用于样品处理的系统和装置 |
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申请号 | CN201480004504.9 | 申请日 | 2014-01-09 | 公开(公告)号 | CN104936698B | 公开(公告)日 | 2017-09-12 |
申请人 | 瑞泽恩制药公司; | 发明人 | R·切尔诺莫斯基; N·盖尔; S·齐雄; | ||||
摘要 | 一种用于通过 机器人 平台处理样品的系统具有界定井的托盘,所述井界定排 水 管。所述井具有底表面、与所述 排水管 流体 连通的进入口,以及适于收纳在所述井中的插入件。所述插入件具有底壁和 侧壁 。所述底壁和所述侧壁中的至少一个界定多个开口,使得当所述插入件插入至所述井中时所述插入件的内部与所述井流体连通。 | ||||||
权利要求 | 1.一种用于通过机器人平台处理样品的系统,所述系统包括: |
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说明书全文 | 用于样品处理的系统和装置[0002] 导言 [0003] 自动机器人处理在实验室环境中被广泛利用以改进准确性和可靠性,以及改进处理时间并释放操作者资源以用于其它任务。实验室机器人经常用以用移液管或被配置用来分配和收集实际上任何量的液体的其它设备来分配多种液体。这些液体可沉积至若干样品井和从若干样品井汲取,该样品井可含有细胞、组织、化学品、生物试剂、含有细胞或组织的载玻片,或被检测的其它材料。液体可以是或可包含组织培养基、试剂、清洗流体、染料或其它化学品,其中任一个或全部可以一种方式或另一方式与井内含有的样品反应。个别样品可含有在微量滴定板的井内,微量滴定板可在需要时由机器人设备输送。微量滴定板通常包含6个、12个、24个、96个、384个或更多井。 [0004] 概述 [0005] 在一方面,技术涉及一种用于通过机器人平台处理样品的系统,该系统具有:托盘,其界定:井,其界定排水管,其中井具有底表面;以及进入口,其与排水管流体连通;插入件,其适于收纳在井中,其中插入件包含底壁和侧壁,其中底壁和侧壁中的至少一个界定多个开口,使得当插入件插入至井中时插入件的内部与井流体连通。在一实施方案中,井界定连接排水管与进入口的通道,其中通道从排水管至进入口向下倾斜。在另一实施方案中,底表面界定排水管。在又一实施方案中,底表面具有高点和低点,且其中排水管位于靠近低点处。在再一实施方案中,低点位于靠近底表面的中心处。 [0006] 在以上方面的另一实施方案中,低点位于靠近底表面的外边缘处。在一实施方案中,井具有外壁,且其中外壁至少部分界定排水管。在另一实施方案中,底表面界定通道的顶表面。在又一实施方案中,底表面至少部分界定通道的边缘。在再一实施方案中,托盘界定槽,其中槽提供井与进入口之间的流体连通。 [0007] 在以上方面的另一实施方案中,槽被配置用来收纳闸门。在一实施方案中,井包含外壁,且其中当插入至井中时,篮形成与外壁的过盈配合。在另一实施方案中,外壁和篮中的至少一个包含垫片,其中垫片形成过盈配合。在又一实施方案中,托盘进一步具有夹具或闩锁中的至少一个以用于将篮紧固在井内。在再一实施方案中,底壁和侧壁两者界定多个开口。 [0008] 在以上方面的另一实施方案中,井具有外壁,其中外壁界定圆形形状、四边形形状、椭圆形形状和三角形形状中的至少一个。在一实施方案中,篮的侧壁界定与外壁形状互补的形状。在另一实施方案中,托盘界定多个井且其中进入口与多个井中的至少两个流体连通。在又一实施方案中,多个开口中的至少一个具有锐角。在再一实施方案中,多个开口中的至少一个界定相对于侧壁的角度。 [0009] 在另一方面,技术涉及用于通过机器人平台处理样品的托盘,托盘具有:井,其界定具有至少一个外壁和底表面的几何形状;进入口,其与井是分立的且流体连通;以及篮,其被配置用来配合在井内,其中篮界定至少一个侧壁和底壁,且其中侧壁和底壁中的至少一个界定多个开口。在一实施方案中,井界定排水管,排水管由外壁和底表面中的至少一个界定。在另一实施方案中,底表面是大体上凸起的和大体上凹入的中的至少一个。在又一实施方案中,底表面朝外壁倾斜。在再一实施方案中,托盘进一步包含将井连接至进入口的通道,其中通道位于底表面下方。 [0010] 在以上方面的另一实施方案中,底表面至少部分界定通道。在一实施方案中,托包含多个井且进入口与多个井中的至少两个流体连通。 [0012] 附图中展示了目前优选的实施方案,然而应理解,技术不限于所展示的精确布置和工具。 [0013] 图1A至3A是托盘的俯视透视图。 [0014] 图3B是图3B的托盘中的井的部分侧视截面图。 [0015] 图4是托盘的透视截面图。 [0016] 图5是另一托盘的俯视透视图。 [0017] 图6是另一托盘的透视截面图。 [0018] 图7是另一托盘的透视截面图。 [0019] 图8A和8B分别是样品篮的透视图和透视截面图。 [0020] 图9A和9B是样品蓝的透视图。 [0021] 图10描绘使用托盘和篮系统以用于样品的机器人处理的一种方法。 [0022] 图11描绘用于处理载玻片的托盘的俯视透视图。 [0023] 详细描述 [0024] 图1A和1B各自描绘用于生物样品处理的六井托盘。在图1A中,托盘100界定六个井102,其各自具有外壁104和底表面106。外壁104还可在井102的上边缘处界定边108。边108按需要或要求可以是光滑的、楔形的或螺纹的以容纳特定的配套篮(下文描述各种类型的篮)。底表面106界定排水管110,其位于底表面106中心且由底表面106界定。通道112将排水管110连接至进入口114。进入口114被设置大小和配置以便收纳移液管。一般来说,进入口 114的底表面位于排水管110的底表面下方,因而允许通道112中的任何流体朝着进入口114被动地排放。底表面106在转角116处与外壁106相交。底表面106从转角116至排水管110向下倾斜。因此,位于井102中的流体从底表面106的高点(在此状况下,转角116)排放至底表面106的低点(在此情况下,排水管110),接着沿着通道112的斜坡向下至进入口114。在此托盘100中,井102和进入口114经由槽118连接,槽118贯穿井102的外壁104。此槽118的优点包含井102与进入口114之间的流动速率增大(举例来说,当将移液管插入至进入口114中以将流体递送至井102或从井102抽回流体时)。 [0025] 图1B描绘托盘100的另一实施方案。在此图中,除非另外指出,否则具有与图1A中识别的元件类似的参考数字的元件大体上与那些先前识别的元件相同。应注意,在图1B的实施方案中,通道112沿着与外壁104大体上垂直的初始定向布设。一旦靠近外壁104,通道112转动约90度,接着继续至进入口114。如同先前实施方案一样,底表面106是凸起的,而通道112从排水管110至进入口114向下倾斜。如从比较图1A和1B的实施方案可见,通道112的布设从排水管110至进入口114可在任何定向上。 [0026] 图2A和2B描绘用于生物液体处理的十二井托盘200的两个实施方案。被识别为具有与图1A的实施方案的元件类似的参考数字的元件大体上与那些先前识别的元件相同。在此实施方案中,值得注意进入口214的对准。进入口114按两列C1和C2,以及沿着六行R1至R6对准。使得进入口214对准的托盘200的配置允许有效地使用多移液管仪器来将流体引入至井202和将流体从井202抽回。另外,图2A的托盘200包含标记220,其可用以通过识别井的相关联的行和列来识别特定井。 [0027] 图2B描绘具有井202的托盘200,井202具有排水管210和通道212。图1A至2A的先前实施方案描绘了直径比进入口114小的排水管110。然而,在图2B的实施方案中,排水管210具有比进入口直径DA大的排水管直径DD。此较大排水管直径DD允许通过排水管214的较高流体流速。此较大排水管帮助减少过程期间的流体扰动,以及填充时间和排水时间。其还在引入流体时减少篮浮动。 [0028] 图3A和3B描绘用于生物液体处理的托盘300。被识别为具有与图1A的实施方案的元件类似的参考数字的元件大体上与那些先前识别的元件相同。托盘300与先前描述的托盘之间的值得注意的差异在于进入口314与井302是分立的。此处,井302的外壁304是完整的。因而,不管流体引入至进入口314或从进入口314抽回的速率如何,所有流体将经由通道312进入井302(在先前描绘的实施方案中,非常高的流动速率可使流体流动通过上文描绘的槽)。如图3B中所描绘,通道312从排水管310至进入口314向下倾斜。在某些实施方案中,倾斜可在约2度至约5度之间。此帮助促进井302的排水,就像井302的凸起的底表面306一样。另外,进入口314的底部部分322比通道312低,这帮助确保所有流体可从井中汲取出(而无任何显著量保留在例如通道312中)。井302中的一个或多个可与可将篮紧固于井302内中的一个或多个夹具、闩锁或其它锁定元件324相关联。 [0029] 图4描绘托盘400的另一实施方案的透视截面图。在此实施方案中,每一井402的底表面406是凸起配置,其帮助减少篮浮动且改进井402的排水。因此,井402内的流体从井402的中心朝外壁404排放。转角416可在底表面406的外部外围处从高点倾斜至低点。排水管(未图示)位于低点处。在某些实施方案中,排水管无需为分立元件,而是可以是将进入口414连接至井402的槽418。 [0030] 图5描绘托盘500的另一实施方案。在此实施方案中,进入口514位于非常靠近井502处,且经由槽518完全与井502流体连通。在此状况下,排水管510是进入口514的低点,且底表面506朝进入口514和排水管510倾斜。因此,在此实施方案中,移液管插入至进入口514中且将流体从排水管510抽回,排水管510由于底表面506的倾斜而收纳井502的流体内容。 槽518可进一步界定一个或多个通道或收纳器524以用于收纳闸门526。闸门526可完全或部分收纳在收纳器524内,以便按照特定应用的需要或要求而将井502与进入口514部分或完全隔离。可在闸门526与收纳器524和底表面506中的任一个或两者的界面处利用垫片或其它防漏装置,以防止进入口514与井502之间的不需要的渗漏。因此,闸门526的底部边缘可位于底表面506上方,以便充当进入口514与井502之间的流动控制元件。 [0031] 图6描绘托盘600的另一实施方案的透视截面图。在此实施方案中,每一井606的底表面602是凸起配置,其帮助减少篮浮动且改进井602的排水。因此,井602内的流体从井602的中心朝外壁604排放。转角616可在底表面606的外部外围处从高点倾斜至低点。排水管,在此状况下,槽618将进入口614连接至井602。进入口614的底部是凹入的,且因此比其相关联的井602的底表面606低,其帮助改进排水。 [0032] 图7描绘托盘700的另一实施方案的透视截面图。在此实施方案中,多个井702由单一进入口714服务。如同图6的实施方案一样,每一井702的底表面706是凸起配置,其帮助减少篮浮动且改进井702的排水。因此,井702内的流体从井702的中心朝外壁704排放。转角716可在底表面706的外部外围处从高点倾斜至低点。排水管,在此状况下,槽718将进入口 714连接至井702中的每一个。进入口714的底部是凹入的,且因此比其相关联的井702的底表面706低,其帮助改进排水。尽管描绘四个井702与单一进入口714连通,但按照特定应用的需要或要求,多于或少于四个井可与单一进入口流体连通。一般来说,当多个井的内容的交叉污染不是问题时,多个井可经由单一进入口排水和填充。 [0033] 图8A和8B描绘样品插入件或篮800的一个实施方案,样品插入件或篮800包含容器部分802和唇缘804。唇缘804可包含用于收纳垫片的凹槽806,垫片可用以在篮800插入至托盘的井中时(诸如上文描述的井和托盘)紧固篮800。井的边与垫片之间的干涉形成过盈配合,其防止篮800在处理期间从井移开。或者,唇缘804本身可由弹性材料制造以代替分立垫片或O形圈形成与井的边的过盈配合。或者,可利用诸如夹具、杠杆、搭扣等机械紧固元件来将篮800保持在井中。在某些实施方案中,唇缘可被车螺纹以与井的边上的对应螺纹配套。另外,掩模或密封件可紧固至托盘的顶表面以紧固篮,以及防止液体在输送期间不注意地从井中晃出。唇缘804的内表面804a帮助防止晃动且有助于篮800从其相关联的井的移除。 [0034] 篮800的容器部分802界定其侧壁810和底壁812两者中的若干孔、开口或贯穿口808。按照特定应用的需要或要求,贯穿口808可界定任何形状或大小。贯穿口808应足够大以实现通过其的高流动速率,但应足够小以防止位于篮800内的样品漏出。相对于利用其它结构以允许流体引入至井中的系统(例如,具有利用网状底表面的井的系统),已确定在侧壁和底壁的重要部分上方包含开口的篮允许改进的流动速率。具有高流动速率的篮允许井被快速地填充而不会移开篮,因为不允许通过其的足够的流速的篮可能从相关联的井移开。另外,界定具有锐角的孔(例如,诸如图8A和8B中的矩形孔)的篮帮助破坏较高粘性液体的表面张力。此实现较多流体流动且帮助减少或消除篮浮动。孔中的一些或全部还可界定相对于篮的侧壁或底壁的角度,以便在流体中引发涌流或旋涡以防止样品粘在其中。 [0035] 图9A和9B描绘篮900的其它配置。如同图8A和8B中描绘的实施方案一样,开口908贯穿容器部分902的侧壁910和底壁912。如从图式为清晰的,开口908可以是任何大小或形状。涵盖了其它篮形状。举例来说,篮可与井的形状互补地塑形(即,圆形的篮和井,正方形的篮和井,等)。事实上,篮和井两者的形状可按照特定应用的需要或要求配置。 [0036] 图10描绘利用托盘和篮系统以用于生物样品处理,具体地说,胚胎的自动机器人处理(包含胚胎的染色)的方法1000。在操作1002中,通过首先将篮插入至托盘的每一井中而使托盘装载一个或多个篮。这可通过技术人员手动地完成,或可由机器人设备的适当配置的零件执行。在制造和组装期间将篮插入至井中也可以是有利的。可接着适当地密封托盘和篮系统以便避免污染并运输至终端用户。在装载篮之后,或在已移除污染物密封件之后,可接着将胚胎装载至一个或多个篮中,如操作1004中。由于胚胎的脆弱性质,这经常由人工操作员执行,但也可使用机器人设备。一旦已将胚胎插入至适当的篮中,接着在操作1006中将每一装载的托盘插入至机器人处理设备中。将特定操作编程至处理设备或实验室管理软件中且按照特定应用的需要或要求执行该操作。在处理期间,不管引入的液体类型如何,本文中所描述的托盘和篮系统的构建允许移液管引入或抽回流体,而不损坏或移除胚胎,或不会使篮变得从托盘移开。通过将移液管插入至进入口中,如操作1008中,消除对胚胎的损坏或胚胎从篮的移除。在操作1010中,经由进入口引入流体且从井抽回流体。可按照特定处理的需要而重复此过程。用以控制机器人设备的程序将继续执行适当的过程,操作1012,直到结束。因此,如操作1014处所指示,从机器人处理设备移除托盘。人工操作员或专用机器人设备可接着移除胚胎,如操作1016中所指示。 [0037] 返回至操作1010,下文提供示范性的整个胚胎处理协议。如上文所指示,经由进入口引入和抽回流体以减少胚胎的损坏或移除的可能性。处理可适于可保持在井中的任何样本,诸如从振动切片机或滑动切片机得到的组织切片、胚胎或成人器官或组织的整个或部分制备,等。 [0038] 整个鼠胚胎处理协议 [0039] A.模块W1,第1天 [0040] i.将鼠胚胎安装在机器人中-开始运行 [0041] ii.将胚胎浸没在2%的戊二醛/多聚甲醛中(60分钟)。 [0042] iii.将胚胎浸没在PBS中(5分钟)。 [0043] iv.将胚胎浸没在PBS中4次(15分钟)。例如,3×10分钟并搅动。 [0044] v.将胚胎浸没在LacZ染色溶液中 [0045] vi.从机器人移除胚胎 [0046] (1)在4℃下孵化载玻片12至48小时 [0047] (2)孵化的时间和温度变化 [0048] B.模块W2,第3天 [0049] i.将胚胎返回至机器人 [0050] ii.将胚胎浸没在PBS中3次(每次5分钟)。 [0051] iii.将胚胎浸没在2%的多聚甲醛中 [0052] iv.从机器人移除胚胎 [0053] (1)孵化12小时 [0054] C.模块W3,第4天 [0055] i.将胚胎返回至机器人 [0056] ii.将胚胎浸没在PBS中3次(15分钟)。 [0057] iii.将胚胎浸没在50%的甘油中 [0058] iv.从机器人移除胚胎 [0059] (1)孵化12小时 [0060] D.模块W4,第5天 [0061] i.将胚胎返回至机器人 [0062] ii.将胚胎浸没在70%的甘油中(12小时) [0063] iii.从机器人移除胚胎 [0064] iv.转移胚胎以进行储存 [0065] 本文中描绘的托盘系统在许多其它生物处理中是有用的,其中流体必须添加至井或从井抽回,而不会因为移液管产生的吸力而损坏或不注意地移除样品。此可包含其它类型的组织化学、原位杂交或免疫组织化学。举例来说,井内的样品可包含任何悬浮组织或细胞培养集落,包含植物或动物细胞或组织。在一些实施方案中,样品生长至载玻片上且托盘系统被配置用来容纳载玻片。在一些实施方案中,样品使用离心机或其它已知技术放置在载玻片上,且被配置用来容纳载玻片的托盘系统用于染色过程。不管其中使用托盘和篮系统的生物处理如何,托盘通常被配置为外部尺寸大小(长、宽、厚度)与标准的微量滴定板类似或相同。这允许篮和托盘系统易于与现有的实验室机器人处理系统一起使用。 [0066] 图11描绘用于处理多个载玻片的托盘1100。托盘包含若干井1102,每一井具有多个侧壁1104和底壁(未图示)。进入口1114(在此状况下,两个与每一井1102相关联)贯穿托盘1100的顶表面。进入口1114可按与前述图式中描绘的相同的方式与井1102流体连通。也就是说,进入口1114与井可为完全分立的,如此处所展示和图3A中所描绘。在其它实施方案中,进入口可经由底表面中的排水管和/或通道,和/或侧壁1104中的槽与井流体连通。每一井1102的一个或多个壁1104(通常是相对面向的壁)至少部分界定若干突起1120。邻近的突起1120间隔以便在其之间收纳载玻片。任何数目的载玻片可容纳在特定井1102中,且载玻片可定向,使得载玻片的纵轴是大体上垂直的(如所描绘)或水平的。在所描绘的实施方案中,无需使用篮,但在其它实施方案中,载玻片可安装在适当地配置的篮中,接着可将篮插入至井中。 [0067] 下文描绘示范性载玻片处理系统。 [0068] 载玻片处理协议 [0069] A.将载玻片安装在机器人中-开始运行(模块S1第1天) [0070] B.将载玻片浸没在2%的多聚甲醛中达(5分钟) [0071] C.将载玻片浸没在PBS中(5分钟) [0072] D.将载玻片浸没在PBS中4次(10分钟) [0073] E.将载玻片浸没在Lac Z染色溶液中 [0074] F.从机器人移除载玻片 [0075] i.在37C下孵化载玻片一夜 [0076] ii.允许载玻片返回至RT [0077] G.将载玻片返回至机器人(模块S2第2天) [0078] H.将载玻片浸没在PBS中3次(每次5分钟) [0079] I.浸没在2%的多聚甲醛中(60分钟) [0080] J.将载玻片浸没在PBS中3次(10分钟) [0081] i.将载玻片浸没在中性红中(3分钟) [0082] K.将载玻片浸没在D H2O中(10秒) [0083] L.将载玻片浸没在70%的乙醇中(5分钟) [0084] M.将载玻片浸没在85%的乙醇中(5分钟) [0085] N.将载玻片浸没在95%的乙醇中(5分钟) [0086] O.将载玻片浸没在100%的乙醇中2次(每次5分钟) [0087] P.将载玻片浸没在乙醇/组织透明液中(5分钟) [0088] Q.将载玻片浸没在组织透明液中2次(每次5分钟) [0089] R.结束机器人运行,握住载玻片 [0090] 在一些方面,样品是鼠胚胎。在其它方面,样品是组织。在又其它方面,样品是悬浮细胞培养集落。此处描述的样品本质上是生物的;然而,任何样品涵盖在本文中,其中样品大小具有足够大小以避免通过篮中的孔、开口或贯穿口的移动。 [0091] 本文中描述的托盘和篮的制造中利用的材料可类似于现有的机器人生物处理系统中使用的材料。举例来说,可使用塑料材料,诸如TEFLON、DELRYN、各种等级的聚丙烯、ABS或PVC。还可利用金属诸如铝、不锈钢和钛。另外,本文中描述的托盘和篮可由用于三维印刷的标准材料制造。在制造之后,可用使托盘或篮的外表面熔化的化学溶液处理托盘或篮,因而将其呈现为无孔的。此过程对非常复杂的托盘或篮配置可特别有用。 [0092] 本文中涵盖了篮可以是处理过的或未处理的。举例来说,处理过的篮可能够释放生长因子或细胞因子以促进篮内的组织或细胞的生长。 |