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一种基于多种信号放大技术检测溶菌酶的QCM检测方法及应用

阅读:1011发布:2020-05-29

专利汇可以提供一种基于多种信号放大技术检测溶菌酶的QCM检测方法及应用专利检索,专利查询,专利分析的服务。并且本 发明 公开一种基于多种 信号 放大技术检测溶菌酶的QCM检测方法及应用,DNA与溶菌酶适体部分互补杂交,通过溶菌酶与适体的特异性结合反应,将DNA释放出来。释放的DNA与金片上修饰的发卡DNA和助理DNA互补杂交形成“Y”型结构,在限制性内切酶的作用下,通过特异性识别位点剪切打开发卡DNA,在DNA连接酶和DNA聚合酶的作用下,以 锁 扣环状DNA为模板链,沿被打开的发卡DNA聚合生长,形成一条具有大量重复序列的单链。标记有 生物 素的信号探针与生成的重复序列杂交互补,并与HRP标记的链酶亲和素结合后催化过 氧 化氢氧化4-氯 萘 酚发生沉淀反应,从而增加了芯片表面 质量 ,实现了QCM对溶菌酶的高灵敏度检测。,下面是一种基于多种信号放大技术检测溶菌酶的QCM检测方法及应用专利的具体信息内容。

1.一种基于多种信号放大技术检测溶菌酶的QCM检测方法,其特征是,该检测方法包括:将连接有磁珠载体的溶菌酶适体与主DNA部分互补杂交,通过溶菌酶与溶菌酶适体的特异性结合反应,将主DNA释放出来;主DNA与助理DNA和连接有金片的发卡DNA互补杂交形成Y型结构;在限制性核酸内切酶作用下,通过特异性识别位点剪切打开发卡DNA,并游离出完整的主DNA循环使用,完整的主DNA与其他发卡DNA和助理DNA形成模板增强杂交;在DNA连接酶和DNA聚合酶的作用下,以扣环状DNA为模板链,沿被打开的发卡DNA聚合生长,形成一条具有若干段重复序列的DNA单链;标记有生物素的信号探针与生成的DNA单链中的重复序列杂交互补,并与HRP标记的链酶亲和素结合后催化过化氢氧化4-氯酚发生沉淀反应,从而增加了金片表面质量,实现QCM对溶菌酶的检测;其中,
所述主DNA包括相互连接的第一段主DNA和第二段主DNA,所述第一段主DNA与部分溶菌酶适体序列互补杂交;
所述助理DNA包括相互连接的第一段助理DNA和第二段助理DNA,所述第二段助理DNA与部分第一段主DNA序列互补杂交;
所述发卡DNA中环状序列中包含限制性内切酶的特异性识别位点,部分环状序列能与第二段主DNA互补杂交,部分环状序列能与第一段助理DNA互补杂交,从而形成Y型结构。
2.如权利要求1所述的检测方法,其特征是,具体包括以下方法:
(1)磁珠的活化:
取咪唑盐酸缓冲液洗涤羧基修饰的磁珠,加入含有1-(3-二甲基丙基)-3-乙基二亚胺盐酸盐(EDC)的咪唑缓冲液中震荡;
(2)磁珠载体的修饰:
向活化好的磁珠加入溶菌酶适体进行反应;磁分离,洗涤,加入主DNA溶液进行反应;磁分离,洗涤,加入含有溶菌酶的待测样品溶液进行反应;磁分离,取上清液;
(3)金片修饰DNA:
将发卡DNA加入到金片上进行反应,洗涤,干燥,发卡DNA固定后,将金片进行钝化;加入助理DNA、步骤(2)中的上清液和限制性核酸内切酶进行反应,洗涤、干燥;
(4)滚环复制放大反应:
将DNA连接酶、连接酶缓冲液和锁扣环状DNA混合均匀加入到步骤(3)中处理得到的金片上进行反应,洗涤,干燥;然后将DNA聚合酶、聚合酶缓冲液、dNTPs和混合均匀后加入到金片上进行反应,洗涤,干燥;
(5)HRP修饰:
将生物素修饰的探针加入到步骤(4)中处理得到的金片进行反应,洗涤,干燥;然后加入链霉亲和素修饰的HRP进行反应;
(6)QCM检测:
向步骤(5)中处理得到的金片加入H2O2和四氯萘酚的混合液,通过石英晶体微天平实时检测频率变化值。
3.如权利要求2所述的检测方法,其特征是,步骤(1)中,加入含有EDC的咪唑缓冲液中反应时间为2h;
优选的,磁珠活化的具体步骤为:取咪唑盐酸缓冲液洗涤羧基修饰的磁珠若干次,加入
100μL含有EDC的咪唑缓冲液中,37℃下振荡2h;其中,所述咪唑盐酸缓冲液的浓度为0.1M,pH6.8。
4.如权利要求2所述的检测方法,其特征是,步骤(2)中,向活化好的磁珠加入溶菌酶适体后,反应16h;
加入主DNA溶液后反应时间为1h;
加入含有溶菌酶的待测样品溶液的反应时间为1h;
优选的,磁珠载体的修饰的具体步骤为:向活化好的磁珠加入溶菌酶适体,37℃下反应
16h;磁分离,Tris-HCl洗涤,加入主DNA溶液,温育1h;磁分离,Tris-HCl洗涤,再加入含有溶菌酶的待测样品溶液,37℃下振荡1h;磁分离,取上清液保存,备用。
5.如权利要求2所述的检测方法,其特征是,步骤(3)中,发卡DNA与金片结合的反应时间为16h;
加入助理DNA、步骤(2)中的上清液和限制性核酸内切酶进行反应的时间为1.5h;
具体步骤为:发卡DNA加入到金片上,37℃下静置16h,Tris-HCl和超纯水分别洗涤3次,氮气吹干;发卡DNA固定后,向金片上加入1%血清白蛋白钝化2h;加入助理DNA、步骤(2)中的上清液和限制性核酸内切酶,37℃下静置1.5h,Tris-HCl和超纯水分别洗涤若干次,氮气吹干。
6.如权利要求2所述的检测方法,其特征是,步骤(4)中,DNA连接酶和锁扣环状DNA反应时间为1h;
将DNA聚合酶、聚合酶缓冲液、dNTPs和水混合均匀后加入到金片上进行反应时间为2h;
具体步骤为:将DNA连接酶、连接酶缓冲液和锁扣探针混合均匀滴加在步骤(3)中处理得到的金片上,37℃下静置1h,Tris-HCl和超纯水分别洗涤3次,氮气吹干;将DNA聚合酶、聚合酶缓冲液、dNTPs和超纯水混合均匀后滴加到金片表面,37℃下静置2h,Tris-HCl和超纯水分别洗涤3次,氮气吹干。
7.如权利要求2所述的检测方法,其特征是,步骤(5)中,将生物素修饰的探针加入到步骤(4)中处理得到的金片进行反应时间为1h;
加入链霉亲和素修饰的HRP进行反应的时间为0.5h;
具体步骤为:将生物素修饰的探针滴加到金片表面,37℃下静置1h,Tris-HCl和超纯水分别洗涤3次,氮气吹干;之后加入链霉亲和素修饰的HRP,37℃下静置0.5h。
8.如权利要求1或2所述的检测方法,其特征是,所述溶菌酶适体序列为5’-TTTT ATC TAC GAA TTC ATC AGG GCT AAA GAG TGC AGA GTT ACT TAG-NH2-3’;
所述主DNA的序列为5’-ATG AAT TCG TAG ATC CGT TCG AC-3’;
所述助理DNA序列为5’-CCT CAG CAA AAT CTA CGA ATT CAT-3’;
所述发卡DNA序列为5’-SH-TTTTTT CTG TGT CCG TAT TTA GAG GGT CGA ACGGTG CTG AGG TAC GGA CAC AG-3’。
9.如权利要求1或2所述的检测方法,其特征是,所述锁扣环状DNA的序列为5’-PO4-GAC CCT CTA AAA CCC AAC CCG CCC TAC CCA AAA CCC AAC CCG CCC TAC CCA AAA CCC AAC CCG CCC TAC CCA AGC ACC GTT C-3’;
所述生物素修饰的探针序列为5’-biotin-TTTTTT CCC AAC CCG CCC TAC C-3’。
10.采用权利要求1~9中任一项所述的基于多种信号放大技术检测溶菌酶的QCM检测方法的检测试剂盒,其特征是,其包括:
连接有磁珠载体的溶菌酶适体、主DNA、助理DNA、连接有金片的发卡DNA、核酸内切酶;
滚环复制放大反应体系:包括用于滚环复制放大的锁扣环状DNA、DNA连接酶、DNA聚合酶和扩增原料dNTPs。

说明书全文

一种基于多种信号放大技术检测溶菌酶的QCM检测方法及

应用

技术领域

背景技术

[0002] 肿瘤是严重威胁人类生命和健康的恶性疾病之一。目前,临床诊断方法主要是依靠影像学检测肿瘤细胞的形态,分辨率低。肿瘤标志物作为肿瘤诊断的一项重要指标,其检测对疾病的早期诊断与治疗,且对预后有着十分重要的意义。已经发现的肿瘤标志物有100多种,但是癌症患者早期体内的肿瘤标志物数量一般非常少,常规的检测方法难以对其进行精确定量分析。因此,寻找可选择性肿瘤标志物的识别探针,建立灵敏度高、特异性好的肿瘤标志物新方法,对癌症的早期诊断及治疗具有非常重要的科学意义和临床价值。

发明内容

[0003] 为提高检测溶菌酶的灵敏度,本发明人之前提出一种技术方案,包括:利用适体与靶蛋白的特异性结合作用,将与适体杂交互补的DNA S1释放出来进一步与固定在电极表面的发卡探针结合,在限制性内切酶的作用下,通过特异性识别位点剪切释放引发链,同时将互补DNA S1释放出来形成循环放大,在T4连接酶和DNA聚合酶的作用下发生滚环复制放大反应,形成一条具有大量重复序列的单链,利用生物素标记信号探针将亲和素标记的HRP捕获到芯片表面,进而引发生物催化沉淀反应,增加芯片的质量,从而对蛋白质进行检测。
[0004] 然而经过发明人的分析,发现DNA S1与发卡DNA杂交,当限制性核酸内切酶存在时,在识别位点处剪切,打开发卡DNA,释放出被剪切的DNA S1片段,虽然能够与其他发卡DNA杂交,但没有限制性核酸内切酶的识别位点,从而不能被剪切,所以其循环反应性能不够优良,从而导致灵敏度较低。
[0005] 发明人发现此问题后,对之前的技术方案做了多种改进处理,然而在检测方法中采用“主DNA、助理DNA和发卡DNA互补杂交形成Y型结构”的技术方案,意外发现该检测方法对溶菌酶可检测到1.0×10-16mol/L,灵敏度比先前工作提高10倍,具有突出的有益效果。经发明人分析可得,这是由于形成Y型结构的增强杂交过程使得信号得到增强,从而提高检测灵敏性。
[0006] 本发明采用的技术方案具体如下:
[0007] 本发明的第一个目的是提供一种基于多种信号放大技术检测溶菌酶的QCM检测方法,该检测方法包括:将连接有磁珠载体的溶菌酶适体与主DNA部分互补杂交,通过溶菌酶与溶菌酶适体的特异性结合反应,将主DNA释放出来;主DNA与助理DNA和连接有金片的发卡DNA互补杂交形成Y型结构;在限制性核酸内切酶作用下,通过特异性识别位点剪切打开发卡DNA,并游离出完整的主DNA循环使用,完整的主DNA与其他发卡DNA和助理DNA形成模板增强杂交;在DNA连接酶和DNA聚合酶的作用下,以扣环状DNA为模板链,沿被打开的发卡DNA聚合生长,形成一条具有若干段重复序列的DNA单链;标记有生物素的信号探针与生成的DNA单链中的重复序列杂交互补,并与HRP标记的链酶亲和素结合后催化过化氢氧化4-氯酚发生沉淀反应,从而增加了金片表面质量,实现QCM对溶菌酶的高灵敏检测;其中,[0008] 所述主DNA包括相互连接的第一段主DNA和第二段主DNA,所述第一段主DNA与部分溶菌酶适体序列互补杂交;
[0009] 所述助理DNA包括相互连接的第一段助理DNA和第二段助理DNA,所述第二段助理DNA与部分第一段主DNA序列互补杂交;
[0010] 所述发卡DNA中环状序列中包含限制性内切酶的特异性识别位点,部分环状序列能与第二段主DNA互补杂交,部分环状序列能与第一段助理DNA互补杂交,从而形成Y型结构。
[0011] 所述方法为非疾病诊断与治疗方法。
[0012] 本发明的第二个目的是提供一种基于多种信号放大技术检测溶菌酶的QCM检测试剂盒,其包括:
[0013] 连接有磁珠载体的溶菌酶适体、主DNA、助理DNA、连接有金片的发卡DNA、核酸内切酶;
[0014] 滚环复制放大反应体系:包括用于滚环复制放大的锁扣环状DNA、DNA连接酶、DNA聚合酶和扩增原料dNTPs。
[0015] 与现有技术相比,本发明的技术方案具有如下有益效果:
[0016] (1)本发明提出一种利用多种信号放大技术高灵敏检测溶菌酶的QCM传感系统及检测方法,首先,本发明采用主DNA、助理DNA和发卡DNA互补杂交形成Y型结构,增强杂交过程使得信号得到增强;其次,本发明采用滚环复制放大反应得到具有大量重复序列的的DNA长链,进一步使得信号得到增强;再者,本发明将HRP通过生物素与亲和素的特异性结合修饰在DNA长链上;最后,经过一系列信号方法技术后采用QCM进行检测。
[0017] 本发明与之前的工作相比较,核心发明点是采用主DNA、助理DNA和发卡DNA互补杂交形成Y型结构,当限制性核酸内切酶存在时,在识别位点处剪切打开发卡DNA,并释放出完整的主DNA,增强杂交过程使得信号得到增强,从而使得检测灵敏度提高一个数量级。该方法对溶菌酶可检测到1.0×10-16mol/L,灵敏度比先前工作提高10倍。
[0018] (2)本发明所提出的检测方法操作简单、成本低廉,快速高效。附图说明
[0019] 构成本发明的一部分的说明书附图用来提供对本发明的进一步理解,本发明的示意性实施例及其说明用于解释本发明,并不构成对本发明的不当限定。
[0020] 图1是本发明设计过程原理图。
[0021] 图2是溶菌酶曲线图,左图为浓度梯度曲线图,a-f浓度分别为0、1.0×10-16mol/L、1.0×10-15mol/L、1.0×10-14mol/L、1.0×10-13mol/L、1.0×10-12mol/L;右图为工作曲线图。

具体实施方式

[0022] 应该指出,以下详细说明都是示例性的,旨在对本发明提供进一步的说明。除非另有指明,本文使用的所有技术和科学术语具有与本发明所属技术领域的普通技术人员通常理解的相同含义。
[0023] 需要注意的是,这里所使用的术语仅是为了描述具体实施方式,而非意图限制根据本发明的示例性实施方式。如在这里所使用的,除非上下文另外明确指出,否则单数形式也意图包括复数形式,此外,还应当理解的是,当在本说明书中使用术语“包含”和/或“包括”时,其指明存在特征、步骤、操作、器件、组件和/或它们的组合。
[0024] 术语解释:
[0025] QCM(quartz crystal microbalance),石英晶体微天平,它是是一种高精度的质-9量检测仪器,具有实时监测、精度高等优点,精度可达到10 克级别。
[0026] HRP,辣根过氧化物酶。
[0027] 正如背景技术所介绍的,现有技术中溶菌酶的检测存在一定的不足,为了解决如上的技术问题,本发明提出了一种基于多种信号放大技术检测溶菌酶的QCM检测方法,该检测方法为非疾病诊断与治疗方法,在非疾病诊断和治疗上,通过检测溶菌酶的活性,可以发现相关的抗癌药物,以及进行对相关抗癌药物的筛选研究。
[0028] 该检测方法包括:将连接有磁珠载体的溶菌酶适体与主DNA部分互补杂交,通过溶菌酶与溶菌酶适体的特异性结合反应,将主DNA释放出来,并和助理DNA与连接有金片的发卡DNA相互杂交形成Y型结构;当限制性核酸内切酶存在时,在识别位点处剪切打开发卡DNA,并游离出完整的主DNA循环使用,完整的主DNA与其他发卡DNA和助理DNA形成模板增强杂交;在DNA连接酶和DNA聚合酶的作用下,被打开的发卡DNA以锁扣环状DNA为模板聚合生长,形成一条具有若干段重复序列的DNA单链;标记有生物素的信号探针与生成的DNA单链中的重复序列杂交互补,并与HRP标记的链酶亲和素结合后催化过氧化氢氧化4-氯萘酚发生沉淀反应,从而增加了金片表面质量,实现QCM对溶菌酶的高灵敏检测;其中,[0029] 所述主DNA包括相互连接的第一段主DNA和第二段主DNA,所述第一段主DNA与溶菌酶适体互补杂交;
[0030] 所述助理DNA包括相互连接的第一段助理DNA和第二段助理DNA,所述第二段助理DNA与部分第二段主DNA序列互补杂交;
[0031] 所述发卡DNA中环状序列中包含限制性内切酶的特异性识别位点,部分环状序列能与第二段主DNA互补杂交,部分环状序列能与第一段助理DNA互补杂交,从而形成Y型结构。
[0032] 该检测方法具体包括以下步骤:
[0033] (1)磁珠的活化:
[0034] 取咪唑盐酸缓冲液洗涤羧基修饰的磁珠,加入含有1-(3-二甲基丙基)-3-乙基二亚胺盐酸盐(EDC)的咪唑缓冲液中震荡。
[0035] (2)磁珠载体的修饰:
[0036] 向活化好的磁珠加入溶菌酶适体进行反应;磁分离,洗涤,加入主DNA溶液进行反应;磁分离,洗涤,加入含有溶菌酶的待测样品溶液进行反应;磁分离,取上清液;
[0037] (3)金片修饰DNA:
[0038] 将发卡DNA加入到金片上进行反应,洗涤,干燥,发卡DNA固定后,将金片进行钝化;加入助理DNA、步骤(2)中的上清液和限制性核酸内切酶进行反应,洗涤、干燥;
[0039] (4)滚环复制放大反应:
[0040] 将DNA连接酶、连接酶缓冲液和锁扣环状DNA混合均匀加入到步骤(3)中处理得到的金片上进行反应,洗涤,干燥;然后将DNA聚合酶、聚合酶缓冲液、dNTPs和混合均匀后加入到金片上进行反应,洗涤,干燥;
[0041] (5)HRP修饰:
[0042] 将生物素修饰的探针加入到步骤(4)中处理得到的金片进行反应,洗涤,干燥;然后加入链霉亲和素修饰的HRP进行反应;
[0043] (6)QCM检测:
[0044] 向步骤(5)中处理得到的金片加入H2O2和四氯萘酚的混合液,通过石英晶体微天平实时检测频率变化值。
[0045] 以下是对上述步骤的具体阐述:
[0046] 步骤(1)中,加入含有EDC的咪唑缓冲液中反应时间为2h。
[0047] 为了更好的活化磁珠,便于后续的磁珠载体的修饰,磁珠活化的具体步骤为:取咪唑盐酸缓冲液洗涤羧基修饰的磁珠若干次,加入100μL含有EDC(0.2M)的咪唑缓冲液中,37℃下振荡2h。其中,所述咪唑盐酸缓冲液的浓度为0.1M,pH6.8。
[0048] 步骤(2)中,向活化好的磁珠加入溶菌酶适体后,反应16h。
[0049] 加入主DNA溶液后反应时间为1h。
[0050] 加入含有溶菌酶的待测样品溶液的反应时间为1h。
[0051] 为了更好的将溶菌酶适体修饰磁珠载体,磁珠载体的修饰的具体步骤为:向活化好的磁珠加入溶菌酶适体,37℃下反应16h;磁分离,Tris-HCl洗涤,加入主DNA溶液,温育1h;磁分离,Tris-HCl洗涤,再加入含有溶菌酶的待测样品溶液,37℃下振荡1h;磁分离,取上清液保存,备用。
[0052] 步骤(3)中,发卡DNA与金片结合的反应时间为16h。
[0053] 加入助理DNA、步骤(2)中的上清液和限制性核酸内切酶进行反应的时间为1.5h。
[0054] 具体步骤为:发卡DNA加入到金片上,37℃下静置16h,Tris-HCl和超纯水分别洗涤3次,氮气吹干;发卡DNA固定后,向金片上加入1%血清白蛋白(BSA,w/w)钝化2h;加入助理DNA、步骤(2)中的上清液和限制性核酸内切酶,37℃下静置1.5h,Tris-HCl和超纯水分别洗涤若干次,氮气吹干。
[0055] 步骤(4)中,DNA连接酶和锁扣环状DNA反应时间为1h。
[0056] 将DNA聚合酶、聚合酶缓冲液、dNTPs和水混合均匀后加入到金片上进行反应时间为2h。
[0057] 为了更好的进行滚环复制放大反应,使得信号得到增强,具体步骤为:将DNA连接酶、连接酶缓冲液和锁扣探针混合均匀滴加在步骤(3)中处理得到的金片上,37℃下静置1h,Tris-HCl和超纯水分别洗涤3次,氮气吹干;将DNA聚合酶、聚合酶缓冲液、dNTPs和超纯水混合均匀后滴加到金片表面,37℃下静置2h,Tris-HCl和超纯水分别洗涤3次,氮气吹干。
[0058] 步骤(5)中,将生物素修饰的探针加入到步骤(4)中处理得到的金片进行反应时间为1h。
[0059] 加入链霉亲和素修饰的HRP进行反应的时间为0.5h。
[0060] 为了更好的实现QCM检测,具体步骤为:将生物素修饰的探针滴加到金片表面,37℃下静置1h,Tris-HCl和超纯水分别洗涤3次,氮气吹干;之后加入链霉亲和素修饰的HRP,37℃下静置0.5h。
[0061] 所述的HRP通过生物素与亲和素的特异性结合修饰在DNA单链上。
[0062] 在本发明中,溶菌酶适体序列并没有特别限定,可为现有技术中的多种溶菌酶适体,在本发明优选的技术方案中,溶菌酶适体序列为5’-TTTT ATC TAC GAA TTC ATC AGG GCT AAA GAG TGC AGA GTT ACT TAG-NH2-3’,如SEQID NO:1所示。
[0063] 在本发明中,主DNA的序列并没有特别限定,只要能与溶菌酶适体部分互补杂交即可。在本发明优选的技术方案中,主DNA的序列为5’-ATG AAT TCG TAG ATC CGT TCG AC-3’,如SEQID NO:2所示。该主DNA包括相互连接的第一段主DNA(如单划线所示的序列)和第二段主DNA(如双划线所示序列),所述第一段主DNA与部分溶菌酶适体序列(如单划线所示的序列)互补杂交;
[0064] 在本发明中,助理DNA的序列并没有特别限定,只要是能与上述的主DNA、发卡DNA形成Y型结构即可。在本发明优选的技术方案中,助理DNA序列为5’-CCT CAG CAA AAT CTA CGA ATT CAT-3’,如SEQID NO:3所示。所述助理DNA包括相互连接的第一段助理DNA(如双划线所示序列)和第二段助理DNA(如单划线所示序列),所述第二段助理DNA与第一段主DNA序列互补杂交(也就是与部分溶菌酶适体序列相同,如溶菌酶适体中单划线所示的序列)。
[0065] 在本发明中,发卡DNA也就是DNA茎环结构,常规的茎环结构的设计是本领域技术人员公知的,其包括茎部和环部,茎部通常是由若干个互补的基对构成的杂交双链DNA序列,环部通常是由寡聚核酸形成的单链序列。本领域的技术人员应当知晓构成茎环结构中的茎部的常规序列,只要能够满足成茎即可。本发明的发卡DNA中的环状序列中包含限制性核酸内切酶的特异性识别位点(斜体并且是粗体所示序列 ),部分环状序列(粗体所示的序列)能与第二段主DNA互补杂交,部分环状序列(斜体所示序列)能与第一段助理DNA互补杂交,在本发明优选的技术方案中,发卡DNA的序列为如SEQID NO:4所示。茎部的杂交互补序列如单划线所示。环部的序列为双划线所示。
[0066] 在本发明中,锁扣环状DNA也称锁扣探针、锁式探针或挂锁探针,一种人工合成的低聚核苷酸链分子大约有70-100个碱基,形成环型分子后的锁扣探针可作为一种特定的信号源被滚环复制方法反应法来快速放大与检测,本发明设计的锁扣探针满足形成环型分子即可,其序列并没有特别的限定,只要能够引发被打开的发卡DNA进行滚环复制反应即可。在本发明优选的技术方案中,锁扣环状DNA的序列为5’-PO4-GAC CCT CTA AAA CCC AAC CCG CCC TAC CCA AAA CCC AAC CCG CCC TAC CCA AAA CCC AAC CCG CCC TAC CCA AGC ACC GTT C-3’,如SEQID NO:5所示。
[0067] 在本发明中,生物素修饰的信号探针中探针序列并没有特别的限定,设计的原则是:只要能够与DNA单链上重复序列部分杂交互补即可。在本发明优选的技术方案中,生物素修饰的探针序列为5’-biotin-TTTTTT CCC AAC CCG CCC TAC C-3’,如SEQID NO:6所示。
[0068] 本发明还提供一种基于多种信号放大技术检测溶菌酶的QCM检测试剂盒,其包括:
[0069] 连接有磁珠载体的溶菌酶适体、主DNA、助理DNA、连接有金片的发卡DNA、核酸内切酶;
[0070] 滚环复制放大反应体系:包括用于滚环复制放大的锁扣环状DNA、DNA连接酶、DNA聚合酶和扩增原料dNTPs。
[0071] 为了使得本领域技术人员能够更加清楚地了解本发明的技术方案,以下将结合具体的实施例详细说明本发明的技术方案。
[0072] 实施例1
[0073] 基于多种信号放大技术的超灵敏检测溶菌酶
[0074] 一、磁珠载体的修饰
[0075] (1)活化磁珠
[0076] 咪唑盐酸缓冲液(0.1M,pH 6.8)洗涤磁珠三次,加入100μL含有0.2mol/LEDC的咪唑缓冲液中,37℃下振荡2h。
[0077] (2)磁珠载体修饰
[0078] 向活化好的磁珠中加入15μL浓度为1.0×10-7mol/L溶菌酶适体DNA,37℃下摇床16h。磁分离去除未连接在磁珠上的DNA,Tris-HCl洗涤,加入主DNA溶液,温育1h。磁分离,-15 -14 -13
Tris-HCl洗涤,再加入30μL不同浓度(1.0×10 mol/L、1.0×10 mol/L、1.0×10 mol/L、
1.0×10-12mol/L、1.0×10-11mol/L)的溶菌酶,37℃孵育1h,磁分离,取上清液保存,备用。
[0079] 二、金片修饰DNA
[0080] 将30μL1.0×10-7mol/L发卡DNA滴加到金片上,恒温孵育16h,Tris-HCl缓冲液和超-7纯水分别洗涤3次,氮气吹干。向金片上加入1%BSA钝化2h,之后加入15μL1.0×10 mol/L助理DNA、磁分离后的上清液和1μL10U/μL限制性核酸内切酶Nb.BbvCI,恒温孵育1.5h,Tris-HCl缓冲液和超纯水分别洗涤3次,氮气吹干。1μL5U/μLT4连接酶、2.5μL T4buffer和21.5μL1.0×10-7mol/L锁扣探针混合均匀滴加在金片上,恒温孵育1h,Tris-HCl缓冲液和超纯水分别洗涤3次,氮气吹干。将1μL 0.2U/μL phi 29聚合酶、2.5μLphi29buffer、2μL10mmol/LdNTPs和19μL超纯水混合滴加到金片表面,恒温孵育2h,Tris-HCl缓冲液和超纯水分别洗涤3次,氮气吹干。30μL1.0×10-7mol/L生物素修饰探针滴加到金片表面,恒温孵育1h,Tris-HCl缓冲液和超纯水分别洗涤3次,氮气吹干。之后加入30μL链霉亲和素修饰的HRP,恒温孵育0.5h,Tris-HCl缓冲液和超纯水分别洗涤3次,氮气吹干。
[0081] 三、QCM检测
[0082] 向金片通入500μL 1mmol/LH2O2和1mmol/L四氯萘酚的混合液,检测其频率变化值。
[0083] 检测结果如下:溶菌酶的检测信号在-209Hz~-81Hz,检测范围大约为1.0×10-16mol/L~1.0×10-12mol/L。
[0084] 上述实施例为本发明较佳的实施方式,但本发明的实施方式并不受上述实施例的限制,其他的任何未背离本发明的精神实质与原理下所作的改变、修饰、替代、组合、简化,均应为等效的置换方式,都包含在本发明的保护范围之内。
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