1.一种使微生物进化以获得所期望表型的高通量HTP基因组工程改造方法，包含：
a.利用转座子诱变扰动具有相同微生物菌株背景的初始多种微生物的基因组，借此创建包含具有独特基因变异的个别微生物菌株的初始HTP基因设计转座子诱变微生物菌株文库；
b.针对所期望表型来筛选和选择所述初始HTP基因设计转座子诱变微生物菌株文库中的个别菌株；
c.提供各自包含独特基因变异组合的后续多种微生物，所述基因变异选自前一步骤所筛选的至少两种个别菌株中所存在的基因变异，借此创建后续HTP基因设计转座子诱变微生物菌株文库；
d.针对所期望表型来筛选和选择所述后续HTP基因设计转座子诱变微生物菌株文库中的个别微生物菌株；和
e.以线性或非线性方式重复步骤c)-d)一或多次，直到微生物已获得所期望表型为止，其中每次后续迭代创建新的HTP基因设计转座子诱变微生物菌株文库，所述微生物菌株文库包含具有独特基因变异的个别菌株，所述独特基因变异为选自前一个HTP基因设计转座子诱变微生物菌株文库的至少两种个别菌株的基因变异的组合。
2.根据权利要求1所述的HTP基因组工程改造方法，其中所述转座子诱变包含：提供转座酶和DNA有效负载序列。
3.根据权利要求2所述的HTP基因组工程改造方法，其中所述转座酶和DNA有效负载序列形成转座酶-DNA有效负载复合物。
4.根据权利要求1所述的HTP基因组工程改造方法，其中所述转座子诱变使得转座子随机插入所述多种微生物的基因组中。
5.根据权利要求1所述的HTP基因组工程改造方法，其中所述转座子诱变产生功能丧失LoF表型。
6.根据权利要求1所述的HTP基因组工程改造方法，其中所述转座子诱变产生功能获得GoF表型。
7.根据权利要求1所述的HTP基因组工程改造方法，其中所述转座子诱变使含有功能获得GoF型元件的DNA有效负载序列插入所述基因组中。
8.根据权利要求7所述的HTP基因组工程改造方法，其中所述功能获得型元件选自由以下组成的群组：启动子、溶解性标签元件，和反向可选标记。
9.根据权利要求1所述的HTP基因组工程改造方法，其中所述转座子诱变使含有功能丧失LoF型元件的DNA有效负载复合物插入。
10.根据权利要求9所述的HTP基因组工程改造方法，其中所述功能丧失型元件是标记。
11.根据权利要求1所述的HTP基因组工程改造方法，其中所述转座子诱变包含用至少两种转座酶-DNA有效负载复合物转化所述多种微生物，所述至少两种复合物中的一种含有功能获得GoF型元件且一种含有功能丧失LoF型元件。
12.根据权利要求1所述的HTP基因组工程改造方法，其中所述转座子诱变利用EZ-Tn5转座子诱变系统。
13.根据权利要求1所述的HTP基因组工程改造方法，其中所述基因组是通过利用转座子诱变和以下中的至少一种来扰动：SNP交换、启动子交换、终止子交换、序列优化或其任何组合。
14.根据权利要求1所述的HTP基因组工程改造方法，其中所述微生物是原核生物。
15.根据权利要求1所述的HTP基因组工程改造方法，其中所述微生物来自选自由以下组成的群组的属：农杆菌属、脂环酸芽孢杆菌属、念珠藻属、倒囊藻属、不动杆菌属、酸热菌属、节杆菌属、固氮菌属、芽孢杆菌属、双叉杆菌属、短杆菌属、丁酸弧菌属、布赫纳氏菌属、野油菜、弯曲杆菌属、梭菌属、棒状杆菌属、红硫菌属、粪球菌属、埃希氏杆菌属、肠球菌属、肠杆菌属、欧文菌属、梭杆菌属、粪栖杆菌属、弗朗西斯氏菌属、黄杆菌属、土芽孢杆菌属、嗜血杆菌属、螺旋杆菌属、克雷伯氏菌属、乳杆菌属、乳球菌属、泥杆菌属、微球菌属、微杆菌属、中间根瘤菌属、甲基杆菌属、甲基杆菌属、分枝杆菌属、奈瑟菌属、泛菌属、假单胞菌属、原绿球藻属、红细菌属、红假单胞菌属、红假单胞菌属、罗斯氏菌属、红螺菌属、红球菌属、栅列藻属、链霉菌属、链球菌属、聚球藻属、糖单孢菌属、糖多孢菌属、葡萄球菌属、沙雷氏菌属、沙门氏菌属、志贺杆菌属、嗜热厌氧杆菌属、养障体、土拉热菌属、蒂梅丘拉、嗜热聚球藻属、热球菌属、脲原体属、黄单胞菌属、木杆菌属、耶尔森氏菌属和发酵单胞菌属。
16.根据权利要求1所述的HTP基因组工程改造方法，其中所述微生物是刺糖多孢菌。
17.根据权利要求1所述的HTP基因组工程改造方法，其中所述微生物为大肠杆菌。
18.根据权利要求1所述的HTP基因组工程改造方法，其中所述微生物是真核生物。
19.一种产生转座子诱变微生物菌株文库的方法，包含：
a)将转座子引入一或多种基本微生物菌株的微生物细胞群中；以及
b)选择包含随机整合的转座子的至少一种微生物菌株，借此创建包含多种个别微生物菌株的初始转座子诱变微生物菌株文库，在所述多种个别菌株的每种菌株内发现独特基因变异，其中所述独特基因变异各自包含一或多种随机整合的转座子。
20.根据权利要求19所述的方法，进一步包含：
c)从所述转座子诱变微生物菌株文库中选择出所测量表型变量的性能相较于所述基本微生物菌株的表型性能展现增强的菌株。
21.根据权利要求19所述的方法，其中利用转座子和转座酶蛋白质的复合物将所述转座子引入所述基本微生物菌株中，所述复合物允许所述转座子活体内转座至所述基本微生物菌株的基因组中。
22.根据权利要求19所述的方法，其中所述转座酶蛋白质来源于EZ-Tn5转座体系统。
23.根据权利要求19所述的方法，其中所述转座子是功能丧失型LoF转座子或功能获得型GoF转座子。
24.根据权利要求23所述的方法，其中所述功能丧失型转座子包含标记。
25.根据权利要求24所述的方法，其中所述标记是反向可选标记。
26.根据权利要求23所述的方法，其中所述功能获得型转座子包含溶解性标签、启动子或反向选择标记。
27.根据权利要求19所述的方法，其中所述微生物菌株是原核生物。
28.根据权利要求19所述的方法，其中所述微生物菌株来自选自由以下组成的群组的属：农杆菌属、脂环酸芽孢杆菌属、念珠藻属、倒囊藻属、不动杆菌属、酸热菌属、节杆菌属、固氮菌属、芽孢杆菌属、双叉杆菌属、短杆菌属、丁酸弧菌属、布赫纳氏菌属、野油菜、弯曲杆菌属、梭菌属、棒状杆菌属、红硫菌属、粪球菌属、埃希氏杆菌属、肠球菌属、肠杆菌属、欧文菌属、梭杆菌属、粪栖杆菌属、弗朗西斯氏菌属、黄杆菌属、土芽孢杆菌属、嗜血杆菌属、螺旋杆菌属、克雷伯氏菌属、乳杆菌属、乳球菌属、泥杆菌属、微球菌属、微杆菌属、中间根瘤菌属、甲基杆菌属、甲基杆菌属、分枝杆菌属、奈瑟菌属、泛菌属、假单胞菌属、原绿球藻属、红细菌属、红假单胞菌属、红假单胞菌属、罗斯氏菌属、红螺菌属、红球菌属、栅列藻属、链霉菌属、链球菌属、聚球藻属、糖单孢菌属、糖多孢菌属、葡萄球菌属、沙雷氏菌属、沙门氏菌属、志贺杆菌属、嗜热厌氧杆菌属、养障体、土拉热菌属、蒂梅丘拉、嗜热聚球藻属、热球菌属、脲原体属、黄单胞菌属、木杆菌属、耶尔森氏菌属和发酵单胞菌属。
29.根据权利要求19所述的方法，其中所述微生物菌株是刺糖多孢菌。
30.根据权利要求19所述的方法，其中所述微生物菌株是大肠杆菌。
31.根据权利要求19所述的方法，其中所述微生物菌株是真核生物。
32.一种用于改良生产性微生物菌株的表型性能的HTP转座子诱变方法，包含以下步骤：
a.通过转座子诱变对基本微生物菌株的基因组进行工程改造，借此创建包含多种个别菌株的初始转座子诱变微生物菌株文库，在所述多种个别菌株的每种菌株内发现独特基因变异，其中所述独特基因变异各自包含一或多种转座子；
b.针对优于参考菌株的表型性能改良，筛选和选择所述初始转座子诱变微生物菌株文库中的个别微生物菌株，借此鉴别赋予表型性能改良的独特基因变异；
c.提供各自包含独特基因变异组合的后续多种微生物菌株，所述独特基因变异来自前一步骤所筛选的至少两种个别菌株中存在的基因变异，借此创建后续转座子诱变微生物菌株文库；
d.针对优于参考微生物菌株的表型性能改良，筛选和选择所述后续转座子诱变微生物菌株文库中的个别菌株，借此鉴别出赋予额外表型性能改良的独特基因变异组合；以及e.以线性或非线性方式重复步骤c)-d)一或多次，直到菌株相较于所述生产性微生物菌株的表型性能展现经改良的表型性能的期望水平，其中每次后续迭代创建新的转座子诱变微生物菌株文库，其中新文库中的每种微生物菌株包含基因变异，所述基因变异是选自前一个文库的至少两种个别微生物菌株的基因变异的组合。
33.根据权利要求32所述的用于改良生产性微生物菌株的表型性能的HTP转座子诱变方法，其中所述后续转座子诱变微生物菌株文库是所述初始转座子诱变微生物菌株文库的部分组合文库。
34.根据权利要求32所述的用于改良生产性微生物菌株的表型性能的HTP转座子诱变方法，其中所述后续转座子诱变微生物菌株文库是所述初始转座子诱变微生物菌株文库的完整组合文库的子集。
35.根据权利要求32所述的用于改良生产性微生物菌株的表型性能的HTP转座子诱变方法，其中所述后续转座子诱变微生物菌株文库是前一个转座子诱变微生物菌株文库的部分组合文库。
36.根据权利要求32所述的用于改良生产性微生物菌株的表型性能的HTP转座子诱变方法，其中所述后续转座子诱变微生物菌株文库是前一个转座子诱变微生物菌株文库的完整组合文库的子集。
37.根据权利要求32所述的用于改良生产性微生物菌株的表型性能的HTP转座子诱变方法，其中重复步骤c)-d)直到后续转座子诱变微生物菌株文库的微生物菌株的表型性能在所测量表型变量上相较于所述生产性微生物菌株的表型性能展现至少10％增强。
38.根据权利要求32所述的用于改良生产性微生物菌株的表型性能的HTP转座子诱变方法，其中重复步骤c)-d)直到后续转座子诱变微生物菌株文库的微生物菌株的表型性能在所测量表型变量上相较于所述生产性微生物菌株的表型性能展现至少一倍的增强。
39.根据权利要求32所述的用于改良生产菌株的表型性能的HTP转座子诱变方法，其中步骤e)的所述经改良的表型性能选自由以下组成的群组：所关注产物的体积生产率、所关注产物的比生产率、所关注产物的产量、所关注产物的效价、所关注产物的生产增加或更有效，所关注的所述产物选自由以下组成的群组：小分子、酶、肽、氨基酸、有机酸、合成化合物、燃料、乙醇、初级细胞外代谢物、次级细胞外代谢物、细胞内组分分子，和其组合。
40.根据权利要求32所述的用于改良生产性微生物菌株的表型性能的HTP转座子诱变方法，其中所述转座子是功能丧失型LoF转座子或功能获得型GoF转座子。
41.根据权利要求40所述的用于改良生产性微生物菌株的表型性能的HTP转座子诱变方法，其中所述功能丧失型转座子含有标记或反向可选标记。
42.根据权利要求40所述的用于改良生产性微生物菌株的表型性能的HTP转座子诱变方法，其中所述功能获得型转座子含有启动子、溶解性标签，或反向可选标记。
43.根据权利要求32所述的用于改良生产性微生物菌株的表型性能的HTP转座子诱变方法，其中所述生产性微生物菌株是原核生物。
44.根据权利要求32所述的用于改良生产性微生物菌株的表型性能的HTP转座子诱变方法，其中所述生产性微生物菌株来自选自由以下组成的群组的属：农杆菌属、脂环酸芽孢杆菌属、念珠藻属、倒囊藻属、不动杆菌属、酸热菌属、节杆菌属、固氮菌属、芽孢杆菌属、双叉杆菌属、短杆菌属、丁酸弧菌属、布赫纳氏菌属、野油菜、弯曲杆菌属、梭菌属、棒状杆菌属、红硫菌属、粪球菌属、埃希氏杆菌属、肠球菌属、肠杆菌属、欧文菌属、梭杆菌属、粪栖杆菌属、弗朗西斯氏菌属、黄杆菌属、土芽孢杆菌属、嗜血杆菌属、螺旋杆菌属、克雷伯氏菌属、乳杆菌属、乳球菌属、泥杆菌属、微球菌属、微杆菌属、中间根瘤菌属、甲基杆菌属、甲基杆菌属、分枝杆菌属、奈瑟菌属、泛菌属、假单胞菌属、原绿球藻属、红细菌属、红假单胞菌属、红假单胞菌属、罗斯氏菌属、红螺菌属、红球菌属、栅列藻属、链霉菌属、链球菌属、聚球藻属、糖单孢菌属、糖多孢菌属、葡萄球菌属、沙雷氏菌属、沙门氏菌属、志贺杆菌属、嗜热厌氧杆菌属、养障体、土拉热菌属、蒂梅丘拉、嗜热聚球藻属、热球菌属、脲原体属、黄单胞菌属、木杆菌属、耶尔森氏菌属和发酵单胞菌属。
45.根据权利要求32所述的用于改良生产性微生物菌株的表型性能的HTP转座子诱变方法，其中所述生产性微生物菌株是刺糖多孢菌。
46.根据权利要求32所述的用于改良生产性微生物菌株的表型性能的HTP转座子诱变方法，其中所述生产性微生物菌株是大肠杆菌。
47.根据权利要求32所述的用于改良生产性微生物菌株的表型性能的HTP转座子诱变方法，其中所述生产性微生物菌株是真核生物。
48.根据权利要求9所述的HTP基因组工程改造方法，其中所述标记是反向可选标记。