技术领域
[0001] 本
发明属于分子
生物学领域,涉及一种采用分子生物学手段鉴定中药的方法,具体为一种用于鉴定中药当归的引物对及其应用。
背景技术
[0002] 当归为伞形科当归属
植物当归的干燥根,性温,味甘、辛。有和血之效,具有补血、活血、调经止痛、润燥滑肠的功能。由于临床上对当归的使用较多,使得当归需求量极大,因此,市场上当归的混伪品层出不穷。市场上常见的当归混伪品有欧当归、日本当归、阿坝当归、重齿毛当归等,这些植物在根茎形态上与正品当归十分类似,但在药效方面相差甚远,严重影响用药安全。
[0003] 目前市售药材多为加工品,当归与其混伪品的表面性状、
纤维特征甚至化学成分都及其相似,在实际应用中药进行准确
鉴别难度极大,且存在主观性大,通用性差,且对观察者经验要求高等
缺陷,不利于标准化、规范化方法的建立及普及。DNA分子遗传标记具有快速、微量、准确且特异性强等特征,为解决药材的鉴别问题提供了客观而有效的手段。前人对当归的分子鉴别主要采用nrDNA-ITS序列。
[0004]
现有技术中对于当归鉴定多是基于当归的核基因
片段或叶绿体基因片段。其中叶绿体基因片段多为单拷贝,在大多数被子植物中是母系遗传,与核基因序列相比,不受网状进化的影响。但是在中药材鉴别中,通常用到药材加工品或饮片,其基因组DNA已遭到不同程度的破坏,而叶绿体基因组则相对于核基因组易于保留,其基因片段更容易扩增。
发明内容
[0005] 本发明的目的是:为了克服现有技术的缺陷,获得一种
稳定性好,能够以痕迹量或
破碎片段为检材的引物对,本发明提供了一种用于鉴定中药当归的引物对及其应用。
[0006] 技术方案:一种用于鉴定中药当归的引物对,所述引物对及其序列为:P1,SEQ ID NO.1~2;P2,SEQ ID NO.3~4;P3,SEQ ID NO.5~6。
[0007] 优选的,所述引物对P1、P2和P3的上游引物的5’端加上特异性的GC发卡结构,所述发卡结构的长度为40bp,序列为SEQ ID NO.7。
[0008] 表1引物对及发卡结构序列
[0009]名称 序列(5’-3’) SEQ ID NO.
P1-F GCATGCGATACTTGGTGTGAAT 1
P1-R CGACGCTTCTCCAGACTACAAT 2
P2-F GGCGAAATCGGTAGACGCTACG 3
P2-R GGATTTGAACTGGTGACACGAG 4
P3-F GGCAAAGAGGGAAGATTTCG 5
P3-R GCCATAAGCATATCTTGAGTTG 6
发卡结构 CGCCCGCCGCGCGCGGCGGGCGGGGCGGGGGCACGGGGGG 7
[0010] 所述引物对在制备鉴定中药当归
试剂盒中的应用。
[0011] 优选的,所述试剂盒的组分包括:引物对、dNTP、DNA聚合酶、LC Green、反应缓冲液。
[0012] 优选的,所述试剂盒鉴定中药当归的步骤包括:
[0013] (1)提取当归样品的基因组DNA;
[0014] (2)以步骤(1)提取的基因组DNA为模板,以P1为特异性引物,进行第一轮PCR扩增;
[0015] (3)取步骤(2)的扩增产物,稀释20~200倍后作为第二轮PCR的模板,以P2作为特异性引物,进行第二轮PCR扩增;
[0016] (4)取第二轮PCR扩增的产物,稀释10~100倍后作为第三轮PCR的模板,以P3作为特异性引物,进行第三轮PCR扩增;
[0017] (5)收集第三轮PCR扩增的产物,并采用琼脂糖凝胶
电泳检测。
[0018] 优选的,所述当归样品的基因组DNA的提取方法是试剂盒法或改良CTAB法。
[0019] 优选的,所述PCR扩增的程序为:95℃,2min;95℃,30s,52℃,30s,72℃,55s,35个循环;72℃,7min。
[0020] 有益效果:(1)本发明所述引物对稳定性好,能够以痕迹量或破碎片段为检材;(2)本发明所述引物对特异性好,灵敏度高。
附图说明
[0021] 图1是
实施例1~3PCR鉴定结果电泳图;
[0022] 其中M为分子量为2000的Maker;1为实施例1PCR产物鉴定结果;2为实施例2PCR产物鉴定结果;3为实施例3PCR产物鉴定结果。
具体实施方式
[0023] 实施例1
[0024] 一种用于鉴定中药当归的引物对,所述引物对及其序列为:P1,SEQ ID NO.1~2;P2,SEQ ID NO.3~4;P3,SEQ ID NO.5~6。
[0025] 所述引物对P1、P2和P3的上游引物的5’端加上特异性的GC发卡结构,所述发卡结构的长度为40bp,序列为SEQ ID NO.7。
[0026] 所述引物对在制备鉴定中药当归试剂盒中的应用。
[0027] 所述试剂盒的组分包括:引物对、dNTP、DNA聚合酶、LC Green、反应缓冲液。
[0028] 所述试剂盒鉴定中药当归的步骤包括:
[0029] (1)提取当归样品的基因组DNA;
[0030] (2)以步骤(1)提取的基因组DNA为模板,以P1为特异性引物,进行第一轮PCR扩增;
[0031] (3)取步骤(2)的扩增产物,稀释20倍后作为第二轮PCR的模板,以P2作为特异性引物,进行第二轮PCR扩增;
[0032] (4)取第二轮PCR扩增的产物,稀释100倍后作为第三轮PCR的模板,以P3作为特异性引物,进行第三轮PCR扩增;
[0033] (5)收集第三轮PCR扩增的产物,并采用琼脂糖凝胶电泳检测。
[0034] 所述当归样品的基因组DNA的提取方法是试剂盒法或改良CTAB法。
[0035] 所述PCR扩增的程序为:95℃,2min;95℃,30s,52℃,30s,72℃,55s,35个循环;72℃,7min。
[0036] 实施例2
[0037] 一种用于鉴定中药当归的引物对,所述引物对及其序列为:P1,SEQ ID NO.1~2;P2,SEQ ID NO.3~4;P3,SEQ ID NO.5~6。
[0038] 所述引物对P1、P2和P3的上游引物的5,端加上特异性的GC发卡结构,所述发卡结构的长度为40bp,序列为SEQ ID NO.7。
[0039] 所述引物对在制备鉴定中药当归试剂盒中的应用。
[0040] 所述试剂盒的组分包括:引物对、dNTP、DNA聚合酶、LC Green、反应缓冲液。
[0041] 所述试剂盒鉴定中药当归的步骤包括:
[0042] (1)提取当归样品的基因组DNA;
[0043] (2)以步骤(1)提取的基因组DNA为模板,以P1为特异性引物,进行第一轮PCR扩增;
[0044] (3)取步骤(2)的扩增产物,稀释200倍后作为第二轮PCR的模板,以P2作为特异性引物,进行第二轮PCR扩增;
[0045] (4)取第二轮PCR扩增的产物,稀释10倍后作为第三轮PCR的模板,以P3作为特异性引物,进行第三轮PCR扩增;
[0046] (5)收集第三轮PCR扩增的产物,并采用琼脂糖凝胶电泳检测。
[0047] 所述当归样品的基因组DNA的提取方法是试剂盒法或改良CTAB法。
[0048] 所述PCR扩增的程序为:95℃,2min;95℃,30s,52℃,30s,72℃,55s,35个循环;72℃,7min。
[0049] 实施例3
[0050] 一种用于鉴定中药当归的引物对,所述引物对及其序列为:P1,SEQ ID NO.1~2;P2,SEQ ID NO.3~4;P3,SEQ ID NO.5~6。
[0051] 所述引物对P1、P2和P3的上游引物的5’端加上特异性的GC发卡结构,所述发卡结构的长度为40bp,序列为SEQ ID NO.7。
[0052] 所述引物对在制备鉴定中药当归试剂盒中的应用。
[0053] 所述试剂盒的组分包括:引物对、dNTP、DNA聚合酶、LC Green、反应缓冲液。
[0054] 所述试剂盒鉴定中药当归的步骤包括:
[0055] (1)提取当归样品的基因组DNA;
[0056] (2)以步骤(1)提取的基因组DNA为模板,以P1为特异性引物,进行第一轮PCR扩增;
[0057] (3)取步骤(2)的扩增产物,稀释180倍后作为第二轮PCR的模板,以P2作为特异性引物,进行第二轮PCR扩增;
[0058] (4)取第二轮PCR扩增的产物,稀释30倍后作为第三轮PCR的模板,以P3作为特异性引物,进行第三轮PCR扩增;
[0059] (5)收集第三轮PCR扩增的产物,并采用琼脂糖凝胶电泳检测。
[0060] 所述当归样品的基因组DNA的提取方法是试剂盒法或改良CTAB法。
[0061] 所述PCR扩增的程序为:95℃,2min;95℃,30s,52℃,30s,72℃,55s,35个循环;72℃,7min。
[0062] 如图1所示,将实施例1~3的扩增产物进行电泳检测,条带清晰可见,产物单一。