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序号 专利名 申请号 申请日 公开(公告)号 公开(公告)日 发明人
101 用于诱导肿瘤特异性免疫响应的通用型抗原肽库及其应用 CN202410043774.6 2024-01-12 CN117552115B 2024-03-26 李锐; 苏小平; 李伟迎
发明提供了一种用于诱导肿瘤特异性免疫响应的通用型抗原肽库及其应用,所述通用型抗原肽库包括基酸序列如SEQ ID NO.1‑SEQ ID NO.5所示的5个抗原肽,所述通用型抗原肽库可在制备用于治疗预防肿瘤的药物中应用。该通用型抗原肽库为一种经过溶性修饰且同时靶向PD‑L和WT1的通用型新抗原肽库,相比个体化新抗原,可以更及时、便捷、标准化地治疗或预防肿瘤防复发或者进展;相比现有单一WT1新抗原,PD‑L1靶标的加入使得免疫协同作用更突出,治疗效果得到提升,同时对现有序列进行溶水性修饰后,增加了肽库制备应用的可行性。
102 mRNA展示抗体文库和方法 CN201980090819.2 2019-01-31 CN113366104B 2024-03-26 克利福德·安德斯·奥尔森; 卡伊万·尼亚兹
提出了重组病毒和/或重组病毒载体的组合物、方法和用途,所述重组病毒和/或重组病毒载体编码从高多样性核酸文库产生的不同的抗体或抗体片段。优选地,所述重组病毒是经基因修饰的低免疫原性病毒,例如,E2b缺失型腺病毒。所述高多样性核酸文库包含或衍生自(1)VH‑CDR1/2子文库,(2)多个VH‑CDR3子文库,和(3)VL子文库,其中的每个包含多个成员。优选地,所述子文库的每个成员包含至少一个具有多个简并位置的随机盒。在一个特别优选的实施例中,将所述VH‑CDR1/2子文库、所述多个VH‑CDR3子文库和所述VL子文库的至少两个成员的至少部分进行重组以形成表达文库中的表达文库成员,其中所述表达文库的每个成员编码不同的抗体或抗体片段。
103 一种甲基化特异性单端锚定多重PCR扩增子文库的构建方法和试剂 CN202311773335.2 2023-12-21 CN117737198A 2024-03-22 李宏志; 刘悦; 许立志; 明鸿博; 李丽珍; 李杰
发明公开了一种甲基化特异性单端锚定多重PCR扩增子文库的构建方法和试剂盒,属于分子生物学领域。本发明利用分子标签和通用序列组成的短Y接头、特异性甲基化捕获引物和带有Index的适用于测序平台的富集引物组成的引物组构建了适用于甲基化突变位点检测的多重PCR文库构建方法。本发明设计了与结直肠癌密切相关的9个抑癌基因启动子区域的甲基化突变捕获引物组合,使用该引物组合可精准筛选结直肠癌相关基因甲基化突变位点。本发明的甲基化特异性单端锚定多重PCR建库方法具有灵敏度高,简便快捷的特点,提高了模板分子的利用率并降低了背景噪音,大幅提高了结直肠癌筛查的灵敏度和特异性,降低了结直肠癌筛查的操作难度,增加了准确性。
104 一种灵活多变的降低污染及PCR偏倚的多标签二代测序文库接头 CN201911112475.9 2019-11-14 CN112795990B 2024-03-22 李英镇; 徐祖元; 吴红龙
发明公开了一种灵活多变的降低污染及PCR偏倚的多标签二代测序文库接头。本发明提供了接头,由DNA单链A(5’端到3’端依次为前导区、随机标签、固定区、标签1和引物1结合区)和DNA单链B(5’端到3’端依次为固定区1、引物2结合区、固定区2、标签2和前导区)退火形成。本发明能为二代测序的DNA文库加入多个标签序列,大大提高样本间的分辨率。同时能为每个插入片段加入唯一序列,可识别原始插入片段及PCR复制子。因此本发明能解决病原生物筛查中由于单标签污染导致的假阳性以及突变检测中的由于PCR扩增导致的突变比例偏移。所有本发明在病原微生物检测、肿瘤基因检测、单基因病检测等领域均具有较大的应用价值。
105 制备DNA纳米球的双链DNA接头及其制备方法、试剂盒以及它们的用途 CN202280048808.X 2022-07-07 CN117730156A 2024-03-19 杨林; 杨贵芳; 聂自豪; 张韶红; 张艳艳; 吕硕; 王业钦; 陈芳
发明涉及制备DNA纳米球的双链DNA接头及其制备方法、试剂盒以及它们的用途。具体地,该制备DNA纳米球的双链DNA接头,其中,所述双链DNA接头具有互补的第一链和第二链,其中,所述第一链和所述第二链分别独立地在3’末端具有3’粘性末端;所述第二链以及可选的第一链在5’末端具有磷酸化修饰;和所述第二链上设置有可选的缺口,前提是,当所述第一链在5’末端具有磷酸化修饰时,所述第二链具有至少一个所述缺口。
106 一种绵羊全基因组10K SNP液相芯片及其应用 CN202311765452.4 2023-12-21 CN117721217A 2024-03-19 李发弟; 张煜坤; 王维民; 乐祥鹏; 李万宏; 张小雪; 翁秀秀; 张德印; 赵源; 李晓龙; 赵利明; 徐丹; 程江博; 杨晓斌; 马宗武
发明提供了一种绵羊全基因组10K液相芯片及应用,该绵羊全基因组10K液相芯片用于检测包括以下定位于绵羊参考基因组Oar_rambouillet_v1.0上的11346个SNP位点和1个Y染色体的片段,利用设计的液相芯片可以通过靶向捕获测序技术实现绵羊基因分型。本发明的液相芯片可用于绵羊遗传多样性分析、品种鉴定、性别判定、亲缘关系鉴定、全基因组关联分析以及基因组选择育种。
107 一种短读长测序检测目标基因突变位点的引物及其设计方法和应用 CN202311721237.4 2023-12-13 CN117721180A 2024-03-19 吴炳义; 罗喜鹏; 马宗灏; 高峰; 姚芳; 刘星沅; 冯俊清
申请公开一种短读长测序检测目标基因突变位点的引物及其设计方法和应用,用于短读长测序检测多种目标基因突变位点的引物组合,由SEQ ID NO:1~SEQ ID NO:31所示的序列组成或由SEQ ID NO:32~SEQ ID NO:52所示的序列组成。所述引物组合可用于制备用于短读长测序检测癌致癌基因突变位点的试剂盒,还可用于基于短读长测序构建肺癌致癌基因文库。本申请在引物设计方面做特殊设计,让突变位点靠近测序端,控制PCR引物起点到突变点距离在50bp内,测序长度大于等于SE50则可,可缩短三分之二到四分三的测序时间的测序时间,同时降低测序成本。
108 RNA快速建库方法及其应用 CN202110673954.9 2021-06-17 CN113322523B 2024-03-19 陈晶晶; 江翱; 马海玲; 侯策; 王嫚; 曹振; 宋东亮
发明提供一种RNA快速建库方法(Easy‑seq),其步骤包括:提取样本中的total RNA,采用逆转录阻碍探针法去除rRNA,同时逆转录获得一端带有P7序列的cDNA;对多余的随机引物进行消解处理;对cDNA进行多聚腺苷酸化,在cDNA的3’端加上polyA,采用带有3’突出末端的双链DNA接头,在cDNA的另一端接上P5序列;文库扩增及回收。Easy‑seq具有耗时短、操作简单和损失小等优点,因此可以应用于单细胞转录组测序(scEasy‑seq)。相较于已有的scRNA‑seq技术,scEasy‑seq具有基因检出率高、RNA信息完整和建库产量高等优点,是一种高效灵敏的单细胞转录组测序技术,可以广泛应用于科学研究和疾病诊断等领域。
109 甲基化测序DNA文库的构建方法及其应用 CN201911233926.4 2019-12-05 CN110938674B 2024-03-19 黄晓强; 刘菲菲; 区小华; 陈禹欣; 杨娟; 赵薇薇; 于世辉
发明涉及一种甲基化测序DNA文库的构建方法,包括:a)使用一端带接头的随机引物和/或半随机引物扩增重亚硫酸盐处理后的单链DNA,得到同时具有所述接头和所述单链DNA互补链的中间体DNA;其中所述接头具有由衔接物连接在一起的两段测序接头序列,且所述衔接物具有AP位点;b)用单链DNA环化连接酶将所述中间体DNA的两端连接得到环化DNA;以及c)使用APE酶切割所述环化DNA中的AP位点以去环化。该方法构建的文库多样性好,且基本不影响后续的测序过程。
110 用于文库构建和序列分析的组合物和方法 CN201880040459.0 2018-04-18 CN110770354B 2024-03-19 杰弗里·A·戈尔; 阿瑟瓦·高赫; 刘蕊
本公开内容涉及用于构建多核苷酸文库和/或多核苷酸测序的方法。还公开了相关的试剂盒和装置。本公开内容还涉及用于通过例如多核苷酸测序进行基因和基因组分析的组合物、试剂盒、装置和方法。在特定方面,本文中提供了用于在测序期间以提高的连接效率和转化率构建文库的组合物、试剂盒和方法。在特定实施方案中,本文中的组合物、试剂盒和方法用于分析受试者体内的多核苷酸片段,例如循环多核苷酸片段,包括循环肿瘤DNA。
111 基于人基因组扩增子的illumina测序文库构建的引物组合 CN202410143213.3 2024-02-01 CN117701691A 2024-03-15 吴康; 赵建华; 张腾; 范小勇; 罗卫峰; 东亚娟; 纪逸群
发明公开了基于人基因组扩增子的illumina测序文库构建的引物组合,所述引物组合通过改变引物3’端基序列或引入硫代磷酸酯键修饰得到。本发明所公开的基于人基因组扩增子的illumina测序文库构建的引物组合,能降低非目标条带的扩增。
112 一种基于5’连接的单链DNA特异的高通量测序方法 CN202410166121.7 2024-02-06 CN117701679A 2024-03-15 刘德培; 谢龑; 马兰枝
发明属于生物技术领域,具体涉及一种基于5’连接的单链DNA特异的高通量测序方法。具体包括一种制备基于5’末端连接的单链DNA测序文库的方法,所述方法包括以下对待测样本处理的步骤:步骤1)使用不含外切酶活性的DNA聚合酶补齐dsDNA5’末端;步骤2)3’末端加尾;步骤3)连接复性处理的5’茎环接头,所述5’茎环接头的结构是:突出末端‑随机基区‑第一茎区‑环区‑第二茎区,所述第一茎区与第二茎区通过复性形成双链;步骤4)对连接产物进行扩增。所述扩增的产物构成单链DNA测序文库。
113 一种减少接头二聚体的小RNA建库方法及应用 CN202311608004.3 2023-11-28 CN117701677A 2024-03-15 赵永席; 陈锋; 余骅航
发明公开了一种减少接头二聚体的小RNA建库方法及应用,可以从抑制形成和形成后消除两个方面减少接头二聚体,实现对小RNA的高效建库。该建库方法中减少接头二聚体的步骤包括:核酸探针接头设计,DNA聚合酶聚合反应和限制性内切酶酶切反应。该建库方法可特异性抑制接头二聚体的文库构建,阻止接头二聚体在后续PCR反应中被扩增,显著降低文库接头二聚体比例,提高目标文库的扩增效率,实现小RNA的精准建库和测序。
114 用于检测基因CYP2C8多态性的探针、建库试剂 CN202311689768.X 2023-12-11 CN117701558A 2024-03-15 丁琳枫; 林筱剑; 周桂兰; 孙翠莲; 肖建锋
发明提供了一种用于检测基因CYP2C8多态性的探针组CYP2C8Panel以及一种利用杂交捕获法检测药物基因组学相关基因CYP2C8多态性的建库试剂盒。该建库试剂盒以极低起始量的基因组DNA为模板,通过酶切法构建文库后,利用个性化定制的探针组CYP2C8Panel对文库进行快速杂交,15分钟即可达到常规需要过夜反应才能达到的杂交效率,对获得的靶向文其进行高通量测序并进行生物信息学分析和比对,即可快速完成CYP2C8基因的多态性检测,并对其进行精准分型,可以用于指导罗格列等降糖药的用药,同时也为他克莫司和紫杉醇等药物的用药毒副作用提供参考,临床应用前景广阔。
115 酸棒杆菌启动子库及其应用 CN202311466406.4 2023-11-06 CN117683771A 2024-03-12 陈振; 竺方欢
发明涉及生物化工技术领域,具体公开了谷酸棒杆菌启动子库及其应用。本发明的启动子库,包含核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示的启动子,其中,n代表a、t、c、g中的任意一种。本发明构建的启动子库具有不同表达强度的启动子,尤其具备高强度表达的启动子,可根据基因表达需求,从启动子库中选择合适的启动子用以更精准地调控基因的表达量。
116 一种制备组织单细胞悬液的试剂盒及其使用方法与应用 CN202311735753.2 2023-12-15 CN117683704A 2024-03-12 黄刚; 向颖彬; 文湘钰; 许美娟; 罗超伟; 刘佳怡; 唐顺学
发明公开了一种制备组织单细胞悬液的试剂盒及其使用方法与应用,涉及生物技术领域。该试剂盒包括:含有0.20~0.30w/v%胰蛋白酶和0.02%~0.04w/v%EDTA的解离酶A液;含有0.5~1.2mg/mL胶原酶II、1.25~2.75mg/mL胶原酶Ⅳ、13.0~17.0μg/mL DNase I和0.04~0.06mg/mL DispaseⅡ的解离酶B液;红细胞裂解液;两种解离酶液的介质均为等渗溶液。该试剂盒用于快速解离肺组织,制备单细胞悬液,且制得的单细胞悬液的细胞浓度高,细胞活性高,结团率低,背景干净无杂质,能够用于细胞原代培养、流式分析及单细胞测序等实验。
117 一种双链DNA结合蛋白-转座酶融合蛋白及文库构建方法 CN202310829608.4 2023-07-07 CN116813800B 2024-03-12 易文洋; 江明扬; 瞿志鹏; 曹林; 朱涵雪; 李玉东; 徐琴
申请提供了一种包含双链DNA结合蛋白‑转座酶融合蛋白以及文库构建方法,属于生物技术领域。本申请的融合蛋白能够有效提高转座酶对DNA的亲和性,改善转座酶的GC偏好以及GC抖动,并且增加对微量病原微生物核酸的捕获能
118 一种构建RNA文库的方法和试剂 CN202311638841.0 2023-11-30 CN117661124A 2024-03-08 殷雷; 孙再桥; 雷骏; 何柏晓; 陈鹏
发明提供了一种构建RNA文库的方法,所述方法包括:从RNA样品中富集获得mRNA,所述富集过程中将所述mRNA打断成mRNA小片段;采用第一引物对所述mRNA小片段进行逆转录并纯化,获得第一链cDNA;采用第二引物扩增所述第一链cDNA并纯化,获得第二链cDNA;采用第三引物扩增所述二链cDNA,获得RNA文库;该方法能够简化建库的过程并有效降低建库成本,通过两轮带有接头序列的cDNA的合成,同步完成模板的逆转录和双端接头序列的引入,并完成模板的富集,实现了低成本且快速高效的建库。
119 一种多样品混合的单细胞建库方法 CN202311638029.8 2023-12-02 CN117661123A 2024-03-08 吴声鹏; 杨文哲; 李强; 黄海波
申请涉及生物信息学技术领域,公开了一种多样品混合的单细胞建库方法,将每个样品的基因组DNA进行打断,获取集中带分布在500bp的DNA片段;对获取到的DNA片段加入与黏性末端结合的黏性引物,加入末端补平试剂进行混合反应;根据DNA片段设计初始引物,将若干个标签分别与设计得到的初始引物进行连接,得到融合引物;采用A接头将第一融合引物与DNA片段的首端进行连接,采用P接头将第二融合引物与DNA片段的末端进行连接;磁珠纯化;对首尾各具有不同融合引物的DNA片段进行PCR扩增;定量、混样后,进行琼脂糖凝胶分离纯化得到单细胞测序文。本申请,有利于降低成本,具有较高的可靠性。
120 一种单链和双链DNA合并建库的方法 CN202311647497.1 2023-12-01 CN117660600A 2024-03-08 汪彪; 曲燕; 吴强
发明提供了对包括单链DNA片段和双链DNA片段的样品构建测序文库的方法,包括步骤:1)使用双链接头在所述样品中进行接头连接反应,其中所述双链接头包括分子标签序列;以及2)对步骤1)中获得的产物进行单链建库。本发明还提供了对所制备的测序文库进行测序和数据分析的方法。本发明方法通过在制备测序文库的过程同时进行双链和单链建库,既保留样本中双链DNA的互补状态信息,又能将不完整的DNA也制备成文库,将会最大限度地保留样本中的序列信息。
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