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一种乳腺癌基因检测试剂

阅读:941发布:2020-05-27

专利汇可以提供一种乳腺癌基因检测试剂专利检索,专利查询,专利分析的服务。并且本 发明 公开了一种 乳腺癌 基因检测 试剂 盒 ,包括 包装 盒体、 衬垫 和试管,所述衬垫设置在包装盒体的内部并且衬垫上设置有容器孔,试管包括引物试管、PCR反应液试管、SAP反应液试管、CODE反应液试管、接头试管、 磁珠 试管、阳性对照品试管和阴性对照品试管。本发明还公布了该试剂盒的使用方法。该产品实现了同时检测4个乳腺癌相关基因全部外显子序列的目的,从而告知被检者患乳腺癌的 风 险数值,提前 预防 和控制,指导医师选择正确的临床 治疗 方案 ,有利于患者进行针对性治疗;该产品将同一 疾病 相关基因的全部外显子检测整合在一个试剂盒内,使用更方便而且成本更低,对患乳腺癌风险性的评估也更便捷,更科学。,下面是一种乳腺癌基因检测试剂专利的具体信息内容。

1.一种乳腺癌基因检测试剂盒,其特征在于,包括包装盒体、衬垫和试管,所述衬垫设置在包装盒体的内部并且衬垫上设置有容器孔,试管包括引物试管、PCR反应液试管、SAP反应液试管、CODE反应液试管、接头试管、磁珠试管、阳性对照品试管和阴性对照品试管,引物试管、PCR反应液试管、SAP反应液试管、CODE反应液试管、接头试管、磁珠试管、阳性对照品试管和阴性对照品试管均放置在容器孔中,引物试管的数量为七个,第一个引物试管中引物的上游引物序列如SEQIDNo.1所述,第一个引物试管中引物的下游引物序列如SEQIDNo.2所述,第二个引物试管中引物的上游引物序列如SEQIDNo.3所述,第二个引物试管中引物的下游引物序列如SEQIDNo.4所述,第三个引物试管中引物的上游引物序列如SEQIDNo.5所述,第三个引物试管中引物的下游引物序列如SEQIDNo.6所述,第四个引物试管中引物的上游引物序列如SEQIDNo.7所述,第四个引物试管中引物的下游引物序列如SEQIDNo.8所述,第五个引物试管中引物的上游引物序列如SEQIDNo.9所述,第五个引物试管中引物的下游引物序列如SEQIDNo.10所述,第六个引物试管中引物的上游引物序列如SEQIDNo.11所述,第六个引物试管中引物的下游引物序列如SEQIDNo.12所述,第七个引物试管中引物的上游引物序列如SEQIDNo.13所述,第七个引物试管中引物的下游引物序列如SEQIDNo.14所述。
2.根据权利要求1所述的乳腺癌基因检测试剂盒,其特征在于,所述PCR反应液试管、SAP反应液试管、CODE反应液试管、磁珠试管、阳性对照品试管和阴性对照品试管的数量均为一个,接头试管的数量为12的整数倍。
3.根据权利要求1或2所述的乳腺癌基因检测试剂盒,其特征在于,所述包装盒体上端设置有封盖。
4.一种如权利要求1-3任一所述的乳腺癌基因检测试剂盒的使用方法,其特征在于,具体步骤如下:
步骤一,在PCR仪上扩增基因片段,每支引物试管的PCR扩增使用3个反应管,其中1个反应管为被检测样本,阳性对照和阴性对照各使用1个反应管,每个试管中总体积6.5ul,其中
3ulPCR反应液、1ul引物和2.5ul检测样本(基因组DNA、阳性对照和阴性对照)。
5.反应条件为:95℃下进行2分钟;45个循环的95℃,30秒,56℃,30秒,72℃,1分钟;72℃,5分钟;最终在4℃保存;
步骤二,扩增反应结束之后,使用SAP反应液对每管产物进行纯化,反应条件为:37℃,
60分钟;80℃、20分钟;最终在4℃保存;
步骤三,SAP反应液反应完成后,使用CODE反应液对每个样本的产物加不同的接头,反应条件为:95℃、10分钟;12个循环的95℃、15秒,60℃、30秒,72℃、30秒;72℃、3分钟;最终在4℃保存;
步骤四,CODE反应结束之后,使用磁珠对产物进行纯化,并使用QIAquick® Gel Extraction Kit回收产物中200-500bp的片段,反应结束后在Hiseq X10仪器上进行测序,根据得到的测序结果进行生物信息学分析,判断BRCA1、BRCA2、PALB2和RECQL基因的外显子序列是否存在致病突变。

说明书全文

一种乳腺癌基因检测试剂

技术领域

[0001] 本发明涉及一种试剂盒,具体是一种乳腺癌基因检测试剂盒。

背景技术

[0002] 乳腺癌是发生在乳腺腺上皮细胞组织的恶性肿瘤,乳腺癌中99%发生在女性,男性仅占1%。乳腺并不是维持人体生命活动的重要器官,原位乳腺癌并不致命,但由于乳腺癌细胞丧失了正常细胞的特性,细胞之间连接松散,容易脱落,一旦脱落,游离的癌细胞可以随血液或淋巴结播散全身,形成转移,危及生命。全球乳腺癌发生率自20世纪70年代末开始一直上升,且逐渐年轻化,严重威胁广大妇女的身体健康,因此,对乳腺癌的合理防治至关重要。
[0003] 乳腺癌是多因素、多基因和环境共同作用的结果,其家族遗传性早已被人们所认识。大量研究表明,与现已知的BRCA1、BRCA2,和PALB2、RECQL等这些基因突变相关的乳腺癌称为遗传性乳腺癌,占全部乳腺癌的5%-10%。随着乳腺癌发病率的增加,乳腺癌易感基因的研究越来越被重视。新一代测序技术为寻找这些易感基因的致病突变提供了一种新的平台。早期发现、早期诊断,将提高治疗的针对性,避免过度化治疗。利用现代科学研究成果,开发一项基于分子遗传基础的乳腺癌基因检测产品会对受检者罹患乳腺癌险性的评估更便捷,更科学,同时对易感基因突变携带者的临床应用也有很重要的意义。人们都是采用乳腺癌检测试剂盒对基因进行检测,现有的乳腺癌检测试剂盒只能检测几个致病SNP位点,其余的检测需要在别的试剂盒中进行检测,使用不方便并且加大了使用成本,花费时间长。

发明内容

[0004] 本发明的目的在于提供一种乳腺癌基因检测试剂盒,以解决上述背景技术中提出的问题。
[0005] 为实现上述目的,本发明提供如下技术方案:一种乳腺癌基因检测试剂盒,包括包装盒体、衬垫和试管,所述衬垫设置在包装盒体的内部并且衬垫上设置有容器孔,试管包括引物试管、PCR反应液试管、SAP反应液试管、CODE反应液试管、接头试管、磁珠试管、阳性对照品试管和阴性对照品试管,引物试管、PCR反应液试管、SAP反应液试管、CODE反应液试管、接头试管、磁珠试管、阳性对照品试管和阴性对照品试管均放置在容器孔中,引物试管的数量为七个,第一个引物试管中引物的上游引物序列如SEQIDNo.1所述,第一个引物试管中引物的下游引物序列如SEQIDNo.2所述,第二个引物试管中引物的上游引物序列如SEQIDNo.3所述,第二个引物试管中引物的下游引物序列如SEQIDNo.4所述,第三个引物试管中引物的上游引物序列如SEQIDNo.5所述,第三个引物试管中引物的下游引物序列如SEQIDNo.6所述,第四个引物试管中引物的上游引物序列如SEQIDNo.7所述,第四个引物试管中引物的下游引物序列如SEQIDNo.8所述,第五个引物试管中引物的上游引物序列如SEQIDNo.9所述,第五个引物试管中引物的下游引物序列如SEQIDNo.10所述,第六个引物试管中引物的上游引物序列如SEQIDNo.11所述,第六个引物试管中引物的下游引物序列如SEQIDNo.12所述,第七个引物试管中引物的上游引物序列如SEQIDNo.13所述,第七个引物试管中引物的下游引物序列如SEQIDNo.14所述。
[0006] 作为本发明进一步的方案: PCR反应液试管、SAP反应液试管、CODE反应液试管、磁珠试管、阳性对照品试管和阴性对照品试管的数量均为一个,接头试管的数量为12的整数倍。
[0007] 作为本发明进一步的方案:包装盒体上端设置有封盖。
[0008] 所述乳腺癌基因检测试剂盒的使用方法,具体步骤如下:步骤一,在PCR仪上扩增基因片段,每支引物试管的PCR扩增使用3个反应管,其中1个反应管为被检测样本,阳性对照和阴性对照各使用1个反应管,每个试管中总体积6.5ul,其中
3ulPCR反应液、1ul引物和2.5ul检测样本(基因组DNA、阳性对照和阴性对照)。反应条件为:
95℃下进行2分钟;45个循环的95℃,30秒,56℃,30秒,72℃,1分钟;72℃,5分钟;最终在4℃保存;
步骤二,扩增反应结束之后,使用SAP反应液对每管产物进行纯化,反应条件为:37℃,
60分钟;80℃、20分钟;最终在4℃保存;
步骤三,SAP反应液反应完成后,使用CODE反应液对每个样本的产物加不同的接头,反应条件为:95℃、10分钟;12个循环的95℃、15秒,60℃、30秒,72℃、30秒;72℃、3分钟;最终在4℃保存;
步骤四,CODE反应结束之后,使用磁珠对产物进行纯化,并使用QIAquick® Gel Extraction Kit回收产物中200-500bp的片段,反应结束后在Hiseq X10仪器上进行测序,根据得到的测序结果进行生物信息学分析,判断BRCA1、BRCA2、PALB2和RECQL基因的外显子序列是否存在致病突变。
[0009] 与现有技术相比,本发明的有益效果是:该产品设计合理,结构简单,运用多重PCR技术实现了同时检测4个乳腺癌相关基因全部外显子序列的目的,从而告知被检者患乳腺癌的风险数值,提前预防和控制,指导医师选择正确的临床治疗方案,有利于患者进行针对性治疗;该产品将同一疾病相关基因的全部外显子检测整合在一个试剂盒内,使用更方便而且成本更低,对患乳腺癌风险性的评估也更便捷,更科学。附图说明
[0010] 图1为乳腺癌基因检测试剂盒的结构示意图。
[0011] 其中:1-包装盒体,2-衬垫,3-引物试管,4-PCR反应液试管,5-SAP反应液试管,6-CODE反应液试管,7-接头试管,8-磁珠试管,9-阳性对照品试管,10-阴性对照品试管。

具体实施方式

[0012] 下面结合具体实施方式对本专利的技术方案作进一步详细地说明。
[0013] 请参阅图1,一种乳腺癌基因检测试剂盒,包括包装盒体1、衬垫2和试管,所述衬垫2设置在包装盒体1的内部并且衬垫2上设置有容器孔,试管包括引物试管3、PCR反应液试管
4、SAP反应液试管5、CODE反应液试管6、接头试管7、磁珠试管8、阳性对照品试管9和阴性对照品试管10,引物试管3、PCR反应液试管4、SAP反应液试管5、CODE反应液试管6、接头试管7、磁珠试管8、阳性对照品试管9和阴性对照品试管10均放置在容器孔中,引物试管3的数量为七个。PCR反应液试管4、SAP反应液试管5、CODE反应液试管6、磁珠试管8、阳性对照品试管9和阴性对照品试管10的数量均为一个,接头试管7的数量为12的整数倍。包装盒体1上端设置有封盖。其中PCR反应液的成分包含:KAPA2G Robust 热启动DNA聚合酶、dNTP、MgCl2和PCR缓冲液。SAP反应液的成分包含:SAP、SAP反应缓冲液、核酸外切酶1和核酸外切酶1反应缓冲液。CODE反应液的成分包含:KAPA HIFI 缓冲液,KAPA HIFI 热启动DNA聚合酶和dNTP。
纯化产物用的磁珠为:Axygen的AMPure XP beads。对照品分为阳性对照品和阴性对照品,阴性对照品为无菌双蒸样品,阳性对照品为血液DNA样本。
实施例
[0014] 血样总DNA提取试剂盒购于美国Qiagen公司,KAPA2G Robust HotStart DNA Polymerase、dNTP、MgCl2、PCR缓冲液、KAPA HiFi Fidelity buffer、KAPA HiFi Hotstart DNA Polymerase等相关试剂购于美国Kapa Biosystems公司,SAP和SAP reaction buffer购于美国Affymetrix公司,Exonuclease 1和Exonuclease 1 reaction buffer购于美国NEB公司,磁珠购于美国Axygen公司,9700型PCR仪为美国ABI公司产品。选取30例血液样本,其中已确定患乳腺癌的为18例。样本用血样总DNA提取试剂盒提取总DNA,每一例检测为21个反应管,每管中总体积6.5ul,其中3ul PCR反应液,1ul引物,每一管引物使用3个反应管,1个反应管中加入2.5ul被检测DNA,另外2个反应管中加入2.5ul阳性对照和阴性对照,在ABI 9700 PCR仪上进行扩增,反应条件为:95℃、2分钟;45个循环的95℃、30秒,56℃、30秒,
72℃、1分钟;72℃、5分钟;最终在4℃保存。扩增反应结束之后,使用SAP反应液对每管产物进行纯化,反应条件为:37℃、60分钟;80℃、20分钟;最终在4℃保存。SAP反应液反应完成后,使用CODE反应液对每个样本的产物加不同的接头,反应条件为:95℃、10分钟;12个循环的95℃、15秒,60℃、30秒,72℃、30秒;72℃、3分钟;最终在4℃保存。CODE反应结束之后,使用磁珠对产物进行纯化,并使用QIAquick® Gel Extraction Kit回收产物中200-500bp的片段。反应结束后在Hiseq X10仪器上进行测序。根据得到的测序结果进行生物信息学分析,判断BRCA1、BRCA2、PALB2、和RECQL基因的外显子序列是否存在致病突变即可。
[0015] 该产品设计合理,结构简单,运用多重PCR技术实现了同时检测4个乳腺癌相关基因全部外显子序列的目的,从而告知被检者患乳腺癌的风险数值,提前预防和控制,指导医师选择正确的临床治疗方案,有利于患者进行针对性治疗;该产品将同一疾病相关基因的全部外显子检测整合在一个试剂盒内,使用更方便而且成本更低,对患乳腺癌风险性的评估也更便捷,更科学。
[0016] 对于本领域技术人员而言,显然本发明不限于上述示范性实施例的细节,而且在不背离本发明的精神或基本特征的情况下,能够以其他的具体形式实现本发明。因此,无论从哪一点来看,均应将实施例看作是示范性的,而且是非限制性的,本发明的范围由所附权利要求而不是上述说明限定,因此旨在将落在权利要求的等同要件的含义和范围内的所有变化囊括在本发明内。不应将权利要求中的任何附图标记视为限制所涉及的权利要求。
[0017] 此外,应当理解,虽然本说明书按照实施方式加以描述,但并非每个实施方式仅包含一个独立的技术方案,说明书的这种叙述方式仅仅是为清楚起见,本领域技术人员应当将说明书作为一个整体,各实施例中的技术方案也可以经适当组合,形成本领域技术人员可以理解的其他实施方式。
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