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序号 专利名 申请号 申请日 公开(公告)号 公开(公告)日 发明人
121 检测HLA杂合性缺失的方法及系统 CN202010302140.X 2020-04-16 CN112885406B 2023-01-31 朱嘉麒; 聂新华; 李艳
发明提供一种检测HLA杂合性缺失的方法及系统,该方法包括:数据获取:获取肿瘤样本和对照样本的测序数据;HLA分型检测:检测肿瘤样本、对照样本的HLA分子类型;HLA等位基因不平衡检测:将测序数据与HLA分型结果比对,获得HLA等位基因不平衡检测结果;拷贝数变异检测:对所有目标区域进行拷贝数变异检测,获得HLA基因座的拷贝数变异检测结果;HLA杂合性缺失判断:根据HLA等位基因不平衡检测结果、拷贝数变异检测结果,判断是否为HLA杂合性缺失。本发明不只单独使用HLA基因上的序列信息,还结合HLA基因附近的序列信息,得到准确的HLA LOH结果。
122 SNP位点在评估基因组异常的应用及评估基因组异常的方法 CN202210903055.8 2022-07-29 CN114990202B 2022-09-30 季序我; 李哲; 朱晓茹; 吕然
发明公开了SNP位点在评估基因组异常中的应用及评估基因组异常的方法。SNP位点为在染色体上接近均匀分布的双等位基因高多态性位点,各个SNP位点的群体最小等位基因频率均分布于0.05‑0.5之间;各个SNP位点在基因组上的密度为16.5个/百万基因组基;以各个SNP位点为中心的250‑350个核苷酸的GC含量为40‑60%;且各个SNP位点符合哈迪‑温伯格平衡定律,同时满足群体分化系数低于0.05。采用本发明提供的技术方案得到的基因组异常评估结果具有更高的精度,能发现更多更全面的基因组异常情况,能处理染色体结构不变的基因组异常情况,更适用于中国人群,更加准确。
123 一种基于全基因组重测序的甘蓝型油菜蜡粉基因定位方法 CN202010517170.2 2020-06-09 CN111575399A 2020-08-25 张俊英; 朱吉风; 周熙荣; 杨立勇; 江建霞; 蒋美艳; 李延莉; 王伟荣; 孙超才
发明提供了一种基于全基因组重测序的甘蓝型油菜蜡粉基因定位方法,属于生物信息技术领域。本发明以分离群体为基础,建立近等基因系。采用混合分组分析,选近等基因系中3:1分离群体中的无蜡粉植株和全部有蜡粉表型不分离群体以及3个亲本,共建5个DNA池用于基因组重测序。利用重测序数据进行遗传关联性分析,将控制蜡粉性状的位点定位在A08染色体的590663~1657546bp区域内。本发明的方法最大的特点是不需要检测所有子代个体,而是将两种极端性状的子代进行混池分析。并且,本发明的方法测序数据充足、质量合格,能够用于下一步分析。
124 体细胞单倍体人类细胞系 CN201480065108.7 2014-11-28 CN106103699B 2019-11-26 蒂尔曼·布尔克斯图默尔
发明提供了一种例如通过靶向缺失体细胞近单倍体人类亲本细胞的一个或多个二体染色体区域可获得的体细胞完全单倍体、核型稳定的人类细胞系,一种产生该体细胞完全单倍体、核型稳定的人类细胞系的方法,以及该细胞系用于产生包含不同基因组靶位点处的基因组突变的等基因细胞变体的用途,以及一个此类细胞变体的文库。
125 基因性雄性不育玉米 CN86104756 1986-07-18 CN86104756A 1987-02-04 盖迪·S·布拉; 奥利弗; 纳尔逊
发明揭示了创造和利用遗传性雄不育玉米进行杂交玉米生产的方法。这个方法用Spm移位因子系统并涉及创造一变异的雄能育等位基因,变异是由于Spm抑制受体基因的存在,在Spm抑剂基因存在的情况下,其表达为受抑制。此外,本发明揭示了转移这个系统到任何一个近交系中以用于杂交种子生产的方法。
126 SNP位点在评估基因组异常的应用及评估基因组异常的方法 CN202210903055.8 2022-07-29 CN114990202A 2022-09-02 季序我; 李哲; 朱晓茹; 吕然
发明公开了SNP位点在评估基因组异常中的应用及评估基因组异常的方法。SNP位点为在染色体上接近均匀分布的双等位基因高多态性位点,各个SNP位点的群体最小等位基因频率均分布于0.05‑0.5之间;各个SNP位点在基因组上的密度为16.5个/百万基因组基;以各个SNP位点为中心的250‑350个核苷酸的GC含量为40‑60%;且各个SNP位点符合哈迪‑温伯格平衡定律,同时满足群体分化系数低于0.05。采用本发明提供的技术方案得到的基因组异常评估结果具有更高的精度,能发现更多更全面的基因组异常情况,能处理染色体结构不变的基因组异常情况,更适用于中国人群,更加准确。
127 高赖酸玉米育种材料创制方法 CN202011019654.0 2020-09-24 CN112167051A 2021-01-05 岳润清; 铁双贵; 刘璐; 徐心志
发明公开了一种高赖酸玉种材料创制方法,旨在解决现有技术中优质高赖氨酸玉米育种材料缺乏的技术问题。本发明以玉米材料供体CA042作为o2基因的供体亲本,玉米自交系郑C09作为受体亲本,先回交数代后进行自交多代,得到近等基因系C09/o2;选择经过鉴定为O2o2杂合基因型的材料继续与轮回亲本进行回交,自交后选择基因型为o2o2纯合材料。本发明用SSR标记umc1066辅助选择与田间回交相结合的手段,经多轮回交和自交得到基因型与高赖氨酸供体亲本一样双隐性纯合体的近等基因系C09/o2材料,其平均赖氨酸含量比郑C09作为受体亲本提高了增加了55.6%~70.4%,可为优良籽粒蛋白品质玉米品种的选育提供丰富的材料基础,大大提高了育种效率和目的基因引入的准确性。
128 一种用于MK-n生产的乳酸乳球菌及其构建方法与应用 CN202310859660.4 2023-07-13 CN117603891A 2024-02-27 王鹏; 沐璟玮; 程诚; 罗旭; 王丽; 赵根海; 王晗
一种用于MK‑n生产的乳酸乳球菌及其构建方法与应用,乳酸乳球菌乳脂亚种MG1363含有来自枯草芽孢杆菌BS168导入的表达甲基醌主环合成途径相关的Men系列基因以及来自嗜热地衣芽孢杆菌的聚异戊二烯途径上合成类异戊二烯侧链相关基因;1、所述甲基萘醌主环途径相关基因包括MenA、MenF等基因;所述聚异戊二烯途径上相关基因包括ispA、fni基因等;2、所述发酵培养基,通过外源添加2.5μg/mL的血红素以及优化氮源,使生物量提高近1.5倍。本发明构建的乳酸乳球菌及优化的发酵培养条件能够较高且稳定产生MK‑n,约0.8mg/g,具有潜在的应用前景。
129 Ghd7基因在调控稻剑叶叶绿素含量中的应用 CN201510182688.4 2015-04-16 CN106148354A 2016-11-23 王功伟; 汪全秀
发明属于植物基因工程技术领域。通过全基因组关联分析(GWAS)发现在第7染色体9.13-9.17Mb区间有一显著的热点区域,能重复检测到9个来自不同GWAS分析的对剑叶叶绿素含量具极显著效应的信号峰值,该峰值与Ghd7基因位置对应。进一步利用近等基因系及转基因材料证实,Ghd7作为一个主要的自然变异位点,通过下调叶绿素代谢及叶绿体合成等相关基因的表达,从而调控稻剑叶叶绿素含量。Ghd7对于优化水稻剑叶叶绿素含量具有重要育种价值。
130 一种与黄瓜果皮颜色基因连的分子标记及应用 CN202110640520.9 2021-06-09 CN113088580A 2021-07-09 黄洪宇; 李愚鹤; 张利东; 孔维良; 李加旺; 魏爱民; 王惠哲
发明公开了一种与黄瓜果皮颜色基因连的分子标记及应用。利用项目组收集的289份种质资源,采用全基因组关联分析(GWAS)结合QTL定位等方法,鉴定了影响黄瓜果皮颜色调控的关键变异区间,利用F2群体进行精细定位将候选区间定位至94kb,对候选区间内的基因进行荧光定量分析发现浅绿果皮和深绿果皮近等基因系材料中Csa3G912920基因有差异显著,认为该基因为控制黄瓜果皮颜色的候选基因。根据该基因的位置设计了1个KASP分子标记,利用该标记对分离群体中进行基因型鉴定,符合率达到100%。研究结果不仅有助于果皮颜色黄瓜品种的早期鉴别及辅助育种,且为解析颜色调控的分子机理提供了基础,具有广泛的推广价值。
131 体细胞单倍体人类细胞系 CN201480065108.7 2014-11-28 CN106103699A 2016-11-09 蒂尔曼·布尔克斯图默尔
发明提供了一种例如通过靶向缺失体细胞近单倍体人类亲本细胞的一个或多个二体染色体区域可获得的体细胞完全单倍体、核型稳定的人类细胞系,一种产生该体细胞完全单倍体、核型稳定的人类细胞系的方法,以及该细胞系用于产生包含不同基因组靶位点处的基因组突变的等基因细胞变体的用途,以及一个此类细胞变体的文库。
132 稻抗褐飞虱基因BPH39的分子标记及其应用 CN202011548180.9 2020-12-24 CN112575109A 2021-03-30 胡杰; 邹玲; 陈志伟; 吴为人
发明提供了稻抗褐飞虱基因BPH39的分子标记及其应用,通过构建BPH39的近等基因系和高世代回交群体的重组交换单株分析,构建了覆盖BPH39的局部高密度物理图谱,并将基因精细定位在30 kb的区间。在此区间的两个分子标记ZL1607和ZL2137与BPH39距离最近,利用这两个标记筛选目的基因的单株可靠性最高。此外,与其紧密连的其它分子标记,I1540、I32‑4、ZL6061均能用于筛选该目的基因的单株,可大大提高抗褐飞虱水稻品种或品系的选择效率,缩短育种年限。
133 一种利用叶绿体全基因组精准鉴别皮石斛及其近缘极易混淆种的方法 CN201810506264.2 2018-05-24 CN108763866A 2018-11-06 丁小余; 朱淑颖; 牛志韬
发明公开了一种利用叶绿体全基因组序列精准鉴别皮石斛及其近缘极易混淆种的方法,该方法包括以下步骤:DNA提取和测序;叶绿体基因组拼接;叶绿体全基因组序列比对和构树;结果判定。本发明的方法针对利用常规方法难以鉴别铁皮石斛及其近缘极易混淆种的问题,建立了一种基于叶绿体全基因组序列的种质鉴定方法,该方法也可为确立铁皮石斛及其近缘种的系统分类地位、追溯物种起源和进化历程提供数据支持和理论依据。利用此方法可对铁皮石斛及其近缘极易混淆种进行高效、精准地鉴别,同时此方法具有稳定性好、通用性强、可重复性好等特点。
134 一种用于高通量基因测序的文库构建的自动化建库系统 CN201921285780.3 2019-08-09 CN210560887U 2020-05-19 张鸿; 李国峰; 张茹松
本实用新型公开了一种用于高通量基因测序的文库构建的自动化建库系统,具体涉及基因测序实验室自动化技术领域,包括建库仪主体,所述建库仪主体的顶端表面设置有标准模,所述标准模块为加热模块,所述标准模块的一侧设置有长条模块,且标准模块的另一侧设置有机械臂,所述建库仪主体的顶端表面靠近标准模块的一端设置有LCD液晶显示屏。本实用新型结构简单合理、经济实用、使用方便,通过该仪器自动化操作一次可完成多个样本的建库工作,减少人工成本、人为操作失误的可能以及仪器操作稳定性高,机械臂根据已设定的操作步骤对样本及试剂的吸取、释放、混匀等操作完成对生物基因样本的文库构建过程。
135 一种利用叶绿体全基因组精准鉴别皮石斛及其近缘极易混淆种的方法 CN201810506264.2 2018-05-24 CN108763866B 2022-06-14 丁小余; 朱淑颖; 牛志韬
发明公开了一种利用叶绿体全基因组序列精准鉴别皮石斛及其近缘极易混淆种的方法,该方法包括以下步骤:DNA提取和测序;叶绿体基因组拼接;叶绿体全基因组序列比对和构树;结果判定。本发明的方法针对利用常规方法难以鉴别铁皮石斛及其近缘极易混淆种的问题,建立了一种基于叶绿体全基因组序列的种质鉴定方法,该方法也可为确立铁皮石斛及其近缘种的系统分类地位、追溯物种起源和进化历程提供数据支持和理论依据。利用此方法可对铁皮石斛及其近缘极易混淆种进行高效、精准地鉴别,同时此方法具有稳定性好、通用性强、可重复性好等特点。
136 隐性性状的连续回交技术 CN200910034174.9 2009-09-02 CN101637119A 2010-02-03 徐大勇; 陈庭木; 方兆伟; 秦德荣; 潘启民; 卢百关; 樊继伟; 刘辉; 李健; 迟铭
隐性性状的连续回交技术,其特征是,将不含目标隐性基因的待改良材料作为轮回亲本,将含有目标隐性基因的材料作为供体亲本;以轮回亲本为母本与供体亲本杂交,收获杂种一代F<sub>1</sub>与轮回亲本种子;种植杂种一代F<sub>1</sub>与轮回亲本种子直至种植回交n代杂种二代BC<sub>n</sub>F<sub>2</sub>群体,直到定型成轮回亲本的目标隐性基因等基因系。本发明还公开了应用上述的隐性性状的连续回交技术的紫叶标记等基因系的创建方法以及以紫叶标记等基因系作中间材料再转育新的紫叶标记核不育系。本发明方法将自交过程与下一次回交过程合并在同一季处理,时间效率提高近50%,可以快速改良现有优良亲本的个别由显性基因控制的不适性状,也可将有用的隐性性状快速导入到现有高平遗传背景中。
137 转人老年性痴呆症APP基因的C57BL/6小鼠动物模型的建立和用途 CN200510011468.1 2005-03-24 CN1686567A 2005-10-26 秦川; 张连峰; 朱华; 高虹; 黄澜
发明公开了一种转人老年性痴呆症APP基因的动物模型,C57BL/6小鼠动物模型的构建方法及用途。发明人用PDGF启动子调控APP构建转基因,将转基因片段通过显微注射进入小鼠的受精卵雄性原核。通过PCR,Southern鉴定,获得转基因阳性动物。首次将阳性鼠进行剖腹产净化,使其生物标准与国际接轨,进行DNA重组近交系传代建系,SPF级转APP基因AD重组近交系动物模型是国内目前唯一的在综合标准方面符合国际标准的动物模型。微生物转基因阳性动物与同胞同宗动物交配10代,建立纯合子同源重组近交系,在所公开的小鼠动物模型重复性、稳定性好,为进一步研究AD症特性、发病机理、药物筛选、疫苗评价等方面的研究奠定了基础
138 一种快速、高通量定位和克隆植物QTL基因的RapMap方法 CN202010256016.4 2020-04-02 CN111489790B 2023-03-17 李一博; 张俊成; 张德建; 李翠翠; 许鹏坤; 樊亚伟; 李威; 苏小敏; 孙琪; 李星星; 宋盈盈
发明公开了一种快速、高通量定位和克隆植物QTL基因的RapMap方法,从核心种质中选取性状差异较小的品系作为梯度亲本,构建尽可能多的F2梯度遗传群体,通过对每个群体分离的两个极端表型DNA池进行芯片检测或二代测序初步定位QTL,根据本发明提出的“共分离标准”在每个梯度群体的单株平验证QTL,再用QTL杂合家系作为近等基因系进行精细定位来克隆目标基因。梯度遗传群体的概念和“共分离标准”的思想是本发明的核心。本发明应用该RapMap方法成功克隆六个水稻粒长和粒宽基因,表明RapMap是一个集QTL定位、验证及其近等基因系筛选“三位一体”的快速、高通量基因克隆RapMap方法。
139 一种快速、高通量定位和克隆植物QTL基因的RapMap方法 CN202010256016.4 2020-04-02 CN111489790A 2020-08-04 李一博; 张俊成; 张德建; 李翠翠; 许鹏坤; 樊亚伟; 李威; 苏小敏; 孙琪; 李星星; 宋盈盈
发明公开了一种快速、高通量定位和克隆植物QTL基因的RapMap方法,从核心种质中选取性状差异较小的品系作为梯度亲本,构建尽可能多的F2梯度遗传群体,通过对每个群体分离的两个极端表型DNA池进行芯片检测或二代测序初步定位QTL,根据本发明提出的“共分离标准”在每个梯度群体的单株平验证QTL,再用QTL杂合家系作为近等基因系进行精细定位来克隆目标基因。梯度遗传群体的概念和“共分离标准”的思想是本发明的核心。本发明应用该RapMap方法成功克隆六个水稻粒长和粒宽基因,表明RapMap是一个集QTL定位、验证及其近等基因系筛选“三位一体”的快速、高通量基因克隆RapMap方法。
140 稻基因qSS7在抗旱中的应用 CN202310083955.7 2023-01-14 CN116121266B 2024-02-27 余四斌; 孙文强; 张倩
发明公开了稻基因qSS7在调控水稻抗旱能中的应用,该基因正调控水稻抗旱能力,具体地,利用转基因的方法将来源于热带粳稻品种CYPRESS的qSS7基因在籼稻品种珍汕97(ZS97)中超量表达,干旱胁迫条件下qSS7超量表达植株的存活率提高,植株鲜重和干重显著增加,抗旱能力增强;利用分子标记辅助选择将CYPRESS的qSS7基因导入到ZS97中,在干旱胁迫条件下近等基因系的植株存活率提高,植株鲜重和干重显著增加,抗旱能力增强。
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