一种茶树RNA提取方法

阅读:695发布:2021-01-17

专利汇可以提供一种茶树RNA提取方法专利检索,专利查询,专利分析的服务。并且本 发明 公开了一种茶树RNA提取方法,步骤包括:取茶树组织,加入不溶性聚乙烯吡咯烷 酮 PVPP,液氮 研磨 成粉末,加入提取液, 水 浴并离心,获得的上清液中加入无水 乙醇 ,沉淀RNA,再用 吸附 柱进行吸附,洗涤吸附柱,最后用RNA-free水洗脱,获得茶树RNA。该方法是将 现有技术 的CTAB法与RNA提取 试剂 盒 结合,在现有茶树RNA提取方法上做了进一步优化,与现有技术相比,该方法提取茶树RNA的时间短,获得的茶树RNA的提取率和纯度高。,下面是一种茶树RNA提取方法专利的具体信息内容。

1.一种茶树RNA提取方法,其特征在于,包括以下步骤:
(1)取茶树组织,加入茶树组织0.5~1.5倍重量的不溶性聚乙烯吡咯烷PVPP,液氮中研磨成粉末;
(2)将步骤(1)的粉末中加入提取液,每1g茶树组织加入4.5mL的提取液,混匀,每1g茶树组织中再加入250μL的β-巯基乙醇浴,得到粗样品;
(3)将步骤(2)的粗样品在4℃下离心,取上清转移至RNA提取试剂盒的过滤柱中,离心,获得上清液;
(4)将步骤(3)的上清液中加入0.5倍上清液体积的无水乙醇,混匀,获得粗提液;
(5)将步骤(4)的粗提液转移至RNA提取试剂盒的吸附柱中进行吸附,然后用RNA提取试剂盒中的去蛋白液和漂洗液洗涤吸附柱,最后用不含核酸酶的RNA-free水洗脱吸附柱上的RNA,获得茶树RNA。
2.如权利要求1所述的一种茶树RNA提取方法,其特征在于,所述步骤(1)中,茶树组织选自茶树嫩叶、成熟叶、茶树嫩根和茶树花蕾中的一种。
3.如权利要求1所述的一种茶树RNA提取方法,其特征在于,所述步骤(1)中,加入的PVPP重量与茶树组织的重量相等。
4.如权利要求1所述的一种茶树RNA提取方法,其特征在于,所述步骤(2)中,水浴温度为65℃,水浴时间为30min。
5.如权利要求1所述的一种茶树RNA提取方法,其特征在于,所述步骤(2)中,提取液的配方为:1.4mol/L的NaCl,重量百分比为2%的十六烷基三甲基溴化铵CTAB,100mmol/L的三羟甲基基甲烷的盐酸溶液Tris-HCl和20mmol/L的乙二胺四乙酸EDTA,溶剂为焦酸二乙酯DEPC水,pH8.0,配制后灭菌。
6.如权利要求1所述的一种茶树RNA提取方法,其特征在于,所述步骤(3)中,离心的转速为12000rpm,离心的时间为5min。

说明书全文

一种茶树RNA提取方法

技术领域

[0001] 本发明涉及RNA提取领域,具体地是一种茶树RNA提取方法。

背景技术

[0002] 茶树原产于我国西南地区,是一种喜温畏寒的多年生经济作物,从分子平上挖掘优良茶树种质资源是一项很有意义的工作。随着现代分子生物学的发展,构建茶树cDNA文库、茶树基因克隆及表达分析、茶树microRNA分析等已经成为茶树生物技术研究的重点工作,而从茶树中提取出高质量的RNA是进行这些研究的关键步骤。
[0003] 茶树是一种的多年生木本植物,富含多糖、多酚类物质,容易在核酸分离纯化时,与RNA相互作用,使得RNA降解,因此,用这些常规方法提取时往往效果较差。现有技术中常用的RNA提取方法包括CTAB法、Trizol法等,也有很多市售的RNA提取试剂盒,如史成颖等人利用传统CTAB法,提取获得了茶树嫩叶RNA(史成颖等,提取高质量茶树总RNA的方法研究,安徽农业大学学报,2007年,第34期第3版,360~363页),该茶树RNA的A260/280值为2.08~2.10,RNA浓度为845.5~901.2ng/μL,提取过程消耗了2天的时间。市售的植物RNA提取试剂盒种类较多,提取时间短,一般只需要2~4小时,但针对性不强,提取率和纯度不能很好地满足开展茶树基因工程实验需要。因此,需要寻找一种更加优化的方法,以达到进一步提高总RNA提取率的基础上缩短提取时间,同时保证RNA的高纯度及完整性的目的。

发明内容

[0004] 本发明的目的在于克服现有技术的不足,提供一种茶树RNA提取方法,以提供一种更加优化的方法,进一步提高茶树RNA提取率和纯度,缩短提取时间。
[0005] 本发明是通过以下技术方案实现的,本发明包括以下步骤:
[0006] 一种茶树RNA提取方法,包括以下步骤:
[0007] (1)取茶树组织,加入茶树组织0.5~1.5倍重量的不溶性聚乙烯吡咯烷PVPP,液氮中研磨成粉末;
[0008] (2)将步骤(1)的粉末中加入提取液,每1g茶树组织加入4.5mL的提取液,混匀,每1g茶树组织中再加入250μL的β-巯基乙醇,水浴,得到粗样品;
[0009] (3)将步骤(2)的粗样品在4℃下离心,取上清转移至RNA提取试剂盒的过滤柱中,离心,获得上清液;
[0010] (4)将步骤(3)的上清液中加入0.5倍上清液体积的无水乙醇,混匀,获得粗提液;
[0011] (5)将步骤(4)的粗提液转移至RNA提取试剂盒的吸附柱中进行吸附,然后用RNA提取试剂盒中的去蛋白液和漂洗液洗涤吸附柱,最后用不含核酸酶的RNA-free水洗脱吸附柱上的RNA,获得茶树RNA。
[0012] 优选地,所述步骤(1)中,茶树组织选自茶树嫩叶、成熟叶、茶树嫩根和茶树花蕾中的一种。
[0013] 优选地,所述步骤(1)中,加入的PVPP重量与茶树组织的重量相等。
[0014] 优选地,所述步骤(2)中,水浴温度为65℃,水浴时间为30min。
[0015] 优选地,所述步骤(2)中,提取液的配方为:1.4mol/L的NaCl,重量百分比为2%的十六烷基三甲基溴化铵CTAB,100mmol/L的三羟甲基基甲烷的盐酸溶液Tris-HCl和20mmol/L的乙二胺四乙酸EDTA,溶剂为焦酸二乙酯DEPC水,pH8.0,配制后灭菌。
[0016] 优选地,所述步骤(3)中,离心的转速为12000rpm,离心的时间为5min,将粗样品离心可以去除粗样品中的固体物质,避免后续将样品转入过滤柱时,固体物质堵塞过滤柱。
[0017] 本发明相比现有技术具有以下优点:本发明提供了一种茶树RNA提取方法,该方法是将现有技术的CTAB法与RNA提取试剂盒结合,在现有茶树RNA提取方法上做了进一步优化,用该方法提取茶树RNA的用时只需2小时,大大缩短了提取时间,同时,用该方法提取茶树RNA与现有技术相比,茶树RNA的提取率和纯度都有大幅度提高。附图说明
[0018] 图1为茶树嫩叶RNA的甲变性胶电泳图,其中泳道1~3为3个重复;
[0019] 图2为茶树成熟叶片RNA的甲醛变性胶电泳图,其中泳道1~2为2个重复;
[0020] 图3为茶树嫩根中RNA的甲醛变性胶电泳图,其中泳道1~3为3个重复;
[0021] 图4为茶树花蕾RNA的甲醛变性胶电泳图,其中泳道1~3为3个重复;
[0022] 图5为用试剂盒提取的茶树嫩叶RNA的甲醛变性胶电泳图,其中1~2为2个重复。

具体实施方式

[0023] 下面对本发明的实施例作详细说明,本实施例在以本发明技术方案为前提下进行实施,给出了详细的实施方式和具体的操作过程,但本发明的保护范围不限于下述的实施例。
[0024] 实施例1
[0025] 本实施例为茶树嫩叶RNA提取方法,包括以下步骤:
[0026] (1)取茶树嫩叶0.2g,加入0.2g的不溶性聚乙烯吡咯烷酮,液氮中迅速研磨成粉末;
[0027] (2)配制提取液并灭菌,将步骤(1)的粉末中加入900μL的提取液,混匀,再加入50μL的β-巯基乙醇,65℃下水浴30min,得到粗样品,所述提取液的配方为:1.4mol/L的NaCl,重量百分比为2%的十六烷基三甲基溴化铵,100mmol/L的Tris-HCl,20mmol/L的EDTA,溶剂为水;
[0028] (3)将步骤(2)的粗样品在4℃下离心5min,离心转速为12000rpm,取上清转移至天根RNA提取试剂盒(购于天根生化科技有限公司)的过滤柱CS中,12000rpm离心2min,获得上清液;
[0029] (4)将步骤(3)的上清液中加入0.5倍上清液体积的无水乙醇,混匀,获得粗提液;
[0030] (5)将步骤(4)的粗提液用天根RNA提取试剂盒提取,所述提取步骤包括:
[0031] 1)将粗提液转移至试剂盒的带有收集管的吸附柱CR3中进行吸附,12000rpm离心1min,弃废液,将吸附柱CR3重新放回收集管中;
[0032] 2)向上述步骤1)的吸附柱CR3中加入350μL去蛋白液RW1溶液,12000rpm离心1min,弃废液,将吸附柱CR3重新放回收集管中;
[0033] 3)配制DNaseⅠ溶液:取10μL的DNaseⅠ的存储液,加入70μL的RDD溶液混匀;
[0034] 4)向上述步骤2)的吸附柱CR3中加入80μL的DNaseⅠ溶液,室温放置15min,然后加入350μL的去蛋白液RW1溶液,12000rpm下离心1min,弃废液,将CR3重新放回收集管中;
[0035] 5)向上述步骤4)的吸附柱CR3中加入500μL的漂洗液RW(使用前已按试剂盒说明书中的提示加入无水乙醇),室温静置2min,12000rpm下离心1min,弃废液,将CR3重新放回收集管中;
[0036] 6)重复上述步骤5),在12000rpm下离心2min,弃废液,将吸附柱CR3于室温下静置10分钟以彻底晾干吸附柱中残留的漂洗液
[0037] 7)将上述步骤6)的吸附柱CR3放入一个新的离心管中,向吸附膜中悬空滴加50μL不含核酸酶的RNA-free水,室温放置2min,12000rpm下离心2min,得到得溶液即为RNA。得到的所述总RNA。
[0038] 以上提取方法中所用到的试剂和实验器材均不含核酸酶,重复3次,提取获得的RNA甲醛变性胶电泳结果如图1所示。
[0039] 实施例2
[0040] 本实施例为茶树成熟叶的RNA提取方法,取茶树成熟叶0.2g,剪碎,加入0.2g的PVPP,其它步骤同实施例1,重复2次,提取获得的RNA甲醛变性胶电泳结果如图2所示。
[0041] 实施例3
[0042] 本实施例为茶树嫩根的RNA提取方法,取茶树嫩根0.2g,剪碎,加入0.2g的PVPP,其它步骤同实施例1,重复3次,提取获得的RNA甲醛变性胶电泳结果如图3所示。
[0043] 实施例4
[0044] 本实施例为茶树花蕾的RNA提取方法,取茶树花蕾0.2g,加入0.2g的PVPP,其它步骤同实施例1,重复3次,提取获得的RNA甲醛变性胶电泳结果如图4所示。
[0045] 取实施例1~4提取的茶树RNA,用甲醛变性胶进行电泳检测,获得如图1~4所示的电泳图,另取茶树嫩叶,用天根RNA提取试剂盒提取RNA作为对照组,重复2次,得到如图5所示的甲醛变性胶电泳图。
[0046] 通过核酸定量仪检测实施例1~4提取的茶树RNA和对照组的RNA的A260/280值和RNA浓度,计算RNA平均浓度,结果如下表1所示:
[0047] 表1:茶树RNA的A260/280值和提取率的测定结果
[0048]
[0049] 本发明的茶树RNA提取方法提取所用的时间只需2小时,从表1中可以看出,用本发明改良的茶树RNA提取方法提取获得的茶树嫩叶RNA的浓度提高50%以上,说明该方法提取的RNA的提取率高;A260/280值更接近2,说明RNA降解的程度更小,纯度更高,将图1~4和图5做比较,可以看出,与RNA提取试剂盒提取获得的RNA相比,本发明改良方法提取获得的RNA电泳条带更清晰,无拖带杂带,RNA质量好。
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