1.向受试者引入氨氧化微生物(AOM)的方法，包括:
向受试者肠内施用包含AOM的制剂。
2.前述权利要求任一项所述的方法，其中肠内施用包括口服、颊、唇下或舌下施用。
3.向受试者引入AOM的方法，包括:
向受试者直肠施用包含AOM的制剂。
4.前述权利要求任一项所述的方法，其中直肠施用包括通过栓剂或灌肠剂施用。
5.前述权利要求任一项所述的方法，其中直肠施用与粪便微生物群移植程序结合。
6.在受试者的胃肠系统中定殖AOM的方法，包括:
向受试者的胃肠系统施用有效量的包含AOM的制剂,
其中所述AOM定殖于胃肠系统的靶组织。
7.改善受试者消化的方法，包括:
向受试者施用有效量的包含AOM的制剂，从而改善受试者的消化。
8.治疗受试者胃肠疾病的方法，包括:
向受试者施用有效量的包含AOM的制剂，从而治疗胃肠疾病。
9.前述权利要求任一项所述的方法，其中施用的量和/或频率足以在受试者的胃肠系
统的至少一部分中增加粘液稠度。
10.前述权利要求任一项的方法，其中所述包含AOM的制剂通过摄入而施用于受试者的
胃肠系统。
11.前述权利要求任一项的方法，其中当施用制剂时，受试者基本上空腹。
12.前述权利要求任一项的方法，其中所述制剂在施用抗生素或清洁肠道制剂后施用。
13.前述权利要求任一项的方法，其中将目标百分比的被施用的AOM转移至受试者的胃
肠系统。
14.前述权利要求任一项的方法，其进一步包括在施用所述制剂后向所述受试者施用
水。
15.前述权利要求任一项的方法，其中施用所述制剂导致与所述受试者摄取的食物或
饮料相关的营养物质的耐受性增加、敏感性降低和/或营养物质的摄取得到改善。
16.前述权利要求任一项所述的方法，其中所述胃肠疾病为炎性病症。
17.前述权利要求任一项所述的方法，其中所述炎性病症为结肠炎、坏死性小肠结肠
炎、炎性肠病、溃疡、克罗恩病、溃疡性结肠炎、乳糜泻、谷蛋白敏感、胃灼热、胰腺炎、阑尾炎、胃炎、胃肠炎、肠易激综合征、或牙齿或牙周病症。
18.前述权利要求任一项的方法，其中所述胃肠疾病涉及乳糖、食物或饮料不耐受、
SIBO、吸收不良症、胆道疾病、反流或缺氧。
19.前述权利要求任一项的方法，其中所述炎性病症与基于导管的物质递送相关，该物
质例如为肠内营养。
20.前述权利要求任一项的方法，其中施用在医疗程序之前或之后进行，该医疗程序例
如为导管插入术、内窥镜检查或结肠镜检查程序、或牙科程序。
21.前述权利要求任一项所述的方法，其中所述炎性病症为一种或多种以下微生物引
起的感染：幽门螺杆菌、艰难梭状芽胞杆菌、霍乱、阿米巴痢疾、小肠结肠炎耶尔森氏菌、肠炎沙门氏菌、鼠伤寒沙门氏菌、宋内志贺菌和大肠杆菌。
22.前述权利要求任一项所述的方法，其中所述胃肠疾病的特征为便秘或腹泻。
23.前述权利要求任一项所述的方法，其中所述胃肠疾病的特征为高氨血症。
24.前述权利要求任一项所述的方法，其中所述胃肠疾病包括肝衰竭，例如急性或慢性
肝衰竭。
25.前述权利要求任一项所述的方法，其中沉积组织、靶组织或这两者为受试者的粘
膜。
26.前述权利要求任一项所述的方法，其中沉积组织、靶组织或这两者与受试者的胃相
关。
27.前述权利要求任一项所述的方法，其中沉积组织、靶组织或这两者为受试者的唾液
腺、口腔、咽部、舌、食管、肝、胆囊、总胆管、结肠(横向、上行和/或下行)、盲肠、阑尾、直肠、肛门、胰腺、胰管、大肠、或小肠(十二指肠、空肠、和/或回肠)。
28.前述权利要求任一项所述的方法，其中所述靶组织与所需的局部效果相关。
29.前述权利要求任一项所述的方法，其中所述靶组织与所需的全身效果相关。
30.前述权利要求任一项所述的方法，其中所需全身效果涉及治疗以下一种或多种疾
病：头痛、心血管疾病、炎症、免疫应答、自身免疫性疾病、肝疾病、感染、神经病、精神性疾病、一氧化氮疾病、尿素循环障碍、充血、血管舒张疾病、皮肤病、创伤愈合、昆虫叮咬反应、眼科疾病、结缔组织疾病和一些病毒、细菌或真菌感染。
31.前述权利要求任一项所述的方法，其中施用有效量的制剂促进内皮功能。
32.前述权利要求任一项所述的方法，其中施用有效量的制剂在靶组织或循环中改变
或修改亚硝酸盐或NO的水平。
33.前述权利要求任一项所述的方法，其中施用有效量的制剂调节与受试者的胃肠系
统相关的微生物组。
34.前述权利要求任一项所述的方法，其中施用是设备辅助的。
35.前述权利要求任一项所述的方法，其中所述制剂在胃肠病症发作之前施用。
36.前述权利要求任一项所述的方法，其中所述制剂在胃肠病症发生期间施用。
37.前述权利要求任一项所述的方法，其中所述制剂在胃肠病症消退后施用。
38.前述权利要求任一项所述的方法，其中所述制剂是响应于胃肠症状、触发或警告标
志例如不适或排便习惯改变而给予的。
39.前述权利要求任一项所述的方法，进一步包括确定受试者是否需要治疗胃肠疾病。
40.前述权利要求任一项所述的方法，其中所述制剂作为溶液、悬浮液、乳剂、软膏、凝胶、水凝胶或液体例如滴剂、喷雾剂、气雾剂、或雾剂施用。
41.前述权利要求任一项所述的方法，其中所述制剂配制为片剂或胶囊。
42.前述权利要求任一项所述的方法，其中所述制剂包含微球体或微囊。
43.前述权利要求任一项所述的方法，其中所述制剂配制为与受试者的胃肠系统相容。
44.前述权利要求任一项所述的方法，其中施用减少了受试者的腹胀、腹泻、胃胀气、胃疼、胃痉挛或腹鸣。
45.前述权利要求任一项所述的方法，其中所述制剂配制为用于立即释放或延长的释
放。
46.前述权利要求任一项所述的方法，其中所述制剂配制为局部或全身递送亚硝酸盐
或NO至靶组织。
47.前述权利要求任一项所述的方法，其中所述制剂配制为用于跨粘膜递送和/或循
环，例如局部或全身。
48.前述权利要求任一项所述的方法，进一步包括向受试者施用第二量的制剂。
49.前述权利要求任一项所述的方法，其中所述制剂作为组合治疗的一部分给予。
50.前述权利要求任一项所述的方法，进一步包括与该制剂组合施用第二治疗。
51.前述权利要求任一项所述的方法，其中所述制剂在开始第二治疗之前施用一段时
间。
52.前述权利要求任一项所述的方法，其中所述制剂与第二治疗同时施用。
53.前述权利要求任一项所述的方法，其中所述制剂在停止第二治疗后施用一段时间。
54.前述权利要求任一项所述的方法，其中所述第二治疗通过不同的施用方式施用，例
如通过吸入或鼻内技术。
55.前述权利要求任一项所述的方法，其中所述受试者具有治疗水平的第二治疗。
56.前述权利要求任一项所述的方法，其中所述制剂与抗炎剂联合施用。
57.前述权利要求任一项所述的方法，其中所述制剂与治疗相关的疾病或障碍或相关
的疾病或障碍的症状的医疗方法联合施用，所述医疗方法例如为被批准治疗或通常用于治疗的。
58.前述权利要求任一项所述的方法，其中所述制剂在手术或诊断程序之前或之后施
用。
59.前述权利要求任一项所述的方法，其中所述制剂与运动、纤维、通便剂、抗利尿剂、益生菌、治疗剂或压力管理一起施用。
60.前述权利要求任一项所述的方法，其中所述制剂与治疗以下疾病的治疗组合施用：
结肠炎、坏死性小肠结肠炎、炎性肠病、溃疡、克罗恩病、溃疡性结肠炎、乳糜泻、谷蛋白敏感、胃灼热、胰腺炎、阑尾炎、胃炎、胃肠炎或肠易激综合征。
61.前述权利要求任一项所述的方法，其中所述制剂与亚硝酸盐、硝酸盐和/或NO联合
施用。
62.前述权利要求任一项所述的方法，其中所述有效量为AOM的治疗有效剂量。
63.前述权利要求任一项所述的方法，其中所述AOM的治疗有效剂量为约1 x 103、104、
105、106、107、108、109、1010、1011、1012、1013或1014CFU或大于约1 x 103、104、105、106、107、108、
109、1010、1011、1012、1013、或1014CFU。
64.前述权利要求任一项所述的方法，其中所述制剂作为镇痛剂施用。
65.前述权利要求任一项所述的方法，其中所述制剂作为预防剂施用。
66.前述权利要求任一项所述的方法，其中所述的制剂是自我施用的。
67.前述权利要求任一项所述的方法，其中所述制剂每天施用约1、2、3、4、5、6、7、8、9、
10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23或24次。
68.前述权利要求任一项所述的方法，其中所述制剂施用约1-3、3-5、5-7、7-9、5-10、
10-14、12-18、12-21、21-28、28-35、35-42、42-49、49-56、46-63、63-70、70-77、77-84或84-
91天。
69.前述权利要求任一项所述的方法，其中所述制剂在受试者从睡眠中醒来后的30、
60、90、120、150或180分钟内施用。
70.前述权利要求任一项所述的方法，其中所述制剂在受试者睡觉前的30、60、90、120、
150或180分钟内施用。
71.前述权利要求任一项所述的方法，其中所述制剂在受试者进食的30、60、90、120、
150或180分钟内食用。
72.前述权利要求任一项所述的方法，其中所述制剂在受试者清洁或淋浴前的30、60、
90、120、150或180分钟施用。
73.前述权利要求任一项所述的方法，其中所述受试者为女性。
74.前述权利要求任一项所述的方法，其中所述受试者为男性。
75.前述权利要求任一项所述的方法，其中所述受试者的特征是以下种族/民族之一：
亚洲人、黑人或非裔美国人、西班牙裔或拉丁裔、白人或多种族。
76.前述权利要求任一项所述的方法，其中所述受试者具有被破坏的微生物组。
77.前述权利要求任一项所述的方法，其中所述受试者的年龄小于1岁，或为1-5、5-10、
10-20、20-30、30-40、40-50、50-60岁，或超过60岁。
78.前述权利要求任一项所述的方法，其中所述制剂在缓冲溶液，例如，水性缓冲溶液
中包含AOM。
79.前述权利要求任一项所述的方法，其中所述缓冲溶液，例如，水性缓冲溶液，在水中包含磷酸二钠和氯化镁，例如，50mM Na2HPO4和2mM MgCl2。
80.前述权利要求任一项所述的方法，其中所述缓冲溶液，例如，水性缓冲溶液，基本上由在水中的磷酸二钠和氯化镁组成，例如，50mM Na2HPO4和2mM MgCl2。
81.前述权利要求任一项所述的方法，其中所述缓冲溶液，例如，水性缓冲溶液，由在水中的磷酸二钠和氯化镁组成，例如，50mM Na2HPO4和2mM MgCl2。
82.前述权利要求任一项所述的方法，其中所述制剂的特征为生理pH水平。
83.前述权利要求任一项所述的方法，其中所述制剂还包含促进AOM的生长或代谢、NO
产生和/或脲酶活性的化合物或与该化合物同时施用。
84.前述权利要求任一项所述的方法，其中所述制剂包含氨、铵盐和尿素中至少一种。
85.前述权利要求任一项所述的方法，其中所述制剂包含控释材料，例如，缓慢释放材
料。
86.前述权利要求任一项所述的方法，其中所述制剂进一步包含赋形剂，例如，药学上
可接受的赋形剂。
87.前述权利要求任一项所述的方法，其中所述赋形剂包括吸收或渗透增强剂、防腐
剂、抗氧化剂、缓冲液、螯合剂、离子交换剂、增溶剂、悬浮剂、增稠剂、表面活性剂、湿润剂、张力调节剂、酶抑制剂或用于适当药物递送的载体。
88.前述权利要求任一项所述的方法，其中所述制剂包含粘膜粘附剂。
89.前述权利要求任一项所述的方法，其中所述制剂包含崩解剂、螯合剂、包衣剂、改良释放产品、或填充剂。
90.前述权利要求任一项所述的方法，其中所述制剂基本上不含其它生物体。
91.前述权利要求任一项所述的方法，其中所述制剂包含约1 x 103CFU/mL至约1 x 
1014CFU/mL AOM。
92.前述权利要求任一项所述的方法，其中所述制剂包含约1 x 109CFU/mL至约10 x 
109CFU/mL AOM。
93.前述权利要求任一项所述的方法，其中所述AOM包含氨氧化细菌(AOB)。
94.前述权利要求任一项所述的方法，其中所述AOM基本上由AOB组成。
95.前述权利要求任一项所述的方法，其中所述AOM由AOB组成。
96.前述权利要求任一项所述的方法，其中所述AOM包括亚硝化单胞菌属、亚硝化球菌
属、亚硝化螺菌属、亚硝化囊菌属、亚硝化叶菌属、亚硝化弧菌属及其组合。
97.前述权利要求任一项所述的方法，其中所述AOM为真养亚硝化单胞菌
(N.eutropha)。
98.前述权利要求任一项所述的方法，其中所述AOM为真养亚硝化单胞菌D23，其具有的
ATCC登记号为PTA-121157。
99.前述权利要求任一项所述的方法，其中所述AOM包括氨氧化古生菌(AOA)。
100.前述权利要求任一项所述的方法，其中所述AOM能够以至少约1pmol/min/mg蛋白
质的速率，例如，至少约0.1nmol/min/mg蛋白质的速率将氨或铵转化为亚硝酸盐。
101.前述权利要求任一项所述的方法，其中所述制剂施用至第一组织，例如沉积组织，
例如，通过摄取而施用。
102.前述权利要求任一项所述的方法，其中所述第一组织为靶组织。
103.前述权利要求任一项所述的方法，其中所述第一组织不为靶组织，例如，该制剂施
用于第一组织，且该制剂或制剂的产物，例如，NO，被运输到第二组织，所述运输例如为通过扩散，所述第二组织例如为靶组织。
104.前述权利要求任一项所述的方法，其中所述第二治疗包括手术程序。
105.前述权利要求任一项所述的方法、其中所述赋形剂包括抗粘着剂、结合剂、包衣
剂、崩解剂、填充剂、调味剂、着色剂、润滑剂、助流剂、吸附剂、防腐剂、或增甜剂。
106.前述权利要求任一项所述的方法，其中生物群友好的产品与施用的包含AOM的制
剂联合使用。
107.前述权利要求任一项中所述的包含AOM的制剂，其用于肠内施用至受试者。
108.前述权利要求任一项所述的制剂，其中所述制剂为食品。
109.前述权利要求任一项所述的制剂，其中所述食品包括食物、饮料、补充剂、营养品、添加剂或医疗营养品。
110.前述权利要求任一项中所述的包含AOM的制剂，其用于治疗受试者的胃肠疾病。
111.前述权利要求任一项中所述的制剂，其中所述制剂被包装以用于一次性使用。
112.前述权利要求任一项中所述的制剂，其中所述制剂被包装以用于多次使用。
113.前述权利要求任一项中所述的制剂，其包含AOM和其它生物体，例如，生物体的群
落。
114.一种设备，其配置为向受试者的胃肠系统的靶组织施用前述权利要求任一项中所
述的包含AOM的制剂。
115.一种试剂盒，其包含前述权利要求任一项中所述的包含AOM的制剂。