首页 / 国际专利分类库 / 物理 / 测量 / 借助于测定材料的化学或物理性质来测试或分析材料 / 疾病的检测或诊断 / 们在用于治疗、预防及诊断IL-1相关性病症和用IL-1结合蛋白 于检测细胞、组织、样品及组合物中的IL-1α和

们在用于治疗预防及诊断IL-1相关性病症和用IL-1结合蛋白 于检测细胞、组织、样品及组合物中的IL-1α和

申请号 CN201180034631.X 申请日 2011-05-13 公开(公告)号 CN103025758B 公开(公告)日 2017-01-18
申请人 ABBVIE; 公司; 发明人 C.吴; D.J.安布罗西; C.谢; T.哈于尔;
摘要 IL-1β的组合物和方法中的用途。描述了结合IL-1α和IL-1β的 蛋白质 以及它
权利要求

1.一种结合蛋白,其包含第一和第二多肽链,其中所述第一多肽链是重链且包含第一VD1-(X1)n-VD2-C-(X2)n,其中:
VD1是第一重链可变域;
VD2是第二重链可变域;
C是重链恒定域;
X1是接头,条件是它不是CH1;
X2是Fc区;
n独立地是0或1;并且
其中所述第二多肽链是轻链且包含第二VD1-(X1)n-VD2-C-(X2)n,其中:
VD1是第一轻链可变域;
VD2是第二轻链可变域;
C是轻链恒定域;
X1是接头,条件是它不是CH1;
X2不包含Fc区;
n独立地是0或1;并且
且其中所述第一多肽链中的VD1-(X1)n-VD2包含SEQ ID NO: 212的基酸序列,且所述第二多肽链中的第二VD1-(X1)n-VD2包含SEQ ID NO: 215的氨基酸序列;且
其中所述结合蛋白结合人IL-1β和人IL-1α。
2.权利要求1的结合蛋白,其中所述第一多肽链中的C-(X2)n包含SEQ ID NO: 214的氨基酸序列,且所述第二多肽链中的C-(X2)n包含SEQ ID NO: 5的氨基酸序列。
3.根据权利要求1所述的结合蛋白,其中所述重链恒定区是IgG1重链恒定区。
4.根据权利要求3所述的结合蛋白,其中所述IgG1重链恒定区包含L234A和L235A铰链区突变。
5.根据权利要求1或权利要求2所述的结合蛋白,其中所述结合蛋白包含两条第一多肽链和两条第二多肽链。
6.根据权利要求1或权利要求2所述的结合蛋白,其中所述Fc区是变异序列Fc区。
7.一种结合蛋白缀合物,其包含如权利要求1或权利要求2中所述的结合蛋白,所述结合蛋白缀合物还包含选自以下的试剂:免疫黏附分子、成像剂、治疗剂和细胞毒剂。
8.根据权利要求7所述的结合蛋白缀合物,其中所述成像剂选自:放射标记物、酶、荧光标记物、发光标记物、磁性标记物和生物素。
9.根据权利要求8所述的结合蛋白缀合物,其中所述放射标记物选自:3H、14C、35S、90Y、
99Tc、111In、125I、131I、177Lu、166Ho和153Sm。
10.根据权利要求7所述的结合蛋白缀合物,其中所述治疗剂或细胞毒剂选自:抗代谢药、烷基化剂、抗生素、生长因子、细胞因子、抗血管生成剂、抗有丝分裂剂、蒽环类、毒素和凋亡剂。
11.根据权利要求1或权利要求2所述的结合蛋白,其中所述结合蛋白是结晶的结合蛋白。
12.一种用于释放结晶的结合蛋白的组合物,所述组合物包含:
(a)制剂,其中所述制剂包含权利要求11中所述的结晶的结合蛋白和一种成分;以及(b)至少一种聚合物载体。
13.根据权利要求12所述的组合物,其中所述聚合物载体是选自以下的一种或多种的聚合物:聚(丙烯酸)、聚(氰基丙烯酸酯)、聚(氨基酸)、聚(酸酐)、聚(缩肽)、聚(酯)、聚(乳酸)、聚(乳酸-共聚-乙醇酸)、聚(b-羟基丁酸酯)、聚(己内酯)、聚(二噁烷);聚(乙二醇)、聚((羟丙基)甲基丙烯酰胺)、聚[(有机)磷腈]、聚(原酸酯)、聚(乙烯醇)、聚(乙烯吡咯烷酮)、来酸酐-烷基乙烯醚共聚物、复合多元醇、白蛋白、藻酸盐、纤维素和纤维素衍生物、胶原蛋白、纤维蛋白、明胶、透明质酸、寡糖、糖胺聚糖、硫酸多糖、其掺合物及共聚物。
14.根据权利要求12所述的组合物,其中所述成分选自白蛋白、蔗糖、海藻糖、乳糖醇、明胶、羟丙基-β-环糊精、甲基聚乙二醇和聚乙二醇。
15.药物组合物,其包含如权利要求1或权利要求2中所述的结合蛋白和可药用载体。
16.根据权利要求15所述的药物组合物,其还包含至少一种额外的试剂。
17.根据权利要求16所述的药物组合物,其中所述额外的试剂选自:治疗剂;成像剂;细胞毒剂;血管生成抑制剂;激酶抑制剂;共刺激分子阻断剂;黏附分子阻断剂;甲氨蝶呤;环孢素;雷帕霉素;FK506;可检测标记物或报道分子;TNF拮抗药;抗湿药;肌松药;非甾体抗炎药(NSAID);止痛药;麻醉剂;镇静药;神经肌肉阻滞剂;抗微生物药;抗屑病药;皮质类固醇;促蛋白合成类固醇;红细胞生成素;免疫球蛋白;生长激素;激素替代药物;放射药物;
抗忧郁药;哮喘药物;β激动剂;吸入型类固醇;肾上腺素或其类似物;细胞因子;和细胞因子拮抗药。
18.药物组合物,其包含如权利要求7中所述的结合蛋白缀合物和可药用载体。
19.根据权利要求18所述的药物组合物,其中所述结合蛋白缀合物包含选自以下的治疗剂或细胞毒剂:抗代谢药、烷基化剂、抗生素、生长因子、细胞因子、抗血管生成剂、抗有丝分裂剂、蒽环类、毒素和凋亡剂。
20.分离的核酸分子,其包含编码权利要求1或权利要求2中所述的结合蛋白的多肽链氨基酸序列的核苷酸序列。
21.载体,其包含一个或多个根据权利要求20所述的分离的核酸分子。
22.根据权利要求21所述的载体,其中所述载体选自:pcDNA、pTT、pTT3、pEFBOS、pBV、pcDNA3.1 TOPO、pEF6 TOPO和pBJ。
23.宿主细胞,其包含根据权利要求21所述的载体。
24.根据权利要求23所述的宿主细胞,其中所述宿主细胞是原核细胞。
25.根据权利要求24所述的宿主细胞,其中所述原核宿主细胞是大肠杆菌。
26.根据权利要求23所述的宿主细胞,其中所述宿主细胞是真核细胞。
27.根据权利要求26所述的宿主细胞,其中所述真核细胞选自:原生生物细胞、动物细胞、植物细胞和真菌细胞。
28.根据权利要求27所述的宿主细胞,其中所述真菌细胞是酵母细胞。
29.根据权利要求28所述的宿主细胞,其中所述酵母细胞是酿酒酵母
30.根据权利要求27所述的宿主细胞,其中所述动物细胞选自:哺乳动物细胞、禽类细胞和昆虫细胞。
31.根据权利要求30所述的宿主细胞,其中所述哺乳动物细胞是CHO细胞或COS细胞。
32.根据权利要求30所述的宿主细胞,其中所述昆虫宿主细胞是昆虫Sf9细胞。
33.一种产生结合蛋白的方法,其包括在培养基中在足以产生所述结合蛋白的条件下培养权利要求23中所述的宿主细胞。
34.根据权利要求33所述的方法产生的结合蛋白。
35.权利要求1或权利要求2中所述的结合蛋白在制备药物中的用途,所述药物用于降低人IL-1活性,从而降低人IL-1蛋白活性。
36.权利要求1或权利要求2所述的结合蛋白在制备药物中的用途,所述药物用于治疗受试者的其中IL-1活性是有害的的病症,其中所述病症是炎性病症。
37.根据权利要求36所述的用途,其中所述病症选自:类风湿性关节炎;骨关节炎;幼年型慢性关节炎;脓毒性关节炎;莱姆病关节炎;银屑病关节炎;和反应性关节炎。
38.权利要求1或权利要求2中所述的结合蛋白在制备药物中的用途,所述药物用于治疗患有其中IL-1是有害的的病症,其中所述药物在施用第二药物之前、同时或之后施用,其中所述第二药物选自:能够结合人IL-1β的抗体或其片段;能够结合人IL-1α的抗体或其片段;甲氨蝶呤;皮质类固醇;β-激动剂;白三烯拮抗药;白三烯受体拮抗药;ADVAIR;IgE抑制剂;XOLAIR;磷酸二酯酶抑制剂;PDE4抑制剂;黄嘌呤;抗胆能药;肥大细胞稳定剂;色甘酸;IL-5抑制剂;嗜酸性粒细胞趋化因子/CCR3抑制剂;组胺拮抗药;组胺受体拮抗药、前列腺素D拮抗药;受体DP1的抑制剂;CRTH2的抑制剂;TNF拮抗药;TNF受体的可溶性片段;
ENBREL;TNF酶拮抗药;TNF转化酶(TACE)抑制剂;蕈毒碱受体拮抗药;TGF-β拮抗药;干扰素γ;吡非尼酮;化疗药,来氟米特;西罗莫司(雷帕霉素)或其类似物、CCI-779;COX2或cPLA2抑制剂;非甾体抗炎药(NSAID);免疫调节剂;p38抑制剂;TPL-2抑制剂;MK-2抑制剂;NFκB抑制剂;布地奈德;表皮生长因子;环孢菌素;柳氮磺吡啶;氨基杨酸盐;6-巯基嘌呤;硫唑嘌呤;甲硝唑;脂氧合酶抑制剂;美沙拉嗪;奥沙拉嗪;巴柳氮;抗氧化剂;血栓烷抑制剂;IL-1受体拮抗药;生长因子;弹性蛋白酶抑制剂;吡啶基咪唑化合物;TNF、LT、IL-2、IL-3、IL-4、IL-5、IL-6、IL-7、IL-8、IL-9、IL-10、IL-11、IL-12、IL-14、IL-15、IL-16、IL-17、IL-18、IL-
19、IL-20、IL-21、IL-22、IL-23、IL-24、IL-25、IL-26、IL-27、IL-28、IL-29、IL-30、IL-31、IL-32、IL-33、EMAP-II、GM-CSF、FGF或PDGF中任一种的抗体或激动剂;针对CD2、CD3、CD4、CD8、CD25、CD28、CD30、CD40、CD45、CD69或CD90的抗体;FK506;麦考酚酸吗乙酯;布洛芬;泼尼松龙;腺苷激动剂;抗血栓药;补体抑制剂;肾上腺素能药;激酶抑制剂;IL-1β转化酶抑制剂;T-细胞信号传导抑制剂;金属蛋白酶抑制剂;血管紧张素转化酶抑制剂;可溶性细胞因子受体;可溶性p55 TNF受体;可溶性p75 TNF受体;可溶性IL-1RI;可溶性IL-1RII;可溶性IL-6R;和抗炎细胞因子。
39.根据权利要求7所述的结合蛋白缀合物,其中所述成像剂是生物发光标记物。
40.根据权利要求16所述的药物组合物,其中所述额外的试剂是麻醉品。
41.根据权利要求16所述的药物组合物,其中所述额外的试剂是局部麻醉剂。
42.根据权利要求16所述的药物组合物,其中所述额外的试剂是免疫药。
43.根据权利要求16所述的药物组合物,其中所述额外的试剂是抗细胞因子抗体或其功能性片段。
44.根据权利要求16所述的药物组合物,其中所述额外的试剂是免疫抑制药。
45.根据权利要求16所述的药物组合物,其中所述额外的试剂是抗精神病药。
46.根据权利要求16所述的药物组合物,其中所述额外的试剂是兴奋剂。
47.权利要求1或权利要求2中所述的结合蛋白在制备药物中的用途,所述药物用于治疗患有其中IL-1是有害的的病症,其中所述药物在施用第二药物之前、同时或之后施用,其中所述第二药物是抗IgE抗体。
48.权利要求1或权利要求2中所述的结合蛋白在制备药物中的用途,所述药物用于治疗患有其中IL-1是有害的的病症,其中所述药物在施用第二药物之前、同时或之后施用,其中所述第二药物选自IL-4;IL-10;IL-11;和TGF-β。
49.权利要求1或权利要求2中所述的结合蛋白在制备药物中的用途,所述药物用于治疗患有其中IL-1是有害的的病症,其中所述药物在施用第二药物之前、同时或之后施用,其中所述第二药物是IL-4抑制剂。

说明书全文

IL-1结合蛋白

[0001] 相关申请的交叉引用
[0002] 本申请对2010年5月14日提交的美国临时申请No.61/334,917和2010年12月21日提交的美国临时申请No.61/425,701要求优先权权益,所述临时申请的内容通过引用的方式完整并入本文。发明领域
[0003] 本发明涉及IL-1结合蛋白,并且更具体地涉及它们在预防和/或治疗急性和慢性免疫学疾病如类湿性关节炎、骨关节炎、屑病、多发性硬化和其他自身免疫疾病中的用途。
[0004] 发明背景
[0005] 细胞因子如白介素(IL-1)和肿瘤坏死因子(TNF)是由各种细胞(如单核细胞和巨噬细胞)产生的作为炎性过程介体的分子。白介素-1是具有广泛生物学和生理学效应的细胞因子,所述效应包括发热、前列腺素合成(在例如纤维细胞、肌肉细胞和内皮细胞中)、T-淋巴细胞活化和白介素生-2产生。
[0006] IL-1超家族的原始成员是IL-1α、IL-1β和IL-1受体拮抗物(IL-1Ra、IL-1RA、IL-1ra、IL-1Rα)。IL-1α和IL-1β是参与对抗感染的免疫防御的促炎细胞因子。IL-1Rα是与IL-1α和IL-1β竞争受体结合的分子,阻断它们在免疫活化中的作用。近年来,已经见到其他分子加入IL-1超家族,包括IL-18(见Dinarello等人,FASEB J.,8(15):1314-3225(1994);
Huising等人,Dev.Comp.Immunol.,28(5):395-413(2004))和另外6种与IL-1α、IL-1β或IL-
1RA具有结构同源性的基因。这些后6个成员命名为IL1F5、IL1F6、IL1F7、IL1F8、IL1F9和IL1F10。因此,IL-1α、IL-1β和IL-1RA已经分别重命名为IL-1F1、IL-1F2和IL-1F3(见Sims等人,TrendsImmunol.,22(10):536-537(2001);Dunn等人,Trends Immunol.,22(10):533-
536(2001))。已经描述了IL-1家族的另外一个推定成员,称作IL-33或IL-1F11,但是这个名称未在HGNC基因家族命名数据库中被正式接受。
[0007] IL-1α和IL-1β均由巨噬细胞、单核细胞和树突细胞产生。它们形成身体对抗感染的炎性反应的重要部分。这些细胞因子增加内皮细胞上黏附因子的表达,以使白细胞(对抗病原体的细胞)能够移行至感染部位并重新设定下丘脑体温调节中心,导致本身表现为发热的增加的体温。IL-1因此称作内源性热原。增加的体温帮助身体的免疫系统对抗感染。IL-1还在血细胞生成的调节中是重要的。周围组织中的IL-1β产生也与痛觉过敏(增加的疼痛敏感性)相关、与发热相关(Morgan等人,Brain Res.,1022(1-2):96-100(2004))。大多数情况下,这两种形式的IL-1与相同的细胞受体结合。这种受体由两个相关但是不相同的亚单位组成,所述亚单位经由大多与某些其他受体共享的途径传递胞内信号。这些受体包括Toll家族先天免疫受体和IL-18的受体。IL-1α和IL-1β也拥有相似的生物学特性,包括诱导发热、慢波睡眠和嗜中性粒细胞增多、T-淋巴细胞和B-淋巴细胞活化、成纤维细胞增殖、某些细胞的细胞毒性、诱导胶原酶、合成肝脏急性期蛋白和增加集落刺激因子和胶原的产生。
[0008] 已经分离并且表达了编码这两种不同形式的IL-1的cDNA;这些cDNA代表两种不同的基因产物,命名为IL-1β(Auron等人,Proc.Natl.Acad.Sci.USA,81:7907-7911(1984))和IL-1α(Lomedico等人,Nature,312:458-462(1984))。IL-1β是由人单核细胞产生的在mRNA平和蛋白质水平上均占优势的形式。这两种形式的人IL-1仅共享26%基酸同源性。尽管它们的多肽序列不同,然而这两种形式的IL-1具有结构相似性(Auron等人,J.Mol.Cell Immunol.,2:169-177(1985)),所述相似性在于氨基酸同源性局限于IL-1分子的离散区域。
[0009] IL-1α和IL-1β作为前体肽产生。换而言之,它们作为长蛋白质制备,所述长蛋白质随后经加工以释放较短的活性分子,该分子称作成熟蛋白。例如,在被胱天蛋白酶蛋白质家族的某个成员(称作胱天蛋白酶-1或白介素-1转化酶(ICE))切割后从前(pro)IL-1β中释放成熟的IL-1β。人IL-1超家族的每个成员的成熟形式的三维结构由产生桶形蛋白质的12-14条β-链组成。
[0010] 虽然自从发现这种重要的促炎细胞因子起,已经在接近二十年的研究中描述了针对IL-1的各种抗体,但是仍需要可有效介导或中和炎性反应和自身免疫病症中IL-1的活性以及用于检测样品和组织中IL-1β的改进抗体。
[0011] 发明概述
[0012] 本发明涉及结合人IL-1α和IL-1β的蛋白质。本发明的结合蛋白包括但不限于可以TM结合人IL-1α和IL-1β的抗体、其抗原结合部分和多价多特异性结合蛋白如DVD-Ig 结合蛋白。本发明还提供了制造和使用本文所述的IL-1α和IL-1β结合蛋白的方法,以及各种组合物,所述组合物可以在检测样品中IL-1α和IL-1β的方法中或在治疗或预防个体中与IL-1活性相关或疑似与IL-1活性相关的病症的方法中使用。
[0013] 在一个实施方案中,本发明提供一种结合蛋白,其包含第一和第二多肽链,其中所述第一多肽链包含第一VD1-(X1)n-VD2-C-(X2)n,其中:
[0014] VD1是第一重链可变域;
[0015] VD2是第二重链可变域;
[0016] C是重链恒定域;
[0017] X1是接头,条件是,它不是CH1;
[0018] X2是Fc区;并且
[0019] n独立地是0或1;并且
[0020] 其中所述第二多肽链包含第二VD1-(X1)n-VD2-C-(X2)n,其中:
[0021] VD1是第一轻链可变域;
[0022] VD2是第二轻链可变域;
[0023] C是轻链恒定域;
[0024] X1是接头,条件是,它不是CH1;
[0025] X2不包含Fc区;并且
[0026] n独立地是0或1;
[0027] 其中,在所述第一多肽链中,VD1包含选自SEQ ID NO:60-148、196、198、200、202、204、206、208和210的氨基酸序列;并且VD2包含选自SEQ ID NO:213和227的氨基酸序列;
[0028] 其中,在所述第二多肽链中,VD1包含选自SEQ ID NO:149-189、197、199、201、203、205、207、209和211的氨基酸序列;并且VD2包含选自SEQ ID NO:216和229的氨基酸序列;并且
[0029] 其中所述结合蛋白结合人IL-1β和人IL-1α。
[0030] 在一个实施方案中,上文描述的结合蛋白包含第一多肽链,所述第一多肽链包含选自SEQ ID NO:212、217、226、230、232、234和236的氨基酸序列。
[0031] 在另一个实施方案中,上文描述的结合蛋白包含第二多肽链,所述第二多肽链包含选自SEQ ID NO:215、218、228、231、233、235和237的氨基酸序列。
[0032] 在本发明的另一个方面,结合蛋白包含第一和第二多肽链,其中所述第一多肽链包含第一VD1-(X1)n-VD2-C-(X2)n,其中:
[0033] VD1是第一重链可变域;
[0034] VD2是第二重链可变域;
[0035] C是重链恒定域;
[0036] X1是接头,条件是,它不是CH1;
[0037] X2是Fc区;并且
[0038] n独立地是0或1;并且
[0039] 其中所述第二多肽链包含第二VD1-(X1)n-VD2-C-(X2)n,其中:
[0040] VD1是第一轻链可变域;
[0041] VD2是第二轻链可变域;
[0042] C是轻链恒定域;
[0043] X1是接头,条件是,它不是CH1;
[0044] X2不包含Fc区;并且
[0045] n独立地是0或1;
[0046] 其中,在所述第一多肽链中,VD1包含选自SEQ ID NO:213和227的氨基酸序列;并且VD2包含选自SEQ ID NO:60-148、196、198、200、202、204、206、208和210的氨基酸序列;
[0047] 其中,在所述第二多肽链中,VD1包含选自SEQ ID NO:216和229的氨基酸序列;并且VD2包含选自SEQ ID NO:149-189、197、199、201、203、205、207、209和211的氨基酸序列;并且
[0048] 其中所述结合蛋白结合人IL-1β和人IL-1α。
[0049] 在另一个实施方案中,上文描述的结合蛋白包含第一多肽链,所述第一多肽链包含选自SEQ ID NO:219和221的氨基酸序列。
[0050] 在另一个实施方案中,上文描述的结合蛋白包含第二多肽链,所述第二多肽链包含选自SEQ ID NO:220和222的氨基酸序列。
[0051] 在另一个方面,本发明提供上文描述的结合蛋白,其中:
[0052] 当所述第一多肽链包含SEQ ID NO:212的氨基酸序列时,则所述第二多肽链包含选自SEQ ID NO:215、228、231、233和235的氨基酸序列;
[0053] 当所述第一多肽链包含SEQ ID NO:217的氨基酸序列时,则所述第二多肽链包含选自SEQ ID NO:218和237的氨基酸序列;
[0054] 当所述第一多肽链包含SEQ ID NO:219的氨基酸序列时,则所述第二多肽链包含SEQ ID NO:220的氨基酸序列;
[0055] 当所述第一多肽链包含SEQ ID NO:221的氨基酸序列时,则所述第二多肽链包含SEQ ID NO:222;
[0056] 当所述第一多肽链包含SEQ ID NO:226的氨基酸序列时,则所述第二多肽链包含选自SEQ ID NO:228、215、231、233和235的氨基酸序列;
[0057] 当所述第一多肽链包含SEQ ID NO:230的氨基酸序列时,则所述第二多肽链包含选自SEQ ID NO:231、215、228、233和235的氨基酸序列;
[0058] 当所述第一多肽链包含SEQ ID NO:232的氨基酸序列时,则所述第二多肽链包含选自SEQ ID NO:233、215、228、231和235的氨基酸序列;
[0059] 当所述第一多肽链包含SEQ ID NO:234的氨基酸序列时,则所述第二多肽链包含选自SEQ ID NO:235、215、228、231和233的氨基酸序列;并且
[0060] 当所述第一多肽链包含SEQ ID NO:236的氨基酸序列时,则所述第二多肽链包含SEQ ID NO:237。
[0061] 在另一个方面,本发明提供上文描述的蛋白质,其中:
[0062] 所述第一多肽链包含SEQ ID NO:212,并且所述第二多肽链包含SEQ ID NO:215;或
[0063] 所述第一多肽链包含SEQ ID NO:217,并且所述第二多肽链包含SEQ ID NO:218;或
[0064] 所述第一多肽链包含SEQ ID NO:219,并且所述第二多肽链包含SEQ ID NO:220;或
[0065] 所述第一多肽链包含SEQ ID NO:221,并且所述第二多肽链包含SEQ ID NO:222;或
[0066] 所述第一多肽链包含SEQ ID NO:226,并且所述第二多肽链包含SEQ ID NO:228;或
[0067] 所述第一多肽链包含SEQ ID NO:230,并且所述第二多肽链包含SEQ ID NO:231;或
[0068] 所述第一多肽链包含SEQ ID NO:232,并且所述第二多肽链包含SEQ ID NO:233;或
[0069] 所述第一多肽链包含SEQ ID NO:234,并且所述第二多肽链包含SEQ ID NO:235;或
[0070] 所述第一多肽链包含SEQ ID NO:236,并且所述第二多肽链包含SEQ ID NO:237。
[0071] 在一个实施方案中,上文描述的本发明结合蛋白包含包含两条第一多肽链和两条第二多肽链。
[0072] 在另一个方面,在上文描述的结合蛋白中,X1或X2是选自SEQ ID NO:26-57、233、224和225的氨基酸序列。
[0073] 在另一个实施方案中,本发明提供上文描述的结合蛋白,其中Fc区选自天然序列Fc区和变异序列Fc区。在另一个实施方案中,Fc区选自来自IgG1、IgG2、IgG3、IgG4、IgA、IgM、IgE和IgD的Fc区。
[0074] 在另一个实施方案中,本发明提供一种结合蛋白缀合物,其包含上文描述的结合蛋白并且还包含试剂。此类试剂包括但不限于免疫黏附分子、成像剂、治疗剂和细胞毒药剂。优选的成像剂包括但不限于放射性标记、酶、荧光标记、发光标记、生物发光标记、磁性标记和生物素。优选的放射性标记包括但不限于3H、14C、35S、90Y、99Tc、111In、125I、131I、177Lu、166Ho和153Sm。优选的治疗剂或细胞毒药剂包括但不限于抗代谢药、烷基化剂、抗生素、生长因子、细胞因子、抗血管生成药、抗有丝分裂药、蒽环霉素(anthracycline)、毒素和凋亡剂。
[0075] 本发明也提供包含抗原结合结构域的结合蛋白,其中所述结合蛋白能够结合人IL-1β,并且所述抗原结合结构域包含如下文定义的6个CDR,即,CDR-H1、CDR-H2、CDR-H3、CDR-L 1、CDR-L2和CDR-L3:
[0076] CDR-H1:X1-Y-D-M-S(SEQ ID NO:190),其中:
[0077] X1是S、K或R;
[0078] CDR-H2:Y-X2-S-X4-G-G-X7-G-T-Y-Y-P-D-X14-X15-K-G(SEQ ID NO:191),
[0079] 其中:
[0080] X2是I或V;
[0081] X4是S或H;
[0082] X7是G或A;
[0083] X14是T或S;和
[0084] X15是V或A;
[0085] CDR-H3:G-G-V-X4-K-G-X7-F-D-X10(SEQ ID NO:192),其中:
[0086] X4是T或Y;
[0087] X7是Y或C;和
[0088] X10是V、E、L、M、Q或Y;
[0089] CDR-L1:R-A-S-G-N-I-X7-X8-X9-L-X11(SEQ ID NO:193),其中:
[0090] X7是H、Y或W;
[0091] X8是N、G、T、Q、E、H、D或K;
[0092] X9是Y或W;和
[0093] X11是T、A或N;
[0094] CDR-L2:X1-A-K-X4-L-X6-X7(SEQ ID NO:194),其中:
[0095] X1是N、Q或D;
[0096] X4是T、N、I、E或S;
[0097] X6是A、M或E;和
[0098] X7是D、E、S或A;
[0099] 和
[0100] CDR-L3:Q-X2-F-W-X5-X6-P-X8-X9(SEQ ID NO:195),其中:
[0101] X2是H或Q;
[0102] X5是S、N、T、K、R或M;
[0103] X6是I或L;
[0104] X8是Y或A;和
[0105] X9是T、I和N;
[0106] 除了当CDR-H1是S-Y-D-M-S(SEQ ID NO:17)时,则:
[0107] CDR-H2不能是Y-I-S-S-G-G-G-G-T-Y-Y-P-D-T-V-K-G(SEQ ID NO:18);
[0108] CDR-H3不能是G-G-V-T-K-G-Y-F-D-V(SEQ ID NO:19);
[0109] CDR-L1不能是R-A-S-G-N-I-H-N-Y-L-T(SEQ ID NO:20);
[0110] CDR-L2不能是N-A-K-T-L-A-D(SEQ ID NO:21);和
[0111] CDR-L3不能是Q-H-F-W-S-I-P-Y-T(SEQ ID NO:22)。
[0112] 在一个实施方案中,上文描述的分离的结合蛋白包含至少一个CDR,所述CDR包含选自以下的CDR序列的氨基酸序列:
[0113]SEQ ID NO:60的残基31-35(CDR-H1); SEQ ID NO:63的残基31-35(CDR-H1);
SEQ ID NO:60的残基50-66(CDR-H2); SEQ ID NO:63的残基50-66(CDR-H2);
SEQ ID NO:60的残基99-108(CDR-H3); SEQ ID NO:63的残基99-108(CDR-H3);
SEQ ID NO:149的残基24-34(CDR-L1); SEQ ID NO:150的残基24-34(CDR-L1);
SEQ ID NO:149的残基50-56(CDR-L2); SEQ ID NO:150的残基50-56(CDR-L2);
SEQ ID NO:149的残基89-97(CDR-L3); SEQ ID NO:150的残基89-97(CDR-L3);
SEQ ID NO:69的残基31-35(CDR-H1); SEQ ID NO:97的残基31-35(CDR-H1);
SEQ ID NO:69的残基50-66(CDR-H2); SEQ ID NO:97的残基50-66(CDR-H2);
SEQ ID NO:69的残基99-108(CDR-H3); SEQ ID NO:97的残基99-108(CDR-H3);
SEQ ID NO:173的残基24-34(CDR-L1); SEQ ID NO:187的残基24-34(CDR-L1);
SEQ ID NO:173的残基50-56(CDR-L2); SEQ ID NO:187的残基50-56(CDR-L2);
SEQ ID NO:173的残基89-97(CDR-L3); SEQ ID NO:187的残基89-97(CDR-L3);
SEQ ID NO:67的残基31-35(CDR-H1); SEQ ID NO:90的残基31-35(CDR-H1);
SEQ ID NO:67的残基50-66(CDR-H2) SEQ ID NO:90的残基50-66(CDR-H2)
SEQ ID NO:67的残基99-108(CDR-H3); SEQ ID NO:90的残基99-108(CDR-H3);
SEQ ID NO:151的残基24-34(CDR-L1); SEQ ID NO:156的残基24-34(CDR-L1);
SEQ ID NO:151的残基50-56(CDR-L2); SEQ ID NO:156的残基50-56(CDR-L2);
SEQ ID NO:151的残基89-97(CDR-L3); SEQ ID NO:156的残基89-97(CDR-L3);
SEQ ID NO:88的残基31-35(CDR-H1); SEQ ID NO:92的残基31-35(CDR-H1);
SEQ ID NO:88的残基50-66(CDR-H2); SEQ ID NO:92的残基50-66(CDR-H2);
SEQ ID NO:88的残基99-108(CDR-H3); SEQ ID NO:92的残基99-108(CDR-H3);
SEQ ID NO:159的残基24-34(CDR-L1); SEQ ID NO:153的残基24-34(CDR-L1);
SEQ ID NO:159的残基50-56(CDR-L2); SEQ ID NO:153的残基50-56(CDR-L2);
SEQ ID NO:159的残基89-97(CDR-L3); SEQ ID NO:153的残基89-97(CDR-L3);
SEQ ID NO:96的残基31-35(CDR-H1); SEQ ID NO:94的残基31-35(CDR-H1);
SEQ ID NO:96的残基50-66(CDR-H2); SEQ ID NO:94的残基50-66(CDR-H2);
SEQ ID NO:96的残基99-108(CDR-H3); SEQ ID NO:94的残基99-108(CDR-H3);
SEQ ID NO:155的残基24-34(CDR-L1); SEQ ID NO:166的残基24-34(CDR-L1);
SEQ ID NO:155的残基50-56(CDR-L2); SEQ ID NO:166的残基50-56(CDR-L2);
SEQ ID NO:155的残基89-97(CDR-L3); SEQ ID NO:166的残基89-97(CDR-L3);
SEQ ID NO:90的残基31-35(CDR-H1); SEQ ID NO:82的残基31-35(CDR-H1);
SEQ ID NO:90的残基50-66(CDR-H2) SEQ ID NO:82的残基50-66(CDR-H2)
SEQ ID NO:90的残基99-108(CDR-H3); SEQ ID NO:82的残基99-108(CDR-H3);
SEQ ID NO:182的残基24-34(CDR-L1); SEQ ID NO:159的残基24-34(CDR-L1);
[0114]SEQ ID NO:182的残基50-56(CDR-L2); SEQ ID NO:159的残基50-56(CDR-L2);
SEQ ID NO:182的残基89-97(CDR-L3); SEQ ID NO:159的残基89-97(CDR-L3);
SEQ ID NO:90的残基31-35(CDR-H1); SEQ ID NO:101的残基31-35(CDR-H1);
SEQ ID NO:90的残基50-66(CDR-H2); SEQ ID NO:101的残基50-66(CDR-H2);
SEQ ID NO:90的残基99-108(CDR-H3); SEQ ID NO:101的残基99-108(CDR-H3);
SEQ ID NO:167的残基24-34(CDR-L1); SEQ ID NO:158的残基24-34(CDR-L1);
SEQ ID NO:167的残基50-56(CDR-L2); SEQ ID NO:158的残基50-56(CDR-L2);
SEQ ID NO:167的残基89-97(CDR-L3); SEQ ID NO:158的残基89-97(CDR-L3);
SEQ ID NO:90的残基31-35(CDR-H1); SEQ ID NO:96的残基31-35(CDR-H1);
SEQ ID NO:90的残基50-66(CDR-H2); SEQ ID NO:96的残基50-66(CDR-H2);
SEQ ID NO:90的残基99-108(CDR-H3); SEQ ID NO:96的残基99-108(CDR-H3);
SEQ ID NO:164的残基24-34(CDR-L1); SEQ ID NO:157的残基24-34(CDR-L1);
SEQ ID NO:164的残基50-56(CDR-L2); SEQ ID NO:157的残基50-56(CDR-L2);
SEQ ID NO:164的残基89-97(CDR-L3); SEQ ID NO:157的残基89-97(CDR-L3);
SEQ ID NO:73的残基31-35(CDR-H1); SEQ ID NO:70的残基31-35(CDR-H1);
SEQ ID NO:73的残基50-66(CDR-H2); SEQ ID NO:70的残基50-66(CDR-H2)
SEQ ID NO:73的残基99-108(CDR-H3); SEQ ID NO:70的残基99-108(CDR-H3);
SEQ ID NO:174的残基24-34(CDR-L1); SEQ ID NO:161的残基24-34(CDR-L1);
SEQ ID NO:174的残基50-56(CDR-L2); SEQ ID NO:161的残基50-56(CDR-L2);
SEQ ID NO:174的残基89-97(CDR-L3); SEQ ID NO:161的残基89-97(CDR-L3);
SEQ ID NO:86的残基31-35(CDR-H1); SEQ ID NO:83的残基31-35(CDR-H1);
SEQ ID NO:86的残基50-66(CDR-H2); SEQ ID NO:83的残基50-66(CDR-H2);
SEQ ID NO:86的残基99-108(CDR-H3); SEQ ID NO:83的残基99-108(CDR-H3);
SEQ ID NO:159的残基24-34(CDR-L1); SEQ ID NO:158的残基24-34(CDR-L1);
SEQ ID NO:159的残基50-56(CDR-L2); SEQ ID NO:158的残基50-56(CDR-L2);
SEQ ID NO:159的残基89-97(CDR-L3); SEQ ID NO:158的残基89-97(CDR-L3);
SEQ ID NO:90的残基31-35(CDR-H1); SEQ ID NO:102的残基31-35(CDR-H1);
SEQ ID NO:90的残基50-66(CDR-H2); SEQ ID NO:102的残基50-66(CDR-H2);
SEQ ID NO:90的残基99-108(CDR-H3); SEQ ID NO:102的残基99-108(CDR-H3);
SEQ ID NO:169的残基24-34(CDR-L1); SEQ ID NO:185的残基24-34(CDR-L1);
SEQ ID NO:169的残基50-56(CDR-L2); SEQ ID NO:185的残基50-56(CDR-L2);
SEQ ID NO:169的残基89-97(CDR-L3); SEQ ID NO:185的残基89-97(CDR-L3);
SEQ ID NO:91的残基31-35(CDR-H1); SEQ ID NO:98的残基31-35(CDR-H1);
SEQ ID NO:91的残基50-66(CDR-H2) SEQ ID NO:98的残基50-66(CDR-H2);
SEQ ID NO:91的残基99-108(CDR-H3); SEQ ID NO:98的残基99-108(CDR-H3);
SEQ ID NO:165的残基24-34(CDR-L1); SEQ ID NO:160的残基24-34(CDR-L1);
SEQ ID NO:165的残基50-56(CDR-L2); SEQ ID NO:160的残基50-56(CDR-L2);
SEQ ID NO:165的残基89-97(CDR-L3); SEQ ID NO:160的残基89-97(CDR-L3);
[0115]SEQ ID NO:76的残基31-35(CDR-H1); SEQ ID NO:74的残基31-35(CDR-H1);
SEQ ID NO:76的残基50-66(CDR-H2); SEQ ID NO:74的残基50-66(CDR-H2);
SEQ ID NO:76的残基99-108(CDR-H3); SEQ ID NO:74的残基99-108(CDR-H3);
SEQ ID NO:175的残基24-34(CDR-L1); SEQ ID NO:186的残基24-34(CDR-L1);
SEQ ID NO:175的残基50-56(CDR-L2); SEQ ID NO:186的残基50-56(CDR-L2);
SEQ ID NO:175的残基89-97(CDR-L3); SEQ ID NO:186的残基89-97(CDR-L3);
SEQ ID NO:99的残基31-35(CDR-H1); SEQ ID NO:95的残基31-35(CDR-H1);
SEQ ID NO:99的残基50-66(CDR-H2); SEQ ID NO:95的残基50-66(CDR-H2);
SEQ ID NO:99的残基99-108(CDR-H3); SEQ ID NO:95的残基99-108(CDR-H3);
SEQ ID NO:189的残基24-34(CDR-L1); SEQ ID NO:157的残基24-34(CDR-L1);
SEQ ID NO:189的残基50-56(CDR-L2); SEQ ID NO:157的残基50-56(CDR-L2);
SEQ ID NO:189的残基89-97(CDR-L3); SEQ ID NO:157的残基89-97(CDR-L3);
SEQ ID NO:100的残基31-35(CDR-H1); SEQ ID NO:72的残基31-35(CDR-H1);
SEQ ID NO:100的残基50-66(CDR-H2); SEQ ID NO:72的残基50-66(CDR-H2);
SEQ ID NO:100的残基99-108(CDR-H3); SEQ ID NO:72的残基99-108(CDR-H3);
SEQ ID NO:168的残基24-34(CDR-L1); SEQ ID NO:178的残基24-34(CDR-L1);
SEQ ID NO:168的残基50-56(CDR-L2); SEQ ID NO:178的残基50-56(CDR-L2);
SEQ ID NO:168的残基89-97(CDR-L3); SEQ ID NO:178的残基89-97(CDR-L3);
SEQ ID NO:71的残基31-35(CDR-H1); SEQ ID NO:96的残基31-35(CDR-H1);
SEQ ID NO:71的残基50-66(CDR-H2) SEQ ID NO:96的残基50-66(CDR-H2);
SEQ ID NO:71的残基99-108(CDR-H3); SEQ ID NO:96的残基99-108(CDR-H3);
SEQ ID NO:170的残基24-34(CDR-L1); SEQ ID NO:163的残基24-34(CDR-L1);
SEQ ID NO:170的残基50-56(CDR-L2); SEQ ID NO:163的残基50-56(CDR-L2);
SEQ ID NO:170的残基89-97(CDR-L3); SEQ ID NO:163的残基89-97(CDR-L3);
SEQ ID NO:84的残基31-35(CDR-H1); SEQ ID NO:77的残基31-35(CDR-H1);
SEQ ID NO:84的残基50-66(CDR-H2); SEQ ID NO:77的残基50-66(CDR-H2);
SEQ ID NO:84的残基99-108(CDR-H3); SEQ ID NO:77的残基99-108(CDR-H3);
SEQ ID NO:188的残基24-34(CDR-L1); SEQ ID NO:183的残基24-34(CDR-L1);
SEQ ID NO:188的残基50-56(CDR-L2); SEQ ID NO:183的残基50-56(CDR-L2);
SEQ ID NO:188的残基89-97(CDR-L3); SEQ ID NO:183的残基89-97(CDR-L3);
SEQ ID NO:78的残基31-35(CDR-H1); SEQ ID NO:90的残基31-35(CDR-H1);
SEQ ID NO:78的残基50-66(CDR-H2); SEQ ID NO:90的残基50-66(CDR-H2);
SEQ ID NO:78的残基99-108(CDR-H3); SEQ ID NO:90的残基99-108(CDR-H3);
SEQ ID NO:179的残基24-34(CDR-L1); SEQ ID NO:171的残基24-34(CDR-L1);
SEQ ID NO:179的残基50-56(CDR-L2); SEQ ID NO:171的残基50-56(CDR-L2);
SEQ ID NO:179的残基89-97(CDR-L3); SEQ ID NO:171的残基89-97(CDR-L3);
SEQ ID NO:93的残基31-35(CDR-H1); SEQ ID NO:79的残基31-35(CDR-H1);
SEQ ID NO:93的残基50-66(CDR-H2); SEQ ID NO:79的残基50-66(CDR-H2);
[0116]SEQ ID NO:93的残基99-108(CDR-H3); SEQ ID NO:79的残基99-108(CDR-H3);
SEQ ID NO:176的残基24-34(CDR-L1); SEQ ID NO:180的残基24-34(CDR-L1);
SEQ ID NO:176的残基50-56(CDR-L2); SEQ ID NO:180的残基50-56(CDR-L2);
SEQ ID NO:176的残基89-97(CDR-L3); SEQ ID NO:180的残基89-97(CDR-L3);
SEQ ID NO:87的残基31-35(CDR-H1); SEQ ID NO:381的残基31-35(CDR-H1);
SEQ ID NO:87的残基50-66(CDR-H2) SEQ ID NO:381的残基50-66(CDR-H2);
SEQ ID NO:87的残基99-108(CDR-H3); SEQ ID NO:381的残基99-108(CDR-H3);
SEQ ID NO:154的残基24-34(CDR-L1); SEQ ID NO:152的残基24-34(CDR-L1);
SEQ ID NO:154的残基50-56(CDR-L2); SEQ ID NO:152的残基50-56(CDR-L2);
SEQ ID NO:154的残基89-97(CDR-L3); SEQ ID NO:152的残基89-97(CDR-L3);
SEQ ID NO:85的残基31-35(CDR-H1); SEQ ID NO:81的残基31-35(CDR-H1);
SEQ ID NO:85的残基50-66(CDR-H2); SEQ ID NO:81的残基50-66(CDR-H2);
SEQ ID NO:85的残基99-108(CDR-H3); SEQ ID NO:81的残基99-108(CDR-H3);
SEQ ID NO:162的残基24-34(CDR-L1); SEQ ID NO:177的残基24-34(CDR-L1);
SEQ ID NO:162的残基50-56(CDR-L2); SEQ ID NO:177的残基50-56(CDR-L2);
SEQ ID NO:162的残基89-97(CDR-L3); SEQ ID NO:177的残基89-97(CDR-L3);
SEQ ID NO:89的残基31-35(CDR-H1); SEQ ID NO:80的残基31-35(CDR-H1);
SEQ ID NO:89的残基50-66(CDR-H2); SEQ ID NO:80的残基50-66(CDR-H2);
SEQ ID NO:89的残基99-108(CDR-H3); SEQ ID NO:80的残基99-108(CDR-H3);
SEQ ID NO:170的残基24-34(CDR-L1); SEQ ID NO:172的残基24-34(CDR-L1);
SEQ ID NO:170的残基50-56(CDR-L2); SEQ ID NO:172的残基50-56(CDR-L2);
SEQ ID NO:170的残基89-97(CDR-L3); SEQ ID NO:172的残基89-97(CDR-L3);
SEQ ID NO:75的残基31-35(CDR-H1); SEQ ID NO:196的残基31-35(CDR-H1);
SEQ ID NO:75的残基50-66(CDR-H2) SEQ ID NO:196的残基50-66(CDR-H2);
SEQ ID NO:75的残基99-108(CDR-H3); SEQ ID NO:196的残基99-108(CDR-H3);
SEQ ID NO:181的残基24-34(CDR-L1); SEQ ID NO:197的残基24-34(CDR-L1);
SEQ ID NO:181的残基50-56(CDR-L2); SEQ ID NO:197的残基50-56(CDR-L2);
SEQ ID NO:181的残基89-97(CDR-L3); SEQ ID NO:197的残基89-97(CDR-L3);
SEQ ID NO:92的残基31-35(CDR-H1); SEQ ID NO:198的残基31-35(CDR-H1);
SEQ ID NO:92的残基50-66(CDR-H2); SEQ ID NO:198的残基50-66(CDR-H2);
SEQ ID NO:92的残基99-108(CDR-H3); SEQ ID NO:198的残基99-108(CDR-H3);
SEQ ID NO:184的残基24-34(CDR-L1); SEQ ID NO:199的残基24-34(CDR-L1);
SEQ ID NO:184的残基50-56(CDR-L2); SEQ ID NO:199的残基50-56(CDR-L2);
SEQ ID NO:184的残基89-97(CDR-L3); SEQ ID NO:199的残基89-97(CDR-L3);
SEQ ID NO:200的残基31-35(CDR-H1); SEQ ID NO:202的残基31-35(CDR-H1);
SEQ ID NO:200的残基50-66(CDR-H2); SEQ ID NO:202的残基50-66(CDR-H2);
SEQ ID NO:200的残基99-108(CDR-H3); SEQ ID NO:202的残基99-108(CDR-H3);
SEQ ID NO:201的残基24-34(CDR-L1); SEQ ID NO:203的残基24-34(CDR-L1);
[0117]SEQ ID NO:201的残基50-56(CDR-L2); SEQ ID NO:203的残基50-56(CDR-L2);
SEQ ID NO:201的残基89-97(CDR-L3); SEQ ID NO:203的残基89-97(CDR-L3);
SEQ ID NO:204的残基31-35(CDR-H1); SEQ ID NO:206的残基31-35(CDR-H1);
SEQ ID NO:204的残基50-66(CDR-H2); SEQ ID NO:206的残基50-66(CDR-H2);
SEQ ID NO:204的残基99-108(CDR-H3); SEQ ID NO:206的残基99-108(CDR-H3);
SEQ ID NO:205的残基24-34(CDR-L1); SEQ ID NO:207的残基24-34(CDR-L1);
SEQ ID NO:205的残基50-56(CDR-L2); SEQ ID NO:207的残基50-56(CDR-L2);
SEQ ID NO:205的残基89-97(CDR-L3); SEQ ID NO:207的残基89-97(CDR-L3);
SEQ ID NO:208的残基31-35(CDR-H1); SEQ ID NO:210的残基31-35(CDR-H1);
SEQ ID NO:208的残基50-66(CDR-H2); SEQ ID NO:210的残基50-66(CDR-H2);
SEQ ID NO:208的残基99-108(CDR-H3); SEQ ID NO:210的残基99-108(CDR-H3);
SEQ ID NO:209的残基24-34(CDR-L1); SEQ ID NO:211的残基24-34(CDR-L1);
SEQ ID NO:209的残基50-56(CDR-L2); SEQ ID NO:211的残基50-56(CDR-L2);
SEQ ID NO:209的残基89-97(CDR-L3); SEQ ID NO:211的残基89-97(CDR-L3);
SEQ ID NO:103的残基31-35(CDR-H1); SEQ ID NO:126的残基31-35(CDR-H1);
SEQ ID NO:103的残基50-66(CDR-H2); SEQ ID NO:126的残基50-66(CDR-H2);
SEQ ID NO:103的残基99-108(CDR-H3); SEQ ID NO:126的残基99-108(CDR-H3);
SEQ ID NO:59的残基24-34(CDR-L1); SEQ ID NO:59的残基24-34(CDR-L1);
SEQ ID NO:59的残基50-56(CDR-L2); SEQ ID NO:59的残基50-56(CDR-L2);
SEQ ID NO:59的残基89-97(CDR-L3); SEQ ID NO:59的残基89-97(CDR-L3);
SEQ ID NO:104的残基31-35(CDR-H1); SEQ ID NO:127的残基31-35(CDR-H1);
SEQ ID NO:104的残基50-66(CDR-H2); SEQ ID NO:127的残基50-66(CDR-H2);
SEQ ID NO:104的残基99-108(CDR-H3); SEQ ID NO:127的残基99-108(CDR-H3);
SEQ ID NO:59的残基24-34(CDR-L1); SEQ ID NO:59的残基24-34(CDR-L1);
SEQ ID NO:59的残基50-56(CDR-L2); SEQ ID NO:59的残基50-56(CDR-L2);
SEQ ID NO:59的残基89-97(CDR-L3); SEQ ID NO:59的残基89-97(CDR-L3);
SEQ ID NO:105的残基31-35(CDR-H1); SEQ ID NO:128的残基31-35(CDR-H1);
SEQ ID NO:105的残基50-66(CDR-H2); SEQ ID NO:128的残基50-66(CDR-H2);
SEQ ID NO:105的残基99-108(CDR-H3); SEQ ID NO:128的残基99-108(CDR-H3);
SEQ ID NO:59的残基24-34(CDR-L1); SEQ ID NO:59的残基24-34(CDR-L1);
SEQ ID NO:59的残基50-56(CDR-L2); SEQ ID NO:59的残基50-56(CDR-L2);
SEQ ID NO:59的残基89-97(CDR-L3); SEQ ID NO:59的残基89-97(CDR-L3);
SEQ ID NO:106的残基31-35(CDR-H1); SEQ ID NO:129的残基31-35(CDR-H1);
SEQ ID NO:106的残基50-66(CDR-H2); SEQ ID NO:129的残基50-66(CDR-H2);
SEQ ID NO:106的残基99-108(CDR-H3); SEQ ID NO:129的残基99-108(CDR-H3);
SEQ ID NO:59的残基24-34(CDR-L1); SEQ ID NO:59的残基24-34(CDR-L1);
SEQ ID NO:59的残基50-56(CDR-L2); SEQ ID NO:59的残基50-56(CDR-L2);
SEQ ID NO:59的残基89-97(CDR-L3); SEQ ID NO:59的残基89-97(CDR-L3);
[0118]SEQ ID NO:107的残基31-35(CDR-H1); SEQ ID NO:130的残基31-35(CDR-H1);
SEQ ID NO:107的残基50-66(CDR-H2); SEQ ID NO:130的残基50-66(CDR-H2);
SEQ ID NO:107的残基99-108(CDR-H3); SEQ ID NO:130的残基99-108(CDR-H3);
SEQ ID NO:59的残基24-34(CDR-L1); SEQ ID NO:59的残基24-34(CDR-L1);
SEQ ID NO:59的残基50-56(CDR-L2); SEQ ID NO:59的残基50-56(CDR-L2);
SEQ ID NO:59的残基89-97(CDR-L3); SEQ ID NO:59的残基89-97(CDR-L3);
SEQ ID NO:108的残基31-35(CDR-H1); SEQ ID NO:131的残基31-35(CDR-H1);
SEQ ID NO:108的残基50-66(CDR-H2); SEQ ID NO:131的残基50-66(CDR-H2);
SEQ ID NO:108的残基99-108(CDR-H3); SEQ ID NO:131的残基99-108(CDR-H3);
SEQ ID NO:59的残基24-34(CDR-L1); SEQ ID NO:59的残基24-34(CDR-L1);
SEQ ID NO:59的残基50-56(CDR-L2); SEQ ID NO:59的残基50-56(CDR-L2);
SEQ ID NO:59的残基89-97(CDR-L3); SEQ ID NO:59的残基89-97(CDR-L3);
SEQ ID NO:109的残基31-35(CDR-H1); SEQ ID NO:132的残基31-35(CDR-H1);
SEQ ID NO:109的残基50-66(CDR-H2); SEQ ID NO:132的残基50-66(CDR-H2);
SEQ ID NO:109的残基99-108(CDR-H3); SEQ ID NO:132的残基99-108(CDR-H3);
SEQ ID NO:59的残基24-34(CDR-L1); SEQ ID NO:59的残基24-34(CDR-L1);
SEQ ID NO:59的残基50-56(CDR-L2); SEQ ID NO:59的残基50-56(CDR-L2);
SEQ ID NO:59的残基89-97(CDR-L3); SEQ ID NO:59的残基89-97(CDR-L3);
SEQ ID NO:110的残基31-35(CDR-H1); SEQ ID NO:133的残基31-35(CDR-H1);
SEQ ID NO:110的残基50-66(CDR-H2); SEQ ID NO:133的残基50-66(CDR-H2);
SEQ ID NO:110的残基99-108(CDR-H3); SEQ ID NO:133的残基99-108(CDR-H3);
SEQ ID NO:59的残基24-34(CDR-L1); SEQ ID NO:59的残基24-34(CDR-L1);
SEQ ID NO:59的残基50-56(CDR-L2); SEQ ID NO:59的残基50-56(CDR-L2);
SEQ ID NO:59的残基89-97(CDR-L3); SEQ ID NO:59的残基89-97(CDR-L3);
SEQ ID NO:111的残基31-35(CDR-H1); SEQ ID NO:134的残基31-35(CDR-H1);
SEQ ID NO:111的残基50-66(CDR-H2); SEQ ID NO:134的残基50-66(CDR-H2);
SEQ ID NO:111的残基99-108(CDR-H3); SEQ ID NO:134的残基99-108(CDR-H3);
SEQ ID NO:59的残基24-34(CDR-L1); SEQ ID NO:59的残基24-34(CDR-L1);
SEQ ID NO:59的残基50-56(CDR-L2); SEQ ID NO:59的残基50-56(CDR-L2);
SEQ ID NO:59的残基89-97(CDR-L3); SEQ ID NO:59的残基89-97(CDR-L3);
SEQ ID NO:112的残基31-35(CDR-H1); SEQ ID NO:135的残基31-35(CDR-H1);
SEQ ID NO:112的残基50-66(CDR-H2); SEQ ID NO:135的残基50-66(CDR-H2);
SEQ ID NO:112的残基99-108(CDR-H3); SEQ ID NO:135的残基99-108(CDR-H3);
SEQ ID NO:59的残基24-34(CDR-L1); SEQ ID NO:59的残基24-34(CDR-L1);
SEQ ID NO:59的残基50-56(CDR-L2); SEQ ID NO:59的残基50-56(CDR-L2);
SEQ ID NO:59的残基89-97(CDR-L3); SEQ ID NO:59的残基89-97(CDR-L3);
SEQ ID NO:113的残基31-35(CDR-H1); SEQ ID NO:136的残基31-35(CDR-H1);
SEQ ID NO:113的残基50-66(CDR-H2); SEQ ID NO:136的残基50-66(CDR-H2);
[0119]SEQ ID NO:113的残基99-108(CDR-H3); SEQ ID NO:136的残基99-108(CDR-H3);
SEQ ID NO:59的残基24-34(CDR-L1); SEQ ID NO:59的残基24-34(CDR-L1);
SEQ ID NO:59的残基50-56(CDR-L2); SEQ ID NO:59的残基50-56(CDR-L2);
SEQ ID NO:59的残基89-97(CDR-L3); SEQ ID NO:59的残基89-97(CDR-L3);
SEQ ID NO:114的残基31-35(CDR-H1); SEQ ID NO:137的残基31-35(CDR-H1);
SEQ ID NO:114的残基50-66(CDR-H2); SEQ ID NO:137的残基50-66(CDR-H2);
SEQ ID NO:114的残基99-108(CDR-H3); SEQ ID NO:137的残基99-108(CDR-H3);
SEQ ID NO:59的残基24-34(CDR-L1); SEQ ID NO:59的残基24-34(CDR-L1);
SEQ ID NO:59的残基50-56(CDR-L2); SEQ ID NO:59的残基50-56(CDR-L2);
SEQ ID NO:59的残基89-97(CDR-L3); SEQ ID NO:59的残基89-97(CDR-L3);
SEQ ID NO:115的残基31-35(CDR-H1); SEQ ID NO:138的残基31-35(CDR-H1);
SEQ ID NO:115的残基50-66(CDR-H2); SEQ ID NO:138的残基50-66(CDR-H2);
SEQ ID NO:115的残基99-108(CDR-H3); SEQ ID NO:138的残基99-108(CDR-H3);
SEQ ID NO:59的残基24-34(CDR-L1); SEQ ID NO:59的残基24-34(CDR-L1);
SEQ ID NO:59的残基50-56(CDR-L2); SEQ ID NO:59的残基50-56(CDR-L2);
SEQ ID NO:59的残基89-97(CDR-L3); SEQ ID NO:59的残基89-97(CDR-L3);
SEQ ID NO:116的残基31-35(CDR-H1); SEQ ID NO:139的残基31-35(CDR-H1);
SEQ ID NO:116的残基50-66(CDR-H2); SEQ ID NO:139的残基50-66(CDR-H2);
SEQ ID NO:116的残基99-108(CDR-H3); SEQ ID NO:139的残基99-108(CDR-H3);
SEQ ID NO:59的残基24-34(CDR-L1); SEQ ID NO:59的残基24-34(CDR-L1);
SEQ ID NO:59的残基50-56(CDR-L2); SEQ ID NO:59的残基50-56(CDR-L2);
SEQ ID NO:59的残基89-97(CDR-L3); SEQ ID NO:59的残基89-97(CDR-L3);
SEQ ID NO:117的残基31-35(CDR-H1); SEQ ID NO:140的残基31-35(CDR-H1);
SEQ ID NO:117的残基50-66(CDR-H2); SEQ ID NO:140的残基50-66(CDR-H2);
SEQ ID NO:117的残基99-108(CDR-H3); SEQ ID NO:140的残基99-108(CDR-H3);
SEQ ID NO:59的残基24-34(CDR-L1); SEQ ID NO:59的残基24-34(CDR-L1);
SEQ ID NO:59的残基50-56(CDR-L2); SEQ ID NO:59的残基50-56(CDR-L2);
SEQ ID NO:59的残基89-97(CDR-L3); SEQ ID NO:59的残基89-97(CDR-L3);
SEQ ID NO:118的残基31-35(CDR-H1); SEQ ID NO:141的残基31-35(CDR-H1);
SEQ ID NO:118的残基50-66(CDR-H2); SEQ ID NO:141的残基50-66(CDR-H2);
SEQ ID NO:118的残基99-108(CDR-H3); SEQ ID NO:141的残基99-108(CDR-H3);
SEQ ID NO:59的残基24-34(CDR-L1); SEQ ID NO:59的残基24-34(CDR-L1);
SEQ ID NO:59的残基50-56(CDR-L2); SEQ ID NO:59的残基50-56(CDR-L2);
SEQ ID NO:59的残基89-97(CDR-L3); SEQ ID NO:59的残基89-97(CDR-L3);
SEQ ID NO:119的残基31-35(CDR-H1); SEQ ID NO:142的残基31-35(CDR-H1);
SEQ ID NO:119的残基50-66(CDR-H2); SEQ ID NO:142的残基50-66(CDR-H2);
SEQ ID NO:119的残基99-108(CDR-H3); SEQ ID NO:142的残基99-108(CDR-H3);
SEQ ID NO:59的残基24-34(CDR-L1); SEQ ID NO:59的残基24-34(CDR-L1);
[0120]SEQ ID NO:59的残基50-56(CDR-L2); SEQ ID NO:59的残基50-56(CDR-L2);
SEQ ID NO:59的残基89-97(CDR-L3); SEQ ID NO:59的残基89-97(CDR-L3);
SEQ ID NO:120的残基31-35(CDR-H1); SEQ ID NO:143的残基31-35(CDR-H1);
SEQ ID NO:120的残基50-66(CDR-H2); SEQ ID NO:143的残基50-66(CDR-H2);
SEQ ID NO:120的残基99-108(CDR-H3); SEQ ID NO:143的残基99-108(CDR-H3);
SEQ ID NO:59的残基24-34(CDR-L1); SEQ ID NO:59的残基24-34(CDR-L1);
SEQ ID NO:59的残基50-56(CDR-L2); SEQ ID NO:59的残基50-56(CDR-L2);
SEQ ID NO:59的残基89-97(CDR-L3); SEQ ID NO:59的残基89-97(CDR-L3);
SEQ ID NO:121的残基31-35(CDR-H1); SEQ ID NO:144的残基31-35(CDR-H1);
SEQ ID NO:121的残基50-66(CDR-H2); SEQ ID NO:144的残基50-66(CDR-H2);
SEQ ID NO:121的残基99-108(CDR-H3); SEQ ID NO:144的残基99-108(CDR-H3);
SEQ ID NO:59的残基24-34(CDR-L1); SEQ ID NO:59的残基24-34(CDR-L1);
SEQ ID NO:59的残基50-56(CDR-L2); SEQ ID NO:59的残基50-56(CDR-L2);
SEQ ID NO:59的残基89-97(CDR-L3); SEQ ID NO:59的残基89-97(CDR-L3);
SEQ ID NO:122的残基31-35(CDR-H1); SEQ ID NO:145的残基31-35(CDR-H1);
SEQ ID NO:122的残基50-66(CDR-H2); SEQ ID NO:145的残基50-66(CDR-H2);
SEQ ID NO:122的残基99-108(CDR-H3); SEQ ID NO:145的残基99-108(CDR-H3);
SEQ ID NO:59的残基24-34(CDR-L1); SEQ ID NO:59的残基24-34(CDR-L1);
SEQ ID NO:59的残基50-56(CDR-L2); SEQ ID NO:59的残基50-56(CDR-L2);
SEQ ID NO:59的残基89-97(CDR-L3); SEQ ID NO:59的残基89-97(CDR-L3);
SEQ ID NO:123的残基31-35(CDR-H1); SEQ ID NO:146的残基31-35(CDR-H1);
SEQ ID NO:123的残基50-66(CDR-H2); SEQ ID NO:146的残基50-66(CDR-H2);
SEQ ID NO:123的残基99-108(CDR-H3); SEQ ID NO:146的残基99-108(CDR-H3);
SEQ ID NO:59的残基24-34(CDR-L1); SEQ ID NO:59的残基24-34(CDR-L1);
SEQ ID NO:59的残基50-56(CDR-L2); SEQ ID NO:59的残基50-56(CDR-L2);
SEQ ID NO:59的残基89-97(CDR-L3); SEQ ID NO:59的残基89-97(CDR-L3);
SEQ ID NO:124的残基31-35(CDR-H1); SEQ ID NO:147的残基31-35(CDR-H1);
SEQ ID NO:124的残基50-66(CDR-H2); SEQ ID NO:147的残基50-66(CDR-H2);
SEQ ID NO:124的残基99-108(CDR-H3); SEQ ID NO:147的残基99-108(CDR-H3);
SEQ ID NO:59的残基24-34(CDR-L1); SEQ ID NO:59的残基24-34(CDR-L1);
SEQ ID NO:59的残基50-56(CDR-L2); SEQ ID NO:59的残基50-56(CDR-L2);
SEQ ID NO:59的残基89-97(CDR-L3); SEQ ID NO:59的残基89-97(CDR-L3);
SEQ ID NO:125的残基31-35(CDR-H1); SEQ ID NO:148的残基31-35(CDR-H1);
SEQ ID NO:125的残基50-66(CDR-H2); SEQ ID NO:148的残基50-66(CDR-H2);
SEQ ID NO:125的残基99-108(CDR-H3); SEQ ID NO:148的残基99-108(CDR-H3);
SEQ ID NO:59的残基24-34(CDR-L1); SEQ ID NO:59的残基24-34(CDR-L1);
SEQ ID NO:59的残基50-56(CDR-L2); SEQ ID NO:59的残基50-56(CDR-L2);
SEQ ID NO:59的残基89-97(CDR-L3); SEQ ID NO:59的残基89-97(CDR-L3)。
[0121] 在另一个实施方案中,上文描述的结合蛋白包含至少3个CDR,其中所述3个CDR来自选自以下的CDR集合(set)的CDR集合:
[0122]
[0123]
[0124]
[0125]
[0126]
[0127]
[0128]
[0129]
[0130]
[0131]
[0132]
[0133]
[0134]
[0135]
[0136]
[0137]
[0138] 在另一个实施方案中,上文描述的结合蛋白包含来自2个CDR集合的CDR,所述2个CDR集合选自以上CDR集合。
[0139] 在另一个实施方案中,本发明提供了包含来自来自以上组的2个CDR集合的CDR的结合蛋白,其中所述2个CDR集合选自:
[0140]CDR集合1和CDR集合2 CDR集合101和CDR集合102
CDR集合3和CDR集合4 CDR集合103和CDR集合104
CDR集合5和CDR集合6 CDR集合105和CDR集合106
CDR集合7和CDR集合8 CDR集合107和CDR集合108
CDR集合9和CDR集合10 CDR集合109和CDR集合110
CDR集合11和CDR集合12 CDR集合111和CDR集合112
CDR集合13和CDR集合14 CDR集合113和CDR集合114
CDR集合15和CDR集合16 CDR集合115和CDR集合116
CDR集合17和CDR集合18 CDR集合117和CDR集合118
CDR集合19和CDR集合20 CDR集合119和CDR集合120
CDR集合21和CDR集合22 CDR集合121和CDR集合122
CDR集合23和CDR集合24 CDR集合123和CDR集合124
CDR集合25和CDR集合26 CDR集合125和CDR集合126
CDR集合27和CDR集合28 CDR集合127和CDR集合128
CDR集合29和CDR集合30 CDR集合129和CDR集合130
CDR集合31和CDR集合32 CDR集合131和CDR集合132
CDR集合33和CDR集合34 CDR集合133和CDR集合134
CDR集合35和CDR集合36 CDR集合135和CDR集合136
CDR集合37和CDR集合38 CDR集合137和CDR集合138
CDR集合39和CDR集合40 CDR集合139和CDR集合140
CDR集合41和CDR集合42 CDR集合141和CDR集合142
CDR集合43和CDR集合44 CDR集合143和CDR集合144
CDR集合45和CDR集合46 CDR集合145和CDR集合146
CDR集合47和CDR集合48 CDR集合147和CDR集合148
CDR集合49和CDR集合50 CDR集合149和CDR集合150
CDR集合51和CDR集合52 CDR集合151和CDR集合152
CDR集合53和CDR集合54 CDR集合153和CDR集合154
CDR集合55和CDR集合56 CDR集合155和CDR集合156
CDR集合57和CDR集合58 CDR集合157和CDR集合158
CDR集合59和CDR集合60 CDR集合159和CDR集合160
CDR集合61和CDR集合62 CDR集合161和CDR集合162
CDR集合63和CDR集合64 CDR集合163和CDR集合164
CDR集合65和CDR集合66 CDR集合165和CDR集合166
CDR集合67和CDR集合68 CDR集合167和CDR集合168
CDR集合69和CDR集合70 CDR集合169和CDR集合170
CDR集合71和CDR集合72 CDR集合171和CDR集合172
[0141]CDR集合73和CDR集合74 CDR集合173和CDR集合174
CDR集合75和CDR集合76 CDR集合175和CDR集合176
CDR集合77和CDR集合78 CDR集合177和CDR集合178
CDR集合79和CDR集合80 CDR集合179和CDR集合180
CDR集合81和CDR集合82 CDR集合181和CDR集合182
CDR集合83和CDR集合84 CDR集合183和CDR集合184
CDR集合85和CDR集合86 CDR集合185和CDR集合186
CDR集合87和CDR集合88 CDR集合187和CDR集合188
CDR集合89和CDR集合90 CDR集合189和CDR集合190
CDR集合91和CDR集合92 CDR集合191和CDR集合192
CDR集合93和CDR集合94 CDR集合193和CDR集合194
CDR集合95和CDR集合96 CDR集合195和CDR集合196
CDR集合97和CDR集合98 CDR集合197和CDR集合198
CDR集合99和CDR集合100 CDR集合199和CDR集合200
[0142] 在另一个实施方案中,上文描述的结合蛋白还包含人接纳体构架。优选地,所述人构架包含包含选自SEQ ID NO:7-10、13-16、25、240-316和317-381的氨基酸序列。在一个实施方案中,本发明的结合蛋白包含选自SEQ ID NO:7-10和13-16的人构架序列。
[0143] 本发明的结合蛋白包括那些包含人接纳体构架的结合蛋白,所述人接纳体构架包含至少一个构架区氨基酸置换,其中所述构架的氨基酸序列与所述人接纳体构架的序列的同一性至少为65%,并且包含至少70个与所述人接纳体构架相同的氨基酸残基。
[0144] 在另一个实施方案中,本发明的结合蛋白包含人接纳体构架,其中所述接纳体构架在关键残基处包含至少一个构架区氨基酸置换,所述关键残基选自以下残基:与CDR毗邻的残基;糖基化位点残基;稀有残基;能够与人IL-1β相互作用的残基;能够与CDR相互作用的残基;规范残基;重链可变域和轻链可变域之间的接触残基;Vernier区内的残基;和在Chothia定义的可变重链CDR1和Kabat定义的第一重链构架之间重叠的区域内的残基。在示例性实施方案中,本发明的结合蛋白包含关键残基,其中所述关键残基选自:2H、4H、24H、26H、27H、29H、34H、35H、37H、39H、44H、45H、47H、48H、49H、50H、51H、58H、59H、60H、63H、67H、
69H、71H、73H、76H、78H、91H、93H、94H、2L、4L、25L、29L、27bL、33L、34L、36L、38L、43L、44L、
46L、47L、48L、49L、55L、58L、62L、64L、71L、87L、89L、90L、91L、94L、95L(均是Kabat编号)。用于本发明的结合蛋白的人源化的这些残基的示例性子集由27H、48H、67H、69H、93H、36L、
43L、46L、47L、49L、58L、71L和87L组成。
[0145] 在另一个实施方案中,本发明的结合蛋白包含共有人可变域。
[0146] 在一个实施方案中,本发明的IL-1β结合蛋白包含至少一个可变域,所述可变域包含选自SEQ ID NO:60-189的氨基酸序列。
[0147] 在另一个实施方案中,本发明的结合蛋白包含至少一个可变重链(VH)区(或结构域),所述可变重链区(或结构域)包含选自SEQ ID NO:60-148、196、198、200、202、204、206、208和210的氨基酸序列。
[0148] 在另一个实施方案中,根据本发明的结合蛋白包含至少一个可变轻链(VL)区(或结构域),所述可变轻链区(或结构域)包含选自SEQ ID NO:149-189的氨基酸序列。
[0149] 在又一个实施方案中,根据本发明的结合蛋白包含至少一个VH区和至少一个VL区,所述VH区包含选自SEQ ID NO:60-148、196、198、200、202、204、206、208和210的氨基酸序列,所述VL区包含选自SEQ ID NO:149-189、197、199、201、203、205、207、209和211的氨基酸序列。
[0150] 在一个实施方案中,根据本发明的结合蛋白包含2个可变域,其中所述2个可变域包含选自以下的氨基酸序列:
[0151]SEQ ID NO:60和SEQ ID NO:149 SEQ ID NO:198和SEQ ID NO:199
SEQ ID NO:69和SEQ ID NO:173 SEQ ID NO:202和SEQ ID NO:203
SEQ ID NO:67和SEQ ID NO:151 SEQ ID NO:206和SEQ ID NO:207
SEQ ID NO:88和SEQ ID NO:159 SEQ ID NO:210和SEQ ID NO:211
SEQ ID NO:96和SEQ ID NO:155 SEQ ID NO:103和SEQ ID NO:59
SEQ ID NO:90和SEQ ID NO:182 SEQ ID NO:104和SEQ ID NO:59
SEQ ID NO:90和SEQ ID NO:167 SEQ ID NO:105和SEQ ID NO:59
SEQ ID NO:90和SEQ ID NO:164 SEQ ID NO:106和SEQ ID NO:59
SEQ ID NO:73和SEQ ID NO:174 SEQ ID NO:107和SEQ ID NO:59
SEQ ID NO:86和SEQ ID NO:159 SEQ ID NO:108和SEQ ID NO:59
SEQ ID NO:90和SEQ ID NO:169 SEQ ID NO:109和SEQ ID NO:59
SEQ ID NO:91和SEQ ID NO:165 SEQ ID NO:110和SEQ ID NO:59
SEQ ID NO:76和SEQ ID NO:175 SEQ ID NO:111和SEQ ID NO:59
SEQ ID NO:99和SEQ ID NO:189 SEQ ID NO:112和SEQ ID NO:59
SEQ ID NO:100和SEQ ID NO:168 SEQ ID NO:113和SEQ ID NO:59
SEQ ID NO:71和SEQ ID NO:170 SEQ ID NO:114和SEQ ID NO:59
SEQ ID NO:84和SEQ ID NO:188 SEQ ID NO:115和SEQ ID NO:59
SEQ ID NO:78和SEQ ID NO:179 SEQ ID NO:116和SEQ ID NO:59
SEQ ID NO:93和SEQ ID NO:176 SEQ ID NO:117和SEQ ID NO:59
SEQ ID NO:87和SEQ ID NO:154 SEQ ID NO:118和SEQ ID NO:59
SEQ ID NO:85和SEQ ID NO:162 SEQ ID NO:119和SEQ ID NO:59
SEQ ID NO:89和SEQ ID NO:170 SEQ ID NO:120和SEQ ID NO:59
[0152]SEQ ID NO:75和SEQ ID NO:181 SEQ ID NO:121和SEQ ID NO:59
SEQ ID NO:92和SEQ ID NO:184 SEQ ID NO:122和SEQ ID NO:59
SEQ ID NO:200和SEQ ID NO:201 SEQ ID NO:123和SEQ ID NO:59
SEQ ID NO:204和SEQ ID NO:205 SEQ ID NO:124和SEQ ID NO:59
SEQ ID NO:208和SEQ ID NO:209 SEQ ID NO:125和SEQ ID NO:59
SEQ ID NO:63和SEQ ID NO:150 SEQ ID NO:126和SEQ ID NO:59
SEQ ID NO:97和SEQ ID NO:187 SEQ ID NO:127和SEQ ID NO:59
SEQ ID NO:90和SEQ ID NO:156 SEQ ID NO:128和SEQ ID NO:59
SEQ ID NO:92和SEQ ID NO:153 SEQ ID NO:129和SEQ ID NO:59
SEQ ID NO:94和SEQ ID NO:166 SEQ ID NO:130和SEQ ID NO:59
SEQ ID NO:82和SEQ ID NO:159 SEQ ID NO:131和SEQ ID NO:59
SEQ ID NO:101和SEQ ID NO:158 SEQ ID NO:132和SEQ ID NO:59
SEQ ID NO:96和SEQ ID NO:157 SEQ ID NO:133和SEQ ID NO:59
SEQ ID NO:70和SEQ ID NO:161 SEQ ID NO:134和SEQ ID NO:59
SEQ ID NO:83和SEQ ID NO:158 SEQ ID NO:135和SEQ ID NO:59
SEQ ID NO:102和SEQ ID NO:185 SEQ ID NO:136和SEQ ID NO:59
SEQ ID NO:98和SEQ ID NO:160 SEQ ID NO:137和SEQ ID NO:59
SEQ ID NO:74和SEQ ID NO:186 SEQ ID NO:138和SEQ ID NO:59
SEQ ID NO:95和SEQ ID NO:157 SEQ ID NO:139和SEQ ID NO:59
SEQ ID NO:72和SEQ ID NO:178 SEQ ID NO:140和SEQ ID NO:59
SEQ ID NO:96和SEQ ID NO:163 SEQ ID NO:141和SEQ ID NO:59
SEQ ID NO:77和SEQ ID NO:183 SEQ ID NO:142和SEQ ID NO:59
SEQ ID NO:90和SEQ ID NO:171 SEQ ID NO:143和SEQ ID NO:59
SEQ ID NO:79和SEQ ID NO:180 SEQ ID NO:144和SEQ ID NO:59
SEQ ID NO:381和SEQ ID NO:152 SEQ ID NO:145和SEQ ID NO:59
SEQ ID NO:81和SEQ ID NO:177 SEQ ID NO:146和SEQ ID NO:59
SEQ ID NO:80和SEQ ID NO:172 SEQ ID NO:147和SEQ ID NO:59
SEQ ID NO:196和SEQ ID NO:197 SEQ ID NO:148和SEQ ID NO:59
[0153] 在另一个实施方案中,本文所述的IL-1β结合蛋白选自:免疫球蛋白分子、scFv、单克隆抗体、人源化抗体、嵌合抗体、人源化抗体、Fab片段、Fab′片段、F(ab′)2、Fv和二硫键连接的Fv。
[0154] 在本发明的一个方面,本文所述的结合蛋白能够调节IL-1的生物学功能。在另一个方面,本文所述的结合蛋白能够中和IL-1。
[0155] 在一个实施方案中,本文所述的结合蛋白具有针对IL-1β的选自以下的结合速率常数(Kon):至少约102M-1s-1;至少约103M-1s-1;至少约104M-1s-1;至少约105M-1s-1;和至少约106M-1s-1,如通过表面胞质团共振法所测量的。
[0156] 在另一个实施方案中,本文所述的结合蛋白具有针对IL-1β的选自以下的脱离(off)速率常数(Koff):至多约10-3s-1;至多约10-4s-1;至多约10-5s-1;和至多约10-6s-1,如通过表面胞质团共振法所测量的。
[0157] 在另一个实施方案中,本文所述的结合蛋白具有针对IL-1β的选自以下的解离常数(KD):至多约10-7M;至多约10-8M;至多约10-9M;至多约10-10M;至多约10-11M;至多约10-12M;和至多10-13M。
[0158] 在一个方面,本发明提供了包含本文所述的结合蛋白并且还包含接头或免疫球蛋白恒定域的结合蛋白构建体。在一个实施方案中,所述结合蛋白构建体包含结合蛋白,其中所述结合蛋白选自:免疫球蛋白分子、二硫键连接的Fv、单克隆抗体、scFv、嵌合抗体、CDR移植抗体、双体抗体(diabody)、人源化抗体、多特异性抗体、Fab、双特异性抗体、Fab′、双特异性抗体和F(ab′)2、DVD-IgTM和Fv。
[0159] 在一个实施方案中,结合蛋白构建体包含选自以下的重链免疫球蛋白恒定域:人IgM恒定域、人IgG4恒定域、人IgG1恒定域、人IgE恒定域、人IgG2恒定域和人IgG3恒定域和人IgA恒定域。
[0160] 在另一个实施方案中,结合蛋白构建体包含具有选自SEQ ID NO:3、SEQID NO:4、SEQ ID NO:5和SEQ ID NO:6的氨基酸序列的免疫球蛋白恒定域。
[0161] 本发明也提供一种结合蛋白缀合物,其包含本文所述的结合蛋白构建体并且还包含选自以下的试剂:免疫黏附分子、成像剂、治疗剂和细胞毒药剂。有用作为本文所述的结合蛋白缀合物中的试剂结构部分的成像剂包括但不限于放射性标记、酶、荧光标记、发光标记、生物发光标记、磁性标记和生物素。在一个实施方案中,放射性标记选自:3H、14C、35S、90Y、99Tc、111In、125I、131I、177Lu、166Ho和153Sm。
[0162] 在另一个实施方案中,结合蛋白缀合物包含试剂,其中所述试剂是选自以下的治疗剂或细胞毒药剂:抗代谢药、烷基化剂、抗生素、生长因子、细胞因子、抗血管生成剂、抗有丝分裂剂、蒽环霉素、毒素和凋亡剂。
[0163] 在一个实施方案中,本文所述的结合蛋白、结合蛋白构建体或结合蛋白缀合物拥有人糖基化模式。
[0164] 本文所述的结合蛋白、结合蛋白构建体和结合蛋白缀合物可以作为可溶性蛋白或作为晶体存在。在一个实施方案中,此类晶体是不含载体的药物控释晶体。在另一个实施方案中,本文所述的结合蛋白、结合蛋白构建体或结合蛋白缀合物的晶体形式比其可溶性对应物具有更长的体内半寿期。在另一个实施方案中,本文所述的结合蛋白、结合蛋白构建体或结合蛋白缀合物的晶体保留其可溶性对应物的生物学活性。
[0165] 本发明的组合物包括用于释放本文所述的结晶的结合蛋白、结合蛋白构建体或结合蛋白缀合物的组合物,所述组合物包含:
[0166] (a)制剂,其中所述制剂包含本文所述的结晶的结合蛋白、结合蛋白构建体或结合蛋白缀合物,和一种成分;以及
[0167] b)至少一种聚合物载体。
[0168] 有用于本发明组合物中的聚合物载体非限制性地包括以下聚合物中的一种或更多种:聚(丙烯酸)、聚(氰基丙烯酸酯)、聚(氨基酸)、聚(酸酐)、聚(缩肽)、聚(酯)、聚(乳酸)、聚(乳酸-共聚-乙醇酸)或PLGA、聚(b-羟基丁酸酯)、聚(己内酯)、聚(二噁烷);聚(乙二醇)、聚((羟丙基)甲基丙烯酰胺)、聚[(有机)磷腈]、聚(原酸酯)、聚(乙烯醇)、聚(乙烯吡咯烷酮)、来酸酐-烷基乙烯醚共聚物、复合多元醇(pluronic polyols)、白蛋白、藻酸盐、纤维素和纤维素衍生物、胶原、纤维蛋白、明胶、透明质酸、寡糖、糖胺聚糖(glycaminoglycans)、硫酸多糖、其共混物及共聚物。
[0169] 在另一个方面,本发明组合物的成分选自白蛋白、蔗糖、海藻糖、乳糖醇(lactitol)、明胶、羟丙基-β-环糊精、甲基聚乙二醇和聚乙二醇。
[0170] 本发明也提供了药物组合物,其包含本文所述的结合蛋白、结合蛋白构建体或结合蛋白缀合物、和可药用载体。本发明的药物组合物还可以包含至少一种额外试剂。在一个实施方案中,此类额外试剂包括但不限于治疗剂、成像剂、细胞毒药剂、血管生成抑制剂、激酶抑制剂、共刺激分子阻断剂、黏附分子阻断剂、抗细胞因子抗体或其功能性片段、甲氨蝶呤、环孢菌素、雷帕霉素、FK506、可检测的标记或报道分子、TNF拮抗剂、抗风湿药、肌肉松弛药、麻醉药(narcotic)、非甾体抗炎药(NSAID)、镇痛药、麻醉药、镇静剂、局部麻醉药、神经肌肉阻滞剂、抗微生物药、抗银屑病药、皮质类固醇、促蛋白合成类固醇、红细胞生成素、免疫药(immunization)、免疫球蛋白、免疫抑制药、生长激素、激素替代药物、放射药物、抗抑郁药、抗精神病药、兴奋剂、哮喘药物、β激动剂、吸入型类固醇、肾上腺素或类似物、细胞因子和细胞因子拮抗剂。
[0171] 在一个实施方案中,本发明的药物组合物包含可药用载体,其中所述载体还充当佐剂,以增加组合物中结合蛋白、结合蛋白构建体或结合蛋白缀合物的吸收或分散。示例性的佐剂是透明质酸酶。在另一个实施方案中,药物组合物还包含至少一种用于治疗其中IL-1β活性有害的病症的额外治疗剂。
[0172] 在一个实施方案中,本发明提供分离的核酸,其编码本文所述的结合蛋白的一种或更多种氨基酸序列。此类核酸可被插入用于进行各种遗传分析或用于表达、表征或改善本文所述的结合蛋白的一种或更多种性能的载体中。载体可以包含编码本文所述的结合蛋白的一种或更多种氨基酸序列的一种或更多种核酸分子,其中所述一种或更多种核酸分子与允许结合蛋白在携带所述载体的特定宿主细胞中表达的适当转录序列和/或翻译序列可操作地(operably)连接。用于克隆或表达编码本文所述结合蛋白的氨基酸序列的核酸的载体实例包括但不限于pcDNA、pTT、pTT3、pEFBOS、pBV、pJV和pBJ。
[0173] 本发明也提供包含载体的宿主细胞,所述载体包含编码本文所述的结合蛋白的一种或更多种氨基酸序列的核酸。有用于本发明中的宿主细胞可以是原核或真核的。示例性的原核宿主细胞是大肠杆菌(Escherichia coli)。作为宿主细胞有用于本发明中的真核细胞包括原生生物细胞、动物细胞、植物细胞和真菌细胞。示例性的真菌细胞是酵母细胞,包括酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae)。有用作为根据本发明的宿主细胞的示例性动物细胞包括但不限于哺乳动物细胞、禽类细胞和昆虫细胞。优选的哺乳动物细胞包括CHO和COS细胞。有用作为根据本发明的宿主细胞的昆虫细胞是昆虫Sf9细胞。
[0174] 在另一个方面,本发明提供产生本文所述的结合蛋白的方法,所述方法包括在培养基中,在足以产生能够结合IL-1α和/或IL-1β的结合蛋白的条件下培养宿主细胞,所述宿主细胞包含编码所述结合蛋白的载体。可以分离如此产生的蛋白质并且将其用于本文所述的各种组合物和方法中。
[0175] 在另一个实施方案中,本发明提供用于降低人IL-1活性的方法,包括使人IL-1与本文所述的结合蛋白接触,以致降低人IL-1活性。
[0176] 本发明的另一个实施方案提供用于治疗受试者病症的方法,所述方法通过向受试者施用本文所述的结合蛋白,以致实现治疗。
[0177] 在另一个实施方案中,本文所述的结合蛋白用于治疗选自以下的病症:糖尿病;葡萄膜炎;神经性疼痛;骨关节炎性疼痛;炎性疼痛;类风湿性关节炎;骨关节炎;幼年型慢性关节炎;脓毒性关节炎;莱姆病关节炎;银屑病关节炎;反应性关节炎;脊椎关节病;系统性红斑狼疮(SLE);克罗恩氏病(Crohn′s disease);溃疡性结肠炎;炎性肠病;自身免疫性糖尿病;胰岛素依赖性糖尿病;甲状腺炎;哮喘;过敏性疾病;银屑病;皮炎;硬皮病;移植物抗宿主病;器官移植排异;与器官移植相关的急性免疫性疾病;与器官移植相关的慢性免疫性疾病;肉瘤样病;动脉粥样硬化;弥漫性血管内凝血(DIC);川崎病(Kawasaki′s disease);格雷夫斯氏病(Grave′s disease);肾病综合征;慢性疲劳综合征;韦格纳肉芽肿病
(Wegener′sgranulomatosis);Henoch-Schoenlein紫癜;肾显微性血管炎;慢性活动性肝炎;自身免疫性葡萄膜炎;脓毒性休克;中毒性休克综合征;脓毒症综合征;恶病质;传染病;
寄生虫病;急性横贯性脊髓炎;亨廷顿舞蹈症;帕金森病;阿尔茨海默病;中风;原发性胆汁性肝硬变;溶血性贫血;恶性肿瘤;心衰竭;心肌梗死;阿狄森病;I型零星多腺体缺陷症;
II型多腺体缺陷症(Schmidt综合征);急性呼吸窘迫综合征(ARDS);脱发;斑秃;血清阴性关节病;关节病;莱特尔病;银屑病性关节病;溃疡性结肠炎关节病;肠病性滑膜炎;衣原体病;
耶尔森菌和沙氏菌相关性关节病;脊椎关节病;动脉粥样硬化病/动脉硬化;异位性变态反应;自身免疫性大疱病;寻常天疱疮;落叶型天疱疮;类天疱疮;线状IgA病;自身免疫性溶血性贫血;库姆氏阳性溶血性贫血;获得性恶性贫血;青少年恶性贫血;肌痛脑脊髓炎/Royal Free病;慢性粘膜皮肤念珠菌病;巨细胞动脉炎(GCA);原发硬化性肝炎;隐源性自身免疫性肝炎;获得性免疫缺陷综合征(AIDS);获得性免疫缺陷相关性疾病;乙型肝炎;丙型肝炎;寻常变异型免疫缺陷(寻常变异型低丙种球蛋白血症);扩张型心肌病;女性不育;卵巢功能衰竭;卵巢功能早衰;纤维化病;隐原性纤维化肺泡炎;炎症后间质性肺病;间质性肺炎;结缔组织病相关性间质性肺病;混合型结缔组织病相关性肺病;系统性硬化症相关性间质性肺病;类风湿性关节炎相关性间质性肺病;系统性红斑狼疮相关性肺病;皮肌炎/多肌炎相关性肺病; 病相关性肺病;强直性脊柱炎相关性肺病;血管炎弥散性肺病;含血黄素沉着症相关性肺病;药物诱导的间质性肺病;纤维化;放射性纤维化;闭塞性细支气管炎;慢性嗜酸性粒细胞性肺炎;淋巴细胞浸润性肺病;感染后间质性肺病;痛风性关节炎;自身免疫性肝炎;1型自身免疫性肝炎(经典自身免疫性或类狼疮性肝炎);2型自身免疫性肝炎(抗LKM抗体肝炎);自身免疫介导的低血糖症;B型胰岛素抵抗伴发黑棘皮病;甲状旁腺功能减退;骨关节病;原发性硬化性胆管炎;1型银屑病;2型银屑病;特发性白细胞减少症;自身免疫性中性粒细胞减少症;肾病NOS;肾小球肾炎;肾显微性血管炎;莱姆病;盘状红斑狼疮;特发性男性不育;一氧化氮相关性男性不育;精子自身免疫症;多发性硬化(全部亚型,包括原发进行型、继发进行型、复发缓解型);交感性眼炎;继发于结缔组织病的肺性高血压;肺出血肾炎综合征;结节性多发性动脉炎的肺部表现;急性风湿热;类风湿性脊柱炎;
斯蒂尔病(Still′s disease);系统性硬化症; 综合征;塔卡亚萨病(Takayasu′s 
disease)/动脉炎;自身免疫性血小板减少症(AITP);特发性血小板减少症;自身免疫性甲状腺病;甲状腺功能亢进症;甲状腺肿性自身免疫性甲状腺功能减退症(桥本氏病);萎缩性自身免疫性甲状腺功能减退症;原发性粘液性水肿;晶状体源性葡萄膜炎;原发性血管炎;
白斑症;急性肝病;慢性肝病;酒精性肝硬化;酒精诱导肝损伤;胆汁淤积;特异体质性肝病;
药物诱导的肝炎;非酒精性脂肪性肝炎;变态反应;B组链球菌(GBS)感染;精神障碍(例如,抑郁和精神分裂症);Th2型和Th1型介导的疾病;急性和慢性疼痛(不同形式的疼痛);癌症(如肺癌、乳腺癌、胃癌、膀胱癌、结肠癌、胰癌、卵巢癌、前列腺癌和直肠癌);造血系统恶性肿瘤;白血病;淋巴瘤;无β脂蛋白血症;肢端发绀症;急性和慢性寄生性或感染性过程;急性白血病;急性淋巴性白血病(ALL);T-细胞ALL;FABALL;急性髓样白血病(AML);急性或慢性细菌性感染;急性胰腺炎;急性肾衰竭;腺癌;心房异位搏动;AIDS痴呆复合征;酒精诱导的肝炎;变应性结膜炎;变应性接触性皮炎;过敏性鼻炎;同种异体移植排斥;α-1抗胰蛋白酶缺乏症;肌萎缩侧索硬化;贫血;心绞痛;前细胞变性;抗CD3疗法;抗磷脂综合征;抗受体超敏反应;主动脉瘤和周围性动脉瘤;主动脉夹层;动脉高血压;动脉硬化;动静脉瘘;共济失调心房颤动(持久性或阵发性);心房扑动;房室传导阻滞;B细胞淋巴瘤;骨移植排斥;骨髓移植(BMT)排斥;束支传导阻滞;伯基特淋巴瘤(Burkitt′s lymphoma);烧伤;心律不齐;
心脏眩晕综合征(cardiac stunsyndrome);心脏肿瘤;心肌病;心肺转流术炎症反应;软骨移植排斥;小脑外皮质变性;小脑疾病;紊乱性或多灶性房性心动过速;化疗相关性病症;慢性粒细胞性白血病(CML);慢性酒精中毒;慢性炎性病理;慢性淋巴细胞白血病(CLL);慢性阻塞性肺病(COPD);慢性水杨酸盐中毒;结直肠癌;充血性心力衰竭;结膜炎;接触性皮炎;
肺源性心脏病;冠状动脉病;克-雅氏病(Creutzfeldt-Jakobdisease);培养阴性脓毒症(culture negative sepsis);囊性纤维化;细胞因子疗法相关性病症;拳击员痴呆;脱髓鞘病;登革出血热;皮炎;皮肤病状;糖尿病;糖尿病性动脉硬化病;弥漫性Lewy体病;扩张性充血性心肌病;基底神经节病症;中年唐氏综合征;由阻断CNS多巴胺受体的药物引起的药物诱导型运动障碍;药物过敏;湿疹;脑脊髓炎;心内膜炎;内分泌病;会厌炎;Epstein-Barr病毒感染;红斑性肢痛病;锥体束外及小脑病;家族性嗜血细胞性淋巴组织细胞增多症;胎儿胸腺植入物排斥;弗里德赖希共济失调;功能性外周动脉病;真菌性败血症;气性坏疽;胃溃疡;肾小球肾炎;任何器官或组织的移植排斥;革兰氏阴性脓毒症;革兰氏阳性脓毒症;归因于胞内生物体的肉芽肿;多毛细胞白血病;哈-斯二氏病(Hallervorden-Spatz disease);
桥本氏甲状腺炎(Hashimoto′s thyroiditis);枯草热;心脏移植排斥;血色素沉着症;血液透析;溶血尿毒症综合征/溶栓性血小板减少性紫癜;出血;甲型肝炎;希氏束心率失常(His bundle arrhythmias);HIV感染/HIV神经病;霍奇金病;多动性运动障碍;超敏反应;过敏性肺炎;高血压;运动机能减退性运动障碍;下丘脑-垂体-肾上腺轴评价;特发性阿狄森病;特发性肺纤维化(IPF);抗体介导的细胞毒性;无力;婴儿脊髓性肌萎缩;主动脉炎症;a型流感;电离辐射暴露;虹膜睫状体炎/葡萄膜炎/视神经炎;局部缺血-再灌注损伤;缺血性发作;幼年型类风湿关节炎;幼年期脊髓性肌萎缩;卡波西肉瘤;肾移植排斥;军团菌病;利什曼病;麻疯病;皮质脊髓束损害;脂肪水肿;肝移植排斥;淋巴水肿;疟疾;恶性淋巴瘤;恶性组织细胞增多症;恶性黑色素瘤;脑膜炎;脑膜炎球菌血症;代谢综合征偏头痛;特发性偏头痛;线粒体多系统障碍;混合型结缔组织病;单克隆丙种球蛋白病;多发性骨髓瘤;多系统变性(Menzel;Dejerine-Thomas;Shy-Drager;和Machado-Joseph);重症肌无力;胞内分枝杆菌病(mycobacterium avium intracellulare);结核分枝杆菌病;骨髓增生异常综合征;
心肌梗死;心肌缺血性病症;鼻咽癌;新生儿慢性肺病;肾炎;肾病;神经变性病;神经源性I肌萎缩;中性粒细胞减少性发热;非霍奇金淋巴瘤;腹主动脉及其分支闭塞;闭塞性动脉病;
疗法;睾丸炎/附睾炎;睾丸炎/输精管复通过程(vasectomy reversal 
procedures);器官巨大症;骨质疏松症;胰移植排斥;胰腺癌;类肿瘤性综合征/恶性肿瘤高血症;甲状旁腺的移植排斥;盆腔炎性疾病;常年性鼻炎;心包疾病;外周动脉粥样硬化性疾病;周围血管病;腹膜炎;恶性贫血;卡氏肺囊虫肺炎;肺炎;POEMS综合征(多发性神经病、器官巨大症、内分泌病、单克隆丙种球蛋白病和皮肤变化综合征);灌注后综合征;后综合征;MI心切开术后综合征;先兆子痫;进行性核上麻痹;原发性肺动脉高压;放射疗法;雷诺氏现象(Raynaud′s phenomenon);雷诺病;雷夫苏姆病(Refsum′sdisease);规则性窄QRS心动过速;肾血管性高血压;再灌注损伤;限制型心肌病;肉瘤;老年舞蹈症;Lewy体型老年性痴呆;血清阴性关节病;休克;镰状细胞性贫血;皮肤同种异体移植排斥;皮肤变化综合征;
小肠移植排斥;实体瘤;特殊心率失常;脊髓性共济失调;脊髓小脑退行性变;链球菌性肌炎;小脑结构性损害;亚急性硬化性全脑炎;晕厥;心血管系统梅毒;全身过敏;全身性炎症反应综合征;全身发病型幼年类风湿性关节炎;毛细血管扩张症;闭塞性血栓性脉管炎;血小板减少症;中毒;移植;创伤/出血;III型超敏反应;IV型超敏反应;不稳定型心绞痛;尿毒症;尿脓毒病;荨麻疹;心脏瓣膜病;静脉曲张;血管炎;静脉病;静脉血栓形成;心室颤动;病毒和真菌感染;病毒性脑炎/无菌性脑膜炎;病毒相关性噬血细胞综合征;韦-科二氏综合征(Wernicke-Korsakoff syndrome);肝豆状核变性(Wilson′s disease);任何器官或组织的异体移植排斥;急性冠状动脉综合征;急性特发性多神经炎;急性炎性脱髓鞘多发性神经根性神经病;急性局部缺血;成人斯蒂尔病;斑秃;过敏反应;抗磷脂抗体综合征;再生障碍性贫血;动脉硬化;异位性湿疹;异位性皮炎;自身免疫性皮炎;与链球菌感染相关的自身免疫病症;自身免疫性肠病;自身免疫性听力损失;自身免疫性淋巴细胞增生综合征(ALPS);自身免疫性心肌炎;自身免疫性卵巢功能早衰;眼睑炎;支气管扩张症;大疱性类天疱疮;心血管疾病;毁灭性抗磷脂综合征(catastrophic antiphospholipidsyndrome);乳糜泻;颈椎病;慢性局部缺血;瘢痕性类天疱疮;存在多发性硬化风险的临床孤立的综合征(CIS);结膜炎;儿童期发病精神异常;泪囊炎;皮肌炎;糖尿病性视网膜病变;椎间盘突出;椎间盘脱出;
药物诱导的免疫性溶血性贫血;心内膜炎;子宫内膜异位症;眼内炎;巩膜外层炎;多形性红斑;重型多形性红斑;妊娠性类天疱疮;格巴二氏综合征(Guillain-Barré syndrome)(GBS);枯草热;休斯氏综合征(Hughes syndrome);特发性帕金森病;特发性间质性肺炎;
IgE介导的变态反应;免疫性溶血性贫血;包涵体肌炎;感染性眼部炎性疾病;炎性脱髓鞘性疾病;炎性心脏病;炎性肾疾病;虹膜炎;角膜炎;干燥性角结膜炎(keratojunctivitis sicca);库斯毛尔病(Kussmaul disease)或Kussmaul-Meier病;急性热病性多神经炎
(Landry′s paralysis);郎格罕氏细胞组织细胞增多症(Langerhan′scell 
histiocytosis);网状青斑;黄斑变性;显微镜下多血管炎;白赫铁列夫症(Morbus 
Bechterev);运动神经元病;粘膜类天疱疮;多器官功能衰竭;重症肌无力;骨髓增生异常综合征;心肌炎;神经根障碍;神经病;非甲非乙肝炎;视神经炎;骨质溶解;少关节JRA;外周动脉闭塞性疾病(PAOD);外周血管疾病(PVD);外周动脉病(PAD);静脉炎;结节性多发性动脉炎(或结节性动脉周围炎);多软骨炎;风湿性多肌痛;白发症;多关节JRA;多内分泌腺缺陷综合征;多肌炎;风湿性多肌痛(PMR);泵后综合征;原发性帕金森症;继发性帕金森症;前列腺炎;单纯红细胞再生障碍;原发性肾上腺功能减退;复发型视神经脊髓炎;再狭窄;风湿性心脏病;SAPHO(滑膜炎、座疮、脓疱病、骨肥厚和骨炎);继发性淀粉样变性;休克肺;巩膜炎;
坐骨神经痛;继发性肾上腺功能减退;氧烷相关性结缔组织病;角层下脓疱性皮肤病(Sneddon-Wilkinson dermatosis);关节强硬性脊椎炎;斯约二氏综合征(Stevens-
Johnson syndrome)(SJS);全身性炎症反应综合征;颞动脉炎;弓形体性视网膜炎;中毒性表皮坏死松解症;横贯性脊髓炎;TRAPS(1型肿瘤坏死因子受体(TNFR)相关的周期性综合征);B型胰岛素抵抗伴发黑棘皮病;I型变态反应;II型糖尿病;荨麻疹;普通间质性肺炎(UIP);春季结膜炎;病毒性视网膜炎;伏格特-小柳-原田三氏综合征(Vogt-Koyanagi-Harada syndrome)(VKH综合征);湿性黄斑变性;伤口愈合;耶尔森菌和沙门氏菌相关性关节病。
[0178] 在本文所述的治疗方法的又一个实施方案中,向受治疗者施用本文所述的结合蛋白或结合蛋白构建体或结合蛋白缀合物的步骤通过选自以下的至少一种模式进行:肠胃外、皮下、肌内、静脉内、关节内、支气管内、腹内、囊内、软骨内、腔内、体腔内(intracelial)、小脑内、脑室内、结肠内、颈管内、胃内、肝内、心肌内、骨内、骨盆内、心包内(intrapericardiac)、腹膜内、胸膜内、前列腺内、肺内、直肠内、肾内、视网膜内、椎管内、滑膜内、胸腔内、子宫内、膀胱内、快速注射(bolus)、经阴道、经直肠、经颊、舌下、鼻内及经皮。
[0179] 本发明的另一个方面是一种治疗患有其中IL-1有害的病症的患者的方法,所述方法包括在施用第二药物之前、同时或之后施用本文所述的结合蛋白、结合蛋白构建体或结合蛋白缀合物的步骤,其中第二药物选自:吸入型甾类;β-激动剂;短效或长效β-激动剂;白三烯或白三烯受体的拮抗剂;ADVAIR;IgE抑制剂;抗IgE抗体;XOLAIR;磷酸二酯抑制剂;PDE4抑制剂;黄嘌呤类;抗胆能药;肥大细胞剂稳定剂;色甘酸(Cromolyn);IL-4抑制剂;
IL-5抑制剂;嗜酸性粒细胞趋化因子/CCR3抑制剂;组胺或其受体(包括H1、H2、H3和H4)的拮抗剂;前列腺素D或其受体DP1和CRTH2的拮抗剂;TNF拮抗剂;TNF受体的可溶性片段;
TNF酶拮抗剂;TNF转化酶(TACE)抑制剂;蕈毒碱受体拮抗剂;TGF-β拮抗剂;干扰
素γ;吡非尼酮(perfenidone);化疗药甲氨蝶呤;来氟米特;西罗莫司(雷帕霉素)或其类似物、CCI-779;COX2或cPLA2抑制剂;NSAID;免疫调节剂;p38抑制剂;TPL-2、MK-2和NFκB抑制剂;布地奈德(budenoside);表皮生长因子;皮质类固醇;环孢菌素;柳氮磺吡啶
(sulfasalazine);氨基水杨酸盐;6-巯基嘌呤;硫唑嘌呤;甲硝唑;脂氧合酶抑制剂;美沙拉嗪(mesalamine);奥沙拉嗪(olsalazine);巴柳氮(Balsalazide);抗氧化剂;血栓烷抑制剂;IL-1受体拮抗剂;抗IL-1β抗体;抗IL-6抗体;生长因子;弹性蛋白酶抑制剂;吡啶基-咪唑化合物;TNF、LT、IL-1、IL-2、IL-3、IL-4、IL-5、IL-6、IL-7、IL-8、IL-9、IL-10、IL-11、IL-
12、IL-14、IL-15、IL-16、IL-17、IL-18、IL-19、IL-20、IL-21、IL-22、IL-23、IL-24、IL-25、IL-26、IL-27、IL-28、IL-29、IL-30、IL-31、IL-32、IL-33、EMAP-II、GM-CSF、FGF或PDGF的抗体或激动剂;CD2、CD3、CD4、CD8、CD25、CD28、CD30、CD40、CD45、CD69、CD90或其配体的抗体;
FK506;雷帕霉素;麦考酚酸吗乙酯(mycophenolate mofetil);布洛芬;泼尼松龙;磷酸二酯酶抑制剂;腺苷激动剂;抗血栓药;补体抑制剂;肾上腺素能药;IRAK、NIK、IKK、p38或MAP激酶抑制剂;IL-1β转化酶抑制剂;TNF-α转化酶抑制剂;T-细胞信号传导抑制剂;金属蛋白酶抑制剂;6-巯基嘌呤;血管紧张素转化酶抑制剂;可溶性细胞因子受体;可溶性p55 TNF受体;可溶性p75 TNF受体;sIL-1RI;sIL-1RII;sIL-6R;抗炎细胞因子;IL-4;IL-10;IL-11;和TGF-β。
[0180] 本发明的另一个方面提供针对本文所述的至少一种IL-1结合蛋白的至少一种IL-1抗独特型抗体。所述抗独特型抗体包括可以并入本发明结合蛋白中的含有分子的任何蛋白质或肽,所述分子包含免疫球蛋白分子的至少一部分,例如但不限于重链或轻链的至少一个CDR或其配体结合部分、重链或轻链可变域、重链或轻链恒定域、构架区或其任何部分。
[0181] 发明详述
[0182] 本发明涉及IL-1β结合蛋白,包括但不限于结合IL-1β的抗IL-1β抗体或其抗原结合部分、以及结合IL-1β和另一个靶标的多价多特异性结合蛋白(如DVD-IgTM)。本发明的多个方面涉及抗体和抗体片段、DVD-Ig结合蛋白和其药物组合物,以及用于制备此类IL-1β结合蛋白(包括抗体、DVD-Ig结合蛋白及其片段)的核酸、重组表达载体和宿主细胞。本发明也包括使用本发明的IL-1β结合蛋白来检测人IL-1β;在体外或在体内抑制人IL-1β;和调节基因表达的方法。
[0183] 本发明还包括能够与本文所述的IL-1β结合蛋白竞争的任何结合蛋白或抗体。
[0184] 除非本文另外定义,否则与本发明相关使用的科学和技术术语应当具有本领域普通技术人员通常理解的含义。所述术语的含义和范围应当是清楚的,然而,在任何潜在模糊性的情况下,本文中提供的定义优先于任何字典定义或外在定义。另外,除非上下文另有要求,否则单数术语应当包括复数,并且复数术语应当包括单数。在本申请中,除非另外声明,否则“或”的使用表示“和/或”。另外,术语“包括”以及其他形式(如“包括了”和“所包括”)的使用不是限制性的。另外,除非另有具体声明,否则术语例如“要素”或“组分”既包括包含一个单位的要素和组分,也包括包含多于一个亚单位的要素和组分。
[0185] 通常,与本文所述的细胞和组织培养、分子生物学、免疫学、微生物学、遗传学和蛋白质和核酸化学及杂交相联系所使用的命名及技术是本领域熟知的和通常使用的那些。除非另外说明,否则本发明的方法和技术通常根据本领域熟知的和如本说明书通篇范围内所引用及讨论的各种普通和更具体参考文献中所述的常规方法来实施。酶促反应和纯化技术根据制造商的说明书(如本领域中通常所完成或如本文所述)来实施。通常,与本文所述的分析化学、合成有机化学、和医学及药物化学相联系所使用的命名及实验室程序和技术是本领域熟知的和通常使用的那些。标准技术用于化学合成、化学分析、药物制备、配制和递送、及患者的治疗。
[0186] 为了可以更容易地理解本发明,下文定义选择的术语。
[0187] 术语“多肽”指氨基酸的任何聚合链(polymeric chain)。术语“肽”和“蛋白质”可与术语“多肽”互换地使用,并且也指氨基酸的聚合链。术语“多肽”包括天然或人工的蛋白质、蛋白质片段和蛋白质序列的多肽类似物。多肽可以是单体的或聚合的。术语“多肽”包括片段及其变体(包括变体的片段),除非与上下文相矛盾。对于抗原性多肽,多肽的片段任选地含有多肽的至少一个连续或非线性表位。可以使用本领域的普通技术来证实至少一个表位片段的精确边界。所述片段包含至少约5个连续氨基酸,例如至少约10个连续氨基酸、至少约15个连续氨基酸或至少约20个连续氨基酸。多肽的变体如本文所述。
[0188] 术语“分离的蛋白质”或“分离的多肽”是这样的蛋白质或多肽:根据其起源或衍生来源,所述蛋白质或多肽与在其天然状态下伴随它的天然相关组分不结合;基本上不含来自相同物种的其它蛋白质;由来自不同物种的细胞表达;或在自然界中不存在。因此,化学合成的或在与其天然起源的细胞不同的细胞系统中合成的多肽将从其天然相关组分“分离”。也可以使用本领域熟知的蛋白质纯化技术,通过分离使一种蛋白质基本上不含天然相关组分。
[0189] 术语“回收”指通过分离(例如使用本领域熟知的蛋白质纯化技术),使化学物质(如多肽)基本上不含天然相关组分的过程。
[0190] 术语“人IL-1α”(本文中缩写为hIL-1α或IL-1α)包括参与各种免疫反应、炎性过程和血细胞生成的多效细胞因子。例如,IL-1α包括由活化的巨噬细胞产生的人细胞因子;它通过诱导IL-2释放、B细胞成熟及增殖、以及成纤维细胞生长因子活性来刺激胸腺细胞增殖。术语“人IL-1α”意在包括可以通过标准重组表达方法来制备的重组人IL-1α(rh IL-1α)。
[0191] 术语“人IL-1β”(本文中缩写为hIL-1β或IL-1β)包括参与各种免疫反应、炎性过程和血细胞生成的多效细胞因子。术语人IL-1β包括可以通过标准重组表达方法来制备的重组人IL-1β(rhIL-1β)。
[0192] 表1中显示人IL-1α和IL-1β的氨基酸序列。
[0193] 表1.人IL-1α和人IL-1β的序列
[0194]
[0195] 术语“生物学活性”指IL-1细胞因子(例如,IL-1α及/或IL-1β)的全部固有生物学性能。IL-1α及IL-1β的生物学性能包括但不限于结合IL-1受体。
[0196] 在指抗体、蛋白质或肽与第二化学物质相互作用时,术语“特异性结合”(″specific binding″或″specifically binding″)表示该相互作用依赖于特定结构(例如,抗原决定簇或表位)在所述化学物质上的存在;例如,抗体识别具体的蛋白结构(而非蛋白质总体)并且与之结合。若抗体对表位“A”具有特异性,则含有表位A的分子(或游离、未标记的A)在含有标记的“A”与该抗体的反应中的存在将减少与抗体结合的标记A的量。
[0197] 术语“抗体”广义地指由4条多肽链(两条重(H)链和两条轻(L)链)组成的任何免疫球蛋白(Ig)分子、或其保留Ig分子的实质性表位结合特征的任何功能性片段、突变体、变体或衍生物。此类突变体、变体或衍生物抗体形式是本领域已知的。下文讨论其非限制性实施方案。
[0198] 在全长抗体中,每条重链由重链可变区(本文中缩写为HCVR或VH)和重链恒定区组成。重链恒定区由3个结构域组成:CH1、CH2和CH3。每条轻链由轻链可变区(本文中缩写为LCVR或VL)和轻链恒定区组成。轻链恒定区由一个结构域(CL)组成。VH和VL区可以进一步再划分为超变区,称为互补决定区(CDR),其散置有更保守的区域(称为构架区(FR))。每个VH和VL由从氨基端至羧基端按以下顺序排列的3个CDR和4个FR组成:FR1、CDR1、FR2、CDR2、FR3、CDR3、FR4。免疫球蛋白分子可以属于任何类型(例如,IgG、IgE、IgM、IgD、IgA和IgY)、类别(例如,IgG1、IgG2、IgG3、IgG4、IgA1和IgA2)或亚类。
[0199] 术语“Fc区”用来定义免疫球蛋白重链的C端区域,所述C端区域可以通过木瓜蛋白酶消化完整的抗体而产生。Fc区可以是天然序列Fc区或变体Fc区。免疫球蛋白的Fc区通常包含2个恒定域(CH2结构域和CH3结构域),且任选地包含CH4结构域。替换Fc部分中的氨基酸残基以改变抗体效应子功能是本领域已知的(Winter等人,美国专利No.5,648,260和5,624,821)。抗体的Fc部分介导几种重要的效应子功能,例如,细胞因子诱导、ADCC、吞噬、依赖于补体的细胞毒性(CDC)和抗体和抗原-抗体复合物的半寿期/清除速率。在一些情况下,这些效应子功能对于治疗性抗体是合意的,但是在其他情况下可能是不必需的或甚至有害的,这取决于治疗目标。某些人IgG同种型(尤其IgG1和IgG3),通过分别与FcγR和补体C1q结合而介导ADCC和CDC。新生儿Fc受体(FcRn)是决定抗体的循环半寿期的关键组分。在又一个实施方案中,将抗体的恒定区(例如抗体的Fc区)中的至少一个氨基酸残基替换,以致改变该抗体的效应子功能。免疫球蛋白的两条相同重链的二聚化由CH3结构域的二聚化介导并且通过铰链区内的二硫键而稳定(Huber等人,Nature,264:415-420(1976);Thies等人,J.Mol.Biol.,293:67-79(1999))。铰链区内防止重链-重链二硫键的半胱氨酸残基突变将使CH3结构域的二聚化失稳定。已经鉴定了负责CH3二聚化的残基(Dall’Acqua等人,
Biochemistry,37:9266-9273(1998))。因此,有可能产生单价半-Ig。有趣地,已经在自然界中发现IgG和IgA亚类的这些单价半Ig分子(Seligmann等人,Ann.Immunol.,129 C:855-870(1978);Biewenga等人,Clin.Exp.Immunol.,51:395-400(1983))。已经确定FcRn∶Ig Fc区的化学计量是2∶1(West等人,Biochemistry,39:9698-9708(2000)),并且半Fc足以介导FcRn结合(Kim等人,Eur.J.Immunol.,24:542-548(1994))。破坏CH3结构域的二聚化的突变可以不对其FcRn结合造成更大的不利影响,因为对CH3二聚化重要的的残基位于CH3b折叠结构(sheet structure)的内部界面上,而负责FcRn结合的区域位于上CH2-CH3结构域的外部界面上。然而,半Ig分子可以在组织渗透方面具有某种优点,这归因于其尺寸比规则抗体更小。在一个实施方案中,将本发明结合蛋白的恒定区(例如Fc区)中的至少一个氨基酸残基替换,以致破坏重链的二聚化,产生半DVD Ig分子。IgG的抗炎活性完全依赖于IgG Fc片段的N-连接的聚糖的唾液酸化。已确定抗炎活性的精确的聚糖要求,以致可以产生适当的IgG1 Fc片段,从而产生效力大大增强的完全重组的唾液酸化IgG1 Fc(Anthony等人,
Science,320:373-376(2008))。
[0200] 术语抗体的“抗原结合部分”指抗体中保留与抗原(例如,hIL-1β)特异性结合的能力的一个或更多个片段。已经显示,可以由全长抗体的片段来实施抗体的抗原结合功能。此类抗体实施方案也可以是双特异性、双重特异性或多特异性形式;与两种或更多种不同抗原(例如,hIL-1β和不同的抗原分子,如hIL-1β和hIL-1α)特异性结合。在术语抗体的“抗原结合部分”内所包括的结合片段的实例包括(i)Fab片段,一种由VL、VH、CL和CH1结构域组成的单价片段;(ii)F(ab′)2片段,一种包含通过二硫键在铰链区连接的两个Fab片段的双价片段;(iii)由VH和CH1结构域组成的Fd片段;(iv)由抗体单臂的VL和VH结构域组成的Fv片段;(v)包含单一可变域的dAb片段(Ward等人,Nature,341:544-546(1989);PCT公开号WO 90/05144);和(vi)分离的互补决定区(CDR)。另外,虽然Fv片段的两个结构域(VL和VH)由单独基因编码,但是使用重组方法,可以将它们通过能够使这两个结构域作为单一蛋白链产生的合成接头而连接,在所述单一蛋白链中VL区和VH区配对以形成单价分子(称作单链Fv(scFv);见例如,Bird等人,Science,242:423-426(1988);和Huston等人,
Proc.Natl.Acad.Sci.USA,85:5879-5883(1988))。此种单链抗体也意在包括在术语抗体的“抗原结合部分”内。也包括单链抗体的其他形式,如双体抗体。双体抗体是双价的双特异性抗体,其中VH和VL结构域在单一多肽链上表达,但是使用太短以至于不允许这两个结构域之间在相同链上配对的接头,从而迫使所述结构域与另一条链的互补结构域配对并且产生两个抗原结合位点(见例如,Holliger等人,Proc.Natl.Acad.Sci.USA,90:6444-6448(1993);Poljak,R.J.,Structure,2:1 121-1123(1994))。此类抗体结合部分是本领域已知的(Kontermann和Dübel编著,Antibody Engineering(Springer-Verlag,New York,2001),第790页(ISBN 3-540-41354-5))。此外,单链抗体还包括“线性抗体”,所述线性抗体包含一对串联Fd区段(VH-CH1-VH-CH1),它们与互补性轻链多肽一起形成一对抗原结合区(Zapata等人,Protein Eng.,8(10):1057-1062(1995);和美国专利No.5,641,870))。
[0201] 免疫球蛋白恒定(C)结构域指重链(CH)或轻链(CL)恒定域。鼠和人IgG重链和轻链恒定域氨基酸序列是本领域已知的。
[0202] 术语“IL-1β结合蛋白构建体”(或“结合蛋白构建体”)指包含与接头或免疫球蛋白恒定域连接的一个或更多个本发明抗原结合部分的多肽。“接头多肽”包含通过肽键连接的、并且用来连接一个或更多个抗原结合部分的两个或更多个氨基酸残基。此类接头多肽是本领域熟知的(见例如,Holliger等人,Proc.Natl.Acad.Sci.USA,90:6444-6448(1993);Poljak,R.J.,Structure,2:1 121-1123(1994))。免疫球蛋白恒定域指重链或轻链恒定域。
人IgG重链和轻链恒定域氨基酸序列是本领域已知的并且在表2中显示。
[0203] 表2.人IgG重链恒定域和轻链恒定域的序列
[0204]
[0205] 此外,IL-1β结合蛋白(例如抗体或其抗原结合部分)可以是通过抗体或其抗原结合部分与一种或更多种其他蛋白质或肽共价或非共价缔合所形成的较大免疫黏附分子的一部分。此类免疫黏附分子的实例包括链霉亲和素核心区域产生四聚体scFv分子的用途(Kipriyanov等人,Human Antibod.Hybridomas,6:93-101(1995))和半胱氨酸残基、标记肽和C端多组氨酸标签产生双价和生物素酰化scFv分子的用途(Kipriyanov等人,Mol.Immunol.,31:1047-1058(1994))。可以使用常规技术(如分别用木瓜蛋白酶或胃蛋白酶消化全抗体)从全抗体制备抗体部分,例如Fab和F(ab′)2片段。另外,可以使用标准重组DNA技术来获得抗体、其抗原结合部分和免疫黏附分子。
[0206] “分离抗体”意在指一种抗体,它基本上不含具有不同抗原特异性的其他抗体(例如,与hIL-1β特异性结合的分离抗体基本上不含特异性结合除hIL-1β之外的抗原的抗体)。然而,特异性结合hIL-1β的分离抗体可以对来自其他物种的其他抗原(如IL-1β分子)具有交叉反应性。另外,分离抗体可以基本上不含其他细胞物质和/或化学品。
[0207] 术语“单克隆抗体”或“mAb”指从基本上同质的抗体群体中获得的抗体,即,构成该群体的单独抗体是相同的,除了可能少量出现的可能天然存在的突变之外。单克隆抗体是高度特异性的,针对单一抗原。另外,与通常包括针对不同决定簇(表位)的不同抗体的多克隆抗体制剂相反,每种mAb针对抗原上的单一决定簇。修饰语“单克隆的”不解释为要求通过任何特定方法来生该抗体。
[0208] 术语“人抗体”包括具有源自人种系免疫球蛋白序列的可变区和恒定区的抗体。本发明的人抗体可以包括(例如在CDR中(尤其在CDR3中)包括)不由人种系免疫球蛋白序列编码的氨基酸残基(例如,通过体外随机或位点特异性诱导或通过体内体细胞突变导入的突变)。然而,术语“人抗体”不包括其中源自另一个哺乳动物物种(如小鼠)的种系的CDR序列已经被移植到人构架序列上的抗体。
[0209] 术语“重组人抗体”包括通过重组手段所制备、表达、产生或分离的所有人抗体,例如使用转染入宿主细胞中的重组表达载体所表达的抗体(在下文第II C部分中进一步描述)、从重组组合性人抗体文库分离的抗体(Hoogenboom,H.R.,TrendsBiotechnol.,15:62-70(1997);Azzazy和Highsmith,Clin.Biochem.,35:425-445(2002);Gavilondo和Larrick,BioTechniques,29:128-145(2000);Hoogenboom和Chames,Immunol.Today,21:371-378(2000))、从对于人免疫球蛋白基因为转基因的动物(例如,小鼠)中分离的抗体(见例如,Taylor等人,Nucl.Acids Res.,20:6287-6295(1992);Kellermann和Green,
Curr.Opin.Biotechnol.,13:593-597(2002);Little等人,Immunol.Today,21:364-370(2000));或通过涉及将人免疫球蛋白基因序列剪接至其他DNA序列的任何其他手段所制备、表达、产生或分离的抗体。此类重组人抗体具有源自人种系免疫球蛋白序列的可变区和恒定区。然而,在某些实施方案中,此类重组人抗体经历体外诱变(或,当使用对于人Ig序列为转基因的动物时,经历体内体细胞诱变)并且因此重组抗体的VH和VL区的氨基酸序列是尽管源自人种系VH和VL序列并且与之相关,但可以不天然存在于体内人抗体种系所有组成成分(repertoire)的序列。
[0210] 术语“嵌合抗体”指包含来自一个物种的重链和轻链可变区序列和来自另一个物种的恒定区序列的抗体,例如具有与人恒定区连接的鼠重链和轻链可变区的抗体。
[0211] 术语“CDR移植抗体”指抗体,其包含来自一个物种的重链和轻链可变区序列,但是在所述可变区序列中,VH和/或VL的一个或更多个CDR区的序列被另一个物种的CDR序列替换,例如具有其中一个或更多个鼠CDR(例如CDR3)已经被人CDR序列替换的鼠重链和轻链可变区的抗体。
[0212] 术语“CDR”指抗体可变序列内的互补决定区。在重链和轻链的每个可变区中存在3个CDR,它们相对于每个可变区命名为CDR1、CDR2和CDR3。如本文所用的术语“CDR集合”指在能够结合抗原的单一可变区中出现的一组3个CDR。已经根据不同的体系,不同地定义这些CDR的确切边界。由Kabat所述的体系(Kabat等人,Sequences of Proteins of Immunological Interest(具有免疫学意义的蛋白质的序列)(National Institutes of Health(国家健康研究所),Bethesda,Maryland(1987)及(1991))不仅提供适用于抗体的任何可变区的明确的残基编号体系,而且提供定义该3个CDR的精确残基边界。这些CDR可以称作Kabat CDR。Chothia和合作者(Chothia和Lesk,J.Mol.Biol.,196:901-917(1987);和Chothia等人,Nature,342:877-883(1989))发现,Kabat CDR内的某些子部分(sub-
portions)尽管在氨基酸序列水平上具有巨大多样性,但采用几乎相同的肽主链构象。这些子部分称为L1、L2和L3或H1、H2和H3,其中“L”和“H”分别指轻链区域和重链区域。这些区域可以称作Chothia CDR,它们具有与Kabat CDR重叠的边界。定义与Kabat CDR重叠的CDR的其他边界已经由Padlan等人(ASEB J.,9:133-139(1995))和MacCallum等人(J.Mol.Biol.,
262(5):732-745(1996))描述。仍有其他CDR边界定义可以不严格遵守以上体系之一,但是会与Kabat CDR重叠,虽然可根据预测或实验发现来缩短或加长它们,以至于特定残基或特定残基组或甚至整个CDR没有显著地影响抗原结合。本文所用的方法可以利用根据这些体系中的任何种所定义的CDR,尽管示例性的实施方案使用Kabat定义的CDR或Chothia定义的CDR。
[0213] 术语“Kabat编号”、“Kabat定义”和“Kabat标记”在本文中可互换地使用。本领域公认的这些术语指将在抗体或其抗原结合部分的重链和轻链可变域中比其他氨基酸残基更为可变(即,超变的)的氨基酸残基编号的体系(Kabat等人,Ann.NY Acad.Sci.,190:382-391(1971);和Kabat等人,Sequences of Proteins ofImmunological Interest(具有免疫学意义的蛋白质的序列),第5版,U.S.Department ofHealth and Human Services,NIH出版编号91-3242(1991))。对于重链可变区,超变区对于CDR1是氨基酸位置31至35,对于CDR2是氨基酸位置50至65,并且对于CDR3是氨基酸位置95至102。对于轻链可变区,超变区对于CDR1是氨基酸位置24至34,对于CDR2是氨基酸位置50至56,并且对于CDR3是氨基酸位置89至97。
[0214] 在过去20年期间,可变重链区域和轻链区域的氨基酸序列广泛公共数据库的增长和分析已经导致理解可变区序列内的构架区(FR)和CDR序列之间的典型边界,并且使本领域技术人员能够根据Kabat编号体系、Chothia编号体系或其他体系精确地确定CDR。见例如,Martin,“Protein Sequence and Structure Analysis ofAntibody Variable Domains,”第31章,引自Antibody Engineering,(Kontermann和Dübel编著)(Springer-Verlag,Berlin,2001),尤其第432-433页。下文提供在可变重链区(VH)和可变轻链区(VL)的氨基酸序列内测定Kabat CDR的氨基酸序列的有用方法:
[0215] 为鉴定CDR-L1氨基酸序列:
[0216] 从VL区的氨基端大约24个氨基酸残基开始;
[0217] 在CDR-L1序列之前的残基总是半胱氨酸(C);
[0218] 在CDR-L1序列之后的残基总是色氨酸(W)残基,通常是Trp-Tyr-Gln(W-Y-Q),但也是Trp-Leu-Gln(W-L-Q)、Trp-Phe-Gln(W-F-Q)和Trp-Tyr-Leu(W-Y-L);
[0219] 长度通常是10至17个氨基酸残基。
[0220] 为鉴定CDR-L2氨基酸序列:
[0221] 总是在CDR-L1末端之后16个残基开始。
[0222] 在CDR-L2序列之前的残基通常是Ile-Tyr(I-Y),但也是Val-Tyr(V-Y)、Ile-Lys(I-K)和Ile-Phe(I-F);
[0223] 长度总是7个氨基酸残基。
[0224] 为鉴定CDR-L3氨基酸序列:
[0225] 总是在CDR-L2末端之后33个氨基酸开始。
[0226] 在CDR-L13氨基酸序列之前的残基总是半胱氨酸(C);
[0227] 在CDR-L3序列之后的残基总是Phe-Gly-X-Gly(F-G-X-G)(SEQ ID NO:11),其中X是任意氨基酸;
[0228] 长度通常是7至11个氨基酸残基。
[0229] 为鉴定CDR-H1氨基酸序列:
[0230] 从VL区的氨基端大约31个氨基酸残基且总是在半胱氨酸(C)后9个残基开始;
[0231] 在CDR-H1序列之前的残基总是Cys-X-X-X-X-X-X-X-X(SEQID NO:12),其中X是任意氨基酸;
[0232] CDR-H1序列之后的残基总是Trp(W),通常是Trp-Val(W-V),但也是Trp-Ile(W-I)和Trp-Ala(W-A);
[0233] 长度通常是5至7个氨基酸残基。
[0234] 为鉴定CDR-H2氨基酸序列:
[0235] 总是在CDR-H1末端之后15个氨基酸残基开始;
[0236] 在CDR-H2序列之前的残基通常是Leu-Glu-Trp-Ile-Gly(L-E-W-I-G)(SEQ ID NO:23),但是也为其他变化;
[0237] 在CDR-H2序列之后的残基是Lys/Arg-Leu/Ile/Val/Phe/Thr/Ala-Thr/Ser/Ile/Ala(K/R-L/I/V/F/T/A-T/S/I/A);
[0238] 长度通常是16至19个氨基酸残基。
[0239] 为鉴定CDR-H3氨基酸序列:
[0240] 总是在CDR-H2末端之后33个氨基酸残基且总是在半胱氨酸(C)之后的3个残基开始。
[0241] 在CDR-H3序列之前的残基总是Cys-X-X(C-X-X),其中X是任意氨基酸,通常是Cys-Ala-Arg(C-A-R);
[0242] 在CDR-H3序列之后的残基总是Trp-Gly-X-Gly(W-G-X-G)(SEQ ID NO:24),其中X是任意氨基酸;
[0243] 长度通常是3至25个氨基酸残基。
[0244] 如本文所用的术语“规范”残基指CDR或构架中的残基,其定义如Chothia等人(J.Mol.Biol.,196:901-917(1987))和Chothia等人(J.Mol.Biol.,227:799-817(1992))(这两份文献均通过引用并入本文)定义的特定规范CDR结构。根据Chothia等人,许多抗体的CDR的关键部分尽管在氨基酸序列水平上存在巨大的多样性,但是具有几乎相同的肽主链构象。每种规范结构主要指明形成环的氨基酸残基连续区段的一组肽主链扭转角。
[0245] “亲和力成熟的”抗体是在其一个或更多个CDR中具有一种或更多种变化的抗体,与不具有所述一种或更多种变化的亲本抗体相比,所述改变导致抗体对靶抗原的亲和力改善。示例性的亲和力成熟抗体将对靶抗原具有纳摩尔或甚至皮摩尔亲和力。用于产生亲和力成熟的抗体的各种程序是本领域已知的。例如,Marks等人,BioTechnology,10:779-783(1992)描述了通过VH和VL结构域改组的亲和力成熟。CDR和/或构架残基的随机诱变由Barbas等人,Proc.Nat.Acad.Sci.USA,91:3809-3813(1994);Schier等人,Gene,169:147-
155(1995);Yelton等人,J.Immunol.,155:1994-2004(1995);Jackson等人,J.Immunol.,
154(7):3310-3319(1995);Hawkins等人,J.Mol.Biol.,226:889-896(1992)描述。美国专利No.6,914,128B1中描述了在选择性诱变位置处和接触或超变位置处用活性增强的氨基酸残基进行选择性突变。
[0246] 术语“多价结合蛋白”表示包含两个或更多个抗原结合位点的结合蛋白。多价结合蛋白优选被人工改造(engineered),以具有3个或更多个抗原结合位点,并且通常不是天然存在的抗体。术语“多特异性结合蛋白”指能够结合两种或更多种相关或不相关的靶标的结合蛋白。本发明的“双重可变域”(“DVD”)结合蛋白包含两个或更多个抗原结合位点,并且是四价或多价结合蛋白。DVD可以是单特异性的(即,能够结合一种抗原),或是多特异性的(即,能够结合两种或更多种抗原)。包含两条重链DVD多肽和两条轻链DVD多肽的DVD结合蛋白称作“DVD免疫球蛋白”或“DVD-Ig”。每半个DVD-Ig包含一条重链DVD多肽和一条轻链DVD多肽、和两个或更多个抗原结合位点。每个结合位点包含一个重链可变域和一个轻链可变域,其中每个抗原结合位点总计6个CDR参与抗原结合。
[0247] 对设计、表达和表征DVD-Ig分子的描述在PCT公开号WO 2007/024715;美国专利No.7,612,181;和Wu等人,Nature Biotechnol.,25:1290-1297(2007)中提供。此类DVD-Ig分子的优选实例包含一条重链,其包含结构式VD1-(X1)n-VD2-C-(X2)n,其中VD1是第一重链可变域,VD2是第二重链可变域,C是重链恒定域,X1是接头,条件是,它不是CH1,X2是Fc区并且n是0或1,但优选是1;和一条轻链,其包含结构式VD1-(X1)n-VD2-C-(X2)n,其中VD1是第一轻链可变域,VD2是第二轻链可变域,C是轻链恒定域,X1是接头,条件是,它不是CH1并且X2不包含Fc区;并且n是0或1,但优选是1。此类DVD-Ig可以包含两条这样的重链和两条这样的轻链,其中每条链包含在可变区之间没有间插性恒定区的串联连接的可变域,其中一条重链与一条轻链缔合,以形成串联的功能抗原结合位点,并且一对重链和轻链可以与另一对重链和轻链缔合,以形成具有4个有功能抗原结合位点的四聚体结合蛋白。在另一个实例中,DVD-Ig分子可以包含重链和轻链,其中每条链包含在可变结构域之间没有间插性恒定区的串联连接的3个可变域(VD1、VD2、VD3),其中一对重链和轻链可以缔合,以形成3个抗原结合位点,并且其中一对重链和轻链可以与另一对重链和轻链缔合,以形成具有6个抗原结合位点的四聚体结合蛋白。
[0248] A DVD-Ig结合蛋白可以结合IL-1β的一个或更多个表位。DVD-Ig结合蛋白也可以结合IL-1β的表位和不同于IL-1β多肽的第二靶抗原的表位。
[0249] 如本文所用的术语“双特异性抗体”指通过以下方式产生的全长抗体:四体杂交瘤(quadroma)技术(见Milstein和Cuello,Nature,305:537-540(1983))、化学缀合两种不同的单克隆抗体(见Staerz等人,Nature,314:628-631(1985))、或在Fc区中导入突变,从而产生仅其中之一是功能性双特异抗体的多种不同免疫球蛋白种类的染色质结入洞法(knob-into-hole)或相似方法(见Holliger等人,Proc.Natl.Acad.Sci.USA,90(14):6444-6448(1993))。对于分子功能,双特异性抗体在其两个结合臂之一(一对HC/LC)上结合一种抗原(或表位),并且在其第二臂(不同的一对HC/LC)上结合一种不同的抗原(或表位)。根据这种定义,双特异性抗体具有两条(在特异性和CDR序列方面)截然不同的抗原结合臂,并且相对于它结合的每种抗原是单价的。
[0250] 如本文所用的术语“双重特异性抗”指可以在其两个结合臂的每条臂(一对HC/LC)中结合两种不同抗原(或表位)的全长抗体(见PCT公开号WO 02/02773)。因此,双重特异性结合蛋白具有两条相同的抗原结合臂,具有相同特异性和相同CDR序列,并且相对于它结合的每种抗原是双价的。
[0251] 结合蛋白的“功能抗原结合位点”是能够结合靶抗原的一个抗原结合位点。抗原结合位点的抗原结合亲和力不必需地与从其中衍生该抗原结合位点的亲本抗体一样强,但是结合抗原的能力必须可使用已知用于评价抗体与抗原结合的各种方法中的任一种来测量的。另外,本文中多价抗体的每个抗原结合位点的抗原结合亲和力不需要在数量上是相同的。
[0252] 术语“细胞因子”是用于由一个细胞群体释放并且作为细胞间介质作用于另一种细胞群体的蛋白质的类属术语。此类细胞因子的实例是淋巴因子、单核因子和传统的多肽激素。在细胞因子当中包括生长激素,例如人生长激素、N-甲硫氨酰人生长激素和生长激素;甲状旁腺激素;甲状腺素;胰岛素;胰岛素原;松弛素;松弛素原;糖蛋白激素,例如促卵泡激素(FSH)、促甲状腺激素(TSH)和促黄体激素(LH);肝生长因子;成纤维细胞生长因子;催乳素;胎盘催乳激素;肿瘤坏死因子,例如肿瘤坏死因子-α(TNF-α)和肿瘤坏死因子-β(TNF-β);缪勒管抑制物质;小鼠促性腺激素相关肽;抑制素;活化素;血管内皮生长因子;整联蛋白;血小板生成素(TPO);神经生长因子,例如NGF-α(NGF-α);血小板生长因子;胎盘生长因子;转化生长因子(TGF),例如TGF-α(TGF-α)和TGF-β(TGF-β);胰岛素样生长因子-I和-II;促红细胞生成素(EPO);骨诱导因子;干扰素,例如干扰素-α(IFN-α)、干扰素-β(IFN-β)和干扰素-γ(IFN-γ);集落刺激因子(CSF),例如巨噬细胞-CSF(M-CSF);粒细胞-巨噬细胞-CSF(GM-CSF);和粒细胞-CSF(G-CSF);白介素(IL),例如IL-1、IL-2、IL-3、IL-4、IL-5、IL-6、IL-7、IL-8、IL-9、IL-10、IL-11、IL-12、IL-13、IL-15、IL-17、IL-18、IL-21、IL-22、IL-
23、IL-33;和其他多肽因子,包括LIF和kit配体(KL)。如本文所用的术语“细胞因子”包括来自天然来源的蛋白质或来自天然序列细胞因子的重组细胞培养物和生物学活性等同物的蛋白质。
[0253] 如本文所用的术语“供体”和“供体抗体”指提供一种或更多种CDR的抗体。在示例性实施方案中,供体抗体是来自与从中获得或衍生的构架区的抗体不同的种类的抗体。在人源化抗体的语境下,术语“供体抗体”指提供一种或更多种CDR的非人抗体。
[0254] 如本文所用的术语“构架”或“构架序列”指扣除CDR的可变区的剩余序列。因为可以通过不同体系来确定CDR序列的确切定义,所以构架序列的含义相应地具有不同的解释。6个CDR(轻链的CDR-L1、CDR-L2和CDR-L3和重链的CDR-H1、CDR-H2和CDR-H3)也将轻链和重链上的构架区划分为每条链上的4个亚区域(FR1、FR2、FR3和FR4),其中CDR1位于FR1和FR2之间,CDR2位于FR2和FR3之间并且CDR3位于FR3和FR4之间。在不规定具体亚区域为FR1、FR2、FR3或FR4的情况下,如其他人所称的构架区代表在单条天然存在的免疫球蛋白链的可变区内的合并的FR。如本文中所用的,FR代表四个亚区域之一,并且FRs代表构成构架区的四个亚区域中的两个或更多个亚区域。
[0255] 如本文所用的术语“接纳体”和“接纳体抗体”指提供一个或更多个构架区的至少80%、至少85%、至少90%、至少95%、至少98%或100%氨基酸序列的抗体或编码所一个或更多个构架区的至少80%、至少85%、至少90%、至少95%、至少98%或100%氨基酸序列的核酸序列。在一些实施方案中,术语“接纳体”指提供一个或更多个恒定区的抗体氨基酸或编码一个或更多个恒定区的核酸序列。在又一个实施方案中,术语“接纳体”指提供一个或更多个构架区和一个或更多个恒定区的抗体氨基酸、或编码一个或更多个构架区和一个或更多个恒定区的核酸序列。在一个具体实施方案中,术语“接纳体”指人抗体氨基酸或核酸序列,其提供或编码一个或更多个构架区的至少80%、优选地,至少85%、至少90%、至少
95%、至少98%或100%的氨基酸序列。根据这个实施方案,接纳体可以含有不在人抗体的一个或更多个具体位置处出现的至少1个、至少2个、至少3个、至少4个、至少5个或至少10个氨基酸残基。接纳体构架区和/或一个或更多个接纳体恒定区可以例如源自或获得自种系抗体基因、成熟抗体基因、功能抗体(例如,本领域熟知的抗体、正在开发的抗体或市售抗体)。
[0256] 人重链和轻链接纳体序列为本领域所已知。在本发明的一个实施方案中,人重链和轻链接纳体序列选自从V-base(http://vbase.mrc-cpe.cam.ac.uk/)或从 (国际ImMunoGeneTics信息系统 )(http://imgt.cines.fr/textes/IMGTrepertoire/
LocusGenes/)列出的序列。在本发明的另一个实施方案中,人重链和轻链接纳体序列是选自表3和表4中所述的序列。
[0257] 表3重链接纳体序列
[0258]
[0259]
[0260]
[0261] 表4.轻链接纳体序列
[0262]
[0263]
[0264]
[0265] 如本文所用的术语“种系抗体基因”或“基因片段”指由未曾经历成熟过程的非淋巴样细胞编码的免疫球蛋白序列,所述成熟过程导致特定免疫球蛋白表达的遗传重排和突变。(见,例如,Shapiro等人,Crit.Rev.Immunol.,22(3):183-200(2002);Marchalonis等人,Adv.Exp.Med.Biol.,484:13-30(2001))。由本发明的各种实施方案提供的优点之一源自以下认识:种系抗体基因比成熟抗体基因更可能使得物种中个体特征的必需氨基酸序列结构保守,因此在该物种中治疗性使用时较不可能被识别为来自外来来源(foreign source)。
[0266] 如本文所用的术语“关键”残基指可变区内的对抗体(尤其人源化抗体)的结合特异性和/或亲和力具有较大影响的某些残基。关键残基包括但不限于以下残基中的一种或更多种:与CDR毗邻的残基、潜在糖基化位点(可以是N-糖基化或O-糖基化位点)、稀有残基、能够与抗原相互作用的残基、能够与CDR相互作用的残基、规范残基、重链可变区和轻链可变区之间的接触残基、Vernier区内的残基和在Chothia定义的可变重链CDR1和Kabat定义的第一重链构架之间重叠的区域内的残基。
[0267] 术语“人源化抗体”指抗体,其包含来自非人物种(例如,小鼠)的重链和轻链可变区序列,但是在所述可变区序列中,VH和/或VL序列的至少一部分已经改变成更为“人样的”,即,与人种系可变序列更相似。一个类型的人源化抗体是CDR移植抗体,其中将人CDR序列导入非人VH和VL序列中,以替换相应的非人CDR序列。另外,“人源化抗体”是与感兴趣的抗原免疫特异性结合,并且包含构架(FR)区和互补决定区(CDR)的抗体或其变体、衍生物、类似物或片段,所述构架区基本上具有人抗体的氨基酸序列,所述互补决定区基本上具有非人抗体的氨基酸序列。如本文所用的术语“基本上”在CDR的语境下指具有与非人抗体CDR的氨基酸序列至少80%、至少85%、至少90%、至少95%、至少98%或至少99%相同的氨基酸序列的CDR。人源化抗体基本上包含基本上全部的至少一个并且通常两个可变域(Fab、Fab′、F(ab′)2、FabC、Fv),其中全部或基本上全部的CDR区对应于非人免疫球蛋白(即,供体抗体)的那些,全部或基本上全部的构架区是人免疫球蛋白共有序列的那些。在一个实施方案中,人源化抗体也包含至少部分的免疫球蛋白恒定区(Fc),通常是人免疫球蛋白的恒定区。在一些实施方案中,人源化抗体含有轻链以及至少含有重链的可变域。所述抗体还可以包含重链的CH1区、铰链区、CH2区、CH3区和CH4区。在一些实施方案中,人源化抗体仅含有人源化轻链。在一些实施方案中,人源化抗体仅含有人源化重链。在具体的实施方案中,人源化抗体仅含有轻链和/或人源化重链的人源化可变域。
[0268] 人源化抗体可以选自任何类别的免疫球蛋白,包括IgM、IgG、IgD、IgA和IgE,以及任何同种型(非限制性地包括IgG1、IgG2、IgG3和IgG4)。人源化抗体可以包含来自多于一个类别或同种型的序列,并且可以选择特定的恒定域,以使用本领域熟知的技术来最优化所需的效应子功能。
[0269] 人源化抗体的构架和CDR区不需要精确地对应于亲本序列,例如,可以通过取代、插入和/或缺失至少一个氨基酸残基来对供体抗体CDR或共有构架进行诱变,以致在这个位点处的CDR或构架残基并不对应于供体抗体或共有构架。然而,在示例性实施方案中,此类突变将不是广泛的。通常,至少80%、优选至少85%、更优选至少90%和最优选至少95%的人源化抗体残基将对应于亲本FR和CDR序列的那些抗体残基。如本文所用的术语“共有构架”指共有免疫球蛋白序列中的构架区。如本文所用的术语“共有免疫球蛋白序列”指从相关的免疫球蛋白序列家族中最频繁出现的氨基酸(或核苷酸)中形成的序列(见,例如,Winnaker,FromGenes to Clones(Verlagsgesellschaft,Weinheim,德国1987))。在免疫球蛋白家族中,共有序列中的每个位置由该家族中这个位置处出现最频繁的氨基酸占据。如果两个氨基酸以相同频率出现,则可以在共有序列中包括任一者。
[0270] 关于构建DVD-Ig或其他结合蛋白分子,使用“接头”来表示单一氨基酸或包含通过肽键连接的两个或更多个氨基酸残基的多肽(“接头多肽“),并且用来连接一个或更多个抗原结合部分。此类接头多肽是本领域熟知的(见,例如,Holliger等人,Proc.Natl.Acad.Sci.USA,90:6444-6448(1993);Poljak,R.J.,Structure,2:1 121-1123(1994))。示例性接头包括但不限于GGGGSG(SEQ ID NO:26),GGSGG(SEQID NO:27),GGGGSGGGGS(SEQ ID NO:28),GGSGGGGSG(SEQ ID NO:223),GGSGGGGSGS(SEQ ID NO:29),GGSGGGGSGGGGS(SEQ ID NO:30),GGGGSGGGGSGGGG(SEQ ID NO:31),GGGGSGGGGSGGGGS(SEQ ID NO:32),ASTKGP(SEQ ID NO:33),ASTKGPSVFPLAP(SEQ ID NO:34),TVAAP(SEQ IDNO:
35),RTVAAP(SEQ ID NO:224),TVAAPSVFIFPP(SEQ ID NO:36),RTVAAPSVFIFPP(SEQ ID NO:
225),AKTTPKLEEGEFSEAR(SEQ ID NO:37),AKTTPKLEEGEFSEARV(SEQ ID NO:38),AKTTPKLGG(SEQ ID NO:39),SAKTTPKLGG(SEQ ID NO:40),SAKTTP(SEQ ID NO:41),RADAAP(SEQ IDNO:
42),RADAAPTVS(SEQ ID NO:43),RADAAAAGGPGS(SEQ ID NO:44),
RADAAAAGGGGSGGGGSGGGGSGGGGS(SEQ ID NO:45),SAKTTPKLEEGEFSEARV(SEQ ID NO:46),ADAAP(SEQ ID NO:47),ADAAPTVSIFPP(SEQ ID NO:48),QPKAAP(SEQ ID NO:49),
QPKAAPSVTLFPP(SEQ ID NO:50),AKTTPP(SEQ ID NO:51),AKTTPPSVTPLAP(SEQ ID NO:52),akttap(SEQ ID NO:53),akttapsvyplap(SEQ ID NO:54),GENKVEYAPALMALS(SEQID NO:
55),GPAKELTPLKEAKVS(SEQ ID NO:56),和GHEAAAVMQVQYPAS(SEQ ID NO:57)。
[0271] 如本文所用的“Vernier区”指可以调节CDR结构和精细调节与抗原配合的构架残基子集,如Foote和Winter,J.Mol.Biol.,224:487-499(1992)所描述(通过引用将所述文献并入本文)。Vernier区残基形成在CDR下方的层并且可以影响CDR的结构和抗体的亲和力。
[0272] 如本文所用的术语“中和”指当结合蛋白特异性结合抗原时中和抗原(例如,细胞因子IL-1β)的生物学活性。优选地,本文所述的中和结合蛋白与hIL-1β结合,导致抑制hIL-1β的生物学活性。优选地,中和结合蛋白结合hIL-1β并且将hIL-1β的生物学活性降低至少约20%、40%、60%、80%、85%或更多。可以通过测量本领域熟知的hIL-1β生物学活性的一个或更多个指标来评估中和结合蛋白对hIL-1β生物学活性的抑制。例如,HS27细胞中IL-1β诱导对人IL-6分泌的抑制。
[0273] 术语“活性”包括以下活性:例如抗体(例如,与IL-1β抗原结合的抗hIL-1β抗体)对抗原的结合特异性/亲和力,和/或抗体(例如,其与hIL-1β的结合抑制hIL-1β生物学活性的抗IL-1β抗体)的中和效力,例如HS27细胞中IL-1β诱导对人IL-6分泌的抑制。
[0274] 术语“表位“包括能够与免疫球蛋白或T-细胞受体特异性结合的任何多肽决定簇。在某些实施方案中,表位决定簇包括分子的化学活性表面基团,如氨基酸、糖侧链、磷酰或磺酰基团,并且在某些实施方案中,可以具有具体的三维结构特征,和/或具体的电荷特征。
表位是抗原中通过抗体结合的区域。在某些实施方案中,当抗体在蛋白质和/或大分子的复杂混合物中优先识别其靶抗原时,将抗体称作特异性结合抗原。如果抗体交叉竞争(一种抗体阻止另一种抗体的结合或调节效应),将抗体称作“与相同的表位结合”。此外,表位的结构定义(重叠、相似、相同)富有信息,但是功能定义通常更具有相关性,因为它们包括结构(结合)参数和功能(调节、竞争)参数。
[0275] 如本文所用的术语“表面胞质团共振”指允许通过(例如使用BIAcore系统(Pharmacia Biosensor AB,Uppsala,Sweden and Piscataway,New Jersey))检测生物传感器基质内蛋白质浓度的改变来分析实时生物特异性相互作用的光学现象。对于进一步描述,见 等人,Ann.Biol.Clin.,51:19-26(1993); 等人,BioTechniques,11:
620-627(1991);Johnsson等人,J.Mol.Recognit.,8:125-131(1995);和Johnsson等人,Anal.Biochem.,198:268-277(1991)。
[0276] 如本文所用的术语“K结合(Kon)”(也为“K结合”、“k结合”)意指如本领域已知的,结合蛋白(例如,抗体)与抗原缔合以形成缔合复合物(例如,抗体/抗原复合物)的结合速率常数(on rate constant)。“K结合”也称为术语“缔合速率常数”或“ka”,如本文中可互换使用的。这个值表示抗体与其靶抗原的结合速率或抗体和抗原之间的复合物形成速率,如以下等式所显示:
[0277] 抗体(“Ab”)+抗原(“Ag”)→Ab-Ag。
[0278] 如本文所用的术语“K脱离(Koff)”(也为“K脱离”、“k脱离”)意指如本领域已知的,结合蛋白(例如,抗体)从缔合复合物(例如,抗体/抗原复合物)中解离的脱离速率常数(off rate constant)或“解离速率常数”。这个值表示抗体从其靶抗原中的解离速率或Ab-Ag复合物随时间推移而分离成游离抗体和抗原的速率,如以下等式所显示:
[0279] Ab+Ag←Ab-Ag。
[0280] 如本文所用的术语“KD”(也为“Kd”)意指“平衡解离常数”并且指在滴定测量中在平衡时所获得的值或通过解离速率常数(K脱离)除以缔合速率常数(K结合)所获得的值。缔合速率常数(K结合)、解离速率常数(K脱离)和平衡解离常数(Kd)用来代表抗体对抗原的结合亲和力。用于测定缔合速率常数和解离速率常数的方法是本领域熟知的。
[0281] 使用基于荧光的技术提供了在生理缓冲液中,在平衡时检查样品的高灵敏度和能力。可以使用其他实验方法和仪器(例如 (生物分子相互作用分析)测定法)(例如,可从BIAcore International AB,GE Healthcare公司,Uppsala,Sweden获得的仪器)。
另外,也可以使用可获得自Sapidyne Instruments(Boise,Idaho)的 测定法(动力
排阻测定法)(Kinetic Exclusion Assay)。
[0282] 术语“标记”和“可检测标记”表示与特异性结合配偶体(partner)(如抗体或分析物)连接例如以使得特异性结合对的成员(如抗体和分析物)之间的反应可检测的部分。如此标记的特异性结合配偶体(例如,抗体或分析物)称作“可检测地标记”。因此,如本文所用的术语“标记的结合蛋白”指具有所并入标记的蛋白质,所述标记提供对结合蛋白的鉴定。在一个实施方案中,标记是可以产生信号的可检测标志,所述信号可通过视觉手段或仪器手段来检测,例如,并入放射标记的氨基酸或将生物素基部分与多肽结合,可以通过标记的抗生物素蛋白或链霉亲合素(例如,可以通过光学或比色方法检测的含有荧光标志或酶活性的链霉亲合素)检测所述生物素基部分。用于多肽的标记的实例包括但不限于以下:放射
3 14 35 90 99 111 125 131 177 166 153
性同位素或放射性核素(例如 H、C、S、Y、Tc、 In、 I、 I、 Lu、 Ho或 Sm)、色素原、荧光标记(例如FITC、若丹明、镧系元素、磷光体)、酶标记(例如辣根过氧化物酶、萤光素酶、碱性磷酸酶)、化学发光标志、生物素基团、由二级(secondary)报道分子识别的预定多肽表位(例如,亮氨酸拉链对序列、二级抗体的结合位点、金属结合结构域、表位标签)和磁性试剂(例如,钆螯合物)。常用于免疫测定的标记的代表性实例包括产生光的部分(例如吖啶鎓化合物)和产生荧光的部分(例如荧光素)。本文中描述其他标记。就此方面而言,所述部分本身可不经过可检测地标记,但是一旦与另一部分反应,则可以变成可检测的。术语“可检测地标记”的使用意在包括后一类型的可检测标记。
[0283] 术语“IL-1β结合蛋白缀合物”指本文所述的与第二化学部分(如治疗剂或细胞毒药剂)化学连接的IL-1β结合蛋白。术语“药剂”在本文中用来表示化合物、化合物的混合物、生物大分子或由生物材料制备的提取物。优选地,治疗剂或细胞毒药剂包括但不限于百日咳毒素(pertussis toxin)、紫杉醇、细胞松弛素B、短杆菌肽D、溴化乙啶、依米丁、丝裂霉素、依托泊苷、替尼泊苷、长春新碱、长春碱、秋水仙碱、多柔比星、道诺霉素、二羟基炭疽菌素二酮(dihydroxy anthracindione)、米托蒽醌、光神霉素、放线菌素D、1-脱氢睾酮、糖皮质激素、普鲁卡因、丁卡因、利多卡因、普洛尔和嘌呤霉素及其类似物或同系物。在免疫测定的情形下使用时,IL-1β结合蛋白缀合物可以是可检测标记的抗体,所述抗体用作检测抗体。
[0284] 如本文所用的术语“晶体”和“结晶的”指以晶体形式存在的结合蛋白(例如抗体)或其抗原结合部分。晶体是固态物质的一种形式,其与其他形式(例如无定形固态或液晶态)截然不同。晶体由原子、离子、分子(例如蛋白质,如抗体)或分子装配物(例如,抗原/抗体复合物)的规则、重复、三维阵列组成。这些三维阵列根据本领域充分理解的特定数学关系排列。在晶体中重复的基本单元或结构单元称作非对称单元。非对称单元以符合给定的、充分定义的结晶学对称性的排列方式重复提供了晶体的“晶胞”。晶胞通过正则变换(regular translation)在全部三个维度上的重复提供了晶体。见Giegé等人,第1章,引自Crystallization of Nucleic Acids andProteins,a Practical Approach,第2版,(Ducruix和Giegé编著)(Oxford UniversityPress,New York,1999)第1-16页。
[0285] 术语“多核苷酸”表示两个或更多个核苷酸(核糖核苷酸或脱氧核苷酸或任一种类型的核苷酸的修饰形式)的多聚体形式。该术语包括单链和双链形式的DNA。
[0286] “分离的多核苷酸”应表示一种多核苷酸(例如基因组起源、cDNA起源或合成起源或其某种组合的多核苷酸),根据其起源,“分离的多核苷酸”与自然界中同所述“分离的多核苷酸”一起发现的多核苷酸的全部或一部分不相关,与自然界中不与所述“分离的多核苷酸”连接的多核苷酸可操作地连接;或不作为较大序列的一部分出现于自然界中。
[0287] 如本文所用的术语“载体”指能够运输已经与之连接的另一核酸的核酸分子。一种类型的载体是“质粒”,其指可将额外DNA区段连接入其中的环形双链DNA环。另一种类型的载体是病毒载体,其中可将额外的DNA区段连接入病毒基因组中。某些载体能够在导入它们的宿主细胞中自主复制(例如,具有细菌复制起点的细菌载体和附加型哺乳动物载体)。其他载体(例如非附加型哺乳动物载体)可以在导入宿主细胞时整合到该宿主细胞的基因组中,并因此随宿主基因组一起复制。另外,某些载体能够引导与它们有效连接(operatively linked)的基因的表达。此类载体在本文中称作“重组表达载体”(或简单地称作“表达载体”)。通常,重组DNA技术中使用的表达载体经常处于质粒形式。在本说明书中,“质粒”和“载体”可以互换地使用,因为质粒是最常用形式的载体。然而,本发明意在包括发挥同等功能的其他形式的表达载体,例如病毒载体(例如,复制缺陷型逆转录病毒、腺病毒和腺相关病毒)。
[0288] 如本文中所用的术语“可操作地连接(operably linked)”指并列,其中所述组分处在允许它们以其预期方式发挥功能的关系中。与编码序列“可操作地连接”的控制序列以在与所述控制序列相容的条件下实现编码序列的表达的方式连接。“可操作地连接的”序列包括与感兴趣的基因邻接的表达控制序列以及以在对侧(in trans)或隔开一定距离发挥作用,以控制感兴趣的基因的表达控制序列。如本文所用的术语“表达控制序列”指实现与其连接的编码序列的表达和加工所必需的多核苷酸序列。表达控制序列包括适当的转录起始序列、终止序列、启动子序列和增强子序列;有效RNA加工信号,例如剪接和多腺苷酸化信号;稳定胞质mRNA的序列;增强翻译效率的序列(即,Kozak共有序列);增强蛋白质稳定性的序列;和在需要时,增强蛋白质分泌的序列。此类控制序列的性质根据宿主有机体而不同;在原核生物中,此类控制序列通常包括启动子、核糖体结合位点和转录终止序列;在真核生物中,通常此类控制序列包括启动子和转录终止序列。术语“控制序列”意在包括其存在对于表达和加工是必需的组分,并且也可以包括其存在是有利的额外组分,例如,前导序列和融合配偶体序列。
[0289] 如本文定义的“转化”指外源DNA借以进入宿主细胞的任何过程。可以在天然或人工条件下,使用本领域熟知的各种方法来发生转化。转化可以依赖于用于将外来核酸序列插入至原核或真核宿主细胞中的任意已知方法。该方法基于待转化的宿主细胞加以选择,并且可以包括但不限于病毒感染、电穿孔、脂质转染和粒子轰击。此类“转化的”细胞包括稳定转化的细胞,其中插入的DNA能够作为自主复制型质粒或作为宿主染色体的一部分而复制。它们也包括以有限的时间段瞬时表达所插入的DNA或RNA的细胞。
[0290] 术语“重组宿主细胞”(或简单地称作“宿主细胞”)意指已将外源DNA导入其中的细胞。在一个实施方案中,宿主细胞包含两种或更多种(例如多种)编码抗体的核酸,例如美国专利No.7,262,028中描述的宿主细胞。此类术语不仅意指特定的主体细胞,还意指此类细胞的子代。因为某些修饰可以归因于突变或环境影响而出现于后续世代中,所以此类子代实际上可能不与亲代细胞相同,但仍包含于如本文中所用的术语“宿主细胞”的范围内。在一个实施方案中,宿主细胞包括选自生物界中任一者的原核细胞和真核细胞。在另一个实施方案中,真核细胞包括原生生物、真菌、植物和动物细胞。在另一个实施方案中,宿主细胞包括但不限于原核细胞系大肠杆菌(Escherichia coli);哺乳动物细胞系CHO、HEK 293、COS 、NS0 、SP2 和PER .C6 ;昆 虫细胞 系Sf9 ;和真菌细 胞酿酒酵 母(Saccharomycescerevisiae)。
[0291] 标准技术可以用于重组DNA、寡核苷酸合成、以及组织培养和转化(例如电穿孔、脂质转染)。可以根据制造商的说明书或者如本领域中通常所完成或如本文所描述那样实施酶促反应和纯化技术。前述技术和程序可通常根据本领域熟知的和如在本说明书通篇范围内引用及讨论的各种一般性和更具体参考文献中所述的常规方法来实施。见,例如Sambrook等人,Molecular Cloning:A Laboratory Manual,第2版(Cold Spring Harbor Laboratory Press,Cold Spring Harbor,N.Y.,1989)。
[0292] 如本领域已知的,“转基因有机体”指具有含转基因的细胞的有机体,其中导入有机体(或该有机体的祖先)中的转基因表达不在该生物中天然表达的多肽。“转基因“是DNA构建体,其稳定并可操作地整合入从中发育转基因有机体的细胞的基因组中,引导编码的基因产物在转基因有机体的一个或更多个细胞类型或组织中的表达。
[0293] 术语“调整”和“调节”可互换地使用,并且如本文所用的,指改变或变化感兴趣的分子的活性(例如,hIL-1β的生物学活性)。调节可以是感兴趣分子的某种活性或功能在幅度上的增加或降低。分子的示例性活性和功能包括但不限于结合特征、酶活性、细胞受体活化和信号转导。
[0294] 相应地,如本文所用的术语“调节剂”是能够改变或变化感兴趣分子的活性或功能(例如,hIL-1β的生物学活性)的化合物。例如,与不存在调节剂的情况下所观察的活性或功能的幅度相比,调节剂可以引起分子的某种活性或功能在幅度上的增加或降低。在某些实施方案中,调节剂是抑制剂,其减小分子的至少一种活性或功能的幅度。示例性的抑制剂包括但不限于蛋白质、肽、抗体、肽体(peptibody)、水化合物或有机小分子。肽体例如在PCT公开号WO 01/83525中描述。
[0295] 如本文所用的术语“激动剂”指一种调节剂,当其与感兴趣的分子接触时,相比于不存在激动剂的情况下所观察的活性或功能的幅度,该调节剂引起所述分子的某种活性或功能在幅度上的增加。感兴趣的特定激动剂可以包括但不限于与hIL-1β结合的IL-1β多肽、核酸、碳水化合物或任何其他分子。如本文所用的术语“拮抗剂”和“抑制剂”指一种调节剂,当其与感兴趣的分子接触时,相比于不存在拮抗剂的情况下所观察的活性或功能的幅度,该调节剂引起所述分子的某种活性或功能在幅度上的降低。感兴趣的特定拮抗剂包括阻断或调节人IL-1β的生物学活性或免疫学活性的那些。人IL-1β的拮抗剂和抑制剂可以包括但不限于与人IL-1β结合的蛋白质、核酸、碳水化合物或任何其他分子。
[0296] 如本文所用的术语“有效量”指足以减少或改善病症或其一种或更多种症状的严重性和/或持续时间;防止病症发展;造成病症消退;防止与病症相关的一种或更多种症状复发、发展、发作或进展;检测病症;或增强或改善另一种疗法(例如,预防药剂或治疗药剂)的预防效果或治疗效果的疗法的量。
[0297] “患者”和“受试者”可以在本文中可互换地用来指动物,如哺乳动物,包括灵长类(例如人、猴和黑猩猩)、非灵长类(例如牛、猪、骆驼、羊驼、马、山羊、兔、绵羊、仓鼠、豚鼠、猫、犬、大鼠、小鼠、鲸)、鸟(例如鸭或鹅)和鲨鱼。优选地,患者或受试者是人,例如,正在因疾病、病症或病况而接受治疗或评估的人;存在疾病、病症或病况风险的人;患有疾病、病症或病况的人;和/或正在因疾病、病症或病况而接受治疗的人。
[0298] 如本文所用的术语“样品”以其最广泛的含义使用。如本文所用的“生物样品”包括但不限于任何量的来自活物或原先为活物的物质。此类活物包括但不限于人、非人灵长类、小鼠、大鼠、猴、犬、兔和其他动物。此类物质包括但不限于血液(例如,全血)、血浆、血清、尿、羊水、滑液、内皮细胞、白细胞、单核细胞、其他细胞、器官、组织、骨髓、淋巴结和脾。
[0299] “组分”、“多种组分”和“至少一种组分”通常指可以包括在用于根据本文所述的方法和本领域已知的其他方法分析测试样品(例如患者尿液、血清或血浆样品)的试剂盒中的捕捉抗体、检测或缀合抗体(conjugate antibody)、对照物、校准物、一系列校准物、灵敏度套件(sensitivity panel)、容器、缓冲剂、稀释剂、盐、酶、酶的辅因子、检测试剂、预处理试剂/溶液、底物(例如,作为溶液)、终止溶液等。因此,在本公开内容的上下文中,“至少一种组分”、“组分”和“多种组分”可以包括如上文所述的多肽或其他分析物,例如包含分析物(例如多肽)的组合物,其任选固定在固体支持物上,例如通过与抗分析物(例如,抗多肽)抗体结合固定在固体支持物上。一些组分可以处于溶液中或被冻干以便重构用于分析中。
[0300] “对照物”指已知不是分析物(“阴性对照物“)或含有分析物(“阳性对照物“)的组合物。阳性对照可以包含已知浓度的分析物。“对照物”、“阳性对照物”和“校准物”可以在本文中可互换地用来指包含已知浓度的分析物的组合物。“阳性对照物“可以用来建立分析性能特征并且是试剂(例如,分析物)完整性的有用指示剂。
[0301] “预定截止值(cutoff)”和“预定水平”通常指用来通过针对预定截止值/水平比较分析结果来评估诊断/预后/治疗功效结果的分析截止值,其中所述预定截止值/水平已经与各种临床参数(例如,疾病的严重性、进展/无进展/改善等)关联或相关。尽管本公开内容可以提供示例性的预定水平,但是众所周知,截止值可以根据免疫测定法的性质(例如,所采用的抗体等)而变化。还完全处于本领域普通技术人员能力范围内的是,修改本文公开内容用于其他免疫测定法,以基于本公开内容获得那些其他免疫测定法的免疫测定法特异性截止值。尽管预定截止值/水平的精确值可以在测定法之间变化,但是如本文所述的相关性(如果有的话)应当总体上是适用的。
[0302] 如在本文所述的诊断测定法中使用的“预处理试剂”(例如,裂解、沉淀和/或增溶试剂)是裂解试样品中存在的任何细胞和/或增溶测试样品中存在的任何分析物的一种试剂。如本文进一步描述的,预处理并非所有样品所必需的。其中,增溶分析物(例如,感兴趣的多肽)可以使得分析物从样品中存在的任何内源性结合蛋白中释放。预处理试剂可以是均质的(不需要分离步骤)或异质的(需要分离步骤)。使用异质预处理试剂时,在进行至测定法的下一个步骤之前,从测试样品中移除任何沉淀的分析物结合蛋白。
[0303] 在本文所述的免疫测定法和试剂盒的背景下,“质量控制试剂”包括但不限于校准物、对照物和灵敏度套件。一般使用“校准物”或“标准品”(例如,一种或更多种(例如多种)),以便建立校准(标准)曲线用于内插分析物(如抗体或分析物)的浓度。或者,可以使用单一校准物,其接近于预定的阳性/阴性截止值。可以联合使用多种校准物(即,多于一种校准物或可变量的校准物),以致包含“灵敏度套件”。
[0304] “风险”指特定事件在目前或在未来某个时刻出现的可能性或概率。“风险分层”指一系列已知临床风险因素,其允许医师将患者划分发展特定疾病、病症或病况的低、中、高或最高风险。
[0305] 在特异性结合对(例如,抗原(或其片段)和抗体(或其抗原反应性片段))的成员之间的相互作用的背景下,“特异性的”和“特异性”指相互作用的选择反应性。短语“与......特异性结合”和类似短语指抗体(或其抗原反应性片段)与分析物(或其片段)特异性结合并且不与其他实体特异性结合的能力。
[0306] “特异性结合配偶体”是特异性结合对的成员。一个特异性结合对包含两种不同的分子,它们通过化学或物理方式彼此特异性结合。因此,除了常见免疫测定法的抗原和抗体特异性结合对之外,其他特异性结合对还可以包括生物素和抗生物素蛋白(或链霉亲和素)、碳水化合物和凝集素、互补性核苷酸序列、效应物和受体分子、辅因子和酶、酶抑制剂和酶等。另外,特异性结合对可以包括作为原始特异性结合成员的类似物的成员(例如,分析物-类似物)。免疫反应性特异性结合成员包括抗原、抗原片段和抗体,包括单克隆和多克隆抗体以及复合物、其片段和变体(包括变体的片段),无论是分离或重组产生的。
[0307] 如本文所用的“变体”表示通过氨基酸的添加(例如,插入)、缺失或保守性取代而在氨基酸序列方面与给定多肽(例如,IL-1β、BNP、NGAL或HIV多肽或抗多肽抗体)不同,但是保留给定多肽生物活性(例如,变体IL-1β可以与抗IL-1β抗体竞争同IL-1β结合)的多肽。本领域中将氨基酸的保守性取代(即,一种氨基酸被具有相似特性(例如,亲水性及亲水程度和带电荷区域分布)的不同氨基酸替换)认识为通常涉及较小变化。如本领域所理解的,可以通过考虑氨基酸的疏水指数(hydropathic index)来部分地鉴定这些较小变化(见,例如,Kyte等人,J.Mol.Biol.,157:105-132(1982))。氨基酸的疏水指数基于对其疏水性和电荷的考虑。本领域已知,疏水指数相似的氨基酸可以被取代,并且仍保留蛋白质功能。在一个方面,具有±2的疏水指数的氨基酸被取代。氨基酸的亲水性也可以用来揭示将产生保留生物学功能的蛋白质的取代。在肽的背景下考虑氨基酸的亲水性允许计算这种肽的最大局部平均亲水性(已经报道与抗原性和免疫原性充分相关的一种有用量度)(见,例如美国专利No.4,554,101)。如本领域所理解的,取代具有相似亲水性值的氨基酸可以产生保留生物活性(例如免疫原性)的肽。在一个方面,用具有彼此的±2范围内的亲水性值的氨基酸实施取代。氨基酸的疏水性指数(hydrophobicity index)和亲水性值均受该氨基酸的特定侧链的影响。与这个观察结果一致,与生物学功能相容的氨基酸取代应理解为取决于氨基酸的相对相似性,并且尤其取决于那些氨基酸侧链的相对相似性(如通过疏水性、亲水性、电荷、大小和其他性能所揭示的)。“变体”也可以用来描述已经被差异性加工(例如通过蛋白酶解、磷酸化或其他翻译后修饰),仍保留其生物活性或抗原反应性(例如,与IL-1β结合的能力)的多肽或其片段。除非与上下文矛盾,本文中“变体”的使用意在包括变体的片段。
[0308] I.结合人IL-1β的抗体
[0309] 本发明的一个方面提供以高亲和力、慢脱离速率和高中和容量与IL-1β结合的分离的鼠单克隆抗体或其抗原结合部分。本发明的第二个方面提供结合IL-1β的嵌合抗体。本发明的第三个方面提供结合IL-1β的CDR移植抗体或其抗原结合部分。本发明的第四个方面提供结合IL-1β的人源化抗体或其抗原结合部分。本发明的第五个方面提供结合IL-1β和一种其他靶标的双重可变域免疫球蛋白(DVD-IgTM)分子。优选地,抗体或其部分是分离的抗体。优选地,本发明的抗体是中和人抗IL-1β抗体。
[0310] A.制备抗IL-1β抗体的方法
[0311] 本发明的抗IL-1β抗体可通过本领域已知的众多技术中的任一种来制备。
[0312] 1.使用杂交瘤技术产生抗IL-1β单克隆抗体
[0313] 单克隆抗体可使用本领域已知的多种技术制备,包括使用杂交瘤技术、重组技术及噬菌体展示技术或其组合。例如,单克隆抗体可使用杂交瘤技术产生,包括本领域中已知且在例如以下参考文献中教导的那些技术:Harlow等人,Antibodies:ALaboratory Manual,第2版(Cold Spring Harbor Laboratory Press,1988);Hammerling等人编,“Monoclonal Antibodiess and T-Cell Hybridomas(单克隆抗体和T-细胞杂交瘤)”,Research Monographs in Immunology,第3卷(J.L.Turk总编辑)(Elsevier,NewYork,
1981)第563-587页(这些参考文献以全文引用的方式并入本文中)。如本文所用的术语“单克隆抗体”并不限于经由杂交瘤技术产生的抗体。术语“单克隆抗体”是指来源于单个克隆(包括任何真核、原核或噬菌体克隆)的抗体,而与产生其的方法无关。
[0314] 使用杂交瘤技术产生及筛选特定抗IL-1β抗体的方法为常规方法且在本领域中已为熟知。在一实施方案中,本发明提供产生单克隆抗体的方法以及由此方法产生的抗体,该方法包含培养分泌本发明抗体的杂交瘤细胞,其中该杂交瘤优选如下产生:通过使从经本发明抗原免疫的小鼠分离的脾细胞与骨髓瘤细胞融合,且随后在分泌能够结合本发明多肽的抗体的杂交瘤克隆中筛选由融合体产生的杂交瘤。简言的,可用IL-1β抗原使小鼠免疫。在一示例性实施方案中,将IL-1β抗原与佐剂一起施用以刺激免疫反应。这些佐剂包括完全或不完全弗氏佐剂(Freund′s adjuvant)、RIBI(胞壁酰二肽)或ISCOM(免疫刺激复合物)。
这些佐剂可通过将多肽螯合于局部沉积物(sequestering it in a local deposit)中而保护其免于快速分散,或其可含有刺激宿主分泌对巨噬细胞及免疫系统的其它组分具有趋化性的因子的物质。优选地,若施用多肽,则免疫程序将涉及两次或两次以上施用多肽,为期数周。
[0315] 用IL-1β抗原使动物免疫的后,可自动物获得抗体和/或产生抗体的细胞。通过将动物放血或处死而自动物获得含有抗IL-1β抗体的血清。可如自动物获得时的原样来使用血清,可自血清获得免疫球蛋白部分,或可自血清纯化抗IL-1β抗体。以此方式获得的血清或免疫球蛋白为多克隆,因此具有一系列不均一的性质。
[0316] 一旦检测到免疫反应,例如在小鼠血清中检测到对抗原IL-1β具特异性的抗体,则采集小鼠脾脏且分离脾细胞。随后由熟知技术使脾细胞与任何适合的骨髓瘤细胞(例如来自可从美国典型培养物保藏中心(American Type Culture Collection,ATCC,Manassas,Virginia)获得的细胞系SP20的细胞)融合。用有限稀释法选择并克隆杂交瘤。随后针对分泌能够结合IL-1β的抗体的细胞,由本领域中已知的方法检定杂交瘤克隆。可通过用阳性杂交瘤克隆使小鼠免疫来产生通常含有高水平抗体的腹水。
[0317] 在另一实施方案中,可由经免疫的动物制备产生抗体的无限增殖化杂交瘤。免疫后,将动物处死且如本领域中所熟知那样,使脾B细胞与无限增殖化骨髓瘤细胞融合。参见例如Harlow等人,同上。在一示例性实施方案中,骨髓瘤细胞不会分泌免疫球蛋白多肽(非分泌性细胞系)。在融合及抗生素选择后,使用IL-1β或其部分或表达IL-1β的细胞来筛选杂交瘤。在一示例性实施方案中,使用酶联免疫吸附测定(ELISA)或放射免疫测定(RIA)、优选使用ELISA来进行初始筛选。ELISA筛选的一实例于PCT公开号WO 00/37504中提供,其以引用的方式并入本文中。
[0318] 选择产生抗IL-1β抗体的杂交瘤,进行克隆,且针对所需特征(包括稳健的杂交瘤生长、高抗体产量及如以下进一步讨论的所需抗体特征)进一步筛选。杂交瘤可在体内于同基因的动物中、缺乏免疫系统的动物(例如裸鼠)中培养及扩充,或在体外于细胞培养物中培养及扩充。选择、克隆及扩充杂交瘤的方法为本领域技术人员所熟知。
[0319] 在一示例性实施方案中,杂交瘤为如上所述的小鼠杂交瘤。在另一优选实施方案中,杂交瘤是在非人、非小鼠物种(诸如大鼠、绵羊、猪、山羊、牛或马)中产生。在另一实施方案中,杂交瘤为人杂交瘤,其中人非分泌性骨髓瘤与表达抗IL-1β抗体的人细胞融合。
[0320] 可由已知技术产生识别特异性表位的抗体片段。例如,可通过使用诸如木瓜蛋白酶(以产生Fab片段)或胃蛋白酶(以产生F(ab′)2片段)的酶,使免疫球蛋白分子发生蛋白酶剪切来产生本发明的Fab及F(ab′)2片段。F(ab′)2片段含有可变区、轻链恒定区及重链CHI域。
[0321] 2.使用SLAM产生抗IL-1β单克隆抗体
[0322] 在本发明的另一方面中,使用如美国专利号5,627,052;PCT公开号WO92/02551;及Babcook等人,Proc.Natl.Acad.Sci.USA,93:7843-7848(1996)中所述的在本领域中称为选择淋巴细胞抗体法(selected lymphocyte antibody method,SLAM)的程序从单个、经分离的淋巴细胞产生重组抗体。在此方法中,使用抗原特异性溶血空斑分析来筛选分泌相关抗体的单细胞,例如来源于第1部分中所述的任一经免疫动物的淋巴细胞,其中使用诸如生物素的接头使抗原IL-1β、IL-1β的亚基或其片段与绵羊红细胞偶联,且用于鉴别分泌对IL-1β具特异性的抗体的单细胞。在鉴别相关抗体分泌细胞后,通过逆转录酶-PCR从细胞中取出(rescue)重链及轻链可变区(VH及VL)cDNA,且随后可在适当免疫球蛋白恒定区(例如人恒定区)的情形下,在哺乳动物宿主细胞(诸如COS或CHO细胞)中表达这些可变区。随后可对来源于体内选择的淋巴细胞的、用扩增的免疫球蛋白序列转染的宿主细胞进行进一步体外分析及选择,例如通过淘选转染的细胞来分离表达针对IL-1β的抗体的细胞。可诸如由体外亲和力成熟方法(诸如PCT公开号WO 97/29131及PCT公开号WO 00/56772中所述的方法)在体外进一步操作扩增的免疫球蛋白序列。
[0323] 3.使用转基因动物的抗IL-1β单克隆抗体
[0324] 在本发明的另一实施方案中,通过用IL-1β抗原使包含一些或全部人免疫球蛋白基因座的非人动物免疫来产生抗体。在一示例性实施方案中,非人动物为XENOMOUSE转基因小鼠,其为包含人免疫球蛋白基因座的较大片段且在小鼠抗体产生方面缺乏的改造小鼠品系。参见例如Green等人,Nature Genetics,7:13-21(1994)及美国专利号5,916,771;5,939,598;5,985,615;5,998,209;6,075,181;6,091,001;6,114,598和6,130,364。还参见
1991年7月25日公开的PCT公开号WO91/10741;1994年2月3日公开的WO 94/02602;1996年10月31日公开的WO96/34096与WO 96/33735;1998年4月23日公开的WO 98/16654;1998年6月
11日公开的WO 98/24893;1998年11月12日公开的WO 98/50433;1999年9月10日公开的WO 
99/45031;1999年10月21日公开的WO 99/53049;2000年2月24日公开的WO00/09560;及2000年6月29日公开的WO 00/037504。 转基因小鼠产生完全人抗体的成人样人
谱系(adult-like human repertoire),且生成抗原特异性人Mab。 转基因
小鼠经由导入人重链基因座及x轻链基因座的百万碱基(megabase)大小的生殖系构型YAC片段而含有约80%的人抗体谱。参见Mendez等人,Nature Genetics 15:146-156(1997);及Green及Jakobovits,J.Exp.Med.188:483-495(1998),两者的揭示内容以引用的方式并入本文中。
[0325] 4.使用重组抗体文库的抗IL-1β单克隆抗体
[0326] 还可使用体外方法制备本发明的抗体,其中筛选抗体文库以鉴别具有所需结合特异性的抗体。该重组抗体文库筛选的方法在本领域中已为熟知且包括例如以下文献中所述的方法:Ladner等人,美国专利号5,223,409;Kang等人,PCT公开号WO92/18619;Dower等人,PCT公开号WO 91/17271;Winter等人,PCT公开号WO92/20791;Markland等人,PCT公开号WO 92/15679;Breitling等人,PCT公开号WO93/01288;McCafferty等人,PCT公开号WO 92/
01047;Garrard等人,PCT公开号WO92/09690;Fuchs等人,Bio/Technology,9:1369-1372(1991);Hay等人,Hum.Antibod.Hybridomas,3:81-85(1992);Huse等人,Science,246:
1275-1281(1989);McCafferty等人,Nature,348:552-554(1990);Griffiths等人,EMBO J.,12:725-734(1993);Hawkins等人,J.Mol.Biol.,226:889-896(1992);Clackson等人,Nature,352:624-628(1991);Gram等人,Proc.Natl.Acad.Sci.USA,89:3576-3580(1992);
Garrard等人,Bio/Technology,9:1373-1377(1991);Hoogenboom等人,Nucl.Acids Res.,
19:4133-4137(1991);及Barbas等人,Proc.Natl.Acad.Sci.USA,88:7978-7982(1991);美国公开号2003/0186374;及PCT公开号WO 97/29131,所述各文献的内容以引用的方式并入本文中。
[0327] 重组抗体文库可来自用IL-1β或IL-1β的一部分免疫的个体。或者,重组抗体文库可来自未经处理的个体,即未用IL-1β免疫的个体,诸如来自未用人IL-1β免疫的人个体的人抗体文库。通过用包含人IL-1β的肽筛选重组抗体文库,由此选择识别IL-1β的那些抗体,从而选择出本发明的抗体。进行该筛选及选择的方法在本领域中已为熟知,诸如前一段的参考文献中所述。为了选择对人IL-1β具有特定结合亲和力的本发明抗体,诸如以特定Koff速率常数从人IL-1β解离的抗体,可使用本领域已知的表面胞质团共振来选择具有所需Koff速率常数的抗体。为了选择对人IL-1β具有特定中和活性的本发明抗体,诸如具有特定IC50的抗体,可使用本领域中已知用于评估抑制人IL-1β活性的标准方法。
[0328] 在一个方面,本发明涉及结合人IL-1β的分离的抗体或其抗原结合部分。该抗体优选为中和抗体。在各种实施方案中,该抗体为重组抗体或单克隆抗体。
[0329] 例如,还可使用本领域已知的各种噬菌体展示法来产生本发明的抗体。在噬菌体展示法中,使功能抗体域展示在带有编码其的多核苷酸序列的噬菌体粒子的表面上。具体而言,可利用该噬菌体展示从谱系(repertoire)或组合抗体文库(例如人或鼠)表达的抗原结合域。可利用抗原,例如使用标记的抗原、或者结合或捕捉于固体表面或珠粒的抗原来选择或鉴别表达结合相关抗原的抗原结合域的噬菌体。这些方法中所用的噬菌体通常为丝状噬菌体,其包括从Fab、Fv或二硫键稳定的Fv抗体域与噬菌体基因III或基因VIII蛋白质重组融合的噬菌体表达的fd及M13结合域。可用于制备本发明抗体的噬菌体展示法的实例包括以下文献中所揭示的方法:Brinkmann等人,J.Immunol.Methods,182:41-50(1995);Ames等人,J.Immunol.Methods,184:177-186(1995);Kettleborough等人,Eur.J.Immunol.,24:952-958(1994);Persic等人,Gene,187:9-18(1997);Burton等人,Adv.Immunol.,57:191-
280(1994);PCT公开号WO 90/02809;WO 91/10737;WO92/01047(PCT/GB91/01134);WO 92/
18619;WO 93/11236;WO 95/15982;WO95/20401;及美国专利号5,698,426;5,223,409;5,
403,484;5,580,717;5,427,908;5,821,047;5,571,698;5,427,908;5,516,637;5,780,
225;5,658,727;5,733,743和5,969,108;所述各文献以全文引用的方式并入本文中。
[0330] 如以上参考文献中所述,在噬菌体选择后,来自噬菌体的抗体编码区可被分离且将其用于产生包括人抗体或任何其它所需抗原结合片段的完整抗体,且在任何所需宿主(包括哺乳动物细胞、昆虫细胞、植物细胞、酵母及细菌)中表达,例如如下详述。例如,还可使用本领域中已知的方法来应用重组产生Fab、Fab′及F(ab′)2片段的技术,诸如PCT公开号WO 92/22324;Mullinax等人,BioTechniques,12(6):864-869(1992);及Sawai等人,Am.J.Reprod.Immunol.,34:26-34(1995);及Better等人,Science,240:1041-1043(1988)(这些参考文献以全文引用的方式并入)中所揭示的方法。可用于产生单链Fv及抗体的技术的实例包括美国专利号4,946,778和5,258,498;Huston等人,Methods Enzymol.,203:46-88(1991);Shu等人,Proc.Natl.Acad.Sci.USA,90:7995-7999(1993);及Skerra等人,Science,240:1038-1041(1988)中所述的技术。
[0331] 替代通过噬菌体展示来筛选重组抗体文库,可应用本领域中已知用于筛选较大组合文库的其它方法来鉴别本发明的双重特异性抗体。如Szostak及Roberts的PCT公开号WO 98/31700和Roberts及Szostak,Proc.Natl.Acad.Sci.USA,94:12297-12302(1997)中所述,一类替代表达系统是将重组抗体文库表达为RNA-蛋白质融合体的表达系统。在此系统中,通过体外翻译在3′末端带有嘌呤霉素(肽基受体抗生素)的合成mRNA,而在mRNA与其编码的肽或蛋白质之间形成共价融合体。因此,可基于所编码的肽或蛋白质(例如抗体或其部分)的性质(诸如抗体或其部分与双重特异性抗原的结合),从mRNA的复杂混合物(例如组合文库)富集特异性mRNA。可由如上所述的重组方式(例如在哺乳动物宿主细胞中)表达从筛选这些文库所回收的编码抗体或其部分的核酸序列,且另外可通过对向最初选择的序列中导入了突变的mRNA-肽融合体进行更多轮筛选或通过如上所述的用于重组抗体的体外亲和力成熟的其它方法来进行进一步亲和力成熟。
[0332] 在另一方法中,还可使用本领域中已知的酵母展示法(yeast display method)来产生本发明的抗体。在酵母展示法中,使用遗传方法将抗体域缚着(tether)至酵母细胞壁且使其展示在酵母表面上。具体而言,可利用该酵母展示从谱系或组合抗体文库(例如人或鼠)表达的抗原结合域。可用于制备本发明抗体的酵母展示法的实例包括Wittrup等人在美国专利号6,699,658中所揭示的方法,该专利以引用的方式并入本文中。
[0333] B.产生重组IL-1β抗体
[0334] 可由本领域中已知的众多技术中的任一种来产生本发明的抗体。例如,从宿主细胞表达,其中通过标准技术将编码重链及轻链的表达载体转染至宿主细胞中。各种形式的术语“转染”意欲涵盖通常用于将外源DNA导入原核或真核宿主细胞中的多种技术,例如电穿孔、磷酸钙沉淀、DEAE-葡聚糖转染等。尽管有可能在原核或真核宿主细胞中表达本发明的抗体,但因为真核细胞(且尤其哺乳动物细胞)与原核细胞相比更可能组装且分泌适当折叠且具免疫活性的抗体,所以优选在这类真核细胞中且最优选在哺乳动物宿主细胞中表达抗体。
[0335] 用于表达本发明重组抗体的优选的哺乳动物宿主细胞包括中国仓鼠卵巢细胞(CHO细胞)(包括Urlaub及Chasin,Proc.Natl.Acad.Sci.USA,77:4216-4220(1980)中所述的dhfr-CHO细胞,其与DHFR可选择标记物一起使用,如例如Kaufman及Sharp,J.Mol.Biol.,
159:601-621(1982)中所述)、NS0骨髓瘤细胞、COS细胞及SP2细胞。当将编码抗体基因的重组表达载体导入哺乳动物宿主细胞中时,通过培养宿主细胞一段时间来产生抗体,所述培养时间足以允许抗体在宿主细胞中表达或更优选允许抗体分泌至宿主细胞所生长的培养基中。可使用标准蛋白质纯化方法从培养基中回收抗体。
[0336] 还可使用宿主细胞产生功能抗体片段,诸如Fab片段或scFv分子。应理解,上述程序的变更处于本发明的范畴内。例如,可能需要用编码本发明抗体的轻链和/或重链的功能片段的DNA转染宿主细胞。还可使用重组DNA技术移除一些或全部编码并非结合相关抗原所必需的轻链及重链之一或两者的DNA。本发明的抗体也包括从这类截断DNA分子表达的分子。另外,可通过使用标准化学交联方法使本发明抗体与第二抗体交联来产生双官能抗体,其中一条重链及一条轻链为本发明抗体且另一重链及另一轻链对非相关抗原的抗原具特异性。
[0337] 在重组表达本发明的抗体或其抗原结合部分的示例性系统中,通过磷酸钙介导的转染将编码抗体重链和抗体轻链的重组表达载体导入dhfr-CHO细胞中。在重组表达载体内,使抗体重链及轻链基因各自可操作地连接至CMV增强子/AdMLP启动子调节元件以驱动基因以高水平转录。重组表达载体还带有DHFR基因,其允许使用甲氨蝶呤选择/扩增来选择已经用载体转染的CHO细胞。培养所选的转化体宿主细胞以允许表达抗体重链及轻链,且从培养基中回收完整抗体。使用标准分子生物学技术来制备重组表达载体,转染宿主细胞,选择转化体,培养宿主细胞且从培养基中回收抗体。另外,本发明提供一种通过在适合的培养基中培养本发明的宿主细胞直至合成本发明的重组抗体来合成本发明重组抗体的方法。该方法可进一步包含从培养基中分离重组抗体。
[0338] 1.抗人IL-1β嵌合抗体
[0339] 嵌合抗体为抗体的不同部分来源于不同动物物种的分子,诸如具有来源于鼠单克隆抗体的可变区和人免疫球蛋白恒定区的抗体。产生嵌合抗体的方法在本领域中为已知的且于实施例部分中详细讨论。参见例如Morrison,S.L.,Science,229:1202-1207(1985);Oi等人,BioTechniques,4:214-221(1986);Gillies等人,J.Immunol.Methods,125:191-202(1989);美国专利号5,807,715;4,816,567;和4,816,397,这些文献以全文引用的方式并入本文中。另外,可使用经开发用于通过将来自具有适当抗原特异性的小鼠抗体分子的基因与来自具有适当生物学活性的人抗体分子的基因剪接在一起来产生“嵌合抗体”的技术(Morrison等人,Proc.Natl.Acad.Sci.USA,81:6851-6855(1984);Neuberger等人,Nature,312:604-608(1984);Takeda等人,Nature,314:452-454(1985),这些文献以全文引用的方式并入本文中)。
[0340] 在一实施方案中,通过用人IgG1恒定区置换第1部分中所述的鼠单克隆抗人IL-1β抗体的重链恒定区而制备本发明的嵌合抗体。
[0341] 2.抗IL-1β CDR移植抗体
[0342] 本发明的CDR移植抗体包含来自人抗体的重链及轻链可变区序列,其中将VH和/或VL的一或多个CDR区置换为本发明的鼠抗体的CDR序列。来自任何人抗体的构架序列可充当CDR移植的模板。然而,此类构架上的直接链置换通常导致与抗原的结合亲和力有一定损失。人抗体与原始鼠抗体的同源性越高,则鼠CDR与人构架的组合向CDR中导入可降低亲和力的畸变的可能性会越小。因此,经选择来置换除CDR以外的鼠可变构架的人可变构架优选与鼠抗体可变区构架具有至少65%的序列同一性。除CDR以外的人与鼠可变区更优选具有至少70%的序列同一性。除CDR以外的人与鼠可变区甚至更优选具有至少75%的序列同一性。除CDR以外的人与鼠可变区最优选具有至少80%的序列同一性。产生嵌合抗体的方法是本领域中已知的。参见例如欧洲专利号EP 0 239 400;PCT公开号WO 91/09967;美国专利号5,225,539;5,530,101;及5,585,089。关于抗体的镶饰(veneering)或改面,参见例如欧洲专利号EP 0 592 106及EP 0 519 596;Padlan,Mol.Immunol.,28(4/5):489-498(1991);
Studnicka等人,Protein Eng.,7(6):805-814(1994);及Roguska等人,
Proc.Natl.Acad.Sci.USA,91:969-973(1994)。关于抗体链改组,参见例如美国专利号5,
565,352。
[0343] 3.抗人IL-1β人源化抗体
[0344] 人源化抗体为来自结合所需抗原的非人物种抗体的抗体分子,其具有来自非人物种抗体的一个或多个互补决定区(CDR)及来自人免疫球蛋白分子的构架区。已知人Ig序列揭示于例如以下全球信息网站:www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez-/query.fcgi;www.atcc.org/phage/hdb.html;www.sciquest.com/;www.abcam.com/;
www.antibodyresource.com/onlinecomp.html;www.public.iastate.edu/.about.pedro/research_tools.html;www.mgen.uni-heidelberg.de/SD/IT/IT.html;
www.whfreeman.com/immunology/CH-05/kuby05.htm;www.library.thinkquest.org/
12429/Immune/Antibody.html;www.hhmi.org/grants/lectures/1996/vlab/;
www.path.cam.ac.uk/.about.mrc7/m-ikeimages.html;www.antibodyresource.com/;
mcb.harvard.edu/BioLinks/Immuno-logy.html.www.immunologylink.com/;
pathbox.wustl.edu/.about.hcenter/index.-html;www.biotech.ufl.edu/.about.hcl/;
www.pebio.com/pa/340913/340913.html-;www.nal.usda.gov/awic/pubs/antibody/;
www.m.ehime-u.acjp/.about.yasuhito-/Elisa.html;www.biodesign.com/table.asp;
www.icnet.uk/axp/facs/davies/lin-ks.html;www.biotech.ufl.edu/.about.fccl/
protocol.html;www.isac-net.org/sites_geo.html;aximtl.imt.uni-marburg.de/
.about.rek/AEP-Start.html;baserv.uci.kun.nl/.about.jraats/linksl.html;
www.recab.uni-hd.de/immuno.bme.nwu.edu/;www.mrc-cpe.cam.ac.uk/imt-doc/pu-
blic/INTRO.html;www.ibt.unam.mx/vir/V_mice.html;imgt.cnusc.fr:8104/;
www.biochem.ucl.ac.uk/.about.martin/abs/index.html;antibody.bath.ac.uk/;
abgen.cvm.tamu.edu/lab/wwwabgen.html;www.unizh.ch/.about.honegger/AHOsem-
inar/Slide01.html;www.cryst.bbk.ac.uk/.about.ubcg07s/;www.nimr.mrc.ac.uk/CC/ccaewg/ccaewg.htm;www.path.cam.ac.uk/.about.mrc7/h-umanisation/TAHHP.html;
www.ibt.unam.mx/vir/structure/stat_aim.html;www.biosci.missouri.edu/smithgp/index.html;www.cryst.bioc.cam.ac.uk/.abo-ut.fmolina/Web-pages/Pept/
spottech.html;www.jerini.de/fr roducts.htm;www.patents.ibm.com/ibm.html;Kabat等人,Sequences of Proteins of ImmunologicalInterest,U.S.Dept.Health(1983),这些以全文引用的方式并入本文中。这些输入序列可用于降低免疫原性,或降低、增强或调节结合性、亲和力、缔合速率(on-rate)、解离速率(off-rate)、活动性(avidity)、特异性、半寿期或如本领域中已知的任何其它适合特征。
[0345] 人构架区中的构架(FR)残基可用来自CDR供体抗体的相应残基取代以改变、优选改良抗原结合。这些构架取代由本领域中熟知的方法鉴别,例如通过建立CDR与构架残基的相互作用模型以鉴别对抗原结合重要的构架残基,且进行序列比较以鉴别特定位置处的异常构架残基。参见例如Queen等人,美国专利号5,585,089;Riechmann等人,Nature 332:323-327(1988),这些文献以全文引用的方式并入本文中。三维免疫球蛋白模型通常可获得且为本领域技术人员所熟知。可获得说明及显示选定候选免疫球蛋白序列的可能三维构象结构的计算机程序。对这些显示的检测允许分析残基在候选免疫球蛋白序列发挥功能方面可能起到的作用,即,分析影响候选免疫球蛋白与其抗原结合的能力的残基。以此方式,可从共有序列及输入序列选择并组合FR残基,以达成所需抗体特征,诸如对靶抗原的亲和力增加。通常,CDR残基直接且最实质性地参与影响抗原结合。可使用本领域中已知的多种技术对抗体进行人源化,诸如但不限于以下文献中所述的技术:Jones等人,Nature,321:522-
525(1986);Verhoeyen等人,Science,239:1534-1536(1988);Sims等人,J.Immunol.,151:
2296-2308(1993);Chothia及Lesk,J.Mol.Biol.,196:901-917(1987);Carter等人,Proc.Natl.Acad.Sci.USA,89:4285-4289(1992);Presta等人,J.Immunol.,151:2623-2632(1993);Padlan,Mol.Immunol.,28(4/5):489-498(1991);Studnicka等人,Protein Eng.,7(6):805-814(1994);Roguska等人,Proc.Natl.Acad.Sci.USA,91:969-973(1994);PCT公开号WO 91/09967;WO 90/14443;WO 90/14424;WO90/14430;WO 99/06834(PCT/US98/16280);
WO 97/20032(PCT/US96/18978);WO92/11272(PCT/US91/09630);WO 92/03461(PCT/US91/
05939);WO94/18219(PCT/US94/01234);WO 92/01047(PCT/GB91/01134);及WO93/06213(PCT/GB92/01755);欧洲专利号EP 0 592 106;EP 0 519 596及EP 0 239400;美国专利号
5,565,332;5,723,323;5,976,862;5,824,514;5,817,483;5,814,476;5,763,192;5,723,
323;5,766,886;5,714,352;6,204,023;6,180,370;5,693,762;5,530,101;5,585,089;5,
225,539及4,816,567,这些文献以全文引用的方式并入本文中,包括其中所引用的参考文献。
[0346] 5.抗IL-1β DVD-IgTM结合蛋白
[0347] 还提供结合IL-1β的一个或多个表位的双重可变域免疫球蛋白结合蛋白(DVD-Ig)。DVD-Ig结合蛋白还可结合IL-1β的表位及除IL-1β多肽以外的第二靶抗原的表位。这些DVD-Ig分子的示例性实施方案包含:包含结构式VD1-(X1)n-VD2-C-(X2)n的重链,其中VD1为第一重链可变域(variable domain),VD2为第二重链可变域,C为重链恒定域,X1为接头,条件为其不为CH1,X2为Fc区,且n为0或1,且优选为1;及包含结构式VD1-(X1)n-VD2-C-(X2)n的轻链,其中VD1为第一轻链可变域,VD2为第二轻链可变域,C为轻链恒定域,X1为接头,条件为其不为CH1,且X2不包含Fc区;且n为0或1,且优选为1。该DVD-Ig可包含两条这样的重链及两条这样的轻链,其中各链包含串联连接的可变区,在可变区之间没有插入的恒定区,其中一条重链与一条轻链缔合形成两个串联的抗原结合位点,且一对重链和轻链可与另一对重链和轻链缔合形成具有四个抗原结合位点的四聚体结合蛋白。在另一实施方案中,DVD-Ig分子可包含各包含串联连接的三个可变域(例如VD1、VD2、VD3)的重链及轻链,在可变域之间没有插入的恒定区,其中一对重链和轻链可缔合形成三个抗原结合位点,且其中一对重链和轻链可与另一对重链和轻链缔合形成具有六个抗原结合位点的四聚体结合蛋白。
[0348] DVD-Ig中的各可变域(VD)可从结合一种或多种所需抗原或表位(诸如IL-1β和/或IL-1α抗原或表位)的一种或多种“亲本”单克隆抗体获得。
[0349] A.生成亲本单克隆抗体
[0350] DVD-Ig结合蛋白的可变域可从能够结合相关抗原的亲本抗体(包括单克隆抗体(mAb))获得。这些抗体可天然产生或可通过重组技术生成。应了解若结合所需靶抗原或表位的抗体为多克隆抗体,则仍有必要获得来自多克隆群体的单一抗体(即多克隆群体的单一单克隆成员)的抗原结合位点的可变域,用于生成DVD-Ig。单克隆抗体可由本领域中已知的多种方法中的任一种,包括本文所述的那些方法生成(参见上文部分A.1.-A.4.)。
[0351] B.选择亲本单克隆抗体的标准
[0352] 本发明的一实施方案涉及选择具有在DVD-Ig分子中所需的至少一种或多种性质的亲本抗体。在一实施方案中,所需性质选自一个或多个抗体参数。在另一实施方案中,抗体参数选自抗原特异性、与抗原的亲和力、效力、生物学功能、表位识别性、稳定性、溶解度、生产效率、免疫原性、药物动力学、生物利用度、组织交叉反应性及直向同源抗原结合性。
[0353] B1.对抗原的亲和力
[0354] 治疗性mAb的所需亲和力可取决于抗原的性质及所需治疗终点。在一实施方案中,因为细胞因子-细胞因子受体相互作用通常为高亲和力相互作用(例如<pM-<nM范围),所以当单克隆抗体阻断该相互作用时,单克隆抗体具有更高亲和力(Kd=0.01-0.50pM)。在这些情况下,mAb对于其靶的亲和力应等于或超过细胞因子(配体)对于其受体的亲和力。另一方面,具有较小亲和力(>nM范围)的mAb可例如在清除循环潜在病理蛋白中在治疗上为有效的,例如结合、螯合(sequester)且清除诸如A-β淀粉样蛋白的靶抗原的循环物质的单克隆抗体。在其它情况下,通过定位诱变来降低现有高亲和力mAb的亲和力或使用对其靶具有较低亲和力的mAb可用于避免潜在副作用,例如高亲和力mAb可螯合或中和所有其预定靶,由此完全消耗/消除靶向蛋白的功能。在此情况下,低亲和力mAb可螯合/中和可能会造成疾病症状的靶的一部分(病理学水平或过量产生水平),因此使得靶的一部分可继续执行其正常生理功能。因此,可能会降低Kd以调节剂量和/或降低副作用。亲本mAb的亲和力可在适当地靶向细胞表面分子以达成所需治疗结果中起作用。例如,若靶以高密度表达于癌细胞上且以低密度表达于正常细胞上,则与正常细胞相比,较低亲和力mAb将在肿瘤细胞上结合更大数目的靶,导致通过ADCC或CDC消除肿瘤细胞,且因此可具有所需治疗作用。因此,选择具有所需亲和力的mAb,对于可溶性及表面靶两者均有意义。
[0355] 经受体与其配体相互作用的信号传导(signaling)可取决于受体-配体相互作用的亲和力。类似地,可以设想mAb对于表面受体的亲和力可决定胞内信号传导的性质及mAb是否可传递激动信号或拮抗信号。基于亲和力的mAb介导的信号传导的性质可影响其副作用概况。因此,治疗性单克隆抗体的所需亲和力及所需功能需要通过体外及体内实验谨慎地确定。
[0356] 结合蛋白(例如抗体)的所需Kd可根据所需治疗结果而以实验方式来确定。在一实施方案中,选择对于特定抗原的亲和力(Kd)等于或超过DVD-Ig对于相同抗原的所需亲和力的亲本抗体。抗原结合亲和力及动力学通过Biacore或另一类似技术来评估。在一实施方案中,各亲本抗体具有选自以下的与其抗原的解离常数(Kd):至多约10-7M、至多约10-8M、至多约10-9M、至多约10-10M、至多约10-11M、至多约10-12M及至多10-13M。从中获得VD1的第一亲本抗体及从中获得VD2的第二亲本抗体可具有对于相应抗原的类似或不同亲和力(KD)。各亲本抗体具有如通过表面胞质团共振所测量的选自以下的与抗原的缔合速率常数(Kon):至少约102M-1s-1、至少约103M-1s-1、至少约104M-1s-1、至少约105M-1s-1,及至少约106M-1s-1。从中获得例如VD1的第一亲本抗体及从中获得VD2的第二亲本抗体可具有对于相应抗原的类似或不同缔合速率常数(Kon)。在一实施方案中,各亲本抗体具有如通过表面胞质团共振所量测的选自以下的与抗原的解离速率常数(Koff):至多约10-3s-1、至多约10-4s-1、至多约10-5s-1,及至多约10-6s-1。从中获得VD1的第一亲本抗体及从中获得VD2的第二亲本抗体可具有对于相应抗原的类似或不同解离速率常数(Koff)。
[0357] B2.效力
[0358] 亲本单克隆抗体的所需亲和力/效力取决于所需治疗结果。例如,对于受体-配体(R-L)相互作用,亲和力(kd)等于或超过R-L kd(pM范围)。对于单纯清除病理性循环蛋白,Kd可在低nM范围中,例如清除循环A-β肽的多个种类。另外,Kd还取决于靶是否表达同一表位的多个拷贝,例如靶向Aβ寡聚物中的构象表位的mAb。
[0359] 在VDI及VD2结合同一抗原但结合不同表位的情况下,DVD-Ig含有针对同一抗原的结合位点,因此增大亲合力且由此增大DVD-Ig的表观Kd。在一实施方案中,选择具有与DVD-Ig中的所需Kd相等或较低的kd的亲本抗体。亲本mAb的亲和力考虑还可取决于DVD-Ig是否含有四个或四个以上相同抗原结合位点(即DVD-Ig来自单一mAb)。在此情况下,表观kd将由于亲合力而大于mAb。这类DVD-Ig可用于交联表面受体、增大中和效力、增强病理蛋白的清除等。
[0360] 在另一实施方案中,选择对于特异性抗原的中和效力等于或超过DVD-Ig对于相同抗原的所需中和潜力的亲本抗体。中和效力可通过靶依赖性生物测定法来评估,其中适当类型的细胞应答于靶刺激而产生可度量信号(即增殖或细胞因子产生),且通过mAb的靶中和可以按剂量依赖性方式减少信号。
[0361] B3.生物学功能
[0362] 单克隆抗体可潜在地执行若干功能,这些功能中的一些列于表5中。这些功能可通过体外测定法(例如基于细胞的测定法及生物化学测定法)及体内动物模型来评估。
[0363] 表5.治疗性抗体的一些潜在应用
[0364]
[0365] 可选择具有在本文实施例中及表5中所述的不同功能的mAb以达成所需治疗结果。两种或两种以上所选亲本单克隆抗体可随后以DVD-Ig形式使用以达成单一DVD-Ig分子中的两个不同功能。例如,DVD-Ig可通过选择中和特定细胞因子(诸如IL-1β)的功能的亲本mAb且选择增强病理蛋白的清除的亲本mAb来生成。类似地,可选择识别两种不同细胞表面受体的两种亲本mAb,一种mAb具有对于一种受体的激动剂功能,且另一种mAb具有对于另一种受体的拮抗剂功能。各自具有不同功能的这两种所选mAb可用于构建在单个分子中拥有所选单克隆抗体的两种不同功能(激动剂及拮抗剂)的单一DVD-Ig分子。类似地,可以按DVD-Ig形式使用针对细胞表面受体的各自阻断相应受体配体(例如EGF及IGF)的结合的两种拮抗mAb。相反地,可选择拮抗性抗受体mAb(例如抗EGFR)及中和性抗可溶性介体(例如抗IGF1/2)mAb来产生DVD-Ig。
[0366] B4.表位识别:
[0367] 蛋白质的不同区域可以执行不同的功能。例如,细胞因子(如IL-1β)的特定区域与细胞因子受体相互作用以引起受体活化,而该蛋白质的其他区域可能是稳定这种细胞因子所需要的。在这种情况下中,可以选择与细胞因子上受体相互作用区域特异性结合并且从而阻断细胞因子-受体相互作用的mAb。在一些情况下,例如结合多个配体的某些趋化因子受体,可以选择一种mAb,其结合至仅与一个配体相互作用的表位(趋化因子受体上的区域)。在其他情况下,单克隆抗体可以与靶上不直接负责该蛋白质生理功能的表位结合,但是mAb与这些区域的结合可能干扰生理功能(空间位阻)或改变蛋白质的构象,从而该蛋白质不能发挥作用(针对具有多个配体的受体的mAb,所述mAb改变受体构象从而没有一个配体可以结合)。也已经鉴定了不阻断细胞因子与其受体结合,但阻断信号转导的抗细胞因子单克隆抗体(例如,125-2H,一种抗IL-18mAb)。
[0368] 表位和mAb功能的实例包括但不限于阻断受体-配体(R-L)相互作用(结合R-相互作用位点的中和性mAb);导致削弱或无R-结合的空间位阻。抗体可以在受体结合位点之外的位点结合靶,但仍通过诱导构象变化及消除功能(例如 奥马珠单抗(omalizumab),Genetech/Novartis)、结合于R但阻断信号传导(125-2H mAb)来干扰受体结合及靶的功能。
[0369] 在一个实施方案中,亲本mAb需要靶向适宜的表位以发挥最大功效。这类表位应当是DVD-Ig中保守的。可以通过几种方法确定mAb的结合表位,包括共结晶学、mAb-抗原复合物有限蛋白酶解法及质谱肽定位法(Legros等人,Protein Sci.,9:1002-1010(2000))、噬菌体展示肽文库(0′Connor等人,J.Immunol.Methods.,299:21-35(2005))以及诱变(Wu C.等人,J.Immunol.,170:5571-5577(2003))。
[0370] B5.物理化学和药学特性
[0371] 采用抗体的治疗性处理经常需要施用高剂量,通常为数个mg/kg(其归因于由通常分子量大所致的基于质量的低效力)。为了适应患者依从性并且充分解决慢性疾病治疗和门诊患者治疗,皮下(s.c.)或肌内(i.m.)施用治疗性mAb是合乎需要的。例如,皮下施用最合乎需要体积是约1.0mL,并且因此需要>100mg/ml的浓度以限制每剂量的注射次数。在一个实施方案中,治疗性抗体以一个剂量施用。然而,这类制剂的开发受蛋白质-蛋白质相互作用(例如,聚集,这潜在地增加免疫原性风险)的制约,并受处理和传递期间的局限(例如,粘度)的制约。因此,临床功效所要求的较大量和相关的开发制约因素限制了对抗体制剂潜力和以高剂量方案皮下施用的充分利用。显然,蛋白质分子和蛋白质溶液的物理化学和药学特性非常重要,例如,稳定性、溶解度和粘度特征。
[0372] B5.1.稳定性
[0373] “稳定的”抗体制剂是其中抗体在储存时基本上保留其物理稳定性和/或化学稳定性和/或生物学活性的制剂。稳定性可以在所选的温度下持续所选时间段来测量。在一个实施方案中,制剂中的抗体在室温(约30℃)或在40℃稳定至少1个月和/或在约2-8℃稳定至少1年,例如,至少2年。另外,在一个实施方案中,在制剂冷冻(至例如-70℃)和解冻(下文称作(“冷冻/解冻循环”))后,制剂是稳定的。在另一个实例中,“稳定的”制剂可以是其中少于约10%和少于约5%的蛋白质在制剂中作为聚集物存在的制剂。
[0374] 在体外在各种温度下稳定持续延长时间段的DVD-Ig是合乎需要的。可以通过快速筛选在体外在升高的温度(例如在40℃)下稳定2-4周的亲本mAb并且随后评估稳定性来实现该目的。在2-8℃下储存期间,蛋白质显示稳定性至少12个月,例如,至少24个月。可以使用多种技术如阳离子交换层析、尺寸排阻层析、SDS-PAGE以及生物活性测试法来评估稳定性(%单体性完整分子)。关于可以用来分析共价修饰和构象修饰的分析技术的更全面清单,参见Jones,A.J.S.,“Analyticalmethods for the assessment of protein formulations and delivery systems”,第2章,Formulation and delivery of peptides and proteins,第1版,(Cleland及Langer编)(American Chemical Society,Washington,D.C.,1994)第22-45页;及Pearlman及Nguyen,“Analysis of Protein drugs”,第6章,Peptide and protein drug delivery,第1版[Advances in Parenteral Sciences,第4卷](Lee,V.H.编)(Marcel Dekker,Inc.,NewYork,1991)第247-301页。
[0375] 异质性和聚集物形成:抗体的稳定性可以是这样的,从而制剂可以显示少于约10%,并且在一个实施方案中,少于约5%,在另一个实施方案中少于约2%,或在一个实施方案中,处于0.5%至1.5%或更小范围的作为聚集物存在的GMP抗体物质。尺寸排阻层析是在检测蛋白质聚集物方面灵敏、可重现和非常稳定的方法。
[0376] 在一个实施方案中,除低聚集物水平之外,抗体还必须是化学稳定的。可以通过离子交换层析(例如,阳离子或阴离子交换层析)、疏水相互作用层析或其他方法(如等电聚焦或毛细管电泳法)来确定化学稳定性。例如,抗体的化学稳定性可以是这样的,从而在2-8℃储存至少12个月后,与储存测试之前的抗体溶液相比,在阳离子交换层析中代表未修饰的抗体的峰可以增加不多于20%,在一个实施方案中,不多于10%,或在另一个实施方案中,不多于5%。
[0377] 在一个实施方案中,亲本抗体显示结构完整性;正确的二硫键形成和正确的折叠:归因于抗体二级结构或三级结构变化的化学不稳定性可以影响抗体活性。例如,如抗体活性所指示的稳定性可以是这样的,从而在2-8℃储存至少12个月后,与储存测试之前的抗体溶液相比,抗体的活性可以下降不多于50%,在一个实施方案中,不多于30%或甚至不多于
10%,或在一个实施方案中不多于5%或1%。合适的抗原结合测定法可以用来测定抗体活性。
[0378] B5.2.溶解度
[0379] mAb的“溶解度”与正确折叠的单体IgG的产生相关。可以因此通过HPLC评估IgG的溶解度。例如,可溶性(单体)IgG将在HPLC色谱图上产生单峰,而不溶性(例如,多聚和聚集)IgG将产生多个峰。本领域技术人员将因此能够使用常规HPLC技术检测IgG溶解度的增加或减少。关于可以用来分析溶解度的分析技术的更全面清单,参见Jones,A.G.,Dep.Chem.Biochem.Eng.,Univ.Coll.London,“Particleformation and separation in suspension crystallization processes”,第4章,Process.Solid-Liquid Suspensions,(P.Ayazi Shamlou编)(Butterworth-Heinemann,Oxford,UK,1993)第93-117页;及
Pearlman及Nguyen,“Analysis of protein drugs”,第6章,Peptide and protein drug delivery,第1版[Advances in Parenteral Sciences,第4卷](Lee,V.H.编)(Marcel Dekker,Inc.,New York,1991)第247-301页。治疗性mAb的溶解度对于配制成充分给药所要求的高浓度是关键性的。如本文中概述,为适应于有效抗体给药,可能要求>100mg/mL的溶解度。例如,抗体溶解度可以在早期研究阶段不少于约5mg/mL,在一个实施方案中在高级工艺科学阶段不少于约25mg/mL,或在一个实施方案中不少于约100mg/mL或在一个实施方案中不少于约150mg/mL。蛋白质分子的固有特性对蛋白溶液的物理化学特性(例如,稳定性、溶解度、粘度)是重要的。然而,本领域技术人员将理解存在用作添加物以有益影响最终蛋白质制剂的特征的广泛类型的赋形剂。这些赋形剂可以包括:(i)液体溶剂、共溶剂(例如,如乙醇的醇);(ii)缓冲剂(例如,磷酸盐、乙酸盐、柠檬酸盐、氨基酸缓冲液);(iii)糖或糖醇(例如,蔗糖、海藻糖、果糖、蜜三糖、甘露醇、山梨醇、葡聚糖);(iv)表面活性剂(例如,聚山梨醇酯20、40、60、80、泊洛沙姆);(v)等渗性调节剂(例如,如NaCl的盐、糖、糖醇);和(vi)其他赋形剂(例如,防腐剂、螯合剂、抗氧化剂、螯合物质(例如,EDTA)、生物可降解聚合物、载体分子(例如,HSA、PEG))。
[0380] 就抗体制造和抗体加工(例如,渗滤/超滤)、填充-整饰(fill-finish)过程(泵送方面、过滤方面)和传递方面(可注射性、复杂装置传递)而言,粘度是十分重要的参数。低粘度使液态抗体溶液能够具有较高浓度。这使相同剂量能够以较小体积施用。较小的注射体积提供注射期间疼痛较少的优点并且溶液不必要等渗,以便在患者中减少注射时的疼痛。抗体溶液的粘度可以是这样的,从而在100(1/s)的剪切速率时,抗体溶液粘度低于200mPa s,在一个实施方案中低于125mPa s,在另一个实施方案中低于70mPa s,并且在又一个实施方案中低于25mPa s或甚至低于10mPa s。
[0381] B5.3.产生效率
[0382] 在一个实施方案中,产生在哺乳动物细胞(如中国仓鼠卵巢细胞(CHO))中有效表达的DVD-Ig将需要本身在哺乳动物细胞中有效表达的两种亲本单克隆抗体。来自稳定哺乳动物系(即,CHO)的产量应当高于约0.5g/L,在一个实施方案中高于约1g/L,并且在另一个实施方案中处于约2至约5g/L或更多的范围内(Kipriyanov等人,Mol.Biotechnol.,12:173-201(1999);Carroll等人,Expert Opin Biol Ther.,4:1821-1829(2004))。
[0383] 抗体和Ig融合蛋白在哺乳动物细胞中的产量受若干因素影响。通过并入强启动子、增强子和选择标记将表达载体工程化可以使相关基因从整合的载体拷贝中的转录最大化。鉴定容许高水平基因转录的载体整合位点可以加强来自载体的蛋白质表达(Wurm,F.M.,Nature Biotechnol.,22(11):1393-1398(2004))。另外,产生水平受抗体重链与轻链的比率和蛋白质装配和分泌过程中的多个步骤影响(Jiang等人,Biotechnol.Prog.,22(1):313-318(2006))。
[0384] B6.免疫原性
[0385] 治疗性mAb的施用可以引起免疫反应(即,形成针对治疗性mAb的内源性抗体)的某种发生率。应当在选择亲本单克隆抗体期间分析可能诱导免疫原性的潜在要素,并且可以采取降低这类风险的步骤以在DVD-Ig构建之前优化亲本单克隆抗体。已发现源自小鼠的抗体在患者中是高度免疫原性的。由小鼠可变区和人恒定区组成的嵌合抗体的产生呈现减少治疗性抗体的免疫原性的下一个逻辑步骤(Morrison和Schlom,″Recombinant Chimeric Monoclonal Antibodies(重组嵌合单克隆抗体),″第1章,Important Advances in Oncology 1990(J.B.Lippincott Company,Philadelphia,1990)第3-18页)。可选地,可以通过将鼠CDR序列转移至人抗体构架中(重构型/CDR移植/人源化)来减少免疫原性,如
Riechmann等人,Nature,332:323-327(1988)对治疗性抗体所描述那样。另一种方法称作“改面”或“镶饰”,始于啮齿类可变轻链和重链结构域,仅将表面可及的构架氨基酸改变成人构架氨基酸,同时CDR和内埋的氨基酸仍来自亲本啮齿抗体(Roguska等人,Protein Eng.,9(10):895-904(1996))。在另一个类型的人源化中,并非移植整个CDR,一项技术仅移植“特异性决定区“(SDR),其定义为参与抗体与其靶结合的CDR残基子集(Kashmiri等人,Methods,36(1):25-34(2005))。这需要通过分析抗体-靶复合物的可用三维结构或对抗体CDR残基进行突变分析以确定哪些残基与靶相互作用而鉴定SDR。可选地,与鼠抗体、嵌合抗体或人源化抗体相比,完全人抗体可以具有降低的免疫原性。
[0386] 降低治疗性抗体免疫原性的另一种方法是消除经预测具有免疫原性的某些特定序列。在一种方法中,在第一代生物制品已经在人类中测试并且发现存在不可接受的免疫原性后,可以将B-细胞表位定位并且随后将其改变以避免免疫探测。另一种方式使用预测和除去潜在T-细胞表位的方法。已经开发了计算方法来扫描并鉴定生物治疗药中具有与MHC蛋白结合的潜力的肽序列(Desmet等人,Proteins,58:53-69(2005))。可选地,基于人树突细胞的方法可以用来鉴定潜在蛋白质变应原中的CD4+T-细胞表位(Stickler等人,J.Immunother.,23:654-660(2000);Morrison和Schlom,Important Adv.Oncol.(1990)第
3-18页;Riechmann等人″Reshaping humanantibodies for therapy(重构型用于治疗的人抗体),″Nature.332:323-327(1988);Roguska等人,″A comparison of two murine mAbs humanized by CDR-grafting andvariable domain resurfacing(通过CDR移植和可变域改面而人源化的两种鼠mAb的比较),″Protein Eng.,9:895-904(1996);Kashmiri等人,″SDR grafting--a new approachto antibody humanization″(SDR移植——一种抗体人源化的新方法),″Methods,36(1):25-34(2005);Desmet等人,″Anchor profiles of HLA-specific peptides:analysisby a novel affinity scoring method and experimental validation(HLA特异性肽的锚形谱(Anchor profile):通过亲和力评分新方法和实验验证的分析),″Proteins,58:53-69(2005);Stickler等人,″CD4+T-cell epitope 
determination using unexposed humandonor peripheral blood mononuclear cells(使用未暴露的人供体外周血单核细胞确定CD4+T-细胞表位),″J.Immunother.,23:654-
660(2000))。
[0387] B7.体内功效
[0388] 为了产生具有所需体内功效的DVD-Ig分子,重要的是在组合给出时产生并且选择具有类似所需体内功效的mAb。然而,在一些情况下,DVD-Ig可以显示出不能以两种单独mAb组合时实现的体内功效。例如,DVD-Ig可以使得两个靶紧密靠近,产生不能以两种单独mAb组合时实现的活性。本文在B3部分中描述额外的合乎需要的生物学功能。可以基于多种因素如药物动力学半寿期(t1/2);组织分布;可溶性相对于(versus)细胞表面靶;以及靶浓度-可溶性/密度-表面来选择具有DVD-Ig分子中所需特征的亲本抗体。
[0389] B8.体内组织分布
[0390] 为了产生具有所需体内组织分布的DVD-Ig分子,在一个实施方案中,必须选择具有相似所需体内组织分布概况的亲本mAb。可选地,当组合给出时,基于双重特异性靶向策略的机制,在其他时间可以不需要选择具有类似所需体内组织分布的亲本mAb。例如在DVD-Ig的情况下,其中一个结合组分将DVD-Ig靶向输送至特定位点,从而将第二结合组分引至相同靶位点。例如,DVD-Ig的一种结合特异性可以靶向胰(胰岛细胞),并且另一种特异性可以使得GLP1到达胰以诱导胰岛素。
[0391] B9.同种型
[0392] 为了产生具有所需特性(包括但不限于同种型、效应子功能和循环半寿期)的DVD-Ig分子,根据治疗用途和所需的治疗终点选择拥有适宜Fc-效应子功能的亲本mAb。存在5个主要重链类型或同种型,其中一些具有几个亚型,并且这些类别决定抗体分子的效应子功能。这些效应子功能存在于抗体分子的铰链区、CH2和CH3结构域内。然而,在抗体分子其他部分中的残基也可以对效应子功能产生影响。铰链区Fc-效应子功能包括:(i)抗体依赖性细胞毒性(ADCC)、(ii)补体(C1q)结合、活化和补体依赖性细胞毒性(CDC)、(iii)抗原-抗体复合物的吞噬/清除、和(iv)在一些情况下细胞因子释放。抗体分子的这些Fc-效应子功能由Fc区与一组类型特异性细胞表面受体的相互作用来介导。IgG1同种型的抗体是最有活性的,而IgG2和IgG4具有最小或没有效应子功能。IgG抗体的效应子功能通过与3种在结构上同源的细胞Fc受体类型(和亚型)(FcgR1、FcgRII和FcgRIII)的相互作用来介导。可以通过在下部铰链区中FcgR和C1q结合所需的特定氨基酸残基突变(例如,L234A、L235A)来消除IgG1的这些效应子功能。在Fc区、尤其CH2-CH3结构域中的氨基酸残基也决定抗体分子的循环半寿期。这种Fc功能由Fc区与新生儿Fc受体(FcRn)的结合作用来介导,所述新生儿Fc受体负责抗体分子从酸性溶酶体再循环返回至周身循环(general circulation)。
[0393] mAb是否应当具有活性或非活性同种型将取决于抗体的所需治疗终点。下文列出同种型的用途和所需治疗性结局的一些实例:
[0394] 1.如果所需的终点是功能性中和可溶性细胞因子,则可以使用非活性同种型;
[0395] 2.如果所需的结局是清除病理蛋白,则可以使用活性同种型;
[0396] 3.如果所需的结局是清除蛋白质聚集物,则可以使用活性同种型;
[0397] 4.如果所需的结局是拮抗表面受体,则使用非活性同种型(Tysabri,IgG4;突变的IgG1);
[0398] 5.如果所需的结局是消除靶细胞,则使用活性同种型(赫赛汀(Herceptin),IgG1(并且具有增强的效应子功能);以及
[0399] 6.如果所需的结局是从循环中清除蛋白质而不进入CNS,可以使用IgM同种型(例如,清除循环型Ab肽种类)。
[0400] 可以通过本领域熟知的各种体外方法来确定亲本mAb的Fc效应子功能。
[0401] 如所讨论,同种型的选择,并且由此效应子功能的选择将取决于所需的治疗终点。在其中需要单纯中和循环型靶(例如阻断受体-配体相互作用)的情况下,可以不需要效应子功能。在这类情况下,抗体Fc区内消除效应子功能的同种型或突变是合乎需要的。在其中消除靶细胞是治疗终点(例如消除肿瘤细胞)的其他情况下,Fc区内增强效应子功能的同种型或突变或去岩藻糖基化是合乎需要的(Presta,L.G.,Adv.Adv.Drug Del.Rev.,58:640-
656(2006);Satoh等人,Expert Opin.Biol.Ther.,6:1161-1173(2006)。类似地,取决于治疗性用途,可以通过在Fc区内导入特定突变而调节抗体-FcRn相互作用来缩短/延长抗体分子的循环半寿期(Dall’Acqua等人,JBiol Chem.,281:23514-23524(2006);Petkova等人,Int.Immunol.,18:1759-1769(2006);Vaccaro等人,Proc.Natl.Acad.Sci.USA,103:18709-
18714(2006)。
[0402] 对于DVD-Ig,关于影响正常治疗性mAb的不同效应子功能的多种残基的公开信息可能需要证实。以下情况是可能的:在DVD-Ig形式中,除经鉴定用于调节单克隆抗体效应子功能的那些残基之外,其它(不同)的Fc区残基可能会比较重要。
[0403] 总体而言,关于哪种Fc-效应子功能(同种型)将在最终DVD-Ig形式中至关重要的判定将取决于疾病适应症、治疗靶、所需的治疗终点和安全性考虑事项。下文列出示例性适宜的重链恒定区和轻链恒定区,包括但不限于:IgG1-同种异型:G1mz;IgG1突变体-A234、A235;IgG2-同种异型:G2m(n-);κ-Km3;和λ。
[0404] Fc受体和C1q研究:可以通过(例如L234A、L235A)铰链区突变来消除因抗体与细胞膜上任何过量表达的靶复合所致的不希望的抗体依赖性细胞介导细胞毒性(ADCC)和补体依赖性细胞毒性(CDC)的可能性。这些置换的氨基酸(存在于mAb的IgG1铰链区内)预期会导致mAb与人Fc受体(而非FcRn)的结合减弱,原因是认为FcgR结合在IgG1铰链区上的重叠位点内部发生。mAb的这个特征可以导致胜过含有野生型IgG的抗体的改进安全概况(safety profile)。可以通过流式细胞术实验使用细胞系(例如,THP-1、K562)和表达FcgRIIb(或其他FcgR)的工程化CHO细胞系来确定mAb与人Fc受体的结合。与IgG1对照单克隆抗体相比,mAb显示与FcgRI和FcgRIIa的结合减少,而与FcgRIIb的结合不受影响。抗原/IgG免疫复合物结合和活化C1q触发经典补体级联,伴随后续的炎症反应和/或免疫调节性反应。IgG上的C1q结合位点已经定位至IgG铰链区内部的残基。通过C1q ELISA评估C1q与增大浓度的mAb结合。结果表明,如所预期那样,与野生型对照IgG1的结合相比时,mAb不能与C1q结合。总之,L234A、L235A铰链区突变取消mAb与FcgRI、FcgRIIa和C1q的结合,但是不影响mAb与FcgRIIb的相互作用。这些数据表明,具有突变Fc的mAb在体内将正常地与抑制性FcgRIIb相互作用,但是将可能不与活化FcgRI和FcgRIIa受体或C1q相互作用。
[0405] 人FcRn结合:新生儿受体(FcRn)负责转运IgG跨过胎盘并且负责控制IgG分子的分解代谢半寿期。可能需要增加抗体的终末半寿期以改善功效、减少剂量或施用频率,或改善对靶的定位。可选地,可能有利的是反其道而行之,即,缩减抗体的终末半寿期以减少整个身体暴露量或改善靶/非靶结合比。调节(tailoring)IgG和其补救受体(salvage receptor)FcRn之间的相互作用提供了一种增加或缩短IgG终末半寿期的方式。在循环中的蛋白质(包括IgG)通过某些细胞(如血管内皮细胞)微胞饮作用而溶解于流体相中。IgG可以在核内体中在略酸性条件(pH 6.0-6.5)下结合FcRn并且可以再循环至细胞表面,在那里,它在几乎中性条件(pH 7.0-7.4)下被释放。FcRn80、16、17上的Fc区结合位点的定位显示跨物种保守的两个组氨酸残基His310和His435负责这种相互作用的pH依赖性。使用噬菌体展示技术,鉴定了增加与FcRn结合和延长小鼠IgG半寿期的小鼠Fc区突变(见Ghetie等人,Nature Biotechnol.,15(7):637-640(1997))。也已经鉴定了增加人IgG在pH 6.0(而非pH 
7.4)下对FcRn的结合亲和力的Fc区突变(见,Dall′Acqua等人,J.Immunol.,169(9):5171-
5180(2002))。另外,在一种情况下,也对恒河猴FcRn观察到结合作用的相似pH依赖性增加(至多到27倍),并且这导致与亲本IgG相比,在恒河猴中血清半寿期增加2倍(见,Hinton等人,J.Biol.Chem.,279(8):6213-6216(2004))。这些研究结果表明,通过调节Fc区与FcRn的相互作用来延长抗体治疗药的血浆半寿期是可行的。相反,减弱与FcRn相互作用的Fc区突变可以缩短抗体半寿期。
[0406] B.10.药物动力学(PK)
[0407] 为了产生具有所需药物动力学概况的DVD-Ig分子,在一个实施方案中,选择了具有类似所需药物动力学概况的亲本mAb。一个考虑因素是针对单克隆抗体的免疫原性反应(即,“HAHA”,人抗人抗体反应;“HACA”,人抗嵌合抗体反应)进一步使这些治疗药的药物动力学复杂化。在一个实施方案中,将具有最小免疫原性或没有免疫原性的单克隆抗体用于构建DVD-Ig分子,从而所得到的DVD-Ig也将具有最小免疫原性或没有免疫原性。决定mAb的PK的一些因素包括但不限于mAb的固有特性(VH氨基酸序列);免疫原性;FcRn结合作用和Fc功能。
[0408] 选择的亲本单克隆抗体的PK概况(PK profile)可以在啮齿类中容易地确定,原因是啮齿类中的PK概况与单克隆抗体在食蟹猴和人中的PK概况良好相关(或密切预测之)。
[0409] 在选出具有所需PK特征(和如本文中讨论的其他所需功能特性)的亲本单克隆抗体后,构建DVD-Ig。由于DVD-Ig分子含有来自两种亲本单克隆抗体的两种抗原结合结构域,故而也评估了DVD-Ig的PK特性。因此,在确定DVD-Ig的PK特性时,可以使用PK测定法,所述PK测定法基于源自两种亲本单克隆抗体的两种抗原结合域的功能来确定PK概况。可以确定DVD-Ig的PK概况。可以影响DVD-Ig的PK概况的额外因素包括抗原结合域(CDR)取向、接头大小和Fc/FcRn相互作用。可以通过评估以下参数:吸收、分布、代谢和排泄,来评估亲本抗体的PK特征。
[0410] 吸收:迄今,治疗性单克隆抗体的施用是经肠胃外途径(例如,静脉内[IV]、皮下[SC]或肌内[IM])。在SC或IM施用后,从胞间隙将mAb吸收至体循环中主要通过淋巴途径。在血管外施用后,饱和、首过(presystemic)、蛋白酶解的降解可以导致可变的绝对生物利用度。通常,可以观察到随单克隆抗体剂量增加,绝对生物利用度增加,这归因于在较高剂量时蛋白酶解的能力饱和。mAb的吸收过程通常相当缓慢,原因是淋巴液缓慢流出至血管系统,并且吸收持续期可以持续数小时至几天。单克隆抗体在SC施用后的绝对生物利用度通常是50%至100%的范围。在DVD-Ig构建体靶向的血脑屏障(BBB)处转运介导的结构的情况下,血浆中的循环时间可以缩减,这归因于增强血脑屏障(BBB)处跨细胞转运入CNS区室,在所述CNS区室中DVD-Ig被释放以便能够通过其第二抗原识别位点相互作用。
[0411] 分布:在IV施用后,单克隆抗体通常符合双相血清(biphasic serum)(或血浆)浓度-时间曲线,始于快速分布相,随后是缓慢消除相。通常,双指数型药物动力学模型最佳地描述这种类型的药物动力学概况。中央区室中mAb的分布容量(Vc)通常等于或略微大于血浆容量(2-3升)。采用其他肠胃外给药途径如IM或SC,血清(血浆)浓度对时间曲线的不同双相样式可能不明显,因为血清(血浆)浓度-时间曲线的分布相被较长的吸收部分掩蔽。许多因素,包括物理化学特性、位点特异性和靶定向的受体(target-oriented receptor)介导的摄入、组织的结合力(binding capacity)和mAb剂量,可以影响mAb的生物分布。这些因素中的一些可以造成mAb生物分布的非线性。
[0412] 代谢和排泄:归因于分子大小、完整的单克隆抗体不是经肾排泄至尿中。它们主要通过代谢(例如,分解代谢)失活。对基于IgG的治疗性单克隆抗体而言,半寿期一般是数小时或1-2天至超过20天。mAb的消除可能受许多因素影响,包括但不限于,对FcRn受体的亲和力、mAb的免疫原性、mAb的糖基化程度、mAb对蛋白酶解的易感性、和受体介导的消除作用。
[0413] B.11.在人类及毒物学物种(tox species)上的组织交叉反应性样式
[0414] 相同的染色样式表示,可以在毒物学物种中评估潜在的人类毒性。毒物学物种是其中研究不相关毒性的那些动物。
[0415] 选择个体抗体以符合两个标准:(1)适用于已知抗体靶表达的组织染色;和(2)来自相同器官的人组织和毒物学物种组织之间相似的染色样式。
[0416] 标准1:免疫和/或抗体选择一般使用重组或合成的抗原(蛋白质、糖类或其他分子)。与天然对应物结合和针对不相关抗原反向筛选(counterscreen)经常是用于治疗性抗体的筛选漏斗(screening funnel)的部分。然而,针对众多抗原的筛选经常是不切实际的。因此,与来自全部主要器官的人组织的组织交叉性反应研究起到排除抗体与任何不相关抗原的不当结合的作用。
[0417] 标准2:采用人组织和毒物学物种组织(食蟹猴、犬、可能的啮齿类和其他物种,如人类研究中那样测试相同的36或37种组织)的对比组织交叉反应性研究有助于验证毒物学物种的选择。在对冷冻组织切片的常见组织交叉反应性研究中,常见的治疗性抗体可以显示与已知抗原的预期结合和/或基于任一低水平相互作用(非特异性结合、与相似抗原的低水平结合、基于低水平电荷的相互作用)与组织的较低程度结合。在任何情况下,最相关的毒物学动物物种是与人组织和动物组织结合的一致程度最高的物种。
[0418] 组织交叉反应性研究遵循适宜的规章准则,包括EC CPMP GuidelineIII/5271/94″Production and quality control of mAbs(mAb的生产和质量控制)″和1997US FDA/CBER″Points to Consider in the Manufacture and Testing of MonoclonalAntibody Products for Human Use(治疗和测试人用单克隆抗体产品的考察要点)″。在尸体剖检或活组织检查时获得的人组织冷冻切片(5μm)在载玻片上固定和干燥。使用抗生物素蛋白-生物素系统进行组织切片的过氧化物酶染色。FDA′s Guidance″Points to Consider in the Manufacture and Testing of Monoclonal Antibody Products forHuman Use″.相关的参考文献包括Clarke,J.(2004),Boon,L.(2002a),Boon,L.(2002b),Ryan,A.(1999)。
[0419] 组织交叉反应性研究经常以两个阶段进行,第一阶段包括来自一个人供体的32种组织(通常是:肾上腺、胃肠道、前列腺、膀胱、心脏、骨骼肌、血细胞、肾、皮肤、骨髓、肝脏、脊髓、乳房、肺、脾、小脑、淋巴结、睾丸、大脑皮质、卵巢、胸腺、结肠、胰、甲状腺、内皮、甲状旁腺、输尿管、眼、垂体、子宫、输卵管和胎盘)的冷冻切片。在第二阶段,对来自3位不相关成人的至多38种组织(包括肾上腺、血液、血管、骨髓、小脑、大脑、子宫颈、食道、眼、心脏、肾、大肠、肝脏、肺、淋巴结、乳腺、卵巢、输卵管、胰、甲状旁腺、外周神经、垂体、胎盘、前列腺、唾液腺、皮肤、小肠、脊髓、脾、胃、横纹肌、睾丸、胸腺、甲状腺、扁桃体、输尿管、膀胱和子宫)进行完整交叉反应性研究。研究一般最少以两个剂量水平进行。
[0420] 治疗性抗体(即,供试品)和同种型匹配的对照抗体可以进行生物素酰化以便用于抗生物素蛋白-生物素复合物(ABC)检测;其他检测方法可以包括用于FITC(或其它)标记的供试品的三级抗体检测,或未标记的供试品与标记的抗人IgG预复合。
[0421] 简而言之,将尸体剖检或活组织检查时获得的人组织冷冻切片(5μm)在载玻片上固定和干燥。使用抗生物素蛋白-生物素系统进行组织切片的过氧化物酶染色。首先(在预复合检测系统的情况下),将供试品与第二生物素酰化的抗人IgG孵育并且形成免疫复合物。将终浓度为2μg/ml和10μg/ml的供试品的情况下的免疫复合物添加到载玻片上的组织切片上,并且随后使组织切片与抗生物素蛋白-生物素-过氧化物酶试剂盒一起反应30分钟。随后,将DAB(3,3′-二氨基联苯胺,过氧化物酶反应底物)涂覆持续4分钟用于组织染色。使抗原-琼脂糖珠作为阳性对照组织切片。
[0422] 基于所讨论的靶抗原的已知表达,判定任何特异性染色是预期(例如,与抗原表达一致)或非预期的反应性。对判定为特异性的任何染色评定强度和频率。抗原或血清竞争或阻断研究可以进一步有助于确定观察到的染色是否为特异性或非特异性。
[0423] 如果发现两种选择的抗体符合选择标准(适宜的组织染色、在人和毒物学动物特定组织之间匹配的染色),则可以选择它们用于产生DVD-Ig。
[0424] 组织交叉反应性研究必需用最终DVD-Ig构建体来重复,但是在这些研究遵循如本文中概述的相同操作方案时,它们的评价更复杂,因为任何结合可能来自两种亲本抗体的任一者,并且需要用复杂的抗原竞争研究来证实任何未经说明的结合。
[0425] 显然,如果针对(1)缺少非预期组织交叉反应性研究结果、及(2)相应的人组织与毒物学动物物种组织之间组织交叉反应性研究结果的适当相似性来选择两种亲本抗体,则大大地简化采用多特异性分子(如DVD-Ig)的组织交叉反应性研究的复杂任务。
[0426] B.12.特异性和选择性
[0427] 为了产生具有所需特异性和选择性的DVD-Ig分子,在一个实施方案中,需要产生和选择具有类似所需特异性和选择性概况的亲本mAb。
[0428] 采用DVD-Ig针对特异性和选择性的结合研究可能因4个或更多个结合位点(每两个结合位点针对每种抗原)而是复杂的。简而言之,对于DVD-Ig,使用ELISA、BIAcore、KinExA或其他相互作用研究的结合研究需要监测1种、2种或更多种抗原与DVD-Ig分子的结合。尽管BIAcore技术可以解析多个抗原的依序、独立结合,但是更多的传统方法(包括ELISA)或更现代的技术如KinExA则不能。因此,仔细地表征每种亲本抗体是关键的。在已经表征每种抗体的特异性后,证实DVD-Ig分子中各个结合位点的特异性保留(specificity retention)大大简化。
[0429] 显然,如果在组合成DVD-Ig之前选择两个亲本抗体的特异性,则大大地简化确定DVD-Ig特异性的复杂任务。
[0430] 抗原-抗体相互作用研究可以采取许多形式,包括许多经典的蛋白质-蛋白质相互作用研究,包括ELISA(酶联免疫吸附测定)、质谱法、化学交联法、采用光散射的SEC、平衡透析法、凝胶渗透法、超滤法、凝胶层析、大区带(large-zone)分析性SEC、微量制备超速离心法(沉降平衡法)、光谱法、滴定微量量热法、沉降平衡法(在分析性超速离心机中)、沉降速度(在分析性离心机中)、表面胞质团共振(包括BIAcore)。相关参考文献包括Current Protocols in Protein Science,第3卷,第19和20章(Coligan等人,编著)(John Wiley & Sons,Inc.)和其中包括的参考文献;和Current Protocols in Immunology,(Coligan等人,编著)(John Wiley & Sons,Inc.)和其中包括的相关参考文献。
[0431] 全血中的细胞因子释放:可以通过细胞因子释放测定法来研究mAb与人血细胞的相互作用(Wing等人,Therapeutic Immunol.,2(4):2(4):183-190(1995);CurrentProtocols in Pharmacology,(Enna等人,编著)(John Wiley & Sons,Inc.);
Madhusudan等人,Clin.Cancer Res.,10(19):6528-6534(2004);Cox等人,Methods,38(4):
274-282(2006);Choi等人,Eur.J.Immunol.,31(1):94-106(2001))。简而言之,将各种浓度的mAb与人全血一起孵育24小时。测试的浓度应当覆盖一个宽范围,其包括模拟患者中常见血液水平的终浓度(包括但不限于100ng/mL-100μg/ml)。在孵育后,对上清液和细胞裂解物分析IL-1Rα、TNF-α、IL-1b、IL-6和IL-8的存在。针对mAb产生的细胞因子浓度概况与人IgG阴性对照和阳性LPS或PHA对照所产生的概况比较。由源自细胞上清液和细胞裂解物两者的mAb所显示的细胞因子概况与使用人IgG对照的细胞因子概况比较。在一个实施方案中,单克隆抗体不与人血细胞相互作用以自发释放炎性细胞因子。
[0432] 针对DVD-Ig的细胞因子释放研究因4个或更多个结合位点(每两个结合位点针对每种抗原)而是复杂的。简而言之,如本文所述的细胞因子释放研究测量完整DVD-Ig分子对全血或其他细胞系统的影响,但是不能解析该分子的哪个部分引起细胞因子释放。一旦已经检测到细胞因子释放,则必须确定DVD-Ig制备物的纯度,因为一些共纯化的细胞组分可独立地引起细胞因子释放。如果纯度不是问题,则可能需要DVD-Ig的片段化(包括但不限于移去Fc部分、分离结合位点等)、结合位点诱变或其他方法用来将任何观察结果去卷积(deconvolute)。显然,如果在组合成DVD-Ig之前就缺少细胞因子释放而言来选择两个亲本抗体,则大大地简化这项复杂任务。
[0433] B.13.与用于毒物学研究的其他物种的交叉反应性
[0434] 在一个实施方案中,选择对适宜毒物学物种(例如,食蟹猴)具有足够交叉反应性的单个抗体。亲本抗体需要与直向同源物种靶(即,食蟹猴)结合并且激发适宜的反应(调节、中和、活化)。在一个实施方案中,与直向同源物种靶的交叉反应性(亲和力/效力)应当在人类靶的10倍以内。在实践中,针对多个物种(包括小鼠、大鼠、犬、猴(和其他非人灵长类))以及疾病模型物种(即,用于哮喘模型的羊)评估亲本抗体。来自亲本单克隆抗体的针对毒物学物种的可接受交叉反应性允许未来在相同物种中进行DVD-Ig的毒物学研究。出于这个原因,这两种亲本单克隆抗体应当对常见的毒物学物种具有可接受的交叉反应性,因此允许未来在相同物种中进行DVD-Ig的毒物学研究。
[0435] 亲本mAb可以选自能够结合特异性靶(specific target)和本领域熟知的多种mAb。这些包括但不限于IL-1β、抗TNF抗体(美国专利号6,258,562)、抗IL-12和/或抗IL-
12p40抗体(美国专利号6,914,128);抗IL-18抗体(美国公开号2005/0147610A1)、抗C5、抗CBL、抗CD147、抗gp120、抗VLA-4、抗CD11a、抗CD18、抗VEGF、抗CD40L、抗CD-40(例如,见PCT公开号WO 2007/124299)、抗Id、抗ICAM-1、抗CXCL13、抗CD2、抗EGFR、抗TGF-β2、抗HGF、抗cMet、抗DLL-4、抗NPR1、抗PLGF、抗ErbB3、抗E-选择素、抗Fact VII、抗Her2/neu、抗F gp、抗CD11/18、抗CD14、抗ICAM-3、抗RON、抗CD-19、抗CD80(例如,见PCT公开号WO 2003/039486)、抗CD4、抗CD3、抗CD23、抗β2-整联蛋白、抗α4β7、抗CD52、抗HLADR、抗CD22(见,例如,美国专利号5,789,554)、抗CD20、抗MIF、抗CD64(FcR)、抗TCRαβ、抗CD2、抗Hep B、抗CA 125、抗EpCAM、抗gp120、抗CMV、抗gpIIbIIIa、抗IgE、抗CD25、抗CD33、抗HLA、抗IGF1,2、抗IGFR、抗VNR整联蛋白、抗IL-1α、抗IL-1β、抗IL-1受体、抗IL-2受体、抗IL-4、抗IL-4受体、抗IL5、抗IL-5受体、抗IL-6、抗IL-6R、RANKL、NGF、DKK、αVβ3、抗IL-8、抗IL-9、抗IL-13、抗IL-13受体和抗IL-23;IL-23p19(见,Presta,L.G.,″Selection,design,and engineering of therapeutic antibodies(治疗性抗体的选择、设计和工程化),″J.Allergy 
Clin.Immunol.,116:731-736(2005)和互联网网址http://www.path.cam.ac.uk/~mrc7/humanisation/antibodies.html)。
[0436] 亲本mAb也可以选自批准用于临床试验或用于开发临床用途的多种治疗性抗体。这类治疗性抗体包括但不限于利妥昔单抗(rituximab)( IDEC/Genentech/Roche)
(参见例如美国专利号5,736,137),经批准用于治疗非霍奇金氏淋巴瘤的嵌合抗CD20抗体;
HuMax-CD20,目前由Genmab开发的抗CD20,描述于美国专利号5,500,362中的抗CD20抗体;
AME-133(Applied MolecularEvolution);hA20(Immunomedics,Inc);HumaL YM(Intracel)及PRO70769(PCT公开号WO 2004/056312(PCT/US2003/040426),名称为“Immunoglobulin Variants andUses Thereof”);曲妥珠单抗(trastuzumab)( Genentech)(参见
例如美国专利号5,677,171),经批准用于治疗乳腺癌的人源化抗Her2/neu抗体;帕妥珠单抗(pertuzumab)(rhuMab-2C4, ),目前由Genentech开发;描述于美国专利号4,
753,894号中的抗Her2抗体;西妥昔单抗(cetuximab)( ImClone)(美国专利号4,
943,533号;PCT公开号WO 96/40210号),多种癌症的临床试验中的嵌合抗EGFR抗体;ABX-EGF(美国专利号6,235,883),目前由Abgenix-Immunex-Amgen开发;HuMax-EGFr(美国第10/
172,317,以US 2003/0091561公开,现为美国专利号7,247,301),目前由Genmab开发;425、EMD55900、EMD62000及EMD72000(Merck KGaA)(美国专利号5,558,864号;Murthy等人,Arch.Biochem.Biophys.,252(2):773-783(1991));ICR62(Institute of Cancer 
Research)(PCT公开号WO 95/20045;549-560(1987);Rodeck等人,J.Cell Biochem.,35(4):315-320(1987);Kettleborough等人,Protein Eng.,4(7);Modjtahedi等人,J.Cell Biophys.,22(1-3):129-146(1993);Modjtahedi等人,Br.J.Cancer,67(2):247-253(1993);Modjtahedi等人,Br.J.Cancer,73(2):228-235(1996);Modjtahedi等人,Int.J.Cancer,105(2):273-280(2003));TheraCIM hR3(YM Biosciences,Canada及Centro de Immunologia Molecular,Cuba)(美国专利号5,891,996;美国专利号6,506,883;Mateo等人,Immunotechnology,3(1):71-81(1997));mAb-806(Ludwig Institue for Cancer Research,Memorial Sloan-Kettering)(Jungbluth等人,Proc.Natl.Acad.Sci.USA.,100(2):639-644(2003));KSB-102(KS Biomedix);MR1-1(IVAX,National Cancer Institute)(PCT公开号WO 01/62931);及SC100(Scancell)(PCT公开号WO 01/88138);阿伦单抗
(alemtuzumab)( Millenium),目前经批准用于治疗B细胞慢性淋巴细胞白血病的
人源化mAb;莫罗单抗(muromonab)-CD3(Orthoclone ),由OrthoBiotech/Johnson & 
Johnson开发的抗CD3抗体;替伊莫单抗(ibritumomab tiuxetan) 由IDEC/
Schering AG开发的抗CD20抗体;吉妥珠单抗奥唑米星(gemtuzumab ozogamicin)
由Celltech/Wyeth开发的抗CD33(p67蛋白质)抗体;阿法赛特(alefacept)
由Biogen开发的抗LFA-3Fc融合体;阿昔单抗(abciximab) 由
Centocor/Lilly开发;巴利昔单抗(basiliximab) 由Novartis开发;帕利珠单
抗(palivizumab) 由Medimmune开发;英利昔单抗(infliximab) 由
Centocor开发的抗TNFα抗体;阿达木单抗(adalimumab) 由Abbott 
Laboratories开发的抗TNFα抗体; 由Celltech开发的抗TNFα抗体;戈利木单抗
(golimumab)(CNTO-148),由Centocor开发的完全人TNF抗体;依那西普(etanercept)
由Immunex/Amgen开发的p75 TNF受体Fc融合体;来那西普(lenercept),先前由
Roche开发的p55TNF受体Fc融合体;ABX-CBL,由Abgenix开发的抗CD147抗体;ABX-IL8,由Abgenix开发的抗IL8抗体;ABX-MA1,由Abgenix开发的抗MUC18抗体;帕木单抗
(Pemtumomab)(R1549、90Y-muHMFG1),由Antisoma开发中的抗MUC1;Therex(R1550),由Antisoma开发的抗MUC1抗体;AngioMab(AS1405),由Antisoma开发;HuBC-1,由Antisoma开发;Thioplatin(AS1407),由Antisoma开发; (那他珠单抗(natalizumab)),由
Biogen开发的抗α-4-β-1(VLA-4)及α-4-β-7抗体;VLA-1 mAb,由Biogen开发的抗VLA-1整联蛋白抗体;LTBR mAb,由Biogen开发的抗淋巴毒素β受体(LTBR)抗体;CAT-152,由Cambridge Antibody Technology开发的抗TGF-β2抗体;ABT 874(J695),由Abbott Laboratories开发的抗IL-12 p40抗体;CAT-192,由Cambridge Antibody Technology及Genzyme开发的抗TGFβ1抗体;CAT-213,由Cambridge Antibody Technology开发的抗嗜酸性粒细胞趋化因子1(Eotaxin1)抗体; 由Cambridge Antibody Technology及HumanGenome 
Sciences Inc.开发的抗Blys抗体;TRAIL-R1mAb,由Cambridge AntibodyTechnology及Human Genome Sciences,Inc.开发的抗TRAIL-R1抗体; 贝伐珠单抗
(bevacizumab)(rhuMAb-VEGF),由Genentech开发的抗VEGF抗体,由Genentech开发的抗HER受体家族抗体;抗组织因子(ATF),由Genentech开发的抗组织因子抗体; (奥马珠单
抗),由Genentech开发的抗IgE抗体; (依法珠单抗(Efalizumab)),由Genentech及
Xoma开发的抗CD11a抗体;MLN-02抗体(先前为LDP-02),由Genentech及Millenium 
Pharmaceuticals开发;HuMax CD4,由Genmab开发的抗CD4抗体;HuMax-IL15,由Genmab及Amgen开发的抗IL15抗体;HuMax-Inflam,由Genmab及Medarex开发;HuMax-Cancer,由Genmab及Medarex及Oxford GcoSciences开发的抗肝素酶I抗体;HuMax-Lymphoma,由
Genmab及Amgen开发;HuMax-TAC,由Genmab开发;由IDEC Pharmaceuticals开发的IDEC-131及抗CD40L抗体;IDEC-151(克立昔单抗(Clenoliximab)),由IDEC Pharmaceuticals开发的抗CD4抗体;IDEC-114,由IDEC Pharmaceuticals开发的抗CD80抗体;IDEC-152,由IDEC Pharmaceuticals开发的抗CD23;抗巨噬细胞迁移因子(MIF)抗体,由IDEC 
Pharmaceuticals开发;BEC2,由ImClone开发的抗个体基因型抗体;IMC-1C11,由ImClone开发的抗KDR抗体;DC101,由ImClone开发的抗flk-1抗体;抗VE钙黏着蛋白抗体,由ImClone开发; (拉贝珠单抗(1abetuzumab)),抗癌胚抗原(CEA)抗体,由Immunomedics开
发; (依帕珠单抗(Epratuzumab)),由Immunomedics开发的抗CD22抗体;AFP-
Cide,由Immunomedics开发;MyelomaCide,由Immunomedics开发;LkoCide,由Immunomedics开发;ProstaCide,由Immunomedics开发;MDX-010,由Medarex开发的抗CTLA4抗体;MDX-
060,由Medarex开发的抗CD30抗体;MDX-070,由Medarex开发;MDX-018,由Medarex开发;由Medarex及Immuno-Designed Molecules开发的 (IDM-1)及抗Her2抗体;
由Medarex及Genmab开发的抗CD4抗体;HuMax-IL15,由Medarex及Genmab开
发的抗IL15抗体;CNTO 148,由Medarex及Centocor/Johnson & Johnson开发的抗TNFα抗体;CNTO 1275,由Centocor/Johnson & Johnson开发的抗细胞因子抗体;MOR101及MOR102,由MorphoSys开发的抗细胞间黏着分子-1(ICAM-1)(CD54)抗体;MOR201,由MorphoSys开发的抗成纤维细胞生长因子受体3(FGFR-3)抗体; (维利珠单抗(visilizumab)),由
Protein Design Labs开发的抗CD3抗体; 由ProteinDesign Labs开发的抗γ干
扰素抗体;抗α5β1整联蛋白,由Protein Design Labs开发;抗IL-12,由Protein Design Labs开发;ING-1,由Xoma开发的抗Ep-CAM抗体; (奥马珠单抗),由Genentech及
Novartis开发的人源化抗IgE抗体;及MLN01,由Xoma开发的抗β2整联蛋白抗体。在另一实施方案中,治疗剂包括KRN330(Kirin);huA33抗体(A33,Ludwig Institute for Cancer Research);CNTO95(αV整联蛋白,Centocor);MEDI-522(αVβ3整联蛋白,Medimmune);伏洛西单抗(volociximab)(αVβ1整联蛋白,Biogen/PDL);人mAb 216(B细胞糖基化表位,NCI);
BiTE MT103(双特异性CD19×CD3,Medimmune);4G7×H22(双特异性B细胞×FcγR1,
Medarex/Merck KGa);rM28(双特异性CD28×MAPG,欧洲专利号EP 1444 268);MDX447(EMD 
82633)(双特异性CD64×EGFR,Medarex);卡莫西单抗(Catumaxomab)(雷默伏(removab))(双特异性EpCAM×抗CD3,Trion/Fres);厄妥索单抗(Ertumaxomab)(双特异性HER2/CD3,Fresenius Biotech);奥戈伏单抗(oregovomab)(奥伏瑞(OvaRex))(CA-125,ViRexx);
(WX G250)(碳酸酐酶IX,Wilex);CNTO 888(CCL2,Centocor);TRC105(CD105(内
皮糖蛋白),Tracon);BMS-663513(CD137激动剂,Brystol Myers Squibb);MDX-1342(CD19,Medarex);希利珠单抗(Siplizumab)(MEDI-507)(CD2,Medimmune);奥托莫单抗
(Ofatumumab)(Humax-CD20)(CD20,Genmab);利妥昔单抗(美罗华(Rituxan))(CD20,
Genentech);维托珠单抗(veltuzumab)(hA20)(CD20,Immunomedics);依帕珠单抗(CD22,Amgen);鲁昔单抗(lumiliximab)(IDEC 152)(CD23,Biogen);莫罗单抗-CD3(CD3,Ortho);
HuM291(CD3 fc受体,PDLBiopharma);HeFi-1(CD30,NCI);MDX-060(CD30,Medarex);MDX-
1401(CD30,Medarex);SGN-30(CD30,Seattle Genentics);SGN-33(林妥珠单抗
(Lintuzumab))(CD33,Seattle Genentics);扎木单抗(Zanolimumab)(HuMax-CD4)(CD4,Genmab);HCD122(CD40,Novartis);SGN-40(CD40,SeattleGenentics);Campathlh(阿伦珠单抗(Alemtuzumab))(CD52,Genzyme);MDX-1411(CD70,Medarex);hLL1(EPB-1)(CD74.38,Immunomedics);加利昔单抗(Galiximab)(IDEC-144)(CD80,Biogen);MT293(TRC093/D93)(裂解的胶原蛋白,Tracon);HuLuc63(CS1,PDL Pharma);伊力莫单抗(ipilimumab)(MDX-
010)(CTLA4,Brystol Myers Squibb);曲力莫单抗(Tremelimumab)(替力莫单抗
(Ticilimumab),CP-675,2)(CTLA4,Pfizer);HGS-ETR1(马妥莫单抗(Mapatumumab))(DR4 TRAIL-R1激动剂,Human Genome Science/Glaxo SmithKline);AMG-655(DR5,Amgen);坡单抗(Apomab)(DR5,Genentech);CS-1008(DR5,Daiichi Sankyo);HGS-ETR2(来沙木单抗(lexatumumab))(DR5 TRAIL-R2激动剂,HGS);西妥昔单抗(艾比特思(Erbitux))(EGFR,ImClone);IMC-11F8(EGFR,ImClone);尼妥珠单抗(Nimotuzumab)(EGFR,YM Bio);盘尼图单抗(Panitumumab)(维克替比(Vectabix))(EGFR,Amgen);扎妥木单抗(Zalutumumab)
(HuMaxEGFr)(EGFR,Genmab);CDX-110(EGFRvIII,AVANTImmunotherapeutics);阿德木单抗(adecatumumab)(MT201)(Epcam,Merck);依可洛单抗(edrecolomab)(Panorex,17-1A)(Epcam,Glaxo/Centocor);MORAb-003(叶酸受体a,Morphotech);KW-2871(神经节苷脂GD3,Kyowa);MORAb-009(GP-9,Morphotech);CDX-1307(MDX-1307)(hCGb,Celldex);曲妥珠单抗(赫赛汀(Herceptin))(HER2,Celldex);帕妥珠单抗(rhuMAb 2C4)(HER2(DI),Genentech);
阿泊珠单抗(apolizumab)(HLA-DRβ链,PDL Pharma);AMG-479(IGF-1R,Amgen);抗IGF-1R R1507(IGF1-R,Roche);CP 751871(IGF1-R,Pfizer);IMC-A12(IGF1-R,ImClone);BIIB022(IGF-1R,Biogen);Mik-β-1(IL-2Rb(CD122),Hoffman LaRoche);CNTO 328(IL6,
Centocor);抗KIR(1-7F9)(杀伤细胞Ig样受体(KIR),Novo);Hu3S193(Lewis(y),Wyeth,Ludwig Institute of Cancer Research);hCBE-11(LTβR,Biogen);HuHMFG1(MUC1,Antisoma/NCI);RAV12(N联糖表位,Raven);CAL(甲状旁腺激素相关蛋白(PTH-rP),
University of California);CT-011(PD1,CureTech);MDX-1106(ono-4538)(PD1,
Medarex/Ono);MAb CT-011(PD1,Curetech);IMC-3G3(PDGFRa,ImClone);巴维昔单抗(bavituximab)(磷脂酰丝氨酸,Peregrine);huJ591(PSMA,Cornell Research 
Foundation);muJ591(PSMA,Cornell Research Foundation);GC1008(TGFb(泛(pan))抑制剂(IgG4),Genzyme);英利昔单抗(雷米卡德(Remicade))(TNFa,Centocor);A27.15(转铁蛋白受体,Salk Institute,INSERM,PCT公开号WO 2005/111082);E2.3(转铁蛋白受体,Salk Institute);贝伐珠单抗(阿瓦斯汀(Avastin))(VEGF,Genentech);HuMV833(VEGF,Tsukuba Research Lab,PCT公开号WO2000/034337,University of Texas);IMC-18F1(VEGFR1,ImClone);IMC-1121(VEGFR2,ImClone)。
[0437] C.DVD-IgTM结合蛋白的构建
[0438] 设计多价多特异性双重可变域免疫球蛋白(DVD-IgTM)结合蛋白,从而来自两种不同亲本单克隆抗体的两个不同轻链可变域(VL)通过重组DNA技术以串联方式直接连接或经短接头连接,随后是轻链恒定域。类似地,重链包含以串联方式连接的两个不同的重链可变域(VH),随后是恒定域CH1和Fc区。
[0439] 可变域可以使用重组DNA技术从通过本文所述的任一方法产生的亲本抗体中获得。在一个实施方案中,可变域是鼠重链或轻链可变域。在另一个实施方案中,可变域是CDR移植或人源化的可变重链或轻链域。在一个实施方案中,可变域是人重链或轻链可变域。
[0440] 在一个实施方案中,使用重组DNA技术,使第一和第二可变域彼此直接连接。在另一个实施方案中,可变域经接头序列连接。在一个实施方案中,连接2个可变域。3个或更多个可变域也可以直接或经接头序列连接。可变域可以结合相同的抗原或可以结合不同的抗原。本发明的DVD-Ig分子可以包含一个免疫球蛋白可变域和一个非免疫球蛋白可变域,如受体的配体结合域、酶的活性域。DVD-Ig分子也可以包含两个或更多个的非Ig结构域。
[0441] 接头序列(linker sequence)可以是单个氨基酸或包含通过肽键连接的两个或更多个氨基酸残基的接头多肽。在一个实施方案中,接头序列选自:GGGGSG(SEQ IDNO:26)、GGSGG(SEQ ID NO:27)、GGGGSGGGGS(SEQ ID NO:28)、GGSGGGGSG(SEQ ID NO:223)、GGSGGGGSGS(SEQ ID NO:29)、GGSGGGGSGGGGS(SEQ ID NO:30)、GGGGSGGGGSGGGG(SEQ ID NO:31)、GGGGSGGGGSGGGGS(SEQ ID NO:32)、ASTKGP(SEQ ID NO:33)、ASTKGPSVFPLAP(SEQ ID NO:34)、TVAAP(SEQ ID NO:35)、RTVAAP(SEQ IDNO:224)、TVAAPSVFIFPP(SEQ ID NO:36)、RTVAAPSVFIFPP(SEQ ID NO:225)、AKTTPKLEEGEFSEAR(SEQ ID NO:37)、
AKTTPKLEEGEFSEARV(SEQ IDNO:38)、AKTTPKLGG(SEQ ID NO:39)、SAKTTPKLGG(SEQ ID NO:
40)、SAKTTP(SEQ ID NO:41)、RADAAP(SEQ ID NO:42)、RADAAPTVS(SEQ ID NO:43)、RADAAAAGGPGS(SEQ ID NO:44)、RADAAAAGGGGSGGGGSGGGGSGGGGS(SEQ ID NO:45)、
SAKTTPKLEEGEFSEARV(SEQ ID NO:46)、ADAAP(SEQ ID NO:47)、ADAAPTVSIFPP(SEQ ID NO:
48)、QPKAAP(SEQ ID NO:49)、QPKAAPSVTLFPP(SEQ ID NO:50)、AKTTPP(SEQ ID NO:51)、AKTTPPSVTPLAP(SEQ ID NO:52)、AKTTAP(SEQ ID NO:53)、AKTTAPSVYPLAP(SEQ ID NO:54)、GENKVEYAPALMALS(SEQ ID NO:55)、GPAKELT PLKEAKVS(SEQ ID NO:56)及GHEAAAVMQVQYPAS(SEQ ID NO:57)。接头序列的选择基于对若干Fab分子的晶体结构分析。在Fab或抗体分子结构中可变域和CH1/CL恒定域之间存在天然的柔性连接(flexible linkage)。这种天然连接包含大约10-12个氨基酸残基,其由来自V结构域C端的4-6个残基和来自CL/CH1结构域N端的4-6个残基提供。可以使用CL或CH1的N端5-6个氨基酸残基或11-12个氨基酸残基分别作为DVD-Ig的轻链和重链中的接头,产生本文所述的DVD-Ig。CL或CH1结构域的N端残基、尤其前5-6个氨基酸残基,采取没有强烈二级结构的环构象,并且因此可以充当两个可变域之间的柔性接头。CL或CH1结构域的N端残基是可变域的天然延长部分,原因是它们为Ig序列的部分,并且因此很大程度使得从接头和接界(junction)可能产生的任何免疫原性最小化。
[0442] 其他接头序列可以包括CL/CH1结构域的任何长度的任何序列,但是不包括CL/CH1结构域的全部残基;例如CL/CH1结构域的前5-12个氨基酸残基;轻链接头可以来自Cκ或Cλ;并且重链接头可以源自任何同种型的CH1,包括Cγ1、Cγ2、Cγ3、Cγ4、Cα1、Cα2、Cδ、Cε及Cμ。接头序列也可以源自其他蛋白质如Ig样蛋白(例如,TCR、FcR、KIR);基于G/S的序列;铰链区来源的序列;和来自其他蛋白质的其他天然序列。
[0443] 在一个实施方案中,使用重组DNA技术,使恒定域与两个连接的可变域连接。在一个实施方案中,包含串联连接的重链可变域的序列与重链恒定域连接,并且包含串联连接的轻链可变域的序列与轻链恒定域连接。在一个实施方案中,恒定域分别是人重链恒定域和人轻链恒定域。在一个实施方案中,DVD重链进一步与Fc区连接。这个Fc区可以是天然序列Fc区或变体Fc区。在另一个实施方案中,Fc区是人Fc区。在另一个实施方案中,Fc区包括来自IgG1、IgG2、IgG3、IgG4、IgA、IgM、IgE或IgD的Fc区。
[0444] 在一个最优选的实施方案中,将两条重链DVD多肽和两条轻链DVD多肽组合以形成DVD-Ig分子。在以下的实施例部分中提供能够结合特异性靶抗原(如IL-1β)的特异性DVD-Ig分子和制造这种分子的方法的具体实施方案。
[0445] D.DVD-Ig结合蛋白的产生
[0446] 本发明的DVD-Ig结合蛋白可以通过本领域已知的众多技术中任一种产生,所述技术包括例如从宿主细胞表达,其中通过标准技术将编码DVD-Ig重链和DVD-Ig轻链的表达载体转染至宿主细胞中。多种形式的术语“转染”意图包括常见用于导入外源DNA至原核或真核宿主细胞中的多种技术,例如,电穿孔法、磷酸钙沉淀法、DEAE-葡聚糖转染法等。虽然可以在原核或真核宿主细胞中表达本发明的DVD-Ig蛋白,但是在真核细胞(例如,哺乳动物宿主细胞)中表达DVD-Ig蛋白,因为这类真核细胞(并且尤其哺乳动物细胞)比原核细胞更有可能装配并分泌正确折叠和有免疫学活性的DVD-Ig蛋白。
[0447] 用于表达本发明重组抗体的示例性哺乳动物宿主细胞包括中国仓鼠卵巢(CHO细胞)(包括Urlaub和Chasin,Proc.Natl.Acad.Sci.USA,77:4216-4220(1980)中所述的dhfr-CHO细胞,其与例如如Kaufman和Sharp,J.Mol.Biol.,159:601-621(1982)中所述的DHFR可选标记一起使用)、NS0骨髓瘤细胞、COS细胞、SP2细胞和PER.C6细胞。当将编码DVD-Ig蛋白的重组表达载体引入哺乳动物宿主细胞时,通过培养宿主细胞足以允许DVD-Ig蛋白在宿主细胞中表达或允许DVD-Ig蛋白分泌进入培养宿主细胞的培养基中的一段时间,产生DVD-Ig蛋白。可以用标准蛋白质纯化方法从培养基回收DVD-Ig蛋白。
[0448] 在重组表达本发明DVD-Ig蛋白的示例性系统中,通过磷酸钙介导的转染,将编码DVD-Ig重链和DVD-Ig轻链两者的重组表达载体导入dhfr-CHO细胞中。在这种重组表达载体内部,DVD-Ig重链基因和轻链基因各自可操作地与CMV增强子/AdMLP启动子调节元件连接以驱动高水平的基因转录。这种重组表达载体还携带DHFR基因,该基因允许使用甲氨蝶呤选择/扩增来选择已经用载体转染的CHO细胞。培养选择的转化体宿主细胞以允许表达DVD-Ig重链和轻链,并且从培养基回收完整的DVD-Ig蛋白。标准分子生物学技术用来制备重组表达载体、转染宿主细胞、选择转化体、培养宿主细胞和从培养基回收DVD-Ig蛋白。另外,本发明提供了通过在合适的培养基中培养本发明的宿主细胞直至合成本发明的DVD-Ig蛋白而合成本发明DVD-Ig蛋白的方法。这种方法可以还包括从培养基分离DVD-Ig蛋白。
[0449] DVD-Ig的重要特征在于,它可以按照与常规抗体相似的方式产生和纯化。DVD-Ig的产生导致均匀、单一的主要产物,其具有所需的双重特异性活性,没有恒定区的任何序列修饰或任何种类的化学修饰。其他先前描述的产生“双特异性”、“多特异性”和“多特异性多价”全长结合蛋白的方法不导致单一初级产物(singleprimary product),而是导致胞内产生或分泌地产生经装配的非活性、单特异性、多特异性、多价、全长结合蛋白和具有不同结合位点组合的多价全长结合蛋白的混合物。作为实例,基于Miller和Presta(PCT公开号WO 2001/077342)所描述的设计,存在重链和轻链的16种可能组合。因此,与其他15种可能的组合相比,仅6.25%的蛋白质可能处于所需的活性形式而非作为单一主要产物或单一初级产物。尚有待证明,使用大规模生产时一般所用的标准层析技术将所需的完全活性形式的蛋白质与非活性及部分活性形式的蛋白质分离。
[0450] 令人惊讶地,本发明“双重特异性多价全长结合蛋白”的设计导致主要装配成所需“双重特异性多价全长结合蛋白”的双重可变域轻链和双重可变域重链。
[0451] 至少50%、至少75%和至少90%的装配和表达的DVD-Ig分子是所需的双重特异性四价蛋白质。本发明的这个方面特别增强本发明的商业用途。因此,本发明包括在单个细胞中表达双重可变域轻链和双重可变域重链,产生“双重特异性四价全长结合蛋白”的单一初级产物的方法。
[0452] 本发明提供在单个细胞中表达双重可变域轻链和双重可变域重链,产生“双重特异性四价全长结合蛋白”的“初级产物”的方法,其中所述“初级产物”是多于50%的所有装配蛋白质,所述装配蛋白质包含双重可变域轻链和双重可变域重链。
[0453] 本发明提供在单个细胞中表达双重可变域轻链和双重可变域重链,产生“双重特异性四价全长结合蛋白”的单一“初级产物”的方法,其中所述“初级产物”是多于75%的所有装配蛋白质,所述装配蛋白质包含双重可变域轻链和双重可变域重链。
[0454] 本发明提供在单个细胞中表达双重可变域轻链和双重可变域重链,产生“双重特异性四价全长结合蛋白”的单一“初级产物”的方法,其中所述“初级产物”是多于90%的所有装配蛋白质,所述装配蛋白质包含双重可变域轻链和双重可变域重链。
[0455] 6.IL-1β结合蛋白和生产结合蛋白的细胞系的产生
[0456] 优选地,本发明的IL-1β结合蛋白(包括抗IL-1β抗体)显示出减少或中和IL-1β活性的较高能力,例如,如通过本领域已知的几种体外和体内测定法中任一个所评估。优选地,本发明的IL-1β结合蛋白还显示减少或中和IL-1β活性的较高能力。
[0457] 在优选的实施方案中,结合蛋白或其抗原结合部分结合人IL-1β,其中结合蛋白或其抗原结合部分以约0.1s-1或0.1s-1以下的koff速率常数(如表面胞质团共振所测定)从人IL-1β解离,或以约1×10-6M或1×10-6M以下的IC50抑制人IL-1β活性。或者,结合蛋白或其抗原结合部分可以约1×10-2s-1或1×10-2s-1以下的koff速率常数(如表面胞质团共振所测定)从人IL-1β解离,或可以约1×10-7M或1×10-7M以下的IC50抑制人IL-1β活性。或者,结合蛋白或其抗原结合部分可以约1×10-3s-1或1×10-3s-1以下的koff速率常数(如表面胞质团共振所测定)从人IL-1β解离,或可以约1×10-8M或1×10-8M以下的IC50抑制人IL-1β。或者,结合蛋白或其抗原结合部分可以约1×10-4s-1或1×10-4s-1以下的koff速率常数(如表面胞质团共振所测定)从人IL-1β解离,或可以约1×10-9M或1×10-9M以下的IC50抑制人IL-1β活性。或者,结合蛋白或其抗原结合部分可以约1×10-5s-1或1×10-5s-1以下的koff速率常数(如表面胞质团共振所测定)从人IL-1β解离,或可以约1×10-10M或1×10-10M以下的IC50抑制人IL-1β活-5 -1 -5 -1性。或者,结合蛋白或其抗原结合部分可以约1×10 s 或1×10 s 以下的koff速率常数(如表面胞质团共振所测定)从人IL-1β解离,或可以约1×10-11M或1×10-11M以下的IC50抑制人IL-1β活性。
[0458] 在某些实施方案中,这种结合蛋白包含重链恒定区,如IgG1、IgG2、IgG3、IgG4、IgA、IgE、IgM或IgD恒定区。优选地,重链恒定区是IgG1重链恒定区或IgG4重链恒定区。另外,抗体可以包含轻链恒定区,κ轻链恒定区或λ轻链恒定区。优选地,抗体包含κ轻链恒定区。可选地,抗体部分可以例如是Fab片段或单链Fv片段。
[0459] 在Fc部分中改变抗体效应子功能的氨基酸残基替换是本领域已知的(Winter等人,美国专利号5,648,260和5,624,821)。抗体的Fc部分介导几种重要的效应子功能,例如,细胞因子诱导、ADCC、吞噬、补体依赖性细胞毒性(CDC)和抗体及抗原-抗体复合物的半寿期/清除速率。在一些情况下,这些效应子功能是治疗性抗体需要的,但是在其他情况下可能是不需要或甚至有害的,这取决于治疗目标。某些人IgG同种型,尤其IgG1和IgG3,通过分别与FcγR和补体C1q结合而介导ADCC和CDC。新生儿Fc受体(FcRn)是决定抗体的循环半寿期的重要组分。在又一个实施方案中,将抗体的恒定区(例如抗体的Fc区)中的至少一个氨基酸残基替换,从而该抗体的效应子功能改变。
[0460] 一个实施方案提供标记的结合蛋白,其中本发明的抗体或抗体部分经衍生化或与另一种功能分子(例如,另一种肽或蛋白质)连接。例如,可以通过以下方式衍生本发明的标记结合蛋白:将本发明的抗体或抗体部分(通过化学偶联、遗传融合、非共价结合或其他等)功能性连接至一种或多种其他分子实体,如另一种抗体(例如,双特异性抗体或双抗体(diabody))、可检测物质、细胞毒药物、药剂(pharmaceutical agent)和/或可以介导所述抗体或抗体部分与另一种分子(如链霉亲合素核心区或多组氨酸标签)结合的蛋白质或肽。
[0461] 可以借以衍生化本发明的结合蛋白(如抗体或抗体部分)的有用可检测物质包括荧光化合物。示例性荧光的可检测物质包括荧光素、荧光素异硫氰酸酯、若丹明、5-二甲胺-1-萘磺酰氯、藻红蛋白(phycoerythrin)等。抗体也可以用可检测的酶,如碱性磷酸酶、辣根过氧化物、葡萄糖氧化酶等衍生化。当抗体用可检测的酶衍生化时,通过添加这种酶用来产生可检测反应产物的其它试剂来检测所述抗体。例如,当可检测物质辣根过氧化物存在时,添加过氧化氢和二氨基联苯胺产生有色的反应产物,其是可检测的。抗体也可以用生物素衍生化,并且通过间接测量抗生物素蛋白或链霉亲合素结合作用来检测。
[0462] 本发明的另一个实施方案提供结晶结合蛋白。优选地本发明涉及如本文中公开的完整抗IL-1β抗体和其片段的晶体、以及包含这些晶体的制剂配方及组合物。在一个实施方案中,结晶结合蛋白具有比结合蛋白的可溶性对应物更长的体内半寿期。在另一个实施方案中,结合蛋白在结晶后保留生物学活性。
[0463] 本发明的结晶结合蛋白可以根据本领域已知和如PCT公开号WO 02/072636中公开的方法制备,所述专利通过引用方式并入本文。
[0464] 本发明的另一个实施方案提供糖基化结合蛋白,其中所述抗体或其抗原结合部分包含一个或多个糖残基。新生体内蛋白质产生可以经历进一步加工,称作翻译后修饰。具体而言,可以酶促方式添加糖(糖基)残基,一种称作糖基化的方法。所得到的携带共价连接的寡糖侧链的蛋白质称作糖基化蛋白或糖蛋白。
[0465] 天然存在的抗体是在Fc结构域以及可变域中具有一个或多个糖残基的糖蛋白。Fc结构域中的糖残基对Fc结构域的效应子功能具有重要影响,极小影响抗体的抗原结合作用或半寿期(Jefferis,R.,iotechnol.Prog.,21:11-16(2005))。相反,可变域的糖基化可以影响抗体的抗原结合活性。可变域中的糖基化可以负面影响抗体结合亲和力,这可能归因于空间位阻(Co等人,Mol.Immunol.,30:1361-1367(1993)),或导致增加的抗原亲和力(Wallick等人,J.Exp.Med.,168:1099-1109(1988);Wright等人,EMBO J.,10:2717-2723(1991))。
[0466] 本发明的一个方面涉及产生其中已经将结合蛋白的O联或N联糖基化突变的糖基化位点突变体。本领域技术人员可以使用标准的熟知技术产生这类突变体。本发明的另一个目的是保留生物学活性但是具有增加或减少的结合活性的糖基化位点突变体。
[0467] 在又一个实施方案中,本发明的抗体或抗原结合部分的糖基化经过修饰。例如,可以产生非糖基化的抗体(即,抗体缺少糖基化)。可以改变糖基化以便例如增加抗体对抗原的亲和力。这类糖修饰也可以通过例如改变抗体序列内部的一个或多个糖基化位点来完成。例如,可以产生一个或多个氨基酸置换,所述氨基酸置换导致一个或多个可变区糖基化位点的消除,从而消除在这个位点的糖基化。这类非糖基化可以增加抗体对抗原的亲和力。这种方法在PCT公开号WO 2003/016466和美国专利号5,714,350及6,350,861中进一步详细描述。
[0468] 另外或可选地,可制备本发明的修饰结合蛋白,所述结合蛋白具有改变的糖基化类型,如具有减少数量的岩藻糖残基的低岩藻糖化的抗体(见,Kanda等人,Biotechnol.,130(3):300-310(2007))或具有增加的对分型(bisecting)GlcNAc结构的抗体。这类改变的糖基化模式已经证明会增加抗体的ADCC能力。这类糖修饰可以通过例如在具有改变的糖基化机构的宿主细胞中表达这种抗体而完成。本领域中已经描述了具有改变的糖基化机构的细胞,并且它们可以用作表达本发明重组抗体的宿主细胞,从而产生具有改变的糖基化的抗体。见例如,Shields等人,J Biol Chem.,277:26733-26740(2002);Umana等人,″Engineered glycoforms of an antineuroblastomaIgG1 with optimized antibody-
dependent cellular cytotoxic activity(具有优化的抗体依赖细胞毒活性的抗成神经细胞瘤IgG1的工程化糖形式),″Nat.Biotechnol.,17:176-180(1999)以及欧洲公开号EP 
1,176,195;PCT公开号WO 03/035835和WO 99/54342。
[0469] 蛋白质糖基化取决于相关蛋白的氨基酸序列以及其中表达这种蛋白质的宿主细胞。不同的生物可以产生不同的糖基化酶(例如,糖基转移酶和糖苷酶),并且具有不同的可用底物(核苷酸糖)。因为这类因素,取决于其中表达特定蛋白质的宿主系统,蛋白质糖基化模式和糖残基的组成可以不同。用于本发明中的糖残基可以包括但不限于葡萄糖、半乳糖、甘露糖、岩藻糖、N-乙酰葡糖胺和唾液酸。优选地,糖基化结合蛋白包含这样的糖残基,从而糖基化模式是人类的。
[0470] 本领域技术人员已知,不同的蛋白质糖基化可以导致不同的蛋白质特征。例如,在微生物宿主(如酵母)中产生并且使用酵母内源性途径糖基化的治疗性蛋白的功效可以与在哺乳动物细胞(如CHO细胞系)中表达的相同蛋白质的功效相比降低。这类糖蛋白也可以在人类中呈现免疫原性,并且在施用后显示缩减的体内半寿期。人和其他动物中的特异性受体可以识别特异性糖残基并且促进从血流中快速清除蛋白质。其他不利作用可以包括在蛋白质折叠、溶解度、蛋白酶易感性、运输、转运、区室化、分泌、由其他蛋白质或因子识别、抗原性或变应原方面的变化。因此,实施者可以偏好具有特定糖基化组成和模式的治疗性蛋白,例如与人细胞中或预定主体动物的物种特异性细胞中所产生的糖基化组成和模式相同或至少与之相似的糖基化组成和模式。
[0471] 可以通过基因修饰宿主细胞以便表达异源糖基化酶,实现表达与宿主细胞的糖基化蛋白不同的糖基化蛋白。使用本领域已知的技术,实施者可以产生显示人类蛋白质糖基化的抗体或其抗原结合部分。例如,已对酵母菌株进行基因修饰以表达非天然产生的糖基化酶,从而在这些酵母菌株中产生的糖基化蛋白(糖蛋白)显示出与动物细胞、尤其人细胞的蛋白质糖基化相同的蛋白质糖基化(美国公开号2004/0018590和2002/0137134)。
[0472] 除结合蛋白之外,本发明还涉及对本发明的这些结合蛋白特异的抗独特型(抗Id)抗体。抗Id抗体是识别通常与另一种抗体的抗原结合区相关的独特决定簇的抗体。可以通过用结合蛋白或其含有CDR的区域免疫动物来制备抗Id。免疫的动物将识别并且应答于免疫用抗体的独特型决定簇并且产生抗Id抗体。显然,可能更容易针对并入DVD-Ig分子的两种或更多种亲本抗体产生抗独特型抗体;并且通过本领域充分认可的方法(例如,BIAcore、ELISA)证实结合研究,以验证对每种亲本抗体的独特型特异的抗独特型抗体也识别DVD-Ig背景下的独特型(例如,抗原结合位点)。对DVD-Ig的两个或更多个抗原结合位点中每一个特异的抗独特型抗体提供了测量患者血清中人DVD-Ig的DVD-Ig浓度的理想试剂。例如,可以使用“夹心ELISA测定模式”建立DVD-Ig浓度测定法,其中将针对第一抗原结合区的抗体涂布在固相(例如,BIAcore芯片、ELISA平板等)上,用淋洗缓冲液淋洗,与血清样品孵育,进行另一个淋洗骤并且最终与针对其他抗原结合位点的另一种抗独特型抗体孵育,所述另一种抗独特型抗体本身经酶标记以定量结合反应。在一个实施方案中,对于具有超过两个不同结合位点的DVD-Ig,针对(距恒定区最远和靠近它的)两个最外结合位点的抗独特型抗体将不仅有助于确定人血清中的DVD-Ig浓度,还反映分子在体内的完整性。每种抗Id抗体也可以用作诱导又一种动物中免疫反应的“免疫原”,产生所谓抗-抗Id抗体。
[0473] 另外,本领域技术人员将理解,相关蛋白可以使用经基因修饰以表达多种糖基化酶的宿主细胞文库来表达,从而这个文库的成员宿主细胞产生具有变异糖基化模式的相关蛋白。实施者随后可以选择和分离具有特定的新糖基化模式的相关蛋白。优选地,具有特别选择的新糖基化模式的蛋白质显示改善或改变的生物学特性。
[0474] 7.IL-1β结合蛋白的用途
[0475] 鉴于它们与人IL-1β结合的能力,使用常规免疫测定法,如酶联免疫吸附测定(ELISA)、放射免疫测定(RIA)或组织免疫组织化学,本发明的IL-1β结合蛋白或其抗原结合部分可以用来检测例如生物学样品、如血清或血浆中的IL-1β。本发明提供一种用于检测生物学样品中的IL-1β的方法,所述方法包括使生物学样品与本发明的结合蛋白或抗原结合部分接触,并且检测与IL-1β结合的结合蛋白(或抗原结合部分)或未结合的结合蛋白(或结合部分),从而检测生物学样品中的IL-1β。结合蛋白直接或间接地用可检测物质标记以促进检测结合或未结合的抗体。合适的可检测物质包括多种酶、辅基、荧光物质、发光物质和放射性物质。合适酶的实例包括辣根过氧化物酶、碱性磷酸酶、β-半乳糖苷酶或乙酰胆碱酯酶;合适辅基复合体的例子包括链霉亲合素/生物素和抗生物素蛋白/生物素;合适荧光物质的实例包括伞形酮、荧光素、异硫氰酸荧光素、若丹明、二氯三嗪胺荧光素(dichlorotriazinylaminefluorescein)、丹磺酰氯、或藻红蛋白;发光物质的实例包括鲁
3 14 35 90 99 111 125 131 177 166 153
米诺;合适放射性物质的实例包括H、C、S、Y、Tc、 In、 I、 I、 Lu、 Ho或 Sm。
[0476] 作为标记结合蛋白的替代,可以使用以可检测物质标记的rh IL-1β标准物和未标记的人IL-1β结合蛋白,通过竞争免疫测定法来测定生物流体中的人IL-1β。在这种测定法中,将生物学样品、标记的rh IL-1β标准物和人IL-1β结合蛋白合并并且测定与未标记抗体结合的标记rh IL-1β标准物的量。人IL-1β在生物学样品中的量与IL-1β结合蛋白结合的标记rh IL-1β标准物的量成反比。类似地,也可以使用以可检测物质标记的rh IL-1β标准物和未标记的人IL-1β结合蛋白,通过竞争免疫测定法来测定生物流体中的人IL-1β。
[0477] 本发明的结合蛋白和IL-1β结合部分优选地能够在体外和体内中和人IL-1β活性。因此,本发明的这类结合蛋白及其IL-1β结合部分可以用来抑制例如在含有人IL-1β的细胞培养物中、在人受试者中或在具有IL-1β与本发明抗体交叉反应的其他哺乳动物受试者中的人IL-1β活性。在另一个实施方案中,本发明提供一种用于抑制人IL-1β活性的方法,包括使人IL-1β与本发明的IL-1β结合蛋白或其结合部分接触,从而人IL-1β活性被抑制。例如,在含有或疑似含有人IL-1β的细胞培养物中,可以将本发明的IL-1β结合蛋白或其结合部分添加至培养基以抑制在培养物中的人IL-1β活性。
[0478] 在另一个实施方案中,本发明提供一种用于在受试者中、有利地从患有IL-1β活性有害的疾病或病症的受试者中减少人IL-1β活性的方法。本发明提供用于在患有这种疾病或病症的受试者中减少IL-1β活性的方法,所述方法包括向受试者施用本发明的抗体或抗体部分,从而受试者中的IL-1β活性减少。优选地,这种IL-1β是人IL-1β并且受试者是人受试者。可选地,受试者可以是表达本发明的抗体能够与其结合的IL-1β的哺乳动物。另外,受试者可以是已经向其中导入IL-1β(例如通过施用IL-1β或通过表达IL-1β转基因)的哺乳动物。本发明的IL-1β结合蛋白可以出于治疗目的施用至人受试者。另外,本发明的结合蛋白可以施用至表达所述抗体能够与其结合的IL-1β的非人哺乳动物,所述非人哺乳动物用于兽医目的或用作人疾病的动物模型。关于后者,这种动物模型可以用于评价本发明抗体的治疗功效(例如,测试给药剂量和时间过程)。
[0479] 如本文所用,术语“其中IL-1β活性有害的病症”意在包括这样的疾病和其他病症,其中已经显示IL-1β在患有这种病症的受试者中的存在造成或疑似造成这种病症的病理生理学或是促进这种病症加重的因素。因此,其中IL-1β活性有害的病症是其中预期IL-1β活性的减少会减缓病症的症状和/或进展的病症。这类病症可以例如由IL-1β的浓度在患有这种病症的受试者的生物流体中增加(例如,IL-1β的浓度在受试者的血清、血浆、滑液等中增加)得到佐证,所述增加可以例如使用如上文所述的抗IL-1β抗体检测到。可以用本发明抗体治疗的病症的非限制性实例包括在涉及本发明抗体的药物组合物的以下部分中讨论的那些病症。
[0480] 本发明的DVD-Ig可以结合单独的IL-1β或多种抗原(例如,人IL-1β和另一种非IL-1β抗原)。因此,DVD-Ig可以阻断或减少hu IL-1β的活性和另一种靶抗原的活性。这类其他的靶抗原可以包括可溶性靶(例如,IL-1α)和细胞表面受体靶(例如,VEGFR、EGFR)。
[0481] 这类其他抗原包括但不限于在公开可获得的数据库中所列的靶,所述数据库包括在互联网上可获得的并且通过引用方式并入本文的那些数据库。这些靶数据库包括:
[0482] 治疗靶(http://xin.cz3.nus.edu.sg/group/cjttd/ttd.asp);
[0483] 细胞因子和细胞因子受体((http://www.cytokinewebfacts.com/,http://www.copewithcytokines.de/cope.cgi,和http://cmbi.bjmu.edu.cn/cmbidata/cgf/CGF_Database/cytokine.medic.kumamoto-u.ac.jp/CFC/indexR.html);
[0484] 趋化因子(http://cytokine.medic.kumamoto-u.ac.jp/CFC/CK/Chemokine.html);
[0485] 趋化因子受体和GPCR(http://csp.medic.kumamoto-u.ac.jp/CSP/Receptor.html,http://www.gpcr.org/7tm/);
[0486] 嗅觉受体(http://senselab.med.yale.edu/senselab/ORDB/default.asp);
[0487] 受体(http://www.iuphar-db.org/iuphar-rd/list/index.htm);
[0488] 癌症靶(http://cged.hgc.jp/cgi-bin/input.cgi);
[0489] 作为潜在抗体靶的分泌型蛋白(http://spd.cbi.pku.edu.cn/);
[0490] 蛋白激酶(http://spd.cbi.pku.edu.cn/),和
[0491] 人CD标记(http://content.labvelocity.com/tools/6/1226/CD_table_final_locked.pdf)和(Zola等人,″CD molecules 2005:human cell differentiation molecules(2005年CD分子:人细胞分化分子),″Blood,106:3123-3126(2005))。
[0492] DVD-Ig作为治疗药用于同时阻断两种或更多种不同靶,即,人IL-1β和一种或多种其他非IL-1β靶抗原以增强功效/安全性和/或增加患者适用范围。这类靶可以包括可溶性靶(TNF)和细胞表面受体靶(VEGFR和EGFR)。
[0493] 另外,本发明的DVD-Ig可以用于组织特异性传递(靶向组织标记和疾病介体用于增强的局部PK,因此功效更高和/或毒性更低),包括胞内传递(靶向内部受体和胞内分子)、传递至内脑(靶向转铁蛋白受体和CNS疾病介体用于跨过血脑屏障)。DVD-Ig也可以充当载体蛋白以通过与抗原的非中和性表位结合而传递这种抗原至特定位置并且还增加这种抗原的半寿期。另外,DVD-Ig可以设计成与植入患者中的医疗装置物理连接或靶向这些医疗装置(见Burke等人,″Zotarolimus eluting stents,″Adv.Drug Deliv.Rev.,58(3):437-446(2006);Hildebrand等人,″Surface coatings forbiological activation and functionalization of medical devices(用于医疗器械的生物学活化和官能化的表面涂料),″Surface and Coatings Technology,200(22-23):6318-6324(2006);Wu等人,″Drug/device combinations for local drug therapies and infectionprophylaxis(局部药物疗法和感染预防的药物/器械考虑),″Biomaterials,27:2450-2467(2006);Marques等人,″Mediation of the Cytokine Network in the Implantation ofOrthopedic 
Devices(植入矫形装置时细胞因子网络的调节),″第21章,BiodegradableSystems in Tissue Engineering and Regenerative Medicine,(Reis等人编著)(CRC PressLLC,Boca Raton,2005)第377-397页)。简而言之,引导适宜类型的细胞至医用植入物部位可以促进愈合和恢复正常组织功能。可选地,还提供通过偶联于或靶向装置的DVD-Ig来抑制当装置植入时释放的介体(包括但不限于细胞因子)。例如,支架已经多年用于介入性治疗心脏病以清除阻塞的动脉并且改善到达心肌的血流。然而,已知传统的裸金属支架在一些患者中造成再狭窄(治疗区域内动脉的再狭窄)和可以导致血。近来,已经描述了抗CD34抗体涂覆的支架,其通过捕获遍及血液循环的内皮祖先细胞(EPC)来减少再狭窄并防止血凝块出现。内皮细胞是内衬血管、允许血液顺畅流动的细胞。EPC黏附于支架的坚硬表面,形成不仅促进愈合、还防止再狭窄和血凝块(以往与使用支架相关的并发症)的光滑层(Aoki等人,J.Am.Coll.Cardiol.,45(10):1574-1579(2005))。除改善需要支架的患者的结果之外,还对于需要心血管搭桥术的患者也存在意义。例如,用抗EPC抗体涂覆的假体血管导管(人工动脉)将不需要使用来自患者腿部或臂部动脉作为搭桥术移植体。这将减少手术时间和麻醉时间,其转而将减少冠状动脉手术死亡。DVD-Ig以如此方式设计,从而它与细胞表面标记(如CD34)以及已经包覆在植入装置上的蛋白质(或任何种类的表位,包括但不限于蛋白质、脂类和多糖)结合以促进细胞募集。这类方法也可以通常适用于其他医用植入物。可选地,DVD-Ig可以包覆在医疗装置上,并且一旦植入并从该装置释放全部DVD(或可能要求额外的新鲜DVD-Ig的任何其他需要,包括已经加载的DVD-Ig的老化和变性),则可以通过全身性施用新鲜的DVD-Ig至患者对这个装置再加载,其中将DVD-Ig设计成与具有一组结合位点的相关靶(细胞因子、细胞表面标记(如CD34)等)和具有另一组结合位点的包覆在该装置上的靶(包括蛋白质、任何种类的表位,包括但不限于脂类、多糖和聚合物)结合。这项技术具有扩展涂覆植入物的用途的优点。
[0494] A.DVD-Ig在多种疾病中的用途
[0495] 本发明的DVD-Ig分子还用作治疗性分子以治疗多种疾病。这类DVD分子可以结合参与特定疾病的一种或多种靶。下文描述多种疾病中这类靶的实例。
[0496] 人自身免疫及炎症反应
[0497] 在一个方面,本发明的DVD-Ig结合蛋白能够结合人IL-1β和已经参与一般性自身免疫反应和炎症反应的一种或多种抗原,包括C5、CCL1(I-309)、CCL11(嗜酸性粒细胞趋化因子)、CCL13(mcp-4)、CCL15(MIP-1d)、CCL16(HCC-4)、CCL17(TARC)、CCL18(PARC)、CCL19、CCL2(mcp-1)、CCL20(MIP-3a)、CCL21(MIP-2)、CCL23(MPIF-1)、CCL24(MPIF-2/嗜酸性粒细胞趋化因子-2(eotaxin-2))、CCL25(TECK)、CCL26、CCL3(MIP-1a)、CCL4(MIP-1b)、CCL5(RANTES)、CCL7(mcp-3)、CCL8(mcp-2)、CXCL1、CXCL10(IP-10)、CXCL11(I-TAC/IP-9)、CXCL12(SDF1)、CXCL13、CXCL14、CXCL2、CXCL3、CXCL5(ENA-78/LIX)、CXCL6(GCP-2)、CXCL9、IL13、IL8、CCL13(mcp-4)、CCR1、CCR2、CCR3、CCR4、CCR5、CCR6、CCR7、CCR8、CCR9、CX3CR1、IL8RA、XCR1(CCXCR1)、IFNA2、IL10、IL13、IL17C、IL1A、IL1B、IL1F10、IL1F5、IL1F6、IL1F7、IL1F8、IL1F9、IL22、IL5、IL8、IL9、LTA、LTB、MIF、SCYE1(内皮单核细胞-活化细胞因子)、SPP1、TNF、TNFSF5、IFNA2、IL10RA、IL10RB、IL13、IL13RA1、IL5RA、IL9、IL9R、ABCF1、BCL6、C3、C4A、CEBPB、CRP、ICEBERG、IL1R1、IL1RN、IL8RB、LTB4R、TOLLIP、FADD、IRAK1、IRAK2、MYD88、NCK2、TNFAIP3、TRADD、TRAF1、TRAF2、TRAF3、TRAF4、TRAF5、TRAF6、ACVR1、ACVR1B、ACVR2、ACVR2B、ACVRL1、CD28、CD3E、CD3G、CD3Z、CD69、CD80、CD86、CNR1、CTLA4、CYSLTR1、FCER1A、FCER2、FCGR3A、GPR44、HAVCR2、OPRD1、P2RX7、TLR2、TLR3、TLR4、TLR5、TLR6、TLR7、TLR8、TLR9、TLR10、BLR1、CCL1、CCL2、CCL3、CCL4、CCL5、CCL7、CCL8、CCL11、CCL13、CCL15、CCL16、CCL17、CCL18、CCL19、CCL20、CCL21、CCL22、CCL23、CCL24、CCL25、CCR1、CCR2、CCR3、CCR4、CCR5、CCR6、CCR7、CCR8、CCR9、CX3CL1、CX3CR1、CXCL1、CXCL2、CXCL3、CXCL5、CXCL6、CXCL10、CXCL11、CXCL12、CXCL13、CXCR4、GPR2、SCYE1、SDF2、XCL1、XCL2、XCR1、AMH、AMHR2、BMPR1A、BMPR1B、BMPR2、C19orf10(IL27w)、CER1、CSF1、CSF2、CSF3、DKFZp451J0118、FGF2、GFI1、IFNA1、IFNB1、IFNG、IGF1、IL1A、IL1B、IL1R1、IL1R2、IL2、IL2RA、IL2RB、IL2RG、IL3、IL4、IL4R、IL5、IL5RA、IL6、IL6R、IL6ST、IL7、IL8、IL8RA、IL8RB、IL9、IL9R、IL10、IL10RA、IL10RB、IL11、IL11RA、IL12A、IL12B、IL12RB1、IL12RB2、IL13、IL13RA1、IL13RA2、IL15、IL15RA、IL16、IL17、IL17R、IL18、IL18R1、IL19、IL20、KITLG、LEP、LTA、LTB、LTB4R、LTB4R2、LTBR、MIF、NPPB、PDGFB、TBX21、TDGF1、TGFA、TGFB1、TGFB1I1、TGFB2、TGFB3、TGFBI、TGFBR1、TGFBR2、TGFBR3、TH1L、TNF、TNFRSF1A、TNFRSF1B、TNFRSF7、TNFRSF8、TNFRSF9、TNFRSF11A、TNFRSF21、TNFSF4、TNFSF5、TNFSF6、TNFSF11、VEGF、ZFPM2及RNF110(ZNF144)。
[0498] 哮喘
[0499] 过敏性哮喘的特征在于,存在嗜伊红细胞增多、杯状细胞化生、上皮细胞改变、气道反应过度(AHR)、及Th2和Th1细胞因子表达,以及升高的血清IgE水平。现在广泛认为,气道炎症是构成哮喘发病的基础的关键因子,涉及炎症细胞如T细胞、B细胞、嗜酸性粒细胞、肥大细胞和巨噬细胞,以及它们的分泌型介体(包括细胞因子和趋化因子)的复杂相互作用。皮质类固醇如今是最重要的哮喘抗炎疗法,然而它们作用机制是非特异性并且存在安全性顾虑,尤其在青少年患者群体中。因此批准了开发更有特异性和靶向的疗法。
[0500] 其中可以评估炎症和AHR的动物模型(如OVA诱导的哮喘小鼠模型)是本领域已知的,并且可以用来测定多种DVD-Ig分子治疗哮喘的能力。用于研究哮喘的动物模型在Coffman等人,J.Exp.Med.,201(12):1875-1879(2005);Lloyd等人,Adv.Immunol.,77:263-
295(2001);Boyce等人,J.Exp.Med.,201(12):1869-1873(2005);和Snibson等人,Clin.Exp.Allergy,35(2):146-152(2005)中公开。除这些靶对的常规安全性评估之外,还可以批准用于免疫抑制程度的特定检验,并且这些检验有助于选择最好的靶对(见Luster等人,Toxicology,92(1-3):229-243(1994);Descotes,J.,Develop.Biol.Standard.,77:
99-102(1992);Hart等人,J.Allergy Clin.Immunol.,108(2):250-257(2001))。
[0501] 本发明的一个方面涉及能够结合IL-1β和选自IL-4、IL-5、IL-8、IL-9、IL-13、IL-18、IL-5R(α)、TNFSF4、IL-4R(α)、干扰素α、嗜酸性粒细胞趋化因子、TSLP、PAR-2、PGD2和IgE的一种或多种(例如两种)靶的DVD-Ig分子。一个实施方案包括作为治疗药有益于治疗哮喘的双重特异性抗IL-1β/IL-1αDVD-Ig。
[0502] 类风湿性关节炎(RA)
[0503] 类风湿性关节炎(RA),一种全身性疾病,以关节滑膜中的慢性炎症反应为特征并且与软骨变性和邻关节骨侵蚀相关。许多促炎细胞因子(包括TNF、趋化因子和生长因子)在发病的关节中表达。全身性施用抗TNF抗体或sTNFR融合蛋白至RA的小鼠模型显示具有抗炎和关节保护性。多种的细胞因子,包括IL-1β,已经涉及RA。其中以静脉内施用英利昔单抗(一种嵌合抗TNF mAb)阻断RA患者中TNF活性的临床研究(Harriman等人,″Summary of clinical trials in rheumatoid arthritis usinginfliximab,an anti-TNFalpha treatment(使用抗TNFα治疗药英利昔单抗的类风湿性关节炎临床试验总结),″
Ann.Rheum.Dis.,58(Suppl 1):I61-I64(1999))已经提供以下证据:TNF调节IL-6、IL-8、MCP-1和VEGF产生,募集免疫细胞和炎症细胞至关节中、血管生成和降低基质金属蛋白酶-1和-3的血液水平。对类风湿性关节炎中炎性途径的更好理解已经导致鉴定参与类风湿性关节炎的其他治疗靶。有前景的治疗药如白介素-6拮抗药(IL-6受体抗体MRA,由Chugai,Roche开发(见Nishimoto等人,Arthritis Rheum.,50(6):1761-1769(2004))、CTLA4Ig(阿巴西普(abatacept),Genovese等人,″Abatacept for rheumatoid arthritis refractory to tumor necrosis factor alphainhibition(用于肿瘤坏死因子α抑制作用耐受型类风湿性关节炎的阿巴西普),″N.Engl.J.Med.,353:1114-1123(2005))和抗B细胞疗法(利妥昔单抗,Okamoto等人,″Rituximab for rheumatoid arthritis(用于类风湿性关节炎的利妥昔单抗),″N.Engl.J.Med.,351:1909(2004))已经在过去一年在随机对照试验中测试。IL-1β和其他细胞因子如IL-15和IL-18已经使用RA动物模型被鉴定为发挥作用(治疗性抗体HuMax-IL_15,AMG 714,见Baslund等人,Arthritis Rheum.,52(9):52(9):2686-2692(2005))。组合抗TNF和另一种介体(如IL-1β)的双重特异性抗体疗法在增强临床功效和/或患者适用范围方面具有巨大潜在。例如,阻断TNF和VEGF可以潜在地根除炎症和血管生成,二者均参与RA的病理生理学。构思了能够阻断IL-1α和IL-1β的DVD-Ig结合蛋白。除这些靶对的常规安全性评估之外,还可以批准用于免疫抑制程度的特定检验,并且这些检验有助于选择最好的靶对(见Luster等人,Toxicology,92(1-3):229-243(1994);Descotes等人,Develop.Biol.Standard.,77:99-102(1992);Hart等人,J.Allergy Clin.Immunol.,108(2):250-257(2001))。可以使用前临床动物RA模型(如胶原蛋白诱导的关节炎小鼠模型)来评估DVD-Ig分子是否适用于治疗类风湿性关节炎。其他有用的模型也是本领域熟知的(见Brand,D.D.,Comp.Med.,55:114-122(2005))。基于亲本抗体对人及小鼠直向同源物的交叉反应(例如,对人及小鼠TNF、人及小鼠IL-15等的反应性),可以在小鼠CIA模型中用源自DVD-Ig分子“匹配的代用抗体”实施验证研究。简而言之,基于两种(或更多种)小鼠靶特异性抗体的DVD-Ig可以匹配至这样的程度,所述程度对于用于构建人DVD-Ig的亲本人抗体或人源化抗体的特征是可能的(相似的亲和力、相似的中和效力、相似的半寿期等)。
[0504] 在一个实施方案中,结合人IL-1β和另一种非IL-1β靶的本发明DVD-Ig也可以用来治疗其中IL-1β发挥作用的其他疾病。这类疾病包括但不限于SLE、多发性硬化(MS)、败血症、多种神经学疾病和癌症(包括宫颈癌、乳腺癌、胃癌)。下文也提供其中IL-1β发挥作用的更广泛疾病和病症清单。
[0505] 本发明的实施方案涉及能够结合人IL-1β和选自IL-1α、TNFα、IL-12、TWEAK、IL-23、CXCL13、CD40、CD40L、IL-18、VEGF、VLA-4、TNFβ、CD45RB、CD200、IFN-γ、GM-CSF、FGF、C5、CD52、硬骨素(sclerostin)和CCR2的一种或多种靶的DVD-Ig分子。
[0506] 系统性红斑狼疮(SLE)
[0507] SLE的免疫致病性标志是多克隆性B细胞活化,这导致高球蛋白血症、自身抗体产生和免疫复合物形成。这种重大异常似乎是T细胞因普遍化T细胞失调而不能抑制禁止性B细胞克隆。此外,B细胞和T细胞相互作用受启动第二信号的几种细胞因子如IL-10以及共刺激分子如CD40和CD40L、B7和CD28和CTLA-4促进。这些相互作用连同免疫复合物和凋亡性物质的受损吞噬清除作用,使免疫反应得以保持,导致组织损伤。
[0508] 在一个方面,本发明的DVD-Ig结合蛋白能够结合人IL-1β和已经在SLE中牵涉的以下抗原中的一种或多种:B细胞靶向疗法:CD-20、CD-22、CD-19、CD28、CD4、CD80、HLA-DRA、IL10、IL2、IL4、TNFRSF5、TNFRSF6、TNFSF5、TNFSF6、BLR1、HDAC4、HDAC5、HDAC7A、HDAC9、ICOSL、IGBP1、MS4A1、RGS1、SLA2、CD81、IFNB1、IL10、TNFRSF5、TNFRSF7、TNFSF5、AICDA、BLNK、GALNAC4S-6ST、HDAC4、HDAC5、HDAC7A、HDAC9、IL10、IL11、IL4、INHA、INHBA、KLF6、TNFRSF7、CD28、CD38、CD69、CD80、CD83、CD86、DPP4、FCER2、IL2RA、TNFRSF8、TNFSF7、CD24、CD37、CD40、CD72、CD74、CD79A、CD79B、CR2、IL1R2、ITGA2、ITGA3、MS4A1、ST6GAL1、CD1C、CHST10、HLA-A、HLA-DRA及NT5E;共刺激性信号:CTLA4或B7.1/B7.2;抑制B细胞存活:BlyS、BAFF;补体失活:C5;细胞因子调节作用:关键原则是,任何组织中的净生物反应是促炎细胞因子或抗炎细胞因子的局部水平之间的平衡的结果(见Sfikakis等人,Curr.Opin.Rheumatol.,17:550-557(2005))。认为SLE是经文献记录血清IL-4、IL-6、IL-10升高的Th-2驱动型疾病。还构思了能够结合选自IL-4、IL-6、IL-10、IFN-α和TNF-α的一种或多种靶的DVD-Ig。本文中讨论的靶的组合将增强针对可以在众多狼疮临床前模型中检验的SLE的治疗功效(见,Peng S.L.,Methods Mol.Med.,102:227-272(2004))。基于亲本抗体对人及小鼠直向同源物的交叉反应(例如,对人及小鼠CD20、人及小鼠干扰素α等的反应性),可以在小鼠狼疮模型中用源自DVD-Ig分子“匹配的代用抗体”实施验证研究。简而言之,基于两种(或更多种)小鼠靶特异性抗体的DVD-Ig可以匹配至这样的程度,所述程度对于用于构建人DVD-Ig的亲本人抗体或人源化抗体的特征是可能的(相似的亲和力、相似的中和效力、相似的半寿期等)。
[0509] 多发性硬化(MS)
[0510] 多发性硬化(MS)是病因基本上未知的一种复杂的人自身免疫型疾病。遍及神经系统的髓鞘碱性蛋白(MBP)的免疫破坏是多发性硬化的主要病理。MS是复杂病理疾病,其涉及CD4+和CD8+T细胞浸润和中枢神经系统内部的反应。细胞因子在CNS中的表达、反应性氮种类和共刺激分子均已经在MS中描述。主要考虑因素是促进自体免疫性形成的免疫学机理。具体而言,抗原表达、细胞因子和白细胞相互作用和帮助平衡/调节其它T-细胞如Th1和Th2细胞的调节性T-细胞是鉴定治疗性靶标的重要领域。
[0511] IL-12是由APC产生并促进Th1效应细胞进分化的促炎细胞因子。IL-12在正在形成的MS患者病灶中以及在患有EAE的动物中产生。先前显示,干扰IL-12途径有效地防止啮齿类中的EAE,并且在常见狨猴的髓磷脂诱导的EAE模型中,使用抗IL-12mAb在体内中和IL-12p40具有有益效果。
[0512] TWEAK是在中枢神经系统(CNS)中组成型表达的TNF家族成员,取决于细胞类型,具有促炎、促增殖或凋亡作用。其受体(Fn14)在CNS中由内皮细胞、反应性星形细胞和神经元表达。TWEAK和Fn14 mRNA表达在实验性自身免疫性脑脊髓炎(EAE)期间在脊髓中增加。当引发阶段后治疗小鼠时,在C57BL/6小鼠中髓磷脂少突胶质细胞糖蛋白(MOG)诱导的EAE中的抗TWEAK抗体治疗导致疾病严重性和白细胞浸润的减少。
[0513] 本发明的一个方面涉及能够结合IL-1β和选自L-12、TWEAK、IL-23、CXCL13、CD40、CD40L、IL-18、VEGF、VLA-4、TNF、CD45RB、CD200、IFNγ、GM-CSF、FGF、C5、CD52、骨桥蛋白(osteopontin)及CCR2的一种或多种(例如两种)靶的DVD-Ig分子。一个实施方案包括作为治疗药有益于治疗MS的双重特异性抗IL-1β/TWEAK DVD-Ig。
[0514] 用于评估治疗MS的DVD-Ig分子的效能的几种动物模型是本领域已知的(见Steinman等人,Trends Immunol.,26(11):565-571(2005);Lublin等人,Springer SeminImmunopathol.,8(3):197-208(1985);Genain等人,J.Mol.Med.,75(3):187-197(1997);Tuohy等人,J.Exp.Med.,189(7):1033-1042(1999);Owens等人,Neurol.Clin.,13(1):51-73(1995);和′t Hart等人,J.Immunol.,175(7):4761-4768(2005))。基于亲代抗体对人及动物物种直向同源物的交叉反应(例如,对人及小鼠IL-1β、人及小鼠TWEAK等的反应性),可以在小鼠EAE模型中用源自DVD-Ig分子“匹配的代用抗体”实施验证研究;简而言之,基于两种(或更多种)小鼠靶特异性抗体的DVD-Ig可以在可能的程度上与用于构建人DVD-Ig的亲代人抗体或人源化抗体的特征匹配(相似的亲和力、相似的中和效力、相似的半衰期等)。相同构思适用于其他非啮齿类物种中的动物模型,其中选择源自DVD-Ig的“匹配的代用抗体”用于预期的药理学和可能的安全性研究。除这些靶标对的常规安全性评估之外,还可以批准用于免疫抑制程度的特异性实验,并且这些实验有助于选择最好的靶标对(见Luster等人,Toxicology,92(1-3):229-243(1994);Descotes等人,
Develop.Biol.Standard.,77:99-102(1992);Jones,R.,″Rovelizumab-ICOS Corp,″IDrugs,3(4):442-446(2000))。
[0515] 败血症
[0516] 败血症的病理生理学由革兰氏阴性生物(脂多糖[LPS]、脂质A、内毒素)和革兰氏阳性生物(脂磷壁酸、肽聚糖)的外膜组分启动。这些外膜组分能够与单核细胞表面上的CD14受体结合。借助最近描述的toll样受体,信号随后传输至细胞,导致最终产生促炎细胞因子:肿瘤坏死因子-α(TNF-α)和白介素-1(IL-1)。巨大的炎性反应和免疫反应是脓毒性休克的实质特征并且在败血症引起的组织损伤、多器官衰竭和死亡的发病机理中发挥核心作用。细胞因子,尤其肿瘤坏死因子(TNF)和白介素(IL-1),已经显示是脓毒性休克的关键介质。这些细胞因子对组织具有直接毒性效应;它们还激活磷脂酶A2。这些及其他作用导致增加的血小板激活因子浓度、促进一氧化氮合酶活性、促进嗜中性粒细胞浸润组织和促进嗜中性粒细胞活性。
[0517] 败血症和脓毒性休克的治疗仍是一项临床难题,并且采用针对炎症反应的生物反应调节物(即抗TNF、抗MIF)的近期前瞻性试验仅显示适中的临床益处。最近,兴趣点已经转向旨在逆转伴随的免疫抑制期的治疗。实验动物和危重患者中的研究已经显示,淋巴器官和一些实质组织凋亡增加促成这种免疫抑制、无反应性和器官系统功能障碍。在脓毒症综合征期间,淋巴细胞凋亡可以因IL-2不存在或因释放糖皮质激素、粒酶或所谓“死亡”细胞因子:肿瘤坏死因子α或Fas配体而触发。凋亡通过胞质和/或线粒体胱天蛋白酶的自动活化进行,所述胱天蛋白酶可以受Bcl-2家族促凋亡和抗凋亡成员影响。在实验动物中,用凋亡抑制剂治疗不仅可以防止淋巴样细胞凋亡;它也可以改善结局。虽然采用抗凋亡药物的临床试验大多因与其施用和组织靶向作用相关的技术难题而仍距实用尚远,但是抑制淋巴细胞凋亡代表了用于败血症患者的一种有吸引力的治疗靶标。同样,靶向炎性介质和凋亡性介质的双重特异性剂药物可以具有附加的益处。本发明的一个方面涉及能够结合IL-1β和参与败血症的一种或多种靶标的DVD-Ig,其中所述靶标选自TNF、IL-1、MIF、IL-6、IL-8、IL-18、IL-12、IL-23、FasL、LPS、Toll样受体、TLR-4、组织因子、MIP-2、ADORA2A、CASP1、CASP4、IL-10、IL-1B、NFKB1、PROC、TNFRSF1A、CSF3、CCR3、IL1RN、MIF、NFKB1、PTAFR、TLR2、TLR4、GPR44、HMOX1、HMG-B1、中期因子、IRAK1、NFKB2、SERPINA1、SERPINE1和TREM1。可以在本领域已知的临床前动物模型中评估用于败血症的这类DVD-Ig的功效(见,Buras等人,
Nat.Rev.Drug Discov.,4(10):854-865(2005);和Calandra等人,Nature Med.,6(2):164-
170(2000))。
[0518] 神经学病症和神经变性病
[0519] 神经变性病或是慢性的,在这种情况下它们通常是年龄依赖的,或是急性的(例如,中风、创伤性脑损伤、脊髓损伤等)。它们以进行性神经元功能丧失(神经元细胞死亡、脱髓鞘)、活动性丧失和记忆丧失为特征。对作为慢性神经变性病(例如,阿尔茨海默病,AD)潜在的机制的最新认识显示复杂的病因学,并已经认识到多种因素促进它们的形成和进展,例如,年龄、血糖状态、淀粉样蛋白产生和多聚化、与其受体RAGE(AGE受体)结合的高级糖化终产物积累(AGE)、脑氧化应激增加、大脑血流量减少、神经炎症,包括释放炎性细胞因子和趋化因子、神经功能障碍和小胶质细胞活化。因此,这些慢性神经变性病代表多个细胞类型和介质之间复杂的相互作用。这类疾病的治疗策略是有限的并且大部分构成采用非特异性抗炎药(例如,皮质类固醇、COX抑制剂)阻断炎症过程或药物防止神经元丧失和/或突触功能。这些治疗不能终止病情进展。最近的研究表明,更为定向的疗法(如针对可溶性Aβ肽(包括Aβ寡聚物形式)的抗体)不仅可以帮助终止病情进展,还可以帮助维持记忆。这些初步观察结果表明,靶向多于一种疾病介质(例如,Aβ和促炎细胞因子如TNF)的特异性疗法可以为慢性神经变性病提供比采用靶向单一疾病机制(例如,单独的可溶性Aβ)时所观察到的甚至更好的治疗功效(见Shepherd等人,Neuropathol.Appl.Neurobiol.,31:503-511(2005);Nelson,R.B.,Curr.Pharm.Des.,11:3335-3352(2005);Klein,W.L.,Neurochem.Int.,41:
345-352(2002);Janelsins等人,″Early correlation of microglial activation with enhanced tumor necrosis factor-alpha andmonocyte chemoattractant protein-I expression specifically within the entorhinal cortexof triple transgenic 
Alzheimer′s disease mice(具体三重转基因阿尔茨海默病小鼠内嗅皮层内部小胶质细胞活化与增强的肿瘤坏死因子和单核细胞趋化蛋白-I表达的早期相关性),″
J.Neuroinflammation,2(23):1-12(2005);Soloman,B.,Curr.Alzheimer.Res.,1:149-163(2004);Klyubin等人,Nature Med.,11:556-561(2005);Arancio等人,EMBO J.,23:4096-
4105(2004);Bornemann等人,Am.J.Pathol.,158:63-73(2001);Deane等人,Nature Med.,
9:907-913(2003);和Masliah等人,Neuron,46:857-868(2005))。
[0520] 本发明的DVD-Ig分子可以结合IL-1β和参与慢性神经变性病(如阿尔茨海默)的一种或多种靶标。这类靶标包括但不限于参与AD发病的任何可溶性或细胞表面介质,例如,AGE(S100A,两性霉素)、促炎细胞因子(例如,IL-1)、趋化因子(例如,MCP 1)、抑制神经再生的分子(例如,Nogo,RGM A)、增强神经突生长的分子(神经营养因子)和可以在血脑屏障处介导转运的分子(例如,转铁蛋白受体、胰岛素受体或RAGE)。DVD-Ig分子的功效可以在临床前动物模型(如过量表达淀粉样前体蛋白或RAGE并且形成阿尔茨海默病样症状的转基因小鼠)中验证。此外,可以构建DVD-Ig分子并且在动物模型中测试其功效,并且可以选择最佳治疗性DVD-Ig用于人类患者中的测试。DVD-Ig分子也可以用于治疗其他神经变性病如帕金森病。α-突触核蛋白参与帕金森病的病理学。能够靶向IL-1β和LINGO-1、α-突触核蛋白和/或炎性介质如TNF、IL-17、MCP-1的DVD-Ig可以证明帕金森病的有效疗法并且在本发明中构思。
[0521] 神经再生和脊髓损伤
[0522] 尽管对病理学机制的理解增加,脊髓损伤(SCI)仍是一种灾难性病状并且代表以高度医疗需要为特征的医学适应症。大部分脊髓损伤是挫伤或挤压损伤,并且原发性损伤通常接着是恶化初始损伤并且导致损害区域明显扩大(有时超过10倍)的继发性损伤机制(炎性介质例如,细胞因子和趋化因子)。SCI中的这些原发性和继发性机制与因其他方式(例如,中风)引起的脑损伤中的那些十分相似。不存在满意的疗法并且高剂量快速浓注甲泼尼龙(methylprednisolone,MP)是在损伤后8小时的狭窄时间窗内唯一使用的疗法。然而,这种治疗仅意在防止继发性损伤,而不引起任何明显的功能恢复。它因缺少明确功效和严重副作用(如免疫抑制伴发后续感染和严重组织病理学性肌肉改变)而饱受批评。没有刺激内源再生潜力的其他药物、生物制品或小分子得到批准,但是近年来,有前景的治疗原理和候选药物已经在SCI的动物模型中显示功效。很大程度上,人SCI中功能恢复的缺乏由损害部位处、瘢痕组织中、髓磷脂中以及损伤相关性细胞上抑制神经突生长的因子引起。这类因子是髓鞘相关蛋白NogoA、OMgp及MAG、RGM A、瘢痕相关CSPG(硫酸软骨素蛋白聚糖)和反应性星形细胞上的抑制性因子(某些脑信号蛋白(semaphorin)及ephrin)。然而,在损害部位处,不仅存在生长抑制性分子,还存在神经突生长刺激因子如神经营养因子、层粘连蛋白、L1和其他。神经突生长抑制性和生长促进性分子的这种总体可以解释:阻断单一因子(如NogoA或RGM A)在啮齿类SCI模型中导致明显的功能恢复,原因在于降低抑制性影响可以使平衡从生长抑制移向生长促进。然而,在阻断单一神经突增生抑制性分子时所观察到的恢复不是完整的。为了实现更快和更明显的恢复,可能需要阻断两种神经突增生抑制性分子(例如,Nogo和RGM A)或阻断神经突增生抑制性分子并且增强神经突增生增强分子(例如,Nogo和神经营养因子)的功能或阻断神经突增生抑制性分子(例如,Nogo)和促炎分子(例如,TNF)(见McGee等人,Trends Neurosci.,26:193-198(2003);Domeniconi等人,J.Neurol.Sci.,233:43-47(2005);Makwana等人,FEBS J.,272:2628-2638(2005);Dickson,B.J.,Science,298:1959-1964(2002);Teng等人,J.Neurosci.Res.,79:273-278(2005);Karnezis等人,Nature Neurosci.,7:736(2004);Xu等人,J.Neurochem.,91:1018-
1023(2004))。
[0523] 在一个方面,结合人IL-1β的DVD-Ig也可以结合靶标对中一个或两个靶标,所述靶标对如NgR和RGM A;NogoA和RGM A;MAG和RGM A;OMgp和RGM A;RGM A和RGM B;CSPGs和RGM A;聚集蛋白聚糖(aggrecan)、中期因子、神经蛋白聚糖(neurocan)、多功能蛋白聚糖(versican)、磷酸蛋白聚糖(phosphacan)、Te38及TNF-α;提供与促进树突和轴突出芽的抗体组合的Aβ球聚体特异性抗体。树突病变是AD的极早期体征并且已知NOGO A限制树突生长。可以将这种类型的ab与SCI-候选(髓鞘质-蛋白质)Ab的任一种组合。其他DVD-Ig靶可以包括NgR-p75、NgR-Troy、NgR-Nogo66(Nogo)、NgR-Lingo、Lingo-Troy、Lingo-p75、MAG或OMgp的任何组合。另外,靶标也可以包括参与抑制神经突的任何可溶性或细胞表面介质,例如,Nogo、OMgp、MAG、RGM A、脑信号蛋白、ephrin、可溶性Aβ、促炎细胞因子(例如,IL-1)、趋化因子(例如,MIP 1a)、抑制神经再生的分子。抗nogo/抗RGM A或相似DVD-Ig分子的功效可以在脊髓损伤的临床前动物模型中验证。此外,可以构建这些DVD-Ig分子并且在动物模型中测试其功效,并且可以选择最佳治疗性DVD-Ig用于人类患者中的测试。此外,可以构建靶向单一受体上两个不同配体结合位点的DVD-Ig分子,例如,结合3个配体Nogo、OMgp和MAG的Nogo受体以及结合Aβ和S100A的RAGE。另外,神经突增生抑制剂(例如,nogo和nogo受体)也在免疫学疾病如多发性硬化中在阻止神经再生方面发挥作用。nogo-nogo受体相互作用抑制已经显示在多发性硬化的动物模型中增强恢复。因此,可以阻断一种免疫介质的功能(例如,细胞因子如IL-12和神经突增生抑制剂分子例如,Nogo或RGM)的DVD-Ig分子可以比单独阻断免疫抑制剂分子或神经突增生抑制剂分子发挥更快和更大的功效。
[0524] 通常,抗体不以高效和有意义的方式跨过血脑屏障(BBB)。然而,在某些神经病学疾病(例如,中风、创伤性脑损伤、多发性硬化等)中,BBB可能受损并且允许DVD-Ig和抗体向脑内渗透增加。在其中不出现BBB泄漏的其他神经病学病状中,可以利用内源性转运系统的靶向作用(包括在BBB的血管内皮处载体介导的转运蛋白如葡萄糖和氨基酸载体和受体介导转胞吞作用介导的细胞结构/受体),因此能够进行DVD-Ig的跨BBB转运。在BBB处能够进行这类转运的结构物包括但不限于胰岛素受体、转铁蛋白受体、LRP和RAGE。此外,多种策略也能够使用DVD-Ig作为向CNS中转运潜在药物(包括低分子量药物、纳米粒子和核酸)的穿梭物(Coloma等人,Pharm.Res.,17(3):266-274(2000);Boado等人,Bioconjug.Chem.,18(2):447-455(2007))。
[0525] 肿瘤学病症
[0526] 单克隆抗体疗法已经成为癌症的重要治疗方式(von Mehren等人,Ann.Rev.Med.,54:343-369(2003))。抗体可以通过诱导凋亡、更改的细胞毒性、干扰配体受体相互作用或阻止对肿瘤表型关键的蛋白质表达发挥抗肿瘤作用。此外,抗体可以靶向肿瘤微环境的组分,从而扰动不可缺少的结构,如肿瘤相关性脉管系统的形成。抗体也可以靶向其配体是生长因子的受体,如表皮生长因子受体。抗体因此抑制刺激细胞生长的天然配体与所靶向的肿瘤细胞结合。可选地,抗体可以诱导抗同种型网络、补体介导的细胞毒性或抗体依赖的细胞毒性(ADCC)。与单特异性疗法相比,靶向两种独立肿瘤介质的双重特异性抗体的使用将可能产生额外的益处。
[0527] 在另一个实施方案中,结合人IL-1β的本发明DVD-Ig也可能能够结合参与肿瘤学疾病的另一个靶标,所述靶标包括但不限于:IGFR、IGF、VGFR1、PDGFRb、PDGFRa、IGF1,2、ERB3、CDCP、1BSG2、ErbB3、CD52、CD20、CD19、CD3、CD4、CD8、BMP6、IL12A、IL1A、IL1B、IL2、IL24、INHA、TNF、TNFSF10、BMP6、EGF、FGF1、FGF10、FGF11、FGF12、FGF13、FGF14、FGF16、FGF17、FGF18、FGF19、FGF2、FGF20、FGF21、FGF22、FGF23、FGF3、FGF4、FGF5、FGF6、FGF7、FGF8、FGF9、GRP、IGF1、IGF2、IL12A、IL1A、IL1B、IL2、INHA、TGFA、TGFB1、TGFB2、TGFB3、VEGF、CDK2、FGF10、FGF18、FGF2、FGF4、FGF7、IGF1R、IL2、BCL2、CD 164、CDKN1A、CDKN1B、CDKN1C、CDKN2A、CDKN2B、CDKN2C、CDKN3、GNRH1、IGFBP6、IL1A、IL1B、ODZ1、PAWR、PLG、TGFB1I1、AR、BRCA1、CDK3、CDK4、CDK5、CDK6、CDK7、CDK9、E2F1、EGFR、ENO1、ERBB2、ESR1、ESR2、IGFBP3、IGFBP6、IL2、INSL4、MYC、NOX5、NR6A1、PAP、PCNA、PRKCQ、PRKD1、PRL、TP53、FGF22、FGF23、FGF9、IGFBP3、IL2、INHA、KLK6、TP53、CHGB、GNRH1、IGF1、IGF2、INHA、INSL3、INSL4、PRL、KLK6、SHBG、NR1D1、NR1H3、NR1I3、NR2F6、NR4A3、ESR1、ESR2、NR0B1、NR0B2、NR1D2、NR1H2、NR1H4、NR1I2、NR2C1、NR2C2、NR2E1、NR2E3、NR2F1、NR2F2、NR3C1、NR3C2、NR4A1、NR4A2、NR5A1、NR5A2、NR6A1、PGR、RARB、FGF1、FGF2、FGF6、KLK3、KRT1、APOC1、BRCA1、CHGA、CHGB、CLU、COL1A1、COL6A1、EGF、ERBB2、ERK8、FGF1、FGF10、FGF11、FGF13、FGF14、FGF16、FGF17、FGF18、FGF2、FGF20、FGF21、FGF22、FGF23、FGF3、FGF4、FGF5、FGF6、FGF7、FGF8、FGF9、GNRH1、IGF1、IGF2、IGFBP3、IGFBP6、IL12A、IL1A、IL1B、IL2、IL24、INHA、INSL3、INSL4、KLK10、KLK12、KLK13、KLK14、KLK15、KLK3、KLK4、KLK5、KLK6、KLK9、MMP2、MMP9、MSMB、NTN4、ODZ1、PAP、PLAU、PRL、PSAP、SERPINA3、SHBG、TGFA、TIMP3、CD44、CDH1、CDH10、CDH19、CDH20、CDH7、CDH9、CDH1、CDH10、CDH13、CDH18、CDH19、CDH20、CDH7、CDH8、CDH9、ROBO2、CD44、ILK、ITGA1、APC、CD164、COL6A1、MTSS1、PAP、TGFB1I1、AGR2、AIG1、AKAP1、AKAP2、CANT1、CAV1、CDH12、CLDN3、CLN3、CYB5、CYC1、DAB2IP、DES、DNCL1、ELAC2、ENO2、ENO3、FASN、FLJ12584、FLJ25530、GAGEB1、GAGEC1、GGT1、GSTP1、HIP1、HUMCYT2A、IL29、K6HF、KAI1、KRT2A、MIB1、PART1、PATE、PCA3、PIAS2、PIK3CG、PPID、PR1、PSCA、SLC2A2、SLC33A1、SLC43A1、STEAP、STEAP2、TPM1、TPM2、TRPC6、ANGPT1、ANGPT2、ANPEP、ECGF1、EREG、FGF1、FGF2、FIGF、FLT1、JAG1、KDR、LAMA5、NRP1、NRP2、PGF、PLXDC1、STAB1、VEGF、VEGFC、ANGPTL3、BAI1、COL4A3、IL8、LAMA5、NRP1、NRP2、STAB1、ANGPTL4、PECAM1、PF4、PROK2、SERPINF1、TNFAIP2、CCL11、CCL2、CXCL1、CXCL10、CXCL3、CXCL5、CXCL6、CXCL9、IFNA1、IFNB1、IFNG、IL1B、IL6、MDK、EDG1、EFNA1、EFNA3、EFNB2、EGF、EPHB4、FGFR3、HGF、IGF1、ITGB3、PDGFA、TEK、TGFA、TGFB1、TGFB2、TGFBR1、CCL2、CDH5、COL18A1、EDG1、ENG、ITGAV、ITGB3、THBS1、THBS2、BAD、BAG1、BCL2、CCNA1、CCNA2、CCND1、CCNE1、CCNE2、CDH1(E-钙黏着蛋白)、CDKN1B(p27Kip1)、CDKN2A(p16INK4a)、COL6A1、CTNNB1(b-联蛋白)、CTSB(组织蛋白酶B)、ERBB2(Her-2)、ESR1、ESR2、F3(TF)、FOSL1(FRA-1)、GATA3、GSN(凝溶胶蛋白)、IGFBP2、IL2RA、IL6、IL6R、IL6ST(糖蛋白130)、ITGA6(a6整联蛋白)、JUN、KLK5、KRT19、MAP2K7(c-Jun)、MKI67(Ki-67)、NGFB(NGF)、NGFR、NME1(NM23A)、PGR、PLAU(uPA)、PTEN、SERPINB5(乳腺丝抑蛋白)、SERPINE1(PAI-1)、TGFA、THBS1(血小板应答蛋白-1)、TIE(Tie-1)、TNFRSF6(Fas)、TNFSF6(FasL)、TOP2A(拓扑异构酶Iia)、TP53、AZGP1(锌-a-糖蛋白)、BPAG1(网蛋白)、CDKN1A(p21Wap1/Cip1)、CLDN7(紧密连接蛋白-7)、CLU(簇集蛋白)、ERBB2(Her-2)、FGF1、FLRT1(纤连蛋白)、GABRP(GABAa)、GNAS1、ID2、ITGA6(a6整联蛋白)、ITGB4(b 4整联蛋白)、KLF5(GC Box BP)、KRT19(角蛋白19)、KRTHB6(毛发特异性II型角蛋白)、MACMARCKS、MT3(metallothionectin-III)、MUC1(黏蛋白)、PTGS2(COX-2)、RAC2(p21Rac2)、S100A2、SCGB1D2(亲脂素B)、SCGB2A1(乳球蛋白2)、SCGB2A2(乳球蛋白1)、SPRR1B(Spr1)、THBS1、THBS2、THBS4和TNFAIP2(B94)、RON、c-Met、CD64、DLL4、PLGF、CTLA4、磷脂酰丝氨酸、ROBO4、CD80、CD22、CD40、CD23、CD28、CD55、CD38、CD70、CD74、CD30、CD138、CD56、CD33、CD2、CD137、DR4、DR5、RANKL、VEGFR2、PDGFR、VEGFR1、MTSP1、MSP、EPHB2、EPHA1、EPHA2、EpCAM、PGE2、NKG2D、LPA、SIP、APRIL、BCMA、MAPG、FLT3、PDGFRα、PDGFRβ、ROR1、PSMA、PSCA、SCD 1和CD59。
[0528] D.药物组合物
[0529] 本发明也提供药物组合物,其包含本发明的抗体(包括本文所述的DVD-Ig)或其抗原结合部分和可药用载体。包含本发明抗体的药物组合物用于但不限于诊断、检测或监测病症、用于病症或其一个或多个症状的预防、治疗、处置或改善和/或用于研究中。在一个具体实施方案中,组合物包含本发明的一种或多种抗体。在另一个实施方案中,药物组合物包含本发明的一种或多种抗体和不是本发明抗体的一种或多种预防药或治疗药用于治疗其中IL-1β活性有害的病症。在一个实施方案中,这种预防药或治疗药已知用于或已经用于或目前正在用于病症或其一个或多个症状的的预防、治疗、处置或改善。根据这些实施方案,组合物还可以包含载体、稀释剂或赋形剂。
[0530] 本发明的抗体和抗体部分可以并入适于施用至受试者的药物组合物中。一般地,这种药物组合物包含本发明的抗体或抗体部分和可药用载体。如本文所用,“可药用载体”包括生理上相容性的任何和全部溶剂、分散介质、包衣、抗菌药和抗真菌药、等渗和吸收延迟剂等。可药用载体的实例包括水、盐水、磷酸盐缓冲盐水、右旋糖、甘油、乙醇等中的一种或多种以及其组合。在许多情况下,将优选在组成上包括等渗剂例如糖、多元醇如甘露醇、山梨醇,或氯化钠。可药用载体可以还包含增强抗体或抗体部分的货架期或有效性的少量辅助物质,如润湿或乳化剂、防腐剂或缓冲剂。
[0531] 多种递送体系是已知的并且可以用来施用本发明的一种或多种抗体或本发明的一种或多种抗体的组合和预防药或治疗药,用于病症或其一个或多个症状的预防、处置、治疗或改善,例如,在脂质体中包囊化、微粒子、微胶囊、能够表达所述抗体或抗体片段的重组细胞、受体介导的内吞作用(见,例如,Wu和Wu,J BiolChem.,262:4429-4432(1987))、构建核酸作为逆转录病毒载体或其他载体的部分。施用本发明的预防药或治疗药的方法包括但不限于肠胃外施用(例如,皮内、肌内、腹膜内、静脉内和皮下)、硬膜外施用,肿瘤内施用和粘膜施用(例如,鼻内和口服途径)。此外,可以使用肺部施用,例如,通过使用吸入器或雾化器和含有雾化剂的制剂。见,例如,美国专利号6,019,968;5,985,320;5,985,309;5,934,272;5,874,064;5,855,913和5,290,540;和PCT公开号WO 92/19244、WO 97/32572、WO 97/
44013、WO 98/31346和WO 99/66903,其全文通过引用方式并入本文。在一个实施方案中,使用Alkermes 肺部药物递送技术(Alkermes,Inc.,Cambridge,Massachusetts)施用本发明的抗体或抗体部分、联合治疗或本发明的组合物。在一个具体实施方案中,肌内、静脉内、肿瘤内、经口、鼻内、经肺或皮下施用本发明的预防药或治疗药。预防药或治疗药可以通过任何便利的途径,例如通过输注或快速浓注、通过经上皮底层或粘膜皮肤底层(例如,口腔粘膜、直肠和肠道粘膜等)吸收来施用,并且可以与其他生物活性物质一起施用。施用可以是全身性或局部性的。
[0532] 在一个实施方案中,抗体偶联的碳纳米管(CNTs)在体外与肿瘤细胞特异性结合,随后用近红外(NIR)光使它们高度特异性消融,这可以用来靶向肿瘤细胞。例如,生物素化的极性脂质可以用来制备稳定的、生物相容性、非细胞毒CNT分散体,所述分散体随后与针对一种或多种肿瘤抗原(例如,CD22)的一种或两种不同的neutralite抗生物素蛋白衍生化DVD-Ig连接(Chakravarty等人,Proc.Natl.Acad.Sci.USA,105:8697-8702(2008))。
[0533] 在一个具体实施方案中,可能合乎需要局部地施用本发明的预防药或治疗药至需要治疗的区域;这可以通过例如并且以非限制方式通过局部输注,通过注射或借助植入物实现,所述植入物是多孔或非多孔材料,包含膜和基质,如赛莱膜(sialastic membrane)、聚合物、纤维基质(例如, )或胶原蛋白基质。在一个实施方案中,将有效量的本发明的一种或多种抗体拮抗剂局部地施用至受试者的患病区域以预防、治疗、处置和/或改善一种病症或其症状。在另一个实施方案中,将有效量的本发明的一种或多种抗体与有效量的除本发明抗体之外的一种或多种治疗(例如,一种或多种预防药或治疗药)组合局部地施用至受试者的患病区域以预防、治疗、处置和/或改善一种病症或其一个或多个症状。
[0534] 在另一个实施方案中,所述预防药或治疗药可以在控释或持续释放系统中递送。在一个实施方案中,可以使用泵来实现控释或持续释放(见Langer,上文;Sefton,M.V.,CRC Crit.Rev.Biomed.Eng.,14:201-240(1987);Buchwald等人,Surgery,88:507-516(1980);
Saudek等人,N.Engl.J.Med.,321:574-579(1989))。在另一个实施方案中,聚合物材料可以用来实现本发明疗法的控释或持续释放(见,例如,Goodson,J.M.,第6章,引自Medical Applications of Controlled Release,第II卷,Applications and Evaluation,(Langer和Wise编著)(CRC Press,Inc.,Boca Raton,1984)第115-138页;Langer和Peppas,J.Macromol.Sci.Rev.Macromol.Chem.Phys.,C23(1):61-126(1983);还见Levy等人,Science,228:190-192(1985);During等人,Ann.Neurol.,25:351-356(1989);Howard等人,J.Neurosurg.,71:105-112(1989));美国专利号5,679,377;美国专利号5,916,597;美国专利号5,912,015;美国专利号5,989,463;美国专利号5,128,326;PCT公开号WO 99/15154;和PCT公开号WO 99/20253。在持续释放制剂中使用的聚合物的实例包括但不限于聚(甲基丙烯酸2-羟乙酯)、聚(甲基丙烯酸甲酯)、聚(丙烯酸)、聚(乙烯-共-醋酸乙烯酯)、聚(甲基丙烯酸)、聚乙交酯(PLG)、聚酸酐、聚(N-乙烯吡咯烷酮)、聚(乙烯醇)、聚丙烯酰胺、聚(乙二醇)、聚乳酸(PLA)、聚(丙交酯-共-乙交酯)(PLGA)和聚原酸酯。在一个示例性实施方案中,在持续释放制剂中使用的聚合物是惰性的,不含可浸出的杂质、储存时稳定、无菌并且是生物可降解的。在又一个实施方案中,可以将控释或持续释放系统靠近预防靶或治疗靶放置,因此仅需要全身性剂量的一部分(见,例如,Goodson,引自Medical Applications of Controlled Release,上文,第2卷,第15-138页(1984))。
[0535] 控释系统在Langer(Science,249:1527-1533(1990))的综述中讨论。本领域技术人员已知的任何技术可以用来产生包含本发明的一种或多种治疗药的持续释放制剂。见,例如,美国专利号4,526,938、PCT公开号WO 91/05548,PCT公开号WO 96/20698;Ning等人,″Intratumoral radioimmunotherapy of a human colon cancerxenograft using a sustained-release gel(使用持续释放凝胶的人结肠癌异体移植物肿瘤内放射免疫疗
法),″Radiotherapy Oncol.,39:179-189(1996);Song等人,″AntibodyMediated Lung Targeting of Long-Circulating Emulsions(抗体介导的长效循环乳剂肺部靶向),″PDA J.Pharm.Sci.Technol.,50:372-377(1996);Cleek等人,″BiodegradablePolymeric Carriers for a bFGF Antibody for Cardiovascular Application(用于心血管应用的b F G F 抗 体 的 生 物 可 降 解 聚 合 物 载 体 ) ,″P r o c e e d . I n t ′l.Symp.Control.Rel.Bioact.Mater.,24:853-854(1997);和Lam等人,″
Microencapsulation of RecombinantHumanized Monoclonal Antibody for Local 
Delivery(用于局部送递的重组人源化单克隆抗体微囊化),″Proceed.Int′
l.Symp.Control Rel.Bioact.Mater.,24:759-760(1997),每篇文献全文通过引用的方式并入本文。
[0536] 在一个具体实施方案中,其中本发明的组合物是编码预防药或治疗药的核酸,可以通过以下方式在体内施用所述核酸以促进其编码的预防药或治疗药的表达:将核酸构建为适宜核酸表达载体的部分并且施用它,从而该核酸变成胞内核酸,例如,通过使用逆转录病毒载体(见美国专利号4,980,286)或通过直接注射或通过使用微粒子轰击法(例如,基因枪; DuPont)或用脂质或细胞表面受体或转染剂涂覆,或通过将核酸与已知进入胞核的同源框样肽连接施用(见,例如,Joliot等人,Proc.Natl.Acad.Sci.USA,88:1864-
1868(1991))。可选地,可以通过同源重组以胞内方式将核酸导入并且并入宿主细胞DNA内部用于表达。
[0537] 将本发明的药物组合物配制成与其预期施用途径相容。施用途径的实例包括但不限于肠胃外,例如,静脉内、皮内、皮下、口服、鼻内(例如,吸入)、经皮(例如,局部)、经粘膜和直肠施用。在一个具体实施方案中,将组合物根据常规方法配制为适应于静脉内、皮下、肌内、口服、鼻内或局部施用至人类的药物组合物。一般地,用于静脉内施用的组合物是无菌等渗含水缓冲液中的溶液剂。如果需要,组合物也可以包含增溶剂和局部麻醉药,利多卡因(lignocamne),以便减轻注射部位处的疼痛。
[0538] 如果本发明的组合物将局部施用,则组合物可以按油膏剂、乳膏剂、透皮贴剂、洗剂、凝胶剂、洗发剂、喷雾剂、气溶胶剂、溶液剂、乳剂的形式或本领域技术人员熟知的其他形式配制。见,例如,Remington′s Pharmaceutical Sciences andIntroduction to Pharmaceutical Dosage Forms,第19版,Mack Pub.Co.,Easton,Pennsylvania(1995)。对于不可喷雾性局部用剂型,一般使用包含载体或一种或多种赋形剂的粘稠至半固体或固体形式,其与局部施加相容并具有优选大于水的动态黏度。合适的制剂包括而不限于溶液剂、混悬剂、乳剂、乳膏剂、油膏剂、粉末剂、搽剂、药膏剂等,如果需要,它们进行消毒或与影响多种特性(例如,渗透压)的助剂(例如,防腐剂、稳定剂、润湿剂、缓冲液或盐)混合。其他合适的局部用剂型包括可喷雾的气溶胶制剂,其中在含有加压的挥发性物质(例如,气态推进剂,如 )的混合物中或在挤瓶中包装有效成分,其优选地与固体或液体惰性载体组合。如果需要,也可以将润湿剂或湿润剂添加至药物组合物和剂型。这类额外成分的实例是本领域熟知的。
[0539] 如果本发明的方法包括组合物的鼻内施用,则这种组合物可以按气溶胶形式、喷雾剂、雾化剂或按滴剂形式配制。具体而言,根据本发明使用的预防药或治疗药可以在使用合适推进剂(例如,二氯二氟甲烷、三氯氟甲烷、二氯四氟乙烷、二氧化碳或其他合适气体)的情况下,以气溶胶喷雾剂形式从加压的包装或雾化器中便利地递送。在加压气溶胶的情况下,可以通过提供递送计量的量的门确定剂量单位。可以配制用于吸入器或吹入器中的胶囊剂和套筒剂(cartridge)(由例如明胶组成),其含有所述化合物及合适粉末剂基底(powder base)(如乳糖或淀粉)的粉末混合物。
[0540] 如果本发明的方法包括口服施用,则组合物可以按口服方式以片剂、胶囊剂、扁囊剂、胶囊锭(gelcap)、溶液剂、混悬剂等形式配制。可以通过常规手段以可药用的赋形剂如粘合剂(例如,预胶化玉米淀粉、聚乙烯吡咯烷酮或羟丙基甲基纤维素);填料(例如,乳糖、微晶纤维素或磷酸氢钙);润滑剂(例如,硬脂酸镁、滑石或二氧化硅);崩解剂(例如,马铃薯淀粉或淀粉羟乙酸钠);或湿润剂(例如,十二烷基硫酸钠钠)制备片剂或胶囊剂。片剂可以通过本领域熟知的方法包衣。口服施用的液体制剂可以采取但不限于溶液剂、糖浆剂或混悬剂形式,或可以将它们作为使用之前与水或其他合适溶媒构成的干燥产品提供。此类液体制剂可以通过常规手段用可药用的添加剂如助悬剂(例如,山梨糖醇糖浆、纤维素衍生物或氢化食用脂肪);乳化剂(例如,卵磷脂或阿拉伯胶);非水溶媒(例如,杏仁油、油质酯、乙醇或分馏植物油);和防腐剂(例如,对羟苯甲酸甲酯或丙酯或山梨酸)制备。如果适宜,这些制剂也可以含有缓冲盐、矫味剂、着色剂甜味剂。可以适当地配制口服施用的制剂用于预防药或治疗药的缓慢释放、控释或持续释放。
[0541] 本发明的方法可以包括肺部施用,例如,通过使用吸入器或雾化器、使用以雾化剂配制的组合物。见,例如,美国专利号6,019,968;5,985,320;5,985,309;5,934,272;5,874,064;5,855,913;和5,290,540;和PCT公开号WO 92/19244、WO 97/32572、WO 97/44013、WO 
98/31346和WO 99/66903,每份专利全文通过引用方式并入本文。在一个具体实施方案中,使用Alkermes 肺部药物递送技术(Alkermes,Inc.,Cambridge,Massachusetts)施用本发明的抗体、联合疗法和/或本发明的组合物。
[0542] 本发明的方法可以包括施用为通过注射(例如通过快速浓注或连续输注)进行肠胃外施用所配制的组合物。用于注射的制剂可以按单位剂量形式(例如,在安瓿或多剂量容器中)伴有添加的防腐剂一起提供。这些组合物可以采用多种形式如在油质或水质溶媒中的混悬剂、溶液剂或乳剂形式,并且可以含有配制剂,例如助悬剂、稳定剂和/或分散剂。可选地,有效成分可以是使用前以合适溶媒(例如无菌无热原水)构成的粉末剂形式。
[0543] 本发明的方法可以额外地包括施用作为储库制剂配制的组合物。这种长效制剂可以通过(例如皮下或肌内)埋植或通过肌内注射施用。因此,例如,这些组合物可以用合适的聚合材料或疏水材料(例如,在可接受油中的乳液)或离子交换树脂配制,或配制为微溶性衍生物,例如配制为微溶性盐。
[0544] 本发明的方法包括施用作为中性形式或盐形式配制的组合物。可药用的盐包括与阴离子如源自氢氯酸、磷酸、乙酸、草酸酒石酸等的那些阴离子形成的那些盐,和与阳离子如源自钠、、铵、钙、氢氧化铁、异丙胺、三乙胺、2-乙氨基乙醇、组氨酸、普鲁卡因等的那些阳离子形成的那些盐。
[0545] 通常,将组合物的成分单独地供应或以单位剂量形式混合在一起,例如,作为显示有效药物的量的密封容器(如安瓿或小袋)中的干燥冻干粉末或无水浓缩物。在施用模式是输注的情况下,组合物可以用含有无菌药用级水或盐水的输液瓶分配。在施用模式是注射的情况下,可以提供含有无菌注射用水或盐水的安瓿,从而各成分可以在施用之前混合。
[0546] 具体而言,本发明也提供本发明的一种或多种预防药或治疗药或药物组合物,其包装在显示药物的量的密封容器(如安瓿或小袋)中。在一个实施方案中,本发明的一种或多种预防药或治疗药或药物组合物作为密封容器中干燥消毒的冻干粉末或无水浓缩物供应并且可以重构(例如,用水或盐水)成适宜浓度以便施用至受试者。优选地,本发明的一种或多种预防药或治疗药或药物组合物作为密封容器中的干燥无菌冻干粉末以至少5mg、更优选地至少10mg、至少15mg、至少25mg、至少35mg、至少45mg、至少50mg、至少75mg或至少100mg的单位剂量供应。本发明的冻干的预防药或治疗药或药物组合物应当在2℃和8℃之间在其原始容器中贮存,并且本发明的预防药或治疗药或药物组合物应当在重构后1周部、优选地在5日内、在72小时内、在48小时内、在24小时内、在12小时内、在6小时内、在5小时内、在3小时内或在1小时内施用。在一个备选实施方案中,本发明的一种或多种预防药或治疗药或药物组合物以液体形式在显示药物的量和浓度的密封容器中供应。优选地,施用的组合物的液体形式在密封容器中以至少0.25mg/mL、更优选地至少0.5mg/mL、至少1mg/mL、至少2.5mg/mL、至少5mg/mL、至少8mg/mL、至少10mg/mL、至少15mg/kg、至少25mg/mL、至少
50mg/mL、至少75mg/mL或至少100mg/mL供应。这种液体形式应当在2℃和8℃之间在其原始容器中贮存。
[0547] 本发明的抗体和抗体部分可以并入适于肠胃外施用的药物组合物中。优选地,抗体或抗体部分将被制备为含有0.1-250mg/mL抗体的可注射溶液剂。所述可注射溶液剂可以由硬质或琥珀小药瓶、安瓿或预填充注射器中的液体或冻干剂型组成。缓冲剂可以是L-组氨酸(1-50mM),最佳地5-10mM,处于pH 5.0至7.0(最佳pH6.0)。其他合适的缓冲剂包括但不限于琥珀酸钠、柠檬酸钠、磷酸钠或磷酸钾。可以用浓度为0-300mM的(对于液体剂型,最佳地是150mM)的氯化钠来调节溶液剂的毒性。对于冻干剂型,可以包含低温保护剂,主要是0-10%蔗糖(最佳0.5-1.0%)。其他合适的低温保护剂包括海藻糖和乳糖。对于冻干剂型,可以包含填充剂,主要是1-10%甘露醇(最佳2-4%)。稳定剂可以用于液体剂型和冻干剂型中,主要是1-50mM L-甲硫氨酸(最佳5-10mM)。其他合适的填充剂包括甘氨酸、精氨酸,可以作为0-0.05%聚山梨醇酯80(最佳0.005-0.01%)来包含。额外的表面活性剂包括但不限于聚山梨醇酯20和BRIJ表面活性剂。作为肠胃外施用的可注射溶液剂而制备的包含本发明抗体或抗体部分的药物组合物还可以包含用作辅助剂的药剂,如用来增加治疗性蛋白(例如,抗体)吸收或分散的那些。一种特别有用的辅助剂是透明质酸酶(如 重组人透明质
酸酶)。在可注射溶液剂中添加透明质酸酶改善在肠胃外施用、尤其皮下施用后的人生物利用率。它还允许更大的注射部位体积(即,大于1ml),同时疼痛和不适较少并且注射部位反应的发生率最小(见,PCT公开号WO 2004/078140和美国公开号2006/104968)。
[0548] 本发明的组合物可以为多种形式。这些形式包括例如液体、半固体和固体剂型,如液态溶液剂(例如,可注射用溶液剂和可输注溶液剂)、分散体剂或混悬剂、片剂、丸剂、粉末剂、脂质体剂和栓剂。优选的形式取决于预期的施用模式和治疗用途。常见的优选组合物为可注射用溶液剂或可输注溶液剂形式,如与用于用其他抗体被动免疫的人的那些组合物相似的组合物。优选的施用模式是肠胃外(例如,静脉内、皮下、腹膜内、肌内)。在一个示例性实施方案中,通过静脉内输注或注射施用抗体。在另一个优选实施方案中,通过肌内或皮下注射施用抗体。
[0549] 治疗性组合物一般必须是无菌并在制造和储存条件下稳定的。可以将组合物配制为溶液、微乳液、分散体、脂质体或适合高药物浓度的其他有序结构。可以通过在适宜的溶剂中以要求的量并入活性活性化合物(即抗体或抗体部分)和上文所列举的一种成分或成分组合,根据需要,随后过滤消毒,制备无菌可注射溶液剂。通常,通过将所述活性化合物并入无菌溶媒中来制备分散体,所述无菌溶媒含有基础分散介质和来自上文所列举那些成分中的所要求的其他成分。在用于制备无菌可注射溶液剂的无菌冻干粉末情况下,优选的制备方法是真空干燥法和喷雾干燥法,所述干燥法产生有效成分的粉末,外加来自其先前无菌过滤的溶液中的任何额外的所需成分。可以例如通过使用包衣如卵磷脂、在分散体的情况下通过维持要求的粒度和通过使用表面活性剂,维持溶液剂的适宜流动性。可注射组合物的延长吸收可以通过在组合物中包含延迟吸收的物质例如单硬脂酸盐和明胶而获得。
[0550] 本发明的结合蛋白可以通过本领域已知的多种方法施用,但是对于许多治疗用途,优选的施用途径/模式是皮下注射、静脉内注射或输注。如技术人员将理解,施用的途径和/或模式将取决于所希望的结果而变动。在某些实施方案中,活性化合物可以连同将保护蛋白质免于快速释放的载体一起制备,如控释制剂,包括植入物、经皮贴剂和微囊化输送系统。可以使用生物可降解、生物相容性聚合物,如乙烯-乙酸乙烯酯、聚酸酐、聚乙醇酸、胶原蛋白、聚原酸酯和聚乳酸。用于制备此类制剂的多种方法是专利授权的或总体上是本领域技术人员已知的。见,例如,Sustained and Controlled Release Drug Delivery Systems,(J.R.Robinson,编著)(MarcelDekker,Inc.,New York,1978)。
[0551] 在某些实施方案中,本发明的抗体或抗体部分可以例如随惰性稀释剂或可吸收的可食用载体一起经口施用。化合物(和其他成分,如果需要)也可以封闭在硬壳或软壳明胶胶囊剂中、压缩成片剂或直接掺入受试者的膳食中。对于口服治疗施用,所述化合物可以随赋形剂一起掺入并且以可摄取的片剂、颊用片剂、药锭剂(troche)、胶囊剂、酏剂、混悬剂、糖浆剂、糯米纸囊剂(wafer)等形式使用。为了通过非肠胃外施用方法施用本发明的化合,可能需要将化合物用防止其失活的材料包衣或随这种材料共施用。
[0552] 补充性活性化合物也可以并入组合物中。在某些实施方案中,将本发明的抗体或抗体部分与一种或多种额外治疗药一起共同配制和/或共施用,所述的额外治疗药用于治疗其中IL-1β活性有害的病症。例如,本发明的抗人IL-1β抗体或抗体部分可以和结合其他靶标的一种或多种额外抗体(例如,结合其他细胞因子或结合细胞表面分子的抗体)一起共同配制和/或共施用。另外,本发明的一种或多种抗体可以与两种或更多种前述治疗药组合使用。这类联合疗法可以有利地利用较低剂量的所施用治疗药,因此避免与多种单一疗法相关的可能毒性或并发症。
[0553] 在某些实施方案中,针对IL-1β的抗体或其片段与本领域已知的延长半寿期的载体连接。这类载体包括但不限于Fc结构域、聚乙二醇和葡聚糖。这类载体例如在美国系列号09/428,082(现在的美国专利号6,660,843)中描述,所述文献因而通过引用方式并入用于任何目的。
[0554] 在一个具体实施方案中,施用核酸序列以通过基因治疗来治疗、预防、处置或改善病症或其一个或多个症状,所述核酸序列包含编码本发明抗体或本发明的另一种预防药或治疗药的核苷酸序列。基因治疗指通过向受试者施用表达或可表达的核酸所进行的疗法。在本发明的这个实施方案中,核酸产生它们编码的介导预防或治疗效果的本发明抗体或预防药或治疗药。
[0555] 可以根据本发明使用本领域可获得的任何用于基因治疗的方法。对于基因治疗方法的一般综述,见Goldspiel等人,Clinical Pharm.,12:488-505(1993);Wu等人,″Delivery systems for gene therapy,″Biotherapy(用于基因治疗的递送体系),3:87-95(1991);Tolstoshev,P.,Ann.Rev.Pharmacol.Toxicol.,32:573-596(1993);Mulligan,R.C.,Science,260:926-932(1993);和Morgan和Anderson,″Human Gene Therapy(人类基因治疗),″Ann.Rev.Biochem.,62:191-217(1993);Robinson,C.,TrendsBiotechnol.,11:155(1993)。可以使用的重组DNA技术的领域共知方法在Ausubel等人(编著),Current Protocols in Molecular Biology,John Wiley & Sons,New York(1993);和Kriegler,Gene Transfer and Expression,A Laboratory Manual,StocktonPress,New York(1990)中描述。多种基因治疗方法的具体描述在美国公开号2005/0042664 A1中公开,所述专利通过引用方式并入本文。
[0556] IL-1家族成员(IL-1β和IL-1α)在与涉及免疫要素和炎性要素的多种病症相关的病理学中发挥关键作用。本文所述的IL-1结合蛋白可以施用至个体以治疗这类病症。在一个实施方案中,可以通过本发明方法(其包括向受试者施用本文所述的IL-1结合蛋白)治疗的病症包括,但不限于:糖尿病;葡萄膜炎;神经性疼痛;骨关节炎性疼痛;炎性疼痛;类风湿性关节炎;骨关节炎;幼年型慢性关节炎;脓毒性关节炎;莱姆病关节炎;银屑病关节炎;反应性关节炎;脊椎关节病;系统性红斑狼疮(SLE);克罗恩氏病;溃疡性结肠炎;炎性肠病;自身免疫性糖尿病;胰岛素依赖性糖尿病;甲状腺炎;哮喘;过敏性疾病;银屑病;皮炎;硬皮病;移植物抗宿主病;器官移植排异;与器官移植相关的急性免疫性疾病;与器官移植相关的慢性免疫性疾病;肉瘤样病;动脉粥样硬化;弥漫性血管内凝血(DIC);川崎病;格雷夫斯氏病;肾病综合征;慢性疲劳综合征;韦格纳肉芽肿病;Henoch-Schoenlein紫癜;肾显微性血管炎;慢性活动性肝炎;自身免疫性葡萄膜炎;脓毒性休克;中毒性休克综合征;脓毒症综合征;恶病质;传染病;寄生虫病;急性横贯性脊髓炎;亨廷顿舞蹈症;帕金森病;阿尔茨海默病;中风;原发性胆汁性肝硬变;溶血性贫血;恶性肿瘤;心力衰竭;心肌梗死;阿狄森病;I型零星多腺体缺陷症;II型多腺体缺陷症(Schmidt综合征);急性呼吸窘迫综合征(ARDS);脱发;斑秃;血清阴性关节病;关节病;莱特尔病;银屑病性关节病;溃疡性结肠炎关节病;肠病性滑膜炎;衣原体病;耶尔森菌和沙门氏菌相关性关节病;脊椎关节病;动脉粥样硬化病/动脉硬化;异位性变态反应;自身免疫性大疱病;寻常天疱疮;落叶型天疱疮;类天疱疮;线状IgA病;自身免疫性溶血性贫血;库姆氏阳性溶血性贫血;获得性恶性贫血;青少年恶性贫血;肌痛脑脊髓炎/Royal Free病;慢性粘膜皮肤念珠菌病;巨细胞动脉炎(GCA);原发硬化性肝炎;隐源性自身免疫性肝炎;获得性免疫缺陷综合征(AIDS);获得性免疫缺陷相关性疾病;乙型肝炎;丙型肝炎;寻常变异型免疫缺陷(寻常变异型低丙种球蛋白血症);扩张型心肌病;女性不育;卵巢功能衰竭;卵巢功能早衰;纤维化肺病;隐原性纤维化肺泡炎;炎症后间质性肺病;间质性肺炎;结缔组织病相关性间质性肺病;混合型结缔组织病相关性肺病;系统性硬化症相关性间质性肺病;类风湿性关节炎相关性间质性肺病;系统性红斑狼疮相关性肺病;皮肌炎/多肌炎相关性肺病; 病相关性肺病;强直性脊柱炎相关性肺病;血管炎弥散性肺病;含铁血黄素沉着症相关性肺病;药物诱导的间质性肺病;纤维化;放射性纤维化;闭塞性细支气管炎;慢性嗜酸性粒细胞性肺炎;淋巴细胞浸润性肺病;感染后间质性肺病;痛风性关节炎;自身免疫性肝炎;1型自身免疫性肝炎(经典自身免疫性或类狼疮性肝炎);2型自身免疫性肝炎(抗LKM抗体肝炎);自身免疫介导的低血糖症;B型胰岛素抵抗伴发黑棘皮病;甲状旁腺功能减退;骨关节病;原发性硬化性胆管炎;1型银屑病;2型银屑病;
特发性白细胞减少症;自身免疫性中性粒细胞减少症;肾病NOS;肾小球肾炎;肾显微性血管炎;莱姆病;盘状红斑狼疮;特发性男性不育;一氧化氮相关性男性不育;精子自身免疫症;
多发性硬化(全部亚型,包括原发进行型、继发进行型、复发缓解型);交感性眼炎;继发于结缔组织病的肺性高血压;肺出血肾炎综合征;结节性多发性动脉炎的肺部表现;急性风湿热;类风湿性脊柱炎;斯蒂尔病;系统性硬化症; 综合征;塔卡亚萨病/动脉炎;自身免疫性血小板减少症(AITP);特发性血小板减少症;自身免疫性甲状腺病;甲状腺功能亢进症;甲状腺肿性自身免疫性甲状腺功能减退症(桥本氏病);萎缩性自身免疫性甲状腺功能减退症;原发性粘液性水肿;晶状体源性葡萄膜炎;原发性血管炎;白斑症;急性肝病;慢性肝病;酒精性肝硬化;酒精诱导肝损伤;胆汁淤积;特异体质性肝病;药物诱导的肝炎;非酒精性脂肪性肝炎;变态反应;B组链球菌(GBS)感染;精神障碍(例如,抑郁和精神分裂症);
Th2型和Th1型介导的疾病;急性和慢性疼痛(不同形式的疼痛);癌症(如肺癌、乳腺癌、胃癌、膀胱癌、结肠癌、胰癌、卵巢癌、前列腺癌和直肠癌);造血系统恶性肿瘤;白血病;淋巴瘤;无β脂蛋白血症;肢端发绀症;急性和慢性寄生性或感染性过程;急性白血病;急性淋巴性白血病(ALL);T-细胞ALL;FAB ALL;急性髓样白血病(AML);急性或慢性细菌性感染;急性胰腺炎;急性肾衰竭;腺癌;心房异位搏动;AIDS痴呆复合征;酒精诱导的肝炎;变应性结膜炎;变应性接触性皮炎;过敏性鼻炎;同种异体移植排斥;α-1抗胰蛋白酶缺乏症;肌萎缩侧索硬化;贫血;心绞痛;前角细胞变性;抗CD3疗法;抗磷脂综合征;抗受体超敏反应;主动脉瘤和周围性动脉瘤;主动脉夹层;动脉高血压;动脉硬化;动静脉瘘;共济失调;心房颤动(持久性或阵发性);心房扑动;房室传导阻滞;B细胞淋巴瘤;骨移植排斥;骨髓移植(BMT)排斥;
束支传导阻滞;伯基特淋巴瘤;烧伤;心律不齐;心脏眩晕综合征;心脏肿瘤;心肌病;心肺转流术炎症反应;软骨移植排斥;小脑外皮质变性;小脑疾病;紊乱性或多灶性房性心动过速;
化疗相关性病症;慢性粒细胞性白血病(CML);慢性酒精中毒;慢性炎性病理;慢性淋巴细胞白血病(CLL);慢性阻塞性肺病(COPD);慢性水杨酸盐中毒;结直肠癌;充血性心力衰竭;结膜炎;接触性皮炎;肺源性心脏病;冠状动脉病;克-雅氏病;培养阴性脓毒症;囊性纤维化;
细胞因子疗法相关性病症;拳击员痴呆;脱髓鞘病;登革出血热;皮炎;皮肤病状;糖尿病;糖尿病性动脉硬化病;弥漫性Lewy体病;扩张性充血性心肌病;基底神经节病症;中年唐氏综合征;由阻断CNS多巴胺受体的药物引起的药物诱导型运动障碍;药物过敏;湿疹;脑脊髓炎;心内膜炎;内分泌病;会厌炎;Epstein-Barr病毒感染;红斑性肢痛病;锥体束外及小脑病;家族性嗜血细胞性淋巴组织细胞增多症;胎儿胸腺植入物排斥;弗里德赖希共济失调;
功能性外周动脉病;真菌性败血症;气性坏疽;胃溃疡;肾小球肾炎;任何器官或组织的移植排斥;革兰氏阴性脓毒症;革兰氏阳性脓毒症;归因于胞内生物体的肉芽肿;多毛细胞白血病;哈-斯二氏病;桥本氏甲状腺炎;枯草热;心脏移植排斥;血色素沉着症;血液透析;溶血尿毒症综合征/溶栓性血小板减少性紫癜;出血;甲型肝炎;希氏束心率失常;HIV感染/HIV神经病;霍奇金病;多动性运动障碍;超敏反应;过敏性肺炎;高血压;运动机能减退性运动障碍;下丘脑-垂体-肾上腺轴评价;特发性阿狄森病;特发性肺纤维化(IPF);抗体介导的细胞毒性;无力;婴儿脊髓性肌萎缩;主动脉炎症;a型流感;电离辐射暴露;虹膜睫状体炎/葡萄膜炎/视神经炎;局部缺血-再灌注损伤;缺血性发作;幼年型类风湿关节炎;幼年期脊髓性肌萎缩;卡波西肉瘤;肾移植排斥;军团菌病;利什曼病;麻疯病;皮质脊髓束损害;脂肪水肿;肝移植排斥;淋巴水肿;疟疾;恶性淋巴瘤;恶性组织细胞增多症;恶性黑色素瘤;脑膜炎;脑膜炎球菌血症;代谢综合征偏头痛;特发性偏头痛;线粒体多系统障碍;混合型结缔组织病;单克隆丙种球蛋白病;多发性骨髓瘤;多系统变性(Menzel;Dejerine-Thomas;Shy-Drager;和Machado-Joseph);重症肌无力;鸟胞内分枝杆菌病;结核分枝杆菌病;骨髓增生异常综合征;心肌梗死;心肌缺血性病症;鼻咽癌;新生儿慢性肺病;肾炎;肾病;神经变性病;神经源性I肌萎缩;中性粒细胞减少性发热;非霍奇金淋巴瘤;腹主动脉及其分支闭塞;
闭塞性动脉病; 疗法;睾丸炎/附睾炎;睾丸炎/输精管复通过程;器官巨大症;骨质疏松症;胰移植排斥;胰腺癌;类肿瘤性综合征/恶性肿瘤高钙血症;甲状旁腺的移植排斥;
盆腔炎性疾病;常年性鼻炎;心包疾病;外周动脉粥样硬化性疾病;周围血管病;腹膜炎;恶性贫血;卡氏肺囊虫肺炎;肺炎;POEMS综合征(多发性神经病、器官巨大症、内分泌病、单克隆丙种球蛋白病和皮肤变化综合征);灌注后综合征;泵后综合征;MI心切开术后综合征;先兆子痫;进行性核上麻痹;原发性肺动脉高压;放射疗法;雷诺氏现象;雷诺病;雷夫苏姆病;
规则性窄QRS心动过速;肾血管性高血压;再灌注损伤;限制型心肌病;肉瘤;老年舞蹈症;
Lewy体型老年性痴呆;血清阴性关节病;休克;镰状细胞性贫血;皮肤同种异体移植排斥;皮肤变化综合征;小肠移植排斥;实体瘤;特殊心率失常;脊髓性共济失调;脊髓小脑退行性变;链球菌性肌炎;小脑结构性损害;亚急性硬化性全脑炎;晕厥;心血管系统梅毒;全身过敏;全身性炎症反应综合征;全身发病型幼年类风湿性关节炎;毛细血管扩张症;闭塞性血栓性脉管炎;血小板减少症;中毒;移植;创伤/出血;III型超敏反应;IV型超敏反应;不稳定型心绞痛;尿毒症;尿脓毒病;荨麻疹;心脏瓣膜病;静脉曲张;血管炎;静脉病;静脉血栓形成;心室颤动;病毒和真菌感染;病毒性脑炎/无菌性脑膜炎;病毒相关性噬血细胞综合征;
韦-科二氏综合征;肝豆状核变性;任何器官或组织的异体移植排斥;急性冠状动脉综合征;
急性特发性多神经炎;急性炎性脱髓鞘多发性神经根性神经病;急性局部缺血;成人斯蒂尔病;斑秃;过敏反应;抗磷脂抗体综合征;再生障碍性贫血;动脉硬化;异位性湿疹;异位性皮炎;自身免疫性皮炎;与链球菌感染相关的自身免疫病症;自身免疫性肠病;自身免疫性听力损失;自身免疫性淋巴细胞增生综合征(ALPS);自身免疫性心肌炎;自身免疫性卵巢功能早衰;眼睑炎;支气管扩张症;大疱性类天疱疮;心血管疾病;毁灭性抗磷脂综合征;乳糜泻;
颈椎病;慢性局部缺血;瘢痕性类天疱疮;存在多发性硬化风险的临床孤立的综合征(CIS);
结膜炎;儿童期发病精神异常;泪囊炎;皮肌炎;糖尿病性视网膜病变;椎间盘突出;椎间盘脱出;药物诱导的免疫性溶血性贫血;心内膜炎;子宫内膜异位症;眼内炎;巩膜外层炎;多形性红斑;重型多形性红斑;妊娠性类天疱疮;格巴二氏综合征(GBS);枯草热;休斯氏综合征;特发性帕金森病;特发性间质性肺炎;IgE介导的变态反应;免疫性溶血性贫血;包涵体肌炎;感染性眼部炎性疾病;炎性脱髓鞘性疾病;炎性心脏病;炎性肾疾病;虹膜炎;角膜炎;
干燥性角结膜炎;库斯毛尔病或Kussmaul-Meier病;急性热病性多神经炎;郎格罕氏细胞组织细胞增多症;网状青斑;黄斑变性;显微镜下多血管炎;白赫铁列夫症;运动神经元病;粘膜类天疱疮;多器官功能衰竭;重症肌无力;骨髓增生异常综合征;心肌炎;神经根障碍;神经病;非甲非乙肝炎;视神经炎;骨质溶解;少关节JRA;外周动脉闭塞性疾病(PAOD);外周血管疾病(PVD);外周动脉病(PAD);静脉炎;结节性多发性动脉炎(或结节性动脉周围炎);多软骨炎;风湿性多肌痛;白发症;多关节JRA;多内分泌腺缺陷综合征;多肌炎;风湿性多肌痛(PMR);泵后综合征;原发性帕金森症;继发性帕金森症;前列腺炎;单纯红细胞再生障碍;原发性肾上腺功能减退;复发型视神经脊髓炎;再狭窄;风湿性心脏病;SAPHO(滑膜炎、座疮、脓疱病、骨肥厚和骨炎);继发性淀粉样变性;休克肺;巩膜炎;坐骨神经痛;继发性肾上腺功能减退;硅氧烷相关性结缔组织病;角层下脓疱性皮肤病;关节强硬性脊椎炎;斯约二氏综合征(SJS);全身性炎症反应综合征;颞动脉炎;弓形体性视网膜炎;中毒性表皮坏死松解症;横贯性脊髓炎;TRAPS(1型肿瘤坏死因子受体(TNFR)相关的周期性综合征);B型胰岛素抵抗伴发黑棘皮病;I型变态反应;II型糖尿病;荨麻疹;普通间质性肺炎(UIP);春季结膜炎;病毒性视网膜炎;伏格特-小柳-原田三氏综合征(VKH综合征);湿性黄斑变性;伤口愈合;耶尔森菌和沙门氏菌相关性关节病。
[0557] 本发明的结合蛋白可以用来治疗患有自身免疫疾病,尤其伴有炎症、类风湿性关节炎(RA)、骨关节炎、银屑病、多发性硬化(MS)和其他自身免疫疾病的那些人。
[0558] 本发明的抗体或抗体部分也可以随用于治疗自身免疫疾病和炎性疾病的一种或多种额外治疗药一起施用。
[0559] 在一个实施方案中,可以用本发明的组合物和方法治疗或诊断的疾病包括但不限于原发性和转移性癌症,包括以下部位的癌:乳腺、结肠、直肠、肺、口咽、下咽、食道、胃、胰、肝脏、胆囊和胆管、小肠、尿路(包括肾、膀胱和尿道上皮)、女性生殖道(包括子宫颈、子宫和卵巢以及绒毛膜癌和妊娠滋养细胞疾病)、男性生殖道(包括前列腺、精囊、睾丸和生殖细胞肿瘤)、内分泌腺(包括甲状腺、肾上腺和脑垂体)和皮肤,以及血管瘤、黑色素瘤、肉瘤(包括源自骨和软组织的那些肉瘤以及卡波西肉瘤),脑、神经、眼和脑膜的肿瘤(包括星形细胞瘤、胶质瘤、胶质母细胞瘤、视网膜母细胞瘤、神经瘤、神经母细胞瘤、神经鞘瘤和脑膜瘤),源自造血系统恶性肿瘤的实体瘤如白血病和淋巴瘤(霍奇金和非霍奇金淋巴瘤)。
[0560] 在另一个实施方案中,本发明的抗体或其抗原结合部分用来治疗癌症或用于防止肿瘤转移。这类治疗可以包括单独地施用或与另一种治疗药或疗法(如放疗法和/或化疗药)组合施用抗体或其抗原结合部分。
[0561] 本发明的抗体或其抗原结合部分可以与药物组合,所述药物包括但不限于抗肿瘤药、放疗法、化疗药如DNA烷基化剂、顺铂、卡铂、抗微管蛋白剂、紫杉醇(paclitaxel)、多西紫杉醇、紫杉醇(taxol)、多柔比星、吉西他滨、健择(gemzar)、蒽环类、阿霉素、拓扑异构酶I抑制剂、拓扑异构酶II抑制剂、5-氟尿嘧啶(5-FU)、甲酰四氢叶酸、依立替康、受体酪氨酸激酶抑制剂(例如,厄洛替尼、吉非替尼)、COX-2抑制剂(例如,塞来昔布)、激酶抑制剂和siRNA。
[0562] 本发明的结合蛋白也可以随用于治疗多种疾病的一种或多种额外治疗药一起施用。
[0563] 本发明的抗体或其抗原结合部分可以单独或组合地用来治疗这类疾病。应当理解,本发明的抗体或其抗原结合部分可以单独或与额外的剂(例如,治疗药)组合使用,所述的额外的剂由技术人员选择用于其预期目的。例如,额外的剂可以是现有技术公认的可用来治疗由本发明抗体治疗的疾病或病状的治疗药。额外的剂也可以是对治疗性组合物赋予有益属性的的剂,例如,影响组合物粘度的剂。
[0564] 应当进一步理解,包含于本发明内的组合是用于其预期目的的那些组合。下文所述的剂出于说明目的并且不意在起限制作用。作为本发明的部分的组合可以是本发明抗体和选自以下清单的至少一种额外的剂。如果这种组合是这样,从而形成的组合物可以履行其预期功能,则这种组合也可以包含多于一个的额外的剂,例如,2种或3种额外的剂。
[0565] 优选的组合是非甾体抗炎药,也称作NSAID,其包括药物如布洛芬。其他优选的组合是皮质类固醇,包括泼尼松龙;可以通过逐步减少与本发明的抗IL-1β抗体组合情况下治疗患者时所需要的类固醇剂量,减少或甚至消除使用类固醇的众知副作用。本发明抗体或抗体部分可以与之组合的用于类风湿性关节炎的治疗药的非限制性实例包括但不限于以下:细胞因子抑制性抗炎药(CSAID);针对其他人细胞因子或生长因子(例如,TNF、LT、IL-1、IL-2、IL-3、IL-4、IL-5、IL-6、IL-7、IL-8、IL-15、IL-16、IL-18、IL-21、干扰素、EMAP-II、GM-CSF、FGF和PDGF)的抗体或拮抗剂。本发明的抗体或其抗原结合部分可以与针对细胞表面分子如CD2、CD3、CD4、CD8、CD25、CD28、CD30、CD40、CD45、CD69、CD80(B7.1)、CD86(B7.2)、CD90、CTLA或其配体(包括CD154(gp39或CD40L))的抗体组合。
[0566] 优选的治疗药组合可以在自身免疫和后续炎性级联中的不同位点处发挥干扰作用;优选的实例包括TNF拮抗剂如嵌合、人源化或人TNF抗体,D2E7(PCT公开号WO 97/29131)、CA2(RemicadeTM)、CDP 571和可溶性p55或p75 TNF受体、其衍生物(p75TNFR1gG(EnbrelTM)或p55TNFR1gG(Lenercept)并且还包括TNFα转化酶(TACE)抑制剂;类似地,IL-1抑制剂(白介素酶-1-转化酶抑制剂,IL-1RA等)可以出于相同原因是有效的。其他优选的组合包括白介素11。又一个优选的组合是自身免疫性反应的其他关键角色,它们可以与IL-1β功能平行地、相依赖地或协作地发挥作用。又一个优选的组合是非耗竭性抗CD4抑制剂。其他优选的组合包括共刺激性途径的拮抗剂CD80(B7.1)或CD86(B7.2),包括抗体、可溶性受体或拮抗性配体。
[0567] 本发明的抗体或其抗原结合部分也可以与以下药物组合,如甲氨蝶呤、6-MP、硫唑嘌呤、柳氮磺胺吡啶、美沙拉秦、奥沙拉秦、氯喹/羟氯喹、青霉胺、金硫代苹果酸盐(肌内和口服)、硫唑嘌呤、秋水仙碱、皮质类固醇(口服、吸入型和局部注射)、β-2肾上腺素能受体激动剂(沙丁胺醇、特布他林、沙美特罗)、黄嘌呤(茶碱、氨茶碱)、色甘酸盐、奈多罗米、酮替芬、异丙托铵和氧托品、环孢素、FK506、雷帕霉素、麦考酚酸吗乙酯、来氟米特、NSAID例如布洛芬、皮质类固醇如泼尼松龙、磷酸二酯酶抑制剂、腺苷激动剂、抗血栓药、补体抑制剂、肾上腺素能药、借助促炎细胞因子如TNF-α或IL-1(例如,IRAK、NIK、IKK、p38或MAP激酶抑制剂)的干扰信号传导的药物、IL-1β转化酶抑制剂、TNFα转化酶(TACE)抑制剂、T-细胞信号传导抑制剂如激酶抑制剂、金属蛋白酶抑制剂、柳氮磺吡啶(sulfasalazine)、硫唑嘌呤、6-巯基嘌呤、血管紧张素转化酶抑制剂、可溶性细胞因子受体及其衍生物(例如,可溶性p55或p75 TNF受体和衍生物p75TNFRIgG( 和p55TNFRIgG(来那西普)、sIL-1RI、sIL-1RII、sIL-6R)、抗炎细胞因子(例如,IL-4、IL-10、IL-11、IL-13和TGFβ)、塞来昔布、叶酸、硫酸羟氯喹、罗非昔布、依那西普、英利昔单抗、萘普生、伐地考昔、柳氮磺吡啶、甲泼尼龙、美洛昔康、醋酸甲泼尼龙、金硫代苹果酸钠、阿司匹林、曲安奈德、萘磺酸右丙氧芬/apap、叶酸、萘丁美酮、双氯芬酸、吡罗昔康、依托度酸、双氯芬酸钠、奥沙普秦、盐酸羟考酮、重酒石酸氢可酮/apap、双氯芬酸钠/米索前列醇、芬太尼、人重组阿那白滞素、盐酸曲马多、双水杨酯、舒林酸、氰钴胺/fa/吡多辛、醋氨酚、阿仑膦酸钠、泼尼松龙、硫酸吗啡、盐酸利多卡因、吲哚美辛、硫酸氨基葡萄糖/软骨素、盐酸阿米替林、磺胺嘧啶、盐酸羟考酮/醋氨酚、盐酸奥洛他定、米索前列醇、萘普生钠、奥美拉唑、环磷酰胺、利妥昔单抗、IL-1TRAP、MRA、CTLA4-IG、IL-
18BP、抗IL-18、抗IL15、BIRB-796、SCIO-469、VX-702、AMG-548、VX-740、罗氟司特、IC-485、CDC-801和甲泼尼龙。优选的组合包括甲氨蝶呤或来氟米特和在中度或重度类风湿性关节炎病例中,包括环孢菌素。
[0568] 也可以与结合蛋白组合使用以治疗类风湿性关节炎(RA)的非限制性的额外的剂包括但不限于以下:非甾体抗炎药(NSAID);细胞因子抑制性抗炎药(CSAID);CDP-571/BAY-10-3356(人源化抗TNFα抗体;Celltech/Bayer);cA2/英利昔单抗(嵌合抗TNFα抗体;
Centocor);75kdTNFR-IgG/依那西普(75kD TNF受体-IgG融合蛋白;Immunex;见,例如,Moreland等人,(摘要第813号),Arthritis Rheum.,37:S295(1994);Baumgartner等人,J.Invest.Med.,44(3):235A(3月1996);55kdTNF-IgG(55kD TNF受体-IgG融合蛋白;
Hoffmann-LaRoche);IDEC-CE9.1/SB210396(非耗竭性灵长类化抗CD4抗体;IDEC/
SmithKline;见,例如,Kaine等人,(摘要第195号),Arthritis Rheum.,38:S185(1995));
DAB 486-IL-2和/或DAB 389-IL-2(IL-2融合蛋白;Seragen;见,例如,Sewell等人,Arthritis Rheum.,36(9):36(9):1223-1233(1993年9月));抗Tac(人源化抗IL-2Rα;
Protein DesignLabs/Roche);IL-4(抗炎细胞因子;DNAX/Schering);IL-10(SCH 52000;重组IL-10,抗炎细胞因子;DNAX/Schering);IL-4;IL-10和/或IL-4激动剂(例如,激动剂抗体);IL-1RA(IL-1受体拮抗剂;Synergen/Amgen);阿那白滞素( /Amgen);TNF-bp/s-TNF(可溶性TNF结合蛋白;见,例如,Evans等人,(摘要第1540号),Arthritis Rheum.,39(9)(增刊):S284(1996));Kapadia等人,Amer.J.Physiol.-Heart and Circulatory 
Physiology,268:H517-H525(1995));RP73401(磷酸二酯IV型抑制剂;见,例如,Chikanza等人,(摘要第1527号),Arthritis Rheum.,39(9)(增刊):S282(1996));MK-966(COX-2抑制剂;见,例如,Erich等人,(摘要第328和329号),Arthritis Rheum.,39(9)(增刊):S81(1996));伊洛前列素(见,例如,Scholz,P.(摘要第336号),Arthritis Rheum.,39(9)(增刊):S82(1996));甲氨蝶呤;沙立度胺(见,例如,Lee等人,(摘要第1524号),Arthritis Rheum.,39(9)(增刊):S282(1996))和沙立度胺相关药物(例如,Celgen);来氟米特(抗炎和细胞因子抑制剂;见,例如,Finnegan等人,(摘要第627号),Arthritis Rheum.,39(9)(增刊):S131(1996));Thoss等人,Inflamm.Res.,45:103-107(1996));氨甲环酸(纤维蛋白溶酶原活化的抑制剂;见,例如,Ronday等人,(摘要第1541号),Arthritis Rheum.,39(9)(增刊):S284(1996));T-614(细胞因子抑制剂;见,例如,Hara等人,(摘要第1526号),Arthritis Rheum.,39(9)(增刊):S282(1996));前列腺素E1(见,例如,Moriuchi等人,(摘要第1528号),Arthritis Rheum.,39(9)(增刊):S282(1996));替尼达普(非甾体抗炎药;
见,例如,Guttadauria,M.(摘要第1516号),Arthritis Rheum.,39(9)(增刊):S280(1996));萘普生(非甾体抗炎药;见,例如,Fiebich等人,NeuroReport,7:1209-1213(1996));美洛昔康(非甾体抗炎药);布洛芬(非甾体抗炎药);吡罗昔康(非甾体抗炎药);双氯芬酸(非甾体抗炎药);吲哚美辛(非甾体抗炎药);柳氮磺吡啶(见,例如,Farr等人,(摘要第1519号),Arthritis Rheum.,39(9)(增刊):S281(1996));硫唑嘌呤(见,例如,Hickey等人,(摘要第1521号),Arthritis Rheum.,39(9)(增刊):S281(1996));ICE抑制剂(白介素-1β转化酶的抑制剂);zap-70和/或lck抑制剂(酪氨酸激酶抑制剂zap-70或lck);VEGF抑制剂和/或VEGF-R抑制剂(血管的皮细胞生长因子或血管内皮细胞生长因子受体的抑制剂;血管生成的抑制剂);皮质类固醇抗炎药物(例如,SB203580);TNF-转化抑制剂;抗IL-12抗体;抗IL-18抗体;白介素-11(见,例如,Keith Jr.等人,(摘要第1613号),ArthritisRheum.,39(9)(增刊):S296(1996));白介素-13(见,例如,Bessis等人,(摘要第1681号),Arthritis Rheum.,39(9)(增刊):S308(1996));白介素-17抑制剂(见,例如,Lotz等人,(摘要第559号),Arthritis Rheum.,39(9)(增刊):S120(1996));金;青霉胺;氯喹;苯丁酸氮芥;羟氯喹;环孢菌素;环磷酰胺;全淋巴照射;抗胸腺细胞球蛋白;抗CD4抗体;CD5-毒素;口服施用的肽和胶原;氯苯扎利二钠;细胞因子调节剂(CRAs)HP228和HP466(Houghten 
Pharmaceuticals,Inc.);ICAM-1反义硫代磷酸酯寡脱氧核苷酸(ISIS 2302;Isis 
Pharmaceuticals,Inc.);可溶性补体受体1(TP10;T Cell Sciences,Inc.);泼尼松;奥古蛋白;聚硫酸糖胺聚糖(glycosaminoglycan polysulphate);米诺环素;抗IL2R抗体;海洋生物和植物脂质(鱼类和植物种子脂肪酸;见,例如,DeLuca等人,Rheum.Dis.Clin.North Am.,21:759-777(1995));金诺芬;保泰松;甲氯芬那酸;氟芬那酸;静脉内免疫球蛋白;齐留通;阿扎立平;霉酚酸(RS-61443);他克莫司(FK-506);西罗莫司(雷帕霉素);氨普立糖(therafectin);克拉屈滨(2-氯脱氧腺苷);甲氨蝶呤;bc1-2抑制剂(见Bruncko等人,J.Med.Chem.,50(4),641-662(2007));抗病毒药和免疫调节剂。
[0569] 在一个实施方案中,结合蛋白或其抗原结合部分与用于治疗类风湿性关节炎(RA)的以下药物之一组合施用:KDR的小分子抑制剂、Tie-2的小分子抑制剂;甲氨蝶呤;泼尼松;塞来昔布;叶酸;硫酸羟氯喹;罗非昔布;依那西普;英利昔单抗;来氟米特;萘普生;伐地考昔;柳氮磺吡啶;甲泼尼龙;布洛芬;美洛昔康;醋酸甲泼尼龙;金硫代苹果酸钠;阿司匹林;
硫唑嘌呤;曲安奈德;萘磺酸右丙氧芬/apap;叶酸;萘丁美酮;双氯芬酸;吡罗昔康;依托度酸;双氯芬酸钠;奥沙普秦;盐酸羟考酮;重酒石酸氢可酮/apap;双氯芬酸钠/米索前列醇;
芬太尼;人重组阿那白滞素;盐酸曲马多;双水杨酯;舒林酸;氰钴胺/fa/吡多辛;醋氨酚;阿仑膦酸钠;泼尼松龙;硫酸吗啡;盐酸利多卡因;吲哚美辛;硫酸氨基葡萄糖/软骨素;环孢菌素;盐酸阿米替林;磺胺嘧啶;盐酸羟考酮/醋氨酚;盐酸奥洛他定;米索前列醇;萘普生钠;
奥美拉唑;麦考酚酸吗乙酯;环磷酰胺;利妥昔单抗;IL-1 TRAP;MRA;CTLA4-IG;IL-18 BP;
IL-12/23;抗IL18;抗IL15;BIRB-796;SCIO-469;VX-702;AMG-548;VX-740;罗氟司特;IC-
485;CDC-801和甲泼尼龙。
[0570] 可以与本发明结合蛋白组合的用于炎性肠病的治疗药的非限制性实例包括以下药物:布地奈德;表皮生长因子;皮质类固醇;环孢菌素、柳氮磺吡啶;氨基水杨酸盐;6-巯基嘌呤;硫唑嘌呤;甲硝唑;脂氧合酶抑制剂;美沙拉嗪;奥沙拉秦;巴柳氮;抗氧化剂;血栓烷抑制剂;IL-1受体拮抗剂;抗IL-1βmAb;抗IL-6mAb;生长因子;弹性蛋白酶抑制剂;吡啶基-咪唑化合物;针对其他人类细胞因子或生长因子(例如TNF、LT、IL-1、IL-2、IL-6、IL-7、IL-8、IL-15、IL-16、IL-17、IL-18、EMAP-II、GM-CSF、FGF和PDGF)的抗体或拮抗剂。本发明的抗体或其抗原结合部分可以与针对细胞表面分子如CD2、CD3、CD4、CD8、CD25、CD28、CD30、CD40、CD45、CD69、CD90或其配体的抗体组合。本发明的抗体或其抗原结合部分也可以与以下药物组合,如甲氨蝶呤、环孢菌素、FK506、雷帕霉素、麦考酚酸吗乙酯、来氟米特、NSAID例如布洛芬、皮质类固醇如泼尼松龙、磷酸二酯酶抑制剂、腺苷激动剂、抗血栓药、补体抑制剂、肾上腺素能药、借助促炎细胞因子如TNF-α或IL-1(例如,IRAK、NIK、IKK、p38或MAP激酶抑制剂)的干扰信号传导的药物、IL-1β转化酶抑制剂、TNFα转化酶抑制剂、T-细胞信号传导抑制剂如激酶抑制剂、金属蛋白酶抑制剂、柳氮磺吡啶、硫唑嘌呤、6-巯基嘌呤、血管紧张素转化酶抑制剂、可溶性细胞因子受体及其衍生物(例如,可溶性p55或p75 TNF受体、sIL-
1RI、sIL-1RII、sIL-6R)和抗炎细胞因子(例如,IL-4、IL-10、IL-11、IL-13和TGFβ)及bcl-2抑制剂。
[0571] 可以与结合蛋白组合的用于Crohn病的治疗药实例包括以下药物:TNF拮抗剂,例如,抗TNF抗体、阿达木单抗(PCT公开号WO 97/29131; )、CA2(REMICADE)、CDP 571、TNFR-Ig构建体、(p75TNFRIgG 和p55TNFRIgG(LENERCEPTTM))抑制剂和PDE4
抑制剂。本发明的抗体或其抗原结合部分可以与皮质类固醇(例如布地奈德和地塞米松)组合。本发明的结合蛋白或其抗原结合部分也可以与药物如柳氮磺吡啶、5-氨基水杨酸酸和奥沙拉秦和干扰促炎细胞因子(如IL-1)合成或作用的药物例如IL-1转化酶抑制剂和IL-
1ra组合。本发明的抗体或其抗原结合部分也可以随T细胞信号传导抑制剂(例如,酪氨酸激酶抑制剂6-巯基嘌呤)一起使用。本发明的结合蛋白或其抗原结合部分可以与IL-11组合。
本发明的结合蛋白或其抗原结合部分可以与美沙拉嗪、泼尼松、硫唑嘌呤、巯基嘌呤、英利昔单抗、琥珀酸甲泼尼龙钠、地芬诺酯/硫酸阿托品、盐酸洛哌丁胺、甲氨蝶呤、奥美拉唑、叶酸、环丙沙星/右旋糖-水、重酒石酸氢可酮/apap、盐酸四环素、醋酸氟轻松、甲硝唑、硫柳汞/酸、考来烯胺/蔗糖、盐酸环丙沙星、硫酸莨菪碱、盐酸哌替啶、盐酸咪达唑仑、盐酸羟考酮/醋氨酚、盐酸异丙嗪、磷酸钠、磺胺甲噁唑/甲氧苄啶、塞来昔布、聚卡波非、萘磺酸右丙氧芬、氢化可的松、多种维生素、巴柳氮二钠、磷酸可待因/apap、盐酸考来维仑、氰钴胺、叶酸、左氧氟沙星、甲泼尼龙、那他珠单抗和干扰素-γ组合。
[0572] 可以与本发明结合蛋白组合的用于多发性硬化(MS)的治疗药的非限制性实例包括以下药物:皮质类固醇;泼尼松龙;甲泼尼龙;硫唑嘌呤;环磷酰胺;环孢菌素;甲氨蝶呤;4-氨基吡啶;替扎尼定;干扰素-β1a(Avonex;Biogen);干扰素-1βb(Betaseron;Chiron/Berlex);干扰素α-n3)(Interferon Sciences/Fujimoto)、干扰素-α(Alfa Wassermann/J&J)、干扰素β1A-IF(Serono/Inhale Therapeutics)、PEG化干扰素α2b(Enzon/Schering-Plough)、共聚物1(Cop-1;COPAXONE;TevaPharmaceutical Industries、Inc.);高压氧;静脉内滴注免疫球蛋白;克拉屈滨(clabribine);针对其他人类细胞因子或生长因子(例如TNF、LT、IL-1、IL-2、IL-6、IL-7、IL-8、IL-23、IL-15、IL-16、IL-18、EMAP-II、GM-CSF、FGF和PDGF)和它们的受体的的抗体或拮抗剂。本发明的结合蛋白可以与针对细胞表面分子如CD2、CD3、CD4、CD8、CD19、CD20、CD25、CD28、CD30、CD40、CD45、CD69、CD80、CD86、CD90或其配体的抗体组合。本发明的结合蛋白也可以与以下药物组合,如甲氨蝶呤、环孢菌素、FK506、雷帕霉素、麦考酚酸吗乙酯、来氟米特、NSAID例如布洛芬、皮质类固醇如泼尼松龙、磷酸二酯酶抑制剂、腺苷激动剂、抗血栓药、补体抑制剂、肾上腺素能药、借助促炎细胞因子如TNF-α或IL-1(例如,IRAK、NIK、IKK、p38或MAP激酶抑制剂)干扰信号传导的药物、IL-1β转化酶抑制剂、TACE抑制剂、T-细胞信号传导抑制剂如激酶抑制剂、金属蛋白酶抑制剂、柳氮磺吡啶(sulfasalazine)、硫唑嘌呤、6-巯基嘌呤、血管紧张素转化酶抑制剂、可溶性细胞因子受体及其衍生物(例如,可溶性p55或p75 TNF受体、sIL-1RI、sIL-1RII、sIL-6R)、抗炎细胞因子(例如,IL-4、IL-10、IL-13和TGFβ)及bcl-2抑制剂。
[0573] 可以与本发明结合蛋白组合的用于多发性硬化的治疗药实例包括干扰素-β,例如,IFNβ1a和IFNβ1b;克帕松(copaxone);皮质类固醇;胱天蛋白酶抑制剂,例如胱天蛋白酶-1的抑制剂;IL-1抑制剂;TNF抑制剂和针对CD40配体和CD80的抗体。
[0574] 本发明的结合蛋白也可以与以下药物组合,如阿伦珠单抗、屈大麻酚、Unimed、达克珠单抗、米托蒽醌、盐酸扎利罗登、氨吡啶、醋酸格拉默、那他珠单抗、辛那比多(sinnabidol)、a-immunokine NNSO3、ABR-215062、AnergiX.MS、趋化因子受体拮抗剂、BBR-
2778、卡勒胍素(calagualine)、CPI-1189、LEM(脂质体包囊化米托蒽醌)、THC.CBD(大麻素激动剂)MBP-8298、甲泼尼龙(PDE4抑制剂)、MNA-715、抗IL-6受体抗体、neurovax、吡非尼酮allotrap 1258(RDP-1258)、sTNF-R1、他仑帕奈、特立氟胺、TGF-β2、替利莫肽、VLA-4拮抗剂(例如,TR-14035,VLA4 Ultrahaler,Antegran-ELAN/Biogen)、干扰素γ拮抗剂、IL-4激动剂。
[0575] 可以与本发明结合蛋白组合的用于心绞痛的治疗药的非限制性实例包括以下药物:阿司匹林、硝酸甘油、单硝酸异山梨酯、琥珀酸美托洛尔、阿替洛尔、酒石酸美托洛尔、苯磺酸氨氯地平、盐酸地尔硫卓、硝酸异山梨酯、硫酸氢氯吡格雷、硝苯地平、阿托伐他汀钙、氯化钾、呋塞米、辛伐他汀、盐酸维拉帕米、地高辛、盐酸普萘洛尔、卡维地洛、赖诺普利、螺内酯、氢氯噻嗪、马来酸依那普利、纳多洛尔、雷米普利、依诺肝素钠、肝素钠、缬沙坦、盐酸索他洛尔、非诺贝特、依折麦布(ezetimibe)、布美他尼、氯沙坦钾、赖诺普利/氢氯噻嗪、非洛他平、卡托普利、延胡索酸比索洛尔。
[0576] 可以与本发明结合蛋白组合的用于强直性脊柱炎的治疗药的非限制性实例包括以下药物:布洛芬、双氯芬酸和米索前列醇、萘普生、美洛昔康、吲哚美辛、双氯芬酸、塞来昔布、罗非昔布、柳氮磺吡啶、甲氨蝶呤、硫唑嘌呤、米诺环、泼尼松、依那西普、英利昔单抗。
[0577] 可以与本发明结合蛋白组合的用于哮喘的治疗药的非限制性实例包括以下药物:沙丁胺醇、沙美特罗/氟替卡松、孟鲁司特钠、丙酸氟替卡松、布地奈德、泼尼松、昔萘酸沙美特罗、盐酸左旋沙丁胺醇、硫酸沙丁胺醇/异丙托铵、泼尼松龙磷酸钠、曲安奈德、丙酸倍氯米松、异丙托溴铵、阿奇霉素、醋酸吡布特罗、泼尼松龙、无水茶碱、琥珀酸甲泼尼龙钠、克拉霉素、扎鲁司特、延胡索酸福莫特罗、流感病毒疫苗、甲泼尼龙、三水合阿莫西林、氟尼缩松、过敏注射、色甘酸钠、盐酸非索非那定、氟尼缩松/薄荷醇、阿莫西林/克拉维酸盐、左氧氟沙星、吸入器辅助装置、愈创甘油醚、地塞米松磷酸钠、盐酸莫西沙星、盐酸多西环素、愈创甘油醚/d-吗喃甲醚、p-麻黄碱/cod/氯苯那敏、加替沙星、盐酸西替利嗪、糠酸莫米松、昔萘酸沙美特罗、苯佐那酯、头孢氨苄、pe/氢可酮/氯苯那敏、盐酸西替利嗪/伪麻黄碱、去氧肾上腺素/cod/异丙嗪、可待因/异丙嗪、头孢丙烯、地塞米松、愈创甘油醚/伪麻黄碱、氯苯那敏/氢可酮、奈多罗米钠、硫酸特布他林、肾上腺素、甲泼尼龙、硫酸奥西那林。
[0578] 可以与本发明结合蛋白组合的用于COPD的治疗药的非限制性实例包括以下药物:硫酸沙丁胺醇/异丙托铵、异丙托溴铵、沙美特罗/氟替卡松、沙丁胺醇、昔萘酸沙美特罗、丙酸氟替卡松、泼尼松、无水茶碱、琥珀酸甲泼尼龙钠、孟鲁司特钠、布地奈德、延胡索酸福莫特罗、曲安奈德、左氧氟沙星、愈创甘油醚、阿奇霉素、丙酸倍氯米松、盐酸左旋沙丁胺醇、氟尼缩松、头孢曲松钠、三水合阿莫西林、加替沙星、扎鲁司特、阿莫西林/克拉维酸盐、氟尼缩松/薄荷醇、氯苯那敏/氢可酮、硫酸奥西那林、甲泼尼龙、糠酸莫米松、p-麻黄碱/cod/氯苯那敏、醋酸吡布特罗、p-麻黄碱/氯雷他定、硫酸特布他林、噻托溴铵、(R,R)-福莫特罗、TgAAT、西洛司特、罗氟司特。
[0579] 可以与本发明结合蛋白组合的用于HCV的治疗药的非限制性实例包括以下药物:干扰素-α-2a、干扰素-α-2b、干扰素-αcon1、干扰素-α-n1、PEG化干扰素-α-2a、PEG化干扰素-α-2b、利巴韦林、PEG化干扰素α-2b+利巴韦林、熊去氧胆酸、甘草酸、胸腺法新、二盐酸组胺、VX-497和用来通过干预以下靶来治疗HCV的任何化合物:HCV聚合酶、HCV蛋白酶、HCV解旋酶、HCV IRES(内部核糖体进入位点)。
[0580] 可以与本发明结合蛋白组合的用于特发性肺纤维化的治疗药的非限制性实例包括以下药物:泼尼松、硫唑嘌呤、沙丁胺醇、秋水仙碱、硫酸沙丁胺醇、地高辛、γ干扰素、甲泼尼龙琥珀酸钠、劳拉西泮、呋塞米、赖诺普利、硝酸甘油、螺内酯、环磷酰胺、异丙托溴铵、放线菌素d、阿替普酶、丙酸氟替卡松、左氧氟沙星、硫酸奥西那林、硫酸吗啡、盐酸羟考酮、氯化钾、曲安奈德、无水他克莫司钙、干扰素-α、甲氨蝶呤、麦考酚酸吗乙酯、干扰素-γ-1β。
[0581] 可以与本发明结合蛋白组合的用于心肌梗死的治疗药的非限制性实例包括以下药物:阿司匹林、硝酸甘油、酒石酸美托洛尔、依诺肝素钠、肝素钠、硫酸氢氯吡格雷、卡维地洛、阿替洛尔、硫酸吗啡、琥珀酸美托洛尔、华法林钠、赖诺普利、单硝酸异山梨酯、地高辛、呋塞米、辛伐他汀、雷米普利、替奈普酶、马来酸依那普利、托拉塞米、瑞替普酶(retavase)、氯沙坦钾、盐酸喹那普利/碳酸镁、布美他尼、阿替普酶、依那普利拉、盐酸胺碘酮、一水合盐酸替罗非班、盐酸地尔硫卓、卡托普利、厄贝沙坦、缬沙坦、盐酸普萘洛尔、福辛普利钠、盐酸利多卡因、依替巴肽、头孢唑林钠、硫酸阿托品、氨基己酸、螺内酯、干扰素、盐酸索他洛尔、氯化钾、多库酯钠、盐酸多巴酚丁胺、阿普唑仑、普伐他汀钠、阿托伐他汀钙、盐酸咪达唑仑、盐酸哌替啶、硝酸异山梨酯、肾上腺素、多巴胺盐酸盐、比伐芦定、瑞舒伐他汀、依折麦布/辛伐他汀、阿伐麦布、卡立泊来德。
[0582] 可以与本发明结合蛋白组合的用于银屑病的治疗药的非限制性实例包括以下药物:KDR的小分子抑制剂、Tie-2的小分子抑制剂、卡泊三烯、丙酸氯倍他索、曲安奈德、丙酸卤倍他索、他扎罗汀、甲氨蝶呤、醋酸氟轻松、增强的二丙酸倍他米松(betamethasone diprop augmented)、氟氯奈德、阿维A、焦油香波(tarshampoo)、戊酸倍他米松、糠酸莫米松、酮康唑、普莫卡因/氟轻松、戊酸氢化可的松、丙酮缩氟氢羟龙、脲、倍他米松、丙酸氯倍他索/软化剂(emoll)、丙酸氟替卡松、阿奇霉素、氢化可的松、湿润配方、叶酸、地奈德、吡美莫司、焦油、双醋二氟拉松、叶酸依那西普、乳酸、甲氧沙林、hc/碱式没食子酸铋/znox/resor、醋酸甲泼尼龙、泼尼松、防晒剂、哈西奈德、水杨酸、地蒽酚、特戊酸氯可托龙、煤提取物、煤焦油/水杨酸、煤焦油/水杨酸/硫磺、去羟米松、地西泮、软化剂、醋酸氟轻松/软化剂、矿物油/蓖麻油/乳酸钠(na lact)、矿物油/花生油、石油/肉豆蔻酸异丙酯、补骨脂素、水杨酸、皂/三溴沙仑、硫柳汞/硼酸、塞来昔布、英利昔单抗、环孢菌素、阿法赛特、依法珠单抗、他克莫司、吡美莫司、PUVA、UVB、柳氮磺吡啶。
[0583] 可以与本发明结合蛋白组合的用于银屑病关节炎的治疗药的非限制性实例包括以下药物:甲氨蝶呤、依那西普、罗非昔布、塞来昔布、叶酸、柳氮磺吡啶、萘普生、来氟米特、醋酸甲泼尼龙、吲哚美辛、硫酸羟氯喹、泼尼松、舒林酸、增强的二丙酸倍他米松、英利昔单抗、甲氨蝶呤、叶酸、曲安奈德、双氯芬酸、二甲基亚砜、吡罗昔康、双氯芬酸钠、酮洛芬、美洛昔康、甲泼尼龙、萘丁美酮、托美丁钠、卡泊三烯、环孢菌素、双氯芬酸钠/米索前列醇、醋酸氟轻松、硫酸氨基葡萄糖、金硫代苹果酸钠、重酒石酸氢可酮/apap、布洛芬、利塞膦酸钠、磺胺嘧啶、硫鸟嘌呤、伐地考昔、阿法赛特、依法珠单抗和bcl-2抑制剂。
[0584] 可以与本发明结合蛋白组合的用于再狭窄的治疗药的非限制性实例包括以下药物:西罗莫司、紫杉醇、依维莫司、他克莫司、唑罗莫司、醋氨酚。
[0585] 可以与本发明结合蛋白组合的用于坐骨神经痛的治疗药的非限制性实例包括以下药物:重酒石酸氢可酮/apap、罗非昔布、盐酸环苯扎林、甲泼尼龙、萘普生、布洛芬、盐酸羟考酮/醋氨酚、塞来昔布、伐地考昔、醋酸甲泼尼龙、泼尼松、磷酸可待因/apap、盐酸曲马多/醋氨酚、美他沙酮、美洛昔康、美索巴莫、盐酸利多卡因、双氯芬酸钠、加巴喷丁、地塞米松、卡立普多、酮咯酸氨丁三醇、吲哚美辛、醋氨酚、地西泮、萘丁美酮、盐酸羟考酮、盐酸替扎尼定、双氯芬酸钠/米索前列醇、萘磺酸右丙氧芬/apap、asa/羟考酮/羟考酮ter(asa/oxycod/oxycodoneter)、布洛芬/重酒石酸二氢可待因酮、盐酸曲马多、依托度酸、盐酸右丙氧芬、盐酸阿米替林、卡立普多/磷酸可待因/asa、硫酸吗啡、多种维生素、萘普生钠、柠檬酸奥芬那君、替马西泮。
[0586] 可以与本发明结合蛋白组合的用于SLE(狼疮)的治疗药实例包括以下药物:NSAIDS例如双氯芬酸、萘普生、布洛芬、吡罗昔康、吲哚美辛;COX2抑制剂例如塞来昔布、罗非昔布、伐地考昔;抗疟药例如羟氯喹;类固醇例如泼尼松、泼尼松龙、布地奈德
(budenoside)、地塞米松;细胞毒药物例如硫唑嘌呤、环磷酰胺、麦考酚酸吗乙酯、甲氨蝶呤;PDE4抑制剂或嘌呤合成抑制剂例如Cellcept。本发明的结合蛋白也可以与药物如柳氮磺吡啶、5-氨基水杨酸酸、奥沙拉秦、依木兰和干扰促炎细胞因子(如IL-1)合成、产生或作用的药物如胱天蛋白酶抑制剂(例如IL-1β转化酶抑制剂和IL-1ra)组合。本发明的结合蛋白也可以与T细胞信号传导抑制剂(例如,酪氨酸激酶抑制剂)或靶向T细胞活化分子的分子(例如CTLA-4-IgG或抗B7家族抗体、抗PD-1家族抗体)一起使用。本发明的结合蛋白可以与IL-11或抗细胞因子抗体(例如,芳妥珠单抗(fonotolizumab)(抗IFNg抗体))或抗受体受体抗体(例如,抗IL-6受体抗体)和针对B-细胞表面分子的抗体组合。本发明的抗体或其抗原结合部分也可以与LJP 394(阿贝莫司)、耗竭或失活B细胞的药物(例如,利妥昔单抗(抗CD20抗体))、lymphostat-B(抗BlyS抗体)、TNF拮抗剂(例如抗TNF抗体,阿达木单抗(PCT公开号WO 97/29131; )、CA2 CDP571、TNFR-Ig构建体、(p75TNFRIgG
和p55TNFRIgG )和bcl-2抑制剂一起使用,因为已经显示转基
因小鼠中的bcl-2过量表达引起狼疮样表型(见Marquina等人,J.Immunol.,172(11):7177-
7185(2004)),因此抑制它预期具有治疗效果。
[0587] 本发明的药物组合物可以包含“治疗有效量”或“预防有效量”的本发明抗体或抗体部分。“治疗有效量”指在需要的剂量上和需要的时间期间有效实现所需治疗结果的量。抗体或抗体部分的治疗有效量可以由本领域技术人员确定并且可以根据因素如疾病状态、个体的年龄、性别和重量和抗体或抗体部分在个体中激发所需反应的能力而变动。治疗有效量也是这样一种量,其中抗体或抗体部分的任何有毒或有害作用被治疗有益作用超过。
“预防有效量”指在需要的剂量上和需要的时间期间有效实现所需预防结果的量。通常,由于预防性剂量在受试者中在疾病之前或在疾病较早阶段使用,故预防有效量将小于治疗有效量。
[0588] 可以调整剂量方案以提供所需的最佳反应(例如,治疗性或预防性反应)。例如,可以施用快速注射剂,可以随时间推移施用几个分开的剂量,或该剂量可以如治疗情况的迫切需要所示,按比例减少或增加。特别有利的是以便利于剂量施用和均匀性的剂量单位形式配制肠胃外组合物。如本文所用的剂量单位形式指适合作为用于待治疗的哺乳动物受试者的单一剂量的物理分立单元;每个单元含有与需要的药用载体结合的经计算以产生所需治疗效果的预定量的活性化合物。用于本发明的剂量单位形式的说明书由以下决定并且直接取决它们:(a)活性化合物的独特特征和实现的具体的治疗或预防效果和(b)复配这种活性化合物用于治疗个体中敏感性的现有技术中固有的限制。
[0589] 应当指出,剂量值可以随待减轻的病状的类型和严重性变化。应进一步理解,对于任何特定的受试者,应当根据个体需要和施用组合物或监督其施用的人的专业判断,随时间推移调节特定剂量方案并且本文中所述的剂量范围仅是示例性并不意在限制要求保护的的组合物的范围或实施。
[0590] 诊断
[0591] 本公开在此还提供诊断性应用。这一点由下文进一步阐明。结合IL-1β的本发明抗体可以按多种形式中的任一形式用来在体内、在体外或离体(即,在已经从活的个体中获得、经历某个过程、随后返回该个体的细胞或组织中)检测IL-1β。本发明的DVD-Ig提供了能够与IL-1β的表位以及多种诊断和检测分析模式中的其他抗原或表位结合的其他优点。
[0592] I.分析方法:
[0593] 本公开也提供一种使用如本文所述的至少一种抗IL-1β结合蛋白或其抗原结合部分(包括DVD-Ig)确定测试样品中IL-1β或其片段(“分析物”)的存在、量或浓度的方法。可以在这种方法中使用如本领域已知的任何适合的测定法。实例包括但不限于免疫测定法,如夹心免疫测定(例如,单克隆、多克隆和/或DVD-Ig夹心免疫测定法或其任何变型(例如,单克隆/DVD-Ig、DVD-Ig/多克隆等),包括放射性同位素检测(放射免疫测定(RIA))和酶检测(酶免疫测定(EIA)或酶联免疫吸附测定(ELISA)(例如,Quantikine ELISA测定,R&D Systems,Minneapolis,Minnesota))、竞争性抑制免疫测定(例如,正向和反向)、荧光偏振免疫测定(FPIA)、酶多重免疫测定技术(EMIT)、生物发光共振能量转移(BRET)和均相化学发光测定法等。在基于SELDI的免疫测定法中,特异性结合目的分析物(或其片段)的捕获试剂与质谱探针的表面(如预活化的蛋白质芯片阵列)连接。随后在生物芯片上特异性捕获分析物(或其片段)并且通过质谱法检测捕获的分析物(或其片段)。可选地,分析物(或其片段)可以从捕获试剂中洗脱并且通过传统MALDI(基质辅助激光解吸附/电离)或通过SELDI检测。化学发光微粒子免疫测定法,尤其使用 自动化分析仪(Abbott 
Laboratories,Abbott Park,Illinois)的一种免疫测定法,是示例性免疫测定法实例。
[0594] 在本公开的实施中使用本领域熟知的用于采集、处置和加工尿、血液、血清和血浆和其他体液的方法,例如,在如本文所述的抗IL-1β结合蛋白作为免疫诊断试剂使用和/或在分析物免疫测定试剂盒中使用时。测试样品可以包含除目的分析物之外的其他部分,如抗体、抗原、半抗原、激素、药物、酶、受体、蛋白质、肽、多肽、寡核苷酸和/或多核苷酸。例如,样品可以是从受试者获得的全血样品。可以需要或要求,测试样品(尤其全血)应当在如本文所述的免疫测定之前例如用预处理试剂处理。甚至在其中不需要预处理的情况下(例如,大部分尿样品),任选地可以进行预处理(例如,作为商业平台上方案的部分)。
[0595] 预处理试剂可以是适宜与本发明的免疫测定法和试剂盒一起使用的任何试剂。预处理任选地包含:(a)一种或多种溶剂(例如,甲醇和乙二醇)及任选地盐,(b)一种或多种溶剂和盐及任选地去垢剂,(c)去垢剂或(d)去垢剂和盐。预处理试剂是本领域已知的,并且这种预处理例如可以如用于Abbott TDx、 和 分析仪上的测定法那样,如文献中所述(见,例如,Yatscoff等人,″Abbott TDx Monoclonal Antibody Assay Evaluated for Measuring Cyclosporine inWhole Blood(针对测量全血中环孢菌素所评估的Abbott TDx单克隆抗体测定法),″Clin.Chem.,36:1969-1973(1990);和Wallemacq等人,″Evaluation of the NewAxSYM Cyclosporine Assay:Comparison with TDx 
Monoclonal Whole Blood andEMIT Cyclosporine Assays(评价新AxSYM环孢菌素测定法:
与TDx单克隆全血和EMIT环孢菌素测定法比较),″Clin.Chem.,45:432-435(1999))和/或如可商业获得那样使用。另外,预处理可以如Abbott的美国专利号5,135,875;欧洲公开号EP 
0,471,293;PCT公开号WO 2008/082984;和美国公开号2008/0020401中所述那样进行(其关于预处理的教导通过引用的方式完整并入)。预处理试剂可以是多相试剂或均相试剂。
[0596] 使用多相预处理试剂时,预处理试剂使样品中存在的分析物结合蛋白(例如,可以与分析物或其片段结合的蛋白质)沉淀。这种预处理步骤包括通过将因添加预处理剂至样品而形成的混合物的上清液与沉淀的分析物结合蛋白分开而移出任何分析物结合蛋白。在这种测定法中,不存在任何结合蛋白的混合物的上清液用于测定法中,直接进行至抗体捕获步骤。
[0597] 使用均相预处理试剂,不存在这个分离步骤。测试样品和预处理试剂的整个混合物与针对分析物(或其片段)的标记的特异性结合伴侣(如标记的抗分析物抗体(或其抗原反应性片段))接触。针对这种测定法所用的预处理试剂一般在由第一特异性结合伴侣捕获之前或在此期间,在预处理的测试样品混合物中稀释。尽管进行这种稀释,一定量的预处理试剂在捕获期间仍存在(或留在)于测试样品混合物中。根据本发明,示例性的标记的特异性结合伴侣可以是DVD-Ig(或其片段、变体或变体片段)。
[0598] 在多相形式下,从受试者获得测试样品后,准备好第一混合物。这种混合物含有评估分析物(或其片段)和第一特异性结合伴侣的测试样品,其中测试样品中所述含的第一特异性结合伴侣和任何分析物形成第一特异性结合伴侣-分析物复合物。优选地,第一特异性结合伴侣是抗分析物抗体或其片段。第一特异性结合伴侣可以是如本文所述的DVD-Ig(或其片段、变体或变体片段)。添加测试样品和第一特异性结合伴侣以形成混合物的顺序不是关键的。优选地,第一特异性结合伴侣固定在固相上。免疫测定法中所用的固相(用于第一特异性结合伴侣和任选地,第二特异性结合伴侣)可以是本领域已知的任何固相,如,但不限于、磁性粒子、珠、试管、微量滴定平板、小杯、膜、支架分子、薄膜滤纸、盘和芯片。
[0599] 在含有第一特异性结合伴侣-分析物复合物的混合物形成后,使用本领域已知的任何技术从复合物中移去任何未结合的分析物。例如,可以通过洗涤移去未结合的分析物。然而,希望地,第一特异性结合伴侣相对于测试样品中存在的任何分析物过量地存在,从而测试样品中存在的全部分析物均被第一特异性结合伴侣结合。
[0600] 在移去任何未结合的分析物后,将第二特异性结合伴侣添加至混合物以形成第一特异性结合伴侣-分析物-第二特异性结合伴侣复合物。第二特异性结合伴侣优选地是与分析物上的表位结合的抗分析物抗体,所述表位与分析物上由第一特异性结合伴侣结合的表位不同。另外,还优选地,第二特异性结合伴侣用如上文所述的可检测标记物标记或含有该标记物。第二特异性结合伴侣可以是如本文所述的DVD-Ig(或其片段、变体或变体片段)。
[0601] 可以使用如本领域已知的任何适合的可检测标记物。例如,可检测标记物可以是放射性标记物(如3H、125I、35S、14C、32P和33P)、酶标记物(如辣根过氧化物酶、碱性过氧化物酶、葡萄糖6-磷酸脱氢酶等)、化学发光标记物(如吖啶酯、硫酯或磺酰胺;鲁米诺、异鲁米诺、菲啶鎓酯等)、荧光标记物(如荧光素(例如,5-荧光素、6-羧基荧光素、3’6-羧基荧光素、5(6)-羧基荧光素、6-六氯-荧光素、6-四氯荧光素、异硫氰酸荧光素等))、罗丹明、藻胆蛋白、R-藻红蛋白、量子点(例如,硫化锌加帽的硒化镉)、量热标记物或免疫聚合酶链反应标记物。在Polak和VanNoorden,Introduction to Immunocytochemistry,第2版,Springer Verlag,N.Y.(1997)和在Haugland,Handbook of Fluorescent Probes and Research Chemicals(1996)(其是Molecular Probes,Inc.,Eugene,Oregon出版的联合手册和目录)中存在标记物、标记方法和标记物的检测的介绍。荧光标记物可以用于FPIA中(见,例如,美国专利号5,593,896;5,573,904;5,496,925;5,359,093和5,352,803)。吖啶化合物可以用作均相或多相化学发光测定法中的可检测标记物(见,例如,Adamczyk等人,
Bioorg.Med.Chem.Lett.,16:1324-1328(2006);Adamczyk等人,Bioorg.Med.Chem.Lett.,
14:2313-2317(2004);Adamczyk等人,Biorg.Med.Chem.Lett.,14:3917-3921(2004);和Adamczyk等人,Org.Lett.,5:3779-3782(2003))。
[0602] 示例性吖啶化合物是吖啶-9-甲酰胺。用于制备吖啶9-甲酰胺的方法在Mattingly,J.Biolumin.Chemilumin.,6:107-114(1991);Adamczyk等人,J.Org.Chem.,63:
5636-5639(1998);Adamczyk等人,Tetrahedron,55:10899-10914(1999);Adamczyk等人,Org.Lett.,1:779-781(1999);Adamczyk等人,Bioconjugate Chem.,11:714-724(2000);
Adamczyk和Mattingly,引自Luminescence Biotechnology:Instruments and 
Applications;(Dyke,K.V.编著)(CRC Press:Boca Raton,2002)第77-105页;Adamczyk等人,Org.Lett.,5:3779-3782(2003);和美国专利号5,468,646,5,543,524和5,783,699中描述。另一个优选的吖啶化合物是吖啶-9-羧酸芳酯。吖啶-9-羧酸芳酯的实例是10-甲基-9-(苯氧羰基)吖啶氟代磺酸酯(从Cayman Chemical,Ann Arbor,Michigan可获得)。用于制备吖啶9-羧酸芳酯的方法在McCapra等人,Photochem.Photobiol.,4:1111-21(1965);Razavi等人,Luminescence,15:245-249(2000);Razavi等人,Luminescence,15:239-244(2000);
和美国专利号5,241,070中描述。关于吖啶-9-羧酸芳酯及其用途的其他细节在美国公开号
2008/0248493中描述。
[0603] 化学发光测定法(例如,使用如上文所述的吖啶或其他化学发光剂)可以根据Adamczyk等人,Anal.Chim.Acta,579(1):61-67(2006)中所述的方法进行。尽管可以使用任何适合的测定法形式,微量平板化学发光计(Mithras LB-940,BertholdTechnologies USA.,LLC,Oak Ridge,Tennessee)能够快速分析多个小体积样品。
[0604] 添加测试样品和特异性结合伴侣以形成用于化学发光测定法的混合物的顺序不是关键的。如果第一特异性结合伴侣是用化学发光剂(如吖啶化合物)以可检测方式标记,则可检测标记的第一特异性结合伴侣-分析物复合物形成。可选地,如果使用第二特异性结合伴侣并且第二特异性结合伴侣是用化学发光剂(如吖啶化合物)以可检测方式标记,则可检测标记的第一特异性结合伴侣-分析物-第二特异性结合伴侣复合物形成。使用本领域已知的任何技术(如洗涤)可从混合物中移去任何未结合的特异性结合伴侣,无论经标记或未标记。
[0605] 可以在添加上述吖啶化合物之前、与其同时或在其后,在混合物中原位产生过氧化氢或将其提供或供应至混合物(例如,过氧化氢源是已知含有过氧化氢的一种或多种缓冲液或其他溶液)。过氧化氢可以按本领域技术人员将显而易见的众多方式原位产生。
[0606] 当同时或随后添加至少一个碱性溶液至样品后,生成了指示分析物存在的可检测信号,即,化学发光信号。碱性溶液含有至少一种碱并且具有大于或等于10、优选地大于或等于12的pH。碱性溶液的实例包含但不限于氢氧化钠、氢氧化钾、氢氧化钙氢氧化铵、氢氧化镁、碳酸钠、碳酸氢钠、氢氧化钙、碳酸钙和重碳酸钙。添加至样品的碱性溶液的量取决于碱性溶液的浓度。基于所用碱性溶液的浓度,本领域技术人员可以容易地确定待添加至样品的碱性溶液的量。
[0607] 可以使用本领域技术人员已知的常规技术检测生成的化学发光信号。基于所生成信号的强度,可以将样品中分析物的量定量。具体而言,样品中分析物的量与生成的信号的强度成正比。可以通过将生成的光的量与分析物的标准曲线比较或通过与参比标准物比较,将存在的分析物的量定量。可以使用分析物浓度已知的系列稀释物或溶液,通过质谱法、重量分析方法和本领域已知的其他技术生成标准曲线。尽管上文重点描述了使用吖啶化合物作为化学发光剂,但是本领域的普通技术人员可以轻易地改变这种描述以便使用其他化学发光剂。
[0608] 分析物免疫测定法通常可以使用本领域已知的任何形式(如,但不限于夹心形式)实施。具体而言,在一种免疫测定形式下,至少两种抗体用来分离并定量样品中的分析物,如人类分析物或其片段。更具体地,所述至少两种抗体与分析物(或其片段)上的不同表位结合,从而形成免疫复合物,这称作“夹心”。通常,在这些免疫测定法中,一种或多种抗体可以用来捕获测试样品中的分析物(或其片段)(经常将这些抗体称作“捕获”抗体或多种“捕获”抗体),并且一种或多种抗体可以用来将可检测(即,可定量)的标记物结合于夹心(经常将这些抗体称作“检测抗体”抗体、多种“检测抗体”抗体、“缀合物”或多种“缀合物”)。因此,在夹心免疫测定形式的情况下,可以使用如本文所述的DVD-Ig(或其片段、变体或变体片段)作为捕获抗体、检测抗体或这两者。例如,可以使用一种具有可以结合分析物(或其片段)上第一表位的结构域的DVD-Ig作为捕获抗体,和/或可以使用另一种具有可以结合分析物(或其片段)上第二表位的结构域的DVD-Ig作为检测抗体。就此方面而言,可以使用具有第一结构域和第二结构域的DVD-Ig作为捕获抗体和/或检测抗体,其中所述第一结构域可以结合分析物(或其片段)上的第一表位,所述第二结构域可以结合分析物(或其片段)上的第二表位。可选地,可以使用具有第一结构域和第二结构域的DVD-Ig作为捕获抗体和/或检测抗体以检测和任选地定量两种或更多种分析物,其中所述第一结构域可以结合第一分析物(或其片段)上的表位,所述第二结构域可以结合第二分析物(或其片段)上的表位。在分析物可以于样品中以多于一种形式(如单体形式和二聚/多聚形式(其可以是同聚或异聚的))存在的情况下,可以使用一种DVD-Ig(其具有可以结合仅在单体形式上暴露的表位的结构域)和另一种DVD-Ig(其具有可以结合二聚/多聚形式的不同部分上的表位的结构域)作为捕获抗体和/或检测抗体,从而能检测和任选地量化不同形式的给定分析物。另外,使用在单个DVD-Ig内部和/或在DVD-Ig之间具有不同亲和力的DVD-Ig可以提供亲合力优势。在如本文所述的免疫测定法的背景下,在DVD-Ig的结构内部并入一个或多个接头通常可以是有帮助或需要的。当存在时,接头最好应当具有足够的长度和结构灵活性以能够通过内部结构域结合某个表位以及通过外部结构域结合另一个表位。就此方面而言,如果DVD-Ig可以结合两种不同的分析物并且一种分析物大于另一种分析物,希望较大分析物由外部结构域结合。
[0609] 通常而言,可以将正在测试(例如,疑似含有)IL-1β蛋白(或其片段)的样品与至少一种捕获抗体(或多种捕获抗体)和至少一种检测抗体(其可以是第二检测抗体或第三检测抗体或甚至依次编号的抗体,例如,在其中捕获和/或检测抗体包括多种抗体的情况下)同时或依次地并且以任何顺序接触。例如,测试样品可以首先与至少一种捕获抗体接触并随后(依次)与至少一种检测抗体接触。可选地,测试样品可以首先与至少一种检测抗体接触并随后(依次)与至少一种捕获抗体接触。在又一个替代形式中,测试样品可以与捕获抗体和检测抗体同时接触。
[0610] 在夹心测定法形式中,疑似含有IL-1β(或其片段)的样品首先与至少一种第一捕获结合蛋白(例如,IL-1β抗体)在允许形成第一结合蛋白/IL-1β复合物的条件下接触。如果使用多于一种捕获结合蛋白,形成了包含两种或更多种捕获结合蛋白的第一捕获结合蛋白/IL-1β复合物。在夹心测定法中,结合蛋白,即,优选地,至少一种捕获结合蛋白以相对于测试样品中预期的IL-1β分析物(或其片段)的最大量而言摩尔过量的量使用。例如,可以使用每mL缓冲液(例如,微粒子包被缓冲液)约5μg至约1mg的抗体。
[0611] 竞争性抑制免疫测定法,其因为要求仅由一种抗体结合而经常用来测量小分析物,包括依次形式和经典形式。在依次竞争性抑制免疫测定法中,将针对IL-1β的捕获结合蛋白包被到微量滴定平板的孔或其他固相支持物上。当添加含有IL-1β的样品至孔时,IL-1β与捕获结合蛋白结合。在洗涤后,将已知量的标记(例如,生物素或辣根过氧化物酶(HRP))的IL-1β添加至这个孔。需要酶标记物的底物以生成信号。HRP的合适底物的实例是3,3′,5,5′-四甲基联苯胺(TMB)。在洗涤后,测量由标记的分析物生成的信号并且它反比于样品中IL-1β的量。在经典竞争性抑制免疫测定法中,将针对IL-1β的捕获结合蛋白包被到固相支持物(例如,微量滴定平板的孔)上。然而,不同于依次竞争性抑制免疫测定法,将样品和标记的IL-1β同时添加至孔。样品中的任何IL-1β同标记的IL-1β竞争与捕获结合蛋白的结合。
在洗涤后,测量由标记的IL-1β生成的信号并且它反比于样品中IL-1β的量。
[0612] 任选地,在使测试样品接触与至少一种捕获结合蛋白(例如,第一捕获抗体)之前,所述至少一种捕获结合蛋白可以与固相支持物结合,这促进第一结合蛋白/IL-1β(或其片段)复合物从测试样品中分离。捕获结合蛋白与之结合的底物可以是促进捕获抗体-分析物复合物从样品中分离的任何适合的固相支持物或固相。
[0613] 实例包括平板(如微量滴定平板)的孔、试管、多孔凝胶(例如,硅胶、琼脂糖、葡聚糖或明胶)、聚合物薄膜(例如,聚丙烯酰胺)、珠(例如,聚苯乙烯珠或磁珠)、滤纸/膜条(例如,硝酸纤维素或尼龙)、微粒子(例如,乳胶粒子、可磁化微粒子(例如,具有氧化铁或氧化铬芯和同聚或异聚物涂层且半径约1-10微米的微粒子)。底物可以包含合适的多孔材料,其具有结合抗原的合适表面亲和力和允许检测抗体通过的足够孔隙度。多微孔材料通常是优选的,但是可以使用处于水合状态的凝胶状材料。这类多孔底物优选地处于具有约0.01至约0.5mm、优选地约0.1mm厚度的片状形式。尽管孔径可以相当大地变动,但孔径优选地是约0.025至约15微米、更优选地约0.15至约15微米。这类底物的表面可以通过引起抗体与底物共价连接的化学过程活化。这导致抗原或抗体与底物的不可逆性结合(通常借助疏水力吸附);可选地,化学偶联剂或其他手段可以用来使抗体与底物共价结合,前提是这类结合不干扰抗体与分析物结合的能力。可选地,抗体可以与微粒子结合,所述微粒子事先已经用链霉亲和素(例如, 磁珠,Invitrogen,Carlsbad,California)或生物素(例如,使用
Power-BindTM-SA-MP链霉亲和素包被的微粒子(Seradyn,Indianapolis,Indiana))或抗物种特异性单克隆抗体包被。如果需要,可以使所述底物衍生以允许与抗体上多种官能团反应。这类衍生需要使用某些偶联剂,其实例包括但不限于马来酸酐、N-羟基琥珀酰亚胺和1-乙基-3-(3-二甲氨基丙基)碳二亚胺。如果需要,对分析物特异的一种或多种捕获试剂(如抗体(或其片段))可以各自与固相在不同的物理或可寻址位置连接(例如,如以生物芯片布局(见,例如,美国专利号6,225,047;PCT公开号WO 99/51773;美国专利号6,329,209;PCT公开号WO 00/56934;和美国专利号5,242,828)。如果捕获试剂与作为固相支持物的质谱探针连接,则可以通过激光解吸附电离质谱法检测与该探针结合的分析物的量。可选地,单根柱可以装填不同的珠,所述珠用一种或多种捕获试剂衍生,从而在单一位置内捕获分析物(见,基于抗体衍生化珠的技术,例如,Luminex的xMAP技术(Austin,Texas))。
[0614] 在测定分析物(或其片段)的测试样品与至少一种捕获抗体(例如,第一捕获抗体)接触后,将混合物孵育,以便允许第一抗体(或多种抗体)-分析物(或其片段)复合物的形成。孵育可以在约4.5至约10.0的pH、在约2℃至约45℃的温度和持续至少约一(1)分钟至约十八(18)小时、优选地约1分钟至约24分钟、最优选地约4分钟至约18分钟的时间来实施。本文所述的免疫测定法可以在一个步骤中(意指,将测试样品、至少一种捕获抗体和至少一种检测抗体全部依次或同时添加至反应容器)或在多于一个步骤,如2个步骤、3个步骤等中实施。
[0615] 在形成(第一或多种)捕获抗体/分析物(或其片段)复合物后,所述复合物随后与至少一种检测抗体在允许(第一或多种)捕获抗体/分析物(或其片段)/第二检测抗体复合物形成的条件下接触。尽管为了清晰而标称为“第二”抗体(例如,第二检测抗体),实际上,在多种抗体用于捕获和/或检测的情况下,所述至少一种检测抗体可以是免疫测定法中所用的第二、第三、第四等抗体。如果捕获抗体/分析物(或其片段)复合物与多于一种检测抗体接触,则形成(第一或多种)捕获抗体/分析物(或其片段)/(多种)检测抗体复合物。与捕获抗体(例如,第一捕获抗体)一样,当至少一种(例如,第二和任何后续)检测抗体与捕获抗体/分析物(或其片段)复合物接触时,需要在与上文所述那些条件相似的条件下的一段孵育时间以形成(第一或多种)捕获抗体/分析物(或其片段)/(第二或多种)检测抗体复合物。优选地,至少一种检测抗体含有可检测标记物。可检测标记物可以在形成(第一或多种)捕获抗体/分析物(或其片段)/(第二或多种)检测抗体复合物之前、与其同时或在其之后与至少一种检测抗体(例如,第二检测抗体)结合。可以使用本领域已知的任何可检测标记物(见上文讨论,包括参考文献Polak和Van Noorden(1997)和Haugland(1996))。
[0616] 可检测标记物可以直接或经偶联剂与抗体结合。可以使用的偶联剂的实例是EDAC(1-乙基-3-(3-二甲氨基丙基)碳二亚胺,盐酸盐),其是从Sigma-Aldrich,St.Louis,Missouri可商业获得的。可以使用的其他偶联剂是本领域已知的。用于使可检测标记物与抗体结合的方法是本领域已知的。另外,可以购买或合成已经含有端基的许多可检测标记物,所述端基促进可检测标记物与抗体偶联,如CPSP-吖啶酯(即,9-[N-对甲苯磺酰基-N-(3-羧丙基)]-10-(3-磺丙基)吖啶甲酰胺)或SPSP-吖啶酯(即,N10-(3-磺丙基)-N-(3-磺丙基)-吖啶-9-甲酰胺)。
[0617] (第一或多种)捕获抗体/分析物/(第二或多种)检测抗体复合物可以在标记物的定量之前从测试样品的剩余部分中分离出来,但是不必须如此。例如,如果至少一种捕获抗体(例如,第一捕获抗体)与固相支持物(如孔或珠)结合,可以通过移走(测试样品的)流体不与固相支持物接触而完成分离。可选地,如果至少第一捕获抗体与固相支持物结合,它可以与含有分析物的样品和至少一种第二检测抗体同时接触以形成第一(多种)抗体/分析物/第二(多种)抗体复合物,随后移走流体(测试样品)不与固相支持物接触。如果至少一种第一捕获抗体不与固相支持物结合,则不必从测试样品中移出(第一或多种)捕获抗体/分析物/(第二或多种)检测抗体复合物用于定量标记物的量。
[0618] 在标记的捕获抗体/分析物/检测抗体复合物(例如,第一捕获抗体/分析物/第二检测抗体复合物)形成后,使用本领域已知的技术定量复合物中标记物的量。例如,如果使用酶标记物,则标记的复合物与所述标记物的底物反应,所述标记物产生可定量反应如显色。如果标记物是放射性标记物,使用适宜的手段如闪烁计数器对标记物定量。如果标记物是荧光标记物,则通过用一种颜色的光(其称作“激发波长”)刺激所述标记物并且检测由标记物应答于所述刺激而发射的另一种颜色的光(其称作“发射波长”),将标记物定量。如果标记物是化学发光标记物,则通过目视方式或使用光度计、x射线胶片、高速照相胶片、CCD照相机等检测所发射的光,来定量标记物。一旦已经将复合物中标记物的量定量,通过适宜手段,如通过使用已经利用已知浓度的分析物或其片段的连续稀释物生成的标准曲线,确定测试样品中分析物或其片段的浓度。除使用分析物或其片段的连续稀释物之外,可以按重量分析方式、通过质谱法和通过本领域已知的其他技术生成标准曲线。
[0619] 在使用 分析仪的化学发光微粒子测定法中,缀合物稀释剂的pH应当是约6.0+/-0.2,微粒子包被缓冲液应当维持在约室温(即,在约17℃至约27℃),微粒子包被缓冲液的pH应当是约6.5+/-0.2并且微粒子稀释剂的pH应当是约7.8+/-0.2。固形物优选地少于约0.2%,如少于约0.15%、少于约0.14%、少于约0.13%、少于约0.12%或少于约
0.11%,如约0.10%。
[0620] FPIA基于竞争性结合免疫测定原理。受线性偏振光激发时,荧光标记的化合物将发射具有与其旋光率成反比的偏振度的荧光。当荧光标记的示踪剂-抗体复合物受线性偏振光激发时,发射光仍高度偏振,原因是在光吸收的时间和光发射的时间之间荧光团转动受约束。当“游离”示踪剂化合物(即,不与抗体结合的化合物)受线性偏振光激发时,其转动比竞争性结合免疫测定法中产生的相应示踪剂-抗体缀合物快得多。FPIA比RIA有利,在于不存在需要特殊处理和处置的放射性物质。此外,FPIA是可以容易和快速进行的均相测定法。
[0621] 考虑到以上情况,提供了一种确定测试样品中分析物(或其片段)的存在、量或浓度的方法。所述方法包括通过一种测定法测定测试样品的分析物(或其片段),其中所述测定法(i)使用(i‘)抗体、能与分析物结合的抗体片段、能与分析物结合的抗体变体、能与分析物结合的抗体变体的片段和能与分析物结合的DVD-Ig(或其片段、变体或变体片段)中的至少一种和(ii’)至少一种可检测标记物并且(ii)包括将可检测标记物所生成的作为分析物(或其片段)在测试样品中的存在、量或浓度的直接或间接指示的信号与在对照或校准物中所生成的作为分析物(或其片段)的存在、量或浓度的直接或间接指示的信号比较。校准物任选地是一系列校准物的部分,其中每种校准物因分析物的浓度不同于其他校准物。
[0622] 所述方法可以包括(i)使测试样品与针对分析物(或其片段)的至少一种第一特异性结合伴侣接触,所述的第一特异性结合伴侣选自抗体、能与分析物结合的抗体片段、能与分析物结合的抗体变体、能与分析物结合的抗体变体的片段和能与分析物结合的DVD-Ig(或其片段、变体或变体片段),从而形成第一特异性结合伴侣/分析物(或其片段)复合物,(ii)使第一特异性结合伴侣/分析物(或其片段)复合物与针对分析物(或其片段)的至少一种第二特异性结合伴侣接触,所述的第二特异性结合伴侣选自可检测标记的抗分析物抗体、可以与分析物结合的抗分析物抗体的可检测标记片段、可以与分析物结合的抗分析物抗体的可检测标记变体、可以与分析物结合的抗分析物抗体变体的可检测标记片段和可检测标记的DVD-Ig(或其片段、变体或变体片段),从而形成第一特异性结合伴侣/分析物(或其片段)/第二特异性结合伴侣复合物,和(iii)通过检测或测量由(ii)中形成的第一特异性结合伴侣/分析物(或其片段)/第二特异性结合伴侣复合物中的可检测标记物生成的信号,确定测试样品中分析物的存在、量或浓度。可以优选其中针对分析物(或其片段)的至少一种第一特异性结合伴侣和/或针对分析物(或其片段)的至少一种第二特异性结合伴侣是如本文所述的DVD-Ig(或其片段、变体或变体片段)的方法。
[0623] 可选地,所述方法可以包括:使测试样品与针对IL-1β分析物(或其片段)的至少一种第一特异性结合伴侣接触,所述的第一特异性结合伴侣选自抗体、可以与分析物结合的抗体片段、可以与分析物结合的抗体变体、可以与分析物结合的抗体变体的片段和DVD-Ig(或其片段、变体或变体片段),并且以任何顺序,同时或依次使测试样品与至少一种第二特异性结合伴侣接触,所述第二特异性结合伴侣可以与分析物(或其片段)竞争结合至少一种第一特异性结合伴侣并且选自可检测标记的分析物、可以与第一特异性结合伴侣结合的可检测标记的分析物片段、可以与第一特异性结合伴侣结合的可检测标记的分析物变体和可以与第一特异性结合伴侣结合的可检测标记的分析物变体片段。测试样品中存在的任何IL-1β(或其片段)和至少一种第二特异性结合伴侣彼此竞争以分别形成第一特异性结合伴侣/分析物(或其片段)复合物和第一特异性结合伴侣/第二特异性结合伴侣复合物。所述方法还包括:通过检测或测量由(ii)中形成的第一特异性结合伴侣/第二特异性结合伴侣复合物中的可检测标记物生成的信号,确定测试样品中分析物在的存在、量或浓度,其中由第一特异性结合伴侣/第二特异性结合伴侣复合物中的可检测标记物生成的信号与测试样品中分析物的量或浓度成反比。
[0624] 以上方法可以还包括诊断、预测或评估从中获得测试样品的患者的治疗性/预防性疗法的功效。如果所述方法还包括评估从中获得测试样品的患者的治疗性/预防性疗法的功效,则所述方法任选地还包括按照需要调整患者的治疗性/预防性疗法以改善功效。可以修改所述方法用于自动化系统或半自动化系统中。
[0625] 就测定方法(和用于该方法的试剂盒)而言,可以使用市售抗分析物抗体或如文献中所述的用于产生抗分析物抗体的方法。多种抗体的商业供应包括但不限于Santa Cruz Biotechnology Inc.(Santa Cruz,California),GenWay Biotech,Inc.(SanDiego,California)和R&D Systems(RDS;Minneapolis,Minnesota)。
[0626] 通常,预定的水平可以作为评估结果的基准用于例如检测疾病或疾病风险,其中所述结果在测定测试样品的分析物或其片段时获得。通常,在进行这种比较时,通过在适宜条件下进行足够次数的特定测定法获得预定的水平,从而可以作出分析物存在、量或浓度与疾病、病症或病状的特定阶段或终点或与特定临床指标的关联或联系。一般而言,用参考受试者(或受试者群体)的测定获得预定的水平。测量的分析物可以包括其片段、其降解产物和/或其酶切割产物。
[0627] 具体而言,相对于用作监测病情进展和/或治疗的预定水平,分析物或其片段的量或浓度可以是“未改变的”、“有利的”、(或“有利改变的”)或“不利的”(或“不利改变的”)。“升高的”或“增加的”指测试样品中高于常见或正常水平或范围(例如,预定水平)或高于另一个参考水平或范围(例如,早期或基线样品)的量或浓度。术语“降低的”或“缩减的”指测试样品中低于常见或正常水平或范围(例如,预定水平)或低于另一个参考水平或范围(例如,早期或基线样品)的量或浓度。术语“改变的”指样品中相对于常见或正常水平或范围(例如,预定水平)或相对于另一个参考水平或范围(例如,早期或基线样品)改变(增加或减少)的量或浓度。
[0628] 分析物的常见或正常水平或范围根据标准实践定义。因为分析物的水平在一些情况下将非常低,所以当与常见或正常水平或范围或参考水平或范围相比存在不能由实验误差或样品变化解释的任何净变化时,可以认为所谓改变的水平或改变已经发生。因此,特定样品中所测量的水平将与来自所谓正常受试者的相似样品中所测定的水平或水平范围比较。在这种情况下,“正常受试者”例如是不存在可检测疾病的个体,并且“正常”(有时称作“对照”)患者或群体例如分别是不显示可检测疾病的一位或一群。另外,鉴于分析物并不在大部分人群体中以高水平常规地存在,可以认为“正常受试者”是不存在明显可检测的增加或升高量或浓度的分析物的个体并且“正常”(有时称作“对照”)患者或群体是不显示明显可检测的增加或升高量或浓度的分析物的那一种。“表观正常的受试者”是其中分析物仍未评估或正在评估的一位受试者。当分析物正常检测不到(例如,正常水平是零或处于约25%至约75%的正常群体范围内),但是在测试样中检测到时以及当分析物在测试样品中以高于正常的水平存在时,将分析物的水平称作“升高”。因此,尤其,本公开提供一种筛查患有特定疾病、病症或病状或存在患有特定疾病、病症或病状的风险的受试者的方法。测定方法也可以包括对其他标记等的测定。
[0629] 因而,本文所述的方法也可以用来确定受试者是否患有给定疾病、病症或病状或存在形成给定疾病、病症或病状的风险。具体而言,所述方法可以包括步骤:
[0630] (a)确定来自受试者的测试样品中IL-1β(或其片段)的浓度或量(例如,使用本文所述的方法或本领域已知的方法);和
[0631] (b)将步骤(a)中所确定的IL-1β(或其片段)的浓度或量与预定水平比较,其中,如果步骤(a)中所确定的分析物的浓度或量相对于预定水平是有利的,则确定这位受试者未患有给定疾病、病症或病状或不存在患有给定疾病、病症或病状的风险。然而,如果步骤(a)中所确定的分析物的浓度或量相对于预定水平是不利的,则确定这位受试者患有给定疾病、病症或病状或存在患有给定疾病、病症或病状的风险。
[0632] 另外,本文中提供在受试者中监测疾病进展的的方法。所述方法最佳地包括步骤:
[0633] (a)确定来自受试者的测试样品中IL-1β的浓度或量;
[0634] (b)确定来自这位受试者的稍后测试样品中IL-1β的浓度或量;并且
[0635] (c)将如步骤(b)中所确定的分析物的浓度或量与步骤(a)中所确定的IL-1β的浓度或量比较,其中如果与步骤(a)中所确定的IL-1β的浓度或量相比时,步骤(b)中所确定的浓度或量是未改变或不利的,则确定受试者中的疾病延续、进展或恶化。通过比较,如果与如步骤(a)中所确定的IL-1β的浓度或量相比时,如步骤(b)中所确定的IL-1β的浓度或量是有利的,则确定受试者中的疾病中断、退行或改善。
[0636] 任选地,该方法还包括将如步骤(b)中所确定的IL-1β分析物的浓度或量例如与预定的水平比较。另外,任选地,如果比较显示如步骤(b)中所确定的分析物的浓度或量例如相对于预定水平不利地改变,则所述方法包括用一种或多种药物组合物治疗受试者一段时间。
[0637] 再者,所述方法可以用来监测在接受一种或多种药物组合物治疗的的受试者中的治疗。具体而言,这类方法包括在受试者已经施用一种或多种药物组合物之前提供来自受试者的第一测试样品。接下来,确定来自受试者的第一测试样品中IL-1β的浓度或量(例如,使用本文所述或如本领域已知的方法)。在确定IL-1β的浓度或量后,任选地,随后将IL-1β的浓度或量与预定的水平比较。如果如第一测试样品中所确定的IL-1β的浓度或量低于预定的水平,则这位受试者不用一种或多种药物组合物治疗。然而,如果如第一测试样品中所确定的IL-1β的浓度或量高于预定的水平,则这位受试者用一种或多种药物组合物治疗一段时间。受试者用一种或多种药物组合物治疗的时间段可以由本领域技术人员决定(例如,这个时间段可以是约七(7)日至约2年,优选地约十四(14)日至约一(1)年)。
[0638] 在用一种或多种药物组合物治疗期间,随后从这位受试者获得第二和后续测试样品。测试样品的数目和其中从受试者获得所述测试样品的时间不是关键的。例如,第二测试样品可以在受试者首次施用一种或多种药物组合物后七(7)日获得,第三测试样品可以在受试者首次施用一种或多种药物组合物后两(2)周获得,第四测试样品可以在受试者首次施用一种或多种药物组合物后三(3)周获得,第五测试样品可以在受试者首次施用一种或多种药物组合物后四(4)周获得等。
[0639] 在每次从受试者获得第二或后续测试样品后,确定第二或后续测试样品中IL-1β分析物的浓度或量(例如,使用本文所述或如本领域已知的方法)。随后如第二和后续测试样品的每份中所确定的IL-1β的浓度或量与如第一测试样品(例如,最初任选地与预定水平比较的测试样品)中所确定的分析物的浓度或量比较。如果与如步骤(a)中所确定的分析物的浓度或量相比时,如步骤(c)中所确定的IL-1β的浓度或量是有利的,则确定受试者中的疾病中断、退行或改善,并且受试者应当继续施用步骤(b)的一种或多种药物组合物。然而,如果与如步骤(a)中所确定的分析物的浓度或量相比时,步骤(c)中所确定的浓度或量是未改变或不利的,则确定受试者中的疾病延续、进展或恶化,并且受试者应当用更高浓度的在步骤(b)中施用至受试者的一种或多种药物组合物治疗或受试者应当用与步骤(b)中施用至受试者的一种或多种药物组合物不同的一种或多种药物组合物治疗。具体而言,受试者可以用一种或多种药物组合物治疗,所述一种或多种药物组合物与受试者先前已经接受以便减小或降低此受试者中分析物水平的一种或多种药物组合物不同。
[0640] 通常,对于其中可以进行重复检验(例如,监测病情进展和/或治疗反应)的测定法,第二或后续测试样品在已经从受试者获得第一测试样品后的一段时间处获得。具体而言,来自受试者的第二测试样品可以在已经从受试者获得第一测试样品后数分钟、数小时、数日、数周或数年获得。例如,第二测试样品可以在从受试者获得第一测试样品后约1分钟、约5分钟、约10分钟、约15分钟、约30分钟、约45分钟、约60分钟、约2小时、约3小时、约4小时、约5小时、约6小时、约7小时、约8小时、约9小时、约10小时、约11小时、约12小时、约13小时、约14小时、约15小时、约16小时、约17小时、约18小时、约19小时、约20小时、约21小时、约22小时、约23小时、约24小时、约2日、约3日、约4日、约5日、约6日、约7日、约2周、约3周、约4周、约5周、约6周、约7周、约8周、约9周、约10周、约11周、约12周、约13周、约14周、约15周、约16周、约17周、约18周、约19周、约20周、约21周、约22周、约23周、约24周、约25周、约26周、约27周、约28周、约29周、约30周、约31周、约32周、约33周、约34周、约35周、约36周、约37周、约38周、约39周、约40周、约41周、约42周、约43周、约44周、约45周、约46周、约47周、约48周、约49周、约50周、约51周、约52周、约1.5年、约2年、约2.5年、约3.0年、约3.5年、约4.0年、约4.5年、约5.0年、约5.5.年、约6.0年、约6.5年、约7.0年、约7.5年、约8.0年、约8.5年、约9.0年、约9.5年或约10.0年的时间从受试者获得。
[0641] 当用来监测病情进展时,上述测定法可以用来监测患有急性病状的受试者中疾病的进展。急性病状,也称作危重护理病状,指急性、致命性疾病或涉及例如心血管系统或排泄系统的其他危重医学病状。通常,危重护理病状指需要在基于医院的环境(包括但不限于急诊室、重症监护单元、创伤中心或其他急诊护理环境)中或由急救医士或其他基于专业领域的医护人员施用的急性医学介入的那些病状。对于危重护理病状,重复监测通常在较短的时间框,即,数分钟、数小时或数日(例如,约1分钟、约5分钟、约10分钟、约15分钟、约30分钟、约45分钟、约60分钟、约2小时、约3小时、约4小时、约5小时、约6小时、约7小时、约8小时、约9小时、约10小时、约11小时、约12小时、约13小时、约14小时、约15小时、约16小时、约17小时、约18小时、约19小时、约20小时、约21小时、约22小时、约23小时、约24小时、约2日、约3日、约4日、约5日、约6日或约7日)内进行,并且初始测定同样通常在较短的时间框内进行,例如,疾病或病状发作的约数分钟、数小时或数日。
[0642] 所述测定法也可以用来监测患有慢性或非急性病状的受试者中疾病的进展。非危重护理病状或非急性病状指除急性致命性疾病或涉及例如心血管系统和/或排泄系统的其他危重医学病状之外的病状。通常,非急性病状包括较长期或慢性持续期的那些病状。对于非急性状况,重复监测通常以较长的时间框,例如,数小时、数日、数周、数月或数年(例如,约1小时、约2小时、约3小时、约4小时、约5小时、约6小时、约7小时、约8小时、约9小时、约10小时、约11小时、约12小时、约13小时、约14小时、约15小时、约16小时、约17小时、约18小时、约19小时、约20小时、约21小时、约22小时、约23小时、约24小时、约2日、约3日、约4日、约5日、约6日、约7日、约2周、约3周、约4周、约5周、约6周、约7周、约8周、约9周、约10周、约11周、约12周、约13周、约14周、约15周、约16周、约17周、约18周、约19周、约20周、约21周、约22周、约23周、约24周、约25周、约26周、约27周、约28周、约29周、约30周、约31周、约32周、约33周、约34周、约35周、约36周、约37周、约38周、约39周、约40周、约41周、约42周、约43周、约44周、约45周、约46周、约47周、约48周、约49周、约50周、约51周、约52周、约1.5年、约2年、约2.5年、约3.0年、约3.5年、约4.0年、约4.5年、约5.0年、约5.5.年、约6.0年、约6.5年、约7.0年、约7.5年、约8.0年、约8.5年、约9.0年、约9.5年或约10.0年)进行,并且初始测定同样通常在较长的时间框内进行,例如,疾病或病状发作的约数小时、数日、数月或数年。
[0643] 另外,以上测定可以使用从受试者获得的第一测试样品进行,其中所述第一测试样品从一个来源(如尿、血清或血浆)获得。任选地,以上测定可以随后使用从受试者获得的第二测试样品重复,其中所述第二测试样品从另一个来源获得。例如,如果第一测试样品从尿获得,则第二测试样品可以从血清或血浆获得。可以比较从使用第一测试样品和第二测试样品的测定所获得的结果。这种比较可以用来评估受试者中疾病或病状的状态。
[0644] 另外,本公开也涉及确定倾向于患有或患有给定疾病、病症或病状的受试者是否将从治疗中获益的方法。具体而言,本公开涉及分析物伴侣诊断方法和产物。因此,如本文所述的“在受试者中监测疾病治疗”的方法进一步最佳地也可以包括选择或鉴定疗法候选者。
[0645] 因此,在特定的实施方案中,本公开还提供一种确定患有给定疾病、病症或病状或存在这种风险的受试者是否为疗法候选者的方法。通常,这种受试者是这样一位受试者,其已经经受到给定疾病、病症或病状的一些症状或已经实际上被诊断为患有给定疾病、病症或病状或存在这种风险和/或显示出如本文所述的分析物或其片段的不利浓度或量。
[0646] 所述方法任选地包括如本文所述的测定法,其中在用一种或多种药物组合物(例如,特别用与涉及分析物的作用机制相关的药物)、用免疫抑制疗法或通过免疫吸附疗法治疗受试者之前和之后评估IL-1β,或其中在这类治疗后评估分析物并且将分析物的浓度或量与预定的水平比较。在治疗后观察到的IL-1β的不利浓度或量证实受试者将不从接受进一步或继续治疗中受益,而在治疗后观察到的分析物的有利浓度或量证实受试者将从接受进一步或继续治疗中受益。这种证实有助于临床研究的管理和提供改善的患者护理。
[0647] 不用说,尽管本文中的某些实施方案在用于如本文中所讨论那样评估给定的疾病、病症或病状时是有利的,但是所述测定和试剂盒可以用来评估其他疾病、病症和病状中的分析物。测定方法也可以包括对其他标记等的测定。
[0648] 测定方法也可以用来鉴定改善给定疾病、病症或病状的化合物。例如,表达分析物的细胞可以与候选化合物接触。使用本文所述的测定方法,可以将与化合物接触的细胞中分析物的表达水平与对照细胞中分析物的表达水平比较。
[0649] II.试剂盒
[0650] 还提供一种用于测试样品中测定测试样品的分析物(或其片段)的存在、量或浓度的试剂盒。所述试剂盒包含用于对测试样品测定IL-1β(或其片段)的至少一种组分和用于对测试样品测定所述分析物(或其片段)的说明书。用于对测试样品测定所述分析物(或其片段)的至少一种组分可以包括组合物,其包含如本文所述并且任选地固定在固相上的抗IL-1β结合蛋白,如单克隆抗体或DVD-Ig(或其片段、变体或变体片段)。
[0651] 所述试剂盒可包含通过免疫测定法(例如化学发光微粒子免疫测定法)用于测定测试样品的IL-1β分析物的至少一种组分和通过免疫测定法(例如化学发光微粒子免疫测定法)用于测定测试样品的IL-1β分析物的说明书。例如,所述试剂盒可以包含针对IL-1β的至少一特异性结合伴侣,如抗IL-1β单克隆/多克隆抗体(或其可以与IL-1β分析物结合的片段、其可以与所述分析物结合的变体或其可以与所述分析物结合的变体片段)或者抗IL-1β DVD-Ig(或其片段、变体或变体片段),可以可检测地标记其中任一种。可选或额外地,所述试剂盒可以包含可检测标记的IL-1β分析物(或其可以与抗分析物单克隆/多克隆抗体或抗分析物DVD-Ig(或其片段、变体或变体片段)结合的片段),所述IL-1β分析物可以与测试样品中的任何分析物竞争结合抗分析物单克隆/多克隆抗体(或其可以与所述分析物结合的片段、其可以与所述分析物结合的变体或其可以与所述分析物结合的变体片段)或者抗分析物DVD-Ig(或其片段、变体或变体片段),所述抗体的任一种可以固定在固相支持物上。所述试剂盒可以包含校准物或对照物,例如,分离或纯化的分析物。所述试剂盒可以包含用于实施测定法的至少一个容器(例如,管、微量滴定平板或板条,其可以例如已经用第一特异性结合伴侣包被)和/或缓冲液(如测定缓冲液或洗涤缓冲液,二者中任一种可以作为浓缩溶液提供)、可检测标记物(例如,酶标记物)的底物溶液或终止溶液。优选地,试剂盒包含实施测定法必需的全部组分,即,试剂、标准物、缓冲液、稀释剂等。说明书可以为纸形式或计算机可读取形式,如磁盘、CD、DVD等。
[0652] 任何结合蛋白,如抗IL-1β结合蛋白或抗分析物DVD-Ig或示踪剂可以并入如本文所述的可检测标记物,如荧光团、放射性部分、酶、生物素/亲和素标记物、发色团、化学发光标记物等,或所述试剂盒可以包括用于实施可检测标记的试剂。抗体、校准物和/或对照可以在独立容器中提供或预分配成适宜测定形式,例如,预分配入微量滴定平板中。
[0653] 任选地,试剂盒包括质量控制组分(例如,灵敏度套件、校准物和阳性对照)。质量控制试剂的制备是本领域熟知的并且在多种免疫诊断产品的插页上描述。灵敏度套件成员任选地用来建立测定法性能特征并且进一步任选地是免疫测定试剂盒试剂完整性和测定法标准化的有用指示剂。
[0654] 试剂盒也可以任选地包括实施诊断测定法或促进质量控制评价所要求的其他试剂,如缓冲液、盐、酶、酶辅因子、酶底物、检测试剂等。也可以在试剂盒中包含其他组分,如用于分离和/或处理测试样品(例如,预处理试剂)的缓冲液和溶液。试剂盒可以额外地包含一种或多种其他对照。试剂盒的一种或多种组分可以是冻干的,在这种情况下,试剂盒还可以包含适于重构冻干组分的试剂。
[0655] 如需要,试剂盒的多种组分任选地在合适容器(例如,微量滴定平板)中提供。试剂盒可以进一步包括用于容纳或储存样品的容器(例如,用于尿样品的容器或筒)。如果适宜,试剂盒任选地还可以含有反应容器、混合容器和促进试剂或测试样品制备的其他组分。试剂盒也可以包含用于辅助获得测试样品的一个或多个工具,如注射器、吸管、钳、量勺等。
[0656] 如果可检测标记物是至少一种吖啶化合物,则试剂盒可以包含至少一种吖啶-9-甲酰胺、至少一种吖啶-9-羧酸芳酯或其任何组合。如果可检测标记物是至少一种吖啶化合物,则试剂盒还可以包含过氧化氢源,如缓冲液、溶液和/或至少一种碱性溶液。如果需要,试剂盒可以含有固相,如磁性粒子、珠、试管、微量滴定平板、小杯、膜、支架分子、薄膜、滤纸、盘或芯片。
[0657] III.试剂盒和方法的修改
[0658] 可以修改通过测定法(如本文所述的免疫测定法)确定测试样品中分析物的存在、量或浓度的试剂盒(或其组分)以及方法,以用于如在例如美国专利号5,089,424和5,006,309中描述和如例如作为 由Abbott Laboratories(Abbott Park,Illinois)
的商业销售的多种自动化和半自动化系统(包括其中固相包括微粒子的那些)。
[0659] 与非自动化系统(例如,ELISA)相比,自动化或半自动化系统之间的一些差异包括与第一特异性结合伴侣(例如,抗分析物单克隆/多克隆抗体(或其片段、其变体或其变体片段)或抗分析物DVD-Ig(或其片段、其变体或其变体片段)连接的底物;以任一种方式,夹心形成和分析物反应性可以受到影响),和捕获、检测和/或任何任选洗涤步骤的时长及时序。在非自动化形式下,如ELISA,可能需要相对较长的样品和捕获试剂孵育时间(例如,约2小时),自动化或半自动化形式(例如, Abbott Laboratories)可以具有相对较
短的孵育时间(例如,对于 大约18分钟)。类似地,在非自动化形式下,如
ELISA,可能需要将检测抗体(如缀合物试剂)孵育相对较长时间(例如,约2小时),自动化的或半自动化形式(例如, )可以具有相对较短的孵育时间(例如,对于
大约4分钟)。
[0660] 从Abbott Laboratories可获得的其他平台包括但不限于 (见,例如,美国专利号5,294,404)、 EIA(珠)和QuantumTM II以及其他平台。另外,测定
法、试剂盒和试剂盒组分可以以其他形式使用,例如,在电化学测定系统或其他手持式或即时(point-of-care)测定系统上。本公开例如适用于进行夹心免疫测定的商用Abbott 
Point of Care( Abbott Laboratories)电化学免疫测定系统。一次性检验装置中
的免疫传感器和它们的制造和操作方法例如在美国专利号5,063,081、美国公开号2003/
0170881、美国公开号2004/0018577、美国公开号2005/0054078和美国公开号2006/0160164中描述。
[0661] 具体而言,就修改分析物测定法用于 系统而言,优选以下布局。用一对金安培计工作电极和银-氯化银参比电极制造出微加工的硅芯片。在工作电极之一上,带有固定的抗分析物单克隆/多克隆抗体(或其片段、其变体或其变体片段)或抗分析物DVD-Ig(或其片段、其变体或其变体片段)的聚苯乙烯珠(0.2mm直径)与电极上带图案的聚乙烯醇聚合物涂层黏附。将这种芯片装配成具有适于免疫测定的射流形式的 筒。在该筒的样
品容纳室的一部分壁上,存在包含针对分析物的特异性结合伴侣的层,所述特异性结合伴侣是例如抗分析物单克隆/多克隆抗体(或可以与所述分析物结合的其片段、其变体或其变体片段)或抗分析物DVD-Ig(或可以与所述分析物结合的其片段、其变体或其变体片段),可以可检测地标记其中任一种。在这个筒的流体袋内是包含磷酸对-氨基苯酚的含水试剂。
[0662] 在操作上,将疑似含有分析物的样品添加至测试筒的容纳腔,并将该筒插入读数仪中。在分析物的特异性结合伴侣已经于样品中溶解后,筒内的泵部件迫使
样品进入含有芯片的导管。在此将样品振荡以促进夹心的形成。在测定法的倒数第二个步骤中,迫使流体离开袋子并且进入导管,以将样品从芯片洗下并进入废物室。在测定法的最终步骤中,碱性磷酸酶标记物与磷酸对-氨基苯酚反应以切下磷酸基团并且允许释放的对-氨基苯酚在工作电极处电化学地氧化。基于测量的电流,读数仪能够借助嵌入的算法和工厂确定的校正曲线计算样品中分析物的量。
[0663] 进一步不言而喻,如本文所述的方法和试剂盒必然地包括用于实施免疫测定的其他试剂和方法。例如,包括如本领域已知和/或可以轻易制备或优化以例如用于洗涤、用作缀合物稀释剂、微粒子稀释剂和/或用作校准物稀释剂的多种缓冲液。示例性缀合物稀释剂是在某些试剂盒(Abbott Laboratories,Abbott Park,Illinois)中使用并且含有2-(N-吗啉代)乙磺酸(MES)、盐、蛋白质封闭剂、抗微生物剂和去垢剂的 缀合物稀释剂。示例性校准物稀释剂是在某些试剂盒(AbbottLaboratories,Abbott Park,Illinois)中使用的 人用校准物稀释剂,其包含含有MES、其他盐、蛋白质封闭剂和抗微
生物剂的缓冲液。另外,如美国系列号12/650,241(美国公开号2010/0167301;还见,PCT公开号WO 2010/078443)中所述,可以获得改进的信号生成,例如,在I-Stat筒形式中,使用与信号抗体连接的核酸序列作为信号放大器
[0664] 本领域技术人员将显而易见,对本文所述的本发明方法的其他合适修改和改变是明显的并且可以使用合适等同物进行,而不脱离本文中公开的本发明范围或实施方案。
[0665] 现在详细描述了本发明,通过参考以下实施例将更清楚地理解本发明,其中仅出于说明目的包括所述实施例并且不意在限制本发明。实施例
[0666] 实施例1:从克隆E26产生亲和力成熟的人源化IL-1β抗体
[0667] 表6提供人源化小鼠E26抗体(GlaxoSmithKline,PCT公开号WO 95/01997)的VH和VL的氨基酸序列。每个VH和VL序列的各个CDR的氨基酸残基以粗体显示。
[0668] 表6.人源化E26抗体的VH和VL区的氨基酸序列
[0669]
[0670] 如下获得亲和力成熟的人源化小鼠E26抗体。构建一个在以下残基处含有有限诱变的轻链文库:CDRL 1:30、31、32;CDRL2:50、53、55、56;CDRL3:92、93、94、96和97(Kabat编号)。产生两个在CDRH1和CDRH2中的残基31、33、50、52a、55、56、57、58和60(Kabat编号)处或在CDRH3中的残基95、96、97、98、99、100、100a、100b和102处含有有限诱变的重链文库。这些重链文库还在残基23(A/S)、24(A/S)、62(T/S)、84(P/A)、88(G/A)、91(F/Y)和108(P/L)处含有双元多样化以允许文库选择期间框架种系化(germ-lining)。全部3个文库通过递减浓度的食蟹猴(cyno)IL-1β独立地选择。全部的突变CDR序列随后组合成一个仅在VH CDR中具有突变的文库和另一个在全部6个CDR中具有突变的文库。采用人IL-1β和cyno IL-1β,使得这两个组合的文库经历更严格的选择条件,此后,鉴定各个抗体并且将其表达为IgG蛋白用于进一步表征。
[0671] 表7提供了源自人源化E26的亲和力成熟IL-1β抗体的VH区的一系列氨基酸序列。每个VH序列的各个CDR的氨基酸残基以粗体显示。
[0672] 表7.亲和力成熟的E26 VH变体的氨基酸序列
[0673]
[0674]
[0675]
[0676]
[0677]
[0678]
[0679] 表8提供了源自E26的亲和力成熟的人源化IL-1β抗体的VL区的一系列氨基酸序列。每个VL序列的各个CDR的氨基酸残基以粗体显示。在下表8中一些亲和力成熟的VL序列内见到的N端D(Asp)至G(Gly)突变更可能是非预期诱变的结果,所述诱变在文库构建期间所实施的聚合酶链反应(PCR)期间发生。当这些区域在IgG分子构建中使用时,可以除去N端G残基,而不造成后果。
[0680] 表8.亲和力成熟的E26 VL变体的氨基酸序列
[0681]
[0682]
[0683]
[0684] 可以比对上表中来自人源化E26的亲和力成熟的IL-1β抗体的VH和VL区的各个CDR的序列,以提供共有性CDR序列,如表9中的那些。
[0685] 表9.亲和力成熟的VH和VL序列的共有序列
[0686]
[0687] 将表10中的序列转化成IgG用于进一步表征。克隆E26.13在分别称作E26.13 JM VH和E26.13 JM VL的可变重链区和可变轻链区的J-区内突变,以除去非种系框架突变。各个CDR的氨基酸残基以粗体显示。
[0688] 表10.亲和力成熟的E26 VH和VL变体的氨基酸序列
[0689]
[0690]
[0691]
[0692]
[0693]
[0694]
[0695] 实施例2:IL-1β抗体的功能性表征
[0696] 实施例2.1:IL-1β酶联免疫吸附测定操作方案
[0697] 为了确定抗IL-1βmAb是否与人IL-1β结合,ELISA平板(Nunc,MaxiSorp,Rochester,New York)用抗人Fc抗体在4℃孵育过夜,所述抗人Fc抗体在Pierce包被缓冲液中以2μg/ml稀释(Jackson Immunoresearch,West Grove,Pennsylvania)。平板在洗涤缓冲液(含有0.05%Tween 20的PBS)中洗涤5次并且在25℃用每孔200μl superblock封闭缓冲液(Thermo scientific,No.37515)封闭1小时。通过拍击平板除去封闭缓冲液,并且将含有
10%Superblock,0.5%Tween-20的PBS中的2μg/ml每种抗体以100μl/孔添加至各孔并且在
25℃孵育1小时。各孔在1XPBST中洗涤5次,并且1μg/ml生物素化的抗原以1∶6连续稀释物(用于含有10%Superblock,0.05%Tween-20的PBS中的μg至pg范围)滴定。将抗原的每种稀释物随后添加至平板并且在25℃孵育1小时。各孔在1XPBST中洗涤5次并且在25℃与多聚HRP链霉亲和素(KPL No.474-3000,Gaithersburg,Maryland)孵育1小时。各孔在1XPBST中洗涤5次,并且每孔添加100μl ULTRA-TMB ELISA(Pierce,Rockford,Illinois)。在显色后,反应用1N HCL终止并且在450nM测量吸光度。表11中显示结果和指示抗IL-1β抗体与人IL-1β结合的数值。
[0698] 表11:ELISA中抗体与人IL-1β的结合
[0699]MAb hIL-1β ELISA中的EC50(pM)
E26.1 12.9
E26.2 567
E26.11 14
E26.12 306
E26.13 7.2
E26.13JM 7.4
E26.35 10.4
E26.37 17.7
[0700] 实施例2.2:IL-1β抗体的中和效力
[0701] 为检验在本发明中的抗人IL-1β抗体的功能活性,在测量抗体抑制IL-1β活性的能力的MRC-5测定中使用这些抗体。MRC-5细胞系是以剂量依赖性方式应答人IL-1β中产生IL-8的人肺成纤维细胞系。这个细胞系还应答于食蟹猴IL-1β(cynoIL-1β)产生IL-8。MRC-5细胞最初从ATCC获得并且在10%FBS完全MEM中继代培养并且在37℃在5%CO2培养箱中培育。
为确定抗体针对IL-1β的中和效力,将抗体(50μl)添加至96孔平板(1E-7至1E-15M终浓度范围)并且在37℃、5%CO2与50μl人或cyno IL-1β(终浓度50pg/mL)预孵育1小时。随后将抗原抗体复合物(100μL)添加至MRC-5细胞(事先以1E5/ml的浓度按照100μl细胞/孔铺种24小时)。测定平板在37℃在5%CO2培养箱中孵育过夜。通过抗体抑制IL-8产生的能力确定抗体效力。通过基于化学发光的测定法测量人IL-8产生。表12总结针对人和cyno IL-1β的抗体效力。
[0702] 表12.IL-1β抗体的中和效力
[0703]
[0704] ND:未测定
[0705] 实施例2.3:通过表面等离子体共振法测量IL-1β抗体的亲和力
[0706] BIACORE测定法(Biacore,Inc,Piscataway,New Jersey)以结合(on)-速率常数和解离(off)-速率常数的动力学量值确定抗体的亲和力。在25℃使用流动的HBS-EP(10mM HEPES[pH 7.4],150mM NaCl,3mM EDTA和0.005%表面活性剂P20),通过基于表面等离子体共振的测量法以 3000仪( AB,Uppsala,Sweden)确定抗体与重组纯化的人IL-1β和食蟹猴IL-1β的结合。全部化学品均从 AB(Uppsala,Sweden)获得或否则来
自如本文所述的不同来源。使用标准胺偶联试剂盒根据制造商的说明书和方法按25μg/ml,将10mM乙酸钠(pH4.5)中稀释的大约5000RU山羊抗小鼠IgG(Fcγ)片段特异性多克隆抗体(PierceBiotechnology Inc,Rockford,Illinois)直接固定遍及CM5研究级生物传感器芯片。生物传感器表面上的未反应部分用乙醇胺封闭。使用流通池2和4中修饰的羧甲基葡聚糖表面作为反应表面。使用流通池1和3中没有山羊抗小鼠IgG的未修饰的羧甲基葡聚糖表面作为参比表面。对于动力学分析,用Biaevaluation 4.0.1软件,将源自1∶1 Langmuir结合模型的速率等式同时与全部8次注射的结合相和解离相拟合(使用总体拟合分析)。纯化的抗体在HEPES缓冲盐水中稀释用于整个山羊抗人IgG特异性反应表面的捕获。在反应介质范围内按5μl/分钟的流速注入待捕获的抗体作为配体(25μg/ml)。在连续流速25μl/分钟下测定结合和解离速率常数k结合(单位M-1s-1)和k解离(单位s-1)。通过在10-200nM的10个不同抗原浓度范围进行动力学结合测量,推导速率常数。随后通过以下公式从动力学速率常数中计算抗体和靶抗原之间反应的平衡解离常数(单位M):KD=k解离/k结合。结合作用记录为时间的函数,和计算动力学速率常数。在这个测定法中,可以测量到快如106M-1s-1的结合速率和慢如10-6s-1的解离速率。表13显示人抗IL-1β抗体的亲和力量值。
[0707] 表13.由Biacore确定的抗体对人和Cyno IL-1β的亲和力
[0708]  人IL-1β CynoIL-1β
E26.2(M) 5.28×10-11 ND
5
K结合(1/Ms) 8.95×10 ND
K解离(1/s) 4.72×10-5 ND
E26.12(M) 7.86×10-11 ND
K结合(1/Ms) 9.33×105 ND
-5
K解离(1/s) 7.37×10 ND
E26.13(M) 4.45×10-11 1.46×10-11
K结合(1/Ms) 9.5×105 1.23×106
K解离(1/s) 4.23×10-5 1.79×10-5
E26.35(M) 2.39×10-11 1.4×10-11
K结合(1/Ms) 1.02×106 9.21×105
K解离(1/s) 2.50×10-5 1.29×10-5
[0709] ND:未测定
[0710] 实施例3:IL-1α/β DVD-IgTM分子的产生
[0711] 实施例3.1:IL-1α/β DVD-Ig DNA构建体的构建
[0712] 通过重叠PCR扩增,采用间插性接头DNA序列,将抗IL-1α抗体(“X3”;见,PCT公开号WO 95/14780)可变域与多种IL-1β抗体可变域组合成DVD-Ig形式(Wu等人,Nature Biotechnol.,25:1290-1297(2007);PCT公开号WO 2007/024715A2)。X3也在可变重链区和可变轻链区的J-区内突变,分别称作X3 JM VH和X3JM VL,以除去非种系框架突变。将扩增的PCR产物亚克隆至适于HEK293细胞中瞬时表达的表达载体内,并且在DVD-Ig表达之前,通过测序证实开放阅读框区域。
[0713] 实施例3.2:IL-1α/β DVD-Ig结合蛋白的表达和生产
[0714] 在DNA序列证实后,将全部DVD-Ig DNA构建体在大肠杆菌中扩充,并且使用Qiagen Hispeed Maxi Prep(目录号12662,QIAGEN)纯化DNA。通过将2∶1比率的PEI和DNA与0.2μg/ml重链DNA和0.3μg/ml轻链DNA混合,将DVD-IgDNA转染至中对数期293E细胞(0.5×106/ml,存活力>95%)。DNA:PEI复合物在室温在TC罩内形成,持续15分钟,随后添加至293E细胞中。24小时后,将0.5%TN1添加至293E细胞。在第5日,收集上清液用于人IgG1效价测量。在第7日收获细胞上清液并且经0.2μM PES滤器过滤。根据制造商的说明通过使用蛋白A琼脂糖凝胶亲和层析纯化上清液。通过0.1M甘氨酸(pH 2.99)从柱中洗脱纯化的DVD-Ig并且将其立即透析入15mM组氨酸缓冲液(pH 6.0)中。通过A280对结合蛋白定量并且通过质谱法和SEC进行分析。
[0715] 实施例3.3:IL-1α/β DVD-Ig构建体的序列
[0716] 测定能够结合人IL-1β和人IL-1α的DVD-Ig蛋白的重链和轻链的氨基酸序列。下表14中显示IL-1α/β DVD-Ig结合蛋白的可变重链(VH)、可变轻链(VL)、恒定轻链(CL)和恒定重链(CH)的氨基酸序列。在表14中,E26.13和E26.35VL区的氨基酸序列分别命名为SEQ ID NO:238和SEQ ID NO:239,替代如先前在表10中显示的SEQ ID NO:205和SEQ ID NO:209,以说明包含C端精氨酸(R)残基。抗体工程领域的技术人员理解,这一C端精氨酸残基是在IgG分子中VL区和CLκ区交界处的氨基酸残基并且有时在CL区或如下表14中那样在VL区中包括表14.IL-1α/β DVD-Ig结合蛋白的可变区和恒定区的序列。
[0717]
[0718]
[0719]
[0720]
[0721]
[0722]
[0723]
[0724]
[0725]
[0726]
[0727]
[0728]
[0729]
[0730]
[0731] 将接头序列显示为加下划线的残基。
[0732] 实施例4:IL-1α/DVD-Ig蛋白的功能性表征
[0733] 实施例4.1:IL-1α/β酶联免疫吸附测定操作方案
[0734] 通过ELISA(上文实施例2.1描述的测定法)评估IL-1β/αDVD-Ig结合蛋白对IL-1β和IL-1α的结合。表15中显示结果。
[0735] 表15.通过ELISA确定的IL-1α/βDVD-Ig蛋白与人IL-1α或IL-1β结合
[0736]
[0737]
[0738] 实施例4.2:IL-1α/β生物测定和中和测定
[0739] MRC5细胞以100μL体积中每孔1.5-2×104个细胞铺种并且在37℃,5%CO2孵育过夜。在完全MEM培养基中制备DVD-Ig的20μg/mL工作母液(4倍浓缩)。在Marsh稀释平板中的完全MEM内进行8点连续稀释(5μg/mL-0.0003μg/mL)。65μL/孔的每种抗体稀释物一式四份添加96孔V形底(Costar No.3894)平板,并且添加65μL的IL-1α或IL-1β的200pg/mL溶液或65μL混合溶液,其含50pg/mL的IL-1α和IL-1β溶液。对照孔接收65μL 200pg/mL IL-1α或IL-
1β或50pg/mL混合IL-1α/β(4x浓缩)外加65μL MEM培养基,并且培养基对照孔接收130μL培养基。在1小时孵育后,将100μL DVD-Ig/Ag混合物添加至MRC5细胞。全部孔体积均等于200μL。全部平板试剂随后进行1X浓缩。在16-20小时孵育后,将孔内容物(150L)转移入96孔圆底平板(Costar No.3799)并且置于-20℃箱中。通过使用人IL-8ELISA试剂盒(R&D 
Systems,Minneapolis,Minnesota)或MSD hIL-8(化学发光试剂盒)检测上清液的hIL-8水平。通过相对于单独IL-1α、L-1β或IL-1α/β对照值计算抑制作用百分数,确定中和效力(表
16)。
[0740] 表16:IL-1α/β DVD-Ig分子对人IL-1α和IL-1β和食蟹猴IL-1α和IL-1β的效力[0741]
[0742] ND:未测定
[0743] 实施例4.3:IL-1α/β DVD-Ig分子的亲和力测量
[0744] 使用如实施例2.3中所述表面等离子体共振法测定IL-1α/β DVD-Ig与纯化的重组人IL-1α和IL-1β和食蟹猴IL-1α和IL-1β的结合,并且在表17中显示结果。
[0745] 表17.IL-1α/β DVD-Ig分子的亲和力测量
[0746]
[0747]
[0748] 参考文献引用
[0749] 本发明通过引用的方式完整并入分子生物学和药物递送领域熟知的技术。这些技术包括但不限于在以下出版物中描述的技术:Ausubel等人(编著),CurrentProtocols in Molecular Biology,John Wiley & Sons,NY(1993);Ausubel,F.M.等人编著,Short Protocols In Molecular Biology(第4版,1999)John Wiley & Sons,NY.(ISBN0-471-32938-X).Controlled Drug Bioavailability Drug Product Design and Performance,Smolen和Ball(编著),Wiley,New York(1984);Giegé等人,第1章,引自Crystallization of Nucleic Acids and Proteins,A Practical Approach,第2版,(Ducruix和Giegé,编著)(Oxford University Press,New York,1999),第1-16页;Goodson,J.M.,第6章,引自Medical Applications of Controlled Release,Vol.II,Applications andEvaluation,(Langer和Wise,编著)(CRC Press,Inc.,Boca Raton,1984),第115-138页;Hammerling等人,编著,″Monoclonal Antibodies and T-Cell Hybridomas,″引自Research Monographs in Immunology,第3卷(J.L.Turk总编辑)(Elsevier,New York,1981),第563-587页;
Harlow等人,Antibodies:A Laboratory Manual,(Cold SpringHarbor Laboratory Press,第2版,1988);Kabat等人,Seouences of Proteins ofImmunological Interest(National Institutes of Health,Bethesda,Md.(1987);Kabat,E.A.,等人(1991)Sequences of Proteins of Immunological Interest,第5版,U.S.Department of 
Health and Human Services,NIH Publication No.91-3242;Kontermann和Dübel,编著,Antibody Engineering(2001)Springer-Verlag.New York.第790页(ISBN 3-540-41354-
5);Kriegler,Gene Transfer and Expression,A Laboratory Manual,Stockton Press,NY(1990);Lu和Weiner编著,Cloning and Expression Vectors forGene Function 
Analysis(2001)BioTechniques Press.Westborough,Mass.第298页(ISBN 1-881299-21-X);Goodson,J.M.,Medical Applications of Controlled Release,(Langer和Wise,编著)(CRC Press,Boca Raton,1974);Old和Primrose,Principles ofGene Manipulation:
An Introduction To Genetic Engineering(第3版.1985)BlackwellScientific 
Publications,Boston;Studies in Microbiology,第2卷:第409页(ISBN 0-632-01318-
4);Sambrook,J.等人,Molecular Cloning:A Laboratory Manual(第2版,1989)Cold Spring Harbor Laboratory Press,NY.第1-3卷(ISBN 0-87969-309-6);Sustained and Controlled Release Drug Delivery Systems,(J.R.Robinson编著)(MarcelDekker,Inc.,New York,1978);Winnacker,E.L.From Genes To Clones:IntroductionTo Gene Technology(1987)VCH Publishers,N.Y.(Horst Ibelgaufts翻译),第634页(ISBN 0-
89573-614-4)。
[0750] 遍及本申请书中引用的全部所引用的参考文献(包括文献参考资料、专利、专利申请和网站)内容在此明确地通过引用的方式完整并入,其中引用的参考文献也以相同方式并入。除非另外说明,否则本发明的实施将使用本领域熟知的免疫学、分子生物学和细胞生物学常规技术。
[0751] 等同物
[0752] 本发明可以体现于其他具体的形式中,而不脱离其精神或实质特征。因此将前述实施方案在全部方面认为是说明性的而非限制本文所述的发明。本发明的范围因而由所附的权利要求书而非前面的描述说明,并且属于权利要求书的等同性含义和范围内的全部变化均意在被包含于本文中。
QQ群二维码
意见反馈