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非小细胞癌的诊断方法

阅读:808发布:2021-04-12

专利汇可以提供非小细胞癌的诊断方法专利检索,专利查询,专利分析的服务。并且本 发明 公开了使用差异表达基因检测非小细胞 肺 癌的方法。还提供了新的人基因,该基因在非小细胞肺癌中的表达与非癌组织中的相比升高。另外还公开了鉴定可用于 治疗 和 预防 非小细胞肺癌的化合物的方法。,下面是非小细胞癌的诊断方法专利的具体信息内容。

1.一种诊断受试者中的非小细胞癌或患非小细胞肺癌倾向性的方 法,该方法包括测定源自该受试者的生物样品中非小细胞肺癌相关基因的 表达平,其中所述水平与该基因的正常对照水平相比升高或降低表明该 受试者患有或易患非小细胞肺癌,其中所述非小细胞肺癌相关的基因选自 NSC 807-1294,1296-1448组成的组,其中所述水平与正常对照水平相比升 高表明所述受试者患有或易患非小细胞肺癌。
2.权利要求1所述方法,其中所述的升高为比所述正常对照水平高至 少10%。
3.权利要求1所述方法,其中所述非小细胞肺癌相关基因选自NSC 1-806组成的组,其中所述水平与正常对照水平相比降低表明该受试者患有 或易患非小细胞肺癌。
4.权利要求3所述方法,其中所述的降低为比所述正常对照水平低至 少10%。
5.权利要求1所述方法,其中该方法还包括测定多个非小细胞肺癌相 关基因的所述水平。
6.权利要求1所述方法,其中所述水平用选自下组的任一方法测定:
(1)检测非小细胞肺癌相关基因的mRNA;
(2)检测非小细胞肺癌相关基因编码的蛋白;以及
(3)检测非小细胞肺癌相关基因所编码蛋白的生物活性。
7.权利要求1所述方法,其中所述水平是通过检测非小细胞肺癌相关 基因探针与所述来自患者的生物样品的基因转录物之间的杂交而测定的。
8.权利要求7所述方法,其中所述的杂交步骤是在DNA阵列上实施 的。
9.权利要求1所述方法,其中所述生物样品包括痰或血液。
10.一种非小细胞肺癌参照表达图谱,包括选自NSC 1-1294,1296-1448 组成的组的两或多个基因的基因表达模式。
11.鉴定能抑制非小细胞肺癌-相关基因的表达或活性的化合物的方法, 该方法包括下列步骤:
(1)使表达所述非小细胞肺癌相关基因的受试细胞与受试化合物接触
(2)检测所述非小细胞肺癌相关基因的表达水平;以及
(3)检测使所述表达水平与所述基因的正常对照水平相比受抑制的化 合物,所述化合物可作为所述非小细胞肺癌相关基因的抑制剂
12.权利要求11所述方法,其中所述受试细胞为NSCLC细胞。
13.鉴定增强非小细胞肺癌-相关基因的表达或活性的化合物的方法, 该方法包括下列步骤:
(1)使表达非小细胞肺癌相关基因的受试细胞与受试化合物接触;
(2)检测所述非小细胞肺癌相关基因的表达水平;以及
(3)测定使所述表达水平与所述基因的正常对照水平相比升高的化合 物,所述化合物可作为所述非小细胞肺癌相关基因的增强物。
14.权利要求13所述方法,其中所述受试细胞为NSCLC细胞。
15.一种筛选用于治疗预防非小细胞肺癌的化合物的方法,该方法包 括下列步骤:
(1)使受试化合物与选自NSC 1-1294,1296-1448组成的组的多核苷酸 所编码的多肽接触;
(2)测定所述多肽与受试化合物之间的结合活性;以及
(3)选出与所述多肽结合的化合物。
16.一种筛选用于治疗或预防非小细胞肺癌的化合物的方法,该方法包 括下列步骤:
(a)使受试化合物与选自NSC 1-1294,1296-1448组成的组的多核苷酸 所编码的多肽接触;
(b)检测步骤(a)的多肽的生物活性;以及
(c)选出这样的化合物,所述化合物使选自NSC 807-1294,1296-1448 组成的组的多核苷酸所编码多肽的生物活性与没有该受试化合物时检测到 的生物活性相比受到抑制,或者使选自NSC 1-806组成的组的多核苷酸所 编码多肽的生物活性与没有该受试化合物时检测到的生物活性相比升高。
17.权利要求16所述方法,其中所述的生物活性为细胞增殖活性。
18一种筛选用于治疗或预防非小细胞肺癌的化合物的方法,该方法包 括下列步骤:
(1)使受试化合物与表达一或多个标记基因的细胞接触,其中所述的一 个或多个标记基因选自NSC 1-1294,1296-1448组成的组;以及
(2)选出化合物,其可降低选自NSC 807-1294,1296-1448组成的组的 一个或多个标记基因的表达水平或者提高选自NSC 1-806组成的组的一个 或多个标记基因的表达水平。
19.权利要求18所述方法,其中所述细胞为NSCLC细胞。
20.一种筛选用于治疗或预防非小细胞肺癌的化合物的方法,该方法包 括下列步骤::
(1)使受试化合物与导入了一种载体的细胞接触,该载体含有一个或多 个标记基因的转录调控区以及在所述转录调控区控制下表达的报道基因, 其中所述一种或多个标记基因选自NSC 1-1294,1296-1448组成的组;
(2)测定所述报道基因的表达水平或活性;以及
(3)选出化合物,其中与缺乏受试化合物时检测到的表达水平或活性相 比,当所述报道基因是选自NSC 807-1294,1296-1448组成的组的上调的标 记基因时所述化合物使所述报道基因的表达水平或活性降低,或者当所述 报道基因是选自NSC 1-806组成的组的下调的标记基因时所述化合物使所 述报道基因的表达水平或活性升高。
21.一种试剂盒,其中含有两种或多种检测试剂,所述检测试剂能够与 选自NSC1-1294,1296-1448组成的组的一种或多种基因或其编码的多肽结 合。
22.一种阵列,其包含两种或多种多核苷酸,所述多核苷酸能够与选自 NSC1-1294,1296-1448组成的组的一种或多种基因结合。
23.反义组合物在制备用于治疗或预防非小细胞肺癌的药物组合物中 的用途,其中所述组合物含有与选自NSC 807-1294,1296-1448组成的组的 基因的编码序列互补的核苷酸序列。
24.siRNA组合物在制备用于治疗或预防非小细胞肺癌的药物组合物 中的用途,其中所述组合物能降低选自NSC 807-1294,1296-1448组成的组 的基因的表达。
25.药学有效量的抗体或其片段在制备用于治疗或预防非小细胞肺癌 的药物组合物中的用途,该抗体或其片段能与选自NSC 807-1294, 1296-1448组成的组的基因编码的多肽结合。
26.选自NSC 807-1294,1296-1448组成的组的基因编码的多肽或所述 多肽的免疫活性片段,或者编码所述多肽的多核苷酸在制备用于治疗或预 防非小细胞肺癌的药物组合物中的用途,其中所述药物组合物是疫苗
27.能够提高选自NSC 1-806组成的组的基因的表达或活性的化合物 在制备用于治疗或预防非小细胞肺癌的药物组合物中的用途。
28.用权利要求11-20中任一项所述方法获得的化合物在制备用于治疗 或预防非小细胞肺癌的药物组合物中的用途。
29.药学有效量的选自NSC 1-806组成的组的多核苷酸或其编码的多 肽在制备用于治疗或预防非小细胞肺癌的药物组合物中的用途。
30.一种用于治疗或预防非小细胞肺癌的组合物,该组合物含有药学有 效量的针对选自NSC 807-1294,1296-1448组成的组的基因的反义多核苷酸 或siRNA。
31.一种用于治疗或预防非小细胞肺癌的组合物,该组合物含有药学有 效量的抗体或其片段,所述抗体或其片段能与选自NSC 807-1294, 1296-1448组成的组的基因编码的多肽结合。
32.一种用于治疗或预防非小细胞肺癌的组合物,该组合物含有药学有 效量的用权利要求11-20之一的方法选出的化合物作为活性成分,并包含可 药用的载体。
33.一种多肽,该多肽选自以下物质组成的组:
(a)包含SEQ ID NO:2所示基酸序列的多肽;
(b)一种多肽,其包含SEQ ID NO:2所示氨基酸序列,其中最多有5 %的氨基酸被取代、缺失、插入和/或添加,且所述多肽具有与由SEQ ID NO: 2所示氨基酸序列组成的蛋白等同的生物活性;以及
(c)多核苷酸编码的多肽,所述多核苷酸在严谨条件下与SEQ ID NO: 1所示核苷酸序列组成的基因杂交,其中该多肽具有与由SEQ ID NO:2所 示氨基酸序列组成的蛋白等同的生物活性。
34.一种多核苷酸,该多核苷酸编码权利要求33所述的多肽。
35.权利要求34所述的多核苷酸,其包含SEQ ID NO:1所示的核苷 酸序列。
36.一种载体,其中含有权利要求34所述多核苷酸。
37.一种宿主细胞,其中包含权利要求34所述多核苷酸或者含有该多 核苷酸的载体。
38.一种用于制备权利要求33所述多肽的方法,该方法包括下列步骤:
(1)培养宿主细胞,该宿主细胞包含编码权利要求33所述多肽的多核 苷酸或者含该多核苷酸的载体;
(2)使所述宿主细胞表达所述多肽;以及
(3)收集所表达的多肽。
39.一种能与权利要求33所述多肽结合的抗体。
40.一种多核苷酸,所述多核苷酸与权利要求34所述多核苷酸或其互 补链互补,且含有至少15个核苷酸。
41.一种针对权利要求34所述多核苷酸的反义多核苷酸或siRNA。
42.一种反义多核苷酸,选自包含SEQ ID NO:423,425,427,429, 431,433,435,437,439,441,443,445,447,449,451,453,455, 457,459,461,463,465,467,469,471,473,475,477,479,481, 483,485,487,489,491,493,495,497,499,501,503,505,507, 509,511,513,515,517,519,521,523,525,527,529或531所示 核苷酸序列的多核苷酸组成的组。
43.一种siRNA,选自包含作为靶序列的SEQ ID NO:533,534,535, 536,537,538,539,540,541,542,543,544,545,546,547,548, 549,550,551或552所示核苷酸序列的多核苷酸组成的组。
44.一种用于治疗或预防非小细胞肺癌的组合物,该组合物含有药学有 效量的权利要求42所述反义多核苷酸。
45.一种用于治疗或预防非小细胞肺癌的组合物,该组合物含有药学有 效量的权利要求43所述siRNA。
46.权利要求44所述反义组合物在制备用于治疗或预防非小细胞肺癌 的药物组合物中的用途。
47.权利要求45所述siRNA组合物在制备用于治疗或预防非小细胞肺 癌的药物组合物中的用途。
48.一种用于治疗或预防非小细胞肺癌的药物组合物,该组合物含有药 学有效量的权利要求33所述多肽或编码该多肽的多核苷酸。
49.权利要求48所述药物组合物,其中所述的多核苷酸被掺入表达载 体。
50.选自NSC 807-1294,1296-1448组成的组的基因编码的多肽或所述 多肽的免疫活性片段,或者编码该多肽或片段的多核苷酸在制备用于诱导 抗肿瘤免疫的药物组合物中的用途。
51.权利要求50所述的用途,还包括施用抗原呈递细胞。

说明书全文

申请是申请日为2003年9月22日、申请号为03825506.5、题目为 “非小细胞癌的诊断方法”的发明专利申请的分案申请。

本申请涉及2002年9月30日提交的USSN60/414,673、2003年2月 28日提交的USSN60/451,374和2003年4月28日提交的USSN60/466,在此 引入作为参考。

发明领域

本发明涉及生物学领域,更具体地涉及癌症研究领域。具体而言,本 发明涉及非小细胞肺癌的诊断方法,以及在这类癌性细胞中的表达升高或 降低了的基因。

背景技术

肺癌是人类最常见的致命性肿瘤之一。现已报道了许多与肺癌发生和 发展有关的遗传变化。尽管遗传变化可以帮助预后并预测转移的险或对 一些治疗的应答,但是关于单个或有限数量的分子标记的信息通常不能为 非小细胞肺癌(NSCLC)的临床诊断提供令人满意的结果(Clin Cancer Res 6: 4055-63(2000);Niklinski et al.,Lung Cancer.34 Suppl 2:S53-8 (2001); Watine,Bmj 320:379-80(2000))。非小细胞肺癌(NSCLC)是目前最常见的 类型,占全部肺肿瘤的近80%(Society,A.C.Cancer Facts and Figures 2001, 2001.)。尽管多种-模式(multi-modality)治疗中进来的进展,但是总的10-年 存活率仍保持在10%的低平,这主要是因为大多数NSCLC直到晚期才能 诊断出来(Fry,W.A.,Phillips,J.L,and Menck,H.R.Ten-year survey of lung cancer treatment and survival in hospitals in the United States:a national cancer data base report,Cancer.86:1867-76.,1999.)。尽管基于铂的化疗方 案被认为是NSCLC治疗的参照标准,但是那些药物仅能将晚期NSCLC患 者的存活时间延长大约6周(Chemotherapy in non-small cell lung cancer:a meta-analysis using updated data on individual patients from 52 randomised clinical trials.Non-small Cell Lung Cancer Collaborative Group,Bmj.311: 899-909.,1995.)。现正研究这种疾病的多种靶向治疗方法,其中包括酪 酸激酶抑制剂,但是迄今为止仅在有限数量的患者中获得了满意的效果, 而一些接受者甚至出现了严重的不良反应(Kris M,N.R.,Herbst RS A phase II trial of ZD1839(′Iressa′)in advanced non-small cell lung cancer(NSCLC) patients who had failed platinum-and docetaxel-based regimens(IDEAL 2)., Proc Am Soc Clin Oncol.21:292a(A1166),2002)。
cDNA微阵列技术已经能够从正常和恶性细胞中获取全面的基因表达 图谱,并将恶性细胞中的基因表达与相应的正常细胞中的基因表达进行比 较(Okabe et al.,Cancer Res 61:2129-37(2001);Kitahara et al.,Cancer Res 61: 3544-9(2001);Lin et al.,Oncogene 21:4120-8(2002);Hasegawa et al.,Cancer Res 62:7012-7(2002))。这种方法能够揭示癌细胞的复杂特性,并有助于理 解致癌作用的机理。鉴定出肿瘤中那些去调节的基因可以更加精确和准确 地诊断个体的癌症,从而开发出新的治疗靶标(Bienz and Clevers,Cell 103:311-20(2000))。为了从基因组度揭示肿瘤的发生机理,并且发现诊 断用的靶标分子以及开发出新的治疗药物,本发明人用23040个基因组成 的cDNA微阵列对肿瘤细胞的表达图谱进行了分析(Okabe et al.,Cancer Res 61:2129-37(2001);Kitahara et al.,Cancer Res 61:3544-9(2001);Lin et al., Oncogene 21:4120-8(2002);Hasegawa et al.,Cancer Res 62:7012-7(2002))。
为揭示致癌机理而设计的实验已经促进了抗-肿瘤剂的分子靶标的鉴 定。例如,最初为抑制与Ras相关的生长-信号途径而设计的法呢基转移酶 (farnexyltransferase)(FTI)抑制剂已经能有效治疗动物模型中的Ras-依赖性 肿瘤,其中Ras的活化依赖于翻译后法呢基化(He et al.,Cell 99:335-45 (1999))。已使用抗-肿瘤药物与抗-HER2单克隆抗体trastuzumab的组合对人 进行临床实验,以拮抗对抗原癌基因受体HER2/neu;并且改善了乳腺癌 患者的临床反应和总存活率(Lin et al.,Cancer Res 6l:6345-9(2001))。一种 能够选择性抑制bcr-abl融合蛋白的酪氨酸激酶抑制剂STI-571已经被开发 用于治疗慢性骨髓性白血病(chronic myelogenous leukemia),其中bcr-abl酪 氨酸激酶的组成性活化在白细胞转化中发挥着重要的作用。这些种类的药 剂被设计用于抑制具体基因产物的致癌活性(Fujita et al.,Cancer Res 61:7722-6(2001))。因此,癌性细胞中通常上调的基因产物可以用作开发新 型抗癌药物的潜在靶标。
已证明CD8+细胞毒T淋巴细胞(CTL)识别来自MHCI类分子呈递的肿 瘤相关抗原(TAA)的表位肽,并溶解肿瘤细胞。自从发现MAGE家族作为 TAA的第一个实例,用免疫学方法已发现了许多其它的TAA(Boon,Int J Cancer 54:177-80(1993);Boon and van der Bruggen,J Exp Med 183:725-9 (1996);van der Bruggen等,Science 254:1643-7(1991);Brichard等,J Exp Med 178:489-95(1993);Kawakami等,J Exp Med 180:347-52(1994))。一些 已经发现的TAA目前正处于作为免疫治疗靶点的临床开发阶段。迄今为止 已经发现的TAA包括MAGE(van der Bruggen等,Science 254:1643-7 (1991)),gp100(Kawakami等,J Exp Med 180:347-52(1994)),SART(Shichijo 等,J Exp Med 187:277-88(1998))和NY-ESO-1(Chen等,Proc Natl Acad Sci USA 94:1914-8(1997))。另一方面,已证实的在肿瘤细胞中尤其过表达的基 因产物可作为诱导细胞免疫反应的靶点而被识别。这种基因产物包括 p53(Umano等,Brit J Cancer 84:1052-7(2001)),HER2/neu(Tanaka等,Brit J Cancer 84:94-9(2001)),CEA(Nukaya等,Int J Cancer 80:92-7(1999))等等。
尽管在关于TAA的基础和临床研究中取得了重要的进展(Rosenbeg等, Nature Med 4:321-7(1998);Mukherji等,Proc Natl Acad Sci USA 92:8078-82 (1995);Hu等,Cancer Res 56:2479-83(1996)),只有有限数量的候选TAA能 治疗腺癌,包括结肠直肠癌。在癌细胞中大量的表达,同时其表达限制在 癌细胞内的TAA是有希望的免疫治疗靶点的候选物(candidate)。此外,对诱 导有效且特异性抗肿瘤免疫反应的新型TAA的鉴定被预期能够促进肽接种 策略在多种类型癌中的临床使用(Boon and can der Bruggen,J Exp Med 183: 725-9(1996);van der Bruggen等,Science 254:1643-7(1991);Brichard等,J Exp Med 178:489-95(1993);Kawakami等,J Exp Med 180:347-52(1994); Shichijo等,J Exp Med 187:277-88(1998);Chen等,Proc Natl Acad Sci USA 94:1914-8(1997);Harris,J Natl Cancer Inst 88:1442-5(1996);Butterfield等, Cancer Res 59:3134-42(1999);Vissers等,Cancer Res 59:5554-9(1999);van der Burg等,J Immunol 156:3308-14(1996);Tanaka等,Cancer Res 57:4465-8 (1997);Fujie等,Int J Cancer 80:169-72(1999);Kikuchi等,Int J Cancer 81: 459-66(1999);Oiso等,Int J Cancer 81:387-94(1999))。
已有报道重复指出,来自具体健康供体的肽刺激的外周血单核细胞 (PBMC)对该肽产生响应而产生显著水平的IFN-γ,但在铬-51释放实验中几 乎不以HLA-A24或-A0201限制性图谱发挥针对肿瘤细胞的细胞毒作用 (Kawano等,Cance Res 60:3550-8(2000);Nishizaka等,Cancer Res 60: 4830-7(2000);Tamura等,Jpn J Cancer Res 92:762-7(2001))。但是,HLA-A24 和HLA-A0201均为一种在日本人以及高加索人中常见的HLA等位基因 (Date等,Tissue Antigens 47:93-101(1996);Kondo等,J Immunol 155: 4307-12(1995);Kubo等,J Immunol 152:3913-24(1994);Imanishi等, Proceeding of the eleventh International Hictocompatibility Workshop and Conference Oxford University Press,Oxford,1065(1992);Williams等,Tissue Antigen 49:129(1997))。因此,由这些HLA所呈递的癌抗原肽特别适用于 治疗日本人和高加索人中的癌症。此外,已知在体外诱导低亲和CTL通 常是使用高浓度肽的结果,所述高浓度肽的使用在抗原呈递细胞(APC)上生 成高水平特异性肽/MHC复合物,所述复合物将有效激活这些CTL (Alexander-Miller等,Proc Natl Acad Sci USA 93:4102-7(1996))。
发明概述
本发明基于与非小细胞肺癌有关的基因表达模式的发现,所述肺癌例 如鳞状细胞癌、腺癌(即,腺泡(acinar)、乳头状(papillary)和支气管肺泡 (bronchoalveolar))、大细胞癌(即,巨细胞和透明细胞)、腺鳞癌和未分化癌。
那些在非小细胞肺癌中差异性表达的基因在本申请中统称为“非小细 胞肺癌-相关基因”、“NSC核酸”或“NSC多核苷酸”,这些基因编码的多 肽称为“NSC多肽”或“NSC蛋白”。本申请中,在非小细胞肺癌中的差异 性表达表明基因在非小细胞肺癌细胞中的表达水平不同于在正常细胞中的 表达水平。正常细胞获自肺组织。
本发明提供了一种诊断或确定受试者中患非小细胞肺癌的倾向性的方 法,该方法通过测定患者来源的生物样品中非小细胞肺癌-相关基因的表达 水平进行。非小细胞肺癌-相关基因包括,例如非小细胞肺癌-相关基因包括, 例如,NSC 1-1448(参见表1-3)。与该基因的正常对照水平相比,该基因表 达水平的变化例如升高或降低,表明该受试者患有或易患非小细胞肺癌。
“正常对照水平”是指从正常健康个体或已知不患有非小细胞肺癌的 个体的群体中检测到的基因表达水平。对照水平是源自单个参照群体的单 一表达模式或者多种表达模式。与“正常对照水平”不同,“对照水平”是从 患病状态背景(即,癌的或非癌)已知的个体或个体群体中检测到的基因表达 水平。因此,对照水平可基于正常健康个体、已知不患非小细胞肺癌的个 体的群体、非小细胞肺癌患者或者所述患者群体中基因的表达水平来测定。 与非小细胞肺癌患者或患者群中基因表达水平相应的对照水平称为“非-小 细胞肺癌对照水平”。此外,所述对照水平可以是此前测试的细胞的表达 模式的数据库
在受试生物样品中检测到的NSC807-1448中的任意一个或一组(panel) 基因的表达水平与正常对照水平相比升高表明:该受试者(从所述受试者获 得了所述样品)患有或易患非小细胞肺癌。相反,在受试生物样品中检测到 NSC 1-806中的任意一个或一组基因的表达水平与正常对照水平相比降低 则表明:该受试者患有或易患非小细胞肺癌。可选,可以将生物样品中任 意一个或一组非小细胞肺癌-相关基因的表达水平与同一个或同一组基因的 非小细胞肺癌对照水平进行比较。
与对照水平相比基因表达升高或降低了10%,25%,50%或更多。或者, 基因表达与对照水平相比增加或减少了1、2、5或更多倍。可以通过检测 非小细胞肺癌-相关基因探针与源自患者的生物样品的基因转录物之间的杂 交(例如在芯片或阵列上)情况来测定所述表达。所述源自患者的生物样品可 以是源自受试者的,例如已知或疑似患有非小细胞肺癌的患者的任何样品。 例如,所述生物样品可以是含有痰、血液、血清、血浆或肺细胞的组织。
本发明还提供了一种非小细胞肺癌的参照表达图谱,其中含有NSC 1-1448中两个或多个的基因表达水平模式图。
本发明进一步还提供了用于鉴定可抑制或提高非小细胞肺癌相关基因 (例如,NSC 1-1448)的表达或活性的化合物的方法,该方法通过使表达非小 细胞肺癌相关基因的受试细胞与受试化合物接触,并测定该非小细胞肺癌 相关基因的表达水平或活性来进行。所述受试细胞可以是肺细胞例如肺上 皮细胞。表达水平与该基因的正常对照水平相比降低则表明该受试化合物 是所述非小细胞肺癌相关基因的表达或功能的抑制剂。因此,如果一种化 合物使非小细胞肺癌-相关基因NSC 807-1448的表达水平与正常对照水平 相比受到抑制,那么该化合物就有望能减轻非小细胞肺癌的症状。反之, 与该基因的正常对照水平相比表达水平或活性升高则表明:所述受试化合 物是所述非小细胞肺癌-相关基因的表达或功能的增强物。预期可提高非小 细胞肺癌-相关基因NSC 1-806表达水平的化合物能够减轻非小细胞肺癌的 症状。
另外,本发明还提供了一种筛选用于治疗或预防非小细胞肺癌的方法。 该方法包括:使NSC多肽与受试化合物接触,然后筛选出能与所述NSC多 肽结合或能改变所述NSC多肽生物活性的受试化合物。另外,本发明还提 供了一种筛选用于治疗或预防非小细胞肺癌的化合物的方法,该方法包括 下述步骤:使受试化合物与一种表达NSC蛋白或导入了一种载体的细胞接 触,该载体含有位于报道基因上游的NSC基因的转录调控区,然后筛选出 能改变NSC蛋白或所述报道基因所编码蛋白表达水平的受试化合物。根据 这些方法,当使用NSC 807-1448编码的多肽或者表达由NSC 807-1448或 NSC 807-1448转录调控区编码的蛋白的细胞时,预期使得所述生物活性或 表达水平与正常对照水平相比受抑制的受试化合物可以减轻非小细胞肺癌 的症状。可选,当使用NSC 1-806编码的多肽或者表达NSC 1-806或 NSC 1-806的转录调控区所编码蛋白的细胞时,预期升高所述表达水平的受 试化合物可以减轻非小细胞肺癌的症状。
本发明还提供了一种试剂盒,其中含有两种或多种检测试剂,该试剂 能够与一种或多种NSC核酸结合或者能够与NSC核酸的基因产物(例如, mRNA和多肽)结合。本发明还提供了能与一种或多种NSC核酸结合的多核 苷酸的阵列。
另外本发明还提供了治疗或预防非小细胞肺癌方法以及该方法所用的 组合物。治疗方法包括治疗或预防受试者中非小细胞肺癌的方法,该方法 通过向该受试者施用含有能够降低基因NSC 807-1448表达的反义、短干扰 RNA(siRNA)或者核酶的组合物,或者含有能与该基因所编码多肽结合并抑 制所述多肽功能的抗体或其片段的组合物来进行。
本发明还包括疫苗和接种方法。例如,通过向该受试者施用疫苗从而 实施治疗或预防非小细胞肺癌的方法,所述疫苗中含有多核苷酸NSC 807-1448编码的多肽或其免疫活性片段。免疫活性片段是一种长度比全长 天然蛋白短并且在导入机体时能够诱导免疫应答的多肽。例如,免疫活性 片段包括长度至少8个残基的多肽,所述多肽可在体内刺激免疫细胞诸如T 细胞或B细胞。免疫细胞刺激的测定可以通过检测细胞增殖、细胞因子(例 如,IL-2)加工(elaboration)或抗体生成来进行。
其它的治疗方法包括:向受试者施用一种能够提高基因NSC 1-806表 达水平或基因NSC 1-806所编码多肽的活性的化合物。可选,可以通过 施用NSC 1-806中的多核苷酸(例如,包含于载体中的多核苷酸)或者该多核 苷酸编码的多肽来治疗或预防非小细胞肺癌。另外,本发明提供了用于治 疗或预防非小细胞肺癌的方法,其中使用由本发明所述筛选方法选出的化 合物。
另一方面,本发明提供了一种基本上纯的多肽,其包含SEQ ID NO:2 所示氨基酸序列。可以通过替代、缺失、插入和/或添加至少1、2、3、5、 10、25、50、100或200个氨基酸使所述氨基酸序列发生突变,只要具有 所述氨基酸序列的多肽仍然保留由SEQ ID NO:2所示氨基酸序列组成的蛋 白的一种或多种生物学活性即可。所述突变多肽与包含SEQ ID NO:2所示 氨基酸序列的多肽之间具有至少85%,90%,95%或99%的同一性。另外 本发明还包括一种由能与SEQ ID NO:1所示核酸序列杂交的多核苷酸编码 的多肽。所述多核苷酸在严谨、中度严谨、或低度严谨条件下与SEQ ID NO: 1所示核苷酸序列杂交。
本申请中使用的术语“严谨(杂交)条件”是指在这样的条件下探针、 引物、寡核苷酸将与靶序列杂交,而不与其它任何序列杂交。严谨条件是 序列-依赖性的,因环境的不同而不同。较长序列发生特异性杂交的温度高 于较短序列。通常,严谨条件的温度设定为比特定序列在规定的离子强度 和pH条件下的热解链温度(Tm)低约5℃。Tm是指这样的温度,(在特定 离子强度、pH和核酸浓度下),在该温度达平衡时,与靶序列互补的探针的 50%与靶序列杂交。由于所述靶序列通常过量,在Tm达平衡时,50%的 探针被占据。通常,严谨条件是这样的条件,其中pH7.0-8.3时,盐浓度 小于约1.0M钠离子,通常为约0.01-1.0M钠离子(或其它盐),且温度对 于较短的探针、引物或核苷酸(例如,10-50个核苷酸)而言为至少约30℃, 对于较长的探针、引物或核苷酸而言为至少约60℃。严谨条件还可以通过 加入去稳定剂例如甲酰胺来实现。
本发明进一步还提供了编码本发明所述多肽的分离的多核苷酸。在本 申请中,分离的多核苷酸是指这样的多核苷酸,其结构与任何天然存在的 多核苷酸或与跨度超过3个独立基因的天然存在基因组多核苷酸的任何片 段不完全相同。因此,该术语包括,例如(a)DNA,它具有生物体基因组中 天然存在的天然基因组DNA分子的部分序列,其中所述DNA天然存在于 所述生物体中;(b)插入载体或插入原核或真核生物基因组DNA中的多核苷 酸,该插入方式使获得的分子与任何天然存在的载体或基因组DNA不相同; (c)分离的分子,如cDNA、基因组片段、聚合酶链式反应(PCR)产生的片段 或限制性酶切片段;和(d)重组核苷酸序列,其为杂合基因(即编码融合蛋白 的基因)的一部分。优选,该分离的核酸分子与SEQ ID NO:1所示核苷酸序 列的同一性为至少65%,70%,75%,80%,85%,90%,91%,92%,93%,94%, 95%,96%,97%,98%,99%或更高。当分离的多核苷酸比参照序列(例如SEQ ID NO:1)的长度更长或者相同时,所述比较是以参照序列的全长进行的。 当分离的多核苷酸比参照序列(例如SEQ ID NO:1)短,所述比较是以参照序 列的相同长度的片段进行的(排除同源性计算所需的任何环(loop))。
另外,本发明还提供了一种载体,其中含有一种或多种本申请所述的 核酸,以及一种含有本发明所述载体或核酸的细胞。本发明还涉及用含有 上述多核苷酸之一的载体转化了的宿主细胞。
本发明还提供了通过培养包含含有SEQ ID NO:1所示分离多核苷酸的 载体的细胞来制备本申请所述多肽的方法。
另一方面,本发明提供了一种能与SEQ ID NO:2所示多肽或其片段特 异性结合的抗体。所述抗体可以是单克隆或多克隆抗体。部分地,本发明 还提供了与本发明所述多核苷酸互补或反义的多核苷酸(例如反义DNA)、 核酶和siRNA(小干扰RNA)。所述多核苷酸构建体可用于检测本发明所述 多核苷酸,即诊断非小细胞肺癌,或者用于治疗或预防该疾病。
本发明进一步提供了反义多核苷酸,其具有SEQ ID NO:423,425, 427,429,431,433,435,437,439,441,443,445,447,449,451, 453,455,457,459,461,463,465,467,469,471,473,475,477, 479,481,483,485,487,489,491,493,495,497,499,501,503, 505,507,509,511,513,515,517,519,521,523,525,527,529, 或531所示的核苷酸序列。已证明具有这些核苷酸序列之一的多核苷酸都 能有效抑制NSCLC细胞系的病灶形成(focus formation)。
此外,本发明还提供了具有SEQ ID NO:533,534,535,536,537, 538,539,540,541,542,543,544,545,546,547,548,549,550, 551或552所示核苷酸序列的siRNA。已证明具有任一上述这些核苷酸序列 的siRNA都能有效地抑制NSCLC细胞系的细胞存活力。
本申请该提供了一种使用任一反义多核苷酸或siRNA治疗非小细胞肺 癌的药物组合物,以及使用该组合物治疗或者预防非小细胞肺癌的方法。
本发明还提供了用于治疗非小细胞肺癌的药物组合物,其含有一种具 有SEQ ID NO:2所示氨基酸序列的多肽、其功能等价物或者编码所述多肽 或其功能等价物的多核苷酸。可以将所述组合物中包含的多核苷酸引入载 体而在体内表达。
期望本发明药物组合物的作用过程(course)可抑制癌细胞的生长。所述 药物组合物可以用于包括人和家养哺乳动物(domesticated mammal)在内的 哺乳动物。
另外,本发明提供了通过施用上调的NSC多肽(例如,NSC 807-1448) 或其免疫片段或者编码它们的多核苷酸来诱导抗肿瘤免疫的方法。
除另有说明外,本申请中的所有科技术语的都具有与本发明所属领域 普通技术人员通常理解相同的含义。尽管与本申请中描述的方法及材料类 似或等同的方法及材料都可用于实施或检验本发明,但是下文仍还是对合 适的方法和材料进行了描述。本申请中引用的全部出版物、专利申请、专 利及其它参考文献其全部内容在此引入作为参考。如有抵触,以本说明书 包括定义为准。另外,所述材料、方法以及实施例都只是为了更好地说明, 而绝无意进行限制。
应该理解的是上述的发明概述和下面的详述部分都是优选的实施方 案,而决不构成对本发明或本发明替代实施方案的限制。
附图简述
图1图示的是印迹的照片,显示了用半定量RT-PCR证实的200个基 因在肺癌细胞中的过表达。肺癌细胞通过LCM方法获自肺癌患者。
图2图示了反义S-寡核苷酸在肺癌细胞系中的生长抑制作用,所述反 义S-寡核苷酸用于抑制NSC 810,NSC 811,NSC 812,NSC 825,NSC 841, NSC 857,NSC 859,NSC 893,NSC 905,NSC 947,NSC 956,NSC 994, NSC 1075,NSC 1107,NSC 1191和NSC 1389。图2图示了MTT实验的结 果,显示了NSC 810-AS,NSC 811-AS1,NSC 811-AS2,NSC 811-AS4,NSC 812-AS1,NSC 812-AS2,NSC 825-AS1,NSC 825-AS3,NSC 825-AS5,NSC 841-AS4,NSC 841-AS5,NSC 857-AS3,NSC 857-AS4,NSC 859-AS2,NSC 859-AS3,NSC 859-AS5,NSC 893-AS1,NSC 893-AS2,NSC 905-AS2,NSC 905-AS3,NSC 905-AS5,NSC 947-AS1,NSC 947-AS2,NSC 947-AS3,NSC 947-AS4,NSC 956-AS1,NSC 956-AS2,NSC 994-AS1,NSC 994-AS3,NSC 994-AS4,NSC 994-AS5,NSC 1075-AS5,NSC 1107-AS1,NSC 1107-AS4, NSC 1191-AS2,NSC 1191-AS4,NSC 1191-AS5和NSC 1389-AS对细胞生 长的抑制作用。
图3图示了siRNA(NSC 807-si1,NSC 810-si1,NSC 825-si1,NSC 825-si2,NSC 841-si1,NSC 841-si2,NSC 903-si1,NSC 903-si2,NSC 956-si1, NSC 956-si2,NSC 994-si1,NSC 1107-si1,NSC 1107-si2,NSC 1107-si3, NSC 1107-si4,NSC 1107-si5,NSC 1191-si2,NSC 1246-si2和NSC 1389-si2) 对肺癌细胞系的生长抑制作用。图3A图示了对用表达对照siRNA或靶 -siRNA的载体转染的A549细胞进行MTT实验的结果。图3B图示的是对 用表达对照-siRNA或靶-siRNA的载体转染的LC319细胞的进行MTT实验 的结果。图3C显示的是用siRNA转染的-LC319细胞的时间推移成像(time lapse imaging)分析的显微照片。图3D图示的是流式细胞分析的结果,显示 了siRNA转染的细胞的细胞周期图谱。图3E是照片,其显示用两种不同 单克隆抗体进行检测的Western印迹的结果,表明LC319细胞中天然蛋白 的表达情况以及被siRNA抑制的情况。图3F、G和H显示A549细胞中的 细胞色素c化酶(CCO)活性及其被COX17 RNAi抑制的情况。图3F是 CCO活性测定的示意图。图3G显示的是Western印迹的结果,其利用鼠 抗人线粒体单克隆抗体(MAB1273;CHEMICON,Temecula,CA)证实了由 COX17 RNAi转染的A549细胞的分级,该细胞的细胞质级分及线粒体级分。 图3H显示在转染后2或5天,抑制内源COX17基因导致CCO活性降低。
图4是照片,通过多-组织northern印迹分析对NSC 807,NSC 810,NSC 811,NSC 822,NSC 825,NSC 841,NSC 849,NSC 855,NSC 859,NSC 885, NSC 895,NSC 903,NSC 904,NSC 905,NSC 915,NSC 948,NSC 956, NSC 994,NSC 1000,NSC 1066,NSC 1075,NSC 1107,NSC 1113,NSC 1131, NSC 1141,NSC 1164,NSC 1183,NSC 1201,NSC 1240,NSC 1246,NSC 1254,NSC 1265,NSC 1277,NSC 1295,NSC 1306,NSC 1343,NSC 1362, NSC 1389,NSC 1399,NSC 1406,NSC 1413,和NSC 1420在不同人组织 中的表达进行的分析。
图5A是照片,显示通过免疫细胞化学分析观察到,NSC 849,NSC 855, NSC 895,NSC 915,NSC 948,NSC 1000,NSC 1103,NSC 1164,NSC 1201, NSC 1288,NSC 1295,NSC 1389,NSC 1420和NSC 1441在COS-7细胞 的亚细胞定位,其中所述COS-7细胞转染有c-myc-His标记的NSC-基因表 达载体,该实验使用抗-His单克隆抗体以及若丹明偶联的第二抗-鼠IgG抗 体用于显色。细胞核用DAPI复染。图5B显示照片,其显示对培养基中分 泌的c-myc标记的NSC 895,NSC 1164和NSC 1295进行Western印迹分析 的结果。
图6显示的是NSC-基因对用加c-myc-His标记的表达载体稳定转染的 COS-7细胞生长的影响。图6a显示通过Western印迹检测到的NSC 810, NSC 841和NSC 1389在稳定转染COS-7细胞中的表达。图6b显示的是 NSC 810、NSC 841和NSC 1389对COS-7细胞生长的影响。将表达高水平 NSC 810(COS7-TTK-1和2)、NSC 841(NIH3T3-URLC2-3和5)和NSC 1389(COS-7-NMU-2,3和5)的2或3种独立转化子以及对照(模拟)按一式 三份进行培养。通过MTT实验测定细胞存活力。
图7显示了通过自分泌(autocrine)系统测定的NMU对细胞生长的影 响。图7A显示的是NMU的自分泌实验结果。每48小时,向单独的COS-7 细胞添加NMU的25氨基酸多肽的活性形式(NMU-25)以及BSA(对照)蛋白。 添加后7天,用MTT实验计数细胞数目。图7B显示的是抗-NMU抗体对 经NMU-25处理过的COS-7细胞的生长抑制作用。图7C显示的是抗-NMU 抗体对内源性表达NMU的COS-7细胞的生长抑制作用。
图8显示Western印迹分析的结果,其证实了TTK蛋白在NSCLC细 胞系A549、LC319和NCI-H522中的过表达。
图9显示用抗-NSC 947抗体、抗-NSC 1164抗体、抗-NSC 1295抗体 和抗-NSC 1389抗体,对包括腺癌、鳞状细胞癌以及正常肺在内的临床样 品中的NSC 947、NSC 1164、NSC 1295和NSC 1389进行免疫组织化学染 色的结果。
发明详述
本申请中使用的“一”、“一种”及“所述”除另有专说明外都是指“至 少一(种)”。
本发明部分地基于下述发现之上:在取自肺癌患者的原发肺癌组织的 肺细胞中,多种基因的表达模式发生变化。通过综合性cDNA微阵列系统 鉴定出了基因表达水平的差异。
对23040个基因进行了cDNA微阵列分析,以选出在非小细胞肺癌患 者中通常过表达或者被抑制的基因。发现1448个基因呈现本发明所述的差 异性表达。其中,642个基因被上调,806个基因被下调。.
通过反义S-寡核苷酸和/或siRNA技术对上述微阵列分析鉴定出的基 因进行进一步筛选,以鉴定出可作为开发治疗药物或免疫疗法的靶标的侯 选基因。反义S-寡核苷酸和siRNA是短的合成DNA/RNA序列,能够与靶 基因对应的特异性mRNA链杂交(Jansen and Zangemeister-Wittke,Lancet Oncol 3:672-83(2002);Brummenlkamp et al.,Science 296:550-3(2002))。 通过与mRNA结合,反义寡核苷酸阻止靶基因翻译成为蛋白,从而阻断所 述基因起作用(Jansen and Zangemeister-Wittke,Lancet Oncol 3:672-83 (2002))。相反,siRNA是一种序列-特异性的双链RNA,将其导入细胞可以 导致不可遗传性后生(epigenetic)的基因功能敲除,从而使对所述靶基因中的 无效突变进行表型模拟(phenocopy)(Brummenlkamp et al.,Science 296:550-3 (2002))。这种利用非小细胞肺癌的整合型基因的表达数据库和上调基因的 后生敲除(epigenetic knock-down)的组合方法,为快速鉴定和评估靶分子以 进行个性化治疗提供了一种强有力的手段。现已鉴定出了能够调节NSCLC 细胞生长、增殖和/或存活的基因。这些基因编码在自分泌、细胞循环/生长 和信号转导中发挥作用的蛋白,或者功能未知的产物。
本申请中鉴定的差异性表达的基因可用于诊断,以及开发用于抑制非 小细胞肺癌的基因靶向型疗法。
在非小细胞肺癌患者中的表达水平受到调节(即,升高或降低)的基因概 括于表1-3,本申请中统称为“非-小细胞肺癌-相关基因(non-small cell lung cancer-associated genes)”、“NSC基因“、“NSC核酸”或“NSC多核苷酸”, 这些基因编码的多肽称为“NSC多肽”或“NSC蛋白”。除另有说明外, “NSC”是指本申请公开的任一序列(例如,NSC 1-1448)。这些基因此前已 经描述过,一并给出其数据库登录号。 NSC 编号 LMMID Acc 代号 名称 1 A2125 M31452 C4BPA 补体成分4-结合蛋白,α(complement component 4-binding protein,alpha) 2 A0386 K02215 SERPINA 8 丝氨酸(或半胱氨酸)蛋白酶抑制因子,进化支 (clade)A(α抗蛋白酶,抗胰蛋白酶),成员8(serine(or cysteine)proteinase inhibitor,clade A(alpha antiproteinase,antitrypsin),member 8) 3 B3893 AA573809 ITLN Intelectin 4 A0038N W73825 TCF21 转录因子21(transcription factor 21) 5 C8088 D87465 KIAA0275 KIAA0275基因产物(KIAA0275 gene product) 6 D1273 AJ001015 RAMP2 受体(降素)活性调节蛋白2(receptor(calcitonin) activity modifying protein 2) 7 C7138 X64559 TNA tetranectin(血纤蛋白溶酶原-结合蛋白)(tetranectin (plasminogen-binding protein)) 8 C7919 X79981 CDH5 钙粘素5,2型,VE-钙粘素(血管上皮)(cadherin 5, type 2,VE-cadherin(vascular epithelium)) 9 A2202 AJ001016 RAMP3 受体(降钙素)活性调节蛋白 3(receptor(calcitonin) activity modifying protein 3) 10 A0960 U60115 FHL1 四个半LIM结构域1(four and a half LIM domains 1) 11 A0760 L05568 SLC6A4 溶质载体蛋白家族6(神经递质转运物,五羟色胺), 成员 4(solute carrier family 6(neurotransmitter transporter,serotonin),member 4) 12 A2415 M15856 LPL 脂蛋白脂酶(lipoprotein lipase) 13 A8600 AI200539 人(Homo sapiens)cDNA:FLJ22690 fis,克隆 HSI11134(Homo sapiens cDNA:FLJ22690 fis,clone HSI11134) 14 A4375N AB008109 RGS5 G蛋白信号调节物5(regulator of G protein signaling 5) 15 A0919N X55635 MRC1 甘露糖受体,C(mannose receptor C)1型 16 A6696 AA491502 C1QR 补体成分C1q受体(complement component C1q receptor) 17 B1090N AA156022 FLJ20798 不确定蛋白(hypothetical protein) 18 C0893 AA122287 GARP 糖蛋白A重复为主(glycoprotein A repetitions predominant) 19 C1603 U01317 HBB 血红蛋白(hemoglobin),β 20 C0724 AA573140 ESTs 21 C8046 X54380 PZP 妊娠区带蛋白(pregnancy-zone protein) 22 C6234 AI247176 DKFZP58 6L2024 DKFZP586L2024蛋白 23 B5155 W84893 AGTRL1 血管紧张素受体-样1(angiotensin receptor-like1) 24 A6358 AA533191 ESTs,略微近似于ALU7_人ALU亚家族SQ序列 污染警告条目(HUMAN ALU SUBFAMILY SQ SEQUENCE CONTAMINATION WARNING ENTRY)[人(H.sapiens)] 25 B3794N N94777 ESTs 26 B9790 AA054482 LOC51267 C-型凝集素-样受体(C-type lectin-like receptor) 27 C8228 L36033 SDF1 基质细胞衍生的因子(stromal cell-derived factor)1 28 E0733 AI459767 SPARCL1 SPARC-样1(mast9,hevin) 29 C2324 AA036631 ESTs 30 A2508 X03350 ADH2 乙醇脱氢酶2(I类),β多肽(alcohol dehydrogenase 2 (class I),beta polypeptide) 31 B7122 AA480009 人cDNA FLJ13569 fis,克隆PLACE1008369 32 A7775 AA922655 FGL2 纤维蛋白原-样2 33 A0702N AA449301 FLT1 fms-相关的酪氨酸激酶1(血管内皮生长因子 (vascular endothelial growth factor)/血管通透因子受 体(vascular permeability factor receptor)) 34 A4630 U89281 RODH 氧化性3α羟基类固醇脱氢酶(oxidative 3 alpha hydroxysteroid dehydrogenase);视黄醇脱氢酶(retino dehydrogenase);3-羟基类固醇表异构酶 (3-hydroxysteroid epimerase) 35 A1739 J02761 SFTPB 表面活性剂(surfactant),肺-相关蛋白 (pulmonary-associated protein)B 36 A6712 W76197 DLC1 在肝癌中缺失1(Deleted in liver cancer 1) 37 A4829N D63412 AQP4 水孔蛋白(aquaporin)4 38 B5205N AI096938 KIAA0758 KIAA0758蛋白 39 D4204 AA868130 ESTs,中度近似于C4BP_人C4B结合蛋白α链前 体(HUMAN C4B-BINDING PROTEIN ALPHA CHAIN PRECURSOR)[H.sapiens(人)] 40 C1604 AA044381 HSD11B1 羟基类固醇(hydroxylsteroid)(11-β)脱氢酶1 41 A2460 AF000959 CLDN5 封闭蛋白(claudin)5(velocardiofacial 综合症中缺失 的跨膜蛋白) 42 A3360 S77410 AGTR1 血管紧张素受体1 43 A1423 L38486 MFAP4 微纤丝(microfillar)-相关蛋白4 44 B9634 AI094298 ESTs 45 B8029 AI090219 ESTs 46 D8515 U21128 LUM 基膜聚糖(lumican) 47 A2195 AF022813 TM4SF7 跨膜4超家族成员7(transmembrane 4 superfamily member 7) 48 B8384 AA147582 ESTs 49 B8411 AA122240 人cDNA FLJ13612 fis,克隆PLACE 50 B9603 AI347579 ESTs 51 A6717 AA487952 SYNEB 突触核表达的基因(synaptic nuclei expressed gene)1b 52 D0946 AA780308 KSP37 ksp37蛋白 53 C6387 AI022180 ESTs 54 A2542 J02874 FABP4 脂肪酸结合蛋白4,脂肪细胞 55 A3412 M10321 VWF von Willebrand因子 56 A4043 AA777648 PMP22 外周髓磷脂蛋白(peripheral myelin protein)22 57 A1818N AA600048 CALD1 钙调蛋白结合(caldesmon)1 58 A2633N D13628 ANGPT1 血管生成素(angiopoietin)1 59 C4884 AA150200 ESTs,略微近似于tuftelin[小家鼠(M.musculus)] 60 B7922 AI004344 人cDNA:FLJ21042 fis,克隆CAE11204 61 D3758 AI193122 ESTs 62 A3037 D12763 IL1RL1 白细胞介素1受体-样1 63 D9082 AI123738 ESTs 64 A2403 S53911 CD34 CD34抗原 65 C7654 AA142989 ESTs 66 A1610 X58295 GPX3 谷胱甘肽过氧化物酶(glutathione peroxidase)3(血 浆) 67 A6545 M98479 TGM2 谷氨酰胺转移酶(transglutaminase)2(C多肽,蛋白-谷 氨酰胺-γ-谷氨酰转移酶) 68 A8531 AA634913 FBLN5 细胞微丝(fibulin)5 69 A7230 X03963 COL4A1 胶原,IV型,α1 70 B4240 AI218211 FXYD6 含FXYD结构域的离子转运调节因子(FXYD domain-containing ion transport regulator)6 71 B3933 AA487977 ETL ETL蛋白 72 D8933 AI239735 ESTs 73 E1622 AI985921 CAV1 陷窝蛋白(caveolin)1,细胞膜穴样内陷蛋白(caveolae protein),22kD 74 B9616 AI208877 NYD-SP21 睾丸发育-相关(Testes development-related) NYD-SP21 75 B7170N AA604083 PCDH18 原钙粘素(protocadherin)18 76 A6237 L05485 SFTPD 表面活性剂,肺-相关蛋白BD 77 A6665 AI279606 LOC55885 神经元特异性转录因子(neuronal specific transcription factor)DAT1 78 B4320 AA029815 C5ORF4 染色体5开放阅读框(chonromosome 5 open reading frame)4 79 B4291 T04932 人cDNA:FLJ21545 fis,克隆COL06195 80 B3695 AI090213 人(Homo sapiens)mRNA;cDNA DKFZp586E2023 (来自克隆DKFZp586E2023) 81 C9642 AA493650 人cDNA:FLJ23494 fis,克隆LNG01885 82 C0250 U20391 FOLR1 叶酸受体(folate receptor)1(成人) 83 A0701 U05291 FMOD 纤调蛋白(fibromodulin) 84 A7247N AA873533 人mRNA;cDNA DKFZp586N0121(来自克隆 DKFZp586N0121) 85 C1412 AA446539 ESTs 86 A2418 M96789 GJA4 缝管隙连接蛋白(gapjunction proten),α4,37kD(连 接蛋白(connexin)37) 87 D3727 AA843148 ESTs 88 B5421 AA648414 ESTs 89 C8253 AA599019 MEOX2 间充质同源框(mesenchyme hemeo box)2(生长停滞 -特异性同源框) 90 A0878 L13288 VIPR1 血管活性肠肽受体(vasoactive intestinal peptide receptor)1 91 B5175N AI350168 KIAA0833 KIAA0833蛋白 92 D5870 AA972840 ESTs 93 B8423 R65585 ESTs 94 B8392 AA971017 人cDNA FLJ12028 fis,克隆HEMBB1001850 95 A6099 W60630 FLJ21935 不确定蛋白FLJ21935 96 B4694 AA436726 DKFZP56 4D0764 DKFZP564D0764蛋白 97 B8366 AI342255 人cDNA FLJ20767 fis,克隆COL06986 98 C8048 X58840 TCF2 转录因子2,肝的;LF-B3;肝细胞核因子变体 (variant hepatic nuclear factor) 99 C7458 AI272261 MBP 髓磷脂性蛋白(myelin basic protein) 100 C1959 AA192426 KIAA0717 ESTs,略微近似于PEBP小鼠磷脂酰乙醇胺-结合蛋 白(MOUSE PHOSPHATIDYLETHANOLAMINE-BINDING PROTEIN)[小家鼠] 101 A3519 D82348 ATIC 5-氨基咪唑(aminoimidazole)-4-氨甲酰核糖核苷酸 甲酰基转移酶(carboxamide ribonucleotide formyltransferase)/IMP环水解酶(cyclohydrolase) 102 A2049 X67292 IGHM 免疫球蛋白重链恒定μ(immunoglobulin heavy constant mu) 103 A0694 M91211 AGER 高级糖基化作用终产物-特异性受体(advanced glycosylation end product-specific receptor) 104 A4491 L15388 GPRK5 G蛋白-偶联的受体激酶(G protein-coupled receptor kinase)5 105 A7286 AI301935 CFFM4 高亲合力免疫球蛋白ε受体β亚基(high affinity immunoglobulin epsilon receptor beta subunit) 106 B4137 AA148493 人cDNA:FLJ22300 fis,克隆HRC04759 l07 B5721N AI075111 人cDNA FLJ14054 fis,克隆HEMBB1000240 108 D5083 AA649967 ESTs 109 B6555N AA904865 KIAA1912 ESTs 110 A5690 AA927075 KIAA1029 突触后蛋白(synaptopodin) 111 A6436 AB014609 KIAA0709 内吞受体(endocytic receptor)(巨噬细胞甘露糖受体 家族(macrophage mannose receptor family) 112 B6700 AI215600 KIAA1300 KIAA1300蛋白 113 B0081N D59339 KIAA1529 人mRNA;cDNA DKFZp434I2420(来自克隆 DKFZp434I2420) 114 C7592 AA936619 DOK2 船坞蛋白(docking protein)2,56kD 115 C1703 W84753 人cDNA FLJ13510 fis,克隆PLACE1005146 116 D1811 AA594318 LOC51304 DHHC1蛋白 117 A2740 D85777 CDO1 半胱氨酸双加氧酶(cystein dioxygenase),I型 117 118 A1779N AF025534 LILRB5 白细胞免疫球蛋白-样受体,亚家族B(带有TM和 ITIM结构域),成员5(leukocyte immunoglobulin-like receptor,subfamily B(with TM and ITIM domains), member5) 119 C7721 AI333309 ESTs 120 A7094 U33749 TITF1 甲状腺转录因子1(thyroid transcription factor1) 121 B1352 M18786 AMY1A 淀粉酶(amylase),α1A;唾液(salivary) 122 A1871N AA778308 RNAE1 核糖核酸酶,RNAe A家族,1(胰腺)) 123 A4798N Y15724 ATP2A3 腺苷三磷酸酶,Ca++转运,遍在(ubiquitous) 124 B5442 AA633352 人cDNA:FLJ23067 fis,克隆LNG04993 125 B7814 AA455087 ESTs 126 A1617 X69490 TTN titin 127 A3536 J03040 SPARC 分泌的蛋白(secreted),酸性的(acidic),富含半胱氨 酸(cysteine-rich)(骨连接蛋白(osteonectin)) 128 A1150 M37033 CD53 CD53抗原 129 B2148 M61900 PTGDS 前列腺素D合成酶基因(prostaglandin D synthease gene) 130 A8156 AI148659 ESTs 131 C1520 D79303 COL14A1 胶原,XIV型,α1(粗纤维调节素)(collagen,type XIV,alpha 1(undulin)) 132 C9503 AA621124 ESTs,略微近似于ALU2_人ALU亚家族SQ序列 污染警告条目[人] 133 D3086 AA806358 ESTs 134 B4661 AA425371 PTPRD 蛋白酪氨酸磷酸酶,受体型,D 135 A0593 X76939 LAMA4 层粘连蛋白(laminin),α4 136 A0184 M59832 LAMA2 层粘连蛋白,α2(分区蛋白,先天性肌肉萎 缩)(laminin,alpha 2(merosin,congenital muscular dystrophy)) 137 B0565 AI090498 PCDH12 原钙粘素(protocadherin)12(protocadherin 12) 138 B7930 N21096 ESTs 139 B4396 W58589 ESTs 140 C0505 AA926639 FLJ11110 不确定蛋白FLJ11110 141 C0219 AA235013 AKAP2 一种激酶(PRKA)锚定蛋白(A kinase(PRKA)anchor protein)2 142 A1450 M33906 HLA-DQA 1 主要组织相容性复合体,II类,DQαl(major histocompatibility complex,classII,DQ alpha 1) 143 B1689 AA664472 人mRNA全长插入cDNA克隆EUROIMAGE 1913076(Homo sapiens mRNA full length insert cDNA clone EUROIMAGE 1913076) 144 C9556 N30188 ESTs 145 C7651 AA142875 ESTs 146 D9990 Z25109 ZP3A 透明带糖蛋白(zona pellucida glycoprotein)3a(精子受 体) 147 A1365 D10653 TM4SF2 跨膜4超家族成员2 148 A1147 M14354 F13A1 凝血因子XIII,A1多肽(coagulation factor XIII,A1 polypeptide) 149 A9462 AA055019 ESTs 150 A6567 C05229 PDK4 丙酸脱氢酶激酶(pyruvate dehydrogenase kinase), 同工酶4 151 A0774N M27717 CPA3 羧肽酶(carboxypeptidase)A3(肥大细胞(mast cell)) 152 B6631 AA968840 人HSPC285 mRNA,部分cds 153 A9546N AI076929 ESTs,略微近似于大鼠酶原粒膜蛋白同源物 (Homolog of rat Zymogen granule memebrane protein)[人] 154 C5014 AI185804 FN1 纤粘连蛋白(fibronectin)1 155 D4936 AI084457 NPR3 利尿钠肽受体(natriuretic peptide receptor)C/苷酸 环化酶(guanylate cyclase)C(心房纳尿肽受体 (atrionatriuretic peptide receptor)C) 156 D1758 AA368303 TIMP3 金属硫蛋白3的组织抑制因子(sorsby fundus dystrophy,pseudoinflammatory) 157 B3918 AF055460 STC2 斯钙素(stanniocalcin)2 158 B9722 AA029906 ESTs 159 B7441 AA994299 人cDNA:FLJ20898 fis,克隆ADKA03584 160 A4014 D28769 PBX2 前-B细胞白血病转录因子(pre-B-cell leukemia transcription factor)2 161 B9242 R59292 MS4A8B 跨膜4-结构域,亚家族A,成员8B 162 A4872 U19568 SSCA1 鳞状细胞癌抗原(squamous cell carcinoma antigen) 163 A0100 J04513 FGF2 成纤维细胞生长因子(fibroblast growth factor)2(碱 性) 164 B4665N AA045171 ESTs 165 B9172 AI221059 DKFZP56 6K1924 DKFZP566K1924蛋白 166 B9957 H39098 KIAA0843 KIAA0843蛋白 167 A5176 U37791 MMP19 基质金属硫蛋白(matrix metalloproteinase)19 168 D5160 AI336306 ESTs 169 A0898 Z22641 CHN1 chimerin(chimaerin)1 170 A5370 R37540 ESTs 171 A9317 AA429693 ESTs 172 B6831 X72012 ENG endoglin(Osler-Rendu-Weber 综合症1)(endoglin (Osler-Rendu-Weber syndrome 1)) 173 B3699 AA864739 人cDNA:FLJ21841 fis,克隆HEP01831 174 B7996N W73609 ESTs 175 D1274 AI147089 ESTs 176 C4665 AF009314 人克隆tua8 Cri-du-chat区mRNA(Homo sapiens clone TUA8 Cri-du-chat region mRNA) 177 A4026 D50312 KCNJ8 内向整流通道,亚家族J,成员8(potassium inwardly-rectifying channel,subfamily J,member 8) 178 A0764 L10320 FBP1 果糖,6-二磷酸酶1(fructose,6-bisphosphatase 1) 179 A2188 J02770 IF I因子(补体)(I factor(complement)) 180 A2510 X04481 C2 补体成分(complement component)2 181 A6248 M15178 HLA-DRB 1 主要组织相容性复合体,II类,DRβ1 182 A1761 K01171 HLA-DRA 主要组织相容性复合体,II类,DRα 183 A7689 X00457 SB类II组织相容性抗原α-链的人mRNA(Human mRNA for SB IIclass histocompatibility antigen alpha -chain) 184 A8152 AA485172 HLA-DNA 主要组织相容性复合体,II类,DNα 185 B7304N AA777308 人cDNA FLJ13942 fis,克隆Y79AA1000962,略微 近似于MYOSIN HEAVY CHAIN,NON-MUSCLE 186 D0766 AA424762 ESTs 187 C4971 U20971 NNMT 烟酰胺(nitocinamide)N-甲基转移酶 188 B4321 AA256196 RBM8B RNA结合基序蛋白(binding motif protein)8b 189 B3746 AA976403 人胰腺肿瘤-相关蛋白(fksg12)mRNA,完整cds 190 A9373 M34570 COL6A2 胶原蛋白,VI型,α2 191 A1810N X72755 MIG γ干扰素诱导的单核因子(monokine induced by gamma interferon) 192 C0371 AA411749 ESTs 193 A3733 X04665 THBS1 血小板反应蛋白(thrombospondin)1 194 C1466 H03229 GAB1 GRB2-相关结合蛋白1 195 A2066 M28443 AMY2A 淀粉酶,α2A;胰腺的 196 C6547 AA774546 NXF3 核RNA输出因子3 197 A0401 X00637 HP 触珠蛋白(haptoglobin) 198 B9211 AI075316 FLJ14033 类似于低氧的诱导因子(hypoxia inducible factor)3 的不确定蛋白FLJ14033,α亚单位 199 A7978 J04813 CYP3A5 细胞色素p450,亚家族IIIA(niphedipine氧化酶), 多肽5(cytochrome P450,subfamily IIIA(niphedipine oxidase),polypeptide 5) 200 B6827N AA127856 MPDZ 多PDZ结构域蛋白(multiple PDZ domain protein) 201 C4268 AA885514 ESTs,略微近似于CAYP_HUMAN CALCYPHOSINE[人] 202 A2487 D10923 HM74 推定的趋化因子受体(putative chemokine receptor); GTP-结合蛋白 203 C7059 AA455044 ESTs,略微近似于AF257182 1G-蛋白-偶联的受体 48[人] 204 A3250 M14144 VIM 波形蛋白(vimentin) 205 A5556 AA310364 TIMP2 金属硫蛋白2的组织抑制因子(tissue inhibitor of metalloproteinase) 206 A6458 H71292 SLC21A9 溶质载体家族21(有机阴离子转运物(organic anion transporter)),成员9 206 207 B3759 AI366242 ESTs 208 B9826 AA621350 SLIT2 slit蛋白(果蝇)同源物2(slit(Drosophila)homolog 2) 209 E0336 AI097529 EPAS1 内皮PAS结构域蛋白1(endothelial PAS domain protein 1) 210 A6143 AF035315 人克隆23664和23905的mRNA序列 211 B7171 H75419 十二指肠细胞色素(Duodenal cytochrome)b 212 C7813 AI201273 ESTs 213 C9730 AA030027 ESTs 214 D8827 AA484891 ESTs 215 A1572 U76421 ADARB1 腺苷脱氨酶,RNA-特异性,B1(大鼠RED1同源物 同源物)(adenosine deaminase,RNA-specific,B1 (homolog of rat RED1)) 216 A1516 U24488 TNXA 肌蛋白(tenascin)XA 217 B4852N X02530 SCYB10 小的可诱导型细胞因子亚家族(small inducible cytokine subfamily)B(Cys-X-Cys),成员10 218 A0791 L13923 FBN1 原纤蛋白1(Marfan综合症) 219 B8265 AA156792 HEYL 毛发(hairy)/与YRPW基序相关的断裂增强子-样 (enhancer-of-split related with YRPW motif-like) 220 A1064 M33492 TPSB1 类胰蛋白酶(tryptase)β1 221 A1708 X85337 MYLK 肌球蛋白(myosin),轻多肽激酶(light polypeptide kinase) 222 A4453 AF027299 EPB41L2 红细胞膜蛋白带4.1-样2(erythrocyte membrane protein band 4.1-like 2) 223 B8354 AA279159 WASPIP 与Wiskott-Aldrich syndrome protein interacting protein综合症蛋白相互作用的蛋白 (Wiskott-Aldrich syndrome protein interacting protein) 224 C9565 AA252389 LHFP 脂肪瘤HMGIC融合伴侣(lipoma HMGIC fusion partner) 225 A3560 L06797 CXCR4 趋化因子(C-X-C基序),受体4(融合素)(chemokine (C-X-C motif),receptor 4(fusin)) 226 A2135 U29091 SELENBP 1 硒结合蛋白1(selenium binding protein 1) 227 A0578 X68277 DUSP1 双重特异性磷酸酶1(dual specificity phosphatase 1) 228 A0884 U15085 HLA-DMB 主要组织相容性复合体,II类,DMβ 229 B1475 AA918725 ARRB1 抑制蛋白(arrestin),β1 230 B4085 T34883 AQP1 水孔蛋白1(成通道整合蛋白,28kD) 231 C4095 K01505 DCII类组织相容性抗原α-链 232 B8722 AB007923 KIAA0477 KIAA0477基因产物 233 B9564 H85019 KPNB1 核转运蛋白(Karyopherin)(输入蛋白(importin))β1 234 A1816N M31158 PRKAR2B 蛋白激酶,cAMP-依赖的,调节的,II型,β 1235 B8257 AA426140 人cDNA FLJ11022 fis,克隆PLACE1003771 236 A9393N W67577 CD74 CD74抗原(主要组织相容性复合体的恒定多肽,II 类抗原-相关的) 237 C6900 AA707766 ESTs 238 B9368 AI342469 ESTs 239 B3966 AI038938 ESTs 240 B1004 N87886 MMP2 基质金属硫蛋白2(明胶酶(gelatinase)A,72kD明胶 酶,72kD IV型胶原酶) 241 A1807N L76465 HPGD 羟前列腺素脱氢酶15-(NAD)(hydroxyprostaglandin dehydrogenase 15-(NAD)) 242 C3775 AW243357 人克隆24775mRNA序列(Homo sapiens clone 24775 mRNA sequence) 243 A1951 L08895 MEF2C MADS盒转录增强子因子2,多肽C(肌细胞增强因 子2C(MADS box transcription enhancer factor 2, polypeptide C(myocyte enhancer factor 2C)) 244 A7679 U38894 ROR1 受体酪氨酸激酶-样孤儿受体1(receptor tyrosine kinase-like orphan receptor 1) 245 B9803 C02532 COL21A1 胶原蛋白,XXI型,α1(Collagen,type XXI,alpha 1) 246 D1219 AA453640 ESTs,略微近似于KCC1_人钙/钙调节蛋白-依赖的 蛋白酶I型[人](ESTs,Weakly similar to KCC1_HUMAN CALCIUM/CALMODULIN-DEPENDENT PROTEIN KINASE TYPE I[H.sapiens]) 247 A3061 M83202 LTF 乳转蛋白(lactotransferrin) 248 A0875 L13740 NR4A1 核受体亚家族A,成员1(nuclear receptor subfamily 4,group A,member 1) 249 A4794 AF064492 LDB2 LIM结构域结合2(LIM domain binding 2) 250 A7232N AA669034 人cDNA:FLJ23125 fis,克隆LNG08217 251 C3653 AL133415 DNMT2 DNA(胞嘧啶-5-)-甲基转移酶 2(DNA (cytosine-5-)-methyltransferase 2) 252 C8039 Z22970 CD163 CD163抗原 253 C8158 K03431 HPR 触珠蛋白-相关蛋白(haptoglobin-related protein) 254 B9924 W52782 LOC58514 HUEL(C4orf1)-相互作用蛋白(HUEL (C4orf1)-interacting protein) 255 A1406 L07555 CD69 CD69抗原(p60,早期T细胞活化抗原)(CD69 antigen(p60,early T-cell activation antigen)) 256 A3488 U39050 DAB2 无功能(果蝇)同源物2(有丝分裂原-响应磷蛋 白)(disabled(Drosophila)homolog 2 (mitogen-responsive phosphoprotein)) 257 A1011 M75106 CPB2 羧肽酶B2(血浆)(carboxypeptidase B2(plasma)) 258 A2427 U69546 CUGBP2 CUG三联体重复,RNA-结合蛋白2(CUG triplet repeat,RNA-binding protein 2) 259 B0337 R37044 MAPRE2 微管-相关蛋白,RP/EB家族,成员 2(microtubule-associated protein,RP/EB family, member 2) 260 A7942 AA578712 ESTs 261 C0629 H16793 C8ORF4 染色体8开放阅读框4(chromosome 8 open reading frame 4) 262 C7057 H22566 DACH Dachshund同源物(果蝇)(Dachshund homolog (Drosophila)) 263 D5981 AA974905 FSCN3 成束蛋白(海胆)同源物3(肌动蛋白-成束蛋白,睾 丸)(fascin(Strongylocentrotus purpuratus)homolog 3 (actin-bundling protein,testicular)) 264 C5002 AC002076 GNG11 鸟苷酸结合蛋白11(guanine nucleotide binding protein11) 265 A8488 N75156 人cDNA FLJ11570 fis,克隆HEMBA1003309 266 B9013 AA904456 ESTs 267 B9925 AA993564 人mRNA;cDNA DKFZp564E153(来自克隆 DKFZp564E153) 268 C4743 AA699559 NYD-SP15 蛋白激酶NYD-SP15(Protein kinase NYD-SP15) 269 A3015 J04080 C1S 补体成分1,S亚成分 270 B6414N AA429149 C11ORF9 染色体11开放阅读框9(chromosome 11open reading frame 9) 271 E0523 AA478501 AHNAK AHNAK核蛋白(桥粒联结蛋白)(AHNAK nucleoprotein(desmoyokin)) 272 A1414 L25286 COL15A1 胶原蛋白,XV型α1 273 C3724 NP_055269 PA26 p53调控的PA26核蛋白(p53 regulated PA26 nuclear protein) 274 B0267 R78436 GATA2 GATA-结合蛋白2(GATA-binding protein 2) 275 A3189 M16801 NR3C2 核受体亚家族3,C群,成员2(nuclear receptor subfamily 3,group C,member 2) 276 B8656 AA398561 FLJ20371 不确定蛋白FLJ20371 277 C8205 AI276150 TUCAN 含有肿瘤上调CARD的caspase 9的拮抗剂(Tumor up-regulated CARD-containing antagonist of caspase nine) 278 A9285 AI027810 KIAA1102 KIAA1102蛋白 279 C8636 AA478752 DKK3 Dickkopf同源物3(爪蟾(Xenopus laevis)) 280 A3178 M29696 IL7R 白细胞介素7受体 281 C4735 AA258282 KIAA1474 KIAA1474蛋白 282 A1137 L20688 ARHGDIB Rho GDP解离抑制物(GDI)β(Rho GDP dissociation inhibitor(GDI)beta) 283 A4414 X97187 ABCA3 ATP-结合框,亚家族A(ABC1),成员3(ATP-binding cassette,sub-family A(ABC1),member 3) 284 A2404 M15395 ITGB2 整联蛋白,β2(抗原CD18(p95),淋巴细胞功能- 相关抗原1;巨噬细胞抗原1(mac)β亚单位)(integrin, beta 2(antigen CD18(p9 5),lymphocyte function-associated antigen 1;macrophage antigen 1 (mac)beta subunit)) 285 A8898 AI022075 FLJ13732 与张力蛋白类似的不确定蛋白 FLJ13732(hypothetical protein FLJ13732 similar to tensin) 286 B3924 AI079876 HSPB7 热休克27kD蛋白家族,成员7(心血管的)(heat shock 27kD protein family,member 7 (cardiovascular)) 287 B5776N U51712 ESTs 288 B9533 W44970 SCA7 脊髓小脑共济失调7(伴有视网膜变性的橄榄核桥 脑小脑萎缩)(spinocerebellar ataxia 7 (olivopontocerebellar atrophy with retinal degeneration)) 289 B0830N AA452493 ID4 DNA结合蛋白4的抑制因子,显性阴性的螺旋-环- 螺旋蛋白(inhibitor of DNA binding 4,dominant negative helix-loop-helix protein) 290 A9067N AI268375 DDB1 损害-特异性DNA结合蛋白1(127kD) (damage-specific DNA binding protein 1(127kD)) 291 C6721 AA761358 753P9 染色体X开放阅读框9(Chromosome X open reading frame 9) 292 B4440 AA418784 LOC64116 由BCG-CWS上调(up-regulated by BCG-CWS) 293 A2644 X04299 ADH3 乙醇脱氢酶3(I类),γ多肽 294 A2972 X72475 IGKC 免疫球蛋白κ恒定(immunoglobulin kappa constant) 295 A1023 X05610 COL4A2 胶原蛋白,IV型,α2 296 C6386 W05570 DKFZP58 6B0621 DKFZP586B0621蛋白 297 D8491 X97324 ADFP 脂肪组织分化-相关蛋白(adipose differentiation-related protein) 298 A1275 AF020543 PPT2 棕榈酰-蛋白硫酯酶2(palmitoyl-protein thioesterase 2) 299 A6750 U09608 NKG7 天然杀伤细胞组7序列(natural killer cell group 7 sequence) 300 A3822 AB001928 CTSL2 组织蛋白酶12(cathepsin L2) 301 C8282 R84710 ASAHL N-酰基鞘氨醇氨基水解酶(酸性神经酰胺酶)-样 (N-acylsphingosine amidohydrolase (acid ceramidase)-like) 302 B9777 AA903451 SRCL 胶凝素亚家族成员12(Collectin sub-family member 12) 303 A0090 D50683 TGFBR2 转化生长因子,β受体II(70-80kD)(transforming growth factor,beta receptor II(70-80kD)) 304 B9201 AI083491 WIF Wnt抑制因子(Wnt inhibitory factor) 305 B1531 AA775224 NPR1 利尿钠肽受体C/鸟苷酸环化酶A(心房纳尿肽受体 A))(natriuretic peptide receptor A/guanylate cyclase A (atrionatriuretic peptide receptor A)) 306 A7760N M62324 MRF 调节子的识别因子I(modulator recognition factor I) 307 B9970 H00903 KIAA0640 人mRNA;cDNA DKFZp586E0724(来自克隆 DKFZp586E0724)(Homo sapiens mRNA;cDNA DKFZp586E0724(from clone DKFZp586E0724)) 308 A4238 AI089249 HK3 己糖激酶3(白细胞)(hexokinase 3(white cell)) 309 C3772 AW237266 ASAH N-酰基鞘氨醇氨基水解酶(酸性神经酰胺酶) (N-acylsphingosine amidohydrolase(acid cerarmidase)) 310 A4709 U62015 CYR61 富含半胱氨酸,血管生成诱导物,61(cysteine-rich, angiogenic inducer,61) 311 B4288 AI078144 HNOEL-is o HNOEL-iso蛋白(HNOEL-iso protein) 312 A6266 AA830322 LMO2 LIM domain only 2(rhombotin-样 1)(LIM domain only 2(rhombotin-like 1)) 313 A7233 AA742701 LCP1 淋巴细胞胞质蛋白1(L-plastin)(lymphocyte cytosolic protein 1(L-plastin)) 314 B8141 AA431105 人cDNA:FLJ21310 fis,克隆COL02160(Homo sapiens cDNA:FLJ21310 fis,clone COL02160) 315 A3200N AA419374 COL5A1 胶原蛋白,V型,α1(collagen,type V,alpha 1) 316 C0922 AA136856 ESTs 317 C0787 AA448082 ESTs 318 A4660 M20681 SLC2A3 溶质载体家族2(易化的葡萄糖转运蛋白),成员 3(solute carrier family 2(facilitated glucose transporter),member 3) 319 A5487 AA256347 KIAA1075 KIAA1075蛋白 320 A0597 X79683 LAMB2 层粘连蛋白,β2(层粘连蛋白S) 321 A3790 X76104 DAPK1 死亡-相关蛋白激酶1(death-associated protein kinase 1) 322 A1496 U03688 CYP1B1 细胞色素p450,亚家族I(二噁英可诱导的),多肽 1(青光眼3,新生儿)(cytochrome P450,subfamily I (dioxin-inducible),polypeptide 1(glaucoma 3,primary nfantile)) 323 C9716 C17007 ESTs,高度近似于C1QC_人补体C1Q子复合体,C 链前体[人](ESTs,Highly similar to C1QC_HUMAN COMPLEMENT C1Q SUBCOMPONENT,C CHAIN PRECURSO [H.sapiens]) 324 D8527 J03037 CA2 酸酐酶II(carbonic anhydrase II) 325 B2696 AA847136 CSF2RB 集落刺激因子2受体,β,低-亲合力(粒性白细胞- 巨噬细胞)(Colony stimulating factor 2 receptor,beta, low-affinity(granulocyte-macrophage)) 326 D8609 AI052435 ESTs,略微近似于二乙基溴乙酰胺-停止蛋白[小 家鼠](ESTs,Weakly similar to neuronal-STOP protein[M.musculus]) 327 E0896 AI141649 NID 巢蛋白(enactin)(nidogen(enactin)) 328 D7108 AI005420 ESTs 329 A0055N AF058925 JAK2 Janus激酶2(一种蛋白酪氨酸激酶)(Janus kinase 2 (a protein tyrosine kinase)) 330 A3613 U20157 PLA2G7 磷脂酶A2,VII群(血小板活化因子乙酰水解酶,血 浆)(phospholipase A2,group VII(platelet-activating factor acetylhydrolase,plasma)) 331 A1879 AF016004 GPM6B 糖蛋白M6B 332 A0711 AF068836 PSCDBP 普列克底物蛋白同源物,Sec7及卷曲/螺旋型结构 域,结合蛋白(pleckstrin homology,Sec7 and coiled/coil domains,binding protein) 333 B9198 AA609519 MSRA 甲硫氨酸亚砜还原酶A(methionine sulfoxide reductase A) 334 A9346N AA317645 PP2135 PP2135蛋白 335 B7497 AA687507 ESTs 336 B5284 AA452079 来自染色体X上的克隆RP11-524D16的人DNA序 列;含有ESTs、STSs和GSSs;含有一种含sushi- 重复单元蛋白的SRPX基因的3′端部分和一种对 应于两个蛋白同种型的新基因,这两个蛋白同种型 类似于小鼠granuphilin a和b(Human DNA sequence from clone RP11-524D16 on chromosome X.Contains ESTs,STSs and GSSs.Contains the 3′part of the SRPX gene for a sushi-repeat containing protein and a novel gene for two protein isoforms similar to mouse granuphilin a und b) 337 A2471 J03578 ANXA6 膜联蛋白A6(annexin A6) 338 C4068 AF005668 PFC 备解素P因子,补体(properdin P factor, complement) 339 A0968 M74718 TCF4 转录因子4 340 B8090 AA152211 KIAA1538 KIAA1538蛋白 341 A2257N AA625532 DDR2 discoidin结构域受体家族,成员2(discoidin domain receptor family,member 2) 342 A1780N AA449181 ENPP2 外核苷酸焦磷酸酶/磷酸二酯酶2(自趋化素) (ectonucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase 2 (autotaxin)) 343 A1859N AA418167 GATA3 GATA-结合蛋白3(GATA-binding protein 3) 344 C3778 BF060779 MSTP032 MSTP032蛋白 345 A0654 M15800 MAL mal,T细胞分化蛋白(mal,T-cell differentiation protein) 346 B4400 AI299106 KIAA1500 KIAA1500蛋白 347 B5172N AI288487 CLIC2 氯化物胞内通道2(chloride intracellular channel 2) 348 A0745 L19871 ATF3 活化转录因子3(activating transcription factor 3) 349 A7672 U20982 IGFBP4 胰岛素-样生长因子-结合蛋白4(insulin-like growth factor-binding protein 4) 350 B1056N AA757029 DF 补体的D成分(脂肪酶)(D component of complement (adipsin)) 351 A1397N M60484 PPP2CB 蛋白磷酸酶2(此前为2A),催化亚单位,β同种型 (protein phosphatase 2(formerly 2A),catalytic subunit,beta isoform) 352 C8146 X53331 MGP 基质Gla蛋白(matrix Gla protein) 353 A0582 X69819 ICAM3 细胞间粘附分子3(intercellular adhesion molecule 3) 354 A2074 K01396 SERPINA 1 丝氨酸(或半胱氨酸)蛋白酶抑制因子,进化枝A(α 抗蛋白酶,α抗胰蛋白酶),成员1 355 A1092 M57230 IL6ST 白细胞介素6信号转导蛋白(gp130,制瘤素M受体) (interleukin 6 signal transducer(gp130,oncostatin M receptor)) 356 A4819 D17408 CNN1 calponin 1,碱性,平滑肌(calponin 1,basic,smooth muscle) 357 A6251 M25460 IFNB1 干扰素,β1,成纤维细胞(interferon,beta 1, fibroblast) 358 C4126 U55766 HRB2 HIV rev结合蛋白2(HIV rev binding protein 2) 359 B8113 AA263000 RNAE6 核糖核酸酶,RNAe家族A,k6(ribonuclease,RNAe A family,k6) 360 B0297 AA775440 KIAA0909 KIAA0909蛋白 361 B7624 AA434557 LNK 淋巴细胞衔接子蛋白(lymphocyte adaptor protein) 362 B9647 AA688025 ESTs 363 B4246 AA479071 人克隆24877 mRNA序列(Homo sapiens clone 24877 mRNA sequence) 364 B5399 N36581 D2S448 黑色素瘤相关基因(Melanoma associated gene) 365 B7723 AI140597 LIFR 白血病抑制因子受体(leukemia inhibitory factor receptor) 366 A6595N AA775497 KIAA1095 人mRNA;cDNA DKFZp564J0923(来自克隆 DKFZp564J0923)(Homo sapiens mRNA;cDNA DKFZp564J0923(from clone DKFZp564J0923)) 367 B7465 AI197941 人mRNA;cDNA DKFZp761K2024(来自克隆 DKFZp761K2024)(Homo sapiens mRNA;cDNA DKFZp761K2024(from clone DKFZp761K2024)) 368 C8947 AA805687 ESTs 369 C8186 AA059489 RGC32 RGC32蛋白 370 C1622 AA807551 ESTs 371 C1422 AA095034 GK001 GK001蛋白 372 C4105 AA494120 ENPP4 ectonucleotide焦磷酸酶/磷酸二酯酶4(推定的功 能)(ectonucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase 4(putative function)) 373 C9836 AA157832 KIAA4844 人cDNA:FLJ22841 fis,克隆KAIA4844(Homo sapiens cDNA:FLJ22841 fis,clone KAIA4844) 374 D9444 AI367157 ESTs 375 D9939 AI079987 ESTs 376 A4385N X59770 IL1R2 白细胞介素1受体,II型(interleukin 1 receptor,type II) 377 B7869N R42449 FLJ10357 不确定蛋白FLJ10357(hypothetical protein FLJ10357) 378 B9611 AA427796 KIAA1754 ESTs 379 B5396 AA446322 FLJ11240 不确定蛋白FLJ11240(hypothetical protein FLJ11240) 380 D0735 AA740582 ARL5 ADP-核糖基化因子-样5(ADP-ribosylation factor-like 5) 381 A1032 M87790 IGL@ 免疫球蛋白λ基因座(immunoglobulin lambda locus) 382 A2530 J02611 APOD 脱脂蛋白D(apolipoprotein D) 383 A4655N L77864 APBB1 淀粉样蛋白β(A4)前体蛋白结合型,家族杆菌,成 员1(fe65)(amyloid beta (A4) precursor protein-binding,family B,member1(Fe65)) 384 C0475 U57961 13CDNA7 3 推定的基因产物(putative gene product) 385 A9282 AA889218 OGN osteoglycin(骨诱导因子,mimecan)(osteoglycin (osteoinductive factor,mimecan)) 386 B1451N AI057161 ESTs 387 C7773 AI300074 ESTs,略微近似于S43506不确定蛋白-大鼠[大家 鼠](ESTs,Weakly similar to S43506 hypothetical protein-rat[R.norvegicus]) 388 B3063 T91708 MD MD,RP105-相关(MD,RP105-associated) 389 A3903 AF026692 SFRP4 分泌的卷曲-相关蛋白4(secreted frizzled-related protein 4) 390 B8377 N50822 ESTs 391 A5720 AI218225 SPON1 spondin 1,(f-spondin)细胞外基质蛋白(spondin 1, (f-spondin)extracellular matrix protein) 392 B7274 AA777360 KIAA1002 ESTs 393 A0765 M77477 ALDH3 脱氢酶3(aldehyde dehydrogenase 3) 394 A3563 L10333 RTN1 reticulon 1 395 B6062 AA773223 SLC16A3 溶质载体家族16(一元羧酸转运物),成员3(solute carrier family 16(monocarboxylic acid transporters), member 3) 396 C8044 AA987624 EGR3 早期生长反应3(early growth response 3) 397 B8707 AA173755 ROBO1 roundabout(轴突引导受体,果蝇)同源物 1 (roundabout(axon guidance receptor,Drosophila) homolog 1) 398 C7370 AA961425 EOMES 同源物3(爪蟾)(Eomesodermin homolog(Xenopus laevis)) 399 D4501 AA521117 ESTs 400 A1750 D31716 BTEB1 碱性转录元件结合蛋白1(basic transcription element binding protein 1) 401 A1522 U28369 SEMA3B sema结构域,免疫球蛋白结构域(免疫球蛋白),短 的基础结构域,分泌型,(semaphorin)3B(sema domain,immunoglobulin domain (Ig),short basic domain,secreted,(semaphorin)3B) 402 A8482 R79064 ESTs,略微近似于推定的III型乙醇脱氢酶[黑腹果 蝇](ESTs,Weakly similar to putative type III alcohol dehydrogenase[D.melanogaster]) 403 B9053 AA446948 KIAA0941 KIAA0941蛋白(KIAA0941 protein) 404 B4643 AI332375 FSTL3 follistatin-样3(分泌糖蛋白)(follistatin-like 3 (secreted glycoprotein)) 405 C0825 D61466 ESTs 406 C3648 W79423 人mRNA;cDNA DKFZp586P1622(来自克隆 DKFZp586P1622)(Homo sapiens mRNA;cDNA DKFZp586P1622(from clone DKFZp586P1622)) 407 D4020 AA858162 人cDNA FLJ13005 fis,克隆NT2RP3000441,略微 近似于T细胞识别的人鳞状细胞癌抗原(SART-2) 的mRNA(Homo sapiens cDNA FLJ13005 fis,clone NT2RP3000441,weakly similar to Homo sapiens squamous cell carcinoma antigen recognized by T cell (SART-2)mRNA) 408 E1621 AL117515 PLCE2 磷脂酶C,ε2(phospholipase C,epsilon 2) 409 A5442 AI290876 KLF4 Kruppel-样因子4(肠)(Kruppel-like factor 4(gut)) 410 A9482 AI160184 LOC51673 脑特异性蛋白(brain specific protein) 411 A3867 AF013249 LAIR1 白细胞-相关免疫球蛋白-样受体 1(leukocyte-associated Ig-like receptor 1) 412 A1510 U16306 CSPG2 硫酸软骨素蛋白多糖2(多功能蛋白聚 糖)(chondroitin sulfate proteoglycan 2(versican)) 413 B9132 AA455877 人cDNA FLJ11177 fis,克隆PLACE1007402(Homo sapiens cDNA FLJ11177 fis,clone PLACE1007402) 414 A2291 AF003341 ALDH1 醛脱氢酶1,可溶解的(aldehyde dehydrogenase 1, soluble) 415 A1010 X83378 CLCN6 氯化物通道6(chloride channel 6) 416 B8379 D25869 DKFZP43 4I1735 DKFZP434I1735蛋白 417 B6622 AA369905 ESTs 418 C8388 N92299 FLJ21939 类似于5-氮胞苷诱导基因2的不确定蛋白 flj21939(hypothetical protein FLJ21939 similar to 5-azacytidine induced gene 2) 419 C4116 AA242923 DXS9928E 染色体X(独特的)9928表达序列上的DNA片段 (DNA segment on chromosome X(unique)9928 expressed sequence) 420 B8203 D81610 FLJ11109 不确定蛋白FLJ11109(hypothetical protein FLJ11109) 421 A1431 L43821 HEF1 成丝作用1的增强子(cas-样停靠;crk-结合底物相 关)(enhancer of filamentation 1(cas-like docking; Crk-associated substrate related)) 422 B5949 AA678263 BIN2 桥联整合蛋白2(bridging integrator 2) 423 C7886 AI270402 INHBA 抑制素,βA(活化素A,活化素ABα多肽)(inhibin, beta A(activin A,activin AB alpha polypeptide)) 424 A1405 L01042 TMF1 TATA元件调节因子1(TATA element modulatory factor1) 425 B3940 W45244 C3 补体成分3(complement component 3) 426 A1387 D86479 AEBP1 AE-结合蛋白1(AE-binding protein 1) 427 A1748 U29089 PRELP 富含脯氨酸精氨酸富含末端亮氨酸重复蛋白 (proline arginine-rich end leucine-rich repeat protein) 428 A3054 U01839 FY Duffy血型(Duffy blood group) 429 A2039N AA843756 ID2 DNA结合蛋白2的抑制因子,显性性状阴性的螺旋 -环-螺旋蛋白(inhibitor of DNA binding 2,dominant negative helix-loop-helix protei) 430 B6319 AA328385 ICSBP1 干扰素共有序列结合蛋白1(consensus sequence binding protein 1) 431 B4364 AI305201 VRL 辣椒素受体-样蛋白1(vanilloid receptor-like protein 1) 432 B4638 AI122867 人cDNA FLJ12666 fis,克隆NT2RM4002256(Homo sapiens cDNA FLJ12666 fis,clone NT2RM4002256) 433 D9799 AI074177 C1QA 补体成分1,q亚成分,α多肽(complement component 1,q subcomponent,alpha polypeptide) 434 A2523 D21238 GLRX 谷氧还蛋(巯基转移酶)(glutaredoxin (thioltransferase)) 435 A5449 U90654 LMO7 LIM domain only 7(LIM domain only 7) 436 A3409 L77564 STK22B 丝氨酸/苏氨酸激酶 22b(精子形成相 关)(serine/threonine kinase 22B(spermiogenesis associated)) 437 A0174 M37435 CSF1 集落刺激因子1(巨噬细胞)(colony stimulating factor 1(macrophage)) 438 B2439 U04735 STCH 应激70蛋白伴侣,微粒体-相关,60kD(stress 70 protein chaperone,microsome-associated,60kD) 439 B5470 AA876372 ESTs,略微近似于ALU1_人ALU亚家族J序列污 染警告条目[人](ESTs,Weakly similar to ALU1_HUMAN ALU SUBFAMILY J SEQUENCE CONTAMINATION WARNING ENTRY [H.sapiens]) 440 B4864 X16665 HOXB2 同源框B2(homeo box B2) 441 B5800 AA233243 BM046 非典型的骨髓蛋白BM046(uncharacterized bone marrow protein BM046) 442 C4170 AB007884 ARHGEF9 Cdc42鸟嘌呤交换因子(GEF)9(Cdc42 guanine exchange factor(GEF)9) 443 A5504N AF052178 人cDNA:FLJ21897 fis,克隆HEP03447,高度近似 于af052178人克隆24523的mRNA序列(Homo sapiens cDNA:FLJ21897 fis,clone HEP03447,highly similar to AF052178 Homo sapiens clone 24523 mRNA sequence) 444 B4574 AI042204 FLJ12895 不确定蛋白FLJ12895(hypothetical protein FLJ12895) 445 B6998 AA401227 SEC31B-1 分泌型的通道成分Sec31B-1(Secretory pathway component Sec3 1B-1) 446 B9299 N53090 人mRNA;cDNA DKFZp434I0835(来自克隆 DKFZp434I0835)(Homo sapiens mRNA;cDNA DKFZp434I0835(from clone DKFZp434I0835)) 447 A3538 J03464 COL1A2 胶原蛋白,I型,α2(collagen,type I,alpha 2) 448 A8508N AA977227 NET-6 tetraspan NET-6蛋白(tetraspan NET-6 protein) 449 A1887N W76477 JUN v-jun鸟类肉瘤病毒17致癌基因同源物(v-jun avian sarcoma virus 17 oncogene homolog) 450 B5459 AA666119 ESTs,高度近似于GBP1_人干扰素诱导的鸟苷酸- 结合型蛋白1[人](ESTs,Highly similar to GBP1_HUMAN INTERFERON-INDUCED GUANYLATE-BINDING PROTEIN1[H.sapiens]) 451 B4646 AI245038 GLS 谷氨酰胺酶(glutaminase) 452 C3799 BE873804 人mRNA;cDNA DKFZp564F053(来自克隆 DKFZp564F053)(Homo sapiens mRNA;cDNA DKFZp564F053(from clone DKFZp564F053)) 453 C8119 D87258 PRSS11 蛋白酶,丝氨酸,11(IGF结合)(protease,serine,11 (IGF binding)) 454 D8494 D16294 ACAA2 乙酰辅酶A酰基转移酶2(线粒体3-噁酰基-辅酶A 硫解酶)(acetyl-Coenzyme A acyltransferase 2 (mitochondrial 3-oxoacyl-Coenzyme A thiolase)) 455 E1456 AB040951 FLJ20004 不确定蛋白FLJ20004(hypothetical protein FLJ20004) 456 B2119 M33552 LSP1 淋巴细胞-特异性蛋白1(lymphocyte-specific protein 1) 457 B0979 AI361053 ESTs 458 A4702 U53445 DOC1 卵巢癌1中表达下调(downregulated in ovarian cancer 1) 459 D0737 AA885279 ESTs 460 A0753 L10918 CCR1 趋化因子(C-C键基序)受体1(chemokine(C-C motif)receptor 1) 461 A3977 AF069736 PAF65B PCAF相关因子65β(PCAF associated factor 65 beta) 462 A2839 M36284 GYPC 血型糖蛋白C(Gerbich血型)(glycophorin C(Gerbich blood group)) 463 A2019N AA442410 EMP1 上皮膜蛋白1(epithelial membrane protein 1) 464 A3203 M64925 MPP1 膜蛋白,棕榈酰化1(55kD)(membrane protein, palmitoylated 1(55kD)) 465 A0539 U23946 RBM5 RNA结合基序蛋白8b 5(RNA binding motif protein 5) 466 A5899 D61837 KIAA1109 KIAA1109蛋白(KIAA1109 protein) 467 A3119 J04621 SDC2 多配体蛋白聚糖2(硫酸乙酰肝素蛋白聚糖1,细胞 表面-结合,纤维蛋白聚糖)(syndecan 2(heparan sulfate proteoglycan 1,cell surface-associated, fibroglycan)) 468 A3745 X16155 NR2F1 核受体亚家族2,C群,成员1(nuclear receptor subfamily 2,group F,member1) 469 A7016 U82108 SLC9A3R 2 溶质载体家族9(钠/氢交换蛋白),同种型3调节因 子2(solute carrier family 9(sodium/hydrogen exchanger),isoform 3 regulatory factor 2) 470 B2609 N42862 KIAA1434 不确定蛋白FLJ11085(hypothetical protein FLJ11085) 471 B1966 AA933908 ROCK1 Rho-相关的,含卷曲-螺旋的蛋白激酶 1(Rho-associated,coiled-coil containing protein kinase 1) 472 A2214N L37080 FMO5 含有核黄素的单加氧酶5(flavin containing monooxygenase 5) 473 D4128 W37848 ARTS 1型肿瘤坏死因子受体脱落型氨肽酶调节因子(type 1 tumor necrosis factor receptor shedding aminopeptidase regulator) 474 A7678 U32331 RIG 在神经胶质瘤中受到调控(regulated in glioma) 475 B5489 AI278652 AP1S2 衔接子-相关蛋白集合体1,σ2亚单位 (adaptor-related protein complex 1,sigma 2 subunit) 476 A0563 X58288 PTPRM 蛋白酪氨酸磷酸酶,受体型,M(protein tyrosine phosphatase,receptor type,M) 477 A4641 J02854 MYRL2 肌球蛋白调节的轻链2,平滑肌同种型(myosin regulatory light chain 2,smooth muscle isoform) 478 B6764 AA313118 DUSP10 双重特异性磷酸酶10(dual specificity phosphatase 10) 479 A6780 M63262 ALOX5AP 花生四烯酸盐5-脂肪氧合酶-活化蛋白(arachidonate 5-lipoxygenase-activating protein) 480 A3161N M92843 ZFP36 与小鼠Zfp-36同源的锌指蛋白(zinc finger protein homologous to Zfp-36 in mouse) 481 B5367 AA151153 DPT dermatopontin 482 A6156 AA587167 ARHE ras同源物基因家族,成员E(ras homolog gene family,member E) 483 A0127 L24158 ITGA9 整联蛋白,α9(integrin,alpha 9) 484 B1524 AI126293 ESTs 485 A6781 M69199 G0S2 推定的淋巴细胞G0/G1开关基因(putative lymphocyte G0/G1 switch gene) 486 B8775 AA588212 FLJ10128 带有卷曲螺旋结构域和锚蛋白重复单元的uveal自 身抗原(uyeal autoantigen with coiled coil domains and ankyrin repeats) 487 A0300 U43142 VEGFC 血管内皮生长因子C(vascular endothelial growth factor C) 488 A6530 AI089584 ADAMTS 去整联蛋白-样且带有血小板反应蛋白型1基序的 金属蛋白酶(reprolysin型)(a disintegrin-like and metalloprotease(reprolysin type)with thrombospondin type 1 motif,1) 489 A0971 D83407 ZAKI4 Down综合症关键区域基因1-样1(Down syndrome critical regiongene 1-like 1) 490 D4142 N93781 TAX1BP1 Taxl(人T细胞白血病毒I型)结合蛋白1(Taxl (human T-cell leukemia virus type I)binding protein 1) 491 A1485N S69790 WASF3 WAS蛋白家族,成员3(WAS protein family, member 3) 492 B8036 R20340 ESTs 493 C9718 W94051 ESTs 494 E0872 AK025627 人cDNA:FLJ21974 fis,克隆HEP05861(Homo sapiens cDNA:FLJ21974 fis,clone HEP05861) 495 B0243 R76379 LOC51316 不确定蛋白(hypothetical protein) 496 A1981 U58514 CHI3L2 壳多糖酶3-样2(chitinase 3-like 2) 497 A2158 Z11793 SEPP1 含硒蛋白P,血浆,1(selenoprotein P,plasma,1) 498 A0975 M14333 FYN 与SRC、FGR、YES相关的FYN癌基因(FYN oncogene related to SRC,FGR,YES) 499 B4849 W74368 人cDNA:FLJ23324 fis,克隆HEP12482,高度近似 于HUMMYOHCB人非肌肉肌球蛋白重链- B(MYH10)mRNA(Homo sapiens cDNA:FLJ23324 fis,clone HEP12482,highly similar to HUMMYOHCB Human nonmuscle myosin heavy chain-B(MYH10)mRNA) 500 A7640 AA147751 人 cDNA FLJ14146 fis,克隆 MAMMA1002947(Homo sapiens cDNA FLJ14146 fis,clone MAMMA1002947) 501 C0830 AA012832 ESTs 502 C6974 AA679312 HIBCH  3-羟异丁酰基-辅酶 A 水解酶 (3-hydroxyisobutyryl-Coenzyme A hydrolase) 503 E0289 AI224952 ESTs 504 B4750 AA769424 VNN2 vanin 2 505 A3334 M90696 CTSS 组织蛋白酶S(cathepsin S) 506 B1676 AJ001563 IGHG3 免疫球蛋白重链γ3恒定区(G3m标 记)(immunoglobulin heavy constant gamma 3(G3m marker)) 507 C7731 AI142828 人adlican mRNA,完整cds(Homo sapiens adlican mRNA,complete cds) 508 C4700 AA099820 ESTs 509 D0533 AA234500 ARHGEF1 2 Rho鸟嘌呤交换因子(GEF)12(Rho guanine exchange factor(GEF)12) 510 A4744 AF020202 UNC13 UNC13(C.elegans)-样(UNC13(C.elegans)-like) 511 A1154 M62401 CYP27A1 细胞色素P450,亚家族XXVIIA(类固醇27-羟化酶, 脑腱性黄色瘤),多肽1(cytochrome P450,subfamily XXVIIA(steroid 27-hydroxylase,cerebrotendinous xanthomatosis),polypeptide 1) 512 A2292 X16832 CTSH 组织蛋白酶H(cathepsin H) 513 A1825 X76775 HLA-DM A 主要组织相容性复合体,II类,DMα(major histocompatibility complex,class II,DM alpha) 514 A3841 AF000984 DBY DEAD/H(Asp-Glu-Ala-Asp/His)框多肽,Y染色体 (DEAD/H(Asp-Glu-Ala-Asp/His)box polypeptide,Y chromosome) 515 A4645 L13852 UBE1L 泛素-激活酶El-样(ubiquitin-activating enzyme E1-like) 516 A9003 W39638 FLJ10856 不确定蛋白FLJ10856(hypothetical protein FLJ10856) 517 A7239 AA523541 GILZ 糖皮质激素-诱导的亮氨基酸拉链结构 (glucocorticoid-induced leucine zipper) 518 A3308N L23823 ITGB7 整联蛋白β7亚单位(integrin beta 7 subunit) 519 B8437 Z20328 DKFZp434 C0328 不确定蛋白  DKFZp434C0328(hypothetical protein DKFZp434C0328) 520 B4481 AA857089 DKFZP56 6G1424 不确定蛋白DKFZp566G1424(hypothetical protein DKFZp566G1424) 521 B6014N H09503 KIAA0740 KIAA0740基因产物(KIAA0740 gene product) 522 B6825 AI290349 C5 补体成分5(complement component 5) 523 B9233 AA211909 ESTs 524 B5381N D42047 KIAA0089 KIAA0089蛋白(KIAA0089 protein) 525 B7003N AF045584 POV1 非小细胞肺癌症过表达基因 1(prostate cancer overexpressed gene 1) 526 C8356 AI265858 人克隆23574 mRNA序列(Human clone 23574 mRNA sequence) 527 C4596 AI344470 ESTs 528 C6906 AA346311 RAI3 视黄酸诱导3(retinoic acid induced 3) 529 C8023 M81141 HLA-DQB 1 主要组织相容性复合体,II类,DQβ1(major histocompatibility complex,class II,DQ beta 1) 530 D2661 AA894447 人BAC 克隆GS1-99H8(Human BAC clone GS1-99H8) 531 B7659 AB007924 KIAA0455 KIAA0455基因产物(KIAA0455 gene product) 532 A6593 AI160213 ANGPTL2 血管生成因子-样2(Angiopoietin-like 2) 533 B7526 R40594 人cDNA:FLJ22845 fis,克隆KAIA5195(Homo sapiens cDNA:FLJ22845 fis,clone KAIA5195) 534 B7796 N52157 人mRNA;cDNA DKFZp762O1615(来自克隆 DKFZp762O1615)(Homo sapiens mRNA;cDNA DKFZp762O1615(from clone DKFZp762O1615)) 535 A8525 W67837 AHSG α-2-HS-糖蛋白(alpha-2-HS-glycoprotein) 536 E0537 AW276358 DPYSL2 二氢嘧啶酶-样2(dihydropyrimidinase-like 2) 537 A4254 AI140851 COL6A1 胶原蛋白,VI型,α1(collagen,type VI,alpha 1) 538 A0941 S59049 RGS1 G-蛋白信号1的调节因子(regulator of G-protein signalling 1) 539 A2122 AB003476 AKAP12 一种激酶(PRKA)锚定蛋白(gravin)12(A kinase (PRKA)anchor protein(gravin)12) 540 A9501 AA279817 GADD45B 生长抑止和DNA-损害-诱导,β(growth arrest and DNA-damage-inducible,beta) 541 B8782 U97067 CTNNAL1 连环蛋白(钙粘着蛋白-相关蛋白),α-样1(catenin (cadherin-associated protein),alpha-like 1) 542 B9769 AA156269 人mRNA;cDNA DKFZp434E2321(来自克隆 DKFZp434E2321);部分cds(Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp434E2321 (from clone DKFZp434E2321);partial cds) 543 A1567 U70824 BLu BLu蛋白()BLu protein 544 A2444 AF002672 LOH11CR 2A 杂合性损失,11,染色体区域2,基因A(loss of heterozygosity,11,chromosomal region 2,gene A) 545 B9317 N35421 ESTs 546 A5086N AA402615 SELPLG 选择蛋白P配体(selectin P ligand) 547 C6059 AA699359 ESTs 548 A0399 M20496 CTSL 组织蛋白酶L(cathepsin L) 549 A0325 X03663 CSF1R 集落刺激因子1受体,此前为McDonough猫的肉瘤 病毒的(v-fms)癌基因同源物(colony stimulating factor 1 receptor,formerly McDonough feline sarcoma viral(v-fms)oncogene homolog) 550 A0131 L34155 LAMA3 层粘连蛋白,α3(nicein(150kd),缰蛋白(165kd), BM600(150kd),epilegrin(laminin,alpha 3(nicein (150kD),kalinin(165kD),BM600(150kD), epilegrin)) 551 A8879N AA583491 HCA112 肝细胞癌-相关抗原112(hepatocellular carcinoma-associated antigen 112) 552 E0691 AL021917 BTN2A3 嗜乳脂蛋白,亚家族2,成员A3(butyrophilin, subfamily 2,member A3) 553 A1051 M33195 FCER1G IgE的Fc片段,高亲合力I,受体;γ多肽(Fc fragment of IgE,high affnity I,receptor for;gamma polypeptide) 554 A9090 AI306435 DKFZP58 6A0522 DKFZP586A0522蛋白(DKFZP586A0522 protein) 555 A1471N AL021026 来自染色体1q23-25上的PAC 127D3的人DNA序 列含有编码含核黄素单加氧酶2及含核黄素单加 氧酶3的FMO2和FMO33基因(二甲苯胺单加氧酶 (氮-氧化物3,EC1.14.13.8,二甲苯胺氧化酶3, FMO(Homo sapiens DNA sequence from PAC 127D3 on chromosome 1q23-25.Contains FMO2 and FMO3 genes for Flavin-containing Monooxygenase 2 and Flavin-containing Monooxygenase 3(Dimethylaniline Monooxygenase(N-Oxide 3,EC1.14.13.8, Dimethylaniline Oxidase 3,FMO) 556 B2937 AA416820 H2AFZ H2A组蛋白家族,成员Z(H2A histone family, member Z) 557 A1125 J04127 CYP19 细胞色素p450,XIX亚家族(芳构化的雄激 素)(cytochrome P450,subfamily XIX(aromatization of androgens)) 558 A6380 T28620 FGB 纤维蛋白原,Bβ多肽(fibrinogen,B beta polypeptide) 559 A4970 AF062075 LPXN leupaxin 560 C9579 N42267 人cDNA:FLJ22554 fis,克隆HSI01092(Homo sapiens cDNA:FLJ22554 fis,clone HSI01092) 561 C7036 U59289 CDH13 钙粘着蛋白13,H-钙粘着蛋白(心)(cadherin 13, H-cadherin(heart)) 562 A9308 AA452780 GENX-341 4 genethonin 1 563 A2638 U20158 LCP2 淋巴细胞胞质蛋白2(含有SH2结构域的白细胞 76kD蛋白)(ymphocyte cytosolic protein 2(SH2 domain-containing 1eukocyte protein of 76kD)) 564 C9620 AI092721 人cDNA FLJ11896 fis,克隆HEMBA1007319 (Homo sapiens cDNA FLJ11896 fis,clone HEMBA1007319) 565 A5868 AA418061 SLC11A3 溶质载体家族11(质子-偶联的二价金属离子转运 物),成员3(solute carrier family 11(proton-coupled divalent metal ion transporters),member 3) 566 A5900 AI091372 AXUD1 AXIN1 上调的(AXIN1 up-regulated) 567 A1453 M37721 PAM 肽基甘氨酸α-酰胺化单加氧酶(peptidylglycine alpha-amidating monooxygenase) 568 A9514 Z39135 人cDNA:FLJ22735 fis,克隆HUV00180(Homo sapiens cDNA:FLJ22735 fis,clone HUV00180) 569 B9504 AA521163 人cDNA:FLJ21333 fis,克隆COL02535(Homo sapiens cDNA:FLJ21333 fis,clone COL02535) 570 B8028 AA701478 人cDNA:FLJ23332 fis,克隆HEP12754(Homo sapiens cDNA:FLJ23332 fis,clone HEP12754) 571 D0786 AB011115 KIAA0543 KIAA0543蛋白 572 B7289N AA379112 SBBI42 BCM-样膜蛋白前体(BCM-like membrane protein precursor) 573 A4367 AF020043 CSPG6 硫酸软骨素蛋白聚糖6(bamacan)(chondroitin sulfate proteoglycan 6(bamacan)) 574 A3150 M97370 ADORA2 A 腺苷A2a受体(adenosine A2a receptor) 575 A5253 AA261780 ESTs 576 B4938 W56507 KIAA0251 KIAA0251蛋白(KIAA0251 protein) 577 A9295 AI266286 ESTs,略微近似于IRX2_HUMAN IROQUOIS-CLASS HOMEODOMAIN PROTEIN IRX-2[人](ESTs,Weakly similar to IRX2_HUMAN IROQUOIS-CLASS HOMEODOMAIN PROTEIN IRX-2[H.sapiens]) 578 A6532 AA449335 ESTs 579 A4597 U97519 PODXL 足细胞特异性标志蛋白-样(podocalyxin-like) 580 B4053 K03191 CYP1A1 细胞色素p450,亚家族I(芳香族化合物-可诱导的), 多肽1(cytochrome P450,subfamily I(aromatic compound-inducible),polypeptide 1) 581 B5138 AI364974 FCN3 ficolin(胶原蛋白/含有纤维蛋白原结构域)3(Hakata 抗原)(ficolin(collagen/fibrinogen domain-containing) 3(Hakata antigen)) 582 A6427 AA402425 人cDNA:FLJ22343 fis,克隆HRC06043(Homo sapiens cDNA:FLJ22343 fis,clone HRC06043) 583 A0970 U44403 SLA Src-样-衔接子(Src-like-adapter) 584 A4680 U40282 ILK 整联蛋白-连接激酶(integrin-linked kinase) 585 A5015 U13219 FOXF1 forkhead box F1(forkhead box F1) 586 A4769 AF004562 STXBP1 突触融合蛋白结合蛋白1(syntaxin binding protein 1) 587 A0056 AF061836 RASSF1 Ras结合(RalGDS/AF-6)结构域家族 1(Ras association(RalGDS/AF-6)domain family 1) 588 A7051 AA429070 ISLR 含有富亮氨基酸重复单元的免疫球蛋白超家族 (immunoglobulin superfamily containing leucine-rich repeat) 589 A7795 AA508749 UBL3 泛素-样3(ubiquitin-like 3) 590 A8561 AA699666 Melanophilin 591 A7764 592 B9056 AI025137 ARHGEF3 Rho鸟苷酸交换因子(GEF)3(Rho guanine nucleotide exchange factor(GEF)3) 593 B4277 AA147512 STX7 突触融合蛋白7(syntaxin 7) 594 B6265 AA902739 ESTs 595 A0925N Z69028 PPP2R5B 蛋白磷酸酶2,调节亚基B(B56),β同种型(protein phosphatase 2,regulatory subunit B(B56),beta isoform) 596 B3833 AI337078 MacGAP蛋白(MacGAP protein) 597 B5623 AA505359 MYO1E 肌球蛋白IE(myosin IE) 598 B7105 AA707941 ESTs 599 B5917N W23481 FLJ20271 不确定蛋白FLJ20271(hypothetical protein FLJ20271) 600 B5291 AA481924 TYROBP TYRO蛋白酪氨酸激酶结合蛋白(TYRO protein tyrosine kinase binding protein) 601 C0211 AA306716 FLJ11937 不确定蛋白FLJ11937(hypothetical protein FLJ11937) 602 A4115 AA290738 GSTM4 谷胱甘肽S-转移酶M4(glutathione S-transferase M4) 603 A9993 AB007903 KIAA0443 KIAA0443基因产物(KIAA0443 gene product) 604 D7150 AA909959 NESH NESH蛋白(NESH protein) 605 B4090 M34175 AP2B1 衔接子-相关蛋白复合体2,β1亚单位 (adaptor-related protein complex 2,beta 1 subunit) 606 B4352N T46905 人克隆23649及23755未知的mRNA,部分 cds(Homo sapiens clone 23649 and 23755 unknown mRNA,partial cds) 607 A3390 L35240 ENIGMA enigma(LIM结构域蛋白)(enigma(LIM domain protein)) 608 B4076 AA293636 GJA1 间隙连接蛋白α1,43kD(连接蛋白43)(gap junction protein,alpha 1,43kD(connexin 43)) 609 B1535 AI161137 人cDNA:FLJ22743 fis,克隆HUV00901(Homo sapiens cDNA:FLJ22743 fis,clone HUV00901) 610 B8678 AA759306 KIAA1249 KIAA1249蛋白(KIAA1249 protein) 611 A1445 M27492 IL1R1 白细胞介素1受体,II型(interleukin 1 receptor,type I) 612 A6886 W76482 ESTs 613 E0242 AI093526 EST,略微近似于Fcγ受体I[人](EST,Weakly similar to Fc gamma receptor I[H.sapiens]) 614 A1710 X06985 HMOX1 血红素加氧酶(去环化)1(heme oxygenase (decycling)1) 615 B4278 AI198543 ESTs,高度近似于KIAA1395蛋白[人](ESTs,Highly similar to KIAA1395 protein[H.sapiens]) 616 B4497 W88815 LOC57406 脂肪酶蛋白人(lipase protein) 617 B7559 N98940 ESTs 618 B5481 AI274152 LOC51762 RAB-8b蛋白(RAB-8b protein) 619 E0721 Z95331 MLLT2 脊髓的/淋巴的或混合-谱系白血病(三空腔蛋白(果 蝇)同源物);移位至-,2(myeloid/lymphoid or mixed-lineage leukemia (trithorax (Drosophila) homolog);translocated to,2) 620 A7301N W37605 ESTs 621 C9246 AI348094 KIAA0882 KIAA0882蛋白(KIAA0882 protein) 622 B9394 H59903 DJ1057B2 0.2 不确定蛋白dJ1057B20.2(hypothetical protein dJ1057B20.2) 623 C6040 H05226 EST 624 E0880 H12644 NFRKB 与KB结合蛋白相关的核因子(nuclear factor related to kappa B binding protein) 625 A2467 AF035752 CAV2 小窝蛋白2(caveolin 2) 626 A6234 M12963 ADH1 乙醇脱氢酶1(I类)α多肽(alcohol dehydrogenase 1 (class I),alpha polypeptide) 627 A2531 V00493 HBA2 血红蛋白,α2(hemoglobin,alpha 2) 628 C4765 N67091 ESTs 629 A5084 M86511 CD14 CD14抗原(CD14 antigen) 630 A4545 M22299 PLS3 网素3(T同种型)(plastin 3(Tisoform)) 631 A2534 M21119 LYZ 溶菌酶(肾的淀粉样变性)(lysozyme(renal amyloidosis)) 632 B4633 AA634261 CLIC4 氯化物胞内通道4(chloride intracellular channel 4) 633 B8081 AA528190 ESTs 634 C0533 AA760720 SPAG6 精子相关抗原6(sperm associated antigen 6) 635 A0323 X03438 CSF3 集落刺激因子3(粒性白细胞)(colony stimulating factor 3(granulocyte)) 636 A8596 AA632025 ESTs 637 A9093 N80081 ESTs 638 B4285 AA812063 人cDNA FLJ13698 fis,克隆PLACE2000176(Homo sapiens cDNA FLJ13698 fis,clone PLACE2000176) 639 A2363 U03274 BTD 生物素化酶(biotinidase) 640 A2518 M62402 IGFBP6 胰岛素-样生长因子-结合蛋白(insulin-like growth factor binding protein 6) 641 B0327 AI038322 ESTs,中度近似于KIAA1058蛋白[人](ESTs, Moderately similar to KIAA1058 protein [H.sapiens]) 642 B4245 AF052101 人克隆23872mRNA序列(Homo sapiens clone 23872 mRNA sequence) 643 B9433 AA031379 ESTs 644 B9992 AA191449 KIAA1254 KIAA1254蛋白 645 C8175 X00129 RBP4 视黄醇-结合蛋白4,间质的(retinol-binding protein 4,interstitial) 646 A0890 L11329 DUSP2 双重特异性磷酸酶2(dual specificity phosphatase 2) 647 B4213 X65460 ATP5A1 ATP合成酶,H+转运,线粒体F1复合体,α亚单位, 同种型1,心肌(ATP synthase,H+ transporting, mitochondrial F1 complex,alpha subunit,isoform 1, cardiac muscle) 648 B6035N AA424407 ZFP106 锌指蛋白106(zinc finger protein 106) 649 A6003 AA678103 FKBP5 FK506-结合蛋白5(FK506-binding protein 5) 650 A7454 AF007162 CRYAB 晶状体蛋白,αB(crystallin,alpha B) 651 B9457 AA340728 NR2F2 核受体亚家族2,C群,成员(nuclear receptor subfamily 2,group F,member 2) 652 B6552 AA678830 KIAA1035 KIAA1035蛋白 653 A2087N X16940 ACTG2 肌动蛋白,γ2,平滑肌,肠的(actin,gamma 2, smooth muscle,enteric) 654 A5785 AA776284 PSMB7 蛋白酶体(prosome,macropain)亚单位,β型, 7(Proteasome(prosome,macropain)subunit,beta type, 7) 655 A1891 L13720 GAS6 生长抑止-特异性6(growth arrest-specific 6) 656 A1183 U28833 DSCR1 综合症关键区域基因1(Down syndrome critical region gene 1) 657 A0905 M64722 CLU clusterin(补体溶解抑制因子,SP-40,40,硫酸化糖 蛋白2,睾丸激素-阻抑的前列腺信息2,脱脂蛋白 J)(clusterin(complement lysis inhibitor,SP-40,40, sulfated glycoprotein 2,testosterone-repressed prostate message 2,apolipoprotein J)) 658 A2516 M77016 TMOD 原肌球调节蛋白(tropomodulin) 659 A6626 AA197086 ESTs 660 A9357 AA682274 FLJ20093 不确定蛋白FLJ20093 661 B4077 M81635 EPB72 红细胞膜蛋白带7.2(气孔蛋白)(erythrocyte membrane protein band 7.2(stomatin)) 662 A9451 AF055066 HLA-A 主要组织相容性复合体,I类,A(major histocompatibility complex,class I,A) 663 A8883 N24759 LOC51170 视网膜短链的脱氢酶/还原酶retSDR2(retinal short-chain dehydrogenase/reductase retSDR2) 664 A8209 AA293061 人cDNA:FLJ21559 fis,克隆COL06406(Homo sapiens cDNA:FLJ21559 fis,clone COL06406) 665 A9564 AI149131 CDKN1C 细胞周期蛋白-依赖性激酶抑制因子1C(p57,Kip2) (cyclin-dependent kinase inhibitor 1C(p57,Kip2)) 666 A1490N AI097058 人cDNA:FLJ23538 fis,克隆LNG08010,高度近似 于BETA2人MEN1区域克隆ε/β mRNA(Homo sapiens cDNA:FLJ23538 fis,clone LNG08010,highly similar to BETA2 Human MEN1 region clone epsilon/beta mRNA) 667 B9739 X94770 EMP2 上皮膜蛋白2(epithelial membrane protein 2) 668 A8504 AI367368 FACL5 长链脂肪酸辅酶A连接酶5(long-chain fatty acid coenzyme A ligase 5) 669 B3883 AA121351 RAI2 视黄酸诱导的2(retinoic acid induced 2) 670 B4335 D59837 KIAA1565 KIAA1565蛋白 671 A4360N U83461 SLC31A2 溶质载体家族31(转运物),成员2(solute carrier family 31(copper transporters),member 2) 672 B9836 R79561 KIAA1376 KIAA1376蛋白 673 B5151 AI189343 人cDNA FLJ13511 fis,克隆PLACE1005331,高度 近似于人7h3蛋白mRNA(Homo sapiens cDNA FLJ13511 fis,clone PLACE1005331,highly similar to Homo sapiens 7h3 protein mRNA) 674 A6320N AF070616 HPCAL1 hippocalcin-样1 675 B6752 AA156797 人mRNA;cDNA DKFZp434E109(来自克隆 DKFZp434E109)(Homo sapiens mRNA;cDNA DKFZp434E109(from clone DKFZp434E109)) 676 C8698 AA903358 CGGBP1 CGG三联体重复单元结合蛋白 1(CGG triplet repeat binding protein 1) 677 E0789 AI969467 ESTs 678 A7498 AA115280 LOC55901 带有血小板反应蛋白组件的跨膜分子的 TMTSP(TMTSP for transmembrane molecule with thrombospondin module) 679 E0783 AI146697 MAPK7 有丝分裂原-活化的蛋白激酶(mitogen-activated protein kinase 7) 680 A6602 W87690 人cDNA:FLJ23173 fis,克隆LNG10019(Homo sapiens cDNA:FLJ23173 fis,clone LNG10019) 681 A7605 R15801 LOC51299 neuritin 682 A1437N W37188 H2AFL H2A组蛋白家族,成员L(H2A histone family, member L) 683 B9007 AI203211 ESTs 684 D9915 AI079175 人mRNA;cDNA DKFZp564F053(来自克隆 DKFZp564F053)(Homo sapiens mRNA;cDNA DKFZp564F053(from clone DKFZp564F053)) 685 B2663 AA953615 ACTC 肌动蛋白,α,心肌(actin,alpha,cardiac muscle) 686 B7193N AI261663 ESTs 687 A1622N X75918 NR4A2 核受体亚家族A,成员2(nuclear receptor subfamily 4, group A,member 2) 688 C6826 L02326 人克隆Huλ7λ-样蛋白(IGLL2)基因,部分 cds(Homo sapiens clone Hu lambda7 lambda-like protein(IGLL2)gene,partial cds) 689 A3739 X14420 COL3A1 胶原蛋白,III型,α1(Ehlers-当洛斯氏综合征IV型, 常染色体显性)(collagen,type III,alpha 1 (Ehlers-Danlos syndrome type IV,autosomal dominant)) 690 A3297 X01410 TRB@ T细胞受体β基因座(T cell receptor beta locus) 691 A7293 N48811 KIAA0786 latrophilin 692 B8295 AI359344 PCAF P300/CBP-相关因子(P300/CBP-associated factor) 693 A2429 M61715 WARS 色氨酰-tRNA合成酶(tryptophanyl-tRNA synthetase) 694 A9007 AA037452 KIAA0992 palladin 695 B0176N W56480 SOS1 son of sevenless(果蝇)同源物1(son of sevenless (Drosophila)homolog 1) 696 C7506 AI025678 人克隆25228 mRNA序列(Homo sapiens clone 25228 mRNA sequence) 697 E0498 AK025773 人cDNA:FLJ22120 fis,克隆HEP18874(Homo sapiens cDNA:FLJ22120 fis,clone HEP18874) 698 A7291 AA594600 CTL2 CTL2基因 699 C8442 AA910738 KIAA0579 KIAA0579蛋白 700 A4472 AF042081 SH3BGRL SH3结构域结合型富含谷氨酸的蛋白样的(SH3 domain binding glutamic acid-rich protein like) 701 A1669 M95787 TAGLN transgelin 702 A8155 T34177 LOC51255 不确定蛋白(hypothetical protein) 703 E0176 AI090671 人cDNA FLJ12057 fis,克隆HEMBB1002068(Homo sapiens cDNA FLJ12057 fis,clone HEMBB1002068) 704 A2452 M33146 CSRP1 富含半胱氨酸及甘氨酸的蛋白1(cysteine and glycine-rich protein 1) 705 A5016 U13220 FOXF2 叉头盒(forkhead box F2) 706 A8843 AA235920 ESTs 707 B4092 AB011126 KIAA0554 KIAA0554蛋白 708 A8493 AA780301 CTSF 组织蛋白酶F(cathepsin F) 709 A9051 AB007934 ACF7 肌动蛋白结合蛋白;macrophin(微丝及肌动蛋白微丝 交联蛋白)(actin binding protein;macrophin (microfilament and actin filament cross-linker protein)) 710 B9813 AI221110 FLJ10980 不确定蛋白FLJ10980 711 B7487 AA036947 人cDNA FLJ10229 fis,克隆HEMBB1000136 712 B9712 AI002977 ESTs 713 B5430 AA290920 ESTs 714 A2632N D14665 ADAM9 一种去整联蛋白及金属硫蛋白酶结构域9(meltrin γ)(a disintegrin and metalloproteinase domain 9 (meltrin gamma)) 715 A0225N M93426 PTPRZ1 蛋白酪氨酸磷酸酶,受体-型,Z多肽1(protein tyrosine phosphatase,receptor-type,Z polypeptide 1) 716 A0704N AA156840 MAP3K8 有丝分裂原-活化蛋白激酶激酶激酶 8(mitogen-activated protein kinase kinase kinase 8) 717 A8969 AA039563 KIAA1415 KIAA1415蛋白 718 B7478 AA443202 KIAA1053 KIAA1053蛋白 719 A3554 K01160 ESTs 720 B9536 AI333662 ESTs 721 C9685 AI275584 大鼠富含脯氨酸突触的相关蛋白2的很可能的直向 同源物(Likely ortholog of rat proline rich synapse associated protein 2) 722 C0335 X13839 ACTA2 肌动蛋白,α2平滑肌,主动脉(actin,alpha 2,smooth muscle,aorta) 723 C4163 AA912674 VE-JAM 血管的内皮连接-相关分子(vascular endothelial junction-associated molecule) 724 D7516 AI074524 ESTs 725 E1492 R27799 BMP6 骨形态发生蛋白6(bone morphogenetic protein 6) 726 A7782 N44246 PRKCH 蛋白激酶C,eta(protein kinase C,eta) 727 A5154 M55543 GBP2 guanylate结合蛋白2,干扰素-可诱导的(guanylate binding protein 2,interferon-inducible) 728 C6278 AA641454 SART-2 由T细胞识别的鳞状细胞癌抗原(squamous cell carcinoma antigen recognized by T cell) 729 A1693 X94991 ZYX zyxin 730 A0808 M58285 HEM1 生血蛋白1(hematopoietic protein 1) 731 A1704N D21254 CDH11 钙粘着蛋白11,型2,OB-钙粘着蛋白(成骨细 胞)(cadherin11,type2,OB-cadherin(osteoblast)) 732 B4614 AI093734 TAZ 带有PDZ-结合基序的翻译共-活化因子(TAZ) (Transcriptional co-activator with PDZ-binding motif (TAZ)) 733 B5081N AA419490 人mRNA全长插入互补DNA克隆 EUROIMAGE248114(Homo sapiens mRNA full length insert cDNA clone EUROIMAGE 24811) 734 A0568 X60957 TIE 带有免疫球蛋白及表皮生长因子同源结构域的酪氨 酸激酶(tyrosine kinase with immunoglobulin and epidermal growth factor homology domains) 735 A8796 AA479330 SLC7A7 溶质载体家族7(阳离子的氨基酸转运物,y+系统), 成员7(solute carrier family 7(cationic amino acid transporter,y+ system),member 7) 736 B9265 AI346969 TRIM14 含有三分基序的14(Triartite motif-containing 14) 737 A9013N D62275 ITM2B 整体蛋白2B(integral membrane protein 2B) 738 B5202N T78873 人cDNA:FLJ22290 fis,克隆HRC04405(Homo sapiens cDNA:FLJ22290 fis,clone HRC04405) 739 C8299 AA600814 PTPN9 蛋白酪氨酸磷酸酶,非-受体型,9(protein tyrosine phosphatase,non-receptor type 9) 740 A2926 X96719 CLECSF2 C-型(钙依赖的,碳水化合物-识别结构域)凝集素, 超家族成员2(活化-诱导的)(C-type(calcium dependent,carbohydrate-recognition domain)lectin, superfamily member 2(activation-induced)) 741 A4681 U02020 PBEF 前-B细胞集落-增强因子(pre-B-cell colony-enhancing factor) 742 A1217 X14454 IRF1 干扰素调节因子1(interferon regulatory factor 1) 743 C4981 X05908 ANXA1 膜联蛋白A1(annexin A1) 744 B0293 AA037349 LAMR1 层粘连蛋白受体1(67kD,核糖体蛋白SA)(laminin receptor1(67kD,ribosomal protein SA)) 745 A8128 M78933 MY047 MY047蛋白 746 C8090 AF052685 PCDHGC3 proto钙粘素γ亚家族C,3(protocadherin gamma subfamily C,3) 747 C4610 N66498 EST 748 B7221N AA706790 ESTs 749 A6623 R64431 RYBP RING1及YY1结合蛋白(RING1 and YY1 binding protein) 750 A8823 N26005 PPP1R5 蛋白磷酸酶1,调节的(抑制因子)亚单位5(protein phosphatase 1,regulatory(inhibitor)subunit 5) 751 B3694 AA745720 ESTs 752 A5459 AA393478 NFAT5 活化的T细胞5的核因子,张力-应答性(Nuclear factor of activated T-cells 5,tonicity-responsive) 753 A6360 W69716 人mRNA;cDNA DKFZp761P06121(来自克隆 DKFZp761P06121)(Homo sapiens mRNA;cDNA DKFZp761P06121(from clone DKFZp761P06121)) 754 A0944 Z24725 MIG2 有丝分裂原可诱导的2(mitogen inducible 2) 755 A5484 AA634825 PINK1 PTEN诱导的推定的激酶1(PTEN induced putative kinase 1) 756 A2503 S60099 APLP2 淀粉样β(A4)前体-样蛋白2(amyloid beta(A4) precursor-like protein 2) 757 A0205 M69066 MSN 膜突蛋白(moesin) 758 A5850 AA282650 SAC1 肌动蛋白1的抑制基因(Suppressor of actin 1) 759 A5423 AA773731 人cDNA:FLJ21028 fis,克隆CAE07155(Homo sapiens cDNA:FLJ21028 fis,clone CAE07155) 760 A2887 M22865 CYB5 细胞色素b-5(cytochrome b-5) 761 A6629 AI366509 HSMNP1 非典型的下丘脑蛋白HSMNP1(uncharacterized hypothalamus protein HSMNP1) 762 A4543N AB001636 DDX15 DEAD/H(Asp-Glu-Ala-Asp/His) 框多肽 15(DEAD/H(Asp-Glu-Ala-Asp/His)box polypeptide 15) 763 B5480 AA044842 AHCP 常染色体的高度保守蛋白(Autosomal Highly Conserved Protein) 764 B4084 AA916826 APP 淀粉样β(A4)前体蛋白(蛋白酶连接蛋白-II,阿尔茨 海默病)(amyloid beta(A4)precursor protein (protease nexin-II,Alzheimet disease)) 765 A0224N D13380 PTPN12 蛋白酪氨酸磷酸酶,非-受体型12(protein tyrosine phosphatase,non-receptor type 12) 766 B4552 AA812671 CDC14B CDC14(细胞分裂周期14,酿酒酵母)同源物 B(CDC14(cell division cycle 14,S.cerevisiae) homolog B) 767 B3700 AA443786 SYTL2 突触结合蛋白-样2(Synaptotagmin-like 2) 768 B4891 W19216 PKIG 蛋白激酶(cAMP-依赖的,催化的)抑制因子γ (protein kinase(cAMP-dependent,catalytic)inhibitor gamma) 769 B5366N AA291036 KIAA0164 KIAA0164基因产物(KIAA0164 gene product) 770 A8477N W44716 HSPC055 HSPC055蛋白 771 C8058 N62855 ESTs 772 E1374 AK000752 KIAA1181 KIAA1181蛋白 773 A2287 U09577 HYAL2 透明质氨基葡糖苷酶2(hyaluronoglucosaminidase 2) 774 A2118 J04130 SCYA4 小的可诱导的细胞因子A4(同源于小鼠Mipb)(small inducible cytokine A4(homologous to mouse Mipb)) 775 A2511 D49547 HSPF1 热休克40kD蛋白1(heat shock 40kD protein 1) 776 A6236 L04656 CA8 碳酸酐酶VIII(carbonic anhydrase VIII) 777 A1795 J03004 GNAI2 鸟苷酸结合蛋白(G蛋白),α抑制性活性多肽2 (guanine nucleotide binding protein(G protein),alpha inhibiting activity polypeptide 2) 778 A4171 AA772230 人cDNA:FLJ23538 fis,克隆LNG08010,高度近似 于BETA2人MEN1区域克隆ε/βmRNA(Homo sapiens cDNA:FLJ23538 fis,clone LNG08010,highly similar to BETA2 Human MEN1 region clone epsilon/beta mRNA) 779 A4766 AF001434 EHD1 含有EH结构域的蛋白1(EH domain containing 1) 780 A1999 D00172 ANXA5 膜联蛋白A5 781 A6187 AA412555 KIAA1536 KIAA1536蛋白 782 A1452 M35198 ITGB6 整联蛋白,β6 783 A3288 M12670 TIMP1 金属硫蛋白酶1的组织抑制因子(红细胞增强活性 (erythroid potentiating activity),胶原酶抑制因 子)(tissue inhibitor of metalloproteinase 1(erythroid potentiating activity,collagenase inhibitor)) 784 A4279 AI222322 TOB2 ERBB2,2的转导蛋白(transducer of ERBB2,2) 785 A8063 H98203 KIAA0987 差异性表达于肺腺癌(differentially expressed in adenocarcinoma of the lung) 786 B0911 W72053 人cDNA:FLJ21904 fis,克隆HEP03585(Homo sapiens cDNA:FLJ21904 fis,clone HEP03585) 787 B4831 M31210 EDG1 内皮分化,鞘脂类G-蛋白-偶联受体,1(endothelial differentiation,sphingolipid G-protein-coupled receptor,1) 788 B3748 D88153 HYA22 HYA22蛋白 789 A6715 U83463 SDCBP 多配体蛋白聚糖结合蛋白(syntenin)(syndecan binding protein(syntenin)) 790 A9327 AA447864 KIAA1055 KIAA1055蛋白 791 B1490 AI199405 ZNF266 锌指蛋白266(zinc finger protein 266) 792 A9412 AA523727 ESTs 793 A6411 AA303231 LOC64744 不确定蛋白AL133206(hypothetical protein AL133206) 794 B1647 AA242740 SCEL sciellin 795 A1992 Z11697 CD83 CD83抗原(活化的B淋巴细胞,免疫球蛋白超家 族)(CD83 antigen(activated B lymphocytes, immunoglobulin superfamily)) 796 A8921 R38569 ESTs 797 B6472 AI288772 DREV1 CGI-81蛋白 798 B7213N D86982 KIAA0229 KIAA0229蛋白 799 B7575 W42910 SEC22C 小泡运输蛋白(vesicle trafficking protein) 800 B9287 AA885480 人的来自染色体1q42.13-43上克隆RP5-858B6的 DNA序列含有ESTs、STSs、GSSs和一个CpG岛。 含有3个新基因(Human DNA sequence from clone RP5-858B6 on chromosome 1q42.13-43 Contains ESTs,STSs,GSSs and a CpG island.Contains three novel genes) 801 B3891 C06051 JAK1 Janus激酶1(一种蛋白酪氨酸激酶)(Janus kinase 1(a protein tyrosine kinase)) 802 B4491 AA148566 人cDNA:FLJ22790 fis,克隆KAIA2176,高度近似 于HUMPMCA人血浆膜钙-ATPase (PMCA4) mRNA(Homo sapiens cDNA:FLJ22790 fis,clone KAIA2176,highly similar to HUMPMCA Human plasma membrane calcium-pumping ATPase (PMCA4)mRNA) 803 C8127 AA478197 MAN2A2 甘露糖苷酶,α,2A类,成员2(mannosidase,alpha, class 2A,member 2) 804 C8456 U90912 KIAA1128 人克隆23865 mRNA序列 805 C0570 H12297 人cDNA:FLJ22167 fis,克隆HRC00584(Homo sapiens cDNA:FLJ22167 fis,clone HRC00584) 806 D1436 AI341482 RNB6 RNB6
表2 上调的基因(≥×5,≥50%的病例) NSC 编号 LMMID Acc 代号 名称 807 A1589 NM_00654 7 KOC1 IGF-II mRNA-结合蛋白3(IGF-II mRNA-binding protein 3) 808 A0042 AF029082 SFN stratifin 805 809 A1063 M19888 SPRR1B 小的富含脯氨酸的蛋白1b(角质蛋白)(small proline-rich protein 1B(cornifin)) 810 A3243 NM_00331 8 TTK TTK蛋白激酶(TTK protein kinase) 811 A0418 NM_00299 7 SDC1 多配体蛋白聚糖1(syndecan 1) 812 A2932 M21551 NMB 神经调节肽B(neuromedin B) 813 A3547 J04739 BPI 杀菌的/通透性-提高蛋白 (bactericidal/permeability-increasing protein) 814 A2282 D79997 KIAA017 5 KIAA0175基因产物 815 A4383 Z97029 RNAEHI 核糖核酸酶HI,大亚基(ribonuclease HI,large subunit) 816 A1257 AF006259 PIR51 RAD51-相互作用性蛋白(RAD51-interacting protein) 817 B4368 AI082560 FLJ20450 不确定蛋白FLJ20450(hypothetical protein FLJ20450) 818 B7725 C20910 CCNB1 细胞周期蛋白B1(cyclin B1) 819 A8043 W72411 TP63 与p53强同源的肿瘤蛋白63kda(tumor protein 63 kDa with strong homology to p53) 820 B6769 AA461217 HMMR 透明质酸-介导的运动性受体(RHAMM) (hyaluronan-mediated motility receptor(RHAMM)) 821 A6695 AF035444 TSSC3 肿瘤抑制亚可转移的侯选物3(tumor suppressing subtransferable candidate 3) 822 C4330 AA234722 ESTs(MGC12536),中度近似于CANS_人钙-依赖的 蛋白酶,小亚基[人](ESTs(MGC12536),Moderately similar to CANS_HUMAN CALCIUM-DEPENDENT PROTEASE.SMALL SUBUNIT[H.sapiens]) 823 B1406 AA483082 XAGE XAGE蛋白 824 A0771N M69225 BPAG1 大疱的类天疱疮抗原1(230/240kD)(bullous pemphigoid antigen 1(230/240kD)) 825 B8870 NM_01868 5 ANLN anillin(果蝇Scraps同源物),肌动蛋白结合蛋白 (anillin(Drosophila Scraps homolog),actin binding protein) 826 B9760 R73030 ESTs,略微近似于ALU1_HUMAN ALU SUBFAMILY J SEQUENCE CONTAMINATION WARNING ENTRY[人](ESTs,Weakly similar to ALU1_HUMAN ALU SUBFAMILY J SEQUENCE CONTAMINATION WARNING ENTRY [H.sapiens]) 827 B5915 T79582 ESTs,略微近似于KIAA0479蛋白[人](ESTs, Weakly similar to KIAA0479 protein[H.sapiens]) 828 A8893N AA460182 PPPlR16 A 蛋白磷酸酶1,调节性(抑制因子)亚单位5 16A(Protein phosphatase 1,regulatory(inhibitor) subunit 16A) 829 B5301 W44796 ESTs 830 B7439 AI318098 ESTs 831 B8547 AI125938 接近ALD基因座的人X28区域,其中含有双重特 异性磷酸酶9(DUSP9)、核糖体蛋白L18a(RPL18a)、 Ca2+/钙调蛋白-依赖的蛋白激酶I(CAMKI)、肌酸 转运物(CRTR)、CDM蛋白(CDM)、肾上腺脑白质 营养不良蛋白(Homo sapiens X28 region near ALD locus containing dual specificity phosphatase 9 (DUSP9),ribosomal protein L18a(RPL18a), Ca2+/Calmodulin-dependent protein kinase I (CAMKI),creatine transporter(CRTR),CDM protein (CDM),adrenoleukodystrophy protein) 832 B8743 AI261284 ESTs 833 B7163 R06794 ESTs 834 B8909 AA552690 人cDNA:FLJ21274 fis,克隆COL01781(Homo sapiens cDNA:FLJ21274 fis,clone COL01781) 835 B4688 AA411315 FLJ10604 不确定蛋白FLJ10604 836 B4788N AA776829 ESTs 837 B6264 T91195 ESTs 838 B4186N AI189587 ESTs 839 B7771 AA427818 HMGIC 高-迁移率群(非组蛋白染色体的)蛋白同种型 I-C(high-mobility group(nonhistone chromosomal) protein isoform I-C) 840 C1730 AA847662 GNAS GNAS,复合基因座(GNAS,complex locus) 841 C4539 AB101204 URLC2 在肺癌中上调的2(up-regulated in lung cancer 2) 842 C8214 AA047315 KIAA088 7 KIAA0887蛋白 843 C6987 AI123912 人cDNA FLJ10041 fis,克隆HEMBA1001022(Homo sapiens cDNA FLJ10041 fis,clone HEMBA1001022) 844 C7403 AI359511 ESTs,中度类似于smoothelin[人] 845 D0773 AA425730 ESTs,略微近似于ALU1_HUMAN ALU SUBFAMILY J SEQUENCE CONTAMINATION WARNING ENTRY[人](ESTs,Weakly similar to ALU1_HUMAN ALU SUBFAMILY J SEQUENCE CONTAMINATION WARNING ENTRY [H.sapiens]) 846 D0006 AI015982 ESTs,略微近似于AF155135 1新型视网膜色素上 皮细胞蛋白[人](ESTs,Weakly similar to AF155135 1 novel retinal pigment epithelial cell protein[H.sapiens]) 847 C0488 AA781195 PRAME 黑色素瘤中优选表达的抗原(preferentially expressed antigen in melanoma) 848 C6902 AA479648 ESTs 849 C7601 NM005268 GJB5 间隙连接蛋白,β5(连接蛋白31.1)(gap junction protein,beta 5(connexin 31.1)) 850 D1135 AA447744 ESTs 851 C5005 AA625553 ESTs 852 C6143 AA678356 ESTs 853 C6664 AI142832 ESTs 854 C1442 AA807192 ESTs,高度近似于未命名的蛋白产品[人](ESTs, Highly similar to unnamed protein product [H.sapiens]) 855 C6719 AB105191 LNIR Ig超家族受体LNIR(Ig superfamily receptor LNIR) 856 D0010 AA358397 EST 857 C7630 NM_03286 2 TIGD5 触发可转位元件来源的5(tigger transposable element derived5) 858 C6447 AA079262 人mRNA;cDNA DKFZp566C0546(来自克隆 DKFZp566C0546)(Homo sapiens mRNA;cDNA DKFZp566C0546(from clone DKFZp566C0546)) 859 C7444 AB101205 URLC3 在肺癌上调的3(up-regulated in lung cancer 3) 860 D9683 AI057353 ESTs 861 D9437 W67209 KIAA025 1 ESTs,中度近似于p53调节的PA26-T2核蛋白[人] (ESTs,Moderately similar to p53 regulated PA26-T2 nuclear protein[H.sapiens]) 862 D3230 AA780074 ESTs 863 E0904 AI394016 FLJ20116 不确定蛋白FLJ20116 864 D5363 AA954567 ESTs 865 A2691N X63629 CDH3 钙粘着蛋白3,1型,P-钙粘着蛋白(胎盘 的)(cadherin 3,type 1,P-cadherin(placental)) 866 A4693 U42408 LAD1 ladinin 1 867 C3760 U75285 BIRC5 含有杆状病毒IAP重复单元的基因5 (survivin)(baculoviral IAP repeat-containing 5 (survivin)) 868 A2603N Z46629 SOX9 SRY(性别决定区域 Y)-框9(campomelic发育异 常,常染色体性-颠倒)(SRY(sex determining region Y)-box 9(campomelic dysplasia,autosomal sex-reversal)) 869 A3529N D89016 NBR 推定的神经母细胞瘤蛋白(putative neuroblastoma protein) 870 C8633 AI161159 人mRNA;cDNA DKFZp566N034(来自克隆 DKFZp566N034);部分cds(Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp566N034 (from clone DKFZp566N034);partial cds) 871 D5753 AA971042 KIAA192 9 ESTs 872 A9044 AA775667 LOC5165 9 HSPC037蛋白 873 C8799 AA219172 ESTs 874 B7197N R07614 ESTs 875 B4414 AA765913 DECR2 2,4-dienoyl辅酶A还原酶2,过氧化物酶体的 (2,4-dienoyl CoA reductase 2,peroxisomal) 876 C9030 AI086906 ESTs,高度近似于LRP1人低密度脂蛋白受体-相关 蛋白1前体[人]/高度近似于S02392α-2-巨球蛋 白受体前体[人](ESTs,Highly similar to LRP1_HUMAN LOW-DENSITY LIPOPROTEIN RECEPTOR-RELATED PROTEIN 1 PRECURSOR [H.sapiens]/Highly similar to S02392 alpha-2-macroglobulin receptor precursor[H.sapiens]) 877 A2709N D85376 ESTs 878 D9621 AI349804 ESTs,略微近似于IQGA_HUMAN RAS GTPASE-ACTIVATING-LIKE PROTEIN IQGAP1 [人](ESTs,Weakly similar to IQGA_HUMAN RAS GTPASE-ACTIVATING-LIKE PROTEIN IQGAP1 [H.sapiens]) 879 C7956 AA172001 FLJ10901 不确定蛋白FLJ10901 880 A2759N X16260 ITIH1 α(球蛋白)间抑制因子,H1多肽(inter-alpha(globulin) inhibitor,H1 polypeptide) 881 C3813 NM_01765 0 FLJ20068 不确定蛋白FLJ20068(hypothetical protein FLJ20068) 882 D4920 AI247180 GUCY1B 2 鸟苷酸环化酶1,可溶解的,β2(guanylate cyclase 1, soluble,beta 2) 883 A7675 U26726 HSD11B2 羟类固醇(11-β)脱氢酶2(hydroxysteroid(11-beta) dehydrogenase 2) 884 B8059 AA625338 RAD51 RAD51(酿酒酵母)同源物(大肠菌RecA同源 物)(RAD51(S.cerevisiae)homolog(E coli RecA homolog))


kinesin)) 919 B4345 AA576959 ESTs 920 A1957 NM_00548 3 CHAF1A 染色质装配因子1,亚单位A(p150)(chromatin assembly factor 1,subunit A(p150)) 921 A4076 AF044961 AKR1B11 氧代酮还原酶家族1,成员B11(醛糖还原酶- 样)(aldo-keto reductase family 1,member B11(aldose reductase-like)) 922 A9518N AA570186 ESTs,ESTs,略微近似于MUC2人粘蛋白2前体 (ESTs,ESTs,Weakly similar to MUC2_HUMAN MUCIN 2 PRECURSOR) 923 B4593 AA946930 SNRPG 小的核核糖核酸蛋白多肽G(small nuclear ribonucleoprotein polypeptide G) 924 C4878 AA446064 ESTs 925 B1898 AA496118 EST 926 C6506 AA004412 ESTs 927 D6607 AI000650 ESTs 928 E1138 N80859 ERBB2 v-erb-b2鸟类成红细胞的白血病病毒癌基因同源物 2(神经/glioblastoma衍生的癌基因同源 物)(v-erb-b2 avian erythroblastic leukemia viral oncogene homolog 2 (neuro/glioblastoma derived oncogene homolog)) 929 B8882 D14657 KIAA010 1 KIAA0101基因产物 930 A5223 AA453716 ESTs 931 A0437 AF047002 ALY 翻译共活化剂(transcriptional coactivator) 932 B0303 AA731891 KIAA151 7 KIAA1517蛋白 933 B2824 AA115381 人cDNA FLJ12640 fis,克隆NT2RM4001940,高度 近似于人永恒的同源物mRNA(Homo sapiens cDNA FLJ12640 fis,clone NT2RM4001940,highly similar to Homo sapiens timeless homolog mRNA) 934 B6283 AA677294 CIT 柠檬(ρ-相互作用,丝氨酸/苏氨酸激酶21)(citron (rho-interacting,serine/threonine kinase 21)) 935 C0716 AI097310 ESTs 936 C8776 AA766028 AF15Q14 AF15q14蛋白 937 C0671 AI091125 FZD10 卷曲(果蝇)同源物10(frizzled(Drosophila)homolog 10) 938 C6173 W72182 FLJ13852 不确定蛋白FLJ13852 939 D8061 AA555306 ESTs 940 D5016 AI191724 KIAA144 3 KIAA1443蛋白 941 C7353 AA587766 FLJ21935 不确定蛋白FLJ21935 942 A4139 AA566069 ARPC4 肌动蛋白相关蛋白2/3复合体,亚单位4(20kD) (actin related protein 2/3 complex,subunit 4(20kD)) 943 B7138 AA429262 ESTs 944 C6222 W74371 ESTs 945 C0912 AJ001014 RAMP1 受体(降钙素)活性调节蛋白1(receptor(calcitonin) activity modifying protein 1) 946 D9981 N30381 ESTs 947 B0259 NM_00718 3 PKP3 plakophilin 3 948 D5142 NM_00374 0 KCNK5 钾通道,K亚家族,成员5(TASK-2)(potassium channel,subfamily K,member 5(TASK-2)) 949 A2391 L38961 ITM1 整合型膜蛋白1(integral membrane protein 1) 950 B0323 AI363295 ESTs 951 B6053 AA916007 ESTs 952 C4825 AA287862 ESTs 953 C6562 AA012883 ESTs 954 D0684 AA420960 EST 955 C9886 AI034428 ESTs 956 D6488 NM_07848 0 SIAHBP1 siah结合蛋白1;FBP相互作用阻遏物;嘧啶序列段 结合;拼接因子;Ro核糖核蛋白-结合蛋白1(siah binding protein 1;FBP interacting repressor; pyrimidine tract binding splicing factor;Ro ribonucleoprotein-binding protein 1) 957 E0502 AI240520 ESTs 958 C4060 N35250 ESTs 959 C9858 AA748883 DNMT3B DNA(胞嘧啶-5-)-甲基转移酶(DNA (cytosine-5-)-methyltransferase 3 beta) 960 C0903 X81420 KRTHB1 角蛋白,毛发,碱性,1(keratin,hair,basic,1) 961 C6634 AA398740 ESTs 962 D9500 AI361654 ESTs 963 C5995 W58277 人mRNA;cDNA DKFZp586P2321(来自克隆 DKFZp586P2321) 964 A3765 X60673 AK3 腺苷酸激酶3(adenylate kinase 3) 965 A2448 AF010314 ENC1 外胚层-神经皮层(带有BTB-样结构 域)(ectodermal-neural cortex(with BTB-like domain)) 966 C0573 H12479 ESTs 967 D0587 AA872040 INHBB 抑制素,βB(活化素ABβ多肽)(inhibin,beta B (activin AB beta polypeptide)) 968 C7590 AB005989 CYP27B1 细胞色素P450,亚家族XXVIIB(25-羟基维生素,D -α-羟化酶),多肽1(cytochrome P450,subfamily XXVIIB(25-hydroxyvitamin D-alpha-hydroxylase), polypeptide 1) 969 B7749 AI346758 GYG2 glycogenin 2 970 C6959 AA054259 EST 971 A0447 U14973 RPS29 核糖体蛋白S29(ribosomal protein S29) 972 C0247 AI352156 LOC5169 0 U6 snRNA-相关Sm-样蛋白LSm7(U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm7) 973 C8682 AA227919 HAS3 透明质酸合成酶3(hyaluronan synthase 3) 974 A2352 M77836 PYCR1 吡咯啉-5-羧化物还原酶1(pyrroline-5-carboxylate reductase 1) 975 B7680 AI342628 FLJ12517 不确定蛋白FLJ12517 976 A1640 X98400 MASP2 甘露聚糖-结合凝集素丝氨酸蛋白酶 2(mannan-binding lectin serine protease 2) 977 A6282 AI076128 ARHD ras同源物基因家族,成员(ras homolog gene family, member) 978 A6884 AA523543 CRABP1 细胞的视黄酸-结合蛋白1(cellular retinoic acid-binding protein 1) 979 B4361 AA989104 NDUFB2 NADH脱氢酶(泛醌)1β子复合形,2(8kD,AGGG) (NADH dehydrogenase(ubiquinone)1 beta subcomplex,2(8kD,AGGG)) 980 B3971 AI298472 ANKT 核仁蛋白ANKT(Nucleolar protein ANKT) 981 C6522 AI249019 ESTs 982 C2298 AA357675 HES6 不确定蛋白HES6 983 C7939 X17620 NME1 非转移性细胞1,蛋白(NM23A)表达于其中 (non-metastatic cells 1,protein(NM23A)expressed in) 984 D3205 AA077280 MLL3 脊髓的/淋巴的或混合-细胞系白血病 3(myeloid/lymphoid or mixed-lineage leukemia3) 985 A1618 X70683 SOX4 SRY(性别决定区域Y)-框4(SRY(sex determining region Y)-box 4) 986 B4397 AA873067 人cDNA:FLJ22940 fis,克隆KAT08051(Homo sapiens cDNA:FLJ22940 fis,clone KAT08051) 987 A2755 AF006043 PHGDH 磷酸甘油酸脱氢酶(phosphoglycerate dehydrogenase) 988 A4873 U10688 MAGEA4 黑色素瘤抗原,家族A,4(elanoma antigen,family A, 4) 989 A3058 L16783 FOXM1 叉头盒M1(forkhead box M1) 990 B4217 AA079060 WFDC2 WAP四-二硫化物核心结构域 2(WAP four-disulfide core domain 2) 991 B6595N XM_20994 4 DOLPP1 连接于Fugu rubripes 2中Surfeit基因;LSFR2基因 2(linked to Surfeit genes in Fugu rubripes 2;LSFR2 gene 2) 992 A7411 M12849 SERPIND 1 丝氨酸(或半胱氨酸)蛋白酶抑制因子,进化枝D(肝 素辅因子),成员1(erine(or cysteine)proteinase inhibitot,clade D(heparin cofactor),member1) 993 A2753N U26662 NPTX2 二乙基溴乙酰胺pentraxin II(neuronal pentraxin II) 994 C7028 NM_03213 8 DKFZp43 4E2318 不确定蛋白DKFZp434E2318 995 B8207 AA411341 人3β-羟Δ5-c27-类固醇氧化还原酶mRNA,完 整cds(Homo sapiens 3 beta-hydroxy-delta 5-C27-steroid oxidoreductase mRNA,complete cds) 996 A7691 X04325 GJB1 间隙连接蛋白,β1,32kD(连接蛋白32, Charcot-Marie-牙齿神经病,X-连接的)(gap unction protein,beta 1,32kD(connexin 32, Charcot-Marie-Tooth neuropathy,X-linked)) 997 B5904 AA806630 FLJ10540 不确定蛋白FLJ10540 998 B8643 AA781393 ESTs 999 A0812 M16937 HOXB7 同源框B7(homeo box B7) 1000 A5513 AB105376 PSK-1 I型跨膜受体(捕捉-相关蛋白)(type I transmembrane receptor(seizure-related protein)) 1001 A0725 U02082 ARHGEF 5 Rho鸟苷酸交换因子(GEF)5(Rho guanine nucleotide exchange factor(GEF)5) 1002 A7887 AF070588 LOC5556 5 不确定蛋白LOC55565 1003 B5018 T47612 ESTs 1004 A0061 AF068760 BUB1B 不受苯并咪唑1抑制的发芽(酵母同源物),β (budding uninhibited by benzimidazoles 1(yeast homolog),beta) 1005 C6805 AA040734 人,克隆MGC:16466 IMAGE:3952569,mRNA, 完整cds(Homo sapiens,clone MGC:16466 IMAGE:3952569,mRNA,complete cds) 1006 C0811 W69611 ESTs 1007 C9517 AA586922 POLR2J 聚合酶(RNA)II(针对DNA的)多肽J(13.3kD) (polymerase(RNA)II(DNA directed)polypeptide J (13.3kD)) 1008 C1590 AI249914 ESTs 1009 C6086 AA235149 ESTs 1010 D9504 AA928656 NTS 神经降压素(neurotensin) 1011 A0329 X07819 MMP7 基质金属硫蛋白7(基质裂解蛋白,子宫的)(matrix metalloproteinase 7(matrilysin,uterine)) 1012 C8953 AA293513 FLJ12428 不确定蛋白FLJ12428 1013 C0802 H63947 ESTs 1014 B0864 AI343440 ESTs,略微近似于Ydr472wp[酿酒酵母](ESTs, Weakly similar to Ydr472wp[S.cerevisiae]) 1015 C6852 AI335883 PHB 抑制素(prohibitin) 1016 C6225 W74482 ESTs,略微近似于KIAA1362蛋白[人](ESTs, Weakly similar to KIAA1362 protein[H.sapiens]) 1017 D8147 AI142227 CS 柠檬酸合酶(citrate synthase) 1018 D4112 AA648521 ESTs,高度近似于前mRNA拼接SR蛋白rA4[人] (ESTs,Highly similar to pre-mRNA splicing SR protein rA4[H.sapiens]) 1019 A0490 L10612 MIF 巨噬细胞移行抑制因子(糖基化作用-抑制因 子)(macrophage migration inhibitory factor (glycosylation-inhibiting factor)) 1020 C1555 AI243620 ESTs 1021 A5740 AI304392 KIAA143 6 前列腺素子F2受体阴性的调节因子(Prostaglandin F2 receptor negative regulator) 1022 A7245 AI275857 ESTs 1023 B1516 AA885961 CLDN2 封闭蛋白2(Claudin 2) 1024 B0436N AA625794 MTX1 metaxin 1 1025 B3987N N30179 PLAB 前列腺分化因子(prostate differentiation factor) 1026 B4030 AA056180 来自染色体20q11.222上的克隆RP4-616B8的人 DNA序列其中含有RNA蜗酶基因、 NPMlP19(nucleophosmin 1(核仁磷蛋白B23, numatrin)假基因19)、KIAA0823蛋白、ESTs、STSs、 GSSs和CpG岛的部分mRNA(Human DNA sequence from clone RP4-616B8 on chromosome 20q11.222 Contains a gene for an RNA helicase, NPM1P19(nucleophosmin 1(nucleolar phosphoprotein B23,numatrin)pseudogene 19),part of an mRNA for KIAA0823 protein,ESTs,STSs, GSSs and CpG Islands) 1027 B4587 AA504314 ESTs 1028 C3815 BE261922 人cDNA FLJ14154 fis,克隆NT2RM1000341(Homo sapiens cDNA FLJ14154 fis,clone NT2RM1000341) 1029 A3534 J00269 KRT6A 角蛋白6A 1030 C0778 AI310465 人的推定的核糖体蛋白L36 mRNA(Human putative ribosomal protein L36 mRNA) 1031 C8481 AA604841 ESTs 1032 A0238 U01828 MAP2 微管-相关蛋白2(microtubule-associated protein 2) 1033 A6127 AI356291 ST5 抑制肿瘤发生5(Suppression of tumorigenicity 5) 1034 A0494 M94556 SSBP 单链DNA-结合蛋白(single-stranded DNA-binding protein) l035 A2123 K03515 GPI 磷酸葡糖异构酶(glucose phosphate isomerase) 1036 A2954 L05096 RPL39 人核糖体蛋白L39 mRNA,完整cds(Homo sapiens ribosomal protein L39 mRNA,complete cds) 1037 A2822 X05978 CSTA 半胍氨酸蛋白酶抑制剂A(stefin A)(cystatin A(stefin A)) 1038 B0292 AA375432 CLDN1 封闭蛋白1 1039 A7172 Y10043 HMG4 高-迁移率群(非组蛋白染色体的)蛋白 4(high-mobility group(nonhistone chromosomal) protein 4) 1040 B3500 AA725807 ESTs,人cDNA FLJ33104 fis,克隆 TRACH2000923(ESTs,Homo sapiens cDNA FLJ33104 fis,clone TRACH2000923) 1041 A6005N AA531437 MLLT4 脊髓的/淋巴的或混合-谱系白血病(三空腔蛋白(果 蝇)同源物);移位至,4(myeloid/lymphoid or mixed-lineage leukemia(trithorax(Drosophila) homolog);translocated to,4) 1042 D0491 AA815427 SLC6A8 溶质载体家族6(神经递质转运物,肌酸),成员 8(solute carrier family 6(neurotransmitter transporter, creatine),member 8) 1043 C2112 AI022193 A1BG α-B糖蛋白(alpha-B glycoprotein) l044 C0844 AA954657 ESTs,略微近似于胶凝素34[人](ESTs,Weakly similar to collectin 34[H.sapiens]) 1045 C6180 AA775500 HsPOX2 脯氨酸氧化酶2(proline oxidase 2) 1046 D1375 AA287860 E2F5 E2F转录因子5,p130-结合(E2F transcription factor 5,p130-binding) l047 D7587 AI096953 SLC7A5 溶质载体家族7(阳离子的氨基酸转运物,y+系统), 成员5(Solute carrier family 7(cationic amino acid transporter,y+system),member 5) 1048 A2673 X16135 HNRPL 核不均一核糖核蛋白L(heterogeneous nuclear ribonucleoprotein L) 1049 A2565 Y00278 S100A8 S100钙-结合蛋白A8(钙粒蛋白A)(S100 calcium-binding protein A8(calgranulin A)) 1050 A2088 D38583 S100A11 S100钙-结合蛋白all(calgizzarin)(S100 calcium-binding protein A11(calgizzarin)) 1051 A5518 AA058761 FLJ20550 不确定蛋白FLJ20550 1052 B4870 AA308062 S100P S100钙-结合蛋白P(S100 calcium-binding protein P) 1053 A8597N AA649986 SNRPF 小的核核糖核酸蛋白多肽F(small nuclear ribonucleoprotein polypeptide F) 1054 C1463 AA001735 ESTs 1055 C0651 AI086281 ESTs 1056 D0952 AI014551 ESTs 1057 A2255 J03826 FDXR 铁氧化还原蛋白还原酶(ferredoxin reductase) 1058 A5292 AC004770 FEN1 flap结构-特异性核酸内切酶1(flap structure-specific endonuclease 1) 1059 B6346 AA235074 TCF19 转录因子19(SC1)(transcription factor 19(SC1)) 1060 C6722 AA977296 ESTs,略微近似于未知的[酿酒酵母](ESTs,Weakly similar to unknown[S.cerevisiae]) 1061 C4081 Z40760 人甘露糖基转移酶的PIG-M mRNA,完整cds(Homo sapiens PIG-M mRNA for mannosyltransferase, complete cds) 1062 D4812 AA923368 PTK2 PTK2蛋白酪氨酸激酶2(PTK2 protein tyrosine kinase 2) 1063 D9731 AI056637 ESTs 1064 A6139 AI356558 PAFAH1 B3 血小板活化因子乙酰水解酶,同种型Ib,γ亚单位 (29kD)(platelet-activating factor acetylhydrolase, isoform Ib,gamma subunit(29kD)) 1065 A8270 AA501416 ESTs 1066 B5461 AJ439063 MCM8 微型染色体保持8(minichromosome maintenance 8) 1067 D6549 AA994711 FLJ10052 不确定蛋白FLJ10052 1068 A6202 AA524968 ESTs,略微近似于T2D3_人转录物起动因子TFIID 13kda亚型[人](ESTs,Weakly similar to T2D3_HUMAN TRANSCRIPTION INITIATION FACTOR TFIID 135 KDA SUBUNIT[H.sapiens]) 1069 B4121 AA877534 GPRC5C G蛋白-偶联受体,家族C,群5,成员C(G protein-coupled receptor,family C,group 5,member C) 1070 B4478 AA910946 AP1M2 衔接子-相关蛋白复合体1,mu 2亚单位 (adaptor-related protein complex 1,mu 2 subunit) 1071 C7114 T16226 ESTs 1072 C7965 AA173172 FLJ13163 不确定蛋白FLJ13163 1073 C7122 AA235710 NJMU-R1 蛋白激酶Njmu-R1(protein kinase Njmu-R1) 1074 D4789 AA921896 ESTs 1075 D6248 AB101206 URLC4 在肺癌中上调的4(up-regulated in lung cancer 4) 1076 A7409 L41559 PCBD 6-丙酮酰-四氢蝶呤合成酶/二聚化辅助因子的肝细 胞核因子1α(TCF1)(6-pyruvoyl-tetrahydropterin synthase/dimerization cofactor of hepatocyte nuclear factor 1 alpha(TCF1)) 1077 B6379 AA443685 人mRNA;cDNA DKFZp564H142(来自克隆 DKFZp564H142)(Homo sapiens mRNA;cDNA DKFZp564H142(from clone DKFZp564H142)) 1078 A0429 U73379 UBCH10 泛素载体蛋白E2-C(ubiquitin carrier protein E2-C) 1079 C4909 W79821 人HSPC265 mRNA,部分cds(Homo sapiens HSPC265 mRNA,partial cds) 1080 A4146 AA586974 PI3 蛋白酶抑制因子3,皮肤-衍生的(SKALP)(protease inhibitor 3,skin-derived(SKALP)) 1081 A1215 X07696 KRT15 角蛋白15 1082 A2978 X04741 UCHL1 泛素羧基末端酯酶L1(泛素巯基酯酶)(ubiquitin carboxyl-terminal esterase L1(ubiquitin thiolesterase)) 1083 A4013 D26485 UQCRC1 泛醇(ubiquinol)-细胞色素c还原酶核心蛋白 I(ubiquinol-cytochrome c reductase core protein I) 1084 A5377 AA339976 TSSC1 肿瘤抑制可亚转移的侯选物1(tumor suppressing subtransferable candidate 1) 1085 B4069 AA128470 DSP 桥粒斑蛋白(DPI,DPII)(desmoplakin(DPI,DPII)) 1086 A7780 AB006630 TCF20 转录因子20(AR1)(transcription factor 20(AR1)) 1087 B2909 AA568223 TOP2A 拓扑异构酶(DNA)IIα(170kD)(topoisomerase(DNA) II alpha(170kD)) 1088 A9040 K03195 SLC2A1 溶质载体家族2(促进葡萄糖转运物),成员1(solute carrier family 2(facilitated glucose transporter), member 1) 1089 B9480 W56303 KIAA080 2 KIAA0802蛋白 1090 B4932 AA909294 LOC5124 3 不确定蛋白 1091 B5787 AA514606 FLJ10633 不确定蛋白FLJ10633 1092 B5534N AA758653 ESTs 1093 A2694N D31628 HPD 4-羟苯丙酮酸双加氧酶(4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase) 1094 B5382N Y09836 KIAA037 4 syntaphilin 1095 C6679 AI168147 人HSPC289 mRNA,部分cds(Homo sapiens HSPC289 mRNA,partial cds) 1096 D1477 T82181 EST 1097 B2980 AI339770 ESTs 1098 C8586 AI014673 FLJ10709 不确定蛋白FLJ10709 1099 C1388 AI244237 H2BFB H2B组蛋白家族,成员B(H2B histone family, member B) 1100 A3156 L02870 COL7A1 胶原蛋白,VII型,α1(表皮水疱症,营养不良,显 性和隐性的)(collagen,type VII,alpha 1 (epidermolysis bullosa,dystrophic,dominant and recessive)) 1101 A1677 U58766 TSTA3 组织特异性移植抗原P35B(tissue specific transplantation antigen P35B) 1102 B1887 AA642480 SMG1 PI-3-激酶-相关激酶SMG-1(PI-3-kinase-related kinase SMG-1) 1103 A2013N NM_00224 5 KCNK1 钾通道,K亚家族,成员1(TWIK)(potassium channel,subfamily K,member 1(TWIK)) 1104 A2967 X54473 COX6B 细胞色素c氧化酶亚单位VIb(cytochrome c oxidase subunit VIb) 1105 A4356 Y00503 KRT19 角蛋白19 1106 A6311 AI090753 SHMT2 丝氨酸羟甲基转移酶2(线粒体)(serine hydroxymethyltransferase 2(mitochondrial)) 1107 B4260 AB101210 URLC8 在肺癌中上调的8(up-regulated in lung cancer 8) 1108 A7435N X16302 IGFBP2 胰岛素-样生长因子-结合蛋白2(36kD)(insulin-like growth factor binding protein 2(36kD)) 1109 A6519N AA703988 ZNF259 锌指蛋白259(zinc finger protein 259) 1110 B4034 AA523881 ESTs 1111 B7362 AA579959 CYP2S1 从ESTs预测的细胞色素p540家族成员(cytochrome P540 family member predicted from ESTs) 1112 B8716 AA766315 FLJ10461 不确定蛋白FLJ10461 1113 C6219 AB101207 URLC5 在肺癌中上调的5(up-regulated in lung cancer 5) 1114 C2132 AA468538 BRPF3 含有溴结构域和PHD指,3(bromodomain and PHD finger containing,3) 1115 A2837 L27711 CDKN3 细胞周期蛋白-依赖性激酶抑制因子3(CDK2-相关 双重特异性磷酸酶)(cyclin-dependent kinase inhibitor 3 (CDK2-associated dual specificity phosphatase)) 1116 C1434 N22773 KIAA085 2 人mRNA;cDNA DKFZp434J1618(来自克隆 DKFZp434J1618);部分cds(Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp434J1618 (from clone DKFZp434J1618);partial cds) 1117 C6321 W86781 ESTs 1118 B7768 AA583339 GCNT3 葡糖氨酰(氮-乙酰基)转移酶3,粘蛋白型 (glucosaminyl(N-acetyl)transferase 3,mucin type) 1119 A1379 D49742 HABP2 透明质酸-结合蛋白2(hyaluronan-binding protein 2) 1120 A0623 Y08302 DUSP9 双重特异性磷酸酶9(dual specificity phosphatase 9) 1121 A6800 AI223817 ESTs,略微近似于分泌粘腺蛋白XAG-2同源物 [人](ESTs,Weakly similar to secreted cement gland protein XAG-2 homolog[H.sapiens]) 1122 B4227 AI189576 FLJ10439 不确定蛋白FLJ10439 1123 B5890 T78421 EST,略微近似于KIAA1498蛋白[人](EST, Weakly similar to KIAA1498 protein[H.sapiens]) 1124 B6599 AI083771 PFKFB2 6-果糖磷酸-2-激酶/果糖-2,6-二磷酸酶 2(6-phosphofructo-2-kinase/fructose-2,6-biphosphatas e2) 1125 B5013 T90472 LOC5125 6 不确定蛋白 1126 D1400 AA481072 ESTs 1127 C8507 N66159 COX6C 细胞色素c氧化酶亚单位VIc(cytochrome c oxidase subunit VIc) 1128 D6136 AA740188 ESTs 1129 D2882 AA777954 ESTs 1130 C7435 AA573892 KIAA135 9 KIAA1359蛋白 1131 A9323N NM_01837 3 SYNJ2BP synaptojanin 2结合蛋白(synaptojanin 2 binding protein) 1132 C7257 AI192528 ESTs 1133 B2900 AI305234 ESTs 1134 C1890 AA308562 PLEK2 普列克底物蛋白2(小鼠)同源物(pleckstrin 2 (mouse)homolog) 1135 A0918 U24183 PFKM 磷酸果糖激酶,肌肉(phosphofructokinase,muscle) 1136 A0516 U12597 TRAF2 TNF受体-相关因子2(TNF receptor-associated factor2) 1137 A9262 AI160327 MRPL12 线粒体核糖体蛋白L12(mitochondrial ribosomal protein L12) 1138 B0335N R32035 人PAK2 mRNA,完整cds(Homo sapiens PAK2 mRNA,complete cds) 1139 B8344 AA164836 ESTs,中度近似于使用外显子13a的替代拼接产物 [人](ESTs,Moderately similar to altematively spliced product using exon 13A[H.sapiens]) 1140 B4915N AA459264 CBFA2T2 核心-结合因子,runt结构域,α亚单位2;移位至, 2(core-binding factor,runt domain,alpha subunit 2; translocated to,2) 1141 C4362 AB105188 URLC11 在肺癌中上调的11(up-regulated in lung cancer 11) 1142 C6551 NM_00382 6 NAPG N-乙基来酰亚胺-敏感因子附着蛋白,γ (N-ethylmaleimide-sensitive factor attachment protein, gamma) 1143 E1497 AA291604 SLC16A3 溶质载体家族16(单羧酸转运物),成员3(solute carrier family 16(monocarboxylic acid transporters), member 3) 1144 D8920 AI038231 USP13 泛素特异性蛋白酶13(异构蛋白酶T-3)(Ubiquitin specific protease 13(isopeptidase T-3)) 1145 D4215 AA883311 ESTs 1146 C3759 AW504047 SMARCA 4 染色质的SWI/SNF相关、基质相关、肌动蛋白依赖 的调节因子,亚家族a,成员4(SWI/SNF related, matrix associated,actin dependent regulator of chromatin,subfamily a,member 4) 1147 D3522 AA813590 RPLP2 核糖体蛋白,大的P2(ribosomal protein,large P2) 1148 A2805 Z49254 MRPL23 线粒体核糖体蛋白L23(mitochondrial ribosomal protein L23) 1149 A0365 U17077 BENE BENE蛋白 1150 B4616 AA534943 SCYB14 小的可诱导的细胞因子亚家族B(Cys-X-Cys),成员 14(BRAK)(small inducible cytokine subfamily B (Cys-X-Cys),member 14(BRAK)) 1151 C0986 AA699879 ESTs 1152 A5623 AF044588 PRC1 胞质分裂1的蛋白调节因子(protein regulator of cytokinesis 1) 1153 A2678 Z29074 KRT9 角蛋白9(表皮松解的掌跖角化病)(keratin 9 (epidermolytic palmoplantar keratoderma)) 1154 A2498 L11932 SHMT1 丝氨酸羟甲基转移酶1(serine hydroxymethyltransferase) 1155 A6942 AA521342 ESTs 1156 B1253N D84557 MCM6 微型染色体保持缺陷的(mis5,裂变酵母) 6(minichromosome maintenance deficient(mis5,S. pombe)6) 1157 B7145N AI088095 NINJ2 ninjurin 2 1158 C1881 H77737 EST 1159 C0969 AI205093 ESTs 1160 D8285 AA748613 SMARCC 染色质的SWI/SNF相关、基质相关、肌动蛋白依赖 的调节因子,亚家族c,成员1(SWI/SNF related, matrix associated,actin dependent regulator of chromatin,subfamily c,member1) 1161 C8167 AA860277 ESTs,略微近似于TB2[人](ESTs,Weakly similar to TB2[H.sapiens]) 1162 C0400 AA031695 IMP-2 IGF-IImRNA-结合蛋白2 1163 A7791 AA578427 ESTs,略微近似于BGAM_人β-半乳糖苷酶-相关 蛋白前体[人](ESTs,Weakly similar to BGAM_HUMAN BETA-GALACTOSIDASE-RELATED PROTEIN PRECURSO[H.sapiens]) 1164 A1198 NM002522 NPTX1 神经元pentraxin I(neuronal pentraxin I) 1165 A7165 X92896 DXS9879 E 染色体X(独特的)9879表达序列上的DNA片段 (DNA segment on chromosome X(unique)9879 expressed sequence) 1166 B1194 AA657405 ESTs 1167 A7724 AA609417 DKFZp76 2M136 不确定蛋白DKFZp762M136 1168 B3984 U69141 GCDH 戊二酰辅酶A脱氢酶(glutaryl-Coenzyme A dehydrogenase) 1169 B3086 AA743688 FLJ12892 不确定蛋白FLJ12892 1170 B6535 AA654506 HLA-A 主要组织相容性复合体,I类,A 1171 A8885N H61951 APMCF1 APMCF1蛋白 1172 B7360 AA876375 ESTs,高度近似于LB4D人NADP-依赖的白细胞 三烯B4 12-羟脱氢酶[人](ESTs,Highly similar to LB4D_HUMAN NADP-DEPENDENT LEUKOTRIENE B4 12-HYDROXYDEHYDROGENASE[H.sapiens]) 1173 B7710 AI341146 ESTs 1174 B9455 AI299327 ESTs 1175 C7085 AI139873 KIAA013 4 KIAA0134基因产物 1176 C9720 AA121245 RANBP7 RAN结合蛋白7 1177 C4408 AA418644 ESTs,略微近似于C4HU补体C4A前体[人] (ESTs,Weakly similar to C4HU complement C4A precursor[H.sapiens]) 1178 D3747 AA843607 ESTs 1179 D9933 AI079544 ESTs 1180 D8458 AA830668 EST 1181 C7801 AI299827 人互补DNA FLJ13782 fis,克隆PLACE4000489,略 微近似于蛋白GRAINY-HEAD(Homo sapiens cDNA FLJ13782 fis,clone PLACE4000489,weakly similar to PROTEIN GRAINY-HEAD) 1182 D9317 AA532638 ESTs,中度近似于ALU2_人ALU亚家族SB序列 污染警告条目[人](ESTs,Moderately similar to ALU2_HUMAN ALU SUBFAMILY SB SEQUENCE CONTAMINATION WARNING ENTRY [H.sapiens]) 1183 B0203 NM_00405 3 BYSL bystin-like 1184 B8260 R27303 SURF6 Surfeit 6 1185 B8930 AB101208 URLC6 在肺癌中上调的6(up-regulated in lung cancer 6) 1186 A2788 X63187 HE4 附睾-特异性,乳清-酸性蛋白型,四-二硫化物核心; 推定的卵巢的癌标记(epididymis-specific, whey-acidic protein type,four-disulfide core;putative ovarian carcinoma marker) 1187 B8232 AA666114 人假尿嘧啶核苷合成酶1(PUS1)mRNA,部分 cds(Homo sapiens pseudouridine synthase 1(PUS1) mRNA,partial cds) 1188 A7045 AA096332 ESTs 1189 B8807 AA214125 NAP1L4 核小体装配蛋白1-样4(nucleosome assembly protein 1-like 4) 1190 B9040 R52161 人mRNA;cDNA DKFZp434A2410(来自克隆 DKFZp434A2410);部分cds(Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp434A2410(from clone DKFZp434A2410);partial cds) 1191 A6241N NM_00569 4 COX17 COX17(酵母)同源物,细胞色素c氧化酶装配蛋白 1192 B8443 AA602585 ESTs 1193 B3749 AA394175 RAR(RAS样的GTPASE) 1194 C0772 AI215719 KIAA044 2 KIAA0442蛋白 1195 C1511 AA905266 LOC5125 0 不确定蛋白 1196 C7658 AA143060 ESTs,高度近似于i38945黑色素瘤遍在突变蛋白 [人](ESTs,Highly similar to I38945 melanoma ubiquitous mutated protein[H.sapiens]) 1197 C7479 AF019413 CYP21A2 细胞色素P450,亚家族XXIA(类固醇21-羟化酶, 肾上腺),多肽2(cytochrome P450,subfamily XXIA (steroid 21-hydroxylase,congenital adrena hyperplasia),polypeptide 2) 1198 A0607N AI347538 BIK BCL2-相互作用致死因子(凋亡-诱导 型)(BCL2-interacting killer(apoptosis-inducing)) 1199 A2154 X59617 RRM1 核糖核苷酸还原酶M1多肽(ribonucleotide reductase M1 polypeptide) 1200 A6724 AI193969 FLJ22759 不确定蛋白FLJ22759 1201 A9581 AB105377 SLC7A1 溶质载体蛋白家族7(阳离子氨基酸转运物,y+系 统),成员1(solute carrer family 7(cationic amino acid transporter,y+system),member 1) 1202 A7303 N50517 ESTs 1203 B1397 AI366215 人mRNA;cDNA DKFZp434C0126(来自克隆 DKFZp434C0126);部分cds(Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp434C0126(from clone DKFZp434C0126);partial cds) 1204 B3912 AA405413 SLC25A1 0 溶质载体家族25(线粒体载体;乙基酯转运物),成 员10(solute carrier family 25(mitochondrial carrier; dicarboxylate transporter),member10) 1205 B3198 AI199919 FLJ20657 不确定蛋白FLJ20657 1206 B4062 X14640 KRT13 角蛋白13 1207 C0531 N20321 D19S1177 E 染色体19(独特的)1177表达序列上的DNA片段 (DNA segment on chromosome 19(unique) 1177 expressed sequence) 1208 C0639 H17516 ESTs 1209 C7434 AI333599 LOC5628 7 CA11 1210 D5382 H90132 ESTs 1211 A1604 X52186 ITGB4 整联蛋白,β4 1212 A0024 AF017790 HEC 在癌症中高表达,富含亮氨酸七联重复(highly expressed in cancer,rich in leucine heptad repeats) 1213 A2728 X87342 LLGL2 致命的巨幼虫(果蝇)同源物2(lethal giant larvae (Drosophila)homolog 2) 1214 A3410 L77566 DGSI DiGeorge综合症关键区域基因DGSI(DiGeorge syndrome critical region gene DGSI) 1215 B5730 AI367310 ESTs,略微近似于dJ37E16.5[人] 1216 B6539 AI239432 ESTs 1217 A4009 D17793 AKR1C3 氧代酮还原酶家族1,成员C3(3-α羟基类固醇脱氢 酶,II型))(aldo-keto reductase family 1,member C3 (3-alpha hydroxysteroid dehydrogenase,type II)) 1218 A2832 D13118 ATP5G1 ATP合成酶,H+转运,线粒体F0复合体,亚单位c(亚 单位9),同种型1(ATP synthase,H+transporting, mitochondrial F0 complex,subunit c(subunit 9), isoform 1) 1219 A5666 AA457022 E2IG5 不确定蛋白,雌二醇-诱导的(hypothetical protein, estradiol-induced) 1220 A1434 M10036 TPI1 磷酸丙糖异构化酶1(triosephosphate isomerase 1) 1221 A4593 U94836 ERPROT2 l3-21 带有聚谷氨酸重复的蛋白;钙(ca2+)内环境平衡内质 网蛋白(protein with polyglutamine repeat;calcium (ca2+)homeostasis endoplasmic reticulum protein) 1222 A2150 D89618 KPNA3 核转运蛋白α3(输入蛋白α4)(karyopherin alpha 3(importin alpha 4)) 1223 A4536 Y09723 ZNF151 锌指蛋白151(pHZ-67) 1224 B2589 AA586814 ESTs 1225 A8643 AA701659 HUGT1 UDP-葡萄糖:糖蛋白葡糖基转移酶 1(UDP-glucose:glycoprotein glucosyltransferase 1) 1226 B9253 R59595 ESTs 1227 B5279 AA700186 FST follistatin 1228 B7214N AA741058 ESTs 1229 A2411N AI312652 MRPS24 线粒体核糖体蛋白S24(Mitochondrial ribosomal protein S24) 1230 B7343N AA521052 ESTs,略微近似于ALU1_人ALU2SB序列污染警 告条目[人](ESTs,Weakly similar to ALU1_HUMAN ALU SUBFAMILY J SEQUENCE CONTAMINATION WARNING ENTRY [H.sapiens]) 1231 C2021 N40918 人mRNA;cDNA DKFZp761G1111(来自克隆 DKFZp761G1111)(Homo sapiens mRNA;cDNA DKFZp761G1111(from clone DKFZp761G1111)) 1232 C9732 AA019655 EST 1233 C3905 L48863 人mRNA;cDNA DKFZp434P0235(来自克隆 DKFZp434P0235)(Homo sapiens mRNA;cDNA DKFZp434P0235(from clone DKFZp434P0235)) 1234 C9495 R99122 ESTs,高度近似于CBF_人CCAAT-结合因子[人] (ESTs,Highly similar to CBF_HUMAN CCAAT-BINDING FACTOR[H.sapiens]) 1235 D8547 AI018498 FLJ20591 不确定蛋白 1236 D5388 AI301490 HSPC135 HSPC135蛋白 1237 D3023 AA781745 ESTs,中度近似于KIAA0638蛋白[人](ESTs, Moderately similar to KIAA0638 protein [H.sapiens]) 1238 D8837 AI025916 FSP-2 fibrousheathin II 1239 A3311 L04483 RPS21 核糖体蛋白S21(ribosomal protein S21) 1240 C3979 AK074088 FLJ00159 人cDNA:FLJ00159 1241 B1719 AA634294 ESTs 1242 B8220 AF074264 LRP6 低密度脂蛋白受体-相关蛋白6(ow density lipoprotein receptor-related protein 6) 1243 C9360 AI366259 ESTs 1244 C7637 AA491000 人mRNA;cDNA DKFZp586N1720(来自克隆 DKFZp586N1720)(Homo sapiens mRNA;cDNA DKFZp586N1720(from clone DKFZp586N1720)) 1245 A4460 AF037335 CA12 碳酸酐酶XII(carbonic anhydrase XII) 1246 A0060 NM_00359 SUPT3H Ty3同源物的抑制基因(酿酒酵母)(suppressor of Ty 9 3 homolog(S.cerevisiae)) 1247 A5640 AA047322 MGC5585 不确定蛋白MGC5585 1248 B7466 AA128378 ESTs 1249 B3907 AA913298 KIAA096 9 KIAA0969蛋白 1250 B3698 AA234475 具有甲基转移酶结构域的PRIP--相互作用蛋白 (PRIP-interacting protein with methyltransferase domain) 1251 C8029 M19309 TNNT1 肌钙蛋白T1,骨骼的,缓慢的(troponin T1,skeletal, slow) 1252 C9747 AA420675 ESTs,中度近似于RL39_人60S核糖体蛋白L3 [人](ESTs,Moderately similar to RL39_HUMAN 60S RIBOSOMAL PROTEIN L3[H.sapiens]) 1253 D6683 AI361048 ESTs 1254 E1250 NM_01823 1 FLJ10815 不确定蛋白FLJ10815 1255 B5640 AA759219 人cDNA FLJ13123 fis,克隆NT2RP3002763(Homo sapiens cDNA FLJ13123 fis,clone NT2RP3002763) 1256 D8485 AI277810 PSMC2 蛋白酶体(prosome,macropain)26S亚单位,ATPase, 2(proteasome(prosome,macropain)26S subunit, ATPase,2) 1257 C1487 N50938 人cDNA FLJ20428 fis,克隆KAT03458,高度近似 于Z184_人锌指蛋白(Homo sapiens cDNA FLJ20428 fis,clone KAT03458,highly similar to Z184_HUMAN ZINC FINGER PROTEIN 184) 1258 C3716 AK025906 人cDNA:FLJ22253 fis,克隆HRC02763(Homo sapiens cDNA:FLJ22253 fis,clone HRC02763) 1259 C2294 AI018174 ESTs 1260 E0161 AI090079 EST 1261 D8466 AA642343 ESTs 1262 A0458 U14968 RPL27A 核糖体蛋白L27a(ribosomal protein L27a) 1263 A0345 X52943 ATF7 活化转录因子7(activating transcription factor 7) 1264 A0333 X13293 MYBL2 v-myb鸟类的成髓细胞血症病毒癌基因同源物-样 2(v-myb avian myeloblastosis viral oncogene homolog-like 2) 1265 A3919 NM_00421 2 SLC28A2 溶质载体家族28(钠-偶联核苷转运物),成员 2(solute carrier family 28(sodium-coupled nucleoside transporter),member 2) 1266 A3982 AJ000553 SH2D2A SH2结构域蛋白2A 1267 A2219 M55265 CSNK2A1 酪蛋白激酶2,α1多肽(casein kinase 2,alpha 1 polypeptide) 1268 A4181 AA847250 SSR4 信号顺序受体,δ(易位子-相关蛋白δ)(signal sequence receptor,delta(translocon-associated protein delta)) 1269 B4899 AI366597 ESTs 1270 B0906 H05704 HCR HCR(α-螺旋卷曲-coil rod同源物)(HCR(a-helix coiled-coil rod homologue)) 1271 B4480 W29089 ESTs,中度近似于未命名的蛋白产物[人](ESTs, Moderately similar to unnamed protein product [H.sapiens]) 1272 B4535 AI125927 FLJ13441 不确定蛋白FLJ13441 1273 B7505 NM152440 FLJ32549 不确定蛋白FLJ32549 1274 C4593 AI192455 ESTs 1275 C6763 AA032253 ESTs 1276 C1901 AA649063 FLJ21865 不确定蛋白FLJ21865 1277 C4573 AA952902 ESTs 1278 C4172 AA477870 B4GALT7 xylosylprotein β1,4-半乳糖基转移酶,多肽7(半乳 糖基转移酶I)(xylosylprotein beta1,4-galactosyltransferase,polypeptide 7 (galactosyltransferase I)) 1279 E1007 Z82244 TOM1 myb1(小鸡)同源物的靶标(target of myb1(chicken) homolog) 1280 C6687 AA043093 ESTs,略微近似于S10590半胱氨酸蛋白酶[人] (ESTs,Weakly similar to S10590 cysteine proteinase [H.sapiens]) 1281 B9303 AI271678 ESTs 1282 C4388 H59788 PBP 前列腺的结合蛋白(prostatic binding protein) 1283 A3553 J05581 MUC1 粘蛋白1,跨膜(mucin 1,transmembrane) 1284 A5644 W76105 ESTs,略微近似于AF151840 1 CGI-82蛋白[人] (ESTs,Weakly similar to AF151840 1 CGI-82 protein[H.sapiens]) 1285 A4962 S76474 NTRK2 亲神经的酪氨酸激酶,受体,2型(neurotrophic tyrosine kinase,receptor,type 2) 1286 B3873N AA703211 FLJ20736 不确定蛋白FLJ20736 1287 B4531 N62451 人cDNA FLJ11883 fis,克隆HEMBA1007178 1288 B5091 AB037857 PTGFRN 前列腺素F2受体阴性调节因子(prostaglandin F2 receptor negative regulator) 1289 C0691 AA132089 ESTs,高度近似于未命名的蛋白产物[人](ESTs, Highly similar to unnamed protein product [H.sapiens]) 1290 E0560 AA701308 GALNT2 UDP-N-乙酰-α-D-半乳糖胺:多肽氮-乙酰氨基半 乳糖基转移酶 2(GalNAc-T2) (UDP-N-acetyl-alpha-D-galactosamine:polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 2(GalNAc-T2)) 1291 A0831 M21389 KRT5 角蛋白5(单纯性大疱性表皮松解,Dowling- Meara/Kobner/Weber-Cockayne型)(keratin 5 (epidermolysis bullosa simplex, Dowling-Meara/Kobner/Weber-Cockayne types)) 1292 A7765 BC035631 C17orf26 染色体17开放阅读框26(chromosome 17 open reading frame 26) 1293 A2507 D13757 PPAT 磷酸核糖焦磷酸盐酰胺转移酶(phosphoribosyl pyrophosphate amidotransferase) 1294 A7115 U78082 MED6 RNA聚合酶II翻译调节介体(Med6,酿酒酵母,同 源物)(RNA polymerase II transcriptional regulation mediator(Med6,S.cerevisiae,homolog of)) 1295 A4114N NM001109 ADAM8 一种去整联蛋白和金属硫蛋白酶结构域8(a disintegrin and metalloproteinase domain 8) 1296 B4017 AA088857 ESTs 1297 B7165N AA194384 ESTs 1298 C4548 N64368 ESTs 1299 B8237 H49431 KIAA072 0 KIAA0720蛋白 1300 B8883 AF070546 IL14 白细胞介素14 1301 A2955 L15203 TFF3 三叶形因子3(肠的)(trefoil factor 3(intestinal)) 1302 A6673 AA020936 LOC5175 4 NAG-5蛋白 1303 A6979 AI357616 人mRNA;cDNA DKFZp434C107(来自克隆 DKFZp434C107) 1304 B6651 N47861 PDP 丙酮酸脱氢酶磷酸酶(pyruvate dehydrogenase phosphatase) 1305 C1558 AI201953 ESTs 1306 C2000 AF000148 ABCA4 ATP-结合框,亚家族A(ABC1),成员4(ATP-binding cassette,sub-family A(ABC1),member 4) 1307 C8101 N47307 NDUFA1 NADH脱氢酶(泛醌)1α子复合形,1(7.5kD, MWFE)(NADH dehydrogenase(ubiquinone)1 alpha subcomplex,1(7.5kD,MWFE)) 1308 D1346 AI091975 ESTs 1309 A7046 W04300 ESTs,高度近似于未知的基因产物[人](ESTs, Highly similar to Unknown gene product [H.sapiens]) 1310 C1849 AI338625 FJX1 与fjxl同源的推定的分泌型配体(putative secreted ligand homologous to fjxl) 1311 A1259 AF007170 KIAA045 2 DEME-6蛋白 1312 A4474 AF047433 ITGB4BP 整联蛋白β4结合蛋白(integrin beta 4 binding protein) 1313 B8016 AA528243 ESTs 1314 B3530N AI333192 GJB2 间隙连接蛋白,β2,26kD(连接蛋白26)(gap junction protein,beta 2,26kD(connexin 26)) 1315 C7582 AA461250 ESTs 1316 D8905 AI021894 ESTs,略微近似于ALU8_人ALU2SB序列污染警 告条目[人](ESTs,Weakly similar to ALU8_HUMAN ALU SUBFAMILY SX SEQUENCE CONTAMINATION WARNING ENTRY [H.sapiens]) 1317 A1139 L24203 ATDC 共济失调-毛细血管扩张D群-相关蛋白 (ataxia-telangiectasia group D-associated protein) 1318 A8614 AA521149 PSAP prosaposin(Gaucher病变体和异染性脑白质营养不 良变体)(prosaposin(variant Gaucher disease and variant metachromatic leukodystrophy)) 1319 C7495 D81606 人mRNA;cDNA DKFZp434M0531(来自克隆 DKFZp434M0531)(Homo sapiens mRNA;cDNA DKFZp434M0531(from clone DKFZp434M0531)) 1320 C9099 AA505974 ESTs 1321 A7204 AA315827 TXN 硫氧还蛋白 1322 B7369 AI289480 人cDNA FLJ13044 fis,克隆NT2RP3001355,略微 近似于tricarboxylate转运蛋白前体(Homo sapiens cDNA FLJ13044 fis,clone NT2RP3001355,weakly similar to TRICARBOXYLATE TRANSPORT PROTEIN PRECURSOR) 1323 C9024 AA281364 DKFZp434D177不确定蛋白 DKFZp434D177(DKFZp434D177 Hypothetical protein DKFZp434D177) 1324 B4647 AA625270 FLJ20640 不确定蛋白FLJ20640 1325 C7351 AI357002 FACL5 长链脂肪酸辅酶A连接酶5(long-chain fatty acid coenzyme A ligase 5) 1326 C0764 AA045020 FLJ13576 不确定蛋白FLJ13576 1327 C1018 AA970651 人cDNA:FLJ22256 fis,克隆HRC02860 1328 E0465 AA421724 CDC20 CDC20(细胞分裂周期20,酿酒酵母,同源 物)(CDC20(cell division cycle 20,S.cerevisiae, homolog)) 1329 A0309 U85658 TFAP2C 转录因子AP-2γ(活化增强子-结合蛋白2 γ)(transcription factor AP-2 gamma(activating enhancer-binding protein 2 gamma)) 1330 B2602 AA810725 FLJ11273 不确定蛋白FLJ11273 1331 B2951 L16785 NME2 非转移性细胞2,蛋白(NM23B)表达于 (non-metastatic cells 2,protein(NM23B)expressed in) 1332 A5136N AA029950 ST14 抑制肿瘤发生14(结肠癌,基质降解蛋白酶, epithin)(suppression of tumorigenicity 14(colon carcinoma,matriptase,epithin)) 1333 B9980 AI284476 ESTs 1334 A3526 D87957 RQCD1 细胞分化1同源物需要的RCD1(粟酒裂殖酵母) (RCD1 required for cell differentiationl homolog(S. pombe)) 1335 A1054 M13755 ISG15 干扰素-刺激蛋白,15kDa 1336 A1803 M31159 IGFBP3 胰岛素-样生长因子结合蛋白3 1337 A4699 U49260 MVD 甲羟戊酸(二磷酸)脱羧酶(mevalonate(diphospho) decarboxylase) 1338 A2108 U05861 AKR1C1 氧代酮还原酶家族1,成员C1(二氢二醇脱氢酶1; 20-α(3-α)-羟基类固醇脱氢酶)(aldo-keto reductase family 1,member C1(dihydrodiol dehydrogenase 1; 20-alpha(3-alpha)-hydroxysteroid dehydrogenase)) 1339 A4072 AF040105 RCL 推定的c-Myc-Myc-应答性 1340 A5567 AA236980 人cDNA FLJ11856 fis,克隆HEMBA1006789 1341 A4011 D26125 AKR1C4 氧代酮还原酶家族1,成员C4(十氯酮还原酶;3-α 羟基类固醇脱氢酶,I型;二氢二醇脱氢酶 4)(aldo-keto reductase family 1,member C4 (chlordecone reductase;3-alpha hydroxysteroid dehydrogenase,type I;dihydrodiol dehydrogenase 4)) 1342 A4122 AA315816 RBX1 环-盒(ring-box)1 1343 A3970 AB105190 GPR49 G G蛋白-偶联受体49(G protein-coupled receptor 49) 1344 A4695 U44427 TPD52L1 肿瘤蛋白D52-样1 1345 A5660 AA780068 HT002 HT002蛋白;高血压-相关钙-调节基因(HT002 protein;hypertension-related calcium-regulated gene) 1346 A2595 Y00281 RPN1 核糖体亲和蛋白I(ribophorin I) 1347 A2402 M61831 AHCY S-腺苷高半胱氨酸水解酶(S-adenosylhomocysteine hydrolase) 1348 A3246 M57899 UGT1A1 UDP多肽糖苷基转移酶1家族,多肽A1(UDP glycosyltransferase 1 family,polypeptide A1) 1349 A0587 X74795 MCM5 微型染色体保持缺陷的(酿酒酵母)5(细胞分裂周期 46)(minichromosome maintenance deficient (S. cerevisiae)5(cell division cycle 46)) 1350 A3009 M30704 AREG 双调蛋白(许旺氏细胞瘤-来源的生长因 子)(amphiregulin(schwannoma-derived growth factor)) 1351 A0374 M61764 TUBG1 微管蛋白,γ1 1352 A2323 V00494 ALB 白蛋白 1353 A7608 AI338589 人mRNA;cDNA DKFZp434B0425(来自克隆 DKFZp434B0425)(Homo sapiens mRNA;cDNA DKFZp434B0425(from clone DKFZp434B0425)) 1354 A6625 AB002341 NRCAM 二乙基溴乙酰胺细胞粘着分子(neuronal cell adhesion molecule) 1355 B5638 AI242496 人cDNA FLJ12827 fis,克隆NT2RP2002939,略微 近似于锌指蛋白136(Homo sapiens cDNA FLJ12827 fis,clone NT2RP2002939,weakly similar to ZINC FINGER PROTEIN 136) 1356 A9077 AA233853 E1B-AP5 E1B-55kDa-相关蛋白5(E1B-55kDa-associated protein 5) 1357 B4311 T55926 ESTs 1358 B3857 AA418779 POLR2F 聚合酶(RNA)II(DNA指导的)多肽F(polymerase (RNA)II(DNA directed)polypeptide F) 1359 B8243 AB011090 KIAA051 8 Max-相互作用蛋白(Max-interacting protein) 1360 B5455 AA847227 NUBP2 核苷酸结合蛋白2(大肠杆菌MinD样)(nucleotide binding protein 2(E.coli MinD like)) 1361 B4495 AI146846 PAR3 含有类似于线虫PAR3的蛋白的三-PDZ(分割缺 陷)(three-PDZ containing protein similar to C.elegans PAR3(partitioning defect)) 1362 A6636 AB105192 SCAMP5 分泌型载体膜蛋白5(secretory carrier membrane protein 5) 1363 B4430 AI147455 H17 不确定蛋白 1364 B8276 AI246699 CATX-8 CATX-8蛋白 1365 A9513N AA775810 ESTs,中度近似于ALUB HUMAN!!!!ALUB类警 告条目!!![人](ESTs,Moderately similar to ALUB_HUMAN !!!!ALU CLASS B WARNING ENTRY!!![H.sapiens]) 1366 B3935 AA514317 FLJ11090 不确定蛋白FLJ11090 1367 B3554 AA720678 ESTs 1368 B4262 AI066536 ESTs,略微近似于ALU8_人ALU SX亚家族序列 污染警告条目[人](ESTs,Weakly similar to ALU8_HUMAN ALU SUBFAMILY SX SEQUENCE CONTAMINATION WARNING ENTRY [H.sapiens]) 1369 B4094 R47458 KIAA115 1 KIAA1151蛋白 1370 B6577N AI086204 TM4SF6 跨膜4超家族成员6(transmembrane 4 superfamily member 6) 1371 B7305 AA342649 LOC5675 5 不确定蛋白LOC56755 1372 B4469 N76634 FLJ20315 不确定蛋白FLJ20315 1373 B5212 AA468294 ESTs 1374 B4508 R55793 ESTs 1375 B6879 N72576 ESTs,略微近似于ALU8_人ALU SX亚家族序列 污染警告条目[人](ESTs,Weakly similar to ALU8_HUMAN ALU SUBFAMILY SXSEQUENCE CONTAMINATION WARNING ENTRY [H.sapiens]) 1376 C2251 AA923049 ESTs,略微近似于ALU4_人ALU SB2亚家族序列 污染警告条目[人](ESTs,Weakly similar to ALU4_HUMAN ALU SUBFAMILY SB2 SEQUENCE CONTAMINATION WARNING ENTRY[H.sapiens]) 1377 C9596 AA830354 ESTs 1378 C0427 AA402968 LTBP3 潜在转化生长因子β结合蛋白3(latent transforming growth factor beta binding protein 3) 1379 C8624 AA827213 AKAP8 一种激酶(PRKA)锚定蛋白8(A kinase(PRKA) anchor protein 8) 1380 C1958 W31174 ESTs 1381 D0767 AA625387 ESTs,中度近似于ALU7_人ALU SQ亚家族序列污 染警告条目[人](ESTs,Moderately similar to ALU7_HUMAN ALU SUBFAMILY SQ SEQUENCE CONTAMINATION WARNING ENTRY [H.sapiens]) 1382 C2226 N20968 ESTs 1383 C8280 D79995 KIAA017 3 KIAA0173基因产物 1384 C6985 AA055971 KIAA081 0 人cDNA FLJ12407 fis,克隆 MAMMA1002843(Homo sapiens cDNA FLJ12407 fis,clone MAMMA1002843) 1385 E1371 AI700180 SES2 sestrin 2 1386 D8019 AA502265 RRP4 酵母RRP4的同源物(核蛋白体RNA加工4),3′-5 -核糖核酸外切酶(homolog of Yeast RRP4 (ribosomal RNA processing 4),3′-5′-exoribonuclease) 1387 D3571 AI208033 ESTs 1388 D9210 AA921763 ESTs NSC 编号 LMMI D Acc 代号 名称 1389 A2796 NM_00668 1 NMU 神经调节肽U(neuromedin U) 1390 A6122 AA332510 MAGE-E1蛋白 1391 A1564 U70370 PITX1 成对的-样同型域转录因子1(p aired-like homeodomain transcription factor 1) 1392 A4242 AI094346 LGALS7 凝集素,半乳糖苷-结合,可溶解的,7(galectin 7)(1ectin,galactoside-binding,soluble,7(galectin 7)) 1393 B1836 AI093275 人cDNA FLJ14259 fis,克隆PLACE1001076(Homo sapiens cDNA FLJ14259 fis,clone PLACE1001076) 1394 B5412N AA604379 FLJ10156 不确定蛋白 1395 A2033 N U03272 FBN2 原纤蛋白2(先天性挛缩蜘蛛脚样指)(fibrillin 2 (congenital contractural arachnodactyly)) 1396 C1701 H60869 ESTs 1397 C4786 N72266 人mRNA;cDNA DKFZp564O2364(来自克隆 DKFZp564O2364)(Homo sapiens mRNA;cDNA DKFZp564O2364(from clone DKFZp564O2364)) 1398 C7152 AI338356 DKFZP58 6C1324 DKFZP586C1324蛋白 1399 D1223 AI278397 DLX5 末梢的-较少同源框5(distal-less homeo box 5) 1400 C7676 AA148929 ESTs 1401 C7747 AI282097 ESTs 1402 C6149 W70242 ESTs 1403 C9574 AA813008 FOP FGFR1癌基因配对物FR1 oncogene partner) 1404 C6936 AI028661 ESTs 1405 C2011 AI087330 ESTs 1406 C3800 AA122217 LOC51654 CGI-05蛋白 1407 C4296 AI193975 ESTs 1408 C6211 AI127359 HSPCA 热休克90kD蛋白1,α(heat shock 90kD protein 1, alpha) 1409 C7751 AA159920 ESTs,略微近似于ALU7_人ALU亚家族SQ序列 污染警告条目[人](ESTs,Weakly similar to ALU7_HUMANALUSUBFAMILYSQSEQUENCE CONTAMINATIONWARNINGENTRY) 1410 C8372 AI243594 ESTs 1411 C7048 R43598 ESTs 1412 C0589 N20480 HSPC157 HSPC157蛋白 1413 C2309 AI351898 ESTs 1414 C7610 AA446866 ESTs 1415 C7681 AA151182 LOC58495 从EUROIMAGE 566589推定的锌指蛋白(putative zinc finger protein from EUROIMAGE 566589) 1416 D1352 AA465341 ESTs 1417 C1938 AI332412 HOXC9 同源框C9(homeo box C9) 1418 C7399 AA195941 ESTs 1419 C9071 AA423972 人cDNA:FLJ22562 fis,克隆HSI01814(Homo sapiens cDNA:FLJ22562 fis,clone HSI01814) 1420 C8926 NM_02494 4 CHODL 软骨凝集素(chondrolectin) 1421 C6055 AA001450 ESTs 1422 C7422 AA131918 TMEM3 跨膜蛋白3(transmembrane protein 3) 1423 D4376 AA883952 ESTs 1424 E0451 U10691 MAGEA6 黑色素瘤抗原,家族A,6(melanoma antigen,family A,6) 1425 D4637 AA740747 ESTs 1426 D5215 AA937589 ESTs 1427 D6767 AA904882 ESTs 1428 D3103 AA760780 人,克隆FLC0675 PRO2870 mRNA,完整cds(Homo sapiens clone FLC0675 PRO2870 mRNA,complete cds) 1429 E1110 AW18798 9 ESTs 1430 B9320 AI360163 ESTs 1431 B6707 AA514538 EIF2C2 真核的翻译起始因子2C,2(eukaryotic translation initiation factor 2C,2) 1432 B6526 AA634299 PAK6 p21-活化的蛋白激酶6(p21-activated protein kinase 6) 1433 C1796 AA019195 ESTs 1434 C4520 N63600 ESTs 1435 C6421 AI050743 DKFZp586 H0623 不确定蛋白DKFZp586H0623(hypothetical protein DKFZp586H0623) 1436 D9991 AI074567 FLJ10858 不确定蛋白FLJ10858(hypothetical protein FLJ10858) 1437 C4449 N62731 ESTs 1438 D1425 T03044 EST 1439 A3477 U30891 PC 丙酮酸羧化酶(pyruvate carboxylase) 1440 B6854 AI243321 高-迁移率群(非组蛋白染色体的)蛋白2 (High-mobility group(nonhistone chromosomal) protein 2) 1441 B4301 BC039195 HSNOV1 新蛋白(novel protein) 1442 C6020 AA863228 KIAA0493 KIAA0493蛋白 1443 C9940 AA923485 ESTs 1444 A5678 N AI219861 TMPO 胸腺生成素(thymopoietin) 1445 C3787 AI439055 RANBP3 RAN结合蛋白3(RAN binding protein 3) 1446 A0574 X66363 PCTK1 PCTAIRE 蛋白激酶 1 1447 A6518 AB009672 ADAM23 一种去整联蛋白和金属硫蛋白酶结构域23(a disintegrin and metalloproteinase domain 23) 1448 B2579N N70341 KIAA0672 ESTs
非小细胞肺癌的诊断
可以使用取自受试者的生物样品,通过测定各种NSC基因的表达水平, 确定该受试者患有非小细胞肺癌或具有患非小细胞肺癌的倾向性。
本发明包括对表1-3所列NSC序列中的至少一个直至所有序列的表达 水平进行测定(例如,检测)。
按照本发明对非小细胞肺癌-相关基因的基因转录物进行检测,以测定 所述基因的表达水平。可以在已知序列GenBank数据库登录(entry)提供的 序列信息基础上,使用本领域普通技术人员熟知的技术对所述非小细胞肺 癌相关基因进行检测和测定。所述方法检测的基因转录物包括转录和翻译 产物,例如mRNA和蛋白。例如:可以使用与NSC多核苷酸相应的序列数 据库登录中的序列构建探针用于通过例如Northern印迹杂交分析的探针检 测NSC mRNA。探针与受试者生物样品中基因转录物间的杂交还可以在 DNA阵列上进行。优选使用阵列检测大量NSC基因的表达水平。作为另一 个实例,在例如以扩增为基础的检测方法如反转录聚合酶链反应(RT-PCR) 中,可以用所述序列构建用来特异性扩增NSC多核苷酸用的引物。另外, 还可以根据所述基因编码蛋白的生物活性或量对NSC的表达水平进行分 析。可用于测定蛋白量的方法包括免疫测定方法。
任何生物材料都可以作为用于测定表达水平的生物样品,只要该样品中 能够检测出NSC基因即可,其中包括受试细胞群(即,取自受试者的组织样 品)。优选地,所述生物样品中含有肺细胞(从肺得到的细胞)。基因表达还可 以在血液、血清其它体液例如痰液中测定。另外,所述受试样品还可以是纯 化自组织的细胞。
用于根据本发明所述方法诊断非小细胞肺癌所针对的受试者优选为哺 乳动物,包括人、非人灵长类动物、小鼠、大鼠、狗、猫、马和母牛。
将生物样品中的一种或多种NSC基因的表达水平与参照样品中所述基 因的表达水平进行比较。所述参照样品包括一种或多种参数已知的细胞,即, 癌性或非癌性细胞。所述参照样品应取自与受受试样品品所来源组织类似的 组织。可选,还可以根据来自细胞的分子信息数据库测定对照表达水平, 其中测定参数或条件已知。
生物样品中基因表达水平的模式是否表明存在NSCLC取决于参照细 胞群的组成。例如,当参照细胞群体是由非癌性细胞组成时,受试生物样 品中基因表达水平与参照的所述水平近似表明所述受试生物样品是非癌 的。反之,当对照细胞群是由癌性细胞组成时,受试生物样品中基因表达 水平与参照的所述水平近似表明所述受试生物样品包含癌性细胞。
可以将受试生物样品与多个参照样品进行比较。所述多种参照样品中 的每一种的已知参数可不相同。因此,可以将受试样品与已知含有例如非小 细胞肺癌细胞的参照样品进行比较,而且同时与已知含有例如非-非小细 胞肺癌(non-non-small cell lung cancer)细胞(正常细胞)的第二参照样品进行 比较。
根据本发明,对生物样品中的一种或多种非小细胞肺癌-相关基因例 如NSC 1-1448的表达进行测定,并与相同基因的正常对照水平进行比较。 术语“正常对照水平“是指通常见于未患非小细胞肺癌群体的生物样品中 的非小细胞肺癌-相关基因的表达图谱。对照和受试者的生物样品中NSC基 因表达水平可以同时测定,或者正常对照水平可以基于对此前从对照组收 集的样品中的基因表达水平进行分析所获结果,通过统计学方法测定。源 自患者组织样品的生物样品中非小细胞肺癌-相关基因的表达水平与正常对 照水平相比升高或降低,表明该受试者患有或易患非小细胞肺癌。例如, 与正常对照水平相比,受试生物样品中NSC 807-1448的表达水平升高,表 明该该受试者患有或易患非小细胞肺癌。反之,受试生物样品中NSC 1-806 的表达水平与正常对照水平相比降低,表明该受试者患有或易患非小细胞 肺癌。
当受试生物样品中NSC基因的表达水平与对照水平之间差别超过1.0, 1.5,2.0,5.0,10.0或更多倍时,可以认为该受试生物样品中NSC基因的 表达水平发生了变化。可选,与对照水平相比,当受试生物样品中NSC基 因的表达水平升高或降低至少50%,60%,80%,90%或更多时,就可以认 为该受试生物样品中NSC基因的表达水平发生了变化。
可以根据对照使受试样品和标准样品之间的基因表达差异标准化,所 述对照例如持家基因(housekeeping gene)。例如,对照多核苷酸可以包括那 些已知其表达水平在癌性和非癌性细胞之间没有差异的多核苷酸。受试核 参比样品中的对照多核苷酸表达水平可用于将所检测到的NSC基因表达水 平标准化。本发明中使用的对照基因包括β-肌动蛋白、甘油醛3磷酸脱氢 酶和核糖体蛋白P1。
本申请中鉴定的差异性表达的NSC基因还可用于监测非小细胞肺癌的 治疗过程。这些方法中,从正在接受非小细胞肺癌治疗的受试者获得受试生 物样品。如果需要,可以在所述治疗之前、期间或之后的不同时间点从受 试者获取多个受试生物样品。然后,对样品中一种或多种NSC基因的表达 进行测定,并与处于还未暴露于所述治疗的非小细胞肺癌已知状态的参照 样品进行比较。
如果所述参照样品不包含非小细胞肺癌细胞,受试生物样品和参照样 品中NSC基因的表达水平近似则表明所述治疗是有效的。但是,NSC基因 的表达水平在受试样品和参照样品中的差异则表明临床结果或预后很差。
术语“有效的”是指所述治疗导致:病理性上调的基因(NSC 807-1448) 的表达减少,病理性下调的基因(NSC 1-806)的表达升高,或者受试者中非 小细胞肺癌的大小、发病率或转移可能性降低。当一种治疗为预性给予时, “有效的”意味着所述治疗延迟或者阻止了非小细胞肺癌的发生或者减轻了 非小细胞肺癌的临床症状。所述非小细胞肺癌的评定可以使用标准临床方 法来完成。另外,可以与用于诊断或治疗非小细胞肺癌的任何已知方法结 合对治疗的有效性进行测定。例如,从组织病理学或者通过鉴别症状来诊 断非小细胞肺癌,所述症状例如慢性咳嗽(chronic cough),嘶哑(hoarseness), 咳血(coughing up blood),体重减少,食欲不振,气短(shortness of breath), 哮喘(wheezing),反复发作的支气管炎或肺炎和胸痛。
此外,本发明用于诊断非小细胞肺癌的方法还可用于通过比较源自患者 的生物样品中NSC基因的表达水平来评估癌症患者的预后。可选,可以在疾 病各个阶段过程中对生物样品中所述基因的表达水平进行测定从而评定患 者的预后情况。
与正常对照水平相比,NSC 807-1448的表达水平升高或者NSC 1-806 的表达水平降低表明预后不良。与正常对照水平相比,NSC 807-1448或者 NSC 1-806的表达水平近似则表明该患者预后良好。优选地,可以通过比较 NSC 807-1448或者NSC 1-806的表达图谱对受试者的预后情况进行评定。
表达图谱
本发明还提供了一种非小细胞肺癌参照表达图谱,其中NSC 1-1448中 两种或多种基因表达水平的模式。所述表达图谱可用作下列用途的对照:诊 断非小细胞肺癌或患所述疾病倾向性,监测治疗过程,以及评定患该疾病受 试者的预后。
鉴定可抑制或增强非小细胞肺癌-相关基因表达的化合物
通过下述方法鉴定可抑制非小细胞肺癌-相关基因表达或活性的化合 物:使表达非小细胞肺癌-相关基因的受试细胞与受试化合物接触,测定该 非小细胞肺癌-相关基因的表达水平或活性。其表达与正常对照水平相比降 低表明该化合物是该非小细胞肺癌-相关基因的抑制因子。当所述受试细胞 中表达的非小细胞肺癌-相关基因是上调的基因时,根据该方法鉴定的化合 物可用于抑制非小细胞肺癌。
可选,通过下述操作可以将提高非小细胞肺癌-相关基因表达或活性的 化合物鉴定为该基因的增强子:使表达非小细胞肺癌-相关基因的受试细胞 群与受试化合物接触,测定该非小细胞肺癌-相关基因的表达水平或活性。 当所述受试细胞中表达的非小细胞肺癌-相关基因是下调的基因时,根据该 方法鉴定的化合物可用于抑制非小细胞肺癌。
所述受试细胞可以是细胞群,包括任何细胞,只要该细胞表达靶非小 细胞肺癌-相关基因。例如,所述受试细胞含有上皮细胞,所述细胞可源自 肺组织、血液、血清或痰。所述受试细胞可以是一种源自非小细胞肺癌细 胞的无限增殖细胞系。可选,所述受试细胞可以是用NSC基因转染的细胞 或者是已经用NSC基因的调控序列(例如启动子)转染的细胞,所述调控序 列可操作地连接于报道基因。
筛选化合物
可以使用NSC基因、该基因编码的蛋白或该基因的转录调控区域,筛 选能够改变所述基因表达或者所述基因编码多肽的生物活性的化合物。该 化合物可用作能够用于治疗或者预防非小细胞肺癌的药物。
因此,本发明还提供了一种使用本发明所述多肽筛选用于治疗或预防 非小细胞肺癌的化合物的方法。这种筛选方法的实施方案中含有下列步骤: (a)使受试化合物与本发明所述多肽接触;(b)检测本发明所述多肽与所述 受试化合物之间的结合活性;以及(c)选择能与本发明所述多肽结合的化 合物。
筛选使用的多肽可以是一种重组多肽或者一种天然来源的蛋白或者其 部分的肽。用于与受试化合物接触的多肽可以是,例如,纯化的多肽、可 溶解的蛋白,与载体结合的形式或者与其它多肽融合在一起的融合蛋白。
作为筛选可结合NSC多肽的蛋白的方法,本领域技术人员熟知的许 多方法都可使用。所述筛选可以通过例如免疫沉淀法法(immunoprecipitation) 实施,具体而言是用下列方式。可以通过下述操作在动物细胞等中表达编 码任一所述NSC多肽的基因:将所述基因插入外来基因的表达载体,诸如 pSV2neo、pcDNA I、pcDNA3.1、pCAGGS和pCD8。所述表达用的启动子 可以是通常使用的任一启动子,包括,例如,SV40早期启动子(Rigby in Williamson(ed.),Genetic Engineering,vol.3.Academic Press London,83-141 (1982))、EF-α启动子(Kim et al.,Gene 91:217-23(1990)),CAG启动子 (Niwa et al.,Gene 108:193-200(1991))、RSVLTR启动子(Cullen,Methods in Enzymology 152 684-704(1987))、SRα启动子(Takebe et al.,Mol Cell Biol 8:466(1988))、CMV即时早期(immediate early)启动子(Seed and Aruffo, Proc Natl Acad Sci USA 84:3365-9(1987))、SV40晚期启动子(Gheysen and Fiers,J Mol Appl Genet 1:385-94(1982))、腺病毒启动子(Kaufman et al., Mol Cell Biol 9:946(1989))、HSV TK启动子等等。将所述基因导入表达外 源基因的动物细胞可以用任一方法完成,例如,电穿孔方法(Chu et al., Nucleic Acids Res 15:1311-26(1987))、磷酸钙方法(Chen and Okayama, Mol Cell Biol 7:2745-52(1987))、DEAE葡聚糖方法(Lopata et al.,Nucleic Acids Res 12:5707-17(1984);Sussman and Milman,Mol Cell Biol 4:1642-3 (1985))、脂质转染(Lipofectin)方法(Derijard,B Cell 7:1025-37(1994);Lamb et al.,Nature Genetics 5:22-30(1993):Rabindran et al.,Science 259:230-4 (1993))等。还可以将所述NSC多肽表达为含有单克隆抗体识别位点的融 合蛋白,可通过将特异性已知该单克隆抗体的表位引入所述多肽的N或C- 末端进行。可以使用商品化的表位-抗体系统(实验医学13:85-90(1995))。 可利用其多克隆位点而表达带有例如β-半乳糖苷酶、麦芽糖结合蛋白、谷 胱甘肽S-转移酶、绿色荧光蛋白(GFP)等的融合蛋白的载体,可以从商业渠 道获得。
另外,还报道了通过引入仅由数个到十数个(dozen)氨基酸组成的小表 位制备的融合蛋白,其中NSC多肽的特性不至因融合而改变。表位例如聚 组氨酸(His-标记)、流感病毒血凝素(influenza aggregate)HA、人C-myc标记、 水泡性口膜炎病毒(Vesicular stomatitis virus)糖蛋白(VSV-GP),T7基因10蛋 白(T7-标记)、人单纯疱疹病毒(human simple herpes virus)糖蛋白(HSV-标 记),E-标记(去单克隆噬菌体上的表位)等,以及识别它们的单克隆抗体都可 用作表位-抗体系统来筛选能结合所述NSC多肽的蛋白(实验医学13: 85-90(1995))。
在免疫沉淀法中,通过向用合适的去污剂制备的细胞裂解物中添加这 些抗体从而形成免疫复合物。所述免疫复合物是由所述NSC多肽、具有能 与该多肽结合能力的多肽和抗体组成。除使用抗上述表位的抗体之外,免 疫沉淀还可以使用抗NSC多肽的抗体实施,所述抗NSC多肽抗体可以用上 述方法制备。
当所述抗体是一种小鼠IgG抗体时,可以用例如蛋白A琼脂糖或蛋白 G琼脂糖沉淀免疫复合物。如果所述NSC多肽被制备成为带有表位例如 GST的融合蛋白时,可以用与使用抗NSC多肽抗体相同的方式形成免疫复 合物,这时要使用能与这些表位特异性结合的物质,例如谷胱甘肽-琼脂糖 4B。
免疫沉淀可以通过按照或根据文献(Harlow and Lane,Antibodies, 511-52,Cold Spring Harbor Laboratory publications,New York(1988))中记载 的方法进行。
通常使用SDS-PAGE对免疫沉淀的蛋白进行分析,结合蛋白可以使用 合适浓度的凝胶通过该蛋白的分子量进行分析。由于与NSC多肽结合的蛋 白用常规染色法例如考马氏染色或染色很难检测,因而可以通过下述方 法提高所述蛋白的检测灵敏度:将细胞培养在含有放射性同位素35S-甲硫 氨酸或35S-半胱氨酸的培养基中,标记所述细胞中的蛋白,然后检测该蛋 白。蛋白可以直接用SDS-聚丙烯酰胺凝胶纯化,然后可以在该蛋白分子量 已知时测定其序列。
使用任意NSC多肽筛选能与该多肽结合的蛋白的方法可用Western印 迹分析(Skolnik et al,Cell 65:83-90(1991))。具体而言,可以通过下述方 法获得能结合NSC多肽的蛋白:使用噬菌体载体(例如ZAP),从期望表达 能与NSC多肽结合的蛋白的细胞、组织、器官(例如,组织如睾丸和前列腺) 或者培养的细胞(例如LNCaP、PC3、DU145)制备cDNA文库;将该蛋白 表达于LB-琼脂糖上,将该蛋白固定在滤膜上,使经过纯化和标记的NSC 多肽与上述滤膜反应,然后根据所述标记来检测表达与NSC多肽结合的蛋 白的噬斑。可以用下述方法对NSC多肽进行标记:利用生物素与抗生物素 蛋白之间的结合,或者使用能特异性结合该NSC多肽的抗体,或者与NSC 多肽融合的肽或者多肽(例如,GST)。也可以使用采用放射性同位素或者荧 光等标记的方法。
可选,在本发明所述筛选方法的另一实施方案中,可以使用双杂交系 统(“MATCHMAKER双杂交系统”,“Mammalian MATCHMAKER双杂交测 定试剂盒”,“MATCHMAKER单杂交系统”(Clontech);“HybriZAP双杂交载 体系统”(Stratagene);参照“Dalton and Treisman,Cell 68:597-612(1992)”, “Fields and Sternglanz,Trends Genet 10:286-92(1994)”)。
在双杂交系统中,将NSC多肽与SRF-结合区或GAL4-结合区融合, 并表达于酵母细胞中。从预期表达与NSC多肽结合的蛋白的细胞制备cDNA 文库,从而使得该文库在表达时与VP16或GAL4转录活化区域融合。然后 将cDNA文库导入上述酵母细胞,从检测为阳性的克隆分离出源自所述文 库的cDNA(当能与本发明所述多肽结合的蛋白表达于酵母细胞时,这两者 的结合能够活化报道基因使得阳性克隆可检测)。可以通过将上述的分离的 cDNA导入大肠杆菌并表达所述蛋白来制备所述cDNA编码的蛋白。
就报道基因而言,除HIS3基因外,还可使用例如Ade2基因、lacZ基 因、CAT基因、荧光素酶基因等。
能与NSC多肽结合的化合物还可以使用亲和层析法筛选。例如,可以 将NSC多肽固定于亲和层析柱的载体,然后将包括能与NSC多肽结合的蛋 白的受试化合物加于该层析柱。本申请中的受试化合物可以是,例如细胞 提取物、细胞裂解物等。在将所述受试化合物上样后,对柱体进行洗涤, 这样就能制备出与NSC多肽结合在一起的化合物。
当受试化合物是一种蛋白时,对获得的蛋白的氨基酸序列进行分析,然 后基于该序列合成寡聚DNA,用该寡聚DNA作探针筛选cDNA文库获得 编码所述蛋白的DNA。
可以将利用表面胞质团共振现象(surface plasmon resonance phenomenon)的生物传感器(biosensor)用作对本发明中结合的化合物进行检 测或定量的手段。当使用这类生物传感器时,NSC多肽和受试化合物之间 的相互作用可以作为一种表面胞质团共振现象进行实时观察,只使用极少 量的多肽且不需标记(例如,BIAcore,Pharmacia)。因此,可以使用生物传 感器诸如BIAcore对NSC多肽和受试化合物之间的结合情况进行测评。
筛选当固定化的NSC多肽暴露于合成化合物、或天然物质库、或随机 噬菌体肽展示文库时发生结合的分子的方法,以及根据组合化学技术 (Wrighton等,Science 273:458-64(1996);Verdine,Nature 384:11-13(1996); Hogan,Nature 384:17-9(1996))利用高通量分离与NSC蛋白(包括激动剂和 拮抗剂)结合的蛋白以及化合物的筛选方法是本领域技术人员熟知的。
另外,本发明提供了一种利用NSC多肽筛选用于治疗或预防非小细胞 肺癌的化合物的方法,包括以下步骤:
(a)将受试化合物与NSC多肽接触;
(b)检测步骤(a)中NSC多肽的生物活性;和
(c)选择使与没有受试化合物时检测到的多肽生物活性相比NSC多肽 生物活性被抑制或增强的化合物。
因为NSC1-1448之一编码的蛋白具有促进非小细胞肺癌细胞增生的 活性,所以用这种活性作为指标可以筛选化合物,所述化合物促进或抑制 这些蛋白之一的这种活性。
可用任何多肽进行筛选只要它们有NSC蛋白的生物活性。这种生物活 性包括NSC 807-1448之一编码的人蛋白的细胞增生活性。例如,也可使 用NSC 807-1448之一编码的人蛋白及其功能等价多肽。这种多肽可由细 胞内源性或外源性表达。
通过这种筛选分离的化合物是NSC多肽的激动剂或拮抗剂。术语“激 动剂“指通过与其结合活化NSC多肽的功能的分子。术语“拮抗剂”指通 过与其结合抑制NSC多肽功能的分子。而且,通过这种筛选分离的化合物 是抑制NSC多肽与分子(包括DNA和蛋白)在体内的相互作用的候选化合 物。
当本发明方法中所检测的生物活性是细胞增生时,可例如下述进行检 测:制备表达NSC多肽(例如NSC 807-1448)的细胞,在存在受试化合物 的情况下培养所述细胞,测定细胞增生速度,测定细胞周期等,以及测定 集落形成活性。
如前文所详细讨论的,通过控制NSC基因的表达水平,我们可以控制 非小细胞肺癌的发病和进程。因此,通过以NSC基因表达水平作为标志进 行筛选可鉴定用于治疗或预防非小细胞肺癌的化合物。在本发明的上下文 中,这种筛选包括,例如下述步骤:
a)将受试化合物与表达一或多种NSC基因的细胞接触;和
b)筛选使得NSC 807-1448基因的的一或多种的表达水平与没有该受 试化合物时检测到所述水平相比降低或升高的化合物。
表达至少一种NSC基因的细胞包括,例如从非小细胞肺癌建立的细胞 系;这种细胞可用于本发明上述的筛选方法(例如A549,NCI-H226, NCI-H522,LC319)。根据本领域技术人员熟知的方法估计所述表达水平。筛 选方法中,选择降低至少一种NSC基因表达水平的化合物作为治疗或预防 非小细胞肺癌的候选试剂。
或者,本发明筛选方法包括以下步骤:
a)使受试化合物与导入了载体的细胞接触,该载体含有一或多种标记 基因的转录调节区以及在该转录调节区控制下表达的报道基因,其中一或 多种标记基因是NSC 1-1448,
b)测定所述报道基因的活性;和
c)当所述报道基因是上调的基因(例如NSC 807-1448)时,选择使得 与对照相比所述报道基因表达水平降低的化合物,或当所述报道基因是下 调的基因(例如NSC 1-806)时,选择使得与对照相比所述报道基因表达水 平升高的化合物。
适合的报道基因和宿主细胞是本领域已知的。筛选所需的报道构建体 可利用标记基因的转录调节区来制备。如果标记基因的转录调节区是本领 域技术人员已知的,可利用前面的序列信息制备报道构建体。当标记基因 的转录调节区是未确定的,可根据该标记基因的核苷酸序列信息从基因组 文库分离含有转录调节区的核苷酸片段。
任何受试化合物,例如,细胞提取物,细胞培养上清液,微生物发酵 产物,海洋生物提取物,植物提取物,纯化的或粗制的蛋白,肽,非肽化 合物,合成的小分子化合物以及天然化合物都可用在本发明的筛选方法 中。本发明受试化合物可使用本领域已知的组合文库中的多种方法之一获 得,所述文库包括(1)生物学文库,(2)空间定位平行固相或液相文库(spatially addressable parallel solid phase or solution phase libraries)(3)需要重叠合法 (deconvolution)的合成文库法,(4)“一珠一化合物(one bead one compound)” 文库法和(5)使用亲和层析筛选的合成文库法。使用亲和层析筛选的生物学 文库法仅限于肽文库,而其它四种方法适用于肽,非肽寡聚体或化合物小 分子文库(Lam(1997)Anticancer Drug Des.12:145)。合成分子文库的方法的 举例见于下述文献(DeWitt等(1993)Proc.Natl.Acad.Sci.USA 90:6909;Erb 等(1994)Proc.Natl.Acad.Sci.USA 91:11422;Zuckermann等(1994)J.Med. Chem.37:2678;Cho等(1993)Science 261:1303;Carell等(1994)Angew. Chem.Int.Ed.Engl.33:2059;Carell等(1994)Angew.Chem.Int.Ed.Engl.33: 2061;Gallop等(1994)J.Med.Chem.37:1233)。化合物文库可存在于溶液 (参见Houghten(1992)Bio/Techniques 13:412)或珠(Lam(1991)Nature 354: 82),芯片(Fodor(1993)Nature 364:555),细菌(美国专利5,223,409),孢子(美 国专利5,571,698;5,403,484,and 5,223,409),质粒(Cull等(1992)Proc.Natl. Acad.Sci.USA 89:1865)或噬菌体(Scott and Smith(1990)Science 249:386; Delvin(1990)Science 249:404;Cwirla等(1990)Proc.Natl.Acad.Sci.USA 87: 6378;Felici(1991)J.Mol.Biol.222:301;美国专利申请2002103360)。根据 本发明所述筛选方法,暴露于细胞或蛋白的受试化合物可以是单个化合物 或化合物的组合。当本发明筛选方法中使用的是化合物的组合时,所述化 合物可以依次或同时接触。
通过本发明所述筛选方法分离的化合物是促进或抑制NSC多肽活性的 药物的候选物,可用于治疗或预防因细胞增生性疾病引发的疾病,诸如非 小细胞肺癌。用本发明筛选方法获得的化合物的部分结构由于添加、缺失 和/或取代发生了变化,这样的化合物也包括在用本发明筛选方法获得的化 合物中。能有效刺激低表达(under-expressed)基因(例如,NSC 1-806)或者能 有效抑制过表达的基因(例如,NSC 807-1448)表达的化合物被认为具有临床 效果,而且可以进一步测定其能否阻止动物模型或者受试对象中癌细胞的 生长。
选择适于具体个体的非小细胞肺癌治疗药物
个体基因组成的不同能导致其代谢各种药物的相对能力的差异。一种 能在受试者中作为抗非小细胞肺癌药物而被代谢的化合物,能够通过在该 受试者细胞中诱导基因表达模式改变而显示出来,所述改变为由具有癌性 状态特征的基因表达模式为具有非癌性状态特征的基因表达模式。因此, 本申请中公开的差异性表达的NSC基因使得能够通过在源自所选择受试者 的受试细胞(或受试细胞群)中检测候选化合物,选出适合具体受试者的非小 细胞肺癌的推定的治疗或预防性抑制物。
为了鉴定适合于具体受试者的抗非小细胞肺癌药物,将源自该受试者 的受试细胞或受试细胞群暴露于该治疗剂,然后测定一种或多种NSC 1-1448基因的表达。
所述受试细胞是表达非小细胞肺癌相关基因的非小细胞肺癌细胞,或 者所述受试细胞群中含有表达非小细胞肺癌相关基因的非小细胞肺癌细 胞。优选地,所述受试细胞是一种上皮细胞或者所述受试细胞群含有上皮 细胞。例如,将所述受试细胞或者受试细胞群在有候选药物存在的条件下 进行保温,然后测定所述受试细胞或细胞群的基因表达模式,并与一种或 多种对照图谱进行比较,例如,非小细胞肺癌参照表达图谱或者非-非小细 胞肺癌肺癌参照表达图谱。
与含有非小细胞肺癌的对照细胞群相比,NSC 807-1448中一种或多种 的表达降低或者NSC1-806中一种或多种的表达升高表明所述药物是有疗 效的。
所述测试药物可以是任一化合物或组合物。例如:,所述测试药物是一 种免疫调节剂。
试剂盒
本发明还提供了一种试剂盒,其中含有NSC-检测试剂,例如,一种能 特异性结合或者鉴定一种或多种NSC多核苷酸的核酸。所述的能特异性结 合或者鉴定一种或多种NSC多核苷酸的核酸例如,与部分NSC多核苷酸互 补的寡核苷酸序列,或能与NSC多核苷酸所编码多肽结合的抗体。可以将 所述试剂一起包装在试剂盒中。所述试剂,诸如核酸或抗体(结合在固体基 质上或者同用于将其结合至所述基质上的试剂分开包装)、对照试剂(阳性和 /或阴性的)和/或检测所述核酸或抗体用的手段(means),优选包装在分开的 容器中。可以将实施所述测定用的说明书(例如,文字、磁带、VCR、CD-ROM 等)包括在所述试剂盒中。所述试剂盒的测定方式可以是本领域已知的 Northern杂交或夹心ELISA。
例如,将NSC检测试剂固定于固体基质例如多孔条带上形成至少一个 NSC检测位点。所述多孔条带的测定或检测区域可以包括大量的检测位点, 每个检测位点含有一种NSC检测试剂。测试条带还可以包含阴性和/或阳性 对照位点。可选,对照位点可位于与所述测试条带分开的带。任选地,所 述不同的检测位点可以包含不同量的固定化试剂,即第一检测位点中的含 量较高,随后的位点中的量较低。当加入受试生物样品时,显示可检测信 号的位点数提供了存在于样品中的NSC含量的定量指标。可以将所述检测 位点设置为任一合适的可检测形状,通常为条形或者横跨测试条带宽度的 斑点。
可选,所述试剂盒包含一种核酸底物阵列,其中含有一种或多种NSC 多核苷酸序列。所述阵列上的核酸能够特异性鉴定NSC 1-1448代表的一 种或多种多核苷酸序列。NSC 1-1448代表的基因的2,3,4,5,6,7,8, 9,10,15,20,25,40或50或更多种基因的表达,可以通过与阵列测试 条带或芯片的结合水平来鉴定。所述底物阵列可以位于例如固体基底例如 美国专利US 5,744,305中描述的“芯片”上。
阵列及复数形式(Pluralities)
本发明还包括一种核酸底物阵列,其中含有一种或多种NSC多核苷酸 序列。所述阵列上的核酸特异性地对应于NSC 1-1448表示的一种或多种多 核苷酸序列。NSC 1-1448表示基因中的2,3,4,5,6,7,8,9,10,15, 20,25,40或50或更多种基因的表达水平可以通过检测核酸与所述阵列的 结合来鉴定。
本发明还包括一种分离的核酸复数形式(即两种或多种核酸的混合物)。 所述核酸处于液相或固相,例如,固定于固体支持物例如硝化纤维膜。所 述复数形式包含NSC 1-1448代表的一种或多种多核苷酸。根据本发明的另 一实施方案,所述复数形式包含NSC 1-1448代表的多核苷酸中的2,3,4, 5,6,7,8,9,10,15,20,25,40或50或更多种多核苷酸。
芯片
DNA芯片是一种便于同时对许多基因的表达水平进行比较的装置。以 DNA芯片为基础的表达图谱的构建可以利用例如“Microarray Biochip Technology”(Mark Schena,Eaton出版,2000)中公开的方法等。
DNA芯片中含有检测大量基因用的经过固定化高-密度探针。因此,通 过单轮分析就能同时测定出许多基因的表达水平。即,样品的表达图谱可 以用DNA芯片测定。本发明所述以DNA芯片为基础的方法包括下列步骤:
(1)合成与标记基因相应的aRNA或cDNA;
(2)将上述aRNA或cDNA与标记基因的探针杂交;以及
(3)检测与所述探针杂交的aRNA或cDNA,然后对其mRNA进行定 量。
aRNA是指用RNA聚合酶从模板cDNA转录得到的RNA。用于基于 DNA芯片的表达图谱的aRNA转录试剂盒可购得。用所述试剂盒,可以使 用T7 RNA聚合酶以连有T7启动子的cDNA为模板合成aRNA。另一方面, 可以通过使用随机引物,用从mRNA合成的cDNA为模板通过PCR扩增 cDNA。
可选,所述DNA芯片中含有已点于所述芯片上的探针,用于检测本发 明所述标记基因的探针。点在所述DNA芯片上的标记基因的数目没有限制。 例如,可以从本发明所述标记基因中挑选5%或更多,优选20%或更多,更 多优选50%或更多,甚至更优选70%或更多。可以将任何其它基因与所述 标记基因一起点在所述DNA芯片上。例如,可以将表达水平几乎不变的基 因的探针点于所述DNA芯片上。当意欲比较多个芯片或不同测定之间的 测定结果时,可以用这样的基因将测定结果标准化。
为所选的每一种标记基因设计探针,然后将所述探针点于DNA芯片 上。所述探针可以是,例如含有5-50个核苷酸残基的寡核苷酸。用于在DNA 芯片上合成所述寡核苷酸的方法已为本领域技术人员所知。较长的DNA可 以通过PCR或化学方法合成。用于将用PCR或其它方法合成的长DNA点 于载玻片上的方法也已为本领域技术人员已知。通过上述方法获得的DNA 芯片可用于诊断本发明所述的非小细胞肺癌。
使制备得到的DNA芯片与aRNA接触,然后对上述探针与aRNA之间 的杂交情况进行检测。可以提前用荧光染料标记aRNA。可以用荧光染料诸 如Cy3(红色)和Cy5(绿色)等标记aRNA。将来自受试者和对照的aRNA分别 用不同的荧光染料标记。可以根据上述信号强度的差异测算出上述二者之 间表达水平的差异。DNA芯片上的荧光染料信号可以用扫描器检测,然后 用专门的程序进行分析。例如,来自Affymetrix的Suite是一种DNA芯片 分析用的软件包。
用于治疗或预防非小细胞肺癌的方法
本发明提供了一种用于治疗、减轻或预防受试者非小细胞肺癌的方法。 治疗化合物可以预防或治疗性给予患有或易患非小细胞肺癌(或对非小细胞 肺癌敏感)的受试者。用常规临床方法或通过检测NSC 1-1448表达或活性的 水平异常对所述受试者进行鉴定。在显现明显的疾病临床症状之前进行预 防给药,从而阻止或者延迟疾病或病症的进程。
所述治疗方法包括提高基因的一种或多种基因产物的表达或/和功能, 所述基因在非小细胞肺癌细胞中的表达与在正常细胞(来自与非小细胞肺癌 细胞所来源组织类型相同的组织)的表达相比降低(“低-表达的基因”)。这 些方法中,用有效量的化合物治疗所述受试者,该化合物能使所述受试者 中一种或多种低表达的基因(NSC 1-806)的表达量升高。该化合物的给药可 以是全身性的或局部性的。所述治疗化合物包括:低表达的基因的多肽产 物,或其生物活性片段;位于表达调控元件下游的编码低表达基因的核酸, 该调控元件使得所述基因能够在非小细胞肺癌细胞中表达;以及能使内源 性存在于非小细胞肺癌细胞中的所述基因的表达水平提高的化合物(即, 上调低表达的基因的表达的化合物)。施用所述治疗化合物能够对抗受试者 肺细胞中异常低表达的基因的作用,改善该受试者的临床状况。所述化合 物可以通过本发明上述筛选方法获得。
所述方法还包括基因的一种或多种基因产物的表达或/和功能,所述基 因在非小细胞肺癌细胞中的表达与在正常细胞(来自与非小细胞肺癌细胞所 来源组织类型相同的组织)的表达相比升高(“过-表达的基因”)。所述表达 可以用本领域已知的任一方法抑制。例如,用有效量的化合物治疗所述受 试者,该化合物能使所述受试者中一种或多种过表达基因(NSC 807-1448) 的表达量降低。该化合物的给药可以是全身性的或局部性的。所述治疗化 合物包括能使内源性存在于非小细胞肺癌细胞中的所述基因的表达水平降 低的化合物(即下调过表达的基因的表达的化合物)。施用所述治疗化合物能 够对抗受试者肺细胞中异常过表达基因的作用,改善该受试者的临床状况。 所述化合物可以通过本发明上述的筛选方法获得。
能够调节用于治疗或预防本发明所述非小细胞肺癌的蛋白(NSC 1-1448)的活性的化合物包括蛋白、这些蛋白的天然同源配体、肽、肽模拟 物以及其它小分子。
可选,可以用下述方法抑制所述过表达的基因(NSC 807-1448)的表达: 向受试者施用一种能抑制或拮抗所述过表达的基因的表达的核酸。能够干 扰过表达的基因的表达的反义寡核苷酸、siRNA或核酶可用于抑制所述过 表达的基因的表达。
如上所述,与NSC 807-1448中任一核苷酸序列对应的反义-寡核苷酸 可用于降低所述NSC 807-1448的表达水平。与非小细胞肺癌中表达上调 的NSC 807-1448对应的反义-寡核苷酸可用于治疗或预防非小细胞肺癌。具 体而言相应mRNA结合发挥作用,从而抑制所述基因的转录或翻译,促进 mRNA的降解,和/或抑制NSC核苷酸编码蛋白的表达,并且最终抑制所述 蛋白的功能。在本申请中的术语“反义-寡核苷酸”包括与靶序列完全互补 的核苷酸和有一处或多处错配的核苷酸,只要所述反义-寡核苷酸能与所述 靶序列特异性杂交即可。例如,本发明所述反义-寡核苷酸包括具有SEQ ID NO:423,425,427,429,431,433,435,437,439,441,443,445, 447,449,451,453,455,457,459,461,463,465,467,469,471, 473,475,477,479,481,483,485,487,489,491,493,495,497, 499,501,503,505,507,509,509,513,515,517,519,521,523, 525,527,529和531所示的核苷酸序列,现已证明这些核苷酸序列都能有 效抑制NSCLC细胞系的转化灶形成。此外,本发明所述反义-寡核苷酸包 括具有下述特征的多核苷酸:在至少15个连续核苷酸范围内与任一NSC 807-1448所示核苷酸序列具有至少70%或更高,优选为80%或更高,更优 选为90%或更高,甚至更优选为95%或更高同源性。所述同源性可以使用 本领域已知的算法测定。另外,所述反义寡核苷酸的衍化物或修饰产物也 可用作本发明所述的反义寡核苷酸。所述修饰产物包括例如低级烷基膦酸 酯(low alkyl phosphnote modification)修饰,例如甲基膦酸酯-型 (methyl-phosphonate type)或乙膦酸酯-型(ethyl-phosphonate-type),硫代磷酸 修饰(phosphorothioate)以及磷酰胺(phosphoroamidate)修饰。
所述反义-寡核苷酸及其衍生物通过下述过程对生成NSC 807-1448编 码蛋白的细胞发挥作用:与编码所述蛋白的DNA或mRNA结合,抑制它 们的转录或翻译,促进所述mRNA的降解并抑制所述蛋白的表达,从而使 所述蛋白的功能受到抑制。
可以通过与相对所述衍生物无活性的合适基底材料混合,将反义-寡核 苷酸及其衍生物制备成外用制剂,例如搽剂(liniment)或膏药(poultice)。
本发明所述反义-寡核苷酸可抑制NSC 807-1448中任一编码的至少一 种NSC蛋白,因而可用于抑制所述蛋白的生物活性。
可抑制过表达基因的一种或多种基因产物的多核苷酸还包括小干扰 RNA(siRNA),这种RNA中含有编码过表达的NSC蛋白的核苷酸序列例如 NSC 807-1448的有义链核酸与反义链核酸的结合。术语″siRNA″是指一种 能阻止靶mRNA翻译的双链RNA。将siRNA导入细胞的常规技术可用于本 发明所述的治疗或预防,包括那些其中DNA是RNA转录模板的技术。构 建siRNA从而使得单个转录物同时具有来自靶基因的有义序列和互补的反 义序列,所述靶基因例如发夹结构。
所述方法可用于抑制其中NSC基因的表达上调的细胞的基因表达。所 述siRNA与靶细胞中NSC基因转录物的结合导致该细胞的NSC蛋白产量 减少。所述寡核苷酸的长度为至少10个核苷酸,也可以与天然生成转录物 等长。优选地,所述寡核苷酸的长度为19-25个核苷酸。最优选地,所述寡 核苷酸长度小于75个、50个或25个核苷酸。本发明优选的siRNA包括以 具有SEQ ID NO:533,534,535,536,537,538,539,540,541,542, 543,544,545,546,547,548,549,550,551或552所示核苷酸序列的 作为靶序列的多核苷酸。
另外,所述的siRNA核苷酸序列可以用siRNA设计电脑程序设计,该 程序可以从Ambion站点 (http://www.ambion.com/techlib/misc/sirna_finder.html)获得。以下列方案为基 础,通过计算机程序选择所述siRNA的核苷酸序列:
siRNA靶位点的选择:
1.从目标转录物的AUG起始密码开始,向下游扫描寻找AA双核苷酸 序列。记录每个AA的出现,临近3′的19个核苷酸作为可能的siRNA靶位 点。Tuschl等建议不要涉及针对5′和3′非翻译区(UTR)和邻近起始密码子的 区域(75个碱基之内)的siRNA,因为上述区域可能较为富含调节性蛋白结合 位点,由此设计为针对这些区域的核酸内切酶与siRNA的复合物可干扰 UTR结合蛋白和/或翻译起始复合物的结合。
2.将所述潜在靶位与人类基因组数据库进行比较,不考虑与其它编码 序列显著同源的任何靶序列。利用BLAST进行同源搜索,BLAST可在NCBI 服务器找到,网址是 www.ncbi.nlm.nih.gov/BLAST/。
3.选择合格的靶序列用于合成。在Ambion网站,沿该基因选择数个 优选靶序列进行评估。
所述siRNA可抑制过表达的NSC蛋白的表达,从而能够用于抑制所述 蛋白的生物活性。因此,含有所述siRNA的组合物可用于治疗或预防非小 细胞肺癌。
可抑制过表达的基因的一种或多种基因产物的核酸还包括针对所述过 表达的基因(NSC 807-1448)的核酶。
所述核酶可抑制过表达NSC蛋白的表达,从而能够用于抑制所述蛋白 的生物活性。因此,含有所述核酶的组合物可用于治疗或预防非小细胞肺 癌。
通常,核酶分为大核酶和小核酶。大核酶是裂解核酸磷酸酯键的酶。 与大核酶反应后,反应位点由5’-磷酸基团和3’-羟基基团组成。大核酶进一 步分为(1)催化鸟苷在5’-剪接位点的酯基转移作用的组I内含子RNA;(2) 催化经由套索样(lariat-like)结构经过两步反应自我剪接的组II内含子RNA; 和(3)通过水解在5’位点切割tRNA前体的核糖核酸酶P的RNA组件。另一 方面,小核酶与大核酶相比较较小(约40bp),并且小核酶切割RNA产生5’- 羟基和2’-3’环状磷酸酯。锤头型核酶(Koizumi等,(1988)FEBS LErr 228:225) 和发夹型核酶(Buzayan,(1986)Nature 323:349;Kikuchi and Sasaki,(1992), Nucleic Acids Res 19:6751)都包括在小核酶中。设计和构建核酶的方法是本 领域中已知的(参见Koizumi等,FEBS Lett 228:225(1988);Koizumi等, Nucleic Acids Res 17:7059(1989);Kikuchi and Sasaki,(1992),Nucleic Acids Res 19:6751),而且抑制过表达的NSC蛋白的核酶也可以根据编码所述NSC 蛋白的核苷酸序列的序列信息(SEQ ID NO:1,3或5)和制备核酶的常规方法 来构建。
所述核酶可抑制过表达NSC蛋白的表达,因而能够用于抑制所述蛋白 的生物活性。因此,含有所述核酶的组合物可用于治疗或预防非小细胞肺 癌。
可选,通过施用可结合或者可抑制所述基因产物功能的化合物,抑制 所述过表达的基因的一种或多种基因产物的功能。例如,所述化合物是一 种能与一或多种过表达的基因的产物结合的抗体。
本发明涉及抗体具体而言为针对一种上调基因编码蛋白的抗体或该抗 体的片段的用途。在本申请中,术语“抗体”是指一种具有特异性结构的 免疫球蛋白分子,该结构能够与其中含有用于合成该抗体的抗原(即,上调 的基因的产物)的分子或与同其密切相关的抗原特异性相互作用(结合)。结 合过表达的NSC核苷酸的抗体可以是任一形式,例如单克隆或多克隆抗体, 包括通过用所述多肽免疫动物例如兔获得的抗血清,所有种类的多克隆和 单克隆抗体,人抗体和通过基因重组制备的人源化抗体。
另外,本发明的抗体可以是抗体片段或修饰的抗体,只要它结合一或 多种本发明NSC蛋白。例如,所述抗体片段可以是Fab,F(ab’)2,Fv或单链 Fv(scFv),其中H链和L链的Fv片段通过合适的接头连接(Huston等,Proc Natl Acad Sci USA 85:5879-83(1988))。更具体地,抗体片段可用酶如木瓜 蛋白酶或胃蛋白酶处理抗体而生成。或者可构建编码该抗体片段的基因, 将其插入合适的表达载体,并在适合的宿主细胞中表达(参见,如Co等,J Immunol 152:2968-76(1994);Better and Horwitz,Methods Enzymol 178: 476-96(1989);Pluckthun and Skerra,Methods Enzymol 178:497-515(1989); Lamoyi,Methods Enzymol 121:652-63(1986);Rousseaux等,Methods Enzymol 121:663-9(1986);Bird and Walker,Trends Biotechnol 9:132-7 (1991))。
抗体可通过与各种分子,如聚乙二醇(PEG)连接进行修饰。本发明提供 了这种修饰的抗体。也可通过化学修饰抗体而获得修饰的抗体。这些修饰 方法是本领域常规的。
或者,本发明的抗体可作为嵌合抗体而获得,所述嵌合抗体可变区来 自非人抗体而恒定区来自人抗体;或者作为人源化抗体而获得,所述人源 化抗体包括来自非人抗体的互补决定区(CDR),来自人抗体的框架区(FR)以 及恒定区。利用已知技术制备这种抗体。
本发明提供了一种用于治疗或者预防非小细胞肺癌的方法,该方法使 用抗过表达的NSC多肽的抗体。按照所述方法,施用药学有效量的抗所述 NSC多肽的抗体。抗过表达的NSC多肽的抗体以足以能减弱所述NSC蛋 白活性的剂量进行施用。可选,能与肿瘤细胞特异性细胞表面标记结合的 抗体可用于药物递送。因此,例如,施用足以破坏肿瘤细胞剂量的、细胞 毒素因子偶联型抗过表达的NSC多肽的抗体。
本发明还涉及一种在受试者中治疗或预防非小细胞肺癌的方法,该方 法包括:对所述受试者施用一种疫苗,该疫苗中含有选自NSC 807-1448的 核酸编码的多肽或所述多肽的免疫活性片段,或者编码所述多肽或其片段 的多核苷酸。所述多肽的给药在受试者体内诱导抗肿瘤免疫。因此,本发 明进一步还提供了一种用于诱导抗肿瘤免疫的方法。所述多肽或其免疫活 性片段可用作针对非小细胞肺癌的疫苗。一些情况下,所述蛋白或其片段 可以与T细胞受体(TCR)结合的形式或者由抗原递呈细胞(APC)呈递的形式 施用。由于DC具有强的提呈能力,因此在APC中优选使用DC。
本发明中,“针对非小细胞肺癌的疫苗”是指那些在接种入动物体内时 能够诱导抗-肿瘤免疫或抑制非小细胞肺癌免疫的物质。通常,抗肿瘤免疫 包括下列等免疫应答:
-诱导针对肿瘤的细胞毒淋巴细胞,
-诱导可识别肿瘤的抗体,和
-诱导抗肿瘤细胞因子的生成。
因此,如果具体蛋白接种入动物体内时能够诱导这些免疫应答中的任 意一种,那么就可以认为该蛋白具有抗肿瘤免疫诱导效力。一种蛋白对抗 肿瘤免疫的诱导可以通过体内或体外观察宿主免疫系统针对该蛋白的应答 来检测。
例如,检测诱导细胞毒T淋巴细胞的方法是已知的。进入活体的外来 物质经过抗原呈递细胞(APC)的作用呈递到T细胞和B细胞。对APC以抗 原特异性方式呈递的抗原有反应的T细胞由于受到该抗原的刺激,分化成 细胞毒T细胞(或细胞毒T淋巴细胞,CTL),随后进行增殖(本文中称为T 细胞激活)。因此,具体肽对CTL的诱导可通过由APC将肽呈递到T细胞 来评估,并检测对CTL的诱导。另外,APC能激活CD4+T细胞,CD8+T 细胞,巨噬细胞,嗜酸性粒细胞和NK细胞。因为CD4+T细胞对抗肿瘤免 疫也很重要,所以肽的抗肿瘤免疫诱导作用可利用这些细胞的活化效应作 为指示物进行评价。
用树突细胞(DC)作为APC评价对CTL的诱导作用的方法是本领域已 知的。DC是一种代表性APC,它的CTL诱导活性在APC中最强。在本方 法中,受试多肽首先与DC接触,然后该DC与T细胞接触。与DC接触后 若检测到T细胞对感兴趣的细胞有细胞毒效应,则说明受试多肽具有诱导 细胞毒T细胞的活性。CTL的抗肿瘤活性可利用例如,51Cr-标记的肿瘤细 胞的溶解作为指示进行检测。或者,利用3H-胸苷吸收活性或LDH(乳糖脱 氢酶)-释放作为指示物,评价肿瘤细胞损伤程度的方法也是本领域已知的。
除了DC,外周血单核细胞(PBMC)也可作为APC。有报道当存在 GM-CSF和IL-4时培养PBMC能促进CTL的诱导。类似地,当存在匙孔血 蓝蛋白(keyhole limpet hemocyanin)(KLH)和IL-7时培养PBMC也能诱导 CTL。
经这些方法证实具有CTL诱导活性的受试多肽是具备DC活化效应以 及随后的CTL诱导活性的多肽。因此,诱导抗肿瘤细胞CTL的多肽可用作 抗非小细胞肺癌的疫苗。另外,通过与该多肽接触而获得了诱导抗非小细 胞肺癌的CTL能力的APC也可用作抗非小细胞肺癌的疫苗。此外,由于 APC对多肽抗原的呈递而获得了细胞毒性的CTL也可作为抗非小细胞肺癌 的疫苗。这种利用由APC和CTL造成的抗肿瘤免疫治疗非小细胞肺癌的方 法称作细胞免疫疗法。
通常,当使用多肽进行细胞免疫疗法时,已知联合使用具有不同结构 的多种多肽并将它们与DC接触可以增加CTL诱导的效率。因此,当用蛋 白片段刺激DC时,使用多种类型片段的混合物是有利的。
或者,多肽的抗肿瘤免疫诱导作用可通过观察到诱导抗肿瘤抗体的产 生而证实。例如,当在用多肽免疫的实验室动物中诱导了抗多肽的抗体时, 以及肿瘤细胞的生长、增殖或转移被这些抗体抑制时,则确定该多肽具有 诱导抗肿瘤免疫的能力。
通过给予本发明的疫苗诱导抗肿瘤免疫,并且抗肿瘤免疫的诱导使得 可以治疗和预防非小细胞肺癌。治疗癌症或预防非小细胞肺癌发病包括下 述任意步骤,诸如抑制NSCLC细胞的生长,NSCLC细胞的退化以及抑制 NSCLC细胞的出现。降低非小细胞肺癌患者受试者的死亡率,减少血液中 的NSC标志物,减轻伴随非小细胞肺癌的可检测的症状等,都包括在治疗 或预防非小细胞肺癌的效果中。这种治疗或预防效果优选是统计学上显著 的。例如,在观察中,显著性水平是5%或更低时,将非小细胞肺癌的疫苗 的治疗或预防效果与不给予疫苗的对照组进行比较。如,Student’s t-检验, 曼-惠特尼U-检验或ANOVA都可用来进行统计分析。
上述具有免疫活性的蛋白或者编码该蛋白的多核苷酸或载体可与佐剂 联合。佐剂指当与具有免疫活性的蛋白同时给予(或相继给予)时,能促进针 对该蛋白的免疫反应的化合物。佐剂包括霍乱毒素,沙门氏菌毒素,等, 但并不限于这些。此外,本发明疫苗可与适当的可药用载体联合。这种载 体例如无菌水,生理盐水,磷酸盐缓冲液,培养液等。而且,如果必要, 疫苗可包含稳定剂,混悬剂,防腐剂,表面活性剂等。疫苗全身性或局部 给药。给予疫苗可以是单次给药或通过多次给药进行强化。
当使用APC或CTL作为本发明的疫苗,可例如通过体外方法治疗或预 防非小细胞肺癌。更具体地,收集正接受治疗或预防疗法的受试者的PBMC, 在离体条件下将该细胞与所述多肽接触,诱导APC或CTL之后,再将该细 胞给予受试者。也可通过在离体条件下将编码所述多肽的载体导入PBMC 从而诱导APC。可在给药之前克隆在体外诱导的APC或CTL。通过克隆对 靶细胞有高损伤活性的细胞并使其生长,细胞免疫疗法可以更加有效地进 行。另外,以这种方式分离的APC和CTL可用于细胞免疫疗法,所述疗法 不仅针对所述细胞来源的受试者,也针对其它受试者相似类型的疾病。
用于治疗或预防非小细胞肺癌的药物组合物
本发明提供了用于治疗或预防非小细胞肺癌的组合物,其中含有用本 发明所述方法选出的化合物,该方法用于筛选能改变非小细胞肺癌-相关基 因的表达或活性的化合物。
当将由本发明筛选方法分离的化合物施用给人及其它哺乳动物用于治 疗细胞增生性疾病(例如,非小细胞肺癌)时,可以将所述分离化合物直接给 药或者用常规药物制剂方法配制成剂型,其中所述哺乳动物诸如小鼠、大 鼠、豚鼠、兔子、猫、狗、绵羊、猪、牛,猴子、狒狒或黑猩猩等。本发 明组合物的剂型包括适于口服、直肠、鼻腔、局部(包括面颊和舌下)、阴道 或肠胃外(包括经肌肉内、皮下和静脉内)给药的剂型,或者适于通过吸入或 吹入给药的剂型。可任选地将制剂包装在分离的剂量单位内。
适合于口服的剂型包括胶囊剂、扁囊剂(cachet)或片剂,每一种都含有 预定量的活性成分。剂型还包括粉末、颗粒、溶液、悬液或乳剂。可以选 择以药糖丸(bolus electuary)或药膏的形式给药。口服用的片剂和胶囊剂可以 包含惯用的赋形剂例如粘合剂、填料、润滑剂、崩解剂或润湿剂。可任选 与一种或多种制剂成分一起,通过压制或模制制成片剂。压制片(compressed tablet)可以通过将自由流动形式的例如粉末或颗粒的活性成分压入合适机 器里制成,所述活性成分还可任选与一种结合剂、润滑剂、惰性稀释剂、 润滑剂、表面活性或分散剂混合。模制片(molded tablet)可以用由惰性液态 稀释剂润湿后的粉末化合物在合适机器内进行模制而成。所述片剂可以用 本领域熟知的方法来包被。口服流体制剂的形式可以是,例如,含水或含 油的悬液、溶液、乳剂、糖浆或酏剂,或者可以是无水产物,在使用前用 水或其它合适载体重配。所述液体药剂可以包含惯用的添加剂例如悬浮剂、 乳化剂、无水载体(包括食用油)或者防腐剂。可以任选配制所述片剂使得其 中的活性成分在体内能够缓慢或有控制地释放。片剂的包装可以包括每月 一次的单个药片。这些制剂中药物的剂型或剂量使得这些制备物为所述可 得范围中的合适剂量。
肠胃外给药的剂型包括:含水和无水的无菌注射液,其中含有抗氧 化剂、缓冲液、抑菌剂和使剂型与目的接受者的血液等张的溶质;以及含 水和无水悬液,其中可以包括悬浮剂和稠化剂。所述剂型可以存在于单位 剂量或多剂量容器中,例如密封的安瓿和小瓶,并且可以保存在冷冻干燥(冻 干)条件下,在使用前只需添加无菌液态载体例如盐水、注射用水,即配即 用。可选,所述剂型可以是连续输注的形式。即用即配的注射液和悬液可 以用上述的无菌粉末、颗粒和片剂制备而成。
直肠给药剂的剂型包括带有标准载体的栓剂,例如可可脂(cocoa butter) 或聚乙二醇。口腔局部给药例如经颊或舌下给药用的剂型,包括糖锭 (lozenges),其中含有的活性成分存在于加香基剂(flavored base)例如蔗糖和 阿拉伯胶(acacia)或黄芪胶(tragacath)中;和软锭剂(pastille),其中含有的活 性成分存在于基剂例如白明胶、甘油,蔗糖或阿拉伯胶中。对于活性成分 的鼻内给药,可以使用液体喷雾剂或可分散性粉剂或滴剂。滴剂可以用含水 或非含水的(non-aqueous)基剂配制而成,其中还含有一种或多种分散剂、增 溶剂或悬浮剂。
对于通过吸入给药,所述组合物要能便利地从吹入器、雾化器 (nebulizer)、加压包装(pressured package)或者递送气溶胶喷剂的其它便利器 具中释放出来。加压包装可以包括一种合适推进剂例如二氯二氟甲烷 (dichlorodifluoromethane)、三氯氟甲烷(trichlorofluromethane)、二氯四氟乙 烷(dichiorotetrafluoroethane)、二氧化碳或其它合适气体。就加压气溶胶而言, 可以通过提供一种可定量递送的确定剂量单位。
可选,就吸入或吹入给药而言,所述组合物可以采用干粉组合物的形 式,例如,活性成分和合适的粉末基剂例如乳糖或淀粉的粉末混合物。所 述粉末组合物可以单位剂型存在例如胶囊、药筒(cartridge)、白明胶或发泡 药包(blister pack)中,所述粉末可通过吸入器或吹入器从中给药。
其它剂型包括可植入用具(implantable device)和粘性补片(adhesive patch);它释放治疗药剂。
当需要时,可以采用经改进能持续释放活性成分的上述剂型。所述药 物组合物还可含有其它活性成分,例如抗微生物药剂(antimicrobial agent)、 免疫抑制剂或防腐剂。
应理解,除上面具体提及的成分之外,本发明所述制剂还可包括根据 目的制剂类型的本领域其它惯用药剂,例如,适于口服的制剂可以包括增 香剂。
优选的单位剂量制剂是如下所述含有有效剂量的活性成分或其合适部 分的那些制剂。
对于上述每种疾病,所述组合物例如多肽和有机化合物可通过口服或 注射以约0.1-约250mg/kg/天的用量给药。成人的剂量范围通常为约5mg- 约17.5g/天,优选为约5mg-约10g/天,最优选为约100mg-约3g/天。本发 明以离散单位提供的片剂或其它单位剂型可方便地包含这样的量,使得在 所述剂量或所述剂量的倍数时所述组合物有效,例如每个单位含有约5毫 克-约500毫克,通常为约100毫克-约500毫克。
采用的剂量取决于许多因素,包括受试者的年龄和性别,要治疗的具 体病症及其严重程度。另外,给药途径还可以随病症及其严重程度而变化。
本发明进一步还提供了一种用于治疗或预防非小细胞肺癌的组合物, 其中含有能抑制选自NSC 807-1448中任一基因表达的活性成分。所述活性 成分可以是一种反义-寡核苷酸、针对所述基因的siRNA或核酶,或者所述 反义-寡核苷酸、siRNA或核酶的衍生物,诸如表达载体等。所述活性成分 可通过与一种针对所述衍生物无活性的合适基底材料混合而制成外用制 剂,比如搽剂或膏药。
另外,如果需要,可以通过添加赋形剂、等渗剂、增溶剂、防腐剂、 镇痛剂等将所述活性成分配制为片剂、粉末、颗粒、胶囊、脂质体胶囊、 注射液、溶液、滴鼻剂及冻干药剂。这些可以利用制备含核酸药物的常用 方法制备。
优选地,所述反义-寡核苷酸衍生物,siRNA衍生物或核酶衍生物可以 通过在患处直接用药,或者通过注射入血管从而到达患处而给予患者。另 外,还可以向所述组合物加入封固剂用于增加持久性和膜-可通透性。封固 剂的实施例包括脂质体、聚L-赖氨酸、脂质、胆固醇、脂转染及其衍生物。
所述组合物剂量可以根据患者身体状况适当调整,以所需的量使用。 例如,可施用0.1-100mg/kg,优选0.1-50mg/kg的剂量。
本发明的另一实施方案是一种用于治疗或预防非小细胞肺癌的组合 物,其中含有抗选自NSC 807-1448任一基因所编码多肽的抗体,或能与所 述多肽结合的抗体的片段。
尽管会因症状不同而有所差异,但是当正常成人(重量60公斤)口服用 药时,用于治疗或预防非小细胞肺癌的抗体或其片段的剂量为约0.1毫克- 约100毫克/天,优选为约1.0毫克-约50毫克/天,更优选为约1.0毫克-约 20毫克/天。
当通过注射向正常成人(重量60公斤)以胃肠道外方式给药时,尽管 会因患者疾病、疾病症状和给药方法的不同而有所差异,一般情况下,静 脉内注射量为约0.01毫克-约30毫克/天,优选为约0.1-约20毫克/天,更优 选为约0.1-约10毫克/天。另外,就其它动物来说,可以施用按60kg体重 转换的量。
多肽
根据本发明,提供了新的人基因URLC1(NSC 905),该基因在非小细胞 肺癌中的表达与在相应的非癌组织中相比显著升高。
URLC1(NSC 905)编码一种TUDOR结构域。TUDOR结构域具有RNA 结合和核酸结合功能。这种基因的核苷酸序列如SEQ ID NO:1所示,该基 因编码的氨基酸序列如SEQ ID NO:2所示。
T正是这些基因使得癌细胞具有了致癌活性,所以抑制这些蛋白的活 性可以是一种治疗癌症,特别是非小细胞肺癌的有效手段。
本发明提供了新型人基因,包括选自SEQ ID NO:1的核苷酸序列及 其简并体和突变体,这些基因编码NSC蛋白,包括如SEQ ID NO:2所示的 氨基酸序列,或其功能等效物。在下文中,这些基因编码的多肽统称为NSC 蛋白。NSC蛋白的多肽功能等价物的实例包括,例如,与所述人NSC蛋白 相应的其它生物体的同源蛋白,以及人NSC蛋白的突变体。
本发明中,术语“功能等价物”是指这样的目的多肽,它们具有与任 一种NSC蛋白一样的能促进细胞增殖的活性,而且能赋予癌细胞致癌活性。 可以通过下述方法判断目的多肽是否具有细胞增殖活性:将编码目的多肽 的DNA导入能编码相应多肽的细胞,然后检测所述细胞的增殖或集落形 成活性的升高。
制备指定蛋白的功能等价多肽的方法是本领域技术人员已知的,包括 在蛋白中导入突变的已知方法。例如,本领域技术人员可通过定点诱变在 这些蛋白之一的氨基酸序列中导入合适的突变,来制备人类NSC蛋白的功 能等价多肽(Hashimoto-Gotoh等,Gene 152:271-5(1995);Zoller and Smith, Methods Enzymol 100:468-500(1983);Kramer等,Nucleic Acids Res. 12:9441-9456(1984);Kramer and Fritz,Methods Enzymol 154:350-67(1987); Kunkel,Proc Natl Acad Sci USA 82:488-92(1985);Kunkel,Methods Enzymol 85:2763-6(1988))。氨基酸突变也会自然发生。本发明的多肽包括具有人类 NSC蛋白氨基酸序列的蛋白,其中一或多个氨基酸发生突变,产生的突变 多肽与人类NSC蛋白功能等价。这种突变体中突变氨基酸的数量通常是10 个或更少,优选6个或更少,最优选3个或更少。
已知突变或修饰的蛋白保持原来的生物活性,所述蛋白为具有通过对 具体氨基酸序列的一或多个氨基酸残基进行取代,缺失,插入和/或添加修 饰而成的氨基酸序列的蛋白(Mark等,Proc Natl Acad Sci USA 81:5662-6 (1984);Zoller and Smith,Nucleic Acids Res 10:6487-500(1982); Dalbadie-McFarland等,Proc Natl Acad Sci USA 79:6409-13(1982))。
被突变的氨基酸残基优选突变为不同的氨基酸,其氨基酸侧链的性质 是保守的(即保守氨基酸取代过程)。氨基酸侧链的性质例如疏水性氨基酸(A, I,L,M,F,P,Y,V),亲水性氨基酸(R,D,N,C,E,Q,G,H,K,S,T),以及侧 链带有下述功能基团或具有共有性质:脂肪族侧链(G,A,V,L,I,P);含有羟 基的侧链(S,T,Y);含有硫原子的侧链(C,M);含有羧酸和酰胺的侧链(D,N, E,Q);含碱基的侧链(R,K,H);含芳香基的侧链(H,F,Y,W)。注意,括号中 的字母是指氨基酸的单字母密码。
在人NSC蛋白的氨基酸序列中添加了一或多个氨基酸残基的多肽的例 子是包含人NSC蛋白的融合蛋白。融合蛋白是人NSC蛋白与其它肽或蛋白 的融合体,并且包括在本发明的范围。可用本领域技术人员熟知的技术制 备融合蛋白,如将编码本发明人NSC蛋白的DNA与编码其它肽或蛋白的 DNA连接,使编码框匹配,将该融合DNA插入表达载体并在宿主细胞中 表达。对于与本发明蛋白融合的肽或蛋白没有限制。
可用作与本发明NSC蛋白进行融合的已知的肽包括,例如FLAG(Hopp 等,Biotechnology 6:1204-10(1988)),含6个His(组氨酸)残基的6×His,10 ×His,流感血凝素(Influenza agglutinin)(HA),人c-myc片段,VSP-GP片段, p18HIV片段,T7-标记,HSV-标记,E-标记,SV40抗原片段,lck标记, α-微管蛋白片段,B-标记,蛋白C片段及类似物。可与本发明蛋白融合的 蛋白包括例如GST(谷胱甘肽-S-转移酶),流感血凝素(HA),免疫球蛋白恒 定区,β-半乳糖苷酶,MBP(麦芽糖结合蛋白)等。
融合蛋白可如下制备:将编码上述融合肽或蛋白的可购得DNA,与编 码本发明NSC多肽的DNA融合,并表达制备的融合DNA。
本领域中已知另一分离功能等价多肽的方法是例如,使用杂交技术的 方法(Sambrook等,Molecular Cloning 2nd ed.9.47-9.58,Cold Spring Harbor Lab.Press(1989))。本领域技术人员可以很容易地分离与NSC蛋白(即SEQ ID NO:1)高度同源的DNA,并从分离的DNA中分离人NSC蛋白的功能等 价多肽。本发明NSC蛋白包括由这样的DNA所编码的多肽,所述NDA与 编码人NSC蛋白的DNA序列的全部或部分杂交,并且本发明多肽与人NSC 蛋白的功能等价。这些多肽包括与衍生自人的蛋白对应的哺乳动物同源物 (例如,猴,鼠,兔和牛基因编码的多肽)。当从动物分离与编码人NSC蛋 白DNA高度同源的cDNA时,具体优选使用来自肺癌的组织。
本领域技术人员可以常规选择用来分离编码人NSC蛋白功能等价多肽 的DNA的杂交条件。例如,杂交如下进行:用“Rapid-hyb缓冲液”在68℃ 预杂交30min或更长,加入标记探针,68℃保温1h或更长。随后的洗涤步 骤可在例如低严谨条件进行。低严谨条件是,例如42℃,2×SSC,0.1%SDS, 或优选50℃,2×SSC,0.1%SDS。更优选,采用高严谨条件。高严谨条件是, 例如室温、于2×SSC,0.01%SDS中洗涤3次每次20min,随后37℃,于1 ×SSC,0.1%SDS中洗涤3次每次20min,然后50℃,于1×SSC,0.1%SDS 洗涤2次每次20min。虽然一些因素如温度和盐浓度会影响杂交的严谨性, 本领域技术人员可以适当的选择这些因素以获得必要的严谨度。
可利用基因扩增方法如聚合酶链式反应(PCR)代替杂交,来分离编码 NSC蛋白功能等价多肽的DNA,使用根据编码该蛋白的DNA的序列信息 (SEQ ID NO:1)合成的引物。
通过上述杂交技术或基因扩增技术分离的DNA编码的人NSC蛋白的 功能等价多肽通常与人NSC蛋白的氨基酸序列高度同源。“高度同源”通常 指40%同源性或更高,优选60%或更高,更优选80%或更高,甚至优选 95%或更高。多肽的同源性可用“Wilbur and Lipman,Proc Natl Acad Sci USA 80:726-30(1983)”的算法确定。
本发明多肽的氨基酸序列,分子量,等电点,糖链的存在或缺失,或 形态可能发生变异,这取决于制备该多肽所使用的细胞或宿主或使用的纯 化方法。不过,只要它的功能等同于本发明的人NSC蛋白,它就属于本发 明的范围。
可用本领域技术人员熟知的方法以重组蛋白或天然蛋白的形式制备本 发明的多肽。重组蛋白如下制备:将编码本发明多肽的DNA(例如,含SEQ ID NO:1的核苷酸序列的DNA)插入合适的表达载体,将该载体导入合适的 宿主细胞,获得提取物,使用其上固定有抗本发明蛋白抗体的柱或联合使 用多个上述柱,对该提取物进行层析从而纯化所述多肽,所述层析如离子 交换层析,反相层析,凝胶过滤或亲和层析。
当本发明多肽在宿主细胞(例如动物细胞和大肠杆菌)中被表达为与谷 胱甘肽-S-转移酶蛋白融合的融合蛋白或附加了多个组氨酸的重组蛋白时, 该表达的重组蛋白可用谷胱甘肽柱或镍柱纯化。或者,当本发明的多肽被 表达为c-myc、多组氨酸或FLAG标记的蛋白时,其可分别使用抗c-myc、 His或FLAG抗体检测和纯化。
纯化该融合蛋白后,还可能通过按需切除凝血酶或因子Xa除去与受试 多肽不同的区域。
分离天然蛋白可采用本领域技术人员已知的方法,例如与亲和柱接触, 其中与下述NSC蛋白结合的抗体与表达本发明多肽的组织或细胞的提取物 相结合。所述抗体可以是多克隆抗体或单克隆抗体。
本发明还包括本发明多肽的部分肽。该部分肽含有本发明NSC蛋白的 特异性氨基酸序列,并由至少7个氨基酸,优选8个或更多氨基酸,更优 选9个或更多氨基酸组成。所述部分肽可用于,例如制备抗本发明NSC蛋 白的抗体,筛选与本发明NSC蛋白结合的化合物,筛选本发明NSC蛋白的 促进剂(accelerator)或抑制剂。
可通过基因工程方法,已知的肽合成方法,或用合适的肽酶消化本发 明多肽来制备本发明的部分肽。对于肽合成,可使用例如固相肽合成或液 相肽合成。
此外,本发明提供了编码本发明NSC蛋白的多核苷酸。本发明的NSC 蛋白可用于在体内或体外制备上述本发明的NSC蛋白,或者应用于疾病的 基因治疗,所述疾病归因于编码本发明多肽的基因的遗传异常。可利用本 发明多核苷酸的任意一种形式,只要它编码本发明的NSC蛋白或其等价物, 所述形式包括mRNA,RNA,cDNA,基因组DNA,化学合成的多核苷酸。本 发明的多核苷酸包括含有给定核苷酸序列的DNA及其简并序列,只要形成 的DNA编码本发明的NSC蛋白或其等价物。
可用本领域技术人员已知的方法制备本发明的多核苷酸。例如,本发 明的多核苷酸可如下制备:从表达本发明NSC蛋白的细胞中制备cDNA文 库,用本发明DNA的部分序列(如SEQ ID NO:1)作为探针进行杂交。cDNA 文库可依照Sambrook等,Molecular Cloning,Cold Spring Harbor Laboratory Press(1989)描述的方法制备;或者也可以使用可购得的cDNA文库。cDNA 文库还可如下制备:从表达本发明NSC蛋白的细胞中提取RNA,根据本发 明DNA序列(如SEQ ID NO:1)合成寡DNA,以该寡DNA为引物进行PCR, 扩增编码本发明NSC蛋白的cDNA。
另外,通过测序获得的cDNA的核苷酸序列,可以常规的确定cDNA 编码的翻译区,也就可以容易地获得本发明NSC蛋白的氨基酸序列。而且, 用获得的cDNA或其部分作为探针筛选基因组DNA文库,可以分离基因组 DNA。
更具体地,可以首先从表达本发明受试NSC蛋白的细胞,组织或器官 中制备mRNA。用已知的方法分离mRNA;例如用胍超速离心(guanidine ultracentrifugation)(Chirgwin等,Biochemistry 18:5294-9(1979))或AGPC方 法(Chomczynski and Sacchi,Anal Biochem 162:156-9(1987))制备总RNA。 另外,用mRNA纯化试剂盒(Pharmacia)从总RNA中纯化mRNA。或者,用 QuickPrep mRNA纯化试剂盒(Pharmacia)直接纯化mRNA。
利用逆转录酶从获得的mRNA合成cDNA。cDNA的合成可使用可购 得的试剂盒,如AMV逆转录酶第一链cDNA合成试剂盒(Seikagaku Kogyo)。 或者,用5’-RACE方法合成并扩增cDNA(Frohman等,Proc Natl Acad Sci USA 85:8998-9002(1988);Belyavsky等,Nucleic Acids Res 17:2919-32 (1989)),其中使用本文所述的引物,5’-Ampli FINDER RACE试剂盒 (Clontech)以及聚合酶链式反应(PCR)。
从PCR产物制备所需的DNA片段并与载体DNA连接。重组载体用于 转化大肠杆菌等,并从选出的集落中制备所需的重组载体。通过常规方法 验证所需的DNA的核苷酸序列,例如双脱氧核苷酸链终止法 (dideoxynucleotide chain termination)。
考虑到用于表达的宿主细胞中的密码子利用频率,设计本发明多核苷 酸的核苷酸序列,使其更有效地表达(Grantham等,Nucleic Acids Res 9:43-74 (1981))。可用商品化试剂盒或常规方法改变本发明多核苷酸的序列。例如, 可用限制酶消化,插入合成的寡核苷酸或合适的多核苷酸片段,增加接头, 或插入起始密码子(ATG)和/或终止密码子(TAA,TGA或TAG)来改变所述序 列。
具体地,本发明的多核苷酸包括含有SEQ ID NO:1的核苷酸序列的 DNA。
另外,本发明提供了多核苷酸,其在严谨条件下与具有SEQ ID NO:1 所示核苷酸序列的多核苷酸杂交,并编码上述与本发明NSC蛋白功能等价 的多肽。本领域技术人员可以适当选择严谨条件。例如,可采用低严谨条 件。更优选,可采用高严谨条件。这些条件与前文所述条件相同。上述用 于杂交的DNA优选cDNA或染色体DNA。
载体及宿主细胞
本发明还提供了其中插入了本发明上述多核苷酸的载体。本发明的载 体用于在宿主细胞中保留本发明的多核苷酸具体是DNA、用于表达本发明 的NSC蛋白,或用于给予本发明的多核苷酸进行基因治疗。
当以大肠杆菌作为宿主细胞并在大肠杆菌中(例如JM109,DH5α, HB101或XL1Blue)大量的扩增和生产载体时,该载体应当具有在大肠杆菌 中扩增的“复制起始点ori”,以及用于筛选转化的大肠杆菌的标记基因(例 如,通过例如氨卡青霉素,四环素,卡那霉素,氯霉素等药物进行筛选的 抗药基因)。例如,可使用M13系列载体,pUC系列载体,pBR322,pBluescript, pCR-Script等等。另外,也可使用pGEM-T,pDIRECT和pT7来进行亚克隆 及提取cDNA和上述载体。当利用载体制备本发明的NSC蛋白时,表达载 体特别有用。例如,在大肠杆菌中表达的表达载体应当具备上述性质以便 在大肠杆菌中扩增。当以大肠杆菌如JM109,DH5α,HB101或XL1Blue作为 宿主细胞时,载体应当具有启动子,如lacZ启动子(Ward等,Nature 341:544-6 (1989);FASEB J 6:2422-7(1992)),araB启动子(Better等,Science 240: 1041-3(1988)),或T7启动子等,它们能在大肠杆菌中有效的表达所需的基 因。在这方面,可使用例如pGEX-5X-1(Pharmacia),“QIAexpress system” (Qiagen),pEGFP和pET(在这种情况中,宿主优选表达T7 RNA聚合酶的 BL21)代替上述载体。另外,该载体还可包含蛋白分泌的信号肽序列。指导 NSC蛋白分泌到大肠杆菌周质的信号肽序列的实例是pelB信号序列(Lei等, J Bacteriol 169:4379(1987))。将所述载体导入靶宿主细胞的方法包括,例如 氯化钙法和电穿孔法。
除了大肠杆菌,还可利用例如哺乳动物表达载体(如pcDNA3(Invitrogen) 和pEGF-BOS(Nucleic Acids Res 18(17):5322(1990)),pEF,pCDM8),昆虫细 胞表达载体(如“Bac-to-BAC杆状病毒表达系统”(GIBCO BRL),pBacPAK8), 植物表达载体(如pMH1,pMH2),动物病毒表达载体(如pHSV,pMV, pAdexLcw),逆转录病毒表达载体(如pZIpneo),酵母表达载体(毕赤酵母(如 “Pichia)表达试剂盒”(Invitrogen),pNV11,SP-Q01),枯草杆菌(Bacillus subtilis) 表达载体(如pPL608,pKTH50)制备本发明的多肽。
为了在动物细胞如CHO,COS或NIH3T3细胞中表达所述载体,该载 体应当具有在这些细胞中表达所必需的启动子,例如SV40启动子 (Mulligan等,Nature 277:108(1979)),MMLV-LTR启动子,EF1α启动子 (Mizushima等,Nucleic Acids Res 18:5322(1990)),CMV启动子等,并优选具 有用于筛选转化体的标记基因(如,经药物(例如新霉素,G418)选出的抗药 基因)。已知具备这些性质的载体包括,例如pMAM,pDR2,pBK-RSV, pBK-CMV,pOPRSV和pOP13。
制备NSC蛋白
本发明还提供了制备本发明NSC蛋白的方法。可通过培养宿主细胞来 制备所述NSC蛋白,所述宿主细胞含有包含编码所述NSC蛋白的基因的表 达载体。根据需要采用方法使所述基因稳定表达,同时增加细胞中该基因 的拷贝数。例如,将含有互补DHFR基因的载体(如pCHO I)导入核酸合成 途径被缺失的CHO细胞,然后由甲氨蝶呤(MTX)进行扩增。另外,当瞬时 表达基因时,可采用下述方法:将含有SV40复制起始点的载体(pcD等)转 化入COS细胞,该细胞染色体包含SV40 T抗原表达基因。
如上所述获得的本发明NSC蛋白可以从宿主细胞内或外(如培养基)分 离,并纯化为基本纯的均质的多肽。本文给定多肽所用的术语“基本纯” 是指该多肽基本上与其它生物大分子分离。基本纯的多肽指干重至少75% (如至少80,85,95,或99%)是纯的。用合适的标准方法测定纯度,所述方法 例如柱层析,聚丙烯酰胺凝胶电泳或HPLC分析。多肽分离纯化的方法并 不限于任何具体方法;事实上,可采用任何标准方法。
例如,可以适当选择并联合使用柱层析,过滤,超滤,盐沉淀,溶剂 沉淀,溶剂提取,蒸馏,免疫沉淀,SDS-聚丙烯酰胺凝胶电泳,等电点电 泳,透析和重结晶以分离纯化所述NSC蛋白。
层析的实例包括,例如亲和层析,离子交换层析,疏水层析,凝胶过 滤,反相层析,吸附层析等(Strategies for Protein Purification and Characterization:A Laboratory Course Manual.Ed.Daniel R.Marshak等,Cold Spring Harbor Laboratory Press(1996))。这些层析法可以液相层析如HPLC 和FPLC进行。因此,本发明提供了上述方法制备的高纯度的多肽。
在纯化之前或之后用合适的蛋白修饰酶处理本发明的NSC蛋白,可任 选修饰或部分缺失所述多肽。有用的蛋白修饰酶包括、但不限于胰蛋白酶, 糜蛋白酶,赖氨酰内肽酶,蛋白激酶,糖苷酶等等。
抗体
本发明提供了与本发明NSC蛋白结合的抗体。本发明的抗体可以任意 形式如单克隆抗体或多克隆抗体进行使用,并且包括用本发明NSC蛋白免 疫动物如兔获得的抗血清,所有类型的多克隆和单克隆抗体,人抗体以及 通过基因重组制备的人源化抗体。
以本发明NSC蛋白作为抗原可以从任何动物种系获得抗体,但优选从 哺乳动物诸如人、小鼠或大鼠,更优选从人获得抗体。来自人的NSC蛋白 可从本文所述的核苷酸或氨基酸序列获得。如本发明所述,用作免疫抗原 的多肽可以是完整的NSC蛋白或NSC蛋白的部分肽。部分肽包括,例如本 发明NSC蛋白的氨基端(N)或羧基端(C)片段。
本文中,抗体定义为与本发明NSC蛋白的全长或其片段反应的蛋白。
将编码本发明NSC蛋白或其片段的基因插入到已知的表达载体,然后 用该载体转化本文所述的宿主细胞。用任意标准方法从宿主细胞内或外回 收所需NSC蛋白或其片段,并随后将所述NSC蛋白或其片段用作抗原。或 者,以表达该NSC蛋白的整个细胞或其裂解物或化学合成多肽作为抗原。
用所述抗原免疫任意哺乳动物,但优选考虑与用于细胞融合的亲本细 胞的相容性。通常使用啮齿目(Rodentia),兔类(Lagomorpha)或灵长类 (Primates)的动物。啮齿目动物包括,如小鼠,大鼠和仓鼠。兔类动物包括 兔。灵长类动物包括,例如狭鼻猿(Catarrhini)(东半球猴(old world monkey)) 如Macaca fascicularis,恒河猴(rhesus monkey),狒狒(sacred baboon)和黑猩 猩(chimpanzee)。
用抗原免疫动物的方法是本领域中已知的。腹腔注射或皮下注射抗原 是免疫动物的标准方法。更具体地,可以用适量的磷酸盐缓冲液(PBS),生 理盐水等稀释和悬浮抗原。如果需要,将抗原悬液与适量的标准佐剂如福 氏(Freund’s)完全佐剂混合,形成乳液,然后给予哺乳动物。优选,将与适 量福氏完全佐剂混合的抗原每4至21天给药数次。也可使用合适的载体进 行免疫。上所述免疫后,用标准方法检验血清中所需的抗体数量的增加。
本发明NSC蛋白的多克隆抗体可如下制备:从经免疫的动物(该动物经 检测其血清中所需的抗体增加)收集血液,用任意常规的方法从所述血液中 分离血清。多克隆抗体包括含多克隆抗体的血清且可从所述血清中分离含 有该多克隆抗体的级分。利用例如与本发明NSC蛋白偶联的亲和层析柱, 从仅识别本发明NSC蛋白的级分制备免疫球蛋白G或M,随后进一步用蛋 白A或蛋白G柱纯化该级分。
为制备单克隆抗体,从用所述抗原免疫、并且如上述经检测血清中所 需抗体水平增高的动物中收集免疫细胞,并进行细胞融合。用于细胞融合 的免疫细胞优选荻自脾。其它待与上述免疫细胞融合的优选亲本细胞包括, 例如哺乳动物骨髓瘤细胞,更优选具备获得的特性以便用药物筛选融合细 胞的骨髓瘤细胞。
根据已知的方法。如Milstein等(Galfre and Milstein,Methods Enzymol 73: 3-46(1981))的方法将上述免疫细胞与骨髓瘤细胞融合。
通过在标准选择性培养基诸如HAT培养基(含次黄嘌呤,氨基蝶呤和胸 苷的培养基)等中进行培养来选择细胞融合所得的杂交瘤。通常,细胞培养 物在HAT培养基中连续培养数天至数周,该时间要足以使除了所需的杂交 瘤细胞之外的所有其它细胞(非融合的细胞)死亡。然后,以标准有限稀释法 筛选并克隆生产所需抗体的杂交瘤细胞。
除了上述以抗原免疫非人动物制备杂交瘤的方法外,人淋巴细胞诸如 EB病毒感染的淋巴细胞也可在体外用NSC蛋白,表达NSC蛋白的细胞或 其裂解物进行免疫。然后,被免疫的淋巴细胞与能模糊分裂的(indefinite dividing)、人来源的骨髓瘤细胞诸如U266融合,以获得产生可与所述NSC 蛋白结合的所需人抗体的杂交瘤细胞(未审查的日本专利申请(Unexamined Published Japanese Patent Application No.)(JP-A)Sho 63-17688)。
获得的杂交瘤细胞随后移植到小鼠的腹腔,并抽提腹水。获得的单克 隆抗体可通过,例如硫酸铵沉淀、蛋白A或蛋白G柱、DEAE离子交换层 析或偶联了本发明NSC蛋白的亲和柱进行纯化。本发明的抗体不仅可以用 于纯化和检测本发明的NSC蛋白,还可以作为本发明NSC蛋白的候选激动 剂和拮抗剂。另外,该抗体可应用于本发明NSC蛋白相关疾病的抗体治疗, 所述疾病包括非小细胞肺癌。当将获得的抗体给予人体(抗体治疗)时,优选 人抗体或人源化抗体以降低免疫原性。
例如,用抗原诸如NSC蛋白,表达NSC蛋白的细胞或其裂解物的来 免疫具有人抗体基因库的转基因动物。然后从该动物收集产生抗体的细胞, 将其与骨髓瘤细胞融合获得杂交瘤,从该杂交瘤制备抗所述多肽的人抗体 (参见WO92-03918,WO93-2227,WO94-02602,WO94-25585,WO96-33735和 WO96-34096)。
或者,用癌基因使产生抗体的免疫细胞如经免疫的淋巴细胞永生化, 用于制备单克隆抗体。
如此获得的单克隆抗体也可以利用基因工程技术通过重组方法制备 (参见,如Borrebaeck and Larrick,Therapeutic Monoclonal Antibodies, published in the United Kingdom by MacMillan Publishers LTD(1990))。例如, 可从免疫细胞,如产生抗体的杂交瘤或经免疫的淋巴细胞来克隆编码该抗 体的DNA,将该DNA插入合适的载体,并转入宿主细胞制备重组抗体。 本发明还提供了如上所述制备的重组抗体。
另外,本发明的抗体可以是抗体片段或修饰的抗体,只要它结合一或 多种本发明的NSC蛋白。例如,所述抗体片段可以是Fab,F(ab’)2,Fv或单 链Fv(scFv),其中H链和L链的Fv片段通过合适的接头连接(Huston等,Proc Natl Acad Sci USA 85:5879-83(1988))。更具体地,抗体片段可用酶如木瓜 蛋白酶或胃蛋白酶处理抗体而生成。或者可构建编码该抗体片段的基因, 将其插入合适的表达载体,并在适合的宿主细胞中表达(参见,如Co等,J Immunol 152:2968-76(1994);Better and Horwitz,Methods Enzymol 178: 476-96(1989);Pluckthun and Skerra,Methods Enzymol 178:497-515(1989); Lamoyi,Methods Enzymol 121:652-63(1986);Rousseaux等,Methods Enzymol 121:663-9(1986);Bird and Walker,Trends Biotechnol 9:132-7 (1991))。
抗体可通过与各种分子,如聚乙二醇(PEG)连接进行修饰。本发明提供 了这种修饰的抗体。也可通过化学修饰抗体而获得修饰的抗体。这些修饰 方法是本领域常规的。
或者,本发明的抗体可作为嵌合抗体而获得,所述嵌合抗体可变区来 自非人抗体而恒定区来自人抗体;或者作为人源化抗体而获得,所述人源 化抗体包括来自非人抗体的互补决定区(CDR),来自人抗体的框架区(FR)以 及恒定区。通过利用已知技术制备这种抗体。
如上所述获得的抗体可以纯化成均质的。例如,以用于普通蛋白的分 离纯化方法进行抗体的分离纯化。例如,抗体可通过适当地选择并联合使 用柱层析来分离及纯化,所述层析诸如亲和层析,过滤,超滤,盐析,透 析,SDS-聚丙烯酰胺凝胶电泳及等电聚焦(Antibodies:A Laboratory Manual. Ed Harlow and David Lane,Cold Spring Harbor Laboratory(1988))等,但不限 于此。蛋白A柱和蛋白G柱可用作亲和柱。可利用的示例性蛋白A柱包括, 如Hyper D,POROS和Sepharose F.F.(Pharmacia)。
除了亲和层析,层析的实例还包括,如离子交换层析,疏水层析,凝 胶过滤,反相层析,吸附层析等(Strategies for Protein Purification and Characterization:A Laboratory Course Manual.Ed.Daniel R.Marshak等,Cold Spring Harbor Laboratory Press(1996))。层析过程可以通过液相层析诸如 HPLC和FPLC等实施。
例如,通过测定吸光度,酶联免疫吸附分析(ELISA),酶免疫分析(EIA), 放射免疫分析(RIA)和/或免疫荧光来测定本发明抗体的抗原结合活性。 ELISA中,本发明的抗体固定在平板上,本发明的NSC蛋白加于平板上, 然后施加含有所需抗体的样品(诸如产生抗体的细胞的培养上清或纯化的抗 体)。接着施加识别第一抗体并用酶诸如碱性磷酸酶标记的第二抗体,温育 所述平板。洗涤后,向平板添加酶底物如磷酸对硝基苯酯,测定吸光度以 评价样品的抗原结合活性。NSC蛋白的片段,如C末端或N末端片段也可 用作抗原来评价抗体的结合活性。根据本发明,可用BIAcore(Pharmacia)评 价抗体的活性。
上述方法可以检测或测定本发明的NSC蛋白,这是通过将本发明的抗 体暴露于推定含有本发明NSC蛋白的样品,检测或测定抗体和蛋白形成的 免疫复合物。
因为本发明所述的检测或测定NSC蛋白的方法可以特异性的检测或测 定所述蛋白,所以该方法能用于各种使用了蛋白的实验。
下列实例的给出是为了阐述本发明,帮助本领域普通技术人员实施和 利用本发明。所述实施例无论如何都不应该对本发明的范围构成限制。
除另有说明外,本申请中的所有科技术语的都具有与本发明所属领域 普通技术人员通常理解相同的含义。尽管与本申请中描述类似或等同的方 法及材料都可用于实施或检验本发明,但是下文仍还是对合适的方法和材 料进行了描述。本申请中引用的任一专利、专利申请和出版物在此引入作 为参考。
实施本发明的最佳方式
本发明通过下列实施例进行了详细阐述,但是本发明决不局限于这些 实施例。
对获自患病组织(例如,来自非小细胞肺癌的上皮细胞)和正常组织的组 织进行评估从而鉴定出在疾病状态例如非小细胞肺癌中差异表达的基因。 所述实验操作如下。
[实施例1]通用方法
(1)患者及组织样品
遵照知情同意原则,从接受了肺叶切除术(lobectomy)的37个患者(15 个女性和22个男性,46-79岁;平均年龄为66.0)获取原代(primary)肺癌组 织。从病案记录中获得临床信息,根据组织病理学亚型及病理学家分级对 每一肿瘤进行诊断;37个肿瘤中的22个归类为腺癌,14个为SCC,佘下 的1个为腺鳞癌。根据UICC TNM分级标准判断每一肿瘤的临床阶段。将 所有样品立即冷冻并包埋入TissueTek OCT介质(medium)(Sakura,Tokyo, Japan),然后保存于-80℃。
(2)激光-俘获显微切割(laser-capture microdissection),RNA提取和基 于T7的RNA扩增
使用激光-俘获显微切割(Kitahara et al.,Cancer Res 61:3544-9(2001)) 从所保存的样品选择性收集癌细胞。按照此前描述的方法(Okabe et al., Cancer Res 61:2129-37(2001))完成总RNA的提取和基于T7的扩增。作为 对照探针,以同样方法扩增正常人肺聚(A)RNA(CLONTECH)。来自每种癌 组织和对照的扩增的RNA(aRNA)的每份均为2.5-μg的等分试样,分别在 Cy5-dCTP和Cy3-dCTP存在的条件下进行逆转录。
(3)cDNA微阵列的制备
为了获得用于在载玻片上点样的cDNA,用此前描述的方法对每一种 基因进行RT-PCR扩增(Kitahara et al.,Cancer Res 61:3544-9(2001))。用 Microarray Spotter Generation III(Amersham Biosciences)将PCR产物点样于 玻片上。将4,608个基因以一式两份的方式点在单个载玻片上。制备5套不 同的载玻片(总共23,040个基因),每一套都点有相同的52个持家基因以及 2种阴性对照基因。
(4)杂交和数据的获得
按照此前的描述进行杂交、洗涤和检测(Yanagawa et al.,Neoplasia 3: 395-401(2001))。调整每个靶斑点(target spot)的Cy5(肿瘤)和Cy3(对照)的荧 光强度,使得所述52个持家基因的平均Cy3/Cy5比等于1。源自低信号强 度的数据不可靠。因此,测定每一载玻片上信号强度的截留值(cut-off value)。 当Cy3和Cy5染料发出的信号强度都低于该截留值时,将这样的基因排除 在进一步分析之外。
(5)根据基因-表达图谱对37个NSCLC进行群集分析(cluster analysis)
对基因和肿瘤都用分级群集(hierachical clustering)方法进行分析。为了 获得所述37个样品的可复制集群,选出899个基因,这些基因已经在95% 的实验中获得了可信数据,而且其表达比值变化的标准偏差大于1.0。使用 M.Eisen编制的软件(″Cluster″和″Tree View″)进行分析,该软件可从网站获 得(http://genome-www5.stanford.edu/MicroArray/SMD/restech.html)。在应用 群集算法(clustering aligorithm)之前,将每一斑点的荧光比值转化为对数 值,然后对每一样品的数据向中位数集中(median-centere)以排除实验的偏 差。
[实施例2]利用非小细胞肺癌细胞中临床相关表达模式鉴定基因
使用从所有37个NSCLC样品的表达图谱获得的数据,应用二维分 级群集算法分析样品和基因间的相似度。当Cy3-或Cy5-荧光强度低于所 述截留值时,将这样的基因排除在进一步的分析之外,如前所述(yanagawa et al.,Neoplasia 3:395-401(2001)),选出在95%以上受试病例中获得了可 信值的基因。将观察(observed)标准偏差<1.0的基因也排除在外。对通过这 种截留滤纸的899个基因作进一步的分析。
在样品轴(横轴)上,将来自37个病例的39份样品(对2个病例作一式两 份平行测定以验证实验方法的再现性和可靠性)根据它们的表达图谱划分为 2个主组(major group)。树状图显示了个体病例表达模式之间的相似性。分 支越短,相似性就越高。在独立实验中被标记并杂交的2个重复病例(第6 号和12号)在同一组中最为接近。根据所述分析,是所述基因分群为相邻的 一排排基因,其中每排基因是相同的且所述基因被点在载玻片不同的位置 上(数据未显示)。37个病例中,22个腺癌病例分入了一个主组,14个SCC 病例分入了另一个主组。唯一的腺鳞细胞癌(第25号)分入了SCC群。显然, 腺癌和SCC看来具有特定且不同的基因表达图谱,这可能揭示了病因学差 异的分子特性。
为了搜索NSCLC中表达下调的基因,对在70%以上的NSCLC中的表 达降低了<0.2倍或更低的基因进行了筛选。鉴定了806个在NSCLC中表 达下调的基因,这些基因可能具有肿瘤抑制功能因而可能可用于将来的基 因治疗(参见,表1)。总共鉴定了582个上调的基因,其Cy5/Cy3比值在50% 以上的NSCLC中大于5.0(表2)。在该表中,在70%以上的NSCLC中表达 高5倍的基因是潜在的诊断标记,在50%以上的病例中具有5倍的过表达 的基因是药物的潜在靶标。作为药物的靶标,数据存在于33%-50%的病例 的基因也被选出,并且还测定了在90%以上的NSCLC中显示高5倍的表达 的60中基因(表3)。进一步选择的标准如下:(1)血清中可检测的肿瘤标记: 仅在人睾丸、卵巢和4份胎儿组织中显示表达的基因;(2)痰中可检测的肿 瘤标记:在气道组织(即,肺、气管和唾液腺)中无表达的基因;以及(3)治 疗的靶标:在人最重要脏器如肝和肾中无表达的基因。利用含有23,040个 人基因的cDNA微阵列,从25份成人及4份胎儿人组织的表达图谱获得了 这些基因的正常组织分布数据。
[实施例3]用于抑制非小细胞肺癌细胞生长的分子靶标的鉴定和定性
为了对那些可调节癌细胞生长、增殖和存活的新分子靶标进行鉴定和 定性,如下应用反义S-寡核苷酸技术选择靶基因。
(1)全长序列的鉴定
使用Marathon cDNA扩增试剂盒(BD Biosciences Clontech,Palo Alto, CA,USA),按照生产商推荐的方法,通过数据库筛选及cDNA的5′快速扩 增,对Cy5/Cy3信号强度比值较高的基因的全长序列进行测定。用所述试 剂盒中的基因-特异性反向引物和AP1引物,从人睾丸mRNA(BD Biosciences Clontech)合成cDNA模板。用ABI PRISM 3700 DNA测序仪 (Applied Biosystems,Foster City,CA,USA),按照生产商说明测定核苷酸 序列。
(2)Northern印迹分析
将被选用于在微阵列实验上进行研究的每种基因的相应32P标记的 PCR产物,与人多-组织印迹(BD Biosciences Clontech)进行了杂交。按照生 产商推荐的方法进行预杂交、杂交和洗涤。-80℃下将所述印迹在增感屏上 放射自显影24-168小时。
为了测定每种基因的组织分布和大小,使用人cDNA作为探针进行人 多组织northern印迹分析(图4),从每种基因得到的结果如下:
NSC 807:单一的(single)4.4kb mRNA,发现于胎盘和睾丸;
NSC 810:单一的3.1kb mRNA,发现于睾丸;
NSC 811:2.4和2.7kb mRNA,发现于胎盘和舌,并且在′肾、肝、肾上 腺、膀胱、脑(全)、淋巴结、前列腺、胃、甲状腺和气管中检测到了弱表达;
NSC 822:单一的1.3kb mRNA,发现于心、肝和睾丸;
NSC 825:单一的4.3kb mRNA,发现于睾丸和脊髓;
NSC 841:2.8kb转录物的弱表达发现于心、肾上腺、脑(全(whole))、 淋巴结、脊髓、胃、甲状腺、舌和气管;
NSC 849:单一的1.4kb mRNA,发现于胎盘、前列腺和气管;
NSC 855:3.6kb mRNA,发现于胎盘、前列腺和气管;
NSC 859:2.1kb转录物的弱表达发现于骨骼肌和淋巴结;
NSC 885:单一的5.0kb mRNA,发现于睾丸;
NSC 895:单一的1.5kb mrna,发现于胎盘、胃和气管;
NSC 903:单一2.7kb mRNA发现于睾丸,并且在胸腺、小肠、结肠和 骨髓中检测到了弱表达;
NSC 904:单一的4.4kb mRNA,发现于睾丸和骨骼肌;
NSC 905:单一2.5kb mRNA,发现于心、骨骼肌、肝、胃和舌,并且 在胎盘和甲状腺中检测到了弱表达;
NSC 915:单一的1.5kb mRNA,发现于睾丸;
NSC 948:单一3.8kb mRNA,发现于肾、肝、胎盘、胃、甲状腺、舌 和气管;
NSC 956:单一的2.1kb mRNA,发现于心、骨骼肌、睾丸、胃、甲状 腺和′肾上腺,并且在肝、胰腺、胸腺、前列腺和脊髓中检测到了弱表达;
NSC 994:单一的3.3kb mRNA,发现于骨骼肌和睾丸,并且在心、肝 和胰腺中检测到了弱表达;
NSC 1000:单一3.5kb mRNA,发现于脑、胰腺、前列腺和睾丸,并且 在胃、脊髓和肾上腺中检测到了弱表达;
NSC 1066:单一的3.6kb mRNA,发现于骨骼肌和睾丸;
NSC 1075:单一的1.9kb mRNA,发现于睾丸;
NSC 1107:单一的2.2kb mRNA,发现于睾丸;
NSC 1131:1.6kb和1.4kb的转录物,发现于睾丸;
NSC 1141:单一的2.9kb mRNA,发现于胎盘,并且在骨骼肌和睾丸中 检测到了弱表达;
NSC 1164:单一的5.2kb mRNA,发现于脑和肾上腺;
NSC 1183:单一的2.0kb mRNA,发现于骨骼肌和心;
NSC 1201:心、骨骼肌、脊髓、前列腺、睾丸、甲状腺、脾、淋巴结、 气管和肾上腺中发现的弱表达的7.8kb转录物;
NSC 1240:胃、脊髓和淋巴结中发现的弱表达的5.7kb转录物;
NSC 1246:单一的1.4kb mRNA,发现于睾丸;
NSC 1254:单一的3.0kb mRNA,发现于睾丸;
NSC 1265:3.0kb转录物的弱表达,发现于胃中;
NSC 1277:单一的1.8kb mRNA,发现于睾丸;
NSC 1295:单一的3.5kb mRNA,发现于白细胞、淋巴结和骨髓;
NSC 1306:单一的7.4kb mRNA,发现于心和骨骼肌;
NSC 1343:单一的4.7kb mRNA,发现于胎盘和骨骼肌;
NSC 1362:单一的3.6kb mRNA,发现于脑和全脑;
NSC 1389:单一的0.9kb mRNA,发现于舌;
NSC 1399:单一的0.9kb mRNA,发现于胎盘;
NSC 1406:单一的2.4kb mRNA,发现于心、骨骼肌和前列腺;
NSC 1413:单一的4.0kb mRNA,发现于肝和前列腺;
NSC 1420:单一的2.8kb mRNA,发现于睾丸。
(2)半定量的RT-PCR分析
对50%以上的NSCLC中的mRNA表达水平升高5倍或更多倍的情况 用半定量的RT-PCR进行验证,如上所述(Akashi et al.Int J Cancer 88:873-80 (2000))。使用Trizol试剂(Life Technologies,Inc.Gaithersburg,MD,USA), 按照生产商推荐的方法,从培养的细胞和临床组织提取总RNA。提取的RNA 的用DNase I(Roche Diagnostics,Basel,Switzerland)处理,然后使用寡聚(dT) 12-18引物用Superscript II反转录酶(Life Technologies,Inc.)反转录为单链的 cDNA。通过监测β-肌动蛋白(ACTB)或β-2-微球蛋白(microglobulin)基因 (B2M)作为定量对照,对每一种单链cDNA都进行适当稀释用于后续的PCR 扩增。所有反应都在GeneAmp PCR system 9700(Applied Biosystems)上进 行,使用以下方案:94 ℃初始变性2min;接着以94℃、30秒,58-62℃、 30秒和72℃、45秒,进行18个(对于ACTB或B2M)或25-30个循环(对 于本发明每种基因)。所述引物序列见表4。
表4:用于半定量RT-PCR实验的引物序列 NSC 编号 代号 RT-PCR引物 SEQ ID NO: 807 KOC1 F 5′-TAAATGGCTTCAGGAGACTTCAG-3′ 3 R 5′-GGTTTTAAATGCAGCTCCTATGTG-3′ 4 810 TTK F 5′-ATGGAATCCGAGGATTTAAGTGGCAGAGAATTGA- 3′ 5 R 5′-TTTTTTTCCCCTTTTTTTTTCAAAAGTCTTGGAGGA T-3′ 6 811 SDC1 F 5′-GCTTCCTCCTGGAAATTGAC-3′ 7 R 5′-TCTACTGTACAGGGAAAAACCCA-3′ 8 812 NMB F 5′-AGTCGTGGTTCAGAAGTTACAGC-3′ 9 R 5′-TCTCTTACCAAATGCTGTTGAGC-3′ 10 816 PIR51 F 5′-CATCTGGCATTTCTGCTCTCTAT-3′ 11 R 5′-CTCAGGGAAAGGAGAATAAAAGAAC-3′ 12 820 HMMR F 5′-GAAGTATCAAAACTCCGCTGTCA-3′ 13 R 5′-ATGCTGAGTAGACATGCAGATGA-3′ 14 822 F 5′-CGGTATGCTAATGAAGATGGAGA-3′ 15 R 5′-CACAGGGTATCAGCAACTGTGTA-3′ 16 824 BPAG1 F 5′-AGAAGTATCTGAGCCCCTGATG-3′ 17 R 5′-GTCTAACCTCCCAGCTGTTCC-3′ 18 825 ANLN F 5′-GCTGCGTAGCTTACAGACTTAGC-3′ 19 R 5′-AAGGCGTTTAAAGGTGATAGGTG-3′ 20 830 F 5′-GTTTGCAACCAGGAGATACAAAG-3′ 21 R 5′-GCTGTGAGGTACAACAAATCACA-3′ 22 837 F 5′-CCTCCTTTCCCTAGAGACTCAAT-3′ 23 R 5′-AGAAGCAACAGCAAGACCACTAC-3′ 24 840 GNAS F 5′-TTGCCTATGAAAGATAGGTCCTG-3′ 25 R 5′-GTTTTAATGCCCAGATAGCACAG-3′ 26 841 URLC2 F 5′-AGGAGAAGTTGGAGGTGGAAA-3′ 27 R 5′-CAGATGAAAGATCCAAATTCCAA-3′ 28 842 KIAA0887 F 5′-TCCACGACTTCTTATTCTCCTTG-3′ 29 R 5′-CATTTCTTTTAGGGACTGGGGTA-3′ 30 846 F 5′-GAGAAACTGAAGTCCCAGGAAAT-3′ 31 R 5′-CTGATACTTCCATTCGCTTCAAC-3′ 32 849 GJB5 F 5′-AGCTAAGCCATGAGGTAGGG-3′ 33 R 5′-CGCATGTGTGTTCTTCTATGA-3′ 34 850 F 5′-CCAAGACAGGCAGAGTAGGTAAA-3′ 35 R 5′-CATTTTCATTGTGATCAGCCAG-3′ 36 853 F 5′-TGTATGGGGGATTACCTACACAC-3′ 37 R 5′-AAAGGAGCACAACAAACATGC-3′ 38 854 F 5′-TGTCCAAGGAGTCTGAAGTTCTC-3′ 39 R 5′-CTTGCCACCATACCTTTATTCTG-3′ 40 855 LNIR F 5′-CGAGAGAGTAGGAGTTGAGGTGA-3′ 41 R 5′-CAGAAATCCAGCAGATTTCAGAC-3′ 42 857 TIGD5 F 5′-GAACAGGTGGCTGTGTTCCT-3′ 43 R 5′-ATAGAATCAAGTGGTGTGCTTCG-3′ 44 859 URLC3 F 5′-CTGAGACTTTGAGTCCTTGGGAG-3′ 45 R 5′-TTCCTCATTTCTCTCAGTAACCG-3′ 46 861 KIAA0251 F 5′-AACAATGCAAAGTAGTGCTCCTC-3′ 47 R 5′-GCTGAACTTCTTTATGCTCTTCG-3′ 48 864 F 5′-ACCTTTGATTTTAGACTGAGGGC-3′ 49 R 5′-ACACTGGGTTGTGTGTTATTTCC-3′ 50 870 F 5′-ATGAGCCTCTCATCCATGTCTTT-3′ 51 R 5′-AGTAAGAGTCTGCCTGAGACACG-3′ 52 871 KIAA1929 F 5′-AGAAAATGGGGGTGCAAGTAG-3′ 53 R 5′-TAACCAAATTAACACGTGCTGG-3′ 54 872 LOC51659 F 5′-AGAAAAGTTGGAGAAGATGAGGG-3′ 55 R 5′-GCCACCTCTGTGAGAGAGTCTAA-3′ 56 881 FLJ20068 F 5′-AGAACTAGTGTGACCCCACCC-3′ 57 R 5′-GCTTGCCTTTTCCCTTAGTAGG-3′ 58 882 GUCY1B2 F 5′-AGGGAAATGAAGACAGGAGAACT-3′ 59 R 5′-GAGACACGGCTTAAGAAGTTTTG-3′ 60 884 RAD51 F 5′-GCTTGTAAAGTCCTCGGAAAGTT-3′ 61 R 5′-ATCTCAACTCTGCATCATCTGGT-3′ 62 885 BAG5 F 5′-ATAAGAGAAATATTGGCCATCG-3′ 63 R 5′-GCAAGCGTAAGAGACTGGTTTTA-3′ 64 889 HSPC150 F 5′-CAAATATTAGGTGGAGCCAACAC-3′ 65 R 5′-TAGATCACCTTGGCAAAGAACAC-3′ 66 892 F 5′-ACACACAGAGAGGAGGAAGTCT-3′ 67 R 5′-GAGTCTTTATGGAGCTGTGTCA-3′ 68 893 MPHOSP H1 F 5′-CAGGCCAAGTGATTTTAATGG-3′ 69 R 5′-CAATACAGGATGCAAGTTCCAA-3′ 70 895 FAM3D F 5′-ACAGCCCAGACACAAACAAATAC-3′ 71 R 5′-ACCCCATTCTCTCCACAGAC-3′ 72 896 PRO0971 F 5′-TACAGGCCAGGATAGAAACACTC-3′ 73 R 5′-GTTCAAATATTGAAAGGGCCAC-3′ 74 898 URLC7 F 5′-AGTTATGGGTTCCTGTGTGCTTA-3′ 75 R 5′-AAAGGCCTGTTCACAAGCTAAGT-3′ 76 901 MAN1B1 F 5′-CTCGTGAAGCCTCAGATGTCC-3′ 77 R 5′-CTCCACCGAAAAGACCCATTC-3′ 78 902 ALDOC F 5′-AGCGTACACCCTCTGCACTTG-3′ 79 R 5′-TTTGCTGTATGGTATGTACTCAAGG-3′ 80 903 URLC9 F 5′-CAGAAGAGAGAGGAGAGAACACG-3′ 81 R 5′-GAGGTTATCTCTGATGGAACCAA-3′ 82 904 F 5′-CTTGAAGAAGAACTTCCAGACGA-3′ 83 R 5′-AATGTTCTAAAGATGAGAGGGGG-3′ 84 905 URLC1 F 5′-AGGAGGCTGCTGGTACAAATACT-3′ 85 R 5′-GCAGGAAATACAGCAGGAACATA-3′ 86 909 FLJ10468 F 5′-ATTCATTCTGGACCAAAGATCC-3′ 87 R 5′-TCTACTGTGGACAAGAAGCCTGT-3′ 88 912 SRD5A1 F 5′-GTGATCTCTTCAAGGTCAACTGC-3′ 89 R 5′-CCAGATGAGATGATAAGGCAAAG-3′ 90 915 URLC10 F 5′-ATTCGCTACTGCAATTTAGAGG-3′ 91 R 5′-GTTTAATGCAACAGGTGACAACG-3′ 92 917 KIAA1096 F 5′-CACTTGGATTCCTTGCTTGTTAC-3′ 93 R 5′-GGGAAAAAGTATGCAACACTCAG-3′ 94 920 CHAF1A F 5′-AGGCGATGACCTGAAGGTACTG-3′ 95 R 5′-CAATAGGCCAGCAATCTCAATA-3′ 96 921 AKR1B11 F 5′-AGGTTCTGATCCGTTTCCATATC-3′ 97 R 5′-ATCTTTACATCCTCAGTGTTGGC-3′ 98 924 F 5′-GAAGACAAATGGTGTCCACAAA-3′ 99 R 5′-CCACTGGAAGTTTTCTTCGTACA-3′ 100 929 KIAA0101 F 5′-TTCGTTCTCTCCTCTCCTCTCTT-3′ 101 R 5′-GGCAGCAGTACAACAATCTAAGC-3′ 102 930 F 5′-CAGCACAGAGTAGGTGAACACAG-3′ 103 R 5′-CCTCAGTACATTTTCAACCCATC-3′ 104 933 F 5′-AGGATGATGAGGATGACTGAAGA-3′ 105 R 5′-GAATGGGCCTCTATCTGGTATCT-3′ 106 934 CIT F 5′-TGTGTCTCATCTGTGAACTGCTT-3′ 107 R 5′-TTCGTGTTACGGTATATCCTGCT-3′ 108 936 AF15Q14 F 5′-CTTCTGTTCCGTAAACTCCTTGA-3′ 109 R 5′-CAATTGTGTACTCCAAACCCAA-3′ 110 938 FLJ13852 F 5′-GCCCTTCCAACTTGTCCTTAAC-3′ 111 R 5′-GCCTCTTTATTCCCATCTCCTTA-3′ 112 940 KIAA1443 F 5′-GAACAGATCACTGGTTTACCTCG-3′ 113 R 5′-ATCTTTCAGTAACAGACCTCCCC-3′ 114 944 F 5′-ACAAGATGGCTAGCTCAAAAGTG-3′ 115 R 5′-CAACACGTGGTGGTTCTAATTT-3′ 116 947 PKP3 F 5′-ATGCAGGACGGTAACTTCCTGC-3′ 117 R 5′-TGGGCCCAGGAAGTCCTCCTT-3′ 118 948 KCNK5 F 5′-CCCAACATGTGAAGACAGTGAT-3′ 119 R 5′-CCTGTCCACCTCATGTTTTATTG-3′ 120 956 SIAHBP1 F 5′-GCTGAAGTGTACGACCAGGAG-3′ 121 R 5′-CACCTTTATCCGCACTGTAGG-3′ 122 957 F 5′-AAAGCTGATGAGGACAGACCAG-3′ 123 R 5′-GGCAGAGGCACAATCATTTTAG-3′ 124 958 F 5′-GAAGAGAATGCAGGTGTTGAGTT-3′ 125 R 5′-GTCCACAGCATTCATAAAACAGG-3′ 126 963 F 5′-CTCCTCAGTGTCCACACTTCAA-3′ 127 R 5′-GTTACTTGCAGCCAAAAGCAG-3′ 128 964 AK3 F 5′-AGTCTCTCCTTTTCAGACATCCC-3′ 129 R 5′-TCCATAAAGTCAGACCAGCAGTT-3′ 130 965 ENC1 F 5′-CCTTCTGGGAGGACAGACTTT-3′ 131 R 5′-TTTCTCTTCATTAGACTTGGCCTCT-3′ 132 966 F 5′-AACCTAGCCTCCCTTCAAACTTA-3′ 133 R 5′-GAGACAGGATGGAAAAATCTGTG-3′ 134 970 F 5′-CCTTTCCTGACCCTTTTAGTCTT-3′ 135 R 5′-CAAATCCTGTATTTCTCACAGGC-3′ 136 972 LOC51690 F 5′-GAAAAAGGAGAGCATCTTGGACT-3′ 137 R 5′-AAAGGAAAATGCTTCCGTTCC-3′ 138 973 HAS3 F 5′-TAATGTAGGATGACAGGCTCTCC-3′ 139 R 5′-CCAATTGTATAAAGGCTCTTCCC-3′ 140 974 PYCR1 F 5′-AGGACAACGTCAGCTCTCCTG-3′ 141 R 5′-TCCACTATTCCACCCACAGTAAC-3′ 142 975 FLJ12517 F 5′-GACCGAGAGTCCAGCATTTTT-3′ 143 R 5′-ACTGAACAGAGCAGACAGAAACC-3′ 144 980 ANKT F 5′-CTGCTGTTATTACCCCATTCAAG-3′ 145 R 5′-GTGAGTGACAGATGGCAATTACA-3′ 146 984 MLL3 F 5′-CTCGGGTAGAATTTGATGACAAC-3′ 147 R 5′-GCTGGTAAAGCAGGTGTAAAAGA-3′ 148 989 FOXM1 F 5′-CCCTGACAACATCAACTGGTC-3′ 149 R 5′-GTCCACCTTCGCTTTTATTGAGT-3′ 150 990 WFDC2 F 5′-CTCTCTGCCCAATGATAAGGAG-3′ 151 R 5′-GAAACTTTCTCTCCTCACTGCTC-3′ 152 991 DOLPP1 F 5′-CAGAAGTTTTGAGGACTGAACTG-3′ 153 R 5′-CCGACCTACCTTCCCTAGAAAT-3′ 154 994 DKFZp43 4E2318 F 5′-GGGGTTTTGAAGGATGTGTACTT-3′ 155 R 5′-TATGAGGCCATTCTGCACATTA-3′ 156 1000 PSK-1 F 5′-GGGAGTATGAAGTTTCCATCTG-3′ 157 R 5′-GGATGCTGGTTTATTTACTGTAGG-3′ 158 1002 LOC55565 F 5′-AATATGGAATCCCTACCCACAGT-3′ 159 R 5′-TTTGACTTCACAACTTCATGGG-3′ 160 1003 F 5′-GAGGCCATTTTAGTTCTGAGGTT-3′ 161 R 5′-CTTTACTGCATATGGATTCTGGG-3′ 162 1004 BUB1B F 5′-TCAACCTCAAGTTAAAGGAACG-3′ 163 R 5′-AGGGAAAAGTAGAGACAAATGGG-3′ 164 1005 F 5′-TCTAGGCAAAGTGGAAGTCAAAG-3′ 165 R 5′-CTCCTAGAGAAATGGGTTGGATT-3′ 166 1012 FLJ12428 F 5′-ATACACTGAATGTGGAAGAACCG-3′ 167 R 5′-GGGCACACAATTTCATGTAGTCT-3′ 168 1015 PHB F 5′-AGACATTGCATACCAGCTCTCAT-3′ 169 R 5′-CCTTTACTTCCTTCACTTTAAGCC-3′ 170 1016 F 5′-GTAACAAACGCCACCTTACACTC-3′ 171 R 5′-TTCTGTTCTTGCAACTGAGTCCT-3′ 172 1018 F 5′-ACCTCCAGTAAAAGTTTCTTCCG-3′ 173 R 5′-GTAAATTCAGCTTCAAACCCTGG-3′ 174 1023 CLDN2 F 5′-CATTGAGCCTTCTCTGATCACTC-3′ 175 R 5′-GCACTGTTACAGATAGTCTGGGG-3′ 176 1026 F 5′-TATCAGTAACTGCTCCGTGTTCA-3′ 177 R 5′-GGTCTGTCATTGACCAAAACATC-3′ 178 1027 F 5′-TCCTGAATAAAGGCCTAGTACCC-3′ 179 R 5′-AAACCAGAATCCAACACTACCCT-3′ 180 1030 F 5′-GAGCCCTCTCCACATTTCTATTT-3′ 181 R 5′-ACACTGAAACGTGATGGGTAACT-3′ 182 1034 SSBP F 5′-GACATGAGTCCGAAACAACTACC-3′ 183 R 5′-ATGAGACTGTACCAAATGATGGC-3′ 184 1037 CSTA F 5′-TGATACCTGGAGGCTTATCTGAG-3′ 185 R 5′-GACTCAGTAGCCAGTTGAAGGAA-3′ 186 1038 CLDN1 F 5′-TCTTGCAGGTCTGGCTATTTTAG-3′ 187 R 5′-TATATTTAAGGAGCACCCCTTCC-3′ 188 1047 SLC7A5 F 5′-ACAAGCAAGTGCATTTTCAGTC-3′ 189 R 5′-GAACAGGGTAGCCATTAACACAA-3′ 190 1049 S100A8 F 5′-TCTATCATCGACGTCTACCACAA-3′ 191 R 5′-GCTACTCTTTGTGGCTTTCTTCA-3′ 192 1052 S100P F 5′-GCATGATCATAGACGTCTTTTCC-3′ 193 R 5′-GATGAACTCACTGAAGTCCACCT-3′ 194 1057 FDXR F 5′-TCTCCAGGACAAGATCAAGGA-3′ 195 R 5′-GTTTTATTTCCAGCATGTTCCC-3′ 196 1058 FEN1 F 5′-AGAGCTGATCAAGTTCATGTGTG-3′ 197 R 5′-ACATAGCAAGTTCGAGTTTCTGC-3′ 198 1059 TCF19 F 5′-GAGCTGGAGGTAGGAATACAGGT-3′ 199 R 5′-CAATAGTTTGGCTTGGTGTAAGG-3′ 200 1064 PAFAH1B 3 F 5′-CTCCTCTGCATGCACTTAACTTT-3′ 201 R 5′-GAGAGTTTAATGTTGTGGGAAGG-3′ 202 1066 MCM8 F 5′-CCGGGCAATAAAGTAACTCTTG-3′ 203 R 5′-GTATTTGTCTGTATGCCTACATCTG-3′ 204 1067 FLJ10052 F 5′-TCTGCGTATCTTGAGTGCTTACA-3′ 205 R 5′-ACAGAGATGTGGTGGTGCTAGTT-3′ 206 1071 F 5′-AGCAGAGGATCAGAGCTTTCTTT-3′ 207 R 5′-AGAAAAGGTGTGAACAGAGTTGC-3′ 208 1072 FLJ13163 F 5′-AGAGCCATAGAAACTGCTCCTCT-3′ 209 R 5′-CATAACTGCATAGACAGCACGTC-3′ 210 1075 URLC4 F 5′-TACCTGCTCTATGTGGGTGCT-3′ 211 R 5′-CCTCAGAACTCTCAGTTTATTCCTG-3′ 212 1077 F 5′-ATAAGCCACAGAGACAAACCAGA-3′ 213 R 5′-GGGAGGTTATTTTCACAGAACAC-3′ 214 1078 UBCH10 F 5′-GAGTTCCTGTCTCTCTGCCAAC-3′ 215 R 5′-TAATATACAAGGGCTCAACCGAG-3′ 216 1086 TCF20 F 5′-GTCATAGCTGTGTCCTGGGTC-3′ 217 R 5′-CTATTTTATCCCCATGGCAGAGT-3′ 218 1089 KIAA0802 F 5′-CAGATATTCTGTATGCTGGAGGG-3′ 219 R 5′-CCATCTCAGAAGGGCTTTATTTC-3′ 220 1090 LOC51243 F 5′-GATTTCCATACTTCGGGAGAAAC-3′ 221 R 5′-TATCAGATGCCACACATACGAGA-3′ 222 1103 KCNK1 F 5′-ATGGAACAAAGAAGCTGTGACC-3′ 223 R 5′-GGGTACATGCAAACCAGTACAC-3′ 224 1107 URLC8 F 5′-TGAACAGTTTGCTGGTCTTG-3′ 225 R 5′-AATGTCAGGTTGGGGAGTTA-3′ 226 1109 ZNF259 F 5′-TTCTGGACAGACGGAGAGACTAC-3′ 227 R 5′-AGTGATGACATACCCCTGGTTC-3′ 228 1113 URLC5 F 5′-CAAGACTTCTCAGATCCTTGGG-3′ 229 R 5′-ACTCACATGTGGAAGTGTTCCTT-3′ 230 1116 KIAA0852 F 5′-TCAAGCAATATGAAGTAGGGCTC-3′ 231 R 5′-AACACAAATGTCCCGTGTAAGTC-3′ 232 1121 F 5′-CTGCCTCTTACTCGTCACAGTTT-3′ 233 R 5′-TGACTTCTTTGAAGTGAAGGCT-3′ 234 1125 LOC51256 F 5′-CCCTAGTTTTTGTAGCTGTCGAA-3′ 235 R 5′-GATCACATGCCAAGAACACAAT-3′ 236 1131 SYNJ2BP F 5′-CTACGTACCTGGGTGCCTATATC-3′ 237 R 5′-GTCCTCTTATAAGGCTCACTCCC-3′ 238 1133 F 5′-GATGTTAGAGACTCCTTCACCCA-3′ 239 R 5′-CGGTATTCTTAACACATCTTGCC-3′ 240 1136 TRAF2 F 5′-GTGTCTGCGTATCTACCTGAACG-3′ 241 R 5′-ATAACTCTGTCTTCGTGAGCTGG-3′ 242 1141 URLC11 F 5′-GTATTTGGCTTACTGTCCCAAAC-3′ 243 R 5′-CTAGGAAGAAATCATGCTGGGTT-3′ 244 1142 NAPG F 5′-CAGTTTGAGCAAGCAAAAGATG-3′ 245 R 5′-CGGATATCCCTAATCTATTCCCA-3′ 246 1157 NINJ2 F 5′-GACAGTATAGCTGCCCTTGCTC-3′ 247 R 5′-AAGCAGTGGGGTAGAGTCAGAAC-3′ 248 1162 IMP-2 F 5′-ACAGAAGAAGCTACCTCAGGTGT-3′ 249 R 5′-CTAGCGGAAGACAATTCAGAAC-3′ 250 1164 NPTX1 F 5′-TAACCTTGATAGAAGAACCTTGG-3′ 251 R 5′-GCAAATGAGACAAAATTGGGAC-3′ 252 1167 DKFZp76 2M136 F 5′-ATCTCCACTCTACGGCCTTTTAC-3′ 253 R 5′-TAATGACTTAAACACCAGCACGG-3′ 254 1169 FLJ12892 F 5′-GTGTTCTCCTAATCCCAGAACCT-3′ 255 R 5′-AAGAGTTGTGGCCTATTACCTCC-3′ 256 1173 F 5′-TGGTCCTACTAAGAGAATGCAGC-3′ 257 R 5′-AGCCATTAGGAAAAAGAGCAGAG-3′ 258 1176 RANBP7 F 5′-GACTGCTATACTCCAACTCTGGG-3′ 259 R 5′-GCCAAAGACATGGTTTAGTCATAC-3′ 260 1183 BYSL F 5′-ACACTGAGCTTTAATGGCTGAAG-3′ 261 R 5′-TCCACAGTGACCTGACACAATAG-3′ 262 1184 SURF6 F 5′-GTCCTCATTCCCTTTCTGTTCC-3′ 263 R 5′-CTGTTTTCTTTCAACCTGCACTC-3′ 264 1185 URLC6 F 5′-AAGAGAGGCCAGAAACTGAGC-3′ 265 R 5′-AACTAGCAGCTTTATTGCCCTTC-3′ 266 1191 COX17 F 5′-GTGGACATCTAATTGAGGCC-3′ 267 R 5′-GAAGATCTTCCACTAGTAATATT-3′ 268 1195 LOC51250 F 5′-CAGAGGACTCTGATGAAGAAAGC-3′ 269 R 5′-TTTCCACAAACGCTAAGAGAAC-3′ 270 1196 F 5′-ATGTCTGCTCCGTGAGTGTCT-3′ 271 R 5′-GCAAATCCTACTTTCAACTGCAC-3′ 272 1201 SLC7A1 F 5′-GCCTTAAAGCTGGACACAGAAG-3′ 273 R 5′-CTCCAGACACCATTGCTTAAATC-3′ 274 1205 FLJ20657 F 5′-AGACTTTAAAATCCCACCTGGAC-3′ 275 R 5′-CACCCAGCCTTCTCTTTATTTTC-3′ 276 1207 D19S1177 E F 5′-AGGGGATTCTGGAACTGAATG-3′ 277 R 5′-TTATACCGAGGAGATGGGAAAGT-3′ 278 1210 F 5′-GTTGCAGTACCAATCCTTTCTTG-3′ 279 R 5′-GTCCTATGTTAATTTCCACCAAGC-3′ 280 1214 DGSI F 5′-TATCCAGAGGGTGTCCCTGAC-3′ 281 R 5′-GTTCTTTAATGACAGTTCAAGGGG-3′ 282 1234 F 5′-ATCGGATCGATATTACACAGCA-3′ 283 R 5′-CCCATCAGGGAAACAAAGATTA-3′ 284 1236 HSPC135 F 5′-TGCATCTGTAACTTCAGGAGGAT-3′ 285 R 5′-TCCATCAACTTACCTATCGATGC-3′ 286 1237 F 5′-AAACCTACGAACGCCTTTTCTAC-3′ 287 R 5′-GGTATCACAGGAGCACCAATAAA-3′ 288 1238 FSP-2 F 5′-CTTTCTGTTGCTTTCCCAGTAGA-3′ 289 R 5′-TTGATACATTACACTGGTGGCAG-3′ 290 1240 FLJ00159 F 5′-ACCCACAGAACTGGGAGTGAG-3′ 291 R 5′-ATTTTACTGCAGAAACGGGTTG-3′ 292 1242 LRP6 F 5′-GATGGGGAAACTATGACTAATGAC-3′ 293 R 5′-GGTATCAATAAAGCCCAGATATTCC-3′ 294 1246 SUPT3H F 5′-TTAGTGGATCTGGCTCTTCTTGT-3′ 295 R 5′-CAGGCACATCACAGTTGTCAC-3′ 296 1247 MGC5585 F 5′-GATTTGGAACTTGGAAGGAGTG-3′ 297 R 5′-ACTTCAGTCACCCAAAACAACAG-3′ 298 1250 F 5′-CGGGAGGATTGTAAGATACTGTG-3′ 299 R 5′-ACTTCTCATGAGTTCAGCCTCAG-3′ 300 1254 FLJ10815 F 5′-GTGAGTATTCCTCCGTTAGCTT-3′ 301 R 5′-CAGGGAGAAGAGAAAACATCAC-3′ 302 1265 SLC28A2 F 5′-AGCTGAAGCTGACTGTGTCT-3′ 303 R 5′-AGGCACAGACGGTATTGTTGTAG-3′ 304 1271 F 5′-GACTTTCAAACAACCCAGTGTCT-3′ 305 R 5′-CTCTAGCCAGCTTCTTCCTCAC-3′ 306 1273 FLJ32549 F 5′-GGTCTTCATACGCTGTACTTGCT-3′ 307 R 5′-TATGCCTTCACTGATCCACCTAC-3′ 308 1277 F 5′-TCCTGTGGAAATAGAACTGTCGT-3′ 309 R 5′-CACAAAGTTCAAGGAAGCAGTCT-3′ 310 1279 TOM1 F 5′-AAGGTTCTCTACCGCCTCAAGT-3′ 311 R 5′-CTGAACACACCGTGGCTTTAT-3′ 312 1288 PTGFRN F 5′-AAGAAGCCACCACTATTCCTCTC-3′ 313 R 5′-CCTGAAGGACTGAAAAGGTCATA-3′ 314 1289 F 5′-CCTGTCTCCAAAGGAAAAACAA-3′ 315 R 5′-CTCAGTTTCATCAAGTCCTTTGC-3′ 316 1290 GALNT2 F 5′-AGCGAGGAGAACTCTTGAAATC-3′ 317 R 5′-GTGTCCCACCATAGAAAACTTC-3′ 318 1292 C17orf26 F 5′-GAAGCCAGCCTACTCCTTCTTAC-3′ 319 R 5′-TAGCATTCACAGAGCAGGAGATT-3′ 320 1293 PPAT F 5′-CATATGTGGAGGTGCTGTGTAAA-3′ 321 R 5′-GTCTACAGTTAGACAGGGAAGCC-3′ 322 1294 MED6 F 5′-GACAGCTCTTGGATCCCTATTTT-3′ 323 R 5′-AGAGTGAACTTGCATCTGTTCCT-3′ 324 1295 ADAM8 F 5′-GTGTGTGTACGTGTCTCCAGGT-3′ 325 R 5′-CAGACAAGATAGCTGACTCTCCC-3′ 326 1299 KIAA0720 F 5′-GAAGTCTGGGGGTGTTGGTCT-3′ 327 R 5′-ATAAAGACTTGTCTAGACTCCACTGGG-3′ 328 1302 LOC51754 F 5′-GAACAGTGTTTGGTCTGGAATGT-3′ 329 R 5′-GGATATGAGAAAGGAAGGCAAGT-3′ 330 1306 ABCA4 F 5′-ATCGTGAGCATCATCAGAGAAG-3′ 331 R 5′-AGACACACAGACAAACATGCAGA-3′ 332 1309 F 5′-GCACTACCCAGACATCTTCGAG-3′ 333 R 5′-TGGGTGGCAAGTCTAATCTATTC-3′ 334 1310 FJX1 F 5′-GATCCGAAGAAACTGGCTACTG-3′ 335 R 5′-AGGTCCTGCTCTCTTTGTCCTAT-3′ 336 1315 F 5′-GAGTCTTCCCCATTTTCAGTCAT-3′ 337 R 5′-CTACATTTATGTGGCACGAAGG-3′ 338 1320 F 5′-CTTTGGCTTATTTACAGAGCTGG-3′ 339 R 5′-AGGAGGCTAAAGGCAATGAATAG-3′ 340 1321 TXN F 5′-GAGTCTTGAAGCTCTGTTTGGTG-3′ 341 R 5′-AACATCCTGACAGTCATCCACAT-3′ 342 1323 F 5′-AGTGTCTGCAACCTTGCTTTAAC-3′ 343 R 5′-AGTCCAGGGCATAAAACCTAAAC-3′ 344 1325 FACL5 F 5′-ATGTGTGTGTGTTCATCTTCCAG-3′ 345 R 5′-ATCCATTTTCTCACAAGCAGTG-3′ 346 1328 CDC20 F 5′-GGGGAATATATATCCTCTGTGGC-3′ 347 R 5′-AAAAACAACTGAGGTGATGGGT-3′ 348 1337 MVD F 5′-ATGAAGGACAGCAACCAGTTC-3′ 349 R 5′-CAATGCTGGTTTATTCCCCAT-3′ 350 1342 RBX1 F 5′-GTGAAAAAGTGGAATGCAGTAGC-3′ 351 R 5′-TTAGGTAACAGCAGGGAAAGTCA-3′ 352 1343 GPR49 F 5′-CAGTCCTGTGACTCAACTCAA-3′ 353 R 5′-CGAGTTTCACCTCAGCTCTTCT-3′ 354 1345 HT002 F 5′-GGATGTAGCAATCTCCACCAGT-3′ 355 R 5′-GTTCAAACACTCACTGAAGAGCC-3′ 356 1350 AREG F 5′-CTCCACTCGCTCTTCCAACAC-3′ 357 R 5′-CTTTTTACCTTCGTGCACCTTT-3′ 358 1353 F 5′-GACAGCAAAGTCTTGACTCCTTC-3′ 359 R 5′-AAAGTGGCTGGGAGTAAGGTATC-3′ 360 1362 SCAMP5 F 5′-AGGGCACACATTCATCTTTGTA-3′ 361 R 5′-GTTACCAAAGACAGACACATTGG-3′ 362 1371 LOC56755 F 5′-CTCAGCAAGAGAAGAACCGTTTA-3′ 363 R 5′-CCACTTAGAAATCGAATACGTCC-3′ 364 1375 F 5′-TACCCAAGTCAGAAAGACTCTGC-3′ 365 R 5′-GGTGGCCTTCTCTCAAAATTAGT-3′ 366 1377 F 5′-CGCTGATAATATTCCTCGTCCTA-3′ 367 R 5′-AGTTTTTAGAGTTTCAGGGGGTC-3′ 368 1378 LTBP3 F 5′-CTCCCTAGGGGTAGACTCTTCTG-3′ 369 R 5′-GAGACTAGGCCTCTTTTCTGGAT-3′ 370 1384 KIAA0810 F 5′-TTCCAGCTATTCTTCAGATGCTC-3′ 371 R 5′-TATATGGCAGGTTTGTGTGTCTG-3′ 372 1389 NMU F 5′-ATGCTGCGAACAGAGAGCTG-3′ 373 R 5′-AATGAACCCTGCTGACCTTC-3′ 374 1390 F 5′-TGAGTCTCCTCTTGGTGATTCTG-3′ 375 R 5′-GGAAGAGCAAAGAGAGCTTCATC-3′ 376 1391 PITX1 F 5′-GCTCAAGTCCAAACAGCACTC-3′ 377 R 5′-ACATACACAGGGACGCTGTAAAC-3′ 378 1394 FLJ10156 F 5′-TCCTAGGGGACTCTTGAGCTTAG-3′ 379 R 5′-ATAAATAGGTACCCGTGAGCCC-3′ 380 1395 FBN2 F 5′-TATGTGCTACCCACAACACCTC-3′ 381 R 5′-GTTTGAGAGGAACAACCAGGAG-3′ 382 1398 DKFZP58 6C1324 F 5′-AGTCTTGGTTTACCTGTGGTGAC-3′ 383 R 5′-AAAACAAAACCCCAGAAACCC-3′ 384 1399 DLX5 F 5′-GGGACTACTGTGTTTTGCTGTTC-3′ 385 R 5′-TGAGGTCATAGATTTCAAGGCAC-3′ 386 1403 FOP F 5′-TAATAGTACCAGCCATCGCTCAG-3′ 387 R 5′-ATCCTACGGCTTTATTGACACCT-3′ 388 1406 LOC51654 F 5′-CAGCCAGTTCTCAGACACTTAGG-3′ 389 R 5′-GTACTCGAGCCATCTGGCCTT-3′ 390 1407 F 5′-ACTTTTGTGGTGTCCCCAAGTA-3′ 391 R 5′-CTGTGTACCCTTTACCCATTCCT-3′ 392 1410 F 5′-ACTAGAGAAATGAGGGGCGTATC-3′ 393 R 5′-ATCTCTAACCAAACATCGTAGCG-3′ 394 1412 HSPC157 F 5′-CTGAGGCAGCTTTATTTCCTACA-3′ 395 R 5′-ACTGGTGGGGTTACATAACCTTT-3′ 396 1413 F 5′-GGTAGTGAAATATGGACAAAGGACA-3′ 397 R 5′-ACTTCTGCCATGTCGTCTTTTT-3′ 398 1417 HOXC9 F 5′-ACAAAGAGGAGAAGGCTGACCT-3′ 399 R 5′-CTCCTCGCTGGGTAGAACTAACT-3′ 400 1420 CHODL F 5′-GGAAGGAAAGGAACTACGAAATC-3′ 401 R 5′-GTTAAAAGGAGCACAGGGACATA-3′ 402 1422 TMEM3 F 5′-CTCCTTACTTGTGGGATCAAATG-3′ 403 R 5′-ATGTGCTAGAATTACAGCCCTGA-3′ 404 1424 MAGEA6 F 5′-AGGAGCTGAGTGTGTTAGAGGTG-3′ 405 R 5′-ATAAACCTGGATGCTGACGCTC-3′ 406 1435 DKFZp58 6H0623 F 5′-AGACCTAAGTCTGGAACAGAGCC-3′ 407 R 5′-CTACAGCACTCATTTGGAAAAGG-3′ 408 1436 FLJ10858 F 5′-TTGGTCCTCCTCTGTTTCATAGA-3′ 409 R 5′-GCTTCTCCCCAGTTACAAGAGAC-3′ 410 1439 PC F 5′-GTACTGAAGGACCTGCCAAGG-3′ 411 R 5′-GGGAAAGCCAGCTTTATTGAGTA-3′ 412 1440 F 5′-AGTTTTGGATGACTCTGCTCAAG-3′ 413 R 5′-GGCATTTACGAGCATTATCTGAC-3′ 414 1441 HSNOV1 F 5′-CAGTTTCAGTCCCAGGTCATACT-3′ 415 R 5′-GGCATACTCTTTGGTGAGAAATG-3′ 416 1444 TMPO F 5′-CTACCCTGAAGGGGAAGAAAAG-3′ 417 R 5′-AACACACCCTACATCCAAGGTC-3′ 418 1445 RANBP3 F 5′-CTTCAGAGGAAATCTCCCAGTC-3′ 419 R 5′-GGCGTTATCTCGTTGTACTCGT-3′ 420 1447 ADAM23 F 5′-AAAGCTGAATACAGAAGGCACTG-3′ 421 R 5′-TTTACTGACAGGTGGTGAAAGGT-3′ 422
从肺癌患者获取的癌组织中每一种基因的表达(图2)用半定量的 RT-PCR进行验证。得到的结果如下:
NSC 807:9个NSCLC病例中的6个出现了NSC807表达上调;
NSC 810:10个NSCLC病例中的6个出现了NSC810表达上调;
NSC 811:9个NSCLC病例全部出现了NSC811表达上调;
NSC 812:15个NSCLC病例全部出现了NSC812表达上调;
NSC 816:8个NSCLC病例全部出现了NSC816表达上调;
NSC 820:9个NSCLC病例中的8个出现了NSC820表达上调;
NSC 822:10个NSCLC病例中的3个出现了NSC822表达上调;
NSC 824:9个NSCLC病例全部出现了NSC824表达上调;
NSC 825:12个NSCLC病例全部出现了NSC825表达上调;
NSC 830:10个NSCLC病例中的7个出现了NSC830表达上调;
NSC 837:9个NSCLC病例中的7个出现了NSC837表达上调;
NSC 840:10个NSCLC病例中的9个出现了NSC840表达上调;
NSC 841:11个NSCLC病例中的9个出现了NSC841表达上调;
NSC 842:8个NSCLC病例中的7个出现了NSC842表达上调;
NSC 846:10个NSCLC病例中的9个出现了NSC846表达上调;
NSC 849:10个NSCLC病例中的7个出现了NSC849表达上调;
NSC 850:7个NSCLC病例全部出现了NSC850表达上调;
NSC 853:10个NSCLC病例中的8个出现了NSC853表达上调;
NSC 854:7个NSCLC病例全部出现了NSC854表达上调;
NSC 855:11个NSCLC病例中的10个出现了NSC855表达上调;
NSC 857:8个NSCLC病例全部出现了NSC857表达上调;
NSC 859:8个NSCLC病例全部出现了NSC859表达上调;
NSC 861:7个NSCLC病例中的5个出现了NSC861表达上调;
NSC 864:半定量RT-PCR证实了10个NSCLC病例全部出现了NSC864 表达上调;
NSC 870:11个NSCLC病例中的10个出现了NSC870表达上调;
NSC 871:13个NSCLC病例中的12个出现了NSC871表达上调;
NSC 872:12个NSCLC病例中的9个出现了NSC872表达上调;
NSC 881:10个NSCLC病例全部出现了NSC881表达上调;
NSC 882:10个NSCLC病例中的7个出现了NSC882表达上调;
NSC 884:9个NSCLC病例全部出现了NSC884表达上调;
NSC 885:8个NSCLC病例全部出现了NSC885表达上调;
NSC 889:8个NSCLC病例中的7个出现了NSC889表达上调;
NSC 893:9个NSCLC病例中的7个出现了NSC893表达上调;
NSC 895:6个NSCLC病例中的5个出现了NSC895表达上调;
NSC 898:6个NSCLC病例中的5个出现了NSC898表达上调;
NSC 901:14个NSCLC病例全部出现了NSC901表达上调;
NSC 902:8个NSCLC病例中的7个出现了NSC902表达上调;
NSC 903:10个NSCLC病例中的9个出现了NSC903表达上调;
NSC 904:10个NSCLC病例中的7个出现了NSC904表达上调;
NSC 905:13个NSCLC病例全部出现了NSC905表达上调;
NSC 909:13个NSCLC病例中的9个出现了NSC909表达上调;
NSC 912:7个NSCLC病例全部出现了NSC912表达上调;
NSC 915:9个NSCLC病例全部出现了NSC915表达上调;
NSC 917:9个NSCLC病例全部出现了NSC917表达上调;
NSC 920:10个NSCLC病例中的8个出现了NSC920表达上调;
NSC 921:8个NSCLC病例全部出现了NSC921表达上调;
NSC 924:8个NSCLC病例全部出现了NSC924表达上调;
NSC 929:12个NSCLC病例中的10个出现了NSC929表达上调;
NSC 930:10个NSCLC病例中的9个出现了NSC930表达上调;
NSC 933:10个NSCLC病例中的9个出现了NSC933表达上调;
NSC 934:8个NSCLC病例中的7个出现了NSC934表达上调;
NSC 936:8个NSCLC病例全部出现了NSC936表达上调;
NSC 938:10个NSCLC病例中的9个出现了NSC938表达上调;
NSC 940:10个NSCLC病例中的2个出现了NSC940表达上调;
NSC 944:10个NSCLC病例全部出现了NSC944表达上调;
NSC 947:10个NSCLC病例中的9个出现了NSC947表达上调;
NSC 948:10个NSCLC病例中的8个出现了NSC948表达上调;
NSC 956:8个NSCLC病例全部出现了NSC956表达上调;
NSC 957:8个NSCLC病例中的7个出现了NSC957表达上调;
NSC 958:10个NSCLC病例全部出现了NSC958表达上调;
NSC 963:10个NSCLC病例全部出现了NSC963表达上调;
NSC 964:8个NSCLC病例全部出现了NSC964表达上调;
NSC 965:11个NSCLC病例中的10个出现了NSC965表达上调;
NSC 966:8个NSCLC病例中的3个出现了NSC966表达上调;
NSC 970:12个NSCLC病例中的7个出现了NSC970表达上调;
NSC 972:10个NSCLC病例中的9个出现了NSC972表达上调;
NSC 973:9个NSCLC病例中的3个出现了NSC973表达上调;
NSC 974:10个NSCLC病例中的9个出现了NSC974表达上调;
NSC 975:12个NSCL病例出现了NSC975表达上调;
NSC 980:8个NSCLC病例中的7个出现了NSC980表达上调;
NSC 984:9个NSCLC病例中的8个出现了NSC984表达上调;
NSC 989:9个NSCLC病例全部出现了NSC989表达上调;
NSC 990:8个NSCLC病例中的4个出现了NSC990表达上调;
NSC 991:10个NSCLC病例中的3个出现了NSC991表达上调;
NSC 994:8个NSCLC病例全部出现了NSC994表达上调;
NSC 1000:13个NSCLC病例中的12个出现了NSC1000表达上调
NSC 1002:8个NSCLC病例全部出现了NSC1002表达上调;
NSC 1003:10个NSCLC病例全部出现了NSC1003表达上调;
NSC 1012:8个NSCLC病例出现了NSC1012表达上调;
NSC 1015:10个NSCLC病例出现了NSC1015表达上调;
NSC 1016:9个NSCLC病例中的8个出现了NSC1016表达上调;
NSC 1018:6个NSCLC病例中的3个出现了NSC1018表达上调;
NSC 1023:12个NSCLC病例中的7个出现了NSC1023表达上调;
NSC 1026:9个NSCLC病例中的7个出现了NSC1026表达上调;
NSC 1027:8个NSCLC病例中的5个出现了NSC1027表达上调;
NSC 1030:6个NSCLC病例中的5个出现了NSC1030表达上调;
NSC 1034:8个NSCLC病例中的5个出现了NSC1034表达上调;
NSC 1037:9个NSCLC病例全部出现了NSC1037表达上调;
NSC 1038:7个NSCLC病例中的6个出现了NSC1038表达上调;
NSC 1047:6个NSCLC病例中的4个出现了NSC1047表达上调;
NSC 1049:6个NSCLC病例都检测到了NSC1049表达上调;
NSC 1052:8个NSCLC病例全部出现了NSC1052表达上调;
NSC 1057:8个NSCLC病例全部出现了NSC1057表达上调;
NSC 1058:10个NSCLC病例中的8个出现了NSC1058表达上调;
NSC 1059:9个NSCLC病例中的8个出现了NSC1059表达上调;
NSC 1064:13个NSCLC病例全部出现了NSC1064表达上调;
NSC 1066:10个NSCLC病例中的8个出现了NSC1066表达上调;
NSC 1067:10个NSCLC病例全部出现了NSC1067表达上调;
NSC 1071:10个NSCLC病例全部出现了NSC1071表达上调;
NSC 1072:10个NSCLC病例中的7个出现了NSC1072表达上调;
NSC 1075:9个NSCLC病例全部出现了NSC1075表达上调;
NSC 1077:11个NSCLC病例中的8个出现了NSC1077表达上调;
NSC 1078:9个NSCLC病例中的8个出现了NSC1078表达上调;
NSC 1086:11个NSCLC病例中的10个出现了NSC1086表达上调;
NSC 1089:9个NSCLC病例中的6个出现了NSC1089表达上调;
NSC 1090:7个NSCLC病例中的3个出现了NSC1090表达上调;
NSC 1103:8个NSCLC病例中的7个出现了NSC1103表达上调;
NSC 1107:9个NSCLC病例中的8个出现了NSC1107表达上调;
NSC 1109:9个NSCLC病例中的8个出现了NSC1109表达上调;
NSC 1113:11个NSCLC病例中的10个出现了NSC1113表达上调;
NSC 1116:9个NSCLC病例中的8个出现了NSC1116表达上调;
NSC 1125:10个NSCLC病例出现了NSC1125表达上调;
NSC 1131:6个NSCLC病例中的2个检测到了NSC1131表达上调;
NSC 1133:10个NSCLC病例全部出现了NSC1133表达上调;
NSC 1136:9个NSCLC病例中的8个出现了NSC1136表达上调
NSC 1141:10个NSCLC病例中的6个出现了NSC1141表达上调;
NSC 1142:11个NSCLC病例中的9个检测到了NSC1142表达上调;
NSC 1157:11个NSCLC病例中的1个出现了NSC1157表达上调;
NSC 1162:10个NSCLC病例中的9个出现了NSC1162表达上调;
NSC 1164:7个NSCLC病例全部出现了NSC1164表达上调;
NSC 1167:9个NSCLC病例中的8个出现了NSC1167表达上调
NSC 1169:7个NSCLC病例中的3个出现了NSC1169表达上调;
NSC 1173:7个NSCLC病例中的5个出现了NSC1173表达上调;
NSC 1176:9个NSCLC病例中的8个出现了NSC1176表达上调;
NSC 1183:10个NSCLC病例全部检测到了NSC1183表达上调;
NSC 1184:9个NSCLC病例中的8个出现了NSC1184表达上调;
NSC 1185:6个NSCLC病例中的5个检测到了NSC1185表达上调;
NSC 1191:8个NSCLC病例中的7个出现了NSC1191表达上调;
NSC 1195:9个NSCLC病例中的5个出现了NSC1195表达上调;
NSC 1196:6个NSCLC病例全部出现了NSC1196表达上调;
NSC 1201:9个NSCLC病例全部出现了NSC1201表达上调;
NSC 1205:9个NSCLC病例中的7个出现了NSC1205表达上调;
NSC 1207:10个NSCLC病例中的8个出现了NSC1207表达上调;
NSC 1210:10个NSCLC病例中的9个出现了NSC1210表达上调;
NSC 1214:9个NSCLC病例中的7个出现了NSC1214表达上调;
NSC 1234:10个NSCLC病例中的9个出现了NSC1234表达上调;
NSC 1236:8个NSCLC病例中的6个出现了NSC1236表达上调;
NSC 1237:6个NSCLC病例中的5个出现了NSC1237表达上调;
NSC 1238:7个NSCLC病例中的6个出现了NSC1238表达上调;
NSC 1240:7个NSCLC病例全部出现了NSC1240表达上调;
NSC 1242:7个NSCLC病例中的4个出现了NSC1242表达上调;
NSC 1246:10个NSCLC病例中的6个出现了NSC1246表达上调;
NSC 1247:8个NSCLC病例中的5个出现了NSC1247表达上调;
NSC 1250:8个NSCLC病例出现了NSC1250表达上调;
NSC 1254:10个NSCLC病例出现了NSC1254表达上调;
NSC 1265:5个NSCLC病例中的4个检测到了NSC1265表达上调;
NSC 1273:6个NSCLC病例中的5个检测到了NSC1273表达上调;
NSC 1277:10个NSCLC病例全部出现了NSC1277表达上调;
NSC 1279:7个NSCLC病例全部出现了NSC1279表达上调;
NSC 1288:9个NSCLC病例中的6个出现了NSC1288表达上调;
NSC 1289:9个NSCLC病例中的6个出现了NSC1289表达上调;
NSC 1290:10个NSCLC病例全部出现了NSC1290表达上调;
NSC 1292:8个NSCLC病例全部出现了NSC1292表达上调;
NSC 1293:6个NSCLC病例中的4个检测到了NSC1293表达上调;
NSC 1294:8个NSCLC病例中的7个出现了NSC1294表达上调;
NSC 1295:7个NSCLC病例中的5个出现了NSC1295表达上调;
NSC 1299:6个NSCLC病例中的5个检测到了NSC1299表达上调;
NSC 1302:7个NSCLC病例全部出现了NSC1302表达上调;
NSC 1306:6个NSCLC病例中的5个检测到了NSC1306表达上调;
NSC 1309:8个NSCLC病例中的7个出现了NSC1309表达上调;
NSC 1310:10个NSCLC病例中的9个出现了NSC1310表达上调;
NSC 1315:9个NSCLC病例中的6个出现了NSC1315表达上调;
NSC 1320:9个NSCLC病例中的5个出现了NSC1320表达上调;
NSC 1323:10个NSCLC病例全部出现了NSC1323表达上调;
NSC 1325:9个NSCLC病例中的2个出现了NSC1325表达上调;
NSC 1328:9个NSCLC病例全部出现了NSC1328表达上调;
NSC 1337:9个NSCLC病例全部出现了NSC1337表达上调;
NSC 1345:8个NSCLC病例中的3个出现了NSC1345表达上调;
NSC 1350:8个NSCLC病例中的6个出现了NSC1350表达上调;
NSC 1353:10个NSCLC病例中的3个出现了NSC1353表达上调;
NSC 1362:7个NSCLC病例中的6个出现了NSC1362表达上调;
NSC 1371:10个NSCLC病例全部出现了NSC1371表达上调;
NSC 1375:8个NSCLC病例全部出现了NSC1375表达上调;
NSC 1377:8个NSCLC病例中的5个出现了NSC1377表达上调;
NSC 1378:9个NSCLC病例中的8个出现了NSC1378表达上调;
NSC 1384:11个NSCLC病例中的8个出现了NSC1384表达上调;
NSC 1389:9个NSCLC病例中的8个出现了NSC1389表达上调;
NSC 1390:10个NSCLC病例中的8个出现了NSC1390表达上调;
NSC 1391:8个NSCLC病例全部出现了NSC1391表达上调;
NSC 1394:10个NSCLC病例中的6个出现了NSC1394表达上调;
NSC 1395:7个NSCLC病例中的4个出现了NSC1395表达上调;
NSC 1398:9个NSCLC病例中的8个出现了NSC1398表达上调;
NSC 1399:10个NSCLC病例中的4个出现了NSC1399表达上调;
NSC 1403:8个NSCLC病例中的6个出现了NSC1403表达上调;
NSC 1406:10个NSCLC病例全部出现了NSC1406表达上调;
NSC 1407:10个NSCLC病例全部出现了NSC1407表达上调;
NSC 1410:10个NSCLC病例中的5个出现了NSC1410表达上调;
NSC 1412:9个NSCLC病例中的6个出现了NSC1412表达上调;
NSC 1417:7个NSCLC病例中的3个出现了NSC1417表达上调;
NSC 1420:7个NSCLC病例全部检测到了NSC1420表达上调;
NSC 1422:10个NSCLC病例中的4个出现了NSC1422表达上调;
NSC 1424:6个NSCLC病例中的5个出现了NSC1424表达上调;
NSC 1435:8个NSCLC病例中的4个出现了NSC1435表达上调;
NSC 1436:7个NSCLC病例全部出现了NSC1436表达上调;
NSC 1439:8个NSCLC病例全部出现了NSC1439表达上调;
NSC 1440:9个NSCLC病例中的8个出现了NSC1440表达上调;
NSC 1441:11个NSCLC病例中的9个出现了NSC1441表达上调;
NSC 1444:6个NSCLC病例中的4个出现了NSC1444表达上调;
NSC 1445:7个NSCLC病例中的6个出现了NSC1445表达上调;
NSC 1447:7个NSCLC病例全部出现了NSC1447表达上调。
(3)反义S-寡核苷酸测定
制备每种基因的相应3-5对反向(对照)和反义S-寡核苷酸对。四种 NSCLC细胞系A549、NCI-H226、NCI-H522和/或LC319铺板于6-孔平板 或10cm培养皿,使用脂转染试剂(Life Technologies,Inc,Inc.)、用与每种 基因相应的合成S-寡核苷酸转染上述细胞系,使转染后的细胞系在含有 10%胎牛血清的培养基中维持2天。然后,用100%甲醇固定上述细胞,并 用Giemsa溶液染色。针对26个基因的反义S-寡核苷酸与对照相比抑制病 灶形成。因此,这些基因的抑制表现为转染后细胞生长、增殖和/或存活降 低。有效(effective)反义S-寡核苷酸和对照反向寡核苷酸的序列显示于表 5。进行了一式三份的MTT实验,采用本领域已知的方法(Akashi et al. (2000)Int.J.Cancer 88:873-80)。每一基因对应的方法和结果如下所示:
NSC 810:TTK;合成了相应于TTK的有效的反义S-寡核苷酸(SEQ ID NO:423)和反向S-寡核苷酸(对照)(SEQ ID NO:424)。将所述S-寡核苷酸都 转染入以最高水平表达TTK的NSCLC细胞系A549和LC319。转染后两天, 通过MTT实验可见,所述反义-S寡核苷酸与对照相比明显抑制了细胞增 殖(图2)。由此可见,对TTK的抑制导致了细胞生长、增殖和/或存活降低。 该结果还得到了病灶形成实验(focus formation)(用Giemsa染色)的证实(数据 未给出)。
NSC 811:SDC1;合成了相应于SDC1的3对有效的反义S-寡核苷酸 (AS1(SEQ ID NO:425)、AS2(SEQ ID NO:427)及AS4(SEQ ID NO:429))和反 向S-寡核苷酸(对照)(R1(SEQ ID NO:426)、R2(SEQ ID NO:428)及R4(SEQ NO:430)),将它们分别转染入以最高水平表达SDC1的NSCLC细胞系 A549。转染后两天,通过MTT实验明显看到,这些反义-S寡核苷酸与对 照相比明显抑制抑制了细胞增殖(图2)。因此可见,SDC1的抑制导致了细 胞生长、增殖和/或存活的减弱。该结果还得到了病灶形成实验(用Giemsa 染色)的证实(数据未给出)。
NSC 812:NMB;合成了相应于NMB的2对有效的反义S-寡核苷酸 (AS1(SEQ ID NO:431)及AS2(SEQ ID NO:433))和反向S-寡核苷酸(对 照)(R1(SEQ ID NO:432)及R2(SEQ ID NO:434))。将每种S-寡核苷酸都转 染入以最高水平表达NMB的NSCLC细胞系A549、NCI-H226和NCI-H522。 转染后两天,通过MTT实验可见,这些反义-S寡核苷酸与对照相比明显 抑制了细胞增殖(图2)。因此可见,NMB的抑制导致了细胞生长、增殖和/ 或存活的降低。这些结果还得到了病灶形成实验(用Giemsa染色)的证实(数 据未给出)。
NSC 816:PIR51;合成了相应于PIR51的有效的反义S-寡核苷酸 AS1(SEQ ID NO:435)和反向S-寡核苷酸(对照)R1(SEQ ID NO:436)。将所述 S-寡核苷酸都转染入以最高水平表达NMB的NSCLC细胞系A549、 NCI-H226和NCI-H522。转染后两天,通过病灶形成实验(用Giemsa染色) 可见,这些反义-S寡核苷酸与对照相比明显抑制了细胞增殖(数据未给出)。 由此可见,对PIR51的抑制导致了细胞生长、增殖和/或存活的降低。
NSC 825:ANLN;合成了相应于ANLN的3对有效的反义S-寡核苷酸 (AS1(SEQ ID NO:437)、AS3(SEQ ID NO:439)及AS5(SEQ ID NO:441))和反 向S-寡核苷酸(对照)(R1(SEQ ID NO:438)、R3(SEQ ID NO:440)及R5(SEQ ID NO:442))。将每种S-寡核苷酸都转染入以最高水平表达ANLN的NSCLC 细胞系A549、NCI-H226和NCI-H522。转染后两天,通过MTT实验可见, 这些反义-S寡核苷酸与对照相比明显抑制了细胞增殖(图2)。由此可见,对 ANLN的抑制导致了细胞生长、增殖和/或存活的降低。
NSC 841:URLC2;合成了相应于URLC2的2对有效的反义S-寡核苷酸 (AS4(SEQ ID NO:443)及AS5(SEQ ID NO:445))和反向S-寡核苷酸(对照)(R4 (SEQ ID NO:444)及R5(SEQ ID NO:446))。将每种S-寡核苷酸都转染入以 最高水平表达URLC2的NSCLC细胞系A549、NCI-H226和NCI-H522。转 染后两天,通过MTT实验可见,这些反义-S寡核苷酸与对照相比明显抑 制了细胞增殖(图2)。由此可见,对URLC2的抑制导致了细胞生长、增殖和 /或存活的降低。该结果还得到了病灶形成实验(用Giemsa染色)的证实(数据 未给出)。
NSC 857:TIGD5;合成了相应于TIGD5的2对有效的反义S-寡核苷酸 (AS3(SEQ ID NO:447)及AS4(SEQ ID NO:449))和反向S-寡核苷酸(对照)(R3 (SEQ ID NO:448)及R4(SEQ ID NO:450))。将每种S-寡核苷酸都转染入以 最高水平表达TIGD5的NSCLC细胞系A549、NCI-H226和NCI-H522。转 染后两天,通过MTT实验可见,这些反义-S寡核苷酸与对照相比明显抑 制了细胞增殖(图2)。由此可见,对TIGD5的抑制导致了细胞生长、增殖和 /或存活的降低。该结果还得到了病灶形成实验(用Giemsa染色)的证实(数据 未给出)。
NSC 859:URLC3;合成了相应于URLC3的3对有效的反义S-寡核苷酸 (AS2(SEQ ID NO:451)、AS3(SEQ ID NO:453)及AS5(SEQ ID NO:455))和反 向S-寡核苷酸(对照)(R2(SEQ ID NO:452)及R5(SEQ ID NO:456))。将每种 S-寡核苷酸都转染入以最高水平表达URLC3的NSCLC细胞系A549、 NCI-H226和NCI-H522。转染后两天,通过MTT实验可见,这些反义-S 寡核苷酸与对照相比明显抑制了细胞增殖(图2)。由此可见,对URLC3的抑 制导致了细胞生长、增殖和/或存活的降低。该结果还得到了病灶形成实验 (用Giemsa染色)的证实(数据未给出)。
NSC 885:BAG5;合成了相应于BAG5的2对有效的反义S-寡核苷酸 (AS1(SEQ ID NO:457)及AS2(SEQ ID NO:459))和反向S-寡核苷酸(R1(SEQ ID 458),R3(SEQ ID NO:448)及R2(SEQ ID 460))。将每种S-寡核苷酸都 转染入以最高水平表达BAG5的NSCLC细胞系A549、NCI-H226和NCI -H522。转染后两天,通过病灶形成实验(用Giemsa染色)可见,这些反义- S寡核苷酸与对照相比明显抑制了细胞增殖(数据未给出)。由此可见,对 BAG5的抑制导致了细胞生长、增殖和/或存活的降低。
NSC 893:MPHOSPH1;合成了相应于MPHOSPH1的2对有效的反义S -寡核苷酸(AS1(SEQ ID NO:461)及AS2(SEQ ID NO:463))和反向S-寡核苷 酸(R1(SEQ ID NO:462)及R2(SEQ ID NO:464))。将每种S-寡核苷酸都转染 入以最高水平表达MPHOSPH1的NSCLC细胞系A549、NCI-H226和NCI -H522。转染后两天,通过MTT实验可见,这些反义-S寡核苷酸与对照相 比明显抑制了细胞增殖(图2)。由此可见,对MPHOSPH1的抑制导致了细 胞生长、增殖和/或存活的降低。该结果还得到了病灶形成实验(用Giemsa 染色)的证实(数据未给出)。
NSC 905:URLC1;合成了相应于URLC1的3对有效的反义S-寡核苷酸 (AS2(SEQ ID NO:465)、AS3(SEQ ID NO:467)及AS5(SEQ ID NO:469))和反 向S-寡核苷酸(对照)(R2(SEQ ID NO:466)、R3(SEQ ID NO:468)及R5 (SEQ ID NO:470))。将每种S-寡核苷酸都转染入以最高水平表达URLC1的 NSCLC细胞系A549、NCI-H226和NCI-H522。转染后两天,通过MTT实 验可见,这些反义-S寡核苷酸与对照相比明显抑制了细胞增殖(图2)。由此 可见,对URLC1的抑制导致了细胞生长、增殖和/或存活的降低。该结果还 得到了病灶形成实验(用Giemsa染色)的证实(数据未给出)。
NSC 909:FLJ10468;合成了相应于FLJ10468的一对有效的反义S-寡 核苷酸AS1(SEQ ID NO:471)和反向S-寡核苷酸(对照)R1(SEQ ID NO:472)。 将每种S-寡核苷酸都转染入以最高水平表达FLJ10468的NSCLC细胞系 A549、NCI-H226和NCI-H522。转染后两天,通过病灶形成实验(用Giemsa 染色)可见,这些反义-S寡核苷酸与对照相比明显抑制了细胞增殖(数据未 给出)。由此可见,对FLJ10468的抑制导致了细胞生长、增殖和/或存活的 降低。
NSC 920:CHAF1A;合成了相应于CHAF1A的2对有效的反义S-寡核 苷酸(AS1(SEQ ID NO:473)及AS4(SEQ ID NO:459))和反向S-寡核苷酸 (R1(SEQ ID NO:474)及R4(SEQ ID NO:476))。将每种S-寡核苷酸都转染入 以最高水平表达CHAFlA的NSCLC细胞系A549、NCI-H226和NCI-H522。 转染后两天,通过病灶形成实验(用Giemsa染色)可见,这些反义-S寡核苷 酸与对照相比明显抑制了细胞增殖(数据未给出)。由此可见,对CHAFlA的 抑制导致了细胞生长、增殖和/或存活的降低。
NSC 947:PKP3;合成了相应于PKP3的4对有效的反义S-寡核苷酸 (AS1(SEQ ID NO:477)、AS2(SEQ ID NO:479)、AS3(SEQ ID NO:481)及 AS4(SEQ ID NO:483))和反向S-寡核苷酸(对照)((R1(SEQ ID NO:478)、R2 (SEQ ID NO:480)、R3(SEQ ID 482)及R4(SEQ ID NO:484))。将每种S-寡 核苷酸都转染入以最高水平表达PKP3的NSCLC细胞系A549和LC319。 转染后两天,通过MTT实验可见,这些反义-S寡核苷酸与对照相比明显 抑制了细胞增殖(图2)。由此可见,对PKP3的抑制导致了细胞生长、增殖 和/或存活的降低。该结果还得到了病灶形成实验(用Giemsa染色)的证实(数 据未给出)。
NSC 956:SIAHBP1;合成了相应于SIAHBP1的2对有效的反义S-寡核 苷酸(AS1(SEQ ID NO:485)及AS2(SEQ ID NO:487))和反向S-寡核苷酸(对 照)(R1(SEQ ID NO:486)及R2(SEQ ID NO:488))。将每种S-寡核苷酸都转染 入以最高水平表达SIAHBP1的NSCLC细胞系A549、NCI-H226和NCI -H522。转染后两天,通过MTT实验可见,这些反义-S寡核苷酸与对照相 比明显抑制了细胞增殖(图2),这表明对SIAHBP1的抑制降低了细胞的生长, 增殖和/或存活。该结果还得到了病灶形成实验(用Giemsa染色)的证实(数据 未给出)。
NSC 994:DKFZP434E2318;合成了相应于DKFZP434E2318的4对有效 的反义S-寡核苷酸((AS1(SEQ ID NO:489)、AS3(SEQ ID NO:491)、AS4 (SEQ ID NO:493)及AS5(SEQ ID NO:495))和反向S-寡核苷酸(对 照)((R1(SEQ ID NO:490)、R3(SEQ ID NO:492)、R4(SEQ ID 494)及R5(SEQ ID NO:496))。将每种S-寡核苷酸都转染入以最高水平表达DKFZP434E2318 的NSCLC细胞系A549、NCI-H226和NCI-H522。转染后两天,通过MTT 实验可见,这些反义-S寡核苷酸与对照相比明显抑制了细胞增殖(图2)。由 此可见,对DKFZP434E2318的抑制降低了细胞生长、增殖和/或存活。该 结果还得到了病灶形成实验(用Giemsa染色)的证实(数据未给出)。
NSC 1075:URLC4;合成了相应于URLC4的一对有效的反义S-寡核苷 酸AS5(SEQ ID NO:497)和反向S-寡核苷酸(对照)R1(SEQ ID NO:498)。将每 种S-寡核苷酸都转染入以最高水平表达URLC4的NSCLC细胞系A549、 NCI-H226和NCI-H522。转染后两天,通过MTT实验明显看到,所述反 义-S寡核苷酸与对照相比明显抑制了细胞增殖(图2)。由此可见,对URLC4 的抑制导致了细胞生长、增殖和/或存活的降低。所述结果还得到了病灶形 成实验(用Giemsa染色)的证实(数据未给出)。
NSC 1107:URLC8;合成了相应于URLC8的2对有效的反义S-寡核苷 酸(AS1(SEQ ID NO:499)及AS4(SEQ ID NO:501))和反向S-寡核苷酸(对 照)(R1(SEQ ID NO:500)及R4(SEQ ID NO:502)),将每对S-寡核苷酸分别转 染入以最高水平表达URLC8的NSCLC细胞系A549。转染后两天,通过 MTT实验可见,这些反义-S寡核苷酸与对照相比明显抑制了细胞增殖(图 2)。由此可见,对URLC8的抑制导致了细胞生长、增殖和/或存活的降低。 该结果还得到了病灶形成实验(用Giemsa染色)的证实(数据未给出)。
NSC 1113:URLC5;合成了相应于URLC5的2对有效的反义S-寡核苷 酸(AS1(SEQ ID NO:503)及AS2(SEQ ID NO:505))和反向S-寡核苷酸 (R1(SEQ ID NO:504)及R2(SEQ ID NO:506))。将每种S-寡核苷酸都转染 入以最高水平表达URLC5的NSCLC细胞系A549、NCI-H226和NCI-H522。 转染后两天,通过病灶形成实验(用Giemsa染色)可见,所述反义-S寡核苷 酸与对照相比明显抑制细胞增殖(数据未给出)。这表明对URLC5抑制降 低了细胞的生长,增殖和/或存活。
NSC 1131:SYNJ2BP;合成了相应于SYNJ2BP的一对有效的反义S-寡 核苷酸(AS1(SEQ ID NO:507))和反向S-寡核苷酸(对照)(R1(SEQ ID NO:508))。将每种S-寡核苷酸都转染入以最高水平表达SYNJ2BP的细胞系 A549和NCI-H226。转染后两天,通过病灶形成实验(用Giemsa染色)可见, 所述反义-S寡核苷酸与对照相比明显抑制细胞增殖(数据未给出)。这表明 对SYNJ2BP的抑制降低了细胞的生长,增殖和/或存活。
NSC 1142:NAPG;合成了相应于NAPG的一对有效的反义S-寡核苷酸 (AS1(SEQ ID NO:509))和反向S-寡核苷酸(对照)(R1(SEQ ID NO:510))。将每 种S-寡核苷酸都转染入以最高水平表达NAPG的NSCLC细胞系A549、 NCI-H226和NCI-H522。转染后两天,通过病灶形成实验(用Giemsa染色) 可见,所述反义-S寡核苷酸与对照相比明显抑制细胞增殖(数据未给出)。 这表明对NAPG的抑制降低了细胞的生长,增殖和/或存活。
NSC 1183:BYSL;合成了相应于BYSL的3对有效的反义S-寡核苷酸 (AS1(SEQ ID NO:511)、AS2(SEQ ID NO:513)及AS3(SEQ ID NO:515))和反 向S-寡核苷酸(对照)(R1(SEQ ID NO:512)、R2(SEQ ID NO:514)及R3 (SEQ ID NO:516))。将每种S-寡核苷酸都转染入以最高水平表达BYSL的 NSCLC细胞系A549、NCI-H226和NCI-H522。转染后两天,通过病灶形 成实验(用Giemsa染色)可见,这些反义S-寡核苷酸与对照相比明显抑制了 细胞增殖(数据未给出),这表明对BYSL的抑制降低了细胞的生长,增殖和/ 或存活。
NSC 1185:URLC6;合成了相应于URLC6的2对有效的反义S-寡核苷酸 (AS4(SEQ ID NO:517)及AS6(SEQ ID NO:519))和反向S-寡核苷酸(对 照)(R4(SEQ ID NO:518)及R6(SEQ ID NO:520))。将每种S-寡核苷酸都转染 入以最高水平表达URLC6的细胞系A549和NCI-H226。转染后两天,通过 病灶形成实验(用Giemsa染色)可见,这些反义S-寡核苷酸与对照相比明显 抑制了细胞增殖(数据未给出),这表明对URLC6的抑制降低了细胞的生长, 增殖和/或存活。
NSC 1191:COX17;合成了相应于COX17的3对有效的反义S-寡核苷 酸(AS2(SEQ ID NO:521)、AS4(SEQ ID NO:523)及AS5(SEQ ID NO:525))和 反向S-寡核苷酸(对照)(R2(SEQ ID NO:522)、R4(SEQ ID NO:524)及R5 (SEQ ID NO:526))。将每种S-寡核苷酸都转染入以最高水平表达COX17的 NSCLC细胞系A549、NCI-H226和NCI-H522。转染后两天,通过MTT实 验可见,这些反义-S寡核苷酸与对照相比明显抑制了细胞增殖(图2),这 表明对COX17的抑制降低了细胞的生长,增殖和/或存活。该结果还得到了 病灶形成实验(用Giemsa染色)的证实(数据未给出)。
NSC 1273:FLJ32549;合成了相应于FLJ32549的2对有效的反义S-寡 核苷酸(AS1(SEQ ID NO:527)及AS2(SEQ ID NO:529))和反向S-寡核苷酸 (R1(SEQ ID NO:528)及R2(SEQ ID NO:530))。将每种S-寡核苷酸都转染 入以最高水平表达FLJ32549的NSCLC细胞系A549、NCI-H226和NCI -H522。转染后两天,通过病灶形成实验(用Giemsa染色)可见,所述反义- S寡核苷酸与对照相比明显抑制细胞增殖(数据未给出)。这表明对FLJ32549 的抑制降低了细胞的生长,增殖和/或存活。
NSC 1389:NMU;合成了相应于NMU的一对有效的反义S-寡核苷酸 AS(SEQ ID NO:531)和反向S-寡核苷酸(对照)R(SEQ ID NO:532)。将每种S -寡核苷酸都转染入以最高水平表达NMU的NSCLC细胞系A549和LC319。 转染后两天,通过MTT实验可见,所述反义-S寡核苷酸与对照相比明显 抑制了细胞增殖(图2),这表明对NMU的抑制降低了细胞的生长,增殖和/ 或存活。该结果还得到了病灶形成实验(用Giemsa染色)的证实(数据未给 出)。
表5 有效的S-寡核苷酸对的序列 NSC 编号 代号 No. S-寡聚AS SEQ ID NO: S-寡聚REV(对照) SEQ ID NO: 810 TTK 5′-TAAATCCTCGGA TTCCAT-3′ 423 5′-TACCTTAGGCTCC TAAAT-3′ 424 811 SDC1 1 5′-CGCCGCGCGCCT CATGCT-3′ 425 5′-TCGTACTCCGCGC GCCGC-3′ 426 2 5′-CGGCCGCACTCA CCGGCA-3′ 427 5′-ACGGCCACTCACG CCGGC-3′ 428 4 5′-ACGACTGCTTGA AAGAGG-3′ 429 5′-GGAGAAAGTTCGT CAGCA-3′ 430 812 NMB 1 5′-AGTGCACTCGGA TCTTGCT-3′ 431 5′-TCGTTCTAGGCTC ACGTGA-3′ 432 2 5′-GCCTCCTGTACT GGATTT-3′ 433 5′-TTTAGGTCATGTC CTCCG-3′ 434 816 PIR51 1 5′-TTGACTGGTTTCT TATGT-3′ 435 5′-TGTATTCTTTGGTC AGTT-3′ 436 825 ANLN 1 5′-CTCCGTAAACGG ATCCAT-3′ 437 5′-TACCTAGGCAAAT GCCTC-3′ 438 3 5′-CGGATCCATCGC CCCAGG-3′ 439 5′-GGACCCCGCTACC TAGGC-3′ 440 5 5′-ACCAAAGACGCA TCATCA-3′ 441 5′-ACTACTACGCAGA AACCA-3′ 442 841 URLC2 4 5′-CCCTCGATTCCTC CGAGT-3′ 443 5′-TGAGCCTCCTTAG CTCCC-3′ 444 5 5′-AACTGCCACACA GTAGTA-3′ 445 5′-ATGATGACACACC GTCAA-3′ 446 857 TIGD5 3 5′-ATCCTCGCTGTCC AGGGC-3′ 447 5′-CGGGACCTGTCGC TCCTA-3′ 448 4 5′-CGTCCAGGTGCA GCCACT-3′ 449 5′-TCACCGACGTGGA CCTGC-3′ 450 859 URLC3 2 5′-GTTCCCATTCAA GAACAT-3′ 451 5′-TACAAGAACTTAC CCTTG-3′ 452 3 5′-CATGAGTGATGG TGGCTC-3′ 453 5′-CTCGGTGGTAGTG AGTAC-3′ 454 5 5′-CCTCTCCCATGG CTTCAA-3′ 455 5′-AACTTCGGTACCC TCTCC-3′ 456 885 BAG5 5′-GGACAGGAACCA ATGTAC-3′ 457 5′-CATGTAACCAAGG ACAGG-3′ 458 2 5′-ACAATACAATGT GACAAG-3′ 459 5′-GAACAGTGTAACA TAACA-3′ 460 893 MPHOSPH 1 1 5′-AGATTCCATTCT GCAAAC-3′ 461 5′-CAAACGTCTTACC TTAGA-3′ 462 2 5′-GATTAAAATTAG ATTCCAT-3′ 463 5′-TACCTTAGATTAA AATTAG-3′ 464 905 URLC1 2 5′-CATCTTGAGATC CTATTC-3′ 465 5′-CTTATCCTAGAGT TCTAC-3′ 466 3 5′-TGGGGGCTTTTT ACTCAT-3′ 467 5′-TACTCATTTTTCG GGGGT-3′ 468 5 5′-AGGTACTTTAAA CCACTT-3′ 469 5′-TTCACCAAATTTC ATGGA-3′ 470 909 FLJ10468 1 5′-AGGAGCCATGGC GCTCGG-3′ 471 5′-GGCTCGCGGTACC GAGGA-3′ 472 920 CHAF1A 1 5′-GCAATCCATGGC TGTGGC-3′ 473 5′-CGGTGTCGGTACC TAACG-3′ 474 4 5′-AATAATTACCTT GTATTA-3′ 475 5′-TACCTAACGTTTC TATCT-3′ 476 947 PKP3 1 5′-GAAGTTACCGTC CTGCAT-3′ 477 5′-TACGTCCTGCCAT TGAAG-3′ 478 2 5′-GCAGGAAGTTAC CGTCCT-3′ 479 5′-TCCTGCCATTGAA GGACG-3′ 480 3 5′-GTTGTTGAGCAC AGCTAT-3′ 481 5′-TATCGACACGAGT TGTTG-3′ 482 4 5′-GAAGTCCTCCTT CCGATA-3′ 483 5′-ATAGCCTTCCTCC TGAAG-3′ 484 956 SIAHBP1 1 5′-CCGTCGCCATCTT GCGTC-3′ 485 5′-CTGCGTTCTACCG CTGCC-3′ 486 2 5′-TATGGTCGCCGT CGCCAT-3′ 487 5′-TACCGCTGCCGCT GGTAT-3′ 488 994 DKFZp434 E2318 1 5′-GGACTGCATGGT GGAGAT-3′ 489 5′-TAGAGGTGGTACG TCAGG-3′ 490 3 5′-CATGGTGGAGAT GGCGAC-3′ 491 5′-CAGCGGTAGAGGT GGTAC-3′ 492 4 5′-AGCAGGGCTGCA GAATGG-3′ 493 5′-GGTAAGACGTCGG GACGA-3′ 494 5 5′-TGCTCTTGAAGT CGGGAC-3′ 495 5′-CAGGGATGAAGTT CTCGT-3′ 496 1075 URLC4 5 5′-GCAGTTGAGATG ATTATT-3′ 497 5′-TTATTAGTAGAGT TGACG-3′ 498 1107 URLC8 1 5′-CAAAATCATTTC CTCCTC-3′ 499 5′-CTCCTCCTTTACTA AAAC-3′ 500 4 5′-CGGGCCACCATC ACGGAA-3′ 501 5′-AAGGCACTACCAC CGGGC-3′ 502 1113 URLC5 1 5′-ACGATTCATTGC TGCCTT-3′ 503 5′-TTCCGTCGTTACTT AGCA-3′ 504 2 5′-ACACAAGACACG ATTCAT-3′ 505 5′-TACTTAGCACAGA ACACA-3′ 506 1131 SYNJ2BP 1 5′-ATCCACTCTTCCG TTCAT-3′ 507 5′-TACTTGCCTTCTC ACCTA-3′ 508 1142 NAPG 1 5′-AGCCGCCATCTC CACAGT-3′ 509 5′-TGACACCTCTACC GCCGA-3′ 510 1183 BYSL 1 5′-CTTGTTCATGAA CATCTCT-3′ 511 5′-TCTCTACAAGTAC TTGTTC-3′ 512 2 5′-TGGCAGGAGGGT TCTTGT-3′ 513 5′-TACTTGTTCTTGG GAGGA-3′ 514 3 5′-CAGGCCTACCTG GCAGGA-3′ 515 5′-AGGACGGTCCATC CGGAC-3′ 516 1185 URLC6 4 5′-ACCGCTTACGGT TGGCTG-3′ 517 5′-GTCGGTTGGCATT CGCCA-3′ 518 6 5′-TCTGAAGAAAAT AGATCA-3′ 519 5′-ACTAGATAAAAGA AGTCT-3′ 520 1191 COX17 2 5′-GTCAACCAGACC CGGCAT-3′ 521 5′-TACGGCCCAGACC AACTG-3′ 522 4 5′-TCTCCTTTCTCGA TCATA-3′ 523 5′-ATAGTAGCTCTTT CCTCT-3′ 524 5 5′-ATTCCTTGTGGG CCTCAA-3′ 525 5′-AACTCCGGGTGTT CCTTA-3′ 526 1273 FLJ32549 1 5′-CCCATGCGAGCT GCGCC-3′ 527 5′-CCGCGTCGAGCGT ACCC-3′ 528 2 5′-AGTGATAAACAG AAAGCG-3′ 529 5′-GCGAAAGACAAA TAGTGA-3′ 530 1389 NMU 5′-TATCCTCGACTTT GACTT-3′ 531 5′-TTCAGTTTCAGCT CCTAT-3′ 532
(4)RNA干扰实验
psiH1BX3.0是一种基于载体的RNAi系统,它能够指导哺乳动物细胞 中小干扰RNA(siRNA)的合成,使用该系统抑制NSCLC细胞中每种内源基 因的表达。设计了5种载体,其用于指导合成针对每种基因靶序列的5个 不同的19-碱基对双链核苷酸。使用Lipofectamin 2000试剂(Invitrogene, Carlsbad,CA,USA)将所述载体转染入四种NSCLC细胞系,所述转染的效 率达到了60-90%以上。将细胞在有适当浓度遗传霉素(geneticin)存在的条件 下(G418)培养5-9天。用Giemsa染色和/或MTT实验以一式三份的方式测 定细胞数目或细胞存活力。
(5)流式细胞术
将细胞以5×105个细胞/100-毫米皿的浓度进行铺板,然后用上述的 siRNA-表达载体转染所述细胞。24-48小时,胰蛋白酶消化细胞,收集于 PBS种,并用70%冷乙醇固定30分钟。用100μg/ml RNAe(Sigma Chemical Co.-Aldrich,St.Louis,MO)处理后,用PBS中的50μg/ml二碘化丙锭 (propidium iodide)(Sigma-Aldrich)给细胞染色。在Becton Dickinson FACScan 上进行流式细胞计数,然后用ModFit软件(Verity Software House,Inc., Topsham,ME)进行分析。测定至少20,000个静止(ungated)细胞中处于细胞 周期G0/G1、S和G2/M阶段的核及亚-G1群所占的百分比。还利用基于膜 联蛋白V的结合的流式细胞术检测凋亡。
(6)RNAi
为了对那些可调节癌细胞生长、增殖和存活的新的分子靶标进行鉴定 和定性,使用psiH1BX3.0载体实施RNA干扰技术,抑制通过上述方法选 出的相应侯选基因的内源性表达。每种侯选基因的具体方法和结果如下所 示:
NSC 807:KOC1:设计了3种有效载体,所述载体能指导靶向所示基因 的19-碱基对双链序列的合成,将这些载体转染入NSCLC细胞系A549和 LC319。转染后5天,与对照相比,将RNAi载体导入该基因抑制了集落 (colony)数目(图3A和3B),这表明对KOC1的抑制降低了细胞的生长,增 殖和/或存活。该结果还得到了病灶形成实验(Giemsa染色)的证实(数据未给 出)。
NSC 810:TTK:设计了3种有效载体,所述载体能指导靶向所示基因 的19-碱基对双链序列的合成,将这些载体转染入NSCLC细胞系A549和 LC319。转染后5天,通过MTT实验发现:与对照相比,将RNAi载体导 入该基因明显抑制了细胞增殖(图3A和3B),这表明对TTK的抑制降低了 细胞的生长,增殖和/或存活。该结果还得到了病灶形成实验(Giemsa染色) 的证实(数据未给出)。将用有效TTK RNAi转染的LC319细胞用显微术 (microscopy)作进一步检验,每24或48天记录图像。所述TTK RNAi转染 过的LC319细胞显示多核化(multi-nucleated)细胞表型,出现完全细胞死亡 (complete cell death),而用上述EGFP RNAi转染的细胞显示单核化 (mono-nucleated)细胞表型(图3C)。通过使用抗-TTK单克隆抗体的Western 印迹分析,检测天然TTK蛋白在LC319细胞中的表达以及TTK RNAi对其 表达的抑制(图3E)。
NSC 825:ANLN:设计了2种有效载体,所述载体能指导靶向所示基因 的19-碱基对双链序列的合成,将这些载体转染入NSCLC细胞系A549和 LC319。转染后5天,通过MTT实验发现:与对照相比,将RNAi载体导 入该基因明显抑制了细胞增殖(图3A和3B),这表明对ANLN的抑制降低 了细胞的生长,增殖和/或存活。该结果还得到了病灶形成实验(Giemsa染色) 的证实(数据未给出)。用上述2种有效ANLN RNAi中任一个转染的LC319 细胞具有多核化细胞表型,且出现完全细胞死亡,而用EGFP RNAi转染过 的细胞显示单核化细胞表型(图3C)。通过流式细胞术测定ANLN RNAi转染 的细胞的细胞周期图谱,显示异常的细胞周期和多倍性(>4N DNA含量)(图 3D)。
NSC 841:URLC2:设计了2种能指导以该基因为靶标的19-碱基对双链 序列合成的有效载体,将这些载体转染入NSCLC细胞系A549和LC319。 转染后5天,通过MTT实验发现:与对照相比,该基因这些RNAi载体的 导入明显抑制了细胞增殖(图3A和3B),这表明对URLC2的抑制降低了细 胞的生长,增殖和/或存活。该结果还得到了病灶形成实验(Giemsa染色)的 证实(数据未给出)。在所述siRNA转染后24小时进行流式细胞计数。结果, 检测发现LC319细胞的亚-G1群增加了28%。上述URLC2-siRNA显著地 减少了凋亡,凋亡还用以膜联蛋白V结合为基础的流式细胞计数实验做了 评定(图3D)。
NSC 903:URLC9:设计了2种有效载体,所述载体能指导靶向所示基 因的19-碱基对双链序列的合成,将这些载体转染入NSCLC细胞系A549 和LC319。转染后5天,与对照相比,该基因的这些RNAi载体的导入明显 地抑制了集落数目(图3A和3B),这表明对URLC9的抑制降低了细胞的生 长,增殖和/或存活。该结果还得到了病灶形成实验(Giemsa染色)的证实(数 据未给出)。
NSC 956:SIAHBP1:设计了2种有效载体,所述载体能指导靶向所示基 因的19-碱基对双链序列的合成,将这些载体转染入NSCLC细胞系A549 和LC319。转染后5天,通过MTT实验发现:与对照相比,将RNAi载体 导入该基因明显抑制了细胞增殖(图3A和3B),这表明对SIAHBP1的抑制 降低了细胞的生长,增殖和/或存活。该结果还得到了病灶形成实验(Giemsa 染色)的证实(数据未给出)。
NSC 994:DKFZP434E2318:设计了2种有效载体,所述载体能指导靶 向所示基因的19-碱基对双链序列的合成,将这些载体转染入NSCLC细胞 系A549和LC319。转染后5天,通过MTT实验发现:与对照相比,该基 因的RNAi载体(No.1)的导入明显抑制了细胞增殖(图3A和3B),这表明 对DKFZP434E2318的抑制降低了细胞的生长,增殖和/或存活。该结果还 得到了病灶形成实验(Giemsa染色)的证实(数据未给出)。
NSC 1107:URLC8:设计了5种有效载体,所述载体能指导靶向所示基 因的19-碱基对双链序列的合成,将这些载体转染入NSCLC细胞系A549 和LC319。转染后5天,与对照相比,该基因的这些RNAi载体的导入明显 地抑制了集落数目(图3A和3B),这表明对URLC8的抑制降低了细胞的生 长,增殖和/或存活。该结果还得到了病灶形成实验(Giemsa染色)的证实(数 据未给出)。
NSC 1191:COX17:设计了2种有效载体,所述载体能指导靶向所示基 因的19-碱基对双链序列的合成,将这些载体转染入NSCLC细胞系A549 和LC319。转染后5天,通过MTT实验发现:与对照相比,该基因的RNAi 载体(No.2)的导入明显抑制了细胞增殖(图3A和3B),这表明对COX17的 抑制降低了细胞的生长,增殖和/或存活。该结果还得到了病灶形成实验 (Giemsa染色)的证实(数据未给出)。
NSC 1246:SUPT3H:设计了3种有效载体,所述载体能指导靶向所示 基因的19-碱基对双链序列的合成,将这些载体转染入NSCLC细胞系 A549。转染后5天,通过MTT实验发现:与对照相比,该基因的RNAi 载体(No.2)的导入明显抑制了细胞增殖(图3A和3B),这表明对SUPT3H 的抑制降低了细胞的生长,增殖和/或存活。该结果还得到了病灶形成实验 (Giemsa染色)的证实(数据未给出)。
NSC 1389:NMU:设计了2种有效载体,所述载体能指导靶向所示基因 的19-碱基对双链序列的合成,将这些载体转染入NSCLC细胞系A549和 LC319。转染后5天,通过MTT实验发现:与对照相比,该基因的RNAi 载体(No.2)的导入明显抑制了细胞增殖(图3A和3B),这表明对NMU的抑 制降低了细胞的生长,增殖和/或存活。该结果还得到了病灶形成实验 (Giemsa染色)的证实(数据未给出)。然后,在siRNA转染后24小时,进行 了流式细胞计数。结果,检测发现LC319细胞的亚-G1群增加了34.5%(图 3D)。
NSC 1395:FBN2:设计了一种有效载体,所述载体能指导靶向所示基 因的19-碱基对双链序列的合成,将该载体转染入NSCLC细胞系A549和 LC319。转染后5天,通过病灶形成实验(Giemsa染色)发现:与对照相比, 该基因的RNAi载体(No.2)的导入明显抑制了细胞增殖(数据未给出)。
(7)细胞色素c氧化酶活性
对A549细胞中的细胞色素c氧化酶(CCO)活性及所述活性被COX17 抑制的情况进行了测定。图3F图示了测定CCO活性的方法。具体而言, 用毛地黄皂苷(digotonin)将细胞分成线粒体及其它级分(Wako,Osaka, Japan)。将细胞色素c(63mM)在缓冲液(10mM Tris,0.2mM EDTA,0.05%n- 十二烷基-b-D-麦芽糖苷,pH7.6)中与12.5mM L(+)-抗坏血酸室温(18℃) 保温30分钟,将三价铁的细胞色素c转化为二价铁的细胞色素c。然后, 37℃将20微升1mg/ml线粒体蛋白溶液加入2ml上述混合物。在550nm 处测定上述反应的CCO活性。
为了说明人NSCLC细胞中上述天然COX17蛋白是否具有细胞色素c 氧化酶(CCO)活性,将有效COX17 RNAi载体转染入检测CCO活性用的 A549细胞系。转染后2-5天,COX活性由于内源COX17基因被抑制而减 弱。该结果证实了COX17发挥的CCO活性在人NSCLC中的重要性(图3F、 G和H)。
起RNAi作用的合成寡核苷酸的序列如表6所示。鉴定了30个基因, 其由于被反义S-寡核苷酸和/或RNAi转染而受到抑制将导致细胞的生长、 增殖和存活受到抑制。
表6:起RNAi作用的合成寡核苷酸的序列 NSC编号 代号 NO. RNAi SEQ ID No: 807 KOC1 1 5′-GGACCAAGCTAGACAAGCA-3′ 533 810 TTK 1 5′-ACAGTGTTCCGCTAAGTGA-3′ 534 825 ANLN 1 5′-CCAGTTGAGTCGACATCTG-3′ 535 2 5′-GCAGCAGATACCATCAGTG-3′ 536 841 URLC2 1 5′-CGCAGCTGCGAAGTGTTGTA-3′ 537 2 5′-GATACGAAAGCAGCTGCGA-3′ 538 903 URLC9 1 5′-GAGCGATTCATCTTCATCA-3′ 539 2 5′-CTGCAATTGAGGCTCCTTC-3′ 540 956 SIAHBP1 1 5′-GAGTGTGCTGGTGAAGCAG-3′ 541 2 5′-GATCAAGTCCTGCACACTG-3′ 542 994 DKFZp434E231 8 1 5′-CGTGCTAGCAGCTGCGTGT-3′ 543 1107 URLC8 1 5′-TGAGGTGCTCAGCACAGTG-3′ 544 2 5′-CGGAGGATCTCATGACCAC-3′ 545 3 5′-GATTCGCATCCTGCCATCG-3′ 546 4 5′-CAGTATTCGGACATAGAGG-3′ 547 5 5′-CACCAAGTACTGCTTGTGC-3′ 548 1191 COX17 2 5′-GGAGAAGAACACTGTGGAC-3′ 549 1246 SUPT3H 2 5′-GACAAATTGAGTGGCAGCA-3′ 550 1389 NMU 2 5′-GAGATTCAGAGTGGACGAA-3′ 551 1395 FBN2 2 5′-GAGAGCAATGAGGATGACT-3′ 552
(8)免疫细胞化学分析
为了制备c-myc-His标记的蛋白,合成了载体,所述载体含有编码位于 每种蛋白C末端的c-myc-His表位序列(LDEESILKQE-HHHHHH)的基因, 并将合成的载体转染入COS-7细胞。用含4%多聚甲醛的PBS固定重铺于 带槽载玻片(chamber slides)的经瞬时转染的COS-7细胞,然后用含0.1% Triton X-100的PBS在4℃处理3分钟使得这些细胞可通透化。上述细胞在 室温下用封闭溶液(2%牛血清白蛋白PBS溶液)覆盖30分钟,封闭非特异性 的抗体-结合位点。然后,用小鼠抗-c-myc抗体(用封闭液1∶800倍稀释) 保温上述细胞。用偶联有FITC的山羊抗-小鼠第二抗体对上述抗体进行染 色,置于ECLIPSE E800显微镜(Nikon)下观察。为了验证c-myc-标记的蛋 白在已经被转染的细胞中的表达,如前描述进行Western-印迹(Shiratsuchi et al.,Biochem Biophys Res Commun 247:597-604(1998))。
(9)潜在靶基因的产物在哺乳动物细胞中的定位
为了研究这些候选基因编码的蛋白在哺乳动物细胞中的细胞定位,用 pcDNA3.1(+)/c-myc-His转染COS-7细胞,pcDNA3.1(+)/c-myc-His是质 粒,其含有编码位于每种蛋白C末端的c-myc-His-表位序列 (LDEESILKQE-HHHHHH)基因。用抗-c-myc抗体,在不同的亚细胞位置检 测到24种蛋白。这些蛋白其中一些在已被转染的细胞中的表达得到了免疫 印迹实验的验证(图5A)。
(10)选择跨膜/分泌型蛋白作为抗-癌治疗和诊断的靶标
选择14种能于肿瘤细胞表面过表达的跨膜/分泌型蛋白。预期这些蛋白 是受体-靶向的/基于抗体的癌症治疗及诊断方法的良好靶标。用免疫细胞化 学分析验证了已被转染的COS-7细胞中所述蛋白其中一些的表达和细胞定 位。
为了测定每种所述基因所编码蛋白的亚细胞定位,用表达c-myc-His 或Flag标记的蛋白的质粒转染COS-7细胞。对每种基因进行免疫细胞化学 分析的结果如下所示:
NSC 807:KOC1:KOC1/c-myc-His蛋白主要见于(detected in)细胞质 (cytoplasm)(数据未显示)。
NSC 810:TTK:TTK/c-myc-His蛋白主要见于细胞核(nucleus)(数据未显 示)。
NSC 825:ANLN:ANLN-myc-His蛋白主要见于细胞核和细胞质(数据 未显示)。
NSC 841:URLC2:URLC2/c-myc-His蛋白主要见于细胞核和细胞质(数 据未显示)。
NSC 849:GJB5:GJB5/c-myc-His蛋白主要见于细胞质膜(cytoplasmic membrane)(图5a)。
NSC 855:LNIR:LNIR/c-myc-His蛋白主要见于细胞质膜(图5a)。
NSC 895:FAM3D:FAM3D/c-myc-His蛋白主要见于胞质颗粒 (cytoplasmic granule)、高尔基体(golgi)和细胞质膜(图5a)。Western印迹检测 到了FAM3D在培养基中的分泌(图5B)。因此,可以认为FAM3D是一种分 泌型蛋白。
NSC 903:URLC9:URLC9/c-myc-His蛋白主要见于细胞核(数据未显 示)。
NSC 915:URLC10:URLC10/c-myc-His蛋白主要见于胞质颗粒和高尔 基体,并且以斑点形式出现在细胞质膜表面(图5A)。
NSC 948:TASK-2:TASK-2/c-myc-His蛋白主要见于细胞质膜(图5A)。
NSC 956:SIAHBP1:SIAHBP1/c-myc-His蛋白主要见于细胞质(数据未 显示)。
NSC 994:DKFZp434E2318:DKFZp434E2318/c-myc-His蛋白主要见于 细胞质(数据未显示)。
NSC 1000:PSK-1:PSK-1/c-myc-His蛋白主要见于细胞质膜(图5A)。
NSC 1103:KCNK1:KCNK1/c-myc-His蛋白主要见于细胞质膜(图5A)。
NSC 1107:URLC8:URLC8/c-myc-His蛋白主要见于细胞核(数据未显 示)。
NSC 1164:NPTX1:NPTX1/c-myc-His蛋白主要见于胞质颗粒(图5A)。 Western印迹检测到了NPTX1在培养基中的分泌(图5B)。因此,可以认为 NPTX1是一种分泌型蛋白。
NSC 1191:COX17:COX17/c-myc-His蛋白主要见于线粒体(数据未显 示)。
NSC 1201:SLC7A1:SLC7A1/c-myc-His蛋白主要见于细胞质膜和高尔 基体(图5A)。
NSC 1246:SUPT3H:SUPT3H/c-myc-His蛋白主要见于细胞核和细胞质 (数据未显示)。
NSC 1288:PTGFRN:PTGFRN/c-myc-His蛋白主要见于细胞质膜和高尔 基体(图5A)。
NSC 1295:ADAM8:ADAM8/c-myc-His蛋白主要见于细胞质膜(图5A)。 Western印迹检测到了ADAM8的三种切割的形式(cleavaged form)在培养基 中的分泌(图5B)。因此,可以认为ADAM8是一种分泌型蛋白。
NSC 1389:NMU:NMU/c-myc-His蛋白主要见于高尔基体,并且为分泌 蛋白的形式(图5A)。
NSC 1420:CHDOL:CHDOL/c-myc-His蛋白主要见于细胞质膜和高尔 基体(图5A)。
NSC 1441:HSCOV:HSNOV/c-myc-His蛋白主要见于细胞质膜和高尔 基体(图5A)。
(12)细胞生长测定和菌落形成测定
按照常规方法建立稳定的转染子。具体而言,在将表达所述靶基因 (pcDNA3.1/myc-His)或该基因互补链(pcDNA3.1-反义)的质粒或模拟质粒 (pcDNA3.1)转染入COS-7细胞后,将该细胞与遗传霉素(G418)一起培养14 天。然后,选择集落,通过Western印迹检测所述基因的表达。用抗c-myc 抗体通过免疫染色验证了所建立的稳定转染子是单克隆的(数据未显示)。将 COS-7细胞的稳定转染子接种于6-孔微量滴定板(5×104个细胞/孔),然后 在加入抗生素的含10%FBS的培养基中维持24,48,72,96,120和144 个小时。在每一时点,用细胞计数试剂盒(WAKO)或通过MTT实验评估细 胞增殖活性。
(13)稳定的转化体的细胞生长测定和自分泌测定
NSC 810:TTK;为了测定TTK对哺乳动物细胞生长的影响,建立了表 达外源TTK的COS-7细胞(COS-7-TTK1和2),并将其生长情况与用模拟 载体转染的对照细胞进行对比。如图6所示,根据pcDNA3.1-TTK-c-myc-His 蛋白的表达水平,COS-7-TTK细胞的生长与对照细胞的生长相比显著加 快。该实验结果得到了3份独立实验的验证。所述COS-7-TTK细胞还表现 出形成大于对照细胞集落的细胞集落的明显倾向(数据未显示)。
NSC 841:URLC2;为了测定URLC2对哺乳动物细胞生长的影响,建立 了表达外源URLC2的NIH3T3细胞(NIH3T3-URLC2、3和5),并将其生 长情况与用模拟载体(NIH3T3-模拟)转染的对照细胞进行对比。如图6所示, 根据pcDNA3.1-URLC2-myc-His蛋白的表达水平,NIH3T3-URLC2细胞的 生长与对照细胞的相比显著提高。该实验结果得到了3份独立实验的验证。 所述NIH3T3-URLC2细胞还表现出形成大于对照细胞集落的细胞集落的明 显倾向(数据未显示)。
NSC 1389:NMU;为了测定NMU对哺乳动物细胞生长的影响,建立了 表达外源NMU的COS-7细胞(COS-7-NMU-2,3和5),并且将它们的生长 情况与用反义链或模拟载体(COS-7-AS-1和2;COS-7-模拟)转染的对照细 胞的生长进行对比。如图6所示,根据pcDNA3.1-NMU-c-myc/His蛋白的表 达水平,COS-7-NMU细胞的生长与对照细胞的生长相比显著提高。该实 验结果得到了四份独立实验的验证。所述COS-7-NMU细胞还表现出形成大 于对照细胞集落的细胞集落的明显倾向(数据未显示)。该结果表明过表达的 NMU对于哺乳动物细胞具有转化效用(transforming effect)。
(14)自分泌测定
为了证实NMU在细胞生长中的自分泌功能,将COS-7细胞培养在含 NMU的25氨基酸多肽之活性形式(NMU-25)的培养基中,NMU-25在培养 基中的终浓度为1μg~50μg(3μM~15μM/ml)。用含相同浓度的牛血清白蛋 白(BSA)的培养基作为对照。在为期7天的时间内,每48小时添加所述多 肽或BSA,持续7天。在第24、48、72、96、120和144小时的时间点, 通过MTT实验检测细胞存活力。为了验证NMU蛋白对COS-7细胞的生长 促进作用,向含3μM/ml NMU-25的培养基中加入终浓度为0.5μM~7.5 μM/ml的抗-NMU抗体。
结果发现,与NMU-25一同保温的COS-7细胞比与BSA一同保温的 COS-7细胞生长得更大而且更快,并且表现为剂量依赖性方式(图7A)。
接着,向含3μM/mlNMU-25的COS-7细胞培养物中加入终浓度为0.5 μM~7.5μM/ml的抗-NMU抗体。MTT实验结果发现,与NMU-25和抗-NMU 抗体共保温的COS-7细胞比对照细胞生长得更为缓慢,并且表现为剂量依 赖性方式(图7B)。
另外,向过表达内源NMU的LC319细胞培养物中加入相同浓度的抗 -NMU抗体。MTT实验结果发现,与抗-NMU抗体一同保温的LC319细胞 比对照细胞生长得更为缓慢,并且表现为剂量依赖性方式(图7C)。
(15)免疫组织化学分析
为了测定所述蛋白在包括正常肺和NSCLC在内的临床组织样品中的 表达情况,用ENVISION+Kit/HRP(DAKO)对切片染色。具体而言,在内 源过氧化物酶和蛋白封闭反应(protein blocking reaction)后,加入作为第一抗 体的抗-人抗体,然后用HRP标记的抗-兔IgG作为第二抗体处理所述组织 样品。然后,加入色原作为用苏木精对组织样品进行复染的底物。
为了验证TTK蛋白在NSCLC中的过表达,首先,通过Western印迹 分析鉴定NSCLC细胞系A549、LC319和NCI中的所述蛋白(图8)。然后, 对每种基因进行免疫组织化学染色,如下所述:
NSC 947:PKP3;用抗-PKP3抗体对用外科手术获得的NSCLC(鳞状细 胞癌)样品进行免疫组织化学染色,该组织样品已经被冷冻并包埋入OCT培 养基中。所有肿瘤组织样品的细胞质大部分都由抗-PKP3抗体染色,而正常 肺组织未被染色(图9)。
NSC 1164:NPTX1;用抗-NPTX1抗体对用外科手术获得的NSCLC样品 进行免疫组织化学染色,该组织样品已被冷冻并包埋入OCT培养基中。所 有肿瘤组织样品的细胞质大部分都被抗-NPTX1抗体染色,而正常肺组织未 被染色(图9)。
NSC 1295:ADAM8;用抗-ADAM8抗体对用外科手术获得的NSCLC样 品进行免疫组织化学染色,该组织样品已被冷冻并包埋入OCT培养基中。 所有肿瘤组织样品被抗-NPTX1抗体强染色,而正常肺组织仅被略微染色(图 9)。
NSC 1389:NMU;用抗-NMU抗体对用外科手术获得的NSCLC样品进 行免疫组织化学染色,该组织样品已被冷冻并包埋入OCT培养基中。所有 肿瘤组织样品的细胞质大部分都被抗-NMU抗体染色,而正常肺组织未被染 色。在腺癌样品中,NMU主要见于导管细胞以及细胞核周围的鳞状细胞癌 中,具体是胞质颗粒中(图9)。
(16)靶基因的全长测序、Northern印迹以及半定量RT-PCR分析
通过对在50%以上NSCLC中的表达与34份正常组织中的表达相比升 高5倍的过表达的基因之列表进行组合,选择642个候选基因作为肿瘤标 记或治疗的靶标,所选择的这些基因特异性表达于NSCLC中,而在除了 对于存活并非至关重要或者可被取代的生殖组织或胎儿器官之外的正常组 织中不表达。通过EST筛选测定所述靶基因的全长序列,而且用半定量 RT-PCR验证它们在肿瘤及正常组织中的基因表达模式。
发现了一种新基因URLC1。它的核苷酸序列及其编码的氨基酸序列在 序列表中具有以下SEQ ID NO:
      核苷酸序列    氨基酸序列
URLC1 SEQ ID NO:1  SEQ ID NO:2
上述方法对每一种本发明所述基因获得的结果概括如下:
NSC 807:KOC1;该基因编码一种hnRNA K-同源性(KH)结构域和一种 RNA识别基序(RRM)结构域。KH结构域具有与IGF-II IGF2)前导3’mRNA 的5’UTR结合的功能,因此可以抑制晚期发育期间IGF-II的翻译。该基因 在正常组织中表达较低,但在NSCLC中高表达,而且抑制该基因使得经 转染的细胞的生长、增殖和/或存活减弱,这些都表明该基因可以用作新诊 断标记以及新药和免疫疗法的靶标。
NSC 810:TTK;该基因编码一种STKc结构域。该基因所编码的蛋白 在丝氨酸、苏氨酸和酪氨酸上磷酸化,这种磷酸化可能与细胞增殖有关。 该基因在正常组织中表达较低,但在NSCLC中高表达,而且抑制该基因 使得经转染的细胞的生长、增殖和/或存活减弱,这些都表明该基因可以用 作新诊断标记以及新药和免疫疗法的靶标。按照本发明,表达于稳定的转 染子中的TTK蛋白以剂量依赖性方式促进了COS-7细胞的生长。这一结果 表明TTK的过表达对于哺乳动物细胞有促转化(transforming)作用。这些数 据表明:TTK是NSCLC的一种新的癌基因,可以通过靶向TTK建立治疗 肺癌的有希望的治疗手段。
NSC 811:SDC1;该基因编码一种推定的条带4.1同源物结合基序(4.1m) 结构域。该基因编码的蛋白是一种细胞表面蛋白聚糖,多配体蛋白聚糖, 是一种可充当细胞外基质受体的整合型膜蛋白。它属于跨膜硫酸乙酰肝素 蛋白聚糖(heparan sulfate proteoglycan)群体。该基因在正常组织中表达较低, 但在NSCLC中高表达,而且抑制该基因使得经转染的细胞的生长、增殖 和/或存活减弱,这些都表明该基因可以用作新诊断标记以及新药和免疫疗 法的靶标。
NSC 812:NMB;该基因编码一种信号肽和一种跨膜结构域。该基因编 码的蛋白可以发挥神经调节肽(neuromedin)B的功能,其为铃蟾肽(bombesin) 家族的一个成员,是一种肺癌的自分泌生长因子。该基因在正常组织中表 达较低,但在NSCLC中高表达,而且抑制该基因使得经转染的细胞的生 长、增殖和/或存活减弱,这些都表明该基因可以用作新诊断标记以及新药 和免疫疗法的靶标。
NSC 816:PIR51;该基因编码的蛋白定位于细胞核,并且在该蛋白中 未发现任何结构域。该蛋白可以充当DNA-和RNA-结合蛋白;并且与参与 DNA重组和修复的RAD51重组酶蛋白相互作用。该基因在正常组织中表 达较低,但在NSCLC中高表达,而且抑制该基因使得经转染的细胞的生 长、增殖和/或存活减弱,这些都表明该基因可以用作新诊断标记以及新药 和免疫疗法的靶标。
NSC 825:ANLN;这些基因编码一种PH结构域,现已发现其数种推 定的功能:(1)与异源三聚体G蛋白的β/γ亚单位结合;(2)与脂质例如, 磷脂酰肌醇-4,5-二磷酸结合;(3)与磷酸化的Ser/Thr残基结合;以及(4) 通过一种未知的机理附着于膜上。该基因编码一种肌动蛋白结合蛋白,这 种蛋白与卵裂沟(cleavage furrow)蛋白例如septins相互作用,能够在胞质分 裂(cytokenesis)中发挥作用。该基因在正常组织中表达较低,但在NSCLC 中高表达,而且抑制该基因使得经转染的细胞的生长、增殖和/或存活减弱, 这些都表明该基因可以用作新诊断标记以及新药和免疫疗法的靶标。
NSC 841:URLC2;该基因编码一种Jmjc结构域(部分cupin金属酶 (metalloenzyme)的结构域家族)。该基因编码的蛋白可能是一种功能未知的 酶,这种酶能够调节染色质重构(reorganization)过程。该基因在正常组织中 表达较低,但在NSCLC中高表达,而且抑制该基因使得经转染的细胞的 生长、增殖和/或存活减弱,这些都表明该基因可以用作新诊断标记以及新 药和免疫疗法的靶标。根据本实验,URLC2的抑制诱导了LC319细胞的凋 亡。而且,表达于稳定的转染子中的URLC2蛋白以剂量依赖性方式促进了 NIH3T3细胞的生长。这一结果表明过表达的URLC2对于哺乳动物细胞具 有转化作用。这些数据表明URLC2是NSCLC的一种新的癌基因,并提示 可以通过以URLC2为焦点建立一种治疗肺癌的有希望的治疗手段。
NSC 849:GJB5;该基因编码一种间隙连接蛋白,β5(连接蛋白 (connexin)31.1)。GJB5连接蛋白家族(β-型(i群)亚家族)的一个成员。据报 导一个间隙连接由一簇紧密堆积的成对跨膜通道连接子(connexon)组成,低 分子量物质通过它从一个细胞扩散至邻接细胞。连接子由连接蛋白六聚物 组成。通过免疫细胞化学分析检测,发现该基因编码的蛋白主要存在于细 胞质膜。该基因在正常组织中表达较低但高表达于NSCLC,这表明该基因 可以用作诊断标记(即,在使用血清或痰的诊断中)以及NSCLC的治疗靶标。
NSC 855:LNIR;该基因编码信号肽、免疫球蛋白、免疫球蛋白C2结 构域和一种跨膜结构域。该基因编码的跨膜蛋白过表达于肿瘤细胞表面上, 但不表达于正常细胞。因此,该基因是靶向受体的治疗或诊断的良好靶。
NSC 857:TIGD5;该基因编码一种着丝点蛋白(Centromere Protein)B(CENP-B)。CENP-B是一种定位至着丝点的DNA-结合蛋白。在该 蛋白N-末端的125个残基中,存在着DNA-结合结构域,该结构域能结合 相应的17bp CENP-B框序列。在C-末端59个残基中,CENP-B具有一个二 聚化结构域。CENP-B二聚体既可以结合两个分离的DNA分子,也可以结 合位于一个DNA分子上的两个CENP-B框,其中DNA的插入片段 (intervening stretch)形成环结构。该基因属于人DNA-介导的转座子pogo超 家族的tigger亚家族。属于该亚家族的蛋白与见于真菌及线虫(nematode)中 的DNA转座子相关,与Tc1和水手转座酶(mariner transposase)之间的关系 较远。该基因编码的蛋白还非常类似于主要(major)哺乳动物着丝点蛋白B。 该基因的确切功能还是未知的。该基因在正常组织中表达较低,但在NSCLC 中高表达,而且抑制该基因使得经转染的细胞的生长、增殖和/或存活减弱, 这些都表明该基因可以用作新诊断标记以及新药和免疫疗法的靶标。
NSC 859:URLC3;该基因不编码任一已知的结构域,该基因编码的 蛋白在56个氨基酸范围上与真核翻译起始因子3亚单位(人)之间具有70% 相似性。该亚单位结合40s核糖体,能促进甲硫氨酰-tRNAi与mRNA的结 合(通过相似性)。该基因在正常组织中表达较低,但在NSCLC中高表达,而 且抑制该基因使得经转染的细胞的生长、增殖和/或存活减弱,这些都表明 该基因可以用作新诊断标记以及新药和免疫疗法的靶标。
NSC 885:BAG5;该基因编码一种BAG结构域。因此,该基因编码的 蛋白是BAG1-相关蛋白家族的一个成员。该基因在正常组织中表达较低, 但在NSCLC中高表达,而且抑制该基因使得经转染的细胞的生长、增殖 和/或存活减弱,这些都表明该基因可以用作新诊断标记以及新药和免疫疗 法的靶标。
NSC 893:MPHOSP1;该基因编码一种KISc结构域及微管-依赖性的分 子马达(motor),其在细胞器的胞内运输以及细胞分裂中发挥重要作用。该 基因编码的蛋白属于驱动蛋白(kenesin)-样蛋白家族,与rab6a及rab6b的 鸟苷三磷酸gtp)-结合形式相互作用。该蛋白可以充当高尔基体膜及相关小 泡沿rab6调节的后退性(retrograde)转运所需的马达(motor)。该蛋白具有微 管正端-导向移动(microtubule plus end-directed motility),在细胞周期的M阶 段被磷酸化。该基因在正常组织中表达较低,但在NSCLC中高表达,而 且抑制该基因使得经转染的细胞的生长、增殖和/或存活减弱,这些都表明 该基因可以用作新诊断标记以及新药和免疫疗法的靶标。
NSC 895:FAM3D;该基因编码一种N-末端带有信号肽结构域的蛋白, 该蛋白被认为是一种分泌型蛋白,尽管它的功能还有待阐明。在免疫细胞 化学分析中,该蛋白主要见于胞质颗粒和高尔基体,这表明该蛋白是分泌 型的。该基因在正常组织中表达较低但高表达于NSCLC,这表明该基因可 以用作NSCLC的诊断标记(即,在使用血清或痰的诊断中)。
NSC 898:URLC7;该基因编码的蛋白定位于细胞核,并且该蛋白中不 存在任何已知的结构域。该基因在正常组织中表达较低,但在NSCLC中高 表达,而且抑制该基因使得经转染的细胞的生长、增殖和/或存活减弱,这 些都表明该基因可以用作新诊断标记以及新药和免疫疗法的靶标。
NSC 903:URLC9;该基因编码的蛋白定位于细胞核,并且该蛋白中不 存在任何已知的结构域。该基因在正常组织中表达较低,但在NSCLC中高 表达,而且抑制该基因使得经转染的细胞的生长、增殖和/或存活减弱,这 些都表明该基因可以用作新诊断标记以及新药和免疫疗法的靶标。
NSC 905:URLC1;这些基因编码一种TUDOR结构域,现已发现其 数种推定的功能:(1)RNA-结合;以及(2)核酸结合。该基因在正常组织中 表达较低,但在NSCLC中高表达,而且抑制该基因使得经转染的细胞的 生长、增殖和/或存活减弱,这些都表明该基因可以用作新诊断标记以及新 药和免疫疗法的靶标。
NSC 909:FLJ10468;该基因编码的蛋白定位于细胞核,并且该蛋白中 不存在任何已知的结构域。该基因在正常组织中表达较低,但在NSCLC中 高表达,而且抑制该基因使得经转染的细胞的生长、增殖和/或存活减弱, 这些都表明该基因可以用作新诊断标记以及新药和免疫疗法的靶标。
NSC 915:URLC10;该基因编码2个跨膜结构域。该基因编码的蛋白 具有一与GML具有低相似性的区域。通过免疫细胞化学分析发现,该蛋白 主要存在于胞质颗粒和高尔基体,并以斑点形式出现在细胞质膜上。推定 该基因编码的跨膜蛋白过表达于肿瘤细胞表面上,但不表达于正常细胞。 因此,该蛋白可以用作靶向受体的治疗或诊断的良好靶。
NSC 920:CHAF1A;未检测到该基因编码任一已知的结构域。该基因 编码的蛋白具有150kDa亚单位染色质装配因子1,其将有助于组蛋白H3 乙酰化H4沉积到正在复制的DNA上。该基因在正常组织中表达较低,但 在NSCLC中高表达,而且抑制该基因使得经转染的细胞的生长、增殖和/ 或存活减弱,这些都表明该基因可以用作新诊断标记以及新药和免疫疗法 的靶标。
NSC 947:PKP3;该基因编码一种犰狳(armadillo)/β-连环蛋白(catenin)- 样重复单元结构域(ARM)。犰狳重复单元是一种大约40氨基酸长串联重复 序列基序,其首先见于果蝇节段极性基因犰狳(armadillo)中。后来在哺乳动 物犰狳同源物β-连环蛋白即连接型噬斑蛋白斑珠蛋白(junctional plaque protein plakoglobin)、腺瘤的息肉病大肠菌(APC)肿瘤抑制基因蛋白以及许多 其它蛋白中发现了类似的重复。该基因编码的蛋白可以发挥plakophillin 3 的作用,介导蛋白-蛋白相互作用,是犰狳蛋白家族的一个成员。该基因在 正常组织中表达较低,但在NSCLC中高表达,而且抑制该基因使得经转染 的细胞的生长、增殖和/或存活减弱,这些都表明该基因可以用作新诊断标 记以及新药和免疫疗法的靶标。免疫组织化学染色显示:PKP3在鳞状细 胞癌细胞的细胞质中被强染色。这些数据表明PKP3可以作为治疗肺癌的一 种有效的治疗及诊断靶标。
NSC 948:TASK-2;该基因编码一种离子转运物结构域,信号肽 (SOSUI)。该基因编码一种蛋白,该蛋白属于含两个成孔P结构域的钾通道 蛋白超家族。该基因的mRNA主要表达于肾的皮质远段(distal)小管和集合 管。该基因编码的蛋白对外界pH高度敏感,这一点结合其表达模式表明: 该基因在肾脏的钾转运中发挥重要作用。该基因编码的跨膜蛋白过表达于 肿瘤细胞表面上,但不表达于正常细胞。因此,该蛋白可以用作靶向受体 的治疗或诊断的良好靶。
NSC 956:SIAHBP1;该基因编码一种RNA识别基序(RRM)结构域, 已知该结构域是一种核酸结合结构域。该基因编码的蛋白是一种Ro RNS- 结合蛋白。它与Ro RNPs相互作用从而活化Ro RNPs的功能。该蛋白还与 远上游元件(FUSE)以及FUSE-结合蛋白形成一种三元络合物。它能够通过 结合FUSE抑制c-myc报道物。转录因子IIH也是该蛋白的靶标,因而该蛋 白能够抑制经活化的转录。该基因还与着色性干皮病(xeroderma pigmentosum disorder)有关。该基因存在两种可选拼接转录物变体,所述变 体编码不同的同种型。该基因上存在多个腺苷酸化位点。该基因在正常组 织中表达较低,但在NSCLC中高表达,而且抑制该基因使得经转染的细 胞的生长、增殖和/或存活减弱,这些都表明该基因可以用作新诊断标记以 及新药和免疫疗法的靶标。
NSC 991:DOLPP1;该基因编码一种信号肽和一种酸性磷酸酶同源物 结构域。该基因编码的跨膜蛋白过表达于肿瘤细胞表面上,但不表达于正 常细胞。因此,该蛋白可以用作靶向受体的治疗或诊断的良好靶。
NSC 994:DKFZP434E2318;该基因编码BTB/POZ结构域和Kelch结 构域。BTB/POZ结构域是蛋白-蛋白相互作用基序。BTB/POZ结构域能介 导同聚二聚化(homomeric dimerization),而且在一些情况下还能介导杂聚二 聚化。数种锌指蛋白的POZ结构域介导转录抑制,并且与包括N-CoR及 SMART的组蛋白去乙酰化酶共-阻遏物复合体的组分相互作用。Kelch结构 域是一种参与蛋白-蛋白相互作用的β螺桨(propeller)结构域,具有某些类 似于gycolate氧化酶的酶促活性。该基因在正常组织中表达较低,但在 NSCLC中高表达,而且抑制该基因使得经转染的细胞的生长、增殖和/或存 活减弱,这些都表明该基因可以用作新诊断标记以及新药和免疫疗法的靶 标。
NSC 1000:PSK-1;这基因编码信号肽、CUB结构域,Sushi结构域(SCR 重复单元)以及一种跨膜结构域。该基因编码的蛋白高度近似于鼠Sez6,鼠 7 Sez6是一种粘附蛋白蛋白,其含有5个sushi(SCR)结构域和一个细胞外 的CUB结构域。推定该基因编码的跨膜蛋白过表达于肿瘤细胞表面上,但 不表达于正常细胞。因此,该蛋白可以用作靶向受体的治疗或诊断的良好 靶。
NSC 1066:MCM8;该基因编码与多种细胞活性结构域及微型染色体 保持(MCM)结构域相关的ATPase(AAA)。该基因在正常组织中表达较低但 高表达于正常组织,这些都表明该基因可以用作新诊断标记以及新药和免 疫疗法的靶标。
NSC 1075:URLC4;未检测到该基因编码的任一已知结构域。该基因 在正常组织中表达较低,但在NSCLC中高表达,而且抑制该基因使得经 转染的细胞的生长、增殖和/或存活减弱,这些都表明该基因可以用作新诊 断标记以及新药和免疫疗法的靶标。
NSC 1103:KCNK1;该基因编码一种蛋白,该蛋白属于含两个成孔P 结构域的钾通道蛋白超家族。没有显示该基因的产物是一种功能通道。其 它非孔道形成蛋白对于发挥功能通道活性可能为必要的。推定该跨膜蛋白 过表达于肿瘤细胞表面上,但不表达于正常细胞。因此,该蛋白可以用作 靶向受体的治疗或诊断的良好靶。
NSC 1107:URLC8;该基因编码一种双链RNA结合基序(DSRM)结构 域。该基因在正常组织中表达较低,但在NSCLC中高表达,而且抑制该 基因使得经转染的细胞的生长、增殖和/或存活减弱,这些都表明该基因可 以用作新诊断标记以及新药和免疫疗法的靶标。
NSC 1113:URLC5;未检测到该基因编码的任一已知结构域。该基因 在正常组织中表达较低,但在NSCLC中高表达,而且抑制该基因使得经 转染的细胞的生长、增殖和/或存活减弱,这些都表明该基因可以用作新诊 断标记以及新药和免疫疗法的靶标。
NSC 1131:SYNJ2BP;该基因编码一种PDZ跨膜结构域。该基因编码的 蛋白可能是一种靶向膜的信号蛋白,其含有PDZ结构域。该基因在正常组 织中表达较低,但在NSCLC中高表达,而且抑制该基因使得经转染的细 胞的生长、增殖和/或存活减弱,这些都表明该基因可以用作新诊断标记以 及新药和免疫疗法的靶标。
NSC 1141:URLC11;该基因编码9个跨膜结构域。该基因编码的跨膜 蛋白过表达于肿瘤细胞表面上,但不表达于正常细胞。因此,该蛋白可以 用作靶向受体的治疗或诊断的良好靶。
NSC 1142:NAPG;未检测到该基因编码的已知结构域。NAPG编码 的推定312-氨基酸人蛋白的序列与牛γSNAP之间具有95%的同一性。 NAPG蛋白介导血小板胞吐作用并且控制该过程的膜融合事件。该基因在正 常组织中表达较低,但在NSCLC中高表达,而且抑制该基因使得经转染 的细胞的生长、增殖和/或存活减弱,这些都表明该基因可以用作新诊断标 记以及新药和免疫疗法的靶标。
NSC 1164:NPTX1;该基因编码一种Pentaxin/C-反应蛋白。NPTX1是 神经元(neuronal)pentraxin基因家族的成员。神经元pentraxin 1类似于大鼠 NP1基因,后者编码蛇毒毒素结合蛋白。免疫细胞化学分析主要在胞质颗 粒中检测到该基因编码的蛋白。该基因在正常组织中表达较低但高表达于 正常组织,这表明该基因可以用作诊断标记(即,在使用血清或痰的诊断中) 以及NSCLC的治疗靶标。免疫组织化学染色表明:在腺癌细胞的细胞质中 NPTX1被强染色。这些数据表明NPTX1可以作为治疗肺癌的一种有效的治 疗及诊断靶标。
NSC 1183:BYSL;未检测到该基因编码的已知结构域。该基因编码的 蛋白具有bystin的功能,其与trophinin(TRO)以及TASTIN形成一种细胞粘 着分子复合体,该复合体对于胚胎植入具有重要意义。该基因在正常组织 中表达较低,但在NSCLC中高表达,而且抑制该基因使得经转染的细胞 的生长、增殖和/或存活减弱,这些都表明该基因可以用作新诊断标记以及 新药和免疫疗法的靶标。
NSC 1185:URLC6;该基因编码一种锌指RNA识别基序结构域。该基 因在正常组织中表达较低,但在NSCLC中高表达,而且抑制该基因使得 经转染的细胞的生长、增殖和/或存活减弱,这些都表明该基因可以用作新 诊断标记以及新药和免疫疗法的靶标。
NSC 1191:COX17;该基因编码的蛋白定位于线粒体膜间腔 (mitochondrial intermemebrane space)(通过相似性),并且能将铜转运至线粒 体。而且,该蛋白可能是细胞色素氧化酶表达所需的。该基因在正常组织 中表达较低,但在NSCLC中高表达,而且抑制该基因使得经转染的细胞 的生长、增殖和/或存活减弱,这些都表明该基因可以用作新诊断标记以及 新药和免疫疗法的靶标。
NSC 1201:SLC7A1;该基因编码14个跨膜结构域。该基因编码的蛋 白高度类似于鼠Rec-1(Atrc 1),其发挥阳离子氨基酸转运蛋白(cationic amino acid transporter)(生态型(ecotropic)反转录病毒受体),转运精氨酸、赖 氨酸和鸟氨酸通过质膜。通过免疫细胞化学分析,该蛋白主要见于细胞质 膜和高尔基体。该基因编码的跨膜蛋白过表达于肿瘤细胞表面上,但不表 达于正常细胞。因此,该蛋白可以用作靶向受体的治疗或诊断的良好靶。
NSC 1240:FLJ00159;该基因编码4个跨膜结构域。该基因编码的跨 膜蛋白过表达于肿瘤细胞表面上,但不表达于正常细胞。因此,该蛋白可 以用作靶向受体的治疗或诊断的良好靶。
NSC 1246:SUPT3H;该基因编码转录物启动因子αD,18kD亚单位。 含该基因编码蛋白在内的家族包括Spt3酵母转录因子以及人转录物起动因 子αD的18kD亚单位(TFαD-18)。晶体结构测定显示其是一种非典型的组 蛋白折叠。该基因在正常组织中表达较低但高表达于正常组织,这些都表 明该基因可以用作新诊断标记以及新药和免疫疗法的靶标。
NSC 1254:FLJ10815;该基因编码一种跨膜氨基酸转运蛋白。该跨膜 区在包括UNC-47和MTR的许多氨基酸转运蛋白中都已发现。UNC-47编 码一种囊泡状的(vesicular)氨基丁酸(GABA)转运蛋白(VGAT)。该基因编码 的蛋白的功能略微类似于氨基酸/植物生长激素通
透酶(auxin permease)(AAAP)家族的膜转运蛋白。该基因编码的跨膜蛋 白过表达于肿瘤细胞表面上,但不表达于正常细胞。因此,该蛋白可以用 作靶向受体的治疗或诊断的良好靶。
NSC 1265:SLC28A2;该基因编码Na+依赖性核苷转运蛋白。该基因 编码的蛋白能发挥钠-偶联的核苷转运蛋白2的作用,其可转运嘌呤核苷和 尿嘧啶核苷。该基因编码的跨膜蛋白过表达于肿瘤细胞表面上,但不表达 于正常细胞。因此,该蛋白可以用作靶向受体的治疗或诊断的良好靶。
NSC 1273:FLJ32549;未检测到该基因编码的任一已知结构域。该基 因在正常组织中表达较低,但在NSCLC中高表达,而且抑制该基因使得 经转染的细胞的生长、增殖和/或存活减弱,这些都表明该基因可以用作新 诊断标记以及新药和免疫疗法的靶标。
NSC 1288:PTGFRN;该基因编码信号肽、6个免疫球蛋白结构域和一 个跨膜结构域。该基因编码的蛋白是通过减少受体数目而非通过降低亲合 常数来抑制前列腺素f2-α(pgf2-α)与其特异性fp受体的结合。该蛋白看上 去能与前列腺素f2-α受体功能性偶联。通过免疫细胞化学分析检测出,该 蛋白主要见于细胞质膜和高尔基体。该基因编码的跨膜蛋白过表达于肿瘤 细胞表面上,但不表达于正常细胞。因此,该蛋白可以用作靶向受体的治 疗或诊断的良好靶。
NSC 1292:C17orf26;该基因编码3个跨膜结构域、锌转运蛋白结构域 和信号肽(SOSUI)。该基因编码的跨膜蛋白过表达于肿瘤细胞表面上,但不 表达于正常细胞。因此,该蛋白可以用作靶向受体的治疗或诊断的良好靶。
NSC 1295:ADAM8;该基因编码蛇去整联蛋白同源蛋白、Reprolysin家 族原肽和Reprolysin(M12B)家族锌金属蛋白酶。ADAM家族的成员是具有 独特结构的细胞表面蛋白,该结构含有潜在的粘附和蛋白酶结构域。 ADAM8的胞外区显示与蛇毒蛋白的显著氨基酸顺序同源性,其中含有金 属蛋白酶和去整联蛋白结构域。该基因在正常组织中表达较低但在NSCLC 中高表达,这表明该基因可以用作诊断标记(即,在使用血清或痰的诊断中) 以及NSCLC的治疗靶标。免疫组织化学染色表明:腺癌细胞中ADAM8被 强染色。这些数据表明ADAM8可以作为治疗肺癌的一种有效的治疗及诊 断靶标。
NSC 1306:ABCA4;该基因编码信号肽和AAA结构域。该基因编码的 膜-结合蛋白是ATP-结合框(ABC)转运蛋白超家族的成员。所述ABC蛋白 转运各种分子通过胞外膜和胞内膜。ABC基因分为7种不同的亚家族 (ABC1,MDR/TAP,MRP,ALD,OABP,GCN20和White)。该基因编码 的蛋白是ABC1亚家族的成员。ABC1亚家族的成员包括只出现于多细胞真 核生物中的唯一主要ABC亚家族。该蛋白是一种视网膜-特异性ABC转运 蛋白,其使用N-retinylidene-PE作为底物。该蛋白仅仅表达于视网膜感光 细胞,表明该基因产物介导必需分子通过感光细胞膜。该基因的突变见于 诊断患有Stargardt病的患者,与色素性视网膜炎(retinis pigmentosa)-19和 黄斑变性年龄-相关2(macular degeneration age-related 2)有关。该基因编码 的跨膜蛋白过表达于肿瘤细胞表面上,但不表达于正常细胞。因此,该蛋 白可以用作靶向受体的治疗或诊断的良好靶。
NSC 1343:GPR49;该基因编码信号肽,富含亮氨酸的修复N-末端结 构域和7跨膜受体(视紫红质家族)。该基因编码的蛋白属于G蛋白-偶联的 受体家族,该家族成员带有大的包含富含亮氨酸受体的胞外区域。该基因 编码的跨膜蛋白过表达于肿瘤细胞表面上,但不表达于正常细胞。因此, 该蛋白可以用作靶向受体的治疗或诊断的良好靶。
NSC 1362:SCAMP5;该基因编码4个跨膜结构域。推定该基因编码的 跨膜蛋白过表达于肿瘤细胞表面上,但不表达于正常细胞。因此,该蛋白 可以用作靶向受体的治疗或诊断的良好靶。
NSC 1389:NMU;该基因编码NMU结构域。与大多数活性肽一样, 该基因编码的蛋白是由较大前体蛋白通过蛋白水解处理而成。该蛋白的成 熟肽长度为8-25个残基,其C-末端被酰胺化。该蛋白刺激肌肉收缩,特别 是胃肠道的肌肉,并抑制摄食。该基因在正常组织中表达较低,但在NSCLC 中高表达,而且抑制该基因使得经转染的细胞的生长、增殖和/或存活减弱, 这些都表明该基因可以用作新诊断标记以及新药和免疫疗法的靶标。根据 本实验,稳定转化体分泌入培养基的NMU蛋白,或添加入培养基中的NMU 肽活性形式,以剂量依赖性方式促进COS-7细胞的生长。根据免疫组织化 学染色,在腺癌细胞和鳞状癌细胞的细胞质中NMU蛋白都被强染色。这些 数据表明NMU可能是NSCLC的一种重要的自分泌生长因子,提示可以以 NMU配体-受体系统中心发展一种治疗肺癌行之有效的治疗及诊断策略。另 外,对NMU的抑制诱导LC39细胞凋亡。而且,与对照LC319细胞相比, 抗-NMU抗体对NMU蛋白的抑制诱导生长抑制。这些结果表明肺癌可以使 用抗体或靶向NMU的siRNA来治疗。
NSC 1395:FBN2;该基因编码钙-结合EGF-样(EGF CA)结构域和一 EGF样(未分类的亚家族)结构域。该基因编码的蛋白发挥原纤蛋白2的作用, 原纤蛋白2是一种胞外基质蛋白,能调节胞外微纤丝的形成和保持。FBN2 的突变会引发先天性先天性挛缩蜘蛛脚样指(congeintal contractual arachnodactyly)。该基因在正常组织中表达较低,但在NSCLC中高表达, 而且抑制该基因使得经转染的细胞的生长、增殖和/或存活减弱,这些都表 明该基因可以用作新诊断标记以及新药和免疫疗法的靶标。
NSC 1420:CHDOL;该基因编码一种带有碳水化合物识别结构域的I 型膜蛋白,该结构域是其胞外部分中C-型植物凝集素的特征。在其它蛋白 中,该结构域参与糖蛋白和外源含糖病原的细胞内吞。该机因编码的蛋白 主要位于核周区。通过免疫细胞化学分析,该蛋白主要见于细胞质膜和高 尔基体。推定该基因编码的跨膜蛋白过表达于肿瘤细胞表面上,但不表达 于正常细胞。因此,该蛋白可以用作靶向受体的治疗或诊断的良好靶。
NSC 1441:HSNOV1;该基因编码整合型(integral)膜蛋白DFU6结构域。 通过免疫细胞化学分析检测,发现该基因编码的蛋白主要存在于细胞质膜 和高尔基体。该基因编码的跨膜蛋白过表达于肿瘤细胞表面上,但不表达 于正常细胞。因此,该蛋白可以用作靶向受体的治疗或诊断的良好靶。
工业实用性
通过激光-俘获解剖和基因组范围cDNA阵列的结合,对本申请所述的 非小细胞肺癌进行的基因表达分析鉴定出了可作为预防和治疗非小细胞肺 癌靶标的具体基因。根据这些差异表达的基因的亚组的表达,本发明提供 了用于鉴定或检测非小细胞肺癌的分子诊断标记。
本申请所述方法还可用于鉴定可用于预防、诊断和治疗非小细胞肺癌 的其它分子靶标。本申请报道的数据使得对非小细胞肺癌的理解更全面, 有助于开发新的诊断策略,并为鉴定治疗药物和预防药剂的分子靶标提供 了线索。这些信息使得对癌发生有了更加深入的认识,并为开发诊断、治 疗及最终预防非小细胞肺癌新策略提供了启示。
尽管结合本发明具体实施方案对本发明进行了详细描述,但是本领域 技术人员显然明白在不脱离本发明实质和范围的前提下可以对本发明进行 各种变动和修改
                             序列表
<110>肿瘤疗法科学股份有限公司(ONCOTHERAPY SCIENCE,INC.) JAPAN AS REPRESENTED BY THE PRESIDENT OF THE UNIVERSITY OF TOKYO
<120>非小细胞肺癌的诊断方法
<130>ONC-A0212Y2P
<150>US 60/414,673
<151>2002-09-30
<150>US 60/451,374
<151>2003-02-28
<150>US 60/466,100
<151>2003-04-28
<160>552
<170>PatentIn version 3.1
<210>1
<211>2235
<212>DNA
<213>人(Homo sapiens)
<400>1
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<210>2
<211>573
<212>PRT
<213>人(Homo sapiens)
<400>2
Met Ser Lys Lys Pro Pro Asn Arg Pro Gly Ile Thr Phe Glu Ile Gly
1                   5               10                  15
Ala Arg Leu Glu Ala Leu Asp Tyr Leu Gln Lys Trp Tyr Pro Ser Arg
             20                 25                  30
Ile Glu Lys Ile Asp Tyr Glu Glu Gly Lys Met Leu Val His Phe Glu
        35                  40                  45
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    50                  55                  60
Leu Arg Pro Leu Glu Arg Pro Ala Leu Arg Lys Glu Gly Leu Lys Asp
65                  70                  75                  80
Glu Glu Asp Phe Phe Asp Phe Lys Ala Gly Glu Glu Val Leu Ala Arg
                85                  90                  95
Trp Thr Asp Cys Arg Tyr Tyr Pro Ala Lys Ile Glu Ala Ile Asn Lys
            100                 105                 110
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145                 150                 155                 160
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Pro Asp Val Glu Lys Lys Glu Asp Leu Pro Thr Ser Ser Glu Thr Phe
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Ala Val Gly Val Asp Gly Ala Glu Lys Lys Glu Asp Tyr Asn Glu Thr
    290                 295                 300
Ala Pro Met Leu Glu Gln Ala Ile Ser Pro Lys Pro Gln Ser Gln Lys
305                 310                 315                 320
Lys Asn Glu Ala Asp Ile Ser Ser Ser Ala Asn Thr Gln Lys Pro Ala
                325                 330                 335
Leu Leu Ser Ser Thr Leu Ser Ser Gly Lys Ala Arg Ser Lys Lys Cys
            340                 345                 350
Lys His Glu Ser Gly Asp Ser Ser Gly Cys Ile Lys Pro Pro Lys Ser
        355                 360                 365
Pro Leu Ser Pro Glu Leu Ile Gln Val Glu Asp Leu Thr Leu Val Ser
    370                 375                 380
Gln Leu Ser Ser Ser Val Ile Asn Lys Thr Ser Pro Pro Gln Pro Val
385                 390                 395                 400
Asn Pro Pro Arg Pro Phe Lys His Ser Glu Arg Arg Arg Arg Ser Gln
                405                 410                 415
Arg Leu Ala Thr Leu Pro Met Pro Asp Asp Ser Val Glu Lys Val Ser
            420                 425                 430
Ser Pro Ser Pro Ala Thr Asp Gly Lys Val Phe Ser Ile Ser Ser Gln
        435                 440                 445
Asn Gln Gln Glu Ser Ser Val Pro Glu Val Pro Asp Val Ala His Leu
    450                 455                 460
Pro Leu Glu Lys Leu Gly Pro Cys Leu Pro Leu Asp Leu Ser Arg Gly
465                 470                 475                 480
Ser Glu Val Thr Ala Pro Val Ala Ser Asp Ser Ser Tyr Arg Asn Glu
                485                 490                 495
Cys Pro Arg Ala Glu Lys Glu Asp Thr Gln Met Leu Pr0 Asn Pro Ser
            500                 505                 5l0
Ser Lys Ala Ile Ala Asp Gly Arg Gly Ala Pro Ala Ala Ala Gly Ile
        5l5                 520                 525
Ser Lys Thr Glu Lys Lys Val Lys Leu Glu Asp Lys Ser Ser Thr Ala
    530                 535                 540
Phe Gly Ile Arg Ser Trp Asp Phe Ser Ala Leu Leu Met Lys Ile Pro
545                 550                 555                 560
Ser Tyr Ser Pro Ile Ser Leu Ser Gly Leu Pro Glu Ser
                565                 570
<210>3
<211>23
<212>DNA
<213>人工
<220>
<223>用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>3
taaatggctt caggagactt cag                                         23
<210>4
<211>24
<212>DNA
<213>人工
<220>
<223>用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>4
ggttttaaat gcagctccta tgtg                                        24
<210>5
<211>34
<212>DNA
<213>人工
<220>
<223>用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>5
atggaatccg aggatttaag tggcagagaa ttga                             34
<210>6
<211>37
<212>DNA
<213>人工
<220>
<223>用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>6
tttttttccc cttttttttt caaaagtctt ggaggat                          37
<210>7
<211>20
<212>DNA
<213>人工
<220>
<223>用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>7
gcttcctcct ggaaattgac                                             20
<210>8
<211>23
<212>DNA
<213>人工
<220>
<223>用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>8
tctactgtac agggaaaaac cca                                         23
<210>9
<211>23
<212>DNA
<213>人工
<220>
<223>用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>9
agtcgtggtt cagaagttac agc                                         23
<210>10
<211>23
<212>DNA
<213>人工
<220>
<223>用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>10
tctcttacca aatgctgttg agc                                         23
<210>11
<211>23
<212>DNA
<213>人工
<220>
<223>用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>11
catctggcat ttctgctctc tat                                         23
<210>12
<211>25
<212>DNA
<213>人工
<220>
<223>用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>12
ctcagggaaa ggagaataaa agaac                                      25
<210>13
<211>23
<212>DNA
<213>人工
<220>
<223>用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>13
gaagtatcaa aactccgctg tca                                        23
<210>14
<211>23
<212>DNA
<213>人工
<220>
<223>用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>14
atgctgagta gacatgcaga tga                                         23
<210>15
<211>23
<212>DNA
<213>人工
<220>
<223>用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>15
cggtatgcta atgaagatgg aga                                         23
<210>16
<211>23
<212>DNA
<213>人工
<220>
<223>用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>16
cacagggtat cagcaactgt gta                                        23
<210>17
<211>22
<212>DNA
<213>人工
<220>
<223>用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>17
agaagtatct gagcccctga tg                                          22
<210>18
<211>21
<212>DNA
<213>人工
<220>
<223>用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>18
gtctaacctc ccagctgttc c                                           21
<210>19
<211>23
<212>DNA
<213>人工
<220>
<223>用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>19
gctgcgtagc ttacagactt agc                                         23
<210>20
<211>23
<212>DNA
<213>人工
<220>
<223>用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>20
aaggcgttta aaggtgatag gtg                                         23
<210>21
<211>23
<212>DNA
<213>人工
<220>
<223>用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>21
gtttgcaacc aggagataca aag                                         23
<210>22
<211>23
<212>DNA
<213>人工
<220>
<223>用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>22
gctgtgaggt acaacaaatc aca                                         23
<210>23
<211>23
<212>DNA
<213>人工
<220>
<223>用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>23
cctcctttcc ctagagactc aat                                         23
<210>24
<211>23
<212>DNA
<213>人工
<220>
<223>用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>24
agaagcaaca gcaagaccac tac                                         23
<210>25
<211>23
<212>DNA
<213>人工
<220>
<223>用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>25
ttgcctatga aagataggtc ctg                                         23
<210>26
<211>23
<212>DNA
<213>人工
<220>
<223>用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>26
gttttaatgc ccagatagca cag                                         23
<210>27
<211>21
<212>DNA
<213>人工
<220>
<223>用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>27
aggagaagtt ggaggtggaa a                                           21
<210>28
<211>23
<212>DNA
<213>人工
<220>
<223>用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>28
cagatgaaag atccaaattc caa                                         23
<210>29
<211>23
<212>DNA
<213>人工
<220>
<223>用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>29
tccacgactt cttattctcc ttg                                         23
<210>30
<211>23
<212>DNA
<213>人工
<220>
<223>用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>30
catttctttt agggactggg gta                                         23
<210>31
<211>23
<212>DNA
<213>人工
<220>
<223>用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>31
gagaaactga agtcccagga aat                                         23
<210>32
<211>23
<212>DNA
<213>人工
<220>
<223>用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>32
ctgatacttc cattcgcttc aac                                         23
<210>33
<211>20
<212>DNA
<213>人工
<220>
<223>用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>33
agctaagcca tgaggtaggg                                             20
<210>34
<211>21
<212>DNA
<213>人工
<220>
<223>用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>34
cgcatgtgtg ttcttctatg a                                           21
<210>35
<211>23
<212>DNA
<213>人工
<220>
<223>用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>35
ccaagacagg cagagtaggt aaa                                         23
<210>36
<211>22
<212>DNA
<213>人工
<220>
<223>用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>36
cattttcatt gtgatcagcc ag                                          22
<210>37
<211>23
<212>DNA
<213>人工
<220>
<223>用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>37
tgtatggggg attacctaca cac                                         23
<210>38
<211>21
<212>DNA
<213>人工
<220>
<223>用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>38
aaaggagcac aacaaacatg c                                           21
<210>39
<211>23
<212>DNA
<213>人工
<220>
<223>用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>39
tgtccaagga gtctgaagtt ctc                                         23
<210>40
<211>23
<212>DNA
<213>人工
<220>
<223>用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>40
cttgccacca tacctttatt ctg                                        23
<210>41
<211>23
<212>DNA
<213>人工
<220>
<223>用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>41
cgagagagta ggagttgagg tga                                         23
<210>42
<211>23
<212>DNA
<213>人工
<220>
<223>用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>42
cagaaatcca gcagatttca gac                                         23
<210>43
<211>20
<212>DNA
<213>人工
<220>
<223>用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>43
gaacaggtgg ctgtgttcct                                             20
<210>44
<211>23
<212>DNA
<213>人工
<220>
<223>用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>44
atagaatcaa gtggtgtgct tcg                                         23
<210>45
<211>23
<212>DNA
<213>人工
<220>
<223>用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>45
ctgagacttt gagtccttgg gag                                         23
<210>46
<211>23
<212>DNA
<213>人工
<220>
<223>用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>46
ttcctcattt ctctcagtaa ccg                                         23
<210>47
<211>23
<212>DNA
<213>人工
<220>
<223>用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>47
aacaatgcaa agtagtgctc ctc                                         23
<210>48
<211>23
<212>DNA
<213>人工
<220>
<223>用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>48
gctgaacttc tttatgctct tcg                                         23
<210>49
<211>23
<212>DNA
<213>人工
<220>
<223>用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>49
acctttgatt ttagactgag ggc                                         23
<210>50
<211>23
<212>DNA
<213>人工
<220>
<223>用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>50
acactgggtt gtgtgttatt tcc                                         23
<210>51
<211>23
<212>DNA
<213>人工
<220>
<223>用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>51
atgagcctct catccatgtc ttt                                         23
<210>52
<211>23
<212>DNA
<213>人工
<220>
<223>用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>52
agtaagagtc tgcctgagac acg                                         23
<210>53
<211>21
<212>DNA
<213>人工
<220>
<223>用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>53
agaaaatggg ggtgcaagta g                                           21
<210>54
<211>22
<212>DNA
<213>人工
<220>
<223>用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>54
taaccaaatt aacacgtgct gg                                          22
<210>55
<211>23
<212>DNA
<213>人工
<220>
<223>用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>55
agaaaagttg gagaagatga ggg                                         23
<210>56
<211>23
<212>DNA
<213>人工
<220>
<223>用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>56
gccacctctg tgagagagtc taa                                         23
<210>57
<211>21
<212>DNA
<213>人工
<220>
<223>用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>57
agaactagtg tgaccccacc c                                           21
<210>58
<211>22
<212>DNA
<213>人工
<220>
<223>用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>58
gcttgccttt tcccttagta gg                                          22
<210>59
<211>23
<212>DNA
<213>人工
<220>
<223>用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>59
agggaaatga agacaggaga act                                         23
<210>60
<211>23
<212>DNA
<213>人工
<220>
<223>用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>60
 gagacacggc ttaagaagtt ttg                                        23
<210>61
<211>23
<212>DNA
<213>人工
<220>
<223>用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>61
gcttgtaaag tcctcggaaa gtt                                         23
<210>62
<211>23
<212>DNA
<213>人工
<220>
<223>用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>62
atctcaactc tgcatcatct ggt                                         23
<210>63
<211>22
<212>DNA
<213>人工
<220>
<223>用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>63
ataagagaaa tattggccat cg                                          22
<210>64
<211>23
<212>DNA
<213>人工
<220>
<223>用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>64
gcaagcgtaa gagactggtt tta                                         23
<210>65
<211>23
<212>DNA
<213>人工
<220>
<223>用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>65
caaatattag gtggagccaa cac                                         23
<210>66
<211>23
<212>DNA
<213>人工
<220>
<223>用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>66
tagatcacct tggcaaagaa cac                                         23
<210>67
<211>22
<212>DNA
<213>人工
<220>
<223>用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>67
acacacagag aggaggaagt ct                                          22
<210>68
<211>22
<212>DNA
<213>人工
<220>
<223>用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>68
gagtctttat ggagctgtgt ca                                          22
<210>69
<211>21
<212>DNA
<213>人工
<220>
<223>用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>69
caggccaagt gattttaatg g                                           21
<210>70
<211>22
<212>DNA
<213>人工
<220>
<223>用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>70
caatacagga tgcaagttcc aa                                          22
<210>71
<211>23
<212>DNA
<213>人工
<220>
<223>用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>71
acagcccaga cacaaacaaa tac                                         23
<210>72
<211>20
<212>DNA
<213>人工
<220>
<223>用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>72
accccattct ctccacagac                                             20
<210>73
<211>23
<212>DNA
<213>人工
<220>
<223>用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>73
tacaggccag gatagaaaca ctc                                         23
<210>74
<211>22
<212>DNA
<213>人工
<220>
<223>用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>74
gttcaaatat tgaaagggcc ac                                          22
<210>75
<211>23
<212>DNA
<213>人工
<220>
<223>用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>75
agttatgggt tcctgtgtgc tta                                         23
<210>76
<211>23
<212>DNA
<213>人工
<220>
<223>用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>76
aaaggcctgt tcacaagcta agt                                         23
<210>77
<211>21
<212>DNA
<213>人工
<220>
<223>用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>77
ctcgtgaagc ctcagatgtc c                                           21
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<213>人工
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<223>用于RT-PCR的人工合成的引物序列
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<212>DNA
<213>人工
<220>
<223>用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>79
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<213>人工
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<223>用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>80
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<213>人工
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<223>用于RT-PCR的人工合成的引物序列
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<213>人工
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<213>人工
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<223>用于RT-PCR的人工合成的引物序列
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<213>人工
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<213>人工
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<213>人工
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<400>90
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<213>人工
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<213>人工
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<213>人工
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<400>94
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<211>22
<212>DNA
<213>人工
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<223>用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>95
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<213>人工
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<223>用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>96
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<213>人工
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<223>用于RT-PCR的人工合成的引物序列
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<213>人工
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<223>用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>98
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<213>人工
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<223>用于RT-PCR的人工合成的引物序列
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<400>100
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<213>人工
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<223>用于RT-PCR的人工合成的引物序列
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<213>人工
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<223>用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>104
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<213>人工
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<223>用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>105
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<213>人工
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<223>用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>106
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<213>人工
<220>
<223>用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>107
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<213>人工
<220>
<223>用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>108
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<213>人工
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<213>人工
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<223>用于RT-PCR的人工合成的引物序列
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<213>人工
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<213>人工
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<223>用于RT-PCR的人工合成的引物序列
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<213>人工
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<213>人工
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<213>人工
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<213>人工
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<400>118
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<213>人工
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<223>用于RT-PCR的人工合成的引物序列
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<213>人工
<220>
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<213>人工
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<223>用于RT-PCR的人工合成的引物序列
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<213>人工
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<213>人工
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<213>人工
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<213>人工
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<223>用于RT-PCR的人工合成的引物序列
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<213>人工
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<213>人工
<220>
<223>用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>128
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<213>人工
<220>
<223>用于RT-PCR的人工合成的引物序列
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<213>人工
<220>
<223>用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>130
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<213>人工
<220>
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<213>人工
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<223>用于RT-PCR的人工合成的引物序列
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<213>人工
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<212>DNA
<213>人工
<220>
<223>用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>134
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<212>DNA
<213>人工
<220>
<223>用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>135
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<213>人工
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<223>用于RT-PCR的人工合成的引物序列
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<213>人工
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<223>用于RT-PCR的人工合成的引物序列
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<213>人工
<220>
<223>用于RT-PCR的人工合成的引物序列
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<213>人工
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<213>人工
<220>
<223>用于RT-PCR的人工合成的引物序列
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<213>人工
<220>
<223>用于RT-PCR的人工合成的引物序列
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<213>人工
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<213>人工
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<223>用于RT-PCR的人工合成的引物序列
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<213>人工
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<223>用于RT-PCR的人工合成的引物序列
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<213>人工
<220>
<223>用于RT-PCR的人工合成的引物序列
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<213>人工
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<223>用于RT-PCR的人工合成的引物序列
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<210>147
<211>23
<212>DNA
<213>人工
<220>
<223>用于RT-PCR的人工合成的引物序列
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<210>148
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<212>DNA
<213>人工
<220>
<223>用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>148
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<212>DNA
<213>人工
<220>
<223>用于RT-PCR的人工合成的引物序列
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<213>人工
<220>
<223>用于RT-PCR的人工合成的引物序列
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<212>DNA
<213>人工
<220>
<223>用于RT-PCR的人工合成的引物序列
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<211>23
<212>DNA
<213>人工
<220>
<223>用于RT-PCR的人工合成的引物序列
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<210>153
<211>23
<212>DNA
<213>人工
<220>
<223>用于RT-PCR的人工合成的引物序列
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<210>154
<211>22
<212>DNA
<213>人工
<220>
<223>用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>154
ccgacctacc ttccctagaa at                                          22
<210>155
<211>23
<212>DNA
<213>人工    
<220>
<223>用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>155
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<210>156
<211>22
<212>DNA
<213>人工
<220>
<223>用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>156
tatgaggcca ttctgcacat ta                                          22
<210>157
<211>22
<212>DNA
<213>人工
<220>
<223>用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>157
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<212>DNA
<213>人工
<220>
<223>用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>158
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<210>159
<211>23
<212>DNA
<213>人工
<220>
<223>用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>159
aatatggaat ccctacccac agt                                         23
<210>160
<211>22
<212>DNA
<213>人工
<220>
<223>用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>160
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<211>23
<212>DNA
<213>人工
<220>
<223>用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>161
gaggccattt tagttctgag gtt                                         23
<210>162
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<212>DNA
<213>人工
<220>
<223>用于RT-PCR的人工合成的引物序列
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<210>163
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<212>DNA
<213>人工
<220>
<223>用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>163
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<211>23
<212>DNA
<213>人工
<220>
<223>用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>164
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<212>DNA
<213>人工
<220>
<223>用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>165
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<213>人工
<220>
<223>用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>166
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<212>DNA
<213>人工
<220>
<223>用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>167
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<212>DNA
<213>人工
<220>
<223>用于RT-PCR的人工合成的引物序列
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<212>DNA
<213>人工
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<223>用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>169
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<213>人工
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<223>用于RT-PCR的人工合成的引物序列
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<212>DNA
<213>人工
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<223>用于RT-PCR的人工合成的引物序列
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<213>人工
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<223>用于RT-PCR的人工合成的引物序列
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<213>人工
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<223>用于RT-PCR的人工合成的引物序列
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<213>人工
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<223>用于RT-PCR的人工合成的引物序列
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<212>DNA
<213>人工
<220>
<223>用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>178
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<212>DNA
<213>人工
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<223>用于RT-PCR的人工合成的引物序列
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<212>DNA
<213>人工
<220>
<223>用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>180
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<211>23
<212>DNA
<213>人工
<220>
<223>用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>181
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<211>23
<212>DNA
<213>人工
<220>
<223>用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>182
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<211>23
<212>DNA
<213>人工
<220>
<223>用于RT-PCR的人工合成的引物序列
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<211>23
<212>DNA
<213>人工
<220>
<223>用于RT-PCR的人工合成的引物序列
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<213>人工
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<223>用于RT-PCR的人工合成的引物序列
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<211>23
<212>DNA
<213>人工
<220>
<223>用于RT-PCR的人工合成的引物序列
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<213>人工
<220>
<223>用于RT-PCR的人工合成的引物序列
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<213>人工
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<223>用于RT-PCR的人工合成的引物序列
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<212>DNA
<213>人工
<220>
<223>用于RT-PCR的人工合成的引物序列
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<213>人工
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<212>DNA
<213>人工
<220>
<223>用于RT-PCR的人工合成的引物序列
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<213>人工
<220>
<223>用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>192
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<213>人工
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<213>人工
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<223>用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>194
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<213>人工
<220>
<223>用于RT-PCR的人工合成的引物序列
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<223>用于RT-PCR的人工合成的引物序列
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<223>用于RT-PCR的人工合成的引物序列
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<223>用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>199
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<213>人工
<220>
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<213>人工
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<223>用于RT-PCR的人工合成的引物序列
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<212>DNA
<213>人工
<220>
<223>用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>202                                                          23
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<212>DNA
<213>人工
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<223>用于RT-PCR的人工合成的引物序列
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<213>人工
<220>
<223>用于RT-PCR的人工合成的引物序列
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<212>DNA
<213>人工
<220>
<223>用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>205
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<212>DNA
<213>人工
<220>
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<213>人工
<220>
<223>用于RT-PCR的人工合成的引物序列
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<213>人工
<220>
<223>用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>208
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<213>人工
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<223>用于RT-PCR的人工合成的引物序列
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<213>人工
<220>
<223>用于RT-PCR的人工合成的引物序列
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<212>DNA
<213>人工
<220>
<223>用于RT-PCR的人工合成的引物序列
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<212>DNA
<213>人工
<220>
<223>用于RT-PCR的人工合成的引物序列
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<211>23
<212>DNA
<213>人工
<220>
<223>用于RT-PCR的人工合成的引物序列
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<211>23
<212>DNA
<213>人工
<220>
<223>用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>214
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<211>22
<212>DNA
<213>人工
<220>
<223>用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>215
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<211>23
<212>DNA
<213>人工
<220>
<223>用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>216
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<212>DNA
<213>人工
<220>
<223>用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>217
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<211>23
<212>DNA
<213>人工
<220>
<223>用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>218
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<211>23
<212>DNA
<213>人工
<220>
<223>用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>219
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<210>220
<211>23
<212>DNA
<213>人工
<220>
<223>用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>220
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<211>23
<212>DNA
<213>人工
<220>
<223>用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>221
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<211>23
<212>DNA
<213>人工
<220>
<223>用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>222
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<212>DNA
<213>人工
<220>
<223>用于RT-PCR的人工合成的引物序列
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<211>22
<212>DNA
<213>人工
<220>
<223>用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>224
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<212>DNA
<213>人工
<220>
<223>用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>225
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<210>226
<211>20
<212>DNA
<213>人工
<220>
<223>用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>226
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<211>23
<212>DNA
<213>人工
<220>
<223>用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>227
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<210>228
<211>22
<212>DNA
<213>人工
<220>
<223>用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>228
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<211>22
<212>DNA
<213>人工
<220>
<223>用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>229
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<210>230
<211>23
<212>DNA
<213>人工
<220>
<223>用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>230
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<210>231
<211>23
<212>DNA
<213>人工
<220>
<223>用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>231
tcaagcaata tgaagtaggg ctc                                         23
<210>232
<211>23
<212>DNA
<213>人工
<220>
<223>用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>232
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<210>233
<211>23
<212>DNA
<213>人工
<220>
<223>用于RT-PCR的人工合成的引物序列    
<400>233
ctgcctctta ctcgtcacag ttt                                         23
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<211>22
<212>DNA
<213>人工
<220>
<223>用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>234
tgacttcttt gaagtgaagg ct                                          22
<210>235
<211>23
<212>DNA
<213>人工
<220>
<223>用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>235
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<210>236
<211>22
<212>DNA
<213>人工
<220>
<223>用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>236
gatcacatgc caagaacaca at                                          22
<210>237
<211>23
<212>DNA
<213>人工
<220>
<223>用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>237
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<210>238
<211>23
<212>DNA
<213>人工
<220>
<223>用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>238
gtcctcttat aaggctcact ccc                                          23
<210>239
<211>23
<212>DNA
<213>人工
<220>
<223>用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>239
gatgttagag actccttcac cca                                         23
<210>240
<211>23
<212>DNA
<213>人工
<220>
<223>用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>240
cggtattctt aacacatctt gcc                                         23
<210>241
<211>23
<212>DNA
<213>人工
<220>
<223>用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>241
gtgtctgcgt atctacctga acg                                         23
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<211>23
<212>DNA
<213>人工
<220>
<223>用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>242
ataactctgt cttcgtgagc tgg                                         23
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<211>23
<212>DNA
<213>人工
<220>
<223>用于RT-PCR的人工合成的引物序列
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<213>人工
<220>
<223>用于RT-PCR的人工合成的引物序列
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<211>22
<212>DNA
<213>人工
<220>
<223>用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>245
cagtttgagc aagcaaaaga tg                                          22
<210>246
<211>23
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<213>人工
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<213>人工
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<223>用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>247
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<213>人工
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<213>人工
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<213>人工
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<223>用于RT-PCR的人工合成的引物序列
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<213>人工
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<213>人工
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<223>用于RT-PCR的人工合成的引物序列
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<212>DNA
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<213>人工
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<213>人工
<220>
<223>用于RT-PCR的人工合成的引物序列
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<213>人工
<220>
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<212>DNA
<213>人工
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<223>用于RT-PCR的人工合成的引物序列
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<223>用于RT-PCR的人工合成的引物序列
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<223>用于RT-PCR的人工合成的引物序列
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<213>人工
<220>
<223>用于RT-PCR的人工合成的引物序列
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<212>DNA
<213>人工
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<213>人工
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<223>用于RT-PCR的人工合成的引物序列
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<212>DNA
<213>人工
<220>
<223>用于RT-PCR的人工合成的引物序列
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<213>人工
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<223>用于RT-PCR的人工合成的引物序列
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<213>人工
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<223>用于RT-PCR的人工合成的引物序列
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cagacaagat agctgactct ccc                                         23
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<213>人工
<220>
<223>用于RT-PCR的人工合成的引物序列
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<213>人工
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<223>用于RT-PCR的人工合成的引物序列
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<212>DNA
<213>人工
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<223>用于RT-PCR的人工合成的引物序列
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<213>人工
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<223>用于RT-PCR的人工合成的引物序列
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<212>DNA
<213>人工
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<223>用于RT-PCR的人工合成的引物序列
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<213>人工
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<213>人工
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<213>人工
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<213>人工
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<223>用于RT-PCR的人工合成的引物序列
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<213>人工
<220>
<223>用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>414
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<210>415
<211>23
<212>DNA
<213>人工
<220>
<223>用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>415
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<210>416
<211>23
<212>DNA
<213>人工
<220>
<223>用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>416
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<210>417
<211>22
<212>DNA
<213>人工
<220>
<223>用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>417
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<212>DNA
<213>人工
<220>
<223>用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>418
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<212>DNA
<213>人工
<220>
<223>用于RT-PCR的人工合成的引物序列
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<213>人工
<220>
<223>用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>420
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<212>DNA
<213>人工
<220>
<223>用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>421
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<212>DNA
<213>人工
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<223>用于RT-PCR的人工合成的引物序列
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<213>人工
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<212>DNA
<213>人工
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<223>用于反义方法的人工合成的S-寡核苷酸序列
<400>424
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<213>人工
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<223>用于反义方法的人工合成的S-寡核苷酸序列
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<213>人工
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<223>用于反义方法的人工合成的S-寡核苷酸序列
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<213>人工
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<213>人工
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<223>用于反义方法的人工合成的S-寡核苷酸序列
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<213>人工
<220>
<223>用于反义方法的人工合成的S-寡核苷酸序列
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<213>人工
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<213>人工
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<223>用于反义方法的人工合成的S-寡核苷酸序列
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<213>人工
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<213>人工
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<223>用于反义方法的人工合成的S-寡核苷酸序列
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<213>人工
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<223>用于反义方法的人工合成的S-寡核苷酸序列
<400>434
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<211>18
<212>DNA
<213>人工
<220>
<223>用于反义方法的人工合成的S-寡核苷酸序列
<400>435
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<213>人工
<220>
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<213>人工
<220>
<223>用于反义方法的人工合成的S-寡核苷酸序列
<400>437
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<213>人工
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<223>用于反义方法的人工合成的S-寡核苷酸序列
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<213>人工
<220>
<223>用于反义方法的人工合成的S-寡核苷酸序列
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<213>人工
<220>
<223>用于反义方法的人工合成的S-寡核苷酸序列
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<213>人工
<220>
<223>用于反义方法的人工合成的S-寡核苷酸序列
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<213>人工
<220>
<223>用于反义方法的人工合成的S-寡核苷酸序列
<400>442
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<213>人工
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<223>用于反义方法的人工合成的S-寡核苷酸序列
<400>443
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<213>人工
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<223>用于反义方法的人工合成的S-寡核苷酸序列
<400>444
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<213>人工
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<400>445
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<213>人工
<220>
<223>用于反义方法的人工合成的S-寡核苷酸序列
<400>446
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<213>人工
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<223>用于反义方法的人工合成的S-寡核苷酸序列
<400>447
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<213>人工
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<223>用于反义方法的人工合成的S-寡核苷酸序列
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<213>人工
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<223>用于反义方法的人工合成的S-寡核苷酸序列
<400>450
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<213>人工
<220>
<223>用于反义方法的人工合成的S-寡核苷酸序列
<400>451
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<213>人工
<220>
<223>用于反义方法的人工合成的S-寡核苷酸序列
<400>452
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<213>人工
<220>
<223>用于反义方法的人工合成的S-寡核苷酸序列
<400>453
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<213>人工
<220>
<223>用于反义方法的人工合成的S-寡核苷酸序列
<400>454
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<211>18
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<213>人工
<220>
<223>用于反义方法的人工合成的S-寡核苷酸序列
<400>455
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<213>人工
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<223>用于反义方法的人工合成的S-寡核苷酸序列
<400>456
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<213>人工
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<223>用于反义方法的人工合成的S-寡核苷酸序列
<400>457
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<213>人工
<220>
<223>用于反义方法的人工合成的S-寡核苷酸序列
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<213>人工
<220>
<223>用于反义方法的人工合成的S-寡核苷酸序列
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<213>人工
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<223>用于反义方法的人工合成的S-寡核苷酸序列
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<213>人工
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<223>用于反义方法的人工合成的S-寡核苷酸序列
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<213>人工
<220>
<223>用于反义方法的人工合成的S-寡核苷酸序列
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<213>人工
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<400>464
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<212>DNA
<213>人工
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<223>用于反义方法的人工合成的S-寡核苷酸序列
<400>465
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<213>人工
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<223>用于反义方法的人工合成的S-寡核苷酸序列
<400>466
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<213>人工
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<223>用于反义方法的人工合成的S-寡核苷酸序列
<400>467
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<213>人工
<220>
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<213>人工
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<223>用于反义方法的人工合成的S-寡核苷酸序列
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<213>人工
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<223>用于反义方法的人工合成的S-寡核苷酸序列
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<213>人工
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<223>用于反义方法的人工合成的S-寡核苷酸序列
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<213>人工
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<223>用于反义方法的人工合成的S-寡核苷酸序列
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<213>人工
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<213>人工
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<223>用于反义方法的人工合成的S-寡核苷酸序列
<400>479
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<223>用于反义方法的人工合成的S-寡核苷酸序列
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<213>人工
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<223>用于反义方法的人工合成的S-寡核苷酸序列
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<213>人工
<220>
<223>用于反义方法的人工合成的S-寡核苷酸序列
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<213>人工
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<213>人工
<220>
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<213>人工
<220>
<223>用于反义方法的人工合成的S-寡核苷酸序列
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<213>人工
<220>
<223>用于反义方法的人工合成的S-寡核苷酸序列
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<212>DNA
<213>人工
<220>
<223>用于反义方法的人工合成的S-寡核苷酸序列
<400>488
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<211>18
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<213>人工
<220>
<223>用于反义方法的人工合成的S-寡核苷酸序列
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<213>人工
<220>
<223>用于反义方法的人工合成的S-寡核苷酸序列
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<213>人工
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<223>用于反义方法的人工合成的S-寡核苷酸序列
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<212>DNA
<213>人工
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<223>用于反义方法的人工合成的S-寡核苷酸序列
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<213>人工
<220>
<223>用于反义方法的人工合成的S-寡核苷酸序列
<400>494
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<213>人工
<220>
<223>用于反义方法的人工合成的S-寡核苷酸序列
<400>495
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<212>DNA
<213>人工
<220>
<223>用于反义方法的人工合成的S-寡核苷酸序列
<400>496
cagggatgaa gttctcgt                                               18
<210>497
<211>18
<212>DNA
<213>人工
<220>
<223>用于反义方法的人工合成的S-寡核苷酸序列
<400>497
gcagttgaga tgattatt                                               18
<210>498
<211>18
<212>DNA
<213>人工
<220>
<223>用于反义方法的人工合成的S-寡核苷酸序列
<400>498
ttattagtag agttgacg                                               18
<210>499
<211>18
<212>DNA
<213>人工
<220>
<223>用于反义方法的人工合成的S-寡核苷酸序列
<400>499
caaaatcatt tcctcctc                                               18
<210>500
<211>18
<212>DNA
<213>人工
<220>
<223>用于反义方法的人工合成的S-寡核苷酸序列
<400>500
ctcctccttt actaaaac                                               18
<210>501
<211>18
<212>DNA
<213>人工
<220>
<223>用于反义方法的人工合成的S-寡核苷酸序列
<400>501
cgggccacca tcacggaa                                               18
<210>502
<211>18
<212>DNA
<213>人工
<220>
<223>用于反义方法的人工合成的S-寡核苷酸序列
<400>502
aaggcactac caccgggc                                               18
<210>503
<211>18
<212>DNA
<213>人工
<220>
<223>用于反义方法的人工合成的S-寡核苷酸序列
<400>503
acgattcatt gctgcctt                                               18
<210>504
<211>18
<212>DNA
<213>人工
<220>
<223>用于反义方法的人工合成的S-寡核苷酸序列
<400>504
ttccgtcgtt acttagca                                               18
<210>505
<211>18
<212>DNA
<213>人工
<220>
<223>用于反义方法的人工合成的S-寡核苷酸序列
<400>505
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<210>506
<211>18
<212>DNA
<213>人工
<220>
<223>用于反义方法的人工合成的S-寡核苷酸序列
<400>506
tacttagcac agaacaca                                               18
<210>507
<211>18
<212>DNA
<213>人工
<220>
<223>用于反义方法的人工合成的S-寡核苷酸序列
<400>507
atccactctt ccgttcat                                               18
<210>508
<211>18
<212>DNA
<213>人工
<220>
<223>用于反义方法的人工合成的S-寡核苷酸序列
<400>508
tacttgcctt ctcaccta                                               18
<210>509
<211>18
<212>DNA
<213>人工
<220>
<223>用于反义方法的人工合成的S-寡核苷酸序列
<400>509
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<210>510
<211>18
<212>DNA
<213>人工
<220>
<223>用于反义方法的人工合成的S-寡核苷酸序列
<400>510
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<210>511
<211>19
<212>DNA
<213>人工
<220>
<223>用于反义方法的人工合成的S-寡核苷酸序列
<400>511
cttgttcatg aacatctct                                              19
<210>512
<211>19
<212>DNA
<213>人工
<220>
<223>用于反义方法的人工合成的S-寡核苷酸序列
<400>512
tctctacaag tacttgttc                                              19
<210>513
<211>18
<212>DNA
<213>人工
<220>
<223>用于反义方法的人工合成的S-寡核苷酸序列
<400>513
tggcaggagg gttcttgt                                               18
<210>514
<211>18
<212>DNA
<213>人工
<220>
<223>用于反义方法的人工合成的S-寡核苷酸序列
<400>514
tacttgttct tgggagga                                               18
<210>515
<211>18
<212>DNA
<213>人工
<220>
<223>用于反义方法的人工合成的S-寡核苷酸序列
<400>515
caggcctacc tggcagga                                               18
<210>516
<211>18
<212>DNA
<213>人工
<220>
<223>用于反义方法的人工合成的S-寡核苷酸序列
<400>516
aggacggtcc atccggac                                               18
<210>517
<211>18
<212>DNA
<213>人工
<220>
<223>用于反义方法的人工合成的S-寡核苷酸序列
<400>517
accgcttacg gttggctg                                               18
<210>518
<211>18
<212>DNA
<213>人工
<220>
<223>用于反义方法的人工合成的S-寡核苷酸序列
<400>518
gtcggttggc attcgcca                                               18
<210>519
<211>18
<212>DNA
<213>人工
<220>
<223>用于反义方法的人工合成的S-寡核苷酸序列
<400>519
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<210>520
<211>18
<212>DNA
<213>人工
<220>
<223>用于反义方法的人工合成的S-寡核苷酸序列
<400>520
actagataaa agaagtct                                               18
<210>521
<211>18
<212>DNA
<213>人工
<220>
<223>用于反义方法的人工合成的S-寡核苷酸序列
<400>521
gtcaaccaga cccggcat                                               18
<210>522
<211>18
<212>DNA
<213>人工
<220>
<223>用于反义方法的人工合成的S-寡核苷酸序列
<400>522
tacggcccag accaactg                                               18
<210>523
<211>18
<212>DNA
<213>人工
<220>
<223>用于反义方法的人工合成的S-寡核苷酸序列
<400>523
tctcctttct cgatcata                                               18
<210>524
<211>18
<212>DNA
<213>人工
<220>
<223>用于反义方法的人工合成的S-寡核苷酸序列
<400>524
atagtagctc tttcctct                                               18
<210>525
<211>18
<212>DNA
<213>人工
<220>
<223>用于反义方法的人工合成的S-寡核苷酸序列
<400>525
attccttgtg ggcctcaa                                               18
<210>526
<211>18
<212>DNA
<213>人工
<220>
<223>用于反义方法的人工合成的S-寡核苷酸序列
<400>526
aactccgggt gttcctta                                               18
<210>527
<211>17
<212>DNA
<213>人工
<220>
<223>用于反义方法的人工合成的S-寡核苷酸序列
<400>527
cccatgcgag ctgcgcc                                                17
<210>528
<211>17
<212>DNA
<213>人工
<220>
<223>用于反义方法的人工合成的S-寡核苷酸序列
<400>528
ccgcgtcgag cgtaccc                                                17
<210>529
<211>18
<212>DNA
<213>人工
<220>
<223>用于反义方法的人工合成的S-寡核苷酸序列
<400>529
agtgataaac agaaagcg                                               18
<210>530
<211>18
<212>DNA
<213>人工
<220>
<223>用于反义方法的人工合成的S-寡核苷酸序列
<400>530
gcgaaagaca aatagtga                                               18
<210>531
<211>18
<212>DNA
<213>人工
<220>
<223>用于反义方法的人工合成的S-寡核苷酸序列
<400>531
tatcctcgac tttgactt                                               18
<210>532
<211>18
<212>DNA
<213>人工
<220>
<223>用于反义方法的人工合成的S-寡核苷酸序列
<400>532
ttcagtttca gctcctat                                               18
<210>533
<211>19
<212>DNA
<213>人工
<220>
<223>用于RNAi的人工合成的寡核苷酸序列
<400>533
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<210>534
<211>19
<212>DNA
<213>人工
<220>
<223>用于RNAi的人工合成的寡核苷酸序列
<400>534
acagtgttcc gctaagtga                                              19
<210>535
<211>19
<212>DNA
<213>人工
<220>
<223>用于RNAi的人工合成的寡核苷酸序列
<400>535
ccagttgagt cgacatctg                                              19
<210>536
<211>19
<212>DNA
<213>人工
<220>
<223>用于RNAi的人工合成的寡核苷酸序列
<400>536
gcagcagata ccatcagtg                                              19
<210>537
<211>20
<212>DNA
<213>人工
<220>
<223>用于RNAi的人工合成的寡核苷酸序列
<400>537
cgcagctgcg aagtgttgta                                             20
<210>538
<211>19
<212>DNA
<213>人工
<220>
<223>用于RNAi的人工合成的寡核苷酸序列
<400>538
gatacgaaag cagctgcga                                              19
<210>539
<211>19
<212>DNA
<213>人工
<220>
<223>用于RNAi的人工合成的寡核苷酸序列
<400>539
gagcgattca tcttcatca                                              19
<210>540
<211>19
<212>DNA
<213>人工
<220>
<223>用于RNAi的人工合成的寡核苷酸序列
<400>540
ctgcaattga ggctccttc                                              19
<210>541
<211>19
<212>DNA
<213>人工
<220>
<223>用于RNAi的人工合成的寡核苷酸序列
<400>541
gagtgtgctg gtgaagcag                                              19
<210>542
<211>19
<212>DNA
<213>人工
<220>
<223>用于RNAi的人工合成的寡核苷酸序列
<400>542
gatcaagtcc tgcacactg                                              19
<210>543
<211>19
<212>DNA
<213>人工
<220>
<223>用于RNAi的人工合成的寡核苷酸序列
<400>543
cgtgctagca gctgcgtgt                                              19
<210>544
<211>19
<212>DNA
<213>人工
<220>
<223>用于RNAi的人工合成的寡核苷酸序列
<400>544
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<210>545
<211>19
<212>DNA
<213>人工
<220>
<223>用于RNAi的人工合成的寡核苷酸序列
<400>545
cggaggatct catgaccac                                              19
<210>546
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<212>DNA
<213>人工
<220>
<223>用于RNAi的人工合成的寡核苷酸序列
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<210>547
<211>19
<212>DNA
<213>人工
<220>
<223>用于RNAi的人工合成的寡核苷酸序列
<400>547
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<210>548
<211>19
<212>DNA
<213>人工
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<210>549
<211>19
<212>DNA
<213>人工
<220>
<223>用于RNAi的人工合成的寡核苷酸序列
<400>549
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<210>550
<211>19
<212>DNA
<213>人工
<220>
<223>用于RNAi的人工合成的寡核苷酸序列
<400>550
gacaaattga gtggcagca                                              19
<210>551
<211>19
<212>DNA
<213>人工
<220>
<223>用于RNAi的人工合成的寡核苷酸序列
<400>551
gagattcaga gtggacgaa                                              19
<210>552
<211>19
<212>DNA
<213>人工
<220>
<223>用于RNAi的人工合成的寡核苷酸序列
<400>552
gagagcaatg aggatgact                                              19
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