一种ASO靶点预测系统 |
|||||||
| 申请号 | CN202321791759.7 | 申请日 | 2023-07-10 | 公开(公告)号 | CN220753084U | 公开(公告)日 | 2024-04-09 |
| 申请人 | 元升生物科技(上海)有限公司; | 发明人 | 陈开华; 蒙艳; | ||||
| 摘要 | 本实用新型涉及基因技术领域，具体是一种ASO靶点预测系统，包括：信息获取模 块 、检测模块、筛选模块、匹配模块以及排序模块，其中信息获取模块用于获取靶标的mRNA序列以及ASO信息，检测模块将根据ASO信息，对靶标的mRNA序列中对应ASO信息的 碱 基靶点连接 位置 进行扫描检测，筛选模块将所述ASO信息以及对应ASO信息的碱基连接位置进行分析，通过统计模型筛选靶标的mRNA序列中具有较高结合 力 的ASO靶点集合，匹配模块将ASO靶点集合与ASO进行依次匹配评分，确定各个目标ASO靶点对应的匹配分值，排序模块按照所述匹配分值的大小，对各个所述目标ASO靶点进行排序，并展示排序后的所述目标ASO靶点，从而通过本实用新型提高ASO靶点预测的准确性。 | ||||||
| 权利要求 | 1.一种ASO靶点预测系统，其特征在于，包括： |
||||||
| 说明书全文 | 一种ASO靶点预测系统技术领域[0001] 本实用新型涉及基因技术领域，具体是一种ASO靶点预测系统。 背景技术[0002] ASO中文名为反义寡核苷酸，是具有多种化学性质的短核酸类似物，可通过碱基配对识别靶mRNA序列。反义寡核苷酸一旦与它们的靶标杂交，就会充当空间阻断剂，阻断剪接因子来改变前mRNA剪接，或者可以通过阻止核糖体募集来阻断mRNA翻译，从而降低有害的蛋白质表达量，ASO的上述特点有望在不久的将来对许多神经系统疾病的治疗产生巨大影响。 [0003] 目前对ASO的应用往往需要预测其对应的靶点。而现有预测ASO靶点的方案非常少，且准确性差，从而本实用新型提供一种ASO靶点预测系统，用于提高ASO靶点预测的准确性。实用新型内容 [0004] 本实用新型的目的在于提供一种ASO靶点预测系统，用于提高ASO靶点预测的准确性。 [0005] 为实现上述目的，本实用新型提供一种ASO靶点预测系统，包括： [0006] 信息获取模块，用于获取靶标的mRNA序列以及ASO信息； [0007] 检测模块，用于根据ASO信息，对靶标的mRNA序列中对应ASO信息的碱基靶点连接位置进行扫描检测； [0008] 筛选模块，用于将所述ASO信息以及对应ASO信息的碱基连接位置进行分析，通过统计模型筛选靶标的mRNA序列中具有较高结合力的ASO靶点集合； [0009] 匹配模块，用于将ASO靶点集合与ASO进行依次匹配评分，确定各个目标ASO靶点对应的匹配分值； [0010] 排序模块，按照所述匹配分值的大小，对各个所述目标ASO靶点进行排序，并展示排序后的所述目标ASO靶点。 [0011] 作为本实用新型进一步的方案，所述ASO靶点集合包括多个ASO靶点。 [0012] 作为本实用新型进一步的方案，所述排序后的所述目标ASO靶点匹配分值由高到低进行排列。 [0013] 与现有技术相比，本实用新型通过设置信息获取模块、检测模块、筛选模块、匹配模块以及排序模块，通过信息获取模块获取靶标的mRNA序列以及ASO信息后，由检测模块将根据ASO信息对靶标的mRNA序列中对应ASO信息的碱基靶点连接位置进行扫描检测，筛选模块对扫描信息进行分析，通过统计模型筛选靶标的mRNA序列中具有较高结合力的ASO靶点集合，匹配模块将ASO靶点集合与ASO进行依次匹配评分，确定各个目标ASO靶点对应的匹配分值，并通过排序模块根据匹配分值的大小进行ASO靶点排序，并展示排序后的所述目标ASO靶点，从而通过本实用新型提高ASO靶点预测的准确性。附图说明 [0014] 图1为本实用新型提供的一种ASO靶点预测系统的流程示意图。 [0015] 附图中：1、信息获取模块；2、检测模块；3、筛选模块；4、匹配模块；5、排序模块。 具体实施方式[0016] 下面结合具体实施方式对本实用新型的技术方案作进一步详细地说明。 [0017] 如图1所示，在本实用新型实施例中，一种ASO靶点预测系统，包括信息获取模块1，用于获取靶标的mRNA序列以及ASO信息；检测模块2，用于根据ASO信息，对靶标的mRNA序列中对应ASO信息的碱基靶点连接位置进行扫描检测；筛选模块3，用于将所述ASO信息以及对应ASO信息的碱基连接位置进行分析，通过统计模型筛选靶标的mRNA序列中具有较高结合力的ASO靶点集合；匹配模块4，用于将ASO靶点集合与ASO进行依次匹配评分，确定各个目标ASO靶点对应的匹配分值；排序模块5，按照所述匹配分值的大小，对各个所述目标ASO靶点进行排序，并展示排序后的所述目标ASO靶点。 [0018] 进一步的，所述ASO靶点集合包括多个ASO靶点，具体的从靶标的mRNA序列中挑选多个初始ASO靶点，计算各个所述初始ASO靶点的结合力实际值，并根据各个所述结合力实际值的平均值，确定各个所述初始ASO靶点的结合力期望值，根据所述结合力实际值和所述结合力期望值，确定各个所述初始ASO靶点的结合力评分，选取预设个数的所述结合力评分较大的初始ASO靶点，得到ASO靶点集合。 [0019] 再进一步的，所述排序后的所述目标ASO靶点匹配分值由高到低进行排列，并根据更新后的匹配分值优选为分值最高部分的ASO靶点，确定最佳ASO靶点。 [0020] 综合以上所述，本实用新型通过设置信息获取模块1、检测模块2、筛选模块3、匹配模块4以及排序模块5，通过信息获取模块1获取靶标的mRNA序列以及ASO信息后，由检测模块2将根据ASO信息对靶标的mRNA序列中对应ASO信息的碱基靶点连接位置进行扫描检测，筛选模块3对扫描信息进行分析，通过统计模型筛选靶标的mRNA序列中具有较高结合力的ASO靶点集合，匹配模块4将ASO靶点集合与ASO进行依次匹配评分，确定各个目标ASO靶点对应的匹配分值，并通过排序模块5根据匹配分值的大小进行ASO靶点排序，并展示排序后的所述目标ASO靶点，从而通过本实用新型提高ASO靶点预测的准确性。 [0021] 上面对本实用新型的较佳实施方式作了详细说明，但是本实用新型并不限于上述实施方式，在本领域的普通技术人员所具备的知识范围内，还可以在不脱离本实用新型宗旨的前提下作出各种变化。 |
||||||
QQ群二维码
意见反馈
意见反馈