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用于对样品进行实时聚糖测定的系统和方法

阅读:902发布:2020-05-11

专利汇可以提供用于对样品进行实时聚糖测定的系统和方法专利检索,专利查询,专利分析的服务。并且提供了系统和方法,所述系统和方法有利于自动(或基本上自动)制备含有用于聚糖分析的多肽的产物的样品,以及自动(或基本上自动)进行该样品的聚糖测定。因此,制备和分析可以基本实时地进行,或者换言之,比常规系统和方法目前所允许的快得多地进行。,下面是用于对样品进行实时聚糖测定的系统和方法专利的具体信息内容。

1.一种实时制备用于聚糖分析的样品的方法,所述方法包括以下步骤:
(a)将包含多肽的样品经由保持盘管移动至多肽结合柱;
(b)将所述样品中的多肽结合至所述多肽结合柱;
(c)将聚糖酶经由所述保持盘管移动至所述多肽结合柱,以从结合的多肽释放聚糖;
(d)将载体溶液经由所述保持盘管移动至所述多肽结合柱并通过所述多肽结合柱,从而将所释放的聚糖移出第一多肽柱;
(e)将所释放的聚糖与所述多肽结合柱下游的聚糖标记试剂混合;
(f)将所释放的聚糖和所述聚糖标记试剂的混合物移动至布置在所述多肽结合柱下游的反应盘管;
(g)将所释放的聚糖和所述聚糖标记试剂的混合物在所述反应盘管中孵育,从而标记所述聚糖;
(h)将所述混合物移动至布置在所述反应盘管下游的冷却盘管;
(i)经由所述冷却盘管降低所述混合物的温度
(j)将冷却的混合物移动至布置在所述冷却盘管下游的聚糖结合柱;
(k)将标记的聚糖结合至所述聚糖结合柱;以及
(l)将洗脱缓冲液移动至所述聚糖结合柱并通过所述聚糖结合柱,以洗脱与所述聚糖结合柱结合的标记的聚糖。
2.如权利要求1所述的方法,其中自动执行(a)、(c)、(d)、(e)、(f)、(h)、(j)、和(l)中的一个或多个。
3.如权利要求1或2所述的方法,其中(a)至(l)在封闭系统中执行。
4.如前述权利要求中任一项所述的方法,所述方法进一步包括在(e)之后和(f)之前,将所述混合物移动至布置在所述冷却盘管下游并且在所述聚糖结合柱上游的真空装置,并使用所述真空装置从所释放的聚糖和所述聚糖标记试剂的混合物中基本上除去气泡。
5.如前述权利要求中任一项所述的方法,所述方法进一步包括在(l)之后,将洗脱的聚糖移动通过布置在所述聚糖结合柱下游的混合室,并调节标记的聚糖的洗脱缓冲液组分以匹配起始色谱流动相条件。
6.如前述权利要求中任一项所述的方法,其中(a)包括将所述样品从含有所述样品的容器移动至所述多肽结合柱。
7.如权利要求6所述的方法,其中所述容器包括生物反应器。
8.如前述权利要求中任一项所述的方法,其中(g)包括用所述聚糖标记试剂对所述聚糖进行荧光标记。
9.如前述权利要求中任一项所述的方法,其中(g)包括对所述反应盘管中的所述混合物施加热。
10.如前述权利要求中任一项所述的方法,所述方法进一步包括(m)将洗脱的聚糖从所述聚糖结合柱移动至聚糖分析装置。
11.如权利要求10所述的方法,所述方法进一步包括(n)使用所述聚糖分析装置分离和定量所述聚糖。
12.如前述权利要求中任一项所述的方法,所述方法进一步包括将流体地联接至所述多肽结合柱并位于其下游的移动至第一位置,在所述第一位置中所述阀将流过所述多肽结合柱的样品的其余部分引导至废物室。
13.如权利要求12所述的方法,所述方法进一步包括在(e)之前,将所述阀移动至第二位置,在所述第二位置中,第一阀将所释放的聚糖从所述多肽结合柱引导出来并引导向所述聚糖标记试剂。
14.一种在封闭系统中实时制备用于聚糖分析的样品的方法,所述封闭系统包括多通路阀、在所述多通路阀上游的保持盘管、流体地联接至所述多通路阀的第一通路并位于其下游的多肽结合柱、布置在所述多肽结合柱下游的反应盘管、布置在所述反应盘管下游的冷却盘管、以及布置在所述冷却盘管下游并流体地联接至所述多通路阀的第二通路并位于其下游的聚糖结合柱,所述方法包括:
(a)经由与所述封闭系统通信地联接的控制器,将含有多肽的样品从含有所述多肽的容器移动至所述保持盘管;
(b)经由所述控制器将所述多通路阀定位在第一位置,在所述第一位置中,所述保持盘管经由所述多通路阀的所述第一通路流体地联接至所述多肽结合柱,使得所述样品流动至所述多肽结合柱,从而所述样品中基本上所有的多肽都结合至第一多肽柱;
(c)当所述多通路阀处于所述第一位置时,经由所述控制器将聚糖酶经由所述保持盘管移动至所述多肽结合柱,以从所述结合的多肽中释放聚糖,然后经由所述控制器将载体溶液经由所述保持盘管移动到所述多肽结合柱并通过所述多肽结合柱,从而将所释放的聚糖移出所述多肽结合柱;
(d)经由所述控制器将所释放的聚糖移向所述反应盘管;
(e)在到达所述反应盘管之前,经由所述控制器将聚糖标记试剂移向所释放的聚糖,使得所述聚糖标记试剂与所释放的聚糖和所述酶混合;
(f)经由所述控制器将所述混合物移动至所述反应盘管,从而标记所述混合物中的聚糖;
(g)经由所述控制器将所述混合物移动至布置在所述反应盘管下游的冷却盘管,从而降低所述混合物的温度;
(h)经由所述控制器将所述冷却的混合物移动至布置在所述冷却盘管下游的聚糖柱,从而基本上将所有标记的聚糖结合至所述聚糖结合柱;
(i)经由所述控制器将所述多通路阀定位在第二位置,在所述第二位置中,所述聚糖结合柱经由所述多通路阀的第二通路流体地联接至洗脱缓冲溶液源;
(j)当所述多通路阀处于所述第二位置时,经由所述控制器将所述洗脱缓冲液从所述洗脱缓冲液源移动至所述聚糖结合柱,并通过所述聚糖结合柱,从而洗脱结合至所述聚糖结合柱的聚糖;以及
(k)经由所述控制器将所述洗脱的聚糖移动至聚糖分析装置。
15.如权利要求14所述的方法,所述方法进一步包括在(e)之后和(f)之前,经由所述控制器将所述混合物移动至布置在所述多肽结合柱下游并且在所述反应盘管上游的真空装置,从而从所述混合物中基本上除去气泡。
16.如权利要求14或15所述的方法,所述方法进一步包括在(j)之后和(k)之前,经由所述控制器将洗脱的聚糖移动通过布置在所述聚糖结合柱下游并且在所述聚糖分析装置上游的混合室。
17.如权利要求14至16中任一项所述的方法,所述方法进一步包括经由所述处理器控制所述多肽结合柱以将所述多肽结合柱维持在约38摄氏度的温度下。
18.如权利要求14至17中任一项所述的方法,所述方法进一步包括经由所述处理器控制所述反应盘管,以将所述反应盘管维持在约80摄氏度的温度下。
19.如权利要求14至18中任一项所述的方法,其中(f)包括经由所述控制器将所述混合物移动至所述反应盘管,从而荧光地标记所述混合物中的聚糖。
20.一种用于实时制备用于聚糖分析的样品的封闭系统,所述封闭系统包括:
适于包含多肽的容器;
保持盘管,所述保持盘管流体地联接至所述生物反应器并被布置成从所述生物反应器接收所述多肽的样品;
多通路阀,所述多通路阀流体地联接至所述保持盘管并位于其下游;
多肽结合柱,所述多肽结合柱流体地联接至所述多通路阀,并被布置成经由所述多通路阀的第一通路从所述保持盘管接收所述样品;
葡聚糖酶源,所述葡聚糖酶源流体地联接至所述多通路阀,并被布置成将葡聚糖酶提供至所述多肽结合柱,使得所述葡聚糖酶浸注结合至所述多肽结合柱的多肽;
载体溶液源,所述载体溶液源流体地联接至所述多通路阀,并被布置成将载体溶液提供至所述多肽结合柱,其中所述载体溶液适于从所述多肽结合柱释放所述聚糖并携带所述聚糖;
第一,所述第一泵布置在所述多肽结合柱的下游,以将聚糖标记试剂引导向来自所述多肽结合柱的携带的释放的聚糖,使得所述聚糖标记试剂与所述聚糖混合;
反应盘管,所述反应盘管布置在所述多肽结合柱和所述第一泵的下游,所述反应盘管适于接收包含所述聚糖标记试剂和所释放的聚糖的混合物并允许标记所释放的聚糖;
冷却盘管,所述冷却盘管布置在所述反应盘管的下游,并适于从所述反应盘管接收所述混合物,所述冷却盘管被配置为降低所述混合物的温度;
聚糖结合柱,所述聚糖结合柱经由所述多通路阀的第二通路流体地联接至所述冷却盘管和所述多通路阀,所述聚糖结合柱被配置为结合基本上所有标记的聚糖,所述聚糖结合柱适于经由所述多通路阀的第二通路接收洗脱缓冲溶液,其中所述洗脱缓冲溶液洗脱结合的标记的聚糖,并将洗脱的标记的聚糖携带到所述聚糖结合柱下游的聚糖分析装置。
21.如权利要求20所述的系统,其中所述容器包括生物反应器。
22.如权利要求20或21所述的系统,所述系统进一步包括真空装置,所述真空装置布置在所述反应盘管的上游并且在所述多肽结合柱和所述第一泵的下游,所述真空装置被配置为从包含所述聚糖标记试剂和所释放的聚糖的混合物中基本上除去气泡。
23.如权利要求20至22中任一项所述的系统,所述系统进一步包括混合室,所述混合室布置在所述多肽结合柱的下游并且在所述反应盘管的上游,其中所述混合室有助于调节标记的聚糖的洗脱缓冲液组分以匹配起始色谱流动相条件。
24.如权利要求20至23中任一项所述的系统,其中所述多通路阀包含12个卫星通路和中心共享通路阀。
25.如权利要求20至24中任一项所述的系统,其中所述多肽结合柱选自下组,该组由以下组成:蛋白A柱、蛋白G柱、蛋白A/G柱、蛋白L柱、基酸柱、亲和素柱、链霉亲和素柱、化合物结合柱、碳水化合物柱、谷胱甘肽柱、肝素柱、疏水相互作用柱、免疫亲和柱、核苷酸/辅酶柱、专柱和固定化金属亲和色谱(IMAC)柱。
26.如权利要求20至25中任一项所述的系统,其中所述葡聚糖酶选自下组,该组由以下组成:内切糖苷酶、糖酰胺酶和O-聚糖酶及其组合。
27.如权利要求26所述的系统,其中所述内切糖苷酶选自下组,该组由以下组成:内切糖苷酶D、内切糖苷酶F(内切糖苷酶F1、内切糖苷酶F2和内切糖苷酶F3及其组合)、内切糖苷酶H、内切糖苷酶S、内切糖苷酶M和内切糖苷酶B。
28.如权利要求26所述的系统,其中所述糖酰胺酶选自下组,该组由以下组成:糖肽酶、肽N-糖苷酶、PNG酶、N-糖水解酶和N-聚糖酶。
29.如权利要求28所述的系统,其中所述PNG酶是肽:N-糖苷酶F(PNGF)。
30.如权利要求26所述的系统,其中所述O-聚糖酶是内切GalNAc酶D或内切GalNAc酶A。
31.如权利要求20至30中任一项所述的系统,其中所述聚糖标记试剂是荧光团或生色团。
32.如权利要求31所述的系统,其中所述荧光团选自下组,该组由以下组成:2-氨基苯甲酸、8-氨基-1,3,6-三磺酸二钠盐、8-氨基萘-1,3,6-三磺酸三钠盐和邻氨基苯甲酰胺、
4-甲基苄脒。
33.如权利要求31所述的系统,其中所述生色团包含3-甲基-1-苯基-2-吡唑啉-5-或苯肼。
34.如权利要求20至33中任一项所述的系统,其中所述聚糖结合柱是多孔石墨碳柱。
35.如权利要求20至34中任一项所述的系统,所述系统进一步包括第二泵,所述第二泵布置在所述多通路阀的上游,以将所述多肽的样品从所述容器泵送至所述保持盘管。
36.如权利要求20至35中任一项所述的系统,所述系统进一步包括控制器,所述控制器通信地联接至所述多通路阀,所述控制器被配置为选择性地打开和关闭所述多通路阀的第一和第二通路。
37.如权利要求20至36中任一项所述的系统,所述系统进一步包括加热元件,所述加热元件紧邻所述反应盘管定位,所述加热元件被配置为将所述反应盘管维持在约80摄氏度的温度。
38.一种用于实时制备用于聚糖分析的样品的封闭系统,所述封闭系统包括:
多通路阀;
保持盘管,所述保持盘管在所述多通路阀上游;
多肽结合柱,所述多肽结合柱流体地联接至所述多通路阀的第一通路并在其下游;
反应盘管,所述反应盘管布置在所述多肽结合柱下游;
冷却盘管,所述冷却盘管布置在所述反应盘管下游;
聚糖结合柱,所述聚糖结合柱流体地联接至所述冷却盘管并位于其下游,所述聚糖结合柱经由所述多通路阀的第二通路流体地联接至所述多通路阀;以及
控制器,所述控制器通信地联接至所述多通路阀并且包括存储器、处理器以及逻辑,所述逻辑存储在所述存储器上并且可由所述处理器执行以:
(a)将含有多肽的产物的样品移动至所述保持盘管;
(b)将所述多通路阀定位在第一位置,在所述第一位置中,所述保持盘管经由所述多通路阀的所述第一通路流体地联接至所述多肽结合柱,使得所述样品流动至第一柱,从而所述样品中基本上所有的多肽都结合至所述多肽结合柱;
(c)当所述多通路阀处于所述第一位置时,将葡聚糖酶经由所述保持盘管移动至所述多肽结合柱,以从所述结合的多肽中释放聚糖,然后将载体溶液经由所述保持盘管移动至所述多肽结合柱并通过所述多肽结合柱,从而将基本上所有的所释放的聚糖移出所述多肽结合柱;
(d)将所释放的聚糖移向所述反应盘管;
(e)在到达所述反应盘管之前将聚糖标记试剂移向所释放的聚糖,使得所述聚糖标记试剂与所释放的聚糖混合;
(f)将所释放的聚糖和所述聚糖标记试剂的混合物移动至所述反应盘管,从而标记所述混合物中的聚糖;
(g)将所述混合物移动至布置在所述反应盘管下游的冷却盘管,其中所述冷却盘管降低所述混合物的温度;
(h)将所述混合物移动至所述聚糖结合柱,从而使所述标记的聚糖结合至所述聚糖结合柱;
(i)将所述多通路阀定位在第二位置,在所述第二位置中,所述聚糖结合柱经由所述多通路阀的第二通路流体地联接至洗脱缓冲溶液源;以及
(j)当所述多通路阀处于所述第二位置时,将洗脱缓冲溶液从所述洗脱缓冲溶液源移动至所述聚糖结合柱并通过所述聚糖结合柱,从而洗脱结合至所述聚糖结合柱的聚糖。
39.如权利要求38所述的系统,所述系统进一步包括真空装置,所述真空装置布置在所述反应盘管的上游并且在所述多肽结合柱和所述第一泵的下游,所述真空装置被配置为从包含所述聚糖标记试剂和所释放的聚糖的混合物中基本上除去气泡。
40.如权利要求38或39所述的系统,所述系统进一步包括混合室,所述混合室布置在所述多肽结合柱的下游并且在所述反应盘管的上游,其中所述混合室有助于调节所述标记的聚糖的洗脱缓冲液组分以匹配起始色谱流动相条件。
41.如权利要求38至40中任一项所述的系统,其中所述逻辑可由所述处理器执行以将所述样品从含有所述样品的容器移动至所述保持盘管。
42.如权利要求38至41中任一项所述的系统,其中所述容器包括生物反应器。
43.如权利要求38至42中任一项所述的系统,其中所述逻辑可由所述处理器执行以将所述洗脱的聚糖从所述聚糖结合柱移动至聚糖分析装置。
44.如权利要求38至43中任一项所述的系统,其中所述多肽结合柱选自下组,该组由以下组成:蛋白A柱、蛋白G柱、蛋白A/G柱、蛋白L柱、氨基酸柱、亲和素柱、链霉亲和素柱、碳水化合物结合柱、碳水化合物柱、谷胱甘肽柱、肝素柱、疏水相互作用柱、免疫亲和柱、核苷酸/辅酶柱、专门柱和固定化金属亲和色谱(IMAC)柱。
45.如权利要求38至44中任一项所述的系统,其中所述葡聚糖酶选自下组,该组由以下组成:内切糖苷酶、糖酰胺酶和O-聚糖酶及其组合。
46.如权利要求45所述的系统,其中所述内切糖苷酶选自下组,该组由以下组成:内切糖苷酶D、内切糖苷酶F(内切糖苷酶F1、内切糖苷酶F2和内切糖苷酶F3及其组合)、内切糖苷酶H、内切糖苷酶S、内切糖苷酶M和内切糖苷酶B。
47.如权利要求45所述的系统,其中所述糖酰胺酶选自下组,该组由以下组成:糖肽酶、肽N-糖苷酶、PNG酶、N-糖水解酶和N-聚糖酶。
48.如权利要求47所述的系统,其中所述PNG酶是肽:N-糖苷酶F(PNGF)。
49.如权利要求45所述的系统,其中所述O-聚糖酶是内切GalNAc酶D或内切GalNAc酶A。
50.如权利要求37至48中任一项所述的系统,其中所述聚糖结合柱是多孔石墨碳柱。
51.如权利要求37至49中任一项所述的系统,其中所述聚糖标记试剂是荧光团或生色团。
52.如权利要求51所述的系统,其中所述荧光团选自下组,该组由以下组成:2-氨基吖啶酮、8-氨基萘-1,3,6-三磺酸二钠盐、8-氨基萘-1,3,6-三磺酸三钠盐和邻氨基苯甲酰胺、
4-甲氧基苄脒。
53.如权利要求51所述的系统,其中所述生色团包含3-甲基-1-苯基-2-吡唑啉-5-酮或苯肼。
54.如权利要求38至53中任一项所述的系统,其中所述控制器被配置为将所述多肽结合柱维持在约38摄氏度的温度。
55.如权利要求54所述的系统,其中所述控制器被配置为将所述反应盘管维持在约80摄氏度的温度。
56.如权利要求1至19所述的方法或如权利要求20至55所述的系统,其中所述产物的所述多肽是治疗性多肽。
57.如权利要求56所述的方法或系统,其中所述治疗性多肽选自由以下组成的组:抗体或其抗原结合片段、抗体或抗体片段的衍生物、和融合多肽。
58.如权利要求57所述的方法或系统,其中所述抗体选自由以下组成的组:英夫利昔单抗、贝伐单抗、兰尼单抗、西妥昔单抗、兰尼单抗、帕利珠单抗、阿巴伏单抗、阿昔单抗、阿克托克单抗、阿达木单抗、阿非莫单抗、阿托珠单抗、阿珠单抗、培化阿珠单抗、ald518、阿仑单抗、阿利库单抗、阿仑单抗、阿妥莫单抗、阿麦妥昔单抗、安那莫单抗、安芦珠单抗、阿泊珠单抗、阿西莫单抗、阿塞珠单抗、阿替奴单抗、阿替珠单抗、阿托立木单抗、托珠单抗、巴匹珠单抗、巴利昔单抗、巴维昔单抗、贝妥莫单抗、贝利木单抗、苯拉利珠单抗、柏替木单抗、贝索单抗、贝伐珠单抗、贝洛托单抗、比西单抗、比伐珠单抗、莫-比伐珠单抗、博纳吐单抗、布索珠单抗、本妥昔单抗、巴列津单抗、布洛鲁单抗、康纳单抗、莫坎妥珠单抗、莫坎妥珠单抗、卡普赛珠单抗、卡罗单抗喷地肽、卡鲁单抗、卡妥索单抗、cc49、西利珠单抗、赛妥珠单抗、西妥昔单抗、泊西他珠单抗、西妥木单抗、克拉扎珠单抗、克立昔单抗、克伐珠单抗、可那木单抗、克雷内治单抗、cr6261、达西珠单抗、达克珠单抗、达罗土珠单抗、达雷木单抗、地莫米佐单抗、地诺单抗、地莫单抗、阿托度单抗、德罗图单抗、杜戈图单抗、杜匹鲁单抗、依美昔单抗、依库丽单抗、埃巴单抗、依决洛单抗、依法利珠单抗、依芬古单抗、埃罗妥珠单抗、西莫单抗、埃文单抗、培化恩莫单抗、恩诺珠单抗、恩诺珠单抗、依诺替库单抗、依诺替库单抗、埃斯托西单抗、西依匹莫单抗、依帕珠单抗、厄利珠单抗、厄马索单抗、埃达珠单抗、依卓利珠单抗、艾韦单抗、艾韦单抗、法索单抗、法拉莫单抗、法拉图珠单抗、法希奴单抗、fbta05、非维珠单抗、非扎奴单抗、费希腊妥单抗、芬妥木单抗、弗兰托单抗、芳妥珠单抗、弗罗鲁单抗、福拉韦单抗、夫苏木单抗、弗兰单抗、弗图希单抗、加利昔单抗、盖尼柱单抗、盖坦德单抗、加维莫单抗、吉妥珠单抗奥佐米星、吉伏珠单抗、吉仁土昔单抗、维德汀单抗、戈利木单抗、戈利昔单抗、gs6624、替伊立珠单抗、替伊莫单抗、依库单抗、伊戈伏单抗、英西单抗、英戈土珠单抗、英克拉库单抗、依坦希单抗、英夫利西单抗、英妥木单抗、伊诺莫单抗、伊珠单抗奥佐米星、伊匹木单抗、艾雷妥木单抗、依拓珠单抗、希凯珠单抗、凯利昔单抗、拉贝珠单抗、来金珠单抗、来马索单抗、乐地单抗、来沙木单抗、利韦单抗、利格珠单抗、林妥珠单抗、立鲁单抗、莫-洛伏珠单抗、鲁卡木单抗、鲁昔单抗、马帕木单抗、马司莫单抗、美力姆单抗、马妥珠单抗、美泊利单抗、美替木单抗、米拉珠单抗、明瑞莫单抗、米妥莫单抗、莫格穆里单抗、莫罗木单抗、莫他珠单抗、莫希土姆单抗、莫罗单抗-cd3、他那可单抗、纳米鲁单抗、他那莫单抗、纳瑞特单抗、那他珠单抗、奈巴库单抗、奈昔木单抗、奈瑞莫单抗、耐西维单抗、尼妥珠单抗、纳武单抗、巯诺莫单抗、奥卡土珠单抗、奥瑞珠单抗、奥度莫单抗、奥法木单抗、奥拉图单抗、奥鲁凯珠单抗、奥马珠单抗、欧那土珠单抗、莫奥珠单抗、奥戈伏单抗、奥泰单抗、奥昔珠单抗、欧西鲁单抗、欧赞尼珠单抗、欧拉丽珠单抗、帕吉昔单抗、帕利珠单抗、帕尼单抗、帕诺库单抗、帕萨土珠单抗、帕考珠单抗、帕特立珠单抗、帕图单抗、帕尼单抗、培拉凯珠单抗、培妥珠单抗、培克珠单抗、皮地利珠单抗、平妥莫单抗、普拉库鲁单抗、拍珠单抗、普立昔单抗、普托木单抗、PRO 140、坤立珠单抗、雷库图单抗、雷德图单抗、雷韦单抗、雷莫芦单抗、雷珠单抗、雷昔库单抗、瑞加韦单抗、瑞利珠单抗、利妥木单抗、利妥昔单抗、罗妥木单抗、罗勒杜单抗、罗姆苏珠单抗、隆他利珠单抗、罗利珠单抗、鲁利珠单抗、沙玛立珠单抗、沙鲁单抗、沙妥莫单抗喷地肽、苏金单抗、司韦单抗、西罗珠单抗、西法木单抗、司妥昔单抗、西姆土珠单抗、西利珠单抗、希瑞库单抗、苏兰珠单抗、苏力图单抗、松普希珠单抗、松妥珠单抗、司他芦单抗、硫索单抗、索维单抗、他贝鲁单抗、他珠单抗、他度珠单抗、他利珠单抗、他尼珠单抗、帕他莫单抗、替非珠单抗、阿替莫单抗、替妥莫单抗、替非珠单抗、阿替莫单抗、替妥莫单抗、替奈昔单抗、替利珠单抗、替普单抗、替扎贝鲁单抗、TGN1412、曲美木单抗、替西木单抗、替拉珠单抗、替加珠单抗、TNX-650、托珠单抗、托利珠单抗、托西莫单抗、曲洛青木单抗、曲妥珠单抗、TRBS07、曲加立珠单抗、曲美木单抗、西莫白介素单抗、妥韦单抗、乌波利土西单抗、乌瑞鲁单抗、乌珠单抗、优特克单抗、伐利昔单抗、维特立珠单抗、维多珠单抗、维妥珠单抗、维帕莫单抗、维西库单抗、维西珠单抗、伏洛昔单抗、伏妥土珠单抗、伏妥莫单抗、扎芦木单抗、扎木单抗、扎土希单抗、齐拉木单抗、阿佐莫单抗,以及表1中显示的那些抗体。
59.如权利要求56所述的方法或系统,其中所述治疗性多肽是选自由以下组成的组的多肽:糖蛋白、CD多肽、HER受体多肽、细胞粘附多肽、生长因子多肽、胰岛素多肽、胰岛素相关多肽、凝血多肽、凝血相关多肽、白蛋白、IgE、血型抗原、集落刺激因子、受体、神经营养因子、干扰素、白介素、病毒抗原、脂蛋白、降素、胰高血糖素、心钠素、表面活性剂肿瘤坏死因子-α和-β、脑啡肽酶、小鼠促性腺激素相关肽、DNA酶、抑制素、激活素、整联蛋白、蛋白A、蛋白D、类湿因子、免疫毒素、骨形态发生蛋白、超氧化物歧化酶、表面膜多肽、衰变促进因子、AIDS包膜、转运多肽、归巢受体、地址素、调节多肽、免疫粘附素、肌生长抑制素、TALL多肽、淀粉样多肽、胸腺基质淋巴细胞生成素、RANK配体、c-kit多肽、TNF受体和血管生成素、及其生物活性片段、类似物或变体。
60.一种监测由权利要求20或38所述的封闭系统执行的联机实时测定的方法,所述方法包括:
确定所述封闭系统中的条件是否满足预定的性能阈值;以及
当确定所述封闭系统中的条件不满足所述预定的性能阈值时,调整至少一种细胞培养构成,直到所述封闭系统中的条件满足所述预定的性能阈值。
61.如权利要求60所述的方法,其中调节至少一种细胞培养构成包括调节以下中的一种或多种:pH、压力、温度、培养基流量、培养基含量、气体处理策略、搅拌、添加剂含量、添加剂进料速率或灌注速率。
62.一种使用如权利要求20或38所述的封闭系统来延长生产运行的方法,所述方法包括:
确定所述封闭系统中的条件是否满足预定的性能阈值;以及
当确定所述封闭系统中的条件不满足所述预定的性能阈值时,调整至少一种细胞培养构成,直到所述封闭系统中的条件满足所述预定的性能阈值。
63.如权利要求62所述的方法,其中调节至少一种细胞培养构成包括调节以下中的一种或多种:pH、压力、温度、培养基流量、培养基含量、气体处理策略、搅拌、添加剂含量、添加剂进料速率或灌注速率。
64.一种减轻风险的方法,所述方法包括:
确定与如权利要求20或38所述的封闭系统的运行相关的过程和产物质量数据;
确定所述过程和产物质量数据是否满足预定的风险阈值;以及
根据所述过程和产物质量数据是否满足所述预定的风险阈值来确定是否继续所述封闭系统的运行。

说明书全文

用于对样品进行实时聚糖测定的系统和方法

[0001] 相关申请的交叉引用
[0002] 本申请要求于2017年8月1日提交的题为“用于对样品执行实时聚糖测定的系统和方法(Systems and Methods for Performing a Real-Time Glycan Assay of a Sample)”的美国临时专利申请号62/539,798的优先权,其全部公开内容通过引用并入本文。

技术领域

[0003] 本披露总体上涉及聚糖测定,并且更具体地,涉及对样品执行实时聚糖测定。
[0004] 序列表
[0005] 本申请连同电子格式的序列表一起提交。序列表作为名为“51970_Seqlisting.txt”的文件提供,所述文件创建于2018年7月31日,大小为263,980字节。将电子格式的序列表的信息通过引用以其全文并入本文。

背景技术

[0006] 测定通常用于量化分析物(如药物、生化物质、或细胞)的一个或多个属性。这种测定的一个实例是多属性方法(MAM)测定,其可以检测和量化样品的关键质量属性(CQA),所述关键质量属性由质量目标产物概况(QTPP)鉴别(Development of a quantitative mass spectrometry multi-attribute method for characterization,quality control testing and disposition of biologics[用于生物制剂的表征、质量控制测试和处置的定量质谱多属性方法的开发].Rogers RS,Nightlinger NS,Livingston B,Campbell P,Bailey R,Balland A.MAbs.2015;7(5):881-90)。所述MAM测定是在例如大分子释放测试(LMRT)实验室中进行的手动操作过程。MAM是基于液相色谱(LC)-质谱(MS)的肽作图方法,具有三个步骤:(1)样品制备(其可包括,例如多肽变性、还原、烷基化和消化);(2)通过LC分离消化的多肽并通过MS对它们进行检测;和(3)与参考标准相比,分析目标CQA的数据并检测新信号(即峰值)。
[0007] CQA是在特定值或范围值内存在的化学、物理或生物学特性。例如,对于大的多肽治疗分子,基酸(多肽的构建模)的物理属性和修饰是在制造过程中、制造后、以及在药物开发过程中监测的重要CQA。与跟踪整个多肽或部分多肽的峰大小和峰形状变化的常规分析测定不同,MAM在氨基酸平检测特定的CQA。
[0008] 多肽治疗剂的聚糖谱分析通常是CQA,例如在生物仿制产物的情况下尤其如此,其中所述生物仿制产物的糖基化谱必须与创新产物的相当。执行聚糖测定的已知过程需要手动收集产物的样品,将其送至测试实验室,并进行手动浓缩、纯化,例如,并准备进行分析。这些已知的手动操作过程的典型周转时间约为五天。这段时间会增加成本并在药物开发(创新药和生物仿制药)和最终的药物释放方面产生延迟。例如,在药物开发过程中,例如,在优化培养条件以实现最佳糖基化时,会累积五天的延迟,这阻碍向患者提供重要的新多肽药物。此外,这种延迟导致谱在制造后被确定,从而导致重新制造不符合规格的产物,而不是实时调整制造参数。因此,需要有效和更快的方法来促进聚糖分析,包括用于这种分析的样品制备。
发明内容
[0009] 本披露的一个方面提供了一种实时制备用于聚糖分析的样品的方法。所述方法包括以下步骤:(a)将包含多肽的样品经由保持盘管移动至多肽结合柱;(b)将所述样品中的多肽结合至所述多肽结合柱;(c)将聚糖酶经由所述保持盘管移动至所述多肽结合柱,以从结合的多肽释放聚糖;(d)将载体溶液经由所述保持盘管移动至所述多肽结合柱并通过所述多肽结合柱,从而将所释放的聚糖移出第一多肽柱;(e)将所释放的聚糖与所述多肽结合柱下游的聚糖标记试剂混合;(f)将所释放的聚糖和所述聚糖标记试剂的混合物移动至布置在所述多肽结合柱下游的反应盘管;(g)将所释放的聚糖和所述聚糖标记试剂的混合物在所述反应盘管中孵育,从而标记所述聚糖;(h)将所述混合物移动至布置在所述反应盘管下游的冷却盘管;(i)经由所述冷却盘管降低所述混合物的温度;(j)将所述冷却的混合物移动至布置在所述冷却盘管下游的聚糖结合柱;(k)将所述标记的聚糖结合至所述聚糖结合柱;以及(l)将洗脱缓冲液移动至所述聚糖结合柱,并通过所述聚糖结合柱,以洗脱与所述聚糖结合柱结合的标记的聚糖。
[0010] 本披露的另一个方面提供了一种在封闭系统中实时制备用于聚糖分析的样品的方法,所述封闭系统包括多通路、在所述多通路阀上游的保持盘管、流体地联接至所述多通路阀的第一通路并位于其下游的多肽结合柱、布置在所述多肽结合柱下游的反应盘管、布置在所述反应盘管下游的冷却盘管、以及布置在所述冷却盘管下游并流体地联接至所述多通路阀的第二通路并位于其下游的聚糖结合柱。所述方法包括:(a)经由与所述封闭系统通信地联接的控制器,将含有多肽的样品从含有所述多肽的容器移动至所述保持盘管;(b)经由所述控制器将所述多通路阀定位在第一位置,在所述第一位置中,所述保持盘管经由所述多通路阀的所述第一通路流体地联接至所述多肽结合柱,使得所述样品流动至所述多肽结合柱,从而所述样品中基本上所有的多肽都结合至第一多肽柱;(c)当所述多通路阀处于所述第一位置时,经由所述控制器将聚糖酶经由所述保持盘管移动至所述多肽结合柱,以从所述结合的多肽中释放聚糖,然后经由所述控制器将载体溶液经由所述保持盘管移动到所述多肽结合柱并通过所述多肽结合柱,从而将所释放的聚糖移出所述多肽结合柱;(d)经由所述控制器将所释放的聚糖移向所述反应盘管;(e)在到达所述反应盘管之前,经由所述控制器将聚糖标记试剂移向所释放的聚糖,使得所述聚糖标记试剂与所释放的聚糖和所述酶混合;(f)经由所述控制器将所述混合物移动至所述反应盘管,从而标记所述混合物中的聚糖;(g)经由所述控制器将所述混合物移动至布置在所述反应盘管下游的冷却盘管,从而降低所述混合物的温度;(h)经由所述控制器将所述冷却的混合物移动至布置在所述冷却盘管下游的聚糖柱,从而基本上将所有标记的聚糖结合至所述聚糖结合柱;(i)经由所述控制器将所述多通路阀定位在第二位置,在所述第二位置中,所述聚糖结合柱经由所述多通路阀的第二通路流体地联接至洗脱缓冲溶液源;(j)当所述多通路阀处于所述第二位置时,经由所述控制器将所述洗脱缓冲液从所述洗脱缓冲液源移动至所述聚糖结合柱,并通过所述聚糖结合柱,从而洗脱结合至所述聚糖结合柱的聚糖;以及(k)经由所述控制器将所述洗脱的聚糖移动至聚糖分析装置。
[0011] 本披露的另一个方面提供了一种实时制备用于聚糖分析的样品的封闭系统。所述封闭系统包括多通路阀、在所述多通路阀上游的保持盘管、与所述多通路阀的第一通路流体地联接并位于其下游的多肽结合柱、布置在所述多肽结合柱下游的反应盘管、布置在所述反应盘管下游的冷却盘管、与所述冷却盘管流体地联接并位于其下游的聚糖结合柱(所述聚糖结合柱经由所述多通路阀的第二通路流体地联接至所述多通路阀)、以及通信地联接至所述多通路阀的控制器。所述控制器包括存储器、处理器以及逻辑,所述逻辑存储在所述存储器上并且可由所述处理器执行以:(a)将含有多肽的产物的样品移动至所述保持盘管;(b)将所述多通路阀定位在第一位置,在所述第一位置中,所述保持盘管经由所述多通路阀的所述第一通路流体地联接至所述多肽结合柱,使得所述样品流动至第一柱,从而所述样品中基本上所有的多肽都结合至所述多肽结合柱;(c)当所述多通路阀处于所述第一位置时,将葡聚糖酶经由所述保持盘管移动至所述多肽结合柱,以从所述结合的多肽中释放聚糖,然后将载体溶液经由所述保持盘管移动至所述多肽结合柱并通过所述多肽结合柱,从而将基本上所有的所释放的聚糖移出所述多肽结合柱;(d)将所释放的聚糖移向所述反应盘管;(e)在到达所述反应盘管之前将聚糖标记试剂移向所释放的聚糖,使得所述聚糖标记试剂与所释放的聚糖混合;(f)将所释放的聚糖和所述聚糖标记试剂的混合物移动至所述反应盘管,从而标记所述混合物中的聚糖;(g)将所述混合物移动至布置在所述反应盘管下游的冷却盘管,其中所述冷却盘管降低所述混合物的温度;(h)将所述混合物移动至所述聚糖结合柱,从而使所述标记的聚糖结合至所述聚糖结合柱;(i)将所述多通路阀定位在第二位置,在所述第二位置中,所述聚糖结合柱经由所述多通路阀的第二通路流体地联接至洗脱缓冲溶液源;以及(j)当所述多通路阀处于所述第二位置时,将洗脱缓冲溶液从所述洗脱缓冲溶液源移动至所述聚糖结合柱,并通过所述聚糖结合柱,从而洗脱结合至所述聚糖结合柱的聚糖。附图说明
[0012] 图1是根据本披露的教导组装的用于执行联机、实时聚糖测定的系统的示意图。
[0013] 图2是图1所示系统的控制器的示意图。
[0014] 图3A和图3B是描绘在32天的生产运行期间监测图1系统的有效性的研究的结果图。
[0015] 图3C是描绘四天期间图3A的结果的快照的图。
[0016] 图3D和3E是描绘研究结果的另外图表。

具体实施方式

[0017] 图1示出了根据本披露的教导组装的系统100的示意图。可以位于实验室(例如,大分子释放测试实验室)处或内的系统100是封闭系统,用于自动或基本上自动制备包含用于聚糖分析的多肽的产物的样品并自动进行此样品的聚糖测定,如下面更详细地描述。通过使用系统100使该过程自动化(或基本自动化),可以实时(或基本实时)执行测定,从而整个过程可以小时计(例如2到3小时)地进行,并获得所需结果,这比常规上已知的手动操作的过程通常需要的5天有显著改善。此外,利用系统100的过程的封闭性质维持无菌条件。
[0018] 在该版本中,多肽是治疗性多肽。治疗性多肽在下面讨论。
[0019] 图1所示的系统100通常包括:多通路阀104、保持盘管108、第一柱112、反应盘管120、第二柱124、和控制器132。在图1所示的版本中,系统100还包括容器136、废物室138、第一140、酶源142、第一缓冲液源144、第二泵146、第二缓冲液源148、真空装置150、冷却盘管152、第三缓冲液源154、第四缓冲液源156、混合室157和用于分析聚糖的分析装置158。然而,在其他版本中,系统100不能包括这些组件中的一个或多个。作为实例,系统100可以不包括容器136、真空装置150、冷却盘管152和/或分析装置158。在任何情况下,通常常规的管道系统在系统100的每个组件之间延伸,以便在需要时促进系统100的组件之间的流体连通,这将在下面更详细地描述。
[0020] 多通路阀104通常被配置为控制系统100的各个部件之间的流体连通。在该版本中,多通路阀104是十二个卫星通路和中心共享通路阀。换句话说,多通路阀104具有中心通路160和十二个卫星通路164-175,其选择性地流体地联接至中心通路160。多通路阀104可在十二个不同的位置之间移动,所述十二个不同的位置分别将中心通路160与十二个不同的卫星通路164-175流体联接(其中一些未在图1的系统100的运行中使用)。在其他版本中,多通路阀104可以具有更多或更少的卫星通路,可以是不同类型的阀,或者可以被一个或多个不同的阀(每个具有一个或多个通路)代替。作为示例,多通路阀104可以由分别连接到控制器132并由其控制的多个单通路阀代替,其中每个单通阀有效地代替了卫星通路164-175之一。
[0021] 容器136通常被配置为容纳或存储含有具有要制备和分析的聚糖的多肽的产物。该版本的容器136采用容纳或存储产物的生物反应器的形式。然而,在其他版本中,容器136可以替代地采取细胞培养容器的形式,例如烧瓶,平板等。容器136经由管道系统的导管180流体地联接至阀104的卫星通路164,使得当需要时,阀104可以从容器136获得容器136中包含的产物的样品。
[0022] 保持盘管108位于阀104的上游,并通过管道系统的导管184流体地联接至阀104的中心通路160。因此,当阀104处于第一位置(在所述第一位置,中心通路160流体地联接至卫星通路164)时,保持盘管108被布置为经由阀104接收来自容器136的产物的样品。
[0023] 泵140位于保持盘管108的上游并且经由管道系统的导管188流体地联接至保持盘管108。该版本中的泵140采取注射泵的形式,所述注射泵通常被配置为帮助获得各种材料并且帮助将那些材料移动至并且在系统100的各个部件之间,如下面更详细地描述的。在其他版本中,泵140可以是不同类型的泵和/或多个泵140可以用于不同的材料和/或用于将材料输出至不同的部件。
[0024] 阀192位于第一泵140与保持盘管108之间,以选择性地将第一泵140流体地联接至保持盘管108。更具体地,阀192可在第一位置和第二位置之间移动,在所述第一位置中泵140流体地联接到保持盘管108,在所述第二位置中泵140与保持盘管108流体地隔离。换句话说,根据阀192的位置,泵140选择性地流体地联接至保持盘管108。
[0025] 当需要时,并且当阀104处于第一位置(其中中心通路160流体地联接至卫星通路164)并且阀192处于第一位置时,第一泵140可以促进产物的样品从容器136经由阀104移动至保持线圈108。产物的样品转而可以传送至第一柱112用于结合。
[0026] 第一柱112位于阀104的下游,并且具有通过管道系统的导管196流体地联接至阀104的卫星通路165的入口。因此,当阀104处于第二位置(其中中心通路160流体地联接至卫星通路165)时,第一泵140可帮助将产物的样品从保持盘管108经由阀104移动(例如泵送,传送)至第一柱112。第一柱112具有流体地联接到三通阀198的出口,所述三通阀198被配置为选择性地将第一柱112与废物室138或反应盘管120流体地联接。更具体地,三通阀198可在第一位置和第二位置之间移动,在第一位置中,第一柱112流体地联接至废物室138并与真空装置150流体地隔离,在第二位置中,第一柱112流体地联接至真空装置150并与废物室
138流体地隔离。在该版本中,三通阀198的第一位置是默认位置,使得三通阀198仅响应于三通阀198的致动(例如,通过控制器132,通过向阀198施加电流)而从第一位置移动至第二位置。然而,在其他版本中,三通阀198的第二位置可以是默认位置。在任何情况下,当第一柱112接收样品时,第一柱112被配置为当样品流过其中并且三通阀198处于其第一位置时基本上结合来自样品的所有多肽。以此方式,第一柱112将样品中的多肽基本上与样品的其余部分分开,所述其余部分可经由三通阀198传送至废物室138。
[0027] 第一柱112,在本文中也可以称为多肽结合柱,选自由以下组成的组:蛋白A柱、蛋白G柱、蛋白A/G柱、蛋白L柱、氨基酸柱、亲和素柱、链霉亲和素柱、水化合物结合柱、碳水化合物柱、谷胱甘肽柱、肝素柱、疏水相互作用柱、免疫亲和柱、核苷酸/辅酶柱、专柱和固定化金属亲和色谱(IMAC)柱。例如,在多肽是1、2或4亚类的人IgG IgM、IgA或IgE(并包含人VH3家族的人Fc部分和/或Fab区)的情况下,蛋白A柱是有用的。蛋白G可用于纯化1-4亚类的人IgG。重组融合蛋白A/G也可用于纯化所有这些类型的人抗体,因为融合蛋白提供蛋白A和蛋白G结合位点。因此,蛋白A/G融合蛋白可用于纯化人IgG、IgA、IgE和IgM。此外,蛋白L可用于纯化人IgG、IgM、IgA、IgE和IgD,前提是靶抗体具有适当的κ(kappa)亚型轻链(即,VκI、VκIII和VκIV亚型);蛋白L也可用于纯化也具有适当κ链亚型的Fab和scFv片段,因为蛋白L结合抗体的可变(V)链。
[0028] 在将来自所述样品的基本上所有的多肽结合至第一柱112上之后,通过酶源142将包含葡聚糖酶的溶液(例如由葡聚糖酶组成)供应至系统100,所述酶源142经由管道系统的导管200流体地联接至阀104的卫星通路166。在该版本中,当阀104处于第三位置(其中中心通路160流体地联接至卫星通路166)以及当阀192处于第一位置时,包含葡萄糖酶的溶液经由阀104并在泵140的辅助下移动至保持盘管108。反过来,当阀104处于第二位置(其中中心通路160流体地联接至卫星通路165)以及当阀192处于第一位置时,包含葡萄糖酶的溶液经由阀104并且再次在泵140的辅助下从保持盘管108移动至第一柱112。然而,在其它版本中,可以以不同的方式将包含葡聚糖酶的溶液提供至第一柱112(例如,在没有泵140的辅助下直接提供至第一柱112)。无论如何,当含有葡聚糖酶的溶液到达第一柱112时,溶液中的葡聚糖酶浸注结合至第一柱112的多肽。通常通过孵育第一柱112来促进浸注,在该版本中,这通过将第一柱112保持在约35℃至约40℃的温度,并且更优选地,约37℃的温度来完成。为此,可以将加热元件(例如,加热线圈、感应加热器、热泵、筒式加热器)连接到第一柱112,以提供将第一柱112保持在期望温度所需的热。在任何情况下,应当理解的是,溶液中葡聚糖酶的浸注用于将结合的多肽中的聚糖从结合的多肽释放至溶液中。
[0029] 溶液中的葡聚糖酶优选地选自下组,该组由以下组成:内切糖苷酶、糖酰胺酶(glycosamidase)和O-聚糖酶及其组合。当葡聚糖酶是或包括内切糖苷酶时,所述内切糖苷酶优选地选自下组,该组由以下组成:内切糖苷酶D、内切糖苷酶F(内切糖苷酶F1、内切糖苷酶F2和内切糖苷酶F3及其组合)、内切糖苷酶H、内切糖苷酶S、内切糖苷酶B和内切糖苷酶。当葡聚糖酶是或包括糖酰胺酶时,所述糖酰胺酶优选地选自下组,该组由以下组成:糖肽酶、肽N-糖苷酶、PNG酶、N-糖水解酶和N-聚糖酶。当所述葡聚糖酶是或包括PNG酶时,所述PNG酶优选地包括肽:N-糖苷酶F(PNGF)。当所述葡聚糖酶是或包括O-聚糖酶时,所述O-聚糖酶优选地是内切GalNAc酶D或内切GalNAc酶A。
[0030] 在结合的多肽中的聚糖释放(或基本上释放)到溶液中后,并且三通阀198处于(或移动至)其第二位置,将载体溶液(例如去离子(DI)水)移动至并通过第一柱112,以将释放的聚糖(在具有葡聚糖酶的溶液中)移出第一柱112。所述载体溶液通常由第一缓冲液源144提供至系统100,所述第一缓冲液源144经由管道系统的导管204流体地联接至阀104的卫星通路167。在该版本中,当阀104处于第四位置(其中中心通路160流体地联接至卫星通路167)以及当阀192处于第一位置时,所述载体溶液经由阀104并在泵140的辅助下移动至保持盘管108。反过来,当阀104处于第二位置(其中中心通路160流体地联接至卫星通路165)以及当阀192处于第一位置时,所述载体溶液经由阀104并且再次在泵140的辅助下从保持盘管108移动至并通过第一柱112。然而,在其它版本中,可以以不同的方式将载体溶液提供至第一柱112(例如,和/或在没有泵140的辅助下直接提供至第一柱112)。无论如何,应当理解的是,载体溶液将释放的聚糖(和葡聚糖酶)携带或移动通过和移出第一柱112。
[0031] 第二泵146位于第一柱112的下游。像第一泵140一样,该版本中的第二泵146采用注射泵的形式,所述注射泵通常被配置为帮助获得各种材料并且帮助将那些材料移动至并且在系统100的各个部件之间,如下面更详细地描述的。在其他版本中,泵146可以是不同类型的泵和/或多个泵146可以用于不同的材料和/或用于将材料输出至不同的部件。
[0032] 阀208位于第二泵146和位于第一柱112下游的管道系统的导管212之间,以选择性地将第二泵146流体地联接至第一柱112下游的导管212。更具体地,阀208可在第一位置和第二位置之间移动,在所述第一位置中泵140流体地联接到保持盘管108,在所述第二位置中泵140与保持盘管108流体地隔离。换句话说,根据阀192的位置,泵140选择性地流体地联接至保持盘管108。
[0033] 该版本中的第二泵146还流体地联接至第二缓冲液源148,所述第二缓冲液源148被配置为提供聚糖标记试剂,例如比如荧光团(例如,选自下组,该组由以下组成:2-氨基苯甲酸、8-氨基-1,3,6-三磺酸二钠盐、8-氨基萘-1,3,6-三磺酸三钠盐和邻氨基苯甲酰胺、4-甲基苯甲酰胺)或生色团(例如,3-甲基-1-苯基-2-吡唑啉-5-或苯肼)。因此,当阀
208处于第一位置时,第二泵146可将聚糖标记试剂移动(例如,泵送、引导)通过导管212,并经由管道系统的导管216向来自第一柱112的携带的释放的聚糖移动。聚糖标记试剂因此在第一柱112下游的位置与释放的聚糖混合。
[0034] 真空装置150位于第一柱112和第二泵146的下游。真空装置150经由管道系统的导管220流体地联接至导管216(携带来自第一柱112的释放的聚糖)和导管212(携带来自第二泵146的聚糖试剂)。因此,真空装置150被布置成接收释放的聚糖和聚糖试剂的混合物。当混合物流过真空装置150时,真空装置150从混合物中移除气泡(例如,空气)(即,使混合物脱气),如本领域所已知的,这会抑制系统100的下游组件的性能(例如,通过干扰梯度传递)。
[0035] 反应盘管120位于真空装置150的下游(因此也位于第一柱112和第二泵146的下游)。反应盘管120的入口224经由管道系统的导管230流体地联接至真空装置150的出口228,使得反应盘管120被布置成接收包括聚糖标记试剂和释放的聚糖的混合物。反过来,反应盘管120通常被配置为促进释放的聚糖的标记(例如,进行荧光标记)。这通常通过在反应盘管120中孵育混合物来实现。为此,在该版本中,反应盘管120由连接到(例如,紧邻、环绕)反应盘管120的加热元件232加热。换句话说,加热元件232可以向反应盘管120施加热,优选地具有约75℃至约85℃的热,并且更优选地具有约80℃的热以促进标记。加热元件232可以例如采取加热线圈,感应加热器,热泵,筒式加热器,电阻丝,或适于加热反应盘管120的一个或多个部分的其他元件。
[0036] 在该版本中由不锈制成的冷却盘管152位于反应盘管120的下游并与其流体地联接。更具体地,冷却盘管152的入口234经由管道系统的导管242流体地联接至反应盘管120的出口238,使得冷却盘管152被布置成接收包括聚糖标记试剂和释放的(和现在标记的)聚糖的混合物。冷却盘管152保持在(例如,通过控制器132)在比反应盘管120保持的温度更低的温度下。因此,冷却盘管152不仅降低混合物的温度,而且在混合物流过其中时将其延展,从而降低了混合物的有机物含量。这样做,反应盘管120增强了聚糖结合至第二柱的能
[0037] 第二柱124,在本文中也称为聚糖结合柱124,优选地采用多孔石墨碳柱的形式,其位于冷却盘管152的下游并且经由导管246流体地联接至冷却盘管152。因此,第二柱124被布置成从冷却盘管152接收冷却和稀释的混合物。为了促进冷却和稀释的混合物从冷却盘管152向第二柱124的移动,当阀208处于第一位置时,第二泵146可以将缓冲溶液(例如,由乙腈(5%)与1%TFA溶液形成)从流体地联接至其的第三缓冲液源154经由导管212、220、230、234和246移动至第二柱124。无论如何,当第二柱124从冷却盘管152接收混合物时,第二柱124被配置为当混合物从中流过时结合来自混合物的标记的聚糖。以这种方式,第二柱
124将混合物中的标记的聚糖与混合物的其余部分分离,所述其余部分可被传送至废物(未示出)。
[0038] 第二柱124也经由管道系统的导管250流体地联接至阀104的卫星通路169。在该版本中,导管250与第二柱124上游的导管246接合或相交,但是在其它版本中,导管250可以替代地绕过导管246并直接连接至第二柱124。在任何情况下,将洗脱缓冲溶液(例如,由乙腈(5%)与1%TFA溶液形成)经由导管250移动至并通过第二柱124,以洗脱基本上所有的结合的和标记的聚糖。洗脱缓冲溶液通常由第四缓冲液源156提供,所述第四缓冲液源156经由管道系统的导管254流体地联接至阀104的卫星通路168。在该版本中,当阀104处于第五位置(其中中心通路160流体地联接至卫星通路168)以及当阀192处于第一位置时,洗脱缓冲溶液经由阀104并在泵140的辅助下从第四缓冲液源156移动至保持盘管108。反过来,当阀104处于第六位置(其中中心通路160流体地联接至卫星通路169)以及当阀192处于第一位置时,洗脱缓冲溶液经由阀104并且再次在泵140的辅助下从保持盘管108移动至并通过第二柱124。然而,在其它版本中,可以以不同的方式将洗脱缓冲溶液提供至第二柱124(例如,和/或在没有泵140的辅助下直接提供至第二柱124)。在任何情况下,提供的洗脱缓冲溶液基本上洗脱与第二柱124结合的聚糖,并携带或移动这些洗脱的聚糖通过并移出第二柱
124。
[0039] 在该版本中,洗脱缓冲溶液将聚糖从第二柱124携带至混合室157,所述混合室157位于第二柱124的下游并且经由管道系统的导管258流体地联接至第二柱124。洗脱缓冲溶液和聚糖的混合物流过混合室157,这有助于降低混合物的有机物含量,并用于调节聚糖的洗脱缓冲液成分以匹配起始色谱流动相条件。换句话说,混合室157有助于确保混合物代表从容器136获得的原始样品。
[0040] 在混合物已经进入混合室157中预定的时间之后,可以将混合物移动(例如使用洗脱缓冲溶液)至分析装置158,其可以例如采用液相色谱装置、高效液相色谱装置、超高效液相色谱装置、质谱装置、聚糖分析装置、另一种分析装置或其组合的形式。在该版本中,分析装置158位于第二柱124的下游,并且经由管道系统的导管262流体地联接至第二柱124。因此,在该版本中,混合物可自动移动至分析装置158以进行聚糖分析(例如,用于定量和分离混合物中的聚糖)。然而,在其他版本中,分析装置158可以不是系统100的一部分(例如,未流体地联接至第三柱128),在这种情况下,混合物可以以不同的方式(例如手动)移动至分析装置158。
[0041] 如上所述,系统100还包括控制器132,在此版本中,控制器132通信地联接或连接至系统100的各个组件,以通过向系统100的各个组件传输信号(例如控制信号,数据)以及从系统100的各个组件接收信号(例如数据)来监测并促进或指导系统100的上述运行。控制器132可以紧邻系统100的其他组件放置(例如,在与系统100相同的环境中),或者可以远离系统100的其他组件放置。如图所示,控制器132经由通信网络300通信地联接或连接至多通路阀104,经由通信网络320、324分别通信地联接或连接至第一和第二泵140、146,经由通信网络336通信地联接或连接至分析装置158,经由通信网络340、344分别通信地联接或连接至阀192、208,以及经由通信网络348通信地联接或连接至加热元件232。在其他版本中,控制器132可以通信地联接或连接至系统100的更多或更少的组件,例如,保持盘管108、第一柱112、反应盘管120、第二柱124、容器136、冷却盘管152、混合室157和/或三通阀198。
[0042] 如本文所使用的,短语“通信地联接”和“连接”被定义为意指直接联接或连接或通过一个或多个中间组件间接联接或连接。这样的中间组件可以包括基于硬件和/或软件的组件。应当理解,网络300-348可以是无线网络、有线网络或有线和无线网络(例如,蜂窝电话网络和/或802.11x兼容网络)的组合,并且可以包括公共可访问的网络,例如因特网、专用网络或其组合。网络300-348的类型和配置取决于实现方式,并且可以使用任何类型的通信网络,所述通信网络促进现在或以后开发的控制器132与系统100的组件之间的所描述的通信。
[0043] 如图2所示,控制器132包括处理器352、存储器356、通信接口360和计算逻辑364。处理器352可以是通用处理器、数字信号处理器、ASIC、现场可编程门阵列图形处理单元、模拟电路、数字电路或任何其他已知或以后开发的处理器。处理器352根据存储器356中的指令进行操作。存储器356可以是易失性存储器或非易失性存储器。存储器356可以包括只读存储器(ROM)、随机存取存储器(RAM)、闪存、电子可擦除程序只读存储器(EEPROM)或其他类型的存储器中的一个或多个。存储器356可以包括光、磁(硬盘)或任何其他形式的数据存储装置。
[0044] 提供通信接口360以经由网络300-348实现或促进控制器132与制冷系统100的组件之间的电子通信。通信接口360可以是或包括例如一个或多个通用串行总线(USB)端口、一个或多个以太网端口和/或一个或多个其他端口或接口。电子通信可以经由任何已知的通信协议发生,例如,包括USB、RS-232、RS-485、WiFi、蓝牙和/或任何其他合适的通信协议。
[0045] 逻辑364通常包括体现为存储在存储器356上的计算机可读指令的一个或多个控制例程和/或一个或多个子例程。控制例程和/或子例程可以执行PID(比例-积分-微分)、模糊逻辑、非线性或任何其他合适类型的控制。处理器352通常执行逻辑364以执行与系统100的运行有关的动作。
[0046] 一般而言,逻辑364在执行时使处理器352控制系统100的组件,尤其是多通路阀104,第一和第二泵140、146,分析装置158,第一和第二阀192、208以及加热元件232,使得系统100以本文讨论的所需方式运行。更特别地,逻辑364在执行时可使处理器352(i)将多通路阀104移动至本文所述的任何位置或之间,从而流体地联接如上所述的系统100的各个组件,(ii)控制第一泵140(例如,使泵140获得或引导如上所述的材料),(iii)控制第二泵146(例如,使泵146获得或引导如上所述的材料),(iv)打开或关闭阀门192,(v)打开或关闭阀门208,(vi)通过选择性地向反应盘管120施加热,控制加热元件232(当使用时)以控制反应盘管120的温度,以及(vii)控制分析装置158。
[0047] 在其他版本中,逻辑364在由处理器352执行时可以使得执行附加的、较少的和/或不同的功能。作为实例,逻辑364在由处理器352执行时可以不将聚糖从第二柱124移动至分析装置158,或者不使分析装置156执行所需的分析。此外,在其他版本中,逻辑364可以由处理器352以与本文所述不同的顺序执行。最后,应当理解,逻辑364可以由处理器352执行任意不同次数,因为系统100可以用于对多个样品(来自同一产物和/或来自不同产物)进行实时分析。
[0048] 图3A-3E示出了联机和实时糖基化谱研究的结果,所述研究用于监测系统100在制备基于抗体的治疗性多肽的样品中的有效性。特别地,所述研究在32天的生产运行中监测系统100的有效性。所述研究在32天的生产运行的第四天开始监测和收集CQA数据,例如%A1G0F、%A2G0F、%A2G1F(聚糖)和%M5(甘露糖5)。如图3A和3B所示,系统100在32天的生产运行的整个持续时间内能够且有效地执行本文讨论的预期功能,并且,如图3D和3E所示,第四天到第32天之间收集的CQA数据一致,也就是说,产物质量不会随时间变化,从而证明了系统100的有效性和稳健性。尽管有以下事实仍是如此:在生产运行的第20天,由于氧气罐中的泄漏,中断了通向容器136的氧气流两个小时。进而,增加了从容器136的采样频率(在这种情况下,从每24小时一次增加到每六个小时一次),以便以更高的分辨率监测容器136并评估继续进行生产运行的险。但是,如图3A-3C所示,该中断仅暂时影响一些CQA数据,并且CQA数据迅速返回至中断前的值并稳定下来。因此,决定继续生产运行。
[0049] 治疗性多肽
[0050] 蛋白质,包括与以下一种或多种结合的蛋白质,可用于所披露的装置和方法。这些包括CD蛋白,包括CD3、CD4、CD8、CD19、CD20、CD22、CD30和CD34;包括干扰受体结合的那些。HER受体家族蛋白,包括HER2、HER3、HER4和EGF受体。细胞粘附分子,例如,LFA-I、MoI、pl50、pl95、VLA-4、ICAM-I、VCAM和αv/β3整联蛋白。生长因子,例如血管内皮生长因子(“VEGF”)、生长激素、甲状腺刺激素、卵泡刺激素、黄体生成激素、生长激素释放因子、甲状旁腺激素、米勒管抑制物质(mullerian-inhibiting substance)、人类巨噬细胞炎性蛋白(MIP-I-α)、促红细胞生成素(EPO)、神经生长因子(诸如NGF-β)、血小板源性生长因子(PDGF)、纤维细胞生长因子(包括例如aFGF和bFGF)、表皮生长因子(EGF)、转化生长因子(TGF)(其中包括TGF-α和TGF-β,包括TGF-βl、TGF-β2、TGF-β3、TGF-β4或TGF-β5)、胰岛素样生长因子-I和胰岛素样生长因子-II(IGF-I和IGF-II)、des(l-3)-IGF-I(脑IGF-I)和骨诱导因子。胰岛素和胰岛素相关蛋白,包括胰岛素、胰岛素A链、胰岛素B链、胰岛素原和类胰岛素生长因子结合蛋白。凝血蛋白和凝血相关蛋白,尤其诸如,VIII因子、组织因子、范威尔邦德(von Willebrand)因子、蛋白C、α-1-抗胰蛋白酶、纤溶酶原激活剂(诸如尿激酶和组织纤溶酶原激活剂(“t-PA”))、邦巴辛(bombazine)、凝血酶、和血小板生成素;(vii)其他血液和血清蛋白,包括但不限于白蛋白、IgE和血型抗原。菌落刺激因子及其受体,其中包括以下:M-CSF,GM-CSF和G-CSF,及其受体,例如CSF-1受体(c-fms)。受体和受体相关蛋白,包括例如flk2/flt3受体、肥胖(OB)受体、LDL受体、生长激素受体、血小板生成素受体(“TPO-R”,“c-mpl”)、胰高血糖素受体、白介素受体、干扰素受体、T细胞受体、干细胞因子受体(例如c-Kit)和其他受体。受体配体,包括例如OX40L、OX40受体的配体。神经营养因子,包括骨源性神经营养因子(BDNF)和神经营养蛋白-3、神经营养蛋白-4、神经营养蛋白-5或神经营养蛋白-6(NT-
3、NT-4、NT-5或NT-6)。松弛素A链、松弛素B链和松弛素原;干扰素和干扰素受体,包括例如干扰素-α、干扰素-β和干扰素-γ,及其受体。白介素和白介素受体,包括IL-I至IL-33和IL-I至IL-33受体,例如IL-8受体,等等。病毒抗原,包括AIDS包膜病毒抗原。脂蛋白、降素、胰高血糖素、心钠素、表面活性剂肿瘤坏死因子-α和-β、脑啡肽酶、RANTES(受激活调节的正常T细胞表达与分泌的)、小鼠促性腺激素相关肽、DNA酶、抑制素和激活素。整联蛋白、蛋白A或D、类风湿因子、免疫毒素、骨形态发生蛋白(BMP)、超氧化物歧化酶、表面膜蛋白、衰变促进因子(DAF)、AIDS包膜、转运蛋白、归巢受体、地址素、调节蛋白、免疫粘附素、抗体。肌生长抑制素、TALL蛋白(包括TALL-I)、淀粉样蛋白(包括但不限于淀粉样β蛋白)、胸腺基质淋巴细胞生成素(“TSLP”)、RANK配体(“OPGL”)、c-kit、TNF受体(包括TNF受体1型)、TRAIL-R2、血管生成素和任何上述物质的生物活性片段或类似物或变体。
[0051] 示例性的多肽和抗体包括 (阿替普酶);阿利库单抗, (达贝泊汀-α), (阿法依伯汀(Epoetin alfa)或促红细胞生成素); (干扰素
β-Ia); (托西莫单抗); (干扰素-β);百库珠单抗(抗PCSK9单克隆抗
体,命名为L1L3,参阅US8080243); (阿仑单抗); (依伯汀δ);
(替佐米);MLN0002(抗α4β7mAb);MLN1202(抗CCR2趋化因子受体mAb);
(依那西普); (依伯汀α); (西妥昔单抗);依伏库单抗;
(生长激素); (曲妥珠单抗); (注射用生长激素
[rDNA来源]); (阿达木单抗); (干扰素Alfacon-1); (奈西
立肽); (阿那白滞素), (沙格司亭); (依帕珠单抗);
BenlystaTM(贝利木单抗); (替奈普酶); (甲氧基聚乙二醇-依伯汀
β); (奥-吉妥珠单抗(Gemtuzumab ozogamicin)); (依法利珠单抗);
(赛妥珠单抗(certolizumab pegol));SolirisTM(依库丽单抗);培克珠单抗(抗C5补体);MEDI-524 (兰尼单抗);依决洛单抗
(乐地单抗(lerdelimumab));TheraCim hR3(尼妥珠单抗);Omnitarg(帕妥珠单抗,2C4); (IDM-I); (B43.13); (威司利珠单抗
(visilizumab));莫坎妥珠单抗(Cantuzumab  mertansine)(huC242-DMl);
(依伯汀β); (奥普瑞白介素); (聚乙二醇化非格司
亭,聚乙二醇化G-CSF,聚乙二醇化hu-Met-G-CSF); (非格司亭);Orthoclone(莫罗单抗-CD3), (依伯汀α); (英夫利昔单抗),
(阿昔单抗), (抗IL6受体mAb), (贝伐单抗),HuMax-CD4(扎木单抗
(zanolimumab)), (利妥昔单抗); (埃罗替尼); (干扰素α-
2a); (巴利昔单抗);StelaraTM(优特克单抗); (罗美昔布);
(帕利珠单抗);146B7-CHO(抗IL15抗体,参见US7153507), (那他珠单抗);
(MDX-1303,抗炭疽杆菌保护性抗原mAb);ABthraxTM; (帕尼单抗);
(奥珠单抗),ETI211(抗MRSA mAb),IL-I陷阱(人IgGl的Fc部分和两个IL-I受体成分(I型受体和受体辅助蛋白)的胞外结构域),VEGF陷阱(VEGFRl的Ig结构域与IgGl Fc融合), (达克珠单抗); (达克珠单抗), (替坦替伊莫单抗
(Ibritumomab tiuxetan),Zetia(依泽替米贝),阿塞西普(TACI-Ig),抗α4β7mAb(维多珠单抗);加利昔单抗(galiximab)(抗CD80单克隆抗体),抗CD23 mAb(鲁昔单抗);BR2-Fc(huBR3/huFc融合蛋白,可溶性BAFF拮抗剂);SimponiTM(戈利木单抗);马帕木单抗(Mapatumumab)(人抗TRAIL受体-1mAb);奥瑞单抗(Ocrelizumab)(抗CD20人mAb);HuMax-EGFR(扎鲁木单抗(zalutumumab));M200(伏洛昔单抗(Volociximab),抗α5β1整合素mAb);
MDX-010(匹利木单抗,抗CTLA-4mAb和VEGFR-I(IMC-18F1);抗BR3 mAb;抗艰难梭菌毒素A和毒素B C mAb MDX-066(CDA-I)和MDX-1388);抗CD22 dsFv-PE38缀合物(CAT-3888和CAT-
8015);抗CD25 mAb(HuMax-TAC);抗TSLP抗体;抗TSLP受体抗体(US8101182);指定为A5的抗TSLP抗体(US7982016);(抗CD3 mAb(NI-0401);阿德木单抗(Adecatumumab)(MT201,抗EpCAM-CD326 mAb);MDX-060、SGN-30、SGN-35(抗CD30 mAb);MDX-1333(抗IFNAR);HuMax CD38(抗CD38 mAb);抗CD40L mAb;抗Cripto mAb;抗CTGF特发性肺纤维化I期纤维蛋白原(FG-3019);抗CTLA4 mAb;抗eotaxinl mAb(CAT-213);抗FGF8 mAb;抗神经节苷脂GD2 mAb;
抗硬化蛋白抗体(参见,US8715663或US7592429)被指定为Ab-5的抗硬化蛋白抗体(US8715663或US7592429);抗神经节苷脂GM2 mAb;抗GDF-8人mAb(MYO-029);抗GM-CSF受体mAb(CAM-3001);抗HepC mAb(HuMax HepC);MEDI-545、MDX-1103(抗IFNαmAb);抗IGFIR mAb;抗IGF-IR mAb(HuMax-Inflam);抗IL12/IL23p40 mAb(布瑞吉努单抗);抗IL-23p19 mAb(LY2525623);抗IL13 mAb(CAT-354);抗IL-17mAb(AIN457);抗IL2Ra mAb(HuMax-TAC);
抗IL5受体mAb;抗整合素受体mAb(MDX-Ol8,CNTO 95);抗IPIO溃疡性结肠炎mAb(MDX-
1100);抗LLY抗体;BMS-66513;抗甘露糖受体/hCGβmAb(MDX-1307);抗间皮素dsFv-PE38缀合物(CAT-5001);抗PDlmAb(MDX-1 106(ONO-4538));抗PDGFRα抗体(IMC-3G3);抗TGFβmAb(GC-1008);抗TRAIL受体-2人mAb(HGS-ETR2);抗TWEAK mAb;抗VEGFR/Flt-1mAb;抗ZP3 mAb(HuMax-ZP3);以及包含序列SEQ ID NO:8和SEQ ID NO:6的淀粉样蛋白β单克隆抗体(US7906625)。
[0052] 适用于所述方法和药物配制品的抗体实例包括表1中所示的抗体。适合的抗体的其他实例包括英夫利昔单抗(infliximab)、贝伐单抗(bevacizumab)、西妥昔单抗(cetuximab)、兰尼单抗(ranibizumab)、帕利珠单抗(palivizumab)、阿巴伏单抗(abagovomab)、阿昔单抗(abciximab)、阿克托克单抗(actoxumab)、阿达木单抗(adalimumab)、阿非莫单抗(afelimomab)、阿托珠单抗(afutuzumab)、阿珠单抗(alacizumab)、培化阿珠单抗(alacizumab pegol)、ald518、阿仑单抗(alemtuzumab)、阿利库单抗(alirocumab)、阿妥莫单抗(altumomab)、阿麦妥昔单抗(amatuximab)、马安那莫单抗(anatumomab mafenatox)、安芦珠单抗(anrukinzumab)、阿泊珠单抗(apolizumab)、阿西莫单抗(arcitumomab)、阿塞珠单抗(aselizumab)、阿替奴单抗(altinumab)、阿替珠单抗(atlizumab)、阿托立木单抗(atorolimiumab)、托珠单抗(tocilizumab)、巴匹珠单抗(bapineuzumab)、巴利昔单抗(basiliximab)、巴维昔单抗(bavituximab)、贝妥莫单抗(bectumomab)、贝利木单抗(belimumab)、苯拉利珠单抗(benralizumab)、柏替木单抗(bertilimumab)、贝索单抗(besilesomab)、贝伐珠单抗(bevacizumab)、贝洛托单抗(bezlotoxumab)、比西单抗(biciromab)、比伐珠单抗(bivatuzumab)、莫-比伐珠单抗(bivatuzumab mertansine)、博纳吐单抗(blinatumomab)、布索珠单抗(blosozumab)、本妥昔单抗(brentuximab vedotin)、巴列津单抗(briakinumab)、布洛鲁单抗(brodalumab)、康纳单抗(canakinumab)、莫坎妥珠单抗(cantuzumab mertansine)、莫坎妥珠单抗(cantuzumab mertansine)、卡普赛珠单抗(caplacizumab)、卡罗单抗喷地肽(capromab pendetide)、卡鲁单抗(carlumab)、卡妥索单抗(catumaxomab)、cc49、西利珠单抗(cedelizumab)、赛妥珠单抗(certolizumab pegol)、西妥昔单抗(cetuximab)、泊西他珠单抗(citatuzumab bogatox)、西妥木单抗(cixutumumab)、克拉扎珠单抗(clazakizumab)、克立昔单抗(clenoliximab)、克伐珠单抗(clivatuzumab tetraxetan)、可那木单抗(conatumumab)、克雷内治单抗(crenezumab)、cr6261、达西珠单抗(dacetuzumab)、达克珠单抗(daclizumab)、达罗土珠单抗(dalotuzumab)、达雷木单抗(daratumumab)、地莫米佐单抗(demcizumab)、地诺单抗(denosumab)、地莫单抗(detumomab)、阿托度单抗(dorlimomab aritox)、德罗图单抗(drozitumab)、杜力戈图单抗(duligotumab)、杜匹鲁单抗(dupilumab)、依美昔单抗(ecromeximab)、依库丽单抗(eculizumab)、埃巴单抗(edobacomab)、依决洛单抗(edrecolomab)、依法利珠单抗(efalizumab)、依芬古单抗(efungumab)、埃罗妥珠单抗(elotuzumab)、艾西莫单抗(elsilimomab)、埃文单抗(enavatuzumab)、培化恩莫单抗(enlimomab pegol)、恩诺珠单抗(enokizumab)、依诺替库单抗(enoticumab)、埃斯托西单抗(ensituximab)、西依匹莫单抗(epitumomab cituxetan)、依帕珠单抗(epratuzumab)、厄瑞奴单抗(erenumab)、厄利珠单抗(erlizumab)、厄马索单抗(ertumaxomab)、埃达珠单抗(etaracizumab)、依卓利珠单抗(etrolizumab)、依伏库单抗(evolocumab)、艾韦单抗(exbivirumab)、法索单抗(fanolesomab)、法拉莫单抗(faralimomab)、法拉图珠单抗(farletuzumab)、法希奴单抗(fasinumab)、fbta05、非维珠单抗(felvizumab)、非扎奴单抗(fezakinumab)、费希腊妥单抗(ficlatuzumab)、芬妥木单抗(figitumumab)、弗兰托单抗(flanvotumab)、芳妥珠单抗(fontolizumab)、弗罗鲁单抗(foralumab)、福拉韦单抗(foravirumab)、夫苏木单抗(fresolimumab)、弗兰单抗(fulranumab)、弗图希单抗(futuximab)、加利昔单抗(galiximab)、盖尼柱单抗(ganitumab)、盖坦德单抗(gantenerumab)、加维莫单抗(gavilimomab)、吉妥珠单抗奥佐米星(gemtuzumab ozogamicin)、吉伏珠单抗(gevokizumab)、吉仁土昔单抗(girentuximab)、维德汀单抗(glembatumumab vedotin)、戈利木单抗(golimumab)、戈利昔单抗(gomiliximab)、gs6624、替伊立珠单抗(ibalizumab)、替伊莫单抗(ibritumomab tiuxetan)、依库单抗(icrucumab)、伊戈伏单抗(igovomab)、英西单抗(imciromab)、英戈土珠单抗(imgatuzumab)、英克拉库单抗(inclacumab)、依坦希单抗(indatuximab ravtansine)、英夫利西单抗(infliximab)、英妥木单抗(intetumumab)、伊诺莫单抗(inolimomab)、伊珠单抗奥佐米星(inotuzumab ozogamicin)、伊匹木单抗(ipilimumab)、艾雷妥木单抗(iratumumab)、依拓珠单抗(itolizumab)、希凯珠单抗(ixekizumab)、凯利昔单抗(keliximab)、拉贝珠单抗(labetuzumab)、来金珠单抗(lebrikizumab)、来马索单抗(lemalesomab)、乐地单抗(lerdelimumab)、来沙木单抗(lexatumumab)、利韦单抗(libivirumab)、利格珠单抗(ligelizumab)、林妥珠单抗(lintuzumab)、立鲁单抗(lirilumab)、莫-洛伏珠单抗(lorvotuzumab mertansine)、鲁卡木单抗(lucatumumab)、鲁昔单抗(lumiliximab)、马帕木单抗(mapatumumab)、马司莫单抗(maslimomab)、美力姆单抗(mavrilimumab)、马妥珠单抗(matuzumab)、美泊利单抗(mepolizumab)、美替木单抗(metelimumab)、米拉珠单抗(milatuzumab)、明瑞莫单抗(minretumomab)、米妥莫单抗(mitumomab)、莫格穆里单抗(mogamulizumab)、莫罗木单抗(morolimumab)、莫他珠单抗(motavizumab)、莫希土姆单抗(moxetumomab pasudotox)、莫罗单抗-cd3(muromonab-cd3)、他那可单抗(nacolomab tafenatox)、纳米鲁单抗(namilumab)、他那莫单抗(naptumomab estafenatox)、纳瑞特单抗(narnatumab)、那他珠单抗(natalizumab)、奈巴库单抗(nebacumab)、奈昔木单抗(necitumumab)、奈瑞莫单抗(nerelimomab)、耐西维单抗(nesvacumab)、尼妥珠单抗(nimotuzumab)、纳武单抗(nivolumab)、巯诺莫单抗(nofetumomab merpentan)、奥卡土珠单抗(ocaratuzumab)、奥瑞珠单抗(ocrelizumab)、奥度莫单抗(odulimomab)、奥法木单抗(ofatumumab)、奥拉图单抗(olaratumab)、奥鲁凯珠单抗(olokizumab)、奥马珠单抗(omalizumab)、欧那土珠单抗(onartuzumab)、莫奥珠单抗(oportuzumab monatox)、奥戈伏单抗(oregovomab)、奥泰单抗(orticumab)、奥昔珠单抗(otelixizumab)、欧西鲁单抗(oxelumab)、欧赞尼珠单抗(ozanezumab)、欧拉丽珠单抗(ozoralizumab)、帕吉昔单抗(pagibaximab)、帕利珠单抗(palivizumab)、帕尼单抗(panitumumab)、帕诺库单抗(panobacumab)、帕萨土珠单抗(parsatuzumab)、帕考珠单抗(pascolizumab)、帕特立珠单抗(pateclizumab)、帕图单抗(patritumab)、帕尼单抗(pemtumomab)、培拉凯珠单抗(perakizumab)、培妥珠单抗(pertuzumab)、培克珠单抗(pexelizumab)、皮地利珠单抗(pidilizumab)、平妥莫单抗(pintumomab)、普拉库鲁单抗(placulumab)、拍珠单抗(ponezumab)、普立昔单抗(priliximab)、普托木单抗(pritumumab)、PRO 140、坤立珠单抗(quilizumab)、雷库图单抗(racotumomab)、雷德图单抗(radretumab)、雷韦单抗(rafivirumab)、雷莫芦单抗(ramucirumab)、雷珠单抗(ranibizumab)、雷昔库单抗(raxibacumab)、瑞加韦单抗(regavirumab)、瑞利珠单抗(reslizumab)、利妥木单抗(rilotumumab)、利妥昔单抗(rituximab)、罗妥木单抗(robatumumab)、罗勒杜单抗(roledumab)、罗姆苏珠单抗(romosozumab)、隆他利珠单抗(rontalizumab)、罗利珠单抗(rovelizumab)、鲁利珠单抗(ruplizumab)、沙玛立珠单抗(samalizumab)、沙鲁单抗(sarilumab)、沙妥莫单抗喷地肽(satumomab pendetide)、苏金单抗(secukinumab)、司韦单抗(sevirumab)、西罗珠单抗(sibrotuzumab)、西法木单抗(sifalimumab)、司妥昔单抗(siltuximab)、西姆土珠单抗(simtuzumab)、西利珠单抗(siplizumab)、希瑞库单抗(sirukumab)、苏兰珠单抗(solanezumab)、苏力图单抗(solitomab)、松普希珠单抗(sonepcizumab)、松妥珠单抗(sontuzumab)、司他芦单抗(stamulumab)、硫索单抗(sulesomab)、索维单抗(suvizumab)、他贝鲁单抗(tabalumab)、他珠单抗(tacatuzumab  tetraxetan)、他度珠单抗
(tadocizumab)、他利珠单抗(talizumab)、他尼珠单抗(tanezumab)、帕他莫单抗(taplitumomab paptox)、替非珠单抗(tefibazumab)、阿替莫单抗(telimomab aritox)、替妥莫单抗(tenatumomab)、替非珠单抗(tefibazumab)、替奈昔单抗(teneliximab)、替利珠单抗(teplizumab)、替普单抗(teprotumumab)、替扎贝鲁单抗(tezepelumab)、TGN1412、曲美木单抗(tremelimumab)、替西木单抗(ticilimumab)、替拉珠单抗(tildrakizumab)、替加珠单抗(tigatuzumab)、TNX-650、托珠单抗(tocilizumab)、托利珠单抗(toralizumab)、托西莫单抗(tositumomab)、曲洛青木单抗(tralokinumab)、曲妥珠单抗(trastuzumab)、TRBS07、曲加立珠单抗(tregalizumab)、西莫白介素单抗(tucotuzumab celmoleukin)、妥韦单抗(tuvirumab)、乌波利土西单抗(ublituximab)、乌瑞鲁单抗(urelumab)、乌珠单抗(urtoxazumab)、优特克单抗(ustekinumab)、伐利昔单抗(vapaliximab)、维特立珠单抗(vatelizumab)、维多珠单抗(vedolizumab)、维妥珠单抗(veltuzumab)、维帕莫单抗(vepalimomab)、维西库单抗(vesencumab)、维西珠单抗(visilizumab)、伏洛昔单抗(volociximab)、伏妥土珠单抗(vorsetuzumab mafodotin)、伏妥莫单抗(votumumab)、扎芦木单抗(zalutumumab)、扎木单抗(zanolimumab)、扎土希单抗(zatuximab)、齐拉木单抗(ziralimumab)、阿佐莫单抗(zolimomab aritox)。
[0053] 抗体还包括阿达木单抗、贝伐单抗、博纳吐单抗、西妥昔单抗、可那木单抗、地诺单抗、依库丽单抗、厄瑞奴单抗、依伏库单抗、英夫利昔单抗、那他珠单抗、帕尼单抗、利妥木单抗、利妥昔单抗、罗姆苏珠单抗、替扎贝鲁单抗、和曲妥珠单抗、和从表1选择的抗体。
[0054]
[0055]
[0056] *适用于患者施用的示例性浓度;^HC-抗体重链;LC-抗体轻链。
[0057] 基于前面的描述,应当理解,本文所述的装置、系统和方法有利于自动(或基本上自动)制备含有用于聚糖分析的多肽的产物的样品,以及自动(或基本上自动)进行该样品的聚糖测定。因此,制备和分析可以基本实时地进行。换句话说,整个过程可以比常规过程目前所允许的快得多地进行。
[0058] 还应当理解,本文所述的装置、系统和方法允许用于聚糖分析的样品的制备过程以及使用系统100制备对该样品进行聚糖测定的性能易于监测,这又可以减轻风险并延长产物的生产运行。特别地,可以通过例如使用诸如控制器132之类的控制器和/或由系统100的操作者手动确定系统100中的条件是否最佳,即,它们是否满足预定的性能阈值来监测该过程。如图3D和图3E所示,例如可以获取一组糖基化物质的%糖基化值(在本情况中为%M5、A1G0F、A2G0F、%HM、%Fuc、%Gal、A2G1F和%杂合),并针对在方法鉴定期间收集的那些糖基化物质的历史值进行比较,确定系统100中的条件是否最佳,使得可以开始,继续或延长生产运行。然而,当确定系统100中的条件不是最佳时,可以调节至少一种细胞培养构成,直到封闭系统中的条件最佳为止。可以调整的细胞培养构成的实例包括但不限于:pH、压力、温度、培养基流量(例如,培养基流速、培养基进料速率)、培养基含量(包括氨基酸、营养物质、糖、缓冲液)、气体处理策略(氧气和二氧化碳的混合、气体速率)、搅拌(例如,搅拌速率)、添加剂(例如金属添加剂、糖添加剂)、添加剂(例如,消泡剂)进料速率和灌注速率。在一些情况下,可能只需要调整一种细胞培养构成,以使封闭系统中的条件达到最佳,而在其他情况下,可能需要调整多种细胞培养构成。可替代地,当确定条件不是最佳的时,或者即使在调整了至少一种细胞培养构成之后系统100中的条件也不是最佳的时,系统100的控制器和/或操作者可以关闭系统100。
[0059] 以此方式,当条件不是最佳的或者在其他方面不希望继续系统100的运行时,本文所述的装置、系统和方法还减轻了系统100的继续运行所涉及的风险。特别地,可以通过以下来减轻风险:确定(例如,计算或获得)与系统100的当前运行有关的过程参数和产物质量数据,例如pH、温度、氧溶解、细胞生存力、细胞密度、滴度、聚集、电荷变化、糖基化等,确定所述过程参数和产物质量数据是否满足预定的风险阈值(通过控制器例如控制器132和/或对系统100的操作者输入的应答,在系统100的运行之前确定),并且然后根据所述过程参数和产物质量数据是否满足所述预定的风险阈值来确定是否继续、停止或调整系统100的运行。预定的风险阈值可以例如通过以下来确定:(1)应用可用的过程参数数据和产物质量数据来计算与系统100或一些其他类似系统的先前运行相关的平均历史多变量(MV)数据,并且然后,(2)将计算出的平均历史MV数据建立为阈值(所述阈值可以是计算出的平均历史MV数据本身,或是基于计算出的平均历史MV数据的某些值或一组值。在一个实例中,预定的风险阈值可以表示与计算出的平均历史MV数据的可接受的偏差(例如,三个标准偏差)。可替代地或另外地,可以根据来自系统100的操作者的输入来确定预定的风险阈值。在一些情况下,当与系统100的当前运行相关的过程参数和产物质量数据不满足(例如,超过)预定的风险阈值时,系统100可以关闭。然而,在其他情况下,当与系统100的当前运行相关的过程参数和产物质量数据不满足预定的风险阈值时,或者当过程参数和产物质量数据满足但接近预定的风险阈值时,可以调整系统100。例如,并且如上简要讨论的,可以调节从容器136的采样频率
[0060] 此外,申请人已经发现,本文描述的装置、系统和方法还允许使用系统100的生产运行得以延长。常规方法通常最多允许32-40天的生产运行。然而,申请人已经发现,本文所述的装置、系统和方法允许50-80(如果不是100)的群体倍增数,即,大约50-80(如果不是100)天生产运行。因此,在监测系统100的运行以确保产物满足质量目标并且减轻风险的同时,可以获得更多的产物。
[0061] 本文描述了本披露的优选实施例,包括已知诸位发明人用于进行本披露的一种或多种最佳模式。尽管在此示出并描述了许多实例,但是本领域技术人员将容易理解,各个实施例的细节不必相互排斥。相反,本领域技术人员在阅读本文的教导后应该能够将一个实施例的一个或多个特征与其余实施例的一个或多个特征相组合。此外,还应当理解,所示出的实施例仅是示例性的,并且不应被视为限制本披露的范围。除非本文另外指示或另外明显地与上下文矛盾,否则本文所述的所有方法能以任何合适顺序进行。本文提供的任何和所有实例或示例性语言(例如“例如”)的使用仅旨在更好地阐明本披露的一个或多个示例性实施例的各个方面,并且不对本披露的范围构成限制。说明书中的语言不应当被解释为指示任何未要求保护的要素为实践本披露所必需的。
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