1.一种植物病原体生物控制系统，包括以下步骤：
-产生具有抑制RNaselll活性的基因修饰内生细菌；
-用核酸结构转化所述基因修饰内生细菌，所述核酸结构包含编码至少一种小抑制性核糖核酸(siRNA)的多核苷酸，所述小抑制性核糖核酸(siRNA)能够形成针对植物病原体中至少一个目标序列的双链RNA(dsRNA)或发夹(hpRNA)；
-将所述基因修饰的内生细菌引入植物；并且
-表达所述核酸结构足够时间以诱导所述植物中的RNA干扰(RNAi)机制，其中所述RNAi机制导致植物病原体中所述至少一个目标序列的下调。
2.根据权利要求1所述的方法，其中所述将所述基因修饰的内生细菌引入植物的步骤包括选自以下组的步骤：通过一次或多次浸泡、喷雾、注射、雾化释放、环境雾化释放、水源中的环境雾化释放、冻干、冷冻干燥、微胶囊化、干燥、在水性载体中、在溶液中、刷洗、敷料、滴涂和涂覆。
3.根据权利要求2所述的方法，其中所述植物是单子叶植物和/或双子叶植物。
4.根据权利要求3所述的方法，其中所述植物选自以下之一：谷物、玉米、小麦、水稻、大麦、燕麦、高粱、小米、向日葵、红花、棉花、大豆、菜籽油、苜蓿、拟南芥、大麻、土豆、芸苔、花生、烟草、热带水果及花卉、香蕉、浮萍、唐菖蒲、甘蔗、菠萝、红枣、洋葱、菠萝、腰果、开心果、鲜花、观赏植物、针叶树、落叶类、葡萄、柑橘、玫瑰、苹果、桃子、草莓、杏仁、咖啡、橡树、豆类、豆科植物、西瓜、南瓜、卷心菜、萝卜、芥末、仙人掌、山核桃、亚麻、红薯、大豆、椰子、鳄梨、甜菜、香瓜和蔬菜。
5.根据权利要求4所述的方法，其中所述植物病原体包含选自以下组的植物病原体：植物病毒；植物类病毒；真菌；害虫、食草动物和霉菌。
6.根据权利要求5所述的方法，其中所述植物病毒选自以下之一：烟草花叶病毒(TMV)；
番茄斑点枯萎病毒(TSWV)；番茄黄叶卷曲病毒(TYLCV)；黄瓜花叶病毒(CMV)；马铃薯病毒y(PVY)；花椰菜花叶病毒(CaMV)；非洲木薯花叶病毒(ACMV)；梅痘病毒(PPV)；雀麦花叶病毒(BMV)；马铃薯病毒X(PVX)；柑橘衰退病毒、大麦黄矮病毒、马铃薯卷叶病毒和番茄和丛生矮缩病毒。
7.根据权利要求6所述的方法，其中所述目标序列系选：病毒关键区序列、病毒家族的保守序列及不同病毒家族成员间的保守序列。
8.根据权利要求6所述的方法，其中所述抑制的目标序列选自：所述烟草花叶病毒中的复制酶基因、运动蛋白、外壳蛋白；所述番茄斑点枯萎病毒中的糖蛋白(GPs)、NSm蛋白、NSs蛋白、病毒RNA基因组片段L、M、S；所述番茄黄叶卷曲病毒中的V1、V2、C1、C2、C3、C4、VI蛋白；
所述黄瓜花叶病毒中的la、2a2b蛋白、3a、外壳蛋白；所述马铃薯病毒Y中的PI、HC-Pro、P3、
6kl、CI、6k2、Nia、Nib、CP；所述花椰菜花叶病毒中的运动蛋白、两种蚜虫传播因子(P2和/或P3)、衣壳蛋白前体(P4)、蛋白酶多蛋白前体、P5、P6蛋白；所述非洲木薯花叶病毒中的AVI、AV2、AC1、AC2、AC3、AC4、BCl、BV1；所述梅痘病毒中的PI、HC-Pro、P3、6k1、CI、6k2、Nia、Nib、CP；所述雀麦花叶病毒中的la、2a、运动蛋白、外壳蛋白；所述马铃薯病毒X中的复制酶、TGB1、TGB2、TGB3、外壳蛋白。
8.根据权利要求4所述的方法，所述真菌选自：稻瘟病菌；灰霉病菌；柄锈菌属；禾谷镰刀菌；尖孢镰刀菌；小麦白粉病菌；禾生球腔菌；炭疽病属；黑粉菌；亚麻锈菌；大豆锈菌；立枯丝核菌。
9.根据权利要求8所述的方法，其中所述目标序列选自：真菌必需基因的关键区序列、必需基因家族的保守序列和不同病毒家族成员中的保守必需基因。
10.根据权利要求1、7和9所述的方法，其中所述目标序列选自：RNA的非编码区，RNA的编码区；所述目标序列含有RNA的剪接位点。
11.根据权利要求1所述的方法，其中所述核酸结构是质粒。
12.根据权利要求11所述的方法，其中所述质粒被修饰以包括来自质粒组的目标序列，所述质粒由以下组成：pAD-WRKY-GHY1；PAD-ADH-GHY2；pOXB-WRKY-GHY3；POXB-ADH-GHY4；
PAD-WRKY-GHY5；hpRNApAD-ADH-GHY6；和hpRNA pAD-WRKY-GHY7。
13.根据权利要求1所述的方法，其中所述siRNA与启动子可操作地连接，所述siRNA配置成能够形成针对植物病原体中至少一种目标序列的双链RNA(dsRNA)或发夹(hpRNA)。
14.根据权利要求13所述的方法，其中所述启动子包含选自下组的启动子：非组成型启动子；诱导型启动子、病原体诱导型启动子；组织优选启动子；组织特异性启动子、植物特异性启动子或组成型启动子。
15.根据权利要求1所述的方法，其中所述具有抑制RNaseIII的基因修饰内生细菌选自：酸杆菌、放线菌、α-变形菌、装甲菌、拟杆菌、β-变形菌、δ-变形菌、厚壁菌、γ-变形菌、TM7、芽孢杆菌、大肠杆菌。
16.根据权利要求15所述的方法，其中所述基因修饰内生细菌是M-JM109-GHY2。
17.根据权利要求15所述的方法，其中所述基因修饰内生细菌是枯草芽孢杆菌CCB422。
18.根据权利要求15所述的方法，其中所述基因修饰内生细菌是大肠杆菌HT27或
HT115。
19.根据权利要求1和18所述的方法，其中所述具有抑制RNaseIII的基因修饰内生细菌包含具有超囊泡活性的基因修饰内生细菌JC8031，和/或具有一种或多种营养缺陷的基因修饰内生细菌，所述营养缺陷足以增强与其他细菌的纳米管形成。
20.根据权利要求1所述的方法，其中所述siRNA在整个植物中迁移。
21.根据权利要求1所述的方法，其中所述表达所述核酸结构足够时间以诱导所述植物中的RNA干扰(RNAi)机制，其中所述RNAi机制导致植物病原体中所述至少一个目标序列的下调的步骤包括，连续表达所述核酸结构并由此在所述植物中启动持续RNAi机制的步骤，其中所述持续RNAi机制使植物对所述植物病原体感染具有比野生型植物更大的抗性。
22.根据权利要求1所述的方法，还包括共表达至少一种辅助基因的步骤。
23.根据权利要求1所述的方法，还包括针对植物病原体中至少一种不同目标序列共表达至少一种其它siRNA分子的步骤。
24.根据权利要求22所述的方法，其中所述辅助基因选自：VrrA；SID1；SID2；AGOl；
AG02，AG07；YmdB；YmdB；Staufen；RDE-4；hlyA；Sec-和Tat-分泌信号肽；一种或多种细胞穿透肽(CPPs)；Tat；触角足肽；ACC脱氨酶；一种或多种韧皮部RNA转运蛋白；PP2-A1；PSRP1；
DRB1；DRB4；HEN1和STVl。
25.根据权利要求23所述的方法，其中所述共表达的辅助基因是从所述核酸结构和/或在所述基因修饰的内生细菌中转化的第二核酸结构。
26.根据权利要求5所述的方法，其中所述植物包含病原体感染的植物。
27.根据权利要求1所述的方法，其中所述植物包含未被所述植物病原体感染的植物。
28.根据权利要求9所述的方法，其中所述真菌植物病原体的所述一种目标序列选自：
在所述稻瘟病度中的MoABCl、MoMAC1及MoPMK1、Iug6、Iug9及Iug18、MoMpg1、MoEmpl、MoMhpl、MoMsp1、MC69和Slp1；在所述灰霉病菌中的Bcpgl和BMP1；所述柄锈菌属中的APK、亲环蛋白、钙调磷酸酶调节亚基、分泌蛋白等；禾谷镰刀菌中的MAP1和MAP激酶gpmk1；尖孢镰刀菌中的MAP激酶、pg1、致病相关基因、分泌蛋白；小麦白粉病菌中的效应基因Avra10、致病相关基因、分泌蛋白；禾生球腔菌中的致病相关基因、MgSlt2,ABC转运蛋白基因MgAtr1和MgAtr2、分泌蛋白；炭疽病属中的CMK1和Clk1，致病相关基因蛋白质10、分泌蛋白；黑粉菌中的致病相关基因、Kpp2、ukc1、分泌蛋白；和亚麻锈菌中的致病相关基因、分泌蛋白。
29.根据权利要求1所述的方法，其中所述小抑制性核糖核酸(siRNA)被配置为下调植物病原体的至少一种必需基因，所述小抑制性核糖核酸(siRNA)具有一种或多种特异性RNA基序，所述RNA基序可掺入dsRNA以促进其通过植物韧皮部的传输。
30.一种向植物递送抑制性RNA分子的跨界系统，包括以下步骤：
-产生具有抑制RNaseIII活性的基因修饰内生细菌；
-用核酸结构转化所述基因修饰的内生细菌，所述核酸结构包含编码至少一种小抑制性核糖核酸(siRNA)的多核苷酸，所述多核苷酸被配置为下调植物病原体的至少一种必需基因；
-将所述基因修饰内生细菌引入植物；
-表达所述核酸结构足够时间以诱导所述植物中的RNA干扰(RNAi)机制，其中所述RNAi机制导致植物病原体中所述至少一个目标序列的下调。
31.根据权利要求30所述的向植物递送抑制性RNA分子的跨界系统，其中所述siRNA包含与所述植物病原体至少一种必需基因的目标序列完全或部分互补的一种或多种hpRNA。
32.根据权利要求31所述的向植物递送抑制性RNA分子的跨界系统，其中所述将基因修饰内生细菌引入植物的步骤包括选自下组的步骤：通过一次或多次浸泡、喷雾、注射、雾化释放、环境雾化释放、水源中的环境雾化释放、冻干、冷冻干燥、微胶囊化、干燥、在水性载体中、在溶液中、刷洗、敷料、滴涂和涂覆。
33.根据权利要求31所述的向植物递送抑制性RNA分子的跨界系统，其中所述植物是单子叶植物和/或双子叶植物。
34.根据权利要求33所述的向植物递送抑制性RNA分子的跨界系统，其中所述植物选自：谷物、玉米、小麦、水稻、大麦、燕麦、高粱、小米、向日葵、红花、棉花、大豆、菜籽油、苜蓿、拟南芥、大麻、土豆、芸苔、花生、烟草、热带水果及花卉、香蕉、浮萍、唐菖蒲、甘蔗、菠萝、红枣、洋葱、菠萝、腰果、开心果、鲜花、观赏植物、针叶树、落叶类、葡萄、柑橘、玫瑰、苹果、桃子、草莓、杏仁、咖啡、橡树、豆类、豆科植物、西瓜、南瓜、卷心菜、萝卜、芥末、仙人掌、山核桃、亚麻、红薯、大豆、椰子、鳄梨、甜菜、香瓜和蔬菜。
35.根据权利要求34所述的向植物递送抑制性RNA分子的跨界系统，其中所述植物病原体包含选自以下组的植物病原体：植物病毒；植物类病毒；真菌；害虫、食草动物和霉菌。
36.根据权利要求35所述的向植物递送抑制性RNA分子的跨界系统，其中所述植物病毒选自以下之一：烟草花叶病毒(TMV)；番茄斑点枯萎病毒(TSWV)；番茄黄叶卷曲病毒(TYLCV)；黄瓜花叶病毒(CMV)；马铃薯病毒Y(PVY)；花椰菜花叶病毒(CaMV)；非洲木薯花叶病毒(ACMV)；梅痘病毒(PPV)；雀麦花叶病毒(BMV)；马铃薯病毒X(PVX)；柑橘衰退病毒、大麦黄矮病毒、马铃薯卷叶病毒和番茄和丛生矮缩病毒。
37.根据权利要求36所述的向植物递送抑制性RNA分子的跨界系统，其中所述病毒植物病原体的至少一个必须基因选自：病毒关键区序列、病毒家族的保守序列及不同病毒家族成员间的保守序列。
38.根据权利要求37所述的向植物递送抑制性RNA分子的跨界系统，其中所述病毒植物病原体的必需基因选自：所述烟草花叶病毒中的复制酶基因、运动蛋白、外壳蛋白；所述番茄斑点枯萎病毒中的糖蛋白(GPs)、NSm蛋白、NSs蛋白、病毒RNA基因组片段L、M、S；所述番茄黄叶卷曲病毒中的V1、V2、C1、C2、C3、C4、VI蛋白；所述黄瓜花叶病毒中的la、2a2b蛋白、3a、外壳蛋白；所述马铃薯病毒Y中的PI、HC-Pro、P3、6kl、CI、6k2、NIa、Nib、CP；所述花椰菜花叶病毒中的运动蛋白、两种蚜虫传播因子(P2和/或P3)、衣壳蛋白前体(P4)、蛋白酶多蛋白前体、P5、P6蛋白；所述非洲木薯花叶病毒中的AVI、AV2、AC1、AC2、AC3、AC4、BCl、BV1；所述梅痘病毒中的PI、HC-Pro、P3、6k1、CI、6k2、NIa、Nib、CP；所述雀麦花叶病毒中的la、2a、运动蛋白、外壳蛋白；所述马铃薯病毒X中的复制酶、TGB1、TGB2、TGB3、外壳蛋白。
39.根据权利要求35所述的向植物递送抑制性RNA分子的跨界系统，其中所述真菌选自：稻瘟病菌；灰霉病菌；柄锈菌属；禾谷镰刀菌；尖孢镰刀菌；小麦白粉病菌；禾生球腔菌；
炭疽病属；黑粉菌；亚麻锈菌；大豆锈菌；立枯丝核菌。
40.根据权利要求39所述的向植物递送抑制性RNA分子的跨界系统，其中所述真菌植物病原体的至少一种必需基因选自：真菌必需基因的关键区序列、真菌基因家族的保守序列和不同真菌基因家族成员中的保守序列。
41.根据权利要求40所述的向植物递送抑制性RNA分子的跨界系统，其中所述真菌植物病原体的至少一种必需基因选自：在所述稻瘟病度中的MoABCl、MoMAC1及MoPMK1、Iug6、Iug9及Iug18、MoMpg1、MoEmpl、MoMhpl、MoMsp1、MC69和Slp1；在所述灰霉病菌中的Bcpgl和BMP1；所述柄锈菌属中的APK、亲环蛋白、钙调磷酸酶调节亚基、分泌蛋白等；禾谷镰刀菌中的MAP1和MAP激酶gpmk1；尖孢镰刀菌中的MAP激酶、pg1、致病相关基因、分泌蛋白；小麦白粉病菌中的效应基因Avra10、致病相关基因、分泌蛋白；禾生球腔菌中的致病相关基因、MgSlt2,ABC转运蛋白基因MgAtr1和MgAtr2、分泌蛋白；炭疽病属中的CMK1和Clk1，致病相关基因蛋白质10、分泌蛋白；黑粉菌中的致病相关基因、Kpp2、ukc1、分泌蛋白；和亚麻锈菌中的致病相关基因、分泌蛋白。
42.根据权利要求30所述的向植物递送抑制性RNA分子的跨界系统，其中所述核酸结构是质粒。
43.根据权利要求42所述的向植物递送抑制性RNA分子的跨界系统，其中所述质粒被修饰以包括来自质粒组的基因序列：pAD-WRKY-GHY1；PAD-ADH-GHY2；POXB-WRKY-GHY3；pOXB-ADH-GHY4；pAD-WRKY-GHY5；hpRNA pAD-ADH-GHY6；和hpRNA pAD-WRKY-GHY7。
44.根据权利要求42所述的向植物递送抑制性RNA分子的跨界系统，其中所述核酸结构包含编码至少一种小抑制性核糖核酸(siRNA)的多核苷酸，所述siRNA被配置为下调至少一种植物病原体的必需基因，并与启动子连接。
45.根据权利要求44所述的向植物递送抑制性RNA分子的跨界系统，其中所述启动子包含选自下组的启动子：非组成型启动子；诱导型启动子、病原体诱导型启动子；组织优选启动子；组织特异性启动子、植物特异性启动子或组成型启动子。
46.根据权利要求30所述的向植物递送抑制性RNA分子的跨界系统，其中所述具有抑制RNaseIII的基因修饰内生细菌选自：酸杆菌、放线菌、α-变形菌、装甲菌、拟杆菌、β-变形菌、δ-变形菌、厚壁菌、γ-变形菌、TM7、芽孢杆菌、大肠杆菌。
47.根据权利要求46所述的向植物递送抑制性RNA分子的跨界系统，其中所述基因修饰内生细菌是M-JM109-GHY2。
48.根据权利要求46所述的向植物递送抑制性RNA分子的跨界系统，其中所述基因修饰内生细菌是枯草芽孢杆菌CCB422。
49.根据权利要求46所述的向植物递送抑制性RNA分子的跨界系统，其中所述基因修饰内生细菌是大肠杆菌HT27或HT115。
50.根据权利要求30和49所述的向植物递送抑制性RNA分子的跨界系统，其中所述具有抑制RNaseIII的基因修饰内生细菌包含具有超囊泡活性的基因修饰内生细菌JC8031，和/或具有一种或多种营养缺陷的基因修饰内生细菌，所述营养缺陷足以增强与其他细菌的纳米管形成。
51.根据权利要求30所述的向植物递送抑制性RNA分子的跨界系统，其中所述siRNA在整个植物中迁移。
52.根据权利要求30所述的向植物递送抑制性RNA分子的跨界系统，其中所述表达所述核酸结构足够时间以诱导所述植物中的RNA干扰(RNAi)机制，其中所述RNAi机制导致植物病原体中所述至少一个目标序列的下调的步骤包括，包括连续表达所述核酸结构并由此在所述植物中启动持续RNAi机制的步骤，其中所述持续RNAi机制使植物对所述植物病原体感染具有比野生型植物更大的抗性。
52.根据权利要求30所述的向植物递送抑制性RNA分子的跨界系统，还包括共表达至少一种辅助基因的步骤。
53.根据权利要求52所述的向植物递送抑制性RNA分子的跨界系统，其中所述辅助基因选自：VrrA；SID1；SID2；AGOl；AG02，AG07；YmdB；YmdB；Staufen；RDE-4；hlyA；Sec-和Tat-分泌信号肽；一种或多种细胞穿透肽(CPPs)；Tat；触角足肽；ACC脱氨酶；一种或多种韧皮部RNA转运蛋白；PP2-A1；PSRP1；DRB1；DRB4；HEN1和STVl。
54.根据权利要求30所述的向植物递送抑制性RNA分子的跨界系统，其中所述小抑制性核糖核酸(siRNA)被配置为下调植物病原体的至少一种必需基因，所述小抑制性核糖核酸(siRNA)具有一种或多种特异性RNA基序，所述RNA基序可掺入dsRNA以促进其通过植物韧皮部的传输。
55.一种抑制植物中病原体的方法，包括以下步骤：
-产生具有抑制RNaseIII活性的基因修饰内生细菌；和
-用核酸结构转化所述基因修饰的内生细菌，所述核酸结构包含编码至少一种小抑制性核糖核酸(siRNA)的多核苷酸，所述siRNA被配置为通过植物中RNA干扰(RNAi)机制的诱导下调植物病原体的至少一种必需基因；
-将所述基因修饰内生细菌引入植物。
56.一种评估对癌症受试者施用组蛋白脱乙酰酶(HDAC)抑制剂疗法治疗的功效或有效性的方法，该方法包括比较：
-在时间t0从受试者获得的第一样品中测量的生物标记的表达水平，其中所述标记是选自表4中确定的组的生物标记；在时间tj从受试者获得的第二样品中的生物标记的水平；
和，
-其中第二样品中生物标记水平相对于第一样品的变化表明组蛋白脱乙酰酶(HDAC)抑制剂治疗对于治疗受试者的癌症是有效的。
57.根据权利要求56所述的方法，其中所述比较在一定范围的时间内重复。
58.一种评估植物中RNA介导的病原体抑制效果的方法，该方法包括比较：
-确定在时间t0从植物获得的第一样品中测量的植物病原体靶基因的表达水平，
-产生抑制RNaseIII活性的基因修饰内生细菌，其中所述具有核酸结构的基因修饰内生细菌包含编码至少一种小抑制性核糖核酸(siRNA)的多核苷酸，所述小抑制性核糖核酸(siRNA)能够形成针对植物病原体中至少一个靶基因的双链RNA(dsRNA)或发夹(hpRNA)；
-在时间t1将所述基因修饰的内生细菌引入植物；并且
-允许表达所述核酸结构以在所述植物中诱导RNA干扰(RNAi)机制，其中所述RNAi机制导致植物病原体中所述至少一种目标序列的下调；和
-确定在时间t2从植物获得的第一样品中测量的所述植物病原体靶基因的表达水平。
59.权利要求58所述的方法，其中所述比较在一定范围的时间内重复。
60.一种治疗病原体感染的植物的方法，包括以下步骤：
-引入有效量的具有抑制RNaseIII活性的基因修饰内生细菌，其中具有核酸结构的所述基因修饰的内生细菌包含包含编码至少一种小抑制性核糖核酸(siRNA)的多核苷酸，所述小抑制性核糖核酸(siRNA)能够形成针对植物病原体中至少一个目标序列的双链RNA(dsRNA)或发夹(hpRNA)。
60.一种产生抗虫植物的方法，包括以下步骤：
-产生具有抑制RNaseIII活性的基因修饰内生细菌；
-用核酸结构转化所述基因修饰的内生细菌，所述核酸结构包含编码至少一种小抑制性核糖核酸(siRNA)的多核苷酸，所述小抑制性核糖核酸(siRNA)能够形成针对害虫或食草动物中至少一个必须基因的双链RNA(dsRNA)或发夹(hpRNA)；
-将所述基因修饰的内生细菌引入植物；
-表达所述核酸结构足够时间以诱导所述植物中的RNA干扰(RNAi)机制，其中所述RNAi机制导致针对害虫或食草动物中至少一种必需基因的hpRNA的dsRNA积累，所述害虫或食草动物具有由害虫和/或食草动物消耗的植物，使得针对害虫中至少一种必需基因的hpRNA的dsRNA诱导RNA干扰(RNAi)机制，导致在所述害虫和/或食草动物中至少一种必需基因的抑制。
61.根据权利要求60所述的方法，其中所述经基因修饰的内生细菌可定殖于害虫肠道。
62.根据权利要求60所述的方法，其中所述siRNA包含与昆虫的至少一个外骨骼基因的目标序列完全或部分互补的一种或多种hpRNA。
63.根据权利要求62所述的方法，其中所述病毒害虫或食草动物的至少一种必需基因选自害虫或食草动物的关键区序列、害虫或食草动物家族的保守序列以及不同害虫或草食动物家族成员之间的保守序列。
64.根据权利要求63的所述方法，其中所述具有抑制RNaseIII活性的基因修饰内生细菌是芽孢杆菌和/或大肠杆菌。
64.根据权利要求64所述的方法，其中所述基因修饰内生细菌选自：M-JM109-GHY2；枯草芽孢杆菌CCB422、HT27、HT115、JC8031。
65.根据权利要求64所述的方法，还包括共表达至少一种辅助基因的步骤。
66.根据权利要求65的方法，其中所述辅助基因选自：VrrA；SID1；SID2；AGOl；AG02，AG07；YmdB；YmdB；Staufen；RDE-4；hlyA；Sec-和Tat-分泌信号肽；一种或多种细胞穿透肽(CPPs)；Tat；触角足肽；ACC脱氨酶；一种或多种韧皮部RNA转运蛋白；PP2-A1；PSRP1；DRB1；
DRB4；HEN1和STVl。