诊断和/或筛选剂及其用途
专利汇可以提供诊断和/或筛选剂及其用途专利检索，专利查询，专利分析的服务。并且本 发明 公开了用于 哺乳动物 中败血症、感染阴性系统性炎性反应综合征(SIRS)和手术后 炎症 的诊断、宿主响应检测、监测、 治疗 或管理的方法和装置。更具体地，本发明公开了用于区分败血症和感染阴性SIRS，包括手术后炎症的标记基因和它们的剪接变体以及它们的表达产物，以及这些标记在这些病况的分级、监测、治疗和管理中的用途。，下面是诊断和/或筛选剂及其用途专利的具体信息内容。
1.一种评估受试者是否患有或者有风险发展选自败血症、感染阴性SIRS(“inSIRS”)
和手术后炎症的多种病况中的一种的方法，所述方法包括：将所述受试者中产生多转录物
的基因的至少一种炎性响应连续谱(IRC)标记表达产物的水平，与选自手术后炎症阳性受
试者、inSIRS阳性受试者、败血症阳性受试者和正常受试者的至少一个对照受试者的相应
IRC标记表达产物的水平进行比较，其中，所述至少一种IRC标记表达产物的水平与所述相
应IRC标记表达产物水平之间的差异表明所述受试者是否患有或者有风险发展所述病况
中的一种，其中预先确定所述至少一种IRC标记表达产物在所述疾病的至少两种病况之间
差异表达，以及其中预先确定来自所述产生多转录物的基因的至少另外一种表达产物并未
这样差异表达。
2.根据权利要求1所述的方法，其中所述产生多转录物的基因选自由下列组成的组：
含锚蛋白重复序列和死亡结构域1A(ANKDD1A)基因、rho2(GABRR2)基因、正小齿同源物
1(OTX1)基因、泛连接蛋白2(PANX2)基因、扁菱形蛋白5同系物2(Drosophila)(RHBDF2)基
因、SLAM家族成员7(SLAMF7)基因、自噬/beclin-1调节子1(AMBRAl)基因、羧酸酯酶2(肠，
肝)(CES2)基因、酪蛋白水解肽酶B同系物(E.coli)(CLPB)基因、同源结构域相互作用蛋
白激酶2(HIPK2)基因和染色体1开放读码框91(C10RF91)基因、N-去乙酰酶/N-磺基转移
酶(类肝素葡糖胺基)1(NDSTI)基因、溶质载体家族36(质子/氨基酸同向转运体)(成员
1(SLC36A1)基因、ADAM金属肽酶结构域19(解链蛋白酶β)(ADAM19)基因、cullin7(CUL7)
基因、甲状腺球蛋白(TG)基因、程序化细胞死亡1配体2(PDCD1LG2)基因、谷氨酸受体(离
子型(N-甲基D-天冬氨酸样1A(GRINL1A)基因、红褐蛋白(环指1(MGRN1)基因、互养蛋白
(β2(抗肌萎缩蛋白结合蛋白A1(59kDa(碱性组分2)(SNTB2)基因、周期蛋白依赖性激酶
5(调节亚基1(p35)(CDK5R1)基因、葡萄糖苷酶(α；酸性(GAA)基因，剑蛋白p60亚基A样
2(KATNAL2)基因、癌胚抗原相关的细胞粘附分子4(CEACAM4)基因、锌指蛋白335(ZNF335)
基因、含天冬氨酸β-羟化酶结构域2(ASPHD2)基因、含酸性重复序列(ACRC)基因、嗜乳
脂蛋白样3/嗜乳脂蛋白样8(BTNL3，BTLN8)基因、莫罗尼白血病病毒10同系物(小鼠)
(MOV10)基因、中介复合体亚基12样(MED12L)基因、kelch样6(Drosophila)(KLHL6)基
因、PDZ和LIM结构域5(PDLIM5)基因、UDP-N-乙酰基-α-D-半乳糖胺：多肽N-乙酰基
半乳糖胺基转移酶10(GALNT10)基因、分离蛋白1(SCRN1)基因、泡状(癌症过表达(促存
活蛋白1(VOPP1、RP11-289110.2)基因、FK506结合蛋白9，63kDa(FKBP9，FKBP9，FKBP9L，
AC091812.2)基因、驱动蛋白家族成员27(KIF27)基因、piwi样4(Drosophila)(PIWIL4)基
因、端粒酶相关蛋白1(TEP1)基因、GTP环化水解酶1、(GCH1)基因、富含脯氨酸11、(PRR11)
基因、钙粘蛋白2，1型，N-钙粘蛋白(神经元的)(CDH2)基因、蛋白磷酸酶1B样(FLJ40125，
AC138534.1)(PPM1N)基因、相关RAS病毒(r-ras)癌基因同系物，(RRAS)基因、多萜基二
磷酸寡聚糖蛋白葡糖基转移酶，(DDOST)基因、前咽缺陷1同系物A(C.elegans)(APH1A)基
因、微管蛋白酪氨酸连接酶(TTL)基因、睾丸表达261，(TEX261)基因、辅酶Q2同系物、异
戊二烯基转移酶(酵母)(COQ2)基因、FCH和双SH3结构域1，(FCHSD1)基因、BCL2-拮抗
剂/杀伤(BCL2-antagonist/killer)1，(BAK1)基因、溶质载体家族25(线粒体载体；磷酸
盐载体)成员25，(SLC25A25)基因、RELT肿瘤坏死因子受体，(RELT)基因、酸性磷酸酶2，
溶酶体的，(ACP2)基因、TBC1结构域家族，成员2B，(TBC1D2B)基因、范科尼贫血，互补组A，(FANCA)基因，溶质载体家族39(金属离子转运体)成员11，(SLC39A11)基因。
3.根据权利要求1所述的方法，包括将至少一种IRC标记转录物的水平与相应IRC标
记转录物的水平进行比较，其中所述IRC标记转录物选自由下列组成的组：(a)包含与SEQ
ID NO：1、3、5、7、9、11、13、15、17、19、21、23、25、27、29、31、33、35、37、39、41、43、45、47、49、
51、53、55、57、59、61、63、65、67、69、71、73、75、77、79、81、83、85、87、89、91、93、95、97、99、
101、103、105、107、109、111、113、115、117、119、121、123、125、127、129、131、133、135、137、
139、141、143、145、147、149、151、153、155、157、159、161、163、165、167、169、171、173、175、
177、179、181、183、185、187、189、191、193、195、197、199、201、203、205、207、209、211、213、
215、217、219、221、223、225、227、229、231、233、235、237、239、241、243、245、247、249、251、
253、255、257、259、261、263、265、267、269、271、273、275、277、279、281、283、285、287、289、
291、293、295、297、299、301、303、305、307、309、311、313、315、317、319、321、323、325、327、
329、331、333、335、337、339、341、343、345、347、349、351、353、355、357、359、361、363、365、
367、369、371、373、375、377、379、381、383、385、387、389、391、393、395、397、399、401、403、
405、407、409、411、413、415、417、419、421、423、425、427、429、431、433、435、437、439、441、
443、445、447、449、451、453、455、457、459、461、463、465、467、469、471、473、475、477、479、
481、483、485、487、489、491、493、495、497、499、501、503、505、507、509、511、513 或 515 中任一个所展示的序列或其互补物共有至少80％(或至少81％到至少99％以及其间的所
有整数百分比)序列同一性的核苷酸序列的多核苷酸；(b)包含编码含SEQ ID NO：2、4、6、
8、10、12、14、16、18、20、22、24、26、28、30、32、34、36、38、40、42、44、46、48、50、52、54、56、58、
60、62、64、66、68、70、72、74、76、78、80、82、84、86、88、90、92、94、96、98、100、102、104、106、
108、110、112、114、116、118、120、122、124、126、128、130、132、134、136、138、140、142、144、
146、148、150、152、154、156、158、160、162、164、166、168、170、172、174、176、178、180、182、
184、186、188、190、192、194、196、198、200、202、204、206、208、210、212、214、216、218、220、
222、224、226、228、230、232、234、236、238、240、242、244、246、248、250、252、254、256、258、
260、262、264、266、268、270、272、274、276、278、280、282、284、286、288、290、292、294、296、
298、300、302、304、306、308、310、312、314、316、318、320、322、324、326、328、330、332、334、
336、338、340、342、344、346、348、350、352、354、356、358、360、362、364、366、368、370、372、
374、376、378、380、382、384、386、388、390、392、394、396、398、400、402、404、406、408、410、
412、414、416、418、420、422、424、426、428、430、432、434、436、438、440、442、444、446、448、
450、452、454、456、458、460、462、464、466、468、470、472、474、476、478、480、482、484、486、
488、490、492、494、496、498、500、502、504、506、508、510、512、514或516中任一个所展示的氨基酸序列的多肽的核苷酸序列的多核苷酸；(c)包含编码与SEQ ID NO：2、4、6、8、10、12、
14、16、18、20、22、24、26、28、30、32、34、36、38、40、42、44、46、48、50、52、54、56、58、60、62、
64、66、68、70、72、74、76、78、80、82、84、86、88、90、92、4、96、98、100、102、104、106、108、110、
112、114、116、118、120、122、124、126、128、130、132、134、136、138、140、142、144、146、148、
150、152、154、156、158、160、162、164、166、168、170、172、174、176、178、180、182、184、186、
188、190、192、194、196、198、200、202、204、206、208、210、212、214、216、218、220、222、224、
226、228、230、232、234、236、238、240、242、244、246、248、250、252、254、256、258、260、262、
264、266、268、270、272、274、276、278、280、282、284、286、288、290、292、294、296、298、300、
302、304、306、308、310、312、314、316、318、320、322、324、326、328、330、332、334、336、338、
340、342、344、346、348、350、352、354、356、358、360、362、364、366、368、370、372、374、376、
378、380、382、384、386、388、390、392、394、396、398、400、402、404、406、408、410、412、414、
416、418、420、422、424、426、428、430、432、434、436、438、440、442、444、446、448、450、452、
454、456、458、460、462、464、466、468、470、472、474、476、478、480、482、484、486、488、490、
492、494、496、498、500、502、504、506、508、510、512、514或516中所展示的序列的至少一部分共有至少80％(或至少81％到至少99％和其间的所有整数百分比)序列相似性或同
一性的多肽的核苷酸序列的多核苷酸；(d)包含能够在至少中等或高严格度条件下与(a)、
(b)、(c)或其互补物杂交的核苷酸序列的多核苷酸表达产物。
4.根据权利要求1所述的方法，包括将至少一种IRC标记多肽的水平与相应IRC标记
多肽的水平进行比较，其中所述IRC标记多肽选自由下列组成的组：(i)包含SEQ ID NO：
2、4、6、8、10、12、14、16、18、20、22、24、26、28、30、32、34、36、38、40、42、44、46、48、50、52、54、
56、58、60、62、64、66、68、70、72、74、76、78、80、82、84、86、88、90、92、94、96、98、100、102、
104、106、108、110、112、114、116、118、120、122、124、126、128、130、132、134、136、138、140、
142、144、146、148、150、152、154、156、158、160、162、164、166、168、170、172、174、176、178、
180、182、184、186、188、190、192、194、196、198、200、202、204、206、208、210、212、214、216、
218、220、222、224、226、228、230、232、234、236、238、240、242、244、246、248、250、252、254、
256、258、260、262、264、266、268、270、272、274、276、278、280、282、284、286、288、290、292、
294、296、298、300、302、304、306、308、310、312、314、316、318、320、322、324、326、328、330、
332、334、336、338、340、342、344、346、348、350、352、354、356、358、360、362、364、366、368、
370、372、374、376、378、380、382、384、386、388、390、392、394、396、398、400、402、404、406、
408、410、412、414、416、418、420、422、424、426、428、430、432、434、436、438、440、442、444、
446、448、450、452、454、456、458、460、462、464、466、468、470、472、474、476、478、480、482、
484、486、488、490、492、494、496、498、500、502、504、506、508、510、512、514或516中任一个所展示的氨基酸序列的多肽；和(ii)包含与SEQ ID NO：2、4、6、8、10、12、14、16、18、20、22、
24、26、28、30、32、34、36、38、40、42、44、46、48、50、52、54、56、58、60、62、64、66、68、70、72、
74、76、78、80、82、84、86、88、90、92、94、96、98、100、102、104、106、108、110、112、114、116、
118、120、122、124、126、128、130、132、134、136、138、140、142、144、146、148、150、152、154、
156、158、160、162、164、166、168、170、172、174、176、178、180、182、184、186、188、190、192、
194、196、198、200、202、204、206、208、210、212、214、216、218、220、222、224、226、228、230、
232、234、236、238、240、242、244、246、248、250、252、254、256、258、260、262、264、266、268、
270、272、274、276、278、280、282、284、286、288、290、292、294、296、298、300、302、304、306、
308、310、312、314、316、318、320、322、324、326、328、330、332、334、336、338、340、342、344、
346、348、350、352、354、356、358、360、362、364、366、368、370、372、374、376、378、380、382、
384、386、388、390、392、394、396、398、400、402、404、406、408、410、412、414、416、418、420、
422、424、426、428、430、432、434、436、438、440、442、444、446、448、450、452、454、456、458、
460、462、464、466、468、470、472、474、476、478、480、482、484、486、488、490、492、494、496、
498、500、502、504、506、508、510、512、514或516中任一个所展示的氨基酸序列共有至少
80％(或至少81％到至少99％及其间的所有整数百分比)序列相似性或同一性的氨基酸
序列的多肽。
5.根据权利要求1-4中任一项所述的方法，包括：(1)测量从所述受试者获得的生物样
本中至少一种IRC标记表达产物的水平，和(2)将测得的每个IRC标记表达产物的水平与
从所述至少一个对照受试者获得的参考样本中相应IRC标记表达产物的水平进行比较。
6.根据权利要求1-5中任一项所述的方法，包括：当所测量的某个或每个IRC标记表
达产物水平与所测量的某个或每个相应IRC标记表达产物水平不同时，评估所述受试者是
否患有或者有风险发展所述多种病况中的一种。
7.根据权利要求6所述的方法，其中单个IRC标记表达产物水平是单个相应IRC表达
产物水平的至少110％。
8.根据权利要求6所述的方法，其中单个IRC标记表达产物水平不超过单个相应的
IRC表达产物水平的大约95％。
9.根据权利要求1-6中任一项或权利要求8所述的方法，其中通过在所述受试者中检
测到来自选自由KIF27、OTX1、CDK5R1、FKBP9、CDH2、ADAM19、BTNL8/3和PANX2(以下称为
“名单A”)组成的组的产生多转录物的基因的至少1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、
15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、
40、41、42、43、44、45、46、47或48个IRC标志表达产物的水平与手术后炎症阳性对照受试者的相应IRC标记表达产物水平相比降低来确定为败血症的存在或者发展败血症的风险。
10.根据权利要求1-7中任一项所述的方法，其中通过在所述受试者中检测到来自选
自由KIF27、OTX1、CDK5R1、FKBP9、CDH2、ADAM19、BTNL8/3和PANX2(即，名单A)组成的组的至少一个产生多转录物的基因的至少1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、
19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41、42、43、
44、45、46、47或48个IRC标志表达产物水平与败血症对照受试者的相应IRC标记表达产物
水平相比增高来确定手术后炎症的存在或者发展手术后炎症的风险。
11.根据权利要求9或权利要求10所述的方法，其中所述KIF27IRC标记表达产物包含
相应于KIF27外显子4和外显子7的核苷酸序列或者由该外显子所编码的氨基酸序列。
12.根据权利要求11所述的方法，其中所述KIF27IRC标记表达产物是如SEQ ID NO：
1、3、5、7或9中任一个所展示的KIF27IRC标记转录物。
13.根据权利要求11所述的方法，其中所述KIF271IRC标志表达产物是如SEQ ID NO：
2、4、6、8或10中的任一个所展示的KIF27IRC标记多肽。
14.根据权利要求9或10所述的方法，其中所述OTX1IRC标记表达产物包含与相应于
OTX1外显子5的核苷酸序列或者由该外显子所编码的氨基酸序列。
15.根据权利要求14所述的方法，其中所述OTX1IRC标记表达产物是如SEQ ID NO：11
或13中的任一个所展示的OTX1IRC标记转录物。
16.根据权利要求14所述的方法，其中所述OTX1IRC标记表达产物是如SEQ ID NO：12
或14中的任一个所展示的OTX1IRC标记多肽。
17.根据权利要求9或10所述的方法，其中所述CDK5R1IRC标记表达产物包含相应于
CDK5R1外显子2的核苷酸序列或者由该外显子所编码的氨基酸序列。
18.根据权利要求17所述的方法，其中所述CDK5R1IRC标记表达产物是如SEQ ID NO：
15中的任一个所展示的CDK5R1IRC标记转录物。
19.根据权利要求17所述的方法，其中所述CDK5R1IRC标记表达产物是如SEQ ID NO：
16中的任一个所展示的CDK5R1IRC标记多肽。
20.根据权利要求9或10的方法，其中所述FKBP9IRC标记表达产物包含相应于FKBP9
外显子10的核苷酸序列或者由该外显子所编码的氨基酸序列。
21.根据权利要求20所述的方法，其中所述IRC标记表达产物是如SEQ ID NO：17中
的任一个所展示的FKBP9IRC标记转录物。
22.根据权利要求20所述的方法，其中所述FKBP9IRC标记表达产物是如SEQ ID NO：
18中的任一个所展示的FKBP9IRC标记多肽。
23.根据权利要求9或权利要求10所述的方法，其中所述CDH2IRC标记表达产物包含
相应于CDH2外显子10的核苷酸序列或者由该外显子所编码的氨基酸序列。
24.根据权利要求23所述的方法，其中所述CDH2IRC标记表达产物是如SEQ ID NO：19
和21中的任一个所展示的CDH2IRC标记转录物。
25.根据权利要求23所述的方法，其中所述CDH2IRC标记表达产物是如SEQ ID NO：19
和21中的任一个所展示的CDH2IRC标记多肽。
26.根据权利要求9或权利要求10所述的方法，其中所述ADAM19IRC标记表达产物包
含相应于ADAM19外显子10的核苷酸序列或者由该外显子所编码的氨基酸序列。
27.根据权利要求26所述的方法，其中所述ADAM19IRC标记表达产物是如SEQ ID NO：
23、25、27和29中的任一个所展示的ADAM19IRC标记转录物。
28.根据权利要求26所述的方法，其中所述ADAM19IRC标记表达产物是如SEQ ID NO：
24、26、28和30中的任一个所展示的ADAM19IRC标记多肽。
29.根据权利要求9或10所述的方法，其中所述BTNL8/3IRC标记表达产物包含相应于
BTNL8/3外显子6的核苷酸序列或者由该外显子所编码的氨基酸序列。
30.根据权利要求29所述的方法，其中所述BTNL8/3IRC标记表达产物是如SEQ ID NO：
31、33、35、37、39和41中的任一个所展示的BTNL8/3IRC标记转录物。
31.根据权利要求29所述的方法，其中所述BTNL8/3IRC标记表达产物是如SEQ ID NO：
32、34、36、38、40和42中的任一个所展示的BTNL8/3IRC标记多肽。
32.根据权利要求9或权利要求10所述的方法，其中所述PANX2IRC标记表达产物包含
相应于选自PANX2外显子1和外显子2的外显子的核苷酸序列或者由该外显子所编码的氨
基酸序列。
33.根据权利要求32所述的方法，其中所述PANX2IRC标记表达产物是如SEQ ID NO：
43、45或47中的任一个所展示的PANX2IRC转录物。
34.根据权利要求32所述的方法，其中所述PANX2IRC标记表达产物是如SEQ ID NO：
44、46或48中的任一个所展示的PANX2IRC多肽。
35.根据权利要求1-7中任一项所述的方法，其中通过在所述受试者中检测到来自选
自由PDLIM5、SCRN1、ASPHD2、VOPP1、ACRC、GALNT10、AC1385341、MED12L、RHBDF2、KLHL6、TEP1、PIWIL6、PRR1、RRAS、TG、ANKDD1A、GABRR2、MOV10、SLAMF7、PDCDILG2和GCH1(以下称为“名单B”)组成的组的至少一个产生多转录物的基因的至少1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、
12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、
37、38、39、40、41、42、43、44、45、46、47、48、49、50、51、52、53、54、55、56、57、58、59、60、61、
62、63、64、65、66、67、68、69、70、71、72、73、74、75、76、77、78、79、80、81、82、83、84、85、86、
87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、99、100、101、102、103、104、105、106、107、108、
109、110、111、112、113、114、115、116、117、118、119、120、121、122、123、124、125、126、127、
128、129、130、131、132、133、134、135、136、137、138、139、140、141、142、143、144、145、146、
147、148、149、150、151、152、153、154、155、156、157或158个IRC标志表达产物的水平与手术后炎症阳性对照受试者的相应IRC标记表达产物水平相比增高来确定败血症的存在或
者发展败血症的风险。
36.根据权利要求1-6中任一项或权利要求8所述的方法，其中通过在所述受试者
中检测到来自选自由PDLIM5、SCRN1、ASPHD2、VOPP1、ACRC、GALNT10、AC1385341、MED12L、RHBDF2、KLHL6、TEP1、PLWIL6、PRR1、RRAS、TG、ANKDD1A、GABRR2、MOV10、SLAMF7、PDCDILG2和GCH1(即，名单B)组成的组的至少一个产生多转录物的基因中的至少1、2、3、4、5、6、7、8、
9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、
35、36、37、38、39、40、41、42、43、44、45、46、47、48、49、50、51、52、53、54、55、56、57、58、59、
60、61、62、63、64、65、66、67、68、69、70、71、72、73、74、75、76、77、78、79、80、81、82、83、84、
85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、99、100、101、102、103、104、105、106、107、
108、109、110、111、112、113、114、115、116、117、118、119、120、121、122、123、124、125、126、
127、128、129、130、131、132、133、134、135、136、137、138、139、140、141、142、143、144、145、
146、147、148、149、150、151、152、153、154、155、156、157或158个IRC标志表达产物的水平与败血症对照受试者的相应IRC标记表达产物水平相比降低来确定手术后炎症的存在或
者发展手术后炎症的风险。
37.根据权利要求35或36所述的方法，其中所述PDLIM5IRC标记表达产物包含相应于
PDLIM5外显子5的核苷酸序列或者由该外显子所编码的氨基酸序列。
38.根据权利要求37所述的方法，其中所述PDLIM5IRC标记表达产物是如SEQ ID NO：
49中的任一个所展示的PDLIM5IRC转录物。
39.根据权利要求37所述的方法，其中所述PDLIM5IRC标记表达产物是如SEQ ID NO：
50中的任一个所展示的PDLIM5IRC多肽。
40.根据权利要求35或权利要求36所述的方法，其中所述SCRN1IRC标记表达产物包
含相应于SCRN1外显子5的核苷酸序列或者由该外显子所编码的氨基酸序列。
41.根据权利要求40所述的方法，其中所述SCRN1IRC标记表达产物是如SEQ ID NO：
51、53、55、57、59、61或63中的任一个所展示的SCRN1IRC转录物。
42.根据权利要求40所述的方法，其中所述SCRN1IRC标记表达产物是如SEQ ID NO：
52、54、56、58、60、62或64中的任一个所展示的SCRN1IRC多肽。
43.根据权利要求35或权利要求36所述的方法，其中所述ASPHD2IRC标记表达产物包
含相应于ASPHD2外显子4的核苷酸序列或者由该外显子所编码的氨基酸序列。
44.根据权利要求43所述的方法，其中所述ASPHD2IRC标记表达产物是如SEQ ID NO：
65、67或69的中的任一个所展示的ASPHD2IRC转录物。
45.根据权利要求43所述的方法，其中所述ASPHD2IRC标记表达产物是如SEQ ID NO：
66、68或70的中的任一个所展示的ASPHD2IRC多肽。
46.根据权利要求35或权利要求36所述的方法，其中所述VOPP1IRC标记表达产物包
含相应于VOPP1外显子3的核苷酸序列或者由该外显子所编码的氨基酸序列。
47.根据权利要求46所述的方法，其中所述VOPP1IRC标记表达产物是如SEQ ID NO：
71、73、75、77、79、81、83、85、87、89、91或93的中的任一个所展示的VOPP1IRC转录物。
48.根据权利要求46所述的方法，其中所述VOPP1IRC标记表达产物是如SEQ ID NO：
72、74、76、78、80、82、84、86、88、90、92或94的中的任一个所展示的VOPP1IRC多肽。
49.根据权利要求35或权利要求36所述的方法，其中所述ACRC IRC标记表达产物包
含相应于ACRC外显子3和外显子5的核苷酸序列或者由该外显子所编码的氨基酸序列。
50.根据权利要求49所述的方法，其中所述ACRC IRC标记表达产物是如SEQ ID NO：
95或97的中的任一个所展示的ACRC IRC转录物。
51.根据权利要求49所述的方法，其中所述ACRC IRC标记表达产物是如SEQ ID NO：
96或98的中的任一个所展示的ACRC IRC多肽。
52.根据权利要求35或权利要求36所述的方法，其中所述GALNT10IRC标记表达产物
包含相应于GALNT10外显子6的核苷酸序列或者由该外显子所编码的氨基酸序列。
53.根据权利要求52所述的方法，其中所述GALNT10IRC标记表达产物是如SEQ ID NO：
99或101中的任一个所展示的GALNT10IRC转录物。
54.根据权利要求52所述的方法，其中所述GALNT10IRC标记表达产物是如SEQ ID NO：
100或102中的任一个所展示的GALNT10IRC多肽。
55.根据权利要求35或权利要求36所述的方法，其中所述PPM1N IRC标记表达产物包
含相应于PPM1N外显子3的核苷酸序列或者由该外显子所编码的氨基酸序列。
56.根据权利要求55所述的方法，其中所述PPM1N IRC标记表达产物是如SEQ ID NO：
107、109、111、113、115、117、119、121或123中的任一个所展示的PPM1NIRC转录物。
57.根据权利要求55所述的方法，其中所述PPM1N IRC标记表达产物是如SEQ ID NO：
108、110、112、114、116、118、120、122或124中的任一个所展示的PPM1N IRC多肽。
58.根据权利要求35或权利要求36所述的方法，其中所述MED12L IRC标记表达产物
包含相应于MED12L外显子17的核苷酸序列或者由该外显子所编码的氨基酸序列。
59.根据权利要求58所述的方法，其中所述MED12L IRC标记表达产物是如SEQ ID NO：
125或127中的任一个所展示的MED12L IRC转录物。
60.根据权利要求58所述的方法，其中所述MED12L IRC标记表达产物是如SEQ ID NO：
126或128中的任一个所展示的MED12L IRC多肽。
61.根据权利要求35或权利要求36所述的方法，其中所述RHBDF2IRC标记表达产物包
含相应于RHBDF2外显子6、9、10、11、14、17、18或19的核苷酸序列或者由该外显子所编码
的氨基酸序列。
62.根据权利要求61所述的方法，其中所述RHBDF2IRC标记表达产物是如SEQ ID NO：
129、131或133中的任一个所展示的RHBDF2IRC转录物。
63.根据权利要求61所述的方法，其中所述RHBDF2IRC标记表达产物是如SEQ ID NO：
130、132或134中的任一个所展示的RHBDF2IRC多肽。
64.根据权利要求35或权利要求36所述的方法，其中所述KLHL6IRC标记表达产物包
含相应于KLHL6外显子7的核苷酸序列或者由该外显子所编码的氨基酸序列。
65.根据权利要求64所述的方法，其中所述KLHL6IRC标记表达产物是如SEQ ID NO：
135中的任一个所展示的KLHL6IRC转录物。
66.根据权利要求64所述的方法，其中所述KLHL6IRC标记表达产物是如SEQ ID NO：
136中的任一个所展示的KLHL6IRC多肽。
67.根据权利要求35或权利要求36所述的方法，其中所述TEP1IRC标记表达产物包含
相应于TEP1外显子49的核苷酸序列或者由该外显子所编码的氨基酸序列。
68.根据权利要求67所述的方法，其中所述TEP1IRC标记表达产物是如SEQ ID NO：
137或139中的任一个所展示的TEP1IRC转录物。
69.根据权利要求67所述的方法，其中所述TEP1IRC标记表达产物是如SEQ ID NO：
138或140中的任一个所展示的TEP1IRC多肽。
70.根据权利要求35或权利要求36所述的方法，其中所述PIWIL4IRC标记表达产物
包含相应于PIWIL4外显子2和外显子14的核苷酸序列或者由该外显子所编码的氨基酸序
列。
71.根据权利要求70所述的方法，其中所述PIWIL4IRC标记表达产物是如SEQ ID NO：
141或143中的任一个所展示的PIWIL4IRC转录物。
72.根据权利要求70所述的方法，其中所述PIWIL4IRC标记表达产物是如SEQ ID NO：
142或144中的任一个所展示的PIWIL4IRC多肽。
73.根据权利要求35或权利要求36所述的方法，其中所述PRR11IRC标记表达产物包
含相应于PRR11外显子4和外显子5的核苷酸序列或者由该外显子所编码的氨基酸序列。
74.根据权利要求73所述的方法，其中所述PRR11IRC标记表达产物是如SEQ ID NO：
145中的任一个所展示的PRR11IRC转录物。
75.根据权利要求73所述的方法，其中所述PRR11IRC标记表达产物是如SEQ ID NO：
146中的任一个所展示的PRR11IRC多肽。
76.根据权利要求35或权利要求36所述的方法，其中所述RRAS IRC标记表达产物包
含相应于RRAS外显子1的核苷酸序列或者由该外显子所编码的氨基酸序列。
77.根据权利要求76所述的方法，其中所述RRAS IRC标记表达产物是如SEQ ID NO：
147中的任一个所展示的RRAS IRC转录物。
78.根据权利要求76所述的方法，其中所述RRAS IRC标记表达产物是如SEQ ID NO：
148中的任一个所展示的RRAS IRC多肽。
79.根据权利要求35或权利要求36所述的方法，其中所述TG IRC标记表达产物包含
相应于TG外显子6的核苷酸序列或者由该外显子所编码的氨基酸序列。
80.根据权利要求79所述的方法，其中所述TG IRC标记表达产物是如SEQ ID NO：149
或151中的任一个所展示的TG IRC转录物。
81.根据权利要求79所述的方法，其中所述TG IRC标记表达产物是如SEQ ID NO：150
或152中的任一个所展示的TG IRC多肽。
82.根据权利要求35或权利要求36所述的方法，其中所述ANKDD1A IRC标记表达产物
包含相应于ANKDD1A外显子7的核苷酸序列或者由该外显子所编码的氨基酸序列。
83.根据权利要求82所述的方法，其中所述ANKDD1A IRC标记表达产物是如SEQ ID
NO：153、155、157、159或161中的任一个所展示的ANKDD1A IRC转录物。
84.根据权利要求82所述的方法，其中所述ANKDD1A IRC标记表达产物是如SEQ ID
NO：154、156、158、160或162中的任一个所展示的ANKDD1A IRC多肽。
85.根据权利要求35或权利要求36所述的方法，其中所述GABRR2IRC标记表达产物包
含相应于GABRR2外显子7、8或9的核苷酸序列或者由该外显子所编码的氨基酸序列。
86.根据权利要求85所述的方法，其中所述GABRR2IRC标记表达产物是如SEQ ID NO：
163或165中的任一个所展示的GABRR2IRC转录物。
87.根据权利要求85所述的方法，其中所述GABRR2IRC标记表达产物是如SEQ ID NO：
164或166中的任一个所展示的GABRR2IRC多肽。
88.根据权利要求35或权利要求36所述的方法，其中所述MOV10IRC标记表达产物包
含相应于MOV10外显子6的核苷酸序列或者由该外显子所编码的氨基酸序列。
89.根据权利要求88所述的方法，其中所述MOV10IRC标记表达产物是如SEQ ID NO：
167、169、171、173、175或177中的任一个所展示的MOV10IRC转录物。
90.根据权利要求85所述的方法，其中所述MOV10IRC标记表达产物是如SEQ ID NO：
168、170、172、174、176或178中的任一个所展示的MOV10IRC多肽。
91.根据权利要求35或权利要求36所述的方法，其中所述SLAMF7IRC标记表达产物包
含相应于SLAMF7外显子2、3、4或5的核苷酸序列或者由该外显子所编码的氨基酸序列。
92.根据权利要求91所述的方法，其中所述SLAMF7IRC标记表达产物是如SEQ ID NO：
179、181、183、185、187、189、191或193中的任一个所展示的SLAMF7IRC转录物。
93.根据权利要求91所述的方法，其中所述SLAMF7IRC标记表达产物是如SEQ ID NO：
180、182、184、186、188、190、192或194中的任一个所展示的SLAMF7IRC多肽。
94.根据权利要求35或权利要求36所述的方法，其中所述PDCD1LG2IRC标记表达产物
包含相应于PDCD1LG2外显子1或2的核苷酸序列或者由该外显子所编码的氨基酸序列。
95.根据权利要求94所述的方法，其中所述PDCD1LG2IRC标记表达产物是如SEQ ID
NO：195或197中的任一个所展示的PDCD1LG2IRC转录物。
96.根据权利要求94所述的方法，其中所述PDCD1LG2IRC标记表达产物是如SEQ ID
NO：196或198中的任一个所展示的PDCD1LG2IRC多肽。
97.根据权利要求35或权利要求36所述的方法，其中所述GCH1IRC标记表达产物包含
相应于GCH1外显子2的核苷酸序列或者由该外显子所编码的氨基酸序列。
98.根据权利要求97所述的方法，其中所述GCH1IRC标记表达产物是由SEQ ID NO：
199、201、203或205中的任一个所展示的GCH1IRC转录物。
99.根据权利要求97所述的方法，其中所述GCH1IRC标记表达产物是由SEQ ID NO：
200、202、204或206中的任一个所展示的GCH1IRC多肽。
100.根据权利要求1-7中任一项所述的方法，其中通过在所述受试者中检测到来自选
自由RELT、ACP2、FCHSD1、CLPB、SLC39A1、TBC1D2B、APH1A、DDOST、BAK1、SLC25A25A、COQ2、FANCA、PIWIL4、ZNF335、TEX261、GABRR2、VOPP1、TTL、CES2、GALNT10、CQORF91、AMBRA1和SCRN1(以下称为“名单C”)组成的组的至少一个产生多转录物的基因的至少1、2、3、4、5、
6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、
33、34、35、36、37、38、39、40、41、42、43、44、45、46、47、48、49、50、51、52、53、54、55、56、57、
58、59、60、61、62、63、64、65、66、67、68、69、70、71、72、73、74、75、76、77、78、79、80、81、82、
83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、99、100、101、102、103、104、105、
106、107、108、109、110、111、112、113、114、115、116、117、118、119、120、121、122、123、124、
125、126、127、128、129、130、131、132、133、134、135、136、137、138、139、140、141、142、143、
144、145、146、147、148、149、150、151、152、153、154、155或156个IRC标志表达产物的水平与inSIRS阳性对照受试者的相应IRC标记表达产物水平相比增高来确定败血症的存在或
者发展患败血症的风险。
101.根据权利要求1-6中任一项或权利要求8所述的方法，其中通过在所述受试者
中检测到来自选自由RELT、ACP2、FCHSD1、CLPB、SLC39A1、TBC1D2B、APH1A、DDOST、BAK1、SLC25A25A、COQ2、FANCA、PIWIL4、ZNF335、TEX261、GABRR2、VOPP1、TTL、CES2、GALNT10、CQORF91、AMBRA1和SCRN1(即，名单C)组成的组的至少一个产生多转录物的基因的至少1、
2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、
30、31、32、33、34、35、36、7、38、39、40、41、42、43、44、45、46、47、48、49、50、51、52、53、54、55、
56、57、58、59、60、61、62、63、64、65、66、67、68、69、70、71、72、73、74、75、76、77、78、79、80、
81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、99、100、101、102、103、104、
105、106、107、108、109、110、111、112、113、114、115、116、117、118、119、120、121、122、123、
124、125、126、127、128、129、130、131、132、133、134、135、136、137、138、139、140、141、142、
143、144、145、146、147、148、149、150、151、152、153、154、155或156个IRC标志表达产物的水平与败血症阳性对照受试者的相应IRC标记表达产物水平相比降低来确定inSIRS的存
在或者发展inSIRS的风险。
102.根据权利要求100或权利要求101所述的方法，其中所述RELT IRC标记表达产物
包含相应于选自RELT外显子4的外显子的核苷酸序列或者由该外显子所编码的氨基酸序
列。
103.根据权利要求102所述的方法，其中所述RELT IRC标记表达产物是如SEQ ID NO：
207或209中的任一个所展示的RELTIRC转录物。
104.根据权利要求102所述的方法，其中所述RELT IRC标记表达产物是如SEQ ID NO：
208或210中的任一个所展示的RELT IRC多肽。
105.根据权利要求100或权利要求101所述的方法，其中所述ACP2IRC标记表达产物
包含相应于选自ACP2外显子7的外显子的核苷酸序列或者由该外显子所编码的氨基酸序
列。
106.根据权利要求105所述的方法，其中所述ACP2IRC标记表达产物是如SEQ ID NO：
211中的任一个所展示的ACP2IRC转录物。
107.根据权利要求105所述的方法，其中所述ACP2IRC标记表达产物是如SEQ ID NO：
212中的任一个所展示的ACP2IRC多肽。
108.根据权利要求100或权利要求101所述的方法，其中所述FCHSD1IRC标记表达产
物包含相应于选自FCHSD1外显子14的外显子的核苷酸序列或者由该外显子所编码的氨基
酸序列。
109.根据权利要求108所述的方法，其中所述FCHSD1IRC标记表达产物是如SEQ ID
NO：213或215中的任一个所展示的FCHSD1IRC转录物。
110.根据权利要求108所述的方法，其中所述FCHSD1IRC标记表达产物是如SEQ ID
NO：214或216中的任一个所展示的FCHSD1IRC多肽。
111.根据权利要求100或权利要求101所述的方法，其中所述CLPB IRC标记表达产物
包含相应于选自CLPB外显子10的外显子的核苷酸序列或者由该外显子所编码的氨基酸序
列。
112.根据权利要求111所述的方法，其中所述CLPB IRC标记表达产物是如SEQ ID NO：
217、219或221中的任一个所展示的CLPB IRC转录物。
113.根据权利要求111所述的方法，其中所述CLPB IRC标记表达产物是如SEQ ID NO：
218、220或222中的任一个所展示的CLPB IRC多肽。
114.根据权利要求100或权利要求101所述的方法，其中所述SLC39A11IRC标记表达
产物包含相应于选自SLC39A11外显子2的外显子的核苷酸序列或者由该外显子所编码的
氨基酸序列。
115.根据权利要求114所述的方法，其中所述SLC39A11IRC标记表达产物是如SEQ ID
NO：223中的任一个所展示的SLC39A11IRC转录物。
116.根据权利要求114所述的方法，其中所述SLC39A11IRC标记表达产物是如SEQ ID
NO：224中的任一个所展示的SLC39A11IRC多肽。
117.根据权利要求100或权利要求101所述的方法，其中所述TBC1D2B IRC标记表达
产物包含相应于选自TBC1D2B外显子13的外显子的核苷酸序列或者由该外显子所编码的
氨基酸序列。
118.根据权利要求117所述的方法，其中所述TBC1D2B IRC标记表达产物是如SEQ ID
NO：225、227或229中的任一个所展示的TBC1D2B IRC转录物。
119.根据权利要求117所述的方法，其中所述TBC1D2B IRC标记表达产物是如SEQ ID
NO：226、228或230中的任一个所展示的TBC1D2B IRC多肽。
120.根据权利要求100或权利要求101所述的方法，其中所述APH1A IRC标记表达产
物包含相应于选自APH1A外显子1的外显子的核苷酸序列或者由该外显子所编码的氨基酸
序列。
121.根据权利要求120所述的方法，其中所述APH1A IRC标记表达产物是如SEQ ID
NO：231、233、235、237、239或241中的任一个所展示的APH1A IRC转录物。
122.根据权利要求120所述的方法，其中所述APH1A IRC标记表达产物是如SEQ ID
NO：232、234、236、238、240或242中的任一个所展示的APH1A IRC多肽。
123.根据权利要求100或权利要求101所述的方法，其中所述DDOST IRC标记表达产
物包含相应于选自DDOST外显子2的外显子的核苷酸序列或者由该外显子所编码的氨基酸
序列。
124.根据权利要求123所述的方法，其中所述DDOST IRC标记表达产物是由SEQ ID
NO：243中的任一个所展示的DDOSTIRC转录物。
125.根据权利要求123所述的方法，其中所述DDOST IRC标记表达产物是由SEQ ID
NO：244中的任一个所展示的DDOST IRC多肽。
126.根据权利要求100或权利要求101所述的方法，其中所述BAK1IRC标记表达产物
包含相应于选自BAK1外显子7的外显子的核苷酸序列或者由该外显子所编码的氨基酸序
列。
127.根据权利要求126所述的方法，其中所述BAK1IRC标记表达产物是如SEQ ID NO：
245或247中的任一个所展示的BAK1IRC转录物。
128.根据权利要求126所述的方法，其中所述BAK1IRC标记表达产物是如SEQ ID NO：
246或248中的任一个所展示的BAK1IRC多肽。
129.根据权利要求100或权利要求101所述的方法，其中所述SLC25A25A IRC标记表
达产物包含相应于选自SLC25A25A外显子10的外显子的核苷酸序列或者由该外显子所编
码的氨基酸序列。
130.根据权利要求129所述的方法，其中所述SLC25A25A IRC标记表达产物是如SEQ
ID NO：249、251、253、255、257、259或261中的任一个所展示的SLC25A25A IRC转录物。
131.根据权利要求129所述的方法，其中所述SLC25A25A IRC标记表达产物是如SEQ
ID NO：250、252、254、256、258、260或262中的任一个所展示的SLC25A25A IRC多肽。
132.根据权利要求100或权利要求101所述的方法，其中所述COQ2IRC标记表达产物
包含相应于选自COQ2外显子1的外显子的核苷酸序列或者由该外显子所编码的氨基酸序
列。
133.根据权利要求132所述的方法，其中所述COQ2IRC标记表达产物是由SEQ ID NO：
263、265或267中的任一个所展示的COQ2IRC转录物。
134.根据权利要求132所述的方法，其中所述COQ2IRC标记表达产物是由SEQ ID NO：
264、266或268中的任一个所展示的COQ2IRC多肽。
135.根据权利要求100或权利要求101所述的方法，其中所述FANCA IRC标记表达产
物包含相应于选自FANCA外显子35的外显子的核苷酸序列或者由该外显子所编码的氨基
酸序列。
136.根据权利要求135所述的方法，其中所述FANCA IRC标记表达产物是如SEQ ID
NO：269或271中的任一个所展示的FANCA IRC转录物。
137.根据权利要求135所述的方法，其中所述FANCA IRC标记表达产物是如SEQ ID
NO：270或272中的任一个所展示的FANCAIRC多肽。
138.根据权利要求100或权利要求101所述的方法，其中所述PIWIL4IRC标记表达产
物包含相应于选自PIWIL4外显子2、14的外显子的核苷酸序列或者由该外显子所编码的氨
基酸序列。
139.根据权利要求138所述的方法，其中所述PIWIL4IRC标记表达产物是如SEQ ID
NO：273或275中的任一个所展示的PIWIL4IRC转录物。
140.根据权利要求138所述的方法，其中所述PIWIL4IRC标记表达产物是如SEQ ID
NO：274或276中的任一个所展示的PIWIL4IRC多肽。
141.根据权利要求100或权利要求101所述的方法，其中所述ZNF335IRC标记表达产
物包含相应于选自ZNF335外显子5的外显子的核苷酸序列或者由该外显子所编码的氨基
酸序列。
142.根据权利要求141所述的方法，其中所述ZNF335IRC标记表达产物是如SEQ ID
NO：277、279或281中的任一个所展示的ZNF335IRC转录物。
143.根据权利要求141所述的方法，其中所述ZNF335IRC标记表达产物是如SEQ ID
NO：278、280或282中的任一个所展示的ZNF335IRC多肽。
144.根据权利要求100或权利要求101所述的方法，其中所述TEX261IRC标记表达产
物包含相应于选自TEX261外显子3的外显子的核苷酸序列或者由该外显子所编码的氨基
酸序列。
145.根据权利要求144所述的方法，其中所述TEX261IRC标记表达产物是如SEQ ID
NO：283或285中的任一个所展示的TEX261IRC转录物。
146.根据权利要求144所述的方法，其中所述TEX261IRC标记表达产物是如SEQ ID
NO：284或286中的任一个所展示的TEX261IRC多肽。
147.根据权利要求100或权利要求101所述的方法，其中所述GABRR2IRC标记表达产
物包含相应于选自GABRR2外显子7、8或9的外显子的核苷酸序列或者由该外显子所编码
的氨基酸序列。
148.根据权利要求147所述的方法，其中所述GABRR2IRC标记表达产物是如SEQ ID
NO：287或289中的任一个所展示的GABRR2IRC转录物。
149.根据权利要求147所述的方法，其中所述GABRR2IRC标记表达产物是如SEQ ID
NO：288或290中的任一个所展示的GABRR2IRC多肽。
150.根据权利要求100或权利要求101所述的方法，其中所述VOPP1IRC标记表达产物
包含相应于选自VOPP1外显子3的外显子的核苷酸序列或者由该外显子所编码的氨基酸序
列。
151.根据权利要求150所述的方法，其中所述VOPP1IRC标记表达产物是如SEQ ID NO：
291、293、295、297、299、301、303、305、307、309、311或313中的任一个所展示的VOPP1IRC转录物。
152.根据权利要求150所述的方法，其中所述VOPP1IRC标记表达产物是如SEQ ID NO：
292、294、296、298、300、302、304、306、308、310、312或314中的任一个所展示的VOPP1IRC多肽。
153.根据权利要求100或权利要求101所述的方法，其中所述TTL IRC标记表达产物
包含相应于选自TTL外显子7的外显子的核苷酸序列或者由该外显子所编码的氨基酸序
列。
154.根据权利要求153所述的方法，其中所述TTL IRC标记表达产物是如SEQ ID NO：
315中的任一个所展示的TTL IRC转录物。
155.根据权利要求153所述的方法，其中所述TTL IRC标记表达产物是如SEQ ID NO：
316中的任一个所展示的TTL IRC多肽。
156.根据权利要求100或权利要求101所述的方法，其中所述CES2IRC标记表达产物
包含相应于选自CES2外显子1的外显子的核苷酸序列或者由该外显子所编码的氨基酸序
列。
157.根据权利要求156所述的方法，其中所述CES2IRC标记表达产物是如SEQ ID NO：
317或319中的任一个所展示的CES2IRC转录物。
158.根据权利要求156所述的方法，其中所述CES2IRC标记表达产物是如SEQ ID NO：
318或320中的任一个所展示的CES2IRC多肽。
159.根据权利要求100或权利要求101所述的方法，其中所述GALNT10IRC标记表达产
物包含相应于选自GALNT10外显子6的外显子的核苷酸序列或者由该外显子所编码的氨基
酸序列。
160.根据权利要求159所述的方法，其中所述GALNT10IRC标记表达产物是如SEQ ID
NO：321或323中的任一个所展示的GALNT10IRC转录物。
161.根据权利要求159所述的方法，其中所述GALNT10IRC标记表达产物是如SEQ ID
NO：322或324中的任一个所展示的GALNT10IRC多肽。
162.根据权利要求100或权利要求101所述的方法，其中所述Clorf91IRC标记表达产
物包含相应于选自Clorf91外显子2的外显子的核苷酸序列或者由该外显子所编码的氨基
酸序列。
163.根据权利要求162所述的方法，其中所述Clorf91IRC标记表达产物是如SEQ ID
NO：325、327、329、331、333或335中的任一个所展示的Clorf91IRC转录物。
164.根据权利要求162所述的方法，其中所述Clorf91IRC标记表达产物是如SEQ ID
NO：326、328、330、332、334或336中的任一个所展示的Clorf91IRC多肽。
165.根据权利要求100或权利要求101所述的方法，其中所述AMBRA1IRC标记表达产
物包含相应于选自AMBRA1外显子2、4的外显子的核苷酸序列或者由该外显子所编码的氨
基酸序列。
166.根据权利要求165所述的方法，其中所述AMBRA1IRC标记表达产物是如SEQ ID
NO：337、339、341、343、345或347中的任一个所展示的AMBRA1IRC转录物。
167.根据权利要求165所述的方法，其中所述AMBRA1IRC标记表达产物是如SEQ ID
NO：338、340、342、344、346或348中的任一个所展示的AMBRA1IRC多肽。
168.根据权利要求100或权利要求101所述的方法，其中所述SCRN IRC标记表达产物
包含相应于选自SCRN外显子5的外显子的核苷酸序列或者由该外显子所编码的氨基酸序
列。
169.根据权利要求168所述的方法，其中所述SCRN IRC标记表达产物是如SEQ ID NO：
349、3512、353、355、357、359或361中的任一个所展示的SCRN IRC转录物。
170.根据权利要求168所述的方法，其中所述SCRN IRC标记表达产物是如SEQ ID NO：
350、352、354、356、358、360或362中的任一个所展示的SCRN IRC多肽。
171.根据权利要求1-7中任一项所述的方法，其中通过在所述受试者检测到来自选自
由GRINL1A和KATLNAL2(即，名单D)组成的组的至少一个产生多转录物的基因的至少1、2、
3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19或20个IRC标志表达产物的水平与败血症阳性对照受试者的相应IRC标记表达产物水平相比增高来确定inSIRS的存在或者发展
inSIRS的风险。
172.根据权利要求1-6中任一项或权利要求8所述的方法，其中通过在所述受试者中
检测到来自选自由GRINL1A和KATLNAL2(以下称为“名单D”)组成的组的至少一个产生多
转录物的基因的至少1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19或20个IRC标志表达产物的水平与inSIRS阳性对照受试者的相应IRC标记表达产物水平相比降低来
确定败血症的存在或者发展败血症的风险。
173.根据权利要求171或权利要求172所述的方法，其中所述GRINL1A标志表达产物
包含相应于选自GRINL1A外显子5的外显子的核苷酸序列或者由该外显子所编码的氨基酸
序列。
174.根据权利要求173所述的方法，其中所述GRINL1A IRC标记表达产物是如SEQ ID
NO：363、365、367、369、371、373、375或377中的任一个所展示的GRINL1A IRC转录物。
175.根据权利要求173所述的方法，其中所述GRINL1A IRC标记表达产物是如SEQ ID
NO：364、366、368、370、372、374、376或378中的任一个所展示的GRINL1AIRC多肽。
176.根据权利要求171或权利要求172所述的方法，其中所述KATNAL2标志表达产物
包含相应于选自KATNAL2外显子3的外显子的核苷酸序列或者由该外显子所编码的氨基酸
序列。
177.根据权利要求176所述的方法，其中所述KATNAL2IRC标记表达产物是如SEQ ID
NO：379或381中的任一个所展示的KATNAL2IRC转录物。
178.根据权利要求176所述的方法，其中所述KATNAL2IRC标记表达产物是如SEQ ID
NO：380或382中的任一个所展示的KATNAL2IRC多肽。
179.根据权利要求1-7中任一项所述的方法，其中通过在所述受试者中检测到来自选
自由KATLNAL2、GRINL1A、ACRC、TG和ASPHD2(以下称为“名单E”)组成的组的至少一个产
生多转录物的基因的至少1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、
22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37或38个IRC标志表达产物的水平与手术后炎症阳性的对照受试者的相应IRC标记表达产物水平相比增高来确定inSIRS的存
在或者发展inSIRS的风险。
180.根据权利要求1-6中任一项或权利要求8所述的方法，其中通过在所述受试者中
检测到来自选自由KATLNAL2、GRINL1A、ACRC、TG和ASPHD2(即，名单E)组成的组的至少一
个产生多转录物的基因的至少1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、
21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37或38个IRC标志表达产物的水平与inSIRS阳性对照受试者的相应IRC标记表达产物水平相比降低来确定手术后炎症的
存在或者发展手术后炎症的风险。
181.根据权利要求179或权利要求180所述的方法，其中所述KATLNAL2IRC标记表达
产物包含相应于选自KATLNAL2外显子3的外显子的核苷酸序列或者由该外显子所编码的
氨基酸序列。
182.根据权利要求181所述的方法，其中所述KATLNAL2IRC标记表达产物是如SEQ ID
NO：387或389中的任一个所展示的KATLNAL2IRC转录物。
183.根据权利要求181所述的方法，其中所述KATLNAL2IRC标记表达产物是如SEQ ID
NO：388或390中的任一个所展示的KATLNAL2IRC多肽。
184.根据权利要求179或权利要求180所述的方法，其中所述GRINL1A IRC标记表达
产物包含相应于选自GRINL1A外显子5的外显子的核苷酸序列或者由该外显子所编码的氨
基酸序列。
185.根据权利要求184所述的方法，其中所述GRINL1A IRC标记表达产物是如SEQ ID
NO：391、393、395、397、399、401、403或405中的任一个所展示的GRINL1A IRC转录物。
186.根据权利要求184所述的方法，其中所述GRINL1A IRC标记表达产物是如SEQ ID
NO：392、394、396、398、400、402、404或406中的任一个所展示的GRINL1A IRC多肽。
187.根据权利要求179或权利要求180所述的方法，其中所述ACRC IRC标记表达产物
包含相应于选自ACRC外显子3、5的外显子的核苷酸序列或者由该外显子所编码的氨基酸
序列。
188.根据权利要求187所述的方法，其中所述ACRC IRC标记表达产物是如SEQ ID NO：
407或409中的任一个所展示的ACRC IRC转录物。
189.根据权利要求187所述的方法，其中所述ACRC IRC标记表达产物是如SEQ ID NO：
408或410中的任一个所展示的ACRC IRC多肽。
190.根据权利要求179或权利要求180所述的方法，其中所述TG IRC标记表达产物包
含相应于选自TG外显子6的外显子的核苷酸序列或者由该外显子所编码的氨基酸序列。
191.根据权利要求190所述的方法，其中所述TG IRC标记表达产物是由SEQ ID NO：
411或413中的任一个所展示的TG IRC转录物。
192.根据权利要求190所述的方法，其中所述TG IRC标记表达产物是由SEQ ID NO：
412或414中的任一个所展示的TG IRC多肽。
193.根据权利要求179或权利要求180所述的方法，其中所述ASPHD2IRC标记表达产
物包含相应于选自ASPHD2外显子4的外显子的核苷酸序列或者由该外显子所编码的氨基
酸序列。
194.根据权利要求193所述的方法，其中所述ASPHD2IRC标记表达产物是如SEQ ID
NO：415、417或419中的任一个所展示的ASPHD2IRC转录物。
195.根据权利要求193所述的方法，其中所述ASPHD2IRC标记表达产物是如SEQ ID
NO：416、418或420中的任一个所展示的ASPHD2IRC多肽。
196.根据权利要求1-7中任一项所述的方法，其中通过在所述受试者中检测到来自选
自由CUL7、BTNL8/3、PANX2、Clorff91、ZNF335、MGRN1、GAA、CDK5R1、SNTB2、CLPB、ADMA19、SLC36A1、FKBP9、NDST1、HIPK2和CEACAM4(即，名单F)组成的组的至少一个产生多转录物的
基因的至少1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、
26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41、42、43、44、45、46、47、48、49、50、
51、52、53、54、55、56、57、58、59、60、61、62、63、64、65、66、67、68、69、70、71、72、73、74、75、
76、77、78、79、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95或96个IRC标志表达产物的水平与inSIRS阳性对照受试者的相应IRC标记表达产物水平相比增高确定手术后
炎症的存在或者发展手术后炎症的风险。
197.根据权利要求1-6中任一项或权利要求8所述的方法，其中通过在所述受试者
中检测到来自选自由CUL7、BTNL8/3、PANX2、Clorf91、ZNF335、MGRN1、GAA、CDK5R1、SNTB2、CLPB、ADMA19、SLC36A1、FKBP9、NDST1、HIPK2和CEACAM4(以下称为“名单F”)组成的组的
至少一个产生多转录物的基因的至少1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、
19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41、42、43、
44、45、46、47、48、49、50、51、52、53、54、55、56、57、58、59、60、61、62、63、64、65、66、67、68、
69、70、71、72、73、74、75、76、77、78、79、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、
94、95或96个IRC标志表达产物的水平与手术后炎症阳性对照受试者的相应IRC标记表达
产物水平相比降低来确定inSIRS的存在或者发展inSIRS的风险。
198.根据权利要求196或权利要求197所述的方法，其中所述CUL7IRC标记表达产物
包含相应于选自CUL7外显子5的外显子的核苷酸序列或者由该外显子所编码的氨基酸序
列。
199.根据权利要求198所述的方法，其中所述CUL7IRC标记表达产物是如SEQ ID NO：
421中的任一个所展示的CUL7IRC转录物。
200.根据权利要求198所述的方法，其中所述CUL7IRC标记表达产物是如SEQ ID NO：
422中的任一个所展示的CUL7IRC多肽。
201.根据权利要求196或权利要求197所述的方法，其中所述BTNL8/3IRC标记表达产
物包含相应于选自BTNL8/3外显子6的外显子的核苷酸序列或者由该外显子所编码的氨基
酸序列。
202.根据权利要求201所述的方法，其中所述BTNL8IRC标记表达产物是如SEQ ID NO：
423、425、427、429、431或433中的任一个所展示的BTNL8/3IRC转录物。
203.根据权利要求201所述的方法，其中所述BTNL8IRC标记表达产物是如SEQ ID NO：
424、426、428、430、432或434中的任一个所展示的BTNL8/3IRC多肽。
204.根据权利要求196或权利要求197所述的方法，其中所述PANX2IRC标记表达产物
包含相应于选自PANX2外显子1、2的外显子的核苷酸序列或者由该外显子所编码的氨基酸
序列。
205.根据权利要求204所述的方法，其中所述PANX2IRC标记表达产物是如SEQ ID NO：
435、437或439中的任一个所展示的PANX2IRC转录物。
206.根据权利要求204所述的方法，其中所述PANX2IRC标记表达产物是如SEQ ID NO：
436、438或440中的任一个所展示的PANX2IRC多肽。
207.根据权利要求196或权利要求197所述的方法，其中所述Clorf91IRC标记表达产
物包含相应于选自Clorf91外显子2的外显子的核苷酸序列或者由该外显子所编码的氨基
酸序列。
208.根据权利要求207所述的方法，其中所述Clorf91IRC标记表达产物是如SEQ ID
NO：441、443、445、447、449或451中的任一个所展示的Clorf91IRC转录物。
209.根据权利要求207所述的方法，其中所述Clorf91IRC标记表达产物是如SEQ ID
NO：442、444、446、448、450或452中的任一个所展示的Clorf91IRC多肽。
210.根据权利要求196或权利要求197所述的方法，其中所述ZNF335IRC标记表达产
物包含相应于选自ZNF335外显子5的外显子的核苷酸序列或者由该外显子所编码的氨基
酸序列。
211.根据权利要求210所述的方法，其中所述ZNF335IRC标记表达产物是如SEQ ID
NO：453、455或457的中的任一个所展示的ZNF335IRC转录物。
212.根据权利要求210所述的方法，其中所述ZNF335IRC标记表达产物是由SEQ ID
NO：454、456或458的中的任一个所展示的ZNF335IRC多肽。
213.根据权利要求196或权利要求197所述的方法，其中所述MGRN1IRC标记表达产物
包含相应于选自MGRN1外显子4的外显子的核苷酸序列或者由该外显子所编码的氨基酸序
列。
214.根据权利要求213所述的方法，其中所述MGRN1IRC标记表达产物是如SEQ ID NO：
459、461或463中的任一个所展示的MGRN1IRC转录物。
215.根据权利要求213所述的方法，其中所述MGRN1IRC标记表达产物是如SEQ ID NO：
460、462或464中的任一个所展示的MGRN1IRC多肽。
216.根据权利要求196或权利要求197所述的方法，其中所述GAA IRC标记表达产物
包含相应于选自GAA外显子3的外显子的核苷酸序列或者由该外显子所编码的氨基酸序
列。
217.根据权利要求216所述的方法，其中所述GAA IRC标记表达产物是如SEQ ID NO：
465、467或469中的任一个所展示的GAA IRC转录物。
218.根据权利要求216所述的方法，其中所述GAA IRC标记表达产物是如SEQ ID NO：
466、468或470中的任一个所展示的GAAIRC多肽。
219.根据权利要求196或权利要求197所述的方法，其中所述CDK5R1IRC标记表达产
物包含相应于选自CDK5R1外显子2的外显子的核苷酸序列或者由该外显子所编码的氨基
酸序列。
220.根据权利要求219所述的方法，其中所述CDK5R1IRC标记表达产物是如SEQ ID
NO：471中的任一个所展示的CDK5R1IRC转录物。
221.根据权利要求219所述的方法，其中所述CDK5R1IRC标记表达产物是如SEQ ID
NO：472中的任一个所展示的CDK5R1IRC多肽。
222.根据权利要求196或权利要求197所述的方法，其中所述SNTB2IRC标记表达产物
包含相应于选自SNTB2外显子4的外显子的核苷酸序列或者由该外显子所编码的氨基酸序
列。
223.根据权利要求222所述的方法，其中所述SNTB2IRC标记表达产物是如SEQ ID NO：
473中的任一个所展示的SNTB2IRC转录物。
224.根据权利要求222所述的方法，其中所述SNTB2IRC标记表达产物是如SEQ ID NO：
474中的任一个所展示的SNTB2IRC多肽。
225.根据权利要求196或权利要求197所述的方法，其中所述CLPB IRC标记表达产物
包含相应于选自CLPB外显子10的外显子的核苷酸序列或者由该外显子所编码的氨基酸序
列。
226.根据权利要求225所述的方法，其中所述CLPB IRC标记表达产物是如SEQ ID NO：
475、477或479中的任一个所展示的CLPB IRC转录物。
227.根据权利要求225所述的方法，其中所述CLPB IRC标记表达产物是如SEQ ID NO：
478或480中的任一个所展示的CLPB IRC多肽。
228.根据权利要求196或权利要求197所述的方法，其中所述ADAM19IRC标记表达产
物包含相应于选自ADAM19外显子10的外显子的核苷酸序列或者由该外显子所编码的氨基
酸序列。
229.根据权利要求228所述的方法，其中所述ADAM19IRC标记表达产物是如SEQ ID
NO：481、483、485或487中的任一个所展示的ADAM19IRC转录物。
230.根据权利要求228所述的方法，其中所述ADAM19IRC标记表达产物是如SEQ ID
NO：482、484、486或488中的任一个所展示的ADAM19IRC多肽。
231.根据权利要求196或权利要求197所述的方法，其中所述SLC36A1IRC标记表达产
物包含相应于选自SLC36A1外显子5的外显子的核苷酸序列或者由该外显子所编码的氨基
酸序列。
232.根据权利要求231所述的方法，其中所述SLC36A1IRC标记表达产物是如SEQ ID
NO：489、491、493或495中的任一个所展示的SLC36A1IRC转录物。
233.根据权利要求231所述的方法，其中所述SLC36A1IRC标记表达产物是如SEQ ID
NO：490、492、494或496中的任一个所展示的SLC36A1IRC多肽。
234.根据权利要求196或权利要求197所述的方法，其中所述FKBP9IRC标记表达产物
包含相应于选自FKBP9外显子10的外显子的核苷酸序列或者由该外显子所编码的氨基酸
序列。
235.根据权利要求234所述的方法，其中所述FKBP9IRC标记表达产物是如SEQ ID NO：
497或499中的任一个所展示的FKBP9IRC转录物。
236.根据权利要求234所述的方法，其中所述FKBP9IRC标记表达产物是如SEQ ID NO：
498或500中的任一个所展示的FKBP9IRC多肽。
237.根据权利要求196或权利要求197所述的方法，其中所述NDST1IRC标记表达产物
包含相应于选自NDST1外显子3的外显子的核苷酸序列或者由该外显子所编码的氨基酸序
列。
238.根据权利要求237所述的方法，其中所述NDST1IRC标记表达产物是如SEQ ID NO：
501或503中的任一个所展示的NDST1IRC转录物。
239.根据权利要求237所述的方法，其中所述NDST1IRC标记表达产物是如SEQ ID NO：
502或504中的任一个所展示的NDST1IRC多肽。
240.根据权利要求196或权利要求197所述的方法，其中所述HIPK2IRC标记表达产物
包含相应于选自HIPK2外显子11的外显子的核苷酸序列或者由该外显子所编码的氨基酸
序列。
241.根据权利要求240所述的方法，其中所述HIPK2IRC标记表达产物是如SEQ ID NO：
505、507、509或511中的任一个所展示的HIPK2IRC转录物。
242.根据权利要求240所述的方法，其中所述HIPK2IRC标记表达产物是如SEQ ID NO：
506、508、510或512中的任一个所展示的HIPK2IRC多肽。
243.根据权利要求196或权利要求197所述的方法，其中所述CEACAM4IRC标记表达产
物包含相应于选自CEACAM4外显子5、7、23的外显子的核苷酸序列或者由该外显子所编码
的氨基酸序列。
244.根据权利要求243所述的方法，其中所述CEACAM4IRC标记表达产物是如SEQ ID
NO：513或515中的任一个所展示的CEACAM4IRC转录物。
245.根据权利要求243所述的方法，其中所述CEACAM4IRC标记表达产物是如SEQ ID
NO：514或516中的任一个所展示的CEACAM4IRC多肽。
246.根据权利要求1-245中任一项所述的方法，包括检测分别来自名单A、B、C、D、E和
F中的两个或更多个名单的至少一个IRC标记表达产物的水平。
247.根据权利要求246所述的方法，包括检测来自名单A的至少一个IRC标记表达产
物的水平和来自名单B的至少另外一个IRC标记表达产物的水平。
248.根据权利要求246所述的方法，包括检测来自名单A的至少一个IRC标记表达产
物的水平和来自名单C至少另外一个的IRC标记表达产物的水平。
249.根据权利要求246所述的方法，包括检测来自名单A的至少一个IRC标记表达产
物的水平和来自名单D的至少另外一个IRC标记表达产物的水平。
250.根据权利要求246所述的方法，包括检测来自名单A的至少一个IRC标记表达产
物的水平和来自名单E的至少另外一个IRC标记表达产物的水平。
251.根据权利要求246所述的方法，包括检测来自名单A的至少一个IRC标记表达产
物的水平和来自名单F的至少另外一个IRC标记表达产物的水平。
252.根据权利要求246所述的方法，包括检测来自名单B的至少一个IRC标记表达产
物的水平和来自名单C的至少另外一个IRC标记表达产物的水平。
253.根据权利要求246所述的方法，包括检测来自名单B的至少一个IRC标记表达产
物的水平和来自名单D的至少另外一个IRC标记表达产物的水平。
254.根据权利要求246所述的方法，包括检测来自名单B的至少一个IRC标记表达产
物的水平和来自名单E的至少另外一个IRC标记表达产物的水平。
255.根据权利要求246所述的方法，包括检测来自名单B的至少一个IRC标记表达产
物的水平和来自名单F的至少另外一个IRC标记表达产物的水平。
256.根据权利要求246所述的方法，包括检测来自名单C的至少一个IRC标记表达产
物的水平和来自名单D的至少另外一个IRC标记表达产物的水平。
257.根据权利要求246所述的方法，包括检测来自名单C的至少一个IRC标记表达产
物的水平和来自名单E的至少另外一个IRC标记表达产物的水平。
258.根据权利要求246所述的方法，包括检测来自名单C的至少一个IRC标记表达产
物的水平和来自名单F的至少另外一个IRC标记表达产物的水平。
259.根据权利要求246所述的方法，包括检测来自名单D的至少一个IRC标记表达产
物的水平和来自名单E的至少另外一个IRC标记表达产物的水平。
260.根据权利要求246所述的方法，包括检测来自名单D的至少一个IRC标记表达产
物的水平和来自名单F的至少另外一个IRC标记表达产物的水平。
261.根据权利要求246所述的方法，包括检测来自名单E的至少一个IRC标记表达产
物的水平和来自名单F的至少另外一个IRC标记表达产物的水平。
262.根据权利要求1-245中任一项所述的方法，包括检测来自选自名单A、B、C、D、E和
F的三个名单中的每一个的至少一个IRC标记表达产物的水平。
263.根据权利要求262所述的方法，包括检测来自名单A的至少一个IRC标记表达产
物的水平和来自名单B的至少一个其他IRC标记表达产物的水平和来自名单C的至少一个
其他IRC标记表达产物的水平。
264.根据权利要求262所述的方法，包括检测来自名单A的至少一个IRC标记表达产
物的水平和来自名单B的至少一个其他IRC标记表达产物的水平和来自名单D的至少一个
其他IRC标记表达产物的水平。
265.根据权利要求262所述的方法，包括检测来自名单A的至少一个IRC标记表达产
物的水平和来自名单B的至少一个其他IRC标记表达产物的水平和来自名单E的至少一个
其他IRC标记表达产物的水平。
266.根据权利要求262所述的方法，包括检测来自名单A的至少一个IRC标记表达产
物的水平和来自名单B的至少一个其他IRC标记表达产物的水平和来自名单F的至少一个
其他IRC标记表达产物的水平。
267.根据权利要求262所述的方法，包括检测来自名单B的至少一个IRC标记表达产
物的水平和来自名单C的至少一个其他IRC标记表达产物的水平和来自名单D的至少一个
其他IRC标记表达产物的水平。
268.根据权利要求262所述的方法，包括检测来自名单B的至少一个IRC标记表达产
物的水平和来自名单C的至少一个其他IRC标记表达产物的水平和来自名单E的至少一个
其他IRC标记表达产物的水平。
269.根据权利要求262所述的方法，包括检测来自名单B的至少一个IRC标记表达产
物的水平和来自名单C的至少一个其他IRC标记表达产物的水平和来自名单F的至少一个
其他IRC标记表达产物的水平。
270.根据权利要求262所述的方法，包括检测来自名单C的至少一个IRC标记表达产
物的水平和来自名单D的至少一个其他IRC标记表达产物的水平和来自名单E的至少一个
其他IRC标记表达产物的水平。
271.根据权利要求262所述的方法，包括检测来自名单C的至少一个IRC标记表达产
物的水平和来自名单D的至少一个其他IRC标记表达产物的水平和来自名单F的至少一个
其他IRC标记表达产物的水平。
272.根据权利要求262所述的方法，包括检测来自名单D的至少一个IRC标记表达产
物的水平和来自名单E的至少一个其他IRC标记表达产物的水平和来自名单F的至少一个
其他IRC标记表达产物的水平。
273.根据权利要求1-245中任一项所述的方法，包括检测来自选自名单A、B、C、D、E和
F的四个名单中的每一个的至少一个IRC标记表达产物的水平。
274.根据权利要求273所述的方法，包括检测来自名单A的至少一个IRC标记表达产
物的水平和来自名单B的至少一个其他IRC标记表达产物的水平和来自名单C的至少一个
其他IRC标记表达产物的水平和来自名单D的至少一个其他IRC标记表达产物的水平。
275.根据权利要求273所述的方法，包括检测来自名单A的至少一个IRC标记表达产
物的水平和来自名单B的至少一个其他IRC标记表达产物的水平和来自名单C的至少一个
其他IRC标记表达产物的水平和来自名单E的至少一个其他IRC标记表达产物的水平。
276.根据权利要求273所述的方法，包括检测来自名单A的至少一个IRC标记表达产
物的水平和来自名单B的至少一个其他IRC标记表达产物的水平和来自名单C的至少一个
其他IRC标记表达产物的水平和来自名单F的至少一个其他IRC标记表达产物的水平。
277.根据权利要求273所述的方法，包括检测来自名单B的至少一个IRC标记表达产
物的水平和来自名单C的至少一个其他IRC标记表达产物的水平和来自名单D的至少一个
其他IRC标记表达产物的水平和来自名单E的至少一个其他IRC标记表达产物的水平。
278.根据权利要求273所述的方法，包括检测来自名单B的至少一个IRC标记表达产
物的水平和来自名单C的至少一个其他IRC标记表达产物的水平和来自名单D的至少一个
其他IRC标记表达产物的水平和来自名单F的至少一个其他IRC标记表达产物的水平。
279.根据权利要求273所述的方法，包括检测来自名单A的至少一个IRC标记表达产
物的水平和来自名单C的至少一个其他IRC标记表达产物的水平和来自名单D的至少一个
其他IRC标记表达产物的水平和来自名单E的至少一个其他IRC标记表达产物的水平。
280.根据权利要求273所述的方法，包括检测来自名单A的至少一个IRC标记表达产
物的水平和来自名单C的至少一个其他IRC标记表达产物的水平和来自名单D的至少一个
其他IRC标记表达产物的水平和来自名单F的至少一个其他IRC标记表达产物的水平。
281.根据权利要求273所述的方法，包括检测来自名单A的至少一个IRC标记表达产
物的水平和来自名单D的至少一个其他IRC标记表达产物的水平和来自名单E的至少一个
其他IRC标记表达产物的水平和来自名单F的至少一个其他IRC标记表达产物的水平。
282.根据权利要求273所述的方法，包括检测来自名单A的至少一个IRC标记表达产
物的水平和来自名单B的至少一个其他IRC标记表达产物的水平和来自名单D的至少一个
其他IRC标记表达产物的水平和来自名单E的至少一个其他IRC标记表达产物的水平。
283.根据权利要求273所述的方法，包括检测来自名单C的至少一个IRC标记表达产
物的水平和来自名单D的至少一个其他IRC标记表达产物的水平和来自名单E至少一个其
他的IRC标记表达产物的水平和来自名单F的至少一个其他IRC标记表达产物的水平。
284.根据权利要求1-245中任一项所述的方法，包括检测分别来自名单A、B、C、D、E和
F的五个名单中的每一个的至少一个IRC标记表达产物的水平。
285.根据权利要求284所述的方法，包括检测来自名单A的至少一个IRC标记表达产
物的水平和来自名单B的至少一个其他IRC标记表达产物的水平和来自名单C的至少一个
其他IRC标记表达产物的水平和来自名单D的至少一个其他IRC标记表达产物的水平和来
自名单E的至少一个其他IRC标记表达产物的水平。
286.根据权利要求284所述的方法，包括检测来自名单A的至少一个IRC标记表达产
物的水平和来自名单B的至少一个其他IRC标记表达产物的水平和来自名单C的至少一个
其他IRC标记表达产物的水平和来自名单D的至少一个其他IRC标记表达产物的水平和来
自名单F的至少一个其他IRC标记表达产物的水平。
287.根据权利要求284所述的方法，包括检测来自名单A的至少一个IRC标记表达产
物的水平和来自名单C的至少一个其他IRC标记表达产物的水平和来自名单D的至少一个
其他IRC标记表达产物的水平和来自名单E的至少一个其他IRC标记表达产物的水平和来
自名单F的至少一个其他IRC标记表达产物的水平。
288.根据权利要求284所述的方法，包括检测来自名单B的至少一个IRC标记表达产
物的水平和来自名单C的至少一个其他IRC标记表达产物的水平和来自名单D的至少一个
其他IRC标记表达产物的水平和来自名单E的至少一个其他IRC标记表达产物的水平和来
自名单F的至少一个其他IRC标记表达产物的水平。
289.根据权利要求284所述的方法，包括检测来自名单A的至少一个IRC标记表达产
物的水平和来自名单B的至少一个其他IRC标记表达产物的水平和来自名单D的至少一个
其他IRC标记表达产物的水平和来自名单E的至少一个其他IRC标记表达产物的水平和来
自名单F的至少一个其他IRC标记表达产物的水平。
290.根据权利要求1-245中任一项所述的方法，包括检测分别来自名单A、B、C、D、E和
F中的每一个的至少一个IRC标记表达产物的水平。
291.根据权利要求5所述的方法，包括当所测量所述或每个IRC表达产物的水平或功
能活性与对照受试者是正常受试者时所测量的所述或每个相应表达产物的水平或功能活
性相同或相似时，诊断不存在败血症、inSIRS或手术后炎症。
292.根据权利要求291所述的方法，其中所测量的单个IRC表达产物的水平相对于所
测量的单个相应表达产物的水平变化不超过约20％。
293.根据权利要求5所述的方法，其中所述生物样本包括血液，尤其是适当包含白细
胞的外周血。
294.一种治疗、预防或抑制受试者中选自败血症、inSIRS或手术后炎症中的至少一种
病况发展的方法，所述方法包括：
-将所述受试者的产生多转录物的基因的至少一种IRC表达产物的水平与选自手术后
炎症阳性受试者、inSIRS阳性受试者和败血症阳性受试者的至少一种对照受试者的相应
IRC标记表达产物的水平进行比较，其中所述至少一种IRC标记表达水平与所述相应IRC标
记表达产物水平的差异表明所述受试者是否患有或者有风险发展所述病况中的一种，其中
预先确定所述至少一种IRC标记表达产物在所述疾病的至少两种疾病之间存在差异表达，
以及其中预先确定来自所述产生多转录物的基因的至少一种其他表达产物并未这样差异
表达；以及
-在所述受试者败血症检测呈阳性的基础上，向所述受试者施用有效量的治疗或改善
败血症的症状或者逆转或抑制败血症发展的剂，或者
-在所述受试者inSIRS检测呈阳性的基础上，向所述受试者施用有效量的治疗或改善
inSIRS的症状或者逆转或抑制inSIRS发展的剂，或者
-在所述受试者手术后炎症检测呈阳性的基础上，向所述受试者施用有效量的治疗或
改善症状或者逆转或抑制手术后炎症发展的剂。
295.根据权利要求294所述的方法，其中所述败血症的治疗或药剂选自抗生素，静脉
内液，血管活性剂，用于损害或受损器官的姑息性支撑和对要害器官的密切监测。
296.根据权利要求294所述的方法，其中所述inSIRS的治疗或药剂选自抗生素，类固
醇，静脉内液，糖皮质激素，血管活性剂，用于损害或受损器官的姑息性支撑(如用于呼吸
窘迫的氧气，血容量减少的液体)和对要害器官的密切监测。
297.根据权利要求294所述的方法，其中所述手术后炎症的治疗或药剂选自抗生素，
静脉内液和抗炎药剂。
诊断和/或筛选剂及其用途
技术领域
们的表达产物，以及这些标记在这些病况的分级、监测、治疗和管理中的用途。本发明可实
际应用于轻微或亚临床状态的败血症或感染阴性SIRS或手术后炎症的早期诊断和诊断，
检测作为活动性或进行性疾病的一部分的特定细胞免疫响应，监测临床感染受试者，以及
对临床和亚临床感染受试者制定更好的治疗和管理决策。另外，本发明还可实际用于对重
症监护病房或加强监护病房的患者进行败血症或感染阴性SIRS或手术后炎症的监测和分
级，以及临床结果的预测。
背景技术
炎、局部缺血、多重创伤和严重组织损伤在内的危重病况有关。大型开放性的外科手术是
一种受控形式的物理损伤，其可引起不同程度的系统性炎症。事实上，已有人报道心脏搭
桥手术(Chello et al.，2006，Critical Care Medicine34(3)：660-667)、开放性的腹
部大动脉修复术(Btown et al.，2003，Journal of Vascular Surgery37(3)：600-606)
以及开放性的结直肠切除术(Haga et al.，1997，Critical Care Medicine25(12)：
1994-2000)后的SIRS的发生是非常常见的并且是引起包括死亡在内的术后并发症的重
要原因。由Michalopoulos和他的同事们公开的调查结果显示在他们的病房中100％的
心脏外科手术患者(n＝2615；平均年龄60.8.7岁)在手术后前12小时的护理中发展了
SIRS(Michalopoulos et al.，2005，Intensive Care Medicine22(1)：S134)。近来的研究
表明，基于来自重大身体伤害和创伤的细胞损伤(坏死)的量，线粒体蛋白释放入血液循环
并激发损伤相关分子模式(DAMP)。值得注意的是，线粒体是一种细胞器，通过一种称为内
共生进化的过程最初来源于细菌。正是这些DAMP通过固有免疫系统激发急性期反应，其
生物学上与感染期释放的病原相关分子模式(PAMP)一致(Zhang et al，2010，Nature464：
104-107)。
或真菌感染。然而，血液循环病原体的微生物证据对于确认败血症的诊断来说不是必要
的。严重败血症可包括低血压和器官功能不全的迹象。当不能用静脉内液来管理低血
压时，可诊断为感染性休克(Bone et al，1992，Chest101：1644-55；American College
of Chest Physicians/Society of Critical Care Medicine Consensus Conference.
Definitions of sepsis and organ failure and guidelines for the use of innovative therapies in sepsis.1992，Crit Care Med.20(6)：864-874；Bernard et al，(PROWESS
Study Group)，2001，N Engl J Med.344(10)：699-709.)。因此，1991年的协商会议中推
荐，当患者被鉴定为患有SIRS或多器官功能障碍综合征(MODS)时，应采用连续的(即，每
日或更频繁地)风险分级或可能性评估技术来描述该综合征的进程(Bone et al，1992，
supra；American College of Chest Physicians/Society of Critical Care Medicine
Consensus Conference，1992，supra)。
century in Australia.Trends and pattems in maj or causes of death.Mortality
Surveillance Series，Number4，p49)。在发达国家，由于老龄化人群、免疫受损患者(如
接受化疗的患者，或者进行器官移植的患者，或者长期服用皮质类固醇的患者)、慢性疾病
患者寿命的增加、抗微生物剂耐受特别是年轻人群的抗微生物剂耐受以及病毒性疾病如
AIDS，败血症的发病率预计将上升。
Immunology6：813-822；Eber et al.，2010，Arch Intern Med.170(4)：374-353)。近来的证据表明，滥用抗生素可导致耐药性，因此，为减少三级医疗监护室中的消耗，抗生素治疗
期间的指导是必不可少的(Hanberger et al，1999，JAMA.281：61-71)。
加的住院患者入院，(Goldmann et al，1996，JAMA.275：234-40)。不仅在重症监护方面，而且对于血液科、器官移植、内科肿瘤和手术后住院患者来说，细菌性和真菌性败血症都是重
大的医学挑战。
侵的反应早期，普遍存在一种超炎性信号。也就是说，大多数败血症病例都是由在具有免
疫能力的宿主中通常不引起系统性疾病的细菌和真菌引起的。局部的固有免疫机制主要
刺激细胞因子、趋化因子、前列腺素和白三烯的释放，其可增加局部感染源的血流量并引起
白细胞的涌入。在这个过程中，作为先天免疫响应的一部分，toll样受体(TLR)也被激活
并具有除了影响抗原特异的适应性响应之外直接的抗微生物活性。TLR是一种模式识别
受体，一旦微生物破坏皮肤或肠屏障，TLR即可识别PAMP(Hotchkiss et al，2009，Nature
Medicine.15(5)：496-497)。然而，宿主固有防御能力的薄弱以及内毒素或其它毒力因子的
释放可在强烈的炎性反应后迅速地引起严重的败血症。
的生理响应的医学决定因素。目前，细菌和真菌检测的黄金标准是在微生物培养基上的
血液培养，其目的是为了使致病微生物得以生长。这种方法在鉴定出微生物以及提供抗
生素的敏感性通常之前需要48-72小时的孵育如此便可实现与初始经验性治疗相对照
的基于证据的治疗。与此相反，近来Hotchkiss等人(Adib-Conquy et al，2009，Thromb
Haemast.101(1)：36-47)提出，败血症的发展表明过剩的固有免疫响应的有害后果。尽管
大多数患者在该“超炎症期”存活，但也有人提出接下来将是称为免疫麻痹的延长的免疫抑
制阶段(Monneret et al，2008，Mol Med.14(1-2)：64-78；Wade et al，2009，Science326：
865-876)。这种继发性免疫抑制被表征为针对阳性对照抗原的迟发型超敏反应的丧失，不
能清除原发感染和可能包括正常潜伏病毒如CMV或HHV激活的继发感染的发生。总之，这
意味着目前的临床焦点应放在加强/维持危重患者的免疫能力上。因此，为达到这一临床
目标，需要一种监测免疫系统状态的方法，以便在恰当的时间进行免疫治疗。
也将用同静脉注射糖皮质激素(GCS)和抗生素治疗。经验性治疗会持续，直到获知阳性的
微生物学结果，既往病史被证实和/或对早期管理已经出现了积极的临床反应。如果基于
临床表现和入院原因，所述SIRS响应与急性创伤如机动车伤害或急性炎性病况如过敏反
应有关是明确的，当有指征时(where indicated)，将给予患者其它静脉内液，血液制剂或
肾上腺素。然而，对具有真正SIRS响应的患者来说尽早进行明确的处理以保存抗生素的
疗效是很重要的。同样地，给予有细菌或真菌感染的患者以抗生素而不是类固醇以使得免
疫功能不被损害也是必要的。当除了发热外还具有生命体征如心率和血压临床显著变化
的患者进入急诊室时，鉴别诊断难度指数级增加。这些是感染阴性SIRS和感染性SIRS早
期阶段的体征和症状且不可能从临床上区分这两种疾病。然而，虽然可以根据生理端点
(physiological endpoints)来区分这两种疾病，但是分子生物学仍被认为是唯一能识别
发展严重感染时所出现的化学特征变化的。
径发展。高特异性和高灵敏性、低污染风险以及低血液收集和处理速度的结合，使得分子技
术如实时定量PCR(qRT PCR)技术成为相对于微生物培养而言更有效的选择。
级和监测，以启动基于证据且目标导向的医学治疗具有重大的临床意义。这是很关键的，因
为对于感染和未感染的SIRS的紧急处理计划是非常不同的。由于还未鉴定出清楚的感染
位点，依赖于经验性治疗意味着一些患者可能接受着过量的抗生素，而另一些患者则在接
受免疫抑制性治疗(如皮质类固醇)。而且，一旦患者被鉴定出患有败血症，那么临床医生
有必要考虑使用常规的免疫系统监测以调整依赖于免疫系统状态、感染类型和可能与败血
症相关的多器官并发症的治疗。
发明内容
本发明人发现，在这些病况之间单个基因的某些外显子(本文也称为“病况区分外显子
(condition-separating exons)”)在外周血中存在差异表达，而来自相同基因的其它外显
子不存在这种差异表达。基于这个发现，本发明人开发了利用病况区分外显子检测败血症、
inSIRS和重大外科手术后的系统性炎症存在、不存在或发展风险的各种各样的方法和试剂
盒。在某些实施方案中，与现有技术的检测方法和试剂盒相比，这些检测方法和试剂盒显示
出超越不能区分重大外科手术后的系统性炎症和感染阴性的SIRS的现有技术的检测方法
和试剂盒的重大进步。相应地，在这些实施方案中，本发明提供了区分这两组自身以及这两
组与败血症的方法以允许炎性响应的定性或定量分级，如同存在从手术后炎症直到败血症
的炎性响应的严重程度的“连续谱”。
胞中某些标记物水平的检测。在一些以血液循环白细胞为分析对象的实施方案中，一般认
为，在广泛的组织损伤发生前的病程的非常早期阶段检测败血症及其相关疾病(本文也称
为“败血症相关疾病”)的宿主响应存在与否的将是切实可行的。
基因转录物的表达，这种监测可能体现在与活动性疾病或疾病响应存在有关的RNA水平或
蛋白产物模式改变上。
法一般包括：将该受试者中产生多转录物的基因(multi-transcript-producing gene)的
至少一种表达产物(本文也称为“炎性响应连续谱”(inflammatory response continuum，
IRC)标记表达产物)的水平与选自手术后炎症阳性受试者、inSIRS阳性受试者、败血症阳
性受试者和正常受试者的至少一种对照受试者的相应IRC标记表达产物的水平进行比较，
其中，所述至少一种IRC标记表达产物的水平与相应IRC标记表达产物水平的差异表明了
该受试者是否患有或者有风险发展所述病况中的一种，其中预先确定所述至少一种IRC标
记表达产物在所述疾病的至少两种疾病之间存在差异表达，以及其中预先确定来自该产生
多转录物的基因的至少另外一种表达产物不存在这种差异表达。所述至少一种ICR标记表
达产物可相应选自ICR标记转录物或ICR标记多肽。
因、泛连接蛋白2(PANX2)基因、扁菱形蛋白5同系物2(Drosophila)(RHBDF2)基因、SLAM
家族成员7(SLAMF7)基因、自噬/beclin-1调节子1(AMBRAl)基因、羧酸酯酶2(肠，肝)
(CES2)基因、酪蛋白水解肽酶B同系物(E.coli)(CLPB)基因、同源结构域相互作用蛋白激
酶2(HIPK2)基因和染色体1开放读码框91(C10RF91)基因、N-去乙酰酶N-磺基转移酶
(类肝素葡糖胺基)1(NDSTI)基因、溶质载体家族36(质子/氨基酸同向转运体)(成员
1(SLC36A1)基因、ADAM金属肽酶结构域19(解链蛋白酶β)(ADAM19)基因、cullin7(CUL7)
基因、甲状腺球蛋白(TG)基因、程序化细胞死亡1配体2(PDCD1LG2)基因、谷氨酸受体(离
子型(N-甲基D-天冬氨酸样1A(GRINL1A)基因、红褐蛋白(环指1(MGRN1)基因、互养蛋白
(β2(抗肌萎缩蛋白结合蛋白A1(59kDa(碱性组分2)(SNTB2)基因、周期蛋白依赖性激酶
5(调节亚基1(p35)(CDK5R1)基因、葡萄糖苷酶(α；酸性(GAA)基因，剑蛋白p60亚基A样
2(KATNAL2)基因、癌胚抗原相关的细胞粘附分子4(CEACAM4)基因、锌指蛋白335(ZNF335)
基因、含天冬氨酸β-羟化酶结构域2(ASPHD2)基因、含酸性重复序列(ACRC)基因、嗜乳
脂蛋白样3/嗜乳脂蛋白样8(BTNL3，BTLN8)基因、莫罗尼(Moloney)白血病病毒10同系
物(小鼠)(MOV10)基因、中介复合体亚基12样(MED12L)基因、kelch样6(Drosophila)
(KLHL6)基因、PDZ和LIM结构域5(PDLIM5)基因、UDP-N-乙酰基-α-D-半乳糖胺：多肽
N-乙酰基半乳糖胺基转移酶10(GALNT10)基因、分离蛋白1(SCRN1)基因、泡状(癌症过表
达(促存活蛋白1(VOPP1、RP11-289110.2)基因、FK506结合蛋白9，63kDa(FKBP9，FKBP9，
FKBP9L，AC091812.2)基因、驱动蛋白家族成员27(KIF27)基因、piwi样4(Drosophila)
(PIWIL4)基因、端粒酶相关蛋白1(TEP1)基因、GTP环化水解酶1、(GCH1)基因、富含脯氨酸
11、(PRR11)基因、钙粘蛋白2，1型，N-钙粘蛋白(神经元的)(CDH2)基因、蛋白磷酸酶1B样
(FLJ40125，AC138534.1)(PPM1N)基因、相关RAS病毒(r-ras)癌基因同系物，(RRAS)基因、
多萜基二磷酸寡聚糖蛋白葡糖基转移酶，(DDOST)基因、前咽缺陷1同系物A(C.elegans)
(APH1A)基因、微管蛋白酪氨酸连接酶(TTL)基因、睾丸表达261，(TEX261)基因、辅酶Q2
同系物、异戊二烯基转移酶(酵母)(COQ2)基因、FCH和双SH3结构域1，(FCHSD1)基因、
BCL2-拮抗剂/杀伤(BCL2-antagonist/killer)1，(BAK1)基因、溶质载体家族25(线粒体
载体；磷酸盐载体)成员25，(SLC25A25)基因、RELT肿瘤坏死因子受体，(RELT)基因、酸性
磷酸酶2，溶酶体的，(ACP2)基因、TBC1结构域家族，成员2B，(TBC1D2B)基因、范科尼贫血
(Fanconi anemia)，互补组A，(FANCA)基因，溶质载体家族39(金属离子转运体)成员11，
(SLC39A11)基因。
ID NO：1、3、5、7、9、11、13、15、17、19、21、23、25、27、29、31、33、35、37、39、41、43、45、47、49、
51、53、55、57、59、61、63、65、67、69、71、73、75、77、79、81、83、85、87、89、91、93、95、97、99、
101、103、105、107、109、111、113、115、117、119、121、123、125、127、129、131、133、135、137、
139、141、143、145、147、149、151、153、155、157、159、161、163、165、167、169、171、173、175、
177、179、181、183、185、187、189、191、193、195、197、199、201、203、205、207、209、211、213、
215、217、219、221、223、225、227、229、231、233、235、237、239、241、243、245、247、249、251、
253、255、257、259、261、263、265、267、269、271、273、275、277、279、281、283、285、287、289、
291、293、295、297、299、301、303、305、307、309、311、313、315、317、319、321、323、325、327、
329、331、333、335、337、339、341、343、345、347、349、351、353、355、357、359、361、363、365、
367、369、371、373、375、377、379、381、383、385、387、389、391、393、395、397、399、401、403、
405、407、409、411、413、415、417、419、421、423、425、427、429、431、433、435、437、439、441、
443、445、447、449、451、453、455、457、459、461、463、465、467、469、471、473、475、477、479、
481、483、485、487、489、491、493、495、497、499、501、503、505、507、509、511、513 或 515 中任一个所展示的序列或其互补物共有至少70％(或至少71％到至少99％以及其间的所有
整数百分比)序列同一性的核苷酸序列的多核苷酸；(b)包含编码含SEQ ID NO：2、4、6、
8、10、12、14、16、18、20、22、24、26、28、30、32、34、36、38、40、42、44、46、48、50、52、54、56、58、
60、62、64、66、68、70、72、74、76、78、80、82、84、86、88、90、92、94、96、98、100、102、104、106、
108、110、112、114、116、118、120、122、124、126、128、130、132、134、136、138、140、142、144、
146、148、150、152、154、156、158、160、162、164、166、168、170、172、174、176、178、180、182、
184、186、188、190、192、194、196、198、200、202、204、206、208、210、212、214、216、218、220、
222、224、226、228、230、232、234、236、238、240、242、244、246、248、250、252、254、256、258、
260、262、264、266、268、270、272、274、276、278、280、282、284、286、288、290、292、294、296、
298、300、302、304、306、308、310、312、314、316、318、320、322、324、326、328、330、332、334、
336、338、340、342、344、346、348、350、352、354、356、358、360、362、364、366、368、370、372、
374、376、378、380、382、384、386、388、390、392、394、396、398、400、402、404、406、408、410、
412、414、416、418、420、422、424、426、428、430、432、434、436、438、440、442、444、446、448、
450、452、454、456、458、460、462、464、466、468、470、472、474、476、478、480、482、484、486、
488、490、492、494、496、498、500、502、504、506、508、510、512、514或516中任一个所展示的氨基酸序列的多肽的核苷酸序列的多核苷酸；(c)包含编码与SEQ ID NO：2、4、6、8、10、12、
14、16、18、20、22、24、26、28、30、32、34、36、38、40、42、44、46、48、50、52、54、56、58、60、62、
64、66、68、70、72、74、76、78、80、82、84、86、88、90、92、4、96、98、100、102、104、106、108、110、
112、114、116、118、120、122、124、126、128、130、132、134、136、138、140、142、144、146、148、
150、152、154、156、158、160、162、164、166、168、170、172、174、176、178、180、182、184、186、
188、190、192、194、196、198、200、202、204、206、208、210、212、214、216、218、220、222、224、
226、228、230、232、234、236、238、240、242、244、246、248、250、252、254、256、258、260、262、
264、266、268、270、272、274、276、278、280、282、284、286、288、290、292、294、296、298、300、
302、304、306、308、310、312、314、316、318、320、322、324、326、328、330、332、334、336、338、
340、342、344、346、348、350、352、354、356、358、360、362、364、366、368、370、372、374、376、
378、380、382、384、386、388、390、392、394、396、398、400、402、404、406、408、410、412、414、
416、418、420、422、424、426、428、430、432、434、436、438、440、442、444、446、448、450、452、
454、456、458、460、462、464、466、468、470、472、474、476、478、480、482、484、486、488、490、
492、494、496、498、500、502、504、506、508、510、512、514或516中所展示的序列的至少一部分共有至少70％(或至少71％到至少99％和其间的所有整数百分比)序列相似性或同
一性的多肽的核苷酸序列的多核苷酸；(d)包含能够在至少中等或高严格度条件下与(a)、
(b)、(c)或其互补物杂交的核苷酸序列的多核苷酸表达产物。
NO：2、4、6、8、10、12、14、16、18、20、22、24、26、28、30、32、34、36、38、40、42、44、46、48、50、52、
54、56、58、60、62、64、66、68、70、72、74、76、78、80、82、84、86、88、90、92、94、96、98、100、102、
104、106、108、110、112、114、116、118、120、122、124、126、128、130、132、134、136、138、140、
142、144、146、148、150、152、154、156、158、160、162、164、166、168、170、172、174、176、178、
180、182、184、186、188、190、192、194、196、198、200、202、204、206、208、210、212、214、216、
218、220、222、224、226、228、230、232、234、236、238、240、242、244、246、248、250、252、254、
256、258、260、262、264、266、268、270、272、274、276、278、280、282、284、286、288、290、292、
294、296、298、300、302、304、306、308、310、312、314、316、318、320、322、324、326、328、330、
332、334、336、338、340、342、344、346、348、350、352、354、356、358、360、362、364、366、368、
370、372、374、376、378、380、382、384、386、388、390、392、394、396、398、400、402、404、406、
408、410、412、414、416、418、420、422、424、426、428、430、432、434、436、438、440、442、444、
446、448、450、452、454、456、458、460、462、464、466、468、470、472、474、476、478、480、482、
484、486、488、490、492、494、496、498、500、502、504、506、508、510、512、514或516中任一个所展示的氨基酸序列的多肽；和(ii)包含与SEQ ID NO：2、4、6、8、10、12、14、16、18、20、22、
24、26、28、30、32、34、36、38、40、42、44、46、48、50、52、54、56、58、60、62、64、66、68、70、72、
74、76、78、80、82、84、86、88、90、92、94、96、98、100、102、104、106、108、110、112、114、116、
118、120、122、124、126、128、130、132、134、136、138、140、142、144、146、148、150、152、154、
156、158、160、162、164、166、168、170、172、174、176、178、180、182、184、186、188、190、192、
194、196、198、200、202、204、206、208、210、212、214、216、218、220、222、224、226、228、230、
232、234、236、238、240、242、244、246、248、250、252、254、256、258、260、262、264、266、268、
270、272、274、276、278、280、282、284、286、288、290、292、294、296、298、300、302、304、306、
308、310、312、314、316、318、320、322、324、326、328、330、332、334、336、338、340、342、344、
346、348、350、352、354、356、358、360、362、364、366、368、370、372、374、376、378、380、382、
384、386、388、390、392、394、396、398、400、402、404、406、408、410、412、414、416、418、420、
422、424、426、428、430、432、434、436、438、440、442、444、446、448、450、452、454、456、458、
460、462、464、466、468、470、472、474、476、478、480、482、484、486、488、490、492、494、496、
498、500、502、504、506、508、510、512、514或516中任一个所展示的氨基酸序列共有至少
70％(或至少71％到至少99％及其间的所有整数百分比)序列相似性或同一性的氨基酸
序列的多肽。
至少一个对照受试者获得的参考样本中相应IRC标记表达产物的水平进行比较。在这种类
型的示例性说明的实例中，所述方法包括：当所测量的某个或每个IRC标记表达产物水平
与所测量的某个或每个相应IRC标记表达产物水平不同时，评估所述受试者是否患有或者
有风险发展所述多种病况中的一种。在某些实施方案中，单个IRC标记表达产物水平至少
是单个相应的IRC表达产物水平的至少110％、120％、130％、140％、150％、160％、170％、
180％、190％、200％、300％、400％、500％、600％、700％、800％、900％或1000％，或者不超过单个相应的IRC表达产物水平的大约95％、90％、80％、70％、60％、50％、40％、30％、
20％、10％、5％、4％、3％、2％、1％、0.5％、0.1％、0.01％、0.001％或者0.0001％，这在下文称为“差异表达”。
26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41、42、43、44、45、46、47 或 48 个 IRC标志表达产物的水平与手术后炎症阳性对照受试者的相应IRC标记表达产物水平相比降
低来确定为败血症的存在或者发展败血症的风险。在一些实施方案中，通过在所述受试者
中检测到来自选自由KIF27、OTX1、CDK5R1、FKBP9、CDH2、ADAM19、BTNL3/8和PANX2(即，名单A)组成的组的至少一个产生多转录物的基因的至少1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、
14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、
39、40、41、42、43、44、45、46、47或48个IRC标志表达产物水平与败血症对照受试者的相应IRC标记表达产物水平相比增高来确定手术后炎症的存在或者发展手术后炎症的风险。在
这些实施方案的示例性说明的实例中，所述KIF27IRC标记表达产物包含相应于选自KIF27
外显子4和外显子7的外显子的核苷酸序列或者由该外显子所编码的氨基酸序列。代表
性的KIF27IRC转录物如SEQ ID NO：1，3，5，7和9中所示，代表性的KIF27IRC多肽如SEQ
ID NO：2，4，6，8和10中所示。在另外的示例性说明的实例中，所述OTX1IRC标记表达产物
包含相应于OTX1外显子5的核苷酸序列或者由该外显子所编码的氨基酸序列。代表性的
OTX1IRC转录物如SEQ ID NO：11和13中所示，代表性的OTX1IRC多肽如SEQ ID NO：12和
14所示。在另外的示例性说明的实例中，所述CDK5R1IRC标记表达产物包含相应于CDK5R1
外显子2的核苷酸序列或者由该外显子所编码的氨基酸序列。代表性的CDK5R1IRC转录物
如SEQ ID NO：15所示，代表性的CDK5R1IRC多肽如SEQ ID NO：16所示。在另外的示例性
说明的实例中，所述FKBP9IRC标记表达产物包含相应于FKBP9外显子10的核苷酸序列或
者由该外显子所编码的氨基酸序列。代表性的FKBP9IRC转录物如SEQ ID NO：17所示，代
表性的FKBP9IRC多肽如SEQ ID NO：18所示。在另外的示例性说明的实例中，所述CDH2IRC
标记表达产物包含相应于CDH2外显子10的核苷酸序列或者由该外显子所编码的氨基酸序
列。代表性的CDH2IRC转录物如SEQ ID NO：19和21所示，代表性的CDH2IRC多肽如SEQ
ID NO：20和22所示。在另外的示例性说明的实例中，所述ADAM19IRC标记表达产物包含
相应于ADAM19外显子10的核苷酸序列或者由该外显子所编码的氨基酸序列。代表性的
ADAM19IRC转录物如SEQ ID NO：23、25、27和29所示，代表性的ADAM19IRC多肽如SEQ ID
NO：24、26、28和30所示。在另外的示例性说明的实例中，所述BTNL8/3IRC标记表达产物包
含相应于BTNL8/3外显子6的核苷酸序列或者由该外显子所编码的氨基酸序列。代表性的
BTNL8/3IRC转录物如SEQ ID NO：31、33、35、37、39和41所示，代表性的BTNL8/3IRC多肽
如SEQ ID NO：32、34、36、38、40和42所示。在另外的示例性说明的实例中，所述PANX2IRC标记表达产物包含相应于选自PANX2外显子1和外显子2的外显子的核苷酸序列或者由该
外显子所编码的氨基酸序列。代表性的PANX2IRC转录物如SEQ ID NO：43、45和47所示，
代表性的PANX2IRC多肽如SEQ ID NO：44、46和48所示。关于名单A中各基因的剪接变异
和确定败血症和手术后炎症存在或风险的能力，相应的序列号，log倍数变化(和方向)，T
调节的P值，基因中相关的外显子数目和可能的外显子数目的信息见表7。
的组的至少一个产生多转录物的基因的至少1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、
17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41、
42、43、44、45、46、47、48、49、50、51、52、53、54、55、56、57、58、59、60、61、62、63、64、65、66、
67、68、69、70、71、72、73、74、75、76、77、78、79、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、
92、93、94、95、96、97、98、99、100、101、102、103、104、105、106、107、108、109、110、111、112、
113、114、115、116、117、118、119、120、121、122、123、124、125、126、127、128、129、130、131、
132、133、134、135、136、137、138、139、140、141、142、143、144、145、146、147、148、149、150、
151、152、153、154、155、156、157或158个IRC标志表达产物的水平与手术后炎症阳性对照受试者的相应IRC标记表达产物水平相比增高来确定败血症的存在或者发展败血症的风
险。在一些实施方案中，通过在所述受试者中检测到来自选自由PDLIM5、SCRN1、ASPHD2、
VOPP1、ACRC、GALNT10、AC1385341、MED12L、RHBDF2、KLHL6、TEP1、PLWIL6、PRR1、RRAS、TG、ANKDD1A、GABRR2、MOV10、SLAMF7、PDCDILG2和GCH1(即，名单B)组成的组的至少一个产生
多转录物的基因中的至少1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、
22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41、42、43、44、45、46、
47、48、49、50、51、52、53、54、55、56、57、58、59、60、61、62、63、64、65、66、67、68、69、70、71、
72、73、74、75、76、77、78、79、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、
97、98、99、100、101、102、103、104、105、106、107、108、109、110、111、112、113、114、115、116、
117、118、119、120、121、122、123、124、125、126、127、128、129、130、131、132、133、134、135、
136、137、138、139、140、141、142、143、144、145、146、147、148、149、150、151、152、153、154、
155、156、157或158个IRC标志表达产物的水平与败血症对照受试者的相应IRC标记表达
产物水平相比降低来确定手术后炎症的存在或者发展手术后炎症的风险。在这些实施方案
的示例性说明的实例中，所述PDLIM5IRC标记表达产物包含相应于PDLIM5外显子5的核
苷酸序列或者由该外显子所编码的氨基酸序列。非限制性的PDLIM5IRC转录物如SEQ ID
NO：49所示，非限制性的PDLIM5IRC多肽如SEQ IDNO：50所示。在另外的示例性说明的实
例中，所述SCRN1IRC标记表达产物包含相应于SCRN1外显子5的核苷酸序列或者由该外显
子所编码的氨基酸序列。代表性的SCRN1IRC转录物如SEQ ID NO：51、53、55、57、59、61和
63所示，代表性的SCRN1IRC多肽如SEQ ID NO：52、54、56、58、60、62和64所示。在另外的示例性说明的实例中，所述ASPHD2IRC标记表达产物包含相应于ASPHD2外显子4的核苷酸
序列或者由该外显子所编码的氨基酸序列。代表性的ASPHD2IRC转录物如SEQ ID NO：65、
67和69所示，代表性的ASPHD2IRC多肽如SEQ ID NO：66、68和70所示。在另外的示例性
说明的实例中，所述VOPP1 IRC标记表达产物包含相应于VOPP1外显子3的核苷酸序列或
者由该外显子所编码的氨基酸序列。代表性的VOPP1IRC转录物如SEQ ID NO：71、73、75、
77、79、81、83、85、87、89、91和93所示，代表性的VOPP1IRC多肽如SEQ ID NO：72、74、76、
78、80、82、84、86、88、90、92和94所示。在另外的示例性说明的实例中，所述ACRC IRC标记表达产物包含相应于选自ACRC外显子3和外显子5的一个或两个外显子的核苷酸序列
或者由该一个或两个外显子所编码的氨基酸序列。非限制性的ACRC IRC转录物如SEQ ID
NO：95和97所示，非限制性的ACRC IRC多肽如SEQ ID NO：96和98所示。在另外的示例
性说明的实例中，所述GALNT10IRC标记表达产物包含相应于GALNT10外显子6的核苷酸序
列或者由该外显子所编码的氨基酸序列。代表性的GALNT10IRC转录物如SEQ ID NO：99和
101所示，代表性的GALNT10IRC多肽如SEQ ID NO：100和102所示。在另外的示例性说明
的实例中，所述AC1385341IRC标记表达产物包含相应于AC1385341外显子3的核苷酸序列
或者由该外显子所编码的氨基酸序列。代表性的AC1385341IRC转录物如SEQ IDNO：103，
105，107、109、111、113、115、117、119、121和123所示，代表性的AC1385341IRC多肽如SEQ ID NO：104、106、108、110、112、114、116、118、120、122和124所示。在另外的示例性说明的实例中，所述MED12L IRC标记表达产物包含相应于MED12L外显子17的核苷酸序列或者由
该外显子所编码的氨基酸序列。代表性的MED12L IRC转录物如SEQ ID NO：125和127所
示，代表性的MED12L IRC多肽如SEQ ID NO：126和128所示。在另外的示例性说明的实例
中，所述RHBDF2IRC标记表达产物包含相应于RHBDF2外显子6、9、10、11、14、17、18或19的核苷酸序列或者由该外显子所编码的氨基酸序列。代表性的RHBDF2IRC转录物如SEQ ID
NO：129、131和133所示，代表性的RHBDF2IRC多肽如SEQ ID NO：130、132和134所示。在
另外的示例性说明的实例中，所述KLHL6IRC标记表达产物包含相应于KLHL6外显子7的
核苷酸序列或者由该外显子所编码的氨基酸序列。代表性的KLHL6IRC转录物如SEQ ID
NO：135所示，代表性的KLHL6IRC多肽如SEQ ID NO：136所示。在另外的示例性说明的实
例中，所述TEP1IRC标记表达产物包含相应于TEP1外显子49的核苷酸序列或者由该外显
子所编码的氨基酸序列。非限制性的TEP1IRC转录物如SEQ ID NO：137和139所示，非限
制性的TEP1IRC多肽如SEQ ID NO：138和140所示。在另外的示例性说明的实例中，所述
PIWIL6IRC标记表达产物包含相应于选自PIWIL6外显子2和外显子14的一个或两个外显
子的核苷酸序列或者由该一个或两个外显子所编码的氨基酸序列。非限制性的PIWIL6IRC
转录物如SEQ ID NO：141和143所示，非限制性的PIWIL6IRC多肽如SEQ ID NO：142和144
所示。在另外的示例性说明的实例中，所述PRR11IRC标记表达产物包含相应于选自PRR11
外显子4和外显子5的一个或两个外显子的核苷酸序列或者由该一个或两个外显子所编码
的氨基酸序列。非限制性的PRR11IRC转录物如SEQ ID NO：145所示，非限制性的PRR11IRC
多肽如SEQ ID NO：146所示。在另外的示例性说明的实例中，所述RRAS IRC标记表达产物
包含相应于RRAS外显子1的核苷酸序列或者由该外显子所编码的氨基酸序列。代表性的
RRASIRC转录物如SEQ ID NO：147所示，代表性的RRAS IRC多肽如SEQ ID NO：148所示。
在另外的示例性说明的实例中，所述TG IRC标记表达产物包含相应于TG外显子6的核苷
酸序列或者由该外显子所编码的氨基酸序列。非限制性的TG IRC转录物如SEQ ID NO：149
和151所示，非限制性的TG IRC多肽如SEQ ID NO：150和152所示。在另外的示例性说明
的实例中，所述ANKDD1AIRC标记表达产物包含相应于ANKDD1A外显子7的核苷酸序列或者
由该外显子所编码的氨基酸序列。非限制性的ANKDD1A IRC转录物如SEQ ID NO：153、155、
157、159和161所示，非限制性的ANKDD1A IRC多肽如SEQ ID NO：154、156、158、160和162
所示。在另外的示例性说明的实例中，所述GABRR2IRC标记表达产物包含相应于GABRR2外
显子7、8或9的核苷酸序列或者由该外显子所编码的氨基酸序列。示例性的GABRR2IRC转
录物如SEQ ID NO：163和165所示，示例性的GABRR2IRC多肽如SEQ ID NO：164和166所
示。在另外的示例性说明的实例中，所述MOV10IRC标记表达产物包含相应于MOV10外显子
6的核苷酸序列或者由该外显子所编码的氨基酸序列。代表性的MOV10IRC转录物如SEQ
ID NO：167、169、171、173、175和177所示，代表性的MOV10IRC多肽如SEQ ID NO：168、170、
172、174、176和178所示。在另外的示例性说明的实例中，所述SLAMF7IRC标记表达产物包
含相应于SLAMF7外显子2、3、4或5的核苷酸序列或者由该外显子所编码的氨基酸序列。非
限制性的SLAMF7IRC转录物如SEQ ID NO：179、181、183、185、187、189、191和193所示，非限制性的SLAMF7IRC多肽如SEQ ID NO：180、182、184、186、188、190、192和194所示。在另外的示例性说明的实例中，所述PDCD1LG2IRC标记表达产物包含相应于PDCD1LG2外显子1和
2中的一个或两个外显子的核苷酸序列或者由该一个或两个外显子所编码的氨基酸序列。
非限制性的PDCD1LG2IRC转录物如SEQ ID NO：195和197所示，非限制性的PDCD1LG2IRC
多肽如SEQ ID NO：196和198所示。在另外的示例性说明的实例中，所述GCH1IRC标记表
达产物包含相应于GCH1外显子2的核苷酸序列或者由该外显子所编码的氨基酸序列。代
表性的GCH1IRC转录物如SEQ ID NO：199、201、203和205所示，代表性的GCH1IRC多肽如
SEQ ID NO：1200、202、204和206所示。关于名单B中各基因的剪接变异和确定败血症和
手术后炎症存在或风险的能力，相应的序列号，log倍数变化(和方向)，T调节的P值，基
因中相关的外显子数目和可能的外显子数目的信息见表7。
C”)组成的组的至少一个产生多转录物的基因的至少1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、
14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、
39、40、41、42、43、44、45、46、47、48、49、50、51、52、53、54、55、56、57、58、59、60、61、62、63、
64、65、66、67、68、69、70、71、72、73、74、75、76、77、78、79、80、81、82、83、84、85、86、87、88、
89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、99、100、101、102、103、104、105、106、107、108、109、110、
111、112、113、114、115、116、117、118、119、120、121、122、123、124、125、126、127、128、129、
130、131、132、133、134、135、136、137、138、139、140、141、142、143、144、145、146、147、148、
149、150、151、152、153、154、155或156个IRC标志表达产物的水平与inSIRS阳性对照受
试者的相应IRC标记表达产物水平相比增高来确定败血症的存在或者发展患败血症的风
险。在一些实施方案中，通过在所述受试者中检测到来自选自由RELT、ACP2、FCHSD1、CLPB、SLC39A1、TBC1D2B、APH1A、DDOST、BAK1、SLC25A25A、COQ2、FANCA、PIWIL4、ZNF335、TEX261、GABRR2、VOPP1、ITL、CES2、GALNT10、C1ORF91、AMBRA1和SCRN1(即，名单C)组成的组的至少一个产生多转录物的基因的至少1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、
20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、7、38、39、40、41、42、43、44、45、
46、47、48、49、50、51、52、53、54、55、56、57、58、59、60、61、62、63、64、65、66、67、68、69、70、
71、72、73、74、75、76、77、78、79、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、
96、97、98、99、100、101、102、103、104、105、106、107、108、109、110、111、112、113、114、115、
116、117、118、119、120、121、122、123、124、125、126、127、128、129、130、131、132、133、134、
135、136、137、138、139、140、141、142、143、144、145、146、147、148、149、150、151、152、153、
154、155或156个IRC标志表达产物的水平与败血症阳性对照受试者的相应IRC标记表达
产物水平相比降低来确定inSIRS的存在或者发展inSIRS的风险。在这些实施方案的示例
性说明的实例中，所述RELTIRC标记表达产物包含相应于RELT外显子4的核苷酸序列或
者由该外显子所编码的氨基酸序列。示例性的RELT IRC转录物如SEQ ID NO：307和209
所示，示例性的RELT IRC多肽如SEQ ID NO：208和210所示。在另外的示例性说明的实
例中，所述ACP2IRC标记表达产物包含相应于ACP2外显子7的核苷酸序列或者由该外显
子所编码的氨基酸序列。非限制性的ACP2IRC转录物如SEQ ID NO：211所示，非限制性的
ACP2IRC多肽如SEQ ID NO：212所示。在另外的示例性说明的实例中，所述FCHSD1IRC标
记表达产物包含相应于FCHSD1外显子14的核苷酸序列或者由该外显子所编码的氨基酸序
列。示范性的FCHSD1IRC转录物如SEQ ID NO：213和215所示，示范性的FCHSD1IRC多肽
如SEQ ID NO：214和216所示。在另外的示例性说明的实例中，所述CLPB IRC标记表达
产物包含相应于CLPB外显子10的核苷酸序列或者由该外显子所编码的氨基酸序列。代表
性的CLPB IRC转录物如SEQ ID NO：217、219和221所示，代表性的CLPB IRC多肽如SEQ
ID NO：218、220和222所示。在另外的示例性说明的实例中，所述SLC39A11IRC标记表达
产物包含相应于SLC39A11外显子2的核苷酸序列或者由该外显子所编码的氨基酸序列。
非限制性的SLC39A11IRC转录物如SEQ ID NO：223所示，非限制性的SLC39A11IRC多肽如
SEQ ID NO：224所示。在另外的示例性说明的实例中，所述TBC1D2BIRC标记表达产物包含
相应于TBC1D2B外显子13的核苷酸序列或者由该外显子所编码的氨基酸序列。示例性的
TBC1D2B IRC转录物如SEQ ID NO：225、227和229所示，示例性的TBC1D2B IRC多肽如SEQ
ID NO：226、228和230所示。在另外的示例性说明的实例中，所述APH1AIRC标记表达产物
包含相应于APH1A外显子1的核苷酸序列或者由该外显子所编码的氨基酸序列。示例性的
APH1A IRC转录物如SEQ ID NO：231、233、235、237、239和241所示，示例性的APH1A IRC多肽如SEQ ID NO：232、234、236、238、240和242所示。在另外的示例性说明的实例中，所述DDOST IRC标记表达产物包含相应于DDOST外显子2的核苷酸序列或者由该外显子所编码
的氨基酸序列。非限制性的DDOST IRC转录物如SEQ ID NO：243所示，非限制性的DDOST
IRC多肽如SEQ ID NO：244所示。在另外的示例性说明的实例中，所述BAK1 IRC标记表达
产物包含相应于BAK1外显子7的核苷酸序列或者由该外显子所编码的氨基酸序列。示例性
的BAK1 IRC转录物如SEQ ID NO：245和247所示，示例性的BAK1 IRC多肽如SEQ ID NO：
246和248所示。在另外的示例性说明的实例中，所述SLC25A25A IRC标记表达产物包含
相应于SLC25A25A外显子10的核苷酸序列或者由该外显子所编码的氨基酸序列。示例性
的SLC25A25A IRC转录物如SEQ ID NO：249、251、253、255、257、259和261所示，示例性的SLC25A25A IRC多肽如SEQ ID NO：250、252、254、256、258、260和262所示。在另外的示例性说明的实例中，所述COQ1 IRC标记表达产物包含相应于COQ1外显子1的核苷酸序列或者
由该外显子所编码的氨基酸序列。示例性的COQ1 IRC转录物如SEQ ID NO：263、265和267
所示，示例性的COQ1IRC多肽如SEQ ID NO：264、266和268所示。在另外的示例性说明的
实例中，所述FANCA IRC标记表达产物包含相应于FANCA外显子35的核苷酸序列或者由该
外显子所编码的氨基酸序列。示例性的FANCA IRC转录物如SEQ ID NO：269和271所示，
示例性的FANCA IRC多肽如SEQ ID NO：270和272所示。在另外的示例性说明的实例中，
所述PIWIL4 IRC标记表达产物包含相应于选自PIWIL4外显子2或14的一个或两个外显
子的核苷酸序列或者由该一个或两个外显子所编码的氨基酸序列。非限制性的PIWIL4 IRC
转录物如SEQ ID NO：273和275，非限制性的PIWIL4 IRC多肽如SEQ ID NO：274和276所
示。在另外的示例性说明的实例中，所述ZNF335 IRC标记表达产物包含相应于ZNF335外显
子5的核苷酸序列或者由该外显子所编码的氨基酸序列。示例性的ZNF335 IRC转录物如
SEQ ID NO：277、279和281所示，示例性的ZNF335 IRC多肽如SEQ ID NO：278、280和282
所示。在另外的示例性说明的实例中，所述TEX261 IRC标记表达产物包含相应于TEX261
外显子3的核苷酸序列或者由该外显子所编码的氨基酸序列。示例性的TEX261 IRC转录
物如SEQ ID NO：283和285所示，示例性的TEX261IRC多肽如SEQ ID NO：284和286所示。
在另外的示例性说明的实例中，所述GABRR2 IRC标记表达产物包含相应于选自GABRR2外
显子7、8或9的1个、2个或每个外显子的核苷酸序列或者由该1个、2个或每个外显子所
编码的氨基酸序列。非限制性的GABRR2 IRC转录物如SEQ ID NO：287和289所示，非限制
性的GABRR2 IRC多肽如SEQ ID NO：288和290所示。在另外的示例性说明的实例中，所述
VOPP1 IRC标记表达产物包含相应于VOPP1外显子3的核苷酸序列或者由该外显子所编码
的氨基酸序列。示例性的VOPP1 IRC转录物如SEQ ID NO：291、293、295、297、299、301、303、
305、307、309、311和313所示，示例性的VOPP1 IRC多肽如SEQ ID NO：292、294、296、298、
300、302、304、306、308、310、312和314所示。在另外的示例性说明的实例中，所述TTL IRC标记表达产物包含相应于TTL外显子7的核苷酸序列或者由该外显子所编码的氨基酸序
列。一个非限制性的TTL IRC转录物如SEQ ID NO：315所示，一个非限制性的TTL IRC多肽
如SEQ ID NO：316所示。在另外的示例性说明的实例中，所述CES2 IRC标记表达产物包含
相应于CES2外显子1的核苷酸序列或者由该外显子所编码的氨基酸序列。示例性的CES2
IRC转录物如SEQ ID NO：317和319所示，示例性的CES2IRC多肽如SEQ ID NO：318和320
所示。在另外的示例性说明的实例中，所述GALNT10IRC标记表达产物包含相应于GALNT10
外显子6的核苷酸序列或者由该外显子所编码的氨基酸序列。示例性的GALNT10IRC转录物
如SEQ ID NO：321和323所示，示例性的GALNT10IRC多肽如SEQ ID NO：322和324所示。
在另外的示例性说明的实例中，所述C1ORF91 IRC标记表达产物包含相应于C1ORF91外显
子2的核苷酸序列或者由该外显子所编码的氨基酸序列。示例性的C1ORF91 IRC转录物如
SEQ ID NO：325、327、329、331、333和335所示，示例性的C1ORF91 IRC多肽如SEQ ID NO：
326、328、330、332、334和336所示。在另外的示例性说明的实例中，所述AMBRA1 IRC标记
表达产物包含相应于选自AMBRA1外显子2或4的外显子的核苷酸序列或者由该外显子所
编码的氨基酸序列。非限制性的AMBRA1 IRC转录物如SEQ ID NO：337、339、341、343、345
和347所示，非限制性的AMBRA1IRC多肽如SEQ ID NO：338、340、342、344、346和348所示。
在另外的示例性说明的实例中，所述SCRN1 IRC标记表达产物包含相应于SCRN1外显子5
的核苷酸序列或者由该外显子所编码的氨基酸序列。示例性的SCRN1IRC转录物如SEQ ID
NO：349、351、353、355、357、359和361所示，示例性的SCRN1 IRC多肽如SEQ ID NO：350、
352、354、356、358、360和362所示。关于名单C中各基因的剪接变异和确定败血症和手术
后炎症存在或风险的能力，相应的序列号，log倍数变化(和方向)，T调节的P值，基因中
相关的外显子数目和可能的外显子数目的信息见表8。
3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19或20个IRC标志表达产物的水平与inSIRS阳性对照受试者的相应IRC标记表达产物水平相比降低来确定败血症的存在或者
发展败血症的风险。在一些实施方案中，通过在所述受试者检测到来自选自由GRINL1A和
KATNAL2(即，名单D)组成的组的至少一个产生多转录物的基因的至少1、2、3、4、5、6、7、
8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19或20个IRC标志表达产物的水平与败血症阳性对照受试者的相应IRC标记表达产物水平相比增高来确定inSIRS的存在或者发展inSIRS
的风险。在这些实施方案的示例性说明的实例中，所述GRINL1IRC标记表达产物包含相
应于GRINL1外显子5的核苷酸序列或者由该外显子所编码的氨基酸序列。非限制性的
GRINL1IRC转录物如SEQ ID NO：363、365、367、369、371、373、375和377所示，非限制性的GRINL1 IRC多肽如SEQ ID NO：364、366、368、370、372、374、376和378所示。在另外的示例性说明的实例中，所述KATNAL2 IRC标记表达产物包含相应于KATNAL2外显子3的核苷
酸序列或者由该外显子所编码的氨基酸序列。示例性的KATNAL2 IRC转录物如SEQ ID NO：
379和381所示，示例性的KATNAL2 IRC多肽如SEQ ID NO：380和382所示。关于名单D中
各基因的剪接变异和确定败血症和手术后炎症的存在或风险的能力，相应的序列号，log倍
数变化(和方向)，T调节的P值，基因中相关的外显子数目和可能的外显子数目的信息见
表8。
基因的至少1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、
26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37或38个IRC标志表达产物的水平与手术后炎症阳性的对照受试者的相应IRC标记表达产物水平相比增高来确定inSIRS的存在或者发
展inSIRS的风险。在一些实施方案中，通过在所述受试者中检测来自选自由PDCD1LG2、
KATLNAL2、GRINL1A、ACRC、TG和ASPHD2(即，名单E)组成的组的至少一个产生多转录物的
基因的至少1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、
26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37或38个IRC标志表达产物的水平与inSIRS阳性对照受试者的相应IRC标记表达产物水平相比降低来确定手术后炎症的存在或者发展手
术后炎症的风险。在这些实施方案的示例性说明的实例中，所述PDCD1LG2 IRC标记表达
产物包含相应于PDCD1LG2外显子1或外显子2的核苷酸序列或者由该外显子所编码的氨
基酸序列。非限制性的PDCD1LG2 IRC转录物如SEQ ID NO：383和385所示，非限制性的
PDCD1LG21 IRC多肽如SEQ ID NO：384和386所示。在另外的示例性说明的实例中，所述
KATNAL2 IRC标记表达产物包含相应于KATNAL2外显子3的核苷酸序列或者由该外显子所
编码的氨基酸序列。示例性的KATNAL2 IRC转录物如SEQ ID NO：387和389所示，示例性
的KATNAL2 IRC多肽如SEQ ID NO：388和390所示。在另外的示例性说明的实例中，所述
GRINL1 IRC标记表达产物包含相应于GRINL1外显子5的核苷酸序列或者由该外显子所编
码的氨基酸序列。非限制性的GRINL1 IRC转录物如SEQ ID NO：391、393、395、397、399、401、
403和405所示，非限制性的GRINL1 IRC多肽如SEQ ID NO：392、394、396、398、400、402、
404和406所示。在另外的示例性说明的实例中，所述ACRC IRC标记表达产物包含相应于
选自ACRC外显子3或5的一个或两个外显子的核苷酸序列或者由该一个或两个外显子所
编码的氨基酸序列。非限制性的ACRC IRC转录物如SEQ ID NO：407和409所示，非限制性
的ACRC IRC多肽如SEQ ID NO：408和410所示。在另外的示例性说明的实例中，所述TG
IRC标记表达产物包含相应于TG外显子6的核苷酸序列或者由该外显子所编码的氨基酸序
列。非限制性的TG IRC转录物如SEQ ID NO：411和413所示，非限制性的TG IRC多肽如
SEQ ID NO：412和414所示。在另外的示例性说明的实例中，所述ASPHD2 IRC标记表达产
物包含相应于ASPHD2外显子4的核苷酸序列或者由该外显子所编码的氨基酸序列。代表
性的ASPHD2 IRC转录物如SEQ ID NO：415、417和419所示，代表性的ASPHD2 IRC多肽如
SEQ ID NO：416、418和420所示。关于名单E中各基因的剪接变异和确定败血症和手术后
炎症存在或风险的能力，相应的序列号，log倍数变化(和方向)，T调节的P值，基因中相
关的外显子数目和可能的外显子数目的信息见表9。
1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、
29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41、42、43、44、45、46、47、48、49、50、51、52、53、
54、55、56、57、58、59、60、61、62、63、64、65、66、67、68、69、70、71、72、73、74、75、76、77、78、
79、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95或96个IRC标志表达产物的水平与手术后炎症阳性对照受试者的相应IRC标记表达产物水平相比的降低来确定inSIRS
的存在或者发展inSIRS的风险。在一些实施方案中，通过在所述受试者中检测到来自选
自由CUL7、BTNL8/3、PANX2、C1ORF91、ZNF335、MGRN1、GAA、CDK5R1、SNTB2、CLPB、ADAM19、SLC36A1、FKBP9、NDST1、HIPK2 and CEACAM4(即，名单F)组成的组的至少一个产生多转录
物的基因的至少1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、
25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41、42、43、44、45、46、47、48、49、
50、51、52、53、54、55、56、57、58、59、60、61、62、63、64、65、66、67、68、69、70、71、72、73、74、
75、76、77、78、79、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95或96个IRC标志表达产物的水平与inSIRS阳性对照受试者的相应IRC标记表达产物水平相比增高来确定
手术后炎症的存在或者发展手术后炎症的风险。在这些实施方案的非限制性的实施例中，
所述CUL7 IRC标记表达产物包含相应于CUL7外显子5的核苷酸序列或者由该外显子所编
码的氨基酸序列。示范性的CUL7 IRC转录物如SEQ ID NO：421所示，示范性的CUL7 IRC
多肽如SEQ ID NO：422所示。在示例性说明的实例中，所述HIPK2 IRC标记表达产物包含
相应于HIPK2外显子11的核苷酸序列或者由该外显子所编码的氨基酸序列。在另外的示
例性说明的实例中，所述BTNL8/3 IRC标记表达产物包含相应于BTNL8/3外显子6的核苷
酸序列或者由该外显子所编码的氨基酸序列。代表性的BTNL8/3 IRC转录物如SEQ ID NO：
423、425、427、429、431和433所示，代表性的BTNL8/3 IRC多肽如SEQ ID NO：424、426、428、
430、432和434所示。在另外的示例性说明的实例中，所述PANX2 IRC标记表达产物包含
相应于选自PANX2外显子1或2的外显子的核苷酸序列或者由该外显子所编码的氨基酸序
列。示例性的PANX2 IRC转录物如SEQ ID NO：435、437和439所示，示例性的PANX2 IRC
多肽如SEQ ID NO：436、438和440所示。在另外的示例性说明的实例中，所述C1ORF91 IRC
标记表达产物包含相应于C1ORF91外显子2的核苷酸序列或者由该外显子所编码的氨基酸
序列。示例性的C1ORF91 IRC转录物如SEQ ID NO：441、443、445、447、449和451所示，示
例性的C1ORF91 IRC多肽如SEQ ID NO：442、444、446、448、450和452所示。在另外的示例
性说明的实例中，所述ZNF335 IRC标记表达产物包含相应于ZNF335外显子5的核苷酸序列
或者由该外显子所编码的氨基酸序列。示例性的ZNF335 IRC转录物如SEQ ID NO：453、455
和457所示，示例性的ZNF335 IRC多肽如SEQ ID NO：454、456和458所示。在另外的示例
性说明的实例中，所述MGRN1 IRC标记表达产物包含相应于MGRN1外显子4的核苷酸序列
或者由该外显子所编码的氨基酸序列。示例性的MGRN1 IRC转录物如SEQ ID NO：459、461
和463所示，示例性的MGRN1 IRC多肽如SEQ ID NO：460、462和464所示。在另外的示例
性说明的实例中，所述GAA IRC标记表达产物包含相应于GAA外显子3的核苷酸序列或者
由该外显子所编码的氨基酸序列。示例性的GAA IRC转录物如SEQ ID NO：465、467和469
所示，示例性的GAA IRC多肽如SEQ ID NO：466、468和470所示。在另外的示例性说明的
实例中，所述CDK5R1 IRC标记表达产物包含相应于CDK5R1外显子2的核苷酸序列或者由
该外显子所编码的氨基酸序列。示例性的CDK5R1 IRC转录物如SEQ ID NO：471所示，示例
性的CDK5R1 IRC多肽如SEQ ID NO：472所示。在另外的示例性说明的实例中，所述SNTB2
IRC标记表达产物包含相应于SNTB2外显子4的核苷酸序列或者由该外显子所编码的氨基
酸序列。示例性的SNTB2 IRC转录物如SEQ ID NO：473所示，示例性的SNTB2 IRC多肽如
SEQ ID NO：474所示。在另外的示例性说明的实例中，所述CLPB IRC标记表达产物包含相
应于CLPB外显子10的核苷酸序列或者由该外显子所编码的氨基酸序列。代表性的CLPB
IRC转录物如SEQ ID NO：475、477和479所示，代表性的CLPB IRC多肽如SEQ ID NO：476，
478和480所示。在另外的示例性说明的实例中，所述ADAM19 IRC标记表达产物包含相应
于ADAM19外显子10的核苷酸序列或者由该外显子所编码的氨基酸序列。代表性的ADAM19
IRC转录物如SEQ ID NO：481、483、485和487所示，代表性的ADAM19 IRC多肽如SEQ ID
NO：482、484、486和488所示。在另外的示例性说明的实例中，所述SLC36A1 IRC标记表达
产物包含相应于SLC36A1外显子5的核苷酸序列或者由该外显子所编码的氨基酸序列。代
表性的SLC36A1 IRC转录物如SEQ ID NO：489、491、493和495所示，代表性的SLC36A1 IRC
多肽如SEQ ID NO：490、492、494和496所示。在另外的示例性说明的实例中，所述FKBP9
IRC标记表达产物包含相应于FKBP9外显子10的核苷酸序列或者由该外显子所编码的氨基
酸序列。代表性的FKBP9 IRC转录物如SEQ ID NO：497和499所示，代表性的FKBP9 IRC
多肽如SEQ ID NO：498和500所示。在另外的示例性说明的实例中，所述CEACAM4 IRC标
记表达产物包含相应于选自CEACAM4外显子5、7或23的1个、2个或每个外显子的核苷酸
序列或者由该1个、2个或每个外显子所编码的氨基酸序列。示例性的CEACAM4 IRC转录
物如SEQ ID NO：501和503所示，示例性的CEACAM4 IRC多肽如SEQ ID NO：502和504所
示。示例性的HIPK2 IRC转录物如SEQ ID NO：505、507、509和511所示，示例性的HIPK2
IRC多肽如SEQ ID NO：506、508、510和512所示。关于名单F中各基因的剪接变异和确定
败血症和手术后炎症的存在或风险的能力，相应的序列号，log倍数变化(和方向)，T调节
的P值，基因中相关的外显子数目和可能的外显子数目的信息见表9。
41、42、43、44、45、46、47、48、49、50、51、52、53、54、55、56或57个产生多转录物的基因(本文也称为“IRC产生多转录物的基因”)中每一个产生多转录物的基因的至少1、2、3、4、5、6、
7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23或24个单个IRC表达产物的水平。
例如，所述方法可能包括测量选自ANKDD1A、GABRR2、OTX1、PANX2、RHBDF2、SLAMF7、AMBRA1、CES2、CLPB、HIPK2、C1ORF91、NDST1、SLC36A1、ADAM19、CUL7、TG、PDCD1LG2、GRINL1A、MGRN1、SNTB2、CDK5R1、GAA、KATNAL2、CEACAM4、ZNF335、ASPHD2、ACRC、BTNL8、MOV10、MED12L、KLHL6、PDLIM.5、GALNT10、SCRN1、VOPP1、FKBP9、KIF27、PIWIL4、TEP1、GCH1、PRR11、CDH2、PPM1N、RRAS、DDOST、APH1A、TTL、TEX261、COQ2、FCHSD1、BAK1、SLC25A25、RELT、ACP2、TBC1D2B、FANCA或SLC39A11的IRC产生多转录物的基因的1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11或12个IRC标记多核苷酸的水平，单独或与来自56、55、54、53、52、51、50、49、48、47、46、45、44、43、42、41、40、
39、38、37、36、35、34、33、32、31、30、29、28、27、26、25、24、23、22、21、19、18、17、16、15、14、
13、12、11、10、9、8、7、6、5、4、3或2个ICR产生多转录物的基因中的每一个或者或1个其他的IRC产生多转录物的基因的多达1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11或12个单个IRC标记多核苷酸组合。在其他实施方案中，所述方法包括测量来自上文定义的IRC产生多转录物的基
因的1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11或12个IRC标记多肽的水平，单独或与来自56、55、54、
53、52、51、50、49、48、47、46、45、44、43、42、41、40、39、38、37、36、35、34、33、32、31、30、29、
28、27、26、25、24、23、22、21、19、18、17、16、15、14、13、12、11、10、9、8、7、6、5、4、3、2个另外的IRC产生多转录物的基因中的每一个或者1个其他的IRC产生多转录物的基因的多达1、2、
3、4、5、6、7、8、9、10、11或12个单个IRC标记多肽组合。
述名单中的另一个的至少一个不同的IRC标记表达产物的水平。在这一类型示例性说明的
实例中，所述方法包括检测来自名单A的至少一个IRC标记表达产物的水平和来自名单B
的至少一个其他IRC标记表达产物的水平。在另外的示例性说明的实例中，所述方法包括
检测来自名单A的至少一个IRC标记表达产物的水平和来自名单C的至少一个其他IRC标
记表达产物的水平。在另外的示例性说明的实例中，所述方法包括检测来自名单A的至少
一个IRC标记表达产物的水平和来自名单D的至少一个其他IRC标记表达产物的水平。在
另外的示例性说明的实例中，所述方法包括检测来自名单A的至少一个IRC标记表达产物
的水平和来自名单E的至少一个其他IRC标记表达产物的水平。在另外的示例性说明的实
例中，所述方法包括检测来自名单A的至少一个IRC标记表达产物的水平和来自名单F的
至少一个其他IRC标记表达产物的水平。在另外的示例性说明的实例中，所述方法包括检
测来自名单B的至少一个IRC标记表达产物的水平和来自名单C的至少一个其他IRC标记
表达产物的水平。在另外的示例性说明的实例中，所述方法包括检测来自名单B的至少一
个IRC标记表达产物的水平和来自名单D的至少一个其他IRC标记表达产物的水平。在另
外的示例性说明的实例中，所述方法包括检测来自名单B的至少一个IRC标记表达产物的
水平和来自名单E的至少一个其他IRC标记表达产物的水平。在另外的示例性说明的实例
中，所述方法包括检测来自名单B的至少一个IRC标记表达产物的水平和来自名单F的至
少一个其他IRC标记表达产物的水平。在另外的示例性说明的实例中，所述方法包括检测
来自名单C的至少一个IRC标记表达产物的水平和来自名单D的至少一个其他IRC标记表
达产物的水平。在另外的示例性说明的实例中，所述方法包括检测来自名单C的至少一个
IRC标记表达产物的水平和来自名单E的至少一个其他IRC标记表达产物的水平。在另外
的示例性说明的实例中，所述方法包括检测来自名单C的至少一个IRC标记表达产物的水
平和来自名单F的至少一个其他IRC标记表达产物的水平。在另外的示例性说明的实例
中，所述方法包括检测来自名单D的至少一个IRC标记表达产物的水平和来自名单E的至
少一个其他IRC标记表达产物的水平。在另外的示例性说明的实例中，所述方法包括检测
来自名单D的至少一个IRC标记表达产物的水平和来自名单F的至少一个其他IRC标记表
达产物的水平。在另外的示例性说明的实例中，所述方法包括检测来自名单E的至少一个
IRC标记表达产物的水平和来自名单F的至少一个其他IRC标记表达产物的水平。
方法包括检测来自名单A的至少一个IRC标记表达产物的水平和来自名单B的至少一个其
他IRC标记表达产物的水平和来自名单C的至少一个其他IRC标记表达产物的水平。在另
外的示例性说明的实例中，所述方法包括检测来自名单A的至少一个IRC标记表达产物的
水平和来自名单B的至少一个其他IRC标记表达产物的水平和来自名单D的至少一个其他
IRC标记表达产物的水平。在另外的示例性说明的实例中，所述方法包括检测来自名单A的
至少一个IRC标记表达产物的水平和来自名单B的至少一个其他IRC标记表达产物的水平
和来自名单E的至少一个其他IRC标记表达产物的水平。在另外的示例性说明的实例中，
所述方法包括检测来自名单A的至少一个IRC标记表达产物的水平和来自名单B的至少一
个其他IRC标记表达产物的水平和来自名单F的至少一个其他IRC标记表达产物的水平。
在另外的示例性说明的实例中，所述方法包括检测来自名单B的至少一个IRC标记表达产
物的水平和来自名单C的至少一个其他IRC标记表达产物的水平和来自名单D的至少一个
其他IRC标记表达产物的水平。在另外的示例性说明的实例中，所述方法包括检测来自名
单B的至少一个IRC标记表达产物的水平和来自名单C的至少一个其他IRC标记表达产物
的水平和来自名单E的至少一个其他IRC标记表达产物的水平。在另外的示例性说明的实
例中，所述方法包括检测来自名单B的至少一个IRC标记表达产物的水平和来自名单C的
至少一个其他IRC标记表达产物的水平和来自名单F的至少一个其他IRC标记表达产物的
水平。在另外的示例性说明的实例中，所述方法包括检测来自名单C的至少一个IRC标记
表达产物的水平和来自名单D的至少一个其他IRC标记表达产物的水平和来自名单E的至
少一个其他IRC标记表达产物的水平。在另外的示例性说明的实例中，所述方法包括检测
来自名单C的至少一个IRC标记表达产物的水平和来自名单D的至少一个其他IRC标记表
达产物的水平和来自名单F的至少一个其他IRC标记表达产物的水平。在另外的示例性说
明的实例中，所述方法包括检测来自名单D的至少一个IRC标记表达产物的水平和来自名
单E的至少一个其他IRC标记表达产物的水平和来自名单F的至少一个其他IRC标记表达
产物的水平。
方法包括检测来自名单A的至少一个IRC标记表达产物的水平和来自名单B的至少一个其
他IRC标记表达产物的水平和来自名单C的至少一个其他IRC标记表达产物的水平和来自
名单D的至少一个其他IRC标记表达产物的水平。在另外的示例性说明的实例中，所述方
法包括检测来自名单A的至少一个IRC标记表达产物的水平和来自名单B的至少一个其他
IRC标记表达产物的水平和来自名单C的至少一个其他IRC标记表达产物的水平和来自名
单E的至少一个其他IRC标记表达产物的水平。在另外的示例性说明的实例中，所述方法包
括检测来自名单A的至少一个IRC标记表达产物的水平和来自名单B的至少一个其他IRC
标记表达产物的水平和来自名单C的至少一个其他IRC标记表达产物的水平和来自名单F
的至少一个其他IRC标记表达产物的水平。在另外的示例性说明的实例中，所述方法包括
检测来自名单A的至少一个IRC标记表达产物的水平和来自名单C的至少一个其他IRC标
记表达产物的水平和来自名单D的至少一个其他IRC标记表达产物的水平和来自名单E的
至少一个其他IRC标记表达产物的水平。在另外的示例性说明的实例中，所述方法包括检
测来自名单A的至少一个IRC标记表达产物的水平和来自名单C的至少一个其他IRC标记
表达产物的水平和来自名单D的至少一个其他IRC标记表达产物的水平和来自名单F的至
少一个其他IRC标记表达产物的水平。在另外的示例性说明的实例中，所述方法包括检测
来自名单A的至少一个IRC标记表达产物的水平和来自名单D的至少一个其他IRC标记表
达产物的水平和来自名单E的至少一个其他IRC标记表达产物的水平和来自名单F的至少
一个其他IRC标记表达产物的水平。在另外的示例性说明的实例中，所述方法包括检测来
自名单B的至少一个IRC标记表达产物的水平和来自名单C的至少一个其他IRC标记表达
产物的水平和来自名单D的至少一个其他IRC标记表达产物的水平和来自名单E的至少一
个其他IRC标记表达产物的水平。在另外的示例性说明的实例中，所述方法包括检测来自
名单B的至少一个IRC标记表达产物的水平和来自名单C的至少一个其他IRC标记表达产
物的水平和来自名单D的至少一个其他IRC标记表达产物的水平和来自名单F的至少一个
其他IRC标记表达产物的水平。在另外的示例性说明的实例中，所述方法包括检测来自名
单C的至少一个IRC标记表达产物的水平和来自名单D的至少一个其他IRC标记表达产物
的水平和来自名单E的至少一个其他IRC标记表达产物的水平和来自名单F的至少一个其
他IRC标记表达产物的水平。在另外的示例性说明的实例中，所述方法包括检测来自名单
A的至少一个IRC标记表达产物的水平和来自名单B的至少一个其他IRC标记表达产物的
水平和来自名单D的至少一个其他IRC标记表达产物的水平和来自名单E的至少一个其他
IRC标记表达产物的水平。
方法包括检测来自名单A的至少一个IRC标记表达产物的水平和来自名单B的至少一个其
他IRC标记表达产物的水平和来自名单C的至少一个其他IRC标记表达产物的水平和来自
名单D的至少一个其他IRC标记表达产物的水平和来自名单E的至少一个其他IRC标记表
达产物的水平。在另外的示例性说明的实例中，所述方法包括检测来自名单A的至少一个
IRC标记表达产物的水平和来自名单B的至少一个其他IRC标记表达产物的水平和来自名
单C的至少一个其他IRC标记表达产物的水平和来自名单D的至少一个其他IRC标记表达
产物的水平和来自名单F的至少一个其他IRC标记表达产物的水平。在另外的示例性说明
的实例中，所述方法包括检测来自名单A的至少一个IRC标记表达产物的水平和来自名单
C的至少一个其他IRC标记表达产物的水平和来自名单D的至少一个其他IRC标记表达产
物的水平和来自名单E的至少一个其他IRC标记表达产物的水平和来自名单F的至少一个
其他IRC标记表达产物的水平。在另外的示例性说明的实例中，所述方法包括检测来自名
单B的至少一个IRC标记表达产物的水平和来自名单C的至少一个其他IRC标记表达产物
的水平和来自名单D的至少一个其他IRC标记表达产物的水平和来自名单E的至少一个其
他IRC标记表达产物的水平和来自名单F的至少一个其他IRC标记表达产物的水平。在另
外的示例性说明的实例中，所述方法包括检测来自名单B的至少一个IRC标记表达产物的
水平和来自名单D的至少一个其他IRC标记表达产物的水平和来自名单E的至少一个其他
IRC标记表达产物的水平和来自名单F的至少一个其他IRC标记表达产物的水平和来自名
单A的至少一个其他IRC标记表达产物的水平。
或功能活性相同或相似时，诊断不存在败血症、inSIRS或手术后炎症。在这些实施方案
中，所测量的单个IRC表达产物的水平或功能活性相对于所测量的单个相应表达产物的水
平或功能活性的变化不超过约20％、18％，16％，14％、12％、10％、9％、8％、7％、6％、5％、
4％、3％、2％、1％或0.1％，这在下文称为“正常表达”。
以至少约70％、80％、85％、90％或95％的灵敏性，适当结合至少约70％、80％、85％、90％或95％的特异性。在一些实施方案中，灵敏性和特异性都至少为约75％、80％、85％、90％
或95％。
另外的实施方案中，所述表达产物是相应表达产物的变体(如等位基因变体)。
行杂交的至少一个核酸探针测量，其中所述核酸探针包含IRC标记多核苷酸上的至少15个
连续核苷酸。在这些实施方案中，所测量的所述靶RNA或其DNA拷贝的水平或丰度以同一
样品中的参考RNA或该参照RNA的DNA拷贝的水平或丰度为参考进行标准化。适合地，所
述核酸探针被固定在固体或半固体支持物上。在这一类型的示例性说明的实例中，所述核
酸探针成为核酸探针空间阵列(spatial array)的一部分。在一些实施方案中，结合到所
述靶RNA或DNA拷贝的核酸探针的水平可通过杂交(如，使用核酸阵列)进行测量。在另
外的实施方案中，结合所述靶RNA或DNA拷贝的核酸探针的水平可通过核酸扩增(如，使用
聚合酶链反应(PCR))进行测量。在另外的实施方案中，结合所述靶RNA或DNA拷贝的核酸
探针的水平可通过核酸酶保护试验进行测量。
量的所述靶多肽的水平以同一样品中的参考多肽的水平为参考进行标准化。适合地，所述
抗原结合分子被固定在固体或半固体支持物上。在这一类型的示例性说明的实例中，所述
抗原结合分子成为抗原结合分子空间阵列(spatial array)的一部分。在一些实施方案中，
结合所述靶多肽的抗原结合分子的水平可通过免疫试验(如，使用ELISA)进行测量。
案中，所测量的所述靶多肽的功能活性以同一样品中的参考多肽的功能活性为参考进行标
准化。
收受试者数据(subject data)，其中所述受试者数据表示与所述生物样本中至少一个表达
产物的测量的或标准化的水平或功能活性相对应的参数值，和(b)将所述受试者数据与表
示所述参考样本的至少一种相应表达产物的测量的或标准化饿水平或功能活性的预定数
据进行比较，从而确定所述生物样本中的所述表达产物的水平或功能活性与所述参考样本
的相应表达产物的水平或功能活性的差异。理想地，所述基站可进一步用于提供对于手术
后炎症、inSIRS或败血症的存在、不存在或者程度的诊断。在这些实施方案中，所述基站可
进一步通过通讯网络将诊断指示传送至终端站。
子宫内膜异位，休克，中毒性休克(即，使用棉条的后遗症)，肠胃炎，盲肠炎，溃疡性结肠
炎，Crohn氏病，炎性肠病，酸肠综合征(acid gut syndrome)，肝功能衰竭和肝硬化，新生儿初乳传递失败(failure ofcolostrum transfer in neonates)，局部缺血(任何器官的)，
菌血症，体腔如腹膜腔、心包腔、腱鞘(thecal)和胸膜腔内感染，烧伤，严重创伤，过度运动或刺激，血液透析，带有无法忍受的疼痛的疾病(如，胰腺炎、肾结石)，外科手术和非愈合
性损伤。对于这些应用，本发明的诊断方法通常以有效监测败血症、inSIRS或手术后炎症
早期发展的频率使用以使这些病况的早期治疗性干预和治疗成为可能。在示例性说明的实
例中，所述诊断方法以至少1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、
22、23或24小时的间隔或至少1、2、3、4、5或6天的间隔，或至少每周，每两周或每月的间隔进行使用。
应IRC标记表达产物的水平进行比较，其中所述至少一种IRC标记表达水平与所述相应IRC
标记表达产物水平的差异表明所述受试者是否患有或者有风险发展所述病况中的一种，其
中预先确定所述至少一种IRC标记表达产物在所述疾病的至少两种疾病之间存在差异表
达，以及其中预先确定来自所述产生多转录物的基因的至少一种其他表达产物并未这样差
异表达；以及
气，用于血容量减少的液体)和对要害器官的密切监测。
少一种IRC标记多核苷酸、或如上文广泛定义的至少一种IRC标记多肽、或包括与编码如上
文广泛定义的IRC标记多肽的核苷酸序列的至少一部分一致或互补的核苷酸序列或者主
要由与编码如上文广泛定义的IRC标记多肽的核苷酸序列的至少一部分一致或互补的核
苷酸序列组成的至少一种探针的用途，或者与如上文广泛定义的IRC标记多肽具有免疫相
互作用的至少一种抗原结合分子的用途。
具体实施方案
施或测试本发明，但是描述了优选的方法和材料。为了本发明的目的，下文定义了下列术
语。
表达(上调)或表达不足(下调)并且涵盖相对于参考样品组织样品或体液中IRC标记
表达产物(例如转录物或多肽)的较高或较低水平。在某些实施方案中如果在从测试受
试者中获得的生物样品中IRC标记表达产物的水平是从如本文所定义的对照受试者中相
应IRC标记基因表达产物表达水平至少110％、120％、130％、140％、150％、160％、170％、
180％、190％、200％、300％、400％、500％、600％、700％、800％、900％或1000％，或不多于约95％、90％、80％、70％、60％、50％、40％、30％、20％、10％、5％、4％、3％、2％、1％、
0.5％、0.1％、0.01％、0.001％或0.0001％，那么IRC标记表达产物为异常表达。
在的其它蛋白质或抗原相结合。在这种条件下与某抗原特异性结合可能需要选择对该特定
抗原有特异性的抗原结合分子。例如，可针对所选蛋白质抗原制备抗原结合分子，该分子能
与该抗原而非样品中其它蛋白质抗原相结合。可使用各种免疫测定方式来选择能与特定
蛋白质起特异性免疫相互作用的抗原结合分子。例如，通常采用固相ELISA免疫测定来选
择能与蛋白质发生特异性免疫相互作用的单克隆抗体。可用于测定特异性免疫反应的免
疫测定方式和条件可参见Harlow和Lane(1988)Antibodies，A Laboratory Manual，Cold
Spring Harbor Publications，New York。
的组，但不排除任何其它的步骤或元素或步骤或元素的组。
编码与肽或蛋白质中的氨基酸序列相同的氨基酸序列。该短语的范围也包括具有与参考肽
或蛋白质的氨基酸序列基本上相同的氨基酸序列的肽或多肽。
制该疾病的这种症状和/或治疗该疾病的已有症状。有效量取决于待治疗个体的健康和身
体状况、待治疗个体的分类学组、组合物的剂型、医学状况的评估和其它相关因素而变化。
预期该用量将落入可用常规试验测定的相对宽的范围内。
通过本领域已知的任何适合的测定所确定的特异性活性。
和3’非编码核苷酸序列。就此而言，基因还可包含与给定基因天然相关的控制信号例如启
动子、增强子、终止和/或聚腺苷酸化信号，或异源控制信号。DNA序列可以是cDNA或基因
组DNA或其片段。可将基因引入合适的载体中以便维持于染色体外或整合入宿主。
配对；C与G配对。在RNA中，U与A配对；C与G配对。在这个意义上，本文使用的术语“匹
配”和“错配”是指互补性核酸链中配对的核苷酸的杂交潜力。匹配的核苷酸有效地杂交，
例如如上所述的经典的A-T和G-C碱基对。错配是未有效杂交的核苷酸的其它组合。
核苷酸，例如，已经从通常临近片段的序列中移出的DNA片段。可选择地，本文使用的“分离的肽”或“分离的多肽”以及类似术语是指在从天然细胞环境或从与细胞的其它成分的结合
中体外分离和/或纯化的肽或多肽分子，即，其不与体内物质结合。
或组织中分离提取物。
基的核苷酸等)组成的聚合物(或其相关的结构变体或合成类似物)。因此，虽然术语“寡
核苷酸”通常是指其中的核苷酸残基和残基之间的键是天然存在的核苷酸聚合物，但是应
该理解的是该术语在其范围内还包括各种类似物，包括但不限于，肽核酸(PNA)、氨基磷酸
酯、硫代磷酸酯(phosphorothioate)、甲基磷酸酯、2-O-甲基核糖核酸等等。分子的精确大
小可以根据特定的应用而变化。寡核苷酸是长度上200个碱基更少以下碱基的多核苷酸亚
组。优选地，寡核苷酸长度为10-60个碱基且最优选长度为12、13、14、15、16、17、18、19或
20-40个碱基。虽然寡核苷酸可以是双链，例如用于构建不同核酸序列，但寡核苷酸通常是
单链的，例如探针。本发明的寡核苷酸可以是有义或反义寡核苷酸。
这种基质可用于合成两维空间寻址的寡核苷酸(矩阵)阵列。可选择地，该基质的特征在
于其形成管状阵列，其中两维平面的薄片被卷成三维管状构型。该基质也可采取与光纤表
面相连的微球或珠的形式，例如Chee等在WO00/39587中所述的那样。寡核苷酸阵列具有
2
至少两种不同的特征元件，其密度为每cm 至少400个元件。在某些实施方案中，这些阵列
2
的密度可以是每cm 约500、至少一千、至少一万、至少十万、至少一百万或至少一千万个特
征元件。例如，该基质可以是硅或玻璃并且具有载玻片或盖玻片的厚度，或者可由其它合成
聚合物构成。当在该基质上进行试验的方法包括光检测时，可用透光的基质。该术语也指
探针阵列和与其相连形成晶片一部分的基质。
合的构建体中，一般优选使遗传序列或启动子与基因转录起始点的距离大体上等于天然环
境即该遗传序列或启动子所源自的基因中遗传序列或启动子与其控制的基因之间的距离。
如本领域中熟知的，可以接受该距离的一些变化而不丧失功能。类似地，调控序列元件相对
于有待置于其控制之下的异源基因的优选位置由天然环境即该元件所源自的基因中元件
的位置定义。
酸或任一种类型核苷酸的修饰形式。该术语包括DNA的单链或双链形式。
涵盖其中有一个或多个核苷酸添加或删除，或用不同的核苷酸取代的多核苷酸。就此而言，
本领域熟知可对参考多核苷酸作出某些改变，包括突变、添加、缺失和取代，由此使改变的
多核苷酸仍保留该参考多核苷酸的生物学功能或活性。术语“多核苷酸变体”和“变体”也
包括天然存在的等位变体。
基酸聚合物。
代。如下文所述，本领域熟知一些氨基酸可以改变为具有大体上相似性质的其它氨基酸而
不改变多肽活性的性质(保守取代)。
征。炎症涉及液体和细胞(例如白细胞或粒细胞、嗜中性细胞、单核细胞以及T和B细胞)
向受影响的区域、位点或组织的移动。手术导致的过度的、指向错误的和.或不适当的免疫
炎性响应可引起SIRS和正常的健康的身体组织的损害。
的。引物必须足够长以在聚合剂存在的情况下启动延伸产物的合成。引物的长度取决于很
多因素，包括应用、要使用的温度、模板反应条件、其它试剂和引物来源。例如，取决于靶序列的复杂程度，例如，取决于靶序列的复杂性，引物可以在引物的3’末端在长度上比模板序列短至少约5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、
29、30、35、40、50、75、100、150、200、300、400、500到1个碱基以允许核酸链的延伸，尽管引物5’末端长度上可延伸超出模板序列的3’末端。在某些实施方案中，引物可以是大的多
核苷酸，例如从约35个核苷酸残基至几千个碱基或更多。可以将引物选择为与该引物设计
用于杂交的模板上的序列“基本上互补”，并且作为合成的起始位点。“基本上互补”意指引物互补性足以与靶多核苷酸杂交。理想地，引物不含有与该引物设计用于杂交的模板的错
配，但这不是必须的。例如，非互补性核苷酸残基可以与引物的5’末端连接，而引物序列的其余部分与模板是互补的。或者，非互补性核苷酸残基或非互补性核苷酸残基的一段序列
可以散布于引物内，只要引物序列与其要杂交的模板序列具有足够的互补性，从而与其杂
交并由此形成用于合成引物的延伸产物的模板。
核苷酸”)结合的多核苷酸探针。探针可以与缺少与探针完全序列互补性的靶多核苷酸结
合，这取决于杂交条件的严格度。探针可以进行直接或间接标记，其范围包括引物。
这样的表达载体包括与核苷酸序列可操作连接的转录和翻译调控核酸。
用序列，例如操纵子序列和核糖体结合位点。适合于真核细胞的控制序列包括启动子、多腺
苷化信号、转录增强子、翻译增强子、调节mRNA稳定性的引导或尾随序列以及将转录的多
核苷酸编码的产物靶向细胞中的细胞内腔室或细胞外环境的靶向序列。
对系统性活的微生物或系统性感染的系统响应。
比较两个最佳比对的序列，确定两个序列中存在相同核酸碱基(例如，A、T、C、G、I)或相同氨基酸残基(例如，Ala、Pro、Ser、Thr、Gly、Val、Leu、Ile、Phe、Tyr、Trp、Lys、Arg、His、Asp、Glu、Asn、Gln、Cys和Met)的位点的数目以生成配对位点的数目，将配对位点的数目除以比较窗口中总的位点数目(即窗口大小)并且将结果乘以100以产生序列同一性百分比
来计算。为本发明的目的，“序列同一性”应理解为用DNASIS计算机程序(适用于windows
的2.5版；购自Hitachi Software engineering Co.，Ltd.，South San Francisco，加利福
尼亚，美国)，使用该软件所附参考手册中使用的缺省条件计算的“匹配百分比”。
Research12：387-395)来确定相似性。按照这个方式，可以通过将空位插入比对中而进行
与本文所列的那些相似或实质上不同长度的序列的比较，这样的空位通过例如GAP所用的
比较算法确定。
为两个多核苷酸每个可以包含(1)在两个多核苷酸之间相似的序列(即，仅仅全部多核苷
酸序列的一部分)，和(2)在两个多核苷酸之间不同的序列，所以，两个(或两个以上)多核
苷酸之间的序列比较通常通过将两个多核苷酸的序列与“比较窗口”进行比较以鉴别并比
较序列相似性的局部区域。“比较窗口”是指概念上的至少6个，通常为约50至约100个，
更通常为约100至约150个连续位点的片段，其中，在将两个序列优化比对之后，将一个序
列与具有相同数目的连续位点的参考序列进行比较。比较窗口与参考序列(参考序列不包
含添加或缺失)相比可以包含约20％或更少的添加或缺失(即空位)，以进行两个序列的
优化比对。可以通过算法(Wisconsin GeneticsSoftware Package Release7.0中的GAP，
BESTFIT，FASTA和TFASTA，Genetics Computer Group，575Science Drive Madison，WI，
USA)的计算机执行或通过检验和所选的不同方法中的任意一个所产生的最佳比对(即，在
对比窗口产生最高的同源性百分比)来进行用于比对对比窗口的序列的优化比对。还可以
参考BLAST程序家族，如例如由Altschul et al.，1997，Nucl.Acids Res.25：3389公开的。
可以在Ausubel et al.，“Current Protocols in Molecular Biology”，John Wiley&Sons Inc，1994-1998，Chapter15中找到序列分析的详细讨论。
解的是以上术语并未暗示有症状存在。
于90下每分钟、呼吸频率高于20次每分钟、白细胞计数(总的白细胞)高于10％。从免疫
区别力来说，其可被看作表示对创伤(例如大型手术)或系统性炎症的系统响应。因此，如
本文所用的，“感染阴性SIRS(inSIRS)”包括上文提到的临床响应但是不存在系统性感染过
程。
包括该“模板”的所有或部分互补序列，和/或可包含突变，因而其与该“模板”并不精确互补。在本文所述的检测测定以及本领域已知的其它测定中，不与模板链精确互补的链可以
与模板链特异性杂交，并且这种可用于检测测定中的互补链是本发明的一部分。
中自主复制，或可以整合进入确定的宿主基因组中以使所克隆的序列可以复制。因此，载体
可以是自主复制的载体，即以染色体外实体存在的载体，其复制独立于染色体的复制，例如
线性或闭合环状质粒、染色体外元件、微小染色体或人工染色体。载体可以包含任意确保自
我复制的方式。或者，载体可以是在被引入宿主细胞时整合进入基因组中并且与其所整合
进入的基因组一起复制的载体。载体系统可以包含单一载体或质粒、两个或两个以上载体
或质粒(其一起包含需要引入宿主细胞基因组的总DNA)或转位子。载体的选择通常取决
于载体与该载体要被引入的宿主细胞的相容性。载体还可以包括选择性标记，例如可用于
选择合适的转化子的抗生素抗性基因。这样的抗性基因的例子是本领域技术人员已知的。
产生多转录物的基因中仅发现有限数目(57个)表达特异性剪接变体，其包含“病况区分外
显子”并且其被用作分类器以区别这些患者群。这些产生多转录物的基因列于表1中。
同具有从手术后炎症直到败血症的免疫响应严重度的“连续谱”。因此本文将这些标记称为
“免疫响应连续谱”或“IRC”标记表达产物，其列于表2、3和4中。
的监测、治疗或管理或者区分inSIRS和败血症以及手术后炎症的方法中。更特别地，本发
明涉及来自产生多转录物的基因的特定表达产物用于区分inSIRS和败血症和手术后炎症
的用途。
式或从这些RNA分子转录的多肽的形式。这些标记指示败血症/inSIRS/手术后炎症并且
当与它们在选自败血症阳性受试者、inSIRS阳性受试者、手术后炎症阳性受试者和正常受
试者以及未患有这些病况中的任一个的受试者的对照受试者中的表达相比差异表达时，它
们在测试的受试者中区分这些病况并且诊断这些病况的存在或不存在。这些标记提供超过
本领域中的现有技术的相当可观的优点。在某些白细胞(例如外周血细胞)被用于分析的
优选的实施方案中，在检测内毒素或致内毒素剂的血清抗体之前诊断败血症是可能的。
些应用的实例包括使用特异性探针扩征IRC标记多核苷酸、通过与寡核苷酸探针杂交检测
IRC标记多核苷酸、将分离的核酸掺入载体、将插入核酸的载体表达为RNA和蛋白以及开发
相应于标记编码产物的免疫/检测/诊断/预后试剂。
以是至少约10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、35、
40、50、75、100、150、200、300、400、500个核苷酸。并且在探针的情况下多达IRC标记多核苷酸中含有的因条件而不同的外显子中的一个或多个的序列的全长或多达如本文所鉴定的
IRC标记多核苷酸的全长。探针在其5’和/或3’端还可以包括另外的序列以使它们的长
度超过它们与其杂交的靶序列。
知的或本文描述的用于复制或增加靶核酸或其补体的拷贝数或量的任何方法或技术。
原结合分子生产、试剂盒和/作为本发明的一部分在本文描述的任一实施方案。对于本领
域中的用途来说理想的代表性的序列是SEQ ID NO：1-88中所展示的那些(参见表2、3和
4)。
症或inSIRS或手术后炎症的临床证明的患者获得的血液的外显子阵列分子鉴定并且它们
展示于SEQ ID NO：1、3、5、7、9、11、13、15、17、19、21、23、25、27、29、31、33、35、37、39、41、43、
45、47、49、51、53、55、57、59、61、63、65、67、69、71、73、75、77、79、81、83、85、87、89、91、93、
95、97、99、101、103、105、107、109、111、113、115、117、119、121、123、125、127、129、131、133、
135、137、139、141、143、145、147、149、151、153、155、157、159、161、163、165、167、169、171、
173、175、177、179、181、183、185、187、189、191、193、195、197、199、201、203、205、207、209、
211、213、215、217、219、221、223、225、227、229、231、233、235、237、239、241、243、245、247、
249、251、253、255、257、259、261、263、265、267、269、271、273、275、277、279、281、283、285、
287、289、291、293、295、297、299、301、303、305、307、309、311、313、315、317、319、321、323、
325、327、329、331、333、335、337、339、341、343、345、347、349、351、353、355、357、359、361、
363、365、367、369、371、373、375、377、379、381、383、385、387、389、391、393、395、397、399、
401、403、405、407、409、411、413、415、417、419、421、423、425、427、429、431、433、435、437、
439、441、443、445、447、449、451、453、455、457、459、461、463、465、467、469、471、473、475、
477、479、481、483、485、487、489、491、493、495、497、499、501、503、505、507、509、511、513或
515中。列于表2-4中的这些序列可诊断败血症或inSIRS或手术后炎症的存在或不存在。
品特异性杂交的寡核苷酸。这些序列通常约10-20个核苷酸长，但可以更长。某些实施方
案需要较长的序列，例如病况区分外显子或IRC标记多核苷酸的约30、40、50、100、500个核苷酸以及甚至多达全长。
87、89、91、93、95、97、99、101、103、105、107、109、111、113、115、117、119、121、123、125、127、
129、131、133、135、137、139、141、143、145、147、149、151、153、155、157、159、161、163、165、
167、169、171、173、175、177、179、181、183、185、187、189、191、193、195、197、199、201、203、
205、207、209、211、213、215、217、219、221、223、225、227、229、231、233、235、237、239、241、
243、245、247、249、251、253、255、257、259、261、263、265、267、269、271、273、275、277、279、
281、283、285、287、289、291、293、295、297、299、301、303、305、307、309、311、313、315、317、
319、321、323、325、327、329、331、333、335、337、339、341、343、345、347、349、351、353、355、
357、359、361、363、365、367、369、371、373、375、377、379、381、383、385、387、389、391、393、
395、397、399、401、403、405、407、409、411、413、415、417、419、421、423、425、427、429、431、
433、435、437、439、441、443、445、447、449、451、453、455、457、459、461、463、465、467、469、
471、473、475、477、479、481、483、485、487、489、491、493、495、497、499、501、503、505、507、
509、511、513或515中任一个中所展示的序列的约10、15、17、20、30、40、50、60、75或100或
500个核苷酸的连续延伸段的核酸分子。也考虑了与上文提及的序列互补且能在高严格度
条件下与这些序列结合的分子。这些探针可用于各种杂交实施方案，例如RNA和DNA印迹。
在一些例子中，考虑到可使用与多种靶序列杂交而不损伤它们有效诊断败血症、inSIRS和
手术后炎症的存在或不存在或区分败血症、inSIRS和手术后炎症能力的探针。总之，考虑
了本文所述杂交探针既可用作溶液杂交(如PCR中)的试剂来检测相应基因的表达以及可
用于使用固相的实施方案中。
的重复延伸段(poly-A尾部)。在其它实施方案中，由于本领域普通技术人员可能认为某些
区段更适用于所述检测方法，因此可将探针和引物专门设计为不包括所鉴定标记基因的这
些或其它区段。在任何情况中，普通技术人员均能为所选的应用选择引物或探针序列。用
于检测IRC标记多核苷酸的示例性说明的引物/探针序列见表5。
32 14 35 3
放射性物质( P、C、S、H或其它标记物)、荧光团(例如罗丹明、荧光素)或化学发光标
记物(例如，萤光素酶)标记这些探针或引物。
开的序列或这些核酸的变体杂交的分离的核酸。例如，可用核酸的部分序列来鉴定结构相
关的基因或其所衍生的全长基因组或cDNA克隆。产生可用作上述探针的靶的cDNA和基因
组文库的方法是本领域已知的(参见，例如Sambrook et ah，1989，supra and Ausubel et
al.，1994，同上)。所有这种核酸以及本文所公开的特异性核酸分子统称为“IRC标记多核
苷酸”。此外，本发明的范围包括IRC标记多核苷酸的分离或纯化的多肽产物。
酸分子或蛋白质天然存在环境相互作用的组分。因此，当分离或纯化的多核苷酸或多肽在
通过重组技术产生时基本上不含其它细胞物质或培养基成分或者在化学合成时基本上不
含化学前体或其它化学物质。适合地“分离的”多核苷酸不含产生该多核苷酸的生物体的
基因组DNA中天然侧接该多核苷酸的序列(即，位于该多核苷酸的5’和3’末端的序列)。
例如，在各种实施方案中，分离的IRC标记多核苷酸可含有少于约5kb、4kb、3kb、2kb、lkb、
0.5kb或0.1kb的产生该多核苷酸的细胞的基因组DNA中天然侧接该多核苷酸的核苷酸序
列。基本上不合细胞物质的多肽包括含有少于约30％、20％、10％、5％(以干重计)的污染
蛋白质的蛋白质制剂。当IRC标记多肽重组制备时，培养基成分宜少于约30％、20％、10％
或5％(以干重计)的化学前体或非感兴趣蛋白质的化学物质。
非天然存在的。可采用熟知的分子生物学技术，例如本领域已知的聚合酶链式反应(PCR)
和杂交技术鉴定天然产生在的变体，例如这些变体。可通过诱变技术包括适用于多核苷酸、
细胞或生物体的那些来制备非天然存在的变体。这些变体可含有核苷酸取代、缺失、倒位和
插入。编码和/或非编码区都可发生变异。变异既可导致保守的和非保守的氨基酸取代(与
编码产物相比)。就核苷酸序列而言，保守性变体包括因遗传密码子的简并性而编码本发
明IRC标记多肽之一的氨基酸序列的那些序列。变体核苷酸序列也包括合成衍生但仍能编
码本发明IRC标记多肽的核苷酸序列，例如通过定点诱变产生的那些序列。总体上，如通过
本文其他地方所述的序列比对程序使用缺省参数所测定的，本发明特定核苷酸序列的变体
与该特定核苷酸序列具有至少约70％、75％、80％、85％，理想地约90％、91％、92％、93％、
94％至95％或更高，更适合地约96％、97％、98％、99％或更高的序列同一性。
列可基于其与本文所述编码序列的序列同一性根据熟知技术分离。在这些技术中，可将所
有或部分的已知编码序列用作与所选生物体的克隆的cDNA片段群(即cDNA文库)中存在
的其它IRC标记编码序列选择性杂交的探针。因此，本发明也考虑了在下述严格度条件下
与所述IRC核苷酸序列或其互补序列杂交的多核苷酸。本文使用的术语“在低度严格、中
度严格、高度严格或非常高度严格的条件下杂交”描述了用于杂交和洗涤的条件。可以在
Ausubel et al.，(1998，同上)，6.3.1-6.3.6部分中找到进行杂交反应的指导。在该参考文献中描述了水性和非水性的方法，每个都可以使用。本文中提及的低度严格条件包括并包
含：在42℃以至少大约1％v/v至至少大约15％v/v甲酰胺和至少大约1M至至少大约2M
的盐进行杂交，在42℃以至少大约1M至至少大约2M的盐进行洗涤。低度严格条件还可以
包括在65℃以1％牛血清白蛋白(BSA)、1mM EDTA、0.5M NaHPO4(pH7.2)、7％SDS进行杂交，
和在室温以(i)2×SSC、0.1％SDS；或(ii)0.5％BSA、1mM EDTA、40mM NaHPO4(pH7.2)、5％
SDS进行洗涤。低度严格条件的一个具体实施方案包括：在大约45℃以6x氯化钠/柠檬酸
钠(SSC)进行杂交，然后在至少50℃以0.2×SSC、0.1％SDS洗涤两次(对于低度严格条件
洗涤温度可以升高至55℃)。中度严格条件包括并包含：在42℃以至少大约16％v/v至至
少大约30％v/v甲酰胺和至少大约0.5M至至少大约0.9M的盐进行杂交，在55℃以至少大
约0.1M至至少大约0.2M的盐进行洗涤。中度严格条件还可以包括在65℃以1％牛血清白
蛋白(BSA)、1mMEDTA、0.5M NaHPO4(pH7.2)、7％SDS进行杂交，和在60-65℃以(i)2×SSC、
0.1％SDS；或(ii)0.5％BSA、1mM EDTA、40mM NaHPO4(pH7.2)、5％SDS进行洗涤。中度严格
条件的一个具体实施方案包括：在大约45℃以6x SSC进行杂交，然后在60℃以0.2×SSC、
0.1％SDS洗涤一次或多次。高度严格条件包括并包含：在42℃以至少大约31％v/v至至
少大约50％v/v甲酰胺和大约0.01M至大约0.15M的盐进行杂交，在55℃以大约0.01M
至大约0.02M的盐进行洗涤。高度严格条件还可以包括在65℃以1％BSA、1mM EDTA、0.5M
NaHPO4(pH7.2)、7％SDS进行杂交，和在65℃以上的温度以(i)0.2×SSC、0.1％SDS；或
(ii)0.5％BSA、1mM EDTA、40mM NaHPO4(pH7.2)、1％SDS进行洗涤。高度严格条件的一个具
体实施方案包括：在大约45℃以6x SSC进行杂交，然后在65℃以0.2×SSC、0.1％SDS洗
涤一次或多次。
外显子。非常高度严格的条件的一个具体实施方案包括：在65℃以0.5M磷酸钠、7％SDS进
行杂交，然后在65℃以0.2×SSC、1％SDS洗涤一次或多次。
参见上文提及的Ausubel et al.，第2.10.1页至2.10.16页，和Sambrook et al.(1989，
见上文)1.101至1.104部分。
成DNA-DNA杂交体。本领域公知，Tm是解链温度，或者是两条互补的多核苷酸序列分离的温
度。用于估算Tm的方法是本领域熟知的(参见Ausubel et al.，supra at page2.10.8))。
通常，完美匹配的DNA双链的Tm可以根据以下公式近似预测：
体积百分比；长度是DNA双螺旋中碱基对的数目。随机错配的碱基对的数目每增加1％，双
链DNA的Tm降低约1℃。对于高严格条件，一般在Tm-15℃下进行洗涤，或对于中等严格条
件，在Tm-30℃下进行洗涤。
(0.1％聚蔗糖、0.1％聚乙烯吡咯烷酮和0.1％牛血清白蛋白)、0.1％SDS和200mg/mL变性
的鲑鱼精子DNA)中于42℃下过夜杂交。然后将膜进行两次相继的中等严格洗涤(即，用
2×SSC、0.1％SDS，在45℃下进行15分钟；随后是用2×SSC、0.1％SDS，在50℃下进行15
分钟)，随后是两次相继的更高严格洗涤(即，用0.2×SSC、0.1％SDS，在55℃下进行12分
钟；随后是用0.2×SSC和0.1％SDS溶液，在65-68℃下进行12分钟)。
括由本文定义的病况区分外显子编码的氨基酸序列并且长度上可包括6、8、10、12、14、16、
18、20、25、30、40、50、60个氨基酸残基。例如，本发明所考虑的片段长度上为至少6个，优选至少8个氨基酸残基，其能在动物中引发免疫应答从而产生能与本发明的IRC标记多肽发
生免疫相互作用的抗原结合分子。这种抗原结合分子可用于筛选脊椎动物，特别是哺乳动
物的结构和/或功能上相关的IRC标记多肽。全长IRC标记多肽的片段包括含有与某(假
定的)全长IRC标记多肽的氨基酸序列，例如SEQ ID NO：2、4、6、8、10、12、14、16、18、20、22、
24、26、28、30、32、34、36、38、40、42、44、46、48、50、52、54、56、58、60、62、64、66、68、70、72、
74、76、78、80、82、84、86、88、90、92、94、96、98、100、102、104、106、108、110、112、114、116、
118、120、122、124、126、128、130、132、134、136、138、140、142、144、146、148、150、152、154、
156、158、160、162、164、166、168、170、172、174、176、178、180、182、184、·186、188、190、192、
194、196、198、200、202、204、206、208、210、212、214、216、218、220、222、224、226、228、230、
232、234、236、238、240、242、244、246、248、250、252、254、256、258、260、262、264、266、268、
270、272、274、276、278、280、282、284、286、288、290、292、294、296、298、300、302、304、306、
308、310、312、314、316、318、320、322、324、326、328、330、332、334、336、338、340、342、344、
346、348、350、352、354、356、358、360、362、364、366、368、370、372、374、376、378、380、382、
384、386、388、390、392、394、396、398、400、402、404、406、408、410、412、414、416、418、420、
422、424、426、428、430、432、434、436、438、440、442、444、446、448、450、452、454、456、458、
460、462、464、466、468、470、472、474、476、478、480、482、484、486、488、490、492、494、496、
498、500、502、504、506、508、510、512、514或516中所展示的氨基酸序列足够相似或衍生自所述氨基酸序列的氨基酸序列的肽，这些序列含有少于全长IRC标记多肽的氨基酸。全长
IRC标记多肽的片段可以是长度上例如5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、
21、22、23、24、25、30、40、50、60、70、80、90、100、120、150、300、400、500、600、700、800、900或
1000，或者甚至至少约2000、3000，或者更多个氨基酸残基的多肽。
和/或C-末端缺失(称为截短)或添加一个或多个氨基酸；在该天然蛋白质的一个或多个
位点处缺失或添加一个或多个氨基酸；或者在该天然蛋白质的一个或多个位点处取代一个
或多个氨基酸从天然蛋白质中衍生的蛋白质。本发明涵盖的变体蛋白质是生物学活性的，
即它们继续具有所述天然蛋白质的所需生物学活性。例如，遗传多态性或人为操作可形成
这种变体。如通过本文其他地方所述的序列比对程序使用缺省参数测定的，IRC标记多肽
变体与参考IRC多肽的氨基酸序列具有至少40％、50％、60％、70％，一般至少75％、80％、
85％，优选约90％至95％或更多，更优选约98％或更多的序列相似性。本发明IRC多肽的
变体与该蛋白质通常可因多达200、100、50或20个氨基酸残基，或者适合地少至1-15个氨
基酸残基、少至1-10个(例如6-10个)、少至5个、少至4、3、2或者甚至1个氨基酸残基而
不同。
的一种取代。本领域中已经定义了具有相似侧链氨基酸残基的家族，其通常可如下再细分
类：
性侧链的氨基酸包括谷氨酸和天冬氨酸。
包含该残基的肽的构象中的表面位置。具有碱性侧链的氨基酸包括精氨酸、赖氨酸和组氨
酸。
酸、缬氨酸、异亮氨酸、亮氨酸、蛋氨酸、苯丙氨酸和色氨酸。
极性侧链的氨基酸包括天冬酰胺、谷氨酰胺、半胱氨酸、组氨酸、丝氨酸和苏氨酸。
侧链时具有四个或四个以下碳以及当侧链上无极性基团时具有三个或三个以下碳的那些。
具有小的侧链的氨基酸包括甘氨酸、丝氨酸、丙氨酸和苏氨酸。基因编码的二级氨基酸脯氨
酸是特殊情况，归因于其已知的对肽链的二级构象的影响。脯氨酸的结构与所有其它天然
存在的氨基酸的不同之处在于其侧链与α-氨基基团的氮以及α-碳结合。但是，几个氨
基酸相似性矩阵(例如，Dayhoff et al.，(1978)，A model of evolutionary change in
proteins.Matrices for determining distance relationships In M.O.Dayhoff，(ed.)，
Atlas of protein sequence 和 structure，Vol.5，pp.345-358，National Biomedical
Research Foundation，Washington DC 和 Gonnet et al.，(1992，Science，256(5062)：
144301445公开的PAM120矩阵和PAM250矩阵)将脯氨酸与甘氨酸、丝氨酸、丙氨酸和苏氨
酸包括在相同的组中。因此，为了本发明的目的，脯氨酸被分类为“小的”氨基酸。
进行分类。
4个或4个以下碳原子(包括羧基碳)则认为该残基是小的，只要存在另一个极性取代基；
如果不存在，则为3个或3个以下。当然，小的残基一定是非芳香族的。取决于其结构特征，
氨基酸残基可以被分成两类或更多类。对于天然存在的蛋白氨基酸，根据该方案进行的再
细分显示于表6。
示与如例如SEQ ID NO：2、4、6、8、10、12、14、16、18、20、22、24、26、28、30、32、34、36、38、40、
42、44、46、48、50、52、54、56、58、60、62、64、66、68、70、72、74、76、78、80、82、84、86、88、90、
92、94、96、98、100、102、104、106、108、110、112、114、116、118、120、122、124、126、128、130、
132、134、136、138、140、142、144、146、148、150、152、154、156、158、160、162、164、166、168、
170、172、174、176、178、180、182、184、186、188、190、192、194、196、198、200、202、204、206、
208、210、212、214、216、218、220、222、224、226、228、230、232、234、236、238、240、242、244、
246、248、250、252、254、256、258、260、262、264、266、268、270、272、274、276、278、280、282、
284、286、288、290、292、294、296、298、300、302、304、306、308、310、312、314、316、318、320、
322、324、326、328、330、332、334、336、338、340、342、344、346、348、350、352、354、356、358、
360、362、364、366、368、370、372、374、376、378、380、382、384、386、388、390、392、394、396、
398、400、402、404、406、408、410、412、414、416、418、420、422、424、426、428、430、432、434、
436、438、440、442、444、446、448、450、452、454、456、458、460、462、464、466、468、470、472、
474、476、478、480、482、484、486、488、490、492、494、496、498、500、502、504、506、508、510、
512、514或516中任一个所展示的参照IRC标记多肽序列的至少约70、75、80、85、90、91、
92、93、94、95、96、97、98、99％的相似性。理想地，变体应与如例如SEQ ID NO：2、4、6、8、10、
12、14、16、18、20、22、24、26、28、30、32、34、36、38、40、42、44、46、48、50、52、54、56、58、60、
62、64、66、68、70、72、74、76、78、80、82、84、86、88、90、92、94、96、98、100、102、104、106、108、
110、112、114、116、118、120、122、124、126、128、130、132、134、136、138、140、142、144、146、
148、150、152、154、156、158、160、162、164、166、168、170、172、174、176、178、180、182、184、
186、188、190、192、194、196、198、200、202、204、206、208、210、212、214、216、218、220、222、
224、226、228、230、232、234、236、238、240、242、244、246、248、250、252、254、256、258、260、
262、264、266、268、270、272、274、276、278、280、282、284、286、288、290、292、294、296、298、
300、302、304、306、308、310、312、314、316、318、320、322、324、326、328、330、332、334、336、
338、340、342、344、346、348、350、352、354、356、358、360、362、364、366、368、370、372、374、
376、378、380、382、384、386、388、390、392、394、396、398、400、402、404、406、408、410、412、
414、416、418、420、422、24、426、428、430、432、434、436、438、440、442、444、446、448、450、
452、454、456、458、460、462、464、466、468、470、472、474、476、478、480、482、484、486、488、
490、492、494、496、498、500、502、504、506、508、510、512、514或516中任一个所展示的参考IRC标记多肽序列具有至少70、75、80、85、90、91、92、93、94、95、96、97、98、99％的序列同一性。而且，考虑了因添加、缺失或取代1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、
19、20、30、40、50、60、70、80、90、100、150、200、300、500或更多个氨基酸而与天然或参考序列不同但仍包含如本文定义的因条件而不同的外显子的序列。IRC标记多肽也包括能在本
文所定义的严格条件下，特别是高严格条件下与本文描述的本发明IRC标记多核苷酸序列
或其非编码链杂交的多核苷酸编码的多肽。
2、4、6、8、10、12、14、16、18、20、22、24、26、28、30、32、34、36、38、40、42、44、46、48、50、52、54、
56、58、60、62、64、66、68、70、72、74、76、78、80、82、84、86、88、90、92、94、96、98、100、102、
104、106、108、110、112、114、116、118、120、122、124、126、128、130、132、134、136、138、140、
142、144、146、148、150、152、154、156、158、160、162、164、166、168、170、172、174、176、178、
180、182、184、186、188、190、192、194、196、198、200、202、204、206、208、210、212、214、216、
218、220、222、224、226、228、230、232、234、236、238、240、242、244、246、248、250、252、254、
256、258、260、262、264、266、268、270、272、274、276、278、280、282、284、286、288、290、292、
294、296、298、300、302、304、306、308、310、312、314、316、318、320、322、324、326、328、330、
332、334、336、338、340、342、344、346、348、350、352、354、356、358、360、362、364、366、368、
370、372、374、376、378、380、382、384、386、388、390、392、394、396、398、400、402、404、406、
408、410、412、414、416、418、420、422、424、426、428、430、432、434、436、438、440、442、444、
446、448、450、452、454、456、458、460、462、464、466、468、470、472、474、476、478、480、482、
484、486、488、490、492、494、496、498、500、502、504、506、508、510、512、514或516中任一个中的相应序列有至少1％但低于20％、15％、10％或5％的残基不同。(如果这一比较需要
比对，则应比对这些序列的最大相似性)。
64、66、68、70、72、74、76、78、80、82、84、86、88、90、92、94、96、98、100、102、104、106、108、
110、112、114、116、118、120、122、124、126、128、130、132、134、136、138、140、142、144、146、
148、150、152、154、156、158、160、162、164、166、168、170、172、174、176、178、180、182、184、
186、188、190、192、194、196、198、200、202、204、206、208、210、212、214、216、218、220、222、
224、226、228、230、232、234、236、238、240、242、244、246、248、250、252、254、256、258、260、
262、264、266、268、270、272、274、276、278、280、282、284、286、288、290、292、294、296、298、
300、302、304、306、308、310、312、314、316、318、320、322、324、326、328、330、332、334、336、
338、340、342、344、346、348、350、352、354、356、358、360、362、364、366、368、370、372、374、
376、378、380、382、384、386、388、390、392、394、396、398、400、402、404、406、408、410、412、
414、416、418、420、422、424、426、428、430、432、434、436、438、440、442、444、446、448、450、
452、454、456、458、460、462、464、466、468、470、472、474、476、478、480、482、484、486、488、
490、492、494、496、498、500、502、504、506、508、510、512、514or516中的任一个展示的IRC标记多肽的相应序列具有至少约50％、55％、60％、65％、70％、75％、80％、85％、90％、
91％、92％、93％、94％95％、96％、97％、98％或更多相似性的氨基酸序列并且其具有因条件而不同的外显子所编码的氨基酸序列。
部分并与调控元件可操作地连接的核苷酸序列的嵌合构建体；(b)将所述嵌合构建体引入
宿主细胞；(c)培养该宿主细胞表达所述IRC标记多肽；和(d)从宿主细胞中分离所述IRC
标记多肽。在示例性说明的实例中，所述核苷酸序列编码SEQ ID NO：2、4、6、8、10、12、14、
16、18、20、22、24、26、28、30、32、34、36、38、40、42、44、46、48、50、52、54、56、58、60、62、64、
66、68、70、72、74、76、78、80、82、84、86、88、90、92、94、96、98、100、102、104、106、108、110、
112、114、116、118、120、122、124、126、128、130、132、134、136、138、140、142、144、146、148、
150、152、154、156、158、160、162、164、166、168、170、172、174、176、178、180、182、184、186、
188、190、192、194、196、198、200、202、204、206、208、210、212、214、216、218、220、222、224、
226、228、230、232、234、236、238、240、242、244、246、248、250、252、254、256、258、260、262、
264、266、268、270、272、274、276、278、280、282、284、286、288、290、292、294、296、298、300、
302、304、306、308、310、312、314、316、318、320、322、324、326、328、330、332、334、336、338、
340、342、344、346、348、350、352、354、356、358、360、362、364、366、368、370、372、374、376、
378、380、382、384、386、388、390、392、394、396、398、400、402、404、406、408、410、412、414、
416、418、420、422、424、426、428、430、432、434、436、438、440、442、444、446、448、450、452、
454、456、458、460、462、464、466、468、470、472、474、476、478、480、482、484、486、488、490、
492、494、496、498、500、502、504、506、508、510、512、514或516中任一个所展示的序列的至少一部分，或其变体。
动子序列(例如可以是天然存在的或不止一种启动子的组合元件的组成型或可诱导启动
子)、前导或信号序列、核糖体结合位点、转录起始和终止序列、翻译起始和终止序列以及增强子或激活序列。
而，“转化”是指宿主的基因型作为细胞摄入外源性DNA或RNA的结果而改变的过程，并且
例如转化的细胞含有本发明的表达系统。有许多方法将嵌合构建体引入细胞。通常，所用
的方法取决于对宿主细胞的选择。本领域技术人员熟知将嵌合构建体引入宿主细胞的技
术。已描述了四类将核酸分子递送入细胞的方法：(1)化学方法，例如磷酸钙沉淀、聚乙二
醇(PEG)-介导的沉淀和脂质转染；(2)物理方法，例如显微注射、电穿孔、加速方法和真空
渗入；(3)基于载体的方法，例如细菌和病毒载体介导的转化；和(4)受体介导的转化。本
领域技术人员熟知这些和其它类型的转化技术，而新的技术也不断涌现。转化技术的具体
选择取决于所述技术转化特定宿主物种的效率以及采用具体选择的方法实施本发明的人
的经验和偏好。对于技术人员来说显而易见的是将嵌合构建体引入细胞中的转化系统的具
体选择对本发明不是实质性的或对本发明的限制，只要所述系统能实现可接受水平的核酸
转移。
过常规实验容易地确定。适合表达的宿主细胞可以是原核或真核的。表达本发明多肽的示
例性说明的宿主细胞是细菌。所用的细菌可以是大肠杆菌(Escherichia coli)。可选择
地，宿主细胞可以是酵母菌细胞或昆虫细胞，例如利用杆状病毒表达系统的SF9细胞。
PROTEIN SCIENCE(John Wiley&Sons，Inc.1995-1997)，特别是第1、5和6章中所述的标准
方法常规制备含有由病况区分外显子编码的氨基酸序列的重组IRC标记多肽或其片段，及
其变体。可选择地，可通过化学合成，例如使用如Atherton和Shephard，(同上)第9章和
Roberge et al(1995，Science269：202)中所述的液相合成或固相合成来化学合成IRC标
记多肽。
治疗成功等的能力的阈值。在示例性说明的实例中，接受者操作特性(ROC)曲线通过将变
量的值对其在两个群体(所谓随意性，例如，“败血症”和“inSIRS”、“败血症”和“手术后炎症”、“败血症”和“正常的”、“inSIRS”和“手术后炎症”、“inSIRS”和“正常的”、“手术后炎症”和“正常的”或者简单地“疾病”和“正常的”或“低风险”和“高风险”)中的相对频率作图来计算。
“正常的”彻底区分开，而重叠的区域表示测试未能将“疾病”和“正常的”区分开。选择一个阈值，高于其(或低于其，取决于IRC标记表达产物如何随疾病或预后而变化)的测试被认
为是“阳性的”而低于其的测试被认为是“阴性的”。ROC曲线下面积是所接受的测量将允许正确鉴定病况的可能性的度量(参见例如Hanley et al，Radiology143：29-36(1982)。可
选择地，或另外，阈值可以通过从同一个患者获得可与较晚的结果相比较的较早的标记基
因表达产物结果来建立。在这些实施方案中，受影响的个体作为他们自己的“对照组”。在
随着疾病严重度或预后风险增加的标记中，同一个患者中随时间的增加可表明疾病的恶化
或治疗方案失败，而随时间的降低可表明疾病的减轻或治疗方案成功。
结果在患病组(例如败血症、inSIRS或手术后炎症中的一个)和对照组(例如不同于患病
组的败血症、inSIRS或手术后炎症中的一个，或者是正常的)两者的受试者中是可能性相
等的；大于1的值表示在患病组中阳性结果更有可能而小于1的值表示在对照组中阳性结
果更有可能。在阴性似然比的实例中，1的值表示阴性结果在两组中的受试者中是可能性相
等的；大于1的值表示在患病组中阴性结果更有可能而小于1的值表示在对照组中阴性结
果更有可能。在某些实施方案中，选择IRC标记和或IRC标记组以显示出至少约1.5或更
多或约0.67或更少、至少约2或更多或约0.5或更少、至少约5或更多或约0.2或更少、至
少约10或更多或约0.1或更少或者至少约20或更多或约0.05或更少的阳性或阴性似然
比。
中阳性结果更有可能。在某些实施方案中，选择IRC标记和或IRC标记组以显示出至少约
2或更多或约0.5或更少、至少约3或更多或约0.33或更少、至少约4或更多或约0.25或
更少、至少约5或更多或约0.2或更少或者至少约10或更多或约0.1或更少的比值比。
高。在某些实施方案中，选择IRC标记和或IRC标记组以显示出至少约1.1或更多或约0.91
或更少、至少约1.25或更多或约0.8或更少、至少约1.5或更多或约0.67或更少、至少约
2或更多或约0.5或更少或至少约2.5或更多或约0.4或更少的风险比。
个之间的边界可被认为是“阈值”。(例如特定诊断或预后的)风险可根据测试受试者落入
哪一“份”来分配。
或排除一种或多种特定的诊断和/或预后。可选择地，IRC标记因在特定测定形式中存在
或不存在与病况、疾病、预后等相关。在IRC标记组的实例中，本发明可利用对IRC标记的
整个概况的评估提供单个结果值(例如表示为数目得分或百分比风险的“组响应”值)。在
这样的实施方案中，特定亚组的IRC标记的增加、降低或其他变化(例如随时间的斜率)可
足以表明一名患者中的特定病况或未来结果，而不同亚组的IRC标记的增加、降低或其他
变化可足以表明另一名患者中相同或不同的病况或结果。
症-阴性受试者、败血症阴性、inSIRS-阴性受试者、败血症阴性、手术后炎症-阴性受试者、inSIRS-阴性、手术后炎症-阴性受试者、败血症-阳性受试者、inSIRS阳性受试者和手术
后炎症-阳性受试者的一个或多个对照受试者相比具有某些基因(本文称为“IRC标记基
因”)的不正常表达，所述基因的转录物包括但不限于SEQ ID NO：1、3、5、7、9、11、13、15、17、
19、21、23、25、27、29、31、33、35、37、39、41、43、45、47、49、51、53、55、57、59、61、63、65、67、
69、71、73、75、77、79、81、83、85、87、89、91、93、95、97、99；101、103、105、107、109、111、113、
115、117、119、121、123、125、127、129、131、133、135、137、139、141、143、145、147、149、151、
153、155、157、159、161、163、165、167、169、171、173、175、177、179、181、183、185、187、189、
191、193、195、197、199、201、203、205、207、209、211、213、215、217、219、221、223、225、227、
229、231、233、235、237、239、241、243、245、247、249、251、253、255、257、259、261、263、265、
267、269、271、273、275、277、279、281、283、285、287、289、291、293、295、297、299、301、303、
305、307、309、311、313、315、317、319、321、323、325、327、329、331、333、335、337、339、341、
343、345、347、349、351、353、355、357、359、361、363、365、367、369、371、373、375、377、379、
381、383、385、387、389、391、393、395、397、399、401、403、405、407、409、411、413、415、417、
419、421、423、425、427、429、431、433、435、437、439、441、443、445、447、449、451、453、455、
457、459、461、463、465、467、469、471、473、475、477、479、481、483、485、487、489、491、493、
495、497、499、501、503、505、507、509、511、513或515。在某些实施方案中，至少两个受试者形成的对照或参考群被用于比较。例如，对照或参考群可选自未患有手术后炎症(“手术
后炎症-阴性”)的个体、未患有inSIRS(“inSIRS-阴性”)的个体、未患有inSIRS但患有
感染过程的个体、患有手术后炎症但无inSIRS或败血症存在(“手术后炎症-阳性”)的个
体、患有inSIRS但无败血症存在(“inSIRS-阳性”)的个体、患有败血症发作的个体、败血
症阳性且患有败血症进行中的一个阶段的个体或具有增加发展败血症的风险的生理损伤
的个体。对照或参考群可以是手术后炎症阳性的并且随后通过常规技术诊断患有inSIRS。
例如，用来产生参考概况的手术后炎症阳性的患者群可在为了生成参考IRC标记概况而从
他们获取生物样品后24、48、72、96或更多小时诊断患有inSIRS。在一些实施方案中，手
术后炎症阳性的个体群在获取生物样品后约0-36小时、约36-60小时、约60-84小时或约
84-108小时使用常规技术诊断患有inSIRS。如果标记概况表明inSIRS或其进行的一个阶
段，那么临床医师可在临床症状显示之前开始治疗。
IRC标记概况而从他们获取生物样品后24、48、72、96或更多小时诊断患有败血症。在一些
实施方案中，inSIRS阳性的个体群在获取生物样品后约0-36小时、约36-60小时、约60-84
小时或约84-108小时使用常规技术诊断患有败血症。如果标记概况表明败血症或其进行
的一个阶段，那么临床医师可在败血症的临床症状显示之前开始治疗。治疗通常包括检查
患者以确定感染的来源。一旦定位来源，临床医生通常将从感染位点获得培养物，适合地在
开始相关的经验性抗微生物治疗以及可能的另外辅助的治疗措施例如排光脓肿或移除被
感染的导尿管之前。
记表达产物的水平相比较表明测试下的受试者是正常的还是患有或处于发展手术后炎症、
inSIRS或败血症的风险中。
试者中这些病况的方法。因此，为了做出这样的诊断，理想的是定性活性两确定IRC标记转
录物的水平或IRC标记多肽的水平或功能活性。在某些实施方案中，手术后炎症、inSIRS
或败血症或者手术后炎症、inSIRS和败血症之间的差异存在或不存在是在IRC标记表达产
物在从测试受试者获得的生物样品中以比在从对照受试者获得的参考样品中相应IRC表
达产物表达水平可检测地更低的水平表达时确定的。通常，在生物样品中的IRC标记表达
产物的水平或功能活性与参考样品中相应IRC标记表达产物的水平或功能活性相差至少
10％、20％、30％、40％、50％、60％、70％、80％、90％、92％、94％、96％、97％、98％或99％或者甚至至少约99.5％、99.9％、99.95％、99.99％、99.995％或99.999％或者甚至至少约
100％、200％、300％、400％、500％、600％、700％、800％、900％或1000％时做出这样的诊断。相应的IRC标记表达产物通常选自在生物样品中存在的相同的IRC标记表达产物、从
变体基因(例如同源的或直向同源的基因)表达的IRC表达产物包括等位变体或剪接变体
或其蛋白质产物。在某些实施方案中，所述方法包括测量来自选自ANKDD1A、GABRR2、OTX1、PANX2、RHBDF2、SLAMF7、AMBRA1、CES2、CLPB、HIPK2、C1ORF91、NDSTl、SLC36A1、ADAM19、CUL7、TG、PDCD1LG2、GRINLIA、MGRNl、SNTB2、CDK5R1、GAA、KATNAL2、CEACAM4、ZNF335、ASPHD2、ACRC、BTNL8、MOV10、MED12L、KLHL6、PDLIM5、GALNT10、SCRNl、VOPP1、FKBP9、KIF27、PIWIL4、TEP1、GCH1、PRR11、CDH2、PPM1N、RRAS、DDOST、APH1A、TTL、TEX261、COQ2、FCHSD1、BAK1、SLC25A25、KELT、ACP2、TBC1D2B、FANCA或SLC39A11的IRC产生多转录物基因的1、2、3、4、
5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23或24种IRC标记表达产物的水平，单独或与来自56、55、54、53、52、51、50、49、48、47、46、45、44、43、42、41、40、39、38、37、
36、35、34、33、32、31、30、29、28、27、26、25、24、23、22、21、19、18、17、16、15、14、13、12、11、
10、9、8、7、6、5、4、3或2个IRC产生多转录物基因中的每一个或1个其他的IRC产生多转录物基因的多达1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23或24个单个IRC标记表达产物组合。
48、47、46、45、44、43、42、41、40、39、38、37、36、35、34、33、32、31、30、29、28、27、26、25、24、
23、22、21、19、18、17、16、15、14、13、12、11、10、9、8、7、6、5、4、3、2或1个其他IRC产生多转录物基因表达的1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11或12个单个IRC标记多肽组合。
性粒细胞，单核细胞，网织红细胞，嗜碱性粒细胞，嗜酸性粒细胞，血细胞，体腔细胞，巨核细胞，巨噬细胞，树突状细胞，自然杀伤细胞，或这些细胞的部分(例如，核酸或蛋白部分)。在特定的实施方案中，生物样品包含白细胞，包括外周血单核细胞(PBMC)。
poly ARNA)或全细胞RNA。当将RNA作为检测对象时，需要将RNA转化为互补DNA。在一
些实施方案中，采用模板依赖性核酸扩增技术扩增所述核酸。可采用许多模板依赖性方法
来扩增给定模板样品中存在的IRC标记序列。示例性说明的核酸扩增技术是详述于美国专
利号4,683,195；4,683,202和4,800,159；Ausubel et al.(同上)和Innis et al.，(PCR
Protocols，Academic Press，Inc.，San Diego Calif.，1990)中的聚合酶链式反应(称为
PCR)。简单地说，在PCR中，制备与所述标记序列的相对互补链上区域互补的两条引物序
列。向反应混合物中加入过量的脱氧核苷三磷酸和DNA聚合酶，例如Taq聚合酶。如果样
品中存在同源IRC标记序列，这些引物将与所述标记结合且聚合酶可通过添加核苷酸使该
引物沿着标记序列延伸。通过升高或降低反应混合物的温度，延伸的引物可与标记解离形
成反应产物，过量的引物可与标记和反应产物结合而反复进行该过程。为定量测定所扩增
的mRNA含量，可进行逆转录酶PCR扩增程序。将RNA逆转录为cDNA的方法是熟知的，其描
述于Sambrook et al，1989，同上。可选择的逆转录方法利用热稳定的RNA依赖性DNA聚合
酶。WO90/07641描述了这些方法。聚合酶链式反应方法是本领域熟知的。
通过测定PCR反应中完成相同数目扩增轮次并处于其线性范围内的靶DNA扩增产物的浓
度，可以测定原始DNA混合物中特异性靶序列的相对浓度。如果DNA混合物是从分离自不
同组织或细胞的RNA合成的cDNA，则可测定各组织或细胞的产生靶序列的特异性mRNA的相
对丰度。PCR产物的浓度与mRNA相对丰度之间的这种直接正比例关系只在PCR反应的线性
范围内才正确。曲线平台部分靶DNA的终浓度可通过反应混合物中试剂的利用率测定且独
立于所述靶DNA的原始浓度。在特定的实施方案中，使用多重串联，其采用两步骤工艺从少
量RNA或DNA概括基因表达，如例如美国申请公开第20070190540号中所描述的。在第一
步中，将RNA转化为cDNA并且使用多种基因特异性引物扩增。在第二步中，每种单个基因
通过实时PCR定量测量。
接。在连接酶存在下，此两对探针可相连形成单个单位。与PCR中一样，通过温度循环，结合的连接单位从靶序列上解离，然后用作连接过量探针对的“靶序列”。美国专利号4,883,750描述了与LCR相似的将探针对和靶序列结合的方法。
所述复制序列，然后可检测复制序列。
Walker et al，(1992，Proc.Natl.Acad.Sci.U.S.A89：392-396)。
区域上退火，之后是其中只存在四种碱基中的两种的修复反应。为便于检测将另两种碱基
作为生物素化衍生物加入。SDA中使用了类似的方法。也可采用循环探针反应(CPR)检测
靶特异性序列。在CPR中，具有非特异性DNA3’和5’序列与特异性RNA中段序列的探针与
样品中存在的DNA杂交。杂交时，用RNA酶H处理反应物，探针的产物鉴定为消化后释放的
不同产物。使原始模板与另一循环探针退火并且重复进行所述反应。
可用捕获部分(例如，生物素)和/或检测部分(例如，酶)标记修饰这些引物。在后一申
请中，将过量的标记探针加入样品。在靶序列存在下，探针结合并被酶催化切割。切割后，
靶序列完整释放进而与过量探针结合。标记探针的切割是靶序列存在的信号。
理和微量离心(minispin)柱分离DNA和RNA或通过氯化胍提取RNA来制备用于扩增的核
酸。这些扩增技术包括使具有靶特异性序列的引物退火。聚合后，用RNA酶H消化杂交的
DNA/RNA杂交物，同时对双链DNA分子再进行热变性。在任一情况中，通过加入第二条靶特
异性引物然后聚合从而将单链DNA制成完全双链。然后用RNA聚合酶，例如T7或SP6多次
转录该双链DNA分子。在恒温循环反应中，将RNA逆转录为单链DNA(其之后转变为双链
DNA)接着用RNA聚合酶，例如T7或SP6再一次转录。得到的产物无论是截短的还是完整的
均显示为靶特异性序列。
并且因此不需要热循环。整个反应可在一个温度进行并且这一方法应在即时DNA诊断上具
有广泛应用。
依赖性DNA聚合酶)延伸的第一引物寡核苷酸的模板。然后通过核糖核酸酶H(RNA酶H，
对含DNA或RNA的双螺旋中RNA特异性RNA酶)的作用除去得到的DNA：RNA双螺旋中的
RNA。得到的ssDNA是第二引物的模板，该引物在5’也含有与该模板同源的RNA聚合酶(例
如T7RNA聚合酶)的启动子序列。然后用DNA聚合酶(例如大肠杆菌DNA聚合酶I的大
“Klenow”片段)延伸这一引物，得到双链DNA(“dsDNA”)分子，其具有与引物之间的与原
始RNA相同的序列并且在一末端还含有启动子序列。合适的RNA聚合酶可利用这一引物序
列制备所述DNA的多份RNA拷贝。然后这些拷贝可再进入循环从而导致快速扩增。适当地
选择酶，可恒温进行这一扩增而无需在每轮加入酶。由于这一方法的循环性质，可选择DNA
或RNA形式的起始序列。
不是循环性的，即得到的RNA转录物不会产生新模板。其它扩增方法包括“RACE”和“单边
PCR”(Frohman，M.A.，In：″PCR Protocols：A Guide to Methods and Applications"，
Academic Press，N.Y.，1990；Ohara et al.，1989，Proc.Natl Acad.Sci.U.S.A..86：
5673-567)。
(1989，Genomics4：560)。
中，可通过目测方法进行检测(例如，凝胶溴化乙锭染色)。可选择地，检测可包括通过化
学发光、放射性标记的放射性闪烁照相术或荧光标记物或甚至通过利用电或热脉冲信号的
系统来间接鉴定产物(Affymax Technology；Bellus，1994，J Macromol.Sci.Pure，Appl.
Chem.，A31(1)：1355-13766)。
体用放射性或荧光标记的核苷酸作了标记，则可在分离后使这些扩增产物曝光x-射线胶
片或在合适的激发光谱下目测。在一些实施方案中，可间接进行目测。扩增产物分离后，使
标记的核酸探针与扩增的IRC标记序列接触。探针优选与生色团偶联但也可放射性标记。
可选择地，探针可与结合伴侣例如抗原结合分子或生物素偶联，而结合对的另一成员携带
可检测部分或报导分子。所涉及的技术是本领域技术人员熟知的，可在许多分子方法的标
准教科书(例如，参见Sambrook el al.，1989，同上和Ausubel et al.，1994，同上)中找
到。例如，用生色团或放射性标记的探针或引物可在扩增期间或其后鉴定靶标。
与印迹或RNA类相似，但各方法可提供不同类型的信息。简单地说，探针用于靶向固定于合
适的基质往往是硝酸纤维素膜上的DNA或RNA。不同类核酸在空间上应分开以便分析。这
一般通过核酸的凝胶电泳，然后“印迹”到膜上来实现。随后，在有利于变性和再杂交的条
件下共同培育印迹的靶与探针(通常是标记的)。因为探针设计为可与靶碱基配对，因此探
针可在复性条件下与靶序列的一部分结合。然后除去未结合的探针，如上所述进行检测。
IRC标记核酸含量与疾病的进程或严重性相关联。
TaqManTM、液相层析和质谱。
说，这些技术包括快速而精确地分析大量基因的定量测定方法。通过寡核苷酸给基因加标
签或者使用固定的探针阵列，可用生物芯片技术将靶分子分隔成高密度阵列并根据杂交筛
选这些分子。也参见Pease et al.(1994，Proc.Natl.Acad.Sci.U.S.A.91：5022-5026)；
Fodor et al.(1991，Science251：767-773)。简单地说，如本文所概述的，制备IRC标记多
核苷酸的核酸探针，将其与用于筛选和诊断方法的生物芯片相连。可将连接生物芯片的核
酸探针设计为基本上与特异性表达的IRC标记核酸即靶序列(无论是样品的靶序列还是其
它探针序列，例如三明治测定中的序列)互补，从而使得靶序列与本发明的探针发生杂交。
这一互补性无需完美；可存在干扰靶序列与本发明的核酸探针之间的杂交的任意数目的碱
基对错配。然而，如果错配的数量太大以致于即使在最低严格度杂交条件下也不发生杂交，
则该序列不是靶序列的互补序列。在某些实施方案中，每条序列可使用不止一种探针，可使
用重叠的探针或针对靶序列不同部分的探针。即，可用两种、三种、四种以上的探针(优选
三种)构建具体靶的冗余度。这些探针可以是重叠的(即某些序列相同)或分离的。
述的结合、洗涤、分析和去除条件下足够稳定。结合可以是共价或非共价的。本文的“非共价结合”与其语法等价体表示静电性、亲水性和疏水性相互作用的一种或多种。非共价结合包
括分子例如链霉亲和素与支持物的共价连接和生物素化探针与链霉亲和素的非共价结合。
本文的“共价结合”及其语法等价体表示两部分，固体支持物与探针，至少通过一根键，包括σ键、π键和配位键相连。探针与固体支持物之间可直接形成共价键，或者可通过交联接
头或通过固体支持物或探针或这两种分子上所含的特异性反应活性基团来形成共价键。固
定化也可包括共价和非共价相互作用的组合。
测方法的任何材料。本领域技术人员应理解可用的基质很多，包括但不限于：玻璃与改性或
功能化玻璃，塑料(丙烯酸、聚苯乙烯与苯乙烯和其它材料的共聚物、聚丙烯、聚乙烯、聚丁TM
烯、聚氨酯、Teflon 等)，多糖，尼龙或硝酸纤维素，树脂，二氧化硅或含硅与修饰的硅、碳、金属、无机玻璃、塑料的二氧化硅材料等。总之，这些基质可用光学方法检测并且不带荧光。
所述基质可以是可弯曲的，例如可弯曲的泡沫塑料，包括特定塑料制成的闭孔泡沫塑料。
术，例如WO95/25116；WO95/35505；美国专利号5,700,637和5,445,934及其引用的参考文
TM
献中所述的技术原位合成核酸；这些连接方法构成Affymetrix GeneChip 技术的基础。
者研碎生物材料，或者按照细胞裂解步骤制备样品的DNA或RNA提取物(无论单链或双
链)，所述步骤包括但不限于：用SDS(或其它去污剂)、渗透压冲击、异硫氰酸胍和溶菌酶处
理进行裂解。可用于本发明方法的合适DNA包括cDNA。可使用多种常用程序中的任一种制
备这种DNA，例如如Ausubel，et al.，1994，同上；和Sambrook，et al.，1989，同上中所述。
和Sambrook，et al.，1989，同上中的相关章节中所述。
下快速接触固定的探针。可选择地，可使用如例如上文所述的合适的核苷酸扩增技术来选
择并扩增cDNA片段，涉及合适的随机或特异性引物。
34
化剂、酶、荧光染料、化学发光分子、生物发光分子、镧系离子(例如，Eu )、放射性同位素和直接可见标记物。在直接可见标记物的实例中，可使用胶体金属颗粒或非金属颗粒、染料颗
粒、酶或底物、有机聚合物、乳胶颗粒、脂质体或含有信号产生物质的其它载体等。这一类型的示例性说明标记物包括大胶体，例如金属胶体，如金、硒、银、锡和钛氧化物胶体。在一些将酶用作直接可见标记物的实施方案中，将生物素化的碱基掺入靶多核苷酸中。通过与链
霉亲和素-报导分子一起孵育来检测杂交。
料包括Dower et al.(国际公布WO93/06121)中所讨论的。荧光染料也可参考美国专
利5,573,909(Singer et al)；5,326,692(Brinkley et al)。可选择地，荧光染料可参
考美国专 利号5,227,487；5,274,113；5,405,975；5,433,896；5,442,045；5,451,663；
5,453,517；5,459,276；5,516,864；5,648,270和5,723,218中所述。可购得的荧光标记物
TM TM
包括，例如荧光素亚磷酰胺，诸如Fluoreprime (Pharmacia)、Fluoredite (Millipore)和
FAM(Applied Biosystems International)。
的 P。
HYBRIDIZATION，A PRACTICAL APPROACH)，(Homes和Higgins编)，(IRL press，Washington D.C.，1985)。一般来说，杂交是否发生受寡核苷酸探针和所测试寡核苷酸序列的长度、pH、温度、一价和二价阳离子的浓度、杂交物形成区中G和C核苷酸的比例、介质粘度和可能存
在的变性剂的影响。这些变量也影响杂交所需时间。因此，优选的条件取决于具体应用。然
而，可用常规方法确定这些经验性条件而无需过多实验。
酸探针作比较，可区别与靶序列完美匹配且完全同源的11-17个碱基长的寡核苷酸探针的
杂交条件。也可参考Wood et al.(1985，Proc.Natl.Acid.Sci.USA82：1585)，他描述了使
用3M氯化四甲铵使11-20个碱基长的寡核苷酸杂交的条件，其中杂交物的解链温度只取决
于寡核苷酸探针的长度，而不考虑其GC含量。此外，Drmanac et al.(同上)描述了6-10
个核苷酸长的寡聚物的严格杂交条件，使用核苷酸类似物，例如“锁定核酸”最容易获得相
似的条件(Christensen et al.，2001，Biochem J354：481-4)。
但不限于：甜菜碱和低级四烷基铵盐。变性剂是通过干扰双链核酸碱基之间的氢键或核
酸分子的水合作用来降低双链核酸分子解链温度的组合物。变性剂包括但不限于：甲酰
胺、甲醛、二甲基亚砜、四乙基乙酸酯(tetraethyl acetate)、脲、异硫氰酸胍(guanidium isothiocyanate)、甘油和离液盐。杂交加速剂包括核内不均一核糖蛋白(hnRP)A1和阳离
子去污剂，如十六烷基三乙基溴化铵(CTAB)和十二烷基三甲基溴化铵(DTAB)、聚赖氨酸、
精胺、亚精胺、单链结合蛋白(SSB)、噬菌体T4基因32蛋白和乙酸铵与乙醇的混合物。杂交
缓冲液可含有浓度为约0.005nM和约50nM之间、优选约0.5nM和5nM之间、更优选约lnM
和2nM之间的靶多核苷酸。
如设计用于盛放其上连接有探针的固体支持物的碟或小室。孵育温度通常为核酸杂交所用
的温度，例如约20℃和约75℃之间、如约25℃、约30℃、约35℃、约40℃、约45℃、约50℃、约55℃、约60℃，或约65℃。对于长度超过14个核苷酸的探针来说优选20℃至50℃。对
较短的探针而言，优选较低温度。将靶多核苷酸样品与探针孵育足够时间使靶多核苷酸中
的靶序列与任何互补探针之间达到所需杂交水平。例如，可在约45℃+/-10℃在甲酰胺中
杂交1-2天。
检测探针以鉴定哪种探针与靶多核苷酸杂交。
光计检测荧光；提供酶系统以产生可用分光光度计检测的染料；或者使用光反射仪检测染
料颗粒或有色的胶体金属颗粒或非金属颗粒；使用放射性标记物或化学发光分子的情况下
采用辐射计数器或放射自显影术。因此，检测装置应适用于检测或扫描标记物相关的光，所
述光可包括荧光、冷光、聚焦光束或激光。在这样的实例中，可用电荷耦合器件(CCD)或光
电池来扫描微阵列中各位置探针：靶多核苷酸杂交物发射的光并直接在数字计算机上记录
数据。在一些情况下，无需检测电子信号。例如，在酶促产生与核酸阵列模式相关的颜色斑
点时，目测该阵列就可解释阵列上的模式。在核酸阵列的实例中，检测装置适合地与模式
识别软件接口从而将阵列的信号模式转化为普通语言遗传分布模式。在某些实施方案中，
不同IRC产物的特异性寡核苷酸探针采取核酸阵列形式并使用“芯片阅读器”检测阵列上
报导分子所产生的信号。可使用“芯片阅读器”的检测系统如Pirrung et al(美国专利号
5,143,854)所述。芯片阅读器通常也包括一些信号加工过程来确定具体阵列位置或特征处
的信号是否是真阳性或者可能是假信号。示例性芯片阅读器例如Fodor et al(美国专利
号5,925,525)所述。可选择地，当阵列是由各种可寻址型标记的微珠混合物制成时，可使
用流式细胞术检测该反应。
用本领域已知的任何合适方法检验生物学样品中IRC标记蛋白质的水平。例如，当IRC标
记蛋白质是酶时，可根据其催化活性或根据样品所含该蛋白质分子数来定量测定所述蛋白
质。可使用抗体技术，例如免疫组织学和免疫组织化学方法来检测组织样品中感兴趣蛋白
质的水平。例如，用初级抗体(多克隆或单克隆)提供特异性识别并且用第二检测系统检
测初级抗体的存在(或结合)情况。可将可检测标记物，例如荧光标记物、放射性标记物或
能产生可定量测定(如有色的)的产物的酶(如，碱性磷酸酶、辣根过氧化物酶)与二级抗
体相轭合。在另一合适的方法中，可检测性标记初级抗体本身。因此可对组织切片进行免
疫组织学标记。在一些实施方案中，从生物学样品(例如，组织、细胞)中制备分析用蛋白
提取物。可使用常规免疫印迹方法(Jalkanen et al.，1985，J.Cell.Biol.101：976-985；
Jalkanen et al，1987，J.Cell.Biol.105：3087-3096)使这些提取物(例如，去污剂提取
物)经手western-印迹或感兴趣蛋白质的水平的斑点/狭线测定。
和定量测定感兴趣的IRC标记蛋白质。可采用线性回归计算机算法(参见，Lacobilli et
al.，1988，Breast Cancer Research and Treatment11：19-30)，参考标准制剂中存在的量来计算样品中这种蛋白质的量。在其它实施方案中，可用针对感兴趣蛋白质的两种不同单
克隆抗体，一种作为免疫吸附剂，另一种作为酶标记探针。
列的抗原图像。也开发了能同时检测临床分析物的免疫传感器阵列。目前用蛋白质阵列来
获得体液，例如健康或患病受试者以及药物治疗前后受试者血清，中的蛋白质表达概况是
可能的。
点的任何分子或分子复合物。蛋白质捕获剂可以是一种蛋白质，其在细胞中的天然功能是
能特异性结合另一种蛋白质，例如抗体或受体。可选择地，蛋白质捕获剂可以替代为能特异
性结合某蛋白质的部分合成或全合成或重组的蛋白质。可选择地，蛋白质捕获剂可以是在
体外根据对特异性蛋白质或肽靶的结合亲和力选自诱变、随机或完全随机化与合成文库的
蛋白质。所用的选择方法任选可以是本领域已知的展示方法，例如核糖体展示或噬菌体展
示。可选择地，经体外选择得到的蛋白质捕获剂可以是能特异性结合蛋白质靶的DNA或RNA
适体(参见，Potyrailo et al，1998Anal.Chem.70：3419-3425；Cohen et al，1998，Proc.Natl.Acad.Sci.USA95：14272-14277；Fukuda，et al.，1997Nucleic Acids Symp.Ser.37：
TM
237-238；可从SomaLogic获得)。例如，通过Selex 工艺从寡核苷酸文库中选择适体并且
可通过共价连接，经由掺入溴化脱氧尿苷和紫外光活化的交联(光适体)来增强它们与蛋
白质的相互作用。适体具有易通过自动寡核苷酸合成来制备和DNA的稳定性和强度优良的
优点；可采用通用荧光蛋白质染色技术来检测结合。可选择地，体外选择的蛋白质捕获剂
可以是多肽(例如，抗原)(参见，例如Roberts and Szostak，1997Proc.Natl.Acad.Sci.
USA94：12297-12302)。
隙；然后这些空隙能特异性捕获具有合适的一级氨基酸序列的(变性的)蛋白质(例如，可
TM
从ProteinPrint 和Aspira Biosystems获得)。
阵列显示具有所需的特异性性质和可接受的背景，并且一些阵列商业上可得(例如，BD
Biosciences，Clontech，BioRad和Sigma)。制备抗体阵列的各种方法已有报道(参见，例如
Lopez et al.，2003J.Chromatogr.B787：19-27；Cahill，2000Trends in Biotechnology7：
47-51；美国专利申请公布2002/0055186；美国专利申请公布2003/0003599；PCT公布
WO03/062444；PCT公布WO03/077851；PCT公布WO02/59601；PCT公布WO02/39120；PCT公布
WO01/79849；PCT公布WO99/39210)。这些阵列的抗原结合分子至少可识别细胞或细胞群所
表达蛋白质的亚组，其示例性说明的实例包括生长因子受体、激素受体、神经递质受体、儿
茶酚胺受体、氨基酸衍生物受体、细胞因子受体、胞外基质受体、抗体、凝集素、细胞因子、丝抑蛋白、蛋白酶、激酶、磷酸酶、ras-样GTP酶、水解酶、类固醇激素受体、转录因子、热激转录因子、DNA-结合蛋白、锌指蛋白、亮氨酸拉链蛋白、同源域蛋白、胞内信号转导调节剂和效应物、凋亡相关因子、DNA合成因子、DNA修复因子、DNA重组因子、细胞表面抗原、丙型肝炎病毒(HCV)蛋白酶和HIV蛋白酶。
瘤)，或作为通常在大肠杆菌中表达的重组片段制备抗体阵列的抗原结合分子。可选择地，
可以从产生双抗体的细菌克隆的组合生成的矩阵形式产生含有非共价缔合的VH和VL结构
域的“混合体(combibody)”(例如，可从Domantis获得)。用作蛋白质捕获剂的示例性抗
原结合分子包括单克隆抗体、多克隆抗体、Fv、Fab、Fab′和F(ab′)2免疫球蛋白片段、合
成的稳定Fv片段(如单链Fv片段(scFv)、二硫键稳定的Fv片段(dsFv))、单可变区结构
域(dAb)小抗体(minibody)、混合体和多价抗体(如双抗体和多-scFv)、camelid的单个
结构域或工程改造的人等同物。
TM
工程改造的微通道(例如，The Living Chip ，可从Biotrove获得)和硅表面的微小3D柱
(例如，可从Zyomyx获得)。
TM TM
纳米晶体(例如，Qdots ，可从Quantum Dots获得)和带条形码的珠(UltraPlex ，可从
TM
Smartbeads获得)和多金属微杆(Nanobarcodes 颗粒，可从Surromed获得)。也可将这些
珠在半导体芯片上组装成平面阵列(例如，可从LEAPS technology和BioArray Solutions
获得)。当用颗粒时，各蛋白质捕获剂通常连接于各颗粒以为阵列提供空间确定限定或分
隔。然后分别(但同时)以隔离方式，例如在微滴定板的孔中或不同试管中检测这些颗粒。
列以将样品中未结合或非特异性结合的组分从阵列除去。然后，使用合适的检测系统检测
与阵列上各特征相结合的蛋白质或肽的存在或量。与阵列上一个特征相结合的蛋白质的量
可相对于与该阵列第二特征相结合的第二蛋白质的量来测定。在某些实施方案中，样品中
第二蛋白质的量已知或已知是不变的。
以类似方式递送到与第一阵列相同的第二阵列。然后清洗两个阵列将样品中未结合或非特
异性结合的组分从阵列除去。在最后步骤中，将维持与第一阵列特征相结合的蛋白质的量
和维持与第二阵列的相应特征相结合的蛋白质的量作比较。为测定两种细胞或细胞群之间
蛋白质表达模式的差异，将与第一阵列各特征相结合的蛋白质的量从与第二阵列的相应特
征相结合的蛋白质的量中扣除。
细胞的荧光标记蛋白质探测捕获阵列(例如，抗体阵列)，两种状态中细胞裂解物用不同荧
光团(例如，Cy-3和Cy-5)标记并混合以使可将颜色作为靶丰度改变的读数。通过酪酰胺
信号扩增(TSA)(例如，可从PerkinElmer Lifesciences获得)可将荧光读数灵敏度提高
10-100倍。平面波导技术(例如，可从Zeptosens获得)能进行超灵敏的荧光检测，并具
有另外的无需清洗的优点。使用藻红蛋白作标记物(例如，可从Luminex获得)或利用半
导体纳米晶体(例如，可从Quantum Dot获得)性能的悬浮珠和颗粒也能实现高灵敏度。
已采纳荧光共振能量转移来检测可用于阵列的未标记配体的结合(例如，可从自Affibody
获得)。已开发了几种其它读出装置，包括以下方法的改进装置：表面等离振子共振(例
如，可从HTS Biosystems和Intrinsic Bioprobes获得)、滚动循环DNA扩增(例如，可从
Molecular Staging获得)、质谱(例如，可从Sense Proteomic，Ciphergen，Intrinsic和
Bioprobes获得)、共振光散射(例如，可从Genicon Sciences获得)和原子力显微镜(例
如，可从BioForce Laboratories获得)。NextGen和Perkin Elmer Life Sciences已经
共同开发了用于样品与载玻片上的阵列自动孵育和清洗的微流体系统。
比样品中相应表达产物进行有效比较。技术人员采用标准程序可以确定这样的标准品。具
体实施例中，测定了各表达产物的水平或功能活性的绝对值。
所述系统包括与基站偶联的至少一个终端站。基站通常与一个或多个数据库偶联，所述数
据库包含来自许多个体的代表IRC标记表达产物的水平或功能活性的预先确定的数据以
及收集预先确定的数据时个体实际状态的指示(例如败血症或inSIRS或手术后炎症的存
在、不存在)。在操作中，基站一般通过通信网络从终端站接受受试者数据，并将所述受试者数据与存储在数据库中的预定数据作比较，所述受试者数据代表从取自受试者的生物学样
品中至少一种表达产物的检测或标准化水平或功能活性。将该受试者数据与预定数据作比
较使基站能根据比较结果确定受试者的状态。因此，基站试图鉴定与测试受试者具有相似
参数值的个体并且一旦根据该鉴定确定了状态，那么基站会将诊断指示送至终端站。
迹膜、微量滴定板稀释缓冲液以及类似物。例如，基于核酸的检测试剂盒可包括(i)IRC标
记多核苷酸(其可被用做阳性对照)，(ii)与IRC标记多核苷酸特异性杂交的引物或探针。
TM
还可以包括的是适于扩增核酸的酶，包括各种聚合酶(逆转录酶、Taq、Sequenase DNA连
接酶等，取决于所使用的核酸扩增技术)、脱氧核苷酸以及缓冲液以便为扩增提供必需的反
应混合物。这些试剂盒通常也将包含，以适合的形式，用于每种单独试剂和酶以及用于每种
引物或探针的不同容器。可选择地，基于蛋白质的检测试剂盒可包括(i)IRC标记多肽(其
可用做阳性对照)，(ii)与IRC标记多肽免疫反应的抗原结合分子。试剂盒还可以用于实
现本文所描述的测定中的一个的各种装置和试剂以及使用所属试剂盒定量败血症标记基
因表达的打印说明书为特征。
试者中治疗效力的评估。手术后炎症通常使用静脉内液、抗炎剂、抗生素或免疫治疗来管
理。然而，败血症或inSIRS病况的管理通常是高强度的并且可包括潜在病因的鉴定和缓解
以及治疗化合物例如抗生素、类固醇、抗内毒素抗体、抗肿瘤坏死因子制剂、重组蛋白C的
强力使用。此外，可使用Cohen和Glauser(1991，Lancet338：736-739)中描述的目的为恢
复和保护器官功能的姑息性治疗，例如静脉内液和氧气以及严格的血糖控制。败血症的治
疗综述于Healy(2002，Ann.Pharmacother.36(4)：648-54)and Brindley(2005，CJEM.7(4)：
227)和Jenkins(2006，J Hosp Med.1(5)：285-295)中。
试者中实现有益响应，例如降低或减轻手术后炎症、败血症或inSIRS的症状。有待施用药
学活性化合物的用量可以取决于有待治疗的受治疗者，包括其年龄、性别、体重和一般健康
状况。就此而言，所施用的活性化合物的精确用量取决于从业医师的判断。在确定治疗或
预防手术后炎症、败血症或inSIRS中有待施用的活性化合物的有效量时，医师或兽医可评
估与手术后炎症、败血症或inSIRS的存在相关的症状的严重性，包括炎症、血压异常、心动
过速、呼吸急促、发烧、发冷、呕吐、腹泻、皮疹、头痛、意识错乱、肌肉疼痛、癫痫发作。在任何情况中，本领域技术人员可容易地确定治疗剂的适合剂量与适合的治疗方案而无需过多实
验。
来分析基因表达，显示235个特定基因显示出剪接变化的证据，其同样在败血症阳性患者、
inSIRS阳性患者和手术后患者之间在表达上不同。这235当中仅有限数目(57个)被鉴
定可以用作区别这些患者组的分类器，所述57个基因产生在手术后炎症和inSIRS之间、手
术后炎症和败血症之间、败血症和inSIRS之间差异表达的258个转录物。可以设计核酸阵
列测量样品中相应于至少一种以及理想地至少2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、
17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、3839、40、41、42、
43、44、45、46、47、48、49、50、51、52、53、64、55、56、57种IRC标记转录物的RNA水平，其代表性转录物序列展示于SEQ ID NO：1、3、5、7、9、11、13、15、17、19、21、23、25、27、29、31、33、35、
37、39、41、43、45、47、49、51、53、55、57、59、61、63、65、67、69、71、73、75、77、79、81、83、85、
87、89、91、93、95、97、99、101、103、105、107、109、111、113、115、117、119、121、123、125、127、
129、131、133、135、137、139、141、143、145、147、149、151、153、155、157、159、161、163、165、
167、169、171、173、175、177、179、181、183、185、187、189、191、193、195、197、199、201、203、
205、207、209、211、213、215、217、219、221、223、225、227、229、231、233、235、237、239、241、
243、245、247、249、251、253、255、257、259、261、263、265、267、269、271、273、275、277、279、
281、283、285、287、289、291、293、295、297、299、301、303、305、307、309、311、313、315、317、
319、321、323、325、327、329、331、333、335、337、339、341、343、345、347、349、351、353、355、
357、359、361、363、365、367、369、371、373、375、377、379、381、383、385、387、389、391、393、
395、397、399、401、403、405、407、409、411、413、415、417、419、421、423、425、427、429、431、
433、435、437、439、441、443、445、447、449、451、453、455、457、459、461、463、465、467、469、
471、473、475、477、479、481、483、485、487、489、491、493、495、497、499、501、503、505、507、
509、511、513或515中。可选择地，或者另外，可以设计测量样品中相应于至少一种且理想
地至少2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、
28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、3839、40、41、42、43、44、45、46、47、48、49、50、51、52、53、
64、55、56、57种IRC标记多肽的蛋白水平的阵列，所述IRC标记多肽的示例性氨基酸序列
展示于SEQ ID NO：2、4、6、8、10、12、14、16、18、20、22、24、26、28、30、32、34、36、38、40、42、
44、46、48、50、52、54、56、58、60、62、64、66、68、70、72、74、76、78、80、82、84、86、88、90、92、
94、96、98、100、102、104、106、108、110、112、114、116、118、120、122、124、126、128、130、132、
134、136、138、140、142、144、146、148、150、152、154、156、158、160、162、164、166、168、170、
172、174、176、178、180、182、184、186、188、190、192、194、196、198、200、202、204、206、208、
210、212、214、216、218、220、222、224、226、228、230、232、234、236、238、240、242、244、246、
248、250、252、254、256、258、260、262、264、266、268、270、272、274、276、278、280、282、284、
286、288、290、292、294、296、298、300、302、304、306、308、310、312、314、316、318、320、322、
324、326、328、330、332、334、336、338、340、342、344、346、348、350、352、354、356、358、360、
362、364、366、368、370、372、374、376、378、380、382、384、386、388、390、392、394、396、398、
400、402、404、406、408、410、412、414、416、418、420、422、424、426、428、430、432、434、436、
438、440、442、444、446、448、450、452、454、456、458、460、462、464、466、468、470、472、474、
476、478、480、482、484、486，488，490，492，494，496，498，500，502，504，506，508，510，512，
514或516中。
测定进行基因表达分析。
者收集的数据仅用于测定不良事件的频率。
入研究，在大多数实例中，在入院的24小时之内。参与者是否患有inSIRS或败血症或手术
后炎症的最终测定是随着临床信息逐渐可得而回顾进行的。
与者。研究参与者均超过18岁并且他们或他们的代替决策人签署了临床试验信息单和同
意书并注明日期。基于由首席研究员进行的简单的体检，所有的对照参与者都被认为处于
良好的健康状况，并已知临床试验登记时的医疗史。
患者。
烧、低血压、白细胞增多或白细胞生成以及降低的外周血管阻力的临床征象。这些标准基于
American College of Physicians and the Society of Critical Care Medicine对败血
症的标准定义。也就是说在24小时内inSIRS和败血症参与者需要包括下列中的两种或更
多种的临床病况的可变化的组合＞38℃或＜36℃的温度；心率＞90下/分钟；呼吸频率
＞20次呼吸/分钟或＜4.3kPa的PaCO2(＜32mm HR)以及白血细胞计数＜4,000个细胞
3 9 3 9
/mm(＜4x10 个细胞/L)或＞12,000个细胞/mm(＞12x10 个细胞/L)或＞10％的未成
熟中性白细胞(带型)的证据。如果参与者患有任何慢性系统性免疫炎性病症包括SLE、
克隆病、IDDM；是移植患者或目前接受对癌症的化疗治疗，那么将参与者排除。大多数患者
患有其他潜在的并存病。允许所计划的大型开放手术的患者在手术程序之前着手处理并同
意，并且他们的研究血液样品在手术之后在他们进入ICU期间内抽取。所有的研究参与者
均为18岁或更年长并且具有低于40的体重指数。
RNA的血液收集试管包括PAXgene 试管(PreAnalytix Inc.，Valencia，CA，USA)。可选择
地，可将血液采集入含有设计用于保藏核酸的溶液(可从Roche，Ambion，Invitrogen和ABI
获得)的试管中。为测定蛋白质水平，将50ml血液收集入含有4ml的4％柠檬酸钠的试管
中防止凝结。分离白细胞和血浆，冷冻保藏用于随后特定蛋白质的分析与检测。提取RNA
之前将PAXgene试管维持于室温。以标准格式记录临床体征。
试管的核酸成团的离心步骤开始。将团块清洗并重悬并且用优化的缓冲液与蛋白酶K一起
孵育以进行蛋白消化。进行另一次离心以除去残留的细胞碎片并将上清液转移至新的微离
心管中。加入乙醇调节结合条件，将裂解物加到PAXgene RNA旋转柱上。在简单离心期间，
RNA选择性地与硅胶膜结合，而污染物流出。经三次有效清洗步骤除去残留的污染物，然后
用缓冲液BR5洗脱RNA。
RNA探针常用于测定样品中总RNA的起始水平。分别运行各基因与内部对照。该技术和
方法详见www.appliedbiosytems.com或www.qiagen.com or www.biorad..com。Applied
Biosystems提供以下服务：即客户提供DNA序列信息并负费，作为回馈该公司提供对各基
因进行RT-PCR所需的全部试剂。
完成。
是所选的方法。
寡核苷酸阵列的杂交性能)。MAS5软件使用B2寡核苷酸边界来比对图像上的栅格从而可
集中和鉴定各方块的寡核苷酸。
合的质量，那么用Affymetrix MAS5软件将其转化为强度数据文件(.CEL文件))。
的标准偏差的局部噪声值的噪声校正组分。
列描述文件(\HuEx-10-st-v2.r2.pgf′和\HuEx-10-st-v2.r2.clf′)，背景的反基因
链探针(\HuEx-10-st-v2.r2.antigenomic.bgp′′)和标准QC探针(\HuEx-10-st-v2.
r2.qcc′′)。此外，在所有的分析物中，使用了鲁棒多芯片平均(RMA)法。
中，焦点在于外显子和基因的核心集合，因为它们是了解并且注释得最好的子集。对于R统
计学软件包(www.r-project.org)来说可获得被称为exonmap的外显子分析包。其由X：
Map genome browser project(http：//xmap.picr.man.ac.uk)提供。exonmap提供了可选
择的芯片描述\exon.pmcdf′，其可用于产生外显子核心集合的表达的外显子水平RMA标
准化测量。与APT应用程序的结果相比，发现差异是很小的。由于APT应用程序同样提供
基因水平的测量，因此这些版本被广泛使用。
来进行。此外，计算机计算3个在一起的对比的整体F统计。之后可以不同方式为多个测
试调整等效p-值。在这一实例中，Holm的调整方法和Benjamini&Hochberg的错误发现率
(FDR)
值。这产生了在探针水平具有共同定位和规模的一组芯片。
势(de-trend)。即，各基因值根据芯片强度中值回归并计算残差。取这些残差作为各基因
表达去趋势的估计值。
用Quantile Quantile normalization(Rizarray et a1，2002，Biostatistics(印刷中))
处理芯片。
始，然后是离心步骤。将团块清洗并重悬并且用优化的缓冲液与蛋白酶K一起孵育以进行
蛋白消化。乙醇沉淀DNA并进行另一次离心使核酸成团。在清洗步骤中除去残留污染物并
且之后将DNA重悬于缓冲液BG4中。
性基因分型方法。
择地，可使用程序诸如ClustalW(http：//www.ebi.ac.uk/clustalw/)比对各等位基因的
DNA序列并针对存在DNA序列差异但保持留足够特异性的区域设计特异性引物以确保扩增
正确扩增子。优选将PCR扩增子设计为在一个等位基因中具有限制性酶切位点，而在其它
等位基因中没有。引物通常长18-25个碱基对，具有相似的解链温度。
和DNA延伸的温度步骤进行循环(最多50次)。.
沉淀和用水重悬，然后用合适的限制性酶进行限制性切割来纯化PCR反应中的DNA。然后将
限制性切割的DNA在琼脂糖凝胶上运行，其中使用电流以打大小对DNA进行。基因的各种
等位基因将取决于是否含有限制性位点而具有不同大小。
非特异性引发。引物条件与SYBR Green测定的相同；
的功能无关)；
探针；
盒具有这样的引物)；
在这些末端附近含有dA核苷酸的引物，则应考虑使用具有3’末端dU-核苷酸的引物。
品；
的引物，但有时这不可能；
混合物之前将探针加入缓冲液组分并使其在室温下平衡也很重要。
50μL反应体积中其用量为1μL，得到推荐的100nM终浓度。
成等份冷冻。当将1mM储备液1/100稀释时，得到的工作溶液是10μM。为了再50μL反应
体积中得到推荐的50-900nM的最终引物浓度，每次反应应用0.25-4.50μL(500nM终浓度
用2.5μL)。
法中，逆转录和实时PCR发生在同一试管中。下游PCR引物的作用也是逆转录酶的引物(随
机六聚体或寡聚-dT不能用于一步RT-PCR中的逆转录)。一步反应需要较高的dNTP浓度
(大于或等于300mM与200mM)，因为该反应合并了各自需要dNTP的两种反应。Gold RT-PCR
试剂盒的一步PCR所用的典型反应混合物如下：
2皮克的RNA且RNA的最大用量可以是1微克。为进行常规分析，可用10pg-100ng的RNA
和100pg-1μg基因组DNA。
结合的较好选择。
中可见，并且扩增图的X-轴显示0-1轮，则在运行一次后必须手动设定该参数。
TM
Baselines and Thresholds。(有趣的是，此问题的最佳讨论在TaqMan Human Endogenous
Control Plate的使用手册中)。
和高浓度探针时，更可能发生CDC照相机饱和。
平)给出。
两者的动态范围相似。控制动态范围的灵敏方法是观察ΔCT(同一起始模板用量的两次
PCR的两个CT值之间的差异)如何随模板的稀释度而变化。如果这两种扩增子的效率大致
相等，将输入量的对数与ΔCT作图得到接近水平的线(斜率＜0.10)。这表示在起始模板
用量范围内效率相同进行了两次PCR。如果该图显示效率不相等，应采用标准曲线方法来定
量测定基因表达。应测定一下二者的动态范围(1)靶标的最低和最高浓度，其结果是精确
的；和(2)两种基因含量的最低和最高比例，其结果是精确的。在常规竞争性RT-PCR中，该
动态范围限制在靶标-竞争物比例约为10∶1-1∶10(1∶1的比例可获得最佳精确性)。
实时PCR能实现更广泛的动态范围。
消除了制作标准曲线样品可能产生的任何稀释误差的不良影响。
品的CT值之间的差异(ΔCT)开始定量计算：
比较性ΔΔC计算包括获得各样品ΔCT与基线ΔCT之间的差异。如果基线值表示最低表
达水平，则预期ΔΔCT值是负的(因为基线样品因具有最大CT值而ΔCT最大)。如果一些
样品中表达增加，而另一些中减少，ΔΔCT值将是正的和负的数值的混合值。定量测定的最
后一步是将这些数值转化为绝对值。此计算公式是：
水平的2 ＝1/8。通过简单地输入CT值用微软Excel进行这些计算(ABI在http：//
www.appliedbiosystems.corn/support/tutorials/7700amp/有关于使用spread sheet
TM
program来产生扩增图的在线指南；TaqMan Human Endogenous Control Plate方法也包
括有关用MS Excel进行实时PCR数据分析的详细说明)。
面理解实时PCR和定量是最有用的。
是500μM-1mM(一步RT-PCR)，但典型的TaqMan反应(只是PCR)，使用200μM的各
dNTP(400μM的dUTP)。
个引物进行优化。这意味着设置了不同的三组(三种温度)，每组有使用固定量的靶模
板的九种反应(50/50mM、50/300mM、50/900、300/50、300/300、300/900、900/50、900/300、
900/900mM)。如果需要，可(进行)第二轮优化来改善结果。可通过选择可提供最低CT和
最高ΔRn的引物浓度来实现最佳性能。类似地，应将探针浓度优化为25-225nM。
反应由50℃2分钟UNG(参见下文)孵育；95℃10分钟聚合酶活化；和95℃15秒(变性)40
轮与60℃1分钟(退火与延伸)组成。如果起始材料是总RNA，在TaqMan反应之前应进行
典型的逆转录循环(用于cDNA合成)，该循环由25℃10分钟(引物孵育)，48℃30分钟
(使用常规逆转录酶进行逆转录)和95℃5分钟(灭活逆转录酶)组成。
因。UNG在55℃以上不起作用并且不切割含末端dU核苷酸的单链DNA。除非逆转录和PCR
使用rTth DNA聚合酶，否则含UNG的主混合物不应与一步RT-PCR联用(TaqMan EZ RT-PCR
试剂盒)。
NTC)。NAC加样板含有样品且不含酶。需要排除样品中或热循环仪的加热块(heating
block)中荧光污染物的存在(这些污染物可导致假阳性)。如果PCR后NAC的绝对荧光大
于NTC的，样品中或热循环仪的加热块中可能存在荧光污染物。
行(一式三份)反应来完成这一检测。相同的总RNA浓度范围的靶标和标准品两者的实时
RT-PCR得到的起始含量的对数与CT值所得到的作图(标准曲线)应该是(接近)直线。
料信号。这一标准化用于孔与孔之间(浓度或体积差异)或随时间变化发生的非PCR相关
荧光波动并且与对cDNA用量或PCR效率进行的标准化不同。将报导染料的发射光强度除
以消极参照物的发射光强度实现标准化。得到定义为Rn的比值。
GAPDH测定的引物是设计不会扩增基因组DNA的。
错框。如果发生此情况，选择“Auto Download”选项。
样品模型将是总体的基因平均值，加上探针组影响加上受试者影响加上误差。其中i为探
针组索引而j为受试者索引。
Map注释中，探针组与多个外显子匹配。这与基因中交替外显子布局有关，因此进行对于
δic(j)的测试，其为经典反应的探针组。为了简单性，忽略了受试者影响(这一变化成为
噪音的一部分)。
中相对上调而OXT1的转录物预期相对于手术后在败血症中相对下调)。
好的分类器。
内毒素血症。事实上，已经证明具有预存的高血浆浓度的抗内毒素抗体的患者与具有低抗
内毒素血浆抗体的那些患者相比具有较好的存活率，证明在这些患者中内毒素和对内毒素
的免疫响应在存活上起到关键作用。这一手术后免疫响应临床上常常表现为发烧。因此处
理患有发烧的手术后患者的护士和重症监护医生必须确定发烧的原因是否和细菌感染有
关。因此能够区分手术后炎症、SIRS和败血症的本发明的IRC生物标记可用于确定这些患
者中适当的作用过程，其可包括抗生素、退热剂、免疫调节剂和/或抗炎剂的使用。监测具
有这些生物标记的患者将允许对何时撤销这样的处理作出明智决定。
者往往用类固醇(或其他抗炎剂)处理以降低炎症的水平，这使其之后易感细菌感染。脑
部受损的患者还常常发烧。因此在这些患者中产生了抗炎剂、免疫调节剂和抗生素的使用
之间的治疗平衡作用。因此能将无菌炎症和由细菌感染导致的炎症区分的本发明的IRC生
物标记可以是能够帮助执业医师确定适合的治疗以便在这些患者中获得最好的结果的有
用的监测工具。
重症监护患者常常因医院获得性感染发展败血症。然而，重症监护的根本目的在于确保患
者存活并且被尽快转移至普通病房。上文的因素妨碍了这一目的。用本发明的IRC生物标
记例行监测重症监护患者将允许执业医师确定炎症的水平，确定患者是否患有医院获得性
感染并且确定对治疗的响应。这些生物标记提供的信息将因此允许执业医师制定并调整治
疗以确保患者存活并且在重症监护室中花费更少的时间。重症监护中的时间较少可带来医
疗花费上可观的节约。此外，明智地使用抗生素带来较少的使用和医疗花费上更多的节约。
适当并且明智的使用抗生素还导致较少的抗生素耐受。
和确定这些患者中适当的治疗。
应施用什么治疗(如有有的话)是重要的。
炎症中的任一种的患者中的预后。已经证实患有inSIRS的患者具有比不患有SIRS的那些
高6.9倍的28天死亡率(Comstedt et al.，2007，Scand.J Trauma Resusc.Emerg.Med.27：
17-67.2009；Esteban et a1.，2007，Crit.Care Med.35(5)：1284-1289)。而且，就死亡风险而言，从inSIRS到败血症、严重的败血症和败血症休克有分级的严重度，分别具有大约
10％、20％、20-40％和40-60％的相关的28天死亡率(Brun-Buisson，C.，2000，Intensive Care Medicine26，Suppl1：S64-74)。这些信息使得可以对治疗的选择和如何渐进治疗作出
明智的决定。
例性具体实施方案作出各种改进与改变而不脱离本发明的范围。所有这种改进与改变预期
包括在随附的权利要求书的范围内。
| 标题 | 发布/更新时间 | 阅读量 |
|---|---|---|
| 杂芳族化合物及其作为多巴胺D1配体的用途 | 2020-05-20 | 505 |
| 精神病阴性四步疗法系列药物 | 2020-05-14 | 238 |
| 稠合噻吩化合物及其医药用途 | 2020-05-16 | 449 |
| 生物标志物鉴定 | 2020-05-19 | 646 |
| 精神病阴性四步疗法系列药物 | 2020-05-13 | 603 |
| 具有谷氨酸NMDA活性的新型精神病治疗剂 | 2020-05-19 | 621 |
| 一种低剂量抗精神病药物组合物 | 2020-05-18 | 605 |
| 精神病阴性四步疗法系列药物 | 2020-05-14 | 486 |
| 一种治疗精神分裂症的药物组合物及其应用 | 2020-05-15 | 682 |
| 一种非典型抗精神病药物组合物 | 2020-05-17 | 226 |
高效检索全球专利专利汇是专利免费检索,专利查询,专利分析-国家发明专利查询检索分析平台，是提供专利分析，专利查询，专利检索等数据服务功能的知识产权数据服务商。
我们的产品包含105个国家的1.26亿组数据，免费查、免费专利分析。
专利汇分析报告产品可以对行业情报数据进行梳理分析，涉及维度包括行业专利基本状况分析、地域分析、技术分析、发明人分析、申请人分析、专利权人分析、失效分析、核心专利分析、法律分析、研发重点分析、企业专利处境分析、技术处境分析、专利寿命分析、企业定位分析、引证分析等超过60个分析角度，系统通过AI智能系统对图表进行解读，只需1分钟，一键生成行业专利分析报告。
