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序号 专利名 申请号 申请日 公开(公告)号 公开(公告)日 发明人
61 一种基于扩增子测序检测FH基因突变的文库构建方法 CN202410142317.2 2024-02-01 CN117965706A 2024-05-03 曾宪旭; 张佩; 闫广伟
发明公开了一种基于扩增子测序检测FH基因突变的文库构建方法,属于基因测序技术领域;包括以下步骤:先使用针对FH基因序列特异修饰引物对靶DNA进行PCR扩增富集,使扩增产物带上特异性与接头扩增引物相结合的序列,得到第一轮PCR产物;使用磁珠纯化第一轮PCR产物,得到富集PCR纯化产物;再使用接头扩增引物对富集PCR纯化产物进行扩增并加上测序接头,包括Ill‑iXX‑P5序列,Ill‑iXX‑P7序列和标签序列(Index),完成测序文库的构建;将文库用于下一步高通量测序仪器进行检测,得到目标序列信息。本发明结合优化的PCR反应程序和高保真Taq酶的使用,在普通PCR平台上实现对样品核酸中目标序列进行用于高通量测序使用的文库构建,以实现对多基因多靶点突变进行准确、快速检测。
62 利用融合多肽的蛋白酶介导的靶向特异性细胞因子递送 CN202280062659.2 2022-07-15 CN117957258A 2024-04-30 维什努·普里亚卡·雷迪·千千力; 南部健; 井川智之; 山本阳平; 佐藤元彦; 广庭奈绪香
发明涉及包含配体结合结构域、蛋白酶切割位点和配体部分的融合蛋白。本发明的融合蛋白包含配体结合结构域、配体部分和蛋白酶切割位点,当蛋白酶切割位点被蛋白酶切割活化时,恢复配体的生物活性。本发明还涉及生产融合蛋白的方法、它们的用途和包含所述融合蛋白的药物组合物。本发明还涉及一种减少配体结合结构域内重链可变结构域(VH)和轻链可变结构域(VL)之间的缔合的方法,这种方法促进一个结构域与另一个的解离。本公开提供了融合蛋白,其中配体与恒定区的C端或配体结合结构域的N端融合。
63 突变型T4 DNA连接酶、试剂盒及其在文库构建中的应用 CN202410354818.7 2024-03-27 CN117946985A 2024-04-30 曹振; 杨春玲; 刘娜; 李麦麦
发明提供一种突变型T4 DNA连接酶,在野生型T4 DNA连接酶的基础上,至少具有下述的六个基酸位点突变:S14D、Q19I、S40Y、V108F、Q133M、N357P,还包括A85P、V169I、D480M中的0~3个突变位点,其中野生型T4 DNA连接酶的氨基酸序列如SEQ ID No.10所示。本发明还涉及突变型T4 DNA连接酶在文库构建中的应用。本发明含有耐盐的热稳定的突变型T4 DNA连接酶的建库试剂盒与常规的含有T4 DNA连接酶试剂盒相比,连接酶的热稳定性显著提高了、连接酶在高盐环境中的活性显著提高了、试剂盒更加耐储存、连接效率显著提高、自连率更低、试剂盒组分更少、操作更简洁,可以满足自动化平台建库的需求。
64 一种适用于高通量靶向基因组甲基化检测的文库构建方法及其试剂 CN202210190373.4 2022-02-28 CN114774514B 2024-04-30 娄加陶; 王琳; 郭志伟; 余佳佳; 杨国华
发明涉及一种适用于高通量靶向基因组甲基化检测的文库构建方法,步骤包括:将片段化DNA中非甲基化的C基转化为U碱基;通过若干线性扩增引物对包括靶向区域的步骤S1转化后的片段化DNA进行线性扩增;在步骤S2线性扩增后的产物中加入连接酶以及接头;对步骤S3连接后的产物进行PCR扩增,即得DNA测序文库分子;所述线性扩增所采用的酶组合物包括:至少一种具有3’‑5’外切酶活性的高保真DNA聚合酶和/或至少一种不具有3’‑5’外切酶活性的DNA聚合酶。本发明的文库构建方法通过在高保真DNA聚合酶中添加其他类型的DNA聚合酶,以有效提高线形扩增效率,并提升文库转化效率,最终达到有效检测稀有的甲基化DNA分子(占比0.3%)。
65 用于改进编索引的核酸文库中的样品鉴定的组合物和方法 CN201880042059.3 2018-04-23 CN110785492B 2024-04-30 迈克尔·切斯尼; V·P·史密斯; 克莱尔·贝维斯-莫特; 乔纳森·马克·鲍特尔; 安吉拉·卡尔班德
发明涉及组合物和方法,所述组合物和方法用于通过在扩增和测序之前,通过外切核酸酶处理和任选地封闭从多个样品汇集的编索引(pooled indexed)的多核苷酸的3’末端来提高用于多重下一代测序的编索引的核酸文库制备物中的正确样品鉴定率。
66 一种高效富集甲基化位点的甲基化测序文库建库方法 CN202410091297.0 2024-01-22 CN117926429A 2024-04-26 孙雪光; 朱辰; 童石渊; 唐诗灿; 魏从翀; 吴晓晖
发明提供了一种用于高效富集甲基化位点的甲基化测序文库的构建方法,其可高效富集核酸中的甲基化位点,以更低用量和更高检出率来检测核酸中的甲基化程度。
67 基于三代测序技术的靶向RNA测序方法及系统 CN202310830408.0 2023-07-07 CN117925777A 2024-04-26 赵方庆; 张金阳; 左振强
发明公开基于三代测序技术的靶向RNA测序方法及系统。本发明的测序方法包括在去除核糖体RNA的总RNA样本中,利用多路反转录法取得全转录组的全长cDNA;将全转录组的全长cDNA片段进行环化和滚环扩增,并根据片段大小筛选得到目标产物,利用目标产物构建纳米孔测序文库;在上机测序时,选择性富集靶标转录本;并利用特定算法同时获得靶标与非靶标分子的丰度信息,进而评估转录本的真实丰度信息。本发明的方法和系统可以在富集目的转录本的同时,对全基因组进行无偏定量。此外,本发明还在测序过程中提供可编程的控制系统,可以让用户批量指定富集靶标。本发明的方法在临床快速诊断和靶向转录本富集的场景具有广泛的应用前景。
68 一种天冬酰胺内肽酶介导的多肽环化方法及在噬菌体展示肽库中的应用 CN202410092951.X 2024-01-23 CN117925757A 2024-04-26 方葛敏; 朱雯静; 万晓翠; 张燕妮; 孙晓园
发明提供一种天冬酰胺内肽酶介导的多肽环化方法及在噬菌体展示肽库中的应用,涉及基因编码的多肽库修饰和环化技术领域。本发明首次建立了一种基于天冬酰胺内肽酶(asparaginyl endopeptidase,AEP)催化的体系来制备大环肽文库的平台技术,通过运用于噬菌体展示的多肽文库的酶法环化修饰产生大规模噬菌体展示的环肽库,并用于筛选针对目标蛋白的环肽配体。本发明中涉及的酶催化多肽环化技术具有反应条件温和、环化效率高、序列特异性高的优势,其产生的噬菌体环肽库可用于发现独特环状结构的环肽配体,是一种强大的环肽体外筛选平台技术。
69 基于人基因组扩增子的illumina测序文库构建的引物组合 CN202410143213.3 2024-02-01 CN117701691B 2024-04-26 吴康; 赵建华; 张腾; 范小勇; 罗卫峰; 东亚娟; 纪逸群
发明公开了基于人基因组扩增子的illumina测序文库构建的引物组合,所述引物组合通过改变引物3’端基序列或引入硫代磷酸酯键修饰得到。本发明所公开的基于人基因组扩增子的illumina测序文库构建的引物组合,能降低非目标条带的扩增。
70 一种构建抗体互补决定区文库的方法 CN202080085735.2 2020-12-13 CN114929737B 2024-04-19 盛夏; 吴政宪; 邱奕凯
一种构建抗体互补决定区(CDR)文库的方法和装置。以及用于确定抗体CDR文库的各个成员序列出现频率的方法、装置和计算机程序产品。通过所述方法、装置和计算机程序产品能够获得一个或多个位置具有特定基酸分布的抗体CDR文库。
71 制备肽文库或肽的方法 CN202280050149.3 2022-04-27 CN117897391A 2024-04-16 C·海尼斯; S·哈贝希安; G·K·莫图库里; M·许特尔; M·默茨; G·桑古阿尔; Z·博格纳尔; A·L·尼尔森
发明涉及一种制备肽文库或分离肽的方法,所述方法包括(a)从固相释放一种或多种线性二硫醇肽,其在所述一种或多种肽的N末端区域中携带巯基,并且通过所述一种或多种肽的C末端区域中的二硫键固定在所述固相上,所述释放是通过以下进行的:(i)还原所述二硫键,从而从所述固相释放所述一种或多种线性二硫醇肽的物质,其中所述物质是挥发性的并且可通过蒸发除去,或(ii),其使所述一种或多种线性二硫醇肽的N末端区域中的巯基去质子化,从而诱导分子内二硫键交换,从而以一种或多种环肽的形式从所述固相释放所述一种或多种线性二硫醇肽。
72 高通量测序质控用文库及其制备方法和应用 CN202410289937.9 2024-03-14 CN117887812A 2024-04-16 陈辉; 王旭彤; 莫敏俐; 陈钊; 刘玉忠; 张艳; 万冲; 侯光远; 张峰; 许军普
发明涉及基因测序技术领域,尤其涉及一种高通量测序质控用文库及其制备方法和应用。本发明提供的高通量测序质控用文库在每个位置的碱基占比均是均衡的。将本发明提供的高通量测序质控用文库与待测样本文库混合后共同上机测序,可消除因待检样本文库碱基序列的不平衡性所导致的测序质量降低,提高对不平衡文库测序的准确性。
73 用于识别或量化在生物样品中的靶标的方法和组合物 CN202311572899.X 2018-02-02 CN117887804A 2024-04-16 马龙·斯托基斯; 皮特·斯密博特; 布莱恩·侯克-卢米斯
描述了包括一个或多个构建体的组合物、试剂盒和方法,每个构建体包括配体,该配体通过连接体与例如寡核苷酸序列的聚合物构建体连接或缀合,每个配体特异性结合位于细胞中或细胞表面上的单个靶标。聚合物构建体包括a)扩增柄;b)特异性识别单个配体的条形码;c)可选的独特分子标识符,该独特分子标识符定位于邻近条形码的5'或3'端;和d)锚,该锚用于与互补序列杂交,例如,用于产生双链寡核苷酸。这些组合物用在包括高通量方法的方法中,用于检测生物样品中的一个或多个靶标或表位。在高通量方法中还使用这些组合物用于通过同时检测位于细胞中或细胞上的一个或多个表位及其转录组来表征细胞。
74 与GYM-B特异性结合的适配体及其应用 CN202410253744.8 2024-03-06 CN117887721A 2024-04-16 胡波; 于豪冰; 刘小宇; 朱玉平; 宁哲; 孙园园; 崔名慧; 孟宪超; 丁金峰
发明公开了与GYM‑B特异性结合的适配体及其应用,属于裸甲藻亚胺毒素检测技术领域,两条与GYM‑B特异性结合的适配体为G15和G15a,序列分别如SEQ ID NO.1和SEQ ID NO.2所示。本发明弥补了尚无与GYM‑B特异性结合的适配体的空白,提供的适配体能与GYM‑B特异性结合,检测灵敏度高、亲和强、稳定性好,其中G15a与GYM‑B的亲和力最高,达到64nM,可以用于GYMs、GYM‑B的检测,进而有效防止接触、误食GYMs污染的和水产品引起的中毒;提供的适配体制备成本低、免疫原性低、性质稳定、方便修饰,可以大幅降低GYMs的检测成本、简化检测过程、提高检测准确性和效率。
75 一种On-DNA亚磺酰亚胺类化合物及其合成方法 CN202311794392.9 2023-12-25 CN117867664A 2024-04-12 孙兆美; 仲萤; 胡允金; 陈雅慧; 邓梅; 杨珂新
申请属于医药研究中先导化合物库构建领域,具体涉及On‑DNA亚磺酰亚胺类化合物库的构建。本申请所述On‑DNA亚磺酰亚胺类先导化合物由寡聚核酸‑硫醚类化合物被化得到。本发明不仅丰富了在DNA上合成编码化合物库的化学反应类型,反应条件温和,转化率高达99%;且为合成DNA编码化合物库构建了新的On‑DNA亚磺酰亚胺类化合物,在先导药物开发中具有非常好的应用前景。
76 一种肿瘤突变小肽展示文库的构建方法 CN202311758869.8 2023-12-19 CN117867662A 2024-04-12 陶生策; 祁环; 马明亮; 李阳
发明涉及一种肿瘤突变小肽展示文库的构建方法,包括以下步骤:S1、在肿瘤突变后的突变蛋白基酸序列上进行截取,获取突变小肽氨基酸序列;S2、将突变小肽氨基酸序列转换成为对应的核苷酸序列;S3、添加共有序列,获得寡聚核苷酸序列;S4、获得寡聚核苷酸实物;S5、扩增寡聚核苷酸;S6、构建小肽展示文库。本发明通过使用突变小肽替代突变蛋白的策略,整合大规模寡聚核苷酸合成技术、展示技术等,构建肿瘤相关突变的小肽展示文库,并为肿瘤相关突变的研究提供实物材料。
77 用于检测呼吸道病原体的引物组合、试剂盒及应用 CN202410276401.3 2024-03-12 CN117867180A 2024-04-12 陈辉; 莫敏俐; 王旭彤; 陈钊; 刘玉忠; 张艳; 万冲; 侯光远; 刘鑫; 张峰; 许军普
发明涉及核酸测序技术领域,尤其涉及用于检测呼吸道病原体的引物组合、试剂盒及应用。本发明提供的引物组合中,各序列仅含病原体或人基因组的靶核酸序列,不含有非靶序列,确保了病原体核酸的高效扩增。同时,本发明提供的引物组合在多重PCR中具有高特异性和高灵敏度,对不同病原体型别检测的包容性强,多对引物之间形成的二聚体极少,使得对多种病原体的检测更加准确。
78 用于制备序列文库的方法和组合物 CN202311756448.1 2015-06-12 CN117867071A 2024-04-12 R·里加蒂; N·A·戈姆利
发明涉及用于制备序列文库的方法和组合物。本文中提供的实施方案涉及用于下一代测序的方法和组合物。一些实施方案包括从与表面接触的靶核酸制备模板文库,以及对该表面上的文库进行测序。
79 端粒扩增子测序用试剂盒及预文库构建方法 CN202311498553.X 2023-11-13 CN117230171B 2024-04-12 纪鑫; 倪守峰; 王伟伟; 田埂
发明公开端粒扩增子测序用试剂盒及预文库构建方法。本发明设计了一种端粒特异性接头,其包括引物结合区和含有封闭基团的端粒特异性结合区,该端粒特异性结合区能够与端粒3’端悬臂的至少部分特异性结合。本发明的端粒特异性接头可识别完整端粒末端,并避免非完整末端被建库。此外,本发明在端粒序列附近的基因组序列上还设计了针对端粒扩增使用的端粒特异性PCR引物,在连接接头后不需要进行酶切处理,同时也不需要再在片段两端添加通用接头,进一步简化了实验流程。
80 一种校正测序错误的UMI序列设计方法及其应用 CN202210314024.9 2022-03-28 CN114774516B 2024-04-12 于源; 叶睿; 黎美燕; 李暾; 廖信辉; 李艳; 李淼; 王光杓; 吴东方; 高志博
申请公开了一种校正测序错误的UMI序列设计方法及其应用。本申请的UMI序列设计方法,包括将UMI序列设计为由X个基序列为单元进行Y次串联重复的序列,UMI序列如公式一:(N1…NX)Y,其中,N表示A、T、C、G碱基中的任意一种,(N1…NX)表示X个碱基序列组成的单元,Y表示单元序列重复的次数;2≤X≤6,Y≥3。本申请的UMI序列设计方法,UMI序列的每一个碱基都被测序至少3次,能够校正UMI序列测序错误中出现的任意的单碱基错误,提高测序结果中UMI序列读取的准确率;可以适用于100000×以上深度测序的UMI序列测序错误校正。
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