc tctaagaacc tgatggagaa
181 ggaatgctgt ccaccgtgga gcggggacag gagtccctgt ggccagcttt caggcagagg
241 ttcctgtcag aatatccttc tgtccaatgc accacttggg cctcaatttc ccttcacagg
301 ggtggatgac cgggagtcgt ggccttccgt cttttataat aggacctgcc agtgctctgg
361 caacttcatg ggattcaact gtggaaactg caagtttggc ttttggggac caaactgcac
421 agagagacga ctcttggtga gaagaaacat cttcgatttg agtgccccag agaaggacaa
481 attttttgcc tacctcactt tagcaaagca taccatcagc tcagactatg tcatccccat
541 agggacctat ggccaaatga aaaatggatc aacacccatg tttaacgaca tcaatattta
601 tgacctcttt gtctggatgc attattatgt gtcaatggat gcactgcttg ggggatctga
661 aatctggaga gacattgatt ttgcccatga agcaccagct tttctgcctt ggcatagact
721 cttcttgttg cggtgggaac aagaaatcca gaagctgaca ggagatgaaa acttcactat
781 tccatattgg gactggcggg atgcagaaaa gtgtgacatt tgcacagatg agtacatggg
841 aggtcagcac cccacaaatc ctaacttact cagcccagca tcattcttct cctcttggca
901 gattgtctgt agccgattgg aggagtacaa cagccatcag tctttatgca atggaacgcc
961 cgagggacct ttacggcgta atcctggaaa ccatgacaaa tccagaaccc caaggctccc
1021 ctcttcagct gatgtagaat tttgcctgag tttgacccaa tatgaatctg gttccatgga
1081 taaagctgcc aatttcagct ttagaaatac actggaagga tttgctagtc cacttactgg
1141 gatagcggat gcctctcaaa gcagcatgca caatgccttg cacatctata tgaatggaac
1201 aatgtcccag gtacagggat ctgccaacga tcctatcttc cttcttcacc atgcatttgt
1261 tgacagtatt tttgagcagt ggctccgaag gcaccgtcct cttcaagaag tttatccaga
1321 agccaatgca cccattggac ataaccggga atcctacatg gttcctttta taccactgta
1381 cagaaatggt gatttcttta tttcatccaa agatctgggc tatgactata gctatctaca
1441 agattcagac ccagactctt ttcaagacta cattaagtcc tatttggaac aagcgagtcg
1501 gatctggtca tggctccttg gggcggcgat ggtaggggcc gtcctcactg ccctgctggc
1561 agggcttgtg agcttgctgt gtcgtcacaa gagaaagcag cttcctgaag aaaagcagcc
1621 actcctcatg gagaaagagg attaccacag cttgtatcag agccatttat aaaaggctta
1681 ggcaatagag tagggccaaa aagcctgacc tcactctaac tcaaagtaat gtccaggttc
1741 ccagagaata tctgctggta tttttctgta aagaccattt gcaaaattgt aacctaatac
1801 aaagtgtagc cttcttccaa ctcaggtaga acacacctgt ctttgtcttg ctgttttcac
1861 tcagcccttt taacattttc ccctaagccc atatgtctaa ggaaaggatg ctatttggta
1921 atgaggaact gttatttgta tgtgaattaa agtgctctta tttt
人滑膜肉瘤,X断裂点2(SSX2),mRNA。
ACCESSION NM_003147
VERSION NM_003147.1 GI:10337582
SEQ ID NO 3
/翻译=″MNGDDAFARRPTVGAQIPEKIQKAFDDIAKYFSKEEWEKMKASE
KIFYVYMKRKYEAMTKLGFKATLPPFMCNKRAEDFQGNDLDNDPNRGNQVERPQMTFG
RLQGISPKIMPKKPAEEGNDSEEVPEASGPQNDGKELCPPGKPTTSEKIHERSGPKRG
EHAWTHRLRERKQLVIYEEISDPEEDDE″
SEQ ID NO 6
起始
1 ctctctttcg attcttccat actcagagta cgcacggtct gattttctct ttggattctt
61 ccaaaatcag agtcagactg ctcccggtgc catgaacgga gacgacgcct ttgcaaggag
121 acccacggtt ggtgctcaaa taccagagaa gatccaaaag gccttcgatg atattgccaa
181 atacttctct aaggaagagt gggaaaagat gaaagcctcg gagaaaatct tctatgtgta
241 tatgaagaga aagtatgagg ctatgactaa actaggtttc aaggccaccc tcccaccttt
301 catgtgtaat aaacgggccg aagacttcca ggggaatgat ttggataatg accctaaccg
361 tgggaatcag gttgaacgtc ctcagatgac tttcggcagg ctccagggaa tctccccgaa
421 gatcatgccc aagaagccag cagaggaagg aaatgattcg gaggaagtgc cagaagcatc
481 tggcccacaa aatgatggga aagagctgtg ccccccggga aaaccaacta cctctgagaa
541 gattcacgag agatctggac ccaaaagggg ggaacatgcc tggacccaca gactgcgtga
601 gagaaaacag ctggtgattt atgaagagat cagcgaccct gaggaagatg acgagtaact
661 cccctcaggg atacgacaca tgcccatgat gagaagcaga acgtggtgac ctttcacgaa
721 catgggcatg gctgcggacc cctcgtcatc aggtgcatag caagtg
人叶酸水解酶(前列腺特异性膜抗原)1(FOLH1),mRNA。
ACCESSION NM_004476
VERSION NM_004476.1 GI:4758397
SEQ ID No.4
/翻译=″MWNLLHETDSAVATARRPRWLCAGALVLAGGFFLLGFLFGWFIK
SSNEATNITPKHNMKAFLDELKAENIKKFLYNFTQIPHLAGTEQNFQLAKQIQSQWKE
FGLDSVELAHYDVLLSYPNKTHPNYISIINEDGNEIFNTSLFEPPPPGYENVSDIVPP
FSAFSPQGMPEGDLVYVNYARTEDFFKLERDMKINCSGKIVIARYGKVFRGNKVKNAQ
LAGAKGVILYSDPADYFAPGVKSYPDGWNLPGGGVQRGNILNLNGAGDPLTPGYPANE
YAYRRGIAEAVGLPSIPVHPIGYYDAQKLLEKMGGSAPPDSSWRGSLKVPYNVGPGFT
GNFSTQKVKMHIHSTNEVTRIYNVIGTLRGAVEPDRYVILGGHRDSWVFGGIDPQSGA
AVVHEIVRSFGTLKKEGWRPRRTILFASWDAEEFGLLGSTEWAEENSRLLQERGVAYI
NADSSIEGNYTLRVDCTPLMYSLVHNLTKELKSPDEGFEGKSLYESWTKKSPSPEFSG
MPRISKLGSGNDFEVFFQRLGIASGRARYTKNWETNKFSGYPLYHSVYETYELVEKFY
DPMFKYHLTVAQVRGGMVFELANSIVLPFDCRDYAVVLRKYADKIYSISMKHPQEMKT
YSVSFDSLFSAVKNFTEIASKFSERLQDFDKSNPIVLRMMNDQLMFLERAFIDPLGLP
DRPFYRHVIYAPSSHNKYAGESFPGIYDALFDIESKVDPSKAWGEVKRQIYVAAFTVQ
AAAETLSEVA″
SEQ ID NO 7
起始
1 ctcaaaaggg gccggatttc cttctcctgg aggcagatgt tgcctctctc tctcgctcgg
61 attggttcag tgcactctag aaacactgct gtggtggaga aactggaccc caggtctgga
121 gcgaattcca gcctgcaggg ctgataagcg aggcattagt gagattgaga gagactttac
181 cccgccgtgg tggttggagg gcgcgcagta gagcagcagc acaggcgcgg gtcccgggag
241 gccggctctg ctcgcgccga gatgtggaat ctccttcacg aaaccgactc ggctgtggcc
301 accgcgcgcc gcccgcgctg gctgtgcgct ggggcgctgg tgctggcggg tggcttcttt
361 ctcctcggct tcctcttcgg gtggtttata aaatcctcca atgaagctac taacattact
421 ccaaagcata atatgaaagc atttttggat gaattgaaag ctgagaacat caagaagttc
481 ttatataatt ttacacagat accacattta gcaggaacag aacaaaactt tcagcttgca
541 aagcaaattc aatcccagtg gaaagaattt ggcctggatt ctgttgagct agcacattat
601 gatgtcctgt tgtcctaccc aaataagact catcccaact acatctcaat aattaatgaa
661 gatggaaatg agattttcaa cacatcatta tttgaaccac ctcctccagg atatgaaaat
721 gtttcggata ttgtaccacc tttcagtgct ttctctcctc aaggaatgcc agagggcgat
781 ctagtgtatg ttaactatgc acgaactgaa gacttcttta aattggaacg ggacatgaaa
841 atcaattgct ctgggaaaat tgtaattgcc agatatggga aagttttcag aggaaataag
901 gttaaaaatg cccagctggc aggggccaaa ggagtcattc tctactccga ccctgctgac
961 tactttgctc ctggggtgaa gtcctatcca gatggttgga atcttcctgg aggtggtgtc
1021 cagcgtggaa atatcctaaa tctgaatggt gcaggagacc ctctcacacc aggttaccca
1081 gcaaatgaat atgcttatag gcgtggaatt gcagaggctg ttggtcttcc aagtattcct
1141 gttcatccaa ttggatacta tgatgcacag aagctcctag aaaaaatggg tggctcagca
1201 ccaccagata gcagctggag aggaagtctc aaagtgccct acaatgttgg acctggcttt
1261 actggaaact tttctacaca aaaagtcaag atgcacatcc actctaccaa tgaagtgaca
1321 agaatttaca atgtgatagg tactctcaga ggagcagtgg aaccagacag atatgtcatt
1381 ctgggaggtc accgggactc atgggtgttt ggtggtattg accctcagag tggagcagct
1441 gttgttcatg aaattgtgag gagctttgga acactgaaaa aggaagggtg gagacctaga
1501 agaacaattt tgtttgcaag ctgggatgca gaagaatttg gtcttcttgg ttctactgag
1561 tgggcagagg agaattcaag actccttcaa gagcgtggcg tggcttatat taatgctgac
1621 tcatctatag aaggaaacta cactctgaga gttgattgta caccgctgat gtacagcttg
1681 gtacacaacc taacaaaaga gctgaaaagc cctgatgaag gctttgaagg caaatctctt
1741 tatgaaagtt ggactaaaaa aagtccttcc ccagagttca gtggcatgcc caggataagc
1801 aaattgggat ctggaaatga ttttgaggtg ttcttccaac gacttggaat tgcttcaggc
1861 agagcacggt atactaaaaa ttgggaaaca aacaaattca gcggctatcc actgtatcac
1921 agtgtctatg aaacatatga gttggtggaa aagttttatg atccaatgtt taaatatcac
1981 ctcactgtgg cccaggttcg aggagggatg gtgtttgagc tagccaattc catagtgctc
2041 ccttttgatt gtcgagatta tgctgtagtt ttaagaaagt atgctgacaa aatctacagt
2101 atttctatga aacatccaca ggaaatgaag acatacagtg tatcatttga ttcacttttt
2161 tctgcagtaa agaattttac agaaattgct tccaagttca gtgagagact ccaggacttt
2221 gacaaaagca acccaatagt attaagaatg atgaatgatc aactcatgtt ctggaaaga
2281 gcatttattg atccattagg gttaccagac aggccttttt ataggcatgt catctatgct
2341 ccaagcagcc acaacaagta tgcaggggag tcattcccag gaatttatga tgctctgttt
2401 gatattgaaa gcaaagtgga cccttccaag gcctggggag aagtgaagag acagatttat
2461 gttgcagcct tcacagtgca ggcagctgca gagactttga gtgaagtagc ctaagaggat
2521 tctttagaga atccgtattg aatttgtgtg gtatgtcact cagaaagaat cgtaatgggt
2581 atattgataa attttaaaat tggtatattt gaaataaagt tgaatattat atataaaaaa
2641 aaaaaaaaaa aaa
人黑素细胞特异性(pmel 17)基因,外显子2-5,和全cds。
ACCESSION U20093
VERSION U20093.1 GI:1142634
SEQ ID NO 70
/翻译=″MDLVLKRCLLHLAVIGALLAVGATKVPRNQDWLGVSRQLRTKAWNRQLYPEW
TEAQRLDCWRGGQVSLKVSNDGPTLIGANASFSIALNFPGSQKVLPDGQVIWVNNTIINGSQVWGG
QPVYPQETDDACIFPDGGPCPSGSWSQKRSFVYVWKTWGQYWQVLGGPVSGLSIGTGRAMLGTHTM
EVTVYHRRGSRSYVPLAHSSSAFTITDQVPFSVSVSQLRALDGGNKHFLRNQPLTFALQLHDPSGY
LAEADLSYTWDFGDSSGTLISRAPVVTHTYLEPGPVTAQVVLQAAIPLTSCGSSPVPGTTDGHRPT
AEAPNTTAGQVPTTEVVGTTPGQAPTAEPSGTTSVQVPTTEVISTAPVQMPTAESTGMTPEKVPVS
EVMGTTLAEMSTPEATGMTPAEVSIVVLSGTTAAQVTTTEWVETTARELPIPEPEGPDASSIMSTE
SITGSLGPLLDGTATLRLVKRQVPLDCVLYRYGSFSVTLDIVQGIESAEILQAVPSGEGDAFELTV
SCQGGLPKEACMEISSPGCQPPAQRLCQPVLPSPACQLVLHQILKGGSGTYCLNVSLADTNSLAVV
STQLIMPGQEAGLGQVPLIVGILLVLMAVVLASLIYRRRLMKQDFSVPQLPHSSSHWLRLPRIFCS
CPIGENSPLLSGQQV″
SEQ ID NO 80
起始
1 gtgctaaaaa gatgccttct tcatttggct gtgataggtg ctttgtggct gtgggggcta
61 caaaagtacc cagaaaccag gactggcttg gtgtctcaag gcaactcaga accaaagcct
121 ggaacaggca gctgtatcca gagtggacag aagcccagag acttgactgc tggagaggtg
181 gtcaagtgtc cctcaaggtc agtaatgatg ggcctacact gattggtgca aatgcctcct
241 tctctattgc cttgaacttc cctggaagcc aaaaggtatt gccagatggg caggttatct
301 gggtcaacaa taccatcatc aatgggagcc aggtgtgggg aggacagcca gtgtatcccc
361 aggaaactga cgatgcctgc atcttccctg atggtggacc ttgcccatct ggctcttggt
421 ctcagaagag aagctttgtt tatgtctgga agacctgggg tgagggactc ccttctcagc
481 ctatcatcca cacttgtgtt tacttctttc tacctgatca cctttctttt ggccgcccct
541 tccaccttaa cttctgtgat tttctctaat cttcattttc ctcttagatc ttttctcttt
601 cttagcacct agcccccttc aagctctatc ataattcttt ctggcaactc ttggcctcaa
661 ttgtagtcct accccatgga atgcctcatt aggacccctt ccctgtcccc ccatatcaca
721 gccttccaaa caccctcaga agtaatcata cttcctgacc tcccatctcc agtgccgttt
781 cgaagcctgt ccctcagtcc cctttgacca gtaatctctt cttccttgct tttcattcca
841 aaaatgcttc aggccaatac tggcaagttc tagggggccc agtgtctggg ctgagcattg
901 ggacaggcag ggcaatgctg ggcacacaca ccatggaagt gactgtctac catcgccggg
961 gatcccggag ctatgtgcct cttgctcatt ccagctcagc cttcaccatt actggtaagg
1021 gttcaggaag ggcaaggcca gttgtagggc aaagagaagg cagggaggct tggatggact
1081 gcaaaggaga aaggtgaaat gctgtgcaaa cttaaagtag aagggccagg aagacctagg
1141 cagagaaatg tgaggcttag tgccagtgaa gggccagcca gtcagcttgg agttggaggg
1201 tgtggctgtg aaaggagaag ctgtggctca ggcctggttc tcaccttttc tggctccaat
1261 cccagaccag gtgcctttct ccgtgagcgt gtcccagttg cgggccttgg atggagggaa
1321 caagcacttc ctgagaaatc agcctctgac ctttgccctc cagctccatg accccagtgg
1381 ctatctggct gaagctgacc tctcctacac ctgggacttt ggagacagta gtggaaccct
1441 gatctctcgg gcacctgtgg tcactcatac ttacctggag cctggcccag tcactgccca
1501 ggtggtcctg caggctgcca ttcctctcac ctcctgtggc tcctccccag ttccaggcac
1561 cacagatggg cacaggccaa ctgcagaggc ccctaacacc acagctggcc aagtgcctac
1621 tacagaagtt gtgggtacta cacctggtca ggcgccaact gcagagccct ctggaaccac
1681 atctgtgcag gtgccaacca ctgaagtcat aagcactgca cctgtgcaga tgccaactgc
1741 agagagcaca ggtatgacac ctgagaaggt gccagtttca gaggtcatgg gtaccacact
1801 ggcagagatg tcaactccag aggctacagg tatgacacct gcagaggtat caattgtggt
1861 gctttctgga accacagctg cacaggtaac aactacagag tgggtggaga ccacagctag
1921 agagctacct atccctgagc ctgaaggtcc agatgccagc tcaatcatgt ctacggaaag
1981 tattacaggt tccctgggcc ccctgctgga tggtacagcc accttaaggc tggtgaagag
2041 acaagtcccc ctggattgtg ttctgtatcg atatggttcc ttttccgtca ccctggacat
2101 tgtccagggt attgaaagtg ccgagatcct gcaggctgtg ccgtccggtg agggggatgc
2161 atttgagctg actgtgtcct gccaaggcgg gctgcccaag gaagcctgca tggagatctc
2221 atcgccaggg tgccagcccc ctgcccagcg gctgtgccag cctgtgctac ccagcccagc
2281 ctgccagctg gttctgcacc agatactgaa gggtggctcg gggacatact gcctcaatgt
2341 gtctctggct gataccaaca gcctggcagt ggtcagcacc cagcttatca tgcctggtag
2401 gtccttggac agagactaag tgaggaggga agtggataga ggggacagct ggcaagcagc
2461 agacatgagt gaagcagtgc ctgggattct tctcacaggt caagaagcag gccttgggca
2521 ggttccgctg atcgtgggca tcttgctggt gttgatggct gtggtccttg catctctgat
2581 atataggcgc agacttatga agcaagactt ctccgtaccc cagttgccac atagcagcag
2641 tcactggctg cgtctacccc gcatcttctg ctcttgtccc attggtgaga atagccccct
2701 cctcagtggg cagcaggtct gagtactctc atatgatgct gtgattttcc tggagttgac
2761 agaaacacct atatttcccc cagtcttccc tgggagacta ctattaactg aaataaa ∥
人激肽释放酶3,(前列腺特异性抗原)(KLK3),mRNA。
ACCESSION NM_001648
VERSION NM_001648.1 GI:4502172
SEQ ID NO 78
/翻译=″MWVPVVFLTLSVTWIGAAPLILSRIVGGWECEKHSQPWQVLVAS
RGRAVCGGVLVHPQWVLTAAHCIRNKSVILLGRHSLFHPEDTGQVFQVSHSFPHPLYDMSLLKNRF
LRPGDDSSHDLMLLRLSEPAELTDAVKVMDLPTQEPALGTTCYASGWGSIEPEEFLTPKKLQCVDL
HVISNDVCAQVHPQKVTKFMLCAGRWTGGKSTCSGDSGGPLVCNGVLQGITSWGSEPCALPERPSL
YTKVVHYRKWIKDTIVANP″
SEQ ID NO 86
起始
1 agccccaagc ttaccacctg cacccggaga gctgtgtgtc accatgtggg tcccggttgt
61 cttcctcacc ctgtccgtga cgtggattgg tgctgcaccc ctcatcctgt ctcggattgt
121 gggaggctgg gagtgcgaga agcattccca accctggcag gtgcttgtgg cctctcgtgg
181 cagggcagtc tgcggcggtg ttctggtgca cccccagtgg gtcctcacag ctgcccactg
241 catcaggaac aaaagcgtga tcttgctggg tcggcacagc ctgtttcatc ctgaagacac
301 aggccaggta tttcaggtca gccacagctt cccacacccg ctctacgata tgagcctcct
361 gaagaatcga ttcctcaggc caggtgatga ctccagccac gacctcatgc tgctccgcct
421 gtcagagcct gccgagctca cggatgctgt gaaggtcatg gacctgccca cccaggagcc
481 agcactgggg accacctgct acgcctcagg ctggggcagc attgaaccag aggagttctt
541 gaccccaaag aaacttcagt gtgtggacct ccatgttatt tccaatgacg tgtgtgcgca
601 agttcaccct cagaaggtga ccaagttcat gctgtgtgct ggacgctgga cagggggcaa
661 aagcacctgc tcgggtgatt ctgggggccc acttgtctgt aatggtgtgc ttcaaggtat
721 cacgtcatgg ggcagtgaac catgtgccct gcccgaaagg ccttccctgt acaccaaggt
781 ggtgcattac cggaagtgga tcaaggacac catcgtggcc aacccctgag cacccctatc
841 aaccccctat tgtagtaaac ttggaacctt ggaaatgacc aggccaagac tcaagcctcc
901 ccagttctac tgacctttgt ccttaggtgt gaggtccagg gttgctagga aaagaaatca
961 gcagacacag gtgtagacca gagtgtttct taaatggtgt aattttgtcc tctctgtgtc
1021 ctggggaata ctggccatgc ctggagacat atcactcaat ttctctgagg acacagatag
1081 gatggggtgt ctgtgttatt tgtggggtac agagatgaaa gaggggtggg atccacactg
1141 agagagtgga gagtgacatg tgctggacac tgtccatgaa gcactgagca gaagctggag
1201 gcacaacgca ccagacactc acagcaagga tggagctgaa aacataaccc actctgtcct
1261 ggaggcactg ggaagcctag agaaggctgt gagccaagga gggagggtct tcctttggca
1321 tgggatgggg atgaagtaag gagagggact ggaccccctg gaagctgatt cactatgggg
1381 ggaggtgtat tgaagtcctc cagacaaccc tcagatttga tgatttccta gtagaactca
1441 cagaaataaa gagctgttat actgtg ∥
人自身免疫原性癌/睾丸抗原NY-ESO-1mRNA,全cds
ACCESSION U87459
VERSION U87459.1 GI:1890098
SEQ ID NO 74
/翻译=″MQAEGRGTGGS TGDADGPGGPGIPDGPGGNAGGPGEAG
ATGGRGPRGAGAARASGPGGGAPRGPHGGAASGLNGCCRCGARGPESRLLEF
YLAMPFATPMEAELARRSLAQDAPPLPVPGVLLKEFTVSGNILTIRLTAADH
RQLQLSISSCLQQLSLLMWITQCFLPVFLAQPPSGQRR″
SEQ ID NO 84
起始
1 atcctcgtgg gccctgacct tctctctgag agccgggcag aggctccgga gccatgcagg
61 ccgaaggccg gggcacaggg ggttcgacgg gcgatgctga tggcccagga ggccctggca
121 ttcctgatgg cccagggggc aatgctggcg gcccaggaga ggcgggtgcc acgggcggca
181 gaggtccccg gggcgcaggg gcagcaaggg cctcggggcc gggaggaggc gccccgcggg
241 gtccgcatgg cggcgcggct tcagggctga atggatgctg cagatgcggg gccagggggc
301 cggagagccg cctgcttgag ttctacctcg ccatgccttt cgcgacaccc atggaagcag
361 agctggcccg caggagcctg gcccaggatg ccccaccgct tcccgtgcca ggggtgcttc
421 tgaaggagtt cactgtgtcc ggcaacatac tgactatccg actgactgct gcagaccacc
481 gccaactgca gctctccatc agctcctgtc tccagcagct ttccctgttg atgtggatca
541 cgcagtgctt tctgcccgtg tttttggctc agcctccctc agggcagagg cgctaagccc
601 agcctggcgc cccttcctag gtcatgcctc ctcccctagg gaatggtccc agcacgagtg
661 gccagttcat tgtgggggcc tgattgtttg tcgctggagg aggacggctt acatgtttgt
721 ttctgtagaa aataaaactg agctacgaaa aa //
LAGE-1a蛋白(人)
ACCESSION CAA11116
PID g3255959
VERSION CAA11116.1 GI:3255959
SEQ ID NO 75
起始
1 mqaegrgtgg stgdadgpgg pgipdgpggn aggpgeagat ggrgprgaga arasgprgga
61 prgphggaas aqdgrcpcga rrpdsrllel hitmpfsspm eaelvrrils rdaaplprpg
121 avlkdftvsg nllfirltaa dhrqlqlsis sclqqlsllm witqcflpvf laqapsgqrr
181 //
LAGE-1b蛋白(人)
ACCESSION CAA11117
PID g3255960
VERSION CAA11117.1 GI:3255960
SEQ ID NO 76
起始
1 mqaegrgtgg stgdadgpgg pgipdgpggn aggpgeagat ggrgprgaga arasgprgga
61 prgphggaas aqdgrcpcga rrpdsrllel hitmpfsspm eaelvrrils rdaaplprpg
121 avlkdftvsg nllfmsvwdq dregagrmrv vgwglgsasp egqkardlrt pkhkvseqrp
181 gtpgppppeg aqgdgcrgva fnvmfsaphi //
人抗原(MAGE-1)基因,全cds,
ACCESSION M77481
VERSION M77481.1 GI:416114
SEQ ID NO 71
/翻译=″MSLEQRSLHCKPEEALEAQQEALGLVCVQAATSSSSPL
VLGTLEEVPTAGSTDPPQSPQGASAFPTTINFTRQRQPSEGSSSREEEGPST
SCILESLFRAVITKKVADLVGFLLLKYRAREPVTKAEMLESVIKNYKHCFPE
IFGKASESLQLVFGIDVKEADPTGHSYVLVTcLGLSYDGLLGDNQIMPKTGF
LIIVLVMIAMEGGHAPEEEIWEELSVMEVYDGREHSAYGEPRKLLTQDLVQE
KYLEYRQVPDSDPARYEFLWGPRALAETSYVKVLEYVIKVSARVRFFFPSLR
EAALREEEEGV″
SEQ ID NO 81
起始
1 ggatccaggc cctgccagga aaaatataag ggccctgcgt gagaacagag ggggtcatcc
61 actgcatgag agtggggatg tcacagagtc cagcccaccc tcctggtagc actgagaagc
121 cagggctgtg cttgcggtct gcaccctgag ggcccgtgga ttcctcttcc tggagctcca
181 ggaaccaggc agtgaggcct tggtctgaga cagtatcctc aggtcacaga gcagaggatg
241 cacagggtgt gccagcagtg aatgtttgcc ctgaatgcac accaagggcc ccacctgcca
301 caggacacat aggactccac agagtctggc ctcacctccc tactgtcagt cctgtagaat
361 cgacctctgc tggccggctg taccctgagt accctctcac ttcctccttc aggttttcag
421 gggacaggcc aacccagagg acaggattcc ctggaggcca cagaggagca ccaaggagaa
481 gatctgtaag taggcctttg ttagagtctc caaggttcag ttctcagctg aggcctctca
541 cacactccct ctctccccag gcctgtgggt cttcattgcc cagctcctgc ccacactcct
601 gcctgctgcc ctgacgagag tcatcatgtc tcttgagcag aggagtctgc actgcaagcc
661 tgaggaagcc cttgaggccc aacaagaggc cctgggcctg gtgtgtgtgc aggctgccac
721 ctcctcctcc tctcctctgg tcctgggcac cctggaggag gtgcccactg ctgggtcaac
781 agatcctccc cagagtcctc agggagcctc cgcctttccc actaccatca acttcactcg
841 acagaggcaa cccagtgagg gttccagcag ccgtgaagag gaggggccaa gcacctcttg
901 tatcctggag tccttgttcc gagcagtaat cactaagaag gtggctgatt tggttggttt
961 tctgctcctc aaatatcgag ccagggagcc agtcacaaag gcagaaatgc tggagagtgt
1021 catcaaaaat tacaagcact gttttcctga gatcttcggc aaagcctctg agtccttgca
1081 gctggtcttt ggcattgacg tgaaggaagc agaccccacc ggccactcct atgtccttgt
1141 cacctgccta ggtctctcct atgatggcct gctgggtgat aatcagatca tgcccaagac
1201 aggcttcctg ataattgtcc tggtcatgat tgcaatggag ggcggccatg ctcctgagga
1261 ggaaatctgg gaggagctga gtgtgatgga ggtgtatgat gggagggagc acagtgccta
1321 tggggagccc aggaagctgc tcacccaaga tttggtgcag gaaaagtacc tggagtaccg
1381 gcaggtgccg gacagtgatc ccgcacgcta tgagttcctg tggggtccaa gggccctcgc
1441 tgaaaccagc tatgtgaaag tccttgagta tgtgatcaag gtcagtgcaa gagttcgctt
1501 tttcttccca tccctgcgtg aagcagcttt gagagaggag gaagagggag tctgagcatg
1561 agttgcagcc aaggccagtg ggagggggac tgggccagtg caccttccag ggccgcgtcc
1621 agcagcttcc cctgcctcgt gtgacatgag gcccattctt cactctgaag agagcggtca
1681 gtgttctcag tagtaggttt ctgttctatt gggtgacttg gagatttatc tttgttctct
1741 tttggaattg ttcaaatgtt tttttttaag ggatggttga atgaacttca gcatccaagt
1801 ttatgaatga cagcagtcac acagttctgt gtatatagtt taagggtaag agtcttgtgt
1861 tttattcaga ttgggaaatc cattctattt tgtgaattgg gataataaca gcagtggaat
1921 aagtacttag aaatgtgaaa aatgagcagt aaaatagatg agataaagaa ctaaagaaat
1981 taagagatag tcaattcttg ccttatacct cagtctattc tgtaaaattt ttaaagatat
2041 atgcatacct ggatttcctt ggcttctttg agaatgtaag agaaattaaa tctgaataaa
2101 gaattcttcc tgttcactgg ctcttttctt ctccatgcac tgagcatctg ctttttggaa
2161 ggccctgggt tagtagtgga gatgctaagg taagccagac tcatacccac ccatagggtc
2221 gtagagtcta ggagctgcag tcacgtaatc gaggtggcaa gatgtcctct aaagatgtag
2281 ggaaaagtga gagaggggtg agggtgtggg gctccgggtg agagtggtgg agtgtcaatg
2341 ccctgagctg gggcattttg ggctttggga aactgcagtt ccttctgggg gagctgattg
2401 taatgatctt gggtggatcc //
人MAGE-2基因外显子1-4,全cds
ACCESSION L18920
VERSION L18920.1 GI:436180
SEQ ID NO 72
/翻译=″MPLEQRSQHCKPEEGLEARGEALGLVGAQAPATEEQQTASSSSTLVEVT
LGEVPAADSPSPPHSPQGASSFSTTINYTLWRQSDEGSSNQEEEGPRMFPDLE
SEFQAAISRKMVELVHFLLLKYRAREPVTKAEMLESVLRNCQDFFPVIFSKASEYLQLVFGIE
VVEVVPISHLYILVTCLGLSYDGLLGDNQVMPKTGLLIIVLAIIAIEGDCAPEEKIWEELSML
EVFEGREDSVFAHPRKLLMQDLVQENYLEYRQVPGSDPACYEFLWGPRALIETSYVKVLHHTL
KIGGEPHISYPPLHERALREGEE″
SEQ ID NO 82
起始
1 attccttcat caaacagcca ggagtgagga agaggaccct cctgagtgag gactgaggat
61 ccaccctcac cacatagtgg gaccacagaa tccagctcag cccctcttgt cagccctggt
121 acacactggc aatgatctca ccccgagcac acccctcccc ccaatgccac ttcgggccga
181 ctcagagtca gagacttggt ctgaggggag cagacacaat cggcagagga tggcggtcca
241 ggctcagtct ggcatccaag tcaggacctt gagggatgac caaaggcccc tcccaccccc
301 aactcccccg accccaccag gatctacagc ctcaggatcc ccgtcccaat ccctacccct
361 acaccaacac catcttcatg cttaccccca cccccccatc cagatcccca tccgggcaga
421 atccggttcc acccttgccg tgaacccagg gaagtcacgg gcccggatgt gacgccactg
481 acttgcacat tggaggtcag aggacagcga gattctcgcc ctgagcaacg gcctgacgtc
541 ggcggaggga agcaggcgca ggctccgtga ggaggcaagg taagacgccg agggaggact
601 gaggcgggcc tcaccccaga cagagggccc ccaataatcc agcgctgcct ctgctgccgg
661 gcctggacca ccctgcaggg gaagacttct caggctcagt cgccaccacc tcaccccgcc
721 accccccgcc gctttaaccg cagggaactc tggcgtaaga gctttgtgtg accagggcag
781 ggctggttag aagtgctcag ggcccagact cagccaggaa tcaaggtcag gaccccaaga
841 ggggactgag ggcaacccac cccctaccct cactaccaat cccatccccc aacaccaacc
901 ccacccccat ccctcaaaca ccaaccccac ccccaaaccc cattcccatc tcctccccca
961 ccaccatcct ggcagaatcc ggctttgccc ctgcaatcaa cccacggaag ctccgggaat
1021 ggcggccaag cacgcggatc ctgacgttca catgtacggc taagggaggg aaggggttgg
1081 gtctcgtgag tatggccttt gggatgcaga ggaagggccc aggcctcctg gaagacagtg
1141 gagtccttag gggacccagc atgccaggac agggggccca ctgtacccct gtctcaaact
1201 gagccacctt ttcattcagc cgagggaatc ctagggatgc agacccactt cagcaggggg
1261 ttggggccca gcctgcgagg agtcaagggg aggaagaaga gggaggactg aggggacctt
1321 ggagtccaga tcagtggcaa ccttgggctg ggggatcctg ggcacagtgg ccgaatgtgc
1381 cccgtgctca ttgcaccttc agggtgacag agagttgagg gctgtggtct gagggctggg
1441 acttcaggtc agcagaggga ggaatcccag gatctgccgg acccaaggtg tgcccccttc
1501 atgaggactg gggatacccc cggcccagaa agaagggatg ccacagagtc tggaagtccc
1561 ttgttcttag ctctggggga acctgatcag ggatggccct aagtgacaat ctcatttgta
1621 ccacaggcag gaggttgggg aaccctcagg gagataaggt gttggtgtaa agaggagctg
1681 tctgctcatt tcagggggtt gggggttgag aaagggcagt ccctggcagg agtaaagatg
1741 agtaacccac aggaggccat cataacgttc accctagaac caaaggggtc agccctggac
1801 aacgcacgtg ggggtaacag gatgtggccc ctcctcactt gtctttccag atctcaggga
1861 gttgatgacc ttgttttcag aaggtgactc aggtcaacac aggggcccca tctggtcgac
1921 agatgcagtg gttctaggat ctgccaagca tccaggtgga gagcctgagg taggattgag
1981 ggtacccctg ggccagaatg cagcaagggg gccccataga aatctgccct gcccctgcgg
2041 ttacttcaga gaccctgggc agggctgtca gctgaagtcc ctccattatc ctgggatctt
2101 tgatgtcagg gaaggggagg ccttggtctg aaggggctgg agtcaggtca gtagagggag
2161 ggtctcaggc cctgccagga gtggacgtga ggaccaagcg gactcgtcac ccaggacacc
2221 tggactccaa tgaatttgga catctctcgt tgtccttcgc gggaggacct ggtcacgtat
2281 ggccagatgt gggtcccctc atatccttct gtaccatatc agggatgtga gttcttgaca
2341 tgagagattc tcaagccagc aaaagggtgg gattaggccc tacaaggaga aaggtgaggg
2401 ccctgagtga gcacagaggg gaccctccac ccaagtagag tggggacctc acggagtctg
2461 gccaaccctg ctgagacttc tgggaatccg tggctgtgct tgcagtctgc acactgaagg
2521 cccgtgcatt cctctcccag gaatcaggag ctccaggaac caggcagtga ggccttggtc
2581 tgagtcagtg tcctcaggtc acagagcaga ggggacgcag acagtgccaa cactgaaggt
2641 ttgcctggaa tgcacaccaa gggccccacc cgcccagaac aaatgggact ccagagggcc
2701 tggcctcacc ctccctattc tcagtcctgc agcctgagca tgtgctggcc ggctgtaccc
2761 tgaggtgccc tcccacttcc tccttcaggt tctgaggggg acaggctgac aagtaggacc
2821 cgaggcactg gaggagcatt gaaggagaag atctgtaagt aagcctttgt cagagcctcc
2881 aaggttcagt tcagttctca cctaaggcct cacacacgct ccttctctcc ccaggcctgt
2941 gggtcttcat tgcccagctc ctgcccgcac tcctgcctgc tgccctgacc agagtcatca
3001 tgcctcttga gcagaggagt cagcactgca agcctgaaga aggccttgag gcccgaggag
3061 aggccctggg cctggtgggt gcgcaggctc ctgctactga ggagcagcag accgcttctt
3121 cctcttctac tctagtggaa gttaccctgg gggaggtgcc tgctgccgac tcaccgagtc
3181 ctccccacag tcctcaggga gcctccagct tctcgactac catcaactac actctttgga
3241 gacaatccga tgagggctcc agcaaccaag aagaggaggg gccaagaatg tttcccgacc
3301 tggagtccga gttccaagca gcaatcagta ggaagatggt tgagttggtt cattttctgc
3361 tcctcaagta tcgagccagg gagccggtca caaaggcaga aatgctggag agtgtcctca
3421 gaaattgcca ggacttcttt cccgtgatct tcagcaaagc ctccgagtac ttgcagctgg
3481 tctttggcat cgaggtggtg gaagtggtcc ccatcagcca cttgtacatc cttgtcacct
3541 gcctgggcct ctcctacgat ggcctgctgg gcgacaatca ggtcatgccc aagacaggcc
3601 tcctgataat cgtcctggcc ataatcgcaa tagagggcga ctgtgcccct gaggagaaaa
3661 tctgggagga gctgagtatg ttggaggtgt ttgaggggag ggaggacagt gtcttcgcac
3721 atcccaggaa gctgctcatg caagatctgg tgcaggaaaa ctacctggag taccggcagg
3781 tgcccggcag tgatcctgca tgctacgagt tcctgtgggg tccaagggcc ctcattgaaa
3841 ccagctatgt gaaagtcctg caccatacac taaagatcgg tggagaacct cacatttcct
3901 acccacccct gcatgaacgg gctttgagag agggagaaga gtgagtctca gcacatgttg
3961 cagccagggc cagtgggagg gggtctgggc cagtgcacct tccagggccc catccattag
4021 cttccactgc ctcgtgtgat atgaggccca ttcctgcctc tttgaagaga gcagtcagca
4081 ttcttagcag tgagtttctg ttctgttgga tgactttgag atttatcttt ctttcctgtt
4141 ggaattgttc aaatgttcct tttaacaaat ggttggatga acttcagcat ccaagtttat
4201 gaatgacagt agtcacacat agtgctgttt atatagttta ggggtaagag tcctgttttt
4261 tattcagatt gggaaatcca ttccattttg tgagttgtca cataataaca gcagtggaat
4321 atgtatttgc ctatattgtg aacgaattag cagtaaaata catgatacaa ggaactcaaa
4381 agatagttaa ttcttgcctt atacctcagt ctattatgta aaattaaaaa tatgtgtatg
4441 tttttgcttc tttgagaatg caaaagaaat taaatctgaa taaattcttc ctgttcactg
4501 gctcatttct ttaccattca ctcagcatct gctctgtgga aggccctggt agtagtggg //
人MAGE-3抗原(MAGE-3)基因,全cds
ACCESSION U03735
VERSION U03735.1 GI:468825
SEQ ID NO 73
/翻译=″MPLEQRSQHcKPEEGLEARGEALGLVGAQAPATEEQEAASSSSTLVEVTLGE
VPAAESPDPPQSPQGASSLPTTMNYPLWSQSYEDSSNQEEEGPSTFPDLESEFQAALSRKVAELVH
FLLLKYRAREPVTKAEMLGSVVGNWQYFFPVIFSKASSSLQLVFGIELMEVDPIGHLYIFATCLGL
SYDGLLGDNQIMPKAGLLIIVLAIIAREGDCAPEEKIWEELSVLEVFEGREDSILGDPKKLLTQHF
VQENYLEYRQVPGSDPACYEFLWGPRALVETSYVKVLHHMVKISGGPHISYPPLHEWVLREGEE″
SEQ ID NO 83
起始
1 acgcaggcag tgatgtcacc cagaccacac cccttccccc aatgccactt cagggggtac
61 tcagagtcag agacttggtc tgaggggagc agaagcaatc tgcagaggat ggcggtccag
121 gctcagccag gcatcaactt caggaccctg agggatgacc gaaggccccg cccacccacc
181 cccaactccc ccgaccccac caggatctac agcctcagga cccccgtccc aatccttacc
241 ccttgcccca tcaccatctt catgcttacc tccaccccca tccgatcccc atccaggcag
301 aatccagttc cacccctgcc cggaacccag ggtagtaccg ttgccaggat gtgacgccac
361 tgacttgcgc attggaggtc agaagaccgc gagattctcg ccctgagcaa cgagcgacgg
421 cctgacgtcg gcggagggaa gccggcccag gctcggtgag gaggcaaggt aagacgctga
481 gggaggactg aggcgggcct cacctcagac agagggcctc aaataatcca gtgctgcctc
541 tgctgccggg cctgggccac cccgcagggg aagacttcca ggctgggtcg ccactacctc
601 accccgccga cccccgccgc tttagccacg gggaactctg gggacagagc ttaatgtggc
661 cagggcaggg ctggttagaa gaggtcaggg cccacgctgt ggcaggaatc aaggtcagga
721 ccccgagagg gaactgaggg cagcctaacc accaccctca ccaccattcc cgtcccccaa
781 cacccaaccc cacccccatc ccccattccc atccccaccc ccacccctat cctggcagaa
841 tccgggcttt gcccctggta tcaagtcacg gaagctccgg gaatggcggc caggcacgtg
901 agtcctgagg ttcacatcta cggctaaggg agggaagggg ttcggtatcg cgagtatggc
961 cgttgggagg cagcgaaagg gcccaggcct cctggaagac agtggagtcc tgaggggacc
1021 cagcatgcca ggacaggggg cccactgtac ccctgtctca aaccgaggca ccttttcatt
1081 cggctacggg aatcctaggg atgcagaccc acttcagcag ggggttgggg cccagccctg
1141 cgaggagtca tggggaggaa gaagagggag gactgagggg accttggagt ccagatcagt
1201 ggcaaccttg ggctggggga tgctgggcac agtggccaaa tgtgctctgt gctcattgcg
1261 ccttcagggt gaccagagag ttgagggctg tggtctgaag agtgggactt caggtcagca
1321 gagggaggaa tcccaggatc tgcagggccc aaggtgtacc cccaaggggc ccctatgtgg
1381 tggacagatg cagtggtcct aggatctgcc aagcatccag gtgaagagac tgagggagga
1441 ttgagggtac ccctgggaca gaatgcggac tgggggcccc ataaaaatct gccctgctcc
1501 tgctgttacc tcagagagcc tgggcagggc tgtcagctga ggtccctcca ttatcctagg
1561 atcactgatg tcagggaagg ggaagccttg gtctgagggg gctgcactca gggcagtaga
1621 gggaggctct cagaccctac taggagtgga ggtgaggacc aagcagtctc ctcacccagg
1681 gtacatggac ttcaataaat ttggacatct ctcgttgtcc tttccgggag gacctgggaa
1741 tgtatggcca gatgtgggtc ccctcatgtt tttctgtacc atatcaggta tgtgagttct
1801 tgacatgaga gattctcagg ccagcagaag ggagggatta ggccctataa ggagaaaggt
1861 gagggccctg agtgagcaca gaggggatcc tccaccccag tagagtgggg acctcacaga
1921 gtctggccaa ccctcctgac agttctggga atccgtggct gcgtttgctg tctgcacatt
1981 gggggcccgt ggattcctct cccaggaatc aggagctcca ggaacaaggc agtgaggact
2041 tggtctgagg cagtgtcctc aggtcacaga gtagaggggg ctcagatagt gccaacggtg
2101 aaggtttgcc ttggattcaa accaagggcc ccacctgccc cagaacacat ggactccaga
2161 gcgcctggcc tcaccctcaa tactttcagt cctgcagcct cagcatgcgc tggccggatg
2221 taccctgagg tgccctctca cttcctcctt caggttctga ggggacaggc tgacctggag
2281 gaccagaggc ccccggagga gcactgaagg agaagatctg taagtaagcc tttgttagag
2341 cctccaaggt tccattcagt actcagctga ggtctctcac atgctccctc tctccccagg
2401 ccagtgggtc tccattgccc agctcctgcc cacactcccg cctgttgccc tgaccagagt
2461 catcatgcct cttgagcaga ggagtcagca ctgcaagcct gaagaaggcc ttgaggcccg
2521 aggagaggcc ctgggcctgg tgggtgcgca ggctcctgct actgaggagc aggaggctgc
2581 ctcctcctct tctactctag ttgaagtcac cctgggggag gtgcctgctg ccgagtcacc
2641 agatcctccc cagagtcctc agggagcctc cagcctcccc actaccatga actaccctct
2701 ctggagccaa tcctatgagg actccagcaa ccaagaagag gaggggccaa gcaccttccc
2761 tgacctggag tccgagttcc aagcagcact cagtaggaag gtggccgagt tggttcattt
2821 tctgctcctc aagtatcgag ccagggagcc ggtcacaaag gcagaaatgc tggggagtgt
2881 cgtcggaaat tggcagtatt tctttcctgt gatcttcagc aaagcttcca gttccttgca
2941 gctggtcttt ggcatcgagc tgatggaagt ggaccccatc ggccacttgt acatctttgc
3001 cacctgcctg ggcctctcct acgatggcct gctgggtgac aatcagatca tgcccaaggc
3061 aggcctcctg ataatcgtcc tggccataat cgcaagagag ggcgactgtg cccctgagga
3121 gaaaatctgg gaggagctga gtgtgttaga ggtgtttgag gggagggaag acagtatctt
3181 gggggatccc aagaagctgc tcacccaaca tttcgtgcag gaaaactacc tggagtaccg
3241 gcaggtcccc ggcagtgatc ctgcatgtta tgaattcctg tggggtccaa gggccctcgt
3301 tgaaaccagc tatgtgaaag tcctgcacca tatggtaaag atcagtggag gacctcacat
3361 ttcctaccca cccctgcatg agtgggtttt gagagagggg gaagagtgag tctgagcacg
3421 agttgcagcc agggccagtg ggagggggtc tgggccagtg caccttccgg ggccgcatcc
3481 cttagtttcc actgcctcct gtgacgtgag gcccattctt cactctttga agcgagcagt
3541 cagcattctt agtagtgggt ttctgttctg ttggatgact ttgagattat tctttgtttc
3601 ctgttggagt tgttcaaatg ttccttttaa cggatggttg aatgagcgtc agcatccagg
3661 tttatgaatg acagtagtca cacatagtgc tgtttatata gtttaggagt aagagtcttg
3721 ttttttactc aaattgggaa atccattcca ttttgtgaat tgtgacataa taatagcagt
3781 ggtaaaagta ttgcttaaa attgtgagcg aattagcaat aacatacatg agataactca
3841 agaaatcaaa agatagttga ttcttgcctt gtacctcaat ctattctgta aaattaaaca
3901 aatatgcaaa ccaggatttc cttgacttct ttgagaatgc aagcgaaatt aaatctgaat
3961 aaataattct tcctcttcac tggctcgttt cttttccgtt cactcagcat ctgctctgtg
4021 ggaggccctg ggttagtagt ggggatgcta aggtaagcca gactcacgcc tacccatagg
4081 gctgtagagc ctaggacctg cagtcatata attaaggtgg tgagaagtcc tgtaagatgt
4141 agaggaaatg taagagaggg gtgagggtgt ggcgctccgg gtgagagtag tggagtgtca
4201 gtgc //
人前列腺干细胞抗原(PSCA)mRNA,全cds
ACCESSION AF043498
VERSION AF043498.1 GI:2909843
SEQ ID NO 79
/翻译=″MKAVLLALLMAGLALQPGTALLCYSCKAQVSNEDCLQVENCTQLGEQCW
TARIRAVGLLTVISKGCSLNCVDDSQDYYVGKKNITCCDTDLCNASGAHALQPAAAILALLPA
LGLLLWGPGQL″
SEQ ID NO 87
起始
1 agggagaggc agtgaccatg aaggctgtgc tgcttgccct gttgatggca ggcttggccc
61 tgcagccagg cactgccctg ctgtgctact cctgcaaagc ccaggtgagc acgaggact
121 gcctgcaggt ggagaactgc acccagctgg gggagcagtg ctggaccgcg cgcatccgcg
181 cagttggcct cctgaccgtc atcagcaaag gctgcagctt gaactgcgtg gatgactcac
241 aggactacta cgtgggcaag aagaacatca cgtgctgtga caccgacttg tgcaacgcca
301 gcggggccca tgccctgcag ccggctgccg ccatccttgc gctgctccct gcactcggcc
361 tgctgctctg gggacccggc cagctatagg ctctgggggg ccccgctgca gcccacactg
421 ggtgtggtgc cccaggcctt tgtgccactc ctcacagaac ctggcccagt gggagcctgt
481 cctggttcct gaggcacatc ctaacgcaag tttgaccatg tatgtttgca ccccttttcc
541 ccnaaccctg accttcccat gggccttttc caggattccn accnggcaga tcagttttag
601 tganacanat ccgcntgcag atggcccctc caaccntttn tgttgntgtt tccatggccc
661 agcattttcc acccttaacc ctgtgttcag gcacttnttc ccccaggaag ccttccctgc
721 ccaccccatt tatgaattga gccaggtttg gtccgtggtg tcccccgcac ccagcagggg
781 acaggcaatc aggagggccc agtaaaggct gagatgaagt ggactgagta gaactggagg
841 acaagagttg acgtgagttc ctgggagttt ccagagatgg ggcctggagg cctggaggaa
901 ggggccaggc ctcacatttg tggggntccc gaatggcagc ctgagcacag cgtaggccct
961 taataaacac ctgttggata agccaaaaaa //
腺激肽释放酶1前体(组织激肽释放酶)(肾/胰腺/唾液腺激肽释放酶)
ACCESSION P06870
PID g125170
VERSION P06870 GI:125170
SEQ ID NO 105
起始
1 mwflvlclal slggtgaapp iqsrivggwe ceqhsqpwqa alyhfstfqc ggilvhrqwv
61 ltaahcisdn yqlwlgrhnl fddentaqfv hvsesfphpg fnmsllenht rqadedyshd
121 lmllrltepa dtitdavkvv elptqepevg stclasgwgs iepenfsfpd dlqcvdlkil
181 pndecekahv qkvtdfmlcv ghleggkdtc vgdsggplmc dgvlqgvtsw gyvpcgtpnk
241 psvavIvlsy vkwiedtiae ns //
弹性蛋白酶2A前体
ACCESSION P08217
PID g119255
VERSION P08217 GI:119255
SEQ ID NO 106
起始
1 mirtlllstl vagalscgdp typpyvtrvv ggeearpnsw pwqvslqyss ngkwyhtcgg
61 slianswvlt aahcisssrt yrvglgrhnl yvaesgslav svskivvhkd wnsnqiskgn
121 diallklanp vsltdkiqla clppagtilp nnypcyvtgw grlqtngavp dvlqqgrllv
181 vdyatcsssa wwgssvktsm icaggdgvis scngdsggpl ncqasdgrwq vhgivs fgsr
241 lgcnyyhkps vftrvsnyid winsviann //
胰弹性蛋白酶IIB[人]
ACCESSION NP_056933
PID g7705648
VERSION NP_056933.1 GI:7705648
SEQ ID NO 107
起始
1 mirtlllstl vagalscgvs tyapdmsrml ggeearpnsw pwqvslqyss ngqwyhtcgg
61 slianswvlt aahcisssri yrvmlgqhnl yvaesgslav svskivvhkd wnsnqvskgn
121 diallklanp vsltdkiqla clppagtilp nnypcyvtgw grlqtngalp ddlkqgrllv
181 vdyatcsssg wwgstvktnm icaggdgvic tcngdsggpl ncqasdgrwe vhgigsltsv
241 lgcnyyykps iftrvsnynd winsviann //
PRAME人黑素瘤中优选表达的抗原
(PRAME),mRNA.
ACCESSION NM_006115
VERSION NM_006115.1 GI:5174640
SEQ ID NO 77
/翻译=″MERRRLWGSIQSRYISMSVWTSPRRLVELAGQSLLKDEALAIAALELLPREL
FPPLFMAAFDGRHSQTLKAMVQAWPFTCLPLGVLMKGQHLHLETFKAVLDGLDVLLAQEVRPRRWK
LQVLDLRKNSHQDFWTVWSGNRASLYSFPEPEAAQPMTKKRKVDGLSTEAEQPFIPVEVLVDLFLK
EGACDELFSYLIEKVKRKKNVLRLCCKKLKIFAMPMQDIKMILKMVQLDSIEDLEVTCTWKLPTLA
KFSPYLGQMINLRRLLLSHIHASSYISPEKEEQYIAQFTSQFLSLQCLQALYVDSLFFLRGRLDQL
LRHVMNPLETLSITNCRLSEGDVMHLSQSPSVSQLSVLSLSGVMLTDVSPEPLQALLERASATLQD
LVFDECGITDDQLLALLPSLSHCSQLTTLSFYGNSISISALQSLLQHLIGLSNLTHVLYPVPLESY
EDIHGTLHLERLAYLHARLRELLCELGRPSMVWLSANPCPHCGDRTFYDPEPILCPCFMPN″
SEQ ID NO 85
起始
1 gcttcagggt acagctcccc cgcagccaga agccgggcct gcagcccctc agcaccgctc
61 cgggacaccc cacccgcttc ccaggcgtga cctgtcaaca gcaacttcgc ggtgtggtga
121 actctctgag gaaaaaccat tttgattatt actctcagac gtgcgtggca acaagtgact
181 gagacctaga aatccaagcg ttggaggtcc tgaggccagc ctaagtcgct tcaaaatgga
241 acgaaggcgt ttgtggggtt ccattcagag ccgatacatc agcatgagtg tgtggacaag
301 cccacggaga cttgtggagc tggcagggca gagcctgctg aaggatgagg ccctggccat
361 tgccgccctg gagttgctgc ccagggagct cttcccgcca ctcttcatgg cagcctttga
421 cgggagacac agccagaccc tgaaggcaat ggtgcaggcc tggcccttca cctgcctccc
481 tctgggagtg ctgatgaagg gacaacatct tcacctggag accttcaaag cgtgcttga
541 tggacttgat gtgctccttg cccaggaggt tcgccccagg aggtggaaac ttcaagtgct
601 ggatttacgg aagaactctc atcaggactt ctggactgta tggtctggaa acagggccag
661 tctgtactca tttccagagc cagaagcagc tcagcccatg acaaagaagc gaaaagtaga
721 tggtttgagc acagaggcag agcagccctt cattccagta gaggtgctcg tagacctgtt
781 cctcaaggaa ggtgcctgtg atgaattgtt ctcctacctc attgagaaag tgaagcgaaa
841 gaaaaatgta ctacgcctgt gctgtaagaa gctgaagatt tttgcaatgc ccatgcagga
901 tatcaagatg atcctgaaaa tggtgcagct ggactctatt gaagatttgg aagtgacttg
961 tacctggaag ctacccacct tggcgaaatt ttctccttac ctgggccaga tgattaatct
1021 gcgtagactc ctcctctccc acatccatgc atcttcctac atttccccgg agaaggaaga
1081 gcagtatatc gcccagttca cctctcagtt cctcagtctg cagtgcctgc aggctctcta
1141 tgtggactct ttatttttcc ttagaggccg cctggatcag ttgctcaggc acgtgatgaa
1201 ccccttggaa accctctcaa taactaactg ccggctttcg gaaggggatg tgatgcatct
1261 gtcccagagt cccagcgtca gtcagctaag tgtcctgagt ctaagtgggg tcatgctgac
1321 cgatgtaagt cccgagcccc tccaagctct gctggagaga gcctctgcca ccctccagga
1381 cctggtcttt gatgagtgtg ggatcacgga tgatcagctc cttgccctcc tgccttccct
1441 gagccactgc tcccagctta caaccttaag cttctacggg aattccatct ccatatctgc
1501 cttgcagagt ctcctgcagc acctcatcgg gctgagcaat ctgacccacg tgctgtatcc
1561 tgtccccctg gagagttatg aggacatcca tggtaccctc cacctggaga ggcttgccta
1621 tctgcatgcc aggctcaggg agttgctgtg tgagttgggg cggcccagca tggtctggct
1681 tagtgccaac ccctgtcctc actgtgggga cagaaccttc tatgacccgg agcccatcct
1741 gtgcccctgt ttcatgccta actagctggg tgcacatatc aaatgcttca ttctgcatac
1801 ttggacacta aagccaggat gtgcatgcat cttgaagcaa caaagcagcc acagtttcag
1861 acaaatgttc agtgtgagtg aggaaaacat gttcagtgag gaaaaaacat tcagacaaat
1921 gttcagtgag gaaaaaaagg ggaagttggg gataggcaga tgttgacttg aggagttaat
1981 gtgatctttg gggagataca tcttatagag ttagaaatag aatctgaatt tctaaaggga
2041 gattctggct tgggaagtac atgtaggagt taatccctgt gtagactgtt gtaaagaaac
2101 tgttgaaaat aaagagaagc aatgtgaagc aaaaaaaaaa aaaaaaaa //
CEA人癌胚抗原相关细胞粘附分子5(CEACAM5),mRNA。
ACCESSION NM_004363
VERSION NM_004363.1 GI:11386170
SEQ ID NO 88
/翻译=″MESPSAPPHRWCIPWQRLLLTASLLTFWNPPTTAKLTIESTPFN
VAEGKEVLLLVHNLPQHLFGYSWYKGERVDGNRQIIGYVIGTQQATPGPAYSGREIIY
PNASLLIQNIIQNDTGFYTLHVIKSDLVNEEATGQFRVYPELPKPSISSNNSKPVEDK
DAVAFTCEPETQDATYLWWVNNQSLPVSPRLQLSNGNRTLTLFNVTRNDTASYKCETQ
NPVSARRSDSVILNVLYGPDAPTISPLNTSYRSGENLNLSCHAASNPPAQYSWFVNGT
FQQSTQELFIPNITVNNSGSYTCQAHNSDTGLNRTTVTTITVYAEPPKPFITSNNSNP
VEDEDAVALTCEPEIQNTTYLWWVNNQSLPVSPRLQLSNDNRTLTLLSVTRNDVGPYE
CGIQNELSVDHSDPVILNVLYGPDDPTISPSYTYYRPGVNLSLSCHAASNPPAQYSWL
IDGNIQQHTQELFISNITEKNSGLYTCQANNSASGHSRTTVKTITVSAELPKPSISSN
NSKPVEDKDAVAFTCEPEAQNTTYLWWVNGQSLPVSPRLQLSNGNRTLTLFNVTRNDA
RAYVCGIQNSVSANRSDPVTLDVLYGPDTPIISPPDSSYLSGANLNLSCHSASNPSPQ
YSWRINGIPQQHTQVLFIAKITPNNNGTYACFVSNLATGRNNSIVKSITVSASGTSPG
LSAGATVGIMIGVLVGVALI″
SEQ ID NO 89
起始
1 ctcagggcag agggaggaag gacagcagac cagacagtca cagcagcctt gacaaaacgt
61 tcctggaact caagctcttc tccacagagg aggacagagc agacagcaga gaccatggag
121 tctccctcgg cccctcccca cagatggtgc atcccctggc agaggctcct gctcacagcc
181 tcacttctaa ccttctggaa cccgcccacc actgccaagc tcactattga atccacgccg
241 ttcaatgtcg cagaggggaa ggaggtgctt ctacttgtcc acaatctgcc ccagcatctt
301 tttggctaca gctggtacaa aggtgaaaga gtggatggca accgtcaaat tataggatat
361 gtaataggaa ctcaacaagc taccccaggg cccgcataca gtggtcgaga gataatatac
421 cccaatgcat ccctgctgat ccagaacatc atccagaatg acacaggatt ctacacccta
481 cacgtcataa agtcagatct tgtgaatgaa gaagcaactg gccagttccg ggtatacccg
541 gagctgccca agccctccat ctccagcaac aactccaaac ccgtggagga caaggatgct
601 gtggccttca cctgtgaacc tgagactcag gacgcaacct acctgtggtg ggtaaacaat
661 cagagcctcc cggtcagtcc caggctgcag ctgtccaatg gcaacaggac cctcactcta
721 ttcaatgtca caagaaatga cacagcaagc tacaaatgtg aaacccagaa cccagtgagt
781 gccaggcgca gtgattcagt catcctgaat gtcctctatg gcccggatgc ccccaccatt
841 tcccctctaa acacatctta cagatcaggg gaaaatctga acctctcctg ccacgcagcc
901 tctaacccac ctgcacagta ctcttggttt gtcaatggga ctttccagca atccacccaa
961 gagctcttta tccccaacat cactgtgaat aatagtggat cctatacgtg ccaagcccat
1021 aactcagaca ctggcctcaa taggaccaca gtcacgacga tcacagtcta tgcagagcca
1081 cccaaaccct tcatcaccag caacaactcc aaccccgtgg aggatgagga tgctgtagcc
1141 ttaacctgtg aacctgagat tcagaacaca acctacctgt ggtgggtaaa taatcagagc
1201 ctcccggtca gtcccaggct gcagctgtcc aatgacaaca ggaccctcac tctactcagt
1261 gtcacaagga atgatgtagg accctatgag tgtggaatcc agaacgaatt aagtgttgac
1321 cacagcgacc cagtcatcct gaatgtcctc tatggcccag acgaccccac catttccccc
1381 tcatacacct attaccgtcc aggggtgaac ctcagcctct cctgccatgc agcctctaac
1441 ccacctgcac agtattcttg gctgattgat gggaacatcc agcaacacac acaagagctc
1501 tttatctcca acatcactga gaagaacagc ggactctata cctgccaggc caataactca
1561 gccagtggcc acagcaggac tacagtcaag acaatcacag tctctgcgga gctgcccaag
1621 ccctccatct ccagcaacaa ctccaaaccc gtggaggaca aggatgctgt ggccttcacc
1681 tgtgaacctg aggctcagaa cacaacctac ctgtggtggg taaatggtca gagcctccca
1741 gtcagtccca ggctgcagct gtccaatggc aacaggaccc tcactctatt aatgtcaca
1801 agaaatgacg caagagccta tgtatgtgga atccagaact cagtgagtgc aaaccgcagt
1861 gacccagtca ccctggatgt cctctatggg ccggacaccc ccatcatttc ccccccagac
1921 tcgtcttacc tttcgggagc gaacctcaac ctctcctgcc actcggcctc taacccatcc
1981 ccgcagtatt cttggcgtat caatgggata ccgcagcaac acacacaagt tctctttatc
2041 gccaaaatca cgccaaataa taacgggacc tatgcctgtt ttgtctctaa cttggctact
2101 ggccgcaata attccatagt caagagcatc acagtctctg catctggaac ttctcctggt
2161 ctctcagctg gggccactgt cggcatcatg attggagtgc tggttggggt tgctctgata
2221 tagcagccct ggtgtagttt cttcatttca ggaagactga cagttgtttt gcttcttcct
2281 taaagcattt gcaacagcta cagtctaaaa ttgcttcttt accaaggata tttacagaaa
2341 agactctgac cagagatcga gaccatccta gccaacatcg tgaaacccca tctctactaa
2401 aaatacaaaa atgagctggg cttggtggcg cgcacctgta gtcccagtta ctcgggaggc
2461 tgaggcagga gaatcgcttg aacccgggag gtggagattg cagtgagccc agatcgcacc
2521 actgcactcc agtctggcaa cagagcaaga ctccatctca aaaagaaaag aaaagaagac
2581 tctgacctgt actcttgaat acaagtttct gataccactg cactgtctga gaatttccaa
2641 aactttaatg aactaactga cagcttcatg aaactgtcca ccaagatcaa gcagagaaaa
2701 taattaattt catgggacta aatgaactaa tgaggattgc tgattcttta aatgtcttgt
2761 ttcccagatt tcaggaaact ttttttcttt taagctatcc actcttacag caatttgata
2821 aaatatactt ttgtgaacaa aaattgagac atttacattt tctccctatg tggtcgctcc
2881 agacttggga aactattcat gaatatttat attgtatggt aatatagtta ttgcacaagt
2941 tcaataaaaa tctgctcttt gtataacaga aaaa //
Her2/Neu人酪氨酸激酶型受体(HER2)mRNA,全cds
ACCESSION M11730
VERSION M11730.1 GI:183986
SEQ ID NO 90
/翻译=″MELAALCRWGLLLALLPPGAASTQVCTGTDMKLRLPASPETHLD
MLRHLYQGCQVVQGNLELTYLPTNASLSFLQDIQEVQGYVLIAHNQVRQVPLQRLRIV
RGTQLFEDNYALAVLDNGDPLNNTTPVTGASPGGLRELQLRSLTEILKGGVLIQRNPQ
LCYQDTILWKDIFHKNNQLALTLIDTNRSRACHPCSPMCKGSRCWGESSEDCQSLTRT
VCAGGCARCKGPLPTDCCHEQCAAGCTGPKHSDCLACLHFNHSGICELHCPALVTYNT
DTFESMPNPEGRYTFGASCVTACPYNYLSTDVGSCTLVCPLHNQEVTAEDGTQRCEKC
SKPCARVCYGLGMEHLREVRAVTSANIQEFAGCKKIFGSLAFLPESFDGDPASNTAPL
QPEQLQVFETLEEITGYLYISAWPDSLPDLSVFQNLQVIRGRILHNGAYSLTLQGLGI
SWLGLRSLRELGSGLALIHHNTHLCFVHTVPWDQLFRNPHQALLHTANRPEDECVGEG
LACHQLCARGHCWGPGPTQCVNCSQFLRGQECVEECRVLQGLPREYVNARHCLPCHPE
CQPQNGSVTCFGPEADQCVACAHYKDPPFCVARCPSGVKPDLSYMPIWKFPDEEGACQ
PCPINCTHSCVDLDDKGCPAEQRASPLTSIVSAVVGILLVVVLGVVFGILIKRRQQKI
RKYTMRRLLQETELVEPLTPSGAMPNQAQMRILKETELRKVKVLGSGAFGTVYKGIWI
PDGENVKIPVAIKVLRENTSPKANKEILDEAYVMAGVGSPYVSRLLGICLTSTVQLVT
QLMPYGCLLDHVRENRGRLGSQDLLNWCMQIAKGMSYLEDVRLVHRDLAARNVLVKSP
NHVKITDFGLARLLDIDETEYHADGGKVPIKWMALESILRRRFTHQSDVWSYGVTVWE
LMTFGAKPYDGIPAREIPDLLEKGERLPQPPICTIDVYMIMVKCWMIDSECRPRFREL
VSEFSRMARDPQRFVVIQNEDLGPASPLDSTFYRSLLEDDDMGDLVDAEEYLVPQQGF
FCPDPAPGAGGMVHHRHRSSSTRSGGGDLTLGLEPSEEEAPRSPLAPSEGAGSDVFDG
DLGMGAAKGLQSLPTHDPSPLQRYSEDPTVPLPSETDGYVAPLTCSPQPEYVNQPDVR
PQPPSPREGPLPAARPAGATLERAKTLSPGKNGVVKDVFAFGGAVENPEYLTPQGGAA
PQPHPPPAFSPAFDNLYYWDQDPPERGAPPSTFKGTPTAENPEYLGLDVPV″
SEQ ID NO 91
起始 染色体17q21-q22。
1 aattctcgag ctcgtcgacc ggtcgacgag ctcgagggtc gacgagctcg agggcgcgcg
61 cccggccccc acccctcgca gcaccccgcg ccccgcgccc tcccagccgg gtccagccgg
121 agccatgggg ccggagccgc agtgagcacc atggagctgg cggccttgtg ccgctggggg
181 ctcctcctcg ccctcttgcc ccccggagcc gcgagcaccc aagtgtgcac cggcacagac
241 atgaagctgc ggctccctgc cagtcccgag acccacctgg acatgctccg ccacctctac
301 cagggctgcc aggtggtgca gggaaacctg gaactcacct acctgcccac caatgccagc
361 ctgtccttcc tgcaggatat ccaggaggtg cagggctacg tgctcatcgc tcacaaccaa
421 gtgaggcagg tcccactgca gaggctgcgg attgtgcgag gcacccagct ctttgaggac
481 aactatgccc tggccgtgct agacaatgga gacccgctga acaataccac ccctgtcaca
541 ggggcctccc caggaggcct gcgggagctg cagcttcgaa gcctcacaga gatcttgaaa
601 ggaggggtct tgatccagcg gaacccccag ctctgctacc aggacacgat tttgtggaag
661 gacatcttcc acaagaacaa ccagctggct ctcacactga tagacaccaa ccgctctcgg
721 gcctgccacc cctgttctcc gatgtgtaag ggctcccgct gctggggaga gagttctgag
781 gattgtcaga gcctgacgcg cactgtctgt gccggtggct gtgcccgctg caaggggcca
841 ctgcccactg actgctgcca tgagcagtgt gctgccggct gcacgggccc caagcactct
901 gactgcctgg cctgcctcca cttcaaccac agtggcatct gtgagctgca ctgcccagcc
961 ctggtcacct acaacacaga cacgtttgag tccatgccca atcccgaggg ccggtataca
1021 ttcggcgcca gctgtgtgac tgcctgtccc tacaactacc tttctacgga cgtgggatcc
1081 tgcaccctcg tctgccccct gcacaaccaa gaggtgacag cagaggatgg aacacagcgg
1141 tgtgagaagt gcagcaagcc ctgtgcccga gtgtgctatg gtctgggcat ggagcacttg
1201 cgagaggtga gggcagttac cagtgccaat atccaggagt ttgctggctg caagaagatc
1261 tttgggagcc tggcatttct gccggagagc tttgatgggg acccagcctc caacactgcc
1321 ccgctccagc cagagcagct ccaagtgttt gagactctgg aagagatcac aggttaccta
1381 tacatctcag catggccgga cagcctgcct gacctcagcg tcttccagaa cctgcaagta
1441 atccggggac gaattctgca caatggcgcc tactcgctga ccctgcaagg gctgggcatc
1501 agctggctgg ggctgcgctc actgagggaa ctgggcagtg gactggccct catccaccat
1561 aacacccacc tctgcttcgt gcacacggtg ccctgggacc agctctttcg gaacccgcac
1621 caagctctgc tccacactgc caaccggcca gaggacgagt gtgtgggcga gggcctggcc
1681 tgccaccagc tgtgcgcccg agggcactgc tggggtccag ggcccaccca gtgtgtcaac
1741 tgcagccagt tccttcgggg ccaggagtgc gtggaggaat gccgagtact gcaggggctc
1801 cccagggagt atgtgaatgc caggcactgt ttgccgtgcc accctgagtg tcagccccag
1861 aatggctcag tgacctgttt tggaccggag gctgaccagt gtgtggcctg tgcccactat
1921 aaggaccctc ccttctgcgt ggcccgctgc cccagcggtg tgaaacctga cctctcctac
1981 atgcccatct ggaagtttcc agatgaggag ggcgcatgcc agccttgccc catcaactgc
2041 acccactcct gtgtggacct ggatgacaag ggctgccccg ccgagcagag agccagccct
2101 ctgacgtcca tcgtctctgc ggtggttggc attctgctgg tcgtggtctt gggggtggtc
2161 tttgggatcc tcatcaagcg acggcagcag aagatccgga agtacacgat gcggagactg
2221 ctgcaggaaa cggagctggt ggagccgctg acacctagcg gagcgatgcc caaccaggcg
2281 cagatgcgga tcctgaaaga gacggagctg aggaaggtga aggtgcttgg atctggcgct
2341 tttggcacag tctacaaggg catctggatc cctgatgggg agaatgtgaa aattccagtg
2401 gccatcaaag tgttgaggga aaacacatcc cccaaagcca acaaagaaat cttagacgaa
2461 gcatacgtga tggctggtgt gggctcccca tatgtctccc gccttctggg catctgcctg
2521 acatccacgg tgcagctggt gacacagctt atgccctatg gctgcctctt agaccatgtc
2581 cgggaaaacc gcggacgcct gggctcccag gacctgctga actggtgtat gcagattgcc
2641 aaggggatga gctacctgga ggatgtgcgg ctcgtacaca gggacttggc cgctcggaac
2701 gtgctggtca agagtcccaa ccatgtcaaa attacagact tcgggctggc tcggctgctg
2761 gacattgacg agacagagta ccatgcagat gggggcaagg tgcccatcaa gtggatggcg
2821 ctggagtcca ttctccgccg gcggttcacc caccagagtg atgtgtggag ttatggtgtg
2881 actgtgtggg agctgatgac ttttggggcc aaaccttacg atgggatccc agcccgggag
2941 atccctgacc tgctggaaaa gggggagcgg ctgccccagc cccccatctg caccattgat
3001 gtctacatga tcatggtcaa atgttggatg attgactctg aatgtcggcc aagattccgg
3061 gagttggtgt ctgaattctc ccgcatggcc agggaccccc agcgctttgt ggtcatccag
3121 aatgaggact tgggcccagc cagtcccttg gacagcacct tctaccgctc actgctggag
3181 gacgatgaca tgggggacct ggtggatgct gaggagtatc tggtacccca gcagggcttc
3241 ttctgtccag accctgcccc gggcgctggg ggcatggtcc accacaggca ccgcagctca
3301 tctaccagga gtggcggtgg ggacctgaca ctagggctgg agccctctga agaggaggcc
3361 cccaggtctc cactggcacc ctccgaaggg gctggctccg atgtatttga tggtgacctg
3421 ggaatggggg cagccaaggg gctgcaaagc ctccccacac atgaccccag ccctctacag
3481 cggtacagtg aggaccccac agtacccctg ccctctgaga ctgatggcta cgttgccccc
3541 ctgacctgca gcccccagcc tgaatatgtg aaccagccag atgttcggcc ccagccccct
3601 tcgccccgag agggccctct gcctgctgcc cgacctgctg gtgccactct ggaaagggcc
3661 aagactctct ccccagggaa gaatggggtc gtcaaagacg tttttgcctt tgggggtgcc
3721 gtggagaacc ccgagtactt gacaccccag ggaggagctg cccctcagcc ccaccctcct
3781 cctgccttca gcccagcctt cgacaacctc tattactggg accaggaccc accagagcgg
3841 ggggctccac ccagcacctt caaagggaca cctacggcag agaacccaga gtacctgggt
3901 ctggacgtgc cagtgtgaac cagaaggcca agtccgcaga agccctgatg tgtcctcagg
3961 gagcagggaa ggcctgactt ctgctggcat caagaggtgg gagggccctc cgaccacttc
4021 caggggaacc tgccatgcca ggaacctgtc ctaaggaacc ttccttcctg cttgagttcc
4081 cagatggctg gaaggggtcc agcctcgttg gaagaggaac agcactgggg agtctttgtg
4141 gattctgagg ccctgcccaa tgagactcta gggtccagtg gatgccacag cccagcttgg
4201 ccctttcctt ccagatcctg ggtactgaaa gccttaggga agctggcctg agaggggaag
4261 cggccctaag ggagtgtcta agaacaaaag cgacccattc agagactgtc cctgaaacct
4321 agtactgccc cccatgagga aggaacagca atggtgtcag tatccaggct ttgtacagag
4381 tgcttttctg tttagttttt actttttttg ttttgttttt ttaaagacga aataaagacc
4441 caggggagaa tgggtgttgt atggggaggc aagtgtgggg ggtccttctc cacacccact
4501ttgtccattt gcaaatatat tttggaaaac //
人SCP1蛋白mRNA
ACCESSION X95654
VERSION X95654.1 GI:1212982
SEQID NO 92
/翻译=″MEKQKPFALFVPPRSSSSQVSAVKPQTLGGDSTFFKSFNKCTED
DLEFPFAKTNLSKNGENIDSDPALQKVNFLPVLEQVGNSDCHYQEGLKDSDLENSEGL
SRVFSKLYKEAEKIKKWKVSTEAELRQKESKLQENRKIIEAQRKAIQELQFGNEKVSL
KLEEGIQENKDLIKENNATRHLCNLLKETCARSAEKTKKYEYEREETRQVYMDLNNNI
EKMITAHGELRVQAENSRLEMHFKLKEDYEKIQHLEQEYKKEINDKEKQVSLLLIQIT
EKENKMKDLTFLLEESRDKVNQLEEKTKLQSENLKQSIEKQHHLTKELEDIKVSLQRS
VSTQKALEEDLQIATKTICQLTEEKETQMEESNKARAAHSFVVTEFETTVCSLEELLR
TEQQRLEKNEDQLKILTMELQKKSSELEEMTKLTNNKEVELEELKKVLGEKETLLYEN
KQFEKIAEELKGTEQELIGLLQAREKEVHDLEIQLTAITTSEQYYSKEVKDLKTELEN
EKLKNTELTSHCNKLSLENKELTQETSDMTLELKNQQEDINNNKKQEERMLKQIENLQ
ETETQLRNELEYVREELKQKRDEVKCKLDKSEENCNNLRKQVENKNKYIEELQQENKA
LKKKGTAESKQLNVYEIKVNKLELELESAKQKFGEITDTYQKEIEDKKISEENLLEEV
EKAKVIADEAVKLQKEIDKRCQHKIAEMVALMEKHKHQYDKIIEERDSELGLYKSKEQ
EQSSLRASLEIELSNLKAELLSVKKQLEIEREEKEKLKREAKENTATLKEKKDKKTQT
FLLETPEIYWKLDSKAVPSQTVSRNFTSVDHGISKDKRDYLWTSAKNTLSTPLPKAYT
VKTPTKPKLQQRENLNIPIEESKKKRKMAFEFDINSDSSETTDLLSMVSEEETLKTLY
RNNNPPASHLCVKTPKKAPSSLTTPGPTLKFGAIRKMREDRWAVIAKMDRKKKLKEAE
KLFV″
SEQ ID NO 93
起始
1 gccctcatag accgtttgtt gtagttcgcg tgggaacagc aacccacggt ttcccgatag
61 ttcttcaaag atatttacaa ccgtaacaga gaaaatggaa aagcaaaagc cctttgcatt
121 gttcgtacca ccgagatcaa gcagcagtca ggtgtctgcg gtgaaacctc agaccctggg
181 aggcgattcc actttcttca agagtttcaa caaatgtact gaagatgatt tggagtttcc
241 atttgcaaag actaatctct ccaaaaatgg ggaaaacatt gattcagatc ctgctttaca
301 aaaagttaat ttcttgcccg tgcttgagca ggttggtaat tctgactgtc actatcagga
361 aggactaaaa gactctgatt tggagaattc agagggattg agcagagtgt tttcaaaact
421 gtataaggag gctgaaaaga taaaaaaatg gaaagtaagt acagaagctg aactgagaca
481 gaaagaaagt aagttgcaag aaaacagaaa gataattgaa gcacagcgaa aagccattca
541 ggaactgcaa tttggaaatg aaaaagtaag tttgaaatta gaagaaggaa tacaagaaaa
601 taaagattta ataaaagaga ataatgccac aaggcattta tgtaatctac tcaaagaaac
661 ctgtgctaga tctgcagaaa agacaaagaa atatgaatat gaacgggaag aaaccaggca
721 agtttatatg gatctaaata ataacattga gaaaatgata acagctcatg gggaacttcg
781 tgtgcaagct gagaattcca gactggaaat gcattttaag ttaaaggaag attatgaaaa
841 aatccaacac cttgaacaag aatacaagaa ggaaataaat gacaaggaaa agcaggtatc
901 actactattg atccaaatca ctgagaaaga aaataaaatg aaagatttaa catttctgct
961 agaggaatcc agagataaag ttaatcaatt agaggaaaag acaaaattac agagtgaaaa
1021 cttaaaacaa tcaattgaga aacagcatca tttgactaaa gaactagaag atattaaagt
1081 gtcattacaa agaagtgtga gtactcaaaa ggctttagag gaagatttac agatagcaac
1141 aaaaacaatt tgtcagctaa ctgaagaaaa agaaactcaa atggaagaat ctaataaagc
1201 tagagctgct cattcgtttg tggttactga atttgaaact actgtctgca gcttggaaga
1261 attattgaga acagaacagc aaagattgga aaaaaatgaa gatcaattga aaatacttac
1321 catggagctt caaaagaaat caagtgagct ggaagagatg actaagctta caaataacaa
1381 agaagtagaa cttgaagaat tgaaaaaagt cttgggagaa aaggaaacac tttatatga
1441 aaataaacaa tttgagaaga ttgctgaaga attaaaagga acagaacaag aactaattgg
1501 tcttctccaa gccagagaga aagaagtaca tgatttggaa atacagttaa ctgccattac
1561 cacaagtgaa cagtattatt caaaagaggt taaagatcta aaaactgagc ttgaaaacga
1621 gaagcttaag aatactgaat taacttcaca ctgcaacaag ctttcactag aaaacaaaga
1681 gctcacacag gaaacaagtg atatgaccct agaactcaag aatcagcaag aagatattaa
1741 taataacaaa aagcaagaag aaaggatgtt gaaacaaata gaaaatcttc aagaaacaga
1801 aacccaatta agaaatgaac tagaatatgt gagagaagag ctaaaacaga aaagagatga
1861 agttaaatgt aaattggaca agagtgaaga aaattgtaac aatttaagga aacaagttga
1921 aaataaaaac aagtatattg aagaacttca gcaggagaat aaggccttga aaaaaaaagg
1981 tacagcagaa agcaagcaac tgaatgttta tgagataaag gtcaataaat tagagttaga
2041 actagaaagt gccaaacaga aatttggaga aatcacagac acctatcaga aagaaattga
2101 ggacaaaaag atatcagaag aaaatctttt ggaagaggtt gagaaagcaa aagtaatagc
2161 tgatgaagca gtaaaattac agaaagaaat tgataagcga tgtcaacata aaatagctga
2221 aatggtagca cttatggaaa aacataagca ccaatatgat aagatcattg aagaaagaga
2281 ctcagaatta ggactttata agagcaaaga acaagaacag tcatcactga gagcatcttt
2341 ggagattgaa ctatccaatc tcaaagctga acttttgtct gttaagaagc aacttgaaat
2401 agaaagagaa gagaaggaaa aactcaaaag agaggcaaaa gaaaacacag ctactcttaa
2461 agaaaaaaaa gacaagaaaa cacaaacatt tttattggaa acacctgaaa tttattggaa
2521 attggattct aaagcagttc cttcacaaac tgtatctcga aatttcacat cagttgatca
2581 tggcatatcc aaagataaaa gagactatct gtggacatct gccaaaaata ctttatctac
2641 accattgcca aaggcatata cagtgaagac accaacaaaa ccaaaactac agcaaagaga
2701 aaacttgaat atacccattg aagaaagtaa aaaaaagaga aaaatggcct ttgaatttga
2761 tattaattca gatagttcag aaactactga tcttttgagc atggtttcag aagaagagac
2821 attgaaaaca ctgtatagga acaataatcc accagcttct catctttgtg tcaaaacacc
2881 aaaaaaggcc ccttcatctc taacaacccc tggacctaca ctgaagtttg gagctataag
2941 aaaaatgcgg gaggaccgtt gggctgtaat tgctaaaatg gatagaaaaa aaaaactaaa
3001 agaagctgaa aagttatttg tttaatttca gagaatcagt gtagttaagg agcctaataa
3061 cgtgaaactt atagttaata ttttgttctt atttgccaga gccacatttt atctggaagt
3121 tgagacttaa aaaatacttg catgaatgat ttgtgtttct ttatattttt agcctaaatg
3181 ttaactacat attgtctgga aacctgtcat tgtattcaga taattagatg attatatatt
3241 gttgttactt tttcttgtat tcatgaaaac tgtttttact aagttttcaa atttgtaaag
3301 ttagcctttg aatgctagga atgcattatt gagggtcatt ctttattctt tactattaaa
3361 atattttgga tgcaaaaaaa aaaaaaaaaa aaa //
人滑膜肉瘤,X断裂点4(SSX4),mRNA。
ACCESSION NM_005636
VERSION NM_005636.1 GI:5032122
SEQ ID NO 94
/翻译=″MNGDDAFARRPRDDAQISEKLRKAFDDIAKYFSKKEWEKMKSSEKIVY
VYMKLNYEVMTKLGFKVTLPPFMRSKRAADFHGNDFGNDRNHRNQVERPQMTFG
SLQRIFPKIMPKKPAEEENGLKEVPEASGPQNDGKQLCPPGNPSTLEKINKTSGPKRG
KHAWTHRLRERKQLVVYEEISDPEEDDE″
SEQ ID NO 95
起始
1 atgaacggag acgacgcctt tgcaaggaga cccagggatg atgctcaaat atcagagaag
61 ttacgaaagg ccttcgatga tattgccaaa tacttctcta agaaagagtg ggaaaagatg
121 aaatcctcgg agaaaatcgt ctatgtgtat atgaagctaa actatgaggt catgactaaa
181 ctaggtttca aggtcaccct cccacctttc atgcgtagta aacgggctgc agacttccac
241 gggaatgatt ttggtaacga tcgaaaccac aggaatcagg ttgaacgtcc tcagatgact
301 ttcggcagcc tccagagaat cttcccgaag atcatgccca agaagccagc agaggaagaa
361 aatggtttga aggaagtgcc agaggcatct ggcccacaaa atgatgggaa acagctgtgc
421 cccccgggaa atccaagtac cttggagaag attaacaaga catctggacc caaaaggggg
481 aaacatgcct ggacccacag actgcgtgag agaaagcagc tggtggttta tgaagagatc
541 agcgaccctg aggaagatga cgagtaactc ccctcg
U19142.Human GAGE-1 prot...[gi:914898]
LOCUS HSU19142 646bp mRNA 线性的
DEFINITION 人GAGE-1蛋白mRNA,全cds
ACCESSION U19142
VERSION U19142.1 GI:914898
SEQ ID No.96
/翻译=″MSWRGRSTYRPRPRRYVEPPEMIGPMRPEQFSDEVEPATPEEGE
PATQRQDPAAAQEGEDEGASAGQGPKPEADSQEQGHPQTGCECEDGPDGQEMDPPNPE
EVKTPEEEMRSHYVAQTGILWLLMNNCFLNLSPRKP″
SEQ ID NO.97
1 ctgccgtccg gactcttttt cctctactga gattcatctg tgtgaaatat gagttggcga
61 ggaagatcga cctatcggcc tagaccaaga cgctacgtag agcctcctga aatgattggg
121 cctatgcggc ccgagcagtt cagtgatgaa gtggaaccag caacacctga agaaggggaa
181 ccagcaactc aacgtcagga tcctgcagct gctcaggagg gagaggatga gggagcatct
241 gcaggtcaag ggccgaagcc tgaagctgat agccaggaac agggtcaccc acagactggg
301 tgtgagtgtg aagatggtcc tgatgggcag gagatggacc cgccaaatcc agaggaggtg
361 aaaacgcctg aagaagagat gaggtctcac tatgttgccc agactgggat tctctggctt
421 ttaatgaaca attgcttctt aaatctttcc ccacggaaac cttgagtgac tgaaatatca
481 aatggcgaga gaccgtttag ttcctatcat ctgtggcatg tgaagggcaa tcacagtgtt
541 aaaagaagac atgctgaaat gttgcaggct gctcctatgt tggaaaattc ttcattgaag
601 ttctcccaat aaagctttac agccttctgc aaagaaaaaa aaaaaa //
NM_001168.Homo sapiens bacu...[gi:4502144]
LOCUS BIRC5 1619bp mRNA 线性的
DEFINITION 人含有杆状病毒IAP重复5
(survivin) (BIRC5),mRNA。
ACCESSION NM_001168
VERSION NM_001168.1 GI:4502144
SEQ ID NO.98
/翻译=″MGAPTLPPAWQPFLKDHRISTFKNWPFLEGCACTPERMAEAGFI
HCPTENEPDLAQCFFCFKELEGWEPDDDPIEEHKKHSSGCAFLSVKKQFEELTLGEFL
KLDRERAKNKIAKETNNKKKEFEETAKKVRRAIEQLAAMD″
SEQ ID NO. 99
1 ccgccagatt tgaatcgcgg gacccgttgg cagaggtggc ggcggcggca tgggtgcccc
61 gacgttgccc cctgcctggc agccctttct caaggaccac cgcatctcta cattcaagaa
121 ctggcccttc ttggagggct gcgcctgcac cccggagcgg atggccgagg ctggcttcat
181 ccactgcccc actgagaacg agccagactt ggcccagtgt ttcttctgct tcaaggagct
241 ggaaggctgg gagccagatg acgaccccat agaggaacat aaaaagcatt cgtccggttg
301 cgctttcctt tctgtcaaga agcagtttga agaattaacc cttggtgaat ttttgaaact
361 ggacagagaa agagccaaga acaaaattgc aaaggaaacc aacaataaga agaaagaatt
421 tgaggaaact gcgaagaaag tgcgccgtgc catcgagcag ctggctgcca tggattgagg
481 cctctggccg gagctgcctg gtcccagagt ggctgcacca cttccagggt ttattccctg
541 gtgccaccag ccttcctgtg ggccccttag caatgtctta ggaaaggaga tcaacatttt
601 caaattagat gtttcaactg tgctcctgtt ttgtcttgaa agtggcacca gaggtgcttc
661 tgcctgtgca gcgggtgctg ctggtaacag tggctgcttc tctctctctc tctctttttt
721 gggggctcat ttttgctgtt ttgattcccg ggcttaccag gtgagaagtg agggaggaag
781 aaggcagtgt cccttttgct agagctgaca gctttgttcg cgtgggcaga gccttccaca
841 gtgaatgtgt ctggacctca tgttgttgag gctgtcacag tcctgagtgt ggacttggca
901 ggtgcctgtt gaatctgagc tgcaggttcc ttatctgtca cacctgtgcc tcctcagagg
961 acagtttttt tgttgttgtg tttttttgtt tttttttttt ggtagatgca tgacttgtgt
1021 gtgatgagag aatggagaca gagtccctgg ctcctctact gtttaacaac atggctttct
1081 tattttgttt gaattgttaa ttcacagaat agcacaaact acaattaaaa ctaagcacaa
1141 agccattcta agtcattggg gaaacggggt gaacttcagg tggatgagga gacagaatag
1201 agtgatagga agcgtctggc agatactcct tttgccactg ctgtgtgatt agacaggccc
1261 agtgagccgc ggggcacatg ctggccgctc ctccctcaga aaaaggcagt ggcctaaatc
1321 ctttttaaat gacttggctc gatgctgtgg gggactggct gggctgctgc aggccgtgtg
1381 tctgtcagcc caaccttcac atctgtcacg ttctccacac gggggagaga cgcagtccgc
1441 ccaggtcccc gctttctttg gaggcagcag ctcccgcagg gctgaagtct ggcgtaagat
1501 gatggatttg attcgccctc ctccctgtca tagagctgca gggtggattg ttacagcttc
1561 gctggaaacc tctggaggtc atctcggctg ttcctgagaa ataaaaagcc tgtcatttc //
U06452.Human melanoma an...[gi:476131]
LOCUS HSU06452 1524bp mRNA 线性的
DEFINITION 由T细胞识别的人黑素瘤抗原(MART-1)
mRNA.
ACCESSION U06452
VERSION U06452.1 GI:476131
SEQ ID NO.100
/翻译=″MPREDAHFIYGYPKKGHGHSYTTAEEAAGIGILTVILGVLLLIG
CWYCRRRNGYRALMDKSLHVGTQCALTRRCPQEGFDHRDSKVSLQEKNCEPVVPNAPP
AYEKLSAEQSPPPYSP″
SEQ ID NO.101
1 agcagacaga ggactctcat taaggaaggt gtcctgtgcc ctgaccctac aagatgccaa
61 gagaagatgc tcacttcatc tatggttacc ccaagaaggg gcacggccac tcttacacca
121 cggctgaaga ggccgctggg atcggcatcc tgacagtgat cctgggagtc ttactgctca
181 tcggctgttg gtattgtaga agacgaaatg gatacagagc cttgatggat aaaagtcttc
241 atgttggcac tcaatgtgcc ttaacaagaa gatgcccaca agaagggttt gatcatcggg
301 acagcaaagt gtctcttcaa gagaaaaact gtgaacctgt ggttcccaat gctccacctg
361 cttatgagaa actctctgca gaacagtcac caccacctta ttcaccttaa gagccagcga
421 gacacctgag acatgctgaa attatttctc tcacactttt gcttgaattt aatacagaca
481 tctaatgttc tcctttggaa tggtgtagga aaaatgcaag ccatctctaa taataagtca
541 gtgttaaaat tttagtaggt ccgctagcag tactaatcat gtgaggaaat gatgagaaat
601 attaaattgg gaaaactcca tcaataaatg ttgcaatgca tgatactatc tgtgccagag
661 gtaatgttag taaatccatg gtgttatttt ctgagagaca gaattcaagt gggtattctg
721 gggccatcca atttctcttt acttgaaatt tggctaataa caaactagtc aggttttcga
781 accttgaccg acatgaactg tacacagaat tgttccagta ctatggagtg ctcacaaagg
841 atacttttac aggttaagac aaagggttga ctggcctatt tatctgatca agaacatgtc
901 agcaatgtct ctttgtgctc taaaattcta ttatactaca ataatatatt gtaagatcc
961 tatagctctt tttttttgag atggagtttc gcttttgttg cccaggctgg agtgcaatgg
1021 cgcgatcttg gctcaccata acctccgcct cccaggttca agcaattctc ctgccttagc
1081 ctcctgagta gctgggatta caggcgtgcg ccactatgcc tgactaattt tgtagtttta
1141 gtagagacgg ggtttctcca tgttggtcag gctggtctca aactcctgac ctcaggtgat
1201 ctgcccgcct cagcctccca aagtgctgga attacaggcg tgagccacca cgcctggctg
1261 gatcctatat cttaggtaag acatataacg cagtctaatt acatttcact tcaaggctca
1321 atgctattct aactaatgac aagtattttc tactaaacca gaaattggta gaaggattta
1381 aataagtaaa agctactatg tactgcctta gtgctgatgc ctgtgtactg ccttaaatgt
1441 acctatggca atttagctct cttgggttcc caaatccctc tcacaagaat gtgcagaaga
1501 aatcataaag gatcagagat tctg //
U19180.Human B melanoma...[gi:726039]
LOCUS HSU19180 1004bp mRNA 线性的
DEFINITION 人B黑素瘤抗原(BAGE)mRNA,全部的cds
ACCESSION U19180
VERSION U19180.1 GI:726039
SEQ IS NO.102
/翻译=″MAARAVFLALSAQLLQARLMKEESPVVSWRLEPEDGTALCFIF″
SEQ ID NO.103
1 cgccaattta gggtctccgg tatctcccgc tgagctgctc tgttcccggc ttagaggacc
61 aggagaaggg ggagctggag gctggagcct gtaacaccgt ggctcgtctc actctggatg
121 gtggtggcaa cagagatggc agcgcagctg gagtgttagg agggcggcct gagcggtagg
181 agtggggctg gagcagtaag atggcggcca gagcggtttt tctggcattg tctgcccagc
241 tgctccaagc caggctgatg aaggaggagt cccctgtggt gagctggagg ttggagcctg
301 aagacggcac agctctgtgc ttcatcttct gaggttgtgg cagccacggt gatggagacg
361 gcagctcaac aggagcaata ggaggagatg gagtttcact gtgtcagcca ggatggtctc
421 gatctcctga cctcgtgatc cgcccgcctt ggccttccaa agtgccgaga ttacagcgat
481 gtgcattttg taagcacttt ggagccacta tcaaatgctg tgaagagaaa tgtacccaga
541 tgtatcatta tccttgtgct gcaggagccg gctcctttca ggatttcagt cacatcttcc
601 tgctttgtcc agaacacatt gaccaagctc ctgaaagatg taagtttact acgcatagac
661 ttttaaactt caaccaatgt atttactgaa aataacaaat gttgtaaatt ccctgagtgt
721 tattctactt gtattaaaag gtaataatac ataatcatta aaatctgagg gatcattgcc
781 agagattgtt ggggagggaa atgttatcaa cggtttcatt gaaattaaat ccaaaaagtt
841 atttcctcag aaaaatcaaa taaagtttgc atgtttttta ttcttaaaac attttaaaaa
901 ccactgtaga atgatgtaaa tagggactgt gcagtatttc tgacatatac tataaaatta
961 ttaaaaagtc aatcagtatt caacatcttt tacactaaaa agcc //
将在任何出版物,包括专利、专利申请和非专利出版物中公开的、此 处公开的教导和实施方案考虑作为涉及本发明和关于本发明有用的支持 原理和实施方案。
可以在缺乏在这里未具体公开的任何要素或多种要素,限制或多种限 制的情况下实行在这里例证性适当描述的本发明。已经使用的术语和表述 是用作描述术语而不是限制术语,没有打算在使用该术语和表述中表示排 除显示和描述的特征的同等物或其部分。应当认识到在要求保护的本发明 的范围内各种修饰是可能的。因此,应当理解尽管已经通过优选实施方案 和任选的特征具体地公开了本发明,在这里公开的概念的修饰和改变可被 本领域那些技术人员所利用,这类修饰和改变被认为是在本发明实施方案 的范围内。
<110>曼康公司
约翰·J·L·西马德
戴维·C·戴蒙德
刘利平
刘征
<120>表位序列
<130>MANNK.032VPC
<150>US 60/4 09123
<151>2002-09-06
<160>610
<170>FastSEQ for Windows Version 4.0
<210>1
<211>10
<212>PRT
<213>人
<400>1
Phe Leu Pro Trp His Arg Leu Phe Leu Leu
1 5 10
<210>2
<211>529
<212>PRT
<213>人
<400>2
Met Leu Leu Ala Val Leu Tyr Cys Leu Leu Trp Ser Phe Gln Thr Ser
1 5 10 15
Ala Gly His Phe Pro Arg Ala Cys Val Ser Ser Lys Asn Leu Met Glu
20 25 30
Lys Glu Cys Cys Pro Pro Trp Ser Gly Asp Arg Ser Pro Cys Gly Gln
35 40 45
Leu Ser Gly Arg Gly Ser Cys Gln Asn Ile Leu Leu Ser Asn Ala Pro
50 55 60
Leu Gly Pro Gln Phe Pro Phe Thr Gly Val Asp Asp Arg Glu Ser Trp
65 70 75 80
Pro Ser Val Phe Tyr Asn Arg Thr Cys Gln Cys Ser Gly Asn Phe Met
85 90 95
Gly Phe Asn Cys Gly Asn Cys Lys Phe Gly Phe Trp Gly Pro Asn Cys
100 105 110
Thr Glu Arg Arg Leu Leu Val Arg Arg Asn Ile Phe Asp Leu Ser Ala
115 120 125
Pro Glu Lys Asp Lys Phe Phe Ala Tyr Leu Thr Leu Ala Lys His Thr
130 135 140
Ile Ser Ser Asp Tyr Val Ile Pro Ile Gly Thr Tyr Gly Gln Met Lys
145 150 155 160
Asn Gly Ser Thr Pro Met Phe Asn Asp Ile Asn Ile Tyr Asp Leu Phe
165 170 175
Val Trp Met His Tyr Tyr Val Ser Met Asp Ala Leu Leu Gly Gly Ser
180 185 190
Glu Ile Trp Arg Asp Ile Asp Phe Ala His Glu Ala Pro Ala Phe Leu
195 200 205
Pro Trp His Arg Leu Phe Leu Leu Arg Trp Glu Gln Glu Ile Gln Lys
210 215 220
Leu Thr Gly Asp Glu Asn Phe Thr Ile Pro Tyr Trp Asp Trp Arg Asp
225 230 235 240
Ala Glu Lys Cys Asp Ile Cys Thr Asp Glu Tyr Met Gly Gly Gln His
245 250 255
Pro Thr Asn Pro Asn Leu Leu Ser Pro Ala Ser Phe Phe Ser Ser Trp
260 265 270
Gln Ile Val Cys Ser Arg Leu Glu Glu Tyr Asn Ser His Gln Ser Leu
275 280 285
Cys Asn Gly Thr Pro Glu Gly Pro Leu Arg Arg Asn Pro Gly Asn His
290 295 300
Asp Lys Ser Arg Thr Pro Arg Leu Pro Ser Ser Ala Asp Val Glu Phe
305 310 315 320
Cys Leu Ser Leu Thr Gln Tyr Glu Ser Gly Ser Met Asp Lys Ala Ala
325 330 335
Asn Phe Ser Phe Arg Asn Thr Leu Glu Gly Phe Ala Ser Pro Leu Thr
340 345 350
Gly Ile Ala Asp Ala Ser Gln Ser Ser Met His Asn Ala Leu His Ile
355 360 365
Tyr Met Asn Gly Thr Met Ser Gln Val Gln Gly Ser Ala Asn Asp Pro
370 375 380
Ile Phe Leu Leu His His Ala Phe Val Asp Ser Ile Phe Glu Gln Trp
385 390 395 400
Leu Arg Arg His Arg Pro Leu Gln Glu Val Tyr Pro Glu Ala Asn Ala
405 410 415
Pro Ile Gly His Asn Arg Glu Ser Tyr Met Val Pro Phe Ile Pro Leu
420 425 430
Tyr Arg Asn Gly Asp Phe Phe Ile Ser Ser Lys Asp Leu Gly Tyr Asp
435 440 445
Tyr Ser Tyr Leu Gln Asp Ser Asp Pro Asp Ser Phe Gln Asp Tyr Ile
450 455 460
Lys Ser Tyr Leu Glu Gln Ala Ser Arg Ile Trp Ser Trp Leu Leu Gly
465 470 475 480
Ala Ala Met Val Gly Ala Val Leu Thr Ala Leu Leu Ala Gly Leu Val
485 490 495
Ser Leu Leu Cys Arg His Lys Arg Lys Gln Leu Pro Glu Glu Lys Gln
500 505 510
Pro Leu Leu Met Glu Lys Glu Asp Tyr His Ser Leu Tyr Gln Ser His
515 520 525
Leu
<210>3
<211>188
<212>PRT
<213>人
<400>3
Met Asn Gly Asp Asp Ala Phe Ala Arg Arg Pro Thr Val Gly Ala Gln
1 5 10 15
Ile Pro Glu Lys Ile Gln Lys Ala Phe Asp Asp Ile Ala Lys Tyr Phe
20 25 30
Ser Lys Glu Glu Trp Glu Lys Met Lys Ala Ser Glu Lys Ile Phe Tyr
35 40 45
Val Tyr Met Lys Arg Lys Tyr Glu Ala Met Thr Lys Leu Gly Phe Lys
50 55 60
Ala Thr Leu Pro Pro Phe Net Cys Ash Lys Arg Ala Glu Asp Phe Gln
65 70 75 80
Gly Asn Asp Leu Asp Asn Asp Pro Asn Arg Gly Asn Gln Val Glu Arg
85 90 95
Pro Gln Met Thr Phe Gly Arg Leu Gln Gly Ile Ser Pro Lys Ile Met
100 105 110
Pro Lys Lys Pro Ala Glu Glu Gly Asn Asp Ser Glu Glu Val Pro Glu
115 120 125
Ala Ser Gly Pro Gln Asn Asp Gly Lys Glu Leu Cys Pro Pro Gly Lys
130 135 140
Pro Thr Thr Ser Glu Lys Ile His Glu Arg Ser Gly Pro Lys Arg Gly
145 150 155 160
Glu His Ala Trp Thr His Arg Leu Arg Glu Arg Lys Gln Leu Val Ile
165 170 175
Tyr Glu Glu Ile Ser Asp Pro Glu Glu Asp Asp Glu
180 185
<210>4
<211>750
<212>PRT
<213>Homo sapiens
<400>4
Met Trp Asn Leu Leu His Glu Thr Asp Ser Ala Val Ala Thr Ala Arg
1 5 10 15
Arg Pro Arg Trp Leu Cys Ala Gly Ala Leu Val Leu Ala Gly Gly Phe
20 25 30
Phe Leu Leu Gly Phe Leu Phe Gly Trp Phe Ile Lys Ser Ser Asn Glu
35 40 45
Ala Thr Asn Ile Thr Pro Lys His Asn Met Lys Ala Phe Leu Asp Glu
50 55 60
Leu Lys Ala Glu Asn Ile Lys Lys Phe Leu Tyr Asn Phe Thr Gln Ile
65 70 75 80
Pro His Leu Ala Gly Thr Glu Gln Asn Phe Gln Leu Ala Lys Gln Ile
85 90 95
Gln Ser Gln Trp Lys Glu Phe Gly Leu Asp Ser Val Glu Leu Ala His
100 105 110
Tyr Asp Val Leu Leu Ser Tyr Pro Asn Lys Thr His Pro Asn Tyr Ile
115 120 125
Ser Ile Ile Asn Glu Asp Gly Asn Glu Ile Phe Asn Thr Ser Leu Phe
130 135 140
Glu Pro Pro Pro Pro Gly Tyr Glu Asn Val Ser Asp Ile Val Pro Pro
145 150 155 160
Phe Ser Ala Phe Ser Pro Gln Gly Met Pro Glu Gly Asp Leu Val Tyr
165 170 175
Val Asn Tyr Ala Arg Thr Glu Asp Phe Phe Lys Leu Glu Arg Asp Met
180 185 190
Lys Ile Asn Cys Ser Gly Lys Ile Val Ile Ala Arg Tyr Gly Lys Val
195 200 205
Phe Arg Gly Asn Lys Val Lys Asn Ala Gln Leu Ala Gly Ala Lys Gly
210 215 220
Val Ile Leu Tyr Ser Asp Pro Ala Asp Tyr Phe Ala Pro Gly Val Lys
225 230 235 240
Ser Tyr Pro Asp Gly Trp Asn Leu Pro Gly Gly Gly Val Gln Arg Gly
245 250 255
Asn Ile Leu Asn Leu Asn Gly Ala Gly Asp Pro Leu Thr Pro Gly Tyr
260 265 270
Pro Ala Asn Glu Tyr Ala Tyr Arg Arg Gly Ile Ala Glu Ala Val Gly
275 280 285
Leu Pro Ser Ile Pro Val His Pro Ile Gly Tyr Tyr Asp Ala Gln Lys
290 295 300
Leu Leu Glu Lys Met Gly Gly Ser Ala Pro Pro Asp Ser Ser Trp Arg
305 310 315 320
Gly Ser Leu Lys Val Pro Tyr Asn Val Gly Pro Gly Phe Thr Gly Asn
325 330 335
Phe Ser Thr Gln Lys Val Lys Met His Ile His Ser Thr Asn Glu Val
340 345 350
Thr Arg Ile Tyr Asn Val Ile Gly Thr Leu Arg Gly Ala Val Glu Pro
355 360 365
Asp Arg Tyr Val Ile Leu Gly Gly His Arg Asp Ser Trp Val Phe Gly
370 375 380
Gly Ile Asp Pro Gln Ser Gly Ala Ala Val Val His Glu Ile Val Arg
385 390 395 400
Ser Phe Gly Thr Leu Lys Lys Glu Gly Trp Arg Pro Arg Arg Thr Ile
405 410 415
Leu Phe Ala Ser Trp Asp Ala Glu Glu Phe Gly Leu Leu Gly Ser Thr
420 425 430
Glu Trp Ala Glu Glu Asn Ser Arg Leu Leu Gln Glu Arg Gly Val Ala
435 440 445
Tyr Ile Asn Ala Asp Ser Ser Ile Glu Gly Asn Tyr Thr Leu Arg Val
450 455 460
Asp Cys Thr Pro Leu Met Tyr Ser Leu Val His Asn Leu Thr Lys Glu
465 470 475 480
Leu Lys Ser Pro Asp Glu Gly Phe Glu Gly Lys Ser Leu Tyr Glu Ser
485 490 495
Trp Thr Lys Lys Ser Pro Ser Pro Glu Phe Ser Gly Met Pro Arg Ile
500 505 510
Ser Lys Leu Gly Ser Gly Asn Asp Phe Glu Val Phe Phe Gln Arg Leu
515 520 525
Gly Ile Ala Ser Gly Arg Ala Arg Tyr Thr Lys Asn Trp Glu Thr Asn
530 535 540
Lys Phe Ser Gly Tyr Pro Leu Tyr His Ser Val Tyr Glu Thr Tyr Glu
545 550 555 560
Leu Val Glu Lys Phe Tyr Asp Pro Met Phe Lys Tyr His Leu Thr Val
565 570 575
Ala Gln Val Arg Gly Gly Met Val Phe Glu Leu Ala Asn Ser Ile Val
580 585 590
Leu Pro Phe Asp Cys Arg Asp Tyr Ala Val Val Leu Arg Lys Tyr Ala
595 600 605
Asp Lys Ile Tyr Ser Ile Ser Met Lys His Pro Gln Glu Met Lys Thr
610 615 620
Tyr Ser Val Ser Phe Asp Ser Leu Phe Ser Ala Val Lys Asn Phe Thr
625 630 635 640
Glu Ile Ala Ser Lys Phe Ser Glu Arg Leu Gln Asp Phe Asp Lys Ser
645 650 655
Asn Pro Ile Val Leu Arg Met Met Asn Asp Gln Leu Met Phe Leu Glu
660 665 670
Arg Ala Phe Ile Asp Pro Leu Gly Leu Pro Asp Arg Pro Phe Tyr Arg
675 680 685
His Val Ile Tyr Ala Pro Ser Ser His Asn Lys Tyr Ala Gly Glu Ser
690 695 700
Phe Pro Gly Ile Tyr Asp Ala Leu Phe Asp Ile Glu Ser Lys Val Asp
705 710 715 720
Pro Ser Lys Ala Trp Gly Glu Val Lys Arg Gln Ile Tyr Val Ala Ala
725 730 735
Phe Thr Val Gln Ala Ala Ala Glu Thr Leu Ser Glu Val Ala
740 745 750
<210>5
<211>1964
<212>DNA
<213>人
<400>5
atcactgtag tagtagctgg aaagagaaat ctgtgactcc aattagccag ttcctgcaga 60
ccttgtgagg actagaggaa gaatgctcct ggctgttttg tactgcctgc tgtggagttt 120
ccagacctcc gctggccatt tccctagagc ctgtgtctcc tctaagaacc tgatggagaa 180
ggaatgctgt ccaccgtgga gcggggacag gagtccctgt ggccagcttt caggcagagg 240
ttcctgtcag aatatccttc tgtccaatgc accacttggg cctcaatttc ccttcacagg 300
ggtggatgac cgggagtcgt ggccttccgt cttttataat aggacctgcc agtgctctgg 360
caacttcatg ggattcaact gtggaaactg caagtttggc ttttggggac caaactgcac 420
agagagacga ctcttggtga gaagaaacat cttcgatttg agtgccccag agaaggacaa 480
attttttgcc tacctcactt tagcaaagca taccatcagc tcagactatg tcatccccat 540
agggacctat ggccaaatga aaaatggatc aacacccatg tttaacgaca tcaatattta 600
tgacctcttt gtctggatgc attattatgt gtcaatggat gcactgcttg ggggatctga 660
aatctggaga gacattgatt ttgcccatga agcaccagct tttctgcctt ggcatagact 720
cttcttgttg cggtgggaac aagaaatcca gaagctgaca ggagatgaaa acttcactat 780
tccatattgg gactggcggg atgcagaaaa gtgtgacatt tgcacagatg agtacatggg 840
aggtcagcac cccacaaatc ctaacttact cagcccagca tcattcttct cctcttggca 900
gattgtctgt agccgattgg aggagtacaa cagccatcag tctttatgca atggaacgcc 960
cgagggacct ttacggcgta atcctggaaa ccatgacaaa tccagaaccc caaggctccc 1020
ctcttcagct gatgtagaat tttgcctgag tttgacccaa tatgaatctg gttccatgga 1080
taaagctgcc aatttcagct ttagaaatac actggaagga tttgctagtc cacttactgg 1140
gatagcggat gcctctcaaa gcagcatgca caatgccttg cacatctata tgaatggaac 1200
aatgtcccag gtacagggat ctgccaacga tcctatcttc cttcttcacc atgcatttgt 1260
tgacagtatt tttgagcagt ggctccgaag gcaccgtcct cttcaagaag tttatccaga 1320
agccaatgca cccattggac ataaccggga atcctacatg gttcctttta taccactgta 1380
cagaaatggt gatttcttta tttcatccaa agatctgggc tatgactata gctatctaca 1440
agattcagac ccagactctt ttcaagacta cattaagtcc tatttggaac aagcgagtcg 1500
gatctggtca tggctccttg gggcggcgat ggtaggggcc gtcctcactg ccctgctggc 1560
agggcttgtg agcttgctgt gtcgtcacaa gagaaagcag cttcctgaag aaaagcagcc 1620
actcctcatg gagaaagagg attaccacag cttgtatcag agccatttat aaaaggctta 1680
ggcaatagag tagggccaaa aagcctgacc tcactctaac tcaaagtaat gtccaggttc 1740
ccagagaata tctgctggta tttttctgta aagaccattt gcaaaattgt aacctaatac 1800
aaagtgtagc cttcttccaa ctcaggtaga acacacctgt ctttgtcttg ctgttttcac 1860
tcagcccttt taacattttc ccctaagccc atatgtctaa ggaaaggatg ctatttggta 1920
atgaggaact gttatttgta tgtgaattaa agtgctctta tttt 1964
<210>6
<211>766
<212>DNA
<213>人
<400>6
ctctctttcg attcttccat actcagagta cgcacggtct gattttctct ttggattctt 60
ccaaaatcag agtcagactg ctcccggtgc catgaacgga gacgacgcct ttgcaaggag 120
acccacggtt ggtgctcaaa taccagagaa gatccaaaag gccttcgatg atattgccaa 180
atacttctct aaggaagagt gggaaaagat gaaagcctcg gagaaaatct tctatgtgta 240
tatgaagaga aagtatgagg ctatgactaa actaggtttc aaggccaccc tcccaccttt 300
catgtgtaat aaacgggccg aagacttcca ggggaatgat ttggataatg accctaaccg 360
tgggaatcag gttgaacgtc ctcagatgac tttcggcagg ctccagggaa tctccccgaa 420
gatcatgccc aagaagccag cagaggaagg aaatgattcg gaggaagtgc cagaagcatc 480
tggcccacaa aatgatggga aagagctgtg ccccccggga aaaccaacta cctctgagaa 540
gattcacgag agatctggac ccaaaagggg ggaacatgcc tggacccaca gactgcgtga 600
gagaaaacag ctggtgattt atgaagagat cagcgaccct gaggaagatg acgagtaact 660
cccctcaggg atacgacaca tgcccatgat gagaagcaga acgtggtgac ctttcacgaa 720
catgggcatg gctgcggacc cctcgtcatc aggtgcatag caagtg 766
<210>7
<211>2653
<212>DNA
<213>人
<400>7
ctcaaaaggg gccggatttc cttctcctgg aggcagatgt tgcctctctc tctcgctcgg 60
attggttcag tgcactctag aaacactgct gtggtggaga aactggaccc caggtctgga 120
gcgaattcca gcctgcaggg ctgataagcg aggcattagt gagattgaga gagactttac 180
cccgccgtgg tggttggagg gcgcgcagta gagcagcagc acaggcgcgg gtcccgggag 240
gccggctctg ctcgcgccga gatgtggaat ctccttcacg aaaccgactc ggctgtggcc 300
accgcgcgcc gcccgcgctg gctgtgcgct ggggcgctgg tgctggcggg tggcttcttt 360
ctcctcggct tcctcttcgg gtggtttata aaatcctcca atgaagctac taacattact 420
ccaaagcata atatgaaagc atttttggat gaattgaaag ctgagaacat caagaagttc 480
ttatataatt ttacacagat accacattta gcaggaacag aacaaaactt tcagcttgca 540
aagcaaattc aatcccagtg gaaagaattt ggcctggatt ctgttgagct agcacattat 600
gatgtcctgt tgtcctaccc aaataagact catcccaact acatctcaat aattaatgaa 660
gatggaaatg agattttcaa cacatcatta tttgaaccac ctcctccagg atatgaaaat 720
gtttcggata ttgtaccacc tttcagtgct ttctctcctc aaggaatgcc agagggcgat 780
ctagtgtatg ttaactatgc acgaactgaa gacttcttta aattggaacg ggacatgaaa 840
atcaattgct ctgggaaaat tgtaattgcc agatatggga aagttttcag aggaaataag 900
gttaaaaatg cccagctggc aggggccaaa ggagtcattc tctactccga ccctgctgac 960
tactttgctc ctggggtgaa gtcctatcca gatggttgga atcttcctgg aggtggtgtc 1020
cagcgtggaa atatcctaaa tctgaatggt gcaggagacc ctctcacacc aggttaccca 1080
gcaaatgaat atgcttatag gcgtggaatt gcagaggctg ttggtcttcc aagtattcct 1140
gttcatccaa ttggatacta tgatgcacag aagctcctag aaaaaatggg tggctcagca 1200
ccaccagata gcagctggag aggaagtctc aaagtgccct acaatgttgg acctggcttt 1260
actggaaact tttctacaca aaaagtcaag atgcacatcc actctaccaa tgaagtgaca 1320
agaatttaca atgtgatagg tactctcaga ggagcagtgg aaccagacag atatgtcatt 1380
ctgggaggtc accgggactc atgggtgttt ggtggtattg accctcagag tggagcagct 1440
gttgttcatg aaattgtgag gagctttgga acactgaaaa aggaagggtg gagacctaga 1500
agaacaattt tgtttgcaag ctgggatgca gaagaatttg gtcttcttgg ttctactgag 1560
tgggcagagg agaattcaag actccttcaa gagcgtggcg tggcttatat taatgctgac 1620
tcatctatag aaggaaacta cactctgaga gttgattgta caccgctgat gtacagcttg 1680
gtacacaacc taacaaaaga gctgaaaagc cctgatgaag gctttgaagg caaatctctt 1740
tatgaaagtt ggactaaaaa aagtccttcc ccagagttca gtggcatgcc caggataagc 1800
aaattgggat ctggaaatga ttttgaggtg ttcttccaac gacttggaat tgcttcaggc 1860
agagcacggt atactaaaaa ttgggaaaca aacaaattca gcggctatcc actgtatcac 1920
agtgtctatg aaacatatga gttggtggaa aagttttatg atccaatgtt taaatatcac 1980
ctcactgtgg cccaggttcg aggagggatg gtgtttgagc tagccaattc catagtgctc 2040
ccttttgatt gtcgagatta tgctgtagtt ttaagaaagt atgctgacaa aatctacagt 2100
atttctatga aacatccaca ggaaatgaag acatacagtg tatcatttga ttcacttttt 2160
tctgcagtaa agaattttac agaaattgct tccaagttca gtgagagact ccaggacttt 2220
gacaaaagca acccaatagt attaagaatg atgaatgatc aactcatgtt tctggaaaga 2280
gcatttattg atccattagg gttaccagac aggccttttt ataggcatgt catctatgct 2340
ccaagcagcc acaacaagta tgcaggggag tcattcccag gaatttatga tgctctgttt 2400
gatattgaaa gcaaagtgga cccttccaag gcctggggag aagtgaagag acagatttat 2460
gttgcagcct tcacagtgca ggcagctgca gagactttga gtgaagtagc ctaagaggat 2520
tctttagaga atccgtattg aatttgtgtg gtatgtcact cagaaagaat cgtaatgggt 2580
atattgataa attttaaaat tggtatattt gaaataaagt tgaatattat atataaaaaa 2640
aaaaaaaaaa aaa 2653
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Gly Ser Arg Ser Tyr Val Pro Leu Ala His Ser Ser Ser Ala Phe Thr
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Ile Thr Asp Gln Val Pro Phe Ser Val Ser Val Ser Gln Leu Arg Ala
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Leu Asp Gly Gly Asn Lys His Phe Leu Arg Asn Gln Pro Leu Thr Phe
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Ala Leu Gln Leu His Asp Pro Ser Gly Tyr Leu Ala Glu Ala Asp Leu
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Ser Tyr Thr Trp Asp Phe Gly Asp Ser Ser Gly Thr Leu Ile Ser Arg
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Ala Pro Val Val Thr His Thr Tyr Leu Glu Pro Gly Pro Val Thr Ala
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Gln Val Val Leu Gln Ala Ala Ile Pro Leu Thr Ser Cys Gly Ser Ser
290 295 300
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Ser Ile Thr Gly Ser Leu Gly Pro Leu Leu Asp Gly Thr Ala Thr Leu
450 455 460
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545 550 555 560
Gly Ser Gly Thr Tyr Cys Leu Asn Val Ser Leu Ala Asp Thr Asn Ser
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50 55 60
Pro Thr Thr Ile Asn Phe Thr Arg Gln Arg Gln Pro Ser Glu Gly Ser
65 70 75 80
Ser Ser Arg Glu Glu Glu Gly Pro Ser Thr Ser Cys Ile Leu Glu Ser
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Leu Leu Leu Lys Tyr Arg Ala Arg Glu Pro Val Thr Lys Ala Glu Met
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Gly Lys Ala Ser Glu Ser Leu Gln Leu Val Phe Gly Ile Asp Val Lys
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Ser Asp Pro Ala Arg Tyr Glu Phe Leu Trp Gly Pro Arg Ala Leu Ala
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Glu Thr Ser Tyr Val Lys Val Leu Glu Tyr Val Ile Lys Val Ser Ala
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Arg Val Arg Phe Phe Phe Pro Ser Leu Arg Glu Ala Ala Leu Arg Glu
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Ile Ala Ile Glu Gly Asp Cys Ala Pro Glu Glu Lys Ile Trp Glu Glu
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Leu Ser Met Leu Glu Val Phe Glu Gly Arg Glu Asp Ser Val Phe Ala
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Trp Gly Pro Arg Ala Leu Ile Glu Thr Ser Tyr Val Lys Val Leu His
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Glu Ala Arg Gly Glu Ala Leu Gly Leu Val Gly Ala Gln Ala Pro Ala
20 25 30
Thr Glu Glu Gln Glu Ala Ala Ser Ser Ser Ser Thr Leu Val Glu Val
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Thr Leu Gly Glu Val Pro Ala Ala Glu Ser Pro Asp Pro Pro Gln Ser
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Ser Gln Ser Tyr Glu Asp Ser Ser Asn Gln Glu Glu Glu Gly Pro Ser
85 90 95
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Val Ala Glu Leu Val His Phe Leu Leu Leu Lys Tyr Arg Ala Arg Glu
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Pro Val Thr Lys Ala Glu Met Leu Gly Ser Val Val Gly Asn Trp Gln
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Tyr Phe Phe Pro Val Ile Phe Ser Lys Ala Ser Ser Ser Leu Gln Leu
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Val Phe Gly Ile Glu Leu Met Glu Val Asp Pro Ile Gly His Leu Tyr
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Ile Phe Ala Thr Cys Leu Gly Leu Ser Tyr Asp Gly Leu Leu Gly Asp
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Trp Ile Thr Gln Cys Phe Leu Pro Val Phe Leu Ala Gln Pro Pro Ser
165 170 175
Gly Gln Arg Arg
180
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<211>180
<212>PRT
<213>人
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Met Gln Ala Glu Gly Arg Gly Thr Gly Gly Ser Thr Gly Asp Ala Asp
1 5 10 15
Gly Pro Gly Gly Pro Gly Ile Pro Asp Gly Pro Gly Gly Asn Ala Gly
20 25 30
Gly Pro Gly Glu Ala Gly Ala Thr Gly Gly Arg Gly Pro Arg Gly Ala
35 40 45
Gly Ala Ala Arg Ala Ser Gly Pro Arg Gly Gly Ala Pro Arg Gly Pro
50 55 60
His Gly Gly Ala Ala Ser Ala Gln Asp Gly Arg Cys Pro Cys Gly Ala
65 70 75 80
Arg Arg Pro Asp Ser Arg Leu Leu Glu Leu His Ile Thr Met Pro Phe
85 90 95
Ser Ser Pro Met Glu Ala Glu Leu Val Arg Arg Ile Leu Ser Arg Asp
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Ala Ala Pro Leu Pro Arg Pro Gly Ala Val Leu Lys Asp Phe Thr Val
115 120 125
Ser Gly Asn Leu Leu Phe Ile Arg Leu Thr Ala Ala Asp His Arg Gln
130 135 140
Leu Gln Leu Ser Ile Ser Ser Cys Leu Gln Gln Leu Ser Leu Leu Met
145 150 155 160
Trp Ile Thr Gln Cys Phe Leu Pro Val Phe Leu Ala Gln Ala Pro Ser
165 170 175
Gly Gln Arg Arg
180
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<212>PRT
<213>人
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1 5 10 15
Gly Pro Gly Gly Pro Gly Ile Pro Asp Gly Pro Gly Gly Asn Ala Gly
20 25 30
Gly Pro Gly Glu Ala Gly Ala Thr Gly Gly Arg Gly Pro Arg Gly Als
35 40 45
Gly Ala Ala Arg Ala Ser Gly Pro Arg Gly Gly Ala Pro Arg Gly Pro
50 55 60
His Gly Gly Ala Ala Ser Ala Gln Asp Gly Arg Cys Pro Cys Gly Ala
65 70 75 80
Arg Arg Pro Asp Ser Arg Leu Leu Glu Leu His Ile Thr Met Pro Phe
85 90 95
Ser Ser Pro Met Glu Ala Glu Leu Val Arg Arg Ile Leu Ser Arg Asp
100 105 110
Ala Ala Pro Leu Pro Arg Pro Gly Ala Val Leu Lys Asp Phe Thr Val
115 120 125
Ser Gly Asn Leu Leu Phe Met Ser Val Trp Asp Gln Asp Arg Glu Gly
130 135 140
Ala Gly Arg Met Arg Val Val Gly Trp Gly Leu Gly Ser Ala Ser Pro
145 150 155 160
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Glu Gln Arg Pro Gly Thr Pro Gly Pro Pro Pro Pro Glu Gly Ala Gln
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Gly Asp Gly Cys Arg Gly Val Ala Phe Asn Val Met Phe Ser Ala Pro
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His Ile
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Ser Leu Leu Lys Asp Glu Ala Leu Ala Ile Ala Ala Leu Glu Leu Leu
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Leu Pro Leu Gly Val Leu Met Lys Gly Gln His Leu His Leu Glu Thr
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100 105 110
Arg Pro Arg Arg Trp Lys Leu Gln Val Leu Asp Leu Arg Lys Asn Ser
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130 135 140
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Val Leu Val Asp Leu Phe Leu Lys Glu Gly Ala Cys Asp Glu Leu Phe
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195 200 205
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Glu Pro Ala Leu Gly Thr Thr Cys Tyr Ala Ser Gly Trp Gly Ser Ile
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Glu Pro Glu Glu Phe Leu Thr Pro Lys Lys Leu Gln Cys Val Asp Leu
165 170 175
His Val Ile Ser Asn Asp Val Cys Ala Gln Val His Pro Gln Lys Val
180 185 190
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Cys Ser Gly Asp Ser Gly Gly Pro Leu Val Cys Asn Gly Val Leu Gln
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Gly Ile Thr Ser Trp Gly Ser Glu Pro Cys Ala Leu Pro Glu Arg Pro
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<400>80
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aaaatgcttc aggccaatac tggcaagttc tagggggccc agtgtctggg ctgagcattg 900
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gttcaggaag ggcaaggcca gttgtagggc aaagagaagg cagggaggct tggatggact 1080
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cccagaccag gtgcctttct ccgtgagcgt gtcccagttg cgggccttgg atggagggaa 1320
caagcacttc ctgagaaatc agcctctgac ctttgccctc cagctccatg accccagtgg 1380
ctatctggct gaagctgacc tctcctacac ctgggacttt ggagacagta gtggaaccct 1440
gatctctcgg gcacctgtgg tcactcatac ttacctggag cctggcccag tcactgccca 1500
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atctgtgcag gtgccaacca ctgaagtcat aagcactgca cctgtgcaga tgccaactgc 1740
agagagcaca ggtatgacac ctgagaaggt gccagtttca gaggtcatgg gtaccacact 1800
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gctttctgga accacagctg cacaggtaac aactacagag tgggtggaga ccacagctag 1920
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tgtccagggt attgaaagtg ccgagatcct gcaggctgtg ccgtccggtg agggggatgc 2160
atttgagctg actgtgtcct gccaaggcgg gctgcccaag gaagcctgca tggagatctc 2220
atcgccaggg tgccagcccc ctgcccagcg gctgtgccag cctgtgctac ccagcccagc 2280
ctgccagctg gttctgcacc agatactgaa gggtggctcg gggacatact gcctcaatgt 2340
gtctctggct gataccaaca gcctggcagt ggtcagcacc cagcttatca tgcctggtag 2400
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<210>81
<211>2420
<212>DNA
<213>人
<400>81
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<212>DNA
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tgcccggcag tgatcctgca tgctacgagt tcctgtgggg tccaagggcc ctcattgaaa 3840
ccagctatgt gaaagtcctg caccatacac taaagatcgg tggagaacct cacatttcct 3900
acccacccct gcatgaacgg gctttgagag agggagaaga gtgagtctca gcacatgttg 3960
cagccagggc cagtgggagg gggtctgggc cagtgcacct tccagggccc catccattag 4020
cttccactgc ctcgtgtgat atgaggccca ttcctgcctc tttgaagaga gcagtcagca 4080
ttcttagcag tgagtttctg ttctgttgga tgactttgag atttatcttt ctttcctgtt 4140
ggaattgttc aaatgttcct tttaacaaat ggttggatga acttcagcat ccaagtttat 4200
gaatgacagt agtcacacat agtgctgttt atatagttta ggggtaagag tcctgttttt 4260
tattcagatt gggaaatcca ttccattttg tgagttgtca cataataaca gcagtggaat 4320
atgtatttgc ctatattgtg aacgaattag cagtaaaata catgatacaa ggaactcaaa 4380
agatagttaa ttcttgcctt atacctcagt ctattatgta aaattaaaaa tatgtgtatg 4440
tttttgcttc tttgagaatg caaaagaaat taaatctgaa taaattcttc ctgttcactg 4500
gctcatttct ttaccattca ctcagcatct gctctgtgga aggccctggt agtagtggg 4559
<210>83
<211>4204
<212>DNA
<213>人
<400>83
acgcaggcag tgatgtcacc cagaccacac cccttccccc aatgccactt cagggggtac 60
tcagagtcag agacttggtc tgaggggagc agaagcaatc tgcagaggat ggcggtccag 120
gctcagccag gcatcaactt caggaccctg agggatgacc gaaggccccg cccacccacc 180
cccaactccc ccgaccccac caggatctac agcctcagga cccccgtccc aatccttacc 240
ccttgcccca tcaccatctt catgcttacc tccaccccca tccgatcccc atccaggcag 300
aatccagttc cacccctgcc cggaacccag ggtagtaccg ttgccaggat gtgacgccac 360
tgacttgcgc attggaggtc agaagaccgc gagattctcg ccctgagcaa cgagcgacgg 420
cctgacgtcg gcggagggaa gccggcccag gctcggtgag gaggcaaggt aagacgctga 480
gggaggactg aggcgggcct cacctcagac agagggcctc aaataatcca gtgctgcctc 540
tgctgccggg cctgggccac cccgcagggg aagacttcca ggctgggtcg ccactacctc 600
accccgccga cccccgccgc tttagccacg gggaactctg gggacagagc ttaatgtggc 660
cagggcaggg ctggttagaa gaggtcaggg cccacgctgt ggcaggaatc aaggtcagga 720
ccccgagagg gaactgaggg cagcctaacc accaccctca ccaccattcc cgtcccccaa 780
cacccaaccc cacccccatc ccccattccc atccccaccc ccacccctat cctggcagaa 840
tccgggcttt gcccctggta tcaagtcacg gaagctccgg gaatggcggc caggcacgtg 900
agtcctgagg ttcacatcta cggctaaggg agggaagggg ttcggtatcg cgagtatggc 960
cgttgggagg cagcgaaagg gcccaggcct cctggaagac agtggagtcc tgaggggacc 1020
cagcatgcca ggacaggggg cccactgtac ccctgtctca aaccgaggca ccttttcatt 1080
cggctacggg aatcctaggg atgcagaccc acttcagcag ggggttgggg cccagccctg 1140
cgaggagtca tggggaggaa gaagagggag gactgagggg accttggagt ccagatcagt 1200
ggcaaccttg ggctggggga tgctgggcac agtggccaaa tgtgctctgt gctcattgcg 1260
ccttcagggt gaccagagag ttgagggctg tggtctgaag agtgggactt caggtcagca 1320
gagggaggaa tcccaggatc tgcagggccc aaggtgtacc cccaaggggc ccctatgtgg 1380
tggacagatg cagtggtcct aggatctgcc aagcatccag gtgaagagac tgagggagga 1440
ttgagggtac ccctgggaca gaatgcggac tgggggcccc ataaaaatct gccctgctcc 1500
tgctgttacc tcagagagcc tgggcagggc tgtcagctga ggtccctcca ttatcctagg 1560
atcactgatg tcagggaagg ggaagccttg gtctgagggg gctgcactca gggcagtaga 1620
gggaggctct cagaccctac taggagtgga ggtgaggacc aagcagtctc ctcacccagg 1680
gtacatggac ttcaataaat ttggacatct ctcgttgtcc tttccgggag gacctgggaa 1740
tgtatggcca gatgtgggtc ccctcatgtt tttctgtacc atatcaggta tgtgagttct 1800
tgacatgaga gattctcagg ccagcagaag ggagggatta ggccctataa ggagaaaggt 1860
gagggccctg agtgagcaca gaggggatcc tccaccccag tagagtgggg acctcacaga 1920
gtctggccaa ccctcctgac agttctggga atccgtggct gcgtttgctg tctgcacatt 1980
gggggcccgt ggattcctct cccaggaatc aggagctcca ggaacaaggc agtgaggact 2040
tggtctgagg cagtgtcctc aggtcacaga gtagaggggg ctcagatagt gccaacggtg 2100
aaggtttgcc ttggattcaa accaagggcc ccacctgccc cagaacacat ggactccaga 2160
gcgcctggcc tcaccctcaa tactttcagt cctgcagcct cagcatgcgc tggccggatg 2220
taccctgagg tgccctctca cttcctcctt caggttctga ggggacaggc tgacctggag 2280
gaccagaggc ccccggagga gcactgaagg agaagatctg taagtaagcc tttgttagag 2340
cctccaaggt tccattcagt actcagctga ggtctctcac atgctccctc tctccccagg 2400
ccagtgggtc tccattgccc agctcctgcc cacactcccg cctgttgccc tgaccagagt 2460
catcatgcct cttgagcaga ggagtcagca ctgcaagcct gaagaaggcc ttgaggcccg 2520
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ctcctcctct tctactctag ttgaagtcac cctgggggag gtgcctgctg ccgagtcacc 2640
agatcctccc cagagtcctc agggagcctc cagcctcccc actaccatga actaccctct 2700
ctggagccaa tcctatgagg actccagcaa ccaagaagag gaggggccaa gcaccttccc 2760
tgacctggag tccgagttcc aagcagcact cagtaggaag gtggccgagt tggttcattt 2820
tctgctcctc aagtatcgag ccagggagcc ggtcacaaag gcagaaatgc tggggagtgt 2880
cgtcggaaat tggcagtatt tctttcctgt gatcttcagc aaagcttcca gttccttgca 2940
gctggtcttt ggcatcgagc tgatggaagt ggaccccatc ggccacttgt acatctttgc 3000
cacctgcctg ggcctctcct acgatggcct gctgggtgac aatcagatca tgcccaaggc 3060
aggcctcctg ataatcgtcc tggccataat cgcaagagag ggcgactgtg cccctgagga 3120
gaaaatctgg gaggagctga gtgtgttaga ggtgtttgag gggagggaag acagtatctt 3180
gggggatccc aagaagctgc tcacccaaca tttcgtgcag gaaaactacc tggagtaccg 3240
gcaggtcccc ggcagtgatc ctgcatgtta tgaattcctg tggggtccaa gggccctcgt 3300
tgaaaccagc tatgtgaaag tcctgcacca tatggtaaag atcagtggag gacctcacat 3360
ttcctaccca cccctgcatg agtgggtttt gagagagggg gaagagtgag tctgagcacg 3420
agttgcagcc agggccagtg ggagggggtc tgggccagtg caccttccgg ggccgcatcc 3480
cttagtttcc actgcctcct gtgacgtgag gcccattctt cactctttga agcgagcagt 3540
cagcattctt agtagtgggt ttctgttctg ttggatgact ttgagattat tctttgtttc 3600
ctgttggagt tgttcaaatg ttccttttaa cggatggttg aatgagcgtc agcatccagg 3660
tttatgaatg acagtagtca cacatagtgc tgtttatata gtttaggagt aagagtcttg 3720
ttttttactc aaattgggaa atccattcca ttttgtgaat tgtgacataa taatagcagt 3780
ggtaaaagta tttgcttaaa attgtgagcg aattagcaat aacatacatg agataactca 3840
agaaatcaaa agatagttga ttcttgcctt gtacctcaat ctattctgta aaattaaaca 3900
aatatgcaaa ccaggatttc cttgacttct ttgagaatgc aagcgaaatt aaatctgaat 3960
aaataattct tcctcttcac tggctcgttt cttttccgtt cactcagcat ctgctctgtg 4020
ggaggccctg ggttagtagt ggggatgcta aggtaagcca gactcacgcc tacccatagg 4080
gctgtagagc ctaggacctg cagtcatata attaaggtgg tgagaagtcc tgtaagatgt 4140
agaggaaatg taagagaggg gtgagggtgt ggcgctccgg gtgagagtag tggagtgtca 4200
gtgc 4204
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<212>DNA
<213>人
<400>84
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ccgaaggccg gggcacaggg ggttcgacgg gcgatgctga tggcccagga ggccctggca 120
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cggagagccg cctgcttgag ttctacctcg ccatgccttt cgcgacaccc atggaagcag 360
agctggcccg caggagcctg gcccaggatg ccccaccgct tcccgtgcca ggggtgcttc 420
tgaaggagtt cactgtgtcc ggcaacatac tgactatccg actgactgct gcagaccacc 480
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<212>DNA
<213>人
<220>
<221>misc_feature
<222>(1)...(2)
<223>n=A,T,C或G
<400>85
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cgatgtaagt cccgagcccc tccaagctct gctggagaga gcctctgcca ccctccagga 1380
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<212>DNA
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<212>PRT
<213>人
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Met Glu Ser Pro Ser Ala Pro Pro His Arg Trp Cys Ile Pro Trp Gln
1 5 10 15
Arg Leu Leu Leu Thr Ala Ser Leu Leu Thr Phe Trp Asn Pro Pro Thr
20 25 30
Thr Ala Lys Leu Thr Ile Glu Ser Thr Pro Phe Asn Val Ala Glu Gly
35 40 45
Lys Glu Val Leu Leu Leu Val His Asn Leu Pro Gln His Leu Phe Gly
50 55 60
Tyr Ser Trp Tyr Lys Gly Glu Arg Val Asp Gly Asn Arg Gln Ile Ile
65 70 75 80
Gly Tyr Val Ile Gly Thr Gln Gln Ala Thr Pro Gly Pro Ala Tyr Ser
85 90 95
Gly Arg Glu Ile Ile Tyr Pro Asn Ala Ser Leu Leu Ile Gln Asn Ile
100 105 110
Ile Gln Asn Asp Thr Gly Phe Tyr Thr Leu His Val Ile Lys Ser Asp
115 120 125
Leu Val Asn Glu Glu Ala Thr Gly Gln Phe Arg Val Tyr Pro Glu Leu
130 135 140
Pro Lys Pro Ser Ile Ser Ser Asn Asn Ser Lys Pro Val Glu Asp Lys
145 150 155 160
Asp Ala Val Ala Phe Thr Cys Glu Pro Glu Thr Gln Asp Ala Thr Tyr
165 170 175
Leu Trp Trp Val Asn Asn Gln Ser Leu Pro Val Ser Pro Arg Leu Gln
180 185 190
Leu Ser Asn Gly Asn Arg Thr Leu Thr Leu Phe Asn Val Thr Arg Asn
195 200 205
Asp Thr Ala Ser Tyr Lys Cys Glu Thr Gln Asn Pro Val Ser Ala Arg
210 215 220
Arg Ser Asp Ser Val Ile Leu Asn Val Leu Tyr Gly Pro Asp Ala Pro
225 230 235 240
Thr Ile Ser Pro Leu Asn Thr Ser Tyr Arg Ser Gly Glu Asn Leu Asn
245 250 255
Leu Ser Cys His Ala Ala Ser Asn Pro Pro Ala Gln Tyr Ser Trp Phe
260 265 270
Val Asn Gly Thr Phe Gln Gln Ser Thr Gln Glu Leu Phe Ile Pro Asn
275 280 285
Ile Thr Val Asn Asn Ser Gly Ser Tyr Thr Cys Gln Ala His Asn Ser
290 295 300
Asp Thr Gly Leu Asn Arg Thr Thr Val Thr Thr Ile Thr Val Tyr Ala
305 310 315 320
Glu Pro Pro Lys Pro Phe Ile Thr Ser Asn Asn Ser Asn Pro Val Glu
325 330 335
Asp Glu Asp Ala Val Ala Leu Thr Cys Glu Pro Glu Ile Gln Asn Thr
340 345 350
Thr Tyr Leu Trp Trp Val Asn Asn Gln Ser Leu Pro Val Ser Pro Arg
355 360 365
Leu Gln Leu Ser Asn Asp Asn Arg Thr Leu Thr Leu Leu Ser Val Thr
370 375 380
Arg Asn Asp Val Gly Pro Tyr Glu Cys Gly Ile Gln Asn Glu Leu Ser
385 390 395 400
Val Asp His Ser Asp Pro Val Ile Leu Asn Val Leu Tyr Gly Pro Asp
405 410 415
Asp Pro Thr Ile Ser Pro Ser Tyr Thr Tyr Tyr Arg Pro Gly Val Asn
420 425 430
Leu Ser Leu Ser Cys His Ala Ala Ser Asn Pro Pro Ala Gln Tyr Ser
435 440 445
Trp Leu Ile Asp Gly Asn Ile Gln Gln His Thr Gln Glu Leu Phe Ile
450 455 460
Ser Asn Ile Thr Glu Lys Asn Ser Gly Leu Tyr Thr Cys Gln Ala Asn
465 470 475 480
Asn Ser Ala Ser Gly His Ser Arg Thr Thr Val Lys Thr Ile Thr Val
485 490 495
Ser Ala Glu Leu Pro Lys Pro Ser Ile Ser Ser Asn Asn Ser Lys Pro
500 505 510
Val Glu Asp Lys Asp Ala Val Ala Phe Thr Cys Glu Pro Glu Ala Gln
515 520 525
Asn Thr Thr Tyr Leu Trp Trp Val Asn Gly Gln Ser Leu Pro Val Ser
530 535 540
Pro Arg Leu Gln Leu Ser Asn Gly Asn Arg Thr Leu Thr Leu Phe Asn
545 550 555 560
Val Thr Arg Asn Asp Ala Arg Ala Tyr Val Cys Gly Ile Gln Asn Ser
565 570 575
Val Ser Ala Asn Arg Ser Asp Pro Val Thr Leu Asp Val Leu Tyr Gly
580 585 590
Pro Asp Thr Pro Ile Ile Ser Pro Pro Asp Ser Ser Tyr Leu Ser Gly
595 600 605
Ala Asn Leu Asn Leu Ser Cys His Ser Ala Ser Asn Pro Ser Pro Gln
610 615 620
Tyr Ser Trp Arg Ile Asn Gly Ile Pro Gln Gln His Thr Gln Val Leu
625 630 635 640
Phe Ile Ala Lys Ile Thr Pro ASn Asn Asn Gly Thr Tyr Ala Cys Phe
645 650 655
Val Ser Asn Leu Ala Thr Gly Arg Asn Asn Ser Ile Val Lys Ser Ile
660 665 670
Thr Val Ser Ala Ser Gly Thr Ser Pro Gly Leu Ser Ala Gly Ala Thr
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Val Gly Ile Met Ile Gly Val Leu Val Gly Val Ala Leu Ile
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<213>人
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ttcaatgtcg cagaggggaa ggaggtgctt ctacttgtcc acaatctgcc ccagcatctt 300
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gagctgccca agccctccat ctccagcaac aactccaaac ccgtggagga caaggatgct 600
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gccaggcgca gtgattcagt catcctgaat gtcctctatg gcccggatgc ccccaccatt 840
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tctaacccac ctgcacagta ctcttggttt gtcaatggga ctttccagca atccacccaa 960
gagctcttta tccccaacat cactgtgaat aatagtggat cctatacgtg ccaagcccat 1020
aactcagaca ctggcctcaa taggaccaca gtcacgacga tcacagtcta tgcagagcca 1080
cccaaaccct tcatcaccag caacaactcc aaccccgtgg aggatgagga tgctgtagcc 1140
ttaacctgtg aacctgagat tcagaacaca acctacctgt ggtgggtaaa taatcagagc 1200
ctcccggtca gtcccaggct gcagctgtcc aatgacaaca ggaccctcac tctactcagt 1260
gtcacaagga atgatgtagg accctatgag tgtggaatcc agaacgaatt aagtgttgac 1320
cacagcgacc cagtcatcct gaatgtcctc tatggcccag acgaccccac catttccccc 1380
tcatacacct attaccgtcc aggggtgaac ctcagcctct cctgccatgc agcctctaac 1440
ccacctgcac agtattcttg gctgattgat gggaacatcc agcaacacac acaagagctc 1500
tttatctcca acatcactga gaagaacagc ggactctata cctgccaggc caataactca 1560
gccagtggcc acagcaggac tacagtcaag acaatcacag tctctgcgga gctgcccaag 1620
ccctccatct ccagcaacaa ctccaaaccc gtggaggaca aggatgctgt ggccttcacc 1680
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tcgtcttacc tttcgggagc gaacctcaac ctctcctgcc actcggcctc taacccatcc 1980
ccgcagtatt cttggcgtat caatgggata ccgcagcaac acacacaagt tctctttatc 2040
gccaaaatca cgccaaataa taacgggacc tatgcctgtt ttgtctctaa cttggctact 2100
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tcaataaaaa tctgctcttt gtataacaga aaaa 2974
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<212>PRT
<213>人
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Leu Gly Leu Asp Val Pro Val
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805 810 815
Ser Gln Thr Val Ser Arg Asn Phe Thr Ser Val Asp His Gly Ile Ser
820 825 830
Lys Asp Lys Arg Asp Tyr Leu Trp Thr Ser Ala Lys Asn Thr Leu Ser
835 840 845
Thr Pro Leu Pro Lys Ala Tyr Thr Val Lys Thr Pro Thr Lys Pro Lys
850 855 860
Leu Gln Gln Arg Glu Asn Leu Asn Ile Pro Ile Glu Glu Ser Lys Lys
865 870 875 880
Lys Arg Lys Met Ala Phe Glu Phe Asp Ile Asn Ser Asp Ser Ser Glu
885 890 895
Thr Thr Asp Leu Leu Ser Met Val Ser Glu Glu Glu Thr Leu Lys Thr
900 905 910
Leu Tyr Arg Asn Asn Asn Pro Pro Ala Ser His Leu Cys Val Lys Thr
915 920 925
Pro Lys Lys Ala Pro Ser Ser Leu Thr Thr Pro Gly Pro Thr Leu Lys
930 935 940
Phe Gly Ala Ile Arg Lys Met Arg Glu Asp Arg Trp Ala Val Ile Ala
945 950 955 960
Lys Met Asp Arg Lys Lys Lys Leu Lys Glu Ala Glu Lys Leu Phe Val
965 970 975
<210>93
<211>3393
<212>DNA
<213>人
<400>93
gccctcatag accgtttgtt gtagttcgcg tgggaacagc aacccacggt ttcccgatag 60
ttcttcaaag atatttacaa ccgtaacaga gaaaatggaa aagcaaaagc cctttgcatt 120
gttcgtacca ccgagatcaa gcagcagtca ggtgtctgcg gtgaaacctc agaccctggg 180
aggcgattcc actttcttca agagtttcaa caaatgtact gaagatgatt tggagtttcc 240
atttgcaaag actaatctct ccaaaaatgg ggaaaacatt gattcagatc ctgctttaca 300
aaaagttaat ttcttgcccg tgcttgagca ggttggtaat tctgactgtc actatcagga 360
aggactaaaa gactctgatt tggagaattc agagggattg agcagagtgt tttcaaaact 420
gtataaggag gctgaaaaga taaaaaaatg gaaagtaagt acagaagctg aactgagaca 480
gaaagaaagt aagttgcaag aaaacagaaa gataattgaa gcacagcgaa aagccattca 540
ggaactgcaa tttggaaatg aaaaagtaag tttgaaatta gaagaaggaa tacaagaaaa 600
taaagattta ataaaagaga ataatgccac aaggcattta tgtaatctac tcaaagaaac 660
ctgtgctaga tctgcagaaa agacaaagaa atatgaatat gaacgggaag aaaccaggca 720
agtttatatg gatctaaata ataacattga gaaaatgata acagctcatg gggaacttcg 780
tgtgcaagct gagaattcca gactggaaat gcattttaag ttaaaggaag attatgaaaa 840
aatccaacac cttgaacaag aatacaagaa ggaaataaat gacaaggaaa agcaggtatc 900
actactattg atccaaatca ctgagaaaga aaataaaatg aaagatttaa catttctgct 960
agaggaatcc agagataaag ttaatcaatt agaggaaaag acaaaattac agagtgaaaa 1020
cttaaaacaa tcaattgaga aacagcatca tttgactaaa gaactagaag atattaaagt 1080
gtcattacaa agaagtgtga gtactcaaaa ggctttagag gaagatttac agatagcaac 1140
aaaaacaatt tgtcagctaa ctgaagaaaa agaaactcaa atggaagaat ctaataaagc 1200
tagagctgct cattcgtttg tggttactga atttgaaact actgtctgca gcttggaaga 1260
attattgaga acagaacagc aaagattgga aaaaaatgaa gatcaattga aaatacttac 1320
catggagctt caaaagaaat caagtgagct ggaagagatg actaagctta caaataacaa 1380
agaagtagaa cttgaagaat tgaaaaaagt cttgggagaa aaggaaacac ttttatatga 1440
aaataaacaa tttgagaaga ttgctgaaga attaaaagga acagaacaag aactaattgg 1500
tcttctccaa gccagagaga aagaagtaca tgatttggaa atacagttaa ctgccattac 1560
cacaagtgaa cagtattatt caaaagaggt taaagatcta aaaactgagc ttgaaaacga 1620
gaagcttaag aatactgaat taacttcaca ctgcaacaag ctttcactag aaaacaaaga 1680
gctcacacag gaaacaagtg atatgaccct agaactcaag aatcagcaag aagatattaa 1740
taataacaaa aagcaagaag aaaggatgtt gaaacaaata gaaaatcttc aagaaacaga 1800
aacccaatta agaaatgaac tagaatatgt gagagaagag ctaaaacaga aaagagatga 1860
agttaaatgt aaattggaca agagtgaaga aaattgtaac aatttaagga aacaagttga 1920
aaataaaaac aagtatattg aagaacttca gcaggagaat aaggccttga aaaaaaaagg 1980
tacagcagaa agcaagcaac tgaatgttta tgagataaag gtcaataaat tagagttaga 2040
actagaaagt gccaaacaga aatttggaga aatcacagac acctatcaga aagaaattga 2100
ggacaaaaag atatcagaag aaaatctttt ggaagaggtt gagaaagcaa aagtaatagc 2160
tgatgaagca gtaaaattac agaaagaaat tgataagcga tgtcaacata aaatagctga 2220
aatggtagca cttatggaaa aacataagca ccaatatgat aagatcattg aagaaagaga 2280
ctcagaatta ggactttata agagcaaaga acaagaacag tcatcactga gagcatcttt 2340
ggagattgaa ctatccaatc tcaaagctga acttttgtct gttaagaagc aacttgaaat 2400
agaaagagaa gagaaggaaa aactcaaaag agaggcaaaa gaaaacacag ctactcttaa 2460
agaaaaaaaa gacaagaaaa cacaaacatt tttattggaa acacctgaaa tttattggaa 2520
attggattct aaagcagttc cttcacaaac tgtatctcga aatttcacat cagttgatca 2580
tggcatatcc aaagataaaa gagactatct gtggacatct gccaaaaata ctttatctac 2640
accattgcca aaggcatata cagtgaagac accaacaaaa ccaaaactac agcaaagaga 2700
aaacttgaat atacccattg aagaaagtaa aaaaaagaga aaaatggcct ttgaatttga 2760
tattaattca gatagttcag aaactactga tcttttgagc atggtttcag aagaagagac 2820
attgaaaaca ctgtatagga acaataatcc accagcttct catctttgtg tcaaaacacc 2880
aaaaaaggcc ccttcatctc taacaacccc tggacctaca ctgaagtttg gagctataag 2940
aaaaatgcgg gaggaccgtt gggctgtaat tgctaaaatg gatagaaaaa aaaaactaaa 3000
agaagctgaa aagttatttg tttaatttca gagaatcagt gtagttaagg agcctaataa 3060
cgtgaaactt atagttaata ttttgttctt atttgccaga gccacatttt atctggaagt 3120
tgagacttaa aaaatacttg catgaatgat ttgtgtttct ttatattttt agcctaaatg 3180
ttaactacat attgtctgga aacctgtcat tgtattcaga taattagatg attatatatt 3240
gttgttactt tttcttgtat tcatgaaaac tgtttttact aagttttcaa atttgtaaag 3300
ttagcctttg aatgctagga atgcattatt gagggtcatt ctttattctt tactattaaa 3360
atattttgga tgcaaaaaaa aaaaaaaaaa aaa 3393
<210>94
<211>188
<212>PRT
<213>人
<400>94
Met Asn Gly Asp Asp Ala Phe Ala Arg Arg Pro Arg Asp Asp Ala Gln
1 5 10 15
Ile Ser Glu Lys Leu Arg Lys Ala Phe Asp Asp Ile Ala Lys Tyr Phe
20 25 30
Ser Lys Lys Glu Trp Glu Lys Met Lys Ser Ser Glu Lys Ile Val Tyr
35 40 45
Val Tyr Met Lys Leu Asn Tyr Glu Val Met Thr Lys Leu Gly Phe Lys
50 55 60
Val Thr Leu Pro Pro Phe Met Arg Ser Lys Arg Ala Ala Asp Phe His
65 70 75 80
Gly Asn Asp Phe Gly Asn Asp Arg Asn His Arg Asn Gln Val Glu Arg
85 90 95
Pro Gln Met Thr Phe Gly Ser Leu Gln Arg Ile Phe Pro Lys Ile Met
100 105 110
Pro Lys Lys Pro Ala Glu Glu Glu Asn Gly Leu Lys Glu Val Pro Glu
115 120 125
Ala Ser Gly Pro Gln Asn Asp Gly Lys Gln Leu Cys Pro Pro Gly Asn
130 135 140
Pro Ser Thr Leu Glu Lys Ile Asn Lys Thr Ser Gly Pro Lys Arg Gly
145 150 155 160
Lys His Ala Trp Thr His Arg Leu Arg Glu Arg Lys Gln Leu Val Val
165 170 175
Tyr Glu Glu Ile Set Asp Pro Glu Glu Asp Asp Glu
180 185
<210>95
<211>576
<212>DNA
<213>人
<400>95
atgaacggag acgacgcctt tgcaaggaga cccagggatg atgctcaaat atcagagaag 60
ttacgaaagg ccttcgatga tattgccaaa tacttctcta agaaagagtg ggaaaagatg 120
aaatcctcgg agaaaatcgt ctatgtgtat atgaagctaa actatgaggt catgactaaa 180
ctaggtttca aggtcaccct cccacctttc atgcgtagta aacgggctgc agacttccac 240
gggaatgatt ttggtaacga tcgaaaccac aggaatcagg ttgaacgtcc tcagatgact 300
ttcggcagcc tccagagaat cttcccgaag atcatgccca agaagccagc agaggaagaa 360
aatggtttga aggaagtgcc agaggcatct ggcccacaaa atgatgggaa acagctgtgc 420
cccccgggaa atccaagtac cttggagaag attaacaaga catctggacc caaaaggggg 480
aaacatgcct ggacccacag actgcgtgag agaaagcagc tggtggttta tgaagagatc 540
agcgaccctg aggaagatga cgagtaactc ccctcg 576
<210>96
<211>94
<212>PRT
<213>人
<400>96
Pro Ala Thr Gln Arg Gln Asp Pro Ala Ala Ala Gln Glu Gly Glu Asp
1 5 10 15
Glu Gly Ala Ser Ala Gly Gln Gly Pro Lys Pro Glu Ala Asp Ser Gln
20 25 30
Glu Gln Gly His Pro Gln Thr Gly Cys Glu Cys Glu Asp Gly Pro Asp
35 40 45
Gly Gln Glu Met Asp Pro Pro Asn Pro Glu Glu Val Lys Thr Pro Glu
50 55 60
Glu Glu Met Arg Ser His Tyr Val Ala Gln Thr Gly Ile Leu Trp Leu
65 70 75 80
Leu Met Asn Asn Cys Phe Leu Asn Leu Ser Pro Arg Lys Pro
85 90
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<211>646
<212>DNA
<213>人
<400>97
ctgccgtccg gactcttttt cctctactga gattcatctg tgtgaaatat gagttggcga 60
ggaagatcga cctatcggcc tagaccaaga cgctacgtag agcctcctga aatgattggg 120
cctatgcggc ccgagcagtt cagtgatgaa gtggaaccag caacacctga agaaggggaa 180
ccagcaactc aacgtcagga tcctgcagct gctcaggagg gagaggatga gggagcatct 240
gcaggtcaag ggccgaagcc tgaagctgat agccaggaac agggtcaccc acagactggg 300
tgtgagtgtg aagatggtcc tgatgggcag gagatggacc cgccaaatcc agaggaggtg 360
aaaacgcctg aagaagagat gaggtctcac tatgttgccc agactgggat tctctggctt 420
ttaatgaaca attgcttctt aaatctttcc ccacggaaac cttgagtgac tgaaatatca 480
aatggcgaga gaccgtttag ttcctatcat ctgtggcatg tgaagggcaa tcacagtgtt 540
aaaagaagac atgctgaaat gttgcaggct gctcctatgt tggaaaattc ttcattgaag 600
ttctcccaat aaagctttac agccttctgc aaagaaaaaa aaaaaa 646
<210>98
<211>98
<212>PRT
<213>人
<400>98
His Cys Pro Thr Glu Asn Glu Pro Asp Leu Ala Gln Cys Phe Phe Cys
1 5 10 15
Phe Lys Glu Leu Glu Gly Trp Glu Pro Asp Asp Asp Pro Ile Glu Glu
20 25 30
His Lys Lys His Ser Ser Gly Cys Ala Phe Leu Ser Val Lys Lys Gln
35 40 45
Phe Glu Glu Leu Thr Leu Gly Glu Phe Leu Lys Leu Asp Arg Glu Arg
50 55 60
Ala Lys Asn Lys Ile Ala Lys Glu Thr Asn Asn Lys Lys Lys Glu Phe
65 70 75 80
Glu Glu Thr Ala Lys Lys Val Arg Arg Ala Ile Glu Gln Leu Ala Ala
85 90 95
Met Asp
<210>99
<211>1619
<212>DNA
<213>人
<400>99
ccgccagatt tgaatcgcgg gacccgttgg cagaggtggc ggcggcggca tgggtgcccc 60
gacgttgccc cctgcctggc agccctttct caaggaccac cgcatctcta cattcaagaa 120
ctggcccttc ttggagggct gcgcctgcac cccggagcgg atggccgagg ctggcttcat 180
ccactgcccc actgagaacg agccagactt ggcccagtgt ttcttctgct tcaaggagct 240
ggaaggctgg gagccagatg acgaccccat agaggaacat aaaaagcatt cgtccggttg 300
cgctttcctt tctgtcaaga agcagtttga agaattaacc cttggtgaat ttttgaaact 360
ggacagagaa agagccaaga acaaaattgc aaaggaaacc aacaataaga agaaagaatt 420
tgaggaaact gcgaagaaag tgcgccgtgc catcgagcag ctggctgcca tggattgagg 480
cctctggccg gagctgcctg gtcccagagt ggctgcacca cttccagggt ttattccctg 540
gtgccaccag ccttcctgtg ggccccttag caatgtctta ggaaaggaga tcaacatttt 600
caaattagat gtttcaactg tgctcctgtt ttgtcttgaa agtggcacca gaggtgcttc 660
tgcctgtgca gcgggtgctg ctggtaacag tggctgcttc tctctctctc tctctttttt 720
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aaggcagtgt cccttttgct agagctgaca gctttgttcg cgtgggcaga gccttccaca 840
gtgaatgtgt ctggacctca tgttgttgag gctgtcacag tcctgagtgt ggacttggca 900
ggtgcctgtt gaatctgagc tgcaggttcc ttatctgtca cacctgtgcc tcctcagagg 960
acagtttttt tgttgttgtg tttttttgtt tttttttttt ggtagatgca tgacttgtgt 1020
gtgatgagag aatggagaca gagtccctgg ctcctctact gtttaacaac atggctttct 1080
tattttgttt gaattgttaa ttcacagaat agcacaaact acaattaaaa ctaagcacaa 1140
agccattcta agtcattggg gaaacggggt gaacttcagg tggatgagga gacagaatag 1200
agtgatagga agcgtctggc agatactcct tttgccactg ctgtgtgatt agacaggccc 1260
agtgagccgc ggggcacatg ctggccgctc ctccctcaga aaaaggcagt ggcctaaatc 1320
ctttttaaat gacttggctc gatgctgtgg gggactggct gggctgctgc aggccgtgtg 1380
tctgtcagcc caaccttcac atctgtcacg ttctccacac gggggagaga cgcagtccgc 1440
ccaggtcccc gctttctttg gaggcagcag ctcccgcagg gctgaagtct ggcgtaagat 1500
gatggatttg attcgccctc ctccctgtca tagagctgca gggtggattg ttacagcttc 1560
gctggaaacc tctggaggtc atctcggctg ttcctgagaa ataaaaagcc tgtcatttc 1619
<210>100
<211>74
<212>PRT
<213>人
<400>100
Cys Trp Tyr Cys Arg Arg Arg Asn Gly Tyr Arg Ala Leu Met Asp Lys
1 5 10 15
Ser Leu His Val Gly Thr Gln Cys Ala Leu Thr Arg Arg Cys Pro Gln
20 25 30
Glu Gly Phe Asp His Arg Asp Ser Lys Val Ser Leu Gln Glu Lys Asn
35 40 45
Cys Glu Pro Val Val Pro Asn Ala Pro Pro Ala Tyr Glu Lys Leu Ser
50 55 60
Ala Glu Gln Ser Pro Pro Pro Tyr Ser Pro
65 70
<210>101
<211>1524
<212>DNA
<213>人
<400>101
agcagacaga ggactctcat taaggaaggt gtcctgtgcc ctgaccctac aagatgccaa 60
gagaagatgc tcacttcatc tatggttacc ccaagaaggg gcacggccac tcttacacca 120
cggctgaaga ggccgctggg atcggcatcc tgacagtgat cctgggagtc ttactgctca 180
tcggctgttg gtattgtaga agacgaaatg gatacagagc cttgatggat aaaagtcttc 240
atgttggcac tcaatgtgcc ttaacaagaa gatgcccaca agaagggttt gatcatcggg 300
acagcaaagt gtctcttcaa gagaaaaact gtgaacctgt ggttcccaat gctccacctg 360
cttatgagaa actctctgca gaacagtcac caccacctta ttcaccttaa gagccagcga 420
gacacctgag acatgctgaa attatttctc tcacactttt gcttgaattt aatacagaca 480
tctaatgttc tcctttggaa tggtgtagga aaaatgcaag ccatctctaa taataagtca 540
gtgttaaaat tttagtaggt ccgctagcag tactaatcat gtgaggaaat gatgagaaat 600
attaaattgg gaaaactcca tcaataaatg ttgcaatgca tgatactatc tgtgccagag 660
gtaatgttag taaatccatg gtgttatttt ctgagagaca gaattcaagt gggtattctg 720
gggccatcca atttctcttt acttgaaatt tggctaataa caaactagtc aggttttcga 780
accttgaccg acatgaactg tacacagaat tgttccagta ctatggagtg ctcacaaagg 840
atacttttac aggttaagac aaagggttga ctggcctatt tatctgatca agaacatgtc 900
agcaatgtct ctttgtgctc taaaattcta ttatactaca ataatatatt gtaaagatcc 960
tatagctctt tttttttgag atggagtttc gcttttgttg cccaggctgg agtgcaatgg 1020
cgcgatcttg gctcaccata acctccgcct cccaggttca agcaattctc ctgccttagc 1080
ctcctgagta gctgggatta caggcgtgcg ccactatgcc tgactaattt tgtagtttta 1140
gtagagacgg ggtttctcca tgttggtcag gctggtctca aactcctgac ctcaggtgat 1200
ctgcccgcct cagcctccca aagtgctgga attacaggcg tgagccacca cgcctggctg 1260
gatcctatat cttaggtaag acatataacg cagtctaatt acatttcact tcaaggctca 1320
atgctattct aactaatgac aagtattttc tactaaacca gaaattggta gaaggattta 1380
aataagtaaa agctactatg tactgcctta gtgctgatgc ctgtgtactg ccttaaatgt 1440
acctatggca atttagctct cttgggttcc caaatccctc tcacaagaat gtgcagaaga 1500
aatcataaag gatcagagat tctg 1524
<210>102
<211>43
<212>PRT
<213>人
<400>102
Met Ala Ala Arg Ala Val Phe Leu Ala Leu Ser Ala Gln Leu Leu Gln
1 5 10 15
Ala Arg Leu Met Lys Glu Glu Ser Pro Val Val Ser Trp Arg Leu Glu
20 25 30
Pro Glu Asp Gly Thr Ala Leu Cys Phe Ile Phe
35 40
<210>103
<211>1004
<212>DNA
<213>人
<400>103
cgccaattta gggtctccgg tatctcccgc tgagctgctc tgttcccggc ttagaggacc 60
aggagaaggg ggagctggag gctggagcct gtaacaccgt ggctcgtctc actctggatg 120
gtggtggcaa cagagatggc agcgcagctg gagtgttagg agggcggcct gagcggtagg 180
agtggggctg gagcagtaag atggcggcca gagcggtttt tctggcattg tctgcccagc 240
tgctccaagc caggctgatg aaggaggagt cccctgtggt gagctggagg ttggagcctg 300
aagacggcac agctctgtgc ttcatcttct gaggttgtgg cagccacggt gatggagacg 360
gcagctcaac aggagcaata ggaggagatg gagtttcact gtgtcagcca ggatggtctc 420
gatctcctga cctcgtgatc cgcccgcctt ggccttccaa agtgccgaga ttacagcgat 480
gtgcattttg taagcacttt ggagccacta tcaaatgctg tgaagagaaa tgtacccaga 540
tgtatcatta tccttgtgct gcaggagccg gctcctttca ggatttcagt cacatcttcc 600
tgctttgtcc agaacacatt gaccaagctc ctgaaagatg taagtttact acgcatagac 660
ttttaaactt caaccaatgt atttactgaa aataacaaat gttgtaaatt ccctgagtgt 720
tattctactt gtattaaaag gtaataatac ataatcatta aaatctgagg gatcattgcc 780
agagattgtt ggggagggaa atgttatcaa cggtttcatt gaaattaaat ccaaaaagtt 840
atttcctcag aaaaatcaaa taaagtttgc atgtttttta ttcttaaaac attttaaaaa 900
ccactgtaga atgatgtaaa tagggactgt gcagtatttc tgacatatac tataaaatta 960
ttaaaaagtc aatcagtatt caacatcttt tacactaaaa agcc 1004
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<213>人
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Trp Val Leu Thr Ala Ala His Cys Ile
1 5
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<213>人
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Pro Met Trp Phe Leu Val Leu Cys Leu Ala Leu Ser Leu Gly Gly Thr
1 5 10 15
Gly Ala Ala Pro Pro Ile Gln Ser Arg Ile Val Gly Gly Trp Glu Cys
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Glu Gln His Ser Gln Pro Trp Gln Ala Ala Leu Tyr His Phe Ser Thr
35 40 45
Phe Gln Cys Gly Gly Ile Leu Val His Arg Gln Trp Val Leu Thr Ala
50 55 60
Ala His Cys Ile Ser Asp Asn Tyr Gln Leu Trp Leu Gly Arg His Asn
65 70 75 80
Leu Phe Asp Asp Glu Asn Thr Ala Gln Phe Val His Val Ser Glu Ser
85 90 95
Phe Pro His Pro Gly Phe Asn Met Ser Leu Leu Glu Asn His Thr Arg
100 105 110
Gln Ala Asp Glu Asp Tyr Ser His Asp Leu Met Leu Leu Arg Leu Thr
115 120 125
Glu Pro Ala Asp Thr Ile Thr Asp Ala Val Lys Val Val Glu Leu Pro
130 135 140
Thr Gln Glu Pro Glu Val Gly Ser Thr Cys Leu Ala Ser Gly Trp Gly
145 150 155 160
Ser Ile Glu Pro Glu Asn Phe Ser Phe Pro Asp Asp Leu Gln Cys Val
165 170 175
Asp Leu Lys Ile Leu Pro Asn Asp Glu Cys Glu Lys Ala His Val Gln
180 185 190
Lys Val Thr Asp Phe Met Leu Cys Val Gly His Leu Glu Gly Gly Lys
195 200 205
Asp Thr Cys Val Gly Asp Ser Gly Gly Pro Leu Met Cys Asp Gly Val
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Leu Gln Gly Val Thr Ser Trp Gly Tyr Val Pro Cys Gly Thr Pro Asn
225 230 235 240
Lys Pro Ser Val Ala Val Arg Val Leu Ser Tyr Val Lys Trp Ile Glu
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Asp Thr Ile Ala Glu Asn Ser
260
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<211>270
<212>PRT
<213>人
<400>106
Pro Met Ile Arg Thr Leu Leu Leu Ser Thr Leu Val Ala Gly Ala Leu
1 5 10 15
Ser Cys Gly Asp Pro Thr Tyr Pro Pro Tyr Val Thr Arg Val Val Gly
20 25 30
Gly Glu Glu Ala Arg Pro Asn Ser Trp Pro Trp Gln Val Ser Leu Gln
35 40 45
Tyr Ser Ser Asn Gly Lys Trp Tyr His Thr Cys Gly Gly Ser Leu Ile
50 55 60
Ala Asn Ser Trp Val Leu Thr Ala Ala His Cys Ile Ser Ser Ser Arg
65 70 75 80
Thr Tyr Arg Val Gly Leu Gly Arg His Asn Leu Tyr Val Ala Glu Ser
85 90 95
Gly Ser Leu Ala Val Ser Val Ser Lys Ile Val Val His Lys Asp Trp
100 105 110
Asn Ser Asn Gln Ile Ser Lys Gly Asn Asp Ile Ala Leu Leu Lys Leu
115 120 125
Ala Asn Pro Val Ser Leu Thr Asp Lys Ile Gln Leu Ala Cys Leu Pro
130 135 140
Pro Ala Gly Thr Ile Leu Pro Asn Asn Tyr Pro Cys Tyr Val Thr Gly
145 150 155 160
Trp Gly Arg Leu Gln Thr Asn Gly Ala Val Pro Asp Val Leu Gln Gln
165 170 175
Gly Arg Leu Leu Val Val Asp Tyr Ala Thr Cys Ser Ser Ser Ala Trp
180 185 190
Trp Gly Ser Ser Val Lys Thr Ser Met Ile Cys Ala Gly Gly Asp Gly
195 200 205
Val Ile Ser Ser Cys Asn Gly Asp Ser Gly Gly Pro Leu Asn Cys Gln
210 215 220
Ala Ser Asp Gly Arg Trp Gln Val His Gly Ile Val Ser Phe Gly Ser
225 230 235 240
Arg Leu Gly Cys Asn Tyr Tyr His Lys Pro Ser Val Phe Thr Arg Val
245 250 255
Ser Asn Tyr Ile Asp Trp Ile Asn Ser Val Ile Ala Asn Asn
260 265 270
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<212>PRT
<213>人
<400>107
Pro Met Ile Arg Thr Leu Leu Leu Ser Thr Leu Val Ala Gly Ala Leu
1 5 10 15
Ser Cys Gly Val Ser Thr Tyr Ala Pro Asp Met Ser Arg Met Leu Gly
20 25 30
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35 40 45
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50 55 60
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65 70 75 80
Ile Tyr Arg Val Met Leu Gly Gln His Asn Leu Tyr Val Ala Glu Ser
85 90 95
Gly Ser Leu Ala Val Ser Val Ser Lys Ile Val Val His Lys Asp Trp
100 105 110
Asn Ser Asn Gln Val Ser Lys Gly Asn Asp Ile Ala Leu Leu Lys Leu
115 120 125
Ala Asn Pro Val Ser Leu Thr Asp Lys Ile Gln Leu Ala Cys Leu Pro
130 135 140
Pro Ala Gly Thr Ile Leu Pro Asn Asn Tyr Pro Cys Tyr Val Thr Gly
145 150 155 160
Trp Gly Arg Leu Gln Thr Asn Gly Ala Leu Pro Asp Asp Leu Lys Gln
165 170 175
Gly Arg Leu Leu Val Val Asp Tyr Ala Thr Cys Ser Ser Ser Gly Trp
180 185 190
Trp Gly Ser Thr Val Lys Thr Asn Met Ile Cys Ala Gly Gly Asp Gly
195 200 205
Val Ile Cys Thr Cys Asn Gly Asp Ser Gly Gly Pro Leu Asn Cys Gln
210 215 220
Ala Ser Asp Gly Arg Trp Glu Val His Gly Ile Gly Ser Leu Thr Ser
225 230 235 240
Val Leu Gly Cys Asn Tyr Tyr Tyr Lys Pro Ser Ile Phe Thr Arg Val
245 250 255
Ser Asn Tyr Asn Asp Trp Ile Asn Ser Val Ile Ala Asn Asn
260 265 270
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1 5
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<211>9
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Asp Ala Leu Leu Gly Gly Ser Glu Ile
1 5
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<211>10
<212>PRT
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Gly Ser Glu Ile Trp Arg Asp Ile Asp Phe
1 5 10
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<211>9
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Ser Glu Ile Trp Arg Asp Ile Asp Phe
1 5
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<211>9
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<213>人
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Glu Ile Trp Arg Asp Ile Asp Phe Ala
1 5
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<211>10
<212>PRT
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Leu Gln Glu Val Tyr Pro Glu Ala Asn Ala
1 5 10
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<211>10
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<213>人
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Glu Val Tyr Pro Glu Ala Asn Ala Pro Ile
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<211>10
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Tyr Pro Glu Ala Asn Ala Pro Ile Gly His
1 5 10
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<211>10
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Pro Ile Gly His Asn Arg Glu Ser Tyr Met
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Ile Pro Leu Tyr Arg Asn Gly Asp Phe Phe
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<400>136
Pro Leu Tyr Arg Asn Gly Asp Phe Phe Ile
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<211>10
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Arg Asn Gly Asp Phe Phe Ile Ser Ser Lys
1 5 10
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Asn Gly Asp Phe Phe Ile Ser Ser Lys
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<211>9
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<400>159
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<400>162
Glu Ala Thr Gly Gln Phe Arg Val Tyr
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<211>9
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<213>人
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<400>164
Pro Glu Leu Pro Lys Pro Ser Ile
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1 5
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<211>9
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Pro Pro Ala Gln Tyr Ser Trp Phe Val
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<211>8
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<213>人
<400>193
Pro Ala Gln Tyr Ser Trp Phe Val
1 5
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<211>9
<212>PRT
<213>人
<400>194
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<212>PRT
<213>人
<400>195
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1 5 10
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<211>9
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<400>196
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<213>人
<400>197
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<212>PRT
<213>人
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Tyr Ala Glu Pro Pro Lys Pro Phe Ile Thr
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<212>PRT
<213>人
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Ala Glu Pro Pro Lys Pro Phe Ile
1 5
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<211>8
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<213>人
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<211>8
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<213>人
<400>202
Pro Pro Lys Pro Phe Ile Thr Ser
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<211>10
<212>PRT
<213>人
<400>203
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<211>9
<212>PRT
<213>人
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<213>人
<400>205
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1 5
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<211>9
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<213>人
<400>206
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<211>9
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<213>人
<400>207
Gly Ile Gln Asn Glu Leu Ser Val Asp
1 5
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<211>9
<212>PRT
<213>人
<400>208
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<211>10
<212>PRT
<213>人
<400>209
His Ser Asp Pro Val Ile Leu Asn Val Leu
1 5 10
<210>210
<211>9
<212>PRT
<213>人
<400>210
Ser Asp Pro Val Ile Leu Asn Val Leu
1 5
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<211>10
<212>PRT
<213>人
<400>211
Ser Asp Pro Val Ile Leu Asn Val Leu Tyr
1 5 10
<210>212
<211>8
<212>PRT
<213>人
<400>212
Asp Pro Val Ile Leu Asn Val Leu
1 5
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<211>9
<212>PRT
<213>人
<400>213
Asp Pro Val Ile Leu Asn Val Leu Tyr
1 5
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<211>10
<212>PRT
<213>人
<400>214
Ile Leu Asn Val Leu Tyr Gly Pro Asp Asp
1 5 10
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<211>10
<212>PRT
<213>人
<400>215
Val Leu Tyr Gly Pro Asp Asp Pro Thr Ile
1 5 10
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<211>9
<212>PRT
<213>人
<400>216
Leu Tyr Gly Pro Asp Asp Pro Thr Ile
1 5
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<211>8
<212>PRT
<213>人
<400>217
Tyr Gly Pro Asp Asp Pro Thr Ile
1 5
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<212>PRT
<213>人
<400>218
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<211>10
<212>PRT
<213>人
<400>219
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1 5 10
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<211>9
<212>PRT
<213>人
<400>220
Thr Ile Ser Pro Ser Tyr Thr Tyr Tyr
1 5
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<211>10
<212>PRT
<213>人
<400>221
Pro Thr Ile Ser Pro Ser Tyr Thr Tyr Tyr
1 5 10
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<211>9
<212>PRT
<213>人
<400>222
Thr Ile Ser Pro Ser Tyr Thr Tyr Tyr
1 5
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<211>10
<212>PRT
<213>人
<400>223
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1 5 10
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<211>10
<212>PRT
<213>人
<400>224
Tyr Thr Tyr Tyr Arg Pro Gly Val Asn Leu
1 5 10
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<213>人
<400>225
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1 5
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<211>8
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<213>人
<400>226
Tyr Tyr Arg Pro Gly Val Asn Leu
1 5
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<211>10
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<400>228
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<400>229
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1 5 10
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<213>人
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<213>人
<400>232
Val Asn Leu Ser Leu Ser Cys His Ala Ala
1 5 10
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Ala Ala Ser Asn Pro Pro Ala Gln Tyr
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<213>人
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Glu Met Arg Ser His Tyr Val Ala Gln Thr
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<211>10
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<213>人
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Val Ala Gln Thr Gly Ile Leu Trp Leu Leu
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<211>9
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<400>303
Gln Thr Gly Ile Leu Trp Leu Leu Met
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<211>9
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<400>304
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Val Ala Gln Thr Gly Ile Leu Trp Leu Leu
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<211>9
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<213>人
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Val Ala Gln Thr Gly Ile Leu Trp Leu
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Tyr Val Ala Gln Thr Gly Ile Leu Trp Leu
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<211>9
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<211>9
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<211>10
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Ala Ser Ala Phe Pro Thr Thr Ile Asn Phe
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<211>9
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Gly Ala Ser Ala Phe Pro Thr Thr Ile
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<211>10
<212>PRT
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Ser Pro Gln Gly Ala Ser Ala Phe Pro Thr
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<211>8
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<213>人
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Phe Gly Lys Ala Ser Glu Ser Leu
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<211>9
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<213>人
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Ile Phe Gly Lys Ala Ser Glu Ser Leu
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<211>10
<212>PRT
<213>人
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Glu Ile Phe Gly Lys Ala Ser Glu Ser Leu
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<211>8
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Glu Ile Phe Gly Lys Ala Ser Glu
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<211>8
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1 5
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<211>9
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<213>人
<400>318
Val Ile Lys Asn Tyr Lys His Cys Phe
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<211>10
<212>PRT
<213>人
<400>319
Ser Val Ile Lys Asn Tyr Lys His Cys Phe
1 5 10
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<400>320
Val Ile Lys Asn Tyr Lys His Cys
1 5
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<211>9
<212>PRT
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<400>321
Ser Val Ile Lys Asn Tyr Lys His Cys
1 5
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<211>9
<212>PRT
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<400>322
Met Leu Glu Ser Val Ile Lys Asn Tyr
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<211>10
<212>PRT
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<211>9
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<213>人
<400>324
Ala Glu Met Leu Glu Ser Val Ile Lys
1 5
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<211>10
<212>PRT
<213>人
<400>325
Gly Pro Arg Ala Leu Ile Glu Thr Ser Tyr
1 5 10
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<211>9
<212>PRT
<213>人
<400>326
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1 5
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<211>9
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<213>人
<400>327
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1 5
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<211>10
<212>PRT
<213>人
<400>328
Ala Leu Ile Glu Thr Ser Tyr Val Lys Val
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<211>9
<212>PRT
<213>人
<400>329
Leu Ile Glu Thr Ser Tyr Val Lys Val
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<211>10
<212>PRT
<213>人
<400>330
Leu Ile Glu Thr Ser Tyr Val Lys Val Leu
1 5 10
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<211>9
<212>PRT
<213>人
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<212>PRT
<213>人
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Glu Thr Ser Tyr Val Lys Val Leu His His
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<211>10
<212>PRT
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<213>人
<400>334
Tyr Val Lys Val Leu His His Thr Leu
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<211>9
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<213>人
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Lys Val Leu His His Thr Leu Lys Ile
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<213>人
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<213>人
<400>337
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<213>人
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<213>人
<400>339
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<213>人
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<213>人
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His Ile Ser Tyr Pro Pro Leu His Glu Arg
1 5 10
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<211>8
<212>PRT
<213>人
<400>342
Lys Ile Gly Gly Glu Pro His Ile
1 5
<210>343
<211>9
<212>PRT
<213>人
<400>343
Leu Lys Ile Gly Gly Glu Pro His Ile
1 5
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<211>10
<212>PRT
<213>人
<400>344
Thr Leu Lys Ile Gly Gly Glu Pro His Ile
1 5 10
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<213>人
<400>345
Pro Leu His Glu Trp Val Leu Arg Glu
1 5
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<211>8
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<213>人
<400>346
Pro Pro Leu His Glu Trp Val Leu
1 5
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<212>PRT
<213>人
<400>347
Tyr Pro Pro Leu His Glu Trp Val Leu
1 5
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<213>人
<400>348
Tyr Pro Pro Leu His Glu Trp Val
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<213>人
<400>349
Ser Tyr Pro Pro Leu His Glu Trp Val
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<211>10
<212>PRT
<213>人
<400>350
Ile Ser Tyr Pro Pro Leu His Glu Trp Val
1 5 10
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<212>PRT
<213>人
<400>351
His Ile Ser Tyr Pro Pro Leu His Glu Trp
1 5 10
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<213>人
<400>352
Ile Ser Gly Gly Pro His Ile Ser Tyr
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<212>PRT
<213>人
<400>353
Lys Ile Ser Gly Gly Pro His Ile Ser Tyr
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<212>PRT
<213>人
<400>354
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<213>人
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<213>人
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<400>610
Arg Leu Glu Pro Glu Asp Gly Thr Ala Leu
1 5 10
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PCV3抗原表位的多肽序列筛选方法 | 2020-05-12 | 839 |
序列特异性检测和表型确定 | 2020-05-12 | 660 |
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一种抑制bak基因表达的siRNA序列 | 2020-05-13 | 451 |
增强表达的内含子序列 | 2020-05-11 | 435 |
增强表达的内含子序列 | 2020-05-11 | 563 |
表位序列 | 2020-05-11 | 517 |
表达调控序列 | 2020-05-11 | 652 |
时间序列数据的多表示存储 | 2020-05-12 | 755 |
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